lowQualScore : 1111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111
lowQualScore : 1 33333 1 2222222222222222 11 1 8888888888888888888888888888 1111 222222222 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 333 3333 55555 22 11 111 1111 333333 11111 111 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222222 44444444444 1111 11111 666666666666666666666666666666666666666666 11 222222 11 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333333333333333 000000000000000000000000000000000000000 1111111 11 1 1111 66666666666666666666666666666666 1 1 44444444444 111 333 11 88888888888888888888888888888888888888888888888 1 222 2222 111 111 55555555555555555555555 22222222 11111 9999999 1 22222222222222222 22222222222 33333333333333333 111111 33333 111 111111111111111111 1 1111111 4444 1 1 6666666 111 33333333333 2222 11111 33333333333333333 111 11 1111111 111111111 2222222 22222 5555555555555555555555555 1111 1 4444444444444444 11 3333333 1 1111111 11 11 11111111 11 111 11 11 222222222 111 11111 111 111111111 444 11 2222 222222222222222222 111 222222 11 44444444444444444444 111111111 2222222222222 11 222222222 11 000000000000000000000 333333 2222222222 111111 3333333 1 1111 111111 22 33333333333 33333 111111111 1
lowQualScore : 3 33333 6 3 2222222222222222 44 8 88 8 9 6 8 8 6666666666666666666666666666 7777 8 8 0 88 8 8 8 6 8 000000000 5 3 5 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 6 6 6 6 99 111 6 99 88 8 444 6666 8 0 99999 2 2 55 33 6 99 444 7777 0 222222 8 77777 88 444 8 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 777777777777 8 11111111111 8 0 0 7777 8 8 99999 8 888888888888888888888888888888888888888888 11 0 8 000000 6 11 8 6 8 1 8 0 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 77 1 77 77 888 5 5 8888888888888888 77 5 777777777777777777777777777777777777777 8888888 5 77 5 00 1 77 77 5 1 5 7777 5 5 77 00000000000000000000000000000000 1 1 5 44444444444 111 6 99 444 6 6 99 99 00 6 11111111111111111111111111111111111111111111111 6 6 6 5 6 6 000 99 4444 9 444 6 3 111 99 77 88888888888888888888888 7 99999 6 6 6 00000000 6 22222 6666666 1 3 00000000000000000 88888888888 5 99999999999999999 444444 5 66666 66 66 888 0 999999999999999999 0 6666666 5 5 66 5555 5 0 66 5 5 5 9999 66 0 0 5 5 66 9999999 333 11111111111 5 5 0000 5 22222 5 5 22222222222222222 666 444 5 11 2222222 0 5 111111111 888 5 66 0000000 5 5 66 66 5 66666 5 5555555555555555555555555 5 5 5 0 0000 66 888 5 0 7777777777777777 5 5 77 5 2222222 0 5 6666666 5 88 5 66 88888888 5 11 777 7 5 5 5 5 66 5 66 11 5 3 5 888 222222222 55 5 5 5 5 333 22222 66 8 9999 1 4 333 4 8 4 888 4 333333333 4 000 4 4 66 4 4 00 2 5 5 6666 5 000000000000000000 5 888 4 4 8888 4 555 4 777 111111 5 11 5 8888 00000000000000000000 5 777777777 5 5 5 888 88 5 4444444444444 5 6 9999 11 5 66 666666666 5 5 66 5 88 1 111111111111111111111 5 66 111111 5 66 5 4444444444 999999 1111111 4 2 2222 0 111111 777 4 4 8888 4 4 4 55 4 8888 55 4 444 99 777 777 88888888888 4 88 77777777 3 44 3 3 6 3 44444 6 3 888888888 555 3 3 3 3 555 0 0 6
lowQualScore : . ..... . . ................ .. . .. . . . . . ............................ .... . . . .. . . . . . ......... . . . . .......................................................................................... . . . . . .. ... . .. .. . ... .... . . ..... . . .. .. . .. ... .... . ...... . ..... .. ... . .. ...................................................................................... ............ . ........... . . . .... . . ..... . .......................................... .. . . ...... . .. . . . . . . ............................................................................................. .. . .. .. ... . . ................ .. . ....................................... ....... . .. . .. . .. .. . . . .... . . .. ................................ . . . ........... ... . .. ... . . .. .. .. . ............................................... . . . . . . ... .. .... . ... . . ... .. .. ....................... . ..... . . . ........ . ..... ....... . . ................. ........... . ................. ...... . ..... .. .. ... . .................. . ....... . . .. .... . . .. . . . .... .. . . . . .. ....... ... ........... . . .... . ..... . . ................. ... ... . .. ....... . . ......... ... . .. ....... . . .. .. . ..... . ......................... . . . . .... .. ... . . ................ . . .. . ....... . . ....... . .. . .. ........ . .. ... . . . . . .. . .. .. . . . ... ......... .. . . . . ... ..... .. . .... . . ... . . . ... . ......... . ... . . .. . . .. . . . .... . .................. . ... . . .... . ... . ... ...... . .. . .... .................... . ......... . . . ... .. . ............. . . .... .. . .. ......... . . .. . .. . ..................... . .. ...... . .. . .......... ...... ....... . . .... . ...... ... . . .... . . . .. . .... .. . ... .. ... ... ........... . .. ........ . .. . . . . ..... . . ......... ... . . . . ... . . .
lowQualScore : 3 33333 0 3 0000000000000000 00 0 88 0 6 0 0 0 6666666666666666666666666666 0000 0 0 8 22 0 0 0 0 0 666666666 0 8 6 0 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 7 7 7 7 7 22 777 7 22 88 0 666 0000 0 6 44444 2 2 00 66 0 00 888 0000 8 000000 0 88888 88 000 0 00 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 444444444444 0 00000000000 0 8 8 0000 0 0 66666 0 222222222222222222222222222222222222222222 22 8 0 222222 0 00 0 0 0 4 0 8 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 7 99 99 111 7 7 3333333333333333 99 7 999999999999999999999999999999999999999 6666666 7 11 7 77 4 11 99 7 4 7 9999 7 7 99 33333333333333333333333333333333 4 4 7 33333333333 777 7 22 222 7 7 22 22 55 7 55555555555555555555555555555555555555555555555 7 7 7 5 7 7 333 22 5555 5 333 7 2 777 22 77 00000000000000000000000 0 33333 7 7 7 00000000 7 77777 8888888 0 3 99999999999999999 88888888888 0 88888888888888888 444444 0 99999 99 99 888 2 000000000000000000 0 2222222 0 0 99 0000 0 0 99 0 0 0 0000 99 0 1 0 0 99 2222222 888 11111111111 0 0 6666 0 55555 0 0 55555555555555555 222 000 0 99 5555555 2 0 222222222 888 0 99 4444444 0 0 99 99 0 22222 0 0000000000000000000000000 0 0 0 4 6666 99 888 0 4 2222222222222222 0 0 22 0 5555555 0 0 2222222 0 88 0 99 11111111 0 99 666 2 0 0 0 0 99 0 99 99 0 2 0 888 222222222 99 0 0 0 0 888 55555 11 9 4444 9 4 999 4 9 4 000 4 999999999 4 000 4 4 33 4 4 66 2 0 0 9999 7 333333333333333333 0 222 4 0 5555 0 999 4 000 999999 0 99 0 0000 66666666666666666666 0 111111111 0 0 0 888 22 0 8888888888888 0 0 0000 99 0 99 999999999 0 0 99 0 99 4 444444444444444444444 0 44 444444 0 99 0 1111111111 444444 2222222 4 2 5555 9 555555 000 0 0 5555 0 0 0 55 0 5555 55 0 444 55 000 000 33333333333 0 66 22222222 3 66 3 3 7 3 88888 2 3 333333333 444 3 3 3 3 888 0 2 7
consensus : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTAT-ACTTTTTTAAAA-----AAGT-AAGTC-GGA-TTGGTATCA-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCCGG-CGAC-AG-TATT---ACA---G--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCNTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACCG-G--AA-TAA---ATGCGCA----GTT-AC------TT-------------A--AATT--------AGG---CCTACCTTACATTATCCT--G-GA-ACTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AAT-TA-TTATATCCATT---C-AGGTTTTTTTTC---CCCTGGATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC--AA--TGC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT------A--NTT--AGA--CN--TATAG-GCTG--T-G-AT-----TAAAA---------AGCAT----------A-------ACAA--TA-ATGGAT-A-ATAGAAT-T-------G-GAG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG-AG--AT-ATT---------TAC-----TCAG--GT---A--ATT--TC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-T-ATTT-TTTTTT-A-ATT----TACATAA---AT-ATAACTGA-TATT-CTCTCGTNAGT-T--ATCAC-AAAC-TTTTCA-TT----G-T------TA------G--AGAAGAA--A--ATG-TAGG-CCT-A-T--G-T---CC--A-TTGAT--GAG-GGG-TTTA-AT------------------GT-AGA-T--A-GGGGG-------G-GGGGG-TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T----AT-AAAG-AAAA--AAAAA---TCA-CTA-TA--ACGCAGT----T-AATTA-GCAGC-ACAA-CTTG--CA--C--TCT---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCC--CC--ACCCACAT-ACACA------TC-AA-GA----ACTA---AAATG--------AC-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGAC--TGAAAGT-CAAACATATC--GCG-TAT---TG--TA-GACT------------AC-C--T---GGTAAAA--T--C-CGCC-AC-AGTGAC-G-----AT-GTGT--ATATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--A-----T---TAT-----------TA-TTACTTTT-AAAT-----ATG--CAACTTTC------ATTTTCAT-AAAAG----AAAGC--A--TT---ACGA----T-CT-A--------C-AAT-------TTCG-C-G--TTGATA--G-AG-T--ATT-T-AT-AAA-A--C--GAGG-CAT-A-T--TAG------AAG---TGAAAGTAAA-N---AAG---TT-AT-TTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTC--GT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-G----AA-CACTTTT-------------------------G-C-TTGA-TCGA----A--T---CCAA-AGAAAAA------------A---T-TG-TTA-GT-GGGTTTGTGAC-GAT-A-------TTT-GA--TGA-GA--GACA--------TCAG-GT--GG-G-TGTATT-A-AT-T-AAT--GA-GATG--AAAATA--G-AGAAA-T---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT---GA-----G--T-G----CATTT-T---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACCG-CA-T-GCA-TT-C-TG--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGGA--N-ACA-TGTANT-G-TA-C-A---T-GTAT-GA-C-AACCATA-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTG--------------------CTTTT-TN-T------GT-TT-C-TG---A-TC-GAGT-------A-----T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAC-A--GTA-G--T----CTC-GAA-A--G-TAAATGTGTGTTA-TAT---TA-AAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TGA-----N-CGTG-GAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-T-A-AT-TT---CCCT---GGAC--T----A---CTT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCNA--AGCAT-TCA---GG---AAAAAAT-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
Reference ( gi|2 ) : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATACTAT-ACTTTTTTAAAAATTTCAAGTTAAGTC-GGA-CTGGTATCA-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCCAG-CGAC-AG-TA-----ACA---G--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AGGACA-TTTA---CACAATCAACACCG-G--AA-TGT---ATGCGCA----GTC-AC------TC-------------A--AATT--------AGG---CCTACCT-------------G-GA-ACTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AAT-TA-TTG-ATCCAT----C-AGGTTTTTTTTTTTTCCTTAGATG-TATTT-GAAATGCG-TTAA--TAAACTTT----CACGC--A---TGC-AGT--AG-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT------A--AT---AGA--TA--TATAG-GCTG--T-G-AT-----TTAAA---------A--------------A-------ACAA--TA-ATGGA--A-ATAGAAT-T-------G-GAG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG-AA--AT-ATT---------TAC-----TC----GT---A--ATT--TC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GGGAGAGTGAA--A-TG-T-ATTT-TTTTTT---ATT----TACATAATGAATTATAACTGA-TATT-ATCTCGTTAGT-T--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----G-T------TA------G--AAAAGAA--A--ATG-TAGG-CCT-A-T--A-T---CC--A-TTGAT--GAG-GGA-TTTACAT------------------GT-AGA-T--A-GGGGG-------G-GGGGG-TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T----AT-AAAG-AAAA--AAA-----TCA-CTA-TA-GATACATT----T-A-TTA-GCAGC-ACAA-CTTA--C---C--TCT---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCC--CC--ACCAACAT-ACACA-ACC--TC-AA-GA----ACTATTTAAATG---T----AC-ATGT--AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AGGAC--TGAACGT-CAAAAATATC--GCG-TAT---TG--TA-GACT------------ACGC--T---GTTAAAA--T--C-CGCC-AC-AGTGAT-G-----AT-GTGT--ATATAGACTCTATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--A-----T---TAT-----------TA-TTACTTT--GAAT-----ATG--TAACTTTC------ATTTTCAT-AAAAT----AAAGC--A--TT---ACGA----T-TT-A--------C-AAT-------TTCG-C-G--TTGA----G-AG-T--ATT-T-AT-AAA-A--C--GAGG-CAT-A-T--TAGTTCT--AAG---TGAAAGTAAA-A---ACG---TT-AT-TTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTT--GT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-G----TA-CACTTTT-------------------------G-C-TTGA-TCAA----A--T---CCAA-AGAAAAA------------A---T-TG-TTT-GT-GGTTTTGGGAC-GAT-A-------TTT-GA--TGA-GA--GACA--------TCAG-GT--GG-G-TGTAAT-A-AT-T-AAT--GA-GATG--AAAATA--G-AGAAA-T---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT---GA-----G--T-G----CATTT-T---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACTGTCA-T-GCA-TT-C-TG--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGGA--A-ACA-TGTATT-G-TA-C-A---T-GCAT-GA-C-AACCATA-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--AGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTG--------------------CTTTT-TT-T------GT-TT-C-TG---A-TC-GAGT-------A-----T-CTCCAGCT--A-ATATCATT--AAAC-A--GTA-A--T----CTC-GAA-A--G-TAAATGTGTGTTA-TACCGGTA-AAC-GT--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TGA-----A-CGTG-GAGGGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-T-A-A--TT---CCCT---GGAC--T----T---CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGAAA--AACAT-TCA---AG---AAAAAAT-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|3 : ATACTAACTCATCAATA-----TTATATTAT-ACTTTTTTAAAA----------AAGTC-GGA-TTGGTATCACATA
gi|1 : tagtaaggcactttttgctttggaTACTAACTCAT-AATAATTTATTATATTAT-ACTGTTTTAAAA-----AAGT-------GGATTTGGTATCA-ATATTattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccggcgacagtattacaggtcatatgaggtcttacaaaagcatatatcgcccgaagatatttaaacttcaacaccgcgaataaatgtgcagtttattattaggcctaccttacaattcatctggaaacttattattattctacacaattatatatccctccagggtttttttttcccctgagatatttgaaatacgttaataaactttcacgcatgcagtctaagttgacgtatggtgttcacttaaggactataggctgttgattaaaagccatcgaaaaacaaattacttgatgaatagaattgagaggagctgcagatatcacacgaccatatatcacgagatatttacatcagtcgtaattcaaggtaattatatcgtaagtactgagagagtgaaatggtatttcttttttatatttacatcacagaacttttattaattgtatatgcttagagaagaaaatgctaggcctattgtctattgatgaggggatgtagattgatgggggggggggtgcaaaggcaacagaatgtcctcgctttataaagaaaaaaaaatcacgaatacgacagttaattagcagccacaacttgcactttggaagaaatataggagctaacccccaccacatagacacatgtgacagcagtgagattttgaatgcaaaaagactgaaagtcaaacatatcgcgtatatttgtagacatcctggtaaaatccgccacgtgacgatgttatatatattgttagcgattttatataactattattactttaattagcaactttcattttcataaaagaaagcatacatcctaccatttcgcagttgatagagatatttataaaacgaggacatattagaaggaaagtgtaaacaagcttgttttcaagcgatccttctcttcgtgtaaaggcgtaccgggtttgatatctttcatgcttaaattgtgaacacttttgcttgagtcaaatccaaagaaaaagtgttagtgggtttgacgatatttgatgaagagacatcaggtggtgttatcaatttaattgatatgaaaataggagaaataacacattaataactttttgtaaaatatgagttgcattttcgaaatgatagttgcatctagaccggcaatgcatttctgtgagccacgtcgatggggcatacatgtactgctacaatgtacatgacaaccataggtaattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacagaaaatttgctttttatgttctgatcgagtatctccgttaatatcattaacagtcagttctcgaaagtaaatgtgttatataacgcaataaagcgtacttctctaacgttgttctgatcgtggagtgctcccaactttatccttaattttcgttccagatttaatttccctggactaacttggtattatcttttaagatgaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttccgagatgcggccgagttttcgcccattggcccct
gi|21 : TACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATAACTTTTTTTAAAA----AAGT----CC-GGA-TTGGTATCA-ATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcgttacgtctcccgacgacaggtaatacgaggctccatgaggtcgtacaaaagcatatcgtcgaccggaagacatttacaataagcaccaggaaattttaaatgcgcagtcacttcacatctttatgatagtaaaagtttattataaaggcctaccttacttatcactgggagacttagttaatttttcttaccaccaaatctatatccattccaggttttcccgccctggatggtattgaagatacgataaaaactttcatgctatgcagtaagttgacgtaatcggattactatgggcaactataggctgtgcatcaaaaagcatcgaacaattatgaaataaatttagagcatgcagatatcacacgacgcattatcacgagatatttactcagtcgttgaatttcaaggtatatatcggtaaagagagagagtgaaatgtaattttttttattaatttacatattataactgatatttctctcgtagttcaatcacaaacttttattgtttgtaagaagaaaagtaggtcctagatgttccattatgagggatttagataggggggcgggggtgacaaaggcataagaaattctcttctgctttatataagaaaaaaccaccaataatgcactagtacattagcagcacaaacttgagcactctatatgggaagaatataggatactagcccccacccacatacacacacaaatcaatgaactaaatgaacatgtgtacgcgagtgagattttgaatgaaagactgaaagtcaaacatatgctgtaactactggtaaaagatctcgccacagtgagatgttgtatatattggttcgattataatataatttaattattactttagaaagcattagatctacgaatttcgcgttgatagtcgattctataaaagacgaggacatattagggaaggtgaaagtaaagcaagttatttttcaagtgatctcttcttcgtagtcaaagcataccggttgaattttctgcttaaattgtgaacacttttgcttgatcaaatccaaagaaatttttttttgtgggtttgacgatattgatgagagacgtcaggtaggggtgtattacattaatgagatgaaaagagaaataaacataataactttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatggttgcatgtagacgcatgcattttgaatgtaccaacgccgatggggatacattatgacaaccatcggataattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacaggaaaacttgctttttatgtgttcttgacgagtatcttcagttatatcataaacaagtaggtctcgaaagttaaatgtgtatatataagcaataatagcgtattttaacgtttctgatcgtggatgctcccaactttatccttatttttcgtccagatttaatttccctggactacttggtattatttttagaaacagacatccatagcaaacattcaggaaataattcatttccgagacggggccgattttcgccttggagccctac
gi|4 : AAGTCCGGA-TTGGTATCA-ATATT
gi|20 : tttaaaaAAGTC-GGA-TTGGTATCA-ATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccgggcgaccagtataaggcctctatgaggtctacaaaagcatatattcgccgaagatatttaattcacaacacccggaaataaatgtgcagttttattatttaggcctaccttacattatcctggaacttatttatttttctacacaattaattatatccattcagggtttttttcccctggattattttgaaatacgttaataaactttcacgcaatgcagtaagttgaacgtatggttgtattaggactataggctgtgattaaaaagcattcgaaaaacaatacttataatagaattggagagcatgcagatatcacacgaccattatcacgagattatttactcagtccgaattcaaggtaattatatcgtaagtacgagagagtgaaaatgtaatttttttttttaatatttacttcacaaactttttattaattgttatatgtagagaagaaaaattaggcctattctattgatgaggggatttagatgagggggggggtgcaaaggccaagaaatttcctgctttattaaagaaaaaaaaaatatcactatacacagttaattagcagccacaacttgccactcttgggagaaatataggagtaacccccacccacatagacacatgggacgcgagtgagatttgaatgcaaacaagactgaagcaaactaatcgcgtattttagactacctggtaatccgccacagtgacgatgtttatatattggttagcgattttataataactattattacttttaattatgcaacttcattcataaaagaaagcattacgatctaccatttcgcgttgatagagtatttattaaaacgaggcatattgaagtgaaagtaaacaaagttgttttcaagcgatcctctctcttcgtgtaaagcgtaccggtatattttctgcttaaattgtgaacactttttgcttgatcaaatccaaaaaaaaattgttaagtgggtttgacgatatttgatgagagacatcaggtggtgtatcaattattgatatgaaaatagagaataacaattaataaacttttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatagttgcattagaccgcatgcatttctgtgagcaacgtcgatgggatacatgtatgtacatgtatgacaacataggataattctgctgtaaccaggggccttgtacaaacagaaatttgctttttatgtttctgactcgagtatctccagttaatatcattaaaacgtagttctcgaaagtaaatgtgtttataacgcataaaaggtaatttctaacgttttctgaatcgtggagtgctctccaactttatccttaattttcgtcccagatttaatttccctggacgtattggtattatttttaagaaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttcgagatgggccgatttttcgccctttggagcccct
gi|4 : tagataagggcacttttttttggaatactactcataatatattaaaCTTAC-AGTC-TCCGGGCGACCAG-TAT----AAG---G--C-CT--------CTATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATATTCG-CC-G-AAGATA-TTTAATTCACAAC--AC-CCG-G--AAATAA---ATGTGCA----GTT---------TT-------------ATTATTT--------AGG---CCTACCTTACATTATCCT--G-GA-ACTTA-TTTA-T-TTTTCT---AC-AC--AAT-TAATTATATCCATT---C-AGGGTTTTTTTC---CCCTGGAT--TATTTTGAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC--AA--TGC-AGT--AA-GTTGAAC---GT-A--TGGTTGT------A--TT---AGG--AC--TATAG-GCTG--T-G-AT-----TAAAA---------AGCATTCGAAA----A-------ACAA--TA-CTTAT--A-ATAGAAT-T-------G-GAG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG-AG--ATTATT---------TAC-----TCA---GTCCGA--ATT---C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--AATG-T-AATT-TTTTTT----TT----TA------------------A-TATT--------TACT-T----CAC-AAAC-TTTTTA-TTAATTG-T------TATATGTAG--AGAAGAA--A--AAT-TAGG-CCT-A-T----T---CT--A-TTGAT--GAG-GGG------AT------------------TT-AGA-T----GAGGG-------G-GGGGG-TG-CAAA-GGCCAAGAAA--TTTCCT--GC-TT-T----ATTAAAG-AAAA--AAAAAATATCA-CTA-TA---CACAGT----T-AATTA-GCAGCCACAA-CTTG--C---CACTCT---TGG-GA-GAAA--TATAGGAG---T-A-ACCC--CC--ACCCACAT-AGACA---------------------------------------C-ATGGG-AC-GCG-AGTGA-GATTT-G-AAT-GCAAACAAGAC--TGAA-G--CAAACTAATC--GCG-TAT---TT--TA-GACT------------AC-C--T---GGTAA----T--C-CGCC-AC-AGTGAC-G-----AT-GTTT--ATATA-------TTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--A-----TAACTAT-----------TA-TTACTTT--TAATT----ATG--CAACTT-C------ATT--CAT-AAAAG----AAAGC--A--TT---ACGA----T-CT-A--------C-CAT-------TTCG-C-G--TTGATA--G-AG-T--ATT-T-ATTAAA-A--C--GAGG-CAT-A-T--TG-------AAG---TGAAAGTAAACA---AAG---TT-GT-TTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTC--GT-GT--AAA-G----CGT-AC----C----GG---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-G----AA-CACTTTTT------------------------G-C-TTGA-TCAA----A--T---CCAA-A-AAAAA------------A---T-TG-TTAAGT-GGGTTTG--AC-GAT-A-------TTT-GA--TGA-GA--GACA--------TCAG-GT--GG---TGTATC-A-AT-T-ATT--GA-TATG--AAAATA--G-AG-AA-T---AA-----CAA-TTAATAAACT-TTT-GTA-AAAT-AT---GA-----G--T-G----CA-TT-T---CGAA-AT-A-T--AGTTGC-A---T-T-A-G-ACCG-CA-T-GCATTT-C-TG--T-GAGCA-ACGTCG-AT-GGGA--T-ACA-TGTA-T-G-TA-C-A---T-GTAT-GA-C-AA-CATA-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCC-T-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTG--------------------CTTTT-TA-T------GT-TT-C-TG---ACTC-GAGT-------A-----T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAA-C--GTA-GT-T----CTC-GAA-A--G-TAAATGTGT-TTA-T--------AAC-GC--A--TAA-AAG-GTA---A--TTT-CT--AA-CGT------T--TTC------TGA-----ATCGTG-GAGTGCTCT---CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-TCCC--A-G----A--TT-T-A-AT-TT---CCCT---GGAC--G----T---ATT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AG-CA--AGCAT-TCA---GG---AAAAAAT-AATTCA-TTT--C-G-AGAT----GGGCCGATTTTTCGCCCTTTGGAGCCCCT
gi|3 : tttaaaaaagtccggattggtatcaatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaCTTAC-AGTC-TCCGG-CGAC-AG-TATT---ACA---G--G-TCA-------T-ATGAGG----TC-TTACAAAAGCATAT-ATCG-CCCG-AAGATA-TTTA---AACT-TCAACACCGCG--AA-TAA---ATGTGCA----GTTTAT------T------------------ATT--------AGG---CCTACCTTACAATTCATCTGG-AA-ACTTA-TTAT-TATT--CT---AC-AC--AAT-TA-TAT-ATCCCT----CCAGGGTTTTTTTTTCCCCTGAGAT---ATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC--A---TGC-AGTCTAA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GTTCACTTA--A----GGA--C---TATAG-GCTG--TTG-AT-----TAAAAGCCATCGAAA--------------A-------ACAAATTA-CTTGATGA-ATAGAAT-T-------GAGAGGAGC-TGCAGATAT----CACACGAC-CATATATCACG-AG--AT-ATT---------TACATCAGTC----GT---A--ATT---C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTACTGAGAGAGTGAA--A-TGGT-ATTT-CTTTTTTATATT----TACATCAC-----AGAACT---T-TT-AT-----TAAT-T--GT-AT-A------------T----GCT------TA------G--AGAAGAA--A--ATGCTAGG-CCT-A-TT-G-T---CT--A-TTGAT--GAG-GGG------AT------------------GT-AGA-TTGATGGGGG-------G-GGGGG-TG-CAAA-GGCAACAGAA--TGTCCTC-GC-TT-T----AT-AAAG-AAAA--AAAAA---TCA-CGAATACGACA-GTT----A-A-TTA-GCAGCCACAA-CTTG--C---A---CT---TTG-GAAGAAA--TATAGGAGC--T-A-ACCC--CC--ACCA-CAT-AGACA---------------------------------------C-ATGTG-ACAGC--AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGAC--TGAAAGT-CAAACATATC--GCG-TATATTTG--TA-GAC-------------ATCC--T---GGTAAAA--T--C-CGCC-AC--GTGAC-G-----AT-GT-T--ATATA-----TATTG-TTAGCG-ATTTTAT----ATAA-----C---TAT-----------TA-TTACTTT--AATT-----A-G--CAACTTTC------ATTTTCAT-AAAAG----AAAGC--A--T----ACAT----C-CT-A--------C-CAT-------TTCG-CAG--TTGATA--G-AGAT--ATT-T-AT-AAA-A--C--GAGGACAT-A-T--TAG------AAG----GAAAGTGTA-A---ACAAGCTT-GT-TTT----CAA-G-----C-GA-TCCT-----------------T-C-TCTTC--GT-GT--AAAGG----CGT-AC----C----GGGTTTGAT--A-----TCTTTCATGC-TTAAAT--TG--T-G----AA-CACTTTT-------------------------G-C-TTGAGTCAA----A--T---CCAA-AGAAAAA------------G---T--G-TTA-GT-GGGTTTG--AC-GAT-A-------TTT-GA--TGAAGA--GACA--------TCAG-GT--GG---TGTTATCA-AT-TTAATT-GA-TATG--AAAATA--GGAGAAA-T---AA-----CACATTAAT-AACT-TTTTGTA-AAAT-AT---GA-----G--TTG----CATTT-T---CGAA-ATGA-T--AGTTGC-A---TCT-A-G-ACCGGCAAT-GCA-TTTC-TG--TGAGCCA--CGTCG-ATGGGGC--ATACA-TGTACT-GCTA-C-AATGT-ACAT-GA-C-AACCATA-GG-TAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GA-AA-A--T-TTG--------------------CTTTT-TA-T------G--TT-C-TG---A-TC-GAGT-------A-----T-CTCC-GTT--A-ATATCATT---AAC-A--GTC-AGTT----CTC-GAA-A--G-TAAA--TGTGTTA-TAT------AAC-GCA-A--TAA-AGC-GTA--CT--TCT-CT--AA-CG-------TTGTTC------TGA-----T-CGTG-GAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-GTT-CC--A-G----A--TT-T-A-AT-TT---CCCT---GGAC--TA---A---CTT-GGTATTATCTTTT---AA---G-ATGAACAGA-C-ATCC-AT-AG-CA--AGCAT-TCA---GG---AAAAAAT-AATTCA-TTTC-C-G-AGAT---GCGGCCGAGTTTTCGCCCATTG--GCCCCT
gi|13 : tagtaaggcactttttgctttggaatactaactcatcaatattatattatacttttttaaaaaagtcggattggtatcacataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaCTTACCAGTCCTCTGG-CAAC-AG-TAT----ACA---GGCC-TTAACTGTACCCATGAG------T-T-ACAAAAGCATATCGTCG-C--G-AAGACA-TTT----TACAATCAACACCG-G--A--TAA---ATGCGCA----GTT-AT------T------------------ATT--------AGGGGGCCTACCTTACATTATCT---G-GA-ACTTA-TTAT-T-TT--CT---AC-AC--AA--TA-TCATATCCATCATGC-AGGTTTTTTTT
gi|1 : tttaaaaagtccggattggtatccaaatattaagagaaaagagagaagagagagagagagagatcaTTAC--GTC-TCCCGACGAC-AGGTA-----ATACGAG--G-CT--------CCATGAGG----TCGT-ACAAAAGCATATCGTCGACC-GGAAGACA-TTTA---CA--ATAAGCACCA-GGAAA-TTTTAAATGCGCA----GTC-ACTTCACATCTTTATGATAGTAAA--AGTTTATTATAAAGG---CCTACCTTACTTATCACTG-G-GAGACTTAGTTAA-T-TT--TTCTTACCACCAAATCTA-T---ATCCATTC--C-AGGTTTTCCCG----CCCTGGATGGTATTG-AAGATACG-ATAA---AAACTTT----CATGCT-A---TGC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-AATCGGA-TT------ACTAT---GGG--CAACTATAG-GCTG--T-GCAT-----CAAAA---------AGCATCG--------A-------ACAA--TT-ATG-A--A-ATAAATT-T----------AG-AGCATGCAGATAT----CACACGACGCAT-TATCACG-AG--AT-ATT---------TAC-----TCAGTCGTTG-A--ATT--TC----AAGGTA--TATATCGGTAA-AGA--GAGAGAGTGAA--A-TG-T-AATT-TTTTTT---ATTAATTTACATA-----TTATAACTGA-TATTTCTCTCGT-AGT-TCAATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----G-T------TT------GTAAGAAGAA--A--A-G-TAGGTCCT-A-G--A-TGTTCC--A-TT-AT--GAG-GGA-TTTA-------------------------GA-T--A-GGGGG-------GCGGGGG-TGACAAA-GGCATAAGAAATTCTCTTCTGC-TT-T----AT-ATAA-GAAA--AAA-----CCA-CCAATA--ATGCACTAGTAC-A-TTA-GCAGC-ACAAACTTGAGCA--C--TCTATATGG-GAAGAA---TATAGGATAC-T-A-GCCC--CC--ACCCACAT-ACACACACAAATC-AATGA----ACTA----AATG---A----AC-ATGTGTAC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-G---A-AAGAC--TGAAAGT-CAAACATAT---GC--------TG--TA--ACT------------AC----T---GGTAAAAGAT--CTCGCC-AC-AGTGA--G-----AT-GT-T--GTATA-----TATTGGTT--CG-ATT--AT----A--A-----T----AT-----------AA-TT---------------------TAATTATT------ACTTT-------AG----AAAGC--A--TT---A-GA----T-CT-A--------CGAAT-------TTCG-C-G--TTGA----T-AG-TCGATTCT-AT-AAA-AGAC--GAGGACAT-A-T--TAGGGA---AGG---TGAAAGTAAA-GC--AAG---TT-AT-TTTT---CAA-G-----T-GA-TC-T--C--------------T---TCTTC--GTAGTCAAA--G----CAT-AC----C----GG---T--TGAA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-G----AA-CACTTTT-------------------------G-C-TTGA-TCAA----A--T---CCAA-AGAAATT------------T---T-TT-TTT-GT-GGGTTT--GAC-GAT-A--------TT-GA--TGA-GA--GACG--------TCAG-GTAGGG-G-TGTATT-ACAT-T-AAT--GA-GATG--AAA--A--G-AGAAA-T----A-----AAC-ATAAT-AAC--TTT-GTA-AAAT-AT---GA-----G--T-G----CA-TT-T---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---TGT-A-G-AC-G-CA-T-GCA-TT-T-TGAATGTACCA-ACGCCG-ATGGGGA-----------------TA-C-A---T--TAT-GA-C-AACCATC-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GGAAA-A--C-TTG--------------------CTTTT-TA-T------GTGTT-CTTG---A--C-GAGT-------A-----T-CTTCAGTT----ATATCA-T--AAACAA--GTAGG--T----CTC-GAA-A--GTTAAATGTGTA-TA-TA----TA-AGC-A---A--TAATAGC-GTA-------TT-TT--AA-CG-------T--TTC------TGA-----T-CGTG-GA-TGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TATT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-T-A-AT-TT---CCCT---GGAC--T----A---CTT-GGTATTAT-TTTT----A---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AG-CA--AACAT-TCA---GG------AAAT-AATTCA-TTTC-C-G-AGAC---GGGGCCGA-TTTTCG-CC-TTGGAG-CCCTACcccctg
gi|5 : tactaactcataataatttattatattatactgttttaaaaaagtggatttggtatcaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcgTTAC-AGTC-TCCCG-CGAC-AG-TACTCGTACA---G--CGCTA-------C-ATGAAGGATCCC-T-ACAAAAGC-TATCTTCG-CC-G-AAGACAATTTA---CA--ATCA---CCG-G--A----T---AT---CATTAGGCT-AC------TT-------------AC-AATT----------------TTCCT-------------GCGA-ATTTA-TTAA-T-TA--TT---AC-AC--AAT-TA-TTA-ATC-AT----C-AGATTTTTTT------CCTGGATG-TATT--GAAATACG-GTAAATCAAACTTT----C-CGCCAA---TTCCAGT--AC-GTCGA-CTGAGT-A--TCGT--T------A--CTT--AGA--CT--CATAGCGCAT--T-G-ATGAAAATTAAT---------A--------------ATTTCTAGACAA--AATATGGG--A-AAAGAAT-G-------G-GAG-AGCATGC-------------------------TCA-------AT-ATT---------TAC-----TCAG--GT---C--GTTATTC----AAGGTAATTAT-TCG-TAAAGTACCGAGAGAGTGAA--A-TGCT-ATTT-T--------GTT----GAAAAAAAAAA--ACAAT--A-CATC--TCTCGTAGGT-T--ATCACCAAACGTTTTAA-TT----G-T------TAC-----G--AGAAGAACAA--ATG-TAGA-CCTCACT--AGT---CCTCACTTGATATGGG-GGA-TTTA---------------------GT-A---T--A-GGGGGAGCTTGGG-GGGGG-GG-CAAACGGCAAAGAGA--TTTCCTC-GC-TT-TTGTGTT-AAAG-AAAAAGAAA-----TCA-CTA-T--TCTACAGTCGCAC-A-TTAGGCAGC-ACAC-ATTG--CACTC--CCT---TGG-GAAGAAAAGTATAGGAGT--T-A-ACCCAGCC--A-CATTAC-ACACA---C--TC-CA-GACAACACTA--GAAATG---CATTAAC-ATGTG-AC-GCG-AGTAATGAATTTGTAAT-GCAAA---GACTATGAA-AT-C--AACTATT--GCGTTAT---CGACTG-AACT-------------CGC--CTGGGTTAAAA--TCCC-CGCC-GC-AGC-AT-GCACGCATCGTGTTCATATA--------TGAATAGCGTATTTTAT----A--ATACACT---TAT-----------TACTTACTTG--AGATTATTCATG--CAACTTTC------ATTTTCATAAAAAA----AAAGG--A--TTA--ATGA----TCCT-A--------CGAAT-------TTCG-C-GGTTTGATG--G-AG-T--ATT-T-AT--AA-A--C--GAGG-CAT-C-T--ACATTGTAGAAG---TGGAAACAGA-AGT-AAG---TT-ATATTT----CAA-AAAAGCC-GACTCCTGCC--------------T-C-TCTTCCAGT-TA--AA--G----CGT-AC----CCTCGGG---T-AT--A-----TATTTC-TGC-TTAAATGATG--T-G----AACCACTTTT-------------------------G-CATTGA-TCGA----ACTC---CCAACAGAAAAG------------AAATT-TG-TTA-GT-TGGATTATGACGGAT-A-------TTTAGAC-TGA-GAC-GACA--------TCA--GT--GG-T-AGTATC-A-AT-T-AAT--GACGATGACAAAATACGA-AGAAA-TCTAGA-----AACATTAAT-AACT-TTT-GTAGAAAT-ATCTACA-----A--TGG----CATTTAA---CGAACATCA-TTGGATCGC-AATTC-T-ACGCACCAGCA-T-GCA-TT-CTTGC-TGAACCACACGCCA-CTGGGGA--ATACATTGTACT---TA-CAA---T-GTAT-GATC-AACCATA-GGATAATT-CTG----CTCT-A
gi|24 : T--------AGG---CCTACCTTACGTTATCCT--G-GA-ACTTA-TTAATT-TT--CT---AC-AC--A
gi|9 : ATTT-GAAATATGATTAA--TAAACTTTACAATACGC--AATATGC-AGT--AAAGTTG--C---GTTA--TGGT-GT------A--CTTGAAGACTTA--TATAG-GCTAGTT-G-AC-----TTAAA---------AAGCCATATCGAAAAA-------ACAA--TA-ATGGATTACGTAGAATATTAATAGGA-GAG-AGTATGCAGATATACTACACACGAC-CAT-TATCACGTAATGAT-ATTACATCTATGTAC------C----GT---AGTATT--TCCAGTAAGATA--TATATCG-TAATGCTC-AAGAGAGTGAACTA-TG-TAATTTGTTTTTTAAAATT----TACAT-AT--ATAATACTTGATTATTCCTCTCGTAGGTCT--ATCAC-AAAC-TT-TTA-TT----G-CTACATGTA------G--AGAAGAA--AAGATG-TAGG-CCT-A-TTGG-T---CC--A-TTGAT--GAG-GGG-ATTA-ATTAGGGGCCCCGGGGGGGGGTGGGG-T--G-GGGGG-------G-GGGGT-TG-CAAA-GGC-AAAGAA--TTT-CTC-ACTTT-T----AT-AAAGAAAAA--AAA-----TCA-CTA-T---ACACAGT----TAA-TTA-GCAGC-ACAA-CTT
gi|7 : aAAT-TTCTCA-CT----T-T------TATAAA--G--AAAA-AA--A--AT--CA----CT-A-T--A-C---AC--AGTTAAT--TAGCAG----CACAA------------------CT-TGACT--A-AAAGT-------G-GGGGG--G-CAA--GGCAAA-GAA--TTTCCTC-AC-TT-TT---AT-TAAG-AAAA--AAAAA---TCAACTA-TA---CACAGT----T-AATTA-GCAGC-ACAA-CTTG--CA--C--TCT---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---TTA-ACCC--CCCGACCCACATTACAAC-ACA--TC-AA-GA-----CTAT--AAATGAATT----AT-ATGTG-AC-GCGCAGTGA-GATTT-G-AATTGCAAA-AG-AC--TGAAAGTTCAAACATATC--GCG-TAT---TG--TA-GACCCGGATTGTAGACACAC--T---GGTAAAA--T--C-CGCC-ACCAGTGAC-G-----AT-GTGT--ATATA-------TTGGTTAGC--ATTTTATTAATA--A-----T---TAT-----------TA-TTACTTTT-AAAT-----AT---CAACTTTC------ATTTTCAT-AAAA-----GAAGC--A--TT---ACGA----T-CT-A--------C-AAT-------TTCG-C-C--GGAA----G-AG-T--ATT-TTAT-AAA-A--C--GAG--CATTA-T--TAG------AAG---TGAAAGTAAA-C---AAG---TT-AT-TTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------TTC-TCTTC--GT-GT--AA--G----CGTTAC----C----GG---G-AT--A-----T-TTTC--GC-T-ATAT--TG--T-G----AA-CACTTT--------------------------G-C-CTGA-TCGA----A--T---CCAACAGAAAAA------------AAGATATG-TTAAGT-GGGTT-GTGAC-GAT-A-------TT--GA--TGA-GAA-GACA--------TCAGCGT--GGAG-TGTATT-A-AT-T-AAT--GA-GATG--AAAATA--G-AGAAA-T---AA-----AA--TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-ATT--GA-----G--T-G----CATTT-TTT-CTAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-TTA-G-AC-G-CA-TTGC--TT-C-TG--TGAACCA-ACGCCGCATGGG-A--T-ACA-TGTATTAG-TA-C-A---TTGTATTGA-C-AACCATA-GGAGAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-AATT-TTG--------------------CTTTT-AT-G------TT-TT-C-TG---A-TC-GAGTACATGTAA-----T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAC-A---TA-G--T----CTC-GAA-A--G-TAAAT-TGTGTTA--AT------AAC-GC--A--TAA-AGC-------A--TTTACT--AA-CG-------T--TTC------TGG-----ATCGTG-GAGTGCTC----CAAA--TTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-T-A-AT-TT---CCCT---GGAC--T----A---CTT-GGTATTA--TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AG-CA--AACAT-TCA---GGGAAAAAAAAT-AATTCA--TTC-C-G-AGAT---GGGGCCGATTTTTCGCCC-TT-GAGCACCTAg
