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lowQualScore                  :                2  5  1  1 1   2 2  1 33 1 33  1  2 44 333333   1 1 999999999   1  1 2  1   1   2      
lowQualScore                  :                .  .  .  . .   . .  . .. . ..  .  . .. ......   . . .........   .  . .  .   .   .      
lowQualScore                  :                2  9  4  3 3   7 7  3 22 3 22  3  7 55 888888   3 3 000000000   3  3 7  3   3   5      
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Reference ( gi|2 )            : GGTTCTTGGGGGTTT-TTATG-CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|1                          :        GGGGGTTTATTGGC-CAGC-ACG-T-GC-T--AAT--GC-GC-G--T------AAACT-AAG-------TTG-TT-G-AA-CTACCTT-TTCAT
gi|23                         :             TTT-TT-TG-CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------GAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTgcgcagg
gi|26                         :             TTT-TTTT---A-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-
gi|20                         :             TTT-TT-TG-CA-C-ATG-T-GC-T--A-T--GCAGC-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|21                         :             TTT-TTTTG-CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GA-A--T------AAA-T-A---------TGG-TT-G-AA-CTA-C
gi|17                         :             TTT-GTTTG-CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-AC-A--T------AAA-C-A---------TCG-TT-G-AA-CTG-CTT-
gi|19                         :             TTT-TTTTG-CA-C-ATG-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------ATA-A-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|16                         :             TTT-TTTTG-CA-C-ACG-T-GT-T--A-TTTGC-GC-A--T------CAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|22                         :             TTT-TTTTG-CA-C-ACG-T-GT-T--A-T--GC-GC-A--T------CAA-T-A---------TCG-TT-G--A-CTA-C
gi|24                         :            aTTT-TTTTG-CA-C-AAC-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G--A-CTA-CT
gi|29                         :             TTT-TT-TG-CA---ACG-T-GCCT--A-T--GC-GC-A--T------AA--T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|15                         :             TTT-TTTTGACA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GC-ATTT------AAA-T-A---------TCA--T-G-AA-CTA-C
gi|18                         :           ttTTT-TT-TG-CA-C-ACG-T-GC-T--T-A--GC-GCCA--T------AAG-C-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|9                          :             TTT-TT-TG-CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GT-A--T------AAA-T-AGTGATAAAGTCG-TT-GAAA-CTA-C
gi|6                          :             TTT-TT-TG-CA---AT--T-GC-T--A-T--GC-GC-AT-T------AAA-T-A---------TCT-TT-GAAA-CTA-CTT-TTAATA
gi|31                         :              TT-TT-TG-CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------ATA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-Cgcgcg
gi|30                         :              TT-TT-TG-CA-C-ACG-T-GT-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-A-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|25                         :               T-TT-TG-CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GT-GC-A--T------TAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C
gi|14                         :                ttaATG-CA-C-ACG-T-GT-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|12                         :                    TG-CA-C-A-G-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-TAA---------TCG-TT-G-AA--TA-CTT-TTCAgc
gi|5                          :                tattTG-CA-C-ACA-TTGC-TT-A-TT-GC-GC-A--T------AAA-T-----------TCG-TT-G-AA-T---CTT-TTCATAaag
gi|10                         :                 gggtG-CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------TTG-TT-G-AA-CTA-C-T-TTCATAacgcggga
gi|27                         :              tttggggG-CA-C-ACG-A-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------GCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATg
gi|8                          :                     G-CA-C-ACGAG-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------GCGTTT-G-AA-CTA-C-T-TTCATA
gi|4                          :                   agG-CA-CCACG-C-GC-T--A-T--GC-AC-A--TTACACGAAA-T-A---------TCG-TT-T-AA-CTA-CTT-TTCATAgcgcgg
gi|3                          :                 ttggG-CA-C-ACGGTAGC-TCAG-T--GA-GCCA--T------AAA-T-AGA-------TCG-TT-G-AA-CTA-CTTATTCATAgcgcg
gi|28                         :                      -CA-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C-T-TTCATAgcgcggaa
gi|7                          :                      -CA-C-CCG-T-GC-T--A-T--GC-GC-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTC-CTT-TTTATA
gi|13                         :               tttggga-CA-C-ACG-C--C-T--A-T---C-GC-A--T------GAA-T-A---------CCA-TTTG-AA-TTA-CTT-TTCAgcg
gi|11                         :                        A-C-ACG-T-GC-T--A-T--GC-GC-AC-T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AACCTA-CTT-TCCTTAaagcgcggg





Alignments
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lowQualScore                  :                     ... ..  .   . .  . .. . ..  . . . .. ......   . . .........   .  . .  .   .   .      
