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Reference ( gi|11 ) : TGTGC-G---TGAA-T---GCA-CGT-G-C-ATTG---TAA-TTTGT-----G-A-TG-TT--T-AAAT-TG-CA-TTA---A-CTGA----CTTC-AGGAGATTACT-TTTC---CA--T-T--GA-A-T-G----A-A-TA--G-T--TTTG--AAA----------T-GTAT----AT--TTC---AG-ATATA--GT-T-TG-------GAACT---CT--TTG--TT-AA----TT-GGT-GA----T-GT-C-AAAATCAT-TATCC----C-CGC-A-C--CGCTC-G------------A-C--G-TG-C-GC---TG-AA-------A-TC-TG-ATTG---G---A-T---A------T----A--T---CG--T-A-TG-TG--------C---AT-----------CT--CT-C-TCTC-TTTA-A---T--------G--GGCTTTT-TGAAATGAAATTTTGGATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-TAAGG-G-AG-A-T-T-A-T--T-A-TTG--TG----G-G-AAA-A-TGT-G-AGCGG-CATGCGTG-TA--TGTGGCA--CGT-G-CAA-TTTTCA-TATA-C-ATAA--T----T----CG--GG-CTC-TCT--TT----------CCATG-T-CTTTT--AC-TG--A--A---C--G-T-TAGA-AA-TG-G--TG--T-C-TCA--TG-T--A--CA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGC
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gi|17 : tgtggtttgtatgacatgatggagtgcctgaaaaaatggttcaagaaaaattatttttatcaaattcgctgtccactgtgtagatgcgtgtgggggaggggggcaaatgagattctgatggtctgaaattgtatttactactctatgaatctttacatgaatgaattagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--T---CG--T-A-T--TG--------C---AT-----------CT-------TCTC-TTTA-----T--------G--AGCTTTT----GATGAAATTT-GGATC----AT--AG-TATA---T--G---T--G--C-AAA----TC-T-A-CAAGG---AG-A-T-T-A-T--T---TTG--TT----G-G-AAA-A-TGT-G-AGCG--CATGCGCG-TA--TAT--CA--CGT-G-CA--TTTTCA-TA-------AA--T----T----TTT-GG-CTC-TTG--TT----------CCATG-T-CTTTT--AC-TG--A--A---C--G-A-TAGA-AAGTG-G--TG--T-C-TCA--TG-T--A--CA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT--A---AAA---TCGttg
gi|15 : --T-A-TG-TG--------C---AT-----------ATATCT-C-TCTC-TTT------T--------G--AGGCTTT-TGGAATGAAATTT-GGATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--G-CAA-AA-TC-T-A-CAAGG-G-GG-A-T-T-A-T--T-A-TTG--TG----G-GAAAA-A-TGT-G-AGC-G-CATGTGTG-TA--TAT-GCA--CGT-G-CAATTTTTCA-TATA-C-ATAT--T----T----CG--GG-CTC-TCTG-TT----------CCATG-T-CTTTT--AC-TG--A--A---C--G-T-TAGA-AAGTG-G--TG--T-C-TCA--TG-T--A--CA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGC
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gi|21 : A-TC-T-A-CAAGG-G-AG-A-T-T-A-T--T-A-TTG--TG----G-A-AAA-A-TGT-G-AGC-G-CATGCGTG-TA--TAT-GCA--CGT-G-CAA-TTTTCA-TATA-C-AT-A--T----T----CG--GG-CTC-TCTG-TT----------CCATG-T-C-TTT--AC-TG--AAGA---C--G-T-TAGA-AAGTG-G--TG--T-T-TCA--TG-T--A--CA---G-ATT-T-G-GTATCATT-A--TG-GT-AA---At
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gi|26 : -TC-T-A-CAAGG-G-GG-A-T-T-A-T--T---TTG--TG----G-A-AAA-A-TGT-G-AGCG--CATGTGTG-TA--TATG-CA--CGT-G-CAA-TTTTCA-TATA-C-ATAT--T----T----CG--GGGCTC-TCTG-TT----------CCATG-T-CTTTT--AC-TG--A--A---C--G-T-TGGA-AG-TG-G--TG--T-C-
gi|25 : -TC-T-A-CAAGG-G-AG-A-T-T------T-A-TTG--TG----G-G-AAA---TGT-G-AGCG--CATGCGTG-TA--TATG-CA--CGT-G-CAA-TTTTCA-TATA-C-ATAT--T----T----CG--G----C-TCTG-TT----------CCATG-T-C-TTT--AC-TG--A--A---C--G-TATAGA-AAGTG-AGTTG--T-C-TCA--TG-T--A--C
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3888 ) : TGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-TCT-AAAT-TG-TA-TTA---A-C-T---ACT-C--TA-G-AGA-TCA-TTTTC---CA-T-TT----------G--A-ATG----A-AT-A--G-TT----TTG--AAA----------T-GTAT----AT--TTC---AG-A-T--AT-GT--T--T-------G--------G--G-ACT---CT--TTG--TT-AATT-GG-TG-AT-GT-C-AAAATCAT-TATCC----C-CGC-A-C-C--GCTC--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT-GA----TA--T-----CG--T-A-TG-TG--------C-AT-----------NT--C-T-C-T-CTC-TTTA-A---T--------G--GGCTTTT-TGGAATGAAATTTTGGATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--CAAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-T-G--T-G----G-AAAA-A-TGT-G-AGCGG-CATGCGTGTA--T-ATGGCA--CGT-G-CAA-TTTTCA-TA-TA-C-A-T-A-TT-T----C-GG--GCTC-T-----CTG-TTCC--ATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGC
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gi|10 : actgacatgcagtgcttaaaaggtatgtatggtttcagacgaaaatataaatcttacaattattcaaaagtgtcgcggtgcgcgtgaatgcgcgtggcattgttaatttatctccagtatgttaaattgttattatcagtagggcttctctcccactttcttcttgtggaatgaagaaatgtttccctGCCC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-TCT-AAAT-CG-TA-AT----A-T-T---ACT-CT-TT-G-AG---TA--CTTC---TA-T-TT----------G--A-ATG----A-AT-A--G------------------------------T----AT--TTC---AG-A-T--AT-GT--A--T-------G--------T--G-ACT---AT--TTG--TT-AATT-GGTTG-AT-GT-C-AAAATAATGTATCC----CGCAC-A-C-C---CTC--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT--A----TA--T-----CG--T-A-TG-TG--------C-ATATATCTCTCTCTT--C-T-C-T-CTC-TTTA-A---T--------G--AGGCTTT-TGGAATGAAATT------------T--GGGTATA---C--AC--T--G--CAAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A--T-A-G-T-G--T-G----G-AAAA-A-TGT-G-AGC-G-CATGTGTGTAC-T-AC-GCA--CGT-G-CAA-TTTTCA-TA-TA-CAA-T-A-TT-T----C-GG--GCTC-T-----CTG-TTCC--ATG-TC-TTTTA-AC-TG--A--AC--T-T-TAGAAAGTG-A--AAT-CTTA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---A
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3888 ) : TGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-T-CT-AAAT-TG-TA---TTA---A-C-T-ACT-C--TA-G-AGA-T--CTTTTC-CAT-TT----------G--A-ATG----A-AT-A--G-TT---TTG--AAA----------T-GTAT----AT--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--G-ACT---CT--TTG--TT-AATT-GGT-GA-T-GT-C-AAAATCAT-TATCC----C-CGC-A-C--CGCTC--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT-GA----TA--T-----CG--T-A-TG-TG--------C--ATAT-----------CTC-T---CTC-TTTA-A---T--------G--GGCTTTT-TGGAATGAAA-T-TT-GGATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGCGG-CATGCGTGTA--T-ATGGCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGC
gi|1 : TGCGC-GTGAA-T---GCG-CGTGG-C-ATTGT--TAA-TTTATCTCCAGTA-TG-T--T-AAAT-TGTTA---TTA-----------T-CAGTA-G-GGCTT--CTCTCC-CAC-TTTCTTCTTGTGG--A-ATG----A-A--------------G--AAA----------T-GT
gi|1 : actgacatgcagtgcttaaaaggtatgtatggtttcagacgaaaatataaatcttacaattattcaaaagtgtcgcgg-ATTG-----A-TT--T-T---G-A-T-----T-AA-T-TG-T-----CA---A-T-T-CTT-C--T-----GA-T--GTTATT-TAT-TT---------------ATG-------------------TTGGAAAA----------TAGTAT----AT--TTCCAGAG-G-TAT-GCTTT-ATT-GCTGC----G--A-ACTGACCT--TTG--TTTAATT-GGT-G--T-TT-C-AAATT--T-CATCC----TGCGCGA-C--AGCTC--G------------------CA-C-GGTG-CGCCTGTG-AAAGTCGTG-ATTGTGGGATAGAATATTA--C-----CG--T-A-TG-TGAG------C--ATAT-----------ATCGT---CTC-TTTATA---CC-------G--AGCTTT---GGAATG------TT-GGATCGAGTAT--AG-TATT---T--GC--T--GTGC-AAA-AA-T--T-A-C-AAGG---AG-A-T--TTA-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT--AGCG--CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CG-T-GCCAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT---AAGG-TA-TTTT--GC-TGA-A--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGTCCTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-ttccctattgattttgattaattgtcaattcttctgatgttatttatttatgttggaaaatagtatatttccagaggtatgctttattgctgcgaactgacctttgtttaattggtgtttcaaatttcatcctgcgcgacagctcgcacggtgcgcctgtgaaagtcgtgattgtgggatagaatattaccgtatgtgagcatatatcgtctctttataccgagctttggaatgttggatcgagtatagtatttgctgtgcaaaaattacaaggagatttattattgtggaaaaatgtagcgcatgcgtgtatatgcacgtgccaattttcatatacatatttcgggctctctgttaaggtattttgctgaaacgttagaaagtggtgtcctcatgtacagatt
gi|10 : actgacatgcagtgcttaaaaggtatgtatggtttcagacgaaaatataaatcttacaattattcaaaagtgtcgcggtgcgcgtgaatgcgcgtggcattgttaatttatctccagtatgttaaattgttattatcagtagggcttctctcccactttcttcttgtggaatgaagaaatgtttccctGCCC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-T-CT-AAAT-CG-TA---ATA-----T-T-ACT-C--TTTG-AGT-A--CTT--C-TAT-TT----------G--A-ATG----A-AT-A--G-T--------------------------------AT--TTC---AG-A-TAT-G---T-AT--G--------T--G-ACT---AT--TTG--TT-AATT-GGTTGA-T-GT-C-AAAATAATGTATCC----CGCAC-A-C--C-CTC--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT--A----TA--T-----CG--T-A-TG-TG--------C--ATATATCTCTCTCTTCTC-T---CTC-TTTA-A---T--------G--AGGCTTT-TGGAATGAAA-T-TT-GG-------------GTATA---C--AC--T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A--T-A-G-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGC-G-CATGTGTGTAC-T-AC-GCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-ACAA-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTTA-AC-TG--A--AC--T-T-TAGAAAGTG-A--AAT-CTTA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---A
gi|11 : tctcaaattcgcgttcTGTGC-GTGAA-T---GCA-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TGT---G-A-TG-T-TT-AAAT-TG-CA---TTA---A-C-TGACT-T--CA-GGAGA-TTACTTTTC-CAT-T-----------G--A-ATG----A-AT-A--G-TT---TTG--AAA----------T-GTAT----AT--TTC---AG-A-TATAG---T--TT-G--------G--A-ACT---CT--TTG--TT-AATT-GGT-GA-T-GT-C-AAAATCAT-TATCC----C-CGC-A-C--CGCTC--G-------------------A-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT--A----TA--T-----CG--T-A-TG-TG--------C--ATCT-----------CTC-T---CTC-TTTA-A---T--------G--GGCTTTT-TGAAATGAAA-T-TTTGGATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-T-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-GAAA-A-TGT-GAGCGG-CATGCGTGTA--T-GTGGCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-AT-T----C-G--G--GCTC-----TCT--TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-TAGAAA-TG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGCtttg
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3888 ) : TGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-T-CT-AAAT-TG-TA---TTA---A-C-T-ACT-C--TA-G-AGA-T--CTTTCC-CAT-TT----------G--A-ATG----A-AT-A--G-TT---TTG--AAA----------T-GTAT----AT--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--G-ACT---CT--TTG--TT-AATT-GGT-GA-T-GT-C-AAAATCAT-TATCC----C-CGC-A-C--CGCTC--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT-GA----TA--T-----CG--T-A-TG-TG--------C--ATAT-----------CTC-T---CTC-TTTA-A---T--------G--GGCTTTT-TGGAATGAAA-T-TT-GGATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGCGG-CATGCGTGTA--T-ATGGCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGC
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gi|15 : --T-A-TG-TG--------CATATAT-----------CTC-T---CTC-TTT------T--------G--AGGCTTT-TGGAATGAAA-T-TT-GGATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--G-CAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-GG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--TGG----G-AAAA-A-TGT-GAGC-G-CATGTGTGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CAATTTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGCttgtgttgaaatcgatcttgtagtcatctgatcagtgatgtaaagaatttgct
gi|16 : G-TG--------C--ATA------------CTC-TT--CTC-TTTA-A---T--------G--AGGCTTT-TGGAATGAAAAT-TT-GGATC----AT--AGGTAT----T--GC--T--G--C-AAA-A--TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--TCA-TT-A-T-TG--TTG----G-AAAA-A-TGT-GAGCG--CATGCGC-TAATT-ATG-CA--CG-T-GACAA-TTTTCA-AA-T-AC-A-TA-TT-T------G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--GAT-AAGAAAGTG-G--TG--CTCA--TG-T--ACAG--G-A-TCT-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGCtt
gi|17 : a--T-----CG--T-A-T--TG--------C--AT-------------CT--T---CTC-TTTA-----T--------G--AGCTTTT----GATGAAA-T-TT-GGATC----AT--AG-TATA---T--G---T--G--C-AAA----TC-T-A-C-AAGG---AG-A-T--T-A-TT---T-TG--T-T----G-GAAA-A-TGT-GAGCG--CATGCGCGTA--T-AT--CA--CG-T-G-CA--TTTTCA-TA------A--A-TT-T----T-T--G--GCTC-----T-TG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-A-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT--A---AAA---TCG
gi|19 : -TC-TCA-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-AATGT-GAGCGC-TATGCGCGTA--T-ATG-CA--CG-T-G-CAA-TTT-CA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----T-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TCTTTTT--AC-TG--A--AC--G-A-TAGAAAGTG-G--TGTCCTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT--A---AAA---TCGC
gi|2 : T--TCT---G-A-TGGT-CTGAAAT-TG-TA---TTT---A-C-T-ACT-C--TA-T-GAA-T--CTTT----AC-AT----------G--A-ATG----A-ATTA--G-TTGNNNNN--NNN----------N-NNNN----NN--NNN---NN-N-NNN-N---N-NNN-N--------N--N-NNN---NN--NNN--NN-NNNN-NNN-NN-N-NN-N-NNNNNNNN-NNNNN----N-NNN-N-N--NNNNN--N------------------NN-N-N-NN-NNN---NN-NNN-NN-NN-NNNN---NNN-NA----T---T-----CG--TTA-TGCTG--------C--ATATAT---------CTC-T---CTC-TTTA-A---TT-------G--GGCTTGT--GGAA-GGAA-T-TT-G-ATC----AT--AGGTATA---TT-GC--T--G--G-CAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-GG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----T-AAAA-A-TGTGGAGC-G-CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CGTT-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-GGTG--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC----T-TAG-AAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--A-A---G-A-T-T-G-G------T-A--TT-GTAAA---AAA---TCGC
gi|20 : tgtggtttgtatgacatgatggagtgcctgaaaaaatggttcaagaaaaattatttttatcaaattcgctgtccactgtgtagatgcgtgtgggggaggggggcaaatgagaA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T----A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-AGTGT-GAGCG--CATGTGTGTA--T-ATG-CA--CG-T-G-CAA-TTT-CA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATT-TC-TTTT--CT-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTGTG--TGT--TCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGCttg
gi|21 : A-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGC-G-CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA--T-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC--TTT--AC-TG--AAGAC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-TTCA--TG-T--ACA---G-ATT-T-G-GTATCATT-A--TG-GT-AA---At
gi|22 : C-T-A-C-AAGG-G-AG-A-TTAT-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGC-G-CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-T--TGT-CTCA--TG-T--ACA---GAA-T-T-G-G------T-A--TG-G--AA---AAA---TCGC
gi|23 : gTG----A-AT-A--G-CA---TTA--ACA----------T-TT-T----GT--TGC---AG-G-TGT-A---T-GTT-T--------G--G-ACT---TT--CTC--CT-AATT-ATT-CT-C-GT-C-AAAATTAA-T-TTT----C-CGT-A------CTC--G------------------TA-A-G-TG-AAA---TT-AAA-TT-TG-ATTG---ACT-GA----TA--TTCAAATA--C-A-TG-TA--------C--GTGTAA---------CTC-T---CT
gi|24 : attcaatt-TT----------T--A-ATG----A-AT-A--A-TG---TTG--ACA----------T-TTAT----GT--TGC---AG-A-TAC-A---T--TT-GTTAACTCTGTTG-ACT---CT--TTG--CT-GATC---T-G--T-GT-C-ATAAAAAA-TATCC----C-------T--TGCTCAAG------------------CA-G-G-TG-CAC---TC-AAT-TT-TG-AT------AT--A----CA--T------G--T-A-TA-TG--------C--A
gi|25 : -TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T----T-A-T-TG--T-G----G-GAAA---TGT-GAGCG--CATGCGTGTA--T-ATG-CA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G-----C-----TCTG-TT--CCATG-TC--TTT--AC-TG--A--AC--G-TATAGAAAGTG-AGTTGT-CTCA--TG-T--AC
gi|26 : -TC-T-A-C-AAGG-G-GG-A-T--T-A-TT---T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGCG--CATGTGTGTA--T-ATG-CA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----CGG--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-T-GGAAGTG-G--TGT-C
gi|27 : TGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-CTTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-T-CA-AAAT-TT-AA---GT----A-C-T-ACA-C--TATG-AGA-T--CTTT
gi|3 : attatttaatcatgcaaattagagTGCGC-GTGAAAT---GCG-CAT-G-C-ATTGG--TAA-TT--TC----G-A-TG-T-CT-AAAT-TG-TA---TTA-----C-T-ACT-C--TATG-AGA-T--CTTTCC-AAT-TT----------G--A-ATG----A-AT-A--G-TT---TTG--GAACGTTTGTTGAT-GTAT----AT--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--G-ACT---CT--TTG--TT-AATT-GGT-GA-T-GT-C-AAAATCAA-TTCTC----C-CGC-A-CAAAGCTA--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG--AA-TC-TG-ATTG---GAT-GA----AA--TTC---CG--T-A-TG-TA--------C--ATATC----------CTC-T---CTC-TTTA-A---T--------G--AGGCTTT-TGGAATGAAA-T-TT-GGAT-----AT--AGGTATA---T--GC--TAGG--CAAAA-AA-TC-T-A-C-AAGGAG-AA-A-T--T-A-TT-GTT-TG--T-G----G-GAAA-A-TGT-GAGC-G-CAAGCGTGT---T-AT-GCA--TG-T-G-C-A-TTTTCA-TA-T-AC-A-AA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--A--TGAAA--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-TAAACA---G-A-T-T-G-G------TAA--TG-GT-AA---AAA---TCGCatta
gi|4 : gaatttatgacagtgagtgccaaagaaatggtgtcaagaaaaaattatcttgaatcaaattcgcgTGTGCAGTGAA-T---GCG-CGC-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-T-CT-AAAT-TG-TA---T-----A-C-T-ACG-C--TACG-ATACT--CTTT-C-CATATG----------G--A-ATG----A-AT-A--GTTT---TTG--AAAG---------T-GTATTATAAT--TTC---AG-A-TAT-G---T-TAT-G--------G--G-ACT---CT--TTGTTTT-AATT-GGT-GA-T-GT-C-AACAT--T-TAT-C----C-CGC-A-CA-CGCGC--G------------------CA-CGG-TG-CAC---TG-AAACTC-TG-ATTG---G-T-GA----TAGTT-----CG--T-T-TG-TG--------C----AT-----------CTC-G---CTC-TTTA-A---T--------GA-GGC--TT-TGGAATGAAA---TT-GGATC----ATAAAGGTATA---T--GCT-T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-GAAG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAACA-TGT-GA--AG-CATGCGCGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CCA-ATTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-TA---T-G--G--GCTC-----TC---TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--T--ACGAG-T-TAGAAAGTG-T--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-A-T-G-G------T----TGCGTAAA---AAA---TCGCttgc
gi|5 : gtagtgtcatgaccatgaggcctaaagaatgtgtcaagaaaaatgcatctttataaaagtcgcgTGCGCCGTGAA-T---GCGGCGT-G-CCATTGGCGTAAATT--TCT---G-A-TG-T--T-AAAT-TG-TAA--TTACACA-CCT-ACT-G---A-G-AAA-T--CTTAAAACAT-TT----------GGTA-TTG----A-AT-A--G-TT---TTG--AAA----------T-GTAT----ATGGTTCA--AG-A-TAT-G---T-ATT-C--------G--G-ACT---CTTGTTG--TT-AATT--GT-GA-T-TTCC-AAAATCATCTAT-C----C-CGC-A----CACCC--G------------------CA-C-G-TG-CGCT--TG-AAA-TC-T--ATTG---GAT-AA----TAG-T-----CG--TAA-TG-TG--------CA-ATAT-----------CTCTT---CTC-CTTA-A---A--------GGAGGC-TTT-TGGAATGAAA-TCTT-GGA-C----AT--A-GTATAACGT--GCTAT--G--C-AAA-AA-TCTT-A-C-AAGG-G-AGAA-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G--------------------ATGCAT---------------CG---G-CAATTTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GTTT-----TC-G-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--GTT-TAGAAAGTG-G--TGT-C-CA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------TCA--TG-GT-AA---AAT---TCACttg