gi|6 : C-TTCTCAGTT----G-T------TA------G--AAAAGAA--A--ATG-TAGG-CCT-AGT--G-T---C---A-GTGAT--GAG-GGAATTT-----------------------T-AGA-T--A-GGGGG-------G-GGGGGGTG-CAA--GGTAA--GAA--TTTCCTC-ACGTTGT----AT-AAAG-AAAA--AA------TCAGCT--TA-CAGGCATT----T-AATTACGCAGC-ACAA-CTTG--CAG-C--TCT---TGGTGAAGAAA--TATGAGAGGGAT-ATACCC--CC--ACCCACAT-ACACA-CAC--TCGAA-GA----AATATA-AAATGG--T----ACTATGTGGAC-GCG-AGTGC-GATTG-G-AAC-GCAAA---GAC--TGAAAAT-CAAAGATATATGGCG-T-T---TG--TATGACT------------AC-CAGT---GTTAAAC--T--C-CGCCCAC-AGTGATTG-----AT-G-GT-----TGGTTAATATTGGTTAGCGGATTTTATT---A--A-----T---TATGCGGTCATATTTA-TTACTTTT-AAAT-----ATGCATAACTTTC------ATTTTCAT-AAAAG----AAAGCCAA--TT---ATGA----T-TTTA--------C-AAT-------TTCG-C-G--TTGATGAAGTAA-T--ATT-T-AT-AAATA--C--GAGG-C-T-ACT--TAGA-----AAG---TGAAA-TAAA-C---AAG---TT-TT-TTTT---CAA-G-----C-CA-TCCT--C--------------T-C-TCTTC--GT-GT--AA--GAACGTGT-AC----C----GG---T-AC--AG----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--TTG----AA-CACTTTT-------------------------G-C-TTGA-TCGA----A--T---CCAA-AGAGAAA------------AC--T-TG-TTT-GT-GGGTT-GTAAC-GATGA-------TTT-GAATTGA-GA--GACA--------TCAG-GT--GG-G-TGTAAT-A-AT-T-AATA-GA-GATG--AAAATAA-G-AGAA--T---AA-----CCA-TTAA--AACT-TTT--TA-AAATGAT---GAACGAGG--T-GGGCCCATTC-TTCTCGAA-AT-A-C--C-TTGCTA---T-G-T-G-ACTG-CA-T-GCA-T--C-TG--TGGACGC-ACGCC--ATGGGGACTG-ACA-TGTAAT-G-TAAC-A---T--CGT-AA-TGAAACATAAGGATAATG-CTG----CTGT-AACCAAG--GGCCTT--GT--ACAAA------A-G--AA-A--TATTG--------------------CTGTT-TTAT------GT-TT-C-TG---A-TC-GAGT-------A-----T-CCCCA-TT--ACATATCATT--A--C-A--GTG----T----ATC-GAA-A--G-TAA---TGTGTTA-TAT------AAT-GCCAA--TAA-AGT-GTA--T----TT-CT--GA-CG-------TC-TTC------TGA-----A-CGTG-GAGTGCTC-------ACTTTTTC------A---TCTAAT-TTT----C-G-T-CG--A-G----A--TT-T-A-AT-TT---CCCT---GGAA--C----A---CTT--GTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-ATGAGCAG--ACCAT-TC----GG---AAAATATAAGTTCA-TTTCAC-G--GAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|10 : ----A--A-----T---TAT-----------AA-TTACTTT--TAAT-----ATG--CA-CTTTCTCATTTGTTTTCAT-AAAAAGAA-AAAGC--A--TTT--ACGAGATTT-TT-ATATTACATC-AACCATAAAATTCAAC-G--TTGGAT--G-AGGT--ATT-T-AT-AAA-A--CGAGAGG-CA--A-TGATATTTAG--AAAAGTTGAAAGTAAA-ACTGAAG---TTAAT-TTTTCTACAA-G-----CTGA-TCCC--CCTACAATTCTTTCGT-C-TTTTG--GT-GTA-AA--G----CAT-ACCCTGC----GG---T-AC--ACAATCC-TTTC-TGCTTTAAAT--TGAAA-G----AA-CATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACATAGCGCG-T-TTGA-TCGAAGCGA--TATACCAAGAGAAAAAAAATAAAGAAAAA---T-TATTTT-GTGGGGTTTGGAACAGAT-GATTTATTTTT-GAGTTTA-GAAGAACAATAGTATATCAG-GT--GG-ATTGTAAT-G-ATCT-AATAGAA-GATT--GAAATA--G-AGAAATT---AA-----AA
gi|8 : --A-----T---TATG----------TA-T-ACTTTTTAAAT-----AT---CAACTTTT------ATTTTCAT-AAAACCAGAAAAGC--AACTTCACACGA----TCTT-A--------C-AAT-------TTCG-C-G--TTGATA--G-AG-T---TT-T-AG-AAA-------GAGG---T-A-T--TA----T--AAGC--TGAAAGTAAA-C---AAG---TT-AT-TTT----CAACG-----C-GA-TCCT--C--------------T-CGTCTTC--GT-GT--AA--G----C----T----C----GT---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAACACA-CACTTTT-------------------------GGC-TTGA-GCGA----A--T---CCAA-AGAAA--------------------TG-TTA-GT-GGGTT----GC-GA--A-------TTT-GA---GA-GA--GATA--------TCAG-GTT-GG-G-TGTATT-A-AT-T-AAT--AA-GATG--AAAATA--G-AG-AA-T---AACCATTAAC-AT-AC-AACTATAT-G-A-AAAT-AT---GA-----GATT-G----CATTT-C---CGAA-AT-ATT--CATAAC-A---T-----G-ACCA--A-T-GC--TT-C-T------AATT-ACGCAG-ATGGATA--A-GTA-TGTAAG-G-TA-----------AT-GA---AACCATC-GGATAA-T-CTG----CTGT-AACCAGG--GG----------A----------A-G--AA-A--A-TTG--------------------C-TTT-TT-T------GT-TT-C-TG---A-TC-GA-T-------A-----T-CT-CAGTT--A-ATATCATTA-AAAC-A--GTA-G--T----CTC-GAA-A--G-T-AATGTGTCTTA--------A-AAC-GCA-A--TAA-GG-------TA--TT---C--GA-CG-------T--TTC------TGA-----T-CGTG-GAGTGC-C----CCAAC-TTATC------C---C-TAAA-TTCACAAC-G-T-CC--A-G----A--TTCT-C-A--CTATACCC-----AAC--T----A---CTT-GGTATTA---TTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCCAAT-AG-----AACAT-TCA---GA---ACAAAA----TTC--TTTC-CAG-AGAT---GGG--CGT-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|19 : tttatatgatctgc-TTT-GTA-AAAT-AT---GA-----G--T-G----CATTT-T---CGAA-AT-A-C--CGTTGC-A---T-T-A-G-ACTG-CA-T-GCA-TT-C-TG--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGGc
gi|17 : --T-G----CATTT-T---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACCA-CA-T-GCA-TT-C-TG--T
gi|22 : T-G-TA-C-A---T-GTAT-GA-C-AACCATA-GGATAATT-ATG----CTGT-AACCACG--GGCCTT-Taaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataataatcagcg
gi|11 : A-GGGTAATTTCTGGGGGCTGT-AACCAGG---GCCTT-TGTCAACAAAAA-C--ACG--AATA--T-TTGTTTTTTTTGGTGCTTACGGTCTTTT-TT-TTTATGGGT-TTTC-TGTAGA-TCCGAGT-------AAAATCT-CTCCAGTTTAA-ATATCATT--AAAC-AAAGTA-G--TTCCCCTC-GAA-AACG-TAGA-ATGTGTTAGTAT---TA-AACCGC--AA-TAT-AGC-GTA--T----TT-CT--AAACGGTTTCTCT--TTCCTTCTTTGA-------CGTG-GGATGCTCAGCGCCAA-TTTATC------CCCCT-TCAT-GTT----C-G-T-TCTCA-GGATAA--TT-C-A-A--TT---TC-T---GGAC--TATAATAAACTT-GGTGTTAT-TTTTTTAGA---GTA--AACAGA-C-G-------AG-GA--AACAT-T
gi|12 : atttatattaatgtactgaagacacagtctgATT-CTG----CTGTTAACCAGGCAGGCCTTCTG---ACAAAACACGAA-A--AA-A--T-TTG--------------------CTTTTATG-T------GT-C--C-TG---A--C-GAGTT------A-----TGCTCCAGTT--A-ATATCATTTAAAAC-A--GTA-G--T----CTCAGAATA--G-TAAA-ATGTGTTA-GAT---TATAAC-GC--AATTAA-AGCAGTAGTTACCTTT-CTCGAA-CG-------T--TTCG-----TGATCCCCG-CCTACGAGGTCGT----CCAACATCATCCTATCGC---T-TAAT-TTT----CAG-T-CC--ATG----ACGTT-T-ATATCTT---CCCTGGGGGACGGT----TA--CTTAGATATTA--TTTT---AAGTGG-C--AACAGAGCGATGC-AT-AG-CA--AGCAT-TC----AG---AAAAAAT-AATTCATTTTC-C-GAAGATTGCGGGGCCGA-TGTTTGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|15 : tTG-GAATGCTC----TTAACTCCATT------C---T-TAAA-TTT----C-T-T-CC--A-T----A--TT-T-G-AC-TT---CCCG---AGAC--A----A---TTT-AGTGTTAT-TTTA---AA---G-A--AATAAA-C-ACCC-AC-GGCAT--A-CAT-TCA---A-----AAAAAT-GGTTCA-ATTT-T-G-AGAT---TGGACCGA-TCTTGATCC-TTAGAGCCCCc
gi|14 : aatGTTC----TTAACTCTATC------C---T-TAATACGT----C-T-T-CC--A-A----A--TT-TTG-C--TT---CCCC---GGGC--A----A---TTT-AGTGTTAG-TTTT---AA---G-G--AATAAA-C-ATAC-AC-AGCAATCAGCAGATCAGGGGG---GGGGGGT-GATTCA-AGTA-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGACC-ATAGAACCCCTA
gi|18 : gtaatTAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCA---GA---CAAAAAT-GGTTCA-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGGGGCgc
gi|16 : aTAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCCCAT-AGCAA--TACAT-TCA---GA---CAAAAAT--GTTCA-TTTC-T-A-A--T---GGG-CCGA-GTTTCGTTC-TTGG-GCCCC
gi|23 : aGTTTC-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGCCC-TTAGAGCCCCCAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 111 555555555555 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333333333333333333333333 1111 111 11 22222 888888888888888888888888888888888888888888 111 111 2222 111 11 111 1111 111 1111111 111 888888888888888888888 11 222222222222 1111 1111 1 444444444444444444 22222222 1 1 1 11 1 4444444444444444444444 22222222222222222 1 1111 444444 11111 222222 1 33333333333333333333333 333333333333333 1 1111 1 222222 111 1 111 22222 2222 3333333333333333333333333333333333333333 1 1 111 11111 333333333333333333 111 11111 1 1111 2222222222222222222 111111 11111111 111 2222222222222222222222 1111 111111111111 1111 111 222222 1111 11111 22222222222222222 22 1111 111 1111111 1111 1 22222 111 222 11 1 111 11 222222222 11111111 1111 111 111 11 111 1111111 111111 11 444444444444444444444444 2222222 11 11 111111 11 3333333333 11111 222222 2222222222 111111 1111111 1111 111111 1111111111111 111111
lowQualScore : 0 8 00000 0 444 0 222222222222 6 6 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 6 6 6 6 6 88888888888888888888888888 4444 6 6 33 6 6 6 6 111 00 2 1 3 6 6 88888 333333333333333333333333333333333333333333 777 66 5 77 5 5 5 77 000 5 77 6 1 7 4444 6 99 3 888 6 88 99 6 000 4444 999999 6 99 6 6 111 6 99 99999 7 7777777 666 99 6 99 6 6 6 777777777777777777777 6 99 6 1 88 99 555555555555 6 4444 6 6 0000 6 3 999999999999999999 00000000 7 6 3 3 99 6 3 55 3 6 2222222222222222222222 44 6 6 11111111111111111 6 5 0 5 0000 5 000000 66 66 11111 5 5 333333 5 777 0 66 33333333333333333333333 888 5 5 444444444444444 5 88 0 44 66 5 0 5 5 0000 5 5 999999 0 444444 66 333 5 5 0 5 66 999 77 000 5 77 66666 5 77 0 2222 1111111111111111111111111111111111111111 5 1 5 5 5 2 5 5 777 77 666 77 1 3 77777 77 5 888888888888888888 77 77 5 77 5 5 77 5 77 5 5 77 333 44444 1 77 5555 8888888888888888888 4 9999 4 8 3 66 222222 55555555 4 66 66 222 4 9999999999999999999999 8 8 4 66 4 4 777 4 4 4 2222 66 777777777777 8 66 7777 4 222 66 333333 4 5555 4 11111 4 4 77777777777777777 4 4 4 11 66 9999 4 9999 3333 333 7777777 4 4 66 66 4 4 3333 5 5 5 66 0 0 77777 000 666 5 5 88 11 5 0 5 444 5 5 5 5 5 5 5 66 66 3 888 555555555 5 5 4 4 4 4 777 22222222 2222 666 4 8 4 666 4 777 000 4 4 22 4 4 4 88 4 99 0 66 4 4 222 5 88888 4444444 55 4 4 4 777 4 4 3 7777 3 55 4 66 888888 4 00 4 66 4 777777777777777777777777 666 88888 4 4 777 66 4 4 5555555 4 66 4 00 00 4 333333 4 4 66 4 44 0 8888888888 4 66666 4 44 333333 4 66 4 0000000000 777777 8 5 4444444 1111 000000 666 3 3 7777 3 3 3 55 3 7777 55 3 3 3 3 3 666 5555555555555 3 77 555 555 3 44 3 3 6 3 888888 3 6666 555 44 3 3 3 3 555 9 6
lowQualScore : . . ..... . ... . ............ . . ............................................................................ . . . . . . .......................... .... . . .. . . . . ... .. . . . . . ..... .......................................... ... .. . .. . . . .. ... . .. . . . .... . .. . ... . .. .. . ... .... ...... . .. . . ... . .. ..... . ....... ... .. . .. . . . ..................... . .. . . .. .. ............ . .... . . .... . . .................. ........ . . . . .. . . .. . . ...................... .. . . ................. . . . . .... . ...... .. .. ..... . . ...... . ... . .. ....................... ... . . ............... . .. . .. .. . . . . .... . . ...... . ...... .. ... . . . . .. ... .. ... . .. ..... . .. . .... ........................................ . . . . . . . . ... .. ... .. . . ..... .. . .................. .. .. . .. . . .. . .. . . .. ... ..... . .. .... ................... . .... . . . .. ...... ........ . .. .. ... . ...................... . . . .. . . ... . . . .... .. ............ . .. .... . ... .. ...... . .... . ..... . . ................. . . . .. .. .... . .... .... ... ....... . . .. .. . . .... . . . .. . . ..... ... ... . . .. .. . . . ... . . . . . . . .. .. . ... ......... . . . . . . ... ........ .... ... . . . ... . ... ... . . .. . . . .. . .. . .. . . ... . ..... ....... .. . . . ... . . . .... . .. . .. ...... . .. . .. . ........................ ... ..... . . ... .. . . ....... . .. . .. .. . ...... . . .. . .. . .......... . ..... . .. ...... . .. . .......... ...... . . ....... .... ...... ... . . .... . . . .. . .... .. . . . . . ... ............. . .. ... ... . .. . . . . ...... . .... ... .. . . . . ... . .
lowQualScore : 8 0 00000 8 222 6 888888888888 7 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 7 7 7 7 7 33333333333333333333333333 2222 7 7 55 7 7 7 7 777 00 5 7 2 7 7 22222 000000000000000000000000000000000000000000 111 44 7 99 7 7 7 99 000 7 99 7 7 3 0000 7 22 2 333 7 00 88 7 888 2222 555555 7 22 7 7 777 7 22 33333 5 7777777 777 22 7 22 7 7 7 222222222222222222222 7 22 7 0 33 22 222222222222 7 2222 7 7 8888 7 3 222222222222222222 77777777 3 7 3 3 22 7 3 88 3 7 8888888888888888888888 22 7 7 77777777777777777 7 0 8 0 6666 0 666666 99 99 88888 0 0 888888 0 111 0 99 00000000000000000000000 888 0 0 555555555555555 0 22 1 00 99 0 0 0 0 6666 0 0 000000 0 000000 99 888 0 0 0 0 99 444 99 000 7 99 00000 7 99 7 1111 7777777777777777777777777777777777777777 7 4 7 7 7 0 7 7 777 99 777 99 7 0 11111 99 7 333333333333333333 99 99 7 99 7 7 99 7 44 7 7 99 444 33333 4 99 6666 2222222222222222222 4 4444 4 0 9 11 888888 33333333 4 11 11 222 4 6666666666666666666666 9 9 4 11 4 4 888 4 4 4 4444 11 999999999999 9 11 2222 4 222 11 888888 4 1111 4 11111 4 4 88888888888888888 4 4 4 11 11 4444 4 4444 9999 999 1111111 4 4 11 11 4 4 9999 0 0 0 99 0 4 66666 888 111 0 0 22 99 0 0 0 444 0 0 0 0 0 0 0 99 99 2 888 111111111 0 0 4 4 4 4 888 44444444 5555 555 0 0 0 222 0 000 333 0 0 88 0 0 0 88 0 55 9 44 4 4 999 0 22222 0000000 55 0 0 0 000 0 0 6 7777 6 55 0 11 333333 4 66 4 11 4 222222222222222222222222 222 77777 4 4 888 33 4 4 6666666 4 11 4 66 66 4 888888 4 4 11 4 77 1 1111111111 4 66666 4 66 222222 4 11 4 4444444444 222222 9 3 4444444 4444 555555 444 6 6 7777 6 6 6 00 6 7777 00 6 6 6 6 6 444 9999999999999 6 22 444 444 1 22 1 1 7 3 888888 3 2222 888 22 1 1 1 1 444 2 2
consensus : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT---GTCGGA-TTGGTATCA-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCATC---C-AGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A-----TCGAAA-A-ACAA--TA-ATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-AGTC-GT--A-------ATT--TC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AGT-T--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----G-TTACA----G--AGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-A--TT-GT-CC--A-TTGAT--GAGGGG-TTTA-AT-TAGA-----T--A-GGG---GGG-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT----ACACAC-C---TC-AA-GA----ACTAT--AAATG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-A---TTG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTT--TAT----AAT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAA--GTAAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GGT---ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TG-AGA-GACATCAG-GT--GG-GTG-TATTA-A-TTAA-T-GA-GATGA--AAATA--GAGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AAC-T-TTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TG----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-C-AT-GCA-TTCT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-C-A-T-GT--A-T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-TATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA-TAT----A-AAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
Reference ( family-3278 ) : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT-AAGTCGGA-TTGGTATCA-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCNTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCATT---C-AGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ANT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A-----T------A-ACAA--TA-ATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-AG---GT--A-------ATT--TC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGTNAGT-T--ATCAC-AAAC-TTTTCA-TT----G-TTA------G--AGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-A--T--GT-CC--A-TTGAT--GAGGGG-TTTA-ATGTAGA-----T--A-GGG---GGG-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT----ACACA------TC-AA-GA----ACTA---AAATG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-A---TTG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTATATA-----TATTGGTTAGCG-ATTT--TAT----AAT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AAATATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAA--GTAAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GGT---ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TG-AGA-GACATCAG-GT--GG-GTG-TATTA-A-TTAA-T-GA-GATGA--AAATA--GAGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AAC-T-TTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TG----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-C-AT-GCA-TTCT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-C-A-T-GT--A-T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-TNTG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA-TAT---TA-AAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ANC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCNA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|1 : TACTAACTCAT-AATAATTTATTATATTATA--CTGTTTTAAAAA-----AGT------GGATTTGGTATCA-ATATT
gi|1 : TTAC--GTC-TCCCGA-CGAC-AGGTAAT---ACGAG--G-CT--------CCATGAGG----TCGT-ACAAAAGCATATCGTCGACC-GGAAGACA-TTTA---CA--ATAAGCACCAG-GAAATTTTAAATGCGCAGTCACTTCACATCTTTATGATAGTAAA--AGTTTATTATAAA---GGCCTACCTTAC---TTATCACTG-GGAGACTTAGTTAA-T-TT--TTCTTACCACCAAATC---TATATCCATT---CCAGG--TTTTCC--CG--CCCTG-GATGGTATTG-AAGATACG-ATAA---AAACTTT----CATGC-TAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-AATCGGA-TT--ACTAT--G--GGCAACTATA--G-GCTG--T-GCA-TCAAAA--AGC---A-----TCG----A-ACAA--TT-ATGAA---A--TAAATT-----T------AG-AGCATGCAGATAT----CACACGACGCAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-AGTC-GTTGA-------ATT--TC----AAGGTA--TATATCGGTAA-AGA--GAGAGAGTGAA--A-TG-TAATTTT-TTTTATTA-A--TTTACATAT----T-A-TAACTGAT-AT-TTC-TCTCGT-AGT-TCAATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----G-TTT------GTAAGAAGAA--AA---G-TAGGTCCT-AGAT--GTTCC--A-TT-AT--GAGGGA-TTTA------GA-----T--A-GGG---GGGCGG-GGG--------------TGACAAA-GGCATAAGAAATTCTCTTCTGC-TT-T-A----T-ATAAGAAAAAACCA---CCA---ATA-ATG-CACTAGTAC--ATTA-G-CAGC-ACAAACTTGAGC-A-CTC--TATATGG-GAAGAA---TATAGGATAC-T-A-GCCCCC--ACCCACAT----ACACACACAAATC-AATGA----ACTA---AA-TG-----AA---C-ATGTGTAC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-G---A-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATAT-GC--------TG--TA--ACT------------AC----TGG--TAAAAGATCTC--GCC-AC-AG--TG-A--G-AT-G--T-TGTATA-----TATTGGTT--CG-ATT----AT----AAT--------------------A-TAA--T----TT-AATTATT----ACTTT------------------A----G---AAA-GC--A--TT---A--GA---------------TC-----T-ACGAATTTCGC-G--TTG-ATAGTC-GA---TTCT-A-TAAA-AGAC--GAGGAC----AT----A-TT--AGGGA-AG-G---TGAAA--GTAAA---GC-AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----T-GA-TC-T--C--------------T---TCTTCGTAGTCAAA--G----CAT-AC----C----GGTTG-A-A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAATTT---T-TTTT-T-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATT--GA--TG-AGA-GACGTCAG-GTAGGG-GTG-TATTACA-TTAA-T-GA-GATGA--AAA----GAGAAAT---AA-----A-C-ATAAT-AAC-T-TT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--TG----CATTT----CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---TGT-A-G-AC--G-C-AT-GCA-TTTT-GAATGTACCA-ACGCCG-ATGGGG-AT--ACAT-------------------T--A-T-GA-CAACCA---T-C-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GGAAA-A--C-TTGCT------------------------TTT-TATG---TGTT-CTTG---A--C-GAGT-A-------T-CTTCAGTT--A--TATCAT---AAACAA-GT-AGGT----CTC-GAA-A--GTTAAATGTGTAT-A-TAT----A-AGC-A---A--TAATAGC-GTA--T-----T-TT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGA-TGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TATT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTAT-TTTT----A---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGG------AAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAC---GGGGCCGA-TTTTCG-CC-TTGGAG-CCCTACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcgttacgtctcccgacgacaggtaatacgaggctccatgaggtcgtacaaaagcatatcgtcgaccggaagacatttacaataagcaccaggaaattttaaatgcgcagtcacttcacatctttatgatagtaaaagtttattataaaggcctaccttacttatcactgggagacttagttaatttttcttaccaccaaatctatatccattccaggttttcccgccctggatggtattgaagatacgataaaaactttcatgctatgcagtaagttgacgtaatcggattactatgggcaactataggctgtgcatcaaaaagcatcgaacaattatgaaataaatttagagcatgcagatatcacacgacgcattatcacgagatatttactcagtcgttgaatttcaaggtatatatcggtaaagagagagagtgaaatgtaattttttttattaatttacatattataactgatatttctctcgtagttcaatcacaaacttttattgtttgtaagaagaaaagtaggtcctagatgttccattatgagggatttagataggggggcgggggtgacaaaggcataagaaattctcttctgctttatataagaaaaaaccaccaataatgcactagtacattagcagcacaaacttgagcactctatatgggaagaatataggatactagcccccacccacatacacacacaaatcaatgaactaaatgaacatgtgtacgcgagtgagattttgaatgaaagactgaaagtcaaacatatgctgtaactactggtaaaagatctcgccacagtgagatgttgtatatattggttcgattataatataatttaattattactttagaaagcattagatctacgaatttcgcgttgatagtcgattctataaaagacgaggacatattagggaaggtgaaagtaaagcaagttatttttcaagtgatctcttcttcgtagtcaaagcataccggttgaattttctgcttaaattgtgaacacttttgcttgatcaaatccaaagaaatttttttttgtgggtttgacgatattgatgagagacgtcaggtaggggtgtattacattaatgagatgaaaagagaaataaacataataactttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatggttgcatgtagacgcatgcattttgaatgtaccaacgccgatggggatacattatgacaaccatcggataattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacaggaaaacttgctttttatgtgttcttgacgagtatcttcagttatatcataaacaagtaggtctcgaaagttaaatgtgtatatataagcaataatagcgtattttaacgtttctgatcgtggatgctcccaactttatccttatttttcgtccagatttaatttccctggactacttggtattatttttagaaacagacatccatagcaaacattcaggaaataattcatttccgagacggggccgattttcgccttggagccctac
gi|10 : tactaactcataataatttattatattatactgttttaaaaaagtggatttggtatcaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcg----AAT-----TAT-----------AA-TTACTT----TT-AA-TATGCA---CTTTCTCATTTGTTTTCATAAAA----AGAAAAA-GC--A--TTT--A-CGAGATTTTTATATTACATCAACCAT-AA-AATTCAAC-G--TTGGATGAGG-TA---TT-T-A-TAAA-A--CGAGAGG-CAATGAT----ATTT--AG----AA-AAGTTGAAA--GTAAAACTG--AAGTTAATTTTTCTACAA-G-----CTGA-TCCC--CCTACAATTCTTTCGT-C-TTTTGGT-GTA-AA--G----CAT-ACCCTGC----GGT---ACACAATCC-TTTC-TGCTTTAAAT--TGAAA-GAAC-AT----TTTT
gi|11 : TAAT-G-TA-C---T-GA--A---GA-CA--CAGTCTGA-GGGTAATTTCTGGGGGCTGT-AACCAGG--G-CCTT-TGTCAACAAAAA-C--ACG--AATA--T-TTGTTTTTTTTGGTGCTTACGGTCTTTTTTTT-TATGGGTT-TT-CT-GTAGA-TCCGAGT-AAAATC--T-CTCCAGTTTAA-ATATCATT--AAACAAAGT-AG-TTCCCCTC-GAA-AACGT-AGA-ATGTGTTAGTAT---TA-AACCGC--AA-TAT-AGC-GTA--T----TT-CT--AAACGGTTTCTCT--TTCCTTCTTTG-A-C-------GTGGGATGCTCAGCGCCAA-TTTATC------CCCCT-TCAT-GTT----C-G-T-TCTCA-GGATAA--TT-CA-AT-T-T-C--T---GGAC---T-ATAATAAACTT-GGTGTTAT-TTTTTTAGA---GTA--AACAGA-C-tttttttttttttttaacatagcgcgtttgatcgaagcgatataccaagagaaaaaaaataaagaaaaattattttgtggggtttggaacagatgatttatttttgagtttagaagaacaatagtatatcaggtggattgtaatgatctaatagaagattgaaatagagaaattaaaa
gi|12 : atttatatATT-CTG----CTGTTAACCAGGCAGGCCTTCTG---ACAAAACACGAA-A--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTATGTG---T-C--CT-G---A--C-GAGTTA-------TGCTCCAGTT--A-ATATCATTTAAAACA--GT-AG-T----CTCAGAATA--GT-AAA-ATGTGTTA-GAT---TATAAC-GC--AATTAA-AGCAGTAGTTACCTTT-CTCGAA-CG-------T--TTCG-----TG-ATCCCCGCCTACGAGGT-CGT----CCAACATCATCCTATCGC---T-TAAT-TTT----CAG-T-CC--ATG----ACGTT-TATATCT-T-CCCTGGGGGACGGTT-A-------CTTAGATATTA--TTTT---AAGTGG-C--AACAGAGCGATGC-AT-AGC-A--AGCAT-TCA-G---AAAAAA---T-AATTCATTTTC-C-GAAGATTGCGGGGCCGA-TGTTTGCCC-TTGGAGCCCCTACgaggaaacatt
gi|13 : tCTTACCAGTCCTCT-GG-CAAC-AG-TAT----AC-AGGCC-TTAACTGTACCCATGAG------T-T-ACAAAAGCATATCGTCG-C--G-AAGACA-TTT----TACAATCAACACC-G-GA-----TAAATGCGCAGTTATT------------------------ATT--------AGGGGGCCTACCTTACA--TTAT--CTG-GAA--CTTA-TTAT-T-TT--CT---AC-AC--AA-TA-TCATATCCATCATGC-AGG--TTTTTTTTC---CCCTG-c
gi|14 : tttaaaaagtccggattggtatccaaatattaagagaaaagagagaagagagagagagagagatcaAATGTTC----TTAACTCTATC------C---T-TAATACGT----C-T-T-CC--A-A----A--TT-TT-GC-T-T-CCCC---GGGC---A-A-------TTT-AGTGTTAG-TTTT---AA---G-G--AATAAA-C-ATAC-AC-AGCAATCAGCAGATCAGG---GGGGGGGGGT-GATTCA-AGTA-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGACC-ATAGAACCCCTA
gi|15 : gtTGGAATGCTC----TTAACTCCATT------C---T-TAAA-TTT----C-T-T-CC--A-T----A--TT-TG-AC-T-T-CCCG---AGAC---A-A-------TTT-AGTGTTAT-TTTA---AA---G-A--AATAAA-C-ACCC-AC-GGCAT--A-CAT-TCA-----AAAAAA---T-GGTTCA-ATTT-T-G-AGAT---TGGACCGA-TCTTGATCC-TTAGAGCCCCgc
gi|16 : aatTAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCCCAT-AGCAA--TACAT-TCAGA---CAAAAA---T--GTTCA-TTTC-T----AAT----GGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGG-GCCCC
gi|17 : a--TG----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-A-C-AT-GCA-TTCT-G--T
gi|18 : TAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGA---CAAAAA---T-GGTTCA-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGGGGCaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataataatcagcg
gi|19 : a-TTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TG----CATTTT---CGAA-AT-A-C--CGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-G-C-AT-GCA-TTCT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-
gi|2 : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATACTATA--CTTTTTTAAAAATTTCAAGTTAAGTCGGA-CTGGTATCA-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-AG-CGAC-AG-TA-----AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AGGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TGTATGCGCAGTCACTC-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCT--------------G-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTG-ATCCAT----C-AGG--TTTTTTTTTTTTCCTTA-GATG-TATTT-GAAATGCG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGT--AG-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--AAT----A--GATA--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTTAAA--A------------------A-ACAA--TA-ATGGA--AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-AAT-ATTTAC-TC------GT--A-------ATT--TC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GGGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA----TTTACATAATGAATTA-TAACTGAT-AT-T-A-TCTCGTTAGT-T--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----G-TTA------G--AAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-A--T--AT-CC--A-TTGAT--GAGGGA-TTTACATGTAGA-----T--A-GGG---GGG-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAA-----TCA-CTATAGATA-CATT--TA----TTA-G-CAGC-ACAA-CTTA--C---CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCAACAT----ACACAACC---TC-AA-GA----ACTATTTAAATGT----A----C-ATGT--AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AGGACT--GAACGT-CAAA--AATATCGCGT-A---TTG--TA-GACT------------ACGC--TGT--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AT-G-AT-G--TGTATATAGACTCTATTGGTTAGCG-ATTT--TAT----AAT-----TAT-----------TA-TTACTT----T--GAATATGTA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----T---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TT-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-A--GAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AGTTCTAA-G---TGAAA--GTAAA---A--ACGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTTGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GGT---ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GTAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-T-GTGGTTTTGGGACG-AT-ATTT-GA--TG-AGA-GACATCAG-GT--GG-GTG-TAATA-A-TTAA-T-GA-GATGA--AAATA--GAGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AAC-T-TTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TG----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-GTC-AT-GCA-TTCT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AA--ACAT-GTATT-G-TA-C-A-T-GC--A-T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--AGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-TTTG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGCT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AA-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA-TACCGGTA-AAC-GT--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-AAC-------GTGGAGGGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-A--T-T-CCCT---GGAC---T-T-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGAAA--AACAT-TCAAG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|20 : ATACTA-CTCAT-AATA-----T--------A-------TTAAAAA-----------GTCGGA-TTGGTATCA-ATA
gi|21 : tagataagggcacttttttttggaTACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATAACTTTTTTTAAAAA-----AGT----CCGGA-TTGGTATCA-ATAT
gi|22 : T-G-TA-C-A-T-GT--A-T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-ATG----CTGT-AACCACG--GGCCTT-T
gi|23 : GTTTC-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGCCC-TTAGAGCCCCCAC
gi|24 : T--------A---GGCCTACCTTACG--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAATT-TT--CT---AC-AC--At
gi|3 : ATACTAACTCATCAATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAA----------AAGTCGGA-TTGGTATCACATA
gi|3 : tagtaaggcactttttgctttggaCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--G-TCA-------T-ATGAGG----TC-TTACAAAAGCATAT-ATCG-CCCG-AAGATA-TTTA---AACT-TCAACACC-GCGAA----TAAATGTGCAGTTTATT-------------------A----TT--------A---GGCCTACCTTACAATTCATC-TGG-AAA--CTTA-TTAT-TATT--CT---AC-AC--AATTA-T-ATATCCCTC---C-AGGGTTTTTTTTTC---CCCTGAGAT---ATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGTCTAA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GTTCACT-T--AAGGAC---TATA--G-GCTG--TTG-A-TTAAAA--GCC---A-----TCGAAA-A-ACAAATTA-CTTGATGAA--TAGAAT-----TGAG---AGGAGC-TGCAGATAT----CACACGAC-CATATATCACG--A-GAT-ATTTACATC-AGTC-GT--A-------ATT---C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTACTGAGAGAGTGAA--A-TGGTA--TTTCTTTT-TTATA--TTTACATCA----C-A-GAACTTTT-AT-T----------AAT-T--GT-AT-A------------T----GCTTA------G--AGAAGAA--AA--TGCTAGG-CCT-A--TT-GT-CT--A-TTGAT--GAGGGG------ATGTAGA-----TTGATGGG---GGG-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAACAGAA--TGTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CGAAT-ACGACAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--C-A-CTT--T-----G-GAAGAAA--TATAGGAGC--T-A-ACCCCC--ACC-ACAT----AGACA----------------------------------------C-ATGTG-ACAGC--AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-ATATTTG--TA-GACA------------TC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC--G--TG-AC-G-AT-G--T-TATATA-----TATT-GTTAGCG-ATTTTATAT----AAC-----TAT-----------TA-TTAC-T----TT-AATTA-GCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A---T---A-CAT---------------CC-----T-AC-CATTTCGCAG--TTG-ATAGAGATA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGGAC----AT----A-TT--AG----AA-G----GAAAGTGTAAA---C--AAGCT-TGTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT-----------------T-C-TCTTCGT-GT--AAAGG----CGT-AC----CG---GGTTTGATA-----TCTTTCATGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGAGTCAAAT--CCAA-AGAAAAAG-----TGTT-A-GTGGGTT--TGACG-AT-ATTT-GA--TGAAGA-GACATCAG-GT---G-GTGTTATCA-ATTTAATT-GA-TATGA--AAATAG-GAGAAAT---AA-----CACATTAAT-AACTT-TTTGTA-AAAT-AT-G---A-----GT-TG----CATTTT---CGAA-ATGA-T--AGTTGC-A---TCT-A-G-ACCGG-CAAT-GCATTTCT-G--TGAGCC--ACGTCG-ATGGGGCAT--ACAT-GTACT-GCTA-CAA-T-GTACA-T-GA-CAACCA---T-A-GG-TAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GA-AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-TATG-----TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCC-GTT--A-ATATCATT---AACA--GTCAGTT----CTC-GAA-A--GT-AAA--TGTGTTA-TAT------AAC-GCA-A--TAA-AGC-GTA--CT--TCT-CT--AA-CG-------TTGTTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-GTT-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---TAA-------CTT-GGTATTATCTTTT---AA---G-ATGAACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAT---GCGGCCGAGTTTTCGCCCATTG--GCCCCTattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccggcgacagtattacaggtcatatgaggtcttacaaaagcatatatcgcccgaagatatttaaacttcaacaccgcgaataaatgtgcagtttattattaggcctaccttacaattcatctggaaacttattattattctacacaattatatatccctccagggtttttttttcccctgagatatttgaaatacgttaataaactttcacgcatgcagtctaagttgacgtatggtgttcacttaaggactataggctgttgattaaaagccatcgaaaaacaaattacttgatgaatagaattgagaggagctgcagatatcacacgaccatatatcacgagatatttacatcagtcgtaattcaaggtaattatatcgtaagtactgagagagtgaaatggtatttcttttttatatttacatcacagaacttttattaattgtatatgcttagagaagaaaatgctaggcctattgtctattgatgaggggatgtagattgatgggggggggggtgcaaaggcaacagaatgtcctcgctttataaagaaaaaaaaatcacgaatacgacagttaattagcagccacaacttgcactttggaagaaatataggagctaacccccaccacatagacacatgtgacagcagtgagattttgaatgcaaaaagactgaaagtcaaacatatcgcgtatatttgtagacatcctggtaaaatccgccacgtgacgatgttatatatattgttagcgattttatataactattattactttaattagcaactttcattttcataaaagaaagcatacatcctaccatttcgcagttgatagagatatttataaaacgaggacatattagaaggaaagtgtaaacaagcttgttttcaagcgatccttctcttcgtgtaaaggcgtaccgggtttgatatctttcatgcttaaattgtgaacacttttgcttgagtcaaatccaaagaaaaagtgttagtgggtttgacgatatttgatgaagagacatcaggtggtgttatcaatttaattgatatgaaaataggagaaataacacattaataactttttgtaaaatatgagttgcattttcgaaatgatagttgcatctagaccggcaatgcatttctgtgagccacgtcgatggggcatacatgtactgctacaatgtacatgacaaccataggtaattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacagaaaatttgctttttatgttctgatcgagtatctccgttaatatcattaacagtcagttctcgaaagtaaatgtgttatataacgcaataaagcgtacttctctaacgttgttctgatcgtggagtgctcccaactttatccttaattttcgttccagatttaatttccctggactaacttggtattatcttttaagatgaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttccgagatgcggccgagttttcgcccattggcccct
gi|4 : tagtaaggcactttttgctttggaatactaactcatcaatattatattatacttttttaaaaaagtcggattggtatcacataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTTAAAAA-----AGT----CCGGA-TTGGTATCA-ATATT
gi|4 : CTTAC-AGTC-TCC-GGGCGACCAG-TAT----AA-GG--C-CT--------CTATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATATTCG-CC-G-AAGATA-TTTAATTCACAAC--AC-CC-G-GAAA---TAAATGTGCAGTT--TT-------------------ATTATTT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTTA-T-TTTTCT---AC-AC--AATTAATTATATCCATT---C-AGG--GTTTTTTTC---CCCTG-GAT--TATTTTGAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGAAC---GT-A--TGGTTGT--A-T-T--A--GGAC--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A-----TTCGAAAA-ACAA--TA-CTT-AT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GATTATTTAC-TC-AGTCCG---A-------ATT---C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--AATG-TA--ATT-TTTT-TT-----TTTA-------------------AT-AT-T-T-ACT------------TCAC-AAAC-TTTTTA-TTAATTG-TTATATGTAG--AGAAGAA--AA--AT-TAGG-CCT-A--T---T-CT--A-TTGAT--GAGGGG------ATTTAGA-----T----GAG---GGG-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCCAAGAAA--TTTCCT--GC-TT-T-A----TTA-AAGAAAAAAAAAATATCA-CTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--CCA-CTC--T---TGG-GA-GAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT----AGACA----------------------------------------C-ATGGG-AC-GCG-AGTGA-GATTT-G-AAT-GCAAACAAGACT--GAAG---CAAA--CTAATCGCGT-A---TTT--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAA----TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--T-T-TATA-----TATTGGTTAGCG-ATTT--TAT----AATAAC--TAT-----------TA-TTACTT----TT-AATTATGCA--AC-TTC------A--TTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-CATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-ATTAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT---G----AA-G---TGAAA--GTAAAC--A--AAGTT-G-TTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GTA-AA--G----CGT-AC----C----GGT---ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACT---TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-A-AAAAAA---T-TGTTAA-GTGGGTT--TGACG-AT-ATTT-GA--TG-AGA-GACATCAG-GT---G-GTG-TATCA-A-TTAT-T-GA-TATGA--AAATA--GAG-AAT---AA-----CAA-TTAATAAAC-T-TTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TG----CA-TTT---CGAA-AT-A-T--AGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-C-AT-GCATTTCT-G--T-GAGCA-ACGTCG-AT-GGG-AT--ACAT-GTA-T-G-TA-C-A-T-GT--A-T-GA-CAA-CA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCC-T-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-TATG---T-TT-CT-G---ACTC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAAC--GT-AGTT----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGT-TTA-T--------AAC-GC--A--TAA-AAG-GTA---A--TTT-CT--AA-CGT------T--TTC------TGAATC-------GTGGAGTGCTCT---CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-TCCC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGACG--T-A--------TT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTT--C-G-AGAT----GGGCCGATTTTTCGCCCTTTGGAGCCCCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccgggcgaccagtataaggcctctatgaggtctacaaaagcatatattcgccgaagatatttaattcacaacacccggaaataaatgtgcagttttattatttaggcctaccttacattatcctggaacttatttatttttctacacaattaattatatccattcagggtttttttcccctggattattttgaaatacgttaataaactttcacgcaatgcagtaagttgaacgtatggttgtattaggactataggctgtgattaaaaagcattcgaaaaacaatacttataatagaattggagagcatgcagatatcacacgaccattatcacgagattatttactcagtccgaattcaaggtaattatatcgtaagtacgagagagtgaaaatgtaatttttttttttaatatttacttcacaaactttttattaattgttatatgtagagaagaaaaattaggcctattctattgatgaggggatttagatgagggggggggtgcaaaggccaagaaatttcctgctttattaaagaaaaaaaaaatatcactatacacagttaattagcagccacaacttgccactcttgggagaaatataggagtaacccccacccacatagacacatgggacgcgagtgagatttgaatgcaaacaagactgaagcaaactaatcgcgtattttagactacctggtaatccgccacagtgacgatgtttatatattggttagcgattttataataactattattacttttaattatgcaacttcattcataaaagaaagcattacgatctaccatttcgcgttgatagagtatttattaaaacgaggcatattgaagtgaaagtaaacaaagttgttttcaagcgatcctctctcttcgtgtaaagcgtaccggtatattttctgcttaaattgtgaacactttttgcttgatcaaatccaaaaaaaaattgttaagtgggtttgacgatatttgatgagagacatcaggtggtgtatcaattattgatatgaaaatagagaataacaattaataaacttttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatagttgcattagaccgcatgcatttctgtgagcaacgtcgatgggatacatgtatgtacatgtatgacaacataggataattctgctgtaaccaggggccttgtacaaacagaaatttgctttttatgtttctgactcgagtatctccagttaatatcattaaaacgtagttctcgaaagtaaatgtgtttataacgcataaaaggtaatttctaacgttttctgaatcgtggagtgctctccaactttatccttaattttcgtcccagatttaatttccctggacgtattggtattatttttaagaaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttcgagatgggccgatttttcgccctttggagcccct
