lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111 1 222222222222 1111 11 777777777777777777777777777777 22222 11 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 1111111 11111111 22222222 11111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 222222222222222222 1111 11111111111111111111111111 1111111111111111111 2222222222 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111 11111111111111111111111111 111111111111111 66666666666666666666666666666666 111111 1111 88888888888888888888 11 111 8888888888888888888888888888888888 111111111
lowQualScore : 2 2 88 2 2 222 2 2 3 3 5 5 6 0 1 555555555555 3333 7 99 8 88 8 333333333333333333333333333333 8 88 11111 99 777 9 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 333 2 8 2 4444 4 22 22 22 6 5 1 3 0 2 2 2 4 5555555 44444 77 4 22 44444444 2 2 88888888 00000000000 4 2 2 333 4444 66 2 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 88 2 33 33 0 4 2 222222222222222222 55 2 88888888888 2 3333 33 33 2 2 33 2 1 88888888888888888888888888 77777 2 5555555555555555555 333 666 5555555555 22 2 55 444 88 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 333333333 7777 99999999999999999999999999 2 2 4444 2 4 2 666 333 2 777777777777777 4444 33 2 4 33333333333333333333333333333333 2 8 33 77 55555 22 000000 666666 2222 4 2 2 88888888888888888888 2 33 333 2 2 33 000 4 4444 2 1111111111111111111111111111111111 111111111 2 2
lowQualScore : . . .. . . ... . . . . . . . . . ............ .... . .. . .. . .............................. . .. ..... .. ... . ......................................................................................................................................................................................................................................................................... . ... . . . .... . .. .. .. . . . . . . . . . ....... ..... .. . .. ........ . . ........ ........... . . . ... .... .. . . .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. .. . .. .. . . . .................. .. . ........... . .... .. .. . . .. . . .......................... ..... . ................... ... ... .......... .. . .. ... .. .................................................................................. . ......... .... .......................... . . .... . . . ... ... . ............... .... .. . . ................................ . . .. .. ..... .. ...... ...... .... . . . .................... . .. ... . . .. ... . .... . .................................. ......... . .
lowQualScore : 7 7 77 7 7 666 7 7 6 2 4 4 7 8 4 666666666666 8888 8 00 0 66 0 000000000000000000000000000000 0 88 22222 00 666 8 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 777 1 4 1 7777 0 88 88 88 2 7 9 8 4 0 0 0 0 4444444 44444 11 2 99 22222222 1 1 88888888 00000000000 2 1 2 999 7777 11 2 4 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 44 4 22 22 2 7 4 999999999999999999 33 2 77777777777 5 8888 44 44 4 4 22 4 6 77777777777777777777777777 00000 0 1111111111111111111 555 222 4444444444 99 1 88 111 88 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 666666666 0000 33333333333333333333333333 2 2 7777 9 4 4 999 999 2 222222222222222 7777 11 2 3 33333333333333333333333333333333 2 9 11 55 99999 99 333333 111111 8888 1 1 1 33333333333333333333 6 11 999 2 2 99 777 4 7777 2 0000000000000000000000000000000000 444444444 9 9
consensus : CAGCGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAG-AT-N-AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTTGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCTGGTGCAA-T-TT-AGAC-AA---------------TTAA---GAGAGG-TATTT-TCAA-AGTC-T-C-GATAG-CAN-ATTTTTTAATTA----------ATT----TAAGATTGATCGCNNCCTCCTTCAAAAAAA-AAAAGG----GG-------GGGGGGG--------------------------G---------------------T---T-----T--N-T--------------------T---------GC-ATTT---TT-----TTTT---------------TN-----------A-----------T---TT---GAG-ACGTTTTG-TACT------CT-TTTT-TA---TA-A-CA-A---CTA-A--AT--T--AGATGCGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--CT-A--C--------T-AA-A--A-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A----GT-----C-TNG-AA----------T-------------T-T--A-A-T--------A----T--A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T------T-----AGT----T-----T--------------GT---------A-----A---------A---------TA-A---------A------C--C----GT-TCCAAA--A----A-A----AAT------TGCA-GTT-AATCT--AA--TTGAT-AA-T--AA--------------T--TT-T--T---G----TT-T----AAA--A--TA-AA-A--TGA-AGGG--G----GC--GG--C-AT-ACG---ATG-----TC-C--G-GT-C----T------TAC---C---CCAN-----N--TGC--CT-TT--GA---T--T-T-AAAAAA-----A-----AAAA--AGA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGAT-GAA----A---TC-A-TT-C----AGCA-TT-TTCGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-TT----CTTT--TCT-TCTTTT--TTT------T--------------------ATT-T-A--AA--TC--T--A--AT------TTTATTTG------A--CTTTTAA-A-TCA--T-T-CA------TTTTTTTTT--TTTTA---C-C-GCAAAAC-A-A-TGTGG----AA-GCA---------CC-------ATGCTTC---------AT---------AGGAAGC-T-ACGCCAC
Reference ( gi|6 ) : CAGTGGC-GTA-GCA-T-GGGGTAG-AT-T-AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAAGGGGTTTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAGCCTGATGCA--T-TT-AGAC-A----------------TTAA---AATAGG-TATTT-TCAA-AGTC-T-C-GATA--CAG-ATTTTTTAATTA----------ACT----TAA---TAATCTCCCCCCCCCCCAAAAAAA-AAAAGG----GG-------GGAGGGG--------------------------G---------------------T---T-----T--C-T--------------------T---------GC-ATTT---TT-----TTTT---------------TC-----------A-----------T---TT---GAG-ACATTTTG-TACTAGATATCTATTTT-TA---TA-A-CA-A---ATA-A--AT--T--AGATGCATTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--CT-A--C--------T-AA-A--T-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A----GT-----CTTCG-AA----------T-------------T-T--A-A-T--------A----T--A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T------T-----AGT----T-----T--------------GT---------A-----A---------A---------TA-A---------A------C--C----GT-TCCAAA--A----A-A----AAT------TGCA-ATT-AATCT--AA--TTGAT-AA-T--AA--------------T--TT-T--T---G----TT-T----AAA--A--TA-AA-A--TGA-AGGG--G----GC--AG--T-AT-ACC---ATG-----TC-C--G-AT-C----T------TAC---C---CCAA-----T--TGC--CT-TT--GA---T--T-TAAAAAAA-----A-----AAAA--AGA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------CTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGAT-GGA----A---TC-A-TT-C----AGCA-TT-TTCGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-TT----CTTT--TCT-TCTTTT--TTT--C---T--------------------ATT-T-A--AA--TC--T--A--AT------TTTATTTG------A--CTTTTAA-A-TCA--T-T-CAATTTTTTTTTTTTTT--TTTTA---C-C-GCAAAAC-G-A-TGTGG----AA-GCA---------CT-------ATGCTT----------AT---------AGGAAGC-T-ACGCCAC
gi|4 : CAGTGGC-G---GTACT-TGGGTTG-AT-T-AATATGGAA-GC-AGAAATGGGCGAGGGG-TTGGGGGCCGGCCCTAAGCCC
gi|3 : CAGTGGC-GTATGCT-T-GGGGTAATAT-G-CATATGGAATGCAAGAAA-Gaatggtcatgcagagccctgtggcgggtccggggcgagccccgaagctggtgcattttagacaagtaaaagaggttattttcaagagtctccgataggcagtttcaataattaaaaacaggacattggggtaagattaaccttctttttcaagaaaaacaaaggggaaaagatttgtccatctaatttagttttatactgttttttttttttttttttattttgagagttttgttactagattttataacaactataattagatgcgttgaattacttgaaagctttcataaaaactaactaaaaattcggtatcgtaaattgaataagatttatacgagtcgaatctattgatgtagtttccagataaaacttgcacaagttcgaagcacattcgttgttatgaatcgcgtaaatacgtgtccaaaaaataagttaatctaattgataatgttttcccgtttaaaaaataaatgagaaggtcggcgaagcaatacatgccggtcttacgctcttagtcctttgatttaaaaaaagataatcaatttgtagggcttattgctacacgatttaaatgaaatcaattcacattttcgaatcccatatctatgttcttttcttcctttgttttgctattaaatctaatttttttgactcttaatatcatttagacttctttttttttttataccgcaaaacgaatgtggaggcgacatgctcgtgcttcaataggaagcatacgc
gi|21 : gatCAGTAGC--TA-GCG-TTGGGGTAG-AT-T-AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCTGGGGG-TTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|52 : gttttaatCAGTGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAG-AT-T-AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGAAAGGGGTTTGGGGGCT-Gaatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgatacacaattttcattaattttaaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|29 : CAGCGGC-GTA-GCT-A-GGGGTAG-GT-A-GATATGGAA-GT-AGAAA-GAGCAGGGAGTTTGGGGGCC-ACCC--AGGTCCT------------G
gi|42 : CAGTTGCCGTA-GC--T-CGGGTTG-AT-G-AAAATGGAG-GC-AGAA---GACAGGG---TTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------atcgattcccccaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|5 : CAGCGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAA-AT-A-AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAataggcgtcaagggcaggcctaggggcgaagcccccggaagc
gi|60 : gacgttacaattttgcaacatatgcacattcttgttaaagttctctaggcgagtcaaaaaataacattatctaaattagaatcatttctatttccttcaaaacaaaacttctgatattttcacggtccaagcattacttgcacataacaatgttttcaggtggtggttgggagggagggggtggggttgaagtggaatttcagaacggggaggagggtagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaattcttacaaacaagaggttatctttatttttatcaaaagcttatacaaacaatttaaaaaaaaagaatcattcggggtgggggctggggtgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgagcatgtttaccgatagtatttacggtaaaagttttatatcctgcaggccagacgcctaagtcgaatttcatgtgccacttttgacagtggtgatattatttctacacaaataaaaaacaagtttattacagaatctctcagttattgaaaaataaaaccaactttttaatgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGCGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAG-AT-T-AATATGGAA-AC-AG
gi|32 : tCAGTGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAT-ATATGAATATGGAA-GC-AGAAA-GGG
gi|1 : ttCAGCGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAA-ATAT-AATATGGAA-GC-AGAGA-Gtccccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|2 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgagcccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaacaattttttaaaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactacCAGCGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAA-AT-A-AATATGGAA-GC-AGAGA-G
gi|57 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgaagccccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaaattttttaaaaaagaaatcacgggggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactacCATTGGT-GTA-ACT-T-AGGGTAG-AT-T-AATATGGAA-GC-AGAAA-
gi|61 : CAGCGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAG-AT-A-AATATAGAA-GC-A
gi|51 : tCAGCGGC-GTA-GCT-T-GGGGTAA-AT-A-AATATGGAA-GC-A
gi|55 : tgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGCGAC-GTA-GCT-T-GGGGTAG-AT-A-AATATGG-A-GC-A
gi|45 : ttttttctattaaccgGGGGCC-GCCCTAAGATTCCCAATGGGTCCAGGGAAGCGGGTGCA--T-TTTAGAC-AA---------------TTAA---GAGAGG-TATTT-TCAA-AGTTAC-C-AATA--CAC-ATTT
gi|21 : AAGCTCCC------------GGAAGCAGGTGCAA-T-TT-AGAC-A----------------TT------------------TCAA-AGTC-T-CTGATA--CAC-AATTTTC-ATTA----------ATT----T
gi|18 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgAAGCCCCC------------GGAAGCTGCTGCAATT-TT-CGAC-A----------------TTAA---GAGAGG-TATTT-TCAA-AGTC-A-C-GATA--CAA-TTTCTTTAtaaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|4 : ttgccctgtgatgtcctgggggaGCCCC------------GAAGC-TGGTGCA--TTTT-AGACAA----------------GTAA---AAGAGGTTATTT-TCAAGAGTC-TCC-GATAGGCAG-TTTCAATAATTAAAAACAGGACATTGGGGTAAGATTAA---CCTTCTTTTTCAAGAAAA-ACAAAG----GG-------GAAAAGA--------------------------T---------------------T---TGTCCAT--C-TAATTTAGTTTTATAC-----T---------GT-TTTT---TTTTTTTTTTT---------------TT-----------AT----------T---TT---GAG-A-GTTTTGTTACTAGA-------TTT-TA---TA-A-CA-A---CTATA--AT--T--AGATGCG---T-TGAA-TT-ACTTGA-A-AGC-T-T-----TCA-T-A-AAAA--CTAA--C--------TAAA-A--A-----TTCG--------------GTA-TCGTAA---AT---TG---AA-T-AAGATTT-A----T-A-CGA----G--------TCG-AA----------TCTA----------T-T--G-A-T--------G----T----------AGTTTCCAGATAAAA---CTT---GC--A-C--A-AG-TTC--G------------AAG-CA--C--------------A------T------T-----CGTTG--T-----T--------------AT---------G-----A---------ATCGCG----TA-A---------A------TA-C----GTGTCCAAA--A----A-A----TA----------A-GTT-AATCT--AA--TTGAT-AA-T---G--------------T--TT-TCCC---G----TT-T----AAA--A--AATAA-A--TGAGAAGGTCG----GCGAAG--CAAT-A-C---ATG------C-C--G-GT-C----T------TACGCTC---TTAG-----T----C--CT-TT--GA---T--T-TAAAAAAA-----G-----ATAATCAAT---T-T-GTA---G--GGC-----TTA-------------------TTG--C-T-ACAC---G----AT----TT-------AAAT-GAA----A---TCAA-TT-C----A-CA-TT-TTCGAATCCC-----A-TATC-----TA------TGTT----CTTT--TCT-TCCTTTG-TTTTGC---T--------------------A-T-T-A--AA--TC--T--A--AT------TTT-TTTG------A--CTCTTAATA-TCA--T-T-TAGACTTCTTTTTTTTT--TTATA---C-C-GCAAAAC-GAA-TGTGG----AG-GCG---------AC-------ATGCTCGTGCTTCA--AT---------AGGAAGCAT-ACGCtctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|3 : cagtggcggtacttgggttgattaatatggaagcagaaatgggcgaggggttgggggccggccctaagcccaatggtcatgcagagccctgtggcgggtccggggcgaCCCA------------GGAAGCTGGTGCA--T-TT-CAAC-AACAACCCCACACCCACTTAATTAGATAG--TATCTGTCAA--GTC-T-CCGATAG-CATCATTTTTTTAATG----------GGT----AAA---TGATCGTAACTTCCTTAGAAAAAC-AAAAGG----GG-------GGGGGGGAGCGGGGGGGGGGGGGGAGTCCATTAG---------------------T---T-----TTAC-T--------------------T---------GC-ATTT---TG-----TTTC---------------TA-----------A-----------T---TT---TGG-ACGTTTTG-TACT---------CTTT-TA---TA-AACA-A---CTA-A--AT--T--AGATGCGGTTT-TAAA-TTGCCTTGA-A-AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-CT-A--C--------T-AA-AATT-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TGA-C-A----AT-----C---G-AA----------T-------------C-T--A-A---------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T------TTATTTAGT----T-----C--------------GTT--------A-----A---------A---------TA-ACTAGAGTAAA------C--G----GG-TGTCAA--A----A-A----AAG------TGTA-GTT-AATCT--AA--TTGATAAA-T--AT--------------T--TT-T--T---G----TT-TA---AAA--A--TA-AA-A--ACA-AAAA--T----AC--AT--C-A--ACCG--ACT-----TC-C--GAAT-CT---T------TAC---C---CCCA-----TG-TGC--TT-TT--GA---TGCT-TCAAAAAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----A