gi|6 : gtaaggttttatgacatgagtttctacaagaatgtcgcctcaagaaacaaatagtctttatcaaattcgctgTGCGCCGTGAA-TCTGGCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-TTCT-AAAT-TC-TAAAATGA---A-----ACT-C--TT-G-AGA-T--CTTTCT--AT-TT----------G--ACATG----A-AT-A--G-TT-------------------------------AT--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--GGACTA--TT--TTG--TT-AATT-TGT-GAAT-GT-C-AAAAT-AT-T--TC----C-CGC-A-A--C-CTC--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT-GA----TAT-T-----CG--T-A-TG-TGTTATCTCTC--CTCT-----------CTC-T---CTC-TTTA-AGATT--------GA-GGCTTTT-CTGAATGAAA-T-T----------------GGTATAC--C--AC--G--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-ATT--T-A-TT-A-G-TGGTT-G----G-AAAA-A-TGT-GAGC-G-CATGCGTG-A--TAATGCAA--CG-T-G-CAA-TTTTCATTA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTCT----TCTGCTT--CCATG-TC--TTT--AC-TGA-A--AC--T-T-TAGAAAGTG-A---AT-CTTA--TG-T--ACA---G---T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---ATT---TCGC
gi|7 : tgtagctttattgacatgagtgccctaaagaatggttgtaaagaaaaaaatccttctcaaatttcgcgGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-GGC-AT-G---TAAATT--TCT---G-A-TG-T-CT-AA-T-TG-TAA--TTA---AAC-T-AC--C--TA-T-GAA-T--TTTTCA-T-T-TT----------G--A-ATG----A--T-A--G-TT---T-G--AAA----------T-GTAT----AT--T-C---AG-A-T---G---T-ATT-G--------G--G-ACTTC-CT--TTG--TT-AATT-GTG-GA-T-GT-C-AAA-TCAT-T--TC----C-CGC-A-A--TGCTC--G------------------CA-C-G-TGGCGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GTT-GA----TA--TT----CG--T-AATG-TG--------C--ATAT-----------CTC-T---CTC-CTTA-A---T--------GATGGCTTT-----GATGAAA-T-TT-G-ATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--C--AA-AA-TC-T-ACC-AAAG-G-AA-A-T--T-A-TTCA-TGGG--T-G----G-AAAA--------------------TGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T--C-A--A--T-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTTTAACTTG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------TAA--TG-GT-AATAGAAA---TCGCt
gi|8 : ctgtaggtttatgacaatgagtgctaaagaatggtgtcaagtaaaaattactttatcaaattcgcaggtg--TG-G-AGA----CTTTCC-CAT-TG----------A--A-ATGGCAAA-AT-ATGG-TT---GGGGGAAA----------T-TAAT-----T--TTC---AGTA-TAT-G---TTATT-G--------G--GGACT---CT--TTG------ATT-G-T-GA-TTGT-C-AAA-TCAT-TATCCG---C-TAC-AAT--CGCTC--GGCACCAAAAACAACATCCCATC-G-AA-CAC---AA-CAA-TC-TG-CTTG---GAT-GA----TGATT-----CG----A-C--CA--------C--ACAT------------TC-T---CTC-TTCA-A---CACTAAACGG--GGCTTTTCTGGAATGCAA-T-TT-G-ATC----CT--AGGTA-A---TTGGC--T--G--C-AAA-AAGTC-T-A-CTAAGG-G-GG-A-TC-T-ATTT-A-T-CG--T-GTGCTG-AGAC-A-T-T-TAGC-G-CATG-GTCTA--T-A-GACAATCG-TCG-CAACTTTTGAGTA-TAAC-ATTACTT-T----T-G--GTCGCTCTTTAGTCTG-TTCCCCATG-TCTTTTT--AC-TG--A--ACT-G-T-T---AAGTT-G--TGT-CTCA--TGTT--ACACAGG-A-T-T-GCG------T-AATTT-GT-GA---AAA---ttc
gi|9 : tacaattgggtaattacttaaaagcttctatTGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-AATG-T-CT-AAAA-TG-TA---ATT---A-C-T-A-T-C--TACG-AGA-T--CTTTCC---T-TT----------G--A-ATG----A-AT-A--G-TT---TTG--AA-----------T-GTAT-----T--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--G-ACT---CT--TTG--TTTAATTTGGT-GA-T-GT-C-AAAATCAT-TATCC----C--AC-A-C---GTT---G-------------------A-C-G-TG-CGC---TG-AA--TC-TG-ATTG----AT-GA----TA--TTG---CG--T-A-TG-TG--------C--AT-------------CTC-T---CTC-TTTA-A---TTG------A--GGCTTTT--GGACTGAAA-T-TT-GGATC----AT--AGGTCTA---T--GC--T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TGA-T-G----G--AAA-A-TGG-TAGC-G-CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-C-A-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT--------G--G--GCTT-----CCT--TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-A-TAG-AAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--A-A---G-A-T-T---G------T-A--TG-GTAAA---AAA---TCGCataagcggctttgcccagtt
blockSeqs : A A CTG G . G C GCG A . . T A G T G G . ATTACACACCTACTGA G TTA AAAC A . GT C GCAA G T TG T TTTGGAACGTTTGTTGA A TATAA GG A T A A . TA C TTAACTCT TT G TC TG TT T T T AA T C C A G ATC AACG GC . CAAAG AA GCACCAAAAACAACATCC CG . G C C C . A . G . TTCAAA TT T A G TTATCTCT AT ATCTCTCTCTT T TCT C . GAT ACTAAACGG GC CT A C T T . AA ACG TG TA AG . A G G T T C T A A A T TA C G C G G GT G TGCT T C A T GGG AT A GG AT T C A T A A A A A C G TTTG G GT TC TTTAG C CC T T TA T AA AG GA A A T GT C AT T AA CAG A T C G C TATCAT A AT C A TAG GTT
