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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGTTGGC-AAAATGCCG-GC-A-TTTAT--CCA-TA--------T-TTTC-C---ATGTCG-C-TGGCA-AAT---A-CCG-GTAA--TTACC--------GGT--------AA-AT-T---CCAGT--------A--A-ATGC--CG----GCA-AAT---ACTG-GT-CAATTG--A----ATCAACC-ACA-C------TGGAAAT-TATATA-TTTA----A-C--T-G-TT---C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A------CACC--G-GT-CAA---T--A---------GATTTT---ATTCTT-A----AG---TTGAAG-TT-A-TTCATA-TTCA-TAC--T-G--AATTA-T---GAG-TTTTA----AG---G-T-TT--TTTTTTT----A-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-CACAA--ATTA--TTTTT--A-G-G-AT----T-TTTGT----AAT-TG----T-TGGCTG-T-----ACA----CTTCT--------A----AATAAAGTTT-TA-------A--GAGTCTTAGC-A-CTGAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GT-C-----AGGCA--T-GCTG--C-ATTG-GTC--TTTCAC-CTC-TT----GTCT-T-TGTC-AA--CAAC-AC-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG---TTTGG-ATT-T-CATGCT-GAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-G-GT-A-AT-TTGT------AGGC----C-T--------------------------G---------------T------------------------G-ATTAT---G-TCCAAA---A---G----CTT---A----------CT-GC----------TG-T-AA--TGTA-TTGGAGG---A-TTG--A--A-ACCA-TGCC----A---AGC-TCATG--C-CA-TA-------CTTGA-TA--CCA--C--TC-GTT--TTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TA---TTTT-----G--G--T-GG-AACAGAAAAT--AATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCAC----------------CCTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT------TGTT---G---TTTAA------A-CAATTT------A-T-ACC-ATA----TG-GTGTC---TTCTT---A-TAACTAGACC-AGGTGG-CACCA-TGCACAGGTAGATTTATA-CCAG--TGATGTATGTTTAACTTTACCC---ATATTATT--G-A------AT--T-----TT--G--------A--------ATTT-T-TT--T-T-A--TCTG-AATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT-AAA---------T----C--AA-G-A--TTC---------AA-C-T-G-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATG-T-T-AATATAA-TGAT-AA-AGAA---TTACTTTAGATTTACTTTGATTTCA-TA-TTTTTGAAT-TG-TTGAAGCTATAAATTTA-C------TTTA---A---A---A-GT---TGAC-CA-TATTTGCCGGT---A-T-TTG-CCAC-TG---AGT-CT------T-ATTTGCC-AG---T-----CCGGTAAATA--CC-G-TA-AATGCCA--GC----GGTAAATACC-AGGG-G--T-GGAATTTACCGTCCAACCCTG
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGGC-TAAATATTGAGC-A-TT-AT--CTA-CAAATAAATTC-TTTC-A---ATG-CG-T-TCGCG-AAT---A-TCTTGTAA--CTA----------GGT--------AA----T---GTAGTT-------A--A-ATGCACTG----GCA-AGT---ACTG-TT-GAATCA--A----ATTGATC-ACA-CATCTTCTGGAATT-CTCATC-TTTACTAAA-C--T-G-TT---CAGGTTTGGATTGTTTTTAGATA-AAT-AAAGGAATATCTGG-GC-CAAGGGT--ACAAAATCACGATTTTTATATTCTC-ATACTAA---TTGA-G-TT-AATTCCTAATTCA--ACAAT-GGAAATTA-TAGTGAGATTTTAGATTAGTATG-T-TT--TTTTTTTTCTTATACTATATACTTAC--ACTGTCAAATT-AAT-TTTAATGTTGAATTA-CAACA--CTTT--TTGTT--GTG-G-ATGTACT-TTTGTGGTTAATATG----TGTGGCTG-TTGTAAACA----CTTT--------------AGTAGAGTTT-AA-------AATGAGTCTTAGCAA-CTAAC---AA---ATGTATTTGGGT-A--GT-CAG---AGGGA--TCACTG--C-ATTGTTTC--TTTCACTCTCATTAGCGGTCA-T-TGTT-AACTCCAT-AC-TCGAAGGAAACTTCGGAA--TGGG-ATAGT-TTTGG-ATT-TAGGTGCT-GTATAAACTAA-TG-G-TGATTAATA-G-GTAA-AT-TAGTTAAGTGAGGCACAAT-G--------------------------G---------------T------------------------GAATTAT---G-TTCAAAGTTA---G-----TT---AGACCAGAGAGCT-GCT---------TG-C-AA--TGTA-TTGGAGGTGAA-TTGTTAACA-ACCACTACCGAAGA---AG--TAATA-----G-TA-------TCTG--TA--CCA--CATTCAGCTTATTG-CGTGGTGATTAGAG-CT-TCCTTACTTTTTT-----G--GGTT-GT-GACATAATAT--AATTTGCTAGAT---TTT---T--ATT-G---TTT-A-TCTACT-GT-TGTGTTGGAAGT--ATAACTTTG-TC-TCA----ACC--T----------------TTTG----AA----------TGAAGGCGATTTCTTTGAAACTAGGTAATGT--------TTTAA------ACCAATTT------A-T-A-A-ATA----TG-G-GTT---GCTTT---A-TAt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aggtgaTGCCG-GC-A-TTTAC--TGG-AA--------T-TTAC-C-------------GGTA-AAT---A-CCG-TTAT--TTGCCAGCGGCATGGA--------AA-ATAT---ATA-T--------A--A-ATGC--CG----GCA-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gggttggcaaaaTACCG-GC-A-TTTAC--CGG-TA--------T-TTTC-C---A-GTGG-CATGGAA-AAT---A-TGG-ATAA--ATGCT--------GGC--------Aaatactggtcaattgaatcacccacactggaatctatatatttaactgttctttggcaggttttaactacactggtcaatagattttattcttaagattgaggtttttcctatccatcctgattttttagttttaagtttttttttttttaactttacactttaatttaaatgtattacacaattattattttttaggctgttttgtaatcacttctaacttacaattttgagtcaaggcagctgcaattggtcttcacctctttgtctgttgtcacaacactgaagaaattccaattgggatgtttggatttcatgctgacaaactatgcgtgatattggtaatagtgtaggcttgattatgaccaaagtcttactgctgtaaatgtattggagaattgagcacaataccataagtcatgtatattacttgattacccccctctttttcctttcaacttccttattttttggtgtgaaacagaaaataatttgtgatattttatgcttttattctagtttatgtctgtcta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttggcaaaaTGCCG-GC-A-TTTAC--TGG-TA--------T-TTAC-C-------------GGTA-AAT---A-CCG-GTAT--TTGCC--------AGTGGCATGGAAA-AT-A---TGGAT--------A--A-ATGC--CG----GCA-aattccactaaatgccggcaaatactgttcaactgaattgaccaaagaggaatttatatattcaactgtttcttcagttagttttaactaatactggtcaatagattttattcttaagattgaaatgattcctatttatactgaattacgagttttaagccctttatttttacactttaatttatatctatattcagggtattttgtgattgttggctggacacttctctctatgtgcataaagtttataaagttttagagccttggcacttacaactgtttggcagtcaaagcatgttgcagtggtcattatctttgtcaataacactgaagaaattccaaatgggatgtttgggtttcatgattaataactatggtgatattagtaatatgcagatctgtagagtaaaaggagtacatgtagcagtgattatgaccaaaatttgtcttactgctgtaaatgtattggaggattgtaaccataccat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggttggcaaaaTGCCG-GC-A-TTTAC--TGG-AA--------T-TTAC-C-------------GGTA-AAT---A-CCG-GTAT--TTGCC--------AGTGGCATGGAAA-AT-A---TGGAT--------A--A-ATGT--CG----GCA-aatactgagaaaactcagt
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttggcaaatgcggcattatt-TA--------T-TTAC-C---A------C-TGGCA-TTT---A-CCG----A--GTACT--------GGC--------AG-AT---------------------A-A-GC--CGAGTGGCA-AATTATACTG-GT-CAATTG--A----Atcaattgaatcaacccacaatggaatttataattttaactgttctttggttagtactacactggtcaatagattttattcttaagattgaagttattcctatttatactgaattatgagttttaaagctttttttcacactttaatttaatttattacaacaattattttagtggtgttttgtaattgttggctggacactttaaataaagttttagagccttagcacttacaactgtttggcagtcaaggcatgttgcagtggtctttcactctttgtcaacaacaactgaagaaattccaaatggatgtttggaatttcatgctgaatatgtgtaggtcaataacagtgattatgaaccaaaatttgtccttactgctgtaaatgtatttggaaggttgaagc
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gggttggcaaaatgccggcatttT---A-CCG-GCAT--TTACC--------GGT--------AT-TT-T---CCAGTGGCATGGAA--A-ATAT--GG----ATA-AAT---GCTG-Gaatactggtcaattgaatcacccacactggaatctatatatttaactgttctttggcaggttttaactacactggtcaatagattttattcttaagattgaggtttttcctatccatcctgattttttagttttaagtttttttttttttaactttacactttaatttaaatgtattacacaattattattttttaggctgttttgtaatcacttctaacttacaattttgagtcaaggcagctgcaattggtcttcacctctttgtctgttgtcacaacactgaagaaattccaattgggatgtttggatttcatgctgacaaactatgcgtgatattggtaatagtgtaggcttgattatgaccaaagtcttactgctgtaaatgtattggagaattgagcacaataccataagtcatgtatattacttgattacccccctctttttcctttcaacttccttattttttggtgtgaaacagaaaataatttgtgatattttatgcttttattctagtttatgtctgtcta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttggcaaaatg-AT-T---CCACC--------A--A-ATGC--CG----GCA-AAT---ACTG-GT-CTATTG--AATCGATCGACC-ACA-G------TAAAATT-TATATA-Taattccactaaatgccggcaaatactgttcaactgaattgaccaaagaggaatttatatattcaactgtttcttcagttagttttaactaatactggtcaatagattttattcttaagattgaaatgattcctatttatactgaattacgagttttaagccctttatttttacactttaatttatatctatattcagggtattttgtgattgttggctggacacttctctctatgtgcataaagtttataaagttttagagccttggcacttacaactgtttggcagtcaaagcatgttgcagtggtcattatctttgtcaataacactgaagaaattccaaatgggatgtttgggtttcatgattaataactatggtgatattagtaatatgcagatctgtagagtaaaaggagtacatgtagcagtgattatgaccaaaatttgtcttactgctgtaaatgtattggaggattgtaaccataccat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C-ACT-C------TGGAATT-TATATA-TTTA----A-C--T-G-TT---C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A------CACT--G-GT-CAA---T--A---------GATTTT---ATTCTT-A----AGA--TTAAAG-TT-A-TTCCTA-TTCA-TAT--T-A--AATTA-T---GAG-TTTTA----AG---T-TGTT--TTTTTTT----A-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-CAC-G--ATTAT-TTTTT--A-G-G-GTG---T-TTTGT----AAT-TG----T-TGGCTG-C-----ACA----CTTCT--------A----GATAAAGTTT-T--------A--GAGTCTTAGC-A-CTTAC---AA---C
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGTTAGTTTT-----A-ACT-A------CACT--G-AT-CAA---TGTA---------GATTTT---ATTCTT-A----AGA--TTGAAG-TT-A-TTCCTA-TTTA-TAC--T-G--AATTA-T---GTG-TTTT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTTT-----A-GCT-A------CGCT--G-GT-CAA---T--A---------G--------------------GA---TTGAAG-TT-A-TTCCTA-CTTA-TAC--T-G--AATtacacttacaactgtttggcagtcaagaaattgtgcagaggtctttttctttgtcaacaacactgaaggaattccaaatggggatgttgggatttcatgcttaataactatggtgatattggtacatgtgtaggtctgtacgtacagtaagaagaatagcagtgattataatgaccaacatttgtcttactgctgtaaatgtattggaggattgaaaccataccatataccacatgccatacttgataccccagtctttttcctttcaacttcatattttttggggagaacagaaaattatttgtgatattttattgctttcatctctgtttttgttaatttaacctatgttgaattaattgacagtttcttggaacttgttgttttaccaatttattataataccatatgatcttgctaactagaccaagtgcatactaggaagaattataccagtgatgtatattttacctgtattattacattgtttacccggtacattttattttaatcctgattttgtatatgaggttaaaattaacaattcaacaatttcagctgttaatgtttcaaccattaggtttaatcctgtgaataatttgatttattaaacaattttaatgttaatacaatgataaagaatttcacattttgaattgttgaagctatgaatttacttgaaagctcaatttg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatttaaaacgtcaagtgcctgtggT-A------TACT--G-GT-CAA---T--A---------AATTTT---CTTCTT-A----AGA--TTGAAG-TT-A-TTCCTA--TCATTAC--T-G--AATTA-T---GAG-TTTGA----AG---C-C-TT--TTTTT----------T------TTAC--ACT------TTAAAT-TTACAT-TT--ATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTT----A-ACT--------AC--ACTGA----TC-AAT-GTAGAT-TT----------------TA--TTCTT--A-A-G-AT----T----GA----AGT-TA----T-TC-CTA-T-----TTA-----TACT--------G----AATTATGT-----------------GTTTTTAC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GT-C-----AAGAAATT-G-TG--C-AGAG-GTC--TTTT--------------TCT-T-TGTC-AA--CAAC-AC-T-GAAGGAA--TTCCAAA--TGGGGATG---TTGGG-ATT-T-CATGCT-TAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-G-GT-ACAT-GTGT------AGGT----C-T--------------------------G---------------TACGTACAGTAAGAAGAATAGCAGTG-ATTATAATG-ACCAAC---ATTTGT---CTT---A----------CT-GC----------TG-T-AAA-TGTA-TTGGAGG---A-TTG--A--A-ACCA-TACC----ATATACC-ACATG--C-CA-TA-------CTTGA-TA--CCC--CAGTC-TTT--TTC-C-------TTTCAA-CT-TCA-TA---TTTTTTG--G--G--G-AG-AACAGAAAAT--TATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--TTG--TTAA-TT-T-A----ACCTAT----------------GTTGAATTAA----------TT--GACAGTTTC-TTGGAACT------TGTT---G---TTTTA------C-CAATTTATTATAA-T-ACC-ATA----TG-A--------TCTT---GCTAACTAGACC-AAGTG-----CA-TAC-TAGGAAGAATTATA-CCAG--TGATGTAT-----ATTTTACCT---GTATTATT--A-C------AT--TG----TT--T--------ACCCGGTACATTT-TATT--T-T-AATCCTG--ATT---TTG-TATA-TGAG-G-TT-AAAATTAACAATT----C--AA-C-AATTTC---------AG-C-T-G-TT---A-AT-GT-T-TCAACCATTAGG----TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-TTTATTAA-A-C-----AA-TT-TTAATG-T-T-AATACAA-TGAT-AA-AGAA-----------------------TTTCA-CA--TTTTGAAT-TG-TTGAAGCTATGAATTTA-C-------TTG---A---A---A-GC---T----CA--ATTTGtaatatctgttgacagaaggatctgattggacactttttttat
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAA-G-TC-AAA---------T------------A--TTC---------AA-C-T-G-TTAAA---T-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATG-T-T-AATACAA-TGAT-AA-AGAA---TTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGAAT-TG-TTG-AGCTATAAATTTc
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gttgcaaaaatgccggccatttatccatattcgcaG-TTGAATATATAAATTCCTC------TTTGGTCA---ATTCA-GT---TGAA-CAGTATTTGCCGGC---A-T-TTtgttgttctttggttagtttacattacacctggtcaatagatttattcttaaattgaagtttatcctattcatactgaatttgagtttaagttgtttttttttaactttacactttaatttaaatttattaccacaattattttttagtgtgtttttttaattgttggctgttacactttctaataaagtttttagagtcttacgacttacactgtttgggcaagatcaggcagctcattggtcctttccacactgttgtctttgtcacaacactgaagaaattccaaatggactgtttggatttcagctgaatacttatggtatattgggtaatgtggtaggcctggattatgtccaaaagtcttagactgctgtaaatgtatggagggattgaataccatacatagctcatgtcatacttgattccccctccttcttcctttcaacttcctatttttgggttggaacagaaaatagaatttgtataatttattgcttttcatctctgtttaatgtctgtctaacccacctgaattgacagtttcttgaaacttgttgttttttaagcatttatacatatggcttcttaagataactaaccaggtggcaccactgcacaggtagatttatccagtgattattttaactttacccatattattaagacttgtttaaatttctttttatcttaattttgtataggaggttaatcataattcaactgttaaaatgttctcagccttaggatttaattcctgtcgaataattttgatttaactcaattttaatgttgaatataagtgataatagaattactttagatttatttgatttcatattttgaattgttgaagctataaat
