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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                            --ATG-CTGTATGCCCAT--GC---ATCAG--TT--------GTTTAGTTCTT-ATATATGTA--AAATTGA-TGTGGGGGACATT-ATA-AA-T---AATGTCTGT---GGCGGG--A--C-TCG-GGA-GTCA-GTC-GCGG-CAG-------GTT-ATGA-TTTT-TTCGG-CCCC-A-A--A-at
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                             ttgggcatcataccatattttcgtatttctgtgttttgcatgtcctaaatcacctttgttacattgttcctaagcacA--AAATGTG-TGTAGGGGC-ATTATGA-A--T---AATGT---C---TGCGGGGGA--C-T-A-GGAAGTCC-GTC-GCGG-CAGGTTACATGTT-ATGA-CTTT-TTATG-CCTC-AGA--A-C-C---T----------TGTCTCCTTC--agtagttgaaagttttgttttccc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                  gtttcataatggtagtgctacacagtcatgcatatacatgtatcaataaaccaccttatagtacttattaagtcaaAATCTACTGAGAGTGACATT-ATA-AAAT---AATGTCG-T---GGCGGGC-A--C-TAG-GGA-GTCAAGTCCGCGA-A------------------CTTG-TTCTG-CCCC-C-ATTA-TTC---GGC-CCCAGGTTGTCTCCTACAAT-ATCATTG-CC-ATT--AGGTGAATATGCAAGAGGCTGTGT--ATCAA--A-TCTAC---TTGTTGTGT--ACTGTA-TAGGC---T-A-----AAAAG----C-CT-AAAAAGT-AGT--T-TG-G-AAGTC-TTGTTT-T-------
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              agttcttA-A--T---AATGT---TTGTGACAGG--A--CAT-G-GGA-GTCG-GTC-GCGG-AAG-------GTT-ATGATTTTT-TTCTG-TTCCAA-A--A-T-C---TG--T------TGTATCGTCC--C-ACC--TG-C----C--A-------------------------ATCA-----TATAT---G-GTTGTGT--ATTGTG-AAGAC---TAA-----AAAG-------CA-AA----A-AGTAGT-TA-A-AAGTG-TTGTTT-T-------TG-CAAGT-GTAG--TCCACCCA-GCGT-CACAAAA---AC----TGGG---GC-----CACAT--C----TAC--TTTCC----AA---C---AAAGGAGCGGGAT-GT-TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --A--C-T-G-GGG-AGCC-GTA-GCGG-CAG-------GTG-ATGA-TTTT-TTCTG-CCCC-A-A--A--------AC-C------TGTCTCCTCC--C-ACC--TGCC--AGT--AAG----------GCAGGGTGTGTGTATCGT--A-TACAG---T-TTTT-GT--ATGGTGATGG-C---T-A-----AAAGCCAAAT-C--AA----TCAGTA-G-TGTA-AAGTG-TTGTTT-G-------TT-CAAGT-G-GGGTT-CA--CA-GTGT-CAC-ACGC--GC----TGGG---GC-----CACAT--C----CAC--GGCCC---AGA---T---AAG-GGTCGGGAT-GC-TACAGG-CTGG-TGCATGCTTC-AGGC-GATG--GTACGG-CGGTACT-ACTCA-TT---TTTA-C--C--TGTA-CATG-CTCTCT-AAA-CCAGGTA-GCACTTAGG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gttgtctaaatttctctttttatagc-GGA-GTC--GTA-GCGG-CAG-------GGG-ATGA-TTTT-TTCTG-CCCCAA-A--A-C-C---TG---------TGTCTCCTCC--C-CCC--TGCC--AGC--AAGGC--------AGGGGGTGTG--TATCGT--A-TACAG---T-TTTT-GT--ATGGTGATGG-T---T-A-----AAAGC----CACTCAG----C-AGTG-T----A-AAGTG-TTGTTT-G-------TT-CAAGT-G-GGGTT-CA--CA-ATGT-CAC-Aa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -GCAG-GGG-------GT-----A-CTTTCTTCTGGCCCC-A-A--AAC-C---TG----------GTCTCCTCC----AC---TG-CC-ATTT-AAG----------GCAGGGTGTGT-TGGTAT--TGTATACAGGT-TTTT-GT--ATGGTA-TGG-C---T-A-----AA-GC---------AA----TCAGTG-G-TGTACAAGTG-TCGTTTGT-------TT-CAAGT-G-GGGTTC-A--CA-GTGTACTC-AAGCGCGTGGGGT------GC-----C-TA---CACTCCAC--AGGCC---CAA---CTCAG---GGTTGAGATTGC-TACTGT-CTGGT-GCATGCTTCAGCGC-GATG--GTGAGGGCGGCACTTACTTCATC---CTTG-C--CGCTGTC-CATG-CTCTCT-AAA-CCAGGTA-GCACTT-AGGAGAT-----GGCGA----GCAGAcgcgctggcnctcagcagtgtaaagtgttgtttgttcaagtagggttcacaatgtcacacgcgctggggccaaatccacggcccaaataagggtcggaatgctataggctggtgcatgcttcaggcgatggtagggcggtactactcatttgacctgtacatgctctctaaaccaggtag
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taaaaatttgtcttgggggagggagagttgttctgtgtggcaaaactagtgcctgaacgagtaggctgGTA-TAGGC---T-A-----AAAGC------CT-AA----A-AGTAGT-TG-G-ACGTA-TTGTTT-T-------CC-CAAGT-G-GGagggcaggt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GC----C-CC-AA----A-AGTAGT-TG-A-AAGTT-TTGTTT-T-------CC-Cg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttgggcatcataccatattttcgtatttctgtgttttgcatgtcctaaatcacctttgttacattgttcctaagcacatgctgtatgcccatgcatcagttgtttagttcttatatatgtaaaattgatgtgggggacattataaataatgtctgtggcgggactcgggagtcagtcgcggcaggttatgattttttcgGC----N-CTCAG----C-AGTG-T----A-AAGTG-TTGTTT-G-------TT-CAAGTAG-GGTT--CA--CA-ATGT-CAC-ACG---------C------GCTGGGGC-CAAATC----CAC--GGCCC---AAA---T---AAG-GGTCGGAAT-GC-TATAGG-CTGGT-GCATGCTTC-AGGC-GATG--GTAGGGC-GGTACT-ACTC--AT---TTGA-C--C--TGTA-CATG-CTCTCT-AAA-CCAGGT--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggagtcgtagcggcaggggatgattttttctgccccaaaacctgtgtctcctcccccctgccagcaaggcagggggtgtgtatcgtatacagtttttgtatggtgatggttaaaagccactcagcagtgtaaagtgttgtttgttcaagtggggttcacaatgtcacacgcgctg-AG----T-AG-A-T-GA-A-AAGTGGTTGTTT-T-------TGGCAA-T-G-GGT--CCA--CG-TTA---AC-GAG---AC----CTGGGGGGC-----A-CAT--C----CAC--GTCCCAACTAACGGT---AAG-GGGCGGGAT-GCTTACAGT-CTGGTGCCATGCGTC-AGGCTAA-G--GTAGGG-CGGCACT-A--C--TT---TTTG-CCGC--TGTC-C--G-CTTTTC--AA-CCAGGTA-GCACTT-AGGAGAC----GGGC-ag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-------CC-CAAGT-G-GGGT-CCA--CA-GCTT-CAC-A-G---AC----TTAA---GG-----C-CA---CA---TATA-CTTCC---TAA---TTAAG---GGTCGGGAT-GC-TACAGG-CTGG-TACATTTTTC-AGGCTAA-G--TTAGGG-TGGTGCC-ACTC--T
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gattaagaactaaacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---C----CAC---TTCC---GAAC--T---AAG-GGTCGGTAT-GG-TACAGG-CTAAT-GCATGCTTC-AGTA-AA-G--GTAATGC-GCCACT-ACTA---A---TTTG-CT-C--TGTC-CGTG-CTCCCC-AAT-CCATGTA-GCAa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctggggccacat---TAA-------A---GGTCGGGATTGC-TACAGT-CTTGTTACATGCGTC-AGGCTAA-G--GCAGTGC--GCACT-ACTT--CT---TTTGCC--C--TGTC-CATGACTTTTCAAAA-CCAGTTTAGCACTGTAGGAGAC----
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gatctgggccacatccactcctttaactaccgg---A---AGTCGGGA--GC-TACAGT-CTGGT-ACATGCGTC-AGCT-AA-G--GCAGGGC-GGCACT-ACTC--T----TTTGCC--C--TGTC-CATG-CTTTTC-AAA-CCAGTTA-GCACTT-AGGAGAC----GGGC-ttggcgagaaggg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gatctggggccacatccacgtcctaactaccggtaGTTGGGAT-GC-TACAGG-CTGG-TGCATGCTTCG-GGCAAA-G--GTAGGA-CGGCACT-ACTC--gagaaggcaggtcta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GT--GTA-TTGTGAAGACTAAAAAGC-AAAAAGTAG-TT-AAAAGTG-TTGTTT-TTG-CAAGT--GT---AG-TCC-ACCCAGCG--T-CA---CAAA-AACTGGGG-C-C--ACA-TCTAC-TTTCC--AAC--A----AAGGAGCGGGAT-GTTa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aataatgtttgtgacaggacatgggagtcggtcgcggaaggttatgatttttttctgttccaaaatctgttgtatcgtcccacctgccaatcatatatggttC-A----GTAG-TG-TAAAGTG-TTGTTTGTT--CAAGT--G----GGGTTC-ACAGT--G--T-CACA-CGCG---CTGGGG-C-C--ACA-TCCAC-GGCCC--A------GATAAGGGTCGGGAT-GCT-ACAGGCTGGTGC-ATGC-TTCAG-GCG-ATGGT-ACGG--CGGT---ACT-A-CTCATT-T----TTA--CC--TGTA---CAT-GCT-CTCTA---AA-CCAG-GTAGCACT-TAGGAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gttgtctaaatttctctttttatagcactggggagccgtagcggcaggtgatgattttttctgccccaaaacctgtctcctcccacctgccagtaaggcagggtgtgtgtatcgtatacagtttttgtatggtgatggctaaaagccaaatcaatC-A----GCAG-TG-TAAAGTG-TTATTTGTT--TAA-TTGG----GG-TTA-ACA----G--TGTC-A-CAAG-CGCTAGGGCGGCCCACA-TCCAC-GGCTC--AA------ATAAGGGTCGGGAT-GCT--CAGTCTGGTGC-ATGC-TTCAG-GCG-ATGGT-AGGG--CGGC---ACT-A-CT---CAT----TTG--AC-CTGTC---CAT-GCTCTC-TA---AA-CCAG-GGAGCACT-TACGAGA---CAGGCGAGAA-GG
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taaaaatttgtcttgggggagggagagttgttctgtgtggcaaaactagtgcctgaacgagtaggctggcagggggtactttcttctggccccaaaacctggtctcctccactgccatttaaggcagggtgtgttggtattgtatacaggtttttgtatggtatggctaaagcaatC-A----GCAG-TG-TAAAGTG-TTGTTTGTT--CAAGTA-G----GG-TTC-ACAAT--G--T-CACA-CGCG---CTGGGG-C-C--AAA-TCCAC-GGCCC--AA------ATAAGGGTCGGAAT-GCT-ATAGGCTGGTGC-ATGC-TTCAG-GCG-ATGGT-AGGG--CGGT---ACT-A-CT---CAT----TTG--AC-CTGTA---CAT-GCTCTC-TA---AA-CCAG-GTAGt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggagtcgtagcggcaggggatgattttttctgccccaaaacctgtgtctcctcccccctgccagcaaggcagggggtgtgtatcgtatacagtttttgtatggtgatggttaaaagccactcagcagtgtaaagtgttgtttgttcaagtggggttcacaatgtcacacgcgctggcnct-A----GTAGATG-AAAAGTGGTTGTTT-TTGGCAA-T--G----GG-TCC-AC-----G--T-TA-A-CGAG-ACCTGGGG-GGC--ACA-TCCAC-GTCCC--AACTAACGGTAAGGGGCGGGAT-GCTTACAGTCTGGTGCCATGC-GTCAG-GCT-AAGGT-AGGG--CGGC---ACT-A-CT---T-T----TTG--CCGCTGTC---C---GCT-TT-TC---AA-CCAG-GTAGCACT-TAGGAGA---CGGGC-
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --G----GG-TCC-AC-----AGCT-TC-A-C-AG-ACTTAAGG-C-C--ACA-TATAC-TTCCT--AATTAA------GGGTCGGGAT-GCT-ACAGGCTGGTAC-ATTT-TTCAG-GCT-AAGTT-AGGG--TGGT---GCC-A-CT---C-T----
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gattaagaactaaacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccaagtgG-ATCTGGGG-C-C--ACA-TCCAC-GTCCT--AACTACCGGTAAAGT-CGGGA--GCT-ACAGTCTGGTAC-ATGC-GTCAG--CT-AAGGC-AGGG--CGGC---ACT-A-CTC--T-T----TTG--CC-CTGTC---CAT-GCT-TT-TCA--AA-CCAG-TTAGCACT-TAGGAGA---CGGGCGAGAA-GGCAGGa
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGG-GCC--ACA-TCCAC-TTCCG--AAC------TAAGGGTCGGTAT-G-GTACAGGCTAATG-CATGC-TTCAG---TAAAGGT-AATG--CGCC---ACT-A-CTA--A-T----TTG--CT-CTGTC---CGT-GCT-CC-CC---AATCCAT-GTAGCAttggcgagaaggg
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): AGTGTGAAATACAGTTTGGGCCCACTGCTACACCTGGTGTCACATCCACTTCTTAACCAATGAGGGGAATACTACTGAGTGGTACATGTTCAAGCAACTGTAGTGCTTTAAGTGCTTGCCCTGTACATGCCCCTCTAACTATGGA






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Reference ( family-3342 )     :                     GCTGTGCATATTTTC-GT-T--TTCTGTGTTTGGGCA-TGTCCTAAATCACCTTTGTT--ACATTGT--TCCAA-----TTG-CCCTTG--TTTT--T----CCTA-GCGCT--GGT----CGCAACTGTA-TATCTANTG---TATG-CTGTATGCTCAC--G-CAT-CAGCT-------TT----G-TT-AG---TTTTTCTT-A-TATATGT---AAAATTTA-TGTGGGGGNCATTNT-AA---TAATGTCTGTGGCGGG-A--C-T-G-GGAGTCC-GTC-GCGGCA-G-------GTT-ATGACTTT-TT-CTG-CCCC-A-A--A-C-C---TGC-C------TGTCTCCTCC--C-ACC--TGCCATT--AGG----------AGGGGGTGT-GT-TATCGTA-TACAN-TNTT--TGTATGGTG--AT-GGC------TAAAA-GCC---CTAATCAGTA--T-TG-A-AAGTGTTGTTT-TT-------CCAAGTGGGGTTC-CACA-GCGT-CACAAGCGC-TNGGG----CCACA-TCCACNT-CCCNAA-TAAGGGTCGGGAT-GCTA-CAGGCTGGT-GCA-TGCTTC-AG-GC--GA-GGTAGGGCCGGCACT-ACTC--T-TTTTGC-C--TGTC-CATGCTCTCCAAA-CCAGGTAGCACTTAGG-AGACGGGCAGTAGATGNAAAGTG-TTGTTTGTTGCAAGTG----GGTCCACAG-TCAACGAGACCTGGGGC-CACATCCACG-TCCC--AACT-A-C-GGTAAGGGTCGGGAT-GC-T-ACAGNCTGGTGCCATGCT-TCAGGC-NAAGGTAGG--GCGGC---ACT-ACT--TTTTG--CC-CTGTC-CATG-CTTTT---NAA-CCAG-GTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGCG-AGAAGGCGGGC
gi|1                          :                          GCATATTTTCAGT-T--TTCTGTGTTTGGTCAATGTCCTAAATCACCTTTGTTTTACATTGT--T---------------------------T----CCTA-ACGCT--GGT----CGCA-CTGTAGCACTTA-TG---TATGTCTGTATGCTCAA--G-CAT-CAGCT-------TT----A-TA-GG---TAGTTCTT-AATATATGT---AAAATTTA--GTGGGGG-CATAG---A---TAATGTATGTGGCGGG-AAAT-G-G-GGAGTCC-GTC-GCGGGAAG-------GTT-ATGACTTT-T--CTG-CCCC-A-A--A-AACAAATGCTC------TGTCTCCTCC--CCACC--TGCCATTTAAGGC---------AGGGGTTGT-GT-TATCATAATACTT-TGTTAGTGTATTGTGTAGC-AGC------TAAAA-AGC---CTAATCAGTA--CGTG-A-GAGTGTTGTTT-TTTTTCGCCCTAAGTGGAGGTC-GACACGCTTGCACAAG-AT-TTGGG----CCACA-TCCAGTT-TCTTAACTAAGGG-CGGGAT-GCTATCAGACTGGT-GAACTGCTTG-AG-GCAAGA-GGTAGGGT-GGCAC---CTC--AATTTTGC-CC-TGTGGCATGCTCTTCAAAACCAGATAGCACTTGGGGAGACAGGCTATAGATG-AAAGTG-TTGTTT-TCGCAAGTGAGAAGGTCC-CAGATCTACAAGATCTGGGGC-CACA-CCACGTTCCT--AACT-A-C-CGTAAGGGGCGGGAT-GC-T-ACAG-CTGGTGTCATGCCGTCAGACTTAAGGTAGGGAGCGACTTTACTAACTC-TTTTGAACC-CT-TCACATG-CCTTTTGCAAA-CCAG-GTAGCACT-CAGGAGAC-GAGGCGAAGAAGG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                               gaAATCTACTGAGAGTGACATTAT-AAAA-TAATGTC-GTGGCGGGCA--C-TAG-GGAGTCAAGTCCGCGA------------------ACTTG-TT-CTG-CCCC-C-ATTA-TTC---GGC-CCCAGGTTGTCTCCTACAAT-ATCATTGCCATT--AGGTGAATATGCAAGAGGCTGT-GT--ATCAAA-TCTAC-TTGT--TGTGTACTGT-ATAGGC------TAAAA-AGC---CTAAAAAGTAGTT-TG-G-AAGTCTTGTTT-Tgcagac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agttcttAGTAGATGAAAAGTGGTTGTTTTTGGCAA-TG----GGTCCAC-G-TTAACGAGACCTGGGGGGCACATCCACG-TCCC--AACT-AAC-GGTAAGGGGCGGGAT-GC-TTACAGTCTGGTGCCATGCG-TCAGGC-TAAGGTAGG--GCGGC---ACT-ACT--TTTTG--CCGCTGTC-C--G-CTTTT---CAA-CCAG-GTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                               CTT-A-T-TAAGTCAAAAAATGTG-TGTAGGGG-CATTATGAA---TAATGTCTGCGG-GGG-A--C-TAG-GAAGTCC-GTC-GCGGCA-GGTTACATGTT-ATGACTTT-TT-ATG-CCTC-AGA--A-C-C---T----------TGTCTCCTTC--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtttcataatggtagtgctacacagtcatgcatatacatgtatcaataaaccaccttatagta-TC-------CCAAGTGGGGT-C-CACA-GCTT-CACAGAC-T-TAAGG----CCACA-TATACTT-CCTAAT-TAAGGGTCGGGAT-GCTA-CAGGCTGGT-ACA-TTTTTC-AG-GCT-AA-GTTAGGG-TGGTGCC-ACTC--T-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gattaagaactaaacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATCTGGG-C-CACATCCAC--TCCTTTAACT-A-CCGGTAAAGGTCGGGATTGC-T-ACAGTCTTGTTACATGCG-TCAGGC-TAAGGCAGT--GC-GC---ACT-ACTTCTTTTG--CC-CTGTC-CATGACTTTTCA-AAA-CCAGTTTAGCACTGTAGGAGACTT-GGCG-AGAAGGa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GATCTGGGGC-CACATCCACG-TCCT--AACT-A-CCGGTAAAG-TCGGGA--GC-T-ACAGTCTGGTAC-ATGCG-TCAG-C-TAAGGCAGG--GCGGC---ACT-ACTC-TTTTG--CC-CTGTC-CATG-CTTTT---CAAACCAG-TTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGCG-AGAAGGCAGGg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TG----GGCCCACTG--CTAC---ACCTGGTGT-CACATCCACT-TCTT--AAC----C-AATGAGG---GGAAT-AC-T-ACTGAGTGGTA-CATG-T-TCAAGC-AACTGTAGT--GCTTT---A---AGT--GCTTG--CC-CTGTA-CATG-Ctcta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtgtgaaatacagttC-TGGGG----CCACA-TCCACTT-CCGAAC-TAAGGGTCGGTAT-GGTA-CAGGCTAAT-GCA-TGCTTC-AG-TA--AA-GGTAATG-CGCCACT-ACTA----ATTTGCTC--TGTC-CGTGCTCCCCAAT-CCATGTAGCAccctctaactatgga
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GATCT-GGGGCCACATCCACG-TCCT--AACT-ACCGGTAAAG-TCGGGA--GC-TACAGTCTGGTAC-ATG-CGTCAG-C-TAAGGCAGG--GCGGC---ACT-ACTC-TTTTG--CC-CTGTC-CATG-CTTTTC---AAACCAG-TTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGCG-AGAA-GGCAGGg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TG----GGCCC-ACTGCTAC---ACCT-GGTGTCACATCCACT-TCTT--AAC---C-AATGAGG---GGAAT-AC-TACTGAGTGGTA-CATG-T-TCAAGC-AACTGTAGT--GCTTT---A---AGT--GCTTG--CC-CTGTA-CATG-CCCCTCT--AA-CTAtcta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtgtgaaatacagttC-TGGGG----CCACA-TCCA-CTT-CCGAACTAAGGGTCGGTAT-GGTA-CAGGCTAA-TGCA-TGCTTC-A--GT--AAAGGT-AATG-CGCCACT-ACT-A-A--T-TTGCTC--TGTC-CGTGCTCCCCAAT-CCATGTAGCAtgga
gi|18                         :                                                                                                     -CCCTTG--TTTT--T----C-TG-GTGCT--GGT----CGCA-CTGTA-TATCTAATGGTACATG-CTGTATGCTCAC--G-CAT-CAGCT-------TT----A-T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTTGGGAT-GCTA-CAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-GG-GC--AAAGGT-AGGA-CGGCACT-ACT-C-
gi|2                          :                     GCTGTGCATATTTTC-GT-T--TTCTGTGTTTTGGCA-TGTTCTAA-TCACCTTTGTTACATTGTCTTCTAAGCTCATTG-CCCTTG--TTTT--TTTATCCTG-GTGCT--GGT----CGCAATTGTA-TATCTACTGGTA--TG-CTGTAT-CTCATAGG-CAT-CAGCC-------TTCATCG-GC-AG---TTTTTCTTCA-TATAT-T---AAAATTTA-TGTGGG-GG-CCATT-TT-AA--TAATGT---TGGCGGG-A--C-T-G-GGAGTCC-GTC-GCGGAA-G-------GTT-ATGACTTT-TT-CTG-CCCCA-A--A-C-C---TGC-C------TGTCTCCTCC--C-ACC--TG-CATT--AGG----------AGGGGGTGT-GT-TATCATT-TCTAC-TGTT--GGCATTGTG---T-AGC------TAAAA-GCT---CTAAT-AGTA--T-TGAAAGTGTTGTTT-TC-------CCAAGTGGGTTTC-CACA-GCAT-CACAAG-AT-T---G----CC-CA--CCA-CCT-TCCTAATA--GGTCGGGAT-GCTA-CCGGCTGGTTGTA-TTTTTCGAG-GC--AA-GGT-AGGGTTGGCACT-ACT-C-T-CT-TTGC-C--TGTA-CATGCTCTTCAAA-CCAGGT-GCACTTGGGGAGACAGGCAGTAGATGAAAAGTGGTTGTTTTTGGCAA-TG----GGTCC-ACGTTAACGAGACCTGGGGGGCACATCCACG-TCCC--AACTAAC-GGTAAGGGGCGGGAT-GCTTACAGTCTGGTGCCATG-CGTCAGGC-TAAGGTAGG--GCGGC---ACT-ACT--TTTTG--CCGCTGTC-C--G-CTTTTC---AA-CCAG-GTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGC--CGAA-GGCAGGCa
