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Reference ( gi|6 )            :        GCGGATTTAA----G---GGAGGGGGGGGGCGCAC--CC-G---GC-GC---CCCCCT-CC-CC-----T--A-----A-----AA--T-TTACA-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATC-AGTTGA
gi|1                          :        GCGGATTTAA----G---GC-------GGGCGCGT--CC-G--------------CCC-CC-CC-----T--A-----A-----AA--T-TTACA-----AAGTGTATA--TA------T-A-A-AAT-C-----TT----------A--T---TTAT--TCA-C-TGG--A--A----A-CAT----T---------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAT-GG---CGCCGCCCCCCC-CCCCT-----CTT-AATTTTGTATAAGA-TTTTATAT--AGTTG
gi|3                          :       gGCGG-TTTAA----GTGGGGAGGGGGGGGGGGGGG-----G---GC-GC---CCCCCC-CT-CT-----TA-A-----A-----AA--T-TTACC-----GAGTGTA-A--TA------TGA-TGAATGA-----TT----------A--TTTGTT-T--TCA-CGTGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TTC-AATCACGGG---CG---------G-CCCCT-----CTT-AA--TTGTATAAGA-TTATATG-C-AGTTGAggcttttctgagaaaaggtatattcgcaattcaaacctctcaaatttgcgtcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacataa
gi|2                          :     gtgGCGG-TTTAA----GTGGGGAGGGGGGGGGGGGGG-----G---GC-GC---CCCCCC-CT-CT-----TA-A-----A-----AA--T-TTACC-----GAGTGTA-A--TA------TGA-TGAATGA-----TT----------A--TTTGTT-T--TCA-CGTGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TTC-AATCACGGG---CG---------G-CCCCT-----CTT-AA--TTGTATAAGA-TTATATG-C-AGTTGAatatcttttgatttattgttgtgtttctgagca
gi|11                         :     gtgGCGGATTTAA----G---GGGG-----------AC--CC-G---GC-GC---CCCCCC-CC-CCC----T--A-----A-----AA--T-TTACCGTGCCAAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCAGC-TGG--A--AAATTA-AAT----T-A-------ATT-ATAA-TGCTAC-ATCTAC-GT---CGC--------C-CCCCT-----CTT-atatcttttgatttattgttgtgtttctgagca
gi|19                         :        GCGGATTTAA----G---GG-------GGGAGCAC--CT-T---TC-GC---CCCTC--CC-CC-----T--A-----A-----AA--T-TTACC-----AAGTGGA-A--T-------------------------------------------T-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-T-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCc
gi|8                          :      tgGCCGATTTAA----A---GGGCTGGGGCGTCGCAC--CC-GC--GC-GC---AC-----CC-CC-----T--A-----A-----AA----TTACC-----AAGTGTC-A--TATT----T-A-T-AA--G-----TT----------A--T---TT-TTCTCA-C-TGG-----A----A-AAT----T---------A-T-G-AA-----AC-A--CAC-GGCCCCC---------C-CCCCT-----CTTAAATTTTG-A-AAAA-TT-TAT
gi|15                         :       tGCGGATTTAA----------------GGGGAGCA------------------CCTCCC-CC-CC-----T--A-----A-----AA--T-TTACC-----AAGTGTA----------------------------------------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AATTTGGT-AAAATTTTA-T-G-AA-T--TAC-A--CAC-GC---CG------------CCCT-----CTT--ATTTTGTA-AAGA-TT
gi|16                         :       gGCGGATTTAA----G---GGGCGGGGTGGGCGCAC--CC-G---GCAG---------------------T--A-----ATTATCAA--TATTATA-----CAGTGTA-A--TG------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-GGG--A--A----A-ta
gi|27                         : agccgtgGTGGATTTAA----G---GG-------GGGCGCAC--CC-----------------CC-CC-CC-----T--A-----A-----CA--T-T-ACC-----AAGTGTA-A--TA------C-A-T-TAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--G----A-tttttttttcataaat
gi|35                         :        GCGAATTTAA----A---GGGGGGGGGGGG---AT--CC-G---GC-GC---GCGC---CC-CC-----T--A-----A-----AT--T-TT
gi|26                         :     gtgGCAGATTTG-----G---GGAGGGTGGGGGGGC-T--CC-G---CC-CT---TCCCCT-TT-TCGTGATT--A-----A-----AATTT-TTATC-----AGGTGTA-c
gi|13                         :    catagCGGATTTAA----G---GG------GGGGCGCAC--CC-G---GC-GCAACCCCCCC-CC-CC-----TTTA-----A-----AA--T-TTACC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----C-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-TG---CA---------C-CCCCT-----CTT-AAga
gi|4                          :         CAGATTTAA----G---GGGGGAGGGGGG-G--------G---GC-AC---CCCCCC-CG-CC-----C--A-----A-----AT--T-TTACT-----AAGT-TA-T--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TGC-A--CAC---------------------TCTGAGAATTT-AATTT-GTA-AAGAATTATATATC-AGTTGA
gi|10                         :       gtCAGATTTAAAGGGG---GGGGGGGGGGGGCGCACACCC-A---GC-GC---CCCCCC-CCACC-----T--A-----A-----AA--T-TTATC-----AAGTGTA-AATTA------T-A-T-ACT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-ATA----T-A-------A-T-ATAA-A--TAC-A--CAC-AG---CC---------C-CCCCC-----Cgtttattttcttaacgatgtaaattcaaaag
gi|12                         :         CGGATTTAA----G---GGCGGGGC----CGCAC--CCCG---AC-GC---CCCCCCACC-CC-----T--A-----A-----AA--T-TTACC-----AA-TGTA-A--TA------T-A-TAAAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGGCAA--A----A-AAT----T-AC------A-T-A-AA-T--CACAA--CAC-GGGC-CG---------C-CCCCcct