blockSeqs : C . . . . . . G A . . . . . . . . . TTAACCTACTACTAT . CT TCC . . . . . . . . . TGNNNNNNNN . A . . . . . . A . . . G A G . . . . A . . . C C ATC G C . CACA . . TC . . T . . . . . G . TTC . A . C . A AT . T . . . GGA CT T . . . T . . AC T T . . . . . . C . . . . . . C . T . T . A T . . . G G GG C . GC . . . . T T . . . T . . A . . . T . . T T A . A . T T . . . . . . . G . . . . . . C . . A . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . TTAACTGACTTCA . A CCA . . . . . . . . . TGGGGGAAA . A . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . A . ATC . A . CACG . . C . . . . . . . . T . GTT . . . . . . AA . . . . . GAT GC T . . . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . GA . . . . C G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAATGAAACTCTT . T CAT . . . . . . . . . TTTGAAAG . A . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . C . NNN . C . ATCG . . C . . . . . . . . N . ATT . . . . . . C . . . . . TGA GT T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTAAACTACCTA . T CCC . . . . . . . . . TTTGAAA . A . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . C . ATC . T . CCG . . C . . . . . . . . G . TTG . . . . . . . . . . . . GA GC T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATTACTCTTT . T CT . . . . . . . . . TTTGAAA . N . . . . . . N . . . . . . . . . . C . . . N . TCT . N . CAG . . N . . . . . . . . G . TT . . . . . . . . . . . . TG GC T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTACTACTCTA . T CT . . . . . . . . . TTTGAAA . G . . . . . . G . . . . . . . . . . N . . . T . ATC . C . NNN . . A . . . . . . . . G . GT . . . . . . . . . . . . GA CT T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTACTACACTAT . T CC . . . . . . . . . ATTAACA . G . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . A . ATC . C . TTG . . G . . . . . . . . A . TT . . . . . . . . . . . . GA CT T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTACTACTCTAT . T CC . . . . . . . . . GTTGACA . A . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . C . AC . C . ATG . . C . . . . . . . . G . TT . . . . . . . . . . . . G GC T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTACTATCTAC . T CT . . . . . . . . . TTTGAAA . A . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . C . AT . C . CC . . C . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . G CT T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TACTACGCTAC . T CC . . . . . . . . . TTGAAA . A . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . C . TT . C . CC . . C . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . G CT T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TTACCTTCT . T . . . . . . . . . . TTTGAA . A . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . C . AT . C . CA . . C . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . G CT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . C . AT . T . AC . . C . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . CG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-3888 ) : TGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-T-CT-AAAT-TG-TA---TT-A--C-T-ACT-CTA-T--GAGA--TC---TTTC--CA-T-TTG--A-ATG----A-AT-A--G-TT---TTG--AAA----------T-GTAT----AT--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--G-ACT---CT--TTG--TT-AATT-GGT-GA-T-GT-C-AAAATCAT-TATCC----C-CGC-A-C--CGCTC--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT-GA----TA--T-----CG--T-A-TG-TG--------C--ATAT-----------CTC-T---CTC-TTTA-A---T--------G--GGCTTTT-TGGAATGAAA-T-TT-GGATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGCGG-CATGCGTGTA--T-ATGGCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGC
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gi|2 : T--TCT---G-A-TGGT-CTGAAAT-TG-TA---TTTA--C-T-ACT-CTA-T--GA-A--TC---TTTA--CA-T---G--A-ATG----A-ATTA--G-TTGNNNNN--NNN----------N-NNNN----NN--NNN---NN-N-NNN-N---N-NNN-N--------N--N-NNN---NN--NNN--NN-NNNN-NNN-NN-N-NN-N-NNNNNNNN-NNNNN----N-NNN-N-N--NNNNN--N------------------NN-N-N-NN-NNN---NN-NNN-NN-NN-NNNN---NNN-NA----T---T-----CG--TTA-TGCTG--------C--ATATAT---------CTC-T---CTC-TTTA-A---TT-------G--GGCTTGT--GGAA-GGAA-T-TT-G-ATC----AT--AGGTATA---TT-GC--T--G--G-CAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-GG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----T-AAAA-A-TGTGGAGC-G-CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CGTT-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-GGTG--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC----T-TAG-AAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--A-A---G-A-T-T-G-G------T-A--TT-GTAAA---AAA---TCGC