gi|5 : tttaaaaaagtccggattggtatcaatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTAC-AGTC-TCC-CG-CGAC-AG-TACTCGTAC-AG--CGCTA-------C-ATGAAGGATCCC-T-ACAAAAGC-TATCTTCG-CC-G-AAGACAATTTA---CA--ATCA---CC-G-GA-----------------TATC------------------------ATT--------A---GGC-TAC-TTACAA-TTTTC-CTGCGAA--TTTA-TTAA-T-TA--TT---AC-AC--AATTA-TTA-ATC-AT----C-AGA--TTTTTTT------CCTG-GATG-TATT--GAAATACG-GTAAATCAAACTTT----C-CGCCAAT--TCCAGT--AC-GTCGA-CTGAGT-A--TCGT--T--ACT-T--A--GACT--CATA--GCGCAT--T-G-A-TGAAAATTAAT---AATTTCT------AGACAA--AATATGGGA-AA---AGAAT-----GG-G---AG-AGCATGC-------------------------TCA-------AT-ATTTAC-TC-AG---GT--C-------GTTATTC----AAGGTAATTAT-TCG-TAAAGTACCGAGAGAGTGAA--A-TGCTA--TTT-TGTT-GAA-A---------AA---AA-A-AAAC-AAT-ACAT-C-TCTCGTAGGT-T--ATCACCAAACGTTTTAA-TT----G-TTAC-----G--AGAAGAACAAA--TG-TAGA-CCTCA--CTAGT-CCTCACTTGATATGGGGGA-TTTA-GTATAGG-----G--G-GAGCTTGGG-GG-GGG--------------GG-CAAACGGCAAAGAGA--TTTCCTC-GC-TT-T-TGTGTT-A-AAGAAAAAGAAA---TCA-CTATT-CTA-CAGT--CGCACATTA-GGCAGC-ACAC-ATTG--C-A-CTCCCT---TGG-GAAGAAAAGTATAGGAG---TTA-ACCC----AGCCACATTAC-ACACAC-----TC-CA-GACAACACTAG--AAATGCATTAA----C-ATGTG-AC-GCG-AGTAATGAATTTGTAAT-GCAAA---GACTATGAAA-T-CAA---C-TATTGCGTTA---TCGACTG-AACTC-----------GC-C--TGGGTTAAAA--TC-CCCGCC-GC-AGCATGCAC-GCATCG--TGTTCATA-----TAT-GAATAGCGTATTT--TAT----AATACACTTAT-----------TACTTACTTGAGATT-ATTCATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----A---AAAAGG--A--TT---AATGA---------------TCC----T-ACGAATTTCGC-GGTTTG-ATGGAG-TA---TT-T-A-TAAA----C--GAGG-C----ATCTACA-TTGTAG----AA-G---TGGAA--ACAGA---AGTAAGTT-ATATTT---CAA-AAAAGCC-GACTCCTGCC--------------T-C-TCTTCCA-GTTAAA--G----CGT-AC----CCTCGGGT---ATA-----TATTTC-TGC-TTAAATGATG--T-GAACCAC----TTTTG-CATTGA-TCGAACTCCCAACAGAAAAGAAATT-TGTT-A-GTTGGATTATGACGGAT-ATTTAGAC-TG-AGACGACATCAG--T--GG-TAG-TATCA-A-TTAA-T-GACGATGACAAAATACGAAGAAATCTAGA-----AACATTAAT-AAC-T-TTTGTAGAAAT-AT-CTACA-----A--TGG---CATTTAA--CGAACATCA-TTGGATCGC-AATTC-T-ACGCACCAG-C-AT-GCA-TTCTTGC-TGAACCACACGCCA-CTGGGG-AAT-ACATTGTACT---TA-C-AAT-GT--A-T-GATCAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTCT-A
gi|6 : C-TTCTCAGTT----G-TTA------G--AAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AG-T--GT-C---A-GTGAT--GAGGGAATTT-----TAGA-----T--A-GGG---GGG-GG-GGGG-------------TG-CAA--GGTAA--GAA--TTTCCTC-ACGTTGT-A----T-A-AAGAAAAAA------TCAGCT-TACAGG-CATT--TA---ATTACG-CAGC-ACAA-CTTG--C-AGCTC--T---TGGTGAAGAAA--TATGAGAGGGAT-ATACCCCC--ACCCACAT----ACACACAC---TCGAA-GA----AATATA-AAATGGT---A----CTATGTGGAC-GCG-AGTGC-GATTG-G-AAC-GCAAA---GACT--GAAAAT-CAAAGATATATGGCGT-----TTG--TATGACT------------AC-CAGTGT--TAAAC--TC-C--GCCCAC-AG--TG-ATTG-AT-GGTTGGTTA-A-----TATTGGTTAGCGGATTT--TATT---AAT-----TATGCGGTCATATTTA-TTACTT----TT-AAATATGCATAACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GCCAA--TT---A-TGA---------------TT-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATGAAG-TAATATT-T-A-TAAATA--C--GAGG-C-----T----ACTT--AG----AAAG---TGAAA---TAAA---C--AAGTT-TTTTTT---CAA-G-----C-CA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--GAACGTGT-AC----C----GGT---ACAG----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--TTGAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAGAAAAC--T-TGTT-T-GTGGGTT-GTAACG-ATGATTT-GAATTG-AGA-GACATCAG-GT--GG-GTG-TAATA-A-TTAA-TAGA-GATGA--AAATAA-GAGAA-T---AA-----CCA-TTAA--AAC-T-TTT-TA-AAATGAT-G---AACGAGG--TGGGCCCATTCTTCTCGAA-AT-A-C--C-TTGCTA---T-G-T-G-ACT-G-C-AT-GCA-T-CT-G--TGGACGC-ACGCC--ATGGGG-ACTGACAT-GTAAT-G-TAAC-A-TCGT--AAT-GA--AAC-A---T-AAGGATAATG-CTG----CTGT-AACCAAG--GGCCTT--GT--ACAAA------A-G--AA-A--TATTGCTG-----------------------TTT-TATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CCCCA-TT--ACATATCATT--A--CA--GT--G-T----ATC-GAA-A--GT-AA---TGTGTTA-TAT------AAT-GCCAA--TAA-AGT-GTA--T----TT-CT--GA-CG-------TC-TTC------TG-AAC-------GTGGAGTGCTC-------ACTTTTTC------A---TCTAAT-TTT----C-G-T-CG--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAA---C-A-------CTT--GTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-ATGAGCAG--ACCAT-TC-GG---AAAATA---TAAGTTCA-TTTCAC-G--GAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|7 : AAT-TTCTCA-CT----T-TTATA----A--AGAAAAA--AA--AT-CA----CT-A--T--AC-AC--AGTTAAT--TAGCAG-CACA-ACTTGAC-----T--A-AAA---GTG-GG-GGG---------------G-CAA--GGCAAA-GAA--TTTCCTC-AC-TT-TTA----T-T-AAGAAAAAAAAA---TCAACTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---TTA-ACCCCCCGACCCACATTACAACACA------TC-AA-GA-----CTAT--AAATG-----AATTAT-ATGTG-AC-GCGCAGTGA-GATTT-G-AATTGCAAA-A-GACT--GAAAGTTCAAA--CATATCGCGT-A---TTG--TA-GACCCGGATTGTAGACACAC--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-ACCAG--TG-AC-G-AT-G--TGTATATA-----T--TGGTTAGC--ATTT--TATTAATAAT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AAATAT-CA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AA--GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-----CG-GAAGAG-TA---TT-TTA-TAAA-A--C--GAG--C----ATT---A-TT--AG----AA-G---TGAAA--GTAAA---C--AAGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------TTC-TCTTCGT-GT--AA--G----CGTTAC----C----GGG---ATA-----T-TTTC--GC-T-ATAT--TG--T-GAAC-AC----TTT-G-C-CTGA-TCGAAT--CCAACAGAAAAAAAGATATGTT-AAGTGGGTT-GTGACG-AT-ATT--GA--TG-AGAAGACATCAGCGT--GGAGTG-TATTA-A-TTAA-T-GA-GATGA--AAATA--GAGAAAT---AA-----AA--TTAAT-AAC-T-TTTGTA-AAAT-ATTG---A-----G--TG----CATTTTTT-CTAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-TTA-G-AC--G-C-ATTGC--TTCT-G--TGAACCA-ACGCCGCATGGG--AT--ACAT-GTATTAG-TA-C-A-TTGT--A-TTGA-CAACCA---T-A-GGAGAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-AATT-TTGCT------------------------TTT--ATG---T-TTTCT-G---A-TC-GAGT-ACATGTAAT-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA---T-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAAT-TGTGTTA--AT------AAC-GC--A--TAA-AGC-------A--TTTACT--AA-CG-------T--TTC------TGGATC-------GTGGAGTGCTC----CAAA--TTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTA--TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGGGAAAAAAAA---T-AATTCA--TTC-C-G-AGAT---GGGGCCGATTTTTCGCCC-TT-GAGCACCTA
gi|8 : AT-----TATG----------TA-T-ACTT----TTTAAATAT-CA--ACTTTT------ATTTTCATAAAACCAGA---AAA-GC--AACTTCACA-CGA---------------TC-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-T----TT-T-A-GAAA-------GAGG-------T----A-TT--AT----AA-GC--TGAAA--GTAAA---C--AAGTT-ATTTT----CAACG-----C-GA-TCCT--C--------------T-CGTCTTCGT-GT--AA--G----C----T----C----GTT---ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACACACTTTTGGC-TTGA-GCGAAT--CCAA-AGAAA--------TGTT-A-GTGGGTT----GCG-A--ATTT-GA---G-AGA-GATATCAG-GTT-GG-GTG-TATTA-A-TTAA-T-AA-GATGA--AAATA--GAG-AAT---AACCATTAAC-AT-AC-AAC-TATATG-A-AAAT-AT-G---A-----GATTG----CATTTC---CGAA-AT-ATT--CATAAC-A---T-----G-ACC-A---AT-GC--TTCT-------AATT-ACGCAG-ATGGAT-AA--GTAT-GTAAG-G-TA-----------A-T-GA--AACCA---T-C-GGATAA-T-CTG----CTGT-AACCAGG--GG----------A----------A-G--AA-A--A-TTGCT------------------------TTT-T-TG---T-TT-CT-G---A-TC-GA-T-A-------T-CT-CAGTT--A-ATATCATTA-AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT--AATGTGTCTTA--------A-AAC-GCA-A--TAA-GG-------TA--TT---C--GA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGC-C----CCAAC-TTATC------C---C-TAAA-TTCACAAC-G-T-CC--A-G----A--TTCTC-AC-TATACCC-----AAC---T-A-------CTT-GGTATTA---TTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCCAAT-AG-----AACAT-TCAGA---ACAAAA-------TTC--TTTC-CAG-AGAT---GGG--CGT-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|9 : tttatatgatctgcATTT-GAAATATGATTAA--TAAACTTTACAATACGC-AATATGC-AGT--AAAGTTG--C---GTTA--TGGT-GT--ACT-TGAA--GACT--TATATAG-GCTAGTT-G-ACTTAAAA--AGCCATA-----TCGAAAAA-ACAA--TA-ATGGAT-TACGTAGAATATTAATA-GGAGAG-AGTATGCAGATATACTACACACGAC-CAT-TATCACGTAATGAT-ATT-ACATCTAT---GT--ACCGTAGTATT--TCCAGTAAGATA--TATATCG-TAATGCTC-AAGAGAGTGAACTA-TG-TAA-TTTGTTTT-TTA-AAATTTACATAT---AT-AATACTTGATTAT-T-CCTCTCGTAGGTCT--ATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----G-CTACATGTAG--AGAAGAA--AAGATG-TAGG-CCT-A--TTGGT-CC--A-TTGAT--GAGGGG-ATTA-AT-TAGGGGCCCC--G-GGG---GGG-GGTGGGGTGGGGGGGGGGGTTG-CAAA-GGC-AAAGAA--TTT-CTC-ACTTT-T-A----T-A-AAG-AAAAAAAA---TCA-CTAT--ACA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--c
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 111 4444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333333333333333333333333 1111 111 11 22222 888888888888888888888888888888888888888888 111 111 1111 111 11 111 1111 111 1111111 111 22222222222222 11 222222222222 1111 1111 1 11111111 11111 111111 1 1 1 11 1 4444444444444444444444 222222222222222222 1 1111 33333333 11111 2222222222222 33333333333333 1111111 333333333333333 1 1111 1 222222 111 1 111 22222 1 111111111111111111111111111111111111111111 1 1 111 111111 333333333333333333 111 11111 1 1111 2222222222222222222 111111 11111111 111 2222222222222222222222 1111 111111111111 1111 111 222222 1111 11111 22222222222222222 22 111111 1111111 1111 1 222 111 2222 11 1 11 1 1 11 222222222 11111 1111 111 111 1111 111 111111 111111 11 444444444444444444444444 11111 2222222 11 11 111111 11 222222222222 11111 222222 2222222222 111111 1111111 1111 111111 1111111111111 1
lowQualScore : 0 8 00000 0 444 0 7777777777777 5 77 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 6 6 6 6 6 88888888888888888888888888 4444 6 6 33 6 6 6 6 111 00 2 1 3 6 6 88888 333333333333333333333333333333333333333333 777 66 5 77 5 5 5 77 000 5 77 6 1 7 6 8888 99 3 888 6 88 99 6 000 4444 999999 6 99 6 6 111 6 99 99999 2 7777777 666 99 6 99 6 6 6 44444444444444 3 6 99 7 1 88 99 555555555555 6 4444 6 6 0000 6 3 77777777 33333 999999 7 6 3 3 99 6 3 55 3 6 2222222222222222222222 44 6 6 222222222222222222 6 5 4 0 5 0000 66666666 66 11111 5 5 0000000000000 66 77 22222222222222 5 6666666 5 5 444444444444444 5 88 0 44 66 5 0 5 5 0000 5 5 999999 0 444444 66 333 5 5 0 5 66 999 77 000 5 77 66666 5 77 0 1 5 5 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 5 5 2 5 5 777 77 666 77 1 3 111111 77 5 888888888888888888 77 77 5 77 5 5 77 5 77 5 5 77 555 44444 1 5555 66 8888888888888888888 4 9999 4 9 3 66 222222 55555555 4 66 66 222 4 9999999999999999999999 8 8 4 66 4 4 777 4 4 4 2222 66 777777777777 8 66 7777 4 222 66 333333 4 5555 4 11111 4 4 77777777777777777 4 4 4 11 66 9999 4 9999 9999 222222 7777777 4 4 66 66 4 4 3333 5 5 5 66 0 0 222 5 000 4444 5 5 88 11 5 0 5 11 0 5 5 0 5 66 11 5 3 888 555555555 5 4 4 4 4 4 777 11111 55 4 2222 666 4 8 4 666 4 777 000 4 4 0000 4 4 44 4 4 99 0 4 4 4 222 5 88888 444444 99 4 4 777 4 4 3 7777 3 55 4 66 888888 4 00 4 66 4 777777777777777777777777 1 33333 4 4 777 66 4 4 5555555 4 66 4 00 00 4 333333 4 4 66 4 44 0 888888888888 3 4 66666 4 44 333333 4 66 4 0000000000 777777 8 2 4444444 1111 000000 666 3 3 7777 3 3 3 55 3 7777 55 3 3 3 3 3 666 5555555555555 3 77 555 555 3 44 3 3 6 3 6666 2 3 6666 555 44 3 3 3 3 555 9 6
lowQualScore : . . ..... . ... . ............. . .. . ............................................................................ . . . . . . .......................... .... . . .. . . . . ... .. . . . . . ..... .......................................... ... .. . .. . . . .. ... . .. . . . . .... .. . ... . .. .. . ... .... ...... . .. . . ... . .. ..... . ....... ... .. . .. . . . .............. . . .. . . .. .. ............ . .... . . .... . . ........ ..... ...... . . . . .. . . .. . . ...................... .. . . .................. . . . . . .... ........ .. ..... . . ............. .. .. .............. . ....... . . ............... . .. . .. .. . . . . .... . . ...... . ...... .. ... . . . . .. ... .. ... . .. ..... . .. . . . . .......................................... . . . . . . . ... .. ... .. . . ...... .. . .................. .. .. . .. . . .. . .. . . .. ... ..... . .... .. ................... . .... . . . .. ...... ........ . .. .. ... . ...................... . . . .. . . ... . . . .... .. ............ . .. .... . ... .. ...... . .... . ..... . . ................. . . . .. .. .... . .... .... ...... ....... . . .. .. . . .... . . . .. . . ... . ... .... . . .. .. . . . .. . . . . . .. .. . . ... ......... . . . . . . ... ..... .. . .... ... . . . ... . ... ... . . .... . . .. . . .. . . . . ... . ..... ...... .. . . ... . . . .... . .. . .. ...... . .. . .. . ........................ . ..... . . ... .. . . ....... . .. . .. .. . ...... . . .. . .. . ............ . . ..... . .. ...... . .. . .......... ...... . . ....... .... ...... ... . . .... . . . .. . .... .. . . . . . ... ............. . .. ... ... . .. . . . . .... . . .... ... .. . . . . ... . .
lowQualScore : 8 0 00000 8 222 6 3333333333333 7 99 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 7 7 7 7 7 33333333333333333333333333 2222 7 7 55 7 7 7 7 777 00 5 7 2 7 7 22222 000000000000000000000000000000000000000000 111 44 7 99 7 7 7 99 000 7 99 7 7 3 7 3333 22 2 333 7 00 88 7 888 2222 555555 7 22 7 7 777 7 22 33333 5 7777777 777 22 7 22 7 7 7 77777777777777 2 7 22 2 0 33 22 222222222222 7 2222 7 7 8888 7 3 55555555 77777 777777 3 7 3 3 22 7 3 88 3 7 8888888888888888888888 22 7 7 888888888888888888 7 0 2 8 0 6666 99999999 99 88888 0 0 6666666666666 99 66 11111111111111 1 2222222 0 0 555555555555555 0 22 1 00 99 0 0 0 0 6666 0 0 000000 0 000000 99 888 0 0 0 0 99 444 99 000 7 99 00000 7 99 7 4 7 7 666666666666666666666666666666666666666666 4 7 7 7 0 7 7 777 99 777 99 7 0 666666 99 7 333333333333333333 99 99 7 99 7 7 99 7 44 7 7 99 999 33333 4 6666 11 2222222222222222222 4 4444 4 7 9 11 888888 33333333 4 11 11 222 4 6666666666666666666666 9 9 4 11 4 4 888 4 4 4 4444 11 999999999999 9 11 2222 4 222 11 888888 4 1111 4 11111 4 4 88888888888888888 4 4 4 11 11 4444 4 4444 4444 000000 1111111 4 4 11 11 4 4 9999 0 0 0 99 0 4 555 0 888 4444 0 0 22 99 0 0 0 99 0 0 0 0 0 99 99 0 2 888 111111111 0 4 4 4 4 4 888 11111 55 0 5555 555 0 0 0 222 0 000 333 0 0 0000 0 0 88 0 0 55 9 4 4 4 999 0 22222 000000 55 0 0 000 0 0 6 7777 6 55 0 11 333333 4 66 4 11 4 222222222222222222222222 9 11111 4 4 888 33 4 4 6666666 4 11 4 66 66 4 888888 4 4 11 4 77 1 000000000000 6 4 66666 4 66 222222 4 11 4 4444444444 222222 9 2 4444444 4444 555555 444 6 6 7777 6 6 6 00 6 7777 00 6 6 6 6 6 444 9999999999999 6 22 444 444 1 22 1 1 7 3 2222 8 3 2222 888 22 1 1 1 1 444 2 2
consensus : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT---GCCGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-ATA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGG-NTTA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CA-CAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
Reference ( family-3278 ) : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT---GTCGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-ACA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGG-TTTA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CA-C-C---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|1 : TACTAACTCAT-AATAATTTATTATATTATA--CTGTTTTAAAAA-----AGT------GGATTTGGTATC--A-ATATT
gi|1 : TTAC--GTC-TCCCGA-CGAC-AGGTAAT---ACGAG--G-CT--------CCATGAGG----TCGT-ACAAAAGCATATCGTCGACC-GGAAGACA-TTTA---CA--ATAAGCACCAG-GAAATTTTAAATGCGCAGTCACTTCACATCTTTATGATAGTAAA--AGTTTATTATAAA---GGCCTACCTTAC---TTATCACTG-GGAGACTTAGTTAA-T-TT--TTCTTACCACCAAATC---TATATCCATTC---CAGG--TTTTCC--CG--CCCTG-GATGGTATTG-AAGATACG-ATAA---AAACTTT----CATGC-TAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-AATCGGA-TT--ACTAT--G--GGCAACTATA--G-GCTG--T-GCA-TCAAAA--AGC---A---T-CGAA----CAA--TTATGAA---A--TAAATT-----T------AG-AGCATGCAGATAT----CACACGACGCAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGTTGA--ATTTC----AAGGTA--TATATCGGTAA-AGA--GAGAGAGTGAA--A-TG-TAATTTT-TTTTATTA-A--TTTACATAT----T-A-TAACTGAT-AT-TTC-TCTCGT-AG--TTCAATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----GTTTGTA-----AGAAGAA--AA---G-TAGGTCCT-AGAT-G-TTCC--A-TT-AT--GAGGGA-TTTA------GA-----TAGGGGG-------GCGG-GGG--------------TGACAAA-GGCATAAGAAATTCTCTTCTGC-TT-T-A----T-ATAAGAAAAAACCA---CCA---ATA-ATG-CACTAGTAC--ATTA-G-CAGC-ACAAACTTGAGC-A-CTC--TATATGG-GAAGAA---TATAGGATAC-T-A-GCCCCC--ACCCACAT-ACA-CA-CACAAATC-AATGA----ACTA----AA-TG-----AA---C-ATGTGTAC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-G---A-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATAT-GC--------TG--TA--ACT------------AC----TGG--TAAAAGATCTC--GCC-AC-AG--TG-A--G-AT-G--T-TGTATA-----TATTGGTT--CG-ATT--AT----A--AT--------------------A-TAA--T----TT-AATTATT----ACTTT------------------A----G---AAA-GC--A--TT---A--GA---------------TC-----T-ACGAATTTCGC-G--TTG-ATAGTC-GA---TTCT-A-TAAA-AGAC--GAGGAC----AT----A-TT--AGGGA-AG-G---TGAAAGT--AAA---GC-AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----T-GA-TC-T--C--------------T---TCTTCGTAGTCAAA--G----CAT-AC----C----GG---TTGA-A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAATTT---T-TTTT-T-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATT--GA--TGA-GA-GACGTCAG-GTAGGG-GTGTATTACATT-AAT-GA-GATGA--AAA----G-AGAAAT---AA-----A-C-ATAAT-AACT-TT--GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTT----CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---TGT-A-G-AC--G-CA-T-GCA-TT-TT-GAATGTACCA-ACGCCG-ATGGGG-AT--ACAT------------------TA--T-GA-CAACCA---T-C-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GGAAA-A--C-TTGCT------------------------TTTTATG---TGTT-CTTG---A--C-GAGT-A-------T-CTTCAGTT--A--TATCAT---AAACAA-GT-AGGT----CTC-GAA-A--GTTAAATGTGTAT-A---TA----T-AAGC-A---A--TAATAGC-GTA--T-----T-TT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGA-TGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TATT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTAT-TTTT----A---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGG------AAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAC---GGGGCCGA-TTTTCG-CC-TTGGAG-CCCTACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcgttacgtctcccgacgacaggtaatacgaggctccatgaggtcgtacaaaagcatatcgtcgaccggaagacatttacaataagcaccaggaaattttaaatgcgcagtcacttcacatctttatgatagtaaaagtttattataaaggcctaccttacttatcactgggagacttagttaatttttcttaccaccaaatctatatccattccaggttttcccgccctggatggtattgaagatacgataaaaactttcatgctatgcagtaagttgacgtaatcggattactatgggcaactataggctgtgcatcaaaaagcatcgaacaattatgaaataaatttagagcatgcagatatcacacgacgcattatcacgagatatttactcagtcgttgaatttcaaggtatatatcggtaaagagagagagtgaaatgtaattttttttattaatttacatattataactgatatttctctcgtagttcaatcacaaacttttattgtttgtaagaagaaaagtaggtcctagatgttccattatgagggatttagataggggggcgggggtgacaaaggcataagaaattctcttctgctttatataagaaaaaaccaccaataatgcactagtacattagcagcacaaacttgagcactctatatgggaagaatataggatactagcccccacccacatacacacacaaatcaatgaactaaatgaacatgtgtacgcgagtgagattttgaatgaaagactgaaagtcaaacatatgctgtaactactggtaaaagatctcgccacagtgagatgttgtatatattggttcgattataatataatttaattattactttagaaagcattagatctacgaatttcgcgttgatagtcgattctataaaagacgaggacatattagggaaggtgaaagtaaagcaagttatttttcaagtgatctcttcttcgtagtcaaagcataccggttgaattttctgcttaaattgtgaacacttttgcttgatcaaatccaaagaaatttttttttgtgggtttgacgatattgatgagagacgtcaggtaggggtgtattacattaatgagatgaaaagagaaataaacataataactttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatggttgcatgtagacgcatgcattttgaatgtaccaacgccgatggggatacattatgacaaccatcggataattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacaggaaaacttgctttttatgtgttcttgacgagtatcttcagttatatcataaacaagtaggtctcgaaagttaaatgtgtatatataagcaataatagcgtattttaacgtttctgatcgtggatgctcccaactttatccttatttttcgtccagatttaatttccctggactacttggtattatttttagaaacagacatccatagcaaacattcaggaaataattcatttccgagacggggccgattttcgccttggagccctac
gi|10 : tactaactcataataatttattatattatactgttttaaaaaagtggatttggtatcaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcg----A--AT-----TAT-----------AA-TTACTT----TT-AA-TATGCA---CTTTCTCATTTGTTTTCATAAAA----AGAAAAA-GC--A--TTT--A-CGAGATTTTTATATTACATCAACCAT-AA-AATTCAAC-G--TTGGATGAGG-TA---TT-T-A-TAAA-A--CGAGAGG-CAATGAT----ATTT--AG----AA-AAGTTGAAAGT--AAAACTG--AAGTTAATTTTTCTACAA-G-----CTGA-TCCC--CCTACAATTCTTTCGT-C-TTTTGGT-GTA-AA--G----CAT-ACCCTGC----GG---T--ACACAATCC-TTTC-TGCTTTAAAT--TGAAA-GAAC-AT----TTTT
gi|11 : TAAT-G-TA-C--T-GAA----GA-CA--CAGTCTGA-GGGTAATTTCTGGGGGCTGT-AACCAGG--G-CCTT-TGTCAACAAAAA-C--ACG--AATA--T-TTGTTTTTTTTGGTGCTTACGGTCTTTTTTTTTATGGGTT-TT-CT-GTAGA-TCCGAGT-AAAATC--T-CTCCAGTTTAA-ATATCATT--AAACAAAGT-AG-TTCCCCTC-GAA-AACGT-AGA-ATGTGTTAG--TA----TTAAACCGC--AA-TAT-AGC-GTA--T----TT-CT--AAACGGTTTCTCT--TTCCTTCTTTG-A-C-------GTGGGATGCTCAGCGCCAA-TTTATC------CCCCT-TCAT-GTT----C-G-T-TCTCA-GGATAA--TT-CA-AT-T-T-C--T---GGAC---T-ATAATAAACTT-GGTGTTAT-TTTTTTAGA---GTA--AACAGA-C-tttttttttttttttaacatagcgcgtttgatcgaagcgatataccaagagaaaaaaaataaagaaaaattattttgtggggtttggaacagatgatttatttttgagtttagaagaacaatagtatatcaggtggattgtaatgatctaatagaagattgaaatagagaaattaaaa
gi|12 : atttatatATT-CTG----CTGTTAACCAGGCAGGCCTTCTG---ACAAAACACGAA-A--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-ATG---TGTC-CT-G---A--C-GAGTTA-------TGCTCCAGTT--A-ATATCATTTAAAACA--GT-AG-T----CTCAGAATA--GT-AAA-ATGTGTTAGATTA----T--AAC-GC--AATTAA-AGCAGTAGTTACCTTT-CTCGAA-CG-------T--TTCG-----TG-ATCCCCGCCTACGAGGT-CGT----CCAACATCATCCTATCGC---T-TAAT-TTT----CAG-T-CC--ATG----ACGTT-TATATCT-T-CCCTGGGGGACGGTT-A-------CTTAGATATTA--TTTT---AAGTGG-C--AACAGAGCGATGC-AT-AGC-A--AGCAT-TCA-G---AAAAAA---T-AATTCATTTTC-C-GAAGATTGCGGGGCCGA-TGTTTGCCC-TTGGAGCCCCTACgaggaaacatt
gi|13 : tTTTAAAAA------GT----CCGGA-TTGGTATCCAA-ATATTc
gi|13 : CTTACCAGTCCTCT-GG-CAAC-AG-TAT----AC-AGGCC-TTAACTGTACCCATGAG------T-T-ACAAAAGCATATCGTCG-C--G-AAGACA-TTT----TACAATCAACACC-G-GA-----TAAATGCGCAGTTATT------------------------ATT--------AGGGGGCCTACCTTACA--TTAT--CTG-GAA--CTTA-TTAT-T-TT--CT---AC-AC--AA-TA-TCATATCCAT-CATGCAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-aagagaaaagagagaagagagagagagagagatcacttaccagtcctctggcaacagtatacaggccttaactgtacccatgagttacaaaagcatatcgtcgcgaagacattttacaatcaacaccggataaatgcgcagttattattagggggcctaccttacattatctggaacttattattttctacacaatatcatatccatcatgcaggttttttttcccctg
gi|14 : tttaaaaagtccggattggtatccaaatattaagagaaaagagagaagagagagagagagagatcaAATGTTC----TTAACTCTATC------C---T-TAATACGT----C-T-T-CC--A-A----A--TT-TT-GC-T-T-CCCC---GGGC---A-A-------TTT-AGTGTTAG-TTTT---AA---G-G--AATAAA-C-ATAC-AC-AGCAATCAGCAGATCAGG---GGGGGGGGGT-GATTCA-AGTA-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGACC-ATAGAACCCCTA
gi|15 : gtTGGAATGCTC----TTAACTCCATT------C---T-TAAA-TTT----C-T-T-CC--A-T----A--TT-TG-AC-T-T-CCCG---AGAC---A-A-------TTT-AGTGTTAT-TTTA---AA---G-A--AATAAA-C-ACCC-AC-GGCAT--A-CAT-TCA-----AAAAAA---T-GGTTCA-ATTT-T-G-AGAT---TGGACCGA-TCTTGATCC-TTAGAGCCCCgc
gi|16 : aatTAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCCCAT-AGCAA--TACAT-TCAGA---CAAAAA---T--GTTCA-TTTC-T----AAT----GGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGG-GCCCC
gi|17 : a--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-A-CA-T-GCA-TT-CT-G--T
gi|18 : TAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGA---CAAAAA---T-GGTTCA-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGGGGCaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataataatcagcg
gi|19 : a-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-C--CGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-
gi|2 : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATACTATA--CTTTTTTAAAAATTTCAAGTTAAGTCGGA-CTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-AG-CGAC-AG-TA-----AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AGGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TGTATGCGCAGTCACTC-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCT--------------G-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTG-ATCCAT-C----AGG--TTTTTTTTTTTTCCTTA-GATG-TATTT-GAAATGCG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGT--AG-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--AAT----A--GATA--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTTAAA--A----------------AA-CAA--TAATGGA--AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-AAT-ATTTAC-TC---------GT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GGGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA----TTTACATAATGAATTA-TAACTGAT-AT-T-A-TCTCGTTAG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT---A-T-CC--A-TTGAT--GAGGGA-TTTACATGTAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAA-----TCA-CTATAGATA-CATT--TA----TTA-G-CAGC-ACAA-CTTA--C---CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCAACAT-ACA-CAAC-C---TC-AA-GA----ACTATTTAAA-TGT----A----C-ATGT--AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AGGACT--GAACGT-CAAA--AATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------ACGC--TGT--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AT-G-AT-G--TGTATATAGACTCTATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TG-AA-TATGTA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----T---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TT-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-A--GAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AGTTCTAA-G---TGAAAGT--AAA---A--ACGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTTGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GTAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-T-GTGGTTTTGGGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-GTCA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AA--ACAT-GTATT-G-TA-CA-T-GCA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--AGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTTTG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGCT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AA-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TACCGGT-AAAC-GT--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-AAC-------GTGGAGGGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-A--T-T-CCCT---GGAC---T-T-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGAAA--AACAT-TCAAG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|20 : ATACTA-CTCAT-AATA-----T--------A-------TTAAAAA-----------GTCGGA-TTGGTATC--A-ATA
gi|21 : tagataagggcacttttttttggaTACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATAACTTTTTTTAAAAA-----AGT----CCGGA-TTGGTATC--A-ATAT
gi|22 : T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-ATG----CTGT-AACCACG--GGCCTT-T
gi|23 : GTTTC-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGCCC-TTAGAGCCCCCAC
gi|24 : T--------A---GGCCTACCTTACG--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAATT-TT--CT---AC-AC--At
gi|3 : ATACTAACTCATCAATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----A-----GTCGGA-TTGGTATC--ACATA
gi|3 : tagtaaggcactttttgctttggaCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--G-TCA-------T-ATGAGG----TC-TTACAAAAGCATAT-ATCG-CCCG-AAGATA-TTTA---AACT-TCAACACC-GCGAA----TAAATGTGCAGTTTATT-------------------A----TT--------A---GGCCTACCTTACAATTCATC-TGG-AAA--CTTA-TTAT-TATT--CT---AC-AC--AATTA-T-ATATCCCT-C---CAGGGTTTTTTTTTC---CCCTGAGAT---ATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGTCTAA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GTTCACT-T--AAGGAC---TATA--G-GCTG--TTG-A-TTAAAA--GCC---A---T-CGAAAAA-CAAATTACTTGATGAA--TAGAAT-----TGAG---AGGAGC-TGCAGATAT----CACACGAC-CATATATCACG--A-GAT-ATTTACATC-A-G-T--CGT--A--ATT-C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTACTGAGAGAGTGAA--A-TGGTA--TTTCTTTT-TTATA--TTTACATCA----C-A-GAACTTTT-AT-T----------AA--TT--GT-AT-ATGC-TT-----------------A----GAGAAGAA--AA--TGCTAGG-CCT-AT-T-G-T-CT--A-TTGAT--GAGGGGATGTAGAT-T-GA-----T-GGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAACAGAA--TGTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CGAAT-ACGACAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--C-A-CTT--T-----G-GAAGAAA--TATAGGAGC--T-A-ACCCCC--ACC-ACAT-AGA-CA-C------------------------------------------ATGTG-ACAGC--AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-ATATTTG--TA-GACA------------TC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC--G--TG-AC-G-AT-G--T-TATATA-----TATTG-TTAGCG-ATTTTAT----ATAAC-----TAT-----------TA-TTACTT----T--AATTA-GCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--T----A-CAT---------------CC-----T-AC-CATTTCGCAG--TTG-ATAGAGATA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGGAC----AT----A-TT--AG----AA-G----GAAAGTGTAAA---C--AAGCT-TGTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT-----------------T-C-TCTTCGT-GT--AAAGG----CGT-AC----C----GGGTTTG-ATA-----TCTTTCATGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGAGTCAAAT--CCAA-AGAAAAAG---T--GTT-A-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATTT-GA--TGAAGA-GACATCAG-GT--GGTGT-TATCA-ATTTAATTGA-TATGA--AAATA--GGAGAAAT---AA-----CACATTAAT-AACT-TTTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TTG----CATTTT---CGAA-ATGA-T--AGTTGC-A---TCT-A-G-ACC-GGCAAT-GCA-TTTCT-G--TGAGCCA--CGTCG-ATGGGGCAT--ACAT-GTACT-GCTA-CAAT-GTACAT-GA-CAACCA---T-A-GG-TAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GA-AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG-----TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCC-GTT--A-ATATCATT---AACA--GTCAGTT----CTC-GAA-A--GT-AAA--TGTGTTA---TA----T--AAC-GCA-A--TAA-AGC-GTA--CT--TCT-CT--AA-CG-------TTGTTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-GTT-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---TAA-------CTT-GGTATTATCTTTT---AA---G-ATGAACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAT---GCGGCCGAGTTTTCGCCCATTG--GCCCCTattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccggcgacagtattacaggtcatatgaggtcttacaaaagcatatatcgcccgaagatatttaaacttcaacaccgcgaataaatgtgcagtttattattaggcctaccttacaattcatctggaaacttattattattctacacaattatatatccctccagggtttttttttcccctgagatatttgaaatacgttaataaactttcacgcatgcagtctaagttgacgtatggtgttcacttaaggactataggctgttgattaaaagccatcgaaaaacaaattacttgatgaatagaattgagaggagctgcagatatcacacgaccatatatcacgagatatttacatcagtcgtaattcaaggtaattatatcgtaagtactgagagagtgaaatggtatttcttttttatatttacatcacagaacttttattaattgtatatgcttagagaagaaaatgctaggcctattgtctattgatgaggggatgtagattgatgggggggggggtgcaaaggcaacagaatgtcctcgctttataaagaaaaaaaaatcacgaatacgacagttaattagcagccacaacttgcactttggaagaaatataggagctaacccccaccacatagacacatgtgacagcagtgagattttgaatgcaaaaagactgaaagtcaaacatatcgcgtatatttgtagacatcctggtaaaatccgccacgtgacgatgttatatatattgttagcgattttatataactattattactttaattagcaactttcattttcataaaagaaagcatacatcctaccatttcgcagttgatagagatatttataaaacgaggacatattagaaggaaagtgtaaacaagcttgttttcaagcgatccttctcttcgtgtaaaggcgtaccgggtttgatatctttcatgcttaaattgtgaacacttttgcttgagtcaaatccaaagaaaaagtgttagtgggtttgacgatatttgatgaagagacatcaggtggtgttatcaatttaattgatatgaaaataggagaaataacacattaataactttttgtaaaatatgagttgcattttcgaaatgatagttgcatctagaccggcaatgcatttctgtgagccacgtcgatggggcatacatgtactgctacaatgtacatgacaaccataggtaattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacagaaaatttgctttttatgttctgatcgagtatctccgttaatatcattaacagtcagttctcgaaagtaaatgtgttatataacgcaataaagcgtacttctctaacgttgttctgatcgtggagtgctcccaactttatccttaattttcgttccagatttaatttccctggactaacttggtattatcttttaagatgaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttccgagatgcggccgagttttcgcccattggcccct
gi|4 : tagtaaggcactttttgctttggaatactaactcatcaatattatattatacttttttaaaaaagtcggattggtatcacataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTTAAAAA-----AGT----CCGGA-TTGGTATC--A-ATATT
