lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 111111 111111111111 11 1111111111 66666666666666666666666666666 1111 111111 1111 111111111 11111111 1111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222222222222 1111 222 11 11 000000000000000000000000000000000000000 2222222222222222222222 333333333333333333 111111 22222222222222222 11111111 66666666666666666666666666666666 2222222 1 3333 111111 3333333 1111111 222222 11111 22222222222 666666666666666666666666666666666666666 2222222222222 77777777777777777777777 1111111111111111111 11111 111111111111111111111111111 1111111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 1111 55555555555555555 1111111111 1 111
lowQualScore : 7 7 99 99 44 1 333 666 88 666 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 44 555 44 111111 777 2 8888888 2 2 555555555555 00 7777777777 33 6 33 2 5 55555555555555555555555555555 33 2 5 0000 2 77 2 888888 0000 5555 000000000 2 2 44444444 6666 666666 3 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 666666666666666666 2 33 5 2 33 444 2 3 2 5 6666 0 2 77 2 2 33 8888 5 555 99 2 333 66 33 00 2 2 5 33 00 2 333333333333333333333333333333333333333 33 99 3333333333333333333333 5 66666 2 77 4 4444 33 2 6 4 2 55 33 888 2 777777777777777777 77777777 2 888888 2 44444444444444444 2 22 33 99999999 2 66 2 66666666666666666666666666666666 2 4 5555 444 33 2 2 66 4 2 2 2 2 33 2 0000000 2 1 222 777 666666 33 444 6 4 7777 2 333 77 4 111111 6666 3 3 77 22 333 2 6666666 3333333 333 1 22 77 2 6 2 2 2 2 1111111 2 0 2 2 6666666 2 4 2 333 2 4 66 444 33 888 4 2 222222 55555 2 7 2 2 77777777777 2 777 2 2 2 99 33 2 555555555555555555555555555555555555555 33 33 3333 66 2 9999999999999 2 8888 777 22 22 4 77777777777777777777777 4 333 7777777777777777777 2 2 00000 33 33 88 33 66 2 22 4 2 2 2 7777 888 66 777777 5 5 444 8888888 7 777777777777777777777777777 888 4 9999999999999 9999 3333333333333333333333333333333333333333333333333 1 2 2 2222222222 6666 5 55555555555555555 3333333333 6 88 2 000 666
lowQualScore : . . .. .. .. . ... ... .. ... .................................................................................... .. ... .. ...... ... . ....... . . ............ .. .......... .. . .. . . ............................. .. . . .... . .. . ...... .... .... ......... . . ........ .... ...... . . ........................................................................ .. .................. . .. . . .. ... . . . . .... . . .. . . .. .... . ... .. . ... .. .. .. . . . .. .. . ....................................... .. .. ...................... . ..... . .. . .... .. . . . . .. .. ... . .................. ........ . ...... . ................. . .. .. ........ . .. . ................................ . . .... ... .. . . .. . . . . . .. . ....... . . ... ... ...... .. ... . . .... . ... .. . ...... .... . . .. .. ... . ....... ....... ... . .. .. . . . . . . ....... . . . . ....... . . . ... . . .. ... .. ... . . ...... ..... . . . . ........... . ... . . . .. .. . ....................................... .. .. .... .. . ............. . .... ... .. .. . ....................... . ... ................... . . ..... .. .. .. .. .. . .. . . . . .... ... .. ...... . . ... ....... . ........................... ... . ............. .... ................................................. . . . .......... .... . ................. .......... . .. . ... ...
lowQualScore : 3 3 22 22 66 1 888 222 66 444 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22 444 11 999999 333 7 7777777 7 7 333333333333 22 3333333333 99 0 99 9 7 99999999999999999999999999999 99 9 7 0000 7 33 5 111111 6666 3333 999999999 5 5 22222222 6666 888888 0 6 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44 444444444444444444 5 44 0 5 44 444 5 2 5 0 4444 1 5 77 9 9 99 3333 7 000 11 9 777 00 99 77 9 9 7 55 77 9 666666666666666666666666666666666666666 99 66 6666666666666666666666 3 77777 7 55 4 7777 11 2 7 4 2 66 22 222 4 111111111111111111 66666666 4 111111 7 11111111111111111 7 88 11 44444444 7 33 7 99999999999999999999999999999999 8 7 0000 111 22 4 4 55 7 2 2 2 2 11 2 1111111 2 7 888 222 888888 22 111 7 7 0000 2 999 55 0 555555 0000 8 8 11 66 333 4 5555555 8888888 333 9 66 99 0 0 0 0 0 0 2222222 1 4 1 1 8888888 2 4 2 999 2 4 55 111 22 888 7 4 666666 88888 5 5 4 5 44444444444 4 888 2 2 2 44 11 2 888888888888888888888888888888888888888 11 11 6666 11 2 1111111111111 0 5555 000 88 88 0 77777777777777777777777 4 999 2222222222222222222 2 2 00000 11 11 33 11 55 2 99 2 4 4 2 4444 999 33 222222 0 0 444 1111111 5 666666666666666666666666666 222 7 2222222222222 7777 2222222222222222222222222222222222222222222222222 4 9 2 5555555555 7777 7 00000000000000000 5555555555 2 77 3 888 444
consensus : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-G--TTTGA--TGA---AATAC-------TA-CAGGC-AC-AG---T-TT----GTTG-TTG-T----T---TTGGG--GT-T-TTCTT---TGC-A------CTGTTT--T---AA-TTT------AGTT---TACCT-A-------A-A-CACAATGT-----CC-----GAAGAN-CGA---T--T-TTAT--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TTT--TTTTTT-CAACCAG-TG----T-ATG--GGG-T--N---AAT----GTG----TT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T--------------------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCA--A-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG-AT--CATA---AAGGA-A---TC-TGA-GG--TTTTT-T--CATG--T-CG-CG-C-GA--TCAG-GTT----T----CA-G-CTT---NN---------GAGGG---G--AGG--GGGG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC------------------TCCAGT------GTGC-CCAT---A--TAA-GCCCTGG-TGAG-G-GC-A-T-NGGGT-G-AAT-CCCCT------AG-TG--TT-A--T---A------G---TAGA-C-C-----TCCCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TATC------G-TCAATTNGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TTANTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GATGA-T-----ATCT-N---A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CCTTG------AC-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----TG-A-TATA-T-CAAAA--NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGT-ATA-T---T-TGT---TGT-CT--GG---AAG--T--TTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---TAAA--A------AAGGG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAA--T-CTGAA-AATA--AAATCC-AGTC-CG-A-A----CACGT---A--A------GGG-GG-AA---G-------CCT-CACTAT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-TCT--C----ACT--NTATA----TAG--C-CAAGCT-TCCCCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTCT-C--AC-TAT-----------------GG----------GGA-AGT-CTC-AC---TATATA---ACAC
Reference ( gi|4 ) : GAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGATC--TA--CATTA-T-G--TTTGA--TGA---AATACT----AATA-CAGAC-AC-AG---T-TT----GTTC-TTG-T----T---TTGGG--GT-T-CTCTT---TGC-G------CTGTTT--T---AA-ATT------AGTT---TACCT-A-------A-A-CACAATGT-----CC-----GAAGAA-TGA---T--T-TTAT--CGG--TG-G-A----------T-----------G---G--TTT--TTTTTT-CAACCAG-TG----T-ATG--GGG-T--A---AAT----GTG----TT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T--------------------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCA--A-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG-AT--CATT---AAGGA-A---TT-TGA-GG--ATTTT-T--CATG--T-CG-CA-C-AA--TCAG-GTT----TTCAACA-G-CT----AT---------GGGGA---G--AGG--GGGG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TGCC------------------TCCAAT------GTGC-CCAT---A--TAA-GCCCTGA-TGAG-G-GC-A-T-GGGGT-G-AAT-CCCCT------TG-TG--TT-A--T---A------C---TAGATC-C---TCTCCCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TATA------G-TCAATTCGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TTATTGGTATAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GATAA-T-----ATAT-C---A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CCTTG------GC-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----CG-A-TATA-T-CAAAA--GA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCATGCACGT-ATA-T---T-TGT---TGT-CT--CA---AAG--T--TTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---TAAA--AAAAA--AAGGG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAA--T-TTGAA-AATA--AAATCC-AGTC-CG-A-A----CACGT---A--A------GGG-GG-AA---G-------TCT-CACTAT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-TCT--C----ACT--CTATA----TAT--C-CAAGCT-TCCCCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTCT-A--AC-TAT-----------------GG----------GGA-AGC-CTC-AC---TATATA---ACAC
gi|5 : GAATAA-T-AATTT----GCTTTGATC--TATACATAA-T-G--CTTGA--TGA---AATAC-----------AGAC-AC-AG---T-TT----GTT----G-T----T---TTGGG--GT-T-TTCTT---TGC-A------CTGTTT--T---TA-ATTC-----AGTT---TACCT-A-------A-A-CACAATGT-----CC-----GAAGAA-TGA------T-TTAT--CAG--TG-G-A----------TATGTTAGGGTGG---G--TTT--TTTTTT-CAACCAG-TG----C-ATG--TGG-T------AAT----GTG----TT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------T-TTCATA---------------T-T--------------------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCA--A-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---AC-AC-CAATCT-AA-ATG-AT--CATA---AAGGA-A---TC-TGA-GG--TTTTT-T--CATG--TCCG-CA-C-GA--TCAG-GTT----T----CA-G-CT----TT---------AAAAAAAGG--GGG--GGGG-----TGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TCACTG--TT---ATTGCC------------------TCCAGT------GTGCACCAT---A--TAA-GCC--GG-T-AA-G-GC-ATT-GGGAT-G-AAT-CCCCT------AG-TG--TT-A--TAA-A------A---TAGA-----------CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTT-TC-----------------------------------TA-TGCCTT-GC-AATTTGGG--A-TATC------G-TCAATTGGT-G-TATGG-T-ATCATACATGT--AA---TTTCA-TTAATGG--TAAGGAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AA-CTAT--A---GATGA-T-----ATAT-CTA-A---AG-G--T--A-C-AA-T-TT-T-CCTTG------AC-AATCT-GA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TCAAA-GA------AG----TG-A-TATA-T-C-AAA--TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGT-ATATT---T-TGT---TG---T--AG---AAG--T--TTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCGCTC---TAAA--AAAGA--AA-AA-AG-GGT---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAA--T-CTGAA-AATA--AAATCC-AGTC-CG-A-A----CACG
gi|6 : ccccctaattgggttaagtttccgGAATAA-T-AATTTTTT-GCTGTGATT--TA--CATTA---G--TTTGA---GA---AATAC-----------AGGCCAA-AG---T-T-----GTTG-TTG-T----T---T---G--GC------------------------GTTT--T---AA-TTT------TGTT---TACCT-C-----------CA-AATAT-----CC-----GAAGAA-TGA---T--T-T-AT--CAG--TG-G-A----------TTTGTTTGGT--G---G--TTT--TTTTTT-CAACCAG-TG----T-ATG--GGG-T--A---AAT----GTG----TT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCCTA---------------T-T--------------------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCA--A-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG-AT--CATA---AAGGA-A---TA-TGA-GG--TTTTT-C--CATG--T-CG-CA-C-AA--TCAG-GTT----T----CA-G-CTTTAAAA---------GGGGG---G--AGG--GGGG----------------------TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGCTG--TT---A-TGCC------------------TCCAAA------GTGC-CCAT---ATGTAA-GCAC------------C-A------GT-G-----------------------TT-A--C---A------A---TAGAGC-C---CATTTCCCTTCCCCCTC-TGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATGT-GG--A-TATC------G-TCAAT---------TGA----------------AA---TTTCA-TTATTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AA-C--T--A---GATAA-T-----ATCT-A---A---AG-A--T--A-A-AA-T-TT-T-CCTTG------AC-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----TG-A-TATA-T-C-AAA--TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-A-CA---ACGT-ATA-A---T-TGT---TG---T--CA---AAG--T--TTT-C--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC----------------AAGGG-GG-GTG---GG-------------------G-TGG-TC----CCG--ATG--G--AAA--T-CTGAA-AATA--AAATCC-AGTC-CG-A-A----CA
gi|1 : ctttcactaatataaaccagtcttccccctttatcatgaggcttcccccccccccttggagttaagttccgGAATCA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--TAATA-T-G--CCTCA--TAACATAATATTGAGAAATAGCAGAC-ACTAG---T-TTTATGGCTAGTTG-T----T---CTTAG--GTATACTCTT----GC--------CTGTTTGTT---AA-TTC------AGTT----ACCTGA-------A-A-CCAAAAGT-----CCC----GAAGAAATGA---T--TGTTACTCCAGCTTG-ATA----------T-----------A---G--TTGGGTTTTTT-CAACCAG-TG----C-ATG--GGG-T--A---A-T----GTG----TT---TA----C-AATTAA-------AAA----TA------TCT----G---------------T-T------------------------------------------------------CG--AATC-T-C--------------AACGCTCT--A-TA-T--GCATAAG-TGTAAACAA-TGGGACAAC-CAATCT-AATATGTATAGTATTTTCATAGA-A---TCGTGA-GG--CTTTT-TTTCATG--C-CGGCA-CGAA--TCAG-GTT----T---ACATG-CT----TTTAAAAAACAAAGGG---G--GGG--AGGG-----CTG------GGA-----TC-A------T-CCCC---G-A----GGCATAG-T-GA-T-T-GGGAGGCT-T-GTTG--TT---A-T-CC------------------TCCG-T------GTGC-CCAT---A--TAA-GCCCTGAGTAAGCG-GCCA-TTGGGGT-G-AATTCCCCT------AGCTG--TT-A--T---AAATAATC---GAGGTA-TAAATATGCCCC--CCCCCTC-AGTAGGTTTTCTGCTC---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GG-AATTT-GG--A-TATC------G-TCAGTTGGT-G-TATGG-T-AT-----------AA---TTTCA-TTAATGGTA--AGGAA-CATTCTT---T----GT--TTTAA-A------TG----TT-AA-T--T--A---TA-GA-T-----ATCT-A---A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CCTTG------AC-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AGTGATCG-A-TATA-T-CAAA---TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TCC--TA-ACCA----CGT-ATA-T---T-TGT---TGT-A----G---AAG--T--TTT-C--TT--A-C-----TA----A-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-AACCCTC---TAAA--AAA-------------GGG---GG-------------------G-GGG-T------------G--G--AAA--T-CTGAA-AATA--AAATGA-AGTC-CG-A-A----CACGT---A--A------GGG-GG-AA---G-------TCT-CACTAT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-TCT--C----A----CAATA----TAG--C-CAAGCT-TCCC
gi|15 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccGAATAA-T-GTGTTTA--GCATTG-TC--TA--CAT-----G--TTTGA--TGA---AATAC-----------AGGC-AC-AGGTTT-TT----GTTG-TTG-CCGCGT---TTGGG--GT-T-TTCTT---TGC-A------ATGTTT--T---AA-TTT------AGTT---TACCT-A-------C-A-CACAATGT-----CC-----GAAGAC-CGA---T--T-T-AT--CAG--TG-G-G----------T-----------AT--G--TTT--TTTTTT-CAATCAG-TG----C-ATG--GGG-T--T---AAT----GTG----AT---AA----C-AAT-ATTTTT---ACT----TG------TCTTTTTG---------------T-T--------------------TAT------------------C------------CG--AAAC------------------AAA-CTCA--A-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG-AT--CATT---AAGGA-A---TC-TGA-G---ATTTTAT--CATG--T-CG-CG-C-GA--TCAGAGTT---------CA-G-CTT---AA---------AAGGG---G--AGG--GGCG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CAC---AG-A----GGCA--A-T-GGGT-C-AGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TACC------------------TCCTCT------GTGT-TCAT---GGCTAA-G
gi|3 : ggtctcgctatatagtaagtcttccccctttatagtgcggcttccccctatacatgtaggttaagtttccgGAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--GAA---AATA--------TA-CAGGC-CA-AA---TGTT----GTTG-TTG-T----T---T-GGC--GT-C------------------------TT--T---AA-TTT------TGTT---TACCT-A-------A-A-CACAATAT------C-----GAAGAATTGACACT--C-TTAT--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTTT--TTTTTT-CAACCAGATG----T-ATGACGGG-T--A---AATGTAGGTG----TTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T--------------------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCA--ATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG-AT--CATTA--AAGGATA---TA-TGA-GGTCTTTTT-C--CATGGTT-CG-CACC-AATTTCAG-GTT----T----CA-G-CTTAAAGT---------GGGG----G--AGG--GGGG----------------------TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCCCACACGGCCCCCCCCACATCCAAA------GTGC-CCAT---A--T
gi|2 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccgGAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--GAA---AATA--------TA-CAGGC-CA-AA---TGTT----GTTG-TTG-T----T---T-GGC--GT-C------------------------TT--T---AA-TTT------TGTT---TACCT-A-------A-A-CACAATAT------C-----GAAGAATTGACACT--C-TTAT--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTTT--TTTTTT-CAACCAGATG----T-ATGACGGG-T--A---AATGTAGGTG----TTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T--------------------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCA--ATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG-AT--CATTA--AAGGATA---TA-TGA-GGTCTTTTT-C--CATGGTT-CG-CACC-AATTTCAG-GTT----T----CA-G-CTTAAAGT---------GGGG----G--AGG--GGGG----------------------TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCCCACACGGCCCCCCCCACATCCAAA------GTGC-CCAT---A--Tgtacagccaccagtgtaccaattaagagccatttccccttccccctctggtaggttctccttaaagattcttgcatgtaattatgctagcaatgtgatatcgtcaattgaaatttcaattattggtaaggatattctttctttgccttttaagataacaaactagataactattctcaaagattaaccaatttcacttgacaagctcattcaattccagtaaattgacaatgactcgagtaaaagattaaacagtcgactatatcacaatcattattgatgaaaaaatctcaatctcaacgttataaattgttgtcaaaggttttccttgactatttggttaagaggcaaatatcaaaaccaacccctcaagggggcgtgggttggtccgatgggaaaatctgaaaataaattccgagttcgaacacgtaagggtggtaagtctccactatgatggttagggggtttggggttcttccacctatattagtcaagcttccaccatttggcgggagaagtttcacctataataggccagccttccgggggagagtctcgacttatatataacaccg
gi|30 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccgGAATAA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--CATCA-T-G--TTTGgtacagccaccagtgtaccaattaagagccatttccccttccccctctggtaggttctccttaaagattcttgcatgtaattatgctagcaatgtgatatcgtcaattgaaatttcaattattggtaaggatattctttctttgccttttaagataacaaactagataactattctcaaagattaaccaatttcacttgacaagctcattcaattccagtaaattgacaatgactcgagtaaaagattaaacagtcgactatatcacaatcattattgatgaaaaaatctcaatctcaacgttataaattgttgtcaaaggttttccttgactatttggttaagaggcaaatatcaaaaccaacccctcaagggggcgtgggttggtccgatgggaaaatctgaaaataaattccgagttcgaacacgtaagggtggtaagtctccactatgatggttagggggtttggggttcttccacctatattagtcaagcttccaccatttggcgggagaagtttcacctataataggccagccttccgggggagagtctcgacttatatataacaccg
gi|9 : agtgagacttcccccatagttgaaacttccccggaaggttgcgctatatagtgaagacttcccccccgcatcgaaattatcactataatccatcttccccctttgatgtgacccccccttgggttcagttaccgAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGCTC--TA--TACAAAT-G--TTTGAGATGA---AAT--T----AA-A--GGAC-AC-AG---T-TT----GTGT-TTGTT----T---TTGGG--AT-T-ATC-T---TGC-A------CTGTTT--T---AA-TTC------AGTT---TACCT-A-------A-A-CACAATGT-----CC-----GAAGAA-TGA---T--T-T--T--CAG--TG-ATA----------T-----------GTGAG--TTT--TTTTTT-AAACCAG-TG----TAATG--GGG-T--A---AAT----GTG----TTTTAAA----CAAAT-AA-------AAA----TA------CCTT-ATA---------------TGT--------------------T--------------------C------------CGATAAAC-T-C--------------AAC-CTC---A-T--T--G---AAG-TG-CA-CAA-T---ACAAC-CAATC---A-ATG-AT--CATA---AAGGA-A---TC-GGGTGT--TTTTT-T--CATG--C-CG-TA-C-GAT-TCAG-GTTCAGCTTTAAAA-A-AA----AG---------GGGGG---G--GGGA-GGGG-----CGT------GGA-----TC-A-----ATCCCCC--AG-A----GGCA--T-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A--GCC------------------TACAGT------GTG--CCAT---A--TAA-GCCCTG--TGAA-G-GC-A-T-TGGGT-G--AT-TCCCT------AG-TGGTTT-A--TGAAA------T---GAGA-C-C---CCCCCCCCTT-----TC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GT-CT--TGCATGTGAAATTA-TGCCTTGGCAAAATT-GG--AGTATC------G-TCA--TTGTGG-TATGG-TAATCA------T--AA---TTTTC-TTAATG---------------------------C--TTTAA-A------TA----TTGAA-C--TACA---GATGA-------ATAT-CT--A---AA-G--T--A-CAAA-T-TTAT-CCTTG------ACAAAGCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---T-GA-
gi|11 : cccttgggttaagtttccaAA-T-ATTTTTT--GCTTTGATC--TA--TATAA-T-G--TTTGA--TGA---AATGC-----AGCA-C---C-GC--G---T-TT----GTTG-TTG-T----TGCTTTTGG--AT-T-TCCTT---AGC-A------CTGTTT--G---AA-TTT------AGTG---TATTC-A-------A-A-TACAATAC-----CC-----GAACAC-CGA---T--T-T-AT--CAC--TG-G-A----------T--------------------------------AC-----G----T--TG--GGG-T--T---AAT----GTG----TT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTCTATAGTTTTACTTGCCTT-T-T--------------------T--------------------TGAAATACATGTACG--AAAC-A-C--------------AAC-CTCA--A-TA-T--G---AAG-TGTCA-TAA-T---GCAAC-CAATCT-AA-ATT-AT--CATA---AAGGA-A---TC-TGA-TG--TTTTA-T--CATA--T-CG-CG-C-GA--TCAG-GTT----T----CA-GTTT----AA---------AAGGG---G--AAG--GGGG-----CGT-------GA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-GGGAGACC-TCGCTG--TT---A-TGTT------------------TCCAGT------GTGT-CCATGGCA---AA-GCCCTGG-TGGG-A-AC-A-T-TGGTT-G-AAT-GTCCA------AG-TG--TT-A--T---A------G---TAGA-----------CTACGGCCCCCTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGTCTT-GC-GATTT-GG--A-TATC------G-TCGATTCGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TTATCGG--CAAGAAA-TACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----AT-AA-C--T--A---GATGA-T-----ATCT-A---A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CCTTG------AC-AAGCT-CA-TTC-------
gi|8 : ggcttccggAA-T-A-TTTTT--GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTTTTGAT-TGA---AATGC-----AGCA-C---C-GC--G---T-TT----GTTG-TTG-TTGC-T---TTTGG--AT-T--TCCT---AGCAA------CTGTTT--G---AATATT------AG-T---TATTC-A-------A-A-TACAATAC-----CCG----GAACAC-CGA------T-TTAT--CAC--TGCG-A----------T--------------------------------AC-----G----T-TGG--GGG-T--T---AAT----GTG----TT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTTTATAGTTTTTACTTGCCTTT-T--------------------T--------------------T------------TG--AAAT-A-CATGTACGAAACAACAAC-CTCA--A-TATT--G---AAGTTGTCA-TAA-T---GCAACGCAATCT-AA-ATT-AT--CA-T---AAAGA-A---TC-TGA-TG--TTTTA-T--CATAT-T-CG-CG-C-GA--TCAG-GTT----T----CA-G-TT----TA---------AAGGG---G--AAG--GGGG-----CGT-------GA-----TC-A-----AT-CCCCAGAG-A----GGCA--A-T-GAG--T-CGGAGACC-TCGCTAGTTT---A-TG-C------------------TTCAGT------GTGT-CCATG--G--CAA-AGCCTGG-TGGG-A-AC-A-T-TGGTT-G-AAT-GTCA-------AG-TG---T-A--T---A------G---TAGA-----------CTACGGCCCCCTC-AGTA-GTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGTAAAATTA-TGTCTT-GC-GATTT-GGAAA-TATC------G-TCGATTCGT-G-TATGG-T-ATCA------TAAAA---TTTCA-TTATCGG--CAAGAAATTACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----ATAAA-C--T--A---GATGA-T-----ATCT-TA--A---AG-ATTT--ACC-AA-T-TT-T-CCTTG------AC-AAGCTCCA-TTC-------A
gi|14 : ttgagcttccggAA-T-AATTTTT--GCATTGATC--TG--CATGA-TTG--TTTGA--TGG---AATAC-----------AGGC-AC-AG---T-TTTT--GTTG-TTA-T----T---TTGGGTTGT-T-TTTTTTTTTGC-AAAGAATCGGTCT--TCGGAC-ATTGTGTATAGGTAAATAGGT-A-------A-A-CTAAAT-T-------------AAGAC-CGA---T--T-T-AT--CAG--TG-G-A----------T------------------TTT--TTTTTT-CATTCAG-TG----C-ATG--GGGTT--AATTAAT----GTGTTAATT---AA----C-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-TTTTACTTGTCTTTTTGGATAT--------------------C------------CG--AAA----C--------------AAA-CTCAATA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T----C------------A-ATG-AT--CGTA---AAGGA-ATCTTT-TAA-AA--GTTGTAT--CATG--T-CG-CG-C-GA--TCAG-GTT----T----CA-T-CT-----T------------GA---A--AGGCAGTGG-----CGTAACCAGGGACTAACTC-AAGTGGAT-GCTT--AG-T----GGCA--AGT-G-GT-T-TGGGGAC
gi|22 : aagtgtcactatatagcaagtcttccccatttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccggATTTTC--ACTGTAATC--TA--CAT-A-T-G--TTTAA--TGA---AA----------TA-CAGGC-AC-AG---T-T--------------T----T---TTGGG--GT-T-TTTTTC--CCC-A------TTGTTT--T---AA-TTT------AGTTG--TACGA-A-------A-ATTAC-ATGTAAGTACCTTTAAAAAGAC-CGA---TTAT-TTAC--CAG--TC-G-A----------T-----------G-------TG--GTTTTT-C-ACCAG-TGCA--T-ATA--GGG-T--T---AAC----GTG----TT---TG----T-ATT-AATATTTTTAAATTTTTACTTGCCTCTTGACA---------------T-T------------------------------------------------------CG--AAGC-A-C--------------AAC-CTCA--A-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-
gi|46 : tagtgaggattcccttgg-T-TTCTT---TGC-A------ATGTTT--T---AA-TTT------AGTT---TACAT-A-------A-A-CACAATGT-----CC-----GAGGAC-CGA------T-TTAT--CAG--TG-A-A----------T-----------
gi|14 : GTCT--T---AA-TTT------AGTT---TACCT-ATTTACCTATA-CACAATGT-----CC-----GAAGAC-CGA---T--T-CTatg
gi|35 : aagtgtcactatatagcaagtcttccccatttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccggaataatttttgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaGTT---TACGT-A-------A-T-TA-AATAT------------GACCAA-TTA---A--T-TAAT--CAA--T----A----------T-----------G---G--TTT--C------CAGGCAG-TG----T-ATG--GGG-T--T---AAT----GGG----TT---AA----C-AAT-AA-------AAA----T---------TTCATA---------------T-T--------------------T--------------------cgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|7 : tcttT---TACCT-A-------A-A-CACAATGT-----CC-----GAAGAA-TGA---T--T-A-AT--CAG--TG-G-A----------TATG--------G---G--TTT--TTTTTTTCAACCAG-TGAACGT-ATG--GGG-T--A---AAT----GGG----GT---AAA---C-AAT-AA-------AAA----TA------T------A---------------T-T--------------------C--------------------C------------CG--GATC-T-C--------------AAC-CTCA--A-TA-T--G---AAG-TACCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG-AT--CATA---AAGGA-A---TC-TGA-GG--TTTTT-C--CATG--T-CG-CA-C-AA--TCAT-GTT----T----CA-G-CTTA--AA---------AAAGA------AGG--GGGG-----GGG------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--CG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGTTG--TT---A-TGCC------------------TCCAAT------GTGC-CCAT---A--TAA-GCCCTAG-TG------------------------------------------TT-A--C---A------G---TAGAGC-C---CATCCCCCTTCCCCCTC-TGTATGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGAATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TATC------G-TCAATT-----------------G------T--AA---TTTCA-TTATTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GATAA-T-----ATCT-A---A---AG-A--T--A-C-AT-T-TT-T-CCTTG------AC-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----TG-----------------------ATTGA-T---AAA-AGC-T-C-----------------------A-T---T-TGT---TG---T--CG---AAG--T--TTT-C--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T--------AA--AAGGG-GG-GGG---GG-------------------GTGGT-T-----CCG--ACG--G--AAA--T-CTGAA-AATA--AAATCC-CGGC-CG-A-A----CACGT---A--A------GGG-GA-AGTACG-------TCC-CACTAT-GGTGG-------TT-AG---------GGGGG---GGGG-TCT--C----ACT--ATATA----ttcttcactctgatatccgaaggacaacctcaa
gi|39 : --TTG--TTTTCT-CGGCCAG-TG----C-ATG--GGA-T--------T----GT-----TT---------C-CAT-AA-------AAAG---TA------CCTTCAAA---------------T-T--------------------T-------------------------------------AAACGTAC--------------AAC-GCCA--G-TT-T--A---AAG-AGACA-CAA-T---ATAGC-AAATCT-A
gi|31 : tt-ATG--GGG-TTAATT-AAT----GTG----TT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T--------------------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCA--A-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T---------CAATT---------AT--CGTA---AAGGA-A---TC-TTA-AG--TTTTA-T--CATG--T-CA-CG-C-GA--TCAG-GTT----Ttgaga
gi|19 : cG-T--T---AAT----GTG----TT---AA----C-AAT-AT-------AAA----TA------TTTTCATAGTTTTACTTGCTT--T-TCTGATA--------------T--------------------C------------CG--AAAG-A-C--------------AAC-CTCA--A-T---------------------A-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG-AT---A-----GAGGA-A---CT-TGA-TG--TTTTA-T--CGTG--T-CG-CA-C-GA--TCAG-catcttga
gi|20 : ------TTTTGATA---------------T-------------------------------------------C------------CG--AAAC-A-C--------------AAC-CTTA--A-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T---ACAAC-CAATTT-AA-ATT-AC--CAAA---AACGA-A---TC-TGA-GG---TTTA-T--CATG--T-TG-CG-C-GA--TCAG-GTT----T----CG-A-CT-----T---------GAAAT---G--TGAT-GGGG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CC---------------A--A-T-GAGT-T-TGGAG---------------------CC------------------TCCAGT------TTGC-CCAT---GGTTAA-GCCGTGG-TGGA-G-GT-G-A-AGGGT-G-GAT-TCCCT------TA-TG--TT-A--T---A------G---TCGACC-C----CTCCTC--TCCCCCAG-AGTAGGTTCTC----C---AAG--AA-GA-TC--TGCGTGT-AAATTA-TGTCTT-CC-AATTT-GG--A-TATC------G-TCAATTCGT-G-TAaagccagagacaatgagtctcgagactccgctctagtgtacccatggctaagccctggtggggtaaaatgccctagtgttatagcagaccaccttccctctcagtaggctgcatgcaaaacatgtcttgcaatttggatacatatatcgtcaattcgtgtatggtatcgtaatttcatttagtggtaatgaatatcctttctttgctctaaataatatttgaatgatgtctaaagat
gi|10 : tct---------GGGGG---GCCAGG--CGGGTCAGCCGT------GGAA----TC-A-----AT-CCCC--AGCA----GGCA--A-TTGTGT-CCTGGGAGCT-TCGCTG--TT---A-TAC-------------------TCCAGT------G-GC-CCAT---A--TAAAGCCCTGG-TAAG-GCGC-A-T-TGGGT-G-AAT-CCCCT------CA-GG--TTTA--T---A------CAAATAGACC-C------CCCCC--CCCCCCC-AGTAAGTTCTC----C---TAGGAAA-GAATC--TGCATGT-AAATCA-TGCCTT-GC-AATTT-AG--A-TATC------GCTCAATTGGT-GTTATGGTT-ATCA------T--TAGTCTTTCA-TTACCATCGTGAGGAA-CATTCTT---TACTTGC--TTTAA-A------TATCCTAC-AA-C--T--A---CACAC-TTGTGCATAT-CTA-A---AGCG--T--A-C-AA-TCTT-T-CCTTG------AC-CA----CA-TTCTCCATATAA-TT-CAAGCTTAA-GA-TA--ACATG--TGACCTCGAA-TAAAACGACAC---AGTC--TG-ACTATACT-CCACA--CATAGTATTGACT---AAA-ATCTT-C-CTCCTTACACCA--CA-AT-ACA-T---TCTGTCCCTG--CTACCAGACAAG--T--TTT-CCTTC--A-C-----T--T-AA-TGGTTAA-G------ATAT---A--A--CC-ACCCCTCAAGTAAACCGAGTG--ATGGG-GC-GGGCCTGGCGCCTCGACCCGCTACGCCG-GCG-TT----CCGCGATG--G--AAATCT-TCGAA-AAAACTAAATCC-AGTCTCGTG-ACACCCACGTCTAA--A------GTC-GG-AA---C-------TCT-GACTA
gi|12 : caaagggGG---G--GGG--GGGG-----AGC------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AGTA----CGCA--A-T-GGGT-T--GCATGCT-TC-CTA--CT---A-TGCCA-----------------TCCA-T------GTGC-C--T---A--TAA--CCCTGC-GGAG----C-A-T-TAGGTTGCAAT-CCCCTAGTACGTG-TGA-TT-A--A---A------A---TAGA-----------CCCCCTCCCCCTC-GATA--TTCTC----CCATTAA--TA-AA-TA---GCATGT-AAATAAATACCTT-GC-AAAT--GG--A-TATC------G-TAAATTAGT-G-TGTG----ATCA------T--AA---TTTCA-TTAATG---TAATCAA-TATTCTTATATCTATGC--TT--A-A------TAT---AT-AA-C--T--AATGGATGA-T-----ATCTAC---A---TG----T--A-C-AAGT-TT-T-CCTTG------AC-AAGCT-CA-TTT-------AGCTT-C-AGT---ATGA-TG--A---ACATGACT----A-TAAAG-AATGTG--AG----TA-A-TAT--T-CAAAA-------TATTGA-T---CAA-AAC-T----TC--TA-AC-----ACTTTATA-T---T-TGT---TGT------A---GAGAAT--TTTGC--TT--A-C-----TA---AA-TG-TTAG-G----AAATAT---A--AACCT-ACCTCTT---TTAA--ATAAA--A-----TA-GGA---GG-------------------G-AGG-T-----CCG--ATG--G--AAA--T-TTGAAGAATA--AAATCC-AGTC-C--A-A----CACCT---A--G------GGA-GG-AA---A-------TCTCCACTA--AGT---------TT-A----------GGGGA---TCAT-TTC--C----ACT---TATA----TAC--G-CA--------------------------------------GCC-TCCG-GGGGGG----------GGGCT-ATCACTTAT-----------------CG----------GGA-AGC-CTC-AC---TATATA---ACA
gi|45 : aaaa-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-TGGAGACT-TCACTG--TT---A-TGGT------------------TCCAGT------GTGC-CCAT---GGCCAA-GTCCTGG-T
gi|21 : CCC--AG-ACCATAACA--A-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A-TGCC------------------TCCAAT------GTGC-CCAT---A--TAA-GCCCTGG-TGAG-G-GC-A-TTGGGGT-G-AAT-CCCCA------TG-TG--TT-A--T---A------AAA-TAGA----------CCCCCTCCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATCA-TGCCTT-GC-AAATT-GG--A-TAGC------G-TCAATTGGT-G-TATGG-T-ATCT------T--AA---TTTCG-TTAATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAG-C------T-----AT-CG-CA-T--G---GGCAA-T-----ATTT-T---A------A--T--A---AA-T-TT-T-Cag
gi|13 : CC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TTCCTG--TT---A-TGCC------------------TCCAATCAGAGTGTGC-CCAT---A--TAA-GCCCTGG-TAAG-G-GC-A-TTGGGGT-G-AAT-CCCCT------AG-TG--TT-A--T---A------AAA-TAAATCTC---CCTCCCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTA-GC-AATTT-GG--A-TATC------G-TCATTTGAT-T-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TTAATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TATAG-A------TG----AT-GT-C--T--A------------------------A---AG-G--T--A-C-AA-T-TT-T-CCTTG------AC-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----TG-A-TTTA-T-C-AAA--TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTT--TA-AC----CACGT-ATA-T---T-TGT---TG---T--AG---AAA--T--TTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGATAG-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTCTT-TAAA--AAAAA--AA-----G-GGG---GG-------------------G-GTT-T-----CCG--CTT--G--CTA--T-CTGAA-CATA--AGATCC-AGTG-CG-T-A----CAtcgaattaacaa
gi|19 : gCC--AG-A----GACA--A-T-GAGT-C-TCGAGACT-CCGCT---------------------------------CTAGT------GTAC-CCAT---GGCTAA-GCCCTGG-TG-G-G-GT-A---------A-AAT-GCCCT------AG-TG--TT-A--T---A------G---CAGA----------CCACCTTCCCTCTC-AGTAGG-------------------------C--TGCATGC-AAAACA-TGTCTT-GC-AATTT-GG--A-TACATATATCG-TCAATTCGT-G-TATGG-T-ATCG------T--AA---TTTCATTTAGTGG--TAATGAA-TATCCTT---TCTTTGC--TCTAA-A------TA----AT-AT-T--T--G---AATGA-T-----GTCT-A---A---AG-A--T--
gi|16 : gttaatgtgttaacaatataaatattttcatagttttacttgcttttctgatatccgaaagacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacttgatgttttatcgtgtcgcacgatcagaagGGT-G-AAT-CCCCT------AG-TG--TT-AAAT---A------A---GAGACC-C---TA----CCTTCCCCCTC-AGTATGTTCTC----C---TAG--AAAGA-TC--TGCATGT-AAATTA-TACCTT-GC-AATTT-GG--A-TATC------G-TCAATTGGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TTAATGG--TAATAAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AA-CTAT--A---GATGA-T-----ATCT-A---A---AG-G--T--A-C-AA-T-TT-T-CCTTG------AT-AATCT-CA-TTT-------AG-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----TGAA-TATA-G-ATAAA--TA---TATTGA-T---ATA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGT-ATA-T---T-TGT---CG---T--AG---AAG--T--TTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----AAATAT---A--A--CC-ACACCTC---TAAA--AAAAGCTGAGAG-GG-GGG---GG-------------------G-GGGTT-----CCG--AGG--G--AAA--T-ATGAA-AATA--AAATCA-AGTC-CG-A-A----
gi|17 : GT-G-AAT-CCC-T------AG-TG--TT-AA-T---A------G---TAGA------------CCCCTCCTCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGTCTT-GC-AATTT-GG--A-T-TC------G-TCAATTCGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTCCA-TTAATGGTA--AGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AA-C--C--A---GATGA-T-----ATCT-A---A---AG-A--T--A-T-AG-T-TT-T-CCTTG------AC-AAGCT-CG-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----TG-A-TATA-T-T-AAA--GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--AA-AC----CACGT-ATA-T---T-TGC---TGTACG--GG---AAG--T--TTT-A--TA--ACC-----TA-T-AA-TGGCTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ATCCCT----TAAA---------------GG-GGA---GG-------------------G-GGG-T-----CCA--ATG--A--AAA--T-GTAAA-ATTA--AAATCC-AATa
gi|3 : AGAGC-C---ATTTCCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT-AA-TTA-TGC-TA-GC-AATGT-G---A-TATC------G-TCAATT---------GA----------------AA---TTTCAATTATTGGTA--AGGA--TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----AC-AAAC--T--A---GATAACT-----AT-T-CTCAA---AG-A--TTAA-CCAA-T-TT-C-ACTTG------AC-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---A--TGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAGT---CG-ACTATA-T-CACAATCAT---TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT--TA-TAAAT-TGT---TGT-C---AA---AGG--T--TTT-C--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC----------------AAGGG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAA--T-CTGAA-AATA--AATTCCGAGTT-CG-A-A----CACGT---A--A------GGGTGGTAA---G-------TCTCCACTAT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTTCTTCC----AC---CTATAT---TAG--T-CAAGCT-TCCACCATTTG----------------------G-----CG-GGAGAA----------GTTTC-A--CC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG----------GGAGAGT-CTCGACTTATATATA---ACACttaag
gi|2 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccggaataagtaatttttttgctgtgattcttacattatggagaaaatatacaggccaaatgttgttgttgtttggcgtctttaattttgtttacctaaacacaatatcgaagaattgacactcttatcagtggatttgcttgtgtggtttttttttttcaaccagatgtatgacgggtaaatgtaggtgttaaacaataaaaaaactatcttcctattttccgaaactcagaacctcaattatgaagtgccacaactacaaccaatctaaaatgatcattaaaggatatatgaggtctttttccatggttcgcaccaatttcaggtttcagcttaaagtgggggaggggggtctaatccccaagaggcaatcaaatcttggaaactcccgctgcttaaatgcccacacggccccccccacatccaaagtgcccatatgtacagccaccagtgtaccaattaAGAGC-C---ATTTCCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT-AA-TTA-TGC-TA-GC-AATGT-G---A-TATC------G-TCAATT---------GA----------------AA---TTTCAATTATTGGTA--AGGA--TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----AC-AAAC--T--A---GATAACT-----AT-T-CTCAA---AG-A--TTAA-CCAA-T-TT-C-ACTTG------AC-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---A--TGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAGT---CG-ACTATA-T-CACAATCAT---TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT--TA-TAAAT-TGT---TGT-C---AA---AGG--T--TTT-C--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC----------------AAGGG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAA--T-CTGAA-AATA--AATTCCGAGTT-CG-A-A----CACGT---A--A------GGGTGGTAA---G-------TCTCCACTAT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTTCTTCC----AC---CTATAT---TAG--T-CAAGCT-TCCACCATTTG----------------------G-----CG-GGAGAA----------GTTTC-A--CC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG----------GGAGAGT-CTCGACTTATATATA---ACACcg
gi|24 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccggaataagtaatttttttgctgtgattcttacattatggagaaaatatacaggccaaatgttgttgttgtttggcgtctttaattttgtttacctaaacacaatatcgaagaattgacactcttatcagtggatttgcttgtgtggtttttttttttcaaccagatgtatgacgggtaaatgtaggtgttaaacaataaaaaaactatcttcctattttccgaaactcagaacctcaattatgaagtgccacaactacaaccaatctaaaatgatcattaaaggatatatgaggtctttttccatggttcgcaccaatttcaggtttcagcttaaagtgggggaggggggtctaatccccaagaggcaatcaaatcttggaaactcccgctgcttaaatgcccacacggccccccccacatccaaagtgcccatatgtacagccaccagtgtaccaattaTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------------------------TGA-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TTATTGGTA--AGGAA-TATTCTT---TCTT-----------A------TT----AC-AA-C-----A---AATGA-T-----ATCA-A---A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CCTTG------AC-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----TG-A-TATA-T-C-AAA--GA---TATTTA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-AC----CACGT-ATA-T---T-TGT---TG---T--AG---AAG--T--TTT-C--TT--A-C-----TA-C----TGGTTAG-G----GAATAT---A--G--CC-ACCCCTC---Tcg
gi|34 : aTTCA-TTAT-GGTA--AGAAA-TAATCTT---TCAATGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GATTA-T-----ATCT-A---A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-TCTTGACAAATGC-AAGCT-TA-TTC-------AG-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---A--TTACT---GT-TAAAA-GA------AG----TA-A-TATA-t
gi|26 : TTTGCG-TTTAA-A------TA----TT-AA-C--T--A--------------------T---A---AG-A--T--G-A-AA-T-TT-TTCCTTG------AC-AAGCT-TAATTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--CGGCT---GA--AAAA-GA------AG----TG-A-TATA-T-C-AAA--GA---TACTGA-T---AAATTTC-T-C-TTC--TA-AC----CACGT-ATA----------------------------------TTT-C--TT--A-C--------T-AA-T-GTTAGTG----AAATAT---A--A---C-ACCCCTCTT-TAAA--AAAAA--AAAGG-TG-GGG---GG-------------------G-GGT-C-----CCG--ATG--G--AAA--T-CTGAA-AATA--AAATCC-AGTT-CC-G-A----CAC
gi|28 : tct--TTTAA-A-------A----A--AA----T--A---AATAA-------GTGC-A---A---AG-A--A--A-C-GA-T------CCTTA------AC-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---A--CGACT---GA-TAAAA-GA------A
gi|18 : atctcaattcagtgtttcattattggtcaggaataatatttgcattgaataatatatgatattaaagatataattcacttcgttttcctctaaagatacattttaagttaA----AT-AG-C--A--A---GATGA-T-----ATCTAC---ATGTAA-A--TTAA-C-AA-T-TT-T-TCTTG------AC-AAACT-GA-TTC-------AA-T----AGT---A-GT-TG--T---A--TGACT---GT-TGAAT-AA------AG----TG-A-TCTG-TTCATTT--GA---TAT--A-T---AAA-A----------------CCG-G---GT-ATA-T---T-TGA---TGTACG--GT---AAA--T--TTT-A--TT--A-CATG--TA-TTGA-TGGTTAA-T----AAATAT---A--A--TT-ATTCCTC---TAAA-----------GGG-TG-TGT---GT-------------------C-GTT-T-----TCG--GTG--G--AAA--T-CTGAA-AATA--AAATCC-AGTT-TG-A-G----CACAC---A--A------AGG-GG-AA---A-------CCT-CATAAT-GGTAG-------TT-A----------GGGGG---GAAA-TCT--T----ACC--AAATACCGGTAG--C-CAAACT-TCCCTC---TGTTGAAATATCACTATTATGACAGTCTTCTGTGGGG------------AGTCT-C--AC-TAT-----------------TG----------GGA-AGT-ATT-AC---
gi|29 : -TT-C-AGT---G-GT-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG----CG-A-TATA-T-CA-----GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--TA-ACCA----CGT-ACA-T---T-TGT---TGTACG--GG---AAG--T--TTT-A--TT--A-CCCCCGTACT-AA-TAGTTAA-G----AAATAT---A--A--CC-ACCTCTT---TAAA---------------GG-GGG---GA-------------------G-GGG-T-----CCG--TCG--G--AAA--T-TTGAA-AATA--AAATCC-AGCC-TG-A-G----TACGT---A--A------c
gi|25 : TA-T-CAAA---GA---CATAGA-C---GAA-CTC-G-C-ATC--TA-AC-A---ACGT-ATA-T---A-TGT---TGTGCA--GA---AAG--T--TTT-A--TT--A-C-----TA--------------G----GAATG-------------ACCCCTT---TAA-----------------G-GGG---GT-------------------G-ACT-T-----CCG--GTG-------A--T-CTGAA-TATC--AAATCC-AGTC-CG-A-G----CACAT---A--A------GGG-GG-AA---G-------CCC-CACTAT-GGTAC-------TT-A----------TGGGG---GAAA-TCT--C----A----CTATA----TAG--C-CAGTCT-TC--------------------------------TTTT------GTAA----------AGTCT-C--AC-TAT-----------------GG----------GGA-AGT-CTC-AC---TATATA---ACAC
gi|23 : ---TATTGA-T---ATA-ATT-G-C-AAT--CA-ACCA-----AT-ATA-T---G-TAT---TGT------A---GGG--GGGTTT-C------A-C-----CACT-AG-TGATAAG-G----GAATAT---A--G--TA-ATTCCTC---TAAG--Aggtatca
gi|27 : ---AAA-ATT-TGC-ATC--CA-ACCA----CGT-AGG-T---G-CGT---TGTACG--GG---AAG--T--TTC--------G-C-----TA-C-AAGTGGTTAG-G----GGATAT---G--A--CT-ACCCGCC-----------------AGGGTGG-TGG---TG-------------------G-TGG-TGGTGACCG---TGTTA--AAA-----TGAG-GACA--GACTCC-AA---AG-A-AAG--CACGT---AGGA------GGG-GG-GG---GGCAGGGCGCT-AACTAA-GGTAG-------TT-T----------GGGAG---G-GG-TT---------CC--CTATA----TAG--C-CAGACC-CCCCCgggacgacttactcaaaacctagaacctgctcgtagagggcgggagaagcctcactatagtttggaggaagtctcactatatattgccagacatccgtggagggggcaccattcagccagtctttcgggggaagtctcgttatataacacaggat
gi|33 : tg-G----GAAGAT---AGGA--CT-ATCCCTT---CA--------------GG-AG-GTA---GG-------------------T-GGT-T-----CCA--ATG--GG-AAA--TCTTGAA-AATA--AA-TCC-AGTC-CG-ATA----GATGT---A--A--------G-GT-AC---G-------TCG-CACTATCGGTGG-------TT-G----------GGG
gi|47 : -G----GAATAG---G--G--CT-ATCCCTT---CA--------------GG-GG-TAG---GT-------------------G-GGT-T-----CCA--ATG--G--AAA--T-CTGAA-AATA--AAATCC-tgtgtgtgtccacttataatacggccgccttctgggg
gi|14 : A--AAATT--ATTC-CG-G-A----AACGT---A--ACCCAAGGGG-GG-AA---A-------CCT-CACTAT-A--------------A----------ATGGG---GAAG-ACT--T----GCT--ATATA----
gi|15 : aagtgtcac-A----CATGT---AT-A------GGG-GG-AA---G-------CCG-CACTAT-A--------------A----------AGGGG---GAAG-ACT--T----ACT--ATATA----tgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|30 : ggtctcgc----CACATCA-A--A------GGG-GG-AA---G-------ATG-GATTAT-AGTGA-------TA-ATTTCGATGCGGGGGG---GAAG-TCTT-C----ACT----ATA----TAG--CGCAA--------------------------------------CCTTCCG-GGG--A----------AGTTTCA--AC-TATG----------------GG----------GGA-AGT-CTC-AC---Taggttaagtttccggaataatgtgtttagcattgtctacatgtttgatgaaatacaggcacaggtttttgttgttgccgcgtttggggttttctttgcaatgttttaatttagtttacctacacacaatgtccgaagaccgatttatcagtgggtatgtttttttttcaatcagtgcatggggttaatgtgataacaatatttttacttgtctttttgtttatccgaaacaaactcaatatgaagtgtcacaatcaatgatcattaaggaatctgagattttatcatgtcgcgcgatcagagttcagcttaaaaggggaggggcgcgtggatcaatcacagaggcaatgggtcaggagactccgctgttatacctcctctgtgttcatggctaag
gi|1 : --A------GGG-GG-AA---G-------CCT-CACT---------------TTAA----------AGGGG---GAAG------A----ACTGGCTATA----TAG--G-AGAACTCTCCCCC---acccccccttgggttcagttaccggaataattaattttttgcttgatctacatcatgtttg
gi|23 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttc------GGG-AG-AA---G-------CCT-CACTAT-AGT---------TT-------------GGAG---GAAG-TCT--C----ACT--ATATA----TTG--C-CAGACA-T--CCG---TG----------------------G-----AG-GGGGCACCATTCAGCCAGTCT-----T-TCG-----------------GG----------GGA-AGT-CTC-GT---TATATA---ACACgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|37 : tattgatataattgcaatcaaccaatatatgtattgtaggggggtttcaccactagtgataagggaatatagtaattcctctaagagggacgacttactcaaaacctagaacctgctcgtagagggc-GG-AA---G-------TTT-TACTAT-A-TAGCCATTACTT-A----------GGAAG---GAAG-TCT--TCAAGAAT--ATATA----TAG--C-CA-GC------------------------------------CTTTCCA-TGGAAA----------AGTCT-C--AC-TAC-----------------AG----------GGG-AAT-TTCAAC---TATACA---ACACaggat
gi|32 : aT-A----------GGAAG---GAAG-TCT--C----AAT--ATATA----TATAGC-CAGCCT-TCCcgca
gi|40 : tccat----------GGGGT---AAAG-TCT--C----A----CTATA----TAG--C-C-AGC---CCTTC---GGGGAAGCT---------------GTCGTCCA-GGGAAA----------AGTCT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctttatattg
gi|41 : agggGGGG---GGAG-TCT--C----ACT--ATATA-----GG--C-CAGTCT-TCCCCT---Tggaagatgggcacttaatcccaatcc
gi|40 : CTTCCG-GGGTAA----------AGTCT-C--AC-TAT-----------------tagtagtaggtcccccctagggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|38 : agggagacttttccctggacgacagcttccccgaagggctggctatTTCCG-GGAGAA-----------GTCT-T--ATATAT-----------------GG----------GGA-AGG-CTC-AC---C-TATA---ACACatgggcacttaatcccaatcc
gi|14 : aggaagggtttcgctttagaggctagagctttcagaggaaggctgacgctagagccacggtaG-GGGGGA----------AACCT-C--AC-TATAAAT-------------GG----------GGA-AGA-CTT-GC---TATATAGTGACACcg
gi|1 : aa-GGGGGA----------AGTCT-C--AC-TAT-----------------GGTGGTTAGGGGGGA-AGT-CTC-AC---AATATA---GCttgggttacgtttccggaataatttttgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|15 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaa-GGGGGA----------AGCCG-C--AC-TATAAAG-------------GG----------GGA-AGA-CTT-AC---TATATA---GCcaagcttccc
gi|43 : ggtctcCT-C--AC-TAT-----------------GG----------GGA-AACACTCGAC---TATATA---tatacatgtaggttaagtttccggaataatgtgtttagcattgtctacatgtttgatgaaatacaggcacaggtttttgttgttgccgcgtttggggttttctttgcaatgttttaatttagtttacctacacacaatgtccgaagaccgatttatcagtgggtatgtttttttttcaatcagtgcatggggttaatgtgataacaatatttttacttgtctttttgtttatccgaaacaaactcaatatgaagtgtcacaatcaatgatcattaaggaatctgagattttatcatgtcgcgcgatcagagttcagcttaaaaggggaggggcgcgtggatcaatcacagaggcaatgggtcaggagactccgctgttatacctcctctgtgttcatggctaag
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): TTGCTGATTCTTCTGTTTGTTATCCTCTCAGTAAGTGCGCATGATATTATGCTCTGTTGAGGGAGCATTAGGGGTGATATGCGCTAGTGTTTAGTAAAATGAGACCCTCCCATACCCCTTC
Unaligned ( gi|42 ): GAGGAAGGCTCACTAATAGGGCCACTGAGGAAGCACCACTTAGCAAGACTTTCCCGGGGGGGTCCCATTATGGAAGAAAGTCTTCA
Unaligned ( gi|44 ): TTTCAGCCTAAATAAAGAAGGGGGAGGGCAAGCCGCCGAAATGATGAAATTGACCATTGCAATGCCCCTAGATCCGC
Unaligned ( gi|48 ): CCCTTTGGGTTAAGTTTCCGGAATAATAGTTTTTGCTTTGA
Unaligned ( gi|49 ): CTCATTATGGGGAAAGGCTTACTCTACAACATCGGCA
Alignments
lowQualScore : 11 555555555555555 111111111 1111 222222222222222 111111111111 11111111111 55555555555555555555555555555 2222 111111111 11111111 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222 11 11 111 22222222222222222222222 11111111111111 333333333333333333 11 111111111 33333333333333333333333333333333333333333 111111 222222 22222222222 2222222 333333333 2222222222222 4444444444444444444444444444444 1111111111111111111 11111 1111111111111 1111111111 1111 777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 44444444444444444 1 111
lowQualScore : 6 6 3 33 88 44 7 3 3 0 44 7777 555555555555555 3 3 3 777777777 1111 3 3 7777 555 66 44 2 3 111111111111111 44 888 3 3 77777 777 2 2 555555555555 5 33 66666666666 2 33 33 2 5 99999999999999999999999999999 5555 5 5555 33 2 66 7 0000 444444444 2 2 22222222 5555 666666 0 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 33 666666666666666666 2 4 2 66 444 2 2 2 4 5555 2 88 2 777777 444 5 5 2 5555 2 11 1 00 2 2 444 8888 2 99999999999999999999999 33 33 55555555555555 99999 5 66666 2 77 4 4444 22 2 6 4 2 4 22 777 2 333333333333333333 2 666666 22 2 4 11 44444 4 2 777777 33 2 111111111 2 333 2 2 2 9999999 11111111111111111111111111111111111111111 3 4 4444 333 33 2 2 66 4 2 2 2 2 22 2 666666 2 1 33 2 2 2 666666 33 333 4 2 555 22 2 333 66 3 000000 5555 7 66 22 333 3333 777 3 3 1 666 333 1 55 22 66 1 1 1 1 1 4444 555555 1 2 2 6666666 2 4 2 333 2 4 66 333 33 888 4 2 111111 33 4 2 7 5555 2 33333333333 2 777 2 2 2 77 22 2 9999999 2 777 2 333 444444444 22 55 2 6666666666666 1 8888 666 22 22 3 7777777777777777777777777777777 2 4 333 5555555555555555555 2 2 11111 22 22 77 44 2 22 22 3 2 2 2 22 777 2 666666 4 4 333 666666 6 2 7777777777777 2 0000000000 666 3 77 4444 22 7777 9999 2 2 44 44 666666666666666666666666666666666666666 6666666666666 8 5 00000000000000000 44 6 6 3 3 111
lowQualScore : . . . .. .. .. . . . . .. .... ............... . . . ......... .... . . .... ... .. .. . . ............... .. ... . . ..... ... . . ............ . .. ........... . .. .. . . ............................. .... . .... .. . .. . .... ......... . . ........ .... ...... . . .......................................................... .. .................. . . . .. ... . . . . .... . .. . ...... ... . . . .... . .. . .. . . ... .... . ....................... .. .. .............. ..... . ..... . .. . .... .. . . . . . .. ... . .................. . ...... .. . . .. ..... . . ...... .. . ......... . ... . . . ....... ......................................... . . .... ... .. . . .. . . . . . .. . ...... . . .. . . . ...... .. ... . . ... .. . ... .. . ...... .... . .. .. ... .... ... . . . ... ... . .. .. .. . . . . . .... ...... . . . ....... . . . ... . . .. ... .. ... . . ...... .. . . . .... . ........... . ... . . . .. .. . ....... . ... . ... ......... .. .. . ............. . .... ... .. .. . ............................... . . ... ................... . . ..... .. .. .. .. . .. .. . . . . .. ... . ...... . . ... ...... . . ............. . .......... ... . .. .... .. .... .... . . .. .. ....................................... ............. . . ................. .. . . . . ...
lowQualScore : 7 7 2 55 55 22 0 1 1 8 22 0000 444444444444444 3 3 3 777777777 7777 3 3 1111 888 66 66 1 1 666666666666666 22 555 1 1 77777 333 7 7 333333333333 3 77 55555555555 7 77 77 7 3 55555555555555555555555555555 3333 3 7777 77 5 99 9 0000 222222222 4 4 88888888 6666 444444 9 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 777777777777777777 4 7 4 55 111 4 5 4 7 5555 4 22 7 777777 777 3 3 7 7777 7 00 4 00 7 7 777 9999 9 00000000000000000000000 77 77 44444444444444 33333 0 22222 5 11 2 5555 99 1 3 2 1 4 99 444 1 222222222222222222 1 111111 99 1 2 66 55555 2 2 555555 22 4 111111111 1 666 1 1 1 7777777 22222222222222222222222222222222222222222 3 2 7777 999 11 2 2 11 4 1 1 1 1 99 1 111111 1 7 44 1 2 2 444444 11 777 0 0 777 88 0 555 88 6 555555 4444 0 55 44 000 7777 222 5 5 7 222 000 7 99 44 88 8 8 8 9 9 0000 555555 9 0 0 5555555 1 2 1 777 1 2 11 999 11 333 4 2 444444 22 7 4 1 0000 2 22222222222 2 444 1 1 1 22 99 1 5555555 1 444 1 777 333333333 99 88 1 2222222222222 9 1111 777 66 66 8 3333333333333333333333333333333 0 0 555 5555555555555555555 0 0 00000 88 88 55 88 0 88 66 8 1 1 0 66 888 4 888888 4 4 999 444444 7 2 1111111111111 0 2222222222 777 8 11 0000 66 6666 8888 2 2 66 44 444444444444444444444444444444444444444 8888888888888 0 3 00000000000000000 22 2 2 1 3 777
consensus : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------AGG-C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTTCATG--TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCTT---------NAA--A--------GG--GG--AGGGGGG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC------------------TC-CA------GT--GTGC-CCAT-A--T--A--A-GCCCTG-GTGAG-G-G--C-A-TT--GGG-T-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------TTA--T--A---A------------T------AGA----CC--CCCCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G-A-T----ATA-TC-AA-A-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-TGT---TGT--C-GG--AAGTTTTC--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-TCT--C----A--CT--ATATA----TA-GC-CAGGCT-TCCCCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTCTCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
Reference ( family-2580 ) : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA-----------CAGG-C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AN-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTTCATG--TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCTT---------NNG--A--------GG--GG--AGGGGGG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC------------------TC-CA------GT--GTGC-CCAT-A--T--A--A-GCCCTG-GTGAG-G-G--C-A-TN--GGG-T-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------TTA--T--A---G------------T------AGA----CC--TCCCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTNGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-N-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G-A-T----ATA-TCAAA-A-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-TGT---TGT--CTGG--AAGTTTTC--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-TCT--C----A--CT--NTATA----TA-GC-CAAGCT-TCCCCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTCTCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
gi|1 : -A----------GGGGG---GAGG-T-T--C----A--CT--ATTTAT---TA-GC--------TC--------A----------------------GCCTTCCG-GGGAA
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaaga-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT----------------TTAA----------AGGGG---GAAG------A----A--CTGGCTATA----TA-GG-AGAACTCTCCCCC---cccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcGAATCA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--TAATA-T-GCCT--CA--T-AACATAATATTGAGAAATAGCAGA-C-ACTAG---T-----TTTATGGCTAGTTG-T----T---CT-TAG--GTATACTCTT---GC--------CTGTTTGTT---A-AT-T-----CAGTT----ACCTGAAA-CCAAAAGT-----CCC----GAAG-AAATGA---T--TG-TTA-CTCCAGCTTG-ATA----------T-----------A---G--TT-GGGTTTTTTCAACCAG-T----G--C-ATG--GGGT-AAT----GTGTT---TA----C-AATTAA-------AAA----TA------TCT----G---------------T-T----------------------------------------CG--AATC-T-C--------------AACGCTCTA-TA-T--GCATAAG-TGTAAACAA-TGGGACAAC-CAATCT-AATATGTATAGTATTTTCA-TA---GA-ATCGT----GA-GGCTTTTTTTCATG--CC-GGCACGAA--TCAGGTTTA---CATGCTT---------TTA--AAAAACAAAGG--GG--GGGAGGG-----CTG------GGA-----TC-A------T-CCCC---G-A----GGCATAG-T-GA-T-T-GGGAGGCT-T-GTTG--TT---A-T-CC------------------TC-C-------GT--GTGC-CCAT-A--T--A--A-GCCCTGAGTAAGCG-G--CCA-TT--GGGGT-G-A-ATTCCCCT-AGCTG-------TTA--T--A---AATAATCGAGGTAT------AAA----TA--TGCCCC--CCCCCTC-AGTAGGTTTTCTGCTC---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GG-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAGTTGGT-G-TATGG-T-AT-----------AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-CATTCTT---T----GT--TTTAA-A------TG----TT-AAT--T--A---TA-----G---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G-A-TCGATATA-TCAAA---TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TCC--TA-ACCA--C--GTATA-T---T-TGT---TGT----AG--AAGTTTTC--TT--A-C-----TA----A-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-AACCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---G--------------------------------------TG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATGA-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-TCT--C----A--C----AATA----TA-GC-CAAGCT-TCCCgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|10 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccG--G--------GG--GGCCAGGCGGGTCAGCCGT------GGAA----TC-A-----AT-CCCC--AGCA----GGCA--A-TTGTGT-CCTGGGAGCT-TCGCTG--TT---A-TAC-------------------TC-CA------GT--G-GC-CCAT-A--T--A--AAGCCCTG-GTAAG-GCG--C-A-TT--GGG-T-G-A-AT-CCCCTCAG-GT-------TTA--T--ACAAA------------T------AGA----CC--CCCCCC--CCCCCCC-AGTAAGTTCTC----C---TAGGAAA-GAAT--CTGCATGT-AAATCA-TGCCTT-GC-AATTT-AG--A-TA------TCGCTCAATTGGT-GTTATGGTT-ATCA------T--TAGTCTTTC-ATT-ACCATCG--TGAGGAA-CATTCTT---TACTTGC--TTTAA-A------TATCCTAC-AAC--T--A---CACACTTGTGCA-TA-TC-T-A-A---AGCG--T--A--C-AA-TCTT-T-CC----TTGA------C-CA----CA-TTCTCCATATAA-TT-CAAGCTTAA-GA-TA--ACATG--TGACCTCGAA-TAAAACGACAC---AGTCT-G-ACT----ATACTCCAC-A-CATAGTATTGACT---AAA-ATCTT-C-CTCCTTACACCA--CA-ATACA-T---TCTGTCCCTGCTACCAGACAAGTTTTCCTTC--A-C-----T--T-AA-TGGTTAA-G------ATAT---A--A--CC-ACCCCTCAAGT-----AAACCGAGTGA------TG---GG-GC-GGGCCTGGCGCCTCGACCCGCTACGCCG-GCG-TT----CCGCGATG--G--AAATCTTCGAA-AA--AACTAAATCC-AGTCTCGTG-A--CAC
gi|11 : caaagggAA-T-A-TTTTTT-GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTT--GA--T-GAAATGC---------------AG-C-AC-CGCG-T-----TT----GTT-GTTG-T----TGCTTT-TGG--ATTTCCT-TA---GC-A------CTGTTT--G---A-AT-T-----TAGTG---TATTC-AAA-TACAATAC-----CC-----GAAC-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAC--TG-G-A----------T--------------------------------AC---------G--T--TG--GGGTTAAT----GTGTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTCTATAGTTTTACTTGCCTT-T-T------T--------------------TGAAATACATGTACG--AAAC-A-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-TAA-T---GCAAC-CAATCT-AA-ATT------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-TG--TTTTATCATA--TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GTTT---------AAA--A--------GG--GG--AAGGGGG-----CGT------G-A-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-GGGAGACC-TCGCTG--TT---A-TGTT------------------TC-CA------GT--GTGT-CCAT-G--GCAA--A-GCCCTG-GTGGG-A-A--C-A-TT--GGT-T-G-A-AT-GTCCA-AG-TG-------TTA--T--A---G------------T------AGA----CT------ACGGCCCCCTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATTA-TGTCTT-GC-GATTT-GG--A-TA------TCG-TCGATTCGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TCGG--CAAGAAA-TACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------ccacgtctaaagtcggaactctgacta
gi|12 : ggcttccgg--A--------AG--GG--GGGGGGG-----AGC------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AGTA----CGCA--A-T-GGGT-T--GCATGCT-TC-CTA--CT---A-TGCCA-----------------TC-CA-------T--GTGC-C--T-A--T--A--A--CCCTG-CGGAG------C-A-TT--AGG-TTGCA-AT-CCCCT-AG-TACGTGTGATTA--A--A---A------------T------AGA----CC--CCC----TCCCCCTC-GATA--TTCTC----CCATTAA--TA-AA-T--A-GCATGT-AAATAAATACCTT-GC-AAAT--GG--A-TA------TCG-TAAATTAGT-G-TGTG----ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATG---TAATCAA-TATTCTTATATCTATGC--TT--A-A------TAT---AT-AAC--T--AATGGA----TG---A-TA-TC-T-A-C---AT-G--T--A--C-AAGT-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTT-------AGCTT-C-AGT---ATGA-TG--A---ACATGACT----A-TAAAG-AATGTG--AG--T-A-A-T----AT--TCAAA-A------TATTGA-T---CAA-AAC-T----TC--TA-AC-A--C-TTTATA-T---T-TGT---TGT--AGAG--AATTTTGC--TT--A-C-----TA---AA-T-GTTAG-G----AAATAT---A--AACCT-ACCTCTT---T-----TAA------AT------AA---AA-TA-GGA---GG-------------------G-AGG-T-----CCG--ATG--G--AAATTT--GAAGAA--TA--AAATCC-AGTC-C--A-A--CACCT---A-G------GGA-GG-AA---AT------CTCCACT-A--AGT---------TT-A----------GGGGA---TCAT-TTC--C----A--CT---TATA----TACGC---AGCC-TCC-------G----------------------G------G-GGGGGG----------GCTATCA-CTTAT-----------------CG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACA
gi|13 : aaCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TTCCTG--TT---A-TGCC------------------TC-CAATCAGAGT--GTGC-CCAT-A--T--A--A-GCCCTG-GTAAG-G-G--C-A-TT--GGGGT-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------TTA--T--A---AAA----------T------AAATCTCCC--TCCCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATTA-TGCCTA-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCATTTGAT-T-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC----TA-----------------------T--A---GA----TG---A-TG-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G-A-T----TTA-TC-AA-A-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTT--TA-AC----CACGTATA-T---T-TGT---TG----TAG--AAATTTTC--TT--A-C--------T-AA-TGGATAG-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTCTT-T-----AAA------AA------AA---AA-AG-GGG---GG-------------------G-GTT-T-----CCG--CTT--G--CTATCT--GAA-CA--TA--AGATCC-AGTG-CG-T-A--CA
gi|14 : gA--AAATT--ATTC-CG-G-A--AACGT---A-ACCCAAGGGG-GG-AA---AC------CT-CACT-AT-A--------------A----------ATGGG---GAAG-ACT--T----G--CT--ATATA----
gi|14 : aagtgtcacAA-T-AATTTTT--GCATTGATC--TG--CATGA-TTGTTT--GA--T-GGAATAC--------------AGG-C-AC-AG---T-----TTTT--GTT-GTTA-T----T---TT-GGGTTGTTTTTT-TTTTTGC-AAAGAATCGGTCT--TCGGACAT-TGTGTATAGGTAAATAGGT-AAA-CTAAAT-T-------------AAG-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------T------------------TT-T--TTTTTTCATTCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAATTAATGTGTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG------AT---CG-TAAAGGA-ATC-TTTTAAA-AG--TTGTATCATG--TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCTT---------GAA--A--------GG-------CAGTGG-----CGTAACCAGGGACTAACTC-AAGTGGAT-GCTT--AG-T----GGCA--AGT-G-GT-T-TGGGGACtgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|15 : aagtgtcactatatagcaagtcttccccatttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccgg-A--CATGT---ATA------GGG-GG-AA---GC------CG-CACT-AT-A--------------A----------AGGGG---GAAG-ACT--T----A--CT--ATATA----
gi|15 : ggtctcgcGAATAA-T-G-TGTTTA-GCATTG-TC--TA--CAT-----GTTT--GA--T-GAAATAC--------------AGG-C-AC-AGGTTT-----TT----GTT-GTTG-CCGCGT---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-ACA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-G----------T-----------AT--G--TT-T--TTTTTTCAATCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAAT----GTGAT---AA----C-AAT-ATTTTT---ACT----TG------TCTTTTTG---------------T-T------TAT------------------C------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG------AT---CA-TTAAGGA-ATC-T----GA-GA--TTTTATCATG--TC-G-CGCGA---TCAGAGTT----CA-GCTT---------AAA--A--------GG--GG--AGGGGCG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT--CAC--AG-A----GGCA--A-T-GGGT-C-AGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TACC------------------TC-CT------CT--GTGT-TCAT-GGCT--A--A-Gaggttaagtttccggaataatgtgtttagcattgtctacatgtttgatgaaatacaggcacaggtttttgttgttgccgcgtttggggttttctttgcaatgttttaatttagtttacctacacacaatgtccgaagaccgatttatcagtgggtatgtttttttttcaatcagtgcatggggttaatgtgataacaatatttttacttgtctttttgtttatccgaaacaaactcaatatgaagtgtcacaatcaatgatcattaaggaatctgagattttatcatgtcgcgcgatcagagttcagcttaaaaggggaggggcgcgtggatcaatcacagaggcaatgggtcaggagactccgctgttatacctcctctgtgttcatggctaag
gi|16 : ggtctcgctatatagtaagtcttccccctttatagtgcggcttccccctatacatgtaggttaagtttccgGG-T-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------TTAAAT--A---A------------G------AGA----CC---CTACCTTCCCCCTC-AGTATGTTCTC----C---TAG--AAAGA-T--CTGCATGT-AAATTA-TACCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAATAAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AACTAT--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------T-AATCT-CA-TTT-------AG-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GAA-T----ATA-GATAA-A-TA---TATTGA-T---ATA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-T---T-TGT---CG----TAG--AAGTTTTC--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----AAATAT---A--A--CC-ACACCTC---T-----AAA------AAAAGCTGAG---AG-GG-GGG---GG-------------------G-GGGTT-----CCG--AGG--G--AAATAT--GAA-AA--TA--AAATCA-AGTC-CG-A-A--
gi|17 : G-T-G-A-AT-CCC-T-AG-TG-------TTAA-T--A---G------------T------AGA----CC--CC-----TCCTCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATTA-TGTCTT-GC-AATTT-GG--A-T-------TCG-TCAATTCGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTCC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AAC--C--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--T-AG-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CG-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G-A-T----ATA-TT-AA-A-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--AA-AC----CACGTATA-T---T-TGC---TGTA-CGGG--AAGTTTTA--TA--ACC-----TA-T-AA-TGGCTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ATCCCT----T-----AAA----------------------GG-GGA---GG-------------------G-GGG-T-----CCA--ATG--A--AAATGT--AAA-AT--TA--AAATCC-AATa
gi|18 : A----AT-AGC--A--A---GA----TG---A-TA-TC-T-ACATGTAA-A--TTAA--C-AA-T-TT-T-TC----TTGA------C-AAACT-GA-TTC-------AA-T----AGT---A-GT-TG--T---A--TGACT---GT-TGAAT-AA------AG--T-G-A-T----CTG-TT------CA---T-TTGA-T---A---------T-ATA--AA-ACCG--G--GTATA-T---T-TGA---TGT--ACGGT-AAATTTTA--TT--A-CATG--TA-TTGA-TGGTTAA-T----AAATAT---A--A--TT-ATTCCTC---T-----AAA---------------G---GG-TG-TGT---GT-------------------C-GTT-T-----TCG--GTG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-TG-A-G--CACAC---A-A------AGG-GG-AA---AC------CT-CATA-AT-GGTAG-------TT-A----------GGGGG---GAAA-TCT--T----A--CC--AAATACCGGTA-GC-CAAACT-TCCCTC---TGTTGAAATATCACTATTATGACAGTCTTCTGTGGGG------------AGTCTCA-C-TAT-----------------TG--GG-A-AGT-ATT-AC---ttaag
gi|19 : GTTAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AT-------AAA----TA------TTTTCATAGTTTTACTTGCTT--T-TCTGATAT--------------------C------------CG--AAAG-A-C--------------AAC-CTCAA-T---------------------A-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------------A-TAGAGGA-ACT-T----GA-TG--TTTTATCGTG--TC-G-CACGA---TCAGc
gi|19 : CC--AG-A----GACA--A-T-GAGT-C-TCGAGACT-CCGCT---------------------------------C-TA------GT--GTAC-CCAT-GGCT--A--A-GCCCTG-GTG-G-G-G--T-A-----------A-A-AT-GCCCT-AG-TG-------TTA--T--A---G------------C------AGA----CC-----ACCTTCCCTCTC-AGTAGG---------------------------CTGCATGC-AAAACA-TGTCTT-GC-AATTT-GG--A-TACATATATCG-TCAATTCGT-G-TATGG-T-ATCG------T--AA---TTTC-ATTTA--GTGG--TAATGAA-TATCCTT---TCTTTGC--TCTAA-A------TA----AT-ATT--T--G---AA----TG---A-TG-TC-T-A-A---AG-A--T--aagccagagacaatgagtctcgagactccgctctagtgtacccatggctaagccctggtggggtaaaatgccctagtgttatagcagaccaccttccctctcagtaggctgcatgcaaaacatgtcttgcaatttggatacatatatcgtcaattcgtgtatggtatcgtaatttcatttagtggtaatgaatatcctttctttgctctaaataatatttgaatgatgtctaaagat
gi|2 : gttaatgtgttaacaatataaatattttcatagttttacttgcttttctgatatccgaaagacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacttgatgttttatcgtgtcgcacgatcagaagGAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--G-AAAATA-TA-----------CAGG-C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT--------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT------C-----GAAGAAT-TGACACT--C--TTA-T--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTT-T--TTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAATGTAGGTGTTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GGTCTTTTTCCATGGTTC-G-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCTT---------AAAGTG--------GG--GG--AGGGGGG----------------------TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCCCACACGGCCCCCCCCACATC-CA------AA--GTGC-CCAT-A--T----------------------G--T-A-CA--G------------CCACC-AG-TG-------TAC--C--A---A------------TTA----AGAG---CCATTTCCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT--AATTA-TG-CTA-GC-AATGT--G--A-TA------TCG-TCAATTGA-------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGG-A-TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----ACAAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-AT-T--AACC-AA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---A--TGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TCG-ACT----ATA-TCACA-ATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-TGT---TGT--C-AA--AGGTTTTC--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------------A------AG---GG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTTCTTCC----A--C---CTATAT---TA-GT-CAAGCT-TCCACCATTTG----------------------GC-------GGGAGA----------AGTTTCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|20 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg------TTTTGATA---------------T-----------------------------C------------CG--AAAC-A-C--------------AAC-CTTAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T---ACAAC-CAATTT-AA-ATT------AC---CA-AAAACGA-ATC-T----GA-GG--TTTAT-CATG--TT-G-CGCGA---TCAGGTTT----CG-ACTT---------GAA--A--------TG--TG--ATGGGG------CGT------GGA-----TC-A-----AT-CC---------------A--A-T-GAGT-T-TGGAG---------------------CC------------------TC-CA------GT--TTGC-CCAT-GGTT--A--A-GCCGTG-GTGGA-G-G--T-G-AA--GGG-T-G-G-AT-TCCCT-TA-TG-------TTA--T--A---G------------T------CGA----CC--CCTCCTCTCCCCCAG-AGTAGGTTCTC----C---AAG--AA-GA-T--CTGCGTGT-AAATTA-TGTCTT-CC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTCGT-G-TAcg
gi|21 : tctCCC--AG-ACCATAACA--A-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A-TGCC------------------TC-CA------AT--GTGC-CCAT-A--T--A--A-GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATTG--GGG-T-G-A-AT-CCCCA-TG-TG-------TTA--TAAA---A------------T------AGA---------CCCCCTCCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATCA-TGCCTT-GC-AAATT-GG--A-TA------GCG-TCAATTGGT-G-TATGG-T-ATCT------T--AA---TTTC-GTT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAG-C------T-----AT-CGCA-T--G---GG----CA---A-TA-TT-T-T-A------A--T--A----AA-T-TT-T-CTCGAATTAA------C-AA
gi|22 : TTTTC-ACTGTAATC--TA--CAT-A-T-GTTT--AA--T-GAAATAC--------------AGG-C-AC-AG---T-----TT------------------T---TT-GGG--GTTTTTT-TC---CCCA------TTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTTG--TACGA-AAATTAC-ATGTAAGTACCTTTAAAAAG-AC-CGA---TTAT--TTA-C--CAG--TC-G-A----------T-----------G-------T-G--GTTTTTC-ACCAG-T----GCAT-ATA--GGGTTAAC----GTGTT---TG----T-ATT-AATATTTTTAAATTTTTACTTGCCTCTTGACA---------------T-T----------------------------------------CG--AAGC-A-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-
gi|23 : tagtgaggattcccttgga---TATTGA-T---ATA-ATT-G-C-AAT--CA-ACCA-----ATATA-T---G-TAT---TGT--AGGG--GGGTTTCA--CC--A-C-----TA----G-TGATAAG-G----GAATAT---A--G--TA-ATTCCTC---T-----AA--------------------------------GA-------------------G-GGA--------CG--ACT--T--A---CT--CAA-AACCTA--GAA-CC-TGCT-CG-T-A--GAGG----G-C------GGG-AG-AA---GC------CT-CACT-AT-AGT---------TT-------------GGAG---GAAG-TCT--C----A--CT--ATATA----TT-GC-CAGACA-T--CCG---TG----------------------G-----AG-GGGGCACCATTCAGCCAGTCT---T-TCG-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-GT---TATATAACAC
gi|24 : TA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------T------------------GA-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTT-----------A------TT----AC-AAC-----A---AA----TG---A-TA-TC-A-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G-A-T----ATA-TC-AA-A-GA---TATTTA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-AC----CACGTATA-T---T-TGT---TG----TAG--AAGTTTTC--TT--A-C-----TA-C----TGGTTAG-G----GAATAT---A--G--CC-ACCCCTC---T-----aggat
gi|25 : aTA-TCAAAGA-CA---TA--GA-C---GAA-CTC-G-C-ATC--TA-AC-A---ACGTATA-T---A-TGT---TGTG-CAGA--AAGTTTTA--TT--A-C-----TA--------------G----GAATG-------------ACCCCTT---T-----AA------------------------G-GGG---GT-------------------G-ACT-T-----CCG--GTG-------ATCT--GAA-TA--TC--AAATCC-AGTC-CG-A-G--CACAT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CC-CACT-AT-GGTAC-------TT-A----------TGGGG---GAAA-TCT--C----A--CT----ATA----TA-GC-CAGTCT-TCTT--------------------------------TT------GTAA----------AGTCTCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACACt
gi|26 : TTTGCG-TTTAA-A------TA----TT-AAC--T--A------------------------T-A---AG-A--T--G--A-AA-T-TT-TTCC----TTGA------C-AAGCT-TAATTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--CGGCT---GA--AAAA-GA------AG--T-G-A-T----ATA-TC-AA-A-GA---TACTGA-T---AAATTTC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA----------------------------TTTC--TT--A-C--------T-AA-T-GTTAGTG----AAATAT---A--A---C-ACCCCTC---TTTAAAAAA------AA------AA---AG-GT-GGG---GG-------------------G-GGG-TC----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-CC-G-A--CACggtatca
gi|27 : tct---AAA-ATT-TGC-ATC--CA-ACCA--C--GTAGG-T---G-CGT---TGTA-CGGG--AAGTTTC-------G-C-----TA-C-AAGTGGTTAG-G----GGATAT---G--A--CT-ACCCGCC--------------------------AG---GGTGG-TGG---TG-------------------G-TGG-TGGTGACCG---TGTTA--AAA--T--GAG-GA--CA--GACTCC-AA---AG-A-AAGCACGTAGGA-G------GGG-GG-GG---GCAGGGCGCT-AACT-AA-GGTAG-------TT-T----------GGGAG---GGGT-TCC--C------------TATA----TA-GC-CAGACC-CCCCC
gi|28 : tg---TTTC-ATT-A--TTGG--TCAGGAA-TA----A---TATTTGC--ATTGA-A------TA----AT-A----T-------A----TG---A-TA-T--T-A-A---AG-A--T--A--T-AA-T-T
gi|28 : atctcaattcagtgTTAT--TTAAA-A------AA----AT-AAA--T--A---AG----TG-----------C-A-A---AG-A--A--A--C-GA-T------CC----TTAA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---A--CGACT---GA-TAAAA-GA------Acacttcgttttcctctaaagatacattttaagttatttaaaaaaataaataagtgcaaagaaacgatccttaacaagctcattcaattcagtagttgaacgactgataaaagaa
gi|29 : atctcaattcagtgtttcattattggtcaggaataatatttgcattgaataatatatgatattaaagatataattcacttcgttttcctctaaagatacattttaag-TT-C-AGT---G-GT-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C-G-A-T----ATA-TC----A-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--TA-AC----CACGTACA-T---T-TGT---TGTA-CGGG--AAGTTTTA--TT--A-CCCCCGTACT-AA-TAGTTAA-G----AAATAT---A--A--CC-ACCTCTT---T-----AAA----------------------GG-GGG---GA-------------------G-GGG-T-----CCG--TCG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGCC-TG-A-G--TACGT---A-A------
gi|3 : GAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--G-AAAATA-TA-----------CAGG-C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT--------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT------C-----GAAGAAT-TGACACT--C--TTA-T--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTT-T--TTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAATGTAGGTGTTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GGTCTTTTTCCATGGTTC-G-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCTT---------AAAGTG--------GG--GG--AGGGGGG----------------------TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCCCACACGGCCCCCCCCACATC-CA------AA--GTGC-CCAT-A--T----------------------G--T-A-CA--G------------CCACC-AG-TG-------TAC--C--A---A------------TTA----AGAG---CCATTTCCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT--AATTA-TG-CTA-GC-AATGT--G--A-TA------TCG-TCAATTGA-------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGG-A-TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----ACAAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-AT-T--AACC-AA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---A--TGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TCG-ACT----ATA-TCACA-ATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-TGT---TGT--C-AA--AGGTTTTC--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------------A------AG---GG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTTCTTCC----A--C---CTATAT---TA-GT-CAAGCT-TCCACCATTTG----------------------GC-------GGGAGA----------AGTTTCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|30 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg--CACATCA-A-A------GGG-GG-AA---GA------TG-GATT-AT-AGTGA-------TA-ATTTCGATGCGGGGGG---GAAG-TCTT-C----A--CT----ATA----TA-GCGCAA--------------------------------------CCTTCCG-GGG--A----------AGTTTCAAC-TAT-----------------GG--GGGA-AGT-CTC-AC---cg
gi|30 : GAATAA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--CATCA-T-GTTT--Gacccccccttgggttcagttaccggaataattaattttttgcttgatctacatcatgtttg
gi|31 : agtgagacttcccccatagttgaaacttccccggaaggttgcgctatatagtgaagacttcccccccgcatcgaaattatcactataatccatcttccccctttgatgtgacccccccttgggttcagttaccg-ATG--GGGTTAATTAATGTGTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T---------CAATT--------------AT---CG-TAAAGGA-ATC-T----TA-AG--TTTTATCATG--TC-A-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCTT---------
gi|32 : cT-A----------GGAAG---GAAG-TCT--C----AATAT--ATATA----TA-GC-CAGCCT-TCCga
gi|33 : tccat-G----GAAGAT---AGGA--CT-ATCCCTT---C-----A---------------------GG-AG-GTA---GG-------------------T-GGT-T-----CCA--ATG--GG-AAATCTT-GAA-AA--TA--AA-TCC-AGTC-CG-ATA--GATGT---A-A--------G-GT-AC---GT------CG-CACT-ATCGGTGG-------TT-G----------GGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctttatattg
gi|34 : TTC-ATT-A---TGG--TAAGAAA-TAATCTT---TCAATGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TT---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-TC----TTGACAAATGC-AAGCT-TA-TTC-------AG-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---A--TTACT---GT-TAAAA-GA------AG--T-A-A-T----ATA-tgtgtgtgtccacttataatacggccgccttctgggg
gi|35 : GTT---TACGT-AAT-TA-AATAT---------------G-AC-CAA---T--TAATTAAT--CAA--T----A----------T-----------G---G--TT-T--C-----CAGGCAG-T----G--T-ATG--GGGTTAAT----GGGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----T---------TTCATA---------------T-T------T--------------------
gi|36 : tcttTG--TT---A-T-CC------------------TCTCA------GTAAGTGC-GCATGA--T--ATTATGCTCTG-TTGAG-G-GAGC-A-TTAGGGG-T-G-ATAT-GCGCT-AG-TG-------TT---T--A---G------------TAAAATGAGA----CC--CTCCCATACCCCTTC-ttcttcactctgatatccgaaggacaacctcaa
gi|37 : ttgctgattcttctgtt-GG-AA---GT------TT-TACT-AT-A-TAGCCATTACTT-A----------GGAAG---GAAG-TCT--TCAAGA--AT--ATATA----TA-GC-CA-GC------------------------------------CTTTCCA-TGGAAA----------AGTCTCA-C-TAC-----------------AG--GG-G-AAT-TTCAAC---TATACAACAC
gi|38 : aTTCCG-GGAGAA-----------GTCTTA-TATAT-----------------GG--GG-A-AGG-CTC-AC---C-TATAACACcgca
gi|39 : aggaagggtttcgctttagaggctagagctttcagaggaaggctgacgctagagccacggta--TT-G--TTTTCTCGGCCAG-T----G--C-ATG--GGAT---T----GT-TT---------C-CAT-AA-------AAAG---TA------CCTTCAAA---------------T-T------T-------------------------------------AAACGTAC--------------AAC-GCCAG-TT-T--A---AAG-AGACA-CAA-T---ATAGC-AAATCT-Acg
gi|4 : ttGAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGATC--TA--CATTA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTAATA--------CAGA-C-AC-AG---T-----TT----GTT-CTTG-T----T---TT-GGG--GTTCTCT-TT---GC-G------CTGTTT--T---A-AA-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--TTA-T--CGG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TTAAGGA-ATT-T----GA-GG--ATTTTTCATG--TC-G-CACAA---TCAGGTTTTCAACA-GC-T---------ATG--G--------GG--AG--AGGGGGG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TGCC------------------TC-CA------AT--GTGC-CCAT-A--T--A--A-GCCCTG-ATGAG-G-G--C-A-TG--GGG-T-G-A-AT-CCCCT-TG-TG-------TTA--T--A---C------------T------AGATCC-TC--TCCCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TAG-TCAATTCGT-G-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGGTATAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TA-T-C-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGG------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C-G-A-T----ATA-TCAAA-A-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCATGCACGTATA-T---T-TGT---TGT--CTCA--AAGTTTTC--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---TAAAA-AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-TCT--C----A--CT--CTATA----TA-TC-CAAGCT-TCCCCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTCTAA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACACtgaga
gi|40 : ----------GGGGT---AAAG-TCT--C----A--C----TATA----TA-GC-C-AGC---CCTTC---GGGGAAGCT---------------GTCGTCCA-GGGAAA----------AGTCTCC-C-T
gi|40 : CTTCCG-GGGTAA----------AGTCTCA-C-TAT-----------------ggaagatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : agggagacttttccctggacgacagcttccccgaagggctggctatGGGG---GGAG-TCT--C----A--CT--ATATA-----G-GC-CAGTCT-TCCCCT---Tatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : T---A-G------GGG-GG-A-----C------CT--ACT-AC--------------T-A----------AAGGG---GAAG-ACT--G----G--C---CTATA----TA-GT-GAGACT-CCCCCC---tagtagtaggtcccccctagggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|42 : GA-GG-AA---GG------CT-CACTAAT-AG-GG-------CC-A----------CTGAG---GAAG-CAC--C----A--CT-----------TA-GC-AAGACT-TTC-----------------------------------CCG-GGGG------------GGTCCCA-T-TAT-----------------GGAAGA-A-AGT-CTgggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|43 : CTCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AACACTCGAC---TATATAtca
gi|45 : -A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-TGGAGACT-TCACTG--TT---A-TGGT------------------TC-CA------GT--GTGC-CCAT-GGCC--A--A-GTCCTG-GTggctggctaataatgaccccccccccccatcccccagtaggctggctata
gi|46 : TTTCT-TT---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACAT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAGG-AC-CGA------T--TTA-T--CAG--TG-A-A----------T-----------ag
gi|47 : -G----GAATAG---G--G--CT-ATCCCTT---C-----A---------------------GG-GG-TAG---GT-------------------G-GGT-T-----CCA--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-atg
gi|49 : CTCA-T-TAT-----------------GG--GGAA-AGG-CTT-AC---TCTACAACA
gi|5 : GAATAA-T-AATTT----GCTTTGATC--TATACATAA-T-GCTT--GA--T-GAAATAC--------------AGA-C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTT-----------TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--TT--A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------TATGTTAGGGTGG---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--C-ATG--TGGT-AAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------T-TTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACA-C-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTTCATG--TCCG-CACGA---TCAGGTTT----CA-GCTT---------TAA--A--------AAAAGG--GGGGGGG-----TGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TCACTG--TT---ATTGCC------------------TC-CA------GT--GTGCACCAT-A--T--A--A-GCC--G-GT-AA-G-G--C-A-TT--GGGAT-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------TTA--TAAA---A------------T------AGA----------CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTT-TC-----------------------------------TA-TGCCTT-GC-AATTTGGG--A-TA------TCG-TCAATTGGT-G-TATGG-T-ATCATACATGT--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AACTAT--A---GA----TGAT-A-TA-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-GA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TCAAA-GA------AG--T-G-A-T----ATA-TC-AA-A-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATATT---T-TGT---TG----TAG--AAGTTTTC--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCGCTC---T-----AAA------AA------AGAAAAA-AG-GGT---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGtcggca
gi|6 : ccccctaattgggttaagtttccgGAATAA-T-AATTTTTT-GCTGTGATT--TA--CATTA---GTTT--GA----GAAATAC--------------AGG-CCAA-AG---T-----T-----GTT-GTTG-T----T---T----G--GC-----------------------GTTT--T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-C---CA-AATAT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------TTTGTTTGGT--G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCCTA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATA-T----GA-GG--TTTTTCCATG--TC-G-CACAA---TCAGGTTT----CA-GCTT---------TAA--A--------AG--GG--GGGAGGG--------------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGCTG--TT---A-TGCC------------------TC-CA------AA--GTGC-CCAT-A--T--------------GTAA----G--C-A---------------------CC-AG-TG-------TTA--C--A---A------------T------AGAG---CCCATTTCCCTTCCCCCTC-TGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-T--CTGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATGT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGA-------------------------AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--A-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G-A-T----ATA-TC-AA-A-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-A-CA---ACGTATA-A---T-TGT---TGT--C--A--AAGTTTTC--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC-------------------A------AG---GG-GG-GTG---GG-------------------G-TGG-TC----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CA
gi|7 : ctttcactaatataaaccagtcttccccctttatcatgaggcttcccccccccccttggagttaagttccgT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--A-A-T--CAG--TG-G-A----------TATG--------G---G--TTTT--TTTTTTCAACCAG-TGAACG--T-ATG--GGGTAAAT----GGGGTA--AA----C-AAT-AA-------AAA----T------------ATA---------------T-T------C--------------------C------------CG--GATC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TACCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTCCATG--TC-G-CACAA---TCATGTTT----CA-GCTT---------AAA--A--------AA--GA--AGGGGGG-----GGG------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--CG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGTTG--TT---A-TGCC------------------TC-CA------AT--GTGC-CCAT-A--T--A--A-G---------------------------------------CCCT-AG-TG-------TTA--C--A---G------------T------AGAG---CCCATCCCCCTTCCCCCTC-TGTATGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGAATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTG-----------------------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AT-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G--------------------------ATTGA-T---AAA-AGC-T-C----------------------A-T---T-TGT---TGT--C--G--AAGTTTTC--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-------A------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------GTGGT-T-----CCG--ACG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-CGGC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GA-AGTACGT------CC-CACT-AT-GGTGG-------TT-AG---------GGGGG---GGGG-TCT--C----A--CT--ATATA----
gi|8 : AA-T-A--TTTTT-GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTTTTGA--TTGAAATGC---------------AG-C-AC-CG---CGTTTGTT----GTT-GTTGCT----T---TT-GGA----TTTCC-TA---GCAA------CTGTTT--G---A-ATAT-----TAG-T---TATTC-AAA-TACAATAC-----CCG----GAAC-AC-CGA------T--TTA-T--CAC--TGCG-A----------T--------------------------------AC---------G--T-TGG--GGGTTAAT----GTGTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTTTATAGTTTTTACTTGCCTTT-T------T--------------------T------------TG--AAAT-A-CATGTACGAAACAACAAC-CTCAA-TATT--G---AAGTTGTCA-TAA-T---GCAACGCAATCT-AA-ATT------AT---CA-TAAA-GA-ATC-T----GA-TG--TTTTATCATAT-TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-G-TT---------TAA--A--------GG--GG--AAGGGGG-----CGT-------GA-----TC-A-----AT-CCCCAGAG-A----GGCA--A-T-GAG--T-CGGAGACC-TCGCTAGTTT---A-TG-C------------------TT-CA------GT--GTGT-CCATGG--C--A--A-AGCCTG-GTGGG-A-A--C-A-TT--GGT-T-G-A-AT-GTCA--AG-TG--------TA--T--A---G------------T------AGA----------CTACGGCCCCCTC-AGTA-GTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGTAAAATTA-TGTCTT-GC-GATTT-GGAAA-TA------TCG-TCGATTCGT-G-TATGG-T-ATCA------TAAAA---TTTC-ATT-A--TCGG--CAAGAAATTACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----ATAAAC--T--A---GA----TG---A-TA-TCTT-A-A---AG-ATTT--AC-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCTCCA-TTC-------A
gi|9 : ttgagcttccggAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGCTC--TA--TACAAAT-GTTT--GAGAT-GAAAT--TA-----------AAGGAC-AC-AG---T-----TT----GTG-TTTG-T----T---TTTGGG--ATTATCT-T----GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T---T--CAG--TG-ATA----------T-----------GTGAG--TT-T--TTTTTTAAACCAG-T----G--TAATG--GGGTAAAT----GTGTTTTAAA----CAAAT-AA-------AAA----TA------CCTT-ATA---------------TGT------T--------------------C------------CGATAAAC-T-C--------------AAC-CTC-A-T--T--G---AAG-TG-CA-CAA-T---ACAAC-CAATC---A-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-G----GGTGT--TTTTTTCATG--CC-G-TACGAT--TCAGG-TT----CA-GCTTTAAAAAAAAGGG--G--------GG--GG--GGAGGGG-----CGT------GGA-----TC-A-----ATCCCCC--AG-A----GGCA--T-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A--GCC------------------TA-CA------GT--GTG--CCAT-A--T--A--A-GCCCT--GTGAA-G-G--C-A-TT--GGG-T-G---AT-TCCCT-AG-TGGT-----TTA--TGAA---A------------TG-----AGA----CC--CCCCC---CCCTTTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GT-C--TTGCATGTGAAATTA-TGCCTTGGCAAAATT-GG--AGTA------TCG-TCA--TTGTGG-TATGG-TAATCA------T--AA---TTTT-CTT-A--A---------------------------TGC--TTTAA-A------TA----TTGAAC--TACA---GA----TGA--A-TA-TC-T-A-A---AG----T--A--CAAA-T-TTAT-CC----TTGA------CAAAGCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---T-GA-
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): TTTCAGCCTAAATAAAGAAGGGGGAGGGCAAGCCGCCGAAATGATGAAATTGACCATTGCAATGCCCCTAGATCCGC
Unaligned ( gi|48 ): CCCTTTGGGTTAAGTTTCCGGAATAATAGTTTTTGCTTTGA
Alignments
lowQualScore : 11 55555555555555555555 111111111 1111 222222222222222 111111111111 11111111111 55555555555555555555555555555 2222 111111111 11111111 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222 11 11 111 111111111 111111111111 11111111111111 111111111111 1111111111111111111111111 1111111111111111111 111111 222222 222222 11111111111 2222222 2222222222222 4444444444444444444444444444444 1111111111111111111 11111 1111111111111 11 7777777777777777777777777777777777 1111111111111 44444444444444444 1 111
lowQualScore : 6 6 3 33 88 44 7 3 3 0 44 7777 22222222222222222222 44 3 3 777777777 1111 3 3 7777 555 66 44 2 3 111111111111111 44 888 3 3 77777 777 2 2 555555555555 5 44 66666666666 2 33 33 2 5 99999999999999999999999999999 5555 5 5555 33 2 66 7 0000 444444444 2 2 22222222 5555 666666 0 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 33 666666666666666666 2 4 2 66 444 2 2 2 4 5555 2 88 2 777777 444 5 5 2 5555 2 11 3 00 2 2 444 8888 2 2 000000000 222222222222 33 8888888 55555555555555 99999 5 66666 2 77 4 4444 22 2 6 4 2 0 4 22 777 2 2 2 666666 22 777 2 4 444444444444 0 2 888888 33 2 9999999 333 2 2 2 6666666 22 4444 9999999999999999999999999 9999999999999999999 4 4444 333 33 2 2 66 4 2 2 2 2 22 2 666666 2 0 2 2 2 2 666666 33 333 4 2 555 22 2 333 66 3 000000 5555 7 66 22 333 3333 777 3 3 1 3 1 333 1 55 22 66 1 1 1 1 1 4444 555555 1 2 2 6666666 2 4 2 333 2 4 66 666 888 4 2 111111 33 9999 7 33 444 2 4 999999 2 777 2 2 2 77 22 2 888888 2 00000000000 9999999 2 2 22 55 2 5555555555555 1 8888 666 22 22 3 7777777777777777777777777777777 2 4 333 5555555555555555555 2 2 11111 22 22 77 44 2 22 22 3 2 2 2 22 777 2 666666 4 4 333 666666 6 2 6666666666666 1 9999999999 666 5 1 8888888888 222 1 5555 2 22 2222222222222222222222222222222222 3 7777777777777 33 8 5 00000000000000000 44 6 6 3 3 111
lowQualScore : . . . .. .. .. . . . . .. .... .................... .. . . ......... .... . . .... ... .. .. . . ............... .. ... . . ..... ... . . ............ . .. ........... . .. .. . . ............................. .... . .... .. . .. . .... ......... . . ........ .... ...... . . .......................................................... .. .................. . . . .. ... . . . . .... . .. . ...... ... . . . .... . .. . .. . . ... .... . . ......... ............ .. ....... .............. ..... . ..... . .. . .... .. . . . . . . .. ... . . . ...... .. ... . . ............ . . ...... .. . ....... ... . . . ....... .. .... ......................... ................... . .... ... .. . . .. . . . . . .. . ...... . . . . . . ...... .. ... . . ... .. . ... .. . ...... .... . .. .. ... .... ... . . . . . ... . .. .. .. . . . . . .... ...... . . . ....... . . . ... . . .. ... ... . . ...... .. .... . .. ... . . ...... . ... . . . .. .. . ...... . ........... ....... . . .. .. . ............. . .... ... .. .. . ............................... . . ... ................... . . ..... .. .. .. .. . .. .. . . . . .. ... . ...... . . ... ...... . . ............. . .......... ... . . .......... ... . .... . .. .................................. . ............. .. . . ................. .. . . . . ...
lowQualScore : 7 7 2 55 55 22 0 1 1 8 22 0000 99999999999999999999 66 3 3 777777777 7777 3 3 1111 888 66 66 1 1 666666666666666 22 555 1 1 77777 333 7 7 333333333333 3 88 55555555555 7 77 77 7 3 55555555555555555555555555555 3333 3 7777 77 5 99 9 0000 222222222 4 4 88888888 6666 444444 9 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 777777777777777777 4 7 4 55 111 4 5 4 7 5555 4 22 7 777777 777 3 3 7 7777 7 00 1 00 7 7 777 9999 9 9 111111111 000000000000 77 7777777 44444444444444 33333 0 22222 5 11 2 5555 99 1 3 2 1 8 4 99 444 1 1 1 111111 99 444 1 2 444444444444 4 2 999999 22 4 8888888 666 1 1 1 8888888 99 5555 0000000000000000000000000 9999999999999999999 2 7777 999 11 2 2 11 4 1 1 1 1 99 1 111111 1 1 5 1 2 2 444444 11 777 0 0 777 88 0 555 88 6 555555 4444 0 55 44 000 7777 222 5 5 7 5 7 000 7 99 44 88 8 8 8 9 9 0000 555555 9 0 0 5555555 1 2 1 777 1 2 11 999 333 4 2 444444 22 7777 1 11 111 4 7 666666 2 444 1 1 1 22 99 1 111111 1 44444444444 9999999 1 1 99 88 1 2222222222222 9 1111 777 66 66 8 3333333333333333333333333333333 0 0 555 5555555555555555555 0 0 00000 88 88 55 88 0 88 66 8 1 1 0 66 888 4 888888 4 4 999 444444 7 2 7777777777777 9 8888888888 111 0 7 8888888888 222 7 2222 0 22 6666666666666666666666666666666666 1 6666666666666 77 0 3 00000000000000000 22 2 2 1 3 777
consensus : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNTCATG--TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-TN--------AA--A---------GG--GGGGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---A------------T--AGA----CCC---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCCCCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
Reference ( family-2580 ) : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTTCATG--TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-TN--------AA--A---------GG--GGAGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---A------------T--AGA----CCC---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-GCTTCCCCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
gi|1 : -A----------GGGGG---GAGG-T--T--C----A--C-TAT-TTAT---TAGCTCAG-CCTTCC
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattcccc-------TT-C----------GGGGG---AGAG-TTCT--C-------C-TAT-A------TAGC-CAGTTCTTCCCCC---Tcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagtt-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT----------------TTAA----------AGGGG---GAAGAA-CT--G----G--C-TAT-ATA----ttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctccGAATCA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--TAATA-T-GCCT--CA--T-AACATAATATTGAGAAATAGCA----GA--C-ACTAG---T-----TTTATGGCTAGTTG-T----T---CT-TAG--GTATACTCTT---GC--------CTGTTTGTT---A-AT-T-----CAGTT----ACCTGAAA-CCAAAAGT-----CCC----GAAG-AAATGA---T--TG-TTA-CTCCAGCTTG-ATA----------T-----------A---G--TT-GGGTTTTTTCAACCAG-T----G--C-ATG--GGGT-AAT----GTGTT---TA----C-AATTAA-------AAA----TA------TCT----G---------------T-T----------------------------------------CG--AATC-T-C--------------AACGCTCTA-TA-T--GCATAAG-TGTAAACAA-TGGGACAAC-CAATCT-AATATGTATAGTATTTTCA-TA---GA-ATCGT----GA-GGCTTTTTTTCATG--CC-GGCACGAA--TCAGGTTTA---CATGCT-TTTAAAAAACAA--A---------GG--GGGGGAG-------GG-----CTG------GGA-----TC-A------T-CCCC---G-A----GGCATAG-T-GA-T-T-GGGAGGCT-T-GTTG--TT---A-T-CC-TC-C-------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTGAGTAAGCG-G--CCATT--GGGGTG-A-ATTCCCCT-AGCT-------G--T----TA--T--A---AATAATCGAGGTAT--AAATATGCCC---C---C------CCCCTC-AGTAGGTTTTCTGCTC---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GG-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAGTTGGTG-TATGG-T----A------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-CA----T---TCTTTGT--TTTAA-A------TG----TT-AAT--T--A---TA-----G---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--TGATCGA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TCC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-AACCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---G--------------------------------------TG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATGA-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C--A--ATA----TAGC-CAA-GCTTCCCgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|10 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttcc--------AA--A---------GG--GGGGGGGCCAGGCGGGTCAGCCGT------GGAA----TC-A-----AT-CCCC--AGCA----GGCA--A-TTGTGT-CCTGGGAGCT-TCGCTG--TT---A-TAC--TC-CA------GT--G----GC-CCAT-A--T--A--AA--GCCCTG-GTAAG-GCG--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCTCAG-G-------T--T----TA--T--ACAAA------------T--AGA----CCC---C---CCCC--CCCCCCC-AGTAAGTTCTC----C---TAGGAAA-GAAT--CTGCATGT-AAAT-CATGCCTT-GC-AATTT-AG--A-TA------TCGCTCAATTGGTGTTATGGTT-ATCA------T--TAGTCTTTC-ATT-ACCATCG--TGAGGAA-CATTCTT---TACTTGC--TTTAA-A------TATCCTAC-AAC--T--A---CACACTTGTGCA-TA-TC-T-A-A---AGCG--T--A--C-AA-TCTT-T-CC----TTGA------C-CA----CA-TTCTCCATATAA-TT-CAAGCTTAA-GA-TA--ACATGTGACCTCGAA-TAAAACGACAC---AGTCT----GACTATACTC---C-A-CA-CATAGTATTGACT---AAA-ATCTT-C-CTCCTTACACCA--CA-ATACA-T---TCTGTCCCTGCTAC-C-AGACAA-GTTTT-CCTTC--A-C-----T--T-AA-TGGTTAA-G------ATAT---A--A--CC-ACCCCTCAAGT-----AAACCGAGTGA------TG---GG-GC-GGGCCTGGCGCCTCGACCCGCTACGCCG-GCG-TT----CCGCGATG--G--AAATCTTCGAA-AA--AACTAAATCC-AGTCTCGTG-A--CAC
gi|11 : cAA-T-A-TTTTTT-GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTT--GA--T-GAAATGC-------------------AG--C-AC-CGCG-T-----TT----GTT-GTTG-T----TGCTTT-TGG--ATTTCCT-TA---GC-A------CTGTTT--G---A-AT-T-----TAGTG---TATTC-AAA-TACAATAC-----CC-----GAAC-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAC--TG-G-A----------T--------------------------------AC---------G--T--TG--GGGTTAAT----GTGTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTCTATAGTTTTACTTGCCTT-T-T------T--------------------TGAAATACATGTACG--AAAC-A-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-TAA-T---GCAAC-CAATCT-AA-ATT------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-TG--TTTTATCATA--TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GTT-TA--------AA--A---------GG--GGAAGGG-------GG-----CGT------G-A-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-GGGAGACC-TCGCTG--TT---A-TGTT-TC-CA------GT--G---TGT-CCAT-G--GCAA--A---GCCCTG-GTGGG-A-A--C-ATT--GGT-TG-A-AT-GTCCA-AG-T-------G--T----TA--T--A---G------------T--AGA----CTA---C---GGCC----CCCTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGTCTT-GC-GATTT-GG--A-TA------TCG-TCGATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TCGG--CAAGAAA-TACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------ccacgtctaaagtcggaactctgacta
gi|12 : ggcttccgg--------AA--A---------AG--GGGGGGG-------GG-----AGC------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AGTA----CGCA--A-T-GGG--T-TGCATGCT-TC-CTA--CT---A-TGCCATC-CA-------T--G---TGC-C--T-A--T--A--A----CCCTG-CGGA----G--C-ATT--AGGTTGCA-AT-CCCCT-AG-TACGTGTGA--T----TA--A--A---A------------T--AGA----CCC---C---C----TCCCCCTC-GATA--TTCTC----CCATTAA--TA-AA-T--A-GCATGT-AAATAAATACCTT-GC-AA-AT-GG--A-TA------TCG-TAAATTAGTG-TGTG----ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--AT-G--TAATCAA-TATTCTTATATCTATGC--TT--A-A------TAT---AT-AAC--T--AATGGA----TG---A-TA-TC-T-A-C---AT-G--T--A--C-AAGT-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTT-------AGCTT-C-AGT---ATGA-TG--AAC-ATGACT----A-TAAAG-AATGTG--AG--T----AA-TAT---T---C-A-AA--A---TATTGA-T---CAA-AAC-T----TC--TA-A-CA--C-TTTATA-T---T-------TGTTGT-A-GA--GA-ATTTTGC--TT--A-C-----TA---AA-T-GTTAG-G----AAATAT---A--AACCT-ACCTCTT---T-----TAA------AT------AA---AA-TA-GGA---GG-------------------G-AGG-T-----CCG--ATG--G--AAATTT--GAAGAA--TA--AAATCC-AGTC-C--A-A--CACCT---A-G------GGA-GG-AA---AT------CTCCACT-A--AGT---------TT-A----------GGGGA---TCAT-T-TC--C----A--C-T-T-ATA----TACG-CAG---------------------------------------CCTCCG-GGGGGG----------GGGCTATCA-CTTAT-----------------CG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACA
gi|13 : CC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TTCCTG--TT---A-TGCC-TC-CAATCAGAGT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTAAG-G-G--C-ATT--GGGGTG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---AAA----------T--AAATCTCCCT---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTA-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCATTTGATT-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC----TA-----------------------T--A---GA----TG---A-TG-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TTTA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTT--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-ATTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGATAG-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTCTT-T-----AAA------AA------AA---AA-AG-GGG---GG-------------------G-GTT-T-----CCG--CTT--G--CTATCT--GAA-CA--TA--AGATCC-AGTG-CG-T-A--CA
gi|14 : gAAG-T-GT--C----A--C-TAT-AT------AGC-AAG-TCTTCCCC
gi|14 : A--AAATT--ATTC-CG-G-A--AACGT---A-ACCCAAGGGG-GG-AA---AC------CT-CACT-AT-A--------------A----------ATGGG---GAAG-A-CT--T----G--C-TAT-ATA----atttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccggaataatttttgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|14 : aagtgtcacAA-T-AATTTTT--GCATTGATC--TG--CATGA-TTGTTT--GA--T-GGAATAC--------------A----GG--C-AC-AG---T-----TTTT--GTT-GTTA-T----T---TT-GGGTTGTTTTTT-TTTTTGC-AAAGAATCGGTCT--TCGGACAT-TGTGTATAGGTAAATAGGT-AAA-CTAAAT-T-------------AAG-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------T------------------TT-T--TTTTTTCATTCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAATTAATGTGTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG------AT---CG-TAAAGGA-ATC-TTTTAAA-AG--TTGTATCATG--TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCT-TG--------AA--A---------GG-----CAGT-------GG-----CGTAACCAGGGACTAACTC-AAGTGGAT-GCTT--AG-T----GGCA--AGT-G-GT-T-TGGGGACtgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|15 : aagtgtcactatatagcaagtcttccccatttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccgg-A--CATGT---ATA------GGG-GG-AA---GC------CG-CACT-AT-A--------------A----------AGGGG---GAAG-A-CT--T----A--C-TAT-ATA----
gi|15 : ggtctcgcGAATAA-T-G-TGTTTA-GCATTG-TC--TA--CAT-----GTTT--GA--T-GAAATAC--------------A----GG--C-AC-AGGTTT-----TT----GTT-GTTG-CCGCGT---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-ACA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-G----------T-----------AT--G--TT-T--TTTTTTCAATCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAAT----GTGAT---AA----C-AAT-ATTTTT---ACT----TG------TCTTTTTG---------------T-T------TAT------------------C------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG------AT---CA-TTAAGGA-ATC-T----GA-GA--TTTTATCATG--TC-G-CGCGA---TCAGAGTT----CA-GCT-TA--------AA--A---------GG--GGAGGGG-------CG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT--CAC--AG-A----GGCA--A-T-GGGT-C-AGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TACC-TC-CT------CT--G---TGT-TCAT-GGCT--A--A---Gaggttaagtttccggaataatgtgtttagcattgtctacatgtttgatgaaatacaggcacaggtttttgttgttgccgcgtttggggttttctttgcaatgttttaatttagtttacctacacacaatgtccgaagaccgatttatcagtgggtatgtttttttttcaatcagtgcatggggttaatgtgataacaatatttttacttgtctttttgtttatccgaaacaaactcaatatgaagtgtcacaatcaatgatcattaaggaatctgagattttatcatgtcgcgcgatcagagttcagcttaaaaggggaggggcgcgtggatcaatcacagaggcaatgggtcaggagactccgctgttatacctcctctgtgttcatggctaag
gi|16 : ggtctcgctatatagtaagtcttccccctttatagtgcggcttccccctatacatgtaggttaagtttccgGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TAAAT--A---A------------G--AGA----CCC---T---ACC-TTCCCCCTC-AGTATGTTCTC----C---TAG--AAAGA-T--CTGCATGT-AAAT-TATACCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAATAAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AACTAT--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------T-AATCT-CA-TTT-------AG-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA--ATA--TAGAT-A-AA-TA---TATTGA-T---ATA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTCGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----AAATAT---A--A--CC-ACACCTC---T-----AAA------AAAAGCTGAG---AG-GG-GGG---GG-------------------G-GGGTT-----CCG--AGG--G--AAATAT--GAA-AA--TA--AAATCA-AGTC-CG-A-A--
gi|17 : G-TG-A-AT-CCC-T-AG-T-------G--T----TAA-T--A---G------------T--AGA----CCC---C--------TCCTCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGTCTT-GC-AATTT-GG--A-T-------TCG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTCC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AAC--C--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--T-AG-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CG-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---T-A-AA-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--AA-AC----CACGTATA-T---T-------TGCTGTACGGG--AA-GTTTT-A--TA--ACC-----TA-T-AA-TGGCTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ATCCCT----T-----AAA----------------------GG-GGA---GG-------------------G-GGG-T-----CCA--ATG--A--AAATGT--AAA-AT--TA--AAATCC-AATa
gi|18 : A----AT-AGC--A--A---GA----TG---A-TA-TC-T-ACATGTAA-A--TTAA--C-AA-T-TT-T-TC----TTGA------C-AAACT-GA-TTC-------AA-T----AGT---A-GT-TG--T---ATGACT---GT-TGAAT-AA------AG--T----GA-TCTG--T---T------CA---T-TTGA-T---A---------T-ATA--AA-ACCG--G--GTATA-T---T-------TGATGTAC-GGT-AA-ATTTT-A--TT--A-CATG--TA-TTGA-TGGTTAA-T----AAATAT---A--A--TT-ATTCCTC---T-----AAA---------------G---GG-TG-TGT---GT-------------------C-GTT-T-----TCG--GTG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-TG-A-G--CACAC---A-A------AGG-GG-AA---AC------CT-CATA-AT-GGTAG-------TT-A----------GGGGG---GAAA-T-CT--T----A--C-CAA-ATACCGGTAGC-CAA-ACTTCCCTC---TGTTGAAATATCACTATTATGACAGTCTTCTGTGGGG------------AGTC--TCA-C-TAT-----------------TG--GG-A-AGT-ATT-AC---ttaag
gi|19 : GTTAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AT-------AAA----TA------TTTTCATAGTTTTACTTGCTT--T-TCTGATAT--------------------C------------CG--AAAG-A-C--------------AAC-CTCAA-T---------------------A-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------------A-TAGAGGA-ACT-T----GA-TG--TTTTATCGTG--TC-G-CACGA---TCAGc
gi|19 : CC--AG-A----GACA--A-T-GAGT-C-TCGAGACT-CCGCT----------------C-TA------GT--G---TAC-CCAT-GGCT--A--A---GCCCTG-GTG-G-G-G--T-A---------A-A-AT-GCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---G------------C--AGA----CCA---C---C---TTCCCTCTC-AGTAGG---------------------------CTGCATGC-AAAA-CATGTCTT-GC-AATTT-GG--A-TACATATATCG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCG------T--AA---TTTC-ATTTA--GTGG--TAATGAA-TATCCTT---TCTTTGC--TCTAA-A------TA----AT-ATT--T--G---AA----TG---A-TG-TC-T-A-A---AG-A--T--aagccagagacaatgagtctcgagactccgctctagtgtacccatggctaagccctggtggggtaaaatgccctagtgttatagcagaccaccttccctctcagtaggctgcatgcaaaacatgtcttgcaatttggatacatatatcgtcaattcgtgtatggtatcgtaatttcatttagtggtaatgaatatcctttctttgctctaaataatatttgaatgatgtctaaagat
gi|2 : gttaatgtgttaacaatataaatattttcatagttttacttgcttttctgatatccgaaagacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacttgatgttttatcgtgtcgcacgatcagaagGAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--G-AAAATA-TAC-----------A----GG--C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT--------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT------C-----GAAGAAT-TGACACT--C--TTA-T--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTT-T--TTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAATGTAGGTGTTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GGTCTTTTTCCATGGTTC-G-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCT-TA--------AAGTG---------GG--GGAGGGG-------GG----------------------TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCC-CA-CA------CG--GCCCCCC-CCAC-A--TCCA--AAGTGCCC-----------A--T-AT-----G-TA-C-AG-CCACC-AG-T-------G--T----AC--C--A---A------------TTAAGA----GCCATTT---CCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT--AAT-TATG-CTA-GC-AATGT--G--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGG-A-TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----ACAAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-AT-T--AACC-AA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---ATGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TC---GACTATA--T---C-ACAATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-------TGTTGT-C-AA--AG-GTTTT-C--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------------A------AG---GG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTT-CTTCC----AC-C-TAT-AT-----TAGT-CAA-GCTTCCACCATTTG----------------------GC-------GGGAGA----------AGTT--TCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|20 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg------TTTTGATA---------------T-----------------------------C------------CG--AAAC-A-C--------------AAC-CTTAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T---ACAAC-CAATTT-AA-ATT------AC---CA-AAAACGA-ATC-T----GA-GG---TTTATCATG--TT-G-CGCGA---TCAGGTTT----CG-ACT-TG--------AA--A---------TG--TGA-TGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-C---------------CA--A-T-GAGT-T-TGGA---------------------GCC-TC-CA------GT--T---TGC-CCAT-GGTT--A--A---GCCGTG-GTGGA-G-G--T-GAA--GGG-TG-G-AT-TCCCT-TA-T-------G--T----TA--T--A---G------------T--CGA----CCC---C---TCCTCTCCCCCAG-AGTAGGTTCTC----C---AAG--AA-GA-T--CTGCGTGT-AAAT-TATGTCTT-CC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTCGTG-TAcg
gi|21 : tctCCC--AG-ACCATAACA--A-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATTG-GGG-TG-A-AT-CCCCA-TG-T-------G--T----TA--TAAA---A------------T--AGA----CCC---C---CTC---CCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-CATGCCTT-GC-AAATT-GG--A-TA------GCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCT------T--AA---TTTC-GTT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAG-C------T-----AT-CGCA-T--G---GG----CA---A-TA-TT-T-T-A------A--T--A----AA-T-TT-T-CTCGAATTAA------C-AA
gi|22 : TTTTC-ACTGTAATC--TA--CAT-A-T-GTTT--AA--T-GAAATAC--------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT------------------T---TT-GGG--GTTTTTT-TC---CCCA------TTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTTG--TACGA-AAATTAC-ATGTAAGTACCTTTAAAAAG-AC-CGA---TTAT--TTA-C--CAG--TC-G-A----------T-----------G-------T-G--GTTTTTC-ACCAG-T----GCAT-ATA--GGGTTAAC----GTGTT---TG----T-ATT-AATATTTTTAAATTTTTACTTGCCTCTTGACA---------------T-T----------------------------------------CG--AAGC-A-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-
gi|23 : tagtgaggattcccttgga---TATTGA-T---ATA-ATT-G-C-AAT--CA-ACCA-----ATATA-T---G-------TATTGT-A-GG--GG-GGTTT-C------A-C-----CACT-AG-TGATAAG-G----GAATAT---A--G--TA-ATTCCTC---T-----AA--------------------------------GA-------------------G-GGA--------CG--ACT--T--A---CT--CAA-AACCTA--GAA-CC-TGCT-CG-T-A--GAGG----G-C------GGG-AG-AA---GC------CT-CACT-AT-AGT---------TT-------------GGAG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TTGC-CAG-ACAT--CCG---TG----------------------G-----AG-GGGGCACCATTCAGCCAGTC--T---T-TCG-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-GT---TATATAACAC
gi|24 : -TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------T-----------------GA-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTT-----------A------TT----AC-AAC-----A---AA----TG---A-TA-TC-A-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-GA---TATTTA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-C----TGGTTAG-G----GAATAT---A--G--CC-ACCCCTC---T-----aggat
gi|25 : aTA--T---C-A-AA-GA---CATAGA-C---GAA-CTC-G-C-ATC--TA-AC-A---ACGTATA-T---A-------TGTTGTGC-AG--AAAGTTTT-A--TT--A-C-----TA--------------G----GAATG-------------ACCCCTT---T-----AA------------------------G-GGG---GT-------------------G-ACT-T-----CCG--GTG-------ATCT--GAA-TA--TC--AAATCC-AGTC-CG-A-G--CACAT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CC-CACT-AT-GGTAC-------TT-A----------TGGGG---GAAA-T-CT--C----A--C---T-ATA----TAGC-CAG-TCTTC--------------------------------TTTT------GTAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACACt
gi|26 : TTTGCG-TTTAA-A------TA----TT-AAC--T--A----------------------T-A-A----G-A--T--G--A-AA-T-TT-TTCC----TTGA------C-AAGCT-TAATTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ACGGCT---GA--AAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-GA---TACTGA-T---AAATTTC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-------------------------------TTT-C--TT--A-C--------T-AA-T-GTTAGTG----AAATAT---A--A---C-ACCCCTC---TTTAAAAAA------AA------AA---AG-GT-GGG---GG-------------------G-GGG-TC----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-CC-G-A--CACggtatca
gi|27 : tct---AAA-ATT-TGC-ATC--CA-ACCA--C--GTAGG-T---G-------CGTTGTAC-GG--GA-AGTTT-C------G-C-----TA-C-AAGTGGTTAG-G----GGATAT---G--A--CT-ACCCGCC--------------------------AG---GGTGG-TGG---TG-------------------G-TGG-TGGTGACCG---TGTTA--AAA--T--GAG-GA--CA--GACTCC-AA---AG-A-AAGCACGTAGGA-G------GGG-GG-GG---GCAGGGCGCT-AACT-AA-GGTAG-------TT-T----------GGGAG---GGGT-T-CC--C-----------T-ATA----TAGC-CAG-ACCCCCCC
gi|28 : tg---TTTC-ATT-A--TTGG--TCAGGAA-TA----A---TATTTGC--ATTGA-A------TA----AT-A----T-------A----TG---A-TA-T--T-A-A---AG-A--T--A--T-AA-T-T
gi|28 : atctcaattcagtgTTAT--TTAAA-A------AA----AT-AAA--T--A---AG----TG-----------C-A-A---AG-A--A--A--C-GA-T------CC----TTAA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---ACGACT---GA-TAAAA-GA------Acacttcgttttcctctaaagatacattttaagttatttaaaaaaataaataagtgcaaagaaacgatccttaacaagctcattcaattcagtagttgaacgactgataaaagaa
gi|29 : atctcaattcagtgtttcattattggtcaggaataatatttgcattgaataatatatgatattaaagatataattcacttcgttttcctctaaagatacattttaag-TT-C-AGT---G-GT-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C----GA-TATA--T---C-A----GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--TA-AC----CACGTACA-T---T-------TGTTGTACGGG--AA-GTTTT-A--TT--A-CCCCCGTACT-AA-TAGTTAA-G----AAATAT---A--A--CC-ACCTCTT---T-----AAA----------------------GG-GGG---GA-------------------G-GGG-T-----CCG--TCG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGCC-TG-A-G--TACGT---A-A------
gi|3 : GAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--G-AAAATA-TAC-----------A----GG--C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT--------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT------C-----GAAGAAT-TGACACT--C--TTA-T--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTT-T--TTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAATGTAGGTGTTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GGTCTTTTTCCATGGTTC-G-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCT-TA--------AAGTG---------GG--GGAGGGG-------GG----------------------TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCC-CA-CA------CG--GCCCCCC-CCAC-A--TCCA--AAGTGCCC-----------A--T-AT-----G-TA-C-AG-CCACC-AG-T-------G--T----AC--C--A---A------------TTAAGA----GCCATTT---CCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT--AAT-TATG-CTA-GC-AATGT--G--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGG-A-TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----ACAAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-AT-T--AACC-AA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---ATGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TC---GACTATA--T---C-ACAATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-------TGTTGT-C-AA--AG-GTTTT-C--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------------A------AG---GG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTT-CTTCC----AC-C-TAT-AT-----TAGT-CAA-GCTTCCACCATTTG----------------------GC-------GGGAGA----------AGTT--TCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|30 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg--CACATCA-A-A------GGG-GG-AA---GA------TG-GATT-AT-AGTGA-------TA-ATTTCGATGCGGGGGG---GAAG-T-CTT-C----A--C-TAT-ATA------GC-----GC-----------A----------------------ACCTTCCG-GGG--A----------AGTT--TCAAC-TAT-----------------GG--GGGA-AGT-CTC-AC---cg
gi|30 : GAATAA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--CATCA-T-GTTT--Gacccccccttgggttcagttaccggaataattaattttttgcttgatctacatcatgtttg
gi|31 : agtgagacttcccccatagttgaaacttccccggaaggttgcgctatatagtgaagacttcccccccgcatcgaaattatcactataatccatcttccccctttgatgtgacccccccttgggttcagttaccg-ATG--GGGTTAATTAATGTGTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T---------CAATT--------------AT---CG-TAAAGGA-ATC-T----TA-AG--TTTTATCATG--TC-A-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCT-TG--------A
gi|32 : cT-A----------GGAAG---GAAG-T-CT--C----AATA-TAT-ATA----TAGC-CAG-CCTTCC
gi|33 : tccat-G----GAAGAT---AGGA--CT-ATCCCTT---C-----A---------------------GG-AG-GTA---GG-------------------T-GGT-T-----CCA--ATG--GG-AAATCTT-GAA-AA--TA--AA-TCC-AGTC-CG-ATA--GATGT---A-A--------G-GT-AC---GT------CG-CACT-ATCGGTGG-------TT-G----------GGGTG---TGTG-T-GTC-C----A--CTTATAATA----CGGC-C-G-CCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctttatattg
gi|34 : TTC-ATT-A---TGG--TAAGAAA-TAATCTT---TCAATGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TT---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-TC----TTGACAAATGC-AAGCT-TA-TTC-------AG-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---ATTACT---GT-TAAAA-GA------AG--T----AA-TATA--tgggg
gi|35 : GTT---TACGT-AAT-TA-AATAT---------------G-AC-CAA---T--TAATTAAT--CAA--T----A----------T-----------G---G--TT-T--C-----CAGGCAG-T----G--T-ATG--GGGTTAAT----GGGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----T---------TTCATA---------------T-T------T--------------------
gi|36 : tcttTG--TT---A-T-CC-TCTCA------GTAAG---TGC-GCATGA--T--ATTAT--GCTCTG-TTGAG-G-GAGC-ATTAGGGG-TG-ATAT-GCGCT-AG-T-------G--TTTAGTA--A--A---A------------TG-AGA----CCC---T---CCCATACCCCTTC-ttcttcactctgatatccgaaggacaacctcaa
gi|37 : ttgctgattcttctgtt-GG-AA---GT------TT-TACT-AT-A-TAGCCATTACTT-A----------GGAAG---GAAG-T-CT--TCAAGA--A-TAT-ATA----TAGC-CAG--------CC---T--------------------------TTCCA-TGGAAA----------AGTC--TCA-C-TAC-----------------AG--GG-G-AAT-TTCAAC---TATACAACAC
gi|38 : aTTCCG-GGAGAA-----------GTC--TTA-TATAT-----------------GG--GG-A-AGG-CTC-AC---C-TATAACACcgca
gi|39 : aggaagggtttcgctttagaggctagagctttcagaggaaggctgacgctagagccacggta--TT-G--TTTTCTCGGCCAG-T----G--C-ATG--GGAT---T----GT-TT---------C-CAT-AA-------AAAG---TA------CCTTCAAA---------------T-T------T-------------------------------------AAACGTAC--------------AAC-GCCAG-TT-T--A---AAG-AGACA-CAA-T---ATAGC-AAATCT-Acg
gi|4 : ttGAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGATC--TA--CATTA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------ATACAGA--C-AC-AG---T-----TT----GTT-CTTG-T----T---TT-GGG--GTTCTCT-TT---GC-G------CTGTTT--T---A-AA-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--TTA-T--CGG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TTAAGGA-ATT-T----GA-GG--ATTTTTCATG--TC-G-CACAA---TCAGGTTTTCAACA-GCTATG------------G---------GG--AGAGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-ATGAG-G-G--C-ATG--GGG-TG-A-AT-CCCCT-TG-T-------G--T----TA--T--A---C------------T--AGA----TCCTCTC---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TAG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGGTATAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TA-T-C-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGG------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C----GA-TATA--T---CAA-AA-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCATGCACGTATA-T---T-------TGTTGT-CTCA--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---TAAAA-AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TCT-ATA----TATC-CAA-GCTTCCCCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TAA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACACtgaga
gi|40 : ----------GGGGT---AAAG-T-CT--C----A--C---T-ATA----TAGC-CAG-----CCCTT---CGGGGAAGCT--------------GTCGTCCA-GGGAAA----------AGTC--TCC-C-T
gi|40 : CTTCCG-GGGTAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------ggaagatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : agggagacttttccctggacgacagcttccccgaagggctggctatGGGG---GGAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA-----GGC-CAG-TCTTCCCCT---Tatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : T---A-G------GGG-GG-A-----C------CT--ACT-AC--------------T-A----------AAGGG---GAAG-A-CT--G----G--C-C-T-ATA----TAGT-GAG-ACTCCCCCC---tagtagtaggtcccccctagggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|42 : GA-GG-AA---GG------CT-CACTAAT-AG-GG-------CC-A----------CTGAG---GAAG-C-AC--C----A--C-T----------TAGC-AAG-ACTTTC-----------------------------------CCG-GGGG------------GGTC--CCA-T-TAT-----------------GGAAGA-A-AGT-CTgggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|43 : C--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AACACTCGAC---TATATAtca
gi|45 : -A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-TGGAGACT-TCACTG--TT---A-TGGT-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-GGCC--A--A---GTCCTG-GTggctggctaataatgaccccccccccccatcccccagtaggctggctata
gi|46 : TTTCT-TT---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACAT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAGG-AC-CGA------T--TTA-T--CAG--TG-A-A----------T-----------ag
gi|47 : -G----GAATAG---G--G--CT-ATCCCTT---C-----A---------------------GG-GG-TAG---GT-------------------G-GGT-T-----CCA--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-atg
gi|49 : C--TCA-T-TAT-----------------GG--GGAA-AGG-CTT-AC---TCTACAACA
gi|5 : GAATAA-T-AATTT----GCTTTGATC--TATACATAA-T-GCTT--GA--T-GAAATAC--------------A----GA--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTT-----------TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--TT--A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------TATGTTAGGGTGG---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--C-ATG--TGGT-AAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------T-TTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACA-C-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTTCATG--TCCG-CACGA---TCAGGTTT----CA-GCT-TT--------AA--A---------AAAAGGGGGGG-------GG-----TGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TCACTG--TT---ATTGCC-TC-CA------GT--G---TGCACCAT-A--T--A--A---GCC--G-GT-AA-G-G--C-ATT--GGGATG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--TAAA---A------------T--AGA--------------CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTT-TC------------------------------------TATGCCTT-GC-AATTTGGG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCATACATGT--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AACTAT--A---GA----TGAT-A-TA-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-GA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TCAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATATT---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCGCTC---T-----AAA------AA------AGAAAAA-AG-GGT---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGtcggca
gi|6 : ccccctaattgggttaagtttccgGAATAA-T-AATTTTTT-GCTGTGATT--TA--CATTA---GTTT--GA----GAAATAC--------------A----GG--CCAA-AG---T-----T-----GTT-GTTG-T----T---T----G--GC-----------------------GTTT--T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-C---CA-AATAT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------TTTGTTTGGT--G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCCTA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATA-T----GA-GG--TTTTTCCATG--TC-G-CACAA---TCAGGTTT----CA-GCT-TT--------AA--A---------AG--GGGGGAG-------GG--------------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AA--G---TGC-CCAT-A--T----------------GTAA----G--C-A-------------------CC-AG-T-------G--T----TA--C--A---A------------T--AGA----GCC---CATTTCCCTTCCCCCTC-TGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATGT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--A-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-A-CA---ACGTATA-A---T-------TGTTGT-C--A--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC-------------------A------AG---GG-GG-GTG---GG-------------------G-TGG-TC----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CA
gi|7 : ctttcactaatataaaccagtcttccccctttatcatgaggcttcccccccccccttggagttaagttccgT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--A-A-T--CAG--TG-G-A----------TATG--------G---G--TTTT--TTTTTTCAACCAG-TGAACG--T-ATG--GGGTAAAT----GGGGTA--AA----C-AAT-AA-------AAA----T------------ATA---------------T-T------C--------------------C------------CG--GATC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TACCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTCCATG--TC-G-CACAA---TCATGTTT----CA-GCT-TA--------AA--A---------AA--GAAGGGG-------GG-----GGG------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--CG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGTTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---G-------------------------------------CCCT-AG-T-------G--T----TA--C--A---G------------T--AGAG---CCCAT-C---CCCCTTCCCCCTC-TGTATGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGAATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTG----------------------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AT-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----G-------------------------ATTGA-T---AAA-AGC-T-C----------------------A-T---T-------TGTTGT-C--G--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-------A------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------GTGGT-T-----CCG--ACG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-CGGC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GA-AGTACGT------CC-CACT-AT-GGTGG-------TT-AG---------GGGGG---GGGG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----
gi|8 : AA-T-A--TTTTT-GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTTTTGA--TTGAAATGC-------------------AG--C-AC-CG---CGTTTGTT----GTT-GTTGCT----T---TT-GGA----TTTCC-TA---GCAA------CTGTTT--G---A-ATAT-----TAG-T---TATTC-AAA-TACAATAC-----CCG----GAAC-AC-CGA------T--TTA-T--CAC--TGCG-A----------T--------------------------------AC---------G--T-TGG--GGGTTAAT----GTGTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTTTATAGTTTTTACTTGCCTTT-T------T--------------------T------------TG--AAAT-A-CATGTACGAAACAACAAC-CTCAA-TATT--G---AAGTTGTCA-TAA-T---GCAACGCAATCT-AA-ATT------AT---CA-TAAA-GA-ATC-T----GA-TG--TTTTATCATAT-TC-G-CGCGA---TCAGGTTT----CA-G-T-TT--------AA--A---------GG--GGAAGGG-------GG-----CGT-------GA-----TC-A-----AT-CCCCAGAG-A----GGCA--A-T-GAG--T-CGGAGACC-TCGCTAGTTT---A-TG-C-TT-CA------GT--G---TGT-CCATGG--C--A--A---AGCCTG-GTGGG-A-A--C-ATT--GGT-TG-A-AT-GTCA--AG-T-------G-------TA--T--A---G------------T--AGA--------------CTACGGCCCCCTC-AGTA-GTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGTAAAAT-TATGTCTT-GC-GATTT-GGAAA-TA------TCG-TCGATTCGTG-TATGG-T-ATCA------TAAAA---TTTC-ATT-A--TCGG--CAAGAAATTACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----ATAAAC--T--A---GA----TG---A-TA-TCTT-A-A---AG-ATTT--AC-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCTCCA-TTC-------A
gi|9 : ttgagcttccggAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGCTC--TA--TACAAAT-GTTT--GAGAT-GAAAT--TA------------A----AGGAC-AC-AG---T-----TT----GTG-TTTG-T----T---TTTGGG--ATTATCT-T----GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T---T--CAG--TG-ATA----------T-----------GTGAG--TT-T--TTTTTTAAACCAG-T----G--TAATG--GGGTAAAT----GTGTTTTAAA----CAAAT-AA-------AAA----TA------CCTT-ATA---------------TGT------T--------------------C------------CGATAAAC-T-C--------------AAC-CTC-A-T--T--G---AAG-TG-CA-CAA-T---ACAAC-CAATC---A-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-G----GGTGT--TTTTTTCATG--CC-G-TACGAT--TCAGG-TT----CA-GCT-TT--------AA--AAAAAAGGGGGG--GGGGAGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----ATCCCCC--AG-A----GGCA--T-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A--GCC-TA-CA------GT--G---TG--CCAT-A--T--A--A---GCCCT--GTGAA-G-G--C-ATT--GGG-TG---AT-TCCCT-AG-T-------GGTT----TA--TGAA---A------------TG-AGA----CCC---C---CCC---CCCTTTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GT-C--TTGCATGTGAAAT-TATGCCTTGGCAAAATT-GG--AGTA------TCG-TC-ATTGTGG-TATGG-TAATCA------T--AA---TTTT-CTT-A--A---------------------------TGC--TTTAA-A------TA----TTGAAC--TACA---GA----TGA--A-TA-TC-T-A-A---AG----T--A--CAAA-T-TTAT-CC----TTGA------CAAAGCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---T-GA-
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): TTTCAGCCTAAATAAAGAAGGGGGAGGGCAAGCCGCCGAAATGATGAAATTGACCATTGCAATGCCCCTAGATCCGC
Unaligned ( gi|48 ): CCCTTTGGGTTAAGTTTCCGGAATAATAGTTTTTGCTTTGA
Alignments
lowQualScore : 11 55555555555555555555 111111111 1111 222222222222222 111111111111 11111111111 55555555555555555555555555555 2222 111111111 11111111 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222 11 11 111 11111111111 1111111111 11111111111111 111111111111 1111111111111111111111111 1111111111111111111 111111 222222 222222 11111111111 2222222 2222222222222 4444444444444444444444444444444 1111111111111111111 11111 1111111111111 777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 44444444444444444 1 111
lowQualScore : 6 6 3 33 88 44 7 3 3 0 44 7777 22222222222222222222 44 3 3 777777777 1111 3 3 7777 555 66 44 2 3 111111111111111 44 888 3 3 77777 777 2 2 555555555555 5 44 66666666666 2 33 33 2 5 99999999999999999999999999999 5555 5 5555 33 2 66 7 0000 444444444 2 2 22222222 5555 666666 0 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 33 666666666666666666 2 4 2 66 444 2 2 2 4 5555 2 88 2 777777 444 5 5 2 5555 2 11 1 00 2 2 444 8888 2 2 99999999999 1111111111 8888888 55555555555555 99999 5 66666 2 77 4 4444 22 2 6 4 2 0 4 22 777 2 2 2 666666 22 777 2 4 444444444444 0 2 888888 33 2 9999999 333 2 2 2 6666666 22 4444 9999999999999999999999999 9999999999999999999 4 4444 333 33 2 2 66 4 2 2 2 2 22 2 666666 2 0 2 2 2 2 666666 33 333 4 2 555 22 2 333 66 3 000000 5555 7 66 22 333 3333 777 3 3 1 3 1 333 1 55 22 66 1 1 1 1 1 4444 555555 1 2 2 6666666 2 4 2 333 2 4 66 666 888 4 2 111111 33 9999 7 33 444 2 4 999999 2 777 2 2 2 77 22 2 888888 2 00000000000 9999999 2 2 22 55 2 5555555555555 1 8888 666 22 22 3 7777777777777777777777777777777 2 4 333 5555555555555555555 2 2 11111 22 22 77 44 2 22 22 3 2 2 2 22 777 2 666666 4 4 333 666666 6 2 4444444444444 1 9999999999 555 4 1 7777777777 444 1 5555 1 33 888888888888888888888888888888888888888 3 7777777777777 33 8 5 00000000000000000 44 6 6 3 3 111
lowQualScore : . . . .. .. .. . . . . .. .... .................... .. . . ......... .... . . .... ... .. .. . . ............... .. ... . . ..... ... . . ............ . .. ........... . .. .. . . ............................. .... . .... .. . .. . .... ......... . . ........ .... ...... . . .......................................................... .. .................. . . . .. ... . . . . .... . .. . ...... ... . . . .... . .. . .. . . ... .... . . ........... .......... ....... .............. ..... . ..... . .. . .... .. . . . . . . .. ... . . . ...... .. ... . . ............ . . ...... .. . ....... ... . . . ....... .. .... ......................... ................... . .... ... .. . . .. . . . . . .. . ...... . . . . . . ...... .. ... . . ... .. . ... .. . ...... .... . .. .. ... .... ... . . . . . ... . .. .. .. . . . . . .... ...... . . . ....... . . . ... . . .. ... ... . . ...... .. .... . .. ... . . ...... . ... . . . .. .. . ...... . ........... ....... . . .. .. . ............. . .... ... .. .. . ............................... . . ... ................... . . ..... .. .. .. .. . .. .. . . . . .. ... . ...... . . ... ...... . . ............. . .......... ... . . .......... ... . .... . .. ....................................... . ............. .. . . ................. .. . . . . ...
lowQualScore : 7 7 2 55 55 22 0 1 1 8 22 0000 99999999999999999999 66 3 3 777777777 7777 3 3 1111 888 66 66 1 1 666666666666666 22 555 1 1 77777 333 7 7 333333333333 3 88 55555555555 7 77 77 7 3 55555555555555555555555555555 3333 3 7777 77 5 99 9 0000 222222222 4 4 88888888 6666 444444 9 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 777777777777777777 4 7 4 55 111 4 5 4 7 5555 4 22 7 777777 777 3 3 7 7777 7 00 0 00 7 7 777 9999 9 9 66666666666 6666666666 7777777 44444444444444 33333 0 22222 5 11 2 5555 99 1 3 2 1 8 4 99 444 1 1 1 111111 99 444 1 2 444444444444 4 2 999999 22 4 8888888 666 1 1 1 8888888 99 5555 0000000000000000000000000 9999999999999999999 2 7777 999 11 2 2 11 4 1 1 1 1 99 1 111111 1 1 5 1 2 2 444444 11 777 0 0 777 88 0 555 88 6 555555 4444 0 55 44 000 7777 222 5 5 7 5 7 000 7 99 44 88 8 8 8 9 9 0000 555555 9 0 0 5555555 1 2 1 777 1 2 11 999 333 4 2 444444 22 7777 1 11 111 4 7 666666 2 444 1 1 1 22 99 1 111111 1 44444444444 9999999 1 1 99 88 1 2222222222222 9 1111 777 66 66 8 3333333333333333333333333333333 0 0 555 5555555555555555555 0 0 00000 88 88 55 88 0 88 66 8 1 1 0 66 888 4 888888 4 4 777 111111 3 1 5555555555555 8 3333333333 888 8 6 7777777777 333 6 0000 8 55 222222222222222222222222222222222222222 1 6666666666666 77 0 3 00000000000000000 22 2 2 1 3 777
consensus : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNTCATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-T--N--------AAA---------GGGGGGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---A------------T--AGA----CCC---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCC-----CCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
Reference ( family-2580 ) : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNTCATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-T--N--------AAA---------GGGGGGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---A------------T--AGA----CCC---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCC-----CCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
gi|1 : -A----------GGGGG---GAGG-T--T--C----A--C-TAT-TTAT---TAGCTCAG-CCTTCC-----
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattcccc-------TT-C----------GGGGG---AGAG-TTCT--C-------C-TAT-A------TAGC-CAGTTCTTCC-----CCC---Tcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagtt-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT----------------TTAA----------AGGGG---GAAGAA-CT--G----G--C-TAT-ATA----ttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctccGAATCA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--TAATA-T-GCCT--CA--T-AACATAATATTGAGAAATAGCA----GA--C-ACTAG---T-----TTTATGGCTAGTTG-T----T---CT-TAG--GTATACTCTT---GC--------CTGTTTGTT---A-AT-T-----CAGTT----ACCTGAAA-CCAAAAGT-----CCC----GAAG-AAATGA---T--TG-TTA-CTCCAGCTTG-ATA----------T-----------A---G--TT-GGGTTTTTTCAACCAG-T----G--C-ATG--GGGT-AAT----GTGTT---TA----C-AATTAA-------AAA----TA------TCT----G---------------T-T----------------------------------------CG--AATC-T-C--------------AACGCTCTA-TA-T--GCATAAG-TGTAAACAA-TGGGACAAC-CAATCT-AATATGTATAGTATTTTCA-TA---GA-ATCGT----GA-GGCTTTTTTTCATG--C-CGGCACGAA--TCAGGTTTA---CATGCT-T--TTAAAAAACAAA---------GGGGGGGAG-------GG-----CTG------GGA-----TC-A------T-CCCC---G-A----GGCATAG-T-GA-T-T-GGGAGGCT-T-GTTG--TT---A-T-CC-TC-C-------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTGAGTAAGCG-G--CCATT--GGGGTG-A-ATTCCCCT-AGCT-------G--T----TA--T--A---AATAATCGAGGTAT--AAATATGCCC---C---C------CCCCTC-AGTAGGTTTTCTGCTC---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GG-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAGTTGGTG-TATGG-T----A------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-CA----T---TCTTTGT--TTTAA-A------TG----TT-AAT--T--A---TA-----G---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--TGATCGA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TCC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-AACCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---G--------------------------------------TG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATGA-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C--A--ATA----TAGC-CAA-GCTTCC-----Cgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|10 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttcc--------AAA---------GGGGGGGGGCCAGGCGGGTCAGCCGT------GGAA----TC-A-----AT-CCCC--AGCA----GGCA--A-TTGTGT-CCTGGGAGCT-TCGCTG--TT---A-TAC--TC-CA------GT--G----GC-CCAT-A--T--A--AA--GCCCTG-GTAAG-GCG--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCTCAG-G-------T--T----TA--T--ACAAA------------T--AGA----CCC---C---CCCC--CCCCCCC-AGTAAGTTCTC----C---TAGGAAA-GAAT--CTGCATGT-AAAT-CATGCCTT-GC-AATTT-AG--A-TA------TCGCTCAATTGGTGTTATGGTT-ATCA------T--TAGTCTTTC-ATT-ACCATCG--TGAGGAA-CATTCTT---TACTTGC--TTTAA-A------TATCCTAC-AAC--T--A---CACACTTGTGCA-TA-TC-T-A-A---AGCG--T--A--C-AA-TCTT-T-CC----TTGA------C-CA----CA-TTCTCCATATAA-TT-CAAGCTTAA-GA-TA--ACATGTGACCTCGAA-TAAAACGACAC---AGTCT----GACTATACTC---C-A-CA-CATAGTATTGACT---AAA-ATCTT-C-CTCCTTACACCA--CA-ATACA-T---TCTGTCCCTGCTAC-C-AGACAA-GTTTT-CCTTC--A-C-----T--T-AA-TGGTTAA-G------ATAT---A--A--CC-ACCCCTCAAGT-----AAACCGAGTGA------TG---GG-GC-GGGCCTGGCGCCTCGACCCGCTACGCCG-GCG-TT----CCGCGATG--G--AAATCTTCGAA-AA--AACTAAATCC-AGTCTCGTG-A--CAC
gi|11 : cAA-T-A-TTTTTT-GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTT--GA--T-GAAATGC-------------------AG--C-AC-CGCG-T-----TT----GTT-GTTG-T----TGCTTT-TGG--ATTTCCT-TA---GC-A------CTGTTT--G---A-AT-T-----TAGTG---TATTC-AAA-TACAATAC-----CC-----GAAC-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAC--TG-G-A----------T--------------------------------AC---------G--T--TG--GGGTTAAT----GTGTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTCTATAGTTTTACTTGCCTT-T-T------T--------------------TGAAATACATGTACG--AAAC-A-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-TAA-T---GCAAC-CAATCT-AA-ATT------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-TG--TTTTATCATA--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GTT-T--A--------AAA---------GGGGAAGGG-------GG-----CGT------G-A-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-GGGAGACC-TCGCTG--TT---A-TGTT-TC-CA------GT--G---TGT-CCAT-G--GCAA--A---GCCCTG-GTGGG-A-A--C-ATT--GGT-TG-A-AT-GTCCA-AG-T-------G--T----TA--T--A---G------------T--AGA----CTA---C---GGCC----CCCTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGTCTT-GC-GATTT-GG--A-TA------TCG-TCGATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TCGG--CAAGAAA-TACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------ccacgtctaaagtcggaactctgacta
gi|12 : ggcttccgg--------AAA---------AGGGGGGGG-------GG-----AGC------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AGTA----CGCA--A-T-GGG--T-TGCATGCT-TC-CTA--CT---A-TGCCATC-CA-------T--G---TGC-C--T-A--T--A--A----CCCTG-CGGA----G--C-ATT--AGGTTGCA-AT-CCCCT-AG-TACGTGTGA--T----TA--A--A---A------------T--AGA----CCC---C---C----TCCCCCTC-GATA--TTCTC----CCATTAA--TA-AA-T--A-GCATGT-AAATAAATACCTT-GC-AA-AT-GG--A-TA------TCG-TAAATTAGTG-TGTG----ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--AT-G--TAATCAA-TATTCTTATATCTATGC--TT--A-A------TAT---AT-AAC--T--AATGGA----TG---A-TA-TC-T-A-C---AT-G--T--A--C-AAGT-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTT-------AGCTT-C-AGT---ATGA-TG--AAC-ATGACT----A-TAAAG-AATGTG--AG--T----AA-TAT---T---C-A-AA--A---TATTGA-T---CAA-AAC-T----TC--TA-A-CA--C-TTTATA-T---T-------TGTTGT-A-GA--GA-ATTTTGC--TT--A-C-----TA---AA-T-GTTAG-G----AAATAT---A--AACCT-ACCTCTT---T-----TAA------AT------AA---AA-TA-GGA---GG-------------------G-AGG-T-----CCG--ATG--G--AAATTT--GAAGAA--TA--AAATCC-AGTC-C--A-A--CACCT---A-G------GGA-GG-AA---AT------CTCCACT-A--AGT---------TT-A----------GGGGA---TCAT-T-TC--C----A--C-T-T-ATA----TACG-CAG-CC-------------------------------------------TCCG-GGGGGG----------GGGCTATCA-CTTAT-----------------CG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACA
gi|13 : CC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TTCCTG--TT---A-TGCC-TC-CAATCAGAGT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTAAG-G-G--C-ATT--GGGGTG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---AAA----------T--AAATCTCCCT---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTA-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCATTTGATT-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC----TA-----------------------T--A---GA----TG---A-TG-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TTTA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTT--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-ATTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGATAG-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTCTT-T-----AAA------AA------AA---AA-AG-GGG---GG-------------------G-GTT-T-----CCG--CTT--G--CTATCT--GAA-CA--TA--AGATCC-AGTG-CG-T-A--CA
gi|14 : gAAG-T-GT--C----A--C-TAT-AT------AGC-AAG-TCTTCC-----CC
gi|14 : A--AAATT--ATTC-CG-G-A--AACGT---A-ACCCAAGGGG-GG-AA---AC------CT-CACT-AT-A--------------A----------ATGGG---GAAG-A-CT--T----G--C-TAT-ATA----atttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccggaataatttttgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|14 : aagtgtcacAA-T-AATTTTT--GCATTGATC--TG--CATGA-TTGTTT--GA--T-GGAATAC--------------A----GG--C-AC-AG---T-----TTTT--GTT-GTTA-T----T---TT-GGGTTGTTTTTT-TTTTTGC-AAAGAATCGGTCT--TCGGACAT-TGTGTATAGGTAAATAGGT-AAA-CTAAAT-T-------------AAG-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------T------------------TT-T--TTTTTTCATTCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAATTAATGTGTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG------AT---CG-TAAAGGA-ATC-TTTTAAA-AG--TTGTATCATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCT-T--G--------AAA------------GGCAGT-------GG-----CGTAACCAGGGACTAACTC-AAGTGGAT-GCTT--AG-T----GGCA--AGT-G-GT-T-TGGGGACtgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|15 : aagtgtcactatatagcaagtcttccccatttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccgg-A--CATGT---ATA------GGG-GG-AA---GC------CG-CACT-AT-A--------------A----------AGGGG---GAAG-A-CT--T----A--C---T-ATA----TAGC-GAG-AC
gi|15 : gGAATAA-T-G-TGTTTA-GCATTG-TC--TA--CAT-----GTTT--GA--T-GAAATAC--------------A----GG--C-AC-AGGTTT-----TT----GTT-GTTG-CCGCGT---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-ACA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-G----------T-----------AT--G--TT-T--TTTTTTCAATCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAAT----GTGAT---AA----C-AAT-ATTTTT---ACT----TG------TCTTTTTG---------------T-T------TAT------------------C------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG------AT---CA-TTAAGGA-ATC-T----GA-GA--TTTTATCATG--T-CG-CGCGA---TCAGAGTT----CA-GCT-T--A--------AAA---------GGGGAGGGG-------CG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT--CAC--AG-A----GGCA--A-T-GGGT-C-AGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TACC-TC-CT------CT--G---TGT-TCAT-GGCT--A--A---Gaggttaagtttccggaataatgtgtttagcattgtctacatgtttgatgaaatacaggcacaggtttttgttgttgccgcgtttggggttttctttgcaatgttttaatttagtttacctacacacaatgtccgaagaccgatttatcagtgggtatgtttttttttcaatcagtgcatggggttaatgtgataacaatatttttacttgtctttttgtttatccgaaacaaactcaatatgaagtgtcacaatcaatgatcattaaggaatctgagattttatcatgtcgcgcgatcagagttcagcttaaaaggggaggggcgcgtggatcaatcacagaggcaatgggtcaggagactccgctgttatacctcctctgtgttcatggctaag
gi|16 : ggtctcgctatatagtaagtcttccccctttatagtgcggcttccccctatacatgtaggttaagtttccgGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TAAAT--A---A------------G--AGA----CCC---T---ACC-TTCCCCCTC-AGTATGTTCTC----C---TAG--AAAGA-T--CTGCATGT-AAAT-TATACCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAATAAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AACTAT--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------T-AATCT-CA-TTT-------AG-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA--ATA--TAGAT-A-AA-TA---TATTGA-T---ATA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTCGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----AAATAT---A--A--CC-ACACCTC---T-----AAA------AAAAGCTGAG---AG-GG-GGG---GG-------------------G-GGGTT-----CCG--AGG--G--AAATAT--GAA-AA--TA--AAATCA-AGTC-CG-A-A--
gi|17 : G-TG-A-AT-CCC-T-AG-T-------G--T----TAA-T--A---G------------T--AGA----CCC---C--------TCCTCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGTCTT-GC-AATTT-GG--A-T-------TCG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTCC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AAC--C--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--T-AG-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CG-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---T-A-AA-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--AA-AC----CACGTATA-T---T-------TGCTGTACGGG--AA-GTTTT-A--TA--ACC-----TA-T-AA-TGGCTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ATCCCT----T-----AAA----------------------GG-GGA---GG-------------------G-GGG-T-----CCA--ATG--A--AAATGT--AAA-AT--TA--AAATCC-AATa
gi|18 : A----AT-AGC--A--A---GA----TG---A-TA-TC-T-ACATGTAA-A--TTAA--C-AA-T-TT-T-TC----TTGA------C-AAACT-GA-TTC-------AA-T----AGT---A-GT-TG--T---ATGACT---GT-TGAAT-AA------AG--T----GA-TCTG--T---T------CA---T-TTGA-T---A---------T-ATA--AA-ACCG--G--GTATA-T---T-------TGATGTAC-GGT-AA-ATTTT-A--TT--A-CATG--TA-TTGA-TGGTTAA-T----AAATAT---A--A--TT-ATTCCTC---T-----AAA---------------G---GG-TG-TGT---GT-------------------C-GTT-T-----TCG--GTG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-TG-A-G--CACAC---A-A------AGG-GG-AA---AC------CT-CATA-AT-GGTAG-------TT-A----------GGGGG---GAAA-T-CT--T----A--C-CAA-ATACCGGTAGC-CAA-ACTTCC-----CTC---TGTTGAAATATCACTATTATGACAGTCTTCTGTGGGG------------AGTC--TCA-C-TAT-----------------TG--GG-A-AGT-ATT-AC---ttaag
gi|19 : GTTAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AT-------AAA----TA------TTTTCATAGTTTTACTTGCTT--T-TCTGATAT--------------------C------------CG--AAAG-A-C--------------AAC-CTCAA-T---------------------A-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------------A-TAGAGGA-ACT-T----GA-TG--TTTTATCGTG--T-CG-CACGA---TCAGc
gi|19 : CC--AG-A----GACA--A-T-GAGT-C-TCGAGACT-CCGCT----------------C-TA------GT--G---TAC-CCAT-GGCT--A--A---GCCCTG-GTG-G-G-G--T-A---------A-A-AT-GCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---G------------C--AGA----CCA---C---C---TTCCCTCTC-AGTAGG---------------------------CTGCATGC-AAAA-CATGTCTT-GC-AATTT-GG--A-TACATATATCG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCG------T--AA---TTTC-ATTTA--GTGG--TAATGAA-TATCCTT---TCTTTGC--TCTAA-A------TA----AT-ATT--T--G---AA----TG---A-TG-TC-T-A-A---AG-A--T--aagccagagacaatgagtctcgagactccgctctagtgtacccatggctaagccctggtggggtaaaatgccctagtgttatagcagaccaccttccctctcagtaggctgcatgcaaaacatgtcttgcaatttggatacatatatcgtcaattcgtgtatggtatcgtaatttcatttagtggtaatgaatatcctttctttgctctaaataatatttgaatgatgtctaaagat
gi|2 : gttaatgtgttaacaatataaatattttcatagttttacttgcttttctgatatccgaaagacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacttgatgttttatcgtgtcgcacgatcagaagGAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--G-AAAATA-TAC-----------A----GG--C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT--------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT------C-----GAAGAAT-TGACACT--C--TTA-T--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTT-T--TTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAATGTAGGTGTTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GGTCTTTTTCCATGGTT-CG-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCT-T-----------AAA---------GTGGGGGAG-------GG--------------GGG-----TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCC-CA-CA------CG--GCCCCCC-CCAC-A--TCCA--AAGTGCCC-----------A--T-AT-----G-TA-C-AG-CCACC-AG-T-------G--T----AC--C--A---A------------TTAAGA----GCCATTT---CCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT--AAT-TATG-CTA-GC-AATGT--G--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGG-A-TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----ACAAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-AT-T--AACC-AA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---ATGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TC---GACTATA--T---C-ACAATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-------TGTTGT-C-AA--AG-GTTTT-C--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------------A------AG---GG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTT-CTTCC----AC-C-TAT-AT-----TAGT-CAA-GCTTCC-----ACCATTTG----------------------GC-------GGGAGA----------AGTT--TCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|20 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg------TTTTGATA---------------T-----------------------------C------------CG--AAAC-A-C--------------AAC-CTTAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T---ACAAC-CAATTT-AA-ATT------AC---CA-AAAACGA-ATC-T----GA-GG---TTTATCATG--T-TG-CGCGA---TCAGGTTT----CG-ACT-T--G--------AAA----------TGTGATGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-C---------------CA--A-T-GAGT-T-TGGA---------------------GCC-TC-CA------GT--T---TGC-CCAT-GGTT--A--A---GCCGTG-GTGGA-G-G--T-GAA--GGG-TG-G-AT-TCCCT-TA-T-------G--T----TA--T--A---G------------T--CGA----CCC---C---TCCTCTCCCCCAG-AGTAGGTTCTC----C---AAG--AA-GA-T--CTGCGTGT-AAAT-TATGTCTT-CC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTCGTG-TAcg
gi|21 : tctCCC--AG-ACCATAACA--A-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATTG-GGG-TG-A-AT-CCCCA-TG-T-------G--T----TA--TAAA---A------------T--AGA----CCC---C---CTC---CCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-CATGCCTT-GC-AAATT-GG--A-TA------GCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCT------T--AA---TTTC-GTT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAG-C------T-----AT-CGCA-T--G---GG----CA---A-TA-TT-T-T-A------A--T--A----AA-T-TT-T-CTCGAATTAA------C-AA
gi|22 : TTTTC-ACTGTAATC--TA--CAT-A-T-GTTT--AA--T-GAAATAC--------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT------------------T---TT-GGG--GTTTTTT-TC---CCCA------TTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTTG--TACGA-AAATTAC-ATGTAAGTACCTTTAAAAAG-AC-CGA---TTAT--TTA-C--CAG--TC-G-A----------T-----------G-------T-G--GTTTTTC-ACCAG-T----GCAT-ATA--GGGTTAAC----GTGTT---TG----T-ATT-AATATTTTTAAATTTTTACTTGCCTCTTGACA---------------T-T----------------------------------------CG--AAGC-A-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-
gi|23 : tagtgaggattcccttgga---TATTGA-T---ATA-ATT-G-C-AAT--CA-ACCA-----ATATA-T---G-------TATTGT-A-GG--GG-GGTTT-C------A-C-----CACT-AG-TGATAAG-G----GAATAT---A--G--TA-ATTCCTC---T-----AA--------------------------------GA-------------------G-GGA--------CG--ACT--T--A---CT--CAA-AACCTA--GAA-CC-TGCT-CG-T-A--GAGG----G-C------GGG-AG-AA---GC------CT-CACT-AT-AGT---------TT-------------GGAG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TTGC-CAG-ACAT-------CCG---TG----------------------G-----AG-GGGGCACCATTCAGCCAGTC--T---T-TCG-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-GT---TATATAACAC
gi|24 : -TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------T-----------------GA-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTT-----------A------TT----AC-AAC-----A---AA----TG---A-TA-TC-A-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-GA---TATTTA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-C----TGGTTAG-G----GAATAT---A--G--CC-ACCCCTC---T-----aggat
gi|25 : aTA--T---C-A-AA-GA---CATAGA-C---GAA-CTC-G-C-ATC--TA-AC-A---ACGTATA-T---A-------TGTTGTGC-AG--AAAGTTTT-A--TT--A-C-----TA--------------G----GAATG-------------ACCCCTT---T-----AA------------------------G-GGG---GT-------------------G-ACT-T-----CCG--GTG-------ATCT--GAA-TA--TC--AAATCC-AGTC-CG-A-G--CACAT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CC-CACT-AT-GGTAC-------TT-A----------TGGGG---GAAA-T-CT--C----A--C---T-ATA----TAGC-CAG-TCTTC-------------------------------------TTTT------GTAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACACt
gi|26 : TTTGCG-TTTAA-A------TA----TT-AAC--T--A----------------------T-A-A----G-A--T--G--A-AA-T-TT-TTCC----TTGA------C-AAGCT-TAATTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ACGGCT---GA--AAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-GA---TACTGA-T---AAATTTC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-------------------------------TTT-C--TT--A-C--------T-AA-T-GTTAGTG----AAATAT---A--A---C-ACCCCTC---TTTAAAAAA------AA------AA---AG-GT-GGG---GG-------------------G-GGG-TC----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-CC-G-A--CACggtatca
gi|27 : tct---AAA-ATT-TGC-ATC--CA-ACCA--C--GTAGG-T---G-------CGTTGTAC-GG--GA-AGTTT-C------G-C-----TA-C-AAGTGGTTAG-G----GGATAT---G--A--CT-ACCCGCC--------------------------AG---GGTGG-TGG---TG-------------------G-TGG-TGGTGACCG---TGTTA--AAA--T--GAG-GA--CA--GACTCC-AA---AG-A-AAGCACGTAGGA-G------GGG-GG-GG---GCAGGGCGCT-AACT-AA-GGTAG-------TT-T----------GGGAG---GGGT-T-CC--C-----------T-ATA----TAGC-CAG-ACCCCC-----CC
gi|28 : tg---TTTC-ATT-A--TTGG--TCAGGAA-TA----A---TATTTGC--ATTGA-A------TA----AT-A----T-------A----TG---A-TA-T--T-A-A---AG-A--T--A--T-AA-T-T
gi|28 : atctcaattcagtgTTAT--TTAAA-A------AA----AT-AAA--T--A---AG----TG-----------C-A-A---AG-A--A--A--C-GA-T------CC----TTAA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---ACGACT---GA-TAAAA-GA------Acacttcgttttcctctaaagatacattttaagttatttaaaaaaataaataagtgcaaagaaacgatccttaacaagctcattcaattcagtagttgaacgactgataaaagaa
gi|29 : atctcaattcagtgtttcattattggtcaggaataatatttgcattgaataatatatgatattaaagatataattcacttcgttttcctctaaagatacattttaag-TT-C-AGT---G-GT-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C----GA-TATA--T---C-A----GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--TA-AC----CACGTACA-T---T-------TGTTGTACGGG--AA-GTTTT-A--TT--A-CCCCCGTACT-AA-TAGTTAA-G----AAATAT---A--A--CC-ACCTCTT---T-----AAA----------------------GG-GGG---GA-------------------G-GGG-T-----CCG--TCG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGCC-TG-A-G--TACGT---A-A------
gi|3 : GAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--G-AAAATA-TAC-----------A----GG--C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT--------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT------C-----GAAGAAT-TGACACT--C--TTA-T--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTT-T--TTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAATGTAGGTGTTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GGTCTTTTTCCATGGTT-CG-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCT-T-----------AAA---------GTGGGGGAG-------GG--------------GGG-----TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCC-CA-CA------CG--GCCCCCC-CCAC-A--TCCA--AAGTGCCC-----------A--T-AT-----G-TA-C-AG-CCACC-AG-T-------G--T----AC--C--A---A------------TTAAGA----GCCATTT---CCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT--AAT-TATG-CTA-GC-AATGT--G--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGG-A-TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----ACAAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-AT-T--AACC-AA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---ATGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TC---GACTATA--T---C-ACAATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-------TGTTGT-C-AA--AG-GTTTT-C--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------------A------AG---GG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTT-CTTCC----AC-C-TAT-AT-----TAGT-CAA-GCTTCC-----ACCATTTG----------------------GC-------GGGAGA----------AGTT--TCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|30 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg--CACATCA-A-A------GGG-GG-AA---GA------TG-GATT-AT-AGTGA-------TA-ATTTCGATGCGGGGGG---GAAG-T-CTT-C----A--C-TAT-ATA----GCGC-AA--------------------------------------------CCTTCCG-GGG--A----------AGTT--TCAAC-TAT-----------------GG--GGGA-AGT-CTC-AC---cg
gi|30 : GAATAA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--CATCA-T-GTTT--Gacccccccttgggttcagttaccggaataattaattttttgcttgatctacatcatgtttg
gi|31 : agtgagacttcccccatagttgaaacttccccggaaggttgcgctatatagtgaagacttcccccccgcatcgaaattatcactataatccatcttccccctttgatgtgacccccccttgggttcagttaccg-ATG--GGGTTAATTAATGTGTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T---------CAATT--------------AT---CG-TAAAGGA-ATC-T----TA-AG--TTTTATCATG--T-CA-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCT-T--G--------A
gi|32 : cT-A----------GGAAG---GAAG-T-CT--C----AATA-TAT-ATA----TAGC-CAG-CCTTCC-----
gi|33 : tccat-G----GAAGAT---AGGA--CT-ATCCCTT---C-----A---------------------GG-AG-GTA---GG-------------------T-GGT-T-----CCA--ATG--GG-AAATCTT-GAA-AA--TA--AA-TCC-AGTC-CG-ATA--GATGT---A-A--------G-GT-AC---GT------CG-CACT-ATCGGTGG-------TT-G----------GGGTG---TGTG-T-GTC-C----A--CTTATAATA----CGGC-C-G-CCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctttatattg
gi|34 : TTC-ATT-A---TGG--TAAGAAA-TAATCTT---TCAATGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TT---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-TC----TTGACAAATGC-AAGCT-TA-TTC-------AG-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---ATTACT---GT-TAAAA-GA------AG--T----AA-TATA--tgggg
gi|35 : GTT---TACGT-AAT-TA-AATAT---------------G-AC-CAA---T--TAATTAAT--CAA--T----A----------T-----------G---G--TT-T--C-----CAGGCAG-T----G--T-ATG--GGGTTAAT----GGGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----T---------TTCATA---------------T-T------T--------------------
gi|36 : tcttTG--TT---A-T-CC-TCTCA------GTAAG---TGC-GCATGA--T--ATTAT--GCTCTG-TTGAG-G-GAGC-ATTAGGGG-TG-ATAT-GCGCT-AG-T-------G--TTTAGTA--A--A---A------------TG-AGA----CCC---T---CCCATACCCCTTC-ttcttcactctgatatccgaaggacaacctcaa
gi|37 : ttgctgattcttctgtt-GG-AA---GT------TT-TACT-AT-A-TAGCCATTACTT-A----------GGAAG---GAAG-T-CT--TCAAGA--A-TAT-ATA----TAGC-CAG-CCTT-----------------------------------------TCCA-TGGAAA----------AGTC--TCA-C-TAC-----------------AG--GG-G-AAT-TTCAAC---TATACAACAC
gi|38 : aTTCCG-GGAGAA-----------GTC--TTA-TATAT-----------------GG--GG-A-AGG-CTC-AC---C-TATAACACcgca
gi|39 : aggaagggtttcgctttagaggctagagctttcagaggaaggctgacgctagagccacggta--TT-G--TTTTCTCGGCCAG-T----G--C-ATG--GGAT---T----GT-TT---------C-CAT-AA-------AAAG---TA------CCTTCAAA---------------T-T------T-------------------------------------AAACGTAC--------------AAC-GCCAG-TT-T--A---AAG-AGACA-CAA-T---ATAGC-AAATCT-Acg
gi|4 : ttGAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGATC--TA--CATTA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------ATACAGA--C-AC-AG---T-----TT----GTT-CTTG-T----T---TT-GGG--GTTCTCT-TT---GC-G------CTGTTT--T---A-AA-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--TTA-T--CGG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TTAAGGA-ATT-T----GA-GG--ATTTTTCATG--T-CG-CACAA---TCAGGTTTTCAACA-GCTAT--G----------G---------GGAGAGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-ATGAG-G-G--C-ATG--GGG-TG-A-AT-CCCCT-TG-T-------G--T----TA--T--A---C------------T--AGA----TCCTCTC---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TAG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGGTATAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TA-T-C-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGG------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C----GA-TATA--T---CAA-AA-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCATGCACGTATA-T---T-------TGTTGT-CTCA--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---TAAAA-AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TCT-ATA----TATC-CAA-GCTTCC-----CCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TAA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACACtgaga
gi|40 : ----------GGGGT---AAAG-T-CT--C----A--C---T-ATA----TAGC-CAG-CCCTTCGGGGAAGC---T-----------------------GTCGTCCA-GGGAAA----------AGTC--TCC-C-T
gi|40 : CTTCCG-GGGTAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------ggaagatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : agggagacttttccctggacgacagcttccccgaagggctggctatGGGG---GGAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA-----GGC-CAG-TCTTCC-----CCT---Tatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : T---A-G------GGG-GG-A-----C------CT--ACT-AC--------------T-A----------AAGGG---GAAG-A-CT--G----G--C-C-T-ATA----TAGT-GAG-ACTCCC-----CCC---tagtagtaggtcccccctagggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|42 : GA-GG-AA---GG------CT-CACTAAT-AG-GG-------CC-A----------CTGAG---GAAG-C-AC--C----A--C-T----------TAGC-AAG-ACTTTC----------------------------------------CCG-GGGG------------GGTC--CCA-T-TAT-----------------GGAAGA-A-AGT-CTgggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|43 : C--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AACACTCGAC---TATATAtca
gi|43 : A---GC------CT--ACT----GGGGG-------AT-G----------GGGGG---GGGG-G-GT--C----A--T-TAT--------TAGC-CAG-CCggctggctaataatgaccccccccccccatcccccagtaggctggctata
gi|45 : tatatagtcgagtgtttccccatagtgag-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-TGGAGACT-TCACTG--TT---A-TGGT-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-GGCC--A--A---GTCCTG-GTggctata
gi|46 : TTTCT-TT---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACAT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAGG-AC-CGA------T--TTA-T--CAG--TG-A-A----------T-----------ag
gi|47 : -G----GAATAG---G--G--CT-ATCCCTT---C-----A---------------------GG-GG-TAG---GT-------------------G-GGT-T-----CCA--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-atg
gi|49 : C--TCA-T-TAT-----------------GG--GGAA-AGG-CTT-AC---TCTACAACA
gi|5 : GAATAA-T-AATTT----GCTTTGATC--TATACATAA-T-GCTT--GA--T-GAAATAC--------------A----GA--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTT-----------TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--TT--A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------TATGTTAGGGTGG---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--C-ATG--TGGT-AAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------T-TTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---AC-AC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTTCATG--TCCG-CACGA---TCAGGTTT----CA-GCT-TTAA--------AAA---------AAGGGGGGG-------GG-----TGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TCACTG--TT---ATTGCC-TC-CA------GT--G---TGCACCAT-A--T--A--A---GCC--G-GT-AA-G-G--C-ATT--GGGATG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--TAAA---A------------T--AGA--------------CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTT-TC------------------------------------TATGCCTT-GC-AATTTGGG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCATACATGT--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AACTAT--A---GA----TGAT-A-TA-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-GA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TCAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATATT---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCGCTC---T-----AAA------AA------AGAAAAA-AG-GGT---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGtcggca
gi|6 : ccccctaattgggttaagtttccgGAATAA-T-AATTTTTT-GCTGTGATT--TA--CATTA---GTTT--GA----GAAATAC--------------A----GG--CCAA-AG---T-----T-----GTT-GTTG-T----T---T----G--GC-----------------------GTTT--T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-C---CA-AATAT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------TTTGTTTGGT--G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCCTA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATA-T----GA-GG--TTTTTCCATG--T-CG-CACAA---TCAGGTTT----CA-GCT-T--T--------AAA---------AGGGGGGAG-------GG--------------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AA--G---TGC-CCAT-A--T----------------GTAA----G--C-A-------------------CC-AG-T-------G--T----TA--C--A---A------------T--AGA----GCC---CATTTCCCTTCCCCCTC-TGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATGT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--A-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-A-CA---ACGTATA-A---T-------TGTTGT-C--A--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC-------------------A------AG---GG-GG-GTG---GG-------------------G-TGG-TC----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CA
gi|7 : ctttcactaatataaaccagtcttccccctttatcatgaggcttcccccccccccttggagttaagttccgT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--A-A-T--CAG--TG-G-A----------TATG--------G---G--TTTT--TTTTTTCAACCAG-TGAACG--T-ATG--GGGTAAAT----GGGGTA--AA----C-AAT-AA-------AAA----T------------ATA---------------T-T------C--------------------C------------CG--GATC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TACCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTCCATG--T-CG-CACAA---TCATGTTT----CA-GCT-T--A--------AAA---------AAGAAGGGG-------GG-----GGG------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--CG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGTTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---G-------------------------------------CCCT-AG-T-------G--T----TA--C--A---G------------T--AGAG---CCCAT-C---CCCCTTCCCCCTC-TGTATGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGAATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTG----------------------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AT-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----G-------------------------ATTGA-T---AAA-AGC-T-C----------------------A-T---T-------TGTTGT-C--G--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-------A------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------GTGGT-T-----CCG--ACG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-CGGC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GA-AGTACGT------CC-CACT-AT-GGTGG-------TT-AG---------GGGGG---GGGG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----
gi|8 : AA-T-A--TTTTT-GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTTTTGA--TTGAAATGC-------------------AG--C-AC-CG---CGTTTGTT----GTT-GTTGCT----T---TT-GGA----TTTCC-TA---GCAA------CTGTTT--G---A-ATAT-----TAG-T---TATTC-AAA-TACAATAC-----CCG----GAAC-AC-CGA------T--TTA-T--CAC--TGCG-A----------T--------------------------------AC---------G--T-TGG--GGGTTAAT----GTGTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTTTATAGTTTTTACTTGCCTTT-T------T--------------------T------------TG--AAAT-A-CATGTACGAAACAACAAC-CTCAA-TATT--G---AAGTTGTCA-TAA-T---GCAACGCAATCT-AA-ATT------AT---CA-TAAA-GA-ATC-T----GA-TG--TTTTATCATAT-T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-G-T-T--T--------AAA---------GGGGAAGGG-------GG-----CGT-------GA-----TC-A-----AT-CCCCAGAG-A----GGCA--A-T-GAG--T-CGGAGACC-TCGCTAGTTT---A-TG-C-TT-CA------GT--G---TGT-CCATGG--C--A--A---AGCCTG-GTGGG-A-A--C-ATT--GGT-TG-A-AT-GTCA--AG-T-------G-------TA--T--A---G------------T--AGA--------------CTACGGCCCCCTC-AGTA-GTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGTAAAAT-TATGTCTT-GC-GATTT-GGAAA-TA------TCG-TCGATTCGTG-TATGG-T-ATCA------TAAAA---TTTC-ATT-A--TCGG--CAAGAAATTACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----ATAAAC--T--A---GA----TG---A-TA-TCTT-A-A---AG-ATTT--AC-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCTCCA-TTC-------A
gi|9 : ttgagcttccggAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGCTC--TA--TACAAAT-GTTT--GAGAT-GAAAT--TA------------A----AGGAC-AC-AG---T-----TT----GTG-TTTG-T----T---TTTGGG--ATTATCT-T----GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T---T--CAG--TG-ATA----------T-----------GTGAG--TT-T--TTTTTTAAACCAG-T----G--TAATG--GGGTAAAT----GTGTTTTAAA----CAAAT-AA-------AAA----TA------CCTT-ATA---------------TGT------T--------------------C------------CGATAAAC-T-C--------------AAC-CTC-A-T--T--G---AAG-TG-CA-CAA-T---ACAAC-CAATC---A-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-G----GGTGT--TTTTTTCATG--C-CG-TACGAT--TCAGG-TT----CA-GCT-T--T--------AAAAAAAAGGGGGGGGGGAGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----ATCCCCC--AG-A----GGCA--T-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A--GCC-TA-CA------GT--G---TG--CCAT-A--T--A--A---GCCCT--GTGAA-G-G--C-ATT--GGG-TG---AT-TCCCT-AG-T-------GGTT----TA--TGAA---A------------TG-AGA----CCC---C---CCC---CCCTTTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GT-C--TTGCATGTGAAAT-TATGCCTTGGCAAAATT-GG--AGTA------TCG-TC-ATTGTGG-TATGG-TAATCA------T--AA---TTTT-CTT-A--A---------------------------TGC--TTTAA-A------TA----TTGAAC--TACA---GA----TGA--A-TA-TC-T-A-A---AG----T--A--CAAA-T-TTAT-CC----TTGA------CAAAGCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---T-GA-
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): TTTCAGCCTAAATAAAGAAGGGGGAGGGCAAGCCGCCGAAATGATGAAATTGACCATTGCAATGCCCCTAGATCCGC
Unaligned ( gi|48 ): CCCTTTGGGTTAAGTTTCCGGAATAATAGTTTTTGCTTTGA
Alignments
lowQualScore : 11 55555555555555555555 111111111 1111 222222222222222 111111111111 11111111111 55555555555555555555555555555 2222 111111111 11111111 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222 11 11 111 11111111111 1111111111 11111111111111 111111111111 1111111111111111111111111 1111111111111111111 111111 222222 222222 11111111111 2222222 2222222222222 4444444444444444444444444444444 1111111111111111111 11111 1111111111111 777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 44444444444444444 1 111
lowQualScore : 6 6 3 33 88 44 7 3 3 0 44 7777 22222222222222222222 44 3 3 777777777 1111 3 3 7777 555 66 44 2 3 111111111111111 44 888 3 3 77777 777 2 2 555555555555 5 44 66666666666 2 33 33 2 5 99999999999999999999999999999 5555 5 5555 33 2 66 7 0000 444444444 2 2 22222222 5555 666666 0 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 33 666666666666666666 2 4 2 66 444 2 2 2 4 5555 2 88 2 777777 444 5 5 2 5555 2 11 1 00 2 2 444 8888 2 2 99999999999 1111111111 8888888 55555555555555 99999 5 66666 2 77 4 4444 22 2 6 4 2 0 4 22 777 2 2 2 666666 22 777 2 4 444444444444 0 2 888888 33 2 9999999 333 2 2 2 6666666 22 4444 9999999999999999999999999 9999999999999999999 4 4444 333 33 2 2 66 4 2 2 2 2 22 2 666666 2 0 2 2 2 2 666666 33 333 4 2 555 22 2 333 66 3 000000 5555 7 66 22 333 3333 777 3 3 1 3 1 333 1 55 22 66 1 1 1 1 1 4444 555555 1 2 2 6666666 2 4 2 333 2 4 66 666 888 4 2 111111 33 9999 7 33 444 2 4 999999 2 777 2 2 2 77 22 2 888888 2 00000000000 9999999 2 2 22 55 2 5555555555555 1 8888 666 22 22 3 7777777777777777777777777777777 2 4 333 5555555555555555555 2 2 11111 22 22 77 44 2 22 22 3 2 2 2 22 777 2 666666 4 4 333 666666 6 2 4444444444444 1 9999999999 555 4 1 7777777777 444 1 5555 1 33 888888888888888888888888888888888888888 3 7777777777777 33 8 5 00000000000000000 44 6 6 3 3 111
lowQualScore : . . . .. .. .. . . . . .. .... .................... .. . . ......... .... . . .... ... .. .. . . ............... .. ... . . ..... ... . . ............ . .. ........... . .. .. . . ............................. .... . .... .. . .. . .... ......... . . ........ .... ...... . . .......................................................... .. .................. . . . .. ... . . . . .... . .. . ...... ... . . . .... . .. . .. . . ... .... . . ........... .......... ....... .............. ..... . ..... . .. . .... .. . . . . . . .. ... . . . ...... .. ... . . ............ . . ...... .. . ....... ... . . . ....... .. .... ......................... ................... . .... ... .. . . .. . . . . . .. . ...... . . . . . . ...... .. ... . . ... .. . ... .. . ...... .... . .. .. ... .... ... . . . . . ... . .. .. .. . . . . . .... ...... . . . ....... . . . ... . . .. ... ... . . ...... .. .... . .. ... . . ...... . ... . . . .. .. . ...... . ........... ....... . . .. .. . ............. . .... ... .. .. . ............................... . . ... ................... . . ..... .. .. .. .. . .. .. . . . . .. ... . ...... . . ... ...... . . ............. . .......... ... . . .......... ... . .... . .. ....................................... . ............. .. . . ................. .. . . . . ...
lowQualScore : 7 7 2 55 55 22 0 1 1 8 22 0000 99999999999999999999 66 3 3 777777777 7777 3 3 1111 888 66 66 1 1 666666666666666 22 555 1 1 77777 333 7 7 333333333333 3 88 55555555555 7 77 77 7 3 55555555555555555555555555555 3333 3 7777 77 5 99 9 0000 222222222 4 4 88888888 6666 444444 9 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 777777777777777777 4 7 4 55 111 4 5 4 7 5555 4 22 7 777777 777 3 3 7 7777 7 00 0 00 7 7 777 9999 9 9 66666666666 6666666666 7777777 44444444444444 33333 0 22222 5 11 2 5555 99 1 3 2 1 8 4 99 444 1 1 1 111111 99 444 1 2 444444444444 4 2 999999 22 4 8888888 666 1 1 1 8888888 99 5555 0000000000000000000000000 9999999999999999999 2 7777 999 11 2 2 11 4 1 1 1 1 99 1 111111 1 1 5 1 2 2 444444 11 777 0 0 777 88 0 555 88 6 555555 4444 0 55 44 000 7777 222 5 5 7 5 7 000 7 99 44 88 8 8 8 9 9 0000 555555 9 0 0 5555555 1 2 1 777 1 2 11 999 333 4 2 444444 22 7777 1 11 111 4 7 666666 2 444 1 1 1 22 99 1 111111 1 44444444444 9999999 1 1 99 88 1 2222222222222 9 1111 777 66 66 8 3333333333333333333333333333333 0 0 555 5555555555555555555 0 0 00000 88 88 55 88 0 88 66 8 1 1 0 66 888 4 888888 4 4 777 111111 3 1 5555555555555 8 3333333333 888 8 6 7777777777 333 6 0000 8 55 222222222222222222222222222222222222222 1 6666666666666 77 0 3 00000000000000000 22 2 2 1 3 777
consensus : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNTCATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-T--N--------AAA---------GGGGGGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---A------------T--AGA----CCC---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCC-----CCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
Reference ( family-2580 ) : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNTCATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-T--N--------AAA---------GGGGGGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---A------------T--AGA----CCC---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCC-----CCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
gi|1 : -A----------GGGGG---GAGG-T--T--C----A--C-TAT-TTAT---TAGCTCAG-CCTTCC-----
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattcccc-------TT-C----------GGGGG---AGAG-TTCT--C-------C-TAT-A------TAGC-CAGTTCTTCC-----CCC---Tcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagtt-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT----------------TTAA----------AGGGG---GAAGAA-CT--G----G--C-TAT-ATA----ttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctccGAATCA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--TAATA-T-GCCT--CA--T-AACATAATATTGAGAAATAGCA----GA--C-ACTAG---T-----TTTATGGCTAGTTG-T----T---CT-TAG--GTATACTCTT---GC--------CTGTTTGTT---A-AT-T-----CAGTT----ACCTGAAA-CCAAAAGT-----CCC----GAAG-AAATGA---T--TG-TTA-CTCCAGCTTG-ATA----------T-----------A---G--TT-GGGTTTTTTCAACCAG-T----G--C-ATG--GGGT-AAT----GTGTT---TA----C-AATTAA-------AAA----TA------TCT----G---------------T-T----------------------------------------CG--AATC-T-C--------------AACGCTCTA-TA-T--GCATAAG-TGTAAACAA-TGGGACAAC-CAATCT-AATATGTATAGTATTTTCA-TA---GA-ATCGT----GA-GGCTTTTTTTCATG--C-CGGCACGAA--TCAGGTTTA---CATGCT-T--TTAAAAAACAAA---------GGGGGGGAG-------GG-----CTG------GGA-----TC-A------T-CCCC---G-A----GGCATAG-T-GA-T-T-GGGAGGCT-T-GTTG--TT---A-T-CC-TC-C-------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTGAGTAAGCG-G--CCATT--GGGGTG-A-ATTCCCCT-AGCT-------G--T----TA--T--A---AATAATCGAGGTAT--AAATATGCCC---C---C------CCCCTC-AGTAGGTTTTCTGCTC---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GG-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAGTTGGTG-TATGG-T----A------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-CA----T---TCTTTGT--TTTAA-A------TG----TT-AAT--T--A---TA-----G---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--TGATCGA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TCC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-AACCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---G--------------------------------------TG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATGA-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C--A--ATA----TAGC-CAA-GCTTCC-----Cgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|10 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttcc--------AAA---------GGGGGGGGGCCAGGCGGGTCAGCCGT------GGAA----TC-A-----AT-CCCC--AGCA----GGCA--A-TTGTGT-CCTGGGAGCT-TCGCTG--TT---A-TAC--TC-CA------GT--G----GC-CCAT-A--T--A--AA--GCCCTG-GTAAG-GCG--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCTCAG-G-------T--T----TA--T--ACAAA------------T--AGA----CCC---C---CCCC--CCCCCCC-AGTAAGTTCTC----C---TAGGAAA-GAAT--CTGCATGT-AAAT-CATGCCTT-GC-AATTT-AG--A-TA------TCGCTCAATTGGTGTTATGGTT-ATCA------T--TAGTCTTTC-ATT-ACCATCG--TGAGGAA-CATTCTT---TACTTGC--TTTAA-A------TATCCTAC-AAC--T--A---CACACTTGTGCA-TA-TC-T-A-A---AGCG--T--A--C-AA-TCTT-T-CC----TTGA------C-CA----CA-TTCTCCATATAA-TT-CAAGCTTAA-GA-TA--ACATGTGACCTCGAA-TAAAACGACAC---AGTCT----GACTATACTC---C-A-CA-CATAGTATTGACT---AAA-ATCTT-C-CTCCTTACACCA--CA-ATACA-T---TCTGTCCCTGCTAC-C-AGACAA-GTTTT-CCTTC--A-C-----T--T-AA-TGGTTAA-G------ATAT---A--A--CC-ACCCCTCAAGT-----AAACCGAGTGA------TG---GG-GC-GGGCCTGGCGCCTCGACCCGCTACGCCG-GCG-TT----CCGCGATG--G--AAATCTTCGAA-AA--AACTAAATCC-AGTCTCGTG-A--CAC
gi|11 : cAA-T-A-TTTTTT-GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTT--GA--T-GAAATGC-------------------AG--C-AC-CGCG-T-----TT----GTT-GTTG-T----TGCTTT-TGG--ATTTCCT-TA---GC-A------CTGTTT--G---A-AT-T-----TAGTG---TATTC-AAA-TACAATAC-----CC-----GAAC-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAC--TG-G-A----------T--------------------------------AC---------G--T--TG--GGGTTAAT----GTGTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTCTATAGTTTTACTTGCCTT-T-T------T--------------------TGAAATACATGTACG--AAAC-A-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-TAA-T---GCAAC-CAATCT-AA-ATT------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-TG--TTTTATCATA--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GTT-T--A--------AAA---------GGGGAAGGG-------GG-----CGT------G-A-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-GGGAGACC-TCGCTG--TT---A-TGTT-TC-CA------GT--G---TGT-CCAT-G--GCAA--A---GCCCTG-GTGGG-A-A--C-ATT--GGT-TG-A-AT-GTCCA-AG-T-------G--T----TA--T--A---G------------T--AGA----CTA---C---GGCC----CCCTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGTCTT-GC-GATTT-GG--A-TA------TCG-TCGATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TCGG--CAAGAAA-TACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------ccacgtctaaagtcggaactctgacta
gi|12 : ggcttccgg--------AAA---------AGGGGGGGG-------GG-----AGC------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AGTA----CGCA--A-T-GGG--T-TGCATGCT-TC-CTA--CT---A-TGCCATC-CA-------T--G---TGC-C--T-A--T--A--A----CCCTG-CGGA----G--C-ATT--AGGTTGCA-AT-CCCCT-AG-TACGTGTGA--T----TA--A--A---A------------T--AGA----CCC---C---C----TCCCCCTC-GATA--TTCTC----CCATTAA--TA-AA-T--A-GCATGT-AAATAAATACCTT-GC-AA-AT-GG--A-TA------TCG-TAAATTAGTG-TGTG----ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--AT-G--TAATCAA-TATTCTTATATCTATGC--TT--A-A------TAT---AT-AAC--T--AATGGA----TG---A-TA-TC-T-A-C---AT-G--T--A--C-AAGT-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTT-------AGCTT-C-AGT---ATGA-TG--AAC-ATGACT----A-TAAAG-AATGTG--AG--T----AA-TAT---T---C-A-AA--A---TATTGA-T---CAA-AAC-T----TC--TA-A-CA--C-TTTATA-T---T-------TGTTGT-A-GA--GA-ATTTTGC--TT--A-C-----TA---AA-T-GTTAG-G----AAATAT---A--AACCT-ACCTCTT---T-----TAA------AT------AA---AA-TA-GGA---GG-------------------G-AGG-T-----CCG--ATG--G--AAATTT--GAAGAA--TA--AAATCC-AGTC-C--A-A--CACCT---A-G------GGA-GG-AA---AT------CTCCACT-A--AGT---------TT-A----------GGGGA---TCAT-T-TC--C----A--C-T-T-ATA----TACG-CAG-CC-------------------------------------------TCCG-GGGGGG----------GGGCTATCA-CTTAT-----------------CG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACA
gi|13 : CC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TTCCTG--TT---A-TGCC-TC-CAATCAGAGT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTAAG-G-G--C-ATT--GGGGTG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---AAA----------T--AAATCTCCCT---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTA-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCATTTGATT-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC----TA-----------------------T--A---GA----TG---A-TG-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TTTA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTT--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-ATTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGATAG-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTCTT-T-----AAA------AA------AA---AA-AG-GGG---GG-------------------G-GTT-T-----CCG--CTT--G--CTATCT--GAA-CA--TA--AGATCC-AGTG-CG-T-A--CA
gi|14 : gAAG-T-GT--C----A--C-TAT-AT------AGC-AAG-TCTTCC-----CC
gi|14 : A--AAATT--ATTC-CG-G-A--AACGT---A-ACCCAAGGGG-GG-AA---AC------CT-CACT-AT-A--------------A----------ATGGG---GAAG-A-CT--T----G--C-TAT-ATA----atttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccggaataatttttgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|14 : aagtgtcacAA-T-AATTTTT--GCATTGATC--TG--CATGA-TTGTTT--GA--T-GGAATAC--------------A----GG--C-AC-AG---T-----TTTT--GTT-GTTA-T----T---TT-GGGTTGTTTTTT-TTTTTGC-AAAGAATCGGTCT--TCGGACAT-TGTGTATAGGTAAATAGGT-AAA-CTAAAT-T-------------AAG-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------T------------------TT-T--TTTTTTCATTCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAATTAATGTGTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG------AT---CG-TAAAGGA-ATC-TTTTAAA-AG--TTGTATCATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCT-T--G--------AAA------------GGCAGT-------GG-----CGTAACCAGGGACTAACTC-AAGTGGAT-GCTT--AG-T----GGCA--AGT-G-GT-T-TGGGGACtgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|15 : aagtgtcactatatagcaagtcttccccatttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccgg-A--CATGT---ATA------GGG-GG-AA---GC------CG-CACT-AT-A--------------A----------AGGGG---GAAG-A-CT--T----A--C---T-ATA----TAGC-GAG-AC
gi|15 : gGAATAA-T-G-TGTTTA-GCATTG-TC--TA--CAT-----GTTT--GA--T-GAAATAC--------------A----GG--C-AC-AGGTTT-----TT----GTT-GTTG-CCGCGT---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-ACA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-G----------T-----------AT--G--TT-T--TTTTTTCAATCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAAT----GTGAT---AA----C-AAT-ATTTTT---ACT----TG------TCTTTTTG---------------T-T------TAT------------------C------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C---A-ATG------AT---CA-TTAAGGA-ATC-T----GA-GA--TTTTATCATG--T-CG-CGCGA---TCAGAGTT----CA-GCT-T--A--------AAA---------GGGGAGGGG-------CG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT--CAC--AG-A----GGCA--A-T-GGGT-C-AGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TACC-TC-CT------CT--G---TGT-TCAT-GGCT--A--A---Gaggttaagtttccggaataatgtgtttagcattgtctacatgtttgatgaaatacaggcacaggtttttgttgttgccgcgtttggggttttctttgcaatgttttaatttagtttacctacacacaatgtccgaagaccgatttatcagtgggtatgtttttttttcaatcagtgcatggggttaatgtgataacaatatttttacttgtctttttgtttatccgaaacaaactcaatatgaagtgtcacaatcaatgatcattaaggaatctgagattttatcatgtcgcgcgatcagagttcagcttaaaaggggaggggcgcgtggatcaatcacagaggcaatgggtcaggagactccgctgttatacctcctctgtgttcatggctaag
gi|16 : ggtctcgctatatagtaagtcttccccctttatagtgcggcttccccctatacatgtaggttaagtttccgGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TAAAT--A---A------------G--AGA----CCC---T---ACC-TTCCCCCTC-AGTATGTTCTC----C---TAG--AAAGA-T--CTGCATGT-AAAT-TATACCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAATAAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AACTAT--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------T-AATCT-CA-TTT-------AG-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA--ATA--TAGAT-A-AA-TA---TATTGA-T---ATA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTCGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----AAATAT---A--A--CC-ACACCTC---T-----AAA------AAAAGCTGAG---AG-GG-GGG---GG-------------------G-GGGTT-----CCG--AGG--G--AAATAT--GAA-AA--TA--AAATCA-AGTC-CG-A-A--
gi|17 : G-TG-A-AT-CCC-T-AG-T-------G--T----TAA-T--A---G------------T--AGA----CCC---C--------TCCTCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGTCTT-GC-AATTT-GG--A-T-------TCG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTCC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AAC--C--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--T-AG-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CG-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---T-A-AA-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--AA-AC----CACGTATA-T---T-------TGCTGTACGGG--AA-GTTTT-A--TA--ACC-----TA-T-AA-TGGCTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ATCCCT----T-----AAA----------------------GG-GGA---GG-------------------G-GGG-T-----CCA--ATG--A--AAATGT--AAA-AT--TA--AAATCC-AATa
gi|18 : A----AT-AGC--A--A---GA----TG---A-TA-TC-T-ACATGTAA-A--TTAA--C-AA-T-TT-T-TC----TTGA------C-AAACT-GA-TTC-------AA-T----AGT---A-GT-TG--T---ATGACT---GT-TGAAT-AA------AG--T----GA-TCTG--T---T------CA---T-TTGA-T---A---------T-ATA--AA-ACCG--G--GTATA-T---T-------TGATGTAC-GGT-AA-ATTTT-A--TT--A-CATG--TA-TTGA-TGGTTAA-T----AAATAT---A--A--TT-ATTCCTC---T-----AAA---------------G---GG-TG-TGT---GT-------------------C-GTT-T-----TCG--GTG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-TG-A-G--CACAC---A-A------AGG-GG-AA---AC------CT-CATA-AT-GGTAG-------TT-A----------GGGGG---GAAA-T-CT--T----A--C-CAA-ATACCGGTAGC-CAA-ACTTCC-----CTC---TGTTGAAATATCACTATTATGACAGTCTTCTGTGGGG------------AGTC--TCA-C-TAT-----------------TG--GG-A-AGT-ATT-AC---ttaag
gi|19 : GTTAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AT-------AAA----TA------TTTTCATAGTTTTACTTGCTT--T-TCTGATAT--------------------C------------CG--AAAG-A-C--------------AAC-CTCAA-T---------------------A-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------------A-TAGAGGA-ACT-T----GA-TG--TTTTATCGTG--T-CG-CACGA---TCAGc
gi|19 : CC--AG-A----GACA--A-T-GAGT-C-TCGAGACT-CCGCT----------------C-TA------GT--G---TAC-CCAT-GGCT--A--A---GCCCTG-GTG-G-G-G--T-A---------A-A-AT-GCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---G------------C--AGA----CCA---C---C---TTCCCTCTC-AGTAGG---------------------------CTGCATGC-AAAA-CATGTCTT-GC-AATTT-GG--A-TACATATATCG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCG------T--AA---TTTC-ATTTA--GTGG--TAATGAA-TATCCTT---TCTTTGC--TCTAA-A------TA----AT-ATT--T--G---AA----TG---A-TG-TC-T-A-A---AG-A--T--aagccagagacaatgagtctcgagactccgctctagtgtacccatggctaagccctggtggggtaaaatgccctagtgttatagcagaccaccttccctctcagtaggctgcatgcaaaacatgtcttgcaatttggatacatatatcgtcaattcgtgtatggtatcgtaatttcatttagtggtaatgaatatcctttctttgctctaaataatatttgaatgatgtctaaagat
gi|2 : gttaatgtgttaacaatataaatattttcatagttttacttgcttttctgatatccgaaagacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacttgatgttttatcgtgtcgcacgatcagaagGAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--G-AAAATA-TAC-----------A----GG--C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT--------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT------C-----GAAGAAT-TGACACT--C--TTA-T--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTT-T--TTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAATGTAGGTGTTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GGTCTTTTTCCATGGTT-CG-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCT-T-----------AAA---------GTGGGGGAG-------GG--------------GGG-----TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCC-CA-CA------CG--GCCCCCC-CCAC-A--TCCA--AAGTGCCC-----------A--T-AT-----G-TA-C-AG-CCACC-AG-T-------G--T----AC--C--A---A------------TTAAGA----GCCATTT---CCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT--AAT-TATG-CTA-GC-AATGT--G--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGG-A-TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----ACAAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-AT-T--AACC-AA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---ATGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TC---GACTATA--T---C-ACAATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-------TGTTGT-C-AA--AG-GTTTT-C--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------------A------AG---GG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTT-CTTCC----AC-C-TAT-AT-----TAGT-CAA-GCTTCC-----ACCATTTG----------------------GC-------GGGAGA----------AGTT--TCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|20 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg------TTTTGATA---------------T-----------------------------C------------CG--AAAC-A-C--------------AAC-CTTAA-TA-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T---ACAAC-CAATTT-AA-ATT------AC---CA-AAAACGA-ATC-T----GA-GG---TTTATCATG--T-TG-CGCGA---TCAGGTTT----CG-ACT-T--G--------AAA----------TGTGATGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-C---------------CA--A-T-GAGT-T-TGGA---------------------GCC-TC-CA------GT--T---TGC-CCAT-GGTT--A--A---GCCGTG-GTGGA-G-G--T-GAA--GGG-TG-G-AT-TCCCT-TA-T-------G--T----TA--T--A---G------------T--CGA----CCC---C---TCCTCTCCCCCAG-AGTAGGTTCTC----C---AAG--AA-GA-T--CTGCGTGT-AAAT-TATGTCTT-CC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTCGTG-TAcg
gi|21 : tctCCC--AG-ACCATAACA--A-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATTG-GGG-TG-A-AT-CCCCA-TG-T-------G--T----TA--TAAA---A------------T--AGA----CCC---C---CTC---CCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-CATGCCTT-GC-AAATT-GG--A-TA------GCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCT------T--AA---TTTC-GTT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAG-C------T-----AT-CGCA-T--G---GG----CA---A-TA-TT-T-T-A------A--T--A----AA-T-TT-T-CTCGAATTAA------C-AA
gi|22 : TTTTC-ACTGTAATC--TA--CAT-A-T-GTTT--AA--T-GAAATAC--------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT------------------T---TT-GGG--GTTTTTT-TC---CCCA------TTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTTG--TACGA-AAATTAC-ATGTAAGTACCTTTAAAAAG-AC-CGA---TTAT--TTA-C--CAG--TC-G-A----------T-----------G-------T-G--GTTTTTC-ACCAG-T----GCAT-ATA--GGGTTAAC----GTGTT---TG----T-ATT-AATATTTTTAAATTTTTACTTGCCTCTTGACA---------------T-T----------------------------------------CG--AAGC-A-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-
gi|23 : tagtgaggattcccttgga---TATTGA-T---ATA-ATT-G-C-AAT--CA-ACCA-----ATATA-T---G-------TATTGT-A-GG--GG-GGTTT-C------A-C-----CACT-AG-TGATAAG-G----GAATAT---A--G--TA-ATTCCTC---T-----AA--------------------------------GA-------------------G-GGA--------CG--ACT--T--A---CT--CAA-AACCTA--GAA-CC-TGCT-CG-T-A--GAGG----G-C------GGG-AG-AA---GC------CT-CACT-AT-AGT---------TT-------------GGAG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TTGC-CAG-ACAT-------CCG---TG----------------------G-----AG-GGGGCACCATTCAGCCAGTC--T---T-TCG-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-GT---TATATAACAC
gi|24 : -TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------T-----------------GA-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTT-----------A------TT----AC-AAC-----A---AA----TG---A-TA-TC-A-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-GA---TATTTA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-C----TGGTTAG-G----GAATAT---A--G--CC-ACCCCTC---T-----aggat
gi|25 : aTA--T---C-A-AA-GA---CATAGA-C---GAA-CTC-G-C-ATC--TA-AC-A---ACGTATA-T---A-------TGTTGTGC-AG--AAAGTTTT-A--TT--A-C-----TA--------------G----GAATG-------------ACCCCTT---T-----AA------------------------G-GGG---GT-------------------G-ACT-T-----CCG--GTG-------ATCT--GAA-TA--TC--AAATCC-AGTC-CG-A-G--CACAT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CC-CACT-AT-GGTAC-------TT-A----------TGGGG---GAAA-T-CT--C----A--C---T-ATA----TAGC-CAG-TCTTC-------------------------------------TTTT------GTAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACACt
gi|26 : TTTGCG-TTTAA-A------TA----TT-AAC--T--A----------------------T-A-A----G-A--T--G--A-AA-T-TT-TTCC----TTGA------C-AAGCT-TAATTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ACGGCT---GA--AAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-GA---TACTGA-T---AAATTTC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-------------------------------TTT-C--TT--A-C--------T-AA-T-GTTAGTG----AAATAT---A--A---C-ACCCCTC---TTTAAAAAA------AA------AA---AG-GT-GGG---GG-------------------G-GGG-TC----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-CC-G-A--CACggtatca
gi|27 : tct---AAA-ATT-TGC-ATC--CA-ACCA--C--GTAGG-T---G-------CGTTGTAC-GG--GA-AGTTT-C------G-C-----TA-C-AAGTGGTTAG-G----GGATAT---G--A--CT-ACCCGCC--------------------------AG---GGTGG-TGG---TG-------------------G-TGG-TGGTGACCG---TGTTA--AAA--T--GAG-GA--CA--GACTCC-AA---AG-A-AAGCACGTAGGA-G------GGG-GG-GG---GCAGGGCGCT-AACT-AA-GGTAG-------TT-T----------GGGAG---GGGT-T-CC--C-----------T-ATA----TAGC-CAG-ACCCCC-----CC
gi|28 : tg---TTTC-ATT-A--TTGG--TCAGGAA-TA----A---TATTTGC--ATTGA-A------TA----AT-A----T-------A----TG---A-TA-T--T-A-A---AG-A--T--A--T-AA-T-T
gi|28 : atctcaattcagtgTTAT--TTAAA-A------AA----AT-AAA--T--A---AG----TG-----------C-A-A---AG-A--A--A--C-GA-T------CC----TTAA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---ACGACT---GA-TAAAA-GA------Acacttcgttttcctctaaagatacattttaagttatttaaaaaaataaataagtgcaaagaaacgatccttaacaagctcattcaattcagtagttgaacgactgataaaagaa
gi|29 : atctcaattcagtgtttcattattggtcaggaataatatttgcattgaataatatatgatattaaagatataattcacttcgttttcctctaaagatacattttaag-TT-C-AGT---G-GT-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C----GA-TATA--T---C-A----GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--TA-AC----CACGTACA-T---T-------TGTTGTACGGG--AA-GTTTT-A--TT--A-CCCCCGTACT-AA-TAGTTAA-G----AAATAT---A--A--CC-ACCTCTT---T-----AAA----------------------GG-GGG---GA-------------------G-GGG-T-----CCG--TCG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGCC-TG-A-G--TACGT---A-A------
gi|3 : GAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA--CATTA-T-G-----GA--G-AAAATA-TAC-----------A----GG--C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT--------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT------C-----GAAGAAT-TGACACT--C--TTA-T--CAG--TG-G-ATTTGCTTGTGT-----------G---GTTTT-T--TTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAATGTAGGTGTTA--AA----C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTAT--------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-CAG------------AAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAAA-ATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GGTCTTTTTCCATGGTT-CG-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCT-T-----------AAA---------GTGGGGGAG-------GG--------------GGG-----TCTA-----AT-CCCCA-AG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCC-CA-CA------CG--GCCCCCC-CCAC-A--TCCA--AAGTGCCC-----------A--T-AT-----G-TA-C-AG-CCACC-AG-T-------G--T----AC--C--A---A------------TTAAGA----GCCATTT---CCCCTTCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT--AAT-TATG-CTA-GC-AATGT--G--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGG-A-TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----ACAAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-AT-T--AACC-AA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---ATGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TC---GACTATA--T---C-ACAATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-------TGTTGT-C-AA--AG-GTTTT-C--CTTGA-C-----TA-T--T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------------A------AG---GG-GGCGTG---GG-------------------T-TGG-T-----CCG--ATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTT-CTTCC----AC-C-TAT-AT-----TAGT-CAA-GCTTCC-----ACCATTTG----------------------GC-------GGGAGA----------AGTT--TCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|30 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg--CACATCA-A-A------GGG-GG-AA---GA------TG-GATT-AT-AGTGA-------TA-ATTTCGATGCGGGGGG---GAAG-T-CTT-C----A--C-TAT-ATA----GCGC-AA--------------------------------------------CCTTCCG-GGG--A----------AGTT--TCAAC-TAT-----------------GG--GGGA-AGT-CTC-AC---cg
gi|30 : GAATAA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA--CATCA-T-GTTT--Gacccccccttgggttcagttaccggaataattaattttttgcttgatctacatcatgtttg
gi|31 : agtgagacttcccccatagttgaaacttccccggaaggttgcgctatatagtgaagacttcccccccgcatcgaaattatcactataatccatcttccccctttgatgtgacccccccttgggttcagttaccg-ATG--GGGTTAATTAATGTGTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------AAA-CTCAA-TA-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T---------CAATT--------------AT---CG-TAAAGGA-ATC-T----TA-AG--TTTTATCATG--T-CA-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCT-T--G--------A
gi|32 : cT-A----------GGAAG---GAAG-T-CT--C----AATA-TAT-ATA----TAGC-CAG-CCTTCC-----
gi|33 : tccat-G----GAAGAT---AGGA--CT-ATCCCTT---C-----A---------------------GG-AG-GTA---GG-------------------T-GGT-T-----CCA--ATG--GG-AAATCTT-GAA-AA--TA--AA-TCC-AGTC-CG-ATA--GATGT---A-A--------G-GT-AC---GT------CG-CACT-ATCGGTGG-------TT-G----------GGGTG---TGTG-T-GTC-C----A--CTTATAATA----CGGC-C-G-CCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctttatattg
gi|34 : TTC-ATT-A---TGG--TAAGAAA-TAATCTT---TCAATGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TT---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-TC----TTGACAAATGC-AAGCT-TA-TTC-------AG-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---ATTACT---GT-TAAAA-GA------AG--T----AA-TATA--tgggg
gi|35 : GTT---TACGT-AAT-TA-AATAT---------------G-AC-CAA---T--TAATTAAT--CAA--T----A----------T-----------G---G--TT-T--C-----CAGGCAG-T----G--T-ATG--GGGTTAAT----GGGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----T---------TTCATA---------------T-T------T--------------------
gi|36 : tcttTG--TT---A-T-CC-TCTCA------GTAAG---TGC-GCATGA--T--ATTAT--GCTCTG-TTGAG-G-GAGC-ATTAGGGG-TG-ATAT-GCGCT-AG-T-------G--TTTAGTA--A--A---A------------TG-AGA----CCC---T---CCCATACCCCTTC-ttcttcactctgatatccgaaggacaacctcaa
gi|37 : ttgctgattcttctgtt-GG-AA---GT------TT-TACT-AT-A-TAGCCATTACTT-A----------GGAAG---GAAG-T-CT--TCAAGA--A-TAT-ATA----TAGC-CAG-CCTT-----------------------------------------TCCA-TGGAAA----------AGTC--TCA-C-TAC-----------------AG--GG-G-AAT-TTCAAC---TATACAACAC
gi|38 : aTTCCG-GGAGAA-----------GTC--TTA-TATAT-----------------GG--GG-A-AGG-CTC-AC---C-TATAACACcgca
gi|39 : aggaagggtttcgctttagaggctagagctttcagaggaaggctgacgctagagccacggta--TT-G--TTTTCTCGGCCAG-T----G--C-ATG--GGAT---T----GT-TT---------C-CAT-AA-------AAAG---TA------CCTTCAAA---------------T-T------T-------------------------------------AAACGTAC--------------AAC-GCCAG-TT-T--A---AAG-AGACA-CAA-T---ATAGC-AAATCT-Acg
gi|4 : ttGAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGATC--TA--CATTA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------ATACAGA--C-AC-AG---T-----TT----GTT-CTTG-T----T---TT-GGG--GTTCTCT-TT---GC-G------CTGTTT--T---A-AA-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--TTA-T--CGG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TTAAGGA-ATT-T----GA-GG--ATTTTTCATG--T-CG-CACAA---TCAGGTTTTCAACA-GCTAT--G----------G---------GGAGAGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-CCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-ATGAG-G-G--C-ATG--GGG-TG-A-AT-CCCCT-TG-T-------G--T----TA--T--A---C------------T--AGA----TCCTCTC---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TAG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGGTATAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TA-T-C-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGG------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C----GA-TATA--T---CAA-AA-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCATGCACGTATA-T---T-------TGTTGT-CTCA--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---TAAAA-AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TCT-ATA----TATC-CAA-GCTTCC-----CCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TAA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACACtgaga
gi|40 : ----------GGGGT---AAAG-T-CT--C----A--C---T-ATA----TAGC-CAG-CCCTTCGGGGAAGC---T-----------------------GTCGTCCA-GGGAAA----------AGTC--TCC-C-T
gi|40 : CTTCCG-GGGTAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------ggaagatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : agggagacttttccctggacgacagcttccccgaagggctggctatGGGG---GGAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA-----GGC-CAG-TCTTCC-----CCT---Tatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : T---A-G------GGG-GG-A-----C------CT--ACT-AC--------------T-A----------AAGGG---GAAG-A-CT--G----G--C-C-T-ATA----TAGT-GAG-ACTCCC-----CCC---tagtagtaggtcccccctagggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|42 : GA-GG-AA---GG------CT-CACTAAT-AG-GG-------CC-A----------CTGAG---GAAG-C-AC--C----A--C-T----------TAGC-AAG-ACTTTC----------------------------------------CCG-GGGG------------GGTC--CCA-T-TAT-----------------GGAAGA-A-AGT-CTgggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|43 : C--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AACACTCGAC---TATATAtca
gi|43 : A---GC------CT--ACT----GGGGG-------AT-G----------GGGGG---GGGG-G-GT--C----A--T-TAT--------TAGC-CAG-CCggctggctaataatgaccccccccccccatcccccagtaggctggctata
gi|45 : tatatagtcgagtgtttccccatagtgag-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-C-TGGAGACT-TCACTG--TT---A-TGGT-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-GGCC--A--A---GTCCTG-GTggctata
gi|46 : TTTCT-TT---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACAT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAGG-AC-CGA------T--TTA-T--CAG--TG-A-A----------T-----------ag
gi|47 : -G----GAATAG---G--G--CT-ATCCCTT---C-----A---------------------GG-GG-TAG---GT-------------------G-GGT-T-----CCA--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-atg
gi|49 : C--TCA-T-TAT-----------------GG--GGAA-AGG-CTT-AC---TCTACAACA
gi|5 : GAATAA-T-AATTT----GCTTTGATC--TATACATAA-T-GCTT--GA--T-GAAATAC--------------A----GA--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTT-----------TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--TT--A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------TATGTTAGGGTGG---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--C-ATG--TGGT-AAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------T-TTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---AC-AC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTTCATG--TCCG-CACGA---TCAGGTTT----CA-GCT-TTAA--------AAA---------AAGGGGGGG-------GG-----TGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCT-TCACTG--TT---ATTGCC-TC-CA------GT--G---TGCACCAT-A--T--A--A---GCC--G-GT-AA-G-G--C-ATT--GGGATG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--TAAA---A------------T--AGA--------------CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTT-TC------------------------------------TATGCCTT-GC-AATTTGGG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCATACATGT--AA---TTTC-ATT-A--ATGG--TAAGGAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AACTAT--A---GA----TGAT-A-TA-TC-T-A-A---AG-G--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-GA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TCAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATATT---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCGCTC---T-----AAA------AA------AGAAAAA-AG-GGT---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGtcggca
gi|6 : ccccctaattgggttaagtttccgGAATAA-T-AATTTTTT-GCTGTGATT--TA--CATTA---GTTT--GA----GAAATAC--------------A----GG--CCAA-AG---T-----T-----GTT-GTTG-T----T---T----G--GC-----------------------GTTT--T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-C---CA-AATAT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T-A-T--CAG--TG-G-A----------TTTGTTTGGT--G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCCTA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATA-T----GA-GG--TTTTTCCATG--T-CG-CACAA---TCAGGTTT----CA-GCT-T--T--------AAA---------AGGGGGGAG-------GG--------------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AA--G---TGC-CCAT-A--T----------------GTAA----G--C-A-------------------CC-AG-T-------G--T----TA--C--A---A------------T--AGA----GCC---CATTTCCCTTCCCCCTC-TGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATGT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--A-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-A-CA---ACGTATA-A---T-------TGTTGT-C--A--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC-------------------A------AG---GG-GG-GTG---GG-------------------G-TGG-TC----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CA
gi|7 : ctttcactaatataaaccagtcttccccctttatcatgaggcttcccccccccccttggagttaagttccgT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--A-A-T--CAG--TG-G-A----------TATG--------G---G--TTTT--TTTTTTCAACCAG-TGAACG--T-ATG--GGGTAAAT----GGGGTA--AA----C-AAT-AA-------AAA----T------------ATA---------------T-T------C--------------------C------------CG--GATC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TACCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTCCATG--T-CG-CACAA---TCATGTTT----CA-GCT-T--A--------AAA---------AAGAAGGGG-------GG-----GGG------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--CG-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACT-CCGTTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---G-------------------------------------CCCT-AG-T-------G--T----TA--C--A---G------------T--AGAG---CCCAT-C---CCCCTTCCCCCTC-TGTATGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGAATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTG----------------------T--AA---TTTC-ATT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TA---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AT-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----G-------------------------ATTGA-T---AAA-AGC-T-C----------------------A-T---T-------TGTTGT-C--G--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T----TGGTTAA-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-------A------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------GTGGT-T-----CCG--ACG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-CGGC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GA-AGTACGT------CC-CACT-AT-GGTGG-------TT-AG---------GGGGG---GGGG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----
gi|8 : AA-T-A--TTTTT-GCTTTGATC--TA--TATAA-T-GTTTTTGA--TTGAAATGC-------------------AG--C-AC-CG---CGTTTGTT----GTT-GTTGCT----T---TT-GGA----TTTCC-TA---GCAA------CTGTTT--G---A-ATAT-----TAG-T---TATTC-AAA-TACAATAC-----CCG----GAAC-AC-CGA------T--TTA-T--CAC--TGCG-A----------T--------------------------------AC---------G--T-TGG--GGGTTAAT----GTGTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTTTATAGTTTTTACTTGCCTTT-T------T--------------------T------------TG--AAAT-A-CATGTACGAAACAACAAC-CTCAA-TATT--G---AAGTTGTCA-TAA-T---GCAACGCAATCT-AA-ATT------AT---CA-TAAA-GA-ATC-T----GA-TG--TTTTATCATAT-T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-G-T-T--T--------AAA---------GGGGAAGGG-------GG-----CGT-------GA-----TC-A-----AT-CCCCAGAG-A----GGCA--A-T-GAG--T-CGGAGACC-TCGCTAGTTT---A-TG-C-TT-CA------GT--G---TGT-CCATGG--C--A--A---AGCCTG-GTGGG-A-A--C-ATT--GGT-TG-A-AT-GTCA--AG-T-------G-------TA--T--A---G------------T--AGA--------------CTACGGCCCCCTC-AGTA-GTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGTAAAAT-TATGTCTT-GC-GATTT-GGAAA-TA------TCG-TCGATTCGTG-TATGG-T-ATCA------TAAAA---TTTC-ATT-A--TCGG--CAAGAAATTACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----ATAAAC--T--A---GA----TG---A-TA-TCTT-A-A---AG-ATTT--AC-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCTCCA-TTC-------A
gi|9 : ttgagcttccggAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGCTC--TA--TACAAAT-GTTT--GAGAT-GAAAT--TA------------A----AGGAC-AC-AG---T-----TT----GTG-TTTG-T----T---TTTGGG--ATTATCT-T----GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AA-TGA---T--T--T---T--CAG--TG-ATA----------T-----------GTGAG--TT-T--TTTTTTAAACCAG-T----G--TAATG--GGGTAAAT----GTGTTTTAAA----CAAAT-AA-------AAA----TA------CCTT-ATA---------------TGT------T--------------------C------------CGATAAAC-T-C--------------AAC-CTC-A-T--T--G---AAG-TG-CA-CAA-T---ACAAC-CAATC---A-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-G----GGTGT--TTTTTTCATG--C-CG-TACGAT--TCAGG-TT----CA-GCT-T--T--------AAAAAAAAGGGGGGGGGGAGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----ATCCCCC--AG-A----GGCA--T-T-GGGT-T-TGGATGCT-TCGCTG--TT---A--GCC-TA-CA------GT--G---TG--CCAT-A--T--A--A---GCCCT--GTGAA-G-G--C-ATT--GGG-TG---AT-TCCCT-AG-T-------GGTT----TA--TGAA---A------------TG-AGA----CCC---C---CCC---CCCTTTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GT-C--TTGCATGTGAAAT-TATGCCTTGGCAAAATT-GG--AGTA------TCG-TC-ATTGTGG-TATGG-TAATCA------T--AA---TTTT-CTT-A--A---------------------------TGC--TTTAA-A------TA----TTGAAC--TACA---GA----TGA--A-TA-TC-T-A-A---AG----T--A--CAAA-T-TTAT-CC----TTGA------CAAAGCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---T-GA-
blockSeqs : G T A TT CT TA A A T TT GAT CTAATACA GA C . CGTTTG TT . C CGCG GCT TT TT C . TTTTGCAAAGAATC . CGG C A GTGTA AAA . T AAGTACCTTTAA A C CACTCTT A . . C T TTTGCTTGTGTGGTT TT A GAAC CA A AC T TAAT AATTAA A . ATATTTTT TTTT CTTGCC T GTTTTACTTGCCTTTTTTGAAATACATGTA AT ACATGTACGAAACAAC . T T AT . T T . C G G TA . . . T T . TTTA T TC A GT C . ATT TCAA . A TAA AAAAAGGGGG CCAGGCG CGTAACCAG CTAAC T AGTGG C AG C CCAT . G T C C C GT TAA T A T ATCAGA AA CCC A G TCCAAAGT . AAGGC AG . TAGGGG CA . C . ACGTGTG GT TTAG TACAAAT TCTCCCTCCCCCT T . CAT GA A A TC A A G A G AA G CATATA C T T T A TACATG AA GTC A T CCA TA T ATA CT G TGCATG TCCT A TA AC ATG CACT TGC C T T C C TGT C TT TA AC A G C A T CGAA CAAATG A C A TCCATAT C C A TTA T T AC CAT TCG G C TTAAAC TC C C CT AGA A C CATAG C GAA T T G AA CT C CATGCA T TCTGTCCC CAGAC A G CT TG C CCCCGTACTAA T AGGC CAA GG AC A AAGTAAACCGAGTGATG T C CCT CGCCTCGACCCGCTACGCC T T GGTGA CG TT GA TC G CC CT G T T T AG AGG T CCCAAG T T TAC AGGGCG C A ATAGCCATTAC A TTTCGATGCG TTT A T TCAAGA TTA A CCGG . TT CTCTGTTGAAATATCACTATTATGACAGTCT T GCACCATTCAGCC . C A AATAGGCCAGCCTTCCG AA G G A G TTA
blockSeqs : G . A TT CT . G . . . TT TACA . . . GTTT . . . . . T . T . CCCCAT . T . . . G . . CCG A C CACTCTT . . . . . TTTGCTTGTGTGGTT T A . . . AC T GTAG AATTAA . . TTTTT AAC . C TTTTTACTTGTCTTTTTGGATATC . TCAG . T . AT . . T . C A . TA . . . T T . . . TC A GT . . ATT . . . A G . TCAGCCGT A T . . A T . . . C C . C . TAA . . . . . CCC . G TCCAAAGT . GGGA . . TAGGT AT . . . . . . TGAAATG GCCATTTCCCCT T . . . . . TC G . . . . . . . . T . . . . . . A . T . . . CT G TGCATG T A TA . . . AT C T . C . . . T . AC . . . . . . . . . . . . C . . . T AC AC C G . TTAAAC . C C . . . C TCAT . GAA . . . AA . . CACA . AAAT ACGGG . . . TG . ATGTATTGA . AGGC CAA . . A TAAAAAAAGCTGAG . C . . . . T . . GA T . . . G . . . . CA . . T T . . C . CGGTGG . G TTT T . TCCAC TA . . . G GGGGAAGCTGTCG . AGA . C . AATAGGCCAGCCTTCCG . A G . G TTA
blockSeqs : . . A T . . T . . . T TACA . . . CGT . . . . . T . C . AGCAAC . . . . . . . . CC . C TTATTT . . . . . TATGTTAGGGTGGG T . . . . . T GTAG TTAAA . . T AAC . T TTTTTACTTGTCTTTTTGGATATC . TCAG . . . . . . T . . A . T . . . . . . . . . A T . . T . . . G G . CGT . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . TATTAT . AAGG . . TGGGG A . . . . . . TAAAAT GCCATTTCCCCT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . G . . . A A . . . A . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TGTG . . C . . . . TCAT . . . . . C . . CAC . AAAT ACGGT . . . . . CACTAG . . . . . . TTTAAAAAAAAAA . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . C . GGTGG . . . T . TCCAC TA . . . C ACCATTTGGC . TAA . A . . . . . . A .
blockSeqs : . . A A . . T . . . T TAA . . . TG . . . . . T . T . AGCAC . . . . . . . . CC . T TTAATT . . . . . TTTGTTTGGTGG T . . . . . T TAAT AAA . . T G . C GTTTTACTTGCTTTTCTGATATC . GTAC . . . . . . C . . A . T . . . . . . . . . A . . . . . . . A A . AGC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCAAA . GGAG . . TGGGG A . . . . . . AATAAG TCCTCTCCCCCT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAC . . . . . . . TA . . . . . T . . CGG . T ACGGG . . . . . TACAAG . . . . . . TAAAAAAAAAAG . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGTAG . . . . . CAAT TA . . . T ACCATTTGGC . AGA . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . A C . . C . . . T CA . . . TG . . . . . T . C . TGCAA . . . . . . . . CC . C TTTT . . . . . TATGGG G . . . . . A . AAA . . T . . C GTTTTTACTTGCCTTTTTT . AC . . . . . . T . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . G G . CGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCTAA . GAGG . . TGGGA A . . . . . . CAATTA GCCCATTTCCCT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . T . . CAA . T GCAG . . . . . TATAA . . . . . . TAAAAAAGAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GATGG . . . . . TCA TA . . . A CCCTGGCCT . AAA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A T . . T . . . G CA . . . T . . . . . T . C . TGCGC . . . . . . . . CC . T TTT . . . . . TGTGAG T . . . . . T . AAA . . A . . G TTTATC . AC . . . . . . C . . A . T . . . . . . . . . A . . . . . . . G G . CGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCTAA . GAGG . . TGGG A . . . . . . TAAAAT GCCCATCCCCCT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . A . . CAC . T ACGG . . . . . TATAA . . . . . . TTTAAAAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGTAC . . . . . CCA CA . . . A CCGTGG . GAA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A T . . A . . . T CA . . . T . . . . . T . C . TGCAA . . . . . . . . CC . C TTT . . . . . TATG T . . . . . A . CA . . A . . G TTTTC . AC . . . . . . C . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . G G . CGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTAA . GAGG . . TGGT A . . . . . . CAATTA CCCCTCCTC . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . A . . CAA . T CTCA . . . . . TTAA . . . . . . TTAAATAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGTAG . . . . . GG TA . . . G TTT . GAA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A T . . T . . . G CA . . . T . . . . . T . C . TGCAC . . . . . . . . CC . A TTT . . . . . TGG G . . . . . T . AA . . T . . C TTTTC . AC . . . . . . T . . A . T . . . . . . . . . A . . . . . . . T G . TGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCCAA . GGGA . . AGGG A . . . . . . TAAAAT CCCTCCCAT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . A . . CAA . T AGA . . . . . TAAA . . . . . . TAAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GATGG . . . . . CA TA . . . A CCT . AAA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . T CA . . . T . . . . . . . C . GCAC . . . . . . . . CC . C TTT . . . . . TGG T . . . . . T . AA . . A . . C TGTTC . TC . . . . . . A . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . A A . GGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAAA . GAAG . . GGGG C . . . . . . ATAGT CCCCCCCC . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . A . . CA . G CAA . . . . . TATT . . . . . . TAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGTGA . . . . . CA TA . . . T . . TAA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . T C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . A TTT . . . . . TG T . . . . . A . TG . . A . . C TTTC . TC . . . . . . C . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . T A . CGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . GGG . . TGGT G . . . . . . AAATG CTACGGCC . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . A . . CA . T AGG . . . . . TATT . . . . . . TAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGTGG . . . . . CA TA . . . A . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A TTT . . . . . T T . . . . . A . AA . . A . . C TTTC . TC . . . . . . C . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . T A . CGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . AAG . . TGGG A . . . . . . TAGT CCCTACCT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . T . . CA . A CAA . . . . . TAA . . . . . . TAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGGGG . . . . . TG TA . . . G . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A TTA . . . . . T T . . . . . A . AA . . A . . C TTTC . TC . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . GA . . G C . . . . . . AAAT CCCCCTC . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . A . . CA . G AG . . . . . TAA . . . . . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGTGG . . . . . TA TA . . . C . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C TTT . . . . . T . . . . . . T . AA . . A . . C TTCC . TC . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . AA . . G A . . . . . . TAGC CCCCCCC . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . A . . CA . T AG . . . . . TAC . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGGG . . . . . TA TC . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . A TTT . . . . . . . . . . . A . AA . . A . . C TTT . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . A . . . . . . TAGT CCACCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . A . . AA . T AG . . . . . TAA . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGT . . . . . CA TA . . . C . . .
blockSeqs : . . . . CA . . T . . T TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . A . . . . . . TACT CCCCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . CA . T AG . . . . . TAA . . . . . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGT . . . . . CA TA . . . G
blockSeqs : . . . . . A . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . CAAT CCCCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . CA . T CA . . . . . TAT . . . . . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . CA TA . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . CAGT CTACG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . T CG . . . . . TAT . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . CA A . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . TAGT CCCC . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA T . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG C . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA T . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . C . . .
blockSeqs : . . C . . .
blockSeqCons : CA****************** **** TGCAC********** ** CC********** C* TTT******** ** ** TTGGG************************ T*** *** A*** ****** *** ** *** **** G********** ** GAGG** TGGG*** TAAT********************* CCCCCCCT*********** **** **** TAAAAG************************* GGTGG******** **** CCTTGGC******************************** **
originalCons : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACTA------------A----GG--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TT---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAG-AC-CGA---T--T--TTA-T--CAG--TG-G-A----------T-----------G---G--TT-T--TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNTCATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-T--N--------AAA---------GGGGGGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TA--T--A---A------------T--AGA----CCC---C---CCCCTTCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-----AAA------AA------AG---GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCC-----CCC---TG----------------------GCCTTCCG-GGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
finalCons : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA--CATNA-T-GTTT--GA--T-GAAATACA------------------GG--C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-TTGCAC----------TGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGTCC----------GAAG-AC-CGATTT--------A-T--CAG--TG-G-ATTGGG------------------------TTT---TTTTTTCAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GTGTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AAC-CTCAA-TA-T--G---AAG-TGCCA-CAA-TA---CAAC-CAATCT-AA-ATG------AT---CA-TAAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNTCATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-TG----------AAA---------GGGGGGGGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--AG-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACT-TCGCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--G---TGC-CCAT-A--T--A--A---GCCCTG-GTGAGG--G--C-ATTGGG---TG-A-AT-CCCCT-AG-T-------G--T----TATAAT---------------------AGACCCCCCCT-----------TCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-T--CTGCATGT-AAAT-TATGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTC-ATT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AAC--T--A---GA----TG---A-TA-TC-T-A-A---AG-A--T--A--C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---ATGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T----GA-TATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T-AA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTCTAAAAG-------------------------GG-GG-GGG---GG-------------------G-GGG-T-----CCG--ATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-ATGGTGG--------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCCCCTTGGC--------------------------------TCCG-GGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): TTTCAGCCTAAATAAAGAAGGGGGAGGGCAAGCCGCCGAAATGATGAAATTGACCATTGCAATGCCCCTAGATCCGC
Unaligned ( gi|48 ): CCCTTTGGGTTAAGTTTCCGGAATAATAGTTTTTGCTTTGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1111111111 1111 111 111111111111111 2222222222222222 111111111111 111 1111 7777777777777777777777 1111 1111 1111 11111111 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222 11 111 33333333333333 11111111111111 111111 1111111111111111111111111 1111111111111111111 111111 222222 2222222 11111111111 2222222 222222222222 3333333333333333333333333333333 1111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 111
lowQualScore : 6 6 3 33 88 7777777777 7 333 6666 44 5555 111 3 3 999999 55 3 3 999999999999999 3 3 7777 555 66 44 2 3 1111111111111111 44 888 3 3 77777 777 2 2 555555555555 000 444 1111 33 2 33 2 2 2 3333333333333333333333 77 5 5555 33 2 66 7 0000 0000 666 4444 2 2 22222222 5555 666666 0 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 33 000000000000000000 66 2 555 66 444 2 2 2 4 5555 2 3 2 5 777777 444 5 5 2 5555 2 33 1 77 00 2 2 444 8888 2 2 00000000000000 0 5555 8888888 55555555555555 99999 5 66666 2 22 4 4 4444 22 2 6 4 2 0 4 22 777 2 2 2 666666 22 2 777 4 555555 22 4 55 0 2 777777 33 2 777 8 2 333 2 2 2 9999999 4444 9999999999999999999999999 8888888888888888888 4444 888 4 4444 333 33 2 2 66 4 2 2 2 2 22 2 666666 2 0 2 2 2 2 666666 33 333 4 2 555 22 2 333 66 3 000000 5555 3 3 66 22 333 3333 777 3 3 1 3 1 333 1 22 77 1 5 1 1 1 1 4444 555555 1 2 2 6666666 2 4 2 333 2 4 66 333 33 888 4 2 111111 33 4 777777 33 444 555 999999 2 777 2 2 2 77 22 2 9999999 2 00000000000 9999999 2 2 22 55 2 555555555555 1 8888 666 22 22 3 4444444444444444444444444444444 4 22 22 99999 22 77 44 2 22 22 3 2 2 2 22 777 2 666666 4 4 333 666666 6 2 4444444444444 1 9999999999 555 4 1 8888888888 333 1 4444 3 22 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 5 5 2 2 000
lowQualScore : . . . .. .. .......... . ... .... .. .... ... . . ...... .. . . ............... . . .... ... .. .. . . ................ .. ... . . ..... ... . . ............ ... ... .... .. . .. . . . ...................... .. . .... .. . .. . .... .... ... .... . . ........ .... ...... . . .......................................................... .. .................. .. . ... .. ... . . . . .... . . . . ...... ... . . . .... . .. . .. .. . . ... .... . . .............. . .... ....... .............. ..... . ..... . .. . . .... .. . . . . . . .. ... . . . ...... .. . ... . ...... .. . .. . . ...... .. . ... . . ... . . . ....... .... ......................... ................... .... ... . .... ... .. . . .. . . . . . .. . ...... . . . . . . ...... .. ... . . ... .. . ... .. . ...... .... . . .. .. ... .... ... . . . . . ... . .. .. . . . . . . .... ...... . . . ....... . . . ... . . .. ... .. ... . . ...... .. . ...... .. ... ... ...... . ... . . . .. .. . ....... . ........... ....... . . .. .. . ............ . .... ... .. .. . ............................... . .. .. ..... .. .. .. . .. .. . . . . .. ... . ...... . . ... ...... . . ............. . .......... ... . . .......... ... . .... . .. ............................................................................................. .. . . . . ...
lowQualScore : 7 7 2 55 55 7777777777 0 999 5555 22 3333 777 3 3 666666 77 3 3 555555555555555 3 3 1111 888 66 66 1 1 6666666666666666 22 555 1 1 77777 333 7 7 333333333333 111 777 3333 77 7 77 7 7 7 5555555555555555555555 33 3 7777 77 5 99 9 0000 0000 555 7777 4 4 88888888 6666 444444 9 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 222222222222222222 55 4 444 55 111 4 5 4 7 5555 4 2 7 3 777777 777 3 3 7 7777 7 77 0 33 00 7 7 777 9999 9 9 11111111111111 9 7777 7777777 44444444444444 33333 0 22222 5 99 2 2 5555 99 1 3 2 1 8 4 99 444 1 1 1 111111 99 1 444 2 777777 99 2 88 4 2 555555 22 4 222 4 1 666 1 1 1 7777777 5555 0000000000000000000000000 6666666666666666666 5555 888 4 7777 999 11 2 2 11 4 1 1 1 1 99 1 111111 1 1 5 1 2 2 444444 11 777 0 0 777 88 0 555 88 6 555555 4444 5 5 55 44 000 7777 222 5 5 7 5 7 000 7 44 22 8 5 8 8 9 9 0000 555555 9 0 0 5555555 1 2 1 777 1 2 11 999 11 333 4 2 444444 22 7 444444 11 111 222 666666 2 444 1 1 1 22 99 1 5555555 1 44444444444 9999999 1 1 99 88 1 222222222222 9 1111 777 66 66 8 1111111111111111111111111111111 0 33 66 55555 88 55 88 0 88 66 8 1 1 0 66 888 4 888888 4 4 777 111111 3 1 5555555555555 8 3333333333 666 6 5 5555555555 444 5 8888 5 77 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 99 7 7 9 3 888
consensus : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA----------CATNA-T-GT----TT--GA--T-GAAA---T-A-C------AGG-C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-T-T---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAGA-C-CG---AT----T--T-AT--CAG-TG-G-AT---------T-------G-GG-TTTTTTTTT--CAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GT----GTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------A--AC-CTCAAT-A-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCTAA-A-TG------AT---CAT-AAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNT--CATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-T-----G--------AAAGGGGGGG----GG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--A-G-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACTTC-GCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--GTGC-CC---AT-A--T---A--A-G--CCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-T-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------T----TA--T--A---A------------T--AGA----C---C-----C----C----CCCT-TCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GA----TG---A-TAT-C-T-A-A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GA-T----ATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-TAA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-------AAA--------AGGG-----GG-GGGGGG-GGG-T-----CCGATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCC-------CC--TTG--G---------------------C---CCGGGGGGA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
Reference ( family-2580 ) : GAATAA-T-AATTTTTT-GCTTTGATC--TA----------CATNA-T-GT----TT--GA--T-GAAA---T-A-C------AGG-C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTTG-T----T---TT-GGG--GTTTTCT-T-T---GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAGA-C-CG---AT----T--T-AT--CAG-TG-G-AT---------T-------G-GG-TTTTTTTTT--CAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTNAAT----GT----GTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------A--AC-CTCAAT-A-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCTAA-A-TG------AT---CAT-AAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTNT--CATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GCT-T-----G--------AAAGGGGGGG----GG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--A-G-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACTTC-GCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------GT--GTGC-CC---AT-A--T---A--A-G--CCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGG-T-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------T----TA--T--A---A------------T--AGA----C---C-----C----C----CCCT-TCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TT-A--NTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GA----TG---A-TAT-C-T-A-A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GA-T----ATA--T---C-A-AA-NA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCA--CACGTATA-T---T-------TGTTGT-C-GG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-TAA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-------AAA--------AGGG-----GG-GGGGGG-GGG-T-----CCGATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TAGC-CAG-NCTTCC-------CC--TTG--G---------------------C--TCCGGGGGAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACAC
gi|1 : -A----------GGGGG---GAGG-T--T--C----A--C-TAT-TTAT---TAGCTCAG-CCTTCC-------
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccGGGC---GCGG-T-CT--C-------C-TAT-ATA-----AGC-CAG-CCTTCC---------------------------------------------GGGGGA----------GG------------------------------GG--GG-A-GGT--TC-AC---TATTTAcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaa-------TT-C----------GGGGG---AGAG-TTCT--C-------C-TAT-A------TAGC-CAGTTCTTCC-------CC--CTacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagtt-A------GGG-GG-AA---GC------CT-CACT----------------TTAA----------AGGGG---GAAGAA-CT--G----G--C-TAT-ATA----ttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|1 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctccGAATCA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TATAATATGCCTCATAA-C-ATAATATT--GA----GAAA---T-AGC------AGA-C-ACTAG---T-----TTTATGGCTAGTTG-T----T---CT-TAG--GTATACTCT-T---GC--------CTGTTTGTT---A-AT-T-----CAGTT----ACCTGAAA-CCAAAAGT-----CCC----GAAGA-AATG---AT----TGTT-ACTCCAGCTT-G-ATATAGT----T-------G-GG-TTTTTT-----CAACCAG-T----G--C-ATG--GGGT-AAT----GT----GTT---TA----C-AATTAA-------AAA----TA------TCT----G---------------T-T----------------------------------------CG--AATC-T-C--------------A--ACGCTCTAT-A-T--GCATAAG-TGTAAACAA-TGGGACAAC-CAATCTAATA-TGTATAGTATTTTCAT-A---GA-ATCGT----GA-GGCTTTTTTT--CATG--C-CGGCACGAA--TCAGGTTTA---CATGCT-T-----TTAAAAAACAAAGGGGGGG----AG-------GG-----CTG------GGA-----TC-A------T-CCCC----G-A----GGCATAG-T-GA-T-T-GGGAGGCTT--GTTG--TT---A-T-CC-TC-C-------GT--GTGC-CC---AT-A--T---A--A-G--CCCTGAGTAAGCG-G--CCATT--GGGGT-G-A-ATTCCCCT-AGCTG-------T----TA--T--A---AATAATCGAGGTAT--AAA----TATGC-----C----C----CCC-----CCCTC-AGTAGGTTTTCTGCTC---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GG-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAGTTGGTG-TATGG-T-AT-----------AA---TTTCA-TT-A--ATGG--TAAGGAA-CATTCTT---T----GT--TTTAA-A------TG----TT-AA-T--T--A---TA-----G---A-TAT-C-T-A-A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GA-TCGATATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TCC--TA-ACCA--C--GTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA---A-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-AACCCTC---T-------AAA--------AAAG-----GG-GGGGGG---------------TG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATGA-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C--A--ATA----TAGC-CAA-GCTTCC-------Cgggttaagtttccgaatcattaattttttgcttgatctataatatgcctcataacataatattgagaaatagcagacactagttttatggctagttgttcttaggtatactcttgcctgtttgttaattcagttacctgaaaccaaaagtcccgaagaaatgattgttactccagcttgatatagttgggttttttcaaccagtgcatggggtaatgtgtttacaattaaaaatatctgttcgaatctcaacgctctatatgcataagtgtaaacaatgggacaaccaatctaatatgtatagtattttcatagaatcgtgaggctttttttcatgccggcacgaatcaggtttacatgcttttaaaaaacaaagggggggagggctgggatcatccccgaggcatagtgattgggaggcttgttgttatcctccgtgtgcccatataagccctgagtaagcggccattggggtgaattcccctagctgttataaataatcgaggtataaatatgccccccccctcagtaggttttctgctctagaagatctgcatgtaaattatgccttggaatttggatatcgtcagttggtgtatggtataatttcattaatggtaaggaacattctttgttttaaatgttaattatagatatctaaagatacaattttccttgacaatctcatttaattcagtagatgaatgactgataaaagaagtgatcgatatatcaaatatattgataaaatctctcctaaccacgtatatttgttgtagaagttttcttactaatggttagggaatataaccaaccctctaaaaaagggggggggtggaaatctgaaaataaaatgaagtccgaacacgtaagggggaagtctcactatggtggttaggggggaagtctcacaatatagccaagcttccc
gi|10 : gccggatgctgtatatatgtcgaagattccccggaaggctgagctaataaatagtgaacctcccccctcccccggaaggctggcttatataggagaccgcgcccacccagttttcgggggagagttctcctatatagccagttcttccccctttaaagtgaggcttccccctgggttaagtttcc--------AAAGGGGGGG----GGCCAGGCGGGTCAGCCGT------GGAA----TC-A-----AT-CCCC--A-GCA----GGCA--A-TTGTGT-CCTGGGAGCTTC-GCTG--TT---A-TAC--TC-CA------GT--G-GC-CC---AT-A--T---A--AAG--CCCTG-GTAAG-GCG--C-ATT--GGG-T-G-A-AT-CCCCTCAG-GT-------T----TA--T--ACAAA------------T--AGA----C---C-----C----C----CCCC-CCCCCC-C-AGTAAGTTCTC----C---TAGGAAA-GAATC--TGCATGT-AAATCA-TGCCTT-GC-AATTT-AG--A-TA------TCGCTCAATTGGTGTTATGGTT-ATCA------T--TAGTCTTTCA-TT-ACCATCG--TGAGGAA-CATTCTT---TACTTGC--TTTAA-A------TATCCTAC-AA-C--T--A---CACACTTGTGCA-TAT-C-T-A-A---AGCG--T--A-C-AA-TCTT-T-CC----TTGA------C-CA----CA-TTCTCCATATAA-TT-CAAGCTTAA-GA-TA--ACATG--TGACCTCGAA-TAAAACGACAC---AGTCT-GACT----ATACTC---C-A-CA-CATAGTATTGACT---AAA-ATCTT-C-CTCCTTACACCA--CA-ATACA-T---TCTGTCCCTGCTAC-C-AGACAA-GTTTT-CCTTC--A-C-----T--TAA-TGGTTAA-G------ATAT---A--A--CC-ACCCCTCAAGT-------AAACCG-----AGTG-----AT-GGGGCG-GG
gi|10 : cCGATG--G--AAATCTTCGAA-AA--AACTAAATCC-AGTCTCGTG-A--CACcctggcgcctcgacccgctacgccggcgttccgcgatggaaatcttcgaaaaaactaaatccagtctcgtgacacccacgtctaaagtcggaactctgacta
gi|11 : caaagggggggggccaggcgggtcagccgtggaatcaatccccagcaggcaattgtgtcctgggagcttcgctgttatactccagtggcccatataaagccctggtaaggcgcattgggtgaatcccctcaggtttatacaaatagacccccccccccccccagtaagttctcctaggaaagaatctgcatgtaaatcatgccttgcaatttagatatcgctcaattggtgttatggttatcattagtctttcattaccatcgtgaggaacattctttacttgctttaaatatcctacaactacacacttgtgcatatctaaagcgtacaatctttccttgaccacattctccatataattcaagcttaagataacatgtgacctcgaataaaacgacacagtctgactatactccacacatagtattgactaaaatcttcctccttacaccacaatacattctgtccctgctaccagacaagttttccttcacttaatggttaagatataaccacccctcaagtaaaccgagtgatggggcgggcctggcgcctcgacccgctacgccggcgttccgAA-T-A-TTTTTT-GCTTTGATC--TA----------TATAA-T-GT----TT--GA--T-GAAA---T-G-C------AG--C-AC-CGCG-T-----TT----GTT-GTTG-T----TGCTTT-TGG--ATTTCCT-T-A---GC-A------CTGTTT--G---A-AT-T-----TAGTG---TATTC-AAA-TACAATAC-----CC-----GAACA-C-CG---AT----T--T-AT--CAC-TG-G-AT-----------------------------------AC---------G--T--TG--GGGTTAAT----GT----GTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTCTATAGTTTTACTTGCCTT-T-T------T--------------------TGAAATACATGTACG--AAAC-A-C--------------A--AC-CTCAAT-A-T--G---AAG-TGTCA-TAA-T---GCAAC-CAATCTAA-A-TT------AT---CAT-AAAGGA-ATC-T----GA-TG--TTTTAT--CATA--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GTT-T-----A--------AAAGGGGAAG----GG-------GG-----CGT------G-A-----TC-A-----AT-CCCC--A-G-A----GGCA--A-T-GAGT-C-GGGAGACCTC-GCTG--TT---A-TGTT-TC-CA------GT--GTGT-CC---AT-G--GCA-A--A-G--CCCTG-GTGGG-A-A--C-ATT--GGT-T-G-A-AT-GTCCA-AG-TG-------T----TA--T--A---G------------T--AGA----C---T-----A----C----GGC----CCCCTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGTCTT-GC-GATTT-GG--A-TA------TCG-TCGATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TT-A--TCGG--CAAGAAA-TACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----AT-AA-C--T--A---GA----TG---A-TAT-C-T-A-A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------ccacgtctaaagtcggaactctgacta
gi|12 : ggcttccgg--------AAAAGGGGGG----GG-------GG-----AGC------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--A-GTA----CGCA--A-T-GGGT-T--GCATGCTTC--CTA--CT---A-TGCCATC-CA-------T--GTGC-C-----T-A--T---A--A----CCCTG-CGGAG------C-ATT--AGG-TTGCA-AT-CCCCT-AG-TACGTGTGAT----TA--A--A---A------------T--AGA----C---C-----C----C----C----TCCCCCTC-GATA--TTCTC----CCATTAA--TA-AA-TA---GCATGT-AAATAAATACCTT-GC-AAAT--GG--A-TA------TCG-TAAATTAGTG-TGTG----ATCA------T--AA---TTTCA-TT-A--ATG---TAATCAA-TATTCTTATATCTATGC--TT--A-A------TAT---AT-AA-C--T--AATGGA----TG---A-TAT-C-T-A-C---AT-G--T--A-C-AAGT-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTT-------AGCTT-C-AGT---ATGA-TG--A---ACATGACT----A-TAAAG-AATGTG--AG--T-AA-T----AT---T---C-A-AA--A---TATTGA-T---CAA-AAC-T----TC--TA-AC-A--C-TTTATA-T---T-------TGTTGT-A-GA--GA-ATTTTGC--TT--A-C-----TA--AA-TG-TTAG-G----AAATAT---A--AACCT-ACCTCTT---TT------AAAT-------AAAA-----TA-GGAGGG-AGG-T-----CCGATG--G--AAATTT--GAAGAA--TA--AAATCC-AGTC-C--A-A--CACCT---A-G------GGA-GG-AA---AT------CTCCACT-A--AGT---------TT-A----------GGGGA---TCAT-T-TC--C----A--C-T-T-ATA----TACG-CAG-C-------------------------------------------C--TCCGGGGGGG----------GGGCTATCA-CTTAT-----------------CG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACA
gi|13 : CC--A-G-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCTTT-CCTG--TT---A-TGCC-TC-CAATCAGAGT--GTGC-CC---AT-A--T---A--A-G--CCCTG-GTAAG-G-G--C-ATT--GGGGT-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------T----TA--T--A---AAA----------T--AAA----T---CTCCCTC----C----CCCT-TCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTA-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCATTTGATT-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC----TA------------------------T--A---GA----TG---A-TGT-C-T-A-A---AG-G--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GA-T----TTA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTT--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-ATTTT-C--TT--A-C--------TAA-TGGATAG-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---TTTAA---AAA--------AAAA-----AG-GGGGGG-GTT-T-----CCGCTT--G--CTATCT--GAA-CA--TA--AGATCC-AGTG-CG-T-A--CA
gi|14 : gAAG-T-GT--C----A--C-TAT-AT------AGC-AAG-TCTTCC-------CC--
gi|14 : A--AAATT--ATTC-CG-G-A--AACGT---A-ACCCAAGGGG-GG-AA---AC------CT-CACT-AT-A--------------A----------ATGGG---GAAG-A-CT--T----G--C-TAT-ATA----atttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccggaataatttttgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|14 : aagtgtcacAA-T-AATTTTT--GCATTGATC--TG----------CATGA-TTGT----TT--GA--T-GGAA---T-A-C------AGG-C-AC-AG---T-----TTTT--GTT-GTTA-T----T---TT-GGGTTGTTTTTT-T-TTTTGC-AAAGAATCGGTCT--TCGGACAT-TGTGTATAGGTAAATAGGT-AAA-CTAAAT-T-------------AAGA-C-CG---AT----T--T-AT--CAG-TG-G-AT---------T-------------TTTTTTTT--CATTCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAATTAATGT----GTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------A--AA-CTCAAT-A-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C--A-A-TG------AT---CGT-AAAGGA-ATC-TTTTAAA-AG--TTGTAT--CATG--T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCT-T-----G--------AAA---GGCA----GT-------GG-----CGTAACCAGGGACTAACTC-AAGTGGAT-GCTT--A-G-T----GGCA--AGT-G-GT-T-TGGGGACtgcattgatctgcatgattgtttgatggaatacaggcacagtttttgttgttattttgggttgtttttttttttgcaaagaatcggtcttcggacattgtgtataggtaaataggtaaactaaattaagaccgatttatcagtggattttttttttcattcagtgcatggggttaattaatgtgttaattaacaatgtaaatattttcatatttttacttgtctttttggatatccgaaacaaactcaatatatgaagtgtcacaatcaatgatcgtaaaggaatcttttaaaagttgtatcatgtcgcgcgatcaggtttcatcttgaaaggcagtggcgtaaccagggactaactcaagtggatgcttagtggcaagtggtttggggac
gi|15 : aagtgtcactatatagcaagtcttccccatttatagtgaggtttccccccttgggttacgtttccgg-A--CATGT---ATA------GGG-GG-AA---GC------CG-CACT-AT-A--------------A----------AGGGG---GAAG-A-CT--T----A--C---T-ATA----TAGC-GAG-AC
gi|15 : gGAATAA-T-G-TGTTTA-GCATTG-TC--TA----------CAT-----GT----TT--GA--T-GAAA---T-A-C------AGG-C-AC-AGGTTT-----TT----GTT-GTTG-CCGCGT---TT-GGG--GTTTTCT-T-T---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACCT-ACA-CACAATGT-----CC-----GAAGA-C-CG---AT----T--T-AT--CAG-TG-G-GTA--------T-------G----TTTTTTTTT--CAATCAG-T----G--C-ATG--GGGTTAAT----GT----GAT---AA----C-AAT-ATTTTT---ACT----TG------TCTTTTTG---------------T-T------TAT------------------C------------CG--AAAC------------------A--AA-CTCAAT-A-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T-------------C--A-A-TG------AT---CAT-TAAGGA-ATC-T----GA-GA--TTTTAT--CATG--T-CG-CGCGA---TCAGAGTT----CA-GCT-T-----A--------AAAGGGGAGG----GG-------CG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT--CAC--A-G-A----GGCA--A-T-GGGT-C-AGGAGACTCC-GCTG--TT---A-TACC-TC-CT------CT--GTGT-TC---AT-GGCT---A--A-G--aggttaagtttccggaataatgtgtttagcattgtctacatgtttgatgaaatacaggcacaggtttttgttgttgccgcgtttggggttttctttgcaatgttttaatttagtttacctacacacaatgtccgaagaccgatttatcagtgggtatgtttttttttcaatcagtgcatggggttaatgtgataacaatatttttacttgtctttttgtttatccgaaacaaactcaatatgaagtgtcacaatcaatgatcattaaggaatctgagattttatcatgtcgcgcgatcagagttcagcttaaaaggggaggggcgcgtggatcaatcacagaggcaatgggtcaggagactccgctgttatacctcctctgtgttcatggctaag
gi|16 : ggtctcgctatatagtaagtcttccccctttatagtgcggcttccccctatacatgtaggttaagtttccgGG-T-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------T----TAAAT--A---A------------G--AGA----C---C-----C----T----ACCT-TCCCCCTC-AGTATGTTCTC----C---TAG--AAAGA-TC--TGCATGT-AAATTA-TACCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TT-A--ATGG--TAATAAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AA-CTAT--A---GA----TG---A-TAT-C-T-A-A---AG-G--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------T-AATCT-CA-TTT-------AG-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GA------ATA--TAGAT-A-AA-TA---TATTGA-T---ATA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTCGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------TAA-TGGTTAG-G----AAATAT---A--A--CC-ACACCTC---T-------AAAAAAAGCTGAGAG-----GG-GGGGGG-GGGTT-----CCGAGG--G--AAATAT--GAA-AA--TA--AAATCA-AGTC-CG-A-A--
gi|17 : G-T-G-A-AT-CCC-T-AG-TG-------T----TAA-T--A---G------------T--AGA----C---C-----C----C----TCCT-----CCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGTCTT-GC-AATTT-GG--A-T-------TCG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTCCA-TT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AA-C--C--A---GA----TG---A-TAT-C-T-A-A---AG-A--T--A-T-AG-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CG-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GA-T----ATA--T---T-A-AA-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--AA-AC----CACGTATA-T---T-------TGCTGTACGGG--AA-GTTTT-A--TA--ACC-----TA-TAA-TGGCTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ATCCCT----T-------AAA-----------------GG-GGAGGG-GGG-T-----CCAATG--A--AAATGT--AAA-AT--TA--AAATCC-AATa
gi|18 : A----AT-AG-C--A--A---GA----TG---A-TAT-C-T-ACATGTAA-A--TTAA-C-AA-T-TT-T-TC----TTGA------C-AAACT-GA-TTC-------AA-T----AGT---A-GT-TG--T---A--TGACT---GT-TGAAT-AA------AG--T-GA-T----CTG--T---T------CA---T-TTGA-T---A---------T-ATA--AA-AC----CGGGTATA-T---T-------TGATGTAC-GGT-AA-ATTTT-A--TT--A-CATG--TATTGA-TGGTTAA-T----AAATAT---A--A--TT-ATTCCTC---T--------AA--------AGGG-----TG-TGTGTC-GTT-T-----TCGGTG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-TG-A-G--CACAC---A-A------AGG-GG-AA---AC------CT-CATA-AT-GGTAG-------TT-A----------GGGGG---GAAA-T-CT--T----A--C-CAA-ATACCGGTAGC-CAA-ACTTCC-------CT--CTGTTGAAATATCACTATTATGACAGTC--TTCTGTGGGG----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------TG--GG-A-AGT-ATT-AC---ttaag
gi|19 : GTTAAT----GT----GTT---AA----C-AAT-AT-------AAA----TA------TTTTCATAGTTTTACTTGCTT--T-TCTGATAT--------------------C------------CG--AAAG-A-C--------------A--AC-CTCAAT----------------------A-T---ACAAC-CAATCTAA-A-TG------------AT-AGAGGA-ACT-T----GA-TG--TTTTAT--CGTG--T-CG-CACGA---TCAGc
gi|19 : CC--A-G-A----GACA--A-T-GAGT-C-TCGAGACTCC-GCT----------------C-TA------GT--GTAC-CC---AT-GGCT---A--A-G--CCCTG-GTG-G-G-G--T-A----------A-A-AT-GCCCT-AG-TG-------T----TA--T--A---G------------C--AGA----C---C-----A----C----C--T-TCCCTCTC-AGTAGG-------------------------C--TGCATGC-AAAACA-TGTCTT-GC-AATTT-GG--A-TACATATATCG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCG------T--AA---TTTCA-TTTA--GTGG--TAATGAA-TATCCTT---TCTTTGC--TCTAA-A------TA----AT-AT-T--T--G---AA----TG---A-TGT-C-T-A-A---AG-A--T--aagccagagacaatgagtctcgagactccgctctagtgtacccatggctaagccctggtggggtaaaatgccctagtgttatagcagaccaccttccctctcagtaggctgcatgcaaaacatgtcttgcaatttggatacatatatcgtcaattcgtgtatggtatcgtaatttcatttagtggtaatgaatatcctttctttgctctaaataatatttgaatgatgtctaaagat
gi|2 : gttaatgtgttaacaatataaatattttcatagttttacttgcttttctgatatccgaaagacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacttgatgttttatcgtgtcgcacgatcagaagGAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA----------CATTA-T-G---------GA----GAAAATAT-A-C------AGG-C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT---------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT-----C------GAAGAAT-TG---ACACTCT--T-AT--CAG-TG-G-AT---------TTGCTTGTGTGG-TTTTTTTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAAT----GTAGGTGTT---AAA---C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTA---------------T-T------TT-------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AGAAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAA-AATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GG--TCTTTTTCCATGGTT-CG-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCT-T--------------AAAGTGGGGG----AG-------GG--------------GGG-----TCTA-----AT-CCCC--AAG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCC-CA-CA------CG--GCCC-CCCCCAC-A--TCCAA--A-GTGCCC-----------A--T-AT-----G-T-A-C-AG-CCACC-AG-TG-------T----AC--C--A---A------------TTAAGA----G---C-----CATTTC----CCCT-TCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT-AA-TTA-TGC-TA-GC-AATGT-G---A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGGA--TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----AC-AAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-A--TTAA-CCAA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---A--TGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TCGACT----ATA--T---C-ACAATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-------TGTTGT-C-AA--AG-GTTTT-C--CTTGA-C-----TA-T-T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------A--------AGGG-----GGCGTGGGT-TGG-T-----CCGATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTT-CTTCC----AC-C-TAT-AT-----TAGT-CAA-GCTTCCA------CCATTTG--G---------------------C------GGGAGA----------AGTT--TCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|20 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg------TTTTGATA---------------T-----------------------------C------------CG--AAAC-A-C--------------A--AC-CTTAAT-A-T--G---AAG-TGTCA-CAA-T---ACAAC-CAATTTAA-A-TT------AC---CAA-AAACGA-ATC-T----GA-GG---TTTAT--CATG--T-TG-CGCGA---TCAGGTTT----CG-ACT-T-----G--------AAA-TGTGAT----GG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-C----------------CA--A-T-GAGT-T-TGGA---------------------GCC-TC-CA------GT--TTGC-CC---AT-GGTT---A--A-G--CCGTG-GTGGA-G-G--T-GAA--GGG-T-G-G-AT-TCCCT-TA-TG-------T----TA--T--A---G------------T--CGA----C---C-----C----C----TCCTCTCCCCCAG-AGTAGGTTCTC----C---AAG--AA-GA-TC--TGCGTGT-AAATTA-TGTCTT-CC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTCGTG-TAcg
gi|21 : tctCCC--A-G-ACCATAACA--A-T-GGGT-T-TGGATGCTTC-GCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--GTGC-CC---AT-A--T---A--A-G--CCCTG-GTGAG-G-G--C-ATT--GGGGT-G-A-AT-CCCCA-TG-TG-------T----TA--TAAA---A------------T--AGA----C---C-----C----C----CTC---CCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATCA-TGCCTT-GC-AAATT-GG--A-TA------GCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCT------T--AA---TTTCG-TT-A--ATGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAG-C------T-----AT-CG-CA-T--G---GG----CA---A-TAT-T-T-T-A------A--T--A---AA-T-TT-T-CTCGAATTAA------C-AA
gi|22 : TTTTC-ACTGTAATC--TA----------CAT-A-T-GT----TT--AA--T-GAAA---T-A-C------AGG-C-AC-AG---T-----T--------------T----T---TT-GGG--GTTTTTT-TCC---CC-A------TTGTTT--T---A-AT-T-----TAGTTG--TACGA-AAATTAC-ATGTAAGTACCTTTAAAAAGA-C-CGATTAT----T--T-AC--CAG-TC-G-ATG--------T-------G-G------TTTTT--C-ACCAG-T----GCAT-ATA--GGGTTAAC----GT----GTT---TG----T-ATT-AATATTTTTAAATTTTTACTTGCCTCTTGACA---------------T-T----------------------------------------CG--AAGC-A-C--------------A--AC-CTCAAT-A-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-
gi|23 : tagtgaggattcccttgga---TATTGA-T---ATA-ATT-G-C-AAT--CA-ACCA-----ATATA-T---G-------TATTGT-A-GG--GG-GGTTT-C------A-C-----CACTAG-TGATAAG-G----GAATAT---A--G--TA-ATTCCTC---T-------AAG--------AGGG-----A--------------------CGACT--T--A---CT--CAA-AACCTA--GAA-CC-TGCT-CG-T-A--GAGG----G-C------GGG-AG-AA---GC------CT-CACT-AT-AGT---------TT-------------GGAG---GAAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----TTGC-CAG-ACAT---------CC--GTG--G--------------------------AGGGGGCACCATTCAGCCAGTC--T---T-TCG-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-GT---TATATAACAC
gi|24 : TA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------T-----------------GA-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTT-----------A------TT----AC-AA-C-----A---AA----TG---A-TAT-C-A-A-A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GA-T----ATA--T---C-A-AA-GA---TATTTA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-AC----CACGTATA-T---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-C---TGGTTAG-G----GAATAT---A--G--CC-ACCCCTC---T-------aggat
gi|25 : aTA--T---C-A-AA-GA---CATAGA-C---GAA-CTC-G-C-ATC--TA-AC-A---ACGTATA-T---A-------TGTTGTGC-AG--AAAGTTTT-A--TT--A-C-----TA-------------G----GAATG-------------ACCCCTT---T-------AA-------------------G-GGGGTG-ACT-T-----CCGGTG-------ATCT--GAA-TA--TC--AAATCC-AGTC-CG-A-G--CACAT---A-A------GGG-GG-AA---GC------CC-CACT-AT-GGTAC-------TT-A----------TGGGG---GAAA-T-CT--C----A--C---T-ATA----TAGC-CAG-TCTTCT-------TT--T-----------------------------------GTAA----------AGTC--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGT-CTC-AC---TATATAACACt
gi|26 : TTTGCG-TTTAA-A------TA----TT-AA-C--T--A----------------------T-A-A----G-A--T--G-A-AA-T-TT-TTCC----TTGA------C-AAGCT-TAATTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--CGGCT---GA--AAAA-GA------AG--T-GA-T----ATA--T---C-A-AA-GA---TACTGA-T---AAATTTC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATA-------------------------------TTT-C--TT--A-C--------TAA-T-GTTAGTG----AAATAT---A--A---C-ACCCCTC---TTTAAAAAAAA--------AAAG-----GT-GGGGGG-GGG-TC----CCGATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTT-CC-G-A--CACggtatca
gi|27 : tct---AAA-ATT-TGC-ATC--CA-ACCA--C--GTAGG-T---G-------CGTTGTAC-GG--GA-AGTTT-C------G-C-----TA-CAAGTGGTTAG-G----GGATAT---G--A--CT-ACCCGCC----------------------AGGGT----GG-TGGTGG-TGG-TGGTGACCG-TGTTA--AAA--T--GAG-GA--CA--GACTCC-AA---AG-A-AAGCACGTAGGA-G------GGG-GG-GG---GCAGGGCGCT-AACT-AA-GGTAG-------TT-T----------GGGAG---GGGT-T-CC--C-----------T-ATA----TAGC-CAG-ACCCCC-------CC--
gi|28 : tg---TTTCA-TT-A--TTGG--TCAGGAA-TA----A---TATTTGC--ATTGA-A------TA----AT-A-----T-------A----TG---A-TAT---T-A-A---AG-A--T--A-T-AA-T-T
gi|28 : atctcaattcagtgTTAT--TTAAA-A------AA----AT-AA-A--T--A---AG----TG-----------C-A-A---AG-A--A--A-C-GA-T------CC----TTAA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---A--CGACT---GA-TAAAA-GA------Acacttcgttttcctctaaagatacattttaagttatttaaaaaaataaataagtgcaaagaaacgatccttaacaagctcattcaattcagtagttgaacgactgataaaagaa
gi|29 : atctcaattcagtgtttcattattggtcaggaataatatttgcattgaataatatatgatattaaagatataattcacttcgttttcctctaaagatacattttaag-TT-C-AGT---G-GT-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C-GA-T----ATA--T---C----A-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-G-C-ATC--TA-AC----CACGTACA-T---T-------TGTTGTACGGG--AA-GTTTT-A--TT--A-CCCCCGTACTAA-TAGTTAA-G----AAATAT---A--A--CC-ACCTCTT---T-------AAA-----------------GG-GGGGAG-GGG-T-----CCGTCG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGCC-TG-A-G--TACGT---A-A------
gi|3 : GAATAAGT-AATTTTTTTGCTGTGATTCTTA----------CATTA-T-G---------GA----GAAAATAT-A-C------AGG-C-CA-AA---TG----TT----GTT-GTTG-T----T---T--GGC--GTCTT---------------------------T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-AAA-CACAATAT-----C------GAAGAAT-TG---ACACTCT--T-AT--CAG-TG-G-AT---------TTGCTTGTGTGG-TTTTTTTTTTTCAACCAGAT----G--T-ATGACGGGTAAAT----GTAGGTGTT---AAA---C-AAT-AA-------AAAAAC-TA------TCTTCCTA---------------T-T------TT-------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------AGAAC-CTCAATTA-T--G---AAG-TGCCA-CAACT---ACAAC-CAATCTAA-AATG------AT---CATTAAAGGATATA-T----GA-GG--TCTTTTTCCATGGTT-CG-CACCAATTTCAGGTTT----CA-GCT-T--------------AAAGTGGGGG----AG-------GG--------------GGG-----TCTA-----AT-CCCC--AAG-A----GGCA--A-TCAAATCT-TGGAAACTCCCGCTG--CTTAAA-TGCC-CA-CA------CG--GCCC-CCCCCAC-A--TCCAA--A-GTGCCC-----------A--T-AT-----G-T-A-C-AG-CCACC-AG-TG-------T----AC--C--A---A------------TTAAGA----G---C-----CATTTC----CCCT-TCCCCCTCTGGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TTCTTGCATGT-AA-TTA-TGC-TA-GC-AATGT-G---A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCAATT-A--TTGG--TAAGGA--TATTCTT---TCTTTGCCTTTTAAGA------TA----AC-AAAC--T--A---GA----TA---ACTATTC-TCA-A---AG-A--TTAA-CCAA-T-TT-C-AC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TTCC-AGT---A-AATTGACA---A--TGACTC--GAGTAAAA-GATTAAACAG--TCGACT----ATA--T---C-ACAATCAT--TATTGA-TGAAAAA-ATC-T-CAATC--T----CA---ACGT-TA-TAAAT-------TGTTGT-C-AA--AG-GTTTT-C--CTTGA-C-----TA-T-T-TGGTTAA-GAGGCAAATATCAAA--A--CCAACCCCTC-------------A--------AGGG-----GGCGTGGGT-TGG-T-----CCGATG--GGAAAATCT--GAA-AA--TA--AATTCCGAGTT-CG-A-A--CACGT---A-A------GGGTGGTAA---GT------CTCCACT-AT-GATGG-------TT-A----------GGGGGTTTGGGGTT-CTTCC----AC-C-TAT-AT-----TAGT-CAA-GCTTCCA------CCATTTG--G---------------------C------GGGAGA----------AGTT--TCACC-TATAATAGGCCAGCCTTCCGGG--GG-AGAGT-CTCGACTTATATATAACAC
gi|30 : atataagccccagtcttccccacctttatcatgaggctttcacccccccttcccccccttggagttaagtttccg--CACATCA-A-A------GGG-GG-AA---GA------TG-GATT-AT-AGTGA-------TA-ATTTCGATGCGGGGGG---GAAG-T-CTT-C----A--C-TAT-ATA------GCGCAA-CCTTCC----------------------------------------------GGGGA----------AGTT--TCAAC-TAT-----------------GG--GGGA-AGT-CTC-AC---cg
gi|30 : GAATAA-TTAATTTTTT-GCTT-GATC--TA----------CATCA-T-GT----TT--Gacccccccttgggttcagttaccggaataattaattttttgcttgatctacatcatgtttg
gi|31 : agtgagacttcccccatagttgaaacttccccggaaggttgcgctatatagtgaagacttcccccccgcatcgaaattatcactataatccatcttccccctttgatgtgacccccccttgggttcagttaccg-ATG--GGGTTAATTAATGT----GTT---AATTAAC-AAT-GT-------AAA----TA------TTTTCATA---------------T-T------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC------------CG--AAAC------------------A--AA-CTCAAT-A-TATG---AAG-TGTCA-CAA-T---------CAATT--------------AT---CGT-AAAGGA-ATC-T----TA-AG--TTTTAT--CATG--T-CA-CGCGA---TCAGGTTT----CA-TCT-T-----G--------A
gi|32 : cT-A----------GGAAG---GAAG-T-CT--C----AATA-TAT-ATA----TAGC-CAG-CCTTCC-------
gi|33 : tccat-G----GAAGAT---AGGA--CT-ATCCCTT---C-------A------------GG-----AG-GTAGGT-GGT-T-----CCAATG--GG-AAATCTT-GAA-AA--TA--AA-TCC-AGTC-CG-ATA--GATGT---A-A--------G-GT-AC---GT------CG-CACT-ATCGGTGG-------TT-G----------GGGTG---TGTG-T-GTC-C----A--CTTATAATA----CGGC-C-G-CCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctttatattg
gi|34 : TTCA-TT-A---TGG--TAAGAAA-TAATCTT---TCAATGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GA----TT---A-TAT-C-T-A-A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-TC----TTGACAAATGC-AAGCT-TA-TTC-------AG-TT-C-AGT---A-GT-TG--A---A--TTACT---GT-TAAAA-GA------AG--T-AA-T----ATA--tgggg
gi|35 : GTT---TACGT-AAT-TA-AATAT---------------GA-C-CA---AT----T--A-AT--TAA-TC-A-ATA--------T-------G-G-------TTTC--CAGGCAG-T----G--T-ATG--GGGTTAAT----GG----GTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----T---------TTCATA---------------T-T------T--------------------
gi|36 : tcttTG--TT---A-T-CC-TCTCA------GTAAGTGC-GC---ATGA--T---ATTATG--CTCTG-TTGAG-G-GAGC-ATTAGGGG-T-G-ATAT-GCGCT-AG-TG-------TTTAGTA--A--A---A------------TG-AGA----C---C-----C----T----CCCA-TACCCCTttcttcactctgatatccgaaggacaacctcaa
gi|37 : ttgctgattcttctgtt-GG-AA---GT------TT-TACT-AT-A-TAGCCATTACTT-A----------GGAAG---GAAG-T-CT--TCAAGA--A-TAT-ATA----TAGC-CAG-CCTTTC-------CA--T----------------------------------GGAAA----------AGTC--TCA-C-TAC-----------------AG--GG-G-AAT-TTCAAC---TATACAACACtc
gi|38 : a--TCCGGGAGAA-----------GTC--TTA-TATAT-----------------GG--GG-A-AGG-CTC-AC---C-TATAACACcgca
gi|39 : aggaagggtttcgctttagaggctagagctttcagaggaaggctgacgctagagccacggtat-TTGTTTTCT--CGGCCAG-T----G--C-ATG--GGAT---T----GT-----TT---------C-CAT-AA-------AAAG---TA------CCTTCAAA---------------T-T------T-------------------------------------AAACGTAC--------------A--AC-GCCAGT-T-T--A---AAG-AGACA-CAA-T---ATAGC-AAATCTAcg
gi|4 : ttGAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGATC--TA----------CATTA-T-GT----TT--GA--T-GAAA---T-A-CTAATACAGA-C-AC-AG---T-----TT----GTT-CTTG-T----T---TT-GGG--GTTCTCT-T-T---GC-G------CTGTTT--T---A-AA-T-----TAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAGA-A-TG---AT----T--TTAT--CGG-TG-G-AT-------------------GG-TTTTTTTTT--CAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GT----GTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------A--AC-CTCAAT-A-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCTAA-A-TG------AT---CAT-TAAGGA-ATT-T----GA-GG--ATTTTT--CATG--T-CG-CACAA---TCAGGTTTTCAACA-GCTAT-----G----------GGGAGAGG----GG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--A-G-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGACTCC-GCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--GTGC-CC---AT-A--T---A--A-G--CCCTG-ATGAG-G-G--C-ATG--GGG-T-G-A-AT-CCCCT-TG-TG-------T----TA--T--A---C------------T--AGATCCTC---T-----C----C----CCCT-TCCCCCTC-AGTAGGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TAG-TCAATTCGTG-TATGG-T-ATCA------T--AA---TTTCA-TT-A--TTGGTATAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GA----TA---A-TAT-A-T-C-A---AG-A--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGG------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--C-GA-T----ATA--T---CAA-AA-GA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-ACCATGCACGTATA-T---T-------TGTTGT-CTCA--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-TAA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---TAAAAAA-AAA--------AGGG-----GG-GGGGGG-GGG-T-----CCGATG--G--AAATTT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GG-AA---GT------CT-CACT-AT-GGTGG-------TT-A----------GGGGG---GAAG-T-CT--C----A--C-TCT-ATA----TATC-CAA-GCTTCC-------CC--CTG--G---------------------CCTTCCGGGGGAA----------AGTC--TAA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AGC-CTC-AC---TATATAACACtgaga
gi|40 : ----------GGGGT---AAAG-T-CT--C----A--C---T-ATA----TAGC-CAG-CCCTTCGGGGAAGC----TG--T---------------------CG-TCCAGGGAAA----------AGTC--TCC-C-T
gi|41 : GGGG---GGAG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA-----GGC-CAG-TCTTCC-------CC--TTggaagatgggcacttaatcccaatcc
gi|41 : T---A-G------GGG-GG-A-----C------CT--ACT-AC--------------T-A----------AAGGG---GAAG-A-CT--G----G--C-C-T-ATA----TAGT-GAG-ACTCCC-------CC--tagtagtaggtcccccctagggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|42 : gGA-GG-AA---GG------CT-CACTAAT-AG-GG-------CC-A----------CTGAG---GAAG-C-AC--C----A--C-T----------TAGC-AAG-ACTTTC------------------------------------------CCGGGGG------------GGTC--CCA-T-TAT-----------------GGAAGA-A-AGT-CTgggttaagtttccggaataatataatgggtctcgt
gi|43 : A---GC------CT--ACT----GGGGG-------AT-G----------GGGGG---GGGG-G-GT--C----A--T-TAT--------TAGC-CAG-CC--------------------------------------------------------------------C--TCA-C-TAT-----------------GG--GG-A-AACACTCGAC---TATATAtca
gi|45 : -A-----AT-CCCC--A-G-A----GGCA--A-T-GAGT-C-TGGAGACTTC-ACTG--TT---A-TGGT-TC-CA------GT--GTGC-CC---AT-GGCC---A--A-G--TCCTG-GTggctata
gi|46 : TTTCT-T-T---GC-A------ATGTTT--T---A-AT-T-----TAGTT---TACAT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAGGA-C-CG---AT----T--T-AT--CAG-TG-A-AT---------ag
gi|47 : -G----GAATAG---G--G--CT-ATCCCTT---C-------A------------GG-----GG-TAGGTG-GGT-T-----CCAATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-atg
gi|49 : C--TCA-T-TAT-----------------GG--GGAA-AGG-CTT-AC---TCTACAACA
gi|5 : GAATAA-T-AATTT----GCTTTGATC--TATA--------CATAA-T-GC----TT--GA--T-GAAA---T-A-C------AGA-C-AC-AG---T-----TT----GTT-GTT-----------TT-GGG--GTTTTCT-T-T---GC-A------CTGTTT--TT--A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAGA-A-TG---AT----T--T-AT--CAG-TG-G-ATATGTTAGGGT-------G-GG-TTTTTTTTT--CAACCAG-T----G--C-ATG--TGGT-AAT----GT----GTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------T-TTCATA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------A--AC-CTCAAT-A-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---AC-AC-CAATCTAA-A-TG------AT---CAT-AAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTT--CATG--TCCG-CACGA---TCAGGTTT----CA-GCT-TTA---A--------AAAAAGGGGG----GG-------GG-----TGT------GGA-----TC-A-----AT-CCCC--A-G-A----GGCA--A-T-GAGT-T-TGGAGGCTTC-ACTG--TT---ATTGCC-TC-CA------GT--GTGCACC---AT-A--T---A--A-G--CC--G-GT-AA-G-G--C-ATT--GGGAT-G-A-AT-CCCCT-AG-TG-------T----TA--TAAA---A------------T--AGA-------------------C----CCCT-TCCCCCTC-AGTAGGTT-TC-----------------------------------TA-TGCCTT-GC-AATTTGGG--A-TA------TCG-TCAATTGGTG-TATGG-T-ATCATACATGT--AA---TTTCA-TT-A--ATGG--TAAGGAA-CATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----TT-AA-CTAT--A---GA----TGAT-A-TAT-C-T-A-A---AG-G--T--A-C-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AATCT-GA-TTT-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TCAAA-GA------AG--T-GA-T----ATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-TTC--TA-AC----CACGTATATT---T-------TGTTGT---AG--AA-GTTTT-C--TT--A-C--------TAA-TGGTTAG-G----GAATAT---A--A--CC-ACCGCTC---T-------AAA--------AAAGAAAAAAG-GGTGGG-GGG-T-----CCGATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CACGtcggca
gi|6 : ccccctaattgggttaagtttccgGAATAA-T-AATTTTTT-GCTGTGATT--TA----------CATTA---GT----TT--GA----GAAA---T-A-C------AGG-CCAA-AG---T-----T-----GTT-GTTG-T----T---T----G--GC------------------------GTTT--T---A-AT-T-----TTGTT---TACCT-C---CA-AATAT-----CC-----GAAGA-A-TG---AT----T--T-AT--CAG-TG-G-AT---------TTGTTTG-GTGG-TTTTTTTTT--CAACCAG-T----G--T-ATG--GGGTAAAT----GT----GTT---AA----C-AAT-AA-------AAA----TA------TCTTCCTA---------------T-T------T--------------------C------------CG--AAAC-T-C--------------A--AC-CTCAAT-A-T--G---AAG-TGCCA-CAA-T---ACAAC-CAATCTAA-A-TG------AT---CAT-AAAGGA-ATA-T----GA-GG--TTTTTC--CATG--T-CG-CACAA---TCAGGTTT----CA-GCT-T-----T--------AAAAGGGGGG----AG-------GG--------------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--A-G-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACTCC-GCTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AA--GTGC-CC---AT-A--T-----------------GTAA----G--C-A--------------------CC-AG-TG-------T----TA--C--A---A------------T--AGA----G---C-----C----CATTTCCCT-TCCCCCTC-TGTAGGTTCTC----C---TTA--AA-GA-TC--TGCATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATGT-GG--A-TA------TCG-TCAATTGA------------------------AA---TTTCA-TT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AC-AA-C--T--A---GA----TA---A-TAT-C-T-A-A---AG-A--T--A-A-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-GA-T----ATA--T---C-A-AA-TA---TATTGA-T---AAA-ATC-T-C-ATC--TA-A-CA---ACGTATA-A---T-------TGTTGT-C--A--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T---TGGTTAA-G----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC-------------A--------AGGG-----GG-GTGGGG-TGG-TC----CCGATG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-AGTC-CG-A-A--CA
gi|7 : ctttcactaatataaaccagtcttccccctttatcatgaggcttcccccccccccttggagttaagttccgT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAGA-A-TG---AT----T--A-AT--CAG-TG-G-ATA--------T-------G-GGTTTTTTTTTT--CAACCAG-TGAACG--T-ATG--GGGTAAAT----GG----GGTA--AA----C-AAT-AA-------AAA----T------------ATA---------------T-T------C--------------------C------------CG--GATC-T-C--------------A--AC-CTCAAT-A-T--G---AAG-TACCA-CAA-T---ACAAC-CAATCTAA-A-TG------AT---CAT-AAAGGA-ATC-T----GA-GG--TTTTTC--CATG--T-CG-CACAA---TCATGTTT----CA-GCT-T-----A--------AAAAAGAAGG----GG-------GG-----GGG------GGG-----TC-A-----AT-CCCC--C-G-A----GGCA--A-T-AAAT-T-TGGAAACTCC-GTTG--TT---A-TGCC-TC-CA------AT--GTGC-CC---AT-A--T---A--A-G----------------------------------------CCCT-AG-TG-------T----TA--C--A---G------------T--AGAG---C---CCAT--C----C----CCCT-TCCCCCTC-TGTATGTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGAATGT-AAATTA-TGCCTT-GC-AATTT-GG--A-TA------TCG-TCAATTG----------------------T--AA---TTTCA-TT-A--TTGG--TAAGGAA-TATTCTT---TCTTTGC--TTTAA-A------TA----AT-AA-C--T--A---GA----TA---A-TAT-C-T-A-A---AG-A--T--A-C-AT-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAACT-CA-TTC-------AA-TT-C-AGT---A-GA-TG--A---A--TGACT---GA-TAAAA-GA------AG--T-G-----------------------------ATTGA-T---AAA-AGC-T-C----------------------A-T---T-------TGTTGT-C--G--AA-GTTTT-C--TT--A-C-----TA-T---TGGTTAA-A----GAATAT---A--A--CC-ACCCCTC---T-------AAA--------AGGG-----GG-GGGGGGTGGT-T-----CCGACG--G--AAATCT--GAA-AA--TA--AAATCC-CGGC-CG-A-A--CACGT---A-A------GGG-GA-AGTACGT------CC-CACT-AT-GGTGG-------TT-AG---------GGGGG---GGGG-T-CT--C----A--C-TAT-ATA----
gi|8 : AA-T-A--TTTTT-GCTTTGATC--TA----------TATAA-T-GT----TTTTGA--TTGAAA---T-G-C------AG--C-AC-CG---CGTTTGTT----GTT-GTTGCT----T---TT-GGA----TTTCC-T-A---GCAA------CTGTTT--G---A-ATAT-----TAG-T---TATTC-AAA-TACAATAC-----CCG----GAACA-C-CG---AT----T--T-AT--CAC-TGCG-AT-----------------------------------AC---------G--T-TGG--GGGTTAAT----GT----GTT---CA----T-GAT-AT-------AAA----TA------TTTTTATAGTTTTTACTTGCCTTT-T------T--------------------T------------TG--AAAT-A-CATGTACGAAACAACA--AC-CTCAAT-ATT--G---AAGTTGTCA-TAA-T---GCAACGCAATCTAA-A-TT------AT---CAT-AAA-GA-ATC-T----GA-TG--TTTTAT--CATAT-T-CG-CGCGA---TCAGGTTT----CA-GTT-T--------------AAAGGGGAAG----GG-------GG-----CGT-------GA-----TC-A-----AT-CCCCAGA-G-A----GGCA--A-T-GAG--T-CGGAGACCTC-GCTAGTTT---A-TG-C-TT-CA------GT--GTGT-CC---ATGG--C---A--A-A--GCCTG-GTGGG-A-A--C-ATT--GGT-T-G-A-AT-GTCA--AG-TG------------TA--T--A---G------------T--AGA-------------------C----TACG-GCCCCCTC-AGTA-GTTCTC----C---TAG--AA-GA-TC--TGCATGTAAAATTA-TGTCTT-GC-GATTT-GGAAA-TA------TCG-TCGATTCGTG-TATGG-T-ATCA------TAAAA---TTTCA-TT-A--TCGG--CAAGAAATTACTCTT---TCTTTGC--TTTAA-ATGCATGTA----ATAAA-C--T--A---GA----TG---A-TAT-CTT-A-A---AG-ATTT--ACC-AA-T-TT-T-CC----TTGA------C-AAGCTCCA-TTC-------A
gi|9 : ttgagcttccggAATAA-T-AATTTTT--GCTTTGCTC--TA----------TACAAAT-GT----TT--GAGAT-GAAA---TTA-A------AGGAC-AC-AG---T-----TT----GTG-TTTG-T----T---TTTGGG--ATTATCT-T-----GC-A------CTGTTT--T---A-AT-T-----CAGTT---TACCT-AAA-CACAATGT-----CC-----GAAGA-A-TG---AT----T--T--T--CAG-TG-ATATG--------T-------G-AG-TTTTTTTTT--AAACCAG-T----G--TAATG--GGGTAAAT----GT----GTTTTAAA----CAAAT-AA-------AAA----TA------CCTT-ATA---------------TGT------T--------------------C------------CGATAAAC-T-C--------------A--AC-CTC-AT---T--G---AAG-TG-CA-CAA-T---ACAAC-CAATC--A-A-TG------AT---CAT-AAAGGA-ATC-G----GGTGT--TTTTTT--CATG--C-CG-TACGAT--TCAGG-TT----CA-GCT-TTAAAAA--------AAAGGGGGGGGGGAGG-------GG-----CGT------GGA-----TC-A-----ATCCCCC--A-G-A----GGCA--T-T-GGGT-T-TGGATGCTTC-GCTG--TT---A--GCC-TA-CA------GT--GTG--CC---AT-A--T---A--A-G--CCCT--GTGAA-G-G--C-ATT--GGG-T-G---AT-TCCCT-AG-TGGT-----T----TA--TGAA---A------------TG-AGA----C---C-----C----C----CCC---CCCTTTC-AGTAGTTTCTC----C---TAG--AA-GT-CT--TGCATGTGAAATTA-TGCCTTGGCAAAATT-GG--AGTA------TCG-TC-ATTGTGG-TATGG-TAATCA------T--AA---TTTTC-TT-A--A---------------------------TGC--TTTAA-A------TA----TTGAA-C--TACA---GA----TGA--A-TAT-C-T-A-A---AG----T--A-CAAA-T-TTAT-CC----TTGA------CAAAGCT-CA-TTT-------AA-TT-C-AGT---T-GA-
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): TTTCAGCCTAAATAAAGAAGGGGGAGGGCAAGCCGCCGAAATGATGAAATTGACCATTGCAATGCCCCTAGATCCGC
Unaligned ( gi|48 ): CCCTTTGGGTTAAGTTTCCGGAATAATAGTTTTTGCTTTGA