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Reference ( gi|2 ) : TGAAATAT-A--TGTGATAAAAAACTGCGGAAA-A--GATCAGTTCT-T-GTCATG-AGCAAGTTTAAA---AATATATA------CGTATATATGGTCAAATTCTAGTTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGCA---C-GTAA--TCAAAGTGTTTTTG---ATACA--TGT-CTC-GTCAAGTTTGAATAA--AAGCGGC-TTACA-TTTTGGCCGAT-GTGG---AAAGGAATGCCAATTTATGTTAA-A-AGA-GTTGTCGAATCC-TTA----------CAT------------TTCAATACA--G--------------A----------------TTA------T---AAGTT-------TA--CTAAA-T---GTATA-------T---GTT----A--TTGTC--T-AATTCGGTAGTT--TGGTGATTGCACCTTTACAATAATCA--GCTAA-TA--AAC-AT-GGTTTGTAA--AGT-ATTATAATT-GGTTTT-AAATAT-A------------------TA----GG--TCCAGTAT-TTGT-ATGATATTA---ATTTAATTATTTGCTAT--GAATTGACGT-AAAGCACTAGT---AATTTATT-A-CGTAAA-GTTGC-AT-TG-----A-T----------ATAGT-GTTG-TGT--A-AGGG-----CTG-GTATGCGCGA-GCGGTATTAAACGA-CA---TCTGCTGTGG--GGG-----GACACC--GTATGACA-TTT-GA--ATTA-TA---ACAGTTTTACA----G-------T-GTGTA--ATCTAT------AAC-GAG----AGGGAA---T-C-TC-TGTGTA-G--GGTGAT--CGGC-AACGCT--AA------T--A-AGTGTTGAC-----GA--C-T--CAT----G-TATAT----------T--TAAAA---G----A----T-G--GATATG----AAA----GTT--TGA-T--C---AA-C-GT----TG----A----------------A--------GT-----------C-------T----CAAC-GT--------T----G---T----T---T---CAAC-GTT----TGAC----A-T---G----CAAC-G-T---G-A----T-T--CA-------------CA--C-G-T--T-A--GA--C--AT-C--AA--------------C---AA--T--TGATC---C----T--T--T---CA--T------A-T-T--C-A-AC----T----C--T-T-------T---TT-C-AAC-GT-T-------G----T--------T----CA-AC-G----T------G-----A---CA------T-G-C---A-T-----A----CG--TTG----A------T----------T---CAA--C-G-TTG-A-------GAA-------TA----------T--------C----AA-CGC-------T-T----GA------T------T--C-A-AC---G---AATT-G--A----GA--CA---TCA--A----ACGT-TTG----A---T---T---C-AA--C--T--T----T----C-A-T--A--TC-C-AAC-CT---TTTTA-TT-C-AA-C---GTT---T------G----T-T-C--------A-AC-A--T--A-A--TTGAC-A-T---GC-----A--A--ACGTT-------G--A--T-TCA--------T-CAA---GT-----TGAGACAT----C-AA-CGTT------------TGAA--GAA--AT-------T-C----A-CGTTG----AT-T--CCAT--A-C-TTT-C---A----TAT--C-CAAC-C-T-T----T-----TTTCAA-A-CGT-T-G---TT-------TCA---A-C-G-T---AA--AA----AA--T--G----------CAACGT-------------ATGT-------T-------T-----TT----T-CAACGT-T----T-A---A--T-C-AAC--GTTG-AGTGCCC
gi|9 : TAAAATAT-A--TGTGATAAAAA-CTG-GGAAA-A--GATCAGTTCT-T-GTAATG-AGCAAGT----A---AAT-TATA------CG
gi|11 : acttcaacgttgaaatatggttgttacgttgatcaaccaaacttcaacgttgtttcaccgttagacttttcaacgttgaggttcatcgagtcaacgttgattcaacgttgtattttacaacgttggagtgacaacgttgttctaacgttgtttcaacgtttcaagggtttataacgaaattgtgtaaAAGTAT-AG-TATAATAAAAA-CTG-GGAAA-A--GATCAGTTCT-T-GTCATG-AGCAAGT----A---AAT-TATA------CGCTCATATGGT-AAATTA-AATTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGCA-----GTAA--TCAAA--GATTTTG----T-CA--TGT-CTC-G-CAG---TGAAAAA--AAGGGGC-TTACA-TTTTGCCCctcatttttacgcagtacttaatcaaagtttttgtcatgtctcgcagtgaaaaaaaaagcggcttacattttgccca
gi|8 : gttctaacgttgtttcaacgttgaggcttgataaattgtatgataattgtatgataaaataagtatagtatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgagggttgataaattgtataataaaatAAATATTA--TGTGATAAAA--CTG-GGAAATA--GAT-AGTTCT-TTGTCATGAAGAAAG--TAAATTTAGTATACG------CTCATAAATGGT-AAATTC-AATTTTTTGT-ATGTTTGTTTGTATACGCA---TAGTAATGTCAATCAGTTTTTG----T-CA--TGTACTCGGTC-AGTGTAAAAAAATAAGAGGCTTTACA-TTGTG
gi|1 : cagcgggcacttcaacgttgaatgaacgttgaagtatgggtttgttaagaggttgatcaaccagacttcataacgttgtttaaactgttagactttttcaacgttgatagttttaacagttgtattttacatggtacgttggtatgtgaccatgttggtttcaacgattgtagggtttgataacattgtattatAATAT-AGTTGTGATAAGAAA-TGGGGAAG-ATAGATCAGTTCTAT-GTCATG-AGCA-GT----A---AATATATAGCGACTCG-ATAT-TGGTAAGATTT--GTTC-ATATCAT-ATTGTTT---TATGCA-----GTAA--TCAAAGT--TTTTGGTCATACAAATGT-TGC-GT--AGTTGAGAAAA--AAG-GGC-TTATACTTTTGGCCCATTGTGGGCAAGAGAGATGCCCATTTTTAGTAATATAGA-GTTGTCGTTTCT-TTAGATTAGTCTACATAGAGTTATCTTTTTCTGTACATTG--------------A----------------TGA------T---AAGTT-------TAGATAAAA-T---GTATAATTGATAT---GTT----AA-TTGTC--T-AAT-CGGTAGTT--TGGTAA----------------AT--------A-TA--AAC-ATTGGGTTGTAA---GT-ATCAT--TT-GGTTTTTGAATATTA------------------TA----GGCGTGTGATAT-CTGTGAAGATATTATGAATTTATTAATTTGCTATCGGAATGGAGGT-AAAGCACTAGTTG-ATTTTATT-A-CGTAAAGGCTGC-AT-T------A-T----------ATCAT-ATTGATGTTAG-AGGA-----CTGTTTGTG-GTAA-GCGGTA-TAATCGA-CA---T-TG-TGT------------GACAGCTGGTGTGACAGTTT-GGGTATTA-TGT--ACAGTTTTACATCTGG-------T-GTATA--TCTTAC------ATG-GAG----AGGGAAAGTC-C-TCTTGTGT--G--AGTGAT--TGGCTAACGCTGAGA------TTAA-AGTGTTGACGT---GA--C-T--CATTCCGG-TGCGT----------C--C-------G----A----T-GCTGA-ATGGT--AAA----GTG--TGC-T--A---GA-TAGT----TA----A----------------------------------------------T----TAA--GT--------T----GCTAT----T---T---T--T-GTT----GAAT----A-----------AAA-G-T---G-A----T-------------------GA--A-G-T--T----GA-----AT-C--AG--------------CT--AG--T--TGAT--------------------G--T--------T-T--C-A-AC----G----T--G-T-------T---TC-A-AAC-GT---------------------------------------T------G-----A---CA------T-G-C---G-A-----A----CGGTTTG----A------T----------T---CAA--C-G-T-------------A-------T-----------T--------G----GA-C----------------AG------T------T--CTA-AC---G-----TT-G--A---------A---T-------------------------T---T---C-AATCT--T--T----T----C-ATT--A--TC-CAAAC-CT---TGATT-TT-C-AA-C---GTA---T------G----T-T-T--------A-AC---------G--TTGAT-A-T---GC-----A--A--ACGTT-------G--A--T-C----------T-CAAC--GT-----T-AGACATG---G-AA-CG-T------------TGAA--GGA--A--------T-C----ATCGTTT----GTGT-----T--A-A-TTT-C---A----TATTCT-CAAC-T-T-A----T-----TACTAG-G-TG--T-G---TT-------TCA---AGC-G-T---AA--AA----AA--T--G----------CAAGAT--------------TGT-------G-------T-----TC----A-CTACGTAT----T-A---A--T-C-AAC--GTTG-att
gi|9 : gttgtctgaacgttttggattgtagtttgaggtttaaatgtgtatactTTT---TACGCAGTAC-TTAA--TCAAAGT--TTTTG----T-CA--TGT-CTC-GC--AGTGAAAAAAA--AAGCGGC-TTACA-TTTTGCCCagctggcc
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gi|16 : tgtggcaaggcattttgtaaattagagtttcttcctaacattccggtgagaggggttatcttttcttacattcgctgattagtaTAA-TA--AAC-AT-GGTT-GTTA---GT-ATTATAATT-GGTTTT-GGATAT-G------------------AA----GG--CCCTGTATATTGT-A--AGATTA---ACTTA-TTATTTGCTAT--GGATGGACGT-AAATCACTAGT---GATTTATT-A-CGTAAA-GTTGC-AT-AT-----T-T----------ATAGT-GATG-T-T--A-GAAG-----CTG-TTTTG-GTGA-GCGGTATT--ACGA-TA---TAT-TTGT------------GACACC--GTGAGACA-TTT-GA--Aggatttgcatataaatagtg
gi|29 : -----A-T----------ATAGT-GTTG-T-T--A-GAGG-----CTG-GTAT-TGCGA-GCGGcaacg
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gi|5 : gatgttggagatgttccattcttacgttgaagattcaacgtgaaactatgaccaagattcagaaggttgaacctatgctgaatttcaaccaatattttaacgttgagttgggtcttttcctaacgttcagtttaatgtttctccactgaaccagtttaaacgttgaaaacatcgT--AA------T--A-A-TGTCGCA-----GT--C-A--CAT----G-TATATAACAACAATTT--TAAAACGGG----T----T-G--TGCATT----ACAC---GCT--TTA-T--C---AA-C-GT----TG----A----------------GAATAT---GTTCATC------C-------T----CAAC-GT--------T----G---T----T---C---CAAC-G-T----TGAA----A----------CATC-GTT---G-A----A-T--CA--------------A--C-G-T--T-A---ATTC--AT-C---A--------------C---AG--T--TTGTCAA-C----G--T--TGAAAA--T------A-TGT--C-G-AA----TAG--C-------------------C-AAC-GT-T-------GT---T--------T----CA-AC-GT---T------G-----A---AA------T-ATT---A-TC----A----AA--T------A------C----------T---CAA--C-G-TTG-A-------AAA-------TATGTCATAGCTT--------C----AA-CG--------T-T----GT------T------T--C-A-AC---G-----TT-G--A----AA--TA---CTA--A----------TA----A-----------G-AA--T--G--T----G----C-A-T--G--TT----AT-GT---T-----TT-C-AA-C---ATT---G------T----T-T-T--------A-AC---------G--TTGAT-A------------A--T--ACGTT-------G--AGGT-TT---------T-GAC---GT-----TGAAAGTT----C-AA-CGTT------------------GAA--A----------CA---A-CGTTG----A-------AT-------------------TGT-----AG------T----T-----GTTC-A-A-CGT-T-G-------------CA---A-C--------C--AA----TA--T--A----------CCACCT-------------A------------------C-----TT----T-CAACGT-T----G-A---A--A-C-AAC--GTTG-
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gi|22 : atccaaccatttcttcaacgttgttacaacagtAT----G-T-TGT----------T--TAGAC---G---------T-T--GACATG----CAAC---GTT--GAA-T--C---AA-C-GT----TT----A----------------G--------AC-----------A-------T----CAAC-GT--------T----G---A----T---T---CAggtaaaaaaagtgcaaccgttgtttcaacgtttacatctaacgttgaagtgcccggct
gi|13 : caacgttgtttcaacgttattgca----------T--TGAAA---C----A----T-G--G---TC----AA------TT--TTA----C---AA-C-GT----TG----A----------------A--------TC-----------T-------T----CAAC-GT--------T----G---A----A---T---AAAC-GTT----
gi|3 : gatgttggagatgttccattcttacgttgaagattcaacgtgaaactatgaccaagattcagaaggttgaacctatgctgaatttcaaccaatattttaacgttgagttgggtcttttcctaacgttcagtttaatgtttctccactgaaccagtttaaacgttgaaaacatcgacgttgaaatatggttaaaacttctacgtaggttcaacgAAAA---G----G----TTG--GATATG----AAA----GTT--GAA-T--C---AA-C-GT----TG----A----------------T--------GT-----------C-------T----CACC-GT--------T----G---A----A---A---CAAC-GTTGCAATGACGTTGA-T---A----CAAC-GTT---G-A-------------------------A--C-G-T--TGA--GA--C--AT--------------------C---AG--T--TGACG---T----TGAT--T---CAACT------T-T-TGGC-A-AC----T----C--T-T-------A---TT-C-AGC-GT-T-------A----G--------T----CGCAC------C------G-----A---TG------T-A-C---A-G-----A---------------A------T----------T---CAG--C-G-TTG-g
gi|20 : tggcaaggaatgccattttgtaaatagagttgtcgttccttacattcctacagttatcttatcttacattactaaaatgtatatagttaattgtctaatcggtagtttagtgattgcaccttacaataatcagtaataaacatggttgtaagtattataattggttttgaatatatatataggcccagtatattgtaagattaatttattatttgctatggatggacgtaaagcactagtgatttattacgtaaagttgcatatatatagtgatgttagagatatttcttttggtgagcgttagtacgacatctatgtggcactgtgtgacattttgaacaatacagtgaacactgtgtaatctacctgagagggaatcctctgtgtacggtgatcgg-G--AATACA----ACA----ATT--TGG----C---AA-C-GT----TG----A----------------A-----------------------------T----CAAC-GT--------T----G---ttcaacgttaatcaacgttgagtg
gi|9 : caacgttgaataaactttgacttcaagttggtcaacgttgcaaccaTATA----AAC----CCT--TGA--------AA-C-GT----TG----A----------------AACAAC---GT-------------------TAGAACAAC-GT--------T----G---TCAC-T---C---CAAC-GTTG---TAAA----A-T---A----CAAC-GTT---G-A----A-T--CA--------------A--C-G-T--T----GA--C--cgtgcccac
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gi|13 : act----AAC----GTT--TAT-T--C---AA-C-GT----TG----A----------------A--------GA-----------T-------T----CAAC-GT--------T----G---T-------------AAA-A-T----TGAC------------------C-A-T---G-T----T-T--CA--------------A--C-G-T--T-G--AA--C--CT-----A--------------C----G--T--AGAAG---T----T--T--TAACCA--T------ATT-T--C-A-ACG---T----CGATGT-------T---TT-C-AAC-GT-TTAAACTGG----T--------T----CA-GT-G-----------G-----A---GA------A-A-C---A-T--------------TAA----A------C----------T---GAA--C-G-TTA-G-------GAA---------------------------------AA-GAC-------C-C----AA------C------T--C-A-AC---G-----TT-A--A----AA--TA---T----------TGG-TTGAA--A---T---T---C-AG------------------C-A-T--AGGTT-C-AAC-CT---TCTGA-AT-C---------TT---G------G----T---------------C-A--T--A-G--TT------T----C-----------ACGTT-------G--A--A-TCT--------T-CAAC--GTAAGAATGGAACAT----C-acgtttcaagggtttataacgaaattgtgtaataaaatatatgtgataaaaactgggaaaagatcagttcttgtaatgagcaagtaaattatacgctcatttttacgcagtacttaatcaaagtttttgtcatgtctcgcagtgaaaaaaaaagcggcttacattttgccca
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gi|25 : atccaaccatttcttcaacgttgttacaacagttctgacatgcaacgttgattcaaacgttggaacatcaaacgttagaattcaaagatgaagaagaatcaacgttgattccaactttacatatccaacacttttttcaaccT--TGA-T--T---AAAC-GT----TG----A----------------A--------A-------------------------CAAC-GT--------T----GCA-T----T---T---TTAC-GTT----GAA-----------G----CAAC-G-T---tgaagtgcccggct
gi|9 : aaccttttttcaT--TGA-T--C---AA-C-C-----------A----------------A--------AC-----------T-------T----CAAC-GT--------T----G---T----T---T---CACC-GTT----AGACT---T-T---T----CAAC-G-TTGAG-G----T-T--CA-------------T---C-G------A--G-------T-C--AA--------------C----G--T--TG--------------------------------A-T-T--C-A-ACGTTGT----A--T-T-------T---TA-C-AAC-GT-T-------G-------------------G-A--G----T------G-----A---CA----------------------A----CG--TTG----T------T----------C---TAA--C-G-TTG-------------------TT----------T--------C----AA-CGT-------T-TCAAGGG------T------TTAT-A-AC---GA--AATT-G--cgttgagtgc
gi|5 : acttcaacgttgaaatatggttgttacgT--TGG-TTGC---AA-C-GT----TG----A----------------ACAACTACAAT-------------------T----CAAC-GT--------T----G---T----T---T---CAAC-GTT----GAAC----T-T---T----CAAC-G-T---C-AAAACC-T--CA--------------A--C-G-TATT-ATCAA--C--GT-T--AAAA------------C---AA--TGTTGAAA---A----C--A--T---AA--C------A-T-G--C-ACAT----T----C--T-TATTAGTAT---TT-C-AAC-GT-T-------G----A--------AA---CA-AC-G----TT-----G-----AAGCTA------T-GAC---A-T-----A--------TT------------T----------T---CAA--C-G-TTG-A-------G---------TA----------T--------------------------T-T----GA------TAATATTT--C-A-AC---G-----TT-G--A----AA--CA-------------ACGT-TGGCT--A---T---T---C-GA--C-----------------A-T--A--TT------------------TT-C-AA-C---GTT----------------------------G-AC-A-----A-A--CTGTG-A-T---GA-----ATTA--ACGTT-------G--A--T-TCAACGATGTTT-CAAC--GT-----TGGAA-------C-AA-CGTTGAGGA-------TGAA--CAT--AT-------T-CTCA-A-CGTTG----AT-----AAA--G-CGTGT-A---A----TGC--A-CAAC-C-C-G----T-----TTTAAA-ATTGT-T-G---TT-------tgtaataaaatatatgtgataaaaactgggaaaagatcagttcttgtaatgagcaagtaaattatacgctcatttttacgcagtacttaatcaaagtttttgtcatgtctcgcagtgaaaaaaaaagcggcttacattttgccca
gi|20 : gcaacgttgtttcaacgttgaaagtaggtggtataT--TGA-C--C---AA-C--T----TG----A----------------A--------GT-----------C-------------AAA-GT--------T----T---A----T---T---CAAC-GTT----atatacatgtgactgcgacattattatgatgtatataacatttta
gi|3 : c--TGA-T--CGGCAA-C-GC----TG----A----------------A--------TT-----------C-------T----GTAC-AT--------C----G---G----T---G---CGAC--------TAAC----GCT---G-----AAT-A-A---G-AG---T-TGCCA-------------AA--A-G-T--T----GA-----AT-C--AA--------------CGTCAA--C--TGATG---T----C--T--C---AA--C------G-T-T--C-A-AC----G----T--T-G-------T---AT-C-AAC-GT-C-------A----T-------------------------------------------------T-G-C---A-------A----CG--TTG----T------T----------T---CAA--C-G-GTG-A-------G-A-------CA----------T--------C----AA-CG--------T-T----GA------T------T--C-A-AC---T-----TT---------CA--TA---TCC--A----ACCT-TTT--------T---T---C-AA--C--G--T----T----A-A-T--------C-AAC-GT---Tcgttgcaaccagaatacaacaatttggcaacgttgaatcaacgttgcgtgcccac
gi|8 : tggcaaggaatgccattttgtaaatagagttgtcgttccttacattcctacagttatcttatcttacattactaaaatgtatatagttaattgtctaatcggtagtttagtgattgcaccttacaataatcagtaataaacatggttgtaagtattataattggttttgaatatatatataggcccagtatattgtaagattaatttattatttgctatggatggacgtaaagcactagtgatttattacgtaaagttgcatatatatagtgatgttagagatatttcttttggtgagcgttagtacgacatctatgtggcactgtgtgacattttgaacaatacagtgaacactgtgtaatctacctgagagggaatcctctgtgtacggA-T--C---AA-C-GT----TGAAA-A----------------A--------GT-----------C-------T-----AAC-A--------------G---T----T---TAAACAAC-GTT------------A-T---G----AAGT-C-T---G-G----T-T--GA---------------------T--C-A---A--C--CT-CTTAA--------------C---AA-------ACC------------------CA--T------ACT-T--C-A-AC----G----T--T-C-------A---TT-C-AAC-GT-T-------G----gagtg
gi|22 : cagcgggcacttA-T--C---AA-C-GT----TG----A----------------T--------GT-----------C-------T----AAAC-GT--------T----G---A----T---T---CAAC-GTT------GC----A-T---GT---CAAC-G-T---agttttaacagttgtattttacatggtacgttggtatgtgaccatgttggtttcaacgattgtagggtttgataacattgtattataaatattatgtgataaaactgggaaatagatagttctttgtcatgaagaaagtaaatttagtatacgctcataaatggtaaattcaattttttgtatgtttgtttgtatacgcatagtaatgtcaatcagtttttgtcatgtactcggtcagtgtaaaaaaataagaggctttacattgtgatt
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gi|25 : gttgtctgaacgttttggattgtagtttgaggtttaaatgtgtatactaatatagttgtgataagaaatggggaagatagatcagttctatgtcatgagcagtaaatatatagcgactcgatattggtaagatttgttcatatcatattgttttatgcagtaatcaaagtttttggtcatacaaatgttgcgtagttgagaaaaaagggcttatacttttggcccattgtgggcaagagagatgcccatttttagtaatatagagttgtcgtttctttagattagtctacatagagttatctttttctgtacattgatgataagtttagataaaatgtataattgatatgttaattgtctaatcggtagtttggtaaatataaacattgggttgtaagtatcatttggtttttgaatattataggcgtgtgatatctgtgaagatattatgaatttattaatttgctatcggaatggaggtaaagcactagttgattttattacgtaaaggctgcattatatcatattgatgttagaggactgtttgtggtaagcggtataatcgacattgtgtgacagctggtgtgacagtttgggtattatgtacagttttacatctggtgtatatcttacatggagagggaaagtcctcttgtgtgagtgattggctaacgctgagattaaagtgttgacgtgactcattccggtgcgtccga-T--C---AA-C-GT----AA----A----------------A--------AT-----------G------------CAAC-GT--------T----G---T----T---T---CAAC-GTT----TAAT---------------CAAC-G-T---aggaatcatcgtttgtgttaatttcatattctcaacttattactaggtgtgtttcaagcgtaaaaaatgcaagattgtgttcactacgtattaatcaacgttgaagctggcc
