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gi|4                          : tgaaatggtgtttatattgaagggccttgtagtgaacctttgttattccgtgaagattctggaaacttttcttaggtgatgctaaattaacctctttaaggggctctgttggatgcttccttgttcaattgactcctatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgcc-----------AGGT----GTTATT---G-AC-CTTC-GTTA--T-GACCTTT-A----TT----CGTGAAGATTCGAAACT-Ttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -----------AGGT----GTTATT---A-AC-CTTC-GTTA--T-GACCTTT-A----TG----TATGAAAATCCGAAACT-Ttcaggtcagctaaataacctttaggggcctgtgggactccttttaatgactatatctgcttgagctcgttgttgctttgccctttataaatgttgtttgatttcatgacccctacgttactagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaaaggttttattaaccttcgttatgacttttattcatgaaaaatcgaaactttcatgggagctaaataaccttcaggggcctgtggaaccccatttaatgactcctcttcttgagttcgttgatgtctcccctttaataattgtttttgaattccattggcctattagttaacggagttataggggtgtgaaatgttggc
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAGGTGTTATTAA-C-CT----TC-GTTA--TG-A--C-CTT--TATG-TA--TG-AAAATCCGAAAC---TTTCAGGTGA-GAT-AAATTAC--CTTTAGGG-GCCTG-T--GGAAG-C--TCATT--TATT-G---AC-
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aggtgTTAT-TA-C-CC----TAAGTTA--TG-A--C-CTT--TATG-CG--TG-AAAATTCGAAAC---TTTCAGGTGA-GCT-AAATCAC--CTTTAAGG-GCCTA-T-----ACAC--CCTTT--CATT-G---AC-TCTAAC--AGCTTG-----ACT-TT-TTTT--ATG-GCT-TG-CCTTTTA--TCATTC----TTGTTTCCTTCTATAACCCCTAC-TTCACTAGTT-TATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaaaggttttattaaccttcgttatgacttttattcatgaaaaatcgaaactttcatgggagctaaataaccttcaggggcctgtggaaccccatttaatgactcctcttcttgagttcgttgatgtctcccctttaataattgtttttgaattccattggcctattagttaacggagttataggggtgtgaaatgttggc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gT-AA-C-AT----TC-GTT----A-A--C-CTG--TATG-CG--TG-AAAATTCTAAAC---TTTCAGGTGA-GTT-AAATTAC--CTTT--GG-GCCTG-T--GGAAC-C--CCATTAATAATTG---AC-TCTATC--TGCTTG-----AGT-TC-GTTG--TTG-------------------AATG----TTGTTCAATTCCATTACCCCTTCTTTTACTAG-TGTATAtggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctcttgttttatcactattgcttcttttatacccctactttaactagatataggggtcttaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttaa--TG-A--CCTTT--TTTG-CGGGTG-AAA--TCGAA-A---CTTTAGGTGA-GCTAAAATAAT--CTC--AGG-Gcgaaatcagtcatcataattgactgaaatgtggtcctaccctcttgaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatgttattaacctttattagcacccatgtgatgcatcatttggaactttcaggtgagctcaattgccttcaagtatcaaactagataatcaagaatatatttattaattatttgttcgaacaattagattgattgtttgataattttcagtattctcgtctaagaactttcagtactttgatgaattttcttattggctgctggttagtggctgttagcttcagctagcctggtcaaaactttcacctcagtaatgtcattaggttgaaaacaccagtttattattttggactagaatactatatagtatatcaatttattggttaaatcaaaat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgaAATTCGAAAC---TTTCAGGTGA-GTT-AAATAAC--CTTTAAGG-GCGTG-T--GGAAC-C--CCATT--TAAT-G---AC-TCTATC--TGCTTG-----AGT-TC-GTTG--TTG-TCT-TG-CCCTTTG--TTAATA----TTGTTTGATTCCATGACCCATAC-TTGACTAG-T-TGTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCAGGTGA-GCT-AAA-AAC--CTggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ccttcggTTTAAGG-ACGTA-T--GGAAA-C--CCATT--TGAT-G---AC-TATATT--CGCCTG-----gacatatttccgtattc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ca-C--CCATT--TAAT-G---AC-TCTGTC--TACTTG-----AGT-TC-GTT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTA--TCACTA----TTGCTTCCTTTTATACCCCCTAC-TTTACTAG-T-TATA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtggccccacctctttgtGTAAAGGTGTTATTAACCTTCGTTATGA--CCTTTAT-G-T--ATGA---A--AATC-CGAAAC--TTTCAGGTGAGAT-AAATTA---CCTT--TAGGGGC-CTG-T--GGAA---GCTCAT---TT-ATT----G---AC-ggtttctgacataaatgatgttgccccaccctcttg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acataaacattttgtttgaatatttatatttgtacgatgagttataggggtctgaaatgtggacacaccttcttggggccctaattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGTGTTATTGACCTTCGTTATGA--CCTTTAT-T-C--GTGA---A--GATT-CGAAAC--TTTCAGGTCAGCT-AAATAA---CCTT--TAGGGGC-CTG-T--GGGAC--TCCTT----TT-AAT----G---AC-TA-TA----TC--TGCTTG-AGCTCGTTGTTGC--TTTG-------C--CCTT-----------TATAAA-----TG-TTGTTTGATTTCATG-ACCCCTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTGTGACT---CTTCGTTATGAACCTTTTAT-G-C--TTGA---A--AATT-CGAAACTTTTTCAGGTGAGC---AAT-----CTCT-TTA-GGGCTCTG-TTGGGAACTTGCCT-----TT-AATG---G---ACTTC-TA----T---TGTTTGTAGTCTG--GTTGG--TTTGTTTTTGTC--CCTT-----------TTTAAA-----TGTTTGTTTGAGTTCATG-ACCCCTAcgttactagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaaaggttttattaaccttcgttatgacttttattcatgaaaaatcgaaactttcatgggagctaaataaccttcaggggcctgtggaaccccatttaatgactcctcttcttgagttcgttgatgtctcccctttaataattgtttttgaattccattggcctattagttaacggagttataggggtgtgaaatgttggc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgaaatggtgtttatattgaagggccttgtagtgaacctttgttattccgtgaagattctggaaacttttcttaggtgatgctaaattaacctctttaaggggctctgttggatgcttccttgttcaattgactcctatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttTGTTATTAACCTTTATTAGCA--CCC--AT------GTGATGCATCATTT-GG-AAC--TTTCAGGTGAGCT-CAATTG---CCTT-cgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTAACATTCGTTA--A--CCTGTAT-G-C--GTGA---A--AATT-CTAAAC--TTTCAGGTGAGTT-AAATTA---CCTT--T--GGGC-CTG-T--GGAA---CCCCA----TT-AATAATTG---AC-TC-TA----TC--TGCTTG-AGTTCGTTGTTGA------------------------------------A-----TG-TTGTTCAATTCCATTACCCCTTCTTTcactagtttatatggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctcttgttttatcactattgcttcttttatacccctactttaactagatataggggtcttaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttttaaGTGATGA--CCTTTTT-TGCGGGTGA---A--A--T-CGAAAC--TTT-AGGTGAGCTAAAATAA---TCTC-Atccgaaatcagtcatcataattgactgaaatgtggtcctaccctcttgaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatgttattaacctttattagcacccatgtgatgcatcatttggaactttcaggtgagctcaattgccttcaagtatcaaactagataatcaagaatatatttattaattatttgttcgaacaattagattgattgtttgataattttcagtattctcgtctaagaactttcagtactttgatgaattttcttattggctgctggttagtggctgttagcttcagctagcctggtcaaaactttcacctcagtaatgtcattaggttgaaaacaccagtttattattttggactagaatactatatagtatatcaatttattggttaaatcaaaat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTCTGG--CCTTCAT-G-C--GTGA---A--CATT-AGACGC--TTTCAGATGAAAT-AAATggg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --AATT-CGAAAC--TTTCAGGTGAGTT-AAATAA---CCTT-TAA-GGGC-GTG-T--GGAA---CCCCA----TTTAAT----G---AC-TC-TA----TC--TGCTTG-AGTTCGTTGTTGT--CTTG-------C--CCTT-----------TGTTAA-----TA-TTGTTTGATTCCATG-ACCCATACTTtgcatttaagag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----TT-AAT----G---AC-TC-TG----TC--TACTTG-AGTTCGTTgactagttgtaggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTGATGTGCCAATCAAACTGTTCAGACGAGTTAAAGTGTTCAATAGGTTATTAACAATCACAATTAACAATTCTATTAAAATTTATTTTAAAATTCATATTTGCAAAATTTTAATATTCTGTCTGATAACTCTAAGTACTTTGAGGATTTTCTTATTGGCTGCTGATACGTGACTGCTAGCTTCAACCTAG
Unaligned ( gi|11 ): ATTTATTAATTATTTGTTGAAAAAAATTATCACATTTGATTGATTGTTTGATTATTTTCAATATCCTCGTCTAAATACTTTCAGTACTCTGATGAATTTTCTTATTGGCTACTAATTTCTATAGGCTTATTGGCTGCTGGTTAGTGGCTGCTAGCTTCAGTCT






Alignments
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgaaatggtgtttatattgaagggccttgtagtgaacctttgttattccgtgaagattctggaaacttttcttaggtgatgctaaattaacctctttaaggggctctgttggatgcttccttgttcaattgactcctatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctTTGCC-ATACTCATTTTCGTTGAACTCTTCAAAGGTATAAGT---GTTTGTGTGACTCTTCGTTATGAACCTTTTATGCTTGAAAATTCGAAACTTTTTCAGGTGAGCAATCT-CTTTAGGGCTC--TGTTGGGAACTTGCCTTTAATGGACTTCTATTGTTTttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttgtgtgactcttcgttatgaaccttttatgcttgaaaattcgaaactttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgaaatggtgtttatattgaagggccttgtagtgaacctttgttattccgtgaagattctggaaacttttcttaggtgatgctaaattaacctctttaaggggctctgttggatgcttccttgttcaattgactcctatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttgtgtgactcttcgttatgaaccttttatgcttgaaaattcgaaactttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaa-GGGCCAGTGTGATAGACCCCT-TTTTGTAACT--TGTACTCCATT--CTTGAGTTGTCGTTGTTGA--TG---TTTGTAAATTTTAATTGTTGTTTTTGCTTCCATGACCCCTgtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
gi|10                         : tgaaatggtgtttatattgaagggccttgtagtgaacctttgttattccgtgaagattctggaaacttttcttaggtgatgctaaattaacctctttaaggggctctgttggatgcttccttgttcaattgactcctatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttgtgtgactcttcgttatgaaccttttatgcttgaaaattcgaaactttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtAATTC--G----A-AAC--T----TTC---AGG-TGA-G---TT-AAATAA-C--CTTT---AA-GG-GC-GTG-T--GGAA-----C-C--CCA----TTTA-AT-G---AC-TC-TAT--C--TGCTT-----G-----AG-T-TC--GTTG--TTG-TCT-T-----G-CCCTT-----------T-GT----TA-----ATA-TT-GTTTG-ATT--CCA-TG-ACCCATA-CTTGACTAG-TTGTAcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTATCA----CTATTGCTTCCTTTTATACCCCCTAC-TTTACTAGTTATAGGggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgtggccccacctctttgTT-CT-G-G---CCTT--CAT-G-C-G--TGAACATTA--G----A-CGC--T----TTC---AGA-TGA-A---AT-AAATTG-C--ATTT---AA-GA-Gtttctgacataaatgatgttgccccaccctcttg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GTG-AT-G-A---CCTT--TTTTG-C-GGGTGAAA--TC--G----A-AAC--T----TT----AGG-TGA-G---CTAAAATAA-T--C-TC---AG-GG-