gi|13                         :             TTTAA----A---GGGGGGGGGGGTTGCGC--CG-G---GT-GC---GCCCC--CC-CT-----T--A-----A-----Actcct
gi|25                         :             cggaA----G---GGGGGGGGGGGGCACAT--TC---------C---CCCCCT-----T-----T--AT----A-----AG--T-TTACatttaccaagtgtaatatataatcttatttttcactggaaaaatcaataaattacacactgcaccccctcttaa
gi|21                         :                   aagg---GGGGGGGGGGGGCG-AC--CC---------------------C-CC-----T--A-----A-----AA--G-TTACC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AGT-------TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-T-------A-T-A-AA-T--ttttttttctggcaaataaatcacaatttaga
gi|24                         :                       ---GGGGGGGGGGGGTGAAC--CC-A---GC-GC---CCCTAC-GC-CG-----T--A-----A-----AA--T-TTTCA-----AAaaactcttctgaga
gi|31                         :                              GGGGGGGGGGCAC--CC-G---GC-AC---ACACAC-AC-CC-----T--A-----A-----AA--T-TTACC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----CT----------tccaaggtaaaacatggtctcttgtttagaga
gi|14                         :                                      CGCCC--TC-GCTCGT-GC---CCTCCC-CC-TT-----T--ACACATA-----AT--T-TTACC-----AAGTGTA-----A------T-A-T-AAT-CCT---CT----------C--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-ATT----T-A-------A-T---GA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-
gi|5                          :                                 tggctgatttaata-G---GC-GC---CCCCCT-----------T--AT----A-----AA--T-TAACC-----AAGTGTA-A--TA------T-AAT-GATTC-----TT----------AATT---TT-T--TC--C-TGG--A--A----ACAAT----T-A-------A-G-A-TA-T---A--A--CAC-GG---CG---------C-CCC-T-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATCAAGTTGAc
gi|30                         :                                                 ggcggtttaaggCCCCC-CC-CC-----T--A-----A-----AA--C-TTATT-----AAGTGTA-A--TA------T-------T-T-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG-----A----A-AAT----T-A-------atatctttgatcatgtgcttttcttggaaaa
gi|18                         :                                                    gtgcggattttattggg-CC-----T--A-----A-----AG--T-TTACC-----AAATGTA-A--TACTAGTAT-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA----TAC-A--C
gi|20                         :                                                                       C-----T--A-----A-----GA--A-TTACC-----AAGTGTA-A--TA------TGA-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-AGG--ATAA----A-AAT----TTA-------A-T-A-AAAT--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----Cgtattgtattcactgattgaaaatatcatttgaaa
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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): AGAATATTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|9 ): ATTATTCCAATTCAAAACTTCAAATTGCTCAATTTTTATTGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|23 ): GGATACTTAACTACATACATGTATAAACTTAAATATAATCACGTGCAGTGGCGGATTTAGAGGGGGGGGGGGCAGGGGGCCC
Unaligned ( gi|29 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCGCATGAGAATATGAATCATTCACAATT
Unaligned ( gi|32 ): ATTTTAAGAATTCTGAAATATGTACACATAAATGCATGTATACAGTCAGTGGTCAGT
Unaligned ( gi|33 ): CACGCTAAAATTTCCAAACACAAGGTAAAGCATTGGCCCTTGTTTATAAAAAA
Unaligned ( gi|36 ): AACTCAGTGGCGGATTTAGAGGGGGGGAGGGGGGGGCGCTCCCTCCC
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Unaligned ( gi|38 ): GCAGTGGCGGATTTAGAGGGGGGGGCGGCAGGGGGCCCCGGGC






Alignments
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Reference ( family-3374 )     :                 GCGGATTTAA------G------GGGGG-GGGGGGGCGCACCC-G---GC-GC---CCCCCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATC-AGTTGA
gi|1                          :                 GCGGATTTAA------G------GCGGG--------CGCGTCC-G--------------CCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CA-----AAGTGTATA--TA------T-A-A-AAT-C-----TT----------A--T---TTAT--TCA-C-TGG--A--A----A-CAT----T---------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAT-GG---CGCCGCCCCCCC-CCCCT-----CTT-AATTTTGTATAAGA-TTTTATAT--AGTTG
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gi|14                         :                                                     CGCCCTC-GCTCGT-GC---CCTCCC-CC-T--------T-T--ACACATAAT--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-----A------T-A-T-AAT-CCT---CT----------C--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-ATT----T-A-------A-T---GA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-
gi|15                         :   tggctgatttaataGCGGATTTAA------G------GGGAG----------CACCT----------------CCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA----------------------------------------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AATTTGGT-AAAATTTTA-T-G-AA-T--TAC-A--CAC-GC---CG------------CCCT-----CTT--ATTTTGTA-AAGA-TTc
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gi|2                          :               tgGCGG-TTTAA------GTGGGGAGGGGG-GGGGGGGGG------G---GC-GC---CCCCCC-CT-C--------T-T--A-----AAAA-TT-T--A---CC-----GAGTGTA-A--TA------TGA-TGAATGA-----TT----------A--TTTGTT-T--TCA-CGTGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TTC-AATCACGGG---CG---------G-CCCCT-----CTT-AA--TTGTATAAGA-TTATATG-C-AGTTGA
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gi|21                         :                       gggggggggcg------GGGGG-GGGGGGGCG-ACCC---------------------C-C--------C-T--A-----AAA--GT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AGT-------TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-T-------A-T-A-AA-T--
gi|22                         :                                                                                                             T-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TTTTTTTTTCATA--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAA-AG---CGC--------C-CCCCT-----CTT-aaactcttctgaga
gi|24                         :                                  ------GGGGG-GGGGGGGTGAACCC-A---GC-GC---CCCTAC-GC-C--------G-T--A-----AAA--TT-TTCAAATCC-----AAG-GTA-A--AA------C-A-T-GGT-C-----Tctg
gi|25                         :                          A------G------GGGGG-GGGGGGGCACA------------T---TCCCCC-CC-T--------T-T--AT----AAG--TT-T--A---Ccttgtttagaga
gi|26                         :             aaggGCAGATTTGG------G------GAGGGTGGGGGGGCTC----------C-GC---CCTTCC-CC-TTTTCGTGAT-T--A-----AAATTTT-T--A---TC-----AGGTGTA-ttttttttctggcaaataaatcacaatttaga
gi|27                         :            catagGTGGATTTAA--------------------GGGGGGCGCA-----------------CCCCC-CC-C--------C-T--A-----ACA---T-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------C-A-T-TAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--G----A-ga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                        ---CG---------C-CCCCT-----CT--AATTTTGCA-AAGA-TTAT-TATC-AGTTGA
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gi|6                          : ggcggtttaaggggcgGCGGATTTAA------G------GGAGG-GGGGGGGCGCACCC-G---GC-GC---CCCCCT-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CA-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATC-AGTTGAatatctttgatcatgtgcttttcttggaaaa
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                 gCAGATTTAAAGGGGGG------GGGGG-GGGGGCGCACACCC-A---GC-GC---CCCCCC-CCAC--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---TC-----AAGTGTA-AATTA------T-A-T-ACT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-ATA----T-A-------A-T-ATAA-A--TAC-A--CAC-AG---CC---------C-CCCCC-----Cggcttttctgagaaaaggtatattcgcaattcaaacctctcaaatttgcgtcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacataa
gi|11                         :                 GCGGATTTAA------G------GGGG------------ACCC-G---GC-GC---CCCCCC-CC-C--------CCT--A-----AAA--TT-T--A---CCGTGCCAAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCAGC-TGG--A--AAATTA-AAT----T-A-------ATT-ATAA-TGCTAC-ATCTAC-GT---CGC--------C-CCCCT-----CTT-cct
gi|12                         :                  CGGATTTAA------G------GGCGG-GGC----CGCACCCCG---AC-GC---CCCCCCACC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AA-TGTA-A--TA------T-A-TAAAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGGCAA--A----A-AAT----T-AC------A-T-A-AA-T--CACAA--CAC-GGGC-CG---------C-CCCCc
gi|13                         :                  CGGATTTAA------G------GGGGG-G------CGCACCC-G---GC-GCAACCCCCCC-CC-C--------C-TTTA-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----C-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-TG---CA---------C-CCCCT-----CTT-AActcct
gi|14                         :                                                     CGCCCTC-GCTCGT-GC---CCTCCC-CC-T--------T-T--ACACATAAT--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-----A------T-A-T-AAT-CCT---CT----------C--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-ATT----T-A-------A-T---GA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-
