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Reference ( gi|2 ) : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAGATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGA-----AGAATGTGATGCTCTAGGCAA-T-TA--ATAT--TCTATAACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTTGTTTGACGCTGAAAATTTGTTTTTGTCGTACG-AGT-CGGT--AGTGAATTTT--TAT--CCAATGTAGTT--GAACTT---TTGA-AC----AAAAAC-ACAGTCTCAATCT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCGTCATTTGCTATCAATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTTC-TAGA-----ATATTCGATACAAATAAAGTG-AT-TGTGGCAGCG-GATCGCCC----GTTTGCTT-----C-----AGGGGATTTTGGGTT--GT-GCAGTA-GATCG-A--CT---GAAGTAAAACAATGAGA-----TC--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-TG----A-ATAAACCGTAA-TTTTCACAGTA---TTTGGAAA-TTGT-ATT-TG-TTGTA----CG---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCA--TTGT-AG-GATCGAGAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAAT-TTTTTATAATCAAGT-TAT--TTTG---ATATT--TAA-C-TTCATCTTTTAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAATGATCAATCTATT-AGT-CGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AA-TGATAAA-AT-AGT-ACA--------TGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CAT--GTAT---ATGCC-CTG--AT--G-A--AC-CA-T-----GGTATG-TAAC-A-A-------C--G-----G--ACGG-TATG------------T-A---A--CA---A---------T-----TT-----GT------T-AC-AA---AC----C---G-T-A--C----CA--C--G-A-AT-GG-TG--AC--G-TTA-----TGTA--A--A---AAAC-A--A-TT--T-----TCT--TTGT-T-A-C----A--TAGC--G-T-CG-C--C---AT--T-CA------A---G----CTA-CGC-T---T---TGT-G------ACAA--------ATCGT-T-AC-A-AC-C-G-TGC--GGG-A----C---AAC-TT--------TTTTAAG--TA--TTT-----G---GGGG-GGG-GGGA------TAA--TT-A---T-TT--T---AGATTCCT-TT------T---CAT--GT--GTGTA-AGTGAGT--GTA--TA---CC-GGTAT-GCG---TGTGATTTT-CAA-GTTTGGATACT-TTCA--TGA---TTTTTC-CC-TAGAAACAAAGATAA--GC-A----TAAGAC-AAA-TAT---------TGAAA--A-C-A-TACACC-------TATAAACTCACTAAACAAACACA-ATTAT---TGAAAAG----CAT--AATACA---AT-AACAATGTATT--TTA-AAC--AC------TCCCCCCCCCCCCCCGAA---A--TA-AATTACT-C-AAA--A-GGTAGAGTCCCCG-C-A-CA-GTATGTAA-CAA--------T-T----TG-T-TA------C-AT-ACC--G--T-T-G--C-C--ATC---T-G---CA-----G-C-ACGG-T----TG-----T---GC----AAC------A----A--------T---TT-----------G-T-T-ACA-AA--------GC---G-TAG---C---T--C---AGATG-G-C-GA-C--G-C----T-A---------TGT-AACAAAAGAAAT-TGG---T--GT-T---A---ACA---TAA--C--GT-C-GCC-AT-T--CG--TG-G-T-A-CG-GTTT-GT-A-A----CAA----A-----T--TG--T---T-A-------C--A------------T-----------GTTACATACC-----G-T-G-GT--CCATCA
gi|3 : CCCCTA-TTTCAGATG-CG-TCGTGGG-TAAGTTGA-CCTGTGCAA--T---AAAC-GGGCTTCAAATT-GAAGAAA-AGA-----AGAATGTGAT-CTCTAG--AATT-TA--ATACTATCTTCAACTTCATGGTAAGC-ATT------CA--CTGAT-G--CTTGATTG-CGCTGGAAA---GTTTTTGCTG-ACGAAATACAGT--AGTGAATTAT--TA---CCAA-GCAGTT----AC-T---TTGA-AC----TAAAA--GCAG-CTCAAATC-T--AGTT-CTAT-T----AA-A--AT--GCAACTAAAA-GTATTCTAA-CA------CGCAGGTTGCTATCAGAGTCT---AAAGT-G--ATACTACAGCATCGCT--A--GTTTC-TAGA-----AAAT--GATACAAATAAA-TGAAT-TGTTGCATCG-GAGCGCCC----G-ATGCCA-----C--------GGATTTTGGGTTTGAT-GCAGTA-GATCGAA--CT---GAAGTAAAACGATGATA------CAACT-A---TTTTGA-TG-GATA-TA-GG-AATTG----G-ATAAA-CG-AA---TTCACA-TA---ATTGG-AA-TTGTAATT-TGTTTGTA----CGTTAAA-TA-ATAGTTAAGA-TTCTTATGTCGT-AG-GAT-GATAAATCG-GATA-TG--GA--TTTTT--GGAAATGCGCAT----TGATTATCAGTAATGTTTCTATAATGAAATATACTGTTTG---ATA-T--TAA-T-CTCATCTTTTAAAA
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gi|19 : tcgattcatacgagccaaatgctttgcaacagttgtgcaagcaaatacgcagggatgacatcgttgcagtagaCCCCAAGATACAGTCG-CG-ATGGGAC-TGAGTTGACTC-GTGCAAACTTATAAATTATACCTTAAAATAGAA-AAACATA-----AAAATGTGATGCTCTGGGCAATT-TA--ATAcgtttaactatgatatataatacataacaaatggaacaatgttatgccttgttcagcggtcacgttgccttctcctattataagctatcgtgaatctggagtagatcgagataatcataagccgttataacgcaattaatctatttagttcgaagactcaagcaatctagcatattatgacatagacgtatggcccaaaggataaatatagtacaaatcgtaatgtttcccaaaagatcataagaacatacatgttatattccgatgcatattcggttgaccacaaaagagacggtatgtacaattgttacaaaaacgtcacgatctagctatgtacaagttttttttattaatagcgtcgccttcaagctcgctttggcatcgtgtacaatgtgtggaccttttaaataattagaggaggggagggagtggttcttgtatttatatgtgagtagtgagtgtaatctccggtatgtgacctgtttttctcaaatttggatctattcatgaattcttttcaccgtagagatagatagtcgcaacaatagtacacactattgaaaacagacgatataaatcataaaaccaaagtaatgaaagtacccatatacatttatgattgttagaaacgcgccccccccgaaaattaattctgcaaaaggtgagtgctcgcacagttggtataaattgatacggtttactaatcttgcagatggtgtgcgcaacatttgtttacagatcgtagattcgagaaatggggatgcctatgtacatgagagagtgtttgtaaataggtcgatgatataaggttagaatgtgcgctatgtaagttcgttagttatagagtggat
gi|16 : ttttcacatcgacacccccttgtagacctccatcG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACC-TGTGCGAATT---GAATTGGGCCTTAAGTC-GAA-AAA-AAAAAATTAGAATGTGATGCTCTCGGCAA-TCTA--ATAT--GCTATTATTTCATCGTGAGCAATTGCAATACACTCTAACGG--CTCATTTGAAGCT
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gi|6 : --CCAATGCAGTT--GAACTT---TTGA-AC----AAAAAC-ACAGTCTCAATCT-T--A--TTCTATGT----AA-AAATT--GCAAATAAAATGTATTT--AACA-----CCGCCATTTGCTATTCATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGCCGCTTTATTTTTTCCTAGA-----AT--TTGATACAAATAAAGTG-AT-TGTG-CAGCG-GATCGCCC----GTTTGCT------C-----AGGGGATTTTGGGTT--GT-GCAGTAAGATCG-A--CT---GAAGTAAAACGATGAGA------C--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AAATG----A-ATAAACCATAAATTTCCACAGTA---TTTGGAAAATTGT--TT-TG-TTGTAA---CG---AAATATATCGTTAAAATTTCTCA--TTGTTAG-GATCGAGAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTTTTA--AATGCGCAT----T--TTATCAATAAT-TTTTCATGATCAAGT-TAT--TTTG---ATATT--TAA-CTTTCATCTTTTAAAAACGTTAACACTATATTATAATTAATAACTACACAATGTGACATCACTTCATGTGCCTGTTTCCAGCGGTCACGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAATAATCAA-CTATT-AGT-CGATCAGACTCACCGTGAT------TACAATGAAAATA-ACTACATGTATTATAGTT--AA-TGATAAA-ATAAGTAACA--------TGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---
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gi|22 : tataccagtatgcttgtgattttcaagtacatgtaattccacaatcaatatttgtgttattcttgctttatttcatgatggcatataaaacaaaataattttttaattcatgaatgcgtcgggcaatacttgaatttaaaagatagataatattcaaaggattttcccctaaataagatacgaataagacaaatattgaaaaccatacacctataaactcactaacaaacacaattattgaaaggcatctacaatatttaaacacccccccccccccccaatactaaaaggtgcagtcccgcacggtatgcaacaatttgttacataccgttgccatctcag-ACGG-T-----G-----T---GT----AAC------A----A--------T---TT-----------G-T-A-ACA-AA---------T---G-TAC---C---A--C---GAATG-G-C-GA-C--G-C----T-A---------TGT-AACAACA---AT-TTTCTTT--GT-T---A----CA---TAT--C--GT-C-GCC-AT-T--TG--AG-C-T-A-CG-CTTT-GT-A-A----CAA----A-----T------------------------------------T-----------GTTACATACC-----G-T-G-ctcgttgttacatccgtgtagtggtccatcactgctccagcatg
gi|15 : -ACGG-TA---TG-----T---G------AC------A----A--------T---TT-----------G-T-T-ACA-AA--------CC---G-TGG---C---A--C---GAATG-G-C-GA-C--G-T----T-A---------TGT-A
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gi|17 : taaaaaatacatgaatattcagaggaacctcaaagataactgcagtcaaccaaaagtgttgaaagagaaatgcggatagaatccggtttgcagtaaccccctatttcagatgcgtcgtgggtaagttgacctgtgcaataaacgggcttcaaattgaagaaaagaagaatgtgatctctagaatttaatactatcttcaacttcatggtaagcattcactgatgcttgattgcgctggaaagtttttgctgacgaaatacagtagtgaattattaccaagcagttactttgaactaaaagcagctcaaatctagttctattaaaatgcaactaaaagtattctaacacgcaggttgctatcagagtctaaagtgatactacagcatcgctagtttctagaaaatgatacaaataaatgaattgttgcatcggagcgcccgatgccacggattttgggtttgatgcagtagatcgaactgaagtaaaacgatgatacaactattttgatggatataggaattggataaacgaattcacataattggaattgtaatttgtttgtacgttaaataatagttaagattcttatgtcgtaggatgataaatcggatatggatttttggaaatgcgcattgattatcagtaatgtttctataatgaaatatactgtttgatattaatctcatcttttaaaaaacttaatcactatagaattagtaaacacatgataataatattcatgtgcgttccagcggtcaacgtctgctcgagccgtgagtgcgggaagttcatgagttcgaaccccttgctcgaacggccacaataatcaattattatgattcaaccacgaattaatgaaataaatatatagttaaatgataaaaagaagtgtttccaaaagatcataatgaacatacagtatgagctgatggactaaggtagaacacgagaac----TA-----T---GT----AAC------A----A--------C---TT-----------G-T-TTACA-AA--------CT---G-TAGGCAC---G--C---A-ATG-G-CGGA-C--A-C----TAA---------TGT-AACCAACCAATT-T-----T--CT-T------------------T--GT-TGGCC-A--T--CA--AG-C-T-A-TG-CTTT-GT-A-A----CAA----A-----T------------------------------------T-----------ATTACATACC-----G-T-G-ttctttatagcataggtgccatatcagctgcgcatttggacataccgtacactcagtgcgggcacctttcaatattagggggtgggtgggtgttttagattcctgttttattggaagtgaggtatcccggtatgctggatttcataggattgatatttcatgatttcacccatagaaaaaaggacgcaataagacaaaatatgaagcaggacaccgtataatccactacaacacatgtaggtgaaaagcatatataatatttcacccccccccgaaaagtaatttactcaaaaaggtaagtcgcgaccagtattaacagttacatgacgtttccaatcagcagca
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Reference ( family-3068 ) : CCCCTAGTTTCAGTCG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGA-----AGAATGTGATGCTCTAGGCAATT-TAATATT--CTA-CA-CTTCATGGTGAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTCGTTTGACGCTGGAA----GTT--TTTGTCGTACGAG---T-GGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTT--GAACTT---TTGA-ACTG---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCGCNATTCGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTTC-TAGA-----ANGTTTGATACGAATAAAGTG-A-T-TGTGGCATCG-GANCGCCC----GTNTGCTN-----C-----AGAGGATTTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCGA--CT---GAAGTAAAACGATGAGA-----TC--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-TG----A-ATAAACCGTAA-TTTCNACAGTA---TTTGGAAA-TTGT-ATT-TG-TTGTAGC---G---AA-TATAT-GTTAAAATTTCTCA--TCGT-AG-GAT-GATAAATCGTGTTATT--GGATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATGATGAAGT-TAC--TTTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATATTATAATTAATA-ACTACACAATG-TGACATCACTTCATGTGCCTGTTTCCAGCGGTC-ACGT-------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAATAATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AATGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCN-CTGATGG-ACC-A----C-----GGTAT-GTAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGT-AG-CA-CG-AA-TGGCG-AC-GCT-----A-TGTAAAAAAC-AA-TTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGNGCTACG-GTTTGT-AACAAATTGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTGAGTATTT---GGGGGGGGGGGA-T-AANTATTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTTAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATAA-GATA--NG----AATAA---G---AC-A-AATAT---------TGA---------------AAACCATAC-ACC-------TATAAACTCAC-TAAGCAAAC---ACA-ATTAT---TG-----AAAG---G---CA-TAATACA-ATAA-AA-T--ATT--TTA-AAC--AC------TCCCC-CCCCCCCCCCAAA-----A--AA--ATTA---CT-C-AA--AA-G--GTGCAGTCCCCG-CA-CG-GTATGTAACAATTT---GT------TAC-AT-ACCGT-T-GCC--ATC---C-GCAGC-ACGG-T-T--GT-GTAAC-----------AATTT-----------G-T-TACA-AAGCGT--AG-CT--C-G------AATG--GCGA-C--G-C----TAT-G-TAACAAAAAAA----AT-TGTT-G-TTA-----ACA--TAGC--GTCGC-C-AT-TCGT-GCTACG-GTTTGTA-AC-----AAATT--GTT-ACA------------TGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
gi|1 : CCCCTAGTTTCAGTTGGCGGTCGGGGGGT--GTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTTGGC-TTAAATT-GAA-AA---GA-----AGAAT-TGATGCT-TAG-CAATTATAATATT--CTA-CG-T---ATGG--AGCAATT-------ACTCTGAT-GGGCTTGTTTGA-GCTGAAA----TTTGTTTTGTCGTACGCG---T-GGT-AA-GAATTTTACTAT----GAGGGAGT---GAACTCATGTTGATACTG---AAAACTACGT-TCAATTTAT--A--T-CGAAAT----GATA--TTTGGCAAATAAAATGTTTTT--A-CAAATACCTGTCATT----ATC-ATGTCT-AGAAG------ATA-TTAAATGTAGCT--TATTTTCC-TAGAGAAAAAGGTTTGATA-GAATAAAGTGTA-T-TG-AGCA-CG-GAT-GCCT----GTATTCTTACCCTCTAATAAGAGGATTTTGGGTTTG-TTGCAGTA-GAT-GATACT---AGAATTAAACGATGTT------TCG-CT-ATCTTTTTGAATGAGATAACT-GG-AA-TATGTTACATAG---GTGA-TTCCAACCGTGAGCTTCGGAAA-TGTT-ATTCTG-TTGTAGCAGCG---AA-TATAT-GT--AAATTT-TTA--TTGT-AGTGA--GATAAAT-GTG-TATTGAGGATG-TTTT--G--AATGCG-ATAAAGT--GTATCAATAATTTTTC-A----GAAGT-TA---TTTGAGTATATTGGTAATCTT-CATCTTGT-AAAACGTTTA--ACTATGATATA--TAATACATAACA-AATG-GAACA--ATGTTATGC-CTTGTT--CAGCGGTC-ACGTTGCCTTCTCCTATTATAAGCTATCGTGAATCTGGAGTAGATCGAGATAATCATAAGCCGTTATAAC--GCAATTAATCTATTTAGTTCGA--AGACTCA-AGCAATCTAGCATATTATG-ACATAGAC--------GTATGGCCCAAAGGATAAATAT-AGT-ACAAATCGTAATGTTTCCCAAAAGATCATAA-GAACATA---CATGT-T---ATATT-CCGATG----C-ATATTC-----GGT----TGACCACAAAAGAG-ACGGTATGT-ACA--A---------TTGTT-ACAAA---AACGT----CA-CG--A-T--CT-A--GCT-----A-TGT-----AC-AAGTTTTTTTTATTA-ATAGCGTCGCC-T-TCAAGCT-CG-CTTTG---GC--ATCGTGTACA-A-TGTGTGG----ACC-TTTTAAATAATTAGAGGAGGGGAGGGAGT-GGTTCTTGTA------T-TTATAT--GTGAG-TAGTGAGTGTA-ATCTCCGGTATGTGACCTGTTTTTCT-CAAATTTGGAT-CTATTCA--TGAATTCTTTT------CACCGTA-GAGAT-A-GATAGTCGCAACAATAG---T---AC-ACACTAT---------TGA---------------AAA-CAGAC-G-A-------TATAAA-TCA--TAA--AACC---A-A-AGTAA---TG-----AAAGTACC---CA-T-ATACATTTAT-GA-T---TG--TTA-GAA--AC------GCGCC-CCCCCC------G-----A--AA--ATTAATTCTGC-AA--AA-G--GTG-AGTGCTCG-CA-CA-GT-TGGTATAAATT---G-----------AT-ACGGT-T-TACTAATCT--T-GCAG--ATGG-TGT--GC-GCAAC------------ATTT-----------GTT-TACA-GATCGT--AGATT--C-GAGA---AATG--GGGA-T--GCC----TAT-G-T-ACATGAGAG----AG-TGTT-T-GTA-----A-A--TAG---GTCG
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gi|11 : ACAA-AGTA--AG----AATAA---G---AC-A-AATGTAGGTTTACATGA---------------AA---GTAT-ACC-------C----ACTCAC--AAGAAAGT---ATA-CCAAC---TC-----ACAA---A---CA-CAATG-A-GTAA-AAGG--AAT--TTACGAG--A-------TCCCC-CTCCCC---------------AA--ATTA---CC-C-AGATAA-G--GTGCAGTCCCCA-C-------ATGTAACAATTT---GTTAACAGTAC-AA-ACCGT-T-GCC--ATC---T-GCAAC-ACGG---T--AC-AGAAC-----------AATTT-----------G-T-TACA-AAGCAT--AT-CA--T-G------AATG--Gttaaggaatttttgttagaaatattttgttcga
gi|12 : tgaatgggtggggtgaatatatcctgaagaataatgatagcatgatgcgatggctgccattgATGTAG--ATTT---GTC-----TAT-AT-ACCGT-T-G-C--ATC---T-GCAGC-AC-A-T-T--GT-A-----------------------------------TACA-AAGCGT--TA-CT--T-G------AATA--GCGA-T--G-G----CAT-G-TAAC------ATTTTAT-T-TT-G-T-------ACA--TAGCAGATCGT-C-AT-TCG--ACTAAT-GGTTGTATAC-----AAATT--G
gi|12 : aacgagacgcttaAATTT---GT------TAT-A--ACCGT-TTGCCC-ATC---TTGCA--------T-T------CATC-----------AATTT-----------G-TATACA-ACCATT--AG--T--C-G------AATG--ACGA-TCTG-C----TAT-G-T-ACAAAATAA----AA-TGTT-----------ACA--TGCC--ATCGC-T-AT-TCAA-GTAACG-CTTTGTATAC-----AATGT--GCT-GCA------------atgaatgcaagatgggcaaacggttataacaaattagt
gi|13 : aacgagacgcttaatgtagatttgtctatataccgttgcatcA-CG-GTATGTAGCAATTT---GT------TAA-AT-ACCAT-T-GCC--ATC---C-ACAGC-ATGG-T----AT-GTAAC-----------AATTT-----------G-T-TTCA-AAGTGT--AG-CG--T-G------AATG--ACAA-T--G-C----TAT-G-TAACAAAAAA--------TGTT-G-TT------ACATTTAGC--GTCAC-C-AT-TCAT-GCTACG-GTATGTA-TC-----AAATT--Gagt
gi|14 : gatagattacatggtaga----C-----GGTGT-GTAACGTA----GAT-ACGGTATTTAACA--A----T----TTGTT-AC-AT---ACCAT-AG-CA-CA-AA-TGGCG-AC-CCT-----A-TGT-AACAGC-AT-TTTTGT---TTACAGAGCGTCGCCAT-TCGTGCTACG-CTTTGT-ATCAAATTG
gi|15 : atGCA-GTGATGG-ACC-A----CTACACGGTAT-GTAACAAC----GAG-ACGGTATGTGACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGT-GG-CA-CG-AA-TGGCG-AC-GTT-----A-TGTAgtgtgataaaactgtttccgggaggcattacat
gi|16 : aacggcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACC-TGTGCGAATT---GAATTGGGCCTTAAGTC-GAA-AAA-AAAAAATTAGAATGTGATGCTCTCGGCAATC-TAATATG--CTATTA-TTTCATCGTGAGCAATTGCAATACACTCTAACGG--CTCATTTGAAGCTtccagctatgtggttctactgcgccaa
gi|17 : G-ACAGTATGTAACA--A----C----TTGTTTAC-AA---ACTGT-AGGCA-CGCAA-TGGCGGAC-ACT-----AATGTAACCAACCAA-TTTTCTTTGTTG---------GCCAT--CAAGCTATG-CTTTGT-AACAAATTAT-TACATACCGTGCt
gi|17 : tactgtTGCATCTGATGG-ATCGA----C-----AGTAT-GTAACAAC----gatccatcagatgcaa
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lowQualScore : 5 0 0 0 8 88 8 000 8 2 0 0 88 00000 0 88 88 888 00 8 000000 0000 8 88 5555555555 5 2 555 0 2 5555555 6 0 0000 000 8 0 66666 8 4 6 8 0 00000 0 2 0000 0 00 00 8 8 8 00 0 00000 2 00 44 8 66 2 000 0 0 00 0 2222 00000000000 0 2 0 0 0 8 8 0 0 0000 0 8 2 8 8888888888 4 8 3 7 7 7 88 777 333333333 7 22 7 7 7 7 7 7 7 7 000000 8 0 8 0 8 000 22 22 0 0 000000000 0 2 8 2 2 5 88 0 0 00 0 5 2 2 2 88 5 888888 5 0000000 0 00 0 0 88 2 555 000 0 0 8 22 88 8 2222 2 8 0 5555 00 2 0 0 5555555555555 000 8 0 888888 8 55555555555555 22 8 0 0 8 8 0 8 000000 666 6 0 000000 8 8 00 0 0 88 88 00000000 8 8 000 8 8 000 0 6 8888888888 3 5 1111 9 9 88 555555555 1 1 888 222 6 6 6 6 6 77777 999 0 0 0 1 1 4 7 4 0 7 66 88 888 2222 2 2 8 555 5 000 0 0 8 5 0 222 2 2 8 000 0000 7 0 2 7 4 99 1111 111111 7 111 0000000000 0 0000000 0 0 000000000 000000000000000 66 66 0000000 3 55555555 4 1 0 7 000 5555 00000 111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 4 2222222222222222222222222 66 3 66 4 2 1 4 4 888 55555 888888 888888 0 0 666 88 55 555 0000 3 22 22222 555555555555 2222222222222 7 4 77 7 7777 77 2222222 33 9999 9 1111 9 9 44 77 11111111 777777777777 99 7 99 22 1 1 99 5 1 2 22 6 2222222222222 4 9 22222 4 4 99
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Reference ( family-3068 ) : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGAA-----GAATGTGATGCTCTAGGCAATT-TAATATT--CTACAACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTCGTTTGACGCTGAAAA---GT-TTTTGTCGTACGAG---CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTT--GAACTT---TTGA-ACTA---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--CCATTTGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTTC-TAGA-----AGATTCGATACAAATAAAGTG-A-T-TGTGGCANCG-GATCGCCC----GT-TTGCTNC---------AGGGGATTTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCGA--CT---GAAGTAAAACGATGAGA-----TC--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-T-G----A-ATAAACCGTAA-TTTCCACAGTA---TTTGGAAA-TTGTA-TT-TGTT-GTAGC---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCAT--TGT-AG-GATCGANAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATAATNAAGT-TATT--TTGA---TATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATGNTATAATTAATA-ACNACACAATG-TAACANCACTTCATGCGCCTGTTTCCAGCGGTCA-CGTT-----CGCNCG--ANNNGCGANCGCGGGNNNNNCGTGGGTCCGGACNNCCNNNNNNCGCGGCAACAAATAATCAATCTATT-AGT-CGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AA-TGATAAA-AT-AGT-ACA--------TGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCNCTGATGGA-CCA----C-----GGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTA-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GCTA-----TGTAAN-AA-C-AA-TTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTAAGTANTT---GGGGGGGGGGGA-T-GGNTNTTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATA---AG--G-TAAG-AATAA---G---AC-A-AATAT---------TGA---------------AAACCATAC--ACC-------TATAA--------ACTCACTAA-CAAAC---ACAATTAT---TG-----AAAG---G---CA-TAATACA-ATAA-AAT--ATT--TTA-AAN--AC------TCCCC-CCCCCCCCCCAAA-----A--AA--ATTA---CT-C-AAA--A-G--GTGCAGTCCCCG-CA-CG-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA------C-AT-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAGC-ACGGT-TAT-G-T-AAC-----------GATTT-----------G-T-TACA-AAGCGT--AG-C----T--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TAT-G-TAACAAAAAAA----AT-TGTT-G-TTA-----ACA--TAGC--GTCGC--C-AT-TCGT-GCTACG-GTTTGTA-ACAAATT--GTT-ACAT-ACC--TCTCG-T-GTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
gi|1 : CCCCTAGTTTCAGTTGGCGGTCGGGGGGT--GTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTTGGC-TTAAATT-GAA-AA---GAA-----GAAT-TGATGCT-TAG-CAATTATAATATT--CTACG----TATGG--AGCAATT-------ACTCTGAT-GGGCTTGTTTGA-GCTGAAAT---TTGTTTTGTCGTACGCG---TGGT-AA-GAATTTTACTAT----GAGGGAGT---GAACTCATGTTGATACTG---AAAACTACGT-TCAATTTAT--A--T-CGAAAT----GATA--TTTGGCAAATAAAATGTTTTT--A-CAAATACCTG--TCATT----ATC-ATGTCT-AGAAG------ATA-TTAAATGTAGCT--TATTTTCC-TAGAGAAAAAGGTTTGATA-GAATAAAGTGTA-T-TG-AGCA-CG-GAT-GCCT----GTATTCTTACCCTCTAATAAGAGGATTTTGGGTTTG-TTGCAGTA-GAT-GATACT---AGAATTAAACGATGTT------TCG-CT-ATCTTTTTGAATGAGATAACT-GG-AA-T-ATGTTACATAG---GTGA-TTCCAACCGTGAGCTTCGGAAA-TGTTA-TTCTGTT-GTAGCAGCG---AA-TATAT-GT--AAATTTTT-AT--TGT-AGTGA--GATAAAT-GTGT-ATTGAGGATGTTTT---G--AATGCG-ATAAAGT--GTATCAATAATTTTTC-A----GAAGT-TATT--T-GAGTATATTGGTAATCTT-CATCTTGTAAAA-CGTTTA--ACTATGATATA--TAATACATAACA-AATG-GAACA--ATGTTATGC-CTTGTT--CAGCGGTCA-CGTTGCCTTCTCCTATTATAAGCTATCGTGAATCTGGAGTAGATCGAGATAATCATAAGCCGTTATAACG--CAATTAATCTATTTAGTTCGA--AGACTCAA-GCAATCTAGCATATTATGACA-TAGAC------G--TATGGCCCAAA-GGATAAATAT-AGT-ACAAATCGTAATGTTTCCCAAAAGATCATAA-GAACATA---CATGT-T---ATATTCCGATG----CATATTC-----GGT----TGACCACAAAAGAG-ACGGTATGT-ACA--A---------TTGTT-ACAAA---AACGT----CA-CG--AT---CT-A--GCTA-----TGT-----A-C-AAGTTTTTTTTATTA-ATAGCGTCGCC-T-TCAAGCT--CGC-TT--T-GGC--ATCGTGTACA-A-TGTGTGG----ACC-TTTTAAATAATTAGAGGAGGGGAGGGAGT-GGTTCTTGTA------T-TTATAT--GTGAGT-AGTGAGTGTA-ATCTCCGGTATGTGACCTGTTTTTCT-CAAATTTGGAT-CTATTCA--TGAATTCTTTT------CACCGTA-GAGATAGATAGTCG-CAAC-AATAG---T---AC-ACACTAT---------TGA---------------AAA-CAGAC--G-A-------TATAA--------A-TCA-TAA--AACC---A-AAGTAA---TG-----AAAGTACC---CA-T-ATACATTTAT-GAT---TG--TTA-GAA--AC------GCGCC-CCCCCC------G-----A--AA--ATTAATTCTGC-AAA--A-G--GTG-AGTGCTCG-CA-CA-GT-TGGTA---TAAATT-----G-----------------AT-ACGGT-T-T--ACTAATCT--T---GCAG--ATGGTGTGC-G-C-AAC------------ATTT-----------GTT-TACA-GATCGT--AGAT----T--CGAGA---AATG--GGGA-T--GCC----TAT-G-T-ACATGAGAG----AG-TGTT-T-GTA-----A-A--TAG---GTCG
gi|10 : tcgattcatacgagccaaatgctttgcaacagttgtgcaagcaaatacgcagggatgacatcgttgcagtagaAATG------CACTCTGGTCG--CTCATT-GAC-CCG----------CTCTGT-GTATGAG---TGTTCGGTGATTTTT--TTTTCCCGATGAAGTTTCAAACAT---TTGA-ATTGTGGAAAATGT-TTCTCAATTT-TCGA--T-TTTTGGCGCAAA-A--TT--ACAAAT-AAATGTA-TA--A-CA-----CCGGACCCT---CTAATTATGTCTTTGGAAATGGTAATG-T-AAATATCACT--ATTTT------GA-----AGAT-------------AATG-A-TATGTGG-ATCGAAAACGTCCATAGAT-TTG-TACA--------AGAGAAACTTGGG--TG-T-GCAGTA-GATCGA--TTTTCAAATTTGAA--ATGAGAGCATGTC--CTAAT--TTTCCA-CA-GTTG-TTAGG-AA-T-atgatataaggttagaatgtgcgctatgtaagttcgttagttatagagtggat
gi|11 : ACA---AA--G-TAAG-AATAA---G---AC-A-AATGTAGGTTTACATGA---------------AAGT-ATACCCACT-------CACAAGAAAGTATACCAACTCA-CAAAC---ACAATGAG---TA-----AAAG---G-------------------AAT-------TTACGAG--A-------TCCCC-CTCCCC---------------AA--ATTA---CC-C-AGATAA-G--GTGCAGTCCCCA-CA-------TGTAA---CAATTT-----GT------TAACAGTAC-AA-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAAC-ACGG--TAC-A-G-AAC-----------AATTT-----------G-T-TACA-AAGCAT--AT-C----A--TG------AATG--Gttaaggaatttttgttagaaatattttgttcga
gi|12 : tgaatgggtggggtgaatatatcctgaagaataatgatagcatgatgcgatggctgccattgATGTAG-----ATTT-----GTC-----TA------T-AT-ACCGT-T-G--C---ATC---T---GCAGC-ACA----------------------------TT-----------G-TATACA-AAGCGT--TA-C----T--TG------AATA--GCGA-T--G-G----CAT-G-TAAC------ATTTTAT-T-TT-G-T-------ACA--TAGCAGATCGT--C-AT-TCG--ACTAAT-GGTTGTATACAAATT--G
gi|12 : aacgagacgcttaAATTT-----GT------TA------T-A--ACCGT-TTG--CCC-ATC---T---T--GC-AT--T-CAT-------C-----------AATTT-----------G-TATACA-ACCATT--AG------T--CG------AATG--ACGA-TCTG-C----TAT-G-T-ACAAAATAA----AA-TGTT-----------ACA--TGCC--ATCGC--T-AT-TCAA-GTAACG-CTTTGTATACAATGT--GCT-GCAatgaatgcaagatgggcaaacggttataacaaattagt
gi|13 : aacgagacgcttaatgtagatttgtctatataccgttgcatcA-CG-GTATGTAG---CAATTT-----GT------TA------A-AT-ACCAT-T-G--CC--ATC---C---ACAGC-ATGGT--AT-G-T-AAC-----------AATTT-----------G-T-TTCA-AAGTGT--AG-C----G--TG------AATG--ACAA-T--G-C----TAT-G-TAACAAAAAA--------TGTT-G-TT------ACATTTAGC--GTCAC--C-AT-TCAT-GCTACG-GTATGTA-TCAAATT--Gagt
gi|14 : gatagattacatggtaga----C-----GGTGTG-TAACGTA----GAT-ACGGTATTTAACA--A----T----TTGTT-AC-AT---ACCATA-G-CA-CA-AAT-GGCG-AC-CCTA-----TGTAAC-AG-C-AT-TTTTGT---TTACAGAGCGTCGCCAT-TCGTGCTA-CGC-TTTGT-ATCAAATTG
gi|15 : atGCAGTGATGGA-CCA----CTACACGGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTGACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTG-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GTTA-----TGTAgtgtgataaaactgtttccgggaggcattacat
gi|16 : aacggcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACC-TGTGCGAATT---GAATTGGGCCTTAAGTC-GAA-AAA-AAAAAATTAGAATGTGATGCTCTCGGCAATC-TAATATG--CTATTATTTCATCGTGAGCAATTGCAATACACTCTAACGG--CTCATTTGAAGCTtccagctatgtggttctactgcgccaa
gi|17 : G-ACAGTATGTAACA--A----C----TTGTTTAC-AA---ACTGTA-GGCA-CGCAAT-GGCGGAC-ACTAA----TGTAACCAA-CCAA-TTTTCTTTGTTG---------GCCAT--CAAGCTA-TGC-TTTGT-AACAAATTAT-TACATACCGTGCt
gi|17 : tactgtA-CA-GTTTGTAAA--CAAGTT-----GT------TA------C-AT-ACTGT-C-GATCC--ATCAGAT---GCAgatccatcagatgcaa
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lowQualScore : 5 0 0 0 8 88 8 000 8 2 0 0 88 00000 0 88 88 888 00 8 000000 0000 8 88 5555555555 5 2 555 0 2 5555555 6 0 0000 000 8 0 66666 8 4 6 8 0 00000 0 2 0000 0 00 00 8 8 8 00 0 00000 2 00 44 8 66 2 000 0 0 00 0 2222 00000000000 0 2 0 0 0 8 8 0 0 0000 0 8 2 0 8888888888 4 8 3 7 7 7 88 777 333333333 7 22 7 7 7 7 7 7 7 7 000000 8 0 8 0 8 000 22 22 0 0 000000000 0 2 8 2 2 5 88 0 0 00 0 5 2 2 2 88 5 888888 5 0000000 0 00 0 0 0 88 555 000 0 0 2 22 88 8 2222 2 8 0 5555 00 2 0 0 00000 8 88 000 8 0 888888 8 55555555555555 222 8 0 0 8 8 0 8 000000 666 8 8 0 8888888 8 00 0 0 88 88 00000000 8 8 000 8 8 000 0 0 1111111111 6 4 7777 1 7 33 777777777 3 3 444 1111 0 0 0 0 77 00000 0 8888 4 1 5 0 2 0 0 7 66 88 888 2222 2 2 8 555 5 000 0 0 8 5 0 222 2 2 8 000 0000 7 0 2 7 4 99 1111 111111 7 11 0000000000 6 0 5555555 0 0 999999999999999999999999999999999999999999999999 88 11 66666666666666666666666666666 4 1 55 7 0000 999999 000 111111111111111111111111111111111 3 4 2222222222222222222222222 66 3 66 4 1 1 4 4 888 55555 888888 888888 0 0 111 88 55 555 0000 3 999999999999999999999999 22222222222 4 7 4 4 77 7 7777 77 2222222 77 7 9999 9 1111 9 9 44 77 99999 9 77777777777777 99 7 99 22 1 1 8 1 5 1 77777 1 2 22 6 99 66 2 00000 0 0 99
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Reference ( family-3068 ) : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGAA-----GAATGTGATGCTCTAGGCAATT-TAATATT--CTACGACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTCGTTTGACGCTGAAAA---GT-TTTTGTCGTACGAG---CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTT--GAACTT---TTGA-ACTA---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--CCATTTGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTTC-TAGA-----AGATTCGATACAAATAAAGTG-A-T-TGTGGCANCG-GATCGCCC----GT-TTGCTAC---------AGGGGATTTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCGA--CT---GAAGTAAAACGATGAGA-----TC--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-T-G----A-ATAAACCGTAA-TTTCCACAGTA---TTTGGAAA-TTGTA-TT-TGTT-GTAGC---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCAT--TGT-AG-GATCGANAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATAATNAAGT-TATT--TTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATGNTATAATTAATA-ACNACACAATG-TAACANCACTTCATGCGCCTGTTTCCAGCGGTCA-CG-----TTCGCCCG--ANNNGCGANCGCGGGNNNNNCGTGGGTCCGGACNNCCNNNNNNCGCGGCAACAAATAATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AA-TGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCNCTGATGG-ACCA----C-----GGTAT-GTAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGT-AG-CA-CG-AA-TGGCG-AC-GCT-----A-TGTAAC-AA-C-AATTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTAAGTAATT---GGGGGGGGGGGA-T-GGNTNTTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATA---AG--G-CAAG-AATAA---G---AC-A-AATAT---------T---------------------GA---------------AAACCATAC--ACC-------TA---------TAA--------ACTCACTAA-CAAACACAATTAT---TGAAA--G---G---CATA-TACA-ATAN-AAT--ATT--TTAAAN--ACTCCCC-CCCCCCCCCCAAA-----A--AA--ATTA---CT-C-AAA--A-G--GTGCAGTCCCCG-CA-CG-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA------C-AT-ACCGT-T-G--CC--ATC---TG---CAGC-ACGGT-TAT-GT-AAC-----------GATTT-----------G-T-T-ACA-AAGCGT--AG-C----T--CG------AATG--G-CGA-C--G-C----TAT-GT-AACAAAAAAA----AT-TGTT-GTT---A-----ACA--TAGC--GTCGC--C-AT-TCGTG-CTACGGT-T-----T-GTA-ACAAATTG--TTA-CAT-ACC--TCTCGTTGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
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gi|10 : tcgattcatacgagccaaatgctttgcaacagttgtgcaagcaaatacgcagggatgacatcgttgcagtagaAATG------CACTCTGGTCG--CTCATT-GAC-CCG----------CTCTGT-GTATGAG---TGTTCGGTGATTTTT--TTTTCCCGATGAAGTTTCAAACAT---TTGA-ATTGTGGAAAATGT-TTCTCAATTT-TCGA--T-TTTTGGCGCAAA-A--TT--ACAAAT-AAATGTA-TA--A-CA-----CCGGACCCT---CTAATTATGTCTTTGGAAATGGTAATG-T-AAATATCACT--ATTTT------GA-----AGAT-------------AATG-A-TATGTGG-ATCGAAAACGTCCATAGAT-TTG-TACA--------AGAGAAACTTGGG--TG-T-GCAGTA-GATCGA--TTTTCAAATTTGAA--ATGAGAGCATGTC--CTAAT--TTTCCA-CA-GTTG-TTAGG-AA-T-atgatataaggttagaatgtgcgctatgtaagttcgttagttatagagtggat
gi|11 : ACA---AA--G-TAAG-AATAA---G---AC-A-AATGTAGGTTTACAT---------------------GA---------------AAGT-ATACCCACT-------CA---------CAAGAAAGTATACCAACTCA-CAAACACAATGAG---TAAAA--G---G---AATT-TACG-AGA----------------------TCCCC-CTCCCC---------------AA--ATTA---CC-C-AGATAA-G--GTGCAGTCCCCA-CA-------TGTAA---CAATTT-----GT------TAACAGTAC-AA-ACCGT-T-G--CC--ATC---TG---CAAC-ACGG--TAC-AG-AAC-----------AATTT-----------G-T-T-ACA-AAGCAT--AT-C----A--TG------AATG--G-ttaaggaatttttgttagaaatattttgttcga
gi|12 : tgaatgggtggggtgaatatatcctgaagaataatgatagcatgatgcgatggctgccattgATGTAG-----ATTT-----GTC-----TA------T-AT-ACCGT-T-G--C---ATC---TG---CAGC-ACA---------------------------TT-----------G-TAT-ACA-AAGCGT--TA-C----T--TG------AATA--G-CGA-T--G-G----CAT-GT-AAC------ATTTTAT-T-TT-GT----------ACA--TAGCAGATCGT--C-AT-TCG-A-CTAATGG-T-----T-GTATACAAATTG--
gi|12 : aacgagacgcttaAATTT-----GT------TA------T-A--ACCGT-TTG--CCC-ATC---TT-----GC-AT--T-CAT------C-----------AATTT-----------G-TAT-ACA-ACCATT--AG------T--CG------AATG--A-CGA-TCTG-C----TAT-GT--ACAAAATAA----AA-TGTT-------------ACA--TGCC--ATCGC--T-AT-TCAAG-TAACGCT-T-----T-GTATACAATGTG--CTG-CAatgaatgcaagatgggcaaacggttataacaaattagt
gi|13 : aacgagacgcttaatgtagatttgtctatataccgttgcatcA-CG-GTATGTAG---CAATTT-----GT------TA------A-AT-ACCAT-T-G--CC--ATC---CA---CAGC-ATGGT--AT-GT-AAC-----------AATTT-----------G-T-T-TCA-AAGTGT--AG-C----G--TG------AATG--A-CAA-T--G-C----TAT-GT-AACAAAAAA--------TGTT-GTT---------ACATTTAGC--GTCAC--C-AT-TCATG-CTACGGT-A-----T-GTA-TCAAATTG--agt
gi|14 : gatagattacatggtaga----C-----GGTGT-GTAACGTA----GAT-ACGGTATTTAACA--A----T----TTGTT-AC-AT---ACCAT-AG-CA-CA-AA-TGGCG-AC-CCT-----A-TGTAAC-AG-C-ATTTTTGT---TTACAGAGCGTCGCCAT-TCGTGCTA-CGC-TTTGT-ATCAAATTG
gi|15 : atGCAGTGATGG-ACCA----CTACACGGTAT-GTAACAAC----GAG-ACGGTATGTGACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGT-GG-CA-CG-AA-TGGCG-AC-GTT-----A-TGTAgtgtgataaaactgtttccgggaggcattacat
gi|16 : aacggcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACC-TGTGCGAATT---GAATTGGGCCTTAAGTC-GAA-AAA-AAAAAATTAGAATGTGATGCTCTCGGCAATC-TAATATG--CTATTATTTCATCGTGAGCAATTGCAATACACTCTAACGG--CTCATTTGAAGCTtccagctatgtggttctactgcgccaa
gi|17 : G-ACAGTATGTAACA--A----C----TTGTTTAC-AA---ACTGT-AGGCA-CGCAA-TGGCGGAC-ACT-----AATGTAACCAA-CCAATTTTCTTTGTTG---------GCCAT--CAAGCTA-TGC-TTTGT-AACAAATTAT-TACATACCGTGCt
gi|17 : tactgtA-CA-GTTTGTAAA--CAAGTT-----GT------TA------C-AT-ACTGT-C-GATCC--ATCAGATG---CAgatccatcagatgcaa
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Reference ( family-3068 ) : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGAA-----GAATGTGATGCTCTAGGCAATT-TAATATT--CTACGACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTCGTTTGACGCTGAAAA---GT-TTTTGTCGTACGAG---CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTT--GAACTT---TTGA-ACTA---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--CCATTTGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTTC-TAGA-----AGATTCGATACAAATAAAGTG-A-T-TGTGGCANCG-GATCGCCC----GT-TTGCTAC---------AGGGGATTTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCGA--CT---GAAGTAAAACGATGAGA-----TC--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-T-G----A-ATAAACCGTAA-TTTCCACAGTA---TTTGGAAA-TTGTA-TT-TGTT-GTAGC---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCAT--TGT-AG-GATCGANAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATAATNAAGT-TATT--TTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATGNTATAATTAATA-ACNACACAATG-TAACANCACTTCATGCGCCTGTTTCCAGCGGTCA-CG-----TTCGCCCG--ANNNGCGANCGCGGGNNNNNCGTGGGTCCGGACNNCCNNNNNNCGCGGCAACAAATAATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AA-TGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCNCTGATGGA-CCA----C-----GGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTA-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GCTA-----TGTAAC-AA-C-AATTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTAAGTAATT---GGGGGGGGGGGA-T-GGNTNTTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATA---AG--G-CAAG-AATAA---G---AC-A-AATAT---------T---------------------GA---------------AAACCATAC--ACC-------TA---------TAA--------ACTCACTAA-CAAACACAATTAT---TGAA-A--G---GCATC-T-ACAAT-A-A----ATA-----TT--TTA-AA---ACTCCCC-CCCCCCCCCCAAA-----A--AA--ATTA---CT-C-AAA--A-G--GTGCAGTCCCCG-CA-CG-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA------C-AT-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAGC-ACGGT-TAT-G-T-AAC-----------GATTT-----------G-T-TACA-AAGCGT--AG-C----T--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TAT-G-TAA-CAAAAAAA----AT-TGTT-G-TTA-----ACA--TAGC--GTCGC--C-AT-TCGT-GCTACG-GT-T-----TGTA-ACAAATT--GTT-ACAT-A-CCG-TCTCGTTGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
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gi|11 : ACA---AA--G-TAAG-AATAA---G---AC-A-AATGTAGGTTTACAT---------------------GA---------------AAGT-ATACCCACT-------CA---------CAAGAAAGTATACCAACTCA-CAAACACAATGAG---TAAA-A--G---GAATT-T-ACGAG-A-----------------------------TCCCC-CTCCCC---------------AA--ATTA---CC-C-AGATAA-G--GTGCAGTCCCCA-CA-------TGTAA---CAATTT-----GT------TAACAGTAC-AA-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAAC-ACGG--TAC-A-G-AAC-----------AATTT-----------G-T-TACA-AAGCAT--AT-C----A--TG------AATG--Gttaaggaatttttgttagaaatattttgttcga
gi|12 : tgaatgggtggggtgaatatatcctgaagaataatgatagcatgatgcgatggctgccattgATGTAG-----ATTT-----GTC-----TA------T-AT-ACCGT-T-G--C---ATC---T---GCAGC-ACA----------------------------TT-----------G-TATACA-AAGCGT--TA-C----T--TG------AATA--GCGA-T--G-G----CAT-G-TAA-C------ATTTTAT-T-TT-G-T-------ACA--TAGCAGATCGT--C-AT-TCG--ACTAAT-GG-T-----TGTATACAAATT--G
gi|12 : aacgagacgcttaAATTT-----GT------TA------T-A--ACCGT-TTG--CCC-ATC---T---T--GC-AT--T-CAT-------C-----------AATTT-----------G-TATACA-ACCATT--AG------T--CG------AATG--ACGA-TCTG-C----TAT-G-T-A-CAAAATAA----AA-TGTT-----------ACA--TGCC--ATCGC--T-AT-TCAA-GTAACG-CT-T-----TGTATACAATGT--GCT-GCAatgaatgcaagatgggcaaacggttataacaaattagt
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gi|15 : atGCAGTGATGGA-CCA----CTACACGGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTGACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTG-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GTTA-----TGTAgtgtgataaaactgtttccgggaggcattacat
gi|16 : aacggcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACC-TGTGCGAATT---GAATTGGGCCTTAAGTC-GAA-AAA-AAAAAATTAGAATGTGATGCTCTCGGCAATC-TAATATG--CTATTATTTCATCGTGAGCAATTGCAATACACTCTAACGG--CTCATTTGAAGCTtccagctatgtggttctactgcgccaa
gi|17 : G-ACAGTATGTAACA--A----C----TTGTTTAC-AA---ACTGTA-GGCA-CGCAAT-GGCGGAC-ACTAA----TGTAACCAA-CCAATTTTCTTTGTTG---------GCCAT--CAAGCTA-TGC-TTTGT-AACAAATTAT-TACATACCGTGCt
gi|17 : tactgtA-CA-GTTTGTAAA--CAAGTT-----GT------TA------C-AT-ACTGT-C-GATCC--ATCAGAT---GCAgatccatcagatgcaa
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Reference ( family-3068 ) : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGAA-----GAATGTGATGCTCTAGGCAATT-TAATATT--CTACGACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTCGTTTGACGCTGAAAA---GT-TTTTGTCGTACGAG---CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTT--GAACTT---TTGA-ACTA---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--CCATTTGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTTC-TAGA-----AGATTCGATACAAATAAAGTG-A-T-TGTGGCANCG-GATCGCCC----GT-TTGCTAC---------AGGGGATTTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCGA--CT---GAAGTAAAACGATGAGA-----TC--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-T-G----A-ATAAACCGTAA-TTTCCACAGTA---TTTGGAAA-TTGTA-TT-TGTT-GTAGC---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCAT--TGT-AG-GATCGANAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATAATNAAGT-TATT--TTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATGNTATAATTAATA-ACNACACAATG-TAACANCACTTCATGCGCCTGTTTCCAGCGGTCA-CG-----TTCGCCCG--ANNNGCGANCGCGGGNNNNNCGTGGGTCCGGACNNCCNNNNNNCGCGGCAACAAATAATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AA-TGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCNCTGATGGA-CCA----C-----GGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTA-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GCTA-----TGTAAC-AA-C-AATTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTAAGTAATT---GGGGGGGGGGGA-T-GGNTNTTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATA---AG--G-CAAG-AATAA---G---AC-A-AATAT---------T---------------------GA---------------AAACCATAC--ACC-------TA---------TAA--------ACTCACTAA-CAAACACAATTAT---TGAA-A--G---GC----ATC-T-ACAATAA-----T-A--TT--TTA-AA---ACTCCCC-CCCCCCCCCCAAA-----A--AA--ATTA---CT-C-AAA--A-G--GTGCAGTCCCCG-CA-CG-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA------C-AT-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAGC-ACGGT-TAT-G-T-AAC-----------GATTT-----------G-T-TACA-AAGCGT--AG-C----T--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TAT-G-TAA-CAAAAAAA----AT-TGTT-G-TTA-----ACA--TAGC--GTCGC--C-AT-TCGT-GCTACG-GT-T-----TGTA-ACAAATT--GTT-ACAT-A-CCG-TCTCGTTGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
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gi|11 : ACA---AA--G-TAAG-AATAA---G---AC-A-AATGTAGGTTTACAT---------------------GA---------------AAGT-ATACCCACT-------CA---------CAAGAAAGTATACCAACTCA-CAAACACAATGAG---TAAA-A--G---GA----ATT-T-ACGAGA--------------------------TCCCC-CTCCCC---------------AA--ATTA---CC-C-AGATAA-G--GTGCAGTCCCCA-CA-------TGTAA---CAATTT-----GT------TAACAGTAC-AA-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAAC-ACGG--TAC-A-G-AAC-----------AATTT-----------G-T-TACA-AAGCAT--AT-C----A--TG------AATG--Gttaaggaatttttgttagaaatattttgttcga
gi|12 : tgaatgggtggggtgaatatatcctgaagaataatgatagcatgatgcgatggctgccattgATGTAG-----ATTT-----GTC-----TA------T-AT-ACCGT-T-G--C---ATC---T---GCAGC-ACA----------------------------TT-----------G-TATACA-AAGCGT--TA-C----T--TG------AATA--GCGA-T--G-G----CAT-G-TAA-C------ATTTTAT-T-TT-G-T-------ACA--TAGCAGATCGT--C-AT-TCG--ACTAAT-GG-T-----TGTATACAAATT--G
gi|12 : aacgagacgcttaAATTT-----GT------TA------T-A--ACCGT-TTG--CCC-ATC---T---T--GC-AT--T-CAT-------C-----------AATTT-----------G-TATACA-ACCATT--AG------T--CG------AATG--ACGA-TCTG-C----TAT-G-T-A-CAAAATAA----AA-TGTT-----------ACA--TGCC--ATCGC--T-AT-TCAA-GTAACG-CT-T-----TGTATACAATGT--GCT-GCAatgaatgcaagatgggcaaacggttataacaaattagt
gi|13 : aacgagacgcttaatgtagatttgtctatataccgttgcatcA-CG-GTATGTAG---CAATTT-----GT------TA------A-AT-ACCAT-T-G--CC--ATC---C---ACAGC-ATGGT--AT-G-T-AAC-----------AATTT-----------G-T-TTCA-AAGTGT--AG-C----G--TG------AATG--ACAA-T--G-C----TAT-G-TAA-CAAAAAA--------TGTT-G-TT------ACATTTAGC--GTCAC--C-AT-TCAT-GCTACG-GT-A-----TGTA-TCAAATT--Gagt
gi|14 : gatagattacatggtagaC-----------AATTT-----------G-A-TACA-AAGCGT--AG-C----A--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TCT-G-TAAACAAAAA---------TGCT-G-TTA------CA--TAGG--GTCGC--C-AT-TTGT-GCTATG-GT-A-----TGTA-ACAAATT--GTT-AAAT-A-CCG-TATCTACGTTACACACC-----G-