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gggttggcaaaatgccggcatttatatatattttcca---TGAC-CAGTATTTGCCG-------------CTAC-TG---GA------------ATTTACC----------------TAAATA--CC-G-TA-TTTGCCA--GCGCATGGAAAATATC-Agaatcacccacactggaatctatatatttaactgttctttggcaggttttaactacactggtcaatagattttattcttaagattgaggtttttcctatccatcctgattttttagttttaagtttttttttttttaactttacactttaatttaaatgtattacacaattattattttttaggctgttttgtaatcacttctaacttacaattttgagtcaaggcagctgcaattggtcttcacctctttgtctgttgtcacaacactgaagaaattccaattgggatgtttggatttcatgctgacaaactatgcgtgatattggtaatagtgtaggcttgattatgaccaaagtcttactgctgtaaatgtattggagaattgagcacaataccataagtcatgtatattacttgattacccccctctttttcctttcaacttccttattttttggtgtgaaacagaaaataatttgtgatattttatgcttttattctagtttatgtctgtcta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tggccaaaatcggatttaa---TGACTCA-GATTTGCTGGC---A-T-TT----AC-GG---A-------------ATTTACC---------------GTAAATA--CCGG-TA-TTTGCCA--GC----ttgaataacacactgaattttatatttagacgttttgttagttttcacttacactgtcagtagattttattcttaagattgaagttatgtattatactgaattaatgaattttaaggtttttttttttaactttaaactgtatttaaattcttccaagttatttttttgggtgtgtttgtattggttgactgtacaattctaaataaagttttaggtctacacttatacaaactttttgcagtaagatgctgatggtctttcccttttgtcttgtcacaacactgaaggaaattcaaatgggatgtttgaattgtcataatgataactt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gttggcaaatgcccgcatttatccatattttccatgccgGAC-CAGTATTTGCCGGC---A-T-TTG-gttgaataaaccacttctggaattctatataatttaacttgttctttggttagttttaactacactggtcaattagattttattcttaaagattaatttattcctattcatactgaatatgagtt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attccacC-CA-TATTTTCCA----------TG-CCAC-TG---------------------GAA-AA---TA----CCGGTAAATG--CCGG-TA-AATTCCA---C------TAAATGCC----G-G--C-AAA---TACTGTTCAACtattgaatcgatcgaccacagtaaaatttatatat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggcaaaatgccagcatttatC-CA-TATTTTCCA----------TG-CCAC-TGGCAAATACCGG----T-ATTTA--------------CCGGTAAATA--CCAG-TA-AATGC-----C----GGCAAATACtgaattgaccaaagaggaatttatatattcaactgtttcttcagttagttttaactaatactggtcaatagattttattcttaagattgaaatgattcctatttatactgaattacgagttttaagccctttatttttacactttaatttatatctatattcagggtattttgtgattgttggctggacacttctctctatgtgcataaagtttataaagttttagagccttggcacttacaactgtttggcagtcaaagcatgttgcagtggtcattatctttgtcaataacactgaagaaattccaaatgggatgtttgggtttcatgattaataactatggtgatattagtaatatgcagatctgtagagtaaaaggagtacatgtagcagtgattatgaccaaaatttgtcttactgctgtaaatgtattggaggattgtaaccataccat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggttggcaaaatgccggcatttatC-CA-TATTTTCCA----------TG-CCAC-TGGCAAATACCGG----T-ATTTA--------------CCGGTAAATT--CCAG-TA-AATGC-----C----GGCAAATACtgagaaaactcagt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agggttggcaaaatgccgacatttat-TATTTGCCGGC---A-T-TT----AC-TG---G-----------T-ATTTA--------------CCGGTAAATA--CCGG-TA-TTTGCCA--GT----GGCAtttttcatggcccttggcctcataacaatagcagattctgaatttatagtt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggttggcaaaatgccggcatttatccatattttcca-TATTTGCCGGC---A-T-TT----AC-TG---GA------------ATTTA--------------CCGGTAAATA--CCGG-TA-TTTGCCA--GT----GGCActgagaaaactcagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agggttggcaaaatgccgacatttatccatattttccaTGCCAGC---A-T-TTATCCAT-------AT-TT------T-CCATGCC-A----------CTGGAAAATA--CCGG-TA-AATGC-----C----GGTAAATTCC-Actttttcatggcccttggcctcataacaatagcagattctgaatttatagtt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttggcaaaaCCGGT---A-T-TTA-CCAC-TG---G-----------C-ATTTACCGAG---TA----CTGGCAGATAAGCC-G----------A--GT----GGCAAATctaaatgccggcaaatactgttcaactgaattgaccaaagaggaatttatatattcaactgtttcttcagttagttttaactaatactggtcaatagattttattcttaagattgaaatgattcctatttatactgaattacgagttttaagccctttatttttacactttaatttatatctatattcagggtattttgtgattgttggctggacacttctctctatgtgcataaagtttataaagttttagagccttggcacttacaactgtttggcagtcaaagcatgttgcagtggtcattatctttgtcaataacactgaagaaattccaaatgggatgtttgggtttcatgattaataactatggtgatattagtaatatgcagatctgtagagtaaaaggagtacatgtagcagtgattatgaccaaaatttgtcttactgctgtaaatgtattggaggattgtaaccataccat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cttggcaaaatgccggcattttatcatttttcccctgccactggcaaatctgggtaattttaccgtaaatacagtacgaatgccggcagaatactggtgccattgaatcgaccacaccggaatttgttatttaaccttgtttcttcgggttgttttatctatgctggtccaatggatttattcccaagattgcagcttattcctatttatactgcattatgagttttaagccttgattttcttttacaaactttaatttatttacagacaattatttggagggtgttttgtacatgtaatttggtggaccttctcttctatgtgcacaatgtttggagcccttgcattaaatgttggcaagtcaaggaatgttgattagtggtctttgtcttatgttgataagacatgaagaaattcaaaatgggatgtgttttggatttcatgctggaataactagtggttgatattggtaatgtggtaggttcggtaaatagcagtgattgattatgacaaaaattggtctttacacttgtaaagtgtattgagggttaaatcatatccataacctcatgtcccatacttgattacccctctctttttcactttcattctcctattttaactgggtagaaacagtaaattattgtgatatttttaattgctttcattccctgttttcatatctgtcttaacccccttgaattgacagattcttgaacttgttgttttaacaatgtataaccaatatgggtcctattcttaactagaccaaagtgtcatctacaggtggtgtatgttattgttttatcattcgtatataaattgtttattatattttttagttaatctgtaattttgtgatgaggtaaaattgaaagaatcaactgtttaaatatgttccaacctaggaattactgcgtcttatggcttgtaattcctgtgaaagtaagttttgatttattcaagtcttaatgtgtaataaaatgataaagaatatttaagatttgccccaatttcaccacttcttgaatgtgttgagctataaatttacttaaaagttcaattgaccagtataAC-TG---AGT-TTTCTCAGT-ATTTGCC-GG---CATTTACTGGTATTTA--CCGG-TA-AATAC-----C----GGTATTTGCC-AGTG-GCAT-GGAAgggtgtaatttaccgcccaaccct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggttggcaaaatgccggcatttatccatatt-----CCGGTAAATT--CCAG-TA-AATGC-----C----GGCAAATAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gggttggcaaaatgccggcatttatatatattttccatgccgctggcaaataacggtatttaCGGTAAATT--CC-G-TA-AATGCCA--GC-------AAATtggtcaattgaatcacccacactggaatctatatatttaactgttctttggcaggttttaactacactggtcaatagattttattcttaagattgaggtttttcctatccatcctgattttttagttttaagtttttttttttttaactttacactttaatttaaatgtattacacaattattattttttaggctgttttgtaatcacttctaacttacaattttgagtcaaggcagctgcaattggtcttcacctctttgtctgttgtcacaacactgaagaaattccaattgggatgtttggatttcatgctgacaaactatgcgtgatattggtaatagtgtaggcttgattatgaccaaagtcttactgctgtaaatgtattggagaattgagcacaataccataagtcatgtatattacttgattacccccctctttttcctttcaacttccttattttttggtgtgaaacagaaaataatttgtgatattttatgcttttattctagtttatgtctgtcta
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): ATATCTAAAACGTCAAGTGCCTGTGGGTTTT






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gi|12                         :             gcgTGGCCAAAAT--CG-G--ATTT-AA--TGA-TA--------TTTTC-C-ATGC-G-CTGGCA-AATA-C-G-GTA--TTTA--GGTAA-ATTCCAGT-A--G-------CG-GCA-AATACTG-GT-CA-TTG--A----AT--AAC-ACA-C------TG-AATT-T-TATA-TTTA----G-A---C-GTT-T---T---GTTAGTTTT-----C-ACTTA-CA-------CTG---TC-AG---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTGAAG-TTA-T--GTA-TT-A-TAC--T-G--AATTAAT---GAA-TTTTAAG-------G--TT-TT--TTTTT---TTA-ACT------TTAA--ACT------GT--AT-TTAAAT-TC---TTC-C-A-A---G-TTATTTTTTT-G-GGTG---TGTTTG----TATT-GG----T-TGACTG-----TACA----ATTCT--------A----AATAAAGTTT-TA-----------GGTCT--AC-A-CTTATACAAA---CT-T-TT--TGC-A--GT-----A-AG--A-T-GCTG----A-TG-GTCTTT----CCC--TT--TT----GTC--T-TGTC--A--CAAC-AC-T-GAAGGAA--ATTCAAA--TGGG-ATG---TTTGA-ATTGT-CATAAT-G-AT-AACT-
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A--TTT---T--ATT-GC-TTTC-G-TCC-CT-GT-T----------T--ATA--ACAG-TC-T-A----ACCCATG----------------TTG----GA----------TT--GACAGGGTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTTA------A--C-AATTT------AC-ACC-ATA----TG---GTC---TT-TT------TAACTAGACC-AAG----------TGCATAGGTAGAATTATACC-AG--TGATGTA------T-A-TTTTACC---T-GTATT--ATTAC-AT---TG-TTT--ATTTTAT--A----TTG-T-TT--T-TAA-TCT-TAATTGTATTGATATACAGAG-GTTT-AAA---------TATGAT--AT-G-A--TTTGCAGAGCGGAG-TT-A-TTAAAATATGGTAT-TCAACC--TAGG----TT------------------TAA-TGTCGT-GAAA--TAA--TTTGATT---TTAA-T-TTCTAAAG-TTATTAATC-T-T-AATGCAA-TGAT-AA-AAAA---ATATTTAAAATTTACCTAGATTTCA-CA--TTTTGA-AC-TG-TTTAAGATATAAATTTAt
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C----A-AGGCAAT-GTTG--CAG-TG-GTCTTT----CAC--C----------TCT-T-TGTCAAA--CAAC-AC-T-GAAG-AA--TTCCAAAATTGGG-ATG---TTTGA-TTT-T-CATGC-----T-AATT-A-T--G-TGTT--A---G-GTCA-AT-AA-------------CA------------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT---G-ACCAAAATTGTTTT-CTT---A----------CT-GCG---------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------GTTTGA-A-GCCATTA-CC--ATA-G-CTTCAT---GT--CA-TACT---TGACCA--CC-C--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTA--GAA-G-TC-AAA---------T------------A--TTC---------AA-CT-G-TTAAA---T-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATG-T-T-AATACAA-TGAT-AA-AGAA---TTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TG-TTG-AGCTATAAATTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attttacattgacaaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggGA-A-ACCA-TA-CC--ATA-G-C-TCA---------A-GAC------A-TA--CC-C--C-------ATTTTTC-C-------TTTCAA-CC-TTC-TA---TTTTTG---G--G--T-AG-AACAGGAAAT--C-ATTTAT--GACA--TTT---T--ATT-GT-TTTC-A-TTC-CT-GT-C----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCATC----------------TTG----AA----------TA--AATAGTTCC-AGGAAACT---TGTTATAA--TTTTT------A--C-AATTT------AT-A
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAT---A-TCCTAACT--TCGT-CCT---A----------TT-GT----------CATAAA-TGTA-TTCAAGG------G-TAGA-A-ACCT-TA-TC--ATA-G-C-TCAA---GT--CA-TACT---TT--TA--TC-T--G--T----CATTTTT-C-------TTTCAG-TT-TTG-TAGT-TTTT-----G--G--T-AG-AGCAGGAAAT--C-ATT------A-A--TT--------TT-GT-TTTC-A-tgtcctct
gi|2                          :   ttgagggtgtgtaTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-ATAGCCAATA--------TTT-C-C-ATGCCA-GTGGCC-AATAACCG-G-A--TTTACCGCTAA---TTCAGT-A--A-AT-C--CGTGCA-AA-ACTG-GT-CAATTGGAA----AT-AACC-ACA-A------TGGAATT-TATATA-TTGA----AAC---TCGTT-C---TT--GTTA-TGTT-----ATAC----CA-------CTGCG-TC-AA---TA---------GATTTA---TTTCTT-A-A--GAAATTGAAG-TTA-TTC-TA-TT-A-TAC--TTG--AATT-AT---GAG-TTT--------------AC-TT--TTTTT---CCA-CCT------TT--------------T-AATATTAA---TT--ATAA-C-ATA------TATTTTT-A-G-GGTG---TGTTTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----GACC----AATCT--------A----AATTAAGTTT-TA-------A--G--CCTTAGC-ATCTTAC---AGAGTCTGT-TTTTGGCCA--GTT----C-AGGCA-T-GTTG--CAG-TG--TCTT-----CAC-------------TCT-T-T-TC-AA--CAAC-ACAT-GAATAAA--TTCCAAA--TGG--ATG---TTTGG-AT----CATGCT-GAA--------------------ATT-GTGT-A-GT-CAAT------AA----A------------------------G---------------T--------------------------G----AT-AT---G-ACAAATAT--TTGT-CTT---A----------CTCGC----------TGTAAA-TGTA-TTGGGGG------T-TTGA-A-GCCA-TA-CC--ATATG-C--CATAAAGT--CA--ACT---TGA-CC--CC-C--T--T----TTTTTTC-C-------TTTCAA-CTCTCC-TA---TTTG-----G--GG-T-G---AC-GAAAAT--CGATTTGTT-GATAGATTTATAT--ATT-AG-TTT--A-TCT-TT-GT-T----------T--ATG---CTGATC-T-ATGGAACCCACC----------------CTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTTA------A--CCAATTT------ATTACC-ATA----CATATGTC---TTTCTT---T-TAACTTGATC-AGGTGGCCACCA-TGCACAG-TAGAATTATACCCAGCATGATG-ATGT--TT------TATC---CTGTATTTTATTAA-TT---TGTTTA--A--------AAAAATTT-T-GT--T-T-A-TCT-TAATT---TTG-TGTA-TGAGCG-TT-AAAG--------T----C--AA-A-AA-TTC---------AA-CTTG-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-AATTT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGTT-T-AATACAATTGATAAA-AGAAAATTTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTTTGAAGCTATAAA--TACTTTTAA---AACG-----TTCATGACC-AGTATTTACCGGTATTTGCCACT-TGAGTCTT-ATTTGCCAGTCC-GTAAATA-CGGTAAATGTCCGCGGTAATTACC-AGGG-GTT-GGAA-TTA-CGCCCAACCCTGa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                            T-A-TA-------CTG-G-TC-AA---TA---------AATTTT---CTTCTT-A-A--GA--TTGAAG-TTA-TTCCTA--TCATTAC--T-G--AATT-AT---GAG-TTTGAA--------G--CC-TT--TTTTT---------T------TTAC--ACT------TTAAAT-TTACAT-TT--ATT
gi|21                         :             GGTTGGC-AAAATGCCG-AC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTtaatatctgttgacagaaggatctgattggacactttttttat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ag--ACT------TT-AAT-TTATAT-TT--ATTA-C-ACA---A-TTATTTTTGA-A-GGTG---C-TTTG----TGAT-TG----T-TGGCTG-----AACA----CTTCTCCCTATGTG----CATAAAGTTT-AA-------A--GAGCCTTAGC-A-CTTAA---AA---CTGT-TA--GGT-A--GTC----A-AGGCA-T-GTTG--ttttcatggcccttggcctcataacaatagcagattctgaatttatagtt
gi|23                         :             GGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAA-ATACCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-T-GTTG--CAG-TA-GTCTTT----CAC-------------TCT-T-TGTT-AA--CAAC-AC-T-GAAGAAA--agaaaactcagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T--GGC-A--GTCGATCA-ATGCA-T-GTTG--CAG-T-----TTT----C-----T--TT----ATCT-T-TGTC-AA--CAAC-AC-T-AAAG----------------GA-ATG---TTTGG-ATT-T-CATTCT-TAAagtaggaaaggatttgttgtttttgtgggtagtttgtgtc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                              GTTTT-----A-GCT-A-CG-------CTG-G-TC-AA---TA---------G--------------------GA--TTGAAG-TTA-TTCCTA-CTTA-TAC--T-G--AAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatttaaaacgtcaagtgcctgtggTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----GACA----TTTCT--------A----AATAAAATTT-TA-------A---AGCCTTAGC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--G
gi|28                         :                                                                                                        -ATTCCACC-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CTATTG--AATCGATCGACC-ACA-G------TAAAATT-TATATA-T
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AATGCCAGCGGTAAATACCCAGGG-G-TTGGAATTTACCGCCCAACCCT
gi|3                          : ccgtaagattagGGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGTCG-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--ATTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCAACC-ACA-C------TGGAAAT-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CCG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--G---TTGAAG-TTA-TTCATA-TTCA-TAC--T-G--AATT-AT---GAG-TTTTAA--------G--GT-TT--TTTTT---TTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-C-ACA---AATTATTTTT-A-G-GAT----T-TTTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----TACA----CTTCT--------A----AATAAAGTTT-TA-------A--GAGTCTTAGC-A-CTGAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A--GGCA-T-GCTG--CAT-TG-GTCTTT----CAC--CTC-TT----GTCT-T-TGTC-AA--CAAC-AC-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG---TTTGG-ATT-T-CATGCT-GAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-G-GT-A-AT-TTGT------AGGC-CT------------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT---G-TCCAAAA-----G--CTT---A----------CT-GC----------TGTAA--TGTA-TTGGAGG------A-TTGA-A-ACCA-TG-CC--A-A-G-C-TCAT---GC--CA-TACT---TGA-TA--CC-A--C--T----CGTTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TA---TTTT-----G--G--T-GG-AACAGAAAAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCACC----------------CTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTAA------A--C-AATTT------AT-ACC-ATA----TG-GTGTC---TT-CTT---A-TAACTAGACC-AGGTGGC-ACCA-TGCACAGGTAGATTTATACC-AG--TGATGTATGT--TTAA-CTTTACC---C-ATATT--ATTGA-AT---T--TTG--A--------A----TTT-T-TT--T-T-A-TCT-GAATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT-AAA---------T----C--AA-G-A--TTC---------AA-CT-G-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATG-T-T-AATATAA-TGAT-AA-AGAA---TTACTTTAGATTTACTTTGATTTCA-TAT-TTTTGA-AT-TG-TTGAAGCTATAAATTTACTTTAAA---A--G-----T---TGACC-A-TATTTGCCGGTATTTGCCACT-GAG-TCTT-ATTTGCCAGTCCGGTAAATACC-GTAAATGCCAGCGGTAAATACC-AGGG-G-T-GGAATTTACCGTCCAACCCTGct
gi|30                         :             GGTTGGC-AAAATGCTG-GC-CTTT-AT--TGA-TA--------TTTTC-C-ATGTCA-CCGG
gi|31                         :            agGTTGGC-AAAATGCCG-GT-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCATCTGGgtaaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ga---TTTT-----A--GA-T-GG-AACAGAACAT--T-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-Ctgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAC--ACT------TT-AAT-TTGAAT-TC--ATTA-C-ACA---A-TTATTTTTTA-G-GGTG---T-T
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --GATA--ATT---T--GCT----TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCAC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCACCAGTAGAATTATACC-AG--TGATGTATGT--TT-
gi|4                          :              GTTGCA-AAAATGCCG-GCCATTT-AT--CCA-TA--------TT--CGC-ATGCTG-CTGGCACAATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAAGATTCCAGT-A--ATATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCAAAC-CCT-C------TGGAATT-TATAT--CTTA----A-CTGTT-GTT-C---TTTGGTTAGTTTA-----C-ATT-A-CAC------CTG-G-TC-AA---TA---------GA-TTT---ATTCTT-A-A---A--TTGAAG-TTT-ATCCTA-TTCA-TAC--T-G--AATT--T---GAG--TTTAA--------G--TTGTT--TTTTT---TTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTACC-ACA---A-TTATTTTTTA-G-TGTGT--T-TTTT----TAAT-TG----T-TGGCTGT----TACA----CTTTC--------T----AATAAAGTTT-TT-------A--GAGTCTTACG-A-CTTAC----A---CTGT-TTG-GGC-AAGATC------AGGCA---GCT---CAT-TG-GTCCTTTCCACAC--TG--TT----GTCT-T-TGTC--A--CAAC-AC-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGA-CTG---TTTGG-ATT-T-CA-GCT-GAAT-ACTT-A-TG-G-T-AT--ATTGG-GT-A-ATGTGGT------AGGC-CT------------------------G------------------------------------------G----ATTAT---G-TCCAAAA-----GT-CTTAG-A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA--TGGAGG------GATTGA-ATACCA-TA--C--ATA-G-C-TCAT---GT--CA-TACT---TGA-TT--CC-C--CCTC----CTTCTTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TAT--TTTT-----G--GGTT-GG-AACAGAAAATAGA-ATTTGT---ATA--ATT---T--ATT-GCTTTTC-A-TCT-CT-GT-T----------TA-ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCACC-----------------TG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---GTTTTTTA------A--G-CATTT------AT-A-C-ATA----TG-G---C---TT-CTTAAGA-TAACTA-ACC-AGGTGGC-ACCACTGCACAGGTAGATTTAT-CC-AG--TGAT-TATTT--TA-A-CTTTACC---C-ATATT--ATTAAGACTTGT--TTA--A--------A----TTTCT-TT--T-T-A-TCT-TAATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT--AA---------T----C--AT-A-A--TTC---------AA-CT-G-TT-AAA-AT-GT-TCTCAGCCT-TAGG-A--TT------------------TAATTCCTGTCG-AA--TAAT-TTTGA-T---TTAACT-C-----AA-TT-TTAATG-T-TGAATATAAGTGAT-AATAGAA---TTACTTTAGATTTA-TTTGATTTCA-TA--TTTTGA-AT-TG-TTGAAGCTATAAATtacc
gi|5                          :                TGGC-TAAATATTGAGC-ATT--AT--CTA-CAAATAAATTCTTTC-A-ATGC-G-TTCGCG-AATA-TCTTGTA--ACTA--GGTAA---TGTAGTTA--A-ATGCACTG-GCA-AGTACTG-TT-GAATCA--A----ATTGATC-ACA-CATCTTCTGGAATT-CTCATC-TTTACTAAA-C---T-GTT-CAGGTTTGGATTGTTTTTAGATA-AAT-A-AAGGAATATCTG-GGCC-AAGGGTACAAAATCACGATTTTTATATTCTC-ATACTAA--TTGA-G-TTAATTCCTAATTCA--ACAAT-GGAAATT-ATAGTGAGATTTTAGATTAGTATG--TT-TT--TTTTTTTCTTATACTATATACTTAC--ACTGTCAAATT-AAT-TTTAATGTTGAATTA-CAACA---C-TT-TTTGTTGTG-GATGTACT-TTTGTGGTTAATATG----TGTGGCTGTTGTAAACA----CTTT--------------AGTAGAGTTT-AA-------AATGAGTCTTAGCAA-CTAAC---AA---ATGTATTTGGGT-A--GTC----AGAGGGA-TCACTG--CAT-TGTTTCTTT----CACT-CTCATTAGCGGTCA-T-TGTT-AACTCCAT-AC-TCGAAGGAAACTTCGGAA--TGGG-ATAGT-TTTGG-ATT-TAGGTGCT-GTATAAACTAA-TG-G-TGATTAATA-G-GTAA-AT-TAGTTAAGTGAGGCACA------------------------A---------------T--------------------------GGTGAATTAT---G-TTCAAAGT--TAG---TT---AGACCAGAGAGCT-GC----------TTGCAA-TGTA-TTGGAGGTGAATTG-TTAACA-ACCACTA-CC--GAA-G-----AA---GT--AA-TAGTATCTG--TA--CCAC--A--TTCAGCTTATTG-CGTGGTGATTAGAG-CT-TCCTTACTTTTTT-----G--GGTT-GT-GACATAATAT--A-ATTTGCTAGAT---TTT---T--ATT-G---TTT-A-TCTACT-GT-TGTGTTGGAAGT--ATAACTTTG-TC-TCA----ACC--TT----------------TTG----AA----------TGAAGGCGATTTCTTTGAAACTAGGTAAT---G--TTTTA------AACC-AATTT------AT-A-A-ATA----TG-G-GTT---GC-TTT---A-TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aggtgaTT---TTA-ACT--------AC--ACTGA----TC-AAT-GTAGAT-TT------------------TATTCTTAA-G-A---------TTG----AAGT-TA----T-TC-CTA-----TTTA-----TACT--------G----AATTATGTGT-T---------------TTTA-C-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A-AGAAA-T-TGTG--CAG-AG-GTCTTT----T---------------TCT-T-TGTC-AA--CAAC-AC-T-GAAGGAA--TTCCAAA--TGGGGATG---TTGGG-ATT-T-CATGCT-TAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-G-GT-ACAT-GTGT------AGGT-CTGTACGTACAGTAAGAAGAATAGCAG---------------T--------------------------G----ATTATAATG-ACCAACAT--TTGT-CTT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGA-A-ACCA-TA-CCATATA-C-C-ACAT---GC--CA-TACT---TGA-TA--CC-C--CAGT----CTTTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCA-TA---TTTTTTG--G--G--G-AG-AACAGAAAAT--T-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--TTG--TTAA-TT-T-A----ACCTATG----------------TTGAATTAA----------TT--GACAGTTTC-TTGGAACT---TGTT---G--TTTTA------C--C-AATTTATTATAAT-ACC-ATA----TG-A--------T-CTT---GCTAACTAGACC-AAGTG-----CA-TAC-TAGGAAGAATTATACC-AG--TGATGTA------T-A-TTTTACC---T-GTATT--ATTAC-AT---TG-TTT--ACCCGGTACA----TTT-TATT--T-TAA-TCC-TGATT---TTG-TATA-TGAG-G-TT-AAAATTAACAATT----C--AA-C-AATTTC---------AG-CT-G-TT---A-AT-GT-T-TCAACCATTAGG----TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-TTTATTAA-A-C-----AA-TT-TTAATG-T-T-AATACAA-TGAT-AA-AGA-----------------------ATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TG-TTGAAGCTATGAATTTAC-TTGAA---A--G-----C---T
gi|7                          :       ggttagGGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--ATA-TA--------TTTTC-C-ATGCCG-CTGGCA-AATA-ACG-GTA--TTTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCACCC-ACA-C------TGGAATC-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGCAGGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTGAGG-TTT-TTCCTA-TCCA-TCC--T-G--ATTT-TT---TAG-TTTTAA--------GTTTT-TT--TTTTT---TTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-GT--ATTA-C-ACAATTA-TTATTTTTTA-G-GCTG---T-TTTG----TAAT----------------------CA----CTTCT--------A--------------------------------------A-CTTAC---AA---T--T-TT--G---A--GTC----A-AGGCA---GCTG--CAATTG-GTC-TT----CACCTCT--TT----GTCTGT-TGTC--A--CAAC-AC-T-GAAGAAA--TTCCAAT--TGGG-ATG---TTTGG-ATT-T-CATGCT-GACA-AACT-A-TGCG-TGAT--ATT-G-GT-A-ATAGTGT------AGGC-T-----------------------------------------T--------------------------G----ATTAT---G-ACCAAA------GT-CTT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGA------A-TTGA-GCACAA-TA-CC--ATA-A-G-TCAT---GTA-TATTACT---TGATTACCCC-C--C--T----CTTTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCCTTATT-TTTT-----GGTG--T-GA-AACAGAAAAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--A-T-GC-TTTT-A-T-T-CTAGT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----caatttg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gCT-A-TG-G-TGAT--ATT-T-GT-A-AT-GTGT------AGGC-CAT-----------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT------TCAAG------GT-CTT---A----------CT-GCAGACAAGTGCTGATAA-TGTA-TTGGAGG------GGTTGA-A-AC-A-TA-C---ATA-G-C-TCAG---GT--CA-TACT---TGA-TA--CC-C-----T----CCTTTTC-C-------TTTCCA-TC-TC--TA---TTTTTG---G--G--T-GGGAACGAAACAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATTTGC-TTTC-A-TCT-CT-GTGT----------T--ATG--TCTG-TC-T-G----A----------------------------------------------ACA----C-CTGAA------------------TTA------C--C---TTT------ATTACCTATA----TG-GT-CC---TT-CTT---A---ACTAAA----GGTGGC-AC-A--GCATCGGTA-ATTTATACC-AG--TGATGT-TGT--TT-AACTTTACC---C-ATATT---TTAA-AT---T--GTT--A--------A----ATT-T-TT--T-T-A-TCT-TAATT---TTG-TATT-GGAG-G-TTAAAA---------T----C--AATG-A--TTC---------AAGCTGG-TCTAAA-GT-GT-T-CAAGCCG-TAGG-A--TT------------------TAA-T-CTGT-G--A--TAA--TTTGA-T---TTAA-TAC-----AA-TT-TTAATG-T-T-AATAT-A-TGATAAA-AGAA---TTA-CTTAGA-TTACTTTGATTTCA--A--TTTTGAGAT-TG-TTGAAG-TATAAATTTACTTTAAATTCA--C-----T---TGACCAAGTA---------GTTTG-CACT-TGAGTCTTAATTTG-CAGT-CGGTAAATACC-GTAAATGGCAG-GGTAAATACC-AGGGTG-T-GAA--TTACCGCCCAACCCTG
gi|9                          :              gTTGGC-AAAATGCCA-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGAA-AATA-CCG-GTA--AATGCCGGTAA-ATTCCACT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-TT-CAACTG--A----ATTGACC-AAA-G------AGGAATT-TATATA-TTCA----A-C---T-GTTTC---TTCAGTTAGTTTT-----A-ACT-AATA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTGAAA-TGA-TTCCTA-TTTA-TAC--T-G--AATT-AC---GAG-TTTTAA--------G--CC-CT--TTATT---TT------------TAC--ACT------TT-AAT-TTATAT-CT--AT---------------ATTC---A-G-GGTA---T-TTTG----TGAT-TG----T-TGGCTG-----GACA----CTTCTCTCTATGTG----CATAAAGTTTATAAAGTTTTA--GAGCCTTGGC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A-AAGCA-T-GTTG--CAG-TG-G----T----CA-------TT----ATCT-T-TGTC-AA--TAAC-AC-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG---TTTGG-GTT-T-CATGAT-TAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-A-GT-A-AT-ATGC------AGAT-CT------------------------G---------------TAGAGTAAAAGGAGTACATGTAGCAGTG----ATTAT---G-ACCAAAAT--TTGT-CTT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGT-A-ACCA-TA-CC--AT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): ATATCTAAAACGTCAAGTGCCTGTGGGTTTT






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-TA-CCATA-G--C-TCAT---GT--CA-TACT---TGA-CA--CC-C--C--T----CTTTTTC-C-------TTTCAAGCT-TCC-TA---TTT----T--GG-GGT-GG-AACAGAAAAT--C-ATTTGT--GATA--TTT------ATT-GC-TTTTGA-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCACCCTGAATTACAGTTTTCTTG----AAAACTTGTTGTTT--AACAATTNN-NNNNNNNN---NNNN---N--NNNNNNNNNNCA--C-AATAT------AT-ACC-ATACATATG-GT--C---TT-CTT---A-TAACTTGACC-AGGTGGC-ACCA-TGCACAGGTAGAATTATACC-AG--TGATGTATGT--TT------TACC---T-CTATT--GTTAAA--TTTTTTGA--------A-----TTTT-TT--TGTAATCT-TAATT---TTG-TGTA-GAAG-G-TT-AAAG--------T----C--AA-ATA--TTC---------AA-CT-G-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATACAA-T-GAT-AA-A-GAA---TTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATAAATT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A--TTT---T--ATT-GC-TTTC-G-TCC-CT-GT-T----------T--ATA--ACAG-TC-T-A----ACCCATG----------------TTG----GA----------TT--GACAGGGTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTTA------A--C-AATTT------AC-ACC-ATA----TG---GTC---TT-TT------TAACTAGACC-AAG----------TGCATAGGTAGAATTATACC-AG--TGATGTA------T-A-TTTTACC---T-GTATT--ATTACA--TTGTTT-ATTTTAT--A-----TTGT-TT--T-TAATCT-TAATTGTATTGATATACAGAG-GTTT-AAA---------TATGAT--AT-G-A--TTTGCAGAGCGGAG-TT-A-TTAAAATATGGTAT-TCAACC--TAGG----TT------------------TAA-TGTCGT-GAAA--TAA--TTTGATT---TTAA-T-TTCTAAAG-TTATTAATCT-T-AATGCAA-T-GAT-AA-A-AAA---ATATTTAAAATTTACCTAGATTTCA-CA--TTTTGA-AC-TGTT-TAAGATATAAATTTAt