gi|4 : CTTAC-AGTC-TCC-GGGCGACCAG-TAT----AA-GG--C-CT--------CTATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATATTCG-CC-G-AAGATA-TTTAATTCACAAC--AC-CC-G-GAAA---TAAATGTGCAGTT--TT-------------------ATTATTT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTTA-T-TTTTCT---AC-AC--AATTAATTATATCCAT-T---CAGG--GTTTTTTTC---CCCTG-GAT--TATTTTGAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGAAC---GT-A--TGGTTGT--A-T-T--A--GGAC--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---TTCGAAAAA-CAA--TACTT-AT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GATTATTTAC-TC-A-G-T--CCG--A--ATT-C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--AATG-TA--ATT-TTTT-TT-----TTTA-------------------AT-AT-T-T-ACT-------------TCAC-AAAC-TTTTTA-TTAATTGTT-ATATGTAGAGAAGAA--AA--AT-TAGG-CCT-AT-T-----CT--A-TTGAT--GAGGGG-ATT-----TAGA-----T-GAGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCCAAGAAA--TTTCCT--GC-TT-T-A----TTA-AAGAAAAAAAAAATATCA-CTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--CCA-CTC--T---TGG-GA-GAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-AGA-CA-C------------------------------------------ATGGG-AC-GCG-AGTGA-GATTT-G-AAT-GCAAACAAGACT--GAAG---CAAA--CTAATCGCGT-AT---TT--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAA----TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--T--TTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--ATAAC--TAT-----------TA-TTACTT----TT-AATTATGCA--AC-TTC------A--TTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-CATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-ATTAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT---G----AA-G---TGAAAGT--AAAC--A--AAGTT-G-TTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GTA-AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACT---TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-A-AAAAAA---T-TGTTAA-GTGGGTT--TGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT---G-GTGTATCA-ATT-ATT-GA-TATGA--AAATA--G-AG-AAT---AA-----CAA-TTAATAAACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CA-TTT---CGAA-AT-A-T--AGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCATTT-CT-G--T-GAGCA-ACGTCG-AT-GGG-AT--ACAT-GTA-T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAA-CA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCC-T-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---ACTC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAAC--GT-AGTT----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGT-TTA---T--------AAC-GC--A--TAA-AAG-GTA---A--TTT-CT--AA-CGT------T--TTC------TGAATC-------GTGGAGTGCTCT---CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-TCCC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGACG--T-A--------TT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTT--C-G-AGAT----GGGCCGATTTTTCGCCCTTTGGAGCCCCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccgggcgaccagtataaggcctctatgaggtctacaaaagcatatattcgccgaagatatttaattcacaacacccggaaataaatgtgcagttttattatttaggcctaccttacattatcctggaacttatttatttttctacacaattaattatatccattcagggtttttttcccctggattattttgaaatacgttaataaactttcacgcaatgcagtaagttgaacgtatggttgtattaggactataggctgtgattaaaaagcattcgaaaaacaatacttataatagaattggagagcatgcagatatcacacgaccattatcacgagattatttactcagtccgaattcaaggtaattatatcgtaagtacgagagagtgaaaatgtaatttttttttttaatatttacttcacaaactttttattaattgttatatgtagagaagaaaaattaggcctattctattgatgaggggatttagatgagggggggggtgcaaaggccaagaaatttcctgctttattaaagaaaaaaaaaatatcactatacacagttaattagcagccacaacttgccactcttgggagaaatataggagtaacccccacccacatagacacatgggacgcgagtgagatttgaatgcaaacaagactgaagcaaactaatcgcgtattttagactacctggtaatccgccacagtgacgatgtttatatattggttagcgattttataataactattattacttttaattatgcaacttcattcataaaagaaagcattacgatctaccatttcgcgttgatagagtatttattaaaacgaggcatattgaagtgaaagtaaacaaagttgttttcaagcgatcctctctcttcgtgtaaagcgtaccggtatattttctgcttaaattgtgaacactttttgcttgatcaaatccaaaaaaaaattgttaagtgggtttgacgatatttgatgagagacatcaggtggtgtatcaattattgatatgaaaatagagaataacaattaataaacttttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatagttgcattagaccgcatgcatttctgtgagcaacgtcgatgggatacatgtatgtacatgtatgacaacataggataattctgctgtaaccaggggccttgtacaaacagaaatttgctttttatgtttctgactcgagtatctccagttaatatcattaaaacgtagttctcgaaagtaaatgtgtttataacgcataaaaggtaatttctaacgttttctgaatcgtggagtgctctccaactttatccttaattttcgtcccagatttaatttccctggacgtattggtattatttttaagaaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttcgagatgggccgatttttcgccctttggagcccct
gi|5 : tttaaaaaagtccggattggtatcaatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTAC-AGTC-TCC-CG-CGAC-AG-TACTCGTAC-AG--CGCTA-------C-ATGAAGGATCCC-T-ACAAAAGC-TATCTTCG-CC-G-AAGACAATTTA---CA--ATCA---CC-G-GA-----------------TATC------------------------ATT--------A---GGC-TAC-TTACAA-TTTTC-CTGCGAA--TTTA-TTAA-T-TA--TT---AC-AC--AATTA-TTA-ATC-AT-C----AGA--TTTTTTT------CCTG-GATG-TATT--GAAATACG-GTAAATCAAACTTT----C-CGCCAAT--TCCAGT--AC-GTCGA-CTGAGT-A--TCGT--T--ACT-T--A--GACT--CATA--GCGCAT--T-G-A-TGAAAATTAAT---AATTT-CTAGACA-AAA--TA-TGGGA-AA---AGAAT-----GG-G---AG-AGCATGC-------------------------TCA-------AT-ATTTAC-TC-A-GGT--CGT--T--ATT-C----AAGGTAATTAT-TCG-TAAAGTACCGAGAGAGTGAA--A-TGCTA--TTT-TGTT-GAA-A---------AA---AA-A-AAAC-AAT-ACAT-C-TCTCGT-AGG-TT--ATCACCAAACGTTTTAA-TT----GTT-AC-----GAGAAGAACAAA--TG-TAGA-CCTCAC-TAG-T-CCTCACTTGATATGGGGGA-TTTA-GT----A-----TAGGGGGAGCTTGGG-GG-GGG--------------GG-CAAACGGCAAAGAGA--TTTCCTC-GC-TT-T-TGTGTT-A-AAGAAAAAGAAA---TCA-CTATT-CTA-CAGT--CGCACATTA-GGCAGC-ACAC-ATTG--C-A-CTCCCT---TGG-GAAGAAAAGTATAGGAG---TTA-ACCC----AGCCACATTACA-CA-CAC---TC-CA-GACAACACTAG--AAA-TGCATTAA----C-ATGTG-AC-GCG-AGTAATGAATTTGTAAT-GCAAA---GACTATGAAA-T-CAA---C-TATTGCGTTAT---CGACTG-AACTC-----------GC-C--TGGGTTAAAA--TC-CCCGCC-GC-AGCATGCAC-GCATCG--TGTTCATA-----TAT-GAATAGCGTATTTTAT----A--ATACACTTAT-----------TACTTACTTGAGATT-ATTCATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----A---AAAAGG--A--TT---AATGA---------------TCC----T-ACGAATTTCGC-GGTTTG-ATGGAG-TA---TT-T-A-TAAA----C--GAGG-C----ATCTACA-TTGTAG----AA-G---TGGAAAC--AGA---AGTAAGTT-ATATTT---CAA-AAAAGCC-GACTCCTGCC--------------T-C-TCTTCCA-GTTAAA--G----CGT-AC----CCTCGGG---T--ATA-----TATTTC-TGC-TTAAATGATG--T-GAACCAC----TTTTG-CATTGA-TCGAACTCCCAACAGAAAAGAAATT-TGTT-A-GTTGGATTATGACGGAT-ATTTAGAC-TGA-GACGACATCAG--T--GG-TAGTATCA-ATT-AAT-GACGATGACAAAATACGA-AGAAATCTAGA-----AACATTAAT-AACT-TTT-GTAGAAAT-AT-CTACA-----A--T-GG---CATTTAA--CGAACATCA-TTGGATCGC-AATTC-T-ACGCACCAG-CA-T-GCA-TT-CTTGC-TGAACCACACGCCA-CTGGGG-AAT-ACATTGTACT---TA-CAAT-GTA--T-GATCAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTCT-A
gi|6 : C-TTCTCAGTT----GTT-A------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AG-T-G-T-C---A-GTGAT--GAGGGA-ATT---T-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGGG-------------TG-CAA--GGTAA--GAA--TTTCCTC-ACGTTGT-A----T-A-AAGAAAAAA------TCAGCT-TACAGG-CATT--TA---ATTACG-CAGC-ACAA-CTTG--C-AGCTC--T---TGGTGAAGAAA--TATGAGAGGGAT-ATACCCCC--ACCCACAT-ACA-CA-CAC---TCGAA-GA----AATAT--AAAATGGT---A----CTATGTGGAC-GCG-AGTGC-GATTG-G-AAC-GCAAA---GACT--GAAAAT-CAAAGATATATGGCGT--T---TG--TATGACT------------AC-CAGTGT--TAAAC--TC-C--GCCCAC-AG--TG-ATTG-AT-GGTTGGTTA-A-----TATTGGTTAGCGGATTTTATT---A--AT-----TATGCGGTCATATTTA-TTACTT----TT-AAATATGCATAACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GCCAA--TT---A-TGA---------------TT-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATGAAG-TAATATT-T-A-TAAATA--C--GAGG-C-----T----ACTT--AG----AAAG---TGAAA-T--AAA---C--AAGTT-TTTTTT---CAA-G-----C-CA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--GAACGTGT-AC----C----GG---T--ACAG----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--TTGAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAGAAAAC--T-TGTT-T-GTGGGTT-GTAACG-ATGATTT-GAATTGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AATAGA-GATGA--AAATAA-G-AGAA-T---AA-----CCA-TTAA--AACT-TTT--TA-AAATGAT-G---AACGAGG--T-GGGCCCATTCTTCTCGAA-AT-A-C--C-TTGCTA---T-G-T-G-ACT-G-CA-T-GCA-T--CT-G--TGGACGC-ACGCC--ATGGGG-ACTGACAT-GTAAT-G-TAACA-TCGTAA-T-GA--AAC-A---T-AAGGATAATG-CTG----CTGT-AACCAAG--GGCCTT--GT--ACAAA------A-G--AA-A--TATTGCTG-----------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CCCCA-TT--ACATATCATT--A--CA--GT--G-T----ATC-GAA-A--GT-AA---TGTGTTA---TA----T-AA-T-GCCAA--TAA-AGT-GTA--T----TT-CT--GA-CG-------TC-TTC------TG-AAC-------GTGGAGTGCTC-------ACTTTTTC------A---TCTAAT-TTT----C-G-T-CG--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAA---C-A-------CTT--GTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-ATGAGCAG--ACCAT-TC-GG---AAAATA---TAAGTTCA-TTTCAC-G--GAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|7 : AAT-TTCTCA-CT----TTT-ATA----AAGAAAAA--AA--AT-CA----CT-AT---A-C-AC--AGTTAAT--TAGCAG-CACA-AC-TTGAC----TAAAAGT-------G-GG-GGG---------------G-CAA--GGCAAA-GAA--TTTCCTC-AC-TT-TTA----T-T-AAGAAAAAAAAA---TCAACTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---TTA-ACCCCCCGACCCACATTACAACA-C-A---TC-AA-GA-----CTAT--AAA-TG-----AATTAT-ATGTG-AC-GCGCAGTGA-GATTT-G-AATTGCAAA-A-GACT--GAAAGTTCAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACCCGGATTGTAGACACAC--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-ACCAG--TG-AC-G-AT-G--TGT--ATA-----TATTGGTTAGC--ATTTTATTAATA--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AAATAT-CA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AA--GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-----CG-GAAGAG-TA---TT-TTA-TAAA-A--C--GAG--C----ATT---A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---C--AAGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------TTC-TCTTCGT-GT--AA--G----CGTTAC----C----GG---G--ATA-----T-TTTC--GC-T-ATAT--TG--T-GAAC-AC----TTT-G-C-CTGA-TCGAAT--CCAACAGAAAAAAAGATATGTT-AAGTGGGTT-GTGACG-AT-ATT--GA--TGA-GAAGACATCAGCGT--GGAGTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AA--TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-ATTG---A-----G--T-G----CATTTTTT-CTAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-TTA-G-AC--G-CA-TTGC--TT-CT-G--TGAACCA-ACGCCGCATGGG--AT--ACAT-GTATTAG-TA-CA-TTGTA--TTGA-CAACCA---T-A-GGAGAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-AATT-TTGCT------------------------TTT-ATG---T-TTTCT-G---A-TC-GAGT-ACATGTAAT-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA---T-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAAT-TGTGTTA----A----T-AA-C-GC--A--TAA-AGC-------A--TTTACT--AA-CG-------T--TTC------TGGATC-------GTGGAGTGCTC----CAAA--TTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTA--TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGGGAAAAAAAA---T-AATTCA--TTC-C-G-AGAT---GGGGCCGATTTTTCGCCC-TT-GAGCACCTA
gi|8 : --AT-----TATG----------TA-T-ACTT----TTTAAATAT-CA--ACTTTT------ATTTTCATAAAACCAGA---AAA-GC--AACTTCACA-CGA---------------TC-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-T----TT-T-A-GAAA-------GAGG-------T----A-TT--AT----AA-GC--TGAAAGT--AAA---C--AAGTT-ATTTT----CAACG-----C-GA-TCCT--C--------------T-CGTCTTCGT-GT--AA--G----C----T----C----GT---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACACACTTTTGGC-TTGA-GCGAAT--CCAA-AGAAA--------TGTT-A-GTGGGTT----GCG-A--ATTT-GA---GA-GA-GATATCAG-GTT-GG-GTGTATTA-ATT-AAT-AA-GATGA--AAATA--G-AG-AAT---AACCATTAAC-AT-AC-AACTATAT-G-A-AAAT-AT-G---A-----GATT-G----CATTTC---CGAA-AT-ATT--CATAAC-A---T-----G-ACC-A--A-T-GC--TT-CT-------AATT-ACGCAG-ATGGAT-AA--GTAT-GTAAG-G-TA--------A--T-GA--AACCA---T-C-GGATAA-T-CTG----CTGT-AACCAGG--GG----------A----------A-G--AA-A--A-TTGCT------------------------TTTT-TG---T-TT-CT-G---A-TC-GA-T-A-------T-CT-CAGTT--A-ATATCATTA-AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT--AATGTGTCTTA-----------AAAC-GCA-A--TAA-GG-------TA--TT---C--GA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGC-C----CCAAC-TTATC------C---C-TAAA-TTCACAAC-G-T-CC--A-G----A--TTCTC-AC-TATACCC-----AAC---T-A-------CTT-GGTATTA---TTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCCAAT-AG-----AACAT-TCAGA---ACAAAA-------TTC--TTTC-CAG-AGAT---GGG--CGT-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|9 : tttatatgatctgcATTT-GAAATATGATTAA--TAAACTTTACAATACGC-AATATGC-AGT--AAAGTTG--C---GTTA--TGGT-GT--ACT-TGAA--GACT--TATATAG-GCTAGTT-G-ACTTAAAA--AGCCATA---T-CGAAAAAACAA--TAATGGAT-TACGTAGAATATTAATA-GGAGAG-AGTATGCAGATATACTACACACGAC-CAT-TATCACGTAATGAT-ATT-ACATCTATG-TACCGT--AGTATTTCCAGTAAGATA--TATATCG-TAATGCTC-AAGAGAGTGAACTA-TG-TAA-TTTGTTTT-TTA-AAATTTACATAT---AT-AATACTTGATTAT-T-CCTCTCGT-AGGTCT--ATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----GCT-ACATGTAGAGAAGAA--AAGATG-TAGG-CCT-AT-T-GGT-CC--A-TTGAT--GAGGGG-ATTA-AT-TAGGGGCCCCGGGGGG-------G-GGTGGGGTGGGGGGGGGGGTTG-CAAA-GGC-AAAGAA--TTT-CTC-ACTTT-T-A----T-A-AAG-AAAAAAAA---TCA-CTAT--ACA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--c
Alignments
lowQualScore : 22222 11 11111 44444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333333333333333333333333 1111 111 11 22222 888888888888888888888888888888888888888888 111 111 1111 111 11 111 1111 111 1111111 111 22222222222222 11 222222222222 1111 1111 1 11111111 11111 111111 1 1 1 11 1 4444444444444444444444 222222222222222222 1 1111 333333333333 11111 2222222222222 33333333333333 1111111 333333333333333 1 1111 1 222222 111 1 111 22222 1 99999999999999999999999999999999999999999 1 1 111 111111 333333333333333333 111 11111 1 1111 2222222222222222222 111111 11111111 111 2222222222222222222222 1111 111111111111 1111 111 222222 1111 11111 22222222222222222 22 111111 1111111 1111 1 222 111 2222 11 1 11 1 1 11 222222222 11111 1111 111 111 1111 111 111111 111111 11 444444444444444444444444 11111 2222222 11 11 111111 11 222222222222 11111 222222 2222222222 111111 1111111 1111 111111 1111111111111 1
lowQualScore : 0 8 00000 0 0 11 0 44444 55555 5 77 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 6 6 6 6 6 88888888888888888888888888 4444 6 6 33 6 6 6 6 111 00 2 1 3 6 6 88888 333333333333333333333333333333333333333333 777 66 5 77 5 5 5 77 000 5 77 6 1 7 6 8888 99 3 888 6 88 99 6 000 4444 999999 6 99 6 6 111 6 99 99999 2 7777777 666 99 6 99 6 6 6 44444444444444 3 6 99 7 1 88 99 555555555555 6 4444 6 6 0000 6 3 77777777 33333 999999 7 6 3 3 99 6 3 55 3 6 2222222222222222222222 44 6 6 222222222222222222 6 5 1 0 5 0000 333333333333 66 11111 5 5 0000000000000 66 1 5 22222222222222 5 6666666 5 5 444444444444444 5 88 0 44 66 5 0 5 5 0000 5 5 999999 0 444444 66 333 5 5 0 5 66 999 77 000 5 77 66666 5 77 0 1 5 88888888888888888888888888888888888888888 1 5 5 5 2 5 5 777 77 666 77 1 3 111111 77 5 888888888888888888 77 77 5 77 5 5 77 5 77 5 5 77 555 44444 1 5555 66 8888888888888888888 4 9999 4 9 3 66 222222 55555555 4 66 66 222 4 9999999999999999999999 8 8 4 66 4 4 777 4 4 4 2222 66 777777777777 8 66 7777 4 222 66 333333 4 5555 4 11111 4 4 77777777777777777 4 4 4 11 66 9999 4 9999 9999 222222 7777777 4 4 66 66 4 4 3333 5 5 5 66 0 0 222 5 000 4444 5 5 88 11 5 0 5 11 0 5 5 0 5 66 11 5 3 888 555555555 5 4 4 4 4 4 777 11111 55 4 2222 666 4 8 4 666 4 777 000 4 4 0000 4 4 44 4 4 99 0 4 4 4 222 5 88888 444444 99 4 4 777 4 4 3 7777 3 55 4 66 888888 4 00 4 66 4 777777777777777777777777 1 33333 4 4 777 66 4 4 5555555 4 66 4 00 00 4 333333 4 4 66 4 44 0 888888888888 3 4 66666 4 44 333333 4 66 4 0000000000 777777 8 2 4444444 1111 000000 666 3 3 7777 3 3 3 55 3 7777 55 3 3 3 3 3 666 5555555555555 3 77 555 555 3 44 3 3 6 3 6666 2 3 6666 555 44 3 3 3 3 555 9 6
lowQualScore : . . ..... . . .. . ..... ..... . .. . ............................................................................ . . . . . . .......................... .... . . .. . . . . ... .. . . . . . ..... .......................................... ... .. . .. . . . .. ... . .. . . . . .... .. . ... . .. .. . ... .... ...... . .. . . ... . .. ..... . ....... ... .. . .. . . . .............. . . .. . . .. .. ............ . .... . . .... . . ........ ..... ...... . . . . .. . . .. . . ...................... .. . . .................. . . . . . .... ............ .. ..... . . ............. .. . . .............. . ....... . . ............... . .. . .. .. . . . . .... . . ...... . ...... .. ... . . . . .. ... .. ... . .. ..... . .. . . . ......................................... . . . . . . . ... .. ... .. . . ...... .. . .................. .. .. . .. . . .. . .. . . .. ... ..... . .... .. ................... . .... . . . .. ...... ........ . .. .. ... . ...................... . . . .. . . ... . . . .... .. ............ . .. .... . ... .. ...... . .... . ..... . . ................. . . . .. .. .... . .... .... ...... ....... . . .. .. . . .... . . . .. . . ... . ... .... . . .. .. . . . .. . . . . . .. .. . . ... ......... . . . . . . ... ..... .. . .... ... . . . ... . ... ... . . .... . . .. . . .. . . . . ... . ..... ...... .. . . ... . . . .... . .. . .. ...... . .. . .. . ........................ . ..... . . ... .. . . ....... . .. . .. .. . ...... . . .. . .. . ............ . . ..... . .. ...... . .. . .......... ...... . . ....... .... ...... ... . . .... . . . .. . .... .. . . . . . ... ............. . .. ... ... . .. . . . . .... . . .... ... .. . . . . ... . .
lowQualScore : 8 0 00000 8 8 00 6 33333 99999 7 99 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 7 7 7 7 7 33333333333333333333333333 2222 7 7 55 7 7 7 7 777 00 5 7 2 7 7 22222 000000000000000000000000000000000000000000 111 44 7 99 7 7 7 99 000 7 99 7 7 3 7 3333 22 2 333 7 00 88 7 888 2222 555555 7 22 7 7 777 7 22 33333 5 7777777 777 22 7 22 7 7 7 77777777777777 2 7 22 2 0 33 22 222222222222 7 2222 7 7 8888 7 3 55555555 77777 777777 3 7 3 3 22 7 3 88 3 7 8888888888888888888888 22 7 7 888888888888888888 7 0 1 8 0 6666 555555555555 99 88888 0 0 6666666666666 99 0 0 11111111111111 1 2222222 0 0 555555555555555 0 22 1 00 99 0 0 0 0 6666 0 0 000000 0 000000 99 888 0 0 0 0 99 444 99 000 7 99 00000 7 99 7 4 7 00000000000000000000000000000000000000000 4 7 7 7 0 7 7 777 99 777 99 7 0 666666 99 7 333333333333333333 99 99 7 99 7 7 99 7 44 7 7 99 999 33333 4 6666 11 2222222222222222222 4 4444 4 7 9 11 888888 33333333 4 11 11 222 4 6666666666666666666666 9 9 4 11 4 4 888 4 4 4 4444 11 999999999999 9 11 2222 4 222 11 888888 4 1111 4 11111 4 4 88888888888888888 4 4 4 11 11 4444 4 4444 4444 000000 1111111 4 4 11 11 4 4 9999 0 0 0 99 0 4 555 0 888 4444 0 0 22 99 0 0 0 99 0 0 0 0 0 99 99 0 2 888 111111111 0 4 4 4 4 4 888 11111 55 0 5555 555 0 0 0 222 0 000 333 0 0 0000 0 0 88 0 0 55 9 4 4 4 999 0 22222 000000 55 0 0 000 0 0 6 7777 6 55 0 11 333333 4 66 4 11 4 222222222222222222222222 9 11111 4 4 888 33 4 4 6666666 4 11 4 66 66 4 888888 4 4 11 4 77 1 000000000000 6 4 66666 4 66 222222 4 11 4 4444444444 222222 9 2 4444444 4444 555555 444 6 6 7777 6 6 6 00 6 7777 00 6 6 6 6 6 444 9999999999999 6 22 444 444 1 22 1 1 7 3 2222 8 3 2222 888 22 1 1 1 1 444 2 2
consensus : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT----CCGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
Reference ( family-3278 ) : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT---GCCGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|1 : TACTAACTCAT-AATAATTTATTATATTATA--CTGTTTTAAAAA-----AGT------GGATTTGGTATC--A-ATATT
gi|1 : TTAC--GTC-TCCCGA-CGAC-AGGTAAT---ACGAG--G-CT--------CCATGAGG----TCGT-ACAAAAGCATATCGTCGACC-GGAAGACA-TTTA---CA--ATAAGCACCAG-GAAATTTTAAATGCGCAGTCACTTCACATCTTTATGATAGTAAA--AGTTTATTATAAA---GGCCTACCTTAC---TTATCACTG-GGAGACTTAGTTAA-T-TT--TTCTTACCACCAAATC---TATATCCATTC---CAGG--TTTTCC--CG--CCCTG-GATGGTATTG-AAGATACG-ATAA---AAACTTT----CATGC-TAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-AATCGGA-TT--ACTAT--G--GGCAACTATA--G-GCTG--T-GCA-TCAAAA--AGC---A---T-CGAA----CAA--TTATGAA---A--TAAATT-----T------AG-AGCATGCAGATAT----CACACGACGCAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGTTGA--ATTTC----AAGGTA--TATATCGGTAA-AGA--GAGAGAGTGAA--A-TG-TAATTTT-TTTTATTA-A--TTTACATAT----T-A-TAACTGAT-AT-TTC-TCTCGT-AG--TTCAATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----GTTTG----TA-----AGAAGAA--AA---G-TAGGTCCT-AGAT-G-TTCC--A-TT-AT--GAGGGATT-TA------GA-----TAGGGGG-------GCGG-GGG--------------TGACAAA-GGCATAAGAAATTCTCTTCTGC-TT-T-A----T-ATAAGAAAAAACCA---CCA---ATA-ATG-CACTAGTAC--ATTA-G-CAGC-ACAAACTTGAGC-A-CTC--TATATGG-GAAGAA---TATAGGATAC-T-A-GCCCCC--ACCCACAT-ACA-CACACAAATC-AATGA----ACTA----AA-TG-----AA---C-ATGTGTAC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-G---A-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATAT-GC--------TG--TA--ACT------------AC----TGG--TAAAAGATCTC--GCC-AC-AG--TG-A--G-AT-G--T-TGTATA-----TATTGGTT--CG-ATT--AT----A--AT--------------------A-TAA--T----TT-AATTATT----ACTTT------------------A----G---AAA-GC--A--TT---A--GA---------------TC-----T-ACGAATTTCGC-G--TTG-ATAGTC-GA---TTCT-A-TAAA-AGAC--GAGGAC----AT----A-TT--AGGGA-AG-G---TGAAAGT--AAA---GC-AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----T-GA-TC-T--C--------------T---TCTTCGTAGTCAAA--G----CAT-AC----C----GG---TTGA-A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAATTT---T-TTTT-T-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATT--GA--TGA-GA-GACGTCAG-GTAGGG-GTGTATTACATT-AAT-GA-GATGA--AAA----G-AGAAAT---AA-----A-C-ATAAT-AACT-TT--GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTT----CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---TGT-A-G-AC--G-CA-T-GCA-TT-TT-GAATGTACCA-ACGCCG-ATGGGG-AT--ACAT------------------TA--T-GA-CAACCA---T-C-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GGAAA-A--C-TTGCT------------------------TTTTATG---TGTT-CTTG---A--C-GAGT-A-------T-CTTCAGTT--A--TATCAT---AAACAA-GT-AGGT----CTC-GAA-A--GTTAAATGTGTAT-A---TA----T-AAGC-A---A--TAATAGC-GTA--T-----T-TT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGA-TGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TATT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTAT-TTTT----A---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGG------AAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAC---GGGGCCGA-TTTTCG-CC-TTGGAG-CCCTACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcgttacgtctcccgacgacaggtaatacgaggctccatgaggtcgtacaaaagcatatcgtcgaccggaagacatttacaataagcaccaggaaattttaaatgcgcagtcacttcacatctttatgatagtaaaagtttattataaaggcctaccttacttatcactgggagacttagttaatttttcttaccaccaaatctatatccattccaggttttcccgccctggatggtattgaagatacgataaaaactttcatgctatgcagtaagttgacgtaatcggattactatgggcaactataggctgtgcatcaaaaagcatcgaacaattatgaaataaatttagagcatgcagatatcacacgacgcattatcacgagatatttactcagtcgttgaatttcaaggtatatatcggtaaagagagagagtgaaatgtaattttttttattaatttacatattataactgatatttctctcgtagttcaatcacaaacttttattgtttgtaagaagaaaagtaggtcctagatgttccattatgagggatttagataggggggcgggggtgacaaaggcataagaaattctcttctgctttatataagaaaaaaccaccaataatgcactagtacattagcagcacaaacttgagcactctatatgggaagaatataggatactagcccccacccacatacacacacaaatcaatgaactaaatgaacatgtgtacgcgagtgagattttgaatgaaagactgaaagtcaaacatatgctgtaactactggtaaaagatctcgccacagtgagatgttgtatatattggttcgattataatataatttaattattactttagaaagcattagatctacgaatttcgcgttgatagtcgattctataaaagacgaggacatattagggaaggtgaaagtaaagcaagttatttttcaagtgatctcttcttcgtagtcaaagcataccggttgaattttctgcttaaattgtgaacacttttgcttgatcaaatccaaagaaatttttttttgtgggtttgacgatattgatgagagacgtcaggtaggggtgtattacattaatgagatgaaaagagaaataaacataataactttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatggttgcatgtagacgcatgcattttgaatgtaccaacgccgatggggatacattatgacaaccatcggataattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacaggaaaacttgctttttatgtgttcttgacgagtatcttcagttatatcataaacaagtaggtctcgaaagttaaatgtgtatatataagcaataatagcgtattttaacgtttctgatcgtggatgctcccaactttatccttatttttcgtccagatttaatttccctggactacttggtattatttttagaaacagacatccatagcaaacattcaggaaataattcatttccgagacggggccgattttcgccttggagccctac
gi|10 : tactaactcataataatttattatattatactgttttaaaaaagtggatttggtatcaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcg----A--AT-----TAT-----------AA-TTACTT----TT-AA-TATGCA---CTTTCTCATTTGTTTTCATAAAA----AGAAAAA-GC--A--TTT--A-CGAGATTTTTATATTACATCAACCAT-AA-AATTCAAC-G--TTGGATGAGG-TA---TT-T-A-TAAA-A--CGAGAGG-CAATGAT----ATTT--AG----AA-AAGTTGAAAGT--AAAACTG--AAGTTAATTTTTCTACAA-G-----CTGA-TCCC--CCTACAATTCTTTCGT-C-TTTTGGT-GTA-AA--G----CAT-ACCCTGC----GG---T--ACACAATCC-TTTC-TGCTTTAAAT--TGAAA-GAAC-AT----TTTT
gi|11 : TAAT-G-TA-C--T-GAA----GA-CA--CAGTCTGA-GGGTAATTTCTGGGGGCTGT-AACCAGG--G-CCTT-TGTCAACAAAAA-C--ACG--AATA--T-TTGTTTTTTTTGGTGCTTACGGTCTTTTTTTTTATGGGTT-TT-CT-GTAGA-TCCGAGT-AAAATC--T-CTCCAGTTTAA-ATATCATT--AAACAAAGT-AG-TTCCCCTC-GAA-AACGT-AGA-ATGTGTTAG--TA----TTAAACCGC--AA-TAT-AGC-GTA--T----TT-CT--AAACGGTTTCTCT--TTCCTTCTTTG-A-C-------GTGGGATGCTCAGCGCCAA-TTTATC------CCCCT-TCAT-GTT----C-G-T-TCTCA-GGATAA--TT-CA-AT-T-T-C--T---GGAC---T-ATAATAAACTT-GGTGTTAT-TTTTTTAGA---GTA--AACAGA-C-tttttttttttttttaacatagcgcgtttgatcgaagcgatataccaagagaaaaaaaataaagaaaaattattttgtggggtttggaacagatgatttatttttgagtttagaagaacaatagtatatcaggtggattgtaatgatctaatagaagattgaaatagagaaattaaaa
gi|12 : atttatatATT-CTG----CTGTTAACCAGGCAGGCCTTCTG---ACAAAACACGAA-A--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-ATG---TGTC-CT-G---A--C-GAGTTA-------TGCTCCAGTT--A-ATATCATTTAAAACA--GT-AG-T----CTCAGAATA--GT-AAA-ATGTGTTAGATTA----T--AAC-GC--AATTAA-AGCAGTAGTTACCTTT-CTCGAA-CG-------T--TTCG-----TG-ATCCCCGCCTACGAGGT-CGT----CCAACATCATCCTATCGC---T-TAAT-TTT----CAG-T-CC--ATG----ACGTT-TATATCT-T-CCCTGGGGGACGGTT-A-------CTTAGATATTA--TTTT---AAGTGG-C--AACAGAGCGATGC-AT-AGC-A--AGCAT-TCA-G---AAAAAA---T-AATTCATTTTC-C-GAAGATTGCGGGGCCGA-TGTTTGCCC-TTGGAGCCCCTACgaggaaacatt
gi|13 : tTTTAAAAA------GT----CCGGA-TTGGTATCCAA-ATATTc
gi|13 : CTTACCAGTCCTCT-GG-CAAC-AG-TAT----AC-AGGCC-TTAACTGTACCCATGAG------T-T-ACAAAAGCATATCGTCG-C--G-AAGACA-TTT----TACAATCAACACC-G-GA-----TAAATGCGCAGTTATT------------------------ATT--------AGGGGGCCTACCTTACA--TTAT--CTG-GAA--CTTA-TTAT-T-TT--CT---AC-AC--AA-TA-TCATATCCAT-CATGCAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-aagagaaaagagagaagagagagagagagagatcacttaccagtcctctggcaacagtatacaggccttaactgtacccatgagttacaaaagcatatcgtcgcgaagacattttacaatcaacaccggataaatgcgcagttattattagggggcctaccttacattatctggaacttattattttctacacaatatcatatccatcatgcaggttttttttcccctg
gi|14 : tttaaaaagtccggattggtatccaaatattaagagaaaagagagaagagagagagagagagatcaAATGTTC----TTAACTCTATC------C---T-TAATACGT----C-T-T-CC--A-A----A--TT-TT-GC-T-T-CCCC---GGGC---A-A-------TTT-AGTGTTAG-TTTT---AA---G-G--AATAAA-C-ATAC-AC-AGCAATCAGCAGATCAGG---GGGGGGGGGT-GATTCA-AGTA-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGACC-ATAGAACCCCTA
gi|15 : gtTGGAATGCTC----TTAACTCCATT------C---T-TAAA-TTT----C-T-T-CC--A-T----A--TT-TG-AC-T-T-CCCG---AGAC---A-A-------TTT-AGTGTTAT-TTTA---AA---G-A--AATAAA-C-ACCC-AC-GGCAT--A-CAT-TCA-----AAAAAA---T-GGTTCA-ATTT-T-G-AGAT---TGGACCGA-TCTTGATCC-TTAGAGCCCCgc
gi|16 : aatTAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCCCAT-AGCAA--TACAT-TCAGA---CAAAAA---T--GTTCA-TTTC-T----AAT----GGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGG-GCCCC
gi|17 : a--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-A-CA-T-GCA-TT-CT-G--T
gi|18 : TAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGA---CAAAAA---T-GGTTCA-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGGGGCaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataataatcagcg
gi|19 : a-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-C--CGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-
gi|2 : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATACTATA--CTTTTTTAAAAATTTCAAGTTAAGTCGGA-CTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-AG-CGAC-AG-TA-----AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AGGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TGTATGCGCAGTCACTC-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCT--------------G-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTG-ATCCAT-C----AGG--TTTTTTTTTTTTCCTTA-GATG-TATTT-GAAATGCG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGT--AG-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--AAT----A--GATA--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTTAAA--A----------------AA-CAA--TAATGGA--AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-AAT-ATTTAC-TC---------GT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GGGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA----TTTACATAATGAATTA-TAACTGAT-AT-T-A-TCTCGTTAG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT---A-T-CC--A-TTGAT--GAGGGATT-TACATGTAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAA-----TCA-CTATAGATA-CATT--TA----TTA-G-CAGC-ACAA-CTTA--C---CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCAACAT-ACA-CAACC---TC-AA-GA----ACTATTTAAA-TGT----A----C-ATGT--AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AGGACT--GAACGT-CAAA--AATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------ACGC--TGT--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AT-G-AT-G--TGTATATAGACTCTATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TG-AA-TATGTA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----T---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TT-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-A--GAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AGTTCTAA-G---TGAAAGT--AAA---A--ACGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTTGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GTAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-T-GTGGTTTTGGGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-GTCA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AA--ACAT-GTATT-G-TA-CA-T-GCA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--AGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTTTG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGCT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AA-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TACCGGT-AAAC-GT--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-AAC-------GTGGAGGGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-A--T-T-CCCT---GGAC---T-T-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGAAA--AACAT-TCAAG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|20 : ATACTA-CTCAT-AATA-----T---ATTA-------------AAA-----AGT-----CGGA-TTGGTATC--A-ATA
gi|21 : tagataagggcacttttttttggaTACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATAACTTTTTTTAAAAA-----AGT----CCGGA-TTGGTATC--A-ATAT
gi|22 : T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-ATG----CTGT-AACCACG--GGCCTT-T
gi|23 : GTTTC-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGCCC-TTAGAGCCCCCAC
gi|24 : T--------A---GGCCTACCTTACG--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAATT-TT--CT---AC-AC--At
gi|3 : ATACTAACTCATCAATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT-----CGGA-TTGGTATC--ACATA
gi|3 : tagtaaggcactttttgctttggaCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--G-TCA-------T-ATGAGG----TC-TTACAAAAGCATAT-ATCG-CCCG-AAGATA-TTTA---AACT-TCAACACC-GCGAA----TAAATGTGCAGTTTATT-------------------A----TT--------A---GGCCTACCTTACAATTCATC-TGG-AAA--CTTA-TTAT-TATT--CT---AC-AC--AATTA-T-ATATCCCT-C---CAGGGTTTTTTTTTC---CCCTGAGAT---ATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGTCTAA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GTTCACT-T--AAGGAC---TATA--G-GCTG--TTG-A-TTAAAA--GCC---A---T-CGAAAAA-CAAATTACTTGATGAA--TAGAAT-----TGAG---AGGAGC-TGCAGATAT----CACACGAC-CATATATCACG--A-GAT-ATTTACATC-A-G-T--CGT--A--ATT-C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTACTGAGAGAGTGAA--A-TGGTA--TTTCTTTT-TTATA--TTTACATCA----C-A-GAACTTTT-AT-T----------AA--TT--GT-AT-A------------T----GCT------TA----GAGAAGAA--AA--TGCTAGG-CCT-AT-T-G-T-CT--A-TTGAT--GAGGGGATGTAGAT-T-GA-----T-GGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAACAGAA--TGTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CGAAT-ACGACAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--C-A-CTT--T-----G-GAAGAAA--TATAGGAGC--T-A-ACCCCC--ACC-ACAT-AGA-CACA------------------------------------------TGTG-ACAGC--AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-ATATTTG--TA-GACA------------TC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC--G--TG-AC-G-AT-G--T-TATATA-----TATTG-TTAGCG-ATTTTAT----ATAAC-----TAT-----------TA-TTACTT----T--AATTA-GCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--T----A-CAT---------------CC-----T-AC-CATTTCGCAG--TTG-ATAGAGATA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGGAC----AT----A-TT--AG----AA-G----GAAAGTGTAAA---C--AAGCT-TGTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT-----------------T-C-TCTTCGT-GT--AAAGG----CGT-AC----C----GGGTTTG-ATA-----TCTTTCATGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGAGTCAAAT--CCAA-AGAAAAAG---T--GTT-A-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATTT-GA--TGAAGA-GACATCAG-GT--GGTGT-TATCA-ATTTAATTGA-TATGA--AAATA--GGAGAAAT---AA-----CACATTAAT-AACT-TTTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TTG----CATTTT---CGAA-ATGA-T--AGTTGC-A---TCT-A-G-ACC-GGCAAT-GCA-TTTCT-G--TGAGCCA--CGTCG-ATGGGGCAT--ACAT-GTACT-GCTA-CAAT-GTACAT-GA-CAACCA---T-A-GG-TAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GA-AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG-----TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCC-GTT--A-ATATCATT---AACA--GTCAGTT----CTC-GAA-A--GT-AAA--TGTGTTA---TA----T--AAC-GCA-A--TAA-AGC-GTA--CT--TCT-CT--AA-CG-------TTGTTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-GTT-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---TAA-------CTT-GGTATTATCTTTT---AA---G-ATGAACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAT---GCGGCCGAGTTTTCGCCCATTG--GCCCCTattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccggcgacagtattacaggtcatatgaggtcttacaaaagcatatatcgcccgaagatatttaaacttcaacaccgcgaataaatgtgcagtttattattaggcctaccttacaattcatctggaaacttattattattctacacaattatatatccctccagggtttttttttcccctgagatatttgaaatacgttaataaactttcacgcatgcagtctaagttgacgtatggtgttcacttaaggactataggctgttgattaaaagccatcgaaaaacaaattacttgatgaatagaattgagaggagctgcagatatcacacgaccatatatcacgagatatttacatcagtcgtaattcaaggtaattatatcgtaagtactgagagagtgaaatggtatttcttttttatatttacatcacagaacttttattaattgtatatgcttagagaagaaaatgctaggcctattgtctattgatgaggggatgtagattgatgggggggggggtgcaaaggcaacagaatgtcctcgctttataaagaaaaaaaaatcacgaatacgacagttaattagcagccacaacttgcactttggaagaaatataggagctaacccccaccacatagacacatgtgacagcagtgagattttgaatgcaaaaagactgaaagtcaaacatatcgcgtatatttgtagacatcctggtaaaatccgccacgtgacgatgttatatatattgttagcgattttatataactattattactttaattagcaactttcattttcataaaagaaagcatacatcctaccatttcgcagttgatagagatatttataaaacgaggacatattagaaggaaagtgtaaacaagcttgttttcaagcgatccttctcttcgtgtaaaggcgtaccgggtttgatatctttcatgcttaaattgtgaacacttttgcttgagtcaaatccaaagaaaaagtgttagtgggtttgacgatatttgatgaagagacatcaggtggtgttatcaatttaattgatatgaaaataggagaaataacacattaataactttttgtaaaatatgagttgcattttcgaaatgatagttgcatctagaccggcaatgcatttctgtgagccacgtcgatggggcatacatgtactgctacaatgtacatgacaaccataggtaattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacagaaaatttgctttttatgttctgatcgagtatctccgttaatatcattaacagtcagttctcgaaagtaaatgtgttatataacgcaataaagcgtacttctctaacgttgttctgatcgtggagtgctcccaactttatccttaattttcgttccagatttaatttccctggactaacttggtattatcttttaagatgaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttccgagatgcggccgagttttcgcccattggcccct