lowQualScore                  :                     777 88  3   6 6  3 11 3 11  3 3 3 44 777777   3 3 777777777   3  3 6  3   3   4      
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Reference ( family-315 )      : NNNNNNNGGGGGTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|1                          :        GGGGGTTTATTGG---CCAGC-ACG-T-GC-T--AAT--GC-G-C-G--T------AAACT-AAG-------TTG-TT-G-AA-CTACCTT-TTCAT
gi|10                         :                    G---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TTG-TT-G-AA-CTA-C-T-TTCATAgcgcagg
gi|11                         :                  tttgggg--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-AC-T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AACCTA-CTT-TCCTTAg
gi|12                         :             gccaTTTG---C--AC-A-G-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-TAA---------TCG-TT-G-AA--TA-CTT-TTCAgcg
gi|13                         :                   ta---C--AC-ACG-C--C-T--A-T---C-G-C-A--T------GAA-T-A---------CCA-TTTG-AA-TTA-CTT-TTCAaag
gi|14                         :                   TG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATAaagcgcggg
gi|15                         :            aTTTTTTTGA--C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-ATTT------AAA-T-A---------TCA--T-G-AA-CTA-Cgc
gi|16                         :           ttTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-TTTGC-G-C-A--T------CAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
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gi|18                         :              TTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--T-A--GC-GCC-A--T------AAG-C-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|19                         :             TTTTTTTG---C--AC-ATG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------ATA-A-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|2                          :        GGGGGTTTTTATG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|20                         :       ggttcttTTTTTTG---C--AC-ATG-T-GC-T--A-T--GCAG-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|21                         :             TTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-A-A--T------AAA-T-A---------TGG-TT-G-AA-CTA-C
gi|22                         :             TTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------CAA-T-A---------TCG-TT-G--A-CTA-C
gi|23                         :             aTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------GAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|24                         :             TTTTTTTG---C--AC-AAC-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G--A-CTA-CT
gi|25                         :             TTATTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GT-G-C-A--T------TAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C
gi|26                         :             TTTTTTT-------AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-
gi|27                         :                    G---C--AC-ACG-A-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------GCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCAT
gi|28                         :                     ---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C-T-TTCATA
gi|29                         :              TTTTTTG---C--A--ACG-T-GCCT--A-T--GC-G-C-A--T------AA--T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|3                          :                    G---C--AC-ACGGTAGC-TCAG-T--GA-G-CCA--T------AAA-T-AGA-------TCG-TT-G-AA-CTA-CTTATTCATA
gi|30                         :               TTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-A-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTgcgcggaa
gi|31                         :               TTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------ATA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C
gi|4                          :                    G---C--ACCACG-C-GC-T--A-T--GC-A-C-A--TTACACGAAA-T-A---------TCG-TT-T-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|5                          :              ttggTTG---C--AC-ACA-TTGC-TT-A-TT-GC-G-C-A--T------AAA-T-----------TCG-TT-G-AA-T---CTT-TTCATAgcgcg
gi|6                          :           gggTTTTTTG---C--A--AT--T-GC-T--A-T--GC-G-C-AT-T------AAA-T-A---------TCT-TT-GAAA-CTA-CTT-TTAATAacgcggga
gi|7                          :                 TTTGGGAC--AC-CCG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTC-CTT-TTTATAgcgcg
gi|8                          :                    G---C--AC-ACGAG-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------GCGTTT-G-AA-CTA-C-T-TTCATAgcg
gi|9                          :            agTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-T-A--T------AAA-T-AGTGATAAAGTCG-TT-GAAA-CTA-Cgcgcgg





Alignments
lowQualScore                  :                     333 11  1   2 2  1 33 1 33  1 1 1 44 333333   1 1 888888888   1  1 2  1   1   2      
lowQualScore                  :                     ... ..  .   . .  . .. . ..  . . . .. ......   . . .........   .  . .  .   .   .      
