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lowQualScore                  :          .    . .  .  .   . . ....   .. .. ... .. ....... .....   ......   . .......  . ....   ....  . ..  ..    .. ..    ....... . ..............  . ...  . ......... . . ...  .... .......    ...   .....  . . .  .  .. .  ... .. .. ...  . .. .   .   .  ....  ......... .   .. . ... .. ..   .. ......  .  . .. ....    .  ....... ..  ................................................ ... ..... ..  .  ........   ..... ..   ...................  .. .  ....  .  . . ....  . .. . ..... . . .    .  ..    .    
lowQualScore                  :          6    6 2  1  4   3 3 7777   55 22 888 88 7777777 88888   000000   3 3333333  1 7777   0000  6 88  88    55 11    5555555 2 33333333333333  5 444  2 333333333 3 3 888  7777 2222222    999   55555  2 2 2  2  88 2  222 44 22 666  6 88 3   6   3  7777  222222222 3   66 2 000 77 77   44 555555  3  2 77 6666    3  6666666 88  222222222222222222222222222222222222222222222222 333 33333 22  7  22222222   88888 88   4444444444444444444  22 3  0000  4  4 4 5555  4 11 4 66666 4 4 5    5  33    7    
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Reference ( gi|11 )           :       TGT-TGAA-C-TG-AG-TGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGTG----ACT----TT-C--GT--CCCT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---AT-A---GT-A-C-------T-A-C---TT----G-A-----AGGGGT-TGT-----TA-T-T-TA-AA-AG-AT---G--T-GT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------T-G-TTGGAA-TA--G--T--TATC-A------GAGTG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GG----------A-A----------T-T-G--A-------T-----A-G-A---G-----G--AT-TC--------ACA--T--T--TTT----A-T--TA-AC-----TT--T-TT----TT-TT-A-T----TT-T-AC-A-----C-A-ACCCGG-AA--GACA-AGCC
gi|12                         :       TGT-TGAA-C-CG-AA-TGG-G-GGTACTAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGCG----ACT----TT-C--GT--CCCT--T--GTAT-------T-G---AT---------AT-A---GT-A-C-------T-A-C---TT----G-A-----AGGGGG-CGT-----TA-T-T-TA-AA-CG-AT---G--T-AT---AA-A--G-GAC-CAA-AA----CT-------T-G-TTGGAA-TT--G--T--TATC-A------GAATG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GG----------G-C----------T-T-T--A-------G-----A-G-A---G-----A--AT-TA--------AC---T--T--TTT------T--TT-AT-----TT--T-TT----TT-TT-A-T----TT-T-AC-A-----A-A-ATCCGG-AA--GACA-
gi|14                         :       TGT-TGAA-C-TG-AG-TGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------TTC---CCA------CGAGT-------GGCG----ACT----TT-CCCGT--CCCT--T--GTAT-------T-G----T-----T---AT-A---GT-A-C-------TAA-C---TT----G-A-----AGGGGG-TGT-----TA-T-T-TA-AA-CA-AT---G--G-GT---AA-A--T-GAC-TAA-AA----CG-------G-G-TTGGAA-TT--G--T--TATT-A------TAGTG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GG----------G-A----------T-T-G--A-------T-----A-G-A---G-----G--AT-TC--------ACA--T--T--TTTA---A-T--TA--------TT--T-TT----TT-TA-A-A----TT-T-AC-A-----C-A-ATCCGG-AA--
gi|13                         :       TGT-TGAA-C-TG-AA-TGG-GTG----TAT-----T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGTG----ACT----TT-C--GT--CCCT--T--GAAT-------G-G---AT---------AT-G---GT-A-C-------G-G-C---TT----G-C-----AGGGGG-TAT-----TA-T-T-TA-AA-CG-AT---G--T-AT---AA-A--T-GAT-CAA-AA---------------------AA-TC--G--T--TATC-A------GTTTG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GG----------A-T----------T-T-C--A-------T-----T-G-A---G-----G--AT-TC--------ATA--A--T--TTT----ATT--TA-AT-----TT--T-TTAAAATTATT-A-T----TT-T-CT-A-----C-A-ATCCAG-AA--TACA-AGCC
gi|15                         :      gTGT-TGAA-C-TG-AG-TGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------TT----CCAG-----AGA-T-------GGCG----A-T----TT-C--GT--CC----T--GTAT-------T-G---AT---------AT-A---GT---C-------T-A-C---T-----G-A-----AGGGGT-GTT-----TA-T-T-AA-AC-AG-----------GG---AACA--T-GAC-CAA-A-----CG-------G-G-TTGGAA-TT--G--T--TATT-A------GAGTG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GG----------A-T----------T-T-A--A-------T-----A-ATG---G-----G--AT-TC--------ACATTT--T--TTT----A-T--TA--------TT--T-TT----TT-TT-AGTTA--TT-T-A--A-----C-A-ATACGG-AA--GACG-AGCC
gi|4                          :       TGT-TGAA-C-CT-AG-TGG-G-A----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGCG----ACT----TT-C--GT--CCTT--T--GTAT-------T-G---TT-----TTAAAT-ACATGT-AGT-------T-G-CATATT----GCA-----AGGGGG-GGGGGGGGTA-T-T-TA-AA-CG-AT---G--T-AT---AC-A--T-GAC-CAA-AA----TG-------T-A-TTGTCA-TC--G--T--TATC-A------GAATG-A--C----TTCA-AA-------G--GG----------A-A----------T-T-T--T-------T-----T-G-A---G-----GGAA------------ACA--C--T--TTT----A-A--CA--------------------TT-TT-A-T----TT-T-CC-A-----C-A-ATTTGG-AA--GACA-AGCCc
gi|5                          :       TGT-TGAATC-TGTAG-TGG-G-G----TAT--A--TATTT--TACAATCAT-----CCA------GCA-T-------GGCG----CCT----TT-C--GT--CCTG--T--ATAT-------G-G---AT-----T---AT-AT--GT-ATC-------T-A-T---TA----G-A-----AGGG---TGTC----TA-T-T-TA-AA-CG-AT---G--T-GT---AA----T-GAC-CAAGAA----CG-------G-G-TTTGGA-TT--G--T---ATT-A------GAGTG-A--C----TTCA-AAAG-----G--GG----------G-A----------T-T-G--A-------A-----T-G-A---G-----G--AT-TC--------ACA--T--T--TTT----A----TA-G-------T--T-TT----TT-AA-A-T----TC-T-AC-A-----CTA-ATCCGA-AT--GACA-AGcc
gi|20                         :       TGT-TGAA-T-CG-AG-TGG-G-G----TAT--T--G---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGCG----ACT----TT-C--GC--CCCT--T--GTAT-------T-G---A------T---GT-A---G--A-C-------T-T-C---TC----G-T-----AGGGG--TGT-----TG-C-T-TA-AA-------------------CA-A--T-GAC-CGA-AG----CG-------T-G-TTGATA-TC--G--T--TATC-A------GAATG-A--C----TTTA-AA-G-----G--GA----------A-T----------T-T-T--A-------T-----T-G-A---G-----G--AT-TC--------ATA--C--T--TTT------------AC-----TT--T-T
gi|18                         :      gTGT-TGAA-C-TT-AG-CGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----TCA------AAA-T-------GGCG----GCT----TT-C--GT--CCCT--T--GTAT-------T-G----------T---A--A---G--------------------TT----G-C-----AGGGGG-TGC-----TA-T-T-TA-AA-CG-ATCTAT--T-AT---AA-A--T-GAC-CAA-CA----CA-------T-A-CTGACA-AC--G--T--TATC-A------GAATG-A--C----TTGA-AA----------------------------------------------------------------------G--AT-TC--------ATA--T--T--TTT----A-T--CA-ATATTA-TT--T-TT----TT-TA-A-T----AT-C-CC-A-----C-A-ATCCGG-AA--GACA-AGgtctact
gi|2                          :       TGT-GGAA-C-CG-AT-TGA-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGCG----ACT----TTTC--GT--CCTT--T--GTAT-------T-G---ATATGAAT---AT-A---GT-A-CAGTGTACT-A-C---TTTAACA-A-----AGAG---TGT-----TA-T-T-TA-AA-CG-AT---G--T-AT---AA-A--TTGAC-CAA-AA----CG-------T-G-TTGGAA-TT--G--T--GATC-A------AAATG-A--C----TTCA-GA-G-----G--TGTTTTCTTTTAA-A----------T-C-T--ATTATTATT-----A-G-AGGGG-----G--AC-TC--------ACA--C--T--TTT----T-T--TC-AC-----GG--C-TT----TT-CT-G-T----------C-A-----C-ATACGCGG-
gi|17                         :     gaTGT-TAAA-CCTA-AGGTGG-G-G----TAT--A--T---G--C-------T-----CAA------AGA-T-------GGCG----ACT----TT-C--CT--CCCT--T--GTAT-------T-G---AT---------AT-A---GT-A-G-------A-A-G---TT----G-C-----AGAGGG-TAT-----TA-T-T-TA-AA-CG-CT---A--T-AT---AC-A--T-GTC-CAA-AA----CG-------T-C-TTGACA-TC--G--T--TATC-G------GAATT-A--C----CTCA-AA-T-----G--GG----------A-T----------T-T-T--C-------T-----A-------------A--AT-TC--------A--------------------------------TT--T-TT----TT-TTAA-A----TT-T-GC-A-----C-A-ATCCGC-CA--GACA-
gi|21                         :      gTGT-TGAA-C-CG-AG-TGA-G-G-----AT--AATT---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGCG----ACT----TT-T--GT--CC-----------------------------------A--A---GTTG-C-------T-A-C---TT----G-C-----AGAAGT-TGT-----TA-T---------------------------AA-G--T-GAT-CAA-AA----CG-------C-G-TTGACA-TC--G--T--T---------------------------CA-AA-G-----G--GT----------A------------T-T-GT-A-------T-----A-G-A---G-----A--AT-TC--------ACA--T--T--TTC----T-T--T---C-----TT--TATT----TT-TA-A-T----TT-T-CC-T-----T-A-ATCCGG-AA--GACT-AG
gi|31                         :      gTGT-TGAA-C-CT-AG-TGG-G-GG---TAT--A--T---T--T-------T-----TCA------AAA-T-------GGCG----ACT----TT-C--GT--CTCT--TACATAC-------T-G----T-----T---ATAA---GT-AGT-------T-G-C---AT----G-A-----GGG----TGT-----TA-C-T-TA-AA-CG-AT---C--C-AT---AC-A--T-GAC-CCA-AA----CG-------T-G-CTGACA-TC--G--T--TATC-A------GAATG-A--C----TT
gi|29                         :      gTGT-TGAA-C-CT-AG-TGG-G-GG---TAT--A--T---T--T-------T-----TCA------AAA-T-------GGCG----ACT----TT-C--GT--CTTA--C--ATAC-------T-G----T-----T---ATAA---GT-AGT-------T-G-C---AT----G-G-----AGGG---TGT-----TA-C-T-TA-AA-CG-AT---C--C-AT---AACA--T-GAC-CCA-AA----CG-------T-G-CTGACA-TC--G--T--TATC-A------GAATG-A--C----TT
gi|23                         :     ggTGT-TGAA-C-TG-GG-TGG-G-G----GGT--A--T---T--T-------TTTTTTCCA------AGA-T-------GAC------CT----TT-C--GT--TCCT--T--GTTT-------C-G----------------------T-C-C-------T-A--------------------------TGT------A-T-C-TA-AA-CG-AT---G--T-AT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CA-------T-G-TC--AA-TGACG--T--TATC-A------GTATG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GA-------------------------------------------------------------------------------------TTT----A-T--T------------------------TC-A-T----TT-T-CC-A-----C-A-ATGTGG-AA--GACA-AGTC
gi|39                         :      gTGC-TCAA-C-TG-AG-TGG-G-G----TA---A--TG--T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGCG----ACT----TT-C--GT--CCCT--T--GTCT-------T-G---A------T---AT-AAT-GT-A-C-------T-T-C---TT----G-C-----AGTGGG-TGT-----TA-T-T-TA-c
gi|10                         :       TAT-TGAA-G-TG-AG-CGGAG-G----TA---A--T---T--T-------T-----CTA------AGA-TTTAAAATGGCA----ACT----TT-C--GG--CCCT--A--ATATCTG----T-A---AT-----T---AT-A----T-G---------T-A-C---CT----G-C-----AGAGTG-TAT-----TA-T-T-TA-AA-CA-AT---G--T-ATAG-AA-A--T-TAC-CAA-TA----CA-------T-G-GCGACA-TC--A--T--TAAG-A------AAATG-A--C----AT-A-AG-GGTGTTG--GG----------G-G----------T-T-G--A-------A-----A-A-A---T-----A--AT-TC--------ATA--T--T--TT--------------------TT--T-TC----TC-TT-A-T----TT-T-TC-A-----T-A-ATCCAG-A
gi|28                         :       TGT-TGAA-CGCG-AA-TGG-G-GGT--TA---A--T---T--TC------T-----CCA------AGA-T-------GG-G----GC--------A--GG--CTTC--T--GAAT-------C-G---AT---------A--A---GT-A-C-------T-A-CC--TT----G-A-----AGGGGG-TGA-----TA-T-T-T--AA-AG-AT---G--TAAC---AA-A--T-GCC-CAA-AA----AA-------G-GCTTGGAA-Tcat
gi|32                         :     ggTGT-TGAA-C-CG-A--------------AT--A--T---T--T--------------CA------AGA-T-------GGCT----ACT----TT-C--TT--CCTT--T--GTGT-------T-G---A------T---GT-A---GT-A-G-------T-A-G---TT----G-T-----AGGGGG-TG-----------T-TA-AA-CG-AT---G--tgcatggctgtcaaaaagattcac
gi|19                         : aactgaTGT-TGAA-G-TG-AG-TGG-G-GG---TAT--A--T---T--T-------T-----T-A------ATC-T-------GGCG----ACT----TT-C--TT--T--T--T--AT-T-------T-G---A--------------------------------A-T---TT----G-T-----AGAG---TGT-----TA-T-T-AA-AA-CA-AA---G--T-AT---CA-A--T-TAC-AAA-TG----CA-------T-G-TCGACA-TC--A--T--TATG-A------AAATG-A--C----TTCATAA-T-----G--GG----------catcgatcgacgatgtatcaacacgttgtttctattgataataaaa
gi|1                          :       TGTGTAAA-C-CG-CG-TTG-G-G----GAT--A--TA--C--T-------G-----CCACGAGTTAGA-CC------GGCG----ACTACTTTC-C--GT--GCCT--T--GTCTGGTACAGT-GTACATGTA--T---AT-A---GT-G-C---------G-T---TT----G-C-----AGCGACATGT-----TA-A-T-TATAA-CG-AT---G--T-AC---AA-ACAT-GAC-TTA-CA-----G-------TAG-TTGACA-TC--C--T--TGTC-A------GAATG-A--C----TTCA-AA-G-----GGAGG----------A-AAAAAAAAACTT-T-T--C-------T-----A-A-A---G-----G--ATCTA--------ACT--T--T--TTTCAA-A-TAGTA-AT-----TA--T-TT----CC-TT-A-T----TT-T-TC-A-----C-A-ACCgtttttaaaaaaaagatactttattttctacaatccgaaatac
gi|7                          :         T-TGAA-C-TG-AG-TGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------TT----CCA------AGA-T-------GGCG----ACT----TT-C--GT--CCCT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---AT-A---GT-A-C-------T-A-C---TT----G-A-----AGGGGG-TGT-----TA-T-T-TA-AA-CG-AT---G--T-GT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------G-G-TTGGAA-TT--G--T--TATT-A------GAGTG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GG----------G-A----------T-TAA--A-------T-----A---A---G-----G--AT-TC--------ACA--T--T--TTT----A-T--TA-TT-----TT--T-TT----TT-TT-A-TTA--TT-T-AC-A-----C-A-ATACGG-AA--GACA-AGCC
gi|8                          :         T-TGAA-C-TG-AG-TGG-G-GG---TAT--AG-T---T--T-------T-----CCA------AGA-TTT-----GGCG----ATT----TT-C--GT--CCCT--T--GTAT-------TTG---AT-----TTATAT-A---GT-A-C-------C-A-C---TT----G-A-----AGGGGG-TGT-----AT-T-T-TA-AA-CGAAT---G--T-GT---AA-A--T-GAC-CAA-AAACGGCG-------T---TTGGAA-TT--T--T--TGTT-A------GAGGG-A--C----TTC--------------------------A-A----------T------------------------A---G-----G--AT-TC--------ACA-----T--TTT----A-T------C-----TTTAT-TT----TT-TT-A-G----AT-T-AC-A-----C-A-ATCCGG-AA--GACA-AGCCc
gi|40                         :    ggtgtT-TGAA-C-CG-AG-TGG-G-GG---TAT--A--G---T--T-------T-----CCA------AAA-T-------GGTG----ACT----AT-C--GT--CCTT--TG-GTAT-------T-G----T-----T---AC-A---GT-A-c
gi|35                         :         T-TGAA-C-CCTAG-TGG-G-GG---TATCTA--C---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGCG----ACC----AT-C--GT--TCCC--A--TTAT-------T-G---A------T---AT-A---GT-A-G-------T-A-G---TT----G-C-----AGGGG--TGT-----CA-T-T-TA-AA-g
gi|16                         :      ggtt-TGAA-C-CT-AG-TGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CAA------AAA-T-------GGAG----ACT----TT-T--GT--TCCT--G--GTAT-------T-G----T-----T---AT-AC--GT-------------------TT----A-A-----A---AT-TGCA----TC-T-T-TA-AA-CA-AT---G--A-AT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----C-----------------A-TA--------TAT------------TG-A--CATTGTTCA-AA-G-----G--GG----------C-ACGGTTTTT--C-T-A--AAC-----T-----A-A-A---G-----G--AT-TC--------ATA--T--T--TTT----A-T--GA--------TT--T-TT----TG-TT-A-T----TT-T-TC-A-----C-A-ATCTGG-AA--GACA-ca
gi|41                         :                  ac-AG-TGA-G-C----TAT--A--TGC-T--T-------T-----CCA------AG--T-------GGCG----ACTC---TT-C--GT--CCTTAAT--GTAT-------T-A---AT-----atc
gi|6                          :                 aatctG-TGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GGCG----ACT----TCAC--CT--CCCTCTT--GTAT-------T-G---AT-----C---AT-A---TC-A-C-------T-A-C---TT----G-A-----AGGGG--TGT-----TA-TAT-TA-AA-CG-AT---G--T-GTA--AA-A--T-GAC-CAA-AA----CGGAGATAAT-T-CTGGAAGTT--G--T--TATT-A------GA-TG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GG------------A----------T-T-A--A-------T-----A-G-A---G-----G--AT-TC--------ACA--TTAT--TCT----A-T--TA--------TT--T-AT----TT-AA-A-T----GT-T-AC-A-----C-A-ATCC-G-AA--GACA-ACCCgt
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gi|3                          :            tgttgaggggccaGG-G-G----TATT-A--T---TAAT-------T-----CCA------AGA-T-------GGTGTACAACT----TT-C--GG--TCCT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---AT-A---GT-A-CT------T-A-CT--TT----G-ATCTATAGGGGT-GGT-----GA-A-T-TA-AATCG-AT---G--T-GTA--AA-A--T-GACAAAA-AA----CA-------G-G-TTGGAA-TT--G--A--TAT--A------GAGTG-A--C----TTAA-AG-G-----G--GG----------AGA----------T-C-A--A-------T-----A-G-A---G-----G--A--TC--------ACA--T--T--TTT------T--TATAT-----TT--T-TT----TT-TT-A-TCAAATT-TAAC-A-----C-A-ATCCGGAAA--GACA-AG
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gi|26                         :                                                                                                                                   -G---AT-----T---AT-A---GT-A-C-------T-A-C---TT----G-A-----AGGGGT--GT-----TA-T-T-TA-AA-CA-AT---G--T-GT---AA-AG-T-GAC-CAA-A-----CG-------G-G-T-GGAA-T---G--T--TATT-A------GAGTG-A--C----TTCA-AA-G-----G--GG----------G-A----------T-T-A--A-------T-----ATG-A---G-----G--GT-T---------ACA--T--T--TTT----A-T--TA---------T--T-TT----TT-TT-A-TAAA-TT-T-AC-A-----C-A-A-TCGG-AA--GACA-ccc
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Reference ( family-2874 )     :                                     TGT-TGAAC-C-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--GT--CC--CT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---ATA-------GT-A-C-T--AC---TT--GNA------GGGG-GT-GTTAT-TT----A-AA-CG-A--T---GT-AT---A--A-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------T-G-TTGGNA-TC-----GT--TATC-A----GAA--TG-A--CTTC-A-AAG-----G--GG----------A--A----------T-T---NA-------T-----A-G-A---G-----G--AT-TC---ACAT--T--TT-T---A--T-----TA--A-T----T-T-TTT----T--TT------A-T---T-T-TNC-A-----C-AATCCGG-AA--GACA-AGCC
gi|1                          :                                     TGTGTAAAC-C-G-C--GTTG-G-G----GAT--A--TA--C--T-------G-----CCACGAGTTAGA-CC------GG--C-G----AC-TACTTTC-C--GT--GC--CT--T--GTCTGGTACAGT-GTACATGTA--T---ATA-------GT-G-C----GT---TT--GCA------GCGACAT-GTTAA-TT----ATAA-CG-A--T---GT-AC---A--A-ACAT-GAC-TTA-CA-----G-------TAG-TTGACA-TC-----CT--TGTC-A----GAA--TG-A--CTTC-A-AAG-----GGAGG----------A--AAAAAAAAACTT-T---TC-------T-----A-A-A---G-----G--ATCTA---ACTT--T--TT-TCAAA--TAG---TA--A-T----TAT-TTC----C--TT------A-T---T-T-TTC-A-----C-AACC
gi|10                         :                                     TAT-TGAAG-T-G-A--GCGGAG-G----TA---A--T---T--T-------T-----CTA------AGA-TTTAAAATGG--C-A----AC-T----TT-C--GG--CC--CT--A--ATATCTG----T-A---AT-----T---ATA--------T-G---T--AC---CT--GCA------GAGT-GT-ATTAT-TT----A-AA-CA-A--T---GT-ATAG-A--A-A--T-TAC-CAA-TA----CA-------T-G-GCGACA-TC-----AT--TAAG-A----AAA--TG-A--CAT--A-AGGGTGTTG--GG----------G--G----------T-T---GA-------A-----A-A-A---T-----A--AT-TC---ATAT--T--TT--------------------T----T-T-TCT----C--TT------A-T---T-T-TTC-A-----T-AATCCAG-A
gi|11                         :                                     TGT-TGAAC-T-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--T-G----AC-T----TT-C--GT--CC--CT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---ATA-------GT-A-C-T--AC---TT--GAA------GGGG-TT-GTTAT-TT----A-AA-AG-A--T---GT-GT---A--A-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------T-G-TTGGAA-TA-----GT--TATC-A----GAG--TG-A--CTTC-A-AAG-----G--GG----------A--A----------T-T---GA-------T-----A-G-A---G-----G--AT-TC---ACAT--T--TT-T---A--T-----TA--ACT----T-T-TTT----T--TT------A-T---T-T-TAC-A-----C-AACCCGG-AA--GACA-AGCCcat
gi|12                         :                                     TGT-TGAAC-C-G-A--ATGG-G-GGTACTAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--GT--CC--CT--T--GTAT-------T-G---AT---------ATA-------GT-A-C-T--AC---TT--GAA------GGGG-GC-GTTAT-TT----A-AA-CG-A--T---GT-AT---A--A-A--G-GAC-CAA-AA----CT-------T-G-TTGGAA-TT-----GT--TATC-A----GAA--TG-A--CTTC-A-AAG-----G--GG----------G--C----------T-T---TA-------G-----A-G-A---G-----A--AT-TA---AC-T--T--TT-T---T--T-----TA--T-T----T-T-TTT----T--TT------A-T---T-T-TAC-A-----A-AATCCGG-AA--GACA-
gi|13                         :                                     TGT-TGAAC-T-G-A--ATGG-GTG----TAT-----T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--T-G----AC-T----TT-C--GT--CC--CT--T--GAAT-------G-G---AT---------ATG-------GT-A-C-G--GC---TT--GCA------GGGG-GT-ATTAT-TT----A-AA-CG-A--T---GT-AT---A--A-A--T-GAT-CAA-AA---------------------AA-TC-----GT--TATC-A----GTT--TG-A--CTTC-A-AAG-----G--GG----------A--T----------T-T---CA-------T-----T-G-A---G-----G--AT-TC---ATAA--T--TT-T---AT-T-----TA--A-T----T-T-TTTAAAATTATT------A-T---T-T-TCT-A-----C-AATCCAG-AA--TACA-AGCC
gi|14                         :                                    gTGT-TGAAC-T-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------TTC---CCA------CGAGT-------GG--C-G----AC-T----TT-CCCGT--CC--CT--T--GTAT-------T-G----T-----T---ATA-------GT-A-C-TA-AC---TT--GAA------GGGG-GT-GTTAT-TT----A-AA-CA-A--T---GG-GT---A--A-A--T-GAC-TAA-AA----CG-------G-G-TTGGAA-TT-----GT--TATT-A----TAG--TG-A--CTTC-A-AAG-----G--GG----------G--A----------T-T---GA-------T-----A-G-A---G-----G--AT-TC---ACAT--T--TT-T---A--A-----TT--A-T----T-T-TTT----T--TA------A-A---T-T-TAC-A-----C-AATCCGG-AA--
gi|15                         :                                     TGT-TGAAC-T-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------TT----CCAG-----AGA-T-------GG--C-G----A--T----TT-C--GT--CC------T--GTAT-------T-G---AT---------ATA-------GT---C-T--AC---T----GA------AGGG-GT-GTTTA-TT----A-AA-C--A--G---GG-A----A--C-A--T-GAC-CAA-A-----CG-------G-G-TTGGAA-TT-----GT--TATT-A----GAG--TG-A--CTTC-A-AAG-----G--GG----------A--T----------T-T---AA-------T-----A-ATG---G-----G--AT-TC---ACAT--T--TT-T------T-----TATTA-T----T-T-TTT----T--TT------AGT---TAT-TTA-A-----C-AATACGG-AA--GACG-AGCC
gi|16                         :                                        -TGAAC-C-T-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CAA------AAA-T-------GG--A-G----AC-T----TT-T--GT--TC--CT--G--GTAT-------T-G----T-----T---ATAC------GT---T-TAAAA---TT--GCA----------------TCT-TT----A-AA-CA-A--T---GA-AT---A--A-A--T-GAC-CAA-AA----CA-------T-A-T----A-TT-----GA--CAT------------TG-----TTC-A-AAG-----G--GG----------C--ACGGTTTT---T-C---TAAAC----T-----A-A-A---G-----G--AT-TC---ATAT--T--TT-T---A--------TG--A-T----T-T-TTT----G--TT------A-T---T-T-TTC-A-----C-AATCTGG-AA--GACA-c
gi|17                         :                                   acTGT-TAAAC-C-T-AAGGTGG-G-G----TAT--A--T---G--C-------T-----CAA------AGA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--CT--CC--CT--T--GTAT-------T-G---AT---------ATA-------GT-A-G-A--AG---TT--GCA------GAGG-GT-ATTAT-TT----A-AA-CG-C--T---AT-AT---A--C-A--T-GTC-CAA-AA----CG-------T-C-TTGACA-TC-----GT--TATC-G----GAA--TT-A--CCTC-A-AAT-----G--GG----------A--T----------T-T---TC-------T-----A-------------A--AT-TC--------------------------------A-T----T-T-TTT----T--TTA-----A-A---T-T-TGC-A-----C-AATCCGC-CA--GACA-atc
gi|18                         :                                    gTGT-TGAAC-T-T-A--GCGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----TCA------AAA-T-------GG--C-G----GC-T----TT-C--GT--CC--CT--T--GTAT-------T-G----------T---A-A-------G--------------TT--GCA------GGGG-GT-GCTAT-TT----A-AA-CG-A--TCTATT-AT---A--A-A--T-GAC-CAA-CA----CA-------T-A-CTGACA-AC-----GT--TATC-A----GAA--TG-A--CTTG-A-AA----------------------------------------------------------------------G--AT-TC---ATAT--T--TT-T---A--T-----CA--A-TATTAT-T-TTT----T--TTA-----A-T---A-T-CCC-A-----C-AATCCGG-AA--GACA-AG
gi|19                         :                                     TGT-TGAAG-T-G-A--GTGG-G-GG---TAT--A--T---T--T-------T-----T-A------ATC-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--TT--T----T--T--AT-T-------T-G---A------------------------------AT---TT--GTA------GAG---T-GTTAT-TA----A-AA-CA-A--A---GT-AT---C--A-A--T-TAC-AAA-TG----CA-------T-G-TCGACA-TC-----AT--TATG-A----AAA--TG-A--CTTC-ATAAT-----G--GG----------G--T----------T-TTTAAA-------A-----A-A-A---A-----G--AT------AC---------------------------------------------T--TT------A-T---T-T-TCT-A-----C-AATCCGA-AA--TAC
gi|2                          :                                     TGT-GGAAC-C-G-A--TTGA-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACTT----TT-C--GT--CC--TT--T--GTAT-------T-G---ATATGAAT---ATAGTACAGTGT-A-C-T--AC---TTTAACA------AAGA-GT-GTTAT-TT----A-AA-CG-A--T---GT-AT---A--A-AT-T-GAC-CAA-AA----CG-------T-G-TTGGAA-TT-----GT--GATC-A----AAA--TG-A--CTTC-A-GAG-----G--TGTTTTCTTTTAA--A----------T-C---TATTATTATT-----A-G-AGGGG-----G--AC-TC---ACAC--T--TT-T---T--T-----T
gi|20                         :                                   gaTGT-TGAAT-C-G-A--GTGG-G-G----TAT--T--G---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--GC--CC--CT--T--GTAT-------T-G---AT---------GTA-------G--A-C-T--TC---TC--GTA------GGGG--T-GTTGC-TT----A-AA-C--------------------A-A--T-GAC-CGA-AG----CG-------T-G-TTGATA-TC-----GT--TATC-A----GAA--TG-A--CTTT-A-AAG-----G--GA----------A--T----------T-T---TA-------T-----T-G-A---G-----G--AT-TC---ATAC--T--TT-T---A--C-----Tcacggcttttctgtcacatacgcgg
gi|21                         :                                    gTGT-TGAAC-C-G-A--GTGA-G-G-----AT--AATT---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-T--GT--CC-------------------------------------A-A-------GTTG-C-T--AC---TT--GCA------GAAG-TT-GTTAT------------------------------A--A-G--T-GAT-CAA-AA----CG-------C-G-TTGACA-TC-----GT--T-----------------------C-A-AAG-----G--GT----------A--T----------T-G---TA-------T-----A-G-A---G-----A--AT-TC---ACAT--T--TT-C---T--T-----TC--T-T----T-A-TTT----T--TA------A-T---T-T-TCC-T-----T-AATCCGG-AA--GACT-AGtttgtctact
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                               gGG-GT-GTTAT-TT----A-AA-CG-AATC---GC-AA---A--A-C--T-GAC-C-A-AA----CA-------T-G-CTGACA-TC-----GT--GACC-A----GAA--TC-A--CTCT-----------G--AG----------ATCG----------T-T---C--------T-----A-A-A---G-----G--AT-TCGAAATAT--T--TC-A---ACGC-----TG--A-T----T-T-TTT----A--TT------A-T---C-TATAT-AATTTTC-AATCCGG-AATGGACA-AG
gi|23                         :                      tacatgtaagttacaTGT-TGAAC-T-G-G--GTGG-G-G----GGT--A--T---T--T-------TTTTTTCCA------AGA-T-------GA--C-------C-T----TT-C--GT--TC--CT--T--GTTT-------C-G-------------------------T-C-C-T--A-----------------------T-GT-AT-CT----A-AA-CG-A--T---GT-AT---A--A-A--T-GAC-CAA-AA----CA-------T-G-TCAATG-AC-----GT--TATC-A----GTA--TG-A--CTTC-A-AAG-----G--G--------------A----------T-T---TA-------T-----------------------T-TC---A-----------------------------------------------------------T---T-T-TCC-A-----C-AATGTGG-AA--GACA-AGTCgcccctctgt
gi|24                         :                                                                                               gCA------AGA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--GT--CC--CT--T--ATAT-------T-G---AT---------ATA-------GT-A-C-T--AG---TT--GCA------GGGC-GT-GTTAA-CT----A-AA-TG-A--T---GT-AT---A--A-A--T-GAC-TGG-AA----CG-------T-G-TCGACA-TC-----GT--TATC-A----GAA--TG-A--CTTT-A-TGG-----G--AG----------A--T----------T-T---TA-------T-----A-G-A---A-----G--AT-TT---ATAT--T--TT-T---A--TC----TG--A-T----T-TATTT----T--TT------c
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                   --GGA------AGGG-GT-GT-AT-TTTTCTA-AC-CA-A--T---GT-ATTTCA--C-A--T-GACACAA-AA----TA-------T-A-GTG----TG-----GC--TATC-ACATGGAAAGTGTA--CTTC-A-AA------G--GG----------A--A----------T-T---TA-------TGGTTCA-G-A---A-----G--AT-CT---CCAG--A--AG-T---G--A-----CA--A------------T----A--TT------A-T---TCT-TTC-A-----C-AATCTGG-AA--AACA-tccc
gi|26                         :                                                                                                                                                                   acgga-G---AT-----T---ATA-------GT-A-C-T--AC---TT--GAA------GGGG--T-GTTAT-TT----A-AA-CA-A--T---GT-GT---A--A-AG-T-GAC-CAA-A-----CG-------G-G-T-GGAA-T------GT--TATT-A----GAG--TG-A--CTTC-A-AAG-----G--GG----------G--A----------T-T---AA-------T-----ATG-A---G-----G--GT-T----ACAT--T--TT-T---A--T-----TA---------T-T-TTT----T--TT------A-TAAAT-T-TAC-A-----C-AAT-CGG-AA--GACA-gaagtctct
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                             T----A-AA-CG-A--T---GT-AT---A--A-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------T-G-CTAAAA-TC-----GT--TATT-A----GAT--TG-A--CTTG-A-AAG-----A--AG----------A--T----------T-T---TC-------T-----A-A-A---G-----G--AT-TC---ATA--------------------------------------TT----T--CT------A-T---T-T-TTC-A-----C-AATCCGG-AA--GAAA-gc
gi|28                         : tgtgtattatttattttgttcagcgggcctacatcaTGT-TGAACGC-G-A--ATGG-G-GGT--TA---A--T---T--TC------T-----CCA------AGA-T-------GGGGCAG----GC-T----TC----------------T--GAAT-------C-G---AT---------A-A-------GT-A-C-T--ACC--TT--GAA------GGGG-GT-GATAT-TT----A-AA--G-A--T---GTAAC---A--A-A--T-GCC-CAA-AA----AA-------G-GCTTGGAA-TTGCATGGC--TGTC-A----AAA--AG-A---TTC-A-aagccc
gi|29                         :                                   ggTGT-TGAAC-C-T-A--GTGG-G-GG---TAT--A--T---T--T-------T-----TCA------AAA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--GT--CT--TA--C--ATAC-------T-G----T-----T---ATA----------A-G-T--AG---TT--GCATG----GAGG-GT-GTTAC-TT----A-AA-CG-A--T---CC-AT---A--ACA--T-GAC-CCA-AA----CG-------T-G-CTGACA-TC-----GT--TATC-A----GAA--TG-A--CTTc
gi|3                          :                                                      ggGG-G-G----TATT-A--T---TAAT-------T-----CCA------AGA-T-------GG--T-GTACAAC-T----TT-C--GG--TC--CT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---ATA-------GT-A-CTT--AC---TT--TGATCTAT-AGGG-GTGGTGAA-TT----A-AATCG-A--T---GT-GTA--A--A-A--T-GACAAAA-AA----CA-------G-G-TTGGAA-TT-----GA--TAT--A----GAG--TG-A--CTTA-A-AGG-----G--GG----------AG-A----------T-C---AA-------T-----A-G-A---G-----G--A--TC---ACAT--T--TT-T------T-----TAT-A-T----T-T-TTT----T--TTTATCAAA-T---T-T-AAC-A-----C-AATCCGGAAA--GACA-AG
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gi|31                         :                                     TGT-TGAAC-C-T-A--GTGG-G-GG---TAT--A--T---T--T-------T-----TCA------AAA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--GT--CT--CT--TACATAC-------T-G----T-----T---ATA----------A-G-T--AG---TT--GCAT-----GAGG-GT-GTTAC-TT----A-AA-CG-A--T---CC-AT---A--C-A--T-GAC-CCA-AA----CG-------T-G-CTGACA-TC-----GT--TATC-A----GAA--TG-A--CTTc
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gi|4                          :                                     TGT-TGAAC-C-T-A--GTGG-G-A----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----AC-T----TT-C--GT--CC--TT--T--GTAT-------T-G---TT-----TTAAATACAT----GT-AGT-T--GCATATT--GCAAGGGGGGGGG-GG-GGTAT-TT----A-AA-CG-A--T---GT-AT---A--C-A--T-GAC-CAA-AA----TG-------T-A-TTGTCA-TC-----GT--TATC-A----GAA--TG-A--CTTC-A-AA------G--GG----------A--A----------T-T---TT-------T-----T-G-A---G-----GGAA-------ACAC--T--TT-T---A--A-----CA---------------T----T--TT------A-T---T-T-TCC-A-----C-AATTTGG-AA--GACA-AGCC
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Reference ( family-2874 )     :                                     TGT-TGAAC-C-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--GTCC--CT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---ATA---GT-A-C-------T-A-C---T------T--GCA------GGGG-GT-GTTA-T-TT----A-AA-CG-A--T---G--T-AT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------T-G-TTGGNA-TC-----GTTAT--C-A----GAA--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------A-N----------T-T-T-----A-------T-----A-G-A---GG-AT-T-----C---ACAT--T--TT-T---A-----T--TA--A-T----T-T-TTT----T--TT------A-T---T-T-TNC-A-----C-AATCCGG-AA--GACA-AGCC
gi|1                          :                                     TGTGTAAAC-C-G-C--GTTG-G-G----GAT--A--TA--C--T-------G-----CCACGAGTTAGA-CC------GG--C-G----ACTACTTTC--C--GTGC--CT--T--GTCTGGTACAGT-GTACATGTA--T---ATA---GT-G-C---------G-T---T------T--GCA------GCGACAT-GTTA-A-TT----ATAA-CG-A--T---G--T-AC---AA-ACAT-GAC-TTA-CA-----G-------TAG-TTGACA-TC-----CTTGT--C-A----GAA--TG-A--CTTCA-AA--G-----GGAGG----------A-AAAAAAAAACTT-T-T-----C-------T-----A-A-A---GG-ATCT-----A---ACTT--T--TT-TCAAA-----TAGTA--A-T----TAT-TTC----C--TT------A-T---T-T-TTC-A-----C-AACC
gi|10                         :                                     TAT-TGAAG-T-G-A--GCGGAG-G----TA---A--T---T--T-------T-----CTA------AGA-TTTAAAATGG--C-A----ACT----TT--C--GGCC--CT--A--ATATCTG----T-A---AT-----T---ATA----T-G---------T-A-C---C------T--GCA------GAGT-GT-ATTA-T-TT----A-AA-CA-A--T---G--T-ATAG-AA-A--T-TAC-CAA-TA----CA-------T-G-GCGACA-TC-----ATTAA--G-A----AAA--TG-A--CAT-A-AG--GGTGTTGG--G----------G-G----------T-T-G-----A-------A-----A-A-A---TA-AT-T-----C---ATAT--T--TT--------------------T----T-T-TCT----C--TT------A-T---T-T-TTC-A-----T-AATCCAG-A
gi|11                         :                                     TGT-TGAAC-T-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--T-G----ACT----TT--C--GTCC--CT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---ATA---GT-A-C-------T-A-C---T------T--GAA------GGGG-TT-GTTA-T-TT----A-AA-AG-A--T---G--T-GT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------T-G-TTGGAA-TA-----GTTAT--C-A----GAG--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------A-A----------T-T-G-----A-------T-----A-G-A---GG-AT-T-----C---ACAT--T--TT-T---A-----T--TA--ACT----T-T-TTT----T--TT------A-T---T-T-TAC-A-----C-AACCCGG-AA--GACA-AGCCcat
gi|12                         :                                     TGT-TGAAC-C-G-A--ATGG-G-GGTACTAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--GTCC--CT--T--GTAT-------T-G---AT---------ATA---GT-A-C-------T-A-C---T------T--GAA------GGGG-GC-GTTA-T-TT----A-AA-CG-A--T---G--T-AT---AA-A--G-GAC-CAA-AA----CT-------T-G-TTGGAA-TT-----GTTAT--C-A----GAA--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------G-C----------T-T-T-----A-------G-----A-G-A---GA-AT-T-----A---AC-T--T--TT-T---T-----T--TA--T-T----T-T-TTT----T--TT------A-T---T-T-TAC-A-----A-AATCCGG-AA--GACA-
gi|13                         :                                     TGT-TGAAC-T-G-A--ATGG-GTG----TAT-----T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--T-G----ACT----TT--C--GTCC--CT--T--GAAT-------G-G---AT---------ATG---GT-A-C-------G-G-C---T------T--GCA------GGGG-GT-ATTA-T-TT----A-AA-CG-A--T---G--T-AT---AA-A--T-GAT-CAA-AA---------------------AA-TC-----GTTAT--C-A----GTT--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------A-T----------T-T-C-----A-------T-----T-G-A---GG-AT-T-----C---ATAA--T--TT-T---AT----T--TA--A-T----T-T-TTTAAAATTATT------A-T---T-T-TCT-A-----C-AATCCAG-AA--TACA-AGCC
gi|14                         :                                    gTGT-TGAAC-T-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------TTC---CCA------CGAGT-------GG--C-G----ACT----TT--CCCGTCC--CT--T--GTAT-------T-G----T-----T---ATA---GT-A-C-------TAA-C---T------T--GAA------GGGG-GT-GTTA-T-TT----A-AA-CA-A--T---G--G-GT---AA-A--T-GAC-TAA-AA----CG-------G-G-TTGGAA-TT-----GTTAT--T-A----TAG--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------G-A----------T-T-G-----A-------T-----A-G-A---GG-AT-T-----C---ACAT--T--TT-T---A-----A--TT--A-T----T-T-TTT----T--TA------A-A---T-T-TAC-A-----C-AATCCGG-AA--
gi|15                         :                                     TGT-TGAAC-T-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------TT----CCAG-----AGA-T-------GG--C-G----A-T----TT--C--GTCC------T--GTAT-------T-G---AT---------ATA---GT---C-------T-A-C---T---------G-A------AGGG-GT-GTTT-A-TT----A-AA-C--A--G---G--G-A----AC-A--T-GAC-CAA-A-----CG-------G-G-TTGGAA-TT-----GTTAT--T-A----GAG--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------A-T----------T-T-A-----A-------T-----A-ATG---GG-AT-T-----C---ACAT--T--TT-T---------T--TATTA-T----T-T-TTT----T--TT------AGT---TAT-TTA-A-----C-AATACGG-AA--GACG-AGCC
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gi|17                         :                                   acTGT-TAAAC-C-T-AAGGTGG-G-G----TAT--A--T---G--C-------T-----CAA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--CTCC--CT--T--GTAT-------T-G---AT---------ATA---GT-A-G-------A-A-G---T------T--GCA------GAGG-GT-ATTA-T-TT----A-AA-CG-C--T---A--T-AT---AC-A--T-GTC-CAA-AA----CG-------T-C-TTGACA-TC-----GTTAT--C-G----GAA--TT-A--CCTCA-AA--T-----GG--G----------A-T----------T-T-T-----C-------T-----A--------A-AT-T-----C--------------------------------A-T----T-T-TTT----T--TTA-----A-A---T-T-TGC-A-----C-AATCCGC-CA--GACA-atc
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gi|19                         :                                     TGT-TGAAG-T-G-A--GTGG-G-GG---TAT--A--T---T--T-------T-----T-A------ATC-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--TTT----T--T--AT-T-------T-G---A-------------------------------A-T---T------T--GTA------GAG---T-GTTA-T-TA----A-AA-CA-A--A---G--T-AT---CA-A--T-TAC-AAA-TG----CA-------T-G-TCGACA-TC-----ATTAT--G-A----AAA--TG-A--CTTCATAA--T-----GG--G----------G-T----------T-T-TTAA--A-------A-----A-A-A---AG-AT-----------AC---------------------------------------------T--TT------A-T---T-T-TCT-A-----C-AATCCGA-AA--TAC
gi|2                          :                                     TGT-GGAAC-C-G-A--TTGA-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TTT-C--GTCC--TT--T--GTAT-------T-G---ATATGAAT---ATA---GT-A-CAGTGTACT-A-C---T------TTAACA------AAGA-GT-GTTA-T-TT----A-AA-CG-A--T---G--T-AT---AA-A--TTGAC-CAA-AA----CG-------T-G-TTGGAA-TT-----GTGAT--C-A----AAA--TG-A--CTTCA-GA--G-----GT--GTTTTCTTTTAA-A----------T-C-T-----ATTATTATT-----A-G-AGGGGG-AC-T-----C---ACAC--T--TT-T---T-----T--T
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                             g---T------T--ACA------GGG---T-GTTA-T-TT----A-AA-CG-AATC---G--C-AA---AA-C--T-GAC-C-A-AA----CA-------T-G-CTGACA-TC-----GTGAC--C-A----GAA--TC-A--CTCT------------GA--G----------A-T----------CGT-T-----C-------T-----A-A-A---GG-AT-T-----CGAAATAT--T--TC-A---ACG---C--TG--A-T----T-T-TTT----A--TT------A-T---C-TATAT-AATTTTC-AATCCGG-AATGGACA-AG
gi|23                         :                           tacatgtaagTGT-TGAAC-T-G-G--GTGG-G-G----GGT--A--T---T--T-------TTTTTTCCA------AGA-T-------GA--C-------CT----TT--C--GTTC--CT--T--GTTT-------C-G---------------------T-C-C-------T-A------------------------------T-GT-A-T-CT----A-AA-CG-A--T---G--T-AT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CA-------T-G-TCAATG-AC-----GTTAT--C-A----GTA--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG---------------A----------T-T-T-----A-------T-----------------T-T-----C---A-----------------------------------------------------------T---T-T-TCC-A-----C-AATGTGG-AA--GACA-AGTCgcccctctgt
gi|24                         :                                                                                               gCA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--GTCC--CT--T--ATAT-------T-G---AT---------ATA---GT-A-C-------T-A-G---T------T--GCA------GGGC-GT-GTTA-A-CT----A-AA-TG-A--T---G--T-AT---AA-A--T-GAC-TGG-AA----CG-------T-G-TCGACA-TC-----GTTAT--C-A----GAA--TG-A--CTTTA-TG--G-----GA--G----------A-T----------T-T-T-----A-------T-----A-G-A---AG-AT-T-----T---ATAT--T--TT-T---A-----TC-TG--A-T----T-TATTT----T--TT------c
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                             A------AGGG-GT-GT-A-T-TTTTCTA-AC-CA-A--T---G--T-ATTTCAC-A--T-GACACAA-AA----TA-------T-A-GTG----TG-----GCTAT--C-ACATGGAAAGTGTA--CTTCA-AA--------GG--G----------A-A----------T-T-T-----A-------TGGTTCA-G-A---AG-AT-C-----T---CCAG--A--AG-T---G-----A--CA--A------------T----A--TT------A-T---TCT-TTC-A-----C-AATCTGG-AA--AACA-tccc
gi|26                         :                                                                                                                                                               acggagg-G---AT-----T---ATA---GT-A-C-------T-A-C---T------T--G-A------AGGG-GT-GTTA-T-TT----A-AA-CA-A--T---G--T-GT---AA-AG-T-GAC-CAA-A-----CG-------G-G-T-GGAA-T------GTTAT--T-A----GAG--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------G-A----------T-T-A-----A-------T-----ATG-A---GG-GT-T---------ACAT--T--TT-T---A-----T--TA---------T-T-TTT----T--TT------A-TAAAT-T-TAC-A-----C-AAT-CGG-AA--GACA-gaagtctct
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                    T----A-AA-CG-A--T---G--T-AT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------T-G-CTAAAA-TC-----GTTAT--T-A----GAT--TG-A--CTTGA-AA--G-----AA--G----------A-T----------T-T-T-----C-------T-----A-A-A---GG-AT-T-----C---ATA--------------------------------------TT----T--CT------A-T---T-T-TTC-A-----C-AATCCGG-AA--GAAA-gc
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gi|3                          :                                                      ggGG-G-G----TATT-A--T---TAAT-------T-----CCA------AGA-T-------GG--T-GTACAACT----TT--C--GGTC--CT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---ATA---GT-A-CT------T-A-C---TTTGATCT--ATA------GGGG-TG-GTGA-A-TT----A-AATCG-A--T---G--T-GTA--AA-A--T-GACAAAA-AA----CA-------G-G-TTGGAA-TT-----GATAT----A----GAG--TG-A--CTTAA-AG--G-----GG--G----------AGA----------T-C-A-----A-------T-----A-G-A---GG-A--T-----C---ACAT--T--TT-T---------T--TAT-A-T----T-T-TTT----T--TTTATCAAA-T---T-T-AAC-A-----C-AATCCGGAAA--GACA-AG
gi|30                         :                                                                                                                                                                          gtg-----T---ACA---GT-A-C-------T-A-C---T------T--GCA------GGGG-GT----------------AG-TGCA--T---G--T-AT---A-----T-GAC-TAA-AA----CG-------T-G-TCGACA-TC-----GTTATATC-A----GAA--T------TTCA-AA--G-----GG--A----------A-T----------T-T-T-----A-------T-----A-C-A---GG-AT-TAGATTC---ATAT--T--TT-T---AGTCATTA-TA--A-T----T-T-TTT----T--TT------A-T---T-T-TCC-A-----C-AAaccc
gi|31                         :                                     TGT-TGAAC-C-T-A--GTGG-G-GG---TAT--A--T---T--T-------T-----TCA------AAA-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--GTCT--CT--TACATAC-------T-G----T-----T---ATA------A-G-------T-A-G---T------T--GCAT-----GAGG-GT-GTTA-C-TT----A-AA-CG-A--T---C--C-AT---AC-A--T-GAC-CCA-AA----CG-------T-G-CTGACA-TC-----GTTAT--C-A----GAA--TG-A--CTTc
gi|32                         :                                    gTGT-TGAAC-C-G-A---------------AT--A--T---T--T--------------CA------AGA-T-------GG--C-T----ACT----TT--C--TTCC--TT--T--GTGT-------T-G---A------T---GTA---GT-A-G-------T-A-G---T------T--GTA------GGGG-GT-G------TT----A-AA-CG-A--T---G--C-AT---CG-A--TCGAC-
gi|33                         :                                                 aactgaTGG-G-G----GATG-A--T---T--T-------T-----CCA------AG-----------G--CAG----ACT----TT--C--GTCC---T--T--GTAT-------T-G---AT-----T---ATA---GT-A-C-------T-ACC---T------T--G-A------TGGG-GTGGTTA-T-TT----A-AG-CG-A--T---G--T-GT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------G-G-TTgatgtatcaacacgttgtttctattgataataaaa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgttgaggggccaTTAT--TTA----GAG--TG-AAACTTCA-AAA-G-----GG--G----------A-T----------T-G-A-----A-------T-----A-G-A---GGAAT-T-----C---ACAT--C--TT-TTA-A-----T--TA--A-T----T-T-TT
gi|35                         :                                aatagaaT-TGAAC-C-CTA--GTGG-G-GG---TATCTA--C---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACC----AT--C--GTTC--CC--A--TTAT-------T-G---A------T---ATA---GT-A-G-------T-A-G---T------T--GCA-------GGG-GT-GTCA-T-TT----A-AA-Caaaaaaaaaattaaatccaacctcgaaagaccaagcccta
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggttA-TC-----GTTAT--C-A----GAA--TG-A--CTTCA-AG--A-----GG--G----------A-T----------T-T-T-----C-------T-----A-A-A---GG-AC-T-----T---ACAT--TGATT-T---------T--TA---------T-A-TTT----A--TC------A-T---T-T-TTCTA-----C-AATCCAG-AA--GACACAGCCa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGAA-TT-----GTTAT--T-A----GAG--TG-A--CTTCC-AA--G-----GG--G----------G-A----------T-T-T-----T-------T-----A-G-A---GG-AT-T-----A---ACAT--T--TT-T---A-----T--TA---------------T----T--TT------A-T---T-T-TAC-A-----C-AATCCGG-AA--GACA-AGCCc
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TC-----GTTAT--C-A----GAA--TG-A--ATTCG-AA--G-----GA--A----------A-T----------G-T-T-----C-------T-----A-A-A---GG-AT-T-----C---ATA---T--TT-T---A-------------------T-T-TTT----T--TC------A-T---T-C-TCC-A-----C-AATCTGG-AA--GACA-AGCCcc
gi|39                         :                                   acTGC-TCAAC-T-G-A--GTGG-G-G----TA---A--TG--T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--GTCC--CT--T--GTCT-------T-G---A------T---ATAAT-GT-A-C-------T-T-C---T------T--GCA------GTGG-GT-GTTA-T-TT----A-tc
gi|4                          :                                     TGT-TGAAC-C-T-A--GTGG-G-A----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--GTCC--TT--T--GTAT-------T-G---TT-----TTAAATACATGT-AGT-------T-G-CATAT------T--GCAAGGGGGGGGG-GG-GGTA-T-TT----A-AA-CG-A--T---G--T-AT---AC-A--T-GAC-CAA-AA----TG-------T-A-TTGTCA-TC-----GTTAT--C-A----GAA--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--A----------A-T----------T-T-T-----T-------T-----G-A-G---GG-A--------A---ACAC--T--TT-T---A-----A--CA---------------T----T--TT------A-T---T-T-TCC-A-----C-AATTTGG-AA--GACA-AGCC
gi|40                         :                                       T-TGAAC-C-G-A--GTGG-G-GG---TAT--A--G---T--T-------T-----CCA------AAA-T-------GG--T-G----ACT----AT--C--GTCC--TT--TG-GTAT-------T-G----T-----T---ACA---GT-A-cc
gi|41                         :                                           AAT-C-T-A--GTGA-G-C----TAT--A--TGC-T--T-------T-----CCA------AG--T-------GG--C-G----ACTC---TT--C--GTCC--TTAAT--GTAT-------T-A---AT-----g
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ------A-T---T-T-CAC-A-----C-AATCCGG-AA--GACA-AGCCgt
gi|5                          :                                     TGT-TGAAT-CTGTA--GTGG-G-G----TAT--A--TATTT--TACAATCAT-----CCA------GCA-T-------GG--C-G----CCT----TT--C--GTCC--TG--T--ATAT-------G-G---AT-----T---ATAT--GT-ATC-------T-A-T---T------A--GAA------GGGT-GT--CTA-T-TT----A-AA-CG-A--T---G--T-GT----A-A--T-GAC-CAAGAA----CG-------G-G-TTTGGA-TT-----G-TAT--T-A----GAG--TG-A--CTTCA-AAAGG-----GG--G----------A-T----------T-G-A-----A-------T-------G-A---GG-AT-T-----C---ACAT--T--TT-T---A-----T------A-G----T-T-TTT----T--AA------A-T---T-C-TAC-A-----CTAATCCGA-AT--GACA-AGcctgtga
gi|6                          :                                                    --GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TCA-C--CTCCCTCT--T--GTAT-------T-G---AT-----C---ATA---TC-A-C-------T-A-C---T------T--G-A------AGGG-GT-GTTA-TATT----A-AA-CG-A--T---G--T-GTA--AA-A--T-GAC-CAA-AA----CGGAGATAAT-T-CTGGAAGTT-----GTTAT--T-A----G-A--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------A------------T-T-A-----A-------T-----A-G-A---GG-AT-T-----C---ACATTAT--TC-T---A-----T--T---A-T----T-T-ATT----T--AA------A-T---G-T-TAC-A-----C-AATCC-G-AA--GACA-ACCC
gi|7                          :                                 gagatgT-TGAAC-T-G-A--GTGG-G-G----TAT--A--T---T--T-------TT----CCA------AGA-T-------GG--C-G----ACT----TT--C--GTCC--CT--T--GTAT-------T-G---AT-----T---ATA---GT-A-C-------T-A-C---T------T--GAA------GGGG-GT-GTTA-T-TT----A-AA-CG-A--T---G--T-GT---AA-A--T-GAC-CAA-AA----CG-------G-G-TTGGAA-TT-----GTTAT--T-A----GAG--TG-A--CTTCA-AA--G-----GG--G----------G-A----------T-TAA-----A-------T-----A---A---GG-AT-T-----C---ACAT--T--TT-T---A-----T--TAT-T-T----T-T-TTT----T--TT------A-TTA-T-T-TAC-A-----C-AATACGG-AA--GACA-AGCC
gi|8                          :                                       T-TGAAC-T-G-A--GTGG-G-GG---TAT--AG-T---T--T-------T-----CCA------AGA-TTT-----GG--C-G----ATT----TT--C--GTCC--CT--T--GTAT-------TTG---AT-----TTATATA---GT-A-C-------C-A-C---T------T--GAA------GGGG-GT-GTAT-T-TT----A-AA-CGAA--T---G--T-GT---AA-A--T-GAC-CAA-AAACGGCG-------T---TTGGAA-TT-----TTTGT--T-A----GAG--GG-A--CTTCA-A-------------------------------------T---------------------------A---GG-AT-T-----C---ACAT--T--TTAT---C-----T--T-----T----A-T-TTT----T--TT------A-G---A-T-TAC-A-----C-AATCCGG-AA--GACA-AGCCc
gi|9                          :                                                   ggtgtGG-G-G----TGT--A--T---T--T-------T-----CCA------AGA-T-------GG--C-A----ACT----TTAAT--TTCC--CT--T--GTAT-------T-G---A------T---ATA---G------------T-A-T---T------T--GCA------GGGG-TT-GTTATT-TT----T-AA-CT-A--T---GTAT-AT---AA-A--T-GAT-CAA-AG----CG-------C-G-CTGACA-TC-----GTTAC--C-A----TAA--TG-G--CTTC--AA--G-----GG--G----------A-T----------T-T-T-----A-------T-----A-T-A---G---T-T-----C---AGA-------------A--------TA--A-----------TA----T--TT------A-T---T-T-CCC-A-----C-TATCCGG-AA--GACA-AGCc