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Reference ( gi|3 ) : AGGGCTGTGGCGG----TGC--ACCGA-A-A-AT-TTCGA-------T-G-CA-CC-G-T--GATT--CA-CTTCG--TTCGATTC--G---A----T-GC-ACCGA-TC-CGGAATTT--C--A--AATT---TCGATTC-----GG----------TT----------C--------AA-A-TTTA-----GT---AT--C-G----T-TA----TAAACAACAAAA-T-GG--GGCAAC-------GAGA-CGGT-CTAAGGTGTT----G--A-ATGT-TTT-ACTTT--TGATTAAAAC-AACG-GAAA-G-TA-G-A-CA--AAATCATCTACCGT------A------TGTACTTG--TAA-GATATACGCT----TACAC-TGTT--CA-AACAT-ATT---A-G-A-GTTCA-GCAAGTT-T--ATGT---T-GCGCATTCTTAC-GA-GAAAA-A-CAATTGGAA-TA-------TCAGTT--CAAG-GAACTCT----T--A--CTAAGCCAACA-CGATGTACAG-AGAGTG-GACAA-CT-CAAATCTCATC------GT-CTT-GA-CACAAGCTAATGCA-AATATCAAC-GCGAGC--G-AC-----A-------T-A-----A-----TCC-AAAATTGAAGTGTTGATGCACTAAACACTAA-TGT-AC-ACTTGTGACAATT-ATTATCTAAAT------TATGTTTTA---ATT-CCTAC-T-ACTC-A----GATGTAAATGTG--G---ATTTTTTAATGC-TA-AGTCAG-TG-A-GTT-----AA----TCACACTTTTCATATC-T-TTTTTTTT---ACATT-A-AG-----TTTG--T-TT-ACCCTTAA-ATACA--GGAATTATTGAAGCATTA--CT-TAG-GTTGTTT-C----------AAGTTTG-TTTCAG--TATC-A---ATT-GATTCGAA-T----CG-GAA--AAATCGAATCG-TAGCA-TTTT-----GA---AATC-----GA---AATCGAAC------CG------AAT-GAA----CCCTGATTTATCGT-CCAG-CC-----TAAGATCAAAGATTTTTT
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originalCons : AGGGCTGTG-CGG----TGC--ACCGA-A-A-AT-TT------CGA-T--GCACC-G--CGATT--CA-CTTCGTTCGATTC-G-A-T-GC-ACCGA-TCCGGAATT--CC--AAATT---TCGATTCGG----------T-----T-----C--------AA-A-TTT---AGT---ATCACG--TGT-------AAACAA-CAAAA-T-GG-------C-GGCAACGAGA-CGGT-CTGAGGTG-TTGGAATA---C-TT-TACTTT--TGATTAAAAC-AATG-GAAAGTAGG-ACA-AAATCATCTACCGT------A------TGTACTTG--TAA-GTTATACGCT----TACAC-CGTTTA--AACA-TATTACG-A----GTTC-AGCAAGTTCT-ATGTCTGCGCA-TCTTAC-GA-G-AAAA-ACAATTTG-AATA-------TCAGTT--CAAGTGGACTCT----TA--C-TAAGCCGAC-GCGATGTACAG-NGAGTG-GAC-AACTGCAAATTTCAT------CGT-CTT-GAC-ACAAGCTGATGCA-AATATCAACAGCGAGC--G-ACA-------T-----G-----A--TCC-AAAATTGAAGTGTTGATACACTAAACACTAA-GTA----CA-CTTGTGACAATT----------A-TA-TCT--ATTATGTTTTAAT--TTCCTA-ATACTC---AAGATTTGAATGTGGCANTTTTGAATTC-TA-AGTCAGT---G-A--NTT-A---------TTACACTTTTCATA--TT-TTTTTTTTTTACA-TTA-AG-TT-TTTTTG--T-TTACCC-TTAAAT--AAAGGAATTATTGAAGCATTA--CT-TAG-GTTGTTTC--------GAAAGTTTG-TTTCAG--TATC-A---ATC-GATTCGAA-T----CG-AAAAAATCGAATCG-CAGCA-TTTT-----GA---AATC-----GAAATCGAAC------CG------AAT-GAA----CCCTGA---ATCGTCCCA-GCC-----TACG-AT-AGAGATTTT
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Reference ( family-3789 ) : AGGGCTGTG-CGG----TGC--ACCGA-A-A-AT-TT------CGA-T--GCACC-G--CGATT--CA-CTTCGTTCGATTC-G-A-T-GC-ACCGA-TCCGGAATT--CC--AAATTTCGATTCGGTT--G-GTTC-------AA-A-TT-T-AG---TATCACG--TGT-------AAACAACAAAA-TGG-------C-GGCAACGAGA-CGGT-CTGAGGTG-TTGGAATA---C-TT-TACTTT--TGATTAAAAC-AATG-GAAAGTAGG-ACA-AAATCATCTACCGT------A------TGTACTTG--TAA-GTTATACGC-----TA--CAC-CGTTTA--AACA-TATTACG-A----GTTC-AGCAAGTTCT-ATGTCTGCGCA-TCTTAT-GA-G-AAAA-ACAATTTG-AATA-------TCAGTT--CAAGTGGACTCT----TA--C-TAAGCCGAC-ACGATGTACAG-NGAGTG-GAC-AACTGCAAATTTCATCGTNT-----TAGAC-ACAAGCTGATGCA-AATATCAACAGCGAGC--GACA-------TG-----A-----TCC-AAAATTGAAGTGTTGATACACT--ACAC----NG-----TA-CA-CTTGTGACAAT------------TAT--TCT--ATTATGTTTTAAT--TTCCTA-ATACTCA---AGATTTGAATGTGGCANTTTTGAATTC-TA-AGTCAGTG-NCGTT-T----------TTACACTTTTCATA--TT-TTTTTTTTTTACA-TTA-AG---TTTTTG--T-TTACCC-TTAAAT--AAAGGAATTATTGAAGCATTA--CT-TAG-GTTGTTTC--T-ATGAGGAAAGTTTG-TTTCAG--TATCA---ATT-GATTCGAA-TCGA---AAAAAATCGAATCG-CAGCA-TTTT-----GA---AATC-----GAAATCGAAC------CG------AAT-GAA----CCCTGA---ATCGTCCCA-GCC-----TACG-AT-AGAGATTTT
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