lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 333 1 555555555 2 1 3333333 2 22 1 1 1 1 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 44444 22 111 222222222 222 11 3333 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 555555555555555555555555555555555555 33333 11111111111 1 111 2 1 11 22 11 11 1111111 1 22222 22222 2222222 333333333 11 111 111 11 1111111 22222222222222222 3333333333333333333333333333333 1111111 111111111 11 3333333 222 1 11111 1111 1111111 3333333333 111 111 33333333333333333 11 11 11111111 1111 1111 1 111111 33333333333 11111 1 111111111 1111 1111111111 111 11111111111 1111111 11111111 11111 1111 11111
lowQualScore : 888 0 4 888 5 666666666 0 5 9999999 0 77 3 7 3 3 6 77 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 0000 11111 00 111 666666666 555 33 8888 9 33 3 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 8 88 333333333333333333333333333333333333 5 88888 88888888888 0 2 444 8 8 6 4 8 0 3 6 5 33 00 8 8 33 4 88 11 8 0 9999999 0 22222 8 66666 6 9999999 6 5 0 444444444 55 5 5 4 4 5 1 000 0 77 66 5 5 5 999 2 8888 5 22 5 2 6666666 44444444444444444 4 7777 3 3 3 55 3 55 3 5555555555555555555555555555555 77 3 555 3 44 8888888 999 3 666 55 3 6 7 7777 55 8 111111111 33 4 55 4 0 3 88 2 55 3 1111111 3 99 3 333 4 3 77777 3 666 55 2 3 99999 3 3 666 4 55 9 8888 4 3333 5 1 2222222 44 4 4 444 4444444444 000 66 222 4 66 1 4 11111111111111111 55 4 11 4 777 4 3 55 8 22 4 55 55 4 4 4 777 55 77777777 3 3 5 7777 3 1111 3 6 3 77 3 2222 6 3 6 3 6 2 555555 4 99999999999 11111 6 6 44 6 888888888 0000 44 0000000000 3 111 3 4 22222222222 3 3 44 2 44 0000000 33 66666666 555 6666 7777 44 55 11111 777 0000 11111 5 5
lowQualScore : ... . . ... . ......... . . ....... . .. . . . . . .. .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. . .... ..... .. ... ......... ... .. .... . .. . ................................................................................................................................................... . . .. .................................... . ..... ........... . . ... . . . . . . . . . .. .. . . .. . .. .. . . ....... . ..... . ..... . ....... . . . ......... .. . . . . . . ... . .. .. . . . ... . .... . .. . . ....... ................. . .... . . . .. . .. . ............................... .. . ... . .. ....... ... . ... .. . . . .... .. . ......... .. . .. . . . .. . .. . ....... . .. . ... . . ..... . ... .. . . ..... . . ... . .. . .... . .... . . ....... .. . . ... .......... ... .. ... . .. . . ................. .. . .. . ... . . .. . .. . .. .. . . . ... .. ........ . . . .... . .... . . . .. . .... . . . . . . ...... . ........... ..... . . .. . ......... .... .. .......... . ... . . ........... . . .. . .. ....... .. ........ ... .... .... .. .. ..... ... .... ..... . .
lowQualScore : 555 0 0 000 5 555555555 0 0 5555555 0 55 3 3 3 3 0 55 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 8888 55555 55 000 222222222 000 88 5555 2 88 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 0 66 888888888888888888888888888888888888 4 66666 88888888888 8 2 000 0 0 0 0 0 8 2 0 4 00 00 0 0 88 6 88 00 0 8 0000000 0 00000 0 66666 7 0000000 3 8 8 222222222 77 7 7 9 0 7 4 000 1 99 66 7 7 7 111 1 9999 7 22 0 0 2222222 44444444444444444 0 7777 6 6 6 00 6 00 6 0000000000000000000000000000000 77 3 444 3 66 8888888 222 3 222 33 3 7 3 7777 00 0 999999999 55 0 55 0 8 6 66 4 00 6 0000000 6 99 6 666 5 6 55555 5 444 00 8 6 11111 6 6 444 0 55 2 8888 4 9999 1 9 3333333 11 0 0 222 4444444444 000 11 222 4 11 1 4 33333333333333333 55 0 00 0 000 0 8 55 0 00 0 55 55 0 0 0 000 00 99999999 3 3 8 1111 3 8888 3 7 3 99 3 6666 7 3 7 3 7 5 888888 5 99999999999 77777 7 7 66 7 888888888 4444 88 9999999999 3 777 3 4 33333333333 3 3 66 5 55 8888888 88 77777777 888 5555 1111 66 55 44444 888 6666 88888 0 7
consensus : CATTAANNNAACTTATNTTTGNAATTTGAGGTCTTNCCCTGTAAATAATGTATGGGTATCGGCGGATATGCCTCAAT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-TGCAGCAGTGCCCACCCCATTCAAAAAACTTTCAGATAACATTACACAATGACTTTTGT-ACCTTTTCATCGCACACCCCCTGTNTTCACTTGAATTCGCTAGATTTTCCAGAATTTTTTTCCCNAATAGAGCTTTCATG----GATC-C-TGTTGCTGTN---AAAGA--AACGT-AC-AT--AAACGTGT-CAA-----AATTAAATGAGATTCA-TCACAAAAA-TAATG--GACATG-TGACCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATT----------CAA-CA-A--TTATCA-----------------TCA-TATCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCT-CCAT-TTTC----CNAAANANTTN----TTTT-T--AAGAAATACTC--GGAC-----AACATCAGAA-T-AACATTT-TNT--TTAACCT--GA----AA---AATGAAAA--CTAGGNAAATT---GA-T--ATGGTAAATAAAC--CA--TT-CGGAT-A-AATT--T---TCAC-----CTTTATACGTNTGAGGATGA-----TC-------TACCCCCCCNCCCC-----CCCAGA-TC-TT--CCTT---CCCAATTAT-NAAAT---A--AT--CTTAGAAAATA-----CTACCAT-TATTCANCCTAGCCTAG-TAAAATAA-CATTNAATTTTTGAA-TGCA--TTA-A-T--AC--CA-TGA-TCANTCCAATTGT--CACTGA-A--------GGT-GNAACGT---GTGTCATTG-CGACGT-AA-TGC---A--TCA-TTGTCAA-TAT-CAATG----TATNANACTNC-CGGCAATATCTTACAT---AAACTTG-GG--TTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TA--GCAGC-AACTGCTTTGC--GGATAAA-----CGTGTCG-GTT--TTNAATT-TC-----CA----------TGAGCA---AACGC-AGAATGNAGCCCCG--------A---------CAGCGT-AAATCG-G---GTAC-AA---TAAAAA---TGCT--AGA---TANCCNAG-T-TTGGGCTTTGAA---TC-------ACA-T--TCAATGAC-AGTTAATNTATCGGGAAA-C-GNTTTT----ACCA-C-ACNTGGCG---TG-TGT-TAACTCGA-CTCCNTGCACA-CTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATATAAAGTAATGAT-NAAG--GG-TGTTT---A---AAATANCCCA---C-A-AAC-AC-CAT-TTTTC---T---GTATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTACAAAAC--C--TACT--TA-TT-ATCTCCTANA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAGTCNGCAA-A-ATTG-AAN--AAATTCANA-TT-TTCC-GTGCCA-ATTTTC-TAT-------TATGAGATA---------T-----C-ATTT-GC----C-C-AT-TGA--TT-TT--TTT-ATC---------CGCC------T---TA--T---ATC-A-TTTAT-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-A----T--G-TG---CCCGG-CTTTTGN-CTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-N-TTT-TG-G-TCA---TTT-A-GCCC---G-AGTTA---TG--ANC-T-----G-TGC-TA---CA-A--AANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTT--GCC-AA-NT-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------A-TTT-CCNAAA----ACTGCA-AN---T-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TAGCCC---GN-TTACT----N-N--TGGA-----AACGGG-TC--AC-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTG---GAA---TATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
Reference ( gi|2 ) : CATTAAACAAA-TTATTTT--GAATTTGAGGTCT-ATC--GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATTATACAG--GTGC--ACC---------A------CAG-TA-CAT-ACAAAAT-A----TGTTACCTTATTATCAC--------TGTGTTCACTTG--------------TCCAGAATTTTTTTCCCTAA-AAAGCTTTCATG----GATC-C-TGTTGCTGTG---AAAGA--AACGC-ACAAT-TAAATACGT-CAA-----AATTTGATGAAATTC--TCACAAAAAATAA----GACATG-TAAACA-TTGAATTCCTTTACACGCATT-ATTTCTT-TTTATCAAACACA--TTATCAC----------------TCACTGTTATGGCGAAAGAAGGGAGGAG-GAGGGGGGGGGGGTTGTCAT-TTCT----TTAAATACTTA----TTTTATG-AAGAAA-ACTC--GGAC-----ATCATCAGGA-T-AAAATTT-TCC--TTAACCT--AA----AA---ATTTAAAAC-TTAGTGAAATT---AA-C--ATGTTAAATAAAC--CA--AT-CAGAT-ATAATT--TAGTTCATTCTTTTTTTATATTTTTGAAGATGA-----TT-------TACCCCCCCCCCCC-----CCCAAACTC-TT--CCTTC--CCCAATTAT-CAAAT---ATTAT-TTTTAGAAAATAT----TTATCATATATTCACCCTGGCTCAGTTGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TTA-A-T--AC--CA-TGA-TCATTTCAATT----TACTTATA-------CGGTCGGAACGT---GTGTCATTA-CAATGT-AA-TGT---ACATCA-TTGTCAA-TAT-CAATG----TATAAAAATTC-AAACAGTA-CTTACGT---AAACTTG-GT--TTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATC-C---A-TTTTCT--TA--ACAGC-A--TGCTTTGT--GGATAAA-----CATGTCG-GTT--TTTAATT-GC-----CA----------TGGG-A---AACGC-AGAATAAACCCCCG--------A---------CAGCAT-AATTCG-G---GTGC-AA---TA-------TGTT--AGA---TATCTCAG-T-TTGAACTTTGAA---TC-------GCA-T--TCCATGAC-AAT--ATTTGTCTGGAAA-C-TTTTTT----ACCA-C-ACTTGGTG---TG-TGT-TAA-TCGA-CTCCCT-CAAA-GTG-AAATACAT-CCAAAT-ACATACAGAATGATGGT-AAAG--GG-TGTTT---A---AAATACCCCA---T-A-AAC-AC-TAT-TTTTC---T---GCATGTCTTTCATTTCCCTCCTGTTTACAAAAC--C--CACT--TA-TT-ATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG-AAA--AAATTCATA-CT-TTCC-ATACCA-TTTTTC-TGT-------TATGAGATA---------T-----C-ATTT-GC----C-C-AT-TGA--TT-TT--TTT-ATC---------CACC------T---TA--T---ATC-A-TTTAT-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-A----T--G-TG---CCCGA-CTTTTGT-CTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-T-TTT-TT-G-TCA---TTT-A-GTCC---A-AGTTA---TG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-A--AAGTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATT--GTC-AA-TT-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------A-TTT-CCAAAA----ACTGCA-AA---T-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TAGCCC---GT-TTACT----T-T--TGGA-----AA-GGG-TC--AC-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTG---GAA---TATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTG
gi|16 : CATTAACAAAA-TTATTTTTGAAATTTGAGATCTTATTCTGTAAATAATG-AT-GG-AT--G-GGATATGCCT--AT-TGGAACAACAATAACAACATATTAT
gi|1 : ggggtgtgtgtgtcctgcgatgtcagcgacacgcatacccattaagaaataatgagtagccgcccgccccccccccccccgcccgTTAAACCAACTTATATT--TAATT-GAGGTTT-TCC--G--AATAATGTATGGGTATCGGCGGATA-GCCTCAATATGGAACA-CAAT-AC-ACATTCT-TGCAGCAGTGCCCACTCCATTCAAAA------CAG-TAACATTACACAAT-ACTTTTGT-ACCTTTTCATCACACACCCCCTGTGTTCACTTGAATTCGCTAGATTTTCCAGAA--TTTTTCCCTAATAGAGC-TTAATC----GAT--C-TG-TGCTGTG---AAAGA--AACGC-ACAATCTATATTTGT-C-A-----AATTTGATGAAATTCA-TCACAAAAATAAA----GACATGTTAAACACTTGAATT-CTTTACACA-ATT-ATTTCTTCTTTATCAAACAAAATTTATCATAAATCATAATGCACTGTCACTGTTATG--GAAAGAAGAG----G-GAGGAAGGGGCTGTTGTCAT-TTTC----CT---TACTTGT---TTTTATGAAAGAAA-ATTC--GGACACGATATCATCAGCA-T-AAAATTT-TTC--CTAACCT--------AA---ATTTAAAACTTTAGGAAAATTAACAA-C--AAGTTAAATAAAC--CATGATCCGGATAATAATTAGTAGTTCATTCTTTCTTTTTA--TTTGAAGATGA-----TT-------TA-------ACCCC-----CCCAGACTC-TTC-CCTTC--CCCAAGTATACAAAT---ATTATATTGTAGAAAATATCATATTATCATATATT-ACCCTGGCTCAG-TGCAA-AA-CATTGGA-TTTTGAA-TGCA--TTA-ATT--GC--CA-TGA-TCA-TCCAATTATTATAGTTTTACAAGACCCGG-CGGAACGT---GTGTCATTGCCAACGGAAA-TGCTTGACCTC--TTGTCAATTAT-CAATGCTTCTATAAAA--TC-CAACAATATCTTACGT---AAACTTG-----TTTTCCA--CTGGC-A-TGAATT-CCCAA-TTTTCT--TAACACAGC-AATTGCTTTGT--GGAT-AA-----CA-GTTGCGTT--TAT-ATT-TC-----CA----------TGAG-----AACGC-AGAATAAA-CCCCG--------A---------CAGCATAAATCCGCG---GTGC-AA---AC-------TG-C--AGA---TTACCCAGTT-TTGAACTTTGAAAATCC-------ACA-T--CCCATGAC-AAT--A--TGTCTGGAAA-C---TTTT----ACCACC-ACTTAGTG---TGTTGT-TAACTCGA-C-CCCT-CAAACGTG--AATACAT-CCAAAT-ACATACAG-GTGATGGT--AAG--GG-TG-TT---A---AAATACCCCA---T-ATAAC-AA-CAT-TTTTC---T---GC-TGTC-TTCATTTCCCTCCT-TTTACAAAACCGC--TACT--TA-TA-TTCGCTTGTA-CTAGATAT--CA---C-----GGGATAAC--T-AATCAGCAATA-ATTG-AAG--AAATTCATA-CT-TTCC-CTACCA-TTTTTC-TGT-------TATG-GATA---------T-----CAATTT-GC----C-C-AT-TGATTTT-TT--TTT-ATC---------CACC------T---TA--TTTAATCAA-TTTAT-C-T-ATCTTC--TTC-----TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-A----T--G-TG---CCCGC-TTTTTG--CTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAG-A--AAACTG-CTAA-A-T-TTT-TG-G-TCAT--TTT-A-GTCC---T-AGTTA---TG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-A--AAGTG----CA-TC----AT-TGCAGATAA-AT-TTGT-ACAT-AT-TGAA-TC----A-AAATTTGCC--C-AAACT--T---A-TCT--CACT-A-----------------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATT--GCCAAA-TT-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTAAAG--TGACA--------A-TTT-TCCAAA----ACTGCA-AA---TATTCC-T-GTTT-TTT---TTC-TATA-TAA-A-TAGCCC---G--TTACC----T-A--T-GC-----AC-GGG-TC--AC-TT--T---T--CACATG---AT-GTGT------A----CAATATTTTT---TTTC-ACAA-TTCCAT---GT-AGATCTA--TG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTG---AAT---TATT----TTTTAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---tttactcacagt
gi|3 : gggggtgtctttcacgaatgtccgcgacacggtccctttcccattaaaaaaataatgacgagtcccccccttccccggttc-TGGAGCAACTGT-GC-ACATATTTTATAG--ATGC--ATC---------AAACTTTCAAATA--AT-ACACAATGA--------ACCTT-TT-TCGT--------TGTTTTCATTT---------------TC--GAATT-------CGAA-AAA-TTCTCA-GACATGATCACATGTTTCTGTTTTTCATGATCAATATTACTAT-AAAACATGTACAATGTGCCATTAAATGAGATTCAATTACAAATA-TAATGGCGTCATA-TGACCA-T-GATTTCATTTACACACATTCATT----------CAATCA-----TATCA---------------------TATCATG---AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCT--TAT-TTTT----CCAAACAACAAAAAATTTTCTT-AAGAAATACTCTGGGAC-----AACATCAGAA-TTAACATTT-AAT--TTATCTT--GA----AAGAAAATGAAAA---TAGGTAAATT---GA-TTAGTGGTAAATAAACTACA--TT-CA------AATT--T---TCACA--------ATGCATCAGGGGATCACAACTTC-------TACCCCCCCCCTCC-----CCCA----T-TTGGCCTTAAATTCATTTTT-TAAATTAGAGAAT-GCTTAAAAAATAG----CTACT---TATTCATC-TAGCCTAGT-AAAATAAACAAATAATGATTGTA-TACA--TTTTA-TTTAC--CA-TGA-TCAACTCA-TT----CACTGAGA-------AAAT-GTAACAT---GT-TCAT-A-TGACGT-AA-TGC------------------TATGCAATG----TATCACACTAC-TGGCGATATCTTACAT-------TTGCGG--TTTTCCAA-CTGGCCA-TGAATA-C---A-CTTTTCAATA--GCAGC-AA-TGTTTTGCCAAAATAAA-----CGT-TCA-GATAGCTAAATT--C-----CA----------TGAGCA---AATGG-A-AATGCAGCCCCG--------AACCACATAACAGCGT-AAATCG-G----TAC-A----TAAAAAGACTGCT--AG----TGACACGT-T-TTG--CTTTGAA---TC-------ATA-T--TCAA-AAC-GGTTTATGTATCGGAAAA-T-GTCTTTGGAAACTA-CTAC--GGCAGCCTG-TTT-TTA-TCAA-CTCCTTGCACA-CTG-GAATACACGTCAGGC-ACATATAAAGTAATGATCAAAGAAGG-T-TTT---A---AAATGCTCAA---C-A-AAC-AC--AT-TTTTT---G---GTATGTCTTGCCTTTCCCCTCTGTTTATCATTCA-C--TACT--TAATT-ATCTCCTAAAATTAGAAATTCCG---CAAAGG-AGATAACACTCAGTATGCAA-A---TG-CAAC-AAATTCAAA-TT-TTCTTGTGCCA-ATTTTC-TAT-------TAGGAAATG---------T-----C-ATTT-AC----C-CCAC-TGA--GT-TT--TTT-A------------ATC------TGGTTGGTT---ATC-A-TTTAT-T-T-ATCTTC--T-------TCT---G-AAT--TCA-ATATT-TGATTGTCTTCAA-ATCAGT--G-TG---C-----TTTTCGT-C---GCAGT-TTTGGT-C--A-AAA--CATAGTA--AAATTG-CTA--A-T-TTT-TG-G-TCATT-TTT-A-GCCTTTGA-ATTAA---TG--AGC-C-----GCTGC-TA---CA-G--TAATG---GGA-TTTAAAATTTCCA-ATAGCAT-T--T-TCAT-AT-TT-T-TTTCAAA-A---TTGTTA-C-TACTT--T---G-TTT--CAATAA-----G-----------GTAA--CAT-AA--A-A---TT-CTTT--GCC-AA-AT-ATC--AA--ATATGA-TTT---T-AATTAAAG--C--AATCT-----A-TTT-TCTTAA----ACTA-A-AATTTT-TTCC-T-G--TGTTT---TCC-TATA-TAA-A-TAGCCC---G---TAC-----C-A--TGGA-----AACGAC-TC--AC-TTTCT---C--AGAAT----AA-GTGGT-----A----TGAAA-TTTT---TTTC-TTAA-GT-TATG--GTAATTTCTA-TTG--AATTA--GACA-------TTCGAC--------AGTG---GAA---AATT----TT--AGTG--CGTG--CC-A-C-CA---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|5 : aaCTTTCATG----GATC-C-TATTGCTATA---AAAGA--AATGT-AC------AATGTTT-CAA-----AATTAAATGAGATTCA-TCAAAAAATATAATG--GACATG-TGACCA-TTGAATTTATTTACATACATT--------------------CA--TTA-CAA----------------TCA-TATCAT---GAGAGTAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCTTCCATATTCCAAAATGAAAAATTTC----TT------AAGAAATACTTG-GGAC-----AACATCAGAATT-AACATTTATCTTATTAATCTTGAAAACGAA---AATGAAAGG-CAGGCGAAATT---GATT--ATGGTAAATAAAC--TA--TT-CAAAT-A--------------------TTTTACATGTATCAGGGTGA-----TCAGAACTGTACCTTCCCTCCCCATTTGCCTTAAATCATT--ATTT-----TAATTAT-AGAAT---G------CTTAGAAAATA-------GCCAT-TATTCAATCTAGCCTAG-TAAAATAA-CACTTAAT------A-T-----TTA----------CA-TGA-TCACTC--ATT----CACTGA--------------GAAATGTAACGTGTCATTA-TGACGT-AA-TG----AAACTA-C--TC-----T-CAATG----CATCACACTAC-TGGCAATA-CTTACAT---AAACTTG-CG--TTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATA-C---ACTTTTCA--TA--GCAGCAA--TGTTTGGC--AAATAAA-----CGTCTAG-ATA--GCTAGCT-TC-----AA----------TGAGCA---AATGTGAAAATGCAGCCCGGAATACATAA---------CAGTGT-AAATCC-GTACGTAT-AT---TAAAAAC--TGCT--AG----TATACAAG-T-TTTGGCTTTGAA---TCCACATGTATA-T--TCAATAA--AGTTAATGTATCGGGATA-TGTTCTTT----GATA-C-ACGCAGCG---TG-TTT-T-A-TCAA-CTCCATGCACA-CTG-GAATGCAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGAT-TAAA--GA-TGTTT---ACTTAAATCGCCCA---CAA-AAC-GA-CATCTTTTC---G---GTATGTCTTTCgtattaaaatctgtctcaa
gi|4 : aaaactctcaagactgatcagcgtctatgcAATAA-CATTGAAATTTTGAAATGCAACTTG-A-T--ACACCACTGAATCAT--CAATTGT--TACT-------------GTAATAACGG---GTGTCACTG-C---GC-AAATGT---A--TCACTTGTTAA-----------------AAAAGTTCCAAACA--A-CTTACATTAAAAACTTT-GTCGTTTTCCAGGCTGGC-AATGAATCAC---A-ATTTCTC-TA--ACAGC-AACTGCTT-GT--GGATAAAAGTAACATGTCG-TTT--TTAAATTCGCATGGACAAAATGGGTTGTGGG-AGTAAAAGC-AGAATAACCGCCTG--------A---------CACCAT-GAATCG-G---GTGCCAAGACTA-------TGTT--TGA---TACC--AG-TCTTGAACTTTGAA---AC-------ACAAT--TCCATGACCAAT--CATTGTCTGGAAAAC-GATTTT----ACCA-CCACTTGGTG---TG-TGTATAACTCGAACTCCCT-CAAA-GTGCAAATACAT-CCAAATGACATACAGAATGATGTT-AAAG--GGATGTTTTAAA---GAATAGCCCGCATT-A-AACCACGTAT-TTTTT---TTCGGCATCGCTTTCATTTCCATCCTG-TTACAAAA---C--CACTACTA-TT-ATCGCCTATA-CTAG-TATTCCACATCAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-ATATTGCAAAGGAAATTCATATCTATTCC-ATACCAGTTTTTCTTAT-------T-TGAGATA---------TCTTCAC-ATTT-GC----CAC-ACAGGA--TC-TTTATTT-ATC---------CATCCTGGTAT---TA--T---AAT-A-TCTAT-C-TCATCTTC--TA------TCTGAATAAAA--TCAGGTATTATGAAT-TACTCTA-A----T--GCTG---CCC-A-CTTTTCTGCTCAGGAGTCTT--GCACAAATAAAC-CATAGAA--AAACTG-CTAA-A-T-TTT-CTGG-TTAAATTTT-ACGTCC---AGAGTTA---TG--ACCGT-----G-GGCATA---CACA--AATTGTACATA-TCG---ATATCCAGATAA-ATAT--TAACAT-ATCTG-ACTCAGA-A-A---ATGCCATC-AACTTAAT---AGTCTCACACT-A-----T-----------GAGA--AAC-AA--ACA---TTCCATTGCGTC-AA-TT-TTC--AA--A-TA-A-TTTATATAAATTGAAGTTTGAAA--------ATTTT-CCAAAAAAAGACAGCATAA---T-GTCCTT-G--T-TTTTC-TTC-TATA-TAA-A-TAGCTT---CC-TTACTAAAATAA--TGGACAAACGA-GAG-TC--AC-TTTGT---CAAAAAAT----ATCGTGCA-----GGAGTCAATG-TTTTTTGTTTC-ACAG-AT-CATCTCAT-TTTTCTA-TTGAAAATGATAAACA--------CC-ATCG------AGTG---GAAACTTATTTTTGTTTCAGTG--CGTG--CCAG-A-AAAGTTAGACTTTTCGGTACC--GT-TACAAA-GAGTtt
gi|10 : ---------CAGTGT-AAATCG-G---GTAC-A----TA-------TATTGAAGACAGTATACAAG-T-TTGGGCTTCGAA---TC--------CA-TACTCAATGG--AGTTAATTTATCGGGAAA---TGTTTT----ATAA-T-ACATGTAG---CG-TGT-TAAATCGA-CTCCAC-CACA-CTG-TAACATAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGAT-CAAA--GA-TGTTC---A---AAATA-CTCA---C-A-AAC-AC--AT-TTTTT---TG--GTACGTCTTTCCTTCCCCTCCTGTTTATAA------------------T-ATC------A-C----TACTCCG---CAATGGGAGATAAC--TCAGTATGCAA-A-ATGC-AAC--ACATTCAAA-TT-TTCT-ATGCCA-ATTTTC-TATTATGTCATATGAAATG---------T-----T-ATTT-AC----C-C-AT-TGA--TT-TT--TTTCATCT--------CGTT------T---T---T---ATC-A-TTCAT-T-T-ACCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGTTT-GTCTTAA-A----T--acattcactctaaaaatctatctaaa
gi|13 : cttccatcaacaaatgggaaaatgcagctcggaccatatagT-TTTTCCTTT---G-ATTGCTTTCTGTGCCCTCCTGTTTATAACAC--C---ACTATTG-TTTATATCCTATA-TTAGATATTCCG---AAAAGGG-GATAAT--TCAATCTGTAA-A-ATTA-AAC--AAATCTATA-AA-TGTC-ATGCCA-ATTTTC-TAT-------TACAAAATA---------T-----C-ATTT-GA----C-C-AC-TTA--TTATT--TAT-ATA---------CATC-----------A--T---ATC-A-TTTAT-T-T-ACTCTC--T-------TCT---T-TAA--TCC-GTATT-TGATT-GTCTATA-A----C--G-TG---CCTGG-CTTTTG--CTCAGGGAT-TT--GC-CAAA-GAA--CATTGAA--AAACTG-CT---A-CATTT-TG-G-TCA---TTTGA-GCCA---A-AATTA---TG--AGC-T-----G-TGC-TA---CG-A--cagtgtattttatcaatctatctcaaaaacat
gi|7 : TACAAAAC--CACTACT--TA-TT-ATCTCCTACA-CTAGATATTCTG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG-AAG--AAATTCATA-TT-TTCC-ATATCA-TTTTTC-TGT-------TATGAGATA---------T-----A-ATTT-GC----C-C-AT-TGA--TT-TT--TTT-ATC---------CACA------T---TA--T---ATC-A-TTTAT-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-A----T--G-TG---CCCGA-CTTTTTG-CTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CTA--A-A-TTT-TG-G-TCAT--TTT-A-GTCC---A-AGTTA---TG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-A--AACTG---ACA-TC----ATATCAAGA-AA-AA-T--T-ACATGAA-TG-A-TCAA--A-A---TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GC-GTTCACTAATTA-AATTTT-CATT--GTC-AA-AT-TTC--AA--A-AT-AGTTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------A-TTTACAAAAA----ACTGC--AA---T-TTCT-T-GT-T-TTT---CTC-TATA-TAA-A-TAGCCC---G--TTAC-----T-A--TGGA-----AACGGG-TC--ACTTT--T---C--AAAAT----AT--TGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-C-T---GT-ATTTCTA--TG--AAT-AT-AACA-------TTT-AT--------A-TG---GAA---TGAT----TTTCAGTG--CGTG--CC-GCA-AA---AA----TTTTGGT--CCTGT-TACAGA-GAATTta
gi|17 : --C--TACT--TA-TT-ATCTCCTAAA-TTAGAAATTCAG---CAAAGGGAGATAAC--CCAGTATGCAA-A-ATGC-AAC--AAATTCAAA-TT-TTCT-GTGCCA-ATTTTC-TAT-------TATGAAATG---------T-----A-ATTT-AC----C-C-AT-TGA--GT-TT--TTA-ATC---------TGGT------T---GT--T---ATT-A-TCCAT-T-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGATT-tgct
gi|6 : tataatatcaCA-ATTTTC-TAT-------TAT-AGACAAATGTAGGCT-----A-ATTTAGCACTGC-C-AC-TGA--GT-TT--TTT-ATCTGTTGTAATCACT------T---TA--G---TT----TTTATACAT-ATCATC--TCTGACAATTT---T-GTA--CAA-ATATT-TGATTGTCTTCAAGA----TCAG-TG------GG-CTTC-GT-CACAG---T-TG--GT-CAAA-AAA--CATAGAAGTAAATTGGCT---AAT-TTT-GT-G--CA---TTTTA-GCCTTGAATAGTTAATATGGGATT-TCGACGG-TGC-CAGTTCA-GTTAA-TG---ATAATA----ATTTCCAAATAC-TT-TG-T-TCAT--T-TG-T-TTCAA-A-A---TTGTTA-CTGACTT--TTGGA-TTT--CAAT-A-----TAAGCGGATTGAGCAG--TAA-GAGAA-A---TT-CTTT--GCC-AA-AT-ATC--AATTG-AT-A-TT------AGTTAATG--TAAAGCACGCATTA-TTT-CGTAAA----ACTACA-A----T-TTCC-TAG--T-TAT---TTC-TATAAT-A-A-AAGCCTCCGGG-TTACT----A-T--GGGG-----AA-CGACTC--AC-TT--T---A--GAATT----AA-GTGTA-----A-----AATA-TTTT---TTTC-TTAAGTT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGGAGAA----ATT----TTTCAGTGTTTGTGCACC------A---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGAGGAACTGgtctt
gi|12 : gctcaataatcatacctgaagattagaccacaggatgtccgcttccaaagggattagaccgtgaagactacagtatgtataagaattcagacaggactgttcaaaaatttgtctcggcgAGATA---------T-----C-ATTT-GC----C-C-AT-TG---TT-TT--TTT-----------------------T---TA--A---AT------TAT-G-T-AGCTT-------------T---T-AAAAATCA-ATATT-TGATT-TTTCTTA-A----T--G-TG---CT-GG-C----GT-CTCAGGAGT-TT--GC-CAAG-GAA---ATAGAA--AA-CTG-CTTGAA-A-TTT-TG-G-TCA---TTG-G-AGCT---G-AATTA---TG--AGC-T-----G-TGC-TA---CA-A--TAATG---ATA-TC----ATATCCAGA---------------------G-A-TC----ATA---TTGTTA---AACTC--T---A-TCT--CAGC-ATGTATT-----------GTAG--CAT--A--G-A---TT-CTTT--GTTAAA-TA-TTC---A--G-AT-A-TTT---TAGACTGAAG--TGAAA--------A--TT-CCTAAA----ACTGCA-AT---T-TCCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-C-AGA-TAG------ATATCAC-----T-A--TGGA-----AACGAG-TC--ACATT--T---C--AGAATATGCAT-GTGTACATGTA----TAGTA-TTTT---TTTTAAAGA-------------------G-TTG--AGTGAG-GGCA-------TTT-AC--------AGTG---G-A---TATT----TTTCAGTG--CGTT--CC-G-C-AA---TA----TTTTGGT--T--GT-TACAGttattaaggtgt
gi|11 : tattaatTT-GC----C-C-AT-TGA--TT-TT--TTT-ATC----------ACC------T---TA--T---ATC-AGTTTAT-C-T-AT--TG--T-------TCT---T-AA---TCA-ATATT-T---T-TCCTCTA-A----T--G-TG---CCCGAACTTTTGC-CTCAGGA-T-TT--GC-CAAA-AAA--C-TAGAA--AAACTG-CT---A-AATTT-TG-G-TC----TTT-A-GTCC---A-A-TTA---GG--ACT-T-----G-TGC-TA---CA-A--AGG-----ACA-TC----ATATC-AGATAA--T-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---ATTCCA---AACTT--TT--A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AG--A-A---TT-CATT--GCC-AAATT-TCC--AA--A-AT-A-TTT---GAAATTAAAG--TGAAA--------A-TTT-CCAAAA----ACTGCA-AA---T-TTTCGT-G--T-TTT---CTT-T-TA-T-A-A-ATGCCC---GA-TTACT----A-T---GGA-----AACGGG-T---AC-TT--TTCAC--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT----TTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTATTTG--AATGA--AACA-------TTC-AT--------AGTG---GAA---TATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GTGTACAGA-GAATT
gi|8 : aaC----C-T-AT-TGA--AT-TT--TTA-ATC---------TGCT------T---T---T---ATC-A-TACAT-T-A-ACCTTC--T-------TCC---T-AAA--TTA-ATATT-TGATT-TCCTTTA-A----A--T-CA---TCTGT-TTTTTCG-CTCAGGAGT-CG--GT-C-AC-AAA--TATAGCA--ATACTG-CT---A-T-TTTGTG-G-TCA---TTTGA-ACCT---G-ATTTA---TG--AGT-T-----G-TGT-TA---CA-A--TAATG---TTA-TC----ATTCCCAGATAA-AT-G--T-GCTT-GT-TC-A-TC----
gi|9 : gaaatattttaacctttttaa--T---ATCCA-TTGAT-C-T-ATCTTTCAT-------TCTG--T-AAA--TCA-ATATT-TGATT--CTTATAGA----T--GGTGACCCTCGA-CTTTTTG-CTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAAACCATAGAA--AAACTG-CT---A-A-ATT-TT-G-GTAAT-TTT-A-GTCC---A-AGTTA---TG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-A--AATTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--AAC-AA--A-A---TT-CATT--GTC-AAATT-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------A-TTT-TCAAAA----ACTGCA-AA---T-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-AATAGCTC---GT-T-ACT----A-TAATGGA-----AACGGG-TC--AC-TT--TT--C--AAAAT----AT-GTGCA-----G----CAATG-TTTTTTTTTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TCG-AT--------AGTG---GAA---TATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagcatagaaatccttaccaaatatttgtgatattttaaattgaaatgaaaactaaaaccccatttgtactctttttgtatataaataaactgttatcatggtaacgattcaattttcagaatatgtgtaacaatatctattgagattattcctattgaatgatataatttacagtggaatatttttcagtgaat
gi|21 : tggtccattgtttgtgttatatcacgctttatactgcatttagagc-AAA--CA--GTA--AAATTA-CT---AAT-TTT-TT-GGTCA---TTTGA-GCCT---G-AATTA---TG--AGC-C-----G-TGC-TA---actcttaaacattatctaaagcaa
gi|14 : -T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGTTA-C-AAATT--C---A-TAT--TAGC-A-----T-----------GTAG--CAT-AA--C-A---TT-CTTT--GTC-AA-AT-AACCAAA--A-AT-A-CAT---TAAATCAAAG--ATAAC--------T-TTT-TCTAAA----ACTTTA-AT---T-TTCC-T-G--T-TTTTCCCTC-TACA-T---A-TAG-CC---AC-TTACT----A-T--AGAA-----AC-CAG-TC--A--------------------------TGCA-----A----CACTA-ATCT---TTT--A-GA----------G----TTCTA-TTG--GATGAT-GACATATACATTTT-ATACATATACAGTG---GAA---TATT----TTTCAGTG--
gi|8 : AG--CAT-AG--A-A---AT-CCTT--ACC-AA-ATATTT--GT--G-AT-A-TTT---TAAATTGAAA--TGAAA--------A-CT-----AAA----ACCCCA-TT---T-GTAC-T-C--T-TTT----TG-TATA-T-A-AATAAACT---GT-T-A-T----C-A--TGGT-----AA-CGA-TTCAAT-TT--T---C--AGAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TCTA---TT---GAGA-TT----------ATTCCTA-TTG--AATGAT-ATAA-------TTT-AC--------AGTG---GAA---TATT----TTTCAGTG--
gi|15 : gaaatattttaacctttttaacctattgaatttttaatctgcttttatcatacattaaccttcttcctaaattaatatttgatttcctttaaatcatctgttttttcgctcaggagtcggtcacaaatatagcaatactgctattttgtggtcatttgaacctgatttatgagttgtgttacaataatgttatcattcccagataaatgtgcttgttcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaATTTAAA--CGATT--------A-TTT-TCTAAA----ACTACT-AT---T-TTCT-T-G--T-TTT---TTCCTATA-TGA-A-TAGCCT---GT-T-ACC----A-T---GGAT----AA-GAT-CC--AC-TT--TT--C--AGAAG----AA-GTGTA-----A----CGATA-TTTT---CTTT-AAG--TT-CAT---GT-ATTTCTG-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AT--------AGAG---GGA---CA-T----TTTCAGTG--CATG--GC-A-ACGA---TA----TCTAGAT--T--GT-TACAGA-GAACTGaat
gi|18 : A--------A-TTT-CTAAAA-----CTACA-AT---T-TTCC-T-G--T-TTT---TTCCTATA-T-A-A-AATGCC---GG-TTACC----A-T---GGA-----AA-CGACTC--AC------------------------------------------------T---TTTC-ATG--TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTG---GAA---AATC----TTTCAGTG--CGTG--gtat
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): ATGCATCAGGAGGATCACAACTTTACCCCTCCCCTATTTGCCTTAAATCATTTTTTTGATTATAGAATGCTTAAAAAATAGCTATTATTCAA
Unaligned ( gi|20 ): TGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGAT
Unaligned ( gi|22 ): CTGAGAATTGCTCTTAACAACTATGGAACAATGCTGTTGAAATATTTACTTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 1 22 444 2 4444444 2 33 1 1 1 1111 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3333333333333333333333 222 222222 11 555555 11 111 111111 1 1 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 1 33333333 44444444444444444444 22222222 1 22 222222 111 222222 1 2222222 111 2222 11 333333333 11 111 11 00000000000000000000000000000000 11 44444444444444 222222 444444444444444444444 11 6666666666666 1 555555555555555 1 11 222222222 222222222 88888888888888888888 55555555555555555555555 1111 1 1 1111 2222 11 111 11 11 11 11 22222 1 11111 444444444444444444 11 555555555555555555555555555 111 5555555555555555 1 111 2222222 1111111 1111 1111 2 1 222 11111 11111111 11 111111111 22 111 1111111 111111111111111 111111111111111111 11111111 11111111111111 1111111 111 222222222 111 1 1111 1111 2222222222 111 22222222222222222 11 11111111 111 1111 1 11111 2222222222 111111111 111 1111111 11111111
lowQualScore : 333 3 4 55 7 1 222 3 5555555 3 00 0 3 0 0 5555 00 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1111111111111111111111 333 7 555555 3 2 88 3 1 3 999999 66 333 1 3 33 111 666666 0 2 0 3 9 55 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666 8888 2 5 3 66666666 33333333333333333333 33333333 5 33 888888 0 111 2 000000 0 8888888 777 4 2 7777 11 222222222 2 33 777 00 99999999999999999999999999999999 77 1 66666666666666 2 00 1 888888 222222222222222222222 11 5555555555555 0 555555555555555 2 1 2 0 0 8 1 8888 1 8 3 11 888888888 8 8 555555555 22222222222222222222 1 33 0 8 0 5 8 99999999999999999999999 7777 1 1 0 1 777 5 4444 4444 44 8 8 99 444 8 99 11 99 5 11 00000 0 66666 1 5 999999999999999999 9 2 44 3 77 5 99 1 666666666666666666666666666 777 111 1111111111111111 3 5 1 88 6 9999 111 8888888 6 3 4444444 1 2222 4444 0 77 2 6 6 5 6 111 2 6 6 6 0 7 33333 66666666 7 6 55 888888888 5 1 888 1 1 5 5 77 555 3 2 5 00 888 66 1 5 5 333 1 1 66 4 4 66 4 1 66 3333333 777777777777777 4 3 6666 3 3 3 3 555 44 77 3 777777777777777777 44 77777777 88888888888888 444 3 44 3333333 222 3 555 3 3 6 6 99 7 777777777 999 3 55 3 3 77 1 44 3 444444444 77 777 6 3 0 0000 2 999999 3 44 1 3 88888 3 3 555 3 55 4 777 4 2222 3 0 44 3 88 3 3 3 3 3 9999999999 888 55 111 4 55 4 77777777777777777 55 3 00 3 666 3 1 55 3 1 7 3 88 55 3 3 3 666 44 66666666 3 1 77777 3 111 3 6 3 77 3 0000 6 3 5 3 6 99999 9999999999 44 44 3 6 666666666 9999 33 9999999999 3 000 3 3 55 3 0 888 3 3 44 1 33 0000000 3 55555555 777777 6666 44 55 88888 777 9999 99999 4 5
lowQualScore : ... . . .. . . ... . ....... . .. . . . . .... .. ...................................................................... . ...................... ... . ...... . . .. . . . ...... .. ... . . .. ... ...... . . . . . .. . ................................................... .... . . . ........ .................... ........ . .. ...... . ... . ...... . ....... ... . . .... .. ......... . .. ... .. ................................ .. . .............. . .. . ...... ..................... .. ............. . ............... . . . . . . . .... . . . .. ......... . . ......... .................... . .. . . . . . ....................... .... . . . . ... . .... .... .. . . .. ... . .. .. .. . .. ..... . ..... . . .................. . . .. . .. . .. . ........................... ... ... ................ . . . .. . .... ... ....... . . ....... . .... .... . .. . . . . . ... . . . . . . ..... ........ . . .. ......... . . ... . . . . .. ... . . . .. ... .. . . . ... . . .. . . .. . . .. ....... ............... . . .... . . . . ... .. .. . .................. .. ........ .............. ... . .. ....... ... . ... . . . . .. . ......... ... . .. . . .. . .. . ......... .. ... . . . .... . ...... . .. . . ..... . . ... . .. . ... . .... . . .. . .. . . . . . .......... ... .. ... . .. . ................. .. . .. . ... . . .. . . . . .. .. . . . ... .. ........ . . ..... . ... . . . .. . .... . . . . . ..... .......... .. .. . . ......... .... .. .......... . ... . . .. . . ... . . .. . .. ....... . ........ ...... .... .. .. ..... ... .... ..... . .
lowQualScore : 000 3 0 33 3 0 333 7 7777777 7 33 0 2 0 0 0000 33 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 7777777777777777777777 333 3 333333 2 5 88 2 0 2 222222 22 888 2 2 22 000 555555 0 5 0 2 2 88 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888 8888 5 5 0 88888888 88888888888888888888 22222222 5 88 888888 8 000 5 888888 0 5555555 555 0 5 2222 00 000000000 5 88 555 88 55555555555555555555555555555555 00 0 55555555555555 5 55 0 888888 222222222222222222222 00 0000000000000 0 888888888888888 5 0 5 0 8 0 0 0000 0 0 2 00 444444444 0 0 444444444 66666666666666666666 0 88 8 0 8 6 0 66666666666666666666666 0000 0 0 0 0 444 8 8888 0000 88 0 0 00 000 0 00 00 00 6 00 00000 0 44444 0 7 222222222222222222 3 2 33 7 00 2 22 0 000000000000000000000000000 555 777 2222222222222222 2 5 0 55 7 3333 777 3333333 7 0 5555555 0 5555 2222 0 77 2 7 7 0 7 888 5 7 7 7 3 5 77777 00000000 5 7 88 999999999 7 3 999 4 0 1 0 55 444 1 8 0 66 888 99 0 0 0 888 0 0 11 4 4 11 4 3 11 0000000 000000000000000 0 3 5555 1 1 1 1 444 22 33 1 000000000000000000 22 33333333 11111111111111 222 1 22 1111111 777 1 000 1 1 2 7 22 3 888888888 555 6 00 6 3 99 4 66 3 999999999 99 111 7 3 1 0000 9 666666 3 66 0 3 33333 3 3 888 6 44 9 000 0 5555 7 8 99 6 66 6 6 6 6 6 5555555555 000 55 000 0 55 0 33333333333333333 00 6 00 6 444 6 0 00 6 0 3 6 66 00 6 6 6 444 66 55555555 1 0 77777 1 222 1 2 1 33 1 8888 2 1 4 1 2 55555 4444444444 22 22 1 2 000000000 6666 88 4444444444 1 888 1 3 55 1 3 555 1 1 22 5 55 0000000 1 44444444 666666 5555 22 00 44444 000 4444 33333 4 0
consensus : CATTAAACAAA-TTAT-TTTG-AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGGTAT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC-CA-T----A------CAG-TAACATTACACAATGA----TGT-ACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGATTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-TA-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCACAAAA-A-TAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCTT--C--AACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATGG--AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGC-TG---TCATTTTCCTA----AATANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAA-CCTGA-----AA---ANTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--ATT-----T---TCAT-----T-----TTTATACGTTTGAGGATGA-----TC-------TACCCCCCCCCCC------CCCCAAACTC-TT--CCTT---CCC-AATTATN-AAAT-----ATT--AT-CTT-AGAAAATA-T-----T-ACCATATATTCACCCTGGCCCAGT-GAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TTA-ATT-AC--CA-TGA-TCATTCCAATT-TTACTGT-----AG-A-G-----GT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--CATCAC---TTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-TGCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATANCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TTT----ACCACCACN-CGGCGTGT-GT-TAA-TCGA-CTCCNT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTCTG-C-ATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTACAAAAC-CACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCGCA---AAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A---A-TTT--TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--C-AAAT-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TAGCCC---G-TTAC-----TNA--TGG--AAAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
Reference ( family-30 ) : CATTAANNNAACTTATNTTTGNAATTTGAGGTCTTNCCCTGTAAATAATGTATGGGTATCGGCGGATATGCCTCAAT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-GCAGCAGTGCCCACCCCATTCAAAAAACTTTCAGATAACATTACACAATGACTTTTGT-ACCTTTTCATCGCACACCCCCTGTNTTCACTT--GAATTCGCTAGATTTTC---CAGAATT---TTTTTCCCNAATAGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTNAAAGAAACGTACA---TAAACGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCACAAAA-A-TAATGGA--CATGT-GACCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTC-----------AACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATGG--AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGC-T----CCATTTTCCNA----AANANT------TNTTTT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AACATTT-TNT--TTAA-CCTGA-----AA---AATGAAAACT--AGG-NAAATTGA-T--AT---GGTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--ATT-----T---TCAC-----C-----TTTATACGTNTGAGGATGA-----TC-------TACCCCCCCNCCC------CCCCAGA-TC-TT--CCTT---CCC-AATTATN-AAAT-----A----AT-CTT-AGAAAATA-C-----T-ACCAT-TATTCANCCTAGCCTAGT-AAAATAA-CATTNAATTTTTGAA-TGCA--TTA-AT--AC--CA-TGA-TCANTCCAATTGTCACTG------A--A-G-----GT-GNAACGTGTGTCATTGC-GACGTAA-TG--CATCA----TTGTCAAT-AT-CAATG----TATNANACTNCCGGCAATATCTTACAT---AAACTTG-G--GTTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAGCA--GCAACTGCTTTGC--GGATAAA-----CGTGTCGGTT--TTNAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGNAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTACA-ATA---AAA--A---TGCTAGATANCCNAGT-TT-GGGCTTTGAA---TC-------ACA-TTCAATGAC-AGTTAATNTATCGGGAAACGNT-TTT----ACCAC-ACN-TGGCGTGT-GT-TAACTCGA-CTCCNTGCACACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATATAAAGTAATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATANCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTCTG-T-ATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTACAAAAC-C--TACTTA-TTATCTCCTANA-CTAGATATTCCGCA---AAGGGAGATAAC--TCAGTCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A---N-TTT--TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ANC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--C-AANT-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCNAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TAGCCC---GNTTAC-----TNN--TGG--AAAC--GGGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
gi|1 : TTAAACCAACTTATATTT--AATT-GAGGTTTTCC-----GAATAATGTATGGGTATCGGCGGATA-GCCTCAATATGGAACA-CAAT-AC-ACATTCT-T-GCAGCAGTGCCCACTCCATTCAAAA------CAG-TAACATTACACAAT-ACTTTTGT-ACCTTTTCATCACACACCCCCTGTGTTCACTT--GAATTCGCTAGATTTTC---CAGAATT---TTT--CCCTAATAGAGCTT-AATCGATC--TGT-GCTGTGAAAGAAACGCACAATCTATATTTGTCAAATTTGA-TGAAATTCA-TCACAAAA-A-TAA-AGA--CATGTTAAACACTTGAATTC-TTTACACA-ATT-ATTTCTTCTTTATCAAACA-AAATTTATCA-TAAATCA-TAATGCACTGTCACTGTTATGG--AAAGAAG-AGGGAG-------GAAGGGGC-TGTTGTCATTTTCCT-------TACT------TGTTTT-T-ATGAAAGAAA-ATTC--GGACACGATATCATCAGCA-T-AAAATTT-TTC--CTAA-CCT-------AA---ATTTAAAACTTTAGG-AAAATTAA-C--AACAAGTTAAATAAAC--CATGATCCGGATA-ATAATTAGTAGT---TCATTCTTTC-----TTTTTA--TTTGAAGATGA-----TT-------TA-------ACCC------CCCCAGACTC-TT--CCCTTC-CCC-AAGTATACAAAT-----ATTATAT-TGT-AGAAAATA-TCATATT-ATCATATATT-ACCCTGGCTCAGT-GCAA-AA-CATTGGATTTT-GAA-TGCA--TTA-ATT-GC--CA-TGA-TCA-TCCAATTATTATAGTTTTACA--A-GACCCGGC-GGAACGTGTGTCATTGCCAACGGAAATG--CTTGACCTCTTGTCAATTAT-CAATGCTTCTATAAAA--TCCAACAATATCTTACGT---AAACTTG-----TTTTCCA--CTGGC-A-TGAATT-CCCAA-TTTTCT--TAACACAGCAATTGCTTTGT--GGATAAC-----AGTTGCG--T--TTATATTTCCATG------------------AG--AACGC-AGAATAAA-CC--CCG--------A---------C--------AGCATAAATCCGCG---GTGCA-A-------A--C---TGC-AGATTACCCAGT-TTTGAACTTTGAAAATCC-------ACA-TCCCATGAC-A----ATATGTCTGGAAAC--T-TTT----ACCACCACT-TAGTGTGTTGT-TAACTCGA-CCCCT--CAAACGT-GAATACAT-CCAAAT-ACATACAG-GTGATGGT-AAGG---G-TGTT----A---AAATACCCCAT-AT-AACAACA-------T-TTTTCTG-C--TGTCTT-CATTTCCCTCCT-TTTACAAAAC-CGCTACTTA-TATTCGCTTGTA-CTAGATAT--CAC--------GGGATAAC--T-AATCAGCAATA-ATTG---AAGAAATTCATACT--T-TC-C-CTAC-CATTTTT--CTGT-------TATG-GATA---------T-----CAATTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTTTA-TC-CACC------TTATTTAAT--CAA-------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCTCT-T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCC-G-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAG-A--AAACTG-CTAA-A---T-TTT--TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-TAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG----CA-TC----AT-TGCAGATAA-AT-TTGT-ACAT-AT-TGAA-TC----A-AAATTTGCC--C-AAACT--T---A-TCT--CACT-A-----------------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGC--CAAATT-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTAAAG--TGACA--------ATTT-TCCAAA-----ACTGCA-A--ATATTCC-T-GTTT-TTT---TTC-TATA-TAA-A-TAGCCC---G-TTAC-----CTA--TG----CAC--GGGTCA-C-TT--T---T--CACATG---AT-GTGT------A----CAATATTTTT---TTTC-ACAA-TTCCAT---GT-AGATCTA--TG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGAAT---T--ATT----TTTTAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---
gi|10 : gggggtgtctttcacgaatgtccgcgacacggtccctttcccattaaaaaaataatgacgagtcccccccttccccggttcTTCCATC------------------AACAAATGGGAAAATGCAGCT--CGG--------A---------CCATATAGCAGTGTAAATC-G-G---GTACATATATTGAAG--A---C---AG-TATACAAGT-TT-GGGCTTCGAA---TCC------ATA-CTCAATGG--AGTTAATTTATCGGGAAATG-T-TTT----ATAAT-ACA-TGTAGCGT-GT-TAAATCGA-CTCCAC-CACACTG-TAACATAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATCAAAG---A-TGTTC---A---AAATA-CTCAC-A--AACAC-A-------T-TTTTTTGGT-ACGTCTTTCCTTCCCCTCCTGTTTATAA---------------TATC------A-CTA----CTCCGCA---ATGGGAGATAAC--TCAGTATGCAA-A-ATGC---AACACATTCAAATT--T-TC-T-ATGC-CAATTTT--CTATTATGTCATATGAAATG---------T-----TA-TTT-AC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTC-A-TCTCGTT------TT-T---AT--CA--------TTCA--------------T-T-T-ACCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGTTT-GTCTTAA-AT--
gi|11 : cTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC--ACC------TTAT---AT--CAG-------TTTA--------------T-C-T-AT--TG--T-------TCT---T-AA---TCA-ATATT-T---T-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGAACTTTT-GCCTCAGGA-T-TT--GC-CAAA-AAA--C-TAGAA--AAACTG-CT---A---AATTT--TGGTC----TTT-A-GTC--C-AA-T------T-AGG--ACT-T-----G-TGC-TA---CA-AA-G--G---ACA-TC----ATATC-AGATAA--T-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---ATTCCA---AACTT--TT--A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AG--A-A---TT-CATTGC--C-AAAT-TT-CC-AA--A-AT-A-TTT---GAAATTAAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTTCGT-G--T-TTT---CTT-T-TA-T-A-A-ATGCCC---GATTAC-----TA---TGG--AAAC--GGGT-A-C-TT--TTCAC--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TT-C-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTATTTG--AATGA--AACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GTGTACAGA-GAATTcagtgtattttatcaatctatctcaaaaacat
gi|12 : aaTAT-------TAATAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TG-TT-T---T--TTT-----------------TTAA---AT--------------TA--------------T-G-T-AGCTT-------------T---T-AAAAATCA-ATATT-TGATT-TTTCTTA-AT--G-TG---CT-GG-C-----GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAG-GAA---ATAGAA--AA-CTG-CTTGAA---A-TTT--TGGTCA---TTG-G-AGC--T-GAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CA-AT-AATG---ATA-TC----ATATCCAGA---------------------G-A-TC----ATA---TTGTTA---AACTC--T---A-TCT--CAGC-ATGTATT-----------GTAG--CAT--A--G-A---TT-CTTTGT--T-AAATATT-C---A--G-AT-A-TTT---TAGACTGAAG--TGAAA--------A-TT-CCTAAA-----ACTGCA-A--TT-TCCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-C-AGA-TAGAT-----ATCAC-----T-A--TGG--AAAC--GAGTCA-CATT--T---C--AGAATATGCAT-GTGTACATGTA----TAGTA-TTTT---TTTTAAAGA-------------------G-TTG--AGTGAG-GGCA-------TTT-AC--------AGTGG-A---T--ATT----TTTCAGTG--CGTT--CC-G-C-AA---TA----TTTTGGT--T--GT-TACAG
gi|13 : -------T-TTTCCTT-TGATTGCTTTCTGTGCCCTCCTGTTTATAACAC-CACTATTGT-TTATATCCTATA-TTAGATATTCCGAA---AAGGG-GATAAT--TCAATCTGTAA-A-ATTA---AACAAATCTATAAA--T-GT-C-ATGC-CAATTTT--CTAT-------TACAAAATA---------T-----CA-TTT-GA----C-C-AC-TTATTAT---T--TAT--A-TA-CATC--------AT---AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ACTCTC--T-------TCT---T-TAA--TCC-GTATT-TGATT-GTCTATA-AC--G-TG---CCTGG-CTTTT-G-CTCAGGGAT-TT--GC-CAAA-GAA--CATTGAA--AAACTG-CT---AC--A-TTT--TGGTCA---TTTGA-GCC--A-AAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CG-A
gi|14 : t-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGTTA-C-AAATT--C---A-TAT--TAGC-A-----T-----------GTAG--CAT-AA--C-A---TT-CTTTGT--C-AAAT-AA-CCAAA--A-AT-A-CAT---TAAATCAAAG--ATAAC--------TTTT-TCTAAA-----ACTTTA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTTTCCCTC-TACA-T---A-TAG-CC---ACTTAC-----T-A--TAG--AAAC--CAGTCA---------------------------TGCA-----A----CACTA-ATCT---TTT--A-GA----------G----TTCTA-TTG--GATGAT-GACATATACATTTT-ATACATATACAGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--ta
gi|15 : ATTTAAA--CGATT--------ATTT-TCTAAA-----ACTACT-A--TT-TTCT-T-G--T-TTT---TTCCTATA-TGA-A-TAGCCT---G-TTAC------CA--TGG--ATAA--GATCCA-C-TT--TT--C--AGAAG----AA-GTGTA-----A----CGATA-TTTT---CTTT-AAG--TT-CAT---GT-ATTTCTG-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AT--------AGAGGGA---C--A-T----TTTCAGTG--CATG--GC-A-ACGA---TA----TCTAGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|16 : CATTAACAAAA-TTATTTTTGAAATTTGAGATCTTATTCTGTAAATAATG-ATGGATG-----GGATATGCCT--AT-TGGAACAACAATAACAACATATT-gtat
gi|17 : ggggtgtgtgtgtcctgcgatgtcagcgacacgcatacccattaagaaataatgagtagccgcccgccccccccccccccgcccg-C--TACTTA-TTATCTCCTAAA-TTAGAAATTCAGCA---AAGGGAGATAAC--CCAGTATGCAA-A-ATGC---AACAAATTCAAATT--T-TC-T-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAAATG---------T-----AA-TTT-AC----C-C-AT-TGAGT-T---T--TTA--A-TC-TGGT------TGTT---AT--TA--------TCCA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGATT-attttactcacagt
gi|18 : tataatatcaA--------ATTT-C-TAAA-----ACTACA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTT---TTCCTATA-T-A-A-AATGCC---GGTTAC------CA--TGG--AAAC--GACTCA-C-TT--T------------------------------------------------TC-ATG--TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGAA---A--ATC----TTTCAGTG--CGTG--gtctt
gi|2 : attCATTAAACAAA-TTAT-TTTG-AATTTGAGGTCTATC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATTAT-ACAG--GTGC--ACCACAGT-----------------ACAT-ACAAAATA-----TGTTACCTTATTATCAC--------TGTGTTCACTT--G--------------TC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AAAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-TAAATACGTCAAAATTTGATGAAATTC--TCACAAAA-AATAA--GA--CATGT-AAACA-TTGAATTCCTTTACACGCATT-ATTTCTTTTTATCA-AACACA---TTATCACT----CACTG--------------TTATGGCGAAAGAAGGGAGGAG-GAGGGGGGGGGGGT-TG---TCATTTCTTTA----AATACT------TATTTTATGA----AGAAA-ACTC--GGACA----T-CATCAGGA-T-AAAATTT-TCC--TTAA-CCTAA-----AA---ATTTAAAACTT-AGT-GAAATTAA-C--AT---GTTAAATAAAC--CAA---TCAGATATA--ATT-----TAGTTCAT-----TCTTTTTTTATATTTTTGAAGATGA-----TT-------TACCCCCCCCCCC------CCCCAAACTC-TT--CCTT---CCCCAATTATC-AAAT-----ATT--AT-TTTTAGAAAATA-T-----TTATCATATATTCACCCTGGCTCAGTTGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TTA-AT--AC--CA-TGA-TCATTTCAATT--TACTT------AT-ACG-----GTCGGAACGTGTGTCATTAC-AATGTAA-TGTACATCA----TTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAAATTCAAACAGTA-CTTACGT---AAACTTG-G--TTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATC-C---A-TTTTCT--TAACA--GCA--TGCTTTGT--GGATAAA-----CATGTCGGTT--TTTAATTGCCATG------------------GG-AAACGC-AGAATAAACCC--CCG--------A---------C--------AGCATAATTC-G-G---GTGCA-ATA------------TGTTAGATATCTCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------GCA-TTCCATGAC-AAT--ATTTGTCTGGAAACTTT-TTT----ACCAC-ACT-TGGTGTGT-GT-TAA-TCGA-CTCCCT-CAAAGTG-AAATACAT-CCAAAT-ACATACAGAATGATGGTAAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAT-A--AACACTA-------T-TTTTCTG-C-ATGTCTTTCATTTCCCTCCTGTTTACAAAAC-C--CACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCGCA---AAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAAAAATTCATACT--T-TC-C-ATAC-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A---T-TTT--TTGTCA---TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGT--C-AATT-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TAGCCC---GTTTAC-----TTT--TGG--AAA---GGGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTGgcc
gi|21 : -AAA--CA--GTA--AAATTA-CT---A---A-TTTTTTGGTCA---TTTGA-GCC--T-GAAT------T-ATG--AGC-C-----G-TGC-TA---
gi|3 : -TGGAGCAACTGT-GC-ACATATT-TTATAG--ATGC--ATC---------AAACTTTCAAATAA---TACACAATGA--------ACCTTTT--TCGT--------TGTTTTCATTTTCGAATTCGAAAAATTCTCAGACATGATCACATGTTTCTGT-------TTTTCATG-ATCAATATTACTATAAAACA--TGTACA------ATGTGCCA---TTAAATGAGATTCAATTACAAAT-A-TAATGGCGTCATAT-GACCA-T-GATTTCATTTACACACATTCATTC-----------AA-------TCAT-A-T----CA-TA--------------TCATG---AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGC-T----T-ATTTTTCCA----AACAACAAAAAATTTTCT-T-A----AGAAATACTCTGGGACA----A-CATCAGAA-TTAACATTT-AAT--TTAT-CTTGA-----AAGAAAATGAAAA-T--AGG-TAAATTGA-TTAGT---GGTAAATAAACTACAT---TC----A-A--ATT-----T---TCAC-----A--------ATGCATCAGGGGATCACAACTTC-------TACCCCCCCCCTC------CCCCA----T-TTGGCCTTAAATTC-ATTTTTT-AAATTAGAGA----ATGCTT-AAAAAATAGC-----T-AC--T-TATTCATC-TAGCCTAGT-AAAATAAACAAATAATGATTGTA-TACA--TTTTATTTAC--CA-TGA-TCAACTCA--T-TCACTG------AGAA-A-----AT-GTAACATGT-TCAT-AT-GACGTAA-TG--C---------------T-ATGCAATG----TATCACACTACTGGCGATATCTTACAT-------TTGCG--GTTTTCCAA-CTGGCCA-TGAATA-C---A-CTTTTCAATAGCA--GCAA-TGTTTTGCCAAAATAAA-----CGT-TCAGATAGCTAAATT-CCATG------------------AGCAAATGG-A-AATGCAGCC--CCG--------AACCACATAAC--------AGCGTAAATC-G-G----TACA--TA---AAA--AGACTGCTAG-TGACACGTT-TT-G--CTTTGAA---TC-------ATA-TTCAA-AAC-GGTTTATGTATCGGAAAATGTC-TTTGGAAACTACTACGGCAGCCTGT-TT-TTA-TCAA-CTCCTTGCACACTG-GAATACACGTCAGGC-ACATATAAAGTAATGATCAAAGAAGG-T-TTT---A---AAATGCTCAAC-A--AACAC-A-------T-TTTTTGG-T-ATGTCTTGCCTTTCCCCTCTGTTTATCATTCAC--TACTTAATTATCTCCTAAAATTAGAAATTCCGCA---AAGG-AGATAACACTCAGTATGCAA-A---TGC--AACAAATTCAAATT--T-TC-TTGTGC-CAATTTT--CTAT-------TAGGAAATG---------T-----CA-TTT-AC----C-CCAC-TGAGT-T---T--TTT--AATC-TGGT------TGGTT--AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---G-AAT--TCA-ATATT-TGATTGTCTTCAA-ATCAG-TG---T---G-CTTTTCGTC---GCAGT-TTTGGT-C--A-AAA--CATAGTA--AAATTG-CTA--A---T-TTT--TGGTCATT-TTT-A-GCCTTT-GAAT------TAATG--AGC-C-----GCTGC-TA---CA-GT-AATG---GGA-TTTAAAATTTCCA-ATAGCAT-T--T-TCAT-AT-TT-T-TTTCAAA-A---TTGTTA-C-TACTT--T---G-TTT--CAATAA-----G-----------GTAA--CAT-AA--A-A---TT-CTTTGC--C-AAAT-AT-C--AA--ATATGA-TTT---T-AATTAAAG--C--AATCT-----ATTT-TCTTAA-----ACTAAA-ATTTT-TTCC-T-G--TGTTT---TCC-TATA-TAA-A-TAGCCC---G--TAC------CA--TGG--AAAC--GACTCA-C-TTTCT---C--AGAAT----AA-GTGGT-----A----TGAAA-TTTT---TTTC-TTAA-GT-TATG--GTAATTTCTA-TTG--AATTA--GACA-------TTCGAC--------AGTGGAA---A--ATT----TT--AGTG--CGTG--CC-A-C-CA---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|4 : aaAATAA-CATTGAAATTTTGAAATGCAACTTG-AT--ACACCACTGAATCAT--CAATTGTTACTGT-----A--A-----------TAACGGGTGTCACTGC-G-CA-AA-TG--TATCAC---TTGTTAA-----------------AAAAGTTCCA--AACAACTTACATTAAAAACTTT-GTCGTTTTCCAGGCTGGC-AATGAATCAC---A-ATTTCTC-TAACA--GCAACTGCTT-GT--GGATAAAAGTAACATGTCGTTT--TTAAATTCGCATGGACAAAATGGGTTGTGGGAGTAAAAGC-AGAAT--AACCGCCTG--------A---------C--------ACCATGAATC-G-G---GTGC---CA---AGACTA---TGTTTGATACC--AGTCTT-GAACTTTGAA---AC-------ACAATTCCATGACCAATCATTGTCT-GGAAAACGAT-TTT----ACCACCACT-TGGTGTGT-GTATAACTCGAACTCCCT-CAAAGTGCAAATACAT-CCAAATGACATACAGAATGATGTTAAAGG---GATGTTTTAAA---GAATAGCCCGC-ATTAA-ACCACGTATTTT-TTTTCGG-C-ATCGCTTTCATTTCCATCCTGTT-ACAAAAC-CACTACT-A-TTATCGCCTATA-CTAG-TATTCCACATCAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-ATATTGCAAAGGAAATTCATATCTAT-TC-C-ATAC-CAGTTTTTCTTAT-------T-TGAGATA---------TCTTCACA-TTT-GC----CAC-ACAGGATC-T---TTATTT--A-TC-CATCCTGGTATTAT---AA--TA--------TCTA--------------T-C-TCATCTTC--TA------TCTGAATAAAA--TCAGGTATTATGAAT-TACTCTA-AT--GCTG---CCCAC-TTTTC-TGCTCAGGAGTCTT--GCACAAATAAAC-CATAGAA--AAACTG-CT---AAATT-TTC--TGGTTAAATTTT-ACGTC--CAGAGT------T-ATG--ACCGT-----G-GGCATA---CACAA-ATTGTACATA-TCG---ATATCCAGATAA-ATAT--TAACAT-ATCTG-ACTCAGA-A-A---ATGCCATC-AACTTAAT---AGTCTCACACT-A-----T-----------GAGA--AAC-AA--ACA---TTCCATTGCGTC-AATT-TT-C--AA--A-TA-A-TTTATATAAATTGAAGTTTGAAA--------ATTT-TCCAAAAAAAGACAGCATA--AT-GTCCTT-G--T-TTTTC-TTC-TATA-TAA-A-TAGCTT---CCTTACTAAAATAA--TGGACAAACGAGAGTCA-C-TTTGT---CAAAAAAT----ATCGTGCA-----GGAGTCAATG-TTTTTTGTTTC-ACAG-AT-CATCTCAT-TTTTCTA-TTGAAAATGATAAACA--------CC-ATCG------AGTGGAAACTT--ATTTTTGTTTCAGTG--CGTG--CCAG-A-AAAGTTAGACTTTTCGGTACC--GT-TACAAA-GAgtattaaaatctgtctcaa
gi|5 : CTTTCATGGATCC-TATTGCTATAAAAGAAATGTACA------ATGTTTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAAAAAATA-TAATGGA--CATGT-GACCA-TTGAATTTATTTACATAC----ATTC----------------A---TTACAA-T----CA-TA--------------TCAT-G--AGAGTAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCTT----CCATATTCCAAAATGAAAAAT--------TTCT-T-A----AGAAATACTTG-GGACA----A-CATCAGAATT-AACATTTATCTTATTAATCTTGAAAACGAA---AATGAAAGGC--AGGCGAAATTGATT--AT---GGTAAATAAAC--TAT---TCAAATA-------------------------T-----TTTACATGTATCAGGGTGA-----TCAGAACTGTACCTTCCCTCCCCATTTGCCTTAAA-TCATT--ATTT-----T-AATTATA-GAAT-----G-------CTT-AGAAAATA---------GCCAT-TATTCAATCTAGCCTAGT-AAAATAA-CACTTAAT------A-T-----TTA---------CA-TGA-TCACTC--AT--TCACTG------AG-A-A-----AT-GTAAC--GTGTCATTAT-GACGTAA-TG--AA--A----CT---ACT-CT-CAATG----CATCACACTACTGGCAATA-CTTACAT---AAACTTG-C--GTTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATA-C---ACTTTTCA--TAGCA--GCAA-TGTTTGGC--AAATAAA-----CGTCTAGATA--GCTAGCTTCAATG------------------AGCAAATGTGAAAATGCAGCC--CGGAATACATAA---------C--------AGTGTAAATC-C-GTACGTATA-TTA---AAA--AC--TGCTAG-TATACAAGT-TT-TGGCTTTGAA---TCCACATGTATA-TTCAATAA--AGTTAATGTATCGGGATATGTTCTTT----GATAC-ACG-CAGCGTGT-TT-TA--TCAA-CTCCATGCACACTG-GAATGCAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATTAAAG---A-TGTTT---ACTTAAATCGCCCACAA--AACGACA-------TCTTTTCGG-T-ATGTCTTTCTTgtacattcactctaaaaatctatctaaa
gi|6 : aaaactctcaagactgatcagcgtctatgcAAATT--TGTCTC-G-GCGCAATTTT--CTAT-------TAT-AGACAAATGTAGGCT-----AA-TTTAGCACTGC-C-AC-TGAGT-T---T--TTT--A-TC-TGTT------GTA----AT--CACTTTAGTTTTTA--------------TACAT-ATCATC--TCTGACAATTT---T-GTA--CAA-ATATT-TGATTGTCTTCAAGATCAG-TG------GG-CTTC--GTCACAG---T-TG--GT-CAAA-AAA--CATAGAAGTAAATTGGCT---A---A-TTT--TGTGCA---TTTTA-GCC--TTGAATAGTTAAT-ATGGGATT-TCGACGG-TGC-CAGTTCA-GTTAATG---ATAATA----ATTTCCAAATAC-TT-TG-T-TCAT--T-TG-T-TTCAA-A-A---TTGTTA-CTGACTT--TTGGA-TTT--CAAT-A-----TAAGCGGATTGAGCAG--TAA-GAGAA-A---TT-CTTTGC--C-AAAT-AT-C--AATTG-AT-A-TT------AGTTAATG--TAAAGCACGCATTATTT-CGTAAA-----ACTACA-A---T-TTCC-TAG--T-TAT---TTC-TATAAT-A-A-AAGCCTCCGGGTTAC-----TAT--GGG--GAAC--GACTCA-C-TT--T---A--GAATT----AA-GTGTA-----A-----AATA-TTTT---TTTC-TTAAGTT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGGA---GAAATT----TTTCAGTGTTTGTGCACC------A---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGAGGAACTG
gi|7 : gctcaataatcatacctgaagattagaccacaggatgtccgcttccaaagggattagaccgtgaagactacagtatgtataagaattcagacaggactgttcaaTACAAAAC-CACTACTTA-TTATCTCCTACA-CTAGATATTCTGCA---AAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAGAAATTCATATT--T-TC-C-ATAT-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----AA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACA------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CTA--A---A-TTT--TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ACTG---ACA-TC----ATATCAAGA-AA-AA-T--T-ACATGAA-TG-A-TCAA--A-A---TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GC-GTTCACTAATTA-AATTTT-CATTGT--C-AAAT-TT-C--AA--A-AT-AGTTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTTACAAAAA-----ACTGCA-A---T-TTCT-T-GT-T-TTT---CTC-TATA-TAA-A-TAGCCC---G-TTAC-----T-A--TGG--AAAC--GGGTCA-CTTT--T---C--AAAAT----AT--TGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-C-T---GT-ATTTCTA--TG--AAT-AT-AACA-------TTT-AT--------A-TGGAA---T--GAT----TTTCAGTG--CGTG--CC-GCA-AA---AA----TTTTGGT--CCTGT-TACAGA-GAATTttattaaggtgt
gi|8 : C----C-T-AT-TGAAT-T---T--TTA--A-TC-TGCT------TT-T---AT--CA--------TACA--------------T-T-A-ACCTTC--T-------TCC---T-AAA--TTA-ATATT-TGATT-TCCTTTA-AA--T-CA---TCTGT-TTTTT-CGCTCAGGAGT-CG--GT-C-AC-AAA--TATAGCA--ATACTG-CT---A---T-TTTG-TGGTCA---TTTGA-ACC--T-GATT------T-ATG--AGT-T-----G-TGT-TA---CA-AT-AATG---TTA-TC----ATTCCCAGATAA-AT-G--T-GCTT-GT-TC-A-TC----tgct
gi|8 : gaaatattttaacctttttaaAG--CAT-AG--A-A---AT-CCTTAC--C-AAATATT-T--GT--G-AT-A-TTT---TAAATTGAAA--TGAAA--------A-----CTAAA-----ACCCCA-T--TT-GTAC-T-C--T-TTT----TG-TATA-T-A-AATAAACT---G-TTA------TCA--TGG--TAAC--GATTCAAT-TT--T---C--AGAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TCTA---TT---GAGA-TT----------ATTCCTA-TTG--AATGAT-ATAA-------TTT-AC--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagcatagaaatccttaccaaatatttgtgatattttaaattgaaatgaaaactaaaaccccatttgtactctttttgtatataaataaactgttatcatggtaacgattcaattttcagaatatgtgtaacaatatctattgagattattcctattgaatgatataatttacagtggaatatttttcagtgaat
gi|9 : gaaatattttaacctttttaacctattgaatttttaatctgcttttatcatacattaaccttcttcctaaattaatatttgatttcctttaaatcatctgttttttcgctcaggagtcggtcacaaatatagcaatactgctattttgtggtcatttgaacctgatttatgagttgtgttacaataatgttatcattcccagataaatgtgcttgttcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaa-GT----C-C-AT-TG-TT-TGTGT--TAT--A-TCACGCT------TTAT---ACTGCA--------TTTAGAGCTATCCATTGAT-C-T-ATCTTTCAT-------TCTG--T-AAA--TCA-ATATT-TGATT--CTTATAGAT--GGTGACCCTCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAAACCATAGAA--AAACTG-CT---A---AATTT--TGGTAA---TTTTA-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ATTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--AAC-AA--A-A---TT-CATTGT--C-AAAT-TTTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-TCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-AATAGCTC---G-TTAC-----TATAATGG--AAAC--GGGTCA-C-TT--TT--C--AAAAT----AT-GTGCA-----G----CAATG-TTTTTTTTTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TCG-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTaat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): ATGCATCAGGAGGATCACAACTTTACCCCTCCCCTATTTGCCTTAAATCATTTTTTTGATTATAGAATGCTTAAAAAATAGCTATTATTCAA
Unaligned ( gi|20 ): TGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGAT
Unaligned ( gi|22 ): CTGAGAATTGCTCTTAACAACTATGGAACAATGCTGTTGAAATATTTACTTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 222 222 1 22222222 1 11 1 1 1 111 11 77777777777777777 111 1 55555555 1 44444444 555555555555555555555555 222 22222 11 55555555 11 1 1 111111 1 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1 22222 444444444444444 22222222 1 22 222222 111 111111 1 111 2222 1111 11 333333333 11 111 11 99999999999999999999999999999 11 44444444444444 5555555555555555555 2 44444 11 333333 11 5555555 1 11 222222 5555555555555555555555555555555 55555555555555555555555 1111 1 1111 2222 11 111 11 11 11 22222 11111 444444444444444444 11 11 555555555555555555555555555 111 5555555555555555 1 11 111 2222222 1111111 1111 11111111 1 11111 11111111 11 1111111 11111 111 1111111 111111111111111 111111111111111111 11111111 11111111111111 1111111 111 222 111 1 1111 1111 2222222222 22222222222222222 11 11111111 111 1111 1 333333333 111111111 111 1111111 11111111
lowQualScore : 3 222 7 1 333 7 3 55555555 3 88 0 3 0 0 444 88 77777777777777777 333 6 33333333 2 0 88888888 333333333333333333333333 333 7 22222 3 2 88 3 3 44444444 333 1 3 33 0 0 666666 0 1 0 3 9 55 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8888 2 5 3 77777 44 444444444444444 33333333 5 33 888888 0 111 1 999999 0 6 777 1 1 1111 6666 00 111111111 1 33 777 00 99999999999999999999999999999 77 1 66666666666666 22 9999999999999999999 0 0 0 11111 11 444444 33 2222222 999 2 0 2 0 0 8 8888 1 8 3 11 444444 8 8 9999999999999999999999999999999 0 33 0 8 0 5 8 33333333333333333333333 7777 0 0 8 1 777 5 4444 4444 44 8 8 99 444 8 99 11 0 8 8 5 11 00000 8 66666 1 5 999999999999999999 9 2 44 3 00 99 1 666666666666666666666666666 777 111 1111111111111111 3 5 00 6 6 4 111 8888888 6 1 4444444 1 2 6 6 4444 77 9999 44444444 6 1 3 1 6 6 6 0 7 33333 66666666 6 6 55 77 8888888 5 77777 4 1 1 5 6 3 5 2 5 00 888 66 1 5 5 333 1 1 66 4 4 66 4 1 66 3333333 777777777777777 4 3 6666 3 3 3 3 555 44 77 3 777777777777777777 44 77777777 88888888888888 444 3 44 3333333 222 3 555 3 3 6 6 99 7 777777777 999 3 55 3 3 77 1 44 3 999 3 000 44 3 777 6 3 0 0000 2 999999 3 44 1 3 88888 3 3 555 3 55 4 777 4 2222 3 0 44 3 88 3 3 3 3 3 9999999999 888 4 55 777 4 55 4 77777777777777777 55 3 00 3 666 3 1 55 3 7 7 55 55 3 3 3 666 44 66666666 3 1 77777 3 111 3 6 3 77 3 0000 6 3 5 3 6 3 44 999999 111111111 44 3 44 3 6 666666666 9999 33 9999999999 3 000 3 3 55 3 0 888 3 3 44 1 33 0000000 3 55555555 777777 6666 44 55 88888 777 9999 99999 4 5
lowQualScore : . ... . . ... . . ........ . .. . . . . ... .. ................. ... . ........ . . ........ ........................ ... . ..... . . .. . . ........ ... . . .. . . ...... . . . . . .. . ...................................................... .... . . . ..... .. ............... ........ . .. ...... . ... . ...... . . ... . . .... .... .. ......... . .. ... .. ............................. .. . .............. .. ................... . . . ..... .. ...... .. ....... ... . . . . . . .... . . . .. ...... . . ............................... . .. . . . . . ....................... .... . . . . ... . .... .... .. . . .. ... . .. .. . . . . .. ..... . ..... . . .................. . . .. . .. .. . ........................... ... ... ................ . . .. . . . ... ....... . . ....... . . . . .... .. .... ........ . . . . . . . . . ..... ........ . . .. .. ....... . ..... . . . . . . . . . .. ... .. . . . ... . . .. . . .. . . .. ....... ............... . . .... . . . . ... .. .. . .................. .. ........ .............. ... . .. ....... ... . ... . . . . .. . ......... ... . .. . . .. . .. . ... . ... .. . ... . . . .... . ...... . .. . . ..... . . ... . .. . ... . .... . . .. . .. . . . . . .......... ... . .. ... . .. . ................. .. . .. . ... . . .. . . . .. .. . . . ... .. ........ . . ..... . ... . . . .. . .... . . . . . . .. ...... ......... .. . .. . . ......... .... .. .......... . ... . . .. . . ... . . .. . .. ....... . ........ ...... .... .. .. ..... ... .... ..... . .
lowQualScore : 3 000 3 0 333 3 3 77777777 3 33 0 2 0 0 333 33 77777777777777777 000 0 33333333 0 7 33333333 777777777777777777777777 333 3 33333 2 5 88 2 2 88888888 888 2 2 22 0 0 555555 0 0 0 2 2 88 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 5 5 0 00000 55 555555555555555 22222222 5 88 888888 8 000 0 555555 0 5 555 0 0 2222 5555 22 555555555 0 88 555 88 22222222222222222222222222222 00 2 55555555555555 88 0000000000000000000 2 0 2 55555 00 888888 88 0000000 555 5 2 5 0 8 0 0000 0 0 2 00 666666 0 0 2222222222222222222222222222222 6 88 8 0 8 6 0 44444444444444444444444 0000 6 6 8 4 444 8 8888 0000 44 0 0 00 000 0 00 00 8 0 0 6 00 00000 8 44444 4 7 222222222222222222 3 2 33 7 33 22 0 000000000000000000000000000 555 777 2222222222222222 2 5 00 7 7 2 777 3333333 7 0 5555555 0 5 7 7 2222 77 0000 22222222 7 0 3 0 7 7 7 3 5 77777 00000000 7 7 88 77 6666666 7 00000 0 4 0 0 6 2 0 4 0 66 888 99 0 0 0 888 0 0 11 4 4 11 4 3 11 0000000 000000000000000 0 3 5555 1 1 1 1 444 22 33 1 000000000000000000 22 33333333 11111111111111 222 1 22 1111111 777 1 000 1 1 2 7 22 3 888888888 555 6 00 6 3 99 4 66 3 222 3 444 66 3 111 7 3 1 0000 9 666666 3 66 8 3 33333 3 3 888 6 44 9 000 0 5555 7 8 99 6 66 6 6 6 6 6 5555555555 000 0 55 000 0 55 0 33333333333333333 00 6 00 6 444 6 0 00 6 3 3 00 00 6 6 6 444 66 55555555 1 3 77777 1 222 1 2 1 33 1 8888 2 1 4 1 2 1 22 777777 444444444 22 1 22 1 2 000000000 6666 88 4444444444 1 888 1 3 55 1 3 555 1 1 22 5 55 0000000 1 44444444 666666 5555 22 00 44444 000 4444 33333 4 0
consensus : CATTAAACAAA-TTATTTT--NAATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--AC-C-A---T-----ACAGTAACA-TACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAA-CCTGAAA---ATTNA----AAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--ATT-G---TTCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGA-----TC-------TACCCCCCCCCCCC-----CCCA----------AACTCATTCCTTC-CCCAATTATA-GAATGTTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATTTCAATT-TTACTGT------AGAC--GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACG-TAGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TC--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
Reference ( family-30 ) : CATTAAACAAA-TTATTTT--GAATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGGTAT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--AC-CCA---T-----ACAGTAACATTACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAA-CCTGAAA---ANTNA----AAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--ATT-----TTCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGA-----TC-------TACCCCCCCCCCCC-----CCCA----------AACTC-TTCCTT--CCCAATTATN-AAATATTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATTCCAATT-TTACTGT------AGA---GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATANCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACN-CGGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCNT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TN--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
gi|1 : TTAAACCAACTTATATT--TAATT-GAGGTTTTCC---G--AATAATGTATGGGTATCGGCGGATA-GCCTCAATATGGAACA-CAAT-AC-ACATTCT-T-GCAGCAGTGCCCACTCCA---TTCAAAACAGTAACATTACACAATACTTTTG-TACCTTTTCATCACACACCCCCTGTGTTCACTT--GAATTCGCTAGA--TTTTC---CAGAATT---TTT--CCCTAATAGAGCTT-AATCGATC--TGT-GCTGTGAAAGAAACGCACAATCT-ATATTTGTCAAATTTGA-TGAAATTCA-TCAC-AAAA-ATAA-AGA--CATGTTAAACACTTGAATTC-TTTACACA-ATT-ATTTCTTCT--TT-ATCAAACA-AAATTTATCA-TAAATCA-TAATGCACTGTCACTGTTATG--GAAAGAAG-AGGGAG-------GAAGGGGCTGTTGTCATTTTCCT---T----ACT------TGTTTT-T-ATGAAAGAAA-ATTC--GGACACGATATCATCAGCA-T-AAAATTT-TTC--CTAA-CCT--AA---ATTTA----AAACTTTAGG-AAAATTAA-C--AACAAGTTAAATAAAC--CATGATCCGGATA-ATAATTAGTAGTTCA-----TTCTTTCTTTTTA--TTTGAAGATGA-----TT-------TAACCCCCCC------------A----------GACTC-TTCCCTTCCCCAAGTATACAAATATTA-TATTGTAGAAAATA-TCATATTATCATATATT-ACCCTGGCTCAG-TGCAA-AA-CATTGGATTTT-GAA-TGCA--TT--AAT-TGCCA-TGA-TCAT-CCAATTATTATAGTTTTACAAGACCCGGC-GGAACGTGTGTCATTGCCAACGGAAATG--CTTGACCTCTTGTCAATTAT-CAATGCTTCTATAAAA--TCCAACAATATCTTACGT---AAACTTG-----TTTTCCA--CTGGC-A-TGAATT-CCCAA-TTTTCT--TAACACAGCAA-TTGCTTTGT--GGATAAC-----AGTTGCG--T--TTATATTTCCATG------------------AG--AACGC-AGAATA-AACC--CCG--------A---------C--------AGCATAAATCCGCG---GTGCA-A-------A--C---TGC-AGATTACCCAGT-TTTGAACTTTGAAAATCC-------ACA-TCCCATGAC-A----ATATGTCTGGAAAC--T-TT-T----ACCACCACT-TAGTGTGTTGT-TAACTCG-AC-CCCT-CAAACGT-GAATACAT-CCAAAT-ACATACAG-GTGATGGT-AAGG---G-TGTT----A---AAATACCCCAT-AT-AACAACA-------T-TTTTC---T-GC-TGTCTT-CATTTCCCTCCT-TTTA-CAAAACCGCTACTTA-TATTCGCTTGTA-CTAGATAT--CA---C-----GGGATAAC--T-AATCAGCAATA-ATTG---AAGAAATTCATACT--T-TC-C-CTAC-CATTTTT--CTGT-------TATG-GATA---------T-----CAATTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTTTA-TC-CACC------TTATTTAAT--CAA-------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCTCT-T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCC-G-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAG-A--AAACTG-CT---A-AAT-T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-TAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG----CA-TC----AT-TGCAGATAA-AT-TTGT-ACAT-AT-TGAA-TC----A-AAATTTGCC--C-AAA-CT--T---A-TCT--CACT-A-----------------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGC--CAAATT-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTAAAG--TGACA--------ATTT-TCCAAA-----ACTGCA-A--ATATTCC-T-GTTT-TTT---TTC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----CT--ATG-----CAC--GGGTCA-C-TT--T---T--CACATG---AT-GTGT------A----CAATATTTTT---TTTC-ACAA-TTCCAT---GT-AGATCTA--TG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGAAT---T--ATT----TTTTAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---
gi|10 : gggggtgtctttcacgaatgtccgcgacacggtccctttcccattaaaaaaataatgacgagtcccccccttccccggttcTTCCATC------------------AACAAATGGGAAAATGCAGCT--CGG--------A---------CCATATAGCAGTGTAAATC-G-G---GTACATATATTGAAG--A---C---AG-TATACAAGT-TT-GGGCTTCGAA---TCC------ATA-CTCAATGG--AGTTAATTTATCGGGAAATGTT-TTAT----AATAC-ATG-TAGCGTGT--T-AAA-TCG-ACTCCAC-CACACTG-TAACATAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATCAAAG---A-TGTTC---A---AAATA-CTCAC-A--AACA-CA-------T-TTTTT---TGGTACGTCTTTCCTTCCCCTCCTGTTTA-TAATATCACTAC-------------------------TCCG---CAATGGGAGATAAC--TCAGTATGCAA-A-ATGC---AACACATTCAAATT--T-TC-T-ATGC-CAATTTT--CTATTATGTCATATGAAATG---------T-----TA-TTT-AC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTC-A-TCTCGTT------TT-T---AT--CA--------TTCA--------------T-T-T-ACCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGTTT-GTCTTAA-AT--
gi|11 : cTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC--ACC------TTAT---AT--CAG-------TTTA--------------T-C-T-AT--TG--T-------TCT---T-AA---TCA-ATATT-T---T-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGAACTTTT-GCCTCAGGA-T-TT--GC-CAAA-AAA--C-TAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTC----TTT-A-GTC--C-AA-T------T-AGG--ACT-T-----G-TGC-TA---CA-AA-G--G---ACA-TC----ATATC-AGATAA--T-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---ATTCCA---AACTTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AG--A-A---TT-CATTGC--CAAA-T-TTCC--AA--A-AT-A-TTT---GAAATTAAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTTCGT-G--T-TTT---CTT-T-TA-T-A-A-AT-GC--CC----GATTAC-----T---ATGG--A-AAC--GGGT-A-C-TT--TTCAC--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA--TTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTATTTG--AATGA--AACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GTGTACAGA-GAATTcagtgtattttatcaatctatctcaaaaacat
gi|12 : aaTAT-------TAATAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TG-TT-T---T--TTT-----------------TTAA---AT--------------TA--------------T-G-T-AGCTT-------------T---T-AAAAATCA-ATATT-TGATT-TTTCTTA-AT--G-TG---CT-GG-C-----GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAG-GAA---ATAGAA--AA-CTG-CTTGAA-A---T--TT-TGGTCA---TTG-G-AGC--T-GAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CA-AT-AATG---ATA-TC----ATATCCAGA---------------------G-A-TC----ATA---TTGTTA---AAC-TC--T---A-TCT--CAGC-ATGTATT-----------GTAG--CAT--A--G-A---TT-CTTTGT--TAAA-TATT-C---A--G-AT-A-TTT---TAGACTGAAG--TGAAA--------A-TT-CCTAAA-----ACTGCA-A--TT-TCCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-C-AGA-TA-G---AT----A-TCAC-----T---ATGG--A-AAC--GAGTCA-CATT--T---C--AGAATATGCAT-GTGTACATGTA----TAGTA-TTTT---TTTTAAAGA-------------------G-TTG--AGTGAG-GGCA-------TTT-AC--------AGTGG-A---T--ATT----TTTCAGTG--CGTT--CC-G-C-AA---TA----TTTTGGT--T--GT-TACAG
gi|13 : -------T-TTTTCCTTT-G-ATTGCTTTCTGTGCCCTCCTGTTTA-TAACACCACTATTGT-TTATATCCTATA-TTAGATATTCCG---AAAAGGG-GATAAT--TCAATCTGTAA-A-ATTA---AACAAATCTATAAA--T-GT-C-ATGC-CAATTTT--CTAT-------TACAAAATA---------T-----CA-TTT-GA----C-C-AC-TTATTAT---T--TAT--A-TA-CATC--------AT---AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ACTCTC--T-------TCT---T-TAA--TCC-GTATT-TGATT-GTCTATA-AC--G-TG---CCTGG-CTTTT-G-CTCAGGGAT-TT--GC-CAAA-GAA--CATTGAA--AAACTG-CT---ACA---T--TT-TGGTCA---TTTGA-GCC--A-AAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CG-A
gi|14 : -T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGTTA-C-AAA-TT--C---A-TAT--TAGC-A-----T-----------GTAG--CAT-AA--C-A---TT-CTTTGT--CAAA-T-AA-CCAAA--A-AT-A-CAT---TAAATCAAAG--ATAAC--------TTTT-TCTAAA-----ACTTTA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTTTCCCTC-TACA-T---A-TA-GC--CA----C-TTAC-----T---ATAG--A-AAC--CAGTCA---------------------------TGCA-----A----CACTA-ATCT---TTT--A-GA----------G----TTCTA-TTG--GATGAT-GACATATACATTTT-ATACATATACAGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--ta
gi|15 : ATTTAAA--CGATT--------ATTT-TCTAAA-----ACTACT-A--TT-TTCT-T-G--T-TTT---TTCCTATA-TGA-A-TA-GC--CT----G-TTAC------C--ATGG--A-TAA--GATCCA-C-TT--TT--C--AGAAG----AA-GTGTA-----A----CGATA-TTTT---CTTT-AAG--TT-CAT---GT-ATTTCTG-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AT--------AGAGGGA---C--A-T----TTTCAGTG--CATG--GC-A-ACGA---TA----TCTAGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|16 : CATTAACAAAA-TTATTTTTGAAATTTGAGATCTTATTCTGTAAATAATG-ATGG--AT--G-GGATATGCCT--AT-TGGAACAACAATAACAACATATT-gtat
gi|17 : ggggtgtgtgtgtcctgcgatgtcagcgacacgcatacccattaagaaataatgagtagccgcccgccccccccccccccgcccgTA-TAATATCACTACTTA-TTATCTCCTAAA-TTAGAAATTCAG---CAAAGGGAGATAAC--CCAGTATGCAA-A-ATGC---AACAAATTCAAATT--T-TC-T-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAAATG---------T-----AA-TTT-AC----C-C-AT-TGAGT-T---T--TTA--A-TC-TGGT------TGTT---AT--TA--------TCCA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGATT-attttactcacagt
gi|18 : A--------ATTT-C-TAAA-----ACTACA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTT---TTCCTATA-T-A-A-AATGC--CG----G-TTAC------C--ATGG--A-AAC--GACTCA-C-TT--T------------------------------------------------TC-ATG--TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGAA---A--ATC----TTTCAGTG--CGTG--gtctt
gi|2 : attCATTAAACAAA-TTATTTT--GAATTTGAGGTCTATC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATTAT-ACAG--GTGC--AC-C-----------ACAGT-ACA-TACAAAAT-AT---GTTACCTTATTATCAC--------TGTGTTCACTT--G----------------TC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AAAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-TAA-ATACGTCAAAATTTGATGAAATTC--TCACAAAAA-ATAA--GA--CATGT-AAACA-TTGAATTCCTTTACACGCATT-ATTTCTTTTTATCAA----ACACA---TTATCACT----CACTG--------------TTATGGCGAAAGAAGGGAGGAG-GAGGGGGGGGGGGTTGT---CATTTCTTTAAAT----ACT------TATTTTATGA----AGAAA-ACTC--GGACA----T-CATCAGGA-T-AAAATTT-TCC--TTAA-CCTAAAA---ATTTA----AAACTT-AGT-GAAATTAA-C--AT---GTTAAATAAAC--CAA---TCAGATATA--ATTTAG--TTCATTCTTTT-----TTTATATTTTTGAAGATGA-----TT-------TACCCCCCCCCCCC-----CCCA----------AACTC-TTCCTTC-CCCAATTATC-AAATATTATTTTT--AGAAAATATT-----TATCATATATTCACCCTGGCTCAGTTGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AA--TACCA-TGA-TCATTTCAA-T-TTACT-T------ATAC--GGTCGGAACGTGTGTCATTAC-AATGTAA-TGTAC---ATCA-TTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAAATTCAAACAGTA-CTTACGT---AAACTTG-G--TTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATC-C---A-TTTTCT--TAACA--GC-A-T-GCTTTGT--GGATAAA-----CATGTCGGTT--TTTAATTGCCATG------------------GG-AAACGC-AGAATAAACCC--CCG--------A---------C--------AGCATAATTC-G-G---GTGCA-AT---------A---TGTTAGATATCTCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------GCA-TTCCATGAC-AAT--ATTTGTCTGGAAACTTT-TT-T----ACCA-CACT-TGGTGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CAAAGTG-AAATACAT-CCAAAT-ACATACAGAATGATGGTAAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAT-A--AACACTA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCATTTCCCTCCTGTTTA-CAAAAC--CCACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAAAAATTCATACT--T-TC-C-ATAC-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-T---T--TT-TTGTCA---TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAT-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----GTTTAC-----TT--TTGG--A-AA---GGGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTGgcc
gi|21 : -AAA--CA--GTA--AAATTA-CT---A-A---TTTTT-TGGTCA---TTTGA-GCC--T-GAAT------T-ATG--AGC-C-----G-TGC-TA---
gi|3 : -TGGAGCAACTGT-GC-ACATATT-TTATAG--ATGC--AT-CAAACTT-----TCA--AATAATACACAATGA-------ACCTTTT--TCGT--------TGTTTTCATTTTCGAATTCG--AAAAATTCTCAGACATGATCACATGTTTCTGT-------TTTTCATG-ATCAATATTACTATAAAACA--TGTACAAT-------GTGCCA---TTAAATGAGATTCAATTAC-AAAT-ATAATGGCGTCATAT-GACCA-T-GATTTCATTTACACACATTCATTC-----------------A-A---TCAT-A-T----CA-TA--------------TCATG---AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCT-----TATTTTTCCAAAC----AACAAAAAATTTTCT-T-A----AGAAATACTCTGGGACA----A-CATCAGAA-TTAACATTT-AAT--TTAT-CTTGAAAGAAAATGA----AAA--T-AGG-TAAATTGA-TTAGT---GGTAAATAAACTACAT---TC----A-A--ATT-----TTCA-----CA--------ATGCATCAGGGGATCACAACTTC-------TACCCCCCCCCTCC-----CCCATTTGGCCTTAAATTCATTTTTT--A--AATTAGA-GAATG-----CTT--AAAAAATAGC-----TACT---TATTCATC-TAGCCTAG-TAAAATAAACAAATAATGATTGTA-TACA--TTTTATT-TACCA-TGA-TCAACTCA--T-TCACTGA------GAA---AAT-GTAACATGT-TCAT-AT-GACGTAA-TG--C---------------T-ATGCAATG----TATCACACTACTGGCGATATCTTACAT-------TTGCG--GTTTTCCAA-CTGGCCA-TGAATA-C---A-CTTTTCAATAGCA--GCAA-T-GTTTTGCCAAAATAAA-----CGT-TCAGATAGCTAAATT-CCATG------------------AGCAAATGG-A-AATGCAGCC--CCG--------AACCACATAAC--------AGCGTAAATC-G-G----TACA--TA---AAA--AGACTGCTAG-TGACACGTT-TT-G--CTTTGAA---TC-------ATA-TTCAA-AAC-GGTTTATGTATCGGAAAATGTC-TT-TGGAAACTACTACGGCAGCCTGT-TT-TTA-TCA-ACTCCTTGCACACTG-GAATACACGTCAGGC-ACATATAAAGTAATGATCAAAGAAGG-T-TTT---A---AAATGCTCAAC-A--AACAC-A-------T-TTTTT---G-GTATGTCTTGCCTTTCCCCTCTGTTTATCAT--TCACTACTTAATTATCTCCTAAAATTAGAAATTCCG---CAAAGG-AGATAACACTCAGTATGCAA-A---TGC--AACAAATTCAAATT--T-TC-TTGTGC-CAATTTT--CTAT-------TAGGAAATG---------T-----CA-TTT-AC----C-CCAC-TGAGT-T---T--TTT--AATC-TGGT------TGGTT--AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---G-AAT--TCA-ATATT-TGATTGTCTTCAA-ATCAG-TG---T---G-CTTTTCGTC---GCAGT-TTTGGT-C--A-AAA--CATAGTA--AAATTG-CT---A-AT--T--TT-TGGTCATT-TTT-A-GCCTTT-GAAT------TAATG--AGC-C-----GCTGC-TA---CA-GT-AATG---GGA-TTTAAAATTTCCA-ATAGCAT-T--T-TCAT-AT-TT-T-TTTCAAA-A---TTGTTA-C-TAC-TT--T---G-TTT--CAATAA-----G-----------GTAA--CAT-AA--A-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-AT-C--AA--ATATGA-TTT---T-AATTAAAG--C--AATCT-----ATTT-TCTTAA-----ACTAAA-ATTTT-TTCC-T-G--TGTTT---TCC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G--TAC------C--ATGG--A-AAC--GACTCA-C-TTTCT---C--AGAAT----AA-GTGGT-----A----TGAAA-TTTT---TTTC-TTAA-GT-TATG--GTAATTTCTA-TTG--AATTA--GACA-------TTCGAC--------AGTGGAA---A--ATT----TT--AGTG--CGTG--CC-A-C-CA---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|4 : aaAATAA-CATTGAAATTTTGAAATGCAACTT--GATACACCACTGAATCAT--CAATTGTTACTGT------AA---------TAACGGGTGTCACTGC-G-CA-AA-TG--T---ATCACTTGTTAA-----------------AAAAGTTCCA--AACAACTTACATTAAAAACTTT-GTCGTTTTCCAGGCTGGC-AATGAATCAC---A-ATTTCTC-TAACA--GCAACT-GCTT-GT--GGATAAAAGTAACATGTCGTTT--TTAAATTCGCATGGACAAAATGGGTTGTGGGAGTAAAAGC-AGAAT--AACCGCCTG--------A---------C--------ACCATGAATC-G-G---GTGC---CA---AGACTA---TGTTTGATA--CCAGTCTT-GAACTTTGAA---AC-------ACAATTCCATGACCAATCATTGTCT-GGAAAACGAT-TT-T----ACCACCACT-TGGTGTGT-GTATAACTCGAACTCCCT-CAAAGTGCAAATACAT-CCAAATGACATACAGAATGATGTTAAAGG---GATGTTTTAAA---GAATAGCCCGC-ATTAA-ACCACGTATTTT-TTTTC---G-GCATCGCTTTCATTTCCATCCTG-TTA-CAAAACCACTAC-TA-TTATCGCCTATA-CTAG-TATTCCACATCAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-ATATTGCAAAGGAAATTCATATCTAT-TC-C-ATAC-CAGTTTTTCTTAT-------T-TGAGATA---------TCTTCACA-TTT-GC----CAC-ACAGGATC-T---TTATTT--A-TC-CATCCTGGTATTAT---AA--TA--------TCTA--------------T-C-TCATCTTC--TA------TCTGAATAAAA--TCAGGTATTATGAAT-TACTCTA-AT--GCTG---CCCAC-TTTTC-TGCTCAGGAGTCTT--GCACAAATAAAC-CATAGAA--AAACTG-CT---A-AATTT--TC-TGGTTAAATTTT-ACGTC--CAGAGT------T-ATG--ACCGT-----G-GGCATA---CACAA-ATTGTACATA-TCG---ATATCCAGATAA-ATAT--TAACAT-ATCTG-ACTCAGA-A-A---ATGCCATC-AAC-TTAAT---AGTCTCACACT-A-----T-----------GAGA--AAC-AA--ACA---TTCCATTGCGTCAAT-T-TT-C--AA--A-TA-A-TTTATATAAATTGAAGTTTGAAA--------ATTT-TCCAAAAAAAGACAGCATA--AT-GTCCTT-G--T-TTTTC-TTC-TATA-TAA-A-TA-GCTTCC------TTACTAAAATA--ATGGACA-AACGAGAGTCA-C-TTTGT---CAAAAAAT----ATCGTGCA-----GGAGTCAATG-TTTTTTGTTTC-ACAG-AT-CATCTCAT-TTTTCTA-TTGAAAATGATAAACA--------CC-ATCG------AGTGGAAACTT--ATTTTTGTTTCAGTG--CGTG--CCAG-A-AAAGTTAGACTTTTCGGTACC--GT-TACAAA-GAgtattaaaatctgtctcaa
gi|5 : CTTTCATGGATCC-TATTGCTATAAAAGAAATGTACAAT-------GTTTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAA-AAAATATAATGGA--CATGT-GACCA-TTGAATTTATTTACATAC----ATTC-------------------A---TTACAA-T----CA-TA--------------TCAT---GAGAGTAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCTTC---CATATTCCAAAATGAAAAAT--------TTCT-T-A----AGAAATACTTG-GGACA----A-CATCAGAATT-AACATTTATCTTATTAATCTTGAAA---ACGAAAATGAAAGGC-AGGCGAAATTGATT--AT---GGTAAATAAAC--TAT---TCAAATA----------------------T-----TTTACATGTATCAGGGTGA-----TCAGAACTGTACCTTCCCTCCCCATTTGCCTT----------AAATCATTATTT----TAATTATA-GAATG-----CTT--AGAAAATA--------GCCAT-TATTCAATCTAGCCTAG-TAAAATAA-CACTTAAT------A-T-----TT--A------CA-TGA-TCACT-CA--T-TCACTG-------AGA---AAT-GTAAC--GTGTCATTAT-GACGTAA-TG--A---A--ACT----ACT-CT-CAATG----CATCACACTACTGGCAATA-CTTACAT---AAACTTG-C--GTTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATA-C---ACTTTTCA--TAGCA--GCAA-T-GTTTGGC--AAATAAA-----CGTCTAGATA--GCTAGCTTCAATG------------------AGCAAATGTGAAAATGCAGCC--CGGAATACATAA---------C--------AGTGTAAATC-C-GTACGTATA-TTA---AAA--AC--TGCTAG-TATACAAGT-TT-TGGCTTTGAA---TCCACATGTATA-TTCAATAA--AGTTAATGTATCGGGATATGTTCTT-T----GATA-CACG-CAGCGTGT-TT-T-A-TCA-ACTCCATGCACACTG-GAATGCAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATTAAAG---A-TGTTT---ACTTAAATCGCCCACAA--AACGACA-------TCTTTTC---G-GTATGTCTTTCTTgtacattcactctaaaaatctatctaaa
gi|6 : aaaactctcaagactgatcagcgtctatgcAAATT--TGTCTC-G-GCGCAATTTT--CTAT-------TAT-AGACAAATGTAGGCT-----AA-TTTAGCACTGC-C-AC-TGAGT-T---T--TTT--A-TC-TGTT------GTA----AT--CACTTTAGTTTTTA--------------TACAT-ATCATC--TCTGACAATTT---T-GTA--CAA-ATATT-TGATTGTCTTCAAGATCAG-TG------GG-CTTC--GTCACAG---T-TG--GT-CAAA-AAA--CATAGAAGTAAATTGGCT---A-A---T--TT-TGTGCA---TTTTA-GCC--TTGAATAGTTAAT-ATGGGATT-TCGACGG-TGC-CAGTTCA-GTTAATG---ATAATA----ATTTCCAAATAC-TT-TG-T-TCAT--T-TG-T-TTCAA-A-A---TTGTTA-CTGAC-TT--TTGGA-TTT--CAAT-A-----TAAGCGGATTGAGCAG--TAA-GAGAA-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-AT-C--AATTG-AT-A-TT------AGTTAATG--TAAAGCACGCATTATTT-CGTAAA-----ACTACA-A---T-TTCC-TAG--T-TAT---TTC-TATAAT-A-A-AA-GC--CTCCGGG-TTAC-----T---ATGG--GGAAC--GACTCA-C-TT--T---A--GAATT----AA-GTGTA-----A-----AATA-TTTT---TTTC-TTAAGTT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGGA---GAAATT----TTTCAGTGTTTGTGCACC------A---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGAGGAACTG
gi|7 : gctcaataatcatacctgaagattagaccacaggatgtccgcttccaaagggattagaccgtgaagactacagtatgtataagaattcagacaggactgttcaaTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTACA-CTAGATATTCTG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAGAAATTCATATT--T-TC-C-ATAT-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----AA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACA------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CTA--A-A---T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ACTG---ACA-TC----ATATCAAGA-AA-AA-T--T-ACATGAA-TG-A-TCAA--A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GC-GTTCACTAATTA-AATTTT-CATTGT--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-AGTTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTTACAAAAA-----ACTGCA-A---T-TTCT-T-GT-T-TTT---CTC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----T---ATGG--A-AAC--GGGTCA-CTTT--T---C--AAAAT----AT--TGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-C-T---GT-ATTTCTA--TG--AAT-AT-AACA-------TTT-AT--------A-TGGAA---T--GAT----TTTCAGTG--CGTG--CC-GCA-AA---AA----TTTTGGT--CCTGT-TACAGA-GAATTttattaaggtgt
gi|8 : C----C-T-AT-TGAAT-T---T--TTA--A-TC-TGCT------TT-T---AT--CA--------TACA--------------T-T-A-ACCTTC--T-------TCC---T-AAA--TTA-ATATT-TGATT-TCCTTTA-AA--T-CA---TCTGT-TTTTT-CGCTCAGGAGT-CG--GT-C-AC-AAA--TATAGCA--ATACTG-CT---A-T---T--TTGTGGTCA---TTTGA-ACC--T-GATT------T-ATG--AGT-T-----G-TGT-TA---CA-AT-AATG---TTA-TC----ATTCCCAGATAA-AT-G--T-GCTT-GT-TC-A-TC----tgct
gi|8 : gaaatattttaacctttttaaAG--CAT-AG--A-A---AT-CCTTAC--CAAA-TATT-T--GT--G-AT-A-TTT---TAAATTGAAA--TGAAA--------A-----CTAAA-----ACCCCA-T--TT-GTAC-T-C--T-TTT----TG-TATA-T-A-AATA-AA--CT----G-TTA------TC--ATGG--T-AAC--GATTCAAT-TT--T---C--AGAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TCTA---TT---GAGA-TT----------ATTCCTA-TTG--AATGAT-ATAA-------TTT-AC--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagcatagaaatccttaccaaatatttgtgatattttaaattgaaatgaaaactaaaaccccatttgtactctttttgtatataaataaactgttatcatggtaacgattcaattttcagaatatgtgtaacaatatctattgagattattcctattgaatgatataatttacagtggaatatttttcagtgaat
gi|9 : gaaatattttaacctttttaacctattgaatttttaatctgcttttatcatacattaaccttcttcctaaattaatatttgatttcctttaaatcatctgttttttcgctcaggagtcggtcacaaatatagcaatactgctattttgtggtcatttgaacctgatttatgagttgtgttacaataatgttatcattcccagataaatgtgcttgttcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaa-GT----C-C-AT-TG-TT-TGTGT--TAT--A-TCACGCT------TTAT---ACTGCA--------TTTAGAGCTATCCATTGAT-C-T-ATCTTTCAT-------TCTG--T-AAA--TCA-ATATT-TGATT--CTTATAGAT--GGTGACCCTCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAAACCATAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTAA---TTTTA-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ATTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--AAC-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAA-T-TTTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-TCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-AATA-GC--TC----G-TTAC-----TATAATGG--A-AAC--GGGTCA-C-TT--TT--C--AAAAT----AT-GTGCA-----G----CAATG-TTTTTTTTTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TCG-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTaat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): ATGCATCAGGAGGATCACAACTTTACCCCTCCCCTATTTGCCTTAAATCATTTTTTTGATTATAGAATGCTTAAAAAATAGCTATTATTCAA
Unaligned ( gi|20 ): TGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGAT
Unaligned ( gi|22 ): CTGAGAATTGCTCTTAACAACTATGGAACAATGCTGTTGAAATATTTACTTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 111 222 1 1 2222 1 11 1 1 1 111 11 777777777777777777777 1 55555555 1 44444444 555555555555555555555555 222 22222 11 55555555 11 1 1 111111 1 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1 22222 444444444444444 22222222 1 22 222222 111 111111 33333333 111 1111 11 333333333 11 111 11 00000000000000000000000000000 11 55555555555555 55555555555555555555555555 3333 44444 11 55555555555555 1 11 222222 333333333 55555555555555555 55555555555555555555555 1111 1 1111 2222 11 111 11 11 11 22222 11111 444444444444444444 11 11 555555555555555555555555555 111 5555555555555555 1 11 111 2222222 1111111 1111 11111111 1 11111 11111111 11 1111111 11111 111 1111111 111111111111111 111111111111111111 11111111 11111111111111 1111111 111 222 111 1 1111 1111 2222222222 22222222222222222 11 11111111 111 1111 1 333333333 111111111 111 1111111 11111111
lowQualScore : 3 999 7 1 333 7 3 6 3 1111 3 88 0 3 0 0 444 88 555555555555555555555 7 6 3 33333333 2 0 88888888 333333333333333333333333 333 7 22222 3 2 88 3 3 44444444 333 1 3 33 0 0 666666 0 1 0 3 9 55 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8888 2 5 3 77777 44 444444444444444 33333333 5 33 888888 0 111 1 999999 99999999 777 1 8888 00 111111111 1 33 777 00 00000000000000000000000000000 77 1 33333333333333 99999999999999999999999999 8 6 1 1111 8 44444 11 22222222222222 0 2 0 0 8 8888 1 8 3 11 444444 8 8 000000000 44444444444444444 0 33 0 8 0 5 8 33333333333333333333333 7777 0 0 8 1 777 5 4444 4444 44 8 8 99 444 8 99 11 0 8 8 5 11 00000 8 66666 1 5 999999999999999999 9 2 44 3 00 99 1 666666666666666666666666666 777 111 1111111111111111 3 5 00 6 6 4 111 8888888 6 1 4444444 1 2 6 6 4444 77 99 44444444 6 1 3 1 6 6 6 0 7 33333 66666666 6 6 55 77 8888888 5 77777 4 1 1 5 6 3 5 2 5 00 888 66 1 5 5 333 1 1 66 4 4 66 4 1 66 3333333 777777777777777 4 3 6666 3 3 3 3 555 44 77 3 777777777777777777 44 77777777 88888888888888 444 3 44 3333333 222 3 555 3 3 6 6 99 7 777777777 999 3 55 3 3 77 1 44 3 999 3 000 44 3 777 6 3 0 0000 2 999999 3 44 1 3 88888 3 3 555 3 55 4 777 4 2222 3 0 44 3 88 3 3 3 3 3 9999999999 888 4 55 777 4 55 4 77777777777777777 55 3 00 3 666 3 1 55 3 7 7 55 55 3 3 3 666 44 66666666 3 1 77777 3 111 3 6 3 77 3 0000 6 3 5 3 6 3 44 999999 000000000 44 3 44 3 6 666666666 9999 33 9999999999 3 000 3 3 55 3 0 888 3 3 44 1 33 0000000 3 55555555 777777 6666 44 55 88888 777 9999 99999 4 5
lowQualScore : . ... . . ... . . . . .... . .. . . . . ... .. ..................... . . . ........ . . ........ ........................ ... . ..... . . .. . . ........ ... . . .. . . ...... . . . . . .. . ...................................................... .... . . . ..... .. ............... ........ . .. ...... . ... . ...... ........ ... . .... .. ......... . .. ... .. ............................. .. . .............. .......................... . . . .... . ..... .. .............. . . . . . .... . . . .. ...... . . ......... ................. . .. . . . . . ....................... .... . . . . ... . .... .... .. . . .. ... . .. .. . . . . .. ..... . ..... . . .................. . . .. . .. .. . ........................... ... ... ................ . . .. . . . ... ....... . . ....... . . . . .... .. .. ........ . . . . . . . . . ..... ........ . . .. .. ....... . ..... . . . . . . . . . .. ... .. . . . ... . . .. . . .. . . .. ....... ............... . . .... . . . . ... .. .. . .................. .. ........ .............. ... . .. ....... ... . ... . . . . .. . ......... ... . .. . . .. . .. . ... . ... .. . ... . . . .... . ...... . .. . . ..... . . ... . .. . ... . .... . . .. . .. . . . . . .......... ... . .. ... . .. . ................. .. . .. . ... . . .. . . . .. .. . . . ... .. ........ . . ..... . ... . . . .. . .... . . . . . . .. ...... ......... .. . .. . . ......... .... .. .......... . ... . . .. . . ... . . .. . .. ....... . ........ ...... .... .. .. ..... ... .... ..... . .
lowQualScore : 3 333 3 0 333 3 3 7 3 7777 3 33 0 2 0 0 333 33 777777777777777777777 3 7 3 33333333 0 7 33333333 777777777777777777777777 333 3 33333 2 5 88 2 2 88888888 888 2 2 22 0 0 555555 0 0 0 2 2 88 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 5 5 0 00000 55 555555555555555 22222222 5 88 888888 8 000 0 555555 00000000 555 0 8888 22 555555555 0 88 555 88 55555555555555555555555555555 00 2 66666666666666 22222222222222222222222222 2 0 4 4444 0 66666 00 00000000000000 2 5 0 8 0 0000 0 0 2 00 666666 0 0 444444444 22222222222222222 6 88 8 0 8 6 0 44444444444444444444444 0000 6 6 8 4 444 8 8888 0000 44 0 0 00 000 0 00 00 8 0 0 6 00 00000 8 44444 4 7 222222222222222222 3 2 33 7 33 22 0 000000000000000000000000000 555 777 2222222222222222 2 5 33 7 7 2 777 3333333 7 0 5555555 0 5 7 7 2222 77 22 22222222 7 0 3 0 7 7 7 3 5 77777 00000000 7 7 88 77 6666666 7 00000 0 4 0 0 6 2 0 4 0 66 888 99 0 0 0 888 0 0 11 4 4 11 4 3 11 0000000 000000000000000 0 3 5555 1 1 1 1 444 22 33 1 000000000000000000 22 33333333 11111111111111 222 1 22 1111111 777 1 000 1 1 2 7 22 3 888888888 555 6 00 6 3 99 4 66 3 222 3 444 66 3 111 7 3 1 0000 9 666666 3 66 8 3 33333 3 3 888 6 44 9 000 0 5555 7 8 99 6 66 6 6 6 6 6 5555555555 000 0 55 000 0 55 0 33333333333333333 00 6 00 6 444 6 0 00 6 3 3 00 00 6 6 6 444 66 55555555 1 3 77777 1 222 1 2 1 33 1 8888 2 1 4 1 2 1 22 777777 999999999 22 1 22 1 2 000000000 6666 88 4444444444 1 888 1 3 55 1 3 555 1 1 22 5 55 0000000 1 44444444 666666 5555 22 00 44444 000 4444 33333 4 0
consensus : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--AC--CA------AC-----AGTAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--ATT-G--GTTCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGACAAC-TT-------TACCCCCCCCCCC----C-----CCCA----------AACTCATTCTTTCCCCAATTATA-GAATGTTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATCTCAATT-TTACTGT------AGAC--GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACG-TAGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TC--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
Reference ( family-30 ) : CATTAAACAAA-TTATTTTN--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--AC--CAT-----AC-----AGTAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--ATT----GTTCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGA-----TC-------TACCCCCCCCCCC----C-----CCCA----------AACTCATTCCTTCCCCAATTATA-GAATGTTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATTTCAATT-TTACTGT------AGAC--GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACG-TAGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TC--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
gi|1 : TTAAACCAACTTATATTT--AATT-GAGGTTTTCC---G--AATAATGTATGGGTATCGGCGGATA-GCCTCAATATGGAACA-CAAT-AC-ACATTCT-T-GCAGCAGTGCCCACTCCATTCAAAAC-----AGTAACATTACACAATACTTTTG-TACCTTTTCATCACACACCCCCTGTGTTCACTT--GAATTCGCTAGA--TTTTC---CAGAATT---TTT--CCCTAATAGAGCTT-AATCGATC--TGT-GCTGTGAAAGAAACGCACAATCT-ATATTTGTCAAATTTGA-TGAAATTCA-TCAC-AAAA-ATAA-AGA--CATGTTAAACACTTGAATTC-TTTACACA-ATT-ATTTCTTCT--TT-ATCAAACA-AAATTTATCA-TAAATCA-TAATGCACTGTCACTGTTATG--GAAAGAAG-AGGGAG-------GAAGGGGCTGTTGTCATTTTCCT---T----ACT------TGTTTT-T-ATGAAAGAAA-ATTC--GGACACGATATCATCAGCA-T-AAAATTT-TTC--CTAACCT---------AA---ATTTAAAACTTTAGG-AAAATTAA-C--AACAAGTTAAATAAAC--CATGATCCGGATA-ATAATTAGTAGTTCA-----TTCTTTCTTTTTA--TTTGAAGATGA-----TT-------TAACCCCCCC----------------A----------GACTCTTCCCTTCCCCAAGTATACAAATATTA-TATTGTAGAAAATA-TCATATTATCATATATT-ACCCTGGCTCAG-TGCAA-AA-CATTGGATTTT-GAA-TGCA--TT--AAT-TGCCA-TGA-TCATC-CAATTATTATAGTTTTACAAGACCCGGC-GGAACGTGTGTCATTGCCAACGGAAATG--CTTGACCTCTTGTCAATTAT-CAATGCTTCTATAAAA--TCCAACAATATCTTACGT---AAACTTG-----TTTTCCA--CTGGC-A-TGAATT-CCCAA-TTTTCT--TAACACAGCAA-TTGCTTTGT--GGATAAC-----AGTTGCG--T--TTATATTTCCATG------------------AG--AACGC-AGAATA-AACC--CCG--------A---------C--------AGCATAAATCCGCG---GTGCA-A-------A--C---TGC-AGATTACCCAGT-TTTGAACTTTGAAAATCC-------ACA-TCCCATGAC-A----ATATGTCTGGAAAC--T-TT-T----ACCACCACT-TAGTGTGTTGT-TAACTCG-AC-CCCT-CAAACGT-GAATACAT-CCAAAT-ACATACAG-GTGATGGT-AAGG---G-TGTT----A---AAATACCCCAT-AT-AACAACA-------T-TTTTC---T-GC-TGTCTT-CATTTCCCTCCT-TTTA-CAAAACCGCTACTTA-TATTCGCTTGTA-CTAGATAT--CA---C-----GGGATAAC--T-AATCAGCAATA-ATTG---AAGAAATTCATACT--T-TC-C-CTAC-CATTTTT--CTGT-------TATG-GATA---------T-----CAATTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTTTA-TC-CACC------TTATTTAAT--CAA-------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCTCT-T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCC-G-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAG-A--AAACTG-CT---A-AAT-T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-TAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG----CA-TC----AT-TGCAGATAA-AT-TTGT-ACAT-AT-TGAA-TC----A-AAATTTGCC--C-AAA-CT--T---A-TCT--CACT-A-----------------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGC--CAAATT-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTAAAG--TGACA--------ATTT-TCCAAA-----ACTGCA-A--ATATTCC-T-GTTT-TTT---TTC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----CT--ATG-----CAC--GGGTCA-C-TT--T---T--CACATG---AT-GTGT------A----CAATATTTTT---TTTC-ACAA-TTCCAT---GT-AGATCTA--TG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGAAT---T--ATT----TTTTAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---
gi|10 : gggggtgtctttcacgaatgtccgcgacacggtccctttcccattaaaaaaataatgacgagtcccccccttccccggttcTTCCATC------------------AACAAATGGGAAAATGCAGCT--CGG--------A---------CCATATAGCAGTGTAAATC-G-G---GTACATATATTGAAG--A---C---AG-TATACAAGT-TT-GGGCTTCGAA---TCC------ATA-CTCAATGG--AGTTAATTTATCGGGAAATGTT-TTAT----AATAC-ATG-TAGCGTGT--T-AAA-TCG-ACTCCAC-CACACTG-TAACATAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATCAAAG---A-TGTTC---A---AAATA-CTCAC-A--AACA-CA-------T-TTTTT---TGGTACGTCTTTCCTTCCCCTCCTGTTTA-TAATATCACTAC-------------------------TCCG---CAATGGGAGATAAC--TCAGTATGCAA-A-ATGC---AACACATTCAAATT--T-TC-T-ATGC-CAATTTT--CTATTATGTCATATGAAATG---------T-----TA-TTT-AC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTC-A-TCTCGTT------TT-T---AT--CA--------TTCA--------------T-T-T-ACCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGTTT-GTCTTAA-AT--
gi|11 : cTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC--ACC------TTAT---AT--CAG-------TTTA--------------T-C-T-AT--TG--T-------TCT---T-AA---TCA-ATATT-T---T-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGAACTTTT-GCCTCAGGA-T-TT--GC-CAAA-AAA--C-TAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTC----TTT-A-GTC--C-AA-T------T-AGG--ACT-T-----G-TGC-TA---CA-AA-G--G---ACA-TC----ATATC-AGATAA--T-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---ATTCCA---AACTTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AG--A-A---TT-CATTGC--CAAA-T-TTCC--AA--A-AT-A-TTT---GAAATTAAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTTCGT-G--T-TTT---CTT-T-TA-T-A-A-AT-GC--CC----GATTAC-----T---ATGG--A-AAC--GGGT-A-C-TT--TTCAC--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA--TTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTATTTG--AATGA--AACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GTGTACAGA-GAATTcagtgtattttatcaatctatctcaaaaacat
gi|12 : aaTAT-------TAATAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TG-TT-T---T--TTT-----------------TTAA---AT--------------TA--------------T-G-T-AGCTT-------------T---T-AAAAATCA-ATATT-TGATT-TTTCTTA-AT--G-TG---CT-GG-C-----GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAG-GAA---ATAGAA--AA-CTG-CTTGAA-A---T--TT-TGGTCA---TTG-G-AGC--T-GAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CA-AT-AATG---ATA-TC----ATATCCAGA---------------------G-A-TC----ATA---TTGTTA---AAC-TC--T---A-TCT--CAGC-ATGTATT-----------GTAG--CAT--A--G-A---TT-CTTTGT--TAAA-TATT-C---A--G-AT-A-TTT---TAGACTGAAG--TGAAA--------A-TT-CCTAAA-----ACTGCA-A--TT-TCCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-C-AGA-TA-G---AT----A-TCAC-----T---ATGG--A-AAC--GAGTCA-CATT--T---C--AGAATATGCAT-GTGTACATGTA----TAGTA-TTTT---TTTTAAAGA-------------------G-TTG--AGTGAG-GGCA-------TTT-AC--------AGTGG-A---T--ATT----TTTCAGTG--CGTT--CC-G-C-AA---TA----TTTTGGT--T--GT-TACAG
gi|13 : -------T-TTTTCCTTT-G-ATTGCTTTCTGTGCCCTCCTGTTTA-TAACACCACTATTGT-TTATATCCTATA-TTAGATATTCCG---AAAAGGG-GATAAT--TCAATCTGTAA-A-ATTA---AACAAATCTATAAA--T-GT-C-ATGC-CAATTTT--CTAT-------TACAAAATA---------T-----CA-TTT-GA----C-C-AC-TTATTAT---T--TAT--A-TA-CATC--------AT---AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ACTCTC--T-------TCT---T-TAA--TCC-GTATT-TGATT-GTCTATA-AC--G-TG---CCTGG-CTTTT-G-CTCAGGGAT-TT--GC-CAAA-GAA--CATTGAA--AAACTG-CT---ACA---T--TT-TGGTCA---TTTGA-GCC--A-AAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CG-A
gi|14 : -T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGTTA-C-AAA-TT--C---A-TAT--TAGC-A-----T-----------GTAG--CAT-AA--C-A---TT-CTTTGT--CAAA-T-AA-CCAAA--A-AT-A-CAT---TAAATCAAAG--ATAAC--------TTTT-TCTAAA-----ACTTTA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTTTCCCTC-TACA-T---A-TA-GC--CA----C-TTAC-----T---ATAG--A-AAC--CAGTCA---------------------------TGCA-----A----CACTA-ATCT---TTT--A-GA----------G----TTCTA-TTG--GATGAT-GACATATACATTTT-ATACATATACAGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--ta
gi|15 : ATTTAAA--CGATT--------ATTT-TCTAAA-----ACTACT-A--TT-TTCT-T-G--T-TTT---TTCCTATA-TGA-A-TA-GC--CT----G-TTAC------C--ATGG--A-TAA--GATCCA-C-TT--TT--C--AGAAG----AA-GTGTA-----A----CGATA-TTTT---CTTT-AAG--TT-CAT---GT-ATTTCTG-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AT--------AGAGGGA---C--A-T----TTTCAGTG--CATG--GC-A-ACGA---TA----TCTAGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|16 : CATTAACAAAA-TTATTTTTGAAATTTGAGATCTTATTCTGTAAATAATG-AT-GG-AT--G-GGATATGCCT--AT-TGGAACAACAATAACAACATATT-gtat
gi|17 : ggggtgtgtgtgtcctgcgatgtcagcgacacgcatacccattaagaaataatgagtagccgcccgccccccccccccccgcccgTA-TAATATCACTACTTA-TTATCTCCTAAA-TTAGAAATTCAG---CAAAGGGAGATAAC--CCAGTATGCAA-A-ATGC---AACAAATTCAAATT--T-TC-T-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAAATG---------T-----AA-TTT-AC----C-C-AT-TGAGT-T---T--TTA--A-TC-TGGT------TGTT---AT--TA--------TCCA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGATT-attttactcacagt
gi|18 : A--------ATTT-C-TAAA-----ACTACA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTT---TTCCTATA-T-A-A-AATGC--CG----G-TTAC------C--ATGG--A-AAC--GACTCA-C-TT--T------------------------------------------------TC-ATG--TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGAA---A--ATC----TTTCAGTG--CGTG--gtctt
gi|19 : attGAGGATCACAAC-TT-------TACCCCTCCCCTATTTGC-----CTTA----------AA-TCATTTTTTT---GATTATA-GAATG-----CTT--AAAAAATA--------GCTAT-TATTCAgcc
gi|2 : atgcatcagCATTAAACAAA-TTATTTTG--AATTTGAGGTCTATC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATTAT-ACAG--GTGC--AC--C-------AC-----AGT-ACAT-ACAAAAT-AT---GTTACCTTATTATCAC--------TGTGTTCACTT--G----------------TC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AAAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-TAA-ATACGTCAAAATTTGATGAAATTC--TCACAAAAA-ATAA--GA--CATGT-AAACA-TTGAATTCCTTTACACGCATT-ATTTCTTTTTATCAA----ACACA---TTATCACT----CACTG--------------TTATGGCGAAAGAAGGGAGGAG-GAGGGGGGGGGGGTTGT---CATTTCTTTAAAT----ACT------TATTTTATGA----AGAAA-ACTC--GGACA----T-CATCAGGA-T-AAAATTT-TCC--TTAACCT-------AAAA---ATTTAAAACTT-AGT-GAAATTAA-C--AT---GTTAAATAAAC--CAA---TCAGATATA--ATTTA--GTTCATTCTTTT-----TTTATATTTTTGAAGATGA-----TT-------TACCCCCCCCCCC----C-----CCCA----------AACTC-TTCCTTCCCCAATTATC-AAATATTATTTTT--AGAAAATATT-----TATCATATATTCACCCTGGCTCAGTTGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AA--TACCA-TGA-TCATTTCAA-T-TTACT-T------ATAC--GGTCGGAACGTGTGTCATTAC-AATGTAA-TGTAC---ATCA-TTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAAATTCAAACAGTA-CTTACGT---AAACTTG-G--TTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATC-C---A-TTTTCT--TAACA--GC-A-T-GCTTTGT--GGATAAA-----CATGTCGGTT--TTTAATTGCCATG------------------GG-AAACGC-AGAATAAACCC--CCG--------A---------C--------AGCATAATTC-G-G---GTGCA-AT---------A---TGTTAGATATCTCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------GCA-TTCCATGAC-AAT--ATTTGTCTGGAAACTTT-TT-T----ACCA-CACT-TGGTGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CAAAGTG-AAATACAT-CCAAAT-ACATACAGAATGATGGTAAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAT-A--AACACTA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCATTTCCCTCCTGTTTA-CAAAAC--CCACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAAAAATTCATACT--T-TC-C-ATAC-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-T---T--TT-TTGTCA---TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAT-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----GTTTAC-----TT--TTGG--A-AA---GGGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTGa
gi|21 : -AAA--CA--GTA--AAATTA-CT---A-A---TTTTT-TGGTCA---TTTGA-GCC--T-GAAT------T-ATG--AGC-C-----G-TGC-TA---
gi|3 : -TGGAGCAACTGT-GC-ACATATT-TTATAG--ATGC--AT--CAA-----ACTTTCAAATAA--T-ACACAATGA-------ACCTTTT--TCGT--------TGTTTTCATTTTCGAATTCG--AAAAATTCTCAGACATGATCACATGTTTCTGT-------TTTTCATG-ATCAATATTACTATAAAACA--TGTACAAT-------GTGCCA---TTAAATGAGATTCAATTAC-AAAT-ATAATGGCGTCATAT-GACCA-T-GATTTCATTTACACACATTCATTC-----------------A-A---TCAT-A-T----CA-TA--------------TCATG---AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCT-----TATTTTTCCAAAC----AACAAAAAATTTTCT-T-A----AGAAATACTCTGGGACA----A-CATCAGAA-TTAACATTT-AAT--TTATCTT-------GAAAGAAAATGAAAA--T-AGG-TAAATTGA-TTAGT---GGTAAATAAACTACAT---TC----A-A--ATT-----TTCA-----CA--------ATGCATCAGGGGATCACAACTTC-------TACCCCCCCCCTC----C-----CCCATTTGGCCTTAAATTCATTTTTTA---AATTAGA-GAATG-----CTT--AAAAAATAGC-----TACT---TATTCATC-TAGCCTAG-TAAAATAAACAAATAATGATTGTA-TACA--TTTTATT-TACCA-TGA-TCAACTCA--T-TCACTG-------AGAA--AAT-GTAACATGT-TCAT-AT-GACGTAA-TG--C---------------T-ATGCAATG----TATCACACTACTGGCGATATCTTACAT-------TTGCG--GTTTTCCAA-CTGGCCA-TGAATA-C---A-CTTTTCAATAGCA--GCAA-T-GTTTTGCCAAAATAAA-----CGT-TCAGATAGCTAAATT-CCATG------------------AGCAAATGG-A-AATGCAGCC--CCG--------AACCACATAAC--------AGCGTAAATC-G-G----TACA--TA---AAA--AGACTGCTAG-TGACACGTT-TT-G--CTTTGAA---TC-------ATA-TTCAA-AAC-GGTTTATGTATCGGAAAATGTC-TT-TGGAAACTACTACGGCAGCCTGT-TT-TTA-TCA-ACTCCTTGCACACTG-GAATACACGTCAGGC-ACATATAAAGTAATGATCAAAGAAGG-T-TTT---A---AAATGCTCAAC-A--AACAC-A-------T-TTTTT---G-GTATGTCTTGCCTTTCCCCTCTGTTTATCAT--TCACTACTTAATTATCTCCTAAAATTAGAAATTCCG---CAAAGG-AGATAACACTCAGTATGCAA-A---TGC--AACAAATTCAAATT--T-TC-TTGTGC-CAATTTT--CTAT-------TAGGAAATG---------T-----CA-TTT-AC----C-CCAC-TGAGT-T---T--TTT--AATC-TGGT------TGGTT--AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---G-AAT--TCA-ATATT-TGATTGTCTTCAA-ATCAG-TG---T---G-CTTTTCGTC---GCAGT-TTTGGT-C--A-AAA--CATAGTA--AAATTG-CT---A-AT--T--TT-TGGTCATT-TTT-A-GCCTTT-GAAT------TAATG--AGC-C-----GCTGC-TA---CA-GT-AATG---GGA-TTTAAAATTTCCA-ATAGCAT-T--T-TCAT-AT-TT-T-TTTCAAA-A---TTGTTA-C-TAC-TT--T---G-TTT--CAATAA-----G-----------GTAA--CAT-AA--A-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-AT-C--AA--ATATGA-TTT---T-AATTAAAG--C--AATCT-----ATTT-TCTTAA-----ACTAAA-ATTTT-TTCC-T-G--TGTTT---TCC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G--TAC------C--ATGG--A-AAC--GACTCA-C-TTTCT---C--AGAAT----AA-GTGGT-----A----TGAAA-TTTT---TTTC-TTAA-GT-TATG--GTAATTTCTA-TTG--AATTA--GACA-------TTCGAC--------AGTGGAA---A--ATT----TT--AGTG--CGTG--CC-A-C-CA---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|4 : aaAATAA-CATTGAAATTTTGAAATGCAACTT--GATACACCACTGAATCAT--CAATTGTTACTGT------AA---------TAACGGGTGTCACTGC-G-CA-AA-TG--T---ATCACTTGTTAA-----------------AAAAGTTCCA--AACAACTTACATTAAAAACTTT-GTCGTTTTCCAGGCTGGC-AATGAATCAC---A-ATTTCTC-TAACA--GCAACT-GCTT-GT--GGATAAAAGTAACATGTCGTTT--TTAAATTCGCATGGACAAAATGGGTTGTGGGAGTAAAAGC-AGAAT--AACCGCCTG--------A---------C--------ACCATGAATC-G-G---GTGC---CA---AGACTA---TGTTTGATA--CCAGTCTT-GAACTTTGAA---AC-------ACAATTCCATGACCAATCATTGTCT-GGAAAACGAT-TT-T----ACCACCACT-TGGTGTGT-GTATAACTCGAACTCCCT-CAAAGTGCAAATACAT-CCAAATGACATACAGAATGATGTTAAAGG---GATGTTTTAAA---GAATAGCCCGC-ATTAA-ACCACGTATTTT-TTTTC---G-GCATCGCTTTCATTTCCATCCTG-TTA-CAAAACCACTAC-TA-TTATCGCCTATA-CTAG-TATTCCACATCAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-ATATTGCAAAGGAAATTCATATCTAT-TC-C-ATAC-CAGTTTTTCTTAT-------T-TGAGATA---------TCTTCACA-TTT-GC----CAC-ACAGGATC-T---TTATTT--A-TC-CATCCTGGTATTAT---AA--TA--------TCTA--------------T-C-TCATCTTC--TA------TCTGAATAAAA--TCAGGTATTATGAAT-TACTCTA-AT--GCTG---CCCAC-TTTTC-TGCTCAGGAGTCTT--GCACAAATAAAC-CATAGAA--AAACTG-CT---A-AATTT--TC-TGGTTAAATTTT-ACGTC--CAGAGT------T-ATG--ACCGT-----G-GGCATA---CACAA-ATTGTACATA-TCG---ATATCCAGATAA-ATAT--TAACAT-ATCTG-ACTCAGA-A-A---ATGCCATC-AAC-TTAAT---AGTCTCACACT-A-----T-----------GAGA--AAC-AA--ACA---TTCCATTGCGTCAAT-T-TT-C--AA--A-TA-A-TTTATATAAATTGAAGTTTGAAA--------ATTT-TCCAAAAAAAGACAGCATA--AT-GTCCTT-G--T-TTTTC-TTC-TATA-TAA-A-TA-GCTTCC------TTACTAAAATA--ATGGACA-AACGAGAGTCA-C-TTTGT---CAAAAAAT----ATCGTGCA-----GGAGTCAATG-TTTTTTGTTTC-ACAG-AT-CATCTCAT-TTTTCTA-TTGAAAATGATAAACA--------CC-ATCG------AGTGGAAACTT--ATTTTTGTTTCAGTG--CGTG--CCAG-A-AAAGTTAGACTTTTCGGTACC--GT-TACAAA-GAgtattaaaatctgtctcaa
gi|5 : CTTTCATGGATCC-TATTGCTATAAAAGAAATGTACAAT-------GTTTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAA-AAAATATAATGGA--CATGT-GACCA-TTGAATTTATTTACATAC----ATTC-------------------A---TTACAA-T----CA-TA--------------TCAT---GAGAGTAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCTTC---CATATTCCAAAATGAAAAAT--------TTCT-T-A----AGAAATACTTG-GGACA----A-CATCAGAATT-AACATTTATCTTATTAATCTTGAAAACGAAA---ATGAAAGGC---AGGCGAAATTGATT--AT---GGTAAATAAAC--TAT---TCAAATA----------------------T-----TTTACATGTATCAGGGTGA-----TCAGAACTGTACCTTCCCTCCC----CATTTGCCTT----------AAATCATTATTT---TAATTATA-GAATG-----CTT--AGAAAATA--------GCCAT-TATTCAATCTAGCCTAG-TAAAATAA-CACTTAAT------A-T-----TT--A------CA-TGA-TCA-CTCA--T-TCACTG-------AGA---AAT-GTAAC--GTGTCATTAT-GACGTAA-TG--A---A--ACT----ACT-CT-CAATG----CATCACACTACTGGCAATA-CTTACAT---AAACTTG-C--GTTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATA-C---ACTTTTCA--TAGCA--GCAA-T-GTTTGGC--AAATAAA-----CGTCTAGATA--GCTAGCTTCAATG------------------AGCAAATGTGAAAATGCAGCC--CGGAATACATAA---------C--------AGTGTAAATC-C-GTACGTATA-TTA---AAA--AC--TGCTAG-TATACAAGT-TT-TGGCTTTGAA---TCCACATGTATA-TTCAATAA--AGTTAATGTATCGGGATATGTTCTT-T----GATA-CACG-CAGCGTGT-TT-T-A-TCA-ACTCCATGCACACTG-GAATGCAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATTAAAG---A-TGTTT---ACTTAAATCGCCCACAA--AACGACA-------TCTTTTC---G-GTATGTCTTTCTTgtacattcactctaaaaatctatctaaa
gi|6 : aaaactctcaagactgatcagcgtctatgcAAATT--TGTCTC-G-GCGCAATTTT--CTAT-------TAT-AGACAAATGTAGGCT-----AA-TTTAGCACTGC-C-AC-TGAGT-T---T--TTT--A-TC-TGTT------GTA----AT--CACTTTAGTTTTTA--------------TACAT-ATCATC--TCTGACAATTT---T-GTA--CAA-ATATT-TGATTGTCTTCAAGATCAG-TG------GG-CTTC--GTCACAG---T-TG--GT-CAAA-AAA--CATAGAAGTAAATTGGCT---A-A---T--TT-TGTGCA---TTTTA-GCC--TTGAATAGTTAAT-ATGGGATT-TCGACGG-TGC-CAGTTCA-GTTAATG---ATAATA----ATTTCCAAATAC-TT-TG-T-TCAT--T-TG-T-TTCAA-A-A---TTGTTA-CTGAC-TT--TTGGA-TTT--CAAT-A-----TAAGCGGATTGAGCAG--TAA-GAGAA-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-AT-C--AATTG-AT-A-TT------AGTTAATG--TAAAGCACGCATTATTT-CGTAAA-----ACTACA-A---T-TTCC-TAG--T-TAT---TTC-TATAAT-A-A-AA-GC--CTCCGGG-TTAC-----T---ATGG--GGAAC--GACTCA-C-TT--T---A--GAATT----AA-GTGTA-----A-----AATA-TTTT---TTTC-TTAAGTT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGGA---GAAATT----TTTCAGTGTTTGTGCACC------A---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGAGGAACTG
gi|7 : gctcaataatcatacctgaagattagaccacaggatgtccgcttccaaagggattagaccgtgaagactacagtatgtataagaattcagacaggactgttcaaTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTACA-CTAGATATTCTG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAGAAATTCATATT--T-TC-C-ATAT-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----AA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACA------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CTA--A-A---T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ACTG---ACA-TC----ATATCAAGA-AA-AA-T--T-ACATGAA-TG-A-TCAA--A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GC-GTTCACTAATTA-AATTTT-CATTGT--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-AGTTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTTACAAAAA-----ACTGCA-A---T-TTCT-T-GT-T-TTT---CTC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----T---ATGG--A-AAC--GGGTCA-CTTT--T---C--AAAAT----AT--TGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-C-T---GT-ATTTCTA--TG--AAT-AT-AACA-------TTT-AT--------A-TGGAA---T--GAT----TTTCAGTG--CGTG--CC-GCA-AA---AA----TTTTGGT--CCTGT-TACAGA-GAATTttattaaggtgt
gi|8 : C----C-T-AT-TGAAT-T---T--TTA--A-TC-TGCT------TT-T---AT--CA--------TACA--------------T-T-A-ACCTTC--T-------TCC---T-AAA--TTA-ATATT-TGATT-TCCTTTA-AA--T-CA---TCTGT-TTTTT-CGCTCAGGAGT-CG--GT-C-AC-AAA--TATAGCA--ATACTG-CT---A-T---T--TTGTGGTCA---TTTGA-ACC--T-GATT------T-ATG--AGT-T-----G-TGT-TA---CA-AT-AATG---TTA-TC----ATTCCCAGATAA-AT-G--T-GCTT-GT-TC-A-TC----tgct
gi|8 : gaaatattttaacctttttaaAG--CAT-AG--A-A---AT-CCTTAC--CAAA-TATT-T--GT--G-AT-A-TTT---TAAATTGAAA--TGAAA--------A-----CTAAA-----ACCCCA-T--TT-GTAC-T-C--T-TTT----TG-TATA-T-A-AATA-AA--CT----G-TTA------TC--ATGG--T-AAC--GATTCAAT-TT--T---C--AGAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TCTA---TT---GAGA-TT----------ATTCCTA-TTG--AATGAT-ATAA-------TTT-AC--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagcatagaaatccttaccaaatatttgtgatattttaaattgaaatgaaaactaaaaccccatttgtactctttttgtatataaataaactgttatcatggtaacgattcaattttcagaatatgtgtaacaatatctattgagattattcctattgaatgatataatttacagtggaatatttttcagtgaat
gi|9 : gaaatattttaacctttttaacctattgaatttttaatctgcttttatcatacattaaccttcttcctaaattaatatttgatttcctttaaatcatctgttttttcgctcaggagtcggtcacaaatatagcaatactgctattttgtggtcatttgaacctgatttatgagttgtgttacaataatgttatcattcccagataaatgtgcttgttcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaa-GT----C-C-AT-TG-TT-TGTGT--TAT--A-TCACGCT------TTAT---ACTGCA--------TTTAGAGCTATCCATTGAT-C-T-ATCTTTCAT-------TCTG--T-AAA--TCA-ATATT-TGATT--CTTATAGAT--GGTGACCCTCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAAACCATAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTAA---TTTTA-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ATTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--AAC-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAA-T-TTTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-TCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-AATA-GC--TC----G-TTAC-----TATAATGG--A-AAC--GGGTCA-C-TT--TT--C--AAAAT----AT-GTGCA-----G----CAATG-TTTTTTTTTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TCG-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGAT
Unaligned ( gi|22 ): CTGAGAATTGCTCTTAACAACTATGGAACAATGCTGTTGAAATATTTACTTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 222 1 1 2222 1 11 1 1 1 111 11 11 888888888888888 1 1 55555555 1 44444444 555555555555555555555555 222 22222 11 55555555 11 1 1 111111 1 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1 22222 444444444444444 22222222 1 22 222222 111 111111 33333333 111 1111 11 333333333 11 111 11 000000000000000000000000000000 11 222222 55555555555555555555555555 3333 44444 11 55555555555555 1 11 222222 1 2222 55555555555555555 55555555555555555555555 1111 1 1111 2222 11 111 11 11 11 22222 11111 444444444444444444 11 11 555555555555555555555555555 111 5555555555555555 1 11 111 2222222 1111111 1111 11111111 1 11111 11111111 11 1111111 11111 111 1111111 111111111111111 111111111111111111 11111111 11111111111111 1111111 111 222 111 1 1111 1111 2222222222 22222222222222222 11 11111111 111 1111 1 333333333 111111111 111 1111111 11111111
lowQualScore : 3 88 7 1 333 7 3 6 3 1111 3 88 0 3 0 0 444 88 88 000000000000000 3 7 6 3 33333333 2 0 88888888 333333333333333333333333 333 7 22222 3 2 88 3 3 44444444 333 1 3 33 0 0 666666 0 1 0 3 9 55 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8888 2 5 3 77777 44 444444444444444 33333333 5 33 888888 0 111 1 999999 99999999 777 1 8888 00 111111111 1 33 777 00 333333333333333333333333333333 77 1 888888 8 99999999999999999999999999 8 6 1 1111 8 44444 11 22222222222222 0 2 0 0 8 8888 1 8 3 11 444444 8 8 6 0 8888 44444444444444444 0 33 0 8 0 5 8 33333333333333333333333 7777 0 0 8 1 777 5 4444 4444 44 8 8 99 444 8 99 11 0 8 8 5 11 00000 8 66666 1 5 999999999999999999 9 2 44 3 00 99 1 666666666666666666666666666 777 111 1111111111111111 3 5 00 6 6 4 111 8888888 6 1 4444444 1 2 6 6 4444 77 99 44444444 6 1 3 1 6 6 6 0 7 33333 66666666 6 6 55 77 8888888 5 77777 4 1 1 5 6 3 5 2 5 00 888 66 1 5 5 333 1 1 66 4 4 66 4 1 66 3333333 777777777777777 4 3 6666 3 3 3 3 555 44 77 3 777777777777777777 44 77777777 88888888888888 444 3 44 3333333 222 3 555 3 3 6 6 99 7 777777777 999 3 55 3 3 77 1 44 3 999 3 000 44 3 777 6 3 0 0000 2 999999 3 44 1 3 88888 3 3 555 3 55 4 777 4 2222 3 0 44 3 88 3 3 3 3 3 9999999999 888 4 55 777 4 55 4 77777777777777777 55 3 00 3 666 3 1 55 3 7 7 55 55 3 3 3 666 44 66666666 3 1 77777 3 111 3 6 3 77 3 0000 6 3 5 3 6 3 44 999999 000000000 44 3 44 3 6 666666666 9999 33 9999999999 3 000 3 3 55 3 0 888 3 3 44 1 33 0000000 3 55555555 777777 6666 44 55 88888 777 9999 99999 4 5
lowQualScore : . .. . . ... . . . . .... . .. . . . . ... .. .. ............... . . . . ........ . . ........ ........................ ... . ..... . . .. . . ........ ... . . .. . . ...... . . . . . .. . ...................................................... .... . . . ..... .. ............... ........ . .. ...... . ... . ...... ........ ... . .... .. ......... . .. ... .. .............................. .. . ...... . .......................... . . . .... . ..... .. .............. . . . . . .... . . . .. ...... . . . . .... ................. . .. . . . . . ....................... .... . . . . ... . .... .... .. . . .. ... . .. .. . . . . .. ..... . ..... . . .................. . . .. . .. .. . ........................... ... ... ................ . . .. . . . ... ....... . . ....... . . . . .... .. .. ........ . . . . . . . . . ..... ........ . . .. .. ....... . ..... . . . . . . . . . .. ... .. . . . ... . . .. . . .. . . .. ....... ............... . . .... . . . . ... .. .. . .................. .. ........ .............. ... . .. ....... ... . ... . . . . .. . ......... ... . .. . . .. . .. . ... . ... .. . ... . . . .... . ...... . .. . . ..... . . ... . .. . ... . .... . . .. . .. . . . . . .......... ... . .. ... . .. . ................. .. . .. . ... . . .. . . . .. .. . . . ... .. ........ . . ..... . ... . . . .. . .... . . . . . . .. ...... ......... .. . .. . . ......... .... .. .......... . ... . . .. . . ... . . .. . .. ....... . ........ ...... .... .. .. ..... ... .... ..... . .
lowQualScore : 3 33 3 0 333 3 3 7 3 7777 3 33 0 2 0 0 333 33 33 000000000000000 3 3 7 3 33333333 0 7 33333333 777777777777777777777777 333 3 33333 2 5 88 2 2 88888888 888 2 2 22 0 0 555555 0 0 0 2 2 88 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 5 5 0 00000 55 555555555555555 22222222 5 88 888888 8 000 0 555555 00000000 555 0 8888 22 555555555 0 88 555 88 555555555555555555555555555555 00 2 444444 0 22222222222222222222222222 2 0 4 4444 0 66666 00 00000000000000 2 5 0 8 0 0000 0 0 2 00 666666 0 0 0 6 0000 22222222222222222 6 88 8 0 8 6 0 44444444444444444444444 0000 6 6 8 4 444 8 8888 0000 44 0 0 00 000 0 00 00 8 0 0 6 00 00000 8 44444 4 7 222222222222222222 3 2 33 7 33 22 0 000000000000000000000000000 555 777 2222222222222222 2 5 33 7 7 2 777 3333333 7 0 5555555 0 5 7 7 2222 77 22 22222222 7 0 3 0 7 7 7 3 5 77777 00000000 7 7 88 77 6666666 7 00000 0 4 0 0 6 2 0 4 0 66 888 99 0 0 0 888 0 0 11 4 4 11 4 3 11 0000000 000000000000000 0 3 5555 1 1 1 1 444 22 33 1 000000000000000000 22 33333333 11111111111111 222 1 22 1111111 777 1 000 1 1 2 7 22 3 888888888 555 6 00 6 3 99 4 66 3 222 3 444 66 3 111 7 3 1 0000 9 666666 3 66 8 3 33333 3 3 888 6 44 9 000 0 5555 7 8 99 6 66 6 6 6 6 6 5555555555 000 0 55 000 0 55 0 33333333333333333 00 6 00 6 444 6 0 00 6 3 3 00 00 6 6 6 444 66 55555555 1 3 77777 1 222 1 2 1 33 1 8888 2 1 4 1 2 1 22 777777 999999999 22 1 22 1 2 000000000 6666 88 4444444444 1 888 1 3 55 1 3 555 1 1 22 5 55 0000000 1 44444444 666666 5555 22 00 44444 000 4444 33333 4 0
consensus : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC--------AA-----CAG-TAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--A-TTAGT---TCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGAC---AACTT-TACCCCCCCCC----CCC-----CCCA----------AACTCATTCTTTCCCCAATTATA-GAATGTTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATCTCAATT-TTACTGT------AGAC--GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACG-TAGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TC--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
Reference ( family-30 ) : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC--------AA-----CAG-TAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--A-TTGGT---TCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGAC---AACTT-TACCCCCCCCC----CCC-----CCCA----------AACTCATTCTTTCCCCAATTATA-GAATGTTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATCTCAATT-TTACTGT------AGAC--GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACG-TAGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TC--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
gi|1 : TTAAACCAACTTATATTT--AATT-GAGGTTTTCC---G--AATAATGTATGGGTATCGGCGGATA-GCCTCAATATGGAACA-CAAT-AC-ACATTCT-T-GCAGCAGTGCCCACTCCATTCAAAA-----CAG-TAACATTACACAATACTTTTG-TACCTTTTCATCACACACCCCCTGTGTTCACTT--GAATTCGCTAGA--TTTTC---CAGAATT---TTT--CCCTAATAGAGCTT-AATCGATC--TGT-GCTGTGAAAGAAACGCACAATCT-ATATTTGTCAAATTTGA-TGAAATTCA-TCAC-AAAA-ATAA-AGA--CATGTTAAACACTTGAATTC-TTTACACA-ATT-ATTTCTTCT--TT-ATCAAACA-AAATTTATCA-TAAATCA-TAATGCACTGTCACTGTTATG--GAAAGAAG-AGGGAG-------GAAGGGGCTGTTGTCATTTTCCT---T----ACT------TGTTTT-T-ATGAAAGAAA-ATTC--GGACACGATATCATCAGCA-T-AAAATTT-TTC--CTAACCT---------AA---ATTTAAAACTTTAGG-AAAATTAA-C--AACAAGTTAAATAAAC--CATGATCCGGATA-ATAA-TTAGTAGTTCA-----TTCTTTCTTTTTA--TTTGAAGATGA-------TT-TAACCCCCCC----------------A----------GACTCTTCCCTTCCCCAAGTATACAAATATTA-TATTGTAGAAAATA-TCATATTATCATATATT-ACCCTGGCTCAG-TGCAA-AA-CATTGGATTTT-GAA-TGCA--TT--AAT-TGCCA-TGA-TCATC-CAATTATTATAGTTTTACAAGACCCGGC-GGAACGTGTGTCATTGCCAACGGAAATG--CTTGACCTCTTGTCAATTAT-CAATGCTTCTATAAAA--TCCAACAATATCTTACGT---AAACTTG-----TTTTCCA--CTGGC-A-TGAATT-CCCAA-TTTTCT--TAACACAGCAA-TTGCTTTGT--GGATAAC-----AGTTGCG--T--TTATATTTCCATG------------------AG--AACGC-AGAATA-AACC--CCG--------A---------C--------AGCATAAATCCGCG---GTGCA-A-------A--C---TGC-AGATTACCCAGT-TTTGAACTTTGAAAATCC-------ACA-TCCCATGAC-A----ATATGTCTGGAAAC--T-TT-T----ACCACCACT-TAGTGTGTTGT-TAACTCG-AC-CCCT-CAAACGT-GAATACAT-CCAAAT-ACATACAG-GTGATGGT-AAGG---G-TGTT----A---AAATACCCCAT-AT-AACAACA-------T-TTTTC---T-GC-TGTCTT-CATTTCCCTCCT-TTTA-CAAAACCGCTACTTA-TATTCGCTTGTA-CTAGATAT--CA---C-----GGGATAAC--T-AATCAGCAATA-ATTG---AAGAAATTCATACT--T-TC-C-CTAC-CATTTTT--CTGT-------TATG-GATA---------T-----CAATTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTTTA-TC-CACC------TTATTTAAT--CAA-------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCTCT-T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCC-G-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAG-A--AAACTG-CT---A-AAT-T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-TAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG----CA-TC----AT-TGCAGATAA-AT-TTGT-ACAT-AT-TGAA-TC----A-AAATTTGCC--C-AAA-CT--T---A-TCT--CACT-A-----------------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGC--CAAATT-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTAAAG--TGACA--------ATTT-TCCAAA-----ACTGCA-A--ATATTCC-T-GTTT-TTT---TTC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----CT--ATG-----CAC--GGGTCA-C-TT--T---T--CACATG---AT-GTGT------A----CAATATTTTT---TTTC-ACAA-TTCCAT---GT-AGATCTA--TG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGAAT---T--ATT----TTTTAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---
gi|10 : gggggtgtctttcacgaatgtccgcgacacggtccctttcccattaaaaaaataatgacgagtcccccccttccccggttcTTCCATC------------------AACAAATGGGAAAATGCAGCT--CGG--------A---------CCATATAGCAGTGTAAATC-G-G---GTACATATATTGAAG--A---C---AG-TATACAAGT-TT-GGGCTTCGAA---TCC------ATA-CTCAATGG--AGTTAATTTATCGGGAAATGTT-TTAT----AATAC-ATG-TAGCGTGT--T-AAA-TCG-ACTCCAC-CACACTG-TAACATAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATCAAAG---A-TGTTC---A---AAATA-CTCAC-A--AACA-CA-------T-TTTTT---TGGTACGTCTTTCCTTCCCCTCCTGTTTA-TAATATCACTAC-------------------------TCCG---CAATGGGAGATAAC--TCAGTATGCAA-A-ATGC---AACACATTCAAATT--T-TC-T-ATGC-CAATTTT--CTATTATGTCATATGAAATG---------T-----TA-TTT-AC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTC-A-TCTCGTT------TT-T---AT--CA--------TTCA--------------T-T-T-ACCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGTTT-GTCTTAA-AT--
gi|11 : cTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC--ACC------TTAT---AT--CAG-------TTTA--------------T-C-T-AT--TG--T-------TCT---T-AA---TCA-ATATT-T---T-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGAACTTTT-GCCTCAGGA-T-TT--GC-CAAA-AAA--C-TAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTC----TTT-A-GTC--C-AA-T------T-AGG--ACT-T-----G-TGC-TA---CA-AA-G--G---ACA-TC----ATATC-AGATAA--T-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---ATTCCA---AACTTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AG--A-A---TT-CATTGC--CAAA-T-TTCC--AA--A-AT-A-TTT---GAAATTAAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTTCGT-G--T-TTT---CTT-T-TA-T-A-A-AT-GC--CC----GATTAC-----T---ATGG--A-AAC--GGGT-A-C-TT--TTCAC--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA--TTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTATTTG--AATGA--AACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GTGTACAGA-GAATTcagtgtattttatcaatctatctcaaaaacat
gi|12 : aaTAT-------TAATAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TG-TT-T---T--TTT-----------------TTAA---AT--------------TA--------------T-G-T-AGCTT-------------T---T-AAAAATCA-ATATT-TGATT-TTTCTTA-AT--G-TG---CT-GG-C-----GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAG-GAA---ATAGAA--AA-CTG-CTTGAA-A---T--TT-TGGTCA---TTG-G-AGC--T-GAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CA-AT-AATG---ATA-TC----ATATCCAGA---------------------G-A-TC----ATA---TTGTTA---AAC-TC--T---A-TCT--CAGC-ATGTATT-----------GTAG--CAT--A--G-A---TT-CTTTGT--TAAA-TATT-C---A--G-AT-A-TTT---TAGACTGAAG--TGAAA--------A-TT-CCTAAA-----ACTGCA-A--TT-TCCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-C-AGA-TA-G---AT----A-TCAC-----T---ATGG--A-AAC--GAGTCA-CATT--T---C--AGAATATGCAT-GTGTACATGTA----TAGTA-TTTT---TTTTAAAGA-------------------G-TTG--AGTGAG-GGCA-------TTT-AC--------AGTGG-A---T--ATT----TTTCAGTG--CGTT--CC-G-C-AA---TA----TTTTGGT--T--GT-TACAG
gi|13 : -------T-TTTTCCTTT-G-ATTGCTTTCTGTGCCCTCCTGTTTA-TAACACCACTATTGT-TTATATCCTATA-TTAGATATTCCG---AAAAGGG-GATAAT--TCAATCTGTAA-A-ATTA---AACAAATCTATAAA--T-GT-C-ATGC-CAATTTT--CTAT-------TACAAAATA---------T-----CA-TTT-GA----C-C-AC-TTATTAT---T--TAT--A-TA-CATC--------AT---AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ACTCTC--T-------TCT---T-TAA--TCC-GTATT-TGATT-GTCTATA-AC--G-TG---CCTGG-CTTTT-G-CTCAGGGAT-TT--GC-CAAA-GAA--CATTGAA--AAACTG-CT---ACA---T--TT-TGGTCA---TTTGA-GCC--A-AAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CG-A
gi|14 : -T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGTTA-C-AAA-TT--C---A-TAT--TAGC-A-----T-----------GTAG--CAT-AA--C-A---TT-CTTTGT--CAAA-T-AA-CCAAA--A-AT-A-CAT---TAAATCAAAG--ATAAC--------TTTT-TCTAAA-----ACTTTA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTTTCCCTC-TACA-T---A-TA-GC--CA----C-TTAC-----T---ATAG--A-AAC--CAGTCA---------------------------TGCA-----A----CACTA-ATCT---TTT--A-GA----------G----TTCTA-TTG--GATGAT-GACATATACATTTT-ATACATATACAGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--ta
gi|15 : ATTTAAA--CGATT--------ATTT-TCTAAA-----ACTACT-A--TT-TTCT-T-G--T-TTT---TTCCTATA-TGA-A-TA-GC--CT----G-TTAC------C--ATGG--A-TAA--GATCCA-C-TT--TT--C--AGAAG----AA-GTGTA-----A----CGATA-TTTT---CTTT-AAG--TT-CAT---GT-ATTTCTG-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AT--------AGAGGGA---C--A-T----TTTCAGTG--CATG--GC-A-ACGA---TA----TCTAGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|16 : CATTAACAAAA-TTATTTTTGAAATTTGAGATCTTATTCTGTAAATAATG-AT-GG-AT--G-GGATATGCCT--AT-TGGAACAACAATAACAACATATT-gtat
gi|17 : ggggtgtgtgtgtcctgcgatgtcagcgacacgcatacccattaagaaataatgagtagccgcccgccccccccccccccgcccgTA-TAATATCACTACTTA-TTATCTCCTAAA-TTAGAAATTCAG---CAAAGGGAGATAAC--CCAGTATGCAA-A-ATGC---AACAAATTCAAATT--T-TC-T-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAAATG---------T-----AA-TTT-AC----C-C-AT-TGAGT-T---T--TTA--A-TC-TGGT------TGTT---AT--TA--------TCCA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGATT-attttactcacagt
gi|18 : A--------ATTT-C-TAAA-----ACTACA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTT---TTCCTATA-T-A-A-AATGC--CG----G-TTAC------C--ATGG--A-AAC--GACTCA-C-TT--T------------------------------------------------TC-ATG--TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGAA---A--ATC----TTTCAGTG--CGTG--gtctt
gi|19 : attGAGGATCAC---AACTT-TACCCCTCCCCTATTTGC-----CTTA----------AA-TCATTTTTT---TGATTATA-GAATG-----CTT--AAAAAATA--------GCTAT-TATTCAgcc
gi|2 : atgcatcagCATTAAACAAA-TTATTTTG--AATTTGAGGTCTATC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATTAT-ACAG--GTGC--ACC---------A-----CAG-T-ACAT-ACAAAAT-AT---GTTACCTTATTATCAC--------TGTGTTCACTT--G----------------TC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AAAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-TAA-ATACGTCAAAATTTGATGAAATTC--TCACAAAAA-ATAA--GA--CATGT-AAACA-TTGAATTCCTTTACACGCATT-ATTTCTTTTTATCAA----ACACA---TTATCACT----CACTG--------------TTATGGCGAAAGAAGGGAGGAG-GAGGGGGGGGGGGTTGT---CATTTCTTTAAAT----ACT------TATTTTATGA----AGAAA-ACTC--GGACA----T-CATCAGGA-T-AAAATTT-TCC--TTAACCT-------AAAA---ATTTAAAACTT-AGT-GAAATTAA-C--AT---GTTAAATAAAC--CAA---TCAGATATA--ATTTAGT---TCATTCTTTT-----TTTATATTTTTGAAGATGA-------TT-TACCCCCCCCC----CCC-----CCCA----------AACTC-TTCCTTCCCCAATTATC-AAATATTATTTTT--AGAAAATATT-----TATCATATATTCACCCTGGCTCAGTTGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AA--TACCA-TGA-TCATTTCAA-T-TTACT-T------ATAC--GGTCGGAACGTGTGTCATTAC-AATGTAA-TGTAC---ATCA-TTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAAATTCAAACAGTA-CTTACGT---AAACTTG-G--TTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATC-C---A-TTTTCT--TAACA--GC-A-T-GCTTTGT--GGATAAA-----CATGTCGGTT--TTTAATTGCCATG------------------GG-AAACGC-AGAATAAACCC--CCG--------A---------C--------AGCATAATTC-G-G---GTGCA-AT---------A---TGTTAGATATCTCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------GCA-TTCCATGAC-AAT--ATTTGTCTGGAAACTTT-TT-T----ACCA-CACT-TGGTGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CAAAGTG-AAATACAT-CCAAAT-ACATACAGAATGATGGTAAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAT-A--AACACTA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCATTTCCCTCCTGTTTA-CAAAAC--CCACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAAAAATTCATACT--T-TC-C-ATAC-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-T---T--TT-TTGTCA---TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAT-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----GTTTAC-----TT--TTGG--A-AA---GGGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTGa
gi|21 : -AAA--CA--GTA--AAATTA-CT---A-A---TTTTT-TGGTCA---TTTGA-GCC--T-GAAT------T-ATG--AGC-C-----G-TGC-TA---
gi|3 : -TGGAGCAACTGT-GC-ACATATT-TTATAG--ATGC--ATC--------AAACTTTCAAATAA--T-ACACAATGA-------ACCTTTT--TCGT--------TGTTTTCATTTTCGAATTCG--AAAAATTCTCAGACATGATCACATGTTTCTGT-------TTTTCATG-ATCAATATTACTATAAAACA--TGTACAAT-------GTGCCA---TTAAATGAGATTCAATTAC-AAAT-ATAATGGCGTCATAT-GACCA-T-GATTTCATTTACACACATTCATTC-----------------A-A---TCAT-A-T----CA-TA--------------TCATG---AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCT-----TATTTTTCCAAAC----AACAAAAAATTTTCT-T-A----AGAAATACTCTGGGACA----A-CATCAGAA-TTAACATTT-AAT--TTATCTT-------GAAAGAAAATGAAAA--T-AGG-TAAATTGA-TTAGT---GGTAAATAAACTACAT---TC----A-A--A-TT--T---TCA-----CA--------ATGCATCAGGGGATCAC---AACTTCTACCCCCCCCC----TCC-----CCCATTTGGCCTTAAATTCATTTTTTA---AATTAGA-GAATG-----CTT--AAAAAATAGC-----TACT---TATTCATC-TAGCCTAG-TAAAATAAACAAATAATGATTGTA-TACA--TTTTATT-TACCA-TGA-TCAACTCA--T-TCACTG-------AGAA--AAT-GTAACATGT-TCAT-AT-GACGTAA-TG--C---------------T-ATGCAATG----TATCACACTACTGGCGATATCTTACAT-------TTGCG--GTTTTCCAA-CTGGCCA-TGAATA-C---A-CTTTTCAATAGCA--GCAA-T-GTTTTGCCAAAATAAA-----CGT-TCAGATAGCTAAATT-CCATG------------------AGCAAATGG-A-AATGCAGCC--CCG--------AACCACATAAC--------AGCGTAAATC-G-G----TACA--TA---AAA--AGACTGCTAG-TGACACGTT-TT-G--CTTTGAA---TC-------ATA-TTCAA-AAC-GGTTTATGTATCGGAAAATGTC-TT-TGGAAACTACTACGGCAGCCTGT-TT-TTA-TCA-ACTCCTTGCACACTG-GAATACACGTCAGGC-ACATATAAAGTAATGATCAAAGAAGG-T-TTT---A---AAATGCTCAAC-A--AACAC-A-------T-TTTTT---G-GTATGTCTTGCCTTTCCCCTCTGTTTATCAT--TCACTACTTAATTATCTCCTAAAATTAGAAATTCCG---CAAAGG-AGATAACACTCAGTATGCAA-A---TGC--AACAAATTCAAATT--T-TC-TTGTGC-CAATTTT--CTAT-------TAGGAAATG---------T-----CA-TTT-AC----C-CCAC-TGAGT-T---T--TTT--AATC-TGGT------TGGTT--AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---G-AAT--TCA-ATATT-TGATTGTCTTCAA-ATCAG-TG---T---G-CTTTTCGTC---GCAGT-TTTGGT-C--A-AAA--CATAGTA--AAATTG-CT---A-AT--T--TT-TGGTCATT-TTT-A-GCCTTT-GAAT------TAATG--AGC-C-----GCTGC-TA---CA-GT-AATG---GGA-TTTAAAATTTCCA-ATAGCAT-T--T-TCAT-AT-TT-T-TTTCAAA-A---TTGTTA-C-TAC-TT--T---G-TTT--CAATAA-----G-----------GTAA--CAT-AA--A-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-AT-C--AA--ATATGA-TTT---T-AATTAAAG--C--AATCT-----ATTT-TCTTAA-----ACTAAA-ATTTT-TTCC-T-G--TGTTT---TCC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G--TAC------C--ATGG--A-AAC--GACTCA-C-TTTCT---C--AGAAT----AA-GTGGT-----A----TGAAA-TTTT---TTTC-TTAA-GT-TATG--GTAATTTCTA-TTG--AATTA--GACA-------TTCGAC--------AGTGGAA---A--ATT----TT--AGTG--CGTG--CC-A-C-CA---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|4 : aaAATAA-CATTGAAATTTTGAAATGCAACTT--GATACACCACTGAATCATC--AATTGTTACTGT------AA---------TAACGGGTGTCACTGC-G-CA-AA-TG--T---ATCACTTGTTAA-----------------AAAAGTTCCA--AACAACTTACATTAAAAACTTT-GTCGTTTTCCAGGCTGGC-AATGAATCAC---A-ATTTCTC-TAACA--GCAACT-GCTT-GT--GGATAAAAGTAACATGTCGTTT--TTAAATTCGCATGGACAAAATGGGTTGTGGGAGTAAAAGC-AGAAT--AACCGCCTG--------A---------C--------ACCATGAATC-G-G---GTGC---CA---AGACTA---TGTTTGATA--CCAGTCTT-GAACTTTGAA---AC-------ACAATTCCATGACCAATCATTGTCT-GGAAAACGAT-TT-T----ACCACCACT-TGGTGTGT-GTATAACTCGAACTCCCT-CAAAGTGCAAATACAT-CCAAATGACATACAGAATGATGTTAAAGG---GATGTTTTAAA---GAATAGCCCGC-ATTAA-ACCACGTATTTT-TTTTC---G-GCATCGCTTTCATTTCCATCCTG-TTA-CAAAACCACTAC-TA-TTATCGCCTATA-CTAG-TATTCCACATCAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-ATATTGCAAAGGAAATTCATATCTAT-TC-C-ATAC-CAGTTTTTCTTAT-------T-TGAGATA---------TCTTCACA-TTT-GC----CAC-ACAGGATC-T---TTATTT--A-TC-CATCCTGGTATTAT---AA--TA--------TCTA--------------T-C-TCATCTTC--TA------TCTGAATAAAA--TCAGGTATTATGAAT-TACTCTA-AT--GCTG---CCCAC-TTTTC-TGCTCAGGAGTCTT--GCACAAATAAAC-CATAGAA--AAACTG-CT---A-AATTT--TC-TGGTTAAATTTT-ACGTC--CAGAGT------T-ATG--ACCGT-----G-GGCATA---CACAA-ATTGTACATA-TCG---ATATCCAGATAA-ATAT--TAACAT-ATCTG-ACTCAGA-A-A---ATGCCATC-AAC-TTAAT---AGTCTCACACT-A-----T-----------GAGA--AAC-AA--ACA---TTCCATTGCGTCAAT-T-TT-C--AA--A-TA-A-TTTATATAAATTGAAGTTTGAAA--------ATTT-TCCAAAAAAAGACAGCATA--AT-GTCCTT-G--T-TTTTC-TTC-TATA-TAA-A-TA-GCTTCC------TTACTAAAATA--ATGGACA-AACGAGAGTCA-C-TTTGT---CAAAAAAT----ATCGTGCA-----GGAGTCAATG-TTTTTTGTTTC-ACAG-AT-CATCTCAT-TTTTCTA-TTGAAAATGATAAACA--------CC-ATCG------AGTGGAAACTT--ATTTTTGTTTCAGTG--CGTG--CCAG-A-AAAGTTAGACTTTTCGGTACC--GT-TACAAA-GAgtattaaaatctgtctcaa
gi|5 : CTTTCATGGATCC-TATTGCTATAAAAGAAATGTACAAT-------GTTTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAA-AAAATATAATGGA--CATGT-GACCA-TTGAATTTATTTACATAC----ATTC-------------------A---TTACAA-T----CA-TA--------------TCAT---GAGAGTAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCTTC---CATATTCCAAAATGAAAAAT--------TTCT-T-A----AGAAATACTTG-GGACA----A-CATCAGAATT-AACATTTATCTTATTAATCTTGAAAACGAAA---ATGAAAGGC---AGGCGAAATTGATT--AT---GGTAAATAAAC--TAT---TCAAATA-----------------------T-----TTTACATGTATCAGGGTGATCAGAACTG-TACCTTCCCTC----CCCATTTGCCTT----------AAATCATTATTT---TAATTATA-GAATG-----CTT--AGAAAATA--------GCCAT-TATTCAATCTAGCCTAG-TAAAATAA-CACTTAAT------A-T-----TT--A------CA-TGA-TCA-CTCA--T-TCACTG-------AGA---AAT-GTAAC--GTGTCATTAT-GACGTAA-TG--A---A--ACT----ACT-CT-CAATG----CATCACACTACTGGCAATA-CTTACAT---AAACTTG-C--GTTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATA-C---ACTTTTCA--TAGCA--GCAA-T-GTTTGGC--AAATAAA-----CGTCTAGATA--GCTAGCTTCAATG------------------AGCAAATGTGAAAATGCAGCC--CGGAATACATAA---------C--------AGTGTAAATC-C-GTACGTATA-TTA---AAA--AC--TGCTAG-TATACAAGT-TT-TGGCTTTGAA---TCCACATGTATA-TTCAATAA--AGTTAATGTATCGGGATATGTTCTT-T----GATA-CACG-CAGCGTGT-TT-T-A-TCA-ACTCCATGCACACTG-GAATGCAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATTAAAG---A-TGTTT---ACTTAAATCGCCCACAA--AACGACA-------TCTTTTC---G-GTATGTCTTTCTTgtacattcactctaaaaatctatctaaa
gi|6 : aaaactctcaagactgatcagcgtctatgcAAATT--TGTCTC-G-GCGCAATTTT--CTAT-------TAT-AGACAAATGTAGGCT-----AA-TTTAGCACTGC-C-AC-TGAGT-T---T--TTT--A-TC-TGTT------GTA----AT--CACTTTAGTTTTTA--------------TACAT-ATCATC--TCTGACAATTT---T-GTA--CAA-ATATT-TGATTGTCTTCAAGATCAG-TG------GG-CTTC--GTCACAG---T-TG--GT-CAAA-AAA--CATAGAAGTAAATTGGCT---A-A---T--TT-TGTGCA---TTTTA-GCC--TTGAATAGTTAAT-ATGGGATT-TCGACGG-TGC-CAGTTCA-GTTAATG---ATAATA----ATTTCCAAATAC-TT-TG-T-TCAT--T-TG-T-TTCAA-A-A---TTGTTA-CTGAC-TT--TTGGA-TTT--CAAT-A-----TAAGCGGATTGAGCAG--TAA-GAGAA-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-AT-C--AATTG-AT-A-TT------AGTTAATG--TAAAGCACGCATTATTT-CGTAAA-----ACTACA-A---T-TTCC-TAG--T-TAT---TTC-TATAAT-A-A-AA-GC--CTCCGGG-TTAC-----T---ATGG--GGAAC--GACTCA-C-TT--T---A--GAATT----AA-GTGTA-----A-----AATA-TTTT---TTTC-TTAAGTT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGGA---GAAATT----TTTCAGTGTTTGTGCACC------A---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGAGGAACTG
gi|7 : gctcaataatcatacctgaagattagaccacaggatgtccgcttccaaagggattagaccgtgaagactacagtatgtataagaattcagacaggactgttcaaTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTACA-CTAGATATTCTG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAGAAATTCATATT--T-TC-C-ATAT-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----AA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACA------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CTA--A-A---T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ACTG---ACA-TC----ATATCAAGA-AA-AA-T--T-ACATGAA-TG-A-TCAA--A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GC-GTTCACTAATTA-AATTTT-CATTGT--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-AGTTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTTACAAAAA-----ACTGCA-A---T-TTCT-T-GT-T-TTT---CTC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----T---ATGG--A-AAC--GGGTCA-CTTT--T---C--AAAAT----AT--TGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-C-T---GT-ATTTCTA--TG--AAT-AT-AACA-------TTT-AT--------A-TGGAA---T--GAT----TTTCAGTG--CGTG--CC-GCA-AA---AA----TTTTGGT--CCTGT-TACAGA-GAATTttattaaggtgt
gi|8 : C----C-T-AT-TGAAT-T---T--TTA--A-TC-TGCT------TT-T---AT--CA--------TACA--------------T-T-A-ACCTTC--T-------TCC---T-AAA--TTA-ATATT-TGATT-TCCTTTA-AA--T-CA---TCTGT-TTTTT-CGCTCAGGAGT-CG--GT-C-AC-AAA--TATAGCA--ATACTG-CT---A-T---T--TTGTGGTCA---TTTGA-ACC--T-GATT------T-ATG--AGT-T-----G-TGT-TA---CA-AT-AATG---TTA-TC----ATTCCCAGATAA-AT-G--T-GCTT-GT-TC-A-TC----tgct
gi|8 : gaaatattttaacctttttaaAG--CAT-AG--A-A---AT-CCTTAC--CAAA-TATT-T--GT--G-AT-A-TTT---TAAATTGAAA--TGAAA--------A-----CTAAA-----ACCCCA-T--TT-GTAC-T-C--T-TTT----TG-TATA-T-A-AATA-AA--CT----G-TTA------TC--ATGG--T-AAC--GATTCAAT-TT--T---C--AGAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TCTA---TT---GAGA-TT----------ATTCCTA-TTG--AATGAT-ATAA-------TTT-AC--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagcatagaaatccttaccaaatatttgtgatattttaaattgaaatgaaaactaaaaccccatttgtactctttttgtatataaataaactgttatcatggtaacgattcaattttcagaatatgtgtaacaatatctattgagattattcctattgaatgatataatttacagtggaatatttttcagtgaat
gi|9 : gaaatattttaacctttttaacctattgaatttttaatctgcttttatcatacattaaccttcttcctaaattaatatttgatttcctttaaatcatctgttttttcgctcaggagtcggtcacaaatatagcaatactgctattttgtggtcatttgaacctgatttatgagttgtgttacaataatgttatcattcccagataaatgtgcttgttcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaa-GT----C-C-AT-TG-TT-TGTGT--TAT--A-TCACGCT------TTAT---ACTGCA--------TTTAGAGCTATCCATTGAT-C-T-ATCTTTCAT-------TCTG--T-AAA--TCA-ATATT-TGATT--CTTATAGAT--GGTGACCCTCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAAACCATAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTAA---TTTTA-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ATTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--AAC-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAA-T-TTTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-TCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-AATA-GC--TC----G-TTAC-----TATAATGG--A-AAC--GGGTCA-C-TT--TT--C--AAAAT----AT-GTGCA-----G----CAATG-TTTTTTTTTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TCG-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGAT
Unaligned ( gi|22 ): CTGAGAATTGCTCTTAACAACTATGGAACAATGCTGTTGAAATATTTACTTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 222 1 1 2222 1 11 1 1 1 111 11 11 888888888888888 1 1 55555555 1 44444444 555555555555555555555555 222 22222 11 55555555 11 1 1 111111 1 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1 22222 444444444444444 22222222 1 22 222222 111 111111 33333333 111 1111 11 333333333 11 111 11 999999999999999999999999999999 11 222222 55555555555555555555555555 3333 44444 11 55555555555555 1 11 222222 1 2222 55555555555555555 55555555555555555555555 1111 1 1111 2222 11 111 11 11 11 22222 11111 444444444444444444 11 11 555555555555555555555555555 111 5555555555555555 1 11 111 2222222 1111111 1111 11111111 1 11111 11111111 11 1111111 11111 111 1111111 111111111111111 111111111111111111 11111111 11111111111111 1111111 111 222 111 1 1111 1111 2222222222 22222222222222222 11 11111111 111 1111 1 333333333 111111111 111 1111111 11111111
lowQualScore : 3 88 7 1 333 7 3 6 3 1111 3 88 0 3 0 0 444 88 88 000000000000000 3 7 6 3 33333333 2 0 88888888 333333333333333333333333 333 7 22222 3 2 88 3 3 44444444 333 1 3 33 0 0 666666 0 1 0 3 9 55 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8888 2 5 3 77777 44 444444444444444 33333333 5 33 888888 0 111 1 999999 99999999 777 1 8888 00 111111111 1 33 777 00 666666666666666666666666666666 77 1 888888 8 99999999999999999999999999 8 6 1 1111 8 44444 11 22222222222222 0 2 0 0 8 8888 1 8 3 11 444444 8 8 6 0 8888 44444444444444444 0 33 0 8 0 5 8 33333333333333333333333 7777 0 0 8 1 777 5 4444 4444 44 8 8 99 444 8 99 11 0 8 8 5 11 00000 8 66666 1 5 999999999999999999 9 2 44 3 00 99 1 666666666666666666666666666 777 111 1111111111111111 3 5 00 6 6 4 111 8888888 6 1 4444444 1 2 6 6 4444 77 99 44444444 6 1 3 1 6 6 6 0 7 33333 66666666 6 6 55 77 8888888 5 77777 4 1 1 5 6 3 5 2 5 00 888 66 1 5 5 333 1 1 66 4 4 66 4 1 66 3333333 777777777777777 4 3 6666 3 3 3 3 555 44 77 3 777777777777777777 44 77777777 88888888888888 444 3 44 3333333 222 3 555 3 3 6 6 99 7 777777777 999 3 55 3 3 77 1 44 3 999 3 000 44 3 777 6 3 0 0000 2 999999 3 44 1 3 88888 3 3 555 3 55 4 777 4 2222 3 0 44 3 88 3 3 3 3 3 9999999999 888 4 55 777 4 55 4 77777777777777777 55 3 00 3 666 3 1 55 3 7 7 55 55 3 3 3 666 44 66666666 3 1 77777 3 111 3 6 3 77 3 0000 6 3 5 3 6 3 44 999999 000000000 44 3 44 3 6 666666666 9999 33 9999999999 3 000 3 3 55 3 0 888 3 3 44 1 33 0000000 3 55555555 777777 6666 44 55 88888 777 9999 99999 4 5
lowQualScore : . .. . . ... . . . . .... . .. . . . . ... .. .. ............... . . . . ........ . . ........ ........................ ... . ..... . . .. . . ........ ... . . .. . . ...... . . . . . .. . ...................................................... .... . . . ..... .. ............... ........ . .. ...... . ... . ...... ........ ... . .... .. ......... . .. ... .. .............................. .. . ...... . .......................... . . . .... . ..... .. .............. . . . . . .... . . . .. ...... . . . . .... ................. . .. . . . . . ....................... .... . . . . ... . .... .... .. . . .. ... . .. .. . . . . .. ..... . ..... . . .................. . . .. . .. .. . ........................... ... ... ................ . . .. . . . ... ....... . . ....... . . . . .... .. .. ........ . . . . . . . . . ..... ........ . . .. .. ....... . ..... . . . . . . . . . .. ... .. . . . ... . . .. . . .. . . .. ....... ............... . . .... . . . . ... .. .. . .................. .. ........ .............. ... . .. ....... ... . ... . . . . .. . ......... ... . .. . . .. . .. . ... . ... .. . ... . . . .... . ...... . .. . . ..... . . ... . .. . ... . .... . . .. . .. . . . . . .......... ... . .. ... . .. . ................. .. . .. . ... . . .. . . . .. .. . . . ... .. ........ . . ..... . ... . . . .. . .... . . . . . . .. ...... ......... .. . .. . . ......... .... .. .......... . ... . . .. . . ... . . .. . .. ....... . ........ ...... .... .. .. ..... ... .... ..... . .
lowQualScore : 3 33 3 0 333 3 3 7 3 7777 3 33 0 2 0 0 333 33 33 000000000000000 3 3 7 3 33333333 0 7 33333333 777777777777777777777777 333 3 33333 2 5 88 2 2 88888888 888 2 2 22 0 0 555555 0 0 0 2 2 88 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 5 5 0 00000 55 555555555555555 22222222 5 88 888888 8 000 0 555555 00000000 555 0 8888 22 555555555 0 88 555 88 000000000000000000000000000000 00 2 444444 0 22222222222222222222222222 2 0 4 4444 0 66666 00 00000000000000 2 5 0 8 0 0000 0 0 2 00 666666 0 0 0 6 0000 22222222222222222 6 88 8 0 8 6 0 44444444444444444444444 0000 6 6 8 4 444 8 8888 0000 44 0 0 00 000 0 00 00 8 0 0 6 00 00000 8 44444 4 7 222222222222222222 3 2 33 7 33 22 0 000000000000000000000000000 555 777 2222222222222222 2 5 33 7 7 2 777 3333333 7 0 5555555 0 5 7 7 2222 77 22 22222222 7 0 3 0 7 7 7 3 5 77777 00000000 7 7 88 77 6666666 7 00000 0 4 0 0 6 2 0 4 0 66 888 99 0 0 0 888 0 0 11 4 4 11 4 3 11 0000000 000000000000000 0 3 5555 1 1 1 1 444 22 33 1 000000000000000000 22 33333333 11111111111111 222 1 22 1111111 777 1 000 1 1 2 7 22 3 888888888 555 6 00 6 3 99 4 66 3 222 3 444 66 3 111 7 3 1 0000 9 666666 3 66 8 3 33333 3 3 888 6 44 9 000 0 5555 7 8 99 6 66 6 6 6 6 6 5555555555 000 0 55 000 0 55 0 33333333333333333 00 6 00 6 444 6 0 00 6 3 3 00 00 6 6 6 444 66 55555555 1 3 77777 1 222 1 2 1 33 1 8888 2 1 4 1 2 1 22 777777 999999999 22 1 22 1 2 000000000 6666 88 4444444444 1 888 1 3 55 1 3 555 1 1 22 5 55 0000000 1 44444444 666666 5555 22 00 44444 000 4444 33333 4 0
consensus : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC--------AA-----CAG-TAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--A-TTAGT---TCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGAC---AACTT-TACCCCCCCCC----CCC-----CCCA----------AACTCATTCTTTCCCCAATTATA-GAATGTTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATCTCAATT-TTACTGT------AGAC--GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACG-TAGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TC--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
Reference ( family-30 ) : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC--------AA-----CAG-TAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--A-TTAGT---TCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGAC---AACTT-TACCCCCCCCC----CCC-----CCCA----------AACTCATTCTTTCCCCAATTATA-GAATGTTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATCTCAATT-TTACTGT------AGAC--GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACG-TAGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TC--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
gi|1 : TTAAACCAACTTATATTT--AATT-GAGGTTTTCC---G--AATAATGTATGGGTATCGGCGGATA-GCCTCAATATGGAACA-CAAT-AC-ACATTCT-T-GCAGCAGTGCCCACTCCATTCAAAA-----CAG-TAACATTACACAATACTTTTG-TACCTTTTCATCACACACCCCCTGTGTTCACTT--GAATTCGCTAGA--TTTTC---CAGAATT---TTT--CCCTAATAGAGCTT-AATCGATC--TGT-GCTGTGAAAGAAACGCACAATCT-ATATTTGTCAAATTTGA-TGAAATTCA-TCAC-AAAA-ATAA-AGA--CATGTTAAACACTTGAATTC-TTTACACA-ATT-ATTTCTTCT--TT-ATCAAACA-AAATTTATCA-TAAATCA-TAATGCACTGTCACTGTTATG--GAAAGAAG-AGGGAG-------GAAGGGGCTGTTGTCATTTTCCT---T----ACT------TGTTTT-T-ATGAAAGAAA-ATTC--GGACACGATATCATCAGCA-T-AAAATTT-TTC--CTAACCT---------AA---ATTTAAAACTTTAGG-AAAATTAA-C--AACAAGTTAAATAAAC--CATGATCCGGATA-ATAA-TTAGTAGTTCA-----TTCTTTCTTTTTA--TTTGAAGATGA-------TT-TAACCCCCCC----------------A----------GACTCTTCCCTTCCCCAAGTATACAAATATTA-TATTGTAGAAAATA-TCATATTATCATATATT-ACCCTGGCTCAG-TGCAA-AA-CATTGGATTTT-GAA-TGCA--TT--AAT-TGCCA-TGA-TCATC-CAATTATTATAGTTTTACAAGACCCGGC-GGAACGTGTGTCATTGCCAACGGAAATG--CTTGACCTCTTGTCAATTAT-CAATGCTTCTATAAAA--TCCAACAATATCTTACGT---AAACTTG-----TTTTCCA--CTGGC-A-TGAATT-CCCAA-TTTTCT--TAACACAGCAA-TTGCTTTGT--GGATAAC-----AGTTGCG--T--TTATATTTCCATG------------------AG--AACGC-AGAATA-AACC--CCG--------A---------C--------AGCATAAATCCGCG---GTGCA-A-------A--C---TGC-AGATTACCCAGT-TTTGAACTTTGAAAATCC-------ACA-TCCCATGAC-A----ATATGTCTGGAAAC--T-TT-T----ACCACCACT-TAGTGTGTTGT-TAACTCG-AC-CCCT-CAAACGT-GAATACAT-CCAAAT-ACATACAG-GTGATGGT-AAGG---G-TGTT----A---AAATACCCCAT-AT-AACAACA-------T-TTTTC---T-GC-TGTCTT-CATTTCCCTCCT-TTTA-CAAAACCGCTACTTA-TATTCGCTTGTA-CTAGATAT--CA---C-----GGGATAAC--T-AATCAGCAATA-ATTG---AAGAAATTCATACT--T-TC-C-CTAC-CATTTTT--CTGT-------TATG-GATA---------T-----CAATTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTTTA-TC-CACC------TTATTTAAT--CAA-------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCTCT-T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCC-G-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAG-A--AAACTG-CT---A-AAT-T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-TAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG----CA-TC----AT-TGCAGATAA-AT-TTGT-ACAT-AT-TGAA-TC----A-AAATTTGCC--C-AAA-CT--T---A-TCT--CACT-A-----------------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGC--CAAATT-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTAAAG--TGACA--------ATTT-TCCAAA-----ACTGCA-A--ATATTCC-T-GTTT-TTT---TTC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----CT--ATG-----CAC--GGGTCA-C-TT--T---T--CACATG---AT-GTGT------A----CAATATTTTT---TTTC-ACAA-TTCCAT---GT-AGATCTA--TG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGAAT---T--ATT----TTTTAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---
gi|10 : gggggtgtctttcacgaatgtccgcgacacggtccctttcccattaaaaaaataatgacgagtcccccccttccccggttcTTCCATC------------------AACAAATGGGAAAATGCAGCT--CGG--------A---------CCATATAGCAGTGTAAATC-G-G---GTACATATATTGAAG--A---C---AG-TATACAAGT-TT-GGGCTTCGAA---TCC------ATA-CTCAATGG--AGTTAATTTATCGGGAAATGTT-TTAT----AATAC-ATG-TAGCGTGT--T-AAA-TCG-ACTCCAC-CACACTG-TAACATAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATCAAAG---A-TGTTC---A---AAATA-CTCAC-A--AACA-CA-------T-TTTTT---TGGTACGTCTTTCCTTCCCCTCCTGTTTA-TAATATCACTAC-------------------------TCCG---CAATGGGAGATAAC--TCAGTATGCAA-A-ATGC---AACACATTCAAATT--T-TC-T-ATGC-CAATTTT--CTATTATGTCATATGAAATG---------T-----TA-TTT-AC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTTC-A-TCTCGTT------TT-T---AT--CA--------TTCA--------------T-T-T-ACCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGTTT-GTCTTAA-AT--
gi|11 : cTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC--ACC------TTAT---AT--CAG-------TTTA--------------T-C-T-AT--TG--T-------TCT---T-AA---TCA-ATATT-T---T-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGAACTTTT-GCCTCAGGA-T-TT--GC-CAAA-AAA--C-TAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTC----TTT-A-GTC--C-AA-T------T-AGG--ACT-T-----G-TGC-TA---CA-AA-G--G---ACA-TC----ATATC-AGATAA--T-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---ATTCCA---AACTTT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AG--A-A---TT-CATTGC--CAAA-T-TTCC--AA--A-AT-A-TTT---GAAATTAAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTTCGT-G--T-TTT---CTT-T-TA-T-A-A-AT-GC--CC----GATTAC-----T---ATGG--A-AAC--GGGT-A-C-TT--TTCAC--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA--TTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTATTTG--AATGA--AACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GTGTACAGA-GAATTcagtgtattttatcaatctatctcaaaaacat
gi|12 : aaTAT-------TAATAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TG-TT-T---T--TTT-----------------TTAA---AT--------------TA--------------T-G-T-AGCTT-------------T---T-AAAAATCA-ATATT-TGATT-TTTCTTA-AT--G-TG---CT-GG-C-----GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAG-GAA---ATAGAA--AA-CTG-CTTGAA-A---T--TT-TGGTCA---TTG-G-AGC--T-GAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CA-AT-AATG---ATA-TC----ATATCCAGA---------------------G-A-TC----ATA---TTGTTA---AAC-TC--T---A-TCT--CAGC-ATGTATT-----------GTAG--CAT--A--G-A---TT-CTTTGT--TAAA-TATT-C---A--G-AT-A-TTT---TAGACTGAAG--TGAAA--------A-TT-CCTAAA-----ACTGCA-A--TT-TCCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-C-AGA-TA-G---AT----A-TCAC-----T---ATGG--A-AAC--GAGTCA-CATT--T---C--AGAATATGCAT-GTGTACATGTA----TAGTA-TTTT---TTTTAAAGA-------------------G-TTG--AGTGAG-GGCA-------TTT-AC--------AGTGG-A---T--ATT----TTTCAGTG--CGTT--CC-G-C-AA---TA----TTTTGGT--T--GT-TACAG
gi|13 : -------T-TTTTCCTTT-G-ATTGCTTTCTGTGCCCTCCTGTTTA-TAACACCACTATTGT-TTATATCCTATA-TTAGATATTCCG---AAAAGGG-GATAAT--TCAATCTGTAA-A-ATTA---AACAAATCTATAAA--T-GT-C-ATGC-CAATTTT--CTAT-------TACAAAATA---------T-----CA-TTT-GA----C-C-AC-TTATTAT---T--TAT--A-TA-CATC--------AT---AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ACTCTC--T-------TCT---T-TAA--TCC-GTATT-TGATT-GTCTATA-AC--G-TG---CCTGG-CTTTT-G-CTCAGGGAT-TT--GC-CAAA-GAA--CATTGAA--AAACTG-CT---ACA---T--TT-TGGTCA---TTTGA-GCC--A-AAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CG-A
gi|14 : -T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGTTA-C-AAA-TT--C---A-TAT--TAGC-A-----T-----------GTAG--CAT-AA--C-A---TT-CTTTGT--CAAA-T-AA-CCAAA--A-AT-A-CAT---TAAATCAAAG--ATAAC--------TTTT-TCTAAA-----ACTTTA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTTTCCCTC-TACA-T---A-TA-GC--CA----C-TTAC-----T---ATAG--A-AAC--CAGTCA---------------------------TGCA-----A----CACTA-ATCT---TTT--A-GA----------G----TTCTA-TTG--GATGAT-GACATATACATTTT-ATACATATACAGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--ta
gi|15 : ATTTAAA--CGATT--------ATTT-TCTAAA-----ACTACT-A--TT-TTCT-T-G--T-TTT---TTCCTATA-TGA-A-TA-GC--CT----G-TTAC------C--ATGG--A-TAA--GATCCA-C-TT--TT--C--AGAAG----AA-GTGTA-----A----CGATA-TTTT---CTTT-AAG--TT-CAT---GT-ATTTCTG-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AT--------AGAGGGA---C--A-T----TTTCAGTG--CATG--GC-A-ACGA---TA----TCTAGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|16 : CATTAACAAAA-TTATTTTTGAAATTTGAGATCTTATTCTGTAAATAATG-AT-GG-AT--G-GGATATGCCT--AT-TGGAACAACAATAACAACATATT-gtat
gi|17 : ggggtgtgtgtgtcctgcgatgtcagcgacacgcatacccattaagaaataatgagtagccgcccgccccccccccccccgcccgTA-TAATATCACTACTTA-TTATCTCCTAAA-TTAGAAATTCAG---CAAAGGGAGATAAC--CCAGTATGCAA-A-ATGC---AACAAATTCAAATT--T-TC-T-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAAATG---------T-----AA-TTT-AC----C-C-AT-TGAGT-T---T--TTA--A-TC-TGGT------TGTT---AT--TA--------TCCA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGATT-attttactcacagt
gi|18 : A--------ATTT-C-TAAA-----ACTACA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTT---TTCCTATA-T-A-A-AATGC--CG----G-TTAC------C--ATGG--A-AAC--GACTCA-C-TT--T------------------------------------------------TC-ATG--TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGAA---A--ATC----TTTCAGTG--CGTG--gtctt
gi|19 : attGAGGATCAC---AACTT-TACCCCTCCCCTATTTGC-----CTTA----------AA-TCATTTTTT---TGATTATA-GAATG-----CTT--AAAAAATA--------GCTAT-TATTCAgcc
gi|2 : atgcatcagCATTAAACAAA-TTATTTTG--AATTTGAGGTCTATC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATTAT-ACAG--GTGC--ACC---------A-----CAG-T-ACAT-ACAAAAT-AT---GTTACCTTATTATCAC--------TGTGTTCACTT--G----------------TC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AAAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-TAA-ATACGTCAAAATTTGATGAAATTC--TCACAAAAA-ATAA--GA--CATGT-AAACA-TTGAATTCCTTTACACGCATT-ATTTCTTTTTATCAA----ACACA---TTATCACT----CACTG--------------TTATGGCGAAAGAAGGGAGGAG-GAGGGGGGGGGGGTTGT---CATTTCTTTAAAT----ACT------TATTTTATGA----AGAAA-ACTC--GGACA----T-CATCAGGA-T-AAAATTT-TCC--TTAACCT-------AAAA---ATTTAAAACTT-AGT-GAAATTAA-C--AT---GTTAAATAAAC--CAA---TCAGATATA--ATTTAGT---TCATTCTTTT-----TTTATATTTTTGAAGATGA-------TT-TACCCCCCCCC----CCC-----CCCA----------AACTC-TTCCTTCCCCAATTATC-AAATATTATTTTT--AGAAAATATT-----TATCATATATTCACCCTGGCTCAGTTGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AA--TACCA-TGA-TCATTTCAA-T-TTACT-T------ATAC--GGTCGGAACGTGTGTCATTAC-AATGTAA-TGTAC---ATCA-TTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAAATTCAAACAGTA-CTTACGT---AAACTTG-G--TTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATC-C---A-TTTTCT--TAACA--GC-A-T-GCTTTGT--GGATAAA-----CATGTCGGTT--TTTAATTGCCATG------------------GG-AAACGC-AGAATAAACCC--CCG--------A---------C--------AGCATAATTC-G-G---GTGCA-AT---------A---TGTTAGATATCTCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------GCA-TTCCATGAC-AAT--ATTTGTCTGGAAACTTT-TT-T----ACCA-CACT-TGGTGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CAAAGTG-AAATACAT-CCAAAT-ACATACAGAATGATGGTAAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAT-A--AACACTA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCATTTCCCTCCTGTTTA-CAAAAC--CCACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAAAAATTCATACT--T-TC-C-ATAC-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-T---T--TT-TTGTCA---TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAT-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----GTTTAC-----TT--TTGG--A-AA---GGGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTGa
gi|21 : -AAA--CA--GTA--AAATTA-CT---A-A---TTTTT-TGGTCA---TTTGA-GCC--T-GAAT------T-ATG--AGC-C-----G-TGC-TA---
gi|3 : -TGGAGCAACTGT-GC-ACATATT-TTATAG--ATGC--ATC--------AAACTTTCAAATAA--T-ACACAATGA-------ACCTTTT--TCGT--------TGTTTTCATTTTCGAATTCG--AAAAATTCTCAGACATGATCACATGTTTCTGT-------TTTTCATG-ATCAATATTACTATAAAACA--TGTACAAT-------GTGCCA---TTAAATGAGATTCAATTAC-AAAT-ATAATGGCGTCATAT-GACCA-T-GATTTCATTTACACACATTCATTC-----------------A-A---TCAT-A-T----CA-TA--------------TCATG---AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCT-----TATTTTTCCAAAC----AACAAAAAATTTTCT-T-A----AGAAATACTCTGGGACA----A-CATCAGAA-TTAACATTT-AAT--TTATCTT-------GAAAGAAAATGAAAA--T-AGG-TAAATTGA-TTAGT---GGTAAATAAACTACAT---TC----A-A--A-TT--T---TCA-----CA--------ATGCATCAGGGGATCAC---AACTTCTACCCCCCCCC----TCC-----CCCATTTGGCCTTAAATTCATTTTTTA---AATTAGA-GAATG-----CTT--AAAAAATAGC-----TACT---TATTCATC-TAGCCTAG-TAAAATAAACAAATAATGATTGTA-TACA--TTTTATT-TACCA-TGA-TCAACTCA--T-TCACTG-------AGAA--AAT-GTAACATGT-TCAT-AT-GACGTAA-TG--C---------------T-ATGCAATG----TATCACACTACTGGCGATATCTTACAT-------TTGCG--GTTTTCCAA-CTGGCCA-TGAATA-C---A-CTTTTCAATAGCA--GCAA-T-GTTTTGCCAAAATAAA-----CGT-TCAGATAGCTAAATT-CCATG------------------AGCAAATGG-A-AATGCAGCC--CCG--------AACCACATAAC--------AGCGTAAATC-G-G----TACA--TA---AAA--AGACTGCTAG-TGACACGTT-TT-G--CTTTGAA---TC-------ATA-TTCAA-AAC-GGTTTATGTATCGGAAAATGTC-TT-TGGAAACTACTACGGCAGCCTGT-TT-TTA-TCA-ACTCCTTGCACACTG-GAATACACGTCAGGC-ACATATAAAGTAATGATCAAAGAAGG-T-TTT---A---AAATGCTCAAC-A--AACAC-A-------T-TTTTT---G-GTATGTCTTGCCTTTCCCCTCTGTTTATCAT--TCACTACTTAATTATCTCCTAAAATTAGAAATTCCG---CAAAGG-AGATAACACTCAGTATGCAA-A---TGC--AACAAATTCAAATT--T-TC-TTGTGC-CAATTTT--CTAT-------TAGGAAATG---------T-----CA-TTT-AC----C-CCAC-TGAGT-T---T--TTT--AATC-TGGT------TGGTT--AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---G-AAT--TCA-ATATT-TGATTGTCTTCAA-ATCAG-TG---T---G-CTTTTCGTC---GCAGT-TTTGGT-C--A-AAA--CATAGTA--AAATTG-CT---A-AT--T--TT-TGGTCATT-TTT-A-GCCTTT-GAAT------TAATG--AGC-C-----GCTGC-TA---CA-GT-AATG---GGA-TTTAAAATTTCCA-ATAGCAT-T--T-TCAT-AT-TT-T-TTTCAAA-A---TTGTTA-C-TAC-TT--T---G-TTT--CAATAA-----G-----------GTAA--CAT-AA--A-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-AT-C--AA--ATATGA-TTT---T-AATTAAAG--C--AATCT-----ATTT-TCTTAA-----ACTAAA-ATTTT-TTCC-T-G--TGTTT---TCC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G--TAC------C--ATGG--A-AAC--GACTCA-C-TTTCT---C--AGAAT----AA-GTGGT-----A----TGAAA-TTTT---TTTC-TTAA-GT-TATG--GTAATTTCTA-TTG--AATTA--GACA-------TTCGAC--------AGTGGAA---A--ATT----TT--AGTG--CGTG--CC-A-C-CA---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|4 : aaAATAA-CATTGAAATTTTGAAATGCAACTT--GATACACCACTGAATCATC--AATTGTTACTGT------AA---------TAACGGGTGTCACTGC-G-CA-AA-TG--T---ATCACTTGTTAA-----------------AAAAGTTCCA--AACAACTTACATTAAAAACTTT-GTCGTTTTCCAGGCTGGC-AATGAATCAC---A-ATTTCTC-TAACA--GCAACT-GCTT-GT--GGATAAAAGTAACATGTCGTTT--TTAAATTCGCATGGACAAAATGGGTTGTGGGAGTAAAAGC-AGAAT--AACCGCCTG--------A---------C--------ACCATGAATC-G-G---GTGC---CA---AGACTA---TGTTTGATA--CCAGTCTT-GAACTTTGAA---AC-------ACAATTCCATGACCAATCATTGTCT-GGAAAACGAT-TT-T----ACCACCACT-TGGTGTGT-GTATAACTCGAACTCCCT-CAAAGTGCAAATACAT-CCAAATGACATACAGAATGATGTTAAAGG---GATGTTTTAAA---GAATAGCCCGC-ATTAA-ACCACGTATTTT-TTTTC---G-GCATCGCTTTCATTTCCATCCTG-TTA-CAAAACCACTAC-TA-TTATCGCCTATA-CTAG-TATTCCACATCAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-ATATTGCAAAGGAAATTCATATCTAT-TC-C-ATAC-CAGTTTTTCTTAT-------T-TGAGATA---------TCTTCACA-TTT-GC----CAC-ACAGGATC-T---TTATTT--A-TC-CATCCTGGTATTAT---AA--TA--------TCTA--------------T-C-TCATCTTC--TA------TCTGAATAAAA--TCAGGTATTATGAAT-TACTCTA-AT--GCTG---CCCAC-TTTTC-TGCTCAGGAGTCTT--GCACAAATAAAC-CATAGAA--AAACTG-CT---A-AATTT--TC-TGGTTAAATTTT-ACGTC--CAGAGT------T-ATG--ACCGT-----G-GGCATA---CACAA-ATTGTACATA-TCG---ATATCCAGATAA-ATAT--TAACAT-ATCTG-ACTCAGA-A-A---ATGCCATC-AAC-TTAAT---AGTCTCACACT-A-----T-----------GAGA--AAC-AA--ACA---TTCCATTGCGTCAAT-T-TT-C--AA--A-TA-A-TTTATATAAATTGAAGTTTGAAA--------ATTT-TCCAAAAAAAGACAGCATA--AT-GTCCTT-G--T-TTTTC-TTC-TATA-TAA-A-TA-GCTTCC------TTACTAAAATA--ATGGACA-AACGAGAGTCA-C-TTTGT---CAAAAAAT----ATCGTGCA-----GGAGTCAATG-TTTTTTGTTTC-ACAG-AT-CATCTCAT-TTTTCTA-TTGAAAATGATAAACA--------CC-ATCG------AGTGGAAACTT--ATTTTTGTTTCAGTG--CGTG--CCAG-A-AAAGTTAGACTTTTCGGTACC--GT-TACAAA-GAgtattaaaatctgtctcaa
gi|5 : CTTTCATGGATCC-TATTGCTATAAAAGAAATGTACAAT-------GTTTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAA-AAAATATAATGGA--CATGT-GACCA-TTGAATTTATTTACATAC----ATTC-------------------A---TTACAA-T----CA-TA--------------TCAT---GAGAGTAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCTTC---CATATTCCAAAATGAAAAAT--------TTCT-T-A----AGAAATACTTG-GGACA----A-CATCAGAATT-AACATTTATCTTATTAATCTTGAAAACGAAA---ATGAAAGGC---AGGCGAAATTGATT--AT---GGTAAATAAAC--TAT---TCAAATA-----------------------T-----TTTACATGTATCAGGGTGATCAGAACTG-TACCTTCCCTC----CCCATTTGCCTT----------AAATCATTATTT---TAATTATA-GAATG-----CTT--AGAAAATA--------GCCAT-TATTCAATCTAGCCTAG-TAAAATAA-CACTTAAT------A-T-----TT--A------CA-TGA-TCA-CTCA--T-TCACTG-------AGA---AAT-GTAAC--GTGTCATTAT-GACGTAA-TG--A---A--ACT----ACT-CT-CAATG----CATCACACTACTGGCAATA-CTTACAT---AAACTTG-C--GTTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATA-C---ACTTTTCA--TAGCA--GCAA-T-GTTTGGC--AAATAAA-----CGTCTAGATA--GCTAGCTTCAATG------------------AGCAAATGTGAAAATGCAGCC--CGGAATACATAA---------C--------AGTGTAAATC-C-GTACGTATA-TTA---AAA--AC--TGCTAG-TATACAAGT-TT-TGGCTTTGAA---TCCACATGTATA-TTCAATAA--AGTTAATGTATCGGGATATGTTCTT-T----GATA-CACG-CAGCGTGT-TT-T-A-TCA-ACTCCATGCACACTG-GAATGCAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATTAAAG---A-TGTTT---ACTTAAATCGCCCACAA--AACGACA-------TCTTTTC---G-GTATGTCTTTCTTgtacattcactctaaaaatctatctaaa
gi|6 : aaaactctcaagactgatcagcgtctatgcAAATT--TGTCTC-G-GCGCAATTTT--CTAT-------TAT-AGACAAATGTAGGCT-----AA-TTTAGCACTGC-C-AC-TGAGT-T---T--TTT--A-TC-TGTT------GTA----AT--CACTTTAGTTTTTA--------------TACAT-ATCATC--TCTGACAATTT---T-GTA--CAA-ATATT-TGATTGTCTTCAAGATCAG-TG------GG-CTTC--GTCACAG---T-TG--GT-CAAA-AAA--CATAGAAGTAAATTGGCT---A-A---T--TT-TGTGCA---TTTTA-GCC--TTGAATAGTTAAT-ATGGGATT-TCGACGG-TGC-CAGTTCA-GTTAATG---ATAATA----ATTTCCAAATAC-TT-TG-T-TCAT--T-TG-T-TTCAA-A-A---TTGTTA-CTGAC-TT--TTGGA-TTT--CAAT-A-----TAAGCGGATTGAGCAG--TAA-GAGAA-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-AT-C--AATTG-AT-A-TT------AGTTAATG--TAAAGCACGCATTATTT-CGTAAA-----ACTACA-A---T-TTCC-TAG--T-TAT---TTC-TATAAT-A-A-AA-GC--CTCCGGG-TTAC-----T---ATGG--GGAAC--GACTCA-C-TT--T---A--GAATT----AA-GTGTA-----A-----AATA-TTTT---TTTC-TTAAGTT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGGA---GAAATT----TTTCAGTGTTTGTGCACC------A---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGAGGAACTG
gi|7 : gctcaataatcatacctgaagattagaccacaggatgtccgcttccaaagggattagaccgtgaagactacagtatgtataagaattcagacaggactgttcaaTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTACA-CTAGATATTCTG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCAGCAA-A-ATTG---AAGAAATTCATATT--T-TC-C-ATAT-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----AA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CACA------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CTA--A-A---T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ACTG---ACA-TC----ATATCAAGA-AA-AA-T--T-ACATGAA-TG-A-TCAA--A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GC-GTTCACTAATTA-AATTTT-CATTGT--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-AGTTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTTACAAAAA-----ACTGCA-A---T-TTCT-T-GT-T-TTT---CTC-TATA-TAA-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----T---ATGG--A-AAC--GGGTCA-CTTT--T---C--AAAAT----AT--TGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-C-T---GT-ATTTCTA--TG--AAT-AT-AACA-------TTT-AT--------A-TGGAA---T--GAT----TTTCAGTG--CGTG--CC-GCA-AA---AA----TTTTGGT--CCTGT-TACAGA-GAATTttattaaggtgt
gi|8 : C----C-T-AT-TGAAT-T---T--TTA--A-TC-TGCT------TT-T---AT--CA--------TACA--------------T-T-A-ACCTTC--T-------TCC---T-AAA--TTA-ATATT-TGATT-TCCTTTA-AA--T-CA---TCTGT-TTTTT-CGCTCAGGAGT-CG--GT-C-AC-AAA--TATAGCA--ATACTG-CT---A-T---T--TTGTGGTCA---TTTGA-ACC--T-GATT------T-ATG--AGT-T-----G-TGT-TA---CA-AT-AATG---TTA-TC----ATTCCCAGATAA-AT-G--T-GCTT-GT-TC-A-TC----tgct
gi|8 : gaaatattttaacctttttaaAG--CAT-AG--A-A---AT-CCTTAC--CAAA-TATT-T--GT--G-AT-A-TTT---TAAATTGAAA--TGAAA--------A-----CTAAA-----ACCCCA-T--TT-GTAC-T-C--T-TTT----TG-TATA-T-A-AATA-AA--CT----G-TTA------TC--ATGG--T-AAC--GATTCAAT-TT--T---C--AGAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TCTA---TT---GAGA-TT----------ATTCCTA-TTG--AATGAT-ATAA-------TTT-AC--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagcatagaaatccttaccaaatatttgtgatattttaaattgaaatgaaaactaaaaccccatttgtactctttttgtatataaataaactgttatcatggtaacgattcaattttcagaatatgtgtaacaatatctattgagattattcctattgaatgatataatttacagtggaatatttttcagtgaat
gi|9 : gaaatattttaacctttttaacctattgaatttttaatctgcttttatcatacattaaccttcttcctaaattaatatttgatttcctttaaatcatctgttttttcgctcaggagtcggtcacaaatatagcaatactgctattttgtggtcatttgaacctgatttatgagttgtgttacaataatgttatcattcccagataaatgtgcttgttcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaa-GT----C-C-AT-TG-TT-TGTGT--TAT--A-TCACGCT------TTAT---ACTGCA--------TTTAGAGCTATCCATTGAT-C-T-ATCTTTCAT-------TCTG--T-AAA--TCA-ATATT-TGATT--CTTATAGAT--GGTGACCCTCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAAACCATAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTAA---TTTTA-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ATTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-AAA-TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--AAC-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAA-T-TTTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-TCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-AATA-GC--TC----G-TTAC-----TATAATGG--A-AAC--GGGTCA-C-TT--TT--C--AAAAT----AT-GTGCA-----G----CAATG-TTTTTTTTTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TCG-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTaat
blockSeqs : . GA T A TCT T . G . G T . . A A A AT . . AAACTTT A A C . ATGT T . TCGAATTCGAAAAATTCTCAGA ACA T AAAA T G AA T A TAAATA AAA T A AA A T TGGCGT . A . T C CA C CTTTTTATCAAACACATTATCACTCACTG GGCG G T G GT TA AACAAAAAATT ATGA T TG T TT A ATCTTA TGAAAACG GAA T CTT CG TTAGT T TA . AG TAATTTAGTTCATTCTTTTT TT T TCAGAA C TCCCCCATTTGGCCTTA C A T CCCC . TTATT . TTTATCATA C T A TTTT A A G AC TTATT C A T T ATTG TATACGGTC GT . T . TACATCATTGTCAATAT . A T AAA T TAAA GTC GG C A CA . C AA . C . T CA AGTAA G GATAG T T GACAAAATGGGTTGTGGG C T GG A GC GC G AACCACATAAC G TAC TATATTGAAGA T A TA C . G . CACATGT A A CCAATCA T G C A GGAA CT GG GTATAAC A A G C C G G C AAGG TTAAA C A TT CT CGTATTT C CTTT T T C T T T A T A CAT AC T . T CAA C A TA G T TG G A TC TATGTCA AATGTAGGCT . A ACTG A C A A GTG TA C A CATCCTGGTATTAT TG CTTTAGTT GAGCTATCCATTGA ACA C CA CTGACAA GAA A AAA G A G G CA C ACCCTCGA CGT C TG A T AC A GT G TGA C ATT TT G AAT G C TTT A AGTTAA A GG C G CGACG C A GTT C TT A TAC A TAAA A CA A G A G C . C TCAAAA TC T AA TGG G CA A TAAGCGGATTGA TT T GA C ATT C A GT . A C CA TT T G G ATA TT CACGCATT A A AAAAG T TTT . G A T G TCCC C A G G A T TT CCGGG TAAAATA AC G GA A A TGTCAA ATGC TC CATGTA . TTG A C GT . CTC A T AA G TA TATACAT G ACATATAC ACTT TTTG TT CA AAC AGT GACT ACC . G
blockSeqs : . . T T . T . . . G . . . A . . TT . . A . . . . GA . . GTC . T . T G C T A G AAA A A A . . TGGA . C . T A CA . AATCATATCATA G G T T TC CA GAAAAAT TA T G A TT C TCC A . G T G TTAT G . . AA AATTTTCACA CA C CAA . CCCATTTGCCTT T A C T . . . GCTACT C . . GATT T . A . GATA . . A T AT AGAAAAT AT . T . TATCACTTGTTAA . C A TGG A A CG G . . C . . C . . . T . . G GTT A G . C C TG G AA . C ACCATATAGC G . TAAAAAGAC T A TC . . A . C . C CGGTTT T T . . . CC G GTTAA . C G A . . . A GA TACTT C . . CC . . TG C T T . C T . A . . . T . . C C T . . . A . A . . TCTTCA . . . . . . . . . . . TGGTTGGTT . G . T . . A G . T . . G G CA G CCCGAA GC . . . . C A . . A . A . . TT G . CA A . . . G . . . . . . A G . . G A A . . . . . . . AGAAA CT . . . . . . TGTATT . . TT . . . T . . A T . . . . . . . TCT . T . . A . T . . . TCT C . A . A . . GA TATA . . . . T TTCAC . T GGAGT . TTT . A T . G . . . G G . . CG GAA . . . AGA . . CCT . .
blockSeqs : . A . . T . C T . G . A A . . . GA . C . . A C . ATTACAATCATA G G . T . AA ACTTA TA . . A T C AAT G . A C T CAT G . . . TT TG A CAA . TATTTGCCTTA A A T A . . . GCTAT . . . TTTT A . G . AA . . T T T AGAAAT GG . T . AAACTACTCT . G T TGG . A G A . . A . . . . . . G . . C TTT A C . T T C G GC . C AATACATAAC G . CAAGACTA T . AC . . A . . . A AGTTA G G . . . C T TTTTA . T . C . . . C A CA G . . AC . . T T T A . T T . T . . . T . . . C A . . . A . A . . T . . . . . . . . . . . ACGCTTTAT . . . C . . . . . A . . . . . . CCTGG GT . . . . . A . . . . T . . T T . TT G . . . G . . . . . . T A . . . A A . . . . . . . CAAAA C . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . C . . A . . . . GT TT . . . . . TCTC . T A . . . A T . . . . . G T . . . T . . . GCA . . T . .
blockSeqs : . . CCCCCCA . . A T . . . GCCAT . . . . . . A . . . . T TAA . . . . CTATG . C A CA . . C A . . A . . . . . . . . . . ATA T T . C A G A GC . T AC G . TTAAAAAC T . TA . . G . . . C AGTTA G G . . . C T TAAA . C . A . . . A G TA G . . C . . G C G C . A T . A . . . A . . . A T . . . G . T . . T . . . . . . . . . . . TCGTTTTT . . . G . . . . . T . . . . . . CCCGA GT . . . . . A . . . . A . . . G . C A . . . C . . . . . . A T . . . T T . . . . . . . AAAA C . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . C . . A . . . . A TC . . . . . TTC . A A . . . T T . . . . . T T . . . T . . . GA . . T . .
blockSeqs : . . . T C . . . G AC C . ATA . . . . . . . . . A CAAT G G . . . C G TTTA . A . C . . . T A TA . . . C . . G T T A . A T . T . . . T . . . C A . . . A . A . . T . . . . . . . . . . . TGGTTGTT . . . T . . . . . A . . . . . . CCCAC TG . . . . . T . . . . . . . . T . T A . . . G . . . . . . T A . . . A A . . . . . . . AAAA C . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . T . . . . . . . C T . . . . . TTC . T A . . . C T . . . . . T T . . . T . . . GC . . C . .
blockSeqs : . . G . T T . A . . C . . . A . . . G T . . . A . G . . T . . . . . . . . . . . CACCTTAT . . . T . . . . . T . . . . . . CCCGA GT . . . . . T . . . . . . . . . . A G . . . G . . . . . . A C . . . T A . . . . . . . AAAA C . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . T . . . . . . . G T . . . . . TC . A A . . . T G . . . . . G T . . . C . . . GA . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . G A . . . G . A . . T . . . . . . . . . . . CACATTAT . . . C . . . . . A . . . . . . TCTGT TG . . . . . A . . . . . . . . . . C A . . . C . . . . . . A A . . . A A . . . . . . . ATA C . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . C . . . . . . . G T . . . . . TC . A A . . . C A . . . . . T T . . . A . . . AC . . T . .
blockSeqs : T . . . A . T . . T . . . . . . . . . . . ACCTTAT . . . T . . . . . A . . . . . . CTGG CG . . . . . A . . . . . . . . . . T G . . . T . . . . . . T T . . . T . . . . . . . . AA . . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C . . A . . . . . T . . . . . . . G C . . . . . TA . T A . . . T T . . . . . G T . . . T . . . GA . . C .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . TGTTGTA . . . C . . . . . A . . . . . . TG TG . . . . . A . . . . . . . . . . C T . . . C . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . AA . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . T . . . . . . . G C . . . . . TC . T A . . . C T . . . . . T T . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TGCTTTT . . . C . . . . . A . . . . . . GG G . . . . . C . . . . . . . . . . T G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . C . . . . . . . G C . . . . . TC . T A . . . A T . . . . . G T . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . CATCAT . . . T . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . G T . . . . . T . . G . . . C . . . . . . G . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TTAA . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqCons : CAA*** CCCCATTTGCCTTA************ T*** ***** ** GCTAT********* TTTT NA**** T*** ANAGT************ TATCATCCG************** **** C*** A* *** ** NTT** GC ACACATAGC****************** G** TAAAAAGAC******* *** CAGTTA* C* TTTAA*** TA****** ** ** CGCTTTAT********** ******** *** CCCGG**** *** *** ** AAAA****** T**************** ** T******** ****
originalCons : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC--------AA-----CAG-TAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--A-TTAGT---TCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGAC---AACTT-TACCCCCCCCC----CCC-----CCCA----------AACTCATTCTTTCCCCAATTATA-GAATGTTA-TCTT--AGAAAATA-T-----TACCATATATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TT--AAT-TACCA-TGA-TCATCTCAATT-TTACTGT------AGAC--GGT-GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TG--C---ATCACTTGTCAAT-AT-CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTG-G--GTTTTCCAG-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGGTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG--------A---------C--------AGCGTAAATC-G-G---GTGCA-ATA---AAA--A---TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCACG-TAGCGTGT-GT-TAA-TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TC-CGCC------TTAT---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TC----A-A---TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-A-----T-----------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTAC-----TC--ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
finalCons : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC--------AA-----CAG-TAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GGACA----A-CATCAGAA-T-AANATTT-TCC--TTAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGA-C--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--A-TTAGT---TCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGACAA---CTT-TACCCCCCCCCCCCCATTTGCCTTA------------AACTCATTCTTTT---AATTATA-GAATG-----CTT--AGAAAATAGCTAT---------TATTCACCCTGGCCCAG-TGAAATAA-CATTGAATTTTTGAA-TGCA--TTNA----TACCA-TGA-TCATCTCAT---TTACTGANAGT------------GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-TGTATCATCCG--------------CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTTGC---GTTTTCCAA-CTGGC-A-TGAATN-C---A-TTTTCT--TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGNTT--TTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCGACACATAGC------------------AGCGTAAATCG--G---GTGCATAAAAAGAC-------TGCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGACAGTTA-ATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCAC-ACG-TAGCGTGTTTTAA---TCG-ACTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNAAGG---G-TGTTTA------AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---T-GCATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTTA-TTATCTCCTATA-CTAGATATTCCG---CAAAGGGAGATAAC--TCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-C-GTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-GC----C-C-AT-TGATT-T---T--TTT--A-TCCGCTTTAT----------AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TGCCCGG----CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-AT-TG-A-TCAAAA------TTGCCA-C-AAC-TT--T---A-TCT--CACT-AT----------------GCAG--CAC-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TT-C--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TATA-T-A-A-TA-GC--CC----G-TTACT--------ATGG--A-AAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA-TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGAT
Unaligned ( gi|22 ): CTGAGAATTGCTCTTAACAACTATGGAACAATGCTGTTGAAATATTTACTTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 222 1 1 2222 1 11 1 1 1 111 11 11 888888888888888 1 1 55555555 1 44444444 555555555555555555555555 222 22222 11 55555555 11 1 1 111111 1 1 2 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222 1 22222 333333333333333333333333333 1 11 1 222222 2 1111111 33333333 111 1111 11 3333333 11 111 11 999999999999999999999999999999 11 222222 333333333333 1 1 33333333 3333333333333 1111 222222 1 11 22222222 111 11 88888888888888888888888888 9999999999999999999999999999999999999999999 1 11111 222 11 22222 111 11 11 22222 1111 444444444444444444 11 11 3333333333 1111111 444444444444 1 11 111 2222222 1111111 1111 2 1111111 1 111 11111111 11 1111111 1111 111 1111111 111111111111111 11 11111111111 11111111 11111111111111 1111111 111 222 111 1 1111 1111 111 11111111111 11111111 111 1111 1 111111 111111111 1111111 11111111
lowQualScore : 3 88 7 1 333 7 3 6 3 1111 3 88 0 3 0 0 444 88 88 000000000000000 3 7 6 3 33333333 2 0 88888888 333333333333333333333333 333 7 22222 3 2 88 3 3 44444444 333 1 3 33 0 0 666666 0 1 0 3 9 2 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 888 2 5 3 77777 44 888888888888888888888888888 5 33 0 888888 0 0 1 4444444 99999999 777 1 8888 00 3333333 1 33 777 00 666666666666666666666666666666 77 1 888888 8 999999999999 66 3 0 1 00000000 8 0000000000000 8 8 7777 333333 8 0 88 8888 1 8 99 1 44444444 8 8 6 333 11 33333333333333333333333333 0 33 3 8 0 5 3333333333333333333333333333333333333333333 0 0 8 1 777 5 66666 8 111 44 8 8 99 11111 777 11 0 8 8 5 11 00000 1 3333 1 3 999999999999999999 9 2 44 3 00 99 1 6 8888888888 7777777 111111111111 99 3 5 00 6 6 4 111 8888888 6 1 4444444 1 2 6 6 4444 0 99 5555555 6 1 3 1 6 6 6 0 7 111 6 66666666 2 6 55 77 8888888 5 1111 99 1 1 5 0 88 5 2 00 888 66 1 5 5 333 1 1 66 4 8 1 4 1 66 3333333 777777777777777 4 3 3 6666 3 3 0 3 555 44 00 77777777777 666666 44 77777777 88888888888888 444 3 44 3333333 222 3 555 3 3 6 6 99 7 777777777 999 3 55 3 3 77 1 44 3 999 3 000 44 3 777 6 3 0 0000 2 999999 3 44 1 3 88888 3 3 555 3 55 4 777 4 2222 3 0 4 9999 3 5555 3 777 3 4 4 555 55 111 4 55 4 99999999999 99999 55 6666 55 3 666 3 1 55 7 7 88 55 3 3 3 666 44 66666666 3 1 77777 3 111 3 6 3 77 3 0000 6 3 8 3 3 3 44 999999 3 3 444444 3 44 44 3 9 222222222 9999 33 9999999999 888 555 3 3 55 3 0 888 3 3 44 1 33 0000000 3 55555555 777777 6666 44 55 88888 777 9999 99999 4 5
lowQualScore : . .. . . ... . . . . .... . .. . . . . ... .. .. ............... . . . . ........ . . ........ ........................ ... . ..... . . .. . . ........ ... . . .. . . ...... . . . . . . . ....................................................... ... . . . ..... .. ........................... . .. . ...... . . . ....... ........ ... . .... .. ....... . .. ... .. .............................. .. . ...... . ............ .. . . . ........ . ............. . . .... ...... . . .. .... . . .. . ........ . . . ... .. .......................... . .. . . . . ........................................... . . . . ... . ..... . ... .. . . .. ..... ... .. . . . . .. ..... . .... . . .................. . . .. . .. .. . . .......... ....... ............ .. . . .. . . . ... ....... . . ....... . . . . .... . .. ....... . . . . . . . . . ... . ........ . . .. .. ....... . .... .. . . . . .. . . .. ... .. . . . ... . . .. . . . . . .. ....... ............... . . . .... . . . . ... .. .. ........... ...... .. ........ .............. ... . .. ....... ... . ... . . . . .. . ......... ... . .. . . .. . .. . ... . ... .. . ... . . . .... . ...... . .. . . ..... . . ... . .. . ... . .... . . . .... . .... . ... . . . ... .. ... . .. . ........... ..... .. .... .. . ... . . .. . . .. .. . . . ... .. ........ . . ..... . ... . . . .. . .... . . . . . . .. ...... . . ...... . .. .. . . ......... .... .. .......... ... ... . . .. . . ... . . .. . .. ....... . ........ ...... .... .. .. ..... ... .... ..... . .
lowQualScore : 3 33 3 0 333 3 3 7 3 7777 3 33 0 2 0 0 333 33 33 000000000000000 3 3 7 3 33333333 0 7 33333333 777777777777777777777777 333 3 33333 2 5 88 2 2 88888888 888 2 2 22 0 0 555555 0 0 0 2 2 5 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 888 5 5 0 00000 55 888888888888888888888888888 5 88 0 888888 8 0 0 2222222 00000000 555 0 8888 22 5555555 0 88 555 88 000000000000000000000000000000 00 2 444444 0 666666666666 22 2 6 4 22222222 0 4444444444444 0 0 0000 000000 8 0 88 0000 0 0 00 0 66666666 0 0 0 666 00 44444444444444444444444444 6 88 8 0 8 6 8888888888888888888888888888888888888888888 6 6 8 4 444 8 22222 0 000 88 0 0 00 00000 444 00 8 0 0 6 00 00000 0 6666 4 8 222222222222222222 3 2 33 7 33 22 0 7 0000000000 5555555 777777777777 22 2 5 33 7 7 2 777 3333333 7 0 5555555 0 5 7 7 2222 0 22 7777777 7 0 3 0 7 7 7 3 5 777 7 00000000 5 7 88 77 6666666 7 3333 77 4 0 0 5 11 0 4 66 888 99 0 0 0 888 0 0 11 4 9 7 4 3 11 0000000 000000000000000 0 3 1 5555 1 1 4 1 444 22 44 33333333333 999999 22 33333333 11111111111111 222 1 22 1111111 777 1 000 1 1 2 7 22 3 888888888 555 6 00 6 3 99 4 66 3 222 3 444 66 3 111 7 3 1 0000 9 666666 3 66 8 3 33333 3 3 888 6 44 9 000 0 5555 7 8 0 9999 6 5555 6 555 6 0 0 555 55 000 0 55 0 00000000000 11111 00 7777 00 6 444 6 0 00 3 3 66 00 6 6 6 444 66 55555555 1 3 77777 1 222 1 2 1 33 1 8888 2 1 5 1 1 1 22 777777 1 1 222222 1 22 22 1 2 999999999 6666 88 4444444444 555 444 1 3 55 1 3 555 1 1 22 5 55 0000000 1 44444444 666666 5555 22 00 44444 000 4444 33333 4 0
consensus : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC--------AA-----CAG-TAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATTCATTTCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GG-ACA----A-CATCAGAATTAANATTT-TCCT--TAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGACT-AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--A-TTAGT---TCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGAC---AACTT-TACCCCCCCCC--CCCCATTTG-CCTTAAACTCATTCTTT---T----AATTATA-GAATG-----CT------TAGAAAATAGC-TA-T----TAT------TCACCCTGGCCCAG-TGAAAT-AACATTGAATTTTTGAA-TGCA--TTNA--T-AC--CA-TGA-TCATCTC-ATT--TACT--GA-AA--GT---------------GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-------------TG-T--ATC-AC--TCG----CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTT-G-C-GTTTTCCAG-CTGG-CA-TGAATN-C---ACTTTTC-T-TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGAT-TTTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG-A--C-ACATAACAGCGTAAATC-G-G---GTGC-ATA-A---AAGACT--GCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCACCAC-GTAGCGTGTT-T-TAA-TCGA-CTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNA---AGGG-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---TG-CATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTT-ATTATCTCCT-ATACTAGATATTCCGCA---AAGGGAGATA--ACTCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-CGTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-G-C----C-CAT-TGATT-T---T--TTT--ATC-CG--CT----TTA-T---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-A--T-TG-A-T-CA-AAA-TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-AT-----------GCA-----G--CA--C-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TAT-ATAA-A-TA-GC--CC----G-TTA-C-T------AT-GG--AAAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA---TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
Reference ( family-30 ) : CATTAAACAAA-TTATTTTT--AATTTGAGGTCTTNC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATT-T-ACAG--GTGC--ACC--------AA-----CAG-TAACAT-ACACAATGAT---G-TACCTTTTCATCGC--------TGTGTTCACTT--GAATTCG--AGA--TTCTC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AGAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-T-A-ATGTGTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAC-AAAA-ATAATGGA--CATGT-GANCA-TTGAATTCATTTACACACATT-ATTCCTTCT--TC-A----ACA-A---TTATCA-T----CA-TA--------------TCATG--GAGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAGGGGCTGT---CATTTTCCTAAAT----ANT------TNTTCT-T-A----AGAAATACTC--GG-ACA----A-CATCAGAAT-AANATTT-TCCT--TAACCT-------GAAA---ATTNAAAACTT-AGG-GAAATTGAC--AT---GNTAAATAAAC--CAT---TCGGATA-A--A-TTAGT---TCA-----TT-----TTTATACGTTTGAGGATGAC---AACTT-TACCCCCCCCC--CCCCATTTG-CCTTAAACTCATTCTTT---T----AATTATA-GAATG-----CT------TAGAAAATAGC-TA-T----TAT------TCACCCTGGCCCAG-TGAAAT-AACATTGAATTTTTGAA-TGCA--TTNA--T-AC--CA-TGA-TCATCTC-ATT--TACT--GA-NA--GT---------------GTAACGTGTGTCATTAC-GACGTAA-------------TG-T--ATC-AT--CCG----CAATG----TATAAAANTTCCGGCAATATCTTACGT---AAACTT-G-C-GTTTTCCAA-CTGG-CA-TGAATN-C---A-TTTTC-T-TAACA--GCAA-T-GCTTTGC--GGATAAA-----CGTNTCGNT-TTTAAATTTCCATG------------------AGCAAACGC-AGAATGCAGCC--CCG-A--C-ACATAGCAGCGTAAATC-G-G---GTGC-ATAAA---AAGACT--GCTAGATATCCCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------ACA-TTCNATGAC-AGTTAATGTATCGGGAAACGTT-TT-T----ACCAC-AC-GTAGCGTGTT-T-TAA-TCGA-CTCCCT-CANACTG-GAATACAC-CCAAGT-ACATACAGAGTGATGATNA---AGGG-TGTTT---A---AAATACCCCAC-A--AACACCA-------T-TTTTC---TG-CATGTCTTTCNTTTCCCTCCTGTTTA-CAAAACCACTACTT-ATTATCTCCT-ATACTAGATATTCCGCA---AAGGGAGATA--ACTCAATCNGCAA-A-ATTG---AANAAATTCANATT--T-TC-CGTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-G-C----C-CAT-TGATT-T---T--TTT--ATC-CG--CT----TTA-T---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGG-CTTTT-GNCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-A---T--TT-TGGTCA---TTT-A-GCC--C-GAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ANTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-A--T-TG-A-T-CA-AAA-TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-AT-----------GCA-----G--CA--C-AA--A-A---TT-CNTTGC--CAAA-T-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCTAAA-----ACTGCA-A--NT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TAT-AT-A-A-TA-GC--CC----G-TTA-C-T------AT-GG--AAAC--GAGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA---TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-GACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAACTG
gi|1 : TTAAACCAACTTATATTT--AATT-GAGGTTTTCC---G--AATAATGTATGGGTATCGGCGGATA-GCCTCAATATGGAACA-CAAT-AC-ACATTCT-T-GCAGCAGTGCCCACTCCATTCAAAA-----CAG-TAACATTACACAATACTTTTG-TACCTTTTCATCACACACCCCCTGTGTTCACTT--GAATTCGCTAGA--TTTTC---CAGAATT---TTT--CCCTAATAGAGCTT-AATCGATC--TGT-GCTGTGAAAGAAACGCACAATCT-ATATTTGTCAAATTTGA-TGAAATTCA-TCAC-AAAA-ATAA-AGA--CATGTTAAACACTTGAATTC-TTTACACA-ATT-ATTTCTTCT--TT-ATCAAACA-AAATTTATCA-TAAATCA-TAATGCACTGTCACTGTTATG--GAAAGAAG-AGGGAG-------GAAGGGGCTGTTGTCATTTTCCT---T----ACT------TGTTTT-T-ATGAAAGAAA-ATTC--GG-ACACGATATCATCAGCAT-AAAATTT-TTCC--TAACCT---------AA---ATTTAAAACTTTAGG-AAAATTAAC--AACAAGTTAAATAAAC--CATGATCCGGATA-ATAA-TTAGTAGTTCA-----TTCTTTCTTTTTA--TTTGAAGATGA-------TT-TAACCCCCCC-----------------AGACTC-TTCCCT---TCCCCAAGTATACAAATA-----TTATATTGTAGAAAATATCATA-T----TATCATATATTACCCTGGCTCAG-TGCAA--AACATTGGATTTT-GAA-TGCA--TTAA--TTGC--CA-TGA-TCATC-C-AAT--TATT---A-TA--GTTTTACAAGACCCGGCGGAACGTGTGTCATTGCCAACGGAAATGCTTGACCTCTTG-TCAATT-AT--C-------AATGCTTCTATAAAA--TCCAACAATATCTTACGT---AAACTT-G----TTTTCCA--CTGG-CA-TGAATT-CCCAA-TTTTC-T-TAACACAGCAA-TTGCTTTGT--GGATAAC-----AGTTGCG---TTTATATTTCCATG------------------AG--AACGC-AGAATA-AACC--CCG-A--C-A-------GCATAAATCCGCG---GTGC-A---------AACT--GC-AGATTACCCAGT-TTTGAACTTTGAAAATCC-------ACA-TCCCATGAC-A----ATATGTCTGGAAAC--T-TT-T----ACCACCAC-TTAGTGTGTTGT-TAACTCGA-C-CCCT-CAAACGT-GAATACAT-CCAAAT-ACATACAG-GTGATGGT-A---AGGG-TGTT----A---AAATACCCCAT-AT-AACAACA-------T-TTTTC---TG-C-TGTCTT-CATTTCCCTCCT-TTTA-CAAAACCGCTACTT-ATATTCGCTT-GTACTAGATAT--CAC--------GGGATA--ACT-AATCAGCAATA-ATTG---AAGAAATTCATACT--T-TC-CCTAC-CATTTTT--CTGT-------TATG-GATA---------T-----CAATTT-G-C----C-CAT-TGATT-T---T--TTTTTATC-CA--CC----TTA-TTTAAT--CAA-------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCTCT-T-AAA--TCA-ATATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCC-G-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAG-A--AAACTG-CT---A-AAT-T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-TAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG----CA-TC----AT-TGCAGATAA-AT-TTGT-ACAT-A--T-TGAA-T-CA-AAATTTGCC--C-AAACT--T---A-TCT--CACT-A------------GCA-----G--CA--C-AA--A-A---TT-CATTGC--CAAATT-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTAAAG--TGACA--------ATTT-TCCAAA-----ACTGCA-A--ATATTCC-T-GTTT-TTT---TTC-TAT-ATAA-A-TA-GC--CC----G-TTACC-T------AT-G----CAC--GGGTCA-C-TT--T---T--CACATG---AT-GTGT------A----CAATAT--TTTT---TTTC-ACAA-TTCCAT---GT-AGATCTA--TG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGAAT---T--ATT----TTTTAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---
gi|10 : gggggtgtctttcacgaatgtccgcgacacggtccctttcccattaaaaaaataatgacgagtcccccccttccccggttcTTCCATC------------------AACAAATGGGAAAATGCAGCT--CGG-A--CCATATAGCAGTGTAAATC-G-G---GTAC-ATATATTGAAGAC------AG-TATACAAGT-TT-GGGCTTCGAA---TCC------ATA-CTCAATGG--AGTTAATTTATCGGGAAATGTT-TTAT----AATAC-AT-GTAGCGTGTT-A--AA-TCGA-CTCCAC-CACACTG-TAACATAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATCA---AAGA-TGTTC---A---AAATACTC-AC-A--AACAC-A-------T-TTTTT---TGGTACGTCTTTCCTTCCCCTCCTGTTTA-TAATATCACTAC-------------------------TCCGCA---ATGGGAGATA--ACTCAGTATGCAA-A-ATGC---AACACATTCAAATT--T-TC-TATGC-CAATTTT--CTATTATGTCATATGAAATG---------T-----TA-TTT-A-C----C-CAT-TGATT-T---T--TTTC-ATCTCG--TT----TT--T---AT--CA--------TTCA--------------T-T-T-ACCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGTTT-GTCTTAA-AT--
gi|11 : cTT-G-C----C-CAT-TGATT-T---T--TTT--ATC--A--CC----TTA-T---AT--CAG-------TTTA--------------T-C-T-AT--TG--T-------TCT---T-AA---TCA-ATATT-T---T-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGAACTTTT-GCCTCAGGA-T-TT--GC-CAAA-AAA--C-TAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTC----TTT-A-GTC--C-AA-T------T-AGG--ACT-T-----G-TGC-TA---CA-AA-G--G---ACA-TC----ATATC-AGATAA--T-T--T-ACAT-A--T-TG-A-T-CA-AA--TT-CCA---AACTT--TT--A-TCT--CACT-AT-----------GCA-----G--CA--C-AG--A-A---TT-CATTGC--CAAA-T-TTCC-AA--A-AT-A-TTT---GAAATTAAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTTCGT-G--T-TTT---CTT-T-T-AT-A-A-AT-GC--CC----GATTA-C-T------AT-GG--AAAC--GGGT-A-C-TT--TTCAC--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA---TTTT----TTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTATTTG--AATGA--AACA-------TTC-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GTGTACAGA-GAATTcagtgtattttatcaatctatctcaaaaacat
gi|12 : aaTAT-------TAATAGATA---------T-----CA-TTT-G-C----C-CAT-TG--T-T---T--TTT-----------T----TTA-A---AT--------------TA--------------T-G-T-AGCTT-------------T---T-AAAAATCA-ATATT-TGATT-TTTCTTA-AT--G-TG---CT-GG-C-----GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAG-GAA---ATAGAA--AA-CTG-CTTGAA-A---T--TT-TGGTCA---TTG-G-AGC--T-GAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CA-AT-AATG---ATA-TC----ATATCCAGA--G-AT-------CAT-A--T-TG------------TTA------AACTC--T---A-TCT--CAGC-AT-----------GTATTGTAG--CA--T-AG--A-----TT-CTTTGT--TAAA-TATTC--AG--A--T-A-TTT---TAGACTGAAG--TGAAA--------ATT--CCTAAA-----ACTGCA-A--TT-TCCC-T-G--T-TTT---CTC-TAT-AC-AGA-TA-G---AT----A-TCA-C-T------AT-GG--AAAC--GAGTCA-CATT--T---C--AGAATATGCAT-GTGTACATGTA----TAGTA---TTTT---TTTTAAAGA-------------------G-TTG--AGTGAG-GGCA-------TTT-AC--------AGTGG-A---T--ATT----TTTCAGTG--CGTT--CC-G-C-AA---TA----TTTTGGT--T--GT-TACAG
gi|13 : -------T-TTTTCCTTTG--ATTGCTTTCTGTGCCCTCCTGTTTA-TAACACCACTATTG-TTTATATCCT-ATATTAGATATTCCGAA---AAGGG-GATA--ATTCAATCTGTAA-A-ATTA---AACAAATCTATAAA--T-GT-CATGC-CAATTTT--CTAT-------TACAAAATA---------T-----CA-TTT-G-A----C-CAC-TTATTAT---T--TAT--ATA-CA--------TCA-T---AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ACTCTC--T-------TCT---T-TAA--TCC-GTATT-TGATT-GTCTATA-AC--G-TG---CCTGG-CTTTT-G-CTCAGGGAT-TT--GC-CAAA-GAA--CATTGAA--AAACTG-CT---ACA---T--TT-TGGTCA---TTTGA-GCC--A-AAAT------T-ATG--AGC-T-----G-TGC-TA---CG-A
gi|14 : -T--T-ACAT-A--T-TG-A-T-CA-AAA-TTGTTA-C-AAATT--C---A-TAT--TAGC-AT-----------GTA-----G--CA--T-AA--C-A---TT-CTTTGT--CAAA-T-AACCAAA--A-AT-A-CAT---TAAATCAAAG--ATAAC--------TTTT-TCTAAA-----ACTTTA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTTTCCCTC-TAC-AT---A-TA-GC--CA----C-TTA-C-T------AT-AG--AAAC--CAGTCA---------------------------TGCA-----A----CACTA---ATCT---TTT--A-GA----------G----TTCTA-TTG--GATGAT-GACATATACATTTT-ATACATATACAGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--ta
gi|15 : ATTTAAA--CGATT--------ATTT-TCTAAA-----ACTACT-A--TT-TTCT-T-G--T-TTT---TTCCTAT-ATGA-A-TA-GC--CT----G-TTA-C-C------AT-GG--ATAA--GATCCA-C-TT--TT--C--AGAAG----AA-GTGTA-----A----CGATA---TTTT---CTTT-AAG--TT-CAT---GT-ATTTCTG-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AT--------AGAGGGA---C--ATT----TT-CAGTG--CATG--GC-A-ACGA---TA----TCTAGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|16 : CATTAACAAAA-TTATTTTTGAAATTTGAGATCTTATTCTGTAAATAATG-AT-GG-AT--G-GGATATGCCT--AT-TGGAACAACAATAACAACATATT-gtat
gi|17 : ggggtgtgtgtgtcctgcgatgtcagcgacacgcatacccattaagaaataatgagtagccgcccgccccccccccccccgcccgTA-TAATATCACTACTT-ATTATCTCCT-AAATTAGAAATTCAGCA---AAGGGAGATA--ACCCAGTATGCAA-A-ATGC---AACAAATTCAAATT--T-TC-TGTGC-CAATTTT--CTAT-------TATGAAATG---------T-----AA-TTT-A-C----C-CAT-TGAGT-T---T--TTA--ATC-TG--GT----TGT-T---AT--TA--------TCCA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAT--TCA-ATATT-TGATT-attttactcacagt
gi|18 : A--------ATTT-C-TAAA-----ACTACA-A--TT-TTCC-T-G--T-TTT---TTCCTAT-AT-A-A-AATGC--CG----G-TTA-C-C------AT-GG--AAAC--GACTCA-C-TT--T--------------------------------------------------TC-ATG--TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGAA---A--ATC----TTTCAGTG--CGTG--gtctt
gi|19 : attGAGGATCAC---AACTT-TACCCCTCCCC--T---ATTTG-CCTTAAA-TCATTTTTT---T----GATTATA-GAATG-----CT------TAAAAAATAGC-TA-T----TAT------TCAgcc
gi|2 : atgcatcagCATTAAACAAA-TTATTTTG--AATTTGAGGTCTATC---GTAAATAATG-ATGGG-AT--G-GGATA-GCCT--AT-TGGAACAACAAT-AC-ACATATTAT-ACAG--GTGC--ACC---------A-----CAG-T-ACAT-ACAAAAT-AT---GTTACCTTATTATCAC--------TGTGTTCACTT--G----------------TC---CAGAATT---TTTTTCCCTAA-AAAGCTTTCATGGATCC-TGTTGCTGTGAAAGAAACGCACAAT-TAA-ATACGTCAAAATTTGATGAAATTC--TCACAAAAA-ATAA--GA--CATGT-AAACA-TTGAATTCCTTTACACGCATT-ATTTCTTTTTATCAA----ACACA---TTATCACT----CACTG--------------TTATGGCGAAAGAAGGGAGGAG-GAGGGGGGGGGGGTTGT---CATTTCTTTAAAT----ACT------TATTTTATGA----AGAAA-ACTC--GG-ACA----T-CATCAGGAT-AAAATTT-TCCT--TAACCT-------AAAA---ATTTAAAACTT-AGT-GAAATTAAC--AT---GTTAAATAAAC--CAA---TCAGATATA--ATTTAGT---TCATTCTTTT-----TTTATATTTTTGAAGATGA-------TT-TACCCCCCCCC--CCCC------CC--AAACTC-TTCCTTCCCC----AATTATC-AAATATTATTTT------TAGAAAATATT-TA-TCATATAT------TCACCCTGGCTCAGTTGAAAT-AACATTGAATTTTTGAA-TGCA--TTAA--T-AC--CA-TGA-TCATTTCAATT--TACT--TA-TACGGTC--------------GGAACGTGTGTCATTAC-AATGTAA-------------TG-TACATC-ATTGTCAATATCAATG----TATAAAAATTCAAACAGTA-CTTACGT---AAACTT-G-G-TTTTTCCAG-CTGG-CA-TGAATC-C---A-TTTTC-T-TAACA--GC-A-T-GCTTTGT--GGATAAA-----CATGTCGGT-TTTTAATTGCCATG------------------GG-AAACGC-AGAATAAACCC--CCG-A----------CAGCATAATTC-G-G---GTGCAATA----------T--GTTAGATATCTCAGT-TT-GAACTTTGAA---TC-------GCA-TTCCATGAC-AAT--ATTTGTCTGGAAACTTT-TT-T----ACCAC-AC-TTGGTGTGTG-T-TAA-TCGA-CTCCCT-CAAAGTG-AAATACAT-CCAAAT-ACATACAGAATGATGGTAA---AGGG-TGTTT---A---AAATACCCCAT-A--AACACTA-------T-TTTTC---TG-CATGTCTTTCATTTCCCTCCTGTTTA-CAAAAC--CCACTT-ATTATCTCCT-ATACTAGATATTCCGCA---AAGGGAGATA--ACTCAATCAGCAA-A-ATTG---AAAAAATTCATACT--T-TC-CATAC-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----CA-TTT-G-C----C-CAT-TGATT-T---T--TTT--ATC-CA--CC----TTA-T---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-GTCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CT---A-T---T--TT-TTGTCA---TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-AGTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-A--T-TG-A-T-C---AA-TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-AT-----------GCA-----G--CA--C-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAT-T-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-CCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TAT-AT-A-A-TA-GC--CC----GTTTA-CTT------TT-GG--AAA---GGGTCA-C-TT--T---C--AAAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA---TTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TTT-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTGa
gi|21 : -AAA--CA--GTA--AAATTA-CT---A-A---TTTTT-TGGTCA---TTTGA-GCC--T-GAAT------T-ATG--AGC-C-----G-TGC-TA---
gi|3 : -TGGAGCAACTGT-GC-ACATATT-TTATAG--ATGC--ATC--------AAACTTTCAAATAA--T-ACACAATGA-------ACCTTTT--TCGT--------TGTTTTCATTTTCGAATTCG--AAAAATTCTCAGACATGATCACATGTTTCTGT-------TTTTCATG-ATCAATATTACTATAAAACA--TGTACAAT-------GTGCCA---TTAAATGAGATTCAATTAC-AAAT-ATAATGGCGTCATAT-GACCA-T-GATTTCATTTACACACATTCATTC-----------------A-A---TCAT-A-T----CA-TA--------------TCATG---AGAGAAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCT-----TATTTTTCCAAAC----AACAAAAAATTTTCT-T-A----AGAAATACTCTGGG-ACA----A-CATCAGAATTAACATTT-AATT--TATCTT-------GAAAGAAAATGAAAA--T-AGG-TAAATTGATTAGT---GGTAAATAAACTACAT---TC----A-A--A-TT--T---TCA-----CA--------ATGCATCAGGGGATCAC---AACTTCTACCCCCCCCCTCCCCCATTTGGCCTTAAATTCATTTTTT---A----AATTAGA-GAATG-----CT------TAAAAAATAGC-TACT----TAT------TCA-TCTAGCCTAG-TAAAATAAACAAATAATGATTGTA-TACAT-TTTATTT-AC--CA-TGA-TCAACTC-ATT--CACTGAGA-AA--AT---------------GTAACATGT-TCA-TAT-GACGTAA-------------TGCT--AT--------G----CAATG----TATCACACTACTGGCGATATCTTAC-------ATTT-G-CGGTTTTCCAA-CTGGCCA-TGAATA-C---ACTTTTCAA-TAGCA--GCAA-T-GTTTTGCCAAAATAAA-----CGTTCAGATAGCTAAA-TTCCATG------------------AGCAAATGG-A-AATGCAGCC--CCG-AACC-ACATAACAGCGTAAATC---G---GTAC-ATAAA---AAGACT--GCTAG-TGACACGTT-TT-G--CTTTGAA---TC-------ATA-TTCAA-AAC-GGTTTATGTATCGGAAAATGTC-TT-TGGAAACTACTACGGCAGCCTGTT-T-TTA-TCAA-CTCCTTGCACACTG-GAATACACGTCAGGC-ACATATAAAGTAATGATCAAAGAAGG-T-TTT---A---AAATGCTCAAC-A--AACA-CA-------T-TTTTT---GG-TATGTCTTGCCTTTCCCCTCTGTTTATC--ATTCACTACTTAATTATCTCCTAAAATTAGAAATTCCGCA---AA-GGAGATAACACTCAGTATGCAA-A---TGC--AACAAATTCAAATT--T-TCTTGTGC-CAATTTT--CTAT-------TAGGAAATG---------T-----CA-TTT-ACC----C-CAC-TGAGT-T---T--TTTA-ATC-TG--GT----TGGTT---AT--CA--------TTTA--------------T-T-T-ATCTTC--T-------TCT---G-AAT--TCA-ATATT-TGATTGTCTTCAA-ATCAG-TG---T---G-CTTTTCGTC---GCAGT-TTTGGT-C--A-AAA--CATAGTA--AAATTG-CT---A-AT--T--TT-TGGTCATT-TTT-A-GCCTTT-GAAT------TAATG--AGC-C-----GCTGC-TA---CA-GT-AATG---GGA-TTTAAAATTTCCA-ATAGCAT-T--T-TCAT-ATTT-TT-T-T-CA-AAA-TTGTTA-C-TACTT--T---G-TTT--CAATAAG-----------GTA-----A--CA--T-AA--A-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-ATC--AA--ATATGA-TTT---T-AATTAAAG--C--AATCT-----ATTT-TCTTAA-----ACTAAA-ATTTT-TTCC-T-G--TGTTT---TCC-TAT-ATAA-A-TA-GC--CC----G--TA-C-C------AT-GG--AAAC--GACTCA-C-TTTCT---C--AGAAT----AA-GTGGT-----A----TGAAA---TTTT---TTTC-TTAA-GT-TATG--GTAATTTCTA-TTG--AATTA--GACA-------TTCGAC--------AGTGGAA---A--ATT----TT--AGTG--CGTG--CC-A-C-CA---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGA-GAACTG
gi|4 : aaAAT-AACATTGAAATTTTGAAATGCAACTTGA--T-ACACCACTGAATCATC-A-ATTGTTACT--GT-AA--------------------TAACGGGTGTCACTGC-G-CA-AA-------------TG-T--ATC-AC--TTG----T--------TAAAAAAGTTCCA--AACAACTTACATTAAAAACTTTGTC-GTTTTCCAGGCTGG-CAATGAATCAC---A-ATTTC-TCTAACA--GCAACT-GCTT-GT--GGATAAAAGTAACATGTCGTT-TTTAAATTCGCATGGACAAAATGGGTTGTGGGAGTAAAAGC-AGAAT--AACCGCCTG-A--C-AC-------CATGAATC-G-G---GTGC-C-------AAGACTATGTTTGATA--CCAGTCTT-GAACTTTGAA---AC-------ACAATTCCATGACCAATCATTGTCT-GGAAAACGAT-TT-T----ACCACCAC-TTGGTGTGTG-TATAACTCGAACTCCCT-CAAAGTGCAAATACAT-CCAAATGACATACAGAATGATGTTAA---AGGGATGTTTTAAA---GAATAGCCCGC-ATTAA-ACCACGTATTTT-TTTTC---GG-CATCGCTTTCATTTCCATCCTGTT-A-CAAAACCACTACT--ATTATCGCCT-ATACTAG-TATTCCACATCAAAGGGAGATA--ACTCAATCAGCAA-ATATTGCAAAGGAAATTCATATCTAT-TC-CATAC-CAGTTTTTCTTAT-------T-TGAGATA---------TCTTCACA-TTT-G-C----CACACAGGATC-T---TTATTT--ATC-CATCCTGGTATTA-T---AA--TA--------TCTA--------------T-C-TCATCTTC--TA------TCTGAATAAAA--TCAGGTATTATGAAT-TACTCTA-AT--GCTG---CCCAC-TTTTC-TGCTCAGGAGTCTT--GCACAAATAAAC-CATAGAA--AAACTG-CT---A-AATTT--TC-TGGTTAAATTTT-ACGTC--CAGAGT------T-ATG--ACCGT-----G-GGCATA---CACAA-ATTGTACATA-TCG---ATATCCAGATAA-ATAT--TAACAT-A--TCTG-ACT-CAGAAA-ATGCCATC-AACTTAAT---AGTCTCACACT-AT-----------GAG-----A--AA--C-AA--ACA---TTCCATTGCGTCAAT-T-TTC--AA--A-TA-A-TTTATATAAATTGAAGTTTGAAA--------ATTT-TCCAAAAAAAGACAGCATA--AT-GTCCTT-G--T-TTTTC-TTC-TAT-ATAA-A-TA-GCTTCC------TTA-C-TAAAATAAT-GGACAAACGAGAGTCA-C-TTTGT---CAAAAAAT----ATCGTGCA-----GGAGTCAATG---TTTTTTGTTTC-ACAG-AT-CATCTCAT-TTTTCTA-TTGAAAATGATAAACA--------CC-ATCG------AGTGGAAACTT--ATTTTTGTTTCAGTG--CGTG--CCAG-A-AAAGTTAGACTTTTCGGTACC--GT-TACAAA-GAgtattaaaatctgtctcaa
gi|5 : CTTTCATGGATCC-TATTGCTATAAAAGAAATGTACAAT-------GTTTCAAAATTAAATGAGATTCA-TCAA-AAAATATAATGGA--CATGT-GACCA-TTGAATTTATTTACATACATTCATT----------------ACA-A---T-----------CA-TA--------------TCATG---AGAGTAGGAGGGGGTGAGGTGGAAAAAGCTTC---CATATTCCAAAATGAAAAAT------T--TCT-T-A----AGAAATACTT--GGGACA----A-CATCAGAATTAACATTTATCTTATTAATCTTGAAAACGAAA---ATGAAAGGC---AGGCGAAATTGATT-AT---GGTAAATAAAC--TAT---TCAAATA-----------------------T-----TTTACATGTATCAGGGTGATCAGAACTG-TACCTTCCCTC--CCC-ATTTG-CCTTAAA-TCATTATTT---T----AATTATA-GAATG-----CT------TAGAAAATAGC-CA-T----TAT------TCAATCTAGCCTAG-TAAAAT-AACACTTAAT-----------A--TTTA--------CA-TGA-TCA-CTC-ATT--CACT--GAGAA--AT---------------GTAAC--GTGTCATTAT-GACGTAA-------------TG-A--AACTAC--TCT----CAATG----CATCACACTACTGGCAATA-CTTACAT---AAACTT-G-C-GTTTTCCAA-CTGG-CA-TGAATA-C---ACTTTTC-A-TAGCA--GCAA-T-GTTTGGC--AAATAAA-----CGTCTAGAT-AGCTAGCTTCAATG------------------AGCAAATGTGAAAATGCAGCC--CGGAA--T-ACATAACAGTGTAAATC-C-GTACGTAT-ATTAA---AA-ACT--GCTAG-TATACAAGT-TT-TGGCTTTGAA---TCCACATGTATA-TTCAATAA--AGTTAATGTATCGGGATATGTTCTT-T----GATAC-AC-GCAGCGTGTT-T-T-A-TCAA-CTCCATGCACACTG-GAATGCAC-CTAAGT-ACATATAAAGTAATGATTA---AAGA-TGTTT---ACTTAAATCGCCCACAA--AACGACA-------TCTTTTC---GG-TATGTCTTTCTTgtacattcactctaaaaatctatctaaa
gi|6 : aaaactctcaagactgatcagcgtctatgcAAATT--TGTCTCG-GCGCAATTTT--CTAT-------TAT-AGACAAATGTAGGCT-----AA-TTTAG-CACTGC-CAC-TGAGT-T---T--TTT--ATC-TG--TT----GTA-----AT--CACTTTAGTTTTTA--------------TACAT-ATCATC--TCTGACAATTT---T-GTA--CAA-ATATT-TGATTGTCTTCAAGATCAG-TG------GG-CTTC--GTCACAG---T-TG--GT-CAAA-AAA--CATAGAAGTAAATTGGCT---A-A---T--TT-TGTGCA---TTTTA-GCC--TTGAATAGTTAAT-ATGGGATT-TCGACGG-TGC-CAGTTCA-GTTAATG---ATAATA----ATTTCCAAATAC-TT-TG-T-TCAT----T-TG-T-TTCA-AAA-TTGTTA-CTGACTT--TTGGA-TTT--CAAT-ATAAGCGGATTGAGCA-----G--TAAGA-GA--A-A---TT-CTTTGC--CAAA-T-ATC--AATTG-AT-A-TT------AGTTAATG--TAAAGCACGCATTATTT-CGTAAA-----ACTACA-A---T-TTCC-TAG--T-TAT---TTC-TATAAT-A-A-AA-GC--CTCCGGG-TTA-C-T------ATGGG--GAAC--GACTCA-C-TT--T---A--GAATT----AA-GTGTA-----A-----AATA---TTTT---TTTC-TTAAGTT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATTAT-GACA-------TTC-AC--------AGTGGGA---GAAATT----TTTCAGTGTTTGTGCACC------A---TA----TTTTGAT--T--GT-TACAGAGGAACTG
gi|7 : gctcaataatcatacctgaagattagaccacaggatgtccgcttccaaagggattagaccgtgaagactacagtatgtataagaattcagacaggactgttcaaTA-CAAAACCACTACTT-ATTATCTCCT-ACACTAGATATTCTGCA---AAGGGAGATA--ACTCAATCAGCAA-A-ATTG---AAGAAATTCATATT--T-TC-CATAT-CATTTTT--CTGT-------TATGAGATA---------T-----AA-TTT-G-C----C-CAT-TGATT-T---T--TTT--ATC-CA--CA----TTA-T---AT--CA--------TTTA--------------T-C-T-ATCTTC--T-------TCT---T-AAA--TCA-GTATT-TGATT-TCCTCTA-AT--G-TG---CCCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAA--CATAGAA--AAACTG-CTA--A-A---T--TT-TGGTCAT--TTT-A-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ACTG---ACA-TC----ATATCAAGA-AA-AA-T--T-ACATGA--A-TG-A-T-CA-AAA-TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-AT-----------GC------GTTCA--CTAATTA-AATTTT-CATTGT--CAAA-T-TTC--AA--A-AT-AGTTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTTACAAAAA-----ACTGCA-A---T-TTCT-T-GT-T-TTT---CTC-TAT-ATAA-A-TA-GC--CC----G-TTA-C-T------AT-GG--AAAC--GGGTCA-CTTT--T---C--AAAAT----AT--TGTA-----A----CAATA---TTTT---TTTC-ACGA-TT-C-T---GT-ATTTCTA--TG--AAT-AT-AACA-------TTT-AT--------A-TGGAA---T--GAT----TTTCAGTG--CGTG--CC-GCA-AA---AA----TTTTGGT--CCTGT-TACAGA-GAATTttattaaggtgt
gi|8 : -C----C-TAT-TGAAT-T---T--TTA--ATC-TG--CT----TT--T---AT--CA--------TACA--------------T-T-A-ACCTTC--T-------TCC---T-AAA--TTA-ATATT-TGATT-TCCTTTA-AA--T-CA---TCTGT-TTTTT-CGCTCAGGAGT-CG--GT-C-AC-AAA--TATAGCA--ATACTG-CT---A-T---T--TTGTGGTCA---TTTGA-ACC--T-GATT------T-ATG--AGT-T-----G-TGT-TA---CA-AT-AATG---TTA-TC----ATTCCCAGATAA-AT-G--T-GCTT-G--T-TC-A-T-Ctgct
gi|8 : gaaatattttaacctttttaaA-----G--CA--T-AG--A-A---AT-CCTTAC--CAAA-TATTT--GT--G-AT-A-TTT---TAAATTGAAA--TGAAA--------A-----CTAAA-----ACCCCA-T--TT-GTAC-T-C--T-TTT----TG-TAT-AT-A-AATA-AA--CT----G-TTA-T-C------AT-GG--TAAC--GATTCAAT-TT--T---C--AGAAT----AT-GTGTA-----A----CAATA---TCTA---TT---GAGA-TT----------ATTCCTA-TTG--AATGAT-ATAA-------TTT-AC--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagcatagaaatccttaccaaatatttgtgatattttaaattgaaatgaaaactaaaaccccatttgtactctttttgtatataaataaactgttatcatggtaacgattcaattttcagaatatgtgtaacaatatctattgagattattcctattgaatgatataatttacagtggaatatttttcagtgaat
gi|9 : gaaatattttaacctttttaacctattgaatttttaatctgcttttatcatacattaaccttcttcctaaattaatatttgatttcctttaaatcatctgttttttcgctcaggagtcggtcacaaatatagcaatactgctattttgtggtcatttgaacctgatttatgagttgtgttacaataatgttatcattcccagataaatgtgcttgttcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaa-G-T----C-CAT-TG-TT-TGTGT--TAT--ATCACG--CT----TTA-T---ACTGCA--------TTTAGAGCTATCCATTGAT-C-T-ATCTTTCAT-------TCTG--T-AAA--TCA-ATATT-TGATT--CTTATAGAT--GGTGACCCTCGA-CTTTT-TGCTCAGGAGT-TT--GC-CAAA-AAAACCATAGAA--AAACTG-CT---A-AA--T--TT-TGGTAA---TTTTA-GTC--C-AAGT------T-ATG--ACC-T-----G-TGC-TA---CA-AA-ATTG---ACA-TC----ATATCCAGATAA-AT-T--T-ACAT-A--T-TG-A-T-CA-AAA-TTGCCA-C-AACTT--T---A-TCT--CACT-AT-----------GCA-----G--AA--C-AA--A-A---TT-CATTGT--CAAATT-TTC--AA--A-AT-A-TTT---TAAATTGAAG--TGAAA--------ATTT-TCAAAA-----ACTGCA-A--AT-TTCC-T-G--T-TTT---CTC-TAT-ATAA-A-TA-GC--TC----G-TTA-C-TATA---AT-GG--AAAC--GGGTCA-CTTT--T---C--AAAAT----AT-GTGCA-----G----CAATGTTTTTTT---TTTC-ACGA-TT-CAT---GT-ATTTCTA-TTG--AATGAT-AACA-------TCG-AT--------AGTGGAA---T--ATT----TTTCAGTG--CGTG--CC-G-A-AA---TA----TTTTGGT--C--GT-TACAGA-GAATTaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGAT
Unaligned ( gi|22 ): CTGAGAATTGCTCTTAACAACTATGGAACAATGCTGTTGAAATATTTACTTTA