gi|5 : aaccttttttcaacgttgct-T--C---AA-C-GT----TG----A----------------A--------ATATTATCAAATAC-------T----CAAC-GT--------T----G-----------------AAA-ATA----TGTC----A-T---AGCTTCAAC-G-TT--G-T----T-T--CA--------------A--C-G-T--TGA--AA--T--AC-T--AA--------------T---AA------GA---------------------A--T------G-T-G--C-ATGT----T----A--TGT-------T---TT-C-AAC-AT-T-------GT---T--------T----TA-AC-GT---T------G-----A---TA--------------A-T-----A----CG--TTG----AGGT---T----------T---TGA--C-G-TTG-A-------AAG-------T-----------T--------C----AA-CG--------T-T----GA------A------A--C-A-ACGTTG---AATT-GT-A----GT--TG---TTC--A----ACG--TTG----------------C-AA--C---------------CAA-T--A--TA-C-CAC-CT---ACT---TT-C-AA-C---GTT---tgagtgc
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gi|24 : caacgttgtt---AA-C-GT----TG-------------------------------T-----------A-------T----CAAC-GT--------T----A---T----T---G---CAGC-GTTG---TNNG----A-T---GTCT-CAAC-G-T---T-G----TAT--CA--------------A--C-A-T--T-A--a
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gi|25 : gatgttggagatgttccattcttT-----------T-------T----CAAC-GT--------T----G---C----T---T---CAAC-G-T----AAAA----A-T---G----CAAC-GTT---G-T----T-T--CA--------------A--C-GTT--T-A---------AT-C--AA--------------C----G--T--TGA
gi|27 : aacctttT-----------T-------T----CAAC-GT--------T----G---T----T---T---CAAC-G-A----AAAA----A-T---G----CAAC-T-T---T-T----T-T--CA--------------A--C-GTT--T-A---------AT-C--AA--------------C----G--T--TGAgtgc
gi|25 : t-----------C-------T----CAAC-GT--------T----G---A----T---T---AAAC-G-T----TGAA----A----------CAAC-GTT---GCA----T-T--TT-------------TA--C-G-T--T----GA-----AG-C--AA--------------C----G--T--TGAgtgc
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gi|15 : -G-T--T-G--GA-----AT-C--AA--------------C---G---T--TGATT---C----T--TCTT---CA--TCTTTGAA-T-T--CTA-AC----G----T--T-TGATG---T---TC-C-AAC-GT-T------------TGAA-----T----CA-AC-G----T------T-----G---CA------T-GTC---A-G-----AAC--TG--TTG----T------A----------A---CAA--C-G-TTGAA-------GAA-------cac
gi|15 : atccaaccat------A-T-C--C-A-AC----C----A--T-T-------TC--TT-C-AAC-GT-T-------G----T--------TA---CA-AC-AGTTCT------G-----A---CA------T-G-C---A-------A----CG--TTG----A------T----------T---CAAA-C-G-TTG---------GAA-------CA----------T--------C----AAACGT-------T-A----GAA-----T------T--C-A-AA---G---A--T-G--AAGAAGA---A---TCA--A-----CGT-T-G----A---T---T---CCAA--C--T--T----TA---C-A-T--A--TC-C-AACACT---TTT---TT-C-AACC---GTG---T------G----T-T-C--------A-ACGG--T--A-A--AAAAA-G-T---GC-----A--A--CCGTT-------G--T--T-TCA-----------AC---GT-----T--TACAT----CTAA-CG-T------------TGAA--Gtttacatatccaacacttttttcaaccgtgtgttcaacggtaaaaaaagtgcaaccgttgtttcaacgtttacatctaacgttgaagtgcccggct
gi|22 : -T-T--C-A-AC----G----T--T-A-------T---TG-C-AAT-GT-T-------G----T--------T----TAGAC-G----TT-----G-----A---CA------T-G-C---A-------A----CG--TTG----A------A----------T---CAA--C-G-TTT-A-------G-A-------CA----------T--------C----AA-CG--------T-T----GA------T------T--C-A-tgcccggct
gi|25 : caacgttgt-A-AC----C----T--T-T-------T---TT-C-AAC-GT-T-------GC---T--------T----CA-AC-G----TA-----A-----A---AA------T-G-C---A-------A----CG--TTG----T------T----------T---CAA--C-G-TTT-A------------------A----------T--------C----AA-CG--------T-T----GA------
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gi|27 : caacgttgaataaa-T-------T---TT-C-AAC-GT-T-------GT---T--------T----CA-AC-GA---A------A-----A---AA------T-G-C---A-------A----CT--TTT-----------T----------T---CAA--C-G-TTT-A------------------A----------T--------C----AA-CG--------T-T----GA------gcgtgcccac
gi|9 : ---TT-C-AAC-GT-T-------G------------------AA-AT-A----T------G-----G---T-------T-G-T-----T-----A----CG--TTG----A------TCAACCAAACTT---CAA--C-G-TTG-------------------TT----------T--------C----AC-CGT-------T-A----GACTT---T------T--C-A-AC---G-----TT-G--A----GGTTCA---TCG--AGTCAACGT-T-G----A---T---T---C-AA--C--G--T----T------G-T--A--T--------------TTTA----C-AA-C---GTT---G------G------------------------------A--GTGAC-A------------------ACGTT-------G-----T-TC---------T-AAC---GT-----TG---TTT----C-AA-CGTT------------TCAA--Ggtgc
gi|22 : ac---TT-C-AAC-GT-T-------G----CATG-----T----CA-AC-G----TCTAAACA-----A---CA------TTG-C---AAT-----AA---CG--TTG----A------A----------A---CAA--C-G-TTG-ggtttataacgaaattgtgtaataaaatatatgtgataaaaactgggaaaagatcagttcttgtaatgagcaagtaaattatacgctcatttttacgcagtacttaatcaaagtttttgtcatgtctcgcagtgaaaaaaaaagcggcttacattttgccca
gi|3 : T-C-AACTGA-T-------G----TC-------T----CA-AC-G----T------------------------T---C---A-------A----CG--TTG----T------A----------T---CAA--C-G-TC------------A-------TT----------G--------C----AA-CG--------T-T----GT------T------T--C-A-AC---G---G--T-G--A----GA--CA---TCA--A-----CGT-T-G----A---T---T---C-AA--C--T--T----T----C-A-T--A--TC-C-AAC-CT---TTT---TT-C-AA-C---G-T---T------A----A-T-C--------A-AC-G--T--tcaacgtttagacatcaacgttgattca
gi|3 : tggcaaggaatgccattttgtaaatagagttgtcgttccttacattcctacagttatcttatcttacattactaaaatgtatatagttaattgtctaatcggtagtttagtgattgcaccttacaataatcagtaataaacatggttgtaagtattataattggttttgaatatatatataggcccagtatattgtaagattaatttattatttgctatggatggacgtaaagcactagtgatttattacgtaaagttgcatatatatagtgatgttagagatatttcttttggtgagcgttagtacgacatctatgtggcactgtgtgacattttgaacaatacagtgaacactgtgtaatctacctgagagggaatcctctgtgtacggtgatcggcaacgctgaattctgtacatcggtgcgactaacgctgaataagagttgccaaaagttgaatcaacgT-C-AAC-GT-T-------GATGTC--------T----CA-CC-G----TT-----G-----A---AA----------C---A-------A----CG--TTGCA--A------T---------------GA--C-G-TTG-A-----------------TA-------------------C----AA-CG--------T-T----GA--------------------AC---G-----TT-G--A----GA--CA---TCA--GTTG-ACGT-T-G----A---T---T---C-AA--C--T--T----T----T-G--------G-C-AAC------TCTTA-TT-C-AG-C---GTT---A------G----T-tgagtg
gi|25 : tggcaaggaatgccattttgtaaatagagttgtcgttccttacattcctacagttatcttatcttacattactaaaatgtatatagttaattgtctaatcggtagtttagtgattgcaccttacaataatcagtaataaacatggttgtaagtattataattggttttgaatatatatataggcccagtatattgtaagattaatttattatttgctatggatggacgtaaagcactagtgatttattacgtaaagttgcatatatatagtgatgttagagatatttcttttggtgagcgttagtacgacatctatgtggcactgtgtgacattttgaacaatacagtgaacactgtgtaatctacctgagagggaatcctctgtgtacggtgatcggcaacgctgaattctgtacatcggtgcgT-C-AAC-GT-T-------GA---T--------T----AA-AC-G----TTGA---A-----A---CAACGT--T-G-C---A-TTTTT-A----CG--TTG----A------A----------G---CAA--C-G-TTG-A-------AAA-------ttcaactttcatatccaaccttttttcaacgttaatcaacgttgagtg
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gi|9 : -C-AAC-GT-T-------G----T--------CACTCCA-AC-G----TTGT---A-----A---AA------T-A-C---A-------A----CG--TTG----A------A----------T---CAA--C-G-TTG-ACTCGAT-GAA-------CC----------T--------C----AA-CG--------T-T----GAAAAG--T------C--T-A-AC---G---G--T-G--A----AA--CAACGTTG--A----A-GT-TTG----G---TTGAT---C-AA------------------C-G-T--A---A-C-AAC-CA---TAT---TT-C-AA-C---GTT---gtgc
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gi|20 : -C-AAC-GT-T-------GA---T--------T----CA-AC-GT---T------G-----C---CAAATTGTT-G-T---A-T-----T----C----TG----G------T----------TG--CAA--C-G-TTG-ACCAACTTGAA--------G----------T--------C----AA-AGT-------T-T-----A------T------T--C-A-AC---G---
gi|24 : caa-AAC-GT-T-------G----TA-------T----CA-AC-G----T------T-----A---T-------T-G-C---A-------G----CG--TTGTNNGA------TGTC-------T---CAA--C-G-TTG-------------------TA----------T--------C----AA-CAT-------T-------A------T------TG-C-A-GC---G---cgtgcccac
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gi|15 : gttgtctgaacgttttggattgtagtttgaggtttaaatgtgtatactaatatagttgtgataagaaatggggaagatagatcagttctatgtcatgagcagtaaatatatagcgactcgatattggtaagatttgttcatatcatattgttttatgcagtaatcaaagtttttggtcatacaaatgttgcgtagttgagaaaaaagggcttatacttttggcccattgtgggcaagagagatgcccatttttagtaatatagagttgtcgtttctttagattagtctacatagagttatctttttctgtacattgatgataagtttagataaaatgtataattgatatgttaattgtctaatcggtagtttggtaaatataaacattgggttgtaagtatcatttggtttttgaatattataggcgtgtgatatctgtgaagatattatgaatttattaatttgctatcggaatggaggtaaagcactagttgattttattacgtaaaggctgcattatatcatattgatgttagaggactgtttgtggtaagcggtataatcgacattgtgtgacagctggtgtgacagtttgggtattatgtacagttttacatctggtgtatatcttacatggagagggaaagtcctcttgtgtgagtgattggctaacgctgagattaaagtgttgacgtgactcattccggtgcgtccgatgctgaatggtaaagtgtgctagatagttaat----T--------T----CA-AC-G----T------T-----A---GA------T-G-T---A-A-----A----CG--TTG----A------A----------A---CAA--C-GGTTG-C---------ACTTTTTTTA----------C--------CGTTGAA-CAC-------A-C----GG------T------T--G-A-AA---A---AAGT-GTTG----GA--TA---TGT--A----AAGT-TGG----A---A---T---C-AA--CGTTGAT----T----C-T-T--C--TT-C-A-T-CT---TTGAA-TT-CTAA-C---GTT---T------GATGTT-C-C--------A-AC-G--T-------TTGA--A-T----C-----A--A---CGTT-------GC-A--TGTCA--------G--AACT-GT-----TGTAACA--------A-CGTT-------------GAA--GAA--AT-------ggaatcatcgtttgtgttaatttcatattctcaacttattactaggtgtgtttcaagcgtaaaaaatgcaagattgtgttcactacgtattaatcaacgttgaagctggcc
gi|22 : atccaacc--------T----CA-AC-G----TT-----G-----A---TG------T-C-T---A-A-----A----CG--TTG----A------T----------T---CAA--C-G-TT----------GCA-------TG----------T--------C----AA-CGT-------C-T----AA-------------A--C-A-AC--------ATT-G--gtgcccggct
gi|8 : caacgttgtttcaacgttattg----CA-AC-G----T------A-----C---CA------T-G-T---A-A-----A---------------A------T----------A---CAA--CTG-TTA-A-------AAC-------TA----------T--------C----AA-CG--------T-T----GAAAAAG-T------C--T-A-AC-------AGTT-T--A----AA--CAACGTTATGA----A-GT-CTG----G---T---TGATC-AA--C--C--T---------C-T-T--A--AC-A-AAC-CC---AT--ACTT-C-AA-C---GTT---C------A----T-T-C--------A-AC---------G--TTGAA-G-T---GC-----ttca
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lowQualScore : 2 0 8 0 0 000 0 0 0 8 0000 6666 4444444444444444 0 0 2222 66 00 000 222222 00 00 00 00 0 000000 0 0 6 0 8 00 8 0 0 5 5 7 4 4 4 1 2 4 11 3 4 44 4 0 0 0 55 55 0 7777777777777777777777777777777777777777 55 55 0 00000 00000 0 000 55 0 000 0 55 0 0 0 7 11111 6 55 0 0 55 0 0 0 0 0 0 0 5555 0 0 555555555555555555 000 0 0 55 5555 0 99 55 0 0 0 000 4 9 4 99999999999999999 0 6666666 555555 0 0 4 888 0 0 88 0 1 0 11 66 7 000 7 4 666666666666666666 99 2 0 99 444444444444444 1111 7777 00000 7 7 0 99 0 7777777 99 7 4 99 2222222222222222222222222222222222 0000000 6666666666666 00000000 000 7 11111111 6666 0 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8888 8 6666666666666666666666666666 888 3 99 222222222222222222222222222 3 3 777777777777777777 3 66 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 9999999999999999999999999999999999999999 4 0 0 77777777777777777 0 7 7 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4444 9 77777 4 4 99 888 4444444 4444444444444444 0 0 0 0 0