gi|4 : tagtaaggcactttttgctttggaatactaactcatcaatattatattatacttttttaaaaaagtcggattggtatcacataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTTAAAAA-----AGT----CCGGA-TTGGTATC--A-ATATT
gi|4 : CTTAC-AGTC-TCC-GGGCGACCAG-TAT----AA-GG--C-CT--------CTATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATATTCG-CC-G-AAGATA-TTTAATTCACAAC--AC-CC-G-GAAA---TAAATGTGCAGTT--TT-------------------ATTATTT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTTA-T-TTTTCT---AC-AC--AATTAATTATATCCAT-T---CAGG--GTTTTTTTC---CCCTG-GAT--TATTTTGAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGAAC---GT-A--TGGTTGT--A-T-T--A--GGAC--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---TTCGAAAAA-CAA--TACTT-AT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GATTATTTAC-TC-A-G-T--CCG--A--ATT-C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--AATG-TA--ATT-TTTT-TT-----TTTA-------------------AT-AT-T-T-ACT-------------TCAC-AAAC-TTTTTA-TTAATTGTT-A----TATGTAGAGAAGAA--AA--AT-TAGG-CCT-AT-T-----CT--A-TTGAT--GAGGGGAT-T-----TAGA-----T-GAGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCCAAGAAA--TTTCCT--GC-TT-T-A----TTA-AAGAAAAAAAAAATATCA-CTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--CCA-CTC--T---TGG-GA-GAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-AGA-CACA------------------------------------------TGGG-AC-GCG-AGTGA-GATTT-G-AAT-GCAAACAAGACT--GAAG---CAAA--CTAATCGCGT-AT---TT--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAA----TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--T--TTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--ATAAC--TAT-----------TA-TTACTT----TT-AATTATGCA--AC-TTC------A--TTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-CATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-ATTAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT---G----AA-G---TGAAAGT--AAAC--A--AAGTT-G-TTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GTA-AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACT---TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-A-AAAAAA---T-TGTTAA-GTGGGTT--TGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT---G-GTGTATCA-ATT-ATT-GA-TATGA--AAATA--G-AG-AAT---AA-----CAA-TTAATAAACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CA-TTT---CGAA-AT-A-T--AGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCATTT-CT-G--T-GAGCA-ACGTCG-AT-GGG-AT--ACAT-GTA-T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAA-CA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCC-T-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---ACTC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAAC--GT-AGTT----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGT-TTA---T--------AAC-GC--A--TAA-AAG-GTA---A--TTT-CT--AA-CGT------T--TTC------TGAATC-------GTGGAGTGCTCT---CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-TCCC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGACG--T-A--------TT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTT--C-G-AGAT----GGGCCGATTTTTCGCCCTTTGGAGCCCCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccgggcgaccagtataaggcctctatgaggtctacaaaagcatatattcgccgaagatatttaattcacaacacccggaaataaatgtgcagttttattatttaggcctaccttacattatcctggaacttatttatttttctacacaattaattatatccattcagggtttttttcccctggattattttgaaatacgttaataaactttcacgcaatgcagtaagttgaacgtatggttgtattaggactataggctgtgattaaaaagcattcgaaaaacaatacttataatagaattggagagcatgcagatatcacacgaccattatcacgagattatttactcagtccgaattcaaggtaattatatcgtaagtacgagagagtgaaaatgtaatttttttttttaatatttacttcacaaactttttattaattgttatatgtagagaagaaaaattaggcctattctattgatgaggggatttagatgagggggggggtgcaaaggccaagaaatttcctgctttattaaagaaaaaaaaaatatcactatacacagttaattagcagccacaacttgccactcttgggagaaatataggagtaacccccacccacatagacacatgggacgcgagtgagatttgaatgcaaacaagactgaagcaaactaatcgcgtattttagactacctggtaatccgccacagtgacgatgtttatatattggttagcgattttataataactattattacttttaattatgcaacttcattcataaaagaaagcattacgatctaccatttcgcgttgatagagtatttattaaaacgaggcatattgaagtgaaagtaaacaaagttgttttcaagcgatcctctctcttcgtgtaaagcgtaccggtatattttctgcttaaattgtgaacactttttgcttgatcaaatccaaaaaaaaattgttaagtgggtttgacgatatttgatgagagacatcaggtggtgtatcaattattgatatgaaaatagagaataacaattaataaacttttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatagttgcattagaccgcatgcatttctgtgagcaacgtcgatgggatacatgtatgtacatgtatgacaacataggataattctgctgtaaccaggggccttgtacaaacagaaatttgctttttatgtttctgactcgagtatctccagttaatatcattaaaacgtagttctcgaaagtaaatgtgtttataacgcataaaaggtaatttctaacgttttctgaatcgtggagtgctctccaactttatccttaattttcgtcccagatttaatttccctggacgtattggtattatttttaagaaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttcgagatgggccgatttttcgccctttggagcccct
gi|5 : tttaaaaaagtccggattggtatcaatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTAC-AGTC-TCC-CG-CGAC-AG-TACTCGTAC-AG--CGCTA-------C-ATGAAGGATCCC-T-ACAAAAGC-TATCTTCG-CC-G-AAGACAATTTA---CA--ATCA---CC-G-GA-----------------TATC------------------------ATT--------A---GGC-TAC-TTACAA-TTTTC-CTGCGAA--TTTA-TTAA-T-TA--TT---AC-AC--AATTA-TTA-ATC-AT-C----AGA--TTTTTTT------CCTG-GATG-TATT--GAAATACG-GTAAATCAAACTTT----C-CGCCAAT--TCCAGT--AC-GTCGA-CTGAGT-A--TCGT--T--ACT-T--A--GACT--CATA--GCGCAT--T-G-A-TGAAAATTAAT---AATTT-CTAGACA-AAA--TA-TGGGA-AA---AGAAT-----GG-G---AG-AGCATGC-------------------------TCA-------AT-ATTTAC-TC-A-GGT--CGT--T--ATT-C----AAGGTAATTAT-TCG-TAAAGTACCGAGAGAGTGAA--A-TGCTA--TTT-TGTT-GAA-A---------AA---AA-A-AAAC-AAT-ACAT-C-TCTCGT-AGG-TT--ATCACCAAACGTTTTAA-TT----GTT-A----C-----GAGAAGAACAAA--TG-TAGA-CCTCAC-TAG-T-CCTCACTTGATATGGGGGATT-TA-GT----A-----TAGGGGGAGCTTGGG-GG-GGG--------------GG-CAAACGGCAAAGAGA--TTTCCTC-GC-TT-T-TGTGTT-A-AAGAAAAAGAAA---TCA-CTATT-CTA-CAGT--CGCACATTA-GGCAGC-ACAC-ATTG--C-A-CTCCCT---TGG-GAAGAAAAGTATAGGAG---TTA-ACCC----AGCCACATTACA-CACAC---TC-CA-GACAACACTAG--AAA-TGCATTAA----C-ATGTG-AC-GCG-AGTAATGAATTTGTAAT-GCAAA---GACTATGAAA-T-CAA---C-TATTGCGTTAT---CGACTG-AACTC-----------GC-C--TGGGTTAAAA--TC-CCCGCC-GC-AGCATGCAC-GCATCG--TGTTCATA-----TAT-GAATAGCGTATTTTAT----A--ATACACTTAT-----------TACTTACTTGAGATT-ATTCATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----A---AAAAGG--A--TT---AATGA---------------TCC----T-ACGAATTTCGC-GGTTTG-ATGGAG-TA---TT-T-A-TAAA----C--GAGG-C----ATCTACA-TTGTAG----AA-G---TGGAAAC--AGA---AGTAAGTT-ATATTT---CAA-AAAAGCC-GACTCCTGCC--------------T-C-TCTTCCA-GTTAAA--G----CGT-AC----CCTCGGG---T--ATA-----TATTTC-TGC-TTAAATGATG--T-GAACCAC----TTTTG-CATTGA-TCGAACTCCCAACAGAAAAGAAATT-TGTT-A-GTTGGATTATGACGGAT-ATTTAGAC-TGA-GACGACATCAG--T--GG-TAGTATCA-ATT-AAT-GACGATGACAAAATACGA-AGAAATCTAGA-----AACATTAAT-AACT-TTT-GTAGAAAT-AT-CTACA-----A--T-GG---CATTTAA--CGAACATCA-TTGGATCGC-AATTC-T-ACGCACCAG-CA-T-GCA-TT-CTTGC-TGAACCACACGCCA-CTGGGG-AAT-ACATTGTACT---TA-CAAT-GTA--T-GATCAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTCT-A
gi|6 : C-TTCTCAGTT----GTT-A----------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AG-T-G-T-C---A-GTGAT--GAGGGAAT-T---T-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGGG-------------TG-CAA--GGTAA--GAA--TTTCCTC-ACGTTGT-A----T-A-AAGAAAAAA------TCAGCT-TACAGG-CATT--TA---ATTACG-CAGC-ACAA-CTTG--C-AGCTC--T---TGGTGAAGAAA--TATGAGAGGGAT-ATACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TCGAA-GA----AATAT--AAAATGGT---A----CTATGTGGAC-GCG-AGTGC-GATTG-G-AAC-GCAAA---GACT--GAAAAT-CAAAGATATATGGCGT--T---TG--TATGACT------------AC-CAGTGT--TAAAC--TC-C--GCCCAC-AG--TG-ATTG-AT-GGTTGGTTA-A-----TATTGGTTAGCGGATTTTATT---A--AT-----TATGCGGTCATATTTA-TTACTT----TT-AAATATGCATAACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GCCAA--TT---A-TGA---------------TT-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATGAAG-TAATATT-T-A-TAAATA--C--GAGG-C-----T----ACTT--AG----AAAG---TGAAA-T--AAA---C--AAGTT-TTTTTT---CAA-G-----C-CA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--GAACGTGT-AC----C----GG---T--ACAG----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--TTGAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAGAAAAC--T-TGTT-T-GTGGGTT-GTAACG-ATGATTT-GAATTGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AATAGA-GATGA--AAATAA-G-AGAA-T---AA-----CCA-TTAA--AACT-TTT--TA-AAATGAT-G---AACGAGG--T-GGGCCCATTCTTCTCGAA-AT-A-C--C-TTGCTA---T-G-T-G-ACT-G-CA-T-GCA-T--CT-G--TGGACGC-ACGCC--ATGGGG-ACTGACAT-GTAAT-G-TAACA-TCGTAA-T-GA--AAC-A---T-AAGGATAATG-CTG----CTGT-AACCAAG--GGCCTT--GT--ACAAA------A-G--AA-A--TATTGCTG-----------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CCCCA-TT--ACATATCATT--A--CA--GT--G-T----ATC-GAA-A--GT-AA---TGTGTTA---TA----T-AA-T-GCCAA--TAA-AGT-GTA--T----TT-CT--GA-CG-------TC-TTC------TG-AAC-------GTGGAGTGCTC-------ACTTTTTC------A---TCTAAT-TTT----C-G-T-CG--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAA---C-A-------CTT--GTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-ATGAGCAG--ACCAT-TC-GG---AAAATA---TAAGTTCA-TTTCAC-G--GAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|7 : AAT-TTCTCA-CT----TTT-A----TA----AAGAAAAA--AA--AT-CA----CT-AT---A-C-AC--AGTTAAT--TAGCAGCA-CA-AC-TTGAC----TAAAAGT-------G-GG-GGG---------------G-CAA--GGCAAA-GAA--TTTCCTC-AC-TT-TTA----T-T-AAGAAAAAAAAA---TCAACTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---TTA-ACCCCCCGACCCACATTACAACACA----TC-AA-GA-----CTAT--AAA-TG-----AATTAT-ATGTG-AC-GCGCAGTGA-GATTT-G-AATTGCAAA-A-GACT--GAAAGTTCAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACCCGGATTGTAGACACAC--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-ACCAG--TG-AC-G-AT-G--TGT--ATA-----TATTGGTTAGC--ATTTTATTAATA--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AAATAT-CA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AA--GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-----CG-GAAGAG-TA---TT-TTA-TAAA-A--C--GAG--C----ATT---A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---C--AAGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------TTC-TCTTCGT-GT--AA--G----CGTTAC----C----GG---G--ATA-----T-TTTC--GC-T-ATAT--TG--T-GAAC-AC----TTT-G-C-CTGA-TCGAAT--CCAACAGAAAAAAAGATATGTT-AAGTGGGTT-GTGACG-AT-ATT--GA--TGA-GAAGACATCAGCGT--GGAGTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AA--TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-ATTG---A-----G--T-G----CATTTTTT-CTAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-TTA-G-AC--G-CA-TTGC--TT-CT-G--TGAACCA-ACGCCGCATGGG--AT--ACAT-GTATTAG-TA-CA-TTGTA--TTGA-CAACCA---T-A-GGAGAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-AATT-TTGCT------------------------TTT-ATG---T-TTTCT-G---A-TC-GAGT-ACATGTAAT-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA---T-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAAT-TGTGTTA----A----T-AA-C-GC--A--TAA-AGC-------A--TTTACT--AA-CG-------T--TTC------TGGATC-------GTGGAGTGCTC----CAAA--TTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTA--TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGGGAAAAAAAA---T-AATTCA--TTC-C-G-AGAT---GGGGCCGATTTTTCGCCC-TT-GAGCACCTA
gi|8 : --AT-----TATG----------TA-T-ACTT----TTTAAATAT-CA--ACTTTT------ATTTTCATAAAACCAGA---AAA-GC--AACTTCACA-CGA---------------TC-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-T----TT-T-A-GAAA-------GAGG-------T----A-TT--AT----AA-GC--TGAAAGT--AAA---C--AAGTT-ATTTT----CAACG-----C-GA-TCCT--C--------------T-CGTCTTCGT-GT--AA--G----C----T----C----GT---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACACACTTTTGGC-TTGA-GCGAAT--CCAA-AGAAA--------TGTT-A-GTGGGTT----GCG-A--ATTT-GA---GA-GA-GATATCAG-GTT-GG-GTGTATTA-ATT-AAT-AA-GATGA--AAATA--G-AG-AAT---AACCATTAAC-AT-AC-AACTATAT-G-A-AAAT-AT-G---A-----GATT-G----CATTTC---CGAA-AT-ATT--CATAAC-A---T-----G-ACC-A--A-T-GC--TT-CT-------AATT-ACGCAG-ATGGAT-AA--GTAT-GTAAG-G-TA--------A--T-GA--AACCA---T-C-GGATAA-T-CTG----CTGT-AACCAGG--GG----------A----------A-G--AA-A--A-TTGCT------------------------TTTT-TG---T-TT-CT-G---A-TC-GA-T-A-------T-CT-CAGTT--A-ATATCATTA-AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT--AATGTGTCTTA-----------AAAC-GCA-A--TAA-GG-------TA--TT---C--GA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGC-C----CCAAC-TTATC------C---C-TAAA-TTCACAAC-G-T-CC--A-G----A--TTCTC-AC-TATACCC-----AAC---T-A-------CTT-GGTATTA---TTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCCAAT-AG-----AACAT-TCAGA---ACAAAA-------TTC--TTTC-CAG-AGAT---GGG--CGT-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|9 : tttatatgatctgcATTT-GAAATATGATTAA--TAAACTTTACAATACGC-AATATGC-AGT--AAAGTTG--C---GTTA--TGGT-GT--ACT-TGAA--GACT--TATATAG-GCTAGTT-G-ACTTAAAA--AGCCATA---T-CGAAAAAACAA--TAATGGAT-TACGTAGAATATTAATA-GGAGAG-AGTATGCAGATATACTACACACGAC-CAT-TATCACGTAATGAT-ATT-ACATCTATG-TACCGT--AGTATTTCCAGTAAGATA--TATATCG-TAATGCTC-AAGAGAGTGAACTA-TG-TAA-TTTGTTTT-TTA-AAATTTACATAT---AT-AATACTTGATTAT-T-CCTCTCGT-AGGTCT--ATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----GCT-ACATGTA----GAGAAGAA--AAGATG-TAGG-CCT-AT-T-GGT-CC--A-TTGAT--GAGGGGAT-TA-AT-TAGGGGCCCCGGGGGG-------G-GGTGGGGTGGGGGGGGGGGTTG-CAAA-GGC-AAAGAA--TTT-CTC-ACTTT-T-A----T-A-AAG-AAAAAAAA---TCA-CTAT--ACA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--c
Alignments
lowQualScore : 22222 11 11111 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333333333333333333333333 1111 111 11 22222 888888888888888888888888888888888888888888 111 111 1111 111 11 111 1111 111 1111111 111 22222222222222 11 222222222222 1111 1111 1 11111111 11111 111111 1 1 1 11 1 4444444444444444444444 222222222222222222 1 1111 333333333333 11111 2222222222222 33333333333333 1111111 333333333333333 1 1111 1 222222 111 1 111 22222 1 99999999999999999999999999999999999999999 1 1 111 111111 333333333333333333 111 11111 1 1111 2222222222222222222 111111 11111111 111 2222222222222222222222 1111 111111111111 1111 111 222222 1111 11111 22222222222222222 22 111111 1111111 1111 1 222 111 2222 11 1 11 1 1 11 222222222 11111 1111 111 111 1111 111 111111 111111 11 444444444444444444444444 11111 2222222 11 11 111111 11 222222222222 11111 222222 2222222222 111111 1111111 1111 111111 1111111111111 1
lowQualScore : 0 8 00000 0 0 11 0 44444 999999 5 77 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 6 6 6 6 6 88888888888888888888888888 4444 6 6 33 6 6 6 6 111 00 2 1 3 6 6 88888 333333333333333333333333333333333333333333 777 66 5 77 5 5 5 77 000 5 77 6 1 7 6 8888 99 3 888 6 88 99 6 000 4444 999999 6 99 6 6 111 6 99 99999 2 7777777 666 99 6 99 6 6 6 44444444444444 3 6 99 7 1 88 99 555555555555 6 4444 6 6 0000 6 3 77777777 33333 999999 7 6 3 3 99 6 3 55 3 6 2222222222222222222222 44 6 6 222222222222222222 6 5 1 0 5 0000 333333333333 66 11111 5 5 0000000000000 66 1 5 22222222222222 5 6666666 5 5 444444444444444 5 88 0 44 66 5 0 5 5 0000 5 5 999999 0 444444 66 333 5 5 0 5 66 999 77 000 5 77 66666 5 77 0 1 5 88888888888888888888888888888888888888888 1 5 5 5 2 5 5 777 77 666 77 1 3 111111 77 5 888888888888888888 77 77 5 77 5 5 77 5 77 5 5 77 555 44444 1 5555 66 8888888888888888888 4 9999 4 9 3 66 222222 55555555 4 66 66 222 4 9999999999999999999999 8 8 4 66 4 4 777 4 4 4 2222 66 777777777777 8 66 7777 4 222 66 333333 4 5555 4 11111 4 4 77777777777777777 4 4 4 11 66 9999 4 9999 9999 222222 7777777 4 4 66 66 4 4 3333 5 5 5 66 0 0 222 5 000 4444 5 5 88 11 5 0 5 11 0 5 5 0 5 66 11 5 3 888 555555555 5 4 4 4 4 4 777 11111 55 4 2222 666 4 8 4 666 4 777 000 4 4 0000 4 4 44 4 4 99 0 4 4 4 222 5 88888 444444 99 4 4 777 4 4 3 7777 3 55 4 66 888888 4 00 4 66 4 777777777777777777777777 1 33333 4 4 777 66 4 4 5555555 4 66 4 00 00 4 333333 4 4 66 4 44 0 888888888888 3 4 66666 4 44 333333 4 66 4 0000000000 777777 8 2 4444444 1111 000000 666 3 3 7777 3 3 3 55 3 7777 55 3 3 3 3 3 666 5555555555555 3 77 555 555 3 44 3 3 6 3 6666 2 3 6666 555 44 3 3 3 3 555 9 6
lowQualScore : . . ..... . . .. . ..... ...... . .. . ............................................................................ . . . . . . .......................... .... . . .. . . . . ... .. . . . . . ..... .......................................... ... .. . .. . . . .. ... . .. . . . . .... .. . ... . .. .. . ... .... ...... . .. . . ... . .. ..... . ....... ... .. . .. . . . .............. . . .. . . .. .. ............ . .... . . .... . . ........ ..... ...... . . . . .. . . .. . . ...................... .. . . .................. . . . . . .... ............ .. ..... . . ............. .. . . .............. . ....... . . ............... . .. . .. .. . . . . .... . . ...... . ...... .. ... . . . . .. ... .. ... . .. ..... . .. . . . ......................................... . . . . . . . ... .. ... .. . . ...... .. . .................. .. .. . .. . . .. . .. . . .. ... ..... . .... .. ................... . .... . . . .. ...... ........ . .. .. ... . ...................... . . . .. . . ... . . . .... .. ............ . .. .... . ... .. ...... . .... . ..... . . ................. . . . .. .. .... . .... .... ...... ....... . . .. .. . . .... . . . .. . . ... . ... .... . . .. .. . . . .. . . . . . .. .. . . ... ......... . . . . . . ... ..... .. . .... ... . . . ... . ... ... . . .... . . .. . . .. . . . . ... . ..... ...... .. . . ... . . . .... . .. . .. ...... . .. . .. . ........................ . ..... . . ... .. . . ....... . .. . .. .. . ...... . . .. . .. . ............ . . ..... . .. ...... . .. . .......... ...... . . ....... .... ...... ... . . .... . . . .. . .... .. . . . . . ... ............. . .. ... ... . .. . . . . .... . . .... ... .. . . . . ... . .
lowQualScore : 8 0 00000 8 8 00 6 33333 444444 7 99 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 7 7 7 7 7 33333333333333333333333333 2222 7 7 55 7 7 7 7 777 00 5 7 2 7 7 22222 000000000000000000000000000000000000000000 111 44 7 99 7 7 7 99 000 7 99 7 7 3 7 3333 22 2 333 7 00 88 7 888 2222 555555 7 22 7 7 777 7 22 33333 5 7777777 777 22 7 22 7 7 7 77777777777777 2 7 22 2 0 33 22 222222222222 7 2222 7 7 8888 7 3 55555555 77777 777777 3 7 3 3 22 7 3 88 3 7 8888888888888888888888 22 7 7 888888888888888888 7 0 1 8 0 6666 555555555555 99 88888 0 0 6666666666666 99 0 0 11111111111111 1 2222222 0 0 555555555555555 0 22 1 00 99 0 0 0 0 6666 0 0 000000 0 000000 99 888 0 0 0 0 99 444 99 000 7 99 00000 7 99 7 4 7 00000000000000000000000000000000000000000 4 7 7 7 0 7 7 777 99 777 99 7 0 666666 99 7 333333333333333333 99 99 7 99 7 7 99 7 44 7 7 99 999 33333 4 6666 11 2222222222222222222 4 4444 4 7 9 11 888888 33333333 4 11 11 222 4 6666666666666666666666 9 9 4 11 4 4 888 4 4 4 4444 11 999999999999 9 11 2222 4 222 11 888888 4 1111 4 11111 4 4 88888888888888888 4 4 4 11 11 4444 4 4444 4444 000000 1111111 4 4 11 11 4 4 9999 0 0 0 99 0 4 555 0 888 4444 0 0 22 99 0 0 0 99 0 0 0 0 0 99 99 0 2 888 111111111 0 4 4 4 4 4 888 11111 55 0 5555 555 0 0 0 222 0 000 333 0 0 0000 0 0 88 0 0 55 9 4 4 4 999 0 22222 000000 55 0 0 000 0 0 6 7777 6 55 0 11 333333 4 66 4 11 4 222222222222222222222222 9 11111 4 4 888 33 4 4 6666666 4 11 4 66 66 4 888888 4 4 11 4 77 1 000000000000 6 4 66666 4 66 222222 4 11 4 4444444444 222222 9 2 4444444 4444 555555 444 6 6 7777 6 6 6 00 6 7777 00 6 6 6 6 6 444 9999999999999 6 22 444 444 1 22 1 1 7 3 2222 8 3 2222 888 22 1 1 1 1 444 2 2
consensus : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
Reference ( family-3278 ) : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|1 : TACTAACTCAT-AATAATTTATTATATTATA--CTGTTTTAAAAA-----AGT------GGATTTGGTATC--A-ATATT
gi|1 : TTAC--GTC-TCCCGA-CGAC-AGGTAAT---ACGAG--G-CT--------CCATGAGG----TCGT-ACAAAAGCATATCGTCGACC-GGAAGACA-TTTA---CA--ATAAGCACCAG-GAAATTTTAAATGCGCAGTCACTTCACATCTTTATGATAGTAAA--AGTTTATTATAAA---GGCCTACCTTAC---TTATCACTG-GGAGACTTAGTTAA-T-TT--TTCTTACCACCAAATC---TATATCCATTC---CAGG--TTTTCC--CG--CCCTG-GATGGTATTG-AAGATACG-ATAA---AAACTTT----CATGC-TAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-AATCGGA-TT--ACTAT--G--GGCAACTATA--G-GCTG--T-GCA-TCAAAA--AGC---A---T-CGAA----CAA--TTATGAA---A--TAAATT-----T------AG-AGCATGCAGATAT----CACACGACGCAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGTTGA--ATTTC----AAGGTA--TATATCGGTAA-AGA--GAGAGAGTGAA--A-TG-TAATTTT-TTTTATTA-A--TTTACATAT----T-A-TAACTGAT-AT-TTC-TCTCGT-AG--TTCAATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----GTTTG----TA-----AGAAGAA--AA---G-TAGGTCCT-AGAT-G-TTCC--A-TT-AT--GAGGGATT-TA------GA-----TAGGGGG-------GCGG-GGG--------------TGACAAA-GGCATAAGAAATTCTCTTCTGC-TT-T-A----T-ATAAGAAAAAACCA---CCA---ATA-ATG-CACTAGTAC--ATTA-G-CAGC-ACAAACTTGAGC-A-CTC--TATATGG-GAAGAA---TATAGGATAC-T-A-GCCCCC--ACCCACAT-ACA-CACACAAATC-AATGA----ACTA----AA-TG-----AA---C-ATGTGTAC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-G---A-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATAT-GC--------TG--TA--ACT------------AC----TGG--TAAAAGATCTC--GCC-AC-AG--TG-A--G-AT-G--T-TGTATA-----TATTGGTT--CG-ATT--AT----A--AT--------------------A-TAA--T----TT-AATTATT----ACTTT------------------A----G---AAA-GC--A--TT---A--GA---------------TC-----T-ACGAATTTCGC-G--TTG-ATAGTC-GA---TTCT-A-TAAA-AGAC--GAGGAC----AT----A-TT--AGGGA-AG-G---TGAAAGT--AAA---GC-AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----T-GA-TC-T--C--------------T---TCTTCGTAGTCAAA--G----CAT-AC----C----GG---TTGA-A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAATTT---T-TTTT-T-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATT--GA--TGA-GA-GACGTCAG-GTAGGG-GTGTATTACATT-AAT-GA-GATGA--AAA----G-AGAAAT---AA-----A-C-ATAAT-AACT-TT--GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTT----CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---TGT-A-G-AC--G-CA-T-GCA-TT-TT-GAATGTACCA-ACGCCG-ATGGGG-AT--ACAT------------------TA--T-GA-CAACCA---T-C-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GGAAA-A--C-TTGCT------------------------TTTTATG---TGTT-CTTG---A--C-GAGT-A-------T-CTTCAGTT--A--TATCAT---AAACAA-GT-AGGT----CTC-GAA-A--GTTAAATGTGTAT-A---TA----T-AAGC-A---A--TAATAGC-GTA--T-----T-TT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGA-TGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TATT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTAT-TTTT----A---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGG------AAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAC---GGGGCCGA-TTTTCG-CC-TTGGAG-CCCTACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcgttacgtctcccgacgacaggtaatacgaggctccatgaggtcgtacaaaagcatatcgtcgaccggaagacatttacaataagcaccaggaaattttaaatgcgcagtcacttcacatctttatgatagtaaaagtttattataaaggcctaccttacttatcactgggagacttagttaatttttcttaccaccaaatctatatccattccaggttttcccgccctggatggtattgaagatacgataaaaactttcatgctatgcagtaagttgacgtaatcggattactatgggcaactataggctgtgcatcaaaaagcatcgaacaattatgaaataaatttagagcatgcagatatcacacgacgcattatcacgagatatttactcagtcgttgaatttcaaggtatatatcggtaaagagagagagtgaaatgtaattttttttattaatttacatattataactgatatttctctcgtagttcaatcacaaacttttattgtttgtaagaagaaaagtaggtcctagatgttccattatgagggatttagataggggggcgggggtgacaaaggcataagaaattctcttctgctttatataagaaaaaaccaccaataatgcactagtacattagcagcacaaacttgagcactctatatgggaagaatataggatactagcccccacccacatacacacacaaatcaatgaactaaatgaacatgtgtacgcgagtgagattttgaatgaaagactgaaagtcaaacatatgctgtaactactggtaaaagatctcgccacagtgagatgttgtatatattggttcgattataatataatttaattattactttagaaagcattagatctacgaatttcgcgttgatagtcgattctataaaagacgaggacatattagggaaggtgaaagtaaagcaagttatttttcaagtgatctcttcttcgtagtcaaagcataccggttgaattttctgcttaaattgtgaacacttttgcttgatcaaatccaaagaaatttttttttgtgggtttgacgatattgatgagagacgtcaggtaggggtgtattacattaatgagatgaaaagagaaataaacataataactttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatggttgcatgtagacgcatgcattttgaatgtaccaacgccgatggggatacattatgacaaccatcggataattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacaggaaaacttgctttttatgtgttcttgacgagtatcttcagttatatcataaacaagtaggtctcgaaagttaaatgtgtatatataagcaataatagcgtattttaacgtttctgatcgtggatgctcccaactttatccttatttttcgtccagatttaatttccctggactacttggtattatttttagaaacagacatccatagcaaacattcaggaaataattcatttccgagacggggccgattttcgccttggagccctac
gi|10 : tactaactcataataatttattatattatactgttttaaaaaagtggatttggtatcaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcg----A--AT-----TAT-----------AA-TTACTT----TT-AA-TATGCA---CTTTCTCATTTGTTTTCATAAAA----AGAAAAA-GC--A--TTT--A-CGAGATTTTTATATTACATCAACCAT-AA-AATTCAAC-G--TTGGATGAGG-TA---TT-T-A-TAAA-A--CGAGAGG-CAATGAT----ATTT--AG----AA-AAGTTGAAAGT--AAAACTG--AAGTTAATTTTTCTACAA-G-----CTGA-TCCC--CCTACAATTCTTTCGT-C-TTTTGGT-GTA-AA--G----CAT-ACCCTGC----GG---T--ACACAATCC-TTTC-TGCTTTAAAT--TGAAA-GAAC-AT----TTTT
gi|11 : TAAT-G-TA-C--T-GAA----GA-CA--CAGTCTGA-GGGTAATTTCTGGGGGCTGT-AACCAGG--G-CCTT-TGTCAACAAAAA-C--ACG--AATA--T-TTGTTTTTTTTGGTGCTTACGGTCTTTTTTTTTATGGGTT-TT-CT-GTAGA-TCCGAGT-AAAATC--T-CTCCAGTTTAA-ATATCATT--AAACAAAGT-AG-TTCCCCTC-GAA-AACGT-AGA-ATGTGTTAG--TA----TTAAACCGC--AA-TAT-AGC-GTA--T----TT-CT--AAACGGTTTCTCT--TTCCTTCTTTG-A-C-------GTGGGATGCTCAGCGCCAA-TTTATC------CCCCT-TCAT-GTT----C-G-T-TCTCA-GGATAA--TT-CA-AT-T-T-C--T---GGAC---T-ATAATAAACTT-GGTGTTAT-TTTTTTAGA---GTA--AACAGA-C-tttttttttttttttaacatagcgcgtttgatcgaagcgatataccaagagaaaaaaaataaagaaaaattattttgtggggtttggaacagatgatttatttttgagtttagaagaacaatagtatatcaggtggattgtaatgatctaatagaagattgaaatagagaaattaaaa
gi|12 : atttatatATT-CTG----CTGTTAACCAGGCAGGCCTTCTG---ACAAAACACGAA-A--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-ATG---TGTC-CT-G---A--C-GAGTTA-------TGCTCCAGTT--A-ATATCATTTAAAACA--GT-AG-T----CTCAGAATA--GT-AAA-ATGTGTTAGATTA----T--AAC-GC--AATTAA-AGCAGTAGTTACCTTT-CTCGAA-CG-------T--TTCG-----TG-ATCCCCGCCTACGAGGT-CGT----CCAACATCATCCTATCGC---T-TAAT-TTT----CAG-T-CC--ATG----ACGTT-TATATCT-T-CCCTGGGGGACGGTT-A-------CTTAGATATTA--TTTT---AAGTGG-C--AACAGAGCGATGC-AT-AGC-A--AGCAT-TCA-G---AAAAAA---T-AATTCATTTTC-C-GAAGATTGCGGGGCCGA-TGTTTGCCC-TTGGAGCCCCTACgaggaaacatt
gi|13 : tTTTAAAA------AGTC----CGGA-TTGGTATCCAA-ATATTc
gi|13 : CTTACCAGTCCTCT-GG-CAAC-AG-TAT----AC-AGGCC-TTAACTGTACCCATGAG------T-T-ACAAAAGCATATCGTCG-C--G-AAGACA-TTT----TACAATCAACACC-G-GA-----TAAATGCGCAGTTATT------------------------ATT--------AGGGGGCCTACCTTACA--TTAT--CTG-GAA--CTTA-TTAT-T-TT--CT---AC-AC--AA-TA-TCATATCCAT-CATGCAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-aagagaaaagagagaagagagagagagagagatcacttaccagtcctctggcaacagtatacaggccttaactgtacccatgagttacaaaagcatatcgtcgcgaagacattttacaatcaacaccggataaatgcgcagttattattagggggcctaccttacattatctggaacttattattttctacacaatatcatatccatcatgcaggttttttttcccctg
gi|14 : tttaaaaagtccggattggtatccaaatattaagagaaaagagagaagagagagagagagagatcaAATGTTC----TTAACTCTATC------C---T-TAATACGT----C-T-T-CC--A-A----A--TT-TT-GC-T-T-CCCC---GGGC---A-A-------TTT-AGTGTTAG-TTTT---AA---G-G--AATAAA-C-ATAC-AC-AGCAATCAGCAGATCAGG---GGGGGGGGGT-GATTCA-AGTA-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGACC-ATAGAACCCCTA
gi|15 : gtTGGAATGCTC----TTAACTCCATT------C---T-TAAA-TTT----C-T-T-CC--A-T----A--TT-TG-AC-T-T-CCCG---AGAC---A-A-------TTT-AGTGTTAT-TTTA---AA---G-A--AATAAA-C-ACCC-AC-GGCAT--A-CAT-TCA-----AAAAAA---T-GGTTCA-ATTT-T-G-AGAT---TGGACCGA-TCTTGATCC-TTAGAGCCCCgc
gi|16 : aatTAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCCCAT-AGCAA--TACAT-TCAGA---CAAAAA---T--GTTCA-TTTC-T----AAT----GGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGG-GCCCC
gi|17 : a--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-A-CA-T-GCA-TT-CT-G--T
gi|18 : TAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGA---CAAAAA---T-GGTTCA-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGGGGCaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataataatcagcg
gi|19 : a-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-C--CGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-
gi|2 : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATACTATA--CTTTTTTAAAAATTTCAAGTTAAGTCGGA-CTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-AG-CGAC-AG-TA-----AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AGGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TGTATGCGCAGTCACTC-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCT--------------G-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTG-ATCCAT-C----AGG--TTTTTTTTTTTTCCTTA-GATG-TATTT-GAAATGCG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGT--AG-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--AAT----A--GATA--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTTAAA--A----------------AA-CAA--TAATGGA--AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-AAT-ATTTAC-TC---------GT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GGGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA----TTTACATAATGAATTA-TAACTGAT-AT-T-A-TCTCGTTAG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT---A-T-CC--A-TTGAT--GAGGGATT-TACATGTAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAA-----TCA-CTATAGATA-CATT--TA----TTA-G-CAGC-ACAA-CTTA--C---CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCAACAT-ACA-CAACC---TC-AA-GA----ACTATTTAAA-TGT----A----C-ATGT--AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AGGACT--GAACGT-CAAA--AATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------ACGC--TGT--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AT-G-AT-G--TGTATATAGACTCTATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TG-AA-TATGTA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----T---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TT-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-A--GAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AGTTCTAA-G---TGAAAGT--AAA---A--ACGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTTGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GTAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-T-GTGGTTTTGGGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-GTCA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AA--ACAT-GTATT-G-TA-CA-T-GCA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--AGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTTTG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGCT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AA-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TACCGGT-AAAC-GT--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-AAC-------GTGGAGGGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-A--T-T-CCCT---GGAC---T-T-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGAAA--AACAT-TCAAG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|20 : ATACTA-CTCAT-AATA-----T---ATTA-------------AAA-----AGTC-----GGA-TTGGTATC--A-ATA
gi|21 : tagataagggcacttttttttggaTACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATAACTTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATAT
gi|22 : T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-ATG----CTGT-AACCACG--GGCCTT-T
gi|23 : GTTTC-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGCCC-TTAGAGCCCCCAC
gi|24 : T--------A---GGCCTACCTTACG--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAATT-TT--CT---AC-AC--At
gi|3 : ATACTAACTCATCAATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT-----CGGA-TTGGTATC--ACATA
gi|3 : tagtaaggcactttttgctttggaCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--G-TCA-------T-ATGAGG----TC-TTACAAAAGCATAT-ATCG-CCCG-AAGATA-TTTA---AACT-TCAACACC-GCGAA----TAAATGTGCAGTTTATT-------------------A----TT--------A---GGCCTACCTTACAATTCATC-TGG-AAA--CTTA-TTAT-TATT--CT---AC-AC--AATTA-T-ATATCCCT-C---CAGGGTTTTTTTTTC---CCCTGAGAT---ATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGTCTAA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GTTCACT-T--AAGGAC---TATA--G-GCTG--TTG-A-TTAAAA--GCC---A---T-CGAAAAA-CAAATTACTTGATGAA--TAGAAT-----TGAG---AGGAGC-TGCAGATAT----CACACGAC-CATATATCACG--A-GAT-ATTTACATC-A-G-T--CGT--A--ATT-C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTACTGAGAGAGTGAA--A-TGGTA--TTTCTTTT-TTATA--TTTACATCA----C-A-GAACTTTT-AT-T----------AA--TT--GT-AT-A------------T----GCT------TA----GAGAAGAA--AA--TGCTAGG-CCT-AT-T-G-T-CT--A-TTGAT--GAGGGGATGTAGAT-T-GA-----T-GGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAACAGAA--TGTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CGAAT-ACGACAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--C-A-CTT--T-----G-GAAGAAA--TATAGGAGC--T-A-ACCCCC--ACC-ACAT-AGA-CACA------------------------------------------TGTG-ACAGC--AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-ATATTTG--TA-GACA------------TC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC--G--TG-AC-G-AT-G--T-TATATA-----TATTG-TTAGCG-ATTTTAT----ATAAC-----TAT-----------TA-TTACTT----T--AATTA-GCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--T----A-CAT---------------CC-----T-AC-CATTTCGCAG--TTG-ATAGAGATA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGGAC----AT----A-TT--AG----AA-G----GAAAGTGTAAA---C--AAGCT-TGTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT-----------------T-C-TCTTCGT-GT--AAAGG----CGT-AC----C----GGGTTTG-ATA-----TCTTTCATGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGAGTCAAAT--CCAA-AGAAAAAG---T--GTT-A-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATTT-GA--TGAAGA-GACATCAG-GT--GGTGT-TATCA-ATTTAATTGA-TATGA--AAATA--GGAGAAAT---AA-----CACATTAAT-AACT-TTTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TTG----CATTTT---CGAA-ATGA-T--AGTTGC-A---TCT-A-G-ACC-GGCAAT-GCA-TTTCT-G--TGAGCCA--CGTCG-ATGGGGCAT--ACAT-GTACT-GCTA-CAAT-GTACAT-GA-CAACCA---T-A-GG-TAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GA-AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG-----TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCC-GTT--A-ATATCATT---AACA--GTCAGTT----CTC-GAA-A--GT-AAA--TGTGTTA---TA----T--AAC-GCA-A--TAA-AGC-GTA--CT--TCT-CT--AA-CG-------TTGTTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-GTT-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---TAA-------CTT-GGTATTATCTTTT---AA---G-ATGAACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAT---GCGGCCGAGTTTTCGCCCATTG--GCCCCTattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccggcgacagtattacaggtcatatgaggtcttacaaaagcatatatcgcccgaagatatttaaacttcaacaccgcgaataaatgtgcagtttattattaggcctaccttacaattcatctggaaacttattattattctacacaattatatatccctccagggtttttttttcccctgagatatttgaaatacgttaataaactttcacgcatgcagtctaagttgacgtatggtgttcacttaaggactataggctgttgattaaaagccatcgaaaaacaaattacttgatgaatagaattgagaggagctgcagatatcacacgaccatatatcacgagatatttacatcagtcgtaattcaaggtaattatatcgtaagtactgagagagtgaaatggtatttcttttttatatttacatcacagaacttttattaattgtatatgcttagagaagaaaatgctaggcctattgtctattgatgaggggatgtagattgatgggggggggggtgcaaaggcaacagaatgtcctcgctttataaagaaaaaaaaatcacgaatacgacagttaattagcagccacaacttgcactttggaagaaatataggagctaacccccaccacatagacacatgtgacagcagtgagattttgaatgcaaaaagactgaaagtcaaacatatcgcgtatatttgtagacatcctggtaaaatccgccacgtgacgatgttatatatattgttagcgattttatataactattattactttaattagcaactttcattttcataaaagaaagcatacatcctaccatttcgcagttgatagagatatttataaaacgaggacatattagaaggaaagtgtaaacaagcttgttttcaagcgatccttctcttcgtgtaaaggcgtaccgggtttgatatctttcatgcttaaattgtgaacacttttgcttgagtcaaatccaaagaaaaagtgttagtgggtttgacgatatttgatgaagagacatcaggtggtgttatcaatttaattgatatgaaaataggagaaataacacattaataactttttgtaaaatatgagttgcattttcgaaatgatagttgcatctagaccggcaatgcatttctgtgagccacgtcgatggggcatacatgtactgctacaatgtacatgacaaccataggtaattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacagaaaatttgctttttatgttctgatcgagtatctccgttaatatcattaacagtcagttctcgaaagtaaatgtgttatataacgcaataaagcgtacttctctaacgttgttctgatcgtggagtgctcccaactttatccttaattttcgttccagatttaatttccctggactaacttggtattatcttttaagatgaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttccgagatgcggccgagttttcgcccattggcccct
gi|4 : tagtaaggcactttttgctttggaatactaactcatcaatattatattatacttttttaaaaaagtcggattggtatcacataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATT
gi|4 : CTTAC-AGTC-TCC-GGGCGACCAG-TAT----AA-GG--C-CT--------CTATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATATTCG-CC-G-AAGATA-TTTAATTCACAAC--AC-CC-G-GAAA---TAAATGTGCAGTT--TT-------------------ATTATTT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTTA-T-TTTTCT---AC-AC--AATTAATTATATCCAT-T---CAGG--GTTTTTTTC---CCCTG-GAT--TATTTTGAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGAAC---GT-A--TGGTTGT--A-T-T--A--GGAC--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---TTCGAAAAA-CAA--TACTT-AT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GATTATTTAC-TC-A-G-T--CCG--A--ATT-C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--AATG-TA--ATT-TTTT-TT-----TTTA-------------------AT-AT-T-T-ACT-------------TCAC-AAAC-TTTTTA-TTAATTGTT-A----TATGTAGAGAAGAA--AA--AT-TAGG-CCT-AT-T-----CT--A-TTGAT--GAGGGGAT-T-----TAGA-----T-GAGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCCAAGAAA--TTTCCT--GC-TT-T-A----TTA-AAGAAAAAAAAAATATCA-CTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--CCA-CTC--T---TGG-GA-GAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-AGA-CACA------------------------------------------TGGG-AC-GCG-AGTGA-GATTT-G-AAT-GCAAACAAGACT--GAAG---CAAA--CTAATCGCGT-AT---TT--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAA----TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--T--TTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--ATAAC--TAT-----------TA-TTACTT----TT-AATTATGCA--AC-TTC------A--TTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-CATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-ATTAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT---G----AA-G---TGAAAGT--AAAC--A--AAGTT-G-TTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GTA-AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACT---TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-A-AAAAAA---T-TGTTAA-GTGGGTT--TGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT---G-GTGTATCA-ATT-ATT-GA-TATGA--AAATA--G-AG-AAT---AA-----CAA-TTAATAAACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CA-TTT---CGAA-AT-A-T--AGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCATTT-CT-G--T-GAGCA-ACGTCG-AT-GGG-AT--ACAT-GTA-T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAA-CA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCC-T-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---ACTC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAAC--GT-AGTT----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGT-TTA---T--------AAC-GC--A--TAA-AAG-GTA---A--TTT-CT--AA-CGT------T--TTC------TGAATC-------GTGGAGTGCTCT---CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-TCCC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGACG--T-A--------TT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTT--C-G-AGAT----GGGCCGATTTTTCGCCCTTTGGAGCCCCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccgggcgaccagtataaggcctctatgaggtctacaaaagcatatattcgccgaagatatttaattcacaacacccggaaataaatgtgcagttttattatttaggcctaccttacattatcctggaacttatttatttttctacacaattaattatatccattcagggtttttttcccctggattattttgaaatacgttaataaactttcacgcaatgcagtaagttgaacgtatggttgtattaggactataggctgtgattaaaaagcattcgaaaaacaatacttataatagaattggagagcatgcagatatcacacgaccattatcacgagattatttactcagtccgaattcaaggtaattatatcgtaagtacgagagagtgaaaatgtaatttttttttttaatatttacttcacaaactttttattaattgttatatgtagagaagaaaaattaggcctattctattgatgaggggatttagatgagggggggggtgcaaaggccaagaaatttcctgctttattaaagaaaaaaaaaatatcactatacacagttaattagcagccacaacttgccactcttgggagaaatataggagtaacccccacccacatagacacatgggacgcgagtgagatttgaatgcaaacaagactgaagcaaactaatcgcgtattttagactacctggtaatccgccacagtgacgatgtttatatattggttagcgattttataataactattattacttttaattatgcaacttcattcataaaagaaagcattacgatctaccatttcgcgttgatagagtatttattaaaacgaggcatattgaagtgaaagtaaacaaagttgttttcaagcgatcctctctcttcgtgtaaagcgtaccggtatattttctgcttaaattgtgaacactttttgcttgatcaaatccaaaaaaaaattgttaagtgggtttgacgatatttgatgagagacatcaggtggtgtatcaattattgatatgaaaatagagaataacaattaataaacttttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatagttgcattagaccgcatgcatttctgtgagcaacgtcgatgggatacatgtatgtacatgtatgacaacataggataattctgctgtaaccaggggccttgtacaaacagaaatttgctttttatgtttctgactcgagtatctccagttaatatcattaaaacgtagttctcgaaagtaaatgtgtttataacgcataaaaggtaatttctaacgttttctgaatcgtggagtgctctccaactttatccttaattttcgtcccagatttaatttccctggacgtattggtattatttttaagaaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttcgagatgggccgatttttcgccctttggagcccct
gi|5 : tttaaaaaagtccggattggtatcaatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTAC-AGTC-TCC-CG-CGAC-AG-TACTCGTAC-AG--CGCTA-------C-ATGAAGGATCCC-T-ACAAAAGC-TATCTTCG-CC-G-AAGACAATTTA---CA--ATCA---CC-G-GA-----------------TATC------------------------ATT--------A---GGC-TAC-TTACAA-TTTTC-CTGCGAA--TTTA-TTAA-T-TA--TT---AC-AC--AATTA-TTA-ATC-AT-C----AGA--TTTTTTT------CCTG-GATG-TATT--GAAATACG-GTAAATCAAACTTT----C-CGCCAAT--TCCAGT--AC-GTCGA-CTGAGT-A--TCGT--T--ACT-T--A--GACT--CATA--GCGCAT--T-G-A-TGAAAATTAAT---AATTT-CTAGACA-AAA--TA-TGGGA-AA---AGAAT-----GG-G---AG-AGCATGC-------------------------TCA-------AT-ATTTAC-TC-A-GGT--CGT--T--ATT-C----AAGGTAATTAT-TCG-TAAAGTACCGAGAGAGTGAA--A-TGCTA--TTT-TGTT-GAA-A---------AA---AA-A-AAAC-AAT-ACAT-C-TCTCGT-AGG-TT--ATCACCAAACGTTTTAA-TT----GTT-A----C-----GAGAAGAACAAA--TG-TAGA-CCTCAC-TAG-T-CCTCACTTGATATGGGGGATT-TA-GT----A-----TAGGGGGAGCTTGGG-GG-GGG--------------GG-CAAACGGCAAAGAGA--TTTCCTC-GC-TT-T-TGTGTT-A-AAGAAAAAGAAA---TCA-CTATT-CTA-CAGT--CGCACATTA-GGCAGC-ACAC-ATTG--C-A-CTCCCT---TGG-GAAGAAAAGTATAGGAG---TTA-ACCC----AGCCACATTACA-CACAC---TC-CA-GACAACACTAG--AAA-TGCATTAA----C-ATGTG-AC-GCG-AGTAATGAATTTGTAAT-GCAAA---GACTATGAAA-T-CAA---C-TATTGCGTTAT---CGACTG-AACTC-----------GC-C--TGGGTTAAAA--TC-CCCGCC-GC-AGCATGCAC-GCATCG--TGTTCATA-----TAT-GAATAGCGTATTTTAT----A--ATACACTTAT-----------TACTTACTTGAGATT-ATTCATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----A---AAAAGG--A--TT---AATGA---------------TCC----T-ACGAATTTCGC-GGTTTG-ATGGAG-TA---TT-T-A-TAAA----C--GAGG-C----ATCTACA-TTGTAG----AA-G---TGGAAAC--AGA---AGTAAGTT-ATATTT---CAA-AAAAGCC-GACTCCTGCC--------------T-C-TCTTCCA-GTTAAA--G----CGT-AC----CCTCGGG---T--ATA-----TATTTC-TGC-TTAAATGATG--T-GAACCAC----TTTTG-CATTGA-TCGAACTCCCAACAGAAAAGAAATT-TGTT-A-GTTGGATTATGACGGAT-ATTTAGAC-TGA-GACGACATCAG--T--GG-TAGTATCA-ATT-AAT-GACGATGACAAAATACGA-AGAAATCTAGA-----AACATTAAT-AACT-TTT-GTAGAAAT-AT-CTACA-----A--T-GG---CATTTAA--CGAACATCA-TTGGATCGC-AATTC-T-ACGCACCAG-CA-T-GCA-TT-CTTGC-TGAACCACACGCCA-CTGGGG-AAT-ACATTGTACT---TA-CAAT-GTA--T-GATCAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTCT-A
gi|6 : C-TTCTCAGTT----GTT-A----------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AG-T-G-T-C---A-GTGAT--GAGGGAAT-T---T-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGGG-------------TG-CAA--GGTAA--GAA--TTTCCTC-ACGTTGT-A----T-A-AAGAAAAAA------TCAGCT-TACAGG-CATT--TA---ATTACG-CAGC-ACAA-CTTG--C-AGCTC--T---TGGTGAAGAAA--TATGAGAGGGAT-ATACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TCGAA-GA----AATAT--AAAATGGT---A----CTATGTGGAC-GCG-AGTGC-GATTG-G-AAC-GCAAA---GACT--GAAAAT-CAAAGATATATGGCGT--T---TG--TATGACT------------AC-CAGTGT--TAAAC--TC-C--GCCCAC-AG--TG-ATTG-AT-GGTTGGTTA-A-----TATTGGTTAGCGGATTTTATT---A--AT-----TATGCGGTCATATTTA-TTACTT----TT-AAATATGCATAACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GCCAA--TT---A-TGA---------------TT-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATGAAG-TAATATT-T-A-TAAATA--C--GAGG-C-----T----ACTT--AG----AAAG---TGAAA-T--AAA---C--AAGTT-TTTTTT---CAA-G-----C-CA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--GAACGTGT-AC----C----GG---T--ACAG----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--TTGAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAGAAAAC--T-TGTT-T-GTGGGTT-GTAACG-ATGATTT-GAATTGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AATAGA-GATGA--AAATAA-G-AGAA-T---AA-----CCA-TTAA--AACT-TTT--TA-AAATGAT-G---AACGAGG--T-GGGCCCATTCTTCTCGAA-AT-A-C--C-TTGCTA---T-G-T-G-ACT-G-CA-T-GCA-T--CT-G--TGGACGC-ACGCC--ATGGGG-ACTGACAT-GTAAT-G-TAACA-TCGTAA-T-GA--AAC-A---T-AAGGATAATG-CTG----CTGT-AACCAAG--GGCCTT--GT--ACAAA------A-G--AA-A--TATTGCTG-----------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CCCCA-TT--ACATATCATT--A--CA--GT--G-T----ATC-GAA-A--GT-AA---TGTGTTA---TA----T-AA-T-GCCAA--TAA-AGT-GTA--T----TT-CT--GA-CG-------TC-TTC------TG-AAC-------GTGGAGTGCTC-------ACTTTTTC------A---TCTAAT-TTT----C-G-T-CG--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAA---C-A-------CTT--GTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-ATGAGCAG--ACCAT-TC-GG---AAAATA---TAAGTTCA-TTTCAC-G--GAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|7 : AAT-TTCTCA-CT----TTT-A----TA----AAGAAAAA--AA--AT-CA----CT-AT---A-C-AC--AGTTAAT--TAGCAGCA-CA-AC-TTGAC----TAAAAGT-------G-GG-GGG---------------G-CAA--GGCAAA-GAA--TTTCCTC-AC-TT-TTA----T-T-AAGAAAAAAAAA---TCAACTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---TTA-ACCCCCCGACCCACATTACAACACA----TC-AA-GA-----CTAT--AAA-TG-----AATTAT-ATGTG-AC-GCGCAGTGA-GATTT-G-AATTGCAAA-A-GACT--GAAAGTTCAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACCCGGATTGTAGACACAC--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-ACCAG--TG-AC-G-AT-G--TGT--ATA-----TATTGGTTAGC--ATTTTATTAATA--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AAATAT-CA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AA--GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-----CG-GAAGAG-TA---TT-TTA-TAAA-A--C--GAG--C----ATT---A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---C--AAGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------TTC-TCTTCGT-GT--AA--G----CGTTAC----C----GG---G--ATA-----T-TTTC--GC-T-ATAT--TG--T-GAAC-AC----TTT-G-C-CTGA-TCGAAT--CCAACAGAAAAAAAGATATGTT-AAGTGGGTT-GTGACG-AT-ATT--GA--TGA-GAAGACATCAGCGT--GGAGTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AA--TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-ATTG---A-----G--T-G----CATTTTTT-CTAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-TTA-G-AC--G-CA-TTGC--TT-CT-G--TGAACCA-ACGCCGCATGGG--AT--ACAT-GTATTAG-TA-CA-TTGTA--TTGA-CAACCA---T-A-GGAGAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-AATT-TTGCT------------------------TTT-ATG---T-TTTCT-G---A-TC-GAGT-ACATGTAAT-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA---T-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAAT-TGTGTTA----A----T-AA-C-GC--A--TAA-AGC-------A--TTTACT--AA-CG-------T--TTC------TGGATC-------GTGGAGTGCTC----CAAA--TTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTA--TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGGGAAAAAAAA---T-AATTCA--TTC-C-G-AGAT---GGGGCCGATTTTTCGCCC-TT-GAGCACCTA
gi|8 : --AT-----TATG----------TA-T-ACTT----TTTAAATAT-CA--ACTTTT------ATTTTCATAAAACCAGA---AAA-GC--AACTTCACA-CGA---------------TC-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-T----TT-T-A-GAAA-------GAGG-------T----A-TT--AT----AA-GC--TGAAAGT--AAA---C--AAGTT-ATTTT----CAACG-----C-GA-TCCT--C--------------T-CGTCTTCGT-GT--AA--G----C----T----C----GT---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACACACTTTTGGC-TTGA-GCGAAT--CCAA-AGAAA--------TGTT-A-GTGGGTT----GCG-A--ATTT-GA---GA-GA-GATATCAG-GTT-GG-GTGTATTA-ATT-AAT-AA-GATGA--AAATA--G-AG-AAT---AACCATTAAC-AT-AC-AACTATAT-G-A-AAAT-AT-G---A-----GATT-G----CATTTC---CGAA-AT-ATT--CATAAC-A---T-----G-ACC-A--A-T-GC--TT-CT-------AATT-ACGCAG-ATGGAT-AA--GTAT-GTAAG-G-TA--------A--T-GA--AACCA---T-C-GGATAA-T-CTG----CTGT-AACCAGG--GG----------A----------A-G--AA-A--A-TTGCT------------------------TTTT-TG---T-TT-CT-G---A-TC-GA-T-A-------T-CT-CAGTT--A-ATATCATTA-AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT--AATGTGTCTTA-----------AAAC-GCA-A--TAA-GG-------TA--TT---C--GA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGC-C----CCAAC-TTATC------C---C-TAAA-TTCACAAC-G-T-CC--A-G----A--TTCTC-AC-TATACCC-----AAC---T-A-------CTT-GGTATTA---TTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCCAAT-AG-----AACAT-TCAGA---ACAAAA-------TTC--TTTC-CAG-AGAT---GGG--CGT-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|9 : tttatatgatctgcATTT-GAAATATGATTAA--TAAACTTTACAATACGC-AATATGC-AGT--AAAGTTG--C---GTTA--TGGT-GT--ACT-TGAA--GACT--TATATAG-GCTAGTT-G-ACTTAAAA--AGCCATA---T-CGAAAAAACAA--TAATGGAT-TACGTAGAATATTAATA-GGAGAG-AGTATGCAGATATACTACACACGAC-CAT-TATCACGTAATGAT-ATT-ACATCTATG-TACCGT--AGTATTTCCAGTAAGATA--TATATCG-TAATGCTC-AAGAGAGTGAACTA-TG-TAA-TTTGTTTT-TTA-AAATTTACATAT---AT-AATACTTGATTAT-T-CCTCTCGT-AGGTCT--ATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----GCT-ACATGTA----GAGAAGAA--AAGATG-TAGG-CCT-AT-T-GGT-CC--A-TTGAT--GAGGGGAT-TA-AT-TAGGGGCCCCGGGGGG-------G-GGTGGGGTGGGGGGGGGGGTTG-CAAA-GGC-AAAGAA--TTT-CTC-ACTTT-T-A----T-A-AAG-AAAAAAAA---TCA-CTAT--ACA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--c
Alignments
lowQualScore : 22222 11 11111 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333333333333333333333333 1111 111 11 22222 888888888888888888888888888888888888888888 111 111 1111 111 11 111 1111 111 1111111 111 22222222222222 11 222222222222 1111 1111 1 11111111 11111 111111 1 1 1 11 1 4444444444444444444444 222222222222222222 1 1111 333333333333 11111 2222222222222 33333333333333 1111111 333333333333333 1 1111 1 222222 111 1 111 22222 1 99999999999999999999999999999999999999999 1 1 111 111111 333333333333333333 111 11111 1 1111 2222222222222222222 111111 11111111 111 2222222222222222222222 1111 111111111111 1111 111 222222 1111 11111 22222222222222222 22 111111 1111111 1111 1 222 111 2222 11 1 11 1 1 11 222222222 11111 1111 111 111 1111 111 111111 111111 11 444444444444444444444444 11111 2222222 11 11 111111 11 222222222222 11111 222222 2222222222 111111 1111111 1111 111111 1111111111111 1
lowQualScore : 0 8 00000 0 0 11 0 44444 999999 5 77 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 6 6 6 6 6 88888888888888888888888888 4444 6 6 33 6 6 6 6 111 00 2 1 3 6 6 88888 333333333333333333333333333333333333333333 777 66 5 77 5 5 5 77 000 5 77 6 1 7 6 8888 99 3 888 6 88 99 6 000 4444 999999 6 99 6 6 111 6 99 99999 2 7777777 666 99 6 99 6 6 6 44444444444444 3 6 99 7 1 88 99 555555555555 6 4444 6 6 0000 6 3 77777777 33333 999999 7 6 3 3 99 6 3 55 3 6 2222222222222222222222 44 6 6 222222222222222222 6 5 1 0 5 0000 333333333333 66 11111 5 5 0000000000000 66 1 5 22222222222222 5 6666666 5 5 444444444444444 5 88 0 44 66 5 0 5 5 0000 5 5 999999 0 444444 66 333 5 5 0 5 66 999 77 000 5 77 66666 5 77 0 1 5 88888888888888888888888888888888888888888 1 5 5 5 2 5 5 777 77 666 77 1 3 111111 77 5 888888888888888888 77 77 5 77 5 5 77 5 77 5 5 77 555 44444 1 5555 66 8888888888888888888 4 9999 4 9 3 66 222222 55555555 4 66 66 222 4 9999999999999999999999 8 8 4 66 4 4 777 4 4 4 2222 66 777777777777 8 66 7777 4 222 66 333333 4 5555 4 11111 4 4 77777777777777777 4 4 4 11 66 9999 4 9999 9999 222222 7777777 4 4 66 66 4 4 3333 5 5 5 66 0 0 222 5 000 4444 5 5 88 11 5 0 5 11 0 5 5 0 5 66 11 5 3 888 555555555 5 4 4 4 4 4 777 11111 55 4 2222 666 4 8 4 666 4 777 000 4 4 0000 4 4 44 4 4 99 0 4 4 4 222 5 88888 444444 99 4 4 777 4 4 3 7777 3 55 4 66 888888 4 00 4 66 4 777777777777777777777777 1 33333 4 4 777 66 4 4 5555555 4 66 4 00 00 4 333333 4 4 66 4 44 0 888888888888 3 4 66666 4 44 333333 4 66 4 0000000000 777777 8 2 4444444 1111 000000 666 3 3 7777 3 3 3 55 3 7777 55 3 3 3 3 3 666 5555555555555 3 77 555 555 3 44 3 3 6 3 6666 2 3 6666 555 44 3 3 3 3 555 9 6
lowQualScore : . . ..... . . .. . ..... ...... . .. . ............................................................................ . . . . . . .......................... .... . . .. . . . . ... .. . . . . . ..... .......................................... ... .. . .. . . . .. ... . .. . . . . .... .. . ... . .. .. . ... .... ...... . .. . . ... . .. ..... . ....... ... .. . .. . . . .............. . . .. . . .. .. ............ . .... . . .... . . ........ ..... ...... . . . . .. . . .. . . ...................... .. . . .................. . . . . . .... ............ .. ..... . . ............. .. . . .............. . ....... . . ............... . .. . .. .. . . . . .... . . ...... . ...... .. ... . . . . .. ... .. ... . .. ..... . .. . . . ......................................... . . . . . . . ... .. ... .. . . ...... .. . .................. .. .. . .. . . .. . .. . . .. ... ..... . .... .. ................... . .... . . . .. ...... ........ . .. .. ... . ...................... . . . .. . . ... . . . .... .. ............ . .. .... . ... .. ...... . .... . ..... . . ................. . . . .. .. .... . .... .... ...... ....... . . .. .. . . .... . . . .. . . ... . ... .... . . .. .. . . . .. . . . . . .. .. . . ... ......... . . . . . . ... ..... .. . .... ... . . . ... . ... ... . . .... . . .. . . .. . . . . ... . ..... ...... .. . . ... . . . .... . .. . .. ...... . .. . .. . ........................ . ..... . . ... .. . . ....... . .. . .. .. . ...... . . .. . .. . ............ . . ..... . .. ...... . .. . .......... ...... . . ....... .... ...... ... . . .... . . . .. . .... .. . . . . . ... ............. . .. ... ... . .. . . . . .... . . .... ... .. . . . . ... . .
lowQualScore : 8 0 00000 8 8 00 6 33333 444444 7 99 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 7 7 7 7 7 33333333333333333333333333 2222 7 7 55 7 7 7 7 777 00 5 7 2 7 7 22222 000000000000000000000000000000000000000000 111 44 7 99 7 7 7 99 000 7 99 7 7 3 7 3333 22 2 333 7 00 88 7 888 2222 555555 7 22 7 7 777 7 22 33333 5 7777777 777 22 7 22 7 7 7 77777777777777 2 7 22 2 0 33 22 222222222222 7 2222 7 7 8888 7 3 55555555 77777 777777 3 7 3 3 22 7 3 88 3 7 8888888888888888888888 22 7 7 888888888888888888 7 0 1 8 0 6666 555555555555 99 88888 0 0 6666666666666 99 0 0 11111111111111 1 2222222 0 0 555555555555555 0 22 1 00 99 0 0 0 0 6666 0 0 000000 0 000000 99 888 0 0 0 0 99 444 99 000 7 99 00000 7 99 7 4 7 00000000000000000000000000000000000000000 4 7 7 7 0 7 7 777 99 777 99 7 0 666666 99 7 333333333333333333 99 99 7 99 7 7 99 7 44 7 7 99 999 33333 4 6666 11 2222222222222222222 4 4444 4 7 9 11 888888 33333333 4 11 11 222 4 6666666666666666666666 9 9 4 11 4 4 888 4 4 4 4444 11 999999999999 9 11 2222 4 222 11 888888 4 1111 4 11111 4 4 88888888888888888 4 4 4 11 11 4444 4 4444 4444 000000 1111111 4 4 11 11 4 4 9999 0 0 0 99 0 4 555 0 888 4444 0 0 22 99 0 0 0 99 0 0 0 0 0 99 99 0 2 888 111111111 0 4 4 4 4 4 888 11111 55 0 5555 555 0 0 0 222 0 000 333 0 0 0000 0 0 88 0 0 55 9 4 4 4 999 0 22222 000000 55 0 0 000 0 0 6 7777 6 55 0 11 333333 4 66 4 11 4 222222222222222222222222 9 11111 4 4 888 33 4 4 6666666 4 11 4 66 66 4 888888 4 4 11 4 77 1 000000000000 6 4 66666 4 66 222222 4 11 4 4444444444 222222 9 2 4444444 4444 555555 444 6 6 7777 6 6 6 00 6 7777 00 6 6 6 6 6 444 9999999999999 6 22 444 444 1 22 1 1 7 3 2222 8 3 2222 888 22 1 1 1 1 444 2 2
consensus : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
Reference ( family-3278 ) : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|1 : TACTAACTCAT-AATAATTTATTATATTATA--CTGTTTTAAAAA-----AGT------GGATTTGGTATC--A-ATATT
gi|1 : TTAC--GTC-TCCCGA-CGAC-AGGTAAT---ACGAG--G-CT--------CCATGAGG----TCGT-ACAAAAGCATATCGTCGACC-GGAAGACA-TTTA---CA--ATAAGCACCAG-GAAATTTTAAATGCGCAGTCACTTCACATCTTTATGATAGTAAA--AGTTTATTATAAA---GGCCTACCTTAC---TTATCACTG-GGAGACTTAGTTAA-T-TT--TTCTTACCACCAAATC---TATATCCATTC---CAGG--TTTTCC--CG--CCCTG-GATGGTATTG-AAGATACG-ATAA---AAACTTT----CATGC-TAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-AATCGGA-TT--ACTAT--G--GGCAACTATA--G-GCTG--T-GCA-TCAAAA--AGC---A---T-CGAA----CAA--TTATGAA---A--TAAATT-----T------AG-AGCATGCAGATAT----CACACGACGCAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGTTGA--ATTTC----AAGGTA--TATATCGGTAA-AGA--GAGAGAGTGAA--A-TG-TAATTTT-TTTTATTA-A--TTTACATAT----T-A-TAACTGAT-AT-TTC-TCTCGT-AG--TTCAATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----GTTTG----TA-----AGAAGAA--AA---G-TAGGTCCT-AGAT-G-TTCC--A-TT-AT--GAGGGATT-TA------GA-----TAGGGGG-------GCGG-GGG--------------TGACAAA-GGCATAAGAAATTCTCTTCTGC-TT-T-A----T-ATAAGAAAAAACCA---CCA---ATA-ATG-CACTAGTAC--ATTA-G-CAGC-ACAAACTTGAGC-A-CTC--TATATGG-GAAGAA---TATAGGATAC-T-A-GCCCCC--ACCCACAT-ACA-CACACAAATC-AATGA----ACTA----AA-TG-----AA---C-ATGTGTAC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-G---A-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATAT-GC--------TG--TA--ACT------------AC----TGG--TAAAAGATCTC--GCC-AC-AG--TG-A--G-AT-G--T-TGTATA-----TATTGGTT--CG-ATT--AT----A--AT--------------------A-TAA--T----TT-AATTATT----ACTTT------------------A----G---AAA-GC--A--TT---A--GA---------------TC-----T-ACGAATTTCGC-G--TTG-ATAGTC-GA---TTCT-A-TAAA-AGAC--GAGGAC----AT----A-TT--AGGGA-AG-G---TGAAAGT--AAA---GC-AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----T-GA-TC-T--C--------------T---TCTTCGTAGTCAAA--G----CAT-AC----C----GG---TTGA-A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAATTT---T-TTTT-T-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATT--GA--TGA-GA-GACGTCAG-GTAGGG-GTGTATTACATT-AAT-GA-GATGA--AAA----G-AGAAAT---AA-----A-C-ATAAT-AACT-TT--GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTT----CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---TGT-A-G-AC--G-CA-T-GCA-TT-TT-GAATGTACCA-ACGCCG-ATGGGG-AT--ACAT------------------TA--T-GA-CAACCA---T-C-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GGAAA-A--C-TTGCT------------------------TTTTATG---TGTT-CTTG---A--C-GAGT-A-------T-CTTCAGTT--A--TATCAT---AAACAA-GT-AGGT----CTC-GAA-A--GTTAAATGTGTAT-A---TA----T-AAGC-A---A--TAATAGC-GTA--T-----T-TT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGA-TGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TATT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTAT-TTTT----A---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGG------AAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAC---GGGGCCGA-TTTTCG-CC-TTGGAG-CCCTACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcgttacgtctcccgacgacaggtaatacgaggctccatgaggtcgtacaaaagcatatcgtcgaccggaagacatttacaataagcaccaggaaattttaaatgcgcagtcacttcacatctttatgatagtaaaagtttattataaaggcctaccttacttatcactgggagacttagttaatttttcttaccaccaaatctatatccattccaggttttcccgccctggatggtattgaagatacgataaaaactttcatgctatgcagtaagttgacgtaatcggattactatgggcaactataggctgtgcatcaaaaagcatcgaacaattatgaaataaatttagagcatgcagatatcacacgacgcattatcacgagatatttactcagtcgttgaatttcaaggtatatatcggtaaagagagagagtgaaatgtaattttttttattaatttacatattataactgatatttctctcgtagttcaatcacaaacttttattgtttgtaagaagaaaagtaggtcctagatgttccattatgagggatttagataggggggcgggggtgacaaaggcataagaaattctcttctgctttatataagaaaaaaccaccaataatgcactagtacattagcagcacaaacttgagcactctatatgggaagaatataggatactagcccccacccacatacacacacaaatcaatgaactaaatgaacatgtgtacgcgagtgagattttgaatgaaagactgaaagtcaaacatatgctgtaactactggtaaaagatctcgccacagtgagatgttgtatatattggttcgattataatataatttaattattactttagaaagcattagatctacgaatttcgcgttgatagtcgattctataaaagacgaggacatattagggaaggtgaaagtaaagcaagttatttttcaagtgatctcttcttcgtagtcaaagcataccggttgaattttctgcttaaattgtgaacacttttgcttgatcaaatccaaagaaatttttttttgtgggtttgacgatattgatgagagacgtcaggtaggggtgtattacattaatgagatgaaaagagaaataaacataataactttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatggttgcatgtagacgcatgcattttgaatgtaccaacgccgatggggatacattatgacaaccatcggataattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacaggaaaacttgctttttatgtgttcttgacgagtatcttcagttatatcataaacaagtaggtctcgaaagttaaatgtgtatatataagcaataatagcgtattttaacgtttctgatcgtggatgctcccaactttatccttatttttcgtccagatttaatttccctggactacttggtattatttttagaaacagacatccatagcaaacattcaggaaataattcatttccgagacggggccgattttcgccttggagccctac
gi|10 : tactaactcataataatttattatattatactgttttaaaaaagtggatttggtatcaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcg----A--AT-----TAT-----------AA-TTACTT----TT-AA-TATGCA---CTTTCTCATTTGTTTTCATAAAA----AGAAAAA-GC--A--TTT--A-CGAGATTTTTATATTACATCAACCAT-AA-AATTCAAC-G--TTGGATGAGG-TA---TT-T-A-TAAA-A--CGAGAGG-CAATGAT----ATTT--AG----AA-AAGTTGAAAGT--AAAACTG--AAGTTAATTTTTCTACAA-G-----CTGA-TCCC--CCTACAATTCTTTCGT-C-TTTTGGT-GTA-AA--G----CAT-ACCCTGC----GG---T--ACACAATCC-TTTC-TGCTTTAAAT--TGAAA-GAAC-AT----TTTT
gi|11 : TAAT-G-TA-C--T-GAA----GA-CA--CAGTCTGA-GGGTAATTTCTGGGGGCTGT-AACCAGG--G-CCTT-TGTCAACAAAAA-C--ACG--AATA--T-TTGTTTTTTTTGGTGCTTACGGTCTTTTTTTTTATGGGTT-TT-CT-GTAGA-TCCGAGT-AAAATC--T-CTCCAGTTTAA-ATATCATT--AAACAAAGT-AG-TTCCCCTC-GAA-AACGT-AGA-ATGTGTTAG--TA----TTAAACCGC--AA-TAT-AGC-GTA--T----TT-CT--AAACGGTTTCTCT--TTCCTTCTTTG-A-C-------GTGGGATGCTCAGCGCCAA-TTTATC------CCCCT-TCAT-GTT----C-G-T-TCTCA-GGATAA--TT-CA-AT-T-T-C--T---GGAC---T-ATAATAAACTT-GGTGTTAT-TTTTTTAGA---GTA--AACAGA-C-tttttttttttttttaacatagcgcgtttgatcgaagcgatataccaagagaaaaaaaataaagaaaaattattttgtggggtttggaacagatgatttatttttgagtttagaagaacaatagtatatcaggtggattgtaatgatctaatagaagattgaaatagagaaattaaaa
gi|12 : atttatatATT-CTG----CTGTTAACCAGGCAGGCCTTCTG---ACAAAACACGAA-A--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-ATG---TGTC-CT-G---A--C-GAGTTA-------TGCTCCAGTT--A-ATATCATTTAAAACA--GT-AG-T----CTCAGAATA--GT-AAA-ATGTGTTAGATTA----T--AAC-GC--AATTAA-AGCAGTAGTTACCTTT-CTCGAA-CG-------T--TTCG-----TG-ATCCCCGCCTACGAGGT-CGT----CCAACATCATCCTATCGC---T-TAAT-TTT----CAG-T-CC--ATG----ACGTT-TATATCT-T-CCCTGGGGGACGGTT-A-------CTTAGATATTA--TTTT---AAGTGG-C--AACAGAGCGATGC-AT-AGC-A--AGCAT-TCA-G---AAAAAA---T-AATTCATTTTC-C-GAAGATTGCGGGGCCGA-TGTTTGCCC-TTGGAGCCCCTACgaggaaacatt
gi|13 : tTTTAAAA------AGTC----CGGA-TTGGTATCCAA-ATATTc
gi|13 : CTTACCAGTCCTCT-GG-CAAC-AG-TAT----AC-AGGCC-TTAACTGTACCCATGAG------T-T-ACAAAAGCATATCGTCG-C--G-AAGACA-TTT----TACAATCAACACC-G-GA-----TAAATGCGCAGTTATT------------------------ATT--------AGGGGGCCTACCTTACA--TTAT--CTG-GAA--CTTA-TTAT-T-TT--CT---AC-AC--AA-TA-TCATATCCAT-CATGCAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-aagagaaaagagagaagagagagagagagagatcacttaccagtcctctggcaacagtatacaggccttaactgtacccatgagttacaaaagcatatcgtcgcgaagacattttacaatcaacaccggataaatgcgcagttattattagggggcctaccttacattatctggaacttattattttctacacaatatcatatccatcatgcaggttttttttcccctg
gi|14 : tttaaaaagtccggattggtatccaaatattaagagaaaagagagaagagagagagagagagatcaAATGTTC----TTAACTCTATC------C---T-TAATACGT----C-T-T-CC--A-A----A--TT-TT-GC-T-T-CCCC---GGGC---A-A-------TTT-AGTGTTAG-TTTT---AA---G-G--AATAAA-C-ATAC-AC-AGCAATCAGCAGATCAGG---GGGGGGGGGT-GATTCA-AGTA-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGACC-ATAGAACCCCTA
gi|15 : gtTGGAATGCTC----TTAACTCCATT------C---T-TAAA-TTT----C-T-T-CC--A-T----A--TT-TG-AC-T-T-CCCG---AGAC---A-A-------TTT-AGTGTTAT-TTTA---AA---G-A--AATAAA-C-ACCC-AC-GGCAT--A-CAT-TCA-----AAAAAA---T-GGTTCA-ATTT-T-G-AGAT---TGGACCGA-TCTTGATCC-TTAGAGCCCCgc
gi|16 : aatTAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCCCAT-AGCAA--TACAT-TCAGA---CAAAAA---T--GTTCA-TTTC-T----AAT----GGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGG-GCCCC
gi|17 : a--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-A-CA-T-GCA-TT-CT-G--T
gi|18 : TAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGA---CAAAAA---T-GGTTCA-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGGGGCaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataataatcagcg
gi|19 : a-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-C--CGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-
gi|2 : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATACTATA--CTTTTTTAAAAATTTCAAGTTAAGTCGGA-CTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-AG-CGAC-AG-TA-----AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AGGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TGTATGCGCAGTCACTC-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCT--------------G-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTG-ATCCAT-C----AGG--TTTTTTTTTTTTCCTTA-GATG-TATTT-GAAATGCG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGT--AG-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--AAT----A--GATA--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTTAAA--A----------------AA-CAA--TAATGGA--AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-AAT-ATTTAC-TC---------GT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GGGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA----TTTACATAATGAATTA-TAACTGAT-AT-T-A-TCTCGTTAG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT---A-T-CC--A-TTGAT--GAGGGATT-TACATGTAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAA-----TCA-CTATAGATA-CATT--TA----TTA-G-CAGC-ACAA-CTTA--C---CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCAACAT-ACA-CAACC---TC-AA-GA----ACTATTTAAA-TGT----A----C-ATGT--AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AGGACT--GAACGT-CAAA--AATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------ACGC--TGT--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AT-G-AT-G--TGTATATAGACTCTATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TG-AA-TATGTA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----T---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TT-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-A--GAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AGTTCTAA-G---TGAAAGT--AAA---A--ACGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTTGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GTAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-T-GTGGTTTTGGGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-GTCA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AA--ACAT-GTATT-G-TA-CA-T-GCA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--AGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTTTG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGCT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AA-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TACCGGT-AAAC-GT--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-AAC-------GTGGAGGGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-A--T-T-CCCT---GGAC---T-T-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGAAA--AACAT-TCAAG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|20 : ATACTA-CTCAT-AATA-----T---ATTA-------------AAA-----AGTC-----GGA-TTGGTATC--A-ATA
gi|21 : tagataagggcacttttttttggaTACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATAACTTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATAT
gi|22 : T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-ATG----CTGT-AACCACG--GGCCTT-T
gi|23 : GTTTC-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGCCC-TTAGAGCCCCCAC
gi|24 : T--------A---GGCCTACCTTACG--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAATT-TT--CT---AC-AC--At
gi|3 : ATACTAACTCATCAATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT-----CGGA-TTGGTATC--ACATA
gi|3 : tagtaaggcactttttgctttggaCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--G-TCA-------T-ATGAGG----TC-TTACAAAAGCATAT-ATCG-CCCG-AAGATA-TTTA---AACT-TCAACACC-GCGAA----TAAATGTGCAGTTTATT-------------------A----TT--------A---GGCCTACCTTACAATTCATC-TGG-AAA--CTTA-TTAT-TATT--CT---AC-AC--AATTA-T-ATATCCCT-C---CAGGGTTTTTTTTTC---CCCTGAGAT---ATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGTCTAA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GTTCACT-T--AAGGAC---TATA--G-GCTG--TTG-A-TTAAAA--GCC---A---T-CGAAAAA-CAAATTACTTGATGAA--TAGAAT-----TGAG---AGGAGC-TGCAGATAT----CACACGAC-CATATATCACG--A-GAT-ATTTACATC-A-G-T--CGT--A--ATT-C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTACTGAGAGAGTGAA--A-TGGTA--TTTCTTTT-TTATA--TTTACATCA----C-A-GAACTTTT-AT-T----------AA--TT--GT-AT-A------------T----GCT------TA----GAGAAGAA--AA--TGCTAGG-CCT-AT-T-G-T-CT--A-TTGAT--GAGGGGATGTAGAT-T-GA-----T-GGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAACAGAA--TGTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CGAAT-ACGACAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--C-A-CTT--T-----G-GAAGAAA--TATAGGAGC--T-A-ACCCCC--ACC-ACAT-AGA-CACA------------------------------------------TGTG-ACAGC--AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-ATATTTG--TA-GACA------------TC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC--G--TG-AC-G-AT-G--T-TATATA-----TATTG-TTAGCG-ATTTTAT----ATAAC-----TAT-----------TA-TTACTT----T--AATTA-GCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--T----A-CAT---------------CC-----T-AC-CATTTCGCAG--TTG-ATAGAGATA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGGAC----AT----A-TT--AG----AA-G----GAAAGTGTAAA---C--AAGCT-TGTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT-----------------T-C-TCTTCGT-GT--AAAGG----CGT-AC----C----GGGTTTG-ATA-----TCTTTCATGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGAGTCAAAT--CCAA-AGAAAAAG---T--GTT-A-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATTT-GA--TGAAGA-GACATCAG-GT--GGTGT-TATCA-ATTTAATTGA-TATGA--AAATA--GGAGAAAT---AA-----CACATTAAT-AACT-TTTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TTG----CATTTT---CGAA-ATGA-T--AGTTGC-A---TCT-A-G-ACC-GGCAAT-GCA-TTTCT-G--TGAGCCA--CGTCG-ATGGGGCAT--ACAT-GTACT-GCTA-CAAT-GTACAT-GA-CAACCA---T-A-GG-TAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GA-AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG-----TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCC-GTT--A-ATATCATT---AACA--GTCAGTT----CTC-GAA-A--GT-AAA--TGTGTTA---TA----T--AAC-GCA-A--TAA-AGC-GTA--CT--TCT-CT--AA-CG-------TTGTTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-GTT-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---TAA-------CTT-GGTATTATCTTTT---AA---G-ATGAACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAT---GCGGCCGAGTTTTCGCCCATTG--GCCCCTattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccggcgacagtattacaggtcatatgaggtcttacaaaagcatatatcgcccgaagatatttaaacttcaacaccgcgaataaatgtgcagtttattattaggcctaccttacaattcatctggaaacttattattattctacacaattatatatccctccagggtttttttttcccctgagatatttgaaatacgttaataaactttcacgcatgcagtctaagttgacgtatggtgttcacttaaggactataggctgttgattaaaagccatcgaaaaacaaattacttgatgaatagaattgagaggagctgcagatatcacacgaccatatatcacgagatatttacatcagtcgtaattcaaggtaattatatcgtaagtactgagagagtgaaatggtatttcttttttatatttacatcacagaacttttattaattgtatatgcttagagaagaaaatgctaggcctattgtctattgatgaggggatgtagattgatgggggggggggtgcaaaggcaacagaatgtcctcgctttataaagaaaaaaaaatcacgaatacgacagttaattagcagccacaacttgcactttggaagaaatataggagctaacccccaccacatagacacatgtgacagcagtgagattttgaatgcaaaaagactgaaagtcaaacatatcgcgtatatttgtagacatcctggtaaaatccgccacgtgacgatgttatatatattgttagcgattttatataactattattactttaattagcaactttcattttcataaaagaaagcatacatcctaccatttcgcagttgatagagatatttataaaacgaggacatattagaaggaaagtgtaaacaagcttgttttcaagcgatccttctcttcgtgtaaaggcgtaccgggtttgatatctttcatgcttaaattgtgaacacttttgcttgagtcaaatccaaagaaaaagtgttagtgggtttgacgatatttgatgaagagacatcaggtggtgttatcaatttaattgatatgaaaataggagaaataacacattaataactttttgtaaaatatgagttgcattttcgaaatgatagttgcatctagaccggcaatgcatttctgtgagccacgtcgatggggcatacatgtactgctacaatgtacatgacaaccataggtaattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacagaaaatttgctttttatgttctgatcgagtatctccgttaatatcattaacagtcagttctcgaaagtaaatgtgttatataacgcaataaagcgtacttctctaacgttgttctgatcgtggagtgctcccaactttatccttaattttcgttccagatttaatttccctggactaacttggtattatcttttaagatgaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttccgagatgcggccgagttttcgcccattggcccct
gi|4 : tagtaaggcactttttgctttggaatactaactcatcaatattatattatacttttttaaaaaagtcggattggtatcacataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATT
gi|4 : CTTAC-AGTC-TCC-GGGCGACCAG-TAT----AA-GG--C-CT--------CTATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATATTCG-CC-G-AAGATA-TTTAATTCACAAC--AC-CC-G-GAAA---TAAATGTGCAGTT--TT-------------------ATTATTT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTTA-T-TTTTCT---AC-AC--AATTAATTATATCCAT-T---CAGG--GTTTTTTTC---CCCTG-GAT--TATTTTGAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGAAC---GT-A--TGGTTGT--A-T-T--A--GGAC--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---TTCGAAAAA-CAA--TACTT-AT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GATTATTTAC-TC-A-G-T--CCG--A--ATT-C----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--AATG-TA--ATT-TTTT-TT-----TTTA-------------------AT-AT-T-T-ACT-------------TCAC-AAAC-TTTTTA-TTAATTGTT-A----TATGTAGAGAAGAA--AA--AT-TAGG-CCT-AT-T-----CT--A-TTGAT--GAGGGGAT-T-----TAGA-----T-GAGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCCAAGAAA--TTTCCT--GC-TT-T-A----TTA-AAGAAAAAAAAAATATCA-CTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGCCACAA-CTTG--CCA-CTC--T---TGG-GA-GAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-AGA-CACA------------------------------------------TGGG-AC-GCG-AGTGA-GATTT-G-AAT-GCAAACAAGACT--GAAG---CAAA--CTAATCGCGT-AT---TT--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAA----TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--T--TTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--ATAAC--TAT-----------TA-TTACTT----TT-AATTATGCA--AC-TTC------A--TTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-CATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-ATTAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT---G----AA-G---TGAAAGT--AAAC--A--AAGTT-G-TTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GTA-AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACT---TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-A-AAAAAA---T-TGTTAA-GTGGGTT--TGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT---G-GTGTATCA-ATT-ATT-GA-TATGA--AAATA--G-AG-AAT---AA-----CAA-TTAATAAACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CA-TTT---CGAA-AT-A-T--AGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCATTT-CT-G--T-GAGCA-ACGTCG-AT-GGG-AT--ACAT-GTA-T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAA-CA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCC-T-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---ACTC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAAC--GT-AGTT----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGT-TTA---T--------AAC-GC--A--TAA-AAG-GTA---A--TTT-CT--AA-CGT------T--TTC------TGAATC-------GTGGAGTGCTCT---CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-TCCC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGACG--T-A--------TT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTT--C-G-AGAT----GGGCCGATTTTTCGCCCTTTGGAGCCCCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccgggcgaccagtataaggcctctatgaggtctacaaaagcatatattcgccgaagatatttaattcacaacacccggaaataaatgtgcagttttattatttaggcctaccttacattatcctggaacttatttatttttctacacaattaattatatccattcagggtttttttcccctggattattttgaaatacgttaataaactttcacgcaatgcagtaagttgaacgtatggttgtattaggactataggctgtgattaaaaagcattcgaaaaacaatacttataatagaattggagagcatgcagatatcacacgaccattatcacgagattatttactcagtccgaattcaaggtaattatatcgtaagtacgagagagtgaaaatgtaatttttttttttaatatttacttcacaaactttttattaattgttatatgtagagaagaaaaattaggcctattctattgatgaggggatttagatgagggggggggtgcaaaggccaagaaatttcctgctttattaaagaaaaaaaaaatatcactatacacagttaattagcagccacaacttgccactcttgggagaaatataggagtaacccccacccacatagacacatgggacgcgagtgagatttgaatgcaaacaagactgaagcaaactaatcgcgtattttagactacctggtaatccgccacagtgacgatgtttatatattggttagcgattttataataactattattacttttaattatgcaacttcattcataaaagaaagcattacgatctaccatttcgcgttgatagagtatttattaaaacgaggcatattgaagtgaaagtaaacaaagttgttttcaagcgatcctctctcttcgtgtaaagcgtaccggtatattttctgcttaaattgtgaacactttttgcttgatcaaatccaaaaaaaaattgttaagtgggtttgacgatatttgatgagagacatcaggtggtgtatcaattattgatatgaaaatagagaataacaattaataaacttttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatagttgcattagaccgcatgcatttctgtgagcaacgtcgatgggatacatgtatgtacatgtatgacaacataggataattctgctgtaaccaggggccttgtacaaacagaaatttgctttttatgtttctgactcgagtatctccagttaatatcattaaaacgtagttctcgaaagtaaatgtgtttataacgcataaaaggtaatttctaacgttttctgaatcgtggagtgctctccaactttatccttaattttcgtcccagatttaatttccctggacgtattggtattatttttaagaaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttcgagatgggccgatttttcgccctttggagcccct
gi|5 : tttaaaaaagtccggattggtatcaatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTAC-AGTC-TCC-CG-CGAC-AG-TACTCGTAC-AG--CGCTA-------C-ATGAAGGATCCC-T-ACAAAAGC-TATCTTCG-CC-G-AAGACAATTTA---CA--ATCA---CC-G-GA-----------------TATC------------------------ATT--------A---GGC-TAC-TTACAA-TTTTC-CTGCGAA--TTTA-TTAA-T-TA--TT---AC-AC--AATTA-TTA-ATC-AT-C----AGA--TTTTTTT------CCTG-GATG-TATT--GAAATACG-GTAAATCAAACTTT----C-CGCCAAT--TCCAGT--AC-GTCGA-CTGAGT-A--TCGT--T--ACT-T--A--GACT--CATA--GCGCAT--T-G-A-TGAAAATTAAT---AATTT-CTAGACA-AAA--TA-TGGGA-AA---AGAAT-----GG-G---AG-AGCATGC-------------------------TCA-------AT-ATTTAC-TC-A-GGT--CGT--T--ATT-C----AAGGTAATTAT-TCG-TAAAGTACCGAGAGAGTGAA--A-TGCTA--TTT-TGTT-GAA-A---------AA---AA-A-AAAC-AAT-ACAT-C-TCTCGT-AGG-TT--ATCACCAAACGTTTTAA-TT----GTT-A----C-----GAGAAGAACAAA--TG-TAGA-CCTCAC-TAG-T-CCTCACTTGATATGGGGGATT-TA-GT----A-----TAGGGGGAGCTTGGG-GG-GGG--------------GG-CAAACGGCAAAGAGA--TTTCCTC-GC-TT-T-TGTGTT-A-AAGAAAAAGAAA---TCA-CTATT-CTA-CAGT--CGCACATTA-GGCAGC-ACAC-ATTG--C-A-CTCCCT---TGG-GAAGAAAAGTATAGGAG---TTA-ACCC----AGCCACATTACA-CACAC---TC-CA-GACAACACTAG--AAA-TGCATTAA----C-ATGTG-AC-GCG-AGTAATGAATTTGTAAT-GCAAA---GACTATGAAA-T-CAA---C-TATTGCGTTAT---CGACTG-AACTC-----------GC-C--TGGGTTAAAA--TC-CCCGCC-GC-AGCATGCAC-GCATCG--TGTTCATA-----TAT-GAATAGCGTATTTTAT----A--ATACACTTAT-----------TACTTACTTGAGATT-ATTCATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----A---AAAAGG--A--TT---AATGA---------------TCC----T-ACGAATTTCGC-GGTTTG-ATGGAG-TA---TT-T-A-TAAA----C--GAGG-C----ATCTACA-TTGTAG----AA-G---TGGAAAC--AGA---AGTAAGTT-ATATTT---CAA-AAAAGCC-GACTCCTGCC--------------T-C-TCTTCCA-GTTAAA--G----CGT-AC----CCTCGGG---T--ATA-----TATTTC-TGC-TTAAATGATG--T-GAACCAC----TTTTG-CATTGA-TCGAACTCCCAACAGAAAAGAAATT-TGTT-A-GTTGGATTATGACGGAT-ATTTAGAC-TGA-GACGACATCAG--T--GG-TAGTATCA-ATT-AAT-GACGATGACAAAATACGA-AGAAATCTAGA-----AACATTAAT-AACT-TTT-GTAGAAAT-AT-CTACA-----A--T-GG---CATTTAA--CGAACATCA-TTGGATCGC-AATTC-T-ACGCACCAG-CA-T-GCA-TT-CTTGC-TGAACCACACGCCA-CTGGGG-AAT-ACATTGTACT---TA-CAAT-GTA--T-GATCAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTCT-A
gi|6 : C-TTCTCAGTT----GTT-A----------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AG-T-G-T-C---A-GTGAT--GAGGGAAT-T---T-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGGG-------------TG-CAA--GGTAA--GAA--TTTCCTC-ACGTTGT-A----T-A-AAGAAAAAA------TCAGCT-TACAGG-CATT--TA---ATTACG-CAGC-ACAA-CTTG--C-AGCTC--T---TGGTGAAGAAA--TATGAGAGGGAT-ATACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TCGAA-GA----AATAT--AAAATGGT---A----CTATGTGGAC-GCG-AGTGC-GATTG-G-AAC-GCAAA---GACT--GAAAAT-CAAAGATATATGGCGT--T---TG--TATGACT------------AC-CAGTGT--TAAAC--TC-C--GCCCAC-AG--TG-ATTG-AT-GGTTGGTTA-A-----TATTGGTTAGCGGATTTTATT---A--AT-----TATGCGGTCATATTTA-TTACTT----TT-AAATATGCATAACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GCCAA--TT---A-TGA---------------TT-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATGAAG-TAATATT-T-A-TAAATA--C--GAGG-C-----T----ACTT--AG----AAAG---TGAAA-T--AAA---C--AAGTT-TTTTTT---CAA-G-----C-CA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--GAACGTGT-AC----C----GG---T--ACAG----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--TTGAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAGAAAAC--T-TGTT-T-GTGGGTT-GTAACG-ATGATTT-GAATTGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AATAGA-GATGA--AAATAA-G-AGAA-T---AA-----CCA-TTAA--AACT-TTT--TA-AAATGAT-G---AACGAGG--T-GGGCCCATTCTTCTCGAA-AT-A-C--C-TTGCTA---T-G-T-G-ACT-G-CA-T-GCA-T--CT-G--TGGACGC-ACGCC--ATGGGG-ACTGACAT-GTAAT-G-TAACA-TCGTAA-T-GA--AAC-A---T-AAGGATAATG-CTG----CTGT-AACCAAG--GGCCTT--GT--ACAAA------A-G--AA-A--TATTGCTG-----------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CCCCA-TT--ACATATCATT--A--CA--GT--G-T----ATC-GAA-A--GT-AA---TGTGTTA---TA----T-AA-T-GCCAA--TAA-AGT-GTA--T----TT-CT--GA-CG-------TC-TTC------TG-AAC-------GTGGAGTGCTC-------ACTTTTTC------A---TCTAAT-TTT----C-G-T-CG--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAA---C-A-------CTT--GTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-ATGAGCAG--ACCAT-TC-GG---AAAATA---TAAGTTCA-TTTCAC-G--GAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|7 : AAT-TTCTCA-CT----TTT-A----TA----AAGAAAAA--AA--AT-CA----CT-AT---A-C-AC--AGTTAAT--TAGCAGCA-CA-AC-TTGAC----TAAAAGT-------G-GG-GGG---------------G-CAA--GGCAAA-GAA--TTTCCTC-AC-TT-TTA----T-T-AAGAAAAAAAAA---TCAACTATA--CA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---TTA-ACCCCCCGACCCACATTACAACACA----TC-AA-GA-----CTAT--AAA-TG-----AATTAT-ATGTG-AC-GCGCAGTGA-GATTT-G-AATTGCAAA-A-GACT--GAAAGTTCAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACCCGGATTGTAGACACAC--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-ACCAG--TG-AC-G-AT-G--TGT--ATA-----TATTGGTTAGC--ATTTTATTAATA--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AAATAT-CA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AA--GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-----CG-GAAGAG-TA---TT-TTA-TAAA-A--C--GAG--C----ATT---A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---C--AAGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------TTC-TCTTCGT-GT--AA--G----CGTTAC----C----GG---G--ATA-----T-TTTC--GC-T-ATAT--TG--T-GAAC-AC----TTT-G-C-CTGA-TCGAAT--CCAACAGAAAAAAAGATATGTT-AAGTGGGTT-GTGACG-AT-ATT--GA--TGA-GAAGACATCAGCGT--GGAGTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AA--TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-ATTG---A-----G--T-G----CATTTTTT-CTAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-TTA-G-AC--G-CA-TTGC--TT-CT-G--TGAACCA-ACGCCGCATGGG--AT--ACAT-GTATTAG-TA-CA-TTGTA--TTGA-CAACCA---T-A-GGAGAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-AATT-TTGCT------------------------TTT-ATG---T-TTTCT-G---A-TC-GAGT-ACATGTAAT-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA---T-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAAT-TGTGTTA----A----T-AA-C-GC--A--TAA-AGC-------A--TTTACT--AA-CG-------T--TTC------TGGATC-------GTGGAGTGCTC----CAAA--TTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTA--TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGGGAAAAAAAA---T-AATTCA--TTC-C-G-AGAT---GGGGCCGATTTTTCGCCC-TT-GAGCACCTA
gi|8 : --AT-----TATG----------TA-T-ACTT----TTTAAATAT-CA--ACTTTT------ATTTTCATAAAACCAGA---AAA-GC--AACTTCACA-CGA---------------TC-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-T----TT-T-A-GAAA-------GAGG-------T----A-TT--AT----AA-GC--TGAAAGT--AAA---C--AAGTT-ATTTT----CAACG-----C-GA-TCCT--C--------------T-CGTCTTCGT-GT--AA--G----C----T----C----GT---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACACACTTTTGGC-TTGA-GCGAAT--CCAA-AGAAA--------TGTT-A-GTGGGTT----GCG-A--ATTT-GA---GA-GA-GATATCAG-GTT-GG-GTGTATTA-ATT-AAT-AA-GATGA--AAATA--G-AG-AAT---AACCATTAAC-AT-AC-AACTATAT-G-A-AAAT-AT-G---A-----GATT-G----CATTTC---CGAA-AT-ATT--CATAAC-A---T-----G-ACC-A--A-T-GC--TT-CT-------AATT-ACGCAG-ATGGAT-AA--GTAT-GTAAG-G-TA--------A--T-GA--AACCA---T-C-GGATAA-T-CTG----CTGT-AACCAGG--GG----------A----------A-G--AA-A--A-TTGCT------------------------TTTT-TG---T-TT-CT-G---A-TC-GA-T-A-------T-CT-CAGTT--A-ATATCATTA-AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT--AATGTGTCTTA-----------AAAC-GCA-A--TAA-GG-------TA--TT---C--GA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGC-C----CCAAC-TTATC------C---C-TAAA-TTCACAAC-G-T-CC--A-G----A--TTCTC-AC-TATACCC-----AAC---T-A-------CTT-GGTATTA---TTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCCAAT-AG-----AACAT-TCAGA---ACAAAA-------TTC--TTTC-CAG-AGAT---GGG--CGT-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|9 : tttatatgatctgcATTT-GAAATATGATTAA--TAAACTTTACAATACGC-AATATGC-AGT--AAAGTTG--C---GTTA--TGGT-GT--ACT-TGAA--GACT--TATATAG-GCTAGTT-G-ACTTAAAA--AGCCATA---T-CGAAAAAACAA--TAATGGAT-TACGTAGAATATTAATA-GGAGAG-AGTATGCAGATATACTACACACGAC-CAT-TATCACGTAATGAT-ATT-ACATCTATG-TACCGT--AGTATTTCCAGTAAGATA--TATATCG-TAATGCTC-AAGAGAGTGAACTA-TG-TAA-TTTGTTTT-TTA-AAATTTACATAT---AT-AATACTTGATTAT-T-CCTCTCGT-AGGTCT--ATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----GCT-ACATGTA----GAGAAGAA--AAGATG-TAGG-CCT-AT-T-GGT-CC--A-TTGAT--GAGGGGAT-TA-AT-TAGGGGCCCCGGGGGG-------G-GGTGGGGTGGGGGGGGGGGTTG-CAAA-GGC-AAAGAA--TTT-CTC-ACTTT-T-A----T-A-AAG-AAAAAAAA---TCA-CTAT--ACA-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--c
blockSeqs : C . AC TTTCA TAAGTC . CA C C C . G C . TACAGGCCTTAACTGTACCC GATC . T CG . C . A ATT CA C A A . C AA ATTATTAGGG AAT C C . . T A TT . . . A C T . ATGC GT T TTT A G TT A ATC ACAA AATAT C CT A A TGA T . GTTC A TAAG A TA C GT T . C TTAATAATTT A A AT A G TG CG ATTAATAGGAG G ACTA . A TAAT T A TATGTAC AGT TCCAGT A . A T CT A G A C . TTTACATAATGAATTAT TG T A CCTCTCGTAGGTCT C G C C G AATT ATATGTA CA GATG . C TAGTCCTCAC AT T G AATTAGGGGCCC A AGCTTGG . T GTGGGGGGGGGGGTT . AC AA . . G G T GTGT T . AAAATA G AGATA . CAC C G C . . CA CC . T AG GGAT T CG T A CTCCAGACAACACTAGAAATGCATTAAC G A C T T T T CAA AT GTT GA A C ATATT AC T CGGATTGTAGACACAC GT . . CC C C CA C TT C C GT GTA GACTC T TAAT TA TATGCGGTCATATT C GAGA T T G TA TCATTT CCAGA A CA AC CAC A GATTTTTATATTACATCAACCA T G A GT G A ATA . T T TA GA CAATGAT T GT TTCT A AGT GT ACTG A TCTA C AAAGC T C CCTACAATTCTTTCG T G . TA AG AACG T CCTG CTCG GTTTG CAATCC A T GA AA T C ACAC G A G TC C AAT A AA TGGG G G TA AT A C C T T . T T C CA CG G A CTA CCATTAAC A A T G G T TAC ACGAG AT T GGCC TCT C G T TGG T ATT CT C C TGT A T AT T T C C C C CTG T CTGC ACATC CA T T GTC G A T GGGG T CA C CA ACACGA C A T AT A TTTTTTGGTGCTTACGGTCTTTTT T GGTT T . TAG CT C T CATGTAA G TA C TA AA C TTCCC A T AC . TG TACCGGTA A C AAT . CA GTTACC A CG A GTTTCTCT CTTCTT A T CCCGCCT AGCG CTATCG CCC C A ACAA A T C TC T GATA CG C T C A A GGG TATAATAAA A TC TTA GTG T TG G G C G AATC G A GAAA GGG AA T A A A TGC G A
blockSeqs : . . . . CC . . . . . . . . . CTCGTACAGCGCTAC . . . CG . . . . . CA C A A . . A ACTCAAATTA AA C . . . . . . . . . . T T . C . T . . G T . T . CAAT . . . . . . . TGT C TGAA C . . . . . . AGCCATAT A . . C G T . TGAG . . . . A . A AGGT A TC A . T C . . C . G . AAATTTACATATATAAT TT . . ATCTCGTTAGTT . . T T . . ACATGTA . TGC . . TGGTCCA . A . ACATGTAGA A . . . GT . A CA . . T . . . . . AAA A TACGA . . . . C . . AG . . . . CT . . T . CTCGAAGAAATATAAAATGGTACT . . . . T . . AG . GT . A C TAT . . ACCAG . . . . . . . . T . . . GTT . G T . ACACTTAT . . . T G . . AGAA . . . T . TCC T . . . . . . . . . A . CATCTAC C . . . C . AGT . T . . . . GCC . . . A . . . . . T TC . . . . . . T . . . . C AGA . AA TATG . . T C . A . . A . . A . . A . A . CACA . . . . . . . . . . G TT . C . G . . TT . . CGG . . A . . . . . . AT . TTAG CAAT A . . . . . . . . . . . AAC . . . . . G T TG . . . T . . AAATC . . . A . . TT . . . . TG GTATTA A . CAA . C TA . . . TTG G G A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGTTA . T . . . . . . A . AT G . A . A . . . . . T T
blockSeqs : . . . . CC . . . . . . . . . TTACAGGTCAT . . . AT . . . . . CT C A A . . A TTATTATTTA A C . . . . . . . . . . T T . C . T . . . T . T . AAT . . . . . . . GT C TA T . . . . . . AGCATT A . . C G A . TGG . . . . A . . AGT A C A . . . . . . . . . TATTTACATCACAG TG . . CTCTCGTAGGTT . . T A . . ATA . TG . . TGTCTA . A . AACTTGAC A . . . T . A AG . . . . . . . . AAA . ACAGG . . . . . . . A . . . . TT . . . . CTCAAGAACTATTTAAATGTAC . . . . T . . AA . GT . T C AT . . ACGC . . . . . . . . C . . . GGT . . . . AACTAT . . . T G . . T . . . . . TT . . . . . . . . . . A . ACAT . . . . . . CA . T . . . . C . . . A . . . . . T TA . . . . . . . . . . . . C . T GTA . . T . . . . . . . . . . . . . A . AACA . . . . . . . . . . . A . . . C . . T . . CAG . . A . . . . . . A . ATG CAAT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T T . . . T . . . . . . . . . TT . . . . TG GATTAT A . AA . C CT . . . TT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . G . . . . . . . . AA A . G . G . . . . . T .
blockSeqs : . . . . CC . . . . . . . . . ACAGCCTACC . . . CT . . . . . CA C A . . . . TATTATTA G C . . . . . . . . . . T . . . . T . . . T . T . AT . . . . . . . GT C TA T . . . . . . GCCAT A . . A G T . TGG . . . . A . . AGT A C A . . . . . . . . . AAAAAAA A . . AATT . . C C . . TA . AT . . ACACAG . T . AGATTGA A . . . T . A AG . . . . . . . . AAA . TCTA . . . . . . . A . . . . TT . . . . TCAAGACTATAAATGAATTAT . . . . . . . A . AT . A T AT . . CGCC . . . . . . . . C . . . TA . . . . TATG . . . A G . . G . . . . . CC . . . . . . . . . . A . CATT . . . . . . A . T . . . . C . . . . . . . . . T GT . . . . . . . . . . . . . . A GTG . . T . . . . . . . . . . . . . A . AAC . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . CA . . A . . . . . . T . TTG CATT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T T . . . T . . . . . . . . . T . . . . A TATA A . AA . C TA . . . TC . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTA . T . . . . . . . . AA A . A . G . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . TAAGGCCTCT . . . A . . . . . . . . . . . . ATCATTA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AT . . . . . . . T . A . . . . . . . A . . . . . . . GGG . . . . . . . . T C . . . . . . . . . . TTTA . . . TACT . . C C . . AC . TG . . ATCCA . A . TTAGA G . . . T . A AA . . . . . . . . AAA . ACA . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . A G AT . . TCC . . . . . . . . C . . . GT . . . . TAT . . . A G . . G . . . . . TC . . . . . . . . . . A . CAT . . . . . . C . T . . . . C . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . A TG . . T . . . . . . . . . . . . . A . CAA . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . TG . . A . . . . . . T . ATG CAT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T T . . . T . . . . . . . . . T . . . . A TAT A . AA . G T . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . T . . . . . . . . AA G . C . G . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . TG . . TGTCA . C . TAGA . . . . G . . A . . . . . . . . A . ACA . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C T . . ACC . . . . . . . . C . . . T . . . . TAT . . . A G . . A . . . . . TT . . . . . . . . . . A . CAT . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . T TG . . T . . . . . . . . . . . . . . . CCA . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . CG . . A . . . . . . T . AGG CAT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T T . . . T . . . . . . . . . T . . . . T ATA A . A . T A . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . T . . . . . . . . AG G . C . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . AT . . TCTA . A . AGTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . TAT . . . . . . . G . . . . . TC . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . C . . T . . TG . . A . . . . . . A . TG CAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . T . . . . . T . . A . C T . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . T . . . . . . . . AA C . A . A . . . . . . .
blockSeqs : . TAT . . . . . . . G . . . . . TC . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . CA . . . . . . . . . CT CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . A . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . T . . . . . . . . A A . A . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . T . . . . . . . . A . . A . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ***** CC**** TTACAGCCTACC************** CA A**** ATTNTAATTA******************************** A** C* ** *** ** C*** *** ** T** AAT*** ** TA***** T** T* TGG********* A**** C***** ** ATTTACATCACAA********* TCTCGTAAGTT******* ATA********* TG*** TGTCCA******* ATTGA********* ** ACA*** ** *** ** *** T**** CTCAAGAACTATAAATGTAC********************* AT**** CACC************** ** C* GTT TAT**************** A*** CAT********* **** C***** ** T***** TG** T* ** CACA***** T** CG** ** NTG** CAT*** ** T**** T* ** T***** TG TATA******** A***
originalCons : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTACTT-------------------A--AATT--------A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-C---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GACN--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGT--A--ATTTC----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTA-A--TTTACATAA---AT-A-TAACTGAT-AT-T-C-TCTCGT-AG--TT--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTT-A----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-T-CC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA-AT-TAGA-----TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATA-ACG-CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG-----A----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GACT------------AC-C--TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA-A--C--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA---N--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T--ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTGTGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AA-----AAC-TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-CT-G---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AG-T----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
finalCons : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGTCC----GGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATTACAGCCTACC--------------ATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-G-AAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAGTTATTNTAATTA--------------------------------GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-GAA--CTTA-TTAA-T-TT--CT---AC-AC--AATTA-TTATATCCAT-CC---AGG--TTTTTTTTC---CCCTG-GAT--TATTT-GAAATACG-TTAAT--AAACTTT----CACGCAAT---GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACTTA-----GACT--TATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAATTGG---------AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATTTAC-TC-A-G-T--CGTA----ATTC-----AAGGTAATTATATCG-TAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-TA--TTT-TTTT-TTAATTTACATCACAA---------AACTGAT-AT-TTCTCGTAAGTT-------ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----GTTATA---------GAGAAGAA--AATG---TAGG-CCT-ATTGTCCA-------TTGAT--GAGGGGNT-TATTGA---------TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CTATACA---CAGT--TA---ATTA-G-CAGC-ACAA-CTTG--C-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGGAGT----A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACACTCAAGAACTATAAATGTAC---------------------ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGTAT----TG--TA-GACTCACC--------------TGG--TAAAA--TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTTTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--ATTAT----------------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAAA---C--GAGGCAT---------A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAAC-----AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GGT-----ATA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GTGGGTTTG--ACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT---AACACA-----TTAAT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---TT--A-G-ACCG--CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANTG--TACAT---GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATGT----TT-CT-G---AT-C-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAACA--GT-AGT-----CTC-GAA-A--GT-AAATGTGTGTTATATA--------AAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGGA---AAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
Alignments
lowQualScore : 22222 11 11111 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333333333333333333333333 1111 1 22222 22222 7777777777777777777777777777777 11111111 111 111 1111 111 111 22 111 1111 111 1111111 1111 22222222222222 1111 222222222222 1111 1111 222222222 1111 1 1 1 1 222222222 44444444444444444444 2222 22222222 1111 2222222222 11111 22222 1 4444444444444444 1111111 333333333333333 1 1111 1 1 1 111 11111 1 8888888888888888888888888888888888888888 1 1 111 111111 555555555555555 111 11111 1 22222222222222 22222222222 111111 11111111 111 2222222222222222222222 111 111111111111 1111 111 11 11111 1111 11111 22222222222222222 22 1111111 1111 1 222 111 1 11 1 11 1 1 11 1111 111 1111 11111 1111 111 111 111 111111 111111 11 444444444444444444444444 11111 2222222 11 11 222222222222 11111 222222 2222222222 111111 1111111 1111 111111 1111111111111 1
lowQualScore : 0 8 00000 0 0 11 0 44444 999999 5 77 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 6 6 6 6 6 88888888888888888888888888 4444 6 6 33 6 3 6 00000 2 1 3 6 6 88888 6666666666666666666666666666666 33333333 777 66 5 77 5 5 5 777 5 77 6 1 7 6 8888 222 1 888 77 99 6 000 4444 999999 6 99 6 6 111 6 99 99999 2 7777777 1111 99 6 99 6 6 6 44444444444444 44 6 99 7 6666 99 555555555555 6 4444 6 6 0000 6 666666666 6 3 6 99 6 6 4444 7 6 3 3 99 6 3 6 6 3 111111111 2 66666666666666666666 6 7777 1 33333333 6 5 5 6 5 0000 5 9999999999 66 11111 5 5 33333 777 0 66 1 5 3333333333333333 5 6666666 5 5 444444444444444 5 88 0 44 66 5 0 5 5 0000 5 5 999999 0 777 66 0 66 5 888 5 5 0 5 66 999 77 000 5 77 77 88888 5 77 0 1 5 3333333333333333333333333333333333333333 1 5 5 5 2 5 5 777 77 666 77 1 3 111111 77 5 5 888888888888888 77 77 77 5 77 5 5 77 5 77 5 5 77 888 44444 1 00000000000000 55555555555 4 9999 4 9 3 66 222222 55555555 4 66 66 222 4 9999999999999999999999 8 8 4 66 4 4 777 4 4 4 222 66 777777777777 8 66 7777 4 222 00 55555 4 5555 4 11111 4 4 77777777777777777 4 4 4 11 66 9999 4 9999 9999 777 4 66 7777777 4 4 66 66 4 4 3333 5 5 5 66 0 0 222 5 000 5 5 66 5 5 5 11 5 0 5 11 0 5 5 0 5 66 11 5 3 0000 777 0000 5 4 4 4 4 4 777 11111 55 4 2222 0 666 4 8 4 666 4 777 000 4 4 4 8 4 4 44 4 4 99 0 4 4 4 222 5 88888 444444 99 4 4 777 4 4 3 7777 3 55 4 66 888888 4 00 4 66 4 777777777777777777777777 1 33333 4 4 777 66 4 4 5555555 4 7777 00 4 66 555 8 9999 4 4 66 4 44 0 888888888888 3 4 66666 4 44 555555 4 66 4 0000000000 777777 8 2 4444444 1111 000000 666 3 3 7777 3 3 3 55 3 7777 55 3 3 3 3 3 666 5555555555555 3 77 555 555 3 44 3 3 6 3 6666 2 3 6666 555 44 3 3 3 3 555 9 6
lowQualScore : . . ..... . . .. . ..... ...... . .. . ............................................................................ . . . . . . .......................... .... . . .. . . . ..... . . . . . ..... ............................... ........ ... .. . .. . . . ... . .. . . . . .... ... . ... .. .. . ... .... ...... . .. . . ... . .. ..... . ....... .... .. . .. . . . .............. .. . .. . .... .. ............ . .... . . .... . ......... . . . .. . . .... . . . . .. . . . . . ......... . .................... . .... . ........ . . . . . .... . .......... .. ..... . . ..... ... . .. . . ................ . ....... . . ............... . .. . .. .. . . . . .... . . ...... . ... .. . .. . ... . . . . .. ... .. ... . .. .. ..... . .. . . . ........................................ . . . . . . . ... .. ... .. . . ...... .. . . ............... .. .. .. . .. . . .. . .. . . .. ... ..... . .............. ........... . .... . . . .. ...... ........ . .. .. ... . ...................... . . . .. . . ... . . . ... .. ............ . .. .... . ... .. ..... . .... . ..... . . ................. . . . .. .. .... . .... .... ... . .. ....... . . .. .. . . .... . . . .. . . ... . ... . . .. . . . .. . . . .. . . . . . .. .. . . .... ... .... . . . . . . ... ..... .. . .... . ... . . . ... . ... ... . . . . . . .. . . .. . . . . ... . ..... ...... .. . . ... . . . .... . .. . .. ...... . .. . .. . ........................ . ..... . . ... .. . . ....... . .... .. . .. ... . .... . . .. . .. . ............ . . ..... . .. ...... . .. . .......... ...... . . ....... .... ...... ... . . .... . . . .. . .... .. . . . . . ... ............. . .. ... ... . .. . . . . .... . . .... ... .. . . . . ... . .
