lowQualScore : 1111 111 55555555 555555555555555555555555555555555555 1111 1111 1111111111 111 7777777777777777777777777 2222 333333333 111 11111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111 11111111111111 2222222222222222222222 1111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 1111111111111111 222222 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111 11111
lowQualScore : 4444 111 88888888 3 6 6 1 444444444444444444444444444444444444 66 4 6666 3 3 9999 2 2 444 2 333 2 2 4444444444 888888888 2 2 4 55 333 4 4 2 2 2 2 7777777777777777777777777 777 33 2 6666 2 2 2 66666 5555 33 2 777777777 55555 999 33 4 4 2 33 5555 00000000000 4444 555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 2 333 4444444444444444444444 1 3333 555555 555 66666 33333333333333 1 3 1 22 22 1 4444 1 9999999999999999999999 1 222 22 8888888888888888888888888888 1 22 9999999999999999999999999999999999 1 1 55555555 1111111111111111 3 44444 33 3 66 1 1 1 1 777777 1 3333 3 444 33333 3 1 1 3 1 22 6 44 1 6666666666666666666666 8888888888888888888888888888 2 00000 55 2 33
lowQualScore : .... ... ........ . . . . .................................... .. . .... . . .... . . ... . ... . . .......... ......... . . . .. ... . . . . . . ......................... ... .. . .... . . . ..... .... .. . ......... ..... ... .. . . . .. .... ........... .... ...................................................... . . ... ...................... . .... ...... ... ..... .............. . . . .. .. . .... . ...................... . ... .. ............................ . .. .................................. . . ........ ................ . ..... .. . .. . . . . ...... . .... . ... ..... . . . . . .. . .. . ...................... ............................ . ..... .. . ..
lowQualScore : 2222 777 55555555 5 7 7 0 444444444444444444444444444444444444 11 0 6666 1 1 9999 5 4 111 4 999 2 2 2222222222 444444444 1 1 2 00 666 2 2 1 1 1 1 6666666666666666666666666 000 77 5 7777 5 5 5 22222 3333 22 4 444444444 99999 999 22 7 7 4 22 0000 66666666666 7777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 555 7777777777777777777777 8 9999 222222 111 44444 88888888888888 6 8 6 22 22 6 8888 5 5555555555555555555555 5 666 00 0000000000000000000000000000 5 00 6666666666666666666666666666666666 5 5 66666666 0000000000000000 5 33333 99 5 55 7 7 7 7 000000 6 4444 3 222 88888 2 6 6 2 7 44 3 11 8 9999999999999999999999 2222222222222222222222222222 2 00000 66 9 99
consensus : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CA-T-TTT-AATAGCT-TG-TGAA--T----TGAATTGAAC-A-CTT--T---------T--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAACC---G-A-GT---A-C---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-AC--TAAAAT--T-G-AC-G-A-A-TGT------------AT-----------ATTAA--T--CCCT-TCATTG-TGGCA-T-TG-TCTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-AATAT---TGGG-----CCC--TGATTC--GGT-A-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----N-T----T-----AA-----C-----A------CNG--------T-TGT-AC-A-AG---------T------C-----TT-GTGA----A------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ACT-T--G--G-AATA----GG-GT-ACT-CT-TG----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGA-A-AT-----A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAG------------------C--------TTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
Reference ( gi|5 ) : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CA---T---GATAACT-TG-TGAAT-T----TGAATTGAAC-A-CTT--T---------T--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAACA---G-A-GT---A-C---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-AC--TAAAAA--T-G-AC-G-A-A-TGT------------A------------ATTAA--T--CCCT-TCATTG-TGGCA-T-TG-TCTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-AATAT---TGGG-----CCA--TGATTC--GGT-A-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----A-T----T-----AA-----C-----A------CTG--------T-TGT-AC-A-AG---------T------C-----TT-GTGA----A------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ACT-T--G--G-AATA----GG-GT-GTT-CT-TG----------CG-T---TTT--G------------------------T-G-A-GG--A-----T------------A----T----CT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGA-A-A------A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTACTA--AAG-AC----------------------GGTAAA------------------C--------TTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|1 : GTATAAAAAGGGGG----TTAGAT-G-CAGT-T---TATAGCT-TG-TGAAA-------GAA----ACGA-CTA--T---------T--GGAGTA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC----G-A-GT---A-----T-G-A----------TG---------TCCTACA-T--C--TAAAAA--TTG-AC-G-A-AATGT------------ATTTGCTTGA---ATTAA--T--CCCT-TCATTG---GCAAT-TG-TCTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACCGAAT-T---TGGG-----CCGCCTGATTC--GGT-A-C-T--AA----TATACAGTAATGTC----CA----TGGGTAA-T----TAGGGGAA-----C-----AG-----TTG--------T-TTT-TT-G-CG---------T------C-----TT-GTGA----A------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ACT-T--G--G-AATA--------T-------------------------------------------------------------------A-----T------------A----T--------------T-TG--------AC----------------ACAA-----A-AT-CA-AAA-AA-TAA-A-AT-----A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-TTT-C-C-T-TTTAAAGTATG--TTG-TA--AAT-AC----------------------GACAAG------------------C--------TTTTT-T-----AAAAAAGGCT-A--TACT
gi|4 : cttctcttacacaagttgtcggtccttatctgtgcaagagaatgtacttgtagtttaaatggtggacctattagtgtgaggctgggtgtggatgtgtaaattagcttgtggacacttatagattgaactctgtgatgtattaatgcaatattgctattacaggatatgagattctgcatattgtcaggagcagtggaatgccatttatatttctacaaggtccggggtggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggagggGTCCAGAAGG---T----TTAGATAG-CATTTT---AATAACTATG-TGAAGAT----TGAATTG-AC-A-CTT--T---------TTACGGATA-ACCTTTA-A-TTT-TTT-AATCA-----A-GTATCA-T---C-G-A----------TG---------TC-TCCA-TAAC--TAAAAATTT-G-AC-G-A-A-T-T------------A------------ATTAAAGTTACCCTATCATTGTTAACA-T-TG-TCAT-----TA----C--------------------------AG-----CT------TTC--GGTAA-A-A--AA----TA-----------C----CA----T-----A-T----T-----AA-----C-----A------C-A--------T-T-T-A--A-AA---------T------C-----TT-GTGA----A------G-A-AA-----TG--------------ATGT-ACT-T--G--A-AATAG---GG-GT-GCTACT-------------CG-T---TTTGAG------------------------T-A-ACGGAAA-----TAAAAGTGGCATAA----T----CT----AAT-T-TG---------C----------------ACGA-----A-ATACGGAAA-AA-TGA-C-AT-----A-A----AAAA-GATAA---T-----CCAAA-CTT-CAC-TCTTTAAAG--TG--TTGCTAC-AAGAAC----------------------GGT-AG------------------C--------TTTt
gi|2 : cccaaaagGTCTAAAAGGGGGT----GTAGAT---CAAT-T---AATAGCG-TG-TGAAT-TAACATAAAT-AAAA-A----------------T--CGGA-A-GCCTTA--A-TTT-TTTTGAACC---G-A-GT---AAT---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-AC----AAAA--T-GTAC-G-A-A-TGT------------A------------ATTAA--T--CCCT-TCATTG-T-GCA-T-TG-TC-T-----TA----CTTGTTTTT-ATGACC--ATAT---TGGG-----CCC--T-ATTC--CGT-A-ATT--AA----TA-----------C----TA----T-----A-T----TTA---AA-----A-----A------GT---------T-TGT-AC-A-AA---------G------T-----TG-GCAT----A------G----------TG-----------TTAATAT-A---G--G--G-AACA-----G-TT-GT---T-TG-----------G-T---CTT--G------------------------T-G-A-GA--AAATG-T------------A----T----GT----ATT-T-GG--------Aactt
gi|26 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggtGTCTAAAATAGGGT----TTAGAT-G-CA---TTT-AATAGCT-TG-TAA---------GA--TGAAC-A-CTT--A---------T--CGGATA-GCCTCT--AATTT-TTT-GAACC---G-A-GT---A-C---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-AC--TAAAAT--T-G-AC-G-A-A-TGT------------A------------TTTaataggtactctgctttttgtaaaggatatctattttgacacaacatcaagaatgaaataaaagagataattcaacttcacttctttaaagttgtgctactgtaagcttttttaaaaagctatactt
gi|21 : gggagggggagGTCTAAAAGGGGGGGGGATTAGCT-GCCA---TTTAAATAGCT-TGTTGAA---------AATTTAAC-A-CTTAAT---------T--CGG-TAGGCCTTTTAA-TTTATTT-GAACAACGG-A-GT---A-C---T-G-ATACAAATGGTTA---------TC-TACA-T-ACT-TAAAAT--T-G-AC-GAA-A-TGT------------A------------gctcgaa
gi|8 : gacagggttggatcccattttattttcttttttcaagttaagggtgaggGGGGT----TCAGAT-G-CA---TTT-AATAGCT-TG-T----------TGAAT-GAAC-AACTT--A---------T--CGGAGA-GCCTTA--A-TTT-TTT-GAACC---GCACGT---A-C---T-G-AC---------TG---------TC-TACACT-AC--TAAAAT--T-G-ACGG-A-A-TG
gi|17 : aT-T----TGAATTGAAC-A------TAAATAAAAGT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAACC---G-A-GT---A-C---T-G-A----------TG---------TT-TACA-T-AC---AAAAT--T-G-AC-G-A-A-TGT------------A------------ATTAA--T---CCT-TCATTG-T-GCA---TG-TCTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-----T---T-GG-----CCC--TGATTC--GG--A-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----T-T----T-----AA-----C-----A------CAG--------T-TGT-AC-A-AG---------T------atatttgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggcttggaagaaaaatgtatgttatttggaatcggtatctctgccttttaaggatatattattgttgacacaaatcaaataatgaaataaaagagatattcaaacttcactatttaaggttgttgctaagacggcaagctctgctata
gi|9 : taatagct-CTTA-T---------T--CGAATA-GCCTTT--AATTG-TTT-GAACT---A-A-TA---A-C---TAG-A----------TG---------TC-TACA-T-AT--TAAAAT--T-G-GC-A-A-A-TG-------------------------------------------ATTG-T-GCA-T-TG-TCTTTATAGTA----CTTG--TTT-ATGACC-AG-ATTCATGGG-----TCC--TGGATT--GGT-A-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----C-TC---T-----AA-----C-----A------CAG--------T-TGTAAC-ACAG----------------------TT-GCAC----A------G----------TG-----------TTAATAT-A------G--G-GACA----GT-G--GTT-TT-TG-----------G-T---TTT--GAAGAAAATGTACTGTACTTGGGAAT-A-G-GG--A-----T------------A---------CTGTGCGTT-T-TG--------GC----------------GC-AAGGACA-AT-C--AAA-AA-TGA-T-A------T-A----AAGA-GATAA---A-----TC-AA--TT-CAC-TCTTTAACGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAA------------------A----------GTT-T-----AAAAA--gcaagtaattatttttgcgcccgttgtttagtaacataagcttaagttaggtattttaaaaaaaaccaatagaata
gi|36 : ---------T--TGGATA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAACC---G-A-GT---A-C---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-AC--TAAAAC--T-G-AC-G-A-C-TGTATTTGCTCGAAGA------------ATTAA--T--CCCT-TCAT
gi|3 : taGATA-GCCTTTT-A-ATT-TTT-GAACC---G-A-GT-----C---T-G-A----------T-----------C-TAAT-T-AC--TTAAAC--T-G-AC-G-A-C-TGT------------ATTTGCCGAGA--ATTAAA-T--CACT-TCATTG-TG-CA-T-T----CC-----TA----CTTG--TTTCATGGCC-AATAT---TGAGGTTTCCTAGCTGATTCTAGGTCA-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----G-T----T-----AA-----C-----A------CTC--------T-GAT-AC-A-A
gi|37 : TT--A-ATT-TTT-AAACT---G-A-GT---A-C---T-GTA----------TG---------TC-TACA-T-AC--TCAAAAT-T-G-AC-T-A-A-TGT------------A------------aattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaatgtacttggatactggaggtagctctagcttttgataaggattctttttgacacaatcaaaaactgaaaaataaaaagtgataattcaactcacttttttgaagttgtgcttaaaacggcaagcttttctttttttttaaaaagagcta
gi|11 : -TTT-TTT-TAACC---G-A-GT---A-C---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-AC--TAAAAT--T-G-AC-G-A-A-TGT------------A------------ATTTA--T--CCCT-TCATTG-T-GCA-T-TG-TCTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-AAT-T-----GG-----CCC--TGATTC--GGT-A-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----T-T----T-----AA-----C-----A--------G--------T-TGT-AC-A-AG---------T------TGCACAGT-GTTAATCTA------GGG-AA------------------C--ACGT-TTT-T-------AATA----TG-GT-ACT-C--TG----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-CGAAAA-AA-AGA-A-AT-----A-A----AGGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAG------------------C--------TTTTTAA-----AAAAA--GTT-A--TAttgcatattaactttgaagaatta
gi|10 : ttaatT-TTT-AAAC----G-A-GT---A-CAGTT-G-AC---------TG---------T--TA-A-TCACCGTAAAAA--T-GGAC-G-ACA-TGT------------ATTTGCTCAAGA-ATTAA--T--CCCT-TCATTGATGCCA-T-TGTTCTT-----GA----CTTG--GT------CC-A--AT---TGGA-----ACC--TGATTC--GGT-A-A-T---C----TA-----------T----TAAT--T-----ACT----T-----AAAATTTC-----A------ATT--------TGTGT-AC-A-AA---------TTGTACAT-----TT-ATAT----A------GGG-AACAGTTTGT----------T--TTGT-TCTGT--GAAG-AAAA----GT-AT-GTTACT-TGAAGATAGGTCTG-TGCGTTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----TGATACT----ATT-TATG--------AC----------------AC-A-----A-TG-C--AAA-AA-TGA-A-A------T-A----AAGA-GATGA---T-----TT-AA-CTT-CAC-TCTTTAAATT-TG--TTGCTA--AAatt
gi|16 : AACT---G-A-GT---A-C---T-G-A-----------G---------TC-GACA-T-AC--TAAAAA--TTG-AC-G-A-A-TGT------------ATACTCGAAAGA-ATTA---C--CCCT-TCATTG-TG-CG-TGTG-TCTC-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-A---T---TGGG-----CCA--GGATTT--TCT-A-A-A--AA----TA-----------C----TG----T-----T-C----T-----AA-----C-----A------CAG--------T-TGT-AC-A-AG----------------------TT-GCAC----A------G----------TG-----------TTAATAT-A---T--G--G-AACA----GT-G--GTT-TT-TG-----------A-T---CTT--G------------------------T-G-A-AG--AAAATGT------------A----T----GT----ACT-T-GG--------Aac
gi|43 : aAACC---G-A-GT---A-C---T-G-A----------TACAAAATGTATC-TACA-T-AC--TAAAAT--T-G-AC-G-A-A-TGT------------A------------atagggcactgtgccttttgtaagtataccaattttggtacatttcaaaaatgaaataaaa
gi|7 : ---G-A-GT---A-C---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-AC--TAATAT--T-G-AC-G-A-A-TGT------------ATTAACTCGAAGAATTAC--T--CCCT-TCATTG-CA-CA-T-TG-TCTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-AA-AT----AGG-----CTC--TGATTC--GGT-A-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----T-C----T-----AA-----C-----A------CAG--------T-TGT-AC-A-AG---------tt
gi|46 : ct-GT---A-C---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-AC--TAAAAT--T-G-AC-G-A-A-TGT------------A------------TTTaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgatcttgtaaagagactgtatgtatctggaaaagggtactgtgcgttttgtaaggatattcattttgacaaatttcagcaatgaaataaaatagatattcaaaatcactctttaaagttgttgctaaagacggtaagcctttttaaaaagctaatac
gi|12 : ---T-G-A----------TG---------TC-TACA-T-A---TAAAAT--T-G-AC-G-A-C-TGT------------ATTAAATCGAAGAATTAC--T--CTTT-TCATTG-TG-CA-T-TG-TCTT-----TA----CTTG------------------------G-----CCC--TGATTC--GGT-A-A-T--AT----TA-----------C----TA----T-----T-T----T-----AA-----C-----A------CAG--------T-TGT-AC-A-AGAGGCTTTAAT------C-----AT-GTTA----ATATAGGGAACAG-----TGGTTTTTGATCTT--GTGT-ACT-T--G--G-AATA----GGTAC-GTA-CTGTG----------CGTT---TTT--A------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----TT-----TT-T-TG--------GC----------------AC-------A-TT-C--AAA-AA-TGA-A-A------ATA----AAGACTACAA---T-----T--AC-CTT-CAT-TCTTTAAAGT-TGNNNNNNNN--NNN-NN----------------------NNNNNN------------------N--------NNNNN-T-----AAAAA--ACgctcgaag
gi|6 : tG---------TC-TACA-T-AC--TAAAAT--T-G-AC-G-A-A-AGT------------ATTAAATCGAAGAATTAC--T--CTCT-TCATTG-TG-CA-T-TG-CCAA-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-AAC-----TGGG-----CCC--TGATCC--GGT-A-A-T--AA----TA-----------C----TAT---T-----A-TATTCT-----AA-----C-----A------CAG--------T-TGA-AC-T-AG---------acata
gi|15 : gA--T--CCCT-TCATTG--GGCA-T-TG-TCTT-----TA----CTGG--TTT-ATGACC-A--AT---TGGG-----CCC--TGATTC--GAT-ATT-T--AA----TA-----------C----TG----T-----T-C----T-----AAAG---C-----AAAGGGTTTG--------T-TTT-AT----G---------T------C------T-ATG-----G------GTA-AA-----TA-----------T--A-G---------G--G-AACA----GT-G--GTT-TT-TG-----------G-T---CTT--G------------------------T-G-A-AG--A-----aggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattatatgaagaaaatgtatgtactgggaatagggtactgcacgttttgtaaggatatctattttggcacatttcaaaaatgaaacatgataaaagagataatgaaaccgctctctttaaagttgttgctaaagacggtaaactttttaatttattttttcttttttaaaaagctatacttgt
gi|34 : A--T--CCCT-TCATTG-TG-CA-T-TG-TCTT-----TA----CTTG--T-------CC-A--AT---TGGG-----aaatgcatgtacttggaatagggtactctgcgttttgtttaggatatttttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggcaagctttttaaaaagctattctt
gi|13 : -TCATTG-TG-CA-T-TG-GTCT-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-AAC-----TGGG-----CCC--TGATTC--GGT-A-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----T-C----T-----AC-----C-----A------CAA--------T-TGT-AC-A-AG---------annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggaaaagcaaaagagtcttgttgatgtc
gi|18 : agtactagatcaTTG-TG-CA-T-TG-TCTT-----TATATACTTG--TTT-ATGACC-AAT-TCA-TGGG-----TCC--TGATTC--GGT-A-A-T--AA----TA-----------C----TA----T-----T-C----T-----AA-----C-----A------CAG--------T-TGT-AC-A-AG----------------------TT-GCAC----A------G----------TG-----------TTAATAT-A---G--G--G-GACA----GT-G--GTT-TT-TG-----------G-T---CTT--G------------------------T-G-A-AG--AAAATGT------------A----T----GT----ACT-T-GGAATAGGGTACTGTGCGTTTTGGAAGGAC-A-----A-TT-C--AAA-AA-TGATA-T------A-A----AAGA-GATAA---A-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgatcttctgaagaaaatgtatgtacctggaatataaggtactgtgcgttttgtaaggatatcaattttacattacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : TG--TTT-ATGACC-AAT-----TGGG-----CCC--CGATTC--GGT-C-A-TTAAAGTTGTA-----------CAAAATA----T-----A-G----GG----AA-----CGGGAAA------CGG--------T-TGT-TTTG-GG---------T------C-----TTTGTAA----A------GAA-AA------G-----------T--ATGT-ACT-T--G--G-AATA----GG-GT-AAT-C--TG----------AG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----------------------------------------------------------------------A-----A-ATCC--CAA-AA-TGA-ATA------A-A----AGGA-GAT-A---T-----TC-AA-CTTCCAC-TCTTTAAAGT-TT--TTTGTA--AGG-A
gi|13 : C--GGT-GGA-T--AA----TA-----------T----TAGGAAT-----A-T----T-----T------C-----A------GTG--------G-TGT-TT-T-GA---------T------C-----TT-CTGA----A------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ACC-T--G--G-AATA----TA-AG-GTA-CTGTG----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CA----ATT-T-T---------AC----------------Aacaaatcaaaaatgaaataaagagataatttcaatcttcactctttaaagttgttgctattaagacggcaggcttttttaaaaagctatacttgt
gi|2 : agtactagatcatcattgtgcattggtcttacttgtttatgaccaactgggccctgattcggtaataatactattctaccacaattgtacaagaggc-----------C----TA----T-----A-T----T-----AA-----C-----A------CTATGCCAACTT-TGT-AC-A-AA---------C------T-----TT-TTAA----A------TAT-A-------G-----------T--AT-T-AAT-TACG--G-AATA----GG-Gttacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|20 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggtgtctaaaagggggtgtagatcaattaatagcgtgtgaattaacataaataaaaatcggaagccttaatttttttgaaccgagtaattgatgtctacatacaaaatgtacgaatgtaattaatcccttcattgtgcattgtcttacttgtttttatgaccatattggg-----AA-----C-----A--------G--------T-TGT-TT-T-GG---------T------C-----TT-GTGA----G------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ACT-T--G--G-AATA----GG-GT-ACT-C--TG----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----AT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGG-A-AT-----A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AC-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAG------------------CT-------TTTTT-T-----AAAAA--GTT-A--TACTggaacagttgtttggtcttgtgagaaaatgtatgtatttggaaataggtactctgctttttgtaaaggatatctattttgacacaacatcaagaatgaaataaaagagataattcaacttcacttctttaaagttgtgctactgtaagcttttttaaaaagctatactt