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Reference ( family-3173 ) : TAAAATATAGT-GTGATAAAAA-CTG-GGAAA---AGATCAGTTC-T-TGTCATG-AGCAAGT----AAAT---ATATA------CG--CATATATGGT-AA-ATTN-AATTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGC---AC-GTAA--TCAA--AGTGTTTT--GT-CAT------GT-CTC-GTCA-GTGNAAAAAA--AAGNGGC-TTACA-TTTTGCCCCAT-GTGG-CAAG-GA-ATGCCAATTT-T--GTNA-A-NAGAGTTGT-CGT-TCCTT-A-CATT--CC--TAC-A--GAG----T-ATC-TT----------AGCT---A--T--TAA--GT--TTAC-TAAAATGTA-----TA-----TA-G---TTAA--TT-GTC---TAAT-CGGTAGTTTAGTG--ATTGCACC-TT-A-CAATAATCA---G-TAA-TA--AAC-A-T--GGTT-G-TAA-GT-ATTAT-AA-TTGGTTTT-GA----A-TAT-A------------------TAGGCCCAGT---ATAT-TGT-A--AGAT----T-AATTTAATTATTTGCTAT--GG-ATGGACGT-AAAGCACTAG-TG---A-TTTATT-ACGTAAA-GTTGC----------A------TNTA----T--ATA------GT-GNTGT-TAGAGG---CT-GNTT-TG-GCGA-GCGGTA-TTA--CGA-CA---TCTG-TGT------------G-----ACACC--GTGTGACA-TTTGA--ACTA-TA-ACAG-TTT-ACA----GTGTGTAATCTAC-AC-GAGAGGGAA---T-C-TC-TGTGTAGGGTGAT--CGGC-AACGCTGA-A-----T--A-AGCGTTGAC--GACTCAC----GTACGTTTAAAAG-ATG--GATATG---AAAGTTTGATCAAC-GT----TGAA-----GT-----CTCAACGTT----G---TT---TCAAC-GTTTGACA-TGCAACG-T-GATTCA-AC-GTTAG------ACA-----TCA-AC-AGTTG-A---T----CTTTC--ATATTCAACNCTT--TTTCAACGTTGT-T-CAACGTGANA---TGCAT---ACG--TTG----A--T---TCAAC-G--TTG-AGAATA----------T---------CA-ACG-TTG-A-------------TT-CAAC-G--TTGAG---ACAT----CG----AACGTTTGAT---T--CA----ACGTTCAT--A-TC-C-AACCT---TTTTA-TTCAACGT------T-----NGTT--CAACGTA-----ATT--GA-A-T-GCA-A-ACGTT-------GA--TTCA--TCAACGTTGAGACAT-CAA-CGTT------------TGAAGAA--ATTC-A-CGTTGAT-T-CATACTTT-CATGT--C-CAAC-CT-T--T-----TTTCAA-ACGTTG---T-TTCAA-C-GT-AAAAA---TGC-------AACGT--ATGTT-------TTTTCAACGT-TNA-ATC-AACGTTG-AGTGCCC
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gi|10 : gttgtctgaacgttttggattgtagtttgaggtttaaatgtgtatactT-GTGG-CAAG-GA-ATGCCA-TTT-T--GT-A-A-TAG--CCGT-TGT-TCCTT-A-CATT--CC--TAC-A--GAG----TTATC-TTTTCTTACATTAGCT---AA-T--TAA--GT--TTAC-TAAAATGTA-----TA-----TA-G---TTAA--TT-GTC---TAAT-CGGTAGTTTAGTG--ATTGTACC-TT-A-CAATAATCA---G-TAA-TA--AAC-A-T--GGTT-G-TAA-GT-ATCAT-AA-CTGGTTTT-GG----A-TAT-A------------------TACGCCCAGT---ATAT-TGT-A--AAAT----T-AATTT-ATTATTTGCTAT--GG-ATGGACGT-AAAGCACCTG-TG---A-TTTATT-ACGTAAA-GTTGCATATATATATA------TATA----T--ATA------GT-GATGT-TAGagctggcc
gi|11 : A-ACG-TTG-T-------------TT-CAAC-G--TTGAG---GCttag
gi|11 : gttctAAGTATAGT-ATAATAAAAA-CTG-GGAAA---AGATCAGTTC-T-TGTCATG-AGCAAGT----AAAT----TATA------CG--CTCATATGGT-AA-ATTA-AATTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGC---A--GTAA--TCAA--AG-ATTTT--GT-CAT------GT-CTC-G-CA-GTG--AAAAA--AAGGGGC-TTACA-TTTTGCCCttgataaattgtatgataattgtatgataaaataagtatagtatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgagggttgataaattgtataataaaataagtatagtataataaaaactgggaaaagatcagttcttgtcatgagcaagtaaattatacgctcatatggtaaattaaattctatatcattttgttttacgcagtaatcaaagattttgtcatgtctcgcagtgaaaaaaaggggcttacattttgccc
gi|12 : gttctaacgttgtttcaacgttgaggcttgataaattgtatgataattgtatgataaaataagtatagtatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgagggttgataaattgtataataaaatTGG-CAAG-AA---GCCAATTT-T--GTAA-A-CAGAGTTGTTCGT-TCCTG-AACATT--CC--TAC-A--GAG----TTATCATT----------ACTT---ACGT--TAGCCGA--TTAG-TAAATTGTG-----TA-----TA-GG--TTAA--GT-TTCCGGTAAT-CAGTAGTT-AGTGGGATTGCATC-TT-A-CAATAATTATGGG-TAG-GAGGAACCA-T--GTTT-GGTAA-GT-AGTATTAA-ATGGTTTT-GA----AATAT-A------------------TAGACCCAGT---ATGT-TGT-A--AGAT----T-AATTT-ATTATTTGCTAC--GGAATGGACGT-AAAGCGTTAG-TG---
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gi|14 : gatgttggagT-GTGG-CAAG------GC--ATTT-T--GTAA-ATTAGAGTT-T-C-T-TCCTA-A-CATT--CC--GGTGA--GAGGGGTT-ATC-TT----------TTCTTACA--T--TCG--CTGATTAG-TAAAATGTT-----TA-----TA-G---TTAA--TT-GTC---TAAT-CGGTAGTTTAGTG--ATTACACC-TT-A-CAATAATTA---T-T---T--------------TT-G-TAG-GTGATT-T-AA-GTGATTTT-GA----A-TAT-A------------------TAGGCCCAGT---ATAT-TGT-A--AAAT----T-AATTT-ATTATTTGCTAT--GG-ACGGACGT-AAAACGCCAC-TG---A-T---------TGGA-TTTGC----------A------TATA----A--ATA------GT-Gtg
gi|15 : --A-TC-C-AACCA---TTTC--TTCAACGT------T------GTTA-CAAC--A-----GTTCTGACA-T-GCA-A--CGTT-------GA--TTCA----AACGTTGGAACAT-CAAACGTTAGAATTCAAAGATGAAGAAGAATCA-A-CGTTGAT-T-CCAACTTTACATAT--C-CAACACT-T--T-----TTTCAA-CCG-TG---TGTTCAA-CGGT-AAAAAAAGTGC-------AAC-----CGTT-------GTTTCAACGT-TTACATCTAACGTTGAAGTGCCC
gi|16 : -TAA-TA--AAC-A-T--GGTT-G-TTA-GT-ATTAT-AA-TTGGTTTT-GG----A-TAT-G------------------AAGGCCCTGT---ATAT-TGT-A--AGAT----T-AACTTA-TTATTTGCTAT--GG-ATGGACGT-AAATCACTAG-TG---A-TTTATT-ACGTAAA-GTTGC----------A------TATT----T--ATA------GT-GATGT-TAGAAG---CT-GTTT-TG-GTGA-GCGGTA-TTA--CGA-TA---TATT-TGT------------G-----ACACC--GTGAGACA-TTTGA--ACggct
gi|17 : TTTT-T-CAACGTTAAA-----CA----ACG--TTGGCT-A--T---TCGAC-A--T-----ATTT----------T---------TACACG-TTG-A-------------CCACAAA-T--ATGAG---A-AT----TA----ACCGTTGAAT---T--TATGTGAGGTTCAC--A-AC-C-A--------TATA-TTCAACGT------T-----GATA--AAGCGTG----------GA-A-T-GCACA-ACaacg
gi|18 : gataTATGTAATCTCC--T-GAGAGGGAA---T-CCTC-TTTGTAG--TGATTGCGAC-AACGCTGA-A-----T--A-AGTGTTGAC--GACTC-T----GTGCGACTAAccggttcttccaaatttatatatgtggactgcgaaacattattatgatgtatataaaatgatttat
gi|18 : gtatttgaacaatttaacaagccgaccacttcCAAC-TTTTG-----GCAACACT-TATTCA-GC-ATTAG------TCG------CACAG-AGTCG---------------------TCAACACTT--ATTCAGCGTTGT-tgctgaataagtgttgccaaaagttgggttttttggggggtgt