gi|14                         :                                                                                                                                                                  C-ACT-C------TGGAATT-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTAAAG-TTA-TTCCT-ATTCA-TAT--T-A--AATT-A---TGAG-TTTTA----A-G-------TTGTT--TTTTTTTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-C-A-CG---A-TTATTTTTTA-G-GGTG---T-TTTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----CACA----CTTCT--------A----GATAAAGTTT-T--------A--GAGTCTTAGC-A-CTTAC---AA---C
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C----A-AGGCAAT-GTTG--CAG-TG-GTCTTT----CAC--C----------TCT-T-TGTCAAA--CAACA-C-T-GAAG-AA--TTCCAAAATTGGG-ATG---TTTGAT-TT-T-CATGC-----T-AATT-A-T--G-TGTT--A---G-GTCA-AT-AA-------------CA------------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT---GA-CCAAAATTGTTTTC-TT---A----------CT-GCG---------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------GTTTGA-A-GCCATTA-CCATA-G--CTTCAT---GT--CA-TACT---TGACCA--CC-C--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTA-GAAG---TC-AAA---------T------------A--TTC---------AA-CT-G-TTAAA---T-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATACAA-T-GAT-AA-A-GAA---TTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTT-G-AGCTATAAATTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attttacattgacaaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggGA-A-ACCA-TA-CCATA-G--C-TCA---------A-GAC------A-TA--CC-C--C-------ATTTTTC-C-------TTTCAA-CC-TTC-TA---TTT----TT-GG-G-T-AG-AACAGGAAAT--C-ATTTAT--GACA--TTT---T--ATT-GT-TTTC-A-TTC-CT-GT-C----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCATC----------------TTG----AA----------TA--AATAGTTCC-AGGAAACT---TGTTATAA--TTTTT------A--C-AATTT------AT-A
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAT---AT-CCTAACT--TCGTC-CT---A----------TT-GT----------CATAAA-TGTA-TTCAAGG------G-TAGA-A-ACCT-TA-TCATA-G--C-TCAA---GT--CA-TACT---TT--TA--TC-T--G--T----CATTTTT-C-------TTTCAG-TT-TTG-TAG--TTT----T--TG-G-T-AG-AGCAGGAAAT--C-ATT------A-A--TT--------TT-GT-TTTC-A-tgtcctct
gi|2                          :   ttgagggtgtgtaTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-ATAGCCAATA--------TTT-C-C-ATGCCA-GTGGCC-AATAACCG-G-A--TTTACCGCTAA---TTCAGT-A--A-AT-C--CGTGCA-AA-ACTG-GT-CAATTGGAA----AT-AACC-ACA-A------TGGAATT-TATATA-TTGA----AAC---TCGTT-C---TT--GTTA-TGTT-----ATAC----CA-------CTGCG-TC-AA---TA---------GATTTA---TTTCTT-A-A--GAAATTGAAG-TTA-TTC-T-ATT-A-TAC--TTG--AATT-A---TGAG-TTT----------------AC-TT--TTTTTCCA-CCT------TT--------------T-AATATTAA---TT--ATAA-C-A-TA------TATTTTT-A-G-GGTG---TGTTTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----GACC----AATCT--------A----AATTAAGTTT-TA-------A--G--CCTTAGC-ATCTTAC---AGAGTCTGT-TTTTGGCCA--GTT----C-AGGCA-T-GTTG--CAG-TG--TCTT-----CAC-------------TCT-T-T-TC-AA--CAACA-CAT-GAATAAA--TTCCAAA--TGG--ATG---TTTGGA-T----CATGCT-GAA--------------------ATT-GTGT-A-GT-CAAT------AA----A------------------------G---------------T--------------------------G----AT-AT---GA-CAAATAT--TTGTC-TT---A----------CTCGC----------TGTAAA-TGTA-TTGGGGG------T-TTGA-A-GCCA-TA-CCATATG--C--CATAAAGT--CA--ACT---TGA-CC--CC-C--T--T----TTTTTTC-C-------TTTCAA-CTCTCC-TA---TTT----G--GG-G-T-G---AC-GAAAAT--CGATTTGTT-GATAGATTTATAT--ATT-AG-TTT--A-TCT-TT-GT-T----------T--ATG---CTGATC-T-ATGGAACCCACC----------------CTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTTA------A--CCAATTT------ATTACC-ATA----CATATGTC---TTTCTT---T-TAACTTGATC-AGGTGGCCACCA-TGCACAG-TAGAATTATACCCAGCATGATG-ATGT--TT------TATC---CTGTATTTTATTAAT--TTGTTT-A--------AAAAAATTTT-GT--T-TA-TCT-TAATT---TTG-TGTA-TGAGCG-TT-AAAG--------T----C--AA-A-AA-TTC---------AA-CTTG-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-AATTT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-TTAATACAA-TTGAT-AA-AAGAAAATTTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTTTGAAGCTATAAAT--ACTTTTAAA---ACG-----TTCATGACC-AGTATTTACCGGTATTTGCCACTTGAGTCTT-ATTTGCCAGTCC-GTAAATA-CGGTAAATGTCCGCGGTAATTACC-AGGG-GTT-GGAA-TTA-CGCCCAACCCTGa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                            T-A-TA-------CTG-G-TC-AA---TA---------AATTTT---CTTCTT-A-A--GA--TTGAAG-TTA-TTCCT-A-TCATTAC--T-G--AATT-A---TGAG-TTTGA----A-G-------CC-TT--TTTTT------T------TTAC--ACT------TTAAAT-TTACAT-TT--ATT
gi|21                         :             GGTTGGC-AAAATGCCG-AC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTtaatatctgttgacagaaggatctgattggacactttttttat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ag--ACT------TT-AAT-TTATAT-TT--ATTA-C-A-CA---A-TTATTTTTGA-A-GGTG---C-TTTG----TGAT-TG----T-TGGCTG-----AACA----CTTCTCCCTATGTG----CATAAAGTTT-AA-------A--GAGCCTTAGC-A-CTTAA---AA---CTGT-TA--GGT-A--GTC----A-AGGCA-T-GTTG--ttttcatggcccttggcctcataacaatagcagattctgaatttatagtt
gi|23                         :             GGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAA-ATACCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-T-GTTG--CAG-TA-GTCTTT----CAC-------------TCT-T-TGTT-AA--CAACA-C-T-GAAGAAA--agaaaactcagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T--GGC-A--GTCGATCA-ATGCA-T-GTTG--CAG-T-----TTT----C-----T--TT----ATCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-AAAG----------------GA-ATG---TTTGGA-TT-T-CATTCT-TAAagtaggaaaggatttgttgtttttgtgggtagtttgtgtc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                              GTTTT-----A-GCT-A-CG-------CTG-G-TC-AA---TA---------G--------------------GA--TTGAAG-TTA-TTCCT-ACTTA-TAC--T-G--AAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatttaaaacgtcaagtgcctgtggTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----GACA----TTTCT--------A----AATAAAATTT-TA-------A---AGCCTTAGC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--G
gi|28                         :                                                                                                        -ATTCCACC-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CTATTG--AATCGATCGACC-ACA-G------TAAAATT-TATATA-T
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATGCCAGCGGTAAATACCCAGGG-G-TTGGAATTTACCGCCCAACCCT
gi|3                          : ccgtaagattagGGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGTCG-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--ATTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCAACC-ACA-C------TGGAAAT-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CCG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--G---TTGAAG-TTA-TTCAT-ATTCA-TAC--T-G--AATT-A---TGAG-TTTTA----A-G-------GT-TT--TTTTTTTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-C-A-CA---AATTATTTTT-A-G-GAT----T-TTTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----TACA----CTTCT--------A----AATAAAGTTT-TA-------A--GAGTCTTAGC-A-CTGAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A--GGCA-T-GCTG--CAT-TG-GTCTTT----CAC--CTC-TT----GTCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG---TTTGGA-TT-T-CATGCT-GAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-G-GT-A-AT-TTGT------AGGC-CT------------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT---GT-CCAAAA-----G-C-TT---A----------CT-GC----------TGTAA--TGTA-TTGGAGG------A-TTGA-A-ACCA-TG-CCA-A-G--C-TCAT---GC--CA-TACT---TGA-TA--CC-A--C--T----CGTTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TA---TTT----T--GG---T-GG-AACAGAAAAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCACC----------------CTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTAA------A--C-AATTT------AT-ACC-ATA----TG-GTGTC---TT-CTT---A-TAACTAGACC-AGGTGGC-ACCA-TGCACAGGTAGATTTATACC-AG--TGATGTATGT--TTAA-CTTTACC---C-ATATT--ATTGAA--TT-TTG-A--------A-----TTTT-TT--T-T-ATCT-GAATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT-AAA---------T----C--AA-G-A--TTC---------AA-CT-G-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATATAA-T-GAT-AA-A-GAA---TTACTTTAGATTTACTTTGATTTCA-TAT-TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATAAATTTACTTT-AAA---A-G-----TT---GACC-A-TATTTGCCGGTATTTGCCACT-GAGTCTT-ATTTGCCAGTCCGGTAAATACC-GTAAATGCCAGCGGTAAATACC-AGGG-G-T-GGAATTTACCGTCCAACCCTGct
gi|30                         :             GGTTGGC-AAAATGCTG-GC-CTTT-AT--TGA-TA--------TTTTC-C-ATGTCA-CCGG
gi|31                         :            agGTTGGC-AAAATGCCG-GT-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCATCTGGgtaaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ga---TTT----T--AG-A-T-GG-AACAGAACAT--T-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-Ctgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAC--ACT------TT-AAT-TTGAAT-TC--ATTA-C-A-CA---A-TTATTTTTTA-G-GGTG---T-T
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --GATA--ATT---T--GCT----TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCAC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCACCAGTAGAATTATACC-AG--TGATGTATGT--TT-
gi|4                          :              GTTGCA-AAAATGCCG-GCCATTT-AT--CCA-TA--------TT--CGC-ATGCTG-CTGGCACAATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAAGATTCCAGT-A--ATATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCAAAC-CCT-C------TGGAATT-TATAT--CTTA----A-CTGTT-GTT-C---TTTGGTTAGTTTA-----C-ATT-A-CAC------CTG-G-TC-AA---TA---------GA-TTT---ATTCTT-A-A---A--TTGAAG-TTT-ATCCT-ATTCA-TAC--T-G--AATT-----TGAG--TTTA----A-G-------TTGTT--TTTTTTTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTACC-A-CA---A-TTATTTTTTA-G-TGTGT--T-TTTT----TAAT-TG----T-TGGCTGT----TACA----CTTTC--------T----AATAAAGTTT-TT-------A--GAGTCTTACG-A-CTTAC----A---CTGT-TTG-GGC-AAGATC------AGGCA---GCT---CAT-TG-GTCCTTTCCACAC--TG--TT----GTCT-T-TGTC--A--CAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGA-CTG---TTTGGA-TT-T-CA-GCT-GAAT-ACTT-A-TG-G-T-AT--ATTGG-GT-A-ATGTGGT------AGGC-CT------------------------G------------------------------------------G----ATTAT---GT-CCAAAA-----GTC-TTAG-A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA--TGGAGG------GATTGA-ATACCA-TA--CATA-G--C-TCAT---GT--CA-TACT---TGA-TT--CC-C--CCTC----CTTCTTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TAT--TTT----T--GG-GTT-GG-AACAGAAAATAGA-ATTTGT---ATA--ATT---T--ATT-GCTTTTC-A-TCT-CT-GT-T----------TA-ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCACC-----------------TG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---GTTTTTTA------A--G-CATTT------AT-A-C-ATA----TG-G---C---TT-CTTAAGA-TAACTA-ACC-AGGTGGC-ACCACTGCACAGGTAGATTTAT-CC-AG--TGAT-TATTT--TA-A-CTTTACC---C-ATATT--ATTAAGACTTGTTTAA--------A-----TTTC-TT--T-TTATCT-TAATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT--AA---------T----C--AT-A-A--TTC---------AA-CT-G-TT-AAA-AT-GT-TCTCAGCCT-TAGG-A--TT------------------TAATTCCTGTCG-AA--TAAT-TTTGA-T---TTAACT-C-----AA-TT-TTAATGT-TGAATATAAGT-GAT-AATA-GAA---TTACTTTAGATTTA-TTTGATTTCA-TA--TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATAAATtacc
gi|5                          :                TGGC-TAAATATTGAGC-ATT--AT--CTA-CAAATAAATTCTTTC-A-ATGC-G-TTCGCG-AATA-TCTTGTA--ACTA--GGTAA---TGTAGTTA--A-ATGCACTG-GCA-AGTACTG-TT-GAATCA--A----ATTGATC-ACA-CATCTTCTGGAATT-CTCATC-TTTACTAAA-C---T-GTT-CAGGTTTGGATTGTTTTTAGATA-AAT-A-AAGGAATATCTG-GGCC-AAGGGTACAAAATCACGATTTTTATATTCTC-ATACTAA--TTGA-G-TTAATTCCTAATTCA--ACAAT-GGAAATT-ATAGTGAGATTTTAGATTA-GTATGTTTTT-TT--TTTTCTTATACTATATACTTAC--ACTGTCAAATT-AAT-TTTAATGTTGAATTA-CAA-CA---C-TT-TTTGTTGTG-GATGTACT-TTTGTGGTTAATATG----TGTGGCTGTTGTAAACA----CTTT--------------AGTAGAGTTT-AA-------AATGAGTCTTAGCAA-CTAAC---AA---ATGTATTTGGGT-A--GTC----AGAGGGA-TCACTG--CAT-TGTTTCTTT----CACT-CTCATTAGCGGTCA-T-TGTT-AACTCCATA-C-TCGAAGGAAACTTCGGAA--TGGG-ATAGT-TTTGGA-TT-TAGGTGCT-GTATAAACTAA-TG-G-TGATTAATA-G-GTAA-AT-TAGTTAAGTGAGGCACA------------------------A---------------T--------------------------GGTGAATTAT---GT-TCAAAGT--TAG---TT---AGACCAGAGAGCT-GC----------TTGCAA-TGTA-TTGGAGGTGAATTG-TTAACA-ACCACTA-CCGAA-G------AA---GT--AA-TAGTATCTG--TA--CCAC--A--TTCAGCTTATTG-CGTGGTGATTAGAG-CT-TCCTTACTTTTT----T--GG-GTT-GT-GACATAATAT--A-ATTTGCTAGAT---TTT---T--ATT-G---TTT-A-TCTACT-GT-TGTGTTGGAAGT--ATAACTTTG-TC-TCA----ACC--TT----------------TTG----AA----------TGAAGGCGATTTCTTTGAAACTAGGTAAT---G--TTTTA------AACC-AATTT------AT-A-A-ATA----TG-G-GTT---GC-TTT---A-TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aggtgaTTTTA-ACT--------AC--ACTGA----TC-AAT-GTAGAT-TT-------------------TATTCTTAA-G-A---------TTG----AAGT-TA----T-TC-CTA-----TTTA-----TACT--------G----AATTATGTGT-T---------------TTTA-C-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A-AGAAA-T-TGTG--CAG-AG-GTCTTT----T---------------TCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-GAAGGAA--TTCCAAA--TGGGGATG---TTGGGA-TT-T-CATGCT-TAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-G-GT-ACAT-GTGT------AGGT-CTGTACGTACAGTAAGAAGAATAGCAG---------------T--------------------------G----ATTATAATGA-CCAACAT--TTGTC-TT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGA-A-ACCA-TA-CCATA-TACC-ACAT---GC--CA-TACT---TGA-TA--CC-C--CAGT----CTTTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCA-TA---TTT----TTTGG-G-G-AG-AACAGAAAAT--T-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--TTG--TTAA-TT-T-A----ACCTATG----------------TTGAATTAA----------TT--GACAGTTTC-TTGGAACT---TGTT---G--TTTTA------C--C-AATTTATTATAAT-ACC-ATA----TG-A--------T-CTT---GCTAACTAGACC-AAGTG-----CA-TAC-TAGGAAGAATTATACC-AG--TGATGTA------T-A-TTTTACC---T-GTATT--ATTACA--TTGTTT-ACCCGGTACA-----TTTTATT--T-TAATCC-TGATT---TTG-TATA-TGAG-G-TT-AAAATTAACAATT----C--AA-C-AATTTC---------AG-CT-G-TT---A-AT-GT-T-TCAACCATTAGG----TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-TTTATTAA-A-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATACAA-T-GAT-AA-A-GA-----------------------ATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATGAATTTACTTG-AAA---
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gCT-A-TG-G-TGAT--ATT-T-GT-A-AT-GTGT------AGGC-CAT-----------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT------TCAAG------GTC-TT---A----------CT-GCAGACAAGTGCTGATAA-TGTA-TTGGAGG------GGTTGA-A-AC-A-TA-C-ATA-G--C-TCAG---GT--CA-TACT---TGA-TA--CC-C-----T----CCTTTTC-C-------TTTCCA-TC-TC--TA---TTT----TT-GG-G-T-GGGAACGAAACAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATTTGC-TTTC-A-TCT-CT-GTGT----------T--ATG--TCTG-TC-T-G----A----------------------------------------------ACA----C-CTGAA------------------TTA------C--C---TTT------ATTACCTATA----TG-GT-CC---TT-CTT---A---ACTAAA----GGTGGC-AC-A--GCATCGGTA-ATTTATACC-AG--TGATGT-TGT--TT-AACTTTACC---C-ATATT---TTAAA--TTGTTA-A--------A-----TTTT-TT--T---ATCT-TAATT---TTG-TATT-GGAG-G-TTAAAA---------T----C--AATG-A--TTC---------AAGCTGG-TCTAAA-GT-GT-T-CAAGCCG-TAGG-A--TT------------------TAA-T-CTGT-G--A--TAA--TTTGA-T---TTAA-TAC-----AA-TT-TTAATGT-T-AATAT-A-T-GATAAA-A-GAA---TTA-CTTAGA-TTACTTTGATTTCA--A--TTTTGAGAT-TGTT-GAAG-TATAAATTTACTTT-AAATTCA-C-----TT---GACCAAGTA---------GTTTG-CACTTGAGTCTTAATTTG-CAGT-CGGTAAATACC-GTAAATGGCAG-GGTAAATACC-AGGGTG-T-GAA--TTACCGCCCAACCCTG
gi|9                          :              gTTGGC-AAAATGCCA-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGAA-AATA-CCG-GTA--AATGCCGGTAA-ATTCCACT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-TT-CAACTG--A----ATTGACC-AAA-G------AGGAATT-TATATA-TTCA----A-C---T-GTTTC---TTCAGTTAGTTTT-----A-ACT-AATA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTGAAA-TGA-TTCCT-ATTTA-TAC--T-G--AATT-A---CGAG-TTTTA----A-G-------CC-CT--TTATTTT------------TAC--ACT------TT-AAT-TTATAT-CT--AT----------------ATTC---A-G-GGTA---T-TTTG----TGAT-TG----T-TGGCTG-----GACA----CTTCTCTCTATGTG----CATAAAGTTTATAAAGTTTTA--GAGCCTTGGC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A-AAGCA-T-GTTG--CAG-TG-G----T----CA-------TT----ATCT-T-TGTC-AA--TAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG---TTTGGG-TT-T-CATGAT-TAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-A-GT-A-AT-ATGC------AGAT-CT------------------------G---------------TAGAGTAAAAGGAGTACATGTAGCAGTG----ATTAT---GA-CCAAAAT--TTGTC-TT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGT-A-ACCA-TA-CCAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): ATATCTAAAACGTCAAGTGCCTGTGGGTTTT






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-TA-CCATA-G--C-TCAT---GT--CA-TACT---TGA-CA--CC-C--C--T----CTTTTTC-C-------TTTCAAGCT-TCC-TA---TTT----T--GG-GGT-GG-AACAGAAAAT--C-ATTTGT--GATA--TTT------ATT-GC-TTTTGA-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCACCCTGAATTACAGTTTTCTTG----AAAACTTGTTGTTT--AACAATTNN-NNNNNNNN---NNNN---N--NNNNNNNNNNCA--C-AATAT------AT-ACC-ATACATATG-GT--C---TT-CTT---A-TAACTTGACC-AGGTGGC-ACCA-TGCACAGGTAGAATTATACC-AG--TGATGTATGT--TT------TACC---T-CTATT--GTTAAA--TTTTTTGA--------A-----TTTT-TT--TGTAATCT-TAATT---TTG-TGTA-GAAG-G-TT-AAAG--------T----C--AA-ATA--TTC---------AA-CT-G-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATACAA-T-GAT-AA-A-GAA---TTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATAAATT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A--TTT---T--ATT-GC-TTTC-G-TCC-CT-GT-T----------T--ATA--ACAG-TC-T-A----ACCCATG----------------TTG----GA----------TT--GACAGGGTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTTA------A--C-AATTT------AC-ACC-ATA----TG---GTC---TT-TT------TAACTAGACC-AAG----------TGCATAGGTAGAATTATACC-AG--TGATGTA------T-A-TTTTACC---T-GTATT--ATTACA--TTGTTT-ATTTTAT--A-----TTGT-TT--T-TAATCT-TAATTGTATTGATATACAGAG-GTTT-AAA---------TATGAT--AT-G-A--TTTGCAGAGCGGAG-TT-A-TTAAAATATGGTAT-TCAACC--TAGG----TT------------------TAA-TGTCGT-GAAA--TAA--TTTGATT---TTAA-T-TTCTAAAG-TTATTAATCT-T-AATGCAA-T-GAT-AA-A-AAA---ATATTTAAAATTTACCTAGATTTCA-CA--TTTTGA-AC-TGTT-TAAGATATAAATTTAt
gi|14                         :                                                                                                                                                                  C-ACT-C------TGGAATT-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTAAAG-TTA-TTCCT-ATTCA-TAT--T-A--AATT-A---TGAG-TTTTA----A-G-------TTGTT--TTTTTTTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-C-A-CG---A-TTATTTTTTA-G-GGTG---T-TTTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----CACA----CTTCT--------A----GATAAAGTTT-T--------A--GAGTCTTAGC-A-CTTAC---AA---C
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C----A-AGGCAAT-GTTG--CAG-TG-GTCTTT----CAC--C----------TCT-T-TGTCAAA--CAACA-C-T-GAAG-AA--TTCCAAAATTGGG-ATG---TTTGAT-TT-T-CATGC-----T-AATT-A-T--G-TGTT--A---G-GTCA-AT-AA-------------CA------------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT---GA-CCAAAATTGTTTTC-TT---A----------CT-GCG---------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------GTTTGA-A-GCCATTA-CCATA-G--CTTCAT---GT--CA-TACT---TGACCA--CC-C--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTA-GAAG---TC-AAA---------T------------A--TTC---------AA-CT-G-TTAAA---T-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATACAA-T-GAT-AA-A-GAA---TTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTT-G-AGCTATAAATTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attttacattgacaaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggGA-A-ACCA-TA-CCATA-G--C-TCA---------A-GAC------A-TA--CC-C--C-------ATTTTTC-C-------TTTCAA-CC-TTC-TA---TTT----TT-GG-G-T-AG-AACAGGAAAT--C-ATTTAT--GACA--TTT---T--ATT-GT-TTTC-A-TTC-CT-GT-C----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCATC----------------TTG----AA----------TA--AATAGTTCC-AGGAAACT---TGTTATAA--TTTTT------A--C-AATTT------AT-A
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAT---AT-CCTAACT--TCGTC-CT---A----------TT-GT----------CATAAA-TGTA-TTCAAGG------G-TAGA-A-ACCT-TA-TCATA-G--C-TCAA---GT--CA-TACT---TT--TA--TC-T--G--T----CATTTTT-C-------TTTCAG-TT-TTG-TAG--TTT----T--TG-G-T-AG-AGCAGGAAAT--C-ATT------A-A--TT--------TT-GT-TTTC-A-tgtcctct
gi|2                          :   ttgagggtgtgtaTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-ATAGCCAATA--------TTT-C-C-ATGCCA-GTGGCC-AATAACCG-G-A--TTTACCGCTAA---TTCAGT-A--A-AT-C--CGTGCA-AA-ACTG-GT-CAATTGGAA----AT-AACC-ACA-A------TGGAATT-TATATA-TTGA----AAC---TCGTT-C---TT--GTTA-TGTT-----ATAC----CA-------CTGCG-TC-AA---TA---------GATTTA---TTTCTT-A-A--GAAATTGAAG-TTA-TTC-T-ATT-A-TAC--TTG--AATT-A---TGAG-TTT----------------AC-TT--TTTTTCCA-CCT------TT--------------T-AATATTAA---TT--ATAA-C-A-TA------TATTTTT-A-G-GGTG---TGTTTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----GACC----AATCT--------A----AATTAAGTTT-TA-------A--G--CCTTAGC-ATCTTAC---AGAGTCTGT-TTTTGGCCA--GTT----C-AGGCA-T-GTTG--CAG-TG--TCTT-----CAC-------------TCT-T-T-TC-AA--CAACA-CAT-GAATAAA--TTCCAAA--TGG--ATG---TTTGGA-T----CATGCT-GAA--------------------ATT-GTGT-A-GT-CAAT------AA----A------------------------G---------------T--------------------------G----AT-AT---GA-CAAATAT--TTGTC-TT---A----------CTCGC----------TGTAAA-TGTA-TTGGGGG------T-TTGA-A-GCCA-TA-CCATATG--C--CATAAAGT--CA--ACT---TGA-CC--CC-C--T--T----TTTTTTC-C-------TTTCAA-CTCTCC-TA---TTT----G--GG-G-T-G---AC-GAAAAT--CGATTTGTT-GATAGATTTATAT--ATT-AG-TTT--A-TCT-TT-GT-T----------T--ATG---CTGATC-T-ATGGAACCCACC----------------CTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTTA------A--CCAATTT------ATTACC-ATA----CATATGTC---TTTCTT---T-TAACTTGATC-AGGTGGCCACCA-TGCACAG-TAGAATTATACCCAGCATGATG-ATGT--TT------TATC---CTGTATTTTATTAAT--TTGTTT-A--------AAAAAATTTT-GT--T-TA-TCT-TAATT---TTG-TGTA-TGAGCG-TT-AAAG--------T----C--AA-A-AA-TTC---------AA-CTTG-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-AATTT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-TTAATACAA-TTGAT-AA-AAGAAAATTTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTTTGAAGCTATAAAT--ACTTTTAAA---ACG-----TTCATGACC-AGTATTTACCGGTATTTGCCACTTGAGTCTT-ATTTGCCAGTCC-GTAAATA-CGGTAAATGTCCGCGGTAATTACC-AGGG-GTT-GGAA-TTA-CGCCCAACCCTGa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                            T-A-TA-------CTG-G-TC-AA---TA---------AATTTT---CTTCTT-A-A--GA--TTGAAG-TTA-TTCCT-A-TCATTAC--T-G--AATT-A---TGAG-TTTGA----A-G-------CC-TT--TTTTT------T------TTAC--ACT------TTAAAT-TTACAT-TT--ATT
gi|21                         :             GGTTGGC-AAAATGCCG-AC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTtaatatctgttgacagaaggatctgattggacactttttttat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ag--ACT------TT-AAT-TTATAT-TT--ATTA-C-A-CA---A-TTATTTTTGA-A-GGTG---C-TTTG----TGAT-TG----T-TGGCTG-----AACA----CTTCTCCCTATGTG----CATAAAGTTT-AA-------A--GAGCCTTAGC-A-CTTAA---AA---CTGT-TA--GGT-A--GTC----A-AGGCA-T-GTTG--ttttcatggcccttggcctcataacaatagcagattctgaatttatagtt
gi|23                         :             GGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAA-ATACCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-T-GTTG--CAG-TA-GTCTTT----CAC-------------TCT-T-TGTT-AA--CAACA-C-T-GAAGAAA--agaaaactcagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T--GGC-A--GTCGATCA-ATGCA-T-GTTG--CAG-T-----TTT----C-----T--TT----ATCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-AAAG----------------GA-ATG---TTTGGA-TT-T-CATTCT-TAAagtaggaaaggatttgttgtttttgtgggtagtttgtgtc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                              GTTTT-----A-GCT-A-CG-------CTG-G-TC-AA---TA---------G--------------------GA--TTGAAG-TTA-TTCCT-ACTTA-TAC--T-G--AAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatttaaaacgtcaagtgcctgtggTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----GACA----TTTCT--------A----AATAAAATTT-TA-------A---AGCCTTAGC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--G
gi|28                         :                                                                                                        -ATTCCACC-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CTATTG--AATCGATCGACC-ACA-G------TAAAATT-TATATA-T
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATGCCAGCGGTAAATACCCAGGG-G-TTGGAATTTACCGCCCAACCCT
gi|3                          : ccgtaagattagGGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGTCG-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--ATTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCAACC-ACA-C------TGGAAAT-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CCG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--G---TTGAAG-TTA-TTCAT-ATTCA-TAC--T-G--AATT-A---TGAG-TTTTA----A-G-------GT-TT--TTTTTTTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-C-A-CA---AATTATTTTT-A-G-GAT----T-TTTG----TAAT-TG----T-TGGCTG-----TACA----CTTCT--------A----AATAAAGTTT-TA-------A--GAGTCTTAGC-A-CTGAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A--GGCA-T-GCTG--CAT-TG-GTCTTT----CAC--CTC-TT----GTCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG---TTTGGA-TT-T-CATGCT-GAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-G-GT-A-AT-TTGT------AGGC-CT------------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT---GT-CCAAAA-----G-C-TT---A----------CT-GC----------TGTAA--TGTA-TTGGAGG------A-TTGA-A-ACCA-TG-CCA-A-G--C-TCAT---GC--CA-TACT---TGA-TA--CC-A--C--T----CGTTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TA---TTT----T--GG---T-GG-AACAGAAAAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCACC----------------CTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTAA------A--C-AATTT------AT-ACC-ATA----TG-GTGTC---TT-CTT---A-TAACTAGACC-AGGTGGC-ACCA-TGCACAGGTAGATTTATACC-AG--TGATGTATGT--TTAA-CTTTACC---C-ATATT--ATTGAA--TT-TTG-A--------A-----TTTT-TT--T-T-ATCT-GAATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT-AAA---------T----C--AA-G-A--TTC---------AA-CT-G-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATATAA-T-GAT-AA-A-GAA---TTACTTTAGATTTACTTTGATTTCA-TAT-TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATAAATTTACTTT-AAA---A-G-----TT---GACC-A-TATTTGCCGGTATTTGCCACT-GAGTCTT-ATTTGCCAGTCCGGTAAATACC-GTAAATGCCAGCGGTAAATACC-AGGG-G-T-GGAATTTACCGTCCAACCCTGct
gi|30                         :             GGTTGGC-AAAATGCTG-GC-CTTT-AT--TGA-TA--------TTTTC-C-ATGTCA-CCGG
gi|31                         :            agGTTGGC-AAAATGCCG-GT-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCATCTGGgtaaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ga---TTT----T--AG-A-T-GG-AACAGAACAT--T-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-Ctgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAC--ACT------TT-AAT-TTGAAT-TC--ATTA-C-A-CA---A-TTATTTTTTA-G-GGTG---T-T
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --GATA--ATT---T--GCT----TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCAC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCACCAGTAGAATTATACC-AG--TGATGTATGT--TT-
gi|4                          :              GTTGCA-AAAATGCCG-GCCATTT-AT--CCA-TA--------TT--CGC-ATGCTG-CTGGCACAATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAAGATTCCAGT-A--ATATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCAAAC-CCT-C------TGGAATT-TATAT--CTTA----A-CTGTT-GTT-C---TTTGGTTAGTTTA-----C-ATT-A-CAC------CTG-G-TC-AA---TA---------GA-TTT---ATTCTT-A-A---A--TTGAAG-TTT-ATCCT-ATTCA-TAC--T-G--AATT-----TGAG--TTTA----A-G-------TTGTT--TTTTTTTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTACC-A-CA---A-TTATTTTTTA-G-TGTGT--T-TTTT----TAAT-TG----T-TGGCTGT----TACA----CTTTC--------T----AATAAAGTTT-TT-------A--GAGTCTTACG-A-CTTAC----A---CTGT-TTG-GGC-AAGATC------AGGCA---GCT---CAT-TG-GTCCTTTCCACAC--TG--TT----GTCT-T-TGTC--A--CAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGA-CTG---TTTGGA-TT-T-CA-GCT-GAAT-ACTT-A-TG-G-T-AT--ATTGG-GT-A-ATGTGGT------AGGC-CT------------------------G------------------------------------------G----ATTAT---GT-CCAAAA-----GTC-TTAG-A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA--TGGAGG------GATTGA-ATACCA-TA--CATA-G--C-TCAT---GT--CA-TACT---TGA-TT--CC-C--CCTC----CTTCTTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TAT--TTT----T--GG-GTT-GG-AACAGAAAATAGA-ATTTGT---ATA--ATT---T--ATT-GCTTTTC-A-TCT-CT-GT-T----------TA-ATG--TCTG-TC-T-A----ACCCACC-----------------TG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---GTTTTTTA------A--G-CATTT------AT-A-C-ATA----TG-G---C---TT-CTTAAGA-TAACTA-ACC-AGGTGGC-ACCACTGCACAGGTAGATTTAT-CC-AG--TGAT-TATTT--TA-A-CTTTACC---C-ATATT--ATTAAGACTTGTTTAA--------A-----TTTC-TT--T-TTATCT-TAATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT--AA---------T----C--AT-A-A--TTC---------AA-CT-G-TT-AAA-AT-GT-TCTCAGCCT-TAGG-A--TT------------------TAATTCCTGTCG-AA--TAAT-TTTGA-T---TTAACT-C-----AA-TT-TTAATGT-TGAATATAAGT-GAT-AATA-GAA---TTACTTTAGATTTA-TTTGATTTCA-TA--TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATAAATtacc
gi|5                          :                TGGC-TAAATATTGAGC-ATT--AT--CTA-CAAATAAATTCTTTC-A-ATGC-G-TTCGCG-AATA-TCTTGTA--ACTA--GGTAA---TGTAGTTA--A-ATGCACTG-GCA-AGTACTG-TT-GAATCA--A----ATTGATC-ACA-CATCTTCTGGAATT-CTCATC-TTTACTAAA-C---T-GTT-CAGGTTTGGATTGTTTTTAGATA-AAT-A-AAGGAATATCTG-GGCC-AAGGGTACAAAATCACGATTTTTATATTCTC-ATACTAA--TTGA-G-TTAATTCCTAATTCA--ACAAT-GGAAATT-ATAGTGAGATTTTAGATTA-GTATGTTTTT-TT--TTTTCTTATACTATATACTTAC--ACTGTCAAATT-AAT-TTTAATGTTGAATTA-CAA-CA---C-TT-TTTGTTGTG-GATGTACT-TTTGTGGTTAATATG----TGTGGCTGTTGTAAACA----CTTT--------------AGTAGAGTTT-AA-------AATGAGTCTTAGCAA-CTAAC---AA---ATGTATTTGGGT-A--GTC----AGAGGGA-TCACTG--CAT-TGTTTCTTT----CACT-CTCATTAGCGGTCA-T-TGTT-AACTCCATA-C-TCGAAGGAAACTTCGGAA--TGGG-ATAGT-TTTGGA-TT-TAGGTGCT-GTATAAACTAA-TG-G-TGATTAATA-G-GTAA-AT-TAGTTAAGTGAGGCACA------------------------A---------------T--------------------------GGTGAATTAT---GT-TCAAAGT--TAG---TT---AGACCAGAGAGCT-GC----------TTGCAA-TGTA-TTGGAGGTGAATTG-TTAACA-ACCACTA-CCGAA-G------AA---GT--AA-TAGTATCTG--TA--CCAC--A--TTCAGCTTATTG-CGTGGTGATTAGAG-CT-TCCTTACTTTTT----T--GG-GTT-GT-GACATAATAT--A-ATTTGCTAGAT---TTT---T--ATT-G---TTT-A-TCTACT-GT-TGTGTTGGAAGT--ATAACTTTG-TC-TCA----ACC--TT----------------TTG----AA----------TGAAGGCGATTTCTTTGAAACTAGGTAAT---G--TTTTA------AACC-AATTT------AT-A-A-ATA----TG-G-GTT---GC-TTT---A-TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aggtgaTTTTA-ACT--------AC--ACTGA----TC-AAT-GTAGAT-TT-------------------TATTCTTAA-G-A---------TTG----AAGT-TA----T-TC-CTA-----TTTA-----TACT--------G----AATTATGTGT-T---------------TTTA-C-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A-AGAAA-T-TGTG--CAG-AG-GTCTTT----T---------------TCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-GAAGGAA--TTCCAAA--TGGGGATG---TTGGGA-TT-T-CATGCT-TAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-G-GT-ACAT-GTGT------AGGT-CTGTACGTACAGTAAGAAGAATAGCAG---------------T--------------------------G----ATTATAATGA-CCAACAT--TTGTC-TT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGA-A-ACCA-TA-CCATA-TACC-ACAT---GC--CA-TACT---TGA-TA--CC-C--CAGT----CTTTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCA-TA---TTT----TTTGG-G-G-AG-AACAGAAAAT--T-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-A-TCT-CT-GT-T----------T--TTG--TTAA-TT-T-A----ACCTATG----------------TTGAATTAA----------TT--GACAGTTTC-TTGGAACT---TGTT---G--TTTTA------C--C-AATTTATTATAAT-ACC-ATA----TG-A--------T-CTT---GCTAACTAGACC-AAGTG-----CA-TAC-TAGGAAGAATTATACC-AG--TGATGTA------T-A-TTTTACC---T-GTATT--ATTACA--TTGTTT-ACCCGGTACA-----TTTTATT--T-TAATCC-TGATT---TTG-TATA-TGAG-G-TT-AAAATTAACAATT----C--AA-C-AATTTC---------AG-CT-G-TT---A-AT-GT-T-TCAACCATTAGG----TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-TTTATTAA-A-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATACAA-T-GAT-AA-A-GA-----------------------ATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATGAATTTACTTG-AAA---
gi|7                          :       ggttagGGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--ATA-TA--------TTTTC-C-ATGCCG-CTGGCA-AATA-ACG-GTA--TTTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCACCC-ACA-C------TGGAATC-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGCAGGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTGAGG-TTT-TTCCT-ATCCA-TCC--T-G--ATTT-T---TTAG-TTTTA----A-GTT-----TT-TT--TTTTTTTA-ACT------TTAC--ACT------TT-AAT-TTAAAT-GT--ATTA-C-A-CAATTA-TTATTTTTTA-G-GCTG---T-TTTG----TAAT----------------------CA----CTTCT--------A--------------------------------------A-CTTAC---AA---T--T-TT--G---A--GTC----A-AGGCA---GCTG--CAATTG-GTC-TT----CACCTCT--TT----GTCTGT-TGTC--A--CAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAT--TGGG-ATG---TTTGGA-TT-T-CATGCT-GACA-AACT-A-TGCG-TGAT--ATT-G-GT-A-ATAGTGT------AGGC-T-----------------------------------------T--------------------------G----ATTAT---GA-CCAAA------GTC-TT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGA------A-TTGA-GCACAA-TA-CCATA-A--G-TCAT---GTA-TATTACT---TGATTACCCC-C--C--T----CTTTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCCTTATT-TTT----T--GGTG-T-GA-AACAGAAAAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--A-T-GC-TTTT-A-T-T-CTAGT-T----------T--ATG--TCTG-TC-T-A----gctcaatttg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gCT-A-TG-G-TGAT--ATT-T-GT-A-AT-GTGT------AGGC-CAT-----------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT------TCAAG------GTC-TT---A----------CT-GCAGACAAGTGCTGATAA-TGTA-TTGGAGG------GGTTGA-A-AC-A-TA-C-ATA-G--C-TCAG---GT--CA-TACT---TGA-TA--CC-C-----T----CCTTTTC-C-------TTTCCA-TC-TC--TA---TTT----TT-GG-G-T-GGGAACGAAACAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATTTGC-TTTC-A-TCT-CT-GTGT----------T--ATG--TCTG-TC-T-G----A----------------------------------------------ACA----C-CTGAA------------------TTA------C--C---TTT------ATTACCTATA----TG-GT-CC---TT-CTT---A---ACTAAA----GGTGGC-AC-A--GCATCGGTA-ATTTATACC-AG--TGATGT-TGT--TT-AACTTTACC---C-ATATT---TTAAA--TTGTTA-A--------A-----TTTT-TT--T---ATCT-TAATT---TTG-TATT-GGAG-G-TTAAAA---------T----C--AATG-A--TTC---------AAGCTGG-TCTAAA-GT-GT-T-CAAGCCG-TAGG-A--TT------------------TAA-T-CTGT-G--A--TAA--TTTGA-T---TTAA-TAC-----AA-TT-TTAATGT-T-AATAT-A-T-GATAAA-A-GAA---TTA-CTTAGA-TTACTTTGATTTCA--A--TTTTGAGAT-TGTT-GAAG-TATAAATTTACTTT-AAATTCA-C-----TT---GACCAAGTA---------GTTTG-CACTTGAGTCTTAATTTG-CAGT-CGGTAAATACC-GTAAATGGCAG-GGTAAATACC-AGGGTG-T-GAA--TTACCGCCCAACCCTG
gi|9                          :              gTTGGC-AAAATGCCA-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGAA-AATA-CCG-GTA--AATGCCGGTAA-ATTCCACT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-TT-CAACTG--A----ATTGACC-AAA-G------AGGAATT-TATATA-TTCA----A-C---T-GTTTC---TTCAGTTAGTTTT-----A-ACT-AATA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTGAAA-TGA-TTCCT-ATTTA-TAC--T-G--AATT-A---CGAG-TTTTA----A-G-------CC-CT--TTATTTT------------TAC--ACT------TT-AAT-TTATAT-CT--AT----------------ATTC---A-G-GGTA---T-TTTG----TGAT-TG----T-TGGCTG-----GACA----CTTCTCTCTATGTG----CATAAAGTTTATAAAGTTTTA--GAGCCTTGGC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A-AAGCA-T-GTTG--CAG-TG-G----T----CA-------TT----ATCT-T-TGTC-AA--TAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG---TTTGGG-TT-T-CATGAT-TAAT-AACT-A-TG-G-TGAT--ATT-A-GT-A-AT-ATGC------AGAT-CT------------------------G---------------TAGAGTAAAAGGAGTACATGTAGCAGTG----ATTAT---GA-CCAAAAT--TTGTC-TT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGT-A-ACCA-TA-CCAT


blockSeqs                     :                    C         A  C    .  AG   A  AATAAATT     G C      G      C    A   T   .            GA       T .  T    AC  T   .       A  .      GA ATCG  CA   C   CATCTTC        C      A    CTAA A TGT T   T AGG             TAGATA    T A  GGAATAT   C G  .  GGG  CAAAATCAC      TAT      A T CT  AA      .   A     A   T T   AA T GA    ATAG     A     GATT G TATGTTTTT   .       TATACTATATAC    .    GTCAAA  A   A      G  GA    C A A  ATTA         T T T    TACT     TGGT    A  .    G      TTGTAA   .        CCCTATGTGC             ATAAAGTTTTA            A T     ACA  AGT    A  TT   C AG   GATC G     AT     .    T  T      TCCA ACTCTCATTAGCGG    G .    AA CT     A A C    A  AC       AT   GG   GT       A  G A      .    A    A .  CG     TA   G T  C C  ATGCAGATCTGTAGAGTAAAAGGAGTACATGTAGCAGT                                                GTGA     AATGA      ATTGTT   C  AGACCAGAGAG     C  AGACAAGTGC      .    T       TGAATTG     C T    T  .     T AC T   TAAA  A   T    ATC   C  CC  A ATTCAG           . GTGGTGA      G  C   T  CTT   TTT      T G .  G          AGA       TA    GA   ATAT     T  T    G .   A  A  G GTGTTGGAAG A    AC    A  . C TGGA       CTGAATTACAGTTTTCTTGAAAACTTGTTGT      AA         T        AGG    ATAA       NNNNNCA   C     ATTATA  T C T   CATA  TATGTC     T  TAAGA           .     G C   ACT      G    A       C  CA       T  .   AAC       CT        TT      AC      ACCCGGTACA          A  .  GTA    .     GTA   A    CA   C T  A   ATTAACAATTCAACAAT           GCAGAGCGG  G  T .  A   T  G  A C      AT    AAT   .                    T      C A  .    T      T TTA    C A TCTAA  .  A       . T       G T   A  T A   AATT  T                     .  T       G  .    T A                 T   TTCAC        CAT    A G  TTTACCGGT     C    T  G    A     C    C G       C G           C          C    T T T   AT
blockSeqs                     :                    .         .  .    .  .    .  .            . .      T      .    .   .   .            A        . .  .    .   .   .       .  .      .  .     AA   .   TC             .      .    .    . .   C   . .               AT        . .  C         . .  .  T    .              .        . . .   .       .   .     .   C .   .  . .     AA       .     .    . TTTT        .       TAACT           .    GA      .   .      .  .     . . .  AA           T . .    TG       .       .  .    .      TT       .        CTCTATGTGC             AAAAT                  . .     .    .      .  TG   . .    .    .     TC     .    .  .      .    ACCTCTTTG         . .    A  .      . . .    G  .        .    G    .        .  . .      .    .    . .  G      .    . .  C .  GTGTAGGTCTGTACGTACAGTAAGAAGAATAGCAGT                                                  .        GAA        ATTT     .  AGA             .  G               .    .       GT          . C    C  .     . .  .   T     .   .    .     T  .   . CCTC             . .            .  .   T  TT    TT       . T .  .          CG        T     .    T        .  .    . .   .  .  . .          .    .     .  . . .          TTGAATTAA                            .          .        .      GTT        AAC       .     .       T C .   .     GTGTC      .  TGC             .     G .   AT       G    A       .  .        T  .   AAC       T         .       .       ATTTTATA            .  .  TA     .     .     .    G    . .  .   TATGATATGA                  .          .  G .  A   .  .  . .      T     A     .                    .      . .  .    .      . .      . . .      .  .       . G       . .   .  . .   T     T                     .  .       .  .    . A                 .   ACG          .      . G  TTTGCCGGT     C    T  G    .     C    C G       C .           C          .    . . .   AT
blockSeqs                     :                    .         .  .    .  .    .  .            . .      .      .    .   .   .            A        . .  .    .   .   .       .  .      .  .     CG   .   A              .      .    .    . .   .   . .               C         . .  .         . .  .  .    .              .        . . .   .       .   .     .   C .   .  . .     A        .     .    . TTG         .       TAACT           .    .       .   .      .  .     . . .  A            G . .    TG       .       .  .    .      G        .        AA                     TAA                    . .     .    .      .  G    . .    .    .     T      .    .  .      .    ACCTCTTG          . .    A  .      . . .    A  .        .    G    .        .  . .      .    .    . .  G      .    . .  A .  TAGTTAAGTGAGGCACAAT                                                                   .        GA         CTTC     .  A               .  .               .    .       GA          . .    .  .     . .  .   T     .   .    .     .  .   . CAGT             . .            .  .   .  G     TT       . T .  .          C         .     .    T        .  .    . .   .  .  . .          .    .     .  . . .          TTGGA                                .          .        .      N          A         .     .       . C .   .     GGTT       .  TA              .     G .   AT       G    A       .  .        T  .   AT        T         .       .       AAAAAAA             .  .  TA     .     .     .    G    . .  .   GTCAAATA                    .          .  . .  A   .  .  . .      G     A     .                    .      . .  .    .      . .      . . .      .  .       . .       . .   .  . .   A     T                     .  .       .  .    . A                 .   AG           .      . .  .             .    .  G    .     .    . .       . .           C          .    . . .   A 
blockSeqs                     :                    .         .  .    .  .    .  .            . .      .      .    .   .   .            A        . .  .    .   .   .       .  .      .  .     CA   .   C              .      .    .    . .   .   . .               A         . .  .         . .  .  .    .              .        . . .   .       .   .     .   C .   .  . .     A        .     .    . TTG         .       CACCT           .    .       .   .      .  .     . . .  G            T . .    TT       .       .  .    .      T        .        AA                     AAA                    . .     .    .      .  .    . .    .    .     T      .    .  .      .    CCTTTTG           . .    A  .      . . .    A  .        .    A    .        .  . .      .    .    . .  G      .    . .  . .  GTGTAGGCCATGT                                                                         .        AT         ATTT     .  A               .  .               .    .       GG          . .    .  .     . .  .   A     .   .    .     .  .   . CT               . .            .  .   .  T     T        . . .  .          C         .     .    T        .  .    . .   .  .  . .          .    .     .  . . .          TTGAA                                .          .        .      G          A         .     .       . C .   .     GTCC       .  TT              .     G .   AT       G    T       .  .        T  .   AC        C         .       .       GAA                 .  .  TT     .     .     .    T    . .  .   GTCAAAAA                    .          .  . .  A   .  .  . .      .     A     .                    .      . .  .    .      . .      . . .      .  .       . .       . .   .  . .   T     T                     .  .       .  .    . A                 .                                                                                          .          .    . . .   . 
blockSeqs                     :                    .         .  .    .  .    .  .            . .      .      .    .   .   .            A        . .  .    .   .   .       .  .      .  .     CA   .   C              .      .    .    . .   .   . .               A         . .  .         . .  .  .    .              .        . . .   .       .   .     .   T .   .  . .     A        .     .    . GC          .       TAACT           .    .       .   .      .  .     . . .  A            T . .    T        .       .  .    .      C        .        AG                     TAA                    . .     .    .      .  .    . .    .    .     T      .    .  .      .    ACTGTTG           . .    A  .      . . .    A  .        .    G    .        .  . .      .    .    . .  G      .    . .  . .  TTGTAGGCCTGT                                                                          .        GA         GTTA     .  A               .  .               .    .       G           . .    .  .     . .  .   T     .   .    .     .  .   . GT               . .            .  .   .  .     T        . . .  .          C         .     .    T        .  .    . .   .  .  . .          .    .     .  . . .          CTGAA                                .          .        .      G          A         .     .       . C .   .     GTC        .  TA              .     G .   AT       G    A       .  .        T  .   AT        C         .       .       AAA                 .  .  TA     .     .     .    G    . .  .   TCAATGA                     .          .  . .  A   .  .  . .      .     A     .                    .      . .  .    .      . .      . . .      .  .       . .       . .   .  . .   T     C                     .  .       .  .    . A                                                                                                                                      
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A--TTT---T--ATT-GC-TTTC-GT-CC-CT-GT-T----------T--ATA--ACAG-TCT-A----ACCCATG----------------TTG----GA----------TT--GACAGGGTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTTA------A--C-AATTT------AC-ACC-ATA----T-G---GTC---TT-T-T-----TAACTAGACC-AAG----------TGCATAGGTAGAATTATACC-AG--TGATGTA------T-A-TTTTACC---T-GTATT--ATTACA--TTGTTTATTTT--ATA----TTGT-TT--T-TAATCT-TAATTGTATTGATATACAGAG-GTTT-AAA---------T--ATGATATGA-TTTGCAGAGCGGAG-TT-A-TTAAAATATGGTAT-TCAACC--TAGG----TT------------------TAA-TGTCGT-GAAA--TAA--TTTGATT---TTAA-T-TTCTAAAG-TTATTAATCT-T-AATGCAA-T-GAT-AA-A-AAA---ATATTTAAAATTTACCTAGATTTCA-CA--TTTTGA-AC-TGTT-TAAGATATAAATTTAt
gi|14                         :                                                                                                                                                                  C-ACT-C------TGGAATT-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTAAAG-TTA-TTCCTA-TTCA-TAT--T-A--AATT-AT---GAG-TTTTA----A-G--T---TGTT--TTTTT----TTA-ACT------TTACA--CT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-C-A-C-G---ATTATTTTTTA-G-GGTG---T-TTTG----TAAT-TGT----TGGCTG-----CACA----CTTCT--------A----GATAAAGTTT-T--------A--GAGTCTTAGC-A-CTTAC---AA---C
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C----A-AGGCAAT-GTTG--CAG-TG-GTCTTT----CAC--C--------------TCT-T-TGTCAAA--CAACA-C-T-GAAG-AA--TTCCAAAATTGGG-ATG--T---TTGAT-TT-T-CATGC-----T-AATT-A-T--GT-GTT--A---G-GTCA-AT-AA--------------CA------------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT---GA-CCAAAATTGTTTTC-TT---A----------CT-GCG---------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------GTTTGA-A-GCCATTA-CCATA-G--CTTCAT---GT-C--A-TACT---TGACC-A--CC-C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTA-GAAG---TC-AAA---------T----------A-TTC---------AA-CT-G-TTAAA---T-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATACAA-T-GAT-AA-A-GAA---TTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTT-G-AGCTATAAATTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attttacattgacaaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggGA-A-ACCA-TA-CCATA-G--C-TCA----------A-GAC------A-T-A--CC-CC-------AT--TTTTC-C-------TTTCAA-CC-TTC-TA---TTTTT---GG-G-TAG-AA-CAGGAAAT--C-ATTTAT--GACA--TTT---T--ATT-GT-TTTC-AT-TC-CT-GT-C----------T--ATG--TCTG-TCT-A----ACCCATC----------------TTG----AA----------TA--AATAGTTCC-AGGAAACT---TGTTATAA--TTTTT------A--C-AATTT------AT-A
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAT---AT-CCTAACT--TCGTC-CT---A----------TT-GT----------CATAAA-TGTA-TTCAAGG------G-TAGA-A-ACCT-TA-TCATA-G--C-TCAA---GT-C--A-TACT---TT--T-A--TC-TG--T----CA--TTTTT-C-------TTTCAG-TT-TTG-TAG--TTTT----TG-G-TAG-AG-CAGGAAAT--C-ATT------A-A--TT--------TT-GT-TTTC-Atgtcctct
gi|2                          :   ttgagggtgtgtaTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-ATAGCCAATA--------TTT-C-C-ATGCCA-GTGGCC-AATAACCG-G-A--TTTACCGCTAA---TTCAGT-A--A-AT-C--CGTGCA-AA-ACTG-GT-CAATTGGAA----AT-AACC-ACA-A------TGGAATT-TATATA-TTGA----AAC---TCGTT-C---TT--GTTA-TGTT-----ATAC----CA-------CTGCG-TC-AA---TA---------GATTTA---TTTCTT-A-A--GAAATTGAAG-TTA-TTC-TA-TT-A-TAC--TTG--AATT-AT---GAG-TTT-----------A---C-TT--TTTTT----CCA-CCT------TT--------------T-AATATTAA---TT--ATAA-C-A-T-A-----TATTTTT-A-G-GGTG---TGTTTG----TAAT-TGT----TGGCTG-----GACC----AATCT--------A----AATTAAGTTT-TA-------A--G--CCTTAGC-ATCTTAC---AGAGTCTGT-TTTTGGCCA--GTT----C-AGGCA-T-GTTG--CAG-TG--TCTT-----CAC-----------------TCT-T-T-TC-AA--CAACA-CAT-GAATAAA--TTCCAAA--TGG--ATG--T---TTGGA-T----CATGCTG-AA--------------------ATT-GTGT-A-GT-CAA-T------AA----A------------------------G---------------T--------------------------G----AT-AT---GA-CAAATAT--TTGTC-TT---A----------CTCGC----------TGTAAA-TGTA-TTGGGGG------T-TTGA-A-GCCA-TA-CCATATG--C--CATAAAGT-C--A--ACT---TGA-C-C--CC-CT--T----TT--TTTTC-C-------TTTCAA-CTCTCC-TA---TTTG----GG-G-TG---A-C-GAAAAT--CGATTTGTT-GATAGATTTATAT--ATT-AG-TTT--AT-CT-TT-GT-T----------T--ATG---CTGATCT-ATGGAACCCACC----------------CTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTTA------A--CCAATTT------ATTACC-ATA----C-ATATGTC---TTTC-TT---TTAACTTGATC-AGGTGGCCACCA-TGCACAG-TAGAATTATACCCAGCATGATG-ATGT--TT------TATC---CTGTATTTTATTAAT--TTGTTTA------A-AAAAATTTT-GT--T-TA-TCT-TAATT---TTG-TGTA-TGAGCG-TT-AAAG--------TC-A----AAAA-TTC---------AA-CTTG-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-AATTT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-TTAATACAA-TTGAT-AA-AAGAAAATTTATTTTAGATTTACTTCGATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTTTGAAGCTATAAAT--ACTTTTAAA---ACG-----TTCATGACC-AGTATTTACCGGTATTTGCCACTTGAGTCTT-ATTTGCCAGTCC-GTAAATA-CGGTAAATGTCCGCGGTAATTACC-AGGG-GTT-GGAA-TTA-CGCCCAACCCTGa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                            T-A-TA-------CTG-G-TC-AA---TA---------AATTTT---CTTCTT-A-A--GA--TTGAAG-TTA-TTCCTA--TCATTAC--T-G--AATT-AT---GAG-TTTGA----A-G--C---C-TT--TTTTT----------T------TTACA--CT------TTAAAT-TTACAT-TT--ATT
gi|21                         :             GGTTGGC-AAAATGCCG-AC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTtaatatctgttgacagaaggatctgattggacactttttttat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agA--CT------TT-AAT-TTATAT-TT--ATTA-C-A-C-A---ATTATTTTTGA-A-GGTG---C-TTTG----TGAT-TGT----TGGCTG-----AACA----CTTCTCCCTATGTG----CATAAAGTTT-AA-------A--GAGCCTTAGC-A-CTTAA---AA---CTGT-TA--GGT-A--GTC----A-AGGCA-T-GTTG--ttttcatggcccttggcctcataacaatagcagattctgaatttatagtt
