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lowQualScore                  :         . .    .. . ..  .   ...  ... .   .    ..... .  ..  .   ....  ... ...............   ..   ........ ..    . .....................  . ...   ...... .  ..  ... . . . ....... ....... ..  . .... . . . ........  .. .   ..  .... ...   ..... ..   . . . ...   . . ....... ... . ...... ..  .    ....... .   . .......... ...... .   ... .   .     . .  .......   . .. .   .. .. .  . ..  . ..  ......  ...  ... .    . ... .. .  .  ..   ..   .....    ... . .   ...  ..   ... .       ... ..  .. . . . .   .......    .    . ... ..  ..     . .... . .  .  ..  .   ... .   ...   . .... .  ... .    .   .    ..   .   . .  . .......  ..    .. ..  ......   .....  .        .   .......     ......................................... ...  .. .  .   . . ..  .....   ......   ... .    . . . . ..............  . ..    .  .. ...   .... ...   .  .  ....................................   .  ........  .  ..  .................................... ...   . .   .    .  ....   .. .   ............ .  ....  ...    . . .     
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gi|5                          :    AGGTA-T-CCAA--C-C--GT-TAT---AT---A-TTTCTCAC-----T-AT--ATTGTT---TCT---A---------------TGT--AGG--------A--AAAA-A--AA-------T-C--G-C--GA-AGAAAAA------T-CA--GT---T-T-A-----CC--A--C----TT-AT-G----T-A-A-A--------AT--A-ATT--CA-T--C---AAA-----C--AGT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TCTC----A--T-CTG-CG---------C------GCATA---T-CAG-AAAAA-T-GA------TACC-C-GG-CAC--G--G-CA-TATTT-T--CT------CA-ATTT---T-TT-G-T--TC--G-CA-AA--CAG-CACT-----ACCCGAGT-C-AAAAA-CC--ACGACGT-GTTTTCCT--C--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGGG-GC--G-CCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCTT--A-TCTT--ACT-A----C-AGA--A-AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AA-T-----T-GAG-TATT--TTGCT----GACAA-----AT-TACATAAA-A-T-------TCCTAATCGGGGT--A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G--AA-----AAA--G---ATG---A-GGGA-A-A-T-G-----A----A---AA-A--CATC-GC--G---CAC-G--G-A-AAA-AATAT--------TT-C---------TGTT-A---------AAT-AT--A-----TG-GA--ACTT-C-A-A-T--------------------------T---GAC-T-AAG-TTCA-TT----TTG--A-TTG------------G-AC----AA---TTAC-C-G-GGT
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gi|12                         :    AGGTA-T-CACAAACGC--GGCTAC---TT---A-GTT-CCAC-----T-AT--GT-ATC---ACT---A---------------TAT--ATG--------A--AAAA-------------T-C--A-T--GATAT--AAA------T-CA--GT---T-T-G-T-T-CA--G--C----TG-AT-G----C-A-A-A--------AG--A-ACT--CAGT--C---GGAT----C--GAA-A-T-T-T-TCT-G-T-------T---A-C------C--CG-TTTC----A--C-CTA-C----------G------G-AAA---C-TGG-GAATA-C-AA------CACC-T-TA-CAT--G--A-TA-T--TT-C--CT------CA-AATG---T-C--A-C--TC--G-CA-AAA-CAA-GACT-----AACA---T-C-AATT--CC--ACG---T-GTTTTTCA--C--TT--T-T-A-T-GTA-------AACA-GCCC-A-G-AT-GC--AACCC-A----G-A-AA-GT--AG-TCCT--A-CCTA--CCT-G----C-ACCT-A-AATA-GTT-CCAT--TGT-AAA-T-GA-T-----T-GAT-AATT--T--CT----T-AAA-----AT-TACACAGA-TTT-------TTCC-----------------------C----------A-------A---------TC-AGG-A--------------------ATGC--A-ACTG-G-A-T-A-----A----A---AGTA--AAT--------------A--G-A-AAA-AA-TT-A------TT-C---------CA-T-A---------AAT-AT--A-----AG-TA--ACTT-C-A-A-T--------------------------T---GAC-T-AA
gi|18                         : tttAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AC-ATTAAATTT---AAAAAAAAACATCCGGTGT--AGG--------A--AAAA-AAAA--------T-C--C-T--CA-A---AAA------T-CA--AT---T-T-A---A-TCG-A--G----TC-AT-GA---T-A-ACAATAGGGCTAT--A-ATT--CA-G--C---AAA-----C--AAT-G-T-T-A-CAT-G-TATTTGGCT---A-C------A--CG-TCTC----G--C-CTG-C----------C------A-GCA---T-CAG-GAAAATT-GA------CA-C-C-GA-CAC--GTAG-CG-T--TC-T-------------ATTT---T-a
gi|14                         :     GGTA-T-CACA--C-C--GG-TAT---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TGT--AAG--------A--AAAA-A--AAA------T-C--C-C--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--A--C----TC-AT-G----T-A-A-A--------AT--A-ATT--CA-T--C---AAA-----C--AGT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TCTC----G--T-CTG-C----------C------G-GTA---T-CAG-AAAAA-T-GA------TACC-C-GA-CAC--G--G-TA-T--TT-T--CT------AA-AAAT---G-TTTG-T--CC--G-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---C-C-AAAA--CC--A-----------------C--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-T-GG-GC--GCCCC-A----G-G-AA-GT--CG-CCTA--A-TCTT--ACT-A----C-AGG--A-AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AA-T-----T-GAG-TATT--T--CT----G-TAA-----AT-TACATAAA-ATT-------TCCTA----------G----------------------------------------TC-GGG-A-G--AA-----AAA--A---ATG---A-GGGGAA-A-T-G-----G----G---AA-A--AATC-gattggcacaaattgccggtgtgttctacccaaacatgccttcctggtagccattccacttccttgtaaatag
gi|1                          :     GGTA-T-CACA--C-CATGG-TAACCCTT---A-TTT-TAACG----C-AT--AT-GTT---TCT---A----------------GT--TGG--------A--AAAA-A--AAAAAAATTT-C--C-T--GA-A---AA-------T-CA--GTATAT-T-A-C-A-AG--A--C----TA-AT-AGCTCC-A-A-A--------AT--ACATTTGCA-T--C---AAAACTCTC--GGT-G-TAT-A-GAT-G-TGTTTTT-T---A-C------CA-TG--CTCCTAAG--T-CTG-CAATTCCTTGCCTAGATGG-GTA---TGCAG-AAAAA-T-GA------TAGC-C----CAC--G--A-CA-T--TT-TTTCT------CA-ATTG---T-TT-G-T--TCCGG-CA-AA--C-G-CACT-----ACCT---C-C-AAA----C--ACG---T-GTTTTCCA--C--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GTCTCGCT-GG-GC--GCCCC--------------T--CG-CCTT--A-GC--------A----C-AGA--ATAATA-GTT--CCT--TGTAAAA-CAAA-T-----GTGAA-TATT--T--TTCATAG-CAATAACTAT-TAGGT----ATTCCTTCACTCCTAGGGTGGTT--A-----------C----------A-------A---CA--T-TT-AAG-A-G--AA-----AAA--A---TTT---A-GGGGAA-A-T-G-----A----AT--AA-A--AATC-GC--GC--CAC-G--G---AAA-AA-AT-ACTCTTTTT-AGGTCACTTCTGTT-A---------AATCATTGA-----TGAGAATAC-A-A-A-A-TACGTA---------------------T---CAT-A-AAG-TTCAGTG----TTG--A-TTG------------G-AC----AA----TAC-C-G-
gi|8                          :      GTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TGT--AGG--------A--AAAA-A--AAA------T-C--G-C--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--A--C----TT-AT-G----T-A-A-A--------AT--A-ATT---A-T--C---AAA-----A--CGT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TCTC----A--T-CTG-C----------C------G-CTA---T-CAG-AAA---T-GA------TACC-C-GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-T--TC--G-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---T-C-AAAAA-CC--ACG---T-GTTTTCCT--C--GT--GGT-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-T-GG-GC--GCCCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCTT--A-TCTT--ATC-A----C-TAA--A-GATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AA-T-----T-GAG-TATT--T--CT----G-CAA-----AT-TACAT-AA-ATT-------TCCTA----------A-----------TCGGGGGTA--A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G---A-----AAA--G---ATG---A-GGGGAA-A-T-G-----A----A---AA-A--AATC-GC--G---CAC-G--G-A-AAA-AA-AT-T------TT-C---------TG-T-T---------AATAAT--A-----TG-GA--AC-T-ACA-A-T--------------------------T---GAC-T-AAG-TTCA-TT----TTG--A-TTG------------G-AC----AA---TTAC-CGG-TGTGgt
gi|7                          :      GTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TGT--AGA--------A--CAAA-A--A--------T-T--C-CT-GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CA--A--G----TC-AT-G----T-A-A-A--------AT--A-ATT--CA-T--C---AAA-----C--AGT-G-T-T-C-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TCTC----G--T-CTG-C----------C------G-GCA---T-CAG-AAAAA-T-TA------CACC-C-TA-AAC--G--T-CA-T--TT-T--CT------TA-ATGT---T-TTAC-T--CC--G-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACG---T-GTTTTCCA--T--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-T-T-GG-----GCCCC-A----G-G-AA-GT--CG-CCTA--A-TCTT--ACT-A----C-AGA--A-AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AA-T-----T-GAT-TATT--T--TT----A-CGA-----AT-TACATAAA-ATT-------TCCTAACCAGGGGT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-GAAAA-----AAA--A---ATA---A-GGGA-A-A-T-G-----A----A---AA-A--ATTC-GT--G---CAA-G--G-A-AAA-AA-AT-A------TT-AC--------TG-TAA---------AAT-AT--A-----TA-GA--AC-T-ACA-A-T--------------------------T---GAC-T-AAG-TTCA-TT----TTG--A-TTG------------G-AC----AA---TTAC-CGG-TGTGat
gi|3                          :      GTA-T-CACA--C-C--GT-TAA---TT---A-TTT-TCAC-------AT--AT-GTT----CT---A---------------T-T--AGA--------A--AAAA-A--T--------T-C--C-T--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--A--C----TC-AT-G----T-A-A-A--------AT--A-ATT--CA-T--C---AAA-----C--AGT-G-TGT-C-TA--G-T-------T---A-C------C--TG-TCTC----G--T-CTG-C----------C------G-GCA---T-CAC-AAAAA-T-GA------CACC-CTAA-AAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-T--CC--G-CA-AA--CAG-CAAT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACA---T-GTTCTTTTTAC--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-T-GG-GC--GGCCC-A----G-G-AA-GT--CG-CCTA--A-TCTT--ATT-A----CAAGA--A-AATG-ATT-CCCT--TGT-AAA-C-AA-T-----T-GAT-TATT--T--CT----A-CGA-----AT-TACATAAA-ATT-------TCCTAATCAGGGGT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G--AA-----AAA--A---ATG---A-AGGA-A-A-T-G----------A---AA-A--ATTT-GC--G---CA-------A-GAA-AA-AT-A------TT-AC--------TG-TAA---------AAT-AT--A-----TG-GA--AC-T-ACA-A-TTGAACTGAAAAAATATGGACTACAATT---GAC-T-AAG-TTCA-TT----TTG--A-TTG------------G-AC----AA---TTAC-CGG-TGTGa
gi|28                         :      GTA-T-CACA--C-AA-GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT---T---CCT---A---------------CGT--AGGTAAAAAAAA--AAAACA--A--------C-C--C-T--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-G-A-T-A-CA--A--G----TT-AT-A----T-A-A-A--------AC--G-ATT--CA-T--C---AAA-----C--AAT-T-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TCTC-------T-CTG-C----------C------A-GCA---T-CAGAAAAAA-TAAA------CACC-C-AA-CAC--G--A-CA-T--GA-T--CT------C--ATTT---T-TTata
gi|34                         :      GTA-T-CATA--C-C--GG-TAA---TT---G-TTT-TTAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------AGT--TGG--------A--AAAA-A--A--------T-T--C-T--GA-A---AA-------T-CA--GT---T-T-A-T-T-CA--A--T----TC-AT-G----T-A-A-A--------AT--A-ATT--CA-T--C---AAA-----T--AGT-G-T-T-A-TTT-G-T-------T---A-C------C--TG-T
gi|42                         :     cGTA-T-CACA--A-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--TT-GTT---TCT---A---------------TGT--AGA--------A--AGAA-A--AT-------T-C--C-C--GA-A---AAA------T-CA--GT---
gi|46                         :      GTG-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--A
gi|33                         :                            A---TT---A-TGT-TCCC-----A-AT--AT-GTT---CTG---A---------------TAA--AGG--------G--GGA--------------T-C--C-T--TT-A---AAA------T-CG--GT---A-G-A-T-G-AA--A--G----TC-AT-G----T-A-A-G--------AT--A-ATG--CA-G--C---AGG-----T--ACT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-CCTC----G--T-CTG-C----------C------A-ATA---T-CA
gi|16                         :                            t---TT---T-TTT-TTAC-----C-AT--AT-ATT---ATC---A---------------TAG--AGGTA------A--AAAA-A--A--------TTC--A-T--TA-A---AAA------T-CA--GT---T-T---T-G-CA--AAAT----TT-AT-G----C-C-A-A--------AT--A-CCG--CA-G--CCGTAAA----------T-G-T-T-C-TGT-C-A-------A---A-C------C--AG--CTT----G--T-CTG-C----------T------G-ACA---T-AAG-AAAAA-A-CA-------ACA-C-TA-CAC--G--A-CA-TCCTT-T--AC------CA-A----------------------CA-AA--TAA-GATT-----------------------C--ACG---T-GTTTTTCA--C--A---G-T-TGT-GTA-------AAAA-GCCC-T-A-GT-GC--ACCCC-A----G-G-G--GTA-CG-TT---------------------C-AGT------TA-GCA-CCTT--TGT-AGA-C-A--T-----ATGAT-TATT--T--CT----A-CAA-----AT-TACACAAA-CTT-------TTCTA----------A-----------T----------C-------A---AA--G-AT-ACA-A-C--AATTATTAAG--G---ATG---G-GGGA-T-A-G-G-----G----A---AA-A--cac
gi|29                         :                             ---TT---A-TTT-CCAT-----TTATTCAT-TTT---CTT---A---------------TGT--AAG--------A--AGAT-A-----------T-C--C-T--TT-A---AAA------T-CA--GG---T-G-A-TGA-AC--G--T----CG-A--G----T-A-A-A--------AA--A-CCT--CA-G--C---AAA-----T--ATT-G-C-T-A-TAT-G-T-------A---G-C------C--TG-TATT----G--T-CTG-T----------T------A-ATA---T-AAG-AAAAA-tgagtaaattcg
gi|40                         :                      cagatactgggccagtttTT-TCAC-----T-GT--AT-G-T---TCTAAAA---------------TGTG-AGG--------A--AAAA-A--T--------T-CCAGTT--GA-A---AAA------T-CAGGGT---T-T-A-TCA-CCTAA--C----TC-AT-G----A-ATA-A--------AT--A-ATT--Catggcat
gi|21                         :                                         T-TCAT-----C-AC--AC-ATT---ACT---A---------------TAA--AGG--------GG-AAAA-A--A--------T-A--A-C---A-A---AAA------T-CA--GT---T-T-G-T--------------------------T-A-A-A--------TT--G-AT----A-G--G---AA---------------T-T-C-TAT-G-T-------T---A-C------C--AT-TTTC----A--T-CTA-C----------C------G-ACA---C-CGG-AAAA-----------------C-AA-CAC--------A-T--TT-T--CT------CATATTT---TGTTCA-C--CC--G-CA-AA--GAA-GAGT-----ACTG---C-C-AAAT--CC--ACG---T-GTTTT--T--C--AT--A-TGT-T-GTA-------TACA-GC
gi|9                          :                                                           T-GTT---TCTT--A---------------CGT--ATT--------A--AAAA-A--A--------T-T--C-CTGAA-A---AAA------TGCA--GT---T-T-G-T-T-AC--A--TAGGGTC-ATCG----T-A-A-A--------ATTTA-ATT--CAAT--C---AAAA----C--AGTTG-T-T-AATATTG-T-------T---A-C------C--TGGTCTC----AGTT-CTA-C----------C------G-ACA---T-TAG-AAAAA-T-GAA-----CACC-C-TA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-TCTT---T-TTTG-T--CC--G-GA-AGACCGG-AACT-----ACTCG--TGC-AAAT--CC--ACG---T-GTTTCCAT--G--GTG-G-T-C-TGGTA-------AACA-GCCT-G-T--T-GC--ACCCC-A----G-G-AATGT--CG-GTTT--A-GATGAAACT-G----T-AGAC-A-AATAGGTT-CCCT--TGT-AAA-C-AA-T-----T-GAGTTATT--T--CT----A-CAT-----AG-CATATTAA-ATG-------TCCTA----------------------------------------------------C-AGG-G-G--TA-----CAG--A---ATGCTTA-GAGA-ACA-T-G-----A----G---AA-A--AATC-GC--G---CAC-G--G-A-AAA-AA-AT-AT-----TT-C---------TT-T-A---------AAT-ATTAG-----GG-GA--AC-T-ACA-A-T--------------------------T---GAC-T-AAGTTTCA-TT----TGG--ATTTG------------G-AC----AA---TTAactagtgtactccaacatgaatctcagctaccaacactt
gi|27                         :                                                               T---TTT---A---------------TGTTTACG--------ACCACAA-A--T--------T-C--C-T--GA-A---AAA------T-CA--GTGGAT-CGA-T-C-CC--A--A----TC-TT-G----T-G-A-A--------A-----ACT---A-T--C---AAA-----CGCAGT-GGT-C-A-TAT-G-T-------T---AGC------C--TG-TCTC----G--T-CTGTC----------C------G-ACA---C-AAC-CAAAA-T-GACCAATATACAAC-GA-CAC--G--GACA-T--TT-T--CT------CG-CTTG---T-ATTA-T--AC--G-CA-AG--CAG-CACTGTGACACAT---C-C-AAAA--Caacggtg
gi|6                          :                                                                   gCT---A---------------TGT--AGC--------A--AAAACAT-A--------T-C--C-T--TA-A---AAA------T-CT--GT---T-T-A-T-C-AA--A--G----TC-AT-G----T-A-A-A---------T--A-ATT--CA-G--C---AAA-----C--AAT-G-A-T-G-TAT-G-T-------T---A-CATGTACC--TG-TTTC----G--T-CGG-C----------C------G-CCAACTT-CAG-AAAAA-T-GA------CATC-C-TA-CTC--G--A-CA-T--TT-T--CT------CA---TT---T-TTTA-T--T
gi|30                         :                                                                                                                                                                          g-CC--A--C----TC-AT-G----T-A-A-A--------AT--A-ATT--CA-T--C---AAA-----C--AGT-G-T-T-ATTAT-GTT-------T---A-C------T--TT-CTTC----G----GTG-C----------C------G-GTAT--T-CAG-AAAAA-G-GA------CA-C-C-GA-C-C--G--G-TA-T--TTAT--CT------TA-ATTT---T-TTTGAT--CC--G-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---TAC-AAattttttttttaatcttatttgtttatttgggatgggtgggtctgcaaacgggactgccctcaaaaccacgtgttttccacgtgcttataacagcctgtgagcgccccaggaagtcgtctaatcaaaccacagcaaatagttcccttgtaaacagttgatcagaatattactgcacattacataaaaatttctaatcaggggtacatttgagaggaaaaaatgaggggaaatgaaaacaaaaaatcgcacaagaaaaaaaaaatatttctgcaaaatgtatggaactaagttcattttgaatgggcaaaatttacctgtat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                    --A-ATT--CA-TGCC---AAATGAGGC--AGT-T-G-G-A-AAT-G-T-------TCTCA-G------C--TA-TCTT-------C-CTG-C----------A------G-ACA---T-TGG-AAAAA-C-AG------CAAC-A-TA-CACTTG--G-CA-T--TT-T--CTATTATTTA-ATTT---C-TTTA-T--GC--A-CA-AA--CAA-GAGA-----ACCA---T-C-AAAT--CG--ACA---A-GTTTTATT--CATGT--G-T-G-T-GTA-------AACA-GTCT-G-A-GT-GC--ACCTC-A----G-G-AA-GC--AG-CCTC--A-GCTA--TCA-A----C-AGC--A-AACA-ATT-TCTT--TGT-AAA-C-AA-T-----T-GAT-TATT--T--TT----A-CAA-----AT-TACACAAA-ATT-------TGCTAATCAGCGGT-A-----------C----------A-------A---AA--A-TC-AAG-AGG--AA-----AGA--A---AAA---A-GGGA-A-A-T-G-----A----G---AATATTAATC-AG--T---CAT----T-A-AAA-AA-AT-A------tagttcccttgtaaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgA---C-CGA-AAAAA-T-GA------TACC-C-GAACAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTTG--T-TTTG-T--CC--G-CA-AAC-CAGTCACT-----ATCC---T-C-AAAAACCT--ATG---T-GTTTTCCCCAC--GT--GTT-T-T-GTAT------AACG-GTCA-G-T-GA-GCAAGCCCTAA----G-G-AT-GT--C--TCTA--ATTCTT--ACT-A----T-AG-------TT-GCC-ACCT--TGT-AAACC-AA-T-----T-GA--TATT--T--CT----GTCAA-----GTATA-ATAAACATT-------TACTA----------T-----------CGCGCGGGT--A-------C---AA--T-TT-AAGAA-G--AA-----CAA--A---ATA---G-GGGA-A-A-T-G-----G----AAACAA-A--AATA-GC--G---CAC-GT-G-AGAAA-AA-AT-T------TTCC---------TGTT-A---------AAT-AT--A-----TG-GT--AA-T-A-G-A-G--------------------------TACAAAT-G-AAG-TTCA--T----TTGAAA-TTG------------G-ACAT--AA---TTAC-C-G-TATG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               atagttaccatttccgtcatgccagagagataccaagtca---T-CAC-AAAAA-T-AA------CTCC-T-GA-AAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-TTTTGTTT-TTTA-T--CC--G-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---T-C-AAAA--aat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-T--CT--G-CA-AA--CGG-GACT-----GCCC---T-C-AAAA--CC--ACG---T-GTTTTCCA--C--GT--G-C-T-T-ATA-------A-CA-GCCT-G-T-GA-GC--GCCCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCTA--A-TCAA--ACC-A----C-AGC--A-AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AG-TTGATCA-GAA-TATT--A--CT----G-CAC-----AT-TACATAAA-AAT-------TTCTA----------AT----------C----------AGGGGT--A---CA--T-TT-GAG-A-G--GA-----AAA--A---ATG---A-GGGGAA-A-T-G-----AAAACA---AA-A--AATC-GC--A---CAA-GAAA-A-AAA-AA-AT-AT-----TT-C---------TG-CAA---------AAT-GT--A-----TG-GA---------------------------------------------AC-T-AAG-TTCA-TT----TTG--A-ATG------------G-GC----AAAATTTAC-C---TGTATtatacatattattcatagtcaataaatttct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                               gctatgtagcaaaaacatatccttaaaaatctgtttatcaaagtcatgtaaataattcagcaaacaatgatgtatgttacatgtacctgtttcgtcggccgccaacttcagaaaaatgacatcctactcgacattttctcattttttattattttttttttaatcttatttgtttatttgggatgggtggC--G-CT-AA--CAC-AACT-----ATCC---T-C-AAA-------------------TCCC--C--GT--A-T-G-T-GAA-------AACA-GCTC-G-A-G---------TC-T----G-G-AA-GT--AG-CCTC--A-GCT---ACC-AA---C-ATT--A-AACA-GTT-ACTT--T-------------------------ATT--T--CT----A-CAA-----AT-GACACATA-ATT-------TCCTA----------A-----------C----------C-------A---AA--TATT-AAA-A-G----------AA--T---ATG---A--GGA-A-G-T-A-----A----G---AA-A--A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgttcaacgtttcctttctcattttgaatagacatgtagagcaatatcgtacacatcattttctaaaaaacaaaaaaataccT--G-T-G-T-GTA-------AACA-GCCT-A-A-GT-GA--ACCTG-A----G-G-AA-AT--TG-TCTC--A-GC-T--ACC-AATACC-AG------ATT-GTT-CCTG--TGT-AAA-C-AA-T-----T-GAT-TATT--T--TT----A-CAA-----AT-AACGCAAA-AAT-------TTTTA----------A-----------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aacatcaaatataattcagaa-T-GTA-------AACA--CCT-T-C-AGTGC--ACTTC-A----G-T-GA-TT--AG-CCTC--A-GCT---ACC-A------ATATCA-AATA-GTT-TCAT--TGT-AAA-C-AA-T-----C-GAT-TAAT--T--CC----A-TAA-----CT-TCAACAAA-A---------TCCTG----------A-----------TCAGGGGTGTAA-------A---AA--T-TA-AAT-G-G--AA-----AGA--ATCTATG---A----A-A-A-C-GCA---A----A---AA-A--AAT------G---CAC-A--A-T-AAA-AA-AT-C------TTCA--------------A---------AAT-AA--G-----TG-GA--AC-T-ATA-T-T--------------------------T---GAC-T-AAG-Ttcagg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--GCCCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCT---A-T-TT--ACT-A----C-AGA--A-AATA-GTT-CCATGTTGT-AAAAC-AA-T-----A-GAG-TATT-----CT----G-CAA-----AT-TACATCAA-CTT-------TCCTA----------ATCGGGGGGTAAC----------A-------A---AA--T-TT-AAG-AAG--AA-----AAA--G---ATG---A-GGGA-A-A-TTG-----A----A---AA-A--AATC-GC--G---CAC-G--GAA-AAA-AA-AT-AT-----TT-C---------TGTT-A---------AAT-AT--A-----TG-GA--AC-T-ACA-A-T--------------------------T---GAC-T-AAG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cCTCC-A----A-GCAA-GT--CG-TCGTCAA-TCTA--ACT-TT---C-AAA--G-AATA-GTT-CCCT--TCC-TAA-C-AATT-----T-GAT-GATC--CA-CT----G-C-A-----AT-TACAAAAA-ATT-------CCTTA----------A-----------
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a----C-AGA--A-AATA-GTT-CCCT---GT-AAA-C-AA-A-----T-GAG-TATT--T--CT----G-CAA-----AT-TACATAAA-ATG-------TCCTAATCGGGGGT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G--AA-----AAA--G---ATG---A-GGGGAA-A-T-GA----A----A---AA-A--AATCGGC--G---CACGG--G-A-AAA-AA-AT-ACTTTT-TT-G---------TGTT-A---------AAT-AT--A-----TG-GA--AC-T-ACA-A-T--------------------------T---GACTT-AAG-TTCA-TT----TTG--A-CTG------------G-AC----AA---TTACACGG-TGTGtcaggtatggtgttaacaagatcttaagccccccacccaccccccccctaaaggtagtggagaacaataacaaaatcatgcacaccggaaaaaaaatctctctaaatatgtatgaaca
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccactcatgtaaaataattcatcaaacagtgttattatgtttactttcttcggtgccggtattcagaaaaaggacaccgaccggtatttatcttaatttttttgatccgcaaacagcactaccctacAA-----AT-TA-ATAA------------TTCTA----------G-----------C----------T-------AGATAA--T-AT-AAT-A-G--AA-----GAACTA---AT----A-TGCG-A-A-T-GGCAAGA----A---AA-AT-AATA-GCCTGAACCAC-G--G-A-ACACAA-AC-ACATATTTT-C---------TG-T-ACATCCCAGAAAT-AC--ACCTCATG-GA--AC-TTACA-A-T--------------------------T---GAC-T-AAG-TTCA-TT----TTGA-A-TTG------------GCACGATTAA---TTAC-C-G-TGTG
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g----------A-----------C----------A-------G---AA--A-TT-AAG-A-G--AA-----GAG--G---TAA---A-GGGA-A-A-C-G-----A----G---AA-A--AATC------------------------------------------------------------------AT-AC--G-----TG-GA--AA-T-A-A---T--------------------------T---GAC-T-AAG-TTAA-TT----TTT--G-TTG------------G-AC----AA---TTAC-CAG-TGTGca
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): TTCCTAATTAGGGGACCAAAACTTAAGAGGAAAAGATTTAGGAAATGAGATTTAAGATCTTCACAAAAAA
Unaligned ( gi|44 ): CTTACATTAGATTTCCTAGTCGGGGGTACAAAATTTAAGA
Unaligned ( gi|45 ): ATCTTGAAAACTGATGATCTACAGAAAAGACTAAGGAG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGGTG-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---CCT---A---------------TGT--AGG--------A--AAA--A-A-A--------TT-C---C--GT-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T--------C----TTAAT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-G--CAAA-----C--AGT-G-T-----TAT-G-T-------T---A-T------C--TA-TC--------TC----G--T-CTG-C----------T------AACA---A--AAG-AAAAA-T-GA-C------ACC-C-GA-TAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATGT---T-CTTG-T--C---CG-CA-AA--CAG-GTCT--------------------------ACG---T-GTTTTCCA--T--GT--G-C-T-T-GTA-------AACA-GTTA-T-TGT-GC--GC-TCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCTT--A-TCAA--AGT-G----T-ACC-A-AATA-GTT-CCCT--TAT-AAA-C-AA-C-T-----GT-TTATT--T--GT----G-CGA-----GT-TGCATAAA-ATT-------T-CTACTCATGGTT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G---AAAA--A---TTA---AGGGGAA-A-T-G-----A----A---GA-AATAATC-GC--A---C-AC-G--GA-AA--------------------------------------A---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--TAT-----A-GA--------------------------G-TAA-G-TTC-C-TT----TC-G--A-CAG------------G-TC----AG---TT-AC-C-GA--TGTG
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --A-ATT--CA-TGCCAAATGAGGC--AGT-T-G-G-A-AAT-G-T-------TCTCA-G------C--TA-TC--------TT-------C-CTG-C----------A------GACA---T--TGG-AAAAA-C-AG-C------AAC-A-TA-CACTTG--G-CA-T--TT-T--CTATTATTTA-ATTT---C-TTTA-T--G---CA-CA-AA--CAA-GAGA-----ACCA---T-C-AAAT--CG--ACA---A-GTTTTATT--CATGT--G-T-G-T-GTA-------AACA-GTCT-G-AGT-GC--AC-CTC-A----G-G-AA-GC--AG-CCTC--A-GCTA--TCA-A----C-AGC-A-AACA-ATT-TCTT--TGT-AAA-C-AA-T-T-----GA-TTATT--T--TT----A-CAA-----AT-TACACAAA-ATT-------TGCTAATCAGCGGT-A-----------C----------A-------A---AA--A-TC-AAG-AGG--AAAGA--A---AAA---AGGGA-A-A-T-G-----A----G---AATATTAATC-AG--T---C-AT----TA-AAA-AA-A---T-A---------------
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AC-ATTAAATTT---AAAAAAAAACATCCGGTGT--AGG--------A--AAA--A-A-AAA------TC-C---T--CA-A---AAA------T-CA--AT---T-T-A---A-TCG-AG----TC-AT-GA---T-A-ACAATAGGGCTAT--A-ATT--CA-G--CAAA-----C--AAT-G-T-T-A-CAT-G-TATTTGGCT---A-C------A--CG-TC--------TC----G--C-CTG-C----------C------AGCA---T--CAG-GAAAA-TTGA-C------ACC---GA-CAC--GTAG-CG-T--TC-T-------------ATTT---T-a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -G-TTCTA-TT----TT-G--A-TTG------------GCAC----AAA--TT-GC-C-GG--TGTGTgattggcacaaattgccggtgtgttctacccaaacatgccttcctggtagccattccacttccttgtaaatag
gi|19                         :                                                                                                  aggtatcacaccggtaattattttcactatacattaaatttaaaaaaaaacatccggtgtaggaaaaaaaaatcctcaaaaatcaatttaatcgagtcatgataacaatagggctataattcagcaaacaatgttacatgtatttggctacacgtctcgcctgccagcatcaggaaaattgacaccgacacgtagcAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAAA--TT---A-TTT--CAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TTT--AGG--------A--AAA--A-A-AA-------TC-G---C--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----A---A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-TTA-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TCC---A--T-CTA-C----------C------GGTA---T--CAG-AAAAA-T-GA-T------ACC-C-GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-TGTT---CG-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACG---T-GTTTTCCT--C--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-T-G-GC--GC-CCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCTT--A-Ttctacccaaacatgccttcctggtagccattccacttccttgtaaatag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---AATTT-TCAC-----T--T--AT-GTT----CT---A---------------TGT--AGG--------A--AAA--A-A-AAA------TCGC---C--GA-A---AAA------T-CA--GT---TGT-A-T-A--C--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--AA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----G--T-CTG-A----------C------GGTA---G--CAGAAAAAA-T-GA-T------ACC-C-GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-A-TT---T-TTTG-T--C---AG-CCTAA--CAG-CACT-----ACCC---T-CAAAAA--GC--ACG---T-GTTTTCCT--C--GTAAG-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGG-GC--GC-CCC-AGGGGG-G-AT-GTCACG-TCTT--A-TGTT--ACT-A----C-GAA-A-ATTA-GTT-CCAC--TGT-AAA-C-AA-T-A-----GA-G-ATTAGT--CT----G-CAA-----AT-T--ATAAA-TTT-------CCCTAATCGGGGGGTA-----------C----------A-------A---AAATT-TT-AAG-A-G--AAAAG--A---ATG---AGGGGAA-A-T-G-----A----A---AA-A--AGTC-GC--G---C-AC-G--G----A-AA-A---TCA---------------TT-TTG---T-T---------AAT-AT--AT----TGG-AAC------AC--AAT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-TTC-A-TTCTTATT-G--A-TTGAACTTTGATTGCG-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGT
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   C-TCC-A----A-GCAA-GT--CG-TCGTCAA-TCTA--ACT-TT---C-AAA-G-AATA-GTT-CCCT--TCC-TAA-C-AATT-T-----GA-TGATC--CA-CT----G-C-A-----AT-TACAAAAA-ATT-------CCTTA----------A-----------actagtgtactccaacatgaatctcagctaccaacactt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                a-T-GTA-------AACA--CCT-T-CAGTGC--AC-TTC-A----G-T-GA-TT--AG-CCTC--A-GCT---ACC-AA---T-ATC-A-AATA-GTT-TCAT--TGT-AAA-C-AA-T-C-----GA-TTAAT--T--CC----A-TAA-----CT-TCAACAAA-A---------TCCTG----------A-----------TCAGGGGTGTAA-------A---AA--T-TA-AAT-G-G--AAAGA--ATCTATG---A---A-A-A-C-GCA---A----A---AA-A--AAT------G---C-AC-A--AT-AAA-AA-A---T-C---------------TT-C-----A-A---------AAT-AA--G-----TGG-AAC----T-AT--ATT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-Ttcaggtatggtgttaacaagatcttaagccccccacccaccccccccctaaaggtagtggagaacaataacaaaatcatgcacaccggaaaaaaaatctctctaaatatgtatgaaca
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----C-AGA-A-AATA-GTT-CCCT---GT-AAA-C-AA-A-T-----GA-GTATT--T--CT----G-CAA-----AT-TACATAAA-ATG-------TCCTAATCGGGGGT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G--AAAAA--G---ATG---AGGGGAA-A-T-GA----A----A---AA-A--AATCGGC--G---C-ACGG--GA-AAA-AA-A---T-ACTT------------TT-TTGTGTT-A---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AAT-----T-GA--------------------------CTTAA-G-TTC-A-TT----TT-G--A-CTG------------G-AC----AA---TT-ACAC-GG--TGTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C--GC-CCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCT---A-T-TT--ACT-A----C-AGA-A-AATA-GTT-CCATGTTGT-AAAAC-AA-T-A-----GA-GTATT-----CT----G-CAA-----AT-TACATCAA-CTT-------TCCTA----------ATCGGGGGGTAAC----------A-------A---AA--T-TT-AAG-AAG--AAAAA--G---ATG---AGGGA-A-A-TTG-----A----A---AA-A--AATC-GC--G---C-AC-G--GA-AAA-AA-AA--T-A---------------TTTCTG---TTA---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AAT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cAA-----AT-TA-ATAA------------TTCTA----------G-----------C----------T-------AGATAA--T-AT-AAT-A-G--AAGAACTA---AT----ATGCG-A-A-T-GGCAAGA----A---AA-AT-AATA-GCCTGAACC-AC-G--GA-ACACAA-A---C-ACATATT---------TT-CTG---T-ACATCCCAGAAAT-AC--ACCTCATGG-AAC----TTAC--AAT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-TTC-A-TT----TT-GA-A-TTG------------GCACGATTAA---TT-AC-C--G--TGTG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caaT---TTT---A---------------TGTTTACG--------ACCACA--A-A-T--------TC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GTGGAT-CGA-T-C-CC--AA----TC-TT-G----T-G-A----A-----A-----ACT---A-T--CAAA-----CGCAGT-GGT-C-A-TAT-G-T-------T---AGC------C--TG-TC--------TC----G--T-CTGTC----------C------GACA---C--AAC-CAAAA-T-GA-CCAATATACAAC-GA-CAC--G--GACA-T--TT-T--CT------CG-CTTG---T-ATTA-T--A---CG-CA-AG--CAG-CACTGTGACACAT---C-C-AAAA--Catggtgtagacct
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gGTA-T-CACA--C-AA-GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT---T---CCT---A---------------CGT--AGGTAAAAAAAA--AAA--ACA-A--------CC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-G-A-T-A-CA--AG----TT-AT-A----T-A-A----A-----AC--G-ATT--CA-T--CAAA-----C--AAT-T-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC-------T-CTG-C----------C------AGCA---T--CAGAAAAAA-TAAA-C------ACC-C-AA-CAC--G--A-CA-T--GA-T--CT------C--ATTT---T-TT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---TT---A-TTT-CCAT-----TTATTCAT-TTT---CTT---A---------------TGT--AAG--------A--AGA--T-A----------TC-C---T--TT-A---AAA------T-CA--GG---T-G-A-T-G--A--ACG---TC-GA-G----T-A-A----A-----AA--A-CCT--CA-G--CAAA-----T--ATT-G-C-T-A-TAT-G-T-------A---G-C------C--TG-TA--------TT----G--T-CTG-T----------T------AATA---T--AAGAAAAAA-T-GG-C------A
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagatactgggccagtttGTA-T-CACA--C-C--GT-TAA---TT---A-TTT-TCAC-------AT--AT-GTT----CT---A---------------T-T--AGA--------A--AAA--A-A-T--------TC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-TGT-C-TA--G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----G--T-CTG-C----------C------GGCA---T--CAC-AAAAA-T-GA-C------ACC-CTAA-AAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-T--C---CG-CA-AA--CAG-CAAT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACA---T-GTTCTTTTTAC--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGG-GC--GG-CCC-A----G-G-AA-GT--CG-CCTA--A-TCTT--ATT-A----CAAGA-A-AATG-ATT-CCCT--TGT-AAA-C-AA-T-T-----GA-TTATT--T--CT----A-CGA-----AT-TACATAAA-ATT-------TCCTAATCAGGGGT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G--AAAAA--A---ATG---AAGGA-A-A-T-G----------A---AA-A--ATTT-GC--G---C-A------A-GAA-AA-A---T-A---------------TTACTG---TAA---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AAT-----T-GAACTGAAAAAATATGGACTACAATTGAC-TAA-G-TTC-A-TT----TT-G--A-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGTGt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---G-Tata
gi|30                         : gtatcacaccgttaattattttcacatatgttctattagaaaaaaattcctgaaaaatcagtttataccactcatgtaaaataattcatcaaacagtgtgtctagttacctgtctcgtctgccggcatcacaaaaatgacaccctaaaacggcattttctcaatttttttgtccgcaaacagcaataccctcaaaaccacatgttctttttacgtgtttgtaaacagcctgtgggcggcccaggaagtcgcctaatcttattacaagaaaatgattcccttgtaaacaattgattatttctacgaattacataaaatttcctaatcaggggtacaaaatttaagagaaaaaaatgaaggaaatgaaaaatttgcgcaagaaaaatattactgtaaaatatatggaactacaattgaactgaaaaaatatggactacaattgactaagttcattttgattgg-CC--AC----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-T-ATTAT-GTT-------T---A-C------T--TT-CT--------TC----G----GTG-C----------C------GGTAT--T--CAG-AAAAA-G-GA-C------A-C-C-GA-C-C--G--G-TA-T--TTAT--CT------TA-ATTT---T-TTTGAT--C---CG-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---TAC-AA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-tagttcccttgtaaac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccactcatgtaaaataattcatcaaacagtgttattatgtttactttcttcggtgccggtattcagaaaaaggacaccgaccggtatttatcttaatttttttgatccgcaaacagcactaccctacT--G-T-G-T-GTA-------AACA-GCCT-A-AGT-GA--AC-CTG-A----G-G-AA-AT--TG-TCTC--A-GC-T--ACC-AATACC-AG-----ATT-GTT-CCTG--TGT-AAA-C-AA-T-T-----GA-TTATT--T--TT----A-CAA-----AT-AACGCAAA-AAT-------TTTTA----------A-----------
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacatcaaatataattcagaaAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAC---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TGC--AGG--------A--AAA--A-A-A---------------------------A------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----GC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-GTT--CA-T--CAAA-----C--AAT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TT----G--T-CTG-C----------C------GGtcagg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A---TT---A-TGT-TCCC-----A-AT--AT-GTT---CTG---A---------------TAA--AGG--------G--GGA---------------TC-C---T--TT-A---AAA------T-CG--GT---A-G-A-T-G-AA--AG----TC-AT-G----T-A-A----G-----AT--A-ATG--CA-G--CAGG-----T--ACT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-CC--------TC----G--T-CTG-C----------C------AATA---T--CA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tGTA-T-CATA--C-C--GG-TAA---TT---G-TTT-TTAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------AGT--TGG--------A--AAA--A-A-A--------TT-C---T--GA-A---AA-------T-CA--GT---T-T-A-T-T-CA--AT----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----T--AGT-G-T-T-A-TTT-G-T-------T---A-C------C--TG-Tcac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      c----------A-----------C----------A-------G---AA--A-TT-AAG-A-G--AAGAGGTA---A-----AGGGA-A-A-C-G-----A----G---AA-A--AATC-----------------------------------------------------------------------AT-AC--G-----TGG-AA-------AT--AAT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-TTA-A-TT----TT-T--G-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-AG--TGTG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cagggat---T--CAC-AAAAA-T-AA-C------TCC-T-GA-AAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-TTTTGTTT-TTTA-T--C---CG-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---T-C-AAAA--ata
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -ATT-------TCCTA----------AT----------C----------GGGGGTACA---AA--T-TT-AAA-A-G--AGAAA--G---ATG---AGGGG-A-AAT-G-----A----A---AA-A--A-TC-GC--G---C-ACGG--GA-AAA-AA-A---T-T---------------TT-CGT---T-A---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--Atatacatattattcatagtcaataaatttct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        g-TT-AAG-A-G--AAAAA--A---TTG---AGGGG-A-AAT-G-----A----A---AA-A--CATC-GC--G---C-AC-G--GG-AAA-AA-AAATT-AT--------------TT-CTGT--T-A---------AAT-AT--A-----TAG-AAC----T-AC--AAT-----T-GA--------------------------C-TA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaggttagataggAGGTAAT-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-GTT-TCAC-----C--T--AT---------C---A---------------TGT--AGAGA------A--AAA--A-A-A--------TC-G---C--GA-A---AAAAAAAATT-CA--GT---T-T-AAT-AACC--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----AT--A---T--CC-TG-CATA-----C--AGT-G-T-T---TAT-G-T-------T---A-C------CCGTG-TC--------TC----G--TTCTG-C----------C------GGTA---T--CAG-AAAAA-T-GA-T------ACC---GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA---TT---T-GTTG-T--C---GG-CA-A---CAG--ACT-----ACCC---T-C-AAAA--CCCGACG---T-GTTTTCCT--C--GT--G-T-T-T-GTACAATGTAAACACGCCT-G-TGG-GC--GC-CC--A----G-G-AA-GT--CG-TCTT--A-TCTT--ACTCA----C-AGA-A-AATT-GTTTCCCT--TGT-AAA-C-AA-TAT-----GA-GTATT--TT-CT----G-CAA------T-T-CATAAA-ATT-------TCCTA----------AATCGAGGGGTAC----------A-------A---AA--T-TTTAAG-A-G--AAAAA--G---ATG---AGGGGGA-A-T-G-----A----A---AA-A----TC-GC--G---CCAC-G--GA-AAA-AATA---T-T---------------TT-CTG---TTA---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AAT-----TTGA--------------------------C-TAAAG-TTC-A-TT----TTTG--A-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGGTG-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---CCT---A---------------TGT--AGG--------A--AAA--A-A-A--------TT-C---C--GT-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T--------C----TTAAT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-G--CAAA-----C--AGT-G-T-----TAT-G-T-------T---A-T------C--TA-TC--------TC----G--T-CTG-C----------T------AACA---A--AAG-AAAAA-T-GA-C------ACC-C-GA-TAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATGT---T-CTTG-T--C---CG-CA-AA--CAG-GTCT--------------------------ACG---T-GTTTTCCA--T--GT--G-C-T-T-GTA-------AACA-GTTA-T-TGT-GC--GC-TCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCTT--A-TCAA--AGT-G----T-ACC-A-AATA-GTT-CCCT--TAT-AAA-C-AA-C-T-----GT-TTATT--T--GT----G-CGA-----GT-TGCATAAA-ATT-------T-CTACTCATGGTT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G---AAAA--A---TTA---AGGGGAA-A-T-G-----A----A---GA-AATAATC-GC--A---C-AC-G--GA-AA--------------------------------------A---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--TAT-----A-GA--------------------------G-TAA-G-TTC-C-TT----TC-G--A-CAG------------G-TC----AG---TT-AC-C-GA--TGTG
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --A-ATT--CA-TGCCAAATGAGGC--AGT-T-G-G-A-AAT-G-T-------TCTCA-G------C--TA-TC--------TT-------C-CTG-C----------A------GACA---T--TGG-AAAAA-C-AG-C------AAC-A-TA-CACTTG--G-CA-T--TT-T--CTATTATTTA-ATTT---C-TTTA-T--G---CA-CA-AA--CAA-GAGA-----ACCA---T-C-AAAT--CG--ACA---A-GTTTTATT--CATGT--G-T-G-T-GTA-------AACA-GTCT-G-AGT-GC--AC-CTC-A----G-G-AA-GC--AG-CCTC--A-GCTA--TCA-A----C-AGC-A-AACA-ATT-TCTT--TGT-AAA-C-AA-T-T-----GA-TTATT--T--TT----A-CAA-----AT-TACACAAA-ATT-------TGCTAATCAGCGGT-A-----------C----------A-------A---AA--A-TC-AAG-AGG--AAAGA--A---AAA---AGGGA-A-A-T-G-----A----G---AATATTAATC-AG--T---C-AT----TA-AAA-AA-A---T-A---------------
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AC-ATTAAATTT---AAAAAAAAACATCCGGTGT--AGG--------A--AAA--A-A-AAA------TC-C---T--CA-A---AAA------T-CA--AT---T-T-A---A-TCG-AG----TC-AT-GA---T-A-ACAATAGGGCTAT--A-ATT--CA-G--CAAA-----C--AAT-G-T-T-A-CAT-G-TATTTGGCT---A-C------A--CG-TC--------TC----G--C-CTG-C----------C------AGCA---T--CAG-GAAAA-TTGA-C------ACC---GA-CAC--GTAG-CG-T--TC-T-------------ATTT---T-a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -G-TTCTA-TT----TT-G--A-TTG------------GCAC----AAA--TT-GC-C-GG--TGTGTgattggcacaaattgccggtgtgttctacccaaacatgccttcctggtagccattccacttccttgtaaatag
gi|19                         :                                                                                                  aggtatcacaccggtaattattttcactatacattaaatttaaaaaaaaacatccggtgtaggaaaaaaaaatcctcaaaaatcaatttaatcgagtcatgataacaatagggctataattcagcaaacaatgttacatgtatttggctacacgtctcgcctgccagcatcaggaaaattgacaccgacacgtagcAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAAA--TT---A-TTT--CAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TTT--AGG--------A--AAA--A-A-AA-------TC-G---C--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----A---A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-TTA-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TCC---A--T-CTA-C----------C------GGTA---T--CAG-AAAAA-T-GA-T------ACC-C-GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-TGTT---CG-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACG---T-GTTTTCCT--C--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-T-G-GC--GC-CCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCTT--A-Ttctacccaaacatgccttcctggtagccattccacttccttgtaaatag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---AATTT-TCAC-----T--T--AT-GTT----CT---A---------------TGT--AGG--------A--AAA--A-A-AAA------TCGC---C--GA-A---AAA------T-CA--GT---TGT-A-T-A--C--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--AA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----G--T-CTG-A----------C------GGTA---G--CAGAAAAAA-T-GA-T------ACC-C-GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-A-TT---T-TTTG-T--C---AG-CCTAA--CAG-CACT-----ACCC---T-CAAAAA--GC--ACG---T-GTTTTCCT--C--GTAAG-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGG-GC--GC-CCC-AGGGGG-G-AT-GTCACG-TCTT--A-TGTT--ACT-A----C-GAA-A-ATTA-GTT-CCAC--TGT-AAA-C-AA-T-A-----GA-G-ATTAGT--CT----G-CAA-----AT-T--ATAAA-TTT-------CCCTAATCGGGGGGTA-----------C----------A-------A---AAATT-TT-AAG-A-G--AAAAG--A---ATG---AGGGGAA-A-T-G-----A----A---AA-A--AGTC-GC--G---C-AC-G--G----A-AA-A---TCA---------------TT-TTG---T-T---------AAT-AT--AT----TGG-AAC------AC--AAT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-TTC-A-TTCTTATT-G--A-TTGAACTTTGATTGCG-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGT
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   C-TCC-A----A-GCAA-GT--CG-TCGTCAA-TCTA--ACT-TT---C-AAA-G-AATA-GTT-CCCT--TCC-TAA-C-AATT-T-----GA-TGATC--CA-CT----G-C-A-----AT-TACAAAAA-ATT-------CCTTA----------A-----------actagtgtactccaacatgaatctcagctaccaacactt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                a-T-GTA-------AACA--CCT-T-CAGTGC--AC-TTC-A----G-T-GA-TT--AG-CCTC--A-GCT---ACC-AA---T-ATC-A-AATA-GTT-TCAT--TGT-AAA-C-AA-T-C-----GA-TTAAT--T--CC----A-TAA-----CT-TCAACAAA-A---------TCCTG----------A-----------TCAGGGGTGTAA-------A---AA--T-TA-AAT-G-G--AAAGA--ATCTATG---A---A-A-A-C-GCA---A----A---AA-A--AAT------G---C-AC-A--AT-AAA-AA-A---T-C---------------TT-C-----A-A---------AAT-AA--G-----TGG-AAC----T-AT--ATT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-Ttcaggtatggtgttaacaagatcttaagccccccacccaccccccccctaaaggtagtggagaacaataacaaaatcatgcacaccggaaaaaaaatctctctaaatatgtatgaaca
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----C-AGA-A-AATA-GTT-CCCT---GT-AAA-C-AA-A-T-----GA-GTATT--T--CT----G-CAA-----AT-TACATAAA-ATG-------TCCTAATCGGGGGT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G--AAAAA--G---ATG---AGGGGAA-A-T-GA----A----A---AA-A--AATCGGC--G---C-ACGG--GA-AAA-AA-A---T-ACTT------------TT-TTGTGTT-A---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AAT-----T-GA--------------------------CTTAA-G-TTC-A-TT----TT-G--A-CTG------------G-AC----AA---TT-ACAC-GG--TGTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C--GC-CCC-A----G-G-AA-GT--CG-TCT---A-T-TT--ACT-A----C-AGA-A-AATA-GTT-CCATGTTGT-AAAAC-AA-T-A-----GA-GTATT-----CT----G-CAA-----AT-TACATCAA-CTT-------TCCTA----------ATCGGGGGGTAAC----------A-------A---AA--T-TT-AAG-AAG--AAAAA--G---ATG---AGGGA-A-A-TTG-----A----A---AA-A--AATC-GC--G---C-AC-G--GA-AAA-AA-AA--T-A---------------TTTCTG---TTA---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AAT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cAA-----AT-TA-ATAA------------TTCTA----------G-----------C----------T-------AGATAA--T-AT-AAT-A-G--AAGAACTA---AT----ATGCG-A-A-T-GGCAAGA----A---AA-AT-AATA-GCCTGAACC-AC-G--GA-ACACAA-A---C-ACATATT---------TT-CTG---T-ACATCCCAGAAAT-AC--ACCTCATGG-AAC----TTAC--AAT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-TTC-A-TT----TT-GA-A-TTG------------GCACGATTAA---TT-AC-C--G--TGTG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caaT---TTT---A---------------TGTTTACG--------ACCACA--A-A-T--------TC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GTGGAT-CGA-T-C-CC--AA----TC-TT-G----T-G-A----A-----A-----ACT---A-T--CAAA-----CGCAGT-GGT-C-A-TAT-G-T-------T---AGC------C--TG-TC--------TC----G--T-CTGTC----------C------GACA---C--AAC-CAAAA-T-GA-CCAATATACAAC-GA-CAC--G--GACA-T--TT-T--CT------CG-CTTG---T-ATTA-T--A---CG-CA-AG--CAG-CACTGTGACACAT---C-C-AAAA--Catggtgtagacct
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gGTA-T-CACA--C-AA-GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT---T---CCT---A---------------CGT--AGGTAAAAAAAA--AAA--ACA-A--------CC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-G-A-T-A-CA--AG----TT-AT-A----T-A-A----A-----AC--G-ATT--CA-T--CAAA-----C--AAT-T-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC-------T-CTG-C----------C------AGCA---T--CAGAAAAAA-TAAA-C------ACC-C-AA-CAC--G--A-CA-T--GA-T--CT------C--ATTT---T-TT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---TT---A-TTT-CCAT-----TTATTCAT-TTT---CTT---A---------------TGT--AAG--------A--AGA--T-A----------TC-C---T--TT-A---AAA------T-CA--GG---T-G-A-T-G--A--ACG---TC-GA-G----T-A-A----A-----AA--A-CCT--CA-G--CAAA-----T--ATT-G-C-T-A-TAT-G-T-------A---G-C------C--TG-TA--------TT----G--T-CTG-T----------T------AATA---T--AAGAAAAAA-T-GG-C------A
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagatactgggccagtttGTA-T-CACA--C-C--GT-TAA---TT---A-TTT-TCAC-------AT--AT-GTT----CT---A---------------T-T--AGA--------A--AAA--A-A-T--------TC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-TGT-C-TA--G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----G--T-CTG-C----------C------GGCA---T--CAC-AAAAA-T-GA-C------ACC-CTAA-AAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-T--C---CG-CA-AA--CAG-CAAT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACA---T-GTTCTTTTTAC--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGG-GC--GG-CCC-A----G-G-AA-GT--CG-CCTA--A-TCTT--ATT-A----CAAGA-A-AATG-ATT-CCCT--TGT-AAA-C-AA-T-T-----GA-TTATT--T--CT----A-CGA-----AT-TACATAAA-ATT-------TCCTAATCAGGGGT-A-----------C----------A-------A---AA--T-TT-AAG-A-G--AAAAA--A---ATG---AAGGA-A-A-T-G----------A---AA-A--ATTT-GC--G---C-A------A-GAA-AA-A---T-A---------------TTACTG---TAA---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AAT-----T-GAACTGAAAAAATATGGACTACAATTGAC-TAA-G-TTC-A-TT----TT-G--A-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGTGt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---G-Tata
gi|30                         : gtatcacaccgttaattattttcacatatgttctattagaaaaaaattcctgaaaaatcagtttataccactcatgtaaaataattcatcaaacagtgtgtctagttacctgtctcgtctgccggcatcacaaaaatgacaccctaaaacggcattttctcaatttttttgtccgcaaacagcaataccctcaaaaccacatgttctttttacgtgtttgtaaacagcctgtgggcggcccaggaagtcgcctaatcttattacaagaaaatgattcccttgtaaacaattgattatttctacgaattacataaaatttcctaatcaggggtacaaaatttaagagaaaaaaatgaaggaaatgaaaaatttgcgcaagaaaaatattactgtaaaatatatggaactacaattgaactgaaaaaatatggactacaattgactaagttcattttgattgg-CC--AC----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-T-ATTAT-GTT-------T---A-C------T--TT-CT--------TC----G----GTG-C----------C------GGTAT--T--CAG-AAAAA-G-GA-C------A-C-C-GA-C-C--G--G-TA-T--TTAT--CT------TA-ATTT---T-TTTGAT--C---CG-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---TAC-AA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-tagttcccttgtaaac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccactcatgtaaaataattcatcaaacagtgttattatgtttactttcttcggtgccggtattcagaaaaaggacaccgaccggtatttatcttaatttttttgatccgcaaacagcactaccctacT--G-T-G-T-GTA-------AACA-GCCT-A-AGT-GA--AC-CTG-A----G-G-AA-AT--TG-TCTC--A-GC-T--ACC-AATACC-AG-----ATT-GTT-CCTG--TGT-AAA-C-AA-T-T-----GA-TTATT--T--TT----A-CAA-----AT-AACGCAAA-AAT-------TTTTA----------A-----------
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacatcaaatataattcagaaAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAC---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TGC--AGG--------A--AAA--A-A-A---------------------------A------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----GC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-GTT--CA-T--CAAA-----C--AAT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TT----G--T-CTG-C----------C------GGtcagg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A---TT---A-TGT-TCCC-----A-AT--AT-GTT---CTG---A---------------TAA--AGG--------G--GGA---------------TC-C---T--TT-A---AAA------T-CG--GT---A-G-A-T-G-AA--AG----TC-AT-G----T-A-A----G-----AT--A-ATG--CA-G--CAGG-----T--ACT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-CC--------TC----G--T-CTG-C----------C------AATA---T--CA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tGTA-T-CATA--C-C--GG-TAA---TT---G-TTT-TTAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------AGT--TGG--------A--AAA--A-A-A--------TT-C---T--GA-A---AA-------T-CA--GT---T-T-A-T-T-CA--AT----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----T--AGT-G-T-T-A-TTT-G-T-------T---A-C------C--TG-Tcac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      c----------A-----------C----------A-------G---AA--A-TT-AAG-A-G--AAGAGGTA---A-----AGGGA-A-A-C-G-----A----G---AA-A--AATC-----------------------------------------------------------------------AT-AC--G-----TGG-AA-------AT--AAT-----T-GA--------------------------C-TAA-G-TTA-A-TT----TT-T--G-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-AG--TGTG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cagggat---T--CAC-AAAAA-T-AA-C------TCC-T-GA-AAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-TTTTGTTT-TTTA-T--C---CG-CA-AA--CAG-CACT-----ACCC---T-C-AAAA--ata
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -ATT-------TCCTA----------AT----------C----------GGGGGTACA---AA--T-TT-AAA-A-G--AGAAA--G---ATG---AGGGG-A-AAT-G-----A----A---AA-A--A-TC-GC--G---C-ACGG--GA-AAA-AA-A---T-T---------------TT-CGT---T-A---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--Atatacatattattcatagtcaataaatttct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        g-TT-AAG-A-G--AAAAA--A---TTG---AGGGG-A-AAT-G-----A----A---AA-A--CATC-GC--G---C-AC-G--GG-AAA-AA-AAATT-AT--------------TT-CTGT--T-A---------AAT-AT--A-----TAG-AAC----T-AC--AAT-----T-GA--------------------------C-TA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaggttagataggAGGTAAT-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-GTT-TCAC-----C--T--AT---------C---A---------------TGT--AGAGA------A--AAA--A-A-A--------TC-G---C--GA-A---AAAAAAAATT-CA--GT---T-T-AAT-AACC--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----AT--A---T--CC-TG-CATA-----C--AGT-G-T-T---TAT-G-T-------T---A-C------CCGTG-TC--------TC----G--TTCTG-C----------C------GGTA---T--CAG-AAAAA-T-GA-T------ACC---GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA---TT---T-GTTG-T--C---GG-CA-A---CAG--ACT-----ACCC---T-C-AAAA--CCCGACG---T-GTTTTCCT--C--GT--G-T-T-T-GTACAATGTAAACACGCCT-G-TGG-GC--GC-CC--A----G-G-AA-GT--CG-TCTT--A-TCTT--ACTCA----C-AGA-A-AATT-GTTTCCCT--TGT-AAA-C-AA-TAT-----GA-GTATT--TT-CT----G-CAA------T-T-CATAAA-ATT-------TCCTA----------AATCGAGGGGTAC----------A-------A---AA--T-TTTAAG-A-G--AAAAA--G---ATG---AGGGGGA-A-T-G-----A----A---AA-A----TC-GC--G---CCAC-G--GA-AAA-AATA---T-T---------------TT-CTG---TTA---------AAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AAT-----TTGA--------------------------C-TAAAG-TTC-A-TT----TTTG--A-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGTG
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   T     .   .                 .    .        .    .  . . .         . C       . .     .      .  .   .   . . . ACC      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         G       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        AT   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    C    .        .   . .   A    .    .   .       T   .   .  . . . .   .          .    . .  T   .   .   . .    . .  .  .   .   T   .   T     . .    .  A  .    .   .    .    .   . .  . T        G     .  .   A        .      .        .   .           ATCAGGGGTACA                              .    .  .  .   . . A      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  A    .  . TATTTCTGCAA                                  .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   A     .   .                 .    .        .    .  . . .         . G       . .     .      .  .   .   . . . CCC      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         G       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        TG   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    C    .        .   . .   A    .    .   .       T   .   .  . . . .   .          .    . .  G   .   .   . .    . .  .  .   .   T   .   T     . .    .  A  .    .   .    .    .   . .  . T        T     .  .   G        .      .        .   .           ACCAGGGGTACA                              .    .  .  .   . . A      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  A    .  . TATTACTGTAA                                  .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   T     .   .                 .    .        .    .  . . .         . T       . .     .      .  .   .   . . . ACA      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         G       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        CG   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    C    .        .   . .   A    .    .   .       T   .   .  . . . .   .          .    . .  G   .   .   . .    . .  .  .   .   T   .   A     . .    .  T  .    .   .    .    .   . .  . A        T     .  .   A        .      .        .   .           TCGCGCGGGTA                               .    .  .  .   . . A      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  A    .  . TCATTTTGTT                                   .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   C     .   .                 .    .        .    .  . . .         . C       . .     .      .  .   .   . . . ACC      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         A       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        CG   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    A    .        .   . .   T    .    .   .       C   .   .  . . . .   .          .    . .  G   .   .   . .    . .  .  .   .   C   .   T     . .    .  A  .    .   .    .    .   . .  . A        G     .  .   G        .      .        .   .           ATCGGGGGTAC                               .    .  .  .   . . A      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  A    .  . TTTTCTGTTA                                   .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   C     .   .                 .    .        .    .  . . .         . C       . .     .      .  .   .   . . . ACC      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         G       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        CA   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    G    .        .   . .   A    .    .   .       T   .   .  . . . .   .          .    . .  G   .   .   . .    . .  .  .   .   C   .   T     . .    .  C  .    .   .    .    .   . .  . T        G     .  .   A        .      .        .   .           ATCGGGGTACA                               .    .  .  .   . . A      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  G    .  . TATTTCTTTA                                   .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   T     .   .                 .    .        .    .  . . .         . C       . .     .      .  .   .   . . . GAA      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         G       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        CA   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    C    .        .   . .   A    .    .   .       T   .   .  . . . .   .          .    . .  T   .   .   . .    . .  .  .   .   A   .   T     . .    .  A  .    .   .    .    .   . .  . C        T     .  .   G        .      .        .   .           ATCGGGGGTAA                               .    .  .  .   . . A      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  C    .  . TATTATGTA                                    .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   C     .   .                 .    .        .    .  . . .         . T       . .     .      .  .   .   . . . TCA      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         G       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        CG   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    C    .        .   . .   A    .    .   .       T   .   .  . . . .   .          .    . .  G   .   .   . .    . .  .  .   .   C   .   T     . .    .  A  .    .   .    .    .   . .  . T        T     .  .   G        .      .        .   .           ATCAGGGGT                                 .    .  .  .   . . A      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  A    .  . TATTCCATA                                    .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   T     .   .                 .    .        .    .  . . .         . T       . .     .      .  .   .   . . . CAA      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         G       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        TG   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    C    .        .   . .   A    .    .   .       A   .   .  . . . .   .          .    . .  G   .   .   . .    . .  .  .   .   T   .   T     . .    .  A  .    .   .    .    .   . .  . A        G     .  .   A        .      .        .   .           ATCA                                      .    .  .  .   . . A      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  A    .  . TTTTCGTTA                                    .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .  . 
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           . .    .  . .   .   .    .   .   .    .     .  .   .   T     .   .                 .    .        .    .  . . .         . T       . .     .      .  .   .   . . . ACC      .     .  . .    . . .    .      .  .   .   . .     .     .    . . . . .   . . .       .   . .      .   .  .         G       .   . .          .         .   .    .     . .  . .        CT   .   .  .  .  . .   . .   .       .    .   .    . .  .    .  .  .    C    .        .   . .   A    .    .   .       T   .   .  . . . .   .          .    . .  G   .   .   . .    . .  .  .   .   A   .   T     . .    .  A  .    .   .    .    .   . .  . T        A     .  .   G        .      .        .   .           ACC                                       .    .  .  .   . . G      .  .     .       . . . . .     .    .    . .     .  .  .   .  . .  A    .  . TCTTCAA                                      .  .  .       .   .    .  .    .     .  .                          .   . .   . .  .     . .  .   .            .  .     .    .  . .    
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGGTG-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---CCT---A---------------TGT--AGG--------A--AAA--A-A-A--------TT-C---C--GT-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T--------C----TTAAT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-G--CAAA-----C--AGT-G-T-----TAT-G-T-------T---A-T------C--TA-TC--------TC----G--T-CTG-C----------T------AACA---A--AAG-AAAAA-T-GA-C------ACC-C-GA-TAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATGT---T-CTTG-T--C---CG-CA-AA--C-AG-GTCT--------------------------ACG---T-GTTTTCCA--T--GT--G-C-T-T-GTA-------AACA-GTTA-T-TGT-GC--GC-TCCA----G-G-AA-GT--CG-TCTT--AT-CAA--AGT-G----TA-CC-A-AATA-GTT-CCCT--TAT-AAA-C-AAC-T-----GT-TTATT--T--GT----G-CGA-----GT-TGCATAAA-ATTT-CT--AC-TC---A-T-G---GT-T----A-CAA-AA--T--TT-AAGA-G---AAAA--ATT-AA-GGGGAAA-T-G-----A----A-G---A---AATAATC-GC--A---CAC-G--GA-AA------------------------------------------AAAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--TA-T-----AGA--------------------------G-T-AAG-TTC-C-TT----TCG--A-CAG------------G-TC----AG---TT-AC-C-GA--TGTG
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AC-ATTAAATTT---AAAAAAAAACATCCGGTGT--AGG--------A--AAA--A-A-AAA------TC-C---T--CA-A---AAA------T-CA--AT---T-T-A---A-TCG-AG----TC-AT-GA---T-A-ACAATAGGGCTAT--A-ATT--CA-G--CAAA-----C--AAT-G-T-T-A-CAT-G-TATTTGGCT---A-C------A--CG-TC--------TC----G--C-CTG-C----------C------AGCA---T--CAG-GAAAA-TTGA-C------ACC---GA-CAC--GTAG-CG-T--TC-T-------------ATTT---T-a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               G-TTCTA-TT----TTG--A-TTG------------GCAC----AAA--TT-GC-C-GG--TGTGTgattggcacaaattgccggtgtgttctacccaaacatgccttcctggtagccattccacttccttgtaaatag
gi|19                         :                                                                                                  aggtatcacaccggtaattattttcactatacattaaatttaaaaaaaaacatccggtgtaggaaaaaaaaatcctcaaaaatcaatttaatcgagtcatgataacaatagggctataattcagcaaacaatgttacatgtatttggctacacgtctcgcctgccagcatcaggaaaattgacaccgacacgtagcAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAAA--TT---A-TTT--CAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TTT--AGG--------A--AAA--A-A-AA-------TC-G---C--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----A---A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-TTA-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TCC---A--T-CTA-C----------C------GGTA---T--CAG-AAAAA-T-GA-T------ACC-C-GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-TGTT---CG-CA-AA--C-AG-CACT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACG---T-GTTTTCCT--C--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-T-G-GC--GC-CCCA----G-G-AA-GT--CG-TCTT--AT-tctacccaaacatgccttcctggtagccattccacttccttgtaaatag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---AATTT-TCAC-----T--T--AT-GTT----CT---A---------------TGT--AGG--------A--AAA--A-A-AAA------TCGC---C--GA-A---AAA------T-CA--GT---TGT-A-T-A--C--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--AA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----G--T-CTG-A----------C------GGTA---G--CAGAAAAAA-T-GA-T------ACC-C-GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-A-TT---T-TTTG-T--C---AG-CCTAA--C-AG-CACT-----ACCC---T-CAAAAA--GC--ACG---T-GTTTTCCT--C--GTAAG-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGG-GC--GC-CCCAGGGGG-G-AT-GTCACG-TCTT--AT-GTT--ACT-A----CG-AA-A-ATTA-GTT-CCAC--TGT-AAA-C-AAT-A-----GA-G-ATTAGT--CT----G-CAA-----AT-T--ATAAA-TTTCCCT--AA-TCG--G-G-G---GG-T----A-CAA-AAATT--TT-AAGA-G--AAAAG--AAT-GA-GGGGAAA-T-G-----A----A-A---A---A--AGTC-GC--G---CAC-G--G----A-AA-A------------TCA-----TTT-TGT---T------AAT-AT--AT----TGG-AAC------AC--AA-T-----TGA--------------------------C-T-AAG-TTC-A-TTCTTATTG--A-TTGAACTTTGATTGCG-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --C---CG-CT-AA--C-AC-AACT-----ATCC---T-C-AAA-------------------TCCC--C--GT--A-T-G-T-GAA-------AACA-GCTC-G-AG----------TCT----G-G-AA-GT--AG-CCTC--AG-CT---ACC-AA---CA-TT-A-AACA-GTT-ACTT--T------------------------ATT--T--CT----A-CAA-----AT-GACACATA-ATTTCCT--AA-CC-----------------------A-AA--TA-TT-AAAA-G-----AA--TAT-GA--GGA-AG-T-A-----A----G-A---A---A--A
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C-TCCA----A-GCAA-GT--CG-TCGTCAAT-CTA--ACT-TT---CA-AA-G-AATA-GTT-CCCT--TCC-TAA-C-AAT-TT----GA-TGATC--CA-CT----G-CAA------T-TACAAAAA-ATTCCTT--AA-TC---A-G-GTATGG-TGTTAA-CAA-GA--TC-TT-AAGactagtgtactccaacatgaatctcagctaccaacactt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 a-T-GTA-------AACA--CCT-T-CAGTGC--AC-TTCA----G-T-GA-TT--AG-CCTC--AG-CT---ACC-AA---TA-TC-A-AATA-GTT-TCAT--TGT-AAA-C-AAT-C-----GA-TTAAT--T--CC----A-TAA-----CT-TCAACAAA-A--TCCT--GA-TC---A-G-G---GG-T----G-TAA-AA--A--TT-AAAT-G--GAAAG--AATCTA-TGAA-AA-C-GCA---A----A-A---A---A--AAT------G---CAC-A--AT-AAA-AA-A------------T-------CTTC------A-----AAAT-AA--G-----TGG-AAC----T-AT--AT-T-----TGA--------------------------C-T-AAG-Tccccccacccaccccccccctaaaggtagtggagaacaataacaaaatcatgcacaccggaaaaaaaatctctctaaatatgtatgaaca
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----CA-GA-A-AATA-GTT-CCCT---GT-AAA-C-AAA-T-----GA-GTATT--T--CT----G-CAA-----AT-TACATAAA-ATGTCCT--AA-TC---G-G-G---GG-T----A-CAA-AA--T--TT-AAGA-G--AAAAA--GAT-GA-GGGGAAA-T-GA----A----A-A---A---A--AATCGGC--G---CACGG--GA-AAA-AA-A------------T-ACTTT-TTTGTGT---T-----AAAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AA-T-----TGA--------------------------CTT-AAG-TTC-A-TT----TTG--A-CTG------------G-AC----AA---TT-ACAC-GG--TGTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C--GC-CCCA----G-G-AA-GT--CG-TCT---AT--TT--ACT-A----CA-GA-A-AATA-GTT-CCATGTTGT-AAAAC-AAT-A-----GA-GTATT-----CT----G-CAA-----AT-TACATCAA-CTTTCCT--AA-TC---G-G-G---GGGT----AACAA-AA--T--TT-AAGAAG--AAAAA--GAT-GA-GGGA-AA-TTG-----A----A-A---A---A--AATC-GC--G---CAC-G--GA-AAAAAA-A------------T-A-----TTTCTGT---T-----AAAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AA-T-----TGA--------------------------C-T-AAG-a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            c-AA--T--AT-AATA-G--AAGAACTAAT--A-TGCG-AA-T-GGCAAGA----A-A---A---AT-AATA-GCCTGAACCAC-G--GA-ACACAA-A------------C-ACATATTTTCTGTACATCCCAGAAAT-AC--ACCTCATGG-AAC----TTAC--AA-T-----TGA--------------------------C-T-AAG-TTC-A-TT----TTGA-A-TTG------------GCACGATTAA---TT-AC-C--G--TGTG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caaaaattaataattctagctagatT---TTT---A---------------TGTTTACG--------ACCACA--A-A-T--------TC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GTGGAT-CGA-T-C-CC--AA----TC-TT-G----T-G-A----A-----A-----ACT---A-T--CAAA-----CGCAGT-GGT-C-A-TAT-G-T-------T---AGC------C--TG-TC--------TC----G--T-CTGTC----------C------GACA---C--AAC-CAAAA-T-GA-CCAATATACAAC-GA-CAC--G--GACA-T--TT-T--CT------CG-CTTG---T-ATTA-T--A---CG-CA-AG--C-AG-CACTGTGACACAT---C-C-AAAA--Catggtgtagacct
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gGTA-T-CACA--C-AA-GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT---T---CCT---A---------------CGT--AGGTAAAAAAAA--AAA--ACA-A--------CC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-G-A-T-A-CA--AG----TT-AT-A----T-A-A----A-----AC--G-ATT--CA-T--CAAA-----C--AAT-T-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC-------T-CTG-C----------C------AGCA---T--CAGAAAAAA-TAAA-C------ACC-C-AA-CAC--G--A-CA-T--GA-T--CT------C--ATTT---T-TT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---TT---A-TTT-CCAT-----TTATTCAT-TTT---CTT---A---------------TGT--AAG--------A--AGA--T-A----------TC-C---T--TT-A---AAA------T-CA--GG---T-G-A-T-G--A--ACG---TC-GA-G----T-A-A----A-----AA--A-CCT--CA-G--CAAA-----T--ATT-G-C-T-A-TAT-G-T-------A---G-C------C--TG-TA--------TT----G--T-CTG-T----------T------AATA---T--AAGAAAAAA-T-GG-C------A
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagatactgggccagtttGTA-T-CACA--C-C--GT-TAA---TT---A-TTT-TCAC-------AT--AT-GTT----CT---A---------------T-T--AGA--------A--AAA--A-A-T--------TC-C---T--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-TGT-C-TA--G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----G--T-CTG-C----------C------GGCA---T--CAC-AAAAA-T-GA-C------ACC-CTAA-AAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-T--C---CG-CA-AA--C-AG-CAAT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACA---T-GTTCTTTTTAC--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGG-GC--GG-CCCA----G-G-AA-GT--CG-CCTA--AT-CTT--ATT-A----CAAGA-A-AATG-ATT-CCCT--TGT-AAA-C-AAT-T-----GA-TTATT--T--CT----A-CGA-----AT-TACATAAA-ATTTCCT--AA-TC---A-G-G---GG-T----A-CAA-AA--T--TT-AAGA-G--AAAAA--AAT-GA-AGGA-AA-T-G----------A-A---A---A--ATTT-GC--G---CA------A-GAA-AA-A------------T-A-----TTACTGT---A-----AAAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AA-T-----TGAACTGAAAAAATATGGACTACAATTGAC-T-AAG-TTC-A-TT----TTG--A-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGTGt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---G-Tata