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTT---AA-GG-AC-GTA-T--GGAA-----A-C--CCA----TTTG-AT-G---AC-TA-TAT--T--CGCCT-----G-----
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ca-C--CCA----TTTA-AT-G---AC-TC-TGT--C--TACTT-----G-----AG-T-TC--GTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGCCTATATTCATTT-CGTT-----------------AGGTTAAGTTT-T-TTAC-ATTAGTTATAA--CCTTTATGCGTGAAAATTCGAAACTT-----AATG--------GCTT--AACTTTGTTGTTG---GTTTGCATTTTATCA----ATATTGTTTCCTTTTATAACCCCTAT-TTCACAAGATAAAGAGGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGTTTTTAT-AA-C-CT----TC-GTT-TT-G-A---CTTT--TAT-G-C-A--TGAAAATTC--G----A-AGA--T----TTC---AGG-TGA-G---CT-AAATAA-C--CTTT---AA-GG-GC-CCG-T--GGAA-----C-C--CCA----TTTA-AT-G---AC-TC-TAT--C--TGCTT-----G-----AG-T-TC--GTTG--TTG-TCT-T-----G-CCCTT-----------T-AT----CA-----ATG-TA-ATTTG-ATT--CCA-TG-ACCCCTA-CTTTACTAG-TTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAAAGGTGTAATTAACCTT-CGTTATGACCTTTAT-TC--G-TGAA-AA-TTGGCAACTTTCAGGTAAGCTAAATAACCTTATA-GGGCCTGTG-GA---AGGCTA-TT----AA----TG-ACTCAATGTGCTTGAGTT--CGTTGTTGACTTGCTCTTTATAAAT-------GTTGTTT--GATTCCAT-CCCCCTATTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cattacgaacaagccaccaccttcgttttaaacgctccctttgttcatatgatacagagatcacaaattccaaaccttcaaatggtactcgtactgtgataaactgaaggtggaaaataatagtctagttagctctcccagctagctg-GTT-TT-A-A---TTTT--CAT-G-TTG--T-AGAATTA--G----G-AAC--T----TTC---AGG-TGA-G---CT-TAATTG-C--CTTT---AT-AT-GC-TTA-T--GCGA-----C-T--CAA----TTTA-AC-G---AA-TC-AGA--C--TGTTT-----G-----AA-T-TT--GGTG--TTC-TCT-T-----G-CTCTT-----------T-AT----CG-----CTA-TT-GTTTC-ATT--CCA-TC-ACCTC
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gCTTG--TTTTATCA----CTATTGCTT-CTTTTAT-ACCCCTACTTTAACTAGATATAGGGGTCTtggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctcttgttttatcactattgcttcttttatacccctactttaactagatataggggtcttaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gttattaccctaagttatgacctttatgcgtgaaaattcgaaactttcaggtgagctaaatcacctttaagggcctatacaccctttcattgactctaacagcttgactttttttatggcttgccttttatcattcttgtttccttctataacccctacttcactagtttatatggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctGTAAAGGTGTTATTAACCTT-CGTTATGACCTTTAT-GT--A-TGAA-AA-TCCGAAACTTTCAGGTGAGATAAATTACCTT-TAGGGGCCTGTG-GA---AGCTCATTT----AT----TG-ACtaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTG--TTTTATCACTATTGCTTCCTTTTATACCCCCTACTTTA-CTAGTTATAGGggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtggccccacctctTTCTGGCCTTCAT-GC--G--TGAA-CA-TTAGACGCT----TTCAGATGAAATAAATTGCATT-TA-AGtttctgacataaatgatgttgccccaccctcttg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTGATGACCTTTTTTGC--GGGTGAA-A---TCGAAACT----TT-AGGTGAGCTAAAATAATCT-CA-GGGag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTATCACTATTGCTTCCTTTTAT-ATCCCTACTTTA-CTAAATATAGGGGTCT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTT---AA-GG-AC-GTAT--GGAA-----A-C--CCA----TTTG-AT-GA---C-TA-TAT--T------CGCCT-----G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caTTC---AGG-TGA-G---CTAAA-AA-C--CT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ccttcgg-C--CCA----TTTA-AT-GA---C-TC-TGT--C------TACTT-----G-AG-T-TC--GTTgacatatttccgtattc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGCCTATATTCATTT-CG-TT-----------------------AGGTTAAGTTT-T-TTA--C-ATTAGTTATAA--CCTTTATGCGTGAAAA---TTCGAAACTT------------AATG-GCTTAA--CTTTGTTGTTGG---TTTGCATTTTATCAATATTGTTTCCTTTTATAACCCCTATTTCA-CAAGATAAAGAGGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGTTTTTAT-AA-C-CT----TC-GTT-TT-G-A---CTTT--TATG-C-ATGAAAATTC--G----A-AG-A--TTTC---AGG-TGA-G---CTAAATAA-C--CTTT---AA-GG-GC-CCGT--GGAA-----C-C--CCA----TTTA-AT-GA---C-TC-TAT--C------TGCTT-----G-AG-T-TC--GTTG--TTG-TCT-T-----G-CCCTT-T-----------ATC----AAT-----G-TA-ATTTG-ATT--CCA-TG-ACCCCTA-CTTTACTAG-TTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAAAGGTGTAATTAACCTT-CGTTATGACCTTTAT-TC--G--TGAA-AA-TTGGCAACT----TTCAGGTAAGCTAAATAACCTTATA-GGGCCTGTG-GA---AGGCTAT---T----AA-T-G-ACTCAATGTGCTTGAGTT--CGTTGTTGACTTGCTCTTTATAAA-------TGTTG--TTTGATTCCA-T-CCCCCTATTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cattacgaacaagccaccaccttcgttttaaacgctccctttgttcatatgatacagagatcacaaattccaaaccttcaaatggtactcgtactgtgataaactgaaggtggaaaataatagtctagttagctctcccagctagctg-GTT-TT-A-A---TTTT--CATG-TTGT-AGAATTA--G----G-AA-C--TTTC---AGG-TGA-G---CTTAATTG-C--CTTT---AT-AT-GC-TTAT--GCGA-----C-T--CAA----TTTA-AC-GA---A-TC-AGA--C------TGTTT-----G-AA-T-TT--GGTG--TTC-TCT-T-----G-CTCTT-T-----------ATC----GCT-----A-TT-GTTTC-ATT--CCA-TC-ACCTC
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gT-GC--G--TGAA-AA-TTCGAAACTTTAATTCAGGTGAGCTAAATTAACTttactagtgtatatgggggggggggggttttggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgcgtgaaaattcgaaactttaattcaggtgagctaaattaactcagctggcattatttcattcc
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gCTTG--TTTTATCACTATTGCTTC-TTTTATA-CCCCTACTTTAACTAGATATAGGGGTCTtggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctcttgttttatcactattgcttcttttatacccctactttaactagatataggggtcttaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttattaccctaagttatgacctttatgcgtgaaaattcgaaactttcaggtgagctaaatcacctttaagggcctatacaccctttcattgactctaacagcttgactttttttatggcttgccttttatcattcttgtttccttctataacccctacttcactagtttatatggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctGTAAAGGTGTTATTAACCTT-CGTTATGACCTTTAT-GT--A--TGAA-AA-TCCGAAACT----TTCAGGTGAGATAAATTACCTT-TAGGGGCCTGTG-GA---AGCTCAT---T----TATT-G-ACtaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acataaacattttgtttgaatatttatatttgtacgatgagttataggggtctgaaatgtggacacaccttcttggggccctaattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAT-GAGC-CTGTTTTC-GTTTATTGTA---CTTTGTTATGTC-ATGAAAATTC--G----A-AAAC--TTTC---AGG--GATG---CTAA-TAA-CGTCCTC---AG-GGTGC-CTGTT-AGAA-----C-CA-CCA----TTTA-AT-GGGAGC-TC-AAT--CATTGCTTGCTT-----GTGG-T-TCT-GTTG--ATG-TTTGT-----G-GTCTT-TGTTTCCGTGGTATT----AATTTGTTG-TT-GTTGG-ATT--CCA-T
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTGATGTGCCAATCAAACTGTTCAGACGAGTTAAAGTGTTCAATAGGTTATTAACAATCACAATTAACAATTCTATTAAAATTTATTTTAAAATTCATATTTGCAAAATTTTAATATTCTGTCTGATAACTCTAAGTACTTTGAGGATTTTCTTATTGGCTGCTGATACGTGACTGCTAGCTTCAACCTAG
Unaligned ( gi|11 ): ATTTATTAATTATTTGTTGAAAAAAATTATCACATTTGATTGATTGTTTGATTATTTTCAATATCCTCGTCTAAATACTTTCAGTACTCTGATGAATTTTCTTATTGGCTACTAATTTCTATAGGCTTATTGGCTGCTGGTTAGTGGCTGCTAGCTTCAGTCT






Alignments
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTGTTTATATTGAAGGGCCTT--GTAGTGAACCTTTGTTATTCCGTGAAGA---TTCTGGAAACTTTTCTTAGGTGATGCTAAATTAACCT-CTTTAAGGGGCTC--TGTTGGATGCTTCC-TTGT-TCA--ATTGACTCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgaaatA-C-CT----TT-GTT-AT-----------------TC-C-G--TGAAGATTCTGG----A-AAC--TTTTCTTAGG-TGATG---CT-AAATTAAC--C--TCTTTAAG-GG-GCTCTG-T--T-GG---ATGCTTC-C--TTG----TTC---A-A--TTG---AC-TCCTAT--C--TGCCTTGTGAG-----GG-C-TCTTGTTG--TTT-TGT-T-----G-CCCTT-----------T-GTATAATAA-----T-------G-TT-GTTT--G-ATTTCCCA-TG-ACCCCTC-CGTTAatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttgtgtgactcttcgttatgaaccttttatgcttgaaaattcgaaactttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTG--TTTTATCACTATTGCTTCCTTTTATACCCCCTACTTTA-CTAGTTATAGGggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtggccccacctctTTCTGGCCTTCATGCG-TGAA-CATTAGACGCT----TTCAGATGAAATAAATTGCATT-TA-AGtttctgacataaatgatgttgccccaccctcttg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -GTG-AT-G-A----CCTTT--TTTG-C-GGGTGAAA--TC--G----A-AAC--TTT----AGG-TGA-G---CTAAAAT-AAT--C---TC---AG-GG-ag
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caTTC---AGG-TGA-G---CT-AAA--AAC--C--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccttcgg-C--CCA----TTT---A-A--T-G---AC-TC-TGT--C--TACTT-----G-----AG-T-TC--GTTgacatatttccgtattc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTGCCTATATTCATTT-CG-TT---------------AGGT--T-AAGT-TTT---TTA-----C-ATTAGTTATAA-CCTTT---ATGCG-TGAAAA---TTC--GAAACTT--------------------AATG-GCTTAA----CTTTGTTGTTGG---TTTGCATTTTATCAATATTGTTTCCTTTTATAACCCCTATTTCA-CAAGATAAAGAGGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGTTTTTAT-AA-C-CT----TC-GTT-TT-G-A----C-TTT--TATG-C-A--TGAAAATTC--G----A-AGA--TTTC---AGG-TGA-G---CT-AAAT-AAC--C--TTT---AA-GG-GC-CCG-T--G-GA---A-----C-C--CCA----TTT---A-A--T-G---AC-TC-TAT--C--TGCTT-----G-----AG-T-TC--GTTG--TTG-TCT-T-----G-CCCTT-----------T-ATC----AA-----T-------G-TA-ATTT--G-ATT--CCA-TG-ACCCCTA-CTTTAC--TAG-TTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAAAGGTGTAATTAACCTTCGTTATGACCTTTATTCG-TGAA-AATTGGCAACT----TTCAGGTAAGCTAAATAACCTTATA-GGGCCTGTG-GA---AGGCTAT---T----AA-T-G-ACTCAATGTGCTTGAGTT--CGTTGTTGACTTGCTCTTTATAAA-------TGTTG--TTTGATTCCA-T-CCCCCTATTT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGTGTTTATATTGAAGGG--CCTT-------GTAGTGA--ACCTTTGTTATTCCGTGAAGA---TTCTGG---A--AACTTTTCTTAGGTGATGCTAAATTAA----CCT-------CTTTAAGGGGCTCTGTTGG--ATGCTTCC-TTGT-T----CA--ATTGACTCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgaaatA-C-CT----TT-GTT-AT-----------------TC-C-G--TGAAGATTCTGG----A-AA-C--TTTTCTTAGG-TGATG---CT-AAATTAAC--C--TCTTTAAG-GG-GCTCTGT--T-GG---ATGCTTC-C--TTG----TTC---A-A--TTG-A---C-TCCTAT--C------TGCCTTGTGAG-GG-C-TCTTGTTG--TTT-TGT-T-----G-CCCTT-T-----------GTATAATAAT-------G-TT-GTTT--G-ATTTCCCA-TG-ACCCCTC-CGTTAatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttgtgtgactcttcgttatgaaccttttatgcttgaaaattcgaaactttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTG--TTTTAT----CACTATTGCTTCCTTTTATACCCCCTACTTTA-CTAGTTATAGGggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtggccccacctctTTCTGGCCTTCATGCG-TGAA-CATTAGACGCT----TTCAGATGAAATAAATTGCATT-TA-AGtttctgacataaatgatgttgccccaccctcttg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -GTG-AT-G-A----CCTTT--TTTG-C-GGGTGAAA--TC--G----A-AA-C--TTT----AGG-TGA-G---CTAAAAT-AAT--C---TC---AG-GG-ag
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --TTT---AA-GG-AC-GTAT--G-GA---A-----A-C--CCA----TTT---G-A--T-G-A---C-TA-TAT--T------CGCCT-----G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caTTC---AGG-TGA-G---CT-AAA--AAC--C--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccttcgg-C--CCA----TTT---A-A--T-G-A---C-TC-TGT--C------TACTT-----G-AG-T-TC--GTTgacatatttccgtattc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTGCCTATATTCATTT-CG-TT------------------AGGT--T-AAGT-TTT---TTA-------CATT-A-----GTTAT-A--ACCTTT---ATGCG-TGAAAA---TTC--G---A--AACTT--------------------AA----TGG-------CTTAA-----CTTTGTTGTT-G-GTTTGCATTTTAT----CAATATTGTTTCCTTTTATAACCCCTATTTCA-CAAGATAAAGAGGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGTTTTTAT-AA-C-CT----TC-GTT-TT-G-A----C-TTT--TATG-C-A--TGAAAATTC--G----A-AG-A--TTTC---AGG-TGA-G---CT-AAAT-AAC--C--TTT---AA-GG-GC-CCGT--G-GA---A-----C-C--CCA----TTT---A-A--T-G-A---C-TC-TAT--C------TGCTT-----G-AG-T-TC--GTTG--TTG-TCT-T-----G-CCCTT-T-----------ATC----AAT-------G-TA-ATTT--G-ATT--CCA-TG-ACCCCTA-CTTTAC--TAG-TTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAAAGGTGTAATTAACCTTCGTTATGACCTTTATTCG-TGAA-AATTGGCAACT----TTCAGGTAAGCTAAATAACCTTATA-GGGCCTGTG-GA---AGGCTAT---T----AA-T-G-ACTCAATGTGCTTGAGTT--CGTTGTTGACTTGCTCTTTATAAA-------TGTTG--TTTGATTCCA-T-CCCCCTATTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cattacgaacaagccaccaccttcgttttaaacgctccctttgttcatatgatacagagatcacaaattccaaaccttcaaatggtactcgtactgtgataaactgaaggtggaaaataatagtctagttagctctcccagctagctg-GTT-TT-A-A----T-TTT--CATG-TTG--T-AGAATTA--G----G-AA-C--TTTC---AGG-TGA-G---CT-TAAT-TGC--C--TTT---AT-AT-GC-TTAT--G-CG---A-----C-T--CAA----TTT---A-A--C-G-A---A-TC-AGA--C------TGTTT-----G-AA-T-TT--GGTG--TTC-TCT-T-----G-CTCTT-T-----------ATC----GCT-------A-TT-GTTT--C-ATT--CCA-TC-ACCTC
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gTGCG-TGAA-AATTCGAAACTTTAATTCAGGTGAGCTAAATTAACTttactagtgtatatgggggggggggggttttggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgcgtgaaaattcgaaactttaattcaggtgagctaaattaactcagctggcattatttcattcc
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gCTTG--TTTTAT----CACTATTGCTTC-TTTTATA-CCCCTACTTTAACTAGATATAGGGGTCTtggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctcttgttttatcactattgcttcttttatacccctactttaactagatataggggtcttaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gttattaccctaagttatgacctttatgcgtgaaaattcgaaactttcaggtgagctaaatcacctttaagggcctatacaccctttcattgactctaacagcttgactttttttatggcttgccttttatcattcttgtttccttctataacccctacttcactagtttatatggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctGTAAAGGTGTTATTAACCTTCGTTATGACCTTTATGTA-TGAA-AATCCGAAACT----TTCAGGTGAGATAAATTACCTT-TAGGGGCCTGTG-GA---AGCTCAT---T----TA-TTG-ACtaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acataaacattttgtttgaatatttatatttgtacgatgagttataggggtctgaaatgtggacacaccttcttggggccctaattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAT-GAGC-CTGTTTTC-GTTTATTGTA----C-TTTGTTATGTC-A--TGAAAATTC--G----A-AAAC--TTTC---AGG--GATG---CT-AA-T-AACGTC--CTC---AG-GGTGC-CTGTT-A-GA---A-----C-CA-CCA----TTT---A-A--T-G-GGAGC-TC-AAT--CATTGCTTGCTT-----GTGG-T-TCT-GTTG--ATG-TTTGT-----G-GTCTT-TGTTTCCGTGGTATT----AATTTGTT--G-TT-GTTG--G-ATT--CCA-T
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTGATGTGCCAATCAAACTGTTCAGACGAGTTAAAGTGTTCAATAGGTTATTAACAATCACAATTAACAATTCTATTAAAATTTATTTTAAAATTCATATTTGCAAAATTTTAATATTCTGTCTGATAACTCTAAGTACTTTGAGGATTTTCTTATTGGCTGCTGATACGTGACTGCTAGCTTCAACCTAG
Unaligned ( gi|11 ): ATTTATTAATTATTTGTTGAAAAAAATTATCACATTTGATTGATTGTTTGATTATTTTCAATATCCTCGTCTAAATACTTTCAGTACTCTGATGAATTTTCTTATTGGCTACTAATTTCTATAGGCTTATTGGCTGCTGGTTAGTGGCTGCTAGCTTCAGTCT






Alignments
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTGTTTATATTGAAGGG-----CCTT-------GTAGTGA--ACCTTTGTTATTCCGTGAAGA---TTCTGG---A--AACTTTTCTTAGGTGATGCTAAATTAA----CCT-------CTTTAAG-GGGCTCTGTTGG--ATGCTTCC-TTGT-T----CA--ATTGACTCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgaaatA-C-CT----TT-GTT-AT-----------------TC-C-G--TGAAGATTCTGG----A-AA-C--TTTTCTTAGG-TGATG---CT-AAATTAAC--C--TCTTTAAG-GG-GCTCTGT--T-GG---ATGCTTC-C--TTG----TTC---A-A--TTG-A---C-TCCTAT--C------TGCCTTGTGAG-GG-C-TCTTGTTG--TTT-TGT-T-----G-CCCTT-T-----------GTATAATAAT-------G-TT-GTTT--G-ATTTCCCA-TG-ACCCCTC-CGTTAatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttgtgtgactcttcgttatgaaccttttatgcttgaaaattcgaaactttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTG--TTTTAT----CACTATTGCTTCCTTTTATACCCCCTACTTTA-CTAGTTATAGGggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtggccccacctctTTCTGGCCTTCATGCG-TGAA-CATTAGACGCT----TTCAGATGAAATAAATTGCATT-TA-AGtttctgacataaatgatgttgccccaccctcttg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -GTG-AT-G-A----CCTTT--TTTG-C-GGGTGAAA--TC--G----A-AA-C--TTT----AGG-TGA-G---CTAAAAT-AAT--C---TC---AG-GG-ag
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --TTT---AA-GG-AC-GTAT--G-GA---A-----A-C--CCA----TTT---G-A--T-G-A---C-TA-TAT--T------CGCCT-----G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caTTC---AGG-TGA-G---CT-AAA--AAC--C--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccttcgg-C--CCA----TTT---A-A--T-G-A---C-TC-TGT--C------TACTT-----G-AG-T-TC--GTTgacatatttccgtattc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGCCTATATTCATTT-CG-TT------------------AGGTTA--AGTTTTTTACATTA---------------------GTTAT-A--ACCTTT---ATGCG-TGAAAA---TTC--G---A--AACTT--------------------AA----TGG-------CTTAA------CTTTGTTGTT-G-GTTTGCATTTTAT----CAATATTGTTTCCTTTTATAACCCCTATTTCA-CAAGATAAAGAGGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGTTTTTAT-AA-C-CT----TC-GTT-TT-G-A----C-TTT--TATG-C-A--TGAAAATTC--G----A-AG-A--TTTC---AGG-TGA-G---CT-AAAT-AAC--C--TTT---AA-GG-GC-CCGT--G-GA---A-----C-C--CCA----TTT---A-A--T-G-A---C-TC-TAT--C------TGCTT-----G-AG-T-TC--GTTG--TTG-TCT-T-----G-CCCTT-T-----------ATC----AAT-------G-TA-ATTT--G-ATT--CCA-TG-ACCCCTA-CTTTAC--TAG-TTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAAAGGTGTAATTAACCTTCGTTATGACCTTTATTCG-TGAA-AATTGGCAACT----TTCAGGTAAGCTAAATAACCTTATA-GGGCCTGTG-GA---AGGCTAT---T----AA-T-G-ACTCAATGTGCTTGAGTT--CGTTGTTGACTTGCTCTTTATAAA-------TGTTG--TTTGATTCCA-T-CCCCCTATTT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gTGCG-TGAA-AATTCGAAACTTTAATTCAGGTGAGCTAAATTAACTttactagtgtatatgggggggggggggttttggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgcgtgaaaattcgaaactttaattcaggtgagctaaattaactcagctggcattatttcattcc
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gCTTG--TTTTAT----CACTATTGCTTC-TTTTATA-CCCCTACTTTAACTAGATATAGGGGTCTtggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctcttgttttatcactattgcttcttttatacccctactttaactagatataggggtcttaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gttattaccctaagttatgacctttatgcgtgaaaattcgaaactttcaggtgagctaaatcacctttaagggcctatacaccctttcattgactctaacagcttgactttttttatggcttgccttttatcattcttgtttccttctataacccctacttcactagtttatatggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctGTAAAGGTGTTATTAACCTTCGTTATGACCTTTATGTA-TGAA-AATCCGAAACT----TTCAGGTGAGATAAATTACCTT-TAGGGGCCTGTG-GA---AGCTCAT---T----TA-TTG-ACtaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acataaacattttgtttgaatatttatatttgtacgatgagttataggggtctgaaatgtggacacaccttcttggggccctaattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAT-GAGC-CTGTTTTC-GTTTATTGTA----C-TTTGTTATGTC-A--TGAAAATTC--G----A-AAAC--TTTC---AGG--GATG---CT-AA-T-AACGTC--CTC---AG-GGTGC-CTGTT-A-GA---A-----C-CA-CCA----TTT---A-A--T-G-GGAGC-TC-AAT--CATTGCTTGCTT-----GTGG-T-TCT-GTTG--ATG-TTTGT-----G-GTCTT-TGTTTCCGTGGTATT----AATTTGTT--G-TT-GTTG--G-ATT--CCA-T
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTGATGTGCCAATCAAACTGTTCAGACGAGTTAAAGTGTTCAATAGGTTATTAACAATCACAATTAACAATTCTATTAAAATTTATTTTAAAATTCATATTTGCAAAATTTTAATATTCTGTCTGATAACTCTAAGTACTTTGAGGATTTTCTTATTGGCTGCTGATACGTGACTGCTAGCTTCAACCTAG
Unaligned ( gi|11 ): ATTTATTAATTATTTGTTGAAAAAAATTATCACATTTGATTGATTGTTTGATTATTTTCAATATCCTCGTCTAAATACTTTCAGTACTCTGATGAATTTTCTTATTGGCTACTAATTTCTATAGGCTTATTGGCTGCTGGTTAGTGGCTGCTAGCTTCAGTCT






Alignments
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTGTTTATATTGAAGGG-----CCTT-------GTAGTGA--ACCTTTGTTATTCCGTGAAGA---TTCTGG---A--AACTTTTCTTAGGTGATGCTAAATTAA----CCT-------CTTTAAG-GGGCTCTGTTGG--ATGCTTCC-TTGT-T----CA--ATTGACTCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgaaatA-C-CT----TT-GTT-AT-----------------TC-C-G--TGAAGATTCTGG----A-AA-C--TTTTCTTAGG-TGATG---CT-AAATTAAC--C--TCTTTAAG-GG-GCTCTGT--T-GG---ATGCTTC-C--TTG----TTC---A-A--TTG-A---C-TCCTAT--C------TGCCTTGTGAG-GG-C-TCTTGTTG--TTT-TGT-T-----G-CCCTT-T-----------GTATAATAAT-------G-TT-GTTT--G-ATTTCCCA-TG-ACCCCTC-CGTTAatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttgtgtgactcttcgttatgaaccttttatgcttgaaaattcgaaactttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTG--TTTTAT----CACTATTGCTTCCTTTTATACCCCCTACTTTA-CTAGTTATAGGggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtggccccacctctTTCTGGCCTTCATGCG-TGAA-CATTAGACGCT----TTCAGATGAAATAAATTGCATT-TA-AGtttctgacataaatgatgttgccccaccctcttg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -GTG-AT-G-A----CCTTT--TTTG-C-GGGTGAAA--TC--G----A-AA-C--TTT----AGG-TGA-G---CTAAAAT-AAT--C---TC---AG-GG-ag
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --TTT---AA-GG-AC-GTAT--G-GA---A-----A-C--CCA----TTT---G-A--T-G-A---C-TA-TAT--T------CGCCT-----G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caTTC---AGG-TGA-G---CT-AAA--AAC--C--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccttcgg-C--CCA----TTT---A-A--T-G-A---C-TC-TGT--C------TACTT-----G-AG-T-TC--GTTgacatatttccgtattc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGCCTATATTCATTT-CG-TT------------------AGGTTA--AGTTTTTTACATTA---------------------GTTAT-A--ACCTTT---ATGCG-TGAAAA---TTC--G---A--AACTT--------------------AA----TGG-------CTTAA------CTTTGTTGTT-G-GTTTGCATTTTAT----CAATATTGTTTCCTTTTATAACCCCTATTTCA-CAAGATAAAGAGGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGTTTTTAT-AA-C-CT----TC-GTT-TT-G-A----C-TTT--TATG-C-A--TGAAAATTC--G----A-AG-A--TTTC---AGG-TGA-G---CT-AAAT-AAC--C--TTT---AA-GG-GC-CCGT--G-GA---A-----C-C--CCA----TTT---A-A--T-G-A---C-TC-TAT--C------TGCTT-----G-AG-T-TC--GTTG--TTG-TCT-T-----G-CCCTT-T-----------ATC----AAT-------G-TA-ATTT--G-ATT--CCA-TG-ACCCCTA-CTTTAC--TAG-TTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAAAGGTGTAATTAACCTTCGTTATGACCTTTATTCG-TGAA-AATTGGCAACT----TTCAGGTAAGCTAAATAACCTTATA-GGGCCTGTG-GA---AGGCTAT---T----AA-T-G-ACTCAATGTGCTTGAGTT--CGTTGTTGACTTGCTCTTTATAAA-------TGTTG--TTTGATTCCA-T-CCCCCTATTT
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gttattaccctaagttatgacctttatgcgtgaaaattcgaaactttcaggtgagctaaatcacctttaagggcctatacaccctttcattgactctaacagcttgactttttttatggcttgccttttatcattcttgtttccttctataacccctacttcactagtttatatggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctGTAAAGGTGTTATTAACCTTCGTTATGACCTTTATGTA-TGAA-AATCCGAAACT----TTCAGGTGAGATAAATTACCTT-TAGGGGCCTGTG-GA---AGCTCAT---T----TA-TTG-ACtaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|11 ): ATTTATTAATTATTTGTTGAAAAAAATTATCACATTTGATTGATTGTTTGATTATTTTCAATATCCTCGTCTAAATACTTTCAGTACTCTGATGAATTTTCTTATTGGCTACTAATTTCTATAGGCTTATTGGCTGCTGGTTAGTGGCTGCTAGCTTCAGTCT






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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGTGTTTATATTGAAGGG---C-C---T-T-----GTAGTGA--ACCTTTGTTAT-TCCGTGAAGA---TTCTGG---A--AACTTTTCTTAGGTGATGCTAAATTAA----CCT-------CTTTAAG-GGGCTCTGTTGG--ATGCTTCC-TTGT-T----CA--ATTGACTCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgaaatA-C-CT----TT-GTT-AT-----------------TC-C-G--TGAAGATTCTGG----A-AA-C--TTTTCTTAGG-TGATG---CT-AAATTAAC--C--TCTTTAAG-GG-GCTCTGT--T-GG---ATGCTTC-C--TTG----TTC---A-A--TTG-A---C-TCCTAT--C------TGCCTTGTGAG-GG-C-TCTTGTTG--TTT-TGT-T-----G-CCCTT-T-----------GTATAATAAT-------G-TT-GTTT--G-ATTTCCCA-TG-ACCCCTC-CGTTAatctgccttgtgagggctcttgttgttttgttgccctttgtataataatgttgtttgatttcccatgacccctccgttaatttatttggggtctgataattggcctcaccctgcttgtggccccaaggtggtaccttccacagcccaaggtactggagggtcgggaaatttatagttcctggggcttcatttttaccttgcatactgcgatggttcgtttgacatcttcagaaggttattatttttattaatttattcctgtcttgctgttatgagaacctttttccttgaaggttcgtttaataactttcagggtaatgtttctacataacctttagtgggccagttgaacgcctcgtttttatatgactctattgctatttgagcttcgtagttgtttttgtttgcctttatataaatgtttgtttgatttcatgaacccctatctttttacgaggttaataagggcctgaatgattgtgcgtttccagtcctcttttgtgggccccaggtttgtgttaccctagcagccaaacttgggggggaaatatgaatatcctgggagccttgtcctgtgccttgccatactcattttcgttgaactcttcaaaggtataagtgtttgtgtgactcttcgttatgaaccttttatgcttgaaaattcgaaactttttcaggtgagcaatctctttagggctctgttgggaacttgcctttaatggacttctattgtttgtagtctggttggtttgtttttgtccctttttaaatgtttgtttgagttcatgacccctacgttctaattatcagggtctgtaagtgttggcctcaccctgctttgtggcctctcaggtgtaccggccatacaagcttcaattacgatgtggggaaatgattagtccgggtacctctcatttcctgcattatcttcgatgttcggttgactctggttgcaaaggttatgaggtgttaatgttattcctttcgttatgacctttttcgcttgtgaaggtttcgaaacttttaaggtacgtttgttttttctgtgtttgtgcttttttttccttgttcttttgctatatataactggttaagtgggccagtgtgatagacccctttttgtaacttgtactccattcttgagttgtcgttgttgatgtttgtaaattttaattgttgtttttgcttccatgacccctcgtttacgatgtttatagttggggtctatttgttaaaatgtggtcgccatccctctttgggtgtccccaggtggttttacc
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTG--TTTTAT----CACTATTGCTTCCTTTTATACCCCCTACTTTA-CTAGTTATAGGggggtctgaaatgtggcccctaccctcttggggctccaggtgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtggccccacctctTTCTGGCCTTCATGCG-TGAA-CATTAGACGCT----TTCAGATGAAATAAATTGCATT-TA-AGtttctgacataaatgatgttgccccaccctcttg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -GTG-AT-G-A----CCTTT--TTTG-C-GGGTGAAA--TC--G----A-AA-C--TTT----AGG-TGA-G---CTAAAAT-AAT--C---TC---AG-GG-ag
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --TTT---AA-GG-AC-GTAT--G-GA---A-----A-C--CCA----TTT---G-A--T-G-A---C-TA-TAT--T------CGCCT-----G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caTTC---AGG-TGA-G---CT-AAA--AAC--C--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccttcgg-C--CCA----TTT---A-A--T-G-A---C-TC-TGT--C------TACTT-----G-AG-T-TC--GTTgacatatttccgtattc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGCCTATATTCATTT-CG-TT------------------AGGTTA--AGTTTTTTACATTA----------------------GTTAT-A--ACCTTT----A-TGCGTGAAAA---TTC--G---A--AACTT--------------------AA----TGG-------CTTAA------CTTTGTTGTT-G-GTTTGCATTTTAT----CAATATTGTTTCCTTTTATAACCCCTATTTCA-CAAGATAAAGAGGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGTTTTTAT-AA-C-CT----TC-GTT-TT-G-A----C-TTT--TATG-C-A--TGAAAATTC--G----A-AG-A--TTTC---AGG-TGA-G---CT-AAAT-AAC--C--TTT---AA-GG-GC-CCGT--G-GA---A-----C-C--CCA----TTT---A-A--T-G-A---C-TC-TAT--C------TGCTT-----G-AG-T-TC--GTTG--TTG-TCT-T-----G-CCCTT-T-----------ATC----AAT-------G-TA-ATTT--G-ATT--CCA-TG-ACCCCTA-CTTTAC--TAG-TTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAAAGGTGTAATTAACCTTCGTTATGACCTTTATTCG-TGAA-AATTGGCAACT----TTCAGGTAAGCTAAATAACCTTATA-GGGCCTGTG-GA---AGGCTAT---T----AA-T-G-ACTCAATGTGCTTGAGTT--CGTTGTTGACTTGCTCTTTATAAA-------TGTTG--TTTGATTCCA-T-CCCCCTATTT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gTGCG-TGAA-AATTCGAAACTTTAATTCAGGTGAGCTAAATTAACTttactagtgtatatgggggggggggggttttggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgcgtgaaaattcgaaactttaattcaggtgagctaaattaactcagctggcattatttcattcc
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gCTTG--TTTTAT----CACTATTGCTTC-TTTTATA-CCCCTACTTTAACTAGATATAGGGGTCTtggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctcttgttttatcactattgcttcttttatacccctactttaactagatataggggtcttaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gttattaccctaagttatgacctttatgcgtgaaaattcgaaactttcaggtgagctaaatcacctttaagggcctatacaccctttcattgactctaacagcttgactttttttatggcttgccttttatcattcttgtttccttctataacccctacttcactagtttatatggttctgaaataaatgatgttgccgccaccctGTAAAGGTGTTATTAACCTTCGTTATGACCTTTATGTA-TGAA-AATCCGAAACT----TTCAGGTGAGATAAATTACCTT-TAGGGGCCTGTG-GA---AGCTCAT---T----TA-TTG-ACtaaatgattgtggccccacctctttgttttatcactattgcttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acataaacattttgtttgaatatttatatttgtacgatgagttataggggtctgaaatgtggacacaccttcttggggccctaattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAT-GAGC-CTGTTTTC-GTTTATTGTA----C-TTTGTTATGTC-A--TGAAAATTC--G----A-AAAC--TTTC---AGG--GATG---CT-AA-T-AACGTC--CTC---AG-GGTGC-CTGTT-A-GA---A-----C-CA-CCA----TTT---A-A--T-G-GGAGC-TC-AAT--CATTGCTTGCTT-----GTGG-T-TCT-GTTG--ATG-TTTGT-----G-GTCTT-TGTTTCCGTGGTATT----AATTTGTT--G-TT-GTTG--G-ATT--CCA-T
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTGATGTGCCAATCAAACTGTTCAGACGAGTTAAAGTGTTCAATAGGTTATTAACAATCACAATTAACAATTCTATTAAAATTTATTTTAAAATTCATATTTGCAAAATTTTAATATTCTGTCTGATAACTCTAAGTACTTTGAGGATTTTCTTATTGGCTGCTGATACGTGACTGCTAGCTTCAACCTAG
Unaligned ( gi|11 ): ATTTATTAATTATTTGTTGAAAAAAATTATCACATTTGATTGATTGTTTGATTATTTTCAATATCCTCGTCTAAATACTTTCAGTACTCTGATGAATTTTCTTATTGGCTACTAATTTCTATAGGCTTATTGGCTGCTGGTTAGTGGCTGCTAGCTTCAGTCT