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gi|12 : TAATG--AACTCTTTCGATATTTTCC-AT-ATGCCAGGTAATTTACACT-C------GGTTCTTACACT-C--GGGG-AC-CA-------G-------A--C---T-AA---GCA-TGA------G-----GT------------AC--GA--ATG--CTAGTGG-TTATACTTAAAGGCAAAGCGTAATGT-TTATTTG-GCGTGCCTG---G--------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCATATGCATTT-ATAGAAGCGGAGGGTGTATCAGTGGCGGATC
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Reference ( family-2778 ) : CGCTAGCATATA--------CG-------TT--A--GTGTTTTTGCA-GCTAAT------GCGCAT-GCTT-GGCGGCCATA---GT-GCGGCATTCTGGGA--GTTATAT---------ATTTTT-AATTTTCCCTA----AAAAC---GT-T--A--AA-T---C--------CAATNC-A-TTTT-ACAC---AAAAACACGATTGCTG-ATACGT----ACACTATCTTTATTCG-AGAAGTTCTGTT-AAGTAA-TCT-NACAATAACTTTTCA-GAT---AAT-G--AACTCTTTC-GATACTTTC--C-GTAA----G--CC----AGGTAATT-TA-CATTC--G------TTCTT----T-C-GT-A-CG---TCA-TG-TG--A-TA--T---AT---GC-----A-------T-----GAGGTAC-----------CGA---ATG----------CTA----GTGG-TTATACTTA--GGCAAAGCGTAATGT-TCATTTG-GCG-TGCGTGG---AAG---AGGN---C-G-G--NCANNNTCCTANCNAAGNTNGNNNNA---NTNACCNCGGGNTTNGGGAAATTCAAGTAAA-----NNGTGC-CCATGTTCA-TTTATAGGAGCGGAGGGTGTATCAGTGGCGGATCC
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gi|1 : CGCTAGCATATA--------CC-------TT--A--GTGTTTTTGCA-GCTAAT------GCGCAT-GCTT-GGCGGTCATA---GC-GCGGCATTCTTGGA--GTTGTAC---------ATCTTT-AATTTTCCCTA----AAAAC---GT-TA--AA-TC--------C-AATC--C-----ATTTT-ACAC-GAAAA---CACGATTGCTAA-TATG-------T----A-----CA-CTATCTTTATTCAAGAAGTTCTG----TT-AAGTAA-TCT-CACAATAACTTTTCA-GATAATG--AACTCTTTC-----GATACTTTCC-GTAAG--TCTGGTAATT-TACA-TTC-G------TTCTT----T-C-GTAA-C-A---TCAT-G-TG--A-TA--T---AT---GC-----A-------T------AGGTAC-----------CGA---CTG----------CTA----GTGG-TTATACTTA--GGCAAAACGTAATGT-TCATTTG-GCG-TCCGTGGN--NNNN---NNNN---N-N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNN-CATGTTCATTT-ATAGGAGCGGAGGGTGTATCAGTGGCGGATCC
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gi|2 : gcgccctcgggCGCTAGCATATA--------CC-------TT--A--GTGTTTTTGCA-GCTAAT------GCGCAT-GCTT-GGCGGCCACA---GT-GCGGCATTCTGGGA--TTTTTAT---------ATTTTTTAATTTTCCCTA----AAAAC---AT-TA--AA-TCTAATAGACC-AATA--C-----ATTTT-ACTC-AAAAA---CACGATTGCTGA-TATG-------T----A-----CA-CTATTTTTATTCAGGAA---------------------------------TTTTCA-GATAATG--AACTCTTTC-----GATACTTTCC-GTAAG--CCATGTGATT-TACA-TTC-GAATCGGTTCTT----T-C-------------CGT-A-TG--A-TA--C---ACATAGC-----A-------T-----GAGGTAC------------GA---ATG----------CTC----TTGG-TTATACTTA--GGCAAAGCGTAATGT-TCATTTG-GCG-TGCGTGG---AAGAAAAGAGCA--G-G--TCATTGTCTTATCAAAGTTAGCACAA---ATTATTTTAGAGTTTAGGAAATTCAAGTAAAG-----AGTGCC-CATGTTCATCT-ATAGGAGCGGAGGGTGTAc
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blockSeqs : . . . . T . . . . . . G A T T T . G TA . . . C T G . C . T . A . TCTTTATTCAG A G C . . T A . . C . . TA . ACATTCGG TCCGTA . . TG . . A . . ATAGAA . C . . . . . G . . . . CTGC N A T . C NNNNNNNNNNNNN AG C A GAG . . G
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blockSeqs : . . . . T . . . . . . G A . T T . A CA . . . C . A . G . C . A . TATTATCTCA A G C . . G A . . C . . TA . ACACTCGG TCCGTA . . TA . . A . . A . . . . . . . A . . . . NN C N N . N NNNNNNNNNNNNN NN N A NNN . . G
blockSeqs : . . . . T . . . . . . G C . T T . A TA . . . C . G . G . T . A . TTTCATTGGC G A A . . T A . . C . . TG . ACATTCGG TCCGAA . . TG . . A . . A . . . . . . . G . . . . NN N A T . C TTAACCACGAGT AA T N TAA . . T
blockSeqs : . . . . C . . . . . . G T . T T . A TA . . . C . A . G . C . G . TCTTTATTT A A A . . T A . . C . . TA . ACATTCGG ACACT . . TG . . T . . A . . . . . . . C . . . . C T G G . . AATAAGC CC . T AG . . G
blockSeqs : . . . . T . . . . . . T A . T T . A TA . . . C . A . G . C . A . TCTA A . C . . T A . . T . . TA . ACATTCG CCATG . . TG . . A . . A . . . . . . . G . . . . T AG . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . A C . T T . A TA . . . A . A . . . C . A . GA A . . . . T A . . T . . TA . ATATTCG TGTA . . TA . . A . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . G A . T C . A TA . . . C . A . . . . . A . GA . . . . . . A . . C . . A . CATTCG TTA . . CG . . A . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . G A . T . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . T . CATTCG GTG . . TG . . A . . A .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . G A . T . . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . TTG . . TG . . . . . A .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . C . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . .
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originalCons : CGCTAGCATATA--------CG-------TT--A--GTGTTTTTGCA-GCTAAT------GCGCAT-GCTT-GGCGGCCATA---GT-GCGGCATTCTGGGA--GTTATAT---------ATTTTT-AATTTTCCCTA----AAAAC---GT-TA--AA-TC--------C-AATA--C-----ATTTT-ACAC-AAAAA---CACGATTGCTGA-TACG-------T----A-----CA-CTATCTTTATTCGAGAAGTTCTG----TT-AAGTAA-TCT-AACAATAACTTTTCA-GATAATG--AACTCTTTC-----GATACTTTCC-GTAAG--CCAGGTAATT-TACA-TTC-G------TTCTT----T-C-GT-A-C-G---TCAT-G-TG--A-TA--T---AT---GC-----A-------T-----GAGGTAC-----------CGA---ATG----------CTA----GTGG-TTATACTTA--GGCAAAGCGTAATGT-TCATTTG-GCG-TGCGTGG---AAGAAA--N---C---GGT-CANTNTCTAATCAAAGT-TGGCACAA---NTNACCTCGAGNTTNNGGAAATTCAAGTNAA-----NGGTGC-CCATGTTCA-TTTATAGGAGCGGAGGGTGTATCAGTGGCGGATCC
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