gi|20                         :                                         --TTTTGTGTTTGGCC--TGTCCTAAATCACCTTTGTTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gttgcgcatcataccatag-GGC------TAAAA-GCC---TAAA--AGTAG-T-TGGACGTATTGTTT-TC-------CCAAGTGGGG
gi|3                          :                gtataGCTGTACATAGTTTG-AT-CCATTCT-TGTGTGGATA-TG-----AA-CGT-TTTGCTACAT--------------ATTGACCTTTGATTTTTGGT----CCCATGTGCTTCGGTGTTACG-AATTGT--TGTC-AGCGTTT--T---TATATGCTCAT--GACATATACCTAATCCCCTC----GTTT-AGTATTTTTTCGT-G-TCT-TAT---AAAATTTG-TGCGGG-GG-T-ATTAAT-TC--TAGTGTCTGTGGCGGG-A--C-T-GAGGAG-CC-GTA-GCGGC--G-------GTTGATGATTTT-TT-CTG-CTCCA-A--ATC-C---TG---------TGTCCCCTTC--C-ACC--TGCCAGCA-AGG----------CAGGGGTGT-G--TATCGTA-TACAG-TATT--TGTATGGAG--AT-GGCTACATATAAAA-ATC-----AATCAGCAG-T-GTAAAGTGTTATTT-GT-------TTAATTGGGGTT--AACA-GTGT-CACAAGCGC-TAGGGCGGCCCACA-TCCA-CGG-CTCAAATAAGGGTCGGGAT-GCT--CAGTCTGG-TGCA-TGCTTC-AG-GC--GATGGT-AGGG-CGGCACT-ACT-C-A-TT-TGAC-C--TGTC-CATGCTCTCTAAA-CCAGGGAGCACTTA-CGAGACAGGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                         cactagcaaacctgctgatgttgagtaatcaccccaagtcaccatttgggtttaagagcatcacacttttaatcaacagcctccgtggctttactgttttattcttctGGCA-G-------GGG-GT-ACTTTCTT-CTGGCCCCA-A--AAC-C---TG----------GTCTCCTCC----AC---TGCCATTTAAGGC---------AGGGTGTGTTGG-TATTGTA-TACAGGTTTT--TGTATGGT---AT-GGC------TAAA--GC------AATCAGTGG-TGTACAAGTGTCGTTTGTT-------TCAAGTGGGGTTC--ACA-GTGTACTCAAGCGCGTGGGGTGC-CTACACTCCA-CAGGCCCAACTCAGGGTTGAGATTGCTA-CTGTCTGG-TGCA-TGCTTC-AGCGC--GATGGTGAGGG-CGGCACTTACTTC-A-TCCTTGC-CGCTGTC-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGCACTTA-GGAGATGGCGAGCAGAgagaaggg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                   taaaaatttgtcttgggggagggagagttgttctgtgtggcaaaactagtgcctgaacgagtaggct-GGAGTC--GTA-GCGGCA-G-------GGG-ATGATTTT-TT-CTG-CCCCA-A--AAC-C---TG---------TGTCTCCTCC--C-CCC--TGCCAGC--AAGGC--------AGGGGGTGT-GT--ATCGTA-TACAG-TTTT--TGTATGGTG--AT-GGT------TAAAA-GCC-----ACTCAGCAG-T-GTAAAGTGTTGTTT-GT-------TCAAGTGGGGTT--CACA-ATGT-CACACGCGC-TGGagggcaggt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCAGCAG-T-GTAAAGTGTTGTTT-GT-------TCAAGTAGGGTTC--ACA-ATGT-CACACGCGC-TGGGG----CCAAA-TCCA-CGG-CCCAAATAAGGGTCGGAAT-GCTA-TAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-AG-GC--GATGGT-AGGG-CGGTACT-ACT-C-A-TT-TGAC-C--TGTA-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGcnctcagcagtgtaaagtgttgtttgttcaagtagggttcacaatgtcacacgcgctggggccaaatccacggcccaaataagggtcggaatgctataggctggtgcatgcttcaggcgatggtagggcggtactactcatttgacctgtacatgctctctaaaccaggtag
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gi|8                          : gttgtctaaatttctctttttatagcCATATTTTC-GTAT--TTCTGTGTTTTG-CA-TGTCCTAAATCACCTTTGTTACATTGT--TC------Ca
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                             CTT-A-T-TAAGTCAAAAAATGTG-TGTAGG-GG-C-ATT-ATGAA--TAATGTCTGCGG-GGG-A--C-TAG-GAAGTCC-GTC-GCGGCA-GGTTACATGTT-ATGACTTT-TT-ATG-CCTCAGA--A-C-C---T----------TGTCTCCTTC--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtttcataatggtagtgctacacagtcatgcatatacatgtatcaataaaccaccttatagta-TC-------CCAAGTGGGGT-C-CACA-GCTT-CACAGAC-T-TAAGG----CCACA-TATA-CTT-CCTAATTAAGGGTCGGGAT-GCTA-CAGGCTGG-TACA-TTTTTC-AG-GCTAA-GTT-AGGG-T----GGTGCC-ACT-C
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gattaagaactaaacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATCT-GGG-CCACATCCAC--TCCTTTAACT-ACCGGTAAAGGTCGGGATTGC-TACAGTCTTGTTACATG-CGTCAGGC-TAAGGCAGT--GC-GC---ACT-ACTTCTTTTG--CC-CTGTC-CATGACTTTTCAA-AACCAGTTTAGCACTGTAGGAGACTT-GGCG-AGAA-GGta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATCT-GGGGCCACATCCACG-TCCT--AACT-ACCGGTAAAGT-CGGGA--GC-TACAGTCTGGTAC-ATG-CGTCAG-C-TAAGGCAGG--GCGGC---ACT-AC-TCTTTTG--CC-CTGTC-CATG-CTTTTCA--AACCAG-TTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGCG-AGAA-GGCAGGg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-TGGTG----TCACA-TCCA-CTT-CTTAACCAATGAGGGGAAT-ACTA-CTGAGTGG-TACA-TG-TTC-AA-GCAAC-TGT-AGTG-CTTTAAGTGC------------TTGCC-C--TGTA-CATGCCCCTCTAA-CTAtcta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtgtgaaatacagtttgggcccactgctacacC-TGGGG----CCACA-TCCA-CTT-CCGAACTAAGGGTCGGTAT-GGTA-CAGGCTAA-TGCA-TGCTTC-A--GTAAA-GGT-AATG-C----GCCACT-ACT-AA--T-TTG-CTC--TGTC-CGTGCTCCCCAAT-CCATGTAGCAtgga
gi|18                         :                                                                                                     -CCCTTG--TTTT--T----C-TG-GTGCT--GGT----CGCA-CTGTA-TATCTAATGGTACATG-CTGTATGCTCAC--G-CAT-CAGCT-------TT----A-T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTTGGGAT-GCTA-CAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-GG-GCAAA-GGT-AGGA-C----GGCACT-ACT-CA-
gi|2                          :                     GCTGTGCATATTTTC-GT-T--TTCTGTGTTTTGGCA-TGTTCTAA-TCACCTTTGTTACATTGTCTTCTAAGCTCATTG-CCCTTG--TTTT--TTTATCCTG-GTGCT--GGT----CGCAATTGTA-TATCTACTGGTA--TG-CTGTAT-CTCATAGG-CAT-CAGCC-------TTCATCG-GC-AG---TTTTTCTTCA-TATAT-T---AAAATTTA-TGTGGG-GG-CCATT-TT-AA--TAATGT---TGGCGGG-A--C-T-G-GGAGTCC-GTC-GCGGAA-G-------GTT-ATGACTTT-TT-CTG-CCCCA-A--A-C-C---TGC-C------TGTCTCCTCC--C-ACC--TG-CATT--AGG----------AGGGGGTGT-GT-TATCATT-TCTAC-TGTT--GGCATTGTG---T-AGCTA-----AAA-GCTC----TAAT-AGTA--T-TGAAAGTGTTGTTT-TC-------CCAAGTGGGTTTC-CACA-GCAT-CACAAG-AT-T---G----CC-CA--CCA-CCT-TCCTAATA--GGTCGGGAT-GCTA-CCGGCTGGTTGTA-TTTTTCGAG-GC-AA-GGT-AGGGTT----GGCACT-ACT-CT-CT-TTG-C-C--TGTA-CATGCTCTTCAAA-CCAGGT-GCACTTGGGGAGACAGGCAGTAGATGAAAAGTGGTTGTTTTTGGCAA-TG----GGTCC-ACGTTAACGAGACCTGGGGGGCACATCCACG-TCCC--AACTAAC-GGTAAGGGGCGGGAT-GCTTACAGTCTGGTGCCATG-CGTCAGGC-TAAGGTAGG--GCGGC---ACT-AC-T-TTTTG--CCGCTGTC-C--G-CTTTTC---AACCAG-GTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGC--CGAA-GGCAGGC
gi|20                         :                                         --TTTTGTGTTTGGCC--TGTCCTAAATCACCTTTGTTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gttgcgcatcataccatag-GGCTA-----AAA-GC-C----TAA-AAGTAG-T-TGGACGTATTGTTT-TC-------CCAAGTGGGG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                         cactagcaaacctgctgatgttgagtaatcaccccaagtcaccatttgggtttaagagcatcacacttttaatcaacagcctccgtggctttactgttttattcttctGGCA-G-------GGG-GT-ACTTTCTT-CTGGCCCCA-A--AAC-C---TG----------GTCTCCTCC----AC---TGCCATTTAAGGC---------AGGGTGTGTTGG-TATTGTA-TACAGGTTTT--TGTATGGT---AT-GGCTA-----AAG---------CAATCAGTGG-TGTACAAGTGTCGTTTGTT-------TCAAGTGGGGTTC--ACA-GTGTACTCAAGCGCGTGGGGTGC-CTACACTCCA-CAGGCCCAACTCAGGGTTGAGATTGCTA-CTGTCTGG-TGCA-TGCTTC-AGCGCGAT-GGTGAGGG-C----GGCACTTACTTCA-TCCTTG-C-CGCTGTC-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGCACTTA-GGAGATGGCGAGCAGAgagaaggg
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gattaagaactaaacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATCTGGG--CCACATCCAC-T-CCTTTAACT-ACCGGTAAAGGTCGGGATTGC-TACAGTCTTGTTACATG-CGTCAGGC-TAAGGCAGT--GC-GC---ACT-ACTTCTTTTG--CC-CTGTC-CATGACTTTT--CAAAACCAGTTTAGCACTGTAGGAGACTT-GGCG-AGAA-GGta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATCTGGGG-CCACATCCACGT-CC--TAACTA-CCGGTAAAGT-CGGGA--GCT-ACAGTCTGGTAC-ATG-CGTCAG-C-TAAGGCAGG--GCGGC---ACT-AC-TCTTTTG--CC-CTGTC-CATG-CTTTT--C-AAACCAG-TTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGCG-AGAA-GGCAGGg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-TGGTG----TCACA-TCCA-CTT-CTTAACCAATGAGGGGAAT-ACTA-CTGAGTGG-TACA-TG-TTC-AA-GCAAC-TGT-AGTG-CTTTAAGTGC------------TTGCC-C--TGTA-CATGCCCCTCTAA-CTAtcta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtgtgaaatacagtttgggcccactgctacacC-TGGGG----CCACA-TCCA-CTT-CCGAACTAAGGGTCGGTAT-GGTA-CAGGCTAA-TGCA-TGCTTC-A--GTAAA-GGT-AATG-C----GCCACT-ACT-AA--T-TTG-CTC--TGTC-CGTGCTCCCCAAT-CCATGTAGCAtgga
gi|18                         :                                                                                                     -CCCTTG--TTTT--T----C-TG-GTGCT--GGT----CGCA-CTGTA-TATCTAATGGTACATG-CTGTATGCTCAC--G-CAT-CAGCT-------TT----A-T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTTGGGAT-GCTA-CAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-GG-GCAAA-GGT-AGGA-C----GGCACT-ACT-CA-
gi|2                          :                     GCTGTGCATATTTTC-GT-T--TTCTGTGTTTTGGCA-TGTTCTAA-TCACCTTTGTTACATTGTCTTCTAAGCTCATTG-CCCTTG--TTTT--TTTATCCTG-GTGCT--GGT----CGCAATTGTA-TATCTACTGGTA--TG-CTGTAT-CTCATAGG-CAT-CAGCC-------TTCATCG-GC-AG---TTTTTCTTCA-TATAT-T---AAAATTTA-TGTGGG-GG-CCATT-TT-AA--TAATGT---TGGCGGG-A--C-T-G-GGAGTCC-GTC-GCGGAA-G-------GTT-ATGACTTT-TT-CTG-CCCCA-A--A-C-C---TGC-C------TGTCTCCTCC--C-ACC--TG-CATT--AGG----------AGGGGGTGT-GT-TATCATT-TCTAC-TGTT--GGCATTGTG---T-AGCTA-----AAA-GCTC----TAAT-AGTA--T-TGAAAGTGTTGTTT-TC-------CCAAGTGGGTTTC-CACA-GCAT-CACAAG-AT-T---G----CC-CA--CCA-CCT-TCCTAATA--GGTCGGGAT-GCTA-CCGGCTGGTTGTA-TTTTTCGAG-GC-AA-GGT-AGGGTT----GGCACT-ACT-CT-CT-TTG-C-C--TGTA-CATGCTCTTCAAA-CCAGGT-GCACTTGGGGAGACAGGCAGTAGATGAAAAGTGGTTGTTTTTGGCAA-TG----GGTCC-ACGTTAACGAGACCTGGGGGGCACATCCACGT-CC--CAACTAA-CGGTAAGGGGCGGGA-TGCTTACAGTCTGGTGCCATG-CGTCAGGC-TAAGGTAGG--GCGGC---ACT-AC-T-TTTTG--CCGCTGTC-C--G-CTTTT--C--AACCAG-GTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGC--CGAA-GGCAGGC
gi|20                         :                                         --TTTTGTGTTTGGCC--TGTCCTAAATCACCTTTGTTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gttgcgcatcataccatag-GGCTA-----AAA-GC-C----TAA-AAGTAG-T-TGGACGTATTGTTT-TC-------CCAAGTGGGG