lowQualScore                  :                     777 88  3   6 6  3 11 3 11  3 3 3 44 777777   3 3 777777777   3  3 6  3   3   4      
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Reference ( family-315 )      : NNNNNNNGGGGGTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|1                          :        GGGGGTTTATTGG---CCAGC-ACG-T-GC-T--AAT--GC-G-C-G--T------AAACT-AAG-------TTG-TT-G-AA-CTACCTT-TTCAT
gi|10                         :                    G---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TTG-TT-G-AA-CTA-C-T-TTCATAgcgcagg
gi|11                         :                  tttgggg--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-AC-T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AACCTA-CTT-TCCTTAg
gi|12                         :             gccaTTTG---C--AC-A-G-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-TAA---------TCG-TT-G-AA--TA-CTT-TTCAgcg
gi|13                         :                   ta---C--AC-ACG-C--C-T--A-T---C-G-C-A--T------GAA-T-A---------CCA-TTTG-AA-TTA-CTT-TTCAaag
gi|14                         :                   TG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATAaagcgcggg
gi|15                         :            aTTTTTTTGA--C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-ATTT------AAA-T-A---------TCA--T-G-AA-CTA-Cgc
gi|16                         :           ttTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-TTTGC-G-C-A--T------CAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|17                         :             TTTGTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-A-C-A--T------AAA-C-A---------TCG-TT-G-AA-CTG-CTT-
gi|18                         :              TTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--T-A--GC-GCC-A--T------AAG-C-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|19                         :             TTTTTTTG---C--AC-ATG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------ATA-A-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|2                          :        GGGGGTTTTTATG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|20                         :       ggttcttTTTTTTG---C--AC-ATG-T-GC-T--A-T--GCAG-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|21                         :             TTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-A-A--T------AAA-T-A---------TGG-TT-G-AA-CTA-C
gi|22                         :             TTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------CAA-T-A---------TCG-TT-G--A-CTA-C
gi|23                         :             aTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------GAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|24                         :             TTTTTTTG---C--AC-AAC-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G--A-CTA-CT
gi|25                         :             TTATTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GT-G-C-A--T------TAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C
gi|26                         :             TTTTTTT-------AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-
gi|27                         :                    G---C--AC-ACG-A-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------GCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCAT
gi|28                         :                     ---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C-T-TTCATA
gi|29                         :              TTTTTTG---C--A--ACG-T-GCCT--A-T--GC-G-C-A--T------AA--T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|3                          :                    G---C--AC-ACGGTAGC-TCAG-T--GA-G-CCA--T------AAA-T-AGA-------TCG-TT-G-AA-CTA-CTTATTCATA
gi|30                         :               TTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-A-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTgcgcggaa
gi|31                         :               TTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------ATA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C
gi|4                          :                    G---C--ACCACG-C-GC-T--A-T--GC-A-C-A--TTACACGAAA-T-A---------TCG-TT-T-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|5                          :              ttggTTG---C--AC-ACA-TTGC-TT-A-TT-GC-G-C-A--T------AAA-T-----------TCG-TT-G-AA-T---CTT-TTCATAgcgcg
gi|6                          :           gggTTTTTTG---C--A--AT--T-GC-T--A-T--GC-G-C-AT-T------AAA-T-A---------TCT-TT-GAAA-CTA-CTT-TTAATAacgcggga
gi|7                          :                 TTTGGGAC--AC-CCG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTC-CTT-TTTATAgcgcg
gi|8                          :                    G---C--AC-ACGAG-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------GCGTTT-G-AA-CTA-C-T-TTCATAgcg
gi|9                          :            agTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-T-A--T------AAA-T-AGTGATAAAGTCG-TT-GAAA-CTA-Cgcgcgg


blockSeqs                     :                     GGA .   C   G A  C CA . TT  A C C TT TACACG   . A GTGATAAAG   T  T A  C   .   A
blockSeqs                     :                     A   .   .   A T  . T  . T   . . . C  .        . . GA          .  . A  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . T  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .   .
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                     .   .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    
blockSeqs                     :                         .   .   . .  . .  . .   . . . .  .        . . .           .  . .  .   .    


blockSeqCons                  :                         **                                            *********
originalCons                  : NNNNNNNGGGGGTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
finalCons                     : NNNNNNNGGGGGTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA





Alignments
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lowQualScore                  :                     ... ..  .   . .  . .. . ..  . . . .. ......   . . .........   .  . .  .   .   .      
lowQualScore                  :                     777 88  3   6 6  3 11 3 11  3 3 3 44 777777   3 3 777777777   3  3 6  3   3   4      
consensus                     : NNNNNNNGGGGGTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
Reference ( family-315 )      : NNNNNNNGGGGGTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|1                          :        GGGGGTTTATTGG---CCAGC-ACG-T-GC-T--AAT--GC-G-C-G--T------AAACT-AAG-------TTG-TT-G-AA-CTACCTT-TTCAT
gi|10                         :                    G---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TTG-TT-G-AA-CTA-C-T-TTCATAgcgcagg
gi|11                         :                  tttgggg--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-AC-T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AACCTA-CTT-TCCTTAg
gi|12                         :             gccaTTTG---C--AC-A-G-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-TAA---------TCG-TT-G-AA--TA-CTT-TTCAgcg
gi|13                         :                   ta---C--AC-ACG-C--C-T--A-T---C-G-C-A--T------GAA-T-A---------CCA-TTTG-AA-TTA-CTT-TTCAaag
gi|14                         :                   TG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATAaagcgcggg
gi|15                         :            aTTTTTTTGA--C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-ATTT------AAA-T-A---------TCA--T-G-AA-CTA-Cgc
gi|16                         :           ttTTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-TTTGC-G-C-A--T------CAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|17                         :             TTTGTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-A-C-A--T------AAA-C-A---------TCG-TT-G-AA-CTG-CTT-
gi|18                         :              TTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--T-A--GC-GCC-A--T------AAG-C-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|19                         :             TTTTTTTG---C--AC-ATG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------ATA-A-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|2                          :        GGGGGTTTTTATG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|20                         :       ggttcttTTTTTTG---C--AC-ATG-T-GC-T--A-T--GCAG-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|21                         :             TTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-A-A--T------AAA-T-A---------TGG-TT-G-AA-CTA-C
gi|22                         :             TTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------CAA-T-A---------TCG-TT-G--A-CTA-C
gi|23                         :             aTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------GAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|24                         :             TTTTTTTG---C--AC-AAC-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G--A-CTA-CT
gi|25                         :             TTATTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GT-G-C-A--T------TAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C
gi|26                         :             TTTTTTT-------AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTT-
gi|27                         :                    G---C--AC-ACG-A-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------GCG-TT-G-AA-CTA-CTT-TTCAT
gi|28                         :                     ---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C-T-TTCATA
gi|29                         :              TTTTTTG---C--A--ACG-T-GCCT--A-T--GC-G-C-A--T------AA--T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CT
gi|3                          :                    G---C--AC-ACGGTAGC-TCAG-T--GA-G-CCA--T------AAA-T-AGA-------TCG-TT-G-AA-CTA-CTTATTCATA
gi|30                         :               TTTTTG---C--AC-ACG-T-GT-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-A-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-CTgcgcggaa
gi|31                         :               TTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------ATA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTA-C
gi|4                          :                    G---C--ACCACG-C-GC-T--A-T--GC-A-C-A--TTACACGAAA-T-A---------TCG-TT-T-AA-CTA-CTT-TTCATA
gi|5                          :              ttggTTG---C--AC-ACA-TTGC-TT-A-TT-GC-G-C-A--T------AAA-T-----------TCG-TT-G-AA-T---CTT-TTCATAgcgcg
gi|6                          :           gggTTTTTTG---C--A--AT--T-GC-T--A-T--GC-G-C-AT-T------AAA-T-A---------TCT-TT-GAAA-CTA-CTT-TTAATAacgcggga
gi|7                          :                 TTTGGGAC--AC-CCG-T-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------TCG-TT-G-AA-CTC-CTT-TTTATAgcgcg
gi|8                          :                    G---C--AC-ACGAG-GC-T--A-T--GC-G-C-A--T------AAA-T-A---------GCGTTT-G-AA-CTA-C-T-TTCATAgcg
gi|9                          :            agTTTTTTG---C--AC-ACG-T-GC-T--A-T--GC-G-T-A--T------AAA-T-AGTGATAAAGTCG-TT-GAAA-CTA-Cgcgcgg