gi|20 : tgtggtttgtatgacatgatggagtgcctgaaaaaatggttcaagaaaaattatttttatcaaattcgctgtccactgtgtagatgcgtgtgggggaggggggcaaatgagaA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T----A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-AGTGT-GAGCG--CATGTGTGTA--T-ATG-CA--CG-T-G-CAA-TTT-CA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATT-TC-TTTT--CT-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTGTG--TGT--TCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---AAA---TCGCttg
gi|21 : A-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGC-G-CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA--T-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC--TTT--AC-TG--AAGAC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-TTCA--TG-T--ACA---G-ATT-T-G-GTATCATT-A--TG-GT-AA---At
gi|22 : C-T-A-C-AAGG-G-AG-A-TTAT-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGC-G-CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-T--TGT-CTCA--TG-T--ACA---GAA-T-T-G-G------T-A--TG-G--AA---AAA---TCGC
gi|23 : gTG----A-AT-A--G-CA---TTA--ACA----------T-TT-T----GT--TGC---AG-G-TGT-A---T-GTT-T--------G--G-ACT---TT--CTC--CT-AATT-ATT-CT-C-GT-C-AAAATTAA-T-TTT----C-CGT-A------CTC--G------------------TA-A-G-TG-AAA---TT-AAA-TT-TG-ATTG---ACT-GA----TA--TTCAAATA--C-A-TG-TA--------C--GTGTAA---------CTC-T---CT
gi|24 : attcaatt-TTT--A-ATG----A-AT-A--A-TG---TTG--ACA----------T-TTAT----GT--TGC---AG-A-TAC-A---T--TT-GTTAACTCTGTTG-ACT---CT--TTG--CT-GATC---T-G--T-GT-C-ATAAAAAA-TATCC----C-------T--TGCTCAAG------------------CA-G-G-TG-CAC---TC-AAT-TT-TG-AT------AT--A----CA--T------G--T-A-TA-TG--------C--A
gi|25 : -TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T----T-A-T-TG--T-G----G-GAAA---TGT-GAGCG--CATGCGTGTA--T-ATG-CA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G-----C-----TCTG-TT--CCATG-TC--TTT--AC-TG--A--AC--G-TATAGAAAGTG-AGTTGT-CTCA--TG-T--AC
gi|26 : -TC-T-A-C-AAGG-G-GG-A-T--T-A-TT---T-TG--T-G----G-AAAA-A-TGT-GAGCG--CATGTGTGTA--T-ATG-CA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----CGG--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-T-T-GGAAGTG-G--TGT-C
gi|27 : TGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-CTTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-T-CA-AAAT-TT-AA---GT-A--C-T-ACA-CTA-T--GAGA--TC---TTT
gi|3 : attatttaatcatgcaaattagagTGCGC-GTGAAAT---GCG-CAT-G-C-ATTGG--TAA-TT--TC----G-A-TG-T-CT-AAAT-TG-TA---TT-A--C-T-ACT-CTA-T--GAGA--TC---TTTC--CAAT-TTG--A-ATG----A-AT-A--G-TT---TTG--GAACGTTTGTTGAT-GTAT----AT--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--G-ACT---CT--TTG--TT-AATT-GGT-GA-T-GT-C-AAAATCAA-TTCTC----C-CGC-A-CAAAGCTA--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG--AA-TC-TG-ATTG---GAT-GA----AA--TTC---CG--T-A-TG-TA--------C--ATATC----------CTC-T---CTC-TTTA-A---T--------G--AGGCTTT-TGGAATGAAA-T-TT-GGAT-----AT--AGGTATA---T--GC--TAGG--CAAAA-AA-TC-T-A-C-AAGGAG-AA-A-T--T-A-TT-GTT-TG--T-G----G-GAAA-A-TGT-GAGC-G-CAAGCGTGT---T-AT-GCA--TG-T-G-C-A-TTTTCA-TA-T-AC-A-AA-TT-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTT--A--TGAAA--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-TAAACA---G-A-T-T-G-G------TAA--TG-GT-AA---AAA---TCGCatta
gi|4 : gaatttatgacagtgagtgccaaagaaatggtgtcaagaaaaaattatcttgaatcaaattcgcgTGTGCAGTGAA-T---GCG-CGC-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-T-CT-AAAT-TG-TA----T-A--C-T-ACG-CTA-C--GATAC-TC---TTTC--CA-TATGG--A-ATG----A-AT-A--GTTT---TTG--AAAG---------T-GTATTATAAT--TTC---AG-A-TAT-G---T-TAT-G--------G--G-ACT---CT--TTGTTTT-AATT-GGT-GA-T-GT-C-AACAT--T-TAT-C----C-CGC-A-CA-CGCGC--G------------------CA-CGG-TG-CAC---TG-AAACTC-TG-ATTG---G-T-GA----TAGTT-----CG--T-T-TG-TG--------C----AT-----------CTC-G---CTC-TTTA-A---T--------GA-GGC--TT-TGGAATGAAA---TT-GGATC----ATAAAGGTATA---T--GCT-T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-GAAG-A-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G-AAAACA-TGT-GA--AG-CATGCGCGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CCA-ATTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-TA---T-G--G--GCTC-----TC---TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--T--ACGAG-T-TAGAAAGTG-T--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-A-T-G-G------T----TGCGTAAA---AAA---TCGCttgc
