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Reference ( gi|10 ) : ACATAGTGTTAAATCCCAA-----------------ATTC--ACGACCAT-----------ACACTGA-G-GAGT-T--C-C-A--A------A---TT----GA--------T-A----G-T--T--T-G-----T----AC--------C--A------TCA--A---CT-A-G---T-C----T-TGA--G----G------T---AC--A---G-AAC-----G-GTTT---GA-AAA--T-GTC-TT-CA-GATAG-AC-TA-TTTG-------AA-A-T-T-TA-A-ATA-T--TTT-----T--CTA--TT-----T--GTT-AATTTT-GTTTTT--CA-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------GTA----A--G----GATA----GA-C-GGGT--C--T-G-TA---C-C--TCA-----A----G-A---C-T-A---AT---T--GA---T--A--------GTA----C--A--A--A-----C--TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---C-G-------------T-G---------------------A-A---------AAT-------A-AT--C-A-AC-T-T-G-ATT--TAA-TTT----GGG-ATTTAA
gi|6 : ACATGGTGTTAAATCCCAATTTGAATCAAGTTGGTTATTTTGACGTCCATTTT--------GTGCTGA-A-GAGT-T--C-C-A--A------A---TT----GA--------T-A----G-T--T--T-G-----T----AC--------T--A------TGG--A---TT-A-G---T-C----T-TGA--G----G------T---AC--A---G-AAC-----G-GTTT---AA-AAA--T-GTT-TT-CA-GGTAG-AC-TG-TTTG-------AT-A-T-T-TA-C-GTA-G--TTT-----A--AAA--TT-----T--GTT-AATTTT-GTTTTT--CA-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----C----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------GTA----C--A----GATA----AA-C-AGGT--C--T-A-TA---C-C--TTA-----A----G-A---C-T-A---GT---T--GA---T--ATAGTACATGTA----C--A--A--A-----C--TA--------T-C----G----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AGGACTTAAAG-TAT-C----------A-----AAATTTATGGAT--C-G-------------T-G---------------------A-A---------A---------A-AT------AC-TAT-G-ATT--AAA-TTT----GGG-GT
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gi|15 : gtgaatcccacattaaatgaatttggttatttttaaggctgttgcaaatggccacacgaatttaatttcataccCCA------------ACACTGA-A-GAGT-T--C-C-A--A------A---TT----GA--------T-G----G-T--T--T-G-----T----AC--------T--A------TCA--A---CT-A-G---T-C----T-TCA--G----G------T---AC--A---G-AAT-----G-GTCT---taaatggtggtcatttgcaatggctttgaaaat
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gi|6 : atttatccaaattaaatccaagttgttattttttacatatattttgtgcattt-----------ACACTGA-A-GAGT-T--C-C-A--A------A---TC----GA--------T-A----G-T--T--T-G-----T----ACATGTACTAT--A------TCA--A---CT-A-G---T-C----T-TAA--G----G------T---AT--A---G-ACC-----T-GTTT---aactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
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gi|11 : ttttcattggtgtgtaaattcccaatttaatcaagttggttattttgacgtccattttgtgctgaaggagttccaagattgattagtttgtactaggatttactcttgacgtacataacggtttttaaaaatgttttcagatagactgtttgcaaatttaacgtagtttctactttcgttaattttgtttttcatgatttgaaatgctttgtgacaaactaaagtcatttaaaagtacaagataaacaggg-----------ATATTGA-A-GAGT-T--C-C-A--A------A---TT----GA--------T-A----G-T--T--T-G-----T----AT--------T--A------TCA--A---CT-A-G---C-C----T-CGA--G----A------T---AC--A---G-AAC-----T-GTTT---AA-CAA--T-TTC-TT-CA-GACAG-AC-CG-GTTG-------AA-A-T-T-TA-T-GCA-G--TTT-----T--CGT--TC-----T--GTT-CATTTT-GATCTT--CA-----T-GA---TTTTTAAA-TGCTT---T-TTT-A-----T----AA-A-GA-A-AGT-CATTTA-AAA------GTA----A--A----GATA----GA-C-TTGT--C--T-G-TA---C-C--TCA-----A----G-A---A-T-A---AT---G--CA---T--A--------GTA----C--A--A--A-----C--TA--------A-C----T----A--T------T---T-G---A--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAT-CA--C----------A-----AA----ATgagaaagcacaaaatggacgttgaaaataaccaaacttgatttaaattgggattttaacactta
gi|11 : aatcccaaattaaatcaagttggttattttgacatatattttgtgctttctca-----------ACACTGA-A-GAGT-T--T-C-A--A------A---TA----GT--------T-A----G-T--T--T-G-----T----AC--------T--A------TGC--A---TT-A-T---T-C----T-TGA--G----G------T---AC--A---G-Aat
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gi|3 : atttatccaaattaaatccaagttgttattttttacatatattttgtgcatttccaacactgaaaagatcacacattgataatgttactattaactagtcttgaggtaccaggaacctgtctcacaaatgttgttcagacaggactggtttgaaatttatgccatttttctatttttaattttgatttcatattttgaaatgcttgtgataaagaaagttcatttaaagtaaaagaatagagCACTGA-A-GAGT-T--C-C-A--A------A---TT----GA--------T-A----G-T--T--T-G-----T----AC--------G--ATTGTATTCA-------T-A-T---T-CTTGTT-TGA--G----A------T---AC--A---A-ACC-----G-cttgcagaaagacataaaattaggtgaagaaccaacttgaatttaattgggatttaaaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|2 : atttatccaaattaaatccaagttgttattttttacatatattttgtgcatttccaacactgaaaagatcacacattgataatgttactattaactagtcttgaggtaccaggaacctgtctcacaaatgttgttcagacaggactggtttgaaatttatgccatttttctatttttaattttgatttcatattttgaaatgcttgtgataaagaaagttcatttaaagtaaaagaatagagCACTGA-A-GAGT-T--C-C-A--A------A---TT----GA--------T-A----G-T--T--T-G-----T----AC--------G--ATTGTATTCA-------T-A-T---T-CTTGTT-TGA--G----A------T---AC--A---A-ACC-----G-cttgcagaaagacataaaattaggtgaagaaccaacttgaatttaattgggatttaaaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|8 : atttatccaaattaaatccaagttgttattttttacatatattttgtgcatttccaacactgaaaagatcacacattgataatgttactattaactagtcttgaggtaccaggaacctgtctcacaaatgttgttcagacaggactggtttgaaatttatgccatttttctatttttaattttgatttcatattttgaaatgcttgtgataaagaaagttcatttaaagtaaaagaatagagACTGA-G--AGT-T--C-C-A--A------A---TT----GA--------T-A----G-TGTT--T-G-----T----AC-----------G------TAA--AGGATT-A-C---T-C----T-TGA--A----G------T---AC--A---T-AAC-----G-GTTT----A-AAA--T-TTT-TT-CA-GAT-G-A--TC-TTGGTT-----AA-A-TGT-TA-A-GTG-T--TTT-----C----A--TT--------GTT-A---TT-ATTGTT--CA-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---TGGTG-------C----AA----A-A-AGT-CATTTA-AA----------------------------------------------G-TA---C-TA-TTA-----A----G-A---C-T-A---GT---T--GAGACG--A--------GT-----C--AGTA--A-----CA-TA--------T------A----A--T------TG--T-G---G--A-A-C--C-AT-C--A----TG-TT-G-AA-----AAGG-----C----------A-----AA----ATGGA---C-G-------------T-G---------------------A-A---------AA--------A-A-----A-AC-T-T-G-ATT--TAA-ATT----GGG-cttgcagaaagacataaaattaggtgaagaaccaacttgaatttaattgggatttaaaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|36 : cttttcatggtttaaattcccaatttaaatcatagtatggttgttttgacagtcatttttgtgACTGA-A-GAGT-T--C-C-A--A------A---TT----GA--------T-A----G-agttaaacgtataga
gi|7 : CTGAAG-GAGT-T--C-C-A--AG-----A---TT----GA--------TTA----G-T--T--T-G-----T----AC--------T--A------GGA--T---TT-A-C---T-C----T-TGA--C----G------T---AC--A---T-AAC-----G-GTTTTT-AA-AAA--T-GTT-TT-CA-GATAG-AC-TG-TTTGC------AA-A-T-T-TA-ACGTA-G--TTT--------CTA--CT-----TTCGTT-AATTTT-GTTTTT--CA-----T-GA---TTT-GAAA-TGCTT---T-GTG-A-----C----AA-ACTA-A-AGT-CATTTA-AAA------GTAC---A--A----GATA----AA-CAGGGT--C--T-G-TA---C-TAAT-A-----A----G-A---C-T-T---GT---T--GA---C--A--------GTA----C--A--A--A-----C--TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C--T-C--A---GTG--T-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---C-GT------------T-G---------------------A-A---------AAT-------A-AC--CAA-AC-T-T-G-ATT--TAA-ATT----GGG-ATTTtttgagaaagtataaaat
gi|18 : ttttcattggtgtgtaaattcccaatttaatcaagttggttattttgacgtccattttgtgCTGA-A-GAGT-TT-C-C-A--A------A---T-----AA--------T-A----G-T--T----G-----T----AC--------T--A------TGG--A---TT-G-C---T-C----T-TGA--A----GC-----T---AC--A---TCAAC-----GCGTTT---AA-AAA--T-GT--TT-CA-GATAG-AC-TG-TT-G-------AA-A-T-TATA-C-GTAGT--TTC-----T--CTA--TT-----T--GTTAAATTTT-G-TTTT--CA-----T--A---TTT--AAA-T-CTT---T-GTGAA-----C----AA-G-TATA-GGT-CATTTA-AAA-------TAC---A--G----AATA----AA-C-AGGT--C--T-taacactta
gi|24 : gtgtttaaatgcccaatttaatcaagttgggtatttgtgacgtccatttgtgtCTGA-A-GAGT-TTCC-C-A--A------A---TT----GAA-------T-A----GAT--T--T-G-----TCGTTAC--------T--A------GGG--A---TT-A-C---T-C----T-TGA--A----G------T---AC--ATTAA-AAC-----G-GTTTTTAAA-GAA--T-GTT-TT-CA-GATAG-
gi|1 : tatggtagttaaatcccaatttacaaattcaagttcgttaattatgacgtccattttgtgA-G-AAGT----C-C-A--A------AAAATT----GAA-------T-A----G-TG-T--TAG-----TGA--AC--------T--AA-----TGG--A---TT-A-G---T-C----T-TG---G----G------T---AT--AA--G-AAC-----G---TT---AA-AAA--TTGTT-TT-CAAGATAG-AC-T--TTTG-------AA-AAT-T-TA-C-GTA-TG-TTT-----TGCTTAATTT-----T--GTTTAATTTT-GTTTTT--CAATTCTT-GAACGTTTGAAAA-TGCTT---TAGTG-A-----C----AA-G-TA-A-AGTTCATTCA-AAA------GTA----A--AA---GATA----AAAC-AGGC--C--T-G-TA---C-C--TTA-----A----G-AA--C-T-A---GT---TCTAA---T--A--------GTA----C--A--A--A-----C--TA--------TTC----A----AC-T------T---T-GA--G--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--CACATCATCAAA-----AA----ATGGA---C-G-------------T-G---------------------A-A---------AAT-------ACAC--C-A-ACGC-T-G-ATT--TAA-TTT----GGG-ATTgac
gi|22 : ttaaattaaccattgaaatgtgggcttaattgtattttgtgtgaaGT-T--C-G-A--A------A---TT----GA--------T-A----G-T--T--T-G-----T----AC--------T--A------TC-----------------------T-TGA--A----G------T---AC--A---G-AAC-----T-ATCT---AA-AAA--T-GTA-TT-CA-GACAG-AC-TG-GTTG-------AA-A-T-T-TA-T-GTG-G--TTT-----T--CTA--TT-----T--GTT-AATTTT-GAGTTT--TA-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----T----AA-A-GA-A-AGT-CATTTA-AAatgaagcactatgcacaaggtaagaaatagcaagttttaattgatgccagggagattaagtgagggatcgtctaa
gi|9 : aattccaacttaaatcaagttggttattttcacatatattttgtgctttT-T--T-C-A--A------A----------A--------T-G----T-T--T--T-G-----T----AG--------T--A------TCA--A---TT-T-G---T-C----T-GGA--G----G------T---AC--G---G-CAC-----T-GCT----GA-AAA--TTGCC-TT-CA-AAGAG-AA-TG-GTTA-------AG-A-T-T-TA-C-ATA-G--TTT-----T--CT----------T--GTT-A-TCTT-AATTT---CA-----T-GC---TTTTAAAA-TGCTT---T-GCG-T-----T----AG-G-TA-A-AAT-CATGTATAAA------GT----------------------------GT-----T-G-TA---C-T--TCA-----A----G-A-----T-AC--AG---A--GA---T--A--------GTA----C--A--A--G-----C--TAATATGAAAT-A----G----A--T------TGT-T-G---G--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAA--ATTC----------A-----AA----GTGG------G-------------T-----------------------A-A---------GAT-------A-TT--C-A-GT-T-T-A-A
gi|5 : aggtatttaatttctcaatttgaatttgtaaatggctaccattcagttttatgcctaagagaattgcgatagtata--------T-A----T-T--T--A-G-----T----AC--------C--A------GAA--A---CT-GTA---T-C----T-TGA--G----A------T---AC--A---G-AAC-----T-TTTT---AA-AA
gi|31 : gtgaatcccacattaaatgaatttggttatttttaaggctgttgcaaatggccacacgaatttaatttcataccttcacaacacagaagagttctgatagtttatttcataatagtttgtatatcatcagtactatcaatgagtacagaaaacttacagaactttctcaagataccttcaaacagaatggttagagttttgattgcttttaattttcatgcttaaatgctttgtgtaaaataattgtc--T--T-G-----T----AC--------T--A------TGA--A---TTGA-G---T-C----T-TGA--G----G------T---AC--A---G-ACC-----G-GCTatagtaaataataataaaaattattatgaaattgactgtttgaactcttttagtgttaataaaatataaaattaaatggtggtcatttgcaatggctttgaaaat
gi|19 : aattaagaaattaattaatcttaaaagtaagat--T--T-G-----T----AC--------T--A------TCA--T---TT-ACG-------------GA--G----G------T---AC--A---T-AAC-----T-GTCT---AA-AGA--T-GCC-TT-CA-GACTG-GT-TA-CATGT------AA-G-T-T-TA-C-ATA-T--TTT-----C--TTT--TT-----T--ATT-
gi|37 : ttacatagtgtaaaccacacagacaatcaaattggttatttcaaagtcgttgcaaattgtcactatttaatattccttctcaccttctcaatactgactaatttcatcgtaa--T-G-----T----AC--------T--A------TCA--A---CT-A-G---T-C----T-TGA--G----G------T---AC--A---G-AGC-----T-GTtctt
gi|25 : aCA--A---CT-A-G---T-C----T-T--------------------AC--A---A-AAT-----G-GTTT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GATAG-AC-TG-TTTG-------AA-T-T-T-TG-C-GTA-TAGTTT-----T--CTA--TT-----T--GTT-AATTTT-GTTTTT--CA-----T-c
gi|13 : agcattaaatcaagttggttattttaatgtccattttgtgctttctcaacactgaagagttcGA--A----G------T---AC--A---ATAAC-----G-GTTTTATAA-AAAGTT-GTT-TTACA-GATAG-AC-T--TTTG-------AAGA-T-T-TA-A-GT--T--TTC-----T--C-A--TT-----T--GTTTAATTTTTGTTTTT--CA-----TAGA---TTTTGAAAATGCTTAAAT-GTG-AGCAACT----AA----A-A-AGT-CATTTA-AAA------GTAC---A--G----TA-A----AA-C-AGGT--C--T-G-TA---C-G--TTA-----G----G-A---C-T-A--------T--GA---C--A--------G-A----C--A--AG-A-----C--TA--------T-C----A----A--T------T---T-GA--G--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG--T-G-AGA----AAAG-CA--C----------------AA----ATGGA---C-GT------------T-G---------------------A-A---------AAT-------A-AC--C-A-AC-T-T-G-ATT--TAA-ATT----GGG-ATTTAAt
gi|14 : tattagattctcttgaaa-AAC-----A-GTCT---AT-AAA--T--TT-TT-CA-GACAG-AC-TA-TAGC-------AA-A-T-T----A-ACG-T--ATT-----T--GTA--TT-----T--G---GATTTT-GATTTT--CA-----T-G----TTCTGAAA-T--CA---T-GTG-A-----TGAAGAA-G-TA-A-A-------TA-AAA------ATA----A--A----AATA----AA-T-CGGA--C--T-G-TT---CTC--CCA-----A----G-A---A-G-A-----------GA---T--A---------TA----C--T--A--A-----C------------T-C----A----A--T------T---T-----G--A-A-CT-C----C--A---G-G-T----GG-----AAAG-AA--C----------------AA----AT--A---T-A-------------T-T---------------------A-A---------AAT-------A-------A-AC-T-T-G-A----TAA-TTT----GGA-ATTTAAcg
gi|15 : agtaT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GACAG-AC-TG-TTTG-------AA-A-T-T-TA-C-GTAAG--TTT-----T--CTA--TTAAATTT--GTT-AATTTT-TATTTT--CA-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----TTT--AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------GTA----A--ATTAAGATA----GA-C-CATT--C--T-G-TA---C-C--TGA-----A----G-A---C-T-A---GT---T--GA---T--A--------GTA----C--A--A--A-----C--CA--------T-C----A----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-GG-----AAAT-CA--C----------A-----AA----ATGGA---T-G-------------T-G---------------------A-A---------AAT-------A-AC--C-A-AC-T-T-G-ATT--TAA-TTT----GGG-ATTTatatatgtatgtaagaaatgcgtgttgtttatagtgataggggtcaaca
gi|27 : ccgccA--T-GTC-TT-CA-GACAG-AC-TG-GTTG-------AA-A-T-T-TA-A-GTA-G--TAT-----T--CAA--TT-----T--GTT-CATTTT-GATTTT--CA-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTtataaagtatg
gi|20 : attggataattactttttaatccttgaaggcggatccagcgctcccagc--TT-----T--GCT-AATTTT-GATTTT--CG-----G-GA---TTTTGAAA-TGTTT---T--TG-A-----T----AA-A-GA-A-AGT-AATTCA-ATA------GTA----A--A----GATATATAGA-C-ATTC--C--T-G-TA---C-C--TCA-----A----G-A---C-T-A---GT---T--TA---T--A--------GTA----T--A--A--AGTAAAC--TA--------T-A----A----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AC----ATATA---T-G-------------T-G---------------------A-A---------AAT-------A-AC--C-A-AC-T-T-G-ATT--TAT-TTT----GGA-ATTTAA
gi|28 : T-AATTTTTGTTTTTTCCA-----T-GA---TTTGAAAA-TGCTT---T-GTG-A-----T----AA-G-TA-A-AGTCCATTTG-AAA------GTaacaat
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gi|8 : -----T----AA-C-CA-A-GAT-CATCTG-AAA------A-A----A--T----TTTA----AA-C-CGTT--A--T-G-TA---C-T--TCA-----A----G-A---G-T-A---ATCCTT--TA---C-----------GTA----C--A--A--A-----CACTA--------T-C----A----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C--T-C--A---GT-------------------CA--C----------A-----AA----AATGA---CTG-------------T-C---------------------A-A---------AAC-------A-AC--C-ATAC-TAT-G-ATT--TAA-ATT----GGGAATTTAAagttttctgttcgaaatg
gi|17 : cttttcatggt-TG-A-AGT-CATTT------------T---------------TA----GA-C-AGTT--C--T-G-TA---C-C--TCA-----A----G-A---C-T-A---CT---T--GA---T--A--------GTA----C--A--A--A-----C--TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C-TT-T--A---ATG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATATA---T-GTTT----------T-A---------------------A-ATTTTAAT--AAT-------A-AT--T-A-AC---C-A-ATT--TTA-TTT----Gaatgttaagtgttttcattgttattattgttcatgattttgaaatgctttggtgcaaaaagtcatttaaagtactattaagactagttgagacgagtcagtaacatataattgtggaaccatcatgttgaaaaggcaaaatggacgtgaaaaaaaacttgatttaaattgggaagttaaacgtataga
gi|16 : -TG-A-AGT-CATTT------------T---------------TA----GA-C-AGTT--C--T-G-TA---C-C--TCA-----AA---G-A---C-T-A---CT---T--GA---T-----------GTA----C--A--A--A-----C--TA--------T-C----A----A--T------T---TGG---G--A-A-CT-C-TT-T--C---ATG-TT-G-AG-----AAAG-CA-------------A-----AA----ATATA---T-GTTT----------T-A---------------------A-AATTTTAATTAAT-------A-AT--T-A-AC---C-A-ATT--TTA-TTT----GGgaaagactggttgcaatttgtgtagttttccgtttgttaattttgattttcatgcttttttgataaagaaaatcaattaaaagtaaagaaagaccggtctgtacctcaaa
gi|31 : aatatagTTA-AAA------GTA----A--G-----ATA----GC-C-GG-T--C--T-G-TA---C-C--TCA-----A----G-A---C-TCA---AT---T--CA---T--A--------GTA----C--A--A--gaaagacttggttgcatttgtgtagttttccgttgttaattttgattttcatgctttttttgataaagaaaaatcaattaaaagtaaagaaaggaccggtctgtacctcaaaac
gi|6 : aattaagaaattaattaatcTA----AA-C-CGTT--C--T-G-TA---C-C--TCA-----A----G-A---C-T-A---AT---C--CA---T--A--------GTA----C--A--A--A-----C--TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C-TT-C------------------------AG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---C-G-------------T-C---------------------A-A---------AAT-------A-AC--C-A-AC-T-T-G-ATT--CAA-ATT----GGG-ATTTAA
gi|11 : tacatggtgTA----AA-C-AGTT--C--T-G-TA---T-C--TCG-----A----G-G---C-T-A---GT---T--GA---T--A--------ATA----C--A--A--A-----C--TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---G--A-A-CT-C-TT-C--A---ATA-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATATA---T-G-------------T-C---------------------A-A---------AAT-------A-AC--C-A-AC-T-T-G-ATT--TAA-TTT----GGG-ATTaaaatgttttcaggtagactgtttgatatttacgtagtttaaaatttgttaattttgtttttcatgattttgaaatgctttgtgacaagtaaagtcatttaaaagtacagataaacaggtctataccttaagactagttgatatagtacatgtacaaactatcgatttggaactcttcagtgttgaggacttaaagtatcaaaatttatggatcgtgaaaaatactatgattaaatttggggtgattgtaaactaa
gi|22 : TA----GA-T-AGTT--C--T-G-TA---C-T--TCA-----A----G-A------------------------T--A--------GTA----C--A--A--A-----C--TA--------T-C----A----A--T------T---T-C---G--A-A-C------------------------------AAAG-CA--C----------A-----AA----ATATA---T-G-------------T-G---------------------A-A---------AAT-------A-AC--C-A-AC-T-T-G-ATT--TAA-GTT----GGA-ATTacaatttcttcagacagaccggttgaaatttatgcagttttcgttctgttcattttgatcttcatgatttttaaatgcttttttataaagaaagtcatttaaaagtaaagatagacttgtctgtacctcaagaataatgcatagtacaaactaactatttgaaactcttcagtgttgagaaatcacaaaatat
gi|18 : TA----AA-C-GCGT--TGAT-G-TAG--C-T--TCA-----A----G-A---G-C-A---AT---C--CA---T--A--------GTA----C--A--A--------C--TA--------T-T----A-------T------T---T-G---G--A-AACT-C-TT-C--A---G------------------A-CA--C----------A-----AA-----TGGA---C-G-------------T-C---------------------ACA---------AAT-------A-CC--C-A-AC-T-T-G-ATT--AAA-TTG----GGC-ATTTAAaaaatgtattcagacagactggttgaaatttatgtggttttctatttgttaattttgagttttatgattttgaaatgctttgtgataaagaaagtcatttaaa
gi|12 : gtgtTA----GA-C-AGTT--T--T-G-TA---C-C--TCA-----A------------------AT---T--GA---T--A--------ATA----C--A--A--A-----C--TA--------T-T----ATGAAA--TAGACTAT---T-A---G--A-A-CT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AT-----AAAG-CA--C----------ATAATCAA----ATGGATCCC-ATTTGAAACAGCTTT-G---------------------A-A---------ATT-------A-AC--C-A-AC-T-T-A-AAT--TAA-TAT----GGG-CTCTAaaaatgtttcagatagactgttgaaattatacgtagtttctctatttgttaaattttgttttcatatttaaatctttgtgaacaagtataggtcatttaaaatacagaataaacaggtct
gi|19 : ggtgTA----GA-C-AGTT--A--T-G-TA---C-C--TC-----------------CGT-A---AA---T--GA---T--A--------GTA----C--A--ATTA-----C--GA--------T-G----A----A--A------T---T-A---G------------T-C--A---GTA-TT-G-AG-----AAGG-TG-------------A-----GA----AGGAA---T-A-------------T-T-----------------------A---------AAT-------A-GTGAC-A-AT-T-T-G-aagatgccttcaaaaagactagtcaaaataaatcttcttttctttctattgcttttgattttcaggcttttaaaatgcttttaataatataaagtgcagtaccacaagataaaagttttctcagataatacaaactaatttatatgaaatac
gi|4 : ttacatagtgtaaaccacacagacaatcaaattggttatttcaaagtcgttgA----GA-C-AGGTTCC--T-GGTA---C-C--TCA-----A----G-A---C-T-A---GT---T--AA---T--A--------GTA-------A--C--A-----T--TA--------T-C----A----A--T------G---T-GT--G--A-T-CT-T-TT-C--A---GTG-TT-G-GA-----AATG-CA--C----------A-----AA----ATATA---T-G-------------TAA---------------------A-A---------AAT-------A-A---C-A-AC-T-TGG-ATT--TAA-TTT----GGaagatgccttcagactggttacatgtaagtttacatattttcttttttatttctt
gi|3 : atttatA----GA-C-AGGTTCC--T-GGTA---C-C--TCA-----A----G-A---C-T-A---GT---T--AA---T--A--------GTA-------A--C--A-----T--TA--------T-C----A----A--T------G---T-GT--G--A-T-CT-T-TT-C--A---GTG-TT-G-GA-----AATG-CA--C----------A-----AA----ATATA---T-G-------------TAA---------------------A-A---------AAT-------A-A---C-A-AC-T-TGG-ATT--TAA-TTT----GGcacaaatgttgttcagacaggactggtttgaaatttatgccatttttctatttttaattttgatttcatattttgaaatgcttgtgataaagaaagttcatttaaagtaaaagaatagagcggtttgtatctcaaacaagaatatgaatacaatcgtacaaactatcaatttggaactcttcagtgcttgcagaaagacataaaattaggtgaagaaccaacttgaatttaattgggatttaaaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|2 : atttatA----GA-C-AGGTTCC--T-GGTA---C-C--TCA-----A----G-A---C-T-A---GT---T--AA---T--A--------GTA-------A--C--A-----T--TA--------T-C----A----A--T------G---T-GT--G--A-T-CT-T-TT-C--A---GTG-TT-G-GA-----AATG-CA--C----------A-----AA----ATATA---T-G-------------TAA---------------------A-A---------AAT-------A-A---C-A-AC-T-TGG-ATT--TAA-TTT----GGcacaaatgttgttcagacaggactggtttgaaatttatgccatttttctatttttaattttgatttcatattttgaaatgcttgtgataaagaaagttcatttaaagtaaaagaatagagcggtttgtatctcaaacaagaatatgaatacaatcgtacaaactatcaatttggaactcttcagtgcttgcagaaagacataaaattaggtgaagaaccaacttgaatttaattgggatttaaaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|37 : atttat----GA-C-AGCT--C--T-G-TA---C-C--TCA-----A----G-A---C-T-A---GT---T--GA---T--A--------GTA----C--A--cacaaatgttgttcagacaggactggtttgaaatttatgccatttttctatttttaattttgatttcatattttgaaatgcttgtgataaagaaagttcatttaaagtaaaagaatagagcggtttgtatctcaaacaagaatatgaatacaatcgtacaaactatcaatttggaactcttcagtgcttgcagaaagacataaaattaggtgaagaaccaacttgaatttaattgggatttaaaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
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gi|5 : agtgaT--C--T-G-TA---C----TCATTGATA----GTA---C-T-G---AT------GA---T--A---------TA----C--A--A--A-----C--TA--------T-TATGAA----A--TAAACTAT---C-A---G--A-A-CT-C-TT-C--T---GTG-TT-G-TG-----AAGG-TA--T----------G-----AA----ATTAAATTC-G-------------T-GTGGCCATTTGCAACAGCCTTAA-A---------AAT-------A-AC--C-A-AA-T-T-C-ATT--TAA-TGT----GGG-ATTCAaccggtttgaaaattatgtatttaactattttatcaggttgagaattttacaatgaattgtaaatgctttgtg
gi|9 : g--C--C-G-TA---C-C--TCC-----A----G-A---C-A-A---AT---T--GA---T--A--------CTA----C--A--A--A-----A--CA--------T--------------T------T---T-G---A--A-A-aaacttacagaactttctcaagataccttcaaacagaatggttagagttttgattgcttttaattttcatgcttaaatgctttgtgtaaaataattgtcttttaaaaagttctgtatctcaagatacagtttctggtactaaataatagtaaataataataaaaattattatgaaattgactgtttgaactcttttagtgttaataaaatataaaattaaatggtggtcatttgcaatggctttgaaaat
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Reference ( family-2576 ) : ACATGGT-GT-T-AAAT--CCCAATTTG-AA--TC---A-AGT-TGGTTA---TT------------------C---AC-GT---------------C--CA---------------AC-------A-CT----GAAG-AG---------------TT--C-C-AA------A---T----T----G-A-T-AG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TCAA---CTA-GTC-TTGAGG---TAC---A-G-AACN-GTCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-TAN-GT-A-T--TTTT--CTA--TT-----T--GTT-AATTTT-GA---TTTT---CA-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AA----G--ATA----GA-CAG-G-TCT-GTAC-C--TCA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAA
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gi|10 : ttaaattaaccattgaaatgtgggcttaattgtattttgtgtgaACATAGT-GT-T-AAAT-CCCAA-----------------------ATT------------------C---ACGA---------------C--CAT----ACA-CTGAGG-AG-TT--C-C-AA------A---TT----G-A-T-AG-T--TT-G----T--A-----------C-CA-TCAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AAC-G-GTTT---GA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-TAG-AC-T--A-TTTG-AA-A-T-T-TA-AA--T-AT-TTT-T--CT-A--TT-----T--GTT-AATTTT-G---TTTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AG----G--ATA----GA-CGG-G-TCT-GTAC-C--TCA-----A----G-A-C-T-----AAT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ATC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAAatgaagcactatgcacaaggtaagaaatagcaagttttaattgatgccagggagattaagtgagggatcgtctaa
gi|11 : AAT-CCCAAATTA-AA--TC-A-AGT-TGGTTATT------------------TTG-ACATATATTTTGTGCTTTCT--CA-----ATA-TTGAAG-AG-TT--C-C-AA------A---TT----G-A-T-AG-T--TT-G----T--A-----------T-TA-TCAA---CTA-G----CC-TCGAG----A---TAC---A-G-AAC-T-GTTT---AA-CAA--T-TTC-TT-CA-GA-CAG-AC-C--G-GTTG-AA-A-T-T-TA-TG--C-AG-TTT-T--CG-T--TC-----T--GTT-CATTTT-G---ATCTT---C-A-----T-GA---TTTTTAAA-TGCTT---T-TTT-A-----T----AA-A-GA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AA----G--ATA----GA-CTT-G-TCT-GTAC-C--TCA-----A----G-A-A-T-----AAT---G-----CA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------A-C----T----A--T------T---T-G---AA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAT-CA--C----------A-----AA----AT
gi|12 : TA----GA-CAG-T-TTT-GTAC-C--TCA-----A----A-------------T---T-----GA---T--A--------ATAC--A--A--A-----C-TA--------T-T----ATGAAA--TAGACTAT---T-A---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AT-----AAAG-CA--C----------ATAATCAA----ATGGATCCCATTTGAAACAGCTTTG---------------------AA---------ATT-------A-ACC-AAC-TTA-AATTAA-TAT----GGGCTCTAat
gi|12 : ggtgCAAATGG-GA--TC-C-ATT-TGATTATG------------------T---GCTT---------------TATCA-----ACA-CTGAAG-AG-TT--C-T-AATAGTCTA---TTTCATA-A-T-AG-T--TT-G----T--A-----------T-TA-TCAA---TT-----------TGAG----G---TAC---A-A-AAC-T-GTCT---AA-AGA--T-GCC-TT-CA-AA-AAG-AC-T--A-GTCA-AA-A-T-A-AA-TC--T-TC-TTT-T--CT-T--TC-----T--ATT-GCTTTT-G---ATTTT---C-A-----G-GC---TTTTAAAA-TGCTT---T--TA-A-----T----AATA-TA-A-AGTGC--------A------G-TACCACAA----G--ATA----AA--AG-T-TTT------C--TCA----------------------------------GA---T--A--------ATAC--A--A--A-----C-T----------------A----A--T------T---T-aagatgccttcaaaaagactagtcaaaataaatcttcttttctttctattgcttttgattttcaggcttttaaaatgcttttaataatataaagtgcagtaccacaagataaaagttttctcagataatacaaactaatttatatgaaatac
gi|13 : ggtgtagagcccatattaatttaagttggttaatttcaaagctgtttA---TTA-GATTCTC-TTGAAAGAAG---TAC---A-ATAAC-G-GTTTTATAA-AAAGTT-GTT-TTACA-GA-TAG-AC-T----TTTG-AAGA-T-T-TA-------AG-TTT-T--CTCA--TT-----T--GTTTAATTTTTG---TTTTT---C-A-----TAGA---TTTTGAAAATGCTTAAAT-GTG-AGCAACT----AA----A-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----CA----G--TAA----AA-CAG-G-TCT-GTAC-G--TTA-----G----G-A-C-T-----A-----T-----GA---C--A--------G-AC--A--AG-A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-GA--GA-ACT-C-TT-C--A---GTG--T-G-AGA----AAAG-CA--C----------------AA----ATGGA---CGT------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-ATT----GGGATTTAAatatgaaatac
gi|14 : t-AAC-A-GTCT---AT-AAA--T--TT-TT-CA-GA-CAG-AC-T--A-TAGC-AA-A-T-T-AA-CG--T-A---TT-T--GT-A--TT-----T--G---GATTTT-G---ATTTT---C-A-----T-G----TTCTGAAA-T--CA---T-GTG-A-----TGAAGAA-G-TA-A-A-------TA-AAA------A-TA----AA----A--ATA----AA-TCG-G-ACT-GTTCTC--CCA-----A----G-A---------AG----A-----GA---T--A---------TAC--T--A--A-----C-----------T-C----A----A--T------T---T-----GA-ACT-C----C--A---G-G-T----GG-----AAAG-AA--C----------------AA----AT--A---TA-------------TT---------------------AA---------AAT-------A-----AAC-TTG-A--TAA-TTT----GGAATTTAAcg
gi|15 : agtaC-C-GCCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-TA-CG--T-AAGTTT-T--CT-A--TTAAATTT--GTT-AATTTT-T---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----TTT--AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AATTAAG--ATA----GA-CCA-T-TCT-GTAC-C--TGA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-CA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-GG-----AAAT-CA--C----------A-----AA----ATGGA---TG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTatatatgtatgtaagaaatgcgtgttgtttatagtgataggggtcaaca
gi|16 : -TG-A-AGT-CATTT-------------T---------------TA----GA-CAG-T-TCT-GTAC-C--TCA-----AA---G-A-C-T-----ACT---T-----GA---T-----------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---TGG---GA-ACT-C-TT-T--C---ATG-TT-G-AG-----AAAG-CA-------------A-----AA----ATATA---TGTTT----------TA---------------------AAATTTTAATTAAT-------A-ATT-AAC--CA-ATTTTA-TTT----GGtataaagtatg
gi|16 : aatatag--CA-----ACA-TGAAAG-AG-TT--C-CCAA------A---TT----G-A-T-AG-T--TT-G----T--A-----------C--A-TCAA---GTA-G----TCTTTGAG----G---TAC---A-G-AAC-T-GTCT---AA-AAA--T-GAC-TT-CA-GA-AAG-ACTT--G-GTTG--C-A-T-T-TG-TG--T-AG-TTT-T--CC-G---T-----T--GTT-AATTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GC---TTTT--------TT------TG-A-----TA---AA-G-AA-A-AAT-CAATTA-AAA------G-TA----AA----G--AAAG---GA-CCG-G-TCT-GTAC-C--TCA-----A----A-A-C-gaaagacttggttgcatttgtgtagttttccgttgttaattttgattttcatgctttttttgataaagaaaaatcaattaaaagtaaagaaaggaccggtctgtacctcaaaac
gi|17 : aatatagccaaataaaattggttaattattaattaaaattttaaaacatatatttttgctttct-TG-A-AGT-CATTT-------------T---------------TA----GA-CAG-T-TCT-GTAC-C--TCA-----A----G-A-C-T-----ACT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-T--A---ATG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATATA---TGTTT----------TA---------------------AATTTTAAT--AAT-------A-ATT-AAC--CA-ATTTTA-TTT----
gi|17 : --CA-----ACA-TTAAAG-AG-TT--C-C-AA------A---TT----G-A-T-AG-T--TT-G----T--A-----------C-TA-TCAA---GTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AAC-T-GTCT---AA-AAA--T-GAC-TT-CA-GA-AAG-AC-T--G-GTTG-CA-A-T-T-TG-TG--T-AG-TTT-T--CC-G--TT-----T--GTT-AATTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GC---TTTT-----T----------TG-A-----T----AA-A-GA-A-AAT-CAATTA-AAA------G-TA----AA----G--AAA----GA-CCG-G-TCT-GTAC-C--TCA-----A----gaaagactggttgcaatttgtgtagttttccgtttgttaattttgattttcatgcttttttgataaagaaaatcaattaaaagtaaagaaagaccggtctgtacctcaaa
gi|18 : caaataaaattggttaattattattaaaatttaaaacatatattttgtgctttctGT-GT-TTAAATGCCCAATTTA-A---TC-A-AGT-TGGGTATT------------------TGTGACGT---------------C--CATTT--GTGTCTGAAG-AGTTT--C-C-AA------A----T----A-A-T-AG----TT-G----T--A-----------C-TA-TGGA---TTG-C----TC-TTGAA----GC--TAC---ATC-AACGC-GTTT---AA-AAA--T-GT--TT-CA-GA-TAG-AC-T--G--TTG-AA-A-T-TATA-CG--T-AG-TTTCT--CT-A--TT-----T--GTTAAATTTT-G----TTTT---C-A-----T--A---TTT--AAA-T-CTT---T-GTGAA-----C----AA-G-TATA-GGT-CATTTA-AAA--------TA----CA----GA-ATA----AA-CAG-G-TCT-a
gi|19 : --CA-----ATA-CTGA----------C-T-AA------T---TT----C-A-T-CG-TAATT-G----T--A-----------C-TA-TCAT---TTACG---------GAG----G---TAC---A-T-AAC-T-GTCT---AA-AGA--T-GCC-TT-CA-GA-CTG-GT-T--A-CATGTAA-G-T-T-TA-CA--T-AT-TTT-C--TT-T--TT-----T--ATT-
gi|2 : ttacatagtgtaaaccacacagacaatcaaattggttatttcaaagtcgttgcaaattgtcactatttaatattccttctcaccttctCCAAATTA-AA--TCCA-AGT-TG-TTATTTTTTACATATATTTTGTGC---ATTT---------------C--CA-----ACA-CTGAAA-AG-AT--CAC-AC------A---TT----G-A-T-AA-T--GT------T--A-----------C-TA-TTAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TACCA-G-G-AAC-CTGTCT---CACAAA--T-GTTGTT-CA-GA-CAGGAC-T--GGTTTG-AA-A-T-T-TA-TG--CCAT-TTT-T--CT-A--TT-----T---TT-AATTTT-G---ATTT----C-A-----T--A---TTTTGAAA-TGCTT-----GTG-A-----T----AA-A-GA-A-AGTTCATTTA-AA-------G-TA----AA----AGAATA----GA-GCG-G-TTT-GTAT-C--TCA-----AACAAG-A-A-T-----A-----T-----GAA--T--ACAATC---GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTGCTT-GCAG-----AAAGACA--T----------A-----AA----AT-TA---GG-------------TG---------------------AA---------G---------A-ACC-AAC-TTGAATTTAA--TT----GGGATTTAAtctt
gi|20 : atttat--TT-----T--GCT-AATTTT-G---ATTTT---C-G-----G-GA---TTTTGAAA-TGTTT---T--TG-A-----T----AA-A-GA-A-AGT-AATTCA-ATA------G-TA----AA----G--ATATATAGA-CAT-T-CCT-GTAC-C--TCA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----TA---T--A--------GTAT--A--A--AGTAAAC-TA--------T-A----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AC----ATATA---TG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAT-TTT----GGAATTTAAaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|21 : GT-GA-T-AAAT-TTCAAATTC-AA--TC-A-AAT-TGGTTATTTT----------------C---AAGTATATTTTGTGCATTCT--CA-----ACA-CTGAAG-AG-TT--C-C-AA------A---TT----G-A-T-AG-T--GT-G----T--A-----------C-C----------TA-A----TC-C-------------AT---A-G-AAC-T-GT-T---GA-A------GTC-TTACA-GAACCG-AC-C--GGTTTG-AA-A-A-T-TA-TG--T-AT-TTA-A--CT-A--TT-----T--TAT-CAGGTT-GAGAATTTTA--CAA-----T-GA---ATTGTAAA-TGCTT---T-GTG-aacaat
gi|21 : aA----AA-CCG-G-TCG-GTTC-T--GTA-----A----G-A-C-TTCAACAGT---TCTATGGA---TTAG--------GTAC--A--C--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AATG-CA--C----------A-----AA----ATATA---CT-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAT-TTG-ATTGAA-TTT----GAAATTTA
gi|22 : agtgaAAT-TCCAACTTA-AA--TC-A-AGT-TGGTTATTTT----------------C---ACAT---------------A--TATTTT-GTG-CTTT----G-TT--C-G-AA------A---TT----G-A-T-AG-T--TT-G----T--A-----------C-TA-TC-----------------TTGAA----G---TAC---A-G-AAC-T-ATCT---AA-AAA--T-GTA-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-GTTG-AA-A-T-T-TA-TG--T-GG-TTT-T--CT-A--TT-----T--GTT-AATTTT-G---AGTTT---T-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----T----AA-A-GA-A-AGT-CATTTA-AAgaaaattatgtatttaactattttatcaggttgagaattttacaatgaattgtaaatgctttgtg
gi|23 : ACATAAT-GT---AAAT-CCCGCAGTA-AA--TC-A-AGT-TGGTTATT------------------
gi|23 : gccgcttgttgcgattaaaatggcctcaacggaatttttaaccaacttcaacttttcccctttggtatctaatgagctccatgtcattaaaaaaaatacattgtatttcttacctttG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAC-TGC----GGGATTTAttcgaagtcgttgcaaatt
gi|24 : gccgcttgttgcgattaaaatggcctcaacggaatttttaaccaacttcaacttttcccctttggtatctaatgagctccatgtcattaaaaaaaatacattgtatttcttacctttacataatgATGGTAGT-T-AAAT-CCCAATTTACAAATTC-A-AGT-TCGTTAAT------------------TATGACGT---------------C--CATTTT-GTG-CTGAAG-AG-TTTCC-C-AA------A---TT----GAA-T-AGAT--TT-GTCGTT--A-----------C-TA-GGGA---TTA-C----TC-TTGAA----G---TACATTA-A-AAC-G-GTTTTTAAA-GAA--T-GTT-TT-CA-GA-TAG-gaagtcgttgcaaatt
gi|25 : tTTA-AA--TC-A-AGT-TGGTTATT------------------TTA-ATGT---------------C--CATTTT-GTG-CT--------TT--CTC-AAC-----A---CT----G-AAG-AG-T--TC---------------------------CAA---CTA-G----TC-TT------------AC---A-A-AAT-G-GTTT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-TAG-AC-T--G-TTTG-AA-T-T-T-TG-CGTAT-AG-TTT-T--CT-A--TT-----T--GTT-AATTTT-G---TTTTT---C-A-----T-gac
gi|26 : agca-GTAC-C--TCC-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--ATAA-----C-TAAGTA----T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TA-A--A---GTG-TT----------AAAG-AA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AATAACCAACA-ACC-AAC-TTG-ATTTAACTTT----GGAGTTTAAt
gi|27 : A--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-GTTG-AA-A-T-T-TA-AG--T-AG-TAT-T--CA-A--TT-----T--GTT-CATTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTcacatgta
gi|28 : attggataattactttttaatccttgaaggcggatccagcgctcccagcT-AATTTT-T---GTTTTTTCC-A-----T-GA---TTTGAAAA-TGCTT---T-GTG-A-----T----AA-G-TA-A-AGTCCATTTG-AAA------GTTA----AA----G--
gi|29 : ttgaccaaatcttcgttaagttccaacccgttgcc-C-T-----AGT---T-----GA---C--A--------GTACTAA--A--A-----CCTA--------T------A----A--T------T---T--------ACTAC-TT-CTAACCCATG-TTCGTAG-----AAAC-CA--C----------A-----AA----A-GGA---CG-----------------------------------------------AAT-------A-ACC-AAC-ATG-ATTAAA---T----GGGATTTtaaaa
gi|3 : agattCCAAATTA-AA--TCCA-AGT-TG-TTATTTTTTACATATATTTTGTGC---ATTT---------------C--CA-----ACA-CTGAAA-AG-AT--CAC-AC------A---TT----G-A-T-AA-T--GT------T--A-----------C-TA-TTAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TACCA-G-G-AAC-CTGTCT---CACAAA--T-GTTGTT-CA-GA-CAGGAC-T--GGTTTG-AA-A-T-T-TA-TG--CCAT-TTT-T--CT-A--TT-----T---TT-AATTTT-G---ATTT----C-A-----T--A---TTTTGAAA-TGCTT-----GTG-A-----T----AA-A-GA-A-AGTTCATTTA-AA-------G-TA----AA----AGAATA----GA-GCG-G-TTT-GTAT-C--TCA-----AACAAG-A-A-T-----A-----T-----GAA--T--ACAATC---GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTGCTT-GCAG-----AAAGACA--T----------A-----AA----AT-TA---GG-------------TG---------------------AA---------G---------A-ACC-AAC-TTGAATTTAA--TT----GGGATTTAA
gi|30 : atttatTTT---C-A-----T-GC---TT---AAA-TGCTT---T-GTA-A-----------A-G-TA-ATCGT-TATTCA-AAA----------------------------------AG-T-TCT-GTAC-C--TCT-----A----G-A-aactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|31 : TTA-AAA------G-TA----A-----G--ATA----GC-C-G-G-TCT-GTAC-C--TCA-----A----G-A-C-TC----AAT---T-----CA---T--A--------GTAC--A--A--taaagttttctgttcgaaatg
gi|33 : aattaagaaattaattaatc-T-----ATT---T-----GA---T--G--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----AACT------T---T-GA--GACACT-C-TTTC--A---GTG-TT-A-AG-----AAAG-CT--C----------A-----AA----ATG
gi|34 : CATGGT-GT-T-AAAT-CCCAATTTA-AA--TC-A-AGT-TGGTTATT------------------TTG-ACGT---------------
gi|35 : tt---------AAT-------G-GCC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGAATTTA
gi|36 : -----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTT-TT-G-AG-----AAAG-TA--T----------A-----AA----ATtaacaatttaaag
gi|37 : ----GA-CAG-C-TCT-GTAC-C--TCA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--
gi|38 : aA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTTTGTGGGGATTTAA
gi|4 : CCAAATTA-AA--TCCA-AGT-TG-TTATTTTTTACATATATTTTGTGC---ATTT---------------C--CA-----ACA-CTGAAA-AG-AT--CAC-AC------A---TT----G-A-T-AA-T--GT------T--A-----------C-TA-TTAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TACCA-G-G-AAC-CTGTCT---CACAAA--T-GTTGTT-CA-GA-CAGGAC-T--GGTTTG-AA-A-T-T-TA-TG--CCAT-TTT-T--CT-A--TT-----T---TT-AATTTT-G---ATTT----C-A-----T--A---TTTTGAAA-TGCTT-----GTG-A-----T----AA-A-GA-A-AGTTCATTTA-AA-------G-TA----AA----AGAATA----GA-GCG-G-TTT-GTAT-C--TCA-----AACAAG-A-A-T-----A-----T-----GAA--T--ACAATC---GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTGCTT-GCAG-----AAAGACA--T----------A-----AA----AT-TA---GG-------------TG---------------------AA---------G---------A-ACC-AAC-TTGAATTTAA--TT----GGGATTTAA
gi|5 : atttat-TCT-GTAC----TCATTGATA----GTA-C-T------GA---T-----GA---T--A---------TAC--A--A--A-----C-TA--------T-T----ATGAAA--TAAACTAT---C-A---GA-ACT-C-TT-C--T---GTG-TT-G-TG-----AAGG-TA--T----------G-----AA----ATTAAATTCG-------------TGTGGCCATTTGCAACAGCCTTAAA---------AAT-------A-ACC-AAA-TTC-ATTTAA-TGT----GGGATTCAaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|5 : g--CA-----ACA-CAGAAG-AG-TT--C-T-GATAGTTTA---TTTCATA-A-T-AG-T--TT-G----T--ATATCATCAGTAC-TA-TCAA---TGA-G----TA-CAGAA----AACTTAC---A-G-AAC-T-TTCT---CA-AGA--T-ACC-TT-CA-AA-CAG-AA-T--G-GTTA-GA-G-T-T-T-------------------T-G--AT-----T--GC----TTTT-A---ATTTT---C-A-----T-GC---TT---AAA-TGCTT---T-GTG-T-----A----AA-A-TA-ATTGT-CTTTTA-AAAAGTTCTG-TATCTCAA----G--AT------A-CAGTT-TCTGGTA--C--TAA-----A----T-A-A-T-----AGTAAAT-----AA---T--A--------ATAA--A--A--A-----T-TA--------T-TATGAA----A--T------TGACT-GTTTGA-ACT-CTTT-T--A---GTG-TT-A-AT-----AAAA-TA--T----------A-----AA----ATaaacttacagaactttctcaagataccttcaaacagaatggttagagttttgattgcttttaattttcatgcttaaatgctttgtgtaaaataattgtcttttaaaaagttctgtatctcaagatacagtttctggtactaaataatagtaaataataataaaaattattatgaaattgactgtttgaactcttttagtgttaataaaatataaaattaaatggtggtcatttgcaatggctttgaaaat
gi|6 : gtgaatcccacattaaatgaatttggttatttttaaggctgttgcaaatggccacacgaatttaatttcataccttcaACATGGT-GT-T-AAAT-CCCAATTTG-AA--TC-A-AGT-TGGTTATT------------------TTG-ACGT---------------C--CATTTT-GTG-CTGAAG-AG-TT--C-C-AA------A---TT----G-A-T-AG-T--TT-G----T--A-----------C-TA-TGGA---TTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AAC-G-GTTT---AA-AAA--T-GTT-TT-CA-GG-TAG-AC-T--G-TTTG-AT-A-T-T-TA-CG--T-AG-TTT-A--AA-A--TT-----T--GTT-AATTTT-G---TTTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----C----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----CA----G--ATA----AA-CAG-G-TCT-ATAC-C--TTA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--ATAGTACATGTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----G----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AGGACTTAAAG-TAT-C----------A-----AAATTTATGGAT--CG-------------TG---------------------AA---------AAA-------T-ACT-A----TG-ATTAAA-TTT----GGGGTtaaatggtggtcatttgcaatggctttgaaaat
gi|7 : tTGGT-GTGT-AAATTCCCAATTTA-A---TC-A-AGT-TGGTTATT------------------TTG-ACGT---------------C--CATTTT-GTG-CTGAAGGAG-TT--C-C-AAG-----A---TT----G-A-TTAG-T--TT-G----T--A-----------C-TA-GGAT---TTA-C----TC-TTGAC----G---TAC---A-T-AAC-G-GTTTTT-AA-AAA--T-GTT-TT-CA-GA-TAG-AC-T--G-TTTGCAA-A-T-T-TAACG--T-AG-TTT----CT-A--CT-----TTCGTT-AATTTT-G---TTTTT---C-A-----T-GA---TTT-GAAA-TGCTT---T-GTG-A-----C----AA-ACTA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TAC---AA----G--ATA----AA-CAG-GGTCT-GTAC-TAAT-A-----A----G-A-C-T-----TGT---T-----GA---C--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C--T-C--A---GTG--T-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CGT------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACCAAAC-TTG-ATTTAA-ATT----GGGATTTgattgtaaactaa
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gi|13 : ggtgtagagcccatattaatttaagttggttaatttcaaagctgtttA---TTA-GATTCTC-TTGAAAGAAG---TAC---A-ATAAC-G-G--TTTTATAA-AAAGTT-GTT-TTACA-GA-TAG-AC-T----TTTG-AAGA-T-T-T-A------A-GTTT-T--CTCA--TT-----TGTTTAATTTTTG---TTTTT---C-A-----TAGA---TTTTGAAAATGCTTAAAT-GTG-AGCAACT----AA----A-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----CA----G--TAA----AA-CA-G-GTCT-GTAC-G-T--TA-----G----G-A-C-T-----A-----T-----GA---C--A--------G-AC--A--AG-A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-GA--GA-ACT-C-TT-C--A---GTG--T-G-AGA----AAAG-CA--C----------------AA----ATGGA---CGT------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-ATT----GGGATTTAAatatgaaatac
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gi|15 : agtaC-C-G--CCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-T-ACG--T-AAGTTT-T--CT-A--TTAAATTTGTT-AATTTT-T---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTG-A-----TTT--AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AATTAAG--ATA----GA-CC-A-TTCT-GTAC-C-T--GA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-CA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-GG-----AAAT-CA--C----------A-----AA----ATGGA---TG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTatatatgtatgtaagaaatgcgtgttgtttatagtgataggggtcaaca
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gi|16 : aatatagAA-GAG-TT--C-CCAA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-G----T--A-----------C--A-TCAA---GTA-G----TCTTTGAG----G---TAC---A-G-AAC-T-G--TCT---AA-AAA--T-GAC-TT-CA-GA-AAG-ACTT--G-GTTG--C-A-T-T-T-GTG--T-A-GTTT-T--CC-G---T-----TGTT-AATTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GC---TTTT--------TT------TG-A-----TA---AA-G-AA-A-AAT-CAATTA-AAA------G-TA----AA----G--AAAG---GA-CC-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----A-A-C-gaaagacttggttgcatttgtgtagttttccgttgttaattttgattttcatgctttttttgataaagaaaaatcaattaaaagtaaagaaaggaccggtctgtacctcaaaac
gi|17 : aatatagccaaataaaattggttaattattaattaaaattttaaaacatatatttttgctttctcaacatgaAATTTA--AAA-C-A-----TA--TATTT-T-G-------------TGC-TT-TCTCAA-CA-T-----------T-----------AAA-GAG-TT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-G----T--A-----------C-TA-TCAA---GTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AAC-T-G--TCT---AA-AAA--T-GAC-TT-CA-GA-AAG-AC-T--G-GTTG-CA-A-T-T-T-GTG--T-A-GTTT-T--CC-G--TT-----TGTT-AATTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GC---TTTT-----T----------TG-A-----T----AA-A-GA-A-AAT-CAATTA-AAA------G-TA----AA----G--AAA----GA-CC-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----
gi|18 : caaataaaattggttaattattattaaGT-GT-TTAAATGCCCAATTTA--A-T-C-A-AGT-TGGGTATTTGT-G-AC---------GTCCATT-T----G-TGTC-----------T-----------GAA-GAGTTT--C-C-AA------A----T----A-A-TAG----TT-G----T--A-----------C-TA-TGGA---TTG-C----TC-TTGAA----GC--TAC---ATC-AACGC-G--TTT---AA-AAA--T-GT--TT-CA-GA-TAG-AC-T--G--TTG-AA-A-T-TAT-ACG--T-A-GTTTCT--CT-A--TT-----TGTTAAATTTT-G----TTTT---C-A-----T--A---TTT--AAA-T-CTT---T-GTGAA-----C----AA-G-TATA-GGT-CATTTA-AAA--------TA----CA----GA-ATA----AA-CA-G-GTCT-a
gi|19 : TA----GA-CA-G-TTAT-GTAC-C-T--C---------------CGT-----AAA---T-----GA---T--A--------GTAC--A--ATTA-----C-GA--------T-G----A----A--A------T---T-A---G---------T-C--A---GTA-TT-G-AG-----AAGG-
gi|19 : ttacatagtgtaaaccacacagacaatcaaattggttatttcaaagtcgttgcaaattgtcactatttaatattccttctca--TT-G----T--A-----------C-TA-TCAT---TTACG---------GAG----G---TAC---A-T-AAC-T-G--TCT---AA-AGA--T-GCC-TT-CA-GA-CTG-GT-T--A-CATGTAA-G-T-T-T-ACA--T-A--TTT-T--CT-T--TT-----Taagatgccttcagactggttacatgtaagtttacatattttcttttttatttctt
gi|2 : ttacatagtgtaaaccacacagacaatcaaattggttatttcaaagtcgttgcaaattgtcactatttaatattccttctcaccttctcaatactgactaatttcatcgtaaCCAAATTA--AAT-CCA-AGT-TG-TTATTT-T-TTACATATATTTTGTGCATT-TCCA-A-CA-C-----------T-----------GAA-AAG-AT--CAC-AC------A---TT----G-A-TAA-T--GT------T--A-----------C-TA-TTAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TACCA-G-G-AAC-CTG--TCT---CACAAA--T-GTTGTT-CA-GA-CAGGAC-T--GGTTTG-AA-A-T-T-T-ATG--CCA-TTTT-T--CT-A--TT-----T-TT-AATTTT-G---ATTT----C-A-----T--A---TTTTGAAA-TGCTT-----GTG-A-----T----AA-A-GA-A-AGTTCATTTA-AA-------G-TA----AA----AGAATA----GA-GC-G-GTTT-GTAT-C-T--CA-----AACAAG-A-A-T-----A-----T-----GAA--T--ACAATC---GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTGCTT-GCAG-----AAAGACA--T----------A-----AA----AT-TA---GG-------------TG---------------------AA---------G---------A-ACC-AAC-TTGAATTTAA--TT----GGGATTTAAtatttctt
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gi|21 : GT-GA-T-AAAT-TTCAAATTC--AAT-C-A-AAT-TGGTTATTT-T-C-AA---------GTATATT-TT---G-TG-CATTCTCAACACT-----------GAA-GAG-TT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--GT-G----T--A-----------C-C----------TA-A----TC-C-------------AT---A-G-AAC-T-G--T-T---GA-A------GTC-TTACA-GAACCG-AC-C--GGTTTG-AA-A-A-T-T-ATG--T-A-TTTA-A--CT-A--TT-----TTAT-CAGGTT-GAGAATTTTA--CAA-----T-GA---ATTGTAAA-TGCTT---T-GTG-aacaat
gi|21 : aA----AA-CC-G-GTCG-GTTC-T-G--TA-----A----G-A-C-TTCAACAGT---TCTATGGA---TTAG--------GTAC--A--C--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AATG-CA--C----------A-----AA----ATATA---CT-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAT-TTG-ATTGAA-TTT----GAAATTTA
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gi|23 : ACATAAT-GT---AAAT-CCCGCAGTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TCG-AA---------GTC
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gi|33 : aattaagaaattaattaatc-T-----ATT---T-----GA---T--G--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----AACT------T---T-GA--GACACT-C-TTTC--A---GTG-TT-A-AG-----AAAG-CT--C----------A-----AA----ATG
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gi|5 : g-----------GAA-GAG-TT--C-T-GATAGTTTA---TTTCATA-A-TAG-T--TT-G----T--ATATCATCAGTAC-TA-TCAA---TGA-G----TA-CAGAA----AACTTAC---A-G-AAC-T-T--TCT---CA-AGA--T-ACC-TT-CA-AA-CAG-AA-T--G-GTTA-GA-G-T-T-T-------------------T-G--AT-----TGC----TTTT-A---ATTTT---C-A-----T-GC---TT---AAA-TGCTT---T-GTG-T-----A----AA-A-TA-ATTGT-CTTTTA-AAAAGTTCTG-TATCTCAA----G--AT------A-CA-GTTTCTGGTA--C-T--AA-----A----T-A-A-T-----AGTAAAT-----AA---T--A--------ATAA--A--A--A-----T-TA--------T-TATGAA----A--T------TGACT-GTTTGA-ACT-CTTT-T--A---GTG-TT-A-AT-----AAAA-TA--T----------A-----AA----ATaaacttacagaactttctcaagataccttcaaacagaatggttagagttttgattgcttttaattttcatgcttaaatgctttgtgtaaaataattgtcttttaaaaagttctgtatctcaagatacagtttctggtactaaataatagtaaataataataaaaattattatgaaattgactgtttgaactcttttagtgttaataaaatataaaattaaatggtggtcatttgcaatggctttgaaaat
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Reference ( family-2576 ) : ACATGGT-GT-T-AAAT-CCCAANTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GTNCATT-TC---G-CG-C-----------T-----------GAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TCAA---TTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACN-G--TCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-T-ACG--T-A-GTTT-T--CT-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AA----G--ATA----GA-CA-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAA
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Reference ( family-2576 ) : ACATGGT-GT-T-AAAT-CCCAANTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GTNCATT-TC---G-CG-C-----------T-----------GAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TCAA---TTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACN-G--TCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-T-ACG--T-A-GTTT-T--CT-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AA----G--ATA----GA-CA-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAA
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gi|16 : -TG-A-AGT-CATTT-------------T---------------TA----GA-CA-G-TTCT-GTAC-C-T--CA-----AA---G-A-C-T-----ACT---T-----GA---T-----------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---TGG---GA-ACT-C-TT-T--C---ATG-TT-G-AG-----AAAG-CA-------------A-----AA----ATATA---TGTTT----------TA---------------------AAATTTTAATTAAT-------A-ATT-AAC--CA-ATTTTA-TTT----GGtataaagtatg
gi|16 : aatatagAA-GAGTT--C-CCAA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC--A-TCAA---GTA-G----TCTTTGAG----G---TAC---A-G-AACT-G--TCT---AA-AAA--T-GAC-TT-CA-GA-AAG-ACTT--G-GTTG--C-A-T-T-T-GTG--T-A-GTTT-T--CC-G---T-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GC---TTTT--------TT------TGA-----TA---AA-G-AA-A-AAT-CAATTA-AAA------G-TA----AA----G--AAAG---GA-CC-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----A-A-C-gaaagacttggttgcatttgtgtagttttccgttgttaattttgattttcatgctttttttgataaagaaaaatcaattaaaagtaaagaaaggaccggtctgtacctcaaaac
gi|17 : aatatagccaaataaaattggttaattattaattaaaattttaaaacatatatttttgctttctcaacatgaAATTTA--AAA-C-A-----TA--TATTT-TG-------------TGC-TT-TCTCAA-CA-T-----------T-----------AAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TCAA---GTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACT-G--TCT---AA-AAA--T-GAC-TT-CA-GA-AAG-AC-T--G-GTTG-CA-A-T-T-T-GTG--T-A-GTTT-T--CC-G--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GC---TTTT-----T----------TGA-----T----AA-A-GA-A-AAT-CAATTA-AAA------G-TA----AA----G--AAA----GA-CC-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----
gi|18 : caaataaaattggttaattattattaaGT-GT-TTAAATGCCCAATTTA--A-T-C-A-AGT-TGGGTATTTGTG-AC---------GTCCATT-T----G-TGTC-----------T-----------GAA-GAGTTT-C-C-AA------A---T-----A-A-TAG-T--T------------G----T--AC-TA-TGGA---TTG-C----TC-TTGAA----GC--TAC---A-TCAACGCG--TTT---AA-AAA--T-GT--TT-CA-GA-TAG-AC-T--G-TT-G-AA-A-T-TAT-ACG--T-A-GTTTCT--CT-A--TT-----TGTT-AAATTTT-G----TTTT---C-A-----T--A---TTT--AAA-T-CTT---T-GTGAA----C----AA-G-TATA-GGT-CATTTA-AAA--------TA----CA----GA-ATA----AA-CA-G-GTCT-a
gi|19 : TA----GA-CA-G-TTAT-GTAC-C-T--C---------------CGT-----AAA---T-----GA---T--A--------GTAC--A--ATTA-----C-GA--------T-G----A----A--A------T---T-A---G---------T-C--A---GTA-TT-G-AG-----AAGG-
gi|19 : ttacatagtgtaaaccacacagacaatcaaattggttatttcaaagtcgttgcaaattgtcactatttaatattccttctca--TT-----------G----T--AC-TA-TCAT---TTACG---------GAG----G---TAC---A-T-AACT-G--TCT---AA-AGA--T-GCC-TT-CA-GA-CTG-GT-T--A-CATGTAA-G-T-T-T-ACA--T-A--TTT-T--CT-T--TT-----Taagatgccttcagactggttacatgtaagtttacatattttcttttttatttctt
gi|2 : ttacatagtgtaaaccacacagacaatcaaattggttatttcaaagtcgttgcaaattgtcactatttaatattccttctcaccttctcaatactgactaatttcatcgtaaCCAAATTA--AAT-CCA-AGT-TG-TTATTT-TTTACATATATTTTGTGCATT-TCCA-A-CA-C-----------T-----------GAA-AAGAT--CAC-AC------A---TT----G-A-TAA-T--GT----------------T--AC-TA-TTAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TACCA-G-G-AACCTG--TCT---CACAAA--T-GTTGTT-CA-GA-CAGGAC-T--GGTTTG-AA-A-T-T-T-ATG--CCA-TTTT-T--CT-A--TT-----T-TT-AA-TTTT-G---ATTT----C-A-----T--A---TTTTGAAA-TGCTT-----GTGA-----T----AA-A-GA-A-AGTTCATTTA-AA-------G-TA----AA----AGAATA----GA-GC-G-GTTT-GTAT-C-T--CA-----AACAAG-A-A-T-----A-----T-----GAA--T--ACAATC---GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTGCTT-GCAG-----AAAGACA--T----------A-----AA----AT-TA---GG-------------TG---------------------AA---------G---------A-ACC-AAC-TTGAATTTAA--TT----GGGATTTAAtatttctt
gi|20 : atttat--TT-----TGCT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-G-----G-GA---TTTTGAAA-TGTTT---T--TGA-----T----AA-A-GA-A-AGT-AATTCA-ATA------G-TA----AA----G--ATATATAGA-CA-T-TCCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----TA---T--A--------GTAT--A--A--AGTAAAC-TA--------T-A----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AC----ATATA---TG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAT-TTT----GGAATTTAAaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|21 : GT-GA-T-AAAT-TTCAAATTC--AAT-C-A-AAT-TGGTTATTT-TC-AA---------GTATATT-TT---G-TG-CATTCTCAACACT-----------GAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--GT-----------G----T--AC-C----------TA-A----TC-C-------------AT---A-G-AACT-G--T-T---GA-A------GTC-TTACA-GAACCG-AC-C--GGTTTG-AA-A-A-T-T-ATG--T-A-TTTA-A--CT-A--TT-----TTAT-CA-GGTT-GAGAATTTTA--CAA-----T-GA---ATTGTAAA-TGCTT---T-GTGaacaat
gi|21 : aA----AA-CC-G-GTCG-GTTC-T-G--TA-----A----G-A-C-TTCAACAGT---TCTATGGA---TTAG--------GTAC--A--C--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AATG-CA--C----------A-----AA----ATATA---CT-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAT-TTG-ATTGAA-TTT----GAAATTTA
gi|22 : agtgaAAT-TCCAACTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TC-AC---------ATATATT-TT---G-TG-C-----------T-----------TT----GTT--C-G-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TC-----------------TTGAA----G---TAC---A-G-AACT-A--TCT---AA-AAA--T-GTA-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-GTTG-AA-A-T-T-T-ATG--T-G-GTTT-T--CT-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---AGTTT---T-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----T----AA-A-GA-A-AGT-CATTTA-AAgaaaattatgtatttaactattttatcaggttgagaattttacaatgaattgtaaatgctttgtg
gi|23 : ACATAAT-GT---AAAT-CCCGCAGTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-T
gi|23 : gccgcttgttgcgattaaaatggcctcaacggaatttttaaccaacttcaacttttcccctttggtatctaatgagctccatgtcattaaaaaaaatacattgtatttcttacctttG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAC-TGC----GGGATTTAcgaagtcgttgcaaatt
gi|24 : gccgcttgttgcgattaaaatggcctcaacggaatttttaaccaacttcaacttttcccctttggtatctaatgagctccatgtcattaaaaaaaatacattgtatttcttacctttacataatgATGGTAGT-T-AAAT-CCCAATTTACAAATTC-A-AGT-TCGTTAATTATG-AC---------GTCCATT-TT---G-TG-C-----------T-----------GAA-GAGTTTCC-C-AA------A---TT----GAA-TAGAT--TT-----------GTCGTT--AC-TA-GGGA---TTA-C----TC-TTGAA----G---TACATTA-A-AACG-G--TTTTTAAA-GAA--T-GTT-TT-CA-GA-TAG-gaagtcgttgcaaatt
gi|25 : tTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TA-AT---------GTCCATT-TT---G-TG-C-----------T------------------TT--CTC-AAC-----A---CT----G-AAGAG-T--TC--------------------------CAA---CTA-G----TC-TT------------AC---A-A-AATG-G--TTT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-TAG-AC-T--G-TTTG-AA-T-T-T-T-GCGTAT-A-GTTT-T--CT-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---TTTTT---C-A-----T-gac
gi|26 : agca-GTAC-C-T--CC-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--ATAA-----C-TAAGTA----T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TA-A--A---GTG-TT----------AAAG-AA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AATAACCAACA-ACC-AAC-TTG-ATTTAACTTT----GGAGTTTAAt
gi|27 : A--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-GTTG-AA-A-T-T-T-AAG--T-A-GTAT-T--CA-A--TT-----TGTT-CA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTcacatgta
gi|28 : attggataattactttttaatccttgaaggcggatccagcgctcccagcT-AA-TTTT-T---GTTTTTTCC-A-----T-GA---TTTGAAAA-TGCTT---T-GTGA-----T----AA-G-TA-A-AGTCCATTTG-AAA------GTTA----AA----G--
gi|29 : ttgaccaaatcttcgttaagttccaacccgttgcc-C-T-----AGT---T-----GA---C--A--------GTACTAA--A--A-----CCTA--------T------A----A--T------T---T--------ACTAC-TT-CTAACCCATG-TTCGTAG-----AAAC-CA--C----------A-----AA----A-GGA---CG-----------------------------------------------AAT-------A-ACC-AAC-ATG-ATTAAA---T----GGGATTTtaaaa
gi|3 : agattCCAAATTA--AAT-CCA-AGT-TG-TTATTT-TTTACATATATTTTGTGCATT-TCCA-A-CA-C-----------T-----------GAA-AAGAT--CAC-AC------A---TT----G-A-TAA-T--GT----------------T--AC-TA-TTAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TACCA-G-G-AACCTG--TCT---CACAAA--T-GTTGTT-CA-GA-CAGGAC-T--GGTTTG-AA-A-T-T-T-ATG--CCA-TTTT-T--CT-A--TT-----T-TT-AA-TTTT-G---ATTT----C-A-----T--A---TTTTGAAA-TGCTT-----GTGA-----T----AA-A-GA-A-AGTTCATTTA-AA-------G-TA----AA----AGAATA----GA-GC-G-GTTT-GTAT-C-T--CA-----AACAAG-A-A-T-----A-----T-----GAA--T--ACAATC---GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTGCTT-GCAG-----AAAGACA--T----------A-----AA----AT-TA---GG-------------TG---------------------AA---------G---------A-ACC-AAC-TTGAATTTAA--TT----GGGATTTAA
gi|30 : atttatTTT---C-A-----T-GC---TT---AAA-TGCTT---T-GTAA-----------A-G-TA-ATCGT-TATTCA-AAA----------------------------------A-G-TTCT-GTAC-C-T--CT-----A----G-A-aactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|31 : TTA-AAA------G-TA----A-----G--ATA----GC-C--G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-TC----AAT---T-----CA---T--A--------GTAC--A--A--taaagttttctgttcgaaatg
gi|33 : aattaagaaattaattaatc-T-----ATT---T-----GA---T--G--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----AACT------T---T-GA--GACACT-C-TTTC--A---GTG-TT-A-AG-----AAAG-CT--C----------A-----AA----ATG
gi|34 : CATGGT-GT-T-AAAT-CCCAATTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GT
gi|35 : tt---------AAT-------G-GCC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGAATTTA
gi|36 : -----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTT-TT-G-AG-----AAAG-TA--T----------A-----AA----ATtaacaatttaaag
gi|37 : ----GA-CA-G-CTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--
gi|38 : aA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTTTGTGGGGATTTAA
gi|4 : CCAAATTA--AAT-CCA-AGT-TG-TTATTT-TTTACATATATTTTGTGCATT-TCCA-A-CA-C-----------T-----------GAA-AAGAT--CAC-AC------A---TT----G-A-TAA-T--GT----------------T--AC-TA-TTAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TACCA-G-G-AACCTG--TCT---CACAAA--T-GTTGTT-CA-GA-CAGGAC-T--GGTTTG-AA-A-T-T-T-ATG--CCA-TTTT-T--CT-A--TT-----T-TT-AA-TTTT-G---ATTT----C-A-----T--A---TTTTGAAA-TGCTT-----GTGA-----T----AA-A-GA-A-AGTTCATTTA-AA-------G-TA----AA----AGAATA----GA-GC-G-GTTT-GTAT-C-T--CA-----AACAAG-A-A-T-----A-----T-----GAA--T--ACAATC---GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTGCTT-GCAG-----AAAGACA--T----------A-----AA----AT-TA---GG-------------TG---------------------AA---------G---------A-ACC-AAC-TTGAATTTAA--TT----GGGATTTAA
gi|5 : atttatTCT-GTAC---T--CATTGATA----GTA-C-T------GA---T-----GA---T--A---------TAC--A--A--A-----C-TA--------T-T----ATGAAA--TAAACTAT---C-A---GA-ACT-C-TT-C--T---GTG-TT-G-TG-----AAGG-TA--T----------G-----AA----ATTAAATTCG-------------TGTGGCCATTTGCAACAGCCTTAAA---------AAT-------A-ACC-AAA-TTC-ATTTAA-TGT----GGGATTCAaactatataagtaagaaaagcgtgtttatagtgataggagtacatgtagtaggattatctaag
gi|5 : g-----------GAA-GAGTT--C-T-GATAGTTTA---TTTCATA-A-TAG-T--TTGTATATCATCAG----T--AC-TA-TCAA---TGA-G----TA-CAGAA----AACTTAC---A-G-AACT-T--TCT---CA-AGA--T-ACC-TT-CA-AA-CAG-AA-T--G-GTTA-GA-G-T-T-T-------------------T-G--AT-----TGC-----TTTT-A---ATTTT---C-A-----T-GC---TT---AAA-TGCTT---T-GTGT-----A----AA-A-TA-ATTGT-CTTTTA-AAAAGTTCTG-TATCTCAA----G--AT------A-CA-GTTTCTGGTA--C-T--AA-----A----T-A-A-T-----AGTAAAT-----AA---T--A--------ATAA--A--A--A-----T-TA--------T-TATGAA----A--T------TGACT-GTTTGA-ACT-CTTT-T--A---GTG-TT-A-AT-----AAAA-TA--T----------A-----AA----ATaaacttacagaactttctcaagataccttcaaacagaatggttagagttttgattgcttttaattttcatgcttaaatgctttgtgtaaaataattgtcttttaaaaagttctgtatctcaagatacagtttctggtactaaataatagtaaataataataaaaattattatgaaattgactgtttgaactcttttagtgttaataaaatataaaattaaatggtggtcatttgcaatggctttgaaaat
gi|6 : gtgaatcccacattaaatgaatttggttatttttaaggctgttgcaaatggccacacgaatttaatttcataccttcacaacacaACATGGT-GT-T-AAAT-CCCAATTTG--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GTCCATT-TT---G-TG-C-----------T-----------GAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TGGA---TTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACG-G--TTT---AA-AAA--T-GTT-TT-CA-GG-TAG-AC-T--G-TTTG-AT-A-T-T-T-ACG--T-A-GTTT-A--AA-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---TTTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----C----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----CA----G--ATA----AA-CA-G-GTCT-ATAC-C-T--TA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--ATAGTACATGTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----G----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AGGACTTAAAG-TAT-C----------A-----AAATTTATGGAT--CG-------------TG---------------------AA---------AAA-------T-ACT-A----TG-ATTAAA-TTT----GGGGTtaaatggtggtcatttgcaatggctttgaaaat
gi|7 : tTGGT-GTGT-AAATTCCCAATTTA--A-T-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GTCCATT-TT---G-TG-C-----------T-----------GAAGGAGTT--C-C-AAG-----A---TT----G-ATTAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-GGAT---TTA-C----TC-TTGAC----G---TAC---A-T-AACG-GTTTTT---AA-AAA--T-GTT-TT-CA-GA-TAG-AC-T--G-TTTGCAA-A-T-T-TAACG--T-A-G-TT-T--CT-ACTTT-----CGTT-AA-TTTT-G---TTTTT---C-A-----T-GA----TTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----C----AA-ACTA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TAC---AA----G--ATA----AA-CAGG-GTCT-GTA--C-TAATA-----A----G-A-C-T-----TGT---T-----GA---C--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C--T-C--A---GTG--T-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CGT------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACCAAAC-TTG-ATTTAA-ATT----GGGATTTgattgtaaactaa
gi|8 : ttttcatCATGGT--T-T-AAATTCCCAATTTA--AAT-C-ATAGTATGGTTGTTT-TG-AC---------AGTCATT-TTT--G-TGAC-----------T-----------GA--GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-TGTTT-----------G----T--ACGTA---AAGGATTA-C----TC-TTGAA----G---TAC---A-T-AACG-G--TTT---AA-AA---T-TTT-TT-CA-GA-TGA-TC-TTGG-TT---AA-A-TGT-T-AAG--T---GTTT-T--C--A--TT------GTT-AT-TATT-G------TT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---TGGTG------C----AA----A-A-AGT-CATTTA-AA--------------------------------------------GTAC-TAT--TA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GAGACG--A--------GT-C--AGTA--A-----CATA--------T------A----A--T------TG--T-G---GA-AC--C-AT-C--A----TG-TT-G-AA-----AAGG-----C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AA--------A-A---AAC-TTG-ATTTAA-ATT----GGGAtaacactta
gi|9 : cttttTT--T-C-AA------A-----------A-TGT-T--TT-----------G----T--AG-TA-TCAA---TTT-G----TC-TGGAG----G---TAC---G-G-CACT-G---CT---GA-AAA--TTGCC-TT-CA-AA-GAG-AA-T--G-GTTA-AG-A-T-T-T-ACA--T-A-GTTT-T--CT-----------TGTT-A--TCTT-A---ATTT----C-A-----T-GC---TTTTAAAA-TGCTT---T-GCGT-----T----AG-G-TA-A-AAT-CATGTATAAA------G-T-----------------------------GT-T-GTAC-T-T--CA-----A----G-A-TAC-----AGA---------GA---T--A--------GTAC--A--A--G-----C-TAATATGAAAT-A----G----A--T------TGT-T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAA--ATTC----------A-----AA----GTGG-----G-------------T----------------------AA---------GAT-------A-TTC-AGT-TTA-Aagttaaacgtataga
blockSeqs : A TT G A CA T C T A G G TT ATATATTTT A A TGTGCTTTCTCAATATT G TC A C TAGTCT . TCAT A A A GT GTATATCATCAG . G . C GGA C ATTC T AGAA ACT ATT . T GC TT TAT C GT T G A . AC G T TG G T G . G A A A TA AAG C . ACT AAATT T A T AGAA TTC A . A . G A AAAT GCAACT TAT T T G T AAGTTCT T CCACAAG TATA . AG T G T A AA TTGAT ACAA T CG TCAACAGTTCTATG GAC TA TAGTACAT TA GT TT GTAAA C ATATGAAA TATGA TGAA AC AGACTA GAC G TTT C A T T TA CCC C C C GACTT A CATAATC ATTT GG ATTCGTGTGGCCATTTGCAACAGCCTTA ATTTTAATT AACCAAC . A . A CT TGTG
blockSeqs : . GT T A . . C . . A A TT ATATATTTT G . TGTGCATTCTCAACACT . T T . TAGTTT . TCAT . T . . GTCGT . . . C . . . . . C CA . C CT . TTA C . . G A . T G . . G C . . . . . T . CAT . . CA . . . . T A . . . . T . TG TGAAG ACT . T T . A . AATTAAG G . G . . . . . . ACAA . TA AGTAAAT A . CAATC . . TA . A AGTA C TGAA . AAACTA GT . A . . . . . . C . T A A TTCA . GG TCCCATTTGAAACAGCTTTG . . . . . A T .
blockSeqs : . T T T . . C . . G . TT ATATATTTT G . CTCAACATT . . A . C . . . . . . G . . . C . . . . . . CA . . CT . . C . . G . . C G . . G . . . . . . T . CAT . . A . . . . A . . . . . A . T TTT GT . . C . A . TCTCAAG . . T . . . . . . ACAA . C CAATT A . CAATC . . G . . . C . . . G . A . . . . . . C . C . A TCA . GG TGTTTTA . . . . . A T .
blockSeqs : . T . T . . . . . G . G . C . CCAACACT . . A . G . . . . . . G . . . C . . . . . . CA . . CT . . . . . . . . A . . . G . . . . . . C . CAT . . T . . . . A . . . . . G . T TA AG . . T . A . AAAGA . . A . . . . . . A . A AATT A . CAATC . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . CA . GG CGTTG . . . . . . A .
blockSeqs : . T . A . . . . . G . G . G . CCAACACT . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . AT . . T . . . . T . . . . . G . T AC GT . . T . A . AAAGA . . A . . . . . . . . C AATG . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . AT TCGTG . . . . . . T .
blockSeqs : . T . A . . . . . G . G . A . CCAACACT . . . . . . . . . . . G . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . AG . . A . . . . A . . . . . G . T T GT . . . . A . AAAGA . . A . . . . . . . . C AGTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . AT CGTTG . . . . . . T .
blockSeqs : . T . C . . . . . G . C . A . TTGTGACT . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . TC . . A . . . . A . . . . . G . T T GA . . . . A . CAGA . . C . . . . . . . . C ACTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . AT CGTG . . . . . . T .
blockSeqs : . . . A . . . . . G . C . C . CAACACT . . . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . C . AG . . G . . . . A . . . . . G . T T AG . . . . A . CAAG . . C . . . . . . . . C AAAT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . GG TATT . . . . . . T .
blockSeqs : . T . . . . . G . G . C . GTGTCT . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . C . AG . . G . . . . A . . . . . T . T T GT . . . . A . AGG . . A . . . . . . . . A AGTT . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . GG TGTG . . . . . . T .
blockSeqs : . A . . . . . G . A . G . TGTGCT . . . . . . . . . . . G . . . G . . . . . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . AG . . A . . . . A . . . . . G . T T AG . . . . A . AAG . . C . . . . . . . . C AGTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . TA GGTG . . . . . . T .
blockSeqs : T . . . . . G . G . G . TGTGCT . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . AG . . T . . . . A . . . . . G . T T AG . . . . A . CAG . . C . . . . . . . . C AGTT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . GG TGTG . . . . . . T .
blockSeqs : A . . . . . G . G . C . TGTGCT . . . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . AT . . A . . . . A . . . . . A . T T AG . . . . A . AAA . . A . . . . . . . . C ATTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . GG CTTG . . . . . . T .
blockSeqs : T . . . . . . . G . C . TGTGCT . . . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . C . GG . . A . . . . T . . . . . G . T T GT . . . . A . AAG . . A . . . . . . . . C AGTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . GG CGTG . . . . . . T .
blockSeqs : T . . . . . . . G . T . TGTGCT . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . AG . . A . . . . A . . . . . G . T T AG . . . . A . AAG . . C . . . . . . . . A AGTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . GG GGTG . . . . . . T .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . ACACT . . . . . . . . . . . G . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . AG . . A . . . . G . . . . . G . T T GT . . . . A . AAG . . A . . . . . . . . C TGTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . T GGTG . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . AG . . A . . . . A . . . . . G . T A AG . . . . A . AAG . . C . . . . . . . . C AGTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . T CGTG . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . . . . . . . C . AG . . A . . . . A . . . . . G . T C AT . . . . A . CAG . . C . . . . . . . . A AGA . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . T CG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . C . AG . . A . . . . A . . . . . A . . C GT . . . . . . AG . . A . . . . . . . . C GAT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . GT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A . A . . G . . . . T . . . . . . . . C GT . . . . . . . . . A . . . . . . . . A AGA . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . A . . A . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . . . . C TT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C AT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : *** ** G*************** ** N* AG** ** A*** ***** *** T**** AAG********** C** AGTT************* C***** ** *** CA*****************
originalCons : ACATGGT-GT-T-AAAT-CCCAANTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GTNCATT-TC---G-CG-C-----------T-----------GAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TCAA---TTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACN-G--TCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-T-ACG--T-A-GTTT-T--CT-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AA----G--ATA----GA-CA-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAA
finalCons : ACATGGT-GT-T-AAAT-CCCAANTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GTNCATT-TC---G-CG-C-----------T-----------GAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TTG---------------T--AC-TA-TCAA---TTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACN-G--TCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-T-ACG--TAG--TTT-T--CTA---TT-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTTT----GTGA-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TAAAG----------ATA----GA-CA-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-AC--TAGTT-------------GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------TC-----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CACA-----------------AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): TTGGCTGCATGTTGCGATTAAAATGGGTTAAACTGAATTTCTCGCCCTCTTCCAATTTTCGCCTT
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consensus : ACATGGT-GT-T-AAAT-CCCAANTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GTNCATT-TC---G-CG-C-----------T-----------GAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TCAA---TTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACN-G--TCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-T-ACG--T-A-GTTT-T--CT-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AA----G--ATA----GA-CA-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAA
Reference ( family-2576 ) : ACATGGT-GT-T-AAAT-CCCAANTTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------GTNCATT-TC---G-CG-C-----------T-----------GAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TCAA---TTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACN-G--TCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-T-ACG--T-A-GTTT-T--CT-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AA----G--ATA----GA-CA-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAA
gi|1 : TGTATT-TT---G-TG-T-----------G-----------AAA-GAAGT--C-C-AA------AAAATT----G-AATAG-TG-TTA----------G----TGAAC-TAATGGA---TTA-G----TC-TTG-G----G---TAT---AAG-AAC--G--T-T---AA-AAA--TTGTT-TT-CAAGA-TAG-AC-T----TTTG-AA-AAT-T-T-ACG--T-ATGTTT-TGCTT-AATTT-----TGTTTAA-TTTT-G---TTTTT---C-AATTCTT-GAACGTTTGAAAA-TGCTT---TAGTGA-----C----AA-G-TA-A-AGTTCATTCA-AAA------G-TA----AAA---G--ATA----AAACA-G-GCCT-GTAC-C-T--TA-----A----G-AAC-T-----AGT---TCT---AA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------TTC----A----AC-T------T---T-GA--GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--CACATCATCAAA-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------ACACC-AACGCTG-ATTTAA-TTT----GGGATT
gi|10 : ttaaattaaccattgaaatgtgggcttaatACATAGT-GT-T-AAAT-CCCAAATT-------C-A---------------CG-AC------------CAT-------A-CA-C-----------T-----------GAG-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-CA-TCAA---CTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACG-G--TTT---GA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-TAG-AC-T--A-TTTG-AA-A-T-T-T-AAA--T-A-TTTT-T--CT-A--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---TTTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----T----AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AG----G--ATA----GA-CG-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-C-T-----AAT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAG-CA--C----------A-----AA----ATGGA---CG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ATC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTAAatgaagcactatgcacaaggtaagaaatagcaagttttaattgatgccagggagattaagtgagggatcgtctaa
gi|11 : AAT-CCCAAATTA--AAT-C-A-AGT-TGGTTATTT-TG-AC---------ATATATT-TT---G-TG-C-----------TTTCTCAATATTGAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AT-TA-TCAA---CTA-G----CC-TCGAG----A---TAC---A-G-AACT-G--TTT---AA-CAA--T-TTC-TT-CA-GA-CAG-AC-C--G-GTTG-AA-A-T-T-T-ATG--C-A-GTTT-T--CG-T--TC-----TGTT-CA-TTTT-G---ATCTT---C-A-----T-GA---TTTTTAAA-TGCTT---T-TTTA-----T----AA-A-GA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AA----G--ATA----GA-CT-T-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----G-A-A-T-----AAT---G-----CA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-TA--------A-C----T----A--T------T---T-G---AA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AG-----AAAT-CA--C----------A-----AA----AT
gi|12 : TA----GA-CA-G-TTTT-GTAC-C-T--CA-----A----A-------------T---T-----GA---T--A--------ATAC--A--A--A-----C-TA--------T-T----ATGAAA--TAGACTAT---T-A---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-AT-----AAAG-CA--C----------ATAATCAA----ATGGATCCCATTTGAAACAGCTTTG---------------------AA---------ATT-------A-ACC-AAC-TTA-AATTAA-TAT----GGGCTCTAat
gi|12 : ggtgCAAATGG--GAT-C-C-ATT-TGATTAT-----------------GTGCTTTATC---AACA-C-----------T-----------GAA-GAGTT--C-T-AATAGTCTA---TTTCATA-A-TAG-T--TT-----------G----T--AT-TA-TCAA---TT-----------TGAG----G---TAC---A-A-AACT-G--TCT---AA-AGA--T-GCC-TT-CA-AA-AAG-AC-T--A-GTCA-AA-A-T-A-A-ATC--T-T-CTTT-T--CT-T--TC-----TATT-GC-TTTT-G---ATTTT---C-A-----G-GC---TTTTAAAA-TGCTT---T--TAA-----T----AATA-TA-A-AGTGC--------A------G-TACCACAA----G--ATA----AA--A-G-TTTT------C-T--CA----------------------------------GA---T--A--------ATAC--A--A--A-----C-T----------------A----A--T------T---T-aagatgccttcaaaaagactagtcaaaataaatcttcttttctttctattgcttttgattttcaggcttttaaaatgcttttaataatataaagtgcagtaccacaagataaaagttttctcagataatacaaactaatttatatgaaatac
gi|13 : ggtgtagagcccatattaatttaagttggttaatttcaaagctgtttA---TTA-GATTCTC-TTGAAAGAAG---TAC---A-ATAACG-G--TTTTATAA-AAAGTT-GTT-TTACA-GA-TAG-AC-T----TTTG-AAGA-T-T-T-A------A-GTTT-T--CTCA--TT-----TGTTTAA-TTTTTG---TTTTT---C-A-----TAGA---TTTTGAAAATGCTTAAAT-GTGAGCAACT----AA----A-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----CA----G--TAA----AA-CA-G-GTCT-GTAC-G-T--TA-----G----G-A-C-T-----A-----T-----GA---C--A--------G-AC--A--AG-A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---T-GA--GA-ACT-C-TT-C--A---GTG--T-G-AGA----AAAG-CA--C----------------AA----ATGGA---CGT------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-ATT----GGGATTTAAatatgaaatac
gi|14 : t-AACA-G--TCT---AT-AAA--T--TT-TT-CA-GA-CAG-AC-T--A-TAGC-AA-A-T-T-A-ACG--T-A---TT-T--GT-A--TT-----TG---GA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-G----TTCTGAAA-T--CA---T-GTGA-----TGAAGAA-G-TA-A-A-------TA-AAA------A-TA----AA----A--ATA----AA-TC-G-GACT-GTTCTC-C--CA-----A----G-A---------AG----A-----GA---T--A---------TAC--T--A--A-----C-----------T-C----A----A--T------T---T-----GA-ACT-C----C--A---G-G-T----GG-----AAAG-AA--C----------------AA----AT--A---TA-------------TT---------------------AA---------AAT-------A-----AAC-TTG-A--TAA-TTT----GGAATTTAAcg
gi|15 : agtaCC-G--CCT---AA-AAA--T-GTC-TT-CA-GA-CAG-AC-T--G-TTTG-AA-A-T-T-T-ACG--T-AAGTTT-T--CT-A--TTAAATTTGTT-AA-TTTT-T---ATTTT---C-A-----T-GA---TTTTGAAA-TGCTT---T-GTGA-----TTT--AA-G-TA-A-AGT-CATTTA-AAA------G-TA----AATTAAG--ATA----GA-CC-A-TTCT-GTAC-C-T--GA-----A----G-A-C-T-----AGT---T-----GA---T--A--------GTAC--A--A--A-----C-CA--------T-C----A----A--T------T---T-G---GA-ACT-C-TT-C--A---GTG-TT-G-GG-----AAAT-CA--C----------A-----AA----ATGGA---TG-------------TG---------------------AA---------AAT-------A-ACC-AAC-TTG-ATTTAA-TTT----GGGATTTatatatgtatgtaagaaatgcgtgttgtttatagtgataggggtcaaca
gi|16 : -TG-A-AGT-CATTT-------------T---------------TA----GA-CA-G-TTCT-GTAC-C-T--CA-----AA---G-A-C-T-----ACT---T-----GA---T-----------GTAC--A--A--A-----C-TA--------T-C----A----A--T------T---TGG---GA-ACT-C-TT-T--C---ATG-TT-G-AG-----AAAG-CA-------------A-----AA----ATATA---TGTTT----------TA---------------------AAATTTTAATTAAT-------A-ATT-AAC--CA-ATTTTA-TTT----GGtataaagtatg
gi|16 : aatatagAA-GAGTT--C-CCAA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC--A-TCAA---GTA-G----TCTTTGAG----G---TAC---A-G-AACT-G--TCT---AA-AAA--T-GAC-TT-CA-GA-AAG-ACTT--G-GTTG--C-A-T-T-T-GTG--T-A-GTTT-T--CC-G---T-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GC---TTTT--------TT------TGA-----TA---AA-G-AA-A-AAT-CAATTA-AAA------G-TA----AA----G--AAAG---GA-CC-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----A-A-C-gaaagacttggttgcatttgtgtagttttccgttgttaattttgattttcatgctttttttgataaagaaaaatcaattaaaagtaaagaaaggaccggtctgtacctcaaaac
gi|17 : aatatagccaaataaaattggttaattattaattaaaattttaaaacatatatttttgctttctcaacatgaAATTTA--AAA-C-A-----TA--TATTT-TG-------------TGC-TT-TCTCAA-CA-T-----------T-----------AAA-GAGTT--C-C-AA------A---TT----G-A-TAG-T--TT-----------G----T--AC-TA-TCAA---GTA-G----TC-TTGAG----G---TAC---A-G-AACT-G--TCT---AA-AAA--T-GAC-TT-CA-GA-AAG-AC-T--G-GTTG-CA-A-T-T-T-GTG--T-A-GTTT-T--CC-G--TT-----TGTT-AA-TTTT-G---ATTTT---C-A-----T-GC---TTTT-----T----------TGA-----T----AA-A-GA-A-AAT-CAATTA-AAA------G-TA----AA----G--AAA----GA-CC-G-GTCT-GTAC-C-T--CA-----A----
gi|18 : caaataaaattggttaattattattaaGT-GT-TTAAATGCCCAATTTA--A-T-C-A-AGT-TGGGTATTTGTG-AC---------GTCCATT-T----G-TGTC-----------T-----------GAA-GAGTTT-C-C-AA------A---T-----A-A-TAG-T--T------------G----T--AC-TA-TGGA---TTG-C----TC-TTGAA----GC--TAC---A-TCAACGCG--TTT---AA-AAA--T-GT--TT-CA-GA-TAG-AC-T--G-TT-G-AA-A-T-TAT-ACG--T-A-GTTTCT--CT-A--TT-----TGTT-AAATTTT-G----TTTT---C-A-----T--A---TTT--AAA-T-CTT---T-GTGAA----C----AA-G-TATA-GGT-CATTTA-AAA--------TA----CA----GA-ATA----AA-CA-G-GTCT-a
gi|19 : TA----GA-CA-G-TTAT-GTAC-C-T--C---------------CGT-----AAA---T-----GA---T--A--------GTAC--A--ATTA-----C-GA--------T-G----A----A--A------T---T-A---G---------T-C--A---GTA-TT-G-AG-----AAGG-
gi|19 : ttacatagtgtaaaccacacagacaatcaaattggttatttcaaagtcgttgcaaattgtcactatttaatattccttctca--TT-----------G----T--AC-TA-TCAT---TTACG---------GAG----G---TAC---A-T-AACT-G--TCT---AA-AGA--T-GCC-TT-CA-GA-CTG-GT-T--A-CATGTAA-G-T-T-T-ACA--T-A--TTT-T--CT-T--TT-----Taagatgccttcagactggttacatgtaagtttacatattttcttttttatttctt
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Unaligned ( gi|32 ): TTGGCTGCATGTTGCGATTAAAATGGGTTAAACTGAATTTCTCGCCCTCTTCCAATTTTCGCCTT