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Reference ( gi|1 )            : ATCTGAT---TCATACTCAGTCATTTT----AGCA--TATTG-AATTTATTATAATTATA-CTCTCTAATT-GAGGAATAAAAACCC--TACGACACT-GTTACCATAAACTAAATTACTAGTATATATATTTCTACACAGCACT--CTGTACACTG-AA---TATCATA---T-ACTGTACCGC--GTCCCTAAGCTTAACCCCAG--TACTTGAAC---TTGGTTACGGTGTTATATACTTGAGCA-CGCAACAATAACTAAGGTTCAAAACAAATTTACAA-ATCCTAT--AAAT-TAATCAAAA--T--AAT-CACG-TATG-TACCCTATCCCTTGA--CCG---AC-TGC-CACC--AA--AATGTAACGTGTTACT----GAGTTCT--TT---ACAAGAGAT---GGGGACT-----------TATAT--T-T-AT------------A-----------A-TTTTCCTCTTACTCTACTT-GAG-TTAT-TTATT-ATATGCTAGT-AAGC----TGATCG-CAATAT-AATT-TTA-CTCTAAAATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTCT-TCTG-AGC-TTGATTGGT--AC-CGAGTTACTT-ATCGCCGG--GTTTCT--AAT----CACCGAGGGTAGTGTAGTA-GTGACTGGGTATCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--AGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTACAG-GGTGCC-TCACCCTTATCCA-GAGATAAATGCAC-CCAGTA-CTGTA--GCAA---TTCCTTA----AGCT---CT-T-CA----CTGAT-G--CTTTA---T----TTATCTTTAATTTCCCTACCCTAGTCTATTATC-TTT---ATCTTATTCTAATT-TGTTTTACCCTTTATTGGCGT--CTA-TTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG--AAACACATCAGACTGA-C--TGAT--TT---TC-TCAACT-GCA-GGCTC-T--------TTTA-TA-CTACT--------GGTCCATGTCCATT-TCAAAA-GAGGGG--GA-ACA-GGTCCT-TGGACCTCATTCTAATA-TTA-GAAT---TCA-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--CAATATACTAACTA----AATCA-TCAG
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gi|7                          :                                                                                                                                                       TACACTG-CA---TA-CAAA---TTAATGTACCGC--ATCCCCTAGCTTAAC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttT--AAATCTGAGCAAGA--TCTAATACACTCTAAGATACCCTATCCGTT-A--CAGCTCATGTGA-TACCATAA--GAT-TAACGTGT--CTTAA-GGGTTAT--TT---GCAAGGAAT---AGGTATT-----------CATAT--aatggggaatatatatatatatatatatataatttttcttttactctacttgattgacttaatctataagctgatcacaacatcaatttttctatttctctaactgagttttgattggtaccgagttatttatccagggttttttatcaccgagggtagtgttgtacgtgactgggtacctgcaccgtgttcccgagccaagttccttttgctaagtacagggtgcctcatccagcataaatgcacccagtactggaatcccttaggctcttgcactgattctttaattacccctatttccctacccgaagctattttctttatttattctaattatttacctattcttctttcgtcttcttcttt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atttaccagagataatcaacc-TACCCTATCCCTTAAACCCG---CT-TGC-CACC---A--AATGT-ACGTGTC-CTCTAAGGGTTCTC-TT---GCAAG-GATAAAAGGTAAT-----------CATATAATGT-AT------------ATGTAATAATAGA-TTTTCCTCCGGCTCTACTT-GGC-CTA--TAATT-AACTACAAGT-AATCAATATTATC-----TAC-AATTATTA-TTCTGA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttacatagataaatcaacttattctagcacagctatacaatctaaga---AC-TGCATACA--AATTAATGTACCGCATCCCC----TAG--CT--TA---ACAA----T---GGGGAATATATATATATATATAT--A-T-AT------------A-----------A-TTTTTCTTTTACTCTACTT-GAT-TGAC-TTA---AT---CTA-T-AAGC----TGATCA-CAACATCAATT-TT---TCTA----TTTCTCTAACTGAG--------------------T-TTTG-A---TTG----GT--AC-CGAGTTATTT-ATC-CAGG--GTTTTT--TAT----CACCGAGGGTAGTGTTGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--AGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTACAG-GGTGCC-TC------ATCCA-G-CATAAATGCAC-CCAGTA-CTG----G-AA---TCCCTTA----GGCT---CT-TGCA----CTGAT-T--CTTTA---A----TTACCCCT-ATTTCCCTACCCGAAGCTATTTTC-TTT---AT-TTATTCTAATT---ATTTACC---TAT------------TCTT---CTTTCGT--CTTCTTCT-TTtttactgggatactctccgggttctattttttttaatatacccggggacacaagacgggttctatgtacacggtac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttacGTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT--CT---GTAAGGGATAAAAAGGTCTC----------TATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------A-TTTTCCTCGGGCTCTACTT-GGGCTTAT-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT--CT---GTAAGGGATAAAAAGGTCTC----------TATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------A-TTTTCCTCGGGCTCTACTT-GGGCTTAT-agttaactagggaattaatattatatacacctattattctgatttactggatacttgtcccgggtttatttgttttactgtatacggggacacaaggacggggtttctaatgttacacggtactgtaacactggctggctgccttgcaccttggttccgttaccaagttgcctaattgttctgtgagtacttcggtgtttcacccttattcaggtattacttcacttttgtatctcaatcaacatttccttgcttaacgttaccagtggcttgatttctaaccccaaccttcaattccgtttcacttttaattctttattaatgtacctttctttttcttcactgcttttttaggccgtcagacttaacaagtgattgatactgcctctgcagcttcttatatagcaaagggctataccaataggggtatacaggatctcgggctattccattagtctgaattacatcagtgtttggaagacataggatcattgtatcgttccttact
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACGTGTTACT----GAGTTCT--TT---ACA-GAGAT---GGGGACA-----------TATAT--T-T-AT------------A-----------A-TTTTCCCTCTACTCTACTT-GAG-TTAT-TT-TT-AT-T-----T-AAGC----TGATCG-CAATAT-AATT-TTA-CTCT---ATTT---------CTCTATCTGAGCGTTGATTGCTAT-ACCG-AGT---------T--AC-----TTA-----TCCCGGG--TTTTCTAAAAT----AACCGAGGGTAGTG-AGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--AGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTACAG-GGTACC-TCACCCTTACCC---GGATAAATGCAC-CCAGTA-CT-----GCAA---TTCCTTA----AGCT---CT-TCCA----CTGAT-G--C-TTA---T----TTATCTTT-ATTTCCTAACCCTAGTCTATTATC-TTT---AT-TTATTCTAA-T-TG-TTTACC--TAATT-GCGT--CTATTTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG---AACACATCAGACTGA-C--TGAT--TT---TC-TCAACT-GCA--GCTCTT--------TTTA-TA-CTACT--------GGTCCATGTCCATT-TC-AAA-GA-GGG--GA-ACA-GGTCCT-TGGAC--CATTCTAATA-TTA-TAAA---TCA-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C------TTAACTACT--AATCA-TCAagttaactatgggaattaatattatatacaccgtatattcttgatttactgggatacttgtcccgggttctatttgttttact
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTTACT----GAGTTCT--TTT--ACAAGAG-T---GGGGACA-----------TATAT--T-TTAT------------G-----------A-TTTTCCTCTTACTCTACT---GG-TTATGTTATT--TAT--TAGTGAAGC----TGATCGGCAATA-------TTA--------ATTTTACTCTA-------------------TTTCTTTATCTGTAGCGTTGATTGGT--ATGCGAGTTACTTTATC-CCGGCCGTTTCT--AAT----CACCGAGGGTAGTG--GTA-GTGACTGGGTA-CT-GCGGCCAGTGTTCCCG--A--CAAGTC-CTT------TTGGC----T----AAGTACAG-GGTGCCTTCA-CCTTATCCATGGAATAAATGCAC-CCAGTA-CT-----GCAA----TCCTTA----AGCT---CT-TCCA----CTGAT-GCCCTTTA---A----TTATCTT--ATTTCCCTA-CCTAGTCTATTCTC-TTTTTAAT-TTATTCTAATT---ATTTACC--TAATT-ACGT--CTA--TTT---TTCCTGT--CTTC-TCG-TTCG-GC----GAACACATAGGACTAA-CCTTGAT--TT---TCTTCAACTGGCA-GGCTCTT--------TTTA-TATCTACT--------GGGTCATGTCCATT-TCAAAA-GAGGGGC-GA-A-A-GGT-AT-TGGAACTCATTCTAATA-TCA-CAA----TCA-----CCTcagtat
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cgtTTACT----GAGTTCT--TT---ACAAAGGATC--GGGGACA-----------TATTA--T-T-AT------------A-----------ATTTTTCCTCTTACTCTAC-T-GAG-TTAT-TTATT-AT----TA---AAGC----TGATCG-CAATAT-AA---TTACCTCT---ATTCTCTCTCTGGCGTTGATTGG-------------T-TCCG-AGT-TTTATC------C-CGGGTT-CT-----------------C--AAT----CA-CGA-GGTAGTGTAGTACGTGAC-GGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCGA-AGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTACAG-GGCACC-TCA-CCTTATCCA-G-GATAAATGCA--CCAGTA-CT-----GCAA---TTCCTTA----AACT---CT-TCCA----CTGAT-G--CTTTA---TTATCTTATTCTTTATTTCCCTACCCTAGTCTATTATCTTTT---AT-TTATTCTAA-T-TG-TTTACC---TATT-GCGT--CTA-TTTT---TTTCCTG--CTTC-TCT-TTCGAGCCG---AACACATCAGACTGA-C--TGAT--TT---TC-TCAACT-GCA-GGCTC-T--------TTTATTA-CTACT--------GGTCCATGTCCATT-TC-AAA-GAGGGG--GA-ACAGGGCCCT-TGGAC--CATTCTAATA-TTATGAAT---CAA-----CTTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATT-TAAGC-ATATACT--CT-----AGTCA-TCAagtatttatga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GG--GTTTCT--AATGTTACAC----GGTACTGTAACA-CTGGCTGGCTGCCTTGCA-CC-TTGGTTCCGTTA-CCAAGTTGCCTAATTGTTCTG-----T----GAGTACTTCGGTGTT-TCACCCTTATTCA-GGTATTACTTCACTTTTGTATCTCAA--TCAACATTTCCTT------GCTTAACG-T-TA----CCAGTGG--CTTGA---T----T----TCTAA---CCCCAACCT--TCAATTCCG-TTT---CAC---TTTTAATT----------CTTTATTAATGTACCT--TTCT---TTTTCTTCACTGC-TTT-TTTAGGCCGTCAGACTTAACA-AGTGA-T--TGATACTG---CC-T---CT-GCA-GCTTC-T--------TATA-TA-GCAAA--------GGGCTATACC---------AA-TAGGGG--TATACA-GGATCT-CGGGC--TATTCCATTAGTCT-GAAT---T-A-----CATCAGTG-TTTGGA--AGACATAGGATCATTGTA--ca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtaacgtgtcctctaagggttctctgtaagggataaaaaggtctctatatgtacatgtaataataaaattttcctcgggctctacttgggcttatagttaactagggaattaatattatatacacctattattctgatttactggatacttgtcccgggtttatttgttttactgtatacggggacacaaggacgT-ACA-CC-TGGTTCCAA--TACCAAGTT-TCT------ATAGT----TCCACGAGAACTC-GGTGCC-TCACGCGTATTCA-GGATTAAGTGCAC-TTTATA-TTTCACCACAA---TTCCTTGGTTTAGCT---TTAC-CAGTGGCTGAT-A--TTTCAGCCT----TAACCGTCAATTCCtcgttccttact
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctT-GCC-CT-G-GTTCCAA--TGCCAAGTT-CTT------ATTGT----TCTGTGAGTACCC-GATGTTATCACCCTTATTCA-GAatttcacttttaattcttaaataatttacctttttaggtcacctgagta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gctcctT-GCA-CC-TGGTTCCAA--TACCAAGTT-CCT------ATTGTTCTGT----GAGTACTC-GGTGCC-TCttacttttactttgtactcacaacaatctt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGACTGA-C---AAT--T---------AACC-GAACGGCTC-TGATGCCGCTTTA-TA--TACTCTAAGAAGAGTCCATGTTCACT-CCCAAA-AAGG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cagctgactgCT-TCGACT--ATTCTA----TTA-GTGTGTGTCA-----CATCAGCG-TTTGGG--AGGCAT-AAG-C-TTATA--atatttgggttattccattatatcaagtcatcaaaacgtttgattacatagaaaaaaatcatcacattacccacgtctccgggtacattcgtctcgaatgacaaagcaaacgtttttttttttttccacatttatttaacatgatgatctgaaacaaa
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): GTAATGTATCCTCCAAATGTTTTGTTCTGAAGGGATAAAAGGTCTCATTTATTTATTTAATAACAAATACACAGTCATGTAATTTTCCCCAGGTTCTATTTGAGCCATTGATTAAGTACAGGGAATCAATATTATTTATAGTAATTATTCTAATTTACTAGGATACTATCTCGGTTTAAGTTTTTCTTATATCCACGGATTGTATCTTACACGTTGATGCAACATTGGCTGAGCTCCTTGCACCTGGTTTAGATACTACGTTTCTATTTCTCAGTGAGTACT
Unaligned ( gi|12 ): TTTGCACCTGGTTCCAATACCAAGTTCCTATCGTCCTGTGAGTACTCGCGGTGTTTCACCAGTATTCAGGATTACTACACTTTGTTTATCGCACAATTTCTTGGTTTAACTTTACCAGTGGGCTTATATTTCAACCCTAACCTTTCAATTCCGTTTTACTTTTGATTCTTTATTAATCTTTGCTTCTTCTTCTTCTTAGGCCGTCAGACTAATAA
Unaligned ( gi|15 ): CAGCCAACTGAGACTGAAAAACTGAACGGCTCTGATGCCGCTTTATATACTCTTAGAGGAGTCCATGTTCGCTCTCAAAAGGGGTATTGGGTCATTTCATTATATCAAGTCATCAAAACGTTTGATTGCATAGAAAAAATTAATCACACTA
Unaligned ( gi|16 ): ATATCATTATAGTTTATCTTGAAAATGTACAAAGAAAAAAATTATTACTTAACCACGCTCCGGGTCATTCGTTCTCTGAATGAAAAACCACATTATTTTTTTTATTCTTTTTTTTTCATTGACAGATAAACTGCAAGACAAA
Unaligned ( gi|17 ): CAGGTTCCTATTGTTCTGTGAGTACTCTGTGCCTCTAGCATTGTTACATCCTTGGTTAATCTTTCACCAATGGCTTGTATTTCGATCTTAACATTTCGATTCCTTAATTCACTATTACTTAAATAATATCAAGTCTTCTTC
Unaligned ( gi|21 ): TATTCTCTTCTATCGGGACACTTGTCCCGGGTTTTATTTTCTATTGTACACAAGGCGGGGTTCTGTGTTACACGGTACTGTACAT
Unaligned ( gi|22 ): AAAAAATTATTACATTACCCACGCCTTCGTGTACACTTGTCCCAAATGAAAACACATATAATTATTTCTTT
Unaligned ( gi|24 ): TTTACCAGTGGCTTATTTTCGACTAACCTTTGAATTCCGTTTCAC






Alignments
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Reference ( family-2617 )     :        ATGTGATCTATCGTACTCAGCCATTCTCTTCAGCAACGATTGGAATTTATGAT--TCATATCTCTCTAATTTGAGAAATAAA--CCCGGTACAATACTTGTTACCATAAACTGAATTATTA-------TATT-CTACACAGCACTGCTTGTACACTGCNACTCTACNANAATCTTANTGTACCGCCGATCCCCGAGCTTAACCCCGGGTTACATGAACTTTTTTGTTACGGTGGGATAAACTTGGGCATCG-AACA-TAATAAAGATTCAAAAGCAACATACAACGCTCTACAAAAATCTGANCAAGAGGTCTNATACACNCTAAG-TACCCTATCCCTTGA--CCG---ACGTGC-TACCA--A--AATGTAACGTGTCACTC--AGGGTTC--T-TT-G-CAAGGGAT---GGGGACT-----------TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACTT--GG----GTTATTTA-TTAT-T-CTA-TAAGCTGATCG-CAATAT-------AAT-T-T---TAC-TCT-A---TT-TT---NTCTACTTG----------------TTTCT-T-TCCGAGCGTTGATCG--GT--AC-CGAGTTACT-T-ATC-CNGG--------------GTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTGTAGTACGTGACTGGGTACC-TGCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CC------TTTTGC----T----GAGTAC-NG-GGTGCC-T-CACCCTTATCCA-GGNATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATG--CTT-TATT----T-AT-CTTT-ATTTCCCTACCCTAGTCTATTNT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAATTTG-TTTACC--TTATT-GCGTCTA-TTTTTT---TCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--TT---C-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGAGGGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGACC-CATTCTAATA-TT-A-NAATTCAC-----CTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C--TATACTAACTACT--AATCA-TCAG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TGCA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-CC------TATCGTCCTGT----GAGTACTCGCGGTGTT-T-CACCAGTATTCA-GG-ATTACTACAC-TTTGTTT-----ATC---GCACAA-------TTTCTTGGTTTAACTT----TA-CCAGTGG-G--C-T-TA------T-AT-TTCA-A---CCCTAACCT-TTCAATTCCGTTTT---AC-TTTTGA-TTC----TTTA-TTAATC--T--TT-GCTTCT--TCTTCT---TC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttCT-TACA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-TC------TATAGT----TCCACGAGAAC-TC-GGTGCC-T-CACGCGTATTCA-GGATTAAGTGCAC-TTTA--TATTTCACC---A--CAA-------TTCCTTGGTTTAGCTT----TA-CCAGTG--G--CTGATATT----TCAG-CCTT-A-------ACC---GTCAATTCC-ATTTC--AC-TTTTAA-TTCTTAAATAA-TTTACC--TTTTT-AGGTCttaggccgtcagactaataa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTC--T-CT-G-TAAGGGATAAAAAGGTCTC----------TATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GG----G---CTTA-TAGT-T-------AACT-ATGG-GAAT-T-------AA--------------T-A---TT-AT---ATACAC-CG----------------TATAT-T-C-------TTGATT----T--AC-TGGGATACT-T-GTC-CCGG--------------G-TT-CTAacctgagta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATCTGAGCAAGA--TCTAATACACTCTAAGATACCCTATCCGTT-A--CAGCTCATGTGA-TACCATAA--GAT-TAACGTGTC-TTA--AGGGTTA--T-TT-G-CAAGGAAT---AGGTATT-----------CATAT--tttgttttact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atttaccagagataatcaacctCT-TCGACT--ATTCTATTA-GT-G-TGTGTCAC-----ATCAGCG-TTTGGG--AGGCAT-AAG-C-TTATA--T--TGTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtgactaatactgcctctgcggtctcctacgtaacaaaggacaatacccatccatgagGTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTC--T-CT-G-TAAGGGATAAAAAGGTCTC----------TATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GG----G---CTTA-TAGT-T-------AACTAG--G-GAAT-T-------AATAT-TATATACACCT-A---TTATTCTGATTTACTGG----------------ATACT-TGTCCCGG-GTTTATTT--GT--------TTTACTGT-ATA-CGGGGACACAAGGACGGGGTTT-CTAA--TGTTACAC----GGTACTGTAACAC-TGGCTGGCTGCCTTGCA-CC-TTGGTTCCGTTA--CCAAGTTGCCTAATTGTTCTG-----T----GAGTACTTC-GGTGTT-T-CACCCTTATTCA-GGTATTACTTCACTTTTG--T-----ATC---T--CAATCAACATTTCCTT------GCTTAACGTTACCAGTG--G--CTT-GATT----------TCT-A--ACCCCAACCT--TCAATTCC-GT------T-TC---ACTTT-TAATTC--TTTA----TTAAT-GTACCT--TTCTTT---TTCTTCACTGC-TTT-TTTAGGCCG-------TCAGACTTAA-CAAGTGATTGATA---C-TGCCTCT-GCAGCTTC-TTATA-TA-GCAAAGGGCTATACC---------AATAGGGG-TATACA-GGATCT-CGGG-C-TATTCCATTAGTC-T-GAATT-AC-----ATCAGTG-TTTGGA--AGACATAGGATCATTGTA--tcgttcattact
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CT-TGCC-CT-G-GTTCCAA--T-GCCAAGTT-CT------TATTGT----TCTGTGAGTAC-CC-GATGTTAT-CACCCTTATTCA-Gtcgttccttact
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTTACTG--AGTTTTCGTT-CT-GACAAGT--T---GTGGA--------------ATAT--T---AT------------A-----------CTTTT-CCTCTTACTCTACTTCGAG----GTTATTTA-TTTA-T-ATA-CAAG-TGATCG-CAA-AT-------AAT-T-T---TAC-TCT------------------TTTA----------------TTTCT-CATCTGAGCGTTAATTG--TTTAAC-CAA--TA-T-T-ATC-CCGG--------------GTTT-C-AA--T----CACC-AGGGTAGTGTAGTACGTGA-TGGGTACC-TGCA-CC-GTGT--CCG--A-GCCAAGTT-C-------TTTTG-----T----AAGT---CA-GGTAC--T-CACCCTTATCCA-GGAATAAATGCAC-CC-G--T-----ACT---G--CAA---------CCTTA----AGCTC----TC-CC--TGATG--CTT-TATT----T-AT-CTT--ATTTCCCTACCCTAGTCT-TTAT-CTTT---AT-T----A-GTC-TAATT-G-TGTAC----TATT-GCGTCTA-TTTTTTATTTTCTT--TTCC-TCTATTCA--CTG-AACTCATC-GAC-TGATC---TACCT--TTAGTC-T-CAACT-GCAG-CTC-TTT-A-TA-C-ACTGGTC--TGTCCATTATC-AAAACGAGG-GG-TCG----CCTATGGACC-TATTCTAATA-TTTA-TAAATCACACATCCTATGCGCTTTGTAGTAGACAT-GGA-CATTATA--C--TATACAAACTACTAGAATCATTCAG
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Reference ( family-2617 )     :                                                                  ATNTGATCTATCGTACTCAGCCATTCTCTTCAGCAACNATTGGAATTTATNATAATCATATCTCTCTAATTTGAGGAATAAAAACCCGGTACGACACTTGTTACCATAAACTGAATTACTAGTATATATATTTCTACACAGCACTGCCTGTACACTGCAACTCTACNATAATCTACTGTACCGCCGGTCCCTGAGCTTAACCCCGGGTTACNTGAACTTNTTTGTTACGGTGNNATANACTTGGGCATCGCAACAATAACNAAGGTTCAAAANNAACNTACAACGCCCTACAAAAATCTAATCAAAATCTAATACACNCTAAGATACCCTATCCCTTGA--CCG---ACGTGCCACC--AAAATGTAACGTGTCACT---AGGGTTCT-TT-GCAAGGGAT---GGGGACT-TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACTT--GGGTTATTTATT-AT---TTA-T-----AAGCTGATCG-CAATAT-------AATT-TTAC-TCT-A---TTTTCTCTACG--------------------TCT----TTCTG-AGCGTTGATTG--GT--AC-CGAGTTACTT-ATC-CCGG--GTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTGTAGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----GAGTAC-NG-GGTGCC-T-CACCCTTATCCA-GGNATAAATGCAC-CCAG--T-----ACC---G--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATG--CTT-TATT----T-AT-CTTT-ATTTCCCTACCCTAGTCTATTNT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAATTTG-TTTACC--TTATT-GCGTCTA-TTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGAGGGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGACC-CATTCTAATA-TTANAANTC-A-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C-ATATACTAACTACT--AATCA-TCAG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-GCA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-CCT------ATCGTCCTGT----GAGTACTCGCGGTGTT-T-CACCAGTATTCA-GG-ATTACTACAC-TTTGTTT-----ATC---GCACAA-------TTTCTTGGTTTAACTT----TA-CCAGTGG-G--C-T-TA------T-AT-TTCA-A---CCCTAACCT-TTCAATTCCGTTTT---AC-TTTTGA-TTC----TTTA-TTAATC--T--TT-GCTTCT--TCTT---CTTC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttCTT-ACA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-TCT------ATAGT----TCCACGAGAAC-TC-GGTGCC-T-CACGCGTATTCA-GGATTAAGTGCAC-TTTA--TATTTCACC---A--CAA-------TTCCTTGGTTTAGCTT----TA-CCAGTG--G--CTGATATT----TCAG-CCTT-A-------ACC---GTCAATTCC-ATTTC--AC-TTTTAA-TTCTTAAATAA-TTTACC--TTTTT-AGGTCttaggccgtcagactaataa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GGG---CTTATA-GT---T----------AACT-ATGG-GAAT-T-------AATA-TTA----T-A---TACAC----CG--------------------TATA---TTC-------TTGATT----T--AC-TGGGATACTT-GTC-CCGG--G-TT-CTAacctgagta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATCTGAGCAAGATCTAATACACTCTAAGATACCCTATCCGTT-A--CAGCTCATGTGATACCATAAGAT-TAACGTGTCTTA---AGGGTTAT-TT-GCAAGGAAT---AGGTATT-CATAT--tttgttttact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atttaccagagataatcaacctCT-TCGACT--ATTCTATTA-GTGTGTGTC-A-----CATCAGCG-TTTGGG--AGGCAT-AAG-C-TTATA--
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtgactaatactgcctctgcggtctcctacgtaacaaaggacaatacccatccatgagGTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GGG---CTTATA-GT---T----------AACTAG--G-GAAT-T-------AATA-TTA----T-A----------TACA--------------------CCTATTATTCTG-A---TTTACTG--G---A-------TACTT-GTC-CCGG--GTTT-ttgtatcgttcattact
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GG--GTTT-CTAA--TGTTACAC----GGTACTGTAACAC-TGGCTGGCTGCCTTGCA-CC-TTGGTTCCGTTA--CCAAGTTGCCTAATTGTTCTG-----T----GAGTAC-TTCGGTGTT-T-CACCCTTATTCA-GGTATTACTTCACTTTTG--T-----ATC---T--CAATCAACATTTCCTT------GCTTAACGTTACCAGTG--G--CTT-GATT----------TCT-A--ACCCCAACCT--TCAATTCC-GT------T-TC---ACTTT-TAATTC--TTTA----TTAAT-GTACCT--TTCT---TTTTCTTCACTGC-TTT-TTTAGGCCG-------TCAGACTTAA-CAAGTGATTGAT---AC-TGCCTCT-GCAGCTTC-TTATA-TA-GCAAAGGGCTATACC---------AATAGGGG-TATACA-GGATCT-CGGG-C-TATTCCATTA-GTCTGAATT-A-----CATCAGTG-TTTGGA--AGACATAGGATCATTGTA--atttgttttactgtatacggggacacaaggacggggtttctaatgttacacggtactgtaacactggctggctgccttgcaccttggttccgttaccaagttgcctaattgttctgtgagtacttcggtgtttcacccttattcaggtattacttcacttttgtatctcaatcaacatttccttgcttaacgttaccagtggcttgatttctaaccccaaccttcaattccgtttcacttttaattctttattaatgtacctttctttttcttcactgcttttttaggccgtcagacttaacaagtgattgatactgcctctgcagcttcttatatagcaaagggctataccaataggggtatacaggatctcgggctattccattagtctgaattacatcagtgtttggaagacataggatcattgtatcgttccttact
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtaacgtgtcctctaagggttctctgtaagggataaaaaggtctctatatgtacatgtaataataaaattttcctcgggctctacttgggcttatagttaactagggaattaatattatatacacctattattctgatttactggatacttgtcccgggtttatttgttttactgtatacggggacacaaggacgCTT-GCC-CT-G-GTTCCAA--T-GCCAAGTT-CTT------ATTGT----TCTGTGAGTAC-CC-GATGTTAT-CACCCTTATTCA-Gtcgttccttact
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gctcT-GCA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-CCT------ATTGTTCTGT----GAGTAC-TC-GGTGCC-T-Cattacttttactttgtactcacaacaatctt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATAT--T---AT------------A-----------CTTTT-CCTCTTACTCTACTTCGAGGTTATTTATTTAT---ATA-C-----AAG-TGATCG-CAA-AT-------AATT-TTAC-TCT-T---TTATTTCT-CA--------------------TCT--------G-AGCGTTAATTG--TTTAAC-CAA--TA-TT-ATC-CCGG--GTTT-C-AA--T----CACC-AGGGTAGTGTAGTACGTGA-TGGGTACCT-GCA-CC-GTGT--CCG--A-GCCAAGTT-C-T------TTTG-----T----AAGT---CA-GGTAC--T-CACCCTTATCCA-GGAATAAATGCAC-CC-G--T-----ACT---G--CAA---------CCTTA----AGCTC----TC-C--CTGATG--CTT-TATT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTACCCTAGTCT-TTAT-CTTT---A--TT---A-GTC-TAA-TTG-TGTAC----TATT-GCGTCTA-TTTTTTATTTTCTT--TTCC-TCTATTC--ACTG-AACTCATC-GAC-TGATC---TACCT--TTAGTC-T-CAACT-GCA-GCTC--TTTA-TA-C-ACTGGTC--TGTCCATTATC-AAAACGAGG-GG-TCG----CCTATGGACC-TATTCTAATATTTATAAATC-ACACATCCTATGCGCTTTGTAGTAGACAT-GGA-CATTATA--C--TATACAAACTACTAGAATCATTCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cgttgttactgagttttcgttctgacaagttgtggaACGTGTTACT----GAGTTCT-TT-ACA-GAGAT---GGGGACA-TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCCTCTACTCTACTT--GAGTTATTT-TT-AT---TTA--------AGCTGATCG-CAATAT-------AATT-TTAC-TCT-A---TTT-CTCTA------------------------------TCTG-AGCGTTGATTGCTAT--AC-CGAGTTACTT-ATC-CCGG--GTTTTCTAAAAT----AACCGAGGGTAGTG-AGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTACC-T-CACCCTTACCC---GGATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATG--CTT--ATT----T-AT-CTTT-ATTTCCTAACCCTAGTCTATTAT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTG-TTTACC--TAATT-GCGTCTATTTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCA-GCTCTTTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGA-GGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGA-C-CATTCTAATA-TTATAAATC-A-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C------TTAACTACT--AATCA-TCAagtatttatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTACT----GAGTTCT-TT-ACAAAGGATC--GGGGACA-TATTA--T-T-AT------------A-----------ATTTTTCCTCTTACTCTACT---GAGTTATTTATT-AT---T-A-------AAGCTGATCG-CAATAT-------AATT---ACCTCT-A---TTCTCTCT--------------------------------CTG--GCGTTGATTG--GT--TC-CGAGTT--TT-ATC-CCGG--GTTC-TCAA--T----CAC-GAGG-TAGTGTAGTACGTGAC-GGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--AAGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGCACC-T-CACC-TTATCCA-GG-ATAAATGCAC-C-AG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AACTC----TT-CCACTGATG--CTT-TATTATCTT-ATTCTTT-ATTTCCCTACCCTAGTCTATTAT-CTTTT--AT-TT---A-TTC-TAATT-G-TTTACC--T-ATT-GCGTCTA-TTTT---TTTCCTG--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTATTA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGAGGGG-GA-ACAGGGCCCT-TGGA-C-CATTCTAATA-TTATGAATCAA-----CTTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATT-TAAGC-ATATACT-----CT--AGTCA-TCAcagtat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTGTTACT----GAGTTCT-TTTACAAGAG-T---GGGGACA-TATAT--T-TTAT------------G-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACT----GGTTAT--GTT-AT---TTA-TTAGTGAAGCTGATCGGCAATATT------AATT-TTAC-TCT-A---TTT-CTTTA------------------------------TCTGTAGCGTTGATTG--GT--ATGCGAGTTACTTTATC-CCGGCCGTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTG--GTA-GTGACTGGGTAC-T-GCGGCCAGTGTTCCCG--A---CAAGTC-CTT------TTGGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-TTCACC-TTATCCATGGAATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------T-CCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATGCCCTT-TAAT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTA-CCTAGTCTATTCT-CTTTTTAAT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC--TAATT-ACGTCTA--TTT---TTCCTGT--CTTC-TCG-TTCGG--CG-AACACATAGGAC-TAA-CCT-TGATT--T---TCTT-CAACTGGCAGGCTCTTTTTA-TATCTACTGGGTCATGTCCATT-TCAAAAGAGGGGCGA-A-A-GGTATT-GGAACT-CATTCTAATA-TCACAA-TC-A-----CCTca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                      ctTACACTGCA----TACAA--AT-TAATGTACCGC--ATCCCCTAGCTTAAC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tt-TATAT--A-T-AT------------A-----------ATTTT-TCTTTTACTCTACTT--GATTGACTTA---AT---CTA-T-----AAGCTGATCA-CAACATC------AATT-TT---TCT-A---TTT-CTCTAA------------------------------CTG-AGTTTTGATTG--GT--AC-CGAGTTATTT-ATC-CAGG--GTTT-TTTA--T----CACCGAGGGTAGTGTTGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-T-C------ATCCA--GCATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--GAA-------TCCCTTA----GGCTC----TT-GCACTGATT--CTT-TAAT----T-AC-CCCT-ATTTCCCTACCCGAAGCTATTTT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC---TAT----------TCTT---CTTTCGT--CTTCTTCT-TTaatggggaatatatatatatatatatatataatttttcttttactctacttgattgacttaatctataagctgatcacaacatcaatttttctatttctctaactgagttttgattggtaccgagttatttatccagggttttttatcaccgagggtagtgttgtacgtgactgggtacctgcaccgtgttcccgagccaagttccttttgctaagtacagggtgcctcatccagcataaatgcacccagtactggaatcccttaggctcttgcactgattctttaattacccctatttccctacccgaagctattttctttatttattctaattatttacctattcttctttcgtcttcttcttt
gi|8                          : tttacactgcatacaaattaatgtaccgcatcccctagcttaacaatggggaatatatatatataATGTGATCTATCGTACTCAGCCATTCTCTTCAGCAACGATTGGAATTTATGAT--TCATATCTCTCTAATTTGAGAAATAAA--CCCGGTACAATACTTGTTACCATAAACTGAATTATTA-------TATT-CTACACAGCACTGCTTGTACACTGCAACTCTACAATAATCTACTGTACCGCCGATCCCTG---TTAACCCCGGGTTACATGAACTTTTTTGTTACGGTGGGATAAACTTGGGCATCG-AAC-ATAATAAAGATTCAAAAGCAACATACAACGCTCTACAAAAAT-TAATCAAAAGGTCAT-CACG---AG-TA-CCTATCCC-TGA--CCG---GCATG--ACC--ATAATGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATACAATCTAAGATACCCTATCCCTTAAACCCG----CTTGCCACC---AAATGT-ACGTGTC-CTCTAAGGGTTCTCTT-GCAA-GGATAAAAGGTAAT-CATATAATGT-AT------------ATGTAATAATAGATTTT-CCTCCGGCTCTACTT--GGCCTA-TAATT-AA---CTA-C-----AAG-TAAT---CAATATTATCTACAATTATTAT-TCTGA---TTTACT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): GTAATGTATCCTCCAAATGTTTTGTTCTGAAGGGATAAAAGGTCTCATTTATTTATTTAATAACAAATACACAGTCATGTAATTTTCCCCAGGTTCTATTTGAGCCATTGATTAAGTACAGGGAATCAATATTATTTATAGTAATTATTCTAATTTACTAGGATACTATCTCGGTTTAAGTTTTTCTTATATCCACGGATTGTATCTTACACGTTGATGCAACATTGGCTGAGCTCCTTGCACCTGGTTTAGATACTACGTTTCTATTTCTCAGTGAGTACT
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Unaligned ( gi|15 ): CAGCCAACTGAGACTGAAAAACTGAACGGCTCTGATGCCGCTTTATATACTCTTAGAGGAGTCCATGTTCGCTCTCAAAAGGGGTATTGGGTCATTTCATTATATCAAGTCATCAAAACGTTTGATTGCATAGAAAAAATTAATCACACTA
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Reference ( family-2617 )     :                                                                  ATNTGATCTATCGTACTCAGCCATTCTCTTCAGCAACNATTGGAATTTATNATAATCATATCTCTCTAATTTGAGGAATAAAAACCCGGTACGACACTTGTTACCATAAACTGAATTACTAGTATATATATTTCTACACAGCACTGCCTGTACACTGCAA---TACAATAAT-TACTGTACCGC--GTCCCTNAGCTTAACCCCGGGTTACNTGAACTTNTTTGTTACGGTGNNATANACTTGGGCATCGCAACAATAACNAAGGTTCAAAANNAACNTACAACGCCCTACAAAAATCTAATCAAAA-T-TAATACACNCTAAGATACCCTATCCCTTGA--CCG---ACGTGCCACC--AAAATGTAACGTGTCACTCTAAGGGTTCT-TT-GCAAGGGATAAAGGGGACT-TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACTT--GGGTTATTTATT-AT---TTA-T-----AAGCTGATCG-CAATAT-------AATT-TTAC-TCT---A----TTTC-TCTAC---------------------TCT-TTCTG-AGCGTTGATTG--GT--AC-CGAGTTACTT-ATC-CCGG--GTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTGTAGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----GAGTAC-NG-GGTGCC-T-CACCCTTATCCA-GGNATAAATGCAC-CCAG--T-----ACC---G--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATG--CTT-TATT----T-AT-CTTT-ATTTCCCTACCCTAGTCTATTNT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAATTTG-TTTACC--TTATT-GCGTCTA-TTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGAGGGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGACC-CATTCTAATA-TTATGAA-TC-A-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C-ATATACTAACTACT--AATCA-TCAG
gi|1                          :                                                                  ATCTGAT---TCATACTCAGTCATTTT----AGCA--TATTG-AATTTATTATAATTATA-CTCTCTAATT-GAGGAATAAAAACCC--TACGACACT-GTTACCATAAACTAAATTACTAGTATATATATTTCTACACAGCACT--CTGTACACTG-AA---TATCATA---TACTGTACCGC--GTCCCTAAGCTTAACCCCAG--TACTTGAACTTG---GTTACGGTGTTATATACTTGAGCA-CGCAACAATAACTAAGGTTCAAAACAAATTTACAA-ATCCTATAAA---TTAATCAAAA-T--AAT-CACG-TATG-TACCCTATCCCTTGA--CCG---AC-TGCCACC--AAAATGTAACGTGTTACT----GAGTTCT-TT-ACAAGAGAT---GGGGACT-TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACTT--GAGTTATTTATT-ATATGCTAGT-----AAGCTGATCG-CAATAT-------AATT-TTAC-TCT---AAAATTTTN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTCTTCTG-AGC-TTGATTG--GT--AC-CGAGTTACTT-ATCGCCGG--GTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTGTAGTA-GTGACTGGGTATCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-T-CACCCTTATCCA-GAGATAAATGCAC-CCAG--T-----ACTGTAG--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT--CACTGATG--CTT-TATT----T-AT-CTTTAATTTCCCTACCCTAGTCTATTAT-CTTT---ATCTT---A-TTC-TAATTTGTTTTACCCTTTATTGGCGTCTA-TTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCGAAACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TCAAAAGAGGGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGACCTCATTCTAATA-TTA-GAATTC-A-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--CAATATACTAACTA----AATCA-TCAG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-GCA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-CCT------ATCGTCCTGT----GAGTACTCGCGGTGTT-T-CACCAGTATTCA-GG-ATTACTACAC-TTTGTTT-----ATC---GCACAA-------TTTCTTGGTTTAACTT----TA-CCAGTGG-G--C-T-TA------T-AT-TTCA-A---CCCTAACCT-TTCAATTCCGTTTT---AC-TTTTGA-TTC----TTTA-TTAATC--T--TT-GCTTCT--TCTT---CTTC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttCTT-ACA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-TCT------ATAGT----TCCACGAGAAC-TC-GGTGCC-T-CACGCGTATTCA-GGATTAAGTGCAC-TTTA--TATTTCACC---A--CAA-------TTCCTTGGTTTAGCTT----TA-CCAGTG--G--CTGATATT----TCAG-CCTT-A-------ACC---GTCAATTCC-ATTTC--AC-TTTTAA-TTCTTAAATAA-TTTACC--TTTTT-AGGTCttaggccgtcagactaataa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GGG---CTTATA-GT---T----------AACT-ATGG-GAAT-T-------AATA-TTA--TAT---A----CACCGTATAT---------------------TC------------TTGATT----T--AC-TGGGATACTT-GTC-CCGG--G-TT-CTAacctgagta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATCTGAGCAAGA-TCTAATACACTCTAAGATACCCTATCCGTT-A--CAGCTCATGTGATACCATAAGAT-TAACGTGTC---TTAAGGGTTAT-TT-GCAAGGAATA---GGTATT-CATAT--tttgttttact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atttaccagagataatcaacctCT-TCGACT--ATTCTATTA-GTGTGTG-TC-A-----CATCAGCG-TTTGGG--AGGCAT-AAG-C-TTATA--
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgactaatactgcctctgcggtctcctacgtaacaaaggacaatacccatccatgagGTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GGG---CTTATA-GT---T----------AACTAG--G-GAAT-T-------AATA-TTA----T---A----TACA-CCTAT---------------------TAT-T---------CTGATT----T--AC-TG-GATACTT-GTC-CCGG--GTTT-ttgtatcgttcattact
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GG--GTTT-CTAA--TGTTACAC----GGTACTGTAACAC-TGGCTGGCTGCCTTGCA-CC-TTGGTTCCGTTA--CCAAGTTGCCTAATTGTTCTG-----T----GAGTAC-TTCGGTGTT-T-CACCCTTATTCA-GGTATTACTTCACTTTTG--T-----ATC---T--CAATCAACATTTCCTT------GCTTAACGTTACCAGTG--G--CTT-GATT----------TCT-A--ACCCCAACCT--TCAATTCC-GT------T-TC---ACTTT-TAATTC--TTTA----TTAAT-GTACCT--TTCT---TTTTCTTCACTGC-TTT-TTTAGGCCG-------TCAGACTTAA-CAAGTGATTGAT---AC-TGCCTCT-GCAGCTTC-TTATA-TA-GCAAAGGGCTATACC---------AATAGGGG-TATACA-GGATCT-CGGG-C-TATTCCATTA-GTCTGAA-TT-A-----CATCAGTG-TTTGGA--AGACATAGGATCATTGTA--atttgttttactgtatacggggacacaaggacggggtttctaatgttacacggtactgtaacactggctggctgccttgcaccttggttccgttaccaagttgcctaattgttctgtgagtacttcggtgtttcacccttattcaggtattacttcacttttgtatctcaatcaacatttccttgcttaacgttaccagtggcttgatttctaaccccaaccttcaattccgtttcacttttaattctttattaatgtacctttctttttcttcactgcttttttaggccgtcagacttaacaagtgattgatactgcctctgcagcttcttatatagcaaagggctataccaataggggtatacaggatctcgggctattccattagtctgaattacatcagtgtttggaagacataggatcattgtatcgttccttact
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtaacgtgtcctctaagggttctctgtaagggataaaaaggtctctatatgtacatgtaataataaaattttcctcgggctctacttgggcttatagttaactagggaattaatattatatacacctattattctgatttactggatacttgtcccgggtttatttgttttactgtatacggggacacaaggacgCTT-GCC-CT-G-GTTCCAA--T-GCCAAGTT-CTT------ATTGT----TCTGTGAGTAC-CC-GATGTTAT-CACCCTTATTCA-Gtcgttccttact
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gctcT-GCA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-CCT------ATTGTTCTGT----GAGTAC-TC-GGTGCC-T-Cattacttttactttgtactcacaacaatctt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAT--T---AT------------A-----------CTTTT-CCTCTTACTCTACTTCGAGGTTATTTATTTAT---ATA-C-----AAG-TGATCG-CAA-AT-------AATT-TTAC-TCTTTTA----TTTC-TC-A---------------------------TCTG-AGCGTTAATTG--TTTAAC-CAA--TA-TT-ATC-CCGG--GTTT-C-AA--T----CACC-AGGGTAGTGTAGTACGTGA-TGGGTACCT-GCA-CC-GTGT--CCG--A-GCCAAGTT-C-T------TTTG-----T----AAGT---CA-GGTAC--T-CACCCTTATCCA-GGAATAAATGCAC-CC-G--T-----ACT---G--CAA---------CCTTA----AGCTC----TC-C--CTGATG--CTT-TATT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTACCCTAGTCT-TTAT-CTTT---A--TT---A-GTC-TAA-TTG-TGTAC----TATT-GCGTCTA-TTTTTTATTTTCTT--TTCC-TCTATTC--ACTG-AACTCATC-GAC-TGATC---TACCT--TTAGTC-T-CAACT-GCA-GCTC--TTTA-TA-C-ACTGGTC--TGTCCATTATC-AAAACGAGG-GG-TCG----CCTATGGACC-TATTCTAATATTTATAAA-TC-ACACATCCTATGCGCTTTGTAGTAGACAT-GGA-CATTATA--C--TATACAAACTACTAGAATCATTCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgttgttactgagttttcgttctgacaagttgtggaACGTGTTACT----GAGTTCT-TT-ACA-GAGAT---GGGGACA-TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCCTCTACTCTACTT--GAGTTATTT-TT-AT---TTA--------AGCTGATCG-CAATAT-------AATT-TTAC-TCT---A----TTTC-TCTA---------------------------TCTG-AGCGTTGATTGCTAT--AC-CGAGTTACTT-ATC-CCGG--GTTTTCTAAAAT----AACCGAGGGTAGTG-AGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTACC-T-CACCCTTACCC---GGATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATG--CTT--ATT----T-AT-CTTT-ATTTCCTAACCCTAGTCTATTAT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTG-TTTACC--TAATT-GCGTCTATTTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCA-GCTCTTTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGA-GGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGA-C-CATTCTAATA-TTATAAA-TC-A-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C------TTAACTACT--AATCA-TCAagtatttatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGTTCT-TT-ACAAAGGATC--GGGGACA-TATTA--T-T-AT------------A-----------ATTTTTCCTCTTACTCTACT---GAGTTATTTATT-AT---T-A-------AAGCTGATCG-CAATAT-------AATT---ACCTCT---A----TT-------C---------------------TCT-CTCTG--GCGTTGATTG--GT--TC-CGAGTT--TT-ATC-CCGG--GTTC-TCAA--T----CAC-GAGG-TAGTGTAGTACGTGAC-GGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--AAGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGCACC-T-CACC-TTATCCA-GG-ATAAATGCAC-C-AG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AACTC----TT-CCACTGATG--CTT-TATTATCTT-ATTCTTT-ATTTCCCTACCCTAGTCTATTAT-CTTTT--AT-TT---A-TTC-TAATT-G-TTTACC--T-ATT-GCGTCTA-TTTT---TTTCCTG--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTATTA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGAGGGG-GA-ACAGGGCCCT-TGGA-C-CATTCTAATA-TTATGAA-TCAA-----CTTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATT-TAAGC-ATATACT-----CT--AGTCA-TCAcagtat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttactGTGTTACT----GAGTTCT-TTTACAAGAG-T---GGGGACA-TATAT--T-TTAT------------G-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACT----GGTTAT--GTT-AT---TTA-TTAGTGAAGCTGATCGGCAATATT------AATT-TTAC-TCT---A----TTTC-TTTA---------------------------TCTGTAGCGTTGATTG--GT--ATGCGAGTTACTTTATC-CCGGCCGTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTG--GTA-GTGACTGGGTAC-T-GCGGCCAGTGTTCCCG--A---CAAGTC-CTT------TTGGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-TTCACC-TTATCCATGGAATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------T-CCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATGCCCTT-TAAT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTA-CCTAGTCTATTCT-CTTTTTAAT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC--TAATT-ACGTCTA--TTT---TTCCTGT--CTTC-TCG-TTCGG--CG-AACACATAGGAC-TAA-CCT-TGATT--T---TCTT-CAACTGGCAGGCTCTTTTTA-TATCTACTGGGTCATGTCCATT-TCAAAAGAGGGGCGA-A-A-GGTATT-GGAACT-CATTCTAATA-TCAC-AA-TC-A-----CCTca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                      ctTACACTGCA----TACAA--AT-TAATGTACCGC--ATCCCCTAGCTTAAC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tt-TATAT--A-T-AT------------A-----------ATTTT-TCTTTTACTCTACTT--GATTGACTTA---AT---CTA-T-----AAGCTGATCA-CAACATC------AATT-TT---TCT---A----TTTC-TCTAA---------------------------CTG-AGTTTTGATTG--GT--AC-CGAGTTATTT-ATC-CAGG--GTTT-TTTA--T----CACCGAGGGTAGTGTTGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-T-C------ATCCA--GCATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--GAA-------TCCCTTA----GGCTC----TT-GCACTGATT--CTT-TAAT----T-AC-CCCT-ATTTCCCTACCCGAAGCTATTTT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC---TAT----------TCTT---CTTTCGT--CTTCTTCT-TTaatggggaatatatatatatatatatatataatttttcttttactctacttgattgacttaatctataagctgatcacaacatcaatttttctatttctctaactgagttttgattggtaccgagttatttatccagggttttttatcaccgagggtagtgttgtacgtgactgggtacctgcaccgtgttcccgagccaagttccttttgctaagtacagggtgcctcatccagcataaatgcacccagtactggaatcccttaggctcttgcactgattctttaattacccctatttccctacccgaagctattttctttatttattctaattatttacctattcttctttcgtcttcttcttt
gi|8                          : tttacactgcatacaaattaatgtaccgcatcccctagcttaacaatggggaatatatatatataATGTGATCTATCGTACTCAGCCATTCTCTTCAGCAACGATTGGAATTTATGAT--TCATATCTCTCTAATTTGAGAAAT--AAACCCGGTACAATACTTGTTACCATAAACTGAATTATTA-TA-------TTCTACACAGCACTGCTTGTACACTGCAACTCTACAATAATCTACTGTACCGCCGATCCCTG---TTAACCCCGGGTTACATGAACTTTTTTGTTACGGTGGGATAAACTTGGGCATCG-AAC-ATAATAAAGATTCAAAAGCAACATACAACGCTCTACAAAAAT-TAATCAAAAGG-TCAT-CACG---AG-TA-CCTATCCC-TGA--CCG---GCATG--ACC--ATAATGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATACAATCTAAGATACCCTATCCCTTAAACCCG----CTTGCCACC--AAA-TGTA-CGTGTC-CTCTAAGGGTTCTCTT-GCAAGG-ATAAAAGGTAAT-CATATAATGT-AT------------ATGTAATAATAGATTTT-CCTCCGGCTCTACTT--GGCCTA-TAATT-AA---CTA-C-----AAG-TAAT---CAATATTATCTACAATTATTAT-TCTG--A----TTT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): GTAATGTATCCTCCAAATGTTTTGTTCTGAAGGGATAAAAGGTCTCATTTATTTATTTAATAACAAATACACAGTCATGTAATTTTCCCCAGGTTCTATTTGAGCCATTGATTAAGTACAGGGAATCAATATTATTTATAGTAATTATTCTAATTTACTAGGATACTATCTCGGTTTAAGTTTTTCTTATATCCACGGATTGTATCTTACACGTTGATGCAACATTGGCTGAGCTCCTTGCACCTGGTTTAGATACTACGTTTCTATTTCTCAGTGAGTACT
Unaligned ( gi|11 ): CAGCTGACTGAGACTGACAATTAACCGAACGGCTCTGATGCCGCTTTATATACTCTAAGAAGAGTCCATGTTCACTCCCAAAAAGGATATTTGGGTTATTCCATTATATCAAGTCATCAAAACGTTTGATTACATAGAAAAAAATCATCACATTACCCACGTCTCCGGGTACATTCGTCTCGAATGACAAAGCAAACGTTTTTTTTTTTTTCCACATTTATTTAACATGATGATCTGAAACAAA
Unaligned ( gi|15 ): CAGCCAACTGAGACTGAAAAACTGAACGGCTCTGATGCCGCTTTATATACTCTTAGAGGAGTCCATGTTCGCTCTCAAAAGGGGTATTGGGTCATTTCATTATATCAAGTCATCAAAACGTTTGATTGCATAGAAAAAATTAATCACACTA
Unaligned ( gi|16 ): ATATCATTATAGTTTATCTTGAAAATGTACAAAGAAAAAAATTATTACTTAACCACGCTCCGGGTCATTCGTTCTCTGAATGAAAAACCACATTATTTTTTTTATTCTTTTTTTTTCATTGACAGATAAACTGCAAGACAAA
Unaligned ( gi|17 ): CAGGTTCCTATTGTTCTGTGAGTACTCTGTGCCTCTAGCATTGTTACATCCTTGGTTAATCTTTCACCAATGGCTTGTATTTCGATCTTAACATTTCGATTCCTTAATTCACTATTACTTAAATAATATCAAGTCTTCTTC
Unaligned ( gi|21 ): TATTCTCTTCTATCGGGACACTTGTCCCGGGTTTTATTTTCTATTGTACACAAGGCGGGGTTCTGTGTTACACGGTACTGTACAT
Unaligned ( gi|22 ): AAAAAATTATTACATTACCCACGCCTTCGTGTACACTTGTCCCAAATGAAAACACATATAATTATTTCTTT
Unaligned ( gi|24 ): TTTACCAGTGGCTTATTTTCGACTAACCTTTGAATTCCGTTTCAC






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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttCTT-ACA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-TCT------ATAGT----TCCACGAGAAC-TC-GGTGCC-T-CACGCGTATTCA-GGATTAAGTGCAC-TTTA--TATTTCACC---A--CAA-------TTCCTTGGTTTAGCTT----TA-CCAGTG--G--CTGATATT----TCAG-CCTT-A-------ACC---GTCAATTCC-ATTTC--AC-TTTTAA-TTCTTAAATAA-TTTACC--TTTTT-AGGTCttaggccgtcagactaataa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GGG---CTTATA-GT---T----------AACT-ATGG-GAAT-T-------AATA-TTA----T---ATACA-------------------------CCGTATA-TTC-------TTGATT----T--AC-TGGGATACTT-GTC-CCGG--G-TT-CTAacctgagta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATCTGAGCAAGA-TCTAATACACTCTAAGATACCCTATCCGTT-A--CAGCTCATGTGATACCATAAGAT-TAACGTGTC---TTAAGGGTTAT-TT-GCAAGGAATA---GGTATT-CATAT--tttgttttact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttaccagagataatcaacctCT-TCGACT--ATTCTATTA-GTGTGTG-TC-A-----CATCAGCG-TTTGGG--AGGCAT-AAG-C-TTATA--
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgactaatactgcctctgcggtctcctacgtaacaaaggacaatacccatccatgagGTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GGG---CTTATA-GT---T----------AACTAG--G-GAAT-T-------AATA-TTA----T---AT-AC-------------------------ACCTATTATTCTG-A---TTTACTG--G---A-------TACTT-GTC-CCGG--GTTT-ttgtatcgttcattact
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GG--GTTT-CTAA--TGTTACAC----GGTACTGTAACAC-TGGCTGGCTGCCTTGCA-CC-TTGGTTCCGTTA--CCAAGTTGCCTAATTGTTCTG-----T----GAGTAC-TTCGGTGTT-T-CACCCTTATTCA-GGTATTACTTCACTTTTG--T-----ATC---T--CAATCAACATTTCCTT------GCTTAACGTTACCAGTG--G--CTT-GATT----------TCT-A--ACCCCAACCT--TCAATTCC-GT------T-TC---ACTTT-TAATTC--TTTA----TTAAT-GTACCT--TTCT---TTTTCTTCACTGC-TTT-TTTAGGCCG-------TCAGACTTAA-CAAGTGATTGAT---AC-TGCCTCT-GCAGCTTC-TTATA-TA-GCAAAGGGCTATACC---------AATAGGGG-TATACA-GGATCT-CGGG-C-TATTCCATTA-GTCTGAA-TT-A-----CATCAGTG-TTTGGA--AGACATAGGATCATTGTA--atttgttttactgtatacggggacacaaggacggggtttctaatgttacacggtactgtaacactggctggctgccttgcaccttggttccgttaccaagttgcctaattgttctgtgagtacttcggtgtttcacccttattcaggtattacttcacttttgtatctcaatcaacatttccttgcttaacgttaccagtggcttgatttctaaccccaaccttcaattccgtttcacttttaattctttattaatgtacctttctttttcttcactgcttttttaggccgtcagacttaacaagtgattgatactgcctctgcagcttcttatatagcaaagggctataccaataggggtatacaggatctcgggctattccattagtctgaattacatcagtgtttggaagacataggatcattgtatcgttccttact
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtaacgtgtcctctaagggttctctgtaagggataaaaaggtctctatatgtacatgtaataataaaattttcctcgggctctacttgggcttatagttaactagggaattaatattatatacacctattattctgatttactggatacttgtcccgggtttatttgttttactgtatacggggacacaaggacgCTT-GCC-CT-G-GTTCCAA--T-GCCAAGTT-CTT------ATTGT----TCTGTGAGTAC-CC-GATGTTAT-CACCCTTATTCA-Gtcgttccttact
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gctcT-GCA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-CCT------ATTGTTCTGT----GAGTAC-TC-GGTGCC-T-Cattacttttactttgtactcacaacaatctt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAT--T---AT------------A-----------CTTTT-CCTCTTACTCTACTTCGAGGTTATTTATTTAT---ATA-C-----AAG-TGATCG-CAA-AT-------AATT-TTAC-TCT----T-TT-------------------------ATTTCTC-ATCTG-AGCGTTAATTG--TTTAAC-CAA--TA-TT-ATC-CCGG--GTTT-C-AA--T----CACC-AGGGTAGTGTAGTACGTGA-TGGGTACCT-GCA-CC-GTGT--CCG--A-GCCAAGTT-C-T------TTTG-----T----AAGT---CA-GGTAC--T-CACCCTTATCCA-GGAATAAATGCAC-CC-G--T-----ACT---G--CAA---------CCTTA----AGCTC----TC-C--CTGATG--CTT-TATT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTACCCTAGTCT-TTAT-CTTT---A--TT---A-GTC-TAA-TTG-TGTAC----TATT-GCGTCTA-TTTTTTATTTTCTT--TTCC-TCTATTC--ACTG-AACTCATC-GAC-TGATC---TACCT--TTAGTC-T-CAACT-GCA-GCTC--TTTA-TA-C-ACTGGTC--TGTCCATTATC-AAAACGAGG-GG-TCG----CCTATGGACC-TATTCTAATATTTATAAA-TC-ACACATCCTATGCGCTTTGTAGTAGACAT-GGA-CATTATA--C--TATACAAACTACTAGAATCATTCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgttgttactgagttttcgttctgacaagttgtggaACGTGTTACT----GAGTTCT-TT-ACA-GAGAT---GGGGACA-TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCCTCTACTCTACTT--GAGTTATTT-TT-AT---TTA--------AGCTGATCG-CAATAT-------AATT-TTAC-TCT---AT-TT-------------------------CTCTATC-T---G-AGCGTTGATTGCTAT--AC-CGAGTTACTT-ATC-CCGG--GTTTTCTAAAAT----AACCGAGGGTAGTG-AGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTACC-T-CACCCTTACCC---GGATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATG--CTT--ATT----T-AT-CTTT-ATTTCCTAACCCTAGTCTATTAT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTG-TTTACC--TAATT-GCGTCTATTTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCA-GCTCTTTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGA-GGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGA-C-CATTCTAATA-TTATAAA-TC-A-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C------TTAACTACT--AATCA-TCAagtatttatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGTTCT-TT-ACAAAGGATC--GGGGACA-TATTA--T-T-AT------------A-----------ATTTTTCCTCTTACTCTACT---GAGTTATTTATT-AT---T-A-------AAGCTGATCG-CAATAT-------AATT---ACCTCT---AT-T--------------------------CTCT----CTCTG--GCGTTGATTG--GT--TC-CGAGTT--TT-ATC-CCGG--GTTC-TCAA--T----CAC-GAGG-TAGTGTAGTACGTGAC-GGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--AAGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGCACC-T-CACC-TTATCCA-GG-ATAAATGCAC-C-AG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AACTC----TT-CCACTGATG--CTT-TATTATCTT-ATTCTTT-ATTTCCCTACCCTAGTCTATTAT-CTTTT--AT-TT---A-TTC-TAATT-G-TTTACC--T-ATT-GCGTCTA-TTTT---TTTCCTG--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTATTA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGAGGGG-GA-ACAGGGCCCT-TGGA-C-CATTCTAATA-TTATGAA-TCAA-----CTTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATT-TAAGC-ATATACT-----CT--AGTCA-TCAcagtat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttactGTGTTACT----GAGTTCT-TTTACAAGAG-T---GGGGACA-TATAT--T-TTAT------------G-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACT----GGTTAT--GTT-AT---TTA-TTAGTGAAGCTGATCGGCAATATT------AATT-TTAC-TCT---AT-TT-------------------------CTTTATC-T---GTAGCGTTGATTG--GT--ATGCGAGTTACTTTATC-CCGGCCGTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTG--GTA-GTGACTGGGTAC-T-GCGGCCAGTGTTCCCG--A---CAAGTC-CTT------TTGGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-TTCACC-TTATCCATGGAATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------T-CCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATGCCCTT-TAAT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTA-CCTAGTCTATTCT-CTTTTTAAT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC--TAATT-ACGTCTA--TTT---TTCCTGT--CTTC-TCG-TTCGG--CG-AACACATAGGAC-TAA-CCT-TGATT--T---TCTT-CAACTGGCAGGCTCTTTTTA-TATCTACTGGGTCATGTCCATT-TCAAAAGAGGGGCGA-A-A-GGTATT-GGAACT-CATTCTAATA-TCAC-AA-TC-A-----CCTca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                      ctTACACTGCA----TACAA--AT-TAATGTACCGC--ATCCCCTAGCTTAAC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tt-TATAT--A-T-AT------------A-----------ATTTT-TCTTTTACTCTACTT--GATTGACTTA---AT---CTA-T-----AAGCTGATCA-CAACATC------AATT-TT---TCT---AT-TT-------------------------CTCTAAC-T---G-AGTTTTGATTG--GT--AC-CGAGTTATTT-ATC-CAGG--GTTT-TTTA--T----CACCGAGGGTAGTGTTGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-T-C------ATCCA--GCATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--GAA-------TCCCTTA----GGCTC----TT-GCACTGATT--CTT-TAAT----T-AC-CCCT-ATTTCCCTACCCGAAGCTATTTT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC---TAT----------TCTT---CTTTCGT--CTTCTTCT-TTaatggggaatatatatatatatatatatataatttttcttttactctacttgattgacttaatctataagctgatcacaacatcaatttttctatttctctaactgagttttgattggtaccgagttatttatccagggttttttatcaccgagggtagtgttgtacgtgactgggtacctgcaccgtgttcccgagccaagttccttttgctaagtacagggtgcctcatccagcataaatgcacccagtactggaatcccttaggctcttgcactgattctttaattacccctatttccctacccgaagctattttctttatttattctaattatttacctattcttctttcgtcttcttcttt
gi|8                          : tttacactgcatacaaattaatgtaccgcatcccctagcttaacaatggggaatatatatatataATGTGATCTATCGTACTCAGCCATTCTCTTCAGCAACGATTGGAATTTATGAT--TCATATCTCTCTAATTTGAGAAAT--AAACCCGGTACAATACTTGTTACCATAAACTGAATTATTA-TA-------TTCTACACAGCACTGCTTGTACACTGCAACTCTACAATAATCTACTGTACCGCCGATCCCTG---TTAACCCCGGGTTACATGAACTTTTTTGTTACGGTGGGATAAACTTGGGCATCG-AAC-ATAATAAAGATTCAAAAGCAACATACAACGCTCTACAAAAAT-TAATCAAAAGG-TCAT-CACG---AG-TA-CCTATCCC-TGA--CCG---GCATG--ACC--ATAATGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATACAATCTAAGATACCCTATCCCTTAAACCCG----CTTGCCACC--AAA-TGTA-CGTGTC-CTCTAAGGGTTCTCTT-GCAAGG-ATAAAAGGTAAT-CATATAATGT-AT------------ATGTAATAATAGATTTT-CCTCCGGCTCTACTT--GGCCTA-TAATT-AA---CTA-C-----AAG-TAAT---CAATATTATCTACAATTATTAT-TCTG--AT-TT-------------------------
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): GTAATGTATCCTCCAAATGTTTTGTTCTGAAGGGATAAAAGGTCTCATTTATTTATTTAATAACAAATACACAGTCATGTAATTTTCCCCAGGTTCTATTTGAGCCATTGATTAAGTACAGGGAATCAATATTATTTATAGTAATTATTCTAATTTACTAGGATACTATCTCGGTTTAAGTTTTTCTTATATCCACGGATTGTATCTTACACGTTGATGCAACATTGGCTGAGCTCCTTGCACCTGGTTTAGATACTACGTTTCTATTTCTCAGTGAGTACT
Unaligned ( gi|11 ): CAGCTGACTGAGACTGACAATTAACCGAACGGCTCTGATGCCGCTTTATATACTCTAAGAAGAGTCCATGTTCACTCCCAAAAAGGATATTTGGGTTATTCCATTATATCAAGTCATCAAAACGTTTGATTACATAGAAAAAAATCATCACATTACCCACGTCTCCGGGTACATTCGTCTCGAATGACAAAGCAAACGTTTTTTTTTTTTTCCACATTTATTTAACATGATGATCTGAAACAAA
Unaligned ( gi|15 ): CAGCCAACTGAGACTGAAAAACTGAACGGCTCTGATGCCGCTTTATATACTCTTAGAGGAGTCCATGTTCGCTCTCAAAAGGGGTATTGGGTCATTTCATTATATCAAGTCATCAAAACGTTTGATTGCATAGAAAAAATTAATCACACTA
Unaligned ( gi|16 ): ATATCATTATAGTTTATCTTGAAAATGTACAAAGAAAAAAATTATTACTTAACCACGCTCCGGGTCATTCGTTCTCTGAATGAAAAACCACATTATTTTTTTTATTCTTTTTTTTTCATTGACAGATAAACTGCAAGACAAA
Unaligned ( gi|17 ): CAGGTTCCTATTGTTCTGTGAGTACTCTGTGCCTCTAGCATTGTTACATCCTTGGTTAATCTTTCACCAATGGCTTGTATTTCGATCTTAACATTTCGATTCCTTAATTCACTATTACTTAAATAATATCAAGTCTTCTTC
Unaligned ( gi|21 ): TATTCTCTTCTATCGGGACACTTGTCCCGGGTTTTATTTTCTATTGTACACAAGGCGGGGTTCTGTGTTACACGGTACTGTACAT
Unaligned ( gi|22 ): AAAAAATTATTACATTACCCACGCCTTCGTGTACACTTGTCCCAAATGAAAACACATATAATTATTTCTTT
Unaligned ( gi|24 ): TTTACCAGTGGCTTATTTTCGACTAACCTTTGAATTCCGTTTCAC






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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttCTT-ACA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-TCT------ATAGT----TCCACGAGAAC-TC-GGTGCC-T-CACGCGTATTCA-GGATTAAGTGCAC-TTTA--TATTTCACC---A--CAA-------TTCCTTGGTTTAGCTT----TA-CCAGTG--G--CTGATATT----TCAG-CCTT-A-------ACC---GTCAATTCC-ATTTC--AC-TTTTAA-TTCTTAAATAA-TTTACC--TTTTT-AGGTCttaggccgtcagactaataa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GGG---CTTATA-GT---T----------AACT-ATGG-GAAT-T-------AATA-TTA----T---ATACA-------------------------CCGTATA-TTC-------TTGATT----T--AC-TGGGATACTT-GTC-CCGG--G-TT-CTAacctgagta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATCTGAGCAAGA-TCTAATACACTCTAAGATACCCTATCCGTT-A--CAGCTCATGTGATACCATAAGAT-TAACGTGTC---TTAAGGGTTAT-TT-GCAAGGAATA---GGTATT-CATAT--tttgttttact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttaccagagataatcaacctCT-TCGACT--ATTCTATTA-GTGTGTG-TC-A-----CATCAGCG-TTTGGG--AGGCAT-AAG-C-TTATA--
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgactaatactgcctctgcggtctcctacgtaacaaaggacaatacccatccatgagGTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GGG---CTTATA-GT---T----------AACTAG--G-GAAT-T-------AATA-TTA----T---AT-AC-------------------------ACCTATTATTCTG-A---TTTACTG--G---A-------TACTT-GTC-CCGG--GTTT-ttgtatcgttcattact
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GG--GTTT-CTAA--TGTTACAC----GGTACTGTAACAC-TGGCTGGCTGCCTTGCA-CC-TTGGTTCCGTTA--CCAAGTTGCCTAATTGTTCTG-----T----GAGTAC-TTCGGTGTT-T-CACCCTTATTCA-GGTATTACTTCACTTTTG--T-----ATC---T--CAATCAACATTTCCTT------GCTTAACGTTACCAGTG--G--CTT-GATT----------TCT-A--ACCCCAACCT--TCAATTCC-GT------T-TC---ACTTT-TAATTC--TTTA----TTAAT-GTACCT--TTCT---TTTTCTTCACTGC-TTT-TTTAGGCCG-------TCAGACTTAA-CAAGTGATTGAT---AC-TGCCTCT-GCAGCTTC-TTATA-TA-GCAAAGGGCTATACC---------AATAGGGG-TATACA-GGATCT-CGGG-C-TATTCCATTA-GTCTGAA-TT-A-----CATCAGTG-TTTGGA--AGACATAGGATCATTGTA--atttgttttactgtatacggggacacaaggacggggtttctaatgttacacggtactgtaacactggctggctgccttgcaccttggttccgttaccaagttgcctaattgttctgtgagtacttcggtgtttcacccttattcaggtattacttcacttttgtatctcaatcaacatttccttgcttaacgttaccagtggcttgatttctaaccccaaccttcaattccgtttcacttttaattctttattaatgtacctttctttttcttcactgcttttttaggccgtcagacttaacaagtgattgatactgcctctgcagcttcttatatagcaaagggctataccaataggggtatacaggatctcgggctattccattagtctgaattacatcagtgtttggaagacataggatcattgtatcgttccttact
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtaacgtgtcctctaagggttctctgtaagggataaaaaggtctctatatgtacatgtaataataaaattttcctcgggctctacttgggcttatagttaactagggaattaatattatatacacctattattctgatttactggatacttgtcccgggtttatttgttttactgtatacggggacacaaggacgCTT-GCC-CT-G-GTTCCAA--T-GCCAAGTT-CTT------ATTGT----TCTGTGAGTAC-CC-GATGTTAT-CACCCTTATTCA-Gtcgttccttact
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gctcT-GCA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-CCT------ATTGTTCTGT----GAGTAC-TC-GGTGCC-T-Cattacttttactttgtactcacaacaatctt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAT--T---AT------------A-----------CTTTT-CCTCTTACTCTACTTCGAGGTTATTTATTTAT---ATA-C-----AAG-TGATCG-CAA-AT-------AATT-TTAC-TCT----T-TT-------------------------ATTTCTC-ATCTG-AGCGTTAATTG--TTTAAC-CAA--TA-TT-ATC-CCGG--GTTT-C-AA--T----CACC-AGGGTAGTGTAGTACGTGA-TGGGTACCT-GCA-CC-GTGT--CCG--A-GCCAAGTT-C-T------TTTG-----T----AAGT---CA-GGTAC--T-CACCCTTATCCA-GGAATAAATGCAC-CC-G--T-----ACT---G--CAA---------CCTTA----AGCTC----TC-C--CTGATG--CTT-TATT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTACCCTAGTCT-TTAT-CTTT---A--TT---A-GTC-TAA-TTG-TGTAC----TATT-GCGTCTA-TTTTTTATTTTCTT--TTCC-TCTATTC--ACTG-AACTCATC-GAC-TGATC---TACCT--TTAGTC-T-CAACT-GCA-GCTC--TTTA-TA-C-ACTGGTC--TGTCCATTATC-AAAACGAGG-GG-TCG----CCTATGGACC-TATTCTAATATTTATAAA-TC-ACACATCCTATGCGCTTTGTAGTAGACAT-GGA-CATTATA--C--TATACAAACTACTAGAATCATTCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgttgttactgagttttcgttctgacaagttgtggaACGTGTTACT----GAGTTCT-TT-ACA-GAGAT---GGGGACA-TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCCTCTACTCTACTT--GAGTTATTT-TT-AT---TTA--------AGCTGATCG-CAATAT-------AATT-TTAC-TCT---AT-TT-------------------------CTCTATC-T---G-AGCGTTGATTGCTAT--AC-CGAGTTACTT-ATC-CCGG--GTTTTCTAAAAT----AACCGAGGGTAGTG-AGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTACC-T-CACCCTTACCC---GGATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATG--CTT--ATT----T-AT-CTTT-ATTTCCTAACCCTAGTCTATTAT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTG-TTTACC--TAATT-GCGTCTATTTTT---TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCA-GCTCTTTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGA-GGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGA-C-CATTCTAATA-TTATAAA-TC-A-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C------TTAACTACT--AATCA-TCAagtatttatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGTTCT-TT-ACAAAGGATC--GGGGACA-TATTA--T-T-AT------------A-----------ATTTTTCCTCTTACTCTACT---GAGTTATTTATT-AT---T-A-------AAGCTGATCG-CAATAT-------AATT---ACCTCT---AT-T--------------------------CTCT----CTCTG--GCGTTGATTG--GT--TC-CGAGTT--TT-ATC-CCGG--GTTC-TCAA--T----CAC-GAGG-TAGTGTAGTACGTGAC-GGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--AAGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGCACC-T-CACC-TTATCCA-GG-ATAAATGCAC-C-AG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AACTC----TT-CCACTGATG--CTT-TATTATCTT-ATTCTTT-ATTTCCCTACCCTAGTCTATTAT-CTTTT--AT-TT---A-TTC-TAATT-G-TTTACC--T-ATT-GCGTCTA-TTTT---TTTCCTG--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTATTA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGAGGGG-GA-ACAGGGCCCT-TGGA-C-CATTCTAATA-TTATGAA-TCAA-----CTTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATT-TAAGC-ATATACT-----CT--AGTCA-TCAcagtat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttactGTGTTACT----GAGTTCT-TTTACAAGAG-T---GGGGACA-TATAT--T-TTAT------------G-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACT----GGTTAT--GTT-AT---TTA-TTAGTGAAGCTGATCGGCAATATT------AATT-TTAC-TCT---AT-TT-------------------------CTTTATC-T---GTAGCGTTGATTG--GT--ATGCGAGTTACTTTATC-CCGGCCGTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTG--GTA-GTGACTGGGTAC-T-GCGGCCAGTGTTCCCG--A---CAAGTC-CTT------TTGGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-TTCACC-TTATCCATGGAATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------T-CCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATGCCCTT-TAAT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTA-CCTAGTCTATTCT-CTTTTTAAT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC--TAATT-ACGTCTA--TTT---TTCCTGT--CTTC-TCG-TTCGG--CG-AACACATAGGAC-TAA-CCT-TGATT--T---TCTT-CAACTGGCAGGCTCTTTTTA-TATCTACTGGGTCATGTCCATT-TCAAAAGAGGGGCGA-A-A-GGTATT-GGAACT-CATTCTAATA-TCAC-AA-TC-A-----CCTca
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tt-TATAT--A-T-AT------------A-----------ATTTT-TCTTTTACTCTACTT--GATTGACTTA---AT---CTA-T-----AAGCTGATCA-CAACATC------AATT-TT---TCT---AT-TT-------------------------CTCTAAC-T---G-AGTTTTGATTG--GT--AC-CGAGTTATTT-ATC-CAGG--GTTT-TTTA--T----CACCGAGGGTAGTGTTGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-T-C------ATCCA--GCATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--GAA-------TCCCTTA----GGCTC----TT-GCACTGATT--CTT-TAAT----T-AC-CCCT-ATTTCCCTACCCGAAGCTATTTT-CTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC---TAT----------TCTT---CTTTCGT--CTTCTTCT-TTaatggggaatatatatatatatatatatataatttttcttttactctacttgattgacttaatctataagctgatcacaacatcaatttttctatttctctaactgagttttgattggtaccgagttatttatccagggttttttatcaccgagggtagtgttgtacgtgactgggtacctgcaccgtgttcccgagccaagttccttttgctaagtacagggtgcctcatccagcataaatgcacccagtactggaatcccttaggctcttgcactgattctttaattacccctatttccctacccgaagctattttctttatttattctaattatttacctattcttctttcgtcttcttcttt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATACAATCTAAGATACCCTATCCCTTAAACCCG----CTTGCCACC--AAA-TGTA-CGTGTC-CTCTAAGGGTTCTCTT-GCAAGG-ATAAAAGGTAAT-CATATAATGT-AT------------ATGTAATAATAGATTTT-CCTCCGGCTCTACTT--GGCCTA-TAATT-AA---CTA-C-----AAG-TAAT---CAATATTATCTACAATTATTAT-TCTG--AT-TT-------------------------


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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttCTT-ACA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-TCT------ATAGT----TCCACGAGAAC-TC-GGTGCC-T-CACGCGTATTCA-GGATTAAGTGCAC-TTTA--TATTTCACC---A--CAA-------TTCCTTGGTTTAGCTT----TA-CCAGTG--G--CTGATATT----TCAG-CCTT-A-------ACC---GTCAATTCC-A-TTTC--AC-TTTTAA-TTCTTAAATAA-TTTACC---T-T-TT-ttaggccgtcagactaataa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GG----G---C--TTATA-GT----T----AACT-ATGG-GAAT-T-------AATA-TTA--TAT---A----CACCGTATA----------------------T-TC---------TTGATT----T--AC-TGGGATACTT-GTC-CCGG--G-TT-CTAtaggtcacctgagta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATCTGAGCAAGA-TCTAATACACTCTAAGATACCCTATCCGTT-A--CAGCTCATGTGATACCATAAGAT-TAACGTGTC---TTAAGGGTTAT-TT-GCAAGGAAT--AGG--------TAT--T-C-AT------------A-----------tttgttttact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttaccagagataatcaacctCT-TCGA--C--T-ATTCTATTA-GTGTGTG-TC-A-----CATCAGCG-TTTGGG--AGGCAT-AAG-C-TTATA--t
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgactaatactgcctctgcggtctcctacgtaacaaaggacaatacccatccatgagGTAACGTGTC-CTCTAAGGGTTCT-CT-GTAAGGGATAAAAAGGTCTCTATAT--G-T-ACATGTAATAATAAA-----------ATTTT-CCTCGGGCTCTACTT--GG----G---C--TTATA-GT----T----AACTAG--G-GAAT-T-------AATA-TTA----T---A----TACA-CCTA----------------------TTAT---T-----CTGATT----T--AC-TG-GATACTT-GTC-CCGG--GTTT-ttgtatcgttcattact
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GG--GTTT-CTAA--TGTTACAC----GGTACTGTAACAC-TGGCTGGCTGCCTTGCA-CC-TTGGTTCCGTTA--CCAAGTTGCCTAATTGTTCTG-----T----GAGTAC-TTCGGTGTT-T-CACCCTTATTCA-GGTATTACTTCACTTTTG--T-----ATC---T--CAATCAACATTTCCTT------GCTTAACGTTACCAGTG--G--CTT-GATT----------TCT-A--ACCCCAACCT--TCAATTCC-G-T------T-TC---ACTTT-TAATTC--TTTA-T---T-A-AT-GTACCT-TTCT---TTTTCTTCACTGC-TTT-TTTAGGCCG-------TCAGACTTAA-CAAGTGATTGAT---AC-TGCCTCT-GCAGCTTC-TTATA-TA-GCAAAGGGCTATACC---------AATAGGGG-TATACA-GGATCT-CGGG--C--T-ATTCCATTA-GTCTGAA-TT-A-----CATCAGTG-TTTGGA--AGACATAGGATCATTGTA--atttgttttactgtatacggggacacaaggacggggtttctaatgttacacggtactgtaacactggctggctgccttgcaccttggttccgttaccaagttgcctaattgttctgtgagtacttcggtgtttcacccttattcaggtattacttcacttttgtatctcaatcaacatttccttgcttaacgttaccagtggcttgatttctaaccccaaccttcaattccgtttcacttttaattctttattaatgtacctttctttttcttcactgcttttttaggccgtcagacttaacaagtgattgatactgcctctgcagcttcttatatagcaaagggctataccaataggggtatacaggatctcgggctattccattagtctgaattacatcagtgtttggaagacataggatcattgtatcgttccttact
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtaacgtgtcctctaagggttctctgtaagggataaaaaggtctctatatgtacatgtaataataaaattttcctcgggctctacttgggcttatagttaactagggaattaatattatatacacctattattctgatttactggatacttgtcccgggtttatttgttttactgtatacggggacacaaggacgCTT-GCC-CT-G-GTTCCAA--T-GCCAAGTT-CTT------ATTGT----TCTGTGAGTAC-CC-GATGTTAT-CACCCTTATTCA-Gtcgttccttact
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gctcT-GCA-CC-TGGTTCCAA--T-ACCAAGTT-CCT------ATTGTTCTGT----GAGTAC-TC-GGTGCC-T-Cattacttttactttgtactcacaacaatctt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAT--T---AT------------A-----------CTTTT-CCTCTTACTCTACTTCGAG----GTTAT--TTATTTATA---TA-CAAG-TGATCG-CAA-AT-------AATT-TTAC-TCTTTTA----TTTC-TC-A----------------------TCT-----GAGCGTTAATTG--TTTAAC-CAA--TA-TT-ATC-CCGG--GTTT-C-AA--T----CACC-AGGGTAGTGTAGTACGTGA-TGGGTACCT-GCA-CC-GTGT--CCG--A-GCCAAGTT-C-T------TTTG-----T----AAGT---CA-GGTAC--T-CACCCTTATCCA-GGAATAAATGCAC-CC-G--T-----ACT---G--CAA---------CCTTA----AGCTC----TC-C--CTGATG--CTT-TATT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTACCCTAGTCT-TTAT-C-TTT---A--TT---A-GTC-TAA-TTG-TGTA-C---T-A-TT-GCGTCTATTTTTTATTTTCTT--TTCC-TCTATTC--ACTG-AACTCATC-GAC-TGATC---TACCT--TTAGTC-T-CAACT-GCA-GCTC--TTTA-TA-C-ACTGGTC--TGTCCATTATC-AAAACGAGG-GG-TCG----CCTATGGA--C--CTATTCTAATATTTATAAA-TC-ACACATCCTATGCGCTTTGTAGTAGACAT-GGA-CATTATA--C--TATACAAACTACTAGAATCATTCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgttgttactgagttttcgttctgacaagttgtggaACGTGTTACT----GAGTTCT-TT-ACA-GAGAT---GGGGACA-TATAT--T-T-AT------------A-----------ATTTT-CCCTCTACTCTACTT--GA----GTTAT--TT-TT-AT----T--TAAGCTGATCG-CAATAT-------AATT-TTAC-TCT---A----TTTC-TCTA----------------------TCT-----GAGCGTTGATTGCTAT--AC-CGAGTTACTT-ATC-CCGG--GTTTTCTAAAAT----AACCGAGGGTAGTG-AGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTACC-T-CACCCTTACCC---GGATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATG--CTT--ATT----T-AT-CTTT-ATTTCCTAACCCTAGTCTATTAT-C-TTT---AT-TT---A-TTC-TAATT-G-TTTACC---T-AATT-GCGTCTATTTTT--TTTCCGT--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCA-GCTCTTTTTA-TA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGA-GGG-GA-ACA-GGTCCT-TGGA--C--C-ATTCTAATA-TTATAAA-TC-A-----CCTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATTATA--C------TTAACTACT--AATCA-TCAagtatttatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGTTCT-TT-ACAAAGGAT--CGGGGACA-TATTA--T-T-AT------------A-----------ATTTTTCCTCTTACTCTACT---GA----GTTAT--TTATT-AT----TA--AAGCTGATCG-CAATAT-------AATT---ACCTCT---A----TT-C-TCT------------------------CTC---TG-GCGTTGATTG--GT--TC-CGAGTT--TT-ATC-CCGG--GTTC-TCAA--T----CAC-GAGG-TAGTGTAGTACGTGAC-GGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--AAGCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGCACC-T-CACC-TTATCCA-GG-ATAAATGCAC-C-AG--T-----ACT---G--CAA-------TTCCTTA----AACTC----TT-CCACTGATG--CTT-TATTATCTT-ATTCTTT-ATTTCCCTACCCTAGTCTATTAT-CTTTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTG-TTTACC---T-A-TT-GCGTCTATTTT---TTTCCTG--CTTC-TCT-TTCGAGCCG-AACACATCAGAC-TGA-C---TGATT--T---TC-T-CAACT-GCAGGCTC-TTTTATTA-CTACTGGTCCATGTCCATT-TC-AAAGAGGGG-GA-ACAGGGCCCT-TGGA--C--C-ATTCTAATA-TTATGAA-TCAA-----CTTCTGCG-TTTGGA--AGACAT-GGA-CATT-TAAGC-ATATACT-----CT--AGTCA-TCAcagtat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttactGTGTTACT----GAGTTCT-TTTACAAGAG-T---GGGGACA-TATAT--T-TTAT------------G-----------ATTTT-CCTCTTACTCTACT---GGTTATGTTAT--TTATT-AG----TG--AAGCTGATCGGCAATATT------AATT-TTAC-TCT---A----TTTC-TTTA----------------------TCTG---T-AGCGTTGATTG--GT--ATGCGAGTTACTTTATC-CCGGCCGTTT-CTAA--T----CACCGAGGGTAGTG--GTA-GTGACTGGGTAC-T-GCGGCCAGTGTTCCCG--A---CAAGTC-CTT------TTGGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-TTCACC-TTATCCATGGAATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--CAA-------T-CCTTA----AGCTC----TT-CCACTGATGCCCTT-TAAT----T-AT-C-TT-ATTTCCCTA-CCTAGTCTATTCT-C-TTTTTAAT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC---TAA-TT-ACGTCTA-TTT---TTCCTGT--CTTC-TCG-TTCGG--CG-AACACATAGGAC-TAA-CCT-TGATT--T---TCTT-CAACTGGCAGGCTCTTTTTA-TATCTACTGGGTCATGTCCATT-TCAAAAGAGGGGCGA-A-A-GGT-AT-TGGAACT--C-ATTCTAATA-TCAC-AA-TC-A-----CCTca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                      ctTACACTGCA----TACAA--AT-TAATGTACCGC--ATCCCCTAGCTTAAC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tt-TATAT--A-T-AT------------A-----------ATTTT-TCTTTTACTCTACTT--GA----TTGAC--TTA---ATC---TA-TAAGCTGATCA-CAACATC------AATT-TT---TCT---A----TTTC-TCTA----------------------ACT-----GAGTTTTGATTG--GT--AC-CGAGTTATTT-ATC-CAGG--GTTT-TTTA--T----CACCGAGGGTAGTGTTGTACGTGACTGGGTACCT-GCA-CC-GTGTTCCCG--A-GCCAAGTT-CCT------TTTGC----T----AAGTAC-AG-GGTGCC-T-C------ATCCA--GCATAAATGCAC-CCAG--T-----ACT---G--GAA-------TCCCTTA----GGCTC----TT-GCACTGATT--CTT-TAAT----T-AC-CCCT-ATTTCCCTACCCGAAGCTATTTT-C-TTT---AT-TT---A-TTC-TAA-TTA-TTTACC---T-A-T---------TCTT---CTTTCGT--CTTCTTCT-TTaatggggaatatatatatatatatatatataatttttcttttactctacttgattgacttaatctataagctgatcacaacatcaatttttctatttctctaactgagttttgattggtaccgagttatttatccagggttttttatcaccgagggtagtgttgtacgtgactgggtacctgcaccgtgttcccgagccaagttccttttgctaagtacagggtgcctcatccagcataaatgcacccagtactggaatcccttaggctcttgcactgattctttaattacccctatttccctacccgaagctattttctttatttattctaattatttacctattcttctttcgtcttcttcttt
gi|8                          : tttacactgcatacaaattaatgtaccgcatcccctagcttaacaatggggaatatatatatataATGTGATCTATCGTACTCAGCCATTCTCTTCAGCAACGATTGGAATTTATGAT--TCATATCTCTCTAATTTGAGAAAT--AAACCCGGTACAATACTTGTTACCATAAACTGAATTATTA-TA-------TTCTACACAGCACTGCTTGTACACTGCAACTCTACAATAATCTACTGTACCGCCGATCCCTG---TTAACCCCGGGTTACATGAACTTTTTTGTTACGGTGGGATAAACTTGGGCATCG-AAC-ATAATAAAGATTCAAAAGCAACATACAACGCTCTACAAAAAT-TAATCAAAAGG-TCAT-CACG---AG-TA-CCTATCCC-TGA--CCG---GCATG--ACC--ATAATGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATACAATCTAAGATACCCTATCCCTTAAACCCG----CTTGCCACC---AAATGT-ACGTGTC-CTCTAAGGGTTCTCTT-GCAA-GGATAAAAGGTAAT-CATATAATGT-AT------------ATGTAATAATAGATTTT-CCTCCGGCTCTACTT--GG----CCTATAATTA---AC----TA-CAAG-TAAT---CAATATTATCTACAATTATTAT-TCTG--A----TTT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): GTAATGTATCCTCCAAATGTTTTGTTCTGAAGGGATAAAAGGTCTCATTTATTTATTTAATAACAAATACACAGTCATGTAATTTTCCCCAGGTTCTATTTGAGCCATTGATTAAGTACAGGGAATCAATATTATTTATAGTAATTATTCTAATTTACTAGGATACTATCTCGGTTTAAGTTTTTCTTATATCCACGGATTGTATCTTACACGTTGATGCAACATTGGCTGAGCTCCTTGCACCTGGTTTAGATACTACGTTTCTATTTCTCAGTGAGTACT
Unaligned ( gi|11 ): CAGCTGACTGAGACTGACAATTAACCGAACGGCTCTGATGCCGCTTTATATACTCTAAGAAGAGTCCATGTTCACTCCCAAAAAGGATATTTGGGTTATTCCATTATATCAAGTCATCAAAACGTTTGATTACATAGAAAAAAATCATCACATTACCCACGTCTCCGGGTACATTCGTCTCGAATGACAAAGCAAACGTTTTTTTTTTTTTCCACATTTATTTAACATGATGATCTGAAACAAA
Unaligned ( gi|15 ): CAGCCAACTGAGACTGAAAAACTGAACGGCTCTGATGCCGCTTTATATACTCTTAGAGGAGTCCATGTTCGCTCTCAAAAGGGGTATTGGGTCATTTCATTATATCAAGTCATCAAAACGTTTGATTGCATAGAAAAAATTAATCACACTA
Unaligned ( gi|16 ): ATATCATTATAGTTTATCTTGAAAATGTACAAAGAAAAAAATTATTACTTAACCACGCTCCGGGTCATTCGTTCTCTGAATGAAAAACCACATTATTTTTTTTATTCTTTTTTTTTCATTGACAGATAAACTGCAAGACAAA
Unaligned ( gi|17 ): CAGGTTCCTATTGTTCTGTGAGTACTCTGTGCCTCTAGCATTGTTACATCCTTGGTTAATCTTTCACCAATGGCTTGTATTTCGATCTTAACATTTCGATTCCTTAATTCACTATTACTTAAATAATATCAAGTCTTCTTC
Unaligned ( gi|21 ): TATTCTCTTCTATCGGGACACTTGTCCCGGGTTTTATTTTCTATTGTACACAAGGCGGGGTTCTGTGTTACACGGTACTGTACAT
Unaligned ( gi|22 ): AAAAAATTATTACATTACCCACGCCTTCGTGTACACTTGTCCCAAATGAAAACACATATAATTATTTCTTT
Unaligned ( gi|24 ): TTTACCAGTGGCTTATTTTCGACTAACCTTTGAATTCCGTTTCAC