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lowQualScore                  :                   6666666 22 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000  22222222 11        1 22      3  66        
lowQualScore                  :                   ....... .. . ..........................................................................  ........ ..        . ..      .  ..        
lowQualScore                  :                   9999999 88 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888  44444444 99        7 33      2  00        
consensus                     :    NNTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G----N-----C--CC-----C----------C--C---T-----------A------TAT-----T--ATA---AT---GG-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-ATGGGAAAC
Reference ( gi|14 )           :    ATTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G----T-----C--CC-----C----------C--C---T-----------A------TAT-----T--GTA---AT---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTCCT-GTGGGAAAC
gi|18                         :      TAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G----T-----C--AC-----C----------C--C---T-----------T------CAT-----T--GTA---AT---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTTCT-GTGGGAAAC
gi|6                          :      TAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G----CACCCGCA-CC-----C----------C--C---A-----------A------TAT-----G--GTACA-AT---GA-CAAAATTC-A--TGTTTTGCT-TTGGGAAA
gi|5                          :      TAGCGGATGAGAA------GC--G-A----G----C-----A--CC-----C----------C--C---TTTCC-------A------TAT-----TTTATA---AT---GG-CAAAGTCA-A--TGTTTTGCT-ATGGGAAAC
gi|11                         :     gTAGCGGATGTGAA------GT--G-G----G----A-----A--CC-----C----------C--C---A-----------A------TATGG---T--ATA---AT---GG-CAGAATCCAA--TGTTTTGCT-ATGGGAAACct
gi|8                          :      TAGCGGGTGGGAG------GT--GTGCT--G----C-----C--CC-----C----------C--C---T-----------A-------ATGG---T--ATA---AT---GT-CAAAATTC-A--TGTTTTGAT-ATGGTAAAC
gi|24                         :     gTAACAGATGGGAA------GT--G-G----G----------C--AT-----C----------C--C---T-----------A-------------------A---AT---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-ATGGc
gi|15                         :      TAGCAGATGGGAG------AT--G-GACAAG----C-----C--CCACAACC----------C--C---T-----------A------TAG-----A--ATA---AT---GA-TAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-Atac
gi|9                          :      TATCGGATGGATG------AT--G-G----G----C-----A--TC-----C----------G--C---C-----------A------TTT-----G--GTATAAAT---GA-CAAAGTCC-A--TG-TTTGCT-ATTGGAAAC
gi|4                          :    agTAGCAGATGGGAG------GT--G-G----G----C-----A--CC-----CTTATCAAATAC--T---T-----------AG-----TATGG---T--ATA---AT----A-TAAAGACA-A--TGTTTTGCA-ATGAGAAAc
gi|10                         :     gTAGCAGATGGGAA------ATTGG-G----A----A-----C--CC-----A----------C--A---T-----------A------CAA-----T--ATA----TCTAGG-CATTGACC-A--TGTTTTGCT-ATGGGAAtcc
gi|19                         :       AGCGGATGGGAG------GT--G-G----G----T-----C--AC-----C----------C--C---T-----------T------CAT-----T--GTA---AT---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTTCT-GTGGGAAACct
gi|17                         :       AGCGGATGGGAA------GT--G-G----G----T-----A--TC-----T----------C--C---C-----------A------TATGA---T--ATA---AA---GG-CAAAGTCA-A--TATTTTGCT-ATGGGAAAc
gi|3                          :       AGCAGATGGGAGTTACATGT--A-G----GACCCT-----C--CC-----T----------C--C---T-----------ACAATAATAT-----T--ATA---TA---GG-CCAGGTCC-A--TGTTTTGCT-ATGGGAAt
gi|12                         :        GCGGATGGGAA------TT--G-G----GAAC-T-----CATCA-----C----------C--C---T-----------A------CAA-----T--ATA---TA---GG-CATAATTC-A--TGTGTTGTT-GTGGTAAccc
gi|16                         :         CGGATTGGAG------TT--G-G----G----A-----A--CC-----C----------C--C---A-----------A------TAC-----A--ATAT--AT---GGGCAAAGTCC-A--TATTTTGCA-ATGGAAAACc
gi|22                         :         aGGATGGGAA-------------------------------CC-----C----------C--C---A-----------A------TAC-----A--ATAT--ATA--GG-CAATATCC-A--GGTTTTCCT-ATGGGAAc
gi|7                          :          tGATGGGAG------GT--------------C-----C--CC-----C----------C--C---CCCACCCCACCAA------TATAAGG-T--ATA---AT---GA-CGAAGTCA-A--TGTTTTGCT-cccc
gi|23                         :        aataATGGGAG------TT--T-T----G----A-----A--CC-----C----------C--C---T-----------A------T-TCAAGAT--ATA---G----GA--AAAGTCC-A--TGTTTTACT-ATGGGactgg
gi|21                         :             TGGGAG------TT--G-G----A----A-----A--CC-----T----------C--C---C-----------A------TAC-----A--ATA---TA---GA-CAAGGTCC-A--TGTATTGCC-ACAGGGAAC
gi|13                         :                tAG------TT--G-G----G----A-----A--CC-----C----------C--CACAT-----------A------TAA-----T--ATA---GA---GG-CAACGTCC-A--TGTTTTGCT-ATGGGAAc
gi|1                          :                             cacattaa----T-----C--CC-----C----------CATC---TC----------A------TGG-----T--ATA---AT---GG-TAAAGTCT-AGATGTTTTGCT-ATGGAAAACcccc
gi|2                          : agcagatgggagatgggcgcctccctgcaacccccctcccc-----C--CC-----C----------C--CAAAT-----------A------TAT-----T--ATA---ATTA-GG-CAAAGTCC-A--TGTTTGGCT-ATGGAA
gi|25                         :                                                                          gcggatggaagttgtaacccccctcccccccccA---AT---GG-CAAAATCC-A--TGTTTTGCTAATGGGAAACtccc
gi|20                         :                                                                                                          atggtaa---GG-CAAAGTCC-A--CGTTTTGCT-ATGGGAAcc





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lowQualScore                  :                                        555555  22 1 6666 0000000000000000  9999999999999999  8888888888888888888888888888 22   777777777  1        1 22         1 1        
lowQualScore                  :                                        ......  .. . .... ................  ................  ............................ ..   .........  .        . ..         . .        
lowQualScore                  :                                        222222  55 8 4444 5555555555555555  9999999999999999  6666666666666666666666666666 33   888888888  6        6 22         6 6        
consensus                     :                         NNTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-N------------C-CC-----C----------CC---T---------------A-TAT----T--ATA---A-T---GG-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAAC
Reference ( family-3336 )     :                         NNTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-N------------C-CC-----C----------CC---T---------------A-TAT----T--ATA---A-T---GG-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAAC
gi|1                          :                            AGCAGATGGGAG------AT--G-G----G-CGCCTCCCTGCAAC-CC-----C----------CC---TCCCCTCCCCCATCTCA-TGG----T--ATA---A-T---GG-TAAAGTCT-AGATGTTTTGCT-A-TGGAAAAC
gi|10                         :                           TAGCAGATGGGAA------ATTGG-G----A-A------------C-CC-----A----------CA---T---------------A-CAA----T--ATATCTA-----GG-CATTGACC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAA
gi|11                         :                           TAGCGGATGTGAA------GT--G-G----G-A------------A-CC-----C----------CC---A---------------A-TATGG--T--ATA---A-T---GG-CAGAATCCAA--TGTTTTGCT-A-TGGGAAACct
gi|12                         :                             GCGGATGGGAA------TT--G-G----GAA------------C-TCATCA-C----------CC---T---------------A-CAA----T--ATA---T-A---GG-CATAATTC-A--TGTGTTGTT-G-TGGTAA
gi|13                         :                                      AG------TT--G-G----G-A------------A-CC-----C----------CCACAT---------------A-TAA----T--ATA---G-A---GG-CAACGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAc
gi|14                         :                   cacattaaTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-T------------C-CC-----C----------CC---T---------------A-TAT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTCCT-G-TGGGAAACcccc
gi|15                         :                         atTAGCAGATGGGAG------AT--G-GACAAG-C------------C-CCACAACC----------CC---T---------------A-TAG----A--ATA---A-T---GA-TAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-
gi|16                         :                              CGGATTGGAG------TT--G-G----G-A------------A-CC-----C----------CC---A---------------A-TAC----A--ATAT--A-T---GGGCAAAGTCC-A--TATTTTGCA-A-TGGAAAAC
gi|17                         :                           aAGCGGATGGGAA------GT--G-G----G-T------------A-TC-----T----------CC---C---------------A-TATGA--T--ATA---A-A---GG-CAAAGTCA-A--TATTTTGCT-A-TGGGAAAc
gi|18                         :                           TAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-T------------C-AC-----C----------CC---T---------------T-CAT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTTCT-G-TGGGAAACt
gi|19                         :                            AGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-T------------C-AC-----C----------CC---T---------------T-CAT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTTCT-G-TGGGAAAC
gi|2                          :                                                            ------------C-CC-----C----------CCAAAT---------------A-TAT----T--ATA---A-TTA-GG-CAAAGTCC-A--TGTTTGGCT-A-TGGAAc
gi|20                         :                                                                                                     gcggatggaagttgtaacccccctccccccccc---GG-CAAAGTCC-A--CGTTTTGCT-A-TGGGAAtccc
gi|21                         : aaaacaaataaaagttgactcatacaatatttcTGGGAG------TT--G-G----A-A------------A-CC-----T----------CC---C---------------A-TAC----A--ATA---T-A---GA-CAAGGTCC-A--TGTATTGCC-A-CAGGGAACcccc
gi|22                         :                                      tG------AT--G-G----G-A------------A-CC-----C----------CC---A---------------A-TAC----A--ATAT--A-TA--GG-CAATATCC-A--GGTTTTCCT-A-TGGGAAc
gi|23                         :                               tgATGGGAG------TT--T-T----G-A------------A-CC-----C----------CC---T---------------A-T-T----C--AAG---A-TATAGG-AAAAGTCC-A--TGTTTTACT-A-TGGGcccc
gi|24                         :                           TAACAGATGGGAA------GT--G-G----G--------------C-AT-----C----------CC---T---------------A-------------A---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGG
gi|25                         :                                                                                                                      ----T--AAA---A-T---GG-CAAAATCC-A--TGTTTTGCTAA-TGGGAAACtac
gi|3                          :                        atggAGCAGATGGGAGTTACATGT--A-G----G-A------------C-CCT----C----------CC---TCCTACAATA------A-TAT----T--ATA---T-A---GG-CCAGGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAcc
gi|4                          :                           TAGCAGATGGGAG------GT--G-G----G-C------------A-CC-----CTTATCAAATACT---T---------------AGTATGG--T--ATA---A-T----A-TAAAGACA-A--TGTTTTGCA-A-TGAGAAAccc
gi|5                          :                          gTAGCGGATGAGAA------GC--G-A----G-C------------A-CC-----C----------CC---TTTCC-----------A-TAT----TTTATA---A-T---GG-CAAAGTCA-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAACtcc
gi|6                          :                          gTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-CACCCG-------CACC-----C----------CC---A---------------A-TATGG--T--ACA---A-T---GA-CAAAATTC-A--TGTTTTGCT-T-TGGGAAAct
gi|7                          :                                GATGGGAG------GT-----------C------------C-CC-----C----------CC---CCCACCCCACCA----A-TATAAGGT--ATA---A-T---GA-CGAAGTCA-A--TGTTTTGCT-ACTGG
gi|8                          :                       aataTAGCGGGTGGGAG------GT--GTGCT--G-C------------C-CC-----C----------CC---T---------------AATGG----T--ATA---A-T---GT-CAAAATTC-A--TGTTTTGAT-A-TGGTAAAC
gi|9                          :                          gTATCGGATGGATG------AT--G-G----G-C------------A-TC-----C----------GC---C---------------A-TTTGG--T--ATA---AAT---GA-CAAAGTCC-A--TG-TTTGCT-A-TTGGAAACc





Alignments
lowQualScore                  :                                                          2222222222222222                    3333333333333333333333333333                                                  
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lowQualScore                  :                                        222222  55 8 4444 5555555555555555  9999999999999999  6666666666666666666666666666 33   888888888  6        6 22         6 6        
consensus                     :                         NNTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-N------------C-CC-----C----------CC---T---------------A-TAT----T--ATA---A-T---GG-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAAC
Reference ( family-3336 )     :                         NNTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-N------------C-CC-----C----------CC---T---------------A-TAT----T--ATA---A-T---GG-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAAC
gi|1                          :                            AGCAGATGGGAG------AT--G-G----G-CGCCTCCCTGCAAC-CC-----C----------CC---TCCCCTCCCCCATCTCA-TGG----T--ATA---A-T---GG-TAAAGTCT-AGATGTTTTGCT-A-TGGAAAAC
gi|10                         :                           TAGCAGATGGGAA------ATTGG-G----A-A------------C-CC-----A----------CA---T---------------A-CAA----T--ATATCTA-----GG-CATTGACC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAA
gi|11                         :                           TAGCGGATGTGAA------GT--G-G----G-A------------A-CC-----C----------CC---A---------------A-TATGG--T--ATA---A-T---GG-CAGAATCCAA--TGTTTTGCT-A-TGGGAAACct
gi|12                         :                             GCGGATGGGAA------TT--G-G----GAA------------C-TCATCA-C----------CC---T---------------A-CAA----T--ATA---T-A---GG-CATAATTC-A--TGTGTTGTT-G-TGGTAA
gi|13                         :                                      AG------TT--G-G----G-A------------A-CC-----C----------CCACAT---------------A-TAA----T--ATA---G-A---GG-CAACGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAc
gi|14                         :                   cacattaaTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-T------------C-CC-----C----------CC---T---------------A-TAT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTCCT-G-TGGGAAACcccc
gi|15                         :                         atTAGCAGATGGGAG------AT--G-GACAAG-C------------C-CCACAACC----------CC---T---------------A-TAG----A--ATA---A-T---GA-TAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-
gi|16                         :                              CGGATTGGAG------TT--G-G----G-A------------A-CC-----C----------CC---A---------------A-TAC----A--ATAT--A-T---GGGCAAAGTCC-A--TATTTTGCA-A-TGGAAAAC
gi|17                         :                           aAGCGGATGGGAA------GT--G-G----G-T------------A-TC-----T----------CC---C---------------A-TATGA--T--ATA---A-A---GG-CAAAGTCA-A--TATTTTGCT-A-TGGGAAAc
gi|18                         :                           TAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-T------------C-AC-----C----------CC---T---------------T-CAT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTTCT-G-TGGGAAACt
gi|19                         :                            AGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-T------------C-AC-----C----------CC---T---------------T-CAT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTTCT-G-TGGGAAAC
gi|2                          :                                                            ------------C-CC-----C----------CCAAAT---------------A-TAT----T--ATA---A-TTA-GG-CAAAGTCC-A--TGTTTGGCT-A-TGGAAc
gi|20                         :                                                                                                     gcggatggaagttgtaacccccctccccccccc---GG-CAAAGTCC-A--CGTTTTGCT-A-TGGGAAtccc
gi|21                         : aaaacaaataaaagttgactcatacaatatttcTGGGAG------TT--G-G----A-A------------A-CC-----T----------CC---C---------------A-TAC----A--ATA---T-A---GA-CAAGGTCC-A--TGTATTGCC-A-CAGGGAACcccc
gi|22                         :                                      tG------AT--G-G----G-A------------A-CC-----C----------CC---A---------------A-TAC----A--ATAT--A-TA--GG-CAATATCC-A--GGTTTTCCT-A-TGGGAAc
gi|23                         :                               tgATGGGAG------TT--T-T----G-A------------A-CC-----C----------CC---T---------------A-T-T----C--AAG---A-TATAGG-AAAAGTCC-A--TGTTTTACT-A-TGGGcccc
gi|24                         :                           TAACAGATGGGAA------GT--G-G----G--------------C-AT-----C----------CC---T---------------A-------------A---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGG
gi|25                         :                                                                                                                      ----T--AAA---A-T---GG-CAAAATCC-A--TGTTTTGCTAA-TGGGAAACtac
gi|3                          :                        atggAGCAGATGGGAGTTACATGT--A-G----G-A------------C-CCT----C----------CC---TCCTACAATA------A-TAT----T--ATA---T-A---GG-CCAGGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAcc
gi|4                          :                           TAGCAGATGGGAG------GT--G-G----G-C------------A-CC-----CTTATCAAATACT---T---------------AGTATGG--T--ATA---A-T----A-TAAAGACA-A--TGTTTTGCA-A-TGAGAAAccc
gi|5                          :                          gTAGCGGATGAGAA------GC--G-A----G-C------------A-CC-----C----------CC---TTTCC-----------A-TAT----TTTATA---A-T---GG-CAAAGTCA-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAACtcc
gi|6                          :                          gTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----G-CACCCG-------CACC-----C----------CC---A---------------A-TATGG--T--ACA---A-T---GA-CAAAATTC-A--TGTTTTGCT-T-TGGGAAAct
gi|7                          :                                GATGGGAG------GT-----------C------------C-CC-----C----------CC---CCCACCCCACCA----A-TATAAGGT--ATA---A-T---GA-CGAAGTCA-A--TGTTTTGCT-ACTGG
gi|8                          :                       aataTAGCGGGTGGGAG------GT--GTGCT--G-C------------C-CC-----C----------CC---T---------------AATGG----T--ATA---A-T---GT-CAAAATTC-A--TGTTTTGAT-A-TGGTAAAC
gi|9                          :                          gTATCGGATGGATG------AT--G-G----G-C------------A-TC-----C----------GC---C---------------A-TTTGG--T--ATA---AAT---GA-CAAAGTCC-A--TG-TTTGCT-A-TTGGAAACc


blockSeqs                     :                                        TTACAT  TG T ACAA CACCCGCA          CTTATCAAATA       CCCACCCCACCAATATAAGG         TT   ATATA      G        A .          A C
blockSeqs                     :                                        .       .  . CT   AAC               ACAACC            TCCTACAATAATAT               .    TCTA       .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    AC                ATCAC             TTTCCATAT                    .    ATTA       .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    AA                TC                ACATATAA                     .    TATA       .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    AA                A                 AAATATAT                     .    TAT        .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    TC                C                 TAGTATGG                     .    AAT        .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    CC                C                 AATATGG                      .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    AA                C                 CATATGA                      .    TA         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    TA                C                 AATATGG                      .    GA         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    TC                T                 CATTTGG                      .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    TC                C                 TAATGG                       .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    AA                C                 TACAA                        .    AA         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    AA                C                 TACAA                        .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    AA                T                 TATAT                        .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    AC                C                 TATAG                        .    TA         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    CA                C                 AATAC                        .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    CA                C                 TTCAT                        .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    CC                C                 TTCAT                        .    TA         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    CC                C                 CATAC                        .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    CA                C                 AATAC                        .    AT         .        . .          . .
blockSeqs                     :                                        .       .  . .    C                 C                 TATT                         .    AT         .        . .          . .
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blockSeqCons                  :                                                          NA**************                    TATAT***********************                            **
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finalCons                     :                         NNTAGCGGATGGGAG------GT--G-G----GNA--------------CC-----C----------CCTATAT-----------------------T--ATA---A-T---GG-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAAC





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lowQualScore                  :                                        222222  8 8 55 0 7777777 44 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33   888888888  6        6 22         6 6        
consensus                     :                         NNTAGCGGATGGGAG------GT-G-G--GNA-------C--C----------------------C----------CC---T-----------A-T---AT----T--ATA---A-T---GG-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAAC
Reference ( family-3336 )     :                         NNTAGCGGATGGGAG------GT-G-G--GNA-------C--C----------------------C----------CC---T-----------A-T---AT----T--ATA---A-T---GG-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAAC
gi|1                          :                            AGCAGATGGGAG------AT-G-G--GCG-------C--CTCCCTGCAACCCCCCTCCCCTCC----------CC---C-----------A-TCTCATGG--T--ATA---A-T---GG-TAAAGTCT-AGATGTTTTGCT-A-TGGAAAAC
gi|10                         :                           TAGCAGATGGGAA------ATTG-G--GAA-------C--C----------------------C----------ACA--T-----------A-C---AA----T--ATATCTA-----GG-CATTGACC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAA
gi|11                         :                           TAGCGGATGTGAA------GT-G-G--GAA-------C--C----------------------C----------CC---A-----------A-T---ATGG--T--ATA---A-T---GG-CAGAATCCAA--TGTTTTGCT-A-TGGGAAACct
gi|12                         :                             GCGGATGGGAA------TT-G-G--GAA-------C--TCATCA-----------------C----------CC---T-----------A-C---AA----T--ATA---T-A---GG-CATAATTC-A--TGTGTTGTT-G-TGGTAA
