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Reference ( gi|1 ) : TCCTCCATATGTTGTTAGAGTCTGCTCTTCACGTACAGGCAGCTCTTCGATTGCATCTAACGCTTCTTGGGTG-CGGAGTTTTCCCTGGAGTAGAGT-CAAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCC-ATTTGCTTTTCCCCTGTCT-T--TGACTTCCCCTGTCTTTGATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGG--TTGCTGGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATGCTCCTGATG----CACTATCCGACGCTT-GCTGAATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-A-AGTCGTTGGCGCAA---------TGTCGT--GC-TGT------TT----AC-------------G--TGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTTTATTCAGACTTGGGTTACGCTGTATAGC---GATAAGT-GCA---T--TGCGT-TTG-CA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGGGCTTCAA-CCAATCAGTGTTCTTGTGC---TCTTTTTT---GCCGTACGTCAAAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTTTCTAAGAGAGTTCCAGTTGT----CCGC---ATT-TTGTTCT---GCATTTATA--TGAGTTGTTTTAAGAG---T--------CTCCTC--AAGTTGTT-----GT--------TGA---A-CTCT----TG---ATTCTTT-----CC--GGGTAA-GC-CGT-T-TTAC-T---G-AT-G--TTGAT-----CC-TGGG---C-GACC-----TT--TAT-CTT--TGAATGATG-AA---TTCT-TTGG----TTCAG--TTTCACCTTTGT----GGT--CAA----G-GAGTGATCAGTGTCGCAATT--CAGACATT-TG-AT-AGGACCTGGTGTT---G---CAAA-CATTG----TTTAGGG--A-ATCACACTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATGCCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA-G----GATA--TTGT-G-GCAT--GCCTT-GTTCTGA-AAGT-AGG--TGTTCATCACG--CAG--AGC-TTGC-------------G-GTA--GCA-G---------CAGAGAT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTTCCTA-TACCGTG--A--TG---TCC--C------AAAAC-GTTT---GG---C-AT-GA--TTC-TCGGTC--T-GC-A----C-----G-ACTC-GC-G-CG-TT---GAAGT-C------GC--------TC--------T-GAT---------------A------TGCTT-CTGCTTCTTGGG--AT--------G--TCGCTG-ACAA-C-GGTG-TCTAATGAACTCG-TAG-AA---TTGG-T-C-T-TT--ACTTC--CAGC--AAGC-TTGC-TG-TGTT-GG-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA-GGGTTC--CCGG-----ACCC---TGC--A-TGGATGAC---A-GGC---GC-----GC--A---TAAAAATTCTCTCTGT-ACCGCCTGT---G---GGTTCAATC-ATCG-G--AAG-CAA--TGC-ATGGCGT-----A-CTGC--AAATTCCA---A--C--AC---CGTG----T--TC---------C---CT-----------------CA-------TTCCTC-AG-TGC---C--T-T--TCC-CTTG-CCAGAAG--AAGGTATTAGA-----TGTTCCTCC---TTC----A-GG-ATCCC--TC-TCTC-TG-G--AGTCGCATT---C--T-GC-AGG-GCTGC--TA----TGT-CGATGTTT-----A-T-C-TG---TACA-GT--TCACAGATC-A-TCA--------CTGCTGTTTTTCG----CGCA--TCAT--CCATGACCTGAAGGT--CATCTGTC--AGCTC-GGGCG-CATAGTTTCTACATTCCAGCTTGCTAATC-GAAGAGCT---GG-G--A---CTT---CGT----TT----TTCTTT--TTCTTTTG--CTTGC--C-TGG-ACAC-GGTTTAACG-ATCC-ACTTGTCA-AG---CTCATAG-ACT----CT--AAGCT--CCAGGCACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGGC-GGGTG-CG----CAG--C-----TTACTG-T-G--GGGGG-CTGCCCAG-CTTGAGGCGGGCGGTAGCT-GACCCAGT--AGGAT-AC-GATGATCCCTCC--CACC-GTC-GAAGACAACCCGTAGCGT-ACAA-C-CTAC-GCCAATCGAGCAAGGACTTATCA-CTCGTAAACTGTTGTCT-TCCG----TGTTG-------T---TG----CTCT-T---------------CCCGGTAA-AGGTGA--GACTGG-AGT-G-CCCCTC
gi|6 : AACGCTTCTTGAGTAACGGAGTTTTCTCTGGTGTAGAGTTCCAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCCCATTTGCTTGTCCC-TGTCTGTGATGACTTCCC--GTCTT-GATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGGGTTTGCCTGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATACTCCTGATGTTGCCACTATCCGACGCTTTGCTGGATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-GTAGTCGGTGGCGCAA---------CGTCGT--GC-TGT------TT----GCTGTGCTTTGCTATG--TGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTT-ATTCAGACTTGGGTCACGCT-TATAGCT--GACAAGT-GCG---T--TGCGT-TTGGCA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGG-CTTCAAACCAACCAATGTTCTTGTGC---TCTTTTTTT--GCCGTACGTCAGAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTT-CTAAGAGAGTTCCAGTTGT----CC-CTCGGTT-TTGTTCT---GCATTTATA--TGAGCTGTTTTGAGAG---T--------CTCCTC--AAGTTGTTT----GT--------TGA---A-CTCT----TG---GTTCTTTT----CC--AGGTGA-GC-CGT-C-TTAC-T---G-AT-G--TTGAT-----CC-TAGG---CTGACCC----TT--TCT-CTT--TGAGTGATG-AAAC-TTCG-TGGT----TTCAG--TTTCACCTTTGT----GG---CAATAATG-GAGTGATCGGTGTCGCAAT---CAGCTCTT-TG-AT-AGGACCTGGTGTT---G---CAAA-CGTTG----TTCAAGG--A-ATCACGTTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATACCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA-G----GATACCTTGT-G-ACAT--GCCTT-GTTCTGA-AAGT-AGG--TGTTCGTCACG--CAG--AGC-CTGC-------------G-GTA--GCA-G---------CAGAGTT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTTCCTA-TGCCGTG----------------------------------------------A--TTC-TCGGTC--T-GC-AC---C-----G-ACTC-GC-G-CG-TT---GAAGT-C------GCAAAGAAGGTA----------GAT---------------A------TGC-T-CTGCT--TTGGG--AT--------C--TTGCTG-ACAA-C-GGTG-TCTAGTG-ACTCG-TAG-AA---TTGG-TCC-T-TT--ACTT---CAGCCGAATC-TTGC-CG-TGTTGGG-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA--GGTTCA-CCGG-----A
gi|21 : TTCTGATGTTTCCGCTGTTGAACGCTT-GCTGAATGTTATCTGACAATTGTGACCTGTA-A-A--CATTTGC-CAAGCCCCG---TGTCATAAGC-TGTGATCTGCT----GT-------------G--TGCAACTCCCAGTACC--TAGGTTT-TTCTGACTTTTATCAAAC-ATATAACT--GATGAGTAGTAGACTGATGCATATTG-CAGACCCATTGACTGtgt
gi|7 : ATTCGAC-CTT-GCTGA-TGTTTTCCGATAA-TGAAGCC---AGA-AGTCGTTGGCGCAACGCGTGATGTGTCGT--GTGCGT------TTTGGCAC-------------GGGTGCAGCTTGCAATGCCTGTAG-TTAATTCAGACCTGG--TACACTTAATAGTCTGGATAAGT-GCGGC-T--TGCGT-TGG-CAG--TCA-TGACTGGCTTCCATCTCAGTAATTAAACGTGG--TTCAAACCACTCAGTGGTACTGTGCCGCTCTTTTTTCTTGCCG-ATGTCGAAACGTGCAAGTGCTGTGAATGGCGTT-CTAAGAGTGTTCCAGTGGTTCTCCCGT---GTGGTTGTTCCCTGGCATTTATAAATGA--TGTTATAAAAGATGT--------CTCCTC--AGTTTGTTT----GT--------TGA---AACTCT----TG---TTCTTTT-----CC--GGGTAA-GC-CGT-CGTTACGT---G-ATTG--TTGAT-----CC-TGAT---CTGACC-----CT--TAT-TTT--TGA-TGATG-AAACCTTCT-TGGT----TTCAG--TTTCACTTTTGTTGCAGAT--CAAA---G-GAGTGGT-AATGTCGCAATCACTACCCCTT-GG-ATCAGAACCTGGT--T---G---CAAAACATTG----TTTAGGG--ATAT-ACGCTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTGCGAATGCAG-GT-TTTT--GACCT-CTGGA--TGTCTCAA-GA-G----AACC--TTGTGG-GCAT---CCTT-GGTTTGATAAGTAAGG--T-TTCGTC-CG--CAA--A---CTGC-------------GCGTA---CA-G---------CAGGAGTTCCAA---GAAG-CC-----TCTG-----A-C-GTTCTCCT-TCG--TC-TCCCTAGCGCCCTG--A--TG---TCCTAT------AAAAC-GTTT---GGGC-C-ATCGACTTCC-TCGTTC--TGGC-GCGACC-----G-ACTCTGC-GTCGTTT---GAAGTGCCAAGAAGC--------TT--------A-GAT---------------A------TGCGT-CTGCTTC-TGGG--ATC-------GTCTCGCTA-ACAA-C-GGTG-TC--ATG--CTCG-T-G-AGTTTTTGT-C-C-T-TT--AATT---CAGTGGAAGCTTTGC-TG-TGTT-GG-A-GGAAGACGCAA--AA-CAA--GGTTCA-CCGG-----A-CC---TGC--ATTGGAT-AC---ATGGCGGGGCA----GC--A---T-AAATTTCTCTCAGTGGCCGCCTG
gi|20 : TATA---GTGTTGTTTTAAGAG---TTATGGGATCTCCTTCTAAGTTGTTTTCTCGTGCTTTTGGTGATCGA-CTCTGTGGTGTATATTTTCTTGTCACCAGGGGTAAAGCTCGTCT-TTAC-TTTAGTAT-GCTTTGATGCCTGCC-TGGG---CTGACCACCCCTTCGTATTCTT--TGAGTGATGCAAAACTTCTCCTGGTT--TTCAGTTTTTCACCTCT-T----GTT--AAA----G-TAGCAATCA
gi|19 : CT----CA---ACTTTCT-----CA--GGGTAC-TG-CAT-C-ATGC-T---G-GT-G--TTGAT-----GCATGGCTTCC-CAAC-----TT--T---CTTGCTGCA--ATG-GA---TCCTCTTGGGGAGT--AG--ACTGGTCTTGAT----GCTTACAA----GCGAGTGGTCAGTGTCACAGT---CTG-CATT---------G---TGGTGTTTGAG---TACA-CAGTACAAATTTGAGGTTG-GTT-CACTT---AGTGATGACCACGTGTAGC---------CA-GTGCTTT--GAGTG-T-GGA--TGTCTC---CA-C----GACACTTTGT-G-ATGT--GGCTT-CATATGG-AAAA-AGG--AGTTGGTCACA--Cagg
gi|27 : GT--CCA----GCGAGTGGTCGGTGTCGCAG-T--CAG-CGCTGTG-GT-AG---CTGCGGGT---GAACCAAA-CTCAG----ATCAGCG--A-GTCTCTCTT---GGTAATGACGAGATCTAGCTG---GTGCCA-ATATT
gi|10 : acGCGGTCTGTGTCGCAGT---CAG-CACTGTGCAT--GCTTTTGGTGTT---C---TTCA-CATTG----TTTA-------ATCTCTCCTTCTGGTCAAGATCATGTCAAGCTG---ATGCAA-ATGCTTA--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CA-at
gi|3 : gcacttttggtggcatgacgcggtttgttcccatatgctaggggcgcagcacgtttgaccgccgctgcaggttccattacttcccagttcacctcaaaccagcccttcttccgatgctctttcttctcaagggcctctactgagcgtctgtagtggtggagtcttctctgagttttcccagtgatgtttttaaagttttgcataatctctgggaaaaggaacagcacaaggttcggctagcattgatgcgtcaaaggctcttggtcttggtgtggtgcattttgcgtaggatgaggttgatcttggagagtactaaggtccatGATCATGTCAAGCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CATA----AACT--TTGT-G-TC-T--ATCTTAGTGCTGG-AAGA-AAG--TGTTCATCA----CAGCCAGG-TTTT-------------T-ATA--AAA-G---------CATACCT--CAA---GAAG-TA-----TTTG-----AAC-ATTGTCAT-TCA--TTTTCCCAA-TA-------A--TG---TCC-----------AAT-GACTGAAGG---C-CTGGA--TTC-AAAGTC--T-GC-AC---C-----A-ACCC-TT-G-CA-TT---GAAGT-C------TC--------CCA-------T-GA----------------AGAAGAGTGCTT-CT--TTGTTGGGTAAA--------G--T-ACAG-ACAA-T-GGGG-TCAAAGGCA-TAA-TAGAAA---CTGACC-C-T-TT--TCTTCTACAGT--GGAC-T--C-TG-AGTG-GA-G-Ccggcactctgt
gi|8 : catcttcctgctcaaTGTCAATCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCAC---CA-T----GCCA--CTTT-GTGTAT--ATCTTTGTGCTGA-AAGA-AGG--TGATCGTCACAGTCAT--ATT-TT------------------TATTGGA-G---------CATAGCT--CAA---GAAG-TC-----CTTG-----ACC-ATTTTCAT-TCA--TTTTTCCAA-TCCCATA--A--TG---TTC--tcatagttgcagcataagcacacacaaaattgactacacctatacctatagccatccacagggtcaggaagtctctctgtccccctgttgggggttttatactgcaacgcccacgtcgtgaattctggattcacctggcttcttcccccgccagaagaatttgtaggttttttttcttttagttatccctcatcagccagtcgggtttcttgtagaacagttatgtcgatgcagagtcggcggagctctctgtcgatgatggcggtcttctgtaggtcacccatggcctgtggatcactgttgaagcctggatacatagttctaacattccagctagctggggtcttcggaattctttgttttgcctggtgctgggttttcgcaacctgcctgtcgattttgtctacgcttcatgcacccaatgaacccagcaagttgaggcggggtagtacctaattgcgagaggactgcctgggcaaggcggaatgtaactacccaatggaacgtgaaaattcctcccaccgtcaggagcaatccctagcgcccggctctacgccaatcgagtttgggcttatcactggtaactgctgctcccattgttgtacctacactgtctcagcgaagctgtagtgacctctccaggtgcaggcctgggcagatgatatggagatcctgaagtgcctagtcgccaggatccccctctcggcgttgcttacaggatccggcagagaggcaagtcaacagttcagcgcagctgcaggagttgccagaaggtttcgcagggctcagccaactgcctaaagggctccactcctgattttctgttggggtgaactcccatagccttggactcttccgggccgttcacaaggcagtgaggctatttgacccatagctgggggtctggatcgtgggcagcagagcgtatccacaaaccggtgagccatgcatgctacatgtttaggggccagaccttctccaagtcccttgtagtctagcccggctatgaggtataac
gi|15 : ttggtgttcttcacattgttaaggttcctcttcctTGCCATGTGTTTTTAGACCTTC-GGGAGTGTCCCTCCCA-GTTGAGACC--TTGT-G-GCATTCGCCTT-GTTCTGA-AAGT-AGGGATGTTCGTCACG--CAG--AGCGTTGCTAATTTTTTTGGGG-GTA--GCA-GCTCATGGCCCAGTTGT--CAAAATGAAGACCATTGTTCTGTTAAAACG-GGTCTCAT-TCACCTCTTTCCTA-TG-CGTGAAA--TG---TCC--CAAAAAAAAAACAGATT---GAAGCC-AT-GA--TTCATCGGTCATT-GC-T----CTCCGGA-ACTC-GC-A-CG-TTTGAGAAGT-C------GC---------C--------A-GATAGAAAGGTAGAGATAA------TGC-T-CTGCTTCTAGAG--ATCTTGGATCG--TCGCTGTGCAACC-GGTG-TTTaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatccgcagggtcaggagtctctctgtcccctatgttgggggttctatactggacagtagggagttcttcactacaaagcccaagccgtgtattctgggttgatttgctttctttccctgccagaggaatgtgtaaaaaaaaacattgcgtagggatccctcatcagccagtcgggtttcttgtaccgcagctatgtcgacgcagagacgatggagctctctgtcaatgatggcggtcttccgtaagtcgtccatggcctgtggatcactgttgaagcttgaacacatagttctcacttccagctagctatacgaagtgctggggtcttcgggattctttgttttttgcctggtgctgggtttttcaacctgcctgtcgattttgtctaagctccatgcacccaatgaagcaagcaagttgaggcggggaagtacctaactgcccgaggactgctcaggtaagacgggcggtaactatccaatg
gi|2 : AG--AGC-TTGC-------------G-GTAA-GCAAG---------CAGAT-T--CAA---GAAG-AC-----TCTG-----ACCCGTTCTCATGTCA--TTTTTC-TA-GCCCGTG--CCCTGCCTTCC--C------AAAAC-GTTG---GG---CCAT-GCCCTTC-TCGGTC--T-GCCA----CCA---G-ACTT-GCCG-CG-TT---GACGT-C-------C--------GCAAGACAGGTAGAT---------------A------TGCTTTCTGCTC--TGGG--AT--------C--TCGTCT-ACAA-CAGGTGGTCTAATGA-CTCGGTAG-AA---TTGG-TTC-TCTT--ACTTC--ATGCCGAAGC-TTGCCTG-TGTT-GG-GGCGTAGACGC-A--AAACAAAGGGTTCACTCGG-----AACCGCTTGCCAG-TGGATG-C---A-GGC---GCAG---GCGAA---TTAAAATTTCATCTGT-ACCTGCTGG---GTTTGGTTCAATC-ACAGCG--AAGATAC--TGC-ATGGCGC-----AACTGCCCAAAT-CCA---A--CTAAC---CGTG----T--TT---------C---CTTCACATCCAGTTTCGCCCACGATTTTTCCCTCCAG-TGC---C--T-T--TTTTCTTGACCAGAAAGAAAGGTAT-AG------TGCTCCTCC---TCA----G-GG-ATCCT--TC-TCGT-GG-G--AGTCGTGTTTTCC--T-GC-AGG-GCTGC--TA----TGT-CGATGTTTTCAGTA-T-CCTG---TGCA-GTGGTCAC-GATC-AATCA--------ATGCTGTTTTTCGGGGTCGCA--TCAT--CCATGACCTGAAGGT--AAT-TGTC--AGTCC-TGGAA-CATAGTTT-TACATTCC-GCTTGCTAATCCGAAGAGCT---GG-GGAA---CTT---CGT----TT----TTCTTT--TTCTTTTG--CTTGC--CCTGC-ACACCGGTTTAACGTATCC-ACTTGTCAGAGACCCTCGTAGCACT----CTTTAAGCTTCCCAGGCACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGG----GTGGCG----TAG--CACCCCTTACTG-C-T--GGGGG-CTTCCCAG-CT-GGGCCGGGCG-TAGCTTGAG--AGTGGAGGATTAC-GATGATTCCTTCAGCACCCGTC-GAAGACAACCCGTAGCGT--CCA-C-CTACGGCCAATCGAGCAAGGACTTATCACCTTGTAAACTGTT-TCTCTCCGCAATTGCTGTCCATCTT---TGACTCCCCT-TTCACCACTTCTCCACCCCGGTAA-AGGTGAGGGACTGGCAAT-GACCTCTCc
gi|4 : TTCTCAT-TCA--T-TTGCCCA-TACCA-A--A--CT---TGC--C------GAGGCAGGAT---GG---CCAC-GA--T-----GGTC--T-GC-A----C-----CCACTC-TA-G-CA-TT---GAAGT-C------GC--------agggcgcggcctgcaaagtcatattgggatcctggctgcccctaagccaaggatccccctctcttctccctggatgtgttttcaaaggatcgcagggcgatacgtttggcatcagtttgtgctgcagattttcctgtaggtttactcaaattagccctttcctacttccgaggttatccacaaggcacgtgggttttgtttgctatttactcatagctcgggactaggattgcaggcaccgcagggcatatccaaacaccgatgtgccatgcatatcgcttgcattagcgggctctagtctcctccaagacctgtggtcctgctaaaggggccaatttaacgcaaaacaaaacacataattaaagtactccccaagcaccactcaccacatggccctaaagcaatttcgtagaacacagaa
gi|16 : catG-TAG-AA---CTGA-T-T-T-TTTTATTTT--GGAT--GAGC-CTAG-TAATATT-GG-G-CGTGGGTGC-A--CA--AA-AGGTTC--CCAGCTAAGACCC---GG---A-TTGATG-CTCGA-GGT---GCAATGTGC--A---TGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GGTTCAGTCCACTC-G--AAG-CAG--TGCCGTGGCGT-----A-CTGC--AAAT--CA---AGAC--AC---CATGCATGT--CT---------C---CT-----------------C---------TCCTC-GG-TGC---C--C-T--GTC-CTTG-CCAAAAG--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC----G-AG-GGCCT--AC-TCACATG-A--AGTCGCGTTCC-C--C-GC-GGGAGTCGC--T-----TGT-TGGCGCTC-----AGT-C-TG---TGTA-GC--------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGCG--TTGT--CAATaagagaaacgagtttcttcatgactgggatgctctcaattgatggatcacaggtttctcatagaattcacctagtgtctggggtggaagacagagtcggtgcgtacacactgacaagggtgacgggaccgcagtggtactgacgcggaggtcagacattgctgcctggttctaccatagctcaagcaagctgtttcttcactgcaaagcctactccatgctctttgggttcgtcggatgttttcccttgctactaaaacgtgaaatctttctcttttaatgtgccagtgccgctaagcgccgttttcttgaagagtggttatgtccacgttcattctcttgagctcgtcgtttatgacagctgtatttcttgcgttgttgcaatgtctagatgtttcacagaaaggccgatcaacattgtccggacattccaacttcccagttttagagctgatccctttatattgttgtggtttttttttttttgttgcctggtgcgaaagctgcgacctgcagtttggattactcctgatctccatgcacccaatgaagaaagcagaccgtggcgggacgacaccaattggctggggactgcccagcttaaggcgggcggaagctgtccagtgaaatccgagaatatctcccaccgtcagagcaacccccggcgccgcgctctacgccaattgagcggtagcttataaccggtaactgctgctccccgtttgtgtcgaggccataggcgaagctggagtggcctctccaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|5 : tA---CTGG-T-CAT-TT--GCTTC---AGC--GAGC-TTGC-TG-TGTG-GG-G-CGTA--CGC-ACCGC-CCC-CGGTTT--CCGC-----GCCC---TGC--C-TGGCTGCC---A-GG----GCAA---GC--C---TACCA-TTATTTCTGT-GC-GCAGGT---G---G-TTCACTC-CTCG-C--C-G-CA---TGCCATGGCGT-------CTGC--CA-CTCC-------C--AC---CGTG----T--TCGTCGTGTATC---CT-----------------AG-------TTC-TA-AG-TGC---AGGT-T--TTC-TTCG-CCA--AGCCGCGGTAT-AG------TGTTCCTATGGATGC----GTGG-ATTTA--CC-TTTC-TG-GG-AGTAGCGTTTTCC--T-GTGAGA-GGTGCAGTAACCTTGTTCGCTGTTCG----A-T-C-TAAGATGCAAGT--TCTC-GATA-A-TCAAATGTCGTTTTTTGTTTTTCG----CGCAAATAAT--C--TG-CCTGA-GGT--CA-CTGTC--AGTCCTGGGCG-CATAGTGTTTCCATT--AGCTTGCTAATC-GAAGAGGCATGGG-G--A---CTTACGTGT----TT----TCCTTT--TTCTTTTG--CTTGC----TGG-TAAC-AGGTTAACG-ATCC-ACTTGCTC-AG---CTCGTAG-ACT----CTAGAAGCT---CAGG-ACCATCTGAAGC--GCAG--TGTGGC-CGG-G-C-----TAGCCC-----TTACTG---GCTGGGGG-CTGCAC---TTTGAGGCGGGCGGTAGCT-GA---AGT--AGGAT-GTAGATGATCC--TC--CA-C-GT----GGACA---CGTAGCGT-CCAA-C-TCAC-G-CAATCGAGCAAGGA-TTATC--CTCGTAAACTGTTGTCT-T-CG----TGTTG-----------TG----TGTT-T---------------CACGGTAA-AGGTGA--GACTGG-AGT-A-GCCTTC
gi|4 : GTC-GGTG-CGTACACAC-T--GA-CAA-GGGTGA--CGGG-----ACC-----GC--AGTGG-T-AC---T-GAC---GC-----GG--AGGTCAGACATT---------GCTGCCTG---------GTTCTACC-ATAG-CTCAAG-CAAGCTGT-TT--CTTC----A-CTGC--AAAG-CCT---A--C--TC---CATG----C--TC---------T---TT-----------------GGG------TTCGTC-GGATGT------T-T--TCC-CTTG-CTACTAA--AACGTG--AAA-----TCTTTCTCT---TTT----A-AT-GTGCCAGTG-CCGC-TAAG--CGCCGTTTT---C--TTGA-AGA-GTGGT--TA----TGT-CCACGTTC-----A-TTC-TC---TTGA-GC--TCGTCGTTT-A-TGA--------CAGCTGTATTTCT----TGCG--TTGTTGCAATG-TCTAGATGTTTCA-CAGAA--AGGCC-GATCAACATTGTCCGGACATTCCAACTTCCCAGTT-TTAGAGCT---G-----ATCCCTT---TATATTGTTGTGGTTTTTT--TTTTTTTG---TTGC--C-TGG--TGC-G----AAAG-CTGCGACCTGC---AG---TT--TGG-ATTACTCCT--GATCT--CCATGCACCCAATGAAGAAAGCAGACCGTGGC-GGG-A-CGACACCAA--T-----TGGCTG-------GGGA-CTGCCCAG-CTTAAGGCGGGCGGAAGCT-G-TCCAGT--GAAAT-CC-GAGAATATCTCC--CACC-GTC-AGAG-CAACCCCCGGCGCCGCGC-T-CTAC-GCCAATTGAGCGGTAGCTTATAA-CCGGTAA-CTGCTGCTC-CCCG----T-TTG-------T----G---------T---------------CGAGGCCATAGGCGA--AGCTGG-AGTGG-CCTCTCagggcgcggatgggcaaagtatatggagatctggctgcccattgtaacggaccccttctttctccctgatatattccaaaggatcgcagggcgatacgtttggatcagtttggtgagatttctgtagggtttactcttagcatttcctactccgaaggtacacaaaggcaggggttgttgctatttacccatagctagggactaggattggaggcacttcagggcatatccaacacgatgtgcagcatgccttgctttaggggctgtctttctcaagacctgtgttctgctagggcatttcctacaaataattaatcccaacacccacctgatacctcccccccaaagaaagcaattcgtacacaga
gi|18 : catttctcattcatttgcccataccaaacttgccgaggcaggatggccacgatggtctgcacccactctagcattgaagtcgcaagagaaacgagtttcttcatgactgggatgctctcaattgatggatcacaggtttctcatagaattcacctagtgtctggggtggaagacaga-GG-G-CGTGGGTGC-A--CA-CAA-GG-TTC--CCAGCTAAGACCC---CGG--A-TTGATG-CTCGA-GGT---GCAATGTGC--A---TGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GGTTCAGTC-ACTC-G--AAG-CAG--TGC-GTGGCGT-----A-CTGC--AAAT--CAAGGA--C--ACATGCATG----T--CT---------C---CT-----------------C---------CCTTC-GG-TGC---C----C--TGT-CTTG-CCAAAAG--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC----G-AG-GGCCT--AC-TCAC-TGAG--AGTCGCGTT---CCAC-GC-GGA-GTCGC--TT----TGT-TGGCGCTC-----AGT-C-TG---TGTA-GC--------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGCG--TTGT--Ccaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|12 : AA-AGGTTCA-CCGG-----ACCC---TGC--A-TGGATGAC---A-GGC---GTA----GC--G---TAAAAATTCTCTCTGT-GCCGCCTGT---T---GGTTaa
gi|8 : aTCTCTCTGT-CCCCTATGTTGGG---GGTTCTAT--ACTG-G--A---CA----GT-AGGGAGTTCTTCA-CTAC--AAAGCCCA---A-----GC---CGTG----TATTC---------TGGGTT-----------------GA-------TT--------TGCTTTC--T-T--TCC-CT-G-CCAGAGG--AATGTGTAAAAAAAAACATTGCG------TA----G-GG-ATCCC--TCATC----A-GCCAGTCGGGTT---TCTT-GT-ACC-GCAGC--TA----TGT-CGACGCAG-----A-G-A-CGA--TGGA-GC--TCTCTG-TC-AATGA--------TGGCGGTCTTCCG----TAAG--TCGT--CCATGGCCTGTGGAT--CA-CTGTTGAAGCTT-GAACA-CATAGTTCTCAC-TTCCAGCTAGCTATAC-GAAGTGCT---GG-G--GT--CTT---CGG----GA----TTCTTT--GTTTTTTG--CCTGGTGC-TGG-------GTTTTTCA-ACCT-GCCTGTCG-AT---TTTGT----------CT--AAGCT--CCATGCACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGC-GGGGA-AG----TAC--C-----TAACTGCC-C--GAGGA-CTGCTCAG--GTAAGACGGGCGGTAACT--ATCCAAT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttcgagcatcatccatgacctgaaggtcatctgtcagtcctgggcgcattgtttttacattcaagcttgctaatcgaagagctggggacttcgttttcttttgcttgcttgagtcttgtaagc
gi|14 : ttggtgttcttcacattgttaaggttcctcttccttgtcaatctgatgccaatgcttggatcttggatggcaccatgccactttgtgtatatctttgtgctgaaagaaggtgatcgtcacagtcatatttttattggagcatagctcaagaagtccttgaccattttcattcatttttccaatcccataatgttcaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatccgcagggtcaggagTCTGT-CCC-CCTGTTGTG---GGTTCTAT--ACTG-G--A---CA----GC-AGAGAGTTCTTCA-TTGC--AAG--CCC---A--C--GC---CGTG----GA-TT---------C---TG-----------------GG-------TTCCTC----TGC---C--T-TCTTTC-CCCG-CCAGAAG--AATGTGTAA---------TT--TCT---TTCGAGTA-GGAATCCC--TC-g
gi|3 : aatgactgagggccactcctcaaagtctgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-----A-CTGC--AACGCCCA------C--GT---CGTGAA--T--TC---------TGGATT-----------------CA---------CCT---G--GC---T--TCT--TCC-CCCG-CCAGAAG--AATTTGTAGGT-----TTTTTTTCT---TTT----A-GTTATCCC--TCATC----A-GCCAGTCGGGTT---TCTT-GT-AGA-ACAGT--TA----TGT-CGATGCAG-----AGT-C-GG---CGGA-GC--TCTCTG-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTCTG----TAGG--TCAC--CCATGGCCTGTGGAT--CA-CTGTTGAAGCCT-GGATA-CATAGTTCTAACATTCCAGCT-------------AGCT---GG-G--GT--CTT---CGG----AA----TTCTTT--GT--TTTG--CCTGGTGC-TGG------GTTTTCGCA-ACCT-GCCTGTCG-AT---TTTGT----------CT--ACGCT--TCATGCACCCAATGAACCCAGCAAGTTGAGGC-GGGGT-AG----TAC--C-----TAATTG-C-G--AGAGGACTGCCTGGGC--AAGGCGGAATGTAACT--ACCCAAT--GGAAC-GT-GAAAATTCCTCC--CACC-GTCAGGAG-CAATCCCTAGCGC-CCGG-CTCTAC-GCCAATCGAGTTTGGGCTTATCA-CTGGT-AACTGCTG-CT-CCCAT---TGTTG-------TACCTA----CACTGT---------------CTCAGCGA-AG--------CTGT-AGT-GACCTCTCatcagccagtcgggttt
gi|26 : catcttcctgctcaagatcatgtcaagctgatgccaatgcttggatcttggatggcgccataaactttgtgtctatcttagtgctggaagaaagtgttcatcacagccaggtttttataaaagcatacctcaagaagtatttgaacattgtcattcattttcccaataatgtccaatgactgaaggcctggattcaaagtctgcaccaacccttgcattgaagtctcccatgaagaagagtgcttctttgttgggtaaagtacagacaatggggtcaaaggcataatagaaactgacccttttcttctacagtggactctgagtggagctcatagttgcagcataagcacacacaaaattgactacacctatacctatagccatccacagggtcaggaagtctctctgtccccctgttgggggttttaGCGGTCTTTCG----TAAG--TCGT--CCATGGCCTGTGGAT--TA-CTGTTGAAGCCT-GGACA-AATAGTTCTCACATTCCAGCTAGCTAcaggtgcaggcctgggcagatgatatggagatcctgaagtgcctagtcgccaggatccccctctcggcgttgcttacaggatccggcagagaggcaagtcaacagttcagcgcagctgcaggagttgccagaaggtttcgcagggctcagccaactgcctaaagggctccactcctgattttctgttggggtgaactcccatagccttggactcttccgggccgttcacaaggcagtgaggctatttgacccatagctgggggtctggatcgtgggcagcagagcgtatccacaaaccggtgagccatgcatgctacatgtttaggggccagaccttctccaagtcccttgtagtctagcccggctatgaggtataac
gi|12 : gctctgtcgacgcagagacgatggagctctctgtcgatgatgTTTTCG----AGCA--TCAT--CCATGACCTGAAGGT--CATCTGTC--AGTCCTGGGCG-CATTGTTTTTACATTCAAGCTTGCTAATC-GAAGAGCTG--GG-G--A---CTT---CG---------------TT--TTCTTTTG--CTTGC--T-TGta
gi|9 : aaaaggttcaccggaccctgcatggatgacaggcgtagcgtaaaaattctctctgtgccgcctgttggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGT--CCATGGCCTGTGGAT--TA-CTGTTGAAGCCT-GGACA-AATAGTTCTCACATTCCAGCTAGCTATAC-GAAGAGCT---GGAG--T---CTT---CGG----AA----TTCTTTGGTGTTTTTGTTTTTGC--C-TGGTACTG-GGTTTTGCA-ACCT-GGCTGTCG-AT---TTTGT----CT----TTAGAAGCT--CCATGCACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGCGGGGTG--G----TA-----------ACTG-TCC--GAGGA-CTACTCGG--GTAAGGCGGGCGGTAACT--ACCCAGT--GGAAC-CT-GAAAATTCCTTC--CACC-GTCAGGAG-CAACCCCTAGCGC-CCGATT-CTAC-GCCAATCGAGCTTGGGCTTACCA-CTGGT-AACTGCTGTTC-CCCG----TGTTG-----------TG----C-CT-A---------------CGCTGTTT-CAGCGA--AGCTGG-AGT-GACCTCTCagtcttgtaagc
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): GGGTTGCAAGTGTGCTAAAACAACGGACGTCACTCCGGATTTTCCTTCAGGGTTTACTCTCTTAGCCTTCTCTCCCGAGGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTACCCATAGCTGGGGTTTGGTTCGTTTGGCACCAGGGCGTATCCACGCACCGGTGGTCCTGCATGCCACACGCCTGAGGGCCAAACCTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCTGAGTCCGTAAGGTGCTCAGTTGCCCAAATGACGGCACGGAGAACCATTGAGGCATAGGTCTTGCGATAGAGAGGCTATGTACTGGCAGGGAAAGAATTGCGCACTCTGCTCCCCTTTTTGCATTAATACTAGCCAGCTGTGTTAGCTGAAAGCGAGAAGTACAAAGCACTACTCAACAACTGCCACACTAGACGCATCACACCGCATTTGT
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Unaligned ( gi|17 ): CAGAACACCCCTCTCGACACACTGATGTTACAGGAGGAAAGCTGAGCAATATGGTTCTGGCATCCATTGGTTGCAGATTGCCGGTGAGACGTACTGGTCAGTGACCAAGGTCATACCGCCTTCGGGCTCCACTCCGATATTTCTGTCGGTTTTTTCCCCCAGTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGGAGTAAGGTCCGTTTGACCCATGACTGGGAGTCTGTGGTGGCACAGGGAATTCCACACGCCGGTTGAGCCTGCATGCCGCCTCTTGGGGCAGACAACCTCCGATCCCTGGTAGTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGC
Unaligned ( gi|22 ): ATTTCTCATTTAATTTCAGCCACACGCCCATGAACAGACCGAGCAAAGAAGGGCCAGAGTCATTGTCTGCTCCAACTCTAGCAGTTGAAGCGCCCTAAGGACAATCTGTTCAGTGCTGGTGGTGTTGCTGATGATGGATGCAAGGTTTATTGTAGAATTTA
Unaligned ( gi|23 ): CCATGACGAGGCATTTGAAAGAACTTGTAGTGGCGTGGCCATGTACTACCAAGGGTTGCAAAGTCTTAACATTTTAGCATTTCTGTTAGCCAGCGATGAGGATTAAAACCAAGAAGTAACAAAGACACACTCATACACACTTGTTGCATCACACACATT
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gi|10 : tcctccatatgttgttagagtctgctcttcacgtacaggcagctcttcgattgcatctGCGGTCTGTGTCGCAGT-C---AGC-ACTGTGCAT------GCTTTTGGTGTTC---T-TCACATTGTTTA-------ATCTCTCCTTCTGGTCAAGATCATGTCAAGCTG---ATGCAA-ATGCTTA--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CACG----GC-A--CTCTGT-
gi|12 : gcacttttggtggcatgacgcggtttgttcccatatgctaggggcgcagcacgtttgaccgccgctgcaggttccattacttcccagttcacctcaaaccagcccttcttccgatgctctttcttctcaagggcctctactgagcgtctgtagtggtggagtcttctctgagttttcccagtgatgtttttaaagttttgcataatctctgggaaaaggaacagcacaaggttcggctagcattgatgcgtcaaaggctcttggtcttggtgtggtgcattttgcgtaggatgaggttgatcttggagagtactaaggtccatAA-AGGTTCAC-CG----GACCC---TGC--A-TGG--A-TG-AC---A-GGC---GT-A---GC--GTAAAAATTCTCTCTGT-GCCGCCTGTTG-G---
gi|12 : aTTTCG----AGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGGT--CATCTGTC--AG-TCCTGGGCG-CATTGT-TTTTACATTCAAGCTTGCTAAT-CGAAGA-GC-T-GGGGACT----------T-CG---------TT--TTCTTTTG--CTTG--C--TTG---ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttcgagcatcatccatgacctgaaggtcatctgtcagtcctgggcgcattgtttttacattcaagcttgctaatcgaagagctggggacttcgttttcttttgcttgcttgagtcttgtaagc
gi|14 : aaaaggttcaccggaccctgcatggatgacaggcgtagcgtaaaaattctctctgtgccgcctgttggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTCTGT-CCC-CCTGTTGTG---GG-TTCTAT--ACTG-G---ACAG-C-A-GAG-A-GTTCTTC-----A-TTGC--AAG-CCCA---C--GC---CGTG----GATT---------CTG-------------------GG-----TTC--CTC----TGC--CT-TCTTTC-CCCG-CCAGAA-G--AATGTGTAA---------TT--TCT---TTCGAGTAG-GA--ATC--CC--TCATCAGC-C---AGTCGGG--TT-agtcttgtaagc
gi|15 : aatgactgagggccactcctcaaagtctgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCCATGTGTTTTTAGACCTTC-GGGAGTGTCCCTCCCA-GTTGAG--A--CCTTGT-G-GCATTCGCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGGGATGTTCGTCACG--CAG--AGCGTTGCTAATTTTTTTGGGG-GTA--GCA-GCTCATGGCCCAGTTGT--CAAAATGAAGACCATTGTTCTGTTAAAACG-GGTCTCAT-TCACCTCTTTC----CTA-TG-CGTGAAATGTCC--CAAAAAAAAAACAGATTG---AAGCC-AT-G-A--TTCATCGGTCATT-GCTC---TCC-GGAACTC-GC-A-CG-TTTGAGAAGT-C------GC-CAGATAGAAAGGTAGAGA--------TAA------TGC-T-CTGCTTCTAGAGATCTTGG-ATCG--TCGCTGTGCAACC-GGTG-TTTt
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gi|18 : t-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA-CAA-GG-TTCCC-AGCTAAGACCC---CGG--A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTC-ACTC-G---A-AG-C-AGT-G-C-GTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAGGAC--ACATGCATG----T-CT---------CCT-------------------C-------CC--TTC-GG-TGC--CC-T--GTC-TT-G-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CT--AC-TC-AC-TGAGAGTCGCG--TT-CCAC-GC-GGAGTCGC--TT----TG-TTGGCG--CTCAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--C
gi|19 : CT----CA---ACTTTCT-----CA--GGGTAC-TG-CATC-AT-GC-T---G-G-TG--TTGAT-----GCATGGCTTCCCAAC-----TT--T---CTTGCTGCAATG-GATCCTCTTGGGG--AGT-AG--ACTGGTCTTGAT----GCTTACAA----GCGAGTGGTCAGTGTCACAGT-C---TGC-ATTGTG-GTGTTTGAGTACACAGTA------C-AAAT-TTG---AGGTTGG-TTCAC--TT---AGTGATGACCACGTGTAGC---------CA-GTGCTTT--GAGTG-T-GGA--TGTCTC---CA-C----GACA--CTTTGT-G-ATGT--GGCTT-CATATGG-AAA-AAGG--AGTTGGTCACA--Caa
gi|2 : AG--AGC-TTGC-------------G-GTAA-GCAAG---------CAGAT-T--CAA---GAAG-AC-----TCTG-----ACCCGTTCTCATGTCA--TTTTTCTAGCCCG-TGCCCTG--CCTTCC--C------AAAAC-GTTGG---G---CCAT-G-CCCTTC-TCGGTC--T-G--CC--ACCAG--ACTT-GCCG-CG-TT---GACGT-C-------CGCA-------------AGACAGGTAGAT-A------TGCTTTCTGCTC---------TGGG-ATC---TCGTCT-ACAA-CAGGTGGTCTAATG-ACTCGGTAGAA---TTGGTTC-TCTT--ACTTC--ATG-CCGA-AGC-TT--------GCCT-G-T-GTT-G-G-GGCGTAGACGC-A--AAACAAAGGGTTCACTCG----GAACCGCTTGCCAG-TGG--A-TG--C---A-GGC---GCAG---GCGAATTAAAATTTCATCTGT-ACCTGCTG--G-GTTTGG-TTCAATC-ACAGCG---A-AGAT-ACT-G-C-ATGGCGC-----AACTGCCCAAA-TCCA--ACTAAC---CGTG----T-TT---------CCTTCACATCCAGTTTCGCCCACGATTTTTCC--CTCCAG-TGC--CT-T--TTTTCTTGACCAGAAAG--AAAG-GTATAG-----TGCTCCTCC---TCA-----G-GG--ATC--CT--TC-TC-GT-GG-GAGTCGTGTTTT-CC-T-GC-AGGGCTGC--TA----TG-TCGATGTTTTCAGTATCCT---GTG-CAGTGGTC-AC--GATCAA-TCA--------ATGCTGTTTTTCGGGGTCGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGGT--AA-TTGTC--AG-TCC-TGGAA-CATAGT-T-TTACATTCC-GCTTGCTAATCCGAAGA-GC-TGGGGAACT----------T-CGTTTTT--CTTT--TTCTTTTG--CTTGC-C--CTGCACA-C--C--G---GTTTAACGTATCCACTTGTCAGAGACCCTCGTAGCACTCTTT--AAGCTTCCCAGG--CACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGG-GTG-G-C-GTAGCACCCCTTACT-G-CTGGGGG-CTTCCC-AG-CT--GGGCCGGGC-GTAGCTTGA--GAGTGGAGGATTAC-GATGATTCCTTCAGCACCCGTC-GAAGACAACCCGTAGCGTC-C-A-C-CTACGGCCAATCGAGCAAGGACTTATCACCTTGTAAACTGTT-TCTCTCCGCAATTGCTGTCCATCTT-TGACTCCC-CTTTCACCACTTCTCCACCCCGGTAA-AGGTGAGGGACTGGCAATGACCTCTC
gi|20 : TAT--A-GTGTTGTTTTAAGA---GTTATGGGATCTCCTTCTAAGTTGTTTTCTCGTGCTTTTGGTG-ATCGACTCTGTGGTGTATATTTTCTTGTCACCAGGGGTAAAGCTCGTC-TTTAC-TTTAGTA-TGCTTTGATGCCTGCC-TGGGCTGAC--CACCCCTTCGTATTCTTTGAGTGATGCAAAACTTCTCCTGGTTTTCAGTTTTTCACCTCT-T----GTT--AAA----GT-AGCAATCagggcgcggcctgcaaagtcatattgggatcctggctgcccctaagccaaggatccccctctcttctccctggatgtgttttcaaaggatcgcagggcgatacgtttggcatcagtttgtgctgcagattttcctgtaggtttactcaaattagccctttcctacttccgaggttatccacaaggcacgtgggttttgtttgctatttactcatagctcgggactaggattgcaggcaccgcagggcatatccaaacaccgatgtgccatgcatatcgcttgcattagcgggctctagtctcctccaagacctgtggtcctgctaaaggggccaatttaacgcaaaacaaaacacataattaaagtactccccaagcaccactcaccacatggccctaaagcaatttcgtagaacacagaa
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gi|4 : catcttcctgctcaaTTCTCAT-TCA--T-TTGC----CCA-TACCA-A--ACTTGC--C------GAGGCAGGATG---G---CCAC-G-A--T-----GGTC--T-G--C---ACC-C--ACTC-TA-G-CA-TT---GAAGT-C------GCcaggtgcaggcctgggcagatgatatggagatcctgaagtgcctagtcgccaggatccccctctcggcgttgcttacaggatccggcagagaggcaagtcaacagttcagcgcagctgcaggagttgccagaaggtttcgcagggctcagccaactgcctaaagggctccactcctgattttctgttggggtgaactcccatagccttggactcttccgggccgttcacaaggcagtgaggctatttgacccatagctgggggtctggatcgtgggcagcagagcgtatccacaaaccggtgagccatgcatgctacatgtttaggggccagaccttctccaagtcccttgtagtctagcccggctatgaggtataac
gi|4 : cat-GTC-G-GTG-CGTACACAC-T--GA-CAA-GGGTG-AC-GG----GACC-----GC--AGTGGT-ACTG-AC------GC---GGAG---GT---CAGACATT---------GCTGCCTG---------G-TTCTACC-A-TA-GCTCA-AG-C-A-A-G-CTGTTTCTTC----A-CTGC--AAA-GCCT--AC--TC---CATG----C-TC---------TTT-------------------GGG----TTC--GTC-GGATGT---T-T--TCC-CTTG-CTACTA-A--AACGTGAAA-------TCTTTCTCT---TTT-----A-AT--GTG--CCAGTG-CC-GC-TAAGCGCCGTT--TT-CT-T-GA-AGAGTGGT--TA----TG-TCCACG--TTCATT---CT---CTT-GAGC--TCGTC--G-TTTA-TGA--------CAGCTGTATTTCT----TGC--GTTGTTGCAATG-TCTAGATGTTTCA-CAG--AAAG-GCC-GATCAACATTGT-CCGGACATTCCAACTTCCCAGT-TTTAGA-GC-T-G--ATCCCTTTATATTGT-TGTGGTT--TTTT--TTTTTTTG---TTG--C--CTG---G-TG-C--GAAAGCT--GCG-ACCTGCAGTTT-GG---ATT------ACTCC-T--GATCT--CCATG--CACCCAATGAAGAAAGCAGACCGTGGCGGG-A-C-GAC-----ACCAATTGG-CTGGGGA-CTGCCC-AG-CTTAAGG-CGGGCGGAAGC-TG-TCCAGTGAAA---TCC-GAGAATATCTCC--CA-CCGTCA-GAG-CAACCCCCGGCGCCGCGC-T-CTAC-GCCAATTGAGCGGTAGCTTATAA-CCGGT-AACTGCTGCTCC-CCG----T-TTG---------TG---------T---------------CGAGGCCATAGGCGAAG--CTGG-AGTGGCCTCTCaagagaaacgagtttcttcatgactgggatgctctcaattgatggatcacaggtttctcatagaattcacctagtgtctggggtggaagacagagtcggtgcgtacacactgacaagggtgacgggaccgcagtggtactgacgcggaggtcagacattgctgcctggttctaccatagctcaagcaagctgtttcttcactgcaaagcctactccatgctctttgggttcgtcggatgttttcccttgctactaaaacgtgaaatctttctcttttaatgtgccagtgccgctaagcgccgttttcttgaagagtggttatgtccacgttcattctcttgagctcgtcgtttatgacagctgtatttcttgcgttgttgcaatgtctagatgtttcacagaaaggccgatcaacattgtccggacattccaacttcccagttttagagctgatccctttatattgttgtggtttttttttttttgttgcctggtgcgaaagctgcgacctgcagtttggattactcctgatctccatgcacccaatgaagaaagcagaccgtggcgggacgacaccaattggctggggactgcccagcttaaggcgggcggaagctgtccagtgaaatccgagaatatctcccaccgtcagagcaacccccggcgccgcgctctacgccaattgagcggtagcttataaccggtaactgctgctccccgtttgtgtcgaggccataggcgaagctggagtggcctctccaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|5 : catttctcattcatttgcccataccaaacttgccgaggcaggatggccacgatggtctgcacccactctagcattgaagtcgcaagagaaacgagtttcttcatgactgggatgctctcaattgatggatcacaggtttctcatagaattcacctagtgtctggggtggaagacagaA---CTGGT-CAT-TT--GCTTC---AG-C-G--AGC-TT--------GC-T-G-T-GTG-G-G-G-CGT--ACGC-ACCGC-CCC-CGGTTT-C-CG----CGCCC---TGC--C-TGG--C-TG-CC---A-GG----GCAA---GC--CT-ACCATTATTTCTGT-G-CGCAGGT-------GG-TTCACTC--CTC-G---C-CG-C-A-T-GCC-ATGGCGT-------CTGC--CAC-TCC----C--AC---CGTG----T-TCGTCGTGTATCCT-------------------AG-----TT---CTA-AG-TGCAGGT-T--TTC-TTCG-CC--AA-GCCGCGGTATA--G-----TGTTCCTATGGATGC-----GTGG--ATTTACC--TT-TCTG---G-GAGTAGCGTTTT-CC-T-GTGAGAGGTGCAGTAACCTTGTTCGCTG--TTCGAT---CTAAGATGCAAGT--TC-TC--GATA-A-TCAAATGTCGTTTTTTGTTTTTCG----CGCAAATAAT--CT---GCCTGA-GGT--CA-CTGTC--AGTCCT-GGGCG-CATAGTGTTTC-CATT--AGCTTGCTAAT-CGAAGAGGCAT-GGGGACT----------TACGTGTTTTCCTTT--TTCTTTTG--CTTG-----CTG---G-TAAC--A---GGTTAACG-ATCCACTTGCT-CA---GCTCGTAG-ACTC--TAGAAGCT---CAGGACCATC---TGAAGC--GCAG--TGTGGCCGG-G-C--TAGC---CCTTACTGG-CTGGGGG-CTGCAC----TTTGAGG-CGGGCGGTAGC-TGA---AGTAGGA---TGTAGATGAT--CCTC--CA--CGT----GGACA---CGTAGCGTC-CAA-C-TCAC-G-CAATCGAGCAAGGA-TTATC--CTCGTAAACTGTTGTCT--TCG----TGTTG-------TGTG-------TTT---------------CACGGTAA-AGGTGAGA--CTGG-AGTAGCCTcaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|6 : AACGCTTCTTGAGTAACGGAGTTTTCTCTGGTGTAGAGTTCCAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCCCATTTGCTTGTCCC-TGTCTGTGATGACTTCCC--GTCTT-GATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGGGTTTGCCTGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATACTCCTGATGTTGCCACTATCCGACGCTTTGCTGGATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-GTAGTCGGTGGCGCAA---C---------GTCGT--GC-TGT------TT--GCTGTGCTTTGCTATGTGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTT-ATTCAGACTTGGGTCACGCT-TA-TAGCT--GACAAGT-----GCG--TTGCGT-TTGGCA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGGCTTCAAACCAACCAATGTTCTTGTGC---TCTTTTTT--TGCCGTACGTCAGAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTT-CTAAGAGAGTTCCAGTTGTCC-----CTCGGTT-TTGTTCT---GCATTTAT--ATGAGCTGTTTTGAGA---GT--------CTCCTC--AAGTTGTTT----GT--------TG-A---ACTCT----TG---GTTCTTTT----CC--AGGTGA-GC-CGTC-TT-AC-T---G-A-TG--TTGAT-----CC-TAGGCTGAC--CC----TT--TCT-CTTTGAGTGATG-AAAC-TTCG-TGG--TTTCAG--TTTCACCTTTGT----GG---CAATAATG-GAGTGATCGGTGTCGCAAT-C---AGCTCTT-TG-AT-----AGGACCTGGTGTTG---C-AAACGTTGTTCAAG--GA-ATCACGTTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATACCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA-G----G--ATACCTTGT-G-ACAT--GCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGG--TGTTCGTCACG--CAG--AGC-CTGC-------------G-GTA--GCA-G---------CAGAGTT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTTC----CTA-TGCCG----------------------------------------T-G-A--TTC-TCGGTC--T-G--C---ACC-G--ACTC-GC-G-CG-TT---GAAGT-C------GCAAAGAAGGT-------AGA--------T-A------TGC-T-CTGCT--T-------TGGG-ATC---TTGCTG-ACAA-C-GGTG-TCTAGTG-ACTCG-TAGAA---TTGGTCC-T-TT--ACTT---CAGCC-GA-ATC-TT--------GC-C-G-T-GTTGG-G-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GAtcagggcgcggatgggcaaagtatatggagatctggctgcccattgtaacggaccccttctttctccctgatatattccaaaggatcgcagggcgatacgtttggatcagtttggtgagatttctgtagggtttactcttagcatttcctactccgaaggtacacaaaggcaggggttgttgctatttacccatagctagggactaggattggaggcacttcagggcatatccaacacgatgtgcagcatgccttgctttaggggctgtctttctcaagacctgtgttctgctagggcatttcctacaaataattaatcccaacacccacctgatacctcccccccaaagaaagcaattcgtacacaga
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gi|12 : aTTTCG----AGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGGT--CATCTGTC--AG-TCCTGGGCG-CATTGT-TTTTACATTCAAGCTTGCTAAT-CGAAGA-GC-TGGGG-ACTT-C--------G---------TT--TTCTTTTG--CTTGCTTGttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttcgagcatcatccatgacctgaaggtcatctgtcagtcctgggcgcattgtttttacattcaagcttgctaatcgaagagctggggacttcgttttcttttgcttgcttgagtcttgtaagc
gi|14 : aaaaggttcaccggaccctgcatggatgacaggcgtagcgtaaaaattctctctgtgccgcctgttggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTCTGT-CCC-CCTGTTGTG---GG-TTCTAT--ACTG-G---ACAG-C-A-GAG-A-GTTCTTC-----A-TTGC--AAG-CCCA---C--GC---CGTG----GATT---------CTGG--------G-TT----------------C--CTC----TGC--CT-TCTTTC-CCCG-CCAGAA-G--AATGTGTAA---------TT--TCT---TTCGAGTAG-GA--ATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT-agtcttgtaagc
gi|15 : aatgactgagggccactcctcaaagtctgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCCATGTGTTTTTAGACCTTC-GGGAGTGTCCCTCCCA-GTTGAG--ACCTTGT-G-GCATTCGCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGGGATGTTCGTCACG--CAG--AGCGTTGCTAATTTTTTTGGGG-GTA--GCA-GCTCATGGCCCAGTTGT--CAAAATGAAGACCATTGTTCTGTTAAAACG-GGTCTCAT-TCACCTCTTTC----CTATG-CGTGAAATGTCC--CAAAAAAAAAACAGATTG---AAGCC-AT-G-A--TTCATCGGTCATT-GCTC---TCC-GGAACTC-GC-A-CG-TTTGAGAAGTC-GC----CAGATAGAAAGGTAGAGATAATGC-T-CTGCTTC----TAGAGATCTTGG-ATCG--TCGC---TGTGCA----ACC-GGTG-TTTt
gi|16 : G-TAGAA---CTGAT-T-T-TTTTATTTT---GG-A-T---G-AGC-CT--------A----G-T-AAT-ATT-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA--AA-AGGTTCCC-AGCTAAGACCC---GG---A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTCCACTC-G---A-AG-C-AGT-G-CCGTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAG-AC--AC---CATGCATGT-CT---------CCTC-----------T----------------C--CTC-GG-TGC--CC-T--GTC-CTTG-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CTAC-TC-ACATG----AAGTCGCG--TTCCC-C-GCGGGAGTCGC--T-----TG-TTGGCG--CTCAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--CAATc
gi|18 : t-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA-CAA-GG-TTCCC-AGCTAAGACCC---CGG--A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTC-ACTC-G---A-AG-C-AGT-G-C-GTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAGGAC--ACATGCATG----T-CT---------CCTC-----------C----------------C--TTC-GG-TGC--CC-T--GTC-TT-G-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CTAC-TC-AC-TGA---GAGTCGCG--TT-CCAC-GC-GGAGTCGC--TT----TG-TTGGCG--CTCAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--C
gi|19 : CT----CA---ACTTTCT-----CA--GGGTAC-TG-CATC-AT-GC-T---G-GT-G--TTGAT-----GCATGGCTTC-CCAA---CT--T-T-CTTGCTGCAATG-GATCCT-CT--TGGGGAGT---AG--ACTGGTCTTGAT----GCTTACAA----GCGAGTGGTCAGTGTCACAGT-CTG---C-ATTGTG-GTGTTTGAGTACACAGTA---CAAA-T-TTG---AGGTTGG-TTCAC--TT---AGTGATGACCACGTGTAGC---------CA-GTGCTTT--GAGTG-T-GGA--TGTCTC---CA-C----GACACTTTGT-G-ATGT--GGCTT-CATATGG-AAA-AAGG--AGTTGGTCACA--Caa
gi|2 : AG--AGC-TTGC-------------G-GTAA-GCAAG---------CAGAT-T--CAA---GAAG-AC-----TCTG-----ACCCGTTCTCATGTCA--TTTTTCTAGCCCGTGCCCTG--CCTTCC--C------AAAAC-GTTGG---G---CCAT-G-CCCTTC-TCGGTC--T-G--CC--ACCAG--ACTT-GCCG-CG-TT---GACGTCCGCAAGACAGGT----------AGAT-ATGCTTTCTGCTC-------------TGGG-ATC---TCGT---CT-ACA----A-CAGGTGGTCTAATG-ACTCGGTAGAA---TTGGTTC-TCTT--ACTTC--ATG-CCG---A-AGC-TT--------G----CCT-G-T-GTT-G-G-GGCGTAGACGC-A--AAACAAAGGGTTCACTCG----GAACCGCTTGCCAG-TGG--A-TG--C---A-GGC---GCAG---GCGAATTAAAATTTCATCTGT-ACCTGCTG--G-GTTTGG-TTCAATC-ACAGCG---A-AGAT-ACT-G-C-ATGGCGC-----AACTGCCCAAA-TCCA--ACTAAC---CGTG----T-TT---------CCTTCACATCCAG-TTTCGCCCACGATTTTTCC--CTCCAG-TGC--CT-T--TTTTCTTGACCAGAAAG--AAAG-GTATAG-----TGCTCCTCC---TCA-----G-GG--ATC--CTTC-TC-GT-GG----GAGTCGTGTTTT-CC-T-GC-AGGGCTGC--TA----TG-TCGATGTTTTCAGTATCCT---GTG-CAGTGGTC-AC--GATCAA-TCA--------ATGCTGTTTTTCGGGGTCGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGGT--AA-TTGTC--AG-TCC-TGGAA-CATAGT-T-TTACATTCC-GCTTGCTAATCCGAAGA-GC-TGGGGAACTT-C--------GTTTTT--CTTT--TTCTTTTG--CTTGCCCTG-C-ACACC--G---GTTTA-ACGTATCCACTTGTCAGAGACCCTCGTAGCACTCTTT--AAGCTTCCCAGG--CACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGG-GTG-G-C-GTAGCACCC-CTTACT-G-CTGGGGG-CTTCCC-AG-CT--GGGCCGGGC-GTAGCTTGA--GAGTGGAGGATTAC-GATGATTCCTTCAGCACCCGTC-GAAGACAACCCGTAGCGTC-C-A-C-CTACGGCCAATCGAGCAAGGACTTATCACCTTGTAAACTGTT-TCTCTCCGCAATTGCTGTCCATCTT-TGACTCCC-CTTTCACCACTTCTCCACCCCGGTAA-AGGTGAGGGACTGGCAATGACCTCTC
gi|20 : TATA---GTGTTGTTTTAAGAG---TTATGGGATCTCCTTCTAAGTTGTTTTCTCGTGCTTTTGGTGATCGA-CTCTGTGGTGTATATTTTCTTGTCACCAGGGGTAAAGCTCGTC-TTTAC-TTTAGTAT-GCTTTGATGCCTGCCTGGGCTGA-CCACCCCTTCGTATTCTTTGAGTGATGCAAAACTTCTCCTGGT---TTTCAGTTTTTCACCTCT-T----GTT--AAA----GT-AGCAATCagggcgcggcctgcaaagtcatattgggatcctggctgcccctaagccaaggatccccctctcttctccctggatgtgttttcaaaggatcgcagggcgatacgtttggcatcagtttgtgctgcagattttcctgtaggtttactcaaattagccctttcctacttccgaggttatccacaaggcacgtgggttttgtttgctatttactcatagctcgggactaggattgcaggcaccgcagggcatatccaaacaccgatgtgccatgcatatcgcttgcattagcgggctctagtctcctccaagacctgtggtcctgctaaaggggccaatttaacgcaaaacaaaacacataattaaagtactccccaagcaccactcaccacatggccctaaagcaatttcgtagaacacagaa
gi|21 : TTCTGATGTTTCCGCTGTTGAACGCTT-GCTGAATGTTATCTGACAATTGTGACCTGTA-A-A--CATTTGC-CAAGCCC------CGTGTCATAAGC-TGTGATCT--GCT-------GT---GTGCAACTCCCAGTACC--TAGGTT-TTTCTGACTTTTATCAAACA-TA-TAACT--GATGAGTAGTAGACTG-ATGCATATTG-CAGACCCATTGACTGaagg
gi|26 : GC--TC----TG-TCGACG--CAGAGA---CG---ATG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTTCG----TAA--GTCGT--CCATGGCCTGTGGAT--TA-CTGTTGAAG-CCT-GGACA-AATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTA
gi|27 : T--CCA----GCGAGTGGTCGGTGTCGCAGT-CAG----CGCTGTG-GT-----AGCTGCGGGTGAACCAAA-CTCAGATCAGC--GA-GTCTCTCTT---GGTAATGACGAGATCTAGCTG---GTGCCA-ATta
gi|3 : acgGATCATGTCAAGCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CATA----A--ACTTTGT-G-TC-T--ATCTTAGTGCTGG-AAG-AAAG--TGTTCATCAC----AGCCAGG-TTTT-------------T-ATA--AAA-G---------CATACCT--CAA---GAAG-TA-----TTTG-----AAC-ATTGTCAT-TCA--T-TTTC----CCA----ATA--ATGTCC-----------AAT-GACTGAAGG---C-CT-GGA--TTC-AAAGTC--T-G--C---ACC-A--ACCC-TT-G-CA-TT---GAAGTC-TCC---CATGAAGA-------AGA--GTGCTT-CT--TTG----T-------TGGGTAAAG--T-AC---AG-ACA----A-T-GGGG-TCAAAGG-CATAA-TAGAAA--CTGAC-CCT-TT--TCTTCTACAG-T-G---G-A-C-TCTGAGTGGAG----C-TCA-TAGTT-GCA-G-CATAAGCAC-A--CA-CAA-AA-TTGAC-TA----CACCTA--TACCTA-TAGCCA-TCCAC---A-GGG---TCAG---G--------AAGTCTCTCTGT-CCC-CCTGTTG-G---GGGTTTTAT--------------------------------------A-CTGC--AAC-GCCC--AC--GT---CGTGAA--T-TC-----------TG--------GATT----------------C--ACC-TG--GC--TTCT--TCC-CCCG-CCAGAA-G--AATTTGTA-GG-----TTTTTTTTC---TTT-----T-AGTTATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT-TC-TTGT-AGAACAGT--TA----TG-TCGATG--CAGAGT---CG---GCG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTCTG----TAG--GTCAC--CCATGGCCTGTGGAT--CA-CTGTTGAAG-CCT-GGATA-CATAGT-TCTAACATTCCAGCT-------------A-GC-TGGGG-TCTT-C--------GGAATT--CTTT--GTTTT--------GCCTGG-T-G---CTGG---GTTTTCGCA-ACCTGCCTGTC-GA---TTTTGT------C--T--ACGCT--TCATG--CACCCAATGAACCCAGCAAGTTGAGGCGGG-G-TAGTA-----C-CTAATT-G-CGAGAGGACTGCCT-GGGC--AAGG-CGGAATGTAAC-T-ACCCAATGGAA---CGT-GAAAATTCCTCC--CA-CCGTCAGGAG-CAATCCCTAGCGCC-CGG-CTCTAC-GCCAATCGAGTTTGGGCTTATCA-CTGGT-AACTGCTG-CTC-CCAT---TGTTG---------TA-----C-CTA---------------CACTGTCT-CAGCGAAG--CTGT-AGTGACCTCTCattat
gi|4 : catcttcctgctcaaTTCTCAT-TCA--T-TTGC----CCATACCA-A--ACTTGC--C------GAGGCAGGATG---G---CCAC-G-A--T-----GGTC--T-G--C---ACC-C--ACTC-TA-G-CA-TT---GAAGTC-GCA---AG-------------AGAA-ACGAGT-TT-CTTCATGAC-------TGGG-ATGC--TCTCAATTG-ATGGATCA-C-AG-G-TTT------CTCA-TAGAA-----------T-TC--AC--C--TAG-T-GTCTG-GGG-TG--------GAAGAC-A-G-A-GTC-G-GTG-CGTACACAC-T--GA-CAA-GGGTG-AC-GG----GACC-----GC--AGTGGT-ACTG-AC------GC---GGAG---GT---CAGACATT---------GCTGCCTG---------G-TTCTACC-A-TA-GCTCA-AG-C-A-A-G-CTGTTTCTTC----A-CTGC--AAA-GCCT--AC--TC---CATG----C-TC---------TTTG--------GGTT----------------C--GTC-GGATGT---T-T--TCC-CTTG-CTACTA-A--AACGTGAAA-------TCTTTCTCT---TTT-----A-AT--GTG--CCAG-T--GC-CGCTAAGCGCCGTT--TT-CT-T-GA-AGAGTGGT--TA----TG-TCCACG--TTCATT---CT---CTT-GAGC--TCGTC--G-TTTA-TGA--------CAGCTGTATTTCT----TGC--GTTGTTGCAATG-TCTAGATGTTTCA-CAG--AAAG-GCC-GATCAACATTGT-CCGGACATTCCAACTTCCCAGT-TTTAGA-GC-TGATC-CCTT-TATATTGTTGTGGTT--TTTT--TTTTTTTG---TTGCCTGG-T-G---C--GAAAGCT---GCG-ACCTGCAGTTT-GG---ATT------ACTCC-T--GATCT--CCATG--CACCCAATGAAGAAAGCAGACCGTGGCGGG-A-C-G-A-----CACCAATTGG-CTGGGGA-CTGCCC-AG-CTTAAGG-CGGGCGGAAGC-TG-TCCAGTGAAA---TCC-GAGAATATCTCC--CA-CCGTCA-GAG-CAACCCCCGGCGCCGCGC-T-CTAC-GCCAATTGAGCGGTAGCTTATAA-CCGGT-AACTGCTGCTCC-CCG----T-TTG---------TG---------T---------------CGAGGCCATAGGCGAAG--CTGG-AGTGGCCTCTCcaggtgcaggcctgggcagatgatatggagatcctgaagtgcctagtcgccaggatccccctctcggcgttgcttacaggatccggcagagaggcaagtcaacagttcagcgcagctgcaggagttgccagaaggtttcgcagggctcagccaactgcctaaagggctccactcctgattttctgttggggtgaactcccatagccttggactcttccgggccgttcacaaggcagtgaggctatttgacccatagctgggggtctggatcgtgggcagcagagcgtatccacaaaccggtgagccatgcatgctacatgtttaggggccagaccttctccaagtcccttgtagtctagcccggctatgaggtataac
gi|5 : catA---CTGGT-CAT-TT--GCTTC---AG-C-G-----AGC-TT--------G----C-T-G-T-GTG-G-G-G-CGT--ACGC-ACCGC-CCC-CGGTTT-C-CG----CGCCC---TGC--C-TGG--C-TG-CC---A-GG----GCAA---GC--CT-ACCATTATTTCTGT-G-CGCAGGT-------GG-TTCACTC--CTC-G---C-CG-C-A-T-GCC-ATGGCGT-------CTGC--CAC-TCC----C--AC---CGTG----T-TCGTCGTGTATCCTA--------G-TT-------------------CTA-AG-TGCAGGT-T--TTC-TTCG-CC--AA-GCCGCGGTATA--G-----TGTTCCTATGGATGC-----GTGG--ATTTACCTT-TCTG---G----GAGTAGCGTTTT-CC-T-GTGAGAGGTGCAGTAACCTTGTTCGCTG--TTCGAT---CTAAGATGCAAGT--TC-TC--GATA-A-TCAAATGTCGTTTTTTGTTTTTCG----CGCAAATAAT--CT---GCCTGA-GGT--CA-CTGTC--AGTCCT-GGGCG-CATAGTGTTTC-CATT--AGCTTGCTAAT-CGAAGAGGCATGGGG-ACTTAC--------GTGTTTTCCTTT--TTCTTTTG--CTTG-CTGG-TAA---C--A---GGTTA-ACG-ATCCACTTGCT-CA---GCTCGTAG-ACTC--TAGAAGCT---CAGGACCATC---TGAAGC--GCAG--TGTGGCCGG-G-C--TAGC---C-CTTACTGG-CTGGGGG-CTGCAC----TTTGAGG-CGGGCGGTAGC-TGA---AGTAGGA---TGTAGATGA-TCCT-C--CA--CGT----GGACA---CGTAGCGTC-CAA-C-TCAC-G-CAATCGAGCAAGGA-TTATC--CTCGTAAACTGTTGTCT--TCG----TGTTG-------TGTG-------TTT---------------CACGGTAA-AGGTGAGA--CTGG-AGTAGCCTcaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|6 : AACGCTTCTTGAGTAACGGAGTTTTCTCTGGTGTAGAGTTCCAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCCCATTTGCTTGTCCC-TGTCTGTGATGACTTCCC--GTCTT-GATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGGGTTTGCCTGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATACTCCTGATGTTGCCACTATCCGACGCTTTGCTGGATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-GTAGTCGGTGGCGCAA---C---------GTCGT--GC-TG---TTT--GCTGTGCTTTGCTATGTGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTT-ATTCAGACTTGGGTCACGCT-TA-TAGCT--GACAAGT-----GCG--TTGCGT-TTGGCA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGG-CTTCAAACCAACCAATGTTCTTGTGC---TCTTTTTT--TGCCGTACGTCAGAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTT-CTAAGAGAGTTCCAGTTGTCC--CTCG-GTT-TTGTTCT---GCATTTATA--TGAGCTGTTTTGAGAG---T--------CTCCTC--AAGTTGTTT----GT--------TGA---A-CTCT----TG---GTTCTTTT----CC--AGGTGA-GC-CGTC-TT-AC-T---G-AT-G--TTGAT-----CCTAGGCTGACCC-----TT--TCT-CTTTGAGTGATG-AAA-CTTCG--TGG----TTTCAG--TTTCACCTTTGT----GG---CAATAATG-GAGTGATCGGTGTCGCAAT-CAG---CTCTT-TG-AT-----AGGACCTGGTGTTGCAAA-CGTTGTTCAAG--GA-ATCACGTTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATACCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA-G----GATACCTTGT-G-ACAT--GCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGG--TGTTCGTCACG--CAG--AGC-CTGC-------------G-GTA--GCA-G---------CAGAGTT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTTC----CTATGCCG----------------------------------------T-G-A--TTC-TCGGTC--T-G--C---ACC-G--ACTC-GC-G-CG-TT---GAAGTC-GCA---AAGAAGGT-------AGAT-ATGC-T-CTGCT------T-------TGGG-ATC---TTGC---TG-ACA----A-C-GGTG-TCTAGTG-ACTCG-TAGAA---TTGGTCC-T-TT--ACTT---CAGCC-G---A-ATC-TT--------G----C-C-G-T-GTTGG-G-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GAtcagggcgcggatgggcaaagtatatggagatctggctgcccattgtaacggaccccttctttctccctgatatattccaaaggatcgcagggcgatacgtttggatcagtttggtgagatttctgtagggtttactcttagcatttcctactccgaaggtacacaaaggcaggggttgttgctatttacccatagctagggactaggattggaggcacttcagggcatatccaacacgatgtgcagcatgccttgctttaggggctgtctttctcaagacctgtgttctgctagggcatttcctacaaataattaatcccaacacccacctgatacctcccccccaaagaaagcaattcgtacacaga
gi|7 : ATTCGAC-CTT-GCTGA-TGTTTTCCGATAA-TGAAGCC---AGA-AGTCGTTGGCGCAA---CGCGTGATGTGTCGT--GTGCG---TTTTGGCACG-----G----GTGCAGCTTGCAATGCCTGTAGTTA-ATTCAGACCTGG--TACACT-TAATAGTCTGGATAAGT-----GCGGCTTGCGT-TGG-CAG--TCA-TGACTGGCTTCCATCTCAGTAATTAAACGTGG--TTCAAACCACTCAGTGGTACTGTGCCGCTCTTTTTTCTTGCCG-ATGTCGAAACGTGCAAGTGCTGTGAATGGCGTT-CTAAGAGTGTTCCAGTGGTTCTCC-CGTGTGGTTGTTCCCTGGCATTTATAAATGA--TGTTATAAAAGATGT--------CTCCTC--AGTTTGTTT----GT--------TGA---AACTCT----TG----TTCTTTT----CC--GGGTAA-GC-CGTCGTT-ACGT---G-ATTG--TTGAT-----CCTGATCTGA-CC-----CT--TAT-TTTTGA-TGATG-AAACCTTCT--TGG----TTTCAG--TTTCACTTTTGTTGCAGAT--CAA----AGGAGTGGT-AATGTCGCAAT-CACTACCCCTTG-G-ATC----AGAACCTGGT--TGCAAAACATTGTTTAGG--GATAT-ACGCTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTGCGAATGCAG-GT-TTTT--GACCT-CTGGA--TGTCTCAA-GA-G----A--ACCTTGTGG-GCAT---CCTT-GGTTTGATAAGTAAGG--T-TTCGTC-CG--CAA--A---CTGC-------------GCGTA---CA-G---------CAGGAGTTCCAA---GAAG-CC-----TCTG-----A-C-GTTCTCCT-TCG--TCTCCC----TAGCGCCCTG--ATGTCCTAT------AAAAC-GTTTG---GGC-C-ATCG-ACTTCC-TCGTTC--TGG--CGCGACC-G--ACTCTGC-GTCGTTT---GAAGT--GCC---AAGAAGCTT------AGAT-ATGCGT-CTGCTTC------------TGGG-ATCGTCTCGC---TA-ACA----A-C-GGTG-TC--ATG--CTCG-T-GAGTTTTTGTC-C-T-TT--AATT---CAG-T-G---GAAGCTTT--------G----C-T-G-T-GTT-G-G-A-GGAAGACGCAA--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GA-CC---TGC--ATTGG--A-T--AC---ATGGCGGGGC-A---GC--AT-AAATTTCTCTCAGTGGCCGCCTGtgt
gi|8 : TGGTGTTCTTCA-CATTGTTAAGG------TTCCTCTT-----------CCTTGTCAATCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCAC---CA-T----GCCACTTTGT-GTATAT---CTTT-GTGCTGA-AAG-AAGG--TGATCGTCACAGTCAT--ATT-TT------------------TATTGGA-G---------CATAGCT--CAA---GAAG-TC-----CTTG-----ACC-ATTTTCAT-TCA--TTTTTC----CAATCCCATA--ATGTTC--
gi|8 : tTCTCTCTGT-CCCCTATGTTG-G---GGGTTCTAT--ACTG-G---ACAG-T-A-------G-GGAGTTCTTCA-CTAC--AAA-GCCC--AA--GC---CGTG----T-AT---------TCTG--------G-GT----------------TGATTT-GC-TTT--CT-T--TCC-CT-G-CCAGAG-G--AATGTGTAAAAAAAAACATTGCG------TA-----G-GG--ATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT-TC-TTGT-ACCGCAGC--TA----TG-TCGACG--CAGAGA---CG---ATG-GAGC--TC-TCT-G-TC-AATGA--------TGGCGGTCTTCCG----TAA--GTCGT--CCATGGCCTGTGGAT--CA-CTGTTGAAG-CTT-GAACA-CATAGT-TCTCAC-TTCCAGCTAGCTATA-CGAAGT-GC-TGGGG-TCTT-C--------GGGATT--CTTT--GTTTT------TTGCCTGG-T-G---CTGG---GTTTT-TCA-ACCTGCCTGTC-GA---TTTTG------TC--T--AAGCT--CCATG--CACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGCGGG-GAA-GTA-----C-CTAACT-GCCCGAGGA-CTGCTCAGG---TAAGA-CGGGCGGTAAC-T-ATCCAATGaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatccgcagggtcaggagtctctctgtcccctatgttgggggttctatactggacagtagggagttcttcactacaaagcccaagccgtgtattctgggttgatttgctttctttccctgccagaggaatgtgtaaaaaaaaacattgcgtagggatccctcatcagccagtcgggtttcttgtaccgcagctatgtcgacgcagagacgatggagctctctgtcaatgatggcggtcttccgtaagtcgtccatggcctgtggatcactgttgaagcttgaacacatagttctcacttccagctagctatacgaagtgctggggtcttcgggattctttgttttttgcctggtgctgggtttttcaacctgcctgtcgattttgtctaagctccatgcacccaatgaagcaagcaagttgaggcggggaagtacctaactgcccgaggactgctcaggtaagacgggcggtaactatccaatg
gi|9 : ttggtgttcttcacattgttaaggttcctcttccttgtcaatctgatgccaatgcttggatcttggatggcaccatgccactttgtgtatatctttgtgctgaaagaaggtgatcgtcacagtcatatttttattggagcatagctcaagaagtccttgaccattttcattcatttttccaatcccataatgttcaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatccgcagggtcaggagCGT--CCATGGCCTGTGGAT--TA-CTGTTGAAG-CCT-GGACA-AATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTATA-CGAAGA-GC-TGGAG-TCTT-C--------GGAATT--CTTTGGTGTTTTTGTTTTTGCCTGG-T-A---CTGG---GTTTT-GCA-ACCTGGCTGTC-GA---TTTTGT----CTT--TAGAAGCT--CCATG--CACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGCGGG-G-T-G---------GTAACT-GTCCGAGGA-CTACTC-GG--GTAAGG-CGGGCGGTAAC-T-ACCCAGTGGAA---CCT-GAAAATTCCTTC--CA-CCGTCAGGAG-CAACCCCTAGCGCC-CGATT-CTAC-GCCAATCGAGCTTGGGCTTACCA-CTGGT-AACTGCTGTTCC-CCG----TGTTG---------TG-----C-CTA---------------CGCTGTTT-CAGCGAAG--CTGG-AGTGACCTCTC
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): GGGTTGCAAGTGTGCTAAAACAACGGACGTCACTCCGGATTTTCCTTCAGGGTTTACTCTCTTAGCCTTCTCTCCCGAGGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTACCCATAGCTGGGGTTTGGTTCGTTTGGCACCAGGGCGTATCCACGCACCGGTGGTCCTGCATGCCACACGCCTGAGGGCCAAACCTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCTGAGTCCGTAAGGTGCTCAGTTGCCCAAATGACGGCACGGAGAACCATTGAGGCATAGGTCTTGCGATAGAGAGGCTATGTACTGGCAGGGAAAGAATTGCGCACTCTGCTCCCCTTTTTGCATTAATACTAGCCAGCTGTGTTAGCTGAAAGCGAGAAGTACAAAGCACTACTCAACAACTGCCACACTAGACGCATCACACCGCATTTGT
Unaligned ( gi|13 ): CGACAGAACCCCCCCTCGACACTACTGATGTTACCAGGCAGGAAAGCTGAGCAATATGTCCTGGCATCAGATTGGTTGCAGGAGTTTGCCGTAGACGTACTGTCAGTGACCAAGTCATACCGCCTTCGGGCTCCTCTCCGAAATTTCGTGTCGGTTTTTTTCCCCCCTAGTTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGCGAGTAAGGTCGTTTGATCCATGACTGGGGAGTCTGTTGGTGGCATCAGGGAATGTCCACACGCCGGTGAGGCCTGCATGCTCGCAACCTCTTGGGCAGACCACCTCCGAGTCCCTGGTAGGTTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGCACATCATACAACATCTAAAATAACGAAATTTCA
Unaligned ( gi|17 ): CAGAACACCCCTCTCGACACACTGATGTTACAGGAGGAAAGCTGAGCAATATGGTTCTGGCATCCATTGGTTGCAGATTGCCGGTGAGACGTACTGGTCAGTGACCAAGGTCATACCGCCTTCGGGCTCCACTCCGATATTTCTGTCGGTTTTTTCCCCCAGTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGGAGTAAGGTCCGTTTGACCCATGACTGGGAGTCTGTGGTGGCACAGGGAATTCCACACGCCGGTTGAGCCTGCATGCCGCCTCTTGGGGCAGACAACCTCCGATCCCTGGTAGTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGC
Unaligned ( gi|22 ): ATTTCTCATTTAATTTCAGCCACACGCCCATGAACAGACCGAGCAAAGAAGGGCCAGAGTCATTGTCTGCTCCAACTCTAGCAGTTGAAGCGCCCTAAGGACAATCTGTTCAGTGCTGGTGGTGTTGCTGATGATGGATGCAAGGTTTATTGTAGAATTTA
Unaligned ( gi|23 ): CCATGACGAGGCATTTGAAAGAACTTGTAGTGGCGTGGCCATGTACTACCAAGGGTTGCAAAGTCTTAACATTTTAGCATTTCTGTTAGCCAGCGATGAGGATTAAAACCAAGAAGTAACAAAGACACACTCATACACACTTGTTGCATCACACACATT
Unaligned ( gi|24 ): CGATGGAGAGGCTTGTACTGGCAGAGAGAGACTTACGCACTCAGCTCCCCTTTTCGCATAAATGCTAGCCAGCGGTGTTAGCTGAAAGGGAGTACAAAGCACTACTCATAAACTACCACACTAGATGTACATGTATCACACCGCCTTT
Unaligned ( gi|25 ): AGGTTGCAAGTGTGCTAAATCAACCGCCTAACAGACCCCACTCCGGATTTTGTTTCAGGGTTTACTCCCTTAGCCTTCTTCTCTCCCAAGGTACAATGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTGCCCATAGCT
Unaligned ( gi|28 ): TAGGGTCCGGCGGAGAGGAAAGCCAATACAGTCGGTGTCAGCGCAGCTGTAGGAGTTGCCAGAAGGTTTCGCAGGGCTCAACCAACTGCCTAAGGGGCTCCACTCCTGATTTT
Unaligned ( gi|29 ): CCGGCATGCCACACGTCTGGGGGCCAAACCTCTTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCCGAGTCCGTGGGAGTCTTTTGCCCAATGACGGTACGAGGAACCACTGAGGC
Unaligned ( gi|30 ): GCGGCTCTCAGGGCCGGCCTGGGCCAAAAGTATAGGAGTCCGGGCTTGCCCAGTAACCAGGATTCTCCCTCTCTTCCCGTGATGTGTTCCAAAGGA
Unaligned ( gi|31 ): CAGGGCGATACGTTTGGCATCAGTTTGGCTACAGATTTATGTAGGGTTTACTCTTTAGCCTTGCCTTACTGAGGATA
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gi|14 : aaaaggttcaccggaccctgcatggatgacaggcgtagcgtaaaaattctctctgtgccgcctgttggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTCTGT-CCC-CCTGTTGTG---GG-TTCTAT--ACTG-G---ACAG-C-A-GAG-A-GTTCTTC-----A-TTGC--AAG-CCCA---C--GC---CGTG----GATT---------CTG-G--------G-TT----------------C--CTC----TGC--CT-TCTTTC-CCCG-CCAGAA-G--AATGTGTAA---------TT--TCT---TTCGAGTAG-GA--ATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT-agtcttgtaagc
gi|15 : aatgactgagggccactcctcaaagtctgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCCATGTGTTTTTAGACCTTC-GGGAGTGTCCCTCCCA-GTTGAG--ACCTTGT-G-GCATTCGCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGGGATGTTCGTCACG--CAG--AGCGTTGCTAATTTTTTTGGGG-GTA--GCA-GCTCATGGCCCAGTTGT--CAAAATGAAGACCATTGTTCTGTTAAAACG-GGTCTCAT-TCACCTCTTTC----CTATGC-GTGAAATGTCC--CAAAAAAAAAACAGATTG---AAGCC-AT-G-A--TTCATCGGTCATT-GC---TCTCC-GGAACTC-GC-A-CG-TTTGAGAAGTC-GC-CA-GATAGAAAG--GTAGAGATAATGCT--CTGC-TTCTAGAGATCTTGG-ATCG--TCGC---TGTGCA----ACC-GGTG-TTTt
gi|16 : G-TAGAA---CTGAT-T-T-TTTTATTTT---GG-A-T---G-AGC-CT--------A----G-T-AAT-ATT-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA--AA-AGGTTCCC-AGCTAAGACCC---GG---A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTCCACTC-G---A-AG-C-AGT-G-CCGTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAG-AC--AC---CATGCATGT-CT---------CCT-C-----------T----------------C--CTC-GG-TGC--CC-T--GTC-CTTG-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CTAC-TC-ACATG----AAGTCGCG--TTCCC-C-GCGGGAGTCGC--T-----TG-TTGGCG--CTCAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--CAATc
gi|18 : t-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA-CAA-GG-TTCCC-AGCTAAGACCC---CGG--A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTC-ACTC-G---A-AG-C-AGT-G-C-GTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAGGAC--ACATGCATG----T-CT---------CCT-C-----------C----------------C--TTC-GG-TGC--CC-T--GTC-TT-G-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CTAC-TC-AC-TGA---GAGTCGCG--TT-CCAC-GC-GGAGTCGC--TT----TG-TTGGCG--CTCAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--C
gi|19 : CT----CA---ACTTTCT-----CA--GGGTAC-TG-CATC-AT-GC-T---G-GT-G--TTGAT-----GCATGGCTTCCCA----AC--TT-TCTTGCTGCAATG-GATCCT-CT--TGGGGAGT---AG--ACTGGTCTTGAT----GCTTACAA----GCGAGTGGTCAGTGTCACAGT-CTG----CATTGTG-GTGTTTGAGTACACAG---TACAAA-T-TTG---AGGTTGG-TTCA--CTT---AGTGATGACCACGTGTA---------GCCA-GTGCTTT--GAGTG-T-GGA--TGTCTC---CA-C----GACACTTTGT-G-ATGT--GGCTT-CATATGG-AAA-AAGG--AGTTGGTCACA--Caa
gi|2 : AG--AGC-TTGC-------------G-GTAA-GCAAGC---------AGAT-T--CAA---GAAG-AC-----TCTG-----ACCCGTTCTCATGTCA--TTTTTCTAGCCCGTGCCCTGC--CTTCC--CAAAA------C-GTTGG---G---CCAT-G-CCCTTC-TCGGTC--T-GCC--AC--CAG--ACTT-GCCG-CG-TT---GACGTCCGCA-A-GAC----AG--GT--AGATA-TGCTTTCTGC-TC---------TGGG-ATC---TCGT---CT-ACA----A-CAGGTGGTCTAATG-ACTCGGTAGAA---TTGGTTC-TCTT--ACTTC--ATG-CCG---A-AGC-TT--------G----CCT-G-T-GTT-G-G-GGCGTAGACGC-A--AAACAAAGGGTTCACTCG----GAACCGCTTGCCAG-TGG--A-TG--C---A-GGC---GCAG---GCGAATTAAAATTTCATCTGT-ACCTGCTG--G-GTTTGG-TTCAATC-ACAGCG---A-AGAT-ACT-G-C-ATGGCGC-----AACTGCCCAAA-TCCA--ACTAAC---CGTG----T-TT---------CCT-TCACATCCAG-TTTCGCCCACGATTTTTCC--CTCCAG-TGC--CT-T--TTTTCTTGACCAGAAAG--AAAG-GTATAG-----TGCTCCTCC---TCA-----G-GG--ATC--CTTC-TC-GT-GG----GAGTCGTGTTTT-CC-T-GC-AGGGCTGC--TA----TG-TCGATGTTTTCAGTATCCT---GTG-CAGTGGTC-AC--GATCAA-TCA--------ATGCTGTTTTTCGGGGTCGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGG--TAA-TTGTC--AG-TCC-TGGA-ACATAGT-T-TTACATTCC-GCTTGCTAATCCGAAGA-GC-TGGGGAACT--------T-CGTTTTT--CTTT--TTCTTTTG--CTTGCCCTG-CACACCGGTTTA-ACGTATCCACTTGTCAGAGACCCTCGTA-GCACT-CTTT--AAGCTTCCCAGG--CACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGG-GTG-G-C-GTAGCACCC-CTTACT-G-CTGGGGG-CTTCCC-AG-CT--GGGCCGGGC-GTAGCTTGA--GAGTGGAGGATTAC-GATGATTCCTTCAGCACCCGTC-GAAGACAACCCGTAGCGTC-C-A-C-CTACGGCCAATCGAGCAAGGACTTATCACCTTGTAAACTGTT-TCTCTCCGCAATTGCTGTCCATCTT-TGACTCCC-CTTTCACCACTTCTCCACCCCGGTAA-AGGTGAGGGACTGGCAATGACCTCTC
gi|20 : TATA---GTGTTGTTTTAAGAG---TTATGGGATCTCCTTCTAAGTTGTTTTCTCGTGCTTTTGGTGATCGA-CTCTGTGGTGTATATTTTCTTGTCACCAGGGGTAAAGCTCGTC-TTTAC-TTTAGTAT-GCTTTGATGCCTGCCTGGGCTGACCACCCCTTCGTATTCTTTGAGTGATGCAAAACTTCTCCTGGT---TTTCAGTTTTTCACCTCT-T----GTT--AAA----GT-AGCAATCagggcgcggcctgcaaagtcatattgggatcctggctgcccctaagccaaggatccccctctcttctccctggatgtgttttcaaaggatcgcagggcgatacgtttggcatcagtttgtgctgcagattttcctgtaggtttactcaaattagccctttcctacttccgaggttatccacaaggcacgtgggttttgtttgctatttactcatagctcgggactaggattgcaggcaccgcagggcatatccaaacaccgatgtgccatgcatatcgcttgcattagcgggctctagtctcctccaagacctgtggtcctgctaaaggggccaatttaacgcaaaacaaaacacataattaaagtactccccaagcaccactcaccacatggccctaaagcaatttcgtagaacacagaa
gi|21 : TTCTGATGTTTCCGCTGTTGAACGCTT-GCTGAATGTTATCTGACAATTGTGACCTGTA-A-A--CATTTGC-CAAGCCC------CGTGTCATAAGC-TGTGATCT--GC-TGTG----------TGCAACTCCCAGTACC--TAGGTT-TTTCTGACTTTTATCAAACA-TA-TAACT--GATGAGTAGTAGACTG-ATGCATATTG-CAGACCCATTGACTGaagg
gi|26 : GC--TC----TG-TCGACG--CAGAGA---CG---ATG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTTCG----TAA--GTCGT--CCATGGCCTGTGGA--TTA-CTGTTGAAG-CCT-GGAC-AAATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTA
gi|27 : T--CCA----GCGAGTGGTCGGTGTCGCAGT-CAG----CGCTGTG-GT-----AGCTGCGGGTGAACCAAA-CTCAGATCAGC--GA-GTCTCTCTT---GGTAATGACGAGATCTAGCTG---GTGCCA-ATta
gi|3 : acgGATCATGTCAAGCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CATA----A--ACTTTGT-G-TC-T--ATCTTAGTGCTGG-AAG-AAAG--TGTTCATCAC----AGCCAGG-TTTT-------------T-ATA--AAA-GC---------ATACCT--CAA---GAAG-TA-----TTTG-----AAC-ATTGTCAT-TCA--T-TTTC----CCA----ATAA--TGTCC-----AA------T-GACTGAAGG---C-CT-GGA--TTC-AAAGTC--T-GC---AC--C-A--ACCC-TT-G-CA-TT---GAAGTC-TCCCATGA-----AG--A---AGA-G-TGCTT-CT---TTGT-------TGGGTAAAG--T-AC---AG-ACA----A-T-GGGG-TCAAAGG-CATAA-TAGAAA--CTGAC-CCT-TT--TCTTCTACAG-T-G---G-A-C-TCTGAGTGGAG----C-TCA-TAGTT-GCA-G-CATAAGCAC-A--CA-CAA-AA-TTGAC-TA----CACCTA--TACCTA-TAGCCA-TCCAC---A-GGG---TCAG---G--------AAGTCTCTCTGT-CCC-CCTGTTG-G---GGGTTTTAT--------------------------------------A-CTGC--AAC-GCCC--AC--GT---CGTGAA--T-TC-----------T-G--------GATT----------------C--ACC-TG--GC--TTCT--TCC-CCCG-CCAGAA-G--AATTTGTA-GG-----TTTTTTTTC---TTT-----T-AGTTATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT-TC-TTGT-AGAACAGT--TA----TG-TCGATG--CAGAGT---CG---GCG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTCTG----TAG--GTCAC--CCATGGCCTGTGGA--TCA-CTGTTGAAG-CCT-GGAT-ACATAGT-TCTAACATTCCAGCT-------------A-GC-TGGGG-TCT--------T-CGGAATT--CTTT--GTTTT--------GCCTGG-TGC-TGGGTTTTCGCA-ACCTGCCTGTC-GA---TTTTGT--------C--T--ACGCT--TCATG--CACCCAATGAACCCAGCAAGTTGAGGCGGG-G-TAGTA-----C-CTAATT-G-CGAGAGGACTGCCT-GGGC--AAGG-CGGAATGTAAC-T-ACCCAATGGAA---CGT-GAAAATTCCTCC--CA-CCGTCAGGAG-CAATCCCTAGCGCC-CGG-CTCTAC-GCCAATCGAGTTTGGGCTTATCA-CTGGT-AACTGCTG-CTC-CCAT---TGTTG---------TA-----C-CTA---------------CACTGTCT-CAGCGAAG--CTGT-AGTGACCTCTCattat
gi|4 : catcttcctgctcaaTTCTCAT-TCA--T-TTGC----CCATACCA-AA--CTTGC--CGAGG------CAGGATG---G---CCAC-G-A--T-----GGTC--T-GC---AC--C-C--ACTC-TA-G-CA-TT---GAAGTC-GCA-A-GA---------G---AAACG-AGTTT-CTTCATGAC-------TGGG-ATGC--TCTCAATTG-ATGGATCA-C-AG-G-TTT------CTCA-TAGAA-----------T-TC--AC--C--TAG-T-GTCTG-GGG-TG--------GAAGAC-A-G-A-GTC-G-GTG-CGTACACAC-T--GA-CAA-GGGTG-AC-GG----GACC-----GC--AGTGGT-ACTG-AC------GC---GGAG---GT---CAGACATT---------GCTGCCTG---------G-TTCTACC-A-TA-GCTCA-AG-C-A-A-G-CTGTTTCTTC----A-CTGC--AAA-GCCT--AC--TC---CATG----C-TC---------TTTGG--------G-TT----------------C--GTC-GGATG---TT-T--TCC-CTTG-CTACTA-A--AACGTGAAA-------TCTTTCTCT---TTT-----A-AT--GTG--CCAG-T--GC-CGCTAAGCGCCGTT--TT-CT-T-GA-AGAGTGGT--TA----TG-TCCACG--TTCATT---CT---CTT-GAGC--TCGTC--GTTT-A-TGA--------CAGCTGTATTTCT----TGC--GTTGTTGCAAT-GTCTAGATGTTTCA-CAG--AAAG-GCC-GATCAACATTGT-CCGGACATTCCAACTTCCCAGT-TTTAGA-GC-TGATC-CCTTTATATTGT-TGTGGTT--TTTT--TTTTTTTG---TTGCCTGG-TGC--GAAAGCT-GCG-ACCTGC-------A---GTTTGGATT-ACTCC--T--GATCT--CCATG--CACCCAATGAAGAAAGCAGACCGTGGCGGG-A-C-G-A-----CACCAATTGG-CTGGGGA-CTGCCC-AG-CTTAAGG-CGGGCGGAAGC-TG-TCCAGTGAAA---TCC-GAGAATATCTCC--CA-CCGTCA-GAG-CAACCCCCGGCGCCGCGC-T-CTAC-GCCAATTGAGCGGTAGCTTATAA-CCGGT-AACTGCTGCTCC-CCG----T-TTG---------TG---------T---------------CGAGGCCATAGGCGAAG--CTGG-AGTGGCCTCTCcaggtgcaggcctgggcagatgatatggagatcctgaagtgcctagtcgccaggatccccctctcggcgttgcttacaggatccggcagagaggcaagtcaacagttcagcgcagctgcaggagttgccagaaggtttcgcagggctcagccaactgcctaaagggctccactcctgattttctgttggggtgaactcccatagccttggactcttccgggccgttcacaaggcagtgaggctatttgacccatagctgggggtctggatcgtgggcagcagagcgtatccacaaaccggtgagccatgcatgctacatgtttaggggccagaccttctccaagtcccttgtagtctagcccggctatgaggtataac
gi|5 : catA---CTGGT-CAT-TT--GCTTC---AG-C-G-----AGC-TT--------G----C-T-G-T-GTG-G-G-G-CGT--ACGC-ACCGC-CCC-CGGTTT-C-CG----CGCCC---TGC--C-TGG--C-TG-CC---A-GG----GCAA---GC--CT-ACCATTATTTCTGT-G-CGCAGGT-------GG-TTCACTC--CTC-G---C-CG-C-A-T-GCC-ATGGCGT-------CTGC--CAC-TCC----C--AC---CGTG----T-TCGTCGTGTATCCT-A--------G-TT-------------------CTA-AG-TGCAGGT-T--TTC-TTCG-CC--AA-GCCGCGGTATA--G-----TGTTCCTATGGATGC-----GTGG--ATTTACCTT-TCTG---G----GAGTAGCGTTTT-CC-T-GTGAGAGGTGCAGTAACCTTGTTCGCTG--TTCGAT---CTAAGATGCAAGT--TC-TC--GATA-A-TCAAATGTCGTTTTTTGTTTTTCG----CGCAAATAAT--CT---GCCTGA-GG--TCA-CTGTC--AGTCCT-GGGC-GCATAGTGTTTC-CATT--AGCTTGCTAAT-CGAAGAGGCATGGGG-ACT--------TACGTGTTTTCCTTT--TTCTTTTG--CTTG-CTGG-TAA-CAGG-TTA-ACG-ATCCACTTGCT-CA---GCTCGTA-G-ACT-C--TAGAAGCT---CAGGACCATC---TGAAGC--GCAG--TGTGGCCGG-G-C--TAGC---C-CTTACTGG-CTGGGGG-CTGCAC----TTTGAGG-CGGGCGGTAGC-TGA---AGTAGGA---TGTAGATGA-TCCT-C--CA--CGT----GGACA---CGTAGCGTC-CAA-C-TCAC-G-CAATCGAGCAAGGA-TTATC--CTCGTAAACTGTTGTCT--TCG----TGTTG-------TGTG-------TTT---------------CACGGTAA-AGGTGAGA--CTGG-AGTAGCCTcaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|6 : AACGCTTCTTGAGTAACGGAGTTTTCTCTGGTGTAGAGTTCCAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCCCATTTGCTTGTCCC-TGTCTGTGATGACTTCCC--GTCTT-GATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGGGTTTGCCTGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATACTCCTGATGTTGCCACTATCCGACGCTTTGCTGGATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-GTAGTCGGTGGCGCAA---C---------GTCGT--GC-TG---TTT--GC-TGTGCTTTGCTATGTGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTT-ATTCAGACTTGGGTCACGCT-TA-TAGCT--GACAAGT-----GCG--TTGCGT-TTGGCA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGG-CTTCAAACCAACCAATGTTCTTGTGC---TCTTTTTT--TGCCGTACGTCAGAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTT-CTAAGAGAGTTCCAGTTGTCC--CTCG-GTT-TTGTTCT---GCATTTATA--TGAGCTGTTTTGAGAG---T--------CTCCTC--AAGTTGTTT----GT--------TGA---A-CTCT----TG---GTTCTTTT----CC--AGGTGA-GC-CGTC-TT-AC-T---G-AT-G--TTGAT-----CCTAGGCTGACCC----TT--TC-TCTTTGAGTGATG-AAA-CTTCG--TGG----TTTCAG--TTTCACCTTTGT----GG---CAATAATG-GAGTGATCGGTGTCGCAAT-CAG---CTCTT-TG-AT-----AGGACCTGGTGTTGCAAA-CGTTGTTCAAG--GA-ATCACGTTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATACCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA-G----GATACCTTGT-G-ACAT--GCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGG--TGTTCGTCACG--CAG--AGC-CTGC-------------G-GTA--GCA-GC---------AGAGTT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTTC----CTATGCCG----------------------------------------T-G-A--TTC-TCGGTC--T-GC---AC--C-G--ACTC-GC-G-CG-TT---GAAGTC-GCAAA-GA-----AG--GT--AGATA-TGC-T-CTGC-T--T-------TGGG-ATC---TTGC---TG-ACA----A-C-GGTG-TCTAGTG-ACTCG-TAGAA---TTGGTCC-T-TT--ACTT---CAGCC-G---A-ATC-TT--------G----C-C-G-T-GTTGG-G-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GAtcagggcgcggatgggcaaagtatatggagatctggctgcccattgtaacggaccccttctttctccctgatatattccaaaggatcgcagggcgatacgtttggatcagtttggtgagatttctgtagggtttactcttagcatttcctactccgaaggtacacaaaggcaggggttgttgctatttacccatagctagggactaggattggaggcacttcagggcatatccaacacgatgtgcagcatgccttgctttaggggctgtctttctcaagacctgtgttctgctagggcatttcctacaaataattaatcccaacacccacctgatacctcccccccaaagaaagcaattcgtacacaga
gi|7 : ATTCGAC-CTT-GCTGA-TGTTTTCCGATAA-TGAAGCC---AGA-AGTCGTTGGCGCAA---CGCGTGATGTGTCGT--GTGCG---TTTTGGCACGGG----------TGCAGCTTGCAATGCCTGTAGTTA-ATTCAGACCTGG--TACACT-TAATAGTCTGGATAAGT-----GCGGCTTGCGT-TGG-CAG--TCA-TGACTGGCTTCCATCTCAGTAATTAAACGTGG--TTCAAACCACTCAGTGGTACTGTGCCGCTCTTTTTTCTTGCCG-ATGTCGAAACGTGCAAGTGCTGTGAATGGCGTT-CTAAGAGTGTTCCAGTGGTTCTCC-CGTGTGGTTGTTCCCTGGCATTTATAAATGA--TGTTATAAAAGATGT--------CTCCTC--AGTTTGTTT----GT--------TGA---AACTCT----TG----TTCTTTT----CC--GGGTAA-GC-CGTCGTT-ACGT---G-ATTG--TTGAT-----CCTGATCTGACC-----CT--TA-TTTTTGA-TGATG-AAACCTTCT--TGG----TTTCAG--TTTCACTTTTGTTGCAGAT--CAA----AGGAGTGGT-AATGTCGCAAT-CACTACCCCTTG-G-ATC----AGAACCTGGT--TGCAAAACATTGTTTAGG--GATAT-ACGCTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTGCGAATGCAG-GT-TTTT--GACCT-CTGGA--TGTCTCAA-GA-G----A--ACCTTGTGG-GCAT---CCTT-GGTTTGATAAGTAAGG--T-TTCGTC-CG--CAA--A---CTGC-------------GCGTA---CA-GC---------AGGAGTTCCAA---GAAG-CC-----TCTG-----A-C-GTTCTCCT-TCG--TCTCCC----TAGCGCCCTGA--TGTCCTATAAAA------C-GTTTG---GGC-C-ATCG-ACTTCC-TCGTTC--TGGCGCGAC--C-G--ACTCTGC-GTCGTTT---GAAGT--GCCAA-GA-----AGCTT---AGATA-TGCGT-CTGC-TTC--------TGGG-ATCGTCTCGC---TA-ACA----A-C-GGTG-TC--ATG--CTCG-T-GAGTTTTTGTC-C-T-TT--AATT---CAG-T-G---GAAGCTTT--------G----C-T-G-T-GTT-G-G-A-GGAAGACGCAA--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GA-CC---TGC--ATTGG--A-T--AC---ATGGCGGGGC-A---GC--AT-AAATTTCTCTCAGTGGCCGCCTGtgt
gi|8 : TGGTGTTCTTCA-CATTGTTAAGG------TTCCTCTT-----------CCTTGTCAATCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCAC---CA-T----GCCACTTTGT-GTATAT---CTTT-GTGCTGA-AAG-AAGG--TGATCGTCACAGTCAT--ATT-TT------------------TATTGGA-GC---------ATAGCT--CAA---GAAG-TC-----CTTG-----ACC-ATTTTCAT-TCA--TTTTTC----CAATCCCATAA--TGTTC--
gi|8 : tTCTCTCTGT-CCCCTATGTTG-G---GGGTTCTAT--ACTG-G---ACAG-T-A-------G-GGAGTTCTTCA-CTAC--AAA-GCCC--AA--GC---CGTG----T-AT---------TCT-G--------G-GT----------------TGATTT-GC-TTT--CT-T--TCC-CT-G-CCAGAG-G--AATGTGTAAAAAAAAACATTGCG------TA-----G-GG--ATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT-TC-TTGT-ACCGCAGC--TA----TG-TCGACG--CAGAGA---CG---ATG-GAGC--TC-TCT-G-TC-AATGA--------TGGCGGTCTTCCG----TAA--GTCGT--CCATGGCCTGTGGA--TCA-CTGTTGAAG-CTT-GAAC-ACATAGT-TCTCAC-TTCCAGCTAGCTATA-CGAAGT-GC-TGGGG-TCT--------T-CGGGATT--CTTT--GTTTT------TTGCCTGG-TGC-TGGGTTTT-TCA-ACCTGCCTGTC-GA---TTTTG-------T-C--T--AAGCT--CCATG--CACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGCGGG-GAA-GTA-----C-CTAACT-GCCCGAGGA-CTGCTCAGG---TAAGA-CGGGCGGTAAC-T-ATCCAATGaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatccgcagggtcaggagtctctctgtcccctatgttgggggttctatactggacagtagggagttcttcactacaaagcccaagccgtgtattctgggttgatttgctttctttccctgccagaggaatgtgtaaaaaaaaacattgcgtagggatccctcatcagccagtcgggtttcttgtaccgcagctatgtcgacgcagagacgatggagctctctgtcaatgatggcggtcttccgtaagtcgtccatggcctgtggatcactgttgaagcttgaacacatagttctcacttccagctagctatacgaagtgctggggtcttcgggattctttgttttttgcctggtgctgggtttttcaacctgcctgtcgattttgtctaagctccatgcacccaatgaagcaagcaagttgaggcggggaagtacctaactgcccgaggactgctcaggtaagacgggcggtaactatccaatg
gi|9 : ttggtgttcttcacattgttaaggttcctcttccttgtcaatctgatgccaatgcttggatcttggatggcaccatgccactttgtgtatatctttgtgctgaaagaaggtgatcgtcacagtcatatttttattggagcatagctcaagaagtccttgaccattttcattcatttttccaatcccataatgttcaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatccgcagggtcaggagCGT--CCATGGCCTGTGGA--TTA-CTGTTGAAG-CCT-GGAC-AAATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTATA-CGAAGA-GC-TGGAG-TCT--------T-CGGAATT--CTTTGGTGTTTTTGTTTTTGCCTGG-TAC-TGGGTTTT-GCA-ACCTGGCTGTC-GA---TTTTGT-----CT-T--TAGAAGCT--CCATG--CACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGCGGG-G-T-G---------GTAACT-GTCCGAGGA-CTACTC-GG--GTAAGG-CGGGCGGTAAC-T-ACCCAGTGGAA---CCT-GAAAATTCCTTC--CA-CCGTCAGGAG-CAACCCCTAGCGCC-CGATT-CTAC-GCCAATCGAGCTTGGGCTTACCA-CTGGT-AACTGCTGTTCC-CCG----TGTTG---------TG-----C-CTA---------------CGCTGTTT-CAGCGAAG--CTGG-AGTGACCTCTC
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): GGGTTGCAAGTGTGCTAAAACAACGGACGTCACTCCGGATTTTCCTTCAGGGTTTACTCTCTTAGCCTTCTCTCCCGAGGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTACCCATAGCTGGGGTTTGGTTCGTTTGGCACCAGGGCGTATCCACGCACCGGTGGTCCTGCATGCCACACGCCTGAGGGCCAAACCTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCTGAGTCCGTAAGGTGCTCAGTTGCCCAAATGACGGCACGGAGAACCATTGAGGCATAGGTCTTGCGATAGAGAGGCTATGTACTGGCAGGGAAAGAATTGCGCACTCTGCTCCCCTTTTTGCATTAATACTAGCCAGCTGTGTTAGCTGAAAGCGAGAAGTACAAAGCACTACTCAACAACTGCCACACTAGACGCATCACACCGCATTTGT
Unaligned ( gi|13 ): CGACAGAACCCCCCCTCGACACTACTGATGTTACCAGGCAGGAAAGCTGAGCAATATGTCCTGGCATCAGATTGGTTGCAGGAGTTTGCCGTAGACGTACTGTCAGTGACCAAGTCATACCGCCTTCGGGCTCCTCTCCGAAATTTCGTGTCGGTTTTTTTCCCCCCTAGTTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGCGAGTAAGGTCGTTTGATCCATGACTGGGGAGTCTGTTGGTGGCATCAGGGAATGTCCACACGCCGGTGAGGCCTGCATGCTCGCAACCTCTTGGGCAGACCACCTCCGAGTCCCTGGTAGGTTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGCACATCATACAACATCTAAAATAACGAAATTTCA
Unaligned ( gi|17 ): CAGAACACCCCTCTCGACACACTGATGTTACAGGAGGAAAGCTGAGCAATATGGTTCTGGCATCCATTGGTTGCAGATTGCCGGTGAGACGTACTGGTCAGTGACCAAGGTCATACCGCCTTCGGGCTCCACTCCGATATTTCTGTCGGTTTTTTCCCCCAGTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGGAGTAAGGTCCGTTTGACCCATGACTGGGAGTCTGTGGTGGCACAGGGAATTCCACACGCCGGTTGAGCCTGCATGCCGCCTCTTGGGGCAGACAACCTCCGATCCCTGGTAGTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGC
Unaligned ( gi|22 ): ATTTCTCATTTAATTTCAGCCACACGCCCATGAACAGACCGAGCAAAGAAGGGCCAGAGTCATTGTCTGCTCCAACTCTAGCAGTTGAAGCGCCCTAAGGACAATCTGTTCAGTGCTGGTGGTGTTGCTGATGATGGATGCAAGGTTTATTGTAGAATTTA
Unaligned ( gi|23 ): CCATGACGAGGCATTTGAAAGAACTTGTAGTGGCGTGGCCATGTACTACCAAGGGTTGCAAAGTCTTAACATTTTAGCATTTCTGTTAGCCAGCGATGAGGATTAAAACCAAGAAGTAACAAAGACACACTCATACACACTTGTTGCATCACACACATT
Unaligned ( gi|24 ): CGATGGAGAGGCTTGTACTGGCAGAGAGAGACTTACGCACTCAGCTCCCCTTTTCGCATAAATGCTAGCCAGCGGTGTTAGCTGAAAGGGAGTACAAAGCACTACTCATAAACTACCACACTAGATGTACATGTATCACACCGCCTTT
Unaligned ( gi|25 ): AGGTTGCAAGTGTGCTAAATCAACCGCCTAACAGACCCCACTCCGGATTTTGTTTCAGGGTTTACTCCCTTAGCCTTCTTCTCTCCCAAGGTACAATGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTGCCCATAGCT
Unaligned ( gi|28 ): TAGGGTCCGGCGGAGAGGAAAGCCAATACAGTCGGTGTCAGCGCAGCTGTAGGAGTTGCCAGAAGGTTTCGCAGGGCTCAACCAACTGCCTAAGGGGCTCCACTCCTGATTTT
Unaligned ( gi|29 ): CCGGCATGCCACACGTCTGGGGGCCAAACCTCTTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCCGAGTCCGTGGGAGTCTTTTGCCCAATGACGGTACGAGGAACCACTGAGGC
Unaligned ( gi|30 ): GCGGCTCTCAGGGCCGGCCTGGGCCAAAAGTATAGGAGTCCGGGCTTGCCCAGTAACCAGGATTCTCCCTCTCTTCCCGTGATGTGTTCCAAAGGA
Unaligned ( gi|31 ): CAGGGCGATACGTTTGGCATCAGTTTGGCTACAGATTTATGTAGGGTTTACTCTTTAGCCTTGCCTTACTGAGGATA
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gi|14 : aaaaggttcaccggaccctgcatggatgacaggcgtagcgtaaaaattctctctgtgccgcctgttggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTCTGT-CCC-CCTGTTGTG---GG-TTCTAT--ACTG-G---ACAG-C-A-GAG-A-GTTCTTC-----A-TTGC--AAG-CCCA---C--GC---CGTG----GATT---------CTG-G--------G-TT----------------C--CTC----TGC--CT-TCTTTC-CCCG-CCAGAA-G--AATGTGTAA---------TT--TCT---TTCGAGTAG-GA--ATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT--agtcttgtaagc
gi|15 : aatgactgagggccactcctcaaagtctgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCCATGTGTTTTTAGACCTTC-GGGAGTGTCCCTCCCA-GTTGAG--ACCTTGT-G-GCATTCGCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGGGATGTTCGTCACG--CAG--AGCGTTGCTAATTTTTTTGGGG-GTA--GCA-GCTCATGGCCCAGTTGT--CAAAATGAAGACCATTGTTCTGTTAAAACG-GGTCTCAT-TCACCTCTTTC----CTATGC-GTGAAATGTCC--CAAAAAAAAAACAGATTG---AAGCC-AT-G-A--TTCATCGGTCATT-GC---TCTCC-GGAACTC-GC-A-CG-TTTGAGAAGTC-GC-CA-GATAGAAAG-GTAGAGATAATGCT--CTGC-TTCTAGAGATCTTGG-ATCG--TCGC---TGTGCA----ACC-GGTG-TTTt
gi|16 : G-TAGAA---CTGAT-T-T-TTTTATTTT---GG-A-T---G-AGC-CT--------A----G-T-AAT-ATT-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA--AA-AGGTTCCC-AGCTAAGACCC---GG---A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTCCACTC-G---A-AG-C-AGT-G-CCGTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAG-AC--AC---CATGCATGT-CT---------CCT-C-----------T----------------C--CTC-GG-TGC--CC-T--GTC-CTTG-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CTAC-TC-ACATG----AAGTCGCG--TTC-CC-C-GCGGGAGTCGC--T-----TG-TTGGCGCT--CAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--CAATc
gi|18 : t-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA-CAA-GG-TTCCC-AGCTAAGACCC---CGG--A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTC-ACTC-G---A-AG-C-AGT-G-C-GTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAGGAC--ACATGCATG----T-CT---------CCT-C-----------C----------------C--TTC-GG-TGC--CC-T--GTC-TT-G-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CTAC-TC-AC-TGA---GAGTCGCG--TT--CCAC-GC-GGAGTCGC--TT----TG-TTGGCGCT--CAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--C
gi|19 : CT----CA---ACTTTCT-----CA--GGGTAC-TG-CATC-AT-GC-T---G-G-TG--TTGAT-----GCATGGCTTCCCA----AC--TT-TCTTGCTGCAATG-GATCCT-CT--TGGGGAGT---AG--ACTGGTCTTGAT----GCTTACAA----GCGAGTGGTCAGTGTCACAGT-C---TG-CATTGTG-GTGTTTGAGTACACAG---TAC-AAAT-TTG---AGGTTGG-TTCA--CTT---AGTGATGACCACGTGTA---------GCCA-GTGCTTT--GAGTG-T-GGA--TGTCTC---CA-C----GACACTTTGT-G-ATGT--GGCTT-CATATGG-AAA-AAGG--AGTTGGTCACA--Caa
gi|2 : AG--AGC-TTGC-------------G-GTAA-GCAAGC---------AGAT-T--CAA---GAAG-AC-----TCTG-----ACCCGTTCTCATGTCA--TTTTTCTAGCCCGTGCCCTGC--CTTCC--CAAAA------C-GTTGG---G---CCAT-G-CCCTTC-TCGGTC--T-GCC--AC--CAG--ACTT-GCCG-CG-TT---GACGTCCGCA-A-GAC----AG-GTAGA--TA-TGCTTTCTGC-TC---------TGGG-ATC---TCGT---CT-ACA----A-CAGGTGGTCTAATG-ACTCGGTAGAA---TTGGTTC-TCTT--ACTTC--ATG-CCG---A-AGC-TT--------G----CCT-G-T-GTT-G-G-GGCGTAGACGC-A--AAACAAAGGGTTCACTCG----GAACCGCTTGCCAG-TGG--A-TG--C---A-GGC---GCAG---GCGAATTAAAATTTCATCTGT-ACCTGCTG--G-GTTTGG-TTCAATC-ACAGCG---A-AGAT-ACT-G-C-ATGGCGC-----AACTGCCCAAA-TCCA--ACTAAC---CGTG----T-TT---------CCT-TCACATCCAG-TTTCGCCCACGATTTTTCC--CTCCAG-TGC--CT-T--TTTTCTTGACCAGAAAG--AAAG-GTATAG-----TGCTCCTCC---TCA-----G-GG--ATC--CTTC-TC-GT-GG----GAGTCGTG--TTTTCC-T-GC-AGGGCTGC--TA----TG-TCGATGTTTTCAGTATCCT---GTG-CAGTGGTC-AC--GATC-AATCA--------ATGCTGTTTTTCGGGGTCGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGG--TAA-TTGTC--AG-TCC-TGGA-ACATAGT-TTT-ACATTCC-GCTTGCTAATCCGAAGA-GC-TGGGGAACT--------T-CGTTTTT--CTTT--TTCTTTTG--CTTGCCCTG-CACACCGGTTTA-ACGTATCCACTTGTCAGAGACCCTCGTA-GCACT-CTTTAAGCTTCCCAGG--CACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGG-GTG-G-C-GTAGCACCC-CTTACT-G-CTGGGGG-CTTCCC-AG-CT--GGGCCGGGCG-TAGCTTGAG--AGTGGAGGATTAC-GATGATTCCTTCAGCACCCGTC-GAAGACAACCCGTAGCGTC-C-A-C-CTACGGCCAATCGAGCAAGGACTTATCACCTTGTAAACTGTT-TCTCTCCGCAATTGCTGTCCATCTT-TGACTCCC-CTTTCACCACTTCTCCACCCCGGTAA-AGGTGAGGGACTGGCAATGACCTCTC
gi|20 : TATA---GTGTTGTTTTAAGAG---TTATGGGATCTCCTTCTAAGTTGTTTTCTCGTGCTTTTGGTGATCGA-CTCTGTGGTGTATATTTTCTTGTCACCAGGGGTAAAGCTCGTC-TTTAC-TTTAGTA-TGCTTTGATGCCTGCCTGGGCTGACCACCCCTTCGTATTCTTTGAGTGATGCAAAACTTCTCCTGGT---TTTCAGTTTTTCACCTCT-T----GTT--AAA----GT-AGCAATCagggcgcggcctgcaaagtcatattgggatcctggctgcccctaagccaaggatccccctctcttctccctggatgtgttttcaaaggatcgcagggcgatacgtttggcatcagtttgtgctgcagattttcctgtaggtttactcaaattagccctttcctacttccgaggttatccacaaggcacgtgggttttgtttgctatttactcatagctcgggactaggattgcaggcaccgcagggcatatccaaacaccgatgtgccatgcatatcgcttgcattagcgggctctagtctcctccaagacctgtggtcctgctaaaggggccaatttaacgcaaaacaaaacacataattaaagtactccccaagcaccactcaccacatggccctaaagcaatttcgtagaacacagaa
gi|21 : TTCTGATGTTTCCGCTGTTGAACGCTT-GCTGAATGTTATCTGACAATTGTGACCTGTA-A-A--CATTTGC-CAAGCCC------CGTGTCATAAGC-TGTGATCT--GC-TGTG----------TGCAACTCCCAGTACC--TAGGTT-TTTCTGACTTTTATCAAACA-TA-TAACT--GATGAGTAGTAGACTG-ATGCATATTG-CAGACCCATTGACTGaagg
gi|26 : GC--TC----TG-TCGACGCA--GAGA---CG---ATG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTTCG----TAA--GTCGT--CCATGGCCTGTGGA--TTA-CTGTTGAAG-CCT-GGAC-AAATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTA
gi|27 : T--CCA----GCGAGTGGTCGGTGTCGCAGT-C---AG-CGCTGTG-GT-----AGCTGCGGGTGAACC-AAACTCAGATCAGC--GA-GTCTCTCTT---GGTAATGACGAGATCTAGCTG---GTGCCA-ATta
gi|3 : acgGATCATGTCAAGCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CATA----A--ACTTTGT-G-TC-T--ATCTTAGTGCTGG-AAG-AAAG--TGTTCATCAC----AGCCAGG-TTTT-------------T-ATA--AAA-GC---------ATACCT--CAA---GAAG-TA-----TTTG-----AAC-ATTGTCAT-TCA--T-TTTC----CCA----ATAA--TGTCC-----AA------T-GACTGAAGG---C-CT-GGA--TTC-AAAGTC--T-GC---AC--C-A--ACCC-TT-G-CA-TT---GAAGTC-TCCCATGA-----AG-A-AGA---G-TGCTT-CT---TTGT-------TGGGTAAAG--T-AC---AG-ACA----A-T-GGGG-TCAAAGG-CATAA-TAGAAA--CTGAC-CCT-TT--TCTTCTACAG-T-G---G-A-C-TCTGAGTGGAG----C-TCA-TAGTT-GCA-G-CATAAGCAC-A--CA-CAA-AA-TTGAC-TA----CACCTA--TACCTA-TAGCCA-TCCAC---A-GGG---TCAG---G--------AAGTCTCTCTGT-CCC-CCTGTTG-G---GGGTTTTAT--------------------------------------A-CTGC--AAC-GCCC--AC--GT---CGTGAA--T-TC-----------T-G--------GATT----------------C--ACC-TG--GC--TTCT--TCC-CCCG-CCAGAA-G--AATTTGTA-GG-----TTTTTTTTC---TTT-----T-AGTTATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT--TC-TTGT-AGAACAGT--TA----TG-TCGATGCA--GAGT---CG---GCG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTCTG----TAG--GTCAC--CCATGGCCTGTGGA--TCA-CTGTTGAAG-CCT-GGAT-ACATAGT-TCTAACATTCCAGCT-------------A-GC-TGGGGT-CT--------T-CGGAATT--CTTT--GTTTT--------GCCTGG-TGC-TGGGTTTTCGCA-ACCTGCCTGTC---GATT-TTGT--------CT--ACGCT--TCATG--CACCCAATGAACCCAGCAAGTTGAGGCGGG-G-TAGTA-----C-CTAATT-G-CGAGAGGACTGCCT-GGGC--AAGGC-GGAATGTAACT--ACCCAATGGAA---CGT-GAAAATTCCTCC--CACC-GTCAGGAG-CAATCCCTAGCGCC-CGG-CTCTACG-CCAATCGAGTTTGGGCTTATCA-CTGGT-AACTGCTG-CTC-CCAT---TGTTG---------TA-----C-CTA---------------CACTGTCT-CAGCGAAG--CTGT-AGTGACCTCTCattat
gi|4 : catcttcctgctcaaTTCTCAT-TCA--T-TTGC----CCATACCA-AA--CTTGC--CGAGG------CAGGATG---G---CCAC-G-A--T-----GGTC--T-GC---AC--C-C--ACTC-TA-G-CA-TT---GAAGTC-GC-----A-----AG-AGAAA--CG-AGTTT-CTTCATGAC-------TGGG-ATGC--TCTCAATTG-ATGGATCA-C-AG-G-TTT------CTCA-TAGAA-----------T-TC--AC--C--TAG-T-GTCTG-GGG-TG--------GAAGAC-A-G-A-GTC-G-GTG-CGTACACAC-T--GA-CAA-GGGTG-AC-GG----GACC-----GC--AGTGGT-ACTG-AC------GC---GGAG---GT---CAGACATT---------GCTGCCTG---------G-TTCTACC-A-TA-GCTCA-AG-C-A-A-G-CTGTTTCTTC----A-CTGC--AAA-GCCT--AC--TC---CATG----C-TC---------TTTGG--------G-TT----------------C--GTC-GGATG---TT-T--TCC-CTTG-CTACTA-A--AACGTGAAA-------TCTTTCTCT---TTT-----A-AT--GTG--CCAG-T--GC-CGCTAAGCGCCGTT--TT--CT-T-GA-AGAGTGGT--TA----TG-TCCACGTT--CATT---CT---CTT-GAGC--TCGTC--GTTT-A-TGA--------CAGCTGTATTTCT----TGC--GTTGTTGCAAT-GTCTAGATGTTTCA-CAG--AAAG-GCC-GATCAACATTGT-CCGGACATTCCAACTTCCCAGTT-TTAGA-GC-TGATCC-CTTTATATTGT-TGTGGTT--TTTT--TTTTTTTG---TTGCCTGG-TG--CGAAAGCT-GCG-ACCTGC---------AGT-TTGGATT-ACTCCT--GATCT--CCATG--CACCCAATGAAGAAAGCAGACCGTGGCGGG-A-C-G-A-----CACCAATTGG-CTGGGGA-CTGCCC-AG-CTTAAGGC-GGGCGGAAGCT-G-TCCAGTGAAA---TCC-GAGAATATCTCC--CACC-GTCA-GAG-CAACCCCCGGCGCCGCGC-T-CTACG-CCAATTGAGCGGTAGCTTATAA-CCGGT-AACTGCTGCTCC-CCG----T-TTG---------TG---------T---------------CGAGGCCATAGGCGAAG--CTGG-AGTGGCCTCTCcaggtgcaggcctgggcagatgatatggagatcctgaagtgcctagtcgccaggatccccctctcggcgttgcttacaggatccggcagagaggcaagtcaacagttcagcgcagctgcaggagttgccagaaggtttcgcagggctcagccaactgcctaaagggctccactcctgattttctgttggggtgaactcccatagccttggactcttccgggccgttcacaaggcagtgaggctatttgacccatagctgggggtctggatcgtgggcagcagagcgtatccacaaaccggtgagccatgcatgctacatgtttaggggccagaccttctccaagtcccttgtagtctagcccggctatgaggtataac
gi|5 : catA---CTGGT-CAT-TT--GCTTC---AG-C-G-----AGC-TT--------G----C-T-G-T-GTG-G-G-G-CGT--ACGC-ACCGC-CCC-CGGTTT-C-CG----CGCCC---TGC--C-TGG--C-TG-CC---A-GG----GCAA---GC--CT-ACCATTATTTCTGT-G-CGCAGGT-------GG-TTCACTC--CTC-G---C-CG-C-A-T-GCC-ATGGCGT-------CTGC--CAC-TCC----C--AC---CGTG----T-TCGTCGTGTATCCT-A--------G-TT-------------------CTA-AG-TGCAGGT-T--TTC-TTCG-CC--AA-GCCGCGGTATA--G-----TGTTCCTATGGATGC-----GTGG--ATTTACCTT-TCTG---G----GAGTAGCGTTTT--CC-T-GTGAGAGGTGCAGTAACCTTGTTCGCTGTT--CGAT---CTAAGATGCAAGT--TC-TC--GATA-A-TCAAATGTCGTTTTTTGTTTTTCG----CGCAAATAAT--CT---GCCTGA-GG--TCA-CTGTC--AGTCCT-GGGC-GCATAGTGTTTC-CATT--AGCTTGCTAATC-GAAGAGGCATGGGGA-CT--------TACGTGTTTTCCTTT--TTCTTTTG--CTTG-CTGG-TAA-CAGG-TTA-ACG-ATCCACTTGCT---CAGC-TCGTA-G-ACT-CTAGAAGCT---CAGGACCATC---TGAAGC--GCAG--TGTGGCCGG-G-C--TAGC---C-CTTACTGG-CTGGGGG-CTGCAC----TTTGAGGC-GGGCGGTAGCT-GA---AGTAGGA---TGTAGATGA-TCCT-C--CA-C-GT----GGACA---CGTAGCGTC-CAA-C-TCACG--CAATCGAGCAAGGA-TTATC--CTCGTAAACTGTTGTCT--TCG----TGTTG-------TGTG-------TTT---------------CACGGTAA-AGGTGAGA--CTGG-AGTAGCCTcaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|6 : AACGCTTCTTGAGTAACGGAGTTTTCTCTGGTGTAGAGTTCCAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCCCATTTGCTTGTCCC-TGTCTGTGATGACTTCCC--GTCTT-GATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGGGTTTGCCTGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATACTCCTGATGTTGCCACTATCCGACGCTTTGCTGGATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-GTAGTCGGTGGCGCAA---C---------GTCGT--GC-TG---TTT--GC-TGTGCTTTGCTATGTGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTT-ATTCAGACTTGGGTCACGCT-TA-TAGCT--GACAAGT-----GCG--TTGCGT-TTGGCA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGG-CTTCAAACCAACCAATGTTCTTGTGC---TCTTTTTT--TGCCGTACGTCAGAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTT-CTAAGAGAGTTCCAGTTGTCC--CTCG-GTT-TTGTTCT---GCATTTATA--TGAGCTGTTTTGAGAG---T--------CTCCTC--AAGTTGTTT----GT--------TGA---A-CTCT----TG---GTTCTTTT----CC--AGGTGA-GC-CGTC-TT-AC-T---G-A-TG--TTGAT-----CCTAGGCTGACCC----TT--TC-TCTTTGAGTGATG-AAA-CTTCG--TGG----TTTCAG--TTTCACCTTTGT----GG---CAATAATG-GAGTGATCGGTGTCGCAAT-C---AGCTCTT-TG-AT-----AGGACCTGGTGTTGC-AAACGTTGTTCAAG--GA-ATCACGTTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATACCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA-G----GATACCTTGT-G-ACAT--GCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGG--TGTTCGTCACG--CAG--AGC-CTGC-------------G-GTA--GCA-GC---------AGAGTT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTTC----CTATGCCG----------------------------------------T-G-A--TTC-TCGGTC--T-GC---AC--C-G--ACTC-GC-G-CG-TT---GAAGTC-GCAAA-GA-----AG-GTAGA--TA-TGC-T-CTGC-T--T-------TGGG-ATC---TTGC---TG-ACA----A-C-GGTG-TCTAGTG-ACTCG-TAGAA---TTGGTCC-T-TT--ACTT---CAGCC-G---A-ATC-TT--------G----C-C-G-T-GTTGG-G-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GAtcagggcgcggatgggcaaagtatatggagatctggctgcccattgtaacggaccccttctttctccctgatatattccaaaggatcgcagggcgatacgtttggatcagtttggtgagatttctgtagggtttactcttagcatttcctactccgaaggtacacaaaggcaggggttgttgctatttacccatagctagggactaggattggaggcacttcagggcatatccaacacgatgtgcagcatgccttgctttaggggctgtctttctcaagacctgtgttctgctagggcatttcctacaaataattaatcccaacacccacctgatacctcccccccaaagaaagcaattcgtacacaga
gi|7 : ATTCGAC-CTT-GCTGA-TGTTTTCCGATAA-TGAAGCC---AGA-AGTCGTTGGCGCAA---CGCGTGATGTGTCGT--GTGCG---TTTTGGCACGGG----------TGCAGCTTGCAATGCCTGTAGTTA-ATTCAGACCTGG--TACACT-TAATAGTCTGGATAAGT-----GCGGCTTGCGT-TGG-CAG--TCA-TGACTGGCTTCCATCTCAGTAATTAAACGTGG--TTCAAACCACTCAGTGGTACTGTGCCGCTCTTTTTTCTTGCCG-ATGTCGAAACGTGCAAGTGCTGTGAATGGCGTT-CTAAGAGTGTTCCAGTGGTTCTCC-CGTGTGGTTGTTCCCTGGCATTTATAAATGA--TGTTATAAAAGATGT--------CTCCTC--AGTTTGTTT----GT--------TGA---AACTCT----TG----TTCTTTT----CC--GGGTAA-GC-CGTCGTT-ACGT---G-ATTG--TTGAT-----CCTGATCTGACC-----CT--TA-TTTTTGA-TGATG-AAACCTTCT--TGG----TTTCAG--TTTCACTTTTGTTGCAGAT--CAA----AGGAGTGGT-AATGTCGCAAT-CACTACCCCTTG-G-ATC----AGAACCTG--GTTGCAAAACATTGTTTAGG--GATAT-ACGCTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTGCGAATGCAG-GT-TTTT--GACCT-CTGGA--TGTCTCAA-GA-G----A--ACCTTGTGG-GCAT---CCTT-GGTTTGATAAGTAAGG--T-TTCGTC-CG--CAA--A---CTGC-------------GCGTA---CA-GC---------AGGAGTTCCAA---GAAG-CC-----TCTG-----A-C-GTTCTCCT-TCG--TCTCCC----TAGCGCCCTGA--TGTCCTATAAAA------C-GTTTG---GGC-C-ATCG-ACTTCC-TCGTTC--TGGCGCGAC--C-G--ACTCTGC-GTCGTTT---GAAGT--GCCAA-GA-----AGCTTAGA--TA-TGCGT-CTGC-TTC--------TGGG-ATCGTCTCGC---TA-ACA----A-C-GGTG-TC--ATG--CTCG-T-GAGTTTTTGTC-C-T-TT--AATT---CAG-T-G---GAAGCTTT--------G----C-T-G-T-GTT-G-G-A-GGAAGACGCAA--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GA-CC---TGC--ATTGG--A-T--AC---ATGGCGGGGC-A---GC--AT-AAATTTCTCTCAGTGGCCGCCTGtgt
gi|8 : TGGTGTTCT-TCACATTGTTAAGG------TTCCTCTT-----------CCTTGTCAATCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCAC---CA-T----GCCACTTTGT-GTATAT---CTTT-GTGCTGA-AAG-AAGG--TGATCGTCACAGTCAT--ATT-TT------------------TATTGGA-GC---------ATAGCT--CAA---GAAG-TC-----CTTG-----ACC-ATTTTCAT-TCA--TTTTTC----CAATCCCATAA--TGTTC--
gi|8 : tTCTCTCTGT-CCCCTATGTTG-G---GGGTTCTAT--ACTG-G---ACAG-T-A-------G-GGAGTTCTTCA-CTAC--AAA-GCCC--AA--GC---CGTG----T-AT---------TCT-G--------G-GT----------------TGATTT-GC-TTT--CT-T--TCC-CT-G-CCAGAG-G--AATGTGTAAAAAAAAACATTGCG------TA-----G-GG--ATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT--TC-TTGT-ACCGCAGC--TA----TG-TCGACGCA--GAGA---CG---ATG-GAGC--TC-TCT-G-TC-AATGA--------TGGCGGTCTTCCG----TAA--GTCGT--CCATGGCCTGTGGA--TCA-CTGTTGAAG-CTT-GAAC-ACATAGT-TCTCAC-TTCCAGCTAGCTATAC-GAAGT-GC-TGGGGT-CT--------T-CGGGATT--CTTT--GTTTT------TTGCCTGG-TGC-TGGGTTTT-TCA-ACCTGCCTGTC---GATT-TTG-------T-CT--AAGCT--CCATG--CACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGCGGG-GAA-GTA-----C-CTAACT-GCCCGAGGA-CTGCTCAGG---TAAGAC-GGGCGGTAACT--ATCCAATGaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatccgcagggtcaggagtctctctgtcccctatgttgggggttctatactggacagtagggagttcttcactacaaagcccaagccgtgtattctgggttgatttgctttctttccctgccagaggaatgtgtaaaaaaaaacattgcgtagggatccctcatcagccagtcgggtttcttgtaccgcagctatgtcgacgcagagacgatggagctctctgtcaatgatggcggtcttccgtaagtcgtccatggcctgtggatcactgttgaagcttgaacacatagttctcacttccagctagctatacgaagtgctggggtcttcgggattctttgttttttgcctggtgctgggtttttcaacctgcctgtcgattttgtctaagctccatgcacccaatgaagcaagcaagttgaggcggggaagtacctaactgcccgaggactgctcaggtaagacgggcggtaactatccaatg
gi|9 : ttggtgttcttcacattgttaaggttcctcttccttgtcaatctgatgccaatgcttggatcttggatggcaccatgccactttgtgtatatctttgtgctgaaagaaggtgatcgtcacagtcatatttttattggagcatagctcaagaagtccttgaccattttcattcatttttccaatcccataatgttcaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatccgcagggtcaggagCGT--CCATGGCCTGTGGA--TTA-CTGTTGAAG-CCT-GGAC-AAATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTATAC-GAAGA-GC-TGGAGT-CT--------T-CGGAATT--CTTTGGTGTTTTTGTTTTTGCCTGG-TAC-TGGGTTTT-GCA-ACCTGGCTGTC---GATT-TTGT-----CT-TTAGAAGCT--CCATG--CACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGCGGG-G-T-G---------GTAACT-GTCCGAGGA-CTACTC-GG--GTAAGGC-GGGCGGTAACT--ACCCAGTGGAA---CCT-GAAAATTCCTTC--CACC-GTCAGGAG-CAACCCCTAGCGCC-CGATT-CTACG-CCAATCGAGCTTGGGCTTACCA-CTGGT-AACTGCTGTTCC-CCG----TGTTG---------TG-----C-CTA---------------CGCTGTTT-CAGCGAAG--CTGG-AGTGACCTCTC
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): GGGTTGCAAGTGTGCTAAAACAACGGACGTCACTCCGGATTTTCCTTCAGGGTTTACTCTCTTAGCCTTCTCTCCCGAGGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTACCCATAGCTGGGGTTTGGTTCGTTTGGCACCAGGGCGTATCCACGCACCGGTGGTCCTGCATGCCACACGCCTGAGGGCCAAACCTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCTGAGTCCGTAAGGTGCTCAGTTGCCCAAATGACGGCACGGAGAACCATTGAGGCATAGGTCTTGCGATAGAGAGGCTATGTACTGGCAGGGAAAGAATTGCGCACTCTGCTCCCCTTTTTGCATTAATACTAGCCAGCTGTGTTAGCTGAAAGCGAGAAGTACAAAGCACTACTCAACAACTGCCACACTAGACGCATCACACCGCATTTGT
Unaligned ( gi|13 ): CGACAGAACCCCCCCTCGACACTACTGATGTTACCAGGCAGGAAAGCTGAGCAATATGTCCTGGCATCAGATTGGTTGCAGGAGTTTGCCGTAGACGTACTGTCAGTGACCAAGTCATACCGCCTTCGGGCTCCTCTCCGAAATTTCGTGTCGGTTTTTTTCCCCCCTAGTTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGCGAGTAAGGTCGTTTGATCCATGACTGGGGAGTCTGTTGGTGGCATCAGGGAATGTCCACACGCCGGTGAGGCCTGCATGCTCGCAACCTCTTGGGCAGACCACCTCCGAGTCCCTGGTAGGTTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGCACATCATACAACATCTAAAATAACGAAATTTCA
Unaligned ( gi|17 ): CAGAACACCCCTCTCGACACACTGATGTTACAGGAGGAAAGCTGAGCAATATGGTTCTGGCATCCATTGGTTGCAGATTGCCGGTGAGACGTACTGGTCAGTGACCAAGGTCATACCGCCTTCGGGCTCCACTCCGATATTTCTGTCGGTTTTTTCCCCCAGTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGGAGTAAGGTCCGTTTGACCCATGACTGGGAGTCTGTGGTGGCACAGGGAATTCCACACGCCGGTTGAGCCTGCATGCCGCCTCTTGGGGCAGACAACCTCCGATCCCTGGTAGTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGC
Unaligned ( gi|22 ): ATTTCTCATTTAATTTCAGCCACACGCCCATGAACAGACCGAGCAAAGAAGGGCCAGAGTCATTGTCTGCTCCAACTCTAGCAGTTGAAGCGCCCTAAGGACAATCTGTTCAGTGCTGGTGGTGTTGCTGATGATGGATGCAAGGTTTATTGTAGAATTTA
Unaligned ( gi|23 ): CCATGACGAGGCATTTGAAAGAACTTGTAGTGGCGTGGCCATGTACTACCAAGGGTTGCAAAGTCTTAACATTTTAGCATTTCTGTTAGCCAGCGATGAGGATTAAAACCAAGAAGTAACAAAGACACACTCATACACACTTGTTGCATCACACACATT
Unaligned ( gi|24 ): CGATGGAGAGGCTTGTACTGGCAGAGAGAGACTTACGCACTCAGCTCCCCTTTTCGCATAAATGCTAGCCAGCGGTGTTAGCTGAAAGGGAGTACAAAGCACTACTCATAAACTACCACACTAGATGTACATGTATCACACCGCCTTT
Unaligned ( gi|25 ): AGGTTGCAAGTGTGCTAAATCAACCGCCTAACAGACCCCACTCCGGATTTTGTTTCAGGGTTTACTCCCTTAGCCTTCTTCTCTCCCAAGGTACAATGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTGCCCATAGCT
Unaligned ( gi|28 ): TAGGGTCCGGCGGAGAGGAAAGCCAATACAGTCGGTGTCAGCGCAGCTGTAGGAGTTGCCAGAAGGTTTCGCAGGGCTCAACCAACTGCCTAAGGGGCTCCACTCCTGATTTT
Unaligned ( gi|29 ): CCGGCATGCCACACGTCTGGGGGCCAAACCTCTTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCCGAGTCCGTGGGAGTCTTTTGCCCAATGACGGTACGAGGAACCACTGAGGC
Unaligned ( gi|30 ): GCGGCTCTCAGGGCCGGCCTGGGCCAAAAGTATAGGAGTCCGGGCTTGCCCAGTAACCAGGATTCTCCCTCTCTTCCCGTGATGTGTTCCAAAGGA
Unaligned ( gi|31 ): CAGGGCGATACGTTTGGCATCAGTTTGGCTACAGATTTATGTAGGGTTTACTCTTTAGCCTTGCCTTACTGAGGATA
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gi|15 : aatgactgagggccactcctcaaagtctgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCCATGTGTTTTTAGACCTTC-GGGAGTGTCCCTCCCA-GTTGAG--ACCTTGT-G-GCATTCGCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGGGATGTTCGTCACG--CAG--AGCGTTGCTAATTTTTTTGGGG-GTA--GCA-GCTCATGGCCCAGTTGT--CAAAATGAAGACCATTGTTCTGTTAAAACG-GGTCTCAT-TCACCTCTTTC----CTATGC-GTGAAATGTCC--CAAAAAAAAAACAGATTG---AAGCC-AT-G-A--TTCATCGGTCATT-GC---TCTCC-GGAACTC-GC-A-CG-TTTGAGAAGTC-GC-CA-GATAGAAAG-GTAGAGATAATGCT--CTGC-TTCTAGAGATCTTGG-ATCG--TCGC---TGTGCA----ACC-GGTG-TTTt
gi|16 : G-TAGAA---CTGAT-T-T-TTTTATTTT---GG-A-T---G-AGC-CT--------A----G-T-AAT-ATT-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA--AA-AGGTTCCC-AGCTAAGACCC---GG---A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTCCACTC-G---A-AG-C-AGT-G-CCGTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAG-AC--AC---CATGCATGT-CT---------CCT-C-----------T----------------C--CTC-GG-TGC--CC-T--GTC-CTTG-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CTAC-TC-ACATG----AAGTCGCG--TTC-CC-C-GCGGGAGTCGC--T-----TG-TTGGCGCT--CAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--CAATc
gi|18 : t-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA-CAA-GG-TTCCC-AGCTAAGACCC---CGG--A-TTG--A-TG--CTCGA-GGT---GCAATGTGC--ATGAA--TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTC-ACTC-G---A-AG-C-AGT-G-C-GTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAGGAC--ACATGCATG----T-CT---------CCT-C-----------C----------------C--TTC-GG-TGC--CC-T--GTC-TT-G-CCAAAA-G--AGGGTATAGGG-----TGTTCCTCC---TTC-----G-AG--GGC--CTAC-TC-AC-TGA---GAGTCGCG--TT--CCAC-GC-GGAGTCGC--TT----TG-TTGGCGCT--CAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--C
gi|19 : CT----CA---ACTTTCT-----CA--GGGTAC-TG-CATC-AT-GC-T---G-G-TG--TTGAT-----GCATGGCTTCCCA----AC--TT-TCTTGCTGCAATG-GATCCT-CT--TGGGGAGT---AG--ACTGGTCTTGAT----GCTTACAA----GCGAGTGGTCAGTGTCACAGT-C---TG-CATTGTG-GTGTTTGAGTACACAG---TAC-AAAT-TTG---AGGTTGG-TTCA--CTT---AGTGATGACCACGTGTA---------GCCA-GTGCTTT--GAGTG-T-GGA--TGTCTC---CA-C----GACACTTTGT-G-ATGT--GGCTT-CATATGG-AAA-AAGG--AGTTGGTCACA--Caa
gi|2 : AG--AGC-TTGC-------------G-GTAA-GCAAGC---------AGAT-T--CAA---GAAG-AC-----TCTG-----ACCCGTTCTCATGTCA--TTTTTCTAGCCCGTGCCCTGC--CTTCC--CAAAA------C-GTTGG---G---CCAT-G-CCCTTC-TCGGTC--T-GCC--AC--CAG--ACTT-GCCG-CG-TT---GACGTCCGCA-A-GAC----AG-GTAGA--TA-TGCTTTCTGC-TC---------TGGG-ATC---TCGT---CT-ACA----A-CAGGTGGTCTAATG-ACTCGGTAGAA---TTGGTTC-TCTT--ACTTC--ATG-CCG---A-AGC-TT--------G----CCT-G-T-GTT-G-G-GGCGTAGACGC-A--AAACAAAGGGTTCACTCG----GAACCGCTTGCCAG-TGG--A-TG--C---A-GGC---GCAG---GCGAATTAAAATTTCATCTGT-ACCTGCTG--G-GTTTGG-TTCAATC-ACAGCG---A-AGAT-ACT-G-C-ATGGCGC-----AACTGCCCAAA-TCCA--ACTAAC---CGTG----T-TT---------CCT-TCACATCCAG-TTTCGCCCACGATTTTTCC--CTCCAG-TGC--CT-T--TTTTCTTGACCAGAAAG--AAAG-GTATAG-----TGCTCCTCC---TCA-----G-GG--ATC--CTTC-TC-GT-GG----GAGTCGTG--TTTTCC-T-GC-AGGGCTGC--TA----TG-TCGATGTTTTCAGTATCCT---GTG-CAGTGGTC-AC--GATC-AATCA--------ATGCTGTTTTTCGGGGTCGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGG--TAA-TTGTC--AG-TCC-TGGA-ACATAGT-TTT-ACATTCC-GCTTGCTAATCCGAAGA-GC-TGGGGAACT--------T-CGTTTTT--CTTT--TTCTTTTG--CTTGCCCTG-CACACCGGTTTA-ACGTATCCACTTGTCAGAGACCCTCGTA-GCACT-CTTTAAGCTTCCCAGG--CACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGG-GTG-G-C-GTAGCACCC-CTTACT-G-CTGGGGG-CTTCCC-AG-CT--GGGCCGGGCG-TAGCTTGAG--AGTGGAGGATTAC-GATGATTCCTTCAGCACCCGTC-GAAGACAACCCGTAGCGTC-C-A-C-CTACGGCCAATCGAGCAAGGACTTATCACCTTGTAAACTGTT-TCTCTCCGCAATTGCTGTCCATCTT-TGACTCCC-CTTTCACCACTTCTCCACCCCGGTAA-AGGTGAGGGACTGGCAATGACCTCTC
gi|20 : TATA---GTGTTGTTTTAAGAG---TTATGGGATCTCCTTCTAAGTTGTTTTCTCGTGCTTTTGGTGATCGA-CTCTGTGGTGTATATTTTCTTGTCACCAGGGGTAAAGCTCGTC-TTTAC-TTTAGTA-TGCTTTGATGCCTGCCTGGGCTGACCACCCCTTCGTATTCTTTGAGTGATGCAAAACTTCTCCTGGT---TTTCAGTTTTTCACCTCT-T----GTT--AAA----GT-AGCAATCagggcgcggcctgcaaagtcatattgggatcctggctgcccctaagccaaggatccccctctcttctccctggatgtgttttcaaaggatcgcagggcgatacgtttggcatcagtttgtgctgcagattttcctgtaggtttactcaaattagccctttcctacttccgaggttatccacaaggcacgtgggttttgtttgctatttactcatagctcgggactaggattgcaggcaccgcagggcatatccaaacaccgatgtgccatgcatatcgcttgcattagcgggctctagtctcctccaagacctgtggtcctgctaaaggggccaatttaacgcaaaacaaaacacataattaaagtactccccaagcaccactcaccacatggccctaaagcaatttcgtagaacacagaa
gi|21 : TTCTGATGTTTCCGCTGTTGAACGCTT-GCTGAATGTTATCTGACAATTGTGACCTGTA-A-A--CATTTGC-CAAGCCC------CGTGTCATAAGC-TGTGATCT--GC-TGTG----------TGCAACTCCCAGTACC--TAGGTT-TTTCTGACTTTTATCAAACA-TA-TAACT--GATGAGTAGTAGACTG-ATGCATATTG-CAGACCCATTGACTGaagg
gi|26 : GC--TC----TG-TCGACGCA--GAGA---CG---ATG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTTCG----TAA--GTCGT--CCATGGCCTGTGGA--TTA-CTGTTGAAG-CCT-GGAC-AAATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTA
gi|27 : T--CCA----GCGAGTGGTCGGTGTCGCAGT-C---AG-CGCTGTG-GT-----AGCTGCGGGTGAACC-AAACTCAGATCAGC--GA-GTCTCTCTT---GGTAATGACGAGATCTAGCTG---GTGCCA-ATta
gi|3 : acgGATCATGTCAAGCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CATA----A--ACTTTGT-G-TC-T--ATCTTAGTGCTGG-AAG-AAAG--TGTTCATCAC----AGCCAGG-TTTT-------------T-ATA--AAA-GC---------ATACCT--CAA---GAAG-TA-----TTTG-----AAC-ATTGTCAT-TCA--T-TTTC----CCA----ATAA--TGTCC-----AA------T-GACTGAAGG---C-CT-GGA--TTC-AAAGTC--T-GC---AC--C-A--ACCC-TT-G-CA-TT---GAAGTC-TCCCATGA-----AG-A-AGA---G-TGCTT-CT---TTGT-------TGGGTAAAG--T-AC---AG-ACA----A-T-GGGG-TCAAAGG-CATAA-TAGAAA--CTGAC-CCT-TT--TCTTCTACAG-T-G---G-A-C-TCTGAGTGGAG----C-TCA-TAGTT-GCA-G-CATAAGCAC-A--CA-CAA-AA-TTGAC-TA----CACCTA--TACCTA-TAGCCA-TCCAC---A-GGG---TCAG---G--------AAGTCTCTCTGT-CCC-CCTGTTG-G---GGGTTTTAT--------------------------------------A-CTGC--AAC-GCCC--AC--GT---CGTGAA--T-TC-----------T-G--------GATT----------------C--ACC-TG--GC--TTCT--TCC-CCCG-CCAGAA-G--AATTTGTA-GG-----TTTTTTTTC---TTT-----T-AGTTATC--CCTCATCAGC-C------AGTCGGG--TT--TC-TTGT-AGAACAGT--TA----TG-TCGATGCA--GAGT---CG---GCG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTCTG----TAG--GTCAC--CCATGGCCTGTGGA--TCA-CTGTTGAAG-CCT-GGAT-ACATAGT-TCTAACATTCCAGCT-------------A-GC-TGGGGT-CT--------T-CGGAATT--CTTT--GTTTT--------GCCTGG-TGC-TGGGTTTTCGCA-ACCTGCCTGTC---GATT-TTGT--------CT--ACGCT--TCATG--CACCCAATGAACCCAGCAAGTTGAGGCGGG-G-TAGTA-----C-CTAATT-G-CGAGAGGACTGCCT-GGGC--AAGGC-GGAATGTAACT--ACCCAATGGAA---CGT-GAAAATTCCTCC--CACC-GTCAGGAG-CAATCCCTAGCGCC-CGG-CTCTACG-CCAATCGAGTTTGGGCTTATCA-CTGGT-AACTGCTG-CTC-CCAT---TGTTG---------TA-----C-CTA---------------CACTGTCT-CAGCGAAG--CTGT-AGTGACCTCTCattat
gi|4 : catcttcctgctcaaTTCTCAT-TCA--T-TTGC----CCATACCA-AA--CTTGC--CGAGG------CAGGATG---G---CCAC-G-A--T-----GGTC--T-GC---AC--C-C--ACTC-TA-G-CA-TT---GAAGTC-GC-----A-----AG-AGAAA--CG-AGTTT-CTTCATGAC-------TGGG-ATGC--TCTCAATTG-ATGGATCA-C-AG-G-TTT------CTCA-TAGAA-----------T-TC--AC--C--TAG-T-GTCTG-GGG-TG--------GAAGAC-A-G-A-GTC-G-GTG-CGTACACAC-T--GA-CAA-GGGTG-AC-GG----GACC-----GC--AGTGGT-ACTG-AC------GC---GGAG---GT---CAGACATT---------GCTGCCTG---------G-TTCTACC-A-TA-GCTCA-AG-C-A-A-G-CTGTTTCTTC----A-CTGC--AAA-GCCT--AC--TC---CATG----C-TC---------TTTGG--------G-TT----------------C--GTC-GGATG---TT-T--TCC-CTTG-CTACTA-A--AACGTGAAA-------TCTTTCTCT---TTT-----A-AT--GTG--CCAG-T--GC-CGCTAAGCGCCGTT--TT--CT-T-GA-AGAGTGGT--TA----TG-TCCACGTT--CATT---CT---CTT-GAGC--TCGTC--GTTT-A-TGA--------CAGCTGTATTTCT----TGC--GTTGTTGCAAT-GTCTAGATGTTTCA-CAG--AAAG-GCC-GATCAACATTGT-CCGGACATTCCAACTTCCCAGTT-TTAGA-GC-TGATCC-CTTTATATTGT-TGTGGTT--TTTT--TTTTTTTG---TTGCCTGG-TG--CGAAAGCT-GCG-ACCTGC---------AGT-TTGGATT-ACTCCT--GATCT--CCATG--CACCCAATGAAGAAAGCAGACCGTGGCGGG-A-C-G-A-----CACCAATTGG-CTGGGGA-CTGCCC-AG-CTTAAGGC-GGGCGGAAGCT-G-TCCAGTGAAA---TCC-GAGAATATCTCC--CACC-GTCA-GAG-CAACCCCCGGCGCCGCGC-T-CTACG-CCAATTGAGCGGTAGCTTATAA-CCGGT-AACTGCTGCTCC-CCG----T-TTG---------TG---------T---------------CGAGGCCATAGGCGAAG--CTGG-AGTGGCCTCTCcaggtgcaggcctgggcagatgatatggagatcctgaagtgcctagtcgccaggatccccctctcggcgttgcttacaggatccggcagagaggcaagtcaacagttcagcgcagctgcaggagttgccagaaggtttcgcagggctcagccaactgcctaaagggctccactcctgattttctgttggggtgaactcccatagccttggactcttccgggccgttcacaaggcagtgaggctatttgacccatagctgggggtctggatcgtgggcagcagagcgtatccacaaaccggtgagccatgcatgctacatgtttaggggccagaccttctccaagtcccttgtagtctagcccggctatgaggtataac
gi|5 : catA---CTGGT-CAT-TT--GCTTC---AG-C-G-----AGC-TT--------G----C-T-G-T-GTG-G-G-G-CGT--ACGC-ACCGC-CCC-CGGTTT-C-CG----CGCCC---TGC--C-TGG--C-TG-CC---A-GG----GCAA---GC--CT-ACCATTATTTCTGT-G-CGCAGGT-------GG-TTCACTC--CTC-G---C-CG-C-A-T-GCC-ATGGCGT-------CTGC--CAC-TCC----C--AC---CGTG----T-TCGTCGTGTATCCT-A--------G-TT-------------------CTA-AG-TGCAGGT-T--TTC-TTCG-CC--AA-GCCGCGGTATA--G-----TGTTCCTATGGATGC-----GTGG--ATTTACCTT-TCTG---G----GAGTAGCGTTTT--CC-T-GTGAGAGGTGCAGTAACCTTGTTCGCTGTT--CGAT---CTAAGATGCAAGT--TC-TC--GATA-A-TCAAATGTCGTTTTTTGTTTTTCG----CGCAAATAAT--CT---GCCTGA-GG--TCA-CTGTC--AGTCCT-GGGC-GCATAGTGTTTC-CATT--AGCTTGCTAATC-GAAGAGGCATGGGGA-CT--------TACGTGTTTTCCTTT--TTCTTTTG--CTTG-CTGG-TAA-CAGG-TTA-ACG-ATCCACTTGCT---CAGC-TCGTA-G-ACT-CTAGAAGCT---CAGGACCATC---TGAAGC--GCAG--TGTGGCCGG-G-C--TAGC---C-CTTACTGG-CTGGGGG-CTGCAC----TTTGAGGC-GGGCGGTAGCT-GA---AGTAGGA---TGTAGATGA-TCCT-C--CA-C-GT----GGACA---CGTAGCGTC-CAA-C-TCACG--CAATCGAGCAAGGA-TTATC--CTCGTAAACTGTTGTCT--TCG----TGTTG-------TGTG-------TTT---------------CACGGTAA-AGGTGAGA--CTGG-AGTAGCCTcaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|6 : AACGCTTCTTGAGTAACGGAGTTTTCTCTGGTGTAGAGTTCCAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCCCATTTGCTTGTCCC-TGTCTGTGATGACTTCCC--GTCTT-GATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGGGTTTGCCTGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATACTCCTGATGTTGCCACTATCCGACGCTTTGCTGGATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-GTAGTCGGTGGCGCAA---C---------GTCGT--GC-TG---TTT--GC-TGTGCTTTGCTATGTGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTT-ATTCAGACTTGGGTCACGCT-TA-TAGCT--GACAAGT-----GCG--TTGCGT-TTGGCA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGG-CTTCAAACCAACCAATGTTCTTGTGC---TCTTTTTT--TGCCGTACGTCAGAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTT-CTAAGAGAGTTCCAGTTGTCC--CTCG-GTT-TTGTTCT---GCATTTATA--TGAGCTGTTTTGAGAG---T--------CTCCTC--AAGTTGTTT----GT--------TGA---A-CTCT----TG---GTTCTTTT----CC--AGGTGA-GC-CGTC-TT-AC-T---G-A-TG--TTGAT-----CCTAGGCTGACCC----TT--TC-TCTTTGAGTGATG-AAA-CTTCG--TGG----TTTCAG--TTTCACCTTTGT----GG---CAATAATG-GAGTGATCGGTGTCGCAAT-C---AGCTCTT-TG-AT-----AGGACCTGGTGTTGC-AAACGTTGTTCAAG--GA-ATCACGTTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATACCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA-G----GATACCTTGT-G-ACAT--GCCTT-GTTCTGA-AAG-TAGG--TGTTCGTCACG--CAG--AGC-CTGC-------------G-GTA--GCA-GC---------AGAGTT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTTC----CTATGCCG----------------------------------------T-G-A--TTC-TCGGTC--T-GC---AC--C-G--ACTC-GC-G-CG-TT---GAAGTC-GCAAA-GA-----AG-GTAGA--TA-TGC-T-CTGC-T--T-------TGGG-ATC---TTGC---TG-ACA----A-C-GGTG-TCTAGTG-ACTCG-TAGAA---TTGGTCC-T-TT--ACTT---CAGCC-G---A-ATC-TT--------G----C-C-G-T-GTTGG-G-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GAtcagggcgcggatgggcaaagtatatggagatctggctgcccattgtaacggaccccttctttctccctgatatattccaaaggatcgcagggcgatacgtttggatcagtttggtgagatttctgtagggtttactcttagcatttcctactccgaaggtacacaaaggcaggggttgttgctatttacccatagctagggactaggattggaggcacttcagggcatatccaacacgatgtgcagcatgccttgctttaggggctgtctttctcaagacctgtgttctgctagggcatttcctacaaataattaatcccaacacccacctgatacctcccccccaaagaaagcaattcgtacacaga
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blockSeqs : . . . . AGA . . C . . . . TGTG . . . . . T GCG . . . . . . T . TGT A TGG T T . . . . . . . G . . CTT C G . AC . . . G . AT GT C G . AGCA G . . C T C . G T C GAG T G . T . . T T . T . CGAC T . A A . . A . A . GG G . . . GT . . . . . . . . C . C ATAAT CAAAACGTTGGGCCATGCCC . . . . . A . . . . . . AAGAC GT CG T . . GAC . AG . . . . . G . TA A . TTGGTTC . . CATGCCGA . A T . . . . . . . C . A C . . TGCAT . . ACATGGCGGGGCAGCAT A T . A TCGAG . A CCACTCGAAGCAGTGCCGTGGCGTA . T A A . CATGTCTCCTCTC G . . . . . T . . . G GGG C . G . . A ACTGAG C . CCAC . T . A . C . . T TCTCTGTCGATGATG A . . TG . . AA . . A . A A GT . . . T . . TGG . . T C TAAC A TG . T . GT TAGACTCTAG . T . AA A A T . CTAGCC A GC T . GGGC . GTC CGT G C . . G . C . GCT . GG . G . T C . TACCTA G CT . . G
blockSeqs : TG T . . . . . . . . A . . CT A . . A . . . . . G GC T G . TGCA G . . G T G . A T T GAA A G . A . . G T . G . GGAT T . T G . . A . G . GC T . . . AG . . . . . . . . C . C CTGAT CGAGGCAGGATGGCCACGA . . . . . C . . . . . . AAAGA AG TA T . . TC . GC . . . . . T . T . . CTGGTCA . . CAGCCGA . G A . . . . . . . A . G A . . TGCA . . CAGGCGCAGGCGAATT C T . T GGTTT . A ACTGGACAGCAGAGAGTTCTTCA . T A A . TATTCTGGGTTGA T . . . . . C . . . A TAG T . G . . . GTGGG T . TCTT . A . C . G . . C TCTCTGTCGATGATG A . . TG . . GA . . A . G T AT . . . C . . TGT . . T C TGCT T AA . C . GC TCTTTAG . G . AA A G T . AAGTAC T GT T . AGGT . ATC TCC T T . . A . G . AAC . AA . C . T C . TGCCTA A AA . . G
blockSeqs : AG T A . AGCG . . . A . G . A T A A A T . C . . T T . T . TGCC C . A . . . T . G . TT G . . . GC . . . . . . . . T . T ATAAT AATGACTGAAGGCCTGGA . . . . . G . . . . . . CAAGA GT TA G . . C . C . . . . . T . . . . TTGGTCC . . CAGTGGA . G T . . . . . . . C . A A . . CGGA . . ACAGGCGTAGCGTA C C . G TTGG . T CACTCGAAGCAGTGCGTGGCGTA . G C G . GATTCTGGGTTC G . . . . . T . . . T GG T . G . . . AGCC G . TCTT . G . A . G . . G TCGTCGTTTATGACA T . . GA . . GA . . A . C T TA . . . A . . GGA . . T . TACT T TT . C . TT TCT . T . AA A G A . CGACA A G C . GGGT . ACC CCT A . . . . . C . AC . TT . G . . . . TGT G TT . . A
blockSeqs : T . C . . . . . C . . C . . T C . T . TAA C . G . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A AAAC TGA . . . . . G . . . . . . A A G . . . T . C . . . . . . . . CTGATT . . TGGATG . G C . . . . . . . G . G A . . GCAG . . CCAGGGCAAGCCT A A . G TTGG . T ACTGGACAGTAGGGAGTTCTTCA . G T T . AATTCTGGATTC A . . . . . C . . . C A C . T . . . AGCC T . CTT . T . A . C . . G TCTCTGTCAATGATG T . . TG . . . . . G . C A TA . . . T . . GAA . . . . TGC . TG . . . TT TCT . T . . . . A . TG A G C . TTT . GA
blockSeqs : A . . G T . A . GA T . . . . . A G . . . CAGCG . G T . . . . . . . A . C A . . TGCC . . CACAGGGTCAGG . C . G TTGG . A CCTCGCCGCATGCCATGGCGT . T C A . CTCTTTGGGTTC G . . . . . . . . . G A G . A . . . TGGG C . CCT . A . A . C . . G TCACT T . . TG . . . . . A . C A . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . A . . GGA . . ACGCGGAGGTCA . C . C T . T A . G . G . TCTCCTCCC . . . . . . . . . . T G . . G . . . AGCC G . . . . G . . G TCACT C . . A . . . . . A . . .
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blockSeqCons : CT******* AC GC**** AGCG**** CGAC***** CGAGACGTTGGGCCATGA******************* CAAGA****** GT* TC******** CG** A* CTGGTCC**** CAGCGGA******** CNCGAGGCGCAGCAT************* TCGG**** N* G******* ATGNN****** CCTC*** GA TAGCTTT****** CTAGCAC****** GN* GGGT*** ACC** AG TGCGCTA*****************************
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): GGGTTGCAAGTGTGCTAAAACAACGGACGTCACTCCGGATTTTCCTTCAGGGTTTACTCTCTTAGCCTTCTCTCCCGAGGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTACCCATAGCTGGGGTTTGGTTCGTTTGGCACCAGGGCGTATCCACGCACCGGTGGTCCTGCATGCCACACGCCTGAGGGCCAAACCTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCTGAGTCCGTAAGGTGCTCAGTTGCCCAAATGACGGCACGGAGAACCATTGAGGCATAGGTCTTGCGATAGAGAGGCTATGTACTGGCAGGGAAAGAATTGCGCACTCTGCTCCCCTTTTTGCATTAATACTAGCCAGCTGTGTTAGCTGAAAGCGAGAAGTACAAAGCACTACTCAACAACTGCCACACTAGACGCATCACACCGCATTTGT
Unaligned ( gi|13 ): CGACAGAACCCCCCCTCGACACTACTGATGTTACCAGGCAGGAAAGCTGAGCAATATGTCCTGGCATCAGATTGGTTGCAGGAGTTTGCCGTAGACGTACTGTCAGTGACCAAGTCATACCGCCTTCGGGCTCCTCTCCGAAATTTCGTGTCGGTTTTTTTCCCCCCTAGTTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGCGAGTAAGGTCGTTTGATCCATGACTGGGGAGTCTGTTGGTGGCATCAGGGAATGTCCACACGCCGGTGAGGCCTGCATGCTCGCAACCTCTTGGGCAGACCACCTCCGAGTCCCTGGTAGGTTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGCACATCATACAACATCTAAAATAACGAAATTTCA
Unaligned ( gi|17 ): CAGAACACCCCTCTCGACACACTGATGTTACAGGAGGAAAGCTGAGCAATATGGTTCTGGCATCCATTGGTTGCAGATTGCCGGTGAGACGTACTGGTCAGTGACCAAGGTCATACCGCCTTCGGGCTCCACTCCGATATTTCTGTCGGTTTTTTCCCCCAGTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGGAGTAAGGTCCGTTTGACCCATGACTGGGAGTCTGTGGTGGCACAGGGAATTCCACACGCCGGTTGAGCCTGCATGCCGCCTCTTGGGGCAGACAACCTCCGATCCCTGGTAGTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGC
Unaligned ( gi|22 ): ATTTCTCATTTAATTTCAGCCACACGCCCATGAACAGACCGAGCAAAGAAGGGCCAGAGTCATTGTCTGCTCCAACTCTAGCAGTTGAAGCGCCCTAAGGACAATCTGTTCAGTGCTGGTGGTGTTGCTGATGATGGATGCAAGGTTTATTGTAGAATTTA
Unaligned ( gi|23 ): CCATGACGAGGCATTTGAAAGAACTTGTAGTGGCGTGGCCATGTACTACCAAGGGTTGCAAAGTCTTAACATTTTAGCATTTCTGTTAGCCAGCGATGAGGATTAAAACCAAGAAGTAACAAAGACACACTCATACACACTTGTTGCATCACACACATT
Unaligned ( gi|24 ): CGATGGAGAGGCTTGTACTGGCAGAGAGAGACTTACGCACTCAGCTCCCCTTTTCGCATAAATGCTAGCCAGCGGTGTTAGCTGAAAGGGAGTACAAAGCACTACTCATAAACTACCACACTAGATGTACATGTATCACACCGCCTTT
Unaligned ( gi|25 ): AGGTTGCAAGTGTGCTAAATCAACCGCCTAACAGACCCCACTCCGGATTTTGTTTCAGGGTTTACTCCCTTAGCCTTCTTCTCTCCCAAGGTACAATGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTGCCCATAGCT
Unaligned ( gi|28 ): TAGGGTCCGGCGGAGAGGAAAGCCAATACAGTCGGTGTCAGCGCAGCTGTAGGAGTTGCCAGAAGGTTTCGCAGGGCTCAACCAACTGCCTAAGGGGCTCCACTCCTGATTTT
Unaligned ( gi|29 ): CCGGCATGCCACACGTCTGGGGGCCAAACCTCTTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCCGAGTCCGTGGGAGTCTTTTGCCCAATGACGGTACGAGGAACCACTGAGGC
Unaligned ( gi|30 ): GCGGCTCTCAGGGCCGGCCTGGGCCAAAAGTATAGGAGTCCGGGCTTGCCCAGTAACCAGGATTCTCCCTCTCTTCCCGTGATGTGTTCCAAAGGA
Unaligned ( gi|31 ): CAGGGCGATACGTTTGGCATCAGTTTGGCTACAGATTTATGTAGGGTTTACTCTTTAGCCTTGCCTTACTGAGGATA
Unaligned ( gi|32 ): CGTTTGGCACCAGGGCGTATCCACGCAACGGATAGTCTCTGC
Alignments
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gi|1 : AACGCTTCTTGGGTG-CGGAGTTTTCCCTGGAGTAGAGT-CAAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCC-ATTTGCTTTTCCCCTGTCT-T--TGACTTCCCCTGTCTTTGATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGG--TTGCTGGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATGCTCCTGATG----CACTATCCGACGCTT-GCTGAATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-A-AGTCGTTGGCGCAA------------TGTCGT--GC-TG---TTT--AC----G----------TGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTTTATTCAGACTTGGGTTACGCTGTA-TAGC---GATAAGT-----GCA--TTGCGT-TTG-CA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGGGCTTCAA-CCAATCAGTGTTCTTGTGC---TCTTTTTT---GCCGTACGTCAAAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTTTCTAAGAGAGTTCCAGTTGTCC-----GCATT-TTGTTCT---GCATTTATA--TGAGTTGTTTTAAGAG---T--------CTCCTC--AAGTTGTT-----GT--------TGA---A-CTCT----TG---ATTCT-TT----CC--GGGTAA-GC-CGTT-TT-AC-T---G-A-TG--TTGAT-----CCTGGGC-GACC----T-TT---AT-CTTTGAATGATG-AA---TTCT--TTG----GTTCAG--TTTCACCTTTGT----GGT--CAA----G-GAGTGATCAGTGTCGCAATTCA----GACATT-TG-AT-----AGGACCTGGTGTTGC-AAACATTGTTTAGG--GA-ATCACACTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATGCCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA--GGATA--TTGT-GGCAT--G-CCTT-GTTCTGA-AAG-TAGG--TGTTCATCACG--CAG--AGC-TTGC-------------G-GTA--GCA-GC---------AGAGAT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTT--C----C-TATA-CCGTG-A--TGTCC--CAAA--A------C--G--TTT--G-G-CAT-GA--TTC-TCGGTC--T-GC---A---C-G--ACTC-GC-G-C-G-TT---GAAGTCGCT----------------CTGA--TA-TGCTT-C--TGCTT--CTTGG--------G-AT-G--TCGC---TG-ACA----A-C-GGTG-TCTAATGAACTCG-T-AGAA-TTGGT-CT-TT-ACT-TCC---A-GC--AAGC-T---TG---C-T-GT-GTT-G-G-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA-GGGTTC-C-CG----GACCC---TGC--A-TGG--ATG-AC-A-GGCGC-----G--CA---TAAAAATTCTCTCTGT-ACCGCCTGT---G---GG-TTCAATC-ATCG-G---A-AG-CAA-T-G-C-ATGGCGT-----A-CTGC--AAATTCCA--AC--AC---CGTG----T-TC---------CCTC--------A-TT----------------C--CTC-AG-TGC--CT-T--TCC-CTTG-CCAGAAG--AAGGTATTAGA------TGTTCCTCC---TTCA-GG-ATC--C--CTC-TCT-CTGGAGTCGC-A--TTC---TGC-AGGGCTGC--TA----TG-TCGATG--TTTA-T---CT---GTA-CAGT--TC-ACAGA-TC-A-TCA--------CTGCTGTTTTTCG----CGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGGT--CATCTGTC--AG-CTC-GGGCG-CATAGT-TTCTACATTCCAGCTTGCTAAT-CGAAGA-GC-T-GGG-ACTT-C--------GTTTTT--CTTT--TTCTTTTGCTT--GCCTGGACAC---GGTTTA-ACG-ATCCACTTGTC-AA---GCTCA---TAGA---CTCT--A--AGCT--CCAGG--CACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGGCGGGTGC---GCA--GCTTACTGT-GGGGGGCTGCCCAGCTT-GAGGCGGGCGGTAGCTGACCCAGTAGGA---TAC-GATGATCCCTCC--CA-CCGTC-GAAGACAACCCGTAGCGTA-CAA-C-CTAC-GCCAATCGAGCAAGGACTTATCA-CTCGTAAACTGTTGTCTT-CCG----TGTTGTTGCTCTTCCCGGTAA-AGGTGAGA--CTGG-AGTG-CCCCTC
gi|10 : tcctccatatgttgttagagtctgctcttcacgtacaggcagctcttcgattgcatctGCGGTCTGTGTCGCAGT-CA----G-CACTGTGCAT------GCTTTTGGTGTTCT-TCACATTGTTTA-------ATCTCTCCTTCTGGTCAAGATCATGTCAAGCTG---ATGCAA-ATGCTTA--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CA--CGGCACTCTGT-
gi|12 : gcacttttggtggcatgacgcggtttgttcccatatgctaggggcgcagcacgtttgaccgccgctgcaggttccattacttcccagttcacctcaaaccagcccttcttccgatgctctttcttctcaagggcctctactgagcgtctgtagtggtggagtcttctctgagttttcccagtgatgtttttaaagttttgcataatctctgggaaaaggaacagcacaaggttcggctagcattgatgcgtcaaaggctcttggtcttggtgtggtgcattttgcgtaggatgaggttgatcttggagagtactaaggtccatAA-AGGTTCAC-CG----GACCC---TGC--A-TGG--ATG-AC-A-GGCGTA----G--CG---TAAAAATTCTCTCTGT-GCCGCCTGTTG-G---
gi|12 : aTTTCG----AGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGGT--CATCTGTC--AG-TCCTGGGCG-CATTGT-TTTTACATTCAAGCTTGCTAAT-CGAAGA-GC-TGGGG-ACTT-C--------G---------TT--TTCTTTTGCTT--GCTTGttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttcgagcatcatccatgacctgaaggtcatctgtcagtcctgggcgcattgtttttacattcaagcttgctaatcgaagagctggggacttcgttttcttttgcttgcttgagtcttgtaagc
gi|14 : aaaaggttcaccggaccctgcatggatgacaggcgtagcgtaaaaattctctctgtgccgcctgttggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTCTGT-CCC-CCTGTTGTG---GG-TTCTAT--ACTG-G---ACAG-C-A-GAG-A-GTTCTTC-----A-TTGC--AAG-CCCA---C--GC---CGTG----GATT---------CTGG--------G-TT----------------C--CTC----TGC--CT-TCTTTC-CCCG-CCAGAAG--AATGTG-TAA-------T-TTCTTTCGA-GTAG-GA-ATC--C--CTCATCA--GCCAGTCGG-G--TTagtcttgtaagc
gi|15 : aatgactgagggccactcctcaaagtctgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCCATGTGTTTTTAGACCTTC-GGGAGTGTCCCTCCCAGTTGAGACCTTGT-GGCATTCG-CCTT-GTTCTGA-AAG-TAGGGATGTTCGTCACG--CAG--AGCGTTGCTAATTTTTTTGGGG-GTA--GCA-GCTCATGGCCCAGTTGT--CAAAATGAAGACCATTGTTCTGTTAAAACG-GGTCTCAT-TCACCTCTTT--C----C-TATG-C-GTG-AAATGTCC--CAAA--AAAAAAAC--AGATTG--AAGCCAT-GA--TTCATCGGTCATT-GC---TCTCC-GGAACTC-GC-A-C-G-TTTGAGAAGTCGCC--AGATA-GA-AAG-GTAGAGATAATGCT--C--TGCTT--C-TAGAGATCTTGG-ATCG--TCGC---TGTGCA----ACC-GGTG-TTTt
gi|16 : G-T-AGAA-CTGATTTT-TTTATT-T-T---G-GATGAGCC-T---AG---T-A-AT-ATT-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA--AA-AGGTTCCC-AGCTAAGACCC---GG---A-TTG--ATGCTCGA-GGTGCAATGTG--CA---T-GAA-TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTCCACTC-G---A-AG-C-AGT-G-CCGTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAG-AC--AC---CATGCATGT-CT---------CCTC-----------T----------------C--CTC-GG-TGC--CC-T--GTC-CTTG-CCAAAAG--AGGGTA-TAGGG-----TGTTCCTCC---TTCG-AG-GGC--CTACTC-ACA-TGA-AGTCGC-G--TTC-CCCGCGGGAGTCGC--T-----TG-TTGGCG--CTCAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--CAATc
gi|18 : t-G-G-G-CGTGGGTGC-A--CA-CAA-GG-TTCCC-AGCTAAGACCC---CGG--A-TTG--ATGCTCGA-GGTGCAATGTG--CA---T-GAA-TTTTCTCTAT-GTCATCTGTCGAG---GG-TTCAGTC-ACTC-G---A-AG-C-AGT-G-C-GTGGCGT-----A-CTGC--AAA-TCAAGGAC--ACATGCATG----T-CT---------CCTC-----------C----------------C--TTC-GG-TGC--CC-T--GTC-TT-G-CCAAAAG--AGGGTA-TAGGG-----TGTTCCTCC---TTCG-AG-GGC--C--TAC-TCACTGAGAGTCGC-G--TTC-CACGC-GGAGTCGC--TT----TG-TTGGCG--CTCAGT---CT---GTG-TAGC----------------TCA--------CTGCTGTCTTCTG----AGC--GTTGT--C
gi|19 : CT----CA---ACTTTCT-----CA--GGGTAC-TG-CATC-AT-GC-T---G-G-TG--TTGAT-----GCATGGCTTCCCAA--C-TT----T-CTTGCTGCAATG-GATCCT-CT--TGGGGAGT---AG--ACTGGTCTTGAT----GCTTACAA----GCGAGTGGTCAGTGTCACAGT-CT----G-CATTGTG-GTGTTTGAGTACACAGT---AC-AAAT-TTG---AGGTTGG-TTCAC--TT---AGTGATGACCACGTGTAGC---------CA-GTGCTTT--GAGTG-T-GGA--TGTCTC---CA--CGACACTTTGT-GATGT--G-GCTT-CATATGG-AAA-AAGG--AGTTGGTCACA--Caa
gi|2 : AG--AGC-TTGC-------------G-GTAA-GCAAGC---------AGAT-T--CAA---GAAG-AC-----TCTG-----ACCCGTTCTCATGTCA--TTTTT--CTAGCC-CGTG-CCCTG-C--CTTCC--CAAA--A------C--G--TTG--G-GCCAT-GCCCTTC-TCGGTC--T-GCC--AC--CAG--ACTT-GCCG-C-G-TT---GACGTCCGC--A---A-GACA-G-GTAGA--TA-TGCTTTC--TGCT---C-TGG--------G-ATC---TCGT---CT-ACA----A-CAGGTGGTCTAATG-ACTCGGT-AGAA-TTGGTTCTCTT-ACT-T-C---ATGCCGAAGC-T---TG---CCT-GT-GTT-G-G-GGCGTAGACGC-A--AAACAAAGGGTTCACTCG----GAACCGCTTGCCAG-TGG--ATGC---A-GGCGCA----GG-CGAATT-AAAATTTCATCTGT-ACCTGCTG--G-GTTTGG-TTCAATC-ACAGCG---A-AGAT-ACT-G-C-ATGGCGC-----AACTGCCCAAA-TCCA--ACTAAC---CGTG----T-TT---------CCTTCACATCCAG-TTTCGCCCACGATTTTTCC--CTCCAG-TGC--CT-T--TTTTCTTGACCAGAAAGAAAGGTA-TAG-------TGCTCCTCC---TCAG-GG-ATC--C--TTC-TCG-TGGGAGTCGT-GTTTTC-CT-GC-AGGGCTGC--TA----TG-TCGATGTTTTCAGTATCCT---GTG-CAGTGGTC-AC--GATCAA-TCA--------ATGCTGTTTTTCGGGGTCGC--ATCAT--CCATGACCTGAAGGT--AA-TTGTC--AG-TCC-TGGAA-CATAGT-T-TTACATTCC-GCTTGCTAATCCGAAGA-GC-TGGGGAACTT-C--------GTTTTT--CTTT--TTCTTTTGCTT--GCCCTG-CACACCGGTTTA-ACGTATCCACTTGTCAGAGACCCTCG---TAGCACTCTTT--A--AGCTTCCCAGG--CACCCTCTGAAGCAGGCAGATCGTGG-GTG-GCGTAGCACCCCTTACTG-CTGGGGGCTTCCCAG-CT-GGGCCGGGC-GTAGCT-TGAGAGTGGAGGATTAC-GATGATTCCTTCAGCACCCGTC-GAAGACAACCCGTAGCGTC-C-A-C-CTACGGCCAATCGAGCAAGGACTTATCACCTTGTAAACTGTT-TCTCTCCGCAATTGCTG-T
gi|2 : CGGTAA-AGGTGAGGGACTGGCAATGACCTCTCccatctttgactcccctttcaccacttctccaccccggtaaaggtgagggactggcaatgacctctcagggcgcggcctgcaaagtcatattgggatcctggctgcccctaagccaaggatccccctctcttctccctggatgtgttttcaaaggatcgcagggcgatacgtttggcatcagtttgtgctgcagattttcctgtaggtttactcaaattagccctttcctacttccgaggttatccacaaggcacgtgggttttgtttgctatttactcatagctcgggactaggattgcaggcaccgcagggcatatccaaacaccgatgtgccatgcatatcgcttgcattagcgggctctagtctcctccaagacctgtggtcctgctaaaggggccaatttaacgcaaaacaaaacacataattaaagtactccccaagcaccactcaccacatggccctaaagcaatttcgtagaacacagaa
gi|20 : agagcttgcggtaagcaagcagattcaagaagactctgacccgttctcatgtcatttttctagcccgtgccctgccttcccaaaacgttgggccatgcccttctcggtctgccaccagacttgccgcgttgacgtccgcaagacaggtagatatgctttctgctctgggatctcgtctacaacaggtggtctaatgactcggtagaattggttctcttacttcatgccgaagcttgcctgtgttggggcgtagacgcaaaacaaagggttcactcggaaccgcttgccagtggatgcaggcgcaggcgaattaaaatttcatctgtacctgctgggtttggttcaatcacagcgaagatactgcatggcgcaactgcccaaatccaactaaccgtgtttccttcacatccagtttcgcccacgatttttccctccagtgccttttttcttgaccagaaagaaaggtatagtgctcctcctcagggatccttctcgtgggagtcgtgttttcctgcagggctgctatgtcgatgttttcagtatcctgtgcagtggtcacgatcaatcaatgctgtttttcggggtcgcatcatccatgacctgaaggtaattgtcagtcctggaacatagttttacattccgcttgctaatccgaagagctggggaacttcgtttttctttttcttttgcttgccctgcacaccggtttaacgtatccacttgtcagagaccctcgtagcactctttaagcttcccaggcaccctctgaagcaggcagatcgtgggtggcgtagcaccccttactgctgggggcttcccagctgggccgggcgtagcttgagagtggaggattacgatgattccttcagcacccgtcgaagacaacccgtagcgtccacctacggccaatcgagcaaggacttatcaccttgtaaactgtttctctccgcaattgctgtccatctttgactcccctttcaccacttctccacccTATA---GTGTTGTTTTAAGAG---TTATGGGATCTCCTTCTAAGTTGTTTTCTCGTGCTTTTGGTGATCGA-CTCTGTGGTGTATATTTTCTTGTCACCAGGGGTAAAGCTCGTC-TTTAC-TTTAGTA-TGCTTTGATGCCTGCCTGGGCTGACCACCCC-TTCGTATTCTTTGAGTGATGCAAAACTTCTCCTGGT---TTTCAGTTTTTCACCTCT-T----GTT--AAA----GT-AGCAATCagggcgcggcctgcaaagtcatattgggatcctggctgcccctaagccaaggatccccctctcttctccctggatgtgttttcaaaggatcgcagggcgatacgtttggcatcagtttgtgctgcagattttcctgtaggtttactcaaattagccctttcctacttccgaggttatccacaaggcacgtgggttttgtttgctatttactcatagctcgggactaggattgcaggcaccgcagggcatatccaaacaccgatgtgccatgcatatcgcttgcattagcgggctctagtctcctccaagacctgtggtcctgctaaaggggccaatttaacgcaaaacaaaacacataattaaagtactccccaagcaccactcaccacatggccctaaagcaatttcgtagaacacagaa
gi|21 : TTCTGATGTTTCCGCTGTTGAACGCTT-GCTGAATGTTATCTGACAATTGTGACCTGTA-A-A--CATTTGC-CAAGCCC------CGTGTCATAAGC-TGTGATCT--GC-TGTG----------TGCAACTCCCAGTACC--TAGGTT-TTTCTGACTTTTATCAAACA-TA-TAACT--GATGAGTAGTAGACTG-ATGCATATTG-CAGACCCATTGACTGaagg
gi|22 : TTCTCAT-TTA--ATTTCAGC----CACACGCCCATGAA--CAGAC--CGAGCAA------A--G--AAG--G-GCCA--GA--GTC-ATTGTC--T-GC---TC--C-A--ACTC-TA-G-CAG-TT---GAAG-CGCCCTA---A-G----G-ACA-A--TC-TG-TT-CAGTGCTG--G-TGG------------TG--TTGC---TG-ATG----A-T-GG
gi|26 : atGC--TC----TG-TCGACG--CAGAGA---CG---ATG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTTCG----TAA--GTCGT--CCATGGCCTGTGGAT--TA-CTGTTGAAG-CCT-GGACA-AATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTAatgcaaggtttattgtagaattta
gi|27 : T--CCA----GCGAGTGGTCGGTGTCGCAGT-CA----G-CGCTGTG-GT-----AGCTGCGGGTGAACC-AAACTCAGATCAGC--GA-GTCTCTCTT---GGTAATGACGAGATCTAGCTG---GTGCCA-ATta
gi|3 : acgGATCATGTCAAGCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCGC---CA--TAA-ACTTTGT-GTC-T--A-TCTTAGTGCTGG-AAG-AAAG--TGTTCATCAC----AGCCAGG-TTTT-------------T-ATA--AAA-GC---------ATACCT--CAA---GAAG-TA-----TTTG-----AAC-ATTGTCAT-TCA--T-TTT--C----C-CA-----ATA-A--TGTCC--AATG--A------C------TGAAG-GCCTG-GA--TTC-AAAGTC--T-GC---AC--C-A--ACCC-TT-G-C-A-TT---GAAGTCTCC--C---ATGA-A-G-A-AGA---G-TGCTT-C--T--TTG-T-TGG--------GTAAAG--T-AC---AG-ACA----A-T-GGGG-TCAAAGG-CATAA-T-AGAAACTGACCCT-TT-TCT-T-CTACA-GTGGACTC-TGAGTGGAGC-TCATAGTT-GCA-G-CATAAGCAC-A--CA-CAA-AA-TTGAC-TA----CACCTA--TACCTA-TAGCCATCCACAG-GGT-CA----G----------GAAGTCTCTCTGT-CCC-CCTGTTG-G---GGGTTTTAT--------------------------------------A-CTGC--AAC-GCCC--AC--GT---CGTGAA--T-TC-----------TG--------GATT----------------C--ACC-TG--GC--TTCT--TCC-CCCG-CCAGAAG--AATTTG-TAGGT-----TTTTTTTCT---TTTA-GTTATC--C--CTCATCA--GCCAGTCGG-G--TTT-CTTGT-AGAACAGT--TA----TG-TCGATG--CAGAGT---CG---GCG-GAGC--TC-TCT-G-TCGA-TGA--------TGGCGGTCTTCTG----TAG--GTCAC--CCATGGCCTGTGGAT--CA-CTGTTGAAG-CCT-GGATA-CATAGT-TCTAACATTCCAGCT-------------A-GC-TGGGG-TCTT-C--------GGAATT--CTTT--GTTTT--------GCCTGG-TGC-TGGGTTTTCGCA-ACCTGCCTGTC-GA---TTTTG---T--------CT--A--CGCT--TCATG--CACCCAATGAACCCAGCAAGTTGAGGCGGG-G--TAGTA--CCTAATTGCGAGAGGACTGCCTGG-GC-AAGGCGGAATGTAACT-ACCCAATGGAA---CGT-GAAAATTCCTCC--CA-CCGTCAGGAG-CAATCCCTAGCGCC-CGG-CTCTAC-GCCAATCGAGTTTGGGCTTATCA-CTGGT-AACTGCTG-CTC-CCAT---TGTTG-TAC-CTACACTGTCT-CAGCGAAG--CTGT-AGTGACCTCTCattat
gi|4 : catcttcctgctcaaTTCTCAT-TCA--T-TTG--C----C-CATA-CCA-A-A--CTTGC--CGAG--G------CAGG--ATG--G--CCAC-GA--T-----GGTC--T-GC---AC--C-C--ACTC-TA-G-C-A-TT---GAAGTCGC---A---A-GA-G-----AAA--CG-AGTTT-C--TTCATGAC-TGG--------G-ATGC--TCTCAATTG-ATGGATCA-C-AG-G-TTT------CTCA-T-AGAA-TTCACC----T-AGTGT-CTGGG-GTGGAAG-------A---C-A-GA-GTC-G-GTG-CGTACACAC-T--GA-CAA-GGGTG-AC-GG----GACC-----GC--AGTGG---TACT-GA-CGCGGA----GGTCA-----GACATT---------GCTGCCTG---------G-TTCTACC-A-TA-GCTCA-AG-C-A-A-G-CTGTTTCTTC----A-CTGC--AAA-GCCT--AC--TC---CATG----C-TC---------TTTG--------GGTT----------------C--GTC-GGATGT---T-T--TCC-CTTG-CTACTAA--AACGTG-AAA-------TCTTTCTCT---TTTA-AT-GTG--C--CAG-TGC-CGCTAAGCGCCG--TTTTCTTGA-AGAGTGGT--TA----TG-TCCACG--TTCATT---CT---CTT-GAGC--TCGTC--G-TTTA-TGA--------CAGCTGTATTTCT----TGC--GTTGTTGCAATG-TCTAGATGTTTCA-CAG--AAAG-GCC-GATCAACATTGT-CCGGACATTCCAACTTCCCAGT-TTTAGA-GC-TGATC-CCTT-TATATTGTTGTGGTT--TTTT--TTTTTTTG-TT--GCCTGG-TGC--GAAAGCT-GCG-ACCTGC-------A---GTTTGGATTAC----TCCT--G--ATCT--CCATG--CACCCAATGAAGAAAGCAGACCGTGGCGGG-AC-GA-CA--CC-AATTGGCTGGGGACTGCCCAG-CTTAAGGCGGGCGGAAGCT-GTCCAGTGAAA---TCC-GAGAATATCTCC--CA-CCGTCA-GAG-CAACCCCCGGCGCCGCGC-T-CTAC-GCCAATTGAGCGGTAGCTTATAA-CCGGT-AACTGCTGCTCC-CCG----T-TTG-TGT----CGAGGCCATAGGCGAAG--CTGG-AGTGGCCTCTCcaggtgcaggcctgggcagatgatatggagatcctgaagtgcctagtcgccaggatccccctctcggcgttgcttacaggatccggcagagaggcaagtcaacagttcagcgcagctgcaggagttgccagaaggtttcgcagggctcagccaactgcctaaagggctccactcctgattttctgttggggtgaactcccatagccttggactcttccgggccgttcacaaggcagtgaggctatttgacccatagctgggggtctggatcgtgggcagcagagcgtatccacaaaccggtgagccatgcatgctacatgtttaggggccagaccttctccaagtcccttgtagtctagcccggctatgaggtataac
gi|5 : catA-CTGGTCAT-TT-GCT-T-C---A-GCG--AGC-T---TG---C-T-GT-GTG-G-G-G-CGT--ACGC-ACCGC-CCC-CGGTTT-C-CG----CGCCC---TGC--C-TGG--CTGC-CAG-GGCA-A----G--CC---T-ACCATTATTTCTGT-G-CGCAGGT-------GG-TTCACTC--CTC-G---C-CG-C-A-T-GCC-ATGGCGT-------CTGC--CAC-TCC----C--AC---CGTG----T-TCGTCGTGTATCCTA--------G-TT-------------------CTA-AG-TGCAGGT-T--TTC-TTCG-CC--AAGCCGCGGTA-TAG-------TGTTCCTATGGATGCGTGG-ATTTAC--CTT-TC--TGGGAGTAGC-GTTTTC-CTGTG-AGAGGTGCAGTAACCTTGTTCGCTG--TTCGAT---CTAAGATGCAAGT--TC-TC--GATA-A-TCAAATGTCGTTTTTTGTTTTTCG----CGCAAATAAT--CT---GCCTGA-GGT--CA-CTGTC--AGTCCT-GGGCG-CATAGTGTTTC-CATT--AGCTTGCTAAT-CGAAGAGGCATGGGG-ACTTAC--------GTGTTTTCCTTT--TTCTTTTGCTT--G-CTGG-TAA-CAGG-TTA-ACG-ATCCACTTGCT-CA---GCTCG---TAGA---CTCTAGA--AGCT---CAGGACCATC---TGAAGC--GCAG--TGTGGCCGG-GC-TAGC---CCTTACTGGCTGGGGGCTGCAC-T-TT-GAGGCGGGCGGTAGCT-G--AAGTAGGA---TGTAGATGA-TCCT-C--CA--CGT----GGACA---CGTAGCGTC-CAA-C-TCAC-G-CAATCGAGCAAGGA-TTATC--CTCGTAAACTGTTGTCT--TCG----TGTTG-TGTGTTTCACGGTAA-AGGTGAGA--CTGG-AGTAGCCTcaggtgcagatgtagatgtacatgtagattgtgggtgagtgaatgttaagatgtaagcctgagcaatctagtatggagagcaggctgttgcccatgcagcacgcccccccctctccacgtcactgatggattcaaaggaacagcaggctgctaaagtgtggcgccgtcgcaggagctgccagagcaaggttgagaacaacgacgaactgccctactgactccaactccggatttttcc
gi|6 : AACGCTTCTTGAGTAACGGAGTTTTCTCTGGTGTAGAGTTCCAGGTAGTGCTCTACCCATCTTCCCCATTTGCTTGTCCC-TGTCTGTGATGACTTCCC--GTCTT-GATTTCAGAGGTGCAGTTTTCTTTGTGGGTTTGCCTGTCGCCTGTTTGATGCCCTCGTACATACTCCTGATGTTGCCACTATCCGACGCTTTGCTGGATGTTGTCCGACAACTGAAGCC---A-GTAGTCGGTGGCGCAA---C---------GTCGT--GC-TG---TTT--GC-TGTGCTTTGCTATGTGCAGCTTGCAATGCCTGTAGGTT-ATTCAGACTTGGGTCACGCT-TA-TAGCT--GACAAGT-----GCG--TTGCGT-TTGGCA---TCAATGACTGGCT-CCATCTCAGTAAT---AC-TGG-CTTCAAACCAACCAATGTTCTTGTGC---TCTTTTTT--TGCCGTACGTCAGAAC-TGCA-GTGCTGTAAATGGCGTT-CTAAGAGAGTTCCAGTTGTCC--CTCG-GTT-TTGTTCT---GCATTTATA--TGAGCTGTTTTGAGAG---T--------CTCCTC--AAGTTGTTT----GT--------TGA---A-CTCT----TG---GTTCTTTT----CC--AGGTGA-GC-CGTC-TT-AC-T---G-A-TG--TTGAT-----CCTAGGCTGACC----CTTT---CT-CTTTGAGTGATG-AAA-CTTCG--TGG----TTTCAG--TTTCACCTTTGT----GG---CAATAATG-GAGTGATCGGTGTCGCAAT-CA----G-CTCTTTG-AT-----AGGACCTGGTGTTGC-AAACGTTGTTCAAG--GA-ATCACGTTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTG---ATACCA-GTGTTTT--GACCT-C-GGA--TGTCTC---CA--GGATACCTTGT-GACAT--G-CCTT-GTTCTGA-AAG-TAGG--TGTTCGTCACG--CAG--AGC-CTGC-------------G-GTA--GCA-GC---------AGAGTT--CAA---GAAG-CC-----TCTG-----ACC-GTTCTCAT-TCA--TCTTT--C----C-TATG-CCG-------------------------------------------T-GA--TTC-TCGGTC--T-GC---AC--C-G--ACTC-GC-G-C-G-TT---GAAGTCGCA--A---A-GA-A-G-GTAGA--TA-TGC-T-C--TGCTT----TGG--------G-ATC---TTGC---TG-ACA----A-C-GGTG-TCTAGTG-ACTCG-T-AGAA-TTGGTCCT-TT-ACT-T-C---A-GCCGAATC-T---TG---C-C-GT-GTTGG-G-G-CGTAGACGC-A--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GAtcagggcgcggatgggcaaagtatatggagatctggctgcccattgtaacggaccccttctttctccctgatatattccaaaggatcgcagggcgatacgtttggatcagtttggtgagatttctgtagggtttactcttagcatttcctactccgaaggtacacaaaggcaggggttgttgctatttacccatagctagggactaggattggaggcacttcagggcatatccaacacgatgtgcagcatgccttgctttaggggctgtctttctcaagacctgtgttctgctagggcatttcctacaaataattaatcccaacacccacctgatacctcccccccaaagaaagcaattcgtacacaga
gi|7 : ATTCGAC-CTT-GCTGA-TGTTTTCCGATAA-TGAAGCC---AGA-AGTCGTTGGCGCAA---CGCGTGATGTGTCGT--GTGCG---TTTTGGCACGGG----------TGCAGCTTGCAATGCCTGTAGTTA-ATTCAGACCTGG--TACACT-TAATAGTCTGGATAAGT-----GCGGCTTGCGT-TGG-CAG--TCA-TGACTGGCTTCCATCTCAGTAATTAAACGTGG--TTCAAACCACTCAGTGGTACTGTGCCGCTCTTTTTTCTTGCCG-ATGTCGAAACGTGCAAGTGCTGTGAATGGCGTT-CTAAGAGTGTTCCAGTGGTTCTCC-CGTGTGGTTGTTCCCTGGCATTTATAAATGA--TGTTATAAAAGATGT--------CTCCTC--AGTTTGTTT----GT--------TGA---AACTCT----TG----TTCTTTT----CC--GGGTAA-GC-CGTCGTT-ACGT---G-ATTG--TTGAT-----CCTGATCTGACC----C-TT---AT-TTTTGA-TGATG-AAACCTTCT--TGG----TTTCAG--TTTCACTTTTGTTGCAGAT--CAA----AGGAGTGGT-AATGTCGCAAT-CACTACC-CCTTG-G-ATC----AGAACCTG--GTTGCAAAACATTGTTTAGG--GATAT-ACGCTT---GGTGATGATCATGTCCAGCTGCGAATGCAG-GT-TTTT--GACCT-CTGGA--TGTCTC---AA--GAGAACCTTGTGGGCAT----CCTT-GGTTTGATAAGTAAGG--T-TTCGTC-CG--CAA--A---CTGC-------------GCGTA---CA-GC---------AGGAGTTCCAA---GAAG-CC-----TCTG-----A-C-GTTCTCCT-TCG--TCTCC--C----T-AGCG-CCCTG-A--TGTCCTATAAA--A------C--GT-TTG--G-GCCATCGACTTCC-TCGTTC--TGGCGCGAC--C-G--ACTCTGC-GTC-GTTT---GAAGT-GCC--A---A-GA-A-GCTTAGA--TA-TGCGT-C--TGCTT--C-TGG--------G-ATCGTCTCGC---TA-ACA----A-C-GGTG-TC--ATG--CTCG-TGAGTT-TTTGTCCT-TT-AAT-T-C---A-GTGGAAGCTT---TG---C-T-GT-GTT-G-G-A-GGAAGACGCAA--AA-CAA--GGTTCAC-CG----GA-CC---TGC--ATTGG--ATACATGGCGGGGCA----G--CA---T-AAATTTCTCTCAGTGGCCGCCTGtgt
gi|8 : TGGTGTTCT-TCACATTGTTAAGG------TTCCTCTT-----------CCTTGTCAATCTG---ATGCCA-ATGCTTG--GATCT-T-GGA--TGGCAC---CA--TGCCACTTTGT--GTAT--ATCTTT-GTGCTGA-AAG-AAGG--TGATCGTCACAGTCAT--ATT-TT------------------TATTGGA-GC---------ATAGCT--CAA---GAAG-TC-----CTTG-----ACC-ATTTTCAT-TCA--TTTTT--C----C-AATC-CCATA-A--TGTTC--
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gi|9 : ttggtgttcttcacattgttaaggttcctcttccttgtcaatctgatgccaatgcttggatcttggatggcaccatgccactttgtgtatatctttgtgctgaaagaaggtgatcgtcacagtcatatttttattggagcatagctcaagaagtccttgaccattttcattcatttttccaatcccataatgttcaatgaatgaaggccacgcctcaaagtgtgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacgtgcacctgtagccatcCGT--CCATGGCCTGTGGAT--TA-CTGTTGAAG-CCT-GGACA-AATAGT-TCTCACATTCCAGCTAGCTATA-CGAAGA-GC-TGGAG-TCTT-C--------GGAATT--CTTTGGTGTTTTTGTTTTTGCCTGG-TAC-TGGGTTTT-GCA-ACCTGGCTGTC-GA---TTTTG---T------CTTT--AGAAGCT--CCATG--CACCCAATGAAGCAAGCAAGTTGAGGCGGG-G--TGG------TAACTGTCCGAGGACTACTCGG-GT-AAGGCGGGCGGTAACT-ACCCAGTGGAA---CCT-GAAAATTCCTTC--CA-CCGTCAGGAG-CAACCCCTAGCGCC-CGATT-CTAC-GCCAATCGAGCTTGGGCTTACCA-CTGGT-AACTGCTGTTCC-CCG----TGTTG-TGC-CTACGCTGTTT-CAGCGAAG--CTGG-AGTGACCTCTC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): GGGTTGCAAGTGTGCTAAAACAACGGACGTCACTCCGGATTTTCCTTCAGGGTTTACTCTCTTAGCCTTCTCTCCCGAGGTAGCTACAAGGCAGTAGAGCTATTTACCCATAGCTGGGGTTTGGTTCGTTTGGCACCAGGGCGTATCCACGCACCGGTGGTCCTGCATGCCACACGCCTGAGGGCCAAACCTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCTGAGTCCGTAAGGTGCTCAGTTGCCCAAATGACGGCACGGAGAACCATTGAGGCATAGGTCTTGCGATAGAGAGGCTATGTACTGGCAGGGAAAGAATTGCGCACTCTGCTCCCCTTTTTGCATTAATACTAGCCAGCTGTGTTAGCTGAAAGCGAGAAGTACAAAGCACTACTCAACAACTGCCACACTAGACGCATCACACCGCATTTGT
Unaligned ( gi|13 ): CGACAGAACCCCCCCTCGACACTACTGATGTTACCAGGCAGGAAAGCTGAGCAATATGTCCTGGCATCAGATTGGTTGCAGGAGTTTGCCGTAGACGTACTGTCAGTGACCAAGTCATACCGCCTTCGGGCTCCTCTCCGAAATTTCGTGTCGGTTTTTTTCCCCCCTAGTTTTTTGCTATTCCTAGCACTTACAAGGCGAGTAAGGTCGTTTGATCCATGACTGGGGAGTCTGTTGGTGGCATCAGGGAATGTCCACACGCCGGTGAGGCCTGCATGCTCGCAACCTCTTGGGCAGACCACCTCCGAGTCCCTGGTAGGTTTAGTCTGAGGCCTAAGGTGCACATCATACAACATCTAAAATAACGAAATTTCA
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Unaligned ( gi|23 ): CCATGACGAGGCATTTGAAAGAACTTGTAGTGGCGTGGCCATGTACTACCAAGGGTTGCAAAGTCTTAACATTTTAGCATTTCTGTTAGCCAGCGATGAGGATTAAAACCAAGAAGTAACAAAGACACACTCATACACACTTGTTGCATCACACACATT
Unaligned ( gi|24 ): CGATGGAGAGGCTTGTACTGGCAGAGAGAGACTTACGCACTCAGCTCCCCTTTTCGCATAAATGCTAGCCAGCGGTGTTAGCTGAAAGGGAGTACAAAGCACTACTCATAAACTACCACACTAGATGTACATGTATCACACCGCCTTT
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Unaligned ( gi|28 ): TAGGGTCCGGCGGAGAGGAAAGCCAATACAGTCGGTGTCAGCGCAGCTGTAGGAGTTGCCAGAAGGTTTCGCAGGGCTCAACCAACTGCCTAAGGGGCTCCACTCCTGATTTT
Unaligned ( gi|29 ): CCGGCATGCCACACGTCTGGGGGCCAAACCTCTTCCGAGTCCTTGCCAGTTTTGCCCGAGTCCGTGGGAGTCTTTTGCCCAATGACGGTACGAGGAACCACTGAGGC
Unaligned ( gi|30 ): GCGGCTCTCAGGGCCGGCCTGGGCCAAAAGTATAGGAGTCCGGGCTTGCCCAGTAACCAGGATTCTCCCTCTCTTCCCGTGATGTGTTCCAAAGGA
Unaligned ( gi|31 ): CAGGGCGATACGTTTGGCATCAGTTTGGCTACAGATTTATGTAGGGTTTACTCTTTAGCCTTGCCTTACTGAGGATA
Unaligned ( gi|32 ): CGTTTGGCACCAGGGCGTATCCACGCAACGGATAGTCTCTGC