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Reference ( family-3063 ) : TATTCAATTGTTAGAC-----G----GTTCACA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTNA-ATA--GTGAA-CTGTAGT--TGAATAGTGGAACTGT-CGTCTTGGGG--TAAT-AT-AAGGTA---TAACTTTTG-AAGATATGTCA--TTA--TATTTTC-AGGGTA---GGCCCTT--T--GG-GGCAAGGG-C--CC-CT-CA----TG-TAT---AAATAT------GGTTATG-TTGAAC--C-TG--CTTGGTTCT---GGAC-TTCCGAGC---CCGACGACT-AT--TCGNCTGT-A-TAAC--AATA--A--TAT--A--------G---TGTATAAAGAT-GGGGC-TGGCG-C---A-------------------TA-TCGTGA---AC-CCA-T-TT------T----AGA--GA-----GANT------GA-A----ATT-TCC-AG--GGT----AGGG----------C---CTTTGGGGCA---AG-GG---GC-C-CT-C-AT--G--TA-----CAAA--TA---TGGTT-ATGTTTG--ACCN--G-CCT-GG-TTCT-------GGACTTC-CG---AGCCC-GACGACTA-TTCGN----------TGT-ATA------C-AATAATA-T-AGTGT-NTA-AA--GATG-GG---GCT--GG-----CGCA--TAC-----C-GTG---A-ACC--CCA---TTTTA---G-AGAG-AT---GA-----AATT-TCCA-G-G-T-A-GGC--C-TT-T--GGGGCAAG---GGGC--CCCCGNTGTA----T-AA-T----------ATGG-T-ATG---TT-NACCNGACCTGGTTCTG--GAC-T-CCGAG-CCC-GACGACTA--TTC-A-T--GT-AT-AC-A-TA-ATATAGTG-----TNT--AAAGAT-GGGGC-TG--CG--C---AT--ACC-GT----GA-AN-CCC-ATTTTAGA--G-----AG-AT-GA----------AA-TTTTC--------A---------GGGTAGG-----CCCT--TTGGGGCA-A--AGGGG--CCC-C--TC-ATG-T--AT---AA-AT--A------TGGTTAT-GTTGANT---G------C--TGG-TTTTGGACTTCCGAGCCCGACGA-TAA------T-TCG---CTGT-A-TACAATAAT--AT---AGTTG---GT-ATAAAGA-T--GGGCTGGCGCATGCCGTGAGCC
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Reference ( family-3063 ) : TATTCAATTGTTAGA-CGA---G---TTCACA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTGA-ATA--GTGAA-CTGTAGT--TGAATAGTTGAACTGT-CGTCTTGGGG--TAAT-AT-AAGGTA---TAACTTTTG-AAGA-TATGTCANTTATATTT--TC--AGGGTA---GGCCCTTT--G------G-GGCAA----GGG-CC-C-C--T-C-A----TG-TA----T---AA---------ATATGGTTATG---TT-GA--------AC--C-TGAC-------TTGGTTNT---GG--ACTT----------------CCGAG-C---CCG-ACGACTA------TTCGN--CTGTA-T--A-C--AATA--AT--AT--AG---TG-----TATAAAGA--T-GGGGCT-GGCG-C---AT-A-CC-G-T-GA---A----C-CCA-C-TT---T------AGAGAGA---A-T-GAA----A---TTTCC--------AG-GGT----AGGG----------CCTT--TGNGGCA---AG-GG---G--C-C-CT-C-A--TG--TA---C-----AAATA---T------GGTTA-TGT---TTG-ACCN--GACC-TGG-TTCT-------GGACTTC-CG---AGCCC-GACGACT-A-T-TCG----------NTGT-AT------A--C-AATAATA-T-A--------GTGT-NTA-AA--GATG-GG---GCTG--G-----CG-CA--TAC--------------------C-GTG---A-ANC--CCA---TTTTA---G-AGAG-AT---GA-----AATT-TCCAG--GGT-A-GG--CC--TT-T--GGGGCGAG---GGGC--CC--CCGATGTA----T-AA-TA----------TG--GTTATG---TT--ACCAGACCTGGTTCTGG--ACTTCCGAG-CCCG-ACGACTA--TTC-G-T--GT-ATACAAT-NATATAGTG-----TNT--AAAGATGGGGCTGG-CG-CAT--ACC-GT----GAANCCC-ATTTTAGAG-----AG-AT-GA----------AA-TTTTC--------A---------GGGTAGG-----CCCT--TTGGGGCA-AAGGGG--CCC-CTCATG-T--AT---AA-AT--A------TGGTTAT-GTTGANC---G------C--TGG-TTTTGGACTCCCGAGCCCGACGA-TAAT-TCG-CTGT-ATACAATAATAT---AGTTG---GT-ATAAAGA-TGGGCTGGCGCATCGTGAGCC
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Reference ( family-3063 ) : TATTCAATTGTTAGA-CGA---G---TTCACA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTGA-ATA--GTGAA-CTGTAGT--TGAATAGTTGAACTGT-CGTCTTGGGG--TAA-TA-TAAGGTA---TAACTTTTG-AAGA-TATGTCAATTATATT--TTC-AGGGTA---GGCCCTTT--G------GGGCAA-GGGCC-C-CT-C-A----TGTA----T---AA---------ATATGGTTATG---TTGA--------AC--C-TGAC-------TTGGTTNT---GG--AC-TT----------------CCGAG-C---CCG-ACGACNA------TTCGN--CTGTA-T--AC--AATA--AT--AT--GG---TG-----TATAAAGA--T-GGGGC-TGGCG-C---AT-A-CCG-T-GA---A----C-CCA-C-TT------TAGAGAGA---A-T-GAA----A---TTTCC--------AG-GGT----AGG----------NCCTT--TGNGGCA---AG-GG---G--C-C-CT-C-A--T-G--TA---C-----AAATA---T------GGTT-ATGT---TT-A--C-CN-GACC-TGG-TTCT-------GGACTTC-CG---AGCCC-GACGACT-A--T-TC-G----------NTGT-AT------A--C-AATA--ATA-T-A--------GTGT-ATA-AA--GATG-GG---GCT--GG-----CG-CA--TAC--------------------C-GTG---A-ANC--CCA---TTTTA---G-AGAG-AT---GA-----AATT-TCCAG--GGT-A-GG--C--C-TT-T--GGGGCAAG---GGGC--CC--CCGATGTA----T-AA-T----------ATG--GTTATG---TT--ACCAGACCTGGTTCTG--GACTTCCGAG-CCC-GACGACTA--TTC-G-T--GT-ATACAAT-CATATAGTG-----TNT--AAAGAT-GGGGCTGG-CG-C---AT--ACC-GT----GA-AN-CCC-ATTTTAGA--G-----AG-AT-GA----------AA-TTTTC--------A---------GGGTAGG-----CCCT--TTGGGGCA-A--AGGGG--CCC-C--TCG-TG-T--AT---AA-AT--A------TGGTTAT-GTTGANC---G------C--TGG-TTTTGGACTCCCGAGCCCGACGACTGATGTNGCCTGTAATACAATAATATATCAGTNGGGCGTAATAAAGATTGGGCTGGCGCATCGTGAGCC
