lowQualScore : 6666 1 2222 11 3333333333
lowQualScore : 6 6 3333 5 1111 22 2 5555 2 4444444444 2 888888888888888
lowQualScore : . . .... . .... .. . .... . .......... . ...............
lowQualScore : 0 0 0000 5 2222 44 5 3333 4 0000000000 1 999999999999999
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-GGGGGC-------C---C---GCCCCCCCCC
Reference ( gi|1 ) : AAAATAGTATAATGATTTGCATATACCATGCTAAAATAGTAGTTAAAATTTGGGTCAACCCATAATGTCTATTTCAGCATAGTGCAATGCAAATCAACACTATCACCTCTCCCAAGTTTTTCAACTTGTTCAACTAAAATTTTGATTCACTTAAAAAAGAATGTTAAGAATGAAAGGTTGCTAAAATGACTCAAGATTGACTGAAGAACACCATAGTGTGTAGTTTAGTTTTCGATACATGCACATG----CATACATCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---CAGGGGGC-------C---C---GCCCCCCCCC
gi|5 : GCTTAATTAT--ATACATGTACATGTAGTCATAT-TCAA---------GGATTTAGAGGGG-GT---C----------C-------C---A---GCCCCCCCC
gi|15 : tttaaagaatcagtcatattcatagATAC-TACATAGG----CATAAGTCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-
gi|9 : CATG----CATA--TCAT-A----GGCGGATTTAGAGGAG-GT---C---T-GGGGGC-------T---C---GCCCCCACCC
gi|8 : ATG----CATATATTAT-TCATAGGCGAATTTAGTGGGG-G--------CAGGGGGG-------TGAGC---ACCCCCCCCCcc
gi|11 : ATACATCAGGT----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C-----GG-----------C---T---GCCCCCCCCC
gi|13 : gTAAATCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C----------C-------C---A---GTTCCCCCCC
gi|7 : ACA-CAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---------GGGGGC-------C---C---GGCCCc
gi|14 : cgattgccatgtgcaagggaTCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG------------GGAGGC-------C---CA--GCCCCCCCCC
gi|10 : TCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGGCGGGCAC---CAGGAGCC-------C---C---CCACCCcc
gi|17 : attCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-----GC-------C---C---ACCCCCCac
gi|20 : aaCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGA-GG-------CAGGGGGC-------C---C---
gi|16 : CAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GC---C---CAG----C-------C---C----CCCCCCCta
gi|19 : ttgCAG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GT---C---CAG
gi|3 : actgG-T----GGCGGATTTAAGGGGG-GG---------GGGGGCGCCCCCCC---C---GCCCCCCCCCccccc
gi|12 : -T----GGCGGATTTAGAGGGG-AG---G---GGGGGGGC-------C---CGGGGCCCCCCCCCccccaaatttaccaagggtaataaataatcttattttttactaaaaaaattaataaattacaacccccccaccccccttct
gi|6 : -T----GACGGATTTAGAGAGG-GG---CGTGCGGGGCGC-------A---C---GCCCCCCCCC
gi|4 : CGGATTTAAGGGGG-GG--------GGGGGGC-------C---C---CCCCCCCCCCccaccccccacccccccttaaatttcaacagatta
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): AAATATAAACGTTTACATAAGTTTACCATGCAGATGTGTTGATTTAGGTAGGGCCAGGCTTCTGCATAATCTATCGACATGACAATGACAGCTATGTAGATCAGTAATCCACCTCCTATTATTGTATTGTTGATTCGAGGACTGGACATCTTTATGTTCCTGAAAAGATAATTTGATACACTATGAAAGGTGAATTATGAACACAATGTACAATGGACCATGAAGGCCACCTGAAGTCCATTTGGAGTATTCATGTCTATCCACAGCATGAAAT
Unaligned ( gi|18 ): GGATCCAGAGGGTTGGACCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Alignments
lowQualScore : 11 1 1111 222222222
lowQualScore : 33 5 4444 77 33 2 4444 4 000000000 2 7777777 444 7777
lowQualScore : .. . .... .. .. . .... . ......... . ....... ... ....