gi|19 : taacacagctgtacaagttgcacagtgttaatatggggG---------T------C-----TT-GTGA----A------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ATT-T--G--G-AATA----GG-GT-ACT-CT--G----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------AATTAT----AT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGA-A-AT-----A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGCAAG------------------C--------TTTTT-A-----AAAAA--GCT-A--t
gi|15 : ataacacagttgtacaagttgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttgG---------T------C-----TT-GTGA----A------GAA-AA-----TG-----------C--ATGT-ACT-T--G--G-AATA----GG-GT-ACT-CT--G----------CG-T---TTT--G------------------------T-TTA-GG--A-----T------------A----T-----------TT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGA-A-AT-----A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAG------------------C---------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TTCT
gi|2 : atcccttcattgggcattgtctttactggtttatgaccaattgggccctgattcgatatttaatactgttctaaagcaaagggtttgttttatgtctatgggtaaatatagggaacagtggtttttgG---------T------C-----TT-GTGA-----------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ATT-T--G--GAAATA-----G-GT-ACT-C--TG----------CT-T---TTT--G------------------------TAA-A-GG--A-----T------------A----T----CT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----ACAT-C--AAG-AA-TGA-A-AT-----A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CACTTCTTTAAAGT-TG---TGCT-------AC----------------------TGTAAG------------------C--------TTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTt
gi|7 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggtgtctaaaagggggtgtagatcaattaatagcgtgtgaattaacataaataaaaatcggaagccttaatttttttgaaccgagtaattgatgtctacatacaaaatgtacgaatgtaattaatcccttcattgtgcattgtcttacttgtttttatgaccatattgggccctattccgtaattaatactatatttaaaaagtttgtacaaagttggcatagtgttaatatagggaacagttgtttg---------T------C-----TT-GTAA----A------GAG-AC-----TG-----------T--ATGT-ATC-T--G--G-AAAA----GG-GT-A---CTGTG----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----TC----ATT-T-TG--------AC----------------AA-A-----T-TT-C--AGC-AA-TGA-A-AT-----A-A----AATA-GATA----T-----TC-AA-AAT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGTAAG------------------C--------CTTTT-T-----AAAAA--GCTAA--TACt
gi|16 : ctgagtactgatgtctacatactaatattgacgaatgtattaactcgaagaattactcccttcattgcacattgtctttacttgtttatgaccaaataggctctgattcggtaataatactattctaacacagttgtacaagaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttga---------T------C-----TT-GTGA----A------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ACT-T--G--G-AATA----GG-GC-A---CTGTG----------CC-T---TTT--G------------------------T-A-A-GT--A-----T------------A----C----CA----ATT-T-TG--------GT----------------AC-A-----T-TT-C--AAA-AA-TGA-A-AT-----A-A----AA
gi|8 : aaactgagtactgagtcgacatactaaaaattgacgaatgtatactcgaaagaattaccccttcattgtgcgtgtgtctctacttgtttatgaccattgggccaggattttctaaaaatactgttctaacacagttgtacaagttgcacagtgttaatatatggaacagtggtttttga------C-----TT-G-GA----A------GAA-AAA----TG-----------T--ATGTTATT-T--G--G-AATC----GG--T-ATC-TC-TG----------CC-T---TTT--A----------------------------A-GG--A-----T------------A----TA---TT----ATTGT-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-C--AAATAA-TGA-A-AT-----A-A----AAGA-GAT-A---T-----TCAAA-CTT-CAC-TATTTAAGGT-TG--TTGCT---AAG-AC----------------------GGCAAG------------------C--------TCT
gi|6 : aggggttcagatgcatttaatagcttgttgaatgaacaacttatcggagagccttaattttttgaaccgcacgtactgactgtctacactactaaaattgacggaatgatatttgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggT-ATGA----A------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ACT-G--G--G-AATA----GG-GT-ACTGC---A----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CT----ATT-T-TG--------GC----------------AC-A-----T-TT-C--AAA-AA-TGA-A-ACATGATA-A----AAGA-GATAA---T-----GA-AA-CCG-CTC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGTAAACTTTTTAATTTATTTTTTC--------TTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTgctata
gi|23 : ggtctacatactaaaattgacgaaagtattaaatcgaagaattactctcttcattgtgcattgccaatacttgtttatgaccaactgggccctgatccggtaataatactattatattctaacacagttgaactagaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttatta-GTTA----A------GAA-AA-----TG-----------T--ATGT-ATT-T--G--G-AAAA----GG-GT-ACT-C--TG----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----AT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-A--AAA-AA-TGA-A-AT-----A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GACAAG------------------C--------ATTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTtgt
gi|24 : --ATGT-ACT-T--G--G-AATA----GG-GT-ACT-C--TG----------CG-T---TTG--G------------------------T-A-G-GG--A-----T------------A----T----CT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGA-A-AT-----A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAG------------------C--------TTTTT-TTAAAAAAAAA--GCT-A--TACT
gi|32 : c--ATGT-ACT-T--G--G-AATA----GG-GT-A---CTGTG----------CG-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A-----T------------A----T----AT----ATT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGA-A-AT-----A-A----AAGA-GATGA---T-----TT-AA-CTT-CAC-TCTTTAGATT-Tt
gi|3 : --ATGT-ACT-T--G--G-A-TACTGGAG-GTAGCT-CT-AG----------C--T---TTT--GA-----------------------T-A-A-GG--A-----T-----------------T----CT-----TT-T-TG--------AC----------------AC-A-----A--T-C--AAA-AACTGA-A-A------A-ATAAAAAGT-GATAA---T-----TC-AA-C-T-CACTTTTTTGAAGT-TG---TGCTT--AAA-AC----------------------GGCAAG------------------CTTTTCTTTTTTTT-T-----AAAAA--Gaaaaagct
gi|27 : gatagccttttaatttttgaaccgagtctgatctaattacttaaactgacgactgtatttgccgagaattaaatcacttcattgtgcattcctacttgtttcatggccaatattgaggtttcctagctgattctaggtcaataatactatgttaacactctgatacaaaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaATA----GG-GT-A---CTGTA----------CG-T---TTT--G------------------------A-A-A-AG--A-----T------------A----T----AT----ATT-T-TG--------GC----------------AC-A-----T-TT-C--AAG-AA-TGA-A-AT-----A-A----AATA-G-TAA---T-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AA----------------------GTTAAG------------------C--------TTTTT-A-----AAAAAT-GCT-A--TACTagcta
gi|40 : G-T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A------------------G----T----CT----ATT-T-TG--------GC----------------AT-------A-TT-C--CAA-AA-TGA-A-G------A-A----AAAATGATAA---T-----tgt
gi|14 : -T---TTT--G------------------------T-A-A-GG--A--------------------------------------------------------------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGA-A-A------T-A----AAGA-GATAAT--T-----TC-AATCTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTATTAAG-AC----------------------GGCAGG------------------C--------TTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTagagattgatcaaac
gi|31 : tgtttatgaccaattgggccccgattcggtcattaaagttgtacaaaatatagggaacgggaaacggttgttttgggtctttgtaaagaaaagtatgtacttggaatagggtaatctgagttttgtaaggaaaatcccaaaatgaataaaaggagatattcaacttccactctttaaagttAA-AA-TGA-A-A------A-A----AAGA-GATAAATTTCAACATC-AA-CTT-CAC-GCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-ACAAAGTTGTTGCTATTAAAAGATGGTAAG------------------C--------TTTTT-TAAA--AAAAA--GCT-A--TACTtgt
gi|39 : ------A-A----AAGA-GATAA---T-----TC-AA-CTT-CG---------AAT-TC--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAG------------------C--------TTTTT-A-----AAAAA--GCT-AATTACTtgt
gi|28 : atTAA---A-----TC-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGTAAA------------------C--------TTTTT-tg
gi|41 : tcccgtacatgagaagactggatgattagggtattgaaaaatttcaaatatcggttttcgtacatttcaataatAA---T-----TC-AT-CTG--AC-TCTTTAAAGT-TT--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGTAAG------------------C--------T
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATGAACTATATTGATGGATTGATGGTGGTAAAAATAAGCTTGATACAAAAACATGAAAGTTTGTTTTATATGGTAGCAGGGGATGCTTAATGCCAGACACTTAATACCACTTCTGATATTTCCGGGCGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
Unaligned ( gi|25 ): ATTATACATGCACAGAGTTTCAAGTCTATTAGTGTCCACAAGCAAATTTACATCCACACCCGGGCCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|29 ): AGTTATGGTGGATGGTAACGCTGTGGATGTAAATTAAGCTTGCTGGGACACTTATTATATTAGACTTGAAAACTCTTGCATGGCATAATGCAATGTTGCATTTACAATCTCAAATTGTTT
Unaligned ( gi|30 ): GCTCTCCTTACACAGAGTTGTCGGTCCTTATCTTCCCTTAACAAAAGACGAAACTCATGTAGCTATTGAGTGGATCTCAGTGAGGCCGGCGTGTGGATCGTAAATTAGCGGTGGACAG
Unaligned ( gi|33 ): GGAACAGTGGATTTTGATCTTCTGAAGAAAATGTATATATATGTACTGGGATCAGTAGTCCAGTCAAACAGGGTACTGCACTACTTTGGCACTTTTCAATAATC
Unaligned ( gi|35 ): ACTATGCTGCCCAGAGTTTTGGATCTATTAGGCCTATAACGATGTCCTAAGCTAATTAACATTCCACACCTGCCTCACTTAATCCACTCATA
Unaligned ( gi|38 ): AATTTACATCCACACCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCCT
Unaligned ( gi|42 ): CGGCCTCACTTAGATCCACCATAGCTACATGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|44 ): TCACCCTGATCACACATCATAAGCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTC
Unaligned ( gi|45 ): TAGTGTCCACAAGCTATTTACATCCACACGTTACCGGGCTCACTTAGA
Unaligned ( gi|47 ): ATATACTATTCTAACATAGTTGTACAAGTTGCAC
Unaligned ( gi|48 ): CTACCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCC
Alignments
lowQualScore : 1111 1 22222222222222222 111 1 1111111111 777777777777 2222 11111 333333333333 11111 111111111111111 1111111 2222222222222222 111111111 222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111 111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 888 5 5 5 66666666666666666 5 4 222 55 3 77 2 2 2 6666 2 2 666 333 2 2 3333333333 888888888 2 55555 2 2 2 2 66 2 2 2 2 555555555555 777777 55 777 2 3333 2 2 2 00000 33 2 000000000000 4444 33 444 33 4 2 88888 33 4444 2 55555 6666 999999999999999 2 22 6666666 1 555 66666 1 3333333333333333 666666666 3333 333333333 1 4444 999999 1 1 99999999999 44 1 3 3 55 1 1 6 222 1 33 777777777 1 444 1 3 1 1 22 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 222 3 44 3 66 1 1 66666 3 1 222 33333 1 3 1 1 3 1 22 44 1 6666666666666666666666 22 888888888888888888888888888 2 99999 55 2 33
lowQualScore : .... ... . . . ................. . . ... .. . .. . . . .... . . ... ... . . .......... ......... . ..... . . . . .. . . . . ............ ...... .. ... . .... . . . ..... .. . ............ .... .. ... .. . . ..... .. .... . ..... .... ............... . .. ....... . ... ..... . ................ ......... .... ......... . .... ...... . . ........... .. . . . .. . . . ... . .. ......... . ... . . . . .. .................................................... . . ... . .. . .. . . ..... . . ... ..... . . . . . . .. .. . ...................... .. ........................... . ..... .. . ..
lowQualScore : 1111 666 6 0 0 00000000000000000 0 4 777 55 6 99 3 9 9 7777 4 2 111 777 1 1 4444444444 000000000 0 00000 0 0 0 0 88 0 0 0 0 777777777777 222222 66 888 4 4444 4 4 4 99999 11 2 555555555555 7777 22 111 22 7 4 22222 22 7777 2 00000 9999 000000000000000 1 99 4444444 7 222 77777 9 8888888888888888 777777777 9999 000000000 9 0000 555555 9 9 00000000000 66 7 3 3 44 6 6 4 888 6 77 111111111 5 666 5 0 5 5 00 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 6 888 3 33 3 22 6 6 00000 1 6 666 77777 5 1 5 5 1 6 33 00 7 1111111111111111111111 55 555555555555555555555555555 1 44444 33 7 77
consensus : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGA--ATT-GA-AT---TGAAC-A-CTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GT---AC---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TGTATT---T------ATT------AA--T---CCCT-TCATTG-TG-CA-T-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT-A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-TT------------T-AA--C-------ACAG---TTG-----TAC-A----------------AG---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CTA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
Reference ( family-35 ) : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTTTAATAGCT-TG-TGA--ATT-GA-AT---TGAAC-A-CTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GT---AC---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TGTAT-----------ATT------AA--T---CCCT-TCATTG-TGGCA-T-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT-A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-NT------------T-AA--C-------ACNG---TTG-----TAC-A----------------AG---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CTA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|1 : GTATAAAAAGGGGG----TTAGAT-G-CAGTTTA-TAGCT-TG-TGA--AA--GA-A-------ACGA-CTA--TT--GGAGTA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC----G-A-GT---A----T-G-A----------TG---------TCCTA-----CA-T--C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-AATGTATTTGCTTGA---ATT------AA--T---CCCT-TCATTG---GCAAT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACCGAAT---TT---GGG----CCGC---CTGATTC--GGT-A-C-----T--AA----T-ATACAG-TA---AT-GTCCATGGG-----T-AA--TTAGGGGAACAG---TTGTTTTTTGC-------------------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA---------T------------------------------------A-----T------------A----T-------------------------------T-TGACA---CAAA-AT-CA-AAA-AA-TAAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-TTT-C-C-T-TTTAAAGTATG--TTG-TA--AAT-AC----------------------GAC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAAAGGCT-A--TACT
gi|10 : cttctcttacacaagttgtcggtccttatctgtgcaagagaatgtacttgtagtttaaatggtggacctattagtgtgaggctgggtgtggatgtgtaaattagcttgtggacacttatagattgaactctgtgatgtattaatgcaatattgctattacaggatatgagattctgcatattgtcaggagcagtggaatgccatttatatttctacaaggtccggggtggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggagggT-TTT-AAAC----G-A-GT---ACAGTT-G-AC---------TG---------T--TAATCACCG-T-A----AAAA--TGGAC-G-ACA-TGTATTTGCTCAAGA-ATT------AA--T---CCCT-TCATTGATGCCA-T-TGTTCTTGA-----CTTG--GT------CC-AAT----T---GGA----A--C---CTGATTC--GGT-A-ATCTATT--AA----TTAC-----TTAAAAT-TT------------C-AA--TTTGTGT-ACAAA--TTG-----TAC-ATTTATATAGGGAAC--AG---------T----TTGTTTTGTTCT-G----TGAA------GAA-AA--G-----------T--A-TGTTACTTGA-AG-A-TA-G-G---------T-CTGT----GCG-TTT----G-T-A-A-GG--A-----T------------A----TGATACTA---------------------TT-TATGACA---C-AA-TG-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAA--GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAAATT-TG--TTGCTA--AAt
gi|11 : -TTT-TTT-TAAC--C-G-A-GT---AC---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TGTA------------ATT------TA--T---CCCT-TCATTG-TG-CA-T-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT----T---GG-----C--C---CTGATTC--GGT-A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-TT------------T-AA--C-------A--G---TTG-----TAC-A----------------AG---------T----TGCACAG----T-G----TTAATCTA--GGG-AA-C---------------A-CGT-TTTT---A--A-TA-T-G---G-TA-CT-CT------GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CTA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-CGAAAA-AA-AGAAA-----TAAAG-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTTAA-----AAAAA--GTT-A--TAac
gi|12 : ttaat---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-A--T-AAAA--TTGAC-G-A-C-TGTATTAAATCGAAGAATT------AC--T---CTTT-TCATTG-TG-CA-T-TGT-CTTTA-----CTTG--------------------------G----C--C---CTGATTC--GGT-A-A-----T--AT----T-AC-----T----AT-TT------------T-AA--C-------ACAG---TTG-----TAC-A----------------AGAGGCTTTAAT----CA---------T-G----TTAATATAGGGAACAG-TGGTTTTTGATCTT--G-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-GTACG-TA-CT--G-T----GCGTTTTT---A-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----TT----------------------TT-T-TGGCA---C--A-TT-C--AAA-AA-TGAAA-----ATAAA-GACTACAA---T-----T---AC-CTT-CAT-TCTTTAAAGT-TGNNNNNNNN--NNN-NN----------------------NNN--NNNN--------N------------------NNNN-T-----AAAAA--ACatt
gi|13 : t-TCATTG-TG-CA-T-TGG-TCTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAC----T---GGG----C--C---CTGATTC--GGT-A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-TC------------T-AC--C-------ACAA---TTG-----TAC-A----------------AG---------acata
gi|13 : agtactagatca---------T----CT---------T-C----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACCTGG-AATA-TA-A-G---G-TA-CT--G-T----GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CAA---------------------TT-T-T-ACA---aggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgatcttctgaagaaaatgtatgtacctggaatataaggtactgtgcgttttgtaaggatatcaattttacattacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : agtactagatcatcattgtgcattggtcttacttgtttatgaccaactgggccctgattcggtaataatactattctaccacaattgtacaagaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgaTG--TTT-ATGACC-AAT----T---GGG----C--C---CCGATTC--GGT-C-A-----TTAAAGTTGT-ACAAAA-T----AT-AG------------GGAA--CGGGAA--ACGG---TTG-----TTTTG----------------GG---------T----CT---------TTG----TAAA------GAA-AA--G-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-AT-C--T----GAG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-------------------------------------------------------------------AA-ATCC--CAA-AA-TG-AA-----TAAAAGGA-GAT-A---T-----T-C-AA-CTTCCAC-TCTTTAAAGT-TT--TTTGTA--AGG-Attacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : A-CT-CT-TTAAAGTT-TTTT---G-T-A-A-GG--A-------------------------------------------------------------A---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAA--GA-GATAA---T-----TTC-AATCTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTATTAAG-AC----------------------GGC--AGGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTacaaatcaaaaatgaaataaagagataatttcaatcttcactctttaaagttgttgctattaagacggcaggcttttttaaaaagctatacttgt
gi|15 : tgtttatgaccaattgggccccgattcggtcattaaagttgtacaaaatatagggaacgggaaacggttgttttgggtctttgtaaagaaaagtatgtacttggaatagggtaatctgagttttgtaaggaaaatcccaaaatgaataaaaggagatattcaacttccA--T---CCCT-TCATTG--GGCA-T-TGT-CTTTA-----CTGG--TTT-ATGACC-A----ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GAT-ATT-----T--AA----T-AC-----T----GT-TC------------T-AAAGC-------AAAGGGTTTGT----TTT-A----------------TG---------T----C----------T-A----TG-G------GTA-AA-TA-----------T--A--G------GG-A--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-G-TCTT---G-T-G-A-AG--A-----tgt