gi|15                         :   tggctgatttaataGCGGATTTAA------G------GGGAG----------CACCT----------------CCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA----------------------------------------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AATTTGGT-AAAATTTTA-T-G-AA-T--TAC-A--CAC-GC---CG------------CCCT-----CTT--ATTTTGTA-AAGA-TTc
gi|16                         :                gGCGGATTTAA------G------GGGCG-GGGTGGGCGCACCC-G---GCAGT---AATTAT-C----------------A-----ATA--TTAT--A---C-------AGTGTA-A--TG------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-GGG--A--A----A-ta
gi|17                         :                                                                                                       agccgtg-T--A---CC-----AAGTGTA-A------------A-T-AAT-CCGTAGTT----------A--T---TT-T--TTA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-G-AA-T--TTC-A--CAC-GG---CG---------CGCACTT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTAtttttttttcataaat
gi|18                         :                                                                 tggcggatttaaggggg-C--------C-T--A-----AAG--TT-T--A---CC-----AAATGTA-A--TACTAGTAT-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA----TAC-A--C
gi|19                         :                 GCGGATTTAA------G------GGGGG-AG-------CACCT-T---TC-GC---CCCTCC-CC----------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGGA-A---------------------------------------------TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-T-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCgtattgtattcactgattgaaaatatcatttgaaa
gi|2                          :               tgGCGG-TTTAA------GTGGGGAGGGGG-GGGGGGGGG------G---GC-GC---CCCCCC-CT-C--------T-T--A-----AAAA-TT-T--A---CC-----GAGTGTA-A--TA------TGA-TGAATGA-----TT----------A--TTTGTT-T--TCA-CGTGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TTC-AATCACGGG---CG---------G-CCCCT-----CTT-AA--TTGTATAAGA-TTATATG-C-AGTTGA
gi|20                         :                                                                                 gtg--------C-T--A-----AGA--AT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------TGA-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-AGG--ATAA----A-AAT----TTA-------A-T-A-AAAT--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----Catatcttttgatttattgttgtgtttctgagca
gi|21                         :                       gggggggggcg------GGGGG-GGGGGGGCG-ACCC---------------------C-C--------C-T--A-----AAA--GT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AGT-------TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-T-------A-T-A-AA-T--
gi|22                         :                                                                                                             T-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TTTTTTTTTCATA--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAA-AG---CGC--------C-CCCCT-----CTT-aaactcttctgaga
gi|24                         :                                  ------GGGGG-GGGGGGGTGAACCC-A---GC-GC---CCCTAC-GC-C--------G-T--A-----AAA--TT-TTCAAATCC-----AAG-GTA-A--AA------C-A-T-GGT-C-----Tctg
gi|25                         :                          A------G------GGGGG-GGGGGGGCACA------------T---TCCCCC-CC-T--------T-T--AT----AAG--TT-T--A---Ccttgtttagaga
gi|26                         :             aaggGCAGATTTGG------G------GAGGGTGGGGGGGCTC----------C-GC---CCTTCC-CC-TTTTCGTGAT-T--A-----AAATTTT-T--A---TC-----AGGTGTA-ttttttttctggcaaataaatcacaatttaga
gi|27                         :            catagGTGGATTTAA--------------------GGGGGGCGCA-----------------CCCCC-CC-C--------C-T--A-----ACA---T-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------C-A-T-TAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--G----A-ga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                        ---CG---------C-CCCCT-----CT--AATTTTGCA-AAGA-TTAT-TATC-AGTTGA
gi|3                          :                 GCGG-TTTAA------GTGGGGAGGGGG-GGGGGGGGG------G---GC-GC---CCCCCC-CT-C--------T-T--A-----AAAA-TT-T--A---CC-----GAGTGTA-A--TA------TGA-TGAATGA-----TT----------A--TTTGTT-T--TCA-CGTGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TTC-AATCACGGG---CG---------G-CCCCT-----CTT-AA--TTGTATAAGA-TTATATG-C-AGTTGAatatatttgatttatgttgcttgcttctgagaaaa
gi|30                         :                                                                       gtgCCCCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--CT-T--A---TT-----AAGTGTA-A--TA------T-------T-T-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG-----A----A-AAT----T-A-------atatcttttgatttattgttgtgtttctgagca
gi|31                         :                           gtgcggattttattgggG-GGGGGGGGGCACCC-G---GC-AC---ACACAC-AC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----CT----------
gi|34                         :                                                                                                                                                                                     -T--TCA-C-TGGA-A--A----A-AAT----T-A-------A-TAA-AA-T--TAC-A--CATGGG---CG---------C-CCCC
gi|35                         :                aGCGAATTTAA------A------GGGGG-GGGGGGG---ATCC-G---GC-G-----CGCGC-CC-C--------C-T--A-----AAT--TT-T--cacccccctc
gi|36                         :              gtgGCGGATTTAG------A------GGGGG-GGAGGGGGG------G---GC-GC---TCCCTC-CC-c
gi|37                         :        aactcagtgGCGGATTTAG------A------GGGGG-GGGGGGGGTCA--G-G---GC-AC---CCCCCC-
gi|39                         :                                                                                                                                            cagtg-A-T-AAT-C-----CT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-TAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAT-A--CA
gi|4                          :                  CAGATTTAA------G------GGGGG-AGGGGGG-G------G---GC-AC---CCCCCC-CG-C--------C-C--A-----AAT--TT-T--A---CT-----AAGT-TA-T--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TGC-A--CAC---------------------TCTGAGAATTT-AATTT-GTA-AAGAATTATATATC-AGTTGAag
gi|5                          :                                                                          gtCCC-CC-C--------T-T--AT----AAA--TT-A--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-AAT-GATTC-----TT----------AATT---TT-T--TC--C-TGG--A--A----ACAAT----T-A-------A-G-A-TA-T---A--A--CAC-GG---CG---------C-CCC-T-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATCAAGTTGAgtttattttcttaacgatgtaaattcaaaag
gi|6                          : ggcggtttaaggggcgGCGGATTTAA------G------GGAGG-GGGGGGGCGCACCC-G---GC-GC---CCCCCT-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CA-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATC-AGTTGAatatctttgatcatgtgcttttcttggaaaa
gi|8                          :                 GCCGATTTAA------A------GGGCT-GGGGCGTCGCACCC-GC--GC-G-------CAC-CC-C--------C-T--A-----AAA---T-T--A---CC-----AAGTGTC-A--TATT----T-A-T-AA--G-----TT----------A--T---TT-TTCTCA-C-TGG-----A----A-AAT----T---------A-T-G-AA-----AC-A--CAC-GGCCCCC---------C-CCCCT-----CTTAAATTTTG-A-AAAA-TT-TAT


blockSeqs                     :                           AGGGGGG           T       CGCCCTCGCTC   A CAACC     A  A TTTCGTGA C TT CACAT   TT  A TC AAT  GTGCC       . AT  CTAGTAT  A A   CCGTAG   TTTTTTTCAT AT TTG  . TC   G G   CA TA AATT C   TTGG T AAATTTT T A T  A GC   A TC   G  CCC  C         G     GAGAA   A         T    A       TCA
blockSeqs                     :                           GTGGGGA           .       CGCACCCCG     . CC        .  . .        . .  T       A   . .  .    .           . .   TTT      . G   CCT      .          .  TTG  . .    . G   A  .  .    .   .    . C       . . T  . .    . AT   G  GC   C         .     .       .         T    .       TC 
blockSeqs                     :                           GTGGGGA           .       CGCACCCGC     . CC        .  . .        . .  T       A   . .  .    .           . .   TG       . G   GA       .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . AT   G  .    .         .     .       .         .    .       TC 
blockSeqs                     :                           G                 .       CACACCCA      . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   TG       . .   GA       .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .         .    .       TC 
blockSeqs                     :                           G                 .       CGCACCCG      . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   TG       . .   TC       .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .         .    .       C  
blockSeqs                     :                           G                 .       CGCACCCG      . TA        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .         .    .       C  
blockSeqs                     :                           G                 .       TGAACCCA      . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .         .    .          
blockSeqs                     :                           G                 .       GGCACCCG      . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .         .    .          
blockSeqs                     :                           G                 .       CGCACCCG      . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .         .    .          
blockSeqs                     :                           G                 .       CACCTT        . TT        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .                         
blockSeqs                     :                           G                 .       CGACCC        . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .                         
blockSeqs                     :                           A                 .       GTCAGG        . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .                         
blockSeqs                     :                           A                 .       ACCCG         . CA        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .       .                         
blockSeqs                     :                           A                 .       CACCT         . CT        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   C        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .                                 
blockSeqs                     :                           G                 .       ATCCG         . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   C        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .     .                                 
blockSeqs                     :                           G                 .       CACA          . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   T        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .                                       
blockSeqs                     :                           A                 .       CGCA          . CC        .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .    .  .    .         .                                       
blockSeqs                     :                           .                 .       GGG           . .         .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .       .    .         .                                       
blockSeqs                     :                                             .       CTC           . .         .  . .        . .  .       .   . .  .    .           . .   T        . .   C        .          .  .    . .    . .   .  .  .    .   .    . .       . . .  . .    . .                                                              
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blockSeqCons                  :                                                                     CC***                                                                                                                                                                                   *********                                      TC*
originalCons                  :                 GCGGATTTAA------G------GGGGG-GGGGGGGCGCACCC-G---GC-GC---CCCCCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATC-AGTTGA
finalCons                     :                 GCGGATTTAA------G------GGGGG-GGGGGGGCGCACCC-G---GC-GCC---CCCCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATC-AGTTGA
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): AGAATATTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|9 ): ATTATTCCAATTCAAAACTTCAAATTGCTCAATTTTTATTGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|23 ): GGATACTTAACTACATACATGTATAAACTTAAATATAATCACGTGCAGTGGCGGATTTAGAGGGGGGGGGGGCAGGGGGCCC
Unaligned ( gi|29 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCGCATGAGAATATGAATCATTCACAATT
Unaligned ( gi|32 ): ATTTTAAGAATTCTGAAATATGTACACATAAATGCATGTATACAGTCAGTGGTCAGT
Unaligned ( gi|33 ): CACGCTAAAATTTCCAAACACAAGGTAAAGCATTGGCCCTTGTTTATAAAAAA
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Reference ( family-3374 )     :                 GCGGATTTAA------G------GGGGG-GGGGGGGCGCACCC-G---GC-GC---CCCCCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATC-AGTTGA
gi|1                          :                 GCGGATTTAA------G------GCGGG--------CGCGTCC-G--------------CCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CA-----AAGTGTATA--TA------T-A-A-AAT-C-----TT----------A--T---TTAT--TCA-C-TGG--A--A----A-CAT----T---------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAT-GG---CGCCGCCCCCCC-CCCCT-----CTT-AATTTTGTATAAGA-TTTTATAT--AGTTG
gi|10                         :                 gCAGATTTAAAGGGGGG------GGGGG-GGGGGCGCACACCC-A---GC-GC---CCCCCC-CCAC--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---TC-----AAGTGTA-AATTA------T-A-T-ACT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-ATA----T-A-------A-T-ATAA-A--TAC-A--CAC-AG---CC---------C-CCCCC-----Cggcttttctgagaaaaggtatattcgcaattcaaacctctcaaatttgcgtcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacataa
gi|11                         :                 GCGGATTTAA------G------GGGG------------ACCC-G---GC-GC---CCCCCC-CC-C--------CCT--A-----AAA--TT-T--A---CCGTGCCAAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCAGC-TGG--A--AAATTA-AAT----T-A-------ATT-ATAA-TGCTAC-ATCTAC-GT---CGC--------C-CCCCT-----CTT-cct
gi|12                         :                  CGGATTTAA------G------GGCGG-GGC----CGCACCCCG---AC-GC---CCCCCCACC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AA-TGTA-A--TA------T-A-TAAAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGGCAA--A----A-AAT----T-AC------A-T-A-AA-T--CACAA--CAC-GGGC-CG---------C-CCCCc
gi|13                         :                  CGGATTTAA------G------GGGGG-G------CGCACCC-G---GC-GCAACCCCCCC-CC-C--------C-TTTA-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----C-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-TG---CA---------C-CCCCT-----CTT-AActcct
gi|14                         :                                                     CGCCCTC-GCTCGT-GC---CCTCCC-CC-T--------T-T--ACACATAAT--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-----A------T-A-T-AAT-CCT---CT----------C--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-ATT----T-A-------A-T---GA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-
gi|15                         :   tggctgatttaataGCGGATTTAA------G------GGGAG----------CACCT----------------CCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA----------------------------------------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AATTTGGT-AAAATTTTA-T-G-AA-T--TAC-A--CAC-GC---CG------------CCCT-----CTT--ATTTTGTA-AAGA-TTc
gi|16                         :                gGCGGATTTAA------G------GGGCG-GGGTGGGCGCACCC-G---GCAGT---AATTAT-C----------------A-----ATA--TTAT--A---C-------AGTGTA-A--TG------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-GGG--A--A----A-ta
gi|17                         :                                                                                                       agccgtg-T--A---CC-----AAGTGTA-A------------A-T-AAT-CCGTAGTT----------A--T---TT-T--TTA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-G-AA-T--TTC-A--CAC-GG---CG---------CGCACTT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTAtttttttttcataaat
gi|18                         :                                                                 tggcggatttaaggggg-C--------C-T--A-----AAG--TT-T--A---CC-----AAATGTA-A--TACTAGTAT-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA----TAC-A--C
gi|19                         :                 GCGGATTTAA------G------GGGGG-AG-------CACCT-T---TC-GC---CCCTCC-CC----------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGGA-A---------------------------------------------TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-T-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCgtattgtattcactgattgaaaatatcatttgaaa
gi|2                          :               tgGCGG-TTTAA------GTGGGGAGGGGG-GGGGGGGGG------G---GC-GC---CCCCCC-CT-C--------T-T--A-----AAAA-TT-T--A---CC-----GAGTGTA-A--TA------TGA-TGAATGA-----TT----------A--TTTGTT-T--TCA-CGTGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TTC-AATCACGGG---CG---------G-CCCCT-----CTT-AA--TTGTATAAGA-TTATATG-C-AGTTGA
gi|20                         :                                                                                 gtg--------C-T--A-----AGA--AT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------TGA-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-AGG--ATAA----A-AAT----TTA-------A-T-A-AAAT--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----Catatcttttgatttattgttgtgtttctgagca
gi|21                         :                       gggggggggcg------GGGGG-GGGGGGGCG-ACCC---------------------C-C--------C-T--A-----AAA--GT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AGT-------TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-T-------A-T-A-AA-T--
gi|22                         :                                                                                                             T-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TTTTTTTTTCATA--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAA-AG---CGC--------C-CCCCT-----CTT-aaactcttctgaga
gi|24                         :                                  ------GGGGG-GGGGGGGTGAACCC-A---GC-GC---CCCTAC-GC-C--------G-T--A-----AAA--TT-TTCAAATCC-----AAG-GTA-A--AA------C-A-T-GGT-C-----Tctg
gi|25                         :                          A------G------GGGGG-GGGGGGGCACA------------T---TCCCCC-CC-T--------T-T--AT----AAG--TT-T--A---Ccttgtttagaga
gi|26                         :             aaggGCAGATTTGG------G------GAGGGTGGGGGGGCTC----------C-GC---CCTTCC-CC-TTTTCGTGAT-T--A-----AAATTTT-T--A---TC-----AGGTGTA-ttttttttctggcaaataaatcacaatttaga
gi|27                         :            catagGTGGATTTAA--------------------GGGGGGCGCA-----------------CCCCC-CC-C--------C-T--A-----ACA---T-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------C-A-T-TAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--G----A-ga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                        ---CG---------C-CCCCT-----CT--AATTTTGCA-AAGA-TTAT-TATC-AGTTGA
gi|3                          :                 GCGG-TTTAA------GTGGGGAGGGGG-GGGGGGGGG------G---GC-GC---CCCCCC-CT-C--------T-T--A-----AAAA-TT-T--A---CC-----GAGTGTA-A--TA------TGA-TGAATGA-----TT----------A--TTTGTT-T--TCA-CGTGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TTC-AATCACGGG---CG---------G-CCCCT-----CTT-AA--TTGTATAAGA-TTATATG-C-AGTTGAatatatttgatttatgttgcttgcttctgagaaaa
gi|30                         :                                                                       gtgCCCCC-CC-C--------C-T--A-----AAA--CT-T--A---TT-----AAGTGTA-A--TA------T-------T-T-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG-----A----A-AAT----T-A-------atatcttttgatttattgttgtgtttctgagca
gi|31                         :                           gtgcggattttattgggG-GGGGGGGGGCACCC-G---GC-AC---ACACAC-AC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----CT----------
gi|34                         :                                                                                                                                                                                     -T--TCA-C-TGGA-A--A----A-AAT----T-A-------A-TAA-AA-T--TAC-A--CATGGG---CG---------C-CCCC
gi|35                         :                aGCGAATTTAA------A------GGGGG-GGGGGGG---ATCC-G---GC-G-----CGCGC-CC-C--------C-T--A-----AAT--TT-T--cacccccctc
gi|36                         :              gtgGCGGATTTAG------A------GGGGG-GGAGGGGGG------G---GC-GC---TCCCTC-CC-c
gi|37                         :        aactcagtgGCGGATTTAG------A------GGGGG-GGGGGGGGTCA--G-G---GC-AC---CCCCCC-
gi|39                         :                                                                                                                                            cagtg-A-T-AAT-C-----CT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-TAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAT-A--CA
gi|4                          :                  CAGATTTAA------G------GGGGG-AGGGGGG-G------G---GC-AC---CCCCCC-CG-C--------C-C--A-----AAT--TT-T--A---CT-----AAGT-TA-T--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TGC-A--CAC---------------------TCTGAGAATTT-AATTT-GTA-AAGAATTATATATC-AGTTGAag
gi|5                          :                                                                          gtCCC-CC-C--------T-T--AT----AAA--TT-A--A---CC-----AAGTGTA-A--TA------T-AAT-GATTC-----TT----------AATT---TT-T--TC--C-TGG--A--A----ACAAT----T-A-------A-G-A-TA-T---A--A--CAC-GG---CG---------C-CCC-T-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATCAAGTTGAgtttattttcttaacgatgtaaattcaaaag
gi|6                          : ggcggtttaaggggcgGCGGATTTAA------G------GGAGG-GGGGGGGCGCACCC-G---GC-GC---CCCCCT-CC-C--------C-T--A-----AAA--TT-T--A---CA-----AAGTGTA-A--TA------T-A-T-AAT-C-----TT----------A--T---TT-T--TCA-C-TGG--A--A----A-AAT----T-A-------A-T-A-AA-T--TAC-A--CAC-GG---CG---------C-CCCCT-----CTT-AATTTTGTA-AAGA-TTATATATC-AGTTGAatatctttgatcatgtgcttttcttggaaaa
gi|8                          :                 GCCGATTTAA------A------GGGCT-GGGGCGTCGCACCC-GC--GC-G-------CAC-CC-C--------C-T--A-----AAA---T-T--A---CC-----AAGTGTC-A--TATT----T-A-T-AA--G-----TT----------A--T---TT-TTCTCA-C-TGG-----A----A-AAT----T---------A-T-G-AA-----AC-A--CAC-GGCCCCC---------C-CCCCT-----CTTAAATTTTG-A-AAAA-TT-TAT
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): AGAATATTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|9 ): ATTATTCCAATTCAAAACTTCAAATTGCTCAATTTTTATTGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|23 ): GGATACTTAACTACATACATGTATAAACTTAAATATAATCACGTGCAGTGGCGGATTTAGAGGGGGGGGGGGCAGGGGGCCC
Unaligned ( gi|29 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCGCATGAGAATATGAATCATTCACAATT
Unaligned ( gi|32 ): ATTTTAAGAATTCTGAAATATGTACACATAAATGCATGTATACAGTCAGTGGTCAGT
Unaligned ( gi|33 ): CACGCTAAAATTTCCAAACACAAGGTAAAGCATTGGCCCTTGTTTATAAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCAGTGGCGGATTTAGAGGGGGGGGCGGCAGGGGGCCCCGGGC