gi|5 : gtagtgtcatgaccatgaggcctaaagaatgtgtcaagaaaaatgcatctttataaaagtcgcgTGCGCCGTGAA-T---GCGGCGT-G-CCATTGGCGTAAATT--TCT---G-A-TG-T--T-AAAT-TG-TAA--TT-A--CAC-AC--CTACT--GAGAAATC---TTAAAACA-T-TTGGTA-TTG----A-AT-A--G-TT---TTG--AAA----------T-GTAT----ATGGTTCA--AG-A-TAT-G---T-ATT-C--------G--G-ACT---CTTGTTG--TT-AATT--GT-GA-T-TTCC-AAAATCATCTAT-C----C-CGC-A----CACCC--G------------------CA-C-G-TG-CGCT--TG-AAA-TC-T--ATTG---GAT-AA----TAG-T-----CG--TAA-TG-TG--------CA-ATAT-----------CTCTT---CTC-CTTA-A---A--------GGAGGC-TTT-TGGAATGAAA-TCTT-GGA-C----AT--A-GTATAACGT--GCTAT--G--C-AAA-AA-TCTT-A-C-AAGG-G-AGAA-T--T-A-TT-A-T-TG--T-G----G--------------------ATGCAT---------------CG---G-CAATTTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GTTT-----TC-G-TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--GTT-TAGAAAGTG-G--TGT-C-CA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------TCA--TG-GT-AA---AAT---TCACttg
gi|6 : gtaaggttttatgacatgagtttctacaagaatgtcgcctcaagaaacaaatagtctttatcaaattcgctgTGCGCCGTGAA-TCTGGCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-A-TG-TTCT-AAAT-TC-TAAAATG-A--A---ACT-CT--T--GAGA--TC---TTTC--TA-T-TTG--ACATG----A-AT-A--G-TT-------------------------------AT--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--GGACTA--TT--TTG--TT-AATT-TGT-GAAT-GT-C-AAAAT-AT-T--TC----C-CGC-A-A--C-CTC--G------------------CA-C-G-TG-CGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GAT-GA----TAT-T-----CG--T-A-TG-TGTTATCTCTC--CTCT-----------CTC-T---CTC-TTTA-AGATT--------GA-GGCTTTT-CTGAATGAAA-T-T----------------GGTATAC--C--AC--G--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-ATT--T-A-TT-A-G-TGGTT-G----G-AAAA-A-TGT-GAGC-G-CATGCGTG-A--TAATGCAA--CG-T-G-CAA-TTTTCATTA-T-AC-A-TA-TT-T----C-G--G--GCTCT----TCTGCTT--CCATG-TC--TTT--AC-TGA-A--AC--T-T-TAGAAAGTG-A---AT-CTTA--TG-T--ACA---G---T-T-G-G------T-A--TG-GT-AA---ATT---TCGC
gi|7 : tgtagctttattgacatgagtgccctaaagaatggttgtaaagaaaaaaatccttctcaaatttcgcgGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-GGC-AT-G---TAAATT--TCT---G-A-TG-T-CT-AA-T-TG-TAA--TT-AAAC-T-AC--CTA-T--GA-A--TT---TTTC--AT-T-TTG--A-ATG----A--T-A--G-TT---T-G--AAA----------T-GTAT----AT--T-C---AG-A-T---G---T-ATT-G--------G--G-ACTTC-CT--TTG--TT-AATT-GTG-GA-T-GT-C-AAA-TCAT-T--TC----C-CGC-A-A--TGCTC--G------------------CA-C-G-TGGCGC---TG-AAA-TC-TG-ATTG---GTT-GA----TA--TT----CG--T-AATG-TG--------C--ATAT-----------CTC-T---CTC-CTTA-A---T--------GATGGCTTT-----GATGAAA-T-TT-G-ATC----AT--AGGTATA---T--GC--T--G--C--AA-AA-TC-T-ACC-AAAG-G-AA-A-T--T-A-TTCA-TGGG--T-G----G-AAAA--------------------TGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-CAA-TTTTCA-TA-T--C-A--A--T-T----C-G--G--GCTC-----TCTG-TT--CCATG-TC-TTTTTAACTTG--A--AC--G-T-TAGAAAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--ACA---G-A-T-T-G-G------TAA--TG-GT-AATAGAAA---TCGCt
gi|8 : ctgtaggtttatgacaatgagtgctaaagaatggtgtcaagtaaaaattactttatcaaattcgcaggtgT-CTA-TTGGAGA--CT---TTCC--CA-T-TGA--A-ATGGCAAA-AT-ATGG-TT---GGGGGAAA----------T-TAAT-----T--TTC---AGTA-TAT-G---TTATT-G--------G--GGACT---CT--TTG------ATT-G-T-GA-TTGT-C-AAA-TCAT-TATCCG---C-TAC-AAT--CGCTC--GGCACCAAAAACAACATCCCATC-G-AA-CAC---AA-CAA-TC-TG-CTTG---GAT-GA----TGATT-----CG----A-C--CA--------C--ACAT------------TC-T---CTC-TTCA-A---CACTAAACGG--GGCTTTTCTGGAATGCAA-T-TT-G-ATC----CT--AGGTA-A---TTGGC--T--G--C-AAA-AAGTC-T-A-CTAAGG-G-GG-A-TC-T-ATTT-A-T-CG--T-GTGCTG-AGAC-A-T-T-TAGC-G-CATG-GTCTA--T-A-GACAATCG-TCG-CAACTTTTGAGTA-TAAC-ATTACTT-T----T-G--GTCGCTCTTTAGTCTG-TTCCCCATG-TCTTTTT--AC-TG--A--ACT-G-T-T---AAGTT-G--TGT-CTCA--TGTT--ACACAGG-A-T-T-GCG------T-AATTT-GT-GA---AAA---ttc
gi|9 : tacaattgggtaattacttaaaagctTGCGC-GTGAA-T---GCG-CGT-G-C-ATTG---TAA-TT--TCT---G-AATG-T-CT-AAAA-TG-TAA--TT-A--C-T-A-T-CTA-C--GAGA--TC---TTTC--C--T-TTG--A-ATG----A-AT-A--G-TT---TTG--AA-----------T-GTAT-----T--TTC---AG-A-TAT-G---T-ATT-G--------G--G-ACT---CT--TTG--TTTAATTTGGT-GA-T-GT-C-AAAATCAT-TATCC----C--AC-A-C---GTT---G-------------------A-C-G-TG-CGC---TG-AA--TC-TG-ATTG----AT-GA----TA--TTG---CG--T-A-TG-TG--------C--AT-------------CTC-T---CTC-TTTA-A---TTG------A--GGCTTTT--GGACTGAAA-T-TT-GGATC----AT--AGGTCTA---T--GC--T--G--C-AAA-AA-TC-T-A-C-AAGG-G-AG-A-T--T-A-TT-A-T-TGA-T-G----G--AAA-A-TGG-TAGC-G-CATGCGTGTA--T-AT-GCA--CG-T-G-C-A-TTTTCA-TA-T-AC-A-TA-TT--------G--G--GCTT-----CCT--TT--CCATG-TC-TTTT--AC-TG--A--AC--G-A-TAG-AAGTG-G--TGT-CTCA--TG-T--A-A---G-A-T-T---G------T-A--TG-GTAAA---AAA---TCGCataagcggctttgcccagtt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TGTAGGTTTACAATATGAATGACTAATGAATGGTGTGATATATCGAACCATAGGTGCTAAATCAAATTTGCTTGCACGTTAAATGCATTGTAATTTTTAATTTGTTACATCAGGTATTGATCTATTTCGAGAGTGCAATGAAATATTAGAAATTTTAAATGGAAGATATAATTTTGGACT
Unaligned ( gi|28 ): AGGTTTACAATATGAATGACTGGTGTGATCCATAGATGCTAAAAATTAATATGAATGTGCATTGTAAATTTTGACTTCTTTCATC