gi|15 : G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------C--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCG-TTTT---G-T-TTA-GG--A-----T------------A----T----------------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC---------------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TTCTaaatgcatgtacttggaatagggtactctgcgttttgtttaggatatttttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggcaagctttttaaaaagctattctt
gi|16 : atcccttcattgggcattgtctttactggtttatgaccaattgggccctgattcgatatttaatactgttctaaagcaaagggtttgttttatgtctatgggtaaatatagggaacagtggtttttgAAC--T-G-A-GT---AC---T-G-A-----------G---------TC-GA-----CA-T-AC-T-AAAAA-TTGAC-G-A-A-TGTAT-----------ACTCGAAAGAA--TTACCCCT-TCATTG-TG-CG-TGTGT-CTCTA-----CTTG--TTT-ATGACC-A-----TT---GGG----C--C---AGGATTT--TCT-A-A-----A--AA----T-AC-----T----GT-TC------------T-AA--C-------ACAG---TTG-----TAC-A----------------AG---------------T---------T-G----CACA------G------TG-----------TTAA-TAT-A--TGG-A--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-A-TCTT---G-TGA-A-GA--A-----A------------A----T----GTA---------------------Tt
gi|16 : a---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-CA-CT--G-T----GCC-TTTT---G-T-A-A-GT--A-----T------------A----C----CAA---------------------TT-T-TGGTA---C-AT-TT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-gtacttggaatagggcactgtgccttttgtaagtataccaattttggtacatttcaaaaatgaaataaaa
gi|17 : aaactgagtactgagtcgacatactaaaaattgacgaatgtatactcgaaagaattaccccttcattgtgcgtgtgtctctacttgtttatgaccattgggccaggattttctaaaaatactgttctaacacagttgtacaagttgcacagtgttaatatatggaacagtggtttttgaTAATAGCT-TT-TGA--ATT-GA-ACA--TAAAT-A-AAA--GT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GT---AC---T-G-A----------TG---------TT-TA-----CA-T-AC---AAAA--TTGAC-G-A-A-TGTA------------ATT------AA--T----CCT-TCATTG-T-GCA---TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-------TT----GG----C--C---CTGATTC--GG--A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-TT------------T-AA--C-------ACAG---TTG-----TAC-A----------------AG---------T----
gi|18 : TTG-TG-CA-T-TGT-CTTTATATA-CTTG--TTT-ATGACC-AATTCAT----GGG----T--C---CTGATTC--GGT-A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-TC------------T-AA--C-------ACAG---TTG-----TAC-A----------------AG---------------T---------T-G----CACA------G------TG-----------TTAA-TAT-A--GGG-G--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-G-TCTT---G-T-G-A-AG--AAAATGT------------A----T----GTACTTGGAATAGGGTACTGTGCGTT-T-TGGAAGGAC-AA-TT-C--AAA-AA-TGATA-----TAAAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAgcaagtaattatttttgcgcccgttgtttagtaacataagcttaagttaggtattttaaaaaaaaccaatagaata
gi|19 : ------------T-AA--C-------ACAG---TTG-----TAC-A----------------AG---------T----
gi|19 : aG---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------AATTAT----ATA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-A--tgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttggtcttgtgaagaaaatgtatgtatttggaatagggtactctgcgttttgtaaggataattatatattttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaaggcggcaagctttttaaaaaagcta
gi|2 : ataacacagttgtacaagttgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttgGTCTAAAAGGGGGT----GTAGAT---CAATT-AATAGCG-TG-TGA--ATT-AACATAAATAAAA-A-------T--CGGA-A-GCCTTA--A-TTT-TTTTGAAC--C-G-A-GTA--AT---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC---AAAA--TGTAC-G-A-A-TGTA------------ATT------AA--T---CCCT-TCATTG-T-GCA-T-TGT-C-TTA-----CTTGTTTTT-ATGACC--AT--ATT---GGG----C--C---CT-ATTC--CGT-A-AT----T--AA----T-AC-----T----ATATT------------T-AA--A-------AAGT---TTG-----TAC-A----------------A
gi|2 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggt-------ACAG---TTG-----TTT-G-----------------G---------T----CT---------T-G----TGA-------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGGAA--A-TA---G---G-TA-CT-C--T----GCT-TTTT---G-TAA-A-GG--A-----T------------A----T----CTA---------------------TT-T-TGACA---C-AACAT-C--AAG-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CACTTCTTTAAAGT-TG---TGCT-------AC----------------------TGT--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTagttggcatagtgttaatatagggaacagttgtttggtcttgtgagaaaatgtatgtatttggaaataggtactctgctttttgtaaaggatatctattttgacacaacatcaagaatgaaataaaagagataattcaacttcacttctttaaagttgtgctactgtaagcttttttaaaaagctatactt
gi|20 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggtgtctaaaagggggtgtagatcaattaatagcgtgtgaattaacataaataaaaatcggaagccttaatttttttgaaccgagtaattgatgtctacatacaaaatgtacgaatgtaattaatcccttcattgtgcattgtcttacttgtttttatgaccatattgggccctattccgtaattaatactatatttaaaaagtttgtacaaagttggcatagtgttaatataggga-------ACAG---TTG-----TTT-T----------------GG---------T----CT---------T-G----TGAG------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----ATA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGGAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AC-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGCT-------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GTT-A--TACTt
gi|21 : taacacagctgtacaagttgcacagtgttaatatggggaGTCTAAAAGGGGGGGGGATTAGCT-GCCATTTAAATAGCT-TGTTGA--A----A-AT---TTAAC-A-CTTAATT--CGG-TAGGCCTTTTAA-TTTATTT-GAACAACGG-A-GT---AC---T-G-ATACAAATGGTTA---------TC-TA-----CA-T-ACTT-AAAA--TTGAC-GAA-A-TGTAt
gi|23 : gacagggttggatcccattttattttcttttttcaagttaagggtgagg-G----TTAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGG-A--A-AA-G-G---G-TA-CT-CT------GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----ATA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-A--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GAC--AAGC--------A------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|24 : --A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCG-TTTG---G-T-A-G-GG--A-----T------------A----T----CTA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-TTAAAAAAAAA--GCT-A--TACT
gi|26 : cGTCTAAAATAGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TAA------GA------TGAAC-A-CTT--AT--CGGATA-GCCTCT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GT---AC---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TGTAT-----------t
gi|27 : gggagggggag--A-TA-G-G---G-TA-CT-GT------ACG-TTTT---G-A-A-A-AG--A-----T------------A----T----ATA---------------------TT-T-TGGCA---C-AT-TT-C--AAG-AA-TGAAA-----TAAAA-TA-G-TAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AA----------------------GTT--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAAT-GCT-A--TACTttgctcgaa
gi|28 : TAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-tgt
gi|3 : tcccgtacatgagaagactggatgattagggtattgaaaaatttcaaatatcggttttcgtacatttcaataatGATA-GCCTTTT-A-ATT-TTT-GAAC--C-G-A-GT----C---T-G-A----------T-----------C-TA-----AT-T-AC-T-TAAA--CTGAC-G-A-C-TGTATTTGCCGAGA--ATT------AAA-T---CACT-TCATTG-TG-CA-T-T----CCTA-----CTTG--TTTCATGGCC-AAT--ATT---GAGGTTTC--CTAGCTGATTCTAGGTCA-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-GT------------T-AA--C-------ACTC---TGA-----TAC-A----------------A
gi|3 : --A-TGT-ACTTGG-AT-ACTG-GAG---G-TAGCT-CT-A----GC--TTTT---GAT-A-A-GG--A-----T-----------------T----CT----------------------TT-T-TGACA---C-AA--T-C--AAA-AACTGAAAAA---TAAAAAGT-GATAA---T-----T-C-AA-C-T-CACTTTTTTGAAGT-TG---TGCTT--AAA-AC----------------------GGC--AAGCTTTTCTTTT------------------TTTT-T-----AAAAA--Gaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaatgtacttggatactggaggtagctctagcttttgataaggattctttttgacacaatcaaaaactgaaaaataaaaagtgataattcaactcacttttttgaagttgtgcttaaaacggcaagcttttctttttttttaaaaagagcta
gi|31 : gatagccttttaatttttgaaccgagtctgatctaattacttaaactgacgactgtatttgccgagaattaaatcacttcattgtgcattcctacttgtttcatggccaatattgaggtttcctagctgattctaggtcaataatactatgttaacactctgatacaaaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaAA-AA-TGAAA------AAAA-GA-GATAAATTTCAACAT-C-AA-CTT-CAC-GCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-ACAAAGTTGTTGCTATTAAAAGATGGT--AAGC--------T------------------TTTT-TAAA--AAAAA--GCT-A--TACTagcta
gi|32 : --A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-GT------GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----ATA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAGATT-Ttgt
gi|34 : A--T---CCCT-TCATTG-TG-CA-T-TGT-CTTTA-----CTTG--T-------CC-A----ATT---GGG----aaaaagct
gi|36 : T--TGGATA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GT---AC---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--CTGAC-G-A-C-TGTATTTGCTCGAAGAATT------AA--T---CCCT-TCATannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggaaaagcaaaagagtcttgttgatgtc
gi|37 : taTT--A-ATT-TTT-AAAC--T-G-A-GT---AC---T-GTA----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-TCAAAA--TTGAC-T-A-A-TGTATTGCAT------ATT------AA--
gi|39 : A-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CG---------AAT-TC--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-AATTACTctttgaagaatta
gi|4 : GTCCAGAAGG---T----TTAGATAG-CATTTTAATAACTATG-TGAAGATT-GA-AT---TG-AC-A-CTT--TTTACGGATA-ACCTTT--A-ATT-TTT-TAAT--C-A-A-GTATCAT---C-G-A----------TG---------TC-TC-----CA-TAAC-T-AAAAATTTGAC-G-A-A-T-TA------------ATT------AAAGTTA-CCCTATCATTGTTAACA-T-TGT-CATTA-----C----------------------------AG----C--T-------TTC--GGTAA-A-----A--AA----T-AC-----C----AT-AT------------T-AA--C-------ACAT---TTA---------A----------------AA---------T----CT---------T-G----TGAA------G-A-AA-TG--------------A-TGT-ACTTGA-A--A-TAGG-G---G-TG-CTACT-------CG-TTTTGA-G-T-A-ACGGAAA-----TAAAAGTGGCATAA----T----CTA---------------------AT-T-TG-CA---CGAA-ATACGGAAA-AA-TGACA-----TAAAA-AA-GATAA---T-----C-CAAA-CTT-CAC-TCTTTAAAG--TG--TTGCTAC-AAGAAC----------------------GGT---AGC--------T------------------TTtg
gi|40 : cccaaaagG-TTTT---G-T-A-A-GG--A------------------G----T----CTA---------------------TT-T-TGGCA---T-AT--T-C--CAA-AA-TGAAG-----AAAAA-AT-GATAA---T-----actt
gi|41 : AA---T-----T-C-AT-CTG--AC-TCTTTAAAGT-TT--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------T------------------agagattgatcaaac
gi|43 : AAC--C-G-A-GT---AC---T-G-A----------TACAAAATGTATC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TGTAT-----------atacttgtccatcaaagat
gi|46 : -GT---AC---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TGTAT-----------t
gi|47 : A----T-AC-----T----AT-TC------------T-AA--C-------ATAG---TTG-----TAC-A----------------AG---------T----ttgctcgaag
gi|5 : atGTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CAT---GATAACT-TG-TGA--ATTTGA-AT---TGAAC-A-CTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--A-G-A-GT---AC---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--ATGAC-G-A-A-TGTA------------ATT------AA--T---CCCT-TCATTG-TGGCA-T-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---ATGATTC--GGT-A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-AT------------T-AA--C-------ACTG---TTG-----TAC-A----------------AG---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TG-TT-CT-T----GCG-TTTT---G-T-G-A-GG--A-----T------------A----T----CTA---------------------TT-T-TGACA---C-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA------AAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTACTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTtgcac
gi|6 : G---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-AGTATTAAATCGAAGAATT------AC--T---CTCT-TCATTG-TG-CA-T-TGC-CAATA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAC----T---GGG----C--C---CTGATCC--GGT-A-A-----T--AA----T-ACTATTAT----AT-TC------------T-AA--C-------ACAG---TTG-----AAC-T----------------AG---------
gi|6 : g---------T-A----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTGGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CTGC-------ACG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----CTA---------------------TT-T-TGGCA---C-AT-TT-C--AAA-AA-TGAAACATGATAAAA-GA-GATAA---T-----G-A-AA-CCG-CTC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------TTTTTAATTTATTTTTTCTTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattatatgaagaaaatgtatgtactgggaatagggtactgcacgttttgtaaggatatctattttggcacatttcaaaaatgaaacatgataaaagagataatgaaaccgctctctttaaagttgttgctaaagacggtaaactttttaatttattttttcttttttaaaaagctatacttgt
gi|7 : ggtctacatactaaaattgacgaaagtattaaatcgaagaattactctcttcattgtgcattgccaatacttgtttatgaccaactgggccctgatccggtaataatactattatattctaacacagttgaactagaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattaC--T-G-A-GT---AC---T-G-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AC-T-AATA--TTGAC-G-A-A-TGTATTAACTCGAAGAATT------AC--T---CCCT-TCATTG-CA-CA-T-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AA---AT----AGG----C--T---CTGATTC--GGT-A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-TC------------T-AA--C-------ACAG---TTG-----TAC-A----------------AG---------tgt
gi|7 : ---------T----CT---------T-G----TAAA------GAG-AC-TG-----------T--A-TGT-ATCTGG-A--A-AA-G-G---G-TA-CT-GT------GCG-TTTT---G-T-A-A-GG--A-----T------------A----T----TCA---------------------TT-T-TGACA---A-AT-TT-C--AGC-AA-TGAAA-----TAAAA-TA-GATA----T-----T-C-AA-AAT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------C------------------TTTT-T-----AAAAA--GCTAA--TACaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgatcttgtaaagagactgtatgtatctggaaaagggtactgtgcgttttgtaaggatattcattttgacaaatttcagcaatgaaataaaatagatattcaaaatcactctttaaagttgttgctaaagacggtaagcctttttaaaaagctaatac
gi|8 : ctgagtactgatgtctacatactaatattgacgaatgtattaactcgaagaattactcccttcattgcacattgtctttacttgtttatgaccaaataggctctgattcggtaataatactattctaacacagttgtacaagaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgaGGGGT----TCAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-T------T-GA-AT----GAAC-AACTT--AT--CGGAGA-GCCTTA--A-TTT-TTT-GAAC--C-GCACGT---AC---T-G-AC---------TG---------TC-TA-----CACT-AC-T-AAAA--TTGACGG-A-A-TG-AT-----------ATT------
gi|8 : a----CT---------T-G-----GAA------GAA-AAATG-----------T--A-TGTTATTTGG-A--A-TC-G-G-----TATCT-CT------GCC-TTTT-------A-A-GG--A-----T------------A----TA---TTA---------------------TTGT-TGACA---C-AA-AT-C--AAATAA-TGAAA-----TAAAA-GA-GAT-A---T-----T-CAAA-CTT-CAC-TATTTAAGGT-TG--TTGCT---AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------CTtgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggcttggaagaaaaatgtatgttatttggaatcggtatctctgccttttaaggatatattattgttgacacaaatcaaataatgaaataaaagagatattcaaacttcactatttaaggttgttgctaagacggcaagctctgctata
gi|9 : aggggttcagatgcatttaatagcttgttgaatgaacaacttatcggagagccttaattttttgaaccgcacgtactgactgtctacactactaaaattgacggaatgatatttgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttgg-CTTA-TT--CGAATA-GCCTTT--AATTG-TTT-GAAC--T-A-A-TA---AC---TAG-A----------TG---------TC-TA-----CA-T-AT-T-AAAA--TTGGC-A-A-A-TG--------------------------------------ATTG-TG-CA-T-TGT-CTTTATAGTACTTG--TTT-ATGACC-AG---ATTCATGGG----T--C---CTGGATT--GGT-A-A-----T--AA----T-AC-----T----AT-CTCTAACACAGTTGT-AA--C-------ACAG---TTG-----CAC-AGTGTTAATATAGGGACAG---------TGGTTTT---------T-GGTTTTGAA------GAA-AA-TG-----------T--ACTGT-ACTTGGGA--A-TA-G-G---GATA-CT--G-T----GCG-TTTTGGCG-C-A-A-GG--A-----C--------------------------------------------------------------A-AT-C--AAA-AA-TGATA-----T-AAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA--TT-CAC-TCTTTAACGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAAAG------------------------------TT-T-----AAAAA--gctata
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATGAACTATATTGATGGATTGATGGTGGTAAAAATAAGCTTGATACAAAAACATGAAAGTTTGTTTTATATGGTAGCAGGGGATGCTTAATGCCAGACACTTAATACCACTTCTGATATTTCCGGGCGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
Unaligned ( gi|25 ): ATTATACATGCACAGAGTTTCAAGTCTATTAGTGTCCACAAGCAAATTTACATCCACACCCGGGCCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|29 ): AGTTATGGTGGATGGTAACGCTGTGGATGTAAATTAAGCTTGCTGGGACACTTATTATATTAGACTTGAAAACTCTTGCATGGCATAATGCAATGTTGCATTTACAATCTCAAATTGTTT
Unaligned ( gi|30 ): GCTCTCCTTACACAGAGTTGTCGGTCCTTATCTTCCCTTAACAAAAGACGAAACTCATGTAGCTATTGAGTGGATCTCAGTGAGGCCGGCGTGTGGATCGTAAATTAGCGGTGGACAG
Unaligned ( gi|33 ): GGAACAGTGGATTTTGATCTTCTGAAGAAAATGTATATATATGTACTGGGATCAGTAGTCCAGTCAAACAGGGTACTGCACTACTTTGGCACTTTTCAATAATC
Unaligned ( gi|35 ): ACTATGCTGCCCAGAGTTTTGGATCTATTAGGCCTATAACGATGTCCTAAGCTAATTAACATTCCACACCTGCCTCACTTAATCCACTCATA
Unaligned ( gi|38 ): AATTTACATCCACACCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCCT
Unaligned ( gi|42 ): CGGCCTCACTTAGATCCACCATAGCTACATGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|44 ): TCACCCTGATCACACATCATAAGCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTC
Unaligned ( gi|45 ): TAGTGTCCACAAGCTATTTACATCCACACGTTACCGGGCTCACTTAGA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCC
Alignments
lowQualScore : 1111 1 22222222222222 1 111 1 1111111111 77777777777777777 11111 333333333333 11111111111111111 1111111111111111111 1111111111111111 22222222222222222222222222 111111111 222222222 11111111111111111111111 1111111111111111111111 111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 888 0 5 5 88888888888888 0 0 222 55 3 77 2 2 2 6666 2 2 2 333 555 2 3333333333 888888888 2 55555 2 2 2 2 66 2 2 2 2 2 33333333333333333 444 2 2 2 2 33 2 4 2 2 00000 33 2 000000000000 4444 33 444 33 888 2 2 99999 33 4444 2 00000000000000000 4444 666666 8888888888888888888 1111111111111111 777 44444 66666 44444 1 88888888888888888888888888 666666666 3333 333333333 1 4444 999999 1 1 99999999999 22 1 3 3 55 1 1 4 222 1 3 999999999 666 1 3 1 1 22 44444444444444444444444 0 1 1 3 55 3 66 1 1 66666 3 1 222 33333 1 3 1 1 3 1 22 44 1 6666666666666666666666 22 888888888888888888888888888 2 99999 55 2 33
lowQualScore : .... ... . . . .............. . . ... .. . .. . . . .... . . . ... ... . .......... ......... . ..... . . . . .. . . . . . ................. ... . . . . .. . . . . ..... .. . ............ .... .. ... .. ... . . ..... .. .... . ................. .... ...... ................... ................ ... ..... ..... ..... . .......................... ......... .... ......... . .... ...... . . ........... .. . . . .. . . . ... . . ......... ... . . . . .. ....................... . . . . .. . .. . . ..... . . ... ..... . . . . . . .. .. . ...................... .. ........................... . ..... .. . ..