gi|19 : gtatttgaacaatttaacaagccgaccacttctatgtaatctcctgagagggaatcctctttgtagtgattgcg-GTGG-CAAG-GA-ATGCCA-TTT-C--GTAA-A-TATAGTTGT-CGT-TCCTT-A-CATT--CC--TAC-A--AAG----TTATC-TTTTCATACATTAGCTG--A--T--TAA--GT--TTAC-TAAAATGTA-----TA-----TA-G---TTAA--TT-GTC---TAAT-CGGTAGTTCAGTT--ATTGCACC-TT-A-CAATAATCA---G-TAA-ggttttttggggggtgt
gi|2 : TGAAATATA-T-GTGATAAAAAACTGCGGAAA---AGATCAGTTC-T-TGTCATG-AGCAAGTTTAAAAAT---ATATA------CG--TATATATGGTCAA-ATTCTAGTTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGC---AC-GTAA--TCAA--AGTGTTTTTGATACAT------GT-CTC-GTCAAGTTTGAATAA--AAGCGGC-TTACA-TTTTGGCCGAT-GTGG-AAAG-GA-ATGCCAATTTAT--GTTA-A-AAGAGTTGT-CGAATCCTT-A-CATT--TCAATAC-A--GA-----------TT----------A------------TAA--GT--TTAC-TAAA-TGTA-----TA-----T--G---TTA---TT-GTC---TAATTCGGTAGTTTGGTG--ATTGCACC-TTTA-CAATAATCA---GCTAA-TA--AAC-A-T--GGTTTG-TAAAGT-ATTAT-AA-TTGGTTTT-AA----A-TAT-A------------------TAGGTCCAGT---AT-T-TGT-ATGATAT----T-AATTTAATTATTTGCTAT--GA-ATTGACGT-AAAGCACTAG-TA---A-TTTATT-ACGTAAA-GTTGC----------A------TTGA----T--ATA------GT-GTTGTGTAAGGG---CT-GGTA-TGCGCGA-GCGGTA-TTAAACGA-CA---TCTGCTGT------------GGGGGGACACC--GTATGACA-TTTGA--ATTA-TA-ACAG-TTTTACA----GTGTGTAATCTATAAC-GAGAGGGAA---T-C-TC-TGTGTAGGGTGAT--CGGC-AACGCT-A-A-----T--A-AGTGTTGAC--GACTCAT----GTATATTTAAAAG-ATG--GATATG---AAAGTTTGATCAAC-GT----TGAA-----GT-----CTCAACGTT----G---TT---TCAAC-GTTTGACA-TGCAACG-T-GATTCACAC-GTTAG------ACA-----TCA-AC-AATTG-A---TC---CTTTC--ATATTCAACTCTT--TTTCAACGTTGT-T-CAACGTGACA---TGCAT---ACG--TTG----A--T---TCAAC-G--TTG-AGAATA----------T---------CA-ACGCTTG-A-------------TT-CAAC-GAATTGAG---ACAT----CA----AACGTTTGAT---T--CA----ACTTTCAT--A-TC-C-AACCT---TTTTA-TTCAACGT------T-----TGTT--CAACATA-----ATT--GACA-T-GCA-A-ACGTT-------GA--TTCA--TCAA-GTTGAGACAT-CAA-CGTT------------TGAAGAA--ATTC-A-CGTTGAT-TCCATACTTT-CATAT--C-CAAC-CT-T--T-----TTTCAA-ACGTTG---T-TTCAA-C-GTAAAAAA---TGC-------AACGT--ATGTT-------TTTTCAACGT-TTA-ATC-AACGTTG-AGTGCCC
gi|20 : GGCA-CGCAACG-TTGATTCA-AC-GTT-G------CCA-------A-AT-TGTTG------------------TATTC------TGGTTGCAACGTTGA-C-CAACTTGAAG---T-CA----AAG--TTT----A--T---TCAAC-G--TTG-
gi|21 : AC-CTAC--T-----TTTCATTATGTTT---C-TTCAA-C-GT---------TTC-------AACTT--ATTTTCAACAAATTTTCAACGT-TGA-GAC-AACGCAG-CGTGCcac
gi|22 : CAACGTTGT-TTCAACGTTAT----TGCA----ATG--TTG----T--T---TAGAC-G--TTG-A---CA----------TG--------CA-ACG-TTG-A-------------AT-CAAC-G--TTTAG---ACAT----C-----AACG-TTGAT---T--CA----ccaaagttaaa
gi|23 : --CGGC-AACGCTGA-T-----T--A-AGTGTTGAC--GACTCG-----GTACATT
gi|24 : AACGTTGTAT-CAACGTTAT----TGCA----GCG--TTGTNNGA--TGTCTCAAC-G--TTG-----TA----------T---------CA-ACA-TT--A-------------TTGCAGC-G--CTGggttcgactgacgctgaataagtgatgccaaaagttta
gi|25 : AAC-CT-T--T-----TTTCAA--CGTTG---C-TTCAA-C-GT-AAAAA---TGC-------AACGT---TG----------TTTCAACGT-TTA-ATC-AACGTTG-AGTGC
gi|26 : CACC--GTGTGACA-TTTGA--AT-----------TCT-ACG----GT---TAATCTAC-AT-GAGAGGGAAT--T-C-TC-TGTGTAGAGTGAT--
gi|27 : --T-----TTTCAA--CGTTG---T-TTCAA-C-GA-AAAAA---TGC-------AAC-------TT-------TTTTCAACGT-TTA-ATC-AACGTTG-AGTGC
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Reference ( family-3173 ) : TGAAATATAGT-GTGATAAAAA-CTG-GGAAA---AGATCAGTTC-T-TGTCATG-AGCAAGT----AAAT---ATATA------CG--CATATATGGT-AA-ATTCGA-TTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGC---AC-GTAA--TCAA--A--GTTTTTG-T-CAT------GT-CTC-GTC-AGTGNAAAAAA--AAGNGGC-TTACA-TTTTGNCCNAT-GTGG-CAAG-GA-ATGCCAATTT-T--GTAA-AT-AGAGTTGT-CG-TTCCTT-A-CATT--CC--TAC-A--G-AG---TTATCTTTT-CT-TACA--AGCTGAT--TAAGTTTAC-TAAAATGTA-----TA-----TA-G---TTAA--TT-GTC---TAA-TCGGTAGTTTAGTG--ATTGCACC-TTA-CAATAATCA---G-TAA-TA--AAC-A-T--GG-TTG-T-AAGT-ATTAT-AA-TTGG-TTTTGA----A-TA------------------TATAGGCCCAGT---ATAT-TGT-A--AGAT-T----AATTTAATTATTTGCTAT--GG-ATGGACGT-AAAGCACTAG-TG---A-TTTATT-ACGTAAA-GTTGC------A----------TATA----T--ATAGT-GATGT-TAGAGG---CTGNTT-TG-GCGA-GCGGTA-TT--A-CGA-CA---TCTG-TGT------------GACACC--GTGTGACA-TTTGA--ACTA-TA-ACAG-TTTACA----GTGTGTAATCTAC-AT-GAGAGGGAA---T-C-TC-TGTGTAGGGTGAT--CGGC-AACGCTGA-A-----T--A-AGTGTTGAC--GACTCAT----G-TGCGTCTAAGA-GNTGGATNCGAAAGT-TTGATCAAC-GT----TGAN-----GT-----CTCAACGTT----G---TT---TCAAC-G-TTGA-----CA---TGCAACGTTGAT--TCA-AC-GTTAG------AC--A-----TCAAC-GGTTG---AT----C-TTTC--AT--ATTCA--ACGTNTTTTCAA--CGTTG-T-T----CA---ACG-T-GACATG--C-A-AC--G--TT----GA-T---TCAAC-G--TTG-AGAATA----------TCAACG-TTG-A-------------TT-CAAC-G--TTGAA---ACATC-----G-----AACGTTTGATT---CAAC-TTCA-TA-TCC-AACCT---T-NTT-TTCAACGT------TGGTTCAACG-A------ATT--GA-A-TGCAA-ACGTT-------GA--TTCA--TCAACGTTGAAACAT-CAA-CGTT------------TGAAGAA--ATTC-A-CGTTGATT-CG-TACTTT-CATAT--CCAAC-CTT--T-----TTTCAAACGTTG---T-TTCAA-C-GT-AAAAA---TGCAA-CGT-TGTTTTTTCAACGT-TTA-ATC-AACGTTG-AGTGCCC