lowQualScore : 8 0 00000 8 8 00 6 33333 444444 7 99 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 7 7 7 7 7 33333333333333333333333333 2222 7 7 55 7 3 7 00000 5 7 2 7 7 22222 8888888888888888888888888888888 11111111 111 44 7 99 7 7 7 999 7 99 7 7 3 7 3333 333 7 333 00 88 7 888 2222 555555 7 22 7 7 777 7 22 33333 5 7777777 2222 22 7 22 7 7 7 77777777777777 77 7 22 2 8888 22 222222222222 7 2222 7 7 8888 7 777777777 7 2 7 22 7 7 2222 3 7 3 3 22 7 3 7 7 3 555555555 5 88888888888888888888 7 0000 0 88888888 7 0 4 5 0 6666 0 5555555555 99 88888 0 0 55555 111 0 99 0 0 5555555555555555 1 2222222 0 0 555555555555555 0 22 1 00 99 0 0 0 0 6666 0 0 000000 0 111 99 0 99 0 888 0 0 0 0 99 444 99 000 7 99 99 11111 7 99 7 4 7 9999999999999999999999999999999999999999 4 7 7 7 0 7 7 777 99 777 99 7 0 666666 99 7 7 000000000000000 99 99 99 7 99 7 7 99 7 44 7 7 99 111 33333 4 77777777777777 66666666666 4 4444 4 7 9 11 888888 33333333 4 11 11 222 4 6666666666666666666666 9 9 4 11 4 4 888 4 4 4 444 11 999999999999 9 11 2222 4 222 66 77777 4 1111 4 11111 4 4 88888888888888888 4 4 4 11 11 4444 4 4444 4444 888 4 11 1111111 4 4 11 11 4 4 9999 0 0 0 99 0 4 555 0 888 0 0 99 0 0 0 99 0 0 0 99 0 0 0 0 0 99 99 0 2 6666 666 6666 0 4 4 4 4 4 888 11111 55 0 5555 8 555 0 0 0 222 0 000 333 0 0 0 0 0 0 88 0 0 55 9 4 4 4 999 0 22222 000000 55 0 0 000 0 0 6 7777 6 55 0 11 333333 4 66 4 11 4 222222222222222222222222 9 11111 4 4 888 33 4 4 6666666 4 0000 66 4 11 333 9 4444 4 4 11 4 77 1 000000000000 6 4 66666 4 66 999999 4 11 4 4444444444 222222 9 2 4444444 4444 555555 444 6 6 7777 6 6 6 00 6 7777 00 6 6 6 6 6 444 9999999999999 6 22 444 444 1 22 1 1 7 3 2222 8 3 2222 888 22 1 1 1 1 444 2 2
consensus : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-GAAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAG-------------TTATTATA----------ATT----A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-G--AACTTA-TTAA-T-TT---CTA-CAC--AATTA-TTATATCCA-TC---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTGGATG-TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GAC--TTATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATT---------TAC-TCAG-TCGT--AA-TT-C----AAGGTAATTATATC-GTAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-T-A-TTT-TTTT--TTA-A--TTTACAT--ATAAA-----AC--T-GAT-ATT--T-CTCGTAGGT-T--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----G-TTA----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-TCC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA----TNGA-------TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CT-A-TA--C-A--C-AGTTA---ATTA-G-CAGC-AC-AACTT--GC-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGG--AG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG---TA----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GAC-TC-----------AC-C--TGG--TAAA--ATC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTNTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA--AC--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA--C--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GT-GGGTT-TG--ACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT----AACACATTA----AT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-C-TG---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAC-A--GT-A-G-T----CTC-GAA-A--G-TAAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
Reference ( family-3278 ) : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-GAAGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TAAATGCGCAG-------------TTATTNTA----------ATT----A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-G--AACTTA-TTAA-T-TT---CTA-CAC--AATTA-TTATATCCA-TC---CAGG--TTTTTTTTC---CCCTGGAT--TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--ACT-T--A--GAC--TTATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---T-CGAAAAA-CAA--TAATGGAT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GAT-ATT---------TAC-TCAG-TCGT--AA-TT-C----AAGGTAATTATATC-GTAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--A-TG-T-A-TTT-TTTT--TTA-A--TTTACAT-CACAAA-----AC--T-GAT-ATT--T-CTCGTAAGT-T--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----G-TTA----TA----GAGAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT-T-G-TCC--A-TTGAT--GAGGGGNT-TA----TTGA-------TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CT-A-TA--C-A--C-AGTTA---ATTA-G-CAGC-AC-AACTT--GC-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGG--AG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TC-AA-GA----ACTAT--AAA-TG---TA----C-ATGTG-AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GAC-TC-----------AC-C--TGG--TAAA--ATC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--TGTTTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AANTATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-A-TAAA--AC--GAGG-C----AT----A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA--C--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-A-GT-GGGTT-TG--ACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT----AACACATTA----AT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AN--ACAT-GTANT-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-C-TG---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAC-A--GT-A-G-T----CTC-GAA-A--G-TAAATGTGTGTTA---TA----T-AAAC-GC--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|1 : TACTAACTCAT-AATAATTTATTATATTATA--CTGTTTTAAAAA-----AGT------GGATTTGGTATC--A-ATATT
gi|1 : TTAC--GTC-TCCCGA-CGAC-AGGTAAT---ACGAG--G-CT--------CCATGAGG----TCGT-ACAAAAGCATATCGTCGACCGGAAGACA-TTT-----ACAATAAGCACCAG-GAAATTTTAAATGCGCAGTCACTTCACATCTTTATGATAGTAAAAGTTTATTATAAA---GGCCTACCTTAC---TTATCACTG-GGAGACTTAGTTAA-T-TTTTCTTACCACCAAAT---CTATATCCATTC---CAGG----TTTTCCCG--CCCTGGATGGTATTG-AAGATACG-ATAA---AAACTTT----CATGC-TAT--GC-AGT--AA-GTTGA-C---GT-AATCGGA-TT--ACTAT--G--GGCAACTATA--G-GCTG--T-GCA-TCAAAA--AGC---A---T-CG---AA-CAA--TTATGA---AA--TAAATT-----T------AG-AGCATGCAGATAT----CACACGACGCAT-TATCACG--A-GAT-ATT---------TAC-TCAG-TCGTTGAATTT-C----AAGGTA--TATATCGGTAA-AGA--GAGAGAGTGAA--A-TG-TAA-TTT-TTTTTATTA-A--TTTACAT-ATTATA-----AC--T-GAT-ATTTCT-CTCGT-AGT-TCAATCAC-AAAC-TT-TTA-TT----GTTTG----TA-----AGAAGAA--AA---G-TAGGTCCT-AGAT-GTTCC--A-TT-AT--GAGGGATT-TA------GA-------TAGGGGG-------GCGG-GGG--------------TGACAAA-GGCATAAGAAATTCTCTTCTGC-TT-T-A----T-ATAAGAAAAAACCA---CCA-ATAA-TG--C-A--CTAGTAC---ATTA-G-CAGC-ACAAACTTGAGC-A-CTC--TATATGG-GAAG-AA--TATAGGATAC---T-A-GCCCCC--ACCCACAT-ACA-CACACAAATC-AATGA----AC--T--AAA-TG---AA----C-ATGTGTAC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-G---A-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATAT-GC--------TG--TA--AC-T------------A--C--TGG--TAAAAGATCTC--GCC-AC-AG--TG-A--G-AT-G--T-TGTATA-----TATTGGTT--CG-A--TTAT----A--A------TAT-----------AA------T----TT-AATTATT----ACTTT------------------A----G---AAA-GC--A--TT---A--GA---------------TC-----T-ACGAATTTCGC-G--TTG-ATAGTC-GA---TTCT-A-TAAAAGAC--GAGGAC----AT----A-TT--AGGGA-AG-G---TGAAAGT--AAAG-C--AAGTT-ATTTTT---CAA-G-----T-GA-T-CT--C--------------T---TCTTCGTAGTCAAA--G----CAT-AC----C----GG---T--TGAA-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAATTT---T-TTTT-T-GT-GGGTT-TG--ACG-AT-A-TT-GA--TGA-GA-GACGTCAG-GTAGGG-GTGTATTACATT-AAT-GA-GATGA--AA--A--G-AGAAAT----AA-ACA-TA----AT-AAC--TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CA-TTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---TGT-A-G-A-C-G-CA-T-GCA-TT-TT-GAATGTACCA-ACGCCG-ATGGGG-AT--ACAT------------------TA--T-GA-CAACCA---T-C-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GGAAA-A--C-TTGCT------------------------TTTTATG---TGTT-CTTG---A--C-GAGT-A-------T-CTTCAGTT----ATATCA-T--AAACAA--GT-AGG-T----CTC-GAA-A--GTTAAATGTGTA-TA---TA----T-AAGC-A---A--TAATAGC-GTA-------TT-TT--AA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGA-TGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TATT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTAT-TTTT----A---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGG------AAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAC---GGGGCCGA-TTTTCG-CC-TTGGAG-CCCTACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcgttacgtctcccgacgacaggtaatacgaggctccatgaggtcgtacaaaagcatatcgtcgaccggaagacatttacaataagcaccaggaaattttaaatgcgcagtcacttcacatctttatgatagtaaaagtttattataaaggcctaccttacttatcactgggagacttagttaatttttcttaccaccaaatctatatccattccaggttttcccgccctggatggtattgaagatacgataaaaactttcatgctatgcagtaagttgacgtaatcggattactatgggcaactataggctgtgcatcaaaaagcatcgaacaattatgaaataaatttagagcatgcagatatcacacgacgcattatcacgagatatttactcagtcgttgaatttcaaggtatatatcggtaaagagagagagtgaaatgtaattttttttattaatttacatattataactgatatttctctcgtagttcaatcacaaacttttattgtttgtaagaagaaaagtaggtcctagatgttccattatgagggatttagataggggggcgggggtgacaaaggcataagaaattctcttctgctttatataagaaaaaaccaccaataatgcactagtacattagcagcacaaacttgagcactctatatgggaagaatataggatactagcccccacccacatacacacacaaatcaatgaactaaatgaacatgtgtacgcgagtgagattttgaatgaaagactgaaagtcaaacatatgctgtaactactggtaaaagatctcgccacagtgagatgttgtatatattggttcgattataatataatttaattattactttagaaagcattagatctacgaatttcgcgttgatagtcgattctataaaagacgaggacatattagggaaggtgaaagtaaagcaagttatttttcaagtgatctcttcttcgtagtcaaagcataccggttgaattttctgcttaaattgtgaacacttttgcttgatcaaatccaaagaaatttttttttgtgggtttgacgatattgatgagagacgtcaggtaggggtgtattacattaatgagatgaaaagagaaataaacataataactttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatggttgcatgtagacgcatgcattttgaatgtaccaacgccgatggggatacattatgacaaccatcggataattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacaggaaaacttgctttttatgtgttcttgacgagtatcttcagttatatcataaacaagtaggtctcgaaagttaaatgtgtatatataagcaataatagcgtattttaacgtttctgatcgtggatgctcccaactttatccttatttttcgtccagatttaatttccctggactacttggtattatttttagaaacagacatccatagcaaacattcaggaaataattcatttccgagacggggccgattttcgccttggagccctac
gi|10 : tactaactcataataatttattatattatactgttttaaaaaagtggatttggtatcaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgcg----A--AT-----TAT-----------AA-TTACTT----TT-AA-TATGCA---CTTTCTCATTTGTTTTCATAAAA----AGAAAAA-GC--A--TTT--A-CGAGATTTTTATATTACATCAACCAT-AA-AATTCAAC-G--TTGGATGAGG-TA---TT-T-A-TAAA--ACGAGAGG-CAATGAT----ATTT--AG----AA-AAGTTGAAAGTA-AAA--CTGAAGTTAATTTTTCTACAA-G-----CTGA-TCCC--CCTACAATTCTTTCGT-C-TTTTGGT-GTA-AA--G----CAT-ACCCTGC----GG---T-AC--ACAATCC-TTTC-TGCTTTAAAT--TGAAA-GAAC-AT----TTTT
gi|11 : TAAT-G-TA-C--T-GAA----GA-CA--CAGTCTGA-GGGTAATTTCTGGGGGCTGT-AACCAGG--G-CCTT-TGTCAACAAAAA-C--ACG--AATA--T-TTGTTTTTTTTGGTGCTTACGGTCTTTTTTTTTATGGGTT-TT-C-TGTAGA-TCCGAGT-AAAATC--T-CTCCAGTTTAA-ATATCATT--AAAC-AAAGT-A-G-TTCCCCTC-GAA-AACG-TAGA-ATGTGTTAG--TA----TTAAACCGC--AA-TAT-AGC-GTA--T----TT-CT--AAACGGTTTCTCT--TTCCTTCTTTG-A-C-------GTGGGATGCTCAGCGCCAA-TTTATC------CCCCT-TCAT-GTT----C-G-T-TCTCA-GGATAA--TT-CA-AT-T-T-C--T---GGAC---T-ATAATAAACTT-GGTGTTAT-TTTTTTAGA---GTA--AACAGA-C-tttttttttttttttaacatagcgcgtttgatcgaagcgatataccaagagaaaaaaaataaagaaaaattattttgtggggtttggaacagatgatttatttttgagtttagaagaacaatagtatatcaggtggattgtaatgatctaatagaagattgaaatagagaaattaaaa
gi|12 : atttatatATT-CTG----CTGTTAACCAGGCAGGCCTTCTG---ACAAAACACGAA-A--AA-A--T-TTGCT------------------------TTT-ATG---TGTC-C-TG---A--C-GAGTTA-------TGCTCCAGTT--A-ATATCATTTAAAAC-A--GT-A-G-T----CTCAGAATA--G-TAAA-ATGTGTTAGATTA----T--AAC-GC--AATTAA-AGCAGTAGTTACCTTT-CTCGAA-CG-------T--TTCG-----TG-ATCCCCGCCTACGAGGT-CGT----CCAACATCATCCTATCGC---T-TAAT-TTT----CAG-T-CC--ATG----ACGTT-TATATCT-T-CCCTGGGGGACGGTT-A-------CTTAGATATTA--TTTT---AAGTGG-C--AACAGAGCGATGC-AT-AGC-A--AGCAT-TCA-G---AAAAAA---T-AATTCATTTTC-C-GAAGATTGCGGGGCCGA-TGTTTGCCC-TTGGAGCCCCTACgaggaaacatt
gi|13 : tTTTAAAA------AGTC----CGGA-TTGGTATCCAA-ATATTc
gi|13 : CTTACCAGTCCTCT-GG-CAAC-AG-TAT----AC-AGGCC-TTAACTGTACCCATGAG------T-T-ACAAAAGCATATCGTCG-C--GAAGACA-TTT----TACAATCAACACC-G-GA-----TAAATGCGCAG-------------TTATT-------------ATT----AGGGGGCCTACCTTACA--TTAT--CTG-G--AACTTA-TTAT-T-TT---CTA-CAC--AA-TA-TCATATCCA-TCATGCAGG--TTTTTTTTC---CCCTGaagagaaaagagagaagagagagagagagagatcacttaccagtcctctggcaacagtatacaggccttaactgtacccatgagttacaaaagcatatcgtcgcgaagacattttacaatcaacaccggataaatgcgcagttattattagggggcctaccttacattatctggaacttattattttctacacaatatcatatccatcatgcaggttttttttcccctg
gi|14 : tttaaaaagtccggattggtatccaaatattaagagaaaagagagaagagagagagagagagatcaAATGTTC----TTAACTCTATC------C---T-TAATACGT----C-T-T-CC--A-A----A--TT-TT-GC-T-T-CCCC---GGGC---A-A-------TTT-AGTGTTAG-TTTT---AA---G-G--AATAAA-C-ATAC-AC-AGCAATCAGCAGATCAGG---GGGGGGGGGT-GATTCA-AGTA-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGACC-ATAGAACCCCTA
gi|15 : gtTGGAATGCTC----TTAACTCCATT------C---T-TAAA-TTT----C-T-T-CC--A-T----A--TT-TG-AC-T-T-CCCG---AGAC---A-A-------TTT-AGTGTTAT-TTTA---AA---G-A--AATAAA-C-ACCC-AC-GGCAT--A-CAT-TCA-----AAAAAA---T-GGTTCA-ATTT-T-G-AGAT---TGGACCGA-TCTTGATCC-TTAGAGCCCCgc
gi|16 : aatTAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCCCAT-AGCAA--TACAT-TCAGA---CAAAAA---T--GTTCA-TTTC-T----AAT----GGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGG-GCCCC
gi|17 : a--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-A-CA-T-GCA-TT-CT-G--T
gi|18 : TAT-ATTT---A----G-A--TATAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGA---CAAAAA---T-GGTTCA-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-GTTTCGTTC-TTGGGGCaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataataatcagcg
gi|19 : a-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-C--CGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-G-CA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-
gi|2 : ATACTAACTCAT-AATA-----TTATACTATA--CTTTTTTAAAAATTTCAAGTTAAGTCGGA-CTGGTATC--A-ATATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAC-AGTC-TCC-AG-CGAC-AG-TA-----AC-AG--C-CTA-------CCATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATCGTCG-CC-GAGGACA-TTTA---CACAATCAACACC-G-GAA----TGTATGCGCAG-------------TCACTCAA----------ATT----A---GGCCTACCT--------------G-G--AACTTA-TTAA-T-TT---CTA-CAC--AATTA-TTG-ATCCA-TC----AGG--TTTTTTTTTTTTCCTTAGATG-TATTT-GAAATGCG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGT--AG-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GT--AAT----A--GAT--ATATA--G-GCTG--T-G-A-TTTAAA--A----------------AA-CAA--TAATGGA--AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-AAT-ATT---------TAC-TC-----GT--AA-TTTC----AAGGTAATTATATC-GTAA-GTAC-GGGAGAGTGAA--A-TG-T-A-TTT-TTTT--TTA----TTTACAT-AATGAATTATAAC--T-GAT-ATTA-T-CTCGTTAGT-T--ATCAC-AAAC-TTCTCA-TT----G-TTA----------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AT---A-TCC--A-TTGAT--GAGGGATT-TACATGTAGA-------TAGGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAAAAGAA--TTTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAA-----TCA-CT-A-TAGAT-A--C-ATTTA----TTA-G-CAGC-AC-AACTT--AC---CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGG--AG---T-A-ACCCCC--ACCAACAT-ACA-CAACC---TC-AA-GA----ACTATTTAAA-TG---TA----C-ATGT--AC-GCG-AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AGGACT--GAACGT-CAAA--AATATCGCGT-AT---TG--TA-GAC-T------------ACGC--TGT--TAAA--ATC-C--GCC-AC-AG--TG-AT-G-AT-G--TGTATATAGACTCTATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TG-AA-TATGTA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----T---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TT-----T-AC-AATTTCGC-G--TTG-A--GAG-TA---TT-T-A-TAAA--AC--GAGG-C----AT----A-TT--AGTTCTAA-G---TGAAAGT--AAA--A--ACGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTTGT-GT--AA--G----CGT-AC----C----GG---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GTAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-AGAAAAAA---T-TGTT-T-GT-GGTTT-TGGGACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT----AAAAC-TTA----AT-AACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CATTTT---CGAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-T-A-G-ACT-GTCA-T-GCA-TT-CT-G--TGGACCA-ACGCCG-ATGGGG-AA--ACAT-GTATT-G-TA-CA-T-GCA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--AGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTTTG---T-TT-C-TG---A-TC-GAGT-A-------T-CTCCAGCT--A-ATATCATT--AAAC-A--GT-A-A-T----CTC-GAA-A--G-TAAATGTGTGTTA---TACCGGT-AAAC-GT--A--TAA-AGC-GTA--TA--TTT-CT--AA-CG-------T--TTC------TG-AAC-------GTGGAGGGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-A--T-T-CCCT---GGAC---T-T-------CTT-GGTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGAAA--AACAT-TCAAG---AAAAAA---T-AGTTCA-TTTC-C-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|20 : ATACTA-CTCAT-AATA-----T---ATTA-------------AAA-----AGTC-----GGA-TTGGTATC--A-ATA
gi|21 : tagataagggcacttttttttggaTACTAACTCAT-AATA-----TTATATTATAACTTTTTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATAT
gi|22 : T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAACCA---T-A-GGATAATT-ATG----CTGT-AACCACG--GGCCTT-T
gi|23 : GTTTC-TTTC-T-G-AGAT---GGGGCCGA-TTTTGGCCC-TTAGAGCCCCCAC
gi|24 : T----A---GGCCTACCTTACG--TTATC-CTG-G--AACTTA-TTAATT-TT---CTA-CAC--At
gi|3 : ATACTAACTCATCAATA-----TTATATTATA--CTTTTTTAAAAA-----AGT-----CGGA-TTGGTATC--ACATA
gi|3 : tagtaaggcactttttgctttggaCTTAC-AGTC-TCC-GG-CGAC-AG-TATT---AC-AG--G-TCA-------T-ATGAGG----TC-TTACAAAAGCATAT-ATCG-CCCGAAGATA-TTTA---AACT-TCAACACC-GCGAA----TAAATGTGCAG-------------TT--TATT----------ATT----A---GGCCTACCTTACAATTCATC-TGG-A--AACTTA-TTAT-TATT---CTA-CAC--AATTA-T-ATATCCC-TC---CAGGGTTTTTTTTTC---CCCTGAGA--TATTT-GAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-A-T--GC-AGTCTAA-GTTGA-C---GT-A--TGGT-GTTCACT-T--AAGGAC--T-ATA--G-GCTG--TTG-A-TTAAAA--GCC---A---T-CGAAAAA-CAAATTACTTGATGAA--TAGAAT-----TGAG---AGGAGC-TGCAGATAT----CACACGAC-CATATATCACG--A-GAT-ATT---------TACATCAG-TCGT--AA-TT-C----AAGGTAATTATATC-GTAA-GTACTGAGAGAGTGAA--A-TGGT-A-TTTCTTTT--TTATA--TTTACAT-CACAGA-----AC--T-TTT-ATT--A-ATTGTA----T--AT----------------------G-CT-----TA----GAGAAGAA--AA--TGCTAGG-CCT-AT-T-G-TCT--A-TTGAT--GAGGGGATGTAGA--TTGA-------T-GGGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCAACAGAA--TGTCCTC-GC-TT-T-A----T-A-AAGAAAAAAAAA---TCA-CG-AATA--CGA--C-AGTTA---ATTA-G-CAGCCAC-AACTT--GC-A-CTT--T-----G-GAAGAAA--TATAGG--AGC--T-A-ACCCCC--ACC-ACAT-AGA-CACA-----------------------------------------TGTG-ACAGC--AGTGA-GATTTTG-AAT-GCAAA-AAGACT--GAAAGT-CAAA--CATATCGCGT-ATATTTG--TA-GACATC--------------C--TGG--TAAA--ATC-C--GCC-AC--G--TG-AC-G-AT-G--T-TATATA-----TATTG-TTAGCG-ATTTTAT----ATAAC-----TAT-----------TA-TTACTT----T--AATTA-GCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GC--A--T----A-CAT---------------CC-----T-AC-CATTTCGCAG--TTG-ATAGAGATA---TT-T-A-TAAA--AC--GAGGAC----AT----A-TT--AG----AA-G----GAAAGTGTAAA--C--AAGCT-TGTTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT-----------------T-C-TCTTCGT-GT--AAAGG----CGT-AC----C----GGGTTTGAT--A-----TCTTTCATGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-AC----TTTTG-C-TTGAGTCAAAT--CCAA-AGAAAAAG---T--GTT-A-GT-GGGTT-TG--ACG-AT-ATTT-GA--TGAAGA-GACATCAG-GT--GGTGT-TATCA-ATTTAATTGA-TATGA--AAATA--GGAGAAAT----AACACATTA----AT-AACT-TTTTGTA-AAAT-AT-G---A-----G--TTG----CATTTT---CGAA-ATGA-T--AGTTGC-A---TCT-A-G-ACC-GGCAAT-GCA-TTTCT-G--TGAGCCA--CGTCG-ATGGGGCAT--ACAT-GTACT-GCTA-CAAT-GTACAT-GA-CAACCA---T-A-GG-TAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-GA-AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG-----TT-C-TG---A-TC-GAGT-A-------T-CTCC-GTT--A-ATATCATT---AAC-A--GTCA-GTT----CTC-GAA-A--G-TAAA--TGTGTTA---TA----T--AAC-GCA-A--TAA-AGC-GTA--CT--TCT-CT--AA-CG-------TTGTTC------TG-ATC-------GTGGAGTGCTC----CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-GTT-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---TAA-------CTT-GGTATTATCTTTT---AA---G-ATGAACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTTC-C-G-AGAT---GCGGCCGAGTTTTCGCCCATTG--GCCCCTattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccggcgacagtattacaggtcatatgaggtcttacaaaagcatatatcgcccgaagatatttaaacttcaacaccgcgaataaatgtgcagtttattattaggcctaccttacaattcatctggaaacttattattattctacacaattatatatccctccagggtttttttttcccctgagatatttgaaatacgttaataaactttcacgcatgcagtctaagttgacgtatggtgttcacttaaggactataggctgttgattaaaagccatcgaaaaacaaattacttgatgaatagaattgagaggagctgcagatatcacacgaccatatatcacgagatatttacatcagtcgtaattcaaggtaattatatcgtaagtactgagagagtgaaatggtatttcttttttatatttacatcacagaacttttattaattgtatatgcttagagaagaaaatgctaggcctattgtctattgatgaggggatgtagattgatgggggggggggtgcaaaggcaacagaatgtcctcgctttataaagaaaaaaaaatcacgaatacgacagttaattagcagccacaacttgcactttggaagaaatataggagctaacccccaccacatagacacatgtgacagcagtgagattttgaatgcaaaaagactgaaagtcaaacatatcgcgtatatttgtagacatcctggtaaaatccgccacgtgacgatgttatatatattgttagcgattttatataactattattactttaattagcaactttcattttcataaaagaaagcatacatcctaccatttcgcagttgatagagatatttataaaacgaggacatattagaaggaaagtgtaaacaagcttgttttcaagcgatccttctcttcgtgtaaaggcgtaccgggtttgatatctttcatgcttaaattgtgaacacttttgcttgagtcaaatccaaagaaaaagtgttagtgggtttgacgatatttgatgaagagacatcaggtggtgttatcaatttaattgatatgaaaataggagaaataacacattaataactttttgtaaaatatgagttgcattttcgaaatgatagttgcatctagaccggcaatgcatttctgtgagccacgtcgatggggcatacatgtactgctacaatgtacatgacaaccataggtaattctgctgtaaccaggggcctttgtacaaacagaaaatttgctttttatgttctgatcgagtatctccgttaatatcattaacagtcagttctcgaaagtaaatgtgttatataacgcaataaagcgtacttctctaacgttgttctgatcgtggagtgctcccaactttatccttaattttcgttccagatttaatttccctggactaacttggtattatcttttaagatgaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttccgagatgcggccgagttttcgcccattggcccct
gi|4 : tagtaaggcactttttgctttggaatactaactcatcaatattatattatacttttttaaaaaagtcggattggtatcacataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTTAAAAA-----AGTC----CGGA-TTGGTATC--A-ATATT
gi|4 : CTTAC-AGTC-TCC-GGGCGACCAG-TAT----AA-GG--C-CT--------CTATGAGG----TC-T-ACAAAAGCATATATTCG-CC-GAAGATA-TTTAATTCACAAC--AC-CC-G-GAAA---TAAATGTGCAG-------------TTTTATTA----------TTT----A---GGCCTACCTTACA--TTATC-CTG-G--AACTTA-TTTA-T-TTTT-CTA-CAC--AATTAATTATATCCA-TT---CAGG--GTTTTTTTC---CCCTGGAT--TATTTTGAAATACG-TTAA--TAAACTTT----CACGC-AAT--GC-AGT--AA-GTTGAAC---GT-A--TGGTTGT--A-T-T--A--GGA--CTATA--G-GCTG--T-G-A-TTAAAA--AGC---A---TTCGAAAAA-CAA--TACTT-AT-AA--TAGAAT-----TG-G---AG-AGCATGCAGATAT----CACACGAC-CAT-TATCACG--A-GATTATT---------TAC-TCAG-TCCG--AA-TT-C----AAGGTAATTATATC-GTAA-GTAC-GAGAGAGTGAA--AATG-T-A-ATT-TTTT--TT-----TTTA----------------------AT-ATT--TACT------------TCAC-AAAC-TTTTTA-TTAATTG-TTA----TATGTAGAGAAGAA--AA--AT-TAGG-CCT-AT-T----CT--A-TTGAT--GAGGGGAT-T-----TAGA-------T-GAGGG-------G-GG-GGG--------------TG-CAAA-GGCCAAGAAA--TTTCCT--GC-TT-T-A----TTA-AAGAAAAAAAAAATATCA-CT-A-TA--C-A--C-AGTTA---ATTA-G-CAGCCAC-AACTT--GCCA-CTC--T---TGG-GA-GAAA--TATAGG--AG---T-A-ACCCCC--ACCCACAT-AGA-CACA-----------------------------------------TGGG-AC-GCG-AGTGA-GATTT-G-AAT-GCAAACAAGACT--GAAG---CAAA--CTAATCGCGT-AT---TT--TA-GAC-T------------AC-C--TGG--TAA----TC-C--GCC-AC-AG--TG-AC-G-AT-G--T--TTATA-----TATTGGTTAGCG-ATTTTAT----A--ATAAC--TAT-----------TA-TTACTT----TT-AATTATGCA--AC-TTC------A--TTCATAAAA----G---AAA-GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-CATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-TA---TT-T-ATTAAA--AC--GAGG-C----AT----A-TT---G----AA-G---TGAAAGT--AAA--CA-AAGTT-G-TTTT---CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GTA-AA--G----CGT-AC----C----GG---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACT---TTTTG-C-TTGA-TCAAAT--CCAA-A-AAAAAA---T-TGTTAA-GT-GGGTT-TG--ACG-AT-ATTT-GA--TGA-GA-GACATCAG-GT---G-GTGTATCA-ATT-ATT-GA-TATGA--AAATA--G-AG-AAT----AACA-ATTA----ATAAACT-TTT-GTA-AAAT-AT-G---A-----G--T-G----CA-TTT---CGAA-AT-A-T--AGTTGC-A---T-T-A-G-ACC-G-CA-T-GCATTT-CT-G--T-GAGCA-ACGTCG-AT-GGG-AT--ACAT-GTA-T-G-TA-CA-T-GTA--T-GA-CAA-CA---T-A-GGATAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCC-T-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-A--T-TTGCT------------------------TTTTATG---T-TT-C-TG---ACTC-GAGT-A-------T-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAA-C--GT-A-GTT----CTC-GAA-A--G-TAAATGTGT-TTA---T--------AAC-GC--A--TAA-AAG-GTA---A--TTT-CT--AA-CGT------T--TTC------TGAATC-------GTGGAGTGCTCT---CCAACTTTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-TCCC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGACG--T-A--------TT-GGTATTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGC-A--AGCAT-TCAGG---AAAAAA---T-AATTCA-TTT--C-G-AGAT----GGGCCGATTTTTCGCCCTTTGGAGCCCCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacttacagtctccgggcgaccagtataaggcctctatgaggtctacaaaagcatatattcgccgaagatatttaattcacaacacccggaaataaatgtgcagttttattatttaggcctaccttacattatcctggaacttatttatttttctacacaattaattatatccattcagggtttttttcccctggattattttgaaatacgttaataaactttcacgcaatgcagtaagttgaacgtatggttgtattaggactataggctgtgattaaaaagcattcgaaaaacaatacttataatagaattggagagcatgcagatatcacacgaccattatcacgagattatttactcagtccgaattcaaggtaattatatcgtaagtacgagagagtgaaaatgtaatttttttttttaatatttacttcacaaactttttattaattgttatatgtagagaagaaaaattaggcctattctattgatgaggggatttagatgagggggggggtgcaaaggccaagaaatttcctgctttattaaagaaaaaaaaaatatcactatacacagttaattagcagccacaacttgccactcttgggagaaatataggagtaacccccacccacatagacacatgggacgcgagtgagatttgaatgcaaacaagactgaagcaaactaatcgcgtattttagactacctggtaatccgccacagtgacgatgtttatatattggttagcgattttataataactattattacttttaattatgcaacttcattcataaaagaaagcattacgatctaccatttcgcgttgatagagtatttattaaaacgaggcatattgaagtgaaagtaaacaaagttgttttcaagcgatcctctctcttcgtgtaaagcgtaccggtatattttctgcttaaattgtgaacactttttgcttgatcaaatccaaaaaaaaattgttaagtgggtttgacgatatttgatgagagacatcaggtggtgtatcaattattgatatgaaaatagagaataacaattaataaacttttgtaaaatatgagtgcatttcgaaatatagttgcattagaccgcatgcatttctgtgagcaacgtcgatgggatacatgtatgtacatgtatgacaacataggataattctgctgtaaccaggggccttgtacaaacagaaatttgctttttatgtttctgactcgagtatctccagttaatatcattaaaacgtagttctcgaaagtaaatgtgtttataacgcataaaaggtaatttctaacgttttctgaatcgtggagtgctctccaactttatccttaattttcgtcccagatttaatttccctggacgtattggtattatttttaagaaacagacatccatagcaagcattcaggaaaaaataattcatttcgagatgggccgatttttcgccctttggagcccct
gi|5 : tttaaaaaagtccggattggtatcaatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaTTAC-AGTC-TCC-CG-CGAC-AG-TACTCGTAC-AG--CGCTA-------C-ATGAAGGATCCC-T-ACAAAAGC-TATCTTCG-CC-GAAGACAATTTA---CA--ATCA---CC-G-GA---------------------------------TATC----------ATT----A---GGC-TAC-TTACAA-TTTTC-CTGCG--AATTTA-TTAA-T-TA---TTA-CAC--AATTA-TTA-ATC-A-TC----AGA--TTTTTTT------CCTGGATG-TATT--GAAATACG-GTAAATCAAACTTT----C-CGCCAAT--TCCAGT--AC-GTCGA-CTGAGT-A--TCGT--T--ACT-T--A--GAC--TCATA--GCGCAT--T-G-A-TGAAAATTAAT---AATTT-CTAGACA-AAA--TA-TGGGA-AA---AGAAT-----GG-G---AG-AGCATGC-------------------------TCA-------AT-ATT---------TAC-TCAGGTCGT--TA-TT-C----AAGGTAATTAT-TC-GTAAAGTACCGAGAGAGTGAA--A-TGCT-A-TTT-TGTT--G-A-A-----AAA---AAAAA-----ACAAT--AC-ATC--T-CTCGTAGGT-T--ATCACCAAACGTTTTAA-TT----G-TTA----C-----GAGAAGAACAAA--TG-TAGA-CCTCAC-TAG-TCCTCACTTGATATGGGGGATT-TA----GT-A-------TAGGGGGAGCTTGGG-GG-GGG--------------GG-CAAACGGCAAAGAGA--TTTCCTC-GC-TT-T-TGTGTT-A-AAGAAAAAGAAA---TCA-CT-A-TT--CTA--C-AGTCGCACATTA-GGCAGC-AC-ACATT--GC-A-CTCCCT---TGG-GAAGAAAAGTATAGG--AG---TTA-ACCC----AGCCACATTACA-CACAC---TC-CA-GACAACACTAG--AAA-TG---CATTAAC-ATGTG-AC-GCG-AGTAATGAATTTGTAAT-GCAAA---GACTATGAAA-T-CAA---C-TATTGCGTTAT---CGACTG-AAC-TC-----------GC-C--TGGGTTAAA--ATC-CCCGCC-GC-AGCATGCAC-GCATCG--TGTTCATA-----TAT-GAATAGCGTATTTTAT----A--ATACACTTAT-----------TACTTACTTGAGATT-ATTCATGCA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----A---AAAAGG--A--TT---AATGA---------------TCC----T-ACGAATTTCGC-GGTTTG-ATGGAG-TA---TT-T-A-TAAA---C--GAGG-C----ATCTACA-TTGTAG----AA-G---TGGAAAC--AGAAGT--AAGTT-ATATTT---CAA-AAAAGCC-GACTCCTGCC--------------T-C-TCTTCCA-GTTAAA--G----CGT-AC----CCTCGGG---T-AT--A-----TATTTC-TGC-TTAAATGATG--T-GAACCAC----TTTTG-CATTGA-TCGAACTCCCAACAGAAAAGAAATT-TGTT-A-GTTGGATTATG--ACGGAT-ATTTAGAC-TGA-GACGACATCAG--T--GG-TAGTATCA-ATT-AAT-GACGATGACAAAATACGA-AGAAATCTAGAA-ACATTA----AT-AACT-TTT-GTAGAAAT-AT-CTACA-----A--T-GG---CATTTAA--CGAACATCA-TTGGATCGC-AATTC-T-ACGCACCAG-CA-T-GCA-TT-CTTGC-TGAACCACACGCCA-CTGGGG-AAT-ACATTGTACT---TA-CAAT-GTA--T-GATCAACCA---T-A-GGATAATT-CTG----CTCT-A
gi|6 : C-TTCTCAGTT----G-TTA----------GAAAAGAA--AA--TG-TAGG-CCT-AG-T-G-TC---A-GTGAT--GAGGGAAT-TT----TAGA-------TAGGGGG-------G-GG-GGGG-------------TG-CAA--GGTAA--GAA--TTTCCTC-ACGTTGT-A----T-A-AAGAAAAAA------TCAGCT---TA--C-AGGC-ATTTA---ATTACG-CAGC-AC-AACTT--GC-AGCTC--T---TGGTGAAGAAA--TATGAG--AGGGAT-ATACCCCC--ACCCACAT-ACA-CACAC---TCGAA-GA----AATAT--AAAATGG--TA----CTATGTGGAC-GCG-AGTGC-GATTG-G-AAC-GCAAA---GACT--GAAAAT-CAAAGATATATGGCGT--T---TG--TATGAC-T------------AC-CAGTGT--TAAA--CTC-C--GCCCAC-AG--TG-ATTG-AT-GGTTGGTTA-A-----TATTGGTTAGCGGATTTTATT---A--AT-----TATGCGGTCATATTTA-TTACTT----TT-AAATATGCATAACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AAA-GCCAA--TT---A-TGA---------------TT-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATGAAG-TAATATT-T-A-TAAAT-AC--GAGG-C-----T----ACTT--AG----AAAG---TGAAA-T--AAA--C--AAGTT-TTTTTT---CAA-G-----C-CA-TCCT--C--------------T-C-TCTTCGT-GT--AA--GAACGTGT-AC----C----GG---T-AC--AG----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--TTGAAC-AC----TTTTG-C-TTGA-TCGAAT--CCAA-AGAGAAAAC--T-TGTT-T-GT-GGGTTGTA--ACG-ATGATTT-GAATTGA-GA-GACATCAG-GT--GG-GTGTAATA-ATT-AATAGA-GATGA--AAATAA-G-AGAA-T----AAC-CATTA----A--AACT-TTT--TA-AAATGAT-G---AACGAGG--T-GGGCCCATTCTTCTCGAA-AT-A-C--C-TTGCTA---T-G-T-G-ACT-G-CA-T-GCA-T--CT-G--TGGACGC-ACGCC--ATGGGG-ACTGACAT-GTAAT-G-TAACA-TCGTAA-T-GA--AAC-A---T-AAGGATAATG-CTG----CTGT-AACCAAG--GGCCTT--GT--ACAAA------A-G--AA-A--TATTGCTG-----------------------TTTTATG---T-TT-C-TG---A-TC-GAGT-A-------T-CCCCA-TT--ACATATCATT--A--C-A--GT---G-T----ATC-GAA-A--G-TAA---TGTGTTA---TA----T-AA-T-GCCAA--TAA-AGT-GTA--T----TT-CT--GA-CG-------TC-TTC------TG-AAC-------GTGGAGTGCTC-------ACTTTTTC------A---TCTAAT-TTT----C-G-T-CG--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAA---C-A-------CTT--GTGTTAT-TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-ATGAGCAG--ACCAT-TC-GG---AAAATA---TAAGTTCA-TTTCAC-G--GAT---GGGGCCGA-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|7 : AAT-TTCTCA-CT----T-TTA----TA----AAGAAAAA--AA--AT-CA----CT-AT---A-CAC--AGTTAAT--TAGCAGCA-CAAC--TTGAC------TAAAAGT-------G-GG-GGG---------------G-CAA--GGCAAA-GAA--TTTCCTC-AC-TT-TTA----T-T-AAGAAAAAAAAA---TCAACT-A-TA--C-A--C-AGTTA---ATTA-G-CAGC-AC-AACTT--GC-A-CTC--T---TGG-GAAGAAA--TATAGG--AG---TTA-ACCCCCCGACCCACATTACAACACA----TC-AA-GA-----CTAT--AAA-TGAATTA----T-ATGTG-AC-GCGCAGTGA-GATTT-G-AATTGCAAA-A-GACT--GAAAGTTCAAA--CATATCGCGT-AT---TG--TA-GAC-CCGGATTGTAGACACAC--TGG--TAAA--ATC-C--GCC-ACCAG--TG-AC-G-AT-G--TGT--ATA-----TATTGGTTAGC--ATTTTATTAATA--AT-----TAT-----------TA-TTACTT----TT-AAATAT-CA--ACTTTC------ATTTTCATAAAA----G---AA--GC--A--TT---A-CGA---------------TC-----T-AC-AATTTCGC-----CG-GAAGAG-TA---TT-TTA-TAAA--AC--GAG--C----ATT---A-TT--AG----AA-G---TGAAAGT--AAA--C--AAGTT-ATTTT----CAA-G-----C-GA-TCCT--C--------------TTC-TCTTCGT-GT--AA--G----CGTTAC----C----GG---G-AT--A-----T-TTTC--GC-T-ATAT--TG--T-GAAC-AC----TTT-G-C-CTGA-TCGAAT--CCAACAGAAAAAAAGATATGTT-AAGT-GGGTTGTG--ACG-AT-ATT--GA--TGA-GAAGACATCAGCGT--GGAGTGTATTA-ATT-AAT-GA-GATGA--AAATA--G-AGAAAT----AA-A-ATTA----AT-AACT-TTT-GTA-AAAT-ATTG---A-----G--T-G----CATTTTTT-CTAA-AT-A-T--GGTTGC-A---T-TTA-G-AC--G-CA-TTGC--TT-CT-G--TGAACCA-ACGCCGCATGGG--AT--ACAT-GTATTAG-TA-CA-TTGTA--TTGA-CAACCA---T-A-GGAGAATT-CTG----CTGT-AACCAGG--GGCCTT-TGT--ACAAA---C--A-G--AA-AATT-TTGCT------------------------TTT-ATG---T-TTTC-TG---A-TC-GAGT-ACATGTAAT-CTCCAGTT--A-ATATCATT--AAAC-A---T-A-G-T----CTC-GAA-A--G-TAAAT-TGTGTTA----A----T-AA-C-GC--A--TAA-AGC-------A--TTTACT--AA-CG-------T--TTC------TGGATC-------GTGGAGTGCTC----CAAA--TTATC------C---T-TAAT-TTT----C-G-T-CC--A-G----A--TT-TA-AT-T-T-CCCT---GGAC---T-A-------CTT-GGTATTA--TTTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCC-AT-AGCAA--A-CAT-TCAGGGAAAAAAAA---T-AATTCA--TTC-C-G-AGAT---GGGGCCGATTTTTCGCCC-TT-GAGCACCTA
gi|8 : --AT-----TATG----------TA-T-ACTT----TTTAAATAT-CA--ACTTTT------ATTTTCATAAAACCAGA---AAA-GC--AACTTCACA-CGA---------------TC-----TTAC-AATTTCGC-G--TTG-ATAGAG-T----TT-T-A-GAAA------GAGG-------T----A-TT--AT----AA-GC--TGAAAGT--AAA--C--AAGTT-ATTTT----CAACG-----C-GA-TCCT--C--------------T-CGTCTTCGT-GT--AA--G----C----T----C----GT---T-AT--A-----T-TTTC-TGC-TTAAAT--TG--T-GAAC-ACACACTTTTGGC-TTGA-GCGAAT--CCAA-AGAAA--------TGTT-A-GT-GGGTT-----GCG-A--ATTT-GA---GA-GA-GATATCAG-GTT-GG-GTGTATTA-ATT-AAT-AA-GATGA--AAATA--G-AG-AAT----AAC-CATTAACATAC-AACTATAT-G-A-AAAT-AT-G---A-----GATT-G----CATTTC---CGAA-AT-ATT--CATAAC-A---T-----G-ACC-A--A-T-GC--TT-CT-------AATT-ACGCAG-ATGGAT-AA--GTAT-GTAAG-G-TA--------A--T-GA--AACCA---T-C-GGATAA-T-CTG----CTGT-AACCAGG--GG----------A----------A-G--AA-A--A-TTGCT------------------------TTTT-TG---T-TT-C-TG---A-TC-GA-T-A-------T-CT-CAGTT--A-ATATCATTA-AAAC-A--GT-A-G-T----CTC-GAA-A--G-T-AATGTGTCTTA-----------AAAC-GCA-A--TAA-GG-------TA--TT---C--GA-CG-------T--TTC------TG-ATC-------GTGGAGTGC-C----CCAAC-TTATC------C---C-TAAA-TTCACAAC-G-T-CC--A-G----A--TTCTC-AC-TATACCC-----AAC---T-A-------CTT-GGTATTA---TTT---AA---G-A--AACAGA-C-ATCCAAT-AG-----AACAT-TCAGA---ACAAAA-------TTC--TTTC-CAG-AGAT---GGG--CGT-TTTTCGCCC-TTGGAGCCCCTAC
gi|9 : tttatatgatctgcATTT-GAAATATGATTAA--TAAACTTTACAATACGC-AATATGC-AGT--AAAGTTG--C---GTTA--TGGT-GT--ACT-TGAA--GAC--TTATATAG-GCTAGTT-G-ACTTAAAA--AGCCATA---T-CGAAAAAACAA--TAATGGAT-TACGTAGAATATTAATA-GGAGAG-AGTATGCAGATATACTACACACGAC-CAT-TATCACGTAATGAT-ATTACATCTATGTAC-C--G-TAGT--AT-TT-CCAGTAAGATA--TATATC-GTAATGCTC-AAGAGAGTGAACTA-TG-T-AATTTGTTTT--TTA-AAATTTACATATATAAT-----AC--TTGATTATTCCT-CTCGTAGGTCT--ATCAC-AAAC-TTTT-A-TT----G-CTACATGTA----GAGAAGAA--AAGATG-TAGG-CCT-AT-T-GGTCC--A-TTGAT--GAGGGGAT-TA----ATTAGGGGCCCCGGGGGG-------G-GGTGGGGTGGGGGGGGGGGTTG-CAAA-GGC-AAAGAA--TTT-CTC-ACTTT-T-A----T-A-AAG-AAAAAAAA---TCA-CT-A-TA--C-A--C-AGTTA---ATTA-G-CAGC-AC-AACTT--Gc