lowQualScore : 1111 666 0 0 0 66666666666666 2 0 777 55 6 99 3 9 9 7777 4 2 2 777 888 1 4444444444 000000000 0 00000 0 0 0 0 88 0 0 0 0 0 55555555555555555 777 7 4 4 4 22 4 7 4 4 99999 11 2 555555555555 7777 22 111 22 888 4 4 11111 11 7777 2 88888888888888888 7777 444444 2222222222222222222 5555555555555555 111 88888 77777 88888 9 66666666666666666666666666 777777777 9999 000000000 9 0000 555555 9 9 00000000000 33 7 3 3 44 6 6 8 888 6 1 333333333 111 5 0 5 5 00 77777777777777777777777 3 6 6 3 33 3 22 6 6 00000 1 6 666 77777 5 1 5 5 1 6 33 00 7 1111111111111111111111 55 555555555555555555555555555 1 44444 33 7 77
consensus : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T----GA---A---TT-AATCCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
Reference ( family-35 ) : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T---------A---TT-AATCCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|1 : GTATAAAAAGGGGG----TTAGAT-G-CAGTT-TATAGCT-TG-TGAA--A--GA-A-------ACGACTA--TT--GGAGTA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC----G-A-GTA-----T---G-A----------TG---------TCCTA-----CA-T--C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-AATG-TAT--T---TGCTTGA---A---TT-AATCCCT-TCATTG----G-CAAT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACCGAAT---TT---GGG----CCGC---CTGATTC--GGT---A-C-T-----A--A----T-ATACAGTAATGTC-----C----A------TGGGTAAT------------TAGGG---G--A------ACAG---T-----TGTTTTTTG-----C----------------------------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA---------T-----------------------------------AT------------A----T----------T-TGACACAAA-AT-CA-AAA-AA-TAAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-TTT-C-C-T-TTTAAAGTATG--TTG-TA--AAT-AC----------------------GAC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAAAGGCT-A--TACT
gi|10 : cttctcttacacaagttgtcggtccttatctgtgcaagagaatgtacttgtagtttaaatggtggacctattagtgtgaggctgggtgtggatgtgtaaattagcttgtggacacttatagattgaactctgtgatgtattaatgcaatattgctattacaggatatgagattctgcatattgtcaggagcagtggaatgccatttatatttctacaaggtccggggtggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggagggT-TTT-AAAC----G-A-GTA-CAGTT---G-AC---------TG---------T--TAATCACCG-TA-----AAAA--TGGAC-G-ACA-TG-TAT--T---TGCTCAAGA-A---TT-AATCCCT-TCATTGAT--G-CCAT-TGTTCTTGA-----CTTG--GT------CC-AAT----T---GGA----A--C---CTGATTC--GGT---A-A-TCTATTA--A----TTA-----------C-----TTAAAA------T---T--T------------CA------A--TTTGTGTACAAA--T-----TG-----TA-----C-ATTTATATAGGGAAC--A---------G---------T----TTGTTTTGTTCT-G----TGAA------GAA-AA--G-----------T--A-TGTTACTTGA-AG-A-TA-G-G---------T-CTGT----GCGTTT----G-T-A-A-GG--AT------------A----TGATACTATT-TATGACAC-AA-TG-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAA--GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAAATT-TG--TTGCTA--AAt
gi|11 : -TTT-TTT-TAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TA-----------------A---TT-TATCCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT----T---GG-----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------A--G---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----TGCACAG----T-G----TTAATCTA--GGG-AA-C---------------A-CGT-TTTT---A--A-TA-T-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-CGAAAA-AA-AGAAA-----TAAAG-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTTAA-----AAAAA--GTT-A--TAac
gi|12 : ttaat---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA---T-AAAA--TTGAC-G-A-C-TG-TAT--TAAATCGAAGA---A---TT-ACTCTTT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--------------------------G----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--T----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------GAGGCTTTAAT----CA---------T-G----TTAATATAGGGAACAG-TGGTTTTTGATCTT--G-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-GTACG-TA-CT-GT------GCGTTTTT--A-T-A-A-GG--AT------------A----T----TT-TT-T-TGGCAC-AT--T-C--AAA-AA-TGAAA-----ATAAA-GACTACAA---T-----T---AC-CTT-CAT-TCTTTAAAGT-TGNNNNNNNN--NNN-NN----------------------NNN--NNNN--------N------------------NNNN-T-----AAAAA--ACatt
gi|13 : t-TCATTG-T--G-C-AT-TGG-TCTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAC----T---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------C--C------ACAA---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------acata
gi|13 : agtactagatca---------T----CT---------T-C----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACCTGG-AATA-TA-A-G---G-TA-CT--G-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CAATT-T-T-ACAaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgatcttctgaagaaaatgtatgtacctggaatataaggtactgtgcgttttgtaaggatatcaattttacattacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : agtactagatcatcattgtgcattggtcttacttgtttatgaccaactgggccctgattcggtaataatactattctaccacaattgtacaagaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgaTG--TTT-ATGACC-AAT----T---GGG----C--C---CCGATTC--GGT---C-A-TTA---A--AGTTGT-A-----------CAAAA-T----A------TA--G--G------------GA------A--CGGGAA-ACGG---T-----TG-----TT-----TTG----------------G---------G---------T----CT---------TTG----TAAA------GAA-AA--G-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-AT-C--T----GAGTTTT---G-T-A-A-GG--A--------------------------------------AA-ATCC--CAA-AA-TG-AA-----TAAAAGGA-GAT-A---T-----T-C-AA-CTTCCAC-TCTTTAAAGT-TT--TTTGTA--AGG-Attacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : A-CT-CT-TTAAAGTTTTTT---G-T-A-A-GG--A-----------------------------------AC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAA--GA-GATAA---T-----TTC-AATCTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTATTAAG-AC----------------------GGC--AGGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTacaaatcaaaaatgaaataaagagataatttcaatcttcactctttaaagttgttgctattaagacggcaggcttttttaaaaagctatacttgt
gi|15 : tgtttatgaccaattgggccccgattcggtcattaaagttgtacaaaatatagggaacgggaaacggttgttttgggtctttgtaaagaaaagtatgtacttggaatagggtaatctgagttttgtaaggaaaatcccaaaatgaataaaaggagatattcaacttccATCCCT-TCATTG-G--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTGG--TTT-ATGACC-A----ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GAT---ATT-T-----A--A----T-A-----------C-----T----G------T---T--C------------TA------AAGC------AAAGGGTT-----TGT----TT-----T-A----------------T---------G---------T----C----------T-A----TG-G------GTA-AA-TA-----------T--A--G------GG-A--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-GTCTT---G-T-G-A-AG--Atgt
gi|15 : ---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------C--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-TTA-GG--AT------------A----T-------TT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC---------------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TTCTaaatgcatgtacttggaatagggtactctgcgttttgtttaggatatttttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggcaagctttttaaaaagctattctt
gi|16 : atcccttcattgggcattgtctttactggtttatgaccaattgggccctgattcgatatttaatactgttctaaagcaaagggtttgttttatgtctatgggtaaatatagggaacagtggtttttgAAC--T-G-A-GTA-C---T---G-A-----------G---------TC-GA-----CA-TA-C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-A-TG-TATACT---CGAAAGA---A---TT-A-CCCCT-TCATTG-T--G-C-GTGTGT-CTCTA-----CTTG--TTT-ATGACC-A-----TT---GGG----C--C---AGGATTT--TCT---A-A-A-----A--A----T-A-----------C-----T----G------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------------T---------T-G----CACA------G------TG-----------TTAA-TAT-A--TGG-A--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-ATCTT---G-TGA-A-GA--AA------------A----T----GTATt
gi|16 : a---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-CA-CT--G-T----GCCTTTT---G-T-A-A-GT--AT------------A----C----CAATT-T-TGGTAC-AT-TT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-gtacttggaatagggcactgtgccttttgtaagtataccaattttggtacatttcaaaaatgaaataaaa
gi|17 : aaactgagtactgagtcgacatactaaaaattgacgaatgtatactcgaaagaattaccccttcattgtgcgtgtgtctctacttgtttatgaccattgggccaggattttctaaaaatactgttctaacacagttgtacaagttgcacagtgttaatatatggaacagtggtttttgaT-AATAGCT-TT-TGAA--TT-GA-ACA--TAAAT-AAAA--GT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TT-TA-----CA-TA-C---AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TA-----------------A---TT-AAT-CCT-TCATTG-T--G-C-A--TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-------TT----GG----C--C---CTGATTC--GG----A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----
gi|18 : TTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTATATA-CTTG--TTT-ATGACC-AATTCAT----GGG----T--C---CTGATTC--GGTAATA-A-T-----ACTA----T-T-----------C-----T----AACACAGT---T--G------------TACAAGTTG--C------ACAG---TGTTAATA-----TAGGGGAC-A----------------GTGGTTTTTGG---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT--G-T----GCGTTTT---G-G-A-A-GG--------------------------------------AC-AA-TT-C--AAA-AA-TGATA-----TAAAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAgcaagtaattatttttgcgcccgttgtttagtaacataagcttaagttaggtattttaaaaaaaaccaatagaata
gi|19 : ------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----
gi|19 : a---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------AATTAT----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-A--tgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttggtcttgtgaagaaaatgtatgtatttggaatagggtactctgcgttttgtaaggataattatatattttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaaggcggcaagctttttaaaaaagcta
gi|2 : ataacacagttgtacaagttgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttgGTCTAAAAGGGGGT----GTAGAT---CAATT-AATAGCG-TG-TGAA--TT-AACATAAATAAAA-A------T--CGGA-A-GCCTTA--A-TTT-TTTTGAAC--C-G-A-GTAAT---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C---AAAA--TGTAC-G-A-A-TG-TA-----------------A---TT-AATCCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-C-TTA-----CTTGTTTTT-ATGACC--AT--ATT---GGG----C--C---CT-ATTC--CGT---A-ATT-----A--A----T-A-----------C-----T----A------TA--T--T------------TA------A---------AAAGT--T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------
gi|2 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggt------ACAG---T-----TG-----TT-----T-G--------------------------G---------T----CT---------T-G----TGA-------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGGAA--A-TA---G---G-TA-CT-C--T----GCTTTTT---G-TAA-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AACAT-C--AAG-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CACTTCTTTAAAGT-TG---TGCT-------AC----------------------TGT--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTagttggcatagtgttaatatagggaacagttgtttggtcttgtgagaaaatgtatgtatttggaaataggtactctgctttttgtaaaggatatctattttgacacaacatcaagaatgaaataaaagagataattcaacttcacttctttaaagttgtgctactgtaagcttttttaaaaagctatactt
gi|20 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggtgtctaaaagggggtgtagatcaattaatagcgtgtgaattaacataaataaaaatcggaagccttaatttttttgaaccgagtaattgatgtctacatacaaaatgtacgaatgtaattaatcccttcattgtgcattgtcttacttgtttttatgaccatattgggccctattccgtaattaatactatatttaaaaagtttgtacaaagttggcatagtgttaatataggga------ACAG---T-----TG-----TT-----T-T----------------G---------G---------T----CT---------T-G----TGAG------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGGAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AC-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGCT-------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GTT-A--TACTt
gi|21 : taacacagctgtacaagttgcacagtgttaatatggggaGTCTAAAAGGGGGGGGGATTAGCT-GCCATTTAAATAGCT-TGTTGAA------A-AT---TTAAC-ACTTAATT--CGG-TAGGCCTTTTAA-TTTATTT-GAACAACGG-A-GTA-C---T---G-ATACAAATGGTTA---------TC-TA-----CA-TA-CTT-AAAA--TTGAC-GAA-A-TG-TAt
gi|23 : gacagggttggatcccattttattttcttttttcaagttaagggtgagg-G----TTAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGG-A--A-AA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-A--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GAC--AAGC--------A------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|24 : --A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTG---G-T-A-G-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-TTAAAAAAAAA--GCT-A--TACT
gi|26 : cGTCTAAAATAGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TAA------GA------TGAAC-ACTT--AT--CGGATA-GCCTCT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T---------t
gi|27 : gggagggggag--A-TA-G-G---G-TA-CT-GT------ACGTTTT---G-A-A-A-AG--AT------------A----T----ATATT-T-TGGCAC-AT-TT-C--AAG-AA-TGAAA-----TAAAA-TA-G-TAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AA----------------------GTT--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAAT-GCT-A--TACTgctcgaa
gi|28 : TAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-tgt
gi|3 : tcccgtacatgagaagactggatgattagggtattgaaaaatttcaaatatcggttttcgtacatttcaataatGATA-GCCTTTT-A-ATT-TTT-GAAC--C-G-A-GT--C---T---G-A---------------------TC-TA-----AT-TA-C-T-TAAA--CTGAC-G-A-C-TG-TAT--T---TGCCGAGA--A---TTAAATCACT-TCATTG-T--G-C-AT-T----CCTA-----CTTG--TTTCATGGCC-AAT--ATT---GAGGTTTC--CTAGCTGATTCTAGGTC--A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---G--T------------TA------A--C------ACTC---T-----GA-----TA-----C-A----------------A---------
gi|3 : --A-TGT-ACTTGG-AT-ACTG-GAG---G-TAGCT-CT-A----GC-TTTT---GAT-A-A-GG--AT-----------------T----CT-TT-T-TGACAC-AA--T-C--AAA-AACTGAAAAA---TAAAAAGT-GATAA---T-----T-C-AA-C-T-CACTTTTTTGAAGT-TG---TGCTT--AAA-AC----------------------GGC--AAGCTTTTCTTTT------------------TTTT-T-----AAAAA--Gaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaatgtacttggatactggaggtagctctagcttttgataaggattctttttgacacaatcaaaaactgaaaaataaaaagtgataattcaactcacttttttgaagttgtgcttaaaacggcaagcttttctttttttttaaaaagagcta
gi|31 : gatagccttttaatttttgaaccgagtctgatctaattacttaaactgacgactgtatttgccgagaattaaatcacttcattgtgcattcctacttgtttcatggccaatattgaggtttcctagctgattctaggtcaataatactatgttaacactctgatacaaaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaAA-AA-TGAAA------AAAA-GA-GATAAATTTCAACAT-C-AA-CTT-CAC-GCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-ACAAAGTTGTTGCTATTAAAAGATGGT--AAGC--------T------------------TTTT-TAAA--AAAAA--GCT-A--TACTagcta
gi|32 : --A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-GT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAGATT-Ttgt
gi|34 : ATCCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--T-------CC-A----ATT---GGG----aaaaagct
gi|36 : T--TGGATA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--CTGAC-G-A-C-TG-TAT--T---TGCTCGAAGAA---TT-AATCCCT-TCATannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggaaaagcaaaagagtcttgttgatgtc
gi|37 : taTT--A-ATT-TTT-AAAC--T-G-A-GTA-C---T---GTA----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-TCAAAA--TTGAC-T-A-A-TG-TAT--TGCAT---------A---TT-AA
gi|39 : A-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CG---------AAT-TC--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-AATTACTctttgaagaatta
gi|4 : GTCCAGAAGG---T----TTAGATAG-CATTTTAATAACTATG-TGAAGATT-GA-AT---TGA-C-ACTT--TTTACGGATA-ACCTTT--A-ATT-TTT-TAAT--C-A-A-GTA-T---CATCG-A----------TG---------TC-TC-----CA-TAAC-T-AAAAATTTGAC-G-A-A-T--TAA--T---T---------AAAGTT-A--CCCTATCATTG-TTAA-C-AT-TGT-CATTA-----C----------------------------AG----C--T-------TTC--GGTA--A-A-A-----A--A----T-A-----------C-----C----A------T---A--T------------TA------A--C------ACAT---T-----TA--------------A----------------A---------A---------T----CT---------T-G----TGAA------G-A-AA-TG--------------A-TGT-ACTTGA-A--A-TAGG-G---G-TG-CTACT-------CGTTTTGA-G-T-A-ACGGAAATAAAAGTGGCATAA----T----CTAAT-T-TG-CACGAA-ATACGGAAA-AA-TGACA-----TAAAA-AA-GATAA---T-----C-CAAA-CTT-CAC-TCTTTAAAG--TG--TTGCTAC-AAGAAC----------------------GGT---AGC--------T------------------TTtg
gi|40 : cccaaaagGTTTT---G-T-A-A-GG--A-------------G----T----CTATT-T-TGGCAT-AT--T-C--CAA-AA-TGAAG-----AAAAA-AT-GATAA---T-----actt
gi|41 : AA---T-----T-C-AT-CTG--AC-TCTTTAAAGT-TT--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------T------------------agagattgatcaaac
gi|43 : AAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TACAAAATGTATC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---atacttgtccatcaaagat
gi|46 : -GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T---------
gi|47 : --A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------A--C------ATAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----gctcgaag
gi|5 : atGTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CAT---GATAACT-TG-TGAA--TTTGA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--A-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--ATGAC-G-A-A-TG-TA-----------------A---TT-AATCCCT-TCATTG-T--GGC-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---ATGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---A--T------------TA------A--C------ACTG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TG-TT-CT-T----GCGTTTT---G-T-G-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA------AAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTACTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTtgcac
gi|6 : G---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-AG-TAT--TAAATCGAAGA---A---TT-ACTCTCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGC-CAATA-----CTTG--TTT-ATGACC-A----ACT---GGG----C--C---CTGATCC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------CTATTAT----A------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----AA-----C-T----------------A---------G---------
gi|6 : g---------T-A----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTGGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CTGC-------ACGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGGCAC-AT-TT-C--AAA-AA-TGAAACATGATAAAA-GA-GATAA---T-----G-A-AA-CCG-CTC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------TTTTTAATTTATTTTTTCTTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattatatgaagaaaatgtatgtactgggaatagggtactgcacgttttgtaaggatatctattttggcacatttcaaaaatgaaacatgataaaagagataatgaaaccgctctctttaaagttgttgctaaagacggtaaactttttaatttattttttcttttttaaaaagctatacttgt
gi|7 : ggtctacatactaaaattgacgaaagtattaaatcgaagaattactctcttcattgtgcattgccaatacttgtttatgaccaactgggccctgatccggtaataatactattatattctaacacagttgaactagaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattaC--T-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AATA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--TAACTCGAAGA---A---TT-ACTCCCT-TCATTG-C--A-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AA---A-T---AGG----C--T---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------tgt
gi|7 : ---------T----CT---------T-G----TAAA------GAG-AC-TG-----------T--A-TGT-ATCTGG-A--A-AA-G-G---G-TA-CT-GT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----TCATT-T-TGACAA-AT-TT-C--AGC-AA-TGAAA-----TAAAA-TA-GATA----T-----T-C-AA-AAT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------C------------------TTTT-T-----AAAAA--GCTAA--TACaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgatcttgtaaagagactgtatgtatctggaaaagggtactgtgcgttttgtaaggatattcattttgacaaatttcagcaatgaaataaaatagatattcaaaatcactctttaaagttgttgctaaagacggtaagcctttttaaaaagctaatac
gi|8 : ctgagtactgatgtctacatactaatattgacgaatgtattaactcgaagaattactcccttcattgcacattgtctttacttgtttatgaccaaataggctctgattcggtaataatactattctaacacagttgtacaagaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgaGGGGT----TCAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-------TT-GA-A----TGAACAACTT--AT--CGGAGA-GCCTTA--A-TTT-TTT-GAAC--C-GCACGTA-C---T---G-AC---------TG---------TC-TA-----CACTA-C-T-AAAA--TTGACGG-A-A-TGATAT--T---T---------
gi|8 : a----CT---------T-G-----GAA------GAA-AAATG-----------T--A-TGTTATTTGG-A--A-TC-G-G-----TATCT-CT------GCCTTTT-------A-A-GG--AT------------A----TA---TTATTGT-TGACAC-AA-AT-C--AAATAA-TGAAA-----TAAAA-GA-GAT-A---T-----T-CAAA-CTT-CAC-TATTTAAGGT-TG--TTGCT---AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------CTgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggcttggaagaaaaatgtatgttatttggaatcggtatctctgccttttaaggatatattattgttgacacaaatcaaataatgaaataaaagagatattcaaacttcactatttaaggttgttgctaagacggcaagctctgctata
gi|9 : aggggttcagatgcatttaatagcttgttgaatgaacaacttatcggagagccttaattttttgaaccgcacgtactgactgtctacactactaaaattgacggaatgatatttgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggCTTA-TT--CGAATA-GCCTTT--AATTG-TTT-GAAC--T-A-A-TAA-C---TA--G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-T-T-AAAA--TTGGC-A-A-A-TG-------------------------------------ATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTATAGTACTTG--TTT-ATGACC-AG---ATTCATGGG----T--C---CTGGATT--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---C--TCTAACACAGTTGTA------A--C------ACAG---T-----TG-----CA-----C-AGTGTTAATATAGGGACA---------G---------TGGTTTT---------T-GGTTTTGAA------GAA-AA-TG-----------T--ACTGT-ACTTGGGA--A-TA-G-G---GATA-CT--G-T----GCGTTTTGGCG-C-A-A-GG--AC--------------------------------------A-AT-C--AAA-AA-TGATA-----T-AAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA--TT-CAC-TCTTTAACGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAAAG------------------------------TT-T-----AAAAA--gctata
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATGAACTATATTGATGGATTGATGGTGGTAAAAATAAGCTTGATACAAAAACATGAAAGTTTGTTTTATATGGTAGCAGGGGATGCTTAATGCCAGACACTTAATACCACTTCTGATATTTCCGGGCGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
Unaligned ( gi|25 ): ATTATACATGCACAGAGTTTCAAGTCTATTAGTGTCCACAAGCAAATTTACATCCACACCCGGGCCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|29 ): AGTTATGGTGGATGGTAACGCTGTGGATGTAAATTAAGCTTGCTGGGACACTTATTATATTAGACTTGAAAACTCTTGCATGGCATAATGCAATGTTGCATTTACAATCTCAAATTGTTT
Unaligned ( gi|30 ): GCTCTCCTTACACAGAGTTGTCGGTCCTTATCTTCCCTTAACAAAAGACGAAACTCATGTAGCTATTGAGTGGATCTCAGTGAGGCCGGCGTGTGGATCGTAAATTAGCGGTGGACAG
Unaligned ( gi|33 ): GGAACAGTGGATTTTGATCTTCTGAAGAAAATGTATATATATGTACTGGGATCAGTAGTCCAGTCAAACAGGGTACTGCACTACTTTGGCACTTTTCAATAATC
Unaligned ( gi|35 ): ACTATGCTGCCCAGAGTTTTGGATCTATTAGGCCTATAACGATGTCCTAAGCTAATTAACATTCCACACCTGCCTCACTTAATCCACTCATA
Unaligned ( gi|38 ): AATTTACATCCACACCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCCT
Unaligned ( gi|42 ): CGGCCTCACTTAGATCCACCATAGCTACATGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|44 ): TCACCCTGATCACACATCATAAGCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTC
Unaligned ( gi|45 ): TAGTGTCCACAAGCTATTTACATCCACACGTTACCGGGCTCACTTAGA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCC
Alignments
lowQualScore : 1111 1 22222222222222 1 111 1 1111111111 5555555555555555555555 11111 333333333333 11111111111111111 1111111111111111111 1111111111111111 22222222222222222222222222 111111111 222222222 11111111111111111111111 1111111111111111111111 111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 888 0 5 5 88888888888888 0 0 222 55 3 77 2 2 2 6666 2 2 2 333 555 2 3333333333 888888888 2 55555 2 2 2 2 66 2 2 2 2 2 1111111111111111111111 2 2 0 444 2 2 33 2 4 2 2 00000 33 2 000000000000 4444 33 444 33 888 2 2 99999 33 4444 2 00000000000000000 4444 666666 8888888888888888888 1111111111111111 777 44444 66666 44444 1 88888888888888888888888888 666666666 3333 333333333 1 4444 999999 1 1 99999999999 22 1 3 3 55 1 1 4 222 1 3 999999999 666 1 3 1 1 22 44444444444444444444444 0 1 1 3 55 3 66 1 1 66666 3 1 222 33333 1 3 1 1 3 1 22 44 1 6666666666666666666666 22 888888888888888888888888888 2 99999 55 2 33
lowQualScore : .... ... . . . .............. . . ... .. . .. . . . .... . . . ... ... . .......... ......... . ..... . . . . .. . . . . . ...................... . . . ... . . .. . . . . ..... .. . ............ .... .. ... .. ... . . ..... .. .... . ................. .... ...... ................... ................ ... ..... ..... ..... . .......................... ......... .... ......... . .... ...... . . ........... .. . . . .. . . . ... . . ......... ... . . . . .. ....................... . . . . .. . .. . . ..... . . ... ..... . . . . . . .. .. . ...................... .. ........................... . ..... .. . ..
lowQualScore : 1111 666 0 0 0 66666666666666 2 0 777 55 6 99 3 9 9 7777 4 2 2 777 888 1 4444444444 000000000 0 00000 0 0 0 0 88 0 0 0 0 0 4444444444444444444444 9 9 1 444 4 4 22 4 7 4 4 99999 11 2 555555555555 7777 22 111 22 888 4 4 11111 11 7777 2 88888888888888888 7777 444444 2222222222222222222 5555555555555555 111 88888 77777 88888 9 66666666666666666666666666 777777777 9999 000000000 9 0000 555555 9 9 00000000000 33 7 3 3 44 6 6 8 888 6 1 333333333 111 5 0 5 5 00 77777777777777777777777 3 6 6 3 33 3 22 6 6 00000 1 6 666 77777 5 1 5 5 1 6 33 00 7 1111111111111111111111 55 555555555555555555555555555 1 44444 33 7 77
consensus : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------AA-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
Reference ( family-35 ) : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------AA-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|1 : GTATAAAAAGGGGG----TTAGAT-G-CAGTT-TATAGCT-TG-TGAA--A--GA-A-------ACGACTA--TT--GGAGTA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC----G-A-GTA-----T---G-A----------TG---------TCCTA-----CA-T--C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-AATG-TAT--T---T-------GCTTG--AA-TT-AAT---CCCT-TCATTG----G-CAAT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACCGAAT---TT---GGG----CCGC---CTGATTC--GGT---A-C-T-----A--A----T-ATACAGTAATGTC-----C----A------TGGGTAAT------------TAGGG---G--A------ACAG---T-----TGTTTTTTG-----C----------------------------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA---------T-----------------------------------AT------------A----T----------T-TGACACAAA-AT-CA-AAA-AA-TAAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-TTT-C-C-T-TTTAAAGTATG--TTG-TA--AAT-AC----------------------GAC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAAAGGCT-A--TACT
gi|10 : cttctcttacacaagttgtcggtccttatctgtgcaagagaatgtacttgtagtttaaatggtggacctattagtgtgaggctgggtgtggatgtgtaaattagcttgtggacacttatagattgaactctgtgatgtattaatgcaatattgctattacaggatatgagattctgcatattgtcaggagcagtggaatgccatttatatttctacaaggtccggggtggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggagggT-TTT-AAAC----G-A-GTA-CAGTT---G-AC---------TG---------T--TAATCACCG-TA-----AAAA--TGGAC-G-ACA-TG-TAT--T---T-------GCTCAAGAA-TT-AAT---CCCT-TCATTGAT--G-CCAT-TGTTCTTGA-----CTTG--GT------CC-AAT----T---GGA----A--C---CTGATTC--GGT---A-A-TCTATTA--A----TTA-----------C-----TTAAAA------T---T--T------------CA------A--TTTGTGTACAAA--T-----TG-----TA-----C-ATTTATATAGGGAAC--A---------G---------T----TTGTTTTGTTCT-G----TGAA------GAA-AA--G-----------T--A-TGTTACTTGA-AG-A-TA-G-G---------T-CTGT----GCGTTT----G-T-A-A-GG--AT------------A----TGATACTATT-TATGACAC-AA-TG-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAA--GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAAATT-TG--TTGCTA--AAt
gi|11 : -TTT-TTT-TAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TA-----------------------A-TT-TAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT----T---GG-----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------A--G---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----TGCACAG----T-G----TTAATCTA--GGG-AA-C---------------A-CGT-TTTT---A--A-TA-T-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-CGAAAA-AA-AGAAA-----TAAAG-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTTAA-----AAAAA--GTT-A--TAac
gi|12 : ttaat---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA---T-AAAA--TTGAC-G-A-C-TG-TAT--TAAATCGAA---G------AA-TT-ACT---CTTT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--------------------------G----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--T----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------GAGGCTTTAAT----CA---------T-G----TTAATATAGGGAACAG-TGGTTTTTGATCTT--G-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-GTACG-TA-CT-GT------GCGTTTTT--A-T-A-A-GG--AT------------A----T----TT-TT-T-TGGCAC-AT--T-C--AAA-AA-TGAAA-----ATAAA-GACTACAA---T-----T---AC-CTT-CAT-TCTTTAAAGT-TGNNNNNNNN--NNN-NN----------------------NNN--NNNN--------N------------------NNNN-T-----AAAAA--ACatt
gi|13 : t-TCATTG-T--G-C-AT-TGG-TCTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAC----T---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------C--C------ACAA---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------acata
gi|13 : agtactagatca---------T----CT---------T-C----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACCTGG-AATA-TA-A-G---G-TA-CT--G-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CAATT-T-T-ACAaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgatcttctgaagaaaatgtatgtacctggaatataaggtactgtgcgttttgtaaggatatcaattttacattacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : agtactagatcatcattgtgcattggtcttacttgtttatgaccaactgggccctgattcggtaataatactattctaccacaattgtacaagaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgaTG--TTT-ATGACC-AAT----T---GGG----C--C---CCGATTC--GGT---C-A-TTA---A--AGTTGT-A-----------CAAAA-T----A------TA--G--G------------GA------A--CGGGAA-ACGG---T-----TG-----TT-----TTG----------------G---------G---------T----CT---------TTG----TAAA------GAA-AA--G-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-AT-C--T----GAGTTTT---G-T-A-A-GG--A--------------------------------------AA-ATCC--CAA-AA-TG-AA-----TAAAAGGA-GAT-A---T-----T-C-AA-CTTCCAC-TCTTTAAAGT-TT--TTTGTA--AGG-Attacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : A-CT-CT-TTAAAGTTTTTT---G-T-A-A-GG--A-----------------------------------AC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAA--GA-GATAA---T-----TTC-AATCTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTATTAAG-AC----------------------GGC--AGGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTacaaatcaaaaatgaaataaagagataatttcaatcttcactctttaaagttgttgctattaagacggcaggcttttttaaaaagctatacttgt
gi|15 : tgtttatgaccaattgggccccgattcggtcattaaagttgtacaaaatatagggaacgggaaacggttgttttgggtctttgtaaagaaaagtatgtacttggaatagggtaatctgagttttgtaaggaaaatcccaaaatgaataaaaggagatattcaacttccAT---CCCT-TCATTG-G--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTGG--TTT-ATGACC-A----ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GAT---ATT-T-----A--A----T-A-----------C-----T----G------T---T--C------------TA------AAGC------AAAGGGTT-----TGT----TT-----T-A----------------T---------G---------T----C----------T-A----TG-G------GTA-AA-TA-----------T--A--G------GG-A--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-GTCTT---G-T-G-A-AG--Atgt
gi|15 : ---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------C--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-TTA-GG--AT------------A----T-------TT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC---------------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TTCTaaatgcatgtacttggaatagggtactctgcgttttgtttaggatatttttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggcaagctttttaaaaagctattctt
gi|16 : atcccttcattgggcattgtctttactggtttatgaccaattgggccctgattcgatatttaatactgttctaaagcaaagggtttgttttatgtctatgggtaaatatagggaacagtggtttttgAAC--T-G-A-GTA-C---T---G-A-----------G---------TC-GA-----CA-TA-C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-A-TG-TATACT---C-------G------AA-AG-AATTACCCCT-TCATTG-T--G-C-GTGTGT-CTCTA-----CTTG--TTT-ATGACC-A-----TT---GGG----C--C---AGGATTT--TCT---A-A-A-----A--A----T-A-----------C-----T----G------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------------T---------T-G----CACA------G------TG-----------TTAA-TAT-A--TGG-A--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-ATCTT---G-TGA-A-GA--AA------------A----T----GTATt
gi|16 : a---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-CA-CT--G-T----GCCTTTT---G-T-A-A-GT--AT------------A----C----CAATT-T-TGGTAC-AT-TT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-gtacttggaatagggcactgtgccttttgtaagtataccaattttggtacatttcaaaaatgaaataaaa
gi|17 : aaactgagtactgagtcgacatactaaaaattgacgaatgtatactcgaaagaattaccccttcattgtgcgtgtgtctctacttgtttatgaccattgggccaggattttctaaaaatactgttctaacacagttgtacaagttgcacagtgttaatatatggaacagtggtttttgaT-AATAGCT-TT-TGAA--TT-GA-ACA--TAAAT-AAAA--GT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TT-TA-----CA-TA-C---AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-T-----------------------AA-TT-AAT----CCT-TCATTG-T--G-C-A--TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-------TT----GG----C--C---CTGATTC--GG----A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----
gi|18 : TTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTATATA-CTTG--TTT-ATGACC-AATTCAT----GGG----T--C---CTGATTC--GGTAATA-A-T-----ACTA----T-T-----------C-----T----AACACAGT---T--G------------TACAAGTTG--C------ACAG---TGTTAATA-----TAGGGGAC-A----------------GTGGTTTTTGG---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT--G-T----GCGTTTT---G-G-A-A-GG--------------------------------------AC-AA-TT-C--AAA-AA-TGATA-----TAAAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAgcaagtaattatttttgcgcccgttgtttagtaacataagcttaagttaggtattttaaaaaaaaccaatagaata
gi|19 : ------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----
gi|19 : a---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------AATTAT----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-A--tgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttggtcttgtgaagaaaatgtatgtatttggaatagggtactctgcgttttgtaaggataattatatattttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaaggcggcaagctttttaaaaaagcta
gi|2 : ataacacagttgtacaagttgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttgGTCTAAAAGGGGGT----GTAGAT---CAATT-AATAGCG-TG-TGAA--TT-AACATAAATAAAA-A------T--CGGA-A-GCCTTA--A-TTT-TTTTGAAC--C-G-A-GTAAT---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C---AAAA--TGTAC-G-A-A-TG-TA-----------------------A-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-C-TTA-----CTTGTTTTT-ATGACC--AT--ATT---GGG----C--C---CT-ATTC--CGT---A-ATT-----A--A----T-A-----------C-----T----A------TA--T--T------------TA------A---------AAAGT--T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------
gi|2 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggt------ACAG---T-----TG-----TT-----T-G--------------------------G---------T----CT---------T-G----TGA-------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGGAA--A-TA---G---G-TA-CT-C--T----GCTTTTT---G-TAA-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AACAT-C--AAG-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CACTTCTTTAAAGT-TG---TGCT-------AC----------------------TGT--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTagttggcatagtgttaatatagggaacagttgtttggtcttgtgagaaaatgtatgtatttggaaataggtactctgctttttgtaaaggatatctattttgacacaacatcaagaatgaaataaaagagataattcaacttcacttctttaaagttgtgctactgtaagcttttttaaaaagctatactt
gi|20 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggtgtctaaaagggggtgtagatcaattaatagcgtgtgaattaacataaataaaaatcggaagccttaatttttttgaaccgagtaattgatgtctacatacaaaatgtacgaatgtaattaatcccttcattgtgcattgtcttacttgtttttatgaccatattgggccctattccgtaattaatactatatttaaaaagtttgtacaaagttggcatagtgttaatataggga------ACAG---T-----TG-----TT-----T-T----------------G---------G---------T----CT---------T-G----TGAG------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGGAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AC-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGCT-------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GTT-A--TACTt
gi|21 : taacacagctgtacaagttgcacagtgttaatatggggaGTCTAAAAGGGGGGGGGATTAGCT-GCCATTTAAATAGCT-TGTTGAA------A-AT---TTAAC-ACTTAATT--CGG-TAGGCCTTTTAA-TTTATTT-GAACAACGG-A-GTA-C---T---G-ATACAAATGGTTA---------TC-TA-----CA-TA-CTT-AAAA--TTGAC-GAA-A-TG-TAt
gi|23 : gacagggttggatcccattttattttcttttttcaagttaagggtgagg-G----TTAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGG-A--A-AA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-A--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GAC--AAGC--------A------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|24 : --A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTG---G-T-A-G-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-TTAAAAAAAAA--GCT-A--TACT
gi|26 : cGTCTAAAATAGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TAA------GA------TGAAC-ACTT--AT--CGGATA-GCCTCT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------t
gi|27 : gggagggggag--A-TA-G-G---G-TA-CT-GT------ACGTTTT---G-A-A-A-AG--AT------------A----T----ATATT-T-TGGCAC-AT-TT-C--AAG-AA-TGAAA-----TAAAA-TA-G-TAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AA----------------------GTT--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAAT-GCT-A--TACTctcgaa
gi|28 : TAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-tgt
gi|3 : tcccgtacatgagaagactggatgattagggtattgaaaaatttcaaatatcggttttcgtacatttcaataatGATA-GCCTTTT-A-ATT-TTT-GAAC--C-G-A-GT--C---T---G-A----------T-----------C-TA-----AT-TA-C-T-TAAA--CTGAC-G-A-C-TG-TAT--T---TGCCGA--G------AA-TTAAAT---CACT-TCATTG-T--G-C-AT-T----CCTA-----CTTG--TTTCATGGCC-AAT--ATT---GAGGTTTC--CTAGCTGATTCTAGGTC--A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---G--T------------TA------A--C------ACTC---T-----GA-----TA-----C-A----------------A---------
gi|3 : --A-TGT-ACTTGG-AT-ACTG-GAG---G-TAGCT-CT-A----GC-TTTT---GAT-A-A-GG--AT-----------------T----CT-TT-T-TGACAC-AA--T-C--AAA-AACTGAAAAA---TAAAAAGT-GATAA---T-----T-C-AA-C-T-CACTTTTTTGAAGT-TG---TGCTT--AAA-AC----------------------GGC--AAGCTTTTCTTTT------------------TTTT-T-----AAAAA--Gaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaatgtacttggatactggaggtagctctagcttttgataaggattctttttgacacaatcaaaaactgaaaaataaaaagtgataattcaactcacttttttgaagttgtgcttaaaacggcaagcttttctttttttttaaaaagagcta
gi|31 : gatagccttttaatttttgaaccgagtctgatctaattacttaaactgacgactgtatttgccgagaattaaatcacttcattgtgcattcctacttgtttcatggccaatattgaggtttcctagctgattctaggtcaataatactatgttaacactctgatacaaaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaAA-AA-TGAAA------AAAA-GA-GATAAATTTCAACAT-C-AA-CTT-CAC-GCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-ACAAAGTTGTTGCTATTAAAAGATGGT--AAGC--------T------------------TTTT-TAAA--AAAAA--GCT-A--TACTagcta
gi|32 : --A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-GT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAGATT-Ttgt
gi|34 : AT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--T-------CC-A----ATT---GGG----aaaaagct
gi|36 : T--TGGATA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--CTGAC-G-A-C-TG-TAT--T---TGCTCGAAG------AA-TT-AAT---CCCT-TCATannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggaaaagcaaaagagtcttgttgatgtc
gi|37 : taTT--A-ATT-TTT-AAAC--T-G-A-GTA-C---T---GTA----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-TCAAAA--TTGAC-T-A-A-TG-TAT--T---
gi|39 : A-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CG---------AAT-TC--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-AATTACTgcatattaactttgaagaatta
gi|4 : GTCCAGAAGG---T----TTAGATAG-CATTTTAATAACTATG-TGAAGATT-GA-AT---TGA-C-ACTT--TTTACGGATA-ACCTTT--A-ATT-TTT-TAAT--C-A-A-GTA-T---CATCG-A----------TG---------TC-TC-----CA-TAAC-T-AAAAATTTGAC-G-A-A-T--TAA--T---T-------A------AAGTT-A-----CCCTATCATTG-TTAA-C-AT-TGT-CATTA-----C----------------------------AG----C--T-------TTC--GGTA--A-A-A-----A--A----T-A-----------C-----C----A------T---A--T------------TA------A--C------ACAT---T-----TA--------------A----------------A---------A---------T----CT---------T-G----TGAA------G-A-AA-TG--------------A-TGT-ACTTGA-A--A-TAGG-G---G-TG-CTACT-------CGTTTTGA-G-T-A-ACGGAAATAAAAGTGGCATAA----T----CTAAT-T-TG-CACGAA-ATACGGAAA-AA-TGACA-----TAAAA-AA-GATAA---T-----C-CAAA-CTT-CAC-TCTTTAAAG--TG--TTGCTAC-AAGAAC----------------------GGT---AGC--------T------------------TTtg
gi|40 : cccaaaagGTTTT---G-T-A-A-GG--A-------------G----T----CTATT-T-TGGCAT-AT--T-C--CAA-AA-TGAAG-----AAAAA-AT-GATAA---T-----actt
gi|41 : AA---T-----T-C-AT-CTG--AC-TCTTTAAAGT-TT--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------T------------------agagattgatcaaac
gi|43 : AAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TACAAAATGTATC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---atacttgtccatcaaagat
gi|46 : -GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------
gi|47 : --A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------A--C------ATAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----ctcgaag
gi|5 : atGTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CAT---GATAACT-TG-TGAA--TTTGA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--A-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--ATGAC-G-A-A-TG-TA-----------------------A-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--GGC-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---ATGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---A--T------------TA------A--C------ACTG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TG-TT-CT-T----GCGTTTT---G-T-G-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA------AAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTACTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTtgcac
gi|6 : G---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-AG-TAT--TAAATCGAA---G------AA-TT-ACT---CTCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGC-CAATA-----CTTG--TTT-ATGACC-A----ACT---GGG----C--C---CTGATCC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------CTATTAT----A------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----AA-----C-T----------------A---------G---------
gi|6 : g---------T-A----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTGGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CTGC-------ACGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGGCAC-AT-TT-C--AAA-AA-TGAAACATGATAAAA-GA-GATAA---T-----G-A-AA-CCG-CTC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------TTTTTAATTTATTTTTTCTTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattatatgaagaaaatgtatgtactgggaatagggtactgcacgttttgtaaggatatctattttggcacatttcaaaaatgaaacatgataaaagagataatgaaaccgctctctttaaagttgttgctaaagacggtaaactttttaatttattttttcttttttaaaaagctatacttgt
gi|7 : ggtctacatactaaaattgacgaaagtattaaatcgaagaattactctcttcattgtgcattgccaatacttgtttatgaccaactgggccctgatccggtaataatactattatattctaacacagttgaactagaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattaC--T-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AATA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--TAACTCGAA---G------AA-TT-ACT---CCCT-TCATTG-C--A-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AA---AT----AGG----C--T---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------tgt
gi|7 : ---------T----CT---------T-G----TAAA------GAG-AC-TG-----------T--A-TGT-ATCTGG-A--A-AA-G-G---G-TA-CT-GT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----TCATT-T-TGACAA-AT-TT-C--AGC-AA-TGAAA-----TAAAA-TA-GATA----T-----T-C-AA-AAT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------C------------------TTTT-T-----AAAAA--GCTAA--TACaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgatcttgtaaagagactgtatgtatctggaaaagggtactgtgcgttttgtaaggatattcattttgacaaatttcagcaatgaaataaaatagatattcaaaatcactctttaaagttgttgctaaagacggtaagcctttttaaaaagctaatac
gi|8 : ctgagtactgatgtctacatactaatattgacgaatgtattaactcgaagaattactcccttcattgcacattgtctttacttgtttatgaccaaataggctctgattcggtaataatactattctaacacagttgtacaagaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgaGGGGT----TCAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-------TT-GA-A----TGAACAACTT--AT--CGGAGA-GCCTTA--A-TTT-TTT-GAAC--C-GCACGTA-C---T---G-AC---------TG---------TC-TA-----CACTA-C-T-AAAA--TTGACGG-A-A-TGATAT--T---T-------G------
gi|8 : a----CT---------T-G-----GAA------GAA-AAATG-----------T--A-TGTTATTTGG-A--A-TC-G-G-----TATCT-CT------GCCTTTT-------A-A-GG--AT------------A----TA---TTATTGT-TGACAC-AA-AT-C--AAATAA-TGAAA-----TAAAA-GA-GAT-A---T-----T-CAAA-CTT-CAC-TATTTAAGGT-TG--TTGCT---AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------CTcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggcttggaagaaaaatgtatgttatttggaatcggtatctctgccttttaaggatatattattgttgacacaaatcaaataatgaaataaaagagatattcaaacttcactatttaaggttgttgctaagacggcaagctctgctata
gi|9 : aggggttcagatgcatttaatagcttgttgaatgaacaacttatcggagagccttaattttttgaaccgcacgtactgactgtctacactactaaaattgacggaatgatatttgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggCTTA-TT--CGAATA-GCCTTT--AATTG-TTT-GAAC--T-A-A-TAA-C---TA--G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-T-T-AAAA--TTGGC-A-A-A-TG--------------------------------------------ATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTATAGTACTTG--TTT-ATGACC-AG---ATTCATGGG----T--C---CTGGATT--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---C--TCTAACACAGTTGTA------A--C------ACAG---T-----TG-----CA-----C-AGTGTTAATATAGGGACA---------G---------TGGTTTT---------T-GGTTTTGAA------GAA-AA-TG-----------T--ACTGT-ACTTGGGA--A-TA-G-G---GATA-CT--G-T----GCGTTTTGGCG-C-A-A-GG--AC--------------------------------------A-AT-C--AAA-AA-TGATA-----T-AAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA--TT-CAC-TCTTTAACGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAAAG------------------------------TT-T-----AAAAA--gctata
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATGAACTATATTGATGGATTGATGGTGGTAAAAATAAGCTTGATACAAAAACATGAAAGTTTGTTTTATATGGTAGCAGGGGATGCTTAATGCCAGACACTTAATACCACTTCTGATATTTCCGGGCGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
Unaligned ( gi|25 ): ATTATACATGCACAGAGTTTCAAGTCTATTAGTGTCCACAAGCAAATTTACATCCACACCCGGGCCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|29 ): AGTTATGGTGGATGGTAACGCTGTGGATGTAAATTAAGCTTGCTGGGACACTTATTATATTAGACTTGAAAACTCTTGCATGGCATAATGCAATGTTGCATTTACAATCTCAAATTGTTT
Unaligned ( gi|30 ): GCTCTCCTTACACAGAGTTGTCGGTCCTTATCTTCCCTTAACAAAAGACGAAACTCATGTAGCTATTGAGTGGATCTCAGTGAGGCCGGCGTGTGGATCGTAAATTAGCGGTGGACAG
Unaligned ( gi|33 ): GGAACAGTGGATTTTGATCTTCTGAAGAAAATGTATATATATGTACTGGGATCAGTAGTCCAGTCAAACAGGGTACTGCACTACTTTGGCACTTTTCAATAATC
Unaligned ( gi|35 ): ACTATGCTGCCCAGAGTTTTGGATCTATTAGGCCTATAACGATGTCCTAAGCTAATTAACATTCCACACCTGCCTCACTTAATCCACTCATA
Unaligned ( gi|38 ): AATTTACATCCACACCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCCT
Unaligned ( gi|42 ): CGGCCTCACTTAGATCCACCATAGCTACATGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|44 ): TCACCCTGATCACACATCATAAGCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTC
Unaligned ( gi|45 ): TAGTGTCCACAAGCTATTTACATCCACACGTTACCGGGCTCACTTAGA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCC
Alignments
lowQualScore : 1111 1 22222222222222 1 111 1 1111111111 5555555555555555555555 11111 333333333333 11111111111111111 1111111111111111111 1111111111111111 22222222222222222222222222 111111111 222222222 11111111111111111111111 1111111111111111111111 111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 888 0 5 5 88888888888888 0 0 222 55 3 77 2 2 2 6666 2 2 2 333 555 2 3333333333 888888888 2 55555 2 2 2 2 66 2 2 2 2 2 1111111111111111111111 2 2 0 444 2 2 33 2 4 2 2 00000 33 2 000000000000 4444 33 444 33 888 2 2 99999 33 4444 2 00000000000000000 4444 666666 8888888888888888888 1111111111111111 777 44444 66666 44444 1 88888888888888888888888888 666666666 3333 333333333 1 4444 999999 1 1 99999999999 22 1 3 3 55 1 1 4 222 1 3 999999999 666 1 3 1 1 22 44444444444444444444444 0 1 1 3 55 3 66 1 1 66666 3 1 222 33333 1 3 1 1 3 1 22 44 1 6666666666666666666666 22 888888888888888888888888888 2 99999 55 2 33
lowQualScore : .... ... . . . .............. . . ... .. . .. . . . .... . . . ... ... . .......... ......... . ..... . . . . .. . . . . . ...................... . . . ... . . .. . . . . ..... .. . ............ .... .. ... .. ... . . ..... .. .... . ................. .... ...... ................... ................ ... ..... ..... ..... . .......................... ......... .... ......... . .... ...... . . ........... .. . . . .. . . . ... . . ......... ... . . . . .. ....................... . . . . .. . .. . . ..... . . ... ..... . . . . . . .. .. . ...................... .. ........................... . ..... .. . ..
lowQualScore : 1111 666 0 0 0 66666666666666 2 0 777 55 6 99 3 9 9 7777 4 2 2 777 888 1 4444444444 000000000 0 00000 0 0 0 0 88 0 0 0 0 0 4444444444444444444444 9 9 1 444 4 4 22 4 7 4 4 99999 11 2 555555555555 7777 22 111 22 888 4 4 11111 11 7777 2 88888888888888888 7777 444444 2222222222222222222 5555555555555555 111 88888 77777 88888 9 66666666666666666666666666 777777777 9999 000000000 9 0000 555555 9 9 00000000000 33 7 3 3 44 6 6 8 888 6 1 333333333 111 5 0 5 5 00 77777777777777777777777 3 6 6 3 33 3 22 6 6 00000 1 6 666 77777 5 1 5 5 1 6 33 00 7 1111111111111111111111 55 555555555555555555555555555 1 44444 33 7 77
consensus : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------AA-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
Reference ( family-35 ) : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------AA-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|1 : GTATAAAAAGGGGG----TTAGAT-G-CAGTT-TATAGCT-TG-TGAA--A--GA-A-------ACGACTA--TT--GGAGTA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC----G-A-GTA-----T---G-A----------TG---------TCCTA-----CA-T--C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-AATG-TAT--T---T-------GCTTG--AA-TT-AAT---CCCT-TCATTG----G-CAAT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACCGAAT---TT---GGG----CCGC---CTGATTC--GGT---A-C-T-----A--A----T-ATACAGTAATGTC-----C----A------TGGGTAAT------------TAGGG---G--A------ACAG---T-----TGTTTTTTG-----C----------------------------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA---------T-----------------------------------AT------------A----T----------T-TGACACAAA-AT-CA-AAA-AA-TAAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-TTT-C-C-T-TTTAAAGTATG--TTG-TA--AAT-AC----------------------GAC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAAAGGCT-A--TACT
gi|10 : cttctcttacacaagttgtcggtccttatctgtgcaagagaatgtacttgtagtttaaatggtggacctattagtgtgaggctgggtgtggatgtgtaaattagcttgtggacacttatagattgaactctgtgatgtattaatgcaatattgctattacaggatatgagattctgcatattgtcaggagcagtggaatgccatttatatttctacaaggtccggggtggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggagggT-TTT-AAAC----G-A-GTA-CAGTT---G-AC---------TG---------T--TAATCACCG-TA-----AAAA--TGGAC-G-ACA-TG-TAT--T---T-------GCTCAAGAA-TT-AAT---CCCT-TCATTGAT--G-CCAT-TGTTCTTGA-----CTTG--GT------CC-AAT----T---GGA----A--C---CTGATTC--GGT---A-A-TCTATTA--A----TTA-----------C-----TTAAAA------T---T--T------------CA------A--TTTGTGTACAAA--T-----TG-----TA-----C-ATTTATATAGGGAAC--A---------G---------T----TTGTTTTGTTCT-G----TGAA------GAA-AA--G-----------T--A-TGTTACTTGA-AG-A-TA-G-G---------T-CTGT----GCGTTT----G-T-A-A-GG--AT------------A----TGATACTATT-TATGACAC-AA-TG-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAA--GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAAATT-TG--TTGCTA--AAt
gi|11 : -TTT-TTT-TAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TA-----------------------A-TT-TAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT----T---GG-----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------A--G---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----TGCACAG----T-G----TTAATCTA--GGG-AA-C---------------A-CGT-TTTT---A--A-TA-T-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-CGAAAA-AA-AGAAA-----TAAAG-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTTAA-----AAAAA--GTT-A--TAac
gi|12 : ttaat---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA---T-AAAA--TTGAC-G-A-C-TG-TAT--TAAATCGAA---G------AA-TT-ACT---CTTT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--------------------------G----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--T----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------GAGGCTTTAAT----CA---------T-G----TTAATATAGGGAACAG-TGGTTTTTGATCTT--G-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-GTACG-TA-CT-GT------GCGTTTTT--A-T-A-A-GG--AT------------A----T----TT-TT-T-TGGCAC-AT--T-C--AAA-AA-TGAAA-----ATAAA-GACTACAA---T-----T---AC-CTT-CAT-TCTTTAAAGT-TGNNNNNNNN--NNN-NN----------------------NNN--NNNN--------N------------------NNNN-T-----AAAAA--ACatt
gi|13 : t-TCATTG-T--G-C-AT-TGG-TCTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAC----T---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------C--C------ACAA---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------acata
gi|13 : agtactagatca---------T----CT---------T-C----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACCTGG-AATA-TA-A-G---G-TA-CT--G-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CAATT-T-T-ACAaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgatcttctgaagaaaatgtatgtacctggaatataaggtactgtgcgttttgtaaggatatcaattttacattacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : agtactagatcatcattgtgcattggtcttacttgtttatgaccaactgggccctgattcggtaataatactattctaccacaattgtacaagaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgaTG--TTT-ATGACC-AAT----T---GGG----C--C---CCGATTC--GGT---C-A-TTA---A--AGTTGT-A-----------CAAAA-T----A------TA--G--G------------GA------A--CGGGAA-ACGG---T-----TG-----TT-----TTG----------------G---------G---------T----CT---------TTG----TAAA------GAA-AA--G-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-AT-C--T----GAGTTTT---G-T-A-A-GG--A--------------------------------------AA-ATCC--CAA-AA-TG-AA-----TAAAAGGA-GAT-A---T-----T-C-AA-CTTCCAC-TCTTTAAAGT-TT--TTTGTA--AGG-Attacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : A-CT-CT-TTAAAGTTTTTT---G-T-A-A-GG--A-----------------------------------AC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAA--GA-GATAA---T-----TTC-AATCTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTATTAAG-AC----------------------GGC--AGGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTacaaatcaaaaatgaaataaagagataatttcaatcttcactctttaaagttgttgctattaagacggcaggcttttttaaaaagctatacttgt
gi|15 : tgtttatgaccaattgggccccgattcggtcattaaagttgtacaaaatatagggaacgggaaacggttgttttgggtctttgtaaagaaaagtatgtacttggaatagggtaatctgagttttgtaaggaaaatcccaaaatgaataaaaggagatattcaacttccAT---CCCT-TCATTG-G--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTGG--TTT-ATGACC-A----ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GAT---ATT-T-----A--A----T-A-----------C-----T----G------T---T--C------------TA------AAGC------AAAGGGTT-----TGT----TT-----T-A----------------T---------G---------T----C----------T-A----TG-G------GTA-AA-TA-----------T--A--G------GG-A--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-GTCTT---G-T-G-A-AG--Atgt
gi|15 : ---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------C--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-TTA-GG--AT------------A----T-------TT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC---------------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TTCTaaatgcatgtacttggaatagggtactctgcgttttgtttaggatatttttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggcaagctttttaaaaagctattctt
gi|16 : atcccttcattgggcattgtctttactggtttatgaccaattgggccctgattcgatatttaatactgttctaaagcaaagggtttgttttatgtctatgggtaaatatagggaacagtggtttttgAAC--T-G-A-GTA-C---T---G-A-----------G---------TC-GA-----CA-TA-C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-A-TG-TATACT---C-------G------AA-AG-AATTACCCCT-TCATTG-T--G-C-GTGTGT-CTCTA-----CTTG--TTT-ATGACC-A-----TT---GGG----C--C---AGGATTT--TCT---A-A-A-----A--A----T-A-----------C-----T----G------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------------T---------T-G----CACA------G------TG-----------TTAA-TAT-A--TGG-A--A-CA-GTG---G-T---T-TT-T----G-ATCTT---G-TGA-A-GA--AA------------A----T----GTATt
gi|16 : a---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-CA-CT--G-T----GCCTTTT---G-T-A-A-GT--AT------------A----C----CAATT-T-TGGTAC-AT-TT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-gtacttggaatagggcactgtgccttttgtaagtataccaattttggtacatttcaaaaatgaaataaaa
gi|17 : aaactgagtactgagtcgacatactaaaaattgacgaatgtatactcgaaagaattaccccttcattgtgcgtgtgtctctacttgtttatgaccattgggccaggattttctaaaaatactgttctaacacagttgtacaagttgcacagtgttaatatatggaacagtggtttttgaT-AATAGCT-TT-TGAA--TT-GA-ACA--TAAAT-AAAA--GT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TT-TA-----CA-TA-C---AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-T-----------------------AA-TT-AAT----CCT-TCATTG-T--G-C-A--TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-------TT----GG----C--C---CTGATTC--GG----A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----
gi|18 : TTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTATATA-CTTG--TTT-ATGACC-AATTCAT----GGG----T--C---CTGATTC--GGTAATA-A-T-----ACTA----T-T-----------C-----T----AACACAGT---T--G------------TACAAGTTG--C------ACAG---TGTTAATA-----TAGGGGAC-A----------------GTGGTTTTTGG---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT--G-T----GCGTTTT---G-G-A-A-GG--------------------------------------AC-AA-TT-C--AAA-AA-TGATA-----TAAAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAgcaagtaattatttttgcgcccgttgtttagtaacataagcttaagttaggtattttaaaaaaaaccaatagaata
gi|19 : ------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----
gi|19 : a---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------AATTAT----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-A--tgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttggtcttgtgaagaaaatgtatgtatttggaatagggtactctgcgttttgtaaggataattatatattttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaaggcggcaagctttttaaaaaagcta
gi|2 : ataacacagttgtacaagttgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttgGTCTAAAAGGGGGT----GTAGAT---CAATT-AATAGCG-TG-TGAA--TT-AACATAAATAAAA-A------T--CGGA-A-GCCTTA--A-TTT-TTTTGAAC--C-G-A-GTAAT---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C---AAAA--TGTAC-G-A-A-TG-TA-----------------------A-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-C-TTA-----CTTGTTTTT-ATGACC--AT--ATT---GGG----C--C---CT-ATTC--CGT---A-ATT-----A--A----T-A-----------C-----T----A------TA--T--T------------TA------A---------AAAGT--T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------
gi|2 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggt------ACAG---T-----TG-----TT-----T-G--------------------------G---------T----CT---------T-G----TGA-------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGGAA--A-TA---G---G-TA-CT-C--T----GCTTTTT---G-TAA-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AACAT-C--AAG-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CACTTCTTTAAAGT-TG---TGCT-------AC----------------------TGT--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTagttggcatagtgttaatatagggaacagttgtttggtcttgtgagaaaatgtatgtatttggaaataggtactctgctttttgtaaaggatatctattttgacacaacatcaagaatgaaataaaagagataattcaacttcacttctttaaagttgtgctactgtaagcttttttaaaaagctatactt
gi|20 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggtgtctaaaagggggtgtagatcaattaatagcgtgtgaattaacataaataaaaatcggaagccttaatttttttgaaccgagtaattgatgtctacatacaaaatgtacgaatgtaattaatcccttcattgtgcattgtcttacttgtttttatgaccatattgggccctattccgtaattaatactatatttaaaaagtttgtacaaagttggcatagtgttaatataggga------ACAG---T-----TG-----TT-----T-T----------------G---------G---------T----CT---------T-G----TGAG------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGGAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AC-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGCT-------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GTT-A--TACTt
gi|21 : taacacagctgtacaagttgcacagtgttaatatggggaGTCTAAAAGGGGGGGGGATTAGCT-GCCATTTAAATAGCT-TGTTGAA------A-AT---TTAAC-ACTTAATT--CGG-TAGGCCTTTTAA-TTTATTT-GAACAACGG-A-GTA-C---T---G-ATACAAATGGTTA---------TC-TA-----CA-TA-CTT-AAAA--TTGAC-GAA-A-TG-TAt
gi|23 : gacagggttggatcccattttattttcttttttcaagttaagggtgagg-G----TTAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ATTTGG-A--A-AA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-A--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GAC--AAGC--------A------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|24 : --A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT------GCGTTTG---G-T-A-G-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-TTAAAAAAAAA--GCT-A--TACT
gi|26 : cGTCTAAAATAGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TAA------GA------TGAAC-ACTT--AT--CGGATA-GCCTCT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------t
gi|27 : gggagggggag--A-TA-G-G---G-TA-CT-GT------ACGTTTT---G-A-A-A-AG--AT------------A----T----ATATT-T-TGGCAC-AT-TT-C--AAG-AA-TGAAA-----TAAAA-TA-G-TAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AA----------------------GTT--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAAT-GCT-A--TACTctcgaa
gi|28 : TAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-tgt
gi|3 : tcccgtacatgagaagactggatgattagggtattgaaaaatttcaaatatcggttttcgtacatttcaataatGATA-GCCTTTT-A-ATT-TTT-GAAC--C-G-A-GT--C---T---G-A----------T-----------C-TA-----AT-TA-C-T-TAAA--CTGAC-G-A-C-TG-TAT--T---TGCCGA--G------AA-TTAAAT---CACT-TCATTG-T--G-C-AT-T----CCTA-----CTTG--TTTCATGGCC-AAT--ATT---GAGGTTTC--CTAGCTGATTCTAGGTC--A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---G--T------------TA------A--C------ACTC---T-----GA-----TA-----C-A----------------A---------
gi|3 : --A-TGT-ACTTGG-AT-ACTG-GAG---G-TAGCT-CT-A----GC-TTTT---GAT-A-A-GG--AT-----------------T----CT-TT-T-TGACAC-AA--T-C--AAA-AACTGAAAAA---TAAAAAGT-GATAA---T-----T-C-AA-C-T-CACTTTTTTGAAGT-TG---TGCTT--AAA-AC----------------------GGC--AAGCTTTTCTTTT------------------TTTT-T-----AAAAA--Gaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaatgtacttggatactggaggtagctctagcttttgataaggattctttttgacacaatcaaaaactgaaaaataaaaagtgataattcaactcacttttttgaagttgtgcttaaaacggcaagcttttctttttttttaaaaagagcta
gi|31 : gatagccttttaatttttgaaccgagtctgatctaattacttaaactgacgactgtatttgccgagaattaaatcacttcattgtgcattcctacttgtttcatggccaatattgaggtttcctagctgattctaggtcaataatactatgttaacactctgatacaaaattgacagttgcttaaatatagggaacagttgttttgtgggttttctctaagaaatgattttttcgtaAA-AA-TGAAA------AAAA-GA-GATAAATTTCAACAT-C-AA-CTT-CAC-GCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-ACAAAGTTGTTGCTATTAAAAGATGGT--AAGC--------T------------------TTTT-TAAA--AAAAA--GCT-A--TACTagcta
gi|32 : --A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-GT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----ATATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAGATT-Ttgt
gi|34 : AT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--T-------CC-A----ATT---GGG----aaaaagct
gi|36 : T--TGGATA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--CTGAC-G-A-C-TG-TAT--T---TGCTCGAAG------AA-TT-AAT---CCCT-TCATannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggaaaagcaaaagagtcttgttgatgtc
gi|37 : taTT--A-ATT-TTT-AAAC--T-G-A-GTA-C---T---GTA----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-TCAAAA--TTGAC-T-A-A-TG-TAT--T---
gi|39 : A-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CG---------AAT-TC--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-AATTACTgcatattaactttgaagaatta
gi|4 : GTCCAGAAGG---T----TTAGATAG-CATTTTAATAACTATG-TGAAGATT-GA-AT---TGA-C-ACTT--TTTACGGATA-ACCTTT--A-ATT-TTT-TAAT--C-A-A-GTA-T---CATCG-A----------TG---------TC-TC-----CA-TAAC-T-AAAAATTTGAC-G-A-A-T--TAA--T---T-------A------AAGTT-A-----CCCTATCATTG-TTAA-C-AT-TGT-CATTA-----C----------------------------AG----C--T-------TTC--GGTA--A-A-A-----A--A----T-A-----------C-----C----A------T---A--T------------TA------A--C------ACAT---T-----TA--------------A----------------A---------A---------T----CT---------T-G----TGAA------G-A-AA-TG--------------A-TGT-ACTTGA-A--A-TAGG-G---G-TG-CTACT-------CGTTTTGA-G-T-A-ACGGAAATAAAAGTGGCATAA----T----CTAAT-T-TG-CACGAA-ATACGGAAA-AA-TGACA-----TAAAA-AA-GATAA---T-----C-CAAA-CTT-CAC-TCTTTAAAG--TG--TTGCTAC-AAGAAC----------------------GGT---AGC--------T------------------TTtg
gi|40 : cccaaaagGTTTT---G-T-A-A-GG--A-------------G----T----CTATT-T-TGGCAT-AT--T-C--CAA-AA-TGAAG-----AAAAA-AT-GATAA---T-----actt
gi|41 : AA---T-----T-C-AT-CTG--AC-TCTTTAAAGT-TT--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------T------------------agagattgatcaaac
gi|43 : AAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TACAAAATGTATC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---atacttgtccatcaaagat
gi|46 : -GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------
gi|47 : --A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------A--C------ATAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----ctcgaag
gi|5 : atGTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CAT---GATAACT-TG-TGAA--TTTGA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--A-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--ATGAC-G-A-A-TG-TA-----------------------A-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--GGC-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---ATGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---A--T------------TA------A--C------ACTG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TG-TT-CT-T----GCGTTTT---G-T-G-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA------AAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTACTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTtgcac
gi|6 : G---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-AG-TAT--TAAATCGAA---G------AA-TT-ACT---CTCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGC-CAATA-----CTTG--TTT-ATGACC-A----ACT---GGG----C--C---CTGATCC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------CTATTAT----A------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----AA-----C-T----------------A---------G---------
gi|6 : g---------T-A----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTGGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CTGC-------ACGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGGCAC-AT-TT-C--AAA-AA-TGAAACATGATAAAA-GA-GATAA---T-----G-A-AA-CCG-CTC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------TTTTTAATTTATTTTTTCTTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattatatgaagaaaatgtatgtactgggaatagggtactgcacgttttgtaaggatatctattttggcacatttcaaaaatgaaacatgataaaagagataatgaaaccgctctctttaaagttgttgctaaagacggtaaactttttaatttattttttcttttttaaaaagctatacttgt
gi|7 : ggtctacatactaaaattgacgaaagtattaaatcgaagaattactctcttcattgtgcattgccaatacttgtttatgaccaactgggccctgatccggtaataatactattatattctaacacagttgaactagaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattaC--T-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AATA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--TAACTCGAA---G------AA-TT-ACT---CCCT-TCATTG-C--A-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AA---AT----AGG----C--T---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--C------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------tgt
gi|7 : ---------T----CT---------T-G----TAAA------GAG-AC-TG-----------T--A-TGT-ATCTGG-A--A-AA-G-G---G-TA-CT-GT------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----TCATT-T-TGACAA-AT-TT-C--AGC-AA-TGAAA-----TAAAA-TA-GATA----T-----T-C-AA-AAT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------C------------------TTTT-T-----AAAAA--GCTAA--TACaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgatcttgtaaagagactgtatgtatctggaaaagggtactgtgcgttttgtaaggatattcattttgacaaatttcagcaatgaaataaaatagatattcaaaatcactctttaaagttgttgctaaagacggtaagcctttttaaaaagctaatac
gi|8 : ctgagtactgatgtctacatactaatattgacgaatgtattaactcgaagaattactcccttcattgcacattgtctttacttgtttatgaccaaataggctctgattcggtaataatactattctaacacagttgtacaagaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgaGGGGT----TCAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-------TT-GA-A----TGAACAACTT--AT--CGGAGA-GCCTTA--A-TTT-TTT-GAAC--C-GCACGTA-C---T---G-AC---------TG---------TC-TA-----CACTA-C-T-AAAA--TTGACGG-A-A-TGATAT--T---T-------G------
gi|8 : a----CT---------T-G-----GAA------GAA-AAATG-----------T--A-TGTTATTTGG-A--A-TC-G-G-----TATCT-CT------GCCTTTT-------A-A-GG--AT------------A----TA---TTATTGT-TGACAC-AA-AT-C--AAATAA-TGAAA-----TAAAA-GA-GAT-A---T-----T-CAAA-CTT-CAC-TATTTAAGGT-TG--TTGCT---AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------CTcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggcttggaagaaaaatgtatgttatttggaatcggtatctctgccttttaaggatatattattgttgacacaaatcaaataatgaaataaaagagatattcaaacttcactatttaaggttgttgctaagacggcaagctctgctata
gi|9 : aggggttcagatgcatttaatagcttgttgaatgaacaacttatcggagagccttaattttttgaaccgcacgtactgactgtctacactactaaaattgacggaatgatatttgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggCTTA-TT--CGAATA-GCCTTT--AATTG-TTT-GAAC--T-A-A-TAA-C---TA--G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-T-T-AAAA--TTGGC-A-A-A-TG--------------------------------------------ATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTATAGTACTTG--TTT-ATGACC-AG---ATTCATGGG----T--C---CTGGATT--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---C--TCTAACACAGTTGTA------A--C------ACAG---T-----TG-----CA-----C-AGTGTTAATATAGGGACA---------G---------TGGTTTT---------T-GGTTTTGAA------GAA-AA-TG-----------T--ACTGT-ACTTGGGA--A-TA-G-G---GATA-CT--G-T----GCGTTTTGGCG-C-A-A-GG--AC--------------------------------------A-AT-C--AAA-AA-TGATA-----T-AAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA--TT-CAC-TCTTTAACGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAAAG------------------------------TT-T-----AAAAA--gctata
blockSeqs : GGGA GC A A T ATTAACATAAA A AAT TA G TA A A T AACG C C A AGT ATC T TACAAATGGT CAAAATGTA . ATCAC C A T C AT G A C . A TTAAATCGAAG G A TAC A A TA G C G T TAGTA TT C AGATTCAT GTTT . TAG TA AAT T T CTATT CT GTTG T CTATTA TAAA ACACAG CTCTAACACAGTTG ATTTGTGT GGT GTTAA T GGGGA T GTGTTAATATAGGGACA AGGCTTTAA GGTT GTTTTGTTC T GTTT TATAGG C A GTTTTTGATCT TA C T A AT C G T TAC A G CTTTAAA GGC A G T C AA AAAAGTGGCATAATC G A G CA C GA T C CATGA G C ATT CAACA T A T C T . NN TT A AAAGTTGTTGCTATTAAAAGAT AA TTTTTAATTTATTTTTTCT A TAAAA T A AT
blockSeqs : . AG T . . AGATTGAAT . AT . . T A . . C . . . . A . C . . . . . . . A . . . . . TTTGCTCGAAG . . . . . . . . . . TATA . . AATTCAT . . . . C . . TA . . . CAAAA . . AGG CAAGTTGC A . . . . TTTATATAGGGAACA . . CACAG . . TCTA . . . . . T G G . . T . . T CTGT GA . A . . . ATGATAC . . . T A GG . . AA A . . . . A . . T . . C . . . TTTTCTTTT . AAA . . .
blockSeqs : . G . . . ATTGAACA . G . . . A . . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . TTAAATCGAAG . . . . . . . . . . . . . AATATT . . . . A . . . . . . C . . ATT ACGGGAA T . . . . GTGGTTTTTG . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . TTT T . . . . . AATTATA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . .
blockSeqs : . G . . . ATTTGAAT . A . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTAACTCGAAG . . . . . . . . . . . . . AATATT . . . . . . . . . . . C . . TT AAGC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . ATAT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . G . . . TTGAA . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTGCTCAAG . . . . . . . . . . . . . ATATT . . . . . . . . . . . C . . TT AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTA . . . . . . ATC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAAT . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTGCCGAG . . . . . . . . . . . . . AATT . . . . . . . . . . . C . . TT AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACT . . . . . . ATT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . GA . A . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TACTCG . . . . . . . . . . . . . AATT . . . . . . . . . . . C . . TC CC . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTT . . . . . . ATC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTG . . . . . . . . . . . . . AACT . . . . . . . . . . . C . . TC AC . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . ATG . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTA . . . . . . . . . . . . . AATT . . . . . . . . . . . C . . TC AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . ACC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTG . . . . . . . . . . . . . AATT . . . . . . . . . . . C . . TT AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . ATC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTG . . . . . . . . . . . . . AATT . . . . . . . . . . . C . . TG AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . ATA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AACT . . . . . . . . . . . C . . GT AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . ATA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAAT . . . . . . . . . . . C . . AT AC . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . ATC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . C . . TC AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . ATA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . C . . AT AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . ATA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TC AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . GTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TC AC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . ATC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . ATC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . ATT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . AT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . GT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : ATTGAAT******* C*** ** TTTCG***************** AATT******** ** C**************** TC***************** AC************** ***** A************************* NT******* ATC******************** ** **
originalCons : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT--T---T-------G------AA-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACC-AAT--ATT---GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-A-----------C-----T----A------T---T--T------------TA------A--C------ACAG---T-----TG-----TA-----C-A----------------A---------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CT-CT-T----GCGTTTT---G-T-A-A-GG--AT------------A----T----CTATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
finalCons : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAATTGAAT-------TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAACC---G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TATTTCG-----------------AA-TT-AAT---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTA-----CTTG--TTT-ATGACCAATT--------GGG----C--C---CTGATTC--GGT---A-A-T-----A--A----T-AC----------------T----A------TTC-----------------TAAC--------------ACAG---T-----TG-----TA-----C-AA-------------------------G---------T----CT---------T-G----TGAA------GAA-AA-TG-----------T--A-TGT-ACTTGG-A--A-TA-G-G---G-TA-CTNT-------GCGTTTT---G-T-A-A-GG--ATATC--------------------TATT-T-TGACAC-AA-AT-C--AAA-AA-TGAAA-----TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATGAACTATATTGATGGATTGATGGTGGTAAAAATAAGCTTGATACAAAAACATGAAAGTTTGTTTTATATGGTAGCAGGGGATGCTTAATGCCAGACACTTAATACCACTTCTGATATTTCCGGGCGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
Unaligned ( gi|25 ): ATTATACATGCACAGAGTTTCAAGTCTATTAGTGTCCACAAGCAAATTTACATCCACACCCGGGCCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|29 ): AGTTATGGTGGATGGTAACGCTGTGGATGTAAATTAAGCTTGCTGGGACACTTATTATATTAGACTTGAAAACTCTTGCATGGCATAATGCAATGTTGCATTTACAATCTCAAATTGTTT
Unaligned ( gi|30 ): GCTCTCCTTACACAGAGTTGTCGGTCCTTATCTTCCCTTAACAAAAGACGAAACTCATGTAGCTATTGAGTGGATCTCAGTGAGGCCGGCGTGTGGATCGTAAATTAGCGGTGGACAG
Unaligned ( gi|33 ): GGAACAGTGGATTTTGATCTTCTGAAGAAAATGTATATATATGTACTGGGATCAGTAGTCCAGTCAAACAGGGTACTGCACTACTTTGGCACTTTTCAATAATC
Unaligned ( gi|35 ): ACTATGCTGCCCAGAGTTTTGGATCTATTAGGCCTATAACGATGTCCTAAGCTAATTAACATTCCACACCTGCCTCACTTAATCCACTCATA
Unaligned ( gi|38 ): AATTTACATCCACACCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCCT
Unaligned ( gi|42 ): CGGCCTCACTTAGATCCACCATAGCTACATGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|44 ): TCACCCTGATCACACATCATAAGCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTC
Unaligned ( gi|45 ): TAGTGTCCACAAGCTATTTACATCCACACGTTACCGGGCTCACTTAGA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCC
Alignments
lowQualScore : 1111 1 22222222222222 1 111 1 1111111111 444444444444444444444444 111 1111 1111111111111111111 1111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111 1111111111111111111111111111 1111111111111111111111 111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 888 0 5 5 88888888888888 0 0 222 55 3 77 2 2 2 6666 2 2 2 333 555 2 3333333333 888888888 2 55555 2 2 2 2 66 2 2 2 2 2 888888888888888888888888 2 444 2 2 33 2 4 2 2 55555 5555 33 2 4 33 000 333 4444 33 444 33 1111 2 2 99999 66 4444 2 7777777777777777777 77777777 666666 22 6666666 777777777 777 44444 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 666666666 222222222 1 8888888888 999999 44 22 1 555555 88888888888 22 1 3 66666666 44444 3 3 33 4 555 3 33 1 1 22 4444 1 1 3 22 5555555555555555555555555555 1 1 3 44444444 3 66 1 1 33333 22 3 1 222 33333 1 3 1 1 3 1 22 44 1 6666666666666666666666 22 888888888888888888888888888 2 99999 55 2 33
lowQualScore : .... ... . . . .............. . . ... .. . .. . . . .... . . . ... ... . .......... ......... . ..... . . . . .. . . . . . ........................ . ... . . .. . . . . ..... .... .. . . .. ... ... .... .. ... .. .... . . ..... .. .... . ................... ........ ...... .. ....... ......... ... ..... .................................................... ......... ......... . .......... ...... .. .. . ...... ........... .. . . ........ ..... . . .. . ... . .. . . .. .... . . . .. ............................ . . . ........ . .. . . ..... .. . . ... ..... . . . . . . .. .. . ...................... .. ........................... . ..... .. . ..
lowQualScore : 1111 666 0 0 0 66666666666666 2 0 777 55 6 99 3 9 9 7777 4 2 2 777 888 1 4444444444 000000000 0 00000 0 0 0 0 88 0 0 0 0 0 555555555555555555555555 4 444 4 4 22 4 7 4 4 99999 0000 11 2 4 11 000 999 7777 22 111 22 5555 4 4 11111 11 7777 2 8888888888888888888 00000000 111111 99 4444444 666666666 111 88888 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 444444444 444444444 8 0000000000 111111 33 55 8 222222 66666666666 33 7 3 00000000 22222 2 2 88 8 000 2 22 6 5 00 6666 5 5 0 00 1111111111111111111111111111 6 6 3 99999999 3 22 6 6 88888 11 1 6 666 77777 5 1 5 5 1 6 33 00 7 1111111111111111111111 55 555555555555555555555555555 1 44444 33 7 77
consensus : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT-T---T---C-----GA--A---TTAA-T---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACCA-A--T---T---GGG----C--C---CTGATTC--GGT----A-A-T-----A--A----T-AC-------T----A------T-TC-----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------TCT---------T-GTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-NT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----CT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
Reference ( family-35 ) : GTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TGAA--TT-GA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT-T---T---C-----GA--A---TTAA-T---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACCA-A--T---T---GGG----C--C---CTGATTC--GGT----A-A-T-----A--A----T-AC-------T----A------T-TC-----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------TCT---------T-GTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-NT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----CT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|1 : GTATAAAAAGGGGG----TTAGAT-G-CAGTT-TATAGCT-TG-TGAA--A--GA-A-------ACGACTA--TT--GGAGTA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC----G-A-GTA-----T---G-A----------TG---------TCCTA-----CA-T--C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-AATG-TAT-T---TGCTT-----GA--A---TTAA-T---CCCT-TCATTG----G-CAAT-TGT-CTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACCG-AATT---T---GGG----CCGC---CTGATTC--GGT----A-C-T-----A--A----T-ATACAGTAAT----G------T-CCATGGGTA------A--TTAGGGGAACA---------G---T-----TGTTTTTT-------------G-----C--------------------------G---------TCT---------T-GTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA-------------------------T--A----T-A---------------------------------------T-T-TGACACAA-----A-AT-CA-AAA-AA-TAAA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-TTT-C-C-T-TTTAAAGTATG--TTG-TA--AAT-AC----------------------GAC--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAAAGGCT-A--TACT
gi|10 : cttctcttacacaagttgtcggtccttatctgtgcaagagaatgtacttgtagtttaaatggtggacctattagtgtgaggctgggtgtggatgtgtaaattagcttgtggacacttatagattgaactctgtgatgtattaatgcaatattgctattacaggatatgagattctgcatattgtcaggagcagtggaatgccatttatatttctacaaggtccggggtggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggagggT-TTT-AAAC----G-A-GTA-CAGTT---G-AC---------TG---------T--TAATCACCG-TA-----AAAA--TGGAC-G-ACA-TG-TAT-T---TGCTCAA---GA--A---TTAA-T---CCCT-TCATTGAT--G-CCAT-TGTTCTT-----GA----CTTG--GT------CCA-A--T---T---GGA----A--C---CTGATTC--GGT----A-A-TCTATTA--A----TTAC-------TTAAAA------T-TT-----CA------A--TTTGTGT-ACA---------AA--T-----TG-----T-------------A-----C-ATTTATATAGGGAACA---------G---------TTTGTTTTGTTCT-GTG----------AA------GAA--A--A--------G-----------T--A-TGTTAC--------TTG-----AAGA-TA--G-G----T--CT-GT-GCG-TTT---G----T-A-A-GG--AT------------A----TGATACT----ATT-TATGACAC-A-----A-TG-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAA--GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAAATT-TG--TTGCTA--AAt
gi|11 : -TTT-TTT-TAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TA--------------------A---TTTA-T---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACCA-A--T---T---GG-----C--C---CTGATTC--GGT----A-A-T-----A--A----T-AC-------T----A------T-TT-----TA------A--C-------A-----------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------TTGCACAG----T-GTT----------AATCTA--GGG--A--A-C---------------------A-CGT-TT--------TT-------A-A-TA--T-G---GTA-CT-CT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----CT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-CGAAAA-AA-AGAA-----A--TAAAG-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTTAA-----AAAAA--GTT-A--TAac
gi|12 : ttaat---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA---T-AAAA--TTGAC-G-A-C-TG-TAT-TAAAT---C-----GA--AGAATTAC-T---CTTT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTT-----TA----CTTG---------------------------G----C--C---CTGATTC--GGT----A-A-T-----A--T----T-AC-------T----A------T-TT-----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------GAGGCTTTAATCA---------T-GTT----------AATATAGGGAAC-A--G-T------GGTTTTTGATCTT--G-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-GTACGTA-CT-GT-GCGTTTTT--A----T-A-A-GG--AT------------A----T----TT-----TT-T-TGGCAC-------A-TT-C--AAA-AA-TGAA-----A--ATAAA-GACTACAA---T-----T---AC-CTT-CAT-TCTTTAAAGT-TGNNNNNNNN--NNN-NN----------------------NNN--NNNN--------N------------------NNNN-T-----AAAAA--ACatt
gi|13 : t-TCATTG-T--G-C-AT-TGG-TCT-----TA----CTTG--TTT-ATGACCA-A--C---T---GGG----C--C---CTGATTC--GGT----A-A-T-----A--A----T-AC-------T----A------T-TC-----TA------C--C-------ACA---------A---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------acata
gi|13 : agtactagatca---------TCT---------T-CTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------CTG-----GA-A-TATAA-G---GTA-CT-GT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----CA----ATT-T-T-ACAaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgatcttctgaagaaaatgtatgtacctggaatataaggtactgtgcgttttgtaaggatatcaattttacattacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : agtactagatcatcattgtgcattggtcttacttgtttatgaccaactgggccctgattcggtaataatactattctaccacaattgtacaagaggccggtggataatattaggaatatttcagtggtgttttgaTG--TTT-ATGACCA-A--T---T---GGG----C--C---CCGATTC--GGT----C-A-TTA---A--AGTTGT-ACAAAA---T----A------TAGG-----GA------A--CGGGAA--ACG---------G---T-----TG-----T-------------T-----TTG--------------G---------G---------TCT---------TTGTA----------AA------GAA--A--A--------G-----------T--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-AT-CT-GAG-TTTT--G----T-A-A-GG--A------------------------------------------A-----A-ATCC--CAA-AA-TG-A-----A--TAAAAGGA-GAT-A---T-----T-C-AA-CTTCCAC-TCTTTAAAGT-TT--TTTGTA--AGG-Attacccgtgactttactaaatgaaaatagattcaaatatttttttagaatatagaaattgtaactttctaccttcaggtaagctt
gi|14 : -TTTT--G----T-A-A-GG--A---------------------------------------AC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAA--GA-GATAA---T-----TTC-AATCTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTATTAAG-AC----------------------GGC--AGGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTacaaatcaaaaatgaaataaagagataatttcaatcttcactctttaaagttgttgctattaagacggcaggcttttttaaaaagctatacttgt
gi|15 : tgtttatgaccaattgggccccgattcggtcattaaagttgtacaaaatatagggaacgggaaacggttgttttgggtctttgtaaagaaaagtatgtacttggaatagggtaatctgagttttgtaaggaaaatcccaaaatgaataaaaggagatattcaacttccactctttaaagttA-T---CCCT-TCATTG-G--G-C-AT-TGT-CTT-----TA----CTGG--TTT-ATGACCA-A--T---T---GGG----C--C---CTGATTC--GAT----ATT-T-----A--A----T-AC-------T----G------T-TC-----TA------AAGC-------AAA---------GGGTT-----TGT----T-------------T-----T-A--------------T---------G---------TC----------T-ATG-----------G------GTA--A--A-T------A-----------T--A--G--------------G-----GA-A-CA--GTG---GT--TT-TT-G-G-TCTT--G----T-G-A-AG--Atgt
gi|15 : ---------G---------TCT---------T-GTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------C--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-CT-GCG-TTTT--G----T-TTA-GG--AT------------A----T-----------TT-T-TGACAC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC---------------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TTCTaaatgcatgtacttggaatagggtactctgcgttttgtttaggatatttttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggcaagctttttaaaaagctattctt
gi|16 : atcccttcattgggcattgtctttactggtttatgaccaattgggccctgattcgatatttaatactgttctaaagcaaagggtttgttttatgtctatgggtaaatatagggaacagtggtttttgAAC--T-G-A-GTA-C---T---G-A-----------G---------TC-GA-----CA-TA-C-T-AAAAA-TTGAC-G-A-A-TG-TATAC---T---C-----GA--A---AGAA-TTACCCCT-TCATTG-T--G-C-GTGTGT-CTC-----TA----CTTG--TTT-ATGACC--A--T---T---GGG----C--C---AGGATTT--TCT----A-A-A-----A--A----T-AC-------T----G------T-TC-----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G-----------T---------T-GCA----------CA------G---------T------G-----------TTAA-TAT-A----------TG-----GA-A-CA--GTG---GT--TT-TT-G-A-TCTT--G----TGA-A-GA--AA------------A----T----GT----ATt
gi|16 : a---------TCT---------T-GTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GCA-CT-GT-GCC-TTTT--G----T-A-A-GT--AT------------A----C----CA----ATT-T-TGGTAC-A-----T-TT-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAAA-gtacttggaatagggcactgtgccttttgtaagtataccaattttggtacatttcaaaaatgaaataaaa
gi|17 : aaactgagtactgagtcgacatactaaaaattgacgaatgtatactcgaaagaattaccccttcattgtgcgtgtgtctctacttgtttatgaccattgggccaggattttctaaaaatactgttctaacacagttgtacaagttgcacagtgttaatatatggaacagtggtttttgaT-AATAGCT-TT-TGAA--TT-GA-ACA--TAAAT-AAAA--GT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TT-TA-----CA-TA-C---AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-T------------------A--A---TTAA-T----CCT-TCATTG-T--G-C-A--TGT-CTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACC-----T---T----GG----C--C---CTGATTC--GG-----A-A-T-----A--A----T-AC-------T----A------T-TT-----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------T
gi|18 : TTG-T--G-C-AT-TGT-CTT-----TATATACTTG--TTT-ATGACCA-A--T---TCATGGG----T--C---CTGATTC--GGTAAT-A-A-T-----ACTA----T-TC-------T----AACACAGT-TG-----TACAAGTTG--C-------ACA---------G---TGTTAATA-----T-------------AGGGGAC-A--------------GTGGTTTTTGG---------TCT---------T-GTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-GT-GCG-TTTT--G----G-A-A-GG------------------------------------------AC-A-----A-TT-C--AAA-AA-TGAT-----A--TAAAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAgcaagtaattatttttgcgcccgttgtttagtaacataagcttaagttaggtattttaaaaaaaaccaatagaata
gi|19 : -----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------T
gi|19 : a---------G---------TCT---------T-GTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AT--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-CT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------AATTAT----AT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-A--tgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttggtcttgtgaagaaaatgtatgtatttggaatagggtactctgcgttttgtaaggataattatatattttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaaggcggcaagctttttaaaaaagcta
gi|2 : ataacacagttgtacaagttgcacagtgttaataaagtgaacagttgttttttgGTCTAAAAGGGGGT----GTAGAT---CAATT-AATAGCG-TG-TGAA--TT-AACATAAATAAAA-A------T--CGGA-A-GCCTTA--A-TTT-TTTTGAAC--C-G-A-GTAAT---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C---AAAA--TGTAC-G-A-A-TG-TA--------------------A---TTAA-T---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-C-T-----TA----CTTGTTTTT-ATGACCATA--T---T---GGG----C--C---CT-ATTC--CGT----A-ATT-----A--A----T-AC-------T----A------TATT-----TA------A----------AAA---------GT--T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------
gi|2 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggt-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------T-----T-G------------------------G---------TCT---------T-GTG----------A-------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AT--------TTG-----GA-AATA--G-G----TA-CT-CT-GCT-TTTT--G----T-A-AAGG--AT------------A----T----CT----ATT-T-TGACAC-A-----ACAT-C--AAG-AA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CACTTCTTTAAAGT-TG---TGCT-------AC----------------------TGT--AAGC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTagttggcatagtgttaatatagggaacagttgtttggtcttgtgagaaaatgtatgtatttggaaataggtactctgctttttgtaaaggatatctattttgacacaacatcaagaatgaaataaaagagataattcaacttcacttctttaaagttgtgctactgtaagcttttttaaaaagctatactt
gi|20 : gacagggggtccatttatttttccaccagttgatgaggggggggggtgtctaaaagggggtgtagatcaattaatagcgtgtgaattaacataaataaaaatcggaagccttaatttttttgaaccgagtaattgatgtctacatacaaaatgtacgaatgtaattaatcccttcattgtgcattgtcttacttgtttttatgaccatattgggccctattccgtaattaatactatatttaaaaagtttgtacaaagttggcatagtgttaatataggga-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------T-----T-T--------------G---------G---------TCT---------T-GTG----------AG------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-CT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----AT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGGA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AC-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGCT-------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GTT-A--TACTt
gi|21 : taacacagctgtacaagttgcacagtgttaatatggggaGTCTAAAAGGGGGGGGGATTAGCT-GCCATTTAAATAGCT-TGTTGAA------A-AT---TTAAC-ACTTAATT--CGG-TAGGCCTTTTAA-TTTATTT-GAACAACGG-A-GTA-C---T---G-ATACAAATGGTTA---------TC-TA-----CA-TA-CTT-AAAA--TTGAC-GAA-A-TG-TAt
gi|23 : gacagggttggatcccattttattttcttttttcaagttaagggtgagg-GTT----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AT--------TTG-----GA-A-AA--G-G---GTA-CT-CT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----AT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-A--AAA-AA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GAC--AAGC--------A------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACT
gi|24 : --A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-CT-GCG-TTTG--G----T-A-G-GG--AT------------A----T----CT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-TTAAAAAAAAA--GCT-A--TACT
gi|26 : cGTCTAAAATAGGGT----TTAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-TAA------GA------TGAAC-ACTT--AT--CGGATA-GCCTCT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT-TTGCT---C-----GA--A---t
gi|27 : gggagggggag-A-TA--G-G---GTA-CT-GT-ACG-TTTT--G----A-A-A-AG--AT------------A----T----AT----ATT-T-TGGCAC-A-----T-TT-C--AAG-AA-TGAA-----A--TAAAA-TA-G-TAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AA----------------------GTT--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAAT-GCT-A--TACT
gi|28 : TAA---A-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-GC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-tgt
gi|3 : tcccgtacatgagaagactggatgattagggtattgaaaaatttcaaatatcggttttcgtacatttcaataatGATA-GCCTTTT-A-ATT-TTT-GAAC--C-G-A-GT--C---T---G-A----------T-----------C-TA-----AT-TA-C-T-TAAA--CTGAC-G-A-C-TG-TAT-T---TGC-C-----GAGAA---TTAAAT---CACT-TCATTG-T--G-C-AT-T----CC-----TA----CTTG--TTTCATGGCCA-A--TAT-T---GAGGTTTC--CTAGCTGATTCTAGGTCAATA-A-T-----ACTA----T-GT-------T----AACA---C-TC-----TG------A--T-------ACAAAATTGACAG---T-----TG-----CTTAAATATAGGGAA-----C-A--------------GTT-------G---------TTT---------T-GTGGGTTTTCTCTAA------GAA--ATGA-TTTTTTCG-----------T--AATGT-AC--------TTG-----GATACTG--GAG---GTAGCT-CTAGC--TTTT--GA---T-A-A-GG--AT-----------------T----CT-----TT-T-TGACAC-A-----A--T-C--AAA-AACTGAA-----AAATAAAAAGT-GATAA---T-----T-C-AA-C-T-CACTTTTTTGAAGT-TG---TGCTT--AAA-AC----------------------GGC--AAGCTTTTCTTTT------------------TTTT-T-----AAAAA--G
gi|31 : AA-AA-TGAA-----A---AAAA-GA-GATAAATTTCAACAT-C-AA-CTT-CAC-GCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-ACAAAGTTGTTGCTATTAAAAGATGGT--AAGC--------T------------------TTTT-TAAA--AAAAA--GCT-A--TACTagcta
gi|32 : --A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-GT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----AT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GATGA---T-----T-T-AA-CTT-CAC-TCTTTAGATT-Ttgt
gi|34 : A-T---CCCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGT-CTT-----TA----CTTG--T-------CCA-A--T---T---GGG----aaaaagct
gi|36 : T--TGGATA-GCCTTT--AATTT-TTT-GAAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--CTGAC-G-A-C-TG-TAT-T---TG--CTCGAAGA--A---TTAA-T---CCCT-TCATannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggaaaagcaaaagagtcttgttgatgtc
gi|37 : taTT--A-ATT-TTT-AAAC--T-G-A-GTA-C---T---GTA----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-TCAAAA--TTGAC-T-A-A-TG-TAT-T---G---C-----AT--A---TTAA-
gi|39 : -----A--TAAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CG---------AAT-TC--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------TTTT-A-----AAAAA--GCT-AATTACTctttgaagaatta
gi|4 : GTCCAGAAGG---T----TTAGATAG-CATTTTAATAACTATG-TGAAGATT-GA-AT---TGA-C-ACTT--TTTACGGATA-ACCTTT--A-ATT-TTT-TAAT--C-A-A-GTA-T---CATCG-A----------TG---------TC-TC-----CA-TAAC-T-AAAAATTTGAC-G-A-A-T--TAA-T---T---A-----AA--G---TTA------CCCTATCATTG-TTAA-C-AT-TGT-CAT-----TA----C-----------------------------AG----C--T-------TTC--GGTA---A-A-A-----A--A----T-AC-------C----A------T-AT-----TA------A--C-------ACA---------T---T-----TA---------------------------A--------------A---------A---------TCT---------T-GTG----------AA------G-A--A--A-T------G--------------A-TGT-AC--------TTG-----AA-A-TAG-G-G---GTG-CT-AC-TCG-TTTTGAG----T-A-ACGGAAATAAAAGTGGCATAA----T----CT----AAT-T-TG-CACGA-----A-ATACGGAAA-AA-TGAC-----A--TAAAA-AA-GATAA---T-----C-CAAA-CTT-CAC-TCTTTAAAG--TG--TTGCTAC-AAGAAC----------------------GGT---AGC--------T------------------TTtg
gi|40 : cccaaaagG-TTTT--G----T-A-A-GG--A-------------G----T----CT----ATT-T-TGGCAT-A-----T--T-C--CAA-AA-TGAA-----G--AAAAA-AT-GATAA---T-----actt
gi|41 : AA---T-----T-C-AT-CTG--AC-TCTTTAAAGT-TT--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------T------------------agagattgatcaaac
gi|43 : AAC--C-G-A-GTA-C---T---G-A----------TACAAAATGTATC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT-T---atacttgtccatcaaagat
gi|46 : -GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT-TTGCT---C-----GA--A---
gi|47 : --A----T-AC-------T----A------T-TC-----TA------A--C-------ATA---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------Tg
gi|5 : atGTCTAAAAGGGGGT----TTAGAT-G-CAT---GATAACT-TG-TGAA--TTTGA-AT---TGAAC-ACTT--TT--CGGATA-GCCTTT--A-TTT-TTT-GAAC--A-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--ATGAC-G-A-A-TG-TA--------------------A---TTAA-T---CCCT-TCATTG-T--GGC-AT-TGT-CTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACCA-A--TAT-T---GGG----C--C---ATGATTC--GGT----A-A-T-----A--A----T-AC-------T----A------T-AT-----TA------A--C-------ACT---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------TCT---------T-GTG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------TTG-----GA-A-TA--G-G---GTG-TTCTT-GCG-TTTT--G----T-G-A-GG--AT------------A----T----CT----ATT-T-TGACAC-A-----A-AT-C--AAA-AA-TGAA-----A---AAAA-GA-GATAA---T-----T-C-AA-CTT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTACTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------T------------------TTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTtgcac
gi|6 : G---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AAAA--TTGAC-G-A-A-AG-TAT-TAAAT---C-----GA--AGAATTAC-T---CTCT-TCATTG-T--G-C-AT-TGC-CAA-----TA----CTTG--TTT-ATGACCA-A--C---T---GGG----C--C---CTGATCC--GGT----A-A-T-----A--A----T-ACTATTA--T----A------T-TC-----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----A-------------A-----C-T--------------A---------G---------
gi|6 : g---------T-ATG----------AA------GAA--A--A-T------G-----------T--A-TGT-AC--------TGG-----GA-A-TA--G-G---GTA-CT-GC-ACG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----CT----ATT-T-TGGCAC-A-----T-TT-C--AAA-AA-TGAAACATGA--TAAAA-GA-GATAA---T-----G-A-AA-CCG-CTC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAAC--------TTTTTAATTTATTTTTTCTTTTT-T-----AAAAA--GCT-A--TACTaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattatatgaagaaaatgtatgtactgggaatagggtactgcacgttttgtaaggatatctattttggcacatttcaaaaatgaaacatgataaaagagataatgaaaccgctctctttaaagttgttgctaaagacggtaaactttttaatttattttttcttttttaaaaagctatacttgt
gi|7 : ggtctacatactaaaattgacgaaagtattaaatcgaagaattactctcttcattgtgcattgccaatacttgtttatgaccaactgggccctgatccggtaataatactattatattctaacacagttgaactagaggccttaatcagttttaatataggggacagcggttttttattaC--T-G-A-GTA-C---T---G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-C-T-AATA--TTGAC-G-A-A-TG-TAT-TAACT---C-----GA--AGAATTAC-T---CCCT-TCATTG-C--A-C-AT-TGT-CTT-----TA----CTTG--TTT-ATGACCA-A--A---T---AGG----C--T---CTGATTC--GGT----A-A-T-----A--A----T-AC-------T----A------T-TC-----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----T-------------A-----C-A--------------A---------G---------tgt
gi|7 : ---------TCT---------T-GTA----------AA------GAG--A--C-T------G-----------T--A-TGT-AT--------CTG-----GA-A-AA--G-G---GTA-CT-GT-GCG-TTTT--G----T-A-A-GG--AT------------A----T----TC----ATT-T-TGACAA-A-----T-TT-C--AGC-AA-TGAA-----A--TAAAA-TA-GAT-A---T-----T-C-AA-AAT-CAC-TCTTTAAAGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGT--AAGC--------C------------------TTTT-T-----AAAAA--GCTAA--TACaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgatcttgtaaagagactgtatgtatctggaaaagggtactgtgcgttttgtaaggatattcattttgacaaatttcagcaatgaaataaaatagatattcaaaatcactctttaaagttgttgctaaagacggtaagcctttttaaaaagctaatac
gi|8 : ctgagtactgatgtctacatactaatattgacgaatgtattaactcgaagaattactcccttcattgcacattgtctttacttgtttatgaccaaataggctctgattcggtaataatactattctaacacagttgtacaagaggctttaatcagttttgatatagggaacagtggtttttgaGGGGT----TCAGAT-G-CATTT-AATAGCT-TG-------TT-GA-A----TGAACAACTT--AT--CGGAGA-GCCTTA--A-TTT-TTT-GAAC--C-GCACGTA-C---T---G-AC---------TG---------TC-TA-----CACTA-C-T-AAAA--TTGACGG-A-A-TGATAT-T---T---
gi|8 : aCT---------T-G-G----------AA------GAA--A--AAT------G-----------T--A-TGTTAT--------TTG-----GA-A-TC--G-G----TATCT-CT-GCC-TTTT---------A-A-GG--AT------------A----TA---TT----ATTGT-TGACAC-A-----A-AT-C--AAATAA-TGAA-----A--TAAAA-GA-GAT-A---T-----T-CAAA-CTT-CAC-TATTTAAGGT-TG--TTGCT---AAG-AC----------------------GGC--AAGC--------T------------------CTgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggcttggaagaaaaatgtatgttatttggaatcggtatctctgccttttaaggatatattattgttgacacaaatcaaataatgaaataaaagagatattcaaacttcactatttaaggttgttgctaagacggcaagctctgctata
gi|9 : aggggttcagatgcatttaatagcttgttgaatgaacaacttatcggagagccttaattttttgaaccgcacgtactgactgtctacactactaaaattgacggaatgatatttgcttcagagaatctataacaaagttgtattaagttgcacagtgtctatcatagggaaacacgtttttttggCTTA-TT--CGAATA-GCCTTT--AATTG-TTT-GAAC--T-A-A-TAA-C---TA--G-A----------TG---------TC-TA-----CA-TA-T-T-AAAA--TTGGC-A-A-A-TG-------------------------------------------ATTG-T--G-C-AT-TGT-CTTTATAGTA----CTTG--TTT-ATGACCAGA--TTCAT---GGG----T--C---CTGGATT--GGT----A-A-T-----A--A----T-AC-------T----A------TCTC-----TA------A--C-------ACA---------G---T-----TG-----TA------------A-----C-AC-------------A---------G-----------T---------T-GCA----------CA------GTGTTA--A-T------A-----------T--A-GGG-ACAGTGGTTTTTGGTTTTGA-A-GA--A-AAT-GTA-CT-GT-AC----TT--GGGAAT-A-G-GG--AT------------A---------CTGTGCGTT-T-TGGCGC-AAGGACA-AT-C--AAA-AA-TGAT-----A--T-AAA-GA-GATAA---A-----T-C-AA--TT-CAC-TCTTTAACGT-TG--TTGCTA--AAG-AC----------------------GGCAAAAG------------------------------TT-T-----AAAAA--gctata
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATGAACTATATTGATGGATTGATGGTGGTAAAAATAAGCTTGATACAAAAACATGAAAGTTTGTTTTATATGGTAGCAGGGGATGCTTAATGCCAGACACTTAATACCACTTCTGATATTTCCGGGCGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
Unaligned ( gi|25 ): ATTATACATGCACAGAGTTTCAAGTCTATTAGTGTCCACAAGCAAATTTACATCCACACCCGGGCCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|29 ): AGTTATGGTGGATGGTAACGCTGTGGATGTAAATTAAGCTTGCTGGGACACTTATTATATTAGACTTGAAAACTCTTGCATGGCATAATGCAATGTTGCATTTACAATCTCAAATTGTTT
Unaligned ( gi|30 ): GCTCTCCTTACACAGAGTTGTCGGTCCTTATCTTCCCTTAACAAAAGACGAAACTCATGTAGCTATTGAGTGGATCTCAGTGAGGCCGGCGTGTGGATCGTAAATTAGCGGTGGACAG
Unaligned ( gi|33 ): GGAACAGTGGATTTTGATCTTCTGAAGAAAATGTATATATATGTACTGGGATCAGTAGTCCAGTCAAACAGGGTACTGCACTACTTTGGCACTTTTCAATAATC
Unaligned ( gi|35 ): ACTATGCTGCCCAGAGTTTTGGATCTATTAGGCCTATAACGATGTCCTAAGCTAATTAACATTCCACACCTGCCTCACTTAATCCACTCATA
Unaligned ( gi|38 ): AATTTACATCCACACCCGGCCTCACTTAGATCCACCATAACTACATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCCT
Unaligned ( gi|42 ): CGGCCTCACTTAGATCCACCATAGCTACATGAGTTATCGGTCCTTATCTAAGGGAGAGA
Unaligned ( gi|44 ): TCACCCTGATCACACATCATAAGCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTC
Unaligned ( gi|45 ): TAGTGTCCACAAGCTATTTACATCCACACGTTACCGGGCTCACTTAGA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCATTCTCTTACACAGAGTTGTCGGTCC