gi|3                          :                gtataGCTGTACATAGTTTG-AT-CCATTCT-TGTGTGGATA-TG-----AA-CGT-TTTGCTACAT--------------ATTGACCTTTGATTTTTGGT----CCCATGTGCTTCGGTGTTACG-AATTGT--TGTC-AGCGTTT--T---TATATGCTCAT--GACATATACCTAATCCCCTC----GTTT-AGTATTTTTTCGT-G-TCT-TAT---AAAATTTG-TGCGGG-GG-T-ATTAAT-TC--TAGTGTCTGTGGCGGG-A--C-T-GAGGAG-CC-GTA-GCGGC--G-------GTTGATGATTTT-TT-CTG-CTCCA-A--ATC-C---TG---------TGTCCCCTTC--C-ACC--TGCCAGCA-AGG----------CAGGGGTGT-G--TATCGTA-TACAG-TATT--TGTATGGAG--AT-GGCTACATATAAA-AA-T----CAATCAGCAG-T-GTAAAGTGTTATTT-GT-------TTAATTGGGGTT--AACA-GTGT-CACAAGCGC-TAGGGCGGCCCACA-TCCA-CGG-CTCAAATAAGGGTCGGGAT-GCT--CAGTCTGG-TGCA-TGCTTC-AG-GCGAT-GGT-AGGG-C----GGCACT-ACT-CA-TT-TGA-C-C--TGTC-CATGCTCTCTAAA-CCAGGGAGCACTTA-CGAGACAGGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                         cactagcaaacctgctgatgttgagtaatcaccccaagtcaccatttgggtttaagagcatcacacttttaatcaacagcctccgtggctttactgttttattcttctGGCA-G-------GGG-GT-ACTTTCTT-CTGGCCCCA-A--AAC-C---TG----------GTCTCCTCC----AC---TGCCATTTAAGGC---------AGGGTGTGTTGG-TATTGTA-TACAGGTTTT--TGTATGGT---AT-GGCTA-----AAG---------CAATCAGTGG-TGTACAAGTGTCGTTTGTT-------TCAAGTGGGGTTC--ACA-GTGTACTCAAGCGCGTGGGGTGC-CTACACTCCA-CAGGCCCAACTCAGGGTTGAGATTGCTA-CTGTCTGG-TGCA-TGCTTC-AGCGCGAT-GGTGAGGG-C----GGCACTTACTTCA-TCCTTG-C-CGCTGTC-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGCACTTA-GGAGATGGCGAGCAGAgagaaggg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                   taaaaatttgtcttgggggagggagagttgttctgtgtggcaaaactagtgcctgaacgagtaggct-GGAGTC--GTA-GCGGCA-G-------GGG-ATGATTTT-TT-CTG-CCCCA-A--AAC-C---TG---------TGTCTCCTCC--C-CCC--TGCCAGC--AAGGC--------AGGGGGTGT-GT--ATCGTA-TACAG-TTTT--TGTATGGTG--AT-GGTTA-----AAA-G--C----CACTCAGCAG-T-GTAAAGTGTTGTTT-GT-------TCAAGTGGGGTT--CACA-ATGT-CACACGCGC-TGGagggcaggt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCAGCAG-T-GTAAAGTGTTGTTT-GT-------TCAAGTAGGGTTC--ACA-ATGT-CACACGCGC-TGGGG----CCAAA-TCCA-CGG-CCCAAATAAGGGTCGGAAT-GCTA-TAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-AG-GCGAT-GGT-AGGG-C----GGTACT-ACT-CA-TT-TGA-C-C--TGTA-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGcnctcagcagtgtaaagtgttgtttgttcaagtagggttcacaatgtcacacgcgctggggccaaatccacggcccaaataagggtcggaatgctataggctggtgcatgcttcaggcgatggtagggcggtactactcatttgacctgtacatgctctctaaaccaggtag
gi|6                          :                                                                                                          ggagtcgtagcggcaggggatgattttttctgccccaaaacctgtgtctcctcccccctgccagcaaggcagggggtgtgtatcgtatacagtttttgtatggtgatggttaaaagccactcagcagtgtaaagtgttgtttgttcaagtggggttcacaatgtcacacgcgctggcnc-A--C-T-G-GGGAGCC-GTA-GCGGCA-G-------GTG-ATGATTTT-TT-CTG-CCCCA-A--A--------AC-C------TGTCTCCTCC--C-ACC--TGCCAGT--AAG----------GCAGGGTGT-GTGTATCGTA-TACAG-TTTT--TGTATGGTG--AT-GGCTA-----AAA-GC-CAAATCAATCAGTAG-T-GTAAAGTGTTGTTT-GT-------TCAAGTGGGGTTC--ACA-GTGT-CACACGCGC-TGGGG----CCACA-TCCA-CGG-CCCAGATAAGGGTCGGGAT-GCTA-CAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-AG-GCGAT-GGT-ACGG-C----GGTACT-ACT-CATTT-TTA-C-C--TGTA-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGCACTTAGG
gi|8                          : gttgtctaaatttctctttttatagcCATATTTTC-GTAT--TTCTGTGTTTTG-CA-TGTCCTAAATCACCTTTGTTACATTGT--TC------Ca
gi|8                          :                                                                                                                                                     ttgggcatcatacA--TG-CTGTATGCCCAT--G-CAT-CAG---------TT----G-TTTAG---TT---CTT-A-TATATGT---AAAATTGA-TGTGGG-GGAC-ATT-AT-AAA-TAATGTCTGTGGCGGG-A--C-TCG-GGAGTCA-GTC-GCGGCA-G-------GTT-ATGATTTT-TT-CGG-CCCCA-A--A-taagcacatgctgtatgcccatgcatcagttgtttagttcttatatatgtaaaattgatgtgggggacattataaataatgtctgtggcgggactcgggagtcagtcgcggcaggttatgattttttcggccccaaaagtagttgaaagttttgttttccc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttgggcatcataccatattttcgtatttctgtgttttgcatgtcctaaatcacctttgttacattgttcctaagcacC-C----CAA-AAGTAG-T-TGAAAGTTTTGTTT-TC-------CCagtagttgaaagttttgttttccc
gi|9                          :                                                               ttgggcatcataccatattttcgtatttctgtgttttgcatgtcctaaatcacctttgttacattgttcctaagcacatgctgtatgcccatgcatcagttgtttagttcttatatatgtaaaattgatgtgggggacattataaataatgtctgtggcgggactcgggagtcagtcgcggcaggttatgattttttcggc-AA--TAATGTTTGTGACAGG-A--CAT-G-GGAGTCG-GTC-GCGGAA-G-------GTT-ATGATTTT-TTTCTG-TTCCA-A--AAT-C---TGT--------TGTATCGTCC--C-ACC--TGCCA-------------------------------ATCATA-TATGG-TTGT---GTATTGTG--AA-GACTA-----AAAAGC-A----AAA--AGTAG-T-TAAAAGTGTTGTTT-TT-------GCAAGTGTAGTCCACCCA-GCGT-CACAAAAAC-TGGGG----CCACA-TCTA-CTT-TCCAACAAAGGAGCGGGAT-GTTA-


blockSeqs                     :                                    .  CCA             GCA         AT              TGTCTTCTAAGCT     AC     AT    TTTAT   C  T     TC   GTTA  C A    A     T AT    CA  .            AG A   A     AATCCCCTCGTTTAGTAT       T     CA  A   G CAA        C      T  A C   ATG   AA      CT        C .  A A A      AA   C    CA  GTTACAT  TG        C  T   G     G TT TTCGGCCCCAGGT               AAT    AT     TTAGGTGAATATGCA           T TGT      .     G    T      A   T   A     CATAT   GCCAAAT     AA     T GTA            G  .                  CAC   .    A      CG G     CGGC     C    . AGG     T             T    .        T    .      G  C  T A    G    T TTTA     TT   T  TCC    C T GC   A              .              G      A              A   G         G   .  .        .                   G            .  TT     AA          G     TT  TT                .      G .         .      .     .  T C     .   G     . AT A     CAA        T        G        TT    G     .
