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lowQualScore                  :                            . .   ..    .          .                ..     .....          ......          ..     ..   . .       . .. .....                 .    .  .  .   ..   . . .  ............             . ..    .    . .    ..................  ..    ...   . .   .  .  ... .  .  .   ..  .. .    .    ..  ....  . . ..  .  .  ...          .  .   .    . ..    .  .. ..   . .   .. .        .     .    . .     ..  ..     ...         ..  ...        .   .    .   .  .     .    .  .       ...... ...    .  ............       . .   ..  .  . .  .      ....  . ...        ...           
lowQualScore                  :                            3 7   33    0          0                55     00000          666666          11     44   0 0       0 55 00000                 0    0  0  5   55   6 6 6  000000000000             5 22    2    3 4    111111111111111111  22    444   1 1   1  1  666 5  1  1   22  77 9    7    88  8888  9 9 99  9  9  000          9  7   9    9 22    3  33 77   3 3   77 7        7     7    7 7     99  99     555         33  444        8   2    2   1  2     1    4  1       888888 888    1  888888888888       7 3   99  3  3 3  3      1111  3 888        888           
consensus                     :                      CCCTGTTCNTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTCGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTTTTT----TGCTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GG-TCTTAG--AAT-G-T-ACG--ATA----T-ATATTTGTGAAAACC--TTCA-TCCT-AGTTCCTA---------T-AT--GTT--TTAT---TAT-A-TAA-CT-AT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-TG-AG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTCAT--TT--ATTAT-TTTATGTGAAT--AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAA
Reference ( gi|3 )            :                      CCCTGTTCCTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTTGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTTTTTT--TTGCTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GG-TCGTAG--AAT-G-T-AC---ATA----T-ATATTTGTGAAAATC--TTCA-TCCT-AGTTCCTACAGTACATGT-AT--GTT--TTAT---TAT-A-TAA-CT-AT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-TG-AG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-AAAT-T-GTCAT--TT--ATTAT-TATATGTGAAT--AA---ATGACTTGTAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAA
gi|2                          :                      CCCTGTTCTTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTTGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTCTAT-----GCTAAGGAGT--GTTTTTTATT-A-TGAATGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GG-TCTTAG--AAT-G-T-ACG--ATA----T-ATATTTGTGAAAACC--TTCA-TCCT-AGTTCCTA-----------A---GTT--TTAT---TAT-A-TAA-CT-AT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-TG-GG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AA-TGCT-TA--A--ACC-CTACC--T-CTCAGTTT-TGCGT-AAAT-T-GTCAT--GT--ATTAT-TTTATGTGAAT--AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGATAA----CC-T---CTAAAGGC---GATT
gi|1                          :  ttgggtggctcagctttcacCCCTGTTCATTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTCATGGCTCTTTTTTG-ATACGATACGCCACCTTTTTC-----GCTAAGGAGT--GTTTTT-ACT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTCGTTATGCGG-T-GGGG-GG-TCTTAG--AAT-G-T-ACG--ATA----T-ATATT-GTAAAAACC--TTCA-TCCT-A---CATGTAGTTCCTAT-AT----T--TTAT---TTT-A-TAA-TT-AT---TTAT-GT-ACA--ATGTT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-TG-AG-A-CTATTTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-TCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTTTT--TTTAATTAT-TTTTTGTGAAT--AA---ATGACGTTCAAC-CACA-CAT-TC-CCATT-ATTATTT-CTCCCTC------AA--TAGA-GC------------AAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TAACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTCAAAA
gi|4                          : ggtggcgcagcttaatttcacCCCTGT-CCTTGTTACCAAGAAGTAAAAGGCTTGTGGCTGTTTTTTGTATGCG-----CCATCTTTTT------GCTAAGGGGT--GTTTT--AT--A-TGACTGGGT--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGAAGG-TCTT-G--AAT-G-T-ACG--ATAC---T-ATATTTGTGAAAACC--TTCA-TCCT-AGTTCCTAT---------------TT--TTAT---TAT-A-TAATCT-AT---T-AT-GT-ACA--ATAAT-GCGT-GAAT--AA-----T-A-G--TT-TG-A----CTAATT-CAA-TG--AT-CATG-AT-TGCT-TT--A--AAC-CTACC--T-CCCAGCTTATGCGT-GAAT-T-GTCAT--TT--ATTAT-T-TATGTGAAT--AA----TGACTTGCAAC-CACA-CAT-CT-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AA--TAGA--C------------AAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA--GACAG-----C-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAatgaaactggaatat
gi|17                         :                         gtggcgcagctttca-GGAGTAAAAT-CTTGTGGCTGATTTTT--ATGCG-----CCACCTTTTTTTCCTTG-----GAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTAG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GG-TCTTAG--------------------------ATTTGTGAAAACC--TTCG-TCC
gi|6                          :                                                                                               TGCTGAGGAGT--GTTTTTCATT-A-TGACTTG-T--AT----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGGTC-TAG--AATTGCT-ACGAGATAGTATT-AT-TTTGTGAAA--C--TCAA-TCCT-AGTTCCC------TATGC--T--GTTATTTAT---AAT-A-TA--CT-ATATATGAT-GT-ACG--ATG-T--CTG-GGAC--GAAAAAGT-A-G--TT-CG-AG-AACTAATTTCA--TG-TATACATG-AT-T-CTATT--A--ACC-TTACAAGT-CCCAG--T-TGCGT-GAAT-TTGT-AT--TT--AT-AT-TTTATATGAAT--AA----TGACTTGCAAC--ACA-CAT-CC-CTAT--ATT--TT-CACCCT-------AT--TAGA-GC-----------AAAAACCT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACGACTGCCC-T---ATATAGGT---GATCTT
gi|9                          :                                                                                                 CTAAGGAATTGATCGTA-ATT-ACTGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATACGGCT-GGGA-GG-TCTTAG--AAT-G-T-AC---ATA----T-TTATTTGTGAAAACC--TTCA-TCCT-AGTTCCTA------------T--GTT--TTAT---TAT-A-TAA-CT-AT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-TG-AG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AA-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGTTT-TGCGT-AAAT-T-GTCAT--TT--ATTAT-TTTATGTGAAT--AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAActttgcaaagataattggcaatata
gi|8                          :                                                                                                 CTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A------TTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GG-TCTTAG--AAT-G-T-ACG--ATA----T-ATATTTGTGAAAACC--TTCA-TCCT-AGTTCCTA------------T--GTT--TTAT---TAT-A-TAA-CT-AT---TTAT-GT-ACA--ATGTT-GCTG-AGAT--GAA---GT-A-G--TT-TG-AG-A-CTAATTTCAA-TG-TTT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ATC-TTACT--T-CCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTCAT--TT--ATTAT-TTTATGTGAAT--AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-TC-CTATT-ATTATTT-CATCCTC------AA--TAGA-GCAAATTAAAAAAAAAAAAAT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAAtagaaattggaat
gi|14                         :                                                                                                  TGAGGGGT--ATTTTT-ATT-G-TAACTG--T--ATGGACGTTTTTGCTATGAGGCC-GGAA-GG-T--------------------AT-----T-ATATTTGTGACAATT--TTCG-TCCC-AGTTGCTA------------T--GTT--TCAT---TAT-A-TAG-TC-AC---CCAT-GT-AAA--ATG-T-TCAGTGGAT--GAG---GT-A-T--TT-TG-AA-G-CTATTGTCAA-TG-TAT-CATA-TT-TGCT-TT--A--ACC-TCACC--T-CCTAGCTT-TGCAT-GAAT-T-Gaagaaattggaatat
gi|7                          :                                                                                                      GAGT--GTTTT--ATT-AGTGATTGGGTCAA-----GTTTTGGTTATGCGGCTGGGGA-GG-TCTTAGTAAGG-G-TAACG--ATAG---TAATATTTGTGAAAACCTATTCATTCCTCAGTTCC-----------T-AT--GTT--TTAT---TAT---TAA-CT-ATTA-TTAT-GT-ACGACATAATGGCTGAGGGT--GA-----T-ACG--TT-TG-AG-A-CTTATTTCAATTG-TAT-TGAG-ACATGCTAAT--ACCACC-TAACC--TCCCCAGCAT-GCCGTAAAATGT-GTCAT--TT--A-TAT---TATGTGAAT---A---ATGACTTGCAAC-CACACCAT-CCACTATTCATTATTT-CACCCTC------ATTATAGA-GC-----------AAAAAACT-ATGCT--GC-GG-A-AATTGACAG----CC-T---AT-AAGGCTATTATTTTGAAAAc
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gi|12                         :                                                                                                                                                                              T-A-T-AA---ATA----C-TTATTC-TGAAAACC--TTCA-TCCT-ACTT-------------T-AT--------TAT---TAT-A-TAA-TC-AT---TTATCGT-ACA--TT--T-TCTA-GGAT--------CT-A-T--TT-TC-AA-A-TTGTTTT---------T-TATG-GT---CT-TT--A--ACC-TTACC--T-CTCATTTT-T-------AT-G-GTCATCATT--ATT-T-TAAATAT---T--AA---AT-ACTT-TCGG-CACA-CATACC-CTGCT-GATATTT---TCCTCGGCGCAAT--AAGA-GC-----------AAAAaagaaaattgaa
gi|11                         :                                                                                                                                                     gtcatagttacacagcacgttttcggatcttatcacaggaaatcttacataatatAAACC--TTCA-TCCT-AGTTCCT----TATGT-T-ATTTATT--TTAT---TAT-A-TA--CT-GT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-G-TG-GGATTTGAA---GTTA-G--TT-TG-AG-A-CTAATTTCAA-TGGTAT-AATG-AA-TGCT-TTT-A--ACCATTACC--T-CC-AGTTT-TGCGT-AA-T-T-GTCAT--TT--ATTATCTTTATGTGA-TGGAA---ATGACTTGCAACGCA-A-CAT-CC-CTATT-ATTA-AT-CACCCTC------A---TAGA-GC------------AAAAACTGA-GCTG-GC-GG-AGAA-TGACAG----CCTT---ATAAA-GC----ATTT--AAAA
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gi|16                         :                                                                                                                                                            tctttaattgcgctctctcccgtataaggaactttttcattgtatttcatatatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgctattgT--TTAT---TAT-AGTAA-TT-GT---T-AC-GTTACA--GTGTT-ACTG-GAAT--GAA---AT-G-T--TT-TG-AG----TATTTTCAA-TG-TAT-CATA-GT-TGCT-TT--A--ACC-T---------CCAGCTT-TGTGT-GAAT-T-ATCAT--TT--Atagaaattgggatataaa
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Reference ( family-3652 )     :                      CCCTGTTCNTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTCGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTTTTTT--GCTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------TA-TGT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAA
gi|1                          :                      CCCTGTTCATTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTCATGGCTCTTTTTTG-ATACGATACGCCACCTTTTTC---GCTAAGGAGT--GTTTTT-ACT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTCGTTATGCGG-T-GGGG-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATT--GT---AAAAACC--TTC-A-TCCT-ACATGTAGTTCC-TA---------TA-T------T-------TTA----TTTT-A-TAA-T-TAT---TTAT-GT-ACA--ATGTT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTATTTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-TCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTTTTTTTAATTAT-TTTTTGTGA-AT-AA---ATGACGTTCAAC-CACA-CAT-TC-CCATT-ATTATTT-CTCCCTC------AA--TAGA-GC------------AAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TAACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTCAAAA
gi|10                         :                                                                                        ggtggcgcagcttaatttcacTTT-ATTTA-TGACTG--T--A-----ATTTTTGTTATGCGGCT-GG---AGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-TGA----TATTT-GT---GAAAACC--TTCAA-TCTT-A-------------------------------------------A----TTAT-A-TAA-CTTAT---TTAT-GT-ACA--AT-AT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-TGGAGCA-CTTAATTCAA-TG-TAA-CATGCAA-TGCT-TA--A--ACC--TACA--T-CCCA-CTT-T-CGT-AAAT-T-GTCATT----TTAT-TTTATGTGA-ATCAA---ATGAC-TGCAAC-CACA-CAA-TC-CCATT-GTTATTTCCACCCTC------AT--TA-A-GCA----------AAAAAACT-A-GCA--GC-GGAA-AA-TGACAG-----C-T---ATAAAGGC---GA-TTTGAAAAatgaaactggaatat
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gi|17                         :                                       g-GGAGTAAAAT-CTTGTGGCTGATTTTT--ATGCG-----CCACCTTTTTTT--CCTT-GGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTAG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG-------------------------ATTT-GT---GAAAACC--TTC-G-TCCc
gi|2                          :                      CCCTGTTCTTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTTGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTCTAT---GCTAAGGAGT--GTTTTTTATT-A-TGAATGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA----------A--GT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GGG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AA-TGCT-TA--A--ACC-CTACC--T-CTCAGTTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATGT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGATAA----CC-T---CTAAAGGC---GATT
gi|3                          :  ttgggtggctcagctttcacCCCTGTTCCTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTTGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTTTTTTTTGCTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCGTAG--AAT-G-T-AC-ATA-T-A----TATTT-GT---GAAAATC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TACAGTACATGTA-TGT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TATATGTGA-AT-AA---ATGACTTGTAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAA
gi|4                          :                      CCCTGT-CCTTGTTACCAAGAAGTAAAAGGCTTGTGGCTGTTTTTTGTATGCG-----CCATCTTTTT----GCTAAGGGGT--GTTTT--AT--A-TGACTGGGT--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGAAGGTCTT-G--AAT-G-T-ACGATACT-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------T----T----T-------TTA----TTAT-A-TAATC-TAT---T-AT-GT-ACA--ATAAT-GCGT-GAAT--AA-----T-A-G--TT-T-GA----CTAATT-CAA-TG--AT-CATG-AT-TGCT-TT--A--AAC-CTACC--T-CCCAGCTTATGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TT-ATGTGA-AT-AA----TGACTTGCAAC-CACA-CAT-CT-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AA--TAGA--C------------AAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA--GACAG-----C-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                             gtggcgcagctttcaAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-T----------TA-TGTCATGT-------TTAATGTTTATGA-TAA-A-TGT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-G-TG-GGATT-GAA---GT-A-GAGTTGT-GAG-A-CTTAATTCAA-TGGTAT--ATG-AA-TGCT-TTTAG--ACCATTACC--T-CC-AGTTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATTT--ATTATCTTTA-GTGA-AT-GAACTATGACTTGCAACGCACAGCAT-CCGCT-TT-ATTA-TT-CACCATC------A---TAGATGC------------AAAAACTGA-GCCTGGCGGG-A-GA-TGACAG----CC-TTGAATAAAGGC---GA--TTGAAAA
gi|6                          : tctttaattgcgctctctcccgtataaggaactttttcattgtatttcatatatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgctattgT--GCTGAGGAGT--GTTTTTCATT-A-TGACTTG-T--AT----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGGTCTAG--AATTGCT-ACGAGA-T-AGTATTATTTTGT---GAAA--C--TCA-A-TCCT-A------GTTCCCTA---------TGCTGT----TAT-----TTA----TAAT-A-TA--C-TATATATGAT-GT-ACG--ATG-T--CTG-GGAC--GAAAAAGT-A-G--TT-C-GAG-AACTAATTTCA--TG-TATACATG-AT-T-CTATT--A--ACC-TTACAAGT-CCCAG--T-TGCGT-GAAT-TTGT-ATTT--AT-AT-TTTATATGA-AT-AA----TGACTTGCAAC--ACA-CAT-CC-CTAT--ATT--TT-CACCCT-------AT--TAGA-GC-----------AAAAACCT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACGACTGCCC-T---ATATAGGT---GATCTTtagaaattgggatataaa
gi|7                          :                                                                                                    GAGT--GTTTT--ATT-AGTGATTGGGTCAA-----GTTTTGGTTATGCGGCTGGGGA-GGTCTTAGTAAGG-G-TAACGATAGTAA----TATTT-GT---GAAAACCTATTC-ATTCCTCA------GTTCC------------TA-TGT----T-------TTA----TTAT---TAA-C-TATTA-TTAT-GT-ACGACATAATGGCTGAGGGT--GA-----T-ACG--TT-T-GAG-A-CTTATTTCAATTG-TAT-TGAG-ACATGCTAAT--ACCACC-TAACC--TCCCCAGCAT-GCCGTAAAATGT-GTCATTT--A-TA---TTATGTGA-AT--A---ATGACTTGCAAC-CACACCAT-CCACTATTCATTATTT-CACCCTC------ATTATAGA-GC-----------AAAAAACT-ATGCT--GC-GG-A-AATTGACAG----CC-T---AT-AAGGCTATTATTTTGAAAActttgcaaagataattggcaatata
gi|8                          :                                                                                               CTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A------TTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------T---GT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATGTT-GCTG-AGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TTT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ATC-TTACT--T-CCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-TC-CTATT-ATTATTT-CATCCTC------AA--TAGA-GCAAATTAAAAAAAAAAAAAT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAAagaagttgg
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Reference ( family-3652 )     :                      CCCTGTTCCTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTTGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTTTTTT--GCTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------TA-TGT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAA
gi|1                          :                      CCCTGTTCATTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTCATGGCTCTTTTTTG-ATACGATACGCCACCTTTTTC---GCTAAGGAGT--GTTTTT-ACT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTCGTTATGCGG-T-GGGG-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATT--GT---AAAAACC--TTC-A-TCCT-ACATGTAGTTCC-TA---------TA-T------T-------TTA----TTTT-A-TAA-T-TAT---TTAT-GT-ACA--ATGTT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTATTTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-TCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTTTTTTTAATTAT-TTTTTGTGA-AT-AA---ATGACGTTCAAC-CACA-CAT-TC-CCATT-ATTATTT-CTCCCTC------AA--TAGA-GC------------AAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TAACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTCAAAA
gi|10                         :                                                                                        ggtggcgcagcttaatttcacTTT-ATTTA-TGACTG--T--A-----ATTTTTGTTATGCGGCT-GG---AGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-TGA----TATTT-GT---GAAAACC--TTCAA-TCTT-A-------------------------------------------A----TTAT-A-TAA-CTTAT---TTAT-GT-ACA--AT-AT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-TGGAGCA-CTTAATTCAA-TG-TAA-CATGCAA-TGCT-TA--A--ACC--TACA--T-CCCA-CTT-T-CGT-AAAT-T-GTCATT----TTAT-TTTATGTGA-ATCAA---ATGAC-TGCAAC-CACA-CAA-TC-CCATT-GTTATTTCCACCCTC------AT--TA-A-GCA----------AAAAAACT-A-GCA--GC-GGAA-AA-TGACAG-----C-T---ATAAAGGC---GA-TTTGAAAAatgaaactggaatat
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gi|12                         :                                                                                                                                                           GGA-AATCTTAC--ATA-A-T-ATTATA-A-A----TACTT-ATTCTGAAAACC--TTC-A-TCCT-A------CTT---TA---------------------------TTA----TTAT-A-TAA-T-CAT---TTATCGT-ACA--TT--T-TCTA-GGAT--------CT-A-T--TT-T-CAA-A-TTGTTTT---------T-TATG-GT---CT-TT--A--ACC-TTACC--T-CTCATTTT-T-------AT-G-GTCA-TC--ATTAT-TTTAAAT-A-TT-AA---AT-ACTTTCGG--CACA-CATACC-CTGCT-GATATTT---TCCTCGGCGCAAT--AAGA-GC-----------AAAAtagaaattggagatcaataa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              gtcatagttacacagcacgttttcggatcttatcacaT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAA
gi|14                         :                                                                                                TGAGGGGT--ATTTTT-ATT-G-TAACTG--T--ATGGACGTTTTTGCTATGAGGCC-GGAA-GGT------------------AT--T-A----TATTT-GT---GACAATT--TTC-G-TCCC-A------GTTGC-TA---------T---GT----T-------TCA----TTAT-A-TAG-T-CAC---CCAT-GT-AAA--ATG-T-TCAGTGGAT--GAG---GT-A-T--TT-T-GAA-G-CTATTGTCAA-TG-TAT-CATA-TT-TGCT-TT--A--ACC-TCACC--T-CCTAGCTT-TGCAT-GAAT-T-Gaagaaattggaatataaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAAc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                      gTCC-TA---------GG-TGCAG--T-------TTA----TTAT-AGTAA-T-TGT---T-AC-GTTACA--GTGTT-ACTG-GAAT--GAA---AT-G-T--TT-T-GAG----TATTTTCAA-TG-TAT-CATA-GT-TGCT-TT--A--ACC-T---------CCAGCTT-TGTGT-GAAT-T-ATCATTT--Aaagaaattggaatataa
gi|17                         :                                       g-GGAGTAAAAT-CTTGTGGCTGATTTTT--ATGCG-----CCACCTTTTTTT--CCTT-GGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTAG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG-------------------------ATTT-GT---GAAAACC--TTC-G-TCCc
gi|2                          :                      CCCTGTTCTTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTTGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTCTAT---GCTAAGGAGT--GTTTTTTATT-A-TGAATGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA----------A--GT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GGG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AA-TGCT-TA--A--ACC-CTACC--T-CTCAGTTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATGT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGATAA----CC-T---CTAAAGGC---GATT
gi|3                          :  ttgggtggctcagctttcacCCCTGTTCCTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTTGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTTTTTTTTGCTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCGTAG--AAT-G-T-AC-ATA-T-A----TATTT-GT---GAAAATC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TACAGTACATGTA-TGT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TATATGTGA-AT-AA---ATGACTTGTAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAA
gi|4                          :                      CCCTGT-CCTTGTTACCAAGAAGTAAAAGGCTTGTGGCTGTTTTTTGTATGCG-----CCATCTTTTT----GCTAAGGGGT--GTTTT--AT--A-TGACTGGGT--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGAAGGTCTT-G--AAT-G-T-ACGATACT-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------T----T----T-------TTA----TTAT-A-TAATC-TAT---T-AT-GT-ACA--ATAAT-GCGT-GAAT--AA-----T-A-G--TT-T-GA----CTAATT-CAA-TG--AT-CATG-AT-TGCT-TT--A--AAC-CTACC--T-CCCAGCTTATGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TT-ATGTGA-AT-AA----TGACTTGCAAC-CACA-CAT-CT-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AA--TAGA--C------------AAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA--GACAG-----C-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                             gtggcgcagctttcaAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-T----------TA-TGTCATGT-------TTAATGTTTATGA-TAA-A-TGT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-G-TG-GGATT-GAA---GT-A-GAGTTGT-GAG-A-CTTAATTCAA-TGGTAT--ATG-AA-TGCT-TTTAG--ACCATTACC--T-CC-AGTTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATTT--ATTATCTTTA-GTGA-AT-GAACTATGACTTGCAACGCACAGCAT-CCGCT-TT-ATTA-TT-CACCATC------A---TAGATGC------------AAAAACTGA-GCCTGGCGGG-A-GA-TGACAG----CC-TTGAATAAAGGC---GA--TTGAAAA
gi|6                          : tctttaattgcgctctctcccgtataaggaactttttcattgtatttcatatatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgctattgT--GCTGAGGAGT--GTTTTTCATT-A-TGACTTG-T--AT----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGGTCTAG--AATTGCT-ACGAGA-T-AGTATTATTTTGT---GAAA--C--TCA-A-TCCT-A------GTTCCCTA---------TGCTGT----TAT-----TTA----TAAT-A-TA--C-TATATATGAT-GT-ACG--ATG-T--CTG-GGAC--GAAAAAGT-A-G--TT-C-GAG-AACTAATTTCA--TG-TATACATG-AT-T-CTATT--A--ACC-TTACAAGT-CCCAG--T-TGCGT-GAAT-TTGT-ATTT--AT-AT-TTTATATGA-AT-AA----TGACTTGCAAC--ACA-CAT-CC-CTAT--ATT--TT-CACCCT-------AT--TAGA-GC-----------AAAAACCT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACGACTGCCC-T---ATATAGGT---GATCTTtagaaattgggatataaa
gi|7                          :                                                                                                    GAGT--GTTTT--ATT-AGTGATTGGGTCAA-----GTTTTGGTTATGCGGCTGGGGA-GGTCTTAGTAAGG-G-TAACGATAGTAA----TATTT-GT---GAAAACCTATTC-ATTCCTCA------GTTCC------------TA-TGT----T-------TTA----TTAT---TAA-C-TATTA-TTAT-GT-ACGACATAATGGCTGAGGGT--GA-----T-ACG--TT-T-GAG-A-CTTATTTCAATTG-TAT-TGAG-ACATGCTAAT--ACCACC-TAACC--TCCCCAGCAT-GCCGTAAAATGT-GTCATTT--A-TA---TTATGTGA-AT--A---ATGACTTGCAAC-CACACCAT-CCACTATTCATTATTT-CACCCTC------ATTATAGA-GC-----------AAAAAACT-ATGCT--GC-GG-A-AATTGACAG----CC-T---AT-AAGGCTATTATTTTGAAAActttgcaaagataattggcaatata
gi|8                          :                                                                                               CTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A------TTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------T---GT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATGTT-GCTG-AGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TTT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ATC-TTACT--T-CCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-TC-CTATT-ATTATTT-CATCCTC------AA--TAGA-GCAAATTAAAAAAAAAAAAAT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAAagaagttgg
gi|9                          :                                                                                               CTAAGGAATTGATCGTA-ATT-ACTGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATACGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-AC-ATA-T-T----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------T---GT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AA-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGTTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAAaagaaattggaatat


blockSeqs                     :                            T     TT    A          G                 T     .              TTTT          TG     TT   T G       G CA TGGAC                 G    A        TA   T C A  G   TAGTAT       T  TCT       TA   A T    C .          C ACAGTACATGTATGTT               ATGT    G G   T T   ATA    C  T   AC  AA G    T    TT  AAAA  T C AG  G G   C A          T  G   A    C CA    A  TA CC   A     AG C        A     AA   G T       .      C         T  C  ACT            G    G   A  G     C       C       GGCGCA TTA    T  AAATTAAAAAAA       G T   TG  G  A G  T      CTGC  T TGA        TAT
blockSeqs                     :                            T     .     .          .                 .     .              TT            .      TC   . C       G .  T                     .    .        .    . . .  T   GTAA         .  .         .    . .    . .          . TATGTTATTTATT                  .       . .   . .   TA     .  .   .   GT .    A    T   A     . . .   . .   . .          .  G   .    . A     A  T  .    A     .  .        .     A    . .       .      C         .  .  .              G    C   .  A     .       .       .      T      .  AA                 G .   G   .  . .  .      .     . .          .  
blockSeqs                     :                            .     .     .          .                 .     .              T             .      T    . .       . .  .                     .    .        .    . . .  G   TGA          .  .         .    . .    . .          . TATGTCATGT                     .       . .   . .   .      .  .   .   AA .    .    .   A     . . .   . .   . .          .  .   .    . A     .  .  .    .     .  .        .     A    . .       .      .         .  .  .              .    .   .  .     .       .       .      T      .  A                  . .   .   .  . .  .      .     . .          .  
blockSeqs                     :                                        .          .                 .     .              .             .      T    . .       . .  .                     .    .        .    . . .  G   CTA          .  .         .    . .    . .          . ATGCTGTTAT                     .       . .   . .   .      .  .   .   AA .    .    .   A     . . .   . .   . .          .  .   .    . T     .  .  .    .     .  .        .     G    . .       .      .         .  .  .              .    .   .  .     .       .       .      T      .  A                  . .   .   .  . .  .      .     . .          .  
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lowQualScore                  :                             . .   ..    .          .                 .     .....          ....          ..     ..   . .       . .. .....                 .    .        ..   . . .  .   ........     .  ...       ..   . .    . ......     . ............................   ....    . .   . .   ... .  .  .   ..  .. .    .    ..  ....  . . ..  . .   . .          .  .   .    . ..    .  .. ..   .     .. .        .     ..   . .       ..     .         .  .  ...            .    .   .  .     .       .       ...... ...    .  ............       . .   ..  .  . .  .      ....  . ...        ...           
lowQualScore                  :                             2 2   88    0          0                 0     00000          3333          55     55   6 3       3 00 77777                 6    3        66   3 3 3  6   77777777     3  888       99   9 9    1 888888     9 3333333333333333333333333333   1111    9 9   9 9   999 8  9  9   99  66 7    3    33  8888  7 7 77  7 7   7 7          7  3   7    7 33    0  99 44   0     44 5        5     22   5 5       77     7         9  9  000            7    7   9  7     9       9       222222 555    9  444444444444       2 1   33  1  1 1  1      5555  1 444        444           
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Reference ( family-3652 )     :                       CCCTGTTCCTTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTTGTGGCTGTTTTTTG-ATGCG-----CCACCTTTTTT---GCTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------TA-TGT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-CCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-CC-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AT--TAGA-GC-----------AAAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAA
gi|1                          :                       CCCTGTTCATTG--ACCA-GAAGTAAAAG-CTCATGGCTCTTTTTTG-ATACGATACGCCACCTTTTTC---GCTAAGGAGT--GTTTTT-ACT-A-TGACTGG-T--A-----GTTTTCGTTATGCGG-T-GGGG-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATT--GT---AAAAACC--TTC-A-TCCT-ACATGTAGTTCC-TA---------TA-T------T-------TTA----TTTT-A-TAA-T-TAT---TTAT-GT-ACA--ATGTT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTATTTTCAA-TG-TAT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ACC-TTACC--T-TCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTTTTTTTAATTAT-TTTTTGTGA-AT-AA---ATGACGTTCAAC-CACA-CAT-TC-CCATT-ATTATTT-CTCCCTC------AA--TAGA-GC------------AAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TAACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTCAAAA
gi|10                         :                                                                                         ggtggcgcagcttaatttcacTTT-ATTTA-TGACTG--T--A-----ATTTTTGTTATGCGGCT-GG---AGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-TGA----TATTT-GT---GAAAACC--TTCAA-TCTT-A-------------------------------------------A----TTAT-A-TAA-CTTAT---TTAT-GT-ACA--AT-AT-GCTG-GGAT--GAA---GT-A-G--TT-TGGAGCA-CTTAATTCAA-TG-TAA-CATGCAA-TGCT-TA--A--ACC--TACA--T-CCCA-CTT-T-CGT-AAAT-T-GTCATT----TTAT-TTTATGTGA-ATCAA---ATGAC-TGCAAC-CACA-CAA-TC-CCATT-GTTATTTCCACCCTC------AT--TA-A-GCA----------AAAAAACT-A-GCA--GC-GGAA-AA-TGACAG-----C-T---ATAAAGGC---GA-TTTGAAAAatgaaactggaatat
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gi|4                          :                       CCCTGT-CCTTGTTACCAAGAAGTAAAAGGCTTGTGGCTGTTTTTTGTATGCG-----CCATCTTTTT----GCTAAGGGGT--GTTTT--AT--A-TGACTGGGT--A-----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGAAGGTCTT-G--AAT-G-T-ACGATACT-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------T----T----T-------TTA----TTAT-A-TAATC-TAT---T-AT-GT-ACA--ATAAT-GCGT-GAAT--AA-----T-A-G--TT-T-GA----CTAATT-CAA-TG--AT-CATG-AT-TGCT-TT--A--AAC-CTACC--T-CCCAGCTTATGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TT-ATGTGA-AT-AA----TGACTTGCAAC-CACA-CAT-CT-CTATT-ATTATTT-CACCCTC------AA--TAGA--C------------AAAAACT-A-GCT--GC-GG-A-AA--GACAG-----C-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                              gtggcgcagctttcaAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-T----------TA-TGTCATGT-------TTAATGTTTATGA-TAA-A-TGT---TTAT-GT-ACA--ATAAT-G-TG-GGATT-GAA---GT-A-GAGTTGT-GAG-A-CTTAATTCAA-TGGTAT--ATG-AA-TGCT-TTTAG--ACCATTACC--T-CC-AGTTT-TGCGT-AAAT-T-GTCATTT--ATTATCTTTA-GTGA-AT-GAACTATGACTTGCAACGCACAGCAT-CCGCT-TT-ATTA-TT-CACCATC------A---TAGATGC------------AAAAACTGA-GCCTGGCGGG-A-GA-TGACAG----CC-TTGAATAAAGGC---GA--TTGAAAA
gi|6                          : tctttaattgcgctctctcccgtataaggaactttttcattgtatttcatatatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgctattgT---GCTGAGGAGT--GTTTTTCATT-A-TGACTTG-T--AT----GTTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGGTCTAG--AATTGCT-ACGAGA-T-AGTATTATTTTGT---GAAA--C--TCA-A-TCCT-A------GTTCCCTA---------TGCTGT----TAT-----TTA----TAAT-A-TA--C-TATATATGAT-GT-ACG--ATG-T--CTG-GGAC--GAAAAAGT-A-G--TT-C-GAG-AACTAATTTCA--TG-TATACATG-AT-T-CTATT--A--ACC-TTACAAGT-CCCAG--T-TGCGT-GAAT-TTGT-ATTT--AT-AT-TTTATATGA-AT-AA----TGACTTGCAAC--ACA-CAT-CC-CTAT--ATT--TT-CACCCT-------AT--TAGA-GC-----------AAAAACCT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACGACTGCCC-T---ATATAGGT---GATCTTtagaaattgggatataaa
gi|7                          :                                                                                                     GAGT--GTTTT--ATT-AGTGATTGGGTCAA-----GTTTTGGTTATGCGGCTGGGGA-GGTCTTAGTAAGG-G-TAACGATAGTAA----TATTT-GT---GAAAACCTATTC-ATTCCTCA------GTTCC------------TA-TGT----T-------TTA----TTAT---TAA-C-TATTA-TTAT-GT-ACGACATAATGGCTGAGGGT--GA-----T-ACG--TT-T-GAG-A-CTTATTTCAATTG-TAT-TGAG-ACATGCTAAT--ACCACC-TAACC--TCCCCAGCAT-GCCGTAAAATGT-GTCATTT--A-TA---TTATGTGA-AT--A---ATGACTTGCAAC-CACACCAT-CCACTATTCATTATTT-CACCCTC------ATTATAGA-GC-----------AAAAAACT-ATGCT--GC-GG-A-AATTGACAG----CC-T---AT-AAGGCTATTATTTTGAAAActttgcaaagataattggcaatata
gi|8                          :                                                                                                CTAAGGAGT--GTTTTT-ATT-A-TGACTGG-T--A------TTTTTGTTATGCGGCT-GGGA-GGTCTTAG--AAT-G-T-ACGATA-T-A----TATTT-GT---GAAAACC--TTC-A-TCCT-A------GTTCC-TA---------T---GT----T-------TTA----TTAT-A-TAA-C-TAT---TTAT-GT-ACA--ATGTT-GCTG-AGAT--GAA---GT-A-G--TT-T-GAG-A-CTAATTTCAA-TG-TTT-CATG-AT-TGCT-TT--A--ATC-TTACT--T-CCCAGCTT-TGCGT-GAAT-T-GTCATTT--ATTAT-TTTATGTGA-AT-AA---ATGACTTGCAAC-CACA-CAT-TC-CTATT-ATTATTT-CATCCTC------AA--TAGA-GCAAATTAAAAAAAAAAAAAT-A-GCT--GC-GG-A-AA-TGACAG----CC-T---ATAAAGGC---GATTTTGAAAAagaagttgg
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