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blockSeqs : T . . . . . . A A . . . . . T CTGTTA T . . A . . . . . . . . C . . . . . . . C . G . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . A A . . . . . A CGTTA T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . A A . . . . . A GCGTA T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . A A . . . . . A CGTTA T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . A A . . . . . T CGT T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A CG T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T CG . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . G . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A CA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
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consensus : GAGTTGTTAATGATG-TA-GATT------G-TT-ATT--CAAATA-AATTG-TGA-T-CA--T--GTGAA-A-AAA-AATC----G---TT-A-TTAT-CAAAA---GATA-CCCT---A-CAG--TG-CT-ATT-G-C-A-TAGA-TT-----CG-GCA-----ATAT-TTC-TAAGC-C-T-CTCT-CG-T-G-G-T--TTT-G-TA-GA---T-TT--AAAT-CCA-AT-GC--------------TTCT----T--T----TT-TG-----T-TT-A-C-AC-G------TCCC---A-TTAC-T-C-GCT-C-TTCGG-AACTC-AT-C------GG-CG-------AC---G-TAT---A-A-----TGT-A-CAG-AATG--TGT--------------------ACC-GA-GC-G-T--T----ACGTTCC---------------GG-TT-GCGC----AAC------T------AAG-T-AC--G-AAA-A--CA-A-TGA-C-CAG-TCA-CACA
Reference ( family-3748 ) : GAGTTGTTAATGATG-TA-GATT------G-TT-ATT--CAAATA-AATTG-TGA-T-CA--T--GTGAA-A-AAA-AATC----G---TT-A-TTAT-CAAAA---GATA-CCCT---A-CAG--TG-CT-ATT-G-C-A-TAGA-TT-----CG-GCA-----ATAT-TTC-TAAGC-C-T-CTCT-TG-T-G-G-T--TTT-G-TA-GA---T-TT--AAAT-CCA-AT-GC--------------TTCT----T--T----TT-TG-----T-TT-A-C-AC-G------TCCC---A-TTAC-T-C-GCT-C-TTCGG-AACTC-AT-C------GG-CG-------AC---G-TAT---A-A-----TGT-A-CAG-AATG--TGT--------------------ACC-GA-GC-G-T--T----ACGTTCC---------------GG-TT-GCGC----AAC------T------AAG-T-AC--G-AAA-A--CA-A-TGA-C-CAG-TCA-CACA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATGGCAGAACAAGCATTACAATTGCCCTCAAGTGCTTTCTGCATTGATTGCATGTTTTTCAG