blockSeqs                     :                                    .  AT              ATA         AT              TGTTC             C      .     GGT     C  .     .    .     C A    A     T CT    .   .            .  .   .     TTCATCGGCAG              T     A   C   A .          .      .  . .   AAT   A       CT        . .  . A .      C    .    AA  .        T         .  .   .     . .  CCTGCC                      C      .      TTTAAGGC                  . TT       .     .    G      T   .   .     .       AGCC        TC     . TG             .  .                  CC    .    .      CG .     TGC      .    . TT      C             .    .        .    .      .  .  A C    .    . .        C    .  TTT    . . .    C              .              G      A              A   G         G   .  .        .                   G            .  .      AC          T     T   TT                .      G .         .      .     .  . C     .   G     . AT .     CA         .        .        G     G     .
blockSeqs                     :                                    .  T               CC          T               .                 C      .     T       .  .     .    .     . .    .     . GC    .   .            .  .   .     TTGTTTAG                 .     G   A   G .          .      .  . .   AT    .       CT        . .  . C .      C    .    CA  .        T         .  .   .     . .  ATCTGT                      C      .      GCAAGGC                   . GT       .     .    T      G   .   .     .       GCTC        TC     . TG             .  .                  CC    .    .      CG .     .        .    . TT      C             .    .        .    .      .  .  A A    .    . .        T    .  CT     . . .    A              .              .      G                                                                .            .  .      AC          G     T   T                 .      G .         .      .     .  . .     .   .     . .  .     C          .        .        G     .     .
blockSeqs                     :                                                       CA          A                                                                                               .   .            .  .   .                                    A   .   . .          .      .  . .   TT    .       TT        . .  . . .      C    .    CA  .        G         .  .   .     . .  TCCTG                       C      .      GCAAGG                    . T        .     .    T      G   .   .     .       AGCA        TC     . TG             .  .                  A     .    .      CG .     .        .    . TT      A             .    .        .    .      .  .  A A    .    . .        T    .  TT     . . .    C              .              .                                                                       .            .  .      AA          .     .   T                 .      . .         .      .     .  . .     .   .     . .  .     C          .        .        G            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                     .      .  . .   AT    .       C         . .  . . .      C    .    CA  .        G         .  .   .     . .  ACCTG                       C      .      TTAGG                     . T        .     .    T      G   .   .     .       GCC         TC     . GT             .  .                  C     .    .      CG .     .        .    . CT      A             .    .        .    .      .  .  G A    .    . .        T    .  TT     . . .    C              .                                                                                                                                                                                                                                                               
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): CCACTTATCAATCTGCAAGCTCAGTAACGACACAAGTCACCAATTAAGTTTAAGGGCATCCTCCGTGGCTTCCTGTTTTATTTTTCTGCTGTACATAGTTTGATCAATTCTTGTGTGGATATGAACATTCTGTTCTGTTCTATAAAGAACTTTGTTAACTATACATTTGCTTATGTGTTCCGAATTCTTGTCAGTGTTATGTCATATGCTCATGACATATACCTAATCCCCTCATTTAGTGTTTTTTTGTGTCATATAAAATTT






Alignments
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GATCTGGGG-CCACATCCACGT-CCT--AACTA-CCGGTAAAGT-CGGGA--GC-TACAGTCTGGTAC-ATG-CGTCAG-C-TAAGGCAGG--GCGGC---ACT-AC-TCTTTTG--CC-CTGTC---CAT-GCTTTT--C-AAACCAG-TTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGCG-AGAA-GGCAGGg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGCC-C-AC--T-GCTA-CAC-----C-TGGTG----TCACA-TCCA-CTT-CTTAACCAATGAGGGGAAT-ACTA-CTGAGTGG-TACA-TG-TTC-AA-GCAAC-TGT-AGTG-CTTTAAGTGC------------TTGCC-C--TGTA-CATGCCCCTCTAA-CTAtcta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agtgtgaaatacagtttC-TGGGG----CCACA-TCCA-CTT-CCGAACTAAGGGTCGGTAT-GGTA-CAGGCTAA-TGCA-TGCTTC-A--GTAAA-GGT-AATG-C----GCCACT-ACT-AA--T-TTG-CTC--TGTC-CGTGCTCCCCAAT-CCATGTAGCAtgga
