lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 11111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 1 1 11 111 111111 4444444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111 11111111 11111111 1111 33333333333333333333333333333333 1111111111 22222222 11111111 333333333333333333333333333333333 222222222222222222222 111 111 111 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 11111 222222222222222222222 333333 11111 11111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1
lowQualScore : 000 2 2 4 00000 4 2 22 2 33 333 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 1 33 2 2 2 2 4 2 2 4 7 777 33 99 2 2 2 3 33 2 2 2 555 2 2 2 2 777777 2 0 4444444444444444444444444444444444444444444 99 6666666 22222222 2 55 444 33333 2 7 2 55 55555555 2 55555 55 4 444 0 33 2 99999999 2 666 2 888888888 33 1111 2 333 77777777777777777777777777777777 333 55 4444444444 1 2 55 2 4444 333 99999999 8888 2 4 555 2 00000000 2 22 222222222222222222222222222222222 2 555555 4 333 2 4 2 999999999999999999999 0 222 999 4 777 000 33 4 55555 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 6666 2 2 555 2 8 2 55 22 666666 2 4 7777 2 4 11111 000000000000000000000 2 555555 3 333 444 2 55 2 2 77777 22222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 66 8 2 2 2 66 55 5 33 8 5 5 33 444 2 2 5 0 2 2 5
lowQualScore : ... . . . ..... . . .. . .. ... ........................................................................................................................ ... . .. . . . . . . . . . ... .. .. . . . . .. . . . ... . . . . ...... . . ........................................... .. ....... ........ . .. ... ..... . . . .. ........ . ..... .. . ... . .. . ........ . ... . ......... .. .... . ... ................................ ... .. .......... . . .. . .... ... ........ .... . . ... . ........ . .. ................................. . ...... . ... . . . ..................... . ... ... . ... ... .. . ..... . .......................................................................................................................................................................................................................... . .... . . ... . . . .. .. ...... . . .... . . ..... ..................... . ...... . ... ... . .. . . ..... ........... ............................................................................................................... .. .. . . . . .. .. . .. . . . .. ... . . . . . . .
lowQualScore : 888 1 1 2 00000 2 1 99 1 11 333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 2 22 4 4 4 4 5 4 4 7 5 888 44 44 5 5 5 3 55 4 4 4 777 5 5 7 7 777777 7 1 5555555555555555555555555555555555555555555 33 2222222 55555555 5 88 111 22222 4 1 4 66 99999999 4 99999 66 7 111 7 22 2 99999999 2 111 2 999999999 11 4444 2 999 66666666666666666666666666666666 999 00 2222222222 7 1 88 1 5555 777 44444444 2222 0 0 555 0 00000000 0 88 444444444444444444444444444444444 0 888888 0 555 0 2 0 444444444444444444444 6 000 888 4 888 000 11 4 66666 4 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 6666 1 1 000 0 0 0 55 88 555555 1 2 4444 1 2 11111 111111111111111111111 4 999999 3 888 888 5 99 7 7 11111 77777777777 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 99 33 0 7 7 7 33 99 0 44 1 0 0 44 444 5 5 0 6 5 5 0
consensus : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TGTTC----GT-C-T--GTA-CTT--CC--CAAAAA--AA-CC----------------CAGC---G----T----A---CA-A---TT-T-ATG--T----T---GA-C--A-C--ATT-TTA-A-----------------AGTA-A---CAAGAAC--AAGTAA--TAG-A-AGT-T-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-G-A-GG--ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-ATACGTAAA-------------TNCGNNNNNCNNNNNNANCGTNNNCGNCGCTGTATA-CTC-A-C---TGGTAT--------TTT-TT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T--GT-T---G-A---------T--A----TA-T---A--------T-------AA-----G-----G--CCT---AG--C----------AGA-AAG--AC-C----AA---GA----CT--GT----T-A-AG---T-CT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCA-T-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---CA---CA--AC-C-----GT-CACC--A-TT-C-AC-------G----ACAC-------C-------------A-GAC-ACC-CAT-CTCA--G-AC-------T-------CCC-ACT-C-CCCG--TC----------TT-A--GT-CC--C--AACA-A--A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-C--C--TGC-----TGTTG-AA-A----A-T-CG----TTT-TT---------AA-------AAAA-GT------TTTTCG--ATT-C-CG-AA--TG-T-GT-----TCT--G-----T--GTTT----------T-TA---------NNNGAAANCNNGCNCCNNNNGNNCCGGCNCCCNNNNGGNNCGCNNNGCCNGNCNNNNNGNGCGNNCNNNGCCNNNTNNT----T----T--CAT--TGG-CTA-A-T-A--TTTTTCA--T-C--AGAATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
Reference ( gi|5 ) : CCGCTGTA--C-GAGA-TT-TGTTT----GT-C-T--GTA-CTT--CC--CAAAAA--AA-CC----------------CAGT---G----T----A---CA-A---TT-T-ATG--T----T---GA-C--A-C--ATT-TTA-A-----------A-----AGTA-A---CATGAAC--GAGTAA--TAG-A-AGT-T-TGAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-G-A-GG--ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-ATACGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTATG-CTC-A-C---TGGTAT--------TTT-TT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-C--GT-T---G-A---------T--A----TA-T---A--------T-------AA-----G-----G--CCT---AG--C----------AGA-AAG--AC-C----AA---GA----C---GT----T-A-AG---T-CT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCA-T-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---CA---CA--AC-C-----GT-CACT--A-TT-C-AC-------G----ACAC-------CCC-CGGG-----CACGAC-ACC-CAT-CTCA--G-AC-------T-------CCC-ACT-C-CCTG--TC----------TT-A--GT-TC--C--AACA-A--A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-C--C--TGT-----TGTTG-AA-A----A-T-CG----TTT-TT---------AA-------AAAA-GT--A---TTTCCG--ATT-C-CG-AA--TG-T-GT-----TCT--G-----T--GTTT----------T-TA---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T----T--CAT--TGG-CTA-A-T-A--TTTTTCA--T-C--AGCATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|6 : CCGCTGTGG-C-AAGA-TT-TGTTC----GT-C-T--GTA-CTT--CC------AA--AA-C----------------------------------A----A-A---TT-T-ATG--T----T---GA-C--A-CCCATT-TTT-A-----------A------GTA-C---CAAGAAC--AAGTAA--TAG-A-AGT-T-TTAA-GA-TT-CGAA---G--C--A-GTC-G-AGGG--AT--AATCTGAATTGT-C-AGG-G-CAT-GGCTTC-CGTA-AAATTT-T-ATACGTAAA
gi|3 : ttaacaatcgaggaacactaatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TGTTC----GTTC-T--GTA-CTT--CC--CAAAAC--AA-CC---------------------------------------------T-T-ATG--T----T---GA-C--A-C--ATT-TTTTA-----------A-----AGTT-A---CAAGAAC--AAGTAA--TAG-A-AGTCT-TAAA-----T-CGTA---G--CA-A-GTC-G-AGGG--ATA-AATCTGAATT-T-TATGGCA-CATGGGCTTC-CGTA-A----TAT-ATACGTAtgacatgtatatcaactggtatttttttccgcatgacttcattaacgtcaattctaaaagaactgttgatatatataggcacctagctagaaaagaaccaagactgtttaagtcttcaatcctgttttccattatatattctgaagcagtgcgcacaaccgtcactaattcacgacacctgccatctcaccgacgtttccctactccccgtcttatagtccccaacaaacacaatcatgttgatgccaacaaagcttagaaattcctgctgttgaaaatgtttttaaaaaaagtttttccgattccgaattgtctgtcagtttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcattggctaatatttttcatcaaagaattatcgttctttagcgtgactgtatagatggcagta
gi|7 : tttccatttcacagtttaacgattttaaacttgttacaatcgaggaactaatggaaCCGCTGTGGGC-GAGAATT-TGTTTC---GT-C-T---TA-CTTTTCC--CAAAA------------------------CA--------------------A-A---TT-A-ATG--T----T---GAAC--A-C--GTT-TTTTA-----------A-----AGTA-A---CAAGAGC--AAGTAA--TAGAA-AGT-T-TT-A-GA-TTCCG-A---C--A--A-GTC-G-A-GGGAATA-AATCTGAATT-T-A-T-G-G-CATGGGC-TC-CGTA-A----A-T-ATA-GTAttttgtacatggtatactcaactggtattttttcccgccacatgacttaataacgtgaattcttaagactgttgatatatatagggcttaggtcgaaagaccaagactattaagtctatcaaaacctgttcttccatttatattttagccgtgcccacaaccgtccactgaattcacgacaccatctcaacgtcttatcccaacaaaccacatcattaattgatccaacaaagctatagaatttcctgctgttgaaatcgtattttaaaaagtttttcgattcgcgaatgttgtacttcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaatatttttcattcagattatcggttcttttagccgtgactgtatagatgcagtac
gi|10 : aatcctatttcacagtttaacgatttttaacccttgtttaacaaatcgaggaaactaatggaataCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TGTTC----GT-C-T--GTA-CTT--CC--CAAAA------------------------CA--------------------A-A---TC-T-ATG--T----T---GA-C--A-C--ATT-TTA-A-----------G-----A--A-A---CA---A---GAGTAA----G-A---T-T-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTT-G-A-GG--ATA-AATCTGAATT-T-T-AGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-ATACATAAAcgtatttttacatgtaactcaacggtattttttccgcaatgaaccttaataacgtaattctaagacgttgataaattataggcttagcaaagacaagactatcaatctactcacctgtttcttccattgtatattctgaagcagtgccacaagaccgtccactaattacgaacacccatctcaacgtcttagtcccaacaaacacatcatatgatccaaaacaaagcttagaaattcctgctgttgaaatcgtttaaaaaaagtttttcgattcgaaatgtgtactttctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaattatttttttcatcagaattatcgttctttagcgggactgtataga
gi|8 : tacaatcgaggaaactaaagtaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TGTTC----GT-C-T--GTA-CTT--CC--CAAAAT--A--CC----------------CAGT---G----T----AGAACA-A---TT-T-ATG--T----T---GA-C--A-C--ATT-TTA-A------------------GTA-----CAAGAAC--AAGTAA--TAG-A-AGT-T-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-G-A-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-ATACCTAAAtacatgtatactcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagactgttgatatattaggcctagcagaaagaccaatactgttaagtctatcaacctgttcttccattatatattctgaaagcagtgccacaacggtcactaaattcaccgacccatctcagaccaattctgctgttgaaaatcgtttttaataaagtttttcgatcgaatgtgttctgtgttttataaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaacatttttcatcagaattatcgttccttagcgtgactgtatagatggcagtac
gi|2 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TGTTC----TT-C-T--GTA-CTT--CC--CCAAAA--A--CC----------------CAGT---G----T----AGGACA-A---TT-T-ATG--T----T---GA-C--A-C--ATT-TTA-A------------------GTA-----CAAGAAC--AAGTAA--TAG-A-AGT-T-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-G-A-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTT-CGTA-A----T-T-ATATGTtacatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|9 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TGTTA----GT-C-T--GAA-CTT-------AAAAAACAA-CC----------------CAGC---G----TATA-A---CA-A---TT-T-CTG--TTATAT---AA-C--A-C--ATT-TT---------------------GTGTA---CAAGAAC--AACT------------------AA-AA-TT-CG-A---G--C--C-ATC-GAA-GG--ATA-AATATGAATT-T-C-TAG-G-Ctatatatgtctctgctggtatttttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctatatagacctagcagaaagaccaagactatgaagtctatcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgttcattccataatatattctgaagcaagtgccagaacccagaggatcattcaatgttaccgacacctcatctcagacctgttattcccactaccccgctctttagttcccaaacagaacacactggttcgttatccaacaaagcttaagaacttcctttgctgctgaaaaaccattttttttaaaccgaagaaaagttttcattcccgcaattgttagaatctgtgtttattaatcaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattgttaaatattttttcatccaaaattatcgtttagcgtgactgcatagatggtagtac
gi|14 : tacaaccgaggaaactcgtacaatgaggttatggaaCTGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT----GTCC-T--GAA-CTT--CC------AA--AA-CCA---------------GAGC---G----TTAGAA---C--A---TT-T--CG--T----C---GA-C--ACC--ATT-TCA-A-----------AGTACTAGTA-A---C---AAC------AT--TAG-A-CGT-T-CTAA-GG-TT-CGAA---G--T--ACGTC-G-A-GG--ATG-AATA-AAATT-T-C-TGG-G-C-TG-----C-CGTA-A----T-T-Atgcagtaaacacatgtacatactcactggtataagtggtattttcccgcaattacttcattctcagactgatgatatatatagactgttaagtatattataacctgtatactctgaatcggtgccaacacaaccgtcaccatttcacgtcacccagacttgtttccccactccccgtcttagtcacaacaaacacatcatgtttatccaacatagctttgaattcgttctacttaaaatcgttttaagtttttcgatttcgaatgttttcggtatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcattggctaatatttcccataagaattatcgttctttagcatgacggtatagatgtat
gi|29 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagCCACTGAG--C-GAGA-TT-TGTTC----GT-C-T--GTA-CTT--CC--AAAAAA--AATCC----------------CAGC---G----TAGA-A---CA-A---TT-T-attatcctcactggtatctttaccagtagtaacatgtacttcattacgtgtgaattctctgatgttgatatgtatatgcctagttgaaaaaaaccaagactggtaagatctatcaacgttttcttccattaatactaatcttgaagcagtgccaacacaaccgtcaccatttcacgcacttcagctagacttttttcccatgcgcaggtcttatccccaacacacacatcatgtactcagcaaagcttatgaacctg
gi|28 : tacaatcaaggaaactcgtacaatgaagttatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TGTTC----GT-C-T--GTG-CTT--CC--
gi|11 : aatcccatttcacagtttaacgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaCACTGTT--C-GAGA-TT-AATTC----GT-C-T--GTA-CTT--CCAACAAAAA--AG-C-------------------GTA--G----A----A---AA-A---TC-C-CAG--T----C---GA-C--A-C--ATT-TC--------------------ATTT-A---CAAGAAC--AACTAA--TAG-G-ATT-T-CTGA-GA-TT-CA-A---G--T--C-GTC-G-AGGG--ATA-AATCTGAATT-T-C---------TAGGCTTC-TGTA-A----A-T-ACATGTAtcgacaacagtttgagcaagcaacataatcggagtcgctaaaatt
gi|23 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaagCACTGCG--C-GAGA-TT-TTGTC----GT-C-T--GTA-CTT--CT--CAAAAA-----------------------CA--------------------A-A---TT-T-ATG--T----T---GA-C--A----------------------------------------A-GAAC--AAGTAA--TAG-A-AGT-T-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-G-AGGG--ATATAATCTGAATT-T-C-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-AAATTT-T-ATACGTAAAtactcactggtattttcccgaattgtccttcgttaacgtacatttgaaggctgttgatgcatgtacaaatatccaagcaaaaagaccaagactgttaagtctatcaagctgtgcttccattatatactccgaagtcgtgccaacacaaccgtcaccatttcccgactcccagaatgttttcttattccctgtcttagtctcaagaaaatcatcatgcttatccagcaataaagcttcgaatccctgctgttaagaattgtttttaaaaaggttttcgattcagaatattttctg
gi|15 : atctcatttcacagattttaacaatttaaactgtttaacaatcgaggaaactaatggaaaCGCTGAA--CAGAGA-TT-TTCTTCAAGGT-CAT--TTAACTT--CA--CAAAA-------T----------------CATC---A----T----T---CATA---CT-T-ATG--T----G---GA-C--A-C--ATT-TTA-ATTAGTAAGTCAA-----AGTA-AGTACAAAAAGTAGAATAA--AAG-ATAGT-T-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTCTG-AGGG--ATA-AATCTGAATT-T-CATGG-GCCATGGGCTTCGCGTA-A----TAT-A-ACGTA---------------TTTTATACATTGTTATATCTTCTCTCACGTTG---G-CTC----------TATAG------TTT-CT-C---CCTCATG-CTA-A--T-----G--AGATTC-----A--TTA-AC---A-GAATT--CT-A--------T--GTAT---G-A---------C--A----TA-CTGAA--------TTTTCATGAA-----GAAGTAG--CCT---AG--C----------ATATAAG--AC-CTTATAG---AA----C---GTTATAT-A-AGGATT-CTTA------A-TC--ACGTAACTA-------------------------T-CT------G-TTTCT-T-TTCCT-TC------AACTAT--------AAATTTTGAAtatatg
gi|20 : cccatttctagcagttaacgatttataacttggtttacaatcgaggaaacactatggaatacgCGCCGTG--T-AAGA-TT-TGTTC----GT-C-TTGATT-CCC--CC--CAAAAA--AA-ACAAAAACAAAAAAAAAACAGC---G----T----A---GA-AGAATT-T-TTG--T----T---GA----A----ATT-TCA--------------------GTA-----CA-GAAC-----TA---TGG-A-AGT-T-CTAA-GA-TTGCG-A---G--T--C-GTC-G-A-GGGGATA-GATCAGA-TT-T-T-TGG-G--AT----TTC-CGTA-A------T-ACATGTA
gi|27 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccgGCTGTG--C-GAGA-TT-TGATC----AT-C-T--GTA-CTT--CC--CAAAAA--AA----------------------T---A----T--------CA-T---TT-C-ATG--T--------------------------------------------------A---CAAGAAC--AACTAAATCAG-A-AGT-T-TTAA-GA-TT-Ctattactgcactgtatctttgggaacaatgataatgataagacttagttactatatcagctgcagaaactccggatgttagtctatcactgttttctcatt
gi|30 : tacgactttgaatttgtttacaatcgaggaaactcgcgcaatgaagttatggaacaGCTGTG--C-GAGA-TT-TGACC----GT-C-T--GTA-CTta
gi|26 : atttacgacttgaattttgttaaatcggaggaactcgcacaatgaagtttgggaaacaCTATG--C-GAGA-TT-TGTTT----GT-C-T--GAA-CTT---A--AAAAAA--AA-CC----------------CAGCGAAG----A----A---CA-A---TT-TCATG--------------C--A-C--A-----A-------------------------------GAAC--AACTAA--TAG-A-AGT-T-CTAA-GA-TT-TG-A---G--C--C-GTC-G-A-G
gi|1 : atcccattttacattttatggctttgaactttttacagccagcgtttacaatcgaggaaaatctGTG--C-GAGA-TTGTGCTC----GT-C-T--GTA-CTT--CT--CCAAAA--AC-CA----------------CAGT---GAGAAT----A----G-A---TT-T-ATGTCT----C---GA----A-C--AAT-TTT-A-----------A-----AGT--A---CAGAAGC--AAGT-A--TAG-A-AGT-TATTAA-GA-TT-CG-AGAGG--CGGA-GTC-G-AGGG--ATA-A--TTGATTT-G-CATGG-C-AATGGGCTTC-CGTATA----T-T-A---ATAAA--------------GCGTATATCACAATAAATGTAAACGTCACTGTAT--CT-------------T--------CTT-TC-C---C-----GAC-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTTGATTACTT-AAGA---C-TA-GT-T---GTA---------G--G----TA-T---A--------T--------A-----G-----G--CCT---AG--C----------A-A-AAG--AC-C----AC---GC----CTG-GTA---T-A-AG---T-CTAACCCATGA-TC--A-------A-------------------------CACT------GTT---T-C-TT--A-A-------AA-TATACCATTTAATATTCTGAAGGCAAGATG-----CA---C---AC-C-----GT-CACTCCA-TTGC-AC-------G----ACA----------------------ACAA------CAT-CTCA--GAAC-------TGTGTTTGCCT-ACT-C-CCCG--TC-----------T-A--GT-CC--C--GACA-ACCA--------CA-------------CTCATGTTGATG----C---------------C-------AACC----------A-A----GTCT-TAA-G-AA-TT-C--C--TGC-----TGTTG-AA-A----A-T-CA----CGT-T--------------------AAA-CT--ATAGTTTGTG---TT-T-CT-AC--TG-T-TT-----TTT--A-----N--NNNN----------N-NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTAT----T----CTGCATGATGGGCTA-A-TAA--TTTTTCA--T-C--AGAATGATC-GTTC-T--TTTTAAG---GTGCACTG-TATTAGAGTGGCAGag
gi|4 : atctcactttcacagtttaacgatttatttaaacttgtttacagtcgaggaaaacgtaatggaactggctga--C-GAGA-TTGTGCTC----GT-C-T--GTA-CTT--CC--CAAAAA--A--CC----------------CAGT---G----AGA--A---TA-A---TT-T-ATG--T----TCTCGA----A-C--ATTGTTA-A------------------GTA-----CA-GAA---AAGTA---TAG-A-AGT-T-TTAA-GAGTT-CG-A---GAGCGGA-GTC-G-A-GGG-ATA-AAT-TGGATT-TGC-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-ATACGTAA
gi|13 : aatctcatttcacagtttaacgatttataacttgttacagtccgaggaaacgtaatggaacgctcgagg----A---CA-A---TTGT-CTG--T----T---GA-TCGA-C--CTT-TCA-T------------------GTA-----CAAGA-C--AACTAA--TAG-A-AGT-T-TTAATGA-TT-CG-AGG-G--T--A-ATA-G---GG--ATA-AATCTGGGCT-T-C-tataatgtaactcatggttttttttccgcaagtgattcattaacgtgaattctaagactgttgatagtatataggctagcaaaaaaccaacgcctggtataagttatcaacctgttctttccatttatattctgaagcagtgcaacaccgtcactaattcacgacaccatctcagactgtttcctactcccgtctagtcccacaacaactcatgttgatccaaccaagttaagaattcctgcgttgaaaatgtttaaagcaagtttgtggttctatgtttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtattctcatatggctatatatttttcatacagatgatcagttcttttagcgtgcatgtatagagtggca
gi|12 : ag-GG--ATA-AATCTGAATT-T-C---------TGGGCTTC-CGTA-A--------ATACcacgaatgtatactctctggtattttcccgcaattacatcattaagtgaattctaagactattaatatataaaggcctagcagaaagatcaagactattaaatctaccaaccttttcttccataattatactctgtagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcaccaagattgttttcccactccccgtcttaatcccacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttcgaatccctgctattgaaaatcgttaaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|22 : gag-GG--ATA-A-TCTGAATT-T-C---------TGGGCTTC-CGCG-A----T-TCATACaagcacttgctgatgttttcccgcaattacatgcacttcattaacgtgacttctaagactgttggtattctataggacttgtagaaagatcaagactgttaagtctatcaacctgttcttccataatatactctgaagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcacgacacccagacttttatcccactccccgtctagacgcgtattagtatctacaaacatatcatgtttatccgacaaagcttcgaattcctgttgttgaaaatcgttcaagtttctctattccgaatgttttttgcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcgttggctaatatttttcataagaattatcgttctttagcgtaacagtataggtggcagca
gi|6 : gatTGTATA-TCA-A-C---TGGTAT--------TTT-TTTC---C-----G-C-A----T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTCAATT--CT-AAAAGAAC-T--GT-T---G-A---------T--A----TA-T---A--------T-------AG-----GC----A--CCT---AG--CT---------AGA-AAAGAAC-C----AA---GA----CT--GT----TTA-AG---T-CT----------TC--A-------AT------------------------C-CT------G-T---T---TTCCA-T----------TAT--------ATATTCTGAA-GC-AG-TG-CG--CA---CA--AC-C-----GT-CACT--AATT-C-AC-------G----ACAC-------CT--------------G-----C-CAT-CTCACCG-ACGTT----T-------CCCTACT-C-CCCG--TC----------TT-ATAGT-CC--CC-AACA-A--A--------CA-------------CAATCAT----G----TTGATGCCAA------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AAATT-C--C--TGC-----TGTTG-AA-A----A-T--G----TTT-TT---------AA-------AAAAAGT--T---TTTCCG--ATT-C-CG-AA--T--T-G------TCT--G-----TCAGTTT----------T-TA----------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----T----T--CAT--TGG-CTA-A-T-A--TTTTTCA--T-CAAAGAATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAtcactagtttttcccccgcaattacatcattaatgtaaattctaagactgttgataaacgtatataggcctagcagaaagatcaagactgttaaatctatccacctcttcttccataattatagtctgaagcggtgccaacacaactgacaccatttcacgacgaaacccagactattttcttactcccgtcttagtcccaacaaacacattgtgtttatccaacaaagcgt
gi|7 : ttaacaatcgaggaacactaatggaaccgctgtggcaagatttgttcgtctgtacttccaaaacaaatttatgttgacacccatttttaagtaccaagaacaagtaatagaagttttaagattcgaagcagtcgagggataatctgaattgtcagggcatggcttccgtaaaattttatacgtaaatgacaTGTA-A-CTC-A-A---CGGTAT--------TTT-TT-C---C-----G-C-A-A--T-----GA-A-CCTT-----A--ATA-AC---GT-AATT--CT-AAGA-----C--GT-T---G-A---------T--A----AATT---A--------T--------A-----G-----G--CTT---AG--C------------A-AAG--A--C----AA---GA----C---TA----T-C-AA---T-CT--------A-CT--C-------A-------------------------C-CT------GTT---T-C-TTCCA-T----------TGT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---CA---CAAGAC-C-----GTCCACT--A-AT-T-AC-------G----A---------------------------AC-ACC-CAT-CTCA----AC----------------------------G--TC----------TT-A--GT-CC--C--AACA-A--A--------CA-------------C----------A----TCATATGATCCAAAA-C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-GAAA-TT-C--C--TGC-----TGTTG--A-A----A-T-CG-----TT-TA---------AA-------AAAA-GT------TTTTCG--ATT-C-GA-AA--TG-T-GT-----AC-------------TTT----------C-TA-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T----T--CAT--TGG-CTA-ATT-ATTTTTTTCA--T-C--AGAATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-GGG-ACTG-TA-TAGA-
gi|10 : aatcctatttcacagtttaacgatttttaacccttgtttaacaaatcgaggaaactaatggaataccgctgtgggcgagaatttgtttcgtcttacttttcccaaaacaaattaatgttgaacacgttttttaaagtaacaagagcaagtaatagaaagttttagattccgacaagtcgagggaataaatctgaatttatggcatgggctccgtaaatatagtacgtatttttacaTGTATA-CTC-A-C---TGGTAT--------TTT-TT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T--GT-T---G-A---------T--A----TA-T------------T--------A-----G-----G--CCT---AG--C----------AGA-AAG--AC-C----AA---TA----CT--GT----T-A-AG---T-CT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCA-T----------TAT--------ATATTCTGAAAGC-A-GTG-C---CA---CA--AC-G-----GT-CACTAAA-TT-C-A--------------------------C-CG--------------ACC-CAT-CTCA--G-AC-------
gi|4 : tacaatcgaggaaactaaagtaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaacaaatctatgttgacacattttaagaaacaagagtaagattttaagattcgagcagttgaggataaatctgaattttagggcatgggcttctgtaattatacataaatacaTGTA-A-CTC-A-----TGGTTT--------TTT-TT-C---C-----G-C-A-AG-T-----G--A--TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T--GT-T---G-A---------T--AG---TA-T---A--------T-------AG-----G---------CT---AG--C----------A-A-AAA--AC-C----AA---CG----CCTGGTA---T-A-AG---T--T--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-CTTTCCA-T----------T-T--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---AA---C---AC-C-----GT-CACTA-A-TT-C-AC-------G----ACA------------------------------C-CAT-CTCA--G-ACTGTT---T-------CCT-ACT-C-CC-G--TC-----------T-A--GT-CCCAC--AACA-A--CT-------CA-------------T----------G----TTGATC----------C-------AACC----------A-A----G-TT-A-A-G-AA-TT-C--C--TG------CGTTG-AA-A----A-T--G----TTT----------------------AAA-GC--A--------A--GTT----------TG-TGGT-----TCT--A-----T--GTTT----------T-TA---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTA----TTC--T--CATA-TGG-CTATA-T-A--TTTTTCA--TAC--AG-ATGATCAGTTCTT--TT---AG-C-GTG-CATG-TA-TAGAGTGGCAcaattctgctgttgaaaatcgtttttaataaagtttttcgatcgaatgtgttctgtgttttataaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaacatttttcatcagaattatcgttccttagcgtgactgtatagatggcagtac
gi|8 : aatctcatttcacagtttaacgatttataacttgttacagtccgaggaaacgtaatggaacgctcgaggcgagattgtgctcgtctgtacttcccaaaaaacccagtgagaataatttatgttctcgaacattgttaagtacagaaaagtatagaagttttaagagttcgagagcggagtcgagggataaattggatttgcatggcatgggcttccgtaattatacgtaatataaTGTATA-CTC-A-C---TTGTAT--------TGT-TT-C---C-----G-CAA-A--T-----GTTA-TGTCGATGGA--TTAGATTTGGTGAATC--TT-AAGA---CTT--GT-TCAAA-A---------T--A-----A-T---A--------T-------AATAAATA-----T--CCTGGAAG--CAAGCAGATCTAGA-AAGTAGCTC----AA---GA--------GT----G-AGAG---TCCT--------A-TC--A-------AG------------------------C-CT------G-T---T-
gi|2 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaatacaTATATGTCTCTG-C---TGGTAT--------TTTTTT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT----------------------A---------T--A----T------------------------A-----G-----A--CCT---AG--C----------AGA-AAG--AC-C----AA---GA----CT--AT----G-A-AG---T-CT--------A-TC--A-------AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CT------G-T---T-CATTCCA-T-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-AAGTG-C---CA---GA--AC-CCAGAGG---ATC--A-TT-CAAT-------G----TTAC----------------------CGAC-ACCTCAT-CTCA--G-ACCTGTTATT-------CCC-ACTAC-CCCGC-TCT---------TT-A--GT-TC--CCAAACAGA--A--------CA-------------CACTG------G----TTCGTTATCCAA----C-------A-------------A-A----G-CT-TAA-G-AACTT-C--CTTTGC-----TGCTG-AA-AAACCA-T-TT----TTT-TT---------AAACCGAAGAAAA-GT------TTTC----ATTCC-CGCAA--T--T-GTTAGAATCT--G-----T--GTTTATTAATCAACT-NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T----T--CAT--TGT-TAA-A-T-AT-TTTTTCA--TCC--AAAATTATC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTAgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|13 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcttctgtacttccccaaaaacccagtgtaggacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggctttcgtaattatatgttaTGTATA-CTC-T-C---TGGTAT--------TTT-C--C---C-----G-C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-A----GTGAATT--CT-AAGA---C-T--AT-T---A-A---------T--A----TA-T---A----------------AA-----G-----G--CCT---AG--C----------AGA-AAG--AT-C----AA---GA----CT--AT----T-A-AA---T-CT--------A-CC--A-------A-------------------------C-CT------T-T---T-C-TTCCA-T-------AA-T-T--------ATACTCTG-TAGC--GGTG-CCAACA---CA--AC-C-----GT-CACC--A-TT-T----------------CAC--------------------CAAGA----T-TGT-TT---------------T-------CCC-ACT-C-CCCG--TC----------TT-A--AT-CC--C---ACA-A--A--------CA-------------C----------A----TCATGTTTATCCAA--C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-C--C--TGC-----TATTG-AA-A----A-T-CG----TTc
gi|11 : agacaattgtctgttgatcgacctttcatgtacaagacaactaatagaagttttaatgattcgagggtaatagggataaatctgggcttccacgaaTGTATA-CTC-A-C---TGGTA---------TTT-TC-C---C-----G-A-A-T--T-----GT-C-CTTC-----G--TTA-AC---GTACATT--TG-AAGG---C-T--GT-T---G-A---------TGCA----TG-T---A--------C-------AAAT---A-----T--CCA---AG--C----------AAA-AAG--AC-C----AA---GA----CT--GT----T-A-AG---T-CT--------A-TC--A-------A-------------------------G-CT------G-T---G-C-TTCCA-T----------TAT--------ATACTCCGAAGTC---GTG-CCAACA---CA--AC-C-----GT-CACC--ATTT-C-CC-------G----ACTC-------CC----AG-----AATG---------T-TT---------------T-------CTT-ATT-C-CCTG--TC----------TT-A--GT-CT--C--AAGA-A--AATCAT---CA-------------T----------GCTTAT---------------CCAGCAATA-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-C--C--TGC-----TGTTA-AG-A----A-T-TG----TTT-TT---------AA-------AAAG-G-------TTTTCG--ATT-C-AG-AA--TA-T-TT-----TCT--G-----aaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|3 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaagcactgttcgagattaattcgtctgtacttccaacaaaaaagcgtagaaaaatcccagtcgacacatttcatttacaagaacaactaataggatttctgagattcaagtcgtcgagggataaatctgaatttctaggcttctgtaaatacaGTATA-CTC-AAC---TGGTAT--------TTT-TT-C---CC----G-CCACA--T-----G--A-CTTA-----A--T-A-AC---GTGAATT--CTTAAGA---C-T--GT-T---G-A---------T--A----TA-T---A--------T-------AG-----G-----G--CTT---AGGTC-----------GA-AAG--AC-C----AA---GA----CT--AT----T-A-AG---T-CT--------A-TCAAA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCA-T----------T-T--------ATATTTT---AGC--CGTGCC---CA---CA--AC-C-----GTCCACTGAA-TT-C-AC-------G----ACA------------------------------C-CAT-CTCA----AC----------------------------G--TC----------TT-A---T-CC--C--AACA-A--AC-------CA-------------C----------A----TCATTAATTGATCCAAC-------A-------------A-A----G-CTAT-A-G-AATTT-C--C--TGC-----TGTTG--A-A----A-T-CG----TAT-TT---------TA-------AAAA-GT------TTTTCG--ATT-CGCG-AA--TGTT-GT-----ACT--------T---CTT----------N-NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T----T--CAT--TGG-CTA-A-T-A--TTTTTCAT-T-C--AG-ATTATCGGTTCTT--TT---AGCC-GTG-ACTG-TA-TAGA-T-GCAGTA
gi|14 : tttccatttcacagtttaacgattttaaacttgttacaatcgaggaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgttctgtacttcccaaaacaaccttatgttgacacattttttaaagttacaagaacaagtaatagaagtcttaaatcgtagcaagtcgagggataaatctgaattttatggcacatgggcttccgtaatatatacgtattttgtacatgTATC-CTC-A-C---TGGTAT--------CTT-TA-C---CAGTA-G-T-A-ACAT-----GT-A-CTTC-----A--TTACGT---GTGAATT--CT-CTGA---T----GT-T---G-A---------T--A----TG-T---A--------T-------A------T-----G--CCT---AG--TTG--------AAA-AAA--AC-C----AA---GA----CT--GG----T-A-AGA--T-CT--------A-TC--A-------A-------------------------C-GT------T-T---T-C-TTCCATT-------AA-TAC---------TAATCTTGAAGC-A-GTG-CCAACA---CA--AC-C-----GT-CACC--ATTT-C-AC-------G-----CAC-------TTC---AG-----CTAGAC-------T-TTT------T-------T-------CCC-ATG-CGCAGG--TC----------TT-A--TC-CC--C--AACA-C--A--------CA-------------C----------A----TCATGTACTCAG----C-------A-------------A-A----G-CT-T-ATG-AA----C--C--TGc
gi|22 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagctgctgtgcgagatttgttgtcctgaacttccaaaaccagagcgttagaacatttcgtcgacaccatttcaaagtactagtaacaacattagacgttctaaggttcgaagtacgtcgaggatgaataaaatttctgggctgccgtaattaatATA-CTC-A-C---TAGTTT--------TTC-CC-C---C-----G-C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-AT---GTAAATT--CT-AAGA---C-T--GT-T---G-A---------T--AAACGTA-T---A--------T-------A------G-----G--CCT---AG--C----------AGA-AAG--AT-C----AA---GA----CT--GT----T-A-AA---T-CT--------A-TC--C-------A-------------------------C-CT------C-T---T-C-TTCCA-T-------AA-T-T--------ATAGTCTGAA-GC--GGTG-C---CAACACA--AC-T-----GA-CACC--A-TTTC-AC-------G----AC-------------------------GAA-ACC-CA--------G-AC-------TATTTT--CTT-ACT-C-CC-G--TC----------TT-A--GT-CC--C--AACA-A--A--------CA-------------C----------A----T---------------
gi|9 : gatggataatctgaatttctgggcttccgcgattcATA-CTC-A-C---TGGTATAAGTGGTATTT-TC-C---C-----G-C-A-A--T-----T--A-CTTC-----A--TT----------------CT-CAGA---C-T--GA-T---G-A---------T--A----TA-T---A--------T-------A------------------------------------------G--AC-T-------------------GT----T-A-AG---T-AT--------A-TT--ATA-----A-------------------------C-CT------G-T-----------------------------------ATACTCTGAA--T-CGGTG-C---CAACACA--AC-C-----GT-CACC--A-TTTC-AC-------G----TCAC-------CC---------------AG-ACT-TGT-TTC----------------------CCC-ACT-C-CCCG--TC----------TT-A--GT-CA--C--AACA-A--A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-ATA----G-CT-T-T-G-AA-TT-C--G--TTC-----TACTT-AA-A----A-T-CG----TTT-T---------------------AA-GT------TTTTCG--ATT-T-CG-AA--TG-T-TT-----TCG--G-----T--ATAT----------T-NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNCT--CAT--TGG-CTA-A-T-A--TTTCCCA--T-A--AGAATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-ATG-ACGG-TA-TAGA-TGtgtgtttatccaacaaagcgt
gi|12 : tacaaccgaggaaactcgtacaatgaggttatggaaccgctgtgcgagatttgttagtctgaacttaaaaaacaacccagcgtataacaatttctgttatataacacattttgtgtacaagaacaactaaaattcgagccatcgaaggataaatatgaatttctaggctgcagtaaacacatgtac-CTT-G-C---TGATGT--------TTT-C--C---C-----G-C-A-A--TTACATGC-A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGACTT--CT-AAGA---C-T--GT-T---G-G---------T--AT---TC-T---A--------T-------AG-----G-----A--CTT----G--T----------AGA-AAG--AT-C----AA---GA----CT--GT----T-A-AG---T-CT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCA-T-------A---AT--------ATACTCTG-AAGC--GGTG-CCAACA---CA--AC-C-----GT-CACC--ATTT-C-AC-------G----ACAC-------C------------CA-GAC-------T-TTTA-------------T-------CCC-ACT-C-CCCG--TCTAGACGCGTATT-A--GT-AT--C--TACA-A--A--------CATATCATGTTTATCC----------G----A---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TT-C--C--TGT-----TGTTG-AA-A----A-T-CG----TTC-----------------------AA-GT------TTCTCT--ATT-C-CG-AA--TG-T-TT-----TTT--GCATANN--NNNN----------N-NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----C----T--CGT--TGG-CTA-A-T-A--TTTTTCA--T-A--AGAATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-GTA-ACAG-TA-TAGG-TGGCAGCAtat
gi|21 : gagggataaatctgaatttctgggcttccgtaaatacaagca-CTC-A-CATCTAGTAT--------TTT-CC-CACCC-----G-C-A-A--T-----T--A-CTTC-----AA-TTA-AC---GTTAATT--CT-AAGA---C-TG-GT-T---G-AATAATTACGT--A----TA-T---ATGT-----T-------AA-----G-----A--CCT---AGA-C----------AGT-AAT--A--C----GA---GAGCAGC---G-----T-A-AA---T-CT--------ACCC--A-------G-------------------------G-CT------G-T---TAT-TTTCG-TCGCAAAAAA-T-T--------ATAGTCTGAAGGG-CGGTG-C---TA---AA--ACAC-----AA-AAAA--A-TT-C-ATCTGTAAAG----AAAC-------CCCAC--------CA-GACTATT-TTT-CTCT--A-AC-------T-------CCT-G-G-C-CCCG--TC----------TT-A--GT-CC--A--AACA-A--A--------CA-------------C----------A----T---------------
gi|16 : a-C---C-----G-C-A-T--T-----T--A-CTAC-----AGATTG-CC----TGAATT--CT-AAAA---A-CTTGT-T---G-T---------T--A----AA-T---AATACAAGTT-------AA-----A-----GGTCCT---A--------------AGC-AAA--AC-C----AA---GAAC--T---GT----T-ACAG---T-TT--------G-TC--A-------AGTATT--------------------C-GTCAAGACG-T---T-C-TTCCA-T-------AA-TAT--------ACTTACTGAA-GC--GGTGAC---CAA--CA--AC-------GT--AC---A-GT-G-AT-------A----A-AT-------CGA-CGAA-----CAGGACTGTT-TATTCTTA----------------------CC-ACTTC-CCCAATTC----------TT-A--TTCTC--C--CACA-A--A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGCTCTTATCC--A-ACACGG-CT-T-C-G-AA-TT-C--C--TGC-----TGTTG-AA-AAC--A-T-CG----GTT----------------------AAG-AT--G---TTTCttgtgtgtatccaaacaacagg
gi|20 : T-AAGA---C-----T-TA--G-T---------T--AC---TA-T---A--------T-------CA-----G---------CT----G--C----------AGA-AAC--TC-C----G----GA----T---GT----T-A--G---T-CT--------A-TC--A-----------------------------------CT------G-T---T-T-TCTCA-T-------gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcactgtgcacttaataattatcaatcagaattagtcatgctttagccgacagcgtagatcagcac
gi|32 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccgcgccgtgtaagatttgttcgtcttgattccccccaaaaaaaacaaaaacaaaaaaaaaacagcgtagaagaatttttgttgaaatttcagtacagaactatggaagttctaagattgcgagtcgtcgaggggatagatcagatttttgggatttccgtaatacatgtatattactgcactgtatctttgggaacaatgataatgaG--C----------AAA-GAA--AC-C----CACCCAA----T---GT----T-A---------T--------G-TT--A-------A-------------------------A-CT------T-T---T-C-TTCCA-T-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---CA---GA--AC-C-----GT-Ct
gi|17 : ----T-A-AG---T-AT--------A-TC--A-------A-------------------------C--T------G-T---T-C-TCCCA-T-------AA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-C---CA---AC--ACAC-----GT-CACT--AATT-C-AC--------------------------------------CGAC-ACC-CAT-CTCA--G-GT-------TGTTTT--CCC-ACT-C-CC-G--TC----------TTTA--GT-CC--C--AACA-A--A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-C--C--TGC-----TGTTG-AA-A----A-T-CG-----TT-TT---------AA-------AAAA-GT------TTTTCG--GTT---TG-AA--TG-T-GT-----CCT--G-----T--GTTT----------T-TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T----T--CAT--TGG-CTA-A-T-A--TTTTTCA--T-C--AGAATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGCA
gi|18 : tctagaaaagttcaataaagttttcacagggttgTCCA-T-------GA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-A---CA---CA--AC-C-----GT-CACT--AATT-C-CC-------GTCTCAGACTCTTATTCCC-CGTCTAATTCACAAC-ACC-CAT-CTCA--G-AC-------TGTTTT--CCT-ACT-C-CCCG--TC----------TT-A--GT-CC--C--AACA-A--A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AATTT-C--C--TGA-----TGTTGAAA-A----A-T-CG-----TT-TT---------AA-------AAAA-GT------TTTTCG--TTT-C-CG-AA--TG-T-GT-----TCT--G-----T--GTTT----------T-TATAACTNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T----T--CAT--TGGCCTA-A-T-A--TTTTTCA--T-C--AGAATTATC-GTTC-T--TT---AG-CAGTG-ACTG-TA-TATA-TGGCAc
gi|25 : -------CCC-ACT-C-CCCG--TC----------TT-A--GT-CC--C--AACA-A--AACACATCACA-------------T----------G----TTTATCCAA-------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-C--C--TGC-----TGCTG-AA-A----A-T-CA----TTT-TTTTTTAAAAAGA-------AAAA-GT------TTTCC---ATT-C-CG-AA--TG-T-GTTAA--TCT--G-----T--GTTT----------T-TA---------agt
gi|19 : ccatttttcgactcatgatttcttacaaatcttggC-ATT-T-CATG--TT----------TG-A--AT--C--C--AAC-------------------------------------------------------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TTTC--C--TGC-----TGGTG-AA-A----AAT-CGGCTTTTTGTT---------AA-------AAAA-GG--T---TTTTCGGGATT-C-CG-AAGTTG-T-GTACT--TCTTAA-----TCAATTC----------T-GA---------TTAGAAATCAAGCTCCTTTTGATCCGGCTCCCATTAGGATCGCTTTGCCTGACTTATAGAGCGTACATAGCCAGTTATT----T----C--CAT--TGGGCTA---T-A--TTTTCCAACT-C--ACAATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-GTGAACTGTTA-TAG--TGGCAGT
gi|31 : ccgtccaactaattcgtgaccacccatctccaaggactgttttcctaactcaacggtcctttaaggtcccaacaaccaaCCG--TC----------TT-A--AT-CC--C--A-CA-A--A--------TA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-A-AC---G-CT-T-C-G-AA-TT-C--C--TAC-----TATTG-AA-A----A-T-CG----T
gi|8 : -------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-TTGC--TCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCGTT--TTT-TT---------AA-------ATAG-GTTCT---TTTTCT--ATT-C-CG-AA--Taaaatttttcttcta
gi|24 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaatacatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaat-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-TTGC--TCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCGTT--TTT-TT---------AA-------ATAG-GTTCT---TTTTCT--ATT-C-CG-AAT-TG-T-Gtg
gi|10 : -AA-TT-C-----TGC-----TGTTG-AA-A----A-T-CG----TTT-TT---------AA-------TAAA-GT------TTTTCG--AT----CG-AA--TG-T-GT-----TCT--G-----T--GTTT----------TATA---------AACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----T--CAT--TGG-CTA-A-C-A--TTTTTCA--T-C--AGAATTATC-GTTC-C--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAagaatgactatcaatatgattaggaatcagctaattattgatccgctctgacttagatcggcgtgcggggggagagatggaaagccgttagttcaattgggctaga
gi|34 : tacaatcgaggaaactaaagtaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaacaaatctatgttgacacattttaagaaacaagagtaagattttaagattcgagcagttgaggataaatctgaattttagggcatgggcttctgtaattatacataaatacatgtatactcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagactgttgatatattaggcctagcagaaagaccaatactgttaagtctatcaacctgttcttccattatatattctgaaagcagtgccacaacggtcactaaattcaccgacccatctcagacc----T--CAT--TGG-TTA-A-T-A--TTTTTCA--T-C--AAAATTATC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTAc
gi|33 : --CAT--TGG-CTA-T-T-G--TTTT-CA--T-C--TAAATTATC-GTTC-TCTTT---AG-A-GTG-ACAG-TG-TAGA-TGGCAGCAc
gi|35 : AT--TGG-CTA-A-T-A--TTTTTCA--T-C--AAAATTATC-GTTC-T--TT---AG-G-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAG
gi|13 : TTTCC--T-C--AGAATTATC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-AA-TAGA-TGGCGGCAc
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): TAGAATAATTTTTGCTGACACATTTCATGTACAGGAACAACTAATA
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555555 11111111 33333333333333333333 11 11 111111 000000000000000000000000000000000000000000000 111111111111 11 11111 11111111 1111 2222222222222222222222222222 1111 11111111 333333333333333333333333333333333 222222222222 1 1111 111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 2222222222222222222222 11111 11111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
lowQualScore : 44 2 2 4 2 2 333 4 2 22 2 22 11 8888888888888888888888888888888888888888 2 777 2 33 00000000 6666 2 22 44444444444444444444 333 3 44444 2 4444 2 2 2 2 2 4 999 33 7777 2 2 55 99 2 2 2 22 444 1 2 2 444444 2 2 1 000000000000000000000000000000000000000000000 2 0 333 000000000000 33 00 333 11111 6666 6 2 55 33333333 2 55555555 4 333 22 2 666 2 4 2 333 888888888 22 0000 333 7777777777777777777777777777 55 55 1 2 33 22 2 2 2 4 0000 2 2 555 00000000 2 22 000000000000000000000000000000000 2 555555 4 333 2 4 777777777777 77777777 0 2 3 6666 2 666 4 777 22 777 2 6666666 2 99999 22 7777 4 4 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 2 2 2 2 66 3333333333 2 55 2 22 44 2 77777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 77777777 6666 2 2 444 1 7 1 22 44444444 2 4 7777 2 4 444 5555555555555555555555 2 2 777 2 555 2 2 2 55 2 444 00000 00000000000 2 2 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 2 2 2 2 2 55 2 55 4 33 2 4 4 33 333 2 2 4 1 2 2 4
lowQualScore : .. . . . . . ... . . .. . .. .. ........................................ . ... . .. ........ .... . .. .................... ... . ..... . .... . . . . . . ... .. .... . . .. .. . . . .. ... . . . ...... . . . ............................................. . . ... ............ .. .. ... ..... .... . . .. ........ . ........ . ... .. . ... . . . ... ......... .. .... ... ............................ .. .. . . .. .. . . . . .... . . ... ........ . .. ................................. . ...... . ... . . ............ ........ . . . .... . ... . ... .. ... . ....... . ..... .. .... . . ..................................................................................... . . . . . .. .......... . .. . .. .. . ..... ............................................................................. ........ .... . . ... . . . .. ........ . . .... . . ... ...................... . . ... . ... . . . .. . ... ..... ........... . . ............................................................................................................. . . . . . . .. . .. . .. . . . .. ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 0 0 0 0 0 555 0 0 88 0 99 66 0000000000000000000000000000000000000000 0 000 0 44 33333333 4444 1 99 99999999999999999999 777 2 66666 2 7777 2 2 2 2 2 7 777 22 8888 4 4 55 77 2 2 2 44 555 0 4 4 555555 4 5 8 333333333333333333333333333333333333333333333 9 1 999 111111111111 11 99 777 88888 6666 3 1 00 22222222 1 99999999 2 777 99 1 666 1 2 1 777 444444444 99 8888 777 6666666666666666666666666666 33 33 5 2 11 88 0 0 0 0 2222 0 0 555 00000000 0 88 555555555555555555555555555555555 0 888888 0 555 0 0 444444444444 22222222 1 5 7 5555 1 888 2 444 99 555 0 5555555 0 88888 99 1111 2 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 1 1 1 88 5555555555 0 55 0 88 88 0 88888 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222 2222 0 0 333 9 6 9 66 55555555 0 0 0000 0 0 888 3333333333333333333333 0 0 000 0 999 1 1 1 00 4 111 66666 00000000000 7 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 4 4 4 4 66 2 33 4 11 2 4 4 11 999 2 2 4 0 2 2 4
consensus : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAA--AA-CC----------------CAGCG----T----ACA-A---TT-T-ATGT----T---GA-C--A-C--ATTTT--AA--A-GTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAGAA-G----TT-TTAA-GA-TT-C-G-A---G--C--A-GTC-G-AG-GG--ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-ACGTAAATNCGTA----------A-CGTANACGTCAC-------------T-GTATA---CT----C-A-C---TGGTAT--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-T--CA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA--TG-TG---T-----TCT--G-----T--GTTT-T-TA---------NNCGA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
Reference ( family-2759 ) : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAA--AA-CC----------------CAGCG----T----ACA-A---TT-T-ATGT----T---GA-C--A-C--ATTTT--AA--A-GTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAGAA-G----TT-TTAA-GA-TT-C-G-A---G--C--A-GTC-G-A--GG--ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-ACGTAAATNCGNNNNNCNNNNNNANCGTNNNCGNCGC-------------T-GTATA---CT----C-A-C---TGGTAT--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-T--CA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA--TG-TG---T-----TCT--G-----T--GTTT-T-TA---------NNNGA---------AANCNNGCNCCNNNNGNNCCGGCNCCCNNNNGGNNCGCNNNGCCNGNCNNNNNGNGCGNNCNNNGCC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|1 : GTG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCCAAAA--AC-CA----------------CAGTGAGAAT----A-G-A---TT-T-ATGT----CTCGAA-C--A----ATTTT--AA--A-GT--A-------CAGA---AGCAAGT---A--TAGAA-G----TTATTAA-GA-TT-C-G-AGAGG--CGGA-GTC-G-AG-GG--ATA-A--TTGATTT-G-CATGG-C-AATGGGCTTC-CGTATA----T-T-A----ATAAA-GCGTATATCACAATAAATGTAAACGTCAC-------------T-GTAT----CT-----------------T--CTTTC-C---C-----GA---C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTTGATTACTT-AAGA---C-TAGT-T---G----------T--A----GGT---A--------T-------ATAG-----G--CCTAG--C--A-A-AAG--ACC--A-C-GC-CTGGTA---T-A-AG---TCTAACCCATGA-T--CA-------A-------------------------CACT------GTT---T-C-TT--AA-------AA-TATACCATTTAATATTCTGAAGGCAAGATG-----C-A---C---AC---C-G-------T-C-----ACTCC--A-TTGC-AC------GA-----C-A-A-----------------C-------A-A-------CA-TCTC---A--GAAC-------TGTGTTTGCCT-A-C-T-C-CCCG--TC-----------T-A--GTC-C--C--GACA-ACC---A--------CA-------------CTCATGTTGATG----C---------------C-------AACC----------A--------A----GTCT-TAA-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-A---CGTT---------AA-------ACTA-TAGT-T---TGT-----GTT-T-CT-AC--TG-TT---T-----TTT--A-----N--NNNN-N-NN---------NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGTTAT----TCTGCATGAT-G-GG-CTA-A-TAA--TTTTTC-A--T-C--AGAATGA-TC-GTTC-T--TTTTAAG---GTGCACTG-TATTAGAGTGGCAG
gi|10 : atctcactttcacagtttaacgatttatttaaacttgtttacagtcgaggaaaacgtaatggaactggctgaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAA------------------------CA--------------A-A---TC-T-ATGT----T---GA-C--A-C--ATTTT--AA----GAA-A-------CAAG---A----GTA--A----GA-------TT-TTAA-GA-TT-C-G-A---G--C--A-GTT-G-A--GG--ATA-AATCTGAATT-T-T-AGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-AT-ACATAAATAC--------------ATGTATAC-TCAC-------------T------------------------GGTAT--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT------------T---------AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-TA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-T--CA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAAAGC-A-GTG-C---C-A---CA--AC---G-G-------T-C-----A--CTAAA-TT-C-AC-------------C-G---------------------------------ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------
gi|10 : tacaatcgaggaaactaaagtaa-AA-TT-C---TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------T--A-AAGT-T---TTT-C--GAT----CG-AA--TG-TG---T-----TCT--G-----T--GTTT-TATA---------AACNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNT-----TCAT-T-GG-CTA-A-C-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-C--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAcaattctgctgttgaaaatcgtttttaataaagtttttcgatcgaatgtgttctgtgttttataaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaacatttttcatcagaattatcgttccttagcgtgactgtatagatggcagtac
gi|11 : tacaatcgaggaaactaaagtaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaacaaatctatgttgacacattttaagaaacaagagtaagattttaagattcgagcagttgaggataaatctgaattttagggcatgggcttctgtaattatacataaatacatgtatactcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagactgttgatatattaggcctagcagaaagaccaatactgttaagtctatcaacctgttcttccattatatattctgaaagcagtgccacaacggtcactaaattcaccgacccatctcagaccCACTGTT--C-GAGA-TT-AA-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAACAAA--AA--------------------AGCG----T----AGA-AAAATC-C-CAGT----C---GA-C--A-C--ATTTC--A-----TTT-A-------CAAG---AACAACTA--A--TAGGA-T----TT-CTGA-GA-TT-C-A-A---G--T--C-GTC-G-AG-GG--ATA-AATCTGAATT-T-C---------TAGGCTTC-TGTA-A----A-T-AC-ATGTAc
gi|11 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaag-------------T-GTATA---CT----C-A-C---TGGTAT--TTTC--C---C-----G----A-A-T--T-----GT-C-CTTC-----G--TTA-AC---GTACATT--TG-AAGG---C-T-GT-T---GA---------TGCA----TGT---A--------C-------A-AA-----TATCCAAG--C--AAA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-T--CA-------A-------------------------G-CT------G-T---G-C-TTCCAT----------TAT--------ATACTCCGAAGTC---GTG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TTTC-CC------GA-----CTC-C-----------------C-------A-GA-------A-TGTT---------T-------T-------CTT-A-T-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTC-T--C--AAGA-A-----AATCAT---CA-------------T----------GCTTAT---------------CCAGCAATA-------------A--------A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------GTTA-AG-A----A-TT-G--TTTTT---------AA-------A--A-AGG--T---TTT-C--GATT-C-AG-AA--TA-TT---T-----TCT--G-----tactcactggtattttcccgaattgtccttcgttaacgtacatttgaaggctgttgatgcatgtacaaatatccaagcaaaaagaccaagactgttaagtctatcaagctgtgcttccattatatactccgaagtcgtgccaacacaaccgtcaccatttcccgactcccagaatgttttcttattccctgtcttagtctcaagaaaatcatcatgcttatccagcaataaagcttcgaatccctgctgttaagaattgtttttaaaaaggttttcgattcagaatattttctg
gi|12 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaagcactgttcgagattaattcgtctgtacttccaacaaaaaagcgtagaaaaatcccagtcgacacatttcatttacaagaacaactaataggatttctgagattcaagtcgtcgagggataaatctgaatttctaggcttctgtaaataca--GG--ATA-AATCTGAATT-T-C---------TGGGCTTC-CGTA-A--------AT-AC
gi|12 : gagA---CT----T-G-C---TGATGT--TTTC--C---C-----G----C-A-A--TTACATGC-A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGACTT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GG---------T--AT---TCT---A--------T-------A-GG-----A--CTT-G--T--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-T--CA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATACTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-ACC-----------------C-------A-GAC--------TTTT---A-------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TCTAGACGCGTATT-A--GTA-T--C--TACA-A-----A--------CATATCATGTTTATCC----------G----A---------------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTC-------------------------AAGT-T---TCT-C--TATT-C-CG-AA--TG-TT---T-----TTT--GCATANN--NNNN-N-NN---------NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----C-----TCGT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTA-ACAG-TA-TAGG-TGGCAGCAaagcacttgctgatgttttcccgcaattacatgcacttcattaacgtgacttctaagactgttggtattctataggacttgtagaaagatcaagactgttaagtctatcaacctgttcttccataatatactctgaagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcacgacacccagacttttatcccactccccgtctagacgcgtattagtatctacaaacatatcatgtttatccgacaaagcttcgaattcctgttgttgaaaatcgttcaagtttctctattccgaatgttttttgcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcgttggctaatatttttcataagaattatcgttctttagcgtaacagtataggtggcagca
gi|13 : gagggataaatctgaatttctgggcttccgtaaatacaagc----ACA-A---TTGT-CTGT----T---GA-TCGA-C--CTTTC--AT----GTA---------CAAG---A-CAACTA--A--TAGAA-G----TT-TTAATGA-TT-C-G-AGG-G--T--A-ATA-G----GG--ATA-AATCTGGGCT-T-C-
gi|13 : ag-------------T-GTATA---CT----C-T-C---TGGTAT--TTTC--C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-A----GTGAATT--CT-AAGA---C-T-AT-T---AA---------T--A----TAT---A----------------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AA---TCT--------A-C--CA-------A-------------------------C-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATACTCTG-TAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-T----------------C-A-C-----------------CA------A-GA----T-TG-TTT------------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C---ACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTTTATCCAA--C-------A-------------A--------A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--TT--------------------------AAAT-T---TTT-C----TT-C-TG-TA--Tcacgaatgtatactctctggtattttcccgcaattacatcattaagtgaattctaagactattaatatataaaggcctagcagaaagatcaagactattaaatctaccaaccttttcttccataattatactctgtagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcaccaagattgttttcccactccccgtcttaatcccacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttcgaatccctgctattgaaaatcgttaaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|13 : agacaattgtctgttgatcgacctttcatgtacaagacaactaatagaagttttaatgattcgagggtaatagggataaatctgggcttccacgaaTTTC-C--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-AA-TAGA-TGGCGGCAaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|14 : agacaattgtctgttgatcgacctttcatgtacaagacaactaatagaagttttaatgattcgagggtaatagggataaatctgggcttccacgaatgtatactctctggtattttcccgcaattacatcattaagtgaattctaagactattaatatataaaggcctagcagaaagatcaagactattaaatctaccaaccttttcttccataattatactctgtagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcaccaagattgttttcccactccccgtcttaatcccacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttcgaatccctgctattgaaaatcgttaaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-----GTCC-T--GAA-CTT--CC----AA--AA-CCA---------------GAGCG----TTAGAAC--A---TT-T--CGT----C---GA-C--ACC--ATTTC--AA--A-GTA-C-------TAGT---AACAA-CA--T--TAGAC-G----TT-CTAA-GG-TT-C-GAA---G--T--ACGTC-G-A--GG--ATG-AATA-AAATT-T-C-TGG-G-C-TG-----C-CGTA-A----T-T-Acg
gi|14 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagTATC---CT----C-A-C---TGGTAT--CTTTA-C---CAGTA-G----T-A-ACAT-----GT-A-CTTC-----A--TTACGT---GTGAATT--CT-CTGA-----T-GT-T---GA---------T--A----TGT---A--------T-------A--T-----G--CCTAG--TTGAAA-AAA--ACC--A-A-GA-CT-GG----T-A-AGA--TCT--------A-T--CA-------A-------------------------C-GT------T-T---T-C-TTCCATT------AA-TAC---------TAATCTTGAAGC-AG-TG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------G------C-A-C--------------------------------TT-CA-GCT----A--G-ACTTTTT--T-------CCC-A-T-G-CGCAGG--TC----------TT-A--TCC-C--C--AACA-C-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTACTCAG----C-------A-------------A--------A----G-CT-T-ATG-AA----CC--TGattatcctcactggtatctttaccagtagtaacatgtacttcattacgtgtgaattctctgatgttgatatgtatatgcctagttgaaaaaaaccaagactggtaagatctatcaacgttttcttccattaatactaatcttgaagcagtgccaacacaaccgtcaccatttcacgcacttcagctagacttttttcccatgcgcaggtcttatccccaacacacacatcatgtactcagcaaagcttatgaacctg
gi|15 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagctgctgtgcgagatttgttgtcctgaacttccaaaaccagagcgttagaacatttcgtcgacaccatttcaaagtactagtaacaacattagacgttctaaggttcgaagtacgtcgaggatgaataaaatttctgggctgccgtaattaatCGCTGAA--CAGAGA-TT-TTCTT-CAAGGT-CAT--TTAACTT--CACAAAA-------T----------------CATCA----T----TCATA---CT-T-ATGT----G---GA-C--A-C--ATTTT--AATTA-GTA-AGTCAAAGTAAGTACAAAAAGTAGAA--TAAAA-GATAGTT-TTAA-GA-TT-C-G-A---G--C--A-GTCTG-AG-GG--ATA-AATCTGAATT-T-CATGG-GCCATGGGCTTCGCGTA-A------T-ATAACGT--ATTTTATACATTGTTATATCTTCTCTCACGT-------------T-G---G---CT----C----------TATAGTTTCT-C---CCTCATG----CTA-A--T-----G--AGATTC-----A--TTA-AC---A-GAATT--CT-A--------T-GTAT---GA---------C--A----TACTGAA--------TTTTCATGA-AGAAGTAG--CCTAG--C--ATATAAG--ACCTTATA-GA-AC-GTTATAT-A-AGGATTCTTA------A-T--CACGTAACTA-------------------------T-CT------G-TTTCT-T-TTCCTTC------AACTAT--------AAATTTTGAA
gi|16 : cccatttctagcagttaacgatttataacttggtttacaatcgaggaaacactatggaatacg-C---C-----G----C-A-T--T-----T--A-CTAC-----AGATTG-CC----TGAATT--CT-AAAAAC-T-T-GT-T---GT---------T--A----AAT---AATACAAGTT-------A-AA-----GGTCCTA------AGC-AAA--ACC--A-A-GAACT-GT----T-ACAG---TTT--------G-T--CA-------AGTATT--------------------C-GTCAAGACG-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ACTTACTG-AAGC--GGTGAC---CAA---CA--ACGTACAG-------T-G-----A--TA--A-AT-CGAC------GA-------A-C-----------------A-------G-GACTGTT-TATTCTT---A----------------------CC-A-CTT-C-CCCAATTC----------TT-A--TTCTC--C--CACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGCTCTTATCC--A--------ACACGG-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-AAC--A-TC-G--GTT-----------------------A-AGAT-G---TTT-C--GNNN-N-NN-NN--NN-NN---N-----NNN--N-----N--NNNN-N-NN---------NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCACTG-----T-----GCAC-T-----TA-A-T-A--ATTATCAA--T-C--AGAATTAGTC-ATGC-T--TT---AG-C--CG-ACAG-CG-TAGA-T--CAGCA
gi|17 : C--A-G-GG-TT-GT------A-AG---TAT--------A-T--CA-------A-------------------------C--T------G-T---T-C-TCCCAT-------AA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-C---C-A---AC--ACA--C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC-----------------------------------C---------GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-GT-------TGTTTT--CCC-A-C-T-C-CC-G--TC----------TTTA--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G---TTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GGTT---TG-AA--TG-TG---T-----CCT--G-----T--GTTT-T-TANNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGCAc
gi|18 : tctagaaaagttcaataaagttttcaTCCAT-------GA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-A---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-CCGTCTCAGA-----C-T-CTTATTCCCCGTCTAATTC-------ACAAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------TGTTTT--CCT-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA--------A----G-CT-T-A-G-AA-TTTCC--TGAT--------GTTG-AA-A----AATC-G--TTTT----------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GTTT-C-CG-AA--TG-TG---T-----TCT--G-----T--GTTT-T-TATAACTNN--NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GGCCTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-CAGTG-ACTG-TA-TATA-TGGCAc
gi|19 : C---C-G-------T-CCA---A--CT--AATT-C-GT------GA-----C---------------------------------C-ACC-CA-TCTCCAAG--G-AC-------TGTTTT--CCT-AAC-T-C-AACGG-TCCT--------TT-AAGGTC-C--C--AACA-ACCAACATTT-----CA-------------T----------G----TTTGAATCCAAC----C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GGTGAAA-A----A-TC-GGCTTTTTGTTA-----AA-------A--A-AGGT-T---TTT-CGGGATT-C-CG-AAGTTG-TGTACT-----TCTTAA-----TCAATTC-T-GA---------TTAGA---------AATCAAGCTCCTTTTGATCCGGCTCCCATTAGGATCGCTTTGCCTGACTTATAGAGCGTACATAGCC--AGTTATT----T-----CCAT-TGGG-CT--A-T-A--TTTTCC-AACT-C--ACAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTGAACTGTTA-TAG--TGGCAGTagt
gi|2 : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---TT-C-T--GTA-CTT--CCC-CAAA--AA-CC----------------CAGTG----TAGG-ACA-A---TT-T-ATGT----T---GA-C--A-C--ATTTT---A--A-GT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAGAA-G----TT-TTAA-GA-TT-C-G-A---G--C--A-GTC-G-AG-GG--ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTT-CGTA-A----T-T-AT-ATGT
gi|2 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaGT-------------T-ATATATGTCT----CTG-C---TGGTAT--TTTTTTC---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-A--------------------------------------T---A--------T-------A--G-----A--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----G-A-AG---TCT--------A-T--CA-------AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CT------G-T---T-CATTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-AAGTG-C---C-A---GA--AC---C-----------CAGAGGA--TC--A-TT-CAAT------GT-----T-A-C-----------------C---------GAC-ACCTCA-TCTC---A--G-ACCTGTTATT-------CCC-A-C-TAC-CCCGC-TCT---------TT-A--GTT-C--CCAAACAGA-----A--------CA-------------CACTG------G----TTCGTTATCCAA----C-------A-------------A--------A----G-CT-TAA-G-AACTT-CCTTTGCT--------GCTG-AA-AAACCA-TT-T--TTTTT---------AAACCGAAGA--A-AAGT-T---TTC-----ATTCC-CGCAA--T--TG---TTAGAATCT--G-----T--GTTTAT-TA---------ATCAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GT-TAA-A-T-AT-TTTTTC-A--TCC--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTAtatatatgtctctgctggtatttttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctatatagacctagcagaaagaccaagactatgaagtctatcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgttcattccataatatattctgaagcaagtgccagaacccagaggatcattcaatgttaccgacacctcatctcagacctgttattcccactaccccgctctttagttcccaaacagaacacactggttcgttatccaacaaagcttaagaacttcctttgctgctgaaaaaccattttttttaaaccgaagaaaagttttcattcccgcaattgttagaatctgtgtttattaatcaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattgttaaatattttttcatccaaaattatcgtttagcgtgactgcatagatggtagtac
gi|20 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcttctgtacttccccaaaaacccagtgtaggacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggctttcgtaattatatCGCCGTG--T-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-TTGATT-CCC--CCCAAAAA--AA-ACAAAAACAAAAAAAAAACAGCG----T----AGA-AGAATT-T-TTGT----T---GA----A----ATTTC--A-----GTA---------CA-G---AAC---TA-----TGGAA-G----TT-CTAA-GA-TTGC-G-A---G--T--C-GTC-G-AGGGG--ATA-GATCAG-ATT-T-T-TGG-G--AT----TTC-CGTA-A------T-AC-ATGTATATc
gi|20 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccg-------------T-GTATA---TTACTGC-A-C---TG-TAT--CTTT------------GGGAAC-A-A--T-----G--A--------------TA-A-----TGA------T-AAGA---C-T--T-A---GT---------T--AC---TAT---A--------T-------C-AG---------CT-G--C--AGA-AAC--TCC--G---GA--T-GT----T-A--G---TCT--------A-T--CA-----------------------------------CT------G-T---T-T-TCTCAT-------tactgcactgtatctttgggaacaatgataatgataagacttagttactatatcagctgcagaaactccggatgttagtctatcactgttttctcatt
gi|21 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccgcgccgtgtaagatttgttcgtcttgattccccccaaaaaaaacaaaaacaaaaaaaaaacagcgtagaagaatttttgttgaaatttcagtacagaactatggaagttctaagattgcgagtcgtcgaggggatagatcagatttttgggatttccgtaatacaA---CT----C-A-CATCTAGTAT--TTTCC-CACCC-----G----C-A-A--T-----T--A-CTTC-----AA-TTA-AC---GTTAATT--CT-AAGA---C-TGGT-T---GAATAATTACGT--A----TAT---ATGT-----T-------A-AG-----A--CCTAGA-C--AGT-AAT--ACG--A-G-AG-CA-GCG---T-A-AA---TCT--------ACC--CA-------G-------------------------G-CT------G-T---TAT-TTTCGTCGCAAAAAA-T-T--------ATAGTCTGAAGGG-CGGTG-C---T-A---AA--ACA--C-AAAAAAATT-C-----A--TC--T-GT-A-AA------GAAACCCC-A-C-----------------C-------A-GACTATT-TT-TCTC---T--A-AC-------T-------CCT-G---G-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--A--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------t
gi|22 : --GG--ATA-A-TCTGAATT-T-C---------TGGGCTTC-CGCG-A----T-TCAT-ACttgtgtgtatccaaacaacagg
gi|22 : gatATA---CT----C-A-C---TAGTTT--TTCCC-C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-AT---GTAAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AAACGTAT---A--------T-------A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AA---TCT--------A-T--CC-------A-------------------------C-CT------C-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATAGTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---T-G-------A-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-------------------------------GAA-ACC-------C---A--G-ACTATTT--T-------CTT-A-C-T---CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------tcactagtttttcccccgcaattacatcattaatgtaaattctaagactgttgataaacgtatataggcctagcagaaagatcaagactgttaaatctatccacctcttcttccataattatagtctgaagcggtgccaacacaactgacaccatttcacgacgaaacccagactattttcttactcccgtcttagtcccaacaaacacattgtgtttatccaacaaagcgt
gi|23 : gatggataatctgaatttctgggcttccgcgattcCACTGCG--C-GAGA-TT-TT-GT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCAAAAA-----------------------CA--------------A-A---TT-T-ATGT----T---G---------------------------A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAGAA-G----TT-TTAA-GA-TT-C-G-A---G--C--A-GTC-G-AG-GG--ATATAATCTGAATT-T-C-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-AAATTT-T-AT-ACGTAAATtgtgtttatccaacaaagcgt
gi|24 : atctcatttcacagattttaacaatttaaactgtttaacaatcgaggaaactaatggaaa-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AAT-TG-TG---atatg
gi|25 : -------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----AACACATCACA-------------T----------G----TTTATCCAA-------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GCTG-AA-A----A-TC-A--TTTTTTTTTAAAAAGA-------A--A-AAGT-T---TTC-C---ATT-C-CG-AA--TG-TG---TTAA--TCT--G-----T--GTTT-T-TA---------agaatgactatcaatatgattaggaatcagctaattattgatccgctctgacttagatcggcgtgcggggggagagatggaaagccgttagttcaattgggctaga
gi|26 : ccatttttcgactcatgatttcttacaaatcttggCTATG--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GAA-CTT---AAAAAAA--AA-CC----------------CAGCG-----------A-A--------------------GA----A-C--AATTT--CA--T-GC--A-------CAAG---AACAACTA--A--TAGAA-G----TT-CTAA-GA-TT-T-G-A---G--C--C-GTC-G-A--G
gi|27 : atcccattttacattttatggctttgaactttttacagccagcgtttacaatcgaggaaaatctGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AT-C---AT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAA--AA----------------------------T----ATC-A---TT-TCATGT------------------------------------A-------CAAG---AACAACTA--AATCAGAA-G----TT-TTAA-GA-TT-C-ag
gi|28 : tacgactttgaatttgtttacaatcgaggaaactcgcgcaatgaagttatggaacaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTG-CTT--CCta
gi|29 : aatcccatttcacagtttaacgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaCCACTGAG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAAAAAA--AATCC----------------CAGCG----TAGA-ACA-A---TT-T-tcgacaacagtttgagcaagcaacataatcggagtcgctaaaatt
gi|3 : tacaatcaaggaaactcgtacaatgaagttatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GTTC-T--GTA-CTT--CCCAAAAC--AA-CC---------------------------------------T-T-ATGT----T---GA-C--A-C--ATTTTTTAA--A-GTT-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAGAA-G----TC-TTAA-A---T-C-GTA---G--C--AAGTC-G-A--GGG-ATA-AATCTGAATT-T-TATGGCA-CATGGGCTTC-CGTA-A----TAT-AT-ACGTA--TT---------------TTGTACATG-------------------GTATA---CT----C-AAC---TGGTAT--TTTTT-C---CC----G----CCACA--T-----G--A-CTTA-----A--T-A-AC---GTGAATT--CTTAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-GG-----G--CTTAGGTC---GA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AG---TCT--------A-T--CA-------AAA-----------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------T-T--------ATATTTT---AGC-CG-TG-C---CCA---CA--AC---C-G-------T-CC----A--CTGAA-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A------------TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A---TC-C--C--AACA-A-----AC-------CA-------------C----------A----TCATTAATTGATCCAAC-------A-------------A--------A----G-CTAT-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G--TATTT---------TA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-CGCG-AA--TGTTG---T-----ACT--------T---CTT-N-NN---------NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-AT-T-C--AG-ATTA-TCGGTTCTT--TT---AGCC-GTG-ACTG-TA-TAGA-T-GCAGTA
gi|30 : tttccatttcacagtttaacgattttaaacttgttacaatcgaggaactaatggaaGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AC-C---GT-C-T--GTA-CTc
gi|31 : atttacgacttgaattttgttaaatcggaggaactcgcacaatgaagtttgggaaacaCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C--A-CA-A-----A--------TA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-A--------AC---G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TACT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--T-------------------------A-AAAT-T---TTT-C--
gi|32 : CC--A-A-----T-GT----T-A--------T--------G-T--TA-------A-------------------------A-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---GA--AC---C-G-------T-C-----ttcta
gi|33 : gcaaagaaacccacCAT-T-GG-CTA-T-T-G--TTTT-C-A--T-C--TAAATTA-TC-GTTC-TCTTT---AG-A-GTG-ACAG-TG-TAGA-TGGCAGCA
gi|34 : -----TCAT-T-GG-TTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|35 : AT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-G-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGc
gi|36 : ----ATA-A---TT-T-TTGC----T---GA-C--A-C--ATTTC---A--T-GT--A-------CAGG---AACAACTA--A--TAc
gi|4 : tagaG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAA--A--CC----------------CAGTG----AGA--ATA-A---TT-T-ATGT----TCTCGA----A-C--ATTGT--TA--A-GTA---------CA-G---AA-AAGTA-----TAGAA-G----TT-TTAA-GAGTT-C-G-A---GAGCGGA-GTC-G-A--GGG-ATA-AAT-TGGATT-TGC-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T----------ATACGTAATATAA-------------------------------T-GTA-A---CT----C-A-----TGGTTT--TTTTT-C---C-----G----C-A-AG-T-----G--A--TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AG---TAT---A--------T-------A-GG---------CTAG--C--A-A-AAA--ACC--A-ACGC-CTGGTA---T-A-AG---T-T--------A-T--CA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-CTTTCCAT----------T-T--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---A-A---C---AC---C-G-------T-C-----A--CTA-A-TT-C-AC------GA-----C-A-----------------------------------C-CA-TCTC---A--G-ACTGTT---T-------CCT-A-C-T---CCCG--TC-----------T-A--GTC-CCAC--AACA-A-----CT-------CA-------------T----------G----TTGATC----------C-------AACC----------A--------A----G-TT-A-A-G-AA-TT-CC--TGC---------GTTG-AA-A----A-T--G----TTT---------AA-------A--GCAAGT-T---T-----------------G--TG--G---T-----TCT--A-----T--GTTT-T-TA---------NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTATT----C-----TCATAT-GG-CTATA-T-A--TTTTTC-A--TAC--AG-ATGA-TCAGTTCTT--TT---AG-C-GTG-CATG-TA-TAGAGTGGCA
gi|5 : aatctcatttcacagtttaacgatttataacttgttacagtccgaggaaacgtaatggaacgctcgagCCGCTGTA--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAA--AA-CC----------------CAGTG----T----ACA-A---TT-T-ATGT----T---GA-C--A-C--ATTTT--AA--AAGTA-A-------CATG---AACGAGTA--A--TAGAA-G----TT-TGAA-GA-TT-C-G-A---G--C--A-GTC-G-A--GG--ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-ACGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-GTATG---CT----C-A-C---TGGTAT--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-C-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-C--GT----T-A-AG---TCT--------A-T--CA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------CCCCGGGCACGAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTT-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGTAT---TTC-C--GATT-C-CG-AA--TG-TG---T-----TCT--G-----T--GTTT-T-TA---------NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGCATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|6 : CCGCTGTGG-C-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CC----AA--AA-C-------------------------------A-A-A---TT-T-ATGT----T---GA-C--A-CCCATTTT--TA--A-GTA-C-------CAAG---AACAAGTA--A--TAGAA-G----TT-TTAA-GA-TT-C-G-AA--G--C--A-GTC-G-A--GGG-ATA-A-TCTGAATTGT-C-AGG-G-CATGG-CTTC-CGTA-A----------------AATT----------TTATA-CGTAAATGACA--------------T-GTATA---TC----A-A-C---TGGTAT--TTTTTTC---C-----G----C-A----T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTCAATT--CT-AAAAGAAC-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-GGC----A--CCTAG--CT-AGA-AAAGAACC--A-A-GA-CT-GT----TTA-AG---TCT----------T--CA-------AT------------------------C-CT------G-T---T---TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAA-GC-AG-TG-CG--C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------T-G-----C-CA-TCTC---ACCG-ACGTT----T-------CCCTA-C-T-C-CCCG--TC----------TT-ATAGTC-C--CC-AACA-A-----A--------CA-------------CAATCAT----G----TTGATGCCAA------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AAATT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-T--G--TTTTTA--------AA-------A--A-AAGT-T---TTTCC--GATT-C-CG-AA--T--TG---------TCT--G-----TCAGTTT-T-T-------------------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-CAAAGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|7 : ttaacaatcgaggaacactaatggaaCCGCTGTGGGC-GAGAATT-TG-TTTC---GT-C-T---TA-CTTTTCCCAAAA------------------------CA--------------A-A---TT-A-ATGT----T---GAAC--A-C--GTTTTTTAA--A-GTA-A-------CAAG---AGCAAGTA--A--TAGAAAG----TT-TTA--GA-TT-CCG-A---C--A--A-GTC-G-A--GGGAATA-AATCTGAATT-T-A-TGG---CATGGGCT-C-CGTA-A----A-T-AT-A-GTA----CGTATT------------TTTACA-----------------T-GTA-A---CT----C-A-A---CGGTAT--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----GA-A-CCTT-----A--ATA-AC---GT-AATT--CT-AAGA---C---GT-T---GA---------T--A----AAT------------T-------ATAG-----G--CTTAG--C----A-AAG--A-C--A-A-GA-CT-AT----C-A-A----TCT--------A-C--TC-------A-------------------------C-CT------GTT---T-C-TTCCAT----------TGT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---CAAGAC---C-G-------TCC-----A--CT--A-AT-T-AC------GA--------------------------------------AC-ACC-CA-TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATATGATCCAAAA-C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-GAAA-TT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G---TTTA---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-GA-AA--TG-TG---T-----AC-------------TTT-C-TA-------------N---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-ATT-ATTTTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GGG-ACTG-TA-TAGA-
gi|8 : aatcctatttcacagtttaacgatttttaacccttgtttaacaaatcgaggaaactaatggaataCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCC-AAAA--TA-CC----------------CAGTG----TAGA-ACA-A---TT-T-ATGT----T---GA-C--A-C--ATTTT---A--A-GT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAGAA-G----TT-TTAA-GA-TT-C-G-A---G--C--A-GTC-G-AG-GG--ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-AT-ACCTAAATAC
gi|8 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaa-------------T-GTATA---CT----C-A-C---TTGTAT--TGTTT-C---C-----G----CAA-A--T-----GTTA-TGTCGATGGA--TTAGATTTGGTGAATC--TT-AAGA---CTT-GT-TCAAAA---------T--A-----AT---A--------T-------A-Aatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|8 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaataca-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AA--Ttaaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|9 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaatacatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaatCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-A---GT-C-T--GAA-CTT-----AAAAAACAA-CC----------------CAGCG----TATA-ACA-A---TT-T-CTGTTATAT---AA-C--A-C--ATTTT--------GTGTA-------CAAG---AACAA----------------------CTAA-AA-TT-C-G-A---G--C--C-ATC-GAA--GG--ATA-AATATGAATT-T-C-TAG-G-C-TG-----C-AGTA-A----A-C-AC-ATGTACATAC-----------------------TCAC-------------TGGTATA-----------A-G---TGGTA---TTTTC-C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CTTC---------------------ATT--CT-CAGA---C-T-GA-T---GA---------T--A----TAT---A--------T---------------------------------------------A-GA-CT-GT----T-A-AG---TAT--------A-TTATA-------A-------------------------C-CT------G---------------------------T--------ATACTCTGAA--T-CGGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GT-----C-ACC-----------------C-------A-G---ACT-TG-TTTC-------------------------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-A--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTT--------ATCCAACATA----G-CT-T-T-G-AA-TT-CG--TTCT--------ACTT-AA-A----A-TC-G--TTTT------------------------AAGT-T---TTT-C--GATT-T-CG-AA--TG-TT---T-----TCG--G-----T--ATAT-T-NN---------NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----NNNNC-TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTCCC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-ATG-ACGG-TA-TAGA-TGtg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555 33333333333333333333 111 1111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111111 1111 22222222222222222222222222222222 1111 11111111 333333333333333333333333333333333 222222222222222222222 1 1111 111 111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111 2222222222222222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 44 2 2 4 2 2 333 2 4 22 2 22 11 0 888888888888888888888888888888888888888888 2 777 2 33 777 4444 6666 55 44444444444444444444 333 3 44444 2 4444 2 2 2 4 2 222 33 88 2 2 2 2 2 2 2 777 2 2 4 1111111111 2 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 666 333 2 33 99 333 99999 4 4 2 55 33333333 2 55555 55 4 333 22 2 666 2 4 2 333 888888888 22 0000 77777777777777777777777777777777 55 55 1 2 33 22 2 2 2 4 0000 2 2 555 00000000 2 22 000000000000000000000000000000000 2 555555 4 333 2 4 777777777777777777777 0 2 3 6666 4 333 2 111 22 777 2 6666666 4 77777 22 5555 6 4 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 2 2 2 2 66 3333333333 2 55 2 22 44 2 77777 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 6666 2 2 444 1 7 1 22 44444444 2 4 7777 2 4 444 5555555555555555555555 2 2 777 2 555 2 2 2 2 2 00000 6666666666 2 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 2 2 2 2 55 2 55 4 33 2 4 4 33 333 2 2 4 1 2 2 4
lowQualScore : .. . . . . . ... . . .. . .. .. . .......................................... . ... . .. ... .... .... .. .................... ... . ..... . .... . . . . . ... .. .. . . . . . . . ... . . . .......... . ................................................................... .. ... ... . .. .. ... ..... . . . .. ........ . ..... .. . ... .. . ... . . . ... ......... .. .... ................................ .. .. . . .. .. . . . . .... . . ... ........ . .. ................................. . ...... . ... . . ..................... . . . .... . ... . ... .. ... . ....... . ..... .. .... . . ..................................................................................... . . . . . .. .......... . .. . .. .. . ..... ............................................................................. . .... . . ... . . . .. ........ . . .... . . ... ...................... . . ... . ... . . . . . ..... .......... . . ........................................................................................................................ . . . . . . .. . .. . .. . . . .. ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 0 0 0 0 0 555 0 0 88 0 99 66 5 333333333333333333333333333333333333333333 0 000 0 44 444 5555 4444 00 99999999999999999999 777 2 66666 2 7777 2 2 2 4 4 111 22 88 4 1 1 1 2 2 2 666 2 2 6 9999999999 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 88 999 999 2 11 55 777 77777 2 2 1 00 22222222 1 33333 00 2 777 99 1 666 1 2 1 777 444444444 99 8888 44444444444444444444444444444444 33 33 5 2 11 88 0 0 0 0 2222 0 0 555 00000000 0 88 555555555555555555555555555555555 0 888888 0 555 0 0 666666666666666666666 1 5 7 5555 2 222 1 111 99 555 0 5555555 0 88888 99 0000 3 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 1 1 1 88 5555555555 0 55 0 88 88 0 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 2222 0 0 333 9 6 9 66 55555555 0 0 0000 0 0 888 3333333333333333333333 0 0 000 0 999 1 1 1 1 4 66666 5555555555 7 7 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 4 4 4 4 4 66 2 33 4 11 2 4 4 11 999 2 2 4 0 2 2 4
consensus : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--A-GTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC----------CGTA-A--------------T-T-ATA---CGTA------AATAC------TA-AC----C-TG-TATA----CTC-AC---TGG---TA-T--TTTTT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--C-TAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
Reference ( family-2759 ) : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--A-GTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC----------CGTA-A--------------T-T-ATA---CGTA------AATNCGTAACGTANACGTCAC-TG-TATA----CTC-AC---TGG---TA-T--TTTTT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--C-TAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------NNC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|1 : GTG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCCAAAAA--C-CA----------------C-AGTGAGAAT----A----G-A---TT-T-ATGTCTCGA----A-C--A---ATTTT--AA--A-GT--A-------CAGA---AGCAAGT---A--TAG-AAG----TTATTAA-GA-TT-CG-AGAGG--CGGA-GTC-GA-GGG-ATA-A--TTGATTT-G-CATGG-C-AATGGGCTTC----------CGTATA--------------T-TAATAAAGCGTATATCACAATA---AATGTAAACGTCAC-TG-TAT-----CT----------------T--CTTTC-C---C-----GAC-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTTGATTACT-TAAGA---C-TAGT-T---G----------T--A----GGT---A--------T-------ATAG-----G--CCTAG--C--A-A-AAG--ACC--A-C-GC-CTGGTA---T-A-AG---TCTAACCCATGA-TC--A-------A-------------------------CACT------GTT---T-C-TT--AA-------AA-TATACCATTTAATATTCTGAAGGCAAGATG-----C-A---C---AC---C-G-------T-C-----ACTCC--A-TTGC-AC------GA-----C-A-A-----------------C-------A-A-------CA-TCTC---A--GAAC-------TGTGTTTGCCT-A-C-T-C-CCCG--TC-----------T-A--GTC-C--C--GACA-ACC---A--------CA-------------CTCATGTTGATG----C---------------C-------AACC----------A-A----GTCT-TAA-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-A---CGTT---------AA-------ACTA-TAGT-T---TGT-----GTT-T-CT-AC-TG-TTT-----TTTA-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGTTAT----TCTGCATGAT-G-GG-CTA-A-TAA--TTTTTC-A--T-C--AGAATGA-TC-GTTC-T--TTTTAAG---GTGCACTG-TATTAGAGTGGCAG
gi|10 : atctcactttcacagtttaacgatttatttaaacttgtttacagtcgaggaaaacgtaatggaactggctgaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAA------------------------C-A-----------------A-A---TC-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA----GAA-A-------CAAG---A----GTA--A----G-A------TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTT-GA-GG--ATA-AATCTGAATT-T-T-AGG-G-CATGGGCTTC----------TGTA-A--------------T-T-ATA---CATA------AATACA----------------TG-TATA----CTC-AC---TGG---TA-T--TTTTT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--C-TAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT------------T---------AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-TA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAAAGC-A-GTG-C---C-A---CA--AC---G-G-------T-C-----A--CTAAA-TT-C-AC-------------C-G---------------------------------ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------
gi|10 : tacaatcgaggaaactaaagtaa-AA-TT-C---TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------T--A-AAGT-T---TTT-C--GAT----CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-TATA---------AAC-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNT-----TCAT-T-GG-CTA-A-C-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-C--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAcaattctgctgttgaaaatcgtttttaataaagtttttcgatcgaatgtgttctgtgttttataaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaacatttttcatcagaattatcgttccttagcgtgactgtatagatggcagtac
gi|11 : tacaatcgaggaaactaaagtaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaacaaatctatgttgacacattttaagaaacaagagtaagattttaagattcgagcagttgaggataaatctgaattttagggcatgggcttctgtaattatacataaatacatgtatactcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagactgttgatatattaggcctagcagaaagaccaatactgttaagtctatcaacctgttcttccattatatattctgaaagcagtgccacaacggtcactaaattcaccgacccatctcagaccCACTGTT--C-GAGA-TT-AA-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAACAAAA--A---------------------AGCG----T----A---GA-AAAATC-C-CAGTC---G----A-C--AC--ATTTC--A-----TTT-A-------CAAG---AACAACTA--A--TAG-GAT----TT-CTGA-GA-TT-CA-A---G--T--C-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TAG-G-C------TTC----------TGTA-A------------------ATA---CAT------------------------------G-TATA----CTC-AC---TGG---TA-T--TTTC--C---C-----G-A-A-T--T-----GT-C-CTTC-----G--TTA-AC---GTACATT--T-GAAGG---C-T-GT-T---GA---------TGCA----TGT---A--------C-------A-AA-----TATCCAAG--C--AAA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TC--A-------A-------------------------G-CT------G-T---G-C-TTCCAT----------TAT--------ATACTCCGAAGTC---GTG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TTTC-CC------GA-----CTC-C-----------------C-------A-GA-------A-TGTT---------T-------T-------CTT-A-T-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTC-T--C--AAGA-A-----AATCAT---CA-------------T----------GCTTAT---------------CCAGCAATA-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------GTTA-AG-A----A-TT-G--TTTTT---------AA-------A--A-AGG--T---TTT-C--GATT-C-AG-AA-TA-TTT-----TCTG-----c
gi|12 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaag-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-C------TTC----------CGTA------------------------------------AATAC-------AAGC------------A----CTT-GC---TGA---TG-T--TTTC--C---C-----G-C-A-A--TTACATGC-A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGACTT--C-TAAGA---C-T-GT-T---GG---------T--AT---TCT---A--------T-------A-GG-----A--CTT-G--T--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATACTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-ACC-----------------C-------A-GAC--------TTTT---A-------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TCTAGACGCGTATT-A--GTA-T--C--TACA-A-----A--------CATATCATGTTTATCC----------G----A---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTC-------------------------AAGT-T---TCT-C--TATT-C-CG-AA-TG-TTT-----TTTGCATANN--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----C-----TCGT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTA-ACAG-TA-TAGG-TGGCAGCA
gi|13 : ----A---CA-A---TTGT-CTGTT---G----A-TCGAC--CTTTC--AT----GTA---------CAAG---A-CAACTA--A--TAG-AAG----TT-TTAATGA-TT-CG-AGG-G--T--A-AT---A-GGG-ATA-AATC-------------------TGGGCTTC----------C-------------------------A---CG---------------AATGTATAC------------------TC-TC---TGG---TA----TTTTC-C---C-----G-C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-A----GTGAATT--C-TAAGA---C-T-AT-T---AA---------T--A----TAT---A----------------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AA---TCT--------A-CC--A-------A-------------------------C-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATACTCTG-TAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-T----------------C-A-C-----------------CA------A-GA----T-TG-TTT------------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C---ACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTTTATCCAA--C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--TT--------------------------AAAT-T---TTT-C----TT-C-TG-TA-T
gi|13 : agTTTC-C--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-AA-TAGA-TGGCGGCAaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|14 : agacaattgtctgttgatcgacctttcatgtacaagacaactaatagaagttttaatgattcgagggtaatagggataaatctgggcttccacgaatgtatactctctggtattttcccgcaattacatcattaagtgaattctaagactattaatatataaaggcctagcagaaagatcaagactattaaatctaccaaccttttcttccataattatactctgtagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcaccaagattgttttcccactccccgtcttaatcccacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttcgaatccctgctattgaaaatcgttaaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-----GT-CCT--GAA-CTT--CC----AAA--A-CC----------------AGAGCG----TTAGAA---CA-----TT-T--CGTC---G----A-C--ACC-ATTTC--AA--A-GTA-C-------TAGT---AACAA-CA--T--TAG-ACG----TT-CTAA-GG-TT-CG-AA--G--T--ACGTC-GA-GG--ATG-AATA-AAATT-T-C-TGG-G-C-TG-----C----------CGTA-A--------------T-T-----------------AAT----------------------TATC----CTC-AC---TGG---TA-T--CTTTA-C---CAGTA-G-T-A-ACAT-----GT-A-CTTC-----A--TTACGT---GTGAATT--C-TCTGA-----T-GT-T---GA---------T--A----TGT---A--------T-------A--T-----G--CCTAG--TTGAAA-AAA--ACC--A-A-GA-CT-GG----T-A-AGA--TCT--------A-TC--A-------A-------------------------C-GT------T-T---T-C-TTCCATT------AA-TAC---------TAATCTTGAAGC-AG-TG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------G------C-A-C--------------------------------TT-CA-GCT----A--G-ACTTTTT--T-------CCC-A-T-G-CGCAGG--TC----------TT-A--TCC-C--C--AACA-C-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTACTCAG----C-------A-------------A-A----G-CT-T-ATG-AA----CC--TGcg
gi|15 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagCGCTGAA--CAGAGA-TT-TTCTT-CAAGGT-CAT--TTAACTT--CACAAAA-------T----------------C-ATCA----T----T---CATA---CT-T-ATGTG---G----A-C--AC--ATTTT--AATTA-GTA-AGTCAAAGTAAGTACAAAAAGTAGAA--TAA-AAGATAGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTCTGA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-CATGG-GCCATGGGCTTCG---------CGTA-A----------------T-ATA----------------ACGTATTTTATACATTGT-TA-TATCTTCTCTC-ACGT-TGGCTCTA-TAGTTTCT-C---CCTCATG-CTA-A--T-----G--AGATTC-----A--TTA-AC---A-GAATT--C-TA--------T-GTAT---GA---------C--A----TACTGAA--------TTTTCATGA-AGAAGTAG--CCTAG--C--ATATAAG--ACCTTATA-GA-AC-GTTATAT-A-AGGATTCTTA------A-TC--ACGTAACTA-------------------------T-CT------G-TTTCT-T-TTCCTTC------AACTAT--------AAATTTTGAA
gi|16 : cccatttctagcagttaacgatttataacttggtttacaatcgaggaaacactatggaatacg-C---C-----G-C-A-T--T-----T--A-CTAC-----AGATTG-CC----TGAATT--C-TAAAAAC-T-T-GT-T---GT---------T--A----AAT---AATACAAGTT-------A-AA-----GGTCCTA------AGC-AAA--ACC--A-A-GAACT-GT----T-ACAG---TTT--------G-TC--A-------AGTATT--------------------C-GTCAAGACG-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ACTTACTG-AAGC--GGTGAC---CAA---CA--ACGTACAG-------T-G-----A--TA--A-AT-CGAC------GA-------A-C-----------------A-------G-GACTGTT-TATTCTT---A----------------------CC-A-CTT-C-CCCAATTC----------TT-A--TTCTC--C--CACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGCTCTTATCC--A-ACACGG-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-AAC--A-TC-G--GTT-----------------------A-AGAT-G---TTT-C--GNNN-N-NN-NN-NN-NNN-----NNNN-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCACTG-----T-----GCAC-T-----TA-A-T-A--ATTATCAA--T-C--AGAATTAGTC-ATGC-T--TT---AG-C--CG-ACAG-CG-TAGA-T--CAGCA
gi|17 : C--A-G-GG-TT-GT------A-AG---TAT--------A-TC--A-------A-------------------------C--T------G-T---T-C-TCCCAT-------AA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-C---C-A---AC--ACA--C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC-----------------------------------C---------GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-GT-------TGTTTT--CCC-A-C-T-C-CC-G--TC----------TTTA--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G---TTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GGTT---TG-AA-TG-TGT-----CCTG-----T--G-TTT-T-TANNNNNNNNNNNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGCAc
gi|18 : tctagaaaagttcaataaagttttcaTCCAT-------GA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-A---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-CCGTCTCAGA-----C-T-CTTATTCCCCGTCTAATTC-------ACAAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------TGTTTT--CCT-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TTTCC--TGAT--------GTTG-AA-A----AATC-G--TTTT----------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GTTT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TATAACTNN--NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GGCCTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-CAGTG-ACTG-TA-TATA-TGGCAc
gi|19 : C---C-G-------T-CCA---A--CT--AATT-C-GT------GA-----C---------------------------------C-ACC-CA-TCTCCAAG--G-AC-------TGTTTT--CCT-AAC-T-C-AACGG-TCCT--------TT-AAGGTC-C--C--AACA-ACCAACATTT-----CA-------------T----------G----TTTGAATCCAAC----C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GGTGAAA-A----A-TC-GGCTTTTTGTTA-----AA-------A--A-AGGT-T---TTT-CGGGATT-C-CG-AA-----GT-----TGTG-----T--ACTTC-T-TA---------ATCAATTCTGATTAGA---------AATCAAGCTCCTTTTGATCCGGCTCCCATTAGGATCGCTTTGCCTGACTTATAGAGCGTACATAGCC--AGTTATT----T-----CCAT-TGGG-CT--A-T-A--TTTTCC-AACT-C--ACAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTGAACTGTTA-TAG--TGGCAGTagt
gi|2 : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---TT-C-T--GTA-CTT--CCC-CAAAA--A-CC----------------C-AGTG----TAGG-A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT---A--A-GT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTT----------CGTA-A--------------T-T-ATA---TGT-------------TA---TATATGTCTC-TG--------------C---TGG---TATT--TTTTT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--C-T-------------------A---------T--A----T------------------------AG-----A--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----G-A-AG---TCT--------A-TC--A-------AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CT------G-T---T-CATTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-AAGTG-C---C-A---GA--AC---C-----------CAGAGGA--TC--A-TT-CAAT------GT-----T-A-C-----------------C---------GAC-ACCTCA-TCTC---A--G-ACCTGTTATT-------CCC-A-C-TAC-CCCGC-TCT---------TT-A--GTT-C--CCAAACAGA-----A--------CA-------------CACTG------G----TTCGTTATCCAA----C-------A-------------A-A----G-CT-TAA-G-AACTT-CCTTTGCT--------GCTG-AA-AAACCA-TT-T--TTTTT---------AAACCGAAGA--A-AAGT-T---TTC-----ATTCC-CGCAA-T--TGTTAGAATCTG-----T--G-TTTAT-TA---------ATC-----------AACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GT-TAA-A-T-AT-TTTTTC-A--TCC--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|20 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaCGCCGTG--T-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-TTGATT-CCC--CCCAAAAAA--A-ACAAAAACAAAAAAAAAAC-AGCG----T----A---GA-AGAATT-T-TTGTT---G----A----A---ATTTC--A-----GTA---------CA-G---AAC---TA-----TGG-AAG----TT-CTAA-GA-TTGCG-A---G--T--C-GTC-GAGGGG-ATA-GATCAG-ATT-T-T-TGG-G--AT----TTC----------CGTA-A----------------T-ACA---TGTA------TAT----------TACTGCAC-TG-TAT-----CT---T---TGG---GA--------------------A-C-A-A--T-----G--A--------------TA-A-----TGA-------TAAGA---C-T--T-A---GT---------T--AC---TAT---A--------T-------C-AG---------CT-G--C--AGA-AAC--TCC----G-GA--T-GT----T---AG---TCT--------A-TC--A-----------------------------------CT------G-T---T-T-TCTCAT-------c
gi|21 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccgA----CTC-ACATCTAG---TA-T--TTTCC-CACCC-----G-C-A-A--T-----T--A-CTTC-----AA-TTA-AC---GTTAATT--C-TAAGA---C-TGGT-T---GAATAATTACGT--A----TAT---ATGT-----T-------A-AG-----A--CCTAGA-C--AGT-AAT--ACG--A-G-AG-CA-GCG---T-A-AA---TCT--------ACCC--A-------G-------------------------G-CT------G-T---TAT-TTTCGTCGCAAAAAA-T-T--------ATAGTCTGAAGGG-CGGTG-C---T-A---AA--ACA--C-AAAAAAATT-C-----A--TC--T-GT-A-AA------GAAACCCC-A-C-----------------C-------A-GACTATT-TT-TCTC---T--A-AC-------T-------CCT-G---G-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--A--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------t
gi|22 : -GA-TGG-ATA-A-TCTGAATT-T-C---------TGGGCTTC----------CGCG-A--------------T-TCATA---Cttgtgtgtatccaaacaacagg
gi|22 : ATA----CTC-AC---TAG---TT-T--TTCCC-C---C-----G-C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-AT---GTAAATT--C-TAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AAACGTAT---A--------T-------A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AA---TCT--------A-TC--C-------A-------------------------C-CT------C-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATAGTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---T-G-------A-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-------------------------------GAA-ACC-------C---A--G-ACTATTT--T-------CTT-A-C-T---CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------tcactagtttttcccccgcaattacatcattaatgtaaattctaagactgttgataaacgtatataggcctagcagaaagatcaagactgttaaatctatccacctcttcttccataattatagtctgaagcggtgccaacacaactgacaccatttcacgacgaaacccagactattttcttactcccgtcttagtcccaacaaacacattgtgtttatccaacaaagcgt
gi|23 : gatggataatctgaatttctgggcttccgcgattcCACTGCG--C-GAGA-TT-TT-GT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCAAAAA-----------------------C-A-----------------A-A---TT-T-ATGTT---G------------------------------A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATATAATCTGAATT-T-C-ATG-G-CATGGGCTTC----------CGTA-AAATT----------T-T-ATA---CGTA------AATtgtgtttatccaacaaagcgt
gi|24 : atctcatttcacagattttaacaatttaaactgtttaacaatcgaggaaactaatggaaa-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AATTG-TGatatg
gi|25 : -------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----AACACATCACA-------------T----------G----TTTATCCAA-------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GCTG-AA-A----A-TC-A--TTTTTTTTTAAAAAGA-------A--A-AAGT-T---TTC-C---ATT-C-CG-AA-TG-TGTTAA--TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------agaatgactatcaatatgattaggaatcagctaattattgatccgctctgacttagatcggcgtgcggggggagagatggaaagccgttagttcaattgggctaga
gi|26 : ccatttttcgactcatgatttcttacaaatcttggCTATG--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GAA-CTT---AAAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG--------------A-A----------------G----A----AC--AATTT--CA--T-GC--A-------CAAG---AACAACTA--A--TAG-AAG----TT-CTAA-GA-TT-TG-A---G--C--C-GTC-GA-GAG-
gi|27 : atcccattttacattttatggctttgaactttttacagccagcgtttacaatcgaggaaaatctGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AT-C---AT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-----------------------------T----A---TC-A---TT-TCATGT-----------------------------------A-------CAAG---AACAACTA--AATCAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-C
gi|28 : tacgactttgaatttgtttacaatcgaggaaactcgcgcaatgaagttatggaacaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTG-CTT--CCta
gi|29 : aatcccatttcacagtttaacgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaCCACTGAG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAAAAAAA--ATCC----------------C-AGCG----TAGA-A---CA-A---TT-T-tcgacaacagtttgagcaagcaacataatcggagtcgctaaaatt
gi|3 : tacaatcaaggaaactcgtacaatgaagttatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GTTC-T--GTA-CTT--CCCAAAACA--A-CC-------------------------------------------T-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTTTTAA--A-GTT-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TC-TTAA-A---T-CGTA---G--CA-A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-TATGGCA-CATGGGCTTC----------CGTA-A--------------TAT-ATA---CGT--------ATTT----TGTACATG------G-TATA----CTCAAC---TGG---TA-T--TTTTTCC---C-----GCC-ACA--T-----G--A-CTTA-----A---TA-AC---GTGAATT--CTTAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-GG-----G--CTTAGGTC---GA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AG---TCT--------A-TCAAA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------T-T--------ATATTTT---AGC--CGTGCC---C-A---CA--AC---C-G-------TCC-----A--CTGAA-TT-C-AC------GA-----C-A-----------------------------------C-CA-TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A---TC-C--C--AACA-A-----AC-------CA-------------C----------A----TCATTAATTGATCCAAC-------A-------------A-A----G-CTAT-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G--TATTT---------TA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-CGCG-AA-TGTTGT-----ACT------T----CTT-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-AT-T-C--AG-ATTA-TCGGTTCTT--TT---AGCC-GTG-ACTG-TA-TAGA-T-GCAGTA
gi|30 : tttccatttcacagtttaacgattttaaacttgttacaatcgaggaactaatggaaGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AC-C---GT-C-T--GTA-CTc
gi|31 : atttacgacttgaattttgttaaatcggaggaactcgcacaatgaagtttgggaaacaCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C--A-CA-A-----A--------TA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-A-AC---G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TACT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--T-------------------------A-AAAT-T---TTT-C--
gi|32 : CC--A-A-----T-GT----T-A--------T--------G-TT--A-------A-------------------------A-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---GA--AC---C-G-------T-C-----ttcta
gi|33 : gcaaagaaacccacCAT-T-GG-CTA-T-T-G--TTTT-C-A--T-C--TAAATTA-TC-GTTC-TCTTT---AG-A-GTG-ACAG-TG-TAGA-TGGCAGCA
gi|34 : -----TCAT-T-GG-TTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|35 : AT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-G-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGc
gi|36 : ----A---TA-A---TT-T-TTGCT---G----A-C--AC--ATTTC---A--T-GT--A-------CAGG---AACAACTA--A--TAc
gi|4 : tagaG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA----CC----------------C-AGTG----AGA--A---TA-A---TT-T-ATGTTCTCG----A----AC--ATTGT--TA--A-GTA---------CA-G---AA-AAGTA-----TAG-AAG----TT-TTAA-GAGTT-CG-A---GAGCGGA-GTC-GA-GGG-ATA-AAT-TGGATT-TGC-ATG-G-CATGGGCTTC----------CGTA-A--------------T-T-ATA---CGTA------A---TATAATGTA---------------A----CTC-A----TGG---TT-T--TTTTT-C---C-----G-C-A-AG-T-----G--A--TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--C-TAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AG---TAT---A--------T-------A-GG---------CTAG--C--A-A-AAA--ACC--A-ACGC-CTGGTA---T-A-AG---T-T--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-CTTTCCAT----------T-T--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---A-A---C---AC---C-G-------T-C-----A--CTA-A-TT-C-AC------GA-----C-A-----------------------------------C-CA-TCTC---A--G-ACTGTT---T-------CCT-A-C-T---CCCG--TC-----------T-A--GTC-CCAC--AACA-A-----CT-------CA-------------T----------G----TTGATC----------C-------AACC----------A-A----G-TT-A-A-G-AA-TT-CC--TGC---------GTTG-AA-A----A-T--G----TTT---------AA-------A--GCAAGT-T---T-----------------G-TG--GT-----TCTA-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTATT----C-----TCATAT-GG-CTATA-T-A--TTTTTC-A--TAC--AG-ATGA-TCAGTTCTT--TT---AG-C-GTG-CATG-TA-TAGAGTGGCA
gi|5 : aatctcatttcacagtttaacgatttataacttgttacagtccgaggaaacgtaatggaacgctcgagCCGCTGTA--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGTG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--AAGTA-A-------CATG---AACGAGTA--A--TAG-AAG----TT-TGAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GG--ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTCCGTAATTATACGTA-AANNNNNNNNNNNNNN-N-NNN---NNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TG-TATG----CTC-AC---TGG---TA-T--TTTTT-C---C-----G-C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--C-TAAGA---C-C-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-C--GT----T-A-AG---TCT--------A-TC--A-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------CCCCGGGCACGAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTT-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGTAT---TTC-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGCATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|6 : CCGCTGTGG-C-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CC----AAA--A-C--------------------------------A----A-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--ACCCATTTT--TA--A-GTA-C-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-AA--G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-A-TCTGAATTGT-C-AGG-G-CATGG-CTTC----------CGTA-AAATT----------T-T-ATA---CGTA------AATG--------ACA-------TG-TATA----TCA-AC---TGG---TA-T--TTTTTTC---C-----G-C-A----T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTCAATT--C-TAAAAGAAC-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-GGC----A--CCTAG--CT-AGA-AAAGAACC--A-A-GA-CT-GT----TTA-AG---TCT----------TC--A-------AT------------------------C-CT------G-T---T---TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAA-GC-AG-TG-CG--C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------T-G-----C-CA-TCTC---ACCG-ACGTT----T-------CCCTA-C-T-C-CCCG--TC----------TT-ATAGTC-C--CC-AACA-A-----A--------CA-------------CAATCAT----G----TTGATGCCAA------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AAATT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-T--G--TTTTTA--------AA-------A--A-AAGT-T---TTTCC--GATT-C-CG-AA-T--TG------TCTG-----TCAG-TTT-T-T------------------------------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-CAAAGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|7 : ttaacaatcgaggaacactaatggaaCCGCTGTGGGC-GAGAATT-TG-TTTC---GT-C-T---TA-CTTTTCCCAAAA------------------------C-A-----------------A-A---TT-A-ATGTT---G----AAC--AC--GTTTTTTAA--A-GTA-A-------CAAG---AGCAAGTA--A--TAGAAAG----TT-TT-A-GA-TTCCG-A---C--A--A-GTC-GA-GGGAATA-AATCTGAATT-T-A-T-G-G-CATGGGC-TC----------CGTA-A--------------A-T-ATA----GT---------------ACGTAT-TTTTACATG-TA-A----CTC-AA---CGG---TA-T--TTTTT-C---C-----G-C-A-A--T-----GA-A-CCTT-----A--ATA-AC---GT-AATT--C-TAAGA---C---GT-T---GA---------T--A----AAT------------T-------ATAG-----G--CTTAG--C----A-AAG--A-C--A-A-GA-CT-AT----C-A-A----TCT--------A-CT--C-------A-------------------------C-CT------GTT---T-C-TTCCAT----------TGT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---CAAGAC---C-G-------TCC-----A--CT--A-AT-T-AC------GA--------------------------------------AC-ACC-CA-TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATATGATCCAAAA-C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-GAAA-TT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G---TTTA---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-GA-AA-TG-TGT-----AC------------TTT-C-TA------------------------N---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-ATT-ATTTTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GGG-ACTG-TA-TAGA-
gi|8 : aatcctatttcacagtttaacgatttttaacccttgtttaacaaatcgaggaaactaatggaataCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCC-AAAAT--A-CC----------------C-AGTG----TAGA-A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT---A--A-GT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTC----------TGTA-A--------------T-T-ATA---CCTA------AATACA----------------TG-TATA----CTC-AC---TTG---TA-T--TGTTT-C---C-----G-CAA-A--T-----GTTA-TGTCGATGGA--TTAGATTTGGTGAATC--T-TAAGA---CTT-GT-TCAAAA---------T--A-----AT---A--------T-------A-A
gi|8 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaa-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AA-Ttaaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|9 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaatacatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaatCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-A---GT-C-T--GAA-CTT-----AAAAAACAA-CC----------------C-AGCG----T----ATAACA-A---TT-T-CTGTT---ATATAA-C--AC--ATTTT--------GTGTA-------CAAG---AACAA----------------------CTAA-AA-TT-CG-A---G--C--C-ATC-GA-AGG-ATA-AATATGAATT-T-C-TAG-G-C-TG-----C----------AGTA-A--------------A-C-ACA---TGTA------CATAC------------TCAC-TGGTATA--------AG---TGG---TA-T--TTTC--C---C-----G-C-A-A--T-----T--A-CTTC-----A--TT----------------C-TCAGA---C-T-GA-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A---------------------------------------GA-CT-GT----T-A-AG---TAT--------A-TT--ATA-----A-------------------------C-CT------G-T----------------------------------ATACTCTGAA--T-CGGTG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TTTC-AC------GT-----C-A-C-----------------CC------A-GAC---T-TG-TTTC-------------------------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-A--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-ATA----G-CT-T-T-G-AA-TT-CG--TTCT--------ACTT-AA-A----A-TC-G--TTTT------------------------AAGT-T---TTT-C--GATT-T-CG-AA-TG-TTT-----TCGG-----T--A-TAT-T-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----NNNNC-TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTCCC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-ATG-ACGG-TA-TAGA-TGtg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555 3333333333333333333 888888888888888888888888888888888888 11 11111 11111111 1111 22222222222222222222222222222222 1111 11111111 333333333333333333333333333333333 222222222222222222222 1 1111 111 111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111 2222222222222222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 44 2 2 4 2 2 333 2 4 22 2 22 11 0 888888888888888888888888888888888888888888 2 777 2 33 777 4444 6666 55 4444444444444444444 333 3 44444 2 4444 2 2 2 4 2 99999999999 2 4 2 2 2 6 2 88 22 2 2 444444444444444444444444444444444444 2 2 2 666666 2 2 2 666 333 666 33 00 333 11111 6666 6 2 55 33333333 2 55555 55 4 333 22 2 666 2 4 2 333 888888888 22 0000 77777777777777777777777777777777 55 55 1 2 33 22 2 2 2 4 0000 2 2 555 00000000 2 333333333333333333333333333333333 2 555555 4 333 2 4 777777777777777777777 0 2 3 6666 2 333 4 111 22 777 2 6666666 2 99999 22 5555 6 4 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 2 2 2 2 66 3333333333 2 55 2 22 44 2 77777 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 6666 2 2 444 1 7 1 22 44444444 2 4 7777 2 4 444 5555555555555555555555 2 2 777 2 555 2 2 2 2 2 00000 6666666666 2 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 2 2 2 55 2 55 4 33 2 4 4 33 333 2 2 4 1 2 2 4
lowQualScore : .. . . . . . ... . . .. . .. .. . .......................................... . ... . .. ... .... .... .. ................... ... . ..... . .... . . . . . ........... . . . . . . . .. .. . . .................................... . . . ...... . . . ... ... ... .. .. ... ..... .... . . .. ........ . ..... .. . ... .. . ... . . . ... ......... .. .... ................................ .. .. . . .. .. . . . . .... . . ... ........ . ................................. . ...... . ... . . ..................... . . . .... . ... . ... .. ... . ....... . ..... .. .... . . ..................................................................................... . . . . . .. .......... . .. . .. .. . ..... ............................................................................. . .... . . ... . . . .. ........ . . .... . . ... ...................... . . ... . ... . . . . . ..... .......... . . ........................................................................................................................ . . . . . . .. . .. . .. . . . .. ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 0 0 0 0 0 555 0 0 88 0 99 66 5 333333333333333333333333333333333333333333 0 000 0 44 444 5555 4444 00 9999999999999999999 777 2 66666 2 7777 2 2 2 4 4 88888888888 1 2 2 2 2 7 2 22 22 2 2 777777777777777777777777777777777777 4 4 5 444444 2 2 2 999 999 111 11 77 777 88888 6666 3 1 00 22222222 1 33333 00 2 777 99 1 666 1 2 1 777 444444444 99 8888 44444444444444444444444444444444 33 33 5 2 11 88 0 0 0 0 2222 0 0 555 00000000 0 222222222222222222222222222222222 0 888888 0 555 0 0 666666666666666666666 1 5 7 5555 1 222 2 111 99 555 0 5555555 0 88888 99 0000 3 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 1 1 1 88 5555555555 0 55 0 88 88 0 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 2222 0 0 333 9 6 9 66 55555555 0 0 0000 0 0 888 3333333333333333333333 0 0 000 0 999 1 1 1 1 4 66666 5555555555 7 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 4 4 4 4 66 2 33 4 11 2 4 4 11 999 2 2 4 0 2 2 4
consensus : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--AGTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GAGGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-GC-ATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-ATA---CG-TAAAT-A--C--TA-A---TG-T-ATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--AC-TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
Reference ( family-2759 ) : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--AGTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GAGGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-GC-ATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-ATA---CG-TAAAT-A--C--TA-AC-CTG-T-ATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--AC-TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|1 : GTG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCCAAAAA--C-CA----------------C-AGTGAGAAT----A----G-A---TT-T-ATGTCTCGA----A-C--A---ATTTT--AA--AGT--A-------CAGA---AGCAAGT---A--TAG-AAG----TTATTAA-GA-TT-CG-AGAGG--CGGA-GTC-GAGGG-ATA-A--TTGATTT-G-CATGG-CA-ATGGGCTTC-CGTATA----T-TAATAAAGCG-TATATCA--CAATA-A--ATG-T-AAA------CGTC-A-C---T-G---TATCTT--CTTTC-C---C-----GA---C-A-A--T-----G--AC-TTC-----A--TTA-AC---GTTGATTACTT-AAGA---C-TAGT-T---G----------T--A----GGT---A--------T-------ATAG-----G--CCTAG--C--A-A-AAG--ACC--A-C-GC-CTGGTA---T-A-AG---TCTAACCCATGA-TCA-------A-------------------------CACT------GTT---T-C-TT--AA-------AA-TATACCATTTAATATTCTGAAGGCAAGATG-----C-A---C---AC---C-G-------T-C-----ACTCC--A-TTGC-AC------GA-----C-A-A-----------------C-------A-A-------CA-TCTC---A--GAAC-------TGTGTTTGCCT-A-C-T-C-CCCG--TC-----------T-A--GTC-C--C--GACA-ACC---A--------CA-------------CTCATGTTGATG----C---------------C-------AACC----------A-A----GTCT-TAA-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-A---CGTT---------AA-------ACTA-TAGT-T---TGT-----GTT-T-CT-AC-TG-TTT-----TTTA-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGTTAT----TCTGCATGAT-G-GG-CTA-A-TAA--TTTTTC-A--T-C--AGAATGA-TC-GTTC-T--TTTTAAG---GTGCACTG-TATTAGAGTGGCAG
gi|10 : atctcactttcacagtttaacgatttatttaaacttgtttacagtcgaggaaaacgtaatggaactggctgaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAA------------------------C-A-----------------A-A---TC-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA---GAA-A-------CAAG---A----GTA--A----G-A------TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTT-GAGG--ATA-AATCTGAATT-T-T-AGG-GC-ATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-ATA---CA-TAAAT-A--C-----A---TG-T-ATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--AC-TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT------------T---------AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-TA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAAAGC-A-GTG-C---C-A---CA--AC---G-G-------T-C-----A--CTAAA-TT-C-AC-------------C-G---------------------------------ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------
gi|10 : tacaatcgaggaaactaaagtaa-AA-TT-C---TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------T--A-AAGT-T---TTT-C--GAT----CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-TATA---------AAC-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNT-----TCAT-T-GG-CTA-A-C-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-C--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAcaattctgctgttgaaaatcgtttttaataaagtttttcgatcgaatgtgttctgtgttttataaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaacatttttcatcagaattatcgttccttagcgtgactgtatagatggcagtac
gi|11 : tacaatcgaggaaactaaagtaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaacaaatctatgttgacacattttaagaaacaagagtaagattttaagattcgagcagttgaggataaatctgaattttagggcatgggcttctgtaattatacataaatacatgtatactcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagactgttgatatattaggcctagcagaaagaccaatactgttaagtctatcaacctgttcttccattatatattctgaaagcagtgccacaacggtcactaaattcaccgacccatctcagaccCACTGTT--C-GAGA-TT-AA-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAACAAAA--A---------------------AGCG----T----A---GA-AAAATC-C-CAGTC---G----A-C--AC--ATTTC--A----TTT-A-------CAAG---AACAACTA--A--TAG-GAT----TT-CTGA-GA-TT-CA-A---G--T--C-GTC-GAGGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TAG-GC-------TTC-TGTA-A--------ATA---CA-T-------------------G-T-ATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTC--C---C-----G----A-A-T--T-----GT-CC-TTC-----G--TTA-AC---GTACATT--TG-AAGG---C-T-GT-T---GA---------TGCA----TGT---A--------C-------A-AA-----TATCCAAG--C--AAA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------G-CT------G-T---G-C-TTCCAT----------TAT--------ATACTCCGAAGTC---GTG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TTTC-CC------GA-----CTC-C-----------------C-------A-GA-------A-TGTT---------T-------T-------CTT-A-T-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTC-T--C--AAGA-A-----AATCAT---CA-------------T----------GCTTAT---------------CCAGCAATA-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------GTTA-AG-A----A-TT-G--TTTTT---------AA-------A--A-AGG--T---TTT-C--GATT-C-AG-AA-TA-TTT-----TCTG-----c
gi|12 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaag-GAGGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-GC-------TTC-CGTA-A--------ATA---C---AAGC-A--C--T------TG-------------------C---TGA---TG---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--TTACATGC-AC-TTC-----A--TTA-AC---GTGACTT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GG---------T--AT---TCT---A--------T-------A-GG-----A--CTT-G--T--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATACTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-ACC-----------------C-------A-GAC--------TTTT---A-------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TCTAGACGCGTATT-A--GTA-T--C--TACA-A-----A--------CATATCATGTTTATCC----------G----A---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTC-------------------------AAGT-T---TCT-C--TATT-C-CG-AA-TG-TTT-----TTTGCATANN--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----C-----TCGT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTA-ACAG-TA-TAGG-TGGCAGCA
gi|13 : ----A---CA-A---TTGT-CTGTT---G----A-TCGAC--CTTTC--AT---GTA---------CAAG---A-CAACTA--A--TAG-AAG----TT-TTAATGA-TT-CG-A---GGGT--A-AT---AGGG-ATA-AATCTG-------------------GGCTTC-C---------------A---CG--------------A-A---TG-T-ATA------C-TC-T-C---TGG---TA---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--T-----T--AC-ATC-----A--TTA-A----GTGAATT--CT-AAGA---C-T-AT-T---AA---------T--A----TAT---A----------------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AA---TCT--------A-CCA-------A-------------------------C-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATACTCTG-TAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-T----------------C-A-C-----------------CA------A-GA----T-TG-TTT------------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C---ACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTTTATCCAA--C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--TT--------------------------AAAT-T---TTT-C----TT-C-TG-TA-T
gi|13 : agTTTC-C--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-AA-TAGA-TGGCGGCAaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|14 : agacaattgtctgttgatcgacctttcatgtacaagacaactaatagaagttttaatgattcgagggtaatagggataaatctgggcttccacgaatgtatactctctggtattttcccgcaattacatcattaagtgaattctaagactattaatatataaaggcctagcagaaagatcaagactattaaatctaccaaccttttcttccataattatactctgtagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcaccaagattgttttcccactccccgtcttaatcccacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttcgaatccctgctattgaaaatcgttaaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-----GT-CCT--GAA-CTT--CC----AAA--A-CC----------------AGAGCG----TTAGAA---CA-----TT-T--CGTC---G----A-C--ACC-ATTTC--AA--AGTA-C-------TAGT---AACAA-CA--T--TAG-ACG----TT-CTAA-GG-TT-CG-AA--G--T--ACGTC-GAGG--ATG-AATA-AAATT-T-C-TGG-GC--TG-----C-CGTA-A----T-T-A-----------AT-----------------T-ATC------C-TC-A-C---TGG---TA---T--CTTTA-C---CAGTA-G----T-A-ACAT-----GT-AC-TTC-----A--TTACGT---GTGAATT--CT-CTGA-----T-GT-T---GA---------T--A----TGT---A--------T-------A--T-----G--CCTAG--TTGAAA-AAA--ACC--A-A-GA-CT-GG----T-A-AGA--TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-GT------T-T---T-C-TTCCATT------AA-TAC---------TAATCTTGAAGC-AG-TG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------G------C-A-C--------------------------------TT-CA-GCT----A--G-ACTTTTT--T-------CCC-A-T-G-CGCAGG--TC----------TT-A--TCC-C--C--AACA-C-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTACTCAG----C-------A-------------A-A----G-CT-T-ATG-AA----CC--TGcg
gi|15 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagCGCTGAA--CAGAGA-TT-TTCTT-CAAGGT-CAT--TTAACTT--CACAAAA-------T----------------C-ATCA----T----T---CATA---CT-T-ATGTG---G----A-C--AC--ATTTT--AATTAGTA-AGTCAAAGTAAGTACAAAAAGTAGAA--TAA-AAGATAGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTCTGAGGG-ATA-AATCTGAATT-T-CATGG-GCCATGGGCTTCGCGTA-A----TAT-A-A---CG-TA--T-T--T--TATACATTG-TTATATCTTCTC-TC-A-CGT-TGGCTCTA---TAGTTTCT-C---CCTCATG----CTA-A--T-----G--AGATTC-----A--TTA-AC---A-GAATT--CT-A--------T-GTAT---GA---------C--A----TACTGAA--------TTTTCATGA-AGAAGTAG--CCTAG--C--ATATAAG--ACCTTATA-GA-AC-GTTATAT-A-AGGATTCTTA------A-TCACGTAACTA-------------------------T-CT------G-TTTCT-T-TTCCTTC------AACTAT--------AAATTTTGAA
gi|16 : cccatttctagcagttaacgatttataacttggtttacaatcgaggaaacactatggaatacg-C---C-----G----C-A-T--T-----T--AC-TAC-----AGATTG-CC----TGAATT--CT-AAAAAC-T-T-GT-T---GT---------T--A----AAT---AATACAAGTT-------A-AA-----GGTCCTA------AGC-AAA--ACC--A-A-GAACT-GT----T-ACAG---TTT--------G-TCA-------AGTATT--------------------C-GTCAAGACG-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ACTTACTG-AAGC--GGTGAC---CAA---CA--ACGTACAG-------T-G-----A--TA--A-AT-CGAC------GA-------A-C-----------------A-------G-GACTGTT-TATTCTT---A----------------------CC-A-CTT-C-CCCAATTC----------TT-A--TTCTC--C--CACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGCTCTTATCC--A-ACACGG-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-AAC--A-TC-G--GTT-----------------------A-AGAT-G---TTT-C--GNNN-N-NN-NN-NN-NNN-----NNNN-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCACTG-----T-----GCAC-T-----TA-A-T-A--ATTATCAA--T-C--AGAATTAGTC-ATGC-T--TT---AG-C--CG-ACAG-CG-TAGA-T--CAGCA
gi|17 : C--A-G-GG-TT-GT------A-AG---TAT--------A-TCA-------A-------------------------C--T------G-T---T-C-TCCCAT-------AA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-C---C-A---AC--ACA--C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC-----------------------------------C---------GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-GT-------TGTTTT--CCC-A-C-T-C-CC-G--TC----------TTTA--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G---TTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GGTT---TG-AA-TG-TGT-----CCTG-----T--G-TTT-T-TANNNNNNNNNNNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGCAc
gi|18 : tctagaaaagttcaataaagttttcaTCCAT-------GA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-A---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-CCGTCTCAGA-----C-T-CTTATTCCCCGTCTAATTC-------ACAAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------TGTTTT--CCT-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TTTCC--TGAT--------GTTG-AA-A----AATC-G--TTTT----------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GTTT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TAT--------AACTNNNNN-----NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GGCCTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-CAGTG-ACTG-TA-TATA-TGGCAc
gi|19 : C---C-G-------T-CCA---A--CT--AATT-C-GT------GA-----C---------------------------------C-ACC-CA-TCTCCAAG--G-AC-------TGTTTT--CCT-AAC-T-C-AACGG-TCCT--------TT-AAGGTC-C--C--AACA-ACCAACATTT-----CA-------------T----------G----TTTGAATCCAAC----C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GGTGAAA-A----A-TC-GGCTTTTTGTTA-----AA-------A--A-AGGT-T---TTT-CGGGATT-C-CG-AA-----GT-----TGTG-----T--ACTTC-T-TA---------ATCAATTCTGATTAGA---------AATCAAGCTCCTTTTGATCCGGCTCCCATTAGGATCGCTTTGCCTGACTTATAGAGCGTACATAGCC--AGTTATT----T-----CCAT-TGGG-CT--A-T-A--TTTTCC-AACT-C--ACAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTGAACTGTTA-TAG--TGGCAGTagt
gi|2 : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---TT-C-T--GTA-CTT--CCC-CAAAA--A-CC----------------C-AGTG----TAGG-A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT---A--AGT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GAGGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-GC-ATGGGCTTT-CGTA-A----T-T-ATA---TGTTATAT-A------------TG-T----------C-TCTG-C---TGG---TAT--T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--AC-TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT--------------------A---------T--A----T------------------------AG-----A--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----G-A-AG---TCT--------A-TCA-------AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CT------G-T---T-CATTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-AAGTG-C---C-A---GA--AC---C-----------CAGAGGA--TC--A-TT-CAAT------GT-----T-A-C-----------------C---------GAC-ACCTCA-TCTC---A--G-ACCTGTTATT-------CCC-A-C-TAC-CCCGC-TCT---------TT-A--GTT-C--CCAAACAGA-----A--------CA-------------CACTG------G----TTCGTTATCCAA----C-------A-------------A-A----G-CT-TAA-G-AACTT-CCTTTGCT--------GCTG-AA-AAACCA-TT-T--TTTTT---------AAACCGAAGA--A-AAGT-T---TTC-----ATTCC-CGCAA-T--TGTTAGAATCTG-----T--G-TTTAT-TA---------ATC-----------AACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GT-TAA-A-T-AT-TTTTTC-A--TCC--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|20 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaCGCCGTG--T-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-TTGATT-CCC--CCCAAAAAA--A-ACAAAAACAAAAAAAAAAC-AGCG----T----A---GA-AGAATT-T-TTGTT---G----A----A---ATTTC--A----GTA---------CA-G---AAC---TA-----TGG-AAG----TT-CTAA-GA-TTGCG-A---G--T--C-GTC-GAGGGGATA-GATCAGA-TT-T-T-TGG-G--AT----TTC-CGTA-A----T---ACA---TG-TA--T-A--T--TA----CTG---------------C-A-C---TG----TA---T--CTTT------------GGGAAC-A-A--T-----G--A--------------TA-A-----TGA------T-AAGA---C-T--T-A---GT---------T--AC---TAT---A--------T-------C-AG---------CT-G--C--AGA-AAC--TCC--G---GA--T-GT----T-A--G---TCT--------A-TCA-----------------------------------CT------G-T---T-T-TCTCAT-------c
gi|21 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccgA------C-TC-A-CATCTAG---TA---T--TTTCC-CACCC-----G----C-A-A--T-----T--AC-TTC-----AA-TTA-AC---GTTAATT--CT-AAGA---C-TGGT-T---GAATAATTACGT--A----TAT---ATGT-----T-------A-AG-----A--CCTAGA-C--AGT-AAT--ACG--A-G-AG-CA-GCG---T-A-AA---TCT--------ACCCA-------G-------------------------G-CT------G-T---TAT-TTTCGTCGCAAAAAA-T-T--------ATAGTCTGAAGGG-CGGTG-C---T-A---AA--ACA--C-AAAAAAATT-C-----A--TC--T-GT-A-AA------GAAACCCC-A-C-----------------C-------A-GACTATT-TT-TCTC---T--A-AC-------T-------CCT-G---G-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--A--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------t
gi|22 : -GATGG-ATA-A-TCTGAATT-T-C-TGG-GC-------TTC-CGCG-A----T-T--------------------------------C-ATA------C-TC-A-C---TAG---TT---T--TTCCC-C---C-----G----C-A-A--T-----T--AC-ATC-----A--TTA-AT---GTAAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AAACGTAT---A--------T-------A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AA---TCT--------A-TCC-------A-------------------------C-CT------C-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATAGTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---T-G-------A-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-------------------------------GAA-ACC-------C---A--G-ACTATTT--T-------CTT-A-C-T---CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------ttgtgtgtatccaaacaacagg
gi|23 : CACTGCG--C-GAGA-TT-TT-GT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCAAAAA-----------------------C-A-----------------A-A---TT-T-ATGTT---G-----------------------------A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GAGGG-ATATAATCTGAATT-T-C-ATG-GC-ATGGGCTTC-CGTA-AAATTT-T-ATA---CG-TAAAT-A--tgtgtttatccaacaaagcgt
gi|24 : atctcatttcacagattttaacaatttaaactgtttaacaatcgaggaaactaatggaaa-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AATTG-TGtatg
gi|25 : -------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----AACACATCACA-------------T----------G----TTTATCCAA-------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GCTG-AA-A----A-TC-A--TTTTTTTTTAAAAAGA-------A--A-AAGT-T---TTC-C---ATT-C-CG-AA-TG-TGTTAA--TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------agaatgactatcaatatgattaggaatcagctaattattgatccgctctgacttagatcggcgtgcggggggagagatggaaagccgttagttcaattgggctaga
gi|26 : ccatttttcgactcatgatttcttacaaatcttggCTATG--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GAA-CTT---AAAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG--------------A-A----------------G----A----AC--AATTT--CA--TGC--A-------CAAG---AACAACTA--A--TAG-AAG----TT-CTAA-GA-TT-TG-A---G--C--C-GTC-GAGAG-
gi|27 : atcccattttacattttatggctttgaactttttacagccagcgtttacaatcgaggaaaatctGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AT-C---AT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-----------------------------T----A---TC-A---TT-TCATGT----------------------------------A-------CAAG---AACAACTA--AATCAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-C
gi|28 : tacgactttgaatttgtttacaatcgaggaaactcgcgcaatgaagttatggaacaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTG-CTT--CCta
gi|29 : aatcccatttcacagtttaacgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaCCACTGAG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAAAAAAA--ATCC----------------C-AGCG----TAGA-A---CA-A---TT-T-tcgacaacagtttgagcaagcaacataatcggagtcgctaaaatt
gi|3 : tacaatcaaggaaactcgtacaatgaagttatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GTTC-T--GTA-CTT--CCCAAAACA--A-CC-------------------------------------------T-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTTTTAA--AGTT-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TC-TTAA-A---T-CGTA---G--C--AAGTC-GAGGG-ATA-AATCTGAATT-T-TATGGCAC-ATGGGCTTC-CGTA-A----TAT-ATA---CG-TA--T-T--T--TGTAC-ATGGT-ATA------C-TC-AAC---TGG---TA---T--TTTTT-C---CC----G----CCACA--T-----G--AC-TTA-----A--T-A-AC---GTGAATT--CTTAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-GG-----G--CTTAGGTC---GA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------AAA-----------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------T-T--------ATATTTT---AGC-CG-TG-C---CCA---CA--AC---C-G-------T-CC----A--CTGAA-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A------------TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A---TC-C--C--AACA-A-----AC-------CA-------------C----------A----TCATTAATTGATCCAAC-------A-------------A-A----G-CTAT-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G--TATTT---------TA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-CGCG-AA-TGTTGT-----ACT------T----CTT-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-AT-T-C--AG-ATTA-TCGGTTCTT--TT---AGCC-GTG-ACTG-TA-TAGA-T-GCAGTA
gi|30 : tttccatttcacagtttaacgattttaaacttgttacaatcgaggaactaatggaaGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AC-C---GT-C-T--GTA-CTc
gi|31 : atttacgacttgaattttgttaaatcggaggaactcgcacaatgaagtttgggaaacaCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C--A-CA-A-----A--------TA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-A-AC---G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TACT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--T-------------------------A-AAAT-T---TTT-C--
gi|32 : CC--A-A-----T-GT----T-A--------T--------G-TTA-------A-------------------------A-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---GA--AC---C-G-------T-C-----ttcta
gi|33 : gcaaagaaacccacCAT-T-GG-CTA-T-T-G--TTTT-C-A--T-C--TAAATTA-TC-GTTC-TCTTT---AG-A-GTG-ACAG-TG-TAGA-TGGCAGCA
gi|34 : -----TCAT-T-GG-TTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|35 : AT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-G-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGc
gi|36 : ----A---TA-A---TT-T-TTGCT---G----A-C--AC--ATTTC---A--TGT--A-------CAGG---AACAACTA--A--TAc
gi|4 : tagaG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA----CC----------------C-AGTG----AGA--A---TA-A---TT-T-ATGTTCTCG----A----AC--ATTGT--TA--AGTA---------CA-G---AA-AAGTA-----TAG-AAG----TT-TTAA-GAGTT-CG-A---GAGCGGA-GTC-GAGGG-ATA-AAT-TGGATT-TGC-ATG-GC-ATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-ATA---CG-TAA-T-A-----TA-A---TG-T-A-A------C-TC-A-----TGG---TT---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-AG-T-----G--A--TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AG---TAT---A--------T-------A-GG---------CTAG--C--A-A-AAA--ACC--A-ACGC-CTGGTA---T-A-AG---T-T--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-CTTTCCAT----------T-T--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---A-A---C---AC---C-G-------T-C-----A--CTA-A-TT-C-AC------GA-----C-A-----------------------------------C-CA-TCTC---A--G-ACTGTT---T-------CCT-A-C-T---CCCG--TC-----------T-A--GTC-CCAC--AACA-A-----CT-------CA-------------T----------G----TTGATC----------C-------AACC----------A-A----G-TT-A-A-G-AA-TT-CC--TGC---------GTTG-AA-A----A-T--G----TTT---------AA-------A--GCAAGT-T---T-----------------G-TG--GT-----TCTA-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTATT----C-----TCATAT-GG-CTATA-T-A--TTTTTC-A--TAC--AG-ATGA-TCAGTTCTT--TT---AG-C-GTG-CATG-TA-TAGAGTGGCA
gi|5 : aatctcatttcacagtttaacgatttataacttgttacagtccgaggaaacgtaatggaacgctcgagCCGCTGTA--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGTG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTTA-AA--AGTA-A-------CATG---AACGAGTA--A--TAG-AAG----TT-TGAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-GC-ATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-ATA---CG-TAAA
gi|5 : TG-T-ATG------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--AC-TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-C-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-AG-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-C--GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------CCCCGGGCACGAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTT-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGTAT---TTC-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGCATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtatgctcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagaccgttgatatatataaggcctagcagaaagaccaagacgttaagtctatcaacctgttcttccataatatatattctgaaagcaggtgccacaaccgtcactattcacgacacccccgggcacgacacccatctcagactcccactccctgtcttagttccaacaaacacgtcaaagcttagaattcctgttgttgaaaatcgtttttaaaaaagtatttccgattccgaatgtgttctgtgtttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaatatttttcatcagcattatcgttctttagcgtgactgtatagatggcagta
gi|6 : ccgctgtacgagatttgtttgtctgtacttcccaaaaaaacccagtgtacaatttatgttgacacattttaaaagtaacatgaacgagtaatagaagtttgaagattcgagcagtcgaggataaatctgaatttctgggcatgggcttccgtaattatacgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCGCTGTGG-C-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CC----AAA--A-C--------------------------------A----A-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--ACCCATTTT--TA--AGTA-C-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-AA--G--C--A-GTC-GAGGG-ATA-A-TCTGAATTGT-C-AGG-GC-ATGG-CTTC-CGTA-AAATTT-T-ATA---CG-TAAAT-G--------AC-ATG-T-ATA------T-CA-A-C---TGG---TA---T--TTTTTTC---C-----G----C-A----T-----G--AC-TTC-----A--TTA-AC---GTCAATT--CT-AAAAGAAC-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-GGC----A--CCTAG--CT-AGA-AAAGAACC--A-A-GA-CT-GT----TTA-AG---TCT----------TCA-------AT------------------------C-CT------G-T---T---TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAA-GC-AG-TG-CG--C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------T-G-----C-CA-TCTC---ACCG-ACGTT----T-------CCCTA-C-T-C-CCCG--TC----------TT-ATAGTC-C--CC-AACA-A-----A--------CA-------------CAATCAT----G----TTGATGCCAA------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AAATT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-T--G--TTTTTA--------AA-------A--A-AAGT-T---TTTCC--GATT-C-CG-AA-T--TG------TCTG-----TCAG-TTT-T-T------------------------------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-CAAAGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|7 : ttaacaatcgaggaacactaatggaaCCGCTGTGGGC-GAGAATT-TG-TTTC---GT-C-T---TA-CTTTTCCCAAAA------------------------C-A-----------------A-A---TT-A-ATGTT---G----AAC--AC--GTTTTTTAA--AGTA-A-------CAAG---AGCAAGTA--A--TAGAAAG----TT-TT-A-GA-TTCCG-A---C--A--A-GTC-GAGGGAATA-AATCTGAATT-T-A-T-G-GC-ATGGGC-TC-CGTA-A----A-T-ATA----G-TACGT-ATTT--TT-AC-ATG-T-A-A------C-TC-A-A---CGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----GA-AC-CTT-----A--ATA-AC---GT-AATT--CT-AAGA---C---GT-T---GA---------T--A----AAT------------T-------ATAG-----G--CTTAG--C----A-AAG--A-C--A-A-GA-CT-AT----C-A-A----TCT--------A-CTC-------A-------------------------C-CT------GTT---T-C-TTCCAT----------TGT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---CAAGAC---C-G-------TCC-----A--CT--A-AT-T-AC------GA--------------------------------------AC-ACC-CA-TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATATGATCCAAAA-C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-GAAA-TT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G---TTTA---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-GA-AA-TG-TGT-----AC------------TTT-C-TA------------------------N---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-ATT-ATTTTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GGG-ACTG-TA-TAGA-
gi|8 : aatcctatttcacagtttaacgatttttaacccttgtttaacaaatcgaggaaactaatggaataCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCC-AAAAT--A-CC----------------C-AGTG----TAGA-A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT---A--AGT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GAGGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-GC-ATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-ATA---CC-TAAAT-A--C---A-----TG-T-ATA------C-TC-A-C---TTG---TA---T--TGTTT-C---C-----G----CAA-A--T-----GTTAT-GTCGATGGA--TTAGATTTGGTGAATC--TT-AAGA---CTT-GT-TCAAAA---------T--A-----AT---A--------T-------A-A
gi|8 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaa-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AA-Ttaaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|9 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaatacatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaatCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-A---GT-C-T--GAA-CTT-----AAAAAACAA-CC----------------C-AGCG----T----ATAACA-A---TT-T-CTGTT---ATATAA-C--AC--ATTTT-------GTGTA-------CAAG---AACAA----------------------CTAA-AA-TT-CG-A---G--C--C-ATC-GAAGG-ATA-AATATGAATT-T-C-TAG-GC--TG-----C-AGTA-A----A-C-ACA---TG-TACAT-A--C--TC-AC-TGG-T-ATA-----------A-G---TGG---TA---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--T-----T--AC-TTC-----A--TT----------------CT-CAGA---C-T-GA-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A---------------------------------------GA-CT-GT----T-A-AG---TAT--------A-TTATA-----A-------------------------C-CT------G-T----------------------------------ATACTCTGAA--T-CGGTG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TTTC-AC------GT-----C-A-C-----------------CC------A-GAC---T-TG-TTTC-------------------------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-A--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-ATA----G-CT-T-T-G-AA-TT-CG--TTCT--------ACTT-AA-A----A-TC-G--TTTT------------------------AAGT-T---TTT-C--GATT-T-CG-AA-TG-TTT-----TCGG-----T--A-TAT-T-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----NNNNC-TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTCCC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-ATG-ACGG-TA-TAGA-TGtg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555 3333333333333333333 6666666666666666666666666666666666666666 11111 11111111 1111 2222222222222222222222222222222222 1111 11111111 333333333333333333333333333333333 222222222222222222222 1 1111 111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111 2222222222222222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 44 2 2 4 2 2 333 2 4 22 2 22 11 0 888888888888888888888888888888888888888888 2 777 2 33 777 4444 6666 55 4444444444444444444 333 3 44444 2 4444 2 2 2 4 2 99999999999 2 2 2 2 2 2 77 2 2 4 2 2 3333333333333333333333333333333333333333 33 4 2 666666 2 2 2 666 333 666 33 88 333 11111 6666 6 2 55 33333333 2 55555 55 4 333 22 2 666 2 4 2 333 888888888 22 0000 7777777777777777777777777777777777 55 55 1 2 33 22 2 2 2 4 0000 2 2 555 00000000 2 333333333333333333333333333333333 2 555555 4 333 2 4 777777777777777777777 0 2 3 6666 2 666 4 777 22 777 2 6666666 2 99999 22 7777 4 4 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 2 2 2 2 66 3333333333 2 55 2 22 44 2 77777 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 6666 2 2 444 1 7 1 22 44444444 2 4 7777 2 4 444 5555555555555555555555 2 2 777 2 555 2 2 2 2 2 00000 6666666666 2 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 2 2 2 55 2 55 4 33 2 4 4 33 333 2 2 4 1 2 2 4
lowQualScore : .. . . . . . ... . . .. . .. .. . .......................................... . ... . .. ... .... .... .. ................... ... . ..... . .... . . . . . ........... . . . . . . .. . . . . . ........................................ .. . . ...... . . . ... ... ... .. .. ... ..... .... . . .. ........ . ..... .. . ... .. . ... . . . ... ......... .. .... .................................. .. .. . . .. .. . . . . .... . . ... ........ . ................................. . ...... . ... . . ..................... . . . .... . ... . ... .. ... . ....... . ..... .. .... . . ..................................................................................... . . . . . .. .......... . .. . .. .. . ..... ............................................................................. . .... . . ... . . . .. ........ . . .... . . ... ...................... . . ... . ... . . . . . ..... .......... . . ........................................................................................................................ . . . . . . .. . .. . .. . . . .. ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 0 0 0 0 0 555 0 0 88 0 99 66 5 333333333333333333333333333333333333333333 0 000 0 44 444 5555 4444 00 9999999999999999999 777 2 66666 2 7777 2 2 2 4 4 88888888888 1 1 1 2 2 2 55 2 2 6 2 2 1111111111111111111111111111111111111111 22 7 5 444444 2 2 2 999 999 111 11 88 777 88888 6666 3 1 00 22222222 1 33333 00 2 777 99 1 666 1 2 1 777 444444444 99 8888 3333333333333333333333333333333333 33 33 5 2 11 88 0 0 0 0 2222 0 0 555 00000000 0 222222222222222222222222222222222 0 888888 0 555 0 0 666666666666666666666 1 5 7 5555 1 888 2 444 99 555 0 5555555 0 88888 99 1111 2 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 1 1 1 88 5555555555 0 55 0 88 88 0 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 2222 0 0 333 9 6 9 66 55555555 0 0 0000 0 0 888 3333333333333333333333 0 0 000 0 999 1 1 1 1 4 66666 5555555555 7 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 4 4 4 4 66 2 33 4 11 2 4 4 11 999 2 2 4 0 2 2 4
consensus : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--AGTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A---AT-A---CTA-AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
Reference ( family-2759 ) : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--AGTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A---AT-A---CTA-AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|1 : GTG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCCAAAAA--C-CA----------------C-AGTGAGAAT----A----G-A---TT-T-ATGTCTCGA----A-C--A---ATTTT--AA--AGT--A-------CAGA---AGCAAGT---A--TAG-AAG----TTATTAA-GA-TT-CG-AGAGG--CGGA-GTC-GA-GGG-ATA-A--TTGATTT-G-CATGG-C-AATGGGCTTC-CGTATA----T-TAAT-AAAGCGTATATCACA---AT-A-----A-AT--G-TAAA------CGTC-A-C---T-G---TATCTT--CTTTC-C---C-----GA---C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTTGATTACTT-AAGA---C-TAGT-T---G----------T--A----GGT---A--------T-------ATA--G-----G--CCTAG--C--A-A-AAG--ACC--A-C-GC-CTGGTA---T-A-AG---TCTAACCCATGA-TCA-------A-------------------------CACT------GTT---T-C-TT--AA-------AA-TATACCATTTAATATTCTGAAGGCAAGATG-----C-A---C---AC---C-G-------T-C-----ACTCC--A-TTGC-AC------GA-----C-A-A-----------------C-------A-A-------CA-TCTC---A--GAAC-------TGTGTTTGCCT-A-C-T-C-CCCG--TC-----------T-A--GTC-C--C--GACA-ACC---A--------CA-------------CTCATGTTGATG----C---------------C-------AACC----------A-A----GTCT-TAA-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-A---CGTT---------AA-------ACTA-TAGT-T---TGT-----GTT-T-CT-AC-TG-TTT-----TTTA-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGTTAT----TCTGCATGAT-G-GG-CTA-A-TAA--TTTTTC-A--T-C--AGAATGA-TC-GTTC-T--TTTTAAG---GTGCACTG-TATTAGAGTGGCAG
gi|10 : atctcactttcacagtttaacgatttatttaaacttgtttacagtcgaggaaaacgtaatggaactggctgaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAA------------------------C-A-----------------A-A---TC-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA---GAA-A-------CAAG---A----GTA--A----G-A------TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTT-GA-GG--ATA-AATCTGAATT-T-T-AGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-AT-A---CATA------A---AT-A---C---AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT------------T---------A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-TA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAAAGC-A-GTG-C---C-A---CA--AC---G-G-------T-C-----A--CTAAA-TT-C-AC-------------C-G---------------------------------ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------
gi|10 : tacaatcgaggaaactaaagtaa-AA-TT-C---TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------T--A-AAGT-T---TTT-C--GAT----CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-TATA---------AAC-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNT-----TCAT-T-GG-CTA-A-C-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-C--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAcaattctgctgttgaaaatcgtttttaataaagtttttcgatcgaatgtgttctgtgttttataaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaacatttttcatcagaattatcgttccttagcgtgactgtatagatggcagtac
gi|11 : tacaatcgaggaaactaaagtaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaacaaatctatgttgacacattttaagaaacaagagtaagattttaagattcgagcagttgaggataaatctgaattttagggcatgggcttctgtaattatacataaatacatgtatactcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagactgttgatatattaggcctagcagaaagaccaatactgttaagtctatcaacctgttcttccattatatattctgaaagcagtgccacaacggtcactaaattcaccgacccatctcagaccCACTGTT--C-GAGA-TT-AA-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAACAAAA--A---------------------AGCG----T----A---GA-AAAATC-C-CAGTC---G----A-C--AC--ATTTC--A----TTT-A-------CAAG---AACAACTA--A--TAG-GAT----TT-CTGA-GA-TT-CA-A---G--T--C-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C---------TAGGCTTC-TGTA-A--------AT-A---C------------------------AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA------TTTTC-C---C-----G----A-A-T--T-----GT-C-CTTC-----G--TTA-AC---GTACATT--TG-AAGG---C-T-GT-T---GA---------TGCA----TGT---A--------C-------A-AATA-----T--CCAAG--C--AAA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------G-CT------G-T---G-C-TTCCAT----------TAT--------ATACTCCGAAGTC---GTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-CC------GA-----CTC-C-----------------C-------A-GA-------A-TGTT---------T-------T-------CTT-A-T-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTC-T--C--AAGA-A-----AATCAT---CA-------------T----------GCTTAT---------------CCAGCAATA-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------GTTA-AG-A----A-TT-G--TTTTT---------AA-------A--A-AGG--T---TTT-C--GATT-C-AG-AA-TA-TTT-----TCTG-----c
gi|12 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaag-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-C------TTC-CGTA-A--------AT-A---C--A------A---GC-A---CT---T--G------------------C---TGA---TG---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--TTACATGC-A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGACTT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GG---------T--AT---TCT---A--------T-------A-G--G-----A--CTT-G--T--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATACTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-ACC-----------------C-------A-GAC--------TTTT---A-------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TCTAGACGCGTATT-A--GTA-T--C--TACA-A-----A--------CATATCATGTTTATCC----------G----A---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTC-------------------------AAGT-T---TCT-C--TATT-C-CG-AA-TG-TTT-----TTTGCATANN--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----C-----TCGT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTA-ACAG-TA-TAGG-TGGCAGCA
gi|13 : ----A---CA-A---TTGT-CTGTT---G----A-TCGAC--CTTTC--AT---GTA---------CAAG---A-CAACTA--A--TAG-AAG----TT-TTAATGA-TT-CG-A---GGGT--A-AT---A-GGG-ATA-AATCTG-------------------GGCTTC-C----------------A---CG---------------------A-AT--G-TATA------C-TC-T-C---TGG---TA---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-A----GTGAATT--CT-AAGA---C-T-AT-T---AA---------T--A----TAT---A----------------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AA---TCT--------A-CCA-------A-------------------------C-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATACTCTG-TAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-T----------------C-A-C-----------------CA------A-GA----T-TG-TTT------------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C---ACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTTTATCCAA--C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--TT--------------------------AAAT-T---TTT-C----TT-C-TG-TA-T
gi|13 : agTTTC-C--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-AA-TAGA-TGGCGGCAaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|14 : agacaattgtctgttgatcgacctttcatgtacaagacaactaatagaagttttaatgattcgagggtaatagggataaatctgggcttccacgaatgtatactctctggtattttcccgcaattacatcattaagtgaattctaagactattaatatataaaggcctagcagaaagatcaagactattaaatctaccaaccttttcttccataattatactctgtagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcaccaagattgttttcccactccccgtcttaatcccacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttcgaatccctgctattgaaaatcgttaaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-----GT-CCT--GAA-CTT--CC----AAA--A-CC----------------AGAGCG----TTAGAA---CA-----TT-T--CGTC---G----A-C--ACC-ATTTC--AA--AGTA-C-------TAGT---AACAA-CA--T--TAG-ACG----TT-CTAA-GG-TT-CG-AA--G--T--ACGTC-GA-GG--ATG-AATA-AAATT-T-C-TGG-G-C-TG-----C-CGTA-A----T-T-A-------------------------------AT----TATC------C-TC-A-C---TGG---TA---T--CTTTA-C---CAGTA-G----T-A-ACAT-----GT-A-CTTC-----A--TTACGT---GTGAATT--CT-CTGA-----T-GT-T---GA---------T--A----TGT---A--------T-------A----T-----G--CCTAG--TTGAAA-AAA--ACC--A-A-GA-CT-GG----T-A-AGA--TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-GT------T-T---T-C-TTCCATT------AA-TAC---------TAATCTTGAAGC-AG-TG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------G------C-A-C--------------------------------TT-CA-GCT----A--G-ACTTTTT--T-------CCC-A-T-G-CGCAGG--TC----------TT-A--TCC-C--C--AACA-C-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTACTCAG----C-------A-------------A-A----G-CT-T-ATG-AA----CC--TGcg
gi|15 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagCGCTGAA--CAGAGA-TT-TTCTT-CAAGGT-CAT--TTAACTT--CACAAAA-------T----------------C-ATCA----T----T---CATA---CT-T-ATGTG---G----A-C--AC--ATTTT--AATTAGTA-AGTCAAAGTAAGTACAAAAAGTAGAA--TAA-AAGATAGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTCTGA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-CATGG-GCCATGGGCTTCGCGTA-A------T-ATAA---CGTATTT---T---AT-A---C-A-TT--GTTATATCTTCTC-TC-A-CGT-TGGCTCTA---TAGTTTCT-C---CCTCATG----CTA-A--T-----G--AGATTC-----A--TTA-AC---A-GAATT--CT-A--------T-GTAT---GA---------C--A----TACTGAA--------TTTTCATGA-A--GAAGTAG--CCTAG--C--ATATAAG--ACCTTATA-GA-AC-GTTATAT-A-AGGATTCTTA------A-TCACGTAACTA-------------------------T-CT------G-TTTCT-T-TTCCTTC------AACTAT--------AAATTTTGAA
gi|16 : cccatttctagcagttaacgatttataacttggtttacaatcgaggaaacactatggaatacg-C---C-----G----C-A-T--T-----T--A-CTAC-----AGATTG-CC----TGAATT--CT-AAAAAC-T-T-GT-T---GT---------T--A----AAT---AATACAAGTT-------A-A--A-----GGTCCTA------AGC-AAA--ACC--A-A-GAACT-GT----T-ACAG---TTT--------G-TCA-------AGTATT--------------------C-GTCAAGACG-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ACTTACTG-AAGC--GGTGAC---CAA---CA--ACGTACAG-------T-G-----A--TA--A-AT-CGAC------GA-------A-C-----------------A-------G-GACTGTT-TATTCTT---A----------------------CC-A-CTT-C-CCCAATTC----------TT-A--TTCTC--C--CACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGCTCTTATCC--A-ACACGG-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-AAC--A-TC-G--GTT-----------------------A-AGAT-G---TTT-C--GNNN-N-NN-NN-NN-NNN-----NNNN-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCACTG-----T-----GCAC-T-----TA-A-T-A--ATTATCAA--T-C--AGAATTAGTC-ATGC-T--TT---AG-C--CG-ACAG-CG-TAGA-T--CAGCA
gi|17 : C--A-G-GG-TT-GT------A-AG---TAT--------A-TCA-------A-------------------------C--T------G-T---T-C-TCCCAT-------AA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-C---C-A---AC--ACA--C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC-----------------------------------C---------GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-GT-------TGTTTT--CCC-A-C-T-C-CC-G--TC----------TTTA--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G---TTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GGTT---TG-AA-TG-TGT-----CCTG-----T--G-TTT-T-TANNNNNNNNNNNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGCAc
gi|18 : tctagaaaagttcaataaagttttcaTCCAT-------GA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-A---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-CCGTCTCAGA-----C-T-CTTATTCCCCGTCTAATTC-------ACAAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------TGTTTT--CCT-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TTTCC--TGAT--------GTTG-AA-A----AATC-G--TTTT----------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GTTT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TAT--------AACTNNNNN-----NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GGCCTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-CAGTG-ACTG-TA-TATA-TGGCAc
gi|19 : C---C-G-------T-CCA---A--CT--AATT-C-GT------GA-----C---------------------------------C-ACC-CA-TCTCCAAG--G-AC-------TGTTTT--CCT-AAC-T-C-AACGG-TCCT--------TT-AAGGTC-C--C--AACA-ACCAACATTT-----CA-------------T----------G----TTTGAATCCAAC----C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GGTGAAA-A----A-TC-GGCTTTTTGTTA-----AA-------A--A-AGGT-T---TTT-CGGGATT-C-CG-AA-----GT-----TGTG-----T--ACTTC-T-TA---------ATCAATTCTGATTAGA---------AATCAAGCTCCTTTTGATCCGGCTCCCATTAGGATCGCTTTGCCTGACTTATAGAGCGTACATAGCC--AGTTATT----T-----CCAT-TGGG-CT--A-T-A--TTTTCC-AACT-C--ACAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTGAACTGTTA-TAG--TGGCAGTagt
gi|2 : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---TT-C-T--GTA-CTT--CCC-CAAAA--A-CC----------------C-AGTG----TAGG-A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT---A--AGT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTT-CGTA-A----T-T-AT-A---TGT------------T-A----TATAT--G-T---------C-TCTG-C---TGG---TAT--T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT--------------------A---------T--A----T------------------------A--G-----A--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----G-A-AG---TCT--------A-TCA-------AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CT------G-T---T-CATTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-AAGTG-C---C-A---GA--AC---C-----------CAGAGGA--TC--A-TT-CAAT------GT-----T-A-C-----------------C---------GAC-ACCTCA-TCTC---A--G-ACCTGTTATT-------CCC-A-C-TAC-CCCGC-TCT---------TT-A--GTT-C--CCAAACAGA-----A--------CA-------------CACTG------G----TTCGTTATCCAA----C-------A-------------A-A----G-CT-TAA-G-AACTT-CCTTTGCT--------GCTG-AA-AAACCA-TT-T--TTTTT---------AAACCGAAGA--A-AAGT-T---TTC-----ATTCC-CGCAA-T--TGTTAGAATCTG-----T--G-TTTAT-TA---------ATC-----------AACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GT-TAA-A-T-AT-TTTTTC-A--TCC--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|20 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaCGCCGTG--T-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-TTGATT-CCC--CCCAAAAAA--A-ACAAAAACAAAAAAAAAAC-AGCG----T----A---GA-AGAATT-T-TTGTT---G----A----A---ATTTC--A----GTA---------CA-G---AAC---TA-----TGG-AAG----TT-CTAA-GA-TTGCG-A---G--T--C-GTC-GAGGGG-ATA-GATCAG-ATT-T-T-TGG-G--AT----TTC-CGTA-A------T-AC-A---TGT-----------AT-A---TTA-CT--G--------------C-A-C---T-G---TA---T--CTTT------------GGGAAC-A-A--T-----G--A--------------TA-A-----TGA------T-AAGA---C-T--T-A---GT---------T--AC---TAT---A--------T-------C-A--G---------CT-G--C--AGA-AAC--TCC----G-GA--T-GT----T---AG---TCT--------A-TCA-----------------------------------CT------G-T---T-T-TCTCAT-------c
gi|21 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccgA------C-TC-A-CATCTAG---TA---T--TTTCC-CACCC-----G----C-A-A--T-----T--A-CTTC-----AA-TTA-AC---GTTAATT--CT-AAGA---C-TGGT-T---GAATAATTACGT--A----TAT---ATGT-----T-------A-A--G-----A--CCTAGA-C--AGT-AAT--ACG--A-G-AG-CA-GCG---T-A-AA---TCT--------ACCCA-------G-------------------------G-CT------G-T---TAT-TTTCGTCGCAAAAAA-T-T--------ATAGTCTGAAGGG-CGGTG-C---T-A---AA--ACA--C-AAAAAAATT-C-----A--TC--T-GT-A-AA------GAAACCCC-A-C-----------------C-------A-GACTATT-TT-TCTC---T--A-AC-------T-------CCT-G---G-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--A--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------t
gi|22 : -GA-TGG-ATA-A-TCTGAATT-T-C-TGG-G-C------TTC-CGCG-A----T-T---------------------------------------CATA------C-TC-A-C---TAG---TT---T--TTCCC-C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-AT---GTAAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AAACGTAT---A--------T-------A----G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AA---TCT--------A-TCC-------A-------------------------C-CT------C-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATAGTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---T-G-------A-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-------------------------------GAA-ACC-------C---A--G-ACTATTT--T-------CTT-A-C-T---CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------ttgtgtgtatccaaacaacagg
gi|23 : CACTGCG--C-GAGA-TT-TT-GT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCAAAAA-----------------------C-A-----------------A-A---TT-T-ATGTT---G-----------------------------A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATATAATCTGAATT-T-C-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-AAATTT-T-AT-A---CGTA------A---AT-A---tgtgtttatccaacaaagcgt
gi|24 : atctcatttcacagattttaacaatttaaactgtttaacaatcgaggaaactaatggaaa-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AATTG-TGtatg
gi|25 : -------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----AACACATCACA-------------T----------G----TTTATCCAA-------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GCTG-AA-A----A-TC-A--TTTTTTTTTAAAAAGA-------A--A-AAGT-T---TTC-C---ATT-C-CG-AA-TG-TGTTAA--TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------agaatgactatcaatatgattaggaatcagctaattattgatccgctctgacttagatcggcgtgcggggggagagatggaaagccgttagttcaattgggctaga
gi|26 : ccatttttcgactcatgatttcttacaaatcttggCTATG--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GAA-CTT---AAAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG--------------A-A----------------G----A----AC--AATTT--CA--TGC--A-------CAAG---AACAACTA--A--TAG-AAG----TT-CTAA-GA-TT-TG-A---G--C--C-GTC-GA-GAG-
gi|27 : atcccattttacattttatggctttgaactttttacagccagcgtttacaatcgaggaaaatctGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AT-C---AT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-----------------------------T----A---TC-A---TT-TCATGT----------------------------------A-------CAAG---AACAACTA--AATCAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-C
gi|28 : tacgactttgaatttgtttacaatcgaggaaactcgcgcaatgaagttatggaacaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTG-CTT--CCta
gi|29 : aatcccatttcacagtttaacgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaCCACTGAG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAAAAAAA--ATCC----------------C-AGCG----TAGA-A---CA-A---TT-T-tcgacaacagtttgagcaagcaacataatcggagtcgctaaaatt
gi|3 : tacaatcaaggaaactcgtacaatgaagttatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GTTC-T--GTA-CTT--CCCAAAACA--A-CC-------------------------------------------T-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTTTTAA--AGTT-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TC-TTAA-A---T-CGTA---G--C--AAGTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-TATGGCA-CATGGGCTTC-CGTA-A----TAT-AT-A---CGTA------TTTTGT-A---C---AT--GGTATA------C-TC-AAC---TGG---TA---T--TTTTT-C---CC----G----CCACA--T-----G--A-CTTA-----A--T-A-AC---GTGAATT--CTTAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-G--G-----G--CTTAGGTC---GA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------AAA-----------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------T-T--------ATATTTT---AGC-CG-TG-C---CCA---CA--AC---C-G-------T-CC----A--CTGAA-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A------------TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A---TC-C--C--AACA-A-----AC-------CA-------------C----------A----TCATTAATTGATCCAAC-------A-------------A-A----G-CTAT-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G--TATTT---------TA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-CGCG-AA-TGTTGT-----ACT------T----CTT-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-AT-T-C--AG-ATTA-TCGGTTCTT--TT---AGCC-GTG-ACTG-TA-TAGA-T-GCAGTA
gi|30 : tttccatttcacagtttaacgattttaaacttgttacaatcgaggaactaatggaaGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AC-C---GT-C-T--GTA-CTc
gi|31 : atttacgacttgaattttgttaaatcggaggaactcgcacaatgaagtttgggaaacaCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C--A-CA-A-----A--------TA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-A-AC---G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TACT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--T-------------------------A-AAAT-T---TTT-C--
gi|32 : CC--A-A-----T-GT----T-A--------T--------G-TTA-------A-------------------------A-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---GA--AC---C-G-------T-C-----ttcta
gi|33 : gcaaagaaacccacCAT-T-GG-CTA-T-T-G--TTTT-C-A--T-C--TAAATTA-TC-GTTC-TCTTT---AG-A-GTG-ACAG-TG-TAGA-TGGCAGCA
gi|34 : -----TCAT-T-GG-TTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|35 : AT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-G-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGc
gi|36 : ----A---TA-A---TT-T-TTGCT---G----A-C--AC--ATTTC---A--TGT--A-------CAGG---AACAACTA--A--TAc
gi|4 : tagaG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA----CC----------------C-AGTG----AGA--A---TA-A---TT-T-ATGTTCTCG----A----AC--ATTGT--TA--AGTA---------CA-G---AA-AAGTA-----TAG-AAG----TT-TTAA-GAGTT-CG-A---GAGCGGA-GTC-GA-GGG-ATA-AAT-TGGATT-TGC-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A----T-A----TA-AT--G-TA-A------C-TC-A-----TGG---TT---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-AG-T-----G--A--TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AG---TAT---A--------T-------A-G--G---------CTAG--C--A-A-AAA--ACC--A-ACGC-CTGGTA---T-A-AG---T-T--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-CTTTCCAT----------T-T--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---A-A---C---AC---C-G-------T-C-----A--CTA-A-TT-C-AC------GA-----C-A-----------------------------------C-CA-TCTC---A--G-ACTGTT---T-------CCT-A-C-T---CCCG--TC-----------T-A--GTC-CCAC--AACA-A-----CT-------CA-------------T----------G----TTGATC----------C-------AACC----------A-A----G-TT-A-A-G-AA-TT-CC--TGC---------GTTG-AA-A----A-T--G----TTT---------AA-------A--GCAAGT-T---T-----------------G-TG--GT-----TCTA-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTATT----C-----TCATAT-GG-CTATA-T-A--TTTTTC-A--TAC--AG-ATGA-TCAGTTCTT--TT---AG-C-GTG-CATG-TA-TAGAGTGGCA
gi|5 : aatctcatttcacagtttaacgatttataacttgttacagtccgaggaaacgtaatggaacgctcgagCCGCTGTA--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGTG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTTA-AA--AGTA-A-------CATG---AACGAGTA--A--TAG-AAG----TT-TGAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA--GG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A---A
gi|5 : T--G-TATG------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-C-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-C--GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------CCCCGGGCACGAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTT-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGTAT---TTC-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGCATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtatgctcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagaccgttgatatatataaggcctagcagaaagaccaagacgttaagtctatcaacctgttcttccataatatatattctgaaagcaggtgccacaaccgtcactattcacgacacccccgggcacgacacccatctcagactcccactccctgtcttagttccaacaaacacgtcaaagcttagaattcctgttgttgaaaatcgtttttaaaaaagtatttccgattccgaatgtgttctgtgtttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaatatttttcatcagcattatcgttctttagcgtgactgtatagatggcagta
gi|6 : ccgctgtacgagatttgtttgtctgtacttcccaaaaaaacccagtgtacaatttatgttgacacattttaaaagtaacatgaacgagtaatagaagtttgaagattcgagcagtcgaggataaatctgaatttctgggcatgggcttccgtaattatacgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCGCTGTGG-C-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CC----AAA--A-C--------------------------------A----A-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--ACCCATTTT--TA--AGTA-C-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-AA--G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-A-TCTGAATTGT-C-AGG-G-CATGG-CTTC-CGTA-AAATTT-T-AT-A---CGTA------A---ATGA---C---AT--G-TATA------T-CA-A-C---TGG---TA---T--TTTTTTC---C-----G----C-A----T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTCAATT--CT-AAAAGAAC-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-G--GC----A--CCTAG--CT-AGA-AAAGAACC--A-A-GA-CT-GT----TTA-AG---TCT----------TCA-------AT------------------------C-CT------G-T---T---TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAA-GC-AG-TG-CG--C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------T-G-----C-CA-TCTC---ACCG-ACGTT----T-------CCCTA-C-T-C-CCCG--TC----------TT-ATAGTC-C--CC-AACA-A-----A--------CA-------------CAATCAT----G----TTGATGCCAA------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AAATT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-T--G--TTTTTA--------AA-------A--A-AAGT-T---TTTCC--GATT-C-CG-AA-T--TG------TCTG-----TCAG-TTT-T-T------------------------------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-CAAAGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|7 : ttaacaatcgaggaacactaatggaaCCGCTGTGGGC-GAGAATT-TG-TTTC---GT-C-T---TA-CTTTTCCCAAAA------------------------C-A-----------------A-A---TT-A-ATGTT---G----AAC--AC--GTTTTTTAA--AGTA-A-------CAAG---AGCAAGTA--A--TAGAAAG----TT-TT-A-GA-TTCCG-A---C--A--A-GTC-GA-GGGAATA-AATCTGAATT-T-A-T-G-G-CATGGGC-TC-CGTA-A----A-T-AT-A----GTA------C---GT-ATTTTTACAT--G-TA-A------C-TC-A-A---CGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----GA-A-CCTT-----A--ATA-AC---GT-AATT--CT-AAGA---C---GT-T---GA---------T--A----AAT------------T-------ATA--G-----G--CTTAG--C----A-AAG--A-C--A-A-GA-CT-AT----C-A-A----TCT--------A-CTC-------A-------------------------C-CT------GTT---T-C-TTCCAT----------TGT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---CAAGAC---C-G-------TCC-----A--CT--A-AT-T-AC------GA--------------------------------------AC-ACC-CA-TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATATGATCCAAAA-C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-GAAA-TT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G---TTTA---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-GA-AA-TG-TGT-----AC------------TTT-C-TA------------------------N---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-ATT-ATTTTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GGG-ACTG-TA-TAGA-
gi|8 : aatcctatttcacagtttaacgatttttaacccttgtttaacaaatcgaggaaactaatggaataCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCC-AAAAT--A-CC----------------C-AGTG----TAGA-A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT---A--AGT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-AT-A---CCTA------A---AT-A---C---AT--G-TATA------C-TC-A-C---TTG---TA---T--TGTTT-C---C-----G----CAA-A--T-----GTTA-TGTCGATGGA--TTAGATTTGGTGAATC--TT-AAGA---CTT-GT-TCAAAA---------T--A-----AT---A--------T-------A-A--
gi|8 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaa-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AA-Ttaaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|9 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaatacatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaatCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-A---GT-C-T--GAA-CTT-----AAAAAACAA-CC----------------C-AGCG----T----ATAACA-A---TT-T-CTGTT---ATATAA-C--AC--ATTTT-------GTGTA-------CAAG---AACAA----------------------CTAA-AA-TT-CG-A---G--C--C-ATC-GA-AGG-ATA-AATATGAATT-T-C-TAG-G-C-TG-----C-AGTA-A----A-C-AC-A---TGTA------C---AT-A---CTC-ACTGG-TATA-----------A-G---TGG---TA---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CTTC-----A--TT----------------CT-CAGA---C-T-GA-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-----------------------------------------GA-CT-GT----T-A-AG---TAT--------A-TTATA-----A-------------------------C-CT------G-T----------------------------------ATACTCTGAA--T-CGGTG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TTTC-AC------GT-----C-A-C-----------------CC------A-GAC---T-TG-TTTC-------------------------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-A--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-ATA----G-CT-T-T-G-AA-TT-CG--TTCT--------ACTT-AA-A----A-TC-G--TTTT------------------------AAGT-T---TTT-C--GATT-T-CG-AA-TG-TTT-----TCGG-----T--A-TAT-T-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----NNNNC-TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTCCC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-ATG-ACGG-TA-TAGA-TGtg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555 3333333333333333333 6666666666666666666666666666666666666666 11111 11111111 1111 2222222222222222222222222222222222 1111 11111111 333333333333333333333333333333333 222222222222222222222 1 1111 111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111 2222222222222222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 44 2 2 4 2 2 333 2 4 22 2 22 11 0 888888888888888888888888888888888888888888 2 777 2 33 777 4444 6666 55 4444444444444444444 333 3 44444 2 4444 2 2 2 4 2 99999999999 2 2 2 2 2 2 77 2 2 4 2 2 3333333333333333333333333333333333333333 33 4 2 666666 2 2 2 666 333 666 33 88 333 11111 6666 6 2 55 33333333 2 55555 55 4 333 22 2 666 2 4 2 333 888888888 22 0000 7777777777777777777777777777777777 55 55 1 2 33 22 2 2 2 4 0000 2 2 555 00000000 2 333333333333333333333333333333333 2 555555 4 333 2 4 777777777777777777777 0 2 3 6666 2 666 4 777 22 777 2 6666666 2 99999 22 7777 4 4 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 2 2 2 2 66 3333333333 2 55 2 22 44 2 77777 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 6666 2 2 444 1 7 1 22 44444444 2 4 7777 2 4 444 5555555555555555555555 2 2 777 2 555 2 2 2 2 2 00000 6666666666 2 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 2 2 2 55 2 55 4 33 2 4 4 33 333 2 2 4 1 2 2 4
lowQualScore : .. . . . . . ... . . .. . .. .. . .......................................... . ... . .. ... .... .... .. ................... ... . ..... . .... . . . . . ........... . . . . . . .. . . . . . ........................................ .. . . ...... . . . ... ... ... .. .. ... ..... .... . . .. ........ . ..... .. . ... .. . ... . . . ... ......... .. .... .................................. .. .. . . .. .. . . . . .... . . ... ........ . ................................. . ...... . ... . . ..................... . . . .... . ... . ... .. ... . ....... . ..... .. .... . . ..................................................................................... . . . . . .. .......... . .. . .. .. . ..... ............................................................................. . .... . . ... . . . .. ........ . . .... . . ... ...................... . . ... . ... . . . . . ..... .......... . . ........................................................................................................................ . . . . . . .. . .. . .. . . . .. ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 0 0 0 0 0 555 0 0 88 0 99 66 5 333333333333333333333333333333333333333333 0 000 0 44 444 5555 4444 00 9999999999999999999 777 2 66666 2 7777 2 2 2 4 4 88888888888 1 1 1 2 2 2 55 2 2 6 2 2 1111111111111111111111111111111111111111 22 7 5 444444 2 2 2 999 999 111 11 88 777 88888 6666 3 1 00 22222222 1 33333 00 2 777 99 1 666 1 2 1 777 444444444 99 8888 3333333333333333333333333333333333 33 33 5 2 11 88 0 0 0 0 2222 0 0 555 00000000 0 222222222222222222222222222222222 0 888888 0 555 0 0 666666666666666666666 1 5 7 5555 1 888 2 444 99 555 0 5555555 0 88888 99 1111 2 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 1 1 1 88 5555555555 0 55 0 88 88 0 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 2222 0 0 333 9 6 9 66 55555555 0 0 0000 0 0 888 3333333333333333333333 0 0 000 0 999 1 1 1 1 4 66666 5555555555 7 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 4 4 4 4 66 2 33 4 11 2 4 4 11 999 2 2 4 0 2 2 4
consensus : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--AGTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A---AT-A---CTA-AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
Reference ( family-2759 ) : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--AGTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A---AT-A---CTA-AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|1 : GTG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCCAAAAA--C-CA----------------C-AGTGAGAAT----A----G-A---TT-T-ATGTCTCGA----A-C--A---ATTTT--AA--AGT--A-------CAGA---AGCAAGT---A--TAG-AAG----TTATTAA-GA-TT-CG-AGAGG--CGGA-GTC-GA-GGG-ATA-A--TTGATTT-G-CATGG-C-AATGGGCTTC-CGTATA----T-TAAT-AAAGCGTATATCACA---AT-A-----A-AT--G-TAAA------CGTC-A-C---T-G---TATCTT--CTTTC-C---C-----GA---C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTTGATTACTT-AAGA---C-TAGT-T---G----------T--A----GGT---A--------T-------ATA--G-----G--CCTAG--C--A-A-AAG--ACC--A-C-GC-CTGGTA---T-A-AG---TCTAACCCATGA-TCA-------A-------------------------CACT------GTT---T-C-TT--AA-------AA-TATACCATTTAATATTCTGAAGGCAAGATG-----C-A---C---AC---C-G-------T-C-----ACTCC--A-TTGC-AC------GA-----C-A-A-----------------C-------A-A-------CA-TCTC---A--GAAC-------TGTGTTTGCCT-A-C-T-C-CCCG--TC-----------T-A--GTC-C--C--GACA-ACC---A--------CA-------------CTCATGTTGATG----C---------------C-------AACC----------A-A----GTCT-TAA-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-A---CGTT---------AA-------ACTA-TAGT-T---TGT-----GTT-T-CT-AC-TG-TTT-----TTTA-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGTTAT----TCTGCATGAT-G-GG-CTA-A-TAA--TTTTTC-A--T-C--AGAATGA-TC-GTTC-T--TTTTAAG---GTGCACTG-TATTAGAGTGGCAG
gi|10 : atctcactttcacagtttaacgatttatttaaacttgtttacagtcgaggaaaacgtaatggaactggctgaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAA------------------------C-A-----------------A-A---TC-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA---GAA-A-------CAAG---A----GTA--A----G-A------TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTT-GA-GG--ATA-AATCTGAATT-T-T-AGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-AT-A---CATA------A---AT-A---C---AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT------------T---------A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-TA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAAAGC-A-GTG-C---C-A---CA--AC---G-G-------T-C-----A--CTAAA-TT-C-AC-------------C-G---------------------------------ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------
gi|10 : tacaatcgaggaaactaaagtaa-AA-TT-C---TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------T--A-AAGT-T---TTT-C--GAT----CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-TATA---------AAC-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNT-----TCAT-T-GG-CTA-A-C-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-C--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAcaattctgctgttgaaaatcgtttttaataaagtttttcgatcgaatgtgttctgtgttttataaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaacatttttcatcagaattatcgttccttagcgtgactgtatagatggcagtac
gi|11 : tacaatcgaggaaactaaagtaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaacaaatctatgttgacacattttaagaaacaagagtaagattttaagattcgagcagttgaggataaatctgaattttagggcatgggcttctgtaattatacataaatacatgtatactcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagactgttgatatattaggcctagcagaaagaccaatactgttaagtctatcaacctgttcttccattatatattctgaaagcagtgccacaacggtcactaaattcaccgacccatctcagaccCACTGTT--C-GAGA-TT-AA-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAACAAAA--A---------------------AGCG----T----A---GA-AAAATC-C-CAGTC---G----A-C--AC--ATTTC--A----TTT-A-------CAAG---AACAACTA--A--TAG-GAT----TT-CTGA-GA-TT-CA-A---G--T--C-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C---------TAGGCTTC-TGTA-A--------AT-A---C------------------------AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA------TTTTC-C---C-----G----A-A-T--T-----GT-C-CTTC-----G--TTA-AC---GTACATT--TG-AAGG---C-T-GT-T---GA---------TGCA----TGT---A--------C-------A-AATA-----T--CCAAG--C--AAA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------G-CT------G-T---G-C-TTCCAT----------TAT--------ATACTCCGAAGTC---GTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-CC------GA-----CTC-C-----------------C-------A-GA-------A-TGTT---------T-------T-------CTT-A-T-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTC-T--C--AAGA-A-----AATCAT---CA-------------T----------GCTTAT---------------CCAGCAATA-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------GTTA-AG-A----A-TT-G--TTTTT---------AA-------A--A-AGG--T---TTT-C--GATT-C-AG-AA-TA-TTT-----TCTG-----c
gi|12 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaag-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-C------TTC-CGTA-A--------AT-A---C--A------A---GC-A---CT---T--G------------------C---TGA---TG---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--TTACATGC-A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGACTT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GG---------T--AT---TCT---A--------T-------A-G--G-----A--CTT-G--T--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATACTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-ACC-----------------C-------A-GAC--------TTTT---A-------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TCTAGACGCGTATT-A--GTA-T--C--TACA-A-----A--------CATATCATGTTTATCC----------G----A---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTC-------------------------AAGT-T---TCT-C--TATT-C-CG-AA-TG-TTT-----TTTGCATANN--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----C-----TCGT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTA-ACAG-TA-TAGG-TGGCAGCA
gi|13 : ----A---CA-A---TTGT-CTGTT---G----A-TCGAC--CTTTC--AT---GTA---------CAAG---A-CAACTA--A--TAG-AAG----TT-TTAATGA-TT-CG-A---GGGT--A-AT---A-GGG-ATA-AATCTG-------------------GGCTTC-C----------------A---CG---------------------A-AT--G-TATA------C-TC-T-C---TGG---TA---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-A----GTGAATT--CT-AAGA---C-T-AT-T---AA---------T--A----TAT---A----------------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AA---TCT--------A-CCA-------A-------------------------C-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATACTCTG-TAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-T----------------C-A-C-----------------CA------A-GA----T-TG-TTT------------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C---ACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTTTATCCAA--C-------A-------------A-A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--TT--------------------------AAAT-T---TTT-C----TT-C-TG-TA-T
gi|13 : agTTTC-C--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-AA-TAGA-TGGCGGCAaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|14 : agacaattgtctgttgatcgacctttcatgtacaagacaactaatagaagttttaatgattcgagggtaatagggataaatctgggcttccacgaatgtatactctctggtattttcccgcaattacatcattaagtgaattctaagactattaatatataaaggcctagcagaaagatcaagactattaaatctaccaaccttttcttccataattatactctgtagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcaccaagattgttttcccactccccgtcttaatcccacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttcgaatccctgctattgaaaatcgttaaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-----GT-CCT--GAA-CTT--CC----AAA--A-CC----------------AGAGCG----TTAGAA---CA-----TT-T--CGTC---G----A-C--ACC-ATTTC--AA--AGTA-C-------TAGT---AACAA-CA--T--TAG-ACG----TT-CTAA-GG-TT-CG-AA--G--T--ACGTC-GA-GG--ATG-AATA-AAATT-T-C-TGG-G-C-TG-----C-CGTA-A----T-T-A-------------------------------AT----TATC------C-TC-A-C---TGG---TA---T--CTTTA-C---CAGTA-G----T-A-ACAT-----GT-A-CTTC-----A--TTACGT---GTGAATT--CT-CTGA-----T-GT-T---GA---------T--A----TGT---A--------T-------A----T-----G--CCTAG--TTGAAA-AAA--ACC--A-A-GA-CT-GG----T-A-AGA--TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-GT------T-T---T-C-TTCCATT------AA-TAC---------TAATCTTGAAGC-AG-TG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--ATTT-C-AC------G------C-A-C--------------------------------TT-CA-GCT----A--G-ACTTTTT--T-------CCC-A-T-G-CGCAGG--TC----------TT-A--TCC-C--C--AACA-C-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTACTCAG----C-------A-------------A-A----G-CT-T-ATG-AA----CC--TGcg
gi|15 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagCGCTGAA--CAGAGA-TT-TTCTT-CAAGGT-CAT--TTAACTT--CACAAAA-------T----------------C-ATCA----T----T---CATA---CT-T-ATGTG---G----A-C--AC--ATTTT--AATTAGTA-AGTCAAAGTAAGTACAAAAAGTAGAA--TAA-AAGATAGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTCTGA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-CATGG-GCCATGGGCTTCGCGTA-A------T-ATAA---CGTATTT---T---AT-A---C-A-TT--GTTATATCTTCTC-TC-A-CGT-TGGCTCTA---TAGTTTCT-C---CCTCATG----CTA-A--T-----G--AGATTC-----A--TTA-AC---A-GAATT--CT-A--------T-GTAT---GA---------C--A----TACTGAA--------TTTTCATGA-A--GAAGTAG--CCTAG--C--ATATAAG--ACCTTATA-GA-AC-GTTATAT-A-AGGATTCTTA------A-TCACGTAACTA-------------------------T-CT------G-TTTCT-T-TTCCTTC------AACTAT--------AAATTTTGAA
gi|16 : cccatttctagcagttaacgatttataacttggtttacaatcgaggaaacactatggaatacg-C---C-----G----C-A-T--T-----T--A-CTAC-----AGATTG-CC----TGAATT--CT-AAAAAC-T-T-GT-T---GT---------T--A----AAT---AATACAAGTT-------A-A--A-----GGTCCTA------AGC-AAA--ACC--A-A-GAACT-GT----T-ACAG---TTT--------G-TCA-------AGTATT--------------------C-GTCAAGACG-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ACTTACTG-AAGC--GGTGAC---CAA---CA--ACGTACAG-------T-G-----A--TA--A-AT-CGAC------GA-------A-C-----------------A-------G-GACTGTT-TATTCTT---A----------------------CC-A-CTT-C-CCCAATTC----------TT-A--TTCTC--C--CACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGCTCTTATCC--A-ACACGG-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-AAC--A-TC-G--GTT-----------------------A-AGAT-G---TTT-C--GNNN-N-NN-NN-NN-NNN-----NNNN-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCACTG-----T-----GCAC-T-----TA-A-T-A--ATTATCAA--T-C--AGAATTAGTC-ATGC-T--TT---AG-C--CG-ACAG-CG-TAGA-T--CAGCA
gi|17 : C--A-G-GG-TT-GT------A-AG---TAT--------A-TCA-------A-------------------------C--T------G-T---T-C-TCCCAT-------AA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-C---C-A---AC--ACA--C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC-----------------------------------C---------GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-GT-------TGTTTT--CCC-A-C-T-C-CC-G--TC----------TTTA--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G---TTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GGTT---TG-AA-TG-TGT-----CCTG-----T--G-TTT-T-TANNNNNNNNNNNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGCAc
gi|18 : tctagaaaagttcaataaagttttcaTCCAT-------GA-TAT--------AT--TCTGAA-GC-AG-TG-A---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-CCGTCTCAGA-----C-T-CTTATTCCCCGTCTAATTC-------ACAAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------TGTTTT--CCT-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA-A----G-CT-T-A-G-AA-TTTCC--TGAT--------GTTG-AA-A----AATC-G--TTTT----------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GTTT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TAT--------AACTNNNNN-----NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GGCCTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-CAGTG-ACTG-TA-TATA-TGGCAc
gi|19 : C---C-G-------T-CCA---A--CT--AATT-C-GT------GA-----C---------------------------------C-ACC-CA-TCTCCAAG--G-AC-------TGTTTT--CCT-AAC-T-C-AACGG-TCCT--------TT-AAGGTC-C--C--AACA-ACCAACATTT-----CA-------------T----------G----TTTGAATCCAAC----C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GGTGAAA-A----A-TC-GGCTTTTTGTTA-----AA-------A--A-AGGT-T---TTT-CGGGATT-C-CG-AA-----GT-----TGTG-----T--ACTTC-T-TA---------ATCAATTCTGATTAGA---------AATCAAGCTCCTTTTGATCCGGCTCCCATTAGGATCGCTTTGCCTGACTTATAGAGCGTACATAGCC--AGTTATT----T-----CCAT-TGGG-CT--A-T-A--TTTTCC-AACT-C--ACAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTGAACTGTTA-TAG--TGGCAGTagt
gi|2 : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---TT-C-T--GTA-CTT--CCC-CAAAA--A-CC----------------C-AGTG----TAGG-A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT---A--AGT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTT-CGTA-A----T-T-AT-A---TGT------------T-A----TATAT--G-T---------C-TCTG-C---TGG---TAT--T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT--------------------A---------T--A----T------------------------A--G-----A--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----G-A-AG---TCT--------A-TCA-------AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CT------G-T---T-CATTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-AAGTG-C---C-A---GA--AC---C-----------CAGAGGA--TC--A-TT-CAAT------GT-----T-A-C-----------------C---------GAC-ACCTCA-TCTC---A--G-ACCTGTTATT-------CCC-A-C-TAC-CCCGC-TCT---------TT-A--GTT-C--CCAAACAGA-----A--------CA-------------CACTG------G----TTCGTTATCCAA----C-------A-------------A-A----G-CT-TAA-G-AACTT-CCTTTGCT--------GCTG-AA-AAACCA-TT-T--TTTTT---------AAACCGAAGA--A-AAGT-T---TTC-----ATTCC-CGCAA-T--TGTTAGAATCTG-----T--G-TTTAT-TA---------ATC-----------AACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GT-TAA-A-T-AT-TTTTTC-A--TCC--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|20 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaCGCCGTG--T-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-TTGATT-CCC--CCCAAAAAA--A-ACAAAAACAAAAAAAAAAC-AGCG----T----A---GA-AGAATT-T-TTGTT---G----A----A---ATTTC--A----GTA---------CA-G---AAC---TA-----TGG-AAG----TT-CTAA-GA-TTGCG-A---G--T--C-GTC-GAGGGG-ATA-GATCAG-ATT-T-T-TGG-G--AT----TTC-CGTA-A------T-AC-A---TGT-----------AT-A---TTA-CT--G--------------C-A-C---T-G---TA---T--CTTT------------GGGAAC-A-A--T-----G--A--------------TA-A-----TGA------T-AAGA---C-T--T-A---GT---------T--AC---TAT---A--------T-------C-A--G---------CT-G--C--AGA-AAC--TCC----G-GA--T-GT----T---AG---TCT--------A-TCA-----------------------------------CT------G-T---T-T-TCTCAT-------c
gi|21 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccgA------C-TC-A-CATCTAG---TA---T--TTTCC-CACCC-----G----C-A-A--T-----T--A-CTTC-----AA-TTA-AC---GTTAATT--CT-AAGA---C-TGGT-T---GAATAATTACGT--A----TAT---ATGT-----T-------A-A--G-----A--CCTAGA-C--AGT-AAT--ACG--A-G-AG-CA-GCG---T-A-AA---TCT--------ACCCA-------G-------------------------G-CT------G-T---TAT-TTTCGTCGCAAAAAA-T-T--------ATAGTCTGAAGGG-CGGTG-C---T-A---AA--ACA--C-AAAAAAATT-C-----A--TC--T-GT-A-AA------GAAACCCC-A-C-----------------C-------A-GACTATT-TT-TCTC---T--A-AC-------T-------CCT-G---G-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--A--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------t
gi|22 : -GA-TGG-ATA-A-TCTGAATT-T-C-TGG-G-C------TTC-CGCG-A----T-T---------------------------------------CATA------C-TC-A-C---TAG---TT---T--TTCCC-C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-AT---GTAAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AAACGTAT---A--------T-------A----G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ATC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AA---TCT--------A-TCC-------A-------------------------C-CT------C-T---T-C-TTCCAT-------AA-T-T--------ATAGTCTG-AAGC--GGTG-CCAAC-A---CA--AC---T-G-------A-C-----A--CC--ATTT-C-AC------GA-----C-------------------------------GAA-ACC-------C---A--G-ACTATTT--T-------CTT-A-C-T---CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------ttgtgtgtatccaaacaacagg
gi|23 : CACTGCG--C-GAGA-TT-TT-GT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCAAAAA-----------------------C-A-----------------A-A---TT-T-ATGTT---G-----------------------------A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATATAATCTGAATT-T-C-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-AAATTT-T-AT-A---CGTA------A---AT-A---tgtgtttatccaacaaagcgt
gi|24 : atctcatttcacagattttaacaatttaaactgtttaacaatcgaggaaactaatggaaa-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AATTG-TGtatg
gi|25 : -------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----AACACATCACA-------------T----------G----TTTATCCAA-------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GCTG-AA-A----A-TC-A--TTTTTTTTTAAAAAGA-------A--A-AAGT-T---TTC-C---ATT-C-CG-AA-TG-TGTTAA--TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------agaatgactatcaatatgattaggaatcagctaattattgatccgctctgacttagatcggcgtgcggggggagagatggaaagccgttagttcaattgggctaga
gi|26 : ccatttttcgactcatgatttcttacaaatcttggCTATG--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GAA-CTT---AAAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG--------------A-A----------------G----A----AC--AATTT--CA--TGC--A-------CAAG---AACAACTA--A--TAG-AAG----TT-CTAA-GA-TT-TG-A---G--C--C-GTC-GA-GAG-
gi|27 : atcccattttacattttatggctttgaactttttacagccagcgtttacaatcgaggaaaatctGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AT-C---AT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-----------------------------T----A---TC-A---TT-TCATGT----------------------------------A-------CAAG---AACAACTA--AATCAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-C
gi|28 : tacgactttgaatttgtttacaatcgaggaaactcgcgcaatgaagttatggaacaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTG-CTT--CCta
gi|29 : aatcccatttcacagtttaacgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaCCACTGAG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAAAAAAA--ATCC----------------C-AGCG----TAGA-A---CA-A---TT-T-tcgacaacagtttgagcaagcaacataatcggagtcgctaaaatt
gi|3 : tacaatcaaggaaactcgtacaatgaagttatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GTTC-T--GTA-CTT--CCCAAAACA--A-CC-------------------------------------------T-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTTTTAA--AGTT-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TC-TTAA-A---T-CGTA---G--C--AAGTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-TATGGCA-CATGGGCTTC-CGTA-A----TAT-AT-A---CGTA------TTTTGT-A---C---AT--GGTATA------C-TC-AAC---TGG---TA---T--TTTTT-C---CC----G----CCACA--T-----G--A-CTTA-----A--T-A-AC---GTGAATT--CTTAAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-G--G-----G--CTTAGGTC---GA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-AT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------AAA-----------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT----------T-T--------ATATTTT---AGC-CG-TG-C---CCA---CA--AC---C-G-------T-CC----A--CTGAA-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A------------TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A---TC-C--C--AACA-A-----AC-------CA-------------C----------A----TCATTAATTGATCCAAC-------A-------------A-A----G-CTAT-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G--TATTT---------TA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-CGCG-AA-TGTTGT-----ACT------T----CTT-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-AT-T-C--AG-ATTA-TCGGTTCTT--TT---AGCC-GTG-ACTG-TA-TAGA-T-GCAGTA
gi|30 : tttccatttcacagtttaacgattttaaacttgttacaatcgaggaactaatggaaGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AC-C---GT-C-T--GTA-CTc
gi|31 : atttacgacttgaattttgttaaatcggaggaactcgcacaatgaagtttgggaaacaCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C--A-CA-A-----A--------TA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-A-AC---G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TACT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--T-------------------------A-AAAT-T---TTT-C--
gi|32 : CC--A-A-----T-GT----T-A--------T--------G-TTA-------A-------------------------A-CT------T-T---T-C-TTCCAT-------A---AT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---GA--AC---C-G-------T-C-----ttcta
gi|33 : gcaaagaaacccacCAT-T-GG-CTA-T-T-G--TTTT-C-A--T-C--TAAATTA-TC-GTTC-TCTTT---AG-A-GTG-ACAG-TG-TAGA-TGGCAGCA
gi|34 : -----TCAT-T-GG-TTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|35 : AT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-G-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGc
gi|36 : ----A---TA-A---TT-T-TTGCT---G----A-C--AC--ATTTC---A--TGT--A-------CAGG---AACAACTA--A--TAc
gi|4 : tagaG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA----CC----------------C-AGTG----AGA--A---TA-A---TT-T-ATGTTCTCG----A----AC--ATTGT--TA--AGTA---------CA-G---AA-AAGTA-----TAG-AAG----TT-TTAA-GAGTT-CG-A---GAGCGGA-GTC-GA-GGG-ATA-AAT-TGGATT-TGC-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A----T-A----TA-AT--G-TA-A------C-TC-A-----TGG---TT---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-AG-T-----G--A--TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--AG---TAT---A--------T-------A-G--G---------CTAG--C--A-A-AAA--ACC--A-ACGC-CTGGTA---T-A-AG---T-T--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-CTTTCCAT----------T-T--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---A-A---C---AC---C-G-------T-C-----A--CTA-A-TT-C-AC------GA-----C-A-----------------------------------C-CA-TCTC---A--G-ACTGTT---T-------CCT-A-C-T---CCCG--TC-----------T-A--GTC-CCAC--AACA-A-----CT-------CA-------------T----------G----TTGATC----------C-------AACC----------A-A----G-TT-A-A-G-AA-TT-CC--TGC---------GTTG-AA-A----A-T--G----TTT---------AA-------A--GCAAGT-T---T-----------------G-TG--GT-----TCTA-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTATT----C-----TCATAT-GG-CTATA-T-A--TTTTTC-A--TAC--AG-ATGA-TCAGTTCTT--TT---AG-C-GTG-CATG-TA-TAGAGTGGCA
gi|5 : aatctcatttcacagtttaacgatttataacttgttacagtccgaggaaacgtaatggaacgctcgagCCGCTGTA--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGTG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTTA-AA--AGTA-A-------CATG---AACGAGTA--A--TAG-AAG----TT-TGAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA--GG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A---A
gi|5 : T--G-TATG------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-C-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-C--GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------CCCCGGGCACGAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTT-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGTAT---TTC-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGCATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtatgctcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagaccgttgatatatataaggcctagcagaaagaccaagacgttaagtctatcaacctgttcttccataatatatattctgaaagcaggtgccacaaccgtcactattcacgacacccccgggcacgacacccatctcagactcccactccctgtcttagttccaacaaacacgtcaaagcttagaattcctgttgttgaaaatcgtttttaaaaaagtatttccgattccgaatgtgttctgtgtttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaatatttttcatcagcattatcgttctttagcgtgactgtatagatggcagta
gi|6 : ccgctgtacgagatttgtttgtctgtacttcccaaaaaaacccagtgtacaatttatgttgacacattttaaaagtaacatgaacgagtaatagaagtttgaagattcgagcagtcgaggataaatctgaatttctgggcatgggcttccgtaattatacgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCGCTGTGG-C-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CC----AAA--A-C--------------------------------A----A-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--ACCCATTTT--TA--AGTA-C-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-AA--G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-A-TCTGAATTGT-C-AGG-G-CATGG-CTTC-CGTA-AAATTT-T-AT-A---CGTA------A---ATGA---C---AT--G-TATA------T-CA-A-C---TGG---TA---T--TTTTTTC---C-----G----C-A----T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTCAATT--CT-AAAAGAAC-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-G--GC----A--CCTAG--CT-AGA-AAAGAACC--A-A-GA-CT-GT----TTA-AG---TCT----------TCA-------AT------------------------C-CT------G-T---T---TTCCAT----------TAT--------ATATTCTGAA-GC-AG-TG-CG--C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CT--AATT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------T-G-----C-CA-TCTC---ACCG-ACGTT----T-------CCCTA-C-T-C-CCCG--TC----------TT-ATAGTC-C--CC-AACA-A-----A--------CA-------------CAATCAT----G----TTGATGCCAA------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AAATT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-T--G--TTTTTA--------AA-------A--A-AAGT-T---TTTCC--GATT-C-CG-AA-T--TG------TCTG-----TCAG-TTT-T-T------------------------------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-CAAAGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|7 : ttaacaatcgaggaacactaatggaaCCGCTGTGGGC-GAGAATT-TG-TTTC---GT-C-T---TA-CTTTTCCCAAAA------------------------C-A-----------------A-A---TT-A-ATGTT---G----AAC--AC--GTTTTTTAA--AGTA-A-------CAAG---AGCAAGTA--A--TAGAAAG----TT-TT-A-GA-TTCCG-A---C--A--A-GTC-GA-GGGAATA-AATCTGAATT-T-A-T-G-G-CATGGGC-TC-CGTA-A----A-T-AT-A----GTA------C---GT-ATTTTTACAT--G-TA-A------C-TC-A-A---CGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----GA-A-CCTT-----A--ATA-AC---GT-AATT--CT-AAGA---C---GT-T---GA---------T--A----AAT------------T-------ATA--G-----G--CTTAG--C----A-AAG--A-C--A-A-GA-CT-AT----C-A-A----TCT--------A-CTC-------A-------------------------C-CT------GTT---T-C-TTCCAT----------TGT--------ATATTCTG-AAGC-A-GTG-C---C-A---CAAGAC---C-G-------TCC-----A--CT--A-AT-T-AC------GA--------------------------------------AC-ACC-CA-TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATATGATCCAAAA-C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-GAAA-TT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G---TTTA---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-GA-AA-TG-TGT-----AC------------TTT-C-TA------------------------N---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-ATT-ATTTTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GGG-ACTG-TA-TAGA-
gi|8 : aatcctatttcacagtttaacgatttttaacccttgtttaacaaatcgaggaaactaatggaataCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCC-AAAAT--A-CC----------------C-AGTG----TAGA-A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT---A--AGT--A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-AT-A---CCTA------A---AT-A---C---AT--G-TATA------C-TC-A-C---TTG---TA---T--TGTTT-C---C-----G----CAA-A--T-----GTTA-TGTCGATGGA--TTAGATTTGGTGAATC--TT-AAGA---CTT-GT-TCAAAA---------T--A-----AT---A--------T-------A-A--
gi|8 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaa-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AA-Ttaaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|9 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaatacatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaatCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-A---GT-C-T--GAA-CTT-----AAAAAACAA-CC----------------C-AGCG----T----ATAACA-A---TT-T-CTGTT---ATATAA-C--AC--ATTTT-------GTGTA-------CAAG---AACAA----------------------CTAA-AA-TT-CG-A---G--C--C-ATC-GA-AGG-ATA-AATATGAATT-T-C-TAG-G-C-TG-----C-AGTA-A----A-C-AC-A---TGTA------C---AT-A---CTC-ACTGG-TATA-----------A-G---TGG---TA---T--TTTC--C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CTTC-----A--TT----------------CT-CAGA---C-T-GA-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-----------------------------------------GA-CT-GT----T-A-AG---TAT--------A-TTATA-----A-------------------------C-CT------G-T----------------------------------ATACTCTGAA--T-CGGTG-C---C-AACACA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TTTC-AC------GT-----C-A-C-----------------CC------A-GAC---T-TG-TTTC-------------------------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-A--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-ATA----G-CT-T-T-G-AA-TT-CG--TTCT--------ACTT-AA-A----A-TC-G--TTTT------------------------AAGT-T---TTT-C--GATT-T-CG-AA-TG-TTT-----TCGG-----T--A-TAT-T-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----NNNNC-TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTCCC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-ATG-ACGG-TA-TAGA-TGtg
blockSeqs : GG A A G C T AAG T C TG A TT CA AACAAAAACAAAAAAAAAACAGCGTAG T AAA G CA CTC TATA TCG CC AATTAGTAAGTCAAAG TAC G GAA A ATAG . T G G T GAGCGGA T G A T G G AT C C A G . AATTTTATACGTAAATGAC TG T T TCTTCT . T A ATC CTC T AG TT ACC CTCAT GGAA T C CA TACATGC G GATGG GA C TTG . T GAA T G A CAA ATAATTACG GC AACG TGAATTTTCATGAAGAAGTAG GT TG G T GA TT T C A G TATA T C GAT TA C AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . CAAGAC T TTC A A CGCAAAAAATT A A AAG A CAA A ACA AG GTA A AAAAAAT C AGAGG . AAA T G GTCTCAGACTCTTATTCCCCGTCTAATTCACAACACCCATCTCAGACTGTTTT T A T A G AT TAGACGCGTA T AG T CA CA G CCAAC ATCATCATGCTTATCCAGCAATA T CACG . A AT A T T TT CTAATCGT A T AACC A C GCT TTTTTAAAAAGAA C A CTT C GGG C G C T T TAGAA CATANNN A A ATCAATTCTGATTAGAAATCAAGCTCCTTTTGATCCGGCTCCCATTAGGATCGCTTTGCCTGACTTATAGAGCGTACATAGCCAGTTATTT A G C T T . TT A AC C AA G G T CT . C A A T T . G
blockSeqs : G . . . . . . . A . . . AA ACCAGAGCGTTAGAAC . GAA . A . . AC C TTAAAGTTA . C AAT . . . . . C . GGGTA . . . . . . AT . . A . . ATATAGTACGTATTTTTAC . G T . . . . GT . . . T . AGTA . C . G GTT . . A G . . . AC . . . . . . T AATACAAGTTAAAGGT A T A . . . . . . . G . . A . . CGTAACTA . . . . . T CAACTAT A G CGG . CAA C ACA . A . . . CA . GAA . A GACACCCCCGGGCACGACACCCATCTCAGACT . . . . . G CT . TA . . C . . ACACATCACATGTTTATCCAACA . C . . AA . C . . CTAATCGT . T AC . C T TAAACCGAAGA . . CTT . G . . . . . TAA TCAG . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . T . T A . . A T . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA CAACCCAGCGTATAAC . . . C . . C . TTAAAGTAA . C A . . . . . . . AGTAC . . . . . . A . . A . . TATAACGTATTTTATACA . . T . . . . . . . . C . C . A . . GT . . . . . . . . . . . . . . C ATGTTAAGA . . G . . . . . . . A . . . . . AGTATT . . . . . . TAATAC G A AGG . CAA . . . A . . . C . AT . . GTTACCGACACCTCATCTCAGACCTGTTATT . . . . . C T . . . . . . . CCACATCATTAATTGATCCAACA . . . . C . T . . . . . . . . T TGTTAAAA . . . . G . . . . . . TAC . . ATCAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA ATCCCAGCGTAGAAC . . . C . . C . AAAAGTAA . G A . . . . . . . GCAA . . . . . . T . . A . . TATATACGTATTTTGTAC . . T . . . . . . . . A . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . G ACAAATAT . . G . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . AATAT A A CGG . CAA . . . . . . . . . AT . . GAAACCCCACCAGACTATTTTTCTCTAACT . . . . . . . . . . . . . . CACACTGGTTCGTTATCCAACA . . . . C . A . . . . . . . . T TTTAAA . . . . T . . . . . . TG . . TAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA ACCCAGTGTAGGAC . . . A . . C . AAAGTAC . G A . . . . . . . AGCA . . . . . . T . . A . . ACACATGTACATACTC . . T . . . . . . . . T . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . ATAGGCA . . A . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . AATAT A A AG . G . . . . . . . . . AT . . GACCACCCATCTCCAAGGACTGTTTT . . . . . . . . . . . . . . CACAATCATGTTGATGCCAACA . . . . C . . . . . . . . . . T TTTAAA . . . . G . . . . . . NN . . AACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AA ACCCAGTGTAGAAC . . . A . . C . TAAGTAC . G T . . . . . . . GCA . . . . . . T . . A . . TTATACATAAATAC . . T . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . ATAGGA . . T . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . GATAT A A GG . . . . . . . . . . . AA . . GACACCTGCCATCTCACCGACGTTT . . . . . . . . . . . . . . TTTCATGTTTGAATCCAACCA . . . . C . . . . . . . . . . G TAAAA . . . . G . . . . . . TG . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA CCCAGTGAGAAT . . . T . . C . AAGAAA . C A . . . . . . . GTC . . . . . . T . . A . . TTATACGTAATATA . . T . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . ATAGGG . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AATAT A A GG . . . . . . . . . . . AA . . CGACACCCATCTCAGGTTGTTTT . . . . . . . . . . . . . . CACATCATATGATCCAAAACA . . . . A . . . . . . . . . . T TAAT . . . . G . . . . . . TG . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTATTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AA ACCCAGTGTAC . . . A . . C . CATGCA . C A . . . . . . . GCA . . . . . . T . . A . . TTATACCTAAATAC . . T . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . ATAAGG . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AATT A G AG . . . . . . . . . . . AA . . GCACTTCAGCTAGACTTTTTT . . . . . . . . . . . . . . CATATCATGTTTATCCGACA . . . . A . . . . . . . . . . T TAAA . . . . T . . . . . . TG . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA TCATCATTC . . . A . . C . TAAGTA . G A . . . . . . . GCA . . . . . . A . . A . . TTATATGTTATAT . . T . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . TATAGG . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AATT A A GG . . . . . . . . . . . AT . . GAACAGGACTGTTTATTCTTA . . . . . . . . . . . . . . CACATCATGTTTATCCAACA . . . . A . . . . . . . . . . T TAAA . . . . G . . . . . . TG . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA AAGCGTAG . . . T . . C . ATTTA . C A . . . . . . . GTC . . . . . . A . . A . . TACATGTATATTA . . T . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . AAAGG . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TAT A A AG . . . . . . . . . . . AA . . GACGAAACCCAGACTATTTT . . . . . . . . . . . . . . CACATCATGTTTATCCAACA . . . . A . . . . . . . . . . T TTAA . . . . G . . . . . . TG . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA ACCCAGCG . . . A . . C . ATGTA . G A . . . . . . . GCA . . . . . . T . . A . . ATACAAGCACT . . T . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . ATATG . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TAT . A AG . . . . . . . . . . . AA . . GACACCATCTCAGACTGTTT . . . . . . . . . . . . . . CACATCATGTTTATCCAACA . . . . A . . . . . . . . . . T TAAA . . . . G . . . . . . TG . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCACTGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA ATAT . . . A . . C . AAGTA . G A . . . . . . . GCC . . . . . . A . . . . . ATAC . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . ATCAG . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AAT . A GG . . . . . . . . . . . A . . GTCACCCAGACTTGTTTC . . . . . . . . . . . . . . TACATCATGTTTATCCAAC . . . . A . . . . . . . . . . T TAAA . . . . G . . . . . . TA . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C ACC . . . A . . C . ATGTA . G A . . . . . . . GCA . . . . . . T . . . . . ACGA . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . ATAGG . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAT . A CG . . . . . . . . . . . A . . GACTCCCAGAATGTTTT . . . . . . . . . . . . . . CACATCATGTTTATCCAAC . . . . C . . . . . . . . . . T AAAA . . . . T . . . . . . T . . ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C ACA . . . A . . . . AAGTA . G A . . . . . . . CAA . . . . . . T . . . . . TTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . ATAGG . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AAT . A AG . . . . . . . . . . . A . . GACACCCAGACTTTTAT . . . . . . . . . . . . . . CACATCATGTACTCAGCA . . . . A . . . . . . . . . . T AAA . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A CA . . . A . . . . GTGTA . G A . . . . . . . GCA . . . . . . T . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . TAGG . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TAT . . AG . . . . . . . . . . . T . . CACCAAGATTGTTTT . . . . . . . . . . . . . . CACATCATGCTCTTATCC . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . CA . . . C . . . . AGTA . . . . . . . . . . GCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . AGA . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TGT . . AG . . . . . . . . . . . A . . GAACACCCATCTCAA . . . . . . . . . . . . . . TCATGTTGATCCAACC . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TT . . AG . . . . . . . . . . . A . . GACACCATCTCAA . . . . . . . . . . . . . . CACGTCA . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TT . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : ACCCAGCGTAGAC***************************** *** AAGTA************** GCA******** T* TTATACGTANATAC************************** *** **** ** ATAGG***************************** **** ******** AATAT**************** AG** ** AA** ***** A** T** TAAA****************** G** ***
originalCons : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCG----T----A---CA-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTT--AA--AGTA-A-------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-AT-A---CGTA------A---AT-A---CTA-AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TAT---A--------T-------A-A--G-----G--CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCAT-------AA-TAT--------ATATTCTGAAAGC-AGGTG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CC--A-TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
finalCons : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAAACCCAGCGTAGAC-----------------------------A-A---TT-T-ATGTT---G----A-C--AC--ATTTTAAGTA--------------CAAG---AACAAGTA--A--TAG-AAG----TT-TTAA-GA-TT-CG-AGCA--------GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-CT-GG-G-CATGGGCTTC-CGTA-ATTATACGTANATAC--------------------------AT--G-TATA------C-TC-A-C---TGG---TA---T--TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T-GT-T---GA---------T--A----TATATAGG-----------------------------CCTAG--C--AGA-AAG--ACC--A-A-GA-CT-GT----T-A-AG---TCT--------A-TCA-------A-------------------------C-CT------G-T---T-C-TTCCATAATAT----------------ATATTCTGAAAGCAG--TG-C---C-A---CA--AC---C-G-------T-C-----A--CCAA--TT-C-AC------GA-----C-A-C-----------------C-------A-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A-A----G-CT-TA--G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-GT--TTTTAAA------------------A-AAGT-T---TTT-CG--ATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 55555555555555555555555555555555555555 2222222222222222222222222 444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111 11111111 11111111111111111 111 1111111111 3333333333333333333333333 22222222222 1 222 111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 2222222222222222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 44 2 2 4 2 2 333 2 4 22 2 22 11 0 55555555555555555555555555555555555555 4 2 1 4444 777 4444 3333 55 2 4444444444444444444444444 2 4 2 0 2 666 22 2 2 2 2 2 4 2 99999999999 2 2 2 2 2 2 77 2 555 2 2 111111111111111111111111111111111111111 2 4 33 2 666666 2 2 2 2 666 333 666 11111111 66 333 11111 6666 6 2 55 33333333 2 55555555 4 333 22 2 77777777 888888 11111111111111111 22 6666 2 555 6666 222 33 333 55 5555555555 0 66 2 2 2 4 6 2 4 2 2 77777777 2 22 1111111111111111111111111 2 555555 4 2 4 66666666666 77777777 0 8 22 5555 2 444 4 22 555 777777 1 44 222222 2 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 2 2 2 66 2222222222 1 55 1 22 44 1 77777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 77777777 6666 2 2 444 1 7 1 22 44444444 2 4 7777 2 4 444 5555555555555555555555 2 2 777 2 555 2 2 2 2 2 00000 6666666666 2 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 2 2 2 55 2 55 4 33 2 4 4 33 333 2 2 4 1 2 2 4
lowQualScore : .. . . . . . ... . . .. . .. .. . ...................................... . . . .... ... .... .... .. . ......................... . . . . . ... .. . . . . . . . ........... . . . . . . .. . ... . . ....................................... . . .. . ...... . . . . ... ... ... ........ .. ... ..... .... . . .. ........ . ........ . ... .. . ........ ...... ................. .. .... . ... .... ... .. ... .. .......... . .. . . . . . . . . . ........ . .. ......................... . ...... . . . ........... ........ . . .. .... . ... . .. ... ...... . .. ...... . . ..................................................................... . . . . . .. .......... . .. . .. .. . ..... ............................................................................. ........ .... . . ... . . . .. ........ . . .... . . ... ...................... . . ... . ... . . . . . ..... .......... . . ........................................................................................................................ . . . . . . .. . .. . .. . . . .. ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 0 0 0 0 0 555 0 0 88 0 99 66 5 22222222222222222222222222222222222222 0 0 4 5555 444 5555 7777 00 1 7777777777777777777777777 1 2 1 4 1 111 99 2 2 2 2 2 4 4 88888888888 1 1 1 2 2 2 55 2 111 2 2 000000000000000000000000000000000000000 2 4 22 6 444444 2 2 2 2 999 999 111 11111111 99 777 88888 6666 3 1 00 22222222 1 99999999 2 777 99 1 55555555 222222 77777777777777777 99 6666 1 888 9999 222 11 999 33 0000000000 1 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22222222 0 88 8888888888888888888888888 0 888888 0 0 2 66666666666 66666666 6 8 44 4444 1 222 2 99 222 444444 9 55 000000 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 44 9999999999 9 22 9 66 55 9 88888 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222 2222 0 0 333 9 6 9 66 55555555 0 0 0000 0 0 888 3333333333333333333333 0 0 000 0 999 1 1 1 1 4 66666 5555555555 7 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 4 4 4 4 66 2 33 4 11 2 4 4 11 999 2 2 4 0 2 2 4
consensus : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCGT-A-G-A-C-A-ATT-TAT----GTT---G----A-C--AC--ATT-T-----------------T---AA--GT-A-C-AAG-AACAAG--TAA--TAG-A-AGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-A---T-A---CGTA---N---AT-AC-----A-TG-T--ATA------C-T-C-A-C---TGG---TA---T--------TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T--GT------TG-------A---------T--A----T-A---TAT----AGG---C--CT---AG--C----------AGAAAG--AC-CAA-GA-CT-GT-T-A-AG-T-CT--------A-T--CAA-------------------------C-CT------G-TT-C-TTCCAT-------AATAT--------ATATTCTGAA-AGC-G--GTG-C---C-ACA--AC---C------GT-C--AC----C-AATT-C-AC-------GA-----C-A-C-------CA-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
Reference ( family-2759 ) : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGCGT-A-G-A-C-A-ATT-TAT----GTT---G----A-C--AC--ATT-T-----------------T---AA--GT-A-C-AAG-AACAAG--TAA--TAG-A-AGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-A---T-A---CGTA---N---AT-AC-----A-TG-T--ATA------C-T-C-A-C---TGG---TA---T--------TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T--GT------TG-------A---------T--A----T-A---TAT----AGG---C--CT---AG--C----------AGAAAG--AC-CAA-GA-CT-GT-T-A-AG-T-CT--------A-T--CAA-------------------------C-CT------G-TT-C-TTCCAT-------AATAT--------ATATTCTGAA-AGC-A--GTG-C---C-ACA--AC---C------GT-C--AC----C-AATT-C-AC-------GA-----C-A-C-------CA-GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------ANC-----------GA---------NANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--NNNTNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|1 : GTG--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCCAAAAA--C-CA----------------C-AGTGA-G-A-A-T-AGATT-TAT----GTCTCGA----A-C--A---ATT-T-----------------TA--AA--GT-A-C-AGA-AGCAAG--T-A--TAG-A-AGTTATTAA-GA-TT-CG-AGAGG--CGGA-GTC-GA-GGG-ATA-A--TTGATTT-G-CATGG-C-AATGGGCTTC-CGTATA----T-TAA---T-AAAGCGTA---T---ATCACAATAAA-TG-T--AAA------CGT-C-A-C---T-G---TATCTT--------CTTTC-C---C-----GA---C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTTGATTACTT-AAGA---C-TA-GT------TGT------A---------G--G----T-A---TAT----AGG---C--CT---AG--C----------A-AAAG--AC-CAC-GC-CTGGTAT-A-AG-T-CTAACCCATGA-T--CAA-------------------------CACT------GTTT-C-TT--AA-------AATATACCATTTAATATTCTGAA-GGC-AAGATG-----C-AC---AC---C------GT-C--ACT---C-CATTGC-AC-------GA-----C-A-A-------CA-A-------CA-TCTC---A--GAAC-------TGTGTTTGCCT-A-C-T-C-CCCG--TC-----------T-A--GTC-C--C--GACA-ACC---A--------CA-------------CTCATGTTGATG----C---------------C-------AACC----------A--------A----GTCT-TAA-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-A---CGTT---------AA-------ACTA-TAGT-T---TGT-----GTT-T-CT-AC-TG-TTT-----TTTA-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGTTAT----TCTGCATGAT-G-GG-CTA-A-TAA--TTTTTC-A--T-C--AGAATGA-TC-GTTC-T--TTTTAAG---GTGCACTG-TATTAGAGTGGCAG
gi|10 : atctcactttcacagtttaacgatttatttaaacttgtttacagtcgaggaaaacgtaatggaactggctgaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAA------------------------C-A-------------A-ATC-TAT----GTT---G----A-C--AC--ATT-T-----------------T---AA--G--------A-AACAAG---AG--TAA-G-A-TT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTT-GA-GG--ATA-AATCTGAATT-T-T-AGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-A---T-A---CATA---A---AT-AC-----A-TG-T--ATA------C-T-C-A-C---TGG---TA---T--------TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T--GT------TG-------A---------T--A----T-A---T-T----AGG---C--CT---AG--C----------AGAAAG--AC-CAA-TA-CT-GT-T-A-AG-T-CT--------A-T--CAA-------------------------C-CT------G-TT-C-TTCCAT---------TAT--------ATATTCTGAA-AGC-A--GTG-C---C-ACA--AC---G------GT-C--AC----TAAATT-C-AC--------------C-G----------------ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------
gi|10 : tacaatcgaggaaactaaagtaa-AA-TT-C---TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------T--A-AAGT-T---TTT-C--GAT----CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-TATA---------AAC-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNT-----TCAT-T-GG-CTA-A-C-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-C--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAcaattctgctgttgaaaatcgtttttaataaagtttttcgatcgaatgtgttctgtgttttataaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaacatttttcatcagaattatcgttccttagcgtgactgtatagatggcagtac
gi|11 : tacaatcgaggaaactaaagtaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaacaaatctatgttgacacattttaagaaacaagagtaagattttaagattcgagcagttgaggataaatctgaattttagggcatgggcttctgtaattatacataaatacatgtatactcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagactgttgatatattaggcctagcagaaagaccaatactgttaagtctatcaacctgttcttccattatatattctgaaagcagtgccacaacggtcactaaattcaccgacccatctcagaccCACTGTT--C-GAGA-TT-AA-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAACAAAA--A---------------------AGCGT-A-G-A-A-A-A----ATCCCAGTC---G----A-C--AC--ATT-T-----------------C---AT--TT-A-C-AAG-AACAAC--TAA--TAG-G-ATTT-CTGA-GA-TT-CA-A---G--T--C-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C---------TAGGCTTC-TGTA-A-----------------------------AT-AC-----A-TG-T--ATA------C-T-C-A-C---TGG---TA------------TTTTC-C---C-----G----A-A-T--T-----GT-C-CTTC-----G--TTA-AC---GTACATT--TG-AAGG---C-T--GT------TG-------A---------TGCA----T-G---TAC----AAATATC--CA---AG--C----------AAAAAG--AC-CAA-GA-CT-GT-T-A-AG-T-CT--------A-T--CAA-------------------------G-CT------G-TG-C-TTCCAT---------TAT--------ATACTCCG-A-AGT-C--GTG-CCAAC-ACA--AC---C------GT-C--AC----C-ATTT-C-CC-------GA-----CTC-C-------CA-GA-------A-TGTT---------T-------T-------CTT-A-T-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTC-T--C--AAGA-A-----AATCAT---CA-------------T----------GCTTAT---------------CCAGCAATA-------------A--------A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------GTTA-AG-A----A-TT-G--TTTTT---------AA-------A--A-AGG--T---TTT-C--GATT-C-AG-AA-TA-TTT-----TCTG-----c
gi|12 : atcccattttgcattttacgactttgaacttgtttacgatcacggaaactcgcacaatgaagttatggaag-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-C------TTC-CGTA-A-----------------------------AT-AC-----A-AG-C--A--------C-T-T-G-C---TGA---TG---T--------TTTC--C---C-----G----C-A-A--TTACATGC-A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGACTT--CT-AAGA---C-T--GT------TG-------G---------T--A----TTC---TAT----AGG---A--CT---TG--T----------AGAAAG--AT-CAA-GA-CT-GT-T-A-AG-T-CT--------A-T--CAA-------------------------C-CT------G-TT-C-TTCCAT-------A--AT--------ATACTCTG-A-AGC-G--GTG-CCAAC-ACA--AC---C------GT-C--AC----C-ATTT-C-AC-------GA-----C-ACC-------CA-GAC--------TTTT---A-------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TCTAGACGCGTATT-A--GTA-T--C--TACA-A-----A--------CATATCATGTTTATCC----------G----A---------------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTC-------------------------AAGT-T---TCT-C--TATT-C-CG-AA-TG-TTT-----TTTGCATANN--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----C-----TCGT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTA-ACAG-TA-TAGG-TGGCAGCA
gi|13 : -A-G-A-C-A-ATTGTCT----GTT---G----A-TCGAC--CTT-T-----------------C---AT--GT-A-C-AAG-A-CAAC--TAA--TAG-A-AGTT-TTAATGA-TT-CG-A---GGGT--A-AT---A-GGG-ATA-AATCTG-------------------GGCTTC-C-------------------A---CG------------A------A-TG-T--ATA------C-T-C-T-C---TGG---TA---T--------TTTC--C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-A----GTGAATT--CT-AAGA---C-T--AT------TA-------A---------T--A----T-A---TAA----AGG---C--CT---AG--C----------AGAAAG--AT-CAA-GA-CT-AT-T-A-AA-T-CT--------A-C--CAA-------------------------C-CT------T-TT-C-TTCCAT-------AAT-T--------ATACTCTG-T-AGC-G--GTG-CCAAC-ACA--AC---C------GT-C--AC----C-ATTT-C-AC--------------C-A----------A-GA----T-TG-TTT------------------T-------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C---ACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTTTATCCAA--C-------A-------------A--------A----G-CT-T-C-G-AA-TC-CC--TGCT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--TT--------------------------AAAT-T---TTT-C----TT-C-TG-TA-T
gi|13 : TTTC-C--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-AA-TAGA-TGGCGGCAaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcctcagaattatcgttctttagcgtgacagaatagatggcggcacg
gi|14 : agacaattgtctgttgatcgacctttcatgtacaagacaactaatagaagttttaatgattcgagggtaatagggataaatctgggcttccacgaatgtatactctctggtattttcccgcaattacatcattaagtgaattctaagactattaatatataaaggcctagcagaaagatcaagactattaaatctaccaaccttttcttccataattatactctgtagcggtgccaacacaaccgtcaccatttcaccaagattgttttcccactccccgtcttaatcccacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttcgaatccctgctattgaaaatcgttaaatttttcttctgtataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-----GT-CCT--GAA-CTT--CC----AAA--A-CC----------------AGAGCGTTA-G-A-A-C-ATT-T-C----GTC---G----A-C--ACC-ATT-T-----------------C---AAA-GT-A-C-TAGTAACAA---CAT--TAG-A-CGTT-CTAA-GG-TT-CG-AA--G--T--ACGTC-GA-GG--ATG-AATA-AAATT-T-C-TGG-G-C-TG-----C-CGTA-A----T-T-A------------------------------A-T--T--ATC------C-T-C-A-C---TGG---TA---T--------CTTTA-C---CAGTA-G----T-A-ACAT-----GT-A-CTTC-----A--TTACGT---GTGAATT--CT-CTGA-----T--GT------TG-------A---------T--A----T-G---TAT----ATG---C--CT---AG--TTG--------AAAAAA--AC-CAA-GA-CT-GG-T-A-AGAT-CT--------A-T--CAA-------------------------C-GT------T-TT-C-TTCCATT------AATAC---------TAATCTTGA-AGC-A--GTG-CCAAC-ACA--AC---C------GT-C--AC----C-ATTT-C-AC-------G------C-A-C---------------TT-CA-GCT----A--G-ACTTTTT--T-------CCC-A-T-G-CGCAGG--TC----------TT-A--TCC-C--C--AACA-C-----A--------CA-------------C----------A----TCATGTACTCAG----C-------A-------------A--------A----G-CT-T-ATG-AA----CC--TGcg
gi|15 : atcccatttcacagtttaacgatttaacttattacaatcgagaaaaccgcacaacgaacagtaatgagCGCTGAA--CAGAGA-TT-TTCTT-CAAGGT-CAT--TTAACTT--CACAAAA-------T----------------C-ATCAT-T-----C-ATACT-TAT----GTG---G----A-C--AC--ATT-TTAATTAGTAAGTCAAAGT---AA--GT-A-C-AAA-AAGTAGAATAA--AAG-ATAGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTCTGA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-CATGG-GCCATGGGCTTCGCGTA-A------T-A---TAA---CGTATTTT---AT-AC-----ATTGTT--ATATCTTCTC-T-C-A-CGT-TGGCTCTA---TAG------TTTCT-C---CCTCATG----CTA-A--T-----G--AGATTC-----A--TTA-AC---A-GAATT--CT-A--------T--GTA-----TG-------A---------C--A----T-A---
gi|16 : cccatttctagcagttaacgatttataacttggtttacaatcgaggaaacactatggaatacg-C---C-----G----C-A-T--T-----T--A-CTAC-----AGATTG-CC----TGAATT--CT-AAAAAC-T-T--GT------TGTTAAATAA---------T--A----C-AAGTTAA----AGGT--C--CT---A--------------AGCAAA--AC-CAA-GAACT-GT-T-ACAG-T-TT--------G-T--CAAGTATT--------------------C-GTCAAGACG-TT-C-TTCCAT-------AATAT--------ACTTACTG-A-AGC-G--GTGAC---CAACA--ACGTACA-----GT-G--AT----A-AATC-G-AC-------GA-------A-C-------AG-GACTGTT-TATTCTT---A----------------------CC-A-CTT-C-CCCAATTC----------TT-A--TTCTC--C--CACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGCTCTTATCC--A--------ACACGG-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-AAC--A-TC-G--GTT-----------------------A-AGAT-G---TTT-C--GNNN-N-NN-NN-NN-NNN-----NNNN-----N--N-NNN-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCACTG-----T-----GCAC-T-----TA-A-T-A--ATTATCAA--T-C--AGAATTAGTC-ATGC-T--TT---AG-C--CG-ACAG-CG-TAGA-T--CAGCActgaattttcatgaagaagtagcctagcatataagaccttatagaacgttatataaggattcttaatcacgtaactatctgtttcttttccttcaactataaattttgaa
gi|17 : -CAG-GG-TT-GT---A-AG-T-AT--------A-T--CAA-------------------------C--T------G-TT-C-TCCCAT-------AATAT--------AT--TCTGAA--GC-A--GTG-C---C-AAC--ACA--C------GT-C--AC----T-AATT-C-AC--------------------------C--GAC-ACC-CA-TCTC---A--G-GT-------TGTTTT--CCC-A-C-T-C-CC-G--TC----------TTTA--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-TC-G---TTTT---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GGTT---TG-AA-TG-TGT-----CCTG-----T--G-TTT-T-TANNNNNNNNNNNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGCAc
gi|18 : tctagaaaagttcaataaagttttcaTCCAT-------GATAT--------AT--TCTGAA--GC-A--GTG-A---C-ACA--AC---C------GT-C--AC----T-AATT---------------------------------------CC-CG-TCTC---A--G-AC-------T-------CTT-A-T-T-C-CCCG--TC----------TA-A--TTC-A--C--AACA-c
gi|18 : C---C------GT-C--------T-AATT-C-AC-------AA-----C-A-C-------C----------CA-TCTC---A--G-AC-------TGTTTT--CCT-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAACAA--------A----G-CT-T-A-G-AA-TTTCC--TGAT--------GTTG-AA-A----AATC-G--TTTT----------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GTTT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TAT--------AACTNNNNN-----NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GGCCTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-CAGTG-ACTG-TA-TATA-TGGCAcccatctcagactgttttcctactccccgtcttagtcccaacaaacacatcatgtttatccaacaaagcttagaatttcctgatgttgaaaaatcgttttaaaaaagtttttcgtttccgaatgtgttctgtgtttttataactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggcctaatatttttcatcagaattatcgttctttagcagtgactgtatatatggcaagt
gi|19 : tccatgatatattctgaagcagtgacacaaccgtcactaattcccgtctcagactcttattccC---C------GT-CCAAC----T-AATT-C-GT-------GA-----C----------------C-ACC-CA-TCTCCAAG--G-AC-------TGTTTT--CCT-AAC-T-C-AACGG-TCCT--------TT-AAGGTC-C--C--AACA-ACCAACATTT-----CA-------------T----------G----TTTGAATCCAAC----C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GGTGAAA-A----A-TC-GGCTTTTTGTTA-----AA-------A--A-AGGT-T---TTT-CGGGATT-C-CG-AA-----GT-----TGTG-----T--ACTTC-T-TA---------ATCAATTCTGATTAGA---------AATCAAGCTCCTTTTGATCCGGCTCCCATTAGGATCGCTTTGCCTGACTTATAGAGCGTACATAGCC--AGTTATT----T-----CCAT-TGGG-CT--A-T-A--TTTTCC-AACT-C--ACAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTGAACTGTTA-TAG--TGGCAGTagt
gi|2 : CCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---TT-C-T--GTA-CTT--CCC-CAAAA--A-CC----------------C-AGTGT-AGG-A-C-A-ATT-TAT----GTT---G----A-C--AC--ATT-T-----------------T---AA--GT-A-C-AAG-AACAAG--TAA--TAG-A-AGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTT-CGTA-A----T-T-A---T-A---TGT----T---AT-AT-----A-TG-T-----------C-T-CTG-C---TGG---TAT--T--------TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--C-------------------------------------------------T-A---TAT----AGA---C--CT---AG--C----------AGAAAG--AC-CAA-GA-CT-AT-G-A-AG-T-CT--------A-T--CAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CT------G-TT-CATTCCAT-------A--AT--------ATATTCTG-A-AGCAA--GTG-C---C-AGA--AC---CCAGAGGAT-C-----------ATT-CAAT-------GT-----T-A-C-------C--GAC-ACCTCA-TCTC---A--G-ACCTGTTATT-------CCC-A-C-TAC-CCCGC-TCT---------TT-A--GTT-C--CCAAACAGA-----A--------CA-------------CACTG------G----TTCGTTATCCAA----C-------A-------------A--------A----G-CT-TAA-G-AACTT-CCTTTGCT--------GCTG-AA-AAACCA-TT-T--TTTTT---------AAACCGAAGA--A-AAGT-T---TTC-----ATTCC-CGCAA-T--TGTTAGAATCTG-----T--G-TTTAT-TA---------ATC-----------AACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GT-TAA-A-T-AT-TTTTTC-A--TCC--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|20 : atcccatttcacagttcccgattttaaacttgtttacaatcgtggaaactaatggaaCGCCGTG--T-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-TTGATT-CCC--CCCAAAAAA--A-ACAAAAACAAAAAAAAAAC-AGCGT-A-G-A-AGA-ATT-TTT----GTT---G----A-A--A-----T-T-----------------T---CA--GT-A-C-A-G-AAC-----TA---TGG-A-AGTT-CTAA-GA-TTGCG-A---G--T--C-GTC-GAGGGG-ATA-GATCAG-ATT-T-T-TGG-G--AT----TTC-CGTA-A------T-A---C-A---TGTA---T---AT-----------------TA------C-TGC-A-C---T-G---TA---T--------CTTT------------GGGAAC-A-A--T-----G--A--------------TA-A-----TGA------T-AAGA---C-TTAGT------TA-------C---------T--A----T-A---T-C----AG-------CT----G--C----------AGAAAC--TC-C-G-GA--T-GT-T---AG-T-CT--------A-T--CA----------------------------CT------G-TT-T-TCTCAT-------c
gi|21 : gtttacaatcgaggaaacttgcacaacgaagtaatggaaccgccgA------C-T-C-A-CATCTAG---TA---T--------TTTCC-CACCC-----G----C-A-A--T-----T--A-CTTC-----AA-TTA-AC---GTTAATT--CT-AAGA---C-TG-GT------TG-------AATAATTACGT--A----T-A---TATGTTAAGA---C--CT---AGA-C----------AGTAAT--AC-GAG-AG-CA-GCGT-A-AA-T-CT--------ACC--CAG-------------------------G-CT------G-TTAT-TTTCGTCGCAAAAAAT-T--------ATAGTCTGAAGGGC-G--GTG-C---T-AAA--A--------------C--ACAAAAA-AATT-C-ATCTGTAAAGAAACCCC-A-C-------CA-GACTATT-TT-TCTC---T--A-AC-------T-------CCT-G---G-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--A--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------t
gi|22 : -GA-TGG-ATA-A-TCTGAATT-T-C-TGG-G-C------TTC-CGCG-A----T-T-------------------------------------C--ATA------C-T-C-A-C---TAG---TT---T--------TTCCC-C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CATC-----A--TTA-AT---GTAAATT--CT-AAGA---C-T--GT------TG-------A---------T--AAACGT-A---TAT----AGG---C--CT---AG--C----------AGAAAG--AT-CAA-GA-CT-GT-T-A-AA-T-CT--------A-T--CCA-------------------------C-CT------C-TT-C-TTCCAT-------AAT-T--------ATAGTCTG-A-AGC-G--GTG-CCAAC-ACA--AC---T------GA-C--AC----C-ATTT-C-AC-------GA-----C--------------GAA-ACC-------C---A--G-ACTATTT--T-------CTT-A-C-T---CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------ttgtgtgtatccaaacaacagg
gi|23 : CACTGCG--C-GAGA-TT-TT-GT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CTCAAAAA-----------------------C-A-------------A-ATT-TAT----GTT---G----------------------------------------------A-C-AAG-AACAAG--TAA--TAG-A-AGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATATAATCTGAATT-T-C-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-AAATTT-T-A---T-A---CGTA---A---AT-AT-----A-TG-tgtgtttatccaacaaagcgt
gi|24 : atctcatttcacagattttaacaatttaaactgtttaacaatcgaggaaactaatggaaa-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AATTG-TG
gi|25 : -------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----AACACATCACA-------------T----------G----TTTATCCAA-------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGCT--------GCTG-AA-A----A-TC-A--TTTTTTTTTAAAAAGA-------A--A-AAGT-T---TTC-C---ATT-C-CG-AA-TG-TGTTAA--TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------agaatgactatcaatatgattaggaatcagctaattattgatccgctctgacttagatcggcgtgcggggggagagatggaaagccgttagttcaattgggctaga
gi|26 : ccatttttcgactcatgatttcttacaaatcttggCTATG--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GAA-CTT---AAAAAAAA--A-CC----------------C-AGCGA-A-GAA-C-A-ATT-T-----------------------C--AT----------------------------GC-A-C-AAG-AACAAC--TAA--TAG-A-AGTT-CTAA-GA-TT-TG-A---G--C--C-GTC-GA-GAG-
gi|27 : atcccattttacattttatggctttgaactttttacagccagcgtttacaatcgaggaaaatctGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AT-C---AT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-----------------------------------------TAT---------------------C--ATT-T-----------------C---AT--GT-A-C-AAG-AACAAC--TAAATCAG-A-AGTT-TTAA-GA-TT-C
gi|28 : tacgactttgaatttgtttacaatcgaggaaactcgcgcaatgaagttatggaacaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTG-CTT--CCta
gi|29 : aatcccatttcacagtttaacgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaCCACTGAG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCAAAAAAA--ATCC----------------C-AGCGT-A-GAA-C-A-ATT-Ttcgacaacagtttgagcaagcaacataatcggagtcgctaaaatt
gi|3 : tacaatcaaggaaactcgtacaatgaagttatggaaCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GTTC-T--GTA-CTT--CCCAAAACA--A-CC------------------------------------T-TAT----GTT---G----A-C--AC--ATT-T-----------------TTTAAA--GTTA-C-AAG-AACAAG--TAA--TAG-A-AGTC-TTAA-A---T-CGTA---G--C--AAGTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-TATGGCA-CATGGGCTTC-CGTA-A----TAT-A---T-A---CGTA---TTTTGT-AC-----A-TGGT--ATA------C-T-C-AAC---TGG---TA---T--------TTTTT-C---CC----G----CCACA--T-----G--A-CTTA-----A--T-A-AC---GTGAATT--CTTAAGA---C-T--GT------TG-------A---------T--A----T-A---TAT----AGGG--C--TT---AGGTC-----------GAAAG--AC-CAA-GA-CT-AT-T-A-AG-T-CT--------A-T--CAAAA-----------------------C-CT------G-TT-C-TTCCAT---------T-T--------ATATTTT----AGC-C--GTG-C---CCACA--AC---C------GT-CC-AC----TGAATT-C-AC-------GA-----C-A-C-------CA------------TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A---TC-C--C--AACA-A-----AC-------CA-------------C----------A----TCATTAATTGATCCAAC-------A-------------A--------A----G-CTAT-A-G-AATTT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G--TATTT---------TA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-CGCG-AA-TGTTGT-----ACT------T----CTT-N-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-AT-T-C--AG-ATTA-TCGGTTCTT--TT---AGCC-GTG-ACTG-TA-TAGA-T-GCAGTA
gi|30 : tttccatttcacagtttaacgattttaaacttgttacaatcgaggaactaatggaaGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-AC-C---GT-C-T--GTA-CTc
gi|31 : atttacgacttgaattttgttaaatcggaggaactcgcacaatgaagtttgggaaacaCCG--TC----------TT-A--ATC-C--C--A-CA-A-----A--------TA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTTATCCAAC-A--------AC---G-CT-T-C-G-AA-TT-CC--TACT--------ATTG-AA-A----A-TC-G--T-------------------------A-AAAT-T---TTT-C--
gi|32 : C-CAA-----T-GT-T-A-------T--------G-T--TAA-------------------------A-CT------T-TT-C-TTCCAT-------A--AT--------ATATTCTG-A-AGC-A--GTG-C---C-AGA--AC---C------GT-C--ttcta
gi|33 : gcaaagaaacccacCAT-T-GG-CTA-T-T-G--TTTT-C-A--T-C--TAAATTA-TC-GTTC-TCTTT---AG-A-GTG-ACAG-TG-TAGA-TGGCAGCA
gi|34 : -----TCAT-T-GG-TTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-G----T--TT---AG-C-GTG-ACTG-CA-TAGA-TGGTAGTA
gi|35 : AT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AAAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-G-GTG-ACAG-TA-TAGA-TGGCAGc
gi|36 : T-A-G-AAT-A-ATT-TTT----GCT---G----A-C--AC--ATT-T-----------------C---AT--GT-A-C-AGG-AACAAC--TAA--TAc
gi|4 : G--C-GAGA-TTGTG-CT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA----CC----------------C-AGTGA-G-A-A-T-A-ATT-TAT----GTTCTCG----A----AC--ATTGT-----------------T---AA--GT-A-C-A-G-AA-AAG--TA---TAG-A-AGTT-TTAA-GAGTT-CG-A---GAGCGGA-GTC-GA-GGG-ATA-AAT-TGGATT-TGC-ATG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-A---T-A---CGTA---AT--AT-A------A-TG-T--A-A------C-T-C-A-----TGG---TT---T--------TTTTT-C---C-----G----C-A-AG-T-----G--A--TTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-T--GT------TG-------A---------T--AG---T-A---TAT----AGG------CT---AG--C----------A-AAAA--AC-CAACGC-CTGGTAT-A-AG-T--T--------A-T--CAA-------------------------C-CT------G-TT-CTTTCCAT---------T-T--------ATATTCTG-A-AGC-A--GTG-C---A-AC---AC---C------GT-C--AC----T-AATT-C-AC-------GA-----C-A------------------C-CA-TCTC---A--G-ACTGTT---T-------CCT-A-C-T---CCCG--TC-----------T-A--GTC-CCAC--AACA-A-----CT-------CA-------------T----------G----TTGATC----------C-------AACC----------A--------A----G-TT-A-A-G-AA-TT-CC--TGC---------GTTG-AA-A----A-T--G----TTT---------AA-------A--GCAAGT-T---T-----------------G-TG--GT-----TCTA-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTATT----C-----TCATAT-GG-CTATA-T-A--TTTTTC-A--TAC--AG-ATGA-TCAGTTCTT--TT---AG-C-GTG-CATG-TA-TAGAGTGGCA
gi|5 : aatctcatttcacagtttaacgatttataacttgttacagtccgaggaaacgtaatggaacgctcgagCCGCTGTA--C-GAGA-TT-TG-TT-T---GT-C-T--GTA-CTT--CCCAAAAAA--A-CC----------------C-AGTGT-A-----C-A-ATT-TAT----GTT---G----A-C--AC--ATT-T-----------------T---AAAAGT-AAC-ATG-AACGAG--TAA--TAG-A-AGTT-TGAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GG--ATA-AATCTGAATT-T-C-TGG-G-CATGGGCTTC-CGTA-A----T-T-A---T-A---CGTA---A---A
gi|5 : -TG-T--ATG------C-T-C-A-C---TGG---TA---T--------TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTGAATT--CT-AAGA---C-C--GT------TG-------A---------T--A----T-A---TATA---AGG---C--CT---AG--C----------AGAAAG--AC-CAA-GA-C--GT-T-A-AG-T-CT--------A-T--CAA-------------------------C-CT------G-TT-C-TTCCAT-------AATAT--------ATATTCTGAA-AGC-AG-GTG-C---C-ACA--AC---C------GT-C--AC----T--ATT-C-AC-------GA-----C-A-CCCCCGGGCACGAC-ACC-CA-TCTC---A--G-AC-------T-------CCC-A-C-T-C-CCTG--TC----------TT-A--GTT-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------G----T---------------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-CC--TGTT--------GTTG-AA-A----A-TC-G--TTTTT---------AA-------A--A-AAGTAT---TTC-C--GATT-C-CG-AA-TG-TGT-----TCTG-----T--G-TTT-T-TA---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-C--AGCATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtatgctcactggtattttttccgcaatgacttcattaacgtgaattctaagaccgttgatatatataaggcctagcagaaagaccaagacgttaagtctatcaacctgttcttccataatatatattctgaaagcaggtgccacaaccgtcactattcacgacacccccgggcacgacacccatctcagactcccactccctgtcttagttccaacaaacacgtcaaagcttagaattcctgttgttgaaaatcgtttttaaaaaagtatttccgattccgaatgtgttctgtgtttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattggctaatatttttcatcagcattatcgttctttagcgtgactgtatagatggcagta
gi|6 : ccgctgtacgagatttgtttgtctgtacttcccaaaaaaacccagtgtacaatttatgttgacacattttaaaagtaacatgaacgagtaatagaagtttgaagattcgagcagtcgaggataaatctgaatttctgggcatgggcttccgtaattatacgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCGCTGTGG-C-AAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CC----AAA--A-C-----------------------------A---A-ATT-TAT----GTT---G----A-C--ACCCATT-T-----------------TT--AA--GT-A-CCAAG-AACAAG--TAA--TAG-A-AGTT-TTAA-GA-TT-CG-AA--G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-A-TCTGAATTGT-C-AGG-G-CATGG-CTTC-CGTA-AAATTT-T-A---T-A---CGTA---A---ATGAC-----A-TG-T--ATA------T-C-A-A-C---TGG---TA---T--------TTTTTTC---C-----G----C-A----T-----G--A-CTTC-----A--TTA-AC---GTCAATT--CT-AAAAGAAC-T--GT------TG-------A---------T--A----T-A---TAT----AGG---CACCT---AG--CT---------AGAAAAGAAC-CAA-GA-CT-GT-TTA-AG-T-CT----------T--CAAT------------------------C-CT------G-TT---TTCCAT---------TAT--------ATATTCTGAA--GC-A--GTG-CG--C-ACA--AC---C------GT-C--AC----T-AATT-C-AC-------GA-----C-A-C-------CT-G-----C-CA-TCTC---ACCG-ACGTT----T-------CCCTA-C-T-C-CCCG--TC----------TT-ATAGTC-C--CC-AACA-A-----A--------CA-------------CAATCAT----G----TTGATGCCAA------C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AAATT-CC--TGCT--------GTTG-AA-A----A-T--G--TTTTTA--------AA-------A--A-AAGT-T---TTTCC--GATT-C-CG-AA-T--TG------TCTG-----TCAG-TTT-T-T------------------------------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNT----T-----TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTTTC-A--T-CAAAGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GTG-ACTG-TA-TAGA-TGGCAGTA
gi|7 : ttaacaatcgaggaacactaatggaaCCGCTGTGGGC-GAGAATT-TG-TTTC---GT-C-T---TA-CTTTTCCCAAAA------------------------C-A-------------A-ATT-AAT----GTT---G----AAC--AC--GTT-T-----------------TTTAAA--GT-AAC-AAG-AGCAAG--TAA--TAGAA-AGTT-TT-A-GA-TTCCG-A---C--A--A-GTC-GA-GGGAATA-AATCTGAATT-T-A-T-G-G-CATGGGC-TC-CGTA-A----A-T-ATAGT-A---CGTATT-T---TT-AC-----A-TG-T--A-A------C-T-C-A-A---CGG---TA---T--------TTTTT-C---C-----G----C-A-A--T-----GA-A-CCTT-----A--ATA-AC---GT-AATT--CT-AAGA---C----GT------TG-------A---------T--A----A-AT--TAT----AGG---C--TT---AG--C------------AAAG--A--CAA-GA-CT-AT-C-A-A--T-CT--------A-C--TCA-------------------------C-CT------GTTT-C-TTCCAT---------TGT--------ATATTCTG-A-AGC-A--GTG-C---C-ACAAGAC---C------GTCC--AC----T-AATT---AC-------GA---------------------AC-ACC-CA-TCTC---A--A--------------------------------CG--TC----------TT-A--GTC-C--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----TCATATGATCCAAAA-C-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-GAAA-TT-CC--TGCT--------GTTG--A-A----A-TC-G---TTTA---------AA-------A--A-AAGT-T---TTT-C--GATT-C-GA-AA-TG-TGT-----AC------------TTT-C-TA------------------------N---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----T-----TCAT-T-GG-CTA-ATT-ATTTTTTTC-A--T-C--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-GGG-ACTG-TA-TAGA-
gi|8 : aatcctatttcacagtttaacgatttttaacccttgtttaacaaatcgaggaaactaatggaataCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-C---GT-C-T--GTA-CTT--CCC-AAAAT--A-CC----------------C-AGTGT-A-GAA-C-A-ATT-TAT----GTT---G----A-C--AC--ATT-T-----------------T---AA--GT-A-C-AAG-AACAAG--TAA--TAG-A-AGTT-TTAA-GA-TT-CG-A---G--C--A-GTC-GA-GGG-ATA-AATCTGAATT-T-T-TGG-G-CATGGGCTTC-TGTA-A----T-T-A---T-A---CCTA---A---AT-AC-----A-TG-T--ATA------C-T-C-A-C---TTG---TA---T--------TGTTT-C---C-----G----CAA-A--T-----GTTA-TGTCGATGGA--TTAGATTTGGTGAATC--TT-AAGA---CTT--GTTCAAAATA-------A---------T--A----T-A----AT----AAATATC--CTGGAAG--CAAGCAGATCTAGAAAGTAGCTCAA-GA----GT-G-AGAG-TCCT--------A-T--CAAG------------------------C-CT------G-TT-
gi|8 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaa-------A-------------A--------A----G-CT-T-A-G-AA-TT-T---TGCTCTAATCGTGTTG-AATA----A-TCCG--TTTTTTT-------AA-------A--T-AGGT-TCTTTTT-C--TATT-C-CG-AA-Tgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaataaagcttagaattttgctctaatcgtgttgaataatccgtttttttaaataggttctttttctattccgaattg
gi|9 : aaccccatttcagtttagcgattttaaacttgtttacaatcgaggaaactaatggaaccgctgtgcgagatttgttcgtctgtacttcccaaaatacccagtgtagaacaatttatgttgacacattttaagtacaagaacaagtaatagaagttttaagattcgagcagtcgagggataaatctgaatttttgggcatgggcttctgtaattatacctaaatacatgtatactcacttgtattgtttccgcaaatgttatgtcgatggattagatttggtgaatcttaagacttgttcaaaataatataataaatatcctggaagcaagcagatctagaaagtagctcaagagtgagagtcctatcaagcctgttgcgtgggcataataaattaggattttctgtaacgagacctacatttaaaccgtgtgaagattaactgacgaatctcgttttcatccctcaagaccgtggcgttttcctctactcccctctggttaggccgagagagaggggagtctcgggatggggtggaggcaactaatCCGCTGTG--C-GAGA-TT-TG-TT-A---GT-C-T--GAA-CTT-----AAAAAACAA-CC----------------C-AGCGT-ATA-A-C-A-ATT-TCT----GTT---ATATAA-C--AC--ATT-T-----------------T---GT--GT-A-C-AAG-AACAA-------------------CTAA-AA-TT-CG-A---G--C--C-ATC-GA-AGG-ATA-AATATGAATT-T-C-TAG-G----------C-TGCA---------------------GTA---A---AC-AC-----A-TG-TACATA------C-T-C-A-C---TGG---TA---TAAGTGGTATTTTC-C---C-----G----C-A-A--T-----T--A-CTTC---------------------ATT--CT-CAGA---C-T--GA------TG-------A---------T--A----T-A---TAT----------------------------------------------A-GA-CT-GT-T-A-AG-T-AT--------A-TTATAA-------------------------C-CT------G-----------------------T--------ATACTCTG-A-ATC-G--GTG-CCAAC-ACA--AC---C------GT-C--AC----C-ATTT-C-AC-------GT-----C-ACC-------CA-G---ACT-TG-TTTC-------------------------CCC-A-C-T-C-CCCG--TC----------TT-A--GTC-A--C--AACA-A-----A--------CA-------------C----------A----T---------------C-------ATGTTT--------ATCCAACATA----G-CT-T-T-G-AA-TT-CG--TTCT--------ACTT-AA-A----A-TC-G--TTTT------------------------AAGT-T---TTT-C--GATT-T-CG-AA-TG-TTT-----TCGG-----T--A-TAT-T-NN---------NNN-----------NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN----NNNNC-TCAT-T-GG-CTA-A-T-A--TTTCCC-A--T-A--AGAATTA-TC-GTTC-T--TT---AG-C-ATG-ACGG-TA-TAGA-TGtg