gi|7 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactcCCTTAGAAAAACAAAAGG----GG-------GGGGGGG--------------------------tattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|22 : tggggtaaaatgatcgtaacttCAAAAAAA-AAGAGGGGGAGG-------GGAGGGG--------------------------GGAGGATTGTCCAATAATTAGTT---T-----T--A-C--------------------T---------GCAATTTTTGTT-----TTTT---------------TT-----------GGTTTTTTGTATT---TT---GAG-ACGTTTTG-TACT--ATA---------------A-A-CA-A---CTA-A--AT--A--GAATGCGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-ACAAC-T-T-----C-A-T-A-AAAA--CT-A--C--------T-AA-A--A-----TTCG-----------A-TGTA-CC-TTA---A----TG--TAA-A-TAG-----A----T-AGC-A----G--------TCG-AA----------T-------------C-T--A-AGT--------AGTT-T--A-------GATAAA--------A---CTT---TG--ACC--AGAG-TTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------T------T-----AGT----T-----agcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|36 : aacacaaacacatggggtaagaagatttaacttctttcaagaaaaCAAGAAAA-AAAAGG----GATTGTCCAATAATAA--------------------------G---------------------T---TA----T--A-C--------------------T---------GC-ATTT---TT-----TTTT---------------TTTAAAAAATTCTA-----------T---TT---GAG-ACGTTTTG-TA--------TTATTTT-TA---TA-A-CA-A---gtta
gi|30 : aacacaggcacatagggtaagatttaacttttttAAGA-AAAAGG----GG-------GGGGGGG--------------------------G---------------------A---T-----T--G-TCCATTAATTAGTTTTAATACT---------GC-ATTT---TT-----TTTTGGGGGGGTGGGGGGGTT-----------A-----------T---TTT--GAG-ACGTTTTG-TACTA------T-TTTT-TA---TA-A-CA-A---CTA-A--AT--T--AGATGCGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----T-ATT-T-AAAG--CT-A--C--------T-AA-A--------TTCG-----------A-TGTA-
gi|12 : aatacaggcgcatggggtaaagaaagttaactttctttcAAA-AAAAGG----GG-------GG-GGGG--------------------------G---------------------TCCAT-----T--A-T--------------------TAGTTTTACAGC-ATTT---TTAAA--ATTT---------------TA-----------T-----------T---TT---GAA-ACGTTTTG-TAT------TC--TTTT-TA---TA-A-CA-A---CTA-A--AT--G--AGATGCGTTTT-TGAA-TT-CCCTGA-A-AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--AT-A--C--------T-AA-A--A-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AA---TG--AAA-G-AAG-----A----TGA-C-AT---GC-----AGTCG-AA----------T-------------C-T--A-AGTAGTTTTTGA----T--A-------AA------------A---TTT---GG--A-C--AGAG-TTCAG-------------AAG-AA--C--------------G------T------T-----AGT----T-----G--------------TT---------A-----A---------AAAATTAGAGTA-A---------A------CA-T----GTGTC---A--A----C-A----AAT------TGCA-GT------T--GA--TTGAT-AA-T--TA--------------T--TT-T--T---
gi|7 : aacacaagcacatgtggcaagaagatcgtgacttccttggggGG----GG-------GGGGGGGAGTCCATTA-----------------G---------------------T---T-----TTAC-T--------------------T---------GC-ATTT---TG-----TTTC---------------TA-----------A-----------T---TT---TGG-ACGTTTTG-TACT---------CTTT-TA---TA-AACA-A---CTA-A--AT--T--AGATGCGGTTT-TAAA-TTGCCTTGA-A-AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-CT-A--C--------T-AA-AATT-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TGA-C-A----AT-----C---G-AA----------T-------------C-T--A-A---------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T------TTATTTAGT----T-----C--------------GTT--------A-----A---------A---------TA-ACTAGAGTAAA------C--G----GG-TGTCAA--A----A-A----AAG------TGTA-GTT-AATCT--AA--TTGATAAA-T--AT--------------T--TT-T--T---G----TT-TA---AAA--A--TA-AA-A--ACA-AAAA--T----AC--AT--C-A--ACCG--ACT-----TC-C--GAAT-CT---T------TAC---C---CCCA-----TG-TGC--TT-TT--GA---TGCT-TCAAAAAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----Aacacggtaaaggctatctatagcctccacctttttacatacgatgtccgctcttactccatgtgcctttgatcttaaaaaagatttttatatacgagcacatactacaattcaatttcagtttactacagataaagatgaaatcattcagcat
gi|8 : tggggtaaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggg--------------------------G---------------------T---T-----T--T-TA-------------------T---------TC-ATTT---GT-----TTTT---------------AT-----------T-----------T---TT---GAG-ACGTTTT--TGTTTGCT-TCT--TTT-TA---TA-A-CA-A---CTA-A--ATAGT--ATGTGC---TT-TGAA-TT-CCTTGATA-GGC-T-T-----TTA-T-T-AAAAAACT-AACT--------T-AA-A--A-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---TT---TG--AAA-A-AAG-----A------A-C-A----AT-----A---G-AA----------T-------------C-T--A-A-TTA------G----T--ACGGTGATAGTTTCACGATGAAA---CTT---GG--G-C--AGAG-TTCGGA------------AGC-CATGC--------------A------T------T-----GGTGGCATTACCGT--------------GT---------A-----A---------A----------A-A---------A--------------------AAA--A----A-A----A--------TGCG-GTT-AATTT--AA--TT--T-AA-T--AA--------------TTATT-T--T---G----TT-T----AAA--A--TA-AA-A--TGA-A-GG--G----GC--GG--C-AT-ACCGGAATG-----TC-T--G--T-C----T------T-C---C---CCAT-----G--TGC--CT-TTTGGA---T--T-TAAATAAA-----A-----ATTT--ACA---T-T-ATATTTA--CAC-----ACA----A--------------TTG--CTT-AC-----G----AT----TA-------AGAT-GAA----G---TC-ACTT-C----AGCA-TT-TTCGA---CC---AAA-TATC-----TAT-----T-TT----CTTT--TCT-TCTTCT--TTT--A---A--------------------ATTAT-A--AAT-TC--T--A--AA------TTTATTT-------A--CTTTAAA-A-T----T-T-CA-----------TTTT--TTTCA---C-C-GCAACAC-----TGTGG----AG-GCA---------AC-------ATGCTTCCGTGTTTC-AT---------AGGAAGC-T-ACGCtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|38 : aacacaggcacatgggtaagaagatccgtaacttaattctttcataaaaagaaaaaaaaagaaaaaaagatttgccatct--------------------------G---------------------T---T-----T--CAC--------------------T---------GC-ATTT---TT-----GTTT----------------------------A-----------T---TTT--GAGGACGTTTT--TACTA------TATTT---A---TA-A-CA-C---ATATA--AT--ACAAGAAGCGTTTTCTGAA-TT-CCTT---A-AAC-T-T-----T-A-----AAA--------------------------------TTCG-----------ATTGTA-TC-TAA---A----TG--AAA-ac
gi|10 : ---------------------T---T-----T--A-C--------------------T---------GC-ATTT---TT-----TGTT---------------T-----------------------------------G-ACGTATTG-TAGT-------T-TTCT-TA---TA-A-CA-A---CTA-A--AT--T--AAATGTGTTTT-TGAA-TT-C----------------------A-T-T-AAAA--CT-G--G--------T-AA-A--A-----TTCG-----------A-TGCA-TC-TAA---AT---TG--GAT-G-A------------------------T-----TTTAGTAG----------T-------------T-TTGA-A-T--------A-------A-------AG----------------CTT---CG--A-T--AGAA-TTAAGA------------AAGCCA--T--------------A------TGATTA-T-----AGT----TA----TCATAACTCAGTATAGT---------A-----A---------A---------TA-A-------------------C----G--TCTAAA--A----A-ATCTTAA-------TGCA-ATT-A--CT--AA----GA--AA-TCCAA--------------G--TT-T--T--------TT-----------------AA-A--TGA-A-GG--G----GC--GG--G-AT-ACG---ATG-----TC-C--G-GC-C----T------GAC---C---CCAT-----G--TGC--CC-TT--GA---T--TCTAAATAGATTGTCATTTTTAAAG--ACA---C-T-A-----A--GAC-----CAA---------------------G------ACA----G----AT----AA-------AGAT--------A---TA-A-TT-C----AGCA-TT-TTCGA---AC---AAA-TAAT-----TA------T-TT----CTGT--T--------------------T--------------------AAT-C-A--AA---------A--A-------TTCA--TA------A--C-ATTAA-A-TTA--C-T-TAA------------TT--TTTTA---C-C-GC--AAC-A-A-TGTGG----AA-GC----------------------TTC----------AT---------AGGAAGC-T-ACGCCc
gi|43 : aaggacatcgtaatttccttcaatttattttttaaaaaaatttaaaaacataatgcaacaaaccgattatccatgcattagc---------------------T---T-----T--A-C--------------------T---------GC-ATTT---TT-----TT------------------------------A-----------C---T----------GTTCTG-TAC-AG----CT--TTT-TA---GA-A-CA-A---CTA-A--AT--T--AGATGCGTTTT-TGAA-TT-C
gi|9 : aaaaaacaaaaaaaacaaacaaacaagatagttcataagt-T--------------------T---------CC-ACTG---CT-----TTTT---------------TG-----------A-----------TATTTT---GAG-ACGTTTTG-TA----AC-TCT-TTTT-TA---TG-A-CA-A---CTA-G--AT--T--AGGTGTGTTTT-TGAA-TT-CCGTGA-A-AGC-T-T-----A-AAT-T-AAAA--CT-A--C--------T-AG-A--A-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A----A--------TCG-AA----------T-------------C-T--A-AGT--------ACTTTT--A-------GAT-----------AAAGCTT---AG--A-T--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--C--------------A------T------T-----AAG----T-----TGTTATGATTAGA--GT---------A-----A---------A---------TATA---------A------A--T----GT-C---AA--C----A-A----AAT------TGCA-GTT-AATCT--AA--TTAAT-CA-T--AAGATTTTGGGTTAGTT--TT-T--T---GTTTTTT-T----TAA--A--CA-AATA--TAT-A------------------T-AT-A-C---ATG-----TC-C--G-AT-C----T------TAC---C---CCAT-----T--TGC--GT-TT--GATATT--T-TGA------------------------------T-ATA--TT--GAT-----AAA----C--------------ATA--A-T-ACA----G----ATAA--AA-------AGAT-GAA----G---CC-A-TT-C----AGCA-TT-TTTGA---CC---AAA-TATT-----TA------A-TT----ATTT--CTG-TCTTTA--CAT------T--------------------ATT-TAA--AA--TC--T--A--AT------TTTATTTG------A---TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-------TTTTTTTT--TTTTA---C-C-GC--AAC-A-A-TGTGG----AA-CCA---------C--------ATGCTT----------GTGTGCTTCAGAGGAAGC-T-ACGCC
gi|25 : aacacagacacatggggtagggacatcgtaacttccttcaatttaaaaaaaagattcatttaatag--------------------T---------GC-ATTT---TG-----TTTT---------------TA-----------C-----------T---TT---AAG-ACATTTTG-TACT------CT--TGT-TA---TA-A-CA-A---CTA-A--AT--A--AGGTGTGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--CT-A--CATGTACTAT-AA-G---------TCG-----------A-TGCA-TC-TAA---AT---TG--AAG-G-AA
gi|18 : ccgatacacatttctttaattttaaacacaggcatatggaggtaaaggcatcgtaacttccttcaattaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgcttttaaC-AATT---TT-----TGTT---------------TG-----------T-----------T---TT---GAA-ACCTTTTTCTACTCG--------TTT-CA---TA-AACA-A---CTA-A--AT--T--AGATGCGTTTA-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGCTT-T-----T-A-T-CAAAAA--CT-A--C--------T-AA-C--A-----TTCGATAAACGGTGCA-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-ACG-----ATATGT-A-C-A----GT-----C
gi|17 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacgatacaatttctttatctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactC-----------A-----------T---TTCTGGAG-ACGCTTTG-TACTA--------TTTT-TA---TA-A-CA-A---CTA-A--AT--T--AGATGTGGTTT-TAAA-TT-TCGTGA-A-AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--CT-T--C--------T-AA-A--A-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAATACATGTATG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A----A--------TAG-AA----------T-------------T-T--G--------------------A-------AG----------------CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--CGTGTAATTGTTATAA------C------T-----AGT----A-----T--------------AT---------ATAG--A---------G---------TA-A---------A------TA-C----GTGTAC-AA--A----A-T----AAT------TGCA-GTT-AATCT--AA--TTGAT-AA-T--CA--------------T--TT-T--T---GT---TT-T----TAA--A--CA-AA-A--TGA-AGGG--G----GT--GG--G-AT-ACG---ATG-----CC-C--A-AT-CAAGAG------TAC---C---CCAggatct
gi|9 : aacacaggcacatgggggtaaggacatcgtaacttccttcaattaaaaaaaacaacattatccattagtttgaatgATTTTG-T--T-GACATTTATATT-TACTCTA-ATCATA---ACA-A--CT--T--A-ATGTGTTTC-TGAA-CT-CTATCT-A-AGC-T-T-----T-A-TCT-AAAA--GT-A--C--------T-TA-G--A-----TTCG-----------ATTGTA-TC-TTC---TT---TC--AAT-T-TAG-----A----T-A-C-A-------------TCG-AATTCTAGTAGTT-------------T-T--A-A-T--------T----T--A-------AG----------------CTT---TC--A-C--GGAA-TTCA-A------------AAA-CA--C--------------ACCTAATC------T-----AGTTG--T-----C--------------AT---------A-----AAAAAGAGTTA---------CA-A---------A------A--C----GT-CTCAAA--ATATCA-A----AAA------AGCA-GTG-GAACT---A--TTA---AA-TG-AA--------------T--CT-T--T---T----TT-T------------TA-AA-T--TGA-AGGA-----------AG--T--T-ACG---ATG-----TC---------C----C------TAC---C---CCAT-----G--TGT--CT-GT--Gtgt
gi|17 : aaATTTTG-TAC-ACGTATTTACTCTATA---TATA-CT-AGTTATA-ACAAT--T--ACACGTGTTTC-TGAA-CT-CTGTCC-A-AGC-T-T-----C-A-----AATT--CT-A--T--------T-GT-A--TCTTCTTTC------------A-TACA-TG-TA-----T---T----------AG-----A----T-A-C-ATCGAAT-----TTTAG-AAGT--------T-------------T-T--A-A-T-------------T--A-------AG----------------CTT---TC--A-C--GAAA-TTTA-A------------AAC-CA--C--------------A------TCTAATTT-----AGT----TGT---T--------------AT---------A-----A---------AAATAGTA--CA-A---------A------G--C----GTCTCCAGA--A----A---------------TGCA-TTC-AAACT--AA--TGGAT-AA-T--GT--------------TG-TT-T--T---T----TT-T----AA------T--------TGA-AGGA-----------AG--T--T-ACG---ATG-----TC-C------------T------TAC---C---CCCA-----TG-TGC--CT-GT--Gtgcagttaatctaattaatcataagattttgggttagttttttgttttttttaaacaaatatatatatacatgtccgatcttaccccatttgcgtttgatattttgatatattgataaacataatacagataaaaagatgaagccattcagcatttttgaccaaatatttaattatttctgtctttacattatttaaaatctaattttatttgattttaaattatttcattttttttttttaccgcaacaatgtggaaccacatgcttgtgtgcttcagaggaagctacgcc
gi|34 : aaTTTT-TA---CG-A-CA-A---CTA-A---T--T--AGATGCGTTTTGTGAATTT-CCTTGA-A-AGC-CAT-----T-A-T-T-AAAaattgcagttaatctaattgataatcatttttgtttttaaacaaaatgaagggggtgggatacgatgcccaatcaagagtaccccatgt
