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gi|28 : TTTAT--G-A-A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTAt
gi|29 : cTTTAT--G-G-A--A--A-CC-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---C-A--------C-A-------ATT-T---T-----AG--AA-AA--C--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|3 : cTAT--G-A-A--G--A-CG-TCACTG--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTTAA---CC-G-CA------A---T-AC-------C-A-------TTT-T---T-----TGTAAA-AA--T--T----G-AT-TTTTCTTA
gi|30 : cgTTTAT--T-G-A--A--A-AA-T----T--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTt
gi|31 : tcTTTAT--T-G-A--A--A-AA-T----T--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTT
gi|32 : tcTTTAT--T-G-A--A--A--A-T----G--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTT
gi|33 : ctcTTTAT--T-G-A--A--A--A-T----G--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTT
gi|34 : ctcTTTAT--T-G-A--A--A--A-T----G--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTT
gi|35 : ctcTTTAT--G-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--C--A-A-A
gi|36 : cTAT--G-G-A--A--A-CG-G----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--T-G-GT-TTTTCTTaatcttctc
gi|37 : ttgTTTCT--G-A-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------T-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|38 : TTTAT--A-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-T-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCT
gi|39 : cTGT--G-G-A--A--A-TG-T----G--AA-ATG-----A-A-G-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------T-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--T-T-AT-TTTTCTTAg
gi|4 : tgTTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATA-----G-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---C-A--------C-GTTTTTTTTTT-T---T-----AG--AA-AA--C--T--T-G-AT-TTTTCTTA
gi|40 : cTTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-AT------A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---T-A--------CGA-------GTT-T---T-----AG--CA-AG--T--T--T-G-AT-TTTTCTT
gi|41 : cTTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-CTA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CT-A-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T---------AA-AA--C--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|42 : cTTAT--G-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CA-G-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AA--TA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTAt
gi|43 : TTTAT--G-G-A--A--A-TG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A--------TT-T---T-----AG--AA-AT--C--T--A-G-AT-TTTTATTt
gi|44 : tcTTTAT--GAG-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A--------T-AA--T--C-TTT-A----C-A-C-------A---T-A--------C-A-------GTT-T---T-----AG--AATAA--T--T--T-G-AT-TTTTCT
gi|45 : gTTTAT--G-G-A--A--A-CA-A----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-T-C-------G---T-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTga
gi|46 : cTTAT--T-G-A--A--A-TA-T----G--GA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CG-T-C-------A---C-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-T-AT-TTTTCTTA
gi|47 : T--G-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----G--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-T-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AC-TA--T--T--C-G-AT-TTTTCTTA
gi|48 : acTTTAT--G-G-A--A-----G-T----------ATG-----A-T-A-----T--C-AA--C--CATTT-A---TC-A-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AG-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTAt
gi|49 : tcTTTAT--G-A-A--A--A-TA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-G---CC-G-C-------A---T-A--------T-T-------TTT-T---T-----CA--AG-AA--------A-G-AT-TTTTt
gi|5 : cTTTAT--A-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-ACAC--T--T-AA--T--CACTTGG---CC-G-C-------A---G-A--------T-A-------TTA-TAA-A-----AA--AA-AA--A--T--A-G-AT-TTCTCTTAgta
gi|50 : cTTTAC--G---A--A--A-TGAT----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--AATTT-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A--------TT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--C-G-AT-TTTCCt
gi|51 : g----G--AA-ATA-----T-A-A-----T--TTAA--T--CATTT-----CC---C-------A---C-A--------G-G-------TAT-T---T-----AA--AA-AAATT--C--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|52 : tttatttaaTTTAT--G-A-A--A--A-TA-T----G--GA-ATA-----G-G-A-----T--T-AG--T--CATTT-A---T----C-------A---C-A--------C-A-------GGT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTCTCT
gi|53 : TTAAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG------------------------T--CATTT-A---CC-A-C-------A---T-A--------C-A-------GTT-T---C-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|54 : c-G-A--A--A-CA-T----A--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-CA--T--CATTT-A---CC-G-T-------A---C-A--------C-A-------TTT-G---T-----AG--AA-TA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|55 : -G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-------T--T-AA--A--CAT---A---CC-GGC-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T-------G-AT-TTTTCCT
gi|56 : agt-CA-T----G--AA-ATA-----A-G-A-----A--T-AC--T--TATTA-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--AA-AA--G--T--A-T-AC-CTTTCTTAt
gi|57 : -CA-T----G--AA-ATA-----A-G-A-----A--T-AC--T--TATTA-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--AA-AA--G--T--A-T-AC-CTTTCTTAt
gi|58 : G-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AG--T--CATTT-A---CC-C-C-------C---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--G--A-C-AT-TTTTCTTAt
gi|59 : TTTAT--G-G-A--A--A-AG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CT-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---A-----AG--AA-AA--T--T--t
gi|6 : ttTTTAT--G-A-A--A--A-TA-T----T--AT-AAA-----A-A-A-----G--T-AA--T--CATTT-AGTACA-G-C-------A---C-A--------A-A-------TTC-T---T-----AG--AA-AA--C--T--C-T-AT-TTTTCTTA
gi|60 : tc-ATG-----A-A-AA----T--T-AA--T--CATTT-A---CCAG-C-------A---T-A--------CAA-------TTT-T---T-----GG--AA-AGATT--T--T-G-AT-TTTTCTt
gi|61 : TG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------T-A-------TGT-T---T-----AG--AA-AA--T--TAGA-G-AT-TTTTCTTAg
gi|62 : TTTAT--A-A-A--A--A-AG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CCTTT-A---CT-G-C-------A---G-A--------T-A-------TTT-t
gi|63 : cTG-----G-A-G-----T--T-AA--T--CATCT-A---CC-G-C-------A---C-A--------T-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AG--T--T--T-G-AT-TTT
gi|64 : --T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AAT-T--T--T-G-AC-TTTTCa
gi|7 : TAT--G-GGA--A--A-TG-T----G--AA-ATG-----A-A-A----------AA--TAAAATTT-A---CC-A-C-------A---T-A--------C-AT------TTT-T---T-----AG--AA-AAATT--T--T-G-AT-TTTTCTTA
gi|8 : tttgTTTATTGG-A-A--A--A-CG-T----G--AA-GTG-----A-A-AC----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTTAT---T-----AGA-AA-AA--T--T--T-G-ATATTTTCTTA
gi|9 : TTTATTGG-A-A--A--A-CG-T----G--AA-GTG-----A-A-AC----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTTAT---T-----AGA-AA-AA--T--T--T-G-ATATTTTCTTA
Alignments
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lowQualScore : .. . . .. .. .. . .... .. . ..... . . ..... .. . .. .. . ... . . ....... ..... ........ . ....... . ... ..... .. . .. .. .... . .
lowQualScore : 11 7 7 00 00 11 4 1111 99 7 66666 6 6 66666 99 3 99 99 2 111 6 6 7777777 55555 99999999 2 3333333 2 000 55555 11 3 99 55 8888 6 3
consensus : TTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
Reference ( family-307 ) : TTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|1 : TTTAT--G-A-AGCA--A-TG-T----T--GA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---G-----AG--AA-AA--TC-T--A-G-AT-TTT
gi|10 : ctcTTTAT--G-G-A--A--A-TA-T----A--AA-AAA-----A-A-A-----AAAT-AA--T--CATTT-A---CG-G-C-------A---A-A--------C-A-------CTT-T---T-----AG--AA-CA--T--T--A-T-AT-TTTTCCTAatttttttta
gi|11 : tcTTTAT--T-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-CATATGTTA---T-A--------T-A-------TTT-T---TTG---AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTt
gi|12 : tcTTTAT--A-A-A--A--AATA-T----G--AA-ACT-----A-A-A-----T--C-AA--T--CATTT-A---CT-A-A-------A---G-A--------T-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--G--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|13 : ttTAT--G-G-A--A--A-CA-T----GATAA-AT--------A-A-----T--T-AA--T--CGTTT-A---CC-A-G-------A---A-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--GA-AA--TTAT--A-G-AT-TTTTTTTAtt
gi|14 : tctg-G-A--A--A-CG-T----G--AACATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---A-ATCTATTATT-A-------TTA-T---T-----AG--AACAA--T--T--A-G--T-TTTTCTT
gi|15 : TTTTT--A-G-A--ACAA-TA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--G-AA--T--AATTT-G---TC-G-T-------A---C-A--------A-A-------TTT-T---A-----AG--AA-AA--T--T--T-A-AT-TTTTCTTAta
gi|16 : TAT--C-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-T-------A---CAA--------C-A-------ATT-TAAAA-----AA--AA-AA--T--T--A-G-AA-TTTTCTtt
gi|17 : TTTAT--G---A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-GA--T--CATTT-A---CC-A-C-------ATGTC-A--------C-A-------TTC-T---T-----AG--AA-AA--T--T--T-G-AT-TTTTCTgtat
gi|18 : tcTTTAT--G-G-A--A--A-TA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A----------A-------TTT-T---TTTTTCAG--AA-AG--T--T--A-G-AT-TTTTa
gi|19 : tcTAT--G-G-A--A--AATG-TC---G--AA-ATG-----A-A-A-----T-----A--T--AATTT-A---CC-A-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--T-G-AG-TTTTCTTg
gi|2 : tctttgTTTAT--G-G-A--A--A-AG-T----G--AA-ATA-----A-A-ACAATTT--T-AAAAT--CGTTT-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|20 : tgTAT--G-G-A--A--ACCGTT----G--GA-CTG-------A-A-----T--T-AA--T--CA-TT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-AT------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--ATG-A--TTTTCTTAt
gi|21 : ttgTTTAT--T-G-A--A--A-AA-T----T--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AAT-T--T--A-G-A--TTTTCTTt
gi|22 : tctcTTTAT--G-G-A--A--A-TA-T----G--AG-A-A-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTC-A---CC-A-C-------A---C-A--------A-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--G-T-GT-TTTTCTTA
gi|23 : tcTTAAC--G-G-A--A--A-CA-T----G--GA-ATA-----A-A-A-----T--TTAA--C--CATTT-A---CC-G-C-------C---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AG-AA--T--T--A-A-AT-TTTTCTTAt
gi|24 : TTTAT--A-A-A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----G--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----CG--AA-AA--T--T--T-T-AT-ATTTCTTAt
gi|25 : tcTTTAA--G-A-A--A--G-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-GA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---A-A--------C-A-------TTT-T---T-----AT--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTGCCTTA
gi|26 : tcTAT--G-G-A--A--G-TG-T----G--AA--TG-----A-ACA-----T--T-AA--T--AATTT-A---TC-A-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG---A-AA--T--T--T-G-AT-TTT
gi|27 : ttctttg-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATACACGTATA-A-----T--T-AA--T--CATTA-A---CC-G-T-------A---C-A--------T-A-------TTG-T---T-----AG--TA-AA--T--T--A-GAAT-TTTTTTTActa
gi|28 : TTTAT--G-A-A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTAt
gi|29 : cTTTAT--G-G-A--A--A-CC-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---C-A--------C-A-------ATT-T---T-----AG--AA-AA--C--T--A-G-AT-TTTTCTTA
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gi|30 : cgTTTAT--T-G-A--A--A-AA-T----T--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTt
gi|31 : tcTTTAT--T-G-A--A--A-AA-T----T--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTT
gi|32 : tcTTTAT--T-G-A--A--A--A-T----G--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTT
gi|33 : ctcTTTAT--T-G-A--A--A--A-T----G--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTT
gi|34 : ctcTTTAT--T-G-A--A--A--A-T----G--TA-ATG-----C-A-A-----G--T-AA--T--CATAT-A---CC-G-C-------A---A-A--------C-A-------TCT-T---T-----GG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTT
gi|35 : ctcTTTAT--G-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--C--A-A-A
gi|36 : cTAT--G-G-A--A--A-CG-G----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--T-G-GT-TTTTCTTaatcttctc
gi|37 : ttgTTTCT--G-A-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------T-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|38 : TTTAT--A-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-T-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCT
gi|39 : cTGT--G-G-A--A--A-TG-T----G--AA-ATG-----A-A-G-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------T-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--T-T-AT-TTTTCTTAg
gi|4 : tgTTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATA-----G-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---C-A--------C-GTTTTTTTTTT-T---T-----AG--AA-AA--C--T--T-G-AT-TTTTCTTA
gi|40 : cTTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-AT------A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-A-C-------A---T-A--------CGA-------GTT-T---T-----AG--CA-AG--T--T--T-G-AT-TTTTCTT
gi|41 : cTTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-CTA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CT-A-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T---------AA-AA--C--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|42 : cTTAT--G-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CA-G-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AA--TA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTAt
gi|43 : TTTAT--G-G-A--A--A-TG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A--------TT-T---T-----AG--AA-AT--C--T--A-G-AT-TTTTATTt
gi|44 : tcTTTAT--GAG-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A--------T-AA--T--C-TTT-A----C-A-C-------A---T-A--------C-A-------GTT-T---T-----AG--AATAA--T--T--T-G-AT-TTTTCT
gi|45 : gTTTAT--G-G-A--A--A-CA-A----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-T-C-------G---T-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTga
gi|46 : cTTAT--T-G-A--A--A-TA-T----G--GA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CG-T-C-------A---C-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-T-AT-TTTTCTTA
gi|47 : T--G-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----G--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-T-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AC-TA--T--T--C-G-AT-TTTTCTTA
gi|48 : acTTTAT--G-G-A--A-----G-T----------ATG-----A-T-A-----T--C-AA--C--CATTT-A---TC-A-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AG-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTAt
gi|49 : tcTTTAT--G-A-A--A--A-TA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-G---CC-G-C-------A---T-A--------T-T-------TTT-T---T-----CA--AG-AA--------A-G-AT-TTTTt
gi|5 : cTTTAT--A-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-ACAC--T--T-AA--T--CACTTGG---CC-G-C-------A---G-A--------T-A-------TTA-TAA-A-----AA--AA-AA--A--T--A-G-AT-TTCTCTTAgta
gi|50 : cTTTAC--G---A--A--A-TGAT----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AA--T--AATTT-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A--------TT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--C-G-AT-TTTCCt
gi|51 : g----G--AA-ATA-----T-A-A-----T--TTAA--T--CATTT-----CC---C-------A---C-A--------G-G-------TAT-T---T-----AA--AA-AAATT--C--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|52 : tttatttaaTTTAT--G-A-A--A--A-TA-T----G--GA-ATA-----G-G-A-----T--T-AG--T--CATTT-A---T----C-------A---C-A--------C-A-------GGT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTCTCT
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gi|54 : c-G-A--A--A-CA-T----A--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-CA--T--CATTT-A---CC-G-T-------A---C-A--------C-A-------TTT-G---T-----AG--AA-TA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
gi|55 : -G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-------T--T-AA--A--CAT---A---CC-GGC-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T-------G-AT-TTTTCCT
gi|56 : agt-CA-T----G--AA-ATA-----A-G-A-----A--T-AC--T--TATTA-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--AA-AA--G--T--A-T-AC-CTTTCTTAt
gi|57 : -CA-T----G--AA-ATA-----A-G-A-----A--T-AC--T--TATTA-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TAT-T---T-----AG--AA-AA--G--T--A-T-AC-CTTTCTTAt
gi|58 : G-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----T--T-AG--T--CATTT-A---CC-C-C-------C---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--G--A-C-AT-TTTTCTTAt
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gi|63 : cTG-----G-A-G-----T--T-AA--T--CATCT-A---CC-G-C-------A---C-A--------T-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AG--T--T--T-G-AT-TTT
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gi|8 : tttgTTTATTGG-A-A--A--A-CG-T----G--AA-GTG-----A-A-AC----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---T-A--------C-A-------TTTAT---T-----AGA-AA-AA--T--T--T-G-ATATTTTCTTA
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Reference ( family-307 ) : TTTAT--G-G-A--A--A-CG-T----G--AA-ATG-----A-A-A-----T--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-C-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AA-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTA
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gi|47 : T--G-G-A--A--A-CA-T----G--AA-ATA-----A-A-A-----G--T-AA--T--CATTT-A---CC-G-T-------A---C-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AC-TA--T--T--C-G-AT-TTTTCTTA
gi|48 : acTTTAT--G-G-A--A-----G-T----------ATG-----A-T-A-----T--C-AA--C--CATTT-A---TC-A-C-------A---T-A--------C-A-------TTT-T---T-----AG--AG-AA--T--T--A-G-AT-TTTTCTTAt
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