lowQualScore : 88 5 2222 99 77 2 7777 2 111111111 4 6666666 111 8888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-GGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
Reference ( family-2790 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-GGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
gi|1 : GTTTAGTTTTCGATACATGCACATG----CATACATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---CAGGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
gi|10 : aaaatagtataatgatttgcatataccatgctaaaatagtagttaaaatttgggtcaacccataatgtctatttcagcatagtgcaatgcaaatcaacactatcacctctcccaagtttttcaacttgttcaactaaaattttgattcacttaaaaaagaatgttaagaatgaaaggttgctaaaatgactcaagattgactgaagaacaccatagtgtgtaTC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGGCGGGCAC---C-AGGA-G-------CC---C---CCCACCC
gi|11 : attATACATC--AGGT----GGCGGATTTAGAGGGG-GG-------C-GG------------C---T---GCCCCCCCCCac
gi|12 : g-T----GGCGGATTTAGAGGGGAGG---G---G-GGGG-G-------CC---CGGGGCCCCCCCCC
gi|13 : TAAATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-CAGT-T-------CC---C---CCCCC
gi|14 : TC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG------------GGAG-G-------CC---CA--GCCCCCCCCC
gi|15 : --ATAC-TACATAGG----CATAAGTC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-cc
gi|16 : C--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GC---C---C-AG-----------CC---C----CCCCCCC
gi|17 : ttgC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C------G-------CC---C---ACCCCCC
gi|19 : aaC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GT---C---C-AG
gi|20 : actgC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGA-GG---C---A-GGGG-G-------CC---C---ccccc
gi|3 : G-T----GGCGGATTTAAGGGGG-GG---------GGGG-GCGCCCCCCC---C---GCCCCCCCCCta
gi|4 : CGGATTTA-AGGGG-GG---G---G-GGGG-G-------CC---C---CCCCCCCCCCccccaaatttaccaagggtaataaataatcttattttttactaaaaaaattaataaattacaacccccccaccccccttct
gi|4 : ATTAT--ATAT-TACACTTG----C-TAAATTCTAG-G----GGGGG-------GGGG-GG---------GGGG-G-------CC---C---CCCCCCCCCCccccctagaatttagcaagtgtaatatataatcttatttttcactggaaaaattaataaattacacacggcgcgccc
gi|5 : cggatttaaGCTTAATTAT--ATACATGTACATGTAGTCATAT-TC--AA---------GGATTTAGAGGGG-GT---C------------------CC---A---GCCCCCCCCcttatttttcactggaaaaattaataaattacacacggcgcgccc
gi|6 : tttaaagaatcagtcatattcatag-T----GACGGATTTAGAGAGG-GG---CGTGC-GGGGCG-------CA---C---GCCCCCCCCC
gi|7 : C--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---------GGGG-G-------CC---C---GGCCCccaccccccacccccccttaaatttcaacagatta
gi|8 : cgattgccatgtgcaagggaacaATG----CATATATT--AT-TCATAGGCGAATTTAG-TGGG-GG---C---A-GGGG-G-------GTGAGC---ACCCCCCCCC
gi|9 : CATG----CATA--TC--AT-A----GGCGGATTTAGAGGAG-GT---C---T-GGGG-G-------CT---C---GCCCCCACCC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): AAATATAAACGTTTACATAAGTTTACCATGCAGATGTGTTGATTTAGGTAGGGCCAGGCTTCTGCATAATCTATCGACATGACAATGACAGCTATGTAGATCAGTAATCCACCTCCTATTATTGTATTGTTGATTCGAGGACTGGACATCTTTATGTTCCTGAAAAGATAATTTGATACACTATGAAAGGTGAATTATGAACACAATGTACAATGGACCATGAAGGCCACCTGAAGTCCATTTGGAGTATTCATGTCTATCCACAGCATGAAAT
Unaligned ( gi|18 ): GGATCCAGAGGGTTGGACCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Alignments
lowQualScore : 11 1 1111 222222222
lowQualScore : 33 5 4444 77 33 2 4444 4 000000000 2 7777777 444 7777
lowQualScore : .. . .... .. .. . .... . ......... . ....... ... ....
lowQualScore : 88 5 2222 99 77 2 7777 2 111111111 4 6666666 111 8888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-GGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
Reference ( family-2790 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-GGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
gi|1 : GTTTAGTTTTCGATACATGCACATG----CATACATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---CAGGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
gi|10 : aaaatagtataatgatttgcatataccatgctaaaatagtagttaaaatttgggtcaacccataatgtctatttcagcatagtgcaatgcaaatcaacactatcacctctcccaagtttttcaacttgttcaactaaaattttgattcacttaaaaaagaatgttaagaatgaaaggttgctaaaatgactcaagattgactgaagaacaccatagtgtgtaTC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGGCGGGCAC---C-AGGA-G-------CC---C---CCCACCC
gi|11 : attATACATC--AGGT----GGCGGATTTAGAGGGG-GG-------C-GG------------C---T---GCCCCCCCCCac
gi|12 : g-T----GGCGGATTTAGAGGGGAGG---G---G-GGGG-G-------CC---CGGGGCCCCCCCCC
gi|13 : TAAATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-CAGT-T-------CC---C---CCCCC
gi|14 : TC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG------------GGAG-G-------CC---CA--GCCCCCCCCC
gi|15 : --ATAC-TACATAGG----CATAAGTC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-cc
gi|16 : C--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GC---C---C-AG-----------CC---C----CCCCCCC
gi|17 : ttgC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C------G-------CC---C---ACCCCCC
gi|19 : aaC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GT---C---C-AG
gi|20 : actgC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGA-GG---C---A-GGGG-G-------CC---C---ccccc
gi|3 : G-T----GGCGGATTTAAGGGGG-GG---------GGGG-GCGCCCCCCC---C---GCCCCCCCCCta
gi|4 : CGGATTTA-AGGGG-GG---G---G-GGGG-G-------CC---C---CCCCCCCCCCccccaaatttaccaagggtaataaataatcttattttttactaaaaaaattaataaattacaacccccccaccccccttct
gi|4 : ATTAT--ATAT-TACACTTG----C-TAAATTCTAG-G----GGGGG-------GGGG-GG---------GGGG-G-------CC---C---CCCCCCCCCCccccctagaatttagcaagtgtaatatataatcttatttttcactggaaaaattaataaattacacacggcgcgccc
gi|5 : cggatttaaGCTTAATTAT--ATACATGTACATGTAGTCATAT-TC--AA---------GGATTTAGAGGGG-GT---C------------------CC---A---GCCCCCCCCcttatttttcactggaaaaattaataaattacacacggcgcgccc
gi|6 : tttaaagaatcagtcatattcatag-T----GACGGATTTAGAGAGG-GG---CGTGC-GGGGCG-------CA---C---GCCCCCCCCC
gi|7 : C--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---------GGGG-G-------CC---C---GGCCCccaccccccacccccccttaaatttcaacagatta
gi|8 : cgattgccatgtgcaagggaacaATG----CATATATT--AT-TCATAGGCGAATTTAG-TGGG-GG---C---A-GGGG-G-------GTGAGC---ACCCCCCCCC
gi|9 : CATG----CATA--TC--AT-A----GGCGGATTTAGAGGAG-GT---C---T-GGGG-G-------CT---C---GCCCCCACCC
blockSeqs : . A TAGT CA CT G CATA C GCACC C CGCCCCC GAG GGGG
blockSeqs : . . . AA . . . A CGTGC . . . AG
blockSeqs : . . . AG . . . . GG . . . C
blockSeqs : . AA . . . . CC . . . G
blockSeqs : . TA . . . . CC . . . C
blockSeqs : T . . . . CC . . . A
blockSeqs : . . . . . CC . . . G
blockSeqs : . . . . CA . . . C
blockSeqs : . . . . GG . . . C
blockSeqs : . . . . CA . . . G
blockSeqs : . . . . CT . . . G
blockSeqs : . . . . C . . . G
blockSeqs : . . . . C . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : CN*******
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-GGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GGCN-------GGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): AAATATAAACGTTTACATAAGTTTACCATGCAGATGTGTTGATTTAGGTAGGGCCAGGCTTCTGCATAATCTATCGACATGACAATGACAGCTATGTAGATCAGTAATCCACCTCCTATTATTGTATTGTTGATTCGAGGACTGGACATCTTTATGTTCCTGAAAAGATAATTTGATACACTATGAAAGGTGAATTATGAACACAATGTACAATGGACCATGAAGGCCACCTGAAGTCCATTTGGAGTATTCATGTCTATCCACAGCATGAAAT
Unaligned ( gi|18 ): GGATCCAGAGGGTTGGACCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Alignments
lowQualScore : 11 1 1111 22222222
lowQualScore : 33 5 4444 77 33 2 4444 4 44444444 2 7777777 444 888
lowQualScore : .. . .... .. .. . .... . ........ . ....... ... ...
lowQualScore : 88 5 2222 99 77 2 7777 2 22222222 4 6666666 111 888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C----GGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
Reference ( family-2790 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTAATTAT--ATACATGCACATG----CATANATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---NGGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
gi|1 : GTTTAGTTTTCGATACATGCACATG----CATACATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GGC--C---AGGGG-G-------CC---C---GCCCCCCCCC
gi|10 : aaaatagtataatgatttgcatataccatgctaaaatagtagttaaaatttgggtcaacccataatgtctatttcagcatagtgcaatgcaaatcaacactatcacctctcccaagtttttcaacttgttcaactaaaattttgattcacttaaaaaagaatgttaagaatgaaaggttgctaaaatgactcaagattgactgaagaacaccatagtgtgtaTC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGGCGGGCAC---CAGGA-G-------CC---C---CCCACCC
gi|11 : attATACATC--AGGT----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---GG-------------C---T---GCCCCCCCCCac
gi|12 : g-T----GGCGGATTTAGAGGGGAGG---G---GGGGG-G-------CC---CGGGGCCCCCCCCC
gi|13 : TAAATC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C-----------------CC---A---GTTCCCCCCC
gi|14 : TC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-----------GGAG-G-------CC---CA--GCCCCCCCCCc
gi|15 : --ATAC-TACATAGG----CATAAGTC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-cc
gi|16 : C--AG-T----GGCGGATTTAGA---------------GGGG-G-------CC---CA--GCCCCCCCCC
gi|17 : ttgC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG---C---C-----G-------CC---C---ACCCCCCc
gi|19 : aaC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-G
gi|20 : actgC--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGA-GG---C---AGGGG-G-------CC---C---tccagccccc
gi|3 : G-T----GGCGGATTTA-AGGGG-GG-------GGGGG-GCGCCCCCCC---C---GCCCCCCCCCta
gi|4 : CGGATTTA-AGGGG-GG---G---GGGGG-G-------CC---C---CCCCCCCCCCccccaaatttaccaagggtaataaataatcttattttttactaaaaaaattaataaattacaacccccccaccccccttct
gi|4 : ATTAT--ATAT-TACACTTG----C-TAAATTCTAG-G----GGGGG-------GGGG-GG--------GGGG-G-------CC---C---CCCCCCCCCCccccctagaatttagcaagtgtaatatataatcttatttttcactggaaaaattaataaattacacacggcgcgccc
gi|5 : cggatttaaGCTTAATTAT--ATACATGTACATGTAGTCATAT-TC--AA---------GGATTTAGAGGGG-GT---C-----------------CC---A---GCCCCCCCCcttatttttcactggaaaaattaataaattacacacggcgcgccc
gi|6 : tttaaagaatcagtcatattcatag-T----GACGGATTTAGAGAGG-GG---CGTGCGGGGCG-------CA---C---GCCCCCCCCC
gi|7 : C--AG-T----GGCGGATTTAGAGGGG-GG--------GGGG-G-------CC---C---GGCCCccaccccccacccccccttaaatttcaacagatta
gi|8 : cgattgccatgtgcaagggaacaATG----CATATATT--AT-TCATAGGCGAATTTAG-TGGG-GG---C---AGGGG-G-------GTGAGC---ACCCCCCCCC
gi|9 : CATG----CATA--TC--AT-A----GGCGGATTTAGAGGAG-GT---C---TGGGG-G-------CT---C---GCCCCCACCC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): AAATATAAACGTTTACATAAGTTTACCATGCAGATGTGTTGATTTAGGTAGGGCCAGGCTTCTGCATAATCTATCGACATGACAATGACAGCTATGTAGATCAGTAATCCACCTCCTATTATTGTATTGTTGATTCGAGGACTGGACATCTTTATGTTCCTGAAAAGATAATTTGATACACTATGAAAGGTGAATTATGAACACAATGTACAATGGACCATGAAGGCCACCTGAAGTCCATTTGGAGTATTCATGTCTATCCACAGCATGAAAT
Unaligned ( gi|18 ): GGATCCAGAGGGTTGGACCCCCCCCCCCCCCCCCCC