lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 55555555555555 11 22222222 33 222 1 3333333 1 1 1 222 1 1 1 222 444444 1 111 222222 1111 111 111 22222 11 7777777777777777777777777777777 1 11 2 222222 1111 111 222222222 222 22222222222222222222222222222222 2222 2222222222222222222222222 11 44444444444 111 11 11 222222222 22222 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 22222 111111 111 11 1 333333333333333333333 1 1111111 22222222222222 111 333333333333333333333333333333333333 444444444444444444 1111 1111111 111111 5555555555555555 44444444444444444444444444444444444 111 333333333 111 11 1 44 44444 111 11 3333 1111111111 111 111 22 11 111 11 1111 222222222222 1111 111 111 3333333 1 222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222 11111 4444444444 1111111 11111 33333333 1111 4444 222222222222222222 4444444 3333333333333333 222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1111 11 555555555555555555555555555 22 555555555 2222 111 666666666666666666666666666666666666666666 111 222222 222 666666666666666666666666666666666 111 1 111111 111 111 2 1 2222 3333333333 1 1111 11 11 444444444 222222 111 111 1 222 4444444444444444444444444444444444444444 2 111 1111 1 1 2 5555 22 111 1 22 444444444 1111 444444444444 1 1 11 1 33333 1 4 4 1 5555555 00000 777777777 111111 4444444 2 2 777 22 444444 4 77777 44 4 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777 55555 4 4 777777777777777777 8888888 4 4 22 666666666666666 4 44 4 4 4 4 55 1 4444444444444 1 4 1111111111111 55 1 4 4 55 1 1 1 2 44 3333333 2 4 1 1 55 1 66666 4 4 22 55 4 4 4 1 9999999999999999999999999 8888 55 1 4 1 555555555555 33 1 222 1 333 4 4 44 11 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000 33 11 2222222 22 33333 4 3333333 444 2 1111 2 22 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 222 3333333333333 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222222 1 6666666666
lowQualScore : 66666666666666 33 99999999 3 3 3 77 2 9 222 5 0000000 3 0 0 99 0 8 0 222 6 5 1 5 8 8 8 7 999 333333 0 0 99 6 6 1 6 5 2 99 7 111 1 555555 4444 6 99 000 2 99 111 6 6 00000 6 44 1111111111111111111111111111111 99 5 6 55 6 1 6 6 6 99 444444 4444 111 99 888888888 99 6 99 555 6 6 7777 6 99 99999999999999999999999999999999 6 6 0000 6 6 6 7777777777777777777777777 5 5 77 5 5 5 1 66 4 44444444444 66 555 66 888 5 2 55 7777 4 4 11 111111111 5 5 5 5 44444 5 5 666 77 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 9999 5 44444 5 666666 5 111 5 5 00 888 2 555555555555555555555 0 5 4444444 44444444444444 5 333 66 5 4 444444444444444444444444444444444444 5 0 4 1 999999999999999999 5 2222 8888888 444444 0000000000000000 6 6 3 88888888888888888888888888888888888 000 333333333 6 6 99 6 111 77 1 55 5 33333 5 5 000 99 5 77 5 9999 5 1 66 555 2 5 7 6666666666 5 5 0 000 555 00 5 5 5 5 99 000 1 888 1 5 5 66 0000 5 77 5 666666666666 1111 1 777 000 0 999 5 5 5 0000000 0 2 77 8888 555555555 9 5 5 77 111111111111111111111111111111111111111111111111111 66 1 5 0 5 9999 2 5 33333 0000000000 3 66 5 5 3333333 44444 77 1 5 66666666 99 9999 5 1111 5 777777777777777777 99 77 1111111 8888888888888888 0 222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 8 33 0 5 8888 5 5 5 5 77 5 5 5 77 1 5 5 33 5 777777777777777777777777777 3 00 77 6 6 888888888 0 7 1111 6 6 6 000 333333333333333333333333333333333333333333 000 888 5 000000 8 6 999 5 333 5 444444444444444444444444444444444 0 000 1 222222 5 555 000 6 6 3 6 1 6 6 5 9999 3 3 2 99 3 4444 7777777777 8 6 8 0 8 7777 0 88 11 99 333333333 88 333333 444 111 88 0 555 2 0000000000000000000000000000000000000000 7 111 4444 7 6 3 3 6 6666 00 333 0 3 00 7 444444444 6666 777 777777777777 0 0 44 88 3 6 99999 7 6 3 3 3 6 0 0 5 6 6 9999999 6 00000 2 111111111 888888 5555555 2 3 88 0 6 000 33 444444 0 66666 66 6 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 000 22222 0 0 555555555555555555 1111111 0 0 11 999999999999999 6 0 66 6 0 0 0 0 55 5 6 66 9999999999999 5 4 0 5555555555555 55 7 0 6 0 55 7 5 7 0 4 22 4 3333333 4 0 0 7 7 55 7 6 77777 0 0 11 55 0 0 0 7 2222222222222222222222222 6 5555 55 5 6 0 5 6 222222222222 7 22 3 7 7 7 555 7 7 7 3 7 7 999 7 6 6 0 0 33 3 22 11 8 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555 0 00 5 11 6666666 11 33333 0 7777777 000 7 3 7 6666 8 7 00 7 6 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 7 666 9999999999999 7 3 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 44444444 4 3 9999999999
lowQualScore : .............. .. ........ . . . .. . . ... . ....... . . . .. . . . ... . . . . . . . . ... ...... . . .. . . . . . . .. . ... . ...... .... . .. ... . .. ... . . ..... . .. ............................... .. . . .. . . . . . .. ...... .... ... .. ......... .. . .. ... . . .... . .. ................................ . . .... . . . ......................... . . .. . . . . .. . ........... .. ... .. ... . . .. .... . . .. ......... . . . . ..... . . ... .. ............................................................................................................................... ... .... . ..... . ...... . ... . . .. ... . ..................... . . ....... .............. . ... .. . . .................................... . . . . .................. . .... ....... ...... ................ . . . ................................... ... ......... . . .. . ... .. . .. . ..... . . ... .. . .. . .... . . .. ... . . . .......... . . . ... ... .. . . . . .. ... . ... . . . .. .... . .. . ............ .... . ... ... . ... . . . ....... . . .. .... ......... . . . .. ................................................... .. . . . . .... . . ..... .......... . .. . . ....... ..... .. . . ........ .. .... . .... . .................. .. .. ....... ................ . ... ........................................................................... . . .. . . .... . . . . .. . . . .. . . . .. . ........................... . .. .. . . ......... . . .... . . . ... .......................................... ... ... . ...... . . ... . ... . ................................. . ... . ...... . ... ... . . . . . . . . .... . . . .. . .... .......... . . . . . .... . .. .. .. ......... .. ...... ... ... .. . ... . ........................................ . ... .... . . . . . .... .. ... . . .. . ......... .... ... ............ . . .. .. . . ..... . . . . . . . . . . . ....... . ..... . ......... ...... ....... . . .. . . ... .. ...... . ..... .. . . ............................................................................................................................................................................................................................. ... ..... . . .................. ....... . . .. ............... . . .. . . . . . .. . . .. ............. . . . ............. .. . . . . .. . . . . . .. . ....... . . . . . .. . . ..... . . .. .. . . . . ......................... . .... .. . . . . . ............ . .. . . . . ... . . . . . . ... . . . . . .. . .. .. . . .................................................. . .. . .. ....... .. ..... . ....... ... . . . .... . . .. . . . .................................................... .. . ... ............. . . ..................................................... ........ . . ..........
lowQualScore : 55555555555555 22 88888888 2 2 2 00 5 2 000 0 0000000 5 0 0 88 0 0 8 000 0 0 0 4 0 0 0 0 000 444444 8 8 22 7 7 0 7 5 5 22 8 777 7 888888 2222 7 22 222 5 22 777 7 7 00000 7 00 2222222222222222222222222222222 22 2 7 88 7 8 7 7 7 22 777777 2222 777 22 555555555 22 7 22 000 7 7 8888 7 22 77777777777777777777777777777777 7 7 8888 7 7 7 5555555555555555555555555 7 7 44 7 7 7 7 00 0 00000000000 99 666 99 888 0 2 88 0000 4 4 99 888888888 0 0 0 0 99999 7 7 777 99 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 333 4444 7 44444 7 444444 7 999 7 7 77 000 4 555555555555555555555 0 0 8888888 55555555555555 0 444 99 0 3 000000000000000000000000000000000000 7 7 3 7 666666666666666666 7 1111 4444444 333333 7777777777777777 7 7 7 00000000000000000000000000000000000 222 888888888 7 7 22 7 777 88 7 22 7 11111 7 7 000 99 7 99 7 0000 0 4 99 999 0 0 0 8888888888 0 0 9 444 666 66 7 7 7 7 11 000 7 666 7 7 7 44 7777 7 99 7 444444444444 6666 7 999 000 1 666 7 7 7 9999999 1 0 44 7777 777777777 1 7 7 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333 99 1 0 1 0 9999 5 0 66666 1111111111 2 99 0 0 4444444 44444 99 4 7 55555555 22 7777 7 1111 7 444444444444444444 66 99 3333333 9999999999999999 1 000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 7 11 1 7 1111 7 7 7 7 99 7 7 7 99 4 7 7 00 7 666666666666666666666666666 9 11 99 0 7 888888888 8 8 0000 7 7 7 222 777777777777777777777777777777777777777777 000 111 7 111111 4 7 666 7 777 0 999999999999999999999999999999999 6 000 4 111111 7 333 000 7 7 3 7 0 7 7 7 3333 7 3 5 22 5 0000 8888888888 0 4 0 8 0 0000 8 88 00 00 000000000 88 000000 888 888 88 6 000 5 0000000000000000000000000000000000000000 8 000 2222 3 7 3 3 7 7777 77 333 7 3 00 3 777777777 5555 333 222222222222 0 0 00 33 3 7 00000 3 7 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0000000 0 00000 5 000000000 000000 0000000 5 0 00 0 0 000 00 000000 0 00000 00 0 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 00000 0 0 000000000000000000 0000000 0 0 00 000000000000000 0 0 00 0 0 0 0 0 00 0 0 55 5555555555555 5 0 0 0000000000000 00 0 0 0 0 00 0 0 0 0 0 55 0 0000000 0 0 0 0 0 00 0 0 00000 0 0 00 00 0 0 0 0 0000000000000000000000000 0 0000 00 0 0 0 5 7 333333333333 3 77 3 3 3 3 777 3 3 3 3 3 3 000 3 0 0 0 0 00 7 00 00 0 8 66666666666666666666666666666666666666666666666666 8 00 0 00 0000000 22 00000 0 7777777 000 3 3 3 7777 7 3 77 3 0 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 77 3 333 7777777777777 3 3 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 33333333 7 3 0000000000
consensus : GAGTGTGAGATCGA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAACA--A--ATGATTTTGGTATCAA-TGGATACACAT--ATGTATG--GAC-NANTG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAAAAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCTC-TA-GTGG-CTGTCAAAC-TAAGGG-AGG--TAACTCTGTGTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCCAT--ATANTA---ATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTATAAAA-TA-T---TGAT-TTTT-TATTA--A-----------AT--AT-GTA---A---TCT--GTTCTAAA-A--TTT-AA-AAAC-A-AT-AAAAA--AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT---T--TC-----AACTGCA-----AAA---ATT-CG-TAAA----TTGTG-AA-TT-TAA--T-C---A-A----A-TTG-T-A-AAG-C-ACAG-ACA-GA-G-TAAATGGAAA---TT-G---AAAAA--A---CA--A---C-TTATTTTTCA--T-AAA-AT-ATA--ATA-AC--A-TTCA-A-TCA-AT-GTGT---CCAA-A-TTT-T-A--GAAA----A--------A-AG-AG-T---GG----AG--CCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C----G-A--NATT-C-C-T-C------T-GA----CC-AG--TTTTTTT-TTCA-G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TAC--GA-T-TT-GTCT-CAATTT---C----A---A--------TTCAA-TAA-AAAAG-C-AA--AT-TA-------AA-TG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-T--ATA-T----TTC-ATGACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT-TA----TT---TA--TAACAGGGAA---AAAAA---TA-TT----AA--T-ATTTC-ATANTGT--CCTTA-CA-AT-C----CAC--CAA-TATA-C-CGTCC--ATT------AC-T-CAGA-ATGA--A-ATAT---GAGGAAAATGTG--CA-TCGTTA-CCAAC-A-TA---TTT-ACA-AA--CAT-A-TA-GAGT-AATGG--AA-A-TAAA-AAAAAGCATA--C--TA-CTT-TTA-T-AAA---ATAT-AC-AACAATC-A-AT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-G--TGG-AG--CCA-TTT----A-AAA-CTAA--T-CAGC---CC---GAA-T-TTC-CT-CT-GAACAGCTTTTCT-----CAGCAAAATTTC-AT--GTTTCT--------AAANT-TG-TC--TTCAAT-CAC-AATAAAC-CAAAAAAAAAAAAAAA-AAANAAAAA---CAA--A--AAGA--AAAAGA-TTAAA-TGGG-AAAATGAA-C-A-TGGT-----AC-A-ATATT--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TG-T----A-ACA---GA-----A----A--AAAAGGT-TAA--TGTTTCATAC--A-TCTCCTCGTCC--ATCG---G---CTCACAATGAAAATAT--AT--------------GAATGA----A--AATTG-TT-AT---CA-C-A------AT----GTG----AA---TC-GTTATCACA-TATTT-T-AC-A-A-CA-T-A--CA-G-AG-TA--ATG-GA-AATNA-AAAAA--GCA--A-----------TACTATT-TTCAT-AAAA--TATAACAAAA-ATT---ATTC--ATGTGTC---C-AA-A-TC--TCAGAAA---AAAGTT-GT---------GGAGC-CA-TT------A--AAAT---AT--TCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG--ACAAAACCATG----AAC---CTG--NA------TGA-AC---ATT---TT-TT--TC--CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-A--AAGTAC-AAGAAC-ATCA--AATT--T-TCTTA-A-TAT---ATGG-CCAAGT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT-G--AGA--C-AAAATAT------CCG--AAT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACT-TCT-TTGTTAT-AGGGTTGTGGT-ACAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TCTTTT-GGATGAATTGGAAT-CTTT-GGCAGTATG-GCACT--GGTTGTACATGTGTTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGANNCTTTGGCA-GTATGCACT--G-TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATNGNTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCT-GGCGAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGG-----CATTGGCAAANTAAGATAAG-ATGGTATAACTAGATGGGGTGGTATAAACGAAACTTTTNNCTCCGCGTACGCCCAAAAGCAATGTATA-TATGATGGTATTCTGCTGCC-GTTGGAAATAAAAAACAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCGC-ATGTG--ACTG-AGGGCGT--TAGAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTAT-TCTGCTTCGGGAACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATTTTTAAC--TGAACA---TCAAAAC-AGGTTATCTAA--TACTGT-ACTC-ATAAAAAAC--ACTGT-AATGAGA---CAC---CTTCATT-ATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTA-C-CGACTTATAGGGA-TGTATATAAACAAAA-TAAAAATA-CCTTTAAAATGGCAGGGA-GACTGTATGTTTGAATTGTGGTT-GCATGCATGAACTGAAGAGGG-AGACCA-CACTTCTGGCAGACTAGTAATATTTCGGATAACA--CAACAAATT-CCACAA-CTCTCCAACC-CTCTGTCCATCCAAA-GCCTT-CGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTNNC-ACACCCATCTGACCTTCATCTATGGGTTAANTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAA--AAAAATTGCAT-GCAGTT-AGCTCA--AGTTTTCTTAATTTACTGATACTGATATCATGNCTGGTNATCTTTTNTCAATACCCTGNATGTACATTGTACAATTACCGGT-AATGAATTTATATAA--AAAATTCTAACACTACNNNCCATGGTTCATATGGTT-TGA-CCATGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGCTCCTAAAGACAT--TTCCTT-CCTATTCCTATGCTGGGAC-GAACATACAAGTGTATGAGTTGACCAAAAG-TGCCT-CCA-ATTTGG---ATAGGGGGGGGGGGG----ACAAGAATAGGCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATCAA-CTTGGC--GC-AATTAATTCACTAATTATATCTC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCAGCT-TTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTATTTCANAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCGA--AA--GAAGG--GAC----------TTGAAN----AACATAA--CATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTGA-TTCCT-T-----GTTACTATAA--GAATTCTAACAAC-ATTTTTATCACGTGC-TA-CATACATTTAC-ACATTGT-CGGGGA-TCTAT--TACTACCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CTGAGAG-CGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT--C----TTACC---AA-TTTTTG-AA-TAG-ATNT-GGTCG--A-------ATATCCACCTCTGGTC
Reference ( gi|1 ) : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---AGTA-ATGGGAA-CA--A--ATGATTTTGGTATCAAATGGATACACAC--ATGTCTG--GAC-CAATG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAAAAAAA---GAGTGTAG-CCGTTTTGCCTC-TA-GTGG-CTGACAAACCTAAGGGCATG--TAACTCTGTGTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCCAT--ATAGTA---ATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTATAAAA-TA-T---TGAT-TTTT-TATTA--A-----------AT--A--GTA---A---TCT--GTTATAAA-A--TTT-AAGAAAC-A-AT-AAAAA--AA--TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT---T--TC-----ACCTGCA-----AAA---ATT-CG-TAAA----TTGTG-AA-TT-TAA--T-C---A-A----A-TTG-TTA-AAG-C-ACAG-ACA-GA-G-TAAATGGAA----C--G---AAAAA--A---CA--A---C-TTATTTTTCA--T-AAA-AT-ATA--ATA-AC--A-T-CA-A-TCA-AT-GTTT---CCAA-A-TTT-T-A--GAAA----A--------A-AG-AG-T---G-----AG--CCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C----G-A--CATT-C-C-T-C------T-GA----CC-A---TTTTTTT-TTCA-G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TAC--GA-T-TT-GTCT-CAAGTT---C----A---A--------TTCAA-TAA-AAAAG-C-AA--AT-TA-------AA-TG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-T--ATA-T----TTC-ATGACTATATA-ATT-CCTG--AA---T-TT-TA----TT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT----AA--T-ATTTC-ATAATGT--C-TTA-CA-AT-C----CAC--CAATTATAAC-CGTCC--ATT------AC-T-CAGA-ATGA--A-ATAT---GAAGAAAATGTGGGCA-TCGTTA-TCAAC-A-TA---TTT-ATA-AA--CAT-A-T--GAGT-AATGG--AA-A-TAAA-AAAAAGTATA--C--TA-CTT-TTA-T-AAA---ATA--AC-AACAATC-A-AT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-G--TGG-AG--CCA-TTT----A-AAA-C-AA--T-CAGC---CC---GAA-T-TTC-CT-CT-GAACAGCTTTTCT-----CAGCAAAATTTC-AT--GTTTCT--------AAAAT-TG-TC--TTCAA--CAC-AATAAAC-CAAAAAAAAAAAAAAA-AAATAAAAAACGCAATTA--AAGA--AAAAGA-TTAAA-TGGGAAAAATGAA-C-A-TGGTA----AC-A-ATATT--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TG-TA---A-ACA---GA-----A----A--AAAAGGT-TAA--TGTTTCATACTAA-TCTCCTCG-CC--ATC----A---CTCACAATGGAAATAT--AT--------------GAATG-----A--AATTG-TT-AT---C--C-A------AT----GTG----AA---TC-GTTATCACA-TATTT-T-AC-A-A-CA-T-A--CA-G-AG-TA--ATG-GA-AATTA-AAAAA--ACA--A-----------TACTATCGTTCAT-AAAA--TATAACAAAA-ATT---AT----ATGCGTC---C-AA-A-TC--TCAGAAA---GAAGTT-GTGGGGGGGGGGGAGC-CA-TT------A--GAAT---AT--TCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG--CCAAAACCATG----AAA---CTG-AAA------TGA-AC---ATT---TT-TT--TT--CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGCAATG-CATGA-AAATT-GCAA-A--AAGTACAAAGAAC-ATCA--AATT--T-TCTTA-A-TAT--AATGG-CCATGT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT----A-A--C-AAAATAT------CCA--AAT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTTCATGCAA-TGC-TTTCACT-TC--TTGCTAT-AAGTTTGTGGTAACAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTG----CTTTT-GGATGAATTTGAGT-CTTT-GGCAGTATGTGTACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTATGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT--GGTTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGGAATCTGCAGTAT-ATGTGATCTTCTTGGCTAAAAATACAATA-AATT--TTAAATTAAGTTGGCCATTGGTAAACTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACAAGACTTTTTACTCC-CGTGC---CAAATACAAT-TATAATATGATG-TATTCTGCTGCCTGT--GAAATAAAAG-CAATATTTG-AAGAA-CA-AATA--TGCCCCCATCTGGTACTGTAAGTCGTACTATA----TTGCAC-AATTGTAT-AG-AATA--ATCTCTGCTTCGGTAACTTTTTGA----------------------ACATTTTTAATCTTGAAGAATTTCAAAACCAGGT-ATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTTCTCCATTGATC-----AATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGT-TATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAT-TGGCAAAAAAGACT--ATGTTTGAATTGTGGTTTGC-TG-ATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCATAAT-CCTCGAACAAGAGACAACAAGTTTCCACAAATTTTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGTCCCACAACTT--AAACGGAAAGTACCAACACCCTTCTGACCTTCATCTATGGATTAAATATTTTAAAATG---TTTATG----TGTATATTTGTAAAAGAAAAAATGCATGGCAATTAAGCTCAGGAGATTTGTTAATTAACTG-TACTGATATCATAACTGGTC-TCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCAGTAAATGAATTTTTAAAATTAAAAATCTAACACTGCATGCCATGGTTCATATGGTTGTGGCCCATGCA-TATTGACTTGTTTTGTTTGACATTCAAGTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTAT-CTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGATGACCACTAGTTGCCTCCCACATTTGATTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGCACAAGA--AGCCTCAACGAAGAAAATTTATC-ACCTGTGTGTTTATCAAACATTGC--ACCAATTAATTCACTAATTATATCTTTCAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCAGC--TTGTTTACATATATA-ATATATATAT-TATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCT-CTTCACAACGGGGAATAACGGGTAATA--ACTCT-AATCG---AA--GAA-C--GAC----------CTGAAA----AAC--AA--CATAGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTGAATTCCT-T-----GTTACTATAATGAAATTCTAACAACCATTTTTATCATGGGC-TATCATACATTTAC-ACATTAT-CGGGGAATCTATATTACTAACTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCT--CTGAGAACCGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT--CTTTATTATCTATAT-TTTTTGAAA-CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|3 : GAGTGTGAGATCAAAG-T---AATGGGGTATATGGGAA-AACTA--ATGATTTTGGTATCA--TGGATCTACAGTAATGTATGTGGACATATTG-CT-TGG-CAT-GAGAATAAAAAAAAAAAGAGTGTAG-CCCGTTTGCCTC-TAAGTGG-CTGTCAAAC-TAAGGG-AGG--TAACTCTGTGTATTT--T-T-CT-----AAAT-AT-GTCCCT--ATAATACTAATTCAAAA-----TAAA-----A-AG--TCAAGG--ATGAACTA---TCAAAATTATAAA--TA-T---TGAT-TATT-TATTA--A------------T--AT-GTAGACA---TCT--GTTCTAAATA--TTTTAAAAAAC-ATAT-AAAAA--AAA-TT--ATAA----CGTA---TTTTCTAT------AACTTT--TACT-CGCA--GCGACCC-A-CC-T--TG-ATGTC--CAATTT---T--TA-----AACTGCA-----ATA---ATTACG-TAAA----TTGTG-AA-TCACAA--T-C---A-A----T-TTG-T-A-AAG-C-AC-G-ACAAGA-G-TAA-TGAAA----CT-G---AAAAA--A---CA--A---C-TTATGT--CA--T-AAATAT-AAA--ATATAC--A-T-CA-AATCA-GTAGTGT---CTAA-AATTTAT-A--GAAA----ACATCG---A-GGTAG-T---GTAG--AG--CCAT------TT--T--GATAAAT-C-CTAAG-----CTAGCTAAATACC----G-AAATATT-C-CCT-CGT----T-GAAAGTTC-A---TTTTTTC-ACCA-G--CAA-A---A-TTTC-CAATGT-TT--AC--GA-T-T--GT-T-CAATTT---C----ACAAG--------TTCAA-TAA-AA--G-C-AA--ATGTA-------AA-TG-GTA--AA-ATGA----A---A-CG-----G--TAC-T--A---------------A-TATAAA-ATTACCTG--AA---TCTT-TA----TT---TAC-TAACAGGGGA---AAAAAACATAATT----AA--TTATTTC-ATAATGTTCC-TTAGCG-AG-GAGAGCAC--CCAATAGTAC-CGTCCCCATCCTTGTAACAT-CAGAGATGA--A-ATAT---GAAGAAA-TGT----A-TCGTTAATCA-C-A-TAATCTTT-ACA-AA--CAT-A-AA-GAGT-AATAGGCAA-A-TAAATAACAGGCATA--C--TAACTT-TTAAT-AAATCTATG--ACTAACAATC-A-AT-CA-ATGT---GACCCAAAATGTT-CAGAAAAA-AGAAG--TGG-AG--CAT-TTT----ATAAA-CTAA--T-CAGC---CC---GAA-T-TTC-CT-CC-TGACAGCTTTTCT-----C-GCAACAATTC-AT---TTTCT--------AATTT-TG-TCCTTTCAATTCACTAATAAACACAACAAAAAAAAACAA-AAAAAAAAAAC-CAAAAAAGAAGA--AAAAGA-TTAAACTATGGAAAATGAA-CAA-TGGT-----AC-A-ATATTAATCAT-G-AACTA-----TAAAGCC---TTCGCTAT-GTAAAGCA-TCCAACTCTTTCAT--TATG-T----A-ACA---GA-----AGAGGA--AAAGGGT-TAACCTGTTTCATACTAACTCTCCTCGTCC--ATCG---A---CTCACAAT-GAAATATCGAT--------------GAATGA----A--AATTG-TTAAT---CAAC-A------AT----ATGTGAAAA---TCGGTTATCACA-TATTT-TAAC-A-A-CA-T-A--CA-GAAG-TA--ATGTGATAATAA-AAAAA--AGC--A-----------TACTATCTTACATAAAAA--TATAACAAAA-ATT---ATTCCAATGAGCTACGC-AATACTC--TCAAAAAATTGAAA-T-GT---------GGAGC-TA-TT------A--GAAA---ATGATCA-GC-TGCAAAAAATTCCAA-TGAAG--TGTTCGA-ACAAAACCAT-----AAT---CTG-TAA------TGA-CA---ATT---TT-TT--CA--CCGATAAATTCCAC---T-CC-ACCGCAATG-CATGAGAAATTGGCAA-A--CGATAC-AAGAAC-AT-A--AATT--TATCTT
gi|7 : agtacGAGTGTGAGATCGA-GATGCAAA---AGTA-ATGGGAAACA--ACCATG--TTTGGTATCAA-TGGATACACAT--ATGTATG--GAC-AACTGGCTGTGATCAT-GA-AATAAAAAAAAA--GAGTGTAGACCGTAT-GCCCT-CA-GTGGGCTGTCAA-CTCAAGGG-ACGGATAAC---GTGTATCT--T-T-TTTTTACAAAT-ATAGTC-AT--ATACTA---ATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CAATGT-AAAAT-ATAAAA-TACT---TGAT-TTTT--ATTA--A-----------AA--T--GTA---AACATCT--GTC-TAAA-AG-TTT-AA-AACC-A-AT-AAAAAGAAA--TTGTATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCG---CCA-CC-AAATG-AC-TT--CATTTT---T--TC-----AA-TGCA-----AAA---TTC-CGATAAAA---TTGTG-AA-TT-TAA--AAC---A-A----ACTTG-TAA-AAG-C-ACAG-TCA-GA-G-TAAG-GAAA----CT-G---AAAAAGAA---CA--A---CCTTATTGT-CA--TTAAA-AT-ATT--AAA-AC--A-TTCACA-TCA-AT-GTGT---CCAA-A-TTT-T-A--GAAA----A--------AGAG-AG-TCTGG-----AG--CCAT------TTCTT--GAAGACT-A-CTCAG-----C-----------CACC-G-A--AATT-CAC-T-C------T-GA----CCCG---TTTTTTT-TTCC-A--CAA-AGAAA-TTCC-AA-TGT-TTCTA----G-T-TT-GTCT-CAATCT---CTCCAA---A--------TTCAA-ATA-AAAAG-C-AA-----TATGGAAACAA-TG-A-A--AA-GT-A----AC--A-TG-----GAATCT-T--ATA-T----TTC-ATGAATATATGGATTACCTG--GAAGTT-TT-TA----TTGTATAACTAACAGGGGAGTAAAAAA---TA-TCC---AA--T-ATTTC-ATAATGT--CCTTA-CA-ATAC----CACAACAAT-ATA-C-CGTCC--ATT------ACCT-CAGA-ATGATAA-GTAT---GA-GAGAATGTGC-CACTTGTTA-TCA-C-ACTA---TTTTACA-AA--CATTA-TA-GAGTTAATGA--AG-A-TAAA-AAA--GCATA--C--AG-CTTCTTA-A-AAACT-ATA--AC-AACAATCCA-AT-CA-ATGT---GACA--GTAT-AT-----AAAC-AGA-G--TGG-AG--CCA-TTTTT--A-AAA-C-AA--TACGAC---CC---GAACT-TTC-CT--T-GAACAGCTTTTTC-----TAGC-AAATTTT-TT--GCTTCT--------AAAAT-TGTTC--TTCAAT-CAC-AAT-AAC-CAAAAAAAAAAAAAAACCCCTCAAAA--------A--AAG---AAAAGA-TTAAA-TTGG-AAAAT-AA-C-A-T-GT-----AC-A-ATATT--TCATGG-AACTA-----G-ATGCC---TT--TC-T-GTActatattgat
gi|10 : ggtagtacGAGTGTGAGATCAA--------A---GGTA-ATGGGAAACA--A--ATGATTT-GGTATCAA-TGGATACACAT--ATGTATG--GAC--AATA-CT-TGGTCAT-GA-AATAAAAACAA---GAGTATAG-CCGTTTGCCCCC-TA-GTGG-CTGTCAAAC-TAAGGG-AGG--TAACTCTGTGTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCCAT--ATACTA---ATTTAAA------ATAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTATAAAA-TA-T---TGA--TTTT-TATTA--A-----------AT--AT-GTAAC-A---TCT--GTTCTAAA-A--TTT-A--AAAC-A-ATGAAAAA--AA--TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TACT-CACA--GCGC--C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT---T--TC-----AACTGC------AAA---ATT-CG-TAAA----TTGTG-AA-TC-TAA--T-C---A-A----A-TTG--TA-AAG-C-ACAG-ACA-TG-G-T-AATGGAAAC--T--G---AAAAA--
gi|4 : aaggtagtacGTGAGATC-----C---AA---AGT---TGGAAA-TA--A--A-GATATTTGTATCAA-TG-AT-CACCT--ATGTATG--A---CAATG-CT-TG-TCATTGA-AATAAAAAAAA---GA-TGTAGTCCGTTT---CTC-TA-ATGG-CTGTCAAA--TAAGG--AGG--TAA-TCTG-GTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-AT---CCAT--AT--CA---ATTTAA-------TAAA----TACAG--TCAAG---AT----CA---T-TAAATTATAAAA-TA-TG--TGAT-TTTT--AT-A--A-----------AT--AT-GTA---A---CTT--GTTCTAAA-A--ATT-AA--AAC-A-AT-AAAAA--AAA-TT--ATA-----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCG---C-A-CC-TA-T--ATGAT--CATTTT---A--TC-----A--TGCA-----AA------T-CG-TATA----ATGTG-AA-TT-TAA--T-C---ATA----A-TTG------AA-C-ACAG--CA-GA-G-TAA-TGGAAAC--T--G---AAAAA--A---CA--A---C-TCATTTT-CA--T-AAA-AT-ATA--ATA-AC--A-TTCA-A-TCA-AT-GTGT---CCAA-A-ATT-T-A--GAAA----A--------A-GT-AG-T---G-----AG--C-AT------TT---------GAT-A--TCAA-----C-----------C------A--CATT-C------------T-GA----CC-AG--TTTTTTT-TTCACG--CAA-A-----TTTC-CA-T----T-TAT--GA-T-T--GTCT-CAATTT---C----A---A--------TTCAA-TAA-AA--G-C-AA--AT--A-------AA-TG---A--AA-ATGA----CT-----------G--TAC-T---TA-TCGAATTA-ATTACC-TATA-ATT--------------TT-TA----TT---TA--TAA---GAAA---AAAAA---TA-------GA--T-ATTTCCATATTAC--C-T-A-CATAT-C----CAC---AATTA-----CGTCC--ATT------GA-T-CAGA-A-GA--A-AT-----GGAGAAA-TGTG--CA-TCGTTA-----C-A-CA---TTT--CA-AA--CAT-A-TA-GATT-AATGG--AA-A-TAAA-AAAGAAT--------CA-CCT-TTA-T-AAA---ATATAAC-A-CAATT-A-AT-CATATGT---GAC---AAAT-TT-CAGAAAAA--GA-G--TGA-----CCA-TTT----A-AA--T-AA-----AAC---CC---G------TT-CT-CT-GAA--GTTCTTTT-----CAGCAAA-TTTC--T--GTTTCT--------AAATT-TG-TC--TTCAAT-CAC-AA------------------------AATAA-----------------A--AAAAAA-TT-AA-TGG--AAAATGAA-C-A-T-GTA----TA-A-ATA-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGC-----T--TCAT-GTAA--C--T-CAA--C-TTAAT--T-TG-T----A-ACA---GA-----A----A--AAAAGGT---A--TG--TCATAC----TCTCCTCGTCC--TTG----A---CTCACAATG--AATAT--G---------------AAATGA----A--AATTG--T-AT---CA-C-A------AT-----TG----AA---TC-GT--TCACAGTA-TT-T-A--A-A-CA-T-A--CA-G-AG-TA--AGG-GA-AATAAGAGAAA--AC---A-----------TACT----TTCAT--AAA--TATAACAAAATATT----C----A-GTGT----C-AC-A-T---TCAGAA-----AAGTT-GT---------GCAGC-TC-TT------A---AATAAAAT--TCA--T-T-C-AAAA--TGCAA-TGAA---TG-TCG--ACAAA--CATG----TAA---CTG-TTA------T---AC---AAT---TT-TT--TC--AC-AT-A--TTCAC---T-CG---CGTAATG-CAT-A-AAATT-GC-A-A--AAGTACATAGAACAAAAA--AATT--C-TCT---A-TAT---ATGG-TCAAGT-A--AA-C----ACACTG-TCA--AT---CT----AGA--C-AAAATAT------CC---AAT-A-GCT-TGC-AGA---CTGCCATAA-GTT----CGA-TGC-TTTCATT--------------------TGGT-ACAG-T-TTCT----CCTTTGTCCTATATACTGT-TAT-TTCTATTG----CTTT---GATGAATTGAAGT-CTTT--GCAGTATGTAT-CT--GGTTGTACATGTA-TTTTCT-T----G-GTT-TGG-ATGTAATT-GAGACTTTGGCA-TTATGCAC----GTTG-AAGT-GTTTT-CTCCA
gi|2 : gA-AATAAAAAA-----GAGTGTAG-CC-TGTTGCCTCCTA-CCTG-CTGTCAAAC-TAAGGGAGT-----ACTCTGTGTATTTCTT-T-TTCTTTAAATT-AT-GTCCACTAATAGCA---ATT-AAA------TAAA----TA-A---TCAAGG--AATA--CA---T-AAAATTATAAAAATA-G---TGAT-TTTG-TATTATCA-----------CT--ATTGTA---AACATCT--GTTCTAAA-A--TTT-AA--AAC-A-AT-AAAAA--AA--AT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------AA-CTTGCTACTTCGCA--GCG---C-AGCT-TA-TG-ATGTC--CAATTC---T--TC-----AACTGCA-----GAA----TT-CG-TAAA----TTCTG-AAATT-TAA--T-CCACA-A----A-T-G-TGA-AAGTC-ACAG-ACA-GA-GGTATAGGAAA----CTTG---AAAAA--A----A--A---C-T-ATTTT-AA--T-AAA-AT-ATATAATA-AG--A-TTCA-A-TCACAT-GTGC---CCAA-A-TTT-T-ATGAAAA----A--------A-AG-AG-T---GG----AA--CAAT------TT--T--TGAAAAT----TCAG-----C-----------CC---G-A---ATTAC-C-TGC------T-GA----C--A---TTTTTTT-T-CA-G--CAA-A---A-TTTC-CA--GTCTT-TAC--GA-T-TT-GTCT-CAAATT---TCA--A---A--------TTCAAATAATAACGG-C-AA--AT-TA-------AAATGCG-ATGAA-ATGA----AC--A-TG-----G--TA--T--ATA-T----TTCCATGACTATATA--TA-CCTG--AAAT-T-TTGTA----TT---TC--TAACAGGGAT---AAAAC---C------------T-ATTTC-ATAATGT--CCTTA-CA-AT-GG---CAC--CAAGTATACCGCGTC---ATTG-----AC-T-CAGA-ATGA--AGATAT---GAG--AAATGTGG-CA-TCGTTA-C--AC-A-TA---TTT--TACAA--CAC-A-TA-GAGT-AATCG--A----TAAA-AAA--GCATAACC--TA-CTT-TTA-T-AAG---ATATAAC-AACAATT-A-AT-CATGTG----GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA--GT-G--TGGTAG--CCA-TTTT---A-GAA-T-AA--T-CAGCGGCCC---GAA-T-TTC-CT-CT-GAACAGCTTTTCT------AGCAAA----T-AT--TTTTCTGTTCAAAAAAAATATG-TC--TTCAAT-CAC--ATAACC-CCCCCAACAAAAAAGC-AACCCAAAA--------A--AAGA--AAAAGAGTTAAA-TGG---AAATGAA-C-A---GT-----AC-AGATATT--TCAT-G-AACTA-----T-ATGTT---TT--TCAT-GTA-------CCAA--CTTTCAT--T-TG-T----A-ACAT--GA-----A----AAGAAAAGGT-AAA--TGTTTCAAAC----TCTCCTGT-CC--ATC----GGATCTCA-AATGAAACGCT--AT--------------GACTGACTGAA--AATTGTTT-AT---C--T-AACAGACAT----GTG----AAT--TC-GT--TCACA-TATTT-T-AC-A-A-CA-TAA--CATG-AG-TA--ATG-CA-AAATA-AAAAA--AAA--AAAGCAGACTGGTACTATTTTCCAC-TAAA--TATGACAAAA-ATT---ATTC--ATATGTC---CAAA-A-TCGTCCAGAAA---ATAGTA-TTGAGG--------CC-CA-TTATG---A--AAAT---AG--TCA-GC-T-C-AAGAATGCCAA-TGAAA--TG-TCG--ACAAAACCATG----AAC---CTG--TA------TGA-GC---AATGAATT-TT--CC--CA-ATAA--TTCCC---T-CG-ACCGTAATG-CATAA-AAATT-GCAA-A--GTGTAC-AAGAACGATCAACAATTGGG-TGTT--A-TAT--TATGG-CCAAGT-AAATA-C----ACACT--TCA--CTG--CT----A-GACC-AAAATAT------CCA--AAT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAA-----ATGTAACTGCTTTTCACT-TCT-TTGTTAT---GGTTGTGGTAGCAT-T-TTTCTT-CCCTCTGT-CTAATTACTAT-TATCTTCTCTTGTTCTTTTTT-GAATGGATTGGAAT-TCTT-GGCAGTA-G-GCACTACGTTTGAAAGTG-GTTTTTCT-
gi|11 : cTATTT--TGTGTTCTCAATAGTTGTAAT---T--ACAATG---ATTTAAAAGTATCTAAAATTTTA-AGAGTAAAAACAATGA--CA---T-AAAATTATATAA-TA-TAGTTGATATTTTATATTA--ATTATTGTTGACATCAA--GTA---A---TGTATGCTACAAA-AGTTTC-AAGAAACTA-AT-AAAAA--AAAATTG-ATAAGGAGCGTAAAATT--CTATTAACGCG--CTT--TACT-CGCGATGCGC--C-A-CCTTA-TGTATGTCTTCAATTTAAATAATCGAGCTACCGACACTCTTAAGTATATT-CG-TGAAAATTTTGTGTGA-TT-TAAATT-C---A-ACACTA-CTGATTATGAG-CAACAGTACA-GA-G-TAATAGGAAAATCT--GTGTAAAAA--AGAGCA--A---C-TTTATTTTCAATT-AAA-AT-ATccactgattgttgaaat
gi|6 : tcttttcttaaaaatt-C-ACAT-ATA-GACG-TTAATG--A----T--A---AAAAA--AGG-CATTA---C-TACTCTTTTA--T-CAA--T-ATA--ACACAG--A-A-TA-A-TCA-AT-GT-----ACAACA-TTT-C-A--GAAA----A--------AGAG-AGGT---GG----AG--CCATCGGCATTT--T--GAAA--T-A-CTAGG-----C-----------CC---G-A--AATT-C-C-T--------T-GA-------A---GTTTTTT-T--A-G--CAA-A---T-TTTC-CA-T----T-TAT--GA-T-TTTGT-T-CAATTT---C----A---AAACCAAATTTCAA-TAA-A-----C-AA--AT-TA-------AA-TG-G-A--AA-ATGACATGATTGA-TG-----G--TAC-T--ATACT----TTC-ATGACTATATA------TTG--AA---T-TT-TT----TT---AA--TAACAGG--A---AAAAA----A-TT----AA--T-ATTTC-ATATGGT--CCTTA-AA-AT-T----TGC--CA--TATA---CGTCT--ATT------AC-T--AGA-ATAA--A-ATAT---GAG--AAATGTG--CA-TCGTTA-C--AC-A-TA---TTT--TA-CA--AAT-A-T--AAG---ATGA--AATG-TCAA-ATAAAGC-TA--C--TA-CTT-TTA-T-AAT---TTA---C-AACAATT-A-ATTCAT---T---G-CC--A--T-TT-CAGAAAAA-AGA-G--TGG-AG--CCATTTT----A-AAA-CTAATGT-CAGC---CC---GAA-T-TT--CT-CT-GAACAGCTTTTCT-----C-TCACAATTTC-AT--G-TTCT---------AAAT-TG-TC--TTCAA--T-C-AGTAA---CAAAAAAAAAAAAAAA-AAAAAGAAAA---AACCA--AAGAGCAAAAAA-TTAAA-TGG--AAAATGAACC-A-TGGT-----AC---ATA-T--TCAT-ATGACTATGATTT-ATGCCCCTTT--CCAT-GT-A--C--T-CAA--CTTTCACA-A-TG-TG---ATACA---AA-----G----G--AAAAGGT-TAA--TGTTTCAT----A-TCTCCTCG-TCATATCG---A---CT-AC-ATGAAAATATG-AT--------------AAATGA----A--AATTG-GT-AT---CAACAA------AT----GTG----AAAGGTC-GTTATCAAA--ATTT-T--C-A-A-C--T-A--CA-G-AG-TAACATG-GA-AA-TA-AGGAA--GCAGCA-----------TAC-ATT-TTCAT--AAA--TAT-AC--AA-ATT---ATTC--ATGTGT----C-AA-A-TC--TCAGAAA---AAGATT-GT--------GCACGCATA-TG------A--AAAT---AT--TCAGGC-T-C-------TGCAA-TGAAG--TT-GCGAACGAAAACCATG----AAC---CTG----------TAT-ACA--ATT---AT-TTGGTTAACC-ATAT--GTCAC---T-CGAACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-GACAAG-ACAA------GTCA--AATTG-G-TCTTATATTAT--GATGGTCCAAGTAAACAA-CCTTAAC-CTGCTCATGCTG--CTGGGAG-A--C--AAATAT------CTG--GATGA-CCTCTGTAAGA---CT
gi|12 : ttacacatattttaAA----T--A---AAAAA--A---TA--AAAGC-ATACACTTTA----AAA-ATGACA--ATA-A---A---CA-A-TCA-AT-GTCTGGACCAA-A-TTT-TCA--GCAA----A--------ATAG-A------------AGTTCCAT------TT------AAAAAT-A-ATCAC-----C-----------CAGTGG-A--TATC-C-C-TAC------TAGA----AC-AGC-TTTTTTTCTTCA-C--CAA-A------TTT-CA-TTT-GT-TACTAAA-T-TT--TC------TT---C----A---A--------TCCGA-CAA-AAAAA---AA--A---A-------AA-TA-A-A--AA-Atag
gi|24 : ttacacaccataacat---CA--A---C-TTATTTCT-A--T-AAA-TT-ATA--ATA-AC--ATT-CA-A-TCA-AT-GTGT---Cgggaaaaaggataataaagataaatgaaaatgaactggggtacaatataacagacacataccttcatcgtacctttcaaactttcatccttgttaatcaacaaaggaaaaaaaggtaatgtctcatactctcgttgctcgtccacatcgac
gi|14 : --T-AAA-AT-ATGT-GTA-ACCGA-T-AT-A-TCA--T-GTGA---CCAA-A-TTT-C-A--GAAAGAAAAAAGGAAAAA-AG-AG-T---GGCAACAA--CCAT------TT--TTGGACAAATCATCTCAGACTCTC-----------C----GAA--AATT-CTC-T-CTGGTCTT-GA----CC-AGGGTTTTTAT-ATCA-GAACAACA---ACTTTCGCA-TGT-TT-TAT--GAGTGTT-GTCTGCAAATTATGC----AC--A--------TTCAA-TAA-AAGAG-CAAA--AT-TA-------AA-TG-G-A--AATATGA----AC--ATTGATGATG--TACAC--ATA-T----TTC-ATGACTATA-A-ATTACCTGAAAA---T-TT-TA----TTA--TA--TAA
gi|7 : ----A---A--------TTTAAATAA-ATAAGTC-AAGGAT-GAC------AA-TG-T-A--AA-AT------AT--A-AA-----A--TAC-TTGAT--T----TTT-ATTAAAATGTA-AACATCTG---------TC-TAAAAGTT---TA--AAACCAATAA---AAAGA---AA-TTGTATAACGT-ATTCT-ATACTTTA-C-TCG-CA-GCGC----CAC--CAA--ATGAC---TTC--ATT------TT-TTCA---ATGC--A-AAATTCCGATAAAATTGTGA--A-T--TTA--AAAC-A-AA---CTT-GTA-AAAGCAC-AGTCAGAGT-AA-GG--AA-ACTGAA-AAAGAACA-A--CCTTA-TTG-TCA-TTAAA---ATATTAA-AACATTC-ACAT-CA-ATGT---GTCC--AAAT-TT-TAGAAAAAGAGA-GTCTGG-AG--CCA-TTTCTTGA-AGA-CTAC--T-CAGCCA-CC---GAA-A-TTCACT-CT-GACCCGTTTTTTTTTCCACAAAGAAATTCCAAT--GTTTCT---------AGTT-TG-TC---TCAAT-CTC---T---C-C---------AAATTC-AAATAAAAA--GCAAT----ATGG--AAACAA-T--------GAAAAGT-AA-C-A-TGGAA----TCTT-ATATT--TCAT-G-AA-TA-----T-ATGGA---TT--ACCT-GGAA--G--T-------TTTTAT--TGTA-TAACTA-ACA---GGGGAGTA----A--AAAATATCCAA--TATTTCA---TAA-TGTCCTTA-CA--AT-----A---C-CACAAC---AATAT--ACCGTCCATTACCTCAGAATG-----AT-AAGTA-TG-AG---A--G-A------AT----GTGCC--AC---TT-GTTATCACACTATTT-T-ACAA-A-CATT-A--TA-G-AGTTA--ATG-AA-GA-TA-AAAAA--GC---A-----------TAC-AGC-TTCTT-AAAAACTATAACAACA-AT
gi|21 : ggtagtacgagtgtgagatcgagatgcaaaagtaatgggaaacaaccatgtttggtatcaatggatacacatatgtatggacaactggctgtgatcatgaaataaaaaaaaagagtgtagaccgtatgccctcagtgggctgtcaactcaagggacggataacgtgtatcttttttttacaaatatagtcatatactA-TCGTAA--CAACTA-TT---TTT-ATA-CA--CAT-A-CA-GAGT-AATGG--AA-A-T-AA-GAAAAGCA-A--C--TA---T-TCA-T-AAA---ATA--Accaatcaatgtgacagtatataaacagagtggagccatttttaaaacaatacgacccgaactttccttgaacagctttttctagcaaattttttgcttctaaaattgttcttcaatcacaataaccaaaaaaaaaaaaaaacccctcaaaaaaagaaaagattaaattggaaaataacatgtacaatatttcatggaactagatgcctttctgta
gi|12 : aatatgatgaatgagaaattggtacaaacaaatactagaaaT-AAT----AA-A-AAAA-TAAAAGCATA--C---A-CTT-T-A---AAA---ATG--AC-AATAAAC-A-AT-CA-ATGTCTGGACC--AAAT-TTTCAGCAAAATAGA--------AGTTCCA-TTT----A-AAAAT-AA--T-CA-C---CCAGTGGA-TATCC-CTACTAGAACAGCTTTTTTTCTT-CACCAAA-TTTC-ATTTGTTACT--------AAA-T-TT-TC--TTCAA--TCC-GACAAAA-AAAAAAAAATAAAAAA-GGG-AAAAAGGATAA-TA--AAGA----------TAAA-TG---AAAATGAA-CTG-GGGT-----AC-A-ATATA--ACA--G-A--CA-----C-ATACC----T--TCATCGTAC--CTTTCAAA--CTTTCATCCT-TGTTAATCA-ACAAAGGA-----A----A--AAAAGG--TAA--TGTCTCATAC----TCTCGTTG-C----TC----G---TCCACAttata
gi|14 : ttacacaccataacaCAATAA--AAGA--GCAAAA-TTAAA-T-GGAAATATGAA-C-ATTGATGATGTAC-ACATATT--TCAT-G--ACTA-----T-Atcgac
gi|23 : taaaatatgtgtaaccgatatatcatgtgaccaaatttcagaaagaaaaaaggaaaaaagagtggcaacaaccatttttggacaaatcatctcagactctccgaaaattctctctggtcttgaccagggtttttatatcagaacaacaactttcgcatgttttatgagtgttgtctgcaaattatgcacattTTTCAT--T-TG-T----A-GCAG--GA-----A----A--AAAAGGT-TAA--TGTTCCATAC----TCTCCTCGTCC--ATCGACAG---CTCACaattacctgaaaattttattatataa
gi|21 : AATATG-AT--------------GAATG-----AGAAATTG-GT-ACAAAC--A-A------ATACTAGAA----AA---TC-GTAACAAC--TATTT-TTAT-ACA-CA-T-A--CA-G-AG-TA--ATG-GA-AATAA-GAAAA--GCA---------------ACTA---TTCAT-AAAA--TA
gi|7 : T----GTG----AA---T---TTAAAACA-AACTTGT-AA-A-AGCA-C-AGTCA-G-AG-TA--A-G-GA-AACTG-AAAAAGAACA--A-----------CCTTATTGT-CATTAAAA--TATTA-AAAC-ATTCACATCA--ATGTGTC---C-AA-A-TT--TTAGAAA---AA--------GAGAGTCTGGAGC-CA-TTTCTTGAA--GACT---AC--TCA-GC-CAC-CGAAATTCattata
gi|16 : ggtagtacgagtgtgagatcgagatgcaaaagtaatgggaaacaaccatgtttggtatcaatggatacacatatgtatggacaactggctgtgatcatgaaataaaaaaaaagagtgtagaccgtatgccctcagtgggctgtcaactcaagggacggataacgtgtatcttttttttacaaatatagtcatatactaatttaaataaataagtcaaggatgacaatgtaaaatataaaatacttgatttttattaaaatgtaaacatctgtctaaaagtttaaaaccaataaaaagaaattgtataacgtattctatactttactcgcagcgccaccaaatgacttcattttttcaatgcaaaattccgataaaatGTC---C-AA-A-TC--TCAGAAA-----AGTTTGTGC---------AGC-CAATT------ACGAAAA---AA--TC--GC-C----AAAATGCCAAATGAAAGTTG-TCG--ACCAAACCATAC---GAA---C----AG------TGATAC---ACC---ATATT--TT--CC-ATAA--TCCACGAAT-CG-ACCGTAA---CA-GA-AAAAT-GCGACA--AAGTAC-AAGAAC-ATCA--AA-A--T-TCTTA-C-TAC------G-TCA-GT-AACAACC----ACACTG--CA--CTGA-CTAG--A-A--CGAAAATAT------CCAATAAT-ACGC---GTAAGAAC-CTGCCAAGATG----------------TCAC-------TGCTATCAACGTTGAGGT-ACAT-TGTTTTTC-CCCactctgacccgtttttttttccacaaagaaattccaatgtttctagtttgtctcaatctctccaaattcaaataaaaagcaatatggaaacaatgaaaagtaacatggaatcttatatttcatgaatatatggattacctggaagtttttattgtataactaacaggggagtaaaaaatatccaatatttcataatgtccttacaataccacaacaatataccgtccattacctcagaatgataagtatgagagaatgtgccacttgttatcacactattttacaaacattatagagttaatgaagataaaaaagcatacagcttcttaaaaactataacaacaatccaatcaatgtgacagtatataaacagagtggagccatttttaaaacaatacgacccgaactttccttgaacagctttttctagcaaattttttgcttctaaaattgttcttcaatcacaataaccaaaaaaaaaaaaaaacccctcaaaaaaagaaaagattaaattggaaaataacatgtacaatatttcatggaactagatgcctttctgta
gi|5 : AAT---AT--TCA-GCGT-C-AAAC-TTCCAA-TGAAG--TG-TCG--ACAAAACCAT-----------CTG-AAAGCCTGTTGA-CCGAGATT---TTATG--TC--CC-ATAAT-TCCAC---TCCG-ACCGTAATGCCATGA-AAAT-----A-A--AAGTAC-AAGAAC-ATCA--AAAT--T-TCTT--A-TATTCCATGC-CAATGT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTGGCCT----AGA--C-AAACTATTATCCGCCA--TAT-C-ACT-TGT-AGACACCTG-CATAAT-TTCATGCAC-TGCGTTTCACTCTCTATTGTAAT-AGG-TTGTGGT-ACATCT-TTCGTCTCCCTC-GTCCTAATTACTGTATAT-TTCT-TTGTGGTCTTTTGGGATGAA--TGGATGCTTTGGGAAGTATG---ACT---GTTG-A-AGGTGGTTTTCTCC----A-CTGATGG-GTG-AA
gi|15 : aG--TG-TCG--TCAAA--TATGTGTTAACTTTCTGCAGA------TCA-AC---ATT---TT-TT--TT--TC-ATA----CCAC---atctgcagtattatgtgatcttctggcgagaagtacaatagaattgtttaaattaggcattggcaaagtaaatggtatgatggggaaaagaaacttttatctccgcgtacgcccaaaagcaatgtatatatgatggtattctgctgccgttggaaataaaaaacaatatctggaagaaacagaatagttgccgcatgtgactgagggcgttagagaggttgcacgaattgtatgagcaatattattctgcttcgggaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacatttttaactgaacatcaaaacaggttatctaatactgtactcataaaaaacactgtaatgagacaccttcattatccagcaaatggctctcaacaaattgtaccgacttatagggatgtatataaacaaaataaaaatacctttaaaatggcagggagactgtatgtttgaattgtggttgcatgcatgaactgaagagggagaccacacttctggcagactagtaatatttcggataacacaacaaattccacaactctccaaccctctgtccatccaaagccttcgcatgtagctggtacaatctcctcatggtccacaacttcaaaactggaagtaacacacccttcatttatgggttaattattttaaatgtaatttgtgtacatgtatatttgtaaaaaaaattgcatgcagttagctcaagttttcttaatttactgatactgatatcatgactggtcatcttttatcatacctgaatgtacatgtacaattaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|5 : gatactgatattatatctggtaatcttttttcatacctgtatgtacattgtacaattatcggtaatgaatttatataaaaaattctaacactactaaaagtttcttgccatttgaccccaagtatactgatatgacctcgaatgtgatcctgactcccactatgaattgactttggattttcttgacattctatggaagtttattatcaataaatgagaagaaattTAC-TGTATATTTCT-TTGTGGTCTTTTGGGATG-AAT-GGATGCTTTGGGAAGTATG-ACT--G-TTGAAGGTGGTTTT-CTCCACTGATGGGTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCT-GGCGAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGG-----CATTGGCAAAGTAA-------ATGGTAT-----GATGGGG------AAAAGAAACTTTTATCTCCGCGTACGCCCAAAAGCAATGTATA-TATGATGGTATTCTGCTGCC-GTTGGAAATAAAAAACAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCGC-ATGTG--ACTG-AGGGCGT--TAGAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTAT-TCTGCTTCGGGAACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATTTTTAAC--TGAACA---TCAAAAC-AGGTTATCTAA--TACTGT-ACTC-ATAAAAAAC--ACTGT-AATGAGA---CAC---CTTCATT-ATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTA-C-CGACTTATAGGGA-TGTATATAAACAAAA-TAAAAATA-CCTTTAAAATGGCAGGGA-GACTGTATGTTTGAATTGTGGTT-GCATGCATGAACTGAAGAGGG-AGACCA-CACTTCTGGCAGACTAGTAATATTTCGGATAACA--CAACAAATT-CCACAA-CTCTCCAACC-CTCTGTCCATCCAAA-GCCTT-CGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTAAC-ACAC--------CCTTCATTTATGGGTTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAA--AAAAATTGCAT-GCAGTT-AGCTCA--AGTTTTCTTAATTTACTGATACTGATATCATGACTGGTCATCTTTTATC-ATA-CCTGAATGTACAT-GTACAATTACCAGa
gi|2 : aaatattcagcgtcaaacttccaatgaagtgtcgacaaaaccatctgaaagcctgttgaccgagattttatgtcccataattccactccgaccgtaatgccatgaaaataaaagtacaagaacatcaaaatttcttatattccatgccaatgtaacaacacactgtcactggcctagacaaactattatccgccatatcacttgtagacacctgcataatttcatgcactgcgtttcactctctattgtaataggttgtggtacatctttcgtctccctcgtcctaatTTGTTCT-T-------TTTTGA-ATG-GATTGGAATTCTTGGCA-GTAGGCACTACGTTTGAAAGTGGTTTTTCTCCACTGATTGTTGAAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|25 : caaataaaaaagagtgtagcctgttgcctcctacctgctgtcaaactaagggagtactctgtgtatttctttttctttaaattatgtccactaatagcaattaaataaataatcaaggaatacataaaattataaaaatagtgattttgtattatcactattgtaaacatctgttctaaaatttaaaacaataaaaaaaatataacgtattctataacttgctacttcgcagcgcagcttatgatgtccaattcttcaactgcagaattcgtaaattctgaaatttaatccacaaatgtgaaagtcacagacagaggtataggaaacttgaaaaaaaactattttaataaaatatataataagattcaatcacatgtgcccaaattttatgaaaaaaagagtggaacaatttttgaaaattcagcccgaattacctgctgacattttttttcagcaaaatttccagtctttacgatttgtctcaaatttcaaattcaaataataacggcaaattaaaatgcgatgaaatgaacatggtatatatttccatgactatatatacctgaaattttgtatttctaacagggataaaacctatttcataatgtccttacaatggcaccaagtataccgcgtcattgactcagaatgaagatatgagaaatgtggcatcgttacacatattttacaacacatagagtaatcgataaaaaagcataacctacttttataagatataacaacaattaatcatgtggaccaaatttcagaaaaagtgtggtagccattttagaataatcagcggcccgaatttcctctgaacagcttttctagcaaatatttttctgttcaaaaaaaatatgtcttcaatcacataacccccccaacaaaaaagcaacccaaaaaaagaaaaagagttaaatggaaatgaacagtacagatatttcatgaactatatgtttttcatgtaccaactttcatttgtaacatgaaaagaaaaggtaaatgtttcaaactctcctgtccatcggatctcaaatgaaacgctatgactgactgaaaattgtttatctaacagacatgtgaattcgttcacatattttacaacataacatgagtaatgcaaaataaaaaaaaaaaagcagactggtactattttccactaaatatgacaaaaattattcatatgtccaaaatcgtccagaaaatagtattgaggcccattatgaaaatagtcagctcaagaatgccaatgaaatgtcgacaaaaccatgaacctgtatgagcaatgaattttcccaataattccctcgaccgtaatgcataaaaattgcaaagtgtacaagaacgatcaacaattgggtgttatattatggccaagtaaatacacacttcactgctagaccaaaatatccaaatagcttgtaagactgccataaatgtaactgcttttcacttctttgttatggttgtggtagcatttttcttccctctgtctaattactattatcttctcTGGTAAACT-AGATAAG-ATGGTATAAC
gi|25 : TGGTA-AACTAGATAAGATGGTAT-AACAA-ATTTTTTACTCC-Caaattttttactccc
gi|22 : CCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTTCC-ACACCCATCTGACCTTCATCTATGGA-TAAAT
gi|15 : -TACTGATATTATATCTGGTAATCTTTTTTCA-TACC-TGTATGTACATTGTACAATTATCGGT-AATGAATTTATATAA--AAAATTCTAACACTACtaattgaacaatcgatataat
gi|9 : gaCCATGGTTCATATGGTT-TGA-CCATGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGAtaaaagtttcttgccatttgaccccaagtatactgatatgacctcgaatgtgatcctgactcccactatgaattgactttggattttcttgacattctatggaagtttattatcaataaatgagaagaaattgtgtcgtcaaatatgtgttaactttctgcagatcaacatttttttttcataccaca
gi|9 : CATTCAGCTCCTAAAGACAT--TTCCTT-CCTATTCCTATGCTGGGAC-GAACATACAAGTGTATGAGTTGACCAAAAG-TGCCT-CCA-ATTTGG---ATAGGGGGGGGGGGG----ACAAGAATAGGCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTG-TTAC--AACTTGGCTTGACAATTAATTCACT-ATTATATCTTGCAAAAGCTTGCTCCAACATACATTACAG---TCAGTTTCCTTGCA--CT-CCGAGT-GCTTTTGTTTatatatctacacaattgattagtattatacatcaattcattcagctcctaaagacatttccttcctattcctatgctgggacgaacatacaagtgtatgagttgaccaaaagtgcctccaatttggataggggggggggggacaagaataggctcaacgaaggaaatttatctacctgtgtgttacaacttggcttgacaattaattcactattatatcttgcaaaagcttgctccaacatacattacagtcagtttccttgcactccgagtgcttttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta
gi|8 : ccatggttcatatggtttgaccatgcagtattgactgttttgtttgaatatatctacacaattgattagtattatacatcaattCCTGTGTGTTTATCAA-CTTGGC--AC-AATTAATTAACTAATTATATCTC-----A-CTTGCTCCAGC-TACA-TAC-GA--TCAG-TTCCTTGCAATCT-CCG-GCAGC---TG-TTACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta
gi|20 : ccTTATCAA-C-TTGC--AC--ATTAATTCACTAATTTAATCTC-CAAAA-CTTGCTCTAACATACATTACAGATTTC-GTTTCCTTACAATCTACCGAGCACCT-TTGTTTACACACACACATATATATATATATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggataacgaaagaagtctaaacaacctggatcaatcgtcaacacatcttgatggttggtaccactgattcctgtgttactataagaattctaacaacattttatcatgtgctacatacattactacttgtcggggatctattactactttatagggctattgtaattttgagtcttctgagacgctcgtatataatacctgccattattatcaaacgacttttcttaccaatttttgaatagatgtggtcgatattcacctctggtcc
gi|19 : CTTTCTATTTCACAACGGGGAATAACGGGAAATA--ACTCT-AATCGA--AA--GAAGA--GAC----------TTCAAC----AACATAA--TATTGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-ATGGTT
gi|8 : ttgtttaaataaaatgcaggggtttaatatctaTTTCT--TTCAACACGGTGGATAACGA--AAGA--AGTCT-AA------------A-C--AAC----------CTG--------------------GATCAATC-G-TCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTACC-A--CTGA-TTCCTGT-----GTTACTATAA--GAATTCTAACAAC-ATTTT-ATCATGTGC-TA-CATACATT-ACTAC-TTGT-CGGGGA-TCTAT--TACTACTTT---A-TAGGGC------TATTGT---AA--TTTTGAGTCTT-CTGAGA--CGCTCGTATATA-----ATA-CCT-GC-----CATT-----ATTATCAAACGA----CTTTT--C----TTACC---AA-TTTTTG-AA-TAG-ATGT-GGTCG----------ATATTCACCTCTGGTC
gi|18 : cccctgtgtgtttatcaacttggcacaattaattaactaattatatctcacttgctccagctacatacgatcagttccttgcaatctccggcagctgttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctactATAATGGGGAATAACGGGGAATA--ACTCT-AATCGA--AA--GAAGA--GAC----------TTCAAC----AACATAA--CATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATCTTTTTTTTTG-ATGGTTGATACC---ACTGAc
gi|13 : gtctactttcatttcacaatggggaGGGTAATAGAACTCTTAATCGTTAAAT-GAA-GTAGAC----------TTGATATATCAAC--AAACCATGGATCA-TC---TCAATTCACATC-------TTGAATGGTTGATATTTACACTGA-TTCCT-TAGATGGCTACTATTAAGAA-TTCTAACCAACATTTTTATCACGTGCTTACGATACATTTAC--CATTGTCCGGGGA--CT-TATTACTATCTTTAAGCTAGGGAATATGTTAAAGTTCCAT--TT--GAGTCTCACTG-GAGACGCT-----ATAAACCCATAACCTAGCTCCTGCGATATTAAATTATCAAATAAACACCTTTTTACTTTAGC-CCAATATATTTTTGAAACCAGAATTTGGGTCA--A-------ATAtt
gi|17 : gaaaataatactgt--ACTCT-AATCG---AAAAGAA-GA-GACTTTTTGAAGTCTGAAA----AAC--AA--TATGGATCAATC-GCTCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTAC--A-ACTGA-TTCCT-T-----GTTACTATAA--GAATTCCAACAAC-ATTTTTATCATTG-C-TA-CATACATTTAC-ACATTGT-CGGGG-ATCTA----------TT---ACTAGGGA------T-ATGT---AATTTT--GAGTCT--CTGAG-ACCGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT----------------------TTTT-------TTACC---AA-TTTTTG-AA-TAG-ATAT-GGTCGCTATGACACCACATCCACCTCTGGTC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111
lowQualScore : 444444444444 11 11 1 111 1 1 111 1 222222 1111 111 11111 11 333333333333333333333333 111 222 11 1111 111 222222222 222 111111 33333333333 1111 1 111111 1111111 111111 1 111 111 11 1 1111 333333333333 1111111 2222222222 111111 11111 1111 55555555555555555555555555555555555555555555 111111 111111 11111 11111 11 333333333333333333333 11 11111111111 111 22222222222222222222 11 11 111 1111111 111 3333333333 222222 1111111 222222222 22 11 333 111 11111 11 11 111 1111 11 1111 111 111111 1 22222222 222222222222222 111 333333 111111 22 1111 1111111 1111 22222222 1111 22222 222 1111111 44444 1111 11 111111 22222 11 3333333333333 11111111111 111 1 1 333333 222222 1 11 11 111 1 1111111 222222222 222 1111 1 2222222 111111111111 1111111 11 111 1 1111 2222222222 1111 111 333 22222 222 4444444444444 1 4444444444444444 1 1 2 3333333 11 11 222 111 333333333 222222 1 1 2 1 11 55555 5555555 11 1 1 222 1 2 1 11 2 1 1 1 1 11 2 22 2 22 2222 1 1 1 22222 88888888888888888888888888 22 333 2 1 22 2 2 22 2 444444444 2 22222 2222 2 1 2 2 1 2 11 222 22 2 2 1 22 2 2 2 2 2 1 1 111 1 222 2222 22 2 2 22 11 2 1 11 1 1 1 22 2 1 2 2 2 2 333 4444 11 1 1 33333 1 11 1 111 1 1 1 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 11 1 11 333333333333333 11 22 2222222 11 22222 2222222 1 11 1 1 1 1 1 11 1 1 1 11 111 222222 1111111 11 22 33 22222 22222 1 33333333333333 2222 33333333333333333333333 1 11 2 1 4444444444
lowQualScore : 4 111111111111 88 88 11 0 0 0 88 5 8 8 11 99 6 8 8 44 8 8 6 666 3 2 1 6 6 6 77 6 111 77 5 5 5 2 888 77 5 3 222222 2222 5 77 77 0 77 000 5 5 55555 5 00 77 5 333333333333333333333333 1 000 5 5 000 5 1 5 5 0 5 5 33 2222 000 77 333333333 77 5 77 111 5 5 5 5 5 77 666666 44 00000000000 77 1 5 5 7777 1 5 888888 5 2222222 777777 5 5 5 55 5 0 0 777 55 777 888 888888 66 5 0 77 66 4 00 5 0 0000 0 2 5 5 5 2 5 5 5 777777777777 6666666 5 5 2222222222 0 666666 33333 1 0 3333 22222222222222222222222222222222222222222222 555555 5 1 555555 5 77777 5 11111 5 4 5 5 00 4 5 5 888888888888888888888 5 5 77 5 99999999999 000 77 5 77777777777777777777 5 5 66 5 7 1 00 1 99 000 5 77 5 8888888 111 3333333333 6 6 1 6 6 6 888888 7777777 6 6 6 6 99 666666666 6 99 6 66 55 6 6 111 6 888 5 5 1 5 5 55555 1 5 0 1 77 3 5 5 77 777 66 5 5 5 5 22 000 888 1 5 5 4 5 5 5 77 4444 55 33 1111 000 0 555 5 5 666666 5 5 888 1 00000000 6 5 5 77 5 444444444444444 1 000 22 444444 77 333333 5 5 33 5 5 3333 5 5 8888 5 5 6666666 1111 77 5 44444444 99 4444 00000 111 8888888 1 77 00000 2222 33 999999 0 44 99 55555 6 6 33 6 1111111111111 77777777777 888 6 1 6 6 666 6 6 6 6 99 3 6 000000 1 777777 888 3 88 3 0 0 0 11 0 444 0 6 6 6 99 5555555 6 666666666 2 6 99 6 6 000 88888 1 5 5 7777 4 5 999 5 1 5 77 77 77 4444444 333333333333 8888888 5 33 000 5 5 5 5 5 3 5 33 5 5 1 77 0 77 1 9999 9999999999 2 6 6 6 6 4444 6 99 111 111 6 6 99 6 44444 888 6 7 000 0 1111111111111 6 8888888888888888 8 8 8 8 0 8 3 2 0 0 0 6666666 33 3 5 22 3 555 666 6 88 333 333333333 11 8 8 11 22 0 8 2 444444 3 2 0 1 1 5 0 2 5 88 00000 1 7777777 44 0 99999999 2 22 5 000 4 5 0 5 88 0 5 5 5 5 88 0 2 2 77 0 2 77 2 3333 5 5 5 00000 2 77777777777777777777777777 77 2 555 0 5 77 0 0 77 0 222222222 0 66666 1111 0 5 0 0 5 4 0 88 000 77 0 0 3 5 77 2 0 0 0 0 0 3 6 22 3 222 0 1 3 111 4444 77 4 0 0 77 4 2 4 7 11 88 1 44 6 6 1 3 0 3 3 3 88 3 9999 3 3 6 6 7 3 2 77 0 5 0 4 77 0 0 0 555 2222 88 2 5 7 3 0 2 33333 3 3 0 22 0 3 3 3 777 3 3 3 0 3 2 5 3 5 5 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 1 1 11 6 99 3 99 222222222222222 77 88 11 2 99 1111111 44 00000 8 6666666 0 33 0 0 3 44 0 0 0 33 5 0 0 33 3 66 777 2 888888 3 9999999 33 99 3 22 55555 55555 3 0 44444444444444 00 1111 77777777777777777777777 0 33 0 1 0 9999999999 0
lowQualScore : . ............ .. .. .. . . . .. . . . .. .. . . . .. . . . ... . . . . . . .. . ... .. . . . . ... .. . . ...... .... . .. .. . .. ... . . ..... . .. .. . ........................ . ... . . ... . . . . . . . .. .... ... .. ......... .. . .. ... . . . . . .. ...... .. ........... .. . . . .... . . ...... . ....... ...... . . . .. . . . ... .. ... ... ...... .. . . .. .. . .. . . .... . . . . . . . . . ............ ....... . . .......... . ...... ..... . . .... ............................................ ...... . . ...... . ..... . ..... . . . . .. . . . ..................... . . .. . ........... ... .. . .................... . . .. . . . .. . .. ... . .. . ....... ... .......... . . . . . . ...... ....... . . . . .. ......... . .. . .. .. . . ... . ... . . . . . ..... . . . . .. . . . .. ... .. . . . . .. ... ... . . . . . . . .. .... .. .. .... ... . ... . . ...... . . ... . ........ . . . .. . ............... . ... .. ...... .. ...... . . .. . . .... . . .... . . ....... .... .. . ........ .. .... ..... ... ....... . .. ..... .... .. ...... . .. .. ..... . . .. . ............. ........... ... . . . . ... . . . . .. . . ...... . ...... ... . .. . . . . .. . ... . . . . .. ....... . ......... . . .. . . ... ..... . . . .... . . ... . . . .. .. .. ....... ............ ....... . .. ... . . . . . . . .. . . . .. . .. . .... .......... . . . . . .... . .. ... ... . . .. . ..... ... . . ... . ............. . ................ . . . . . . . . . . . ....... .. . . .. . ... ... . .. ... ......... .. . . .. .. . . . ...... . . . . . . . . . .. ..... . ....... .. . ........ . .. . ... . . . . .. . . . . . .. . . . .. . . .. . .... . . . ..... . .......................... .. . ... . . .. . . .. . ......... . ..... .... . . . . . . . .. ... .. . . . . .. . . . . . . . . .. . ... . . . ... .... .. . . . .. . . . . .. .. . .. . . . . . . . . .. . .... . . . . . . . .. . . . . .. . . . ... .... .. . . . . . . ..... . . . .. . . . . ... . . . . . . . . . . ................................................................................. . . . .. . .. . .. ............... .. .. .. . .. ....... .. ..... . ....... . .. . . . .. . . . .. . . . .. . .. ... . ...... . ....... .. .. . .. ..... ..... . . .............. .. .... ....................... . .. . . . .......... .
lowQualScore : 6 444444444444 88 88 00 8 8 8 88 6 0 0 00 00 6 0 0 00 0 0 7 555 3 5 3 7 7 7 77 7 777 99 7 7 7 0 666 99 7 0 111111 1111 7 99 99 7 99 000 7 7 99999 7 77 99 1 999999999999999999999999 4 000 7 7 777 7 4 7 7 1 7 7 66 1111 000 99 111111111 99 7 99 444 7 7 7 7 7 99 444444 33 00000000000 99 7 7 7 9999 4 7 333333 7 7777777 444444 7 0 0 44 0 0 4 555 22 666 888 888888 99 0 4 66 11 4 66 0 0 6666 4 5 0 0 0 2 7 7 7 111111111111 7777777 7 7 1111111111 7 444444 77777 6 1 6666 33333333333333333333333333333333333333333333 111111 7 7 999999 7 44444 7 66666 7 0 7 7 77 3 7 7 444444444444444444444 7 7 44 7 00000000000 999 99 7 00000000000000000000 7 7 44 7 9 7 77 4 33 000 7 99 7 4444444 777 5555555555 7 7 0 7 7 7 555555 7777777 7 7 7 7 22 888888888 7 22 7 33 88 7 7 333 7 333 7 7 7 7 7 33333 4 7 1 4 99 9 7 7 44 111 44 7 7 7 7 11 000 666 7 7 7 9 7 7 7 99 0000 77 66 7777 000 1 999 7 7 666666 7 0 666 7 77777777 6 7 7 99 7 333333333333333 3 000 66 333333 99 666666 7 7 00 7 7 9999 7 7 3333 7 7 6666666 4444 99 7 00000000 22 0000 00000 444 9999999 7 99 44444 1111 66 333333 8 66 22 22222 7 7 88 7 0000000000000 33333333333 333 7 7 7 7 888 7 7 7 7 22 3 7 888888 0 555555 333 3 33 8 8 8 8 00 8 000 8 7 7 7 22 3333333 7 777777777 5 7 22 7 7 888 99999 9 7 7 0000 9 7 666 7 4 7 99 99 99 1111111 000000000000 1111111 7 66 000 7 7 7 7 7 6 7 99 7 7 4 99 7 99 7 3333 0000000000 5 7 7 7 7 2222 7 22 777 000 7 7 22 7 88888 333 7 3 888 8 2222222222222 0 6666666666666666 0 0 0 0 8 0 2 5 0 0 0 0000000 22 2 0 55 2 222 222 0 88 666 999999999 88 0 0 66 00 8 0 5 888888 2 5 0 0 0 5 0 5 0 00 00000 0 0000000 77 7 00000000 0 00 0 000 0 0 0 0 00 0 5 0 5 0 00 0 5 5 55 0 5 55 5 0000 0 0 0 55555 5 00000000000000000000000000 55 5 000 0 5 55 0 0 55 0 000000000 0 00000 0000 0 5 0 0 5 0 0 00 555 55 0 0 0 5 55 5 0 0 0 0 0 3 7 00 3 777 7 0 3 555 0000 55 0 0 0 55 0 5 0 3 77 33 0 77 7 7 0 7 7 3 0 0 33 0 7777 3 3 7 7 3 3 5 55 0 0 0 0 00 0 0 0 000 5555 55 5 5 3 2 0 5 55555 2 2 0 55 0 2 2 2 000 2 2 2 0 2 5 5 2 0 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0 0 00 7 22 3 88 888888888888888 77 88 77 5 22 7777777 77 88888 0 0000000 0 88 0 0 2 55 0 0 0 88 5 0 0 88 2 88 555 5 888888 2 8888888 88 00 2 88 00000 00000 2 0 88888888888888 55 2222 22222222222222222222222 0 88 0 0 0 5555555555 7
consensus : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-A-TG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAA-ATGG-AAA-C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AATAA-AA-AGC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATGAG-AAAATGT--GC-A-TCGTTACC--AC-ATA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCATTT--A-AAACTAAT--CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAAAC----CAAAAAAAAA---AAAAAAAAAAAAAAA----AA--AAAGAA----AAAGA-TTAAA-T--GG-AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCG---A--CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G--C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC---AAT---TT-TTT-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CT-G-CT---AGA-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACT-TCT-TTGCTAT-AAGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGAGNCTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGG-TTTTCTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACA-TGTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGTTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGCACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---AC-AACA-AACATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGC-TA-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CTGAGAN-CGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
Reference ( family-290 ) : GAGTGTGAGATCGA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GACN-ANTG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAA-ATGG-AAA-T-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-ANAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AATAA-AAAAGC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGAA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATANTGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATGAGGAAAATGT--GC-A-TCGTTACCA-AC-ATA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCATTT--A-AAACTAAT--CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAAAC----CAAAAAAAAA---AAAAAAAAANAAAAA---CAA--AAAGAA----AAAGA-TTAAA-TG-GG-AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCG---G--CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----NAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GGA-G--C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC---ATT---TT-TTT-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTTAATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CT-G-CT--GAGA-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACT-TCT-TTGTTAT-AGGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAATCTTT-GGCAGTATG-GCACT--GGTTGTACATGTGTTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGANNCTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGG-TTTTCTCCACTGATNGNTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTC-TGGCGAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGG-----CATTGGCAAANTAAGATAAG-ATGGTATAACTAGATGGGGTGGTATAAACGAAACTTTTNNCTCCGCGTACGCCCAAAAGCAATGTAT-ATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTG-GAAATAAAAAACAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTG-CCGCATGTG--ACTG-AGGGCGT--TAGAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTAT-TCTGCTTCGGGAACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATTTTTAA--CTGAACA---TCAAAA-CAGGTTATCT--AATACTGT-ACTC-ATAAAAAA--CACTG-TAATGAG---ACA---CCTTCATT-ATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGT-AC-CGACTTATAGGG-ATGTATATAAAC-AAAATAAAAAT-ACCTTTAAAATGGC-AGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGC--ATGAACTGAAGA-GGGAGACC-ACACTTCTGGCAGACTAGTAATATTTCGGATA--ACACAACAAA-TTCCAC-AACTCTCCAACC-CTCTGTCCATCC-AAAGCC-TTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTNNC-ACACCCATCTGACCTTCATCTATGGGTTAANTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAA--AAAAATTGCAT-GCAGTT-AGCTCA--AGTTTTCTTAATTTACTGATACTGATATCATGNCTGGTNATCTTTTNTCAATACCCTGNATGTACATTGTACAATTACCGGT-AATGAATTTATATAA--AAAATTCTAACACTACNNNCCATGGTTCATATGGTT-TGA-CCATGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGCTCCTAAAGAC--ATTTCC-TTCCTATTCCTATGCTGGGAC-GAACATACAAGTGTATGAGTTGACCAAAAG-TGCCT-CCA-ATTTGG---ATAGGGGGGGGGGGG----ACAAGAATAGGCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---G-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCAGCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTATTTCANAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-GGACTT----------GA---AN-AACATAACATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCACGTGC-TA-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTACCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CTGAGAG-CGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATNT-GGTCG--A-------ATATCCACCTCTGGTC
gi|1 : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---AGTA-ATGGGAA--CAA--ATGATTTTGGTATCAAATGGATACACA-CA-TGTCTG--GACC-AATG-CT-TGGTCAT-GA-AAT-AA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGACAAACCTAAGGGCA--TGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TAGTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA--------------GTA---A---TCTGTTATA---AA-A-TTT--AAGAAAC-A-AT-AAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCACCTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTGT-T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAA-ATGG-AA----CG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----A-TCA-ATCA-AT-GTTTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T-----G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-ACAT---T-C-CT-C------TGACCA---TTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AAGTT---C----A---A--------TTC-AATAA-AAAAGC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATT-CCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT--CTTA-CA-AT-C----CAC--C-AATTA-TAACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATGAAGAAAATGTGGGC-A-TCGTTATCA-AC-ATA---TTT-ATAAACAT-AT-GA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGTATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATA--A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCATTT--A-AAAC-AAT--CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAAAT-TGT-C--TTCAA--CA-C-AATAAAC----CAAAAAAAAA---AAAAAAAAATAAAAAACGCAATTAAAGAA----AAAGA-TTAAA-TG-GGAAAAATGAA-C-ATGGTAACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGTA----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATACTAA--TCTC----CTCG-C--CATC----A--CTCACAATGGAA--ATAT--A--TG-AATG--AAATTG-TT-AT---C---C-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----TAAAAAAACA-----ATACTATCGTT-CAT-AAAATATAACAAAAATTAT----ATG---CGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAG---AAGTT-GTGGGGGGGGGGGA-G--C-CA-TT---A--G--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-CC-AAAACCA--T--GAA--ACTGAAATGA-AC---ATT---TT-TTT-----T-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGCAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTACAA-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTTAATA-TA---ATGG-CCAT-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CT-G-CT----AA-C-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTTCATGCAA-TGC-TTTCACT-TC--TTGCTAT-AAGTTTGTGGTAA-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTG----C--TTTT-GGATGAATTTGAGTCTTT-GGCAGTATGTGTACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTATGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACTGG---TTGAAAGTGG-TTTTCTCCACTGATTGTTGGAATCTGCAGTA-TATGTGATCTTCTTGGCTAAAAATACAATA-AAT--TTTAAATTAAGTTGGCCATTGGTAAACTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACAAGACTTTTTACTCC-CGTG---CCAAATACAAT-TATAATATGAT-GTATTCTGCTGCC--TGTGAAAT-AAAAGCAATATTT-GAAG-AACA-AATA--TGCCCCCATCTGGTACTGTAAGTCGTACTATA----TTGCAC-AATTGTAT-AG-AATA--ATCTCTGCTTCGGTAACTTTTTGA----------------------ACATTTTTAATCTTGAAGAATTTCAAAACCAGG-TATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTTCTCCATTGATC-----AATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGT-TATAAACAAAAATAAAAATAACCTTT-AATTGGCAAAAAAGAC--TATGTTTGAATTGTGGTT---TGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCATAAT-CCTCGAACAAGAGACAACAAGTTTCCACAAATTTTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGTCCCACAACTT--AAACGGAAAGTACCAACACCCTTCTGACCTTCATCTATGGATTAAATATTTTAAAATG---TTTATG----TGTATATTTGTAAAAGAAAAAATGCATGGCAATTAAGCTCAGGAGATTTGTTAATTAACTG-TACTGATATCATAACTGGTC-TCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACA-TGTACAATTACCAGTAAATGAATTTTTAAAATTAAAAATCTAACACTGCATGCCATGGTTCATATGGTTGTGGCCCATGCA-TATTGACTTGTTTTGTTTGACATTCAAGTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTAT-CTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGATGACCACTAGTTGCCTCCCACATTTGATTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGCACAAGA--AGCCTCAACGAAGAAAATTTATC-ACCTGTGTGTTTATCAAACATTGC---ACCAATTAATTCACTAATTATATCTTT-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCAGC-TTGTTTACATATATA-ATATATATAT-TATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCT-CTTCACAACGGGGAATAACGGGTAATA--ACTCT-AATCG---AA-GAA--CGACCT----------GA---AA-AAC--AACATAGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTGAATTCCT-T-----GTTACTAT-AATGAAATTCTAAC-AACCATTTTTATCATGGGC-TATC-ATACATT--TACACATTAT-CGGGGAATCTATATTACTAACTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCT--CTGAGAACCGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---CTTTATTA--TCTATA----TTTTTTGAAA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|10 : GAGTGTGAGATCAA--------A---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTT-GGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-A-TA-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AACAA---GAGTATAG-CCGTTTGCCCC-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TACTAATTTAAA------ATAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGA--TTTT-TATTA--AATA-T------------GTAAC-A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT---A-AAAC-A-ATGAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCACA--GCGC--C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC-----------A--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATC-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-TG-GT-A-ATGG-AAA-C-TG---AAAAA--
gi|11 : aaggtagtacTATT--TTGTGTTCTCAATAGTTGTAAT-----T--A-CAATGATTTAAAAGTATCTAAAATTTTA-AGAGTAAAAACAATGA--CA---T-AAAATTAT-ATAATA-TAGTTGATATTTTATATTA--ATTA-TTGTTGACATCAAGTA---A---TGTATGCTACAAAA-G-TTTCAAG-AAACTA-ATAAAAA-AAAATTG-ATAAGGAGCGTAAAATT--CTATTAACGCG--CTT--TAC-TCGCGATGCGC--C-A-CCTTA-TGTATGTCTTCAATTTAAATAATCGAGCTACCGACACTCTTAAGTATATT-CG-TGAAAATTTTGTGTGATT-TAAATT---CA-ACACTA-CTGATT-ATGA-G-CAACAGTACA-GA-GTAATAGGA-AAA-TCTGTGTAAAAA--AGAGCA--AC-TTTATTTTCAATT-AAA--ATAT
gi|12 : tcttttcttaaaaattTT-ACACAC-C-ATAAC-AT-AAT----AAAAAAA-TAAAAGCATA--C-A-CTT-T-A--AAA-ATG--A-C-AATAAAC-AAT-CA-ATGTCTGGACC--AAAT-TTTCAGCAAAATAGA------AGTTCCATTT--A-AAAATAAT--CA----CCCAGTGGA-TATCCCTACTAGAACAGCTTTTTTTCTTCACCAAA-TTTCATTTGTTACT--------AAATT-T-T-C--TTCAAT-C----------C----GACAAAAAAA---AAAAAATAAAAAAGG---GAA--AAAGGATAATAAAGA--TAAA-T---G-AAAATGAA-CTGGGGT-ACA-ATAT-A--ACA--G-A--CA-----C-ATACC----T--TCATCGTAC--CTTTCAAA--CTTTCATCCT-TGTTAATCAACAAAGGAA----A--AAAAGG-TAA--TGTCTCATAC-----TCTCGTTGCTCGTCCACATCG---A--C
gi|13 : GGGTAATAGAACTCTTAATCGTTAAATGAAGTAGACTT----------GATATATCAACAAACCATGGATCA-TC---TCAATTCACATC-------TTGAATGGTTGATATTTACACTG-ATTCCT-TAGATGGCTACTATTAA--GAATTCTAACCAA-CATTTTTATCACGTGCTTA-CGATACATT--TAC-CATTGTCCGGGG-ACT--TATTACTATCTTTAAGCTAGGGAATATGTTAAAGTTCCAT--TT--GAGTCTCACTG-GAGACGCT-----ATAAACCCATAACCTAGCTCCTGCGATATTAAATTATCAAATAAACACCTTTTTACT----TTAGCCC---AATATATTTTTG-AAACCAGAATTTGGGTCA--A-------ATA
gi|14 : gaaaataatactgt--T-AAA--ATATGTGTA-ACCGATAT----ATCA--T-GTGACCAA-A-TTT-CAGAAAGAAAAAAGGAAAA-----A-AG-AG-T--G--GCAACAACCAT------TT--TTGGACAAATCATCTCAGACTCTC-----------C---GAAAAT---T-CTCT-CTGGTCTTGACCAGGGTTT-TTATATCA---GAACAACA---ACTTTCGCA-TGT-TT-TATGAGTGTT-GTCTGC-AAATTATGC----AC--A--------TTC-AATAA-AAGAGCAAAAT-T-A-------AATG-G-A--AATATGA----AC--ATTGATGATG--TACACATA-TTT-CAT-GACTATA-A-ATTACCTGAAAA---T-TT--T-ATTA--TA--TAA
gi|15 : GATACTGATATTATATCTGGTAATCTTTTTTCA-TACC-TGTATGTACATTGTACAATTATCGGT-AATGAATTTATATAA--AAAATTCTAACACTACTAA--AAGTTTCTTGCCATT-TGA-CCCCA-AGTAT--AC-TG
gi|16 : GTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA-----GTTTGT---------GCA-G--C-CAATT---ACGA--AAAAATC--GC-C----AAAATGCCAAATGAAAGTTG-TCG-AC-CAAACCA--TACGAA--C----AGTGATAC---ACC---ATATTT-----T-CC-ATAA--TCCACGAAT-CG-ACCGTAA---CA-GA-AAAAT-GCGACAAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AA-A--T-TCTTACTA-C-------G-TC-A-GT-AACAACC----ACACTG--CA--CT-GACT--AGAA-CGAAA--A-TATCCAATA-AT-ACGC---GTAAGAAC-CTGCCA-A----------GA-TG----TCAC-------TGCTATCAACGTTGAGGT-A-CAT-TGTTTTTC-CCCatatgacctcgaatgtgatcctgactcccactatgaattgactttggattttcttgacattctatggaagtttattatcaataaatgagaagaaattgtgtcgtcaaatatgtgttaactttctgcagatcaacatttttttttcataccaca
gi|17 : --ACTCT-AATCG--AAAAGAAG-AGACTTTTTGAAGTCTGA---AA-AACA--ATATGGATCAATC-GCTCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTAC--A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCCAAC-AA-CATTTTTATCAT-TGC-TA-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TA--------TT---ACTAGGGA------T-ATGT---AATTTT--GAGTCT--CTGAGAC-CGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGA-----------------------TTTT---T----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATAT-GGTCGCTATGACACCACATCCACCTCTGGTC
gi|18 : ATAATGGGGAATAACGGGGAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------CA---AC-AACATAACATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATCTTTTTTTTTG-ATGGTTGATACC---ACTG-ATTct
gi|19 : gtctactttcatttcacaatggggaCTTTCTATTTCACAACGGGGAATAACGGGAAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------CA---AC-AACATAATATTGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-ATGGTT
gi|2 : ttgtttaaataaaatgcaggggtttaatatctaAAATAAAAAA--GAGTGTAG-CC-TGTTGCCTCCTA-CCTG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A---GT-ACTCTGTGTATTTCTT-T-TTCTTTAAATT-AT-GTCC--ACTAA-TAGCAA-TTAAA------TAAA----TA-A---TCAAGG--AATA--CA---T-AAAATTATAAAAATA-G---TGAT-TTTG-TATTATCACTATT------------GTAAACA---TCTGTTCTA---AA-A-TTT---A-AAAC-A-ATAAAAA-AAA--T--ATAA----CGTA---TT--CTATA-----A--CTTGCTACTTCGCA--GCG---C-AGCT-TA-TG-ATGTC--CAATTC------TTCAACTGC-----------A--GAATT-CG-TAAA----TTCTGAAATT-TAA--TCCACA-A----A--TG--TGA-AA-GTC-ACAG-ACA-GAGGTAT-A-GG-AAACT-TG---AAAAA--A----A--AC--TA-TTTTAA--T-AAAATATATA-ATA-AG----ATTCA-ATCACAT-GTGCCCAA-A-TTT-TATG----------AAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AACAAT------TT--T--TGAAAAT----TCAG-----C-----------C---C-GAAT---TAC-CTGC------TGA-CA----TT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA--GTCTT-TACGA-T-TT-GTCT-CAAATTT---CA---A---A--------TTCAAATAATAACGGC-AAAT-TAA-------AATGCG-ATGAA-ATGA----AC--A-TG-----G--TA--TATA-TTTCCAT-GACTATATA---TACCTGA-AA---T-TTTGT-ATT---TC--TAACAGGGAT---AAAAC---C-------T-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-ATGG----CAC--C-AAGTA-T-ACCGCGTC--ATTG-----AC-TCAGA-ATGA--AGATATGAG--AAATGTG-GC-A-TCGTTAC---AC-ATAT--TTT-AC-AACAC-ATAGA-GT-AATCG----AT--A-AAAAAGCATAACCTA-CTT-TTA-TAAG-ATATAA-C-AACAATT-AAT-CATGTG----GACC--AAAT-TT-CAG-AAAA-AGT-GTGGTAG--CCATTT--T-AGAATAAT--CAGCGGCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT-----AGCAAA----TAT--TTTTCTGTTCAAAAAAAATATGT-C--TTCAAT-CA-C--ATAACC----CCCCCAACAA---AAAAGCAACCCAA------AA--AAAGAA----AAAGAGTTAAA-TG-G---AAATGAA-C-A--GT-ACAGATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGTT---TT--TCAT-GTA-------CCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACAT--GAA----AAGAAAAGGTAAA--TGTTTCAAAC-----TCTC----CT-GTC--CATCG---GATCTCA-AATGAAACGCTAT--GACTG-ACTGA-AAATTGTTT-AT---CTAAC-AGACAT----GTG----AAT--TC-GT--TCAC-A-TATTTT-ACA-ACATAACATG-AGTA--ATGCAA-AATAAAAAAAAAAAAGCAGACTGGTACTATT-TTCCAC-TAAATATGACAAAAATTATTC--ATA---TGTCCAAA-A-TCGTCCAGAAAA---TAG-T-AT---------TGA-GGCC-CA-TTATGA--A--AATAGTCA-GC-T-C-AAGAATGCCAA-TGAAA--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-TATGA-GC---AATGAATT-TTC-----C-CA-ATAA--TTCCC---T-CG-ACCGTAATG-CATAA-AAATT-GCAA-AGTGTAC-A-AGAACGA--TCAACAATTGGG-TGTT-ATATT----ATGG-CCAA-GT-AAATA-C----ACACT--TCA--CT-G-CT---AGACC-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAA-----ATGTAACTGCTTTTCACT-TCT-TTGTTAT---GGTTGTGGT-AGCAT-T-TTTCTT-CCCTCTGT-CTAATTACTAT-TATCTTCTCTTGT--TCTTTTTT-GAATGGATTGGAATTCTT-GGCAGTA-G-GCACTACGTTTGAAAGTG-GTTTTTCT-
gi|2 : cTTGTTCT-T-------TTTTGA-ATG-GATTGGAATTCTTGGCA-GTAGGCACT-ACGTTTGAAAGTGGTTTTTCTCCACTGATTGTTGAAATccactgattgttgaaat
gi|20 : caaataaaaaagagtgtagcctgttgcctcctacctgctgtcaaactaagggagtactctgtgtatttctttttctttaaattatgtccactaatagcaattaaataaataatcaaggaatacataaaattataaaaatagtgattttgtattatcactattgtaaacatctgttctaaaatttaaaacaataaaaaaaatataacgtattctataacttgctacttcgcagcgcagcttatgatgtccaattcttcaactgcagaattcgtaaattctgaaatttaatccacaaatgtgaaagtcacagacagaggtataggaaacttgaaaaaaaactattttaataaaatatataataagattcaatcacatgtgcccaaattttatgaaaaaaagagtggaacaatttttgaaaattcagcccgaattacctgctgacattttttttcagcaaaatttccagtctttacgatttgtctcaaatttcaaattcaaataataacggcaaattaaaatgcgatgaaatgaacatggtatatatttccatgactatatatacctgaaattttgtatttctaacagggataaaacctatttcataatgtccttacaatggcaccaagtataccgcgtcattgactcagaatgaagatatgagaaatgtggcatcgttacacatattttacaacacatagagtaatcgataaaaaagcataacctacttttataagatataacaacaattaatcatgtggaccaaatttcagaaaaagtgtggtagccattttagaataatcagcggcccgaatttcctctgaacagcttttctagcaaatatttttctgttcaaaaaaaatatgtcttcaatcacataacccccccaacaaaaaagcaacccaaaaaaagaaaaagagttaaatggaaatgaacagtacagatatttcatgaactatatgtttttcatgtaccaactttcatttgtaacatgaaaagaaaaggtaaatgtttcaaactctcctgtccatcggatctcaaatgaaacgctatgactgactgaaaattgtttatctaacagacatgtgaattcgttcacatattttacaacataacatgagtaatgcaaaataaaaaaaaaaaagcagactggtactattttccactaaatatgacaaaaattattcatatgtccaaaatcgtccagaaaatagtattgaggcccattatgaaaatagtcagctcaagaatgccaatgaaatgtcgacaaaaccatgaacctgtatgagcaatgaattttcccaataattccctcgaccgtaatgcataaaaattgcaaagtgtacaagaacgatcaacaattgggtgttatattatggccaagtaaatacacacttcactgctagaccaaaatatccaaatagcttgtaagactgccataaatgtaactgcttttcacttctttgttatggttgtggtagcatttttcttccctctgtctaattactattatcttctcTTATC-AACTTG-C---A-CA-TTAATTCACTAATTTAATC-TC-CAAAA-CTTGCTCTAACATACATTACAGATTTC-GTTTCCTTACAATCTACCGAGCACCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATAT
gi|21 : A--ATATG-A--TG-AATGAGAAATTG-GT-ACAAAC--A--A---ATACTAGAA----AA---TC-GTAACAACTA-T-TTTT-ATACACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAGAAAAGCA-------ACTA---TT-CAT-AAAATA
gi|22 : CCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTTCC-ACACCCATCTGACCTTCATCTATGGATAAATTAATTG-AAattata
gi|23 : TTTCAT--T-TGT-----AGCAG--GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTCCATAC-----TCTC----CTCGTC--CATCGACAG--CTCACcaatcgatataat
gi|24 : ---CA--AC-TTATTTCT-A--T-AAA--TTATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTC
gi|25 : TGGTA-AACTAGATAAGATGGTAT-AAC-AAATTTTTTACTCC
gi|3 : GAGTGTGAGATCAAAG-T---AATGGGGTATATGGGAAAACTA--ATGATTTTGGTATCA--TGGATCTACAGTAATGTATGTGGACATATTG-CT-TGG-CAT-GAGAATAAA-AAAAAAAAGAGTGTAG-CCCGTTTGCCT-CTAAGTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-CT-----AAAT-AT-GTCCCTAT--AATACTAATTCAAAA-----TAAA-----A-AG--TCAAGG--ATGAACTA---TCAAAATTAT-AAA-TA-T---TGAT-TATT-TATTA--A-TA-T------------GTAGACA---TCTGTTCTA---AATA-TTTTAAA-AAAC-ATATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TTTTCTAT------AACTTT--TAC-TCGCA--GCGACCC-A-CC-T--TG-ATGTC--CAATTT------TTAAACTGC----------AA--TAATTACG-TAAA----TTGTG-AATCACAA--T---CA-A----T-TTG--T-A-AA-G-C-AC-G-ACAAGA-GTAA--TG--AAA-C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATGT--CA--T-AAAT-ATAAA-ATATAC----ATCAA-ATCA-GTAGTGTCTAA-AATTTATA------------GAAAACATCGA-GGTAG-T--GTAG----AGCCAT------TT--T--GATAAAT-C-CTAAG-----CTAGCTAAATACC---G-AAATATTC-C-CT-CGT----TGAA-A--GTTCATTTTTTCACCAG--CAA-A---A-TTTC-CAATGT-TT--ACGA-T-T--GT-T-C-AATTT---C----ACAAG--------TTC-AATAA-AA--GC-AAATGT-A-------AATG-GTA--AA-ATGA----A---A-CG-----G--TAC-TA------------A-TATAAA-ATTACCTG--AA---TCTT--T-ATT---TAC-TAACAGGGGA---AAAAAACATAATT-AATTATTTC-ATAATGTTCCTTAGCG-AG-GAGAGCAC--CCAA-TAGT-ACCGT-CCCCATCCTTGTAACATCAGAGATGA--A-ATATGAAGAAA---T--GT-A-TCGTTAATC-AC-ATAATCTTT-ACAAACAT-AAAGA-GT-AATAGGCAAATAAATAACAGGCATA--CTAACTT-TTAATAAATCTATGA-CTAACAATC-AAT-CA-ATGT---GACCCAAAATGTT-CAGAAAAA-AGAAGTGG-AG--CATTTT--ATAAACTAAT--CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CC-TGACAGCTTTTCT----C-GCAACAATTCAT---TTTCT--------AATTT-TGT-CCTTTCAATTCA-CTAATAAACACAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAACCAAA---AAA--GAAGAA----AAAGA-TTAAACTATGG-AAAATGAA-CAATGGT-ACA-ATAT-TAATCAT-G-AACTA-----TAAAGCC---TTCGCTAT-GTAAAGCA-TCCAACTCTTTCAT--TATGT-----AACA---GAAGAGGA--AAAGGGTTAACCTGTTTCATACT-AACTCTC----CTCGTC--CATCG---A--CTCACAATG-AA--ATATCGA--TG-AATGA-AAATTG-TTAAT---CA-AC-A---AT----ATGTGAAAA---TCGGTTATCAC-A-TATTTTAACA-ACAT-ACA-GAAGTA--ATGTGATAATA----AAAAAAAGC------ATACTATC-TTACATAAAAATATAACAAAAATTATTCCAATGAGCTACGC-AATACTC--TCAAAAAATTGAAA-T-GT---------GGA-G--C-TA-TTAG-A--A--AATGATCA-GC-TGCAAAAAATTCCAA-TGAAG--TGTTCGAAC-AAAACCA--T---AA--TCTGTAATG--AC---AAT---TT-TTT-----CACCGATAAATTCCAC---T-CC-ACCGCAATG-CATGAGAAATTGGCAA-ACGATAC-A-AGAAC-A--T-A--AATT--TATCTT-CTA-T----ATc
gi|4 : agtacGTGAGATCCA-------AA---GTT-----GGAAA-TAA--A-GATATTTGTATCAA-TG-AT-CACC-TA-TGTATG---ACA-A-TG-CT-TG-TCATTGA-AATAAA-AAAAA---GA-TGTAGTCCGTTT---CT-CTA-ATGG-CTGTCAAA--TAAGG--A--GGTAA-TCTG-GTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-AT---CC--AT--A-T--CAATTTAA-------TAAA----TACAG--TCAAG---AT----CA---T-TAAATTAT-AAAATA-TG--TGAT-TTTT--AT-A--AATA-T------------GTA---A---CTTGTTCTA---AA-A-ATT--AA-AA-C-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATA-----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-T--ATGAT--CATTTT------ATCA--TGC----------AA--A---T-CG-TATA----ATGTG-AATT-TAA--T---CATA----A-TTG-------A-A-C-ACAG--CA-GA-GTAA--TGG-AAA-C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TCATTTT-CA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-ATT-TA------------GAAAA-----A-GT-AG-T--G-------AGC-AT------TT---------GAT-A--TCAA-----C-----------C-----ACAT---T-C-----------TGACCA--GTTT-TTTTTTCAC--G--CAA-A-----TTTC-CA-T----T-TATGA-T-T--GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AATAA-AA--GC-AAAT---A-------AATG---A--AA-ATGA----------------------C-TGTA-CTT--ATCGA--AT-TA-ATTACCTAT-AA---T-TT--TTATT---TA--TAA---GAAA---AAAAA---TA----GAT-ATTTCCATATTAC-C--TA-CATAT-C----CAC----AA-T--T-AC-GT-CC--ATT------GA-TCAGA-A-GA--A-ATG-GAG--AAATGT--GC-A-TCGTTAC------ACA---TTT--CAAACAT-ATAGA-TT-AATGG--AAATAAA-AAAGA----A--TCA-CCT-TTA-TAAA-ATAT-A-A-CACAATT-AAT-CATATGT---GAC---AAAT-TT-CAGAAAAA--GA-GTGA-----CCATTT--A-AA--TAA----A---ACCC---G------TTCT-CT-GAA--GTTCTTTT----CAGCAAA-TTTC-T--GTTTCT--------AAATT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AA-------------------------AATAAAAAAAA-----------------------A-TT-AA-T--GG-AAAATGAA-C-AT-GT-ATA-A-ATAT--TCAT-G-AACTA-----T-ATGC-----T--TCAT-GTAA--C--T-CAA--C-TTAAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGT--A--TG--TCATAC-----TCTC----CTCGTC--C-TTG---A--CTCACAATGA------AT--A--TGAAATGA-AAATTG--T-AT---C--AC-A---AT-----TG----AA---TC-GT--TCAC-AGTA-TTT-A-A-ACAT-ACA-G-AGTA--AGG-GA-AAT-----AAGAGAA--A-----ACA-TACT-TT-CAT--AAATATAACAAAA--TATTC--A-G---TGT-C-AC-A-T---TCAG--AA---AAGTT-GT---------GCA-G--C-TC-TT---A--AATAAAATTCA--T-T-C-AAAA--TGCAA-TGAA---TG-TCG-AC-AAA--CA--T--GTA--ACTGTTAT---AC---AAT---TT-TTT-----C-AC-AT-A--TTCAC---T-CG---CGTAATG-CAT-A-AAATT-GC-A-AAAGTAC-ATAGAACAA--AAA--AATT--C-TCT--ATA-T----ATGG-TCAA-GT-A--AA-C----ACACTG-TCA--AT---CT---AGA-C-AAA--A-TATCC---A-AT-A-GCT-TGC-AGA---CTGCCATAA-GTT----CGA-TGC-TTTCATT--------------------TGGT-A-CAG-T-TTCT----CCTTTGTCCTATATACTGT-TAT-TTCTATTG----C--TTT---GATGAATTGAAGTCTTT--GCAGTATG-TATCT--GGTTGTACATGTA-TTTTCT-T----G--GTTTGG-ATGTAATT-GAGACTTTGGCA-TTATGCAC--G---TTG-AAGT-G-TTTTCTCCAtgat
gi|5 : g--A--AATATTCA-GCGT-C--AAACTTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCATCT--GAAAGCCTG-T-TGA-CCGAGATT---TTATGT-----C-CC-ATAAT-TCCAC---TCCG-ACCGTAATGCCATGA-AAAT-----A-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AAAT--T-TCTT-ATA-TTCC-AT-G-CCAATGT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTGG-CC--TAGA-C-AAACTATTATCCGCCATAT-C-ACT-TGT-AGACACCTG-CATAATTTC-ATGCAC-TGCGTTTCACTCTCTATTGTAAT-A-GGTTGTGGT-A-CATCT-TTCGTCTCCCTC-GTCCTAATTACTGTATAT-TTCT-TTGTGGTC--TTTTGGGATGAA-TGGATGCTTTGGGAAGTATG---ACT---GTTG-A-AGGTGGTTTTCTCC----A-CT----G-ATG-GG-TGAAATCT---GCA-GTAT
gi|5 : TAC-TGTATATTTCT-TTGTGGTCTTTTGGGATG-AAT-GGATGCTTTGGGAAGTATG-ACT-G---TTGAAGGTGG-TTTTCTCCACTGATGGGTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTC-TGGCGAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGG-----CATTGGCAAAGTAA-------ATGGTAT-----GATGGGG------AAAAGAAACTTTTATCTCCGCGTACGCCCAAAAGCAATGTAT-ATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTG-GAAATAAAAAACAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTG-CCGCATGTG--ACTG-AGGGCGT--TAGAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTAT-TCTGCTTCGGGAACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATTTTTAA--CTGAACA---TCAAAA-CAGGTTATCT--AATACTGT-ACTC-ATAAAAAA--CACTG-TAATGAG---ACA---CCTTCATT-ATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGT-AC-CGACTTATAGGG-ATGTATATAAAC-AAAATAAAAAT-ACCTTTAAAATGGC-AGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGC--ATGAACTGAAGA-GGGAGACC-ACACTTCTGGCAGACTAGTAATATTTCGGATA--ACACAACAAA-TTCCAC-AACTCTCCAACC-CTCTGTCCATCC-AAAGCC-TTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTAAC-ACAC--------CCTTCATTTATGGGTTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAA--AAAAATTGCAT-GCAGTT-AGCTCA--AGTTTTCTTAATTTACTGATACTGATATCATGACTGGTCATCTTTTATC-ATA-CCTGAATGTACA-TGTACAATTACCAGN-NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNACAtatgtgatcttctggcgagaagtacaatagaattgtttaaattaggcattggcaaagtaaatggtatgatggggaaaagaaacttttatctccgcgtacgcccaaaagcaatgtatatatgatggtattctgctgccgttggaaataaaaaacaatatctggaagaaacagaatagttgccgcatgtgactgagggcgttagagaggttgcacgaattgtatgagcaatattattctgcttcgggaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacatttttaactgaacatcaaaacaggttatctaatactgtactcataaaaaacactgtaatgagacaccttcattatccagcaaatggctctcaacaaattgtaccgacttatagggatgtatataaacaaaataaaaatacctttaaaatggcagggagactgtatgtttgaattgtggttgcatgcatgaactgaagagggagaccacacttctggcagactagtaatatttcggataacacaacaaattccacaactctccaaccctctgtccatccaaagccttcgcatgtagctggtacaatctcctcatggtccacaacttcaaaactggaagtaacacacccttcatttatgggttaattattttaaatgtaatttgtgtacatgtatatttgtaaaaaaaattgcatgcagttagctcaagttttcttaatttactgatactgatatcatgactggtcatcttttatcatacctgaatgtacatgtacaattaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|6 : aaatattcagcgtcaaacttccaatgaagtgtcgacaaaaccatctgaaagcctgttgaccgagattttatgtcccataattccactccgaccgtaatgccatgaaaataaaagtacaagaacatcaaaatttcttatattccatgccaatgtaacaacacactgtcactggcctagacaaactattatccgccatatcacttgtagacacctgcataatttcatgcactgcgtttcactctctattgtaataggttgtggtacatctttcgtctccctcgtcctaat-C-ACAT-ATA-GACGTTA-ATGATAAA--------AAAAG--G---CATTAC-TACTCTTTTA--T-CAA---TATA-ACACAG----AAT-A-ATCA-AT-GTA--CAACA-TTT-CA------------GAAAA-----AGAG-AGGT--G--G----AGCCATCGGCATTT--T--GAAA--T-A-CTAGG-----C-----------CC--G-AAAT---T-C-CT--------TGA--A--GTTT-TTTT---A---G--CAA-A---T-TTTC-CA-T----T-TATGA-T-TTTGT-T-C-AATTT---C----A---AAACCAAATTTC-AATAA-A----C-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGACATGATTGA-TG-----G--TAC-TATACTTT-CAT-GACTATATA------TTG--AA---T-TT--T-TTT---AA--TAACAGGAAA---AAAA-------TT-AAT-ATTTC-ATATGGT-CCTTA-AA-AT-T----TGC--C-A--TA-T-AC-GT-CT--ATT------AC-T-AGA-ATAA--A-ATATGAG--AAATGT--GC-A-TCGTTAC---AC-ATA---TTTTACAAATAT-A-AGATGA-AATG------TCAA-ATAAAGC-TA--CTA-CTT-TTA-TAA---TTT-A-C-AACAATT-AATTCAT---T---G-CC--A--T-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCATTTT-A-AAACTAATGTCA---GCCC---GAA-T-TTC-T-CT-GAACAGCTTTTCT----C-TCACAATTTCAT--GTT-CT--------AAA-T-TGT-C--TTCAAT-CAGT-AACAAA------AAAAAAAAA---AAAAAAAAGAAAAAAC--CAA--AGAGCA----AAAAA-TTAAA-T--GG-AAAATGAACC-ATGGT-AC--ATA--T--TCAT-ATGACTATGATTT-ATGCCCCTTT--CCAT-GT-A--C--T-CAA--CTTTCACA-A-TGT-----GATA---CAA----AGGAAAAGGTTAA--TGTTTCAT----A--TCTC----CTCGTCA-TATCG---A--CT-AC-ATGAAA--ATATG-A--TA-AATGA-AAATTG-GT-AT---CA-ACAA---AT----GTG----AAAGGTC-GTTATCAA-A--ATTTT--CA-AC-T-ACA-G-AGTAACATG-GA-AAT------AAGGAAGCAGC---ATAC-ATT-TT-CAT--AAATAT-AC--AAATTATTC--ATG---TGT-C-AA-A-TC--TCAGAAAA---AGATT-GT---------GCACG--CATA-TG---A--A--AATATTCAGGC-T-C-------TGCAA-TGAAG--TT-GCGAACGAAAACCA--T--GAA--CCTG-TAT---AC---AAT---TA-TTTGGTTAA-CC-ATAT--GTCAC---T-CGAACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-G----AC-A-AG-AC-AAGTCA--AATTG-G-TCTT-ATA-TTATGATGGTCCAA-GTAAACAA-CCTTAAC-CTGCTCATGCT-G-CTGGGAGA-C--AA--A-TATCTG--G-ATGA-CCTCTGTAAGA---CT
gi|7 : ttacacatattttaGAGTGTGAGATCGA-GATGCAAA---AGTA-ATGGGAAA-CAACCATG--TTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ACTGGCTGTGATCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAGACCGTAT-GCCC-TCA-GTGGGCTGTCAAC-TCAAGGG-ACGGATAAC---GTGTATC--TT-T-TTTTTACAAAT-ATAGTC---AT--A-TACTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CAATGT-AAAAT-AT-AAAATACT---TGAT-TTTT--ATTA--AA-A-T------------GTA---AACATCTGT-CTA---AA-AGTTT--AA-AACC-A-ATAAAAAGAAA-TTGTATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---CCA-CC-AAATG-AC-TT--CATTTT------TTCAA-TGC----------AA--AATTC-CGATAAAA---TTGTG-AATT-TAA--AA--CA-A----ACTTG--T-A-AAAG-C-ACAG-TCA-GA-GTAA---GG-AAA-C-TG---AAAAAGAA---CA--ACCTTATTGT-CA--TTAAA--ATATT-AAA-AC----ATTCACATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----AGAG-AG-TCTG--G----AGCCAT------TTCTT--GAAGACT-A-CTCAG-----C-----------CACCG-AAAT---T-CACT-C------TGACCC--GTTT-TTTTTTCC---A--CAA-AGAAA-TTCC-AA-TGT-TTCTA--G-T-TT-GTCT-C-AATCT---CTCCAA---A--------TTC-AAATA-AAAAGC-AA---T-ATGGAAACAATG-A-A--AA-GT-A----AC--A-TG-----GAATCT-TATA-TTT-CAT-GAATATATGGATTACCTG--GAAGTT-TT--T-ATTGTATAACTAACAGGGGAGTAAAAAA---TA-TCCAAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-ATAC----CACAAC-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------ACCTCAGA-ATGATAA-GTATGAG-AGAATGT--GCCACTTGTTATCACACTAT----TTT-ACAAACATTATAGA-GTTAATGA--AGATAAA-AAA--GCATA--CAG-CTTCTTA-AAAA-CTAT-AAC-AACAATCCAAT-CA-ATGT---GACA--GTAT-AT-----AAAC-AGA-GTGG-AG--CCATTTTTA-AAAC-AATA-CG---ACCC---GAACT-TTCCT--T-GAACAGCTTTTTC----TAGCAAATTTTT-T--GCTTCT--------AAAAT-TGTTC--TTCAAT-CA-C-AAT-AAC----CAAAAAAAAA---AAAAAACCCCTCAA-----AA--AAAG-A----AAAGA-TTAAA-TT-GG-AAAAT-AA-C-AT-GT-ACA-ATAT-T--TCATGG-AACTA-----G-ATGCC---TT--TC-T-GTAtag
gi|8 : ggtagtacCCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTAACTAATTATATC-TC-----A-CTTGCTCCAGC-TACA-TAC-GA--TCAG-TTCCTTGCAATCT-CCG-GCAGC--TG-TTACA
gi|8 : ccT-AA-CG--AAA-GAAG----TCT----------AA---AC-AAC----C-TGGATCAATC-G-TCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTACC-A--CTG-ATTCCTGT-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTT-ATCATGTGC-TA-C-ATACATTACTAC---TTGT-CGGGG-ATC--TATTACTACTTT---A-TAGGGC------TATTGT---AA--TTTTGAGTCTT-CTGAGA--CGCTCGTATATA-----ATA-CCT-GC-----CATT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATGT-GGTCG----------ATATTCACCTCTGGTCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggataacgaaagaagtctaaacaacctggatcaatcgtcaacacatcttgatggttggtaccactgattcctgtgttactataagaattctaacaacattttatcatgtgctacatacattactacttgtcggggatctattactactttatagggctattgtaattttgagtcttctgagacgctcgtatataatacctgccattattatcaaacgacttttcttaccaatttttgaatagatgtggtcgatattcacctctggtcc
gi|9 : cccctgtgtgtttatcaacttggcacaattaattaactaattatatctcacttgctccagctacatacgatcagttccttgcaatctccggcagctgttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggaCCATGGTTCATATGGTT-TGA-CCATGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGAc
gi|9 : CATTCAGCTCCTAAAGAC--ATTTCC-TTCCTATTCCTATGCTGGGAC-GAACATACAAGTGTATGAGTTGACCAAAAG-TGCCT-CCA-ATTTGG---ATAGGGGGGGGGGGG----ACAAGAATAGGCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTG-TTA-C-AACTTGGCTTGA-CAATTAATTCACT-ATTATATC-TTGCAAAAGCTTGCTCCAACATACATTACAG---TCAGTTTCCTTGCA--CT-CCGAGTGCTTTTGTTTatatatctacacaattgattagtattatacatcaattcattcagctcctaaagacatttccttcctattcctatgctgggacgaacatacaagtgtatgagttgaccaaaagtgcctccaatttggataggggggggggggacaagaataggctcaacgaaggaaatttatctacctgtgtgttacaacttggcttgacaattaattcactattatatcttgcaaaagcttgctccaacatacattacagtcagtttccttgcactccgagtgcttttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111
lowQualScore : 444444444444 11 11 11 111 1 1 111 1 222222 1111 111 11111 11 333333333333333333333333 111 222 11 1111 111 222222222 222 111111 33333333333 1111 1 111111 1111111 111111 1 11 1111 11 1 1111 333333333333 1111111 2222222222 111111 11111 1111 44444444444444444444444444444444444444444444 111111 111111 11111 11111 11 333333333333333333333 2222 11111111111 111 22222222222222222222 11 11 111 1111111 111 333333333 222222 1111111 222222222 11 2222 111 1 11111 11 11 111 1111 1111 111 111111 1 22222222 33333333333 1111 111111 33333333333333 111 1111 1111111 1111 22222222 1111 22222 222 1111111 44444 1111 11 111 22222 11 3333333333333 11111111111 111 1 1 222222 222222 1 11 11 111 1 1111 222222222 222 1111 1 2222222 111 1111111 11 111 111111 2222 1111 11 111 22222 222 4444444444444 1 4444444444444444 1 1 2 3333333 11 11 222 111 333333333 1 222222 1 1 1 1 11 22222 3333333 11 1 1 222 1 1 1 11 1 1 1 1 1 11 11 11 1 11 2222 1 1 1 11 1 8888888888888888888888 11 222 1 1 11 1 1 11 1 22222222 1 22222 222 1 1 1 1 1 1 11 222 11 1 1 1 111 1 1 1 1 1 1 1 333 1 222 2222 11 1 1 11 11 1 1 11 1 1 1 11 1 1 1 1 222 3333333 11 1 1 11111 1 11 1 111 1 1 1 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 11 1 333333333333333 222222 22 2222222 11 111111 2222222 1 11 1 1 1 1 1 11 1 1 1 11 111 222222 1111111 11 22 111 22222 22222 1 33333333333333 2222 33333333333333333333333 1 11 1 1 4444444444
lowQualScore : 111111111111 88 88 11 0 0 0 88 5 8 8 11 8 8 99 8 44 8 8 6 666 3 2 1 6 6 6 77 6 111 77 5 5 5 2 888 77 5 3 222222 2222 5 77 77 0 77 000 5 5 55555 5 00 77 5 333333333333333333333333 1 000 5 5 000 5 1 5 5 0 5 5 33 2222 000 77 333333333 77 5 77 111 5 5 5 5 5 77 666666 44 00000000000 77 1 5 5 7777 1 5 888888 5 2222222 777777 5 5 5 55 5 0 0 66 5 1111 888 888888 66 5 0 77 66 4 00 5 0 0000 0 2 5 5 5 2 5 5 5 777777777777 6666666 5 5 2222222222 0 666666 33333 1 0 3333 99999999999999999999999999999999999999999999 555555 5 1 555555 5 77777 5 11111 5 4 5 5 00 4 5 5 888888888888888888888 5 5 5 2222 5 99999999999 000 77 5 77777777777777777777 5 5 66 5 7 1 00 1 99 000 5 77 5 8888888 1 111 000000000 6 6 6 6 6 888888 7777777 6 6 6 6 99 666666666 6 99 6 6 1 7 55 6 6 6666 6 888 1 5 1 5 5 55555 1 5 0 1 77 3 5 5 77 777 66 5 5 5 5 22 000 888 1 5 5 4 5 5 5 77 5 8888 55 1111 1111 000 0 555 5 5 666666 5 5 8888 00000000 6 5 5 77 5 5 55 33 00000000000 2222 666666 5 55555555555555 000 5 77 5 3333 5 5 8888 5 5 6666666 1111 77 5 44444444 99 4444 00000 111 8888888 1 77 00000 2222 33 777 0 44 99 55555 6 6 33 6 1111111111111 77777777777 888 6 1 6 6 666 6 6 6 6 99 3 6 666666 1 777777 888 3 88 3 0 0 0 11 0 444 0 6 6 6 99 5555 6 666666666 1 6 6 6 6 000 88888 1 5 5 7777 4 5 999 5 1 5 77 77 77 4444444 88888 000 5 5 5555555 66 33 000 5 5 5 5 5 3 5 33 5 5 5 77 0 77 777777 5 5 7777 6 6 6 6 4444 6 99 55 111 6 6 6 99 6 44444 888 6 7 000 0 1111111111111 6 1111111111111111 8 8 8 8 0 8 3 2 0 0 0 6666666 33 3 0 22 3 333 666 6 88 0 3 333333333 1 8 8 55 11 0 2 444444 3 2 0 5 5 1 5 88 66666 1 2222222 44 8888888 2 5 000 1 5 5 5 88 5 5 5 5 5 88 66 1 88 5 1 88 1 3333 5 5 5 88 5 1 5555555555555555555555 88 1 111 5 5 88 5 5 77 5 33333333 5 66666 000 5 5 5 5 5 1 5 88 000 88 5 5 2 5 999 5 5 5 5 5 3 6 3 111 3 111 4444 88 1 5 5 77 1 1 1 7 7 44 6 6 3 0 3 1 1 88 1 22 6 0 3 3 0 6 6 7 3 1 88 5 5 5 1 22 5 111 4 1111111 2 88 1 5 7 3 0 2 88888 3 3 0 22 0 3 3 3 777 3 3 3 0 3 33 5 3 5 5 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 1 11 6 99 3 99 222222222222222 6 000000 11 2 99 1111111 44 444444 8 6666666 0 33 0 0 3 2 0 0 0 33 5 0 0 33 3 44 777 2 888888 3 9999999 33 99 555 55555 55555 3 0 44444444444444 00 1111 77777777777777777777777 0 33 5 1 0 9999999999
lowQualScore : ............ .. .. .. . . . .. . . . .. . . .. . .. . . . ... . . . . . . .. . ... .. . . . . ... .. . . ...... .... . .. .. . .. ... . . ..... . .. .. . ........................ . ... . . ... . . . . . . . .. .... ... .. ......... .. . .. ... . . . . . .. ...... .. ........... .. . . . .... . . ...... . ....... ...... . . . .. . . . .. . .... ... ...... .. . . .. .. . .. . . .... . . . . . . . . . ............ ....... . . .......... . ...... ..... . . .... ............................................ ...... . . ...... . ..... . ..... . . . . .. . . . ..................... . . . .... . ........... ... .. . .................... . . .. . . . .. . .. ... . .. . ....... . ... ......... . . . . . ...... ....... . . . . .. ......... . .. . . . . .. . . .... . ... . . . . . ..... . . . . .. . . . .. ... .. . . . . .. ... ... . . . . . . . .. . .... .. .... .... ... . ... . . ...... . . .... ........ . . . .. . . .. .. ........... .... ...... . .............. ... . .. . .... . . .... . . ....... .... .. . ........ .. .... ..... ... ....... . .. ..... .... .. ... . .. .. ..... . . .. . ............. ........... ... . . . . ... . . . . .. . . ...... . ...... ... . .. . . . . .. . ... . . . . .. .... . ......... . . . . . ... ..... . . . .... . . ... . . . .. .. .. ....... ..... ... . . ....... .. .. ... . . . . . . . .. . . . .. . .. ...... . . .... . . . . .... . .. .. ... . . . .. . ..... ... . . ... . ............. . ................ . . . . . . . . . . . ....... .. . . .. . ... ... . .. . . ......... . . . .. .. . . ...... . . . . . . . .. ..... . ....... .. ....... . . ... . . . . .. . . . . . .. .. . .. . . .. . .... . . . .. . . ...................... .. . ... . . .. . . .. . ........ . ..... ... . . . . . . . .. ... .. . . . . ... . . . . . . . . ... . ... .... .. . . . .. . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . . . . . . . . . . .. . . . . .. . ... . ....... . .. . . . . . . ..... . . . .. . . . . ... . . . . . .. . . . . ................................................................................. . . .. . .. . .. ............... . ...... .. . .. ....... .. ...... . ....... . .. . . . . . . . .. . . . .. . .. ... . ...... . ....... .. .. ... ..... ..... . . .............. .. .... ....................... . .. . . . ..........
lowQualScore : 444444444444 88 88 00 8 8 8 88 6 0 0 00 0 0 00 0 00 0 0 7 555 3 5 3 7 7 7 77 7 777 99 7 7 7 0 666 99 7 0 111111 1111 7 99 99 7 99 000 7 7 99999 7 77 99 1 999999999999999999999999 4 000 7 7 777 7 4 7 7 1 7 7 66 1111 000 99 111111111 99 7 99 444 7 7 7 7 7 99 444444 33 00000000000 99 7 7 7 9999 4 7 333333 7 7777777 444444 7 0 0 44 0 0 4 00 0 2222 888 888888 99 0 4 66 11 4 66 0 0 6666 4 5 0 0 0 2 7 7 7 111111111111 7777777 7 7 1111111111 7 444444 77777 6 1 6666 11111111111111111111111111111111111111111111 111111 7 7 999999 7 44444 7 66666 7 0 7 7 77 3 7 7 444444444444444444444 7 7 7 0000 7 00000000000 999 99 7 00000000000000000000 7 7 44 7 9 7 77 4 33 000 7 99 7 4444444 0 777 555555555 7 7 7 7 7 555555 7777777 7 7 7 7 22 888888888 7 22 7 7 7 3 88 7 7 3333 7 333 4 7 7 7 7 33333 4 7 1 4 99 9 7 7 44 111 44 7 7 7 7 11 000 666 7 7 7 9 7 7 7 99 7 3333 77 6666 7777 000 1 999 7 7 666666 7 0 7777 77777777 6 7 7 99 7 7 99 77 77777777777 1111 444444 7 00000000000000 000 7 99 7 9999 7 7 3333 7 7 6666666 4444 99 7 00000000 22 0000 00000 444 9999999 7 99 44444 1111 66 999 8 66 22 22222 7 7 88 7 0000000000000 33333333333 333 7 7 7 7 888 7 7 7 7 22 3 7 888888 0 555555 333 3 33 8 8 8 8 00 8 000 8 7 7 7 22 2222 7 777777777 0 7 7 7 7 888 99999 9 7 7 0000 9 7 666 7 4 7 99 99 99 1111111 99999 000 7 7 9999999 44 66 000 7 7 7 7 7 6 7 99 7 7 7 99 7 99 333333 7 7 9999 7 7 7 7 2222 7 22 88 777 7 7 7 22 7 88888 333 7 3 888 8 2222222222222 0 2222222222222222 0 0 0 0 8 0 2 5 0 0 0 0000000 22 2 2 55 2 222 222 0 88 8 2 999999999 4 0 0 88 22 0 5 888888 2 5 0 5 5 0 0 00 00000 0 0000000 77 3333333 0 0 000 0 0 5 0 00 5 5 0 5 0 00 00 0 00 5 0 00 0 0000 0 0 0 55 0 0 0000000000000000000000 00 0 555 0 5 55 0 0 55 5 00000000 0 00000 555 5 5 5 5 5 0 5 00 555 00 0 5 5 5 000 5 5 0 5 5 3 7 3 777 3 555 0000 00 0 0 5 55 0 0 0 3 3 77 7 7 3 7 3 0 0 33 0 00 7 7 3 3 7 7 7 3 3 0 55 5 0 5 0 00 5 000 0 0000000 5 55 0 5 3 2 0 5 55555 2 2 0 55 0 2 2 2 000 2 2 2 0 2 00 5 2 0 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0 00 7 22 3 88 888888888888888 7 888888 77 5 22 7777777 77 000000 0 0000000 0 88 0 0 2 5 0 0 0 88 5 0 0 88 2 88 555 5 888888 2 8888888 88 00 555 00000 00000 2 0 88888888888888 55 2222 22222222222222222222222 0 88 5 2 0 5555555555
consensus : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GAC-A-ATT-GCT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATG-AGAAAATGT--GC-A-TCGTTA-TC-ACA-TA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAA-AAAAAA---AA--AAAGAA-AAAGATTAA---A-TGG--AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G-C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC--A--AT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACTTCTTTGCTAT-A--AGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---A-CAACA-AAC-ATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTA-CCA-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTA-TAA--GAATTCTAA-CAA-CATTTTTATCATGTGC-TA-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CTGAG-ACCGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
Reference ( family-290 ) : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GAC-A-AT--GCT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATG-AGAAAATGT--GC-A-TCGTTA-CC-ACA-TA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAA-AAAAAA---AA--AAAGAA-AAAGATTAA---A-TGG--AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G-C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC--A--AT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACTTCTTTGCTAT-A--AGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGAGNCTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGTTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGCACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---A-CAACA-AAC-ATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTA-CCA-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTA-TAA--GAATTCTAA-CAA-CATTTTTATCATGTGC-TA-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CTGAG-ANCGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|1 : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---AGTA-ATGGGAA--CAA--ATGATTTTGGTATCAAATGGATACACA-CA-TGTCTG--GACCA-AT--GCT-TGGTCAT-GA-AAT-AA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGACAAACCTAAGGGCA--TGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TAGTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA--------------GTA---A---TCTGTTATA---AA-A-TTT--AAGAAAC-A-AT-AAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCACCTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTGT-T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AA-----CG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----A-TCA-ATCA-AT-GTTTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T-----G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-ACAT---T-C-CT-C------TGACCA---TTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AAGTT---C----A---A--------TTC-AA-TAAAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATT-CCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT--CTTA-CA-AT-C----CAC--C-AATTA-TAACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATGAAGAAAATGTGGGC-A-TCGTTA-TCAACA-TA---TTT-ATAAACAT-AT-GA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGTATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATA--A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAAC-AA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAAAT-TGT-C--TTCAA--CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAATAAAAAACGCAATTAAAGAA-AAAGATTAA---A-TGGGAAAAATGAA-C-ATGGTAACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGTA----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATACTAA--TCTC----CTCG-C--CATC-A---CTCACAATGGAA--ATAT--A--TG-AATG--AAATTG-TT-AT---C---C-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----TAAAAAAACA-----ATACTATCGTT-CAT-AAAATATAACAAAAATTAT----ATG---CGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAG---AAGTT-GTGGGGGGGGGGGA-G-C-CA-TT---A--G--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-CC-AAAACCA--T--GAA--ACTGAAATGA-AC--A--TT---TTT-T-T-----T-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGCAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTACAA-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTTAATA-TA---ATGG-CCAT-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---A--A-C-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTTCATGCAA-TGC-TTTCACTTC-TTGCTAT-A--AGTTTGTGGTAA-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTG----C--TTTT-GGATGAATTTGAGTCTTT-GGCAGTATGTGTACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTATGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACTGG---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGGAATCTGCAGTA-TATGTGATCTTCTTGGCTAAAAATACAATA-AAT--TTTAAATTAAGTTGGCCATTGGTAAACTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACAAGACTTTTTACTCC-CGTG---CCAAATACAAT-TATAATATGAT-GTATTCTGCTGCC--TGTGAAAT-AAAAGCAATATTT-GAAG-AACA-AATA--TGCCCCCATCTGGTACTGTAAGTCGTACTATA----TTGCAC-AATTGTAT-AG-AATA--ATCTCTGCTTCGGTAACTTTTTGA----------------------ACATTTTTAATCTTGAAGAATTTCAAAACCAGG-TATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTTCTCCATTGATC-----AATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGT-TATAAACAAAAATAAAAATAACCTTT-AATTGGCAAAAAAGAC--TATGTTTGAATTGTGGTT---TGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCATAAT-CCTCGAACAAGAGACAACAAGTTTCCACAAATTTTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGTCCCACAACTT--AAACGGAAAGTACCAACACCCTTCTGACCTTCATCTATGGATTAAATATTTTAAAATG---TTTATG----TGTATATTTGTAAAAGAAAAAATGCATGGCAATTAAGCTCAGGAGATTTGTTAATTAACTG-TACTGATATCATAACTGGTC-TCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCAGTAAATGAATTTTTAAAATTAAAAATCTAACACTGCATGCCATGGTTCATATGGTTGTGGCCCATGCA-TATTGACTTGTTTTGTTTGACATTCAAGTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTAT-CTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGATGACCACTAGTTGCCTCCCACATTTGATTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGCACAAGA--AGCCTCAACGAAGAAAATTTATC-ACCTGTGTGTTTATCAAACATTGC---ACCAATTAATTCACTAATTATATCTTT-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCAGC-TTGTTTACATATATA-ATATATATAT-TATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCT-CTTCACAACGGGGAATAACGGGTAATA--ACTCT-AATCG---AA-GAA--CGACCT----------GA---A-AAAC--AAC-ATAGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTA-CCA-ACTGAATTCCT-T-----GTTACTA-TAATGAAATTCTAA-CAACCATTTTTATCATGGGC-TATC-ATACATT--TACACATTAT-CGGGGAATCTATATTACTAACTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCT--CTGAGAACCGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---CTTTATTA--TCTATA----TTTTTTGAAA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|10 : GAGTGTGAGATCAA--------A---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTT-GGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GAC-A-AT--ACT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AACAA---GAGTATAG-CCGTTTGCCCC-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TACTAATTTAAA------ATAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGA--TTTT-TATTA--AATA-T------------GTAAC-A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT---A-AAAC-A-ATGAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCACA--GCGC--C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC-----------A--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATC-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-TG-GT-AATGG-AAA--C-TG---AAAAA--
gi|11 : aaggtagtacTATT--TTGTGTTCTCAATAGTTGTAAT-----T--A-CAATGATTTAAAAGTATCTAAAATTTTA-AGAGTAAAAACAATGA--CA---T-AAAATTAT-ATAATA-TAGTTGATATTTTATATTA--ATTA-TTGTTGACATCAAGTA---A---TGTATGCTACAAAA-G-TTTCAAG-AAACTA-ATAAAAA-AAAATTG-ATAAGGAGCGTAAAATT--CTATTAACGCG--CTT--TAC-TCGCGATGCGC--C-A-CCTTA-TGTATGTCTTCAATTTAAATAATCGAGCTACCGACACTCTTAAGTATATT-CG-TGAAAATTTTGTGTGATT-TAAATT---CA-ACACTA-CTGATT-ATGA-G-CAACAGTACA-GA-GTAATAGG-AAAATC-TGTGTAAAAA--AGAGCA--AC-TTTATTTTCAATT-AAA--ATAT
gi|12 : tcttttcttaaaaattTT-ACACAC-C-ATAAC-AT-AAT----AAAAAAA-TAAAAGCATA--C-A-CTT-T-A--AAA-ATG--A-C-AATAAAC-AAT-CA-ATGTCTGGACC--AAAT-TTTCAGCAAAATAGA------AGTTCCA-TTT--A-AAAATAA--T-CA----CCCAGTGGA-TATCCCTACTAGAACAGCTTTTTTTCTTCACCAAA-TTTCATTTGTTACT--------AAATT-T-T-C--TTCAAT-C--C-GACAA----A-------AAAAAAAA----AATAAA------AAA-GGGAAA---AA--GGATAATAAAGA-TAA---A-T-G--AAAATGAA-CTGGGGT-ACA-ATAT-A--ACA--G-A--CA-----C-ATACC----T--TCATCGTAC--CTTTCAAA--CTTTCATCCT-TGTTAATCAACAAAGGAA----A--AAAAGG-TAA--TGTCTCATAC-----TCTCGTTGCTCGTCCACATCGA---C
gi|13 : GGGTAATAGAACTCTTAATCGTTAAATGAAGTAGACTT----------GATATATCAACA-AACCATGGATCA-TC---TCAATTCACATC-------TTGAATGGTTGATATTTACACTG-ATTCCT-TAGATGGCTACTATTAA--GAATTCTAACCAA-CATTTTTATCACGTGCTTA-CGATACATT--TAC-CATTGTCCGGGG-ACT--TATTACTATCTTTAAGCTAGGGAATATGTTAAAGTTCCAT--TT--GAGTCTCACTGGA-GACGCT-----ATAAACCCATAACCTAGCTCCTGCGATATTAAATTATCAAATAAACACCTTTTTACT----TTAGCCC---AATATATTTTTG-AAACCAGAATTTGGGTCA--A-------ATA
gi|14 : gaaaataatactgt--T-AAA--ATATGTGTA-ACCGATAT----ATCA--T-GTGACCAA-A-TTT-CAGAAAGAAAAAAGGAAAA-----A-AG-AG-T--G--GCAACAACCAT------TT--TTGGACAAATCATCTCAGACTCTC-----------C---GAAAAT---T-CTCT-CTGGTCTTGACCAGGGTTT-TTATATCA---GAACAACA---ACTTTCGCA-TGT-TT-TATGAGTGTT-GTCTGC-AAATTATGC----AC--A--------TTC-AA-T-AAAAGA--GCAAAAT-T-A-------AATG-G-A--AATATGA----AC--ATTGATGATG--TACACATA-TTT-CAT-GACTATA-A-ATTACCTGAAAA---T-TT--T-ATTA--TA--TAA
gi|15 : GATACTGATATTATATCTGGTAATCTTTTTTCA-TACC-TGTATGTACATTGTACAATTATCGGT-AATGAATTTATATAA--AAAATTCTAACACTACTAA--AAGTTTCTTGCCATT-TGA-CCCCA-AGTAT--AC-TG
gi|16 : GTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA-----GTTTGT---------GCA-G-C-CAATT---ACGA--AAAAATC--GC-C----AAAATGCCAAATGAAAGTTG-TCG-AC-CAAACCA--TACGAA--C----AGTGATAC--ACCAT---ATT-T-T-----C-C--ATAA--TCCACGAAT-CG-ACCGTAA---CA-GA-AAAAT-GCGACAAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AA-A--T-TCTT-AC--T----ACGT-C--A-GT-AACAACC----ACACTG--CA--CTGA-CT---AGAA-CGAAA--A-TATCCAATA-AT-ACGC---GTAAGAAC-CTGCCA-A----------GA-TG----TCAC-----TGCTATCA--ACGTTGAGGT-A-CAT-TGTTTTTC-CCCatatgacctcgaatgtgatcctgactcccactatgaattgactttggattttcttgacattctatggaagtttattatcaataaatgagaagaaattgtgtcgtcaaatatgtgttaactttctgcagatcaacatttttttttcataccaca
gi|17 : --ACTCT-AATCG--AAAAGAAG-AGACTTTTTGAAGTCTGA---A-AAACA-A-T-ATGGATCAATC-GCTCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTA-C-A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTA-TAA--GAATTCCAA-CAA-CATTTTTATCAT-TGC-TA-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TA--------TT---ACTAGGGA------T-ATGT---AATTTT--GAGTCT--CTGAG-ACCGCT-----ATA-----ATAACCT-GC-----CGA-----------------------TTTT---T----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATAT-GGTCGCTATGACACCACATCCACCTCTGGTC
gi|18 : ATAATGGGGAATAACGGGGAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------CA---A-CAACATAAC-ATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATCTTTTTTTTTG-ATGGTTGATA-CC--ACTG-ATTct
gi|19 : gtctactttcatttcacaatggggaCTTTCTATTTCACAACGGGGAATAACGGGAAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------CA---A-CAACATAAT-ATTGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-ATGGTT
gi|2 : ttgtttaaataaaatgcaggggtttaatatctaAAATAAAAAA--GAGTGTAG-CC-TGTTGCCTCCTA-CCTG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A---GT-ACTCTGTGTATTTCTT-T-TTCTTTAAATT-AT-GTCC--ACTAA-TAGCAA-TTAAA------TAAA----TA-A---TCAAGG--AATA--CA---T-AAAATTATAAAAATA-G---TGAT-TTTG-TATTATCACTATT------------GTAAACA---TCTGTTCTA---AA-A-TTT---A-AAAC-A-ATAAAAA-AAA--T--ATAA----CGTA---TT--CTATA-----A--CTTGCTACTTCGCA--GCG---C-AGCT-TA-TG-ATGTC--CAATTC------TTCAACTGC-----------A--GAATT-CG-TAAA----TTCTGAAATT-TAA--TCCACA-A----A--TG--TGA-AA-GTC-ACAG-ACA-GAGGTATA-GG-AAA--CTTG---AAAAA--A----A--AC--TA-TTTTAA--T-AAAATATATA-ATA-AG----ATTCA-ATCACAT-GTGCCCAA-A-TTT-TATG----------AAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AACAAT------TT--T--TGAAAAT----TCAG-----C-----------C---C-GAAT---TAC-CTGC------TGA-CA----TT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA--GTCTT-TACGA-T-TT-GTCT-CAAATTT---CA---A---A--------TTCAAA-T-AATA-ACGGC-AAAT-TAA-------AATGCG-ATGAA-ATGA----AC--A-TG-----G--TA--TATA-TTTCCAT-GACTATATA---TACCTGA-AA---T-TTTGT-ATT---TC--TAACAGGGAT---AAAAC---C-------T-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-ATGG----CAC--C-AAGTA-T-ACCGCGTC--ATTG-----AC-TCAGA-ATGA--AGATATG-AG-AAATGTG-GC-A-TCGTTA--C-ACA-TAT--TTT-AC-AACAC-ATAGA-GT-AATCG----AT--A-AAAAAGCATAACCTA-CTT-TTA-TAAG-ATATAA-C-AACAATT-AAT-CATGTG----GACC--AAAT-TT-CAG-AAAA-AGT-GTGGTAG--CCA-TTT--T-AGAATAA--T-CAGCGGCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT-----AGCAAA----TAT--TTTTCTGTTCAAAAAAAATATGT-C--TTCAAT-CA-C--ATAACCCCCC----CAACAAAAAA----GCAACC------CAA-AAAAAG---AA--AAAGA------GTTAA---A-TGG---AAATGAA-C-A--GT-ACAGATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGTT---TT--TCAT-GTA-------CCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACAT--GAA----AAGAAAAGGTAAA--TGTTTCAAAC-----TCTC----CT-GTC--CATCGGAT-CTCA-AATGAAACGCTAT--GACTG-ACTGA-AAATTGTTT-AT---CTAAC-AGACAT----GTG----AAT--TC-GT--TCAC-A-TATTTT-ACA-ACATAACATG-AGTA--ATGCAA-AATAAAAAAAAAAAAGCAGACTGGTACTATT-TTCCAC-TAAATATGACAAAAATTATTC--ATA---TGTCCAAA-A-TCGTCCAGAAAA---TAGTA-TT---------GAG-GCC-CA-TTATGA--A--AATAGTCA-GC-T-C-AAGAATGCCAA-TGAAA--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-TATGA-GC--A--ATGAATTT-T-C-----C-CA-ATAA--TTCCC---T-CG-ACCGTAATG-CATAA-AAATT-GCAA-AGTGTAC-A-AGAACGA--TCAACAATTGGG-TGTT-ATATT----ATGG-CCAA-GT-AAATA-C----ACACT--TCA--CTG--CT---AG-ACC-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAA-----ATGTAACTGCTTTTCACTTCTTTGTTAT-----GGTTGTGGT-AGCAT-T-TTTCTT-CCCTCTGT-CTAATTACTAT-TATCTTCTCTTGT--TCTTTTTT-GAATGGATTGGAATTCTT-GGCAGTA-G-GCACTACGTTTGAAAGTG-GTTTTTCT-
gi|2 : cTTGTTCT-T-------TTTTGA-ATG-GATTGGAATTCTTGGCA-GTAGGCACT-ACGTTTGAAAGTGGTTTTTCTCCACTGATTGTTGAAATccactgattgttgaaat
gi|20 : caaataaaaaagagtgtagcctgttgcctcctacctgctgtcaaactaagggagtactctgtgtatttctttttctttaaattatgtccactaatagcaattaaataaataatcaaggaatacataaaattataaaaatagtgattttgtattatcactattgtaaacatctgttctaaaatttaaaacaataaaaaaaatataacgtattctataacttgctacttcgcagcgcagcttatgatgtccaattcttcaactgcagaattcgtaaattctgaaatttaatccacaaatgtgaaagtcacagacagaggtataggaaacttgaaaaaaaactattttaataaaatatataataagattcaatcacatgtgcccaaattttatgaaaaaaagagtggaacaatttttgaaaattcagcccgaattacctgctgacattttttttcagcaaaatttccagtctttacgatttgtctcaaatttcaaattcaaataataacggcaaattaaaatgcgatgaaatgaacatggtatatatttccatgactatatatacctgaaattttgtatttctaacagggataaaacctatttcataatgtccttacaatggcaccaagtataccgcgtcattgactcagaatgaagatatgagaaatgtggcatcgttacacatattttacaacacatagagtaatcgataaaaaagcataacctacttttataagatataacaacaattaatcatgtggaccaaatttcagaaaaagtgtggtagccattttagaataatcagcggcccgaatttcctctgaacagcttttctagcaaatatttttctgttcaaaaaaaatatgtcttcaatcacataacccccccaacaaaaaagcaacccaaaaaaagaaaaagagttaaatggaaatgaacagtacagatatttcatgaactatatgtttttcatgtaccaactttcatttgtaacatgaaaagaaaaggtaaatgtttcaaactctcctgtccatcggatctcaaatgaaacgctatgactgactgaaaattgtttatctaacagacatgtgaattcgttcacatattttacaacataacatgagtaatgcaaaataaaaaaaaaaaagcagactggtactattttccactaaatatgacaaaaattattcatatgtccaaaatcgtccagaaaatagtattgaggcccattatgaaaatagtcagctcaagaatgccaatgaaatgtcgacaaaaccatgaacctgtatgagcaatgaattttcccaataattccctcgaccgtaatgcataaaaattgcaaagtgtacaagaacgatcaacaattgggtgttatattatggccaagtaaatacacacttcactgctagaccaaaatatccaaatagcttgtaagactgccataaatgtaactgcttttcacttctttgttatggttgtggtagcatttttcttccctctgtctaattactattatcttctcTTATC-AACTTG-C---A-CA-TTAATTCACTAATTTAATC-TC-CAAAA-CTTGCTCTAACATACATTACAGATTTC-GTTTCCTTACAATCTACCGAGCACCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATAT
gi|21 : A--ATATG-A--TG-AATGAGAAATTG-GT-ACAAAC--A--A---ATACTAGAA----AA---TC-GTAACAACTA-T-TTTT-ATACACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAGAAAAGCA-------ACTA---TT-CAT-AAAATA
gi|22 : CCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTTCC-ACACCCATCTGACCTTCATCTATGGATAAATTAATTG-AAattata
gi|23 : TTTCAT--T-TGT-----AGCAG--GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTCCATAC-----TCTC----CTCGTC--CATCGACAGCTCACcaatcgatataat
gi|24 : ---CA--AC-TTATTTCT-A--T-AAA--TTATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTC
gi|25 : TGGTA-AACTAGATAAGATGGTAT-AAC-AAATTTTTTACTCC
gi|3 : GAGTGTGAGATCAAAG-T---AATGGGGTATATGGGAAAACTA--ATGATTTTGGTATCA--TGGATCTACAGTAATGTATGTGGAC-ATATT-GCT-TGG-CAT-GAGAATAAA-AAAAAAAAGAGTGTAG-CCCGTTTGCCT-CTAAGTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-CT-----AAAT-AT-GTCCCTAT--AATACTAATTCAAAA-----TAAA-----A-AG--TCAAGG--ATGAACTA---TCAAAATTAT-AAA-TA-T---TGAT-TATT-TATTA--A-TA-T------------GTAGACA---TCTGTTCTA---AATA-TTTTAAA-AAAC-ATATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TTTTCTAT------AACTTT--TAC-TCGCA--GCGACCC-A-CC-T--TG-ATGTC--CAATTT------TTAAACTGC----------AA--TAATTACG-TAAA----TTGTG-AATCACAA--T---CA-A----T-TTG--T-A-AA-G-C-AC-G-ACAAGA-GTAA-TG--AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATGT--CA--T-AAAT-ATAAA-ATATAC----ATCAA-ATCA-GTAGTGTCTAA-AATTTATA------------GAAAACATCGA-GGTAG-T--GTAG----AGCCAT------TT--T--GATAAAT-C-CTAAG-----CTAGCTAAATACC---G-AAATATTC-C-CT-CGT----TGAA-A--GTTCATTTTTTCACCAG--CAA-A---A-TTTC-CAATGT-TT--ACGA-T-T--GT-T-C-AATTT---C----ACAAG--------TTC-AA-T-AAAA----GC-AAATGT-A-------AATG-GTA--AA-ATGA----A---A-CG-----G--TAC-TA------------A-TATAAA-ATTACCTG--AA---TCTT--T-ATT---TAC-TAACAGGGGA---AAAAAACATAATT-AATTATTTC-ATAATGTTCCTTAGCG-AG-GAGAGCAC--CCAA-TAGT-ACCGT-CCCCATCCTTGTAACATCAGAGATGA--A-ATATG-AAGAAATGT-----A-TCGTTAATC-ACA-TAATCTTT-ACAAACAT-AAAGA-GT-AATAGGCAAATAAATAACAGGCATA--CTAACTT-TTAATAAATCTATGA-CTAACAATC-AAT-CA-ATGT---GACCCAAAATGTT-CAGAAAAA-AGAAGTGG-AG--CAT-TTT--ATAAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CC-TGACAGCTTTTCT----C-GCAACAATTCAT---TTTCT--------AATTT-TGT-CCTTTCAATTCA-CTAATAA----ACACAACAAAAAAAAACAAAAAAAAA------AAA-CCAAAA---AA--GAAGAA-AAAGATTAAACTA-TGG--AAAATGAA-CAATGGT-ACA-ATAT-TAATCAT-G-AACTA-----TAAAGCC---TTCGCTAT-GTAAAGCA-TCCAACTCTTTCAT--TATGT-----AACA---GAAGAGGA--AAAGGGTTAACCTGTTTCATACT-AACTCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATG-AA--ATATCGA--TG-AATGA-AAATTG-TTAAT---CA-AC-A---AT----ATGTGAAAA---TCGGTTATCAC-A-TATTTTAACA-ACAT-ACA-GAAGTA--ATGTGATAATA----AAAAAAAGC------ATACTATC-TTACATAAAAATATAACAAAAATTATTCCAATGAGCTACGC-AATACTC--TCAAAAAATTGAAA-T-GT---------GGA-G-C-TA-TTAG-A--A--AATGATCA-GC-TGCAAAAAATTCCAA-TGAAG--TGTTCGAAC-AAAACCA--T---AA--TCTGTAATG--AC--A--AT---TTT-T-T-----CACCGATAAATTCCAC---T-CC-ACCGCAATG-CATGAGAAATTGGCAA-ACGATAC-A-AGAAC-A--T-A--AATT--TATCTT-CTA-T----ATc
gi|4 : agtacGTGAGATCCA-------AA---GTT-----GGAAA-TAA--A-GATATTTGTATCAA-TG-AT-CACC-TA-TGTATG---AC-A-AT--GCT-TG-TCATTGA-AATAAA-AAAAA---GA-TGTAGTCCGTTT---CT-CTA-ATGG-CTGTCAAA--TAAGG--A--GGTAA-TCTG-GTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-AT---CC--AT--A-T--CAATTTAA-------TAAA----TACAG--TCAAG---AT----CA---T-TAAATTAT-AAAATA-TG--TGAT-TTTT--AT-A--AATA-T------------GTA---A---CTTGTTCTA---AA-A-ATT--AA-AA-C-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATA-----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-T--ATGAT--CATTTT------ATCA--TGC----------AA--A---T-CG-TATA----ATGTG-AATT-TAA--T---CATA----A-TTG-------A-A-C-ACAG--CA-GA-GTAA-TGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TCATTTT-CA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-ATT-TA------------GAAAA-----A-GT-AG-T--G-------AGC-AT------TT---------GAT-A--TCAA-----C-----------C-----ACAT---T-C-----------TGACCA--GTTT-TTTTTTCAC--G--CAA-A-----TTTC-CA-T----T-TATGA-T-T--GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA----GC-AAAT---A-------AATG---A--AA-ATGA----------------------C-TGTA-CTT--ATCGA--AT-TA-ATTACCTAT-AA---T-TT--TTATT---TA--TAA---GAAA---AAAAA---TA----GAT-ATTTCCATATTAC-C--TA-CATAT-C----CAC----AA-T--T-AC-GT-CC--ATT------GA-TCAGA-A-GA--A-ATG-G-AGAAA-TGT--GC-A-TCGTTA-C----A-CA---TTT--CAAACAT-ATAGA-TT-AATGG--AAATAAA-AAAGA----A--TCA-CCT-TTA-TAAA-ATAT-A-A-CACAATT-AAT-CATATGT---GAC---AAAT-TT-CAGAAAAA--GA-GTGA-----CCA-TTT--A-AA--TAA-----A---ACCC---G------TTCT-CT-GAA--GTTCTTTT----CAGCAAA-TTTC-T--GTTTCT--------AAATT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AA-------------------------------AA------TAA-AAAAAA------------------ATT-A---A-TGG--AAAATGAA-C-AT-GT-ATA-A-ATAT--TCAT-G-AACTA-----T-ATGC-----T--TCAT-GTAA--C--T-CAA--C-TTAAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGT--A--TG--TCATAC-----TCTC----CTCGTC--C-TTGA---CTCACAATGA------AT--A--TGAAATGA-AAATTG--T-AT---C--AC-A---AT-----TG----AA---TC-GT--TCAC-AGTA-TTT-A-A-ACAT-ACA-G-AGTA--AGG-GA-AAT-----AAGAGAA--A-----ACA-TACT-TT-CAT--AAATATAACAAAA--TATTC--A-G---TGT-C-AC-A-T---TCAG--AA---AAGTT-GT---------GCA-G-C-TC-TT---A--AATAAAATTCA--T-T-C-AAAA--TGCAA-TGAA---TG-TCG-AC-AAA--CA--T--GTA--ACTGTTAT---AC--A--AT---TTT-T-T-----C-AC-AT-A--TTCAC---T-CG---CGTAATG-CAT-A-AAATT-GC-A-AAAGTAC-ATAGAAC-A--AAA--AAAT--T-CTCT-ATA-T----ATGG-TCAA-GT-A--AA-C----ACACTG-TCA--AT---CT---AG-A-C-AAA--A-TATCC---A-AT-A-GCT-TGC-AGA---CTGCCATAA-GTT----CGA-TGC-TTTCATT--------------------TGGT-A-CAG-T-TTCT----CCTTTGTCCTATATACTGT-TAT-TTCTATTG----C--TTT---GATGAATTGAAGTCTTT--GCAGTATG-TATCT--GGTTGTACATGTA-TTTTCT-T----G--GTTTGG-ATGTAATT-GAGACTTTGGCA-TTATGCAC--G---TTG-AAGT-GTTTT-CTCCAtgat
gi|5 : g--A--AATATTCA-GCGT-C--AAACTTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCATCT--GAAAGCCTG-T-TGA-CCGAG--AT---TTTATGT-----C-CC-ATAAT-TCCAC---TCCG-ACCGTAATGCCATGA-AAAT-----A-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AAAT--T-TCTT-ATA-TTCC-AT-G-CCAATGT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTGGCCT---AG-A-C-AAACTATTATCCGCCATAT-C-ACT-TGT-AGACACCTG-CATAATTTC-ATGCAC-TGCGTTTCAC-TCTCTATTGT-AATAGGTTGTGGT-A-CATCT-TTCGTCTCCCTC-GTCCTAATTACTGTATAT-TTCT-TTGTGGTC--TTTTGGGATGAA-TGGATGCTTTGGGAAGTATG---ACT---GTTG-A-AGGTGGTTTTCTCC----A-CTGATGG-GTG-AA
gi|5 : TAC-TGTATATTTCT-TTGTGGTCTTTTGGGATG-AAT-GGATGCTTTGGGAAGTATG-ACT-G---TTGAAGGTGGTTTT-CTCCACTGATGGGTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCT-GGCGAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGG-----CATTGGCAAAGTAA-------ATGGTAT-----GATGGGG------AAAAGAAACTTTTATCTCCGCGTACGCCCAAAAGCAATGTATA-TATGATGGTATTCTGCTGCCGTTG-GAAATAAAAAACAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCC-GCATGTG--ACTG-AGGGCGT--TAGAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTAT-TCTGCTTCGGGAACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATTTTTAA--CTGAACA---TCAAAAC-AGGTTATCTAA--TACTGT-ACTC-ATAAAAAAC--ACTGT-AATGAGA---CA---CCTTCATT-ATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTA-C-CGACTTATAGGGA-TGTATATAAACAAAA-TAAAAATA-CCTTTAAAATGGCA-GGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGC--ATGAACTGAAGAGGG-AGACCA-CACTTCTGGCAGACTAGTAATATTTCGGATAA--CACAACAAATT-CCACAA-CTCTCCAACC-CTCTGTCCATCCAAA-GCCTT-CGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTAAC-ACAC--------CCTTCATTTATGGGTTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAA--AAAAATTGCAT-GCAGTT-AGCTCA--AGTTTTCTTAATTTACTGATACTGATATCATGACTGGTCATCTTTTATC-ATA-CCTGAATGTACAT-GTACAATTACCAGN-NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNACAatctgcagtattatgtgatcttctggcgagaagtacaatagaattgtttaaattaggcattggcaaagtaaatggtatgatggggaaaagaaacttttatctccgcgtacgcccaaaagcaatgtatatatgatggtattctgctgccgttggaaataaaaaacaatatctggaagaaacagaatagttgccgcatgtgactgagggcgttagagaggttgcacgaattgtatgagcaatattattctgcttcgggaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacatttttaactgaacatcaaaacaggttatctaatactgtactcataaaaaacactgtaatgagacaccttcattatccagcaaatggctctcaacaaattgtaccgacttatagggatgtatataaacaaaataaaaatacctttaaaatggcagggagactgtatgtttgaattgtggttgcatgcatgaactgaagagggagaccacacttctggcagactagtaatatttcggataacacaacaaattccacaactctccaaccctctgtccatccaaagccttcgcatgtagctggtacaatctcctcatggtccacaacttcaaaactggaagtaacacacccttcatttatgggttaattattttaaatgtaatttgtgtacatgtatatttgtaaaaaaaattgcatgcagttagctcaagttttcttaatttactgatactgatatcatgactggtcatcttttatcatacctgaatgtacatgtacaattaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|6 : aaatattcagcgtcaaacttccaatgaagtgtcgacaaaaccatctgaaagcctgttgaccgagattttatgtcccataattccactccgaccgtaatgccatgaaaataaaagtacaagaacatcaaaatttcttatattccatgccaatgtaacaacacactgtcactggcctagacaaactattatccgccatatcacttgtagacacctgcataatttcatgcactgcgtttcactctctattgtaataggttgtggtacatctttcgtctccctcgtcctaat-C-ACAT-ATA-GACGTTAATGATAAA---------AAAAG--G---CATTAC-TACTCTTTTA--T-CAA---TATA-ACACAG----AAT-A-ATCA-AT-GTA--CAACA-TTT-CA------------GAAAA-----AGAG-AGGT--G--G----AGCCATCGGCATTT--T--GAAA--T-A-CTAGG-----C-----------CC--G-AAAT---T-C-CT--------TGA--A--GTTT-TTTT---A---G--CAA-A---T-TTTC-CA-T----T-TATGA-T-TTTGT-T-C-AATTT---C----A---AAACCAAATTTC-AA-T-AAA------C-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGACATGATTGA-TG-----G--TAC-TATACTTT-CAT-GACTATATA------TTG--AA---T-TT--T-TTT---AA--TAACAGG--A---AAAAA----A-TT-AAT-ATTTC-ATATGGT-CCTTA-AA-AT-T----TGC--C-A--TA-T-AC-GT-CT--ATT------AC-T-AGA-ATAA--A-ATATG-AGAAA-TGT--GC-A-TCGTTA-C--ACA-TA---TTTTACAAATAT-A-AGATGA-AATG------TCAA-ATAAAGC-TA--CTA-CTT-TTA-TAA---TTT-A-C-AACAATT-AATTCAT---T---G-CC--A--T-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCATTTT--A-AAACTAATGT-CA---GCCC---GAA-T-TT-CT-CT-GAACAGCTTTTCT----C-TCACAATTTCAT--G-TTCT--------AAA-T-TGT-C--TTCAAT-CAGT-AACAA----A------AAAAAAAAA----AAAAAA------AAG-AAAAAACC-AA--AGAGCA-AAAAATTAA---A-TGG--AAAATGAACC-ATGGT-AC--ATA--T--TCAT-ATGACTATGATTT-ATGCCCCTTT--CCAT-GT-A--C--T-CAA--CTTTCACA-A-TGT-----GATA---CAA----AGGAAAAGGTTAA--TGTTTCAT----A--TCTC----CTCGTCA-TATCGA---CT-AC-ATGAAA--ATATG-A--TA-AATGA-AAATTG-GT-AT---CA-ACAA---AT----GTG----AAAGGTC-GTTATCAA-A--ATTTT--CA-AC-T-ACA-G-AGTAACATG-GA-AAT------AAGGAAGCAGC---ATAC-ATT-TT-CAT--AAATAT-AC--AAATTATTC--ATG---TGT-C-AA-A-TC--TCAGAAAA---AGATT-GT---------GCACG-CATA-TG---A--A--AATATTCAGGC-T-C-------TGCAA-TGAAG--TT-GCGAACGAAAACCA--T--GAA--CCTG-TAT---AC--A--AT---TAT-T-TGGTTAA-CC-ATAT--GTCAC---T-CGAACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-G----AC-A-AG-AC-AAGTCA--AATTG-G-TCTT-ATA-TTATGATGGTCCAA-GTAAACAA-CCTTAAC-CTGCTCATGCTG--CTGGGAG-A-C--AA--A-TATCTG--G-ATGA-CCTCTGTAAGA---CT
gi|7 : ttacacatattttaGAGTGTGAGATCGA-GATGCAAA---AGTA-ATGGGAAA-CAACCATG--TTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GAC-A-ACTGGCTGTGATCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAGACCGTAT-GCCC-TCA-GTGGGCTGTCAAC-TCAAGGG-ACGGATAAC---GTGTATC--TT-T-TTTTTACAAAT-ATAGTC---AT--A-TACTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CAATGT-AAAAT-AT-AAAATACT---TGAT-TTTT--ATTA--AA-A-T------------GTA---AACATCTGT-CTA---AA-AGTTT--AA-AACC-A-ATAAAAAGAAA-TTGTATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---CCA-CC-AAATG-AC-TT--CATTTT------TTCAA-TGC----------AA--AATTC-CGATAAAA---TTGTG-AATT-TAA--AA--CA-A----ACTTG--T-A-AAAG-C-ACAG-TCA-GA-GTAA--GG-AAA--C-TG---AAAAAGAA---CA--ACCTTATTGT-CA--TTAAA--ATATT-AAA-AC----ATTCACATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----AGAG-AG-TCTG--G----AGCCAT------TTCTT--GAAGACT-A-CTCAG-----C-----------CACCG-AAAT---T-CACT-C------TGACCC--GTTT-TTTTTTCC---A--CAA-AGAAA-TTCC-AA-TGT-TTCTA--G-T-TT-GTCT-C-AATCT---CTCCAA---A--------TTC-AAAT-AAAA-A--GC-AA---T-ATGGAAACAATG-A-A--AA-GT-A----AC--A-TG-----GAATCT-TATA-TTT-CAT-GAATATATGGATTACCTG--GAAGTT-TT--T-ATTGTATAACTAACAGGGGAGTAAAAAA---TA-TCCAAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-ATAC----CACAAC-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------ACCTCAGA-ATGATAA-GTATG-AGAGAATGT--GCCACTTGTTA-TC-ACACTA---TTTTACAAACATTATAGA-GTTAATGA--AGATAAA-AAA--GCATA--CAG-CTTCTTA-AAAA-CTAT-AAC-AACAATCCAAT-CA-ATGT---GACA--GTAT-AT-----AAAC-AGA-GTGG-AG--CCA-TTTTTA-AAAC-AA--TACG---ACCC---GAACT-TTCCT--T-GAACAGCTTTTTC----TAGCAAATTTTT-T--GCTTCT--------AAAAT-TGTTC--TTCAAT-CA-C-AAT-A----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAACCCCTCAAA-AAAA-------------GA-AAAGATTAA---ATTGG--AAAAT-AA-C-AT-GT-ACA-ATAT-T--TCATGG-AACTA-----G-ATGCC---TT--TC-T-GTAtag
gi|8 : ggtagtacCCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTAACTAATTATATC-TC-----A-CTTGCTCCAGC-TACA-TAC-GA--TCAG-TTCCTTGCAATCT-CCG-GCAGC--TG-TTACA
gi|8 : ccT-AA-CG--AAA-GAAG----TCT----------AA---A-CAAC----C--TGGATCAATC-G-TCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTA-CCA--CTG-ATTCCTGT-----GTTACTA-TAA--GAATTCTAA-CAA-CATTTT-ATCATGTGC-TA-C-ATACATTACTAC---TTGT-CGGGG-ATC--TATTACTACTTT---A-TAGGGC------TATTGT---AA--TTTTGAGTCTT-CTGAG-A-CGCTCGTATATA-----ATA-CCT-GC-----CATT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATGT-GGTCG----------ATATTCACCTCTGGTCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggataacgaaagaagtctaaacaacctggatcaatcgtcaacacatcttgatggttggtaccactgattcctgtgttactataagaattctaacaacattttatcatgtgctacatacattactacttgtcggggatctattactactttatagggctattgtaattttgagtcttctgagacgctcgtatataatacctgccattattatcaaacgacttttcttaccaatttttgaatagatgtggtcgatattcacctctggtcc
gi|9 : cccctgtgtgtttatcaacttggcacaattaattaactaattatatctcacttgctccagctacatacgatcagttccttgcaatctccggcagctgttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggaCCATGGTTCATATGGTT-TGA-CCATGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGAc
gi|9 : CATTCAGCTCCTAAAGACAT--TTCCTT-CCTATTCCTATGCTGGGAC-GAACATACAAGTGTATGAGTTGACCAAAAGT-GCCTCC-A-ATTTGGAT-------AGGGGGGGGGGGGACAAGAATAGGCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTG-TTA-C-AACTTGGCTTGA-CAATTAATTCACT-ATTATATC-TTGCAAAAGCTTGCTCCAACATACATTACAG---TCAGTTTCCTTGCA--CT-CCGAGTGCTTTTGTTTatatatctacacaattgattagtattatacatcaattcattcagctcctaaagacatttccttcctattcctatgctgggacgaacatacaagtgtatgagttgaccaaaagtgcctccaatttggataggggggggggggacaagaataggctcaacgaaggaaatttatctacctgtgtgttacaacttggcttgacaattaattcactattatatcttgcaaaagcttgctccaacatacattacagtcagtttccttgcactccgagtgcttttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111
lowQualScore : 444444444444 11 11 111 111 1 1 111 1 222222 1111 111 11111 11 333333333333333333333333 111 222 11 1111 111 222222222 222 111111 33333333333 1111 1 111111 1111111 111111 1 11 1111 11 1 1111 333333333333 1111111 2222222222 111111 11111 1111 44444444444444444444444444444444444444444444 111111 111111 11111 11111 11 333333333333333333333 2222 11111111111 111 22222222222222222222 11 11 111 1111111 111 333333333 222222 1111111 222222222 11 2222 111 1 11111 11 11 111 1111 1111 111 111111 1 22222222 33333333333 1111 111111 33333333333333 111 1111 1111111 1111 22222222 1111 22222 222 1111111 44444 1111 11 111 22222 11 3333333333333 11111111111 111 1 1 222222 222222 1 11 11 111 1 1111 222222222 222 1111 1 2222222 111 1111111 11 111 111111 2222 1111 11 111 22222 222 4444444444444 1 4444444444444444 1 1 2 3333333 11 11 222 111 333333333 1 222222 1 1 1 1 11 22222 3333333 11 1 1 222 1 1 1 11 1 1 1 1 1 11 11 11 1 11 2222 1 1 1 11 1 8888888888888888888888 11 222 1 1 11 1 1 11 1 22222222 1 22222 222 1 1 1 1 1 1 11 222 11 1 1 1 111 1 1 1 1 1 1 1 333 1 222 2222 11 1 1 11 11 1 1 11 1 1 1 11 1 1 1 1 222 3333333 11 1 1 11111 1 11 1 111 1 1 1 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 11 1 333333333333333 222222 22 2222222 11 22222 2222222 1 11 1 1 111 1 11 1 1 1 11 111 222222 1111111 11 22 1 222222 1 22222 1 33333333333333 2222 33333333333333333333333 1 11 1 1 4444444444
lowQualScore : 111111111111 88 0 8 11 0 0 0 8 0 5 8 8 11 8 111 8 44 8 8 6 666 3 2 1 6 6 6 77 6 111 77 5 5 5 2 888 77 5 3 222222 2222 5 77 77 0 77 000 5 5 55555 5 00 77 5 333333333333333333333333 1 000 5 5 000 5 1 5 5 0 5 5 33 2222 000 77 333333333 77 5 77 111 5 5 5 5 5 77 666666 44 00000000000 77 1 5 5 7777 1 5 888888 5 2222222 777777 5 5 5 55 5 0 0 66 5 1111 888 888888 66 5 0 77 66 4 00 5 0 0000 0 2 5 5 5 2 5 5 5 777777777777 6666666 5 5 2222222222 0 666666 33333 1 0 3333 99999999999999999999999999999999999999999999 555555 5 1 555555 5 77777 5 11111 5 4 5 5 00 4 5 5 888888888888888888888 5 5 5 2222 5 99999999999 000 77 5 77777777777777777777 5 5 66 5 7 1 00 1 99 000 5 77 5 8888888 1 111 000000000 6 6 6 6 6 888888 7777777 6 6 6 6 99 666666666 6 99 6 6 1 7 55 6 6 3333 6 888 1 5 1 5 5 55555 1 5 0 1 77 3 5 5 77 777 66 5 5 5 5 22 000 888 1 5 5 4 5 5 5 77 5 8888 55 1111 1111 000 0 555 5 5 666666 5 5 8888 00000000 6 5 5 77 5 5 55 33 00000000000 2222 666666 5 55555555555555 000 5 77 5 3333 5 5 8888 5 5 6666666 1111 77 5 44444444 99 4444 00000 111 8888888 1 77 00000 2222 33 777 0 44 99 55555 6 6 33 6 1111111111111 77777777777 888 6 1 6 6 666 6 6 6 6 99 3 6 666666 1 777777 888 3 88 3 0 0 0 11 0 444 0 6 6 6 99 5555 6 666666666 1 6 6 6 6 000 88888 1 5 5 7777 4 5 999 5 1 5 77 77 77 4444444 88888 000 5 5 5555555 66 33 000 5 5 5 5 5 3 5 33 5 5 5 77 0 77 777777 5 5 7777 6 6 6 6 4444 6 99 55 111 6 6 6 99 6 44444 888 6 7 000 0 1111111111111 6 1111111111111111 8 8 8 8 0 8 3 2 0 0 0 6666666 33 3 0 22 3 333 666 6 88 0 3 333333333 1 8 8 55 11 0 2 444444 3 2 0 5 5 1 5 88 66666 1 2222222 44 8888888 2 5 000 1 5 5 5 88 5 5 5 5 5 88 66 1 88 5 1 88 1 3333 5 5 5 88 5 1 5555555555555555555555 88 1 111 5 5 88 5 5 77 5 33333333 5 66666 000 5 5 5 5 5 1 5 88 000 88 5 5 2 5 999 5 5 5 5 5 3 6 3 111 3 111 4444 88 1 5 5 77 1 1 1 7 7 44 6 6 3 0 3 1 1 88 1 22 6 0 3 3 0 6 6 7 3 1 88 5 5 5 1 22 5 111 1 1111111 1 88 1 5 7 3 0 2 88888 3 3 0 22 0 3 3 3 777 3 3 3 0 3 33 5 3 5 5 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 1 11 6 99 3 99 222222222222222 6 000000 11 2 99 1111111 44 00000 8 6666666 0 33 0 0 3 2 111 0 33 5 0 0 33 3 44 777 2 888888 3 9999999 33 99 0 111111 0 55555 3 0 44444444444444 00 1111 77777777777777777777777 0 33 5 1 0 9999999999
lowQualScore : ............ .. . . .. . . . . . . . . .. . ... . .. . . . ... . . . . . . .. . ... .. . . . . ... .. . . ...... .... . .. .. . .. ... . . ..... . .. .. . ........................ . ... . . ... . . . . . . . .. .... ... .. ......... .. . .. ... . . . . . .. ...... .. ........... .. . . . .... . . ...... . ....... ...... . . . .. . . . .. . .... ... ...... .. . . .. .. . .. . . .... . . . . . . . . . ............ ....... . . .......... . ...... ..... . . .... ............................................ ...... . . ...... . ..... . ..... . . . . .. . . . ..................... . . . .... . ........... ... .. . .................... . . .. . . . .. . .. ... . .. . ....... . ... ......... . . . . . ...... ....... . . . . .. ......... . .. . . . . .. . . .... . ... . . . . . ..... . . . . .. . . . .. ... .. . . . . .. ... ... . . . . . . . .. . .... .. .... .... ... . ... . . ...... . . .... ........ . . . .. . . .. .. ........... .... ...... . .............. ... . .. . .... . . .... . . ....... .... .. . ........ .. .... ..... ... ....... . .. ..... .... .. ... . .. .. ..... . . .. . ............. ........... ... . . . . ... . . . . .. . . ...... . ...... ... . .. . . . . .. . ... . . . . .. .... . ......... . . . . . ... ..... . . . .... . . ... . . . .. .. .. ....... ..... ... . . ....... .. .. ... . . . . . . . .. . . . .. . .. ...... . . .... . . . . .... . .. .. ... . . . .. . ..... ... . . ... . ............. . ................ . . . . . . . . . . . ....... .. . . .. . ... ... . .. . . ......... . . . .. .. . . ...... . . . . . . . .. ..... . ....... .. ....... . . ... . . . . .. . . . . . .. .. . .. . . .. . .... . . . .. . . ...................... .. . ... . . .. . . .. . ........ . ..... ... . . . . . . . .. ... .. . . . . ... . . . . . . . . ... . ... .... .. . . . .. . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . . . . . . . . . . .. . . . . .. . ... . ....... . .. . . . . . . ..... . . . .. . . . . ... . . . . . .. . . . . ................................................................................. . . .. . .. . .. ............... . ...... .. . .. ....... .. ..... . ....... . .. . . . . ... . .. . . . .. . .. ... . ...... . ....... .. .. . ...... . ..... . . .............. .. .... ....................... . .. . . . ..........
lowQualScore : 444444444444 88 8 0 00 8 8 8 0 8 6 0 0 00 0 888 0 00 0 0 7 555 3 5 3 7 7 7 77 7 777 99 7 7 7 0 666 99 7 0 111111 1111 7 99 99 7 99 000 7 7 99999 7 77 99 1 999999999999999999999999 4 000 7 7 777 7 4 7 7 1 7 7 66 1111 000 99 111111111 99 7 99 444 7 7 7 7 7 99 444444 33 00000000000 99 7 7 7 9999 4 7 333333 7 7777777 444444 7 0 0 44 0 0 4 00 0 2222 888 888888 99 0 4 66 11 4 66 0 0 6666 4 5 0 0 0 2 7 7 7 111111111111 7777777 7 7 1111111111 7 444444 77777 6 1 6666 11111111111111111111111111111111111111111111 111111 7 7 999999 7 44444 7 66666 7 0 7 7 77 3 7 7 444444444444444444444 7 7 7 0000 7 00000000000 999 99 7 00000000000000000000 7 7 44 7 9 7 77 4 33 000 7 99 7 4444444 0 777 555555555 7 7 7 7 7 555555 7777777 7 7 7 7 22 888888888 7 22 7 7 7 3 88 7 7 0000 7 333 4 7 7 7 7 33333 4 7 1 4 99 9 7 7 44 111 44 7 7 7 7 11 000 666 7 7 7 9 7 7 7 99 7 3333 77 6666 7777 000 1 999 7 7 666666 7 0 7777 77777777 6 7 7 99 7 7 99 77 77777777777 1111 444444 7 00000000000000 000 7 99 7 9999 7 7 3333 7 7 6666666 4444 99 7 00000000 22 0000 00000 444 9999999 7 99 44444 1111 66 999 8 66 22 22222 7 7 88 7 0000000000000 33333333333 333 7 7 7 7 888 7 7 7 7 22 3 7 888888 0 555555 333 3 33 8 8 8 8 00 8 000 8 7 7 7 22 2222 7 777777777 0 7 7 7 7 888 99999 9 7 7 0000 9 7 666 7 4 7 99 99 99 1111111 99999 000 7 7 9999999 44 66 000 7 7 7 7 7 6 7 99 7 7 7 99 7 99 333333 7 7 9999 7 7 7 7 2222 7 22 88 777 7 7 7 22 7 88888 333 7 3 888 8 2222222222222 0 2222222222222222 0 0 0 0 8 0 2 5 0 0 0 0000000 22 2 2 55 2 222 222 0 88 8 2 999999999 4 0 0 88 55 0 5 888888 2 5 0 5 5 0 0 00 00000 0 0000000 77 3333333 0 0 000 0 0 5 0 00 5 5 0 5 0 00 00 0 00 5 0 00 0 0000 0 0 0 55 0 0 0000000000000000000000 00 0 555 0 5 55 0 0 55 5 00000000 0 00000 555 5 5 5 5 5 0 5 00 555 00 0 5 5 5 000 5 5 0 5 5 3 7 3 777 3 555 0000 00 0 0 5 55 0 0 0 3 3 77 7 7 3 7 3 0 0 33 0 00 7 7 3 3 7 7 7 3 3 0 55 5 0 5 0 00 5 000 0 0000000 0 55 0 5 3 2 0 5 55555 2 2 0 55 0 2 2 2 000 2 2 2 0 2 00 5 2 0 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0 00 7 22 3 88 888888888888888 7 888888 77 5 22 7777777 77 88888 0 0000000 0 88 0 0 2 5 000 0 88 5 0 0 88 2 88 555 5 888888 2 8888888 88 00 0 000000 0 00000 2 0 88888888888888 55 2222 22222222222222222222222 0 88 5 2 0 5555555555
consensus : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ATTG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATG-AGAAAATGT--GC-A-TCGTTA-TC-ACA-TA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAA-AAAAAA---AA--AAAGAA-AAAGATTAA---A-TGG--AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G-C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC--A--AT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACTTCTTTGCTAT-A--AGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---A-CAACA-AAC-ATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
Reference ( family-290 ) : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ATTG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATG-AGAAAATGT--GC-A-TCGTTA-TC-ACA-TA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAA-AAAAAA---AA--AAAGAA-AAAGATTAA---A-TGG--AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G-C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC--A--AT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACTTCTTTGCTAT-A--AGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---A-CAACA-AAC-ATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|1 : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---AGTA-ATGGG-AA-CAA--ATGATTTTGGTATCAAATGGATACACA-CA-TGTCTG--GACC-AATG-CT-TGGTCAT-GA-AAT-AA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGACAAACCTAAGGGCA--TGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TAGTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA--------------GTA---A---TCTGTTATA---AA-A-TTT--AAGAAAC-A-AT-AAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCACCTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTGT-T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AA-----CG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----A-TCA-ATCA-AT-GTTTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T-----G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-ACAT---T-C-CT-C------TGACCA---TTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AAGTT---C----A---A--------TTC-AA-TAAAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATT-CCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT--CTTA-CA-AT-C----CAC--C-AATTA-TAACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATGAAGAAAATGTGGGC-A-TCGTTA-TCAACA-TA---TTT-ATAAACAT-AT-GA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGTATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATA--A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAAC-AA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAAAT-TGT-C--TTCAA--CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAATAAAAAACGCAATTAAAGAA-AAAGATTAA---A-TGGGAAAAATGAA-C-ATGGTAACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGTA----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATACTAA--TCTC----CTCG-C--CATC-A---CTCACAATGGAA--ATAT--A--TG-AATG--AAATTG-TT-AT---C---C-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----TAAAAAAACA-----ATACTATCGTT-CAT-AAAATATAACAAAAATTAT----ATG---CGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAG---AAGTT-GTGGGGGGGGGGGA-G-C-CA-TT---A--G--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-CC-AAAACCA--T--GAA--ACTGAAATGA-AC--A--TT---TTT-T-T-----T-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGCAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTACAA-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTTAATA-TA---ATGG-CCAT-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---A--A-C-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTTCATGCAA-TGC-TTTCACTTC-TTGCTAT-A--AGTTTGTGGTAA-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTG----C--TTTT-GGATGAATTTGAGTCTTT-GGCAGTATGTGTACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTATGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACTGG---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGGAATCTGCAGTA-TATGTGATCTTCTTGGCTAAAAATACAATA-AAT--TTTAAATTAAGTTGGCCATTGGTAAACTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACAAGACTTTTTACTCC-CGTG---CCAAATACAAT-TATAATATGAT-GTATTCTGCTGCC--TGTGAAAT-AAAAGCAATATTT-GAAG-AACA-AATA--TGCCCCCATCTGGTACTGTAAGTCGTACTATA----TTGCAC-AATTGTAT-AG-AATA--ATCTCTGCTTCGGTAACTTTTTGA----------------------ACATTTTTAATCTTGAAGAATTTCAAAACCAGG-TATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTTCTCCATTGATC-----AATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGT-TATAAACAAAAATAAAAATAACCTTT-AATTGGCAAAAAAGAC--TATGTTTGAATTGTGGTT---TGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCATAAT-CCTCGAACAAGAGACAACAAGTTTCCACAAATTTTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGTCCCACAACTT--AAACGGAAAGTACCAACACCCTTCTGACCTTCATCTATGGATTAAATATTTTAAAATG---TTTATG----TGTATATTTGTAAAAGAAAAAATGCATGGCAATTAAGCTCAGGAGATTTGTTAATTAACTG-TACTGATATCATAACTGGTC-TCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCAGTAAATGAATTTTTAAAATTAAAAATCTAACACTGCATGCCATGGTTCATATGGTTGTGGCCCATGCA-TATTGACTTGTTTTGTTTGACATTCAAGTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTAT-CTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGATGACCACTAGTTGCCTCCCACATTTGATTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGCACAAGA--AGCCTCAACGAAGAAAATTTATC-ACCTGTGTGTTTATCAAACATTGC---ACCAATTAATTCACTAATTATATCTTT-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCAGC-TTGTTTACATATATA-ATATATATAT-TATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCT-CTTCACAACGGGGAATAACGGGTAATA--ACTCT-AATCG---AA-GAA--CGACCT----------GA---A-AAAC--AAC-ATAGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTGAATTCCT-T-----GTTACTAT-AATGAAATTCTAAC-AACCATTTTTATCATGGGCT-ATC-ATACATT--TACACATTAT-CGGGGAATCTATATTACTAACTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCT--CT-GAGAAC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---CTTTATTA--TCTATA----TTTTTTGAAA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|10 : GAGTGTGAGATCAA--------A---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTT-GGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-AT-A-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AACAA---GAGTATAG-CCGTTTGCCCC-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TACTAATTTAAA------ATAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGA--TTTT-TATTA--AATA-T------------GTAAC-A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT---A-AAAC-A-ATGAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCACA--GCGC--C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC-----------A--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATC-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-TG-GT-AATGG-AAA--C-TG---AAAAA--
gi|11 : aaggtagtacTATT--TTGTGTTCTCAATAGTTGTAAT-----T--A-CAATGATTTAAAAGTATCTAAAATTTTA-AGAGTAAAAACAATGA--CA---T-AAAATTAT-ATAATA-TAGTTGATATTTTATATTA--ATTA-TTGTTGACATCAAGTA---A---TGTATGCTACAAAA-G-TTTCAAG-AAACTA-ATAAAAA-AAAATTG-ATAAGGAGCGTAAAATT--CTATTAACGCG--CTT--TAC-TCGCGATGCGC--C-A-CCTTA-TGTATGTCTTCAATTTAAATAATCGAGCTACCGACACTCTTAAGTATATT-CG-TGAAAATTTTGTGTGATT-TAAATT---CA-ACACTA-CTGATT-ATGA-G-CAACAGTACA-GA-GTAATAGG-AAAATC-TGTGTAAAAA--AGAGCA--AC-TTTATTTTCAATT-AAA--ATAT
gi|12 : tcttttcttaaaaattTT-ACACAC-C-ATAAC-AT-AAT----AAAAAAA-TAAAAGCATA--C-A-CTT-T-A--AAA-ATG--A-C-AATAAAC-AAT-CA-ATGTCTGGACC--AAAT-TTTCAGCAAAATAGA------AGTTCCA-TTT--A-AAAATAA--T-CA----CCCAGTGGA-TATCCCTACTAGAACAGCTTTTTTTCTTCACCAAA-TTTCATTTGTTACT--------AAATT-T-T-C--TTCAAT-C--C-GACAA----A-------AAAAAAAA----AATAAA------AAA-GGGAAA---AA--GGATAATAAAGA-TAA---A-T-G--AAAATGAA-CTGGGGT-ACA-ATAT-A--ACA--G-A--CA-----C-ATACC----T--TCATCGTAC--CTTTCAAA--CTTTCATCCT-TGTTAATCAACAAAGGAA----A--AAAAGG-TAA--TGTCTCATAC-----TCTCGTTGCTCGTCCACATCGA---C
gi|13 : GGGTAATAGAACTCTTAATCGTTAAATGAAGTAGACTT----------GATATATCAACA-AACCATGGATCA-TC---TCAATTCACATC-------TTGAATGGTTGATATTTACACTG-ATTCCT-TAGATGGCTACTATTAA--GAATTCTAACCAA-CATTTTTATCACGTGCTTA-CGATACATT--TAC-CATTGTCCGGGG-ACT--TATTACTATCTTTAAGCTAGGGAATATGTTAAAGTTCCAT--TT--GAGTCTCACTGGAG-A----CGC-TATAAACCCATAACCTAGCTCCTGCGATATTAAATTATCAAATAAACACCTTTTTACT----TTAGCCC---AATATATTTTTG-AAACCAGAATTTGGGTCA--A-------ATA
gi|14 : gaaaataatactgt--T-AAA--ATATGTGTA-ACCGATAT----ATCA--T-GTGACCAA-A-TTT-CAGAAAGAAAAAAGGAAAA-----A-AG-AG-T--G--GCAACAACCAT------TT--TTGGACAAATCATCTCAGACTCTC-----------C---GAAAAT---T-CTCT-CTGGTCTTGACCAGGGTTT-TTATATCA---GAACAACA---ACTTTCGCA-TGT-TT-TATGAGTGTT-GTCTGC-AAATTATGC----AC--A--------TTC-AA-T-AAAAGA--GCAAAAT-T-A-------AATG-G-A--AATATGA----AC--ATTGATGATG--TACACATA-TTT-CAT-GACTATA-A-ATTACCTGAAAA---T-TT--T-ATTA--TA--TAA
gi|15 : GATACTGATATTATATCTGGTAATCTTTTTTCA-TACC-TGTATGTACATTGTACAATTATCGGT-AATGAATTTATATAA--AAAATTCTAACACTACTAA--AAGTTTCTTGCCATT-TGA-CCCCA-AGTAT--AC-TG
gi|16 : GTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA-----GTTTGT---------GCA-G-C-CAATT---ACGA--AAAAATC--GC-C----AAAATGCCAAATGAAAGTTG-TCG-AC-CAAACCA--TACGAA--C----AGTGATAC--ACCAT---ATT-T-T-----C-C--ATAA--TCCACGAAT-CG-ACCGTAA---CA-GA-AAAAT-GCGACAAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AA-A--T-TCTT-AC--T----ACGT-C--A-GT-AACAACC----ACACTG--CA--CTGA-CT---AGAA-CGAAA--A-TATCCAATA-AT-ACGC---GTAAGAAC-CTGCCA-A----------GA-TG----TCAC-----TGCTATCA--ACGTTGAGGT-A-CAT-TGTTTTTC-CCCatatgacctcgaatgtgatcctgactcccactatgaattgactttggattttcttgacattctatggaagtttattatcaataaatgagaagaaattgtgtcgtcaaatatgtgttaactttctgcagatcaacatttttttttcataccaca
gi|17 : --ACTCT-AATCG--AAAAGAAG-AGACTTTTTGAAGTCTGA---A-AAACA-A-T-ATGGATCAATC-GCTCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTAC--A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCCAAC-AA-CATTTTTATCAT-TGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TA--------TT---ACTAGGGA------T-ATGT---AATTTT--GAGTCT--CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGA-----------------------TTTT---T----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATAT-GGTCGCTATGACACCACATCCACCTCTGGTC
gi|18 : ATAATGGGGAATAACGGGGAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------CA---A-CAACATAAC-ATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATCTTTTTTTTTG-ATGGTTGATACC---ACTG-ATTct
gi|19 : gtctactttcatttcacaatggggaCTTTCTATTTCACAACGGGGAATAACGGGAAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------CA---A-CAACATAAT-ATTGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-ATGGTT
gi|2 : ttgtttaaataaaatgcaggggtttaatatctaAAATAAAAAA--GAGTGTAG-CC-TGTTGCCTCCTA-CCTG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A---GT-ACTCTGTGTATTTCTT-T-TTCTTTAAATT-AT-GTCC--ACTAA-TAGCAA-TTAAA------TAAA----TA-A---TCAAGG--AATA--CA---T-AAAATTATAAAAATA-G---TGAT-TTTG-TATTATCACTATT------------GTAAACA---TCTGTTCTA---AA-A-TTT---A-AAAC-A-ATAAAAA-AAA--T--ATAA----CGTA---TT--CTATA-----A--CTTGCTACTTCGCA--GCG---C-AGCT-TA-TG-ATGTC--CAATTC------TTCAACTGC-----------A--GAATT-CG-TAAA----TTCTGAAATT-TAA--TCCACA-A----A--TG--TGA-AA-GTC-ACAG-ACA-GAGGTATA-GG-AAA--CTTG---AAAAA--A----A--AC--TA-TTTTAA--T-AAAATATATA-ATA-AG----ATTCA-ATCACAT-GTGCCCAA-A-TTT-TATG----------AAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AACAAT------TT--T--TGAAAAT----TCAG-----C-----------C---C-GAAT---TAC-CTGC------TGA-CA----TT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA--GTCTT-TACGA-T-TT-GTCT-CAAATTT---CA---A---A--------TTCAAA-T-AATA-ACGGC-AAAT-TAA-------AATGCG-ATGAA-ATGA----AC--A-TG-----G--TA--TATA-TTTCCAT-GACTATATA---TACCTGA-AA---T-TTTGT-ATT---TC--TAACAGGGAT---AAAAC---C-------T-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-ATGG----CAC--C-AAGTA-T-ACCGCGTC--ATTG-----AC-TCAGA-ATGA--AGATATG-AG-AAATGTG-GC-A-TCGTTA--C-ACA-TAT--TTT-AC-AACAC-ATAGA-GT-AATCG----AT--A-AAAAAGCATAACCTA-CTT-TTA-TAAG-ATATAA-C-AACAATT-AAT-CATGTG----GACC--AAAT-TT-CAG-AAAA-AGT-GTGGTAG--CCA-TTT--T-AGAATAA--T-CAGCGGCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT-----AGCAAA----TAT--TTTTCTGTTCAAAAAAAATATGT-C--TTCAAT-CA-C--ATAACCCCCC----CAACAAAAAA----GCAACC------CAA-AAAAAG---AA--AAAGA------GTTAA---A-TGG---AAATGAA-C-A--GT-ACAGATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGTT---TT--TCAT-GTA-------CCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACAT--GAA----AAGAAAAGGTAAA--TGTTTCAAAC-----TCTC----CT-GTC--CATCGGAT-CTCA-AATGAAACGCTAT--GACTG-ACTGA-AAATTGTTT-AT---CTAAC-AGACAT----GTG----AAT--TC-GT--TCAC-A-TATTTT-ACA-ACATAACATG-AGTA--ATGCAA-AATAAAAAAAAAAAAGCAGACTGGTACTATT-TTCCAC-TAAATATGACAAAAATTATTC--ATA---TGTCCAAA-A-TCGTCCAGAAAA---TAGTA-TT---------GAG-GCC-CA-TTATGA--A--AATAGTCA-GC-T-C-AAGAATGCCAA-TGAAA--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-TATGA-GC--A--ATGAATTT-T-C-----C-CA-ATAA--TTCCC---T-CG-ACCGTAATG-CATAA-AAATT-GCAA-AGTGTAC-A-AGAACGA--TCAACAATTGGG-TGTT-ATATT----ATGG-CCAA-GT-AAATA-C----ACACT--TCA--CTG--CT---AG-ACC-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAA-----ATGTAACTGCTTTTCACTTCTTTGTTAT-----GGTTGTGGT-AGCAT-T-TTTCTT-CCCTCTGT-CTAATTACTAT-TATCTTCTCTTGT--TCTTTTTT-GAATGGATTGGAATTCTT-GGCAGTA-G-GCACTACGTTTGAAAGTG-GTTTTTCT-
gi|2 : cTTGTTCT-T-------TTTTGA-ATG-GATTGGAATTCTTGGCA-GTAGGCACT-ACGTTTGAAAGTGGTTTTTCTCCACTGATTGTTGAAATccactgattgttgaaat
gi|20 : caaataaaaaagagtgtagcctgttgcctcctacctgctgtcaaactaagggagtactctgtgtatttctttttctttaaattatgtccactaatagcaattaaataaataatcaaggaatacataaaattataaaaatagtgattttgtattatcactattgtaaacatctgttctaaaatttaaaacaataaaaaaaatataacgtattctataacttgctacttcgcagcgcagcttatgatgtccaattcttcaactgcagaattcgtaaattctgaaatttaatccacaaatgtgaaagtcacagacagaggtataggaaacttgaaaaaaaactattttaataaaatatataataagattcaatcacatgtgcccaaattttatgaaaaaaagagtggaacaatttttgaaaattcagcccgaattacctgctgacattttttttcagcaaaatttccagtctttacgatttgtctcaaatttcaaattcaaataataacggcaaattaaaatgcgatgaaatgaacatggtatatatttccatgactatatatacctgaaattttgtatttctaacagggataaaacctatttcataatgtccttacaatggcaccaagtataccgcgtcattgactcagaatgaagatatgagaaatgtggcatcgttacacatattttacaacacatagagtaatcgataaaaaagcataacctacttttataagatataacaacaattaatcatgtggaccaaatttcagaaaaagtgtggtagccattttagaataatcagcggcccgaatttcctctgaacagcttttctagcaaatatttttctgttcaaaaaaaatatgtcttcaatcacataacccccccaacaaaaaagcaacccaaaaaaagaaaaagagttaaatggaaatgaacagtacagatatttcatgaactatatgtttttcatgtaccaactttcatttgtaacatgaaaagaaaaggtaaatgtttcaaactctcctgtccatcggatctcaaatgaaacgctatgactgactgaaaattgtttatctaacagacatgtgaattcgttcacatattttacaacataacatgagtaatgcaaaataaaaaaaaaaaagcagactggtactattttccactaaatatgacaaaaattattcatatgtccaaaatcgtccagaaaatagtattgaggcccattatgaaaatagtcagctcaagaatgccaatgaaatgtcgacaaaaccatgaacctgtatgagcaatgaattttcccaataattccctcgaccgtaatgcataaaaattgcaaagtgtacaagaacgatcaacaattgggtgttatattatggccaagtaaatacacacttcactgctagaccaaaatatccaaatagcttgtaagactgccataaatgtaactgcttttcacttctttgttatggttgtggtagcatttttcttccctctgtctaattactattatcttctcTTATC-AACTTG-C---A-CA-TTAATTCACTAATTTAATC-TC-CAAAA-CTTGCTCTAACATACATTACAGATTTC-GTTTCCTTACAATCTACCGAGCACCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATAT
gi|21 : A--ATATG-A--TG-AATGAGAAATTG-GT-ACAAAC--A--A---ATACTAGAA----AA---TC-GTAACAACTA-T-TTTT-ATACACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAGAAAAGCA-------ACTA---TT-CAT-AAAATA
gi|22 : CCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTTCC-ACACCCATCTGACCTTCATCTATGGATAAATTAATTG-AAattata
gi|23 : TTTCAT--T-TGT-----AGCAG--GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTCCATAC-----TCTC----CTCGTC--CATCGACAGCTCACcaatcgatataat
gi|24 : ---CA--AC-TTATTTCT-A--T-AAA--TTATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTC
gi|25 : TGGTA-AACTAGATAAGATGGTAT-AAC-AAATTTTTTACTCC
gi|3 : GAGTGTGAGATCAAAG-T---AATGGGGTATATGGGAAAACTA--ATGATTTTGGTATC-A-TGGATCTACAGTAATGTATGTGGACATATTG-CT-TGG-CAT-GAGAATAAA-AAAAAAAAGAGTGTAG-CCCGTTTGCCT-CTAAGTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-CT-----AAAT-AT-GTCCCTAT--AATACTAATTCAAAA-----TAAA-----A-AG--TCAAGG--ATGAACTA---TCAAAATTAT-AAA-TA-T---TGAT-TATT-TATTA--A-TA-T------------GTAGACA---TCTGTTCTA---AATA-TTTTAAA-AAAC-ATATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TTTTCTAT------AACTTT--TAC-TCGCA--GCGACCC-A-CC-T--TG-ATGTC--CAATTT------TTAAACTGC----------AA--TAATTACG-TAAA----TTGTG-AATCACAA--T---CA-A----T-TTG--T-A-AA-G-C-AC-G-ACAAGA-GTAA-TG--AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATGT--CA--T-AAAT-ATAAA-ATATAC----ATCAA-ATCA-GTAGTGTCTAA-AATTTATA------------GAAAACATCGA-GGTAG-T--GTAG----AGCCAT------TT--T--GATAAAT-C-CTAAG-----CTAGCTAAATACC---G-AAATATTC-C-CT-CGT----TGAA-A--GTTCATTTTTTCACCAG--CAA-A---A-TTTC-CAATGT-TT--ACGA-T-T--GT-T-C-AATTT---C----ACAAG--------TTC-AA-T-AAAA----GC-AAATGT-A-------AATG-GTA--AA-ATGA----A---A-CG-----G--TAC-TA------------A-TATAAA-ATTACCTG--AA---TCTT--T-ATT---TAC-TAACAGGGGA---AAAAAACATAATT-AATTATTTC-ATAATGTTCCTTAGCG-AG-GAGAGCAC--CCAA-TAGT-ACCGT-CCCCATCCTTGTAACATCAGAGATGA--A-ATATG-AAGAAATGT-----A-TCGTTAATC-ACA-TAATCTTT-ACAAACAT-AAAGA-GT-AATAGGCAAATAAATAACAGGCATA--CTAACTT-TTAATAAATCTATGA-CTAACAATC-AAT-CA-ATGT---GACCCAAAATGTT-CAGAAAAA-AGAAGTGG-AG--CAT-TTT--ATAAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CC-TGACAGCTTTTCT----C-GCAACAATTCAT---TTTCT--------AATTT-TGT-CCTTTCAATTCA-CTAATAA----ACACAACAAAAAAAAACAAAAAAAAA------AAA-CCAAAA---AA--GAAGAA-AAAGATTAAACTA-TGG--AAAATGAA-CAATGGT-ACA-ATAT-TAATCAT-G-AACTA-----TAAAGCC---TTCGCTAT-GTAAAGCA-TCCAACTCTTTCAT--TATGT-----AACA---GAAGAGGA--AAAGGGTTAACCTGTTTCATACT-AACTCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATG-AA--ATATCGA--TG-AATGA-AAATTG-TTAAT---CA-AC-A---AT----ATGTGAAAA---TCGGTTATCAC-A-TATTTTAACA-ACAT-ACA-GAAGTA--ATGTGATAATA----AAAAAAAGC------ATACTATC-TTACATAAAAATATAACAAAAATTATTCCAATGAGCTACGC-AATACTC--TCAAAAAATTGAAA-T-GT---------GGA-G-C-TA-TTAG-A--A--AATGATCA-GC-TGCAAAAAATTCCAA-TGAAG--TGTTCGAAC-AAAACCA--T---AA--TCTGTAATG--AC--A--AT---TTT-T-T-----CACCGATAAATTCCAC---T-CC-ACCGCAATG-CATGAGAAATTGGCAA-ACGATAC-A-AGAAC-A--T-A--AATT--TATCTT-CTA-T----ATc
gi|4 : agtacGTGAGATCCA-------AA---GTT-----GGAAA-TAA--A-GATATTTGTATC-AATG-AT-CACC-TA-TGTATG---ACA-AT-G-CT-TG-TCATTGA-AATAAA-AAAAA---GA-TGTAGTCCGTTT---CT-CTA-ATGG-CTGTCAAA--TAAGG--A--GGTAA-TCTG-GTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-AT---CC--AT--A-T--CAATTTAA-------TAAA----TACAG--TCAAG---AT----CA---T-TAAATTAT-AAAATA-TG--TGAT-TTTT--AT-A--AATA-T------------GTA---A---CTTGTTCTA---AA-A-ATT--AA-AA-C-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATA-----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-T--ATGAT--CATTTT------ATCA--TGC----------AA--A---T-CG-TATA----ATGTG-AATT-TAA--T---CATA----A-TTG-------A-A-C-ACAG--CA-GA-GTAA-TGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TCATTTT-CA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-ATT-TA------------GAAAA-----A-GT-AG-T--G-------AGC-AT------TT---------GAT-A--TCAA-----C-----------C-----ACAT---T-C-----------TGACCA--GTTT-TTTTTTCAC--G--CAA-A-----TTTC-CA-T----T-TATGA-T-T--GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA----GC-AAAT---A-------AATG---A--AA-ATGA----------------------C-TGTA-CTT--ATCGA--AT-TA-ATTACCTAT-AA---T-TT--TTATT---TA--TAA---GAAA---AAAAA---TA----GAT-ATTTCCATATTAC-C--TA-CATAT-C----CAC----AA-T--T-AC-GT-CC--ATT------GA-TCAGA-A-GA--A-ATG-G-AGAAA-TGT--GC-A-TCGTTA-----CA-CA---TTT--CAAACAT-ATAGA-TT-AATGG--AAATAAA-AAAGA----A--TCA-CCT-TTA-TAAA-ATAT-A-A-CACAATT-AAT-CATATGT---GAC---AAAT-TT-CAGAAAAA--GA-GTGA-----CCA-TTT--A-AA--TAA-----A---ACCC---G------TTCT-CT-GAA--GTTCTTTT----CAGCAAA-TTTC-T--GTTTCT--------AAATT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AA-------------------------------AA------TAA-AAAAAA------------------ATT-A---A-TGG--AAAATGAA-C-AT-GT-ATA-A-ATAT--TCAT-G-AACTA-----T-ATGC-----T--TCAT-GTAA--C--T-CAA--C-TTAAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGT--A--TG--TCATAC-----TCTC----CTCGTC--C-TTGA---CTCACAATGA------AT--A--TGAAATGA-AAATTG--T-AT---C--AC-A---AT-----TG----AA---TC-GT--TCAC-AGTA-TTT-A-A-ACAT-ACA-G-AGTA--AGG-GA-AAT-----AAGAGAA--A-----ACA-TACT-TT-CAT--AAATATAACAAAA--TATTC--A-G---TGT-C-AC-A-T---TCAG--AA---AAGTT-GT---------GCA-G-C-TC-TT---A--AATAAAATTCA--T-T-C-AAAA--TGCAA-TGAA---TG-TCG-AC-AAA--CA--T--GTA--ACTGTTAT---AC--A--AT---TTT-T-T-----C-AC-AT-A--TTCAC---T-CG---CGTAATG-CAT-A-AAATT-GC-A-AAAGTAC-ATAGAAC-A--AAA--AAAT--T-CTCT-ATA-T----ATGG-TCAA-GT-A--AA-C----ACACTG-TCA--AT---CT---AG-A-C-AAA--A-TATCC---A-AT-A-GCT-TGC-AGA---CTGCCATAA-GTT----CGA-TGC-TTTCATT--------------------TGGT-A-CAG-T-TTCT----CCTTTGTCCTATATACTGT-TAT-TTCTATTG----C--TTT---GATGAATTGAAGTCTTT--GCAGTATG-TATCT--GGTTGTACATGTA-TTTTCT-T----G--GTTTGG-ATGTAATT-GAGACTTTGGCA-TTATGCAC--G---TTG-AAGT-GTTTT-CTCCAtgat
gi|5 : g--A--AATATTCA-GCGT-C--AAACTTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCATCT--GAAAGCCTG-T-TGA-CCGAG--AT---TTTATGT-----C-CC-ATAAT-TCCAC---TCCG-ACCGTAATGCCATGA-AAAT-----A-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AAAT--T-TCTT-ATA-TTCC-AT-G-CCAATGT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTGGCCT---AG-A-C-AAACTATTATCCGCCATAT-C-ACT-TGT-AGACACCTG-CATAATTTC-ATGCAC-TGCGTTTCAC-TCTCTATTGT-AATAGGTTGTGGT-A-CATCT-TTCGTCTCCCTC-GTCCTAATTACTGTATAT-TTCT-TTGTGGTC--TTTTGGGATGAA-TGGATGCTTTGGGAAGTATG---ACT---GTTG-A-AGGTGGTTTTCTCC----A-CTGATGG-GTG-AA
gi|5 : TAC-TGTATATTTCT-TTGTGGTCTTTTGGGATG-AAT-GGATGCTTTGGGAAGTATG-ACT-G---TTGAAGGTGGTTTT-CTCCACTGATGGGTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCT-GGCGAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGG-----CATTGGCAAAGTAA-------ATGGTAT-----GATGGGG------AAAAGAAACTTTTATCTCCGCGTACGCCCAAAAGCAATGTATA-TATGATGGTATTCTGCTGCCGTTG-GAAATAAAAAACAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCC-GCATGTG--ACTG-AGGGCGT--TAGAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTAT-TCTGCTTCGGGAACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATTTTTAA--CTGAACA---TCAAAAC-AGGTTATCTAA--TACTGT-ACTC-ATAAAAAAC--ACTGT-AATGAGA---CA---CCTTCATT-ATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTA-C-CGACTTATAGGGA-TGTATATAAACAAAA-TAAAAATA-CCTTTAAAATGGCA-GGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGC--ATGAACTGAAGAGGG-AGACCA-CACTTCTGGCAGACTAGTAATATTTCGGATAA--CACAACAAATT-CCACAA-CTCTCCAACC-CTCTGTCCATCCAAA-GCCTT-CGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTAAC-ACAC--------CCTTCATTTATGGGTTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAA--AAAAATTGCAT-GCAGTT-AGCTCA--AGTTTTCTTAATTTACTGATACTGATATCATGACTGGTCATCTTTTATC-ATA-CCTGAATGTACAT-GTACAATTACCAGN-NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNACAatctgcagtattatgtgatcttctggcgagaagtacaatagaattgtttaaattaggcattggcaaagtaaatggtatgatggggaaaagaaacttttatctccgcgtacgcccaaaagcaatgtatatatgatggtattctgctgccgttggaaataaaaaacaatatctggaagaaacagaatagttgccgcatgtgactgagggcgttagagaggttgcacgaattgtatgagcaatattattctgcttcgggaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacatttttaactgaacatcaaaacaggttatctaatactgtactcataaaaaacactgtaatgagacaccttcattatccagcaaatggctctcaacaaattgtaccgacttatagggatgtatataaacaaaataaaaatacctttaaaatggcagggagactgtatgtttgaattgtggttgcatgcatgaactgaagagggagaccacacttctggcagactagtaatatttcggataacacaacaaattccacaactctccaaccctctgtccatccaaagccttcgcatgtagctggtacaatctcctcatggtccacaacttcaaaactggaagtaacacacccttcatttatgggttaattattttaaatgtaatttgtgtacatgtatatttgtaaaaaaaattgcatgcagttagctcaagttttcttaatttactgatactgatatcatgactggtcatcttttatcatacctgaatgtacatgtacaattaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|6 : aaatattcagcgtcaaacttccaatgaagtgtcgacaaaaccatctgaaagcctgttgaccgagattttatgtcccataattccactccgaccgtaatgccatgaaaataaaagtacaagaacatcaaaatttcttatattccatgccaatgtaacaacacactgtcactggcctagacaaactattatccgccatatcacttgtagacacctgcataatttcatgcactgcgtttcactctctattgtaataggttgtggtacatctttcgtctccctcgtcctaat-C-ACAT-ATA-GACGTTAATGATAAA---------AAAAG--G---CATTAC-TACTCTTTTA--T-CAA---TATA-ACACAG----AAT-A-ATCA-AT-GTA--CAACA-TTT-CA------------GAAAA-----AGAG-AGGT--G--G----AGCCATCGGCATTT--T--GAAA--T-A-CTAGG-----C-----------CC--G-AAAT---T-C-CT--------TGA--A--GTTT-TTTT---A---G--CAA-A---T-TTTC-CA-T----T-TATGA-T-TTTGT-T-C-AATTT---C----A---AAACCAAATTTC-AA-T-AAA------C-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGACATGATTGA-TG-----G--TAC-TATACTTT-CAT-GACTATATA------TTG--AA---T-TT--T-TTT---AA--TAACAGG--A---AAAAA----A-TT-AAT-ATTTC-ATATGGT-CCTTA-AA-AT-T----TGC--C-A--TA-T-AC-GT-CT--ATT------AC-T-AGA-ATAA--A-ATATG-AGAAA-TGT--GC-A-TCGTTA--C-ACA-TA---TTTTACAAATAT-A-AGATGA-AATG------TCAA-ATAAAGC-TA--CTA-CTT-TTA-TAA---TTT-A-C-AACAATT-AATTCAT---T---G-CC--A--T-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCATTTT--A-AAACTAATGT-CA---GCCC---GAA-T-TT-CT-CT-GAACAGCTTTTCT----C-TCACAATTTCAT--G-TTCT--------AAA-T-TGT-C--TTCAAT-CAGT-AACAA----A------AAAAAAAAA----AAAAAA------AAG-AAAAAACC-AA--AGAGCA-AAAAATTAA---A-TGG--AAAATGAACC-ATGGT-AC--ATA--T--TCAT-ATGACTATGATTT-ATGCCCCTTT--CCAT-GT-A--C--T-CAA--CTTTCACA-A-TGT-----GATA---CAA----AGGAAAAGGTTAA--TGTTTCAT----A--TCTC----CTCGTCA-TATCGA---CT-AC-ATGAAA--ATATG-A--TA-AATGA-AAATTG-GT-AT---CA-ACAA---AT----GTG----AAAGGTC-GTTATCAA-A--ATTTT--CA-AC-T-ACA-G-AGTAACATG-GA-AAT------AAGGAAGCAGC---ATAC-ATT-TT-CAT--AAATAT-AC--AAATTATTC--ATG---TGT-C-AA-A-TC--TCAGAAAA---AGATT-GT---------GCACG-CATA-TG---A--A--AATATTCAGGC-T-C-------TGCAA-TGAAG--TT-GCGAACGAAAACCA--T--GAA--CCTG-TAT---AC--A--AT---TAT-T-TGGTTAA-CC-ATAT--GTCAC---T-CGAACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-G----AC-A-AG-AC-AAGTCA--AATTG-G-TCTT-ATA-TTATGATGGTCCAA-GTAAACAA-CCTTAAC-CTGCTCATGCTG--CTGGGAG-A-C--AA--A-TATCTG--G-ATGA-CCTCTGTAAGA---CT
gi|7 : ttacacatattttaGAGTGTGAGATCGA-GATGCAAA---AGTA-ATGGGAAA-CAACCATG--TTTGGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ACTGGCTGTGATCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAGACCGTAT-GCCC-TCA-GTGGGCTGTCAAC-TCAAGGG-ACGGATAAC---GTGTATC--TT-T-TTTTTACAAAT-ATAGTC---AT--A-TACTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CAATGT-AAAAT-AT-AAAATACT---TGAT-TTTT--ATTA--AA-A-T------------GTA---AACATCTGT-CTA---AA-AGTTT--AA-AACC-A-ATAAAAAGAAA-TTGTATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---CCA-CC-AAATG-AC-TT--CATTTT------TTCAA-TGC----------AA--AATTC-CGATAAAA---TTGTG-AATT-TAA--AA--CA-A----ACTTG--T-A-AAAG-C-ACAG-TCA-GA-GTAA--GG-AAA--C-TG---AAAAAGAA---CA--ACCTTATTGT-CA--TTAAA--ATATT-AAA-AC----ATTCACATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----AGAG-AG-TCTG--G----AGCCAT------TTCTT--GAAGACT-A-CTCAG-----C-----------CACCG-AAAT---T-CACT-C------TGACCC--GTTT-TTTTTTCC---A--CAA-AGAAA-TTCC-AA-TGT-TTCTA--G-T-TT-GTCT-C-AATCT---CTCCAA---A--------TTC-AAAT-AAAA-A--GC-AA---T-ATGGAAACAATG-A-A--AA-GT-A----AC--A-TG-----GAATCT-TATA-TTT-CAT-GAATATATGGATTACCTG--GAAGTT-TT--T-ATTGTATAACTAACAGGGGAGTAAAAAA---TA-TCCAAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-ATAC----CACAAC-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------ACCTCAGA-ATGATAA-GTATG-AGAGAATGT--GCCACTTGTTA-TC-ACACTA---TTTTACAAACATTATAGA-GTTAATGA--AGATAAA-AAA--GCATA--CAG-CTTCTTA-AAAA-CTAT-AAC-AACAATCCAAT-CA-ATGT---GACA--GTAT-AT-----AAAC-AGA-GTGG-AG--CCA-TTTTTA-AAAC-AA--TACG---ACCC---GAACT-TTCCT--T-GAACAGCTTTTTC----TAGCAAATTTTT-T--GCTTCT--------AAAAT-TGTTC--TTCAAT-CA-C-AAT-A----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAACCCCTCAAA-AAAA-------------GA-AAAGATTAA---ATTGG--AAAAT-AA-C-AT-GT-ACA-ATAT-T--TCATGG-AACTA-----G-ATGCC---TT--TC-T-GTAtag
gi|8 : ggtagtacCCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTAACTAATTATATC-TC-----A-CTTGCTCCAGC-TACA-TAC-GA--TCAG-TTCCTTGCAATCT-CCG-GCAGC--TG-TTACA
gi|8 : ccT-AA-CG--AAA-GAAG----TCT----------AA---A-CAAC----C--TGGATCAATC-G-TCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTACC-A--CTG-ATTCCTGT-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTT-ATCATGTGCT-A-C-ATACATTACTAC---TTGT-CGGGG-ATC--TATTACTACTTT---A-TAGGGC------TATTGT---AA--TTTTGAGTCTT-CT-GAG-ACGCTCGTATATA-----ATA-CCT-GC-----CATT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATGT-GGTCG----------ATATTCACCTCTGGTCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggataacgaaagaagtctaaacaacctggatcaatcgtcaacacatcttgatggttggtaccactgattcctgtgttactataagaattctaacaacattttatcatgtgctacatacattactacttgtcggggatctattactactttatagggctattgtaattttgagtcttctgagacgctcgtatataatacctgccattattatcaaacgacttttcttaccaatttttgaatagatgtggtcgatattcacctctggtcc
gi|9 : cccctgtgtgtttatcaacttggcacaattaattaactaattatatctcacttgctccagctacatacgatcagttccttgcaatctccggcagctgttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggaCCATGGTTCATATGGTT-TGA-CCATGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGAc
gi|9 : CATTCAGCTCCTAAAGACAT--TTCCTT-CCTATTCCTATGCTGGGAC-GAACATACAAGTGTATGAGTTGACCAAAAGT-GCCTCC-A-ATTTGGAT-------AGGGGGGGGGGGGACAAGAATAGGCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTG-TTA-C-AACTTGGCTTGA-CAATTAATTCACT-ATTATATC-TTGCAAAAGCTTGCTCCAACATACATTACAG---TCAGTTTCCTTGCA--CT-CCGAGTGCTTTTGTTTatatatctacacaattgattagtattatacatcaattcattcagctcctaaagacatttccttcctattcctatgctgggacgaacatacaagtgtatgagttgaccaaaagtgcctccaatttggataggggggggggggacaagaataggctcaacgaaggaaatttatctacctgtgtgttacaacttggcttgacaattaattcactattatatcttgcaaaagcttgctccaacatacattacagtcagtttccttgcactccgagtgcttttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111
lowQualScore : 444444444444 11 11 111 111 1 1 111 1 222222 1111 111 11111 11 333333333333333333333333 111 222 11 1111 111 222222222 222 111111 33333333333 1111 1 111111 1111111 111111 1 11 1111 11 1 1111 333333333333 1111111 2222222222 111111 11111 1111 44444444444444444444444444444444444444444444 111111 111111 11111 11111 11 333333333333333333333 2222 11111111111 111 22222222222222222222 11 11 111 1111111 111 333333333 222222 1111111 222222222 11 2222 111 1 11111 11 11 111 1111 1111 111 111111 1 22222222 33333333333 1111 111111 33333333333333 111 1111 1111111 1111 22222222 1111 22222 222 1111111 44444 1111 11 111 22222 11 3333333333333 11111111111 111 1 1 222222 222222 1 11 11 111 1 1111 222222222 222 1111 1 2222222 111 1111111 11 111 111111 2222 1111 11 111 22222 222 4444444444444 1 4444444444444444 1 1 2 3333333 11 11 222 111 333333333 1 222222 1 1 1 1 11 22222 3333333 11 1 1 222 1 1 1 11 1 1 1 1 1 11 11 11 1 11 2222 1 1 1 11 1 8888888888888888888888 11 222 1 1 11 1 1 11 1 22222222 1 22222 222 1 1 1 1 1 1 11 222 11 1 1 1 111 1 1 1 1 1 1 1 333 1 222 2222 11 1 1 11 11 1 1 11 1 1 1 11 1 1 1 1 222 3333333 11 1 1 11111 1 11 1 111 1 1 1 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 11 1 333333333333333 222222 22 2222222 11 22222 2222222 1 11 1 1 111 1 11 1 1 1 11 111 222222 1111111 11 22 1 222222 1 22222 1 33333333333333 2222 33333333333333333333333 1 11 1 1 4444444444
lowQualScore : 111111111111 88 0 8 11 0 0 0 8 0 5 8 8 11 8 111 8 44 8 8 6 666 3 2 1 6 6 6 77 6 111 77 5 5 5 2 888 77 5 3 222222 2222 5 77 77 0 77 000 5 5 55555 5 00 77 5 333333333333333333333333 1 000 5 5 000 5 1 5 5 0 5 5 33 2222 000 77 333333333 77 5 77 111 5 5 5 5 5 77 666666 44 00000000000 77 1 5 5 7777 1 5 888888 5 2222222 777777 5 5 5 55 5 0 0 66 5 1111 888 888888 66 5 0 77 66 4 00 5 0 0000 0 2 5 5 5 2 5 5 5 777777777777 6666666 5 5 2222222222 0 666666 33333 1 0 3333 99999999999999999999999999999999999999999999 555555 5 1 555555 5 77777 5 11111 5 4 5 5 00 4 5 5 888888888888888888888 5 5 5 2222 5 99999999999 000 77 5 77777777777777777777 5 5 66 5 7 1 00 1 99 000 5 77 5 8888888 1 111 000000000 6 6 6 6 6 888888 7777777 6 6 6 6 99 666666666 6 99 6 6 1 7 55 6 6 3333 6 888 1 5 1 5 5 55555 1 5 0 1 77 3 5 5 77 777 66 5 5 5 5 22 000 888 1 5 5 4 5 5 5 77 5 8888 55 1111 1111 000 0 555 5 5 666666 5 5 8888 00000000 6 5 5 77 5 5 55 33 00000000000 2222 666666 5 55555555555555 000 5 77 5 3333 5 5 8888 5 5 6666666 1111 77 5 44444444 99 4444 00000 111 8888888 1 77 00000 2222 33 777 0 44 99 55555 6 6 33 6 1111111111111 77777777777 888 6 1 6 6 666 6 6 6 6 99 3 6 666666 1 777777 888 3 88 3 0 0 0 11 0 444 0 6 6 6 99 5555 6 666666666 1 6 6 6 6 000 88888 1 5 5 7777 4 5 999 5 1 5 77 77 77 4444444 88888 000 5 5 5555555 66 33 000 5 5 5 5 5 3 5 33 5 5 5 77 0 77 777777 5 5 7777 6 6 6 6 4444 6 99 55 111 6 6 6 99 6 44444 888 6 7 000 0 1111111111111 6 1111111111111111 8 8 8 8 0 8 3 2 0 0 0 6666666 33 3 0 22 3 333 666 6 88 0 3 333333333 1 8 8 55 11 0 2 444444 3 2 0 5 5 1 5 88 66666 1 2222222 44 8888888 2 5 000 1 5 5 5 88 5 5 5 5 5 88 66 1 88 5 1 88 1 3333 5 5 5 88 5 1 5555555555555555555555 88 1 111 5 5 88 5 5 77 5 33333333 5 66666 000 5 5 5 5 5 1 5 88 000 88 5 5 2 5 999 5 5 5 5 5 3 6 3 111 3 111 4444 88 1 5 5 77 1 1 1 7 7 44 6 6 3 0 3 1 1 88 1 22 6 0 3 3 0 6 6 7 3 1 88 5 5 5 1 22 5 111 1 1111111 1 88 1 5 7 3 0 2 88888 3 3 0 22 0 3 3 3 777 3 3 3 0 3 33 5 3 5 5 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 1 11 6 99 3 99 222222222222222 6 000000 11 2 99 1111111 44 00000 8 6666666 0 33 0 0 3 2 111 0 33 5 0 0 33 3 44 777 2 888888 3 9999999 33 99 0 111111 0 55555 3 0 44444444444444 00 1111 77777777777777777777777 0 33 5 1 0 9999999999
lowQualScore : ............ .. . . .. . . . . . . . . .. . ... . .. . . . ... . . . . . . .. . ... .. . . . . ... .. . . ...... .... . .. .. . .. ... . . ..... . .. .. . ........................ . ... . . ... . . . . . . . .. .... ... .. ......... .. . .. ... . . . . . .. ...... .. ........... .. . . . .... . . ...... . ....... ...... . . . .. . . . .. . .... ... ...... .. . . .. .. . .. . . .... . . . . . . . . . ............ ....... . . .......... . ...... ..... . . .... ............................................ ...... . . ...... . ..... . ..... . . . . .. . . . ..................... . . . .... . ........... ... .. . .................... . . .. . . . .. . .. ... . .. . ....... . ... ......... . . . . . ...... ....... . . . . .. ......... . .. . . . . .. . . .... . ... . . . . . ..... . . . . .. . . . .. ... .. . . . . .. ... ... . . . . . . . .. . .... .. .... .... ... . ... . . ...... . . .... ........ . . . .. . . .. .. ........... .... ...... . .............. ... . .. . .... . . .... . . ....... .... .. . ........ .. .... ..... ... ....... . .. ..... .... .. ... . .. .. ..... . . .. . ............. ........... ... . . . . ... . . . . .. . . ...... . ...... ... . .. . . . . .. . ... . . . . .. .... . ......... . . . . . ... ..... . . . .... . . ... . . . .. .. .. ....... ..... ... . . ....... .. .. ... . . . . . . . .. . . . .. . .. ...... . . .... . . . . .... . .. .. ... . . . .. . ..... ... . . ... . ............. . ................ . . . . . . . . . . . ....... .. . . .. . ... ... . .. . . ......... . . . .. .. . . ...... . . . . . . . .. ..... . ....... .. ....... . . ... . . . . .. . . . . . .. .. . .. . . .. . .... . . . .. . . ...................... .. . ... . . .. . . .. . ........ . ..... ... . . . . . . . .. ... .. . . . . ... . . . . . . . . ... . ... .... .. . . . .. . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . . . . . . . . . . .. . . . . .. . ... . ....... . .. . . . . . . ..... . . . .. . . . . ... . . . . . .. . . . . ................................................................................. . . .. . .. . .. ............... . ...... .. . .. ....... .. ..... . ....... . .. . . . . ... . .. . . . .. . .. ... . ...... . ....... .. .. . ...... . ..... . . .............. .. .... ....................... . .. . . . ..........
lowQualScore : 444444444444 88 8 0 00 8 8 8 0 8 6 0 0 00 0 888 0 00 0 0 7 555 3 5 3 7 7 7 77 7 777 99 7 7 7 0 666 99 7 0 111111 1111 7 99 99 7 99 000 7 7 99999 7 77 99 1 999999999999999999999999 4 000 7 7 777 7 4 7 7 1 7 7 66 1111 000 99 111111111 99 7 99 444 7 7 7 7 7 99 444444 33 00000000000 99 7 7 7 9999 4 7 333333 7 7777777 444444 7 0 0 44 0 0 4 00 0 2222 888 888888 99 0 4 66 11 4 66 0 0 6666 4 5 0 0 0 2 7 7 7 111111111111 7777777 7 7 1111111111 7 444444 77777 6 1 6666 11111111111111111111111111111111111111111111 111111 7 7 999999 7 44444 7 66666 7 0 7 7 77 3 7 7 444444444444444444444 7 7 7 0000 7 00000000000 999 99 7 00000000000000000000 7 7 44 7 9 7 77 4 33 000 7 99 7 4444444 0 777 555555555 7 7 7 7 7 555555 7777777 7 7 7 7 22 888888888 7 22 7 7 7 3 88 7 7 0000 7 333 4 7 7 7 7 33333 4 7 1 4 99 9 7 7 44 111 44 7 7 7 7 11 000 666 7 7 7 9 7 7 7 99 7 3333 77 6666 7777 000 1 999 7 7 666666 7 0 7777 77777777 6 7 7 99 7 7 99 77 77777777777 1111 444444 7 00000000000000 000 7 99 7 9999 7 7 3333 7 7 6666666 4444 99 7 00000000 22 0000 00000 444 9999999 7 99 44444 1111 66 999 8 66 22 22222 7 7 88 7 0000000000000 33333333333 333 7 7 7 7 888 7 7 7 7 22 3 7 888888 0 555555 333 3 33 8 8 8 8 00 8 000 8 7 7 7 22 2222 7 777777777 0 7 7 7 7 888 99999 9 7 7 0000 9 7 666 7 4 7 99 99 99 1111111 99999 000 7 7 9999999 44 66 000 7 7 7 7 7 6 7 99 7 7 7 99 7 99 333333 7 7 9999 7 7 7 7 2222 7 22 88 777 7 7 7 22 7 88888 333 7 3 888 8 2222222222222 0 2222222222222222 0 0 0 0 8 0 2 5 0 0 0 0000000 22 2 2 55 2 222 222 0 88 8 2 999999999 4 0 0 88 55 0 5 888888 2 5 0 5 5 0 0 00 00000 0 0000000 77 3333333 0 0 000 0 0 5 0 00 5 5 0 5 0 00 00 0 00 5 0 00 0 0000 0 0 0 55 0 0 0000000000000000000000 00 0 555 0 5 55 0 0 55 5 00000000 0 00000 555 5 5 5 5 5 0 5 00 555 00 0 5 5 5 000 5 5 0 5 5 3 7 3 777 3 555 0000 00 0 0 5 55 0 0 0 3 3 77 7 7 3 7 3 0 0 33 0 00 7 7 3 3 7 7 7 3 3 0 55 5 0 5 0 00 5 000 0 0000000 0 55 0 5 3 2 0 5 55555 2 2 0 55 0 2 2 2 000 2 2 2 0 2 00 5 2 0 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0 00 7 22 3 88 888888888888888 7 888888 77 5 22 7777777 77 88888 0 0000000 0 88 0 0 2 5 000 0 88 5 0 0 88 2 88 555 5 888888 2 8888888 88 00 0 000000 0 00000 2 0 88888888888888 55 2222 22222222222222222222222 0 88 5 2 0 5555555555
consensus : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ATTG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATG-AGAAAATGT--GC-A-TCGTTA-TC-ACA-TA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAA-AAAAAA---AA--AAAGAA-AAAGATTAA---A-TGG--AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G-C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC--A--AT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACTTCTTTGCTAT-A--AGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---A-CAACA-AAC-ATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
Reference ( family-290 ) : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ATTG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATG-AGAAAATGT--GC-A-TCGTTA-TC-ACA-TA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAA-AAAAAA---AA--AAAGAA-AAAGATTAA---A-TGG--AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G-C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC--A--AT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACTTCTTTGCTAT-A--AGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---A-CAACA-AAC-ATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|1 : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---AGTA-ATGGG-AA-CAA--ATGATTTTGGTATCAAATGGATACACA-CA-TGTCTG--GACC-AATG-CT-TGGTCAT-GA-AAT-AA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGACAAACCTAAGGGCA--TGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TAGTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA--------------GTA---A---TCTGTTATA---AA-A-TTT--AAGAAAC-A-AT-AAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCACCTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTGT-T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AA-----CG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----A-TCA-ATCA-AT-GTTTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T-----G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-ACAT---T-C-CT-C------TGACCA---TTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AAGTT---C----A---A--------TTC-AA-TAAAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATT-CCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT--CTTA-CA-AT-C----CAC--C-AATTA-TAACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATGAAGAAAATGTGGGC-A-TCGTTA-TCAACA-TA---TTT-ATAAACAT-AT-GA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGTATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATA--A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAAC-AA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAAAT-TGT-C--TTCAA--CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAATAAAAAACGCAATTAAAGAA-AAAGATTAA---A-TGGGAAAAATGAA-C-ATGGTAACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGTA----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATACTAA--TCTC----CTCG-C--CATC-A---CTCACAATGGAA--ATAT--A--TG-AATG--AAATTG-TT-AT---C---C-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----TAAAAAAACA-----ATACTATCGTT-CAT-AAAATATAACAAAAATTAT----ATG---CGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAG---AAGTT-GTGGGGGGGGGGGA-G-C-CA-TT---A--G--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-CC-AAAACCA--T--GAA--ACTGAAATGA-AC--A--TT---TTT-T-T-----T-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGCAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTACAA-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTTAATA-TA---ATGG-CCAT-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---A--A-C-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTTCATGCAA-TGC-TTTCACTTC-TTGCTAT-A--AGTTTGTGGTAA-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTG----C--TTTT-GGATGAATTTGAGTCTTT-GGCAGTATGTGTACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTATGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACTGG---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGGAATCTGCAGTA-TATGTGATCTTCTTGGCTAAAAATACAATA-AAT--TTTAAATTAAGTTGGCCATTGGTAAACTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACAAGACTTTTTACTCC-CGTG---CCAAATACAAT-TATAATATGAT-GTATTCTGCTGCC--TGTGAAAT-AAAAGCAATATTT-GAAG-AACA-AATA--TGCCCCCATCTGGTACTGTAAGTCGTACTATA----TTGCAC-AATTGTAT-AG-AATA--ATCTCTGCTTCGGTAACTTTTTGA----------------------ACATTTTTAATCTTGAAGAATTTCAAAACCAGG-TATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTTCTCCATTGATC-----AATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGT-TATAAACAAAAATAAAAATAACCTTT-AATTGGCAAAAAAGAC--TATGTTTGAATTGTGGTT---TGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCATAAT-CCTCGAACAAGAGACAACAAGTTTCCACAAATTTTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGTCCCACAACTT--AAACGGAAAGTACCAACACCCTTCTGACCTTCATCTATGGATTAAATATTTTAAAATG---TTTATG----TGTATATTTGTAAAAGAAAAAATGCATGGCAATTAAGCTCAGGAGATTTGTTAATTAACTG-TACTGATATCATAACTGGTC-TCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCAGTAAATGAATTTTTAAAATTAAAAATCTAACACTGCATGCCATGGTTCATATGGTTGTGGCCCATGCA-TATTGACTTGTTTTGTTTGACATTCAAGTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTAT-CTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGATGACCACTAGTTGCCTCCCACATTTGATTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGCACAAGA--AGCCTCAACGAAGAAAATTTATC-ACCTGTGTGTTTATCAAACATTGC---ACCAATTAATTCACTAATTATATCTTT-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCAGC-TTGTTTACATATATA-ATATATATAT-TATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCT-CTTCACAACGGGGAATAACGGGTAATA--ACTCT-AATCG---AA-GAA--CGACCT----------GA---A-AAAC--AAC-ATAGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTGAATTCCT-T-----GTTACTAT-AATGAAATTCTAAC-AACCATTTTTATCATGGGCT-ATC-ATACATT--TACACATTAT-CGGGGAATCTATATTACTAACTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCT--CT-GAGAAC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---CTTTATTA--TCTATA----TTTTTTGAAA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|10 : GAGTGTGAGATCAA--------A---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTT-GGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-AT-A-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AACAA---GAGTATAG-CCGTTTGCCCC-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TACTAATTTAAA------ATAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGA--TTTT-TATTA--AATA-T------------GTAAC-A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT---A-AAAC-A-ATGAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCACA--GCGC--C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC-----------A--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATC-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-TG-GT-AATGG-AAA--C-TG---AAAAA--
gi|11 : aaggtagtacTATT--TTGTGTTCTCAATAGTTGTAAT-----T--A-CAATGATTTAAAAGTATCTAAAATTTTA-AGAGTAAAAACAATGA--CA---T-AAAATTAT-ATAATA-TAGTTGATATTTTATATTA--ATTA-TTGTTGACATCAAGTA---A---TGTATGCTACAAAA-G-TTTCAAG-AAACTA-ATAAAAA-AAAATTG-ATAAGGAGCGTAAAATT--CTATTAACGCG--CTT--TAC-TCGCGATGCGC--C-A-CCTTA-TGTATGTCTTCAATTTAAATAATCGAGCTACCGACACTCTTAAGTATATT-CG-TGAAAATTTTGTGTGATT-TAAATT---CA-ACACTA-CTGATT-ATGA-G-CAACAGTACA-GA-GTAATAGG-AAAATC-TGTGTAAAAA--AGAGCA--AC-TTTATTTTCAATT-AAA--ATAT
gi|12 : tcttttcttaaaaattTT-ACACAC-C-ATAAC-AT-AAT----AAAAAAA-TAAAAGCATA--C-A-CTT-T-A--AAA-ATG--A-C-AATAAAC-AAT-CA-ATGTCTGGACC--AAAT-TTTCAGCAAAATAGA------AGTTCCA-TTT--A-AAAATAA--T-CA----CCCAGTGGA-TATCCCTACTAGAACAGCTTTTTTTCTTCACCAAA-TTTCATTTGTTACT--------AAATT-T-T-C--TTCAAT-C--C-GACAA----A-------AAAAAAAA----AATAAA------AAA-GGGAAA---AA--GGATAATAAAGA-TAA---A-T-G--AAAATGAA-CTGGGGT-ACA-ATAT-A--ACA--G-A--CA-----C-ATACC----T--TCATCGTAC--CTTTCAAA--CTTTCATCCT-TGTTAATCAACAAAGGAA----A--AAAAGG-TAA--TGTCTCATAC-----TCTCGTTGCTCGTCCACATCGA---C
gi|13 : GGGTAATAGAACTCTTAATCGTTAAATGAAGTAGACTT----------GATATATCAACA-AACCATGGATCA-TC---TCAATTCACATC-------TTGAATGGTTGATATTTACACTG-ATTCCT-TAGATGGCTACTATTAA--GAATTCTAACCAA-CATTTTTATCACGTGCTTA-CGATACATT--TAC-CATTGTCCGGGG-ACT--TATTACTATCTTTAAGCTAGGGAATATGTTAAAGTTCCAT--TT--GAGTCTCACTGGAG-A----CGC-TATAAACCCATAACCTAGCTCCTGCGATATTAAATTATCAAATAAACACCTTTTTACT----TTAGCCC---AATATATTTTTG-AAACCAGAATTTGGGTCA--A-------ATA
gi|14 : gaaaataatactgt--T-AAA--ATATGTGTA-ACCGATAT----ATCA--T-GTGACCAA-A-TTT-CAGAAAGAAAAAAGGAAAA-----A-AG-AG-T--G--GCAACAACCAT------TT--TTGGACAAATCATCTCAGACTCTC-----------C---GAAAAT---T-CTCT-CTGGTCTTGACCAGGGTTT-TTATATCA---GAACAACA---ACTTTCGCA-TGT-TT-TATGAGTGTT-GTCTGC-AAATTATGC----AC--A--------TTC-AA-T-AAAAGA--GCAAAAT-T-A-------AATG-G-A--AATATGA----AC--ATTGATGATG--TACACATA-TTT-CAT-GACTATA-A-ATTACCTGAAAA---T-TT--T-ATTA--TA--TAA
gi|15 : GATACTGATATTATATCTGGTAATCTTTTTTCA-TACC-TGTATGTACATTGTACAATTATCGGT-AATGAATTTATATAA--AAAATTCTAACACTACTAA--AAGTTTCTTGCCATT-TGA-CCCCA-AGTAT--AC-TG
gi|16 : GTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA-----GTTTGT---------GCA-G-C-CAATT---ACGA--AAAAATC--GC-C----AAAATGCCAAATGAAAGTTG-TCG-AC-CAAACCA--TACGAA--C----AGTGATAC--ACCAT---ATT-T-T-----C-C--ATAA--TCCACGAAT-CG-ACCGTAA---CA-GA-AAAAT-GCGACAAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AA-A--T-TCTT-AC--T----ACGT-C--A-GT-AACAACC----ACACTG--CA--CTGA-CT---AGAA-CGAAA--A-TATCCAATA-AT-ACGC---GTAAGAAC-CTGCCA-A----------GA-TG----TCAC-----TGCTATCA--ACGTTGAGGT-A-CAT-TGTTTTTC-CCCatatgacctcgaatgtgatcctgactcccactatgaattgactttggattttcttgacattctatggaagtttattatcaataaatgagaagaaattgtgtcgtcaaatatgtgttaactttctgcagatcaacatttttttttcataccaca
gi|17 : --ACTCT-AATCG--AAAAGAAG-AGACTTTTTGAAGTCTGA---A-AAACA-A-T-ATGGATCAATC-GCTCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTAC--A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCCAAC-AA-CATTTTTATCAT-TGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TA--------TT---ACTAGGGA------T-ATGT---AATTTT--GAGTCT--CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGA-----------------------TTTT---T----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATAT-GGTCGCTATGACACCACATCCACCTCTGGTC
gi|18 : ATAATGGGGAATAACGGGGAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------CA---A-CAACATAAC-ATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATCTTTTTTTTTG-ATGGTTGATACC---ACTG-ATTct
gi|19 : gtctactttcatttcacaatggggaCTTTCTATTTCACAACGGGGAATAACGGGAAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------CA---A-CAACATAAT-ATTGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-ATGGTT
gi|2 : ttgtttaaataaaatgcaggggtttaatatctaAAATAAAAAA--GAGTGTAG-CC-TGTTGCCTCCTA-CCTG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A---GT-ACTCTGTGTATTTCTT-T-TTCTTTAAATT-AT-GTCC--ACTAA-TAGCAA-TTAAA------TAAA----TA-A---TCAAGG--AATA--CA---T-AAAATTATAAAAATA-G---TGAT-TTTG-TATTATCACTATT------------GTAAACA---TCTGTTCTA---AA-A-TTT---A-AAAC-A-ATAAAAA-AAA--T--ATAA----CGTA---TT--CTATA-----A--CTTGCTACTTCGCA--GCG---C-AGCT-TA-TG-ATGTC--CAATTC------TTCAACTGC-----------A--GAATT-CG-TAAA----TTCTGAAATT-TAA--TCCACA-A----A--TG--TGA-AA-GTC-ACAG-ACA-GAGGTATA-GG-AAA--CTTG---AAAAA--A----A--AC--TA-TTTTAA--T-AAAATATATA-ATA-AG----ATTCA-ATCACAT-GTGCCCAA-A-TTT-TATG----------AAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AACAAT------TT--T--TGAAAAT----TCAG-----C-----------C---C-GAAT---TAC-CTGC------TGA-CA----TT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA--GTCTT-TACGA-T-TT-GTCT-CAAATTT---CA---A---A--------TTCAAA-T-AATA-ACGGC-AAAT-TAA-------AATGCG-ATGAA-ATGA----AC--A-TG-----G--TA--TATA-TTTCCAT-GACTATATA---TACCTGA-AA---T-TTTGT-ATT---TC--TAACAGGGAT---AAAAC---C-------T-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-ATGG----CAC--C-AAGTA-T-ACCGCGTC--ATTG-----AC-TCAGA-ATGA--AGATATG-AG-AAATGTG-GC-A-TCGTTA--C-ACA-TAT--TTT-AC-AACAC-ATAGA-GT-AATCG----AT--A-AAAAAGCATAACCTA-CTT-TTA-TAAG-ATATAA-C-AACAATT-AAT-CATGTG----GACC--AAAT-TT-CAG-AAAA-AGT-GTGGTAG--CCA-TTT--T-AGAATAA--T-CAGCGGCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT-----AGCAAA----TAT--TTTTCTGTTCAAAAAAAATATGT-C--TTCAAT-CA-C--ATAACCCCCC----CAACAAAAAA----GCAACC------CAA-AAAAAG---AA--AAAGA------GTTAA---A-TGG---AAATGAA-C-A--GT-ACAGATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGTT---TT--TCAT-GTA-------CCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACAT--GAA----AAGAAAAGGTAAA--TGTTTCAAAC-----TCTC----CT-GTC--CATCGGAT-CTCA-AATGAAACGCTAT--GACTG-ACTGA-AAATTGTTT-AT---CTAAC-AGACAT----GTG----AAT--TC-GT--TCAC-A-TATTTT-ACA-ACATAACATG-AGTA--ATGCAA-AATAAAAAAAAAAAAGCAGACTGGTACTATT-TTCCAC-TAAATATGACAAAAATTATTC--ATA---TGTCCAAA-A-TCGTCCAGAAAA---TAGTA-TT---------GAG-GCC-CA-TTATGA--A--AATAGTCA-GC-T-C-AAGAATGCCAA-TGAAA--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-TATGA-GC--A--ATGAATTT-T-C-----C-CA-ATAA--TTCCC---T-CG-ACCGTAATG-CATAA-AAATT-GCAA-AGTGTAC-A-AGAACGA--TCAACAATTGGG-TGTT-ATATT----ATGG-CCAA-GT-AAATA-C----ACACT--TCA--CTG--CT---AG-ACC-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAA-----ATGTAACTGCTTTTCACTTCTTTGTTAT-----GGTTGTGGT-AGCAT-T-TTTCTT-CCCTCTGT-CTAATTACTAT-TATCTTCTCTTGT--TCTTTTTT-GAATGGATTGGAATTCTT-GGCAGTA-G-GCACTACGTTTGAAAGTG-GTTTTTCT-
gi|2 : cTTGTTCT-T-------TTTTGA-ATG-GATTGGAATTCTTGGCA-GTAGGCACT-ACGTTTGAAAGTGGTTTTTCTCCACTGATTGTTGAAATccactgattgttgaaat
gi|20 : caaataaaaaagagtgtagcctgttgcctcctacctgctgtcaaactaagggagtactctgtgtatttctttttctttaaattatgtccactaatagcaattaaataaataatcaaggaatacataaaattataaaaatagtgattttgtattatcactattgtaaacatctgttctaaaatttaaaacaataaaaaaaatataacgtattctataacttgctacttcgcagcgcagcttatgatgtccaattcttcaactgcagaattcgtaaattctgaaatttaatccacaaatgtgaaagtcacagacagaggtataggaaacttgaaaaaaaactattttaataaaatatataataagattcaatcacatgtgcccaaattttatgaaaaaaagagtggaacaatttttgaaaattcagcccgaattacctgctgacattttttttcagcaaaatttccagtctttacgatttgtctcaaatttcaaattcaaataataacggcaaattaaaatgcgatgaaatgaacatggtatatatttccatgactatatatacctgaaattttgtatttctaacagggataaaacctatttcataatgtccttacaatggcaccaagtataccgcgtcattgactcagaatgaagatatgagaaatgtggcatcgttacacatattttacaacacatagagtaatcgataaaaaagcataacctacttttataagatataacaacaattaatcatgtggaccaaatttcagaaaaagtgtggtagccattttagaataatcagcggcccgaatttcctctgaacagcttttctagcaaatatttttctgttcaaaaaaaatatgtcttcaatcacataacccccccaacaaaaaagcaacccaaaaaaagaaaaagagttaaatggaaatgaacagtacagatatttcatgaactatatgtttttcatgtaccaactttcatttgtaacatgaaaagaaaaggtaaatgtttcaaactctcctgtccatcggatctcaaatgaaacgctatgactgactgaaaattgtttatctaacagacatgtgaattcgttcacatattttacaacataacatgagtaatgcaaaataaaaaaaaaaaagcagactggtactattttccactaaatatgacaaaaattattcatatgtccaaaatcgtccagaaaatagtattgaggcccattatgaaaatagtcagctcaagaatgccaatgaaatgtcgacaaaaccatgaacctgtatgagcaatgaattttcccaataattccctcgaccgtaatgcataaaaattgcaaagtgtacaagaacgatcaacaattgggtgttatattatggccaagtaaatacacacttcactgctagaccaaaatatccaaatagcttgtaagactgccataaatgtaactgcttttcacttctttgttatggttgtggtagcatttttcttccctctgtctaattactattatcttctcTTATC-AACTTG-C---A-CA-TTAATTCACTAATTTAATC-TC-CAAAA-CTTGCTCTAACATACATTACAGATTTC-GTTTCCTTACAATCTACCGAGCACCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATAT
gi|21 : A--ATATG-A--TG-AATGAGAAATTG-GT-ACAAAC--A--A---ATACTAGAA----AA---TC-GTAACAACTA-T-TTTT-ATACACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAGAAAAGCA-------ACTA---TT-CAT-AAAATA
gi|22 : CCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTTCC-ACACCCATCTGACCTTCATCTATGGATAAATTAATTG-AAattata
gi|23 : TTTCAT--T-TGT-----AGCAG--GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTCCATAC-----TCTC----CTCGTC--CATCGACAGCTCACcaatcgatataat
gi|24 : ---CA--AC-TTATTTCT-A--T-AAA--TTATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTC
gi|25 : TGGTA-AACTAGATAAGATGGTAT-AAC-AAATTTTTTACTCC
gi|3 : GAGTGTGAGATCAAAG-T---AATGGGGTATATGGGAAAACTA--ATGATTTTGGTATC-A-TGGATCTACAGTAATGTATGTGGACATATTG-CT-TGG-CAT-GAGAATAAA-AAAAAAAAGAGTGTAG-CCCGTTTGCCT-CTAAGTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-CT-----AAAT-AT-GTCCCTAT--AATACTAATTCAAAA-----TAAA-----A-AG--TCAAGG--ATGAACTA---TCAAAATTAT-AAA-TA-T---TGAT-TATT-TATTA--A-TA-T------------GTAGACA---TCTGTTCTA---AATA-TTTTAAA-AAAC-ATATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TTTTCTAT------AACTTT--TAC-TCGCA--GCGACCC-A-CC-T--TG-ATGTC--CAATTT------TTAAACTGC----------AA--TAATTACG-TAAA----TTGTG-AATCACAA--T---CA-A----T-TTG--T-A-AA-G-C-AC-G-ACAAGA-GTAA-TG--AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATGT--CA--T-AAAT-ATAAA-ATATAC----ATCAA-ATCA-GTAGTGTCTAA-AATTTATA------------GAAAACATCGA-GGTAG-T--GTAG----AGCCAT------TT--T--GATAAAT-C-CTAAG-----CTAGCTAAATACC---G-AAATATTC-C-CT-CGT----TGAA-A--GTTCATTTTTTCACCAG--CAA-A---A-TTTC-CAATGT-TT--ACGA-T-T--GT-T-C-AATTT---C----ACAAG--------TTC-AA-T-AAAA----GC-AAATGT-A-------AATG-GTA--AA-ATGA----A---A-CG-----G--TAC-TA------------A-TATAAA-ATTACCTG--AA---TCTT--T-ATT---TAC-TAACAGGGGA---AAAAAACATAATT-AATTATTTC-ATAATGTTCCTTAGCG-AG-GAGAGCAC--CCAA-TAGT-ACCGT-CCCCATCCTTGTAACATCAGAGATGA--A-ATATG-AAGAAATGT-----A-TCGTTAATC-ACA-TAATCTTT-ACAAACAT-AAAGA-GT-AATAGGCAAATAAATAACAGGCATA--CTAACTT-TTAATAAATCTATGA-CTAACAATC-AAT-CA-ATGT---GACCCAAAATGTT-CAGAAAAA-AGAAGTGG-AG--CAT-TTT--ATAAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CC-TGACAGCTTTTCT----C-GCAACAATTCAT---TTTCT--------AATTT-TGT-CCTTTCAATTCA-CTAATAA----ACACAACAAAAAAAAACAAAAAAAAA------AAA-CCAAAA---AA--GAAGAA-AAAGATTAAACTA-TGG--AAAATGAA-CAATGGT-ACA-ATAT-TAATCAT-G-AACTA-----TAAAGCC---TTCGCTAT-GTAAAGCA-TCCAACTCTTTCAT--TATGT-----AACA---GAAGAGGA--AAAGGGTTAACCTGTTTCATACT-AACTCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATG-AA--ATATCGA--TG-AATGA-AAATTG-TTAAT---CA-AC-A---AT----ATGTGAAAA---TCGGTTATCAC-A-TATTTTAACA-ACAT-ACA-GAAGTA--ATGTGATAATA----AAAAAAAGC------ATACTATC-TTACATAAAAATATAACAAAAATTATTCCAATGAGCTACGC-AATACTC--TCAAAAAATTGAAA-T-GT---------GGA-G-C-TA-TTAG-A--A--AATGATCA-GC-TGCAAAAAATTCCAA-TGAAG--TGTTCGAAC-AAAACCA--T---AA--TCTGTAATG--AC--A--AT---TTT-T-T-----CACCGATAAATTCCAC---T-CC-ACCGCAATG-CATGAGAAATTGGCAA-ACGATAC-A-AGAAC-A--T-A--AATT--TATCTT-CTA-T----ATc
gi|4 : agtacGTGAGATCCA-------AA---GTT-----GGAAA-TAA--A-GATATTTGTATC-AATG-AT-CACC-TA-TGTATG---ACA-AT-G-CT-TG-TCATTGA-AATAAA-AAAAA---GA-TGTAGTCCGTTT---CT-CTA-ATGG-CTGTCAAA--TAAGG--A--GGTAA-TCTG-GTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-AT---CC--AT--A-T--CAATTTAA-------TAAA----TACAG--TCAAG---AT----CA---T-TAAATTAT-AAAATA-TG--TGAT-TTTT--AT-A--AATA-T------------GTA---A---CTTGTTCTA---AA-A-ATT--AA-AA-C-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATA-----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-T--ATGAT--CATTTT------ATCA--TGC----------AA--A---T-CG-TATA----ATGTG-AATT-TAA--T---CATA----A-TTG-------A-A-C-ACAG--CA-GA-GTAA-TGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TCATTTT-CA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-ATT-TA------------GAAAA-----A-GT-AG-T--G-------AGC-AT------TT---------GAT-A--TCAA-----C-----------C-----ACAT---T-C-----------TGACCA--GTTT-TTTTTTCAC--G--CAA-A-----TTTC-CA-T----T-TATGA-T-T--GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA----GC-AAAT---A-------AATG---A--AA-ATGA----------------------C-TGTA-CTT--ATCGA--AT-TA-ATTACCTAT-AA---T-TT--TTATT---TA--TAA---GAAA---AAAAA---TA----GAT-ATTTCCATATTAC-C--TA-CATAT-C----CAC----AA-T--T-AC-GT-CC--ATT------GA-TCAGA-A-GA--A-ATG-G-AGAAA-TGT--GC-A-TCGTTA-----CA-CA---TTT--CAAACAT-ATAGA-TT-AATGG--AAATAAA-AAAGA----A--TCA-CCT-TTA-TAAA-ATAT-A-A-CACAATT-AAT-CATATGT---GAC---AAAT-TT-CAGAAAAA--GA-GTGA-----CCA-TTT--A-AA--TAA-----A---ACCC---G------TTCT-CT-GAA--GTTCTTTT----CAGCAAA-TTTC-T--GTTTCT--------AAATT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AA-------------------------------AA------TAA-AAAAAA------------------ATT-A---A-TGG--AAAATGAA-C-AT-GT-ATA-A-ATAT--TCAT-G-AACTA-----T-ATGC-----T--TCAT-GTAA--C--T-CAA--C-TTAAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGT--A--TG--TCATAC-----TCTC----CTCGTC--C-TTGA---CTCACAATGA------AT--A--TGAAATGA-AAATTG--T-AT---C--AC-A---AT-----TG----AA---TC-GT--TCAC-AGTA-TTT-A-A-ACAT-ACA-G-AGTA--AGG-GA-AAT-----AAGAGAA--A-----ACA-TACT-TT-CAT--AAATATAACAAAA--TATTC--A-G---TGT-C-AC-A-T---TCAG--AA---AAGTT-GT---------GCA-G-C-TC-TT---A--AATAAAATTCA--T-T-C-AAAA--TGCAA-TGAA---TG-TCG-AC-AAA--CA--T--GTA--ACTGTTAT---AC--A--AT---TTT-T-T-----C-AC-AT-A--TTCAC---T-CG---CGTAATG-CAT-A-AAATT-GC-A-AAAGTAC-ATAGAAC-A--AAA--AAAT--T-CTCT-ATA-T----ATGG-TCAA-GT-A--AA-C----ACACTG-TCA--AT---CT---AG-A-C-AAA--A-TATCC---A-AT-A-GCT-TGC-AGA---CTGCCATAA-GTT----CGA-TGC-TTTCATT--------------------TGGT-A-CAG-T-TTCT----CCTTTGTCCTATATACTGT-TAT-TTCTATTG----C--TTT---GATGAATTGAAGTCTTT--GCAGTATG-TATCT--GGTTGTACATGTA-TTTTCT-T----G--GTTTGG-ATGTAATT-GAGACTTTGGCA-TTATGCAC--G---TTG-AAGT-GTTTT-CTCCAtgat
gi|5 : g--A--AATATTCA-GCGT-C--AAACTTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCATCT--GAAAGCCTG-T-TGA-CCGAG--AT---TTTATGT-----C-CC-ATAAT-TCCAC---TCCG-ACCGTAATGCCATGA-AAAT-----A-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AAAT--T-TCTT-ATA-TTCC-AT-G-CCAATGT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTGGCCT---AG-A-C-AAACTATTATCCGCCATAT-C-ACT-TGT-AGACACCTG-CATAATTTC-ATGCAC-TGCGTTTCAC-TCTCTATTGT-AATAGGTTGTGGT-A-CATCT-TTCGTCTCCCTC-GTCCTAATTACTGTATAT-TTCT-TTGTGGTC--TTTTGGGATGAA-TGGATGCTTTGGGAAGTATG---ACT---GTTG-A-AGGTGGTTTTCTCC----A-CTGATGG-GTG-AA
gi|5 : TAC-TGTATATTTCT-TTGTGGTCTTTTGGGATG-AAT-GGATGCTTTGGGAAGTATG-ACT-G---TTGAAGGTGGTTTT-CTCCACTGATGGGTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCT-GGCGAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGG-----CATTGGCAAAGTAA-------ATGGTAT-----GATGGGG------AAAAGAAACTTTTATCTCCGCGTACGCCCAAAAGCAATGTATA-TATGATGGTATTCTGCTGCCGTTG-GAAATAAAAAACAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCC-GCATGTG--ACTG-AGGGCGT--TAGAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTAT-TCTGCTTCGGGAACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATTTTTAA--CTGAACA---TCAAAAC-AGGTTATCTAA--TACTGT-ACTC-ATAAAAAAC--ACTGT-AATGAGA---CA---CCTTCATT-ATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTA-C-CGACTTATAGGGA-TGTATATAAACAAAA-TAAAAATA-CCTTTAAAATGGCA-GGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGC--ATGAACTGAAGAGGG-AGACCA-CACTTCTGGCAGACTAGTAATATTTCGGATAA--CACAACAAATT-CCACAA-CTCTCCAACC-CTCTGTCCATCCAAA-GCCTT-CGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTAAC-ACAC--------CCTTCATTTATGGGTTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAA--AAAAATTGCAT-GCAGTT-AGCTCA--AGTTTTCTTAATTTACTGATACTGATATCATGACTGGTCATCTTTTATC-ATA-CCTGAATGTACAT-GTACAATTACCAGN-NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNACAatctgcagtattatgtgatcttctggcgagaagtacaatagaattgtttaaattaggcattggcaaagtaaatggtatgatggggaaaagaaacttttatctccgcgtacgcccaaaagcaatgtatatatgatggtattctgctgccgttggaaataaaaaacaatatctggaagaaacagaatagttgccgcatgtgactgagggcgttagagaggttgcacgaattgtatgagcaatattattctgcttcgggaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacatttttaactgaacatcaaaacaggttatctaatactgtactcataaaaaacactgtaatgagacaccttcattatccagcaaatggctctcaacaaattgtaccgacttatagggatgtatataaacaaaataaaaatacctttaaaatggcagggagactgtatgtttgaattgtggttgcatgcatgaactgaagagggagaccacacttctggcagactagtaatatttcggataacacaacaaattccacaactctccaaccctctgtccatccaaagccttcgcatgtagctggtacaatctcctcatggtccacaacttcaaaactggaagtaacacacccttcatttatgggttaattattttaaatgtaatttgtgtacatgtatatttgtaaaaaaaattgcatgcagttagctcaagttttcttaatttactgatactgatatcatgactggtcatcttttatcatacctgaatgtacatgtacaattaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|6 : aaatattcagcgtcaaacttccaatgaagtgtcgacaaaaccatctgaaagcctgttgaccgagattttatgtcccataattccactccgaccgtaatgccatgaaaataaaagtacaagaacatcaaaatttcttatattccatgccaatgtaacaacacactgtcactggcctagacaaactattatccgccatatcacttgtagacacctgcataatttcatgcactgcgtttcactctctattgtaataggttgtggtacatctttcgtctccctcgtcctaat-C-ACAT-ATA-GACGTTAATGATAAA---------AAAAG--G---CATTAC-TACTCTTTTA--T-CAA---TATA-ACACAG----AAT-A-ATCA-AT-GTA--CAACA-TTT-CA------------GAAAA-----AGAG-AGGT--G--G----AGCCATCGGCATTT--T--GAAA--T-A-CTAGG-----C-----------CC--G-AAAT---T-C-CT--------TGA--A--GTTT-TTTT---A---G--CAA-A---T-TTTC-CA-T----T-TATGA-T-TTTGT-T-C-AATTT---C----A---AAACCAAATTTC-AA-T-AAA------C-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGACATGATTGA-TG-----G--TAC-TATACTTT-CAT-GACTATATA------TTG--AA---T-TT--T-TTT---AA--TAACAGG--A---AAAAA----A-TT-AAT-ATTTC-ATATGGT-CCTTA-AA-AT-T----TGC--C-A--TA-T-AC-GT-CT--ATT------AC-T-AGA-ATAA--A-ATATG-AGAAA-TGT--GC-A-TCGTTA--C-ACA-TA---TTTTACAAATAT-A-AGATGA-AATG------TCAA-ATAAAGC-TA--CTA-CTT-TTA-TAA---TTT-A-C-AACAATT-AATTCAT---T---G-CC--A--T-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCATTTT--A-AAACTAATGT-CA---GCCC---GAA-T-TT-CT-CT-GAACAGCTTTTCT----C-TCACAATTTCAT--G-TTCT--------AAA-T-TGT-C--TTCAAT-CAGT-AACAA----A------AAAAAAAAA----AAAAAA------AAG-AAAAAACC-AA--AGAGCA-AAAAATTAA---A-TGG--AAAATGAACC-ATGGT-AC--ATA--T--TCAT-ATGACTATGATTT-ATGCCCCTTT--CCAT-GT-A--C--T-CAA--CTTTCACA-A-TGT-----GATA---CAA----AGGAAAAGGTTAA--TGTTTCAT----A--TCTC----CTCGTCA-TATCGA---CT-AC-ATGAAA--ATATG-A--TA-AATGA-AAATTG-GT-AT---CA-ACAA---AT----GTG----AAAGGTC-GTTATCAA-A--ATTTT--CA-AC-T-ACA-G-AGTAACATG-GA-AAT------AAGGAAGCAGC---ATAC-ATT-TT-CAT--AAATAT-AC--AAATTATTC--ATG---TGT-C-AA-A-TC--TCAGAAAA---AGATT-GT---------GCACG-CATA-TG---A--A--AATATTCAGGC-T-C-------TGCAA-TGAAG--TT-GCGAACGAAAACCA--T--GAA--CCTG-TAT---AC--A--AT---TAT-T-TGGTTAA-CC-ATAT--GTCAC---T-CGAACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-G----AC-A-AG-AC-AAGTCA--AATTG-G-TCTT-ATA-TTATGATGGTCCAA-GTAAACAA-CCTTAAC-CTGCTCATGCTG--CTGGGAG-A-C--AA--A-TATCTG--G-ATGA-CCTCTGTAAGA---CT
gi|7 : ttacacatattttaGAGTGTGAGATCGA-GATGCAAA---AGTA-ATGGGAAA-CAACCATG--TTTGGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ACTGGCTGTGATCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAGACCGTAT-GCCC-TCA-GTGGGCTGTCAAC-TCAAGGG-ACGGATAAC---GTGTATC--TT-T-TTTTTACAAAT-ATAGTC---AT--A-TACTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CAATGT-AAAAT-AT-AAAATACT---TGAT-TTTT--ATTA--AA-A-T------------GTA---AACATCTGT-CTA---AA-AGTTT--AA-AACC-A-ATAAAAAGAAA-TTGTATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---CCA-CC-AAATG-AC-TT--CATTTT------TTCAA-TGC----------AA--AATTC-CGATAAAA---TTGTG-AATT-TAA--AA--CA-A----ACTTG--T-A-AAAG-C-ACAG-TCA-GA-GTAA--GG-AAA--C-TG---AAAAAGAA---CA--ACCTTATTGT-CA--TTAAA--ATATT-AAA-AC----ATTCACATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----AGAG-AG-TCTG--G----AGCCAT------TTCTT--GAAGACT-A-CTCAG-----C-----------CACCG-AAAT---T-CACT-C------TGACCC--GTTT-TTTTTTCC---A--CAA-AGAAA-TTCC-AA-TGT-TTCTA--G-T-TT-GTCT-C-AATCT---CTCCAA---A--------TTC-AAAT-AAAA-A--GC-AA---T-ATGGAAACAATG-A-A--AA-GT-A----AC--A-TG-----GAATCT-TATA-TTT-CAT-GAATATATGGATTACCTG--GAAGTT-TT--T-ATTGTATAACTAACAGGGGAGTAAAAAA---TA-TCCAAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-ATAC----CACAAC-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------ACCTCAGA-ATGATAA-GTATG-AGAGAATGT--GCCACTTGTTA-TC-ACACTA---TTTTACAAACATTATAGA-GTTAATGA--AGATAAA-AAA--GCATA--CAG-CTTCTTA-AAAA-CTAT-AAC-AACAATCCAAT-CA-ATGT---GACA--GTAT-AT-----AAAC-AGA-GTGG-AG--CCA-TTTTTA-AAAC-AA--TACG---ACCC---GAACT-TTCCT--T-GAACAGCTTTTTC----TAGCAAATTTTT-T--GCTTCT--------AAAAT-TGTTC--TTCAAT-CA-C-AAT-A----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAACCCCTCAAA-AAAA-------------GA-AAAGATTAA---ATTGG--AAAAT-AA-C-AT-GT-ACA-ATAT-T--TCATGG-AACTA-----G-ATGCC---TT--TC-T-GTAtag
gi|8 : ggtagtacCCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTAACTAATTATATC-TC-----A-CTTGCTCCAGC-TACA-TAC-GA--TCAG-TTCCTTGCAATCT-CCG-GCAGC--TG-TTACA
gi|8 : ccT-AA-CG--AAA-GAAG----TCT----------AA---A-CAAC----C--TGGATCAATC-G-TCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTACC-A--CTG-ATTCCTGT-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTT-ATCATGTGCT-A-C-ATACATTACTAC---TTGT-CGGGG-ATC--TATTACTACTTT---A-TAGGGC------TATTGT---AA--TTTTGAGTCTT-CT-GAG-ACGCTCGTATATA-----ATA-CCT-GC-----CATT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATGT-GGTCG----------ATATTCACCTCTGGTCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggataacgaaagaagtctaaacaacctggatcaatcgtcaacacatcttgatggttggtaccactgattcctgtgttactataagaattctaacaacattttatcatgtgctacatacattactacttgtcggggatctattactactttatagggctattgtaattttgagtcttctgagacgctcgtatataatacctgccattattatcaaacgacttttcttaccaatttttgaatagatgtggtcgatattcacctctggtcc
gi|9 : cccctgtgtgtttatcaacttggcacaattaattaactaattatatctcacttgctccagctacatacgatcagttccttgcaatctccggcagctgttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggaCCATGGTTCATATGGTT-TGA-CCATGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGAc
gi|9 : CATTCAGCTCCTAAAGACAT--TTCCTT-CCTATTCCTATGCTGGGAC-GAACATACAAGTGTATGAGTTGACCAAAAGT-GCCTCC-A-ATTTGGAT-------AGGGGGGGGGGGGACAAGAATAGGCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTG-TTA-C-AACTTGGCTTGA-CAATTAATTCACT-ATTATATC-TTGCAAAAGCTTGCTCCAACATACATTACAG---TCAGTTTCCTTGCA--CT-CCGAGTGCTTTTGTTTatatatctacacaattgattagtattatacatcaattcattcagctcctaaagacatttccttcctattcctatgctgggacgaacatacaagtgtatgagttgaccaaaagtgcctccaatttggataggggggggggggacaagaataggctcaacgaaggaaatttatctacctgtgtgttacaacttggcttgacaattaattcactattatatcttgcaaaagcttgctccaacatacattacagtcagtttccttgcactccgagtgcttttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta
blockSeqs : AGTAATGG AT A CC . A G A TG T TGG G GT T G T AAA T G G C A G C . CGG TC G G T A CCT TA A C AGTATC ATTT C AG CA AC ATG C A TAGT A AT TC A TTGTTGACATCAAGTAA T CAA T G CAA . A T T G A GT GGAG AAA TT TAACGCG GC T AT ACC C G T A T TT AAATAA AC CGACACTCTTA GT A A A AATT T A TCCA T CACTAC ATTAT A T A TA A G AT T ATC TGT AGAG TT C TC AT T AT T T CGAT C C C A A C A A GAAAGAAAAAAG CATCGA T G GGCAAC CGGCAT TTG C CATC CTAGCTAAATACCGAAATATTCCCTCGT CCAGGG A A CCAG C GAAA G ATGT C T G G TT C G A CAAAACCAAAT A A . ACG A TATGGAAAC CG TG T ACATTGATGATG A C CC C C T GA A AA AGT C TG T GTATAAC G GTA ACATAATT T C T G T GAGAG AACAA G . C G CC CTTGTAACA G TA G . G A G C C ATC C ATC T T T T T AGGCA A T A AC T A C AT ATC TA A T C T TG CTG CCA A G T C T A T TT T TTA AT TGT GCGG AGT TA A A TCTTCA A A TTGT GTTCAAAA T A T CT T G TA CA CCCCCCC CAAA CCCCTC . CCAAAGAGCA ACT T . C TGGG . G TAA G T TGATTT CCTT CG C AAGCATC CT CCT TAATC AAG GAGGA T CC TAAC GTTG CA CAG AA CG GAC A G TT A CTAACAGAC ACTAGAA AGG G A T G AAC C A T A AC C T AAAAAA G GACTGG TT C AA G CA AGC C A T C GT TTGA T . C C C A A ATG CGA A G G GCAA A A AGT T A G TC AC AG AGTGAT ACC GAA A G GGTTAA CG AT GAA C A C G G G C AA . T G AG AC TTGGG . T TATG T T A C CTTA C TG GC GGG A C G CT T GCCAT AC C A CAC ATTTCATGCAC T TCTCTATTGTAATA . G C G T T C A C C TTCTT TG T GG T GC ACG A AG T TTGTGGTC T G T TG AT A C TACGT A G T T . G G TG . G . A TGGTAT G G CGC A G . G GT . A G A G GT G G . . G . G GAGG G G C TT . G NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG . C . . T . . . . . CA . CAGCA C . A . . A A . TG GCA . . . A A C . . . . . . C . CCA . TAA TACA . T . . . T C T A A A C C T . A T . T TA C . . C G T . C . . G . T AA . A A . G AT G T T T . G TTGA A A . GC G A T A ATT A T A A A AC T T C A A T GA T TT T TA TTTGAAGTCTGA T AAACC C C TT TTTTTTT AA TTACA . TAGATG T . C . T G TA G AC A C . . T TC TAA C ATATGT A TCCAT TT CA G ACGCT A AACCC A A TCCTGCGATATTAA ACAC TACTTTAGCCCAATAT . AC A T G CTATGACACC
blockSeqs : GATGCAAA A . . . C . . . . TG . AT . . . A A C T . . . C . G . . . . A C . . A A . . . . . . . . TG . T . T TTGTAAACA G . . . TAA . A . . . . G . . . AAC . . . C . . . . . . . GC A . T . . A A . ATT . ACT TGA . . . A . C TA . CT . GAA . . TA . . T . C . C . . . C . . . TG AG . . GTAG . CTT A CC ACTCTCCGAAAATTCTCTCTGGTCT CCAG . T GAA . AC . TGT . C . . T C . . ATGCACA . . . GA . TAA GT . . CATGATTGATGG . . C . C A A A A . . . . ATA G . TATCC . . . . . GG CAAG . . C . . GAC . . . . A A . . . TC . T T . T . . GGA A . A . T . . T AA TG . . . . TA . C A . . A . . . . . AT AT TA G . CT . . CA A A TT . A . . . . . G TA ACACAAC . . . AAGGATAAT . . . . AATG . . AT . . TA T . . CCTTTC . TA . T AAG A . A . A AT AA . CGA . . G . AAACAA ATGTGAA T . T . . AC . . . . . T . AA G GCA TC A T A . . C . . . . T . . A . . . . AG AAT G . . CA A . A . A . . . . TATGA GAG . . . CA A T . . . . . . A . GT . . . . . TTTA . . TCC . . . . . . . A . . . . . . AATA GA . A AC AATGTAAC G TTCTTTGTTAT . . . . . T C . . A TGGTC T T G T TA G T CA T CCAC T . . T GA . C TG A G . T A . . C . . . A A A . . . . N N . N . . . . G . . . T . G A A A . C . A T A A A T A . A AG T T G . . . A A GATAT . ATAAC C C . . A AA . GT . . . . T G A . . . . . . T CT . C . A AATT . T . AC . . A . CATT . TTTACCA . . . A . A
blockSeqs : AA A . . . A . . . . A . G . . . A . G T . . . C . G . . . . A C . . G . . . . . . . . . CT . T . C TGTAGACA T . . . A . A . . . . . . . . AA . . . C . . . . . . . AC A . A . . . . . AA . AT TA . . . A . . AT . C . A . . TT . . . . . . A . . . T . . . . AG . . CTGG . T T AC CCACCGAAATTCACTC CCCG . T CG . A . GTC . C . . T C . . CTCCAAA . . . A . GTA G . . ACATGGAA . . C . C T A A T . . . . TAC A . ATT . . . . . AC CCAA . . C . . ACC . . . . A A . . . C . . . . A . . GAA A . A . C . . T GA T . . . . A . C A . . A . . . . . A CT T A . T . . TA T A GT . T . . . . . A TA ACC . . . AAGAAGAA . . . . ATG . . A . . C T . . ACT . AA . G AGG T . . . . . A . GA . . T . CAACAA GTG . . T . . AT . . . . . . . A G A CT . A A . . G . . . . A . . G . . . . . A A . . CA A . G . . . . . . TAATG A . . . C C . . . . . . . A . CG . . . . . TTGG . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . A . AGTTCGA . TGCTATCAA . . . . . . . . . . C . . . . . . T A G TG A . . G TG . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . GC . . A . . . . A CA . ATAAT C C . . A CA . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . AA . . . A . . . . CGA . CTTACCA . . . G . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . G . T . . . . . G . . . . T . G . . . . . C . . C . . . . . . . . . T . T . A TGTAAACA T . . . A . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . AC A . A . . . . . T . TT TA . . . A . . A . C . A . . T . . . . . . C . . . T . . . . A . . GG . T A AC CCCGAATTACCTGC AAG . T G . A . TGT . T . . T C . . CACAAG . . . . . TA G . . ACATGG . . C . A T A A . . . . . TC G . TA . . . . . C AA . . . . . GA . . . . A . . . . C . . . . T . . CG C . A . T . . T AA T . . . . A . C A . . A . . . . . T CT T G . T . . A . A GC . T . . . . . A CA A . . . AAAAAGA . . . . AT . . T . . T T . . ACT . T . . A T . . . . . A . GA . . G . CAACA GTG . . . . . A . . . . . . . A G A TT . . . . . . . . . . A . . C . . . . . A T . . C C . G . . . . . . TTAT A . . . C C . . . . . . . A . AA . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . GG A . . . GA . T . . . . . . C T T T . . . . . . A CA . AAT C . . . A CA .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . A TGTAACA T . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . T . AT TA . . . A . . T . C . A . . C . . . . . . C . . . T . . . . A . . GG . T A A CCCGAAATTCCT CA . T G . T . T . T . . . . . . CAAA . . . . . TA A . . AACGG . . . . . T . A . . . . . TA . . C . . . . . T CA . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . T . . A A . . . A . . A AC T . . . . T . A T . . . . . . . . A T T A . T . . C . . T . A . . . . . A T A . . . GA . . . . AT . . T . . T . . . C . T . . A T . . . . . . A . . . . CACA TG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A T . . C . . G . . . . . . TTGA A . . . C C . . . . . . . . . AA . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . AA . C C . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . TGTAA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . T . . T . C . G . . C . . . . . . . . . . T . . . . A . . G . . . . CCACATTC AG . . A . . . T . . . . . . . . CAA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A C . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . G . . . T . . A . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . TAT A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : AA********** TG* GT C* TTGTAGACA*************** AA* TA**** T* C*** C* GG******** CCAG** CAAA***************** A*** ACATGG************** ATC****** AAC****** ** C*** GGA** T* A* NT CA**** ACCC******* AAGGAGA******* ** ATG* ACC***** ***** ***** GA*** CAACAA******* GTG******** AC* TT* ********* CA** TATGA** **** AATCG******** TCTGTAT********* A* T******** ATAAC* C* A* CA***
originalCons : GAGTGTGAGATCAA-G-T---AA---GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ATTG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAA-CTAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATA-T------------GTA---A---TCTGTTCTA---AA-A-TTT--AA-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTG--T-A-AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAATGG-AAA--C-TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTTCA--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-T--G--G----AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTT---C----A---A--------TTC-AA-T-AAAA-A--GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAA---TA-TT-AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATT------AC-TCAGA-ATGA--A-ATATG-AGAAAATGT--GC-A-TCGTTA-TC-ACA-TA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CATATGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAACTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAA----AC----CAAAAAAAAA----AAAAAA------AAA-AAAAAA---AA--AAAGAA-AAAGATTAA---A-TGG--AAAATGAA-C-ATGGT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAA--C--TCCAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC--A--TCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAA--ATAT--A--TG-AATGA-AAATTG-TT-AT---C--AC-A---AT----GTG----AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G-C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTG-NATGA-AC--A--AT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTT-ATGCGA-TGC-TTTCACTTCTTTGCTAT-A--AGGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGTATTTTTCT-T----G-CTTTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---A-CAACA-AAC-ATGGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAATGGTTGGTACC-A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
finalCons : GAGTGTGAGATCAAAA----------GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATC-AATGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ATTG-CT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCT-CTA-GTGG-CTGTCAAAC-TAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATT--TT-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTAT-AAAATA-T---TGAT-TTTT-TATTA--AATATTGTAGACA---------------TCTGTTCTA---AA-A-TTTAA-A-AAAC-A-ATAAAAA-AAA-TT--ATAA----CGTA---TT--CTAT------A--CTT--TAC-TCGCA--GCG---C-A-CC-TA-TG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-TAAA----TTGTG-AATT-TAA--T---CA-A----A-TTGTA----AA-G-C-ACAG-ACA-GA-GTAAT-GG-AAAC---TG---AAAAA--A---CA--AC-TTATTTTC-A--T-AAA--ATATA-ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG-TGG--------AGCCAT------TT--T--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C---G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCAG--TTT-TTTTTTCA---G--CAA-A---A-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-C-AATTTCAAA-----------------TTC-AA-T-AAAAA---GC-AAAT-T-A-------AATG-G-A--AA-ATGAACATGG--------------TAC-TATA-TTT-CAT-GACTATATA-ATTACCTG--AA---T-TT--T-ATT---TA--TAACAGGGGA---AAAAAATC------AAT-ATTTC-ATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TA-T-ACCGT-CC--ATTAAC------TCAGA-ATGA--A-ATATG-AGAAAATGT--GC-A-TCGTTAC---ACA-TA---TTT-ACAAACAT-ATAGA-GT-AATGGA--AATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAATC-AAT-CAA-TGT---GACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA-TTT--A-AAANTAA--T-CA---GCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCTCA----GCAAAATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TGT-C--TTCAAT-CA-C-AATAAACCC-------AAAAAAAAA----AAAAAA------AAA-AAAAAAAAGGAGA-------AAAGATTAA---A-TGG--AAAATGAA-CATG-GT-ACA-ATAT-T--TCAT-G-AACTA-----T-ATGCC---TT--TCAT-GTAACC-----CAA--CTTTCAT--T-TGT-----AACA---GAA----A--AAAAGGTTAA--TGTTTCATAC-----TCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAA--ATATGA---TG-AATGA-AAATTG-TT-ATCAACAA-------ATGTG--------AA---TC-GTTATCAC-A-TATTTTAC-A-ACAT-ACA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-----AAAAAAAGCA-----ATACTATT-TT-CAT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCC-AA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-G-C-CA-TT---A--A--AATATTCA-GC-TCA--AAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CCTGTATGA--AC--A--AT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAAATCG--------TGC-TTTCACTCTGTAT---------GGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTAA-TGTATTTTTCTT--------TTTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGGTTTT-CTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT----------GA---A-CAACATAAC-ATGGATCAATC-GCTCAA--CACATC-------TTGA-TGGTTGGTACCA---CTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111
lowQualScore : 55555555555555 11 11 11 222 1 1 222222 1111 111 11111 11 22 1 2222222222 1111 1111 111 222222222 222 1 111111 22222222222222222 1111 111 111111 222222 111 11 11 1 1111 333333333333 1111111 11111111111 111111 1111 444444444444444444444444444444444444444444 111111 111111 111 11111 11111 111 22222222222 2222 1111111 22222222222222222222 11 222 1111111 22222222222 222222 111 2222222222 22 11111 111 1 1111 11 1 111 11 111 111 111111 22222222 33333333 555555555555555555555555555555555555555555 111 11111 111111 11111 1111 444444444 1111 22222 111 1111 11111111 1111 11 111 1 1 11 1111111 111 1 11 3333333333333333 11 11 111 1 1 1111 222222222 11111 111111111 1111 1 2222222 111 1111111 11 111 111111 2222 1111 11 111 22222 222 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 2 3333333 11 11 222 111 111 3333333333 11 222222 1 1 1 1 11 22222 3333333 11 1 1 222 1 1 1 11 1 1 1 1 1 11 11 11 1 11 2222 1 1 1 11 1 8888888888888888888888 11 222 1 1 11 1 1 11 1 22222222 1 22222 222 1 1 1 1 1 1 11 222 11 1 1 1 111 1 1 1 1 1 1 1 333 1 222 2222 11 1 1 11 11 1 1 11 1 1 1 11 1 1 1 1 222 3333333 11 1 1 11111 1 11 1 111 1 1 1 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 11 1 222222222222222 11 2222222 11111 2222222 1 11 1 1 111 1 11 1 1 1 11 111 222222 1111111 11 22 1 222222 1 22222 1 33333333333333 2222 33333333333333333333333 1 11 1 1 4444444444
lowQualScore : 11111111111111 88 88 11 0 0 0 88 5 8 8 11 8 88 8 44 8 8 6 444 3 55 3 6 6 6 77 6 99 1 77 5 5 5 2 4 77 77 5 3 0 222222 2222 5 77 77 0 77 000 5 5 55555 00 5 77 5 00 6 5555555555 0 5 77 77 66 5 5 5 5 1111 2222 000 77 333333333 77 5 77 777 5 1 5 77 666666 44 55555555555555555 5 5 5 2222 5 5 5 5 77 000 5 222222 5 444444 5 5 55 5 5 5 222 5 999999999 66 888 66 5 5 66 66 00 4 11 0 0000 77 5 5 5 2 5 5 5 777777777777 6666666 5 88888888888 666666 77 77 1 0 3333 999999999999999999999999999999999999999999 555555 5 1 555555 000 5 5 5 55555 5 4 999 5 4 5 33333 000 11111111111 5 5 0000 5 77 8888888 5 5 5 77 5 33333333333333333333 5 5 66 5 7 77 5 1 33 333 5 5 8888888 9999 6 55555555555 6 6 6 6 6 888888 99 6 6 222 6 6 99 0000000000 6 99 6 6 1 7 22 6 77777 6 888 1 5 1 777 3333 3 1 5 0 1 77 3 5 5 77 777 66 5 5 5 1 000 5 77 1 5 5 4 5 5 66 77 77 666 88 33 1 000 000 0 555 5 5 666666 5 5 5 888 1 00000000 6 5 5 77 5 5 5 2 99999999 1 77 1 888888888888888888888888888888888888888888 5 555 77 99999 5 5 000000 5 5 44444 5 1111 77 5 000000000 77 4444 00000 555 5 2222 77 77 1 77 33333333 2222 33 777 0 3 99 6 6 6 7 3 44 777 4444444 99 111 6 6 66 6 6 666 6 6 6 6 99 3 6 00 8888888888888888 888 6 6 88 3 0 0 0 11 0 444 0 6 3 99 5555 6 666666666 1 6 33333 999999999 1 5 5 7777 4 5 999 5 1 5 77 77 77 5 2222222 77 000 5 5 5555555 66 33 000 5 5 5 5 5 3 5 33 5 5 5 77 0 77 777777 5 5 7777 6 6 6 6 4444 6 99 55 111 6 6 6 99 6 44444 888 6 7 000 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 8 8 8 0 8 3 2 0 0 0 6666666 33 3 0 22 3 333 666 777 1 8 5555555555 8 8 55 1 0 8 2 444444 3 2 0 5 5 1 5 88 66666 1 2222222 44 8888888 2 5 000 1 5 5 5 88 5 5 5 5 5 88 66 1 88 5 1 88 1 3333 5 5 5 88 5 1 5555555555555555555555 88 1 111 5 5 88 5 5 77 5 33333333 5 66666 000 5 5 5 5 5 1 5 88 000 88 5 5 2 5 999 5 5 5 5 5 3 6 3 111 3 111 4444 88 1 5 5 77 1 1 1 7 7 44 6 6 3 0 3 1 1 88 1 22 6 0 3 3 0 6 6 7 3 1 88 5 5 5 1 22 5 111 1 1111111 1 88 1 5 7 3 0 2 88888 3 3 0 22 0 3 3 3 777 3 3 3 0 3 33 5 3 5 5 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 1 11 6 99 3 99 888888888888888 33 6 2 99 1111111 6 6 77777 8 6666666 0 33 0 0 3 2 111 0 33 5 0 0 33 3 44 777 2 888888 3 9999999 33 99 0 111111 0 55555 3 0 44444444444444 00 1111 77777777777777777777777 0 33 5 1 0 9999999999
lowQualScore : .............. .. .. .. . . . .. . . . .. . .. . .. . . . ... . .. . . . . .. . .. . .. . . . . . .. .. . . . ...... .... . .. .. . .. ... . . ..... .. . .. . .. . .......... . . .. .. .. . . . . .... .... ... .. ......... .. . .. ... . . . .. ...... .. ................. . . . .... . . . . .. ... . ...... . ...... . . .. . . . ... . ......... .. ... .. . . .. .. .. . .. . .... .. . . . . . . . ............ ....... . ........... ...... .. .. . . .... .......................................... ...... . . ...... ... . . . ..... . . ... . . . ..... ... ........... . . .... . .. ....... . . . .. . .................... . . .. . . .. . . .. ... . . ....... .... . ........... . . . . . ...... .. . . ... . . .. .......... . .. . . . . .. . ..... . ... . . . ... .... . . . . . .. . . . .. ... .. . . . . ... . .. . . . . . . .. .. .. ... .. .. . ... ... . ... . . ...... . . . ... . ........ . . . .. . . . . ........ . .. . .......................................... . ... .. ..... . . ...... . . ..... . .... .. . ......... .. .... ..... ... . .... .. .. . .. ........ .... .. ... . . .. . . . . . .. ... ....... .. ... . . .. . . ... . . . . .. . . .. ................ ... . . .. . . . . .. . ... . . . .. .... . ......... . . ..... ......... . . . .... . . ... . . . .. .. .. . ....... .. ... . . ....... .. .. ... . . . . . . . .. . . . .. . .. ...... . . .... . . . . .... . .. .. ... . . . .. . ..... ... . . ... . ....................................................... . . . . . . . . . . . ....... .. . . .. . ... ... ... . . .......... . . .. . . . . ...... . . . . . . . .. ..... . ....... .. ....... . . ... . . . . .. . . . . . .. .. . .. . . .. . .... . . . .. . . ...................... .. . ... . . .. . . .. . ........ . ..... ... . . . . . . . .. ... .. . . . . ... . . . . . . . . ... . ... .... .. . . . .. . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . . . . . . . . . . .. . . . . .. . ... . ....... . .. . . . . . . ..... . . . .. . . . . ... . . . . . .. . . . . ................................................................................. . . .. . .. . .. ............... .. . . .. ....... . . ..... . ....... . .. . . . . ... . .. . . . .. . .. ... . ...... . ....... .. .. . ...... . ..... . . .............. .. .... ....................... . .. . . . ..........
lowQualScore : 88888888888888 88 88 00 8 8 8 88 6 0 0 00 0 66 0 00 0 0 7 777 3 77 2 7 7 7 77 7 22 0 99 7 7 7 0 3 99 99 7 0 1 111111 1111 7 99 99 7 99 000 7 7 99999 77 7 99 1 44 0 0000000000 1 7 99 44 33 7 7 7 7 6666 1111 000 99 111111111 99 7 99 111 7 4 7 99 444444 33 66666666666666666 7 7 7 1111 7 7 7 7 99 000 7 666666 7 444444 0 0 44 0 0 0 111 0 000000000 99 888 99 0 0 99 44 66 4 99 0 6666 66 0 0 0 2 7 7 7 111111111111 7777777 7 99999999999 444444 99 99 6 1 6666 111111111111111111111111111111111111111111 111111 7 7 999999 000 7 7 7 00000 7 0 444 7 3 7 99999 000 00000000000 7 7 7777 7 11 6666666 7 7 7 99 7 44444444444444444444 7 7 44 7 9 44 0 4 66 666 7 7 4444444 3333 7 77777777777 7 7 7 7 7 555555 22 7 7 555 7 7 22 0000000000 7 22 7 7 7 3 55 7 77777 7 333 4 7 7 333 9999 6 4 7 1 4 99 9 7 7 44 111 44 7 7 7 4 000 7 99 7 7 7 9 7 7 44 99 99 111 00 66 7 000 000 1 999 7 7 666666 0 7 1 666 7 77777777 6 7 7 99 7 7 7 3 77777777 6 99 7 666666666666666666666666666666666666666666 7 777 99 66666 7 7 999999 7 0 33333 7 4444 99 7 777777777 99 0000 00000 777 7 1111 99 99 7 99 11111111 1111 66 999 8 6 22 7 7 7 2 3 00 555 3333333 22 777 7 7 77 7 7 888 7 7 7 7 22 3 7 22 5555555555555555 333 7 7 33 8 8 8 8 00 8 000 8 7 3 22 2222 7 777777777 0 7 00000 000000000 9 7 7 0000 9 7 666 7 4 7 99 99 99 7 7777777 99 000 7 7 9999999 44 66 000 7 7 7 7 7 6 7 99 7 7 7 99 7 99 333333 7 7 9999 7 7 7 7 2222 7 22 88 777 7 7 7 22 7 88888 333 7 3 888 8 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 0 0 8 0 2 5 0 0 0 0000000 22 2 2 55 2 222 222 666 0 0 8888888888 0 0 66 4 8 0 5 888888 2 5 0 5 5 0 0 00 00000 0 0000000 77 3333333 0 0 000 0 0 5 0 00 5 5 0 5 0 00 00 0 00 5 0 00 0 0000 0 0 0 55 0 0 0000000000000000000000 00 0 555 0 5 55 0 0 55 5 00000000 0 00000 555 5 5 5 5 5 0 5 00 555 00 0 5 5 5 000 5 5 0 5 5 3 7 3 777 3 555 0000 00 0 0 5 55 0 0 0 3 3 77 7 7 3 7 3 0 0 33 0 00 7 7 3 3 7 7 7 3 3 0 55 5 0 5 0 00 5 000 0 0000000 0 55 0 5 3 2 0 5 55555 2 2 0 55 0 2 2 2 000 2 2 2 0 2 00 5 2 0 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0 00 7 22 3 88 000000000000000 22 7 5 22 7777777 7 7 00000 0 0000000 0 88 0 0 2 5 000 0 88 5 0 0 88 2 88 555 5 888888 2 8888888 88 00 0 000000 0 00000 2 0 88888888888888 55 2222 22222222222222222222222 0 88 5 2 0 5555555555
consensus : GAGTGTGAGATCAAG-----AA------GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ATT-GCT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCTC-TA-GT-GGCTGTCAAAC-TAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTATAAAA-TA---T-TGAT-TTTT-TATTA--AATATTGTAGACATC----------TGTTCTAAA-A--TTT-AAAAAAC-A-AT-AAAAA-AAAT--T-ATAA----CGT---ATT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCGC--CA-CC-TATG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-T-AAA----TTGTG-AA-TT-T-AA--TC---A-A----A-T-TG--T-A-AAG-C-ACAG-ACA-GA-GT-AA-T-GG-AAA--CT-G---AAAA--AA---CA--A-C-T--TATTTT-CA--TAAA-ATATA--ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG--TG--G----AGCCAT------T--TT--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C-G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CA---A-AA-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-CAA-T---TT---CA--AA-------TTC-AA-TAAAA-A--GC-AAAT-TA-------AA-TG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTTC-AT-GACTATAT-AATTACCTG--AA---T-TT-TATT-TA----TAACAGGGGA--AAAAA-A-----T---TAAT-ATTT-CATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-T-A-TA-CCGT-CC--AT-----TAAC-TCAGA-ATG--AA-ATATGA-GAAAATGTG--CA-TCGTTA--C--ACA-TA---TTT-ACAAACA-TATAGA-G-TAATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAAT-CAATCA-ATGT---G-ACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA--TTT-A-AAACTAAT--CAGC---CC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAA-ATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TG-TC--TTCAAT-CA-C-AATAAAC-C--CAAAAAAAAA--AAAAAA------AAAAA--AAAA---------------AAGGAG-A--AAA-GATTAAA---TGG--AAAATGAAC-A-TGGT-ACA-ATAT-T--T-CAT-GAACTAT-----AT-GCC---TTT--CAT-GTAA----C---CCAACT--TTCAT--T-TGT-----AACA---G-AA----A--A--AAAGGTTAA--TGTTTCATAC---T----CTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAAA--TAT-GA-TGAATGA-AAATTGTT-ATC-AACAA-A--T----GTG--AA---T-C-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACATA-CA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-AAAAAAA-----GCA--A-----TACTATT-TT-C-AT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCCAA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-GC-C-A-TT--A---A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CC-TG-T-ATGAAC--AAT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAAT----A-T-C-G----TGC------TTTCA---CT-----CTA-T-AN-------GGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTACATGT-ATTTTTCTT--T-------TTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGG-TTTTCTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT---GA---A--C---AACA-AACATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-A-TGGTTGGTAC---C-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
Reference ( family-290 ) : GAGTGTGAGATCAA------AA------GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ATT-GCT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAG-CCGTTTTGCCTC-TA-GT-GGCTGTCAAAC-TAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TANTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTATAAAA-TA---T-TGAT-TTTT-TATTA--AATATTGTAGACATC----------TGTTCTAAA-A--TTT-AAAAAAC-A-AT-AAAAA-AAAT--T-ATAA----CGT---ATT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCG---CA-CC-TATG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC----------AA--AAATT-CG-T-AAA----TTGTG-AA-TT-T-AA--TC---A-A----A-T-TG--T-A-AAG-C-ACAG-ACA-GA-GT-AA-T-GG-AAA--CT-G---AAAA--AA---CA--A-C-T--TATTTT-CA--TAAA-ATATA--ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG--TG--G----AGCCAT------T--TT--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C-G-AAAT---T-C-CT-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCA---G--CA---A-AA-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-CAA-T---TT---CA--AA-------TTC-AA-TAAAA-A--GC-AAAT-TA-------AA-TG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTTC-AT-GACTATAT-AATTACCTG--AA---T-TT-TATT-TA----TAACAGGGGA--AAAAA-A-----T---CAAT-ATTT-CATAATGT-CCTTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-T-A-TA-CCGT-CC--AT-----TAAC-TCAGA-ATG--AA-ATATGA-GAAAATGTG--CA-TCGTTA--C--ACA-TA---TTT-ACAAACA-TATAGA-G-TAATGG--AAATAAA-AAAAAGCATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATAT-A-C-AACAAT-CAATCA-ATGT---G-ACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA--TTT-A-AAANTAAT--CAGC---CC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAA-ATTTCAT--GTTTCT--------AAANT-TG-TC--TTCAAT-CA-C-AATAAAC-C--CAAAAAAAAA--AAAAAA------AAAAA--AAAA---------------AAGGAG-A--AAA-GATTAAA---TGG--AAAATGAAC-A-TGGT-ACA-ATAT-T--T-CAT-GAACTAT-----AT-GCC---TTT--CAT-GTAA----C---CCAACT--TTCAT--T-TGT-----AACA---G-AA----A--A--AAAGGTTAA--TGTTTCATAC---T----CTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATGAAAA--TAT-GA-TGAATGA-AAATTGTT-ATC-AACAA-A--T----GTG--AA---T-C-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACATA-CA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-AAAAAAA-----GCA--A-----TACTATT-TT-C-AT-AAAATATAACAAAAATTATTC--ATG---TGTCCAA-A-TC--TCAGAAAA---AAGTT-GT---------GNA-GC-C-A-TT--A---A--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CC-TG-T-ATGAAC--AAT---TTT-T-T-----C-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTT-ATA-T----ATGG-CCAA-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---AG-A-C-AAA--A-TATCCG--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAA-----A-T-C-G----TGC------TTTCA---CT-----CTG-T-AT-------GGTTGTGGT-A-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTGT--TC--TTTT-GGATGAATTGGAGTCTTT-GGCAGTATG-GNACT--GGTTGTA-ATGT-ATTTTTCTT--T-------TTTGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACT-G---TTGAAAGTGG-TTTTCTCCACTGATTGTTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCTTGGCNAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGGTTGGCCATTGGCAAANTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACGAAACTTTTTACTCCGCGTGCGCCCAAANGCAATGTATAATATGATGGTATTCTGCTGCCGTTGTGAAATAAAAAGCAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCCCNCATNTGGTACTGTAGGNCGTACTANAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTATCTCTGCTTCGGNAACTTTTTGA---------------------GACATTTTTAATCCTGAANAATTTCAAAACCAGGTTATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTCCTCCATTGATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGTATATAAACAAAAATAAAAATAACCTTTAAANTGGCAAGGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCGTAATACCTCGGACAAGANACAACAAGTTTCCACAAACTCTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTACC-ACACCC-TCTGACCTTCATCTATGGATTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAAAGAAAAANTGCATGGCAGTTAAGCTCAGGAGNTTTNTTAATTNACTGATACTGATATCATAACTGGTCATCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCGGT-AATGAATTTNTANAA--AAAANTCTAACACTGCNNGCCATGGTTCATACGGTT-TGA-CCACGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGACATTCAGNTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTATGCTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGNTGACCANNAGTTGCCTCCCACATTTGGNTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGNACAAGAATAGNCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTCACTAATTATATC-TC-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCGNCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCTACTTCACAACGGGGAATAACGGGNAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT---GA---A--C---AACATAACATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-A-TGGTTGGTAC---C-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTTTATCATGTGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TATTACTANCTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCTC-CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|1 : GAGTGTGAGATCAAGT----AA------AGTA-ATGGGAA--CAA--ATGATTTTGGTATCAAATGGATACACA-CA-TGTCTG--GACC-AAT-GCT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AAAAA---GAGTGTAG-CCGTTTTGCCTC-TA-GT-GGCTGACAAACCTAAGGGCA--TGTAACTCTGTGTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TAGTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTATAAAA-TA---T-TGAT-TTTT-TATTA--AATA--GTA---ATC----------TGTTATAAA-A--TTT-AAGAAAC-A-AT-AAAAA-AA-T--T-ATAA----CGT---ATT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCG---CA-CC-TATG-ATGTC--CAATTT------TTCACCTGC----------AA--AAATT-CG-T-AAA----TTGTG-AA-TT-T-AA--TC---A-A----A-T-TG--TTA-AAG-C-ACAG-ACA-GA-GT-AAAT-GG-AA----C-G---AAAA--AA---CA--A-C-T--TATTTTTCA--TAAA-ATATA--ATA-AC----AT-CA-ATCA-AT-GTTTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----A-AG-AG--TG-------AGCCAT------T--TT--GAAAAAT-A-CTCAG-----C-----------C-G-ACAT---T-C-CT-C------TGACCA---TTT-TTTTTTCA---G--CA---A-AA-TTTC-CA-TGT-TT-TACGA-T-TT-GTCT-CAA-G---TT---CA--A--------TTC-AA-TAAAA-AA-GC-AAAT-TA-------AA-TG-G-A--AA-ATGA----AC--A-TG-----G--TAC-TATA-TTTC-AT-GACTATAT-AATT-CCTG--AA---T-TT-TATT-TA----TAACAGGGGA--AAAAATA-----T---TAAT-ATTT-CATAATGT-C-TTA-CA-AT-C----CAC--C-AA-TTA-TAACCGT-CC--AT-----TA-C-TCAGA-ATG--AA-ATATGAAGAAAATGTGGGCA-TCGTTA--TCAACA-TA---TTT-ATAAACA-TAT-GA-G-TAATGG--AAATAAA-AAAAAGTATA--CTA-CTT-TTA-TAAA-ATA--A-C-AACAAT-CAATCATATGT---G-ACC--AAAT-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA--TTT-A-AAAC-AAT--CAGC---CC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT----CAGCAAA-ATTTCAT--GTTTCT--------AAAAT-TG-TC--TTCAA--CA-C-AATAAAC-C----------AA--AAAAAA------AAAAA--AAAAATAAAAAACGCAATTAAAGA--A--AAA-GATTAAA---TGGGAAAAATGAAC-A-TGGTAACA-ATAT-T--T-CAT-GAACTAT-----AT-GCC---TTT--CAT-GTAA----CT--CCAACT--TTCAT--T-TGTA----AACA---G-AA----A--A--AAAGGTTAA--TGTTTCATACTAAT----CTC----CTCG-C--CATC-A---CTCACAATGGAAA--TAT--A-TGAATG--AAATTGTT-ATC---C-A-A--T----GTG--AA---T-C-GTTATCAC-A-TATTTT-ACA-ACATA-CA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-TAAAAAA-----ACA--A-----TACTATCGTT-C-AT-AAAATATAACAAAAATTAT----ATG---CGTCCAA-A-TC--TCAGAAAG---AAGTT-GTGGGGGGGGGGGA-GC-C-A-TT--A---G--AATATTCA-GC-T-C-AAAAATTCCAA-TGAAG--TG-TCG-CC-AAAACCA--T--GAA--AC-TGAA-ATGAAC--ATT---TTT-T-T-----T-CC-ATAA--TCCAC---T-CG-ACCGCAATG-CATGA-AAATT-GCAA-AAAGTACAA-AGAAC-A--TCA--AATT--T-TCTTAATA-TA---ATGG-CCAT-GT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTG--CT---A--A-C-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAATGTTCA-TGCAA----TGC------TTTCA---CTTCTTGCTA-T-AA-------GTTTGTGGTAA-CAT-T-TTCTTC-CCCTCTGTCCTAATTACTGT-TAT-TTCT-TTG----C--TTTT-GGATGAATTTGAGTCTTT-GGCAGTATGTGTACT--GGTTGTACATGT-ATTTTTCTTGCT-------TATGG-ATG-AATTGGAGACTTTGGCA-GTATGCACTGG---TTGAAAGTGG-TTTTCTCCACTGATTGTTGGAATCTGCAGTA-TATGTGATCTTCTTGGCTAAAAATACAATA-AAT--TTTAAATTAAGTTGGCCATTGGTAAACTAAGATGAGAATGGTATAACTAGATGAGATGGTATAAACAAGACTTTTTACTCC-CGTG---CCAAATACAAT-TATAATATGAT-GTATTCTGCTGCC--TGTGAAAT-AAAAGCAATATTT-GAAG-AACA-AATA--TGCCCCCATCTGGTACTGTAAGTCGTACTATA----TTGCAC-AATTGTAT-AG-AATA--ATCTCTGCTTCGGTAACTTTTTGA----------------------ACATTTTTAATCTTGAAGAATTTCAAAACCAGG-TATCTAAAATACTGTGACTCGATAAAAAACCCACTGTTAATGAGAGTACATGTTCTCCATTGATC-----AATGGCTCTCAACAAATTGTAACGCGACTTATAGGGAATGT-TATAAACAAAAATAAAAATAACCTTT-AATTGGCAAAAAAGAC--TATGTTTGAATTGTGGTT---TGCTGATGAACTGAAGAGGGGAGACCAACACTTCTGGCAGACTCATAAT-CCTCGAACAAGAGACAACAAGTTTCCACAAATTTTCCAACCGCTCTGTCCATCCAAAAGCCTTTCGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGTCCCACAACTT--AAACGGAAAGTACCAACACCCTTCTGACCTTCATCTATGGATTAAATATTTTAAAATG---TTTATG----TGTATATTTGTAAAAGAAAAAATGCATGGCAATTAAGCTCAGGAGATTTGTTAATTAACTG-TACTGATATCATAACTGGTC-TCTTTTTTCAATACCCTGTATGTACAT-GTACAATTACCAGTAAATGAATTTTTAAAATTAAAAATCTAACACTGCATGCCATGGTTCATATGGTTGTGGCCCATGCA-TATTGACTTGTTTTGTTTGACATTCAAGTCCTAAAGACATATTTCCTTTCCTATTCCTAT-CTGGGACTGAACATACAAGTGTATGAGATGACCACTAGTTGCCTCCCACATTTGATTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGCACAAGA--AGCCTCAACGAAGAAAATTTATC-ACCTGTGTGTTTATCAAACATTGC---ACCAATTAATTCACTAATTATATCTTT-CAAAA-CTTGCTCCAACATACATTACAGA--TCAGTTTCCTTGCAATCT-CCGAGCAGC-TTGTTTACATATATA-ATATATATAT-TATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTCT-CTTCACAACGGGGAATAACGGGTAATA--ACTCT-AATCG---AA-GAA--CGACCT---GA---A--A---AAC--AACATAGATCAATCCGCTCAA--CACATC-------TTGAA-TGGTTGGTAC---CAACTGAATTCCT-T-----GTTACTAT-AATGAAATTCTAAC-AACCATTTTTATCATGGGCT-ATC-ATACATT--TACACATTAT-CGGGGAATCTATATTACTAACTT---ACTAGGGA------TAATGT---AA--TT--GAGTCT--CT-GAGAAC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGAT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---CTTTATTA--TCTATA----TTTTTTGAAA--CAGAATAT-GGTCG--A-------ATATTCACCTCTGGTC
gi|10 : GAGTGTGAGATCAA------A-------GGTA-ATGGGAAA-CAA--ATGATTT-GGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-AT--ACT-TGGTCAT-GA-AATAAA-AACAA---GAGTATAG-CCGTTTGCCCCC-TA-GT-GGCTGTCAAAC-TAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-ATAGTCC--AT--A-TACTAATTTAAA------ATAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CA---T-AAAATTATAAAA-TA---T-TGA--TTTT-TATTA--AATA-TGTA-ACATC----------TGTTCTAAA-A--TTT---AAAAC-A-AT-GAAAA-AAAT--T-ATAA----CGT---ATT--CTAT------A--CTT--TACT-CACA--GCGC--CA-CC-TATG-ATGTC--CAATTT------TTCAACTGC-----------A--AAATT-CG-T-AAA----TTGTG-AA-TC-T-AA--TC---A-A----A-T-TG--T-A-AAG-C-ACAG-ACA-TG-GT-AA-T-GG-AAA--CT-G---AAAA--A
gi|11 : aaggtagtacTATTT--TGTGTTCTCAATAGTTGTAAT-----T--A-CAATGATTTAAAAGTATCTAAAATTTTA-AGAGTAAAAACAATGA--CA---T-AAAATTATATAA-TATAGT-TGATATTTTATATTA--ATTATTGTTGACATCAAGTAATGTATGCTACAAA-AGTTTC-AAGAAACTA-ATAAAAAA-AAAT--TGATAAGGAGCGTAAAATT--CTATTAACGCG--CTT--TACT-CGCGATGCGC--CA-CCTTATGTATGTCTTCAATTTAAATAATCGAGCTACCGACACTCTTAAGTATATT-CG-T-GAAAATTTTGTGTGA-TT-T-AAATTC---A-ACACTA-C-TGATT-ATGAG-CAACAGTACA-GA-GT-AA-TAGG-AAAATCT-GTGTAAAA--AAGAGCA--A-CTT--TATTTT-CAATTAAA-ATAT
gi|12 : tcttttcttaaaaattTT-ACACAC--CATAAC-A-TAAT----AAAAAAA-TAAAAGCATA--C-A-CTT-T-A--AAA-ATG--A-C-AATAAA-CAATCA-ATGTCTGG-ACC--AAAT-TTTCAGCAAAATAGA------AGTTCCA--TTT-A-AAAATAAT--CA-C---CCAGTGGA-TATCCCTACTAGAACAGCTTTTTTTCTTCACCAAA--TTTCATTTGTTACT--------AAATT-T--TC--TTCAAT-C--C-GACAAA-------AAAAAAAA--AATAAA------AAAGG--GAAA---------------AAGGAT-AATAAA-GA-TAAA---T-G--AAAATGAACTG-GGGT-ACA-ATAT-A--A-CA--GA--CAC-----AT-ACC----TT--CATCGTAC----CTTTCAAACT--TTCATCCT-TGTTAATCAACAAAGG-AA----A--A--AAAGG-TAA--TGTCTCATAC---T----CTCGTTGCTCGTCCACATCGA---C
gi|13 : GGGTAATAGAACTCTTAATCGTTAAATGAAGTAGACTT---GATATAT-C---AACAAACCATGGATCA-T-C--TCAATTCACATC-------TTG-AATGGTTGATATTTAC-ACTG-ATTCCT-TAGATGGCTACTATTAA--GAATTCTAACCAA-CATTTTTATCACGTGCTTA-CGATACATT--TAC-CATTGTCCGGGG-ACT--TATTACTATCTTTAAGCTAGGGAATATGTTAAAGTTCCAT--TT--GAGTCTCACTGGAG-A----CGC-TATAAACCCATAACCTAGCTCCTGCGATATTAAATTATCAAATAAACACCTTTTTACT----TTAGCCC---AATATATTTTTG-AAACCAGAATTTGGGTCA--A-------ATA
gi|14 : gaaaataatactgt--TAAA-ATATGT-GTA-ACCGATAT----ATCA--T-GTGACCAA-A-TTT-CAGAAAGAAAAAAGGAAAA-----A-AG-AG--TG--GCAACAACCAT------T--TTTGGACAAATCATCTCAGACTCTC-----------C-GAAAAT---T-CTCT-CTGGTCTTGACCAGGGTTT-TTATATCA---GAACA---ACAACTTTCGCA-TGT-TT-TATGAGTGTT-GTCTGCAA-A---TTATGCA--CA-------TTC-AA-TAAAAGA--GCAAAAT-TA-------AA-TG-G-A--AATATGA----AC--ATTGATGATG--TACACATA-TTTC-AT-GACTATA--AATTACCTGAAAA---T-TT-TATTATA----TAA
gi|15 : GATACTGATATTATATCTGGTAATCTTTTTTCA-TACC-TGTATGTACATTGTACAATTATCGGT-AATGAATTTATATAA--AAAATTCTAACACTACTAA--AAGTTTCTTGCCATT-TGA-CCCCA-AGTAT--AC-TG
gi|16 : GTCCAA-A-TC--TCAGAAAA-----GTTTGT---------GCA-GC-C-AATT--ACG-A--AAAAATC--GC-C----AAAATGCCAAATGAAAGTTG-TCG-AC-CAAACCA--TACGAA--CAGTG---ATACAC--CAT---ATT-T-T-----C-C--ATAA--TCCACGAAT-CG-ACCGTAA---CA-GA-AAAAT-GCGACAAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AA-A--T-TCTT-AC--T----ACGT-C--A-GT-AACAACC----ACACTG--CA--CTGA-CT---AGAA-CGAAA--A-TATCCAATA-AT-ACGC---GTAAGAAC-CTGCCA-AG-----A-T---G---------------TCA---CTG----CTA-TCAA-------CGTTGAGGT-A-CAT-TGTTTTTC-CCCatatgacctcgaatgtgatcctgactcccactatgaattgactttggattttcttgacattctatggaagtttattatcaataaatgagaagaaattgtgtcgtcaaatatgtgttaactttctgcagatcaacatttttttttcataccaca
gi|17 : --ACTCT-AATCG--AAAAGAAG-AGACTTTTTGA---AGTCTGAAAAACAATATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-A-TGGTTGGTAC---A-ACTG-ATTCCT-T-----GTTACTAT-AA--GAATTCCAAC-AA-CATTTTTATCAT-TGCT-A-C-ATACATT--TACACATTGT-CGGGG-ATC--TA--------TT---ACTAGGGA------T-ATGT---AATTTT--GAGTCT--CT-GAG-AC---CGC-TATA-----ATAACCT-GC-----CGA-----------------------TTTT---T----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATAT-GGTCGCTATGACACCACATCCACCTCTGGTC
gi|18 : ATAATGGGGAATAACGGGGAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT---CA---A--C---AACATAACATGGATCAAT-CGCTCAA--CACATCTTTTTTTTTG-A-TGGTTGATAC---C-ACTG-ATTct
gi|19 : gtctactttcatttcacaatggggaCTTTCTATTTCACAACGGGGAATAACGGGAAATA--ACTCT-AATCG--AAA-GAAG-AGACTT---CA---A--C---AACATAATATTGATCAAT-CGCTCAA--CACATC-------TTG-A-TGGTT
gi|2 : ttgtttaaataaaatgcaggggtttaatatctaAAATAAAAAA--GAGTGTAG-CC-TGTTGCCTCCTA-CC-TGCTGTCAAAC-TAAGGG-A--G-TA-CTCTGTGTATTTCTT-T-TTCTTTAAATT-AT-GTCC--ACTAA-TAGCAATT-AAA------TAAA----TA-A---TCAAGG--AATA--CA---T-AAAATTATAAAAATA---G-TGAT-TTTG-TATTATCACTATTGTAAACATC----------TGTTCTAAA-A--TTT-AAAA--C-A-AT-AAAAA-AAAT----ATAA----CGT---ATT--CTAT------AA-CTTGCTACTTCGCA--GCG---CAGCT-TATG-ATGTC--CAATTC------TTCAACTGC----------AG--AA-TT-CG-T-AAA----TTCTG-AAATT-T-AA--TCCACA-A----A-TGTG----A-AAGTC-ACAG-ACA-GA-GG-TA-TAGG-AAA--CTTG---AAAA--AA----A--A-C-T---ATTTT-AA--TAAA-ATATATAATA-AG----ATTCA-ATCACAT-GTGCCCAA-A-TTT-TATG----------AAAAA-----A-AG-AG--TG--G----AACAAT------T--TT--TGAAAAT----TCAG-----C-----------C-C-GAAT---TAC-CTGC------TGAC-A----TT-TTTTTTCA---G--CA---A-AA-TTTC-CA--GTCTT-TACGA-T-TT-GTCT-CAAAT---TT---CA--AA-------TTC-AAATAATA-ACGGC-AAAT-TA-------AAATGCG-ATGAA-ATGA----AC--A-TG-----G--TA--TATA-TTTCCAT-GACTATAT-A--TACCTG--AAAT-T-TTGTATT-TC----TAACAGGG----ATAAA-A-----C---C--T-ATTT-CATAATGT-CCTTA-CA-AT-GG---CAC--C-AAGT-A-TA-CCGCGTC--AT-----TGAC-TCAGA-ATG--AAGATATGA-GAAA-TGTGG-CA-TCGTTA--C--ACA-TA---TTTTACAA-CA-CATAGA-G-TAATCG--A--TAAA-AAA--GCATAACCTA-CTT-TTA-TAAG-ATAT-AAC-AACAAT-TAATCA--TGT---GGACC--AAAT-TT-CAGAAAAA--GT-GTGGTAG--CCA--TTT-T-AGAATAAT--CAGCGGCCC---GAA-T-TTCCT-CT-GAACAGCTTTTCT-----AGCAAATATTT-------TTCTGTTCAAAAAAAATATG-TC--TTCAAT-CA-C-A-TAACC-C--CCCCAACAAA--AAAGCA------ACCCA--AAAA---------------AAGAAA-A--AGA-G-TTAAA---TGG--AAA-TGAAC-A---GT-ACAGATAT-T--T-CAT-GAACTAT-----AT-GTT---TTT--CAT-GTA---------CCAACT--TTCAT--T-TGT-----AACAT--G-AA----A--AGAAAAGGTAAA--TGTTTCAAAC---T----CTC----CT-GTC--CATCGGAT-CTCA-AATGAAACGCTAT-GACTGACTGA-AAATTGTTTATCTAACAG-ACAT----GTG--AA---TTC-GTT--CAC-A-TATTTT-ACA-ACATAACATG-AGTA--ATGCAA-AAT-AAAAAAAAAAAAGCA--GACTGGTACTATT-TT-CCAC-TAAATATGACAAAAATTATTC--ATA---TGTCCAA-AATCGTCCAGAAAA---TAGTA-TT---------GAG-GC-CCA-TT--ATGAA--AATAGTCA-GC-T-C-AAGAATGCCAA-TGAAA--TG-TCG-AC-AAAACCA--T--GAA--CC-TG-T-ATGAGC--AATGAATTT-T-C-----C-CA-ATAA--TTCCC---T-CG-ACCGTAATG-CATAA-AAATT-GCAA-AGTGTAC-A-AGAACGA--TCAACAATTGGG-TGTT-ATATT----ATGG-CCAA-GT-AAATA-C----ACACT--TCA--CTG--CT---AG-ACC-AAA--A-TATCCA--A-AT-A-GCT-TGTAAGA---CTGCCATAA-----A-T---GTAACTGCT-----TTTCACTTCT-----TTGTT-AT-------GGTTGTGGT-AGCAT-T-TTTCTT-CCCTCTGT-CTAATTACTAT-TATCTTCTCTTGT--TCTTTTTT-GAATGGATTGGAATTCTT-GGCAGTA-G-GCACTACGTTTG-A-AAGTGGTTTTTCT
gi|2 : cTTGTTCTT--T-------TTTGA-ATG-GATTGGAATTCTTGGCA-GTAGGCACT-ACGTTTGAAAGTGGTTTTTCTCCACTGATTGTTGAAATccactgattgttgaaat
gi|20 : caaataaaaaagagtgtagcctgttgcctcctacctgctgtcaaactaagggagtactctgtgtatttctttttctttaaattatgtccactaatagcaattaaataaataatcaaggaatacataaaattataaaaatagtgattttgtattatcactattgtaaacatctgttctaaaatttaaaacaataaaaaaaatataacgtattctataacttgctacttcgcagcgcagcttatgatgtccaattcttcaactgcagaattcgtaaattctgaaatttaatccacaaatgtgaaagtcacagacagaggtataggaaacttgaaaaaaaactattttaataaaatatataataagattcaatcacatgtgcccaaattttatgaaaaaaagagtggaacaatttttgaaaattcagcccgaattacctgctgacattttttttcagcaaaatttccagtctttacgatttgtctcaaatttcaaattcaaataataacggcaaattaaaatgcgatgaaatgaacatggtatatatttccatgactatatatacctgaaattttgtatttctaacagggataaaacctatttcataatgtccttacaatggcaccaagtataccgcgtcattgactcagaatgaagatatgagaaatgtggcatcgttacacatattttacaacacatagagtaatcgataaaaaagcataacctacttttataagatataacaacaattaatcatgtggaccaaatttcagaaaaagtgtggtagccattttagaataatcagcggcccgaatttcctctgaacagcttttctagcaaatatttttctgttcaaaaaaaatatgtcttcaatcacataacccccccaacaaaaaagcaacccaaaaaaagaaaaagagttaaatggaaatgaacagtacagatatttcatgaactatatgtttttcatgtaccaactttcatttgtaacatgaaaagaaaaggtaaatgtttcaaactctcctgtccatcggatctcaaatgaaacgctatgactgactgaaaattgtttatctaacagacatgtgaattcgttcacatattttacaacataacatgagtaatgcaaaataaaaaaaaaaaagcagactggtactattttccactaaatatgacaaaaattattcatatgtccaaaatcgtccagaaaatagtattgaggcccattatgaaaatagtcagctcaagaatgccaatgaaatgtcgacaaaaccatgaacctgtatgagcaatgaattttcccaataattccctcgaccgtaatgcataaaaattgcaaagtgtacaagaacgatcaacaattgggtgttatattatggccaagtaaatacacacttcactgctagaccaaaatatccaaatagcttgtaagactgccataaatgtaactgcttttcacttctttgttatggttgtggtagcatttttcttccctctgtctaattactattatcttctcTTATC-AACTTG-C---A-CA-TTAATTCACTAATTTAATC-TC-CAAAA-CTTGCTCTAACATACATTACAGATTTC-GTTTCCTTACAATCTACCGAGCACCTTTGTTTACACACACACATATATATATATATAT
gi|21 : AA--TAT-GA-TGAATGAGAAATTGGT-ACA-AACAA-A--TACTAGAA--AA---T-C-GTAACAACTA-T-TTTT-ATACACATA-CA-G-AGTA--ATG-GA-AAT-AAGAAAA-----GCA---------ACTA---TT-C-AT-AAAATA
gi|22 : CCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTTCC-ACACCCATCTGACCTTCATCTATGGATAAATTAATTG-AAattata
gi|23 : T--TTCAT--T-TGT-----AGCA---GGAA----A--A--AAAGGTTAA--TGTTCCATAC---T----CTC----CTCGTC--CATCGACAGCTCACcaatcgatataat
gi|24 : ---CA--A-C-T--TATTTC-TA--TAAA-TTATA--ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTC
gi|25 : TGGTA-AACTAGATAAGATGGTAT-AAC-AAATTTTTTACTCC
gi|3 : GAGTGTGAGATCAA------AGTAATGGGGTATATGGGAAAACTA--ATGATTTTGGTATCA--TGGATCTACAGTAATGTATGTGGACATATT-GCT-TGG-CAT-GAGAATAAA-AAAAAAAAGAGTGTAG-CCCGTTTGCCTC-TAAGT-GGCTGTCAAAC-TAAGGG-A--GGTAACTCTGTGTATTT--T-T-CT-----AAAT-AT-GTCCCTAT--AATACTAATTCAAAA-----TAAA-----A-AG--TCAAGG--ATGAACTA---TCAAAATTATAAA--TA---T-TGAT-TATT-TATTA--A-TAT-GTAGACATC----------TGTTCTAAATA--TTTTAAAAAAC-ATAT-AAAAA-AAAT--T-ATAA----CGT---ATTTTCTAT------AACTTT--TACT-CGCA--GCGACCCA-CC-T-TG-ATGTC--CAATTT------TTAAACTGC----------AA--TAATTACG-T-AAA----TTGTG-AA-TCAC-AA--TC---A-A----T-T-TG--T-A-AAG-C-AC-G-ACAAGA-GT-AA-T-G--AAA--CT-G---AAAA--AA---CA--A-C-T--TATGT--CA--TAAATATAAA--ATATAC----ATCAA-ATCA-GTAGTGTCTAA-AATTTATA------------GAAAACATCGA-GGTAG--TGTAG----AGCCAT------T--TT--GATAAAT-C-CTAAG-----CTAGCTAAATACC-G-AAATATTC-C-CT-CGT----TGAA-A--GTTCATTTTTTCACCAG--CA---A-AA-TTTC-CAATGT-TT--ACGA-T-T--GT-T-CAA-T---TT---CACAAG-------TTC-AA-TAAAA----GC-AAATGTA-------AA-TG-GTA--AA-ATGA----A---A-CG-----G--TAC-TA------------A-TATAA-AATTACCTG--AA---TCTT-TATT-TAC---TAACAGGGGA--AAAAA-ACATAAT---TAATTATTT-CATAATGTTCCTTAGCG-AG-GAGAGCAC--CCAA-T-AGTA-CCGT-CCCCATCCTTGTAACATCAGAGATG--AA-ATATGA-AGAAATGT----A-TCGTTAATC--ACA-TAATCTTT-ACAAACA-TAAAGA-G-TAATAGGCAAATAAATAACAGGCATA--CTAACTT-TTAATAAATCTATGA-CTAACAAT-CAATCA-ATGT---G-ACCCAAAATGTT-CAGAAAAA-AGAAGTGG-AG--CAT--TTT-ATAAACTAAT--CAGC---CC---GAA-T-TTCCT-CC-TGACAGCTTTTCT----C-GCAAC-AATTCAT---TTTCT--------AATTT-TG-TCCTTTCAATTCA-CTAATAAACACAACAAAAAAAAACAAAAAAA------AAAAACCAAAA---------------AAGAAG-A--AAAAGATTAAACTATGG--AAAATGAAC-AATGGT-ACA-ATAT-TAAT-CAT-GAACTAT-----AAAGCC---TTCGCTAT-GTAAAGCAT---CCAACTCTTTCAT--TATGT-----AACA---G-AAGAGGA--A--AAGGGTTAACCTGTTTCATAC---TAACTCTC----CTCGTC--CATCGA---CTCACAATG-AAA--TATCGA-TGAATGA-AAATTGTTAATC-AACAATA--T----GTGAAAA---T-CGGTTATCAC-A-TATTTTAACA-ACATA-CA-GAAGTA--ATGTGATAATAAAAAAAA-----GC---A-----TACTATC-TTAC-ATAAAAATATAACAAAAATTATTCCAATGAGCTACGCAATACTC--TCAAAAAATTGAAA-T-GT---------GGA-GC-T-A-TTAGA---A--AATGATCA-GC-TGCAAAAAATTCCAA-TGAAG--TGTTCGAAC-AAAACCA--T---AA--TC-TG-TAATG-AC--AAT---TTT-T-T-----CACCGATAAATTCCAC---T-CC-ACCGCAATG-CATGAGAAATTGGCAA-ACGATAC-A-AGAAC-A--T-A--AATT--TATCTT-CTA-T----ATc
gi|4 : agtacGTGAGATCCA------AA------GTT-----GGAAA-TAA--A-GATATTTGTATCAA-TG-AT-CACC-TA-TGTATG---ACA-AT--GCT-TG-TCATTGA-AATAAA-AAAAA---GA-TGTAGTCCGTTT---CTC-TA-AT-GGCTGTCAAA--TAAGG--A--GGTAA-TCTG-GTATTT--T-T-TTCTTAAAAAT-AT---CC--AT--A-T--CAATTTAA-------TAAA----TACAG--TCAAG---AT----CA---T-TAAATTATAAAA-TA---TGTGAT-TTTT--AT-A--AATAT-GTA---ACT----------TGTTCTAAA-A--ATT-AAAA--C-A-AT-AAAAA-AAAT--T-ATA-----CGT---ATT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCG---CA-CC-TAT--ATGAT--CATTTT------ATCA--TGC----------AA--A---T-CG-T-ATA----ATGTG-AA-TT-T-AA--TC---ATA----A-T-TG-------AA-C-ACAG--CA-GA-GT-AA-T-GG-AAA--CT-G---AAAA--AA---CA--A-C-T--CATTTT-CA--TAAA-ATATA--ATA-AC----ATTCA-ATCA-AT-GTGTCCAA-A-ATT-TA------------GAAAA-----A-GT-AG--T---G----AG-CAT------T--T-------GAT-A--TCAA-----C-----------C---ACAT--------T-C------TGACCA--GTTT-TTTTTTCAC--G--C----A-AA-TTTC-CA-----TT-TATGA---TT-GTCT-CAA-T---TT---C---AA-------TTC-AA-T-AAA-A--GC-AAA--TA-------AA-T--G-A--AA-ATG----------------------AC-TGTA-CTT--ATCGA--AT-T-AATTACCTAT-AAT--T-TT-TATT-TA----TAA----GAA--AAAAA-A-----T---AGAT-ATTTCCATATTA---CCTA-CATAT-C----CA---C-AA-T---TA--CGT-CC--AT-----TGA--TCAGA-A-G--AA-ATG-GA-G-AAATGTG--CA-TCGTTA--C--ACA-T----TT---CAAACA-TATAGA-T-TAATGG--AAATAAA-AAAGA----A--TCA-CCT-TTA-TAAA-ATAT-A-A-CACAAT-TAATCATATGT---G-A-C--AAAT-TT-CAG-AAAA-AGA-GTG---A--CCA--TTT-A-AA--TAA----AAC---CC---G------TTCT-CT-GA--AGTTCTTTT----CAGC-AA-ATTTC-T--GTTTCT--------AAATT-TG-TC--TTCAAT-CA-C-AA----------AATAAAAAA--AA---------------------------------------------------ATTA-A---TGG--AAAATGAAC-A-T-GT-ATA-A-ATAT--T-CAT-GAACTAT-----AT-GC-----TT--CAT-GTAA----C---TCAAC---TTAAT--T-TGT-----AACA---G-AA----A--A--AAAGGT--A--TG--TCATAC---T----CTC----CTCGTC--C-TTGA---CTCACAATG--AA--TAT-GA---AATGA-AAATTG-T-ATC--AC-A-A--T-----TG--AA---T-C-GT--TCAC-AGTA-TTT-A-A-ACATA-CA-G-AGTA--AGG-GA-AAT-AAGAGAA-------A--A-----CA-TACT-TT-C-AT--AAATATAACAAAA--TATTC--A-G---TGT-CAC-A-T---TCAG--AA---AAGTT-GT---------GCA-GC-T-C-TT--A---AATAAAATTCA--T-T-C-AAAA--TGCAA-TGAA---TG-TCG-AC-AAA--CA--T--GTA--AC-TGTT-AT--AC--AAT---TTT-T-T-----C-AC-AT-A--TTCAC---T-CG---CGTAATG-CAT-A-AAATT-GC-A-AAAGTAC-ATAGAAC-A--AAA--AAAT--T-CTCT-ATA-T----ATGG-TCAA-GT-A--AA-C----ACACTG-TCA--AT---CT---AG-A-C-AAA--A-TATCC---A-AT-A-GCT-TGC-AGA---CTGCCATAA-----GTT-C-GA---TGC------TTTCA---TT-------------------------TGGT-A-CAG-T-TTCT----CCTTTGTCCTATATACTGT-TAT-TTCTATTG----C--TTT---GATGAATTGAAGTCTTT--GCAGTATG-TATCT--GGTTGTACATGT-ATTTTCTTG--G-------TTTGG-ATGTAATT-GAGACTTTGGCA-TTATGCAC--G---TTG-AAGT-G-TTTTCTCCAtgat
gi|5 : g---A--AATATTCA-GCGT-C--AAACTTCCAA-TGAAG--TG-TCG-AC-AAAACCATCT--GAAAGCC-TG-T--TGACCGAGAT---TTTATGT-----C-CC-ATAAT-TCCAC---TCCG-ACCGTAATGCCATGA-AAAT-----A-AAAGTAC-A-AGAAC-A--TCA--AAAT--T-TCTT-ATA-TTCC-AT-G-CCAATGT-AACAA-C----ACACTG-TCA--CTGGCCT---AG-A-C-AAACTATTATCCGCCATAT-C-ACT-TGT-AGACACCTG-CATAAT----T-T-C-A----TGCACTGCGTTTCA---CT-----CTC-T-ATTGTAATAGGTTGTGGT-A-CATCT-TTCGTCTCCCTC-GTCCTAATTACTGTATAT-TTCT-TTGTGGTC--TTTTGGGATGAA-TGGATGCTTTGGGAAGTATG---ACT---GTTG-A-AGGT-GGTTTTCTC--C-------ACT-G-ATG-GGT--GAAATCT--GCA-GTAT
gi|5 : TA-CTGT-ATATTTCTT--TGTGGTCTTTTGGGATG-AAT-GGATGCTTTGGGAAGTATG-ACT-G---TTGAAGGTGG-TTTTCTCCACTGATGGGTGAAATCTGCAGTATTATGTGATCTTCT-GGCGAGAAGTACAATAGAATTGTTTAAATTAGG-----CATTGGCAAAGTAA-------ATGGTAT-----GATGGGG------AAAAGAAACTTTTATCTCCGCGTACGCCCAAAAGCAATGTATA-TATGATGGTATTCTGCTGCCGTTG-GAAATAAAAAACAATATCTGGAAGAAACAGAATAGTTGCC-GCATGTG--ACTG-AGGGCGT--TAGAGAGGTTGCACGAATTGTATGAGCAATATTAT-TCTGCTTCGGGAACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATTTTTAA--CTGAACA---TCAAAAC-AGGTTATCTAA--TACTGT-ACTC-ATAAAAAAC--ACTGT-AATGAGA---CA---CCTTCATT-ATCCAGCAAATGGCTCTCAACAAATTGTA-C-CGACTTATAGGGA-TGTATATAAACAAAA-TAAAAATA-CCTTTAAAATGGCA-GGGAGACTGTATGTTTGAATTGTGGTTGCATGC--ATGAACTGAAGAGGG-AGACCA-CACTTCTGGCAGACTAGTAATATTTCGGATAA--CACAACAAATT-CCACAA-CTCTCCAACC-CTCTGTCCATCCAAA-GCCTT-CGCATGTAGCTGGTACAATCTCCTCATGGT-CCACAACTTCAAAACTGGAAGTAAC-ACAC--------CCTTCATTTATGGGTTAATTATTTT-AAATGTAATTTGTGTACATGTATATTTGTAAA--AAAAATTGCAT-GCAGTT-AGCTCA--AGTTTTCTTAATTTACTGATACTGATATCATGACTGGTCATCTTTTATC-ATA-CCTGAATGTACAT-GTACAATTACCAGN-NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNACAtatgtgatcttctggcgagaagtacaatagaattgtttaaattaggcattggcaaagtaaatggtatgatggggaaaagaaacttttatctccgcgtacgcccaaaagcaatgtatatatgatggtattctgctgccgttggaaataaaaaacaatatctggaagaaacagaatagttgccgcatgtgactgagggcgttagagaggttgcacgaattgtatgagcaatattattctgcttcgggaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacatttttaactgaacatcaaaacaggttatctaatactgtactcataaaaaacactgtaatgagacaccttcattatccagcaaatggctctcaacaaattgtaccgacttatagggatgtatataaacaaaataaaaatacctttaaaatggcagggagactgtatgtttgaattgtggttgcatgcatgaactgaagagggagaccacacttctggcagactagtaatatttcggataacacaacaaattccacaactctccaaccctctgtccatccaaagccttcgcatgtagctggtacaatctcctcatggtccacaacttcaaaactggaagtaacacacccttcatttatgggttaattattttaaatgtaatttgtgtacatgtatatttgtaaaaaaaattgcatgcagttagctcaagttttcttaatttactgatactgatatcatgactggtcatcttttatcatacctgaatgtacatgtacaattaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|6 : aaatattcagcgtcaaacttccaatgaagtgtcgacaaaaccatctgaaagcctgttgaccgagattttatgtcccataattccactccgaccgtaatgccatgaaaataaaagtacaagaacatcaaaatttcttatattccatgccaatgtaacaacacactgtcactggcctagacaaactattatccgccatatcacttgtagacacctgcataatttcatgcactgcgtttcactctctattgtaataggttgtggtacatctttcgtctccctcgtcctaat-C-ACAT-ATA-GACGTTAA-T-GATAAA---------AAAA--GG---CATTA-C-TACTCTTTT--A--TCAA--TATA--ACACAG----AAT-A-ATCA-AT-GTA--CAACA-TTT-CA------------GAAAA-----AGAG-AGG-TG--G----AGCCATCGGCATT--TT--GAAA--T-A-CTAGG-----C-----------CCG-AAAT---T-C-CT--------TGA--A--GTTT-TTTT---A---G--CA---A-AT-TTTC-CA-T----T-TATGA-T-TTTGT-T-CAA-T---TT---CA--AAACCAAATTTC-AA-TAAA------C-AAAT-TA-------AA-TG-G-A--AA-ATGACATGATTGA-TG-----G--TAC-TATACTTTC-AT-GACTATAT-A-----TTG--AA---T-TT-TTTT-AA----TAACAGG--A--AAAAA-A-----T---TAAT-ATTT-CATATGGT-CCTTA-AA-AT-T----TGC--C-A--T-A-TA-C-GT-CT--AT-----TA-C-T-AGA-ATA--AA-ATATGA-GAAA-TGTG--CA-TCGTTA--C--ACA-TA---TTTTACAAATA-TA-AGATG-AAATG------TCAA-ATAAAGC-TA--CTA-CTT-TTA-TAA---TTT-A-C-AACAAT-TAATTC-AT-T---G--CC--A--T-TT-CAGAAAAA-AGA-GTGG-AG--CCA--TTTTA-AAACTAATGTCAGC---CC---GAA-T-TTC-T-CT-GAACAGCTTTTCT----C-TCACA-ATTTCAT--GTT-CT--------AAA-T-TG-TC--TTCAAT-CAGT-AACAAA------AAAAAAAAA--AAAAAA------AAGAA--AAAACC-------------AAAGAGCA--AAA-AATTAAA---TGG--AAAATGAACCA-TGGT-ACA--TAT-T--CATAT-GA-CTATGATTTAT-GCCCCTTTC--CAT-GTA-----C---TCAACT--TTCAC--AATGT-----GATA---C-AA----AGGA--AAAGGTTAA--TGTTTCATA----T----CTC----CTCGTCA-TATCGA---CT-ACA-TGAAAA--TAT-GA-TAAATGA-AAATTGGT-ATC-AACAA-A--T----GTG--AAAGGT-C-GTTATCAA-A--ATTTT--CA-AC-TA-CA-G-AGTAACATG-GA-AAT--AAGGAA-----GCAGCA-----TAC-ATT-TT-C-AT--AAATAT-AC--AAATTATTC--ATG---TGT-CAA-A-TC--TCAGAAAA---AGATT-GT---------GCACGCAT-A-TG--A---A--AATATTCAGGC-T-C-------TGCAA-TGAAG--TT-GCGAACGAAAACCA--T--GAA--CC-TG-T-AT--AC--AAT---TAT-T-TGGTTAA-CC-ATAT--GTCAC---T-CGAACCGTAATG-CATGA-AAATT-GCAA-G----AC-A-AG-AC-AAGTCA--AATTG-G-TCTT-ATA-TTATGATGGTCCAA-GTAAACAA-CCTTAAC-CTGCTCATGCTG--CTGGGAG-A-C--AA--A-TATCTG--G-ATGA-CCTCTGTAAGA---CT
gi|7 : ttacacatattttaGAGTGTGAGATCGAGATGCAAA------AGTA-ATGGGAAA-CAACCATG--TTTGGTATCAA-TGGATACACA-TA-TGTATG--GACA-ACTGGCTGTGATCAT-GA-AATAAA-AAAAAA--GAGTGTAGACCG-TATGCCCT-CA-GTGGGCTGTCAACT-CAAGGG-ACGGATAAC---GTGTATCT--T-T-TTTTTACAAAT-ATAGT-C--AT--A-TACTAATTTAAA------TAAA----TA-AG--TCAAGG--ATGA--CAATGT-AAAA-TATAAAA-TAC--T-TGA--TTTT-TATTA--AA-A-TGTAAACATC----------TG-TCTAAA-A--GTT-TAAAACC-A-AT-AAAAAGAAATTGT-ATAA----CGT---ATT--CTAT------A--CTT--TACT-CGCA--GCGC--CA-CCAAATG-AC-TT--CATTTT------TTCAA-TGC----------AA--AATTC-CGATAAAA----TTGTG-AA-TT-TAAA--AC---A-A----ACT-TG--TAA-AAG-C-ACAG-TCA-GA-GT-AA---GG-AAA--CT-G---AAAAAGAA---CA--ACC-T--TATTGT-CAT-TAAA-ATATT--AAA-AC----ATTCACATCA-AT-GTGTCCAA-A-TTT-TA------------GAAAA-----AGAG-AGTCTG--G----AGCCAT------TTCTT--GAAGACT-A-CTCAGCCA--C-----------C-G-AAAT---T-CACT-C------TGACCC--GTTT-TTTTTTCC---A--CAAAGA-AA-TTCC-AA-TGT-TTCTA--G-T-TT-GTCT-CAA-TCTCTC---CA--AA-------TTCAAA-TAAAA-A--GC-AA---TATGGAAACAA-TG-A-A--AA-GT-A----AC--A-TG-----GAATCT-TATA-TTTC-AT-GAATATATGGATTACCTG--GAAGTT-TT-TATTGTATAACTAACAGGGGAGTAAAAA-A-----TATCCAAT-ATTT-CATAATGT-CCTTA-CA-ATAC----CACAAC-AA-T-A-TA-CCGT-CC--AT-----TACC-TCAGA-ATGATAA-GTATGA-GAGAATGTGC-CACTTGTTAT-C--ACACTAT--TTT-ACAAACATTATAGA-GTTAATGA--AGAT--A-AAAAAGCATA--CAG-CTTCTTA-AAAA-CTATAA-C-AACAATCCAATCA-ATGT---G-ACA--GTAT-AT-----AAAC-AGA-GTGG-AG--CCATTTTT-A-AAAC-AATA-CGAC---CC---GAACT-TTCCT--T-GAACAGCTTTTTC----TAGC-AA-ATTTTTT--GCTTCT--------AAAAT-TGTTC--TTCAAT-CA-C-AATAA---C--CAAAAAAAAA--AAAAAACCCCTCAAAAA--A----------------------AG-A--AAA-GATTAAAT--TGG--AAAAT-AAC-A-T-GT-ACA-ATAT-T--T-CATGGAACTAG-----AT-GCC---TTT--C-T-GTAtag
gi|8 : ggtagtacCCTGTGTGTTTATC-AACTTGGC---A-CAATTAATTAACTAATTATATC-TC-----A-CTTGCTCCAGC-TACA-TAC-GA--TCAG-TTCCTTGCAATCT-CCG-GCAGC--TG-TTACA
gi|8 : ccT-AA-CG--AAA-GAAG----TCT---AA---A--C---AAC----C-TGGATCAAT-CG-TCAA--CACATC-------TTG-A-TGGTTGGTAC---C-ACTG-ATTCCTGT-----GTTACTAT-AA--GAATTCTAAC-AA-CATTTT-ATCATGTGCT-A-C-ATACATTACTAC---TTGT-CGGGG-ATC--TATTACTACTTT---A-TAGGGC------TATTGT---AA--TTTTGAGTCTT-CT-GAG-ACGCTCGTATATA-----ATA-CCT-GC-----CATT-----ATTATCAAACGA----CTTTT---C----TTA--CC---A----ATTTTTG-AA--TAG-ATGT-GGTCG----------ATATTCACCTCTGGTCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggataacgaaagaagtctaaacaacctggatcaatcgtcaacacatcttgatggttggtaccactgattcctgtgttactataagaattctaacaacattttatcatgtgctacatacattactacttgtcggggatctattactactttatagggctattgtaattttgagtcttctgagacgctcgtatataatacctgccattattatcaaacgacttttcttaccaatttttgaatagatgtggtcgatattcacctctggtcc
gi|9 : cccctgtgtgtttatcaacttggcacaattaattaactaattatatctcacttgctccagctacatacgatcagttccttgcaatctccggcagctgttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctacttttctttcaacacggtggaCCATGGTTCATATGGTT-TGA-CCATGCAGTATTGAC-TGTTTTGTTTGAc
gi|9 : CATTCAGCTCCTAAAGACAT--TTCCTT-CCTATTCCTATGCTGGGAC-GAACATACAAGTGTATGAGTTGACCAAAAGT-GCCTCC-A-ATTTGGAT-------AGGGGGGGGGGGGACAAGAATAGGCTCAACGAAGGAAATTTATCTACCTGTGTG-TTA-C-AACTTGGCTTGA-CAATTAATTCACT-ATTATATC-TTGCAAAAGCTTGCTCCAACATACATTACAG---TCAGTTTCCTTGCA--CT-CCGAGTGCTTTTGTTTatatatctacacaattgattagtattatacatcaattcattcagctcctaaagacatttccttcctattcctatgctgggacgaacatacaagtgtatgagttgaccaaaagtgcctccaatttggataggggggggggggacaagaataggctcaacgaaggaaatttatctacctgtgtgttacaacttggcttgacaattaattcactattatatcttgcaaaagcttgctccaacatacattacagtcagtttccttgcactccgagtgcttttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta