lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : 2222 2222 1 111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 11111111 111111 111 222222222222 2222222 333333333333333 1 111 11 222222 2222 111 2222 11 11 1111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11111 1111 111 7777777777777777 1111111 5555555 11 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 555 2 1
lowQualScore : 2 0000 2 3333 0 555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 5 88888888 444444 888 5 888 999999999999 66 6666666 4 0 5 222222222222222 5 0 5 5 3 3 5 555 33 5 555555 5 5 5 5555 000 77 999 6666 77 33 44 0000 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44444 77 77 8888 000 77 7777777777777777 3 1111111 6 2 4444444 11 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 99 777 5 2 7
lowQualScore : . .... . .... . ...... ................................................................................................................ .. . ........ ...... ... . ... ............ .. ....... . . . ............... . . . . . . . ... .. . ...... . . . .... ... .. ... .... .. .. .. .... ........................................................ ..... .. .. .... ... .. ................ . ....... . . ....... .. .. .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. . .. ... . . .
lowQualScore : 0 8888 2 7777 9 333333 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99 0 11111111 666666 111 0 888 444444444444 11 0000000 4 2 0 555555555555555 0 0 0 0 2 1 0 999 66 7 777777 7 7 7 7777 000 99 666 0000 99 66 44 5555 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33333 11 99 9999 000 99 1111111111111111 7 0000000 7 8 0000000 00 00 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 66 111 7 9 0
consensus : CATGGGC-C--AGNAA-CACATTAC-C----CCCCCCC-CTCTANGGG-ATTTTTC-----NA-CA-T---ATGATTTTTTGA-------AAG--TGTGT---A------AAAAA--T--A-AA-GGT------AAA--CGG-C-G--TTG--T-TT--------GA--CAANTTTTA-TGT-T---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TTC--GAATTTAT---CAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTA-TAGACCAT--TA-C-T----GT-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-T--TGTA-TTAAN-GC-GG-ACG-------------------GAAA---CA--CA------ACAG-C---TTTNA--AGAG-----TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAGCAA--C--AATA-AT-TTAG---A---ATA-TAGAAGACAGT--N---ATCA--TATG--GAA-----AG-------------NAC-C----TT--T---TG---G---CAAGA--------T--A--TTT-T-TTTT-C---ATTT--GTGCCT-TGCCAT---TTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---CTA--CT--A----T-ACATGCAA-TA-ATTATG--GCA-GGTNC-T-AAGT-G--CTA-GTAT-TGAATA----AAGCG--TACGATG-A-AC-GGTT-TAA-TTTCTA--------C----TAN---A-----GTA-TGA---C--TTT----G-T-----A-T--AAT-ACA--CA-ATCTT---GAAT--TAG--NACN--------T-TA-GTAAA-TAT-AAC-TT-CCAATGT-AAAATATT----TAATTACCGGCAGGT-T--CCAT-GTCC---TTTGAATGTA-TG-GAGGCCCATT-AATGGTAT--ATA-ATCA-GC---A---AAAGAAAT-GT-----CGT-----GG-ACT----CTTTGGA-GCAT-----A-AAT-GCTTAAAAT-A-----GG-GGAAA---TA--T--A---ATA-ATGA--------TT-TA--G-CTG---TAGA-GAATGG--G--GCAT-A---T-AGAAACACAATGAA--AT-A---TT-C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-T-TGATGA-A----A-TAT----TTC--ATATTT-----TATA--AAAA--TA---TGTATATAA----TATTAC-GC--C-AAAA-TAAAA---TTGTAT-A------TTTTTTT---AATTTT--C--TGTTAGA--C--TTT--ATGCTNANCATANAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGAT--GATTGACATTAATATAGGAGTCCGAGA-TTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGCT-ATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGG--TTAGA--C-T-TTTAT--CTGAGCA-T--ATA-GAA-ATGAGCG-T-CGT--G--------A-ATTA-CATGGTTA--CGAGAGTATTACAGTGGTC-AG-ACAA--T-GAG----ANTATTTGTC-ATTT-A-TGT-TGGCAT-------AATTAT----------CCCAA-CTCGNT------------ATC-A-AATTGA--T-TAAAC----TGGTCAAATTCAAGA----TAGA---GAAA--ACTTATTG-GT--AGCA-TATCAATAATTT--TT-TTGGTAAA-TTCCAAAG--G-------GCGAAC-TT--GATATGAT---TTCTG-CGCTAT---TGC-TAC--TNGACAAGCTATTGAA-TC-T-GCGCTTCGC-GTT-G--GC--C---CTNT-CGGCAA-ANTTGACAGAGTT-TAAG--AATC-T----AC-----ATAA-AAT---CA-GAGA-CGCGCTTTCATAGTAT--TGGT--ATA-CA-T-CAG---A-ATGT-CGA--TA--GCGAAAT----GAACGG--AT------CAATG-ATT--GAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT-N--TGGAGGTGAA-TNGACT---TAGGA-ACGAA----TT-TC--A---AAA-------AA------------C--C--ATGNTTCTA-AA-GACAAAAACA--TGA-CCA--TTTG-TC-CAA-A--CCACAT-GCATGATCCATC-CGC-AGG--ACC-A-C----------AG---TGA-TAA-G--GAAAGAC-CGT--TCTC-A-TTTG-TTGGATA--GT--A-CTG-AAAAAG-GG-GT-C-----AA--C-TAAACC--AACCGTACCTTC-TAA----GGN--AG-GATG-------C-TGAT---CA--CAC-AC--TGA-------TG--AAGAAAGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTA-TA-CGGTTCA--TCA-ACTGCCC------TA-----TAC-A-AGAATGAA-NATA------TTC-AG--C-AGGTTA---T-TCA-G---CTA--TC-----A-CAA-GAAG--GCN-----GTC-AANATGT--AA-NTAT----CCTTGCATG-TGATTTTG-CAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
Reference ( gi|2 ) : CGTGGGC-C--AGTA--CACATTAC-T----CCCCCTCACTCTAAGGGTATTTTTC-----AAGCA-T---ATGATTTTTTGA-------CAG--TGTGT---A------AAA----T--A-A--GGT------AAC--CGG-C-G--TTG--T-TT--------GA--CAAATTTT--TGT-T---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT---GAATTTATG--CAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGCA-TAAACCAT--TA-C-G----GT-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTA--T-T--TGTA-GTAAT-GC-AG-ACG-------------------GAGA---CA--CA------ATAG-C---TTTAT--ATAG-----TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-----C--A-----T-TTGG---A---ATA-TAGAGGACGG---G---ATCA--TATG--GAA-----AG-------------GAC-T----TTTTT---TG---G---CGAGA--------T-CA--TTT-T-TATT-C---ATTT--GTGCCT-TGCCATTA-TTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---CTAC-CT--A----TTACATGTAAATA-ATTATG--GCA-GGTGT-T-AAGT-G--CTA-GTATGTGAATA----AAGCG--TACGATG-ATAT-GGTT-TAA-TTTCTA--------C----TCC---A-----GTA-TGA---CG-TTT----G-T-----A-T--AAT-ACA--CGTATGTT---GAAT--TAG--AACA--------T-TA-GTAAA-TAT-TAC-TT-C-AATGTTAAAATATT----TAATTGCTGGCTCGT-T--CCAT-GTT----TTTGAATGTAATG-GAGGCCCATT-AATGGTAT--ATAGATCA-GC---A---AATGAACT-GT-----CGT-----GG-ACT----CTTTGGA-GCAT-----A-AGT-GCTTAAAAT-A-----TG-GGGAC---TA--T--A---ATA-ATGAA-------TT-TA--GGCTG---TAGG-GAATGG--G--GAAT-A---T-AGAAACACA-TGAA--AT-A---TT-C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-T-TGATGG-A----A-TAT----TT---ATATTT-----TATA--AAAAATTA---TGTATATAA----TATTATTGC--C-ATGC-TAAAAT--TTGTAT-A------TTTTTTTGTAAAGTTT--C--TGCT-GA--C--TTT--ATGTTGA--ATAGAAAA--TAAAA-ACC-AAGCAA--TCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTTT--CA-GTTC--CA-TC----AAT---AAATCA---CCATA--AAATA-TTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTGTA--AAGGATTTGAT-GACGATAATATAGG--TCCGAGAATTA-GAAGTAG--AGTCAC--AAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGATTGT--TATTCAA------AACGCATAC-TTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGG--TTTGA--C-T-TTTAT--CTGAGCACT-GATA-GAATATGAACGGTGTGT--G--------A-ATTA-CATGGTT---TGAGAGTATTACAGTGGTC-AG-A-A---T-GAG----ATTATTTGTC-ATTTGA-TGT-TGG-AT-------AATTAT----------CCCAAGCTTGTT------------AT--A-AAATGA--T-TAAAC----TGG---A--TAAAGA----TAGA---GAGA--ACTT--TG-GT--AGC--CATCAAAAATTTTTTTGTTGGTAAATTTCCAAAG--G-------GCAAAC-TT--G-TAT-AT---TTTTG-TGC-AT-G-TG--TAC--TGGACAAGATATTAAA-TC-T-GTACTTCAC-ATT-G--GC--C---CTTT-CAACAATAG--AACAGAGTT-TAAG--AAT--T----ACT----ATGA-AAT---CA-AAGG-CGGGCTTTCATAGTAT--TAGT--ATA-GAGT-TAG---A-ATGT-CGAATTG--GCGAAAT----GA-TAG--AT--C---CAA-G-ATT--GAGT-CCC-TAGAA--GAAT-AT-C--TGGAGAAGAAATAGA-T---TACGA-ACAAA----TT-TC--A---AAA-------AA-----------GC--T--ATGATTCTA-AA-GACAGAAAT---TGA-ACA--TC-G-TC-CAA-A--CCATATTGCATGATCTATC-TGC-AGG--ACCGAGCACTGG-GA--AG---TGA-TAA-G--AATAGAC-TAT--TCTC-A-TTTGTTTGGACA-GAT--A-CTG-AAAAAA-AG-AT-C-----AA--C-TAAACC--AACCGTACCTTC-TA-----GGA--AG-GATG-------C-TG-----------------TAA-------TG--GAGGAAGTACTTTG-TTCG-ACTGT--TGAATTG-TA-CGGTTC---TCA-ATTACCT------T------T---A-AGAATTAA-GATA------TTC-AG--C-AGGTTA---T-TC--G---CTA--TC-----G-CAA-GAAA--GCA-----GTCAAAAATGT--AA-GTACTG--CCTTGCATA-TGATTT---CAG-TTGCT-AAAAAGTGTTTGC
gi|3 : CGTCGGC-C--AGTA--ACCATACC-T----CCCCCCC--TCTATGG--ATTTCT--------ACACT---ATGATTTTTTGA-------AAG---GTGT---AGGTAACAAA----T--A-AAGGGT------AACA-CGGAC-GAGTTAGAT-TT--------GAG-CAATTCTTA-TGT-T---GGG------------CGTTTC--A-----A-GTATATGAT-A-TT---GGAATTATA---AATTTTT-G-G-CA-A-TTCAGAA-TAG-CCAT--AA-C-T----GT-G-TT-CC---AT---A--C--CGCATTACCT-T--TGTA-TTAAA-GG-GA-ACA-------------------AA-A---CAACCA------ACGG-T---TTTA---AGAG-----TTG-CCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-----C--AATATATGTTAG---AGATATA-TAAAGGACAG--------TCA--TAAGACGAA-----GT-------------AGC-C----ATGGTGCATG---GATGCAAGAA-------T-TT--TTT-T-TTTT-C---ATT---G-GCCTATGCCATT----G-ACTAGA------------T---------T-AACATCAT---AT----T--A----GAACAT-CAAATT--TTATG---CATGGTTTGC-ATGT-GGCTTA-GTAT-TGAATA----A-GCG--TAC-ATG-A-AC-GGTC--AA-TT-CTA-------------TAA---A-----GTA-TGA---C--TTT----GCT-----A-T--AATGACA--CA-ATCTT---GAAG--TAG--CACGC-------T-TA-GTAAA--ATATAC-TT-CCAAT------AGATG----TAATTACTGGCAGGT-TG-CCATTGTC----TT--AATGATATG-G--GCCAGTT-TACGTTAT--ATA-ATCA-GCCATG---AAGAAAGT-G------CGA-----CG-ACT----CTTTGGAAGCAT-----A-ACTTGCT-AAAAT-AGG---TG-TGAAA---TAATT--A---GTA-GTGAAATATAAATT-TAATGATTGCGTTAGTTGAATGGTGG--GCATTA---T-AGAAACA-A-TGAA--AT-A---AT-T-AAGTT-CAA---T--AA-G-----TTA-A-TGT-TGATAG-A----AATAC----TTCATATATTTGATATTATAGTAAAAA--A---AG-ATA-AA----TATTAT-GC--C-AAAA-CGAAATCATTGTAT-A------TTTTTT-----AATGT--C--TGTTAGACTC--TTT--ATGCTGAGCATATAAA
gi|10 : CATGGGC-C--AGCA---ACACCCC-C----CCCCCCC-CTCTA-GGGC-TTTTTC-----TA-CA-C----TGATTTTTTGA-------AAG--CGTGT---A------AAAAA--T--A-AA-GGT------AAA--CGA-C-GG-TTG--T-TT--------GA--CAATTTTA--TGT-T---GGG--G---------CGTTTT--CA----A-G-ATATGATCATTT---GAATTTATA---AATTGTT-G-G-CA-AATTCAGTA-T-AGCCAT--TA-C-C----GT-G-TTCC----AT---A--C--CGTATTAC-T-T--TGTA-TTAAA-GC-AG-ACGAAACACAACTGTTACAGACGAAA---CA--CAACTATTACAG-T---TTTTA--AGAG-----TTT-GCA--GAA---------TTCGAT--GAGCAATAC--A-----T-TTAG---A---ATA-TAGAtgagctcgtgagattaatggttgaaagtagtacagggtccagaaacttagagatatttgtccattggctaatggaaattatcccaactcgttatcgaaattgataaactggaatcaaagatagagaaaacttgttagtgtagatatcaattttggtaattcaaaggccatatggcgaatttttgtatgattactgctttatttgctactggaagctgttgaatgatgagcttcggttgtcgcgacctcggcaaacaacaagttgtagaatcttcaatcataatatcagaagtcgactttcatgtattggttcaaacatgtacgatacgaaattcgggaagtaacttaagattttggtcccctagacaagtatgctggatatgagttgaatatctgagatgccaatctcaaaaaatggagacttacgcctcatgattctaaagacaaatacataaccatttgtccaaaaaccacatgtatgatcatctgcagacacatgataaggaaaaacagggtcgcaatttgtttagatgcggtatctgaaaaaaaagccgttccaactaaacaaccgtacctctagtgagggagggttgttaatctacactaaccactgatgaagatagactttttatgtgaggatacgttcatcacgctgccctattcaatagagaatggcattcgcaggttatagctacgacaggatggtggttttgcactatcctgatgtgattttgcagttgctaaaacgtgtatgcaa
gi|11 : cCATGGGTTC--AGAAAGCACATTAC-C----TCCCCCCCCTCT--GGGGATTTTTCTCTCCACTAA-T---AT-ATTTTTTAA--------AG--TGTGT---A------AAAAA--T--A-A--AGT------AAA--CGA-C-G--GTG--T-TT--------GA--C-TATTCTAATGT-T---GGA-------------GTTTT--CA----A-G-ATATGGTCA---------------------TTTT-G-GACA-AATTCAGCA-T-GACTAT--TA-C-T----GT-G-TT-CCA--AT---A--C--CGCATTAC-T-T--TGTA-GTG---GC-A--ACG--------------------------CA--CC------ACA--C-------------G-----TTTCGCA--GAAA--GAC---ATCGAT--AAGCAATAC--A-----T-TTAG---A---Aa
gi|19 : gacCATGGGC-CC-AGAA--C-CAATACCT----CCCCC---CTCTAGGGATGTTTCT--------ACACT---ATGATTTTTTGA-------AAG--TGTGTAAAA------AAA----T--A-A---GT------AAA--CGA-CAG--TTG--G-TT--------GA--CAATTTTA--TGT-T---TGGCCG---------CGTTTT--C-----A-A-ATAT
gi|4 : accTGGGC-----GTAA-CACAT-AC-T----CCCCCTC----TAGGG--ATTTTTC-----TTACA-T---ATGA-------------------------------------A----T--A-A--G-T------AAC--TAT-G-T--TTG--T-TT--------GAACCCAATTTCA-TGT-TTGGGAG--G---------CGTGTT--C-----AAG-ATATG--TA-TT---GAATTGAT---CAATTTTTTG-G-CA-A-TTCAGTA-TAG-CCAT--TA-C-T----GTCG-TT-C----ATCATA--CGATG-ATTA--TAT--TGTA-TTAAGAGC-A--ACT----------------------A---CA--CA------GAA-------TTATTCAGAG-----TTT-GCA--GAA--GGAC---ATCGAT--GTG-----C--AATACAT-TTAG---A---ATA-TAGAAGACAG---T---ATCA--TATG--GAA-----AGTAGCACATTAATAGAC-T----T------------A---CAAGA--------T--A--TTT-TATTTT-C---ATTT--GGG----TGC------TTG-CCCTTG------------CC-C---TAGTCAACT--AT---CGAT-CTGAA----T--CATGT---CA-ATTATG--G---GGTTC-T-AA--------A-GTAT-TGA-TA------GCG--TCTAATG-AC---GGTC---A-TTT-TA--------C-----AA---A-----GT--TGA---CT-TTT----T-T-----AAT--AAT-ACA--CA-AT-TT---GAAT--TAT--CACC--------T-TA-GTAAT-AAT-AAC-TT-CCAATGT-AAAATGTT-----AAT----GGC--GTAT--CCAT-GTTC---TTTAAGTGT--TG-GAGGCC-ATT-AATG-TAT--AT-TATC--GC---A---CAAGAAGT-GG-----CGT-----TG-TTT----CTTTGG--GCCT-----A-CAT-G-TAAAAAT-A-----AG-GGGAAATATA--C--A---ATA-ATGA--------TT-TA--G-CTG---TAGA-GAATGG--G--GCAT-A---T-AGA---ACA-TG-A--AT-A---AT-T-A---A-CAA---T---A-T-----GTAGA-T-T-TGATGA-A----A---------T---ATATTC-----TATT--AA----TA---TATATATt
gi|12 : GGC-CCGAGTAA-CACATTAC-CTCCCCCCCCCCCCTCTGTGGG-ATTTGTC-----AA-CA-CTTGATGATTATCTG--------CAGAATGTGT---ACG----AAA----TTAACA--GGTCAGATCAAC----G-CAG--TTGA-T-TT--------GA----AATTTC--TATGT---GGG--G---------CGTTTT--C-----AAG-ATATGATTA-TTT--GAATCT-TGATCAATTTTG-G-G-CA-AATTCAGTA-TAAACCCTC-TA-CTG----TT-G-TC-C----AT---A--C--CGCATTA--C-T--T-----TAAG-TC-AG-A-G-------------------GA-A---CG--CA------ATAG-C---TTttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatttgttaggtgcgtgtcgagtagaattatggttatggagtttagtggtagacaagaagtatttgtctttatgttggcatattgccactggtataaatgattaactggtcaatcaagataggaaaacttattgttagcatgtaatttggtattaaaggattgatatatttttgcgctattgtacgcgaaagctttgacttgcttgcttggttgtcggcaaagttgacgattctaataattaagacgtgcttcatagtttgggtatacaatgtcagcatgaatggataatgattggtcctgaaaattgtatgtaggtgattgacttagggatgggatgctttcatgtttctaaaagacaaaacatgactttgtctacatgcatgatctatctgctaggacccagtgataaggaaacagtctcaatttgttggatgtctgaaaaagcggatcaataaacaatccgtaactctaagggcaggatttgattatcatacacaacactgatgaagaagatctctgactcgattgtcatgattatatcggttcatcactgccctaatacaaagaatgaactataacagcaggttaattttcagctctcacaagaaggagttttgtgtaacatatccttgtgtgattttgcagttgctcacaaagtgtatgcata
gi|17 : cctA--TACAT-AC-T----CCCCCTC--TATGAGA----TTTTC-----TACCC-T---ATGATTTTTTGA-------AAG--TGTGT---A------AAAAA--T--A-A--GTA------AAA--CGC-C-A--TTC--TCTT--------GA--CAATGTAT--TGT-T---AGC--G---------CTTTTC--C-----AAG-ATATAATCA-TTTT-GAATTTATC--AAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTA-TAA
gi|1 : gtaaGGATATATTTT-----GA----T---AT--TTTTTTGAGAGAAGATAG--TG-GT---A------GAAAAATT--A-AATGGT------AAAGGCGG-C-GG-TTG--T-TTTTGCAACCAA--CATGTTTT--TGT-T---GGG--GACTGAAATGCGTTTT--CTCAACA-G-ATATGATCA-TTCTGAAATTTAT---CAATTTTT-GTG-CACAATTCAACAAGAAACCATAATA-C-GAAAAGT-GATT-CTCCAAT---AGGC--TGCATTA--C-TATTGTAAGTAAT-GCTAGTACG-------------------GAAATCACA--CA------ATAA-TAAGTCTATT-ATAGAAGCTTTT-GCATGGATAAGGACTTCATCGATCTGAG-----TCGA-----TGTTGGTAGA---ATA-TAGAG-ACGGT--GC--ATCAAATATG--GTATT---AA-------------GAC-T-----------------G---CGAGAATGAGAGCT-AA--TTTAT-TATT-TTCAATTTTGGTGCCT-TGCCATGAATTGCACCTTACGATTATGTGACTCGCGTGTAA--AACTTTATAATCTACTCT--AAAAATTACATGTAA-TA--TTATGTTGCA-G-TGT-TTAAGTCG--CTAAGTCT-TGAATATATAAAGCGCGTA-GATGGAAATCGGTTATAAATTTCTA--------AA---TTCGTAA-----GTAATGAAATCG-TCTCAGTG-TTATAAA-T--AAT-CCAAGCG-ATGTTTGAGAATATTAGCAAATC--------T-TAAGTAAAATAT-TAC-TTTC-AATGTTGAAATATTATATTAACTATCGGC-CGT-TTTCCAT-GTCCCTATTTGCATGTA-TG--AGGTCCATTTAATAGTATCAATA-ATCATGC---ACAAAATGAAATCGTATATACGTAGTACGG-ACTACCTTTTTAGG-GCAT-----ATAGT-GGCTAAAAT-A-----GG-TGAAA---TA--TTAA---ATA-ATGAT-------TA-TA--G-CTG---TAGG-GAATGG--GAAGAAT-A---TTAGAAA-ACAATGAA--AT-AAATTTAC-A---TACAAAGGT--AA-TCGAAAGTA-C-T-T-TGA-GG-A----A-TATA---TTCG-ATATTT------ATA--AAAACTTAATATGTATATAAACTATATTAAGGCATCGATACATAAA----TTGTAT-AATTTTTTTTCTTTTTAAATTTTACCAATGAT-GA--C--TCTTGATGTTTAC-ATAGAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGAT--GATTGACATTAATATAGGAGTCCGAGA-TTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGCT-ATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGGCATTTGAACC-T-TTTATCACTGAGCAATAAATA-GTCAATGAACGATCCGT--GGGATAGAAA-ACTA-CATCGTTACACGAGA--ATTACAGTGGTC-AGCA-AAT-T-GAGCAGCA-TATCTGTC-ATTTTAGCAT-CGA-ATAGACAGGAATTATGCGAGAAATGTCCACACTTGTTTAAGGCGTCCAAAT--ATAATTGAGCT-TAAACACTGTGGA--A--TCAATAGTATTAGATACGAGA--ACTT--TGAGT--A-CAACATCAA------TATTGTGGGTAAA-TTCCAAAG--G-------GCGAACTTT--G-TATGATAAGTTCTGATGCAATAG-TAGCTACTTTGGACAAGCTATTAAACTC-TAGTA-TTCACTATTAG--GC--CACACTTTCCACCAATGA--CACAACGTTATAAGAAAATCGT----ACTTCAGAT-A-AATGTACAGAAGGCCGCGTCTTCATAGTATTCTAGTCAATATGCATGTAGCTTA-GTGA-CGAAATAGTGCGAAAT----GA-CAG--ATAAC---CAA-GAATT--GAGTCCCC-TAGAACCAAATAAT-TGATGGAGAAGAACTAGA-TCC-TAGTA-GCATA----TTCTCGAG---AGA-------AA-----------GCCTC--ATGGTTC-A-AA-AAAACCAATACATGAGACAATTT-GCTCGCAAGA--CCATA-TGCATGA-CTATCGCGC-AGG---CC-ACCACTGGCGAATAGCCTTGATTAATG--AA-AGACACGTG-TGTC-A--TTGTTTGGA-A-CAT--A-CTG-AAAAAA-AG-TTAC-----AACCC-T-AACC--AATCGTACCTGCTTA-----GGAC-AGAGATG-------CTTGTT---------------TAA-------TG----AGCAGTACTTTG-TTCGAACTGT--TG-ATTG-TA-CGGTTC----CA-ATTACCT------T------T---A-AGAATTCA--ATA------TTCGAGGTCGAGGTTA---TGTC--ACGTCTACTCC-----GTCAACGAAAACGCACAGATGTC-AAAATGTAAAA-GTACTGACCCTTGCATACTGATTTTTGCAGTTTGCTAAAAAAGTGTATGCgtgtagtgtg
gi|7 : GCTTTAAC-----G-G-AGAAGATCA-TTT--GAATT-ATC--CAATCTTT-GCG-CA-AATTCAGTA-TAG-CCAT--TATC-T----GT-G-TC-C----AT---A--C---GCATTAC-T-T--TGTA-TTAAT-GC-GG-ACC-------------------AA-A---TA--CA------ACAGGC---TTTTA--AGAG-----TT--GCA--GAAAAGGAC---ATCGAT--GAGCAAA-C--A-----T-TTAG---A---ATAGTAGAAGACAGTACGGCTATCA--TATG--GGAAATTTAG-------------CACAC----TTACA---TGACTG---CAAGA--------T--ATTTTT-T-TTTT-C---ATTT--GTGCCT-TGCCA--A-TTG-ACC
gi|5 : G-ACG-------------------AAAA---CA--CA-------CAG-C---TTTTA--AGAG-----TTT-GCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-----C--AATACAT-TTAG---A---ATA-TAGAAGACAG---T---ATCA--TATG--GAA-----AG-------------TAG-CACAATATAT---TGACTG---CAAGA--------TATA--TTT-T-TTTTTC---GTTT--GTGCCT-TGCCATT----G-ACC---------------------------GAGCTTA--------------------ACATGCGA-----TTATG--GCA-GG-----------G--CTA-TTATG--AATA----AAGC------------------TT-TAAATTTCTA--------CAAAGTAC---AT----GTA-TGA---C--TTT----G-T-----A-C--AAT-ACA--CA-ATCTT---GAAT--TAG--CACC--------T-TA-GTAAA-TAT-AAC-TT-CCAATGT-AAAATGTT-----AATTACTGGCAGTT-T--CCAT-GTC----TTT-AATGTA-TG-GAGGCCCATT-AATG-TAT--ATA-ATCA-GC---A---AAAGAAAG-GTG----TGT-----GGGACT----CTTTAGA-GCAT-----A-CAT-GCT-AAAAT-A------G-GGGA----TA--T--AGGAATA-CTGA--------TT-TA--G-CGT---TAGA-GAATGG--G--GCAT-A---T-AGAAA-ACAATGAA--AT-----TT-C-AA--T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-T-TGATGA-A----A-TATATTCTT---ATATTTA----TATA--AGA---TA----------AA----TA-TACTGC--C-AAAA-TAAAAA--TTGTATAA------TTTTTTT---AATTTT--C--TGTTAGA--CCTTTT--ATccgcgcttacatttgcgaacgtcatggccgcaggataattgatatagaaactgcgttaccgatcgaaggtttatttacaatctattctaatacaaagtacatagtgttaaaatgatgcttatgtattagacaatgttactaacaatcattgaat
gi|14 : ---G---CAAGA--------T--A--TAT-T-T-TT-C---ATTG--GTGCCT-T------------ACCTT-------------TC-C-----AT-A----------------T--A----T-ACATGCAT-TATATTATG--GCA-TGTGC-T-AAGT-G--CTA-GTAT-TGAATA----AAGTA--TATGATG--TAT-GGTT-C-A-TTTCTA--------C-----AT---A-----GTA-TAA---C--TTT----G-T-----A-T--AAT-ACA--CA-ATCTT---GAGT--T----AACAGCTGCAGGT-TA-GTAAA-TAT-AACTTT-C-AATG-TAAATTA-T----TAATTACCGACctgggcattatatgaaatgagtgttgtgttagaattaacatggttgagagtattacagtagtcagaatgagatttttgtcatttatgtatggaaattatccgaactcatatcaaaatgatataaactggaatcaaagatagagagaagactttgtagcatatcaaaatttggtaaattccaaagaaggcggacttgaatattctacgcatattgctactgacaagcattaaatctgcattcgcattggccctttccgccaacaagttgaagaatctacaataataatcagaaaggggacttcatagtattggta
gi|8 : aaattaaagactT-G--CTA-G-AT-TGGATA----AAGTG--TTCCATN-NNNN-NNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNNTC----TCT---ACAAACGTA-TGA---CGGTTT----GGT-----A-TTTAAT-ACG--CA-ATCTT---GA-T--TAA--GGCA--------CCTA-GTAAA-TAT-AAC-TT-CCAATGT-ACAA-ATT------ATTACTACCT----------T-GTC----TTTGA-TGTA-TGAGGGGACCATT-AACTGTAT--ATAATTCA-GCAA-A---AAGGAAC--GT-----CGT-----AG-AC-----CTTTGGA-GTATC----A-AGT-GGCTAAAATCA-----GGCGGAAA---TC--T--G---ATAGATTGA-------TT-TA---GTTG---TA-G-GAATGG--G--GTAT-AT--T-AGAAACA-A-TGAATTAC-A---TT-A-A---T-CAGT--T--AA-T-----GTA-ATT-T-TGATGACAATATA-TAT----CT---ATATTT-----AGTA--AAAAatgtat
gi|16 : TTTAACGTA-TG-GAGGTCAATT-AAT-GTAT--AT-GATCA-ATA--A---AAAGAAAT-GG-----CAT-----GG-ACTA---CTTTTAA-GTATATAACA-AAT-AC--AAAAG-AAACCCT-----AC---TA-----A---ATA-ATGAC-------TTATC--GACTAC--TA----AAAGT--C--AAAC-AGATT-AAAAACA-A-TGAA--CTAA---TT-G-A---T-CAA---TTGAACT-----GAA-A-T-TATGA
gi|20 : TAAAAT-A-----GG-GGAAA---TA--TG-A---ATA-ATGA--------TT-TA--G-CTG---TAGA-TAATGG--G--GCAT-T---T-AAAAA-ACAATGAC--AT-AA--TT-C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-T-TGATGA-A----A-Tct
gi|21 : AAACA-G-TGAA--AT-A---AT-CTA---T-CAA---T--AA-C-----GTA-AAT-T-TGATGA-A----A-TAT----
gi|5 : agaataggacaG--TTAGA--CCT-TTTAT--CTGGGCATT--ATATGAA-ATGAGTGTTGTGTTAG--------A-ATTAACATGGTT----GAGAGTATTACAGTAGTC-AG-A-A---T-GAG----ATT-TTTGTC-ATTT-A-TGTATGG-A--------AATTAT----------CCGAA-CTCA-T------------ATC-A-AAATGA--TATAAAC----TGG---AATCAAAGA----TAGA---GAGAAGACTT--T--GT--AGCA-TATC-AAAAT-------TTGGTAAA-TTCCAAAGAAG-------GCGGAC-TT--G-AAT-A----TTCTA-CGC-AT-ATTGC-TAC--T-GACAAG-CATTAAA-TC-T-GCA-TTCGC-ATT-G--GC--C---CTTT-CCGC----C--AACA-AGTT-GAAG--AATC-T----ACA----ATAATAAT---CA-GAAA-GGGGACTTCATAGTAT--TGGT--Aattc
gi|3 : gacgaaaacacacagcttttaagagtttgcagaaaggacatcgatgagcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacaatatattgactgcaagatatatttttttttcgtttgtgccttgccattgaccgagcttaacatgcgattatggcagggctattatgaataaagctttaaatttctacaaagtacatgtatgactttgtacaatacacaatcttgaattagcaccttagtaaatataacttccaatgtaaaatgttaattactggcagtttccatgtctttaatgtatggaggcccattaatgtatataatcagcaaaagaaaggtgtgtgggactctttagagcatacatgctaaaataggggatataggaatactgatttagcgttagagaatggggcatatagaaaacaatgaaatttcaatcaataatgtaatttgatgaaatatattcttatatttatataagataaatatactgccaaaataaaaattgtataatttttttaattttctG--TTAGA--C-TCTTTATG-CTGAGCA-----TA-TAA-ATGAGC--T-CGT--G--------AGATTA--ATGGTT----GAAAGTAGTACAG-GGTCCAG-A-AACTTAGAG----AT-ATTTGTCCATTGGC-TAA-TGG-A--------AATTAT----------CCCAA-CTCGTT------------ATCGA-AATTGA--T--AAAC----TGG---AATCAAAGA----TAGA---GAAA--ACTTGTTA-GTGTAGA--TATCAA--------TT-TTGGTAA---TTCAAAG--GCCATATGGCGAAT-TTTTG-TATGAT---TACTGCTTT-AT-T-TGC-TAC--TGGA--AGCTGTTGAA-TGAT-GAGCTTCG--GTT-GTCGCGAC---CT---CGGCAA-AC--AACA-AGTT-GTAG--AAT--CTTCAATC----ATAA-TAT---CA-GAAG-TCGACTTTCAT-GTAT--TGGT---------T-CAA---ACATGTACGA--TA---CGAAATTCGGGA--AGTAAC--T---TAA-G-ATTTTGGTC-CCC-TAGAC--AAGT-ATGC--TGGATATGAGTTGAA-TATCTGAGATGCCAA----TC-TC--A---AAA-------AATGGAGACTTACGC--CTCATGATTCTA-AA-GACAAATACA--TAA-CCA--TTTG-TC-CAA-AAACCACAT-GTATGATC-ATC-TGC-AGA--------CAC---------A---TGA-TAA-G--GAAAAAC--AGGGTCGC-AATTTGTTTAGATGCGGT--ATCTG-AAAAAA-AA-GC-CGTTCCAA--C-TAAAC---AACCGTACCT-C-TAGTGAGGGA--GG-GTTG-------T-TAATCTACACTAACCAC--TGA-------TG--AAGATAG-ACTTT--TT---A-TGT---GAG--GATA-CG-TTCA--TCACGCTGCCC------TATTCAAT---AGAGAAT----GGCA------TTC--G--C-AGGTTA---T--A--G---CTA--CG-----A-CAG-GATG--GTG-----GT------TTT-----GCACTA--TCCTG-ATG-TGATTTTG-CAG-TTGCT-AAAACGTGTATGC
gi|4 : cgtcggccagtaaccatacctccccccctctatggatttctacactatgattttttgaaaggtgtaggtaacaaataaagggtaacacggacgagttagatttgagcaattcttatgttgggcgtttcaagtatatgatattggaattataaatttttggcaattcagaatagccataactgtgttccataccgcattacctttgtattaaagggaacaaaacaaccaacggttttaagagttgccagaaaggacatcgatgagcaatatatgttagagatatataaaggacagtcataagacgaagtagccatggtgcatggatgcaagaatttttttttttcattggcctatgccattgactagattaacatcatattagaacatcaaattttatgcatggtttgcatgtggcttagtattgaataagcgtacatgaacggtcaattctataaagtatgactttgctataatgacacaatcttgaagtagcacgcttagtaaaatatacttccaatagatgtaattactggcaggttgccattgtcttaatgatatgggccagtttacgttatataatcagccatgaagaaagtgcgacgactctttggaagcataacttgctaaaataggtgtgaaataattagtagtgaaatataaatttaatgattgcgttagttgaatggtgggcattatagaaacaatgaaataattaagttcaataagttaatgttgatagaaatacttcatatatttgatattatagtaaaaaaagataaatattatgccaaaacgaaatcattgtatattttttaatgtct--G--------A-ATTA---TGGTTA--TG-GAGT-TTA--GTGGT--AG-ACA---A-GA-----AGTATTTGTC--TTT-A-TGT-TGGCAT-------A-TTG------------CCA---CTGGT------------AT--A-AA-TGA--T-TAA-C----TGGTCAA--TCAAGA----TAG----GAAA--ACTTATTG-TT--AGC---AT--GTAATTT-------GGTA---TT--AAAG--G-------A------TT--GATAT-AT---TTTTG-CGCTAT---TG--TAC--GCGA-AAGCT-TTGA---C-T--TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGT-CGGCAA-AGTTGAC-GATTC-TAAT--AAT--T----A---------------------AGA-CGTGCTT-CATAGTTT--GGGT--ATA-CA-----------ATGT-CA-------GC---AT----GAATGG--AT-------AATG-ATT--G-GT-CCT---GAA--AATT-GT-A--TGTAGGTGA--TTGACT---TAGGG-ATGGGATGCTT-TC--A----------------------------------TGTTTCTA-AAAGACAAAACA---TGA--CT--TT-G-TC-TA------CAT---GCATGATCTATC-TGCTAGG--ACC---C----------AG---TGA-TAA-GGAAACAG--------TCTCAA-TTTG-TTGGAT---GT----CTG-AAAAAGCGG-AT-C-----AA----TAAACA--ATCCGTAAC-TC-TAAG---GGC--AG-GAT--------T-TGATTATCATACACAACACTGA-------TG--AAGAAGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTA-TATCGGTTCA--TC--ACTGCCC------TAA----TACAA-AGAATGAACTATA-------AC-AG--C-AGGTTAATTT-TCA-G---CTC--TC-----A-CAA-GAAG--G-A-----GTT--TTGTGT--AACATAT----CCTTG--TG-TGATTTTG-CAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCaa
gi|6 : tgggcgtaacacatactccccctctagggatttttcttacatatgaataagtaactatgtttgtttgaacccaatttcatgtttgggaggcgtgttcaagatatgtattgaattgatcaattttttggcaattcagtatagccattactgtcgttcatcatacgatgattatattgtattaagagcaactacacagaattattcagagtttgcagaaggacatcgatgtgcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacattaatagacttacaagatattttattttcatttgggtgcttgcccttgccctagtcaactatcgatctgaatcatgtcaattatggggttctaaagtattgatagcgtctaatgacggtcattttacaaagttgacttttttaataatacacaatttgaattatcaccttagtaataataacttccaatgtaaaatgttaatggcgtatccatgttctttaagtgttggaggccattaatgtatattatcgcacaagaagtggcgttgtttctttgggcctacatgtaaaaataaggggaaatatacaataatgatttagctgtagagaatggggcatatagaacatgaataattaacaatatgtagatttgatgaaatatattctattaatatatatatttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatttgttaggtgcgtgtcgagta--G--------A-ATTA---TGGTTA--TG-GAGT-TTA--GTGGT--AG-ACA---A-GA-----AGTATTTGTC--TTT-A-TGT-TGGCAT-------A-TTG------------CCA---CTGGT------------AT--A-AA-TGA--T-TAA-C----TGGTCAA--TCAAGA----TAG----GAAA--ACTTATTG-TT--AGC---AT--GTAATTT-------GGTA---TT--AAAG--G-------A------TT--GATAT-AT---TTTTG-CGCTAT---TG--TAC--GCGA-AAGCT-TTGA---C-T--TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGT-CGGCAA-AGTTGAC-GATTC-TAAT--AAT--T----A---------------------AGA-CGTGCTT-CATAGTTT--GGGT--ATA-CA-----------ATGT-CA-------GC---AT----GAATGG--AT-------AATG-ATT--G-GT-CCT---GAA--AATT-GT-A--TGTAGGTGA--TTGACT---TAGGG-ATGGGATGCTT-TC--A----------------------------------TGTTTCTA-AAAGACAAAACA---TGA--CT--TT-G-TC-TA------CAT---GCATGATCTATC-TGCTAGG--ACC---C----------AG---TGA-TAA-GGAAACAG--------TCTCAA-TTTG-TTGGAT---GT----CTG-AAAAAGCGG-AT-C-----AA----TAAACA--ATCCGTAAC-TC-TAAG---GGC--AG-GAT--------T-TGATTATCATACACAACACTGA-------TG--AAGAAGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTA-TATCGGTTCA--TC--ACTGCCC------TAA----TACAA-AGAATGAACTATA-------AC-AG--C-AGGTTAATTT-TCA-G---CTC--TC-----A-CAA-GAAG--G-A-----GTT--TTGTGT--AACATAT----CCTTG--TG-TGATTTTG-CAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCata
gi|15 : CGAAAT----GA--AG--AT--AATACAA-T-ATT--GAGT-CCCCTAAAC--AAAT-AT-C--TGGGATAGGAATAT--T---CAGGA-A--AA----TG-GG--A---ACT-------AG-----------CC--C--ATGATTCTA-AA-GACCAAAACA--TAA-CCA--TTTG-TCTCAA-A--CCAC-TTGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC--ATC----------AG---TGA-TAA-G--GA
gi|18 : tgtacgaacaAAA----TT-TC--AGGAAAATCGGATTAA-----------CC--TC-ATGCTTGTATAA-GACCAAAACA--TGA-CTA--TTTG-TC-TCA-A--CCACATC-TATGACCCATC-TGC-AGG--CTATAGC------GA-------TGA-TAA-G--GGAAAACATGT--CATC-A-TT------GAC----T--G-CTGTAAAAAA-CGCGT-C-----AA--CTTAAGCC--AACCaaacatgtttcaatag
gi|9 : a-G-TC-TAA-A--CCACAT-ACATGACTCATC-CGC-AGGCCACCGA-----------------TGA-TAA-G--GAAAG---CAC--TCTC-A-TTTGGACATACA-AATGTA-ATG-TAAAAG-CG-TT-A-----AA--C-TTAACC--AACC------TC-CA-----GGC--AG-GATGGTTATGTC-TACAACAACACC-------TAA-------TG--AAG-AAGTACTTTA-CTCG-A-TAT--TTGATAA-GA-CAGCTCCAATCG-ACTGCCC------TA-----T---A-ACAG--AA-AATGCCACTGTTC-AG--T-AGAATA---T-TCA-G---CTA--TTTTAATA-CAA-GAA---GCT-----ATCAAAT-TTT--AA-CTAT----CCTCCCATG-TGATTTGG-CAG-TTGCT-AAAAAGTTTATGCtcg
gi|13 : tC-A-TTTTGTTGGATA---T--A-CTG-AAAAAA-GC-GT-C-----AA--C-TAAACCTGAACCGTACATTC-TA-----AGAGCAG-GATGGTTAT--C-TA-----------------CAACACCACCTGATGAAGAAGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTATTA-TGGTTC----CA-ATAACCTGCCCTAT------TAC-A-AGAATGGC-ACTA-------TC-AG--C-AAGTTA---T-TTCAG---CTA--TC-----A-C-A-GAGA--GCT-----GT--AAAATGC--AA-CTAT----CCCTGCATG-TGATTTTG-CAG-TTGCT-AAAAAGTGTa
gi|23 : AAATGT--AA-CTAT----CCTTGCATG-TGATTTTG-CAG-TT-CTAAAAAAGTGTATGCa
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): ATCATATGGAGAGTAGCACATTACATGACTGCAAGATAAATATTTATTCATT
Unaligned ( gi|24 ): CAAGTGAGTTCAGTACATCATGGAAAGGCAAATGTAACTATCC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1 22222 1 1111 11111 1111111 333333333 11 11 11111111 11 222222222222 2222222 111 111 111 222 11 1111 2222 111 11111111 5555555555555555555555555555555555 11 5555555 3333333 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222 111 11111111 111 555555555555555555555555555555 33333333333333 222222222 1 22222222222 11111 222222 111111 11111 1111 11111 11 111 1 22222 22222 1111 22222222222222 333333333333333333 1111 33 111111111 111 11111 333333333333333 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 111 333 44444444 11 111 1 22222 11 2222 1 1 11 222 11 1 11 1 2222 222 222 11 1 222222 1 222 11 22 1 11 2 1 11 11 222 2 22 11 222222 1 2 2 1 11 22222 3333333 11 222 1 33333333 3333333 2222 2 222 2222 11 11 11 1 1 1 11 1 1 333 1 2 2 2 22222 11 2 22222 11 333333333 22 44444444444 1 222222 55555555555555555 1 1 333333 2222222 2222 2222 2 222 11 111 1 22222 11 1 44444444444 222222 1 3333333 2 1 33333333 1 2222 222 11 11 2 11 111111 22 4444444444444444444444444444444444444444444 22 2222 11 2222222222222222 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1111111 88888888888 1111 3333333333333333 222222 11111111111 1111 1 22222222222222222 22222 8888888888888888888888888888888888888888 11111 11111 1111 111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 111 1111 22222 2222222222222222222222222222222222222222222222222 111 1 1 22222222 1 555555555555555555555555 33333333 1 1 4444444444444444 2222222222 1 222222 00000000000000000000000000 1 22 1 2222222 33333333 222 11 2222222 22222 333333333333333 1111111 2
lowQualScore : 0000 1 5 5 2 44444 5 5 55 0000 66 5 66 11111 1 4 8888888 66 4 66 4 333333333 4 4 9999 77 4 55 4 00 4 66666666 00 9 7 777 555555555555 55 4444444 4 4 999 333 111 4 8 4 4 1 222 11 5 0000 5 5 5 5 2222 888 66 777 5 5 5 5 222 99999999 66 4444444444444444444444444444444444 4 66 888 55 66 66 888 66 8888888 66 888 5 7777777 99 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555555 99 777 777 666 77 5 5 22222222 333 444444444444444444444444444444 77777777777777 5 000000000 1 77 77 5 5 55555555555 22222 444444 1 000000 1 5 1 5 555 1 77777 5 7 9999 777 6 99999 555 5 5 5 4 5 00 77 5 5 000 5 77 1 99 55555 00000 2222 5 55 55555555555555 5 5 999999999999999999 888 9999 66 888 66 5 5 888 5 77 66 66 9999 33 3 66 666666666 777 4 222 66 4 11111 4 8 4 4 4 5 999999999999999 0 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666 0000000 444 8 000 0 33333333 33 8 444 8 0 33333 11 2 1 3333 1 1 5 5 88 111 88 5 88 5 3333 111 000 88 5 444444 3 4 5 111 88 77 5 4 88 0 5 4 88 4 88 111 0 77 33 88 999999 5 0 0 5 2 2 99 66666 1111111 88 000 66 5 44444444 2222222 3333 0 111 3333 88 88 88 5 5 5 88 5 5 555 5 2 0 0 2 0 66666 88 0 4 77777 88 999999999 3 3 77 11111111111 5 4 999999 99999999999999999 5 2 2 5 000000 3 5555555 5555 4444 0 000 88 222 5 77777 2 88 4 5 33333333333 999999 5 2222222 0 5 55555555 5 4444 111 3 88 88 0 33 4 444444 33 8888888888888888888888888888888888888888888 6 11 5555 7 6 33 6666666666666666 5 99 6 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99 6 7 9999999 2 6 55555555555 2222 9 4444444444444444 9 333333 6 77777777777 5555 0 9 66666666666666666 6 99 00000 1 1 4444444444444444444444444444444444444444 77777 6 66666 1 3333 999999 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 99 9 6 44 99 1 6 666 9999 4444 7 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555555 1 111 5 5 77 0 5 11111111 5 0 77 0 777777777777777777777777 5 88888888 7 888 0 6666666666666666 3333333333 5 77 5 66 0 5 111111 5 66 5 5 88 33 66666666666666666666666666 9 5 1 5 11 5 5 1 1111111 33333333 5 666 66 5 77 5 0000000 5 5 5 88888 0 000000000000000 66 2222222 66 8 5 5 0 5 0
lowQualScore : .... . . . . ..... . . .. .... .. . .. ..... . . ....... .. . .. . ......... . . .... .. . .. . .. . ........ .. . . ... ............ .. ....... . . ... ... ... . . . . . ... .. . .... . . . . .... ... .. ... . . . . ... ........ .. .................................. . .. ... .. .. .. ... .. ....... .. ... . ....... .. . ....................................................................................................................................................................... ....... .. ... ... ... .. . . ........ ... .............................. .............. . ......... . .. .. . . ........... ..... ...... . ...... . . . . ... . ..... . . .... ... . ..... ... . . . . . .. .. . . ... . .. . .. ..... ..... .... . .. .............. . . .................. ... .... .. ... .. . . ... . .. .. .. .... .. . .. ......... ... . ... .. . ..... . . . . . . ............... . . ................................................... ....... ... . ... . ........ .. . ... . . ..... .. . . .... . . . . .. ... .. . .. . .... ... ... .. . ...... . . . ... .. .. . . .. . . . .. . .. ... . .. .. .. ...... . . . . . . .. ..... ....... .. ... .. . ........ ....... .... . ... .... .. .. .. . . . .. . . ... . . . . . . ..... .. . . ..... .. ......... . . .. ........... . . ...... ................. . . . . ...... . ....... .... .... . ... .. ... . ..... . .. . . ........... ...... . ....... . . ........ . .... ... . .. .. . .. . ...... .. ........................................... . .. .... . . .. ................ . .. . ................................................................................................... .. . . ....... . . ........... .... . ................ . ...... . ........... .... . . ................. . .. ..... . . ........................................ ..... . ..... . .... ...... ..................................................... .. .. . . .. .. . . ... .... .... . ..... ................................................. . ... . . .. . . ........ . . .. . ........................ . ........ . ... . ................ .......... . .. . .. . . ...... . .. . . .. .. .......................... . . . . .. . . . ....... ........ . ... .. . .. . ....... . . . ..... . ............... .. ....... .. . . . . . .
lowQualScore : 7777 0 7 0 0 33333 0 6 11 6666 00 0 11 00000 1 4 9999999 11 4 11 4 999999999 4 4 7777 11 4 00 4 66 4 11111111 66 7 3 888 000000000000 55 0000000 0 4 999 333 777 4 9 4 4 9 444 99 0 6666 0 0 0 0 5555 888 99 111 0 0 0 9 222 88888888 11 3333333333333333333333333333333333 4 22 888 11 99 00 888 99 2222222 99 888 7 3333333 22 8 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5555555 22 555 888 111 99 7 7 44444444 444 000000000000000000000000000000 00000000000000 7 000000000 4 99 99 7 7 77777777777 33333 333333 0 333333 7 7 7 7 999 4 11111 0 6 3333 777 7 00000 999 7 7 7 3 7 99 99 7 7 000 7 99 4 33 77777 00000 1111 7 99 00000000000000 0 0 444444444444444444 888 6666 99 888 99 0 0 888 0 11 11 11 0000 44 6 11 222222222 888 4 222 11 4 11111 4 9 4 4 4 0 333333333333333 0 7 111111111111111111111111111111111111111111111111111 8888888 000 0 000 8 00000000 66 0 000 0 6 00000 00 5 0 8888 0 2 5 0 00 000 55 5 55 5 0000 555 555 00 5 555555 0 0 0 555 55 55 5 0 00 0 5 0 00 0 00 555 0 00 00 00 000000 0 0 0 0 5 5 55 55555 5555555 00 555 55 5 55555555 5555555 5555 0 000 5555 00 55 00 0 0 0 55 5 0 000 5 5 0 0 5 0 55555 55 0 0 00000 00 000000000 0 0 55 55555555555 0 0 000000 55555555555555555 5 5 5 0 000000 0 0000000 0000 5555 0 555 00 000 0 00000 5 55 0 5 55555555555 555555 0 5555555 0 5 55555555 0 5555 555 0 55 55 0 88 0 888888 88 2222222222222222222222222222222222222222222 7 77 8888 3 7 33 8888888888888888 5 88 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22 7 3 8888888 5 7 00000000000 2222 3 5555555555555555 8 555555 7 00000000000 7777 8 8 22222222222222222 7 22 88888 0 0 3333333333333333333333333333333333333333 55555 7 22222 8 8888 222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 8 7 00 22 0 7 888 5555 2222 5 88888 3333333333333333333333333333333333333333333333333 0 999 7 3 99 1 0 66666666 0 9 00 0 000000000000000000000000 0 00000000 1 888 0 9999999999999999 2222222222 0 55 0 99 7 4 111111 7 77 7 7 33 11 77777777777777777777777777 3 0 4 7 44 7 7 4 6666666 33333333 7 333 99 7 99 7 4444444 7 7 7 66666 1 999999999999999 99 6666666 99 8 0 0 1 0 0
consensus : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG-ATTTT----TCN-A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA--CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TTT--GAATTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG--ACCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGT-ATTAANGC--GGACGGAA---ACA--CAAC--------------------------AG-----CT-TTTAAGAG---TTT-GCA--GAAAGGGA---CATCGA--TGAGCAATAA--ATT--TAGA---ATA-TAGAAGACGGT-------ATC--ATATGGAA--A-----GTANC------TT-------T---T--G--T----GCGAGA-------------T-AT---TTT--TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGA-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA------GCA---C-CTTAGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GGA----CT-CTTTGG-AGCAT-----A-AG-TGCCTAAAAT-A-GG-G----------------GAAA---TA-T--A--A---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-A-ATATA--TTC---------ATATATTT-ATA-------AA-----AA--TANGTA--TATA----ATATT------A---CTGCCAAAAT-A-AA---ATT-GTATA--ATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGA--CC-TTT--ATGCTGAGCA-TATAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCNCTCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGCTTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGCATT-ATA-GA-----A-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-A--G-TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--TCAA----ATT-AAGAT--A-GAGAAAACTTATTG--GTAGCATATCAA-A----TT---TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GCC---CTTTCGGCAA-AG-TGACA-A--GTT--AAG--AATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGTATACA-T-TAG---A-ATGT-CG--A--TA--GCGAAAT---GAACGGA--T----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--G-AA-TTGA----CTTAGGAA---C----GGA----TT-TC---A-AAAA--------------C--C--ATGNTTC-T-A-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACGN-TCTCAATT---TG-TTGGAT--A-------G-TA-CTGAAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAG-GA-TGNTNAT-------C----AC-A-----C-AC-TGATGAAGAAAGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A-AGAATGAA-NNTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
Reference ( family-288 ) : CATGGGC-C--AGNAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTANGGG-ATTTT----TCN-A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA--CAANTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TTC--GAATTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG--ACCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGT-ATTAANGC--GGACGGAA---ACA--CAAC--------------------------AG-----CT-TTNAAGAG---TTT-GCA--GAAAGGGA---CATCGA--TGAGCAACAATAATT--TAGA---ATA-TAGAAGACAGT-N-----ATC--ATATGGAA--A-----GNACC------TT-------T---T--G-------GCAAGA-------------T-AT---TTT--TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGCAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTNC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGA-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA------GNA---C-NTTAGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GGA----CT-CTTTGG-AGCAT-----A-AA-TGCTTAAAAT-A-GG-G----------------GAAA---TA-T--A--A---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAACACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-A-ATAT---TTC---------ATAT-TTT-ATA-------AA-----AA--TATGTA--TATA----ATATT------A---C-GCCAAAAT-A-AA---ATT-GTAT---ATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGA--C--TTT--ATGCTNANCA-TANAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGAT--GATTGACATTAATATAGGAGTCCGAGA-TTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGCT-ATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGG--TTAGA--C-T-TTTAT--CTGAGCAT--ATA-GA-----A-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-A--N-TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--TCAA----ATTCAAGAT--A-GAGAAAACTTATTG--GTAGCATATCAATAATTTTT---TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TNGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-GTT-G--GCC---CTNTCGGCAA-ANTTGACAGA--GTT-TAAG--AATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GACGCGCTTTCATAGTATT------GGTATACA-T-CAG---A-ATGT-CG--A--TA--GCGAAAT---GAACGGA--T----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGGT--G-AA-TNGA----CTTAGGAA---C----GAA----TT-TC---AAAAAA--------------C--C--ATGNTTC-T-A-AAGACAAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-CGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGAC-CGT-TCTC-ATT---TG-TTGGAT--A-------G-TA-CTGAAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-NAG-GA-TGCTGAT-------C----AC-A-----C-AC-TGATGAAGAAAGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A-AGAATGAA-NATAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AANATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
gi|1 : --A-T---AT--TTTTTTG-AGAGAAGATAGTG---GT-AGAAAAATT-AA------ATGG-T-AA-AGGCGG-C-GG-TT-G--T-TTTTGCAACCAA--CATGTTTT-TGTT---GGG--GACTGAAATGCGTTTT--CTCAACA-G-ATATGATCA-TTCTGAAATTT--AT-C-AATTTTT-GTG-CACAATTCAACA-AGAAACCATAATA-CGAAAAG-T-GATT-CTCCAAT---AGGC--TGCATTAC-TATTGTAAGTAATGCTAGTACGGAAATCACA--CAAT--------------------------AATAAGTCTATTATAGAAGCTTTT-GCATGGATAAGGACTTCATCGATCTGAGT--CGAT-GTTGGTAGA---ATA-TAG-AGACGGTGC-----ATCAAATATGGTATTA-----AGACT------------------------------GCGAGAATGAGAGCTAATTT-AT---TAT--TTTCAATTTTGGTGCCT-TGCCATGAAT--TGCACCTTACGATTATGTGACTCGCGTGTAA--AACTTTATAATC-TACTC-T--AAAAATT-ACATGTAA-T--ATTATGTTGCA-GTGTT--TAAGTCG--CTAAGTCT-TGAATATATAAAGCGCGTA-GATGG-AAATCGGTTATAAA--------------TTTCTAAATTCG---TA-A-GTAATGAAATCGTC--TCAG-T--GT--TAT-AAATA-ATCCAAGCGATGTTTGAGAATATTA------GCAAATC-TTAAGTAAAATATT-ACTTTCAATGTT-GAAATATTATATTAACTATCGGCCGTTT-T-CCA-TGTCCCTATTTGCATG-TA-T--GAGGTCCATTTAATAGTATCAATA-A-TCATGCAC-AA--AATGAAATCGTATATACGTAGTACGGACTACCT-TTTTAG-GGCAT-----ATAG-TGGCTAAAAT-A-GG-T----------------GAAA---TA-TTAA--A---TAA--TGA-TTATA---G-CTGTAG-GGAATG--GGAAGAA-TATTAGAAA-ACAATGAA--ATAAATTTAC-A---TACAAAGGT--AA-TCGAAAGTA-C-T-TTGAG-GA-ATATAT---TCG---------ATA--TTT-ATA-------AAAACTTAA--TATGTA--TATAAACTATATT------AAGGC-ATCGATAC-ATAA---ATT-GTATA--ATTTTTTTTCTTTTTAAAT-TTTACCAATG-AT-GA--C--TCTTGATGTTTA-CA-TAGAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGAT--GATTGACATTAATATAGGAGTCCGAGA-TTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGCT-ATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGGCATTTGAACC-T-TTTATCACTGAGCA---ATA-AATAGTCA-ATGAAC-GATC-CG--T-GGGATAGAAA-ACTA-CATCGTTACACGAGAATTACAGTGGTC-AG-CAAATTGAGCAGCA-TATCTGTCATT-----T-TAGC--ATCGAATAGACAGGAATTATGCGAGAAATGTCCACA-CTTGTTTAAGGCGTCC-AAATATAATTGAGCT-TAAACACTGTGGAATCAATAGTATT--AGAT--ACGAG--AACT--TTGA-GTACAACATCAATA---TTG---TGGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTTGTATGATAAGTTCTGATGCAATA-G-TAGCTACTTTGGACAAGCTATTAAACT-CTAGTATTCACTATTAG--GCCACACTTTCCACCA-A--TGACACAACGTTATAAGAAAATCGT--A--CTTCAGATAA-ATGTACAG-AAGGCCGCGTCTTCATAGTATTCTAGTCAATATGCA-TGTAGCTTA-GTGA-CGAAA--TAGTGCGAAAT---G-ACAGA--TAAC-CAAGAA--TTGAGTCCCC-TAGAACCAAATAATTGATGGAGAA--G-AACTAGAT---CCTAGTAG---C----ATA----TTCTCGAGAGAAAG--------------CCTC--ATGGTTCAA-A-AAAACCAATACATGAGACAATTTGCTCGC--AAGACCATA-TGCATGA-CTATCGCGC-AGGCCAC----CACTGGCGAATAGCCTTGATTAATGAAAGACACGTGTGTC-ATT---GT-TTGGAA--C-------A-TA-CTGAAAAAA-AGT-----TACAAC-CCTAACC--AATCGTACCTGCTT---A-G-GACAGAGA-TGCTTGT------------------------T-TAATGA--GCAGTACTTTG-TTCGAACTGT--TG-ATTGT-A-CGGTTC----CA-ATTACCTT------T-A-AGAATTCA--ATAT-TCGAGGTCGAGGTTA---TGT-CACGTCTACTCCGTCAACGAAAACGCACAGATGTC-AAAATGTAAAA-GTACTGAC--CCTTGCATACTGATTTTTGCAGTTTGCTAAAAAAGTGTATGC
gi|10 : ggatatattttgCATGGGC-C--AGCAA-CACCC--CC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG-CTTTT----TCT-A-C--A-C----TGATTTTTTG-AAAG-------CGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGA-C-GG-TT-G--T-TT--------GA--CAA-TTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----AAG-ATATGATCA-TTT--GAATTT--AT-A-AATTGTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CC----G-T-G-TTCC----AT---A--C--CGTATTAC-T-TTGT-ATTAAAGC--AGAC-GAA---ACA--CAACTGTTACAGACGAAACACAACTATTACAG-----TT-TTTAAGAG---TTT-GCA--GAA---------TTCGA--TGAGCAATA--CATT--TAGA---ATA-TAGAA
gi|11 : cCATGGGTTC--AGAAAGCACATTACCTCC--CCCCCCT-CT---GGGG-ATTTTTCTCTCC-A-CTAA-T---AT-ATTTTTT--AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A--G-T-AA-A--CGA-C-G--GT-G--T-TT--------GA--CTATTCTAATGTT---GGA-------------GTTTT--CA----A-G-ATATGGTCA----------------------TTTT-G-GACA-AATTCAGCAT-G--ACTAT--TA-CT----G-T-G-TT-CCA--AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGT-AGT--GGC---AACG-------CA--CCAC--------------------------A------C---------G---TTTCGCA--GAAA--GA---CATCGA--TAAGCAATA--CATT--TAGA---A
gi|12 : gacGGC-CCGAGTAA-CACATTACCTCCCCCCCCCCC-CTCTGTGGG-ATTTG----TCA-A-C--A-CTTGATGATTATCTGCAGAA-------TGT--GT-ACGAAA--TTAACAGGTCA-GA-T-CA-A--CGC-A-G--TT-GA-T-TT--------GA---AATTTCTATGT----GGG--G---------CGTTTT--C-----AAG-ATATGATTA-TTT--GAATCTTGAT-C-AATTTTG-G-G-CA-AATTCAGTATAA--ACCCTC-TA-CT----GTT-G-TC-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-------TTAAGTC--AGA--GGA---ACG--CAAT--------------------------AG-----CT-T
gi|13 : cctTT---TG-TTGGAT--A---------TA-CTGAAAAAA-GCG-----T-CAAC-TA-AACCTGAACCGTACATTCTA---A-GAG-CAG-GA-TGGTTAT-------CTACAAC-A-----CCACCTGATGAAGAA-GTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTATTA-TGGTTCCAATAA-CCTGCCCT-ATTA-C-A-AGAATGGC-ACTAT--C-AG--C-AAGTTA---T-TTCA-G-CTA-TC-----ACA-GAGAGC-----TGT--AAAATGC--AA-CT----AT--CCCTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTA
gi|14 : cat-------GCAAGA-------------T-AT---ATT--TTT-CATTG--GTGCCT-T--------------ACCTT-------------TC-C-----AT-A------------------T--A-----T-ACATGCAT-TATATTATG--GCA-T-GTGC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GTATATGATGT-A---TGGTT-C--A--------------TTTCTA----C-----ATA-GT-ATAA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----GTTAACAGCTGCA---G-GTTAGT-AAATATA-ACTTTCAATG-T-AAATTA-----TTAATTACCGACAT-GT-
gi|15 : aaattaaagactCGAAAT---GAA--GA--TAATACAAT-A--TTGAGT-CCCCTAAAC--AAAT-AT--CTGG-GATAGG-AA-T--A----TTCAGGAA---AATGGGAA----CT---------AGC--------------C--C--ATGATTC-T-A-AAGACCAAAACAT--AACCATTTG-TCTC--AA-ACCACT-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----ATC--------AG---TGA-TAAGGAAAat
gi|16 : tgtacgaacaTTTAACG-TA-TG-GAGGTCAA-TTAATG-TAT--ATG-A-TCA---AT-AA--AAAGAAAT-GG-----CAT-----GGA----CTACTTTTA-AGTATATAACA-AA-TAC--AAAA------------------------GAAACCCTA-CTAA--A---TAA--TGA-CT-TATCGA-CTACTA-AAAGTC--AA--ACA-GA-TTAAAA-ACAATGAA--CTA-ATT--G-A---T-CAA---TTGAACT-----GAA-A-T-T--AT-GA-acatgtttcaatag
gi|17 : CTCCCC-CTCTATGAG-ATTTT----CTA-C-C--C-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA---------G-TAAA-A--CGC-C-A--TT-C--TCTT--------GA--CAATGTAT-TGTT---AGC--G---------C-TTTT--CCA---A-G-ATATAATCATTTT--GAATTT--AT-CAAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAct
gi|18 : gtaaatacataTCAGGAAAATC----GGA----TT----------AA--------------C--CTCATGCTTG-T-ATAAGACCAAAACAT--GACTATTTG-TC-T--CA-ACCACA-TCTATGACCCATC-TGC-AGG---C----TAT--------AGCGATGA-TAAGGGAAAACATGT-CATC-ATTGACTG-CTG-------------------TAAAAAAC-GCG-----T-CAACTTA-AGCC--AACCagtgtagtgtg
gi|19 : aaaattCATGGGC-C--CAGAA-C-CAATACC-----TCCCCCC--TCTA-GGG-ATGTT----TCT-A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GTAAAAAAA--T-AA---------G-T-AA-A--CGA-CAG--TT-G--G-TT--------GA--CAA-TTTTATGTT---TGGCCG---------CGTTTT--C-----A-A-ATATtcg
gi|2 : accCGTGGGC-C--AGTA--CACATTACT-----CCCCCTCACTCTAAGGGTATTTT----TCA-AGC--A-T---ATGATTTTTTG-ACAG-------TGT--GT-AAAA----T-AA--------GG-T-AA-C--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA--CAAATTTT-TGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT---GAATTT--ATGC-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGCATAA--ACCAT--TA-CG----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTA--T-TTGT-AGTAATGC--AGACGGAG---ACA--CAAT--------------------------AG-----CT-TTATATAG---TTT-GCA--GAAAGGGA---CATCGA--TGAGCA-------TT--TGGA---ATA-TAGAGGACGG--G-----ATC--ATATGGAA--A-----GGACT------TT-------T---TTTG-------GCGAGA-------------TCAT---TTT--TATTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---TATTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--CCT--A-----TTACATGTAAATA-ATTATG--GCA-G-GTGT-TAAGT-G--CT-AGTATGTGAATA---AA---GCGTACGATGATA---TGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TCCA-GT-ATGA------CG-TTTG-T--AT--AAT-ACACGTATG----------TTGA----ATTA------GAA---C-ATTAGT-AAATATT-ACTTC-AATG-TTAAAATAT----TTAATTGCTGGCTC-GT-T-CCA-TGTT----TTTGAATG-TAATG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATAGA-TCA---GC-AA--AT-GAACT-GT-----CGT-----GGA----CT-CTTTGG-AGCAT-----A-AG-TGCTTAAAAT-A-TG-G----------------GGAC---TA-T--A--A---TAA--TGAATT-TA---GGCTGTAG-GGAATG--GG--GAA-TA-TAGAAACACA-TGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GG-A-ATAT---TT----------ATAT-TTT-ATA-------AA-----AAATTATGTA--TATA----ATATT------A---TTGCCATGCT-A-AA---ATTTGTAT---ATTTTTTTGTA-----AAG-TTT-C---TG-CT-GA--C--TTT--ATGTTGA-----ATAGAAAATAAAA-ACC-AAGCAA--TCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTTT--CA-GTTC--CA-TC----AAT---AAATCA---CCATA--AAATA-TTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTGTA--AAGGATTTGAT-GACGATAATATAGG--TCCGAGAATTA-GAAGTAG--AGTCAC--AAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGATTGT--TATTCAA------AACGCATAC-TTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGG--TTTGA--C-T-TTTAT--CTGAGCACTGATA-GA-----ATATGAACGG--TGTG--T-G--------A-ATTA-CATGGTT-TGAGAGTATTACAGTGGTC-AG--AA--TGAG-A--T-TATTTGTCATTTGATGT-TGG---AT------------AATTAT----------CCCA-AGCTTG-TTA------TA-AA-----A-TGA--T-TAAAC----TGG--ATA---------AAGAT--A-GAGAGAACT--TTG--GTAGC-CATCAAAAATTTTTTTGTTGGTAAATTTCCAAAG-------GGCAAA--CTTG-TAT-AT---TTTTG-TGC---A-TGT-G-TAC--TGGACAAGATATTAAA-T-CTGTACTTCAC-ATT-G--GCC---CTTTCAACAATAG--AACAGA--GTT-TAAG--AAT--T--A--CT----ATGA-A-AT-CAA-A--GGCGGGCTTTCATAGTATT------AGTATAGAGT-TAG---A-ATGT-CG--AATTG--GCGAAAT---G-ATAGA--T----CCAAGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--GAAT-AT--CTGGAGAA--GAAA-TAGA-----TTACGAA---C----AAA----TT-TC---AAAAAAG-------------C--T--ATGATTC-T-A-AAGACAGAAAT-T--GAACA-TCG-TC-C--AA-ACCATATTGCATGATCTATC-TGC-AGG--ACCGAGCACTGGGA---AG---TGA-TAAGAATAGAC-TAT-TCTC-ATT---TGTTTGGAC--A-------GATA-CTGAAAAAA-AGA-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCT----A-G-G-AAG-GA-TGCTG----------------------------TAATGGAGGAAGTACTTTG-TTCG-ACTGT--TGAATTGT-A-CGGTTC---TCA-ATTACCTT------T-A-AGAATTAA-GATAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-C--G-CTA-TC-----GCAAGAAAGC-----AGTCAAAAATGT--AA-GT----ACTGCCTTGCATA-TGA-TTT--CAG-TTGCT-AAAAAGTGTTTGCt
gi|20 : TAAAAT-A-GG-G----------------GAAA---TA-TG-A--A---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-ATAATG--GG--GCA-TT-TAAAAA-ACAATGAC--ATA-ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-A-AT
gi|21 : -AGAATA--GG--ACA--------AA-ACAGTGAA--AT--AAT--CTA---T-CAA---T--AA-C-----GTA-AAT-TTGAT-GA-A-ATATA--TTC---------
gi|23 : AAATGT--AA-CT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TT-CTAAAAAAGTGTATGC
gi|3 : cGGC-C--AGTAA-C-CAT-ACC-----TCCCCCC-CTCTATGGA----TT----TCT-A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAGG------TGTAGGT-AACAAA--T-AA------A-GGGT-AACA--CGGAC-GAGTT-AGAT-TT--------GAG-CAATTCTTATGTT---GGG------------CGTTTC--A-----A-GTATATGAT-A-TTG--GAATT---AT-A-AATTTTT-G-G-CA-A-TTCAGAATAG---CCAT--AA-CT----G-T-G-TT-CC---AT---A--C--CGCATTACCT-TTGT-ATTAAAGG--GAAC-AAA---ACAACCAAC--------------------------GG------T-TTTAAGAG---TTG-CCA--GAAA-GGA---CATCGA--TGAGCAAT-ATATGT--TAGAGATATA-TAAAGGACAGT-C-----ATA--AGACG--A--A-----GTAGC------CA-------TGG-T--GCATGGATGCAAGAAT-----------T-TT---TTT--TTTTCA-TT--G-GCCTATGCCA----T--TG-ACTAGA------------T---------T-AAC------ATCATA--T-T--A-----GAACATCAAA-T--TTTAT---GCATG-GTTTGCATGT-GGCTT-AGTAT-TGAAT----AA---GCGTAC-ATGA-A---CGG-T-C-AA---------------TTCTA---------TAAA-GT-ATGA------C--TTTGCT--AT--AATGACACA-ATC----------TTGA----AGTA------GCA---CGCTTAGT-AAA-ATATACTTCCAAT-------AGAT----GTAATTACTGGCAG-GT-TGCCATTGTCT---T---AATGATA-TG---GGCCAG-TTTACGTTAT--ATA-A-TCA---GC-CATGAA-GAAA--GTG----CGA-----CGA----CT-CTTTGGAAGCAT-----A-ACTTGC-TAAAAT-A-GGTGTGAAATAATTAGTAGTGAAA---TA-T--A--AATTTAA--TGA-TT------G-CGTTAGTTGAATGGTGG--GCATTA-TAGAA--ACAATGAA--AT--AAT--T-AAGTT-CAA---T--AA-G-----TTA-A-TGTTGATAGA-A-ATAC---TTC---------ATATATTTGATATTATAGTAA-----AA--AAAG-A--TA-A----ATATT------A---T-GCCAAAAC-G-AAATCATT-GTAT---A-TTTTTT--------AA--TGT-C---TG-TTAGACTC--TTT--ATGCTGAGCA-TATAAA
gi|3 : cgtcG--TTAGA--C-TCTTTATG-CTGAGCAT--ATA--------A-ATGAGC----T-CG--T-G--------AGATTA--ATGGTT--GAAAGTAGTACAG-GGTCCAGAAAC--TTAG-A--GATATTTGTC------CAT-TGGCTAATGGA---------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-TTA------TCGAA-----ATTGA--T--AAAC----TGG-----A----ATCAAAGAT--A-GAGAAAACTTGTTAGTGTAG-ATATCAA------TT---TTGGTAA---TTCAAAGGCCATATGGCGAATTTTTG-TATGAT---TACTG-CTT--TATT-T-GCTAC--TGG--AAGCTGTTGAA-TGATGAGCTTCG--GTT-GTCGCG---ACCTCGGCAA-AC--AACA-A--GTT-GTAG--AATC-TTCAATC-----ATAA-T-AT-CAGAA--GTCG-ACTTTCAT-GTATT------GGT------T-CAA---ACATGTACG--A--TA---CGAAATTCGGGAAGTAACT----TAA-GATTTTGGTC-CCC-TAGAC--AAGT-ATG-CTGGATAT--G-AG-TTGAATATCTGAGATG---C----CAA----TC-TC---AAAAAATGGAGACTTACGCCT--C--ATGATTC-T-A-AAGACAAATACAT--AACCATTTG-TC-CAAAA-ACCACA-TGTATGAT-CATC-TGC-AGA--------CAC--------A----TGA-TAAGGAAAAACAGGG-TCGCAATT---TGTTTAGATGCG-------G-TATCTGAAAAAA-AAGCCGTTC-CAAC-TA-AA-C--AACCGTACC-TCTAGTGA-G-G-GAG-GGTTGTTAAT-------CT---AC-ACTAACC-AC-TGATGAAGATAG-ACTTT--------TTATG-TG-AGGAT-A-C-GTTC--ATCACGCTGCCCT-AT-T-C-A-ATAGAGAATGGCAT-TC--G--C-AGGTTA---T----A-G-CTA-CG-----ACAGGATGGT-----GGT----TTTGC---A-CT----AT--CC-TG-ATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAACGTGTATGCtgagctcgtgagattaatggttgaaagtagtacagggtccagaaacttagagatatttgtccattggctaatggaaattatcccaactcgttatcgaaattgataaactggaatcaaagatagagaaaacttgttagtgtagatatcaattttggtaattcaaaggccatatggcgaatttttgtatgattactgctttatttgctactggaagctgttgaatgatgagcttcggttgtcgcgacctcggcaaacaacaagttgtagaatcttcaatcataatatcagaagtcgactttcatgtattggttcaaacatgtacgatacgaaattcgggaagtaacttaagattttggtcccctagacaagtatgctggatatgagttgaatatctgagatgccaatctcaaaaaatggagacttacgcctcatgattctaaagacaaatacataaccatttgtccaaaaaccacatgtatgatcatctgcagacacatgataaggaaaaacagggtcgcaatttgtttagatgcggtatctgaaaaaaaagccgttccaactaaacaaccgtacctctagtgagggagggttgttaatctacactaaccactgatgaagatagactttttatgtgaggatacgttcatcacgctgccctattcaatagagaatggcattcgcaggttatagctacgacaggatggtggttttgcactatcctgatgtgattttgcagttgctaaaacgtgtatgcaa
gi|4 : cgtcggccagtaaccatacctccccccctctatggatttctacactatgattttttgaaaggtgtaggtaacaaataaagggtaacacggacgagttagatttgagcaattcttatgttgggcgtttcaagtatatgatattggaattataaatttttggcaattcagaatagccataactgtgttccataccgcattacctttgtattaaagggaacaaaacaaccaacggttttaagagttgccagaaaggacatcgatgagcaatatatgttagagatatataaaggacagtcataagacgaagtagccatggtgcatggatgcaagaatttttttttttcattggcctatgccattgactagattaacatcatattagaacatcaaattttatgcatggtttgcatgtggcttagtattgaataagcgtacatgaacggtcaattctataaagtatgactttgctataatgacacaatcttgaagtagcacgcttagtaaaatatacttccaatagatgtaattactggcaggttgccattgtcttaatgatatgggccagtttacgttatataatcagccatgaagaaagtgcgacgactctttggaagcataacttgctaaaataggtgtgaaataattagtagtgaaatataaatttaatgattgcgttagttgaatggtgggcattatagaaacaatgaaataattaagttcaataagttaatgttgatagaaatacttcatatatttgatattatagtaaaaaaagataaatattatgccaaaacgaaatcattgtatattttttaatgtctTGGGC-----GTAA-CACAT-ACT-----CCCCC----TCTA-GGG-ATTTT----TCTTA-C--A-T---ATGA--------------------------------A--T-AA---------G-T-AA----CTA-T-G--TTTG--T-TT--------GAACCCAATTTCATGTTTGGGAG--G---------CGTGTT--C-----AAG-ATATG--TA-TT---GAATTG--AT-C-AATTTTTTG-G-CA-A-TTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-TCG-TT-C----ATCATA--CGATG-ATTAT-A-TTGT-ATTAA------GA-GCAACT-ACA--CAG---------------------------AA-----TT-ATTCAGAG---TTT-GCA--GAA--GGA---CATCGA--TGTGCAATAC--ATT--TAGA---ATA-TAGAAGACAGT-------ATC--ATATGGAA--A-----GTAGCACA---TTAATAGACT---T--A--------CAAGA-------------T-AT---TTTA-TTTTCATTT--GGG----TGC------T--TG-CCCTTG------------CC-C---TAGTCAACT-----ATC-GAT-C-TGAA-----T--CATGT---CA-ATTATG--G---G-GTTC-TAA---------AGTAT-TGA-TA--------GCGTCTAATGA-----CGGTC----A--------------TTT-TA----C-----AAA-GT--TGA------C--TTTT-TTAAT--AAT-ACACA-AT-----------TTGA----ATTA------TCA---C-CTTAGT-AATAATA-ACTTCCAATG-T-AAAATGT----T-AAT----GGC---GTAT-CCA-TGTTC---TTTAAGTG-T--TG-GAGGCC-A-TTAATG-TAT--ATT-A-TC----GC-AC--AA-GAAGT-GG-----CGT-----TGT----TT-CTTTGG--GCCT-----A-CA-TG-TAAAAAT-AAGG-G----------------GAAA---TA-T--ACAA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAA---CA-TGAA---T--AAT--T-A---A-CAA---T--A--T-----GTAGA-T-TTGAT-GA-A-ATATA--TTCTATTAATATATATATTT-AAA-------AA-----AA--CAAAAAAAGATA----ATATCCTGGGGA---C-GC----GT-A-AA---ATT-GTATTTAATCTTTTT--------AATATTA-C---TGATTAGG--CCATTT--Aaa
gi|4 : TGCGT-G--T-CGAGTAG--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--A--G-TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGG--TCAA------TCAAGAT--A-G-GAAAACTTATTG--TTAGCATGT-AA-------T---TTGGT--A-TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--G-----TTGTCGGCAA-AGTTGAC------------G--ATTC-T--A--------AT---A-AT-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGTATAC----------A-ATGT-C-------A--GC---AT---GAATGGA--T-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--G--A-TTGA----CTTAGGGA---T----GGGATGCTT-T---------------------------C--ATGTTTC-TAA-AAGAC-AAAACAT--GAC--TTTG-T---------CTACA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAAA----CAG-TCTCAATT---TG-TTGGAT----------G-T--CTGAAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAG-GA-T-TTGATTATCATAC----ACAA-----C-AC-TGATGAAGAAGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA-AGAATGAA-C-TATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCatttgttaggtgcgtgtcgagtagaattatggttatggagtttagtggtagacaagaagtatttgtctttatgttggcatattgccactggtataaatgattaactggtcaatcaagataggaaaacttattgttagcatgtaatttggtattaaaggattgatatatttttgcgctattgtacgcgaaagctttgacttgcttgcttggttgtcggcaaagttgacgattctaataattaagacgtgcttcatagtttgggtatacaatgtcagcatgaatggataatgattggtcctgaaaattgtatgtaggtgattgacttagggatgggatgctttcatgtttctaaaagacaaaacatgactttgtctacatgcatgatctatctgctaggacccagtgataaggaaacagtctcaatttgttggatgtctgaaaaagcggatcaataaacaatccgtaactctaagggcaggatttgattatcatacacaacactgatgaagaagatctctgactcgattgtcatgattatatcggttcatcactgccctaatacaaagaatgaactataacagcaggttaattttcagctctcacaagaaggagttttgtgtaacatatccttgtgtgattttgcagttgctcacaaagtgtatgcata
gi|5 : tgggcgtaacacatactccccctctagggatttttcttacatatgaataagtaactatgtttgtttgaacccaatttcatgtttgggaggcgtgttcaagatatgtattgaattgatcaattttttggcaattcagtatagccattactgtcgttcatcatacgatgattatattgtattaagagcaactacacagaattattcagagtttgcagaaggacatcgatgtgcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacattaatagacttacaagatattttattttcatttgggtgcttgcccttgccctagtcaactatcgatctgaatcatgtcaattatggggttctaaagtattgatagcgtctaatgacggtcattttacaaagttgacttttttaataatacacaatttgaattatcaccttagtaataataacttccaatgtaaaatgttaatggcgtatccatgttctttaagtgttggaggccattaatgtatattatcgcacaagaagtggcgttgtttctttgggcctacatgtaaaaataaggggaaatatacaataatgatttagctgtagagaatggggcatatagaacatgaataattaacaatatgtagatttgatgaaatatattctattaatatatatatttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatttgttaggGACGAAA---ACA--CA-C--------------------------AG-----CT-TTTAAGAG---TTT-GCA--GAAAGG-A---CATCGA--TGAGCAATAC--ATT--TAGA---ATA-TAGAAGACAGT-------ATC--ATATGGAA--A-----GTAGCACAATATA-------T---T--GACT----GCAAGA-------------T-ATATTTTT--TTTTCGTTT--GTGCCT-TGCCAT---T---G-ACC---------------------------GAGCTT---A--------------------ACATGCGA-T----TATG--GCA-G-G----------G--CT-ATTAT--GAATA---AA---GC-----------------TT-T-AAA-------------TTTCTA----CAAAGTACATGT-ATGA------C--TTTG-T--AC--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA------GCA---C-CTTAGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATG-----TTAATTACTGGCAG-TT-T-CCA-TGTCT---TT--AATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAAT-GTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAG-GTG----TGTG----GGA----CT-CTTTAG-AGCAT-----A-CA-TGC-TAAAAT-A-GG-G----------------GATA---TAGG--A--A---TAC--TGA-TT-TA---G-CGTTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT---TT--CAA---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-A-ATATA--TTC---------TTATATTT-ATAT------AA-----GA--TA---------A----ATA-T------A---CTGCCAAAATAA-AA---ATT-GTATA--ATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGA--CCTTTT--AT-CTGGGCATTATATGAAATGAata
gi|5 : G--TTAGA--CCT-TTTAT--CTGGGCATT-ATATGA-----A-ATGAGT-G--T-TG--T-GTTAG----A-ATTAACATGGTT--GAGAGTATTACAGTAGTC-AG--AA--TGAG-A--T-T-TTTGTCATTT-ATGTATGG---A-------------AATTAT----------CCGA-A-CTC--ATA------TC-AA-----AATGA--TATAAAC----TGG-----A----ATCAAAGATAGA-GAGAAGACTT-T----GTAGCATATCAA-AA----T---TTGGTAAA-TTCCAAAGAA-----GGCGGA--CTTGA-ATA-----TTCTA-CGCA-TA-T-T-GCTAC--T-GACAAGC-ATTAAA-T-CTGCA-TTCGC-ATT-G--GCC---CTTTCCGCCA------ACA-A--GTT-GAAG--AATC-T--A--CA----ATAATA-AT-CAG-A--AAGGGGACTTCATAGTATT------GGTAgtgttgtgttagaattaacatggttgagagtattacagtagtcagaatgagatttttgtcatttatgtatggaaattatccgaactcatatcaaaatgatataaactggaatcaaagatagagagaagactttgtagcatatcaaaatttggtaaattccaaagaaggcggacttgaatattctacgcatattgctactgacaagcattaaatctgcattcgcattggccctttccgccaacaagttgaagaatctacaataataatcagaaaggggacttcatagtattggta
gi|6 : gacgaaaacacacagcttttaagagtttgcagaaaggacatcgatgagcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacaatatattgactgcaagatatatttttttttcgtttgtgccttgccattgaccgagcttaacatgcgattatggcagggctattatgaataaagctttaaatttctacaaagtacatgtatgactttgtacaatacacaatcttgaattagcaccttagtaaatataacttccaatgtaaaatgttaattactggcagtttccatgtctttaatgtatggaggcccattaatgtatataatcagcaaaagaaaggtgtgtgggactctttagagcatacatgctaaaataggggatataggaatactgatttagcgttagagaatggggcatatagaaaacaatgaaatttcaatcaataatgtaatttgatgaaatatattcttatatttatataagataaatatactgccaaaataaaaattgtataatttttttaattttct-G--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--A--G-TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGG--TCAA------TCAAGAT--A-G-GAAAACTTATTG--TTAGCATGT-AA-------T---TTGGT--A-TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--G-----TTGTCGGCAA-AGTTGAC------------G--ATTC-T--A--------AT---A-AT-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGTATAC----------A-ATGT-C-------A--GC---AT---GAATGGA--T-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--G--A-TTGA----CTTAGGGA---T----GGGATGCTT-T---------------------------C--ATGTTTC-TAA-AAGAC-AAAACAT--GAC--TTTG-T---------CTACA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAAA----CAG-TCTCAATT---TG-TTGGAT----------G-T--CTGAAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAG-GA-T-TTGATTATCATAC----ACAA-----C-AC-TGATGAAGAAGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA-AGAATGAA-C-TATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGC
gi|7 : GCTTTAAC-----G-G-AGAAGATCA-TTT--GAATT---AT-CCAATCTTT-GCG-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TATCT----G-T-G-TC-C----AT---A--C---GCATTAC-T-TTGT-ATTAATGC--GGACC-AA---ATA--CAAC--------------------------AGG----CT-TTTAAGAG---TT--GCA--GAAAAGGA---CATCGA--TGAGCAA--ACA-TT--TAGA---ATAGTAGAAGACAGT-ACGGCTATC--ATATGGGA--AATTTAGCACA------CT-------TACAT--GACT----GCAAGA-------------T-AT---TTTTTTTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAA---T--TG-ACC
gi|8 : T-G--CT-AG-AT-TGGATA---AA---GTGTTCCATNN-N---NNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTA----C----AAAC-GT-ATGA------CGGTTTGGT--ATTTAAT-ACGCA-ATC----------TTGA-----TTAAG----GCA---C-CT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-ACAA-AT----T--ATTAC--------T-A-CCT-TGT-C---TTTG-ATG-TA-TGAGGGGACCA-TTAACTGTAT--ATA-ATTCA---GCAAA--AA-GGAAC-GT-----CGT-----AGA----C--CTTTGG-AGTATC----A-AG-TGGCTAAAATCA-GGCG----------------GAAA---TC-T--G--A---TAGATTGA-TT-TA---G-TTGTAG--GAATG--GG--GTA-TATTAGAA--ACAATGAATTAC--ATT--A-A---T-CAGT--T--AA-T-----GTA-ATT-TTGAT-GACA-ATATATATCT---------ATAT-TTA-GTA-------AA-----AA--ccgcgcttacatttgcgaacgtcatggccgcaggataattgatatagaaactgcgttaccgatcgaaggtttatttacaatctattctaatacaaagtacatagtgttaaaatgatgcttatgtattagacaatgttactaacaatcattgaat
gi|9 : TG-TC-T--AA-ACCACA-TACATGACTCATC-CGC-AGG---C----CAC--------CGA--TGA-TAAGGAAAG---CAC-TCTC-ATT---TG----GAC--ATACAAATG-TA-ATGTAAAAG-CGT-----T-AAAC-TT-AACC--AACC------TCCA-----G-G-CAG-GA-TGGTTATGTC----T----AC-AACAA-C-ACCTAATGAAGAA-GTACTTTA-CTCG-ATATT--TG-ATAAG-A-CAGCTCCAATCG-ACTGCCCT-AT-AAC-AGAAAATGCC-ACTGT-TC-AG--T-AGAATA---T-T-CA-G-CTA-TTTTAATACAAGAAG-C-----TATC-AAATTTT--AA-CT----AT--CCTCCCATG-TGA-TTTGGCAG-TTGCT-AAAAAGTTTATGC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): ATCATATGGAGAGTAGCACATTACATGACTGCAAGATAAATATTTATTCATT
Unaligned ( gi|24 ): CAAGTGAGTTCAGTACATCATGGAAAGGCAAATGTAACTATCC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1 22222 1 11111 11111 1111111 33333333333 1111111 11 11111111 111 222222222222 2222222 11 111 111 222 11 1111 2222 111 111 5555555555555555555555555555555555 11 1 333333333 1111 1111111111111111111111111111 3333333333333333333333 22222222 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222 111 11111111 111 555555555555555555555555555555 33333333333333 222222222 1 22222222222 11111 111111 111111 1111 11111 1 111 1 22222 1111111111111 111 333333333333333333 22 111111111 111 11111 2222222222 3333333333333333333333333333 111111 11 22222222 111 11 1 44444444 11 111 1 333 1111 1 1 11 222 11 1 11 1 2222 222 222 11 1 222222 1 222 11 11 1 11 1 1 11 11 222 1 11 11 222222 1 1 1 1 11 22222 3333333 11 222 1 33333333 3333333 2222 1 222 2222 11 11 11 1 1 1 11 1 1 222 1 1 1 1 22222 11 1 22222 11 333333333 11 44444444444 1 222222 55555555555555555 1 1 333333 1 2222 2222 2222 1 222 11 1 22222 11 1 44444444444 222222 1 3333333 1 1 33333333 1 2222 222 11 11 1 11 111111 22 2222 222222 444444444444444444444 22 2222 11 222222222222222 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 222 2222 22222222 222 3333333333333333 222222 11111111111 1111 1 2222222222 11111 222222222 999999999999999999999999999999999999999999 2222222222222 1 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 111 2222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1111111 1 555555555555555555555555 111111111 1 1 3333333333333333 2222222222 1 222222 22 99999999999999999999999999 1 22 1 2222222 33333333 222 11 2222222 22222 222222222222222 1111111 2
lowQualScore : 6666 3 5 5 2 00000 5 0 66 0 66666 5 66 11111 1 4 8888888 66 4 66 4 00000000000 4 9999 2222222 4 00 4 66666666 222 7 7 777 555555555555 55 4444444 4 4 11 4 333 111 4 8 4 4 1 222 11 5 0000 5 5 5 5 2222 888 66 777 5 5 5 5 222 555 66 777 66 4444444444444444444444444444444444 55 888 55 66 66 888 66 5 0 8 5 66 888 5 2 0 111111111 99 8888 2222222222222222222222222222 5 1 9999999999999999999999 5 0 77 1 5 0 22222222 5 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333333 99 777 777 666 77 5 5 22222222 333 444444444444444444444444444444 77777777777777 5 000000000 1 77 77 5 5 55555555555 22222 77 77 5 666666 5 5 1 5 555 1 888888 7 9999 777 6 99999 555 5 5 5 4 5 5 77 5 5 000 5 77 1 99 55555 6666666666666 5 55 5 222 999 5 5 888888888888888888 888 33 66 888 66 5 5 888 5 77 66 66 4444 6 4 66 666666666 777 4 222 66 4 11111 4 8 4 4 4 5 5 8888888888 6 5555555555555555555555555555 888888 0 99 11 00000000 444 8 11 0 33333333 33 8 444 8 0 222 2 8888 1 5 5 88 111 88 5 88 5 3333 111 000 88 5 444444 1 1 5 111 88 88 5 1 88 5 5 1 88 1 88 111 5 22 66 88 999999 5 5 5 5 1 1 66 66666 1111111 88 000 22 5 44444444 2222222 3333 5 111 3333 88 88 88 5 5 5 88 5 5 111 5 1 5 5 1 5 66666 88 5 1 77777 88 999999999 1 1 88 11111111111 5 1 999999 99999999999999999 5 1 1 5 000000 1 5 4444 5555 4444 5 000 88 333 5 77777 1 88 1 5 33333333333 888888 5 2222222 5 5 55555555 5 1111 111 1 88 88 5 33 1 444444 33 8888 666666 444444444444444444444 6 11 5555 7 6 33 444444444444444 5 99 6 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6 6 7 99 77 222 2 3333 6 88888888 111 9 4444444444444444 9 333333 6 77777777777 4444 0 9 2222222222 66666 6 99 888888888 1 222222222222222222222222222222222222222222 6666666666666 1 1 2 999999 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 88 99 9 6 44 99 1 6 666 99 5555555555 5555555555555555555555555555555555555555555555555 1 5 5 77 0 5 7777777 5 0 5 0 777777777777777777777777 5 555555555 2 0 5 9999999999999999 66 3333333333 5 77 5 66 0 5 111111 5 5 5 11 1 11 11111111111111111111111111 9 5 1 5 11 5 5 1 1111111 33333333 5 444 66 5 77 5 0000000 5 5 5 88888 0 999999999999999 66 2222222 66 8 5 5 0 5 0
lowQualScore : .... . . . . ..... . . .. . ..... . .. ..... . . ....... .. . .. . ........... . .... ....... . .. . ........ ... . . ... ............ .. ....... . . .. . ... ... . . . . . ... .. . .... . . . . .... ... .. ... . . . . ... ... .. ... .. .................................. .. ... .. .. .. ... .. . . . . .. ... . . . ......... .. .... ............................ . . ...................... . . .. . . . ........ . ......................................................... ....... .. ... ... ... .. . . ........ ... .............................. .............. . ......... . .. .. . . ........... ..... .. .. . ...... . . . . ... . ...... . .... ... . ..... ... . . . . . . .. . . ... . .. . .. ..... ............. . .. . ... ... . . .................. ... .. .. ... .. . . ... . .. .. .. .... . . .. ......... ... . ... .. . ..... . . . . . . . .......... . ............................ ...... . .. .. ........ ... . .. . ........ .. . ... . . ... . .... . . . .. ... .. . .. . .... ... ... .. . ...... . . . ... .. .. . . .. . . . .. . .. ... . .. .. .. ...... . . . . . . .. ..... ....... .. ... .. . ........ ....... .... . ... .... .. .. .. . . . .. . . ... . . . . . . ..... .. . . ..... .. ......... . . .. ........... . . ...... ................. . . . . ...... . . .... .... .... . ... .. ... . ..... . .. . . ........... ...... . ....... . . ........ . .... ... . .. .. . .. . ...... .. .... ...... ..................... . .. .... . . .. ............... . .. . ................................................................................................... . . . .. .. ... . .... . ........ ... . ................ . ...... . ........... .... . . .......... ..... . .. ......... . .......................................... ............. . . . ...... .................................................... .. .. . . .. .. . . ... .. .......... ................................................. . . . .. . . ....... . . . . ........................ . ......... . . . ................ .. .......... . .. . .. . . ...... . . . .. . .. .......................... . . . . .. . . . ....... ........ . ... .. . .. . ....... . . . ..... . ............... .. ....... .. . . . . . .
lowQualScore : 4444 9 7 0 0 00000 0 0 99 1 66666 0 11 00000 1 4 9999999 11 4 11 4 11111111111 4 7777 9999999 4 66 4 11111111 222 4 3 888 000000000000 55 0000000 0 4 77 4 333 777 4 9 4 4 9 444 99 0 6666 0 0 0 0 5555 888 99 111 0 0 0 9 222 222 11 888 11 3333333333333333333333333333333333 22 888 11 99 00 888 99 0 1 4 0 99 888 7 3 7 555555555 22 5555 1111111111111111111111111111 7 4 6666666666666666666666 7 1 99 4 7 7 33333333 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777777 22 555 555 111 99 7 7 44444444 444 000000000000000000000000000000 00000000000000 7 000000000 4 99 99 7 7 77777777777 33333 99 99 7 444444 7 7 7 7 999 4 666666 6 3333 777 7 00000 999 7 7 7 3 7 0 99 7 7 000 7 99 4 33 77777 3333333333333 7 99 7 333 999 0 0 222222222222222222 888 88 99 888 99 0 0 888 0 11 11 11 6666 2 4 11 222222222 888 4 222 11 4 11111 4 9 4 4 4 0 7 9999999999 7 9999999999999999999999999999 666666 8 00 00 88888888 000 0 00 6 00000000 66 0 000 0 6 000 5 2222 2 5 0 00 000 55 5 55 5 0000 555 555 00 5 555555 0 0 0 555 55 55 5 0 00 5 5 0 00 0 00 555 5 00 55 00 000000 0 5 5 0 0 0 55 55555 5555555 00 555 00 5 55555555 5555555 5555 5 000 5555 00 55 00 0 0 0 55 5 0 000 5 0 5 5 0 0 55555 55 5 0 00000 00 000000000 0 0 00 55555555555 0 0 000000 55555555555555555 5 0 0 0 000000 0 0 0000 0000 5555 0 555 00 000 0 00000 0 55 0 5 55555555555 000000 0 5555555 0 5 55555555 0 5555 555 0 55 55 0 88 0 888888 88 2222 555555 444444444444444444444 7 77 8888 3 7 33 222222222222222 5 88 7 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 7 3 22 00 555 5 0000 7 22222222 222 3 5555555555555555 8 555555 7 00000000000 8888 8 8 5555555555 88888 7 22 000000000 0 333333333333333333333333333333333333333333 7777777777777 0 0 0 222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 22 8 7 00 22 0 7 888 22 1111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333 0 7 7 99 1 0 1111111 0 9 0 0 000000000000000000000000 0 444444444 5 2 0 8888888888888888 99 2222222222 0 55 0 99 7 4 111111 7 7 7 44 0 11 33333333333333333333333333 3 0 4 7 44 7 7 4 6666666 33333333 7 444 99 7 99 7 4444444 7 7 7 66666 1 111111111111111 99 6666666 99 8 0 0 1 0 0
consensus : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGG-A--AAG--TAGCACA---TT--T---TGAC----TG-CGAGA-------------T-A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGA-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGNCTAAAAT-A-GG-G----------------GAAA---TAT--A--A---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AA-----AA--T--AAGTATATA----ATATTACTGC--CGA--NAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACTC-TTTATGCTGAGCA-TATAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCNCTCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGCTTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGCATTG-ATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--TCAA----ATC-AA-GATA-GAGAAAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-AGC-GACA-A--G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGTATACA-T-TAG---A-ATGT-CG--A--TA--GCGAAAT---GAACGGA--T----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-GTCTCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAG-GAT-TGNTTAT---C----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGAAAGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A-AGAATGAA-GCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
Reference ( family-288 ) : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCN----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATAAAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGG-A--AAG--TANC------TT--T---TG------TG-CGAGA-------------T-A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGA-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGCCTAAAAT-A-GG-G----------------GAAA---TAT--A--A---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AA-----AA--T--ANGTATATA----ATATTACTGC--CAA--AAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGAC-C-TTTATGCTGAGCA-TATAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCNCTCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGCTTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGCATT--ATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--TCAA----ATT-AA-GATA-GAGAAAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-AGT-GACA-A--G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGTATACA-T-TAG---A-ATGT-CG--A--TA--GCGAAAT---GAACGGA--T----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-NTCTCAATTTG-TTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAG-GA--TGNTNAT---C----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGAAAGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A-AGAATGAA-NNTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
gi|1 : --A-T---AT--TTTTTTG-AGAGAAGATAGTG---GT-AGAAAAATT-AA------ATGG-T-AA-AGGCGG-C-GG-TT-G--T-TTTTGCAACCAA---CATGTTTT-TGTT---GGG--GACTGAAATGCGTTTT--CTCAACA-G-ATATGATCA-TTCTGAAATTT--AT-C-AATTTTT-GTG-CACAATTCAACA-AGAAACCATAATA-CGAAAAG-T-GATT-CTCCAAT---AGGC--TGCATTAC-TATTGTAAGTAATGCTAGTACGGAA--ATCACA--CAAT--------------------------AATAAGTCTATTATAGAAGCTTTT-GCATGGATAAGGACTTCATCGATCTGAGTCGATG--T-TGGTAGA---ATA-TAGA-GACGG------TGCATCAAATATGGTATTAAG----AC------T----------------G-CGAGAATGAGAGCTAATTT-A--T---TAT-TTTCAATTTTGGTGCCT-TGCCATGAAT--TGCACCTTACGATTATGTGACTCGCGTGTAA--AACTTTATAATC-TACTC-T--AAAAATT-ACATGTAA-T--ATTATGTTGCA-GTGTT--TAAGTCG--CTAAGTCT-TGAATATATAAAGCGCGTA-GATGG-AAATCGGTTATAAA--------------TTTCTAAATTCG---TA-A-GTAATGAAATCGTC--TCAG-T--GT--TAT-AAATA-ATCCAAGCGATGTTTGAGAATATTA--GCAAAT-C------TTAAGTAAAATATT-ACTTTCAATGTT-GAAATATTATATTAACTATCGGCCGTTT-T-CCA-TGTCCCTATTTGCATG-TA-T--GAGGTCCATTTAATAGTATCAATA-A-TCATGCAC-AA--AATGAAATCGTATATACGTAGTACGG-ACTACCT-TTTTAG-GGCAT-ATAGTGGCTAAAAT-A-GG-T----------------GAAA---TATTAA--A---TAA--TGA-TTATA---G-CTGTAG-GGAATG--GGAAGAA-TATTAGAAA-ACAATGAA--ATAAATTTAC-A---TACAAAGGT--AA-TCGAAAGTA-C-T-TTGA--GG-AATATAT-TC---------G-ATATTT-A-TA-------AAAACTTAA--T--ATGTATATAAACTATATTAAGGCATCGA--TAC-ATAA---ATT-GTA--TAATTTTTTTTCTTTTTAAAT-TTTACCAATG-AT-GACTC-TTGATGTTTA-CA-TAGAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGA--TGATTGACATTAATATAGGAGTCCGAG-ATTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGC-TATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGGCATTTGAACC-T-TTTATCACTGAGCAATAAATA-GTCA-ATGAAC-GATC-CG--T-GGGATAGAAA-ACTA-CATCGTTACACGAGAATTACAGTGGTC-AG-CAAATTGAGCAGCATATCTGTCATT-----T-TAGC--ATCGAATAGACAGGAATTATGCGAGAAATGTCCACA-CTTGTTTAAGGCGTCC-AAATATAATTGAGCT-TAAACACTGTGGAATCAATAGTATT--A-GATACGAG--AA--CT--TTGA-GTACAACATC--AATATTG-----TGGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTTGTATGATAAGTTCTGATGCAATA-G-TAGCTACTTTGGACAAGCTATTAAACT-CTAGTATTCACTATTAG--GC--CACACTTTCCACCA-A-T-GACACAACG-TT-ATAAGAAAATCGT--A--CTTCAGATAA-ATGTACAG-AAGGCCGCGTCTTCATAGTATTCTAGTCAATATGCA-TGTAGCTTA-GTGA-CGAAA--TAGTGCGAAAT---G-ACAGA--TAAC-CAAGAA--TTGAGTCCCC-TAGAACCAAATAATTGATGGAGAA--GAACTAGAT---CCTAGTAG---C---ATA----TTCTCGAGAGAAAG---------------CCTC--ATGGTTCAAA-AAAACCAATACATGAGACAATTTGCTCGC--AAGACCATA-TGCATGA-CTATCGCGC-AGGCCAC----CACTGGCGAATAGCCTTGATTAATGAAAGACACGTGTGTCA--TTGTTTGGAA--C-------A-TA-CTG--AAAAAA-AGT-----TACAAC-CCTAACC--AATCGTACCTGCTT---A-G-GACAGAGA--TGCTTGT------------------------T-TAATGA--GCAGTACTTTG-TTCGAACTGT--TG-ATTGT-A-CGGTTC----CA-ATTACCTT------T-A-AGAATTCA--ATAT-TCGAGGTCGAGGTTA---TGT-CACGTCTACTCCGTCAACGAAAACGCACAGATGTC-AAAATGTAAAA-GTACTGAC--CCTTGCATACTGATTTTTGCAGTTTGCTAAAAAAGTGTATGC
gi|10 : ggatatattttgCATGGGC-C--AGCAA-CACCC--CC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--CTTTTTCT----A-C--A-C----TGATTTTTTG-AAAG-------CGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGA-CGG--TT-G--T-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--CA----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-A-AATTGTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CC----G-T-G-TTCC----AT---A--C--CGTATTAC-T-TTGTA-TTAAAGC--AGAC-GAA--A---CA--CAACTGTTACAGACGAAACACAACTATTACAG-----TTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAA---------TTCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAA
gi|11 : cCATGGGTTC--AGAAAGCACATTACCT----CCCCCCC-CTCTG-GGG--ATTTTTCTCTCCA-CTAA-T---AT-ATTTTTT--AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-G--T-AA-A--CGA-C-G--GT-G--T-TT--------GA---CTATTCTAATGTT---GGA-------------GTTTT--CA----A-G-ATATGGTCA----------------------TTTT-G-GACA-AATTCAGCAT-GA--CTAT--TA-CT----G-T-G-TT-CCA--AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-GT--GGC---AACG---------CA--CCAC--------------------------A------C---------G---TTTCGCA--GAAA--GAC---ATCGAT--AAG-CAATACAT-T--TAGA---A
gi|12 : gacGGC-CCGAGTAA-CACATTACCTCCCCCCCCCCC-CTCTGTGGG--ATTTGTCA----A-C--A-CTTGATGATTATCTGCAGAA-------TGT--GT-ACGAAA--TTAACAGGTCA-GA-T-CA-A--CGC-A-G--TT-GA-T-TT--------GA----AATTTCTATGT----GGG--G---------CGTTTT--C-----AAG-ATATGATTA-TT-TGAA-TCTTGAT-C-AATTTTG-G-G-CA-AATTCAGTATAAA--CCCTC-TA-CT----GTT-G-TC-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-------TTAAGTC--AGA--GGA--A---CG--CAAT--------------------------AG-----CTT
gi|13 : cctCATTTTG-TTGGAT--A---------TA-CTG--AAAAAA-GCG-----T-CAAC-TA-AACCTGAACCGTACATTCTA---A-GAG-CAG-GA--TGGTTAT---CTACAAC-----A-----CCACCTGATGAAGAA-GTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTATTA-TGGTTCCAATAA-CCTGCCCT-ATTA-C-A-AGAATGGC-ACTAT--C-AG--C-AAGTTA---T-TTCA-G-CTA-TC-----ACA-GAGAGC-----TGT--AAAATGC--AA-CT----AT--CCCTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTA
gi|14 : ------TG-CAAGA-------------T-A--T---ATT-TTT-CATTG--GTGCCT-T--------------ACCTT-------------TC-C-----AT-A------------------T--A-----T-ACATGCAT-TATATTATG--GCA-T-GTGC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GTATATGATGT-A---TGGTT-C--A--------------TTTCTA----C-----ATA-GT-ATAA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----GTTA--AC--AG-CTGCAGGTT-AGT-AAATATA-ACTTTCAATG-T-AAATTA-----TTAATTACCGACAT-GT-
gi|15 : aaattaaagacCGAAAT---GAA--GA--TAATACAAT-A--TTGAGT-CCCCTAAAC--AAAT-AT--CTGG-GATAGGAAT---A----TTCAGGAA---AATGGGA----AC-T-------AGC---------------C--C--ATGATTC-TA-AAGACCAAAACAT--AACCATTTG-TCTC--AA-ACCACT-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----ATC--------AG---TGA-TAAGGAAA-ACATG-TT-TCAATat
gi|16 : tgtacgaacaTTTAACG-TA-TG-GAGGTCAA-TTAATG-TAT--ATG-A-TCA---AT-AA--AAAGAAAT-GG-----CAT-----GG-A----CTACTTTTA-AGTAT-A---TAACAAATAC-A-AA-A----------------GAAACCCTACTAA--A---TAA--TGA-CT-TATCGA-CTACTA-AAAGTC--AA--ACA-GA-TTAAAA-ACAATGAA--CTA-ATT--G-A---T-CAA---TTGAACT-----GAA-A-T-T--AT-GA-ag
gi|17 : CTCCCC-CTCTATGAG--ATTTTCTA----C-C--C-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA---------G-TAAA-A--CGC-C-A--TT-C--TCTT--------GA---CAATGTAT-TGTT---AGC--G---------C-TTTT--CCA---A-G-ATATAATCATTT-TGAA-TTT--AT-CAAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAct
gi|18 : gtaaatacataAATT--------TCAGGAAAATC---GGA----TT----------AA---------------C--CTCATGCTTG-TATAAGACCAAAACAT--GACTATTTG-TC-T--CA-ACCACA-TCTATGACCCATC-TGC-AGG---C----TAT--------AGCGATGA-TAAGGGAAAACATG-TCATCA--TTG---------A-------C-TG-CTGTAAAAAAC-GCG-----T-CAACTTA-AGCC--AACCagtgtagtgtg
gi|19 : aaCATGGGC-CC-AG-AA-C-CAATACC-----TCCCCCC--TCTA-GGG--ATGTTTCT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GTAAAAAAA--T-AA---------G-T-AA-A--CGA-CAG--TT-G--G-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---TGGCCG---------CGTTTT--C-----A-A-ATATtcg
gi|2 : accCGTGGGC-C--AGTA--CACATTACT-----CCCCCTCACTCTA-AGGGTATTTTTCA----AGC--A-T---ATGATTTTTTG-ACAG-------TGT--GT-AAAA----T-AA--------GG-T-AA-C--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAAATTTT-TGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT--GAA-TTT--ATGC-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGCATAAA--CCAT--TA-CG----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTA--T-TTGTA-GTAATGC--AGACGGAG--A---CA--CAAT--------------------------AG-----CTTTAT-ATAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CA-----T-T--TGGA---ATA-TAGAGGACGG------G--ATCA--TATGG-A--AAG--GACT------TT--T---TT------TGGCGAGA-------------TCA--T---TTT-TATTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---TATTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--CCT--A-----TTACATGTAAATA-ATTATG--GCA-G-GTGT-TAAGT-G--CT-AGTATGTGAATA---AA---GCGTACGATGATA---TGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TCCA-GT-ATGA------CG-TTTG-T--AT--AAT-ACACGTATG----------TTGA----ATTA--GA--AC-A------TT-AGT-AAATATT-ACTTC-AATG-TTAAAATAT----TTAATTGCTGGCTC-GT-T-CCA-TGTT----TTTGAATG-TAATG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATAGA-TCA---GC-AA--AT-GAACT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGCTTAAAAT-A-TG-G----------------GGAC---TAT--A--A---TAA--TGAATT-TA---GGCTGTAG-GGAATG--GG--GAA-TA-TAGAAACACA-TGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GG-AATAT---TT---------ATAT-TTT-A-TA-------AA-----AAATT--ATGTATATA----ATATTATTGC--CAT--GCT-A-AA---ATTTGTA--TA-TTTTTTTGTA-----AAG-TTT-C---TG-CT-GAC---TTTATGTTGA-----ATAGAAAATAAAA-ACC-AAGCAA--TCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTTT--CA-GTTC--CA-TC----AAT---AAATCA---CCATA--AAATA-TTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTGTA--AAGGATTTGAT-GACGATAATATAGG--TCCGAGAATTA-GAAGTAG--AGTCAC--AAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGATTGT--TATTCAA------AACGCATAC-TTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGG--TTTGA--C-T-TTTAT--CTGAGCACTG-ATA-G-AATATGAACGG--TGTG--T-G--------A-ATTA-CATGGTT-TGAGAGTATTACAGTGGTC-AG--AA--TGAG-AT--TATTTGTCATTTGATGT-TGG---AT------------AATTAT----------CCCA-AGCTTG-TTA------TA-AA-----A-TGA--T-TAAAC----TGG----------ATA-AA-GATA-GAGAGAA--CT--TTG--GTAGC-CATCAAAA-ATTTTTTTGTTGGTAAATTTCCAAAG-------GGCAAA--CTTG-TAT-AT---TTTTG-TGC---A-TGT-G-TAC--TGGACAAGATATTAAA-T-CTGTACTTCAC-ATT-G--GC--C---CTTTCAACAATAG--AACAGA--GTTT-A----AGAAT--T--A--CT----ATGA-A-AT-CAA-A--GGCGGGCTTTCATAGTATT------AGTATAGAGT-TAG---A-ATGT-CG--AATTG--GCGAAAT---G-ATAGA--T----CCAAGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--GAAT-AT--CTGGAGAA--GAAAT-AG----ATTACGAA---C---AAA----TT-TC----AAAAAAG-------------C--T--ATGATTC-TA-AAGACAGAAAT-T--GAACA-TCG-TC-C--AA-ACCATATTGCATGATCTATC-TGC-AGG--ACCGAGCACTGGGA---AG---TGA-TAAGAATAGAC-TA-TTCTC-ATTTGTTTGGAC--A-------GATA-CTG--AAAAAA-AGA-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCT----A-G-G-AAG-GA--TGCTG----------------------------TAATGGAGGAAGTACTTTG-TTCG-ACTGT--TGAATTGT-A-CGGTTC---TCA-ATTACCTT------T-A-AGAATTAA-GATAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-C--G-CTA-TC-----GCAAGAAAGC-----AGTCAAAAATGT--AA-GT----ACTGCCTTGCATA-TGA-TTT--CAG-TTGCT-AAAAAGTGTTTGCt
gi|20 : TAAAAT-A-GG-G----------------GAAA---TATG-A--A---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-ATAATG--GG--GCA-TT-TAAAAA-ACAATGAC--ATA-ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AAT
gi|21 : -AGAATA--GG--ACA--------AA-ACAGTGAA--AT--AAT--CTA---T-CAA---T--AA-C-----GTA-AAT-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------
gi|23 : AAATGT--AA-CT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TT-CTAAAAAAGTGTATGC
gi|3 : cGGC-C--AGTAA-C-CAT-ACC-----TCCCCCC-CTCTA-TGG--ATTT--CT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAGG------TGTAGGT-AACAAA--T-AA------A-GGGT-AACA--CGGAC-GAGTT-AGAT-TT--------GAG--CAATTCTTATGTT---GGG------------CGTTTC--A-----A-GTATATGAT-A-TT-GGAA-TT---AT-A-AATTTTT-G-G-CA-A-TTCAGAATAG---CCAT--AA-CT----G-T-G-TT-CC---AT---A--C--CGCATTACCT-TTGTA-TTAAAGG--GAAC-AAA--A---CAACCAAC--------------------------GG------TTTTA-AGAG---TTG-CCA--GAAA-GGAC---ATCGAT--GAG-CAATATATGT--TAGAGATATA-TAAAGGACAG----------TCA--TA-AG-ACGAAG--TAGC------CA--TGG-TGCATGGATG-CAAGAAT-----------T-T--T---TTT-TTTTCA-TT--G-GCCTATGCCA----T--TG-ACTAGA------------T---------T-AAC------ATCATA--T-T--A-----GAACATCAAA-T--TTTAT---GCATG-GTTTGCATGT-GGCTT-AGTAT-TGAAT----AA---GCGTAC-ATGA-A---CGG-T-C-AA---------------TTCTA---------TAAA-GT-ATGA------C--TTTGCT--AT--AATGACACA-ATC----------TTGA----AGTA--GC--ACGC------TT-AGT-AAA-ATATACTTCCAAT-------AGAT----GTAATTACTGGCAG-GT-TGCCATTGTCT---T---AATGATA-TG---GGCCAG-TTTACGTTAT--ATA-A-TCA---GC-CATGAA-GAAA--GTG----CGA-----CG-A----CT-CTTTGGAAGCAT-A-ACTTGCTAAAAT-A-GGTGTGAAATAATTAGTAGTGAAA---TAT--A--AATTTAA--TGA-TT------G-CGTTAGTTGAATGGTGG--GCATTA-TAG-AA-ACAATGAA--AT--AAT--T-AAGTT-CAA---T--AA-G-----TTA-A-TGTTGATAGA-AATAC-T-TC---------ATATATTTGA-TATTATAGTAA-----AA--A--AAG-ATA-A----ATATTA-TGC--CAA--AAC-G-AAATCATT-GTA--TA--TTTTTT--------AA--TGT-C---TG-TTAGACTC-TTTATGCTGAGCA-TATAAA
gi|3 : cgtcG--TTAGA--C-TCTTTATG-CTGAGCAT---ATA----A-ATGAGC----T-CG--T-G--------AGATTA--ATGGTT--GAAAGTAGTACAG-GGTCCAGAAAC--TTAG-AGA-TATTTGTC------CAT-TGGCTAATGGA---------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-TTA------TCGAA-----ATTGA----TAAAC----TGG-----A----ATCAAA-GATA-GAGAAAA--CTTGTTAGTGTAG-ATATC---A-ATT------TTGGTAA---TTCAAAGGCCATATGGCGAATTTTTG-TATGAT---TACTG-CTT--TATT-T-GCTAC--TGG--AAGCTGTTGAA-TGATGAGCTTCG--GTT-GTCGCGAC---C--TCGGCAA-A-C-AACA-A--G-TT-GT---AGAATC-TTCAATC-----ATAA-T-AT-CAGAA--GTCGA-CTTTCAT-GTATT------GGT------T-CAA---ACATGTACG--A--TA---CGAAATTCGGGAAGTAACT----TAA-GATTTTGGTC-CCC-TAGAC--AAGT-ATG-CTGGATAT--GAGTT-GAATATCTGAGATG---C---CAA----TC-TC----AAAAAATGGAGACTTACGCCT--C--ATGATTC-TA-AAGACAAATACAT--AACCATTTG-TC-CAAAA-ACCACA-TGTATGAT-CATC-TGC-AGA--------CAC--------A----TGA-TAAGGAAAAACAGG-GTCGCAATTTGTTTAGATGCG-------G-TATCTG--AAAAAA-AAGCCGTTC-CAAC-TA-AA-C--AACCGTACC-TCTAGTGA-G-G-GAG-GGT-TGTTAAT---CT---AC-----ACTAACC-AC-TGATGAAGATAG-ACTTT--------TTATG-TG-AGGAT-A-C-GTTC--ATCACGCTGCCCT-AT-T-C-A-ATAGAGAATGGCAT-TC--G--C-AGGTTA---T----A-G-CTA-CG-----ACAGGATGGT-----GGTT----TTGC---A-CT----AT--CC-TG-ATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAACGTGTATGCtgagctcgtgagattaatggttgaaagtagtacagggtccagaaacttagagatatttgtccattggctaatggaaattatcccaactcgttatcgaaattgataaactggaatcaaagatagagaaaacttgttagtgtagatatcaattttggtaattcaaaggccatatggcgaatttttgtatgattactgctttatttgctactggaagctgttgaatgatgagcttcggttgtcgcgacctcggcaaacaacaagttgtagaatcttcaatcataatatcagaagtcgactttcatgtattggttcaaacatgtacgatacgaaattcgggaagtaacttaagattttggtcccctagacaagtatgctggatatgagttgaatatctgagatgccaatctcaaaaaatggagacttacgcctcatgattctaaagacaaatacataaccatttgtccaaaaaccacatgtatgatcatctgcagacacatgataaggaaaaacagggtcgcaatttgtttagatgcggtatctgaaaaaaaagccgttccaactaaacaaccgtacctctagtgagggagggttgttaatctacactaaccactgatgaagatagactttttatgtgaggatacgttcatcacgctgccctattcaatagagaatggcattcgcaggttatagctacgacaggatggtggttttgcactatcctgatgtgattttgcagttgctaaaacgtgtatgcaa
gi|4 : cgtcggccagtaaccatacctccccccctctatggatttctacactatgattttttgaaaggtgtaggtaacaaataaagggtaacacggacgagttagatttgagcaattcttatgttgggcgtttcaagtatatgatattggaattataaatttttggcaattcagaatagccataactgtgttccataccgcattacctttgtattaaagggaacaaaacaaccaacggttttaagagttgccagaaaggacatcgatgagcaatatatgttagagatatataaaggacagtcataagacgaagtagccatggtgcatggatgcaagaatttttttttttcattggcctatgccattgactagattaacatcatattagaacatcaaattttatgcatggtttgcatgtggcttagtattgaataagcgtacatgaacggtcaattctataaagtatgactttgctataatgacacaatcttgaagtagcacgcttagtaaaatatacttccaatagatgtaattactggcaggttgccattgtcttaatgatatgggccagtttacgttatataatcagccatgaagaaagtgcgacgactctttggaagcataacttgctaaaataggtgtgaaataattagtagtgaaatataaatttaatgattgcgttagttgaatggtgggcattatagaaacaatgaaataattaagttcaataagttaatgttgatagaaatacttcatatatttgatattatagtaaaaaaagataaatattatgccaaaacgaaatcattgtatattttttaatgtctTGGGC-----GTAA-CACAT-ACT-----CCCCC----TCTA-GGG--ATTTTTCTT---A-C--A-T---ATGA--------------------------------A--T-AA---------G-T-AA----CTA-T-G--TTTG--T-TT--------GAACCCAATTTC-ATGTTTGGGAG--G---------CGTGTT--C-----AAG-ATATG--TA-TT--GAA-TTG--AT-C-AATTTTTTG-G-CA-A-TTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-TCG-TT-C----ATCATA--CGATG-ATTAT-A-TTGTA-TTAA------GA-GCAACTA---CA--CAG---------------------------AA-----TTATTC-AGAG---TTT-GCA--GAA--GGAC---ATCGAT--GTG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGG-A--AAG--TAGCACA---TTAAT---AGACT---TA-CAAGA-------------T-A--T---TTTATTTTCATTT--GGG----TGC------T--TG-CCCTTG------------CC-C---TAGTCAACT-----ATC-GAT-C-TGAA-----T--CATGT---CA-ATTATG--G---G-GTTC-TAA---------AGTAT-TGA-TA--------GCGTCTAATGA-----CGGTC----A--------------TTT-TA----C-----AAA-GT--TGA------C--TTTT-TTAAT--AAT-ACACA-AT-----------TTGA----ATTA--TC--AC-C------TT-AGT-AATAATA-ACTTCCAATG-T-AAAATGT----T-AAT----GGC---GTAT-CCA-TGTTC---TTTAAGTG-T--TG-GAGGCC-A-TTAATG-TAT--ATT-A-TC----GC-AC--AA-GAAGT-GG-----CGT-----TG-T----TT-CTTTGG--GCCT-A-CATGTA-AAAAT-AAGG-G----------------GAAA---TAT--ACAA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAG--A-AC-ATG-A--AT--AAT--T-A---A-CAA---T---A-T-----GTAGA-T-TTGAT-GA-AATATAT-TCTATTAATATATATATTT-A-AA-------AA-----AA--CAAAAAAAGATA----ATATC-CTGG--GGACGCGT-A-AA---ATT-GTATTTAATCTTTTT--------AATATTA-C---TGATTAGGC-CATTTAaa
gi|4 : TGCGT-G--T-CGAGTAG--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--AG--TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGG--TCAA-----TC-AA-GATA-G-GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GGTA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-AGTTGAC----------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGTATACA-----------ATGT-C-------A--GC---AT---GAATGGA--T-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TC----A--------------------------TGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAA----ACA-GTCTCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAG-GATTTGATTAT---C----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGAAGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA-AGAATGAA--CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCatttgttaggtgcgtgtcgagtagaattatggttatggagtttagtggtagacaagaagtatttgtctttatgttggcatattgccactggtataaatgattaactggtcaatcaagataggaaaacttattgttagcatgtaatttggtattaaaggattgatatatttttgcgctattgtacgcgaaagctttgacttgcttgcttggttgtcggcaaagttgacgattctaataattaagacgtgcttcatagtttgggtatacaatgtcagcatgaatggataatgattggtcctgaaaattgtatgtaggtgattgacttagggatgggatgctttcatgtttctaaaagacaaaacatgactttgtctacatgcatgatctatctgctaggacccagtgataaggaaacagtctcaatttgttggatgtctgaaaaagcggatcaataaacaatccgtaactctaagggcaggatttgattatcatacacaacactgatgaagaagatctctgactcgattgtcatgattatatcggttcatcactgccctaatacaaagaatgaactataacagcaggttaattttcagctctcacaagaaggagttttgtgtaacatatccttgtgtgattttgcagttgctcacaaagtgtatgcata
gi|5 : tgggcgtaacacatactccccctctagggatttttcttacatatgaataagtaactatgtttgtttgaacccaatttcatgtttgggaggcgtgttcaagatatgtattgaattgatcaattttttggcaattcagtatagccattactgtcgttcatcatacgatgattatattgtattaagagcaactacacagaattattcagagtttgcagaaggacatcgatgtgcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacattaatagacttacaagatattttattttcatttgggtgcttgcccttgccctagtcaactatcgatctgaatcatgtcaattatggggttctaaagtattgatagcgtctaatgacggtcattttacaaagttgacttttttaataatacacaatttgaattatcaccttagtaataataacttccaatgtaaaatgttaatggcgtatccatgttctttaagtgttggaggccattaatgtatattatcgcacaagaagtggcgttgtttctttgggcctacatgtaaaaataaggggaaatatacaataatgatttagctgtagagaatggggcatatagaacatgaataattaacaatatgtagatttgatgaaatatattctattaatatatatatttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatttgttaggGACGAAA--A---CA--CA-C--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGG-A--AAG--TAGCACAATATA--T---TGAC----TG-CAAGA-------------T-A--TATTTTT-TTTTCGTTT--GTGCCT-TGCCAT---T---G-ACC---------------------------GAGCTT---A--------------------ACATGCGA-T----TATG--GCA-G-G----------G--CT-ATTAT--GAATA---AA---GC-----------------TT-T-AAA-------------TTTCTA----CAAAGTACATGT-ATGA------C--TTTG-T--AC--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATGT----T-AATTACTGGCAG-TT-T-CCA-TGTCT---TT--AATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATG-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAG-GTG----TGT-----GGGA----CT-CTTTAG-AGCAT-A-CATGC-TAAAAT-A-GG-G----------------GATA---TAGG-A--A---TAC--TGA-TT-TA---G-CGTTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT---TT--CAA---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------TTATATTT-A-T----------------A--T--AAG-ATA-A----ATA-TACTGC--CAA--AATAA-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGAC-CTTTTAT-CTGGGCATTATATGAAATGAata
gi|5 : G--TTAGA--CCT-TTTAT--CTGGGCATT--ATATG-AA-ATGAGT-G--T-TG--T-GTTAG----A-ATTAACATGGTT--GAGAGTATTACAGTAGTC-AGA--A--TGAG-AT--T-TTTGTCATTT-ATGTATGG---A-------------AATTAT----------CCGA-A-CTC--ATA------TC-AA-----AATGA--TATAAAC----TGG-----A----ATC-AAAGATA-GAGAGAAGACTT--TG---TAGCATATC--AA-AAT------TTGGTAAA-TTCCAAAGAA-----GGCGGA--CTTGA-ATA-----TTCTA-CGCA-TA-T-T-GCTAC--T-GACAAGC-ATTAAA-T-CTGCA-TTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCCGCCA------ACA-A--G-TTGA----AGAATC-T--A--CA----ATAATA-AT-CAG-A--AAGGGGACTTCATAGTATT------GGTAgtgttgtgttagaattaacatggttgagagtattacagtagtcagaatgagatttttgtcatttatgtatggaaattatccgaactcatatcaaaatgatataaactggaatcaaagatagagagaagactttgtagcatatcaaaatttggtaaattccaaagaaggcggacttgaatattctacgcatattgctactgacaagcattaaatctgcattcgcattggccctttccgccaacaagttgaagaatctacaataataatcagaaaggggacttcatagtattggta
gi|6 : gacgaaaacacacagcttttaagagtttgcagaaaggacatcgatgagcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacaatatattgactgcaagatatatttttttttcgtttgtgccttgccattgaccgagcttaacatgcgattatggcagggctattatgaataaagctttaaatttctacaaagtacatgtatgactttgtacaatacacaatcttgaattagcaccttagtaaatataacttccaatgtaaaatgttaattactggcagtttccatgtctttaatgtatggaggcccattaatgtatataatcagcaaaagaaaggtgtgtgggactctttagagcatacatgctaaaataggggatataggaatactgatttagcgttagagaatggggcatatagaaaacaatgaaatttcaatcaataatgtaatttgatgaaatatattcttatatttatataagataaatatactgccaaaataaaaattgtataatttttttaattttct-G--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--AG--TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGG--TCAA-----TC-AA-GATA-G-GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GGTA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-AGTTGAC----------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGTATACA-----------ATGT-C-------A--GC---AT---GAATGGA--T-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TC----A--------------------------TGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAA----ACA-GTCTCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAG-GATTTGATTAT---C----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGAAGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA-AGAATGAA--CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGC
gi|7 : GCTTTAAC-----G-G-AGAAGATCA-TT-TGAA-TT---AT-CCAATCTTT-GCG-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TATCT----G-T-G-TC-C----AT---A--C---GCATTAC-T-TTGTA-TTAATGC--GGACC-AA--A---TA--CAAC--------------------------AGG----CTTTTA-AGAG---TT--GCA--GAAAAGGAC---ATCGAT--GAG-CAA-ACAT-T--TAGA---ATAGTAGAAGACAGTACGGCT--ATCA--TATGG-G--AAATTTAGCACA---CT--TACATGAC----TG-CAAGA-------------T-ATTT---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAA---T--TG-ACC
gi|8 : T-G--CT-AG-AT-TGGATA---AA---GTGTTCCATNN-N---NNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTA----C----AAAC-GT-ATGA------CGGTTTGGT--ATTTAAT-ACGCA-ATC----------TTGA-----TTAAGGC--AC-C------T--AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-ACAA-AT----T--ATTAC--------T-A-CCT-TGT-C---TTTG-ATG-TA-TGAGGGGACCA-TTAACTGTAT--ATA-ATTCA---GCAAA--AA-GGAAC-GT-----CGT-----AG-A----C--CTTTGG-AGTATCA-AGTGGCTAAAATCA-GGCG----------------GAAA---TCT--G--A---TAGATTGA-TT-TA---G-TTGTAG--GAATG--GG--GTA-TA-TTAGAA-ACAATGAATTAC--ATT--A-A---T-CAGT--T--AA-T-----GTA-ATT-TTGAT-GACAATATATATC----------TATATTT-AGTA-------AA-----AA--ccgcgcttacatttgcgaacgtcatggccgcaggataattgatatagaaactgcgttaccgatcgaaggtttatttacaatctattctaatacaaagtacatagtgttaaaatgatgcttatgtattagacaatgttactaacaatcattgaat
gi|9 : TG-TC-T--AA-ACCACA-TACATGACTCATC-CGC-AGG---C----CAC--------CGA--TGA-TAAGGAAAG-CAC---TCTCA---T--TTGGAC--ATACAAATG-TA-ATG--TAAAAG-CGT-----T-AAAC-TT-AACC--AACC------TCCA-----G-G-CAG-GA--TGGTTATGTCT----AC-----AACAA-C-ACCTAATGAAGAA-GTACTTTA-CTCG-ATATT--TG-ATAAG-A-CAGCTCCAATCG-ACTGCCCT-AT-AAC-AGAAAATGCC-ACTGT-TC-AG--T-AGAATA---T-T-CA-G-CTA-TTTTAATACAAGAAG-C-----TATC-AAATTTT--AA-CT----AT--CCTCCCATG-TGA-TTTGGCAG-TTGCT-AAAAAGTTTATGC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): ATCATATGGAGAGTAGCACATTACATGACTGCAAGATAAATATTTATTCATT
Unaligned ( gi|24 ): CAAGTGAGTTCAGTACATCATGGAAAGGCAAATGTAACTATCC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 2222222222222222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1 22222 1 111111111111111 1111111 33333333333 1111111 11 11111111 111 222222222222 2222222 11 111 111 222 11 1111 2222 111 111 5555555555555555555555555555555555 11 333333333 444444444444 3333333333333333333 22222222 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222222 111 11111 111111 55555555555555555555555555555 33333333333333 222222222 1 22222222222 11111 11111111111 1 11111 1111111 11111 11 11 111 1 22222 11111 1111 111 1 333333333333333333 33 111111 2222222222 33333333333333333333333 1 222222 111 1 11 1 111 11 1 1 1111 55555 55 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 7777777777 4 55 4 99999999999999999 55 2222222 4 4 44 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 44 4 11 00000 55 3333333333333333333333333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 55 55 111 1 11 22222 222222222222222 222 3333 1 11 11 11111 1 2 2222222222 111 111 22 11 1111 33333 1 1111 1111 1 222 2222 22222222 222 3333333333333333 222222 11111111111 111 1 2222222222 11111 222222222 888888888888888888888888888888888888888888 2222222222222 1 111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777 22 111111 2222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111 1111 1111111 1 555555555555555555555555 22222222 1 3333333333333333 2222222222 1 222222 8888888888888888888888888888888888888 11 1 22 1 2222222 4444444444444 222 11 2222222 22222 222222222222222 1111111 2
lowQualScore : 6666 3 5 5 2 00000 5 0 66 00 666666666666666 1 4 8888888 66 4 66 4 00000000000 4 9999 2222222 4 00 4 66666666 222 7 7 777 555555555555 55 4444444 4 4 11 4 333 111 4 8 4 4 1 222 11 5 0000 5 5 5 5 2222 888 66 777 5 5 5 5 222 555 66 777 66 4444444444444444444444444444444444 55 888 55 66 66 888 66 5 0 1 5 66 888 5 2 0 000000000 77 888 77 0 5 333333333333 5 2 8888888888888888888 888 5 77 1 5 0 22222222 5 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33333333 99 777 777 666 77 5 5 0 77777 555555 44444444444444444444444444444 77777777777777 5 000000000 1 77 77 5 5 55555555555 22222 77 99999999999 5 77 5 1 1 5 77777 7 9999999 6 99999 555 5 5 00 5 5 00 77 5 5 000 5 77 1 99 55555 44444 5 7777 55 5 222 6 0 0 888888888888888888 888 00 888 66 5 5 888 5 77 66 0 66 6 4 0 66 8 555555 4 66 55 4 8 4 4 4 5 5 6666666666 8 99999999999999999999999 5 3 99 2 000000 777 0 33 5 777 99 0 3 2 6 7777 4 11111 55 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 0 9999999999 0 1 55 0 1 66666666666666666 6 22 1 55 1111111 0 6 6 0 1 1 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 66 6 0 1 22 1 6 00000 6 55 6 1 1111111111111111111111111 1 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 55 55 1 777 3 22 66666 111111111111111 8 888 0000 0 00 0 88 33333 0 8 0 0 8 8 8888888888 555 8 444 33 00 99 6 7 4444 99999 3 4444 9999 99 3 222 2 3333 6 11111111 6 111 9 4444444444444444 9 333333 6 77777777777 555 0 9 2222222222 66666 6 99 888888888 1 3 222222222222222222222222222222222222222222 6666666666666 1 1 2 999999 11111111111111111111111111111111111111111111111111 88 99 9 00 99 1 444444 99 5555555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 1 5 5 1111 5 7777777 5 0 5 0 777777777777777777777777 5 55555555 5 0 9 0 9999999999999999 66 3333333333 5 77 5 66 0 5 111111 5 5 0000000000000000000000000000000000000 44 5 1 5 11 5 5 1 1111111 2222222222222 5 000 66 5 77 5 0000000 5 5 5 88888 0 999999999999999 66 2222222 66 8 5 5 0 5 0
lowQualScore : .... . . . . ..... . . .. .. ............... . . ....... .. . .. . ........... . .... ....... . .. . ........ ... . . ... ............ .. ....... . . .. . ... ... . . . . . ... .. . .... . . . . .... ... .. ... . . . . ... ... .. ... .. .................................. .. ... .. .. .. ... .. . . . . .. ... . . . ......... .. ... .. . . ............ . . ................... ... . .. . . . ........ . ....................................................... ........ .. ... ... ... .. . . . ..... ...... ............................. .............. . ......... . .. .. . . ........... ..... .. ........... . .. . . . . ..... . ....... . ..... ... . . .. . . .. .. . . ... . .. . .. ..... ..... . .... .. . ... . . . .................. ... .. ... .. . . ... . .. .. . .. . . . .. . ...... . .. .. . . . . . . . .......... . ....................... . . .. . ...... ... . .. . ... .. . . . . .... . ..... .. . .................................................................... . . . .......... . . .. . . ................. . .. . .. ....... . . . . . . .. ...................................................................................................................................................... .. . . . .. . . ..... . .. . . ......................... . . ............................................................................................................................................................................................................................................................................................. .. .. .. . ... . .. ..... ............... . ... .... . .. . .. ..... . . . . . . .......... ... . ... .. .. .. . . .... ..... . .... .... .. . ... . .... . ........ . ... . ................ . ...... . ........... ... . . .......... ..... . .. ......... . . .......................................... ............. . . . ...... .................................................. .. .. . .. .. . ...... .. .......... ............................................... . . . .... . ....... . . . . ........................ . ........ . . . . ................ .. .......... . .. . .. . . ...... . . ..................................... .. . . . .. . . . ....... ............. . ... .. . .. . ....... . . . ..... . ............... .. ....... .. . . . . . .
lowQualScore : 4444 9 7 0 0 00000 0 0 99 22 888888888888888 1 4 9999999 11 4 11 4 11111111111 4 7777 9999999 4 66 4 11111111 222 4 3 888 000000000000 55 0000000 0 4 77 4 333 777 4 9 4 4 9 444 99 0 6666 0 0 0 0 5555 888 99 111 0 0 0 9 222 222 11 888 11 3333333333333333333333333333333333 22 888 11 99 00 888 99 0 1 4 0 99 888 7 3 7 222222222 99 000 99 7 1 111111111111 0 0 4444444444444444444 888 0 99 4 7 7 33333333 7 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00000000 22 555 555 111 99 7 7 1 11111 777777 00000000000000000000000000000 00000000000000 7 000000000 4 99 99 7 7 77777777777 33333 99 44444444444 7 44 7 4 4 0 11111 6 0000000 7 00000 999 7 7 00 3 7 99 99 7 7 000 7 99 4 33 77777 33333 7 9999 99 7 333 6 4 0 222222222222222222 888 66 888 99 0 0 888 0 11 11 1 22 2 4 8 11 9 000000 4 11 22 4 9 4 4 4 0 7 4444444444 0 99999999999999999999999 5 2 88 0 222222 555 0 88 5 555 22 0 2 8 7 3333 7 00000 00 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0000000000 0 0 00 0 0 00000000000000000 0 00 0 00 0000000 0 0 0 0 0 0 00 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 0 0 0 00 0 0 00000 0 00 0 0 0000000000000000000000000 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 00 00 0 777 3 00 55555 222222222222222 0 666 6666 6 66 8 00 00000 0 0 8 4 0 0 4444444444 666 0 222 00 88 22 7 3 2222 77777 3 2222 0000 22 8 555 5 0000 7 55555555 7 222 3 5555555555555555 8 555555 7 00000000000 888 8 8 5555555555 88888 7 22 000000000 0 2 222222222222222222222222222222222222222222 7777777777777 0 0 0 222222 88888888888888888888888888888888888888888888888888 55 22 8 77 22 0 555555 22 1111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333 0 7 7 6666 0 1111111 0 9 0 0 000000000000000000000000 0 11111111 0 2 4 1 8888888888888888 99 2222222222 0 55 0 99 7 4 111111 7 7 6666666666666666666666666666666666666 44 0 4 7 44 7 7 4 6666666 1111111111111 7 999 99 7 99 7 4444444 7 7 7 66666 1 111111111111111 99 6666666 99 8 0 0 1 0 0
consensus : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACAT----TA--N---TGAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-C-T------AT-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CTA-GTAT-TGAATA----AAGCG--TACGATGN-A---CGGTT-TAA--------------TTTCTA----C----TANA-GTA-TGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GCA--C-C------TTA-GTAAA-TATA-ACTTCCAATGT-AAAATATT----TAATTACCGGCAGGT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCATT-AATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-ACT----CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCTAAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GGGCA-TATAGAAA-ACAATGAA--AT-ATTC-A---TCAA-T--AA-TGTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T--AAG-ATATAATATTACTGCCAA--AAT-AAA---ATT-GTA--TAATTTTTTT---AAT-TTTCTG-TTAGACCNTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAA-ACC-AAGCAA--TCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTTT--CA-GTTC--CA-TC----AAT---AAATCA---CCATA--AAATA-TTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTGTA--AAGGATTTGAT-GACGATAATATAGG--TCCGAGAATTA-GAAGTAG--AGTCAC--AAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGATTGT--TATTCAA------AACGCATAC-TTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGGTTAGAC-T-TTTAT-CTGAGCATTGATA-GAA-ATGAGC-GT-CG--T-G----A-ATTA-CATGGTTATGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAATGAGAG-TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT---AATTATCCCAA-CTCGNTATC-AAATTGA--T-TAAAC----TGG---AATCAA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGG-TAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTACT--GGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGTATACA-T-TAG---A-ATGT-CGAA-TAG--CGAAAT---GAACGGA--T----CAATGA--TTGAGTCCC-TAGAA--AANTA--T-N-TGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TCAA----AAA---------------CC--ATGNTTCTA-AAGA-CCAAAACATGA--CCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGAT-AAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGAAGGTACTTTG-CTCGA-CTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
Reference ( family-288 ) : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACAT----T---T---TGAC-TGCGAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-C-T------AT-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CTA-GTAT-TGAATA----AAGCG--TACGATGA-A---CGGTT-TAA--------------TTTCTA----C----TANA-GTA-TGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GCA--C-C------TTA-GTAAA-TATA-ACTTCCAATGT-AAAATATT----TAATTACCGGCAGGT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCATT-AATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-ACT----CTTTGG-AGCAT-A-AGTGNCTAAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GGGCA-TATAGAAA-ACAATGAA--AT-ATTC-A---TCAA-T--AA-TGTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T--AAGTATATAATATTACTGCCGA--NAT-AAA---ATT-GTA--TAATTTTTTT---AAT-TTTCTG-TTAGACTCTTTATGCTGAGCA-TATAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCNCTCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGCTTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGGTTNGAC-T-TTTAT-CTGAGCATTGATA-GAA-ATGAGC-GT-CG--T-G----A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAATGAGAG-TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT---AATTATCCCAA-CTCGNTATC-AAATTGA--T-TAAAC----TGGTCAAATCAA-GA----TAGA---GAAAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGG-TAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTACT--GGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGTATACA-T-TAG---A-ATGT-CGA--TAG--CGAAAT---GAACGGA--T----CAATGA--TTGAGTCCC-TAGAA--AANTA--T-N-TGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TCAA----AAA---------------CC--ATGNTTCTA-AAGA-CCAAAACATGA--CCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGAT-AAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGAAAGTACTTTG-CTCGA-CTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
gi|1 : --A-T---AT--TTTTTTG-AGAGAAGATAGTG---GT-AGAAAAATT-AA------ATGG-T-AA-AGGCGG-C-GG-TT-G--T-TTTTGCAACCAA---CATGTTTT-TGTT---GGG--GACTGAAATGCGTTTT--CTCAACA-G-ATATGATCA-TTCTGAAATTT--AT-C-AATTTTT-GTG-CACAATTCAACA-AGAAACCATAATA-CGAAAAG-T-GATT-CTCCAAT---AGGC--TGCATTAC-TATTGTAAGTAATGCTAGTACGGAA--ATCACA--CAAT--------------------------AATAAGTCTATTATAGAAGCTTTT-GCATGGATAAGGACTTCATCGATCTGAGTCGATG--T-TGGTAGA---ATA-TAGA-GACGG------TGCATCAAATATGG-------------TAT----T---A---AGAC-TGCGAGAATGAGAGCTAATTT--A--T---TAT-TTTCAATTTTGGTGCCT-TGCCATGAAT--TGCACCTTACGATTATGTGACTCGCGTGTAA--AACTTTATAATC-TA-C-TCTAAAAATTACATGTAA-TA--TTATGTTGCA-GTGTT--TAAGTCG--CTAAGTCT-TGAATATATAAAGCGCGTA-GATGG-AAATCGGTTATAAA-------------TTTCTAAATTCG---TA-A-GTAATGAAATCGTC--TCAG-T--GT--TAT-AAATA-ATCCAAGCGATGTTTGAGAATATTA--GCAAAT-C------TTAAGTAAAATATT-ACTTTCAATGTTGAAATATTATATTAACTATCGGCCGTT-TTCCA-TGTCCCTATTTGCATG-TA-TG--AGGTCCATTTAATAGTATCAATA-A-TCATGCAC-AA--AATGAAATCGTATATACGTAGTACGG-ACTACCTTTTTAG-GGCAT-ATAGTGGCTAAAAT-AGG-T----------------GAAA---TATTAAA---TAA--TGA-TTATA---G-CTGTAG-GGAATG--GGA------AGAA-------------T-ATT---------A-G--AA----A-A-C---AAT-GA-AATAAAT-TT---------ACATA
gi|1 : ggatatattttgAATTGAGCT-TAAACACTGTGG---AATCAA-TAGTATTAGATACGAGAA--CTT--TGA-GTACAACATC--AATATT------GTGGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTTGTATGATAAGTTCTGATGCAATA-G-TAGCTACTTTGGACAAGCTATTAAACT-CTAGTATTCACTATTAG--GC--CACACTTTCCACCA-ATGA-CACA-ACG-TT-ATAAGAAAATCGT--A--CTTCAGATAA-ATGTACAG-AAGGCCGCGTCTTCATAGTATTCTAGTCAATATGCA-TGTAGCTTA-GTGA-CGAAATAGTGCGAAAT---GA-CAGA--TAAC-CAAGAA--TTGAGTCCCCTAGAACCAAATAATT-GATGGAGAA--GAACTAGAT---CCTAGTAG---C---ATA----TTCTCGAGAGAAAG---------------CCTCATGGTTCAA-AAAAACCAATACATGAGACAATTTGCTCGC--AAGACCATA-TGCATGA-CTATCGCGC-AGGCCAC----CACTGGCGAATAGCCTTGATTAATGAAAGACACGTGTG-TCA--TTGTTTGGAA--C-------A-TA-CTG--AAAAAA-AGT-----TACAAC-CCTAACC--AATCGTACCTGCTT---A-G-GACAGAG-A-----TGCTTGTT----------------------TAATGAGCA--GTACTTTG-TTCGAACTGT--TG-ATTGT-A-CGGTTC----CA-ATTACCTT------T-A----AGAATTCAA--TAT-TCGAGGTCGAGGTTA---TGT-CACGTCTACTCCGTCAACGAAAACGCACAGATGTC-AAAATGTAAAA-GTACTGAC--CCTTGCATACTGATTTTTGCAGTTTGCTAAAAAAGTGTATGCcaaaggtaatcgaaagtactttgaggaatatattcgatatttataaaaacttaatatgtatataaactatattaaggcatcgatacataaattgtataattttttttctttttaaattttaccaatgatgactcttgatgtttacatagaaaaaataaaatacccaagcaacatcttaaatctgtaaagaacattctctttatcaagctcaacaatcgggaaatttaaaatcgtccccatacaaaataatttgaatcgctgtaaattaaaatttgacaacagaaatttgtataaaggatgattgacattaatataggagtccgagattatgtagtaggaagtctctcaaggtactagtcaaaagaaaggattgtgttattcaggttgagaacgcataccttccattggtggtgctatgtcaattccacacatacttgattaattgaaaacctaaaattaagataatgaggtaggaagagcagagaggtacaaccgttgagtgaggaagtgaacaggagagagacaatttgagtagactaagaagatgtaagagacgttcttaagttaacgcactgtgttcaacttttattaccgatccggacagaagtgtctgattcgagtaattaagaacgtatagaaggacaatggagcgaaacggaactagctaacgttaaaaaacaaaaacgaacaaaattcgaaaagcaagaaaaaaaaataagtaaaaaaaaatgtaaaaaaaaccttccaagaaaataaacacccacccctaaaacacacacacactcgtccacgcgaaccagaattgcccgcgtgatacaaatccctagcatgttcgctttgcaatgctgcagcagtgattatgatttattaatataatctagaaaataatacgagaaatatatatctgattttgttctgaccaaaggaggtgttaatattcttcatatttacgtgtgaagaaaaaaacttcatctgttgtcgttctttttcgcgaatgagaaagagtgcacataagtaactcaaagaaactgaaagacataaaccaaatccagaaatgctctgaaaaaatcaaagtgagtttttgagcatctaatggaaaggcatttgaaccttttatcactgagcaataaatagtcaatgaacgatccgtgggatagaaaactacatcgttacacgagaattacagtggtcagcaaattgagcagcatatctgtcattttagcatcgaatagacaggaattatgcgagaaatgtccacacttgtttaaggcgtccaaatataattgagcttaaacactgtggaatcaatagtattagatacgagaactttgagtacaacatcaatattgtgggtaaattccaaagggcgaactttgtatgataagttctgatgcaatagtagctactttggacaagctattaaactctagtattcactattaggccacactttccaccaatgacacaacgttataagaaaatcgtacttcagataaatgtacagaaggccgcgtcttcatagtattctagtcaatatgcatgtagcttagtgacgaaatagtgcgaaatgacagataaccaagaattgagtcccctagaaccaaataattgatggagaagaactagatcctagtagcatattctcgagagaaagcctcatggttcaaaaaaaccaatacatgagacaatttgctcgcaagaccatatgcatgactatcgcgcaggccaccactggcgaatagccttgattaatgaaagacacgtgtgtcattgtttggaacatactgaaaaaaagttacaaccctaaccaatcgtacctgcttaggacagagatgcttgtttaatgagcagtactttgttcgaactgttgattgtacggttccaattacctttaagaattcaatattcgaggtcgaggttatgtcacgtctactccgtcaacgaaaacgcacagatgtcaaaatgtaaaagtactgacccttgcatactgatttttgcagtttgctaaaaaagtgtatgc
gi|10 : ggatatattttgatatttttttgagagaagatagtggtagaaaaattaaatggtaaaggcggcggttgtttttgcaaccaacatgtttttgttggggactgaaatgcgttttctcaacagatatgatcattctgaaatttatcaatttttgtgcacaattcaacaagaaaccataatacgaaaagtgattctccaataggctgcattactattgtaagtaatgctagtacggaaatcacacaataataagtctattatagaagcttttgcatggataaggacttcatcgatctgagtcgatgttggtagaatatagagacggtgcatcaaatatggtattaagactgcgagaatgagagctaatttattattttcaattttggtgccttgccatgaattgcaccttacgattatgtgactcgcgtgtaaaactttataatctactctaaaaattacatgtaatattatgttgcagtgtttaagtcgctaagtcttgaatatataaagcgcgtagatggaaatcggttataaatttctaaattcgtaagtaatgaaatcgtctcagtgttataaataatccaagcgatgtttgagaatattagcaaatcttaagtaaaatattactttcaatgttgaaatattatattaactatcggccgttttccatgtccctatttgcatgtatgaggtccatttaatagtatcaataatcatgcacaaaatgaaatcgtatatacgtagtacggactacctttttagggcatatagtggctaaaataggtgaaatattaaataatgattatagctgtagggaatgggaagaatattagaaaacaatgaaataaatttacatacaaaggtaatcgaaagtactttgaggaatatattcgatatttataaaaacttaatatgtatataaactatattaaggcatcgatacataaattgtataattttttttctttttaaattttaccaatgatgactcttgatgtttacatagaaaaaataaaatacccaagcaacatcttaaatctgtaaagaacattctctttatcaagctcaacaatcgggaaatttaaaatcgtccccatacaaaataatttgaatcgctgtaaattaaaatttgacaacagaaatttgtataaaggatgattgacattaatataggagtccgagattatgtagtaggaagtctctcaaggtactagtcaaaagaaaggattgtgttattcaggttgagaacgcataccttccattggtggtgctatgtcaattccacacatacttgattaattgaaaacctaaaattaagataatgaggtaggaagagcagagaggtacaaccgttgagtgaggaagtgaacaggagagagacaatttgagtagactaagaagatgtaagagacgttcttaagttaacgcactgtgttcaacttttattaccgatccggacagaagtgtctgattcgagtaattaagaacgtatagaaggacaatggagcgaaacggaactagctaacgttaaaaaacaaaaacgaacaaaattcgaaaagcaagaaaaaaaaataagtaaaaaaaaatgtaaaaaaaaccttccaagaaaataaacacccacccctaaaacacacacacactcgtccacgcgaaccagaattgcccgcgtgatacaaatccctagcatgttcgctttgcaatgctgcagcagtgattatgatttattaatataatctagaaaataatacgagaaatatatatctgattttgttctgaccaaaggaggtgttaatattcttcatatttacgtgtgaagaaaaaaacttcatctgttgtcgttctttttcgcgaatgagaaagagtgcacataagtaactcaaagaaactgaaagacataaaccaaatccagaaatgctctgaaaaaatcaaagtgagtttttgagcatctaatggaaaggcatttgaaccttttatcactgagcaataaatagtcaatgaacgatccgtgggatagaaaactacatcgttacacgagaattacagtggtcagcaaattgagcagcatatctgtcattttagcatcgaatagacaggaattatgcgagaaatgtccacacttgtttaaggcgtccaaatatCATGGGC-C--AGCAA-CACCC--CC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--CTTTTTCT----A-C--A-C----TGATTTTTTG-AAAG-------CGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGA-CGG--TT-G--T-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--CA----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-A-AATTGTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CC----G-T-G-TTCC----AT---A--C--CGTATTAC-T-TTGTA-TTAAAGC--AGAC-GAA--A---CA--CAACTGTTACAGACGAAACACAACTATTACAG-----TTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAA---------TTCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAA
gi|11 : cCATGGGTTC--AGAAAGCACATTACCT----CCCCCCC-CTCTG-GGG--ATTTTTCTCTCCA-CTAA-T---AT-ATTTTTT--AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-G--T-AA-A--CGA-C-G--GT-G--T-TT--------GA---CTATTCTAATGTT---GGA-------------GTTTT--CA----A-G-ATATGGTCA----------------------TTTT-G-GACA-AATTCAGCAT-GA--CTAT--TA-CT----G-T-G-TT-CCA--AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-GT--GGC---AACG---------CA--CCAC--------------------------A------C---------G---TTTCGCA--GAAA--GAC---ATCGAT--AAG-CAATACAT-T--TAGA---A
gi|12 : gacGGC-CCGAGTAA-CACATTACCTCCCCCCCCCCC-CTCTGTGGG--ATTTGTCA----A-C--A-CTTGATGATTATCTGCAGAA-------TGT--GT-ACGAAA--TTAACAGGTCA-GA-T-CA-A--CGC-A-G--TT-GA-T-TT--------GA----AATTTCTATGT----GGG--G---------CGTTTT--C-----AAG-ATATGATTA-TT-TGAA-TCTTGAT-C-AATTTTG-G-G-CA-AATTCAGTATAAA--CCCTC-TA-CT----GTT-G-TC-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-------TTAAGTC--AGA--GGA--A---CG--CAAT--------------------------AG-----CTT
gi|13 : cctCATTTTGTT-GGAT--A---------TA-CTG--AAAAAA-GCG-----T-CAAC-TA-AACCTGAACCGTACATTCTA---A-GAG-CAGGA-T------GGTTATCTACAAC-----A-----CCACCTGATGAAGAA-GTACTTTG-CTCGA-CTGT--TG-ATTATTA-TGGTTCCAATAA-CCTGCCCT-ATTA-C-A----AGAA-TGGCACTAT--C-AG--C-AAGTTA---T-TTCA-G-CTA-TC-----ACA-GAGAGC-----TGT--AAAATGC--AA-CT----AT--CCCTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTA
gi|14 : GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---ATT-TTT-CATTG--GTGCCT-T--------------ACCTT-------------TC-C-----AT-A-----------------T------AT-ACATGCAT-TATATTATG--GCA-T-GTGC-TAAGT-G--CTA-GTAT-TGAATA----AAGTA--TATGATGT-A---TGGTT-C-A--------------TTTCTA----C-----ATA-GTA-TAA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----GTTA--ACA--G-CTGCAGGTTA-GTAAA-TATA-ACTTTCAATGT-AAATTA-T----TAATTACCGACATGT-
gi|15 : aaattaaa--CGAAAT---GAA--GA--TAATACAAT-A--TTGAGTCCCCTAAAC--AAATA--T-C-TGG-GATAGGAAT---A----TTCAGGAA---AATGGGA----AC-T-------AGC---------------CC--ATGATTCTA-AAGA-CCAAAACATAA--CCATTTG-TCTC--AA-ACCACT-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----ATC--------AG---TGAT-AAGGAAA-ACAT--GTT-TCAATat
gi|16 : tgtacgaacaTTTAACG-TA-TG-GAGGTCAATT-AATG-TAT--ATG-A-TCA---AT-AA--AAAGAAAT-GG-----CAT-----GG-ACTA---CTTTTA-AGTAT-A---TAACAAATAC-AAA-A----------------GAAACCCTACTAAA---TAA--TGA-CT-TATCGA-CTACTA-AAAGTC--AAACA-GATTAAAA-ACAATGAA--CTAATTG-A---TCAA-TTGAACTGAA-A-T-T--AT-GA-ag
gi|17 : CTCCCC-CTCTATGAG--ATTTT-CT----A-C--CCT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA---------G-TAAA-A--CGC-C-A--TT-C--TCTT--------GA---CAATGTAT-TGTT---AGC--G---------C-TTTT--CCA---A-G-ATATAATCATTT-TGAA-TTT--AT-CAAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAct
gi|18 : gtaaatacataAATT--------TCAGGAAAATC---GGA----TT----------AA---------------CCTCATGCTTGTATAAGA-CCAAAACATGA--CTATTTG-TC-T--CA-ACCACA-TCTATGACCCATC-TGC-AGG---C----TAT--------AGCGATGAT-AAGGGAAAACAT--GTCATCA--TTG---------A-------C-TG-CTGTAAAAAAC-GCG-----T-CAACTTA-AGCC--AACCagtgtagtgtg
gi|19 : aaCATGGGC-CC-AG-AA-C-CAATACC-----TCCCCCC--TCTA-GGG--ATGTTTCT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GTAAAAAAA--T-AA---------G-T-AA-A--CGA-CAG--TT-G--G-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---TGGCCG---------CGTTTT--C-----A-A-ATATtcg
gi|2 : accCGTGGGC-C--AGTA--CACATTACT-----CCCCCTCACTCTA-AGGGTATTTTTCA----AGC--A-T---ATGATTTTTTG-ACAG-------TGT--GT-AAAA----T-AA--------GG-T-AA-C--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAAATTTT-TGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT--GAA-TTT--ATGC-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGCATAAA--CCAT--TA-CG----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTA--T-TTGTA-GTAATGC--AGACGGAG--A---CA--CAAT--------------------------AG-----CTTTAT-ATAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CA-----T-T--TGGA---ATA-TAGAGGACGG------G--ATCA--TATGGA--AAG--GA-CTTTT----T---T---TG----GCGAGA-------------TC-A--T---TTT-TATTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---TATTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-CCT------ATTACATGTAAATA-ATTATG--GCA-G-GTGT-TAAGT-G--CTA-GTATGTGAATA----AAGCG--TACGATGATA---TGGTT-TAA--------------TTTCTA----C----TCCA-GTA-TGA------CG-TTTG-T--AT--AAT-ACACGTATG----------TTGA----ATTA--GAA--C-A------TTA-GTAAA-TATT-ACTTC-AATGTTAAAATATT----TAATTGCTGGCTCGT-T-CCA-TGTT----TTTGAATG-TAATG-GAGGCCCATT-AATGGTAT--ATAGA-TCA---GC-AA--AT-GAACT-GT-----CGT-----GG-ACT----CTTTGG-AGCAT-A-AGTGCTTAAAAT-ATG-G----------------GGAC---TAT--AA---TAA--TGAATT-TA---GGCTGTAG-GGAATG--GGGAA-TATAGAAACACA-TGAA--AT-ATTC-A---TCAA-T--AA-TGTA-A-T-TTGAT-GG-AATAT---TT---------ATAT-TTT-A-TA-------AAAAATT--ATGTATATAATATTATTGCCAT--GCT-AAA---ATTTGTA--TA-TTTTTTTGTAAAG-TTTCTG-CT-GACT--TTATGTTGA-----ATAGAAAATAAAA-ACC-AAGCAA--TCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTTT--CA-GTTC--CA-TC----AAT---AAATCA---CCATA--AAATA-TTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTGTA--AAGGATTTGAT-GACGATAATATAGG--TCCGAGAATTA-GAAGTAG--AGTCAC--AAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGATTGT--TATTCAA------AACGCATAC-TTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGGTTTGAC-T-TTTAT-CTGAGCACTGATA-GAATATGAACGGTGTG--T-G----A-ATTA-CATGGTT-TGAGAGTATTACAGTGGTC-AG--AATGAGAT-TATTTGTCATTTGATGT-TGG---AT---AATTATCCCAAGCTTGTTATA-AAA-TGA--T-TAAAC----TGG----ATAAA-GA----TAGA---GAGAA--CT--TTG--GTAGC-CATCAAAA-ATTTTTTTGTTGG-TAAATTTCCAAAG-------GGCAAA--CTTG-TAT-AT---TTTTG-TGC---A-TGT-G-TACT--GGACAAGATATTAAA-T-CTGTACTTCAC-ATT-G--GC--C---CTTTCAACAATA-G--AACAGA-GTTT-A----AGAAT--T--A--CT----ATGA-A-AT-CAA-A--GGCGGGCTTTCATAGTATT------AGTATAGAGT-TAG---A-ATGT-CGAATTGG--CGAAAT---G-ATAGA--T----CCAAGA--TTGAGTCCC-TAGAA--GAATA--T-C-TGGAGAA--GAAAT-AG----ATTACGAA---C---AAA----TT-TCAA----AAAAG-------------CT--ATGATTCTA-AAGA-CAGAAAT-TGA--ACA-TCG-TC-C--AA-ACCATATTGCATGATCTATC-TGC-AGG--ACCGAGCACTGGGA---AG---TGAT-AAGAATAGAC-TA-TTC-TC-ATTTGTTTGGAC--A-------GATA-CTG--AAAAAA-AGA-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCT----A-G-G-AAGGA-------TGCT------------------------G-TAATGGAGGAAGTACTTTG-TTCGA-CTGT--TGAATTGT-A-CGGTTC---TCA-ATTACCTT------T-A----AGAA-TTAAGATAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-C--G-CTA-TC-----GCAAGAAAGC-----AGTCAAAAATGT--AA-GT----ACTGCCTTGCATA-TGA-TTT--CAG-TTGCT-AAAAAGTGTTTGCt
gi|20 : TAAAAT-AGG-G----------------GAAA---TATG-AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-ATAATG--GGGCA-TTTAAAAA-ACAATGAC--ATAATTC-A---TCAA-T--AA-TGTA-A-T-TTGAT-GA-AAT
gi|21 : -AGAATA--GGACA-------AA-ACAGTGAA--AT-AATCTA---TCAA-T--AA-CGTA-AAT-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------
gi|22 : --ATCA--TATGGA--GAG--TAGCACAT----TAC-A---TGAC-TGCAAGA-------------TAAA--T---ATT-TATTCATT
gi|23 : AAATGT--AA-CT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TT-CTAAAAAAGTGTATGC
gi|3 : cGGC-C--AGTAA-C-CAT-ACC-----TCCCCCC-CTCTA-TGG--ATTT--CT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAGG------TGTAGGT-AACAAA--T-AA------A-GGGT-AACA--CGGAC-GAGTT-AGAT-TT--------GAG--CAATTCTTATGTT---GGG------------CGTTTC--A-----A-GTATATGAT-A-TT-GGAA-TT---AT-A-AATTTTT-G-G-CA-A-TTCAGAATAG---CCAT--AA-CT----G-T-G-TT-CC---AT---A--C--CGCATTACCT-TTGTA-TTAAAGG--GAAC-AAA--A---CAACCAAC--------------------------GG------TTTTA-AGAG---TTG-CCA--GAAA-GGAC---ATCGAT--GAG-CAATATATGT--TAGAGATATA-TAAAGGACAG----------TCA--TA-AGACGAAG--TAGC-CATGGTGC---A---TGGA-TGCAAGAAT-----------T--T--T---TTT-TTTTCA-TT--G-GCCTATGCCA----T--TG-ACTAGA------------T---------T-AAC---AT---CATA-T-T------AGAACATCAAA-T--TTTAT---GCATG-GTTTGCATGT-GGCTTA-GTAT-TGAAT-----AAGCG--TAC-ATGA-A---CGG-T-CAA---------------TTCTA---------TAAA-GTA-TGA------C--TTTGCT--AT--AATGACACA-ATC----------TTGA----AGTA--GCA--CGC------TTA-GTAAA--ATATACTTCCAAT------AGATG----TAATTACTGGCAGGT-TGCCATTGTCT---T---AATGATA-TG---GGCCAGTT-TACGTTAT--ATA-A-TCA---GC-CATGAA-GAAA--GTG----CGA-----CG-ACT----CTTTGGAAGCAT-A-ACTTGCTAAAAT-AGGTGTGAAATAATTAGTAGTGAAA---TAT--AAATTTAA--TGA-TT------G-CGTTAGTTGAATGGTGGGCATTATAG-AA-ACAATGAA--AT-AATT-AAGTTCAA-T--AA-GTTA-A-TGTTGATAGA-AATAC-T-TC---------ATATATTTGA-TATTATAGTAAAA--A--AAG-ATA-AATATTA-TGCCAA--AAC-GAAATCATT-GTA--TA--TTTTTT---AA--TGTCTG-TTAGACTCTTTATGCTGAGCA-TATAAA
gi|3 : cgtcGTTAGAC-TCTTTATGCTGAGCAT--ATA---A-ATGAGC--T-CG--T-G----AGATTA--ATGGTT--GAAAGTAGTACAG-GGTCCAGAAACTTAGAGATATTTGTC------CAT-TGGCTAATGGAAATTATCCCAA-CTCGTTATCGAAATTGA--T--AAAC----TGG---AATCAAAGA----TAGA---GAAAA--CTTGTTAGTGTAG-ATATC---A-ATT------TTGG-TAA---TTCAAAGGCCATATGGCGAATTTTTG-TATGAT---TACTG-CTT--TATT-T-GCTACT--GG--AAGCTGTTGAA-TGATGAGCTTCG--GTT-GTCGCGAC---C--TCGGCAA-A--C-AACA-A-G-TT-GT---AGAATC-TTCAATC-----ATAA-T-AT-CAGAA--GTCGA-CTTTCAT-GTATT------GGT------T-CAA---ACATGTACGA--TA---CGAAATTCGGGAAGTAACT----TAA-GATTTTGGTCCCC-TAGAC--AAGTA--TGC-TGGATAT--GAGTT-GAATATCTGAGATG---C---CAA----TC-TCAA----AAAATGGAGACTTACGCCTC--ATGATTCTA-AAGA-CAAATACATAA--CCATTTG-TC-CAAAA-ACCACA-TGTATGAT-CATC-TGC-AGA--------CAC--------A----TGAT-AAGGAAAAACAGG-GTC-GCAATTTGTTTAGATGCG-------G-TATCTG--AAAAAA-AAGCCGTTC-CAAC-TA-AA-C--AACCGTACC-TCTAGTGA-G-G-GAGGG-T-----TGTTAATCT---AC-----ACTAACC-AC-TGATGAAGATAG-ACTTT--------TTATG-TG-AGGAT-A-C-GTTC--ATCACGCTGCCCT-AT-T-C-AATAGAGAA-TG--GC-AT-TC--G--C-AGGTTA---T----A-G-CTA-CG-----ACAGGATGGT-----GGTT----TTGC---A-CT----AT--CC-TG-ATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAACGTGTATGCtgagctcgtgagattaatggttgaaagtagtacagggtccagaaacttagagatatttgtccattggctaatggaaattatcccaactcgttatcgaaattgataaactggaatcaaagatagagaaaacttgttagtgtagatatcaattttggtaattcaaaggccatatggcgaatttttgtatgattactgctttatttgctactggaagctgttgaatgatgagcttcggttgtcgcgacctcggcaaacaacaagttgtagaatcttcaatcataatatcagaagtcgactttcatgtattggttcaaacatgtacgatacgaaattcgggaagtaacttaagattttggtcccctagacaagtatgctggatatgagttgaatatctgagatgccaatctcaaaaaatggagacttacgcctcatgattctaaagacaaatacataaccatttgtccaaaaaccacatgtatgatcatctgcagacacatgataaggaaaaacagggtcgcaatttgtttagatgcggtatctgaaaaaaaagccgttccaactaaacaaccgtacctctagtgagggagggttgttaatctacactaaccactgatgaagatagactttttatgtgaggatacgttcatcacgctgccctattcaatagagaatggcattcgcaggttatagctacgacaggatggtggttttgcactatcctgatgtgattttgcagttgctaaaacgtgtatgcaa
gi|4 : cgtcggccagtaaccatacctccccccctctatggatttctacactatgattttttgaaaggtgtaggtaacaaataaagggtaacacggacgagttagatttgagcaattcttatgttgggcgtttcaagtatatgatattggaattataaatttttggcaattcagaatagccataactgtgttccataccgcattacctttgtattaaagggaacaaaacaaccaacggttttaagagttgccagaaaggacatcgatgagcaatatatgttagagatatataaaggacagtcataagacgaagtagccatggtgcatggatgcaagaatttttttttttcattggcctatgccattgactagattaacatcatattagaacatcaaattttatgcatggtttgcatgtggcttagtattgaataagcgtacatgaacggtcaattctataaagtatgactttgctataatgacacaatcttgaagtagcacgcttagtaaaatatacttccaatagatgtaattactggcaggttgccattgtcttaatgatatgggccagtttacgttatataatcagccatgaagaaagtgcgacgactctttggaagcataacttgctaaaataggtgtgaaataattagtagtgaaatataaatttaatgattgcgttagttgaatggtgggcattatagaaacaatgaaataattaagttcaataagttaatgttgatagaaatacttcatatatttgatattatagtaaaaaaagataaatattatgccaaaacgaaatcattgtatattttttaatgtctTGGGC-----GTAA-CACAT-ACT-----CCCCC----TCTA-GGG--ATTTTTCTT---A-C--A-T---ATGA--------------------------------A--T-AA---------G-T-AA----CTA-T-G--TTTG--T-TT--------GAACCCAATTTC-ATGTTTGGGAG--G---------CGTGTT--C-----AAG-ATATG--TA-TT--GAA-TTG--AT-C-AATTTTTTG-G-CA-A-TTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-TCG-TT-C----ATCATA--CGATG-ATTAT-A-TTGTA-TTAA------GA-GCAACTA---CA--CAG---------------------------AA-----TTATTC-AGAG---TTT-GCA--GAA--GGAC---ATCGAT--GTG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACAT----TAA-T---AGACTTACAAGA-------------T--A--T---TTTATTTTCATTT--GGG----TGC------T--TG-CCCTTG------------CC-C---TAGTCAAC--TAT---C-GATC-TGA----AT--CATGT---CA-ATTATG--G---G-GTTC-TAA--------A-GTAT-TG-AT------AGCG--TCTAATG--A---CGGTC---A--------------TTT-TA----C-----AAA-GT--TGA------C--TTTT-TTAAT--AAT-ACACA-AT-----------TTGA----ATTA--TCA--C-C------TTA-GTAAT-AATA-ACTTCCAATGT-AAAATG-T----TAAT----GGC--GTAT-CCA-TGTTC---TTTAAGTG-T--TG-GAGG-CCATT-AAT-GTAT--ATT-A-TC----GC-AC--AA-GAAGT-GG-----CGT-----TG-TTT----CTTTGG--GCCT-A-CATGTA-AAAATAAGG-G----------------GAAA---TATACAA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GGGCA-TATAG--A-AC-ATG-A--AT-AATT-A---ACAA-T---A-TGTAGA-T-TTGAT-GA-AATATAT-TCTATTAATATATATATTT-A-AA-------AAAA--CAAAAAAAGATAATATC-CTGGGGACGCGT-AAA---ATT-GTATTTAATCTTTTT---AATATTACTGATTAGGCCATTTAaa
gi|4 : TTGTTA-GG---TGCGT-GT-CGAGTAG----A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA-GA-AG-TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT---A-TTGCC---A-CT-GGTAT--AAAT-GA--T-TAA-C----TGGTCAA-TCAA-GA----TAG----GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GG-TA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TACG--CGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-A-GTTGAC---------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGTATACA-----------ATGT-C-----AG--C---AT---GAATGGA--T-----AATGA--TTG-GTCCT---GAA--AATTG--T-A-TGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TCA----------------------------TGTTTCTA-AAAG-ACAAAACATGA--C--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGAT-AAGGAA----ACA-GTC-TCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAGGATT-----TGATTATC----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGAAGAT-CTCTGACTCGA-TTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA----AGAA-TGAA-CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCatttgttaggtgcgtgtcgagtagaattatggttatggagtttagtggtagacaagaagtatttgtctttatgttggcatattgccactggtataaatgattaactggtcaatcaagataggaaaacttattgttagcatgtaatttggtattaaaggattgatatatttttgcgctattgtacgcgaaagctttgacttgcttgcttggttgtcggcaaagttgacgattctaataattaagacgtgcttcatagtttgggtatacaatgtcagcatgaatggataatgattggtcctgaaaattgtatgtaggtgattgacttagggatgggatgctttcatgtttctaaaagacaaaacatgactttgtctacatgcatgatctatctgctaggacccagtgataaggaaacagtctcaatttgttggatgtctgaaaaagcggatcaataaacaatccgtaactctaagggcaggatttgattatcatacacaacactgatgaagaagatctctgactcgattgtcatgattatatcggttcatcactgccctaatacaaagaatgaactataacagcaggttaattttcagctctcacaagaaggagttttgtgtaacatatccttgtgtgattttgcagttgctcacaaagtgtatgcata
gi|5 : tgggcgtaacacatactccccctctagggatttttcttacatatgaataagtaactatgtttgtttgaacccaatttcatgtttgggaggcgtgttcaagatatgtattgaattgatcaattttttggcaattcagtatagccattactgtcgttcatcatacgatgattatattgtattaagagcaactacacagaattattcagagtttgcagaaggacatcgatgtgcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacattaatagacttacaagatattttattttcatttgggtgcttgcccttgccctagtcaactatcgatctgaatcatgtcaattatggggttctaaagtattgatagcgtctaatgacggtcattttacaaagttgacttttttaataatacacaatttgaattatcaccttagtaataataacttccaatgtaaaatgttaatggcgtatccatgttctttaagtgttggaggccattaatgtatattatcgcacaagaagtggcgttgtttctttgggcctacatgtaaaaataaggggaaatatacaataatgatttagctgtagagaatggggcatatagaacatgaataattaacaatatgtagatttgatgaaatatattctattaatatatatatttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatGACGAAA--A---CA--CA-C--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACAA----TATAT---TGAC-TGCAAGA-------------T--A--TATTTTT-TTTTCGTTT--GTGCCT-TGCCAT---T---G-ACC---------------------------GAGCTTA---------------------ACATGCGA-T----TATG--GCA-G-G----------G--CTA-TTAT--GAATA----AAGC-------------------TT-TAAA-------------TTTCTA----CAAAGTACATGTA-TGA------C--TTTG-T--AC--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GCA--C-C------TTA-GTAAA-TATA-ACTTCCAATGT-AAAATGTT-----AATTACTGGCAGTT-T-CCA-TGTCT---TT--AATG-TA-TG-GAGGCCCATT-AATG-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAG-GTG----TGT-----GGGACT----CTTTAG-AGCAT-A-CATG-CTAAAAT-AGG-G----------------GATA---TAGG-AA---TAC--TGA-TT-TA---G-CGTTAG-AGAATG--GGGCA-TATAGAAA-ACAATGAA--AT--TTCAA---TCAA-T--AA-TGTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------TTATATTT-A-T-----------A--T--AAG-ATA-AATA-TACTGCCAA--AATAAAA---ATT-GTA--TAATTTTTTT---AAT-TTTCTG-TTAGACCTTTTAT-CTGGGCATTATATGAAATGAata
gi|5 : GTTAGACCT-TTTAT-CTGGGCATT-ATATGAA-ATGAGT-GT-TG--T-GTTAGA-ATTAACATGGTT--GAGAGTATTACAGTAGTC-AGA--ATGAGAT-T-TTTGTCATTT-ATGTATGG---A----AATTATCCGAA-CTC-ATATC-AAAATGA--TATAAAC----TGG---AATCAAAGA----TAGA---GAGAAGACTT--TG---TAGCATATC--AA-AAT------TTGG-TAAA-TTCCAAAGAA-----GGCGGA--CTTGA-ATA-----TTCTA-CGCA-TA-T-T-GCTACT---GACAAGC-ATTAAA-T-CTGCA-TTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCCGC------C-AACA-A-G-TTGA----AGAATC-T--A--CA----ATAATA-AT-CAG-A--AAGGGGACTTCATAGTATT------GGTAgtgttgtgttagaattaacatggttgagagtattacagtagtcagaatgagatttttgtcatttatgtatggaaattatccgaactcatatcaaaatgatataaactggaatcaaagatagagagaagactttgtagcatatcaaaatttggtaaattccaaagaaggcggacttgaatattctacgcatattgctactgacaagcattaaatctgcattcgcattggccctttccgccaacaagttgaagaatctacaataataatcagaaaggggacttcatagtattggta
gi|6 : gacgaaaacacacagcttttaagagtttgcagaaaggacatcgatgagcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacaatatattgactgcaagatatatttttttttcgtttgtgccttgccattgaccgagcttaacatgcgattatggcagggctattatgaataaagctttaaatttctacaaagtacatgtatgactttgtacaatacacaatcttgaattagcaccttagtaaatataacttccaatgtaaaatgttaattactggcagtttccatgtctttaatgtatggaggcccattaatgtatataatcagcaaaagaaaggtgtgtgggactctttagagcatacatgctaaaataggggatataggaatactgatttagcgttagagaatggggcatatagaaaacaatgaaatttcaatcaataatgtaatttgatgaaatatattcttatatttatataagataaatatactgccaaaataaaaattgtataatttttttaattttct-G----A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA-GA-AG-TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT---A-TTGCC---A-CT-GGTAT--AAAT-GA--T-TAA-C----TGGTCAA-TCAA-GA----TAG----GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GG-TA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TACG--CGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-A-GTTGAC---------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGTATACA-----------ATGT-C-----AG--C---AT---GAATGGA--T-----AATGA--TTG-GTCCT---GAA--AATTG--T-A-TGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TCA----------------------------TGTTTCTA-AAAG-ACAAAACATGA--C--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGAT-AAGGAA----ACA-GTC-TCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAGGATT-----TGATTATC----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGAAGAT-CTCTGACTCGA-TTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA----AGAA-TGAA-CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGC
gi|7 : GCTTTAAC-----G-G-AGAAGATCA-TT-TGAA-TT---AT-CCAATCTTT-GCG-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TATCT----G-T-G-TC-C----AT---A--C---GCATTAC-T-TTGTA-TTAATGC--GGACC-AA--A---TA--CAAC--------------------------AGG----CTTTTA-AGAG---TT--GCA--GAAAAGGAC---ATCGAT--GAG-CAA-ACAT-T--TAGA---ATAGTAGAAGACAGTACGGCT--ATCA--TATGGG--AAATTTAGCACAC----T---TACATGAC-TGCAAGA-------------T--ATTT---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAA---T--TG-ACC
gi|8 : T-G--CTA-G-AT-TGGATA----AAGTG--TTCCATNN-N---NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTA----C----AAAC-GTA-TGA------CGGTTTGGT--ATTTAAT-ACGCA-ATC----------TTGA-----TTAAGGCA--C-C------T-A-GTAAA-TATA-ACTTCCAATGT-ACAA-ATT------ATTAC-------T-A-CCT-TGT-C---TTTG-ATG-TA-TGAGGGGACCATT-AACTGTAT--ATA-ATTCA---GCAAA--AA-GGAAC-GT-----CGT-----AG-AC-----CTTTGG-AGTATCA-AGTGGCTAAAATCAGGCG----------------GAAA---TCT--GA---TAGATTGA-TT-TA---G-TTGTAG--GAATG--GGGTA-TATTAGAA-ACAATGAATTAC-ATTA-A---TCAGTT--AA-TGTA-ATT-TTGAT-GACAATATATATC----------TATATTT-AGTA-------AAAA--ccgcgcttacatttgcgaacgtcatggccgcaggataattgatatagaaactgcgttaccgatcgaaggtttatttacaatctattctaatacaaagtacatagtgttaaaatgatgcttatgtattagacaatgttactaacaatcattgaat
gi|9 : TG-TC-T--AA-ACCACA-TACATGACTCATC-CGC-AGG---C----CAC--------CGA--TGAT-AAGGAAAG-CAC---TC-TCA-----TTTGGAC--ATACAAATG-TA-ATG--TAAAAG-CGT-----T-AAAC-TT-AACC--AACC------TCCA-----G-G-CAGGA-TGGTTATGTCTACA----AC-----AA----C-ACCTAATGAAGAA-GTACTTTA-CTCGA-TATT--TG-ATAAG-A-CAGCTCCAATCG-ACTGCCCT-AT-AAC-AG---AAAA-TGCCACTGT-TC-AG--T-AGAATA---T-T-CA-G-CTA-TTTTAATACAAGAAG-C-----TATC-AAATTTT--AA-CT----AT--CCTCCCATG-TGA-TTTGGCAG-TTGCT-AAAAAGTTTATGC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CAAGTGAGTTCAGTACATCATGGAAAGGCAAATGTAACTATCC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1 22222 1 111111111111111 1111111 33333333333 1111111 11 11111111 111 222222222222 2222222 11 111 111 222 11 1111 2222 111 111 5555555555555555555555555555555555 11 333333333 1111 2222 3333333333333333333 22222222 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222 111 1111 111 111 555555555555555555555555555555 33333333333333 222222222 1 22222222222 11111 111111 11111 1111 11111 11 111 1 22222 1111111111111 111 1 1 333333333333333333 33 111111111 111 11111 2222222222 2222222222 33333333333333333333333 11 22222222 111 11 1 44444444 11 111 1 11 1111 333 22 333 22222 66666666666666666 333 22 2 444444 2 333 22 11 2 22 1 2 333333 333 1 11 22 555555 2 1 1 2 22 777777777777777777777777777777 2 88888888888888888888888888888 1 333 4444 2222222 22 2 2 22222 2 2 222 2 1 1 1 55555 22 1 55555 22 888888888 11 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 2 555555 1 44444444444444444444 1 333 22 111 2 55555 22 2 0000000000000000000000 2 6666666 1 2 77777777 2 4444444444 22 22 1 11 111111 22 1 11 222222 444444444444444444444 22 2222 11 222222222222222 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 1111 11 1111 1111 11 222 2222 22222222 222 3333333333333333 222222 11111111111 1111 1 2222222222 11111 222222222 888888888888888888888888888888888888888888 2222222222222 1 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777 11 111 2222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1111111 1 555555555555555555555555 22222222 1 3333333333333333 2222222222 1 222222 8888888888888888888888888888888888888 1 1 22 1 2222222 4444444444444 222 11 2222222 22222 222222222222222 1111111 2
lowQualScore : 6666 3 5 5 2 00000 5 0 66 00 666666666666666 1 4 8888888 66 4 66 4 00000000000 4 9999 2222222 4 00 4 66666666 222 7 7 777 555555555555 55 4444444 4 4 11 4 333 111 4 8 4 4 1 222 11 5 0000 5 5 5 5 2222 888 66 777 5 5 5 5 222 555 66 777 66 4444444444444444444444444444444444 55 888 55 66 66 888 66 5 0 1 5 66 888 5 2 0 000000000 77 888 999 22 2222 6666 5 8888888888888888888 888 5 77 1 5 0 22222222 5 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333333 99 777 777 666 77 5 5 0 5555 000 333 333333333333333333333333333333 77777777777777 5 000000000 1 77 77 5 5 55555555555 22222 77 77 5 666666 5 5 1 5 555 1 77777 5 7 9999 777 6 99999 555 5 5 5 5 5 00 77 5 5 000 5 77 1 99 55555 6666666666666 5 55 5 222 0 5 0 888888888888888888 888 00 888 66 5 5 888 5 77 66 66 4444 6 4 66 666666666 777 4 222 66 4 11111 4 8 4 4 4 5 5 8888888888 6 2222222222 66666666666666666666666 0 99 11 00000000 444 8 11 0 33333333 33 8 444 8 0 00 2 8888 888 111 77 555 88888 00000000000000000 555 77 0 333333 2 4 0 555 77 88 0 4 77 5 0 4 666666 4 111 5 66 88 77 777777 0 5 5 0 3 3 44 888888888888888888888888888888 66 0 44444444444444444444444444444 5 555 2222 8888888 77 0 0 88888 0 0 111 0 3 5 5 3 5 00000 77 5 4 00000 77 000000000 2 2 88 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 3 3 0 777777 2 5 88888888888888888888 5 555 77 222 0 00000 2 77 4 0 9999999999999999999999 0 0000000 5 0 22222222 0 5555555555 2 77 77 5 33 4 444444 33 0 44 888888 444444444444444444444 6 11 1111 7 6 33 444444444444444 5 99 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 7 4444 88 6 6 4444 9999 99 77 222 2 3333 6 88888888 111 9 4444444444444444 9 333333 6 77777777777 4444 0 9 2222222222 66666 6 99 888888888 1 3 222222222222222222222222222222222222222222 6666666666666 1 1 2 999999 99 9999999999999999999999999999999999999999999999 88 99 9 6 44 99 1 6 666 99 5555555555 5555555555555555555555555555555555555555555555555 1 5 5 77 0 5 7777777 5 0 5 0 777777777777777777777777 5 55555555 5 0 9 0 9999999999999999 66 3333333333 5 77 5 66 0 5 111111 5 5 0000000000000000000000000000000000000 5 6 5 1 5 11 5 5 1 1111111 2222222222222 5 000 66 5 77 5 0000000 5 5 5 88888 0 999999999999999 66 2222222 66 8 5 5 0 5 0
lowQualScore : .... . . . . ..... . . .. .. ............... . . ....... .. . .. . ........... . .... ....... . .. . ........ ... . . ... ............ .. ....... . . .. . ... ... . . . . . ... .. . .... . . . . .... ... .. ... . . . . ... ... .. ... .. .................................. .. ... .. .. .. ... .. . . . . .. ... . . . ......... .. ... ... .. .... .... . ................... ... . .. . . . ........ . ....................................................... ....... .. ... ... ... .. . . . .... ... ... .............................. .............. . ......... . .. .. . . ........... ..... .. .. . ...... . . . . ... . ..... . . .... ... . ..... ... . . . . . .. .. . . ... . .. . .. ..... ............. . .. . ... . . . .................. ... .. ... .. . . ... . .. .. .. .... . . .. ......... ... . ... .. . ..... . . . . . . . .......... . .......... ....................... . .. .. ........ ... . .. . ........ .. . ... . . .. . .... ... ... .. ... ..... ................. ... .. . ...... . . . ... .. .. . . .. . . . ...... . ... . .. .. .. ...... . . . . . . .. .............................. .. . ............................. . ... .... ....... .. . . ..... . . ... . . . . . . ..... .. . . ..... .. ......... . . .. ........................................................ . . . . ...... . . .................... . ... .. ... . ..... . .. . . ...................... . ....... . . ........ . .......... . .. .. . .. . ...... .. . .. ...... ..................... . .. .... . . .. ............... . .. . ................................................................... .... . .... .. . . .... .... .. .. ... . .... . ........ ... . ................ . ...... . ........... .... . . .......... ..... . .. ......... . . .......................................... ............. . . . ...... .. .............................................. .. .. . . .. .. . . ... .. .......... ................................................. . . . .. . . ....... . . . . ........................ . ........ . . . . ................ .. .......... . .. . .. . . ...... . . ..................................... . . . . . .. . . . ....... ............. . ... .. . .. . ....... . . . ..... . ............... .. ....... .. . . . . . .
lowQualScore : 4444 9 7 0 0 00000 0 0 99 22 888888888888888 1 4 9999999 11 4 11 4 11111111111 4 7777 9999999 4 66 4 11111111 222 4 3 888 000000000000 55 0000000 0 4 77 4 333 777 4 9 4 4 9 444 99 0 6666 0 0 0 0 5555 888 99 111 0 0 0 9 222 222 11 888 11 3333333333333333333333333333333333 22 888 11 99 00 888 99 0 1 4 0 99 888 7 3 7 222222222 99 000 333 11 9999 4444 0 4444444444444444444 888 0 99 4 7 7 33333333 7 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777777 22 555 555 111 99 7 7 1 0000 000 444 999999999999999999999999999999 00000000000000 7 000000000 4 99 99 7 7 77777777777 33333 99 99 7 444444 7 7 7 7 999 4 11111 0 6 3333 777 7 00000 999 7 7 7 3 7 99 99 7 7 000 7 99 4 33 77777 3333333333333 7 99 7 333 1 0 0 222222222222222222 888 66 888 99 0 0 888 0 11 11 11 6666 2 4 11 222222222 888 4 222 11 4 11111 4 9 4 4 4 0 7 9999999999 7 8888888888 33333333333333333333333 8 00 00 88888888 000 0 00 6 00000000 66 0 000 0 6 22 5 2222 555 000 55 000 55555 00000000000000000 000 55 0 555555 5 0 0 000 55 55 0 0 55 5 0 0 000000 0 000 5 55 00 55 555555 0 5 5 0 0 0 00 555555555555555555555555555555 55 0 00000000000000000000000000000 5 000 5555 0000000 55 0 0 55555 0 0 000 0 0 5 5 0 0 00000 55 5 0 00000 55 000000000 5 5 00 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 0 555555 5 0 55555555555555555555 0 000 55 000 0 00000 5 55 0 0 5555555555555555555555 0 0000000 0 0 55555555 0 0000000000 5 55 55 0 88 0 888888 88 0 22 444444 444444444444444444444 7 77 0000 3 7 33 222222222222222 5 88 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0000 3 2222 33 7 7 2222 0000 22 00 555 5 0000 7 22222222 222 3 5555555555555555 8 555555 7 00000000000 8888 8 8 5555555555 88888 7 22 000000000 0 2 222222222222222222222222222222222222222222 7777777777777 0 0 0 222222 22 4444444444444444444444444444444444444444444444 55 22 8 7 00 22 0 7 888 22 1111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333 0 7 7 99 1 0 1111111 0 9 0 0 000000000000000000000000 0 11111111 0 2 4 1 8888888888888888 99 2222222222 0 55 0 99 7 4 111111 7 7 6666666666666666666666666666666666666 7 0 0 4 7 44 7 7 4 6666666 1111111111111 7 999 99 7 99 7 4444444 7 7 7 66666 1 111111111111111 99 6666666 99 8 0 0 1 0 0
consensus : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-C-T------AT-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGN-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T---AAG-ATATA--------ATATTACTGC--CGA--NAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--ATACA-TGTAG---AATGT-CG-AA--TA--GCGAAATGAACGGAT----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
Reference ( family-288 ) : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TA-NT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-C-T------AT-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGN-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T---AAG-ATATA--------ATATTACTGC--CAA--AAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCNTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAA-A-CCAAGCA--ATCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTT--TC-AGTTC--C-ATC----AAT---AAATCA---CCAT--AAAAT-ATTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTG--TAAAGGATTTGA-TGACGATAATATAG--GTCCGAGAATTA-GAAGTAG--AG--TCACAAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGAT--TGTTATTC------AAAACGCATA-CTTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGG--TTAGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTATGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--ATACA-T-TAG---AATGT-CG-AA--TA--GCGAAATGAACGGAT----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
gi|1 : --A-T---AT--TTTTTTG-AGAGAAGATAGTG---GT-AGAAAAATT-AA------ATGG-T-AA-AGGCGG-C-GG-TT-G--T-TTTTGCAACCAA---CATGTTTT-TGTT---GGG--GACTGAAATGCGTTTT--CTCAACA-G-ATATGATCA-TTCTGAAATTT--AT-C-AATTTTT-GTG-CACAATTCAACA-AGAAACCATAATA-CGAAAAG-T-GATT-CTCCAAT---AGGC--TGCATTAC-TATTGTAAGTAATGCTAGTACGGAA--ATCACA--CAAT--------------------------AATAAGTCTATTATAGAAGCTTTT-GCATGGATAAGGACTTCATCGATCTGAGTCGATG--T-TGGTAGA---ATA-TAGA-GACGG------TGCATCAAATATGG-------------TA-T--TA-A--GAC-TGCGAGAATGAGAGCTAATTT--A--T---TAT-TTTCAATTTTGGTGCCT-TGCCATGAAT--TGCACCTTACGATTATGTGACTCGCGTGTAA--AACTTTATAATC-TA-C-TCTAAAAATTACATGTAA-T--ATTATGTTGCA-GTGTT--TAAGTCG--CTAAGTCT-TGAATATATAAAGCGCGTA-GATGG-AAATCGGTTATAAA--------------TTTCTAAATTCG---TA-A-GTAATGAAATCGTC--TCAG-T--GT--TAT-AAATA-ATCCAAGCGATGTTTGAGAATATTA--GCAAAT-C------TTAAGTAAAATATT-ACTTTCAATGTT-GAAATATTATATTAACTATCGGCCGTTT-T-CCA-TGTCCCTATTTGCATG-TA-T--GAGGTCCATTTAATAGTATCAATA-A-TCATGCAC-AA--AATGAAATCGTATATACGTAGTACGG-ACTACCT-TTTTAG-GGCAT-ATAGTGGCT-AAAAT-AGG-T----------------GAAA---TATTAAA---TAA--TGA-TTATA---G-CTGTAG-GGAATG--GGAAGAA-TATTAGAAA-ACAATGAA--ATAAATTTAC-A---TACAAAGGT--AA-TCGAAAGTA-C-T-TTGA--GG-AATATAT-TC---------G-ATATTT-A-TA-------AAAACTT---AAT-ATGTATATAAACTATATTAAGGCATCGA--TAC-ATAA---ATT-GTA--TAATTTTTTTTCTTTTTAAAT-TTTACCAATG-AT-GACTCTTGATGTTTA-CA-TAGAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGA--TGATTGACATTAATATAGGAGTCCGAG-ATTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTG-CTATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGGCATTTGAACC-T-TTTATCACTGAGCAATAAATA-GTCA-ATGAAC-GATC-CG--T-GGGATAGAAA-ACTA-CATCGTTACACGAGAATTACAGTGGTC-AG-CAAATTGAGCAGCATATCTGTCATT-----T-TAGC--ATCGAATAGACAGGAATTATGCGAGAAATGTCCACA-CTTGTTTAAGGCGTCC-AAATATAATTGAGCT-TAAACACTGTGG--AATC-AA-TAGTATTAGATACGAGAA--CT--TTGA-GTACAACATC--AATATTG-----TGGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTTGTATGATAAGTTCTGATGCAATA-G-TAGCTACTTTGGACAAGCTATTAAACT-CTAGTATTCACTATTAG--GC--CACACTTTCCACCA-ATGA-CACA-ACG-TT-ATAAGAAAATCGT--A--CTTCAGATAA-ATGTACAG-AAGGCCGCGTCTTCATAGTATTCTAGTCAAT--ATGCA-TGTAGCTTAGTGA-CGAAA--TAGTGCGAAATG-ACAGATAAC-CAAGAA--TTGAGTCCCC-TAGAACCAAATAATTGATGGAGAA--GAACTAGAT---CCTAGTAG---C---ATA----TTCTCGAGAGAAAG---------------CCTC--ATGGTTCAAA-AAAACCAATACATGAGACAATTTGCTCGC--AAGACCATA-TGCATGA-CTATCGCGC-AGGCCAC----CACTGGCGAATAGCCTTGATTAATGAAAGACACGTGTG-TCA--TTGTTTGGAA--C-------A-TA-CTG--AAAAAA-AGT-----TACAAC-CCTAACC--AATCGTACCTGCTT---A-G-GACAGAG-A-----TGCTTGT---------------------T-TAATGAGCA---GTACTTTG-TTCGAACTGT--TG-ATTGT-A-CGGTTC----CA-ATTACCTT------T-A----AGAATTCAA--TAT-TCGAGGTCGAGGTTA---TGT-CACGTCTACTCCGTCAACGAAAACGCACAGATGTC-AAAATGTAAAA-GTACTGAC--CCTTGCATACTGATTTTTGCAGTTTGCTAAAAAAGTGTATGC
gi|10 : ggatatattttgCATGGGC-C--AGCAA-CACCC--CC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--CTTTTTCT----A-C--A-C----TGATTTTTTG-AAAG-------CGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGA-CGG--TT-G--T-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--CA----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-A-AATTGTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CC----G-T-G-TTCC----AT---A--C--CGTATTAC-T-TTGTA-TTAAAGC--AGAC-GAA--A---CA--CAACTGTTACAGACGAAACACAACTATTACAG-----TTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAA---------TTCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAA
gi|11 : cCATGGGTTC--AGAAAGCACATTACCT----CCCCCCC-CTCTG-GGG--ATTTTTCTCTCCA-CTAA-T---AT-ATTTTTT--AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-G--T-AA-A--CGA-C-G--GT-G--T-TT--------GA---CTATTCTAATGTT---GGA-------------GTTTT--CA----A-G-ATATGGTCA----------------------TTTT-G-GACA-AATTCAGCAT-GA--CTAT--TA-CT----G-T-G-TT-CCA--AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-GT--GGC---AACG---------CA--CCAC--------------------------A------C---------G---TTTCGCA--GAAA--GAC---ATCGAT--AAG-CAATACAT-T--TAGA---A
gi|12 : gacGGC-CCGAGTAA-CACATTACCTCCCCCCCCCCC-CTCTGTGGG--ATTTGTCA----A-C--A-CTTGATGATTATCTGCAGAA-------TGT--GT-ACGAAA--TTAACAGGTCA-GA-T-CA-A--CGC-A-G--TT-GA-T-TT--------GA----AATTTCTATGT----GGG--G---------CGTTTT--C-----AAG-ATATGATTA-TT-TGAA-TCTTGAT-C-AATTTTG-G-G-CA-AATTCAGTATAAA--CCCTC-TA-CT----GTT-G-TC-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-------TTAAGTC--AGA--GGA--A---CG--CAAT--------------------------AG-----CTT
gi|13 : cctCATTTTGTT-GGAT--A---------TA-CTG--AAAAAA-GCG-----T-CAAC-TA-AACCTGAACCGTACATTCTA---A-GAG-CAGGA-T------GGTTATCTACAAC-----A-----CCACCTGATGAAGA-AG-TACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTATTA-TGGTTCCAATAA-CCTGCCCT-ATTA-C-A----AGAA-TGGCACTAT--C-AG--C-AAGTTA---T-TTCA-G-CTA-TC-----ACA-GAGAGC-----TGT--AAAATGC--AA-CT----AT--CCCTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTA
gi|14 : A-T--TA-AA-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---ATT-TTT-CATTG--GTGCCT-T--------------ACCTT-------------TC-C-----AT-A-----------------T------AT-ACATGCAT-TATATTATG--GCA-T-GTGC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GTATATGATGT-A---TGGTT-C--A--------------TTTCTA----C-----ATA-GT-ATAA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----GTTA--AC--AG-CTGCAGGTT-AGT-AAATATA-ACTTTCAATG-T-AAATTA-----TTAATTACCGACAT-GT-
gi|15 : aaTGTACG-AA--CA---CGAAATGAA--GATAATACAAT-A--TTGAGT-CCCCTAAAC--AAAT-AT--CTGG-GATAGGAAT---A----TTCAGGAA---AATGGGA----AC-T-------AGC---------------C--C--ATGATTC-TA-AAGACCAAAACAT--AACCATTTG-TCTC--AA-ACCACT-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----ATC--------AG---TGA-TAAGGAAA-ACAT--GTT-TCAATat
gi|16 : TTTAACG-TA-TG-GAGGTCAA-TTAATG-TAT--ATG-A-TCA---AT-AA--AAAGAAAT-GG-----CAT-----GG-A----CTACTTTTA-AGTAT-A---TAACA-AATAC-AAA-A----------------GAAACCCTACTAAA---TAA--TGA-CT-TATCGA-CTACTA-AAAGTC--AA--ACA-GA-TTAAAA-ACAATGAA--CTA-ATT--G-A---T-CAA---TTGAACT-----GAA-A-T-T--AT-GA-ag
gi|17 : CTCCCC-CTCTATGAG--ATTTT-CT----A-C--CCT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA---------G-TAAA-A--CGC-C-A--TT-C--TCTT--------GA---CAATGTAT-TGTT---AGC--G---------C-TTTT--CCA---A-G-ATATAATCATTT-TGAA-TTT--AT-CAAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAct
gi|18 : gtaaatacataAATT--------TCAGGAAAATC---GGA----TT----------AA---------------C--CTCATGCTTG-TATAAGACCAAAACAT--GACTATTTG-TC-T--CA-ACCACA-TCTATGACCCATC-TGC-AGG---C----TAT--------AGCGATGA-TAAGGGAAAACAT--GTCATCA--TTG---------A-------C-TG-CTGTAAAAAAC-GCG-----T-CAACTTA-AGCC--AACCagtgtagtgtg
gi|19 : aaCATGGGC-CC-AG-AA-C-CAATACC-----TCCCCCC--TCTA-GGG--ATGTTTCT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GTAAAAAAA--T-AA---------G-T-AA-A--CGA-CAG--TT-G--G-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---TGGCCG---------CGTTTT--C-----A-A-ATATtcg
gi|2 : accCGTGGGC-C--AGTA--CACATTACT-----CCCCCTCACTCTA-AGGGTATTTTTCA----AGC--A-T---ATGATTTTTTG-ACAG-------TGT--GT-AAAA----T-AA--------GG-T-AA-C--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAAATTTT-TGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT--GAA-TTT--ATGC-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGCATAAA--CCAT--TA-CG----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTA--T-TTGTA-GTAATGC--AGACGGAG--A---CA--CAAT--------------------------AG-----CTTTAT-ATAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CA-----T-T--TGGA---ATA-TAGAGGACGG------G--ATCA--TATGGA--AAG----G-ACT-T--TT-TTTG----GCGAGA-------------TC-A--T---TTT-TATTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---TATTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-CCT------ATTACATGTAAATA-ATTATG--GCA-G-GTGT-TAAGT-G--CT-AGTATGTGAATA---AA---GCGTACGATGATA---TGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TCCA-GT-ATGA------CG-TTTG-T--AT--AAT-ACACGTATG----------TTGA----ATTA--GA--AC-A------TT-AGT-AAATATT-ACTTC-AATG-TTAAAATAT----TTAATTGCTGGCTC-GT-T-CCA-TGTT----TTTGAATG-TAATG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATAGA-TCA---GC-AA--AT-GAACT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGCTT-AAAAT-ATG-G----------------GGAC---TAT--AA---TAA--TGAATT-TA---GGCTGTAG-GGAATG--GG--GAA-TA-TAGAAACACA-TGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GG-AATAT---TT---------ATAT-TTT-A-TA-------AAAAATT---ATGTATATA--------ATATTATTGC--CAT--GCT-A-AA---ATTTGTA--TA-TTTTTTTGTA-----AAG-TTT-C---TG-CT-GAC--TTTATGTTGA-----ATAGAAAATAAAA-A-CCAAGCA--ATCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTT--TC-AGTTC--C-ATC----AAT---AAATCA---CCAT--AAAAT-ATTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTG--TAAAGGATTTGA-TGACGATAATATAG--GTCCGAGAATTA-GAAGTAG--AG--TCACAAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGAT--TGTTATTC------AAAACGCATA-CTTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGG--TTTGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ACTGATA-G-AATATGAACGG--TGTG--T-G--------A-ATTA-CATGGTT-TGAGAGTATTACAGTGGTC-AG--AA--TGAG-AT--TATTTGTCATTTGATGT-TGG---AT------------AATTAT----------CCCA-AGCTTG-TTA------TA-AA-----A-TGA--T-TAAAC----TGG---ATA-AA-GA----TAGA---GAGAA--CT--TTG--GTAGC-CATCAAAA-ATTTTTTTGTTGGTAAATTTCCAAAG-------GGCAAA--CTTG-TAT-AT---TTTTG-TGC---A-TGT-G-TAC--TGGACAAGATATTAAA-T-CTGTACTTCAC-ATT-G--GC--C---CTTTCAACAATA-G--AACAGA-GTTT-A----AGAAT--T--A--CT----ATGA-A-AT-CAA-A--GGCGGGCTTTCATAGTATT------AGT--ATAGAGT-TAG---AATGT-CG-AAT-TG--GCGAAATG-ATAGAT----CCAAGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--GAAT-AT--CTGGAGAA--GAAAT-AG----ATTACGAA---C---AAA----TT-TC----AAAAAAG-------------C--T--ATGATTC-TA-AAGACAGAAAT-T--GAACA-TCG-TC-C--AA-ACCATATTGCATGATCTATC-TGC-AGG--ACCGAGCACTGGGA---AG---TGA-TAAGAATAGAC-TA-TTC-TC-ATTTGTTTGGAC--A-------GATA-CTG--AAAAAA-AGA-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCT----A-G-G-AAGGA-------TGCT------------------------G-TAATGGAGG-AAGTACTTTG-TTCG-ACTGT--TGAATTGT-A-CGGTTC---TCA-ATTACCTT------T-A----AGAA-TTAAGATAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-C--G-CTA-TC-----GCAAGAAAGC-----AGTCAAAAATGT--AA-GT----ACTGCCTTGCATA-TGA-TTT--CAG-TTGCT-AAAAAGTGTTTGCt
gi|20 : T-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TATG-AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-ATAATG--GG--GCA-TT-TAAAAA-ACAATGAC--ATA-ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AAT
gi|21 : -AGAATA--GG--ACA--------AA-ACAGTGAA--AT--AAT--CTA---T-CAA---T--AA-C-----GTA-AAT-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------
gi|22 : --ATCA--TATGGA--GAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------TAAA--T---ATT-TATTCATT
gi|23 : AAATGT--AA-CT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TT-CTAAAAAAGTGTATGC
gi|3 : cGGC-C--AGTAA-C-CAT-ACC-----TCCCCCC-CTCTA-TGG--ATTT--CT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAGG------TGTAGGT-AACAAA--T-AA------A-GGGT-AACA--CGGAC-GAGTT-AGAT-TT--------GAG--CAATTCTTATGTT---GGG------------CGTTTC--A-----A-GTATATGAT-A-TT-GGAA-TT---AT-A-AATTTTT-G-G-CA-A-TTCAGAATAG---CCAT--AA-CT----G-T-G-TT-CC---AT---A--C--CGCATTACCT-TTGTA-TTAAAGG--GAAC-AAA--A---CAACCAAC--------------------------GG------TTTTA-AGAG---TTG-CCA--GAAA-GGAC---ATCGAT--GAG-CAATATATGT--TAGAGATATA-TAAAGGACAG----------TCA--TA-AGACGAAG--TAGC-CA-TGGTGCAT-GGA-TGCAAGAAT-----------T--T--T---TTT-TTTTCA-TT--G-GCCTATGCCA----T--TG-ACTAGA------------T---------T-AAC---AT---CATA-T-T------AGAACATCAAA-T--TTTAT---GCATG-GTTTGCATGT-GGCTT-AGTAT-TGAAT----AA---GCGTAC-ATGA-A---CGG-T-C-AA---------------TTCTA---------TAAA-GT-ATGA------C--TTTGCT--AT--AATGACACA-ATC----------TTGA----AGTA--GC--ACGC------TT-AGT-AAA-ATATACTTCCAAT-------AGAT----GTAATTACTGGCAG-GT-TGCCATTGTCT---T---AATGATA-TG---GGCCAG-TTTACGTTAT--ATA-A-TCA---GC-CATGAA-GAAA--GTG----CGA-----CG-A----CT-CTTTGGAAGCAT-A-ACTTGCT-AAAAT-AGGTGTGAAATAATTAGTAGTGAAA---TAT--AAATTTAA--TGA-TT------G-CGTTAGTTGAATGGTGG--GCATTA-TAG-AA-ACAATGAA--AT--AAT--T-AAGTT-CAA---T--AA-G-----TTA-A-TGTTGATAGA-AATAC-T-TC---------ATATATTTGA-TATTATAGTAAAA--A---AAG-ATA-A--------ATATTA-TGC--CAA--AAC-G-AAATCATT-GTA--TA--TTTTTT--------AA--TGT-C---TG-TTAGACTCTTTATGCTGAGCA-TAT---AAATGA
gi|3 : cgtcG--TTAGA--C-TCTTTATG-CTGAGC-AT--ATA----A-ATGAGC----T-CG--T-G--------AGATTA--ATGGTT--GAAAGTAGTACAG-GGTCCAGAAAC--TTAG-AGA-TATTTGTC------CAT-TGGCTAATGGA---------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-TTA------TCGAA-----ATTGA----TAAAC----TGG--AATCAAA-GA----TAGA---GAAAA--CTTGTTAGTGTAG-ATATC---A-ATT------TTGGTAA---TTCAAAGGCCATATGGCGAATTTTTG-TATGAT---TACTG-CTT--TATT-T-GCTAC--TGG--AAGCTGTTGAA-TGATGAGCTTCG--GTT-GTCGCGAC---C--TCGGCAA-A--C-AACA-A-G-TT-GT---AGAATC-TTCAATC-----ATAA-T-AT-CAGAA--GTCGA-CTTTCAT-GTATT------GGTTCAAACA-TGTAC---GATA--CG-AAATTC--GGGAAGT-AAC---T----TAA-GATTTTGGTC-CCC-TAGAC--AAGT-ATG-CTGGATAT--GAGTT-GAATATCTGAGATG---C---CAA----TC-TC----AAAAAATGGAGACTTACGCCT--C--ATGATTC-TA-AAGACAAATACAT--AACCATTTG-TC-CAAAA-ACCACA-TGTATGAT-CATC-TGC-AGA--------CAC--------A----TGA-TAAGGAAAAACAGG-GTC-GCAATTTGTTTAGATGCG-------G-TATCTG--AAAAAA-AAGCCGTTC-CAAC-TA-AA-C--AACCGTACC-TCTAGTGA-G-G-GAGGG-T-----TGTTAATCT---AC-----ACTAACC-AC-TGATGAAGATAG--ACTTT--------TTATG-TG-AGGAT-A-C-GTTC--ATCACGCTGCCCT-AT-T-C-AATAGAGAA-TG--GC-AT-TC--G--C-AGGTTA---T----A-G-CTA-CG-----ACAGGATGGT-----GGTT----TTGC---A-CT----AT--CC-TG-ATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAACGTGTATGCgctcgtgagattaatggttgaaagtagtacagggtccagaaacttagagatatttgtccattggctaatggaaattatcccaactcgttatcgaaattgataaactggaatcaaagatagagaaaacttgttagtgtagatatcaattttggtaattcaaaggccatatggcgaatttttgtatgattactgctttatttgctactggaagctgttgaatgatgagcttcggttgtcgcgacctcggcaaacaacaagttgtagaatcttcaatcataatatcagaagtcgactttcatgtattggttcaaacatgtacgatacgaaattcgggaagtaacttaagattttggtcccctagacaagtatgctggatatgagttgaatatctgagatgccaatctcaaaaaatggagacttacgcctcatgattctaaagacaaatacataaccatttgtccaaaaaccacatgtatgatcatctgcagacacatgataaggaaaaacagggtcgcaatttgtttagatgcggtatctgaaaaaaaagccgttccaactaaacaaccgtacctctagtgagggagggttgttaatctacactaaccactgatgaagatagactttttatgtgaggatacgttcatcacgctgccctattcaatagagaatggcattcgcaggttatagctacgacaggatggtggttttgcactatcctgatgtgattttgcagttgctaaaacgtgtatgcaa
gi|4 : cgtcggccagtaaccatacctccccccctctatggatttctacactatgattttttgaaaggtgtaggtaacaaataaagggtaacacggacgagttagatttgagcaattcttatgttgggcgtttcaagtatatgatattggaattataaatttttggcaattcagaatagccataactgtgttccataccgcattacctttgtattaaagggaacaaaacaaccaacggttttaagagttgccagaaaggacatcgatgagcaatatatgttagagatatataaaggacagtcataagacgaagtagccatggtgcatggatgcaagaatttttttttttcattggcctatgccattgactagattaacatcatattagaacatcaaattttatgcatggtttgcatgtggcttagtattgaataagcgtacatgaacggtcaattctataaagtatgactttgctataatgacacaatcttgaagtagcacgcttagtaaaatatacttccaatagatgtaattactggcaggttgccattgtcttaatgatatgggccagtttacgttatataatcagccatgaagaaagtgcgacgactctttggaagcataacttgctaaaataggtgtgaaataattagtagtgaaatataaatttaatgattgcgttagttgaatggtgggcattatagaaacaatgaaataattaagttcaataagttaatgttgatagaaatacttcatatatttgatattatagtaaaaaaagataaatattatgccaaaacgaaatcattgtatattttttaatgtctTGGGC-----GTAA-CACAT-ACT-----CCCCC----TCTA-GGG--ATTTTTCTT---A-C--A-T---ATGA--------------------------------A--T-AA---------G-T-AA----CTA-T-G--TTTG--T-TT--------GAACCCAATTTC-ATGTTTGGGAG--G---------CGTGTT--C-----AAG-ATATG--TA-TT--GAA-TTG--AT-C-AATTTTTTG-G-CA-A-TTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-TCG-TT-C----ATCATA--CGATG-ATTAT-A-TTGTA-TTAA------GA-GCAACTA---CA--CAG---------------------------AA-----TTATTC-AGAG---TTT-GCA--GAA--GGAC---ATCGAT--GTG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TA-ATAGACTTACAAGA-------------T--A--T---TTTATTTTCATTT--GGG----TGC------T--TG-CCCTTG------------CC-C---TAGTCAAC--TAT---C-GATC-TGA----AT--CATGT---CA-ATTATG--G---G-GTTC-TAA---------AGTAT-TG-AT-----A---GCGTCTAATG--A---CGGTC----A--------------TTT-TA----C-----AAA-GT--TGA------C--TTTT-TTAAT--AAT-ACACA-AT-----------TTGA----ATTA--TC--AC-C------TT-AGT-AATAATA-ACTTCCAATG-T-AAAATG-----TTAAT----GGC---GTAT-CCA-TGTTC---TTTAAGTG-T--TG-GAGG-CCA-TTAAT-GTAT--ATT-A-TC----GC-AC--AA-GAAGT-GG-----CGT-----TG-T----TT-CTTTGG--GCCT-A-CATG--TAAAAATAAGG-G----------------GAAA---TATACAA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAG--A-AC-ATG-A--AT--AAT--T-A---A-CAA---T---A-T-----GTAGA-T-TTGAT-GA-AATATAT-TCTATTAATATATATATTT-A-AA-------AAAA--CAAAAAA-AGATA--------ATATC-CTGG--GGACGCGT-A-AA---ATT-GTATTTAATCTTTTT--------AATATTA-C---TGATTAGGCCATTTAaa
gi|4 : TTGTTA-G-G---TGCGT-G--T-CGAGTAG--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--AG--TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGGTCAATC-AA-GA----TAG----GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GGTA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-A-GTTGAC---------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGT--ATACA----------ATGT-C-------A--GC---ATGAATGGAT-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TC----A--------------------------TGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAA----ACA-GTC-TCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAGGATT-----TGATTATC----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGA-AGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA----AGAA-TGAA-CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCatttgttaggtgcgtgtcgagtagaattatggttatggagtttagtggtagacaagaagtatttgtctttatgttggcatattgccactggtataaatgattaactggtcaatcaagataggaaaacttattgttagcatgtaatttggtattaaaggattgatatatttttgcgctattgtacgcgaaagctttgacttgcttgcttggttgtcggcaaagttgacgattctaataattaagacgtgcttcatagtttgggtatacaatgtcagcatgaatggataatgattggtcctgaaaattgtatgtaggtgattgacttagggatgggatgctttcatgtttctaaaagacaaaacatgactttgtctacatgcatgatctatctgctaggacccagtgataaggaaacagtctcaatttgttggatgtctgaaaaagcggatcaataaacaatccgtaactctaagggcaggatttgattatcatacacaacactgatgaagaagatctctgactcgattgtcatgattatatcggttcatcactgccctaatacaaagaatgaactataacagcaggttaattttcagctctcacaagaaggagttttgtgtaacatatccttgtgtgattttgcagttgctcacaaagtgtatgcata
gi|5 : tgggcgtaacacatactccccctctagggatttttcttacatatgaataagtaactatgtttgtttgaacccaatttcatgtttgggaggcgtgttcaagatatgtattgaattgatcaattttttggcaattcagtatagccattactgtcgttcatcatacgatgattatattgtattaagagcaactacacagaattattcagagtttgcagaaggacatcgatgtgcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacattaatagacttacaagatattttattttcatttgggtgcttgcccttgccctagtcaactatcgatctgaatcatgtcaattatggggttctaaagtattgatagcgtctaatgacggtcattttacaaagttgacttttttaataatacacaatttgaattatcaccttagtaataataacttccaatgtaaaatgttaatggcgtatccatgttctttaagtgttggaggccattaatgtatattatcgcacaagaagtggcgttgtttctttgggcctacatgtaaaaataaggggaaatatacaataatgatttagctgtagagaatggggcatatagaacatgaataattaacaatatgtagatttgatgaaatatattctattaatatatatatttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatGACGAAA--A---CA--CA-C--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACAATA-TA-TT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--TATTTTT-TTTTCGTTT--GTGCCT-TGCCAT---T---G-ACC---------------------------GAGCTTA---------------------ACATGCGA-T----TATG--GCA-G-G----------G--CT-ATTAT--GAATA---AA---GC-----------------TT-T-AAA-------------TTTCTA----CAAAGTACATGT-ATGA------C--TTTG-T--AC--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATGT----T-AATTACTGGCAG-TT-T-CCA-TGTCT---TT--AATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATG-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAG-GTG----TGT-----GGGA----CT-CTTTAG-AGCAT-A-CATG-CT-AAAAT-AGG-G----------------GATA---TAGG-AA---TAC--TGA-TT-TA---G-CGTTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT---TT--CAA---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------TTATATTT-A-T-----------A--T---AAG-ATA-A--------ATA-TACTGC--CAA--AATAA-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCTTTTAT-CTGGGCATTATATGAAATGAata
gi|5 : G--TTAGA--CCT-TTTAT--CTGGGC-ATT-ATATG-AA-ATGAGT-G--T-TG--T-GTTAG----A-ATTAACATGGTT--GAGAGTATTACAGTAGTC-AGA--A--TGAG-AT--T-TTTGTCATTT-ATGTATGG---A-------------AATTAT----------CCGA-A-CTC--ATA------TC-AA-----AATGA--TATAAAC----TGG--AATC-AAAGA----TAGA---GAGAAGACTT--TG---TAGCATATC--AA-AAT------TTGGTAAA-TTCCAAAGAA-----GGCGGA--CTTGA-ATA-----TTCTA-CGCA-TA-T-T-GCTAC--T-GACAAGC-ATTAAA-T-CTGCA-TTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCCGC------C-AACA-A-G-TTGA----AGAATC-T--A--CA----ATAATA-AT-CAG-A--AAGGGGACTTCATAGTATT------GGT--Agtgttgtgttagaattaacatggttgagagtattacagtagtcagaatgagatttttgtcatttatgtatggaaattatccgaactcatatcaaaatgatataaactggaatcaaagatagagagaagactttgtagcatatcaaaatttggtaaattccaaagaaggcggacttgaatattctacgcatattgctactgacaagcattaaatctgcattcgcattggccctttccgccaacaagttgaagaatctacaataataatcagaaaggggacttcatagtattggta
gi|6 : gacgaaaacacacagcttttaagagtttgcagaaaggacatcgatgagcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacaatatattgactgcaagatatatttttttttcgtttgtgccttgccattgaccgagcttaacatgcgattatggcagggctattatgaataaagctttaaatttctacaaagtacatgtatgactttgtacaatacacaatcttgaattagcaccttagtaaatataacttccaatgtaaaatgttaattactggcagtttccatgtctttaatgtatggaggcccattaatgtatataatcagcaaaagaaaggtgtgtgggactctttagagcatacatgctaaaataggggatataggaatactgatttagcgttagagaatggggcatatagaaaacaatgaaatttcaatcaataatgtaatttgatgaaatatattcttatatttatataagataaatatactgccaaaataaaaattgtataatttttttaattttct-G--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--AG--TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGGTCAATC-AA-GA----TAG----GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GGTA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-A-GTTGAC---------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGT--ATACA----------ATGT-C-------A--GC---ATGAATGGAT-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TC----A--------------------------TGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAA----ACA-GTC-TCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAGGATT-----TGATTATC----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGA-AGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA----AGAA-TGAA-CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGC
gi|7 : GCTTTAAC-----G-G-AGAAGATCA-TT-TGAA-TT---AT-CCAATCTTT-GCG-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TATCT----G-T-G-TC-C----AT---A--C---GCATTAC-T-TTGTA-TTAATGC--GGACC-AA--A---TA--CAAC--------------------------AGG----CTTTTA-AGAG---TT--GCA--GAAAAGGAC---ATCGAT--GAG-CAA-ACAT-T--TAGA---ATAGTAGAAGACAGTACGGCT--ATCA--TATGGG--AAATTTAGCACACT--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--ATTT---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAA---T--TG-ACC
gi|8 : T-G--CT-AG-AT-TGGATA---AA---GTGTTCCATNN-N---NNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTA----C----AAAC-GT-ATGA------CGGTTTGGT--ATTTAAT-ACGCA-ATC----------TTGA-----TTAAGGC--AC-C------T--AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-ACAA-AT----T--ATTAC--------T-A-CCT-TGT-C---TTTG-ATG-TA-TGAGGGGACCA-TTAACTGTAT--ATA-ATTCA---GCAAA--AA-GGAAC-GT-----CGT-----AG-A----C--CTTTGG-AGTATCA-AGTGGCT-AAAATCAGGCG----------------GAAA---TCT--GA---TAGATTGA-TT-TA---G-TTGTAG--GAATG--GG--GTA-TA-TTAGAA-ACAATGAATTAC--ATT--A-A---T-CAGT--T--AA-T-----GTA-ATT-TTGAT-GACAATATATATC----------TATATTT-AGTA-------AAAA--ccgcgcttacatttgcgaacgtcatggccgcaggataattgatatagaaactgcgttaccgatcgaaggtttatttacaatctattctaatacaaagtacatagtgttaaaatgatgcttatgtattagacaatgttactaacaatcattgaat
gi|9 : TG-TC-T--AA-ACCACA-TACATGACTCATC-CGC-AGG---C----CAC--------CGA--TGA-TAAGGAAAG-CAC---TC-TCA-----TTTGGAC--ATACAAATG-TA-ATG--TAAAAG-CGT-----T-AAAC-TT-AACC--AACC------TCCA-----G-G-CAGGA-TGGTTATGTCTACA----AC-----AA----C-ACCTAATGAAGA-AG-TACTTTA-CTCG-ATATT--TG-ATAAG-A-CAGCTCCAATCG-ACTGCCCT-AT-AAC-AG---AAAA-TGCCACTGT-TC-AG--T-AGAATA---T-T-CA-G-CTA-TTTTAATACAAGAAG-C-----TATC-AAATTTT--AA-CT----AT--CCTCCCATG-TGA-TTTGGCAG-TTGCT-AAAAAGTTTATGC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CAAGTGAGTTCAGTACATCATGGAAAGGCAAATGTAACTATCC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1 22222 1 111111111111111 1111111 33333333333 1111111 11 11111111 111 222222222222 2222222 11 111 111 222 11 1111 2222 111 111 5555555555555555555555555555555555 11 333333333 1111 3333333333333333333 22222222 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222 111 1111 111 111 555555555555555555555555555555 33333333333333 222222222 1 22222222222 11111 111111 11111 1111 11111 11 111 1 22222 1111111111111 111 1 1 333333333333333333 33 111111111 111 11111 2222222222 2222222222 33333333333333333333333 1111111111111 111 11 1 44444444 11 111 1 1111 1 1 11 222 11 1 11 1 2222 222 222 11 1 222222 1 222 11 11 1 11 1 1 11 111 222 1 11 11 222222 1 1 1 1 11 22222 3333333 11 222 1 33333333 3333333 2222 1 222 2222 11 11 11 1 1 1 11 1 1 222 1 1 1 1 22222 11 1 22222 11 333333333 11 44444444444 1 222222 55555555555555555 1 1 333333 1 2222 2222 2222 1 222 11 1 22222 11 1 44444444444 222222 1 3333333 1 1 33333333 1 2222 222 11 11 1 11 111111 22 1 11 222222 444444444444444444444 22 2222 11 222222222222222 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 1111 11 1111 1111 11 222 2222 22222222 222 3333333333333333 222222 11111111111 1111 1 2222222222 11111 222222222 888888888888888888888888888888888888888888 2222222222222 1 111111 666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 2222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1111111 1 555555555555555555555555 22222222 1 3333333333333333 2222222222 1 222222 8888888888888888888888888888888888888 1 1 22 1 2222222 4444444444444 222 11 2222222 22222 222222222222222 1111111 2
lowQualScore : 6666 3 5 5 2 00000 5 0 66 00 666666666666666 1 4 8888888 66 4 66 4 00000000000 4 9999 2222222 4 00 4 66666666 222 7 7 777 555555555555 55 4444444 4 4 11 4 333 111 4 8 4 4 1 222 11 5 0000 5 5 5 5 2222 888 66 777 5 5 5 5 222 555 66 777 66 4444444444444444444444444444444444 55 888 55 66 66 888 66 5 0 1 5 66 888 5 2 0 000000000 77 888 999 22 5 66 7777 5 8888888888888888888 888 5 77 1 5 0 22222222 5 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333333 99 777 777 666 77 5 5 0 5555 000 333 333333333333333333333333333333 77777777777777 5 000000000 1 77 77 5 5 55555555555 22222 77 77 5 666666 5 5 1 5 555 1 77777 5 7 9999 777 6 99999 555 5 5 5 5 5 00 77 5 5 000 5 77 1 99 55555 6666666666666 5 55 5 222 0 5 0 888888888888888888 888 00 888 66 5 5 888 5 77 66 66 4444 6 4 66 666666666 777 4 222 66 4 11111 4 8 4 4 4 5 5 8888888888 6 2222222222 66666666666666666666666 0 99 9999999999999 444 8 11 0 33333333 33 8 444 8 0 99 2 8888 888 5 5 88 111 88 5 88 5 3333 111 000 88 5 444444 1 1 5 111 88 88 5 1 88 5 5 1 88 999 111 5 22 66 88 999999 5 5 5 5 1 1 66 66666 1111111 88 000 22 5 44444444 2222222 3333 5 111 3333 88 88 88 5 5 5 88 5 5 111 5 1 5 5 1 5 66666 88 5 1 77777 88 999999999 1 1 88 11111111111 5 1 999999 99999999999999999 5 1 1 5 000000 1 5 4444 5555 4444 5 000 88 333 5 77777 1 88 1 5 33333333333 888888 5 2222222 5 5 55555555 5 1111 111 1 88 88 5 33 1 444444 33 0 44 888888 444444444444444444444 6 11 5555 7 6 33 444444444444444 5 99 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 7 4444 88 6 6 4444 9999 99 77 222 2 3333 6 88888888 111 9 4444444444444444 9 333333 6 77777777777 4444 0 9 2222222222 66666 6 99 888888888 1 3 222222222222222222222222222222222222222222 6666666666666 1 1 2 999999 99 555555555555555555555555555555555555555555555 88 99 9 6 44 99 1 6 666 99 5555555555 5555555555555555555555555555555555555555555555555 1 5 5 77 0 5 7777777 5 0 5 0 777777777777777777777777 5 55555555 5 0 9 0 9999999999999999 66 3333333333 5 77 5 66 0 5 111111 5 5 0000000000000000000000000000000000000 5 6 5 1 5 11 5 5 1 1111111 2222222222222 5 000 66 5 77 5 0000000 5 5 5 88888 0 999999999999999 66 2222222 66 8 5 5 0 5 0
lowQualScore : .... . . . . ..... . . .. .. ............... . . ....... .. . .. . ........... . .... ....... . .. . ........ ... . . ... ............ .. ....... . . .. . ... ... . . . . . ... .. . .... . . . . .... ... .. ... . . . . ... ... .. ... .. .................................. .. ... .. .. .. ... .. . . . . .. ... . . . ......... .. ... ... .. . .. .... . ................... ... . .. . . . ........ . ......................................................... ....... .. ... ... ... .. . . . .... ... ... .............................. .............. . ......... . .. .. . . ........... ..... .. .. . ...... . . . . ... . ..... . . .... ... . ..... ... . . . . . .. .. . . ... . .. . .. ..... ............. . .. . ... . . . .................. ... .. ... .. . . ... . .. .. .. .... . . .. ......... ... . ... .. . ..... . . . . . . . .......... . .......... ....................... . .. ............. ... . .. . ........ .. . ... . . .. . .... ... . . .. ... .. . .. . .... ... ... .. . ...... . . . ... .. .. . . .. . . . .. ... ... . .. .. .. ...... . . . . . . .. ..... ....... .. ... .. . ........ ....... .... . ... .... .. .. .. . . . .. . . ... . . . . . . ..... .. . . ..... .. ......... . . .. ........... . . ...... ................. . . . . ...... . . .... .... .... . ... .. ... . ..... . .. . . ........... ...... . ....... . . ........ . .... ... . .. .. . .. . ...... .. . .. ...... ..................... . .. .... . . .. ............... . .. . ................................................................... .... . .... .. . . .... .... .. .. ... . .... . ........ ... . ................ . ...... . ........... .... . . .......... ..... . .. ......... . . .......................................... ............. . . . ...... .. ............................................. .. .. . . .. .. . . ... .. .......... ................................................. . . . .. . . ....... . . . . ........................ . ........ . . . . ................ .. .......... . .. . .. . . ...... . . ..................................... . . . . . .. . . . ....... ............. . ... .. . .. . ....... . . . ..... . ............... .. ....... .. . . . . . .
lowQualScore : 4444 9 7 0 0 00000 0 0 99 22 888888888888888 1 4 9999999 11 4 11 4 11111111111 4 7777 9999999 4 66 4 11111111 222 4 3 888 000000000000 55 0000000 0 4 77 4 333 777 4 9 4 4 9 444 99 0 6666 0 0 0 0 5555 888 99 111 0 0 0 9 222 222 11 888 11 3333333333333333333333333333333333 22 888 11 99 00 888 99 0 1 4 0 99 888 7 3 7 222222222 99 000 333 11 0 99 1111 0 4444444444444444444 888 0 99 4 7 7 33333333 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777777 22 555 555 111 99 7 7 1 0000 000 444 999999999999999999999999999999 00000000000000 7 000000000 4 99 99 7 7 77777777777 33333 99 99 7 444444 7 7 7 7 999 4 11111 0 6 3333 777 7 00000 999 7 7 7 3 7 99 99 7 7 000 7 99 4 33 77777 3333333333333 7 99 7 333 1 0 0 222222222222222222 888 66 888 99 0 0 888 0 11 11 11 6666 2 4 11 222222222 888 4 222 11 4 11111 4 9 4 4 4 0 7 9999999999 7 8888888888 33333333333333333333333 8 00 6666666666666 000 0 00 6 00000000 66 0 000 0 6 66 5 2222 555 5 0 00 000 55 5 55 5 0000 555 555 00 5 555555 0 0 0 555 55 55 5 0 00 5 5 0 00 000 555 5 00 55 00 000000 0 5 5 0 0 0 55 55555 5555555 00 555 00 5 55555555 5555555 5555 5 000 5555 00 55 00 0 0 0 55 5 0 000 5 0 5 5 0 0 55555 55 5 0 00000 00 000000000 0 0 00 55555555555 0 0 000000 55555555555555555 5 0 0 0 000000 0 0 0000 0000 5555 0 555 00 000 0 00000 0 55 0 5 55555555555 000000 0 5555555 0 5 55555555 0 5555 555 0 55 55 0 88 0 888888 88 0 22 444444 444444444444444444444 7 77 8888 3 7 33 222222222222222 5 88 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0000 3 2222 33 7 7 2222 0000 22 00 555 5 0000 7 22222222 222 3 5555555555555555 8 555555 7 00000000000 8888 8 8 5555555555 88888 7 22 000000000 0 2 222222222222222222222222222222222222222222 7777777777777 0 0 0 222222 22 222222222222222222222222222222222222222222222 55 22 8 7 00 22 0 7 888 22 1111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333 0 7 7 99 1 0 1111111 0 9 0 0 000000000000000000000000 0 11111111 0 2 4 1 8888888888888888 99 2222222222 0 55 0 99 7 4 111111 7 7 6666666666666666666666666666666666666 7 0 0 4 7 44 7 7 4 6666666 1111111111111 7 999 99 7 99 7 4444444 7 7 7 66666 1 111111111111111 99 6666666 99 8 0 0 1 0 0
consensus : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGN-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T---AAG-ATATA--------ATATTACTGC--CGA--NAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--ATACATGTAG---AATGT-CG-AA--TA--GCGAAATGAACGGAT----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
Reference ( family-288 ) : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGN-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T---AAG-ATATA--------ATATTACTGC--CGA--NAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--ATACATGTAG---AATGT-CG-AA--TA--GCGAAATGAACGGAT----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
gi|1 : --A-T---AT--TTTTTTG-AGAGAAGATAGTG---GT-AGAAAAATT-AA------ATGG-T-AA-AGGCGG-C-GG-TT-G--T-TTTTGCAACCAA---CATGTTTT-TGTT---GGG--GACTGAAATGCGTTTT--CTCAACA-G-ATATGATCA-TTCTGAAATTT--AT-C-AATTTTT-GTG-CACAATTCAACA-AGAAACCATAATA-CGAAAAG-T-GATT-CTCCAAT---AGGC--TGCATTAC-TATTGTAAGTAATGCTAGTACGGAA--ATCACA--CAAT--------------------------AATAAGTCTATTATAGAAGCTTTT-GCATGGATAAGGACTTCATCGATCTGAGTCGATG--T-TGGTAGA---ATA-TAGA-GACGG------TGCATCAAATATGG-------------TA-T--TA-A--GAC-TGCGAGAATGAGAGCTAATTT--A--T---TAT-TTTCAATTTTGGTGCCT-TGCCATGAAT--TGCACCTTACGATTATGTGACTCGCGTGTAA--AACTTTATAATC-TACTC-T--AAAAATT-ACATGTAA-T--ATTATGTTGCA-GTGTT--TAAGTCG--CTAAGTCT-TGAATATATAAAGCGCGTA-GATGG-AAATCGGTTATAAA--------------TTTCTAAATTCG---TA-A-GTAATGAAATCGTC--TCAG-T--GT--TAT-AAATA-ATCCAAGCGATGTTTGAGAATATTA--GCAAAT-C------TTAAGTAAAATATT-ACTTTCAATGTT-GAAATATTATATTAACTATCGGCCGTTT-T-CCA-TGTCCCTATTTGCATG-TA-T--GAGGTCCATTTAATAGTATCAATA-A-TCATGCAC-AA--AATGAAATCGTATATACGTAGTACGG-ACTACCT-TTTTAG-GGCAT-ATAGTGGCT-AAAAT-AGG-T----------------GAAA---TATTAAA---TAA--TGA-TTATA---G-CTGTAG-GGAATG--GGAAGAA-TATTAGAAA-ACAATGAA--ATAAATTTAC-A---TACAAAGGT--AA-TCGAAAGTA-C-T-TTGA--GG-AATATAT-TC---------G-ATATTT-A-TA-------AAAACTT---AAT-ATGTATATAAACTATATTAAGGCATCGA--TAC-ATAA---ATT-GTA--TAATTTTTTTTCTTTTTAAAT-TTTACCAATG-AT-GACTCTTGATGTTTA-CA-TAGAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGA--TGATTGACATTAATATAGGAGTCCGAG-ATTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTG-CTATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGGCATTTGAACC-T-TTTATCACTGAGCAATAAATA-GTCA-ATGAAC-GATC-CG--T-GGGATAGAAA-ACTA-CATCGTTACACGAGAATTACAGTGGTC-AG-CAAATTGAGCAGCATATCTGTCATT-----T-TAGC--ATCGAATAGACAGGAATTATGCGAGAAATGTCCACA-CTTGTTTAAGGCGTCC-AAATATAATTGAGCT-TAAACACTGTGG--AATC-AA-TAGTATTAGATACGAGAA--CT--TTGA-GTACAACATC--AATATTG-----TGGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTTGTATGATAAGTTCTGATGCAATA-G-TAGCTACTTTGGACAAGCTATTAAACT-CTAGTATTCACTATTAG--GC--CACACTTTCCACCA-ATGA-CACA-ACG-TT-ATAAGAAAATCGT--A--CTTCAGATAA-ATGTACAG-AAGGCCGCGTCTTCATAGTATTCTAGTCAAT--ATGCATGTAGCTTAGTGA-CGAAA--TAGTGCGAAATG-ACAGATAAC-CAAGAA--TTGAGTCCCC-TAGAACCAAATAATTGATGGAGAA--GAACTAGAT---CCTAGTAG---C---ATA----TTCTCGAGAGAAAG---------------CCTC--ATGGTTCAAA-AAAACCAATACATGAGACAATTTGCTCGC--AAGACCATA-TGCATGA-CTATCGCGC-AGGCCAC----CACTGGCGAATAGCCTTGATTAATGAAAGACACGTGTG-TCA--TTGTTTGGAA--C-------A-TA-CTG--AAAAAA-AGT-----TACAAC-CCTAACC--AATCGTACCTGCTT---A-G-GACAGAG-A-----TGCTTGT---------------------T-TAATGAGCA---GTACTTTG-TTCGAACTGT--TG-ATTGT-A-CGGTTC----CA-ATTACCTT------T-A----AGAATTCAA--TAT-TCGAGGTCGAGGTTA---TGT-CACGTCTACTCCGTCAACGAAAACGCACAGATGTC-AAAATGTAAAA-GTACTGAC--CCTTGCATACTGATTTTTGCAGTTTGCTAAAAAAGTGTATGC
gi|10 : ggatatattttgCATGGGC-C--AGCAA-CACCC--CC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--CTTTTTCT----A-C--A-C----TGATTTTTTG-AAAG-------CGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGA-CGG--TT-G--T-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--CA----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-A-AATTGTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CC----G-T-G-TTCC----AT---A--C--CGTATTAC-T-TTGTA-TTAAAGC--AGAC-GAA--A---CA--CAACTGTTACAGACGAAACACAACTATTACAG-----TTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAA---------TTCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAA
gi|11 : cCATGGGTTC--AGAAAGCACATTACCT----CCCCCCC-CTCTG-GGG--ATTTTTCTCTCCA-CTAA-T---AT-ATTTTTT--AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-G--T-AA-A--CGA-C-G--GT-G--T-TT--------GA---CTATTCTAATGTT---GGA-------------GTTTT--CA----A-G-ATATGGTCA----------------------TTTT-G-GACA-AATTCAGCAT-GA--CTAT--TA-CT----G-T-G-TT-CCA--AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-GT--GGC---AACG---------CA--CCAC--------------------------A------C---------G---TTTCGCA--GAAA--GAC---ATCGAT--AAG-CAATACAT-T--TAGA---A
gi|12 : gacGGC-CCGAGTAA-CACATTACCTCCCCCCCCCCC-CTCTGTGGG--ATTTGTCA----A-C--A-CTTGATGATTATCTGCAGAA-------TGT--GT-ACGAAA--TTAACAGGTCA-GA-T-CA-A--CGC-A-G--TT-GA-T-TT--------GA----AATTTCTATGT----GGG--G---------CGTTTT--C-----AAG-ATATGATTA-TT-TGAA-TCTTGAT-C-AATTTTG-G-G-CA-AATTCAGTATAAA--CCCTC-TA-CT----GTT-G-TC-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-------TTAAGTC--AGA--GGA--A---CG--CAAT--------------------------AG-----CTT
gi|13 : cctCATTTTGTT-GGAT--A---------TA-CTG--AAAAAA-GCG-----T-CAAC-TA-AACCTGAACCGTACATTCTA---A-GAG-CAGGA-T------GGTTATCTACAAC-----A-----CCACCTGATGAAGA-AG-TACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTATTA-TGGTTCCAATAA-CCTGCCCT-ATTA-C-A----AGAA-TGGCACTAT--C-AG--C-AAGTTA---T-TTCA-G-CTA-TC-----ACA-GAGAGC-----TGT--AAAATGC--AA-CT----AT--CCCTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTA
gi|14 : A-T--TAAA--GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---ATT-TTT-CATTG--GTGCCT-T--------------ACCTT-------------TC-C-----AT-A------------------T--A-----T-ACATGCAT-TATATTATG--GCA-T-GTGC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GTATATGATGT-A---TGGTT-C--A--------------TTTCTA----C-----ATA-GT-ATAA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----GTTA--AC--AG-CTGCAGGTT-AGT-AAATATA-ACTTTCAATG-T-AAATTA-----TTAATTACCGACAT-GT-
gi|15 : aaTGTACG-AA--CA---CGAAATGAA--GATAATACAAT-A--TTGAGT-CCCCTAAAC--AAAT-AT--CTGG-GATAGGAAT---A----TTCAGGAA---AATGGGA----AC-T-------AGC---------------C--C--ATGATTC-TA-AAGACCAAAACAT--AACCATTTG-TCTC--AA-ACCACT-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----ATC--------AG---TGA-TAAGGAAA-ACAT--GTT-TCAATat
gi|16 : TTTAACG-TA-TG-GAGGTCAA-TTAATG-TAT--ATG-A-TCA---AT-AA--AAAGAAAT-GG-----CAT-----GG-A----CTACTTTTA-AGTAT-A---TAACA-AATAC-AAA-A----------------GAAACCCTACTAAA---TAA--TGA-CT-TATCGA-CTACTA-AAAGTC--AA--ACA-GA-TTAAAA-ACAATGAA--CTA-ATT--G-A---T-CAA---TTGAACT-----GAA-A-T-T--AT-GA-ag
gi|17 : CTCCCC-CTCTATGAG--ATTTT-CT----A-C--CCT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA---------G-TAAA-A--CGC-C-A--TT-C--TCTT--------GA---CAATGTAT-TGTT---AGC--G---------C-TTTT--CCA---A-G-ATATAATCATTT-TGAA-TTT--AT-CAAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAct
gi|18 : gtaaatacataAATT--------TCAGGAAAATC---GGA----TT----------AA---------------C--CTCATGCTTG-TATAAGACCAAAACAT--GACTATTTG-TC-T--CA-ACCACA-TCTATGACCCATC-TGC-AGG---C----TAT--------AGCGATGA-TAAGGGAAAACAT--GTCATCA--TTG---------A-------C-TG-CTGTAAAAAAC-GCG-----T-CAACTTA-AGCC--AACCagtgtagtgtg
gi|19 : aaCATGGGC-CC-AG-AA-C-CAATACC-----TCCCCCC--TCTA-GGG--ATGTTTCT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GTAAAAAAA--T-AA---------G-T-AA-A--CGA-CAG--TT-G--G-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---TGGCCG---------CGTTTT--C-----A-A-ATATtcg
gi|2 : accCGTGGGC-C--AGTA--CACATTACT-----CCCCCTCACTCTA-AGGGTATTTTTCA----AGC--A-T---ATGATTTTTTG-ACAG-------TGT--GT-AAAA----T-AA--------GG-T-AA-C--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAAATTTT-TGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT--GAA-TTT--ATGC-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGCATAAA--CCAT--TA-CG----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTA--T-TTGTA-GTAATGC--AGACGGAG--A---CA--CAAT--------------------------AG-----CTTTAT-ATAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CA-----T-T--TGGA---ATA-TAGAGGACGG------G--ATCA--TATGGA--AAG----G-ACT-T--TTTTT-G----GCGAGA-------------TC-A--T---TTT-TATTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---TATTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--CCT--A-----TTACATGTAAATA-ATTATG--GCA-G-GTGT-TAAGT-G--CT-AGTATGTGAATA---AA---GCGTACGATGATA---TGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TCCA-GT-ATGA------CG-TTTG-T--AT--AAT-ACACGTATG----------TTGA----ATTA--GA--AC-A------TT-AGT-AAATATT-ACTTC-AATG-TTAAAATAT----TTAATTGCTGGCTC-GT-T-CCA-TGTT----TTTGAATG-TAATG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATAGA-TCA---GC-AA--AT-GAACT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGCTT-AAAAT-ATG-G----------------GGAC---TAT--AA---TAA--TGAATT-TA---GGCTGTAG-GGAATG--GG--GAA-TA-TAGAAACACA-TGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GG-AATAT---TT---------ATAT-TTT-A-TA-------AAAAATT---ATGTATATA--------ATATTATTGC--CAT--GCT-A-AA---ATTTGTA--TA-TTTTTTTGTA-----AAG-TTT-C---TG-CT-GAC--TTTATGTTGA-----ATAGAAAATAAAA-ACC-AAGCAA--TCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTTT--CA-GTTC--CA-TC----AAT---AAATCA---CCATA--AAATA-TTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTGTA--AAGGATTTGAT-GACGATAATATAGG--TCCGAGAATTA-GAAGTAG--AGTC--ACAAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGATTGT--TATTCAA------AACGCATAC-TTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGG--TTTGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ACTGATA-G-AATATGAACGG--TGTG--T-G--------A-ATTA-CATGGTT-TGAGAGTATTACAGTGGTC-AG--AA--TGAG-AT--TATTTGTCATTTGATGT-TGG---AT------------AATTAT----------CCCA-AGCTTG-TTA------TA-AA-----A-TGA--T-TAAAC----TGG---ATA-AA-GA----TAGA---GAGAA--CT--TTG--GTAGC-CATCAAAA-ATTTTTTTGTTGGTAAATTTCCAAAG-------GGCAAA--CTTG-TAT-AT---TTTTG-TGC---A-TGT-G-TAC--TGGACAAGATATTAAA-T-CTGTACTTCAC-ATT-G--GC--C---CTTTCAACAATA-G--AACAGA-GTTT-A----AGAAT--T--A--CT----ATGA-A-AT-CAA-A--GGCGGGCTTTCATAGTATT------AGT--ATAGAGTTAG---AATGT-CG-AAT-TG--GCGAAATG-ATAGAT----CCAAGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--GAAT-AT--CTGGAGAA--GAAAT-AG----ATTACGAA---C---AAA----TT-TC----AAAAAAG-------------C--T--ATGATTC-TA-AAGACAGAAAT-T--GAACA-TCG-TC-C--AA-ACCATATTGCATGATCTATC-TGC-AGG--ACCGAGCACTGGGA---AG---TGA-TAAGAATAGAC-TA-TTC-TC-ATTTGTTTGGAC--A-------GATA-CTG--AAAAAA-AGA-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCT----A-G-G-AAGGA-------TGCT------------------------G-TAATGGAGG-AAGTACTTTG-TTCG-ACTGT--TGAATTGT-A-CGGTTC---TCA-ATTACCTT------T-A----AGAA-TTAAGATAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-C--G-CTA-TC-----GCAAGAAAGC-----AGTCAAAAATGT--AA-GT----ACTGCCTTGCATA-TGA-TTT--CAG-TTGCT-AAAAAGTGTTTGCt
gi|20 : T-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TATG-AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-ATAATG--GG--GCA-TT-TAAAAA-ACAATGAC--ATA-ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AAT
gi|21 : -AGAATA--GG--ACA--------AA-ACAGTGAA--AT--AAT--CTA---T-CAA---T--AA-C-----GTA-AAT-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------
gi|22 : --ATCA--TATGGA--GAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------TAAA--T---ATT-TATTCATT
gi|23 : AAATGT--AA-CT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TT-CTAAAAAAGTGTATGC
gi|3 : cGGC-C--AGTAA-C-CAT-ACC-----TCCCCCC-CTCTA-TGG--ATTT--CT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAGG------TGTAGGT-AACAAA--T-AA------A-GGGT-AACA--CGGAC-GAGTT-AGAT-TT--------GAG--CAATTCTTATGTT---GGG------------CGTTTC--A-----A-GTATATGAT-A-TT-GGAA-TT---AT-A-AATTTTT-G-G-CA-A-TTCAGAATAG---CCAT--AA-CT----G-T-G-TT-CC---AT---A--C--CGCATTACCT-TTGTA-TTAAAGG--GAAC-AAA--A---CAACCAAC--------------------------GG------TTTTA-AGAG---TTG-CCA--GAAA-GGAC---ATCGAT--GAG-CAATATATGT--TAGAGATATA-TAAAGGACAG----------TCA--TA-AGACGAAG--TAGC-CA-TGGTGCAT-GGA-TGCAAGAAT-----------T--T--T---TTT-TTTTCA-TT--G-GCCTATGCCA----T--TG-ACTAGA------------T---------T-AAC------ATCATA--T-T--A-----GAACATCAAA-T--TTTAT---GCATG-GTTTGCATGT-GGCTT-AGTAT-TGAAT----AA---GCGTAC-ATGA-A---CGG-T-C-AA---------------TTCTA---------TAAA-GT-ATGA------C--TTTGCT--AT--AATGACACA-ATC----------TTGA----AGTA--GC--ACGC------TT-AGT-AAA-ATATACTTCCAAT-------AGAT----GTAATTACTGGCAG-GT-TGCCATTGTCT---T---AATGATA-TG---GGCCAG-TTTACGTTAT--ATA-A-TCA---GC-CATGAA-GAAA--GTG----CGA-----CG-A----CT-CTTTGGAAGCAT-A-ACTTGCT-AAAAT-AGGTGTGAAATAATTAGTAGTGAAA---TAT--AAATTTAA--TGA-TT------G-CGTTAGTTGAATGGTGG--GCATTA-TAG-AA-ACAATGAA--AT--AAT--T-AAGTT-CAA---T--AA-G-----TTA-A-TGTTGATAGA-AATAC-T-TC---------ATATATTTGA-TATTATAGTAAAA--A---AAG-ATA-A--------ATATTA-TGC--CAA--AAC-G-AAATCATT-GTA--TA--TTTTTT--------AA--TGT-C---TG-TTAGACTCTTTATGCTGAGCA-TAT---AAATGA
gi|3 : cgtcG--TTAGA--C-TCTTTATG-CTGAGC-AT--ATA----A-ATGAGC----T-CG--T-G--------AGATTA--ATGGTT--GAAAGTAGTACAG-GGTCCAGAAAC--TTAG-AGA-TATTTGTC------CAT-TGGCTAATGGA---------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-TTA------TCGAA-----ATTGA----TAAAC----TGG--AATCAAA-GA----TAGA---GAAAA--CTTGTTAGTGTAG-ATATC---A-ATT------TTGGTAA---TTCAAAGGCCATATGGCGAATTTTTG-TATGAT---TACTG-CTT--TATT-T-GCTAC--TGG--AAGCTGTTGAA-TGATGAGCTTCG--GTT-GTCGCGAC---C--TCGGCAA-A--C-AACA-A-G-TT-GT---AGAATC-TTCAATC-----ATAA-T-AT-CAGAA--GTCGA-CTTTCAT-GTATT------GGTTCAAACATGTAC---GATA--CG-AAATTC--GGGAAGT-AAC---T----TAA-GATTTTGGTC-CCC-TAGAC--AAGT-ATG-CTGGATAT--GAGTT-GAATATCTGAGATG---C---CAA----TC-TC----AAAAAATGGAGACTTACGCCT--C--ATGATTC-TA-AAGACAAATACAT--AACCATTTG-TC-CAAAA-ACCACA-TGTATGAT-CATC-TGC-AGA--------CAC--------A----TGA-TAAGGAAAAACAGG-GTC-GCAATTTGTTTAGATGCG-------G-TATCTG--AAAAAA-AAGCCGTTC-CAAC-TA-AA-C--AACCGTACC-TCTAGTGA-G-G-GAGGG-T-----TGTTAATCT---AC-----ACTAACC-AC-TGATGAAGATAG--ACTTT--------TTATG-TG-AGGAT-A-C-GTTC--ATCACGCTGCCCT-AT-T-C-AATAGAGAA-TG--GC-AT-TC--G--C-AGGTTA---T----A-G-CTA-CG-----ACAGGATGGT-----GGTT----TTGC---A-CT----AT--CC-TG-ATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAACGTGTATGCgctcgtgagattaatggttgaaagtagtacagggtccagaaacttagagatatttgtccattggctaatggaaattatcccaactcgttatcgaaattgataaactggaatcaaagatagagaaaacttgttagtgtagatatcaattttggtaattcaaaggccatatggcgaatttttgtatgattactgctttatttgctactggaagctgttgaatgatgagcttcggttgtcgcgacctcggcaaacaacaagttgtagaatcttcaatcataatatcagaagtcgactttcatgtattggttcaaacatgtacgatacgaaattcgggaagtaacttaagattttggtcccctagacaagtatgctggatatgagttgaatatctgagatgccaatctcaaaaaatggagacttacgcctcatgattctaaagacaaatacataaccatttgtccaaaaaccacatgtatgatcatctgcagacacatgataaggaaaaacagggtcgcaatttgtttagatgcggtatctgaaaaaaaagccgttccaactaaacaaccgtacctctagtgagggagggttgttaatctacactaaccactgatgaagatagactttttatgtgaggatacgttcatcacgctgccctattcaatagagaatggcattcgcaggttatagctacgacaggatggtggttttgcactatcctgatgtgattttgcagttgctaaaacgtgtatgcaa
gi|4 : cgtcggccagtaaccatacctccccccctctatggatttctacactatgattttttgaaaggtgtaggtaacaaataaagggtaacacggacgagttagatttgagcaattcttatgttgggcgtttcaagtatatgatattggaattataaatttttggcaattcagaatagccataactgtgttccataccgcattacctttgtattaaagggaacaaaacaaccaacggttttaagagttgccagaaaggacatcgatgagcaatatatgttagagatatataaaggacagtcataagacgaagtagccatggtgcatggatgcaagaatttttttttttcattggcctatgccattgactagattaacatcatattagaacatcaaattttatgcatggtttgcatgtggcttagtattgaataagcgtacatgaacggtcaattctataaagtatgactttgctataatgacacaatcttgaagtagcacgcttagtaaaatatacttccaatagatgtaattactggcaggttgccattgtcttaatgatatgggccagtttacgttatataatcagccatgaagaaagtgcgacgactctttggaagcataacttgctaaaataggtgtgaaataattagtagtgaaatataaatttaatgattgcgttagttgaatggtgggcattatagaaacaatgaaataattaagttcaataagttaatgttgatagaaatacttcatatatttgatattatagtaaaaaaagataaatattatgccaaaacgaaatcattgtatattttttaatgtctTGGGC-----GTAA-CACAT-ACT-----CCCCC----TCTA-GGG--ATTTTTCTT---A-C--A-T---ATGA--------------------------------A--T-AA---------G-T-AA----CTA-T-G--TTTG--T-TT--------GAACCCAATTTC-ATGTTTGGGAG--G---------CGTGTT--C-----AAG-ATATG--TA-TT--GAA-TTG--AT-C-AATTTTTTG-G-CA-A-TTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-TCG-TT-C----ATCATA--CGATG-ATTAT-A-TTGTA-TTAA------GA-GCAACTA---CA--CAG---------------------------AA-----TTATTC-AGAG---TTT-GCA--GAA--GGAC---ATCGAT--GTG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TA-ATAGACTTACAAGA-------------T--A--T---TTTATTTTCATTT--GGG----TGC------T--TG-CCCTTG------------CC-C---TAGTCAAC--T---ATC-GAT-C-TGAA-----T--CATGT---CA-ATTATG--G---G-GTTC-TAA---------AGTAT-TG-AT-----A---GCGTCTAATG--A---CGGTC----A--------------TTT-TA----C-----AAA-GT--TGA------C--TTTT-TTAAT--AAT-ACACA-AT-----------TTGA----ATTA--TC--AC-C------TT-AGT-AATAATA-ACTTCCAATG-T-AAAATG-----TTAAT----GGC---GTAT-CCA-TGTTC---TTTAAGTG-T--TG-GAGG-CCA-TTAAT-GTAT--ATT-A-TC----GC-AC--AA-GAAGT-GG-----CGT-----TG-T----TT-CTTTGG--GCCT-A-CATG--TAAAAATAAGG-G----------------GAAA---TATACAA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAG--A-AC-ATG-A--AT--AAT--T-A---A-CAA---T---A-T-----GTAGA-T-TTGAT-GA-AATATAT-TCTATTAATATATATATTT-A-AA-------AAAA--CAAAAAA-AGATA--------ATATC-CTGG--GGACGCGT-A-AA---ATT-GTATTTAATCTTTTT--------AATATTA-C---TGATTAGGCCATTTAaa
gi|4 : TTGTTA-G-G---TGCGT-G--T-CGAGTAG--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--AG--TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGGTCAATC-AA-GA----TAG----GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GGTA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-A-GTTGAC---------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGT--ATACA---------ATGT-C-------A--GC---ATGAATGGAT-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TC----A--------------------------TGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAA----ACA-GTC-TCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAGGATT-----TGATTATC----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGA-AGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA----AGAA-TGAA-CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCatttgttaggtgcgtgtcgagtagaattatggttatggagtttagtggtagacaagaagtatttgtctttatgttggcatattgccactggtataaatgattaactggtcaatcaagataggaaaacttattgttagcatgtaatttggtattaaaggattgatatatttttgcgctattgtacgcgaaagctttgacttgcttgcttggttgtcggcaaagttgacgattctaataattaagacgtgcttcatagtttgggtatacaatgtcagcatgaatggataatgattggtcctgaaaattgtatgtaggtgattgacttagggatgggatgctttcatgtttctaaaagacaaaacatgactttgtctacatgcatgatctatctgctaggacccagtgataaggaaacagtctcaatttgttggatgtctgaaaaagcggatcaataaacaatccgtaactctaagggcaggatttgattatcatacacaacactgatgaagaagatctctgactcgattgtcatgattatatcggttcatcactgccctaatacaaagaatgaactataacagcaggttaattttcagctctcacaagaaggagttttgtgtaacatatccttgtgtgattttgcagttgctcacaaagtgtatgcata
gi|5 : tgggcgtaacacatactccccctctagggatttttcttacatatgaataagtaactatgtttgtttgaacccaatttcatgtttgggaggcgtgttcaagatatgtattgaattgatcaattttttggcaattcagtatagccattactgtcgttcatcatacgatgattatattgtattaagagcaactacacagaattattcagagtttgcagaaggacatcgatgtgcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacattaatagacttacaagatattttattttcatttgggtgcttgcccttgccctagtcaactatcgatctgaatcatgtcaattatggggttctaaagtattgatagcgtctaatgacggtcattttacaaagttgacttttttaataatacacaatttgaattatcaccttagtaataataacttccaatgtaaaatgttaatggcgtatccatgttctttaagtgttggaggccattaatgtatattatcgcacaagaagtggcgttgtttctttgggcctacatgtaaaaataaggggaaatatacaataatgatttagctgtagagaatggggcatatagaacatgaataattaacaatatgtagatttgatgaaatatattctattaatatatatatttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatGACGAAA--A---CA--CA-C--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-A--TATATTGAC-TGCAAGA-------------T--A--TATTTTT-TTTTCGTTT--GTGCCT-TGCCAT---T---G-ACC---------------------------GAGCTT---A--------------------ACATGCGA-T----TATG--GCA-G-G----------G--CT-ATTAT--GAATA---AA---GC-----------------TT-T-AAA-------------TTTCTA----CAAAGTACATGT-ATGA------C--TTTG-T--AC--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATGT----T-AATTACTGGCAG-TT-T-CCA-TGTCT---TT--AATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATG-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAG-GTG----TGT-----GGGA----CT-CTTTAG-AGCAT-A-CATG-CT-AAAAT-AGG-G----------------GATA---TAGG-AA---TAC--TGA-TT-TA---G-CGTTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT---TT--CAA---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------TTATATTT-A-T-----------A--T---AAG-ATA-A--------ATA-TACTGC--CAA--AATAA-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCTTTTAT-CTGGGCATTATATGAAATGAata
gi|5 : G--TTAGA--CCT-TTTAT--CTGGGC-ATT-ATATG-AA-ATGAGT-G--T-TG--T-GTTAG----A-ATTAACATGGTT--GAGAGTATTACAGTAGTC-AGA--A--TGAG-AT--T-TTTGTCATTT-ATGTATGG---A-------------AATTAT----------CCGA-A-CTC--ATA------TC-AA-----AATGA--TATAAAC----TGG--AATC-AAAGA----TAGA---GAGAAGACTT--TG---TAGCATATC--AA-AAT------TTGGTAAA-TTCCAAAGAA-----GGCGGA--CTTGA-ATA-----TTCTA-CGCA-TA-T-T-GCTAC--T-GACAAGC-ATTAAA-T-CTGCA-TTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCCGC------C-AACA-A-G-TTGA----AGAATC-T--A--CA----ATAATA-AT-CAG-A--AAGGGGACTTCATAGTATT------GGT--Agtgttgtgttagaattaacatggttgagagtattacagtagtcagaatgagatttttgtcatttatgtatggaaattatccgaactcatatcaaaatgatataaactggaatcaaagatagagagaagactttgtagcatatcaaaatttggtaaattccaaagaaggcggacttgaatattctacgcatattgctactgacaagcattaaatctgcattcgcattggccctttccgccaacaagttgaagaatctacaataataatcagaaaggggacttcatagtattggta
gi|6 : gacgaaaacacacagcttttaagagtttgcagaaaggacatcgatgagcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacaatatattgactgcaagatatatttttttttcgtttgtgccttgccattgaccgagcttaacatgcgattatggcagggctattatgaataaagctttaaatttctacaaagtacatgtatgactttgtacaatacacaatcttgaattagcaccttagtaaatataacttccaatgtaaaatgttaattactggcagtttccatgtctttaatgtatggaggcccattaatgtatataatcagcaaaagaaaggtgtgtgggactctttagagcatacatgctaaaataggggatataggaatactgatttagcgttagagaatggggcatatagaaaacaatgaaatttcaatcaataatgtaatttgatgaaatatattcttatatttatataagataaatatactgccaaaataaaaattgtataatttttttaattttct-G--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--AG--TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGGTCAATC-AA-GA----TAG----GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GGTA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-A-GTTGAC---------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGT--ATACA---------ATGT-C-------A--GC---ATGAATGGAT-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TC----A--------------------------TGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAA----ACA-GTC-TCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAGGATT-----TGATTATC----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGA-AGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA----AGAA-TGAA-CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGC
gi|7 : GCTTTAAC-----G-G-AGAAGATCA-TT-TGAA-TT---AT-CCAATCTTT-GCG-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TATCT----G-T-G-TC-C----AT---A--C---GCATTAC-T-TTGTA-TTAATGC--GGACC-AA--A---TA--CAAC--------------------------AGG----CTTTTA-AGAG---TT--GCA--GAAAAGGAC---ATCGAT--GAG-CAA-ACAT-T--TAGA---ATAGTAGAAGACAGTACGGCT--ATCA--TATGGG--AAATTTAGCACACT--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--ATTT---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAA---T--TG-ACC
gi|8 : T-G--CT-AG-AT-TGGATA---AA---GTGTTCCATNN-N---NNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTA----C----AAAC-GT-ATGA------CGGTTTGGT--ATTTAAT-ACGCA-ATC----------TTGA-----TTAAGGC--AC-C------T--AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-ACAA-AT----T--ATTAC--------T-A-CCT-TGT-C---TTTG-ATG-TA-TGAGGGGACCA-TTAACTGTAT--ATA-ATTCA---GCAAA--AA-GGAAC-GT-----CGT-----AG-A----C--CTTTGG-AGTATCA-AGTGGCT-AAAATCAGGCG----------------GAAA---TCT--GA---TAGATTGA-TT-TA---G-TTGTAG--GAATG--GG--GTA-TA-TTAGAA-ACAATGAATTAC--ATT--A-A---T-CAGT--T--AA-T-----GTA-ATT-TTGAT-GACAATATATATC----------TATATTT-AGTA-------AAAA--ccgcgcttacatttgcgaacgtcatggccgcaggataattgatatagaaactgcgttaccgatcgaaggtttatttacaatctattctaatacaaagtacatagtgttaaaatgatgcttatgtattagacaatgttactaacaatcattgaat
gi|9 : TG-TC-T--AA-ACCACA-TACATGACTCATC-CGC-AGG---C----CAC--------CGA--TGA-TAAGGAAAG-CAC---TC-TCA-----TTTGGAC--ATACAAATG-TA-ATG--TAAAAG-CGT-----T-AAAC-TT-AACC--AACC------TCCA-----G-G-CAGGA-TGGTTATGTCTACA----AC-----AA----C-ACCTAATGAAGA-AG-TACTTTA-CTCG-ATATT--TG-ATAAG-A-CAGCTCCAATCG-ACTGCCCT-AT-AAC-AG---AAAA-TGCCACTGT-TC-AG--T-AGAATA---T-T-CA-G-CTA-TTTTAATACAAGAAG-C-----TATC-AAATTTT--AA-CT----AT--CCTCCCATG-TGA-TTTGGCAG-TTGCT-AAAAAGTTTATGC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CAAGTGAGTTCAGTACATCATGGAAAGGCAAATGTAACTATCC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1 22222 1 111111111111111 1111111 33333333333 1111111 11 11111111 111 222222222222 2222222 11 111 111 222 11 1111 2222 111 111 5555555555555555555555555555555555 11 333333333 1111 3333333333333333333 22222222 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222 111 1111 111 111 555555555555555555555555555555 33333333333333 222222222 1 22222222222 11111 111111 11111 1111 11111 11 111 1 22222 1111111111111 111 1 1 333333333333333333 33 111111111 111 11111 2222222222 2222222222 33333333333333333333333 1111111111111 111 11 1 44444444 11 111 1 1111 1 1 11 222 11 1 11 1 2222 222 222 11 1 222222 1 222 11 11 1 11 1 1 11 111 222 1 11 11 222222 1 1 1 1 11 22222 3333333 11 222 1 33333333 3333333 2222 1 222 2222 11 11 11 1 1 1 11 1 1 222 1 1 1 1 22222 11 1 22222 11 333333333 11 44444444444 1 222222 55555555555555555 1 1 333333 1 2222 2222 2222 1 222 11 1 22222 11 1 44444444444 222222 1 3333333 1 1 33333333 1 2222 222 11 11 1 11 111111 22 1 11 222222 444444444444444444444 22 2222 11 222222222222222 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 1111 11 1111 1111 11 222 2222 22222222 222 3333333333333333 222222 11111111111 1111 1 2222222222 11111 222222222 888888888888888888888888888888888888888888 2222222222222 1 111111 666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 2222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1111111 1 555555555555555555555555 22222222 1 3333333333333333 2222222222 1 222222 8888888888888888888888888888888888888 1 1 22 1 2222222 4444444444444 222 11 2222222 22222 222222222222222 1111111 2
lowQualScore : 6666 3 5 5 2 00000 5 0 66 00 666666666666666 1 4 8888888 66 4 66 4 00000000000 4 9999 2222222 4 00 4 66666666 222 7 7 777 555555555555 55 4444444 4 4 11 4 333 111 4 8 4 4 1 222 11 5 0000 5 5 5 5 2222 888 66 777 5 5 5 5 222 555 66 777 66 4444444444444444444444444444444444 55 888 55 66 66 888 66 5 0 1 5 66 888 5 2 0 000000000 77 888 999 22 5 66 7777 5 8888888888888888888 888 5 77 1 5 0 22222222 5 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333333 99 777 777 666 77 5 5 0 5555 000 333 333333333333333333333333333333 77777777777777 5 000000000 1 77 77 5 5 55555555555 22222 77 77 5 666666 5 5 1 5 555 1 77777 5 7 9999 777 6 99999 555 5 5 5 5 5 00 77 5 5 000 5 77 1 99 55555 6666666666666 5 55 5 222 0 5 0 888888888888888888 888 00 888 66 5 5 888 5 77 66 66 4444 6 4 66 666666666 777 4 222 66 4 11111 4 8 4 4 4 5 5 8888888888 6 2222222222 66666666666666666666666 0 99 9999999999999 444 8 11 0 33333333 33 8 444 8 0 99 2 8888 888 5 5 88 111 88 5 88 5 3333 111 000 88 5 444444 1 1 5 111 88 88 5 1 88 5 5 1 88 999 111 5 22 66 88 999999 5 5 5 5 1 1 66 66666 1111111 88 000 22 5 44444444 2222222 3333 5 111 3333 88 88 88 5 5 5 88 5 5 111 5 1 5 5 1 5 66666 88 5 1 77777 88 999999999 1 1 88 11111111111 5 1 999999 99999999999999999 5 1 1 5 000000 1 5 4444 5555 4444 5 000 88 333 5 77777 1 88 1 5 33333333333 888888 5 2222222 5 5 55555555 5 1111 111 1 88 88 5 33 1 444444 33 0 44 888888 444444444444444444444 6 11 5555 7 6 33 444444444444444 5 99 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 7 4444 88 6 6 4444 9999 99 77 222 2 3333 6 88888888 111 9 4444444444444444 9 333333 6 77777777777 4444 0 9 2222222222 66666 6 99 888888888 1 3 222222222222222222222222222222222222222222 6666666666666 1 1 2 999999 99 555555555555555555555555555555555555555555555 88 99 9 6 44 99 1 6 666 99 5555555555 5555555555555555555555555555555555555555555555555 1 5 5 77 0 5 7777777 5 0 5 0 777777777777777777777777 5 55555555 5 0 9 0 9999999999999999 66 3333333333 5 77 5 66 0 5 111111 5 5 0000000000000000000000000000000000000 5 6 5 1 5 11 5 5 1 1111111 2222222222222 5 000 66 5 77 5 0000000 5 5 5 88888 0 999999999999999 66 2222222 66 8 5 5 0 5 0
lowQualScore : .... . . . . ..... . . .. .. ............... . . ....... .. . .. . ........... . .... ....... . .. . ........ ... . . ... ............ .. ....... . . .. . ... ... . . . . . ... .. . .... . . . . .... ... .. ... . . . . ... ... .. ... .. .................................. .. ... .. .. .. ... .. . . . . .. ... . . . ......... .. ... ... .. . .. .... . ................... ... . .. . . . ........ . ......................................................... ....... .. ... ... ... .. . . . .... ... ... .............................. .............. . ......... . .. .. . . ........... ..... .. .. . ...... . . . . ... . ..... . . .... ... . ..... ... . . . . . .. .. . . ... . .. . .. ..... ............. . .. . ... . . . .................. ... .. ... .. . . ... . .. .. .. .... . . .. ......... ... . ... .. . ..... . . . . . . . .......... . .......... ....................... . .. ............. ... . .. . ........ .. . ... . . .. . .... ... . . .. ... .. . .. . .... ... ... .. . ...... . . . ... .. .. . . .. . . . .. ... ... . .. .. .. ...... . . . . . . .. ..... ....... .. ... .. . ........ ....... .... . ... .... .. .. .. . . . .. . . ... . . . . . . ..... .. . . ..... .. ......... . . .. ........... . . ...... ................. . . . . ...... . . .... .... .... . ... .. ... . ..... . .. . . ........... ...... . ....... . . ........ . .... ... . .. .. . .. . ...... .. . .. ...... ..................... . .. .... . . .. ............... . .. . ................................................................... .... . .... .. . . .... .... .. .. ... . .... . ........ ... . ................ . ...... . ........... .... . . .......... ..... . .. ......... . . .......................................... ............. . . . ...... .. ............................................. .. .. . . .. .. . . ... .. .......... ................................................. . . . .. . . ....... . . . . ........................ . ........ . . . . ................ .. .......... . .. . .. . . ...... . . ..................................... . . . . . .. . . . ....... ............. . ... .. . .. . ....... . . . ..... . ............... .. ....... .. . . . . . .
lowQualScore : 4444 9 7 0 0 00000 0 0 99 22 888888888888888 1 4 9999999 11 4 11 4 11111111111 4 7777 9999999 4 66 4 11111111 222 4 3 888 000000000000 55 0000000 0 4 77 4 333 777 4 9 4 4 9 444 99 0 6666 0 0 0 0 5555 888 99 111 0 0 0 9 222 222 11 888 11 3333333333333333333333333333333333 22 888 11 99 00 888 99 0 1 4 0 99 888 7 3 7 222222222 99 000 333 11 0 99 1111 0 4444444444444444444 888 0 99 4 7 7 33333333 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777777 22 555 555 111 99 7 7 1 0000 000 444 999999999999999999999999999999 00000000000000 7 000000000 4 99 99 7 7 77777777777 33333 99 99 7 444444 7 7 7 7 999 4 11111 0 6 3333 777 7 00000 999 7 7 7 3 7 99 99 7 7 000 7 99 4 33 77777 3333333333333 7 99 7 333 1 0 0 222222222222222222 888 66 888 99 0 0 888 0 11 11 11 6666 2 4 11 222222222 888 4 222 11 4 11111 4 9 4 4 4 0 7 9999999999 7 8888888888 33333333333333333333333 8 00 6666666666666 000 0 00 6 00000000 66 0 000 0 6 66 5 2222 555 5 0 00 000 55 5 55 5 0000 555 555 00 5 555555 0 0 0 555 55 55 5 0 00 5 5 0 00 000 555 5 00 55 00 000000 0 5 5 0 0 0 55 55555 5555555 00 555 00 5 55555555 5555555 5555 5 000 5555 00 55 00 0 0 0 55 5 0 000 5 0 5 5 0 0 55555 55 5 0 00000 00 000000000 0 0 00 55555555555 0 0 000000 55555555555555555 5 0 0 0 000000 0 0 0000 0000 5555 0 555 00 000 0 00000 0 55 0 5 55555555555 000000 0 5555555 0 5 55555555 0 5555 555 0 55 55 0 88 0 888888 88 0 22 444444 444444444444444444444 7 77 8888 3 7 33 222222222222222 5 88 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0000 3 2222 33 7 7 2222 0000 22 00 555 5 0000 7 22222222 222 3 5555555555555555 8 555555 7 00000000000 8888 8 8 5555555555 88888 7 22 000000000 0 2 222222222222222222222222222222222222222222 7777777777777 0 0 0 222222 22 222222222222222222222222222222222222222222222 55 22 8 7 00 22 0 7 888 22 1111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333 0 7 7 99 1 0 1111111 0 9 0 0 000000000000000000000000 0 11111111 0 2 4 1 8888888888888888 99 2222222222 0 55 0 99 7 4 111111 7 7 6666666666666666666666666666666666666 7 0 0 4 7 44 7 7 4 6666666 1111111111111 7 999 99 7 99 7 4444444 7 7 7 66666 1 111111111111111 99 6666666 99 8 0 0 1 0 0
consensus : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGN-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T---AAG-ATATA--------ATATTACTGC--CGA--NAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--ATACATGTAG---AATGT-CG-AA--TA--GCGAAATGAACGGAT----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
Reference ( family-288 ) : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGN-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T---AAG-ATATA--------ATATTACTGC--CGA--NAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--ATACATGTAG---AATGT-CG-AA--TA--GCGAAATGAACGGAT----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
gi|1 : --A-T---AT--TTTTTTG-AGAGAAGATAGTG---GT-AGAAAAATT-AA------ATGG-T-AA-AGGCGG-C-GG-TT-G--T-TTTTGCAACCAA---CATGTTTT-TGTT---GGG--GACTGAAATGCGTTTT--CTCAACA-G-ATATGATCA-TTCTGAAATTT--AT-C-AATTTTT-GTG-CACAATTCAACA-AGAAACCATAATA-CGAAAAG-T-GATT-CTCCAAT---AGGC--TGCATTAC-TATTGTAAGTAATGCTAGTACGGAA--ATCACA--CAAT--------------------------AATAAGTCTATTATAGAAGCTTTT-GCATGGATAAGGACTTCATCGATCTGAGTCGATG--T-TGGTAGA---ATA-TAGA-GACGG------TGCATCAAATATGG-------------TA-T--TA-A--GAC-TGCGAGAATGAGAGCTAATTT--A--T---TAT-TTTCAATTTTGGTGCCT-TGCCATGAAT--TGCACCTTACGATTATGTGACTCGCGTGTAA--AACTTTATAATC-TACTC-T--AAAAATT-ACATGTAA-T--ATTATGTTGCA-GTGTT--TAAGTCG--CTAAGTCT-TGAATATATAAAGCGCGTA-GATGG-AAATCGGTTATAAA--------------TTTCTAAATTCG---TA-A-GTAATGAAATCGTC--TCAG-T--GT--TAT-AAATA-ATCCAAGCGATGTTTGAGAATATTA--GCAAAT-C------TTAAGTAAAATATT-ACTTTCAATGTT-GAAATATTATATTAACTATCGGCCGTTT-T-CCA-TGTCCCTATTTGCATG-TA-T--GAGGTCCATTTAATAGTATCAATA-A-TCATGCAC-AA--AATGAAATCGTATATACGTAGTACGG-ACTACCT-TTTTAG-GGCAT-ATAGTGGCT-AAAAT-AGG-T----------------GAAA---TATTAAA---TAA--TGA-TTATA---G-CTGTAG-GGAATG--GGAAGAA-TATTAGAAA-ACAATGAA--ATAAATTTAC-A---TACAAAGGT--AA-TCGAAAGTA-C-T-TTGA--GG-AATATAT-TC---------G-ATATTT-A-TA-------AAAACTT---AAT-ATGTATATAAACTATATTAAGGCATCGA--TAC-ATAA---ATT-GTA--TAATTTTTTTTCTTTTTAAAT-TTTACCAATG-AT-GACTCTTGATGTTTA-CA-TAGAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGA--TGATTGACATTAATATAGGAGTCCGAG-ATTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTG-CTATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGGCATTTGAACC-T-TTTATCACTGAGCAATAAATA-GTCA-ATGAAC-GATC-CG--T-GGGATAGAAA-ACTA-CATCGTTACACGAGAATTACAGTGGTC-AG-CAAATTGAGCAGCATATCTGTCATT-----T-TAGC--ATCGAATAGACAGGAATTATGCGAGAAATGTCCACA-CTTGTTTAAGGCGTCC-AAATATAATTGAGCT-TAAACACTGTGG--AATC-AA-TAGTATTAGATACGAGAA--CT--TTGA-GTACAACATC--AATATTG-----TGGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTTGTATGATAAGTTCTGATGCAATA-G-TAGCTACTTTGGACAAGCTATTAAACT-CTAGTATTCACTATTAG--GC--CACACTTTCCACCA-ATGA-CACA-ACG-TT-ATAAGAAAATCGT--A--CTTCAGATAA-ATGTACAG-AAGGCCGCGTCTTCATAGTATTCTAGTCAAT--ATGCATGTAGCTTAGTGA-CGAAA--TAGTGCGAAATG-ACAGATAAC-CAAGAA--TTGAGTCCCC-TAGAACCAAATAATTGATGGAGAA--GAACTAGAT---CCTAGTAG---C---ATA----TTCTCGAGAGAAAG---------------CCTC--ATGGTTCAAA-AAAACCAATACATGAGACAATTTGCTCGC--AAGACCATA-TGCATGA-CTATCGCGC-AGGCCAC----CACTGGCGAATAGCCTTGATTAATGAAAGACACGTGTG-TCA--TTGTTTGGAA--C-------A-TA-CTG--AAAAAA-AGT-----TACAAC-CCTAACC--AATCGTACCTGCTT---A-G-GACAGAG-A-----TGCTTGT---------------------T-TAATGAGCA---GTACTTTG-TTCGAACTGT--TG-ATTGT-A-CGGTTC----CA-ATTACCTT------T-A----AGAATTCAA--TAT-TCGAGGTCGAGGTTA---TGT-CACGTCTACTCCGTCAACGAAAACGCACAGATGTC-AAAATGTAAAA-GTACTGAC--CCTTGCATACTGATTTTTGCAGTTTGCTAAAAAAGTGTATGC
gi|10 : ggatatattttgCATGGGC-C--AGCAA-CACCC--CC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--CTTTTTCT----A-C--A-C----TGATTTTTTG-AAAG-------CGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGA-CGG--TT-G--T-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--CA----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-A-AATTGTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CC----G-T-G-TTCC----AT---A--C--CGTATTAC-T-TTGTA-TTAAAGC--AGAC-GAA--A---CA--CAACTGTTACAGACGAAACACAACTATTACAG-----TTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAA---------TTCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAA
gi|11 : cCATGGGTTC--AGAAAGCACATTACCT----CCCCCCC-CTCTG-GGG--ATTTTTCTCTCCA-CTAA-T---AT-ATTTTTT--AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-G--T-AA-A--CGA-C-G--GT-G--T-TT--------GA---CTATTCTAATGTT---GGA-------------GTTTT--CA----A-G-ATATGGTCA----------------------TTTT-G-GACA-AATTCAGCAT-GA--CTAT--TA-CT----G-T-G-TT-CCA--AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-GT--GGC---AACG---------CA--CCAC--------------------------A------C---------G---TTTCGCA--GAAA--GAC---ATCGAT--AAG-CAATACAT-T--TAGA---A
gi|12 : gacGGC-CCGAGTAA-CACATTACCTCCCCCCCCCCC-CTCTGTGGG--ATTTGTCA----A-C--A-CTTGATGATTATCTGCAGAA-------TGT--GT-ACGAAA--TTAACAGGTCA-GA-T-CA-A--CGC-A-G--TT-GA-T-TT--------GA----AATTTCTATGT----GGG--G---------CGTTTT--C-----AAG-ATATGATTA-TT-TGAA-TCTTGAT-C-AATTTTG-G-G-CA-AATTCAGTATAAA--CCCTC-TA-CT----GTT-G-TC-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-------TTAAGTC--AGA--GGA--A---CG--CAAT--------------------------AG-----CTT
gi|13 : cctCATTTTGTT-GGAT--A---------TA-CTG--AAAAAA-GCG-----T-CAAC-TA-AACCTGAACCGTACATTCTA---A-GAG-CAGGA-T------GGTTATCTACAAC-----A-----CCACCTGATGAAGA-AG-TACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTATTA-TGGTTCCAATAA-CCTGCCCT-ATTA-C-A----AGAA-TGGCACTAT--C-AG--C-AAGTTA---T-TTCA-G-CTA-TC-----ACA-GAGAGC-----TGT--AAAATGC--AA-CT----AT--CCCTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTA
gi|14 : A-T--TAAA--GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---ATT-TTT-CATTG--GTGCCT-T--------------ACCTT-------------TC-C-----AT-A------------------T--A-----T-ACATGCAT-TATATTATG--GCA-T-GTGC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GTATATGATGT-A---TGGTT-C--A--------------TTTCTA----C-----ATA-GT-ATAA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----GTTA--AC--AG-CTGCAGGTT-AGT-AAATATA-ACTTTCAATG-T-AAATTA-----TTAATTACCGACAT-GT-
gi|15 : aaTGTACG-AA--CA---CGAAATGAA--GATAATACAAT-A--TTGAGT-CCCCTAAAC--AAAT-AT--CTGG-GATAGGAAT---A----TTCAGGAA---AATGGGA----AC-T-------AGC---------------C--C--ATGATTC-TA-AAGACCAAAACAT--AACCATTTG-TCTC--AA-ACCACT-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----ATC--------AG---TGA-TAAGGAAA-ACAT--GTT-TCAATat
gi|16 : TTTAACG-TA-TG-GAGGTCAA-TTAATG-TAT--ATG-A-TCA---AT-AA--AAAGAAAT-GG-----CAT-----GG-A----CTACTTTTA-AGTAT-A---TAACA-AATAC-AAA-A----------------GAAACCCTACTAAA---TAA--TGA-CT-TATCGA-CTACTA-AAAGTC--AA--ACA-GA-TTAAAA-ACAATGAA--CTA-ATT--G-A---T-CAA---TTGAACT-----GAA-A-T-T--AT-GA-ag
gi|17 : CTCCCC-CTCTATGAG--ATTTT-CT----A-C--CCT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA---------G-TAAA-A--CGC-C-A--TT-C--TCTT--------GA---CAATGTAT-TGTT---AGC--G---------C-TTTT--CCA---A-G-ATATAATCATTT-TGAA-TTT--AT-CAAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAct
gi|18 : gtaaatacataAATT--------TCAGGAAAATC---GGA----TT----------AA---------------C--CTCATGCTTG-TATAAGACCAAAACAT--GACTATTTG-TC-T--CA-ACCACA-TCTATGACCCATC-TGC-AGG---C----TAT--------AGCGATGA-TAAGGGAAAACAT--GTCATCA--TTG---------A-------C-TG-CTGTAAAAAAC-GCG-----T-CAACTTA-AGCC--AACCagtgtagtgtg
gi|19 : aaCATGGGC-CC-AG-AA-C-CAATACC-----TCCCCCC--TCTA-GGG--ATGTTTCT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GTAAAAAAA--T-AA---------G-T-AA-A--CGA-CAG--TT-G--G-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---TGGCCG---------CGTTTT--C-----A-A-ATATtcg
gi|2 : accCGTGGGC-C--AGTA--CACATTACT-----CCCCCTCACTCTA-AGGGTATTTTTCA----AGC--A-T---ATGATTTTTTG-ACAG-------TGT--GT-AAAA----T-AA--------GG-T-AA-C--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAAATTTT-TGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT--GAA-TTT--ATGC-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGCATAAA--CCAT--TA-CG----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTA--T-TTGTA-GTAATGC--AGACGGAG--A---CA--CAAT--------------------------AG-----CTTTAT-ATAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CA-----T-T--TGGA---ATA-TAGAGGACGG------G--ATCA--TATGGA--AAG----G-ACT-T--TTTTT-G----GCGAGA-------------TC-A--T---TTT-TATTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---TATTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--CCT--A-----TTACATGTAAATA-ATTATG--GCA-G-GTGT-TAAGT-G--CT-AGTATGTGAATA---AA---GCGTACGATGATA---TGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TCCA-GT-ATGA------CG-TTTG-T--AT--AAT-ACACGTATG----------TTGA----ATTA--GA--AC-A------TT-AGT-AAATATT-ACTTC-AATG-TTAAAATAT----TTAATTGCTGGCTC-GT-T-CCA-TGTT----TTTGAATG-TAATG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATAGA-TCA---GC-AA--AT-GAACT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGCTT-AAAAT-ATG-G----------------GGAC---TAT--AA---TAA--TGAATT-TA---GGCTGTAG-GGAATG--GG--GAA-TA-TAGAAACACA-TGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GG-AATAT---TT---------ATAT-TTT-A-TA-------AAAAATT---ATGTATATA--------ATATTATTGC--CAT--GCT-A-AA---ATTTGTA--TA-TTTTTTTGTA-----AAG-TTT-C---TG-CT-GAC--TTTATGTTGA-----ATAGAAAATAAAA-ACC-AAGCAA--TCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTTT--CA-GTTC--CA-TC----AAT---AAATCA---CCATA--AAATA-TTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTGTA--AAGGATTTGAT-GACGATAATATAGG--TCCGAGAATTA-GAAGTAG--AGTC--ACAAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGATTGT--TATTCAA------AACGCATAC-TTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCG-AGTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA--TTT--TTACC--TCC-GACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGAC-ATGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGG--TTTGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ACTGATA-G-AATATGAACGG--TGTG--T-G--------A-ATTA-CATGGTT-TGAGAGTATTACAGTGGTC-AG--AA--TGAG-AT--TATTTGTCATTTGATGT-TGG---AT------------AATTAT----------CCCA-AGCTTG-TTA------TA-AA-----A-TGA--T-TAAAC----TGG---ATA-AA-GA----TAGA---GAGAA--CT--TTG--GTAGC-CATCAAAA-ATTTTTTTGTTGGTAAATTTCCAAAG-------GGCAAA--CTTG-TAT-AT---TTTTG-TGC---A-TGT-G-TAC--TGGACAAGATATTAAA-T-CTGTACTTCAC-ATT-G--GC--C---CTTTCAACAATA-G--AACAGA-GTTT-A----AGAAT--T--A--CT----ATGA-A-AT-CAA-A--GGCGGGCTTTCATAGTATT------AGT--ATAGAGTTAG---AATGT-CG-AAT-TG--GCGAAATG-ATAGAT----CCAAGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--GAAT-AT--CTGGAGAA--GAAAT-AG----ATTACGAA---C---AAA----TT-TC----AAAAAAG-------------C--T--ATGATTC-TA-AAGACAGAAAT-T--GAACA-TCG-TC-C--AA-ACCATATTGCATGATCTATC-TGC-AGG--ACCGAGCACTGGGA---AG---TGA-TAAGAATAGAC-TA-TTC-TC-ATTTGTTTGGAC--A-------GATA-CTG--AAAAAA-AGA-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCT----A-G-G-AAGGA-------TGCT------------------------G-TAATGGAGG-AAGTACTTTG-TTCG-ACTGT--TGAATTGT-A-CGGTTC---TCA-ATTACCTT------T-A----AGAA-TTAAGATAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-C--G-CTA-TC-----GCAAGAAAGC-----AGTCAAAAATGT--AA-GT----ACTGCCTTGCATA-TGA-TTT--CAG-TTGCT-AAAAAGTGTTTGCt
gi|20 : T-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TATG-AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-ATAATG--GG--GCA-TT-TAAAAA-ACAATGAC--ATA-ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AAT
gi|21 : -AGAATA--GG--ACA--------AA-ACAGTGAA--AT--AAT--CTA---T-CAA---T--AA-C-----GTA-AAT-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------
gi|22 : --ATCA--TATGGA--GAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------TAAA--T---ATT-TATTCATT
gi|23 : AAATGT--AA-CT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TT-CTAAAAAAGTGTATGC
gi|3 : cGGC-C--AGTAA-C-CAT-ACC-----TCCCCCC-CTCTA-TGG--ATTT--CT----A-C--ACT---ATGATTTTTTG-AAAGG------TGTAGGT-AACAAA--T-AA------A-GGGT-AACA--CGGAC-GAGTT-AGAT-TT--------GAG--CAATTCTTATGTT---GGG------------CGTTTC--A-----A-GTATATGAT-A-TT-GGAA-TT---AT-A-AATTTTT-G-G-CA-A-TTCAGAATAG---CCAT--AA-CT----G-T-G-TT-CC---AT---A--C--CGCATTACCT-TTGTA-TTAAAGG--GAAC-AAA--A---CAACCAAC--------------------------GG------TTTTA-AGAG---TTG-CCA--GAAA-GGAC---ATCGAT--GAG-CAATATATGT--TAGAGATATA-TAAAGGACAG----------TCA--TA-AGACGAAG--TAGC-CA-TGGTGCAT-GGA-TGCAAGAAT-----------T--T--T---TTT-TTTTCA-TT--G-GCCTATGCCA----T--TG-ACTAGA------------T---------T-AAC------ATCATA--T-T--A-----GAACATCAAA-T--TTTAT---GCATG-GTTTGCATGT-GGCTT-AGTAT-TGAAT----AA---GCGTAC-ATGA-A---CGG-T-C-AA---------------TTCTA---------TAAA-GT-ATGA------C--TTTGCT--AT--AATGACACA-ATC----------TTGA----AGTA--GC--ACGC------TT-AGT-AAA-ATATACTTCCAAT-------AGAT----GTAATTACTGGCAG-GT-TGCCATTGTCT---T---AATGATA-TG---GGCCAG-TTTACGTTAT--ATA-A-TCA---GC-CATGAA-GAAA--GTG----CGA-----CG-A----CT-CTTTGGAAGCAT-A-ACTTGCT-AAAAT-AGGTGTGAAATAATTAGTAGTGAAA---TAT--AAATTTAA--TGA-TT------G-CGTTAGTTGAATGGTGG--GCATTA-TAG-AA-ACAATGAA--AT--AAT--T-AAGTT-CAA---T--AA-G-----TTA-A-TGTTGATAGA-AATAC-T-TC---------ATATATTTGA-TATTATAGTAAAA--A---AAG-ATA-A--------ATATTA-TGC--CAA--AAC-G-AAATCATT-GTA--TA--TTTTTT--------AA--TGT-C---TG-TTAGACTCTTTATGCTGAGCA-TAT---AAATGA
gi|3 : cgtcG--TTAGA--C-TCTTTATG-CTGAGC-AT--ATA----A-ATGAGC----T-CG--T-G--------AGATTA--ATGGTT--GAAAGTAGTACAG-GGTCCAGAAAC--TTAG-AGA-TATTTGTC------CAT-TGGCTAATGGA---------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-TTA------TCGAA-----ATTGA----TAAAC----TGG--AATCAAA-GA----TAGA---GAAAA--CTTGTTAGTGTAG-ATATC---A-ATT------TTGGTAA---TTCAAAGGCCATATGGCGAATTTTTG-TATGAT---TACTG-CTT--TATT-T-GCTAC--TGG--AAGCTGTTGAA-TGATGAGCTTCG--GTT-GTCGCGAC---C--TCGGCAA-A--C-AACA-A-G-TT-GT---AGAATC-TTCAATC-----ATAA-T-AT-CAGAA--GTCGA-CTTTCAT-GTATT------GGTTCAAACATGTAC---GATA--CG-AAATTC--GGGAAGT-AAC---T----TAA-GATTTTGGTC-CCC-TAGAC--AAGT-ATG-CTGGATAT--GAGTT-GAATATCTGAGATG---C---CAA----TC-TC----AAAAAATGGAGACTTACGCCT--C--ATGATTC-TA-AAGACAAATACAT--AACCATTTG-TC-CAAAA-ACCACA-TGTATGAT-CATC-TGC-AGA--------CAC--------A----TGA-TAAGGAAAAACAGG-GTC-GCAATTTGTTTAGATGCG-------G-TATCTG--AAAAAA-AAGCCGTTC-CAAC-TA-AA-C--AACCGTACC-TCTAGTGA-G-G-GAGGG-T-----TGTTAATCT---AC-----ACTAACC-AC-TGATGAAGATAG--ACTTT--------TTATG-TG-AGGAT-A-C-GTTC--ATCACGCTGCCCT-AT-T-C-AATAGAGAA-TG--GC-AT-TC--G--C-AGGTTA---T----A-G-CTA-CG-----ACAGGATGGT-----GGTT----TTGC---A-CT----AT--CC-TG-ATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAACGTGTATGCgctcgtgagattaatggttgaaagtagtacagggtccagaaacttagagatatttgtccattggctaatggaaattatcccaactcgttatcgaaattgataaactggaatcaaagatagagaaaacttgttagtgtagatatcaattttggtaattcaaaggccatatggcgaatttttgtatgattactgctttatttgctactggaagctgttgaatgatgagcttcggttgtcgcgacctcggcaaacaacaagttgtagaatcttcaatcataatatcagaagtcgactttcatgtattggttcaaacatgtacgatacgaaattcgggaagtaacttaagattttggtcccctagacaagtatgctggatatgagttgaatatctgagatgccaatctcaaaaaatggagacttacgcctcatgattctaaagacaaatacataaccatttgtccaaaaaccacatgtatgatcatctgcagacacatgataaggaaaaacagggtcgcaatttgtttagatgcggtatctgaaaaaaaagccgttccaactaaacaaccgtacctctagtgagggagggttgttaatctacactaaccactgatgaagatagactttttatgtgaggatacgttcatcacgctgccctattcaatagagaatggcattcgcaggttatagctacgacaggatggtggttttgcactatcctgatgtgattttgcagttgctaaaacgtgtatgcaa
gi|4 : cgtcggccagtaaccatacctccccccctctatggatttctacactatgattttttgaaaggtgtaggtaacaaataaagggtaacacggacgagttagatttgagcaattcttatgttgggcgtttcaagtatatgatattggaattataaatttttggcaattcagaatagccataactgtgttccataccgcattacctttgtattaaagggaacaaaacaaccaacggttttaagagttgccagaaaggacatcgatgagcaatatatgttagagatatataaaggacagtcataagacgaagtagccatggtgcatggatgcaagaatttttttttttcattggcctatgccattgactagattaacatcatattagaacatcaaattttatgcatggtttgcatgtggcttagtattgaataagcgtacatgaacggtcaattctataaagtatgactttgctataatgacacaatcttgaagtagcacgcttagtaaaatatacttccaatagatgtaattactggcaggttgccattgtcttaatgatatgggccagtttacgttatataatcagccatgaagaaagtgcgacgactctttggaagcataacttgctaaaataggtgtgaaataattagtagtgaaatataaatttaatgattgcgttagttgaatggtgggcattatagaaacaatgaaataattaagttcaataagttaatgttgatagaaatacttcatatatttgatattatagtaaaaaaagataaatattatgccaaaacgaaatcattgtatattttttaatgtctTGGGC-----GTAA-CACAT-ACT-----CCCCC----TCTA-GGG--ATTTTTCTT---A-C--A-T---ATGA--------------------------------A--T-AA---------G-T-AA----CTA-T-G--TTTG--T-TT--------GAACCCAATTTC-ATGTTTGGGAG--G---------CGTGTT--C-----AAG-ATATG--TA-TT--GAA-TTG--AT-C-AATTTTTTG-G-CA-A-TTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-TCG-TT-C----ATCATA--CGATG-ATTAT-A-TTGTA-TTAA------GA-GCAACTA---CA--CAG---------------------------AA-----TTATTC-AGAG---TTT-GCA--GAA--GGAC---ATCGAT--GTG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TA-ATAGACTTACAAGA-------------T--A--T---TTTATTTTCATTT--GGG----TGC------T--TG-CCCTTG------------CC-C---TAGTCAAC--T---ATC-GAT-C-TGAA-----T--CATGT---CA-ATTATG--G---G-GTTC-TAA---------AGTAT-TG-AT-----A---GCGTCTAATG--A---CGGTC----A--------------TTT-TA----C-----AAA-GT--TGA------C--TTTT-TTAAT--AAT-ACACA-AT-----------TTGA----ATTA--TC--AC-C------TT-AGT-AATAATA-ACTTCCAATG-T-AAAATG-----TTAAT----GGC---GTAT-CCA-TGTTC---TTTAAGTG-T--TG-GAGG-CCA-TTAAT-GTAT--ATT-A-TC----GC-AC--AA-GAAGT-GG-----CGT-----TG-T----TT-CTTTGG--GCCT-A-CATG--TAAAAATAAGG-G----------------GAAA---TATACAA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAG--A-AC-ATG-A--AT--AAT--T-A---A-CAA---T---A-T-----GTAGA-T-TTGAT-GA-AATATAT-TCTATTAATATATATATTT-A-AA-------AAAA--CAAAAAA-AGATA--------ATATC-CTGG--GGACGCGT-A-AA---ATT-GTATTTAATCTTTTT--------AATATTA-C---TGATTAGGCCATTTAaa
gi|4 : TTGTTA-G-G---TGCGT-G--T-CGAGTAG--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--AG--TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGGTCAATC-AA-GA----TAG----GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GGTA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-A-GTTGAC---------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGT--ATACA---------ATGT-C-------A--GC---ATGAATGGAT-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TC----A--------------------------TGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAA----ACA-GTC-TCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAGGATT-----TGATTATC----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGA-AGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA----AGAA-TGAA-CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCatttgttaggtgcgtgtcgagtagaattatggttatggagtttagtggtagacaagaagtatttgtctttatgttggcatattgccactggtataaatgattaactggtcaatcaagataggaaaacttattgttagcatgtaatttggtattaaaggattgatatatttttgcgctattgtacgcgaaagctttgacttgcttgcttggttgtcggcaaagttgacgattctaataattaagacgtgcttcatagtttgggtatacaatgtcagcatgaatggataatgattggtcctgaaaattgtatgtaggtgattgacttagggatgggatgctttcatgtttctaaaagacaaaacatgactttgtctacatgcatgatctatctgctaggacccagtgataaggaaacagtctcaatttgttggatgtctgaaaaagcggatcaataaacaatccgtaactctaagggcaggatttgattatcatacacaacactgatgaagaagatctctgactcgattgtcatgattatatcggttcatcactgccctaatacaaagaatgaactataacagcaggttaattttcagctctcacaagaaggagttttgtgtaacatatccttgtgtgattttgcagttgctcacaaagtgtatgcata
gi|5 : tgggcgtaacacatactccccctctagggatttttcttacatatgaataagtaactatgtttgtttgaacccaatttcatgtttgggaggcgtgttcaagatatgtattgaattgatcaattttttggcaattcagtatagccattactgtcgttcatcatacgatgattatattgtattaagagcaactacacagaattattcagagtttgcagaaggacatcgatgtgcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacattaatagacttacaagatattttattttcatttgggtgcttgcccttgccctagtcaactatcgatctgaatcatgtcaattatggggttctaaagtattgatagcgtctaatgacggtcattttacaaagttgacttttttaataatacacaatttgaattatcaccttagtaataataacttccaatgtaaaatgttaatggcgtatccatgttctttaagtgttggaggccattaatgtatattatcgcacaagaagtggcgttgtttctttgggcctacatgtaaaaataaggggaaatatacaataatgatttagctgtagagaatggggcatatagaacatgaataattaacaatatgtagatttgatgaaatatattctattaatatatatatttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatGACGAAA--A---CA--CA-C--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-A--TATATTGAC-TGCAAGA-------------T--A--TATTTTT-TTTTCGTTT--GTGCCT-TGCCAT---T---G-ACC---------------------------GAGCTT---A--------------------ACATGCGA-T----TATG--GCA-G-G----------G--CT-ATTAT--GAATA---AA---GC-----------------TT-T-AAA-------------TTTCTA----CAAAGTACATGT-ATGA------C--TTTG-T--AC--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATGT----T-AATTACTGGCAG-TT-T-CCA-TGTCT---TT--AATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATG-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAG-GTG----TGT-----GGGA----CT-CTTTAG-AGCAT-A-CATG-CT-AAAAT-AGG-G----------------GATA---TAGG-AA---TAC--TGA-TT-TA---G-CGTTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT---TT--CAA---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------TTATATTT-A-T-----------A--T---AAG-ATA-A--------ATA-TACTGC--CAA--AATAA-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCTTTTAT-CTGGGCATTATATGAAATGAata
gi|5 : G--TTAGA--CCT-TTTAT--CTGGGC-ATT-ATATG-AA-ATGAGT-G--T-TG--T-GTTAG----A-ATTAACATGGTT--GAGAGTATTACAGTAGTC-AGA--A--TGAG-AT--T-TTTGTCATTT-ATGTATGG---A-------------AATTAT----------CCGA-A-CTC--ATA------TC-AA-----AATGA--TATAAAC----TGG--AATC-AAAGA----TAGA---GAGAAGACTT--TG---TAGCATATC--AA-AAT------TTGGTAAA-TTCCAAAGAA-----GGCGGA--CTTGA-ATA-----TTCTA-CGCA-TA-T-T-GCTAC--T-GACAAGC-ATTAAA-T-CTGCA-TTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCCGC------C-AACA-A-G-TTGA----AGAATC-T--A--CA----ATAATA-AT-CAG-A--AAGGGGACTTCATAGTATT------GGT--Agtgttgtgttagaattaacatggttgagagtattacagtagtcagaatgagatttttgtcatttatgtatggaaattatccgaactcatatcaaaatgatataaactggaatcaaagatagagagaagactttgtagcatatcaaaatttggtaaattccaaagaaggcggacttgaatattctacgcatattgctactgacaagcattaaatctgcattcgcattggccctttccgccaacaagttgaagaatctacaataataatcagaaaggggacttcatagtattggta
gi|6 : gacgaaaacacacagcttttaagagtttgcagaaaggacatcgatgagcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacaatatattgactgcaagatatatttttttttcgtttgtgccttgccattgaccgagcttaacatgcgattatggcagggctattatgaataaagctttaaatttctacaaagtacatgtatgactttgtacaatacacaatcttgaattagcaccttagtaaatataacttccaatgtaaaatgttaattactggcagtttccatgtctttaatgtatggaggcccattaatgtatataatcagcaaaagaaaggtgtgtgggactctttagagcatacatgctaaaataggggatataggaatactgatttagcgttagagaatggggcatatagaaaacaatgaaatttcaatcaataatgtaatttgatgaaatatattcttatatttatataagataaatatactgccaaaataaaaattgtataatttttttaattttct-G--------A-ATTA---TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AGACAA---GA--AG--TATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGGTCAATC-AA-GA----TAG----GAAAA--CTTATTG--TTAGCATGT----A-ATT------T-GGTA---TT--AAAG-------GA-------TTGATAT-AT---TTTTG-CGC--TA-T-T-G-TAC--GCGA-AAGCT-TTGA----CT-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA-A-GTTGAC---------------GATTC-T--A--------ATAA----T-TA--A--GACGTGC-TTCATAGTTTG------GGT--ATACA---------ATGT-C-------A--GC---ATGAATGGAT-----AATGA--TTG-GT-CCT---GAA--AATT-GT--ATGTAGGT--GA-TT-GA----CTTAGGGA---T---GGGATGCTT-TC----A--------------------------TGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTG-TC-T--A------CA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC----C-C--------AG---TGA-TAAGGAA----ACA-GTC-TCAATTTG-TTGGAT----------G-T--CTG--AAAAAGCGGA-----T-CAA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAGGATT-----TGATTATC----ATACACAA-----C-AC-TGATGAAGA-AGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC--ATC--ACTGCCCTAAT-A-CAA----AGAA-TGAA-CTATAAC-AG--C-AGGTTAATTT-T-CA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG------AGTT--TTGTGT--AACAT----AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGC
gi|7 : GCTTTAAC-----G-G-AGAAGATCA-TT-TGAA-TT---AT-CCAATCTTT-GCG-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TATCT----G-T-G-TC-C----AT---A--C---GCATTAC-T-TTGTA-TTAATGC--GGACC-AA--A---TA--CAAC--------------------------AGG----CTTTTA-AGAG---TT--GCA--GAAAAGGAC---ATCGAT--GAG-CAA-ACAT-T--TAGA---ATAGTAGAAGACAGTACGGCT--ATCA--TATGGG--AAATTTAGCACACT--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--ATTT---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAA---T--TG-ACC
gi|8 : T-G--CT-AG-AT-TGGATA---AA---GTGTTCCATNN-N---NNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTA----C----AAAC-GT-ATGA------CGGTTTGGT--ATTTAAT-ACGCA-ATC----------TTGA-----TTAAGGC--AC-C------T--AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-ACAA-AT----T--ATTAC--------T-A-CCT-TGT-C---TTTG-ATG-TA-TGAGGGGACCA-TTAACTGTAT--ATA-ATTCA---GCAAA--AA-GGAAC-GT-----CGT-----AG-A----C--CTTTGG-AGTATCA-AGTGGCT-AAAATCAGGCG----------------GAAA---TCT--GA---TAGATTGA-TT-TA---G-TTGTAG--GAATG--GG--GTA-TA-TTAGAA-ACAATGAATTAC--ATT--A-A---T-CAGT--T--AA-T-----GTA-ATT-TTGAT-GACAATATATATC----------TATATTT-AGTA-------AAAA--ccgcgcttacatttgcgaacgtcatggccgcaggataattgatatagaaactgcgttaccgatcgaaggtttatttacaatctattctaatacaaagtacatagtgttaaaatgatgcttatgtattagacaatgttactaacaatcattgaat
gi|9 : TG-TC-T--AA-ACCACA-TACATGACTCATC-CGC-AGG---C----CAC--------CGA--TGA-TAAGGAAAG-CAC---TC-TCA-----TTTGGAC--ATACAAATG-TA-ATG--TAAAAG-CGT-----T-AAAC-TT-AACC--AACC------TCCA-----G-G-CAGGA-TGGTTATGTCTACA----AC-----AA----C-ACCTAATGAAGA-AG-TACTTTA-CTCG-ATATT--TG-ATAAG-A-CAGCTCCAATCG-ACTGCCCT-AT-AAC-AG---AAAA-TGCCACTGT-TC-AG--T-AGAATA---T-T-CA-G-CTA-TTTTAATACAAGAAG-C-----TATC-AAATTTT--AA-CT----AT--CCTCCCATG-TGA-TTTGGCAG-TTGCT-AAAAAGTTTATGC
blockSeqs : CCG A G A T TCCCC A T GT CTCCACTAAT G C G AG A . T CAGGTCAGA A CA GACGAG T GA C . ACC T A TGG CCG AA CAA T T T . TTG CA T C A . A A C T . T C . C CA CAT . GAT C . . A A CGG CT . AC CTGTTACAGACGAAACACAACTATTACAG A . TC . AG . . . C G . GAT G A TACGGCT . ACG TTT CA C GG TATT T TAAA ATT A . T A TTATT . TTATCCTAATAACTTTATCTACCTATT CATTAT . TG TTG GT GC . G A . ATG NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN CAAAGTACAT . CGG C TA TT G T C G AG . G TGCAGG . . T T TT T T T C ATG TG T CT TTA A A A T . GG . G T . A TG A T G GGGA A AA C AG A A A TGTGAAATAATTAGTAGT CCC TA ATT AT A . TCG G TT GT . TTA A C TT AATTG AGT . T TG C . G A G A C A A TATTAATATA G TATTATAGT ATTATGTATATA AT GGACGCGTA ATC T TT A GTA TA . . A A TC G GCAT AGA . . . . . . . . . . . . . TG C T . . . TT . A . A . A . A A A TC CT . . . T T . A T T . . . . TC . . T . A . . . . . . . . . . . CTA . A T T A C . . T T . . . C C CA . . A . . . A A . . G G . T . G . . AAT . . C . T . . T . C G . . . A . C . . G . T CTC G . TG GAAT GTTGTGTTAG G AC TGA A C CC AAACTTAGAGA A TG A CTAATGGAAATTATCCCAACTCGTTATCGAAATT TA A . TC A A . A GA TG GTG C CAAA . TTTTTGTT AAT C GCCATATGGCGAATTT A GAT . TATTTGC TG C A ATGATGAGC CACA . TC CCTT A A ACAACAAGTTGTAGAATCTTCAATC TATCAGAA G G T . TC GTTAGAATGTCGAATTGGCGAAATGATAGATC AG TT A . CT . A . GC AG GTTGAATAT CCAATCTCAAAAAATGGAGACTTACGCCTC A . T . C . CAAAA T . T ACCGAGCACTGGGAAG . AAACAGG A T T CATACAAATGTA TA AAAGCCGTT . CT . TG T AGTGA A . TGGTTATGTCTACAACAACACC T G A A . CA A T T CAATAA ATTCAATAG . GCA AA . . . ATTTT . . . TTAAT CAGTCAAAAA . CAT TG C . . . A
blockSeqs : TC T . A T T . T . ACACTTG G . . . . . . AGGG . A ACGG . A . . G T A . G . AA . . T . T GC . . . . A A . . . . . . . C . . C . . . G A CGA . . . CAGG T . T . AG . . . C . . . . G G . A T CA . . TTT . ATTT . . . T . ATT . TTGCCCTAGTCAACTATCGATCTGAAT TAAATA . T GC GT . . . A . ACG ATATGGTTTAA CTCCA . CG G . . . . G A . . . . . . T . T T T T T TCG AT . TC TGA . . . C . GT . . . . . . . T G GGA . A . AC C . C CG . AC . . . . . . A . . GA A . . AATTC . . . . . . . T . . . A . A . GTA CAAAAAAAGATA AC CAAAATAA . . . A . G . . . A CA G GCA ATG . A CCT . . TG TGAA GTCGAGTAG . C ATG A C C AATGAGAT A T . ATAATTATCCCAAGCTTGTTATAAAAT T A . TC . . . A . TA G C CA . TT AA T AAGGCGGAC A AT . ATATTGC TG C G ATCTGTAC CGCA . . GACC G A TAGAACAGAGTTTAAGAATTACT TAATCAGA T A T . . TGTACGATACGAAATTCGGGAAGTAACTT TG . A . T . A . C . AATAG CAAATTTCAAAAAAGCT C . . . T . TCAA . . T CTATAGCGA . AAACAT . A T TGCGGTAT . GCGGA . C . . T AAG . . TTGTTAATCTACACTAACCAC . A A A . CA . . T CAATCG AATACAA . AAG AA . . . ATTTT . . . . CTATCAAAT . CAT . C . . . C
blockSeqs : CC T . A T . . . . ACCCT G . . . . . . AGG . A ACAG . . . . . T A . G . AA . . T . T CC . . . . A A . . . . . . . . . . C . . . G A CG . . . TAG A . T . AA . . . T . . . . G T . A T CA . . CAT . TATT . . . G . TT . AGATTAACATCATATTAGA AAAT . G GT GT . . . A . CTA TATGGTTCA CAAAC . C . . . . . C A . . . . . . A . T G T T T AGG T . CT TAA . . . C . TG . . . . . . . T . GGA . A . CA G . . A . G . . . . . . G . . TA A . . AATCT . . . . . . . . . . . A . A . TA AAAGATAA A CATGCTA . . . . . T . . . A CT . . . . A CT . . T GG GGTGTGTG . . ATG A C C ACAAGAAG . T . AAATTATCCGAACTCATATCAAAAT T A . . . . . A . TA T C C . TT A C GGCAAAC A AT . ATGTG GC . A ATCTGCA CGG . . CCTT G A CAACAAGTTGAAGAATCTACA AATCAAA A T C . . ATGTCAGCATGAATGGAT TG . G . T . G . C . TTGA AATGGGAACTAGCCC A . . . C . TCA . . . ACATCAG . AGACTA . A T CAGATA . GCGGA . C . . . AAG . . TTTGATTATCATACACAACAC . A A . . G . . . ATCAC AATACAA . CCA T . . . TTT . . . . CTGTAAAA . CT . C . . . C
blockSeqs : C T . A T . . . . ACACT G . . . . . . AG . A ACG . . . . . A A . G . AA . . G . T A . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . T G CG . . . TAG C . G . A . . . C . . . . A T . A T CA . . CAT . TCA . . . T . TT . TTTCCATATAT CGAT . G TC . . . . A . TCC AACGGTCAA CATA . C . . . . . C A . . . . . . T . T T T T T AGT T . T TG . . . C . G . . . . . . . G . CGA . A . CA G . . G . G . . . . . . A . . TT A . . ATTC . . . . . . . . . . . A . T . AA TAAGATAA C CAAAACG . . . . . . . . . . . . A TCGTG . . GA . . . AATGAGAT . T . CATATTGCCACTGGTATAAAT T . . . . . . . . T T C . . T . . GA . AT . TATTG GC . . CTTGC GC . . TG C A AGTTGACGATTCTA TTAA A G . . . ATGTCAGCATGAATGGAT T . . . . . T . A . TTGA AATCGGATTAACCTC A . . . C . CAA . . . CCACCGA . AACAT . A T TATA . AGCG . C . . . AA . . TTTGATTATCATACACAACAC . . A . . . . . . TCA ATAACAG . AA T . . . TT . . . . AGTTTTG . GT . C . . . .
blockSeqs : C T . . . . . . . AGCAT G . . . . . . GG . A CAG . . . . . T A . G . AA . . T . G C . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . A G CA . . . CGG A . T . A . . . C . . . . A . . A T A . . ATA . TA . . . T . TT . GAGCTTA TCA . G . . . . . . . AC ACGGTCA TAAA . C . . . . . C A . . . . . . T . T T . . . G A . C A . . . A . G . . . . . . . C . TGT . A . AG . . . G . . . . . . . . A . . TA G . . AATT . . . . . . . . . . . . . . . T . . GA . . . ACAAGAAG . . . CATATTGCCACTGGTATAAAT . . . . . . . . . . . . . . T . . GA . A . TATTG T . . CTTGC GC . . TG G . AGTTGACGATTCTA TTAA A T . . . G . . . . . T . A . ATA TGGGATGCTTTCA T . . . . . TAA . . . ACCCAG . AGCAC . A . ACTG . CGCG . C . . . A . . TGGTTATCTACAACACCACC . . . . . . . . . ATC ATTACA . AA T . . . TT . . . . AGTTTTG . CT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . ACACT G . . . . . . G . A CCA . . . . . T A . G . A . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . T . GC . . . CAG A . T . . . . . C . . . . A . G . C . . CAT . TA . . . . . . . . . . . . . TTTAAA CAAA . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . . . . AGA . . . . . . . G . . . . . . . . A . . TA . . . AATT . . . . . . . . . . . . . ATT TGGGATGCTTTCA T . . . . . TA . . . ACCCAG . ACA . A . TGT . AAGA . . . . . A . . TGCTG . . . . . . . . . ATC TA . G . . . . T . . . . TGGTTT . CT . . . . . .
blockSeqs : . . . TACAT G . . . . . . G . C GCG . . . . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . CA . . . . . . . . . . . . . . AA . TA . . . . G . . . . . . . . A . . TA . . . TTCA . . . . . . . . . . . . TA . . . CACA . ACA . . . TGT . GCGT . . . . . CT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . ATG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . G . . . AA . . . . . . . ATTA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G .
blockSeqCons : ACCCT********** ******* ** AGG******** A*** NCG**** ******** G*********** AA***** T* *** ** **** **** ** A** CG* *** CAG******************************* A* *** ** *** ** ** T******** ** A** T** CA CAT* TA***************** ** TT****** ** G** GC* GT* A*** *** NCG TACGGTCNA********************* CAAA********** C******** C********** A**** ** T** T**** ANG* CT*** G* ** *** T* ***** NGA********** AG* G* ** TA** ATTN***** *** ***** AAAGATAA*************** AC CGANNCG****** ******** *** GTCGTGTG************* ** ATG* C* ANNGGGAN******* T* T*** **** **** A*** TA T** C*** TT****** A** GGCGGAC********* AT**** TATTG****** NN** ATCTGCGC** CGCG* CCTT***** CAACAAGTTGANGANTCTCA********************** TATCAAA****** ****** ATGTCGGCACGAATGGAT*************************** ** N** TTGA****** AATGGGACGCTTCCA********************************** ** TAA**** ACCCAG****************** AGCA**** CGTA************ AA**** TTTGGTTATCTACAACAACACC*************** CAATC** ATTACAA****** ACA ** TTT**** ***** CAGTTTTG******* ** CT*****
originalCons : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCT----A-C--A-T---ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-A--CGG-C-G--TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTT--C-----A-G-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGC--GGACGGAA--A---CA--CAAC--------------------------AG-----CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAT---T--TG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCA-G-GTTC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTACGATGN-A---CGGTT-T-AA--------------TTTCTA----C----TANA-GT-ATGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCAG-GT-T-CCA-TGTCC---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATGGTAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGT-----GG-A----CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TAT--AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--ATT--C-A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA--T---AAG-ATATA--------ATATTACTGC--CGA--NAT-A-AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGC-G--T-CG--T-G--------A-ATTA-CATGGTTACGAGAGTATTACAGTGGTC-AGACAA--TGAG-AG--TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTG--GTAGCATATC--AA-ATT------TTGGTAAA-TTCCAAAG-------GGCGAA--CTTGATATGAT---TTCTG-CGC--TA-T-T-GCTAC--TGGACAAGCTATTGAA-T-CTGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-A-GC-GACA-A-G-TT-A----AGAATC-T--A--C-----ATAA-A-AT-CAG-A--GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--ATACATGTAG---AATGT-CG-AA--TA--GCGAAATGAACGGAT----CAATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--NTGGAGAT--GAATT-GA----CTTAGGAA---C---GGA----TT-TC----AAAAA---------------C--C--ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TC-C--AA-ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC----CAC--------AG---TGA-TAAGGAAAGACACG-GTC-TCAATTTGTTTGGAT--A-------G-TA-CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAGGA-T-----TGNTTATC----AC-----A-----C-AC-TGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC--ATCA-ACTGCCCT-AT-A-C-A----AGAA-TGAAGCTAT-TC-AG--C-AGGTTA---T-T-CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGC-----NGTC-AAAATGT--AA-NT----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
finalCons : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCTACCCT----------ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AAAGG--------T-AAA---CGNCG----TT-G--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGGG-----------CGTTTT--CAA-----G-ATATGATCA-TTT-GAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAANGCA--GACG-AA--A---CA--CAACAG-------------------------------CTTTTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGGT--------ATCA--TATGGA--AAGT--AGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGATA-----------------T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCATT------G-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTT---ATC-TA--C-T--A-----T-ACATGTAA-TA-ATTATG--GCAG--GTGC-TAAGT-G--CT-AGTAT-TGAATA---AA---GCGTNCGATGTACGGTCNA---------------------TTTCTACAAA----------GT-ATGAC--------TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGAA----TTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATGT--AAAATAT----TTAATTACCGGCANG-T-T-CCA-TGTCT---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAATG-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGTNGA----------CT-CTTTGG-AGCAT-AAG-TGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TATG-AA---TAA--TGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCATA--TAGAAA-ACAATGAA--ATATTN-----A---T-CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAAAAAGATAA---------------ATATTACTGCCGANNCG------AA---ATT-GTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGCGTCGTGTG-------------A-ATTA--ATGGTTATG-GAGTATTACAGTGGTC-AGANNGGGAN-------TATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGAT---TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGAA--CTTATTGT--TAGCATATC---A-ATTTT------GGTAA--TTCCAAAGGGCGGAC---------TTGATATAT----TTCTG-CGCTATTG------TACNN--GACAAGCTATTGAATCTGCGC--TTCGCG-TT-G--GCCCTT-----TCGGCAACAACAAGTTGANGANTCTCA----------------------ATAATATCAAA------GNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--ATACAATGTCGGCACGAATGGAT---------------------------AATGA--TTGAGT-CCC-TAGAA--AANT-ATN--TGGAGAT--GATTGA------CTTAGGAAAATGGGACGCTTCCA----------------------------------ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTG-TCTAA----ACCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGGACCCAG------------------TGA-TAAGGAAAGCA----GTC-TCAATTTGTTTGGACGTA------------CTG--AAAAAG-GGG-----T-CAAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTAA----G-G-CAGGATTTGGTTATCTACAACAACACC---------------TGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTCCAATC--ACTGCCCTATTACAA------AGAA-TGACACTAT-TC-AG--C-AGGTTATTT----CA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGGCAGTTTTG-------TGT--AACT-----AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CAAGTGAGTTCAGTACATCATGGAAAGGCAAATGTAACTATCC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1 22222 1 11111 1111111 333333333 11111 111 11 11111111 111 222222222222 11 111 111 222 1111 2222 11111 1111 555555555555555555555555555555555555 1111 222222222 1111 44444444444444444444444 11111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222222 1111111 11111111111111 11111 55555555555555555555555555555555555555 1111111 22222222 222222222 1 22222222222 11111 111111 11111 22222 1111111 1 111 1 22222 2222222222 111 1 1 333333333333333333 1111 11 111 11111 2222222222 44444444444444444444444444 111 1111 2222 111111 11 1 44444444 11 111 1 1111 1 1 11 222 11 1 11 1 2222 222 222 11 1 222222 1 222 11 11 1 11 1 1 11 111 222 1 11 11 222222 1 1 1 1 11 22222 3333333 11 222 1 33333333 3333333 2222 1 222 2222 222 1 11 1 1 1 11 1 1 222 1 1 1 1 22222 11 1 22222 11 333333333 11 44444444444 1 222222 55555555555555555 1 1 333333 1 2222 2222 2222 1 222 11 1 22222 11 1 44444444444 222222 1 3333333 1 1 33333333 1 2222 222 11 11 1 11 111111 22 1 11 222222 11 2222222222 2222 2222 11 222222222222222222 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11 1111 1111 22 222 2222 22222222222 22222 222222 111 1111 111111 11 1 222222222 1 22222222222222222 222222 44444444444444 444444444444444444444444444 1 111111 111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 1111 22222222222222 999999999999999999999999999999999999999999999999 1 222222222 1 555555555555555555555555 33333333333 1 222222222222222222 1111111111111 222222 22 33333333333333333 1 1 22 1 111 111 111 11 11 11 22222 33333333333333333 11111 1 2
lowQualScore : 6666 3 5 5 2 00000 4 5 0 66 00 2 22222 66 4 8888888 66 4 66 4 333333333 4 4 77777 66 333 4 00 4 66666666 222 7 7 777 555555555555 777 4 4 4 11 4 333 111 4 8 4 4 1 000 66 5 0000 5 5 5 5 2222 888 00000 5 5 5 66 5 77 1 4 3333 66 888888888888888888888888888888888888 4 55 888 5 66 1111 888 66 5 0 1 5 66 888 5 2 0 222222222 77 888 999 22 5 66 7777 5 44444444444444444444444 5 999 1 5 66 66666666 5 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33333333 0000000 88888888888888 5 5 22222 99999999999999999999999999999999999999 4444444 5 00000000 000000000 1 77 77 5 5 55555555555 22222 77 77 5 666666 5 5 1 5 555 1 77777 5 7 22222 777 6 1 5555555 5 5 5 5 5 5 5 1 77 5 5 000 1 77 5 99 55555 1 6666666666 5 55 5 222 0 5 0 888888888888888888 888 3333 5 66 5 5 888 5 77 66 66 4444 6 4 66 99 4 1 999999 222 66 4 11111 4 8 4 4 4 5 5 8888888888 6 55555555555555555555555555 8 88 444 0 99 2222 22 8888 666666 11 0 33333333 33 8 444 8 0 99 2 8888 888 5 5 88 111 88 5 88 5 3333 111 000 88 5 444444 1 1 5 111 88 88 5 1 88 5 5 1 88 999 111 5 22 66 88 999999 5 5 5 5 1 1 66 66666 1111111 88 000 22 5 44444444 2222222 3333 5 111 3333 111 5 88 5 5 5 88 5 5 111 5 1 5 5 1 5 66666 88 5 1 77777 88 999999999 1 1 88 11111111111 5 1 999999 99999999999999999 5 1 1 5 000000 1 5 4444 5555 4444 5 000 88 333 5 77777 1 88 1 5 33333333333 888888 5 2222222 5 5 55555555 5 1111 111 1 88 88 5 33 1 444444 33 0 44 888888 11 6666666666 9999 5555 7 6 33 444444444444444444 5 99 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 6 7 4444 88 6 6 4444 9999 99 11 6 000 2 5555 99999999999 00000 99 888888 444 1 3333 555555 6 00 888 3 000000000 5 9 66666666666666666 6 99 777777 7 5 33333333333333 6 6 1 99 1 999999999999999999999999999 1 1 2 999999 999999999 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 9 6 44 99 1 6 6666 99 22222222222222 333333333333333333333333333333333333333333333333 1 5 5 77 0 444444444 5 0 4 5 0 66 555555555555555555555555 5 5 11111111111 0 3 3 5 999999999999999999 66 4444444444444 77 5 999 0 99 111111 5 5 5 33 33333333333333333 5 6 5 1 5 11 5 5 1 888 5 777 5 222 33 4 66 5 77 5 55 55555 5 5 88888 0 33333333333333333 22222 0 5 66 8 5 5 0 5 0
lowQualScore : .... . . . . ..... . . . .. .. . ..... .. . ....... .. . .. . ......... . . ..... .. ... . .. . ........ ... . . ... ............ ... . . . .. . ... ... . . . . . ... .. . .... . . . . .... ... ..... . . . .. . .. . . .... .. .................................... . .. ... . .. .... ... .. . . . . .. ... . . . ......... .. ... ... .. . .. .... . ....................... . ... . . .. ........ . ......................................................... ........ ....... .............. . . ..... ...................................... ....... . ........ ......... . .. .. . . ........... ..... .. .. . ...... . . . . ... . ..... . . ..... ... . . ....... . . . . . . . . .. . . ... . .. . .. ..... . .......... . .. . ... . . . .................. ... .... . .. . . ... . .. .. .. .... . . .. .. . . ...... ... .. . ..... . . . . . . . .......... . .......................... . .. ... . .. .... .. .... ...... .. . ........ .. . ... . . .. . .... ... . . .. ... .. . .. . .... ... ... .. . ...... . . . ... .. .. . . .. . . . .. ... ... . .. .. .. ...... . . . . . . .. ..... ....... .. ... .. . ........ ....... .... . ... .... ... . .. . . . .. . . ... . . . . . . ..... .. . . ..... .. ......... . . .. ........... . . ...... ................. . . . . ...... . . .... .... .... . ... .. ... . ..... . .. . . ........... ...... . ....... . . ........ . .... ... . .. .. . .. . ...... .. . .. ...... .. .......... .... .... . . .. .................. . .. . ................................................................... .. . . .... .. . . .... .... .. .. . ... . .... ........... ..... .. ...... ... . .... ...... . .. ... . ......... . . ................. . .. ...... . . .............. . . . .. . ........................... . . . ...... ......... .. .................................................... .. . . .. .. . . .... .. .............. ................................................ . . . .. . ......... . . . . . .. ........................ . . ........... . . . . .................. .. ............. .. . ... . .. ...... . . . .. ................. . . . . . .. . . . ... . ... . ... .. . .. . .. . .. ..... . . ..... . ................. ..... . . .. . . . . . .
lowQualScore : 4444 9 7 0 0 00000 5 0 0 99 22 5 55555 99 4 9999999 11 4 11 4 999999999 4 4 22222 11 888 4 66 4 11111111 222 4 3 888 000000000000 888 4 4 4 77 4 333 777 4 9 4 4 9 666 99 0 6666 0 0 0 0 5555 888 00000 0 0 0 00 0 33 4 4 9999 11 111111111111111111111111111111111111 4 22 888 0 99 6666 888 99 0 1 4 0 99 888 7 3 7 000000000 99 000 333 11 0 99 1111 0 22222222222222222222222 0 333 4 7 44 66666666 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00000000 0000000 77777777777777 7 7 33333 99999999999999999999999999999999999999 4444444 7 11111111 000000000 4 99 99 7 7 77777777777 33333 99 99 7 444444 7 7 7 7 999 4 11111 0 6 11111 777 7 0 7777777 7 7 7 3 7 7 7 4 99 7 7 000 4 99 7 33 77777 0 9999999999 7 99 7 333 1 0 0 222222222222222222 888 2222 0 99 0 0 888 0 11 11 11 6666 2 4 11 44 4 0 444444 222 11 4 11111 4 9 4 4 4 0 7 9999999999 7 44444444444444444444444444 0 88 000 8 00 4444 00 4444 000000 00 6 00000000 66 0 000 0 6 66 5 2222 555 5 0 00 000 55 5 55 5 0000 555 555 00 5 555555 0 0 0 555 55 55 5 0 00 5 5 0 00 000 555 5 00 55 00 000000 0 5 5 0 0 0 55 55555 5555555 00 555 00 5 55555555 5555555 5555 5 000 5555 000 5 00 0 0 0 55 5 0 000 5 0 5 5 0 0 55555 55 5 0 00000 00 000000000 0 0 00 55555555555 0 0 000000 55555555555555555 5 0 0 0 000000 0 0 0000 0000 5555 0 555 00 000 0 00000 0 55 0 5 55555555555 000000 0 5555555 0 5 55555555 0 5555 555 0 55 55 0 88 0 888888 88 0 22 444444 00 0000000000 8888 3333 3 7 33 555555555555555555 5 88 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 7 3 2222 33 7 7 2222 0000 22 00 7 555 5 0000 22222222222 88888 22 333333 000 0 2222 222222 7 22 777 3 333333333 0 8 22222222222222222 7 22 555555 2 2 88888888888888 7 7 0 22 0 888888888888888888888888888 0 0 0 222222 333333333 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 22 8 7 00 22 0 7 8888 22 22222222222222 999999999999999999999999999999999999999999999999 0 7 7 99 1 666666666 0 9 2 0 0 99 999999999999999999999999 0 0 55555555555 2 2 2 0 111111111111111111 99 2222222222222 55 0 444 7 99 111111 7 7 7 77 66666666666666666 7 0 0 4 7 44 7 7 4 444 7 999 0 999 66 3 99 7 99 7 77 99999 7 7 66666 1 11111111111111111 55555 0 0 99 8 0 0 1 0 0
consensus : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCTACNC-----T--ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-----A--CGNC-G-TTG--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTTC---A-AG-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAGA--CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAAN-GC-AG-ACGAA-A----CA--CAAC--------------------------A-G-----CTT-TTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCC-AT----T---G-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-C-T------AT-A-CATGTAA-TA-ATTATG--GCA-GGT--G-CTAAGT-G--CT-AGTAT-TGA----ATAAAGCGTNC-GATG-TA---CGGTT---AA---------------TTTCTAC-A-----AA-GT-A------TGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCACG--T-T-CCA-TGTCT---TTT-AATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAA-T-G-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGTGG-A--------CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TA-TG-A-A--TAATGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--ATA-A-TTNA--T---CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA---A--A-----AG-ATA-A---ATATTACTGC--CGANAC-GT-AA---A--TTGTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGCG--TCGTGT--G------AATTA-A--TGGTTACG-GAGTATTACAGTGGTC-AG---ANN----GAG-A--NTATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGA--ACTTATT-G-T-TAGCATATC---AATT------TT---GGT-AA--TTCCAAAG------GGCGAACTT--GATAT-AT---TTCTG-CGC-TAT-T-G-TA------CTNGACAAGCTATTGAA-TC-TGCGCTTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-C--A-----ACA-A-GTTG-AAG--AATC-----T-CA-AT---AAT-AT-C--A-AAGNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--A------TACAATGTA---------CGAA-T-GCGCG-AA--T--G---GA--TA-ATC-AAG----ATT--GAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--A-TGGAGAT--G--A--TTGA----CTTAGG------------A--AAAT---------GGG-----AN--GCC-TCC-ATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTGTCT----AAA--CCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC-C---------C-------AG---TGA-TAA-GGAAAGA-CA---G--TCTCAATTTGTTTGG-AC--G---TA-C--------TG--AAAAAG-GGGT-C-----AAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAG-GATTTGGTTA-T--C-TACAACAACA-CTGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC-CAATC-AC--TGCCCTATT--ACAAAGAATGACACTAT-TC-AG--C-AGGTTA--TTTCA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGG---CAGTT--TT----GTGTA-----AC-T-AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
Reference ( family-288 ) : CATGGGC-C--AGTAA-CACATTACC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--ATTTTTCTACCC-----T--ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-----A--CGNC-G-TTG--T-TT--------GA---CAATTTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTTC---A-AG-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-C-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-TTAAN-GC-AG-ACGAA-A----CA--CAAC--------------------------A-G-----CTT-TTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACGG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--A--T---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCC-AT----T---G-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-C-T------AT-A-CATGTAA-TA-ATTATG--GCA-GGT--G-CTAAGT-G--CT-AGTAT-TGA----ATAAAGCGTNC-GATG-TA---CGGTC---NA---------------TTTCTAC-A-----AA-GT-A------TGA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATAT----TTAATTACCGGCANG--T-T-CCA-TGTCT---TTTGAATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAA-T-G-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAT-GT-----CGTNG-A--------CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGGCT-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TA-TG-A-A--TAATGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--A-TTNA--T---CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------ATATATTT-A-TA-------AAAA---A--A-----AG-ATA-A---ATATTACTGC--CGANNC-G--AA---A--TTGTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCCTTTATGCTGAGCA-TATANAAAATGAAATACCCAAGCAACATCTTAGGTCTGTAAGGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTANATTAAANTTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGATTTGATTGACGNTAATATAGGAGTCCGAGAATTATGNAGTAGGAAGTCTCNCAAGGTACTAGTACAANNGANTAGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTGTCTATGTCAATTCCACACTATACTTGATTAATTGAAAGNCCAAAATTAGNATANTGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGCTGAGTGNNGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACGATTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAGGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTATCTAAGGAGGACAATGGAGNGAATACGGAACTGGCTAACGTTTAAAAAANAAAAACGCAACAAAACTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAATAANAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACNCCCNCCCCCCAAAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATNGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCGATGNTGNAGCAGTGACTATGATTTATNAATATAAGTCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCTGGATTTTGTTCTGGCCAAAGGAGGTGNNNATATTCTTCATATTTACGTNTGAAGAAAAAAGCTTCNTCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATNAGAAAGAGCGCACACAAGTAACTCAAGGAAACGTGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCNCTGAAAAAATCNAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGAGAAGG--TTNGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ATTGATA-G-AA-ATGAGCG--TCGTGT--G------AATTA-A--TGGTTATG-GAGTATTACAGTGGTC-AG---ANN----GGG-A--NTATTTGTCATTT-ATGT-TGGC--AT------------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-NTA------TC-AA-----ATTGA--T-TAAAC----TGG--AATC-AA-GA----TAGA---GAGA--ACTTATT-G-T-TAGCATATC---AATT------TT---GGT-AA--TTCCAAAG------GGCGGACTT--GATAT-AT---TTCTG-CGC-TAT-T-G-TA------CNNGACAAGCTATTGAA-TC-TGCGCTTCGC-GTT-G--GC--C---CTTTCGGCAA-C--A-----ACA-A-GTTG-ANG--ANTC-----T-CA-AT---AAT-AT-C--A-AAGNCGNGCCTTCATAGTATT------GGT--A------TACAATGT----------CG-----GCACG-AA--T--G---GA--TA-AT----G----ATT--GAGT-CCC-TAGAA--AANT-AT--N-TGGAGAT--G--A--TTGA----CTTAGG------------A--AAAT---------GGG-----AC--GCT-TCCAATGNTTC-TA-AAGACCAAAACAT--GACCATTTGTCT----AAA--CCACA-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--AC-C---------C-------AG---TGA-TAA-GGAAAG--CA---G--TCTCAATTTGTTTGG-AC--G---TA-C--------TG--AAAAAG-GGGT-C-----AAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCTA---A-G-G-CAG-GATTTGGTTA-T--C-TACAACAACACCTGATGAAGA-AGGTACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTAT-A-CGGTTC-CAATC-AC--TGCCCTATT--ACAAAGAATGACACTAT-TC-AG--C-AGGTTA--TTTCA-G-CTA-TC-----ACAAGAAGG---CAGTT--TT----GTGTA-----AC-T-AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTATGC
gi|1 : TTTTTTG-AGAGAAGATAGTG---GT-AGAAAAATT-AA------ATGG-T-AA-----AGGCGGC-GGTTG--T-TTTTGCAACCAA---CATGTTTT-TGTT---GGG--GACTGAAATGCGTTTTCTCAACAG-ATATGATCA-TTCTGAAATTT--AT-C-AATTTTT-GTG-CACAATTCAACA-AGAAACCATAATA-CGAAAAG-T-GATT-CTCCAAT---AGGC--TGCATTAC-TATTGTAAGTAAT-GCTAGTACGGA-AATCACA--CAAT--------------------------A-ATAAGTCTA-TTATAGAAGCTTTT-GCATGGATAAGGACTTCATCGATCTGAGTCGATG--T-TGGTAGA---ATA-TAGA-GACGG------TGCATCAAATATGG-------------TA-T--TA-A--GAC-TGCGAGAATGAGAGCTAATTT--A--T---TAT-TTTCAATTTTGGTGCCT-TGCC-ATGAATT---GCACCTTACGATTATGTGACTCGCGTGTAA--AACTTTATAATC-TA-C-TCTAAAAATTA-CATGTAA-T--ATTATGTTGCA--GT--GTTTAAGTCG--CTAAGTCT-TGAATATATAAAGCGCGTAGATG-GAAATCGGTTATAAA---------------TTTCTAA-ATTCGTAA-GTAA------TGAAATCGTC--TCAG-T--GT--TAT-AAATA-ATCCAAGCGATGTTTGAGAATATTA--GCAAAT-C------TTAAGTAAAATATT-ACTTTCAATGTT-GAAATATTATATTAACTATCGGC-CGTTT-T-CCA-TGTCCCTATTTGCATG-TA-T--GAGGTCCATTTAA-TAG-TATCAATA-A-TCATGCAC-AA--AATGAAATCGTATATACGTAGTACGGACTACCT-TTTTAG-GGCAT-ATAGTGGCT-AAAAT-AGG-T----------------GAAA---TATTA-A-A--TAATGA-TTATA---G-CTGTAG-GGAATG--GGAAGAA-TATTAGAAA-ACAATGAA--ATAAA-TTTA--CATACAAAGGT--AA-TCGAAAGTA-C-T-TTGA--GG-AATATAT-TC---------G-ATATTT-A-TA-------AAAACTTA--ATATGTAT-ATA-AACTATATTAAGGCATCGATAC-AT-AA---A--TTGTA--TAATTTTTTTTCTTTTTAAAT-TTTACCAATG-AT-GACTCTTGATGTTTA-CA-TAGAAAAAATAAAATACCCAAGCAACATCTTAAATCTGTAAAGAACATTCTCTTTATCAAGCTCAACAATCGGGAAATTTAAAATCGTCCCCATACAAAATAATTTGAATCGCTGTAAATTAAAATTTGACAACAGAAATTTGTATAAAGGA--TGATTGACATTAATATAGGAGTCCGAG-ATTATGTAGTAGGAAGTCTCTCAAGGTACTAGT-CAAAAGAA-AGGATTGTGTTATTCAGGTTGAGAACGCATACCTTCCATTGGTGGTG-CTATGTCAATTCCACAC-ATACTTGATTAATTGAAAACCTAAAATTAAGATAATGAGGTAGGAAGAGCAGAGAGGTACAACCGTTGAGTGAGGAAGTGAACAGGAGAGAGACAATTTGAGTAGACTAAGAAGATGTAAGAGACG-TTCTTAAGTTAACGCACTGTGTTCAACTTTTATTACCGATCCGGACAGAAGTGTCTGATTCGAGTAATTAAGAACGTAT---AGAAGGACAATGGAGCGAA-ACGGAACTAGCTAACG-TTAAAAAACAAAAACG-AACAAAATTCGAAAAGCAAGAAAAAAAAATAAGTAA-AAAAAAATGTAAAAAAAACCTTCCAAGAAAATAAACACCCACCCCT--AAAACACACACACACTCGTCCACGCGAACCAGAATTGCCCGCGTGATACAAATCCCTAGCATGTTCGCTTTGCAATGCTGCAGCAGTGATTATGATTTATTAATATAA-TCTAGAAAATAATACGAGAAATATATATCT-GATTTTGTTCTGACCAAAGGAGGTGTTAATATTCTTCATATTTACGTGTGAAGAAAAAAACTTCATCTGTTGTCGTTCTTTTTCGCGAATGAGAAAGAGTGCACATAAGTAACTCAAAGAAAC-TGAAAGACATAAACCAAATCCAGAAATGCTCTGAAAAAATCAAAGTGAGTTTTTGAGCATCTAATGGA-AAGGCATTTGAACC-T-TTTATCACTGAGCAATAAATA-GTCA-ATGAACGATCCGTGG--GATAGAAAACTACA--TCGTTACACGAGAATTACAGTGGTC-AGCAAATT----GAGCAGCATATCTGTCATT-----T-TAGC--ATCGAATAGACAGGAATTATGCGAGAAATGTCCACA-CTTGTTTAAGGCGTCC-AAATATAATTGAGCT-TAAACACTGTGG--AATC-AA-TAGTATTAGATACGAGA--ACT--TT-GAG-TACAACATC---AATA------TTGTGGGTAAA--TTCCAAAG------GGCGAACTT--TGTATGATAAGTTCTGATGC-AAT-A-G-TAGCTACTTTGGACAAGCTATTAAACTC-TAGTATTCACTATTAG--GC--CACACTTTC--CAC-C--AATGACACA-ACGTTATAAGAAAATCGTACTT-CAGATA--AAT-GTACAGA-AGGCCGCGTCTTCATAGTATTCTAGTCAAT--A------TGC-ATGTAGCTTAGTGACGAAATAGTGCGAAA--T--GACAGA--TA-ACCAAGA----ATT--GAGTCCCC-TAGAACCAAATAATTGA-TGGAGAA--G--AACTAGAT---CCTAGT------------A--GCATATTCTCGAGAGA-----AA--GCC-TC--ATGGTTCAAA-AAAACCAATACATGAGACAATTTG-CTCGCAAGA--CCATA-TGCATGA-CTATCGCGC-AGGCCAC-CACTGGCGAAT-------AGCCTTGATTAA-TGAAAGA-CACGTG--TGTCA--TTGTTTGGAAC--A---TA-C--------TG--AAAAAA-AGTTAC-----AAC-CCTAACC--AATCGTACCTGCTT---A-G-GACAGAGA--TGCTTG-T--T-TA------------ATGAGCA---GTACTTTG-TTCGAACTGT--TG-ATTGT-A-CGGTTC-CAATT-A------CCT-TT-----AAGAATT-CAATAT-TCGAGGTCGAGGTTA--TGTCACGTCTACTCCGTCAACGAAAACGCA-CAGAT--GTCAAAATGTAAAAGTAC-TGAC--CCTTGCATACTGATTTTTGCAGTTTGCTAAAAAAGTGTATGC
gi|10 : ggatatattttgatatCATGGGC-C--AGCAA-CACCC--CC-----CCCCCCC-CTCTA-GGG--CTTTTTCTACAC-----T----GATTTTTTG-AAAG-------CGT--GT-AAAAAA--T-AA------A-GG-T-AA-----A--CGACGG-TTG--T-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---GGG--G---------CGTTTTC---A-AG-ATATGATCA-TT-TGAA-TTT--AT-A-AATTGTT-G-G-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TA-CC----G-T-G-TTCC----AT---A--C--CGTATTAC-T-TTGTA-TTAAA-GC-AG-ACGAA-A----CA--CAACTGTTACAGACGAAACACAACTATTACA-G-----TTT-TTA-AGAG---TTT-GCA--GAA---------TTCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAA
gi|11 : cCATGGGTTC--AGAAAGCACATTACCT----CCCCCCC-CTCTG-GGG--ATTTTTCTCTCCACTAAT--AT-ATTTTTT--AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA------A--G-T-AA-----A--CGAC-G-GTG--T-TT--------GA---CTATTCTAATGTT---GGA-------------GTTTTC---A-AG-ATATGGTCA----------------------TTTT-G-GACA-AATTCAGCATGA---CTAT--TA-CT----G-T-G-TT-CCA--AT---A--C--CGCATTAC-T-TTGTA-GT--G-GC-A--ACG--------CA--CCAC--------------------------A-------C----------G---TTTCGCA--GAAA--GAC---ATCGAT--AAG-CAATACAT-T--TAGA---A
gi|12 : gacGGC-CCGAGTAA-CACATTACCTCCCCCCCCCCC-CTCTGTGGG--ATTTGTCAACAC-----TTGATGATTATCTGCAGAA-------TGT--GT-ACGAAA--TTAACAGGTCA-GA-T-CA-----A--CGCA-G-TTGA-T-TT--------GA----AATTTCTATGT----GGG--G---------CGTTTTC---A-AG-ATATGATTA-TT-TGAA-TCTTGAT-C-AATTTTG-G-G-CA-AATTCAGTATAAAC-CCTC--TA-CT----GTT-G-TC-C----AT---A--C--CGCATTAC-T-------TTAAG-TC-AG-A-GGA-A----CG--CAAT--------------------------A-G-----CTT-
gi|13 : cctCATTTTGTT-GG-AT--A---TA-C--------TG--AAAAAA-GCGT-C-----AAC-TA-AACCTGAACCGTACATTCTA---A-GAG-CAG-GAT--GGTTA-T--C-TACAACACCACCTGATGAAGA-AG-TACTTTG-CTCG-ACTGT--TG-ATTATTA-TGGTTC-CAATA-ACC-TGCCCTATT--ACAA-GAATGGCACTAT--C-AG--C-AAGTTA--TTTCA-G-CTA-TC-----ACA-GAGAG---CTGTA--AA----ATGCA-----AC-T-AT--CCCTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAAAGTGTA
gi|14 : A-T--TAAA--GAC-TGCAAGA-------------T--A------TAT-TTTTCATTG--GTGCCT-T----------------ACCTT-------------TC-C-----AT-A-----------------T------AT-A-CATGCAT-TATATTATG--GCA-TGT--G-CTAAGT-G--CT-AGTAT-TGA----ATAAAGTATAT-GATG-TA---TGGTT---CA---------------TTTCTAC-A-----TA-GT-A------TAA------C--TTTG-T--AT--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----GTTA--AC--AG-CTGCAGGTT-AGT-AAATATA-ACTTTCAATG-T-AAATTA-----TTAATTACCGACATG--T-
gi|15 : aaCACG-AAA-T--GAA-GA--TA-AT----ACAATATT--GAGT-CCCCTAAAC--AAAT-AT--C-TGG-GATAGG--A--AT-A----TTCAGG------------A--AAAT---------GGG-----A---ACTAGCCCATGATTC-TA-AAGACCAAAACAT--AACCATTTGTCTC---AAA--CCACT-TGCATGATCCATC-TGC-AGG--ACAT---------C-------AG---TGA-TAA-GGAAAA--CAT--G--TTTCAATat
gi|16 : tgtacgaaTTTAACG-TA-TG-GAGGTCAA-TTAA-T-G-TAT--ATG-A-TCA---ATAAA--AA-GAAAT-GG-----CATGG-A--------CTACTTTTA-AGTAT-A---TAACA-AATAC-AAA-A----------------GAAACCCTACTA-A-A--TAATGA-CT-TATCGA-CTACTA-AAAGTC--AA--ACA-GA-TTAAAA-ACAATGAA--CTA-A-TTGA--T---CAA---TTGAACT-----GAA-A-T-T--AT-GA-ag
gi|17 : CTCCCC-CTCTATGAG--ATTTT-CTACCC-----T--ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GT-AAAAAA--T-AA---------G-TAAA-----A--CGCC-A-TTC--TCTT--------GA---CAATGTAT-TGTT---AGC--G---------CTTTTCC---A-AG-ATATAATCATTT-TGAA-TTT--AT-CAAATTTTT-G-G-CA-AATTCAGTATAct
gi|18 : gtaaatacataTCAGG------------A--AAAT---------CGG-----ATTAACC-TC--ATGCTTG-TATAAGACCAAAACAT--GACTATTTGTCT----CAA--CCACA-TCTATGACCCATC-TGC-AGG--CT-A---------T-------AGCGATGA-TAAGGGAAAA--CA------TGTCA--TCATT--G-AC------TG-C--------TGTAAAAAAC-GCGT-C-----AACTTA-AGCC--AACCagtgtagtgtg
gi|19 : aaaattCATGGGC-CC-AG-AA-C-CAATACC-----TCCCC-C-CTCTA-GGG--ATGTTTCTACAC-----T--ATGATTTTTTG-AAAG-------TGT--GTAAAAAAA--T-AA---------G-T-AA-----A--CGACAG-TTG--G-TT--------GA---CAA-TTTTATGTT---TGGCCG---------CGTTTTC---A-A--ATATtcg
gi|2 : accCGTGGGC-C--AGTA--CACATTACT-----CCCCCTCACTCTA-AGGGTATTTTTCAAGCA-----T--ATGATTTTTTG-ACAG-------TGT--GT-AAAA----T-AA--------GG-T-AA-----C--CGGC-G-TTG--T-TT--------GA---CAAATTTT-TGTT---GGG--G---------CGTTTTC---A--G-ATATGATCA-TT--GAA-TTT--ATGC-AATTTTT-G-G-CA-AATTCAGCATAAA--CCAT--TA-CG----G-T-G-TT-C----AT---A--C--CGCATTA--T-TTGTA-GTAAT-GC-AG-ACGGAGA----CA--CAAT--------------------------A-G-----CTT-TAT-ATAG---TTT-GCA--GAAAGGGAC---ATCGAT--GAG-CA-----T-T--TGGA---ATA-TAGAGGACGG------G--ATCA--TATGGA--AAG----G-ACT-T--TTTTT-G----GCGAGA-------------TC-A--T---TTT-TATTCATTT--GTGCCT-TGCC-AT----TATTG-ACCTTA------------TC-C---TAAT-AACTTTAT---C-TA-CCT------ATTA-CATGTAAATA-ATTATG--GCA-GGT--G-TTAAGT-G--CT-AGTATGTGA----ATAAAGCGTAC-GATGATA---TGGTT---TAA--------------TTTCTACTC-----CA-GT-A------TGA------CG-TTTG-T--AT--AAT-ACACGTATG----------TTGA----ATTA--GA--AC-A------TT-AGT-AAATATT-ACTTC-AATG-TTAAAATAT----TTAATTGCTGGCTCG--T-T-CCA-TGT-T---TTTGAATG-TAATG-GAGGCCCA-TTAA-T-GGTAT--ATAGA-TCA---GC-AA--AT-GAACT-GT-----CGTGG-A--------CT-CTTTGG-AGCAT-A-AGTGCTT-AAAAT-ATG-G----------------GGAC---TA-T--A-A--TAATGAATT-TA---GGCTGTAG-GGAATG--GG--GAA-TA-TAGAAACACA-TGAA--AT--A-TTCA--T---CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GG-AATAT---TT---------ATAT-TTT-A-TA-------AAAA---ATTA-----TGTATATA---ATATTATTGC--C-ATGC-T--AA---AATTTGTA--TA-TTTTTTTGTA-----AAG-TTT-C---TG-CT-GAC--TTTATGTTGA-----ATAGAAAATAAAA-ACC-AAGCAA--TCTTAGGTCTGTAAGAAA---TCTCTTT--CA-GTTC--CA-TC----AAT---AAATCA---CCATA--AAATA-TTTG---TG-TGTACATTAAATTTTGA-AACAGA---TTGTA--AAGGATTTGAT-GACGATAATATAGG--TCCGAGAATTA-GAAGTAG--AGTC--ACAAGG-A-TAGTATAATCGACTAGGATTGT--TATTCAA------AACGCATAC-TTCCATTGGTGGTGTTTATGTCAATTTCACACTATA-TTGATTAATTGAAAGACCAAAATTAGTAT-TTGAGG-----AAAGC-------TATA--CGCT---TGTCGA-GTGAACAG--------CAATTT---T---CTAA----ATGTAAGAGACGATTCTT---TTAACA----GTGTTCA---TTT-TTACC--TCCG-ACA-AGATGT-TG--TTG-GTAATTAAGAAT-TATCTAAAGAGGACA-TGGAGAGAATATAGAACTGGCTAACGTTTAAAAAAAAAAAACACAACAAAAC-----AAGCAAAAAAAAAAA--AAATAATAATAAAAT-----AAAAAC--TCC---------AACCCCCCCCCCCCAAAAACACACACACAC-----------AA-CAGAATAGCCTA------ACAAATC-----------------GCGA-GATGAAG-AGTGACTA------ATGAATATAAGTC----AAAT--T-CGAG----ATATATTTGGATTTTGTT---GCTAAAG--AGTGAATATATTCTT-ATA-----ATCTGAAG--AAAAGCTTCTTC-GTTGTC-----------TGAATT-----GAGCG-ACACAAAT--C----GGAAACGTG-AAGAC--------AAT-CAGAAA---ACTG---AAATTCAAGTGAG--TTTGAGCATC--ATGGAGAAGG--TTTGA--C-T-TTTAT--CTGAGC-ACTGATA-G-AATATGAACG--GTGTGT--G------AATTACA--TGGTT-TGAGAGTATTACAGTGGTC-AG---AAT----GAG-A--TTATTTGTCATTTGATGT-TGG---AT------------AATTAT----------CCCA-AGCTTG-TTA------TA-AA-----A-TGA--T-TAAAC----TGG---ATA-AA-GA----TAGA---GAGA--ACT--TT-G-G-TAGC-CATCAAAAATTTTTTTGTT---GGT-AAATTTCCAAAG------GGCAAACTT--G-TAT-AT---TTTTG-TGC--ATGT-G-TA------CTGGACAAGATATTAAA-TC-TGTACTTCAC-ATT-G--GC--C---CTTTCAACAA-TAGA-----ACAGA-GTTT-AAG--AATT-----A-CT-AT---GAA-AT-C--A-AAGGCGGGCTTTCATAGTATT------AGT--ATAGAGTTAGAATGT----------CGAATT-G-GCG-AA--A--T---GA--TAGATCCAAG----ATT--GAGT-CCC-TAGAA--GAAT-AT--C-TGGAGAA--GAAA--TAGA-----TTACG------------AACAAATTTCA-----AAA-----AA--GCT-----ATGATTC-TA-AAGACAGAAAT-T--GAACA-TCGTCC----AAA--CCATATTGCATGATCTATC-TGC-AGG--AC-CGAG------CACTGGGAAG---TGA-TAA-GAATAGACTA---T--TCTC-ATTTGTTTGG-ACAGA---TA-C--------TG--AAAAAA-AGAT-C-----AAC-TA-AACC--AACCGTACCTTCT----A-G-G-AAG-GAT---GCTG------------------TAATGGAGG-AAGTACTTTG-TTCG-ACTGT--TGAATTGT-A-CGGTTCTCAATT-A------CCT-TT-----AAGAATTAAGATAT-TC-AG--C-AGGTTA--TTC---G-CTA-TC-----GCAAGAAAG---CAGTCAAAA----ATGTA-----AG-T-ACTGCCTTGCATA-TGA-TTT--CAG-TTGCT-AAAAAGTGTTTGCt
gi|20 : T-AAAAT-AGG-G----------------GAAA---TA-TG-A-A--TAATGA-TT-TA---G-CTGTAG-ATAATG--GG--GCA-TT-TAAAAA-ACAATGAC--ATA-A-TTCA--T---CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AAT
gi|21 : -AGAATA--GG--ACA--------AA-ACAGTGAA--AT--AATCTA--T---CAA---T--AA-C-----GTA-AAT-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------
gi|22 : --ATCA--TATGGA--GAG--TAGCACA-T--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------TAAA--T---ATT-TATTCATT
gi|23 : TGTA-----AC-T-AT--CCTTGCATG-TGA-TTTTGCAG-TT-CTAAAAAAGTGTATGC
gi|3 : caaaGGC-C--AGTAA-C-CAT-ACC-----TCCCCCC-CTCTA-TGG--ATTT--CTACAC-----T--ATGATTTTTTG-AAAGG------TGTAGGT-AACAAA--T-AA------A-GGGT-AACACGGA--CGA--G-TTAGAT-TT--------GAG--CAATTCTTATGTT---GGG------------CGTTT-C---A-AGTATATGAT-A-TT-GGAA-TT---AT-A-AATTTTT-G-G-CA-A-TTCAGAATAG---CCAT--AA-CT----G-T-G-TT-CC---AT---A--C--CGCATTACCT-TTGTA-TTAAA-GG-GA-ACAAA-A----CAACCAAC--------------------------G-G------TT-TTA-AGAG---TTG-CCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-CAATATATGT--TAGAGATATA-TAAAGGACAG------T----CA--TA-AGACGAAG--TAGC-CA-TGGTGCAT-GGA-TGCAAGAAT-----------T--T--T---TTT-TTTTCATT---G-GCCTATGCC-AT----T---G-ACTAGA------------T---------T-AAC---AT---CATA-T-T------AG-AACATCAAA-TT--TTATG---CATGGTTTG-C-ATGT-GGCTT-AGTAT-TGA----ATAA-GCGTAC--ATG-AA---CGGTC---AA---------------TT-CTAT-A-----AA-GT-A------TGA------C--TTTGCT--AT--AATGACACA-ATC----------TTGA----AGTA--GC--ACGC------TT-AGT-AAA-ATATACTTCCAAT-------AGAT----GTAATTACTGGCAGG--T-TGCCATTGTCT---T---AATGATA-TG---GGCCAG-TTTA-C-GTTAT--ATA-A-TCA---GC-CATGAA-GAAA--GTG----CGACG-A--------CT-CTTTGGAAGCAT-A-ACTTGCT-AAAAT-AGGTGTGAAATAATTAGTAGTGAAA---TA-TA-A-ATTTAATGA-TT------G-CGTTAGTTGAATGGTGG--GCATTA-TAG-AA-ACAATGAA--ATA-A-TTAAGTT---CAA---T--AA-G-----TTA-A-TGTTGATAGA-AATAC-T-TC---------ATATATTTGA-TATTATAGTAAAA---A--A-----AG-ATA-A---ATATTA-TGC--CAAAAC-G--AAATCA--TTGTA--TA--TTTTTT--------AA--TGT-C---TG-TTAGACTCTTTATGCTGAGCA-TAT---AAATGA
gi|3 : cgtcG--TTAGA--C-TCTTTATG-CTGAGC-AT--ATA----A-ATGAGC---TCGTGA--G------A-TTA-A--TGGTTG-A-AAGTAGTACAG-GGTCCAG---AAACTTAGAG-A---TATTTGTC------CAT-TGGCTAATGGA---------AATTAT----------CCCA-A-CTCG-TTA------TCGAA-----ATTGA--T--AAAC----TGG--AATC-AAAGA----TAGA---GAAA--ACTTGTTAG-TGTAG-ATATC---AATT------TT---GGT-AA--TTCAAAGGCCATATGGCGAATTTTTG-TATGAT---TACTG-CTT-TAT-TTGCTA------CTGGA--AGCTGTTGAA-TGATGAGCTTCG--GTT-GTCGCGAC---CT--CGGCAAAC--A-----ACA-A-GTTG-TAG--AATC-----TTCA-ATCATAAT-AT-C--AGAAGTCGA-CTTTCAT-GTATT------GGTTCA------AACA-TGTA---------CG-----ATACG-AAATTCGG---GAAGTA-ACTTAAG----ATTTTGGTC-CCC-TAGAC--AAGT-AT--GCTGGATAT--G--AG-TTGAATATCTGAGATGCCAATCTCAAA--AAAT---------GGAGACTTAC--GCC-TC--ATGATTC-TA-AAGACAAATACAT--AACCATTTGTCC----AAAAACCACA-TGTATGATC-ATC-TGC-AG---AC-A---------C-------A----TGA-TAA-GGAAAAA-CA---GGGTCGCAATTTGTTTAG-AT--GCGGTATC--------TG--AAAAAA-AAGC-CGTTCCAAC-TA-AAC---AACCGTACCT-CTAGTGA-G-G-GAG-GGTT--GTTAAT--C-TACACTAACCACTGATGAAGATAG--ACTTT--------TTATG-TG-AGGAT-A-CG-TTC---ATC-ACGCTGCCCTATTCAATAGAGAATGGCA---T-TC--G--C-AGGTTA--T---A-G-CTA-CG-----ACAGGATGG---TGGTT--TT----GC--------AC-T-AT--CCT-G-ATG-TGA-TTTTGCAG-TTGCT-AAAACGTGTATGCgctcgtgagattaatggttgaaagtagtacagggtccagaaacttagagatatttgtccattggctaatggaaattatcccaactcgttatcgaaattgataaactggaatcaaagatagagaaaacttgttagtgtagatatcaattttggtaattcaaaggccatatggcgaatttttgtatgattactgctttatttgctactggaagctgttgaatgatgagcttcggttgtcgcgacctcggcaaacaacaagttgtagaatcttcaatcataatatcagaagtcgactttcatgtattggttcaaacatgtacgatacgaaattcgggaagtaacttaagattttggtcccctagacaagtatgctggatatgagttgaatatctgagatgccaatctcaaaaaatggagacttacgcctcatgattctaaagacaaatacataaccatttgtccaaaaaccacatgtatgatcatctgcagacacatgataaggaaaaacagggtcgcaatttgtttagatgcggtatctgaaaaaaaagccgttccaactaaacaaccgtacctctagtgagggagggttgttaatctacactaaccactgatgaagatagactttttatgtgaggatacgttcatcacgctgccctattcaatagagaatggcattcgcaggttatagctacgacaggatggtggttttgcactatcctgatgtgattttgcagttgctaaaacgtgtatgcaa
gi|4 : cgtcggccagtaaccatacctccccccctctatggatttctacactatgattttttgaaaggtgtaggtaacaaataaagggtaacacggacgagttagatttgagcaattcttatgttgggcgtttcaagtatatgatattggaattataaatttttggcaattcagaatagccataactgtgttccataccgcattacctttgtattaaagggaacaaaacaaccaacggttttaagagttgccagaaaggacatcgatgagcaatatatgttagagatatataaaggacagtcataagacgaagtagccatggtgcatggatgcaagaatttttttttttcattggcctatgccattgactagattaacatcatattagaacatcaaattttatgcatggtttgcatgtggcttagtattgaataagcgtacatgaacggtcaattctataaagtatgactttgctataatgacacaatcttgaagtagcacgcttagtaaaatatacttccaatagatgtaattactggcaggttgccattgtcttaatgatatgggccagtttacgttatataatcagccatgaagaaagtgcgacgactctttggaagcataacttgctaaaataggtgtgaaataattagtagtgaaatataaatttaatgattgcgttagttgaatggtgggcattatagaaacaatgaaataattaagttcaataagttaatgttgatagaaatacttcatatatttgatattatagtaaaaaaagataaatattatgccaaaacgaaatcattgtatattttttaatgtctTGGGC-----GTAA-CACAT-ACT-----CCCCC----TCTA-GGG--ATTTTTCTTACA-----T--ATGA--------------------------------A--T-AA---------G-T-AACT---A--TGT----TTG--T-TT--------GAACCCAATTTC-ATGTTTGGGAG--G---------CGTGTTC---A-AG-ATATG--TA-TT--GAA-TTG--AT-C-AATTTTTTG-G-CA-A-TTCAGTATAG---CCAT--TA-CT----G-TCG-TT-C----ATCATA--CGATG-ATTAT-A-TTGTA-TTAAGAGC-A--ACTAC-A----CA--GAA------------------------------------TTATTC-AGAG---TTT-GCA--GAA--GGAC---ATCGAT--GTG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-T--TA-ATAGACTTACAAGA-------------T--A--T---TTTATTTTCATTT--GGG----TGC---T----T---G-CCCTTG------------CC-C---TAGTCAAC--TAT---C-GATC-TGA----AT---CATGT---CA-ATTATG--G---GGT--T-CTAA---------AGTAT-TG-----AT--AGCGTCT-AATG--A---CGGTC----A---------------TTT-TAC-A-----AA-GT--------TGA------C--TTTT-TTAAT--AAT-ACACA-AT-----------TTGA----ATTA--TC--AC-C------TT-AGT-AATAATA-ACTTCCAATG-T-AAAATG-----TTAAT----GGC--G--TAT-CCA-TGTTC---TTTAAGTG-T--TG-GAGG-CCA-TTAA-T-G-TAT--ATT-A-TC----GC-AC--AA-GAAGT-GG-----CGTTG-T--------TT-CTTTGG--GCCT-A-CATG--TAAAAATAAGG-G----------------GAAA---TA-TACA-A--TAATGA-TT-TA---G-CTGTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAG--A-AC-ATG-A--AT--A-ATTA--A---CAA---T---A-T-----GTAGA-T-TTGAT-GA-AATATAT-TCTATTAATATATATATTT-A-AAAAAAC--AAAA---A--A-----AG-AT--A---ATATC-CTGG--GGACGC-GTAAA---A--TTGTATTTAATCTTTTT--------AATATTA-C---TGATTAGGCCATTTAaa
gi|4 : TTGTTA-G-G---TGCGTG--TCGAGTA-G------AATTA----TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AG---ACA----AGA-A--GTATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGGTCAATC-AA-GA----TAG----GAAA--ACTTATT-G-T-TAGCATGT----AATT------T----GGT-A---TT--AAAG------GA-----TT--GATAT-AT---TTTTG-CGC-TAT-T-G-TA------CGCGA-AAGCT-TTGA---C-T-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA--------------A-GTTG-ACG--ATTC-----T--A-AT---AAT--T------AAGACGTGC-TTCATAGTTTG------GGT--A------TACAATGT----------CA-----GCATG-AA--T--G---GA--TA-AT----G----ATT--G-GT-CCT---GAA--AATT-GT--A-TGTAGGT--G--A--TTGA----CTTAGG----------------GAT---------GGG-----AT--GCT-TTC-ATGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTGTCT-----------ACA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC-C---------C-------AG---TGA-TAA-GGAAA---CA---G--TCTCAATTTG-TTGG-AT--G---T--C--------TG--AAAAAGCGGAT-C-----AA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAG-GATTTGATTA-T--CATAC-ACAACA-CTGATGAAGA-AGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC---ATC-AC--TGCCCTAAT--ACAAAGAATGA-ACTATAAC-AG--C-AGGTTAATTTTCA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG----AGTT--TT----GTGTA-----ACAT-AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGCatttgttaggtgcgtgtcgagtagaattatggttatggagtttagtggtagacaagaagtatttgtctttatgttggcatattgccactggtataaatgattaactggtcaatcaagataggaaaacttattgttagcatgtaatttggtattaaaggattgatatatttttgcgctattgtacgcgaaagctttgacttgcttgcttggttgtcggcaaagttgacgattctaataattaagacgtgcttcatagtttgggtatacaatgtcagcatgaatggataatgattggtcctgaaaattgtatgtaggtgattgacttagggatgggatgctttcatgtttctaaaagacaaaacatgactttgtctacatgcatgatctatctgctaggacccagtgataaggaaacagtctcaatttgttggatgtctgaaaaagcggatcaataaacaatccgtaactctaagggcaggatttgattatcatacacaacactgatgaagaagatctctgactcgattgtcatgattatatcggttcatcactgccctaatacaaagaatgaactataacagcaggttaattttcagctctcacaagaaggagttttgtgtaacatatccttgtgtgattttgcagttgctcacaaagtgtatgcata
gi|5 : tgggcgtaacacatactccccctctagggatttttcttacatatgaataagtaactatgtttgtttgaacccaatttcatgtttgggaggcgtgttcaagatatgtattgaattgatcaattttttggcaattcagtatagccattactgtcgttcatcatacgatgattatattgtattaagagcaactacacagaattattcagagtttgcagaaggacatcgatgtgcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacattaatagacttacaagatattttattttcatttgggtgcttgcccttgccctagtcaactatcgatctgaatcatgtcaattatggggttctaaagtattgatagcgtctaatgacggtcattttacaaagttgacttttttaataatacacaatttgaattatcaccttagtaataataacttccaatgtaaaatgttaatggcgtatccatgttctttaagtgttggaggccattaatgtatattatcgcacaagaagtggcgttgtttctttgggcctacatgtaaaaataaggggaaatatacaataatgatttagctgtagagaatggggcatatagaacatgaataattaacaatatgtagatttgatgaaatatattctattaatatatatatttaaaaaaacaaaaaaagataatatcctggggacgcgtaaaattgtatttaatctttttaatattactgattaggccatttaatG-ACGAA-AA---CA--CA-C--------------------------A-G-----CTT-TTA-AGAG---TTT-GCA--GAAAGG-AC---ATCGAT--GAG-CAATACAT-T--TAGA---ATA-TAGAAGACAG------T--ATCA--TATGGA--AAG--TAGCACA-A--TATATTGAC-TGCAAGA-------------T--A--TATTTTT-TTTTCGTTT--GTGCCT-TGCC-AT----T---G-ACC---------------------------GAGCTTA---------------------A-CATGCGA-T----TATG--GCA-GG------------G--CT-ATTAT--GA----ATAAAGCTT--------TA-----------AA---------------TTTCTAC-A-----AA-GT-ACATGTATGA------C--TTTG-T--AC--AAT-ACACA-ATC----------TTGA----ATTA--GC--AC-C------TT-AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-AAAATGT----T-AATTACTGGCAGT--T-T-CCA-TGTCT---TT--AATG-TA-TG-GAGGCCCA-TTAA-T-G-TAT--ATA-A-TCA---GC-AA--AA-GAAAG-GTG----TGTGGGA--------CT-CTTTAG-AGCAT-A-CATG-CT-AAAAT-AGG-G----------------GATA---TA-GG-A-A--TACTGA-TT-TA---G-CGTTAG-AGAATG--GG--GCA-TA-TAGAAA-ACAATGAA--AT--T-TCAA--T---CAA---T--AA-T-----GTA-A-T-TTGAT-GA-AATATAT-TC---------TTATATTT-A-T-----------A---T--A-----AG-ATA-A---ATA-TACTGC--CAAAATAA--AA---A--TTGTA--TAATTTTTTT--------AAT-TTT-C---TG-TTAGACCTTTTAT-CTGGGCATTATATGAAATGAata
gi|5 : G--TTAGA--CCT-TTTAT--CTGGGC-ATT-ATATG-AA-ATGAGTG--TTGTGTTAG------AATTA-ACATGGTTG-A-GAGTATTACAGTAGTC-AG---AAT----GAG-A--TT-TTTGTCATTT-ATGTATGG---A-------------AATTAT----------CCGA-A-CTC--ATA------TC-AA-----AATGA--TATAAAC----TGG--AATCAAA-GA----TAGA---GAGAAGACT--TT-G---TAGCATATCA--AAAT------TT---GGTAAA--TTCCAAAGAA----GGCGGACTT--GA-AT-A----TTCTA-CGCATAT-T-GCTA------C-TGACAAGC-ATTAAA-TC-TGCA-TTCGC-ATT-G--GC--C---CTTTCCGC---C--A-----ACA-A-GTTG-AAG--AATC-----TACA-AT---AATAAT-C--A-GAAAGGGGACTTCATAGTATT------GGT--A------gtgttgtgttagaattaacatggttgagagtattacagtagtcagaatgagatttttgtcatttatgtatggaaattatccgaactcatatcaaaatgatataaactggaatcaaagatagagagaagactttgtagcatatcaaaatttggtaaattccaaagaaggcggacttgaatattctacgcatattgctactgacaagcattaaatctgcattcgcattggccctttccgccaacaagttgaagaatctacaataataatcagaaaggggacttcatagtattggta
gi|6 : gacgaaaacacacagcttttaagagtttgcagaaaggacatcgatgagcaatacatttagaatatagaagacagtatcatatggaaagtagcacaatatattgactgcaagatatatttttttttcgtttgtgccttgccattgaccgagcttaacatgcgattatggcagggctattatgaataaagctttaaatttctacaaagtacatgtatgactttgtacaatacacaatcttgaattagcaccttagtaaatataacttccaatgtaaaatgttaattactggcagtttccatgtctttaatgtatggaggcccattaatgtatataatcagcaaaagaaaggtgtgtgggactctttagagcatacatgctaaaataggggatataggaatactgatttagcgttagagaatggggcatatagaaaacaatgaaatttcaatcaataatgtaatttgatgaaatatattcttatatttatataagataaatatactgccaaaataaaaattgtataatttttttaattttct--G------AATTA----TGGTTATG-GAGT-TTA--GTGGT--AG---ACA----AGA-A--GTATTTGTC-TTT-ATGT-TGGC--AT------------A-TTGC----------C----A-CT-G-GTA------T--AA-----AT-GA--T-TAA-C----TGGTCAATC-AA-GA----TAG----GAAA--ACTTATT-G-T-TAGCATGT----AATT------T----GGT-A---TT--AAAG------GA-----TT--GATAT-AT---TTTTG-CGC-TAT-T-G-TA------CGCGA-AAGCT-TTGA---C-T-TGCTT-GC--TT-G--GT-------TGTCGGCAA--------------A-GTTG-ACG--ATTC-----T--A-AT---AAT--T------AAGACGTGC-TTCATAGTTTG------GGT--A------TACAATGT----------CA-----GCATG-AA--T--G---GA--TA-AT----G----ATT--G-GT-CCT---GAA--AATT-GT--A-TGTAGGT--G--A--TTGA----CTTAGG----------------GAT---------GGG-----AT--GCT-TTC-ATGTTTC-TA-AAAGACAAAACAT--GAC--TTTGTCT-----------ACA-TGCATGATCTATC-TGCTAGG--AC-C---------C-------AG---TGA-TAA-GGAAA---CA---G--TCTCAATTTG-TTGG-AT--G---T--C--------TG--AAAAAGCGGAT-C-----AA--TA-AACA--ATCCGTAAC-TCTA---AGG-G-CAG-GATTTGATTA-T--CATAC-ACAACA-CTGATGAAGA-AGAT-CTCTGACTCG-ATTGTCATG-ATTAT-ATCGGTTC---ATC-AC--TGCCCTAAT--ACAAAGAATGA-ACTATAAC-AG--C-AGGTTAATTTTCA-G-CTC-TC-----ACAAGAAGG----AGTT--TT----GTGTA-----ACAT-AT--CCTTG--TG-TGA-TTTTGCAG-TTGCTCACAAAGTGTATGC
gi|7 : GATCA-TT-TGAA-TT---AT-CCAATCTTT-GCG-CA-AATTCAGTATAG---CCAT--TATCT----G-T-G-TC-C----AT---A-----CGCATTAC-T-TTGTA-TTAAT-GC-GG-ACCAA-A----TA--CAAC--------------------------AGG-----CTT-TTA-AGAG----TT-GCA--GAAAAGGAC---ATCGAT--GAG-CAA-ACAT-T--TAGA---ATAGTAGAAGACAGTACGGCT--ATCA--TATGGG--AAATTTAGCACACT--TACAT-GAC-TGCAAGA-------------T--ATTT---TTT-TTTTCATTT--GTGCCT-TGCCAAT----T---G-ACC
gi|8 : gctttaacggagaaT-G--CT-AG-AT-TGG----ATAAAGTGTTC-CATN-NN---NNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTAC-A-----AACGT-A------TGA------CGGTTTGGT--ATTTAAT-ACGCA-ATC----------TTGA-----TTAAGGC--AC-C------T--AGT-AAATATA-ACTTCCAATG-T-ACAA-AT----T--ATTAC---------T-A-CCT-TGTCT---TT--GATG-TA-TGAGGGGACCA-TTAACT-G-TAT--ATA-ATTCA---GCAAA--AA-GGAAC-GT-----CGTAG-A--------C--CTTTGG-AGTATCA-AGTGGCT-AAAATCAGGCG----------------GAAA---TC-TG-ATA--GATTGA-TT-TA---G-TTGTAG--GAATG--GG--GTA-TA-TTAGAA-ACAATGAATTAC--A-TTAA--T---CAGT--T--AA-T-----GTA-ATT-TTGAT-GACAATATATATC----------TATATTT-AGTA-------AAAA---ccgcgcttacatttgcgaacgtcatggccgcaggataattgatatagaaactgcgttaccgatcgaaggtttatttacaatctattctaatacaaagtacatagtgttaaaatgatgcttatgtattagacaatgttactaacaatcattgaat
gi|9 : TGTCT----AAA--CCACA-TACATGACTCATC-CGC-AGG--CCAC---------C-------GA---TGA-TAA-GGAAAG--CA---C--TCTCA-----TTTGG-AC--A---TA-CAAATGTAATG--TAAAAG-CGTT-A-----AAC-TT-AACC--AACC------TCCA-----G-G-CAG-GAT--GGTTA-TGTC-TACAACAACACCTAATGAAGA-AG-TACTTTA-CTCG-ATATT--TG-ATAAG-A-CAGCTC-CAATCGAC--TGCCCTATA--ACAGAAAATGCCACTGT-TC-AG--T-AGAATA--TT-CA-G-CTA-TTTTAATACAAGAAGCTATCAAAT--TT-------TA-----AC-T-AT--CCTCCCATG-TGA-TTTGGCAG-TTGCT-AAAAAGTTTATGC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CAAGTGAGTTCAGTACATCATGGAAAGGCAAATGTAACTATCC