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gi|1 : gtattcaattgttagatcgagagattcacagtcagcctacagtttgaaagtaagatagtgaatctgtagttgaatagttgaactgtcgtcttggggcttaattattaaggtatactttttgaaatatatcaatttacttattctagggtaatgggcccattgccggcaaggggcccctcatgtataaatatggttatgttgactactgctaggttattgagaactttccgagcacaccgacgactattcgctgtaaacgaaataggatattcgatgtataaagttggggcttggcgcatacccgtgtacaccactttcttcatagaagagttatgaagaatttttcaggtaggggcacccaccccttttgggggaagtgaaagctcctcatgcttataatatggttaatgttgagctgcctggtttttggacttccgagcccgacgactattcgctgtcataagcaataatatagcgtatatgaccgatgggtgagctgaggtgcataccagtgaacccactttagcagagtatgagaactaatttcagggaaggccgcttgtggagtgagcaagggcaacctcgatatacttgtaatagcagcagaaatggtatgacattgaaccatgcgtggttcaggcgactcccgagacccggacgactaatttcgctagtaataacatacatatgacggtcgctataaaaaaagagggctggggacatcaccggtagaaaaaccccacttagagagtgtagaaactttcttcaatatagagaaggcccttcttggggcaagggctcccctcatgtattacgaacattacattggttatggttaatcgctgaccctggttttggacttccgagcccgacgactgatgtagctgtaataaataatatatcaatagggcgtataaagattgggctggtgtcaacttctttaaaaaagcgggcaacgtgaaccccctttagagagttccgagcaataattgtctaggTG-----TA---AAAGATTGGGGCTGG-CG-CCGAGT--ACCCGT----GACATACCC-ACTTTAAAAGG-----AG-TT-TA----------AA-TTTTCCA------A---------GGGCAGG-----CCGA--TTGGGGCA-AACAGGGG--CCG-CAATCGACC-T--AT---AG-AA--A------CAGTGAT-GCTgcaatcgacctatagaaacagtgatgctagaagagt
gi|10 : gtattcaattgttagatcgagagattcacagtcagcctacagtttgaaagtaagatagtgaatctgtagttgaatagttgaactgtcgtcttggggcttaattattaaggtatactttttgaaatatatcaatttacttattctagggtaatgggcccattgccggcaaggggcccctcatgtataaatatggttatgttgactactgctaggttattgagaactttccgagcacaccgacgactattcgctgtaaacgaaataggatattcgatgtataaagttggggcttggcgcatacccgtgtacaccactttcttcatagaagagttatgaagaatttttcaggtaggggcacccaccccttttgggggaagtgaaagctcctcatgcttataatatggttaatgttgagctgcctggtttttggacttccgagcccgacgactattcgctgtcataagcaataatatagcgtatatgaccgatgggtgagctgaggtgcataccagtgaacccactttagcagagtatgagaactaatttcagggaaggccgcttgtggagtgagcaagggcaacctcgatatacttgtaatagcagcagaaatggtatgacattgaaccatgcgtggttcaggcgactcccgagacccggacgactaatttcgctagtaataacatacatatgacggtcgctataaaaaaagagggctggggacatcaccggtagaaaaaccccacttagagagtgtagaaactttcttcaatatagagaaggcccttcttggggcaagggctcccctcatgtattacgaacattacattggttatggttaatcgctgaccctggttttggacttccgagcccgacgactgatgtagctgtaataaataatatatcaatagggcgtataaagattgggctggtgtcaacttctttaaaaaagcgggcaacgtgaaccccctttagagagttccgagcaataattgtctaggagggagggccctcttgggggcaaggggccctacaaaggtatatttgaagtttgttatattgataatgagtaactgacgcggaatttagtgttggtacctatacacacgagagagactgagtgggacgacaacacaatttcggtcctataatacaacaatgaatcagctc----A---TTTCT---------G-AGT----ATA----------TCCTT--TGCGGCA---AA-GT---G--T-C-CT-TTA--T-G--TA---C-----AAATA---T------AGTT-AT-T---TT-A--C-CA-GACT-TGG-TTCT-------GAACTTC-CG---AGCCC-GACAAAA-A--T-TC-G----------AAGT-AT------G--C-AATA--CTA-T-A--------GTGT-TTA-AA--GATG-CG---GCT--Gagaagagt
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gi|7 : ---AT-A-CCG-T-GA---G----C-CCATC-TTTAC---TAAAGAGA---A-T-GAACATTG---TTTCTG-------AG-GGTTTACGCG----------CCCTT--CGTGGGA---AGTGG---G--C-CTCT-C-ACTC-G--TAAT-CACCAAAAATACACT------GGTT-ATGC---TT-ACCC-CT-GCCT-TAG-TTTTACACTGGGGACTTT-CGGATAGCCC-TACGACT-AC-T-TC-GCAATCGTACAATGT-ATATTTAGA--C-AATA--ATA-TAA--------GTGTAATA-AA--GATGAGG---GCT--GGAAGCTTG-CAATTACCTTCA---------------C-GTA---ATAGCAACCATGCTTTTAATTG-AGAG-ATGACGA-----AATTATTCAG--GGT-A-GG--T--T-CT-T--TGGGCGAG---GGTC--C
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Reference ( family-3063 ) : TATTCAATTGTTAGA-CGA---G---TTCACA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTGA-ATA--GTGAA-CTGTAGT--TGAATAGTTGAACTGT-CGTCTTGGGG--TAAT-AT-AAGGTA---TAACTTTTG-AAGA-TATGTCAATTATATTT--TC-AGGGTA---GGCCCTTT--G------G-GGCAAGGG-CC-C-CT-C-A----TGTA----T---AA---------ATATGGTTATG---TTGA--------AC--C-TGAC-------TTGGTTNT---GG--ACTT----------------CCGAG-C---CCG-ACGACNA------TTCGN--CTGTA-T--AC--AATA--AT--AT--GG---TG-----TATAAAGA--T-GGGGCT-GGCG-C---AT-A-CC-G-T-GA---A----C-CCA-C-TT---T------AGAGAGA---A-T-GAA----A---TTTCC--------AG-GGT----AGG----------CCCTT--TGNGGCA---AG-GG---G--C-C-CT-C-A--T-G--TA---C-----AAATA---T------GGTTA-TGT---TT-A--C-CN-GACC-TGGTTCT-------GGACTTC-CG---AGCCC-GACGACT-A--T-TC-G----------NTGT-AT------A--C-AATA--ATA-T-A--------GTGT-ATA-AA--GATG-GG---GCTG--G-----CG-CA--TAC--------------------C-GTG---A-ANC--CCA---TTTTA---G-AGAG-AT---GA-----AATT-TCCAG--GGT-A-GG--CC--TT-T--GGGGCAAG---GGGC--CC--CCGATGTA----T-AA-TA----------TG--GTTATG---TT--ACCAGACCTGGTTCTGG--ACTTCCGAG-CCCG-ACGACTA--TTC-G-T--GTA-TACAAT-CATATAGTG-----TNTAAAGA--T-GGGGCTGG-CG-C---AT--ACC-G-TG----A-AN-CCC-ATTTTAGA--G-----AG-AT-GA----------AA-TTTTC--------A---------GGGTAGG-----CCCT-T--TGGGGCA-A--AGGGG--CCC-C--TCG-TG-T--AT---AA-AT--A-T------GGTTATG-TTGANC---GC--TG------G-TTTTGGACTCCCGAGCCCGACGACTGATGTNGCCTGTAATACAATAATATATCAGTNGGGCGTAATAAAGATTGGGCTGGCGCATCGTGAGCC
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gi|1 : gtattcaattgttagatcgagagattcacagtcagcctacagtttgaaagtaagatagtgaatctgtagttgaatagttgaactgtcgtcttggggcttaattattaaggtatactttttgaaatatatcaatttacttattctagggtaatgggcccattgccggcaaggggcccctcatgtataaatatggttatgttgactactgctaggttattgagaactttccgagcacaccgacgactattcgctgtaaacgaaataggatattcgatgtataaagttggggcttggcgcatacccgtgtacaccactttcttcatagaagagttatgaagaatttttcaggtaggggcacccaccccttttgggggaagtgaaagctcctcatgcttataatatggttaatgttgagctgcctggtttttggacttccgagcccgacgactattcgctgtcataagcaataatatagcgtatatgaccgatgggtgagctgaggtgcataccagtgaaccc-AGGGAG---GGCCCTCTTGG------G-GGCAAGGG-GC-C-CTAC-AAAGGTATA----TTTGAA---------GT-TTGTTATA---TTGATAATGAGTAA--C-TGACGCGGAATTTAGTGTT---GGT-ACCTATACACACGAGAGAGACTGAG-T---GGG-ACGACAACACAATTTCGGTCCTATAAT--AC--AACA--ATGAATC-AGCTCTG-----TA-AAAGA--TTGGGGCT-GGCG-CCGAGT-ACCC-G-T-GACATA----C-CCA-C-TT---T------AAAAGGA---GTT-TAA----A---TTTTCCA------AG-GGC----AGG----------CCGAT--TGGGGCAAACAG-GG---G--C-C-tattgataatgagtaactgacgcggaatttagtgttggtacctatacacacgagagagactgagtgggacgacaacacaatttcggtcctataatacaacaatgaatcagctctgtaaaagattggggctggcgccgagtacccgtgacatacccactttaaaaggagtttaaattttccaagggcaggccgattggggcaaacaggggccgcaatcgacctatagaaacagtgatgctagaagagt
gi|1 : gtattcaattgttagatcgagagattcacagtcagcctacagtttgaaagtaagatagtgaatctgtagttgaatagttgaactgtcgtcttggggcttaattattaaggtatactttttgaaatatatcaatttacttattctagggtaatgggcccattgccggcaaggggcccctcatgtataaatatggttatgttgactactgctaggttattgagaactttccgagcacaccgacgactattcgctgtaaacgaaataggatattcgatgtataaagttggggcttggcgcatacccgtgtacaccactttcttcatagaagagttatgaagaatttttcaggtaggggcacccaccccttttgggggaagtgaaagctcctcatgcttataatatggttaatgttgagctgcctggtttttggacttccgagcccgacgactattcgctgtcataagcaataatatagcgtatatgaccgatgggtgagctgaggtgcataccagtgaacccactttagcagagtatgagaactaatttcagggaaggccgcttgtggagtgagcaagggcaacctcgatatacttgtaatagcagcagaaatggtatgacattgaaccatgcgtggttcaggcgactcccgagacccggacgactaatttcgctagtaataacatacatatgacggtcgctataaaaaaagagggctggggacatcaccggtagaaaaaccccacttagagagtgtagaaactttcttcaatatagagaaggcccttcttggggcaagggctcccctcatgtattacgaacattacattggttatggttaatcgctgaccctggttttggacttccgagcccgacgactgatgtagctgtaataaataatatatcaatagggcgtataaagattgggctggtgtcaacttctttaaaaaagcgggcaacgtgaaccccctttagagagttccgagcaataattgtctaggTG-----TA-AAAGA--TTGGGGCTGG-CG-CCGAGT--ACCCG-TG----ACATACCC-ACTTTAAAAGG-----AG-TT-TA----------AA-TTTTCCA------A---------GGGCAGG-----CCGA-T--TGGGGCA-AACAGGGG--CCG-CAATCGACC-T--AT---AG-AA--A-C------AGTGATG-CTgcaatcgacctatagaaacagtgatgctagaagagt
gi|10 : gtattcaattgttagatcgagagattcacagtcagcctacagtttgaaagtaagatagtgaatctgtagttgaatagttgaactgtcgtcttggggcttaattattaaggtatactttttgaaatatatcaatttacttattctagggtaatgggcccattgccggcaaggggcccctcatgtataaatatggttatgttgactactgctaggttattgagaactttccgagcacaccgacgactattcgctgtaaacgaaataggatattcgatgtataaagttggggcttggcgcatacccgtgtacaccactttcttcatagaagagttatgaagaatttttcaggtaggggcacccaccccttttgggggaagtgaaagctcctcatgcttataatatggttaatgttgagctgcctggtttttggacttccgagcccgacgactattcgctgtcataagcaataatatagcgtatatgaccgatgggtgagctgaggtgcataccagtgaacccactttagcagagtatgagaactaatttcagggaaggccgcttgtggagtgagcaagggcaacctcgatatacttgtaatagcagcagaaatggtatgacattgaaccatgcgtggttcaggcgactcccgagacccggacgactaatttcgctagtaataacatacatatgacggtcgctataaaaaaagagggctggggacatcaccggtagaaaaaccccacttagagagtgtagaaactttcttcaatatagagaaggcccttcttggggcaagggctcccctcatgtattacgaacattacattggttatggttaatcgctgaccctggttttggacttccgagcccgacgactgatgtagctgtaataaataatatatcaatagggcgtataaagattgggctggtgtcaacttctttaaaaaagcgggcaacgtgaaccccctttagagagttccgagcaataattgtctaggagggagggccctcttgggggcaaggggccctacaaaggtatatttgaagtttgttatattgataatgagtaactgacgcggaatttagtgttggtacctatacacacgagagagactgagtgggacgacaacacaatttcggtcctataatacaacaatgaatcagctc----A---TTTCT---------G-AGT----ATA----------TCCTT--TGCGGCA---AA-GT---G--T-C-CT-TTA--T-G--TA---C-----AAATA---T------AGTTA-T-T---TT-A--C-CA-GACT-TGGTTCT-------GAACTTC-CG---AGCCC-GACAAAA-A--T-TC-G----------AAGT-AT------G--C-AATA--CTA-T-A--------GTGT-TTA-AA--GATG-CG---GCTG--agaagagt
gi|11 : ttatcccttattttatat-----AAATA---T------GGGTA-TATATGTT-A--C-CCTGGCT-TGGTTCT-------GGACTTTTCG---AGCCC-GAC-ACT-A--T-TC-G----------CTCT-A-------A--CTAATA--ATAGT-A--------GGTT-ATA-AA--GATG-TG---GCTG--G-----TG-CA--TGC--------------------C-GTGTTGA-AAC--CCA---TTTTA---G-AGAG-AT---GA-----AATT-TTCAA--Gc
gi|12 : aatgTATTCAATTGTT-GA-CGAACAG---TTCACACGTT----CATCCAGTTC-A-TATTGA-ATACGATGAA-CTG-AGTACTGA-TAGGTGAACTGTGCGTCTTGGGG--TAAT-CC-TAGAGG---TAACTTTTGTAAGA-TATt
gi|13 : gG---G--C-C-CT-C-A--TGG--TA---T------AATA---T------GGTAT-TGT---TG-A--C-CT-GGCC-T-GTTTT-------GGACTTC-CG---A-CCC-GACGACT-ATGT-TCAG----------CTGT-AT------AT-C-AATAATATA-T-A--------GTAG-ACA-GA--GATG-tatca
gi|14 : cacactgt-AT-CCC-ATTTTAGA--G-----AG-AT-GA----------AA-ATTAC--------A---------AGGTAGG-----CCCT-T--TTGGGT--A--AGGTA--CCC-C--TCG-TG-T--AC---AA-AT--
gi|15 : ttgaaaattctcgtgatattaggttCA-A--AGGGGACCCC-C--TCA-TG-TTAAT---AA-AT--AGT------GGTTAT--TTGACCTGGGCCATG------G-TTTTGAACTCCCGAGCCCc
gi|16 : --ACC-G-TG----A-AA-CCC-ATCTCAAA--A-----AA-AT-GA----------CA-TTTTC--------A---------GGGTAGG-----CCCT-T--TG
gi|17 : TATTCAATTGTTAGA-CG-----------ACA-GTT----CA--
gi|2 : ggTATTCAATTGTTGGA-C-A---G---TTC-CA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTGA-ATA--GTGAA-CTGTAGTC-TGAATAGTGAAACTGT-CGTCT-GGGG--TAAT-AT-AAGGTA---TAACTTTTG-AAGA-TATAT--ATTATATTT--TC-AGGGTA---GGCC--TT--G------G-GGCA-GGG-CC-C-CT-C-A----TGTA----T---CA---------ATATGGTTATG---TTGA--------AC--C-TG----------TGGTTTT---GG--ACTT----------------CCGAG-C---CCG-ACGACTA------TTCGC--CTGTA-TTAGC--AA-A--AT--AT--AG---TG-----TATAAAGA--T-GGGGCT-GGCG-C---CT-A-C--G-T-AA---G----C-CCC-CGTT---T------AGAGAGT---T-T-GAA----A---TTTTC--------AGTGGT----AGG----------C--TT--TGGGGCA---AG-AG---G--T-C-CT-T-A--T-G--TA---T-----AAATA----------GGTT--TGT---TTGA--C-CT-G-CC-TGGTTTTT------GGACTTC--G---AGCCC-GACGACT-A--T-TC-G----------CTGT-AT------A--C-AATA--ATA-T-A--------GTGT-ATA-AA--G-TG-GG---GCTG--G-----CG--A--TAC--------------------C-GTG---A-GCC--CCA---TTT-A---G-AGAG-TT---GA-----AATT-TTCAG--G-T-A-GG--CC--TT-T--GGGGCAAG---GGGT--CC--CCATTGTA----T-AA-TA----------TG--GT-A-G---TTG-ACCTG-CCTGGTTTTGG--ACT-CCGAG-CCCG-ACGACTC--TTC-A-T--GTA-TACA-T-AATAT-GTG-----TATAAAGA--T-GGGGCTG--CG-----AT--ACC-G-TG----A-AG-CCC-ACTTTAGA--G------G-TT-GA----------AACTTTTC--------A---------AGGTAGG-----CCCT-T--TGGGGCA-A--AGGGG--CCC-C--TCA-TG-T---T---AA-AT--A-T------GGTTATG-TTGAAT---GC--TG------GTTTTTGGACT--CGAGCCCGACGA-TAAT-TCGCCTGT--TACAATAATAT---AGTTG---GTAATAAAGA-TGGGTTGGCGCATCGTGAGCC
gi|3 : ATTT--CCTAGGGTA---GGGCGTTT--A------G-GACAAGGG-CC-CTCT-G-A----TGTA----C---AA---------ATATGGTTATG---T--A--------AT--C-AGAT-------CTTGTTCT---GG--ACTT----------------CCAAG-T---CCG-ACCAAAA------TTTGA---TGTA-T--AC--AATT--AT--AT--AG---TG-----TTTAAAGA--T-TGGGCT-GGTG-C---AT-A-TC-G-T-GA---A----T-CCAAT-TT---T------AGAGA-A---A-T-GAA----A---TTTCT--------AG-GGT----AGG----------GCCAT--TTCGGCA---AG-CG---A--T-CTCT-G-A--T-G--TA---C-----ACATA---T------GATTA-TGT---T--A--C-CT-GACC-TA-TTTT-------GGACTTA-CG---AGCCT-GACGACA-A--T-TC-G----------ATGT-AT------A--C-CATT--ATA-T-A--------GTGT-TTA-AA--GATG-CG---GCTG--G-----TG-CA--TAT--------------------C-TTG---G-ATC--CCA---TTTTA---T-AGAG-AT---GC-----AATT-CCTAG--GGTAA-AG--CT--TT-T--GGGACAAG---GAGA--CT--CTGATGTA----TAAA-TA----------TG--GTTATG---AT--ATCAGACCTGGTTCTGG--ACTTCTGAG-CCCG-GTGTCTA--TTC-GAT--GTA-TACAAT-TATTTAGTG-----TTTA
gi|4 : ccactttcgtaagatga--C-C-CT-C-G--T-G--TA---T-----AAATA---T------GGTTG-TGT---T--A--C-TA-GATT-TGGTTCT-------GGGCTTC-CC---AGACC-GACGACT-A--T-TC-A----------ATGT-AT------A--C-AATA--ATA-G-A--------GTGT-ATA-AA--GATG-GG---A-TG--G-----CG-CG--TAC--------------------C-GTG---A-AGC--CCA---TTTTA---G-AGAA-AT---GA-----AATT-TTCAG--GGT-A-GG--CCC-TT-T--GGGGCAAG---GGGC--CC--CTCATGTA----T-AAATA----------GG--GTTATT---TT--ACCAGACTTGGTTCTTG--ACATCCGAG-CCCG-ACGACTA--TTC-GCT--GTA-TACAAT-TACAGAGTG-----TATAAAGA--T-GGGGCTGG-CG-C---AT--ACC-G-TG----A-AG-CCC-ATTTTAGA--G-----AG-AT-GC----------AA-TTTTC--------A---------GAGTAGG-----CCCT-T--TGGGGC--A--AGGGG--CTC-C--TCA-GG-T--AT---AA-AT--A-T------GGTTATG-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat
gi|5 : gc----C-CCA-T-TT---T------AGAGA-A---A-T-GAA----G---TTCCT--------AG-GGT----GAG----------ACCTT--TGTGGCA---AG-GG---G--C-CTCT-G-A--T-G--TA---A-----AAATA---T------GGAAA-TGT---T--A--C-CA-GACT-TGGTTCT-------GGACTTC-CG---AGCCC-GACGACA-A--T-TC-A----------ATGT-AT------A--C-AATC--ATA-T-A--------GTGT-TTA-AA--GATG-GG---GCTT--G-----AG-CA--TAT--------------------C-GTG---A-ACC--CTA---TTTTA---G-AGAG-AT---GC-----AATT-TCTAG--AGT-AGGG--CC--AA-T--GGGGCAAG---GGCC--CT--CTGATGTA----CAAA-TA----------TG--GTTATG---TT--ATCAGACCTTGTTCTGG--ACTTCCGAG-ACCG-ACGACAA--TTCAA-T--GTA-TACAAT-CATATAGTG-----TTTAAAGA--T-GGGGCTTG-AG-C---AT--ATC-G-TG----A-AC-CCT-ATTTTAGA--G-----AG-AT-GC----------AA-TTTCT--------A---------GAGTAGG-----GCCA-A--TGGGGCA-A----GGG--CCCTC--TGA-TG-T--AC---AA-cataggccctttaagtaagaccgtctggatgatgcatcaaatatcattcta
gi|6 : atAT-AT-AAAGTACAATAAC----A-AAGA-CATGTCAGTTATATTT--CC--GGGTA---GCCTCTTG--G------G-GATTGATG-TC-C-CT-T-A----TATA----C---AA---------ATATGGCTATA---TT----------AC--C-ACAC-------TTGATAAT---GG--ACTT----------------CCGAG-C---CCG-ATGAAAA------TT-AT--TTGCA-T--TC--AATA--GT--AT--GA---TA-----TAT---------GGGGCT-AG-G-C---AT-A-TT-G-T-GA---T----C-CCA-T-TT---C------AAATT-----A-T-GAT----A---TTTCC--------AG-GGT----AG--------------------AG--A---AG-GT---G--C-C-CCAT-A--T-G--TA---C-----AAATA---T------GGTTA-TGT---T--A--C-CA-GACC-TGGTTCT-------GGACTTC-TG---AGCCCTGATGAA--A--T-TA-A----------TTGG-AT------T--T-GATA--GTA-T-G--------ATTT--TA-AA--GATG-GG---CCTG--T-----GG-CT--TAT--------------------C-GTG---A-ATC--CCA---TTTGT---C-AGAG-AT---GA-----AATT-TCCAG--GGT-A-GG--CA--AT-TAGGGGGTAAG---GTGC--CC--CT-ATTTA----T-AAGTA----------TG--
gi|7 : ---AT-A-CC-G-T-GA---G----C-CCATC-TTTACT------AAAGAGA---A-T-GAACATTG---TTTCTG-------AG-GGTTTACGCG----------CCCTT--CGTGGGA---AGTGG---G--C-CTCT-C-ACTC-G--TAAT-CACCAAAAATACACT------GGTTA-TGC---TT-ACCC-CT-GCCT-TAGTTTTACACTGGGGACTTT-CGGATAGCCC-TACGACT-AC-T-TC-GCAATCGTACAATGT-ATATTTAGA--C-AATA--ATA-TAA--------GTGTAATA-AA--GATGAGG---GCTG--GAAGCTTG-CAATTACCTTCA---------------C-GTA---ATAGCAACCATGCTTTTAATTG-AGAG-ATGACGA-----AATTATTCAG--GGT-A-GG--TT--CT-T--TGGGCGAG---GGTC--C
gi|8 : aTAT-GTG-----TTGAAAGA--T-GGGGCTGGTTG-C---ATTCACC-G-TG----A-AG-CCCTATTTCAGA--GGTGGAAG-GT-GGTAAATGTGATAA-TTTTC--------AAATATTAAGAGGTAAGGATATTCCTAT--TGGGACATG--AGGGA--CCT-C--CAG-TGAT--AT---AAGATAGA-T------GGTTATG-Tttcctca
gi|9 : TATTCAATTGTTAGA-CGACA-G---TTCACA-GTT----CA--CAGTTC-ACTATTGA-ATA--GTGAA-CTGT------------------TGT-C----TGGGG--TAAT-AT-AAGGTA---TAA-TTTTG-AAGA-TATGTCATTTATATTT--TC-AAGGTA---GGCCCTTT--G-------------GGG-CC-C-CT-C-A----TGTA----T---AA---------ATATGGTTATG---gtata
blockSeqs : A . AACAG C . TC AC . CG . TA AC A GTG G G T . . . CAA C T G G AT CCT . GC GTGGAGTG A . A T CG AAGG CTTGTAATAGCAGCAG ACA G TAATGAGTAACTGACGCGGAATTTAGTGTTGGTACCTATACACACGAGAGAGA AC G T CACAAT C GTCC TTAGC T C GA GACGGTCGC AAG . G A CGA C C . G A AAAAC . CG TACT G GAGT A CATTG TTCAATAT T TTAC C CT G AAC T . TC . T TT CT G . ATCACCAA TTACATT . ATG TAAT G CT A C ACACTGG T GAT T TG TG G A CAATCGTACAA A ATTTAGA T AT G A TCAATAGG AA . . A . . AAGCTT T AT TTCTTTAAAAAAGCGGGCAA . TTG T C AA TGC ATT . . CCGAGCAAT G GA A G GC TCTTG . . TACAA TAAATA AA T . G A . T . . . GAT . A A . AT TT TT CCGA TC C . . C TA T AG GTGGA T . TAAATGTGAT C AAATATTAAG GATAT A . AT AC AC T AA A A TA . G AG GT . C TGGGCCATGG C . . C C . C . T . A .
blockSeqs : G . ACAG . . . A . . . A C . TGA . G T . . . . C . . C AT TC . CT TGGG A . . . AC . TTTGAA . G ACCATGCGTGGTTCAGGCGACTC T . A AT C CT ATAA C . . CAGCTCTG TT . C . . . . . . . CATA . AT T A GTG . A CA . . C . G . . . . . T AT . . . TTAC CACT . . TACC . T A . T . . . A C . . C . AT . . . . . A . . . . . T . . CTTCA . . . A . . . . . GACGA A . . . . ATTAG . . CCA TAAATA . T . . A . T . . . GCT . T A . TT T C C . . . . . T . . . A . . . CAA . . . A . . . . . . . . . . C . A GCTGGT .
blockSeqs : A . AG . . . A . . . T . . . . . . . . . . C . . C AT CC . GT GG A . . . C . TCA . G ATCAGATCTTGTTCTGGACTT C . T . C CC ATAC T . . AGTG T . C . . . . . . . G . TC T G GTT . A G . . T . C . . . . . T C . . . C T . . TGA . A G . . . . . T . . . A . A . . . . . T . . . . . T . . . . . . C . . . . . GA . . . . . CTTT . . CTG CAAATA . T . . A . T . . . AAT . T A . AT T C C . . . . . A . . . A . . . A . . . A . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . A TC . CT AG G . . . G . CAA . . ACCACACTTGATAATGGACTT T . A . T TT TAC T . . AGTG T . T . . . . . . . A . C T G GAA . A . . . C . G . . . . . . C . . . T T . . TA . T G . . . . . T . . . C . G . . . . . A . . . . . C . . . . . . T . . . . . GA . . . . . TTT . . CTC TAAGTA . T . . . . . . . . AT . C . . TT T C C . . . . . G . . . T . . . A . . . A . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . C . CT GG . . . . T . CAA . . ACCTGTGGTTTTGGACTT C . A . . A TTC . . . GATA . . . . . . . . . . T . C T G AA . A . . . G . C . . . . . . T . . . T T . . TA . T A . . . . . T . . . C . A . . . . . A . . . . . T . . . . . . G . . . . . GC . . . . . TTT . . CTG TAATA . . . . . . TG T A . . . . . . G . . . A . . . A . . . A . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . G . . . . C . TAA . . . . . . . G . T C T AA . A . . . A . T . . . . . . G . . . C T . . GA . T A . . . . . A . . . C . A . . . . . A . . . . . C . . . . . . C . . . . . GA . . . . . AAT . . CT TATT . . A . . . . . C . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . G A . G . . . C . A . . . . . . C . . . T T . . A . A A . . . . . T . . . A . A . . . . . T . . . . . A . . . . . . T . . . . . GC . . . . . CTT . . . G . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . T . . . . . . G . . . A T . . A . A A . . . . . A . . . A . A . . . . . A . . . . . G . . . . . . G . . . . . GA . .
blockSeqs : . . . . C . . . C T . . A . A C . . . . . T . . . A . A . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . T . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . .
blockSeqCons : AG****** **** AT TC*** *** GG********* C**** CT** TTAC**** ** AGTG********** T********* GAA**** A******* C********** *** ** TA*** ******* A******** ** *** ** GA******** TTT***** *** ** TAAATA*************** *** ** ** ** GAT*** T* ***** T*** C**** ** **** A* A***************** ** *** T*******
originalCons : TATTCAATTGTTAGA-CGA---G---TTCACA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTGA-ATA--GTGAA-CTGTAGT--TGAATAGTTGAACTGT-CGTCTTGGGG--TAAT-AT-AAGGTA---TAACTTTTG-AAGA-TATGTCAATTATATTT--TC-AGGGTA---GGCCCTTT--G------G-GGCAAGGG-CC-C-CT-C-A----TGTA----T---AA---------ATATGGTTATG---TTGA--------AC--C-TGAC-------TTGGTTNT---GG--ACTT----------------CCGAG-C---CCG-ACGACNA------TTCGN--CTGTA-T--AC--AATA--AT--AT--GG---TG-----TATAAAGA--T-GGGGCT-GGCG-C---AT-A-CC-G-T-GA---A----C-CCA-C-TT---T------AGAGAGA---A-T-GAA----A---TTTCC--------AG-GGT----AGG----------CCCTT--TGNGGCA---AG-GG---G--C-C-CT-C-A--T-G--TA---C-----AAATA---T------GGTTA-TGT---TT-A--C-CN-GACC-TGGTTCT-------GGACTTC-CG---AGCCC-GACGACT-A--T-TC-G----------NTGT-AT------A--C-AATA--ATA-T-A--------GTGT-ATA-AA--GATG-GG---GCTG--G-----CG-CA--TAC--------------------C-GTG---A-ANC--CCA---TTTTA---G-AGAG-AT---GA-----AATT-TCCAG--GGT-A-GG--CC--TT-T--GGGGCAAG---GGGC--CC--CCGATGTA----T-AA-TA----------TG--GTTATG---TT--ACCAGACCTGGTTCTGG--ACTTCCGAG-CCCG-ACGACTA--TTC-G-T--GTA-TACAAT-CATATAGTG-----TNTAAAGA--T-GGGGCTGG-CG-C---AT--ACC-G-TG----A-AN-CCC-ATTTTAGA--G-----AG-AT-GA----------AA-TTTTC--------A---------GGGTAGG-----CCCT-T--TGGGGCA-A--AGGGG--CCC-C--TCG-TG-T--AT---AA-AT--A-T------GGTTATG-TTGANC---GC--TG------G-TTTTGGACTCCCGAGCCCGACGACTGATGTNGCCTGTAATACAATAATATATCAGTNGGGCGTAATAAAGATTGGGCTGGCGCATCGTGAGCC
finalCons : TATTCAATTGTTAGA-CGAG------TTCACA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTGA-ATA--GTGAA-CTGTAGT--TGAATAGTTGAACTGT-CGTCTTGGGG--TAAT-AT-AAGGTA---TAACTTTTG-AAGA-TATGTCAATTATATTTTC---AGGGTA---GGCCCTTTGG---------GGCAAGGG-CC-C-CT-C-A----TGTA----T---AA---------ATATGGTTATG---TTGA--------AC--C-TGAC-------TTGGTTNT---GG--ACTT----------------CCGAGC----CCG-ACGACNA------TTCGCT--TGTATTAC----AATA--AT--ATAGTG----------TATAAAGA--T-GGGGCT-GGCG-C---AT-A-CC-G-T-GA---A----C-CCA-C-TTT---------AGAGAGAA----T-GAAA-------TTTCC--------AG-GGT----AGGC----------CCTT--TGNGGCA---AG-GG---G--C-C-CT-C-A--T-G--TA---C-----AAATA---T------GGTTA-TGT---TTA---C-CN-GACC-TGGTTCT-------GGACTTC-CG---AGCCC-GACGACT-A--T-TC-G----------NTGT-ATA--------C-AATA--ATA-T-A--------GTGT-ATA-AA--GATG-GG---GCTG--G-----CG-CA--TAC--------------------C-GTG---A-ANC--CCA---TTTTA---G-AGAG-ATGA--------AATT-TCCAG--GGT-A-GG--CCTTT-----GGGGCAAG---GGGC--CC--CCGATGTATAAATA---------------TG--GTTATG---TT--ACCAGACCTGGTTCTGG--ACTTCCGAG-CCCG-ACGACTA--TTCGAT---GTA-TACAATT-ATATAGTG-----TNTAAAGAT---GGGGCTGG-CGC----AT--ACC-G-TG----A-AN-CCC-ATTTTAGA--G-----AGA-T-GA----------AA-TTTTCA-----------------GGGTAGG-----CCCT-T--TGGGGCA-A--AGGGG--CCC-C--TCG-TG-T--AT---AA-AT--AT-------GGTTATG-TTGANC---GC--TG------G-TTTTGGACTCCCGAGCCCGACGACTGATGTNGCCTGTAATACAATAATATATCAGTNGGGCGTAATAAAGATTGGGCTGGCGCATCGTGAGCC
Alignments
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Reference ( family-3063 ) : TATTCAATTGTTAGA-CGA---G---TTCACA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTGA-ATA--GTGAA-CTGTAGT--TGAATAGTTGAACTGT-CGTCTTGGGG--TAA-TA-TAAGGTA---TAACTTTTG-AAGATATGTCAATTATATT--TTC-AGGGTA---GGCCCTT--T--G-GGGCAA-GGGC--CC-CT-CA----TGTAT---AAATAT------GGTTATG-TTGA--------AC--CTGAC-------T-TGGTTNT---GG-AC-TT----------------CCGAGC---CCGACGAC-NA------T-TCG--CTTGTATTA-C--AATA--AT--AT--A--------G---TGTATAAAGAT-GGGGC-TGGCG-C---ATA-C--------------------C-GTGA---AC-CCA-C-TT------TA---GAGAG--------A---ATG-AA----A---TT-TCC---AG-GGT----AGG----------CCCTTT--GNGGCA---AG-GG---GC-C-CT-C-AT--G--TA-----CAAA--TA---TGGTT-ATGT---TT-ACCN--GACCTGG-TTCT-------GGACTTC-CG---AGCCC-GACGACTA--TTC-GN----------TGT-ATA------C-AATA--ATA-TA-GTGTA-TA-AA--GATG-GG---GCT--GG-----CGCA--TACC-----GTG---A-ANC--CCAT---TTTA---G-AGAG-ATGA-----AATT-TCCAGGGTAG-G-C--CTT-T--GGGGCAAG---GGGC--CCCCGATGTA----TAA---------ATATGGTTATG---TT--ACCAGACCTGGTTCTG--GACTTCCGAG-CCC-GACGACTA--TTCGAT-GTATACAAT-TATATAGTG--------TNT--AAAGAT-GGGGCTGG-CG-C---AT--ACC-GT----GA-AN-CCC-ATTTTAGA--G-----AG-AT-GA----------AA-TTTTC--------A---------GGGTAGG-----CCCT--TTGGGGCA-A--AGGGG--CCC-C--TCG-TG-T--AT---AA-AT--A------TGGTTAT-GTTGANC---G------C--TGG-TTTTGGACTCCCGAGCCCGACGACTGATGTNGCCTGTAATACAATAATATATCAGTNGGGCGTAATAAAGATTGGGCTGGCGCATCGTGAGCC
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gi|1 : gtattcaattgttagatcgagagattcacagtcagcctacagtttgaaagtaagatagtgaatctgtagttgaatagttgaactgtcgtcttggggcttaattattaaggtatactttttgaaatatatcaatttacttattctagggtaatgggcccattgccggcaaggggcccctcatgtataaatatggttatgttgactactgctaggttattgagaactttccgagcacaccgacgactattcgctgtaaacgaaataggatattcgatgtataaagttggggcttggcgcatacccgtgtacaccactttcttcatagaagagttatgaagaatttttcaggtaggggcacccaccccttttgggggaagtgaaagctcctcatgcttataatatggttaatgttgagctgcctggtttttggacttccgagcccgacgactattcgctgtcataagcaataatatagcgtatatgaccgatgggtgagctgaggtgcataccagtgaacccactttagcagagtatgagaactaatttcagggaaggccgcttgtggagtgagcaagggcaacctcgatatacttgtaatagcagcagaaatggtatgacattgaaccatgcgtggttcaggcgactcccgagacccggacgactaatttcgctagtaataacatacatatgacggtcgctataaaaaaagagggctggggacatcaccggtagaaaaaccccacttagagagtgtagaaactttcttcaatat-AGGGAG---GGCCCTC--TTGG-GGGCAA-GGGG--CC-CTACAAAGGTATATTTGAAGT-T------TGTTATA-TTGATAATGAGTAA--CTGACGCGGAATT-TAGTGTT---GGTAC-CTATACACACGAGAGAGACTGAGT---GGGACGAC-AACACAATT-TCGGTCCTATAATA-C--AACA--ATGAATC-A--------GCTCTGTA-AAAGATTGGGGC-TGGCG-CCGAGTA-C--------------------CCGTGACATAC-CCA-C-TT------TA---AAAGG--------A---GTTTAA----A---TT-TTCCA-AG-GGC----AGG----------CCGATT--GGGGCAAACAG-GG---GC-C-gaagtttgttatattgataatgagtaactgacgcggaatttagtgttggtacctatacacacgagagagactgagtgggacgacaacacaatttcggtcctataatacaacaatgaatcagctctgtaaaagattggggctggcgccgagtacccgtgacatacccactttaaaaggagtttaaattttccaagggcaggccgattggggcaaacaggggccgcaatcgacctatagaaacagtgatgctagaagagt
gi|1 : gtattcaattgttagatcgagagattcacagtcagcctacagtttgaaagtaagatagtgaatctgtagttgaatagttgaactgtcgtcttggggcttaattattaaggtatactttttgaaatatatcaatttacttattctagggtaatgggcccattgccggcaaggggcccctcatgtataaatatggttatgttgactactgctaggttattgagaactttccgagcacaccgacgactattcgctgtaaacgaaataggatattcgatgtataaagttggggcttggcgcatacccgtgtacaccactttcttcatagaagagttatgaagaatttttcaggtaggggcacccaccccttttgggggaagtgaaagctcctcatgcttataatatggttaatgttgagctgcctggtttttggacttccgagcccgacgactattcgctgtcataagcaataatatagcgtatatgaccgatgggtgagctgaggtgcataccagtgaacccactttagcagagtatgagaactaatttcagggaaggccgcttgtggagtgagcaagggcaacctcgatatacttgtaatagcagcagaaatggtatgacattgaaccatgcgtggttcaggcgactcccgagacccggacgactaatttcgctagtaataacatacatatgacggtcgctataaaaaaagagggctggggacatcaccggtagaaaaaccccacttagagagtgtagaaactttcttcaatatagagaaggcccttcttggggcaagggctcccctcatgtattacgaacattacattggttatggttaatcgctgaccctggttttggacttccgagcccgacgactgatgtagctgtaataaataatatatcaatagggcgtataaagattgggctggtgtcaacttctttaaaaaagcgggcaacgtgaaccccctttagagagttccgagcaataattgtctaggTG--------TA---AAAGATTGGGGCTGG-CG-CCGAGT--ACCCGT----GACATACCC-ACTTTAAAAGG-----AG-TT-TA----------AA-TTTTCCA------A---------GGGCAGG-----CCGA--TTGGGGCA-AACAGGGG--CCG-CAATCGACC-T--AT---AG-AA--A------CAGTGAT-GCTgcaatcgacctatagaaacagtgatgctagaagagt
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gi|2 : ggTATTCAATTGTTGGA-C-A---G---TTC-CA-GTT----CA--CAGTTC-A-TATTGA-ATA--GTGAA-CTGTAGTC-TGAATAGTGAAACTGT-CGTCT-GGGG--TAA-TA-TAAGGTA---TAACTTTTG-AAGATATAT--ATTATATT--TTC-AGGGTA---GGCC--T--T--G-GGGCA--GGGC--CC-CT-CA----TGTAT---CAATAT------GGTTATG-TTGA--------AC--CTG-----------TGGTTTT---GG-AC-TT----------------CCGAGC---CCGACGAC-TA------T-TCG--CCTGTATTAGC--AA-A--AT--AT--A--------G---TGTATAAAGAT-GGGGC-TGGCG-C---CTA----------------------C-GTAA---GC-CCC-CGTT------TA---GAGAG--------T---TTG-AA----A---TT-TTC---AGTGGT----AGG------------CTTT--GGGGCA---AG-AG---GT-C-CT-T-AT--G--TA-----TAAA--TA----GGTT--TGT---TTGACCT--G-CCTGGTTTTT-------GGACTT--CG---AGCCC-GACGACTA--TTC-GC----------TGT-ATA------C-AATA--ATA-TA-GTGTA-TA-AA--G-TG-GG---GCT--GG-----CG-A--TACC-----GTG---A-GCC--CCA----TTTA---G-AGAG-TTGA-----AATT-TTCA-GGTAG-G-C--CTT-T--GGGGCAAG---GGGT--CCCCATTGTA----T-A---------ATATGG-TA-G---TTG-ACCTG-CCTGGTTTTG--GAC-TCCGAG-CCC-GACGACTC--TTC-AT-GTATAC-AT-AATAT-GTG--------TAT--AAAGAT-GGGGCT-G-CG-----AT--ACC-GT----GA-AG-CCC-ACTTTAGA--G------G-TT-GA----------AACTTTTC--------A---------AGGTAGG-----CCCT--TTGGGGCA-A--AGGGG--CCC-C--TCA-TG-T---T---AA-AT--A------TGGTTAT-GTTGAAT---G------C--TGGTTTTTGGACT--CGAGCCCGACGA-TAAT-TCGCCTGT--TACAATAATAT---AGTTG---GTAATAAAGA-TGGGTTGGCGCATCGTGAGCC
gi|3 : ATT--TCCTAGGGTA---GGGCGTT--T--A-GGACAA-GGGC--CCTCT-GA----TGTAC---AAATAT------GGTTATG-T--A--------AT--CAGAT-------C-TTGTTCT---GG-AC-TT----------------CCAAGT---CCGACCAA-AA------T-TTG--AT-GTAT-A-C--AATT--AT--AT--A--------G---TGTTTAAAGAT-TGGGC-TGGTG-C---ATA-T--------------------C-GTGA---AT-CCAAT-TT------TA---GAGA---------A---ATG-AA----A---TT-TCT---AG-GGT----AGG----------GCCATT--TCGGCA---AG-CG---AT-CTCT-G-AT--G--TA-----CACA--TA---TGATT-ATGT---T--ACCT--GACCTA--TTTT-------GGACTTA-CG---AGCCT-GACGACAA--TTC-GA----------TGT-ATA------C-CATT--ATA-TA-GTGTT-TA-AA--GATG-CG---GCT--GG-----TGCA--TATC-----TTG---G-ATC--CCAT---TTTA---T-AGAG-ATGC-----AATT-CCTAGGGTAAAG-C--TTT-T--GGGACAAG---GAGA--CTCTGATGTA----TAA---------ATATGGTTATG---AT--ATCAGACCTGGTTCTG--GACTTCTGAG-CCC-GGTGTCTA--TTCGAT-GTATACAAT-TATTTAGTG--------TTT--A
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gi|7 : ---ATA-C--------------------C-GTGA---GC-CCATC-TT------TACTAAAGAG--------A---ATG-AACATTG---TT-TCTG--AG-GGTTTACGCG----------CCCTTC--GTGGGA---AGTGG---GC-CTCT-C-ACTCG--TAATCACCAAAAATACACTGGTT-ATGC---TT-ACCCCTGCCTTAG-TTTTACACTGGGGACTTT-CGGATAGCCC-TACGACTAC-TTC-GCAATCGTACAATGT-ATATTTAGAC-AATA--ATA-TAAGTGTAATA-AA--GATGAGG---GCT--GGAAGCTTGCAATTACCTTCACGTA---ATAGCAACCATGCTTTTAATTG-AGAG-ATGACGA--AATTATTCAGGGTAG-G-T--TCT-T--TGGGCGAG---GGTC--C
gi|8 : aTAT-GTG--------TTG--AAAGAT-GGGGCTGGTTG-C---ATTCACC-GT----GA-AG-CCCTATTTCAGA--GGTGGAAG-GT-GGTAAATGTGATAA-TTTTC--------AAATATTAAGAGGTAAGGATATTCCTA-TTGGGACATG--AGGGA--CCT-C--CAG-TGAT--AT---AAGATAGA------TGGTTAT-GTttcctca
gi|9 : TATTCAATTGTTAGA-CGACA-G---TTCACA-GTT----CA--CAGTTC-ACTATTGA-ATA--GTGAA-CTGT------------------TGT-C----TGGGG--TAA-TA-TAAGGTA---TAA-TTTTG-AAGATATGTCATTTATATT--TTC-AAGGTA---GGCCCTT--T--G--------GGGC--CC-CT-CA----TGTAT---AAATAT------GGTTATG-gtata