lowQualScore : 22222 111 1 111111 1111111111111 1 222222 1 1111111111111111 2222222 22 111
lowQualScore : 2 55 11111 000 1 1 3 3 1 1 22 3 1 1 111111 22 1 888888 7 1 555 1 6666666666666 8 1 2 2 000000 77777 3 8888 2 7777777777777777 55 2222222 444 5555555 2 55555 3 33 2 2 77 33 2 3 77 44 00 3 3 3 111 77
lowQualScore : . .. ..... ... . . . . . . .. . . . ...... .. . ...... . . ... . ............. . . . . ...... ..... . .... . ................ .. ....... ... ....... . ..... . .. . . .. .. . . .. .. .. . . . ... ..
lowQualScore : 1 00 44444 777 9 4 8 8 9 9 66 8 9 9 000000 66 9 777777 6 9 000 8 0000000000000 4 1 4 4 888888 88888 6 2222 4 8888888888888888 99 2222222 111 2222222 2 66666 4 22 5 7 11 77 7 1 33 66 88 3 6 6 444 99
consensus : TGGGTT-TTACA--TTATA----AA-C-AA-CAA-CCC-GTT-GT-CG--T-CT-CT-TA------TA--G-T-TC---AAT-GCA---A-GTTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--AT-GGAATTT-----CAAAGACAAA----CATT-TT----C--G----TTT-T--TTTT-------A---T----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACA-AT-GT-GTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TT-GCTTCA
Reference ( gi|5 ) : TGGGTT-TTACA--TTATC----AA-T-AA-CCA-CCC-GTT-GT-CG--T-CT-CT-TA------TA--G-T-CC---AGT-ACA---A-GTTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--AC-AGAATTT-----CAACGACAAA----CATT-TT----C--G----TTC-T--TTTT-------A---T----A--TCTATAAAC-AT-----CTCATCGAA--TTCACA-AT-GC-GTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-AG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TT-ACTTCA
gi|6 : TGGGTT-TTACA--TTATA----AA-C-AA-CAA-CCC-GTT-GT-CA--T-CT-CT-TA------TA--G-T-TC---AAT-ACA---A-GTTGA-------------TGAT-T-A-A-------AA-GGAATTT-----CTCGGACAAA----CATT-TT----C--G----TT--T--TTTA-------A---T----A--TTTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACA-GT-CT-GTTTT--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-TG-TGCAAATG-TGT-TTGT---TT-GCTT
gi|10 : TGGGTT-TTACA--TTATA----AA-C-AA-CAA-CCC-ATT-GT-CG--T-CT-CT-TA------TATAG-T-TC---AAA-GCA---A-GTTGA-------------TAAA-TTA-ATAT-T--GT-GGAATTT-----CAAAGACAGA----CATA-TT----A--GG---TTT-T--TTTT-------AAAAT----A--TCTATAACC-AT-----CTCATCGAA--TTCACA-AT-GC-GTTTC--AAA-ATTGA
gi|9 : TGGGTT-TTACA--TTATA----AA-C-AA-C-A-CCCTGTT-GT-CG--T-CT-CT-TA------TA--G-T-TC---AAT-ACATATA-ATATA-------------TTGA-T-A-A-AT-T--A-----ATTT-----CAAAGACAAA----CATT-TT----G--G----TT------TTG-------A---T-------TTTATAAAC-AT-----CTCATCGAA--TTCACA-AT-GT-GTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--A-CG-TG-----T-TGT-ATGC---TT-GCTTCAtaaaaaattaa
gi|3 : TGGGTT-TTACA--TTCCA----AA-C-AAACCAACCC-GTT-GT-TG--T-CAACT-TA------TA--G-T-TC---AAT-ACA---A-GTTGATAAAATTTTTAATTAAA-T-A-ATATAT--AT-GGAATTT-----CAAAGACAAA----CATT-TT----C--------CCGT--CTTT-------A---T----A--TCTTTAAAC-AT-----TCCATTAAA--CCCATA-ATGGT-GTTTA--AAG-ATTAAA-A--TAA--TCCG-CGCAAATT-TGT-ATGC---TT-GCTTCA
gi|25 : TGGGTT-TTACA--TTATA----AA-C-AA-CAA-CCC-GTT-GT-TG--T-TT-CT-TA------TA--G-T-TC---AAT-ACA---A-GTT
gi|2 : aGGGTTGTTACAA-TTATA----AAAC-AA-ACA-CCCTGTTTGT-CG--TTCT-CT-TA------TA--G-T-TC---AATGACAT--A-G------------------AAA-T-A--TAT-TG-AT-ACAATTTATTTTCAAAGACAAA----CATT-TT----G--G----GT--T--TTGG-------A---T----T--TTTATAAAC-AT-----CTCATCGGAATTTCACC-AT-GCTGTTTC--AAACATTTAA-ATTTGAATT-CGTTGCAATTT-TGTAATGCTCTTT-GCTTCA
gi|22 : GGGTT-TTACA--GTATA----AA-C-A----A-CCC-GCT-GT-CG--T-TT-CT-TA------CA--C-T-TTTAAAAT-GCA---A-GTTGG-------------TAAA-
gi|20 : GGATT-TTACA--TTATTTATAAA-C-AA-CAA-CCT-GT------G--T-CT-CT-TATACATGTA--G-T-TC---AAT-GCA---A-GTTGA-------------TA
gi|8 : GGTT-TTACA--TTACA----AA-C-AA-CAA-CCC-GTT-GT-CG--T-CT-CT-TA------TA--G-T-A----AAT-ACA---A-GTTGA-------------TAAA-TTA-ATA-----------ATTT-----CAAAGACAAA----C-TT-TT----C--G----GTT-T--TTTT-------A---T----A--TCTGTAAAC-AT-----CCTATTGAA--TTAACA-AT-GT-GTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-TG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TT-GCTTCAttaaactaaatttta
gi|12 : GGTT-TTACA--ATATA----AA-C-AA-CAA-TTC-GTT-GT-CG--T-CT-CT-TA------TA--G-T-TC---AAT-ACA---A-GTTGA-------------TGAA-TTA-ATAT-T--AA-GGAATTT-----CAAAGAATAA----CATT-TT----C--G----TTT-T--TTTT-------A---T----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACA-AT-GT-TTTTC--AAA-ATTAAA-A--T
gi|1 : GATT-TTACAAATTATA----AA-C-AG-CAA-CCC-GTT-GT-CG--T-CT-CTATA------TA--G-TATC---AAT-ACA---A-GTTGAATAAAT-------TAAA-T-ATACAT-T--AT-GGAATTT-----CAAAGACAAAAC--TATT-CTG---C--G----TTT-T--TTTTTA-----G---T----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCTAA--TTCACA-AT-GT-ATTTC--AAA-ATTAAA-AT-TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGTAA-TTGACTTCA
gi|13 : ttGGTT-TTACA--TTATA----AA-C-AA-CAA-CCC-GTT-GT-CG--T-GT-CT-TA------TA--G-T-TT---AAT-GCA---A-GTTGA-------------TAAACT-G-ATAT-T--GT-GGAATTT-----CAAAGACAAA----CATT-TT----CTTT----TTC-T--TTTTTTA----A---T----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATTAAA--TTCACA-AT-GT-GTTTC--AAA-AT
gi|14 : GGTT-TTACA--TTATA----AA-C-AA-CAA-CTC-GTT-GT-CA--T-TC-CT-AA------TA--G-T-TC---CAT-GTA---A-GTTGA-------------TAAATT-A-ATAT-T--GT-GCAATTT-----CAAAGACAAA----CATT-TTGGGGT--G----TTT-T--TTTTTTTTTAAA---T----A--TTCATAATC-AT-----CCCTTCGGA--TTCAC
gi|17 : aGGAT-TTACA--TTATA----AA-C-AA-CAA-CCC-GTT-GT-CA--T-CT-CT-TATACATGTA--G-T-TT---AAT-ATT---T-GTTGA-------------TAAATT-A-ACAT-T--AT-GTAATTT-----CAAAGACAAA----CATT-TT----C--G----
gi|23 : tGATT-TT-CA--TTATA----AA-C-AA-CC----C-GCT-GT-TG--T-CT-CT-TA------TA--G-T-TC---AAT-GCA---A-GTTGA-------------TAAA-T-
gi|24 : GATT-TT-CA--TTAT-----AA---AA-CAA-CCC-GCT-GT-TG--T-CT-CT-TA------TA--G-T-TC---A-T-GCA---A-GTTGA-------------TAAA-T-caa
gi|7 : GTT-TTACA--TTAT------A-C-AA-CAA-CCC--TT-GT-CA--TTCT-CT-TA------TA--G-T-TC---AAT-ACA---A-TTTGG----------------A-T-G-AT-T-TGAAA-AGGATTT-----CG--GACAAA----CATT-TT----C--G----TT------TTA-------A---T----AAGTTTATAAAC-AT-----CCAATCGAA--TTCACA-GT-CT-GTTTTAAAAA-ATTAAAGA--TGA--T--G-TGCAAATG-TGT--TGT---TT-GCTTCAcaa
gi|4 : T-TTACG--TTATA----AA-C-AG-CAA-CCC-GTC-GTTCG--T-CT-CT-TA------TA--G-T-TA---AAT-GCA---A-GT-GT-------------TGAA-TTA-ATAT-T--GT-TGA--TT-----CGAGGA-AAA----TATTATT----T--T----TTC-TATTTTTCATAC--A---T----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATTGAA--TTCACAGAT----ATTTC--AAA-ATTAAC-A--TGA--T-CA-TGCACGTTCCAT-ATGC---TC-ACTTC
gi|15 : ggagT-TCATA--TTATA----AA-CCAA-CAA-CCC-GCT-AT-CGAGT--T-CT-TA------TA--GCT-TA---AAT-GCA---ACGTTGA-------------TAAA-T-T-ATAT-T--GCTGGAATTTC----CAAC-ACAAATCTTTGTT-TT----C--C----TTT-TC-TTTT-------A---TATTAA--TCTATAAACAAT-----ACCATTGAA--TTCACA-
gi|11 : ----AA-C-AA-CAA-TCC-GTT-AT-CA--T-TT-TT-TT------TA--G-T-TC---AAT-ACA---A-GTTGA-------------TAAA-TTA-ATAT-T--AT-GGAATTT-----CAAAGACAAA----CATT-TT----CTGG----TTT-T--TTTT-------T---T----T--TCTATAAAC-AT-----CCTATCGAT--TTCACA-AT-GT-GTTTA--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CA-TACAAATT-TGT-ATTC---TT-TCTT
gi|26 : A-T-AA-ACATCCC-GCT-GT-CG--T-TT-TT-TA------TA--G-T-TC---AAT-GCA---A-GCTGA-------------TA
gi|27 : gattcacagtCA---A-GTTGA-------------TAAATT-A-ACAT-T--GT-GGAATTT-----CAAAGA
gi|18 : g-ATAT-T--AT-GGAATTT-----CAAAGACAAA----CATT-TT----C--G----GTT-T--TTTT-------A---T----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCAAA--TTTACA-AT-GT-GTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCA
gi|21 : ATTT-----CAAAGGCAAA----CATT-TT----C--GGGGTTTT-T--TTTT-------A---T----A--TCCATAAAC-AT-----
gi|19 : tattatggaatttcatt---T----A--TCTATAAAC-ATTACATCCCATCGAA--TTCACA-TT-GT-GTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TT-GCTTTA
gi|16 : ATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACA-AA-GT-GTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CA-TGCAAATT-TGT-ATGC---TT-GCTTC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1 2222222 111
lowQualScore : 1 44 4444 1 1 44 1 1 22 3 1 44 555555 555555 1 1 333 1 444 1 5555555 5555555555555 8 0 2 2 5555 77777777 7777 2 999999999999 444 55 6666666 4444 33 2 55555 33 2 2 33 2 2 66 44 3 3 3 3 000 3
lowQualScore : . .. .... . . .. . . .. . . .. ...... ...... . . ... . ... . ....... ............. . . . . .... ........ .... . ............ ... .. ....... .... .. . ..... .. . . .. . . .. .. . . . . ... .
lowQualScore : 9 55 0000 8 8 33 8 8 55 6 8 33 222222 222222 8 8 222 7 888 7 7777777 2222222222222 0 5 2 1 8888 66666666 8888 2 000000000000 111 66 8888888 7777 11 1 33333 11 5 5 44 5 9 88 22 1 1 3 3 444 3
consensus : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
Reference ( family-2933 ) : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|1 : GATT-TTACAAATTAT----AAA-C-AG--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CTA-TA------TA------G-TATC---AATA-CA---A-G-------TTGAATAAAT-------TAAA-T-ATACAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAAAC--TAT-TCTG---C--G----TTT---T--TTTTTA-----GT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCTAA--TTCACAAT-G-TATTTC--AAA-ATTAAA-AT-TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGTAA-TTGACTTCA
gi|10 : ttTGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCATT-GT-CG--T-CT-CTTATA------TA------G-T-TC---AAAG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ATAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGACAGA----CATATTA----G--G----TTT---T--TTTTAAA----AT----A--TCTATAACC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-CGTTTC--AAA-ATTGA
gi|11 : AA-C-AA--CAATCCGTT-AT-CA--T-TT-TT--TT------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----CTGG----TTT---T--TTTT-------TT----T--TCTATAAAC-AT-----CCTATCGAT--TTCACAAT-G-TGTTTA--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CA-TACAAATT-TGT-ATTC---TTT-CTTtaaaaaattaa
gi|12 : GGTT-TTACA--ATAT----AAA-C-AA--CAATTCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TGAA-TTA-ATAT-T--A-AGGAATTTCA--------AAGAATAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TTTTTC--AAA-ATTAAA-A--T
gi|13 : GGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-GT-CT--TA------TA------G-T-TT---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAACT-G-ATAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--T----TTT---T--CTTTTTTTA--AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATTAAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-AT
gi|14 : GGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACTCGTT-GT-CA--T-TC-CT--AA------TA------G-T-TC---CATG-TA---A-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ATAT-T--G-TGCAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTTGGGGT--G----TTT---T--TTTTTTTTTAAAT----A--TTCATAATC-AT-----CCCTTCGGA--TTCAC
gi|15 : aT-TCATA--TTAT----AAA-CCAA--CAACCCGCT-AT-CGAGT--T-CT--TA------TA------GCT-TA---AATG-CA---ACG-------TTGA-------------TAAA-T-T-ATAT-T--GCTGGAATTTCC--------AACACAAATCTTTGT-TTT----C--C----TTT---TC-TTTT-------ATATTAA--TCTATAAACAAT-----ACCATTGAA--TTCACA
gi|16 : ATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAA-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CA-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTC
gi|17 : gttggtaccagtagaaaatttagaaattttttggcaatacccatccctaGGAT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CA--T-CT-CT--TATACATGTA------G-T-TT---AATA-TT---T-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ACAT-T--A-TGTAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----
gi|18 : t-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----GTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCAAA--TTTACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCA
gi|19 : T----A--TCTATAAAC-ATTACATCCCATCGAA--TTCACATT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTTA
gi|2 : GGGTTGTTACAA-TTAT----AAAAC-AAA-CACCCTGTTTGT-CG--TTCT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATGACAT--A-GAAATATATTGA-------------TA---C-A-AT-T-T--A-T----TTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT-------G----GGT---T--TTGG-------AT----T--TTTATAAAC-AT-----CTCATCGGAATTTCACCAT-GCTGTTTC--AAACATTTAA-ATTTGAATT-CGTTGCAATTT-TGTAATGCTCTTTG-CTTCA
gi|20 : GGATT-TTACA--TTATTTATAAA-C-AA--CAACCTGT------G--T-CT-CT--TA------TACATGTAG-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TA
gi|21 : TAT-T--A-TGGAATTTCATTATTTCAAAGGCAAA----CAT-TTT----C--GGGGTTTT---T--TTTT-------AT----A--TCCATAAAC-AT-----ttaaactaaatttta
gi|22 : GGGTT-TTACA--GTAT----AAA-C-AA--C---CCGCT-GT-CG--T-TT-CT--TA------CA------C-T-TTTAAAATG-CA---A-G-------TTGG-------------TAAA-
gi|23 : GATT-TT-CA--TTAT----AAA-C-AA--C---CCGCT-GT-TG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-
gi|24 : GATT-TT-CA--TTAT----AAA----A--CAACCCGCT-GT-TG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC----ATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-caa
gi|25 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-TG--T-TT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTcaa
gi|26 : aT-TCACA--GTAT----AAA-C-AT--C---CCGCT-GT-CG--T-TT-TT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------CTGA-------------TA
gi|27 : gaG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ACAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGA
gi|3 : TGGGTT-TTACA--TTCC----AAA-C-AAACCAACCCGTT-GT-TG--T-CAACT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGATAAAATTTTTAATTAAA-T-A-ATATAT--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C-------CCG---T--CTTT-------AT----A--TCTTTAAAC-AT-----TCCATTAAA--CCCATAATGG-TGTTTA--AAG-ATTAAA-A--TAA--TCCG-CGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|4 : T-TTACG--TTAT----AAA-C-AG--CAACCCGTC-GTTCG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TA---AATG-CA---A-G-------T-GT-------------TGAA-TTA-ATAT-T--G-TTGA--TTCG--------AGGA-AAA----TAT-TAT----T--T----TTTCTAT--TTTTCATAC--AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATTGAA--TTCACAG--A-TATTTC--AAA-ATTAAC-A--TGA--T-CA-TGCACGTTCCAT-ATGC---TCA-CTTC
gi|5 : ggagTGGGTT-TTACA--TTAT----CAA-T-AA--CCACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-CC---AGTA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-CAGAATTTCA--------ACGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTC---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-CGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-AG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTA-CTTCA
gi|6 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CA--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TGAT-T-A-AAA--------GGAATTTCT--------CGGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTA--------AT----A--TTTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAGT-C-TGTTTT--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-TG-TGCAAATG-TGT-TTGT---TTG-CTT
gi|7 : GTT-TTACA--TTAT----A---C-AA--CAACCC-TT-GT-CA--TTCT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-T-------TTGG----------------A-T-G-AT-T-TGAA-AAGGATTTCG----------GACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--A----------AT----AAGTTTATAAAC-AT-----CCAATCGAA--TTCACAGT-C-TGTTTTAAAAA-ATTAAAGA--TGA--T--G-TGCAAATG-TGT--TGT---TTG-CTTCA
gi|8 : GGTT-TTACA--TTAC----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T--A---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ATA-----------ATTTCA--------AAGACAAA----C-T-TTT----C--G----GTT---T--TTTT-------AT----A--TCTGTAAAC-AT-----CCTATTGAA--TTAACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-TG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|9 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CACCCTGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CATATA-A-------TATA-------------TTGA-T-A-A-AT-T-------AATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----G--G----TTT---TGATTT-------------------TATAAAC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--A-CG-TG-----T-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1 2222222 111
lowQualScore : 1 44 4444 1 1 44 1 1 22 3 1 44 555555 555555 1 1 333 1 444 1 5555555 5555555555555 8 0 2 2 5555 77777777 7777 2 999999999999 444 55 6666666 4444 33 2 55555 33 2 2 33 2 2 66 44 3 3 3 3 000 3
lowQualScore : . .. .... . . .. . . .. . . .. ...... ...... . . ... . ... . ....... ............. . . . . .... ........ .... . ............ ... .. ....... .... .. . ..... .. . . .. . . .. .. . . . . ... .
lowQualScore : 9 55 0000 8 8 33 8 8 55 6 8 33 222222 222222 8 8 222 7 888 7 7777777 2222222222222 0 5 2 1 8888 66666666 8888 2 000000000000 111 66 8888888 7777 11 1 33333 11 5 5 44 5 9 88 22 1 1 3 3 444 3
consensus : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
Reference ( family-2933 ) : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|1 : GATT-TTACAAATTAT----AAA-C-AG--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CTA-TA------TA------G-TATC---AATA-CA---A-G-------TTGAATAAAT-------TAAA-T-ATACAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAAAC--TAT-TCTG---C--G----TTT---T--TTTTTA-----GT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCTAA--TTCACAAT-G-TATTTC--AAA-ATTAAA-AT-TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGTAA-TTGACTTCA
gi|10 : ttTGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCATT-GT-CG--T-CT-CTTATA------TA------G-T-TC---AAAG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ATAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGACAGA----CATATTA----G--G----TTT---T--TTTTAAA----AT----A--TCTATAACC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-CGTTTC--AAA-ATTGA
gi|11 : AA-C-AA--CAATCCGTT-AT-CA--T-TT-TT--TT------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----CTGG----TTT---T--TTTT-------TT----T--TCTATAAAC-AT-----CCTATCGAT--TTCACAAT-G-TGTTTA--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CA-TACAAATT-TGT-ATTC---TTT-CTTtaaaaaattaa
gi|12 : GGTT-TTACA--ATAT----AAA-C-AA--CAATTCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TGAA-TTA-ATAT-T--A-AGGAATTTCA--------AAGAATAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TTTTTC--AAA-ATTAAA-A--T
gi|13 : GGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-GT-CT--TA------TA------G-T-TT---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAACT-G-ATAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--T----TTT---T--CTTTTTTTA--AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATTAAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-AT
gi|14 : GGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACTCGTT-GT-CA--T-TC-CT--AA------TA------G-T-TC---CATG-TA---A-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ATAT-T--G-TGCAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTTGGGGT--G----TTT---T--TTTTTTTTTAAAT----A--TTCATAATC-AT-----CCCTTCGGA--TTCAC
gi|15 : aT-TCATA--TTAT----AAA-CCAA--CAACCCGCT-AT-CGAGT--T-CT--TA------TA------GCT-TA---AATG-CA---ACG-------TTGA-------------TAAA-T-T-ATAT-T--GCTGGAATTTCC--------AACACAAATCTTTGT-TTT----C--C----TTT---TC-TTTT-------ATATTAA--TCTATAAACAAT-----ACCATTGAA--TTCACA
gi|16 : ATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAA-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CA-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTC
gi|17 : gttggtaccagtagaaaatttagaaattttttggcaatacccatccctaGGAT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CA--T-CT-CT--TATACATGTA------G-T-TT---AATA-TT---T-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ACAT-T--A-TGTAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----
gi|18 : t-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----GTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCAAA--TTTACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCA
gi|19 : T----A--TCTATAAAC-ATTACATCCCATCGAA--TTCACATT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTTA
gi|2 : GGGTTGTTACAA-TTAT----AAAAC-AAA-CACCCTGTTTGT-CG--TTCT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATGACAT--A-GAAATATATTGA-------------TA---C-A-AT-T-T--A-T----TTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT-------G----GGT---T--TTGG-------AT----T--TTTATAAAC-AT-----CTCATCGGAATTTCACCAT-GCTGTTTC--AAACATTTAA-ATTTGAATT-CGTTGCAATTT-TGTAATGCTCTTTG-CTTCA
gi|20 : GGATT-TTACA--TTATTTATAAA-C-AA--CAACCTGT------G--T-CT-CT--TA------TACATGTAG-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TA
gi|21 : TAT-T--A-TGGAATTTCATTATTTCAAAGGCAAA----CAT-TTT----C--GGGGTTTT---T--TTTT-------AT----A--TCCATAAAC-AT-----ttaaactaaatttta
gi|22 : GGGTT-TTACA--GTAT----AAA-C-AA--C---CCGCT-GT-CG--T-TT-CT--TA------CA------C-T-TTTAAAATG-CA---A-G-------TTGG-------------TAAA-
gi|23 : GATT-TT-CA--TTAT----AAA-C-AA--C---CCGCT-GT-TG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-
gi|24 : GATT-TT-CA--TTAT----AAA----A--CAACCCGCT-GT-TG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC----ATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-caa
gi|25 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-TG--T-TT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTcaa
gi|26 : aT-TCACA--GTAT----AAA-C-AT--C---CCGCT-GT-CG--T-TT-TT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------CTGA-------------TA
gi|27 : gaG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ACAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGA
gi|3 : TGGGTT-TTACA--TTCC----AAA-C-AAACCAACCCGTT-GT-TG--T-CAACT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGATAAAATTTTTAATTAAA-T-A-ATATAT--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C-------CCG---T--CTTT-------AT----A--TCTTTAAAC-AT-----TCCATTAAA--CCCATAATGG-TGTTTA--AAG-ATTAAA-A--TAA--TCCG-CGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|4 : T-TTACG--TTAT----AAA-C-AG--CAACCCGTC-GTTCG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TA---AATG-CA---A-G-------T-GT-------------TGAA-TTA-ATAT-T--G-TTGA--TTCG--------AGGA-AAA----TAT-TAT----T--T----TTTCTAT--TTTTCATAC--AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATTGAA--TTCACAG--A-TATTTC--AAA-ATTAAC-A--TGA--T-CA-TGCACGTTCCAT-ATGC---TCA-CTTC
gi|5 : ggagTGGGTT-TTACA--TTAT----CAA-T-AA--CCACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-CC---AGTA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-CAGAATTTCA--------ACGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTC---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-CGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-AG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTA-CTTCA
gi|6 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CA--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TGAT-T-A-AAA--------GGAATTTCT--------CGGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTA--------AT----A--TTTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAGT-C-TGTTTT--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-TG-TGCAAATG-TGT-TTGT---TTG-CTT
gi|7 : GTT-TTACA--TTAT----A---C-AA--CAACCC-TT-GT-CA--TTCT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-T-------TTGG----------------A-T-G-AT-T-TGAA-AAGGATTTCG----------GACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--A----------AT----AAGTTTATAAAC-AT-----CCAATCGAA--TTCACAGT-C-TGTTTTAAAAA-ATTAAAGA--TGA--T--G-TGCAAATG-TGT--TGT---TTG-CTTCA
gi|8 : GGTT-TTACA--TTAC----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T--A---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ATA-----------ATTTCA--------AAGACAAA----C-T-TTT----C--G----GTT---T--TTTT-------AT----A--TCTGTAAAC-AT-----CCTATTGAA--TTAACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-TG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|9 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CACCCTGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CATATA-A-------TATA-------------TTGA-T-A-A-AT-T-------AATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----G--G----TTT---TGATTT-------------------TATAAAC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--A-CG-TG-----T-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
blockSeqs : G A TTAT A C AC T T AG T A TA TACATG CATGTA C . TAA A TAT C AAATATA TAAAATTTTTAAT T T . A GAA TTATTTCA TCTT A GGGGTG CTA GA TTTTTAA ATTA AG A TACAT AT G C AA C G TT AT C T C A TCT .
blockSeqs : . . . . . A . . . T . . . . . . . . T . . . C T . . GC . . . CGGGGT . C TTTTA . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . G . . . CTGG . . CATAC . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . A . . . GG . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . CG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . CG . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . GG . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : ** ** ************* **** CG********** ******* ** ***
originalCons : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
finalCons : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTTCG----------TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1 2222222 111
lowQualScore : 1 44 4444 1 1 44 1 1 22 3 1 44 555555 555555 1 1 333 1 444 1 5555555 5555555555555 8 0 2 2 5555 77777777 7777 2 999999999999 444 55 6666666 4444 33 2 55555 33 2 2 33 2 2 66 44 3 3 3 3 000 3
lowQualScore : . .. .... . . .. . . .. . . .. ...... ...... . . ... . ... . ....... ............. . . . . .... ........ .... . ............ ... .. ....... .... .. . ..... .. . . .. . . .. .. . . . . ... .
lowQualScore : 9 55 0000 8 8 33 8 8 55 6 8 33 222222 222222 8 8 222 7 888 7 7777777 2222222222222 0 5 2 1 8888 66666666 8888 2 000000000000 111 66 8888888 7777 11 1 33333 11 5 5 44 5 9 88 22 1 1 3 3 444 3
consensus : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
Reference ( family-2933 ) : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|1 : GATT-TTACAAATTAT----AAA-C-AG--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CTA-TA------TA------G-TATC---AATA-CA---A-G-------TTGAATAAAT-------TAAA-T-ATACAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAAAC--TAT-TCTG---C--G----TTT---T--TTTTTA-----GT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCTAA--TTCACAAT-G-TATTTC--AAA-ATTAAA-AT-TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGTAA-TTGACTTCA
gi|10 : ttTGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCATT-GT-CG--T-CT-CTTATA------TA------G-T-TC---AAAG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ATAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGACAGA----CATATTA----G--G----TTT---T--TTTTAAA----AT----A--TCTATAACC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-CGTTTC--AAA-ATTGA
gi|11 : AA-C-AA--CAATCCGTT-AT-CA--T-TT-TT--TT------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----CTGG----TTT---T--TTTT-------TT----T--TCTATAAAC-AT-----CCTATCGAT--TTCACAAT-G-TGTTTA--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CA-TACAAATT-TGT-ATTC---TTT-CTTtaaaaaattaa
gi|12 : GGTT-TTACA--ATAT----AAA-C-AA--CAATTCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TGAA-TTA-ATAT-T--A-AGGAATTTCA--------AAGAATAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAT-G-TTTTTC--AAA-ATTAAA-A--T
gi|13 : GGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-GT-CT--TA------TA------G-T-TT---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAACT-G-ATAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--T----TTT---T--CTTTTTTTA--AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATTAAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-AT
gi|14 : GGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACTCGTT-GT-CA--T-TC-CT--AA------TA------G-T-TC---CATG-TA---A-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ATAT-T--G-TGCAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTTGGGGT--G----TTT---T--TTTTTTTTTAAAT----A--TTCATAATC-AT-----CCCTTCGGA--TTCAC
gi|15 : aT-TCATA--TTAT----AAA-CCAA--CAACCCGCT-AT-CGAGT--T-CT--TA------TA------GCT-TA---AATG-CA---ACG-------TTGA-------------TAAA-T-T-ATAT-T--GCTGGAATTTCC--------AACACAAATCTTTGT-TTT----C--C----TTT---TC-TTTT-------ATATTAA--TCTATAAACAAT-----ACCATTGAA--TTCACA
gi|16 : ATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAAA-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CA-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTC
gi|17 : gttggtaccagtagaaaatttagaaattttttggcaatacccatccctaGGAT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CA--T-CT-CT--TATACATGTA------G-T-TT---AATA-TT---T-G-------TTGA-------------TAAATT-A-ACAT-T--A-TGTAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----
gi|18 : t-ATAT-T--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C--G----GTT---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATCAAA--TTTACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCA
gi|19 : T----A--TCTATAAAC-ATTACATCCCATCGAA--TTCACATT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-CG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTTA
gi|2 : GGGTTGTTACAA-TTAT----AAAAC-AAA-CACCCTGTTTGT-CG--TTCT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATGACAT--A-GAAATATATTGA-------------TA---C-A-AT-T-T--A-T----TTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT-------G----GGT---T--TTGG-------AT----T--TTTATAAAC-AT-----CTCATCGGAATTTCACCAT-GCTGTTTC--AAACATTTAA-ATTTGAATT-CGTTGCAATTT-TGTAATGCTCTTTG-CTTCA
gi|20 : GGATT-TTACA--TTATTTATAAA-C-AA--CAACCTGT------G--T-CT-CT--TA------TACATGTAG-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TA
gi|21 : TAT-T--A-TGGAATTTCATTATTTCAAAGGCAAA----CAT-TTT----C--GGGGTTTT---T--TTTT-------AT----A--TCCATAAAC-AT-----ttaaactaaatttta
gi|22 : GGGTT-TTACA--GTAT----AAA-C-AA--C---CCGCT-GT-CG--T-TT-CT--TA------CA------C-T-TTTAAAATG-CA---A-G-------TTGG-------------TAAA-
gi|23 : GATT-TT-CA--TTAT----AAA-C-AA--C---CCGCT-GT-TG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-
gi|24 : GATT-TT-CA--TTAT----AAA----A--CAACCCGCT-GT-TG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC----ATG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-caa
gi|25 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-TG--T-TT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTcaa
gi|26 : aT-TCACA--GTAT----AAA-C-AT--C---CCGCT-GT-CG--T-TT-TT--TA------TA------G-T-TC---AATG-CA---A-G-------CTGA-------------TA
gi|27 : gaG-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ACAT-T--G-TGGAATTTCA--------AAGA
gi|3 : TGGGTT-TTACA--TTCC----AAA-C-AAACCAACCCGTT-GT-TG--T-CAACT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGATAAAATTTTTAATTAAA-T-A-ATATAT--A-TGGAATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----C-------CCG---T--CTTT-------AT----A--TCTTTAAAC-AT-----TCCATTAAA--CCCATAATGG-TGTTTA--AAG-ATTAAA-A--TAA--TCCG-CGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|4 : T-TTACG--TTAT----AAA-C-AG--CAACCCGTC-GTTCG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TA---AATG-CA---A-G-------T-GT-------------TGAA-TTA-ATAT-T--G-TTGA--TTCG--------AGGA-AAA----TAT-TAT----T--T----TTTCTAT--TTTTCATAC--AT----A--TCTATAAAC-AT-----CCCATTGAA--TTCACAG--A-TATTTC--AAA-ATTAAC-A--TGA--T-CA-TGCACGTTCCAT-ATGC---TCA-CTTC
gi|5 : ggagTGGGTT-TTACA--TTAT----CAA-T-AA--CCACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-CC---AGTA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-T-A-ATAT-T--A-CAGAATTTCA--------ACGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTC---T--TTTT-------AT----A--TCTATAAAC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-CGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-AG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTA-CTTCA
gi|6 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CA--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TGAT-T-A-AAA--------GGAATTTCT--------CGGACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--TTA--------AT----A--TTTATAAAC-AT-----CCCATCGAA--TTCACAGT-C-TGTTTT--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-TG-TGCAAATG-TGT-TTGT---TTG-CTT
gi|7 : GTT-TTACA--TTAT----A---C-AA--CAACCC-TT-GT-CA--TTCT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CA---A-T-------TTGG----------------A-T-G-AT-T-TGAA-AAGGATTTCG----------GACAAA----CAT-TTT----C--G----TTT---T--A----------AT----AAGTTTATAAAC-AT-----CCAATCGAA--TTCACAGT-C-TGTTTTAAAAA-ATTAAAGA--TGA--T--G-TGCAAATG-TGT--TGT---TTG-CTTCA
gi|8 : GGTT-TTACA--TTAC----AAA-C-AA--CAACCCGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T--A---AATA-CA---A-G-------TTGA-------------TAAA-TTA-ATA-----------ATTTCA--------AAGACAAA----C-T-TTT----C--G----GTT---T--TTTT-------AT----A--TCTGTAAAC-AT-----CCTATTGAA--TTAACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--T-TG-TGCAAATT-TGT-ATGC---TTG-CTTCA
gi|9 : TGGGTT-TTACA--TTAT----AAA-C-AA--CACCCTGTT-GT-CG--T-CT-CT--TA------TA------G-T-TC---AATA-CATATA-A-------TATA-------------TTGA-T-A-A-AT-T-------AATTTCA--------AAGACAAA----CAT-TTT----G--G----TTT---TGATTT-------------------TATAAAC-AT-----CTCATCGAA--TTCACAAT-G-TGTTTC--AAA-ATTAAA-A--TGA--A-CG-TG-----T-TGT-ATGC---TTG-CTTCA