gi|18                         :                                                                                                     -CCCTTG--TTTT----TC-TG-GTGCT--GGT----CGCA-CTGTA-TATCTAATGGTACATG-CTGTATGCTCAC--G-CAT-CAGCT-------TT----A-T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTGGGAT-GCTA-CAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-GG-GCAAA-GGT-AGGA-C----GGCACT-ACT-CA-
gi|2                          :                     GCTGTGCATATTTTC-GT-T--TTCTGTGTTTTGGCA-TGTTCTAA-TCACCTTTGTTACATTGTCTTCTAAGCTCATTG-CCCTTG--TTTTTTTATCCTG-GTGCT--GGT----CGCAATTGTA-TATCTACTGGTA--TG-CTGTAT-CTCATAGG-CAT-CAGCC-------TTCATCG-GC-AG---TTTTTCTTCA-TATAT-T---AAAATTTA-TGTGGG-GGCCATT-TT-AA--TAATGT---TGGCGGG-A--C-T-G-GGAGTCC-GTC-GCGG-AA-G-------GTT-ATGAC----TTT-TT-CTG-CCCC-AAACC---TGCC-T-GTCTCCTCC--C-ACC--TG-CATT-AGG----------A-GGGGGTGT--GTT-ATCATT-TCTAC-TGTT--GGCATTGTG---T-AGCTA-----AAA-GCTC----TAAT-AGTA--T-TGAAAGTGTTGTTT-TC-------CCAAGTGGGTTTCC-AC--A-GCAT-CACAAG-AT-T---G----CC-CA--CCA-CCT-TCCTAATA--GGTCGGGAT-GCTA-CCGGCTGGTTGTA-TTTTTCGAG-GC-AA-GGT-AGGGTT----GGCACT-ACT-CT-CT-TTG-C-C--TGTA-CATGCTCTTCAAA-CCAGGT-GCACTTGGGGAGACAGGCAGTAGATGAAAAGTGGTTGTTTTTGGCAA-TG----GGTCC-ACGTTAACGAGACCTGGGGGGCACATCCACGT-CCC--AACTAA-CGGTAAGGGGCGGGAT-GCTTACAGTCTGGTGCCATG-CGTCAGGC-TAAGGTAGG--GCGGC---ACT-AC-T-TTTTG--CCGCTGTC---C---GCTTTT--C--AACCAG-GTAGCACT-TAGGAGAC-G-GGC--CGAA-GGCAGGC
gi|20                         :                                         --TTTTGTGTTTGGCC--TGTCCTAAATCACCTTTGTTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gttgcgcatcataccatag-GGCTA-----AAA-GC-C----TAA-AAGTAG-T-TGGACGTATTGTTT-TC-------CCAAGTGGGG
gi|3                          :                gtataGCTGTACATAGTTTG-AT-CCATTCT-TGTGTGGATA-TG-----AA-CGT-TTTGCTACAT--------------ATTGACCTTTGATTTTTGG--TCCCATGTGCTTCGGTGTTACG-AATTGT--TGTC-AGCGTTT--T---TATATGCTCAT--GACATATACCTAATCCCCTC----GTTT-AGTATTTTTTCGT-G-TCT-TAT---AAAATTTG-TGCGGG-GG-TATTAAT-TC--TAGTGTCTGTGGCGGG-A--C-T-GAGGAG-CC-GTA-GCGG-C--G-------GTTGATGAT----TTT-TT-CTG-CTCCAAATCC---TG---T-GTCCCCTTC--C-ACC--TGCCAGC-AAG----------GCAGGGGTGT--G-T-ATCGTA-TACAG-TATT--TGTATGGAG--AT-GGCTACATATAAA-AA-T----CAATCAGCAG-T-GTAAAGTGTTATTT-GT-------TTAATTGGGGTT-A-AC--A-GTGT-CACAAGCGC-TAGGGCGGCCCACA-TCCA-CGG-CTCAAATAAGGGTCGGGAT-GCT--CAGTCTGG-TGCA-TGCTTC-AG-GCGAT-GGT-AGGG-C----GGCACT-ACT-CA-TT-TGA-C-C--TGTC-CATGCTCTCTAAA-CCAGGGAGCACTTA-CGAGACAGGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                      cactagcaaacctgctgatgttgagtaatcaccccaagtcaccatttgggtttaagagcatcacacttttaatcaacagcctccgtggctttactgttttattcttctGG-CA-G-------GGG-GT-AC----TTTCTT-CTGGCCCCAAAACC---TG-----GTCTCCTCC----AC---TGCCATTTAAGGC--------A-GGGTGTGTTGG-T-ATTGTA-TACAGGTTTT--TGTATGGT---AT-GGCTA-----AAG---------CAATCAGTGG-TGTACAAGTGTCGTTTGTT-------TCAAGTGGGGTT-C-AC--A-GTGTACTCAAGCGCGTGGGGTGC-CTACACTCCA-CAGGCCCAACTCAGGGTTGAGATTGCTA-CTGTCTGG-TGCA-TGCTTC-AGCGCGAT-GGTGAGGG-C----GGCACTTACTTCA-TCCTTG-C-CGCTGTC-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGCACTTA-GGAGATGGCGAGCAGAgagaaggg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                taaaaatttgtcttgggggagggagagttgttctgtgtggcaaaactagtgcctgaacgagtaggct-GGAGTC--GTA-GCGG-CA-G-------GGG-ATGAT----TTT-TT-CTG-CCCCAAAACC---TG---T-GTCTCCTCC--C-CCC--TGCCAGC-AAGGC--------A-GGGGGTGT--G-T-ATCGTA-TACAG-TTTT--TGTATGGTG--AT-GGTTA-----AAA-G--C----CACTCAGCAG-T-GTAAAGTGTTGTTT-GT-------TCAAGTGGGGTT-C-AC--A-ATGT-CACACGCGC-TGGagggcaggt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAGCAG-T-GTAAAGTGTTGTTT-GT-------TCAAGTAGGGTT-C-AC--A-ATGT-CACACGCGC-TGGGG----CCAAA-TCCA-CGG-CCCAAATAAGGGTCGGAAT-GCTA-TAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-AG-GCGAT-GGT-AGGG-C----GGTACT-ACT-CA-TT-TGA-C-C--TGTA-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGcnctcagcagtgtaaagtgttgtttgttcaagtagggttcacaatgtcacacgcgctggggccaaatccacggcccaaataagggtcggaatgctataggctggtgcatgcttcaggcgatggtagggcggtactactcatttgacctgtacatgctctctaaaccaggtag
gi|6                          :                                                                                                       ggagtcgtagcggcaggggatgattttttctgccccaaaacctgtgtctcctcccccctgccagcaaggcagggggtgtgtatcgtatacagtttttgtatggtgatggttaaaagccactcagcagtgtaaagtgttgtttgttcaagtggggttcacaatgtcacacgcgctggcnc-A--C-T-G-GGGAGCC-GTA-GCGG-CA-G-------GTG-ATGAT----TTT-TT-CTG-CCCCAAAACC---TG---T---CTCCTCC--C-ACC--TGCCAGT-AAGGC--------A-GGGTGTGT--G-T-ATCGTA-TACAG-TTTT--TGTATGGTG--AT-GGCTA-----AAA-GC-CAAATCAATCAGTAG-T-GTAAAGTGTTGTTT-GT-------TCAAGTGGGGTT-C-AC--A-GTGT-CACACGCGC-TGGGG----CCACA-TCCA-CGG-CCCAGATAAGGGTCGGGAT-GCTA-CAGGCTGG-TGCA-TGCTTC-AG-GCGAT-GGT-ACGG-C----GGTACT-ACT-CATTT-TTA-C-C--TGTA-CATGCTCTCTAAA-CCAGGTAGCACTTAGG
gi|8                          : gttgtctaaatttctctttttatagcCATATTTTC-GTAT--TTCTGTGTTT-TGCA-TGTCCTAAATCACCTTTGTTACATTGT--TC------Ca
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): CCACTTATCAATCTGCAAGCTCAGTAACGACACAAGTCACCAATTAAGTTTAAGGGCATCCTCCGTGGCTTCCTGTTTTATTTTTCTGCTGTACATAGTTTGATCAATTCTTGTGTGGATATGAACATTCTGTTCTGTTCTATAAAGAACTTTGTTAACTATACATTTGCTTATGTGTTCCGAATTCTTGTCAGTGTTATGTCATATGCTCATGACATATACCTAATCCCCTCATTTAGTGTTTTTTTGTGTCATATAAAATTT