gi|15 : atGCAGTGATGGA-CCA----CTACACGGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTGACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTG-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GTTA-----TGTAgtgtgataaaactgtttccgggaggcattacat
gi|16 : aacggcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACC-TGTGCGAATT---GAATTGGGCCTTAAGTC-GAA-AAA-AAAAAATTAGAATGTGATGCTCTCGGCAATC-TAATATG--CTATTATTTCATCGTGAGCAATTGCAATACACTCTAACGG--CTCATTTGAAGCTtccagctatgtggttctactgcgccaa
gi|17 : G-ACAGTATGTAACA--A----C----TTGTTTAC-AA---ACTGTA-GGCA-CGCAAT-GGCGGAC-ACTAA----TGTAACCAA-CCAATTTTCTTTGTTG---------GCCAT--CAAGCTA-TGC-TTTGT-AACAAATTAT-TACATACCGTGCt
gi|17 : tactgtA-CA-GTTTGTAAA--CAAGTT-----GT------TA------C-AT-ACTGT-C-GATCC--ATCAGAT---GCAgatccatcagatgcaa
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Reference ( family-3068 ) : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGAA-----GAATGTGATGCTCTAGGCAATT-TAATATT--CTACGACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTCGTTTGACGCTGAAAA---GT-TTTTGTCGTACGAG---CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTT--GAACTT---TTGA-ACTA---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--CCATTTGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTTC-TAGA-----AGATTCGATACAAATAAAGTG-A-T-TGTGGCANCG-GATCGCCC----GT-TTGCTAC---------AGGGGATTTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCGA--CT---GAAGTAAAACGATGAGA-----TC--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-T-G----A-ATAAACCGTAA-TTTCCACAGTA---TTTGGAAA-TTGTA-TT-TGTT-GTAGC---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCAT--TGT-AG-GATCGANAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATAATNAAGT-TATT--TTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATGNTATAATTAATA-ACNACACAATG-TAACANCACTTCATGCGCCTGTTTCCAGCGGTCA-CG-----TTCGCCCG--ANNNGCGANCGCGGGNNNNNCGTGGGTCCGGACNNCCNNNNNNCGCGGCAACAAATAATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AA-TGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCNCTGATGGA-CCA----C-----GGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTA-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GCTA-----TGTAAC-AA-C-AATTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTAAGTAATT---GGGGGGGGGGGA-T-GGNTNTTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATA---AG--G-CAAG-AATAA---G---AC-A-AATAT---------T---------------------GA---------------AAACCATAC--ACC-------TA---------TAA--------ACTCACTAA-CAAACACAATTAT---TGAA-A--G---GC----ATC-T-ACAATAA-----T-A--TT--TTA-AA---ACTCCCC-CCCCCCCCCCAAA-----A--AA--ATTA---CT-C-AAA--A-G--GTGCAGTCCCCG-CA-CG-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA------C-AT-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAGC-ACGGT-TAT-G-T-AAC-----------GATTT-----------G-T-TACA-AAGCGT--AG-C----T--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TAT-G-TAA-CAAAAAAA----AT-TGTT-G-TTA-----ACA--TAGC--GTCGC--C-AT-TCGT-GCTACG-GT-T-----TGTA-ACAAATT--GTT-ACAT-A-CCG-TCTCGTTGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
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gi|11 : ACA---AA--G-TAAG-AATAA---G---AC-A-AATGTAGGTTTACAT---------------------GA---------------AAGT-ATACCCACT-------CA---------CAAGAAAGTATACCAACTCA-CAAACACAATGAG---TAAA-A--G---GA----ATT-T-ACGAGA--------------------------TCCCC-CTCCCC---------------AA--ATTA---CC-C-AGATAA-G--GTGCAGTCCCCA-CA-------TGTAA---CAATTT-----GT------TAACAGTAC-AA-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAAC-ACGG--TAC-A-G-AAC-----------AATTT-----------G-T-TACA-AAGCAT--AT-C----A--TG------AATG--Gttaaggaatttttgttagaaatattttgttcga
gi|12 : tgaatgggtggggtgaatatatcctgaagaataatgatagcatgatgcgatggctgccattgATGTAG-----ATTT-----GTC-----TA------T-AT-ACCGT-T-G--C---ATC---T---GCAGC-ACA----------------------------TT-----------G-TATACA-AAGCGT--TA-C----T--TG------AATA--GCGA-T--G-G----CAT-G-TAA-C------ATTTTAT-T-TT-G-T-------ACA--TAGCAGATCGT--C-AT-TCG--ACTAAT-GG-T-----TGTATACAAATT--G
gi|12 : aacgagacgcttaAATTT-----GT------TA------T-A--ACCGT-TTG--CCC-ATC---T---T--GC-AT--T-CAT-------C-----------AATTT-----------G-TATACA-ACCATT--AG------T--CG------AATG--ACGA-TCTG-C----TAT-G-T-A-CAAAATAA----AA-TGTT-----------ACA--TGCC--ATCGC--T-AT-TCAA-GTAACG-CT-T-----TGTATACAATGT--GCT-GCAatgaatgcaagatgggcaaacggttataacaaattagt
gi|13 : aacgagacgcttaatgtagatttgtctatataccgttgcatcA-CG-GTATGTAG---CAATTT-----GT------TA------A-AT-ACCAT-T-G--CC--ATC---C---ACAGC-ATGGT--AT-G-T-AAC-----------AATTT-----------G-T-TTCA-AAGTGT--AG-C----G--TG------AATG--ACAA-T--G-C----TAT-G-TAA-CAAAAAA--------TGTT-G-TT------ACATTTAGC--GTCAC--C-AT-TCAT-GCTACG-GT-A-----TGTA-TCAAATT--Gagt
gi|14 : gatagattacatggtagaC-----------AATTT-----------G-A-TACA-AAGCGT--AG-C----A--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TCT-G-TAAACAAAAA---------TGCT-G-TTA------CA--TAGG--GTCGC--C-AT-TTGT-GCTATG-GT-A-----TGTA-ACAAATT--GTT-AAAT-A-CCG-TATCTACGTTACACACC-----G-
gi|15 : atGCAGTGATGGA-CCA----CTACACGGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTGACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTG-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GTTA-----TGTAgtgtgataaaactgtttccgggaggcattacat
gi|16 : aacggcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACC-TGTGCGAATT---GAATTGGGCCTTAAGTC-GAA-AAA-AAAAAATTAGAATGTGATGCTCTCGGCAATC-TAATATG--CTATTATTTCATCGTGAGCAATTGCAATACACTCTAACGG--CTCATTTGAAGCTtccagctatgtggttctactgcgccaa
gi|17 : G-ACAGTATGTAACA--A----C----TTGTTTAC-AA---ACTGTA-GGCA-CGCAAT-GGCGGAC-ACTAA----TGTAACCAA-CCAATTTTCTTTGTTG---------GCCAT--CAAGCTA-TGC-TTTGT-AACAAATTAT-TACATACCGTGCt
gi|17 : tactgtA-CA-GTTTGTAAA--CAAGTT-----GT------TA------C-AT-ACTGT-C-GATCC--ATCAGAT---GCAgatccatcagatgcaa
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gi|19 : CCCCAAGATACAGTCG-CG-ATGGGAC-TGAGTTGACTC-GTGCAAACTTATAAATTATACCTTAAAATAGAA-AAACATAA-----AAATGTGATGCTCTGGGCAATT-TAATAt
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blockSeqs : . . . . A C . C . . A . G T . AAC TA . G AC . . . . . T TA T C TG . . A G A . A . G . . . . . . . C . TT A TA G G . A . G C AAAT C G . . . T . G . . C A A G T . . . . . TC . . T . . . . . . . G C . T . . . . . CG . . C T . C . . . T G C . T . . . TG C T . TG C . T . . . . . A C . A A C . . ATA TG . . . . N . NNN N N NNNNNN N NNNNNNNNNNNNNN ACA . . C T . TA . T . . . T T . T . G . A . T . . . A . GGTCG . . . G . . . . . . AAC C TC . G A . . T T CTC GC T . . . . T G T G . . A . . G . T A A . . . . . G AAGC . G . . AGGTTTACATGA CC . ATACCGTTATAC T A A T . G . TAC ATATTGCTTAT . AGAGATTGACG . . . C . . . . . . . . . T . A . G T TTGTGCAACA G . . . . . . G . T . . . . . AA A AAA GTTAA . . . . . T . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . A T . T . . A . . . . G C . C T . . A A . . A . . . . . . . . . . . . C . G . . . . T . ATTT . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . CC . . T . . . . . . . A . . . . AA . . . . . A . T . . . . . . . . A . A . C . . . A . T . . . C . . . . . . AAC C GC . G A . . C . AC . . . G . A . . . . . G AAGC . G . . TGA TC . GTATAA T A C A . A . TAA TTTAAACAC . ATAAATTACTC . . . C . . . . . . . . . T . . . T . TATGTTAACG G . . . . . . G . T . . . . . AA G AAT GTTA . . . . . T . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . A . C . . . T . C . . . G . . . . . . GAC C G . A A . . . . T . . . . . . . G AGAT . G . . TGA CC . TATAT T A C T . A . TAC TTTAAACAC . AAAAGAATCTC . . . C . . . . . . . . . T . . . A . TACAGAACA G . . . . . . G . C . . . . . AA A AAT GTTA . . . . . T . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : T . C . . . A . T . . . G . . . . . . AAC . . . . G . . . . . . . AAGC . C . . TGA CC . TATAA T A C T . A . TAC ATATTTCA . AAAAAAACTCA . . . C . . . . . . . . . C . . . G . TATGTAACA G . . . . . . G . C . . . . . AA G AAT GTTA . . . . . T . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : G . T . . . A . T . . . C . . . . . . . . AGAT . G . . TGA T . TATAA T A C T . G . CA CCTTATCT . AAAATCACTCC . . . C . . . . . . . . . T . . . C . TATATAACA G . . . . . . A . A . . . . . AA G AAT GTTA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . A . T . . . C . . . . . . . AGG . C . . TGA C . TATAA . . C T . G . A CTATTT . AAATTACCC . . . T . . . . . . . . . T . . . G . TATGTAACA G . . . . . . A . C . . . . . AA A AAT CGTA . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . A . T . . . . . . G . . G TA . . . . . G . T T . TACTC . . . . . . . . . . . . . T . . . A . TATGTAACG G . . . . . . A . C . . . . . AG A AAT CGTA . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . T . . . TACT . . . . . . . . . . . . . T . . . G . TATGTAACG G . . . . . . A . C . . . . . AA A AA GTTA . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AT . . . . . . . . . . . . . T . . . G . TTTGGAGTG C . . . . . . A . C . . . . . A A . CTTA . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . A . TTTGTAACA C . . . . . . A . C . . . . . A . . GTA . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . G . TTATTGTA A . . . . . . G . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . G . TCATCA G . . . . . . A . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . G . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqCons : T* A* T* G*** AC TG** *** TA*** ** ***** TT TA G** C*** ANAT******* A********* ** CC******* ** A***** *** AAA ****** T****** ** ******** C********* **** T******** N** AAC*** A* T* TAC *** G*** **** AAGC****** CC C* G***** AATTTAAACAC**************** AAAATTACTC*************** ** *** TATGTAACG**************** G************ G****** GTTA******** T*
originalCons : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGAA-----GAATGTGATGCTCTAGGCAATT-TAATATT--CTACGACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTCGTTTGACGCTGAAAA---GT-TTTTGTCGTACGAG---CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTT--GAACTT---TTGA-ACTA---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--CCATTTGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTTC-TAGA-----AGATTCGATACAAATAAAGTG-A-T-TGTGGCANCG-GATCGCCC----GT-TTGCTAC---------AGGGGATTTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCGA--CT---GAAGTAAAACGATGAGA-----TC--CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-T-G----A-ATAAACCGTAA-TTTCCACAGTA---TTTGGAAA-TTGTA-TT-TGTT-GTAGC---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCAT--TGT-AG-GATCGANAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATAATNAAGT-TATT--TTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATGNTATAATTAATA-ACNACACAATG-TAACANCACTTCATGCGCCTGTTTCCAGCGGTCA-CG-----TTCGCCCG--ANNNGCGANCGCGGGNNNNNCGTGGGTCCGGACNNCCNNNNNNCGCGGCAACAAATAATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AA-TGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCNCTGATGGA-CCA----C-----GGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTT-AC-AA---ACCGTA-G-CA-CG-AAT-GGCG-AC-GCTA-----TGTAAC-AA-C-AATTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTAAGTAATT---GGGGGGGGGGGA-T-GGNTNTTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATA---AG--G-CAAG-AATAA---G---AC-A-AATAT---------T---------------------GA---------------AAACCATAC--ACC-------TA---------TAA--------ACTCACTAA-CAAACACAATTAT---TGAA-A--G---GC----ATC-T-ACAATAA-----T-A--TT--TTA-AA---ACTCCCC-CCCCCCCCCCAAA-----A--AA--ATTA---CT-C-AAA--A-G--GTGCAGTCCCCG-CA-CG-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA------C-AT-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAGC-ACGGT-TAT-G-T-AAC-----------GATTT-----------G-T-TACA-AAGCGT--AG-C----T--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TAT-G-TAA-CAAAAAAA----AT-TGTT-G-TTA-----ACA--TAGC--GTCGC--C-AT-TCGT-GCTACG-GT-T-----TGTA-ACAAATT--GTT-ACAT-A-CCG-TCTCGTTGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
finalCons : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCT-GTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGAA-----GAATGTGATGCTCTAGGCAATTT-AATATT--CTACGACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGATG---CTCGTTTGACGCTGAAAA---GT-TTTTGTCGTACGAG---CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTTG--AACTT---TTGA-ACTA---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--CCATTTGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTC---TAGAANAT-------GATACAAATAAAGTG-A-T-TGTGGCANCG-GATCGCCC----GT-TTGCTACA---------GGGGATTTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCGA--CT---GAAGTAAAACGATGAGACC-------CT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-T-GA-----ATAAACCGTAA-TTTCCACAGTA---TTTGGAAA-TTGTA-TT-TGTT-GTAGC---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCAT--TGT-AG-GATCGANAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATAATNAAGT-TATT--TTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATGNTATAATTAATA-ACNACACAATG-TAACANCACTTCATGCGCCTGTTTCCAGCGGTCA-CG-----TTCGCCCG--ANNNGCGANCGCGGGNNNNNCGTGGGTCCGGACNNCCNNNNNNCGCGGCAACAAATAATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-ACT------ATTATAGTT--AA-TGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCNCTGATGGA-CCAC---------GGTATG-TAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--AT--------TTGTT-AC-AA---ACCGTAN--CA-CG-AAT-GGCG-AC-GCTA-----TGTAACAAC---AATTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTAAGTAATT---GGGGGGGGGGGA-T-GGNTNTTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATAAAGC------AAG-AATAA---G---AC-A-AATAT---------T---------------------GA---------------AAACCATAC--ACC-------TA---------TAA--------ACTCACTAAC-AAACACAATTAT---TGAA-AG-----GC----ATC-T-ACAATAAATTTAAACAC----------------CCCC-CCCCCCCCCCAAAAAATTACTC---------------AAA--A-G--GTGCAGTCCCCG-CA-CG-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA------C-AT-ACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAGC-ACGGTATGTAACG----------------ATTTG------------T-TACA-AAGCGT--AG-C----T--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TAT-G-TAA-CAAAAAAA----AT-TGTTGTTA--------CA--TAGC--GTCGC--C-AT-TCGT-GCTACG-GT-T-----TGTA-ACAAATT--GTT-ACAT-A-CCG-TCTCGTTGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
Alignments
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lowQualScore : . . . . . . . ... . . . . .. ..... . .. .. ... .. . ...... .... . .. .......... . . ... . . ....... . . .... ... . . ..... . . . . . ..... . . .... . .. .. .. ... . ..... . .. .. . .. . ... . . .. ........ . ........ . . . . . . .. ...................... . . . . . . .. ... ....... . .. . . . . . . ...... .. . . . ... . . .. . . ......... . . . . . . .. . . .. . . . . . .. . ...... . ....... . .. . . ... ... . .. . . . .. ... . .... .. . .... .. . . . . ..... . .. ... . . ...... . .............. .. . . . . . . . ....... . . . ......... .. . .. .. ........ . . ... . . ... . . ...... .. . .... . . ............ . ... . ... . . . . ..... ... . . .. . .. .. . .. ... .... . . . ... . ... . . . . . ... . . . ... .... . . . . . .. .... ...... . .. . ........ . . ....... . . ................................................ ...... . ....... ......... ... . .. . . .... . ...... .... .... . ... ........................ ..................... ... .. . .. . .. . . ... ..... ...... . ...... ... .. .. ........ . . . .. .. . . ............ ........... . . . .. . .... .. ....... .. .... . .... . . . ........ . . ....... . .. . .. . .. . . . .. . . . ..... . . .. . . . . . ..... . . ..
lowQualScore : 5 0 0 0 8 0 8 000 8 2 0 0 88 00000 0 88 88 888 00 8 000000 0000 8 88 5555555555 5 2 555 0 2 5555555 6 0 0000 000 8 0 66666 8 4 6 8 0 00000 0 2 0000 0 00 00 66 888 0 00000 2 00 44 8 66 2 000 0 8 00 88888888 0 00000000 0 8 0 0 8 8 00 0000000000000000000000 0 3 7 7 7 7 22 777 7777777 7 22 7 7 7 7 7 3 000000 88 8 0 8 000 2 0 22 0 0 000000000 0 2 8 2 2 5 88 0 0 00 0 5 2 2 2 88 2 888888 5 0000000 0 00 0 0 888 555 2 88 0 0 2 22 222 8 2222 00 0 5555 00 2 8 8 0 00000 8 88 000 8 0 888888 8 55555555555555 22 8 0 0 8 8 0 8 8888888 8 6 0 222222222 00 0 88 88 00000000 8 8 000 8 8 000 0 4 000000 22 0 4444 0 4 111111111111 4 888 4 666 7 7 7 7 33333 333 7 3 33 7 88 88 8 66 666 2222 2 2 8 555 5 000 0 0 8 5 0 222 2 2 8 000 0000 7 0 2 7 4 99 1111 111111 7 11 3 11111111 6 0 5555555 0 0 999999999999999999999999999999999999999999999999 888888 3 5555555 000000000 333 9 11 5 7 0000 0 333333 5555 5555 6 000 000000000000000000000000 333333333333333333333 777 66 7 66 4 88 4 4 888 55555 888888 0 888888 666 88 55 22222222 0 0 2 22 11 2 2 333333333333 66666666666 4 7 2 22 4 0000 22 4444444 66 6666 5 3333 5 5 5 55555555 5 5 1111111 4 66 6 22 4 44 5 5 5 11 5 5 5 22222 5 0 44 9 1 2 3 8 00000 0 4 11
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Reference ( family-3068 ) : CCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACC-TGTGCAAATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGA-----AGAATGTGATGCTCTAGGCAATT-TAATATT--CTACGACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTCGTTTGACGCTGAAAA---GT-TTTTGTCGTACGAG---CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCGATGNAGTT--GAACTT---TTGA-ACTA---AAAACGCAGTCTCAATTT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--CCATTTGCTATCNATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTT---CT---AGAANA-----T--GATACAAATAAAGTG-ATTGTGGCANCGGAT-CGCCCGT----TTGCTAC---------AGGGGAT-TTTGGGTTTG-T-GCAGTA-GATCG-A--CT---GAAGTAAAACGATGAGA-----C-CCT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-TG----A-ATAAACCGTAA-TTTCCACAGTA---TTTGGAAA-TTGT-ATT-TG-TTGTAGC---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCA--TTGT-AG-GATCGANAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTC-ATAATNAAGT-TAT--TTTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAAACGTTAA-CACTATGNTATAATTAATA-ACNACACAATG-TAACANCACTTCATGCGCCTGTTTCCAGCGGTC-ACG-----TTCGCCCG--ANNNGCGANCGCGGGNNNNNCGTGGGTCCGGACNNCCNNNNNNCGCGGCAACAAATAATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AATGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCNCTGATGG-ACCA----C-GGTAT-GTAACAAC----GAG-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTTAC-AA---ACCGT-ANCA-CGAA-TGGCGAC-GCT-----ATGTAACAA-CAATTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCGAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACATACCGTGCGGGACAACCTTTTTAAGTAATT---GGGGGGGGGGGA-T-GGNTNTTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------C-CCCTA-GAAATAAA-----G-CAAG-AATAA---G---AC-A-AATAT---------T---------------------GA---------------AAA-----CCATACACC-------TA---------TA--AACTCACT-AACAAACACAATTAT---TGAA-A--G---GC----AT-CT-ACA---ATAA--A------T-TTAAAC--A-C-CCCCCCCCCCCCCCA-----AA--A--AA-TTA---CT-C-AA--AA-G--GTGCAGTCCCC-GCA-CG-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA-CA------TACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAG-C-ACGG-T-AT--G-T-AAC-----------GATTT-----------G-T-TACA-AAGCGT--AG-C----T--CG------AATG--GCGA-C--G-C----TA-TG-TAA-CAAAA-AAAAT-T-GTT-GT-------T-ACA--TAGC--GT-CGC--C-AT-T-CGT-G-CTACG-GT-T-----TGT-A-ACAAATT--GTT-ACAT-A-CCG-TCTCGTTGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
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gi|15 : at-------T-ACA--TAAC--GT-CGC--C-AT-T-CGT-G-CCACG-GT-T-----TGT-A-ACAAATT--GTC-ACAT-A-CCG-TCTCGTTGTTACATACCGTGTAG-TG-GT--CCATCAgtgtgataaaactgtttccgggaggcattacat
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gi|17 : tactgtA-CA-GTTTGTAAA--CAAGTT-----GT------TA-CA------TACTGT-C-GATCC--ATCAGAT---GCAgatccatcagatgcaa
gi|18 : tactgtgcacggtatgtaataatttgttacaaagcatagcttgatggccaacaaagaaaattggttggttacattagtgtccgccattgcgtgcctC-------TA---------TA--TACACACG-CAAAAATACAATT------GAATA--G---TCTCAAAT-C--A-A---ATAA--GAATT--T-TTAAATTGATC-CCCCCCCCCCCCCCA-----AAG-A--GA-TTG---AC-G-AA--GA-GCTGTGC--TTTCT-AC--------TGTAA---CAGTAT-----AT------TA-CA-----------T-T-G--CC--ATG---T---CCAG-C-Aa
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gi|2 : ttttcacatcgacacccccttgtagacctccatcCCCCTAGTTTCAGTTG-CG-TCGGGGG-TAAGTTGACCCTGTGCAGATT---AAACTGGGCCTTAAATT-GAA-AAA-AGA-----AGAATGTGATGCTCTAGGCAATT--AATATT--CTATAACTTCATGGTAAGCAATT------CACTCTGAT-G--CTTGTTTGACGCTGAAAATTTGT-TTTTGTCGTACGAGT--CGGT-AGTGAATTTT--TAT--CCAATGTAGTT--GAACTT---TTGA-AC-A---AAAACACAGTCTCAATCT-T--A--T-CTATGT----AA-A--TT--GCAAATAAAATGTATTT--A-CA-----CCG--TCATTTGCTATCAATGTCTTAGAAGGTGG--ATA-TAAAATGTCGCT--ATTTTTT-CT---AGAATA-----TTCGATACAAATAAAGTG-ATTGTGGCAGCGGAT-CGCCCGT----TTGCTTC---------AGGGGAT-TTTGGGTT-G-T-GCAGTA-GATCG-A--CT---GAAGTAAAACAATGAGA-----T-CCT-AT--TTTTGA-TG-GATA-TT-GG-AA-TG----A-ATAAACCGTAA-TTTTCACAGTA---TTTGGAAA-TTGT-ATT-TG-TTGTA-C---G---AA-TATATCGTTAAAATTTCTCA--TTGT-AG-GATCGAGAAATCGTGTTATTG--GATGTTTTT--G--AATGCGCAT----T--TTATCAATAATTTTTT-ATAATCAAGT-TAT--TTTG---ATATT--TAA-CTT-CATCTTTTAAAANNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAATGATCAATCTA-TTAG-TCGATCAGACTCACCGTAAT------TATAATGAAAATA-AC------TATTATAGTT--AATGATAAA-AT-AGT-AC--------ATGTTTTCCAAAAGATCATAATGAACATA---CATGTAT---ATGCCCTGATGA-ACCA----T-GGTAT-GTAACAAC----G-G-ACGGTATGTAACA--A----T----TTGTTAC-AA---ACCGT-ACCA-CGAA-TGGTGAC-GTT-----ATGTAAAAAACAATTTTCTTTGTTACATAGCGTCGCCAT-TCAAGCTA-CGC-TTTGT-GACAAATCGT-TACA-ACCGTGCGGGACAACTTTTTTAAGTATTT---GGGGGGGGGGGA-T-AATTATTTTAGATTCCT-TTTCAT--GTGTGTAAGTGAGTGTATA---CCGGTATGCG---TGTGATTTT-CAAGTTTGGATACT-TTCA--TGA----TTTT------T-CCCTA-GAAACAAA-----GATAAG-CATAA---G---AC-A-AATAT---------T---------------------GA---------------AAA------CATACACC-------TA---------TA--AACTCACTAAACAAACACAATTAT---TGAA-A--A---GC----ATAAT-ACA---ATAAC-AATGTATT-TTAAAC--A-CTCCCCCCCCCCCCCCG-----AAATA--AA-TTA---CT-C-AA--AA-G--GTAGAGTCCCC-GCA-CA-GTATGTAA---CAATTT-----GT------TA-CA------TACCGT-T-G--CC--ATC---T---GCAG-C-ACGGTT-GT--G-C-AAC-----------AATTT-----------G-T-TACA-AAGCGT--AG-C----T--CA------GATG--GCGA-C--G-C----TA-TG-TAA-CAAAA-GAAAT-T-GGT-GT-------TAACA--TAAC--GT-CGC--C-AT-T-CGT-G-GTACG-GT-T-----TGT-A-ACAAATT--GTT-ACA--------------TGTTACATACC-----G-TG-GT--CCATCA
gi|20 : TGTATTGATGG-ACCA----C-GGTAT-GT---AAC----GAA-ACGGTATGTAACATCA----TCTCGTTGTTAC-
gi|20 : tttcagcgATGTATTCCATGCATTGATGG-ACCA----C-G-----GTAACAAC----GAG-ATG--ATGTTACAT-ACCGTT----TCGTTAC-AT---ACCGT-cgtggtccatcaatgcatggaatacatcaagagtaatggaattttcattttcattaaatgttacataatgttg
gi|21 : tttcagcgtgtattgatggaccATGG-ACAA----C-GGTAT-GTAACAAC----AAG-ACGGTAAGTAACA--A----T----TTGTTAC-AA---ACCGT-AGCA-CGAA-TGGCGAC-ACT-----ATGTAACAA-CAATTATCTTTGTTACATATCGCCGCCAT-TTGAGCTA-CGC-TTTcaagagtaatggaattttcattttcattaaatgttacataatgttg
gi|22 : -ACGGTGTGTAACA--A----T----TTGTAAC-AA---AT-GT-ACCA-CGAA-TGGCGAC-GCT-----ATGTAACAA-CAATTTTCTTTGTTACATATCGTCGCCAT-TTGAGCTA-CGC-TTTGT-AACAAATTGT-TACATACCGTG
gi|23 : TGCACTGATGGAACCA----CAGGTATGGTAACTAA----GAG-AC-GTATGTACTA--AGG--TCG--TTGTTTT-AATCGACCGTAAGCGTCGAATTAGCGACTGCTAACACACGTAATGA-CAATTTT-TTTGTT
gi|24 : CCCCCCTCCCCA-----AA-----------------T-AA--AA-G--GCGCAGCCCCC-ACA-CG-GTATGTAA---CAATTC-----GT------AA-CA------CATCGT-T-G--CA--ATT---C---ACAA-A-AC-G-T-AT--A-T-AAC-----------AATTT-----------G-T-TACA-AAG
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