gi|23                         :             GGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAA-ATACCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-T-GTTG--CAG-TA-GTCTTT----CAC-----------------TCT-T-TGTT-AA--CAACA-C-T-GAAGAAA--agaaaactcagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T--GGC-A--GTCGATCA-ATGCA-T-GTTG--CAG-T-----TTT----C----T---TT--------ATCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-AAAG----------------GA-ATG--T---TTGGA-TT-T-CATTCTT-AAagtaggaaaggatttgttgtttttgtgggtagtttgtgtc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                              GTTTT-----A-GCT-A-CG-------CTG-G-TC-AA---TA---------G--------------------GA--TTGAAG-TTA-TTCCTA-CTTA-TAC--T-G--AAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tatttaaaacgtcaagtgcctgtggTG----TAAT-TGT----TGGCTG-----GACA----TTTCT--------A----AATAAAATTT-TA-------A---AGCCTTAGC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--G
gi|28                         :                                                                                                        -ATTCCACC-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CTATTG--AATCGATCGACC-ACA-G------TAAAATT-TATATA-T
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATGCCAGCGGTAAATACCCAGGG-G-TTGGAATTTACCGCCCAACCCT
gi|3                          : ccgtaagattagGGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGTCG-CTGGCA-AATA-CCG-GTA--ATTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCAACC-ACA-C------TGGAAAT-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGTTAGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CCG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--G---TTGAAG-TTA-TTCATA-TTCA-TAC--T-G--AATT-AT---GAG-TTTTA----A-G--G---T-TT--TTTTT----TTA-ACT------TTACA--CT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTA-C-A-CAA---ATTA-TTTTTA-G-GAT----T-TTTG----TAAT-TGT----TGGCTG-----TACA----CTTCT--------A----AATAAAGTTT-TA-------A--GAGTCTTAGC-A-CTGAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC------AGGCA-T-GCTG--CAT-TG-GTCTTT----CACCTC---TT--------GTCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG--T---TTGGA-TT-T-CATGCTG-AAT-AACT-A-TG-GT-GAT--ATT-G-GT-A-AT-TTG-T------AGGC-CT------------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT---GT-CCAAAA-----G-C-TT---A----------CT-GC----------TGT-AA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGA-A-ACCA-TG-CCA-A-G--C-TCAT---GC-C--A-TACT---TGA-T-A--CC-AC--T----CG--TTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TA---TTTT-----G-G-TGG-AA-CAGAAAAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-AT-CT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TCT-A----ACCCACC----------------CTG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---G--TTTAA------A--C-AATTT------AT-ACC-ATA----T-GGT-GTC---TT-C-TT---ATAACTAGACC-AGGTGGC-ACCA-TGCACAGGTAGATTTATACC-AG--TGATGTATGT--TTAA-CTTTACC---C-ATATT--ATTGAA--T--TTTG------A-A----TTTT-TT--T-T-ATCT-GAATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT-AAA---------TC-A----A-GA-TTC---------AA-CT-G-TTAAAA-AT-GT-T-TCAGCC--TAGG-A--TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-T---TTAA-T-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATATAA-T-GAT-AA-A-GAA---TTACTTTAGATTTACTTTGATTTCA-TAT-TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATAAATTTACTTT-AAA---A-G-----TT---GACC-A-TATTTGCCGGTATTTGCCACT-GAGTCTT-ATTTGCCAGTCCGGTAAATACC-GTAAATGCCAGCGGTAAATACC-AGGG-G-T-GGAATTTACCGTCCAACCCTGct
gi|30                         :             GGTTGGC-AAAATGCTG-GC-CTTT-AT--TGA-TA--------TTTTC-C-ATGTCA-CCGG
gi|31                         :            agGTTGGC-AAAATGCCG-GT-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCATCTGGgtaaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ga---TTTT----AG-A-TGG-AA-CAGAACAT--T-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-AT-CT-Ctgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TACA--CT------TT-AAT-TTGAAT-TC--ATTA-C-A-C-A---ATTATTTTTTA-G-GGTG---T-T
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --GATA--ATT---T--GCT----TTTC-AT-CT-CT-GT-T----------T--ATG--TCTG-TCT-A----ACCCAC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCACCAGTAGAATTATACC-AG--TGATGTATGT--TT-
gi|4                          :              GTTGCA-AAAATGCCG-GCCATTT-AT--CCA-TA--------TT--CGC-ATGCTG-CTGGCACAATA-CCG-GTA--TTTACCGGTAAGATTCCAGT-A--ATATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCAAAC-CCT-C------TGGAATT-TATAT--CTTA----A-CTGTT-GTT-C---TTTGGTTAGTTTA-----C-ATT-A-CAC------CTG-G-TC-AA---TA---------GA-TTT---ATTCTT-A-A---A--TTGAAG-TTT-ATCCTA-TTCA-TAC--T-G--AATT--T---GAG--TTTA----A-G--T---TGTT--TTTTT----TTA-ACT------TTACA--CT------TT-AAT-TTAAAT-TT--ATTACC-A-C-A---ATTATTTTTTA-G-TGTGT--T-TTTT----TAAT-TGT----TGGCTGT----TACA----CTTTC--------T----AATAAAGTTT-TT-------A--GAGTCTTACG-A-CTTAC----A---CTGT-TTG-GGC-AAGATC------AGGCA---GCT---CAT-TG-GTCCTTTCCACAC--TG--TT--------GTCT-T-TGTC--A--CAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGA-CTG--T---TTGGA-TT-T-CA-GCTG-AAT-ACTT-A-TG-GT--AT--ATTGG-GT-A-ATGTGG-T------AGGC-CT------------------------G------------------------------------------G----ATTAT---GT-CCAAAA-----GTC-TTAG-A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA--TGGAGG------GATTGA-ATACCA-TA--CATA-G--C-TCAT---GT-C--A-TACT---TGA-T-T--CC-CCCTC----CT--TCTTC-C-------TTTCAA-CT-TCC-TAT--TTTT----GG-GTTGG-AA-CAGAAAATAGA-ATTTGT---ATA--ATT---T--ATT-GCTTTTC-AT-CT-CT-GT-T----------TA-ATG--TCTG-TCT-A----ACCCACC-----------------TG----AA----------TT--GACAGTTTC-TTGAAACT---TGTT---GTTTTTTA------A--G-CATTT------AT-A-C-ATA----T-G---G-C---TT-C-TTAAGATAACTA-ACC-AGGTGGC-ACCACTGCACAGGTAGATTTAT-CC-AG--TGAT-TATTT--TA-A-CTTTACC---C-ATATT--ATTAAGACTTGTTTA------A-A----TTTC-TT--T-TTATCT-TAATT---TTG-TATA-GGAG-G-TT--AA---------TC------ATAA-TTC---------AA-CT-G-TT-AAA-AT-GT-TCTCAGCCT-TAGG-A--TT------------------TAATTCCTGTCG-AA--TAAT-TTTGA-T---TTAACT-C-----AA-TT-TTAATGT-TGAATATAAGT-GAT-AATA-GAA---TTACTTTAGATTTA-TTTGATTTCA-TA--TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATAAATtacc
gi|5                          :                TGGC-TAAATATTGAGC-ATT--AT--CTA-CAAATAAATTCTTTC-A-ATGC-G-TTCGCG-AATA-TCTTGTA--ACTA--GGTAA---TGTAGTTA--A-ATGCACTG-GCA-AGTACTG-TT-GAATCA--A----ATTGATC-ACA-CATCTTCTGGAATT-CTCATC-TTTACTAAA-C---T-GTT-CAGGTTTGGATTGTTTTTAGATA-AAT-A-AAGGAATATCTG-GGCC-AAGGGTACAAAATCACGATTTTTATATTCTC-ATACTAA--TTGA-G-TTAATTCCTAATTCA--ACAAT-GGAAATT-ATAGTGAGATTTTAGATTA-G--TATGT-TT--TTTTTTTTCTTATACTATATACTTACA--CTGTCAAATT-AAT-TTTAATGTTGAATTA-CAA-C-A---CTT-TTTGTTGTG-GATGTACT-TTTGTGGTTAATATGTG---TGGCTGTTGTAAACA----CTTT--------------AGTAGAGTTT-AA-------AATGAGTCTTAGCAA-CTAAC---AA---ATGTATTTGGGT-A--GTC----AGAGGGA-TCACTG--CAT-TGTTTCTTT----CAC--T---CTCATTAGCGGTCA-T-TGTT-AACTCCATA-C-TCGAAGGAAACTTCGGAA--TGGG-ATAGTT---TTGGA-TT-TAGGTGCTG-TATAAACTAA-TG-GT-GATTAATA-G-GTAA-AT-TAG-TTAAGTGAGGCACA------------------------A---------------T--------------------------GGTGAATTAT---GT-TCAAAGT--TAG---TT---AGACCAGAGAGCT-GC----------TTGCAA-TGTA-TTGGAGGTGAATTG-TTAACA-ACCACTA-CCGAA-G------AA---GT-A--A-TAGTATCTG--T-A--CCACA--TTCAGCT--TATTG-CGTGGTGATTAGAG-CT-TCCTTACTTTTTT----GG-GTTGT-GA-CATAATAT--A-ATTTGCTAGAT---TTT---T--ATT-G---TTT-AT-CTACT-GT-TGTGTTGGAAGT--ATAACTTTG-TCTCA----ACC--TT----------------TTG----AA----------TGAAGGCGATTTCTTTGAAACTAGGTAAT---G--TTTTA------AACC-AATTT------AT-A-A-ATA----T-G---GGT---TG-CTTT---ATA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aggtgaTT----TTA-ACT--------ACA--CTGA----TC-AAT-GTAGAT-TT-------------------TATTCTTAA-G-A---------TTG----AAGT-TAT----TC-CTA-----TTTA-----TACT--------G----AATTATGTGT-T---------------TTTA-C-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A-AGAAA-T-TGTG--CAG-AG-GTCTTT----T-------------------TCT-T-TGTC-AA--CAACA-C-T-GAAGGAA--TTCCAAA--TGGGGATG--T---TGGGA-TT-T-CATGCTT-AAT-AACT-A-TG-GT-GAT--ATT-G-GT-ACAT-GTG-T------AGGT-CTGTACGTACAGTAAGAAGAATAGCAG---------------T--------------------------G----ATTATAATGA-CCAACAT--TTGTC-TT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGA-A-ACCA-TA-CCATA-TACC-ACAT---GC-C--A-TACT---TGA-T-A--CC-CCAGT----CT--TTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCA-TA---TTTTTT--GG-G-GAG-AA-CAGAAAAT--T-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATT-GC-TTTC-AT-CT-CT-GT-T----------T--TTG--TTAA-TTT-A----ACCTATG----------------TTGAATTAA----------TT--GACAGTTTC-TTGGAACT---TGTT---G--TTTTA------C--C-AATTTATTATAAT-ACC-ATA----T-G---ATC---TTGC-------TAACTAGACC-AAGTG-----CA-TAC-TAGGAAGAATTATACC-AG--TGATGTA------T-A-TTTTACC---T-GTATT--ATTACA--TTGTTTACCCGGTACA----TTTTATT--T-TAATCC-TGATT---TTG-TATA-TGAG-G-TT-AAAATTAACAATTC-A----ACAATTTC---------AG-CT-G-TT---A-AT-GT-T-TCAACCATTAGG----TT------------------TAA-TCCTGT-G-AA--TAA--TTTGA-TTTATTAA-A-C-----AA-TT-TTAATGT-T-AATACAA-T-GAT-AA-A-GA-----------------------ATTTCA-CA--TTTTGA-AT-TGTT-GAAGCTATGAATTTACTTG-AAA---
gi|7                          :       ggttagGGTTGGC-AAAATGCCG-GC-ATTT-AT--ATA-TA--------TTTTC-C-ATGCCG-CTGGCA-AATA-ACG-GTA--TTTACCGGTAA-ATTCCAGT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-GT-CAATTG--A----ATCACCC-ACA-C------TGGAATC-TATATA-TTTA----A-C---T-GTT-C---TTTGGCAGGTTTT-----A-ACT-A-CA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTGAGG-TTT-TTCCTA-TCCA-TCC--T-G--ATTT-TT---TAG-TTTTA----A-GTTT---T-TT--TTTTT----TTA-ACT------TTACA--CT------TT-AAT-TTAAAT-GT--ATTA-C-A-C-AATTATTATTTTTTA-G-GCTG---T-TTTG----TAAT---------------------CA----CTTCT--------A--------------------------------------A-CTTAC---AA---T--T-TT--G---A--GTC----A-AGGCA---GCTG--CAATTG-GTC-TT----CAC--CTCTTT--------GTCTGT-TGTC--A--CAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAT--TGGG-ATG--T---TTGGA-TT-T-CATGCTG-ACA-AACT-A-TGCGT-GAT--ATT-G-GT-A-ATAGTG-T------AGGC-T-----------------------------------------T--------------------------G----ATTAT---GA-CCAAA------GTC-TT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGA------A-TTGA-GCACAA-TA-CCATA-A--G-TCAT---GTAT--ATTACT---TGATT-ACCCC-CC--T----CT--TTTTC-C-------TTTCAA-CT-TCCTTATT-TTTT----GGTG-TGA-AA-CAGAAAAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--A-T-GC-TTTT-AT--T-CTAGT-T----------T--ATG--TCTG-TCT-A----gctcaatttg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gCT-A-TG-GT-GAT--ATT-T-GT-A-AT-GTG-T------AGGC-CAT-----------------------G---------------T--------------------------G----ATTAT------TCAAG------GTC-TT---A----------CT-GCAGACAAGTGCTGATAA-TGTA-TTGGAGG------GGTTGA-A-AC-A-TA-C-ATA-G--C-TCAG---GT-C--A-TACT---TGA-T-A--CC-C---T----CC--TTTTC-C-------TTTCCA-TC-TC--TA---TTTTT---GG-G-TGGGAA-CGAAACAT--A-ATTTGT--GATA--TTT---T--ATTTGC-TTTC-AT-CT-CT-GTGT----------T--ATG--TCTG-TCT-G----A----------------------------------------------ACA----C-CTGAA------------------TTA------C--C---TTT------ATTACCTATA----T-G---GTCC--TT-C-TT---A--ACTAAA----GGTGGC-AC-A--GCATCGGTA-ATTTATACC-AG--TGATGT-TGT--TT-AACTTTACC---C-ATATT---TTAAA--TTGTT-A------A-A----TTTT-TT--T---ATCT-TAATT---TTG-TATT-GGAG-G-TTAAAA---------TC-A----ATGA-TTC---------AAGCTGG-TCTAAA-GT-GT-T-CAAGCCG-TAGG-A--TT------------------TAA-T-CTGT-G--A--TAA--TTTGA-T---TTAA-TAC-----AA-TT-TTAATGT-T-AATAT-A-T-GATAAA-A-GAA---TTA-CTTAGA-TTACTTTGATTTCA--A--TTTTGAGAT-TGTT-GAAG-TATAAATTTACTTT-AAATTCA-C-----TT---GACCAAGTA---------GTTTG-CACTTGAGTCTTAATTTG-CAGT-CGGTAAATACC-GTAAATGGCAG-GGTAAATACC-AGGGTG-T-GAA--TTACCGCCCAACCCTG
gi|9                          :              gTTGGC-AAAATGCCA-GC-ATTT-AT--CCA-TA--------TTTTC-C-ATGCCA-CTGGAA-AATA-CCG-GTA--AATGCCGGTAA-ATTCCACT-A--A-ATGC--CG-GCA-AATACTG-TT-CAACTG--A----ATTGACC-AAA-G------AGGAATT-TATATA-TTCA----A-C---T-GTTTC---TTCAGTTAGTTTT-----A-ACT-AATA-------CTG-G-TC-AA---TA---------GATTTT---ATTCTT-A-A--GA--TTGAAA-TGA-TTCCTA-TTTA-TAC--T-G--AATT-AC---GAG-TTTTA----A-G--C---C-CT--TTATT----TT------------TACA--CT------TT-AAT-TTATAT-CT--AT----------------ATTC---A-G-GGTA---T-TTTG----TGAT-TGT----TGGCTG-----GACA----CTTCTCTCTATGTG----CATAAAGTTTATAAAGTTTTA--GAGCCTTGGC-A-CTTAC---AA---CTGT-TT--GGC-A--GTC----A-AAGCA-T-GTTG--CAG-TG-G----T----CA-------TT--------ATCT-T-TGTC-AA--TAACA-C-T-GAAGAAA--TTCCAAA--TGGG-ATG--T---TTGGG-TT-T-CATGATT-AAT-AACT-A-TG-GT-GAT--ATT-A-GT-A-AT-ATG-C------AGAT-CT------------------------G---------------TAGAGTAAAAGGAGTACATGTAGCAGTG----ATTAT---GA-CCAAAAT--TTGTC-TT---A----------CT-GC----------TGTAAA-TGTA-TTGGAGG------A-TTGT-A-ACCA-TA-CCAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): ATATCTAAAACGTCAAGTGCCTGTGGGTTTT