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Reference ( family-3173 ) : TGAAATATAGT-GTGATAAAAA-CTG-GGAAA---AGATCAGTTC-T-TGTCATG-AGCAAGT----AAAT---ATATA------CG--CATATATGGT-AA-ATTCGA-TTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGCA---C-GTAA--TCAA--AGT--TTTTG-T-CAT------GT-CTC-GTCA-GTGNAAAAAA--AAGNGGC-TTACA-TTTTGNCCNAT-GTGG-CAAG-GA-ATGCCAATTT-T--GTAA-AT-AGAGTTGT-CGT-TCCTT-A-CATT--CC--TAC-A--G-AG---TTATCTTTT-CT-TACATTAGCTGATTAAGTTTAC-TAAAATGTA-----TA-----T--A-G-TT---AA-TTGTC---TAAT-CGGTAGTTTAGTG--ATTGCACC-TT-ACAATAATCA---G-TAA-TA--AAC-AT--GGTT-G-TAA-GT-ATTAT-AA-TTGG-TTTTGA----A-TA------------------TATAGGCCCAGT---ATAT-TGT-A--AGAT-T----AATTTAATTATTTGCTAT--GG-ATGGACGT-AAAGCACTAG-TG---A-TTTATT-ACGTAAA-GTTGC------A----------TATA----T--ATAGT-GATGT-TAGAGG---CTGNTT-TG-GCGA-GCGGTA-TT--A-CGA-CA---TCTG-TGT------------GACACC--GTGTGACA-TTTGA--ACTA-TA-ACAG-TTTACA----GTGTGTAATCTAC-AT-GAGAGGGAA---T-C-TC-TGTGTAGGGTGAT--CGGC-AACGCTGA-A-----T--A-AGCGTTGAC--GACT-----C---AT----G-TGCGTCTAAGA-GCTGAA---T---AAAGT-TTGAT----CAAC-GT----TGAN-----GT-----CTCAACG---TT----G---TT---TCAACG-TTGA------------CA---TGCAACGTTGAT--TCA-AC-G-TTAG------ACA-----T---CAAC--GTTG---AT----C-TTTC--AT--ATTCA--ACGTNTTTT-CA----A--CGTTG-T----T-CA---ACGT--GACG--TG--C-A-AC--G--TTG----A-T---TCAAC-G--TTG-AGAATA----------TCAACG-TTG-----------A-----T---T-CAAC-G--TTGAAACA-TCGT----AAGTTTGATT---CAAC-TTCA-TA-TCC-AACCT---T-NTT-TTCAACGTTC------GTT-CAACG-AATT--GACATGCA----AACGTT-------GA--TTCA--TCAACGTTGAAACAT-CAA-CGTT------------TGAAGAA--ATTC-A-CGTTGATT-CG-TACTTT-CATAT--CCAAC-CTT--T-----TTTCAAACGT-TG---TTTCAA-CG-T-AAAAA---TGCAAC-GT-TG--TTTTCA--ACGT-TTA-ATC-AACGTTG-AGTGCCC
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gi|23 : caacgttgtt--CGGC-AACGCTGA-T-----T--A-AGTGTTGAC--GACTCGGTAC---ATTG--G-TTCGACT--GACGCTGAA---T---AAtca
gi|24 : A----A--CGTTG-TA---T-CA---ACGT--TAT---TG--C-A-GC--G--TTGTNNGA-TGTCTCAAC-G--TTG-----TA----------TCAACA-TT------------A-----T---TGCAGC-G--CTGgtgatgccaaaagttta
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gi|29 : ----------TATA----T--ATAGT-GTTGT-TAGAGG---CTGGTA-TT-GCGA-GCGG
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Reference ( family-3173 ) : TGAAATATAGT-GTGATAAAAA-CTG-GGAAA---AGATCAGTTC-T-TGTCATG-AGCAAGT----AAAT---ATATA------CG--CATATATGGT-AA-ATTCGA-TTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGCA---C-GTAA--TCAA--AGT--TTTTG-T-CAT------GT-CTC-GTCA-GTGNAAAAAA--AAGNGGC-TTACA-TTTTGNCCNAT-GTGG-CAAG-GA-ATGCCAATTT-T--GTAA-AT-AGAGTTGT-CGT-TCCTT-A-CATT--CC--TAC-A--G-AG---TTATCTTTT-CT-TACATTAGCTGATTAAGTTTAC-TAAAATGTA-----TA-----T--A-G-TT---AA-TTGTC---TAAT-CGGTAGTTTAGTG--ATTGCACC-TT-ACAATAATCA---G-TAA-TA--AAC-AT--GGTT-G-TAA-GT-ATTAT-AA-TTGG-TTTTGA----A-TA------------------TATAGGCCCAGT---ATAT-TGT-A--AGAT-T----AATTTAATTATTTGCTAT--GG-ATGGACGT-AAAGCACTAG-TG---A-TTTATT-ACGTAAA-GTTGC------A----------TATA----T--ATAGT-GATGT-TAGAGG---CTGNTT-TG-GCGA-GCGGTA-TT--A-CGA-CA---TCTG-TGT------------GACACC--GTGTGACA-TTTGA--ACTA-TA-ACAG-TTTACA----GTGTGTAATCTAC-AT-GAGAGGGAA---T-C-TC-TGTGTAGGGTGAT--CGGC-AACGCTGA-AT--AAGTGTTGAC--GACT-----CATT---GTGCGNCTAAGA-GCTGAA---T-----------AAAGT-TTGAT-CAAC-GT----TG----AN-----GT-----CTCAACGTT----G---TT---TCGACG-TTGA-----CA---TGCAACGTTGATTCA-AC-G-TTAG------ACA-----T--CAAC--GTTG---AT-----NTTTC--AT--ATTCAACGTNTTTTCA-A--CGTTGN----T-C---A---ACGT--GACGTG-C-A-A-CG--TTGATTCAAC-G--TTG-AG-A-TA----------T----CA-A--CG-TTG--A-------------TTCAAC-G--TTGAAACANC-GT----AAGTTTGATT---CAAC-TTCA-TA-TCC-AACCT---T-NTT-TTCAACGTTC------GTT-CAACG-AATT--GACATGCA----AACGTT-------GA--TTCA--TCAACGTTGAAACAT-CAA-CGTT------------TGAAGAA--ATTC-A-CGTTGATT-CG-TACTTT-CATAT--CCAAC-CT-T--T-----TTTCAA-ACGT-TG---TTTCAA-CG-T-AAAAA---TGCAAC-GT-TG--TTTTCA--ACG--T-TTA-ATC-AACGTTG-AGTGCCC
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gi|14 : gT-GTGG-CAAG-G------CA-TTT-T--GTAA-ATTAGAGTT-T-C-T-TCCTA-A-CATT--CC--GGTGA--G-AGGGGTTATCTTTT-CT-TACATTCGCTGATTAG-------TAAAATGTT-----TA-----T--A-G-TT---AA-TTGTC---TAAT-CGGTAGTTTAGTG--ATTACACC-TT-ACAATAATTA---T-T------------T----TT-G-TAG-GTGATT-T-AA-GTGA-TTTTGA----A-TA------------------TATAGGCCCAGT---ATAT-TGT-A--AAAT-T----AATTTA-TTATTTGCTAT--GG-ACGGACGT-AAAACGCCAC-TG---A-TT---------GGA-TTTGC------A----------TATA----A--ATAGT-G
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Reference ( family-3173 ) : TGAAATATAGT-GTGATAAAAA-CTG-GGAAA---AGATCAGTTC-T-TGTCATG-AGCAAGT----AAAT----TATA-CGC-C---AT--AT-GGT-AA-ATT--AGTTCTATATCAT-TTTGTTT---TACGC---AC-GTAA--TCAA--AGT--TTTTG-T-CAT------GT-CTC-GTCA-GTGNAAAAAA--AAGNGGC-TTACA-TTTTGNCCNAT-GTGG-CAAG-GA-ATGCCAATTT-T--GTAA-AT-AGAGTTGT-CGT-TCCTT-A-CATT--CC--TAC-A--G-AG---TTATCTTTT-CT-TACATTAGCTGATTAAGTTTAC-TAAAATGTA-----TA-----T--A-G-TT---AATT-GTC---TAAT-CGGTAGTTTAGTG--ATTGCACC-TT-ACAATAATCA---G-TAA-TA--AAC-A-T--GGTT-G-TAA-GT-ATTAT-AA-TTGG-TTTTGAA-TA------------------TATA----GGCCCAGT---ATAT-TGT-A--AGAT-T----AATTT-A-TT-ATTTGCTAT--GG-ATGGACGT-AAAGCACTAG-TG---A-TTTATT-ACGTAAA-GTTGC------A----------TATA----T--ATAGT-GATGT-TAGAGG-C---TG-NTNTG-GCGA-GCGGTA-TT--A-CGA-CA---TCTG-TGT------------GACACC--GTGTGACA-TTT-GA--ACTA--T-ACAG-TTTACA----GT----------------GTGTA--ATCTA---C-NT-GAGA----GG--GA-A--TCCTC-TGTGTA-G--GGTGAT--CGGC-AACGCTGA-AT--AAGTGTTGAC--GACT-----CNGTG--------CG-ACT--AACGCTGAATA-G---------AAAGT-TTGATCAAC-GT----TGA-A-----GT-----CTCAAC-GTT----G---T--T---TCA------ACG-TTGA-----CA---T-GCAAC---GTTGNTT-CA-ACG-TT-AG------AC--A-----TCAAC--GTTG---A--T-TC-----TCG--TATTCAACGTNTTTTCA-ACGTTG-AC----CA-ACGT-----TG--A---CA-----AT-----GTTGATT-CAAC-G--TTG-AG-A--T--A----------T----C-AACG--TTG--A-----TTCAAC-G--TTGAAAC----AACGT-----AGGCCGATTCGAC---CA------TA-TCCA-AC--C-NTT--TT-TTCAACGTTC------GTT-CAACG-GAT-TGACATGCA----AACGTT-------GA--TTCAA-TCAACGTTGAAACAT-CAA-CGTT------------TGAAGAA--ATTC-A-CGTTG-ATTCCA-ACTT--T-CATAT--CCAAC-CT-T--T-----TTTCAA-ACGT-TG---CTTCAA-C-GT-AAAAA---TGCAA-CGT-TG--TT--TTCA--ACG--T-T-TA-A--T-C-AACGTTG-AGTGCCC
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