gi|30                         : gtatcacaccgttaattattttcacatatgttctattagaaaaaaattcctgaaaaatcagtttataccactcatgtaaaataattcatcaaacagtgtgtctagttacctgtctcgtctgccggcatcacaaaaatgacaccctaaaacggcattttctcaatttttttgtccgcaaacagcaataccctcaaaaccacatgttctttttacgtgtttgtaaacagcctgtgggcggcccaggaagtcgcctaatcttattacaagaaaatgattcccttgtaaacaattgattatttctacgaattacataaaatttcctaatcaggggtacaaaatttaagagaaaaaaatgaaggaaatgaaaaatttgcgcaagaaaaatattactgtaaaatatatggaactacaattgaactgaaaaaatatggactacaattgactaagttcattttgattgg-CC--AC----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-T-ATTAT-GTT-------T---A-C------T--TT-CT--------TC----G----GTG-C----------C------GGTAT--T--CAG-AAAAA-G-GA-C------A-C-C-GA-C-C--G--G-TA-T--TTAT--CT------TA-ATTT---T-TTTGAT--C---CG-CA-AA--C-AG-CACT-----ACCC---TAC-AA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-tagttcccttgtaaac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccactcatgtaaaataattcatcaaacagtgttattatgtttactttcttcggtgccggtattcagaaaaaggacaccgaccggtatttatcttaatttttttgatccgcaaacagcactaccctacT--G-T-G-T-GTA-------AACA-GCCT-A-AGT-GA--AC-CTGA----G-G-AA-AT--TG-TCTC--AG-C-T--ACC-AATACCA-G-----ATT-GTT-CCTG--TGT-AAA-C-AAT-T-----GA-TTATT--T--TT----A-CAA-----AT-AACGCAAA-AATTTTT--AA-TC---A-G-G---
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacatcaaatataattcagaaAGGTA-T-CACA--C-C--GG-TAC---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TGC--AGG--------A--AAA--A-A-A---------------------------A------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----GC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-GTT--CA-T--CAAA-----C--AAT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TT----G--T-CTG-C----------C------GG
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A---TT---A-TGT-TCCC-----A-AT--AT-GTT---CTG---A---------------TAA--AGG--------G--GGA---------------TC-C---T--TT-A---AAA------T-CG--GT---A-G-A-T-G-AA--AG----TC-AT-G----T-A-A----G-----AT--A-ATG--CA-G--CAGG-----T--ACT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-CC--------TC----G--T-CTG-C----------C------AATA---T--CA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tGTA-T-CATA--C-C--GG-TAA---TT---G-TTT-TTAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------AGT--TGG--------A--AAA--A-A-A--------TT-C---T--GA-A---AA-------T-CA--GT---T-T-A-T-T-CA--AT----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----T--AGT-G-T-T-A-TTT-G-T-------T---A-C------C--TG-Tcac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cC---A-G-G---GA-T----A-CAG-AA--A--TT-AAGA-G--AAGAG--G-T-AA-AGGG-AA-----------------------------------------AC-G--AG-AAA-AA------------------------TC--------------AT-AC--G-----TGG-AA-------AT--AA-T-----TGA--------------------------C-T-AAG-TTA-A-TT----TTT--G-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-AG--TGTG
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gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -ATTTCCT--AA-TC---G-G-G---GG-T----A-CAA-A---T--TT-AAAA-G--AGAAA--GAT-GA-GGGG-AAAT-G-----A----A-A---A---A--A-TC-GC--G---CAC-G--GG-AAA-AA-A--------------A-----TTTTCGT---T-----AAAT-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--Atatacatattattcatagtcaataaatttct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g--TT-AAGA-G--AAAAA--ATT-GA-GGGG-AAAT-G-----A----A-A---A---A--CATC-GC--G---CAC-G--GG-AAA-AA-AAAT---------T-A-----TTTCTGT---T-----AAAT-AT--A-----TAG-AAC----T-AC--AA-T-----TGA--------------------------C-T-A
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gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-TACATTAG-ATTTCCT--AG-TC---G-G-G---GG-T----A-CAA-AA--T--TT-AAGA-gattacct
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cGTG-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--A
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGGTA-T-CCAA--C-C--GT-TAT---AT---A-TTTCTCAC-----T-AT--ATTGTT---TCT---A---------------TGT--AGG--------A--AAA--A-A-AA-------TC-G---C--GA-AGAAAAA------T-CA--GT---T-T-A-----CC--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----A--T-CTG-C----------G------CGCA---TATCAG-AAAAA-T-GA-T------ACC-C-GG-CAC--G--G-CA-TATTT-T--CT------CA-ATTT---T-TT-G-T--T---CG-CA-AA--C-AG-CACT-----ACCCGAGT-C-AAAAA-CC--ACGACGT-GTTTTCCT--C--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGG-G---GCGCCCA----G-G-AA-GT--CG-TCTT--AT-CTT--ACT-A----CA-GA-A-AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AAT-T-----GA-GTATT--TTGCT----GACAA-----AT-TACATAAA-A-TTCCT--AA-TC-----G-G---GG-T----A-CAA-AA--T--TT-AAGA-G--AAAAA--GAT-GA-GGGA-AA-T-G-----A----A-A---A---A--CATC-GC--G---CAC-G--G--AAA-AA-A------------T-A-----TTTCTGT---T-----AAAT-AT--A-----TGG-AAC----T-TC--AA-T-----TGA--------------------------C-T-AAG-TTC-A-TT----TTG--A-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-GGGTTGTAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CT---A---------------TGT--AGC--------A--AAA--ACATA--------TC-C---T--TA-A---AAA------T-CT--GT---T-T-A-T-C-AA--AG----TC-AT-G----T-A-A----A------T--A-ATT--CA-G--CAAA-----C--AAT-G-A-T-G-TAT-G-T-------T---A-CATGTACC--TG-TT--------TC----G--T-CGG-C----------C------GCCAACTT--CAG-AAAAA-T-GA-C------ATC-C-TA-CTC--G--A-CA-T--TT-T--CT------C--ATTT---T-TTa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gG-T--C---TG-CA-AA--C-GG-GACT-----GCCC---T-C-AAAA--CC--ACG---T-GTTTTCCA--C--GT--G-C-T-T-ATA-------A-CA-GCCT-G-TGA-GC--GC-CCCA----G-G-AA-GT--CG-TCTA--AT-CAA--ACC-A----CA-GC-A-AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AGT-TGATCAGA-ATATT--A--CT----G-CAC-----AT-TACATAAA-AATTTCT--AA-TC---A-G-G---GG-T----A-C----A--T--TT-GAGA-G--GAAAA--AAT-GA-GGGGAAA-T-G-----AAAACA-A---A---A--AATC-GC--A---CAA-GAAAA-AAA-AA-A------------T-A-----TTTCTGC---A-----AAAT-GT--A-----TGG-A-----------------------A--------------------------C-T-AAG-TTC-A-TT----TTG--A-ATG------------G-GC----AAAATTT-AC-C-TG--TATattattttttttttaatcttatttgtttatttgggatgggtgggtctgcaaacgggactgccctcaaaaccacgtgttttccacgtgcttataacagcctgtgagcgccccaggaagtcgtctaatcaaaccacagcaaatagttcccttgtaaacagttgatcagaatattactgcacattacataaaaatttctaatcaggggtacatttgagaggaaaaaatgaggggaaatgaaaacaaaaaatcgcacaagaaaaaaaaaatatttctgcaaaatgtatggaactaagttcattttgaatgggcaaaatttacctgtat
gi|7                          :                                                                                                          gctatgtagcaaaaacatatccttaaaaatctgtttatcaaagtcatgtaaataattcagcaaacaatgatgtatgttacatgtacctgtttcgtcggccgccaacttcagaaaaatgacatcctactcgacattttctcattttttattattttttttttaatcttatttgtttatttgggatgggtggGTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TGT--AGA--------A--CAA--A-A-A--------TT-C---CT-GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CA--AG----TC-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT--CA-T--CAAA-----C--AGT-G-T-T-C-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----G--T-CTG-C----------C------GGCA---T--CAG-AAAAA-T-TA-C------ACC-C-TA-AAC--G--T-CA-T--TT-T--CT------TA-ATGT---T-TTAC-T--C---CG-CA-AA--C-AG-CACT-----ACCC---T-C-AAAA--CC--ACG---T-GTTTTCCA--T--GT--G-T-T-T-GTA-------AACA-GCCT-T-TGG-----GC-CCCA----G-G-AA-GT--CG-CCTA--AT-CTT--ACT-A----CA-GA-A-AATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AAT-T-----GA-TTATT--T--TT----A-CGA-----AT-TACATAAA-ATTTCCT--AA-CC---A-G-G---GG-T----A-CAA-AA--T--TT-AAGA-GAAAAAAA--AAT-AA-GGGA-AA-T-G-----A----A-A---A---A--ATTC-GT--G---CAA-G--GA-AAA-AA-A------------T-A-----TTACTGT---A-----AAAT-AT--A-----TAG-AAC----T-AC--AA-T-----TGA--------------------------C-T-AAG-TTC-A-TT----TTG--A-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGTG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTA-T-CACA--C-C--GG-TAA---TT---A-TTT-TCAC-----T-AT--AT-GTT---TCT---A---------------TGT--AGG--------A--AAA--A-A-AAA------TC-G---C--GA-A---AAA------T-CA--GT---T-T-A-T-A-CC--AC----TT-AT-G----T-A-A----A-----AT--A-ATT---A-T--CAAA-----A--CGT-G-T-T-A-TAT-G-T-------T---A-C------C--TG-TC--------TC----A--T-CTG-C----------C------GCTA---T--CAG-AAA---T-GA-T------ACC-C-GA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-ATTT---T-TTTG-T--T---CG-CA-AA--C-AG-CACT-----ACCC---T-C-AAAAA-CC--ACG---T-GTTTTCCT--C--GT--GGT-T-T-GTA-------AACA-GCCT-G-TGG-GC--GC-CCCA----G-G-AA-GT--CG-TCTT--AT-CTT--ATC-A----CT-AA-A-GATA-GTT-CCCT--TGT-AAA-C-AAT-T-----GA-GTATT--T--CT----G-CAA-----AT-TACAT-AA-ATTTCCT--AA-TC---G-G-G---GG-T----A--AA-AA--T--TT-AAGA-G---AAAA--GAT-GA-GGGGAAA-T-G-----A----A-A---A---A--AATC-GC--G---CAC-G--GA-AAA-AA-A------------T-------TTTCTGT---T-----AATA-AT--A-----TGG-AAC----T-AC--AA-T-----TGA--------------------------C-T-AAG-TTC-A-TT----TTG--A-TTG------------G-AC----AA---TT-AC-C-GG--TGTGa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-GTT---TCTT--A---------------CGT--ATT--------A--AAA--A-A-A--------TT-C---CTGAA-A---AAA------TGCA--GT---T-T-G-T-T-AC--ATAGGGTC-ATCG----T-A-A----A-----ATTTA-ATT--CAAT--CAAAA----C--AGTTG-T-T-AATATTG-T-------T---A-C------C--TGGTC--------TC----AGTT-CTA-C----------C------GACA---T--TAG-AAAAA-T-GAAC------ACC-C-TA-CAC--G--G-CA-T--TT-T--CT------CA-TCTT---T-TTTG-T--C---CG-GA-AGACC-GG-AACT-----ACTCG--TGC-AAAT--CC--ACG---T-GTTTCCAT--G--GTG-G-T-C-TGGTA-------AACA-GCCT-G-T-T-GC--AC-CCCA----G-G-AATGT--CG-GTTT--AG-ATGAAACT-G----TA-GACA-AATAGGTT-CCCT--TGT-AAA-C-AAT-T-----GAGTTATT--T--CT----A-CAT-----AG-CATATTAA-ATGTCCT--A---C---A-G-G---GG-T----A-CAG-AA--TGCTT--AGA-G--AA-----------------CA-T-G-----A----G-A---A---A--AATC-GC--G---CAC-G--GA-AAA-AA-A------------T-A-----TTTCT-T---T-----AAAT-ATTAG-----GGG-AAC----T-AC--AA-T-----TGA--------------------------C-T-AAGTTTC-A-TT----TGG--ATTTG------------G-AC----AA---TTAAA-C-GG--TGat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|45 ): ATCTTGAAAACTGATGATCTACAGAAAAGACTAAGGAG