gi|13                         :                                      AG------TT-G-G--GAA-------C--C----------------------C----------CCACAT-----------A-T---AA----T--ATA---G-A---GG-CAACGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAc
gi|14                         :                   cacattaaTAGCGGATGGGAG------GT-G-G--GTC-------C--C----------------------C----------CC---T-----------A-T---AT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTCCT-G-TGGGAAACcccc
gi|15                         :                         atTAGCAGATGGGAG------AT-G-G--ACAAGCCCCACAAC----------------------C----------CC---T-----------A-T---AG----A--ATA---A-T---GA-TAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-
gi|16                         :                              CGGATTGGAG------TT-G-G--GAA-------C--C----------------------C----------CC---A-----------A-T---AC----A--ATAT--A-T---GGGCAAAGTCC-A--TATTTTGCA-A-TGGAAAAC
gi|17                         :                           aAGCGGATGGGAA------GT-G-G--GTA-------T--C----------------------T----------CC---C-----------A-T---ATGA--T--ATA---A-A---GG-CAAAGTCA-A--TATTTTGCT-A-TGGGAAAc
gi|18                         :                           TAGCGGATGGGAG------GT-G-G--GTC-------A--C----------------------C----------CC---T-----------T-C---AT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTTCT-G-TGGGAAACt
gi|19                         :                            AGCGGATGGGAG------GT-G-G--GTC-------A--C----------------------C----------CC---T-----------T-C---AT----T--GTA---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTTCT-G-TGGGAAAC
gi|2                          :                                                         -------C--C----------------------C----------CCAAAT-----------A-T---AT----T--ATA---A-TTA-GG-CAAAGTCC-A--TGTTTGGCT-A-TGGAAc
gi|20                         :                                                                                                            gcggatggaagttgtaacccccctcccccccccc---GG-CAAAGTCC-A--CGTTTTGCT-A-TGGGAAtccc
gi|21                         : aaaacaaataaaagttgactcatacaatatttcTGGGAG------TT-G-G--AAA-------C--C----------------------T----------CC---C-----------A-T---AC----A--ATA---T-A---GA-CAAGGTCC-A--TGTATTGCC-A-CAGGGAACcccc
gi|22                         :                                      tG------AT-G-G--GAA-------C--C----------------------C----------CC---A-----------A-T---AC----A--ATAT--A-TA--GG-CAATATCC-A--GGTTTTCCT-A-TGGGAAc
gi|23                         :                               tgATGGGAG------TT-T-T--GAA-------C--C----------------------C----------CC---T-----------A-T----T----C--AAG---A-TATAGG-AAAAGTCC-A--TGTTTTACT-A-TGGGcccc
gi|24                         :                           TAACAGATGGGAA------GT-G-G--GCA-------T--C----------------------C----------C----------------------------T--A-A---A-T---GA-CAAAGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGG
gi|25                         :                                                                                                                              ----T--AAA---A-T---GG-CAAAATCC-A--TGTTTTGCTAA-TGGGAAACtac
gi|3                          :                        atggAGCAGATGGGAGTTACATGT-A-G--GAC-------C--CT---------------------C----------CC---TCCTACAATA--A-T---AT----T--ATA---T-A---GG-CCAGGTCC-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAcc
gi|4                          :                           TAGCAGATGGGAG------GT-G-G--GCA-------C--C----------------------CTTATCAAATACT---T-----------AGT---ATGG--T--ATA---A-T----A-TAAAGACA-A--TGTTTTGCA-A-TGAGAAAccc
gi|5                          :                          gTAGCGGATGAGAA------GC-G-A--GCA-------C--C----------------------C----------CC---TTTCC-------A-T---AT----TTTATA---A-T---GG-CAAAGTCA-A--TGTTTTGCT-A-TGGGAAACtcc
gi|6                          :                          gTAGCGGATGGGAG------GT-G-G--GCA-------C--C----------------------CGCACCC----CC---A-----------A-T---ATGG--T--ACA---A-T---GA-CAAAATTC-A--TGTTTTGCT-T-TGGGAAAct
gi|7                          :                                GATGGGAG------GT-------CC-------C--C----------------------C----------CC---CCCACCCCACCAA-T---ATAAGGT--ATA---A-T---GA-CGAAGTCA-A--TGTTTTGCT-ACTGG
gi|8                          :                       aataTAGCGGGTGGGAG------GT-GTGCTGCC-------C--C----------------------C----------CC---T-----------AAT---GG----T--ATA---A-T---GT-CAAAATTC-A--TGTTTTGAT-A-TGGTAAAC
gi|9                          :                          gTATCGGATGGATG------AT-G-G--GCA-------T--C----------------------C----------GC---C-----------A-T---TTGG--T--ATA---AAT---GA-CAAAGTCC-A--TG-TTTGCT-A-TTGGAAACc