gi|14 : caaaacaaaaacaaaaaaccccaaaaaacaaaaaacaacaaacaacaaacagataagttcaataagttttactgcattttttaactgttctgtcgcTT-TA---TA-A-CA-A---CTA-A--AT--T--AGATGTGTTTTTTGAA-TT-CCACCA-A-AGC-T-T-----A-A-A-T-AAAA--CT-A--C--------T-AACA--T-----TT-G-----------A-TGTG-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A----A--------TAG-AA----------T-------------T-T--AGG-T--------AGTTTT--A-------GATGAA--------G---GTT---GG--A-T--AGAG-TTCAGAACTCGGTTTCCGAAA-CA--C--------------A------TG-----T-----AATTG--T-----T--------------AT---------AACTAGA---------G---------TA-A---------ATATGTGC--CTTTATT-TACAAATGA----A-AT---AAT------TGCA-GGT--ATCT--AA--TTGAT-AA-T--CA--------------T--TT-T--T---G----T
gi|16 : tccgtacacaatttcttaattttaaactcaggaacatgggggcaaggacaccataactttcttcaattaaaaaacaacattatccatcagtttgaatgtatttttaaagacTA-A--TT--T--AAATGCATTTT-T--------TTTAG-A-CGT-T-T-----T-G-T------A--CT-A--C--------T-AA-A--A-----TTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-G-C-A----GTAGAATCTAAGTAG----------T-------------T-T--C-A-G--------A----T--A-------AA------------A---CTT---GG--A-C--AGAG-CTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T------T-----AGT----TGT---T--------------ATCACTA----A-----A---------G---------TA-A---------A------TA-C----GT-GTCAAA--A----A-A----AAT------C-CA-GTT-AACCT--GA--TTGAT-AA-T--TA--------------T--TG-T------A----TT-T----AAA--A--TA-AA-A--TGA-AGGG--G-----C--AGCAT-AT-ACG---ATG-----TC-C--G-GT-C----T------TAC---C---CCAT-----G--TGA--CT-----GA---T--T-TAAAAAAA-----A-----A-----------T-T-ATA--TA-----------------C--------------TTG--G-C-ACA----G----AT----AA-------AGAT-GAA----A---TC-A-TT-C----AACA-TT-TTCGA---CC---TAA-TATC-----TA------T-TT----CCTT--TCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|15 : ttttctttaattttaaacagatcataaattctctaaaaaataaaatgtctatTA-A--TT--T--AAATGCATATT-T----TT---TTGA-A-CGT-TGT-----T-G-T-T-A-----CTCA--CA-------T-AA-A--A-----T-CG-----------G-T----TC-AAA---AT---TG--AAA-G-AAGTTGGCA----TTA-T-A----GT-----ATCTG-AAGAGC------T-------------TAC--A-G-T--------A----TTCA-------AAC-----------A---CTT---GGCGA-CTCAGAG-CTCAGA------------AA--CA--CT-------------A------T------T-----A-T----T-----T--------------GTTATCACTAAA-----A---------G---------TA-T---------A------CTAC----GT-GTAAAA--T----ATA----AAT------C-CA-GTT-AATCCTGGA--TTTGT-AT-T--AA--------------C--TTATG-T---G----TT-TTG--AAA--A--TA-AA-A--TGA-AGGA--G----GC--AG--C-AT-ACCTACATG-----TC-C--C-GT-C----T------TAC---C---C--A-----T--TGT--GA-CT--GA---T--T-TAAAAAA--------------AA--A-------T-AT----------------TA----C--------------TTG--G-C-ACA----GT---ATAAGGAA-------GGAT-GGG----AAATTC-A-TT-CGTATGACA-TT-TTCGA---TCTGGTAA-TATCA----TA--------TT----CCTT--TCT-TCT
gi|19 : aaaaaataaaatgtctatTT-TGAA-TT-CCGTGA-C-AGC-G-T-------A-T-T-AAAA--CT-A--CACGT----T-AA-G--TAAAAGTTCG-----------A-TGCAATC-TAA---AT---TG--GAATGTAAG-----A----T-AAC-A----GT-----C---G-AA----------TCCTATTAGTAGTAT-T--G-A-T--------A----A--A-------AAA-----------A---CTTAGAGG--A-A--AAAGATTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------C------T-----AGT----T----------------------------------------------------------A-A---------A------C--T----------AGA--AT---A-A----AATATAACATACAGATTCAATCT--AAGATTAAT-AAAT--AA--------------T--TT-T--T---G----TTAC----AAT--A--TA-AA-AAATTA-AGGG--G----GC--GG--C-AT-A-A---ACGAAAATTCTC--T-ATGC----TA-----TAC---CGT-CTAA-----T--TTTTACT-TT--GA---T--T-T------------T-----AAAA--AGA---TGT-ATA--TA-----------CA----T--------------GTG--T-TGAAA----GGAATAT----AATACT---AAAC-AAA----A---T--A-TTCC----AGCA-TT-TCCGA---CC---AAT-TATC-------------T-TT----ATTT--TCC-TGTTTT--T
gi|13 : --------A----T--A-------AA------------A---CTT---GG--A-G--AGAC-TTCACG------------AAG-CA--C--------------A------T------T-----AG-----T-----T--------------AT---------A-----A---------T---------TA-G---------A--------------GT----AAA-----------------------TACA---C-AATCT--AA--ATGAT--A-T---A--------------T--TT-T--T---G----TT-T----AAA--A--TG-AA-A--TGA-AGGG--G----GC--GGC-T-A--ACG---ATG-----TC-CT-G----C----C------TAC---T---CT-------TG-TGC--CT-TT--GG---T--T-T------------T-----AAAA--AGA---T-T------------T-----CAA--------------------TA--C-T-AAA----A----AT----AA-------AG---------------C-A---------------T-TTCGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-TT----GTGT--T-----TTTT--ATA--T---T--------------------ATT-T-A--AC--TC--T--A--CT------TTTATTTG------A--CTTTAAA-A-CCa
gi|23 : aacacagcacatggggtaagaagatcgtagcttccttttaatttaaaaaaaaaaaaggttcgtctaggttagtttcacttccttttttttttttcttcagtttttttaacttatgagcgctttgcactctctttttcaataacaactaaattagatgcgtttcttttcttttttttttttatctcGAG-TTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T------T-----AGT----TGT---T--------------AT---------A-----G---------AAG-------TA-A---------A------TA-C----GT-GT-AAA--A----A-A----AAT-------GCA-GTT-AATCT--AA--TTGAT--------------------------TT-T--T---G----TT-TTTAAAAA--A--TA-AA-A--TGA-AGGG--G----GC--GG--C-AT-ACG---ATG-----TC-C--G-GT-T----T------TAC---C---CCAT-----T--TGC--CT-TT--GA---T--T--------------------------------T-T-A-----------------TA----C--------------GTG--C-T-ACA----------------------------------------TC-A-TT-C----AGCA-TT-TTCGA---CC---AAC-TATC-----TT------A-TT----CTTT--TCT-TCTTTT--TTTG-A---A--------------------ATT-TAA--AA--TC--T--A--AT------TTTATTTG------A--C-TTTAA------------------TTTATTTCATT--TTTTA---C-T-GC--AAC-A-A-TGTGG----AA-GCA---------C--------ATGCTTCCGTGCTTC-AT---------ACGAAGC-C-ACGCCgcaacattgtgaagcacttgcttccgtgcttcataggaagctacgtcac
gi|20 : --C----GTGTCCAAA--A----A-A------T------TGCA-ATT-AAT----AA--CT-----------A--------------T--TT-T--CTGGG----GT-T----AAACAACCTA-AT-A--TGA-AGGG--GCGACGCC-AG--T-A--ACG---ATG-----TC-CCGG-CT-C----TCCTTCCTAC---CTCCCCGAACCCTC--TCC--CTATTCCGG---T--T-----AAAA-----T-----AGAA--AGA---T-T-CTAATTA--GGC-----CTG----G----------------G--C-T-TCACCGGA----AT----GA-------AGAG-TGACTACA---TCTA-TT-C----AGCA-ATATTCGAAG-CC---AAAATATGAGTGGTA------T-TTTCACCTTC--TCTCTTTTTT--TTT--CCCAT--------------------ATT-T-A--AA--T------A--ATAAGAAATCT-TTTG------A-------GA-A-TCAGTT-T-CTTTTTATTTTTTT-----TTTTA---C-C-GCAAAAC-G-A-TGTGG----AA-GCA---------
gi|27 : --------------T--TT-T--T---G----TT-T----AAA--A--TG-AA-A--TGA-AGGG--G----GC--GG--C-AT-ACG---ATG-----TC-C--T-GC-C----T------TAC---C---TCAT-----G--TGC--CT-TT--GG---T--T-TTAAAAA-------------------GA---T-T------TA--A------------------------------TA--C-T-AAA----G----AT----AA-------AGAT-AAA----A---CA-A-TT-A----AGCA-TT-TTCGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-TT----CTGT--TTT-TATAT------------T--------------------ATT-T-A--AAC-TC--T--A--CT------TTTATTTG------A--CTTTAAA-A-CCaatgttcccgtcccgtgcttc
gi|24 : A-AA-A--TGA-AGAG--G----GC--A---T--T-ACG---ATGA----TC-C--G-GT-C----T------TCT---C---CCCA-----TGCTGC--CT-TT--GA---A--T-TTAAAAAA-----A-----AAAA--AAA---gcaacattgtgaagcacttgcttccgtgcttcataggaagctacgtca
gi|26 : aaGG--G----GC--GA--C-AT-ACG---ATG-----TC-C--G-GT-C----T------TAC---C---CCAT-----G--TGT--CT-TT--GA---T--T----GAAAA-----A-----AAAA--AGA---T-TTATA--TA-----------TA----C--------------ATA--T-T-ACA----G----AT----AA-------AGAT-GAA----A---TC-A-CT-T----AGTA-TT-TTCGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-TT----CTTT--TCT-T-TTTT--TTA--A---A--------------------ATT-G-A--AA--TC--T--A--AT------TTTATTTG------A--C-TTTA------------------TTTTCTCTCTTT--TTTTA---C-C-GC--AAC-A-A-TGTTGTTCAAA-GCACATCCTT--CC-------GTGCTTC---------AT---------AGGAAGC-T-ACGCCACaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagaaaaaagaaaagattatatatacacactaggggcctagtacattataaataaaattttcgaccaaatatctacatgtatttctttcttcttttttttttttttttttttttttaatttaaaattcgaattttatttgattttaaatttattcatattttttttaaccgcaacaatgtggaagcacatgcttcctgctt
gi|28 : --T-ATGATC---ATG-----TC-T--G-GC-C----T------TAC---C---CCAT-----G--TGC--CT-TT--GA---T--T-TTAGATA-------------------GA---T-T-G-A--TA--AACA----TTA----C-----------------------ACA----G----AT----AA-------AGAT-GAA----A---TC-A-TT-C----ATTA-TA-TTCTA---CT---AAC-TATT-----TA------T----------------------------------C--------------------ATT-TAA--AA--TCTAT--A--ATA-----TTCATTTGAACTTAA--TTTTTAA-A-AAA------AAA--TTCTTTTTTTTT--TTTTA---C-C-GT--AAC-A-A-TGTGG----AA-GCA---------C--------ATGCTTC---------AT---------AGGAAGC-T-ACG
gi|12 : gcggga-AT-ACG---ATG-----TC-C--G-CT-C----T------TAC---T---CCAT-----G--TGC--CT-TT--GA---TC-T-T------------A-----AAAA--AGATTTT-T-ATA--TACGAGCACATACTA----CAATTCAATTTCAGTTTA--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGAT-GAA----A---TC-A-TT-C----AGCA-Tgtac
gi|24 : aacacaagcacatgtggcaagaagatcgtgacttccttggggaaaaaaagggggggggggtccattattagttttacagcatttttaaaattttattttgaaacgttttgtattctttttataacaactaaatgagatgcgtttttgaattccctgaaagctttattaaaaatactaaaattcgatgtatctaaaatgaaagaagatgacatgcagtcgaatctaagtagtttttgataaaatttggacagagttcagaagaacgttagttgttaaaaaattagagtaaacatgtgtcaacaaattgcagttgattgataattatttttacacggtaaaggctatctatagcctccacctttttacAGAAAAA-----A-----GAAA--AGA---T-T-ATA--TA--TACACA--CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----TT---AT----AA-------ATA----A----A-------------------A-TT-TTCGA---CC---AAA-TATC-----TACATGTAT-TT----CTTTCTTCT-TTTTTT--TTT--T---TTTTTTTTTTTTTA-------ATT-T-A--AAATTC--G--A--AT------TTTATTTG------A---TTTTAA-ATTTA--T-T-CA--------TATTTTT--TTTAA---C-C-GC--AAC-A-A-TGTGG----AA-GCA---------C--------ATGCTT----------
gi|31 : aaaaaatgaagagggcattacgatgatccggtcttctccccatgctgcctttgaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaAAA-----A-----GAAA--AGA---T-TTATA--TA--CACA----CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----T----AT----AA-------ATA----A----A-------------------A-TT-TTCGA---CC---AAA-TATC-----TACATGTAT-TT----CTTT--TCT-TCTTTT--TTT--T---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATT-TAA--AA--TC--G--A--AT------TTTATTTG------A---TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA--------TATTTTT--TTTAA---C-C-GC--AAC-A-A-TGTGG----AA-GCA---------C--------ATGCTT----------cctgctt
gi|3 : CA----G----AT----AAGAACTTTAGATTGAA----A---TC-A-TT-C----ACCATTT-TTCGA---AC---A----ATC------A------G-TT----ACTT--TCT-TCGTGT--T--------A--------------------AAT-C-A--AA--CT--A--A--AG------TTTATTTG------A--C-TTGAA-A-TAA--T-TGCA----------TTTTT--TTTTA---C-C----AAAC-A-AGCGTGG----AA-GCA----------T-------ATGCTTCCGTGCTTTCAT---------AGGAAGT-T-ACGCCACcctgctt
gi|7 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggCA----G----AT----AAGAACTTTAGATTGAA----A---TC-A-TT-C----ACCATTT-TTCGA---AC---A----ATC------A------G-TT----ACTT--TCT-TCGTGT--T--------A--------------------AAT-C-A--AA--CT--A--A--AG------TTTATTTG------A--C-TTGAA-A-TAA--T-TGCA----------TTTTT--TTTTA---C-C----AAAC-A-AGCGTGG----AA-GCA----------T-------ATGCTTCCGTGCTTTCAT---------AGGAAGT-T-ACGCCAC
gi|35 : tggggtaaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggA---CC---AAA-TATC-----TA------T-TT----CTTT--TCT-T-TTTT--TTC--C---T--------------------ATT-T-AAGAA--TC--T--A--AT------TTCATTTG------A--C-TTTAA-A-TCA--T-T-TAA----TTTTTTTTTT--TTTTA---C-C-GCAAAAT-G-A-TGTTG----AA-GCA---------C--------ATGCTTCCGTGCTTC-AT---------AGGAAGC-T-ACGC
gi|37 : T-TCTTTTAATTT--A---G--------------------GCT-C-A--AG--TC--T--ATAAT------TTTATT-G------A--CTTTTAA-A-TTA----------------TGTTATT--TTTAA---CGC-GCAGACCAA-A-TGTGG----AATGCACATTTGTTTCC-------GTGCTTC---------AT---------AGG-AGC-TAACGC
gi|13 : acat--------------------ATT-T-C--GA--CC--A--A--ATA-----TCTATTTG------TGTTTTTTAT-A-TTA--T-T-TAACTCTACTTTTATTTGACTTTAAAAC-C-GCAACAT-----TGTG-----AA-GCA---------CTTGCTTCCGTGCTTC---------AT---------AGGAAGC-T-ACGTCACa
gi|49 : aacacagcacatggggtaagaagatcgtagcttccttttaatttaaaaaaaaaaaaggttcgtctaggttagtttcacttccttttttttttttcttcagtttttttaacttatgagcgctttgcactctctttttcaataacaactaaattagatgcgtttcttttcttttttttttttatctcataaaacttggagagacttcacgaagcacattagttataattagagtaaatacacaatctaaatgatatatttttgtttaaaatgaaatgaagggggcggctaacgatgtcctgcctactcttgtgcctttggttttaaaaagatttcaatactaaaaataaagcT-T-A--AA--TA--TCAA--AT------TTTATTTG------A--CTTT-AA-A-TTA--TCT-CA-------------TT--TTTTA---C-C-GCAA--C-A-A-TGTGG----AA-GCA---------C--------ATGCTT----------
gi|44 : C--T--A--AT------TTTATTTG------A--CTTT-AA-A-TCA--T-T-TAAATTTTTCTTTT---------A---C-C-GCAAAAC-G-A-TGTGG----AA-GCACATGGTT--CC-------ATGCTTC---------AT---------AGGAAGC-T-ACGtcgtgctt
gi|47 : --TTTTA---C-CAGCAA--C-A-A-TGTGG----AA-GCA---------CTTGCTTC-GTGCTTC---------AT---------AGGA--C-T-ACGCtacgc
14 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AAGAGCAAGAGTCACGAATAGATCCAAAATGGACGCCATTTGCTGAGACAGTTGATATCATTTCATAGATCAGTAGATCAAGAAAAGTGTTAATTTTCAAATATACTTCCCTTTTTCGATATCGTATCAATTTATTTAGTTATATAGACGTTTCAAAGTTAGTCATTTGTTATTTCTTGGGCCAATTTTTGTTTTTGACGTAAAACACTTTTACAACGTATGTATCTAGTATCAAAACATATACATATATATTCGTCATTTCTTTACATACAAAAATCTAGATTATGTTCACTGTTCCAGACTCACTACTTTGTCACTTTGCAATGTTTTTCAAGAGTGGTGGTTGGAAAGAACGGGGGAGGGTGATCGTTGCTGTATCTAACGAATTTCAAGAAGAGGAGGGGTGGGTGTGTAGAAAGGTCAGGGGGTATAACAATTCTGCATTGAAACTCCTTTAGTGGATCTTCAGGTAGACGAGTTATTAAAAGGCAATAGGTAAGGTGATATTTAATTATTTTTAATCA
Unaligned ( gi|33 ): TCAGGAATTTCAGAAACAGTGGGAGGGGGAGAAGGTGAGTTGCTTGAAGCTCCCAGAGGACAGAGCGAGACCCCCGGAAAGCTGACACATTCTCTACACAAGCAAAAGTTTTTATTTTTAATTTTTTTAAGAAATGCTTTGTTCGGCACAAACACTTTTTTAAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CCCCAGTAGGTCCAGGACAGAAACCCTGTTTGTGGGCCAGCAGGGGCGAAGGCCCCCGGGAAGCAGCATGGAACTTCTTTTACAAGAACGATTTCGCTAAACATTTTTATTTTTTA
Unaligned ( gi|40 ): GGGGTCTGGCAGCCGCTTAAAAATAGGCCGCCCAGTGGGTCAGAACTTGCCCTATATAGTAGCCTAGGGGGTCCAGGGGGCGAAGCTCCCGGAAACTGAGAGGTTTTAGAATTC
Unaligned ( gi|41 ): TAAACACAGGCACTTGGGGTAAGAAGATTTAACTTCTTCAAGAAAAAAATGGGGGGGGGGGTGTCCATTAATTAGTTTTATAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTT
Unaligned ( gi|46 ): CTTTTATTTGACTTGAGATTTATCATTATTTTGCCGCAAGCAATGTGAAAGCACATCTTCCGTTGCTTTCATACGACGCCTACGCCC
Unaligned ( gi|48 ): GGCGAAGCCCCTGAAAGCTGACAAATTCTTACAAACAAGAAGTTTTTGTTTTATCAAATGCTTGTTGTACAAACAAAATG
Unaligned ( gi|50 ): AAGGTACTAGTATGGGAGCCGCCCTAAGGCCTTGGTGAGTCCAGGACAAAGCCTTGGTTGAGGCCCTGGGGGC
Unaligned ( gi|53 ): TTGGGGCTGCCATGAGACCAGCCCCGAGGGTCCAGGACTAAGTCCTAGTAGGGGTCCAG
Unaligned ( gi|54 ): TAAATTCTTACAAGCAAGAGGTTTTTAAAAAATTAAATGCTTGTTGTACAAACTA
Unaligned ( gi|56 ): CATTGGTTTTACTGCATTTTGTTTTTAATTTTGGACGTTTTGTACTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAGTATGAGTACGGTAAAAGTTTTATAACCTCCAGGCC
Unaligned ( gi|59 ): AGGTGCATTTGACTATTTCAAAAGGTTCCCGAACCATTT
Unaligned ( gi|62 ): GGAAGCACATGCTTCTGTGCTTCATAGGAACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111111 111 1 33333 444444444444444444444444444444 111 11111 22 111111 44444444444444444 1111 1111111 111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111111111111111111111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111 222222222222222222 111111111111111111 22222222222222 11111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 1111111 22222222222222 333333333333333333333333 4444444444444444444444444 11 88888888888888888
lowQualScore : 2 2 2 2 6666 2 2 44 0 1 0 3 1 777777777777 777 0 33333 66 666666666666666666666666666666 5 777 5 00000 3 99 222222 5 66666666666666666 7777 1 777 2 1111111 111 3 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44 333 1 3 22 1 22222222222222222222222222 2 5 22 1 3 22 777777 3 1 999999999 1 3 5555555 3 1 3 66 555555 4 22 99999999 2 2 55 99999999999 4 2 2 333 3333 55 2 2 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 2 2 6666 00000000 33 33 33 333 2 4 2 111111111111111111 22 2 444444444444444444 2 66666666666666 2 444 2 2 33 22 0 555555555 1 44 22 666 4444 333 1 1 888888888 8888 2 6 2 00000000 444 22 2 55 555 77 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 111111111 6666 8888888 2 77 22 2 2 44 2 2 4444 2 2 4 666 555 0 55555 1 2 88888888888888 4444 0 22 33 888888888888888888888888 33333 2 4 22 99 44 22 555555 99 7 1 5555555555555555555555555 3 1 1 99 3 3 4444 1 1 22222222222222222 33 99999999 4 2 2 2 2
lowQualScore : . . . . .... . . .. . . . . . ............ ... . ..... .. .............................. . ... . ..... . .. ...... . ................. .... . ... . ....... ... . . ........................................................................................................................................................................................................................................ .. ... . . .. . .......................... . . .. . . .. ...... . . ......... . . ....... . . . .. ...... . .. ........ . . .. ........... . . . ... .... .. . . ................................................................................................................................................................................................................................................................................................ .. . . .... ........ .. .. .. ... . . . .................. .. . .................. . .............. . ... . . .. .. . ......... . .. .. ... .... ... . . ......... .... . . . ........ ... .. . .. ... .. ...................................................................................... . ......... .... ....... . .. .. . . .. . . .... . . . ... ... . ..... . . .............. .... . .. .. ........................ ..... . . .. .. .. .. ...... .. . . ......................... . . . .. . . .... . . ................. .. ........ . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 9999 2 2 44 9 2 4 3 8 111111111111 555 0 11111 99 666666666666666666666666666666 0 555 0 11111 2 44 222222 0 55555555555555555 5555 9 000 4 8888888 444 6 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 88 333 9 8 66 9 44444444444444444444444444 0 7 66 9 6 00 000000 6 9 555555555 9 8 3333333 8 9 8 88 888888 0 88 22222222 0 0 55 55555555555 0 0 1 777 9999 88 1 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33 2 2 9999 44444444 11 11 11 999 2 4 2 999999999999999999 99 1 333333333333333333 4 88888888888888 4 111 2 2 11 99 7 999999999 9 55 66 777 0000 333 9 9 222222222 2222 0 0 0 00000000 000 99 1 88 888 99 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 333333333 7777 2222222 1 11 99 1 1 77 1 1 5555 2 1 4 666 888 1 33333 3 1 22222222222222 5555 4 99 11 333333333333333333333333 66666 2 2 99 22 88 88 555555 22 4 9 2222222222222222222222222 5 9 9 88 8 8 0000 9 9 44444444444444444 22 22222222 0 1 4 4 4
consensus : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-CAN----TTTAG--ACAA------------TTAAG-AGA-GG-----TATTT-T---CAA-AGTC-T-C-GATA--CAN-A---TTTTTTAATTA----------ATT----TAAGATTGATCGTAACTTCCTTC-------AA---AAAAAA-AAAGGGG-----------------G--------G----G-------GG-----------------GG---------G-----------------T---T-TA--T--------------------T---------G---CA----------TT----TTT--T---T-----T--T---------------TN-----------A-T---T----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-AGT--C------TA--G-AAT-------------CT--A--A------T--------A----T--A-------AGT-----------A---C---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA-A---TA-AA-A--TGAAGGG--GGCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-T-CCG-G-------TC----T-TA-C-C--------CCATG-TGC--CT-TT--GA---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGC-ATTTT-CGA---CC---AAATAT-----CTA-T--------------TT----CTTTTCT--TCTTT--T-T-TT-----T-------------A--T--T-T-A--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---TTTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-T-CTT--C-------CG-TGC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
Reference ( family-2559 ) : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTTGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-CAA----TTTAG--ACAA------------TTAAG-AGA-GG-----TATTT-T---CAA-AGTC-T-C-GATA-GCAN-A---TTTTTTAATTA----------ATT----TAAGATTGATCGCNNCCTCCTTC-------AA---AAAAAA-AAAGGGG-----------------G--------G----G-------GG-----------------GG---------G-----------------T---T-TN--T--------------------T---------G---CA----------TT----TTT--T---T-----T--T---------------TN-----------A-T---T----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-AGT--C------TN--G-AAT-------------TT--A--A------T--------A----T--A-------AGT-----------A---C---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA-A---TA-AA-A--TGAAGGG--GGCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-T-CCG-G-------TC----T-TA-C-C--------CCANN-TGC--CT-TT--GA---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGC-ATTTT-CGA---CC---AAATAT-----CTA-T--------------TT----CTTTTCT--TCTTT--T-T-TT-----T-------------A--T--T-T-A--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TCA--T-T-CA------TT---TTTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-A---------C-------CA-TGC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|1 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAG--CCC------------AGCAGGTCCAGGTGACAAATTTCTTAC--AAAA------------C-AAG-AGG-TGATCTTTATTT-TTATCAA-AAGC-T-T-G-TA--CAA-ACAATTTTTTAA
gi|1 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-ATAT--AATATGGAA-GC-AGAGA-Gaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaatataatatggaagcagagag
gi|10 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgagcccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaacaattttttaaaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactac--T--------------------T---------G---CA----------TTAAGATTT--T---T-----T------------------------------------------------------------------AG--ACGTTA---T-T-T--A-CT------AT-A-----CTGAGT-T---ATGA-TAACTATAATC--AT-ATGGCTTTC-T-TAA------TT-CTATCG-A---------AGC-T-T-----T-A-T-TCAAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-T--------------------CA-TC-CAA---TT---T----------AG-----A----T-G-C-A-----------TC--G-AAT-------------TT------------T--------A----C--C-------AGT-------------------TT---TA--A-T---GAA-TTCA-A------------AAA-CA--C--------------ATTTAATT-----T-----AGTTG---T----T--------------AT---------A-----A--G---------AA-A---------A------CTACAATAC----GT---CAAAC-A-A-A----AAA------TGCAG--TAAAGCT--AA--TGCATGGAT-AA-T--CG--------------GT--T-TGTTGCATTAT---G----TT-TTTAAATTTTTTTAAAAA-A---TA-AA-T--TGAAGGA--AAT-----------T--A--C---GA----T---G-T-CC
gi|10 : aa-----------------T---T-TA--C--------------------T---------G---CA----------TT----TTT--T---G-----T--T---------------T------------------------------------------------G--ACGTAT---T-G-T--A-GT-------T-T-----TC---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AA-ATGTGTTTT-T-GAA------TT-C------------------------------A-T-T-AAAA--C------T-G--G--------T-AAAA-TT--CG-----------A-TGCA-TC-TAA---AT---TG------G-ATG-----A----T-------T--T------TA--GTAGT-------------TTTGA--A------T--------A-------A-------AG----------------C---TT---CG--A-T--AGAA-TTAAGA------------AAGCCA--T--------------A------TGATTAT-----AGT-----TA---TCATAACTCAGTATAGT---------A-----A--A---------TA-A------------------------C----G--TCTAAA--A-A-ATCTTAA-------TGCAA--TTA--CT--AA--------GA--AA-TCCAA--------------GT--T-T---------T--------TT---------------------------AA-A--TGAA-GG--GGCGGG------A-T--A--C---GA----T---G-T-CCG-G-------CC----T-GA-C-C--------CCATG-TGC--CC-TT--GA---T--TCT-AAA-T--AGATTGTCATTTTTAAAGA--CA---C-T-A-----A--GAC-----CAA---------------------G------ACA----G----AT----AA-------AGA-T--------A-TA-A-TT-C----AGC-ATTTT-CGA---AC---AAATAA-----TTA-T--------------TT----C---------------T-G-TT-----T-------------A--A--T-C-A--AA-------A--A-------TTCA--TAAC-ATTAA-A-TTA--C-T-TA---------------ATTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA--------------------------GC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGCCttactaagaaatccaagttttttaaatgaaggggcgggatacgatgtccggcctgaccccatgtgcccttgattctaaatagattgtcatttttaaagacactaagaccaagacagataaagatataattcagcattttcgaacaaataattatttctgtttaatcaaaaattcataacattaaattacttaattttttaccgcaacaatgtggaagcttcataggaagctacgcc
gi|12 : aaggacatcgtaatttccttcaatttattttttaaaaaaatttaaaaacataatgcaacaaaccgattatccatgcattagcGATCGTGACTTCCTTG-------GG---GAAAAA-AA--GGG-----------------G--------G----G-------GG-----------------GG---------G-----------------TCCAT-TA--T--------------------TAGTTTTACAG---CA----------TT----TTT--AAAAT-----T--T---------------TA-----------T-T---T----------------T---G-------AA--ACGTTT---T-G-T--A-TT------CT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AATG--AG-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCCTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--A------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-TGTA-TC-TAA---AA---TG--AAA-G-AAGATGACA----T-G-C-AGT--C----------G-AAT-------------CT--A--AG-----TAGTTTTTGA----T--A-------AA------------A---T---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAG-------------AAG-AA--C--------------G------T-----T-----AGT-----T----G--------------TT---------A-----A--AAAATTAGAGTA-A---------A------CA------T----GTGTC---A--A-C-A----AAT------TGCAG--T-----T--GA--T---T-GAT-AA-T--TA--------------TT--T-T---------T---
gi|12 : aacacaagcacatgtggcaagaaC------A-T--A--C---GA----T---G-T-CCG-C-------TC----T-TA-C-T--------CCATG-TGC--CT-TT--GA---TC-T-T----------A-----------AAAAA--GATTTT-T-ATA--TACGAGCACATACTA----CAATTCAATTTCAGTTTA--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGC-ATacacggtaaaggctatctatagcctccacctttttacatacgatgtccgctcttactccatgtgcctttgatcttaaaaaagatttttatatacgagcacatactacaattcaatttcagtttactacagataaagatgaaatcattcagcat
gi|13 : aacacaagcacatgtggcaagaagatcgtgacttccttggggaaaaaaagggggggggggtccattattagttttacagcatttttaaaattttattttgaaacgttttgtattctttttataacaactaaatgagatgcgtttttgaattccctgaaagctttattaaaaatactaaaattcgatgtatctaaaatgaaagaagatgacatgcagtcgaatctaagtagtttttgataaaatttggacagagttcagaagaacgttagttgttaaaaaattagagtaaacatgtgtcaacaaattgcagttgattgataattatttttacacggtaaaggctatctatagcctccaccttttta----TAAGAA-GATCGTAGCTTCCTTTTAATTTAAA---AAAAAA-AAAGGTT-----------------C--------GTCTAG-------GT-----------------TA---------G-----------------T---T-TCACT--------------------T---------C---CT----------TT----TTT--T---T-----T--T---------------TT-----------C-T---TCAGTTTTTTTAACTTAT---G-------AG---CGCTT---T-G-C--A-CT------CT-C-----TT---T-TTCAATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTC-T----------TT-TCTT
gi|13 : aacacagcacatgggg--------A----T--A-------AA------------A---C---TT---GG--A-G--AGAC-TTCACG------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T-------------------AT---------A-----A--T---------TA-G---------A-------------------GT-------------A----AAT-------ACA----CAATCT--AA--A---T-GAT-A--T--A---------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA-A---TG-AA-A--TGAAGGG--GGCGGC------T-A--A--C---GA----T---G-T-CCT-G--------C----C-TA-C-T--------CT-TG-TGC--CT-TT--GG---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T-TCA------------------------------------ATA--C-T-AAA----A----AT----AA-------AG--------------C-A---------------TTT-CGA---CC---AAATAT-----CTA-T--------------TT----GTGTT------TTT--TAT-AT-----T-------------A--T--T-T-A--AC--TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A----------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-ACTTGCTT--C-------CG-TGC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGTCACttttttttttatctcataaaacttggagagacttcacgaagcacattagttataattagagtaaatacacaatctaaatgatatatttttgtttaaaatgaaatgaagggggcggctaacgatgtcctgcctactcttgtgcctttggttttaaaaagatttcaatactaaaaataaagcatttcgaccaaatatctatttgtgttttttatattatttaactctacttttatttgactttaaaaccgcaacattgtgaagcacttgcttccgtgcttcataggaagctacgtcac
gi|14 : aacacagcacatggggtaagaagatcgtagcttccttttaatttaaaaaaaaaaaaggttcgtctaggttagtttcacttccttttttttttttcttcagtttttttaacttatgagcgctttgcactctctttttcaataacaactaaattagatgcgtttcttttcttttttttttttatctcT--T---A-----T--T---------------TC-----------A-T---T----------------T---GTAAATAAAGGCACATAT---T---T--A-CT------CT-A-----GT---T-----ATAA-CAA------TT--AC-ATGTGTTTC-G-GAAACCGAGTT-C--TGA-ACTCTATCCAACC-T-T-----C-A-TCT-AAAA--C------T-A--C--------C-TAAA-TT--CT-----------ATTGTA-TC-TTC---TT---TC--AAT-T-TAG-----A----C-A-C-A-T--CAAATGTTA--GTAGT-------------TT--T--A------T--------T----T--A-------AG----------------C---TT---TG--G-T--GGAA-TTCAAA------------AAA-CA--C--------------A------TC----T-----AAT-----T----TA-------------GT---------T-----GTTA---------TA-A---------A-------------------GTCTTTAAA--A-A---------------TACAT--TCAAACT--GA--T---G-GAT-AA-T---G--------------TT--G-T---------T---T----TT-T----------------A-A---T--------TGAAGAA--AGT-----------T--A--T---GG----T---G-T-C------------C----T-TG-C-C--------CC-CA-TGT--TC-CT--GAG--T--T-T-AAA-ATTAAG-----------AAA
gi|14 : tccgtacacaaGTTTGAAT-G-T--A-TT------TT-TAAAGACT---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGTGTTTT-TTGAA------TT-CCACCA-A---------AGC-T-T-----A-A-A-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AACA-TT--TG-----------A-TGTG-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-AAT----------A--G-AAT-------------TT--A--GG-----T--------AGTTTT--A-------GAT-----------G---AAGGTT---GG--A-T--AGAG-TTCAGAACTCGGTTTCCGAAA-CA--C--------------A------TG----T-----AATTG---T----T--------------AT---------AACTAGA--G---------TA-A---------ATATGTGC-------CTTTATT-TACAAATGA-A-AT---AAT------TGCAG--GT-ATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--CA--------------TT--T-T---------T---G----Tttgcaggtatctaattgataatcatttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|15 : tccgtacacaatttcttaattttaaactcaggaacatgggggcaaggacaccataactttcttcaattaaaaaacaacattatccatcaATTA-ATTT--AA-ATGCATATT-T----------TT---TTGA-A---------CGT-TGT-----T-G-T-T-A-----C------TCA--CA-------T-AAAA-T---CG-----------G-T----TC-AAA---AT---TG--AAA-G-AAGTTGGCA----TTA-T-AGTATC------TGAAG-AGC-------------TT--ACAG------T--------A----TTCA-------AAC-----------A---C---TT---GGCGA-CTCAGAG-CTCAGA------------AA--CA--CT-------------A------T-----T-----A-T-----T----T--------------GTTATCACTAAA-----A--G---------TA-T---------A------CTA-----C----GT-GTAAAA--T-ATA----AAT------C-CAG--TTAATCCTGGA--T---T-TGT-AT-T--AA--------------CT--TATG--------T---G----TT-TTG------------AAA-A---TA-AA-A--TGAAGGA--GGCAGC------A-T--A--CCTACA----T---G-T-CCC-G-------TC----T-TA-C-C--------CATTG-TGA--C---T--GA---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA------------T-AT----------------TA----C--------------TTG--G-C-ACA----GT---ATAAGGAA-------GGA-TGGGA--A-ATTC-A-TT-CGTATGAC-ATTTT-CGA---TCTGGTAATAT-----C-A-TA-------------TT----CCTTTCT--TCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|16 : aaaaaataaaatgtctATTA-ATTT--AA-ATGCATTTT-T--------------TTTAG-A---------CGT-T-T-----T-G-T------A--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-G-C-AGT----------A--G-AAT-------------CT--A--AGTAGTTTCAG-----A----T--A-------AA------------A---C---TT---GG--A-C--AGAG-CTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------ATCACTA----A-----A--G---------TA-A---------A------TA------C----GT-GTCAAA--A-A-A----AAT------C-CAG--TTAACCT--GA--T---T-GAT-AA-T--TA--------------TT--G-T-------------A----TT-T--------------AAA-A---TA-AA-A--TGAAGGG--G-CAGC------A-T--ATAC---GA----T---G-T-CCG-G-------TC----T-TA-C-C--------CCATG-TGA--CT-----GA---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA----------T-T-ATA--TA-----------------C--------------TTG--G-C-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AAC-ATTTT-CGA---CC---TAATAT-----CTA-T--------------TT----CCTTTC
gi|17 : ttttctttaattttaaacagatcataaattctctaaaaaataaaatgtctATCGTAACTTCCTTC-------AATT-AAAAAA-AACAACA-------------------------------------------------------------------------------------------T-TA--T--------------------C-------------CA----------TT----AGT--T---T-----GAAT---------------GC-----------A-T---T----------------TCTGG-------AG--ACGCTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGTGGTTT-T-AAA------TT-TCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--C------T-T--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-TGTA-TC-TAATACATGTATG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-AA----------TA--G-AAT-------------TT--G--------------------------A-------AG----------------C---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--CGTGTAATTGTTATAA------C-----T-----AGT-----A----T--------------AT---------ATAG--A--G---------TA-A---------A------TA------C----GTGTAC-AA--A-A-T----AAT------TGCAG--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--CA--------------TT--T-T---------T---GT---TT-T--------------TAA-A---CA-AA-A--TGAAGGG--GGTGGG------A-T--A--C---GA----T---G-C-CCA-A-------TCAAGAG-TA-C-C--------CCATG-T
gi|18 : aacacaggcacatgggggtaaggacAAGCCCCC------------GGAAGCT---GCTG-CAAT---TTTCG--AC-A------------TTAAG-AGA-GG-----TATTT-T---CAA-AGTC-A-C-GATA--CAA-T---TTCTTTA
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctggggga---CA----------AT----TTT--T---G-----T--T---------------TG-----------T-T---T----------------T---G-------AA--ACCTTT---T-TCT--A-CT------CG-T-----TT---CAT---A-AA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTA-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGCTT-T-----T-A-T-CAAAAA--C------T-A--C--------T-AACA-TT--CGATAAACGGTGCA-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-ACG-----ATATGT-A-C-AGT--C------tctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|19 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacgatacaatttctttatctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactTT-T-GAA------TT-CCGTGA-C---------AGC-G-T-------A-T-T-AAAA--C------T-A--CACGTTAAGT-AAAAGTT--CG-----------A-TGCAATC-TAA---AT---TG--GAATGTAAG-----A----T-AAC-AGT--C----------G-AATCCTATTAGTAGTATT--G--A------T--------A----A--A-------AAA-----------A---C---TTAGAGG--A-A--AAAGATTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------C-----T-----AGT-----T--------------------------------------------------A-A---------A------C-------T----------AGA--ATA-A----AATATAACATACAGATTCAATCT--AAGAT---T-AAT-AAAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TTAC--------------AAT-A---TA-AA-AAATTAAGGG--GGCGGC------A-TAAA--C---GAAAATT---C-T-CTA-T-------GC----TATA-C-CGT------CTAAT-TTTTACT-TT--GA---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---TGT-ATA--TA-----------CA----T--------------GTG--T-TGAAA----GGAATAT----AATACT---AAA-C--AA--A-A-T--A-TTCC----AGC-ATTTC-CGA---CC---AATTAT-----C---T--------------TT----ATTTTCC--TGTTT--T-T-ggatct
gi|2 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAAGCCCC------------AGCAGGTCCAGGTGACAAATTTCTTAC--AAAA------------C-AAG-AGG-TGATCTTTATTT-TTATCAA-AAGC-T-T-G-TA-CAAA-A---TTTTTTAAa
gi|2 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAGA-Gaaaagaaatcacgggggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaataaatatggaagcagagag
gi|20 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgaagccccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaaattttttaaaaaagaaatcacgggggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactac-------C----GTGTCCAAA--A--------AAT------TGCAA--TTAA--T--AA--C---T------------A--------------TT--T-T---------CTGGG----GT-T--------------AAACAACCTA-AT-A--TGAAGGGGCGACGCC------AGTA-A--C---GA----T---G-TCCCG-GCTCTCCTTC----C-TA-C-CTCCCCGAACCCTC-TCC--CTATTCCGG---T--T-----A-A--AAT-----------AGAAA--GA---T-T-CTAATTA--GGC-----CT--------------------GGG--C-T-TCACCGGA----AT----GA-------AGAGT--GACTACA-TCTA-TT-C----AGCAATATT-CGAAG-CCA--AAATATGAGTGGTA-T--------------TTTCACCTTCTCT--CTTTT--T-T-TTTCCCAT-------------A--T--T-T-A--AA----T--A--ATAAGAAATCT-TTTGA-----GA-A-TCAGTT-T-CT------TTTTATTTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-A---------
gi|21 : CAGTAGC--TA-GCGTTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCTGGGGGTTT-GGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------aatgttcccgtcccgtgcttc
gi|21 : gttttaatGGGGGTCCAGGATGC-G----AAGCTCCC------------GGAAGCA---GGTG-CAA----TTTAG--ACA---------------------------------TT-T---CAA-AGTC-T-CTGATA--CAC-A---ATTTTC-ATTA----------ATT----Taatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgatacacaattttcattaattttaaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|22 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgatC-------AA---AAAAAA-AGAGGGG-----------------GAGGGGAGGG----G-------GG-----------------AG---------GATTGTCCAATAATTAGTT---T-TA--C--------------------T---------G---CAATTTTTGTTTTT----TTTGGT---T-----T--T---------------TT-----------G-TATTT----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-CT--------------------------ATAAACAACTA-AATA--GA-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-AC--------AAC-T-T-----C-A-T-A-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-TGTA-CC-TTA---A----TG--TAA-A-TAG-----A----T-AGC-AGT--C----------G-AAT-------------CT--A--AG-----T--------AGTT-T--A-------GATAAA--------A---C---TT---TG--ACC--AGAG-TTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----taaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|23 : aacacaaacacatggggtaagaagatttaacttctttcaagaaaaGAG-TTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------AT---------A-----G--AAG-------TA-A---------A------TA------C----GT-GT-AAA--A-A-A----AAT-------GCAG--TTAATCT--AA--T---T-GAT------------------------T--T-T---------T---G----TT-TTTAA----------AAA-A---TA-AA-A--TGAAGGG--GGCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-T-CCG-G-------TT----T-TA-C-C--------CCATT-TGC--CT-TT--GA---T--T------------------------------------T-T-A-----------------TA----C--------------GTG--C-T-AC--------------------------------------A-TC-A-TT-C----AGC-ATTTT-CGA---CC---AACTAT-----CTT-A--------------TT----CTTTTCT--TCTTT--T-T-TT-----GAA-----------A--T--T-TAA--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGAC-TTTA------A--T-T-TA-----------TTTCATTTTTTAC-T-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-ACATGCTT--C-------CG-TGC--------TT-C-ATACGAAG-C-C-ACGCCgtta
gi|24 : A-AA-A--TGAAGAG--GGCAT---------T--A--C---GA----T---GAT-CCG-G-------TC----T-TCTC-C--------CCATGCTGC--CT-TT--GA---A--T-T-TAA-A--AAA-----------AAAAA--AA---
gi|24 : aaAA-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-T-ATA--TA--TACACA--CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----TT---AT----AA-------A---T--AA--A-A-T------------------TTT-CGA---CC---AAATAT-----CTA-CATGTATTTCTTTC-TT----CTTTTTT--TTTTT--T-T-TT-----TTTTTTTTTA----A--T--T-T-A--AAATTCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-ATTTA--T-T-CA-----------TATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-A-----------------CA-TGC--------TT-C-aaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagaaaaaagaaaagattatatatacacactaggggcctagtacattataaataaaattttcgaccaaatatctacatgtatttctttcttcttttttttttttttttttttttttaatttaaaattcgaattttatttgattttaaatttattcatattttttttaaccgcaacaatgtggaagcacatgcttcctgctt
gi|25 : aaaaaatgaagagggcattacgatgatccggtcttctccccatgctgcctttgaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaag-----------------T---T-TA--A--------------------T---------G---CA----------TT----TTG--T---T-----T--T---------------TA-----------C-T---T----------------T---A-------AG--ACATTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----GT---T-----ATAA-CAACTA-AATA--AG-GTGTGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--CTACATGT-A--C--------T-ATAA-GT--CG-----------A-TGCA-TC-TAA---AT---TG--AAG-G-AActgctt
gi|26 : ccgatacacatttctttaattttaaacacaggcatatggaggtaaaggcatcgtaacttccttcaattaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgctGG--GGCGAC------A-T--A--C---GA----T---G-T-CCG-G-------TC----T-TA-C-C--------CCATG-TGT--CT-TT--GA---T--T----GA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-TTATA--TA-----------TA----C--------------ATA--T-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-CT-T----AGT-ATTTT-CGA---CC---AAATAT-----CTA-T--------------TT----CTTTTCT--TTTTT--T-T-AA-----A-------------A--T--T-G-A--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTT--------A--T-T-T-------TC---TCTCTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTTGTTCAAA-GC-ACATCCTT--C-------CG-TGC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|27 : --------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA-A---TG-AA-A--TGAAGGG--GGCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-T-CCT-G-------CC----T-TA-C-C--------TCATG-TGC--CT-TT--GG---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T--TA------------------------------------ATA--C-T-AAA----G----AT----AA-------AGA-T--AA--A-A-CA-A-TT-A----AGC-ATTTT-CGA---CC---AAATAT-----CTA-T--------------TT----CTGTT------TTT--A-T-AT-----T-------------A--T--T-T-A--AAC-TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A----------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-ACTTGCTT--C-------CG-TGC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGTCA
gi|28 : GCGGG------A-T--A--T---GA----TCATG-T-CTG-G-------CC----T-TA-C-C--------CCATG-TGC--CT-TT--GA---T--T-T-TAG-A--TA-------------------GA---T-T-G-A--TA--AACA----TTA----C-----------------------ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----ATT-ATATT-CTA---CT---AACTAT-----TTA-T--------------------CATTTAAAATCTATAAT-A-TT-----C-------------A--T--T-T-G--AA--CTT--A--AT------TTT---TAAA----AA-A-AAA--T-T-C-------TT---TTTTTTTTTTTAC-C-GTAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-A-----------------CA-TGC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|29 : CAGCGGCG-TA-GC-TAGGGGTAG-GT-A--GATATGGAA-GT-AGAAA-GAGCAGGGAGTTTGGGGGCC-ACCC--AGGTCCT------------Ggtac
gi|3 : CAGTGGCG-TATGC-TTGGGGTAATAT-G--CATATGGAATGCAAGAAA-Gatcgattcccccaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|3 : gatCCCA------------GGAAGCT---GGTG-CAT----TTCAACAACAACCCCACACCCACTTAATTAGATAG-----TATCTGT---CAA--GTC-T-CCGATA-GCATCA---TTTTTT---TA----------ATGGG--TAAA--TGATCGTAACTTCCTTA-------GA---AAAACA-AAAGGGGGGGGGGGAGCGGGGGGGG--------G----G-------GG-----------------GGAGTCCATTAG-----------------T---T-TTACT--------------------T---------G---CA----------TT----TTG--T---T-----T--C---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------GG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGGTTT-T-AAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------T-AAAA-TTTTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TGA-C-AAT--C----------G-AAT-------------CT--A--A--------------------------------GT-----------A---G---TTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------TA-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--AA--T---T-GATAAA-T--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA-A---TA-AA-A--ACAAAAA--TACATC------A-A--C--C---GA----C---T-T-CCGAA-------TCT---T-TACC-C--------CCATG-TGC--TT-TT--GA---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|3 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactcCA----G----AT----AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACC-ATTTTTCGA---AC---AA---T-----C-A-G--------------TT----ACTTTCT--TCGTG--T-T-A--------------------A--A--T-C-A--AA--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---TTTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-ATATGCTT--C-------CG-TGC--------TTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|30 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggTCTTTC-------AA---GAAAAA----GGGG-----------------G--------G----G-------GG-----------------GG---------G-----------------A---T-TG--TCCATTAATTAGTTTTAATACT---------G---CA----------TT----TTT--T---T-----T--TGGGGGGGTGGGGGGGTT-----------A-T---T----------------TT--G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-ATT-T-AAAG--C------T-A--C--------T--AAA-TT--CG-----------A-TGTA-
gi|31 : aatacaggcgcatggggtaaagaaagttaactt-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-TTATA--TA--CACA----CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----T----AT----AA-------A---T--AA--A-A-T------------------TTT-CGA---CC---AAATAT-----CTA-CATGTATTTCTTTTCTT----CTTTTTT--TTTTT--T-T-TT-----TTTTTTTTTTTTTAA--T--T-T-A--AAA-TCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-----------TATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-A-----------------CA-TGC--------TT-C-
gi|32 : CAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAT-AT-ATGAATATGGAA-GC-AGAAA-GGGctgctt
gi|34 : tt-----------------T---T-TA--C--------------------T---------G---CA----------TT----TTT--T-----------------------------A-----------A-C---T----------------------------------GTTC---T-G-T----CG------CT-T-----TT---T-----ACGA-CAACTA-A-TT--AG-ATGCGTTTTGT-GAAT-----TT-CCTTGA-A---------AGC-CAT-----T-A-T-T-AAAtccccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|35 : caaaacaaaaacaaaaaaccccaaaaaacaaaaaacaacaaacaacaaacagataagttcaataagtA---CC---AAATAT-----CTA-T--------------TT----CTTTTCT--TTTTT--T-T-CC-----T-------------A--T--T-T-AAGAA--TCT--A--AT------TTCATTTGAC-TTTAA-A-TCA--T-T-TAAT----TT---TTTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAT-GA-TGTTG----AA-GC-ACATGCTT--C-------CG-TGC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|36 : ----TAAGATTTA-----ACTTTTTTC-------AA---GAAAAA-AAAGGGA-----------------T--------T----GTCCAATAAT-----------------AA---------G-----------------T---TATA--C--------------------T---------G---CA----------TT----TTT--T---T-----T--T---------------TTTAAAAAATTCTA-T---T----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-TT------A--T-----TT---T-T---ATAA-CAA
gi|37 : aacacaggcacatagggT--TCTTT--T-AATT-----T-------------AGGC--T-C-A--AG--TCT--ATAAT------TTTATT-GACTTTTAA-A-TTA-------------------TGTTATTTTTAACGC-GCAGACCAAA-TGTGG----AATGC-ACATTTGTTTC-------CG-TGC--------TT-C-ATAGG-AG-C-TAACGC
gi|38 : acat-----------------T---T-CA--C--------------------T---------G---CA----------TT----TTT--G---T-----T--T---------------AT-------------T---T----------------T---G-------AGG-ACGTTT---T---T--A-CT------AT-A-----TT---T-----ATAA-CACATATAATACAAG-AAGCGTTTTCT-GAA------TT-CCTT----------------------------------AAA--C------T----T--------T-AAAA-TT--CG-----------ATTGTA-TC-TAA---A----TG--AAA-a
gi|4 : gtCAGTGGCGGTA--C-TTGGGTT-G-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAATGGGCGAGGGG-TTGGGGGCCGGCCCTAAGCCCc
gi|4 : GGGTCCGGGG--C-G------AGCCCC------------G-AAGCT---GGTG-CAT----TTTAG--ACAA------------GTAAA-AGA-GGT----TATTT-T---CAAGAGTC-TCC-GATAGGCAG-T---TTCAATAATTAAAAACAGGACATTGGGGTAAGATTAA---CCTTCTTTTTC-------AA---GAAAAACAAAGGGG-----------------A--------A----A-------AGATTTGTCCATCTAATTTAG---------T-----------------T---T-TA--TAC------------------T---------G---TT----------TT----TTT--T---TTTTTTT--T---------------TT-----------ATT---T----------------T---G-------AG--A-GTTT---T-GTT--A-CT------AG-A-----TT---T-T---ATAA-CAACTATAATT--AG-ATGCG---T-T-GAA------TT-ACTTGA-A---------AGC-T-T-----TCA-T-A-AAAA--C------TAA--C--------TAAAAA-TT--CG--------------GTA-TCGTAA---AT---TG---AA-T-AAGATTT-A----T-A-CGAGT--C----------G-AATCTA----------TT--G--A------T--------G----T----------AGTTTCCAGATAAAA---C---TT---GC--A-C--A-AG-TTC--G------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----CGTTG---T----T--------------AT---------G-----A--ATCGCG----TA-A---------A------TA------C----GTGTCCAAA--A-A-A----TA----------AG--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T---G--------------TT--T-TCC-------C---G----TT-T--------------AAA-A---AATAA-A--TGAGAAG--GTCGGCGAAGCAA-T--A--C----A----T---G---CCG-G-------TC----T-TA-CGC--------TCTTA-GTC--CT-TT--GA---T--T-T-AAA-A--AAA-----------GATAATCAA---T-T--TG--TA--GGG-----CTT----A--------------TTG--C-T-ACAC---G----AT----TT-------AAA-T--GA--A-A-TCAA-TT-C----A-C-ATTTT-CGAATCCC-----ATAT-----CTA-TG-------------TT----CTTTTCT--TCCTT--TGT-TT-----T-------------G--CTAT-T-A--AA--TCT--A--AT------TTT-TTTGACTCTTAATA-TCA--T-T-TAGACTTCTT---TTTTTTTTTATAC-C-GCAAAACGAA-TGTGG----AG-GCGA---------CATGCT--CG-TGC--------TT-CAATAGGAAG-CAT-ACGCaatggtcatgcagagccctgtggcgggtccggggcgagccccgaagctggtgcattttagacaagtaaaagaggttattttcaagagtctccgataggcagtttcaataattaaaaacaggacattggggtaagattaaccttctttttcaagaaaaacaaaggggaaaagatttgtccatctaatttagttttatactgttttttttttttttttttattttgagagttttgttactagattttataacaactataattagatgcgttgaattacttgaaagctttcataaaaactaactaaaaattcggtatcgtaaattgaataagatttatacgagtcgaatctattgatgtagtttccagataaaacttgcacaagttcgaagcacattcgttgttatgaatcgcgtaaatacgtgtccaaaaaataagttaatctaattgataatgttttcccgtttaaaaaataaatgagaaggtcggcgaagcaatacatgccggtcttacgctcttagtcctttgatttaaaaaaagataatcaatttgtagggcttattgctacacgatttaaatgaaatcaattcacattttcgaatcccatatctatgttcttttcttcctttgttttgctattaaatctaatttttttgactcttaatatcatttagacttctttttttttttataccgcaaaacgaatgtggaggcgacatgctcgtgcttcaataggaagcatacgc
gi|42 : cagtggcggtacttgggttgattaatatggaagcagaaatgggcgaggggttgggggccggccctaagcccaatggtcatgcagagccctgtggcCG-TA-GC-TCGGGTT-G-AT-G--AAAATGGAG-GC-AGAA---GACAGGG--TTTGGGG-CC-GCCCTAAGGCCCC------------ATAGGC
gi|44 : cagttgcCT--A--AT------TTTATTTGACTTT-AA-A-TCA--T-T-TA------AA---TTTTTCTTTT-AC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-ACATGGTT--C-------CA-TGC--------TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGgtcaagggcaggcctaggggcgaagcccccggaagc
gi|45 : GGGGCC-GCCCTAAGATTCCCAATGGGTCCAGGGAAGCG---GGTG-CAT----TTTAG--ACAA------------TTAAG-AGA-GG-----TATTT-T---CAA-AGTTAC-C-AATA--CAC-A---TTTtacgc
gi|46 : T------TTTATTTGACTTGAGA-T-TTA--T---CA------TT---ATTTT------GC-C-GCAAG-C-AA-TGTGA----AA-GC-ACATCTT---C-------CGTTGCT-------TT-C-ATACGACGCC-T-ACGCC
gi|47 : c-A--AA--TATC-A--AA------TTTAT--GACTTT-AA-A-TTA--G-T-C----------------TCATTTTAC-CAGCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-A---------CTTGCTT-CG-TGC--------TT-C-ATAGGA---C-T-ACGCc
gi|49 : --T-T-A--AA--TATCAA--AT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-TTA--TCT-CA----------------TTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-A-----------------CA-TGC--------TT-
gi|5 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAtcgtgctt
gi|50 : gacgttacaattttgcaacatatgcacattcttgttaaagttctctaggcgagtcaaaaaataacattatctaaattagaatcatttctatttccttcaaaacaaaacttctgatattttcacggtccaagcattacttgcacataacaatgttttcaggtggtggttgggagggagggggtggggttgaagtggaatttcagaacggggaggagggtagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaattcttacaaacaagaggttatctttatttttatcaaaagcttatacaaacaatttaaaaaaaaagaatcattcggggtgggggctggggtgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgagcatgtttaccgatagtatttacggtaaaagttttatatcctgcaggccagacgcctaagtcgaatttcatgtgccacttttgacagtggtgatattatttctacacaaataaaaaacaagtttattacagaatctctcagttattgaaaaataaaaccaactttttaatgagtgagggtgcatttttccttaatacGTATGGGAGCC-GCCCTAAGGCCTT------------GG
gi|51 : aaggtactaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-Atgagtccaggacaaagccttggttgaggccctgggggc
gi|52 : tgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGAAAGGGGTTTGGGGGCT-G
gi|55 : CAGCGACG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATGG-A-GC-A
gi|56 : ttttttctattaaccg-----------------GG---------T-----------------T---T-TA--C--------------------T---------G---CA----------TT----TTG--T---T-----T--T---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------GG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------C
gi|57 : cattGGTG-TA-AC-TTAGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-
gi|6 : cattCAGTGGCG-TA-GC-ATGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAAGGGGTTTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAGCCT---GATG-CA-----TTTAG--ACA-------------TTAAA-ATA-GG-----TATTT-T---CAA-AGTC-T-C-GATA--CAG-A---TTTTTTAATTA----------ACT----TAA---TAATCTCCCCCCCCCCC-------AA---AAAAAA-AAAGGGG-----------------G--------G----A-------GG-----------------GG---------G-----------------T---T-TC--T--------------------T---------G---CA----------TT----TTT--T---T-----T--T---------------TC-----------A-T---T----------------T---G-------AG--ACATTT---T-G-T--A-CTAGATATCTAT-----TT---T-T---ATAA-CAAATA-AATT--AG-ATGCATTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAT-TT--CG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-AGT--C------TTC-G-AAT-------------TT--A--A------T--------A----T--A-------AGT-----------A---C---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAA--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA-A---TA-AA-A--TGAAGGG--GGCAGT------A-T--A--C---CA----T---G-T-CCG-A-------TC----T-TA-C-C--------CCAAT-TGC--CT-TT--GA---T--T-TAAAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------CTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GG--A-A-TC-A-TT-C----AGC-ATTTT-CGA---CC---AAATAT-----CTA-T--------------TT----CTTTTCT--TCTTT--T-T-TTC----T-------------A--T--T-T-A--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TCA--T-T-CAATTTTTTT---TTTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-A---------C-------TA-TGC--------TT---ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|60 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-AC-AG
gi|61 : tCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATAGAA-GC-A
gi|7 : t----TAAAAT-GATCGTAACTTCCTTA-------GA---AAAACA-AAAGGGGGGGGGGGAGCGGGGGGGG--------G----G-------GG-----------------GGAGTCCATTAG-----------------T---T-TTACT--------------------T---------G---CA----------TT----TTG--T---T-----T--C---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------GG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGGTTT-T-AAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------T-AAAA-TTTTCG-----------A-TGTA-TC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TGA-C-AAT--C----------G-AAT-------------CT--A--A--------------------------------GT-----------A---G---TTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------TA-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--AA--T---T-GATAAA-T--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA-A---TA-AA-A--ACAAAAA--TACATC------A-A--C--C---GA----C---T-T-CCGAA-------TCT---T-TACC-C--------CCATG-TGC--TT-TT--GA---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----A
gi|7 : tggggCA----G----AT----AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACC-ATTTTTCGA---AC---AA---T-----C-A-G--------------TT----ACTTTCT--TCGTG--T-T-A--------------------A--A--T-C-A--AA--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---TTTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-ATATGCTT--C-------CG-TGC--------TTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|8 : tggggtaaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcagg-----------------T---T-TA--T--------------------T-------------CA----------TT----TGT--T---T-----T--T---------------AT-----------T-T---T----------------T---G-------AG--ACGTTT---TTG-TTTG-CT------TC-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT---AGTATGTGCTTT---GAA------TT-CCTTGATA---------GGC-T-T-----TTA-T-T-AAAAAAC------T-AACT--------T-AAAA-TT--CG-----------A-TGTA-TC-TAA---TT---TG--AAA-A-AAG-----A------A-C-AAT----------A--G-AAT-------------CT--A--A------TTA------G----T--ACGGTGATAGTTTCACGATGAAA---C---TT---GG--G-C--AGAG-TTCGGA------------AGC-CATGC--------------A------T-----T-----GGTGGCATTACCGT--------------GT---------A-----A--A------------A---------A-------------------------AAA--A-A-A----AAT-------GCGG--TTAATTT--AA--T---T---T-AA-T--AA--------------TTATT-T---------T---G----TT-T--------------AAA-A---TA-AA-A--TGAAGGG--G-CGGC------A-T--A--CCGGAA----T---G-T-CT--G-------TC----T-T--C-C--------CCATG-TGC--CT-TTTGGA---T--T-T-AAATA--AAA-----------ATTTA--CA---T-T-ATATTTA--CAC-----ACA----A--------------TTG--CTT-AC-----G----AT----TA-------AGA-T--GA--A-G-TC-ACTT-C----AGC-ATTTT-CGA---CC---AAATAT-----CTATT--------------TT----CTTTTCT--TCTTC--T-T-TTA----A-------------A--T--TAT-A--AAT-TCT--A--AA------TTTATTT-ACTTTAAA-A-T----T-T-CA--------------TTTTTTTCAC-C-GC--AAC-AC-TGTGG----AG-GC-A---------A-------CA-TGCTTCCGTGTTT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|9 : aacacaggcacatgggtaagaagatccgtaacttaattctttcataaaaagaaaaaaaaagaaaaaaagatttgccatctgttATCGTAACTTCCTTC-------AATTTAAAAAA-AA----------------------------------------------------------------G---------A-----------------T---T-CA--T--------------------TTAATA----GTTCCA----------CT----GCT--T---T-----T--T---------------TG-----------A-TATTT----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--AACT------CT-T-----TT---T-T---ATGA-CAACTA-GATT--AG-GTGTGTTTT-T-GAA------TT-CCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-AAT-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AGAA-TT--CG-----------A-TGTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-AAT--C----------G-AAT-------------CT--A--AG-----T--------ACTTTT--A-------GAT-----------AAAGC---TT---AG--A-T--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--C--------------A------T-----T-----AAG-----T----TGTTATGATTAGA--GT---------A-----A--A---------TATA---------A------A-------T----GT-C---AA--C-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--AA--T---T-AAT-CA-T--AAGATTTTGGGTTAGTTT--T-T---------T---GTTTTTT-T--------------TAA-A---CA-AATA--TATA----------T------A-T--A--C----A----T---G-T-CCG-A-------TC----T-TA-C-C--------CCATT-TGC--GT-TT--GATATT--T-T-GA---------------------------------T-ATA--TT--GAT-----AAA----C--------------ATA--A-T-ACA----G----ATAA--AA-------AGA-T--GA--A-G-CC-A-TT-C----AGC-ATTTT-TGA---CC---AAATAT-----TTA-A--------------TT----ATTTCTG--TCTTT--A-C-AT-----T-------------A--T--T-TAA--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-------T---TTTTTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-CC-A---------CATGCTTGTG-TGC--------TT-C-AGAGGAAG-C-T-ACGCCac
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AAGAGCAAGAGTCACGAATAGATCCAAAATGGACGCCATTTGCTGAGACAGTTGATATCATTTCATAGATCAGTAGATCAAGAAAAGTGTTAATTTTCAAATATACTTCCCTTTTTCGATATCGTATCAATTTATTTAGTTATATAGACGTTTCAAAGTTAGTCATTTGTTATTTCTTGGGCCAATTTTTGTTTTTGACGTAAAACACTTTTACAACGTATGTATCTAGTATCAAAACATATACATATATATTCGTCATTTCTTTACATACAAAAATCTAGATTATGTTCACTGTTCCAGACTCACTACTTTGTCACTTTGCAATGTTTTTCAAGAGTGGTGGTTGGAAAGAACGGGGGAGGGTGATCGTTGCTGTATCTAACGAATTTCAAGAAGAGGAGGGGTGGGTGTGTAGAAAGGTCAGGGGGTATAACAATTCTGCATTGAAACTCCTTTAGTGGATCTTCAGGTAGACGAGTTATTAAAAGGCAATAGGTAAGGTGATATTTAATTATTTTTAATCA
Unaligned ( gi|33 ): TCAGGAATTTCAGAAACAGTGGGAGGGGGAGAAGGTGAGTTGCTTGAAGCTCCCAGAGGACAGAGCGAGACCCCCGGAAAGCTGACACATTCTCTACACAAGCAAAAGTTTTTATTTTTAATTTTTTTAAGAAATGCTTTGTTCGGCACAAACACTTTTTTAAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CCCCAGTAGGTCCAGGACAGAAACCCTGTTTGTGGGCCAGCAGGGGCGAAGGCCCCCGGGAAGCAGCATGGAACTTCTTTTACAAGAACGATTTCGCTAAACATTTTTATTTTTTA
Unaligned ( gi|40 ): GGGGTCTGGCAGCCGCTTAAAAATAGGCCGCCCAGTGGGTCAGAACTTGCCCTATATAGTAGCCTAGGGGGTCCAGGGGGCGAAGCTCCCGGAAACTGAGAGGTTTTAGAATTC
Unaligned ( gi|41 ): TAAACACAGGCACTTGGGGTAAGAAGATTTAACTTCTTCAAGAAAAAAATGGGGGGGGGGGTGTCCATTAATTAGTTTTATAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTT
Unaligned ( gi|43 ): AAAAAACAAAAAAAACAAACAAACAAGATAGTTCATAAGTTTTACTGCATTTTTTTACTGTTCTGTACAGCTTTTTAGAACAACTAAATTAGATGCGTTTTTGAATTC
Unaligned ( gi|48 ): GGCGAAGCCCCTGAAAGCTGACAAATTCTTACAAACAAGAAGTTTTTGTTTTATCAAATGCTTGTTGTACAAACAAAATG
Unaligned ( gi|53 ): TTGGGGCTGCCATGAGACCAGCCCCGAGGGTCCAGGACTAAGTCCTAGTAGGGGTCCAG
Unaligned ( gi|54 ): TAAATTCTTACAAGCAAGAGGTTTTTAAAAAATTAAATGCTTGTTGTACAAACTA
Unaligned ( gi|58 ): TGAGTATGAGTACGGTAAAAGTTTTATAACCTCCAGGCC
Unaligned ( gi|59 ): AGGTGCATTTGACTATTTCAAAAGGTTCCCGAACCATTT
Unaligned ( gi|62 ): GGAAGCACATGCTTCTGTGCTTCATAGGAACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111111111111 111 1 111 44444444444444444444 1 11111 5555555555555555555555555 1111111111 111111 111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111 111111111 1111111 11111111111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111 222222222222222222 111111111111111111 22222222222222 11111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 1111111 33333333333333333333333 33333333333333333333 55555555555555555555555555 22 4444444444444444
lowQualScore : 2 2 2 2 6666 2 2 44 0 00 1 3 0 2 888888888888 777 0 5 999 0 66 55555555555555555555 5 5 0 5 2 88 88888 99999 2222222222222222222222222 2222222222 33 888888 777777 2 222 555 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44 333 1 3 22 1 111111111111111 000000000 2 5 22 1 3 22 777777 3 1 999999999 1 3 5555555 3 1 3 66 555555 4 22 99999999 2 2 55 99999999999 2 2 2 2 333 3333 55 2 2 22222222222222 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 55 2 2 6666 00000000 33 33 33 333 2 4 2 111111111111111111 22 2 444444444444444444 2 66666666666666 33 33 2 2 33 333 555555555 1 22 44 666 4444 333 1 00000000000 7777 1 5 1 99999999 1 44 1 1 44 55 1 555 77 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 222222222 6666 8888888 2 77 22 2 2 44 2 2 4444 2 2 4 666 333 22 00000000000000000000000 4444 333 33 88888888888888888888 33333 2 4 22 99 44 22 555555 99 7 1 1 22222222222222222222222222 1 1 1 33 1 5 3333 1 333 1 9999999999999999 1 1 3 2 2 2 2
lowQualScore : . . . . .... . . .. . .. . . . . ............ ... . . ... . .. .................... . . . . . .. ..... ..... ......................... .......... .. ...... ...... . ... ... ............................................................................................................................................................................................................................ .. ... . . .. . ............... ......... . . .. . . .. ...... . . ......... . . ....... . . . .. ...... . .. ........ . . .. ........... . . . . ... .... .. . . .............. . ................................................................................................................................................................................................................................................................................ .. . . .... ........ .. .. .. ... . . . .................. .. . .................. . .............. .. .. . . .. ... ......... . .. .. ... .... ... . ........... .... . . . ........ . .. . . .. .. . ... .. . .................................................................................... . ......... .... ....... . .. .. . . .. . . .... . . . ... ... .. ....................... .... ... .. .................... ..... . . .. .. .. .. ...... .. . . . .......................... . . . .. . . .... . ... . ................ . . . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 9999 2 2 44 9 33 4 6 7 8 666666666666 555 0 0 666 5 99 44444444444444444444 0 0 0 0 5 11 44444 22222 4444444444444444444444444 9999999999 66 222222 111111 9 666 000 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 55 222 8 6 55 8 999999999999999 000000000 0 7 66 9 6 00 000000 6 9 555555555 9 8 3333333 8 9 8 88 888888 0 88 22222222 0 0 55 55555555555 0 0 0 1 777 9999 88 1 2 44444444444444 4 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 2 2 9999 44444444 11 11 11 999 2 4 2 999999999999999999 99 1 333333333333333333 4 88888888888888 22 22 2 2 11 555 999999999 9 66 55 777 0000 333 9 22222222222 5555 8 5 8 11111111 8 33 8 8 55 22 9 222 11 9 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 555555555 7777 2222222 1 11 99 1 1 77 1 1 5555 2 2 4 666 777 22 99999999999999999999999 5555 333 11 33333333333333333333 66666 2 2 99 22 88 88 555555 22 4 9 9 00000000000000000000000000 1 9 9 22 9 7 9999 8 222 8 4444444444444444 8 8 6 1 4 4 4
consensus : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GG-T-ATTT-TCAA-AGTC-T-C-GATA-CAC-ATTTTT--TAATTA----------ATT----TAAGATTGATCG--TAACTTCCTTC------AA------AAAAAA-AA--AGGG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-T----A-T--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TN-----------A-T---T----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------GTC--AG-AATC-------T--A---A-----------T--------A----T------A-------AGT-----------A---C---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--TA-AA-A--TGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-T-------------A--T--T-T-A--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-G---C-A------CA--TG-C--TTCCG-TGC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
Reference ( family-2559 ) : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-G-AGA-GG-T-ATTT-TCAA-AGTC-T-C-GATA-CAN-ATTTTT--TAATTA----------ATT----TAAGATTGATCG--TAACTTCCTTC------AA------AAAAAA-AA--AGGG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-T----A-T--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TN-----------A-T---T----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------GTCT-AG-AATC-------T--A---A-----------T--------A----T------A-------AGT-----------A---C---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--TA-AA-A--TGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-T-------------A--T--T-T-A--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-G---C-A------C---T--C--TTCCG-TGC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|1 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAG--CCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GG-TGATCT-T--------------------T-ATTTTT----ATCA----------A-------AAGCTTGTACAAACAATTT--TTT------AA------AAAAAG-AATCACGG---G---G----------------GTT--G-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-
gi|1 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-ATAT--AATATGGAA-GC-AGAGA-Ggaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaatataatatggaagcagagag
gi|10 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgagcccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaacaattttttaaaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactac----A-T--T---------G---CA----------TTAAGATTT-----T------TT------------------------------------------------------------------AG--ACGTTA---T-T-T--A-CT------AT-A-----CTGAGT-T---ATGA-TAACTATAATC--AT-ATGGCTTTC-T-TAA------TT-CTATCG-A---------AGC-T-T-----T-A-T-TCAAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-T---------------------CA-TC-CAA---TT---T----------AG-----A----T-G-C-A-------TC---G-AATT-------T------------------T--------A----C------C-------AGT-------------------TT---TA--A-T---GAA-TTCA-A------------AAA-CA--C--------------ATTTAATT-----T-----AGTTG---T----T--------------AT---------A-----A--G---------AA-A---------A------CTACAATAC----GT---CAAAC-A-A-A----AAA------TGCAG--TAAAGCT--AA--TGCATGGAT-AA-T--CG--------------GT--T-TGTTGCATTAT---G----TT-TTTAAATTTTTTTAAAAA--A--TA-AA-T--TGAAGGAA--AT-----------T--A--C---GA----T---G-TCC-
gi|10 : aa--------------------T---T-T----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------GT--T---------------T------------------------------------------------G--ACGTAT---T-G-T--A-GT-------T-T-----TC---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AA-ATGTGTTTT-T-GAA------TT-C------------------------------A-T-T-AAAA--C------T-G--G--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GCA-TC-TAA---AT---TG------G-ATG-----A----T-------------TTT-AGTAGTT-------TTGA---A-----------T--------A-----------A-------AG----------------C---TT---CG--A-T--AGAA-TTAAGA------------AAGCCA--T--------------A------TGATTAT-----AGT-----TA---TCATAACTCAGTATAGT---------A-----A--A---------TA-A------------------------C----G--TCTAAA--A-A-ATCTTAA-------TGCAA--TTA--CT--AA--------GA--AA-TCCAA--------------GT--T-T---------T--------TT---------------------------AA-A--TGAA-GGG--GCGGG------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------CC----T-GA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCC--TT--G-A---T--TCT-AAA-T--AGATTGTCATTTTTAAAGA--CA---C-T-A-----A--GAC-----CAA---------------------G------ACA----G----AT----AA-------AGA-T--------A-TA-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---AC---AAA-TAAT-----TA-T--------------TT----C---------------T-G-TT-T-------------A--A--T-C-A--AA-------A--A-------TTCA--TAAC-ATTAA-A-TTA--C-T-TA------------------ATTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-------------------------------GC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGCCtactaagaaatccaagttttttaaatgaaggggcgggatacgatgtccggcctgaccccatgtgcccttgattctaaatagattgtcatttttaaagacactaagaccaagacagataaagatataattcagcattttcgaacaaataattatttctgtttaatcaaaaattcataacattaaattacttaattttttaccgcaacaatgtggaagcttcataggaagctacgcc
gi|12 : aaggacatcgtaatttccttcaatttattttttaaaaaaatttaaaaacataatgcaacaaaccgattatccatgcattagcGATCG--TGACTTCCTTG------GG------GAAAAA-AA----GG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GG--------------G--------------------TCCAT-T----A-T--TAGTTTTACAG---CA----------TT----TTT-----AAAA---TT--T---------------TA-----------T-T---T----------------T---G-------AA--ACGTTT---T-G-T--A-TT------CT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AATG--AG-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCCTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--A------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GTA-TC-TAA---AA---TG--AAA-G-AAGATGACA----T-G-C-A------GTC---G-AATC-------T--A---AG----------TAGTTTTTGA----T------A-------AA------------A---T---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAG-------------AAG-AA--C--------------G------T-----T-----AGT-----T----G--------------TT---------A-----A--AAAATTAGAGTA-A---------A------CA------T----GTGTC---A--A-C-A----AAT------TGCAG--T-----T--GA--T---T-GAT-AA-T--TA--------------TT--T-T---------T---
gi|12 : aacacaagcacatgtggcaagaaC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-C-------TC----T-TA-C-T--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---TC-T-T----------A-----------AAAAA--GATTTT-T-ATA--TACGAGCACATACTA----CAATTCAATTTCAGTTTA--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATacacggtaaaggctatctatagcctccacctttttacatacgatgtccgctcttactccatgtgcctttgatcttaaaaaagatttttatatacgagcacatactacaattcaatttcagtttactacagataaagatgaaatcattcagcat
gi|13 : aacacaagcacatgtggcaagaagatcgtgacttccttggggaaaaaaagggggggggggtccattattagttttacagcatttttaaaattttattttgaaacgttttgtattctttttataacaactaaatgagatgcgtttttgaattccctgaaagctttattaaaaatactaaaattcgatgtatctaaaatgaaagaagatgacatgcagtcgaatctaagtagtttttgataaaatttggacagagttcagaagaacgttagttgttaaaaaattagagtaaacatgtgtcaacaaattgcagttgattgataattatttttacacggtaaaggctatctatagcctccaccttttta----TAAGAA-GATCG--TAGCTTCCTTTTAATTTAA------AAAAAA-AA--AAGGTTCGTCTA----------------G----G-------TT-----------------AG--------------T--------------------T---T-C----ACT--T---------C---CT----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TT-----------C-T---TCAGTTTTTTTAACTTAT---G-------AG---CGCTT---T-G-C--A-CT------CT-C-----TT---T-TTCAATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTC-T----------TT-TCTT
gi|13 : aacacagcacatggggATC-------T--C---A-----------T--------A-----------A-------A-------------A---C---TT---GG--A-G--AGAC-TTCACG------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T-------------------AT---------A-----A--T---------TA-G---------A-------------------GT-------------A----AAT-------ACA----CAATCT--AA--A---T-GAT-A--T--A---------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--TG-AA-A--TGAAGGGG--GCGGC------T-A--A--C---GA----T---G-TCC-T-G--------C----C-TA-C-T--------CT----T-G-TGCCT--TT--G-G---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T-TCA------------------------------------ATA--C-T-AAA----A----AT----AA-------AG--------------C-A--------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----GTGTT------TTT--TAT-AT-T-------------A--T--T-T-A--AC--TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-G---C-A------C---TTGC--TTCCG-TGC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGTCACttttttttttatctcataaaacttggagagacttcacgaagcacattagttataattagagtaaatacacaatctaaatgatatatttttgtttaaaatgaaatgaagggggcggctaacgatgtcctgcctactcttgtgcctttggttttaaaaagatttcaatactaaaaataaagcatttcgaccaaatatctatttgtgttttttatattatttaactctacttttatttgactttaaaaccgcaacattgtgaagcacttgcttccgtgcttcataggaagctacgtcac
gi|14 : aacacagcacatggggtaagaagatcgtagcttccttttaatttaaaaaaaaaaaaggttcgtctaggttagtttcacttccttttttttttttcttcagtttttttaacttatgagcgctttgcactctctttttcaataacaactaaattagatgcgtttcttttcttttttttttttT-----T------AT--T---------------TC-----------A-T---T----------------T---GTAAATAAAGGCACATAT---T---T--A-CT------CT-A-----GT---T-----ATAA-CAA------TT--AC-ATGTGTTTC-G-GAAACCGAGTT-C--TGA-ACTCTATCCAACC-T-T-----C-A-TCT-AAAA--C------T-A--C--------C-TAAA-TT--CT-----------A-TTGTA-TC-TTC---TT---TC--AAT-T-TAG-----A----C-A-C-ATCAAATGT-T-AGTAGTT-------T--T---A-----------T--------T----T------A-------AG----------------C---TT---TG--G-T--GGAA-TTCAAA------------AAA-CA--C--------------A------TC----T-----AAT-----T----TA-------------GT---------T-----GTTA---------TA-A---------A-------------------GTCTTTAAA--A-A---------------TACAT--TCAAACT--GA--T---G-GAT-AA-T--G---------------TT--G-T---------T---T----TT-T--------------AA------T--------TGAAGAAA--GT-----------T--A--T---GG----T---G-TCC-----------------T-TG-C-C--------CCCA--T-G-TTCC----T--G-AG--T--T-T-AAA-ATTAAG-----------AAA
gi|14 : tccgtacacaaGTTTGAAT-G-T--A-TT------TT-TAAAGACT---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGTGTTTT-TTGAA------TT-CCACCA-A---------AGC-T-T-----A-A-A-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AACA-TT--TG-----------A-T-GTG-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------AT---AG-AATT-------T--A---GG----------T--------AGTTTT------A-------GAT-----------G---AAGGTT---GG--A-T--AGAG-TTCAGAACTCGGTTTCCGAAA-CA--C--------------A------TG----T-----AATTG---T----T--------------AT---------AACTAGA--G---------TA-A---------ATATGTGC-------CTTTATT-TACAAATGA-A-AT---AAT------TGCAG--GT-ATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--CA--------------TT--T-T---------T---G----Tttgcaggtatctaattgataatcatttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|15 : tccgtacacaatttcttaattttaaactcaggaacatgggggcaaggacaccataactttcttcaattaaaaaacaacattatccatcaATTA-ATTT--AA-ATGCATATT-T----------TT---TTGA-A---------CGT-TGT-----T-G-T-T-A-----C------TCA--CA-------T-AAAA-T---CG-----------G-T-----TC-AAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----T----T-GGC-A------TTAT-AG-TATC-------T--G---AAGAGCTTACAGT--------A----TTC----A-------AAC-----------A---C---TT---GGCGA-CTCAGAG-CTCAGA------------AA--CA--CT-------------A------T-----T-----A-T-----T----T--------------GTTATCACTAAA-----A--G---------TA-T---------A------CTA-----C----GT-GTAAAA--T-ATA----AAT------C-CAG--TTAATCCTGGA--T---T-TGT-AT-T--AA--------------CT--TATG--------T---G----TT-TTG------------AAA--A--TA-AA-A--TGAAGGAG--GCAGC------A-T--A--CCTACA----T---G-TCC-C-G-------TC----T-TA-C-C--------CA-T--T-G-TGAC----T--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA------------T-AT----------------TA----C--------------TTG--G-C-ACA----GT---ATAAGGAA-------GGA-TGGGA--A-ATTC-A-TT-CGTATGACATT-TT-CGA---TCTGGTAA-TATC------A-TA-------------TT----CCTTT--CTTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|16 : aaaaaataaaatgtctATTA-ATTT--AA-ATGCATTTT-T--------------TTTAG-A---------CGT-T-T-----T-G-T------A--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-G-C-A------GT---AG-AATC-------T--A---AGTAGTT-----TCAG-----A----T------A-------AA------------A---C---TT---GG--A-C--AGAG-CTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------ATCACTA----A-----A--G---------TA-A---------A------TA------C----GT-GTCAAA--A-A-A----AAT------C-CAG--TTAACCT--GA--T---T-GAT-AA-T--TA--------------TT--G-T-------------A----TT-T--------------AAA--A--TA-AA-A--TGAAGGGG---CAGC------A-T--ATAC---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGACT------G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA----------T-T-ATA--TA-----------------C--------------TTG--G-C-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AACATT-TT-CGA---CC---TAA-TATC-----TA-T--------------TT----CCTTT--C
gi|17 : ttttctttaattttaaacagatcataaattctctaaaaaataaaatgtctATCG--TAACTTCCTTC------AATT----AAAAAA-AA--CAAC---A---------------------------------------------------------------------------------------------T-T----A-T--C-------------CA----------TT----AGT-----T------TGAAT---------------GC-----------A-T---T----------------TCTGG-------AG--ACGCTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGTGGTTT-T-AAA------TT-TCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--C------T-T--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GTA-TC-TAATACATGTATG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------A--T-AG-AATT-------T--G------------------------------------A-------AG----------------C---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--CGTGTAATTGTTATAA------C-----T-----AGT-----A----T--------------AT---------ATAG--A--G---------TA-A---------A------TA------C----GTGTAC-AA--A-A-T----AAT------TGCAG--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--CA--------------TT--T-T---------T---GT---TT-T--------------TAA--A--CA-AA-A--TGAAGGGG--GTGGG------A-T--A--C---GA----T---G-CCC-A-A-------TCAAGAG-TA-C-C--------CC-A--T-G-T
gi|18 : aacacaggcacatgggggtaaggacAAGCCCCC------------GGAAGCT---GCTG-CAAT--TTTCG--AC-A------------TTAA-G-AGA-GG-T-ATTT-TCAA-AGTC-A-C-GATA-CAA-TTTCTT--TA
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctggggga----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--GT--G-T---T--C-T-AGA-T--AAA-----------GAA-----A---T-T-GTA--Ttctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacg---CA----------AT----TTT-----T------GT--T---------------TG-----------T-T---T----------------T---G-------AA--ACCTTT---T-TCT--A-CT------CG-T-----TT---CAT---A-AA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTA-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGCTT-T-----T-A-T-CAAAAA--C------T-A--C--------T-AACA-TT--CGATAAACGGTGCA-T-GTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-ACG-----ATATGT-A-C-A------GTC---G-GATC-------T--agtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|19 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacgatacaatttctttatctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactTT-T-GAA------TT-CCGTGA-C---------AGC-G-T-------A-T-T-AAAA--C------T-A--CACGTTAAGT-AAAAGTT--CG-----------A-T-GCAATC-TAA---AT---TG--GAATGTAAG-----A----T-AAC-A------GTC---G-AATCCTATTAGT--A---G-----------T--------A----TTGATAAA-------AAA-----------A---C---TTAGAGG--A-A--AAAGATTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------C-----T-----AGT-----T--------------------------------------------------A-A---------A------C-------T----------AGA--ATA-A----AATATAACATACAGATTCAATCT--AAGAT---T-AAT-AAAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TTAC--------------AAT--A--TA-AA-AAATTAAGGGG--GCGGC------A-TAAA--C---GAAAATT---C-TCT-A-T-------GC----TATA-C-CGT------CT-AATT-T-TTACT--TT--G-A---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---TGT-ATA--TA-----------CA----T--------------GTG--T-TGAAA----GGAATAT----AATACT---AAA-C--AA--A-A-T--A-TTCC----AGCATT-TC-CGA---CC---AAT-TATC--------T--------------TT----ATTTT--CCTGTTT--T-T-
gi|2 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAAGCCCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GG-TGATCT-T--------------------T-ATTTTT----ATCA----------A-------AAGCTTGTACA--AAATTT--TTT------AA------AAAAGA-AATCACGG---G---G----------------GGGTTG-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-a
gi|2 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAGA-Ggaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaataaatatggaagcagagag
gi|20 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgaagccccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaaattttttaaaaaagaaatcacgggggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactac-------C----GTGTCCAAA--A-A-A------T------TGCAA--TTAAT----AA--C---T------------A--------------TT--T-T---------CTGGG----GT-T--------------AAACAACCTA-AT-A--TGAAGGGGCGACGCC------AGT--AA-C---GA----T---G-TCCCG-GCTCTCCTTC----C-TA-C-CTCCCCGAACC-C--T-C-TCCCTA-TTCCG-G---T--T-----A-A--AAT-----------AGAAA--GA---T-T-CTAATTA--GGC-----CT--------------------GGG--C-T-TCACCGGA----AT----GA-------AGAGT--GACTACA-TCTA-TT-C----AGCAATATT-CGAAG-CC---AAAATATGAGTGGTA-T--------------TTTCACCTTCT--CTCTTTT--T-T-TT-TCCCAT--------A--T--T-T-A--AA----T--A--ATAAGAAATCT-TTTGA-----GA-A-TCAGTT-T-CT------TTTTAT---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-G---C-AAATGTTC---C--CG-TCCCG-TGC-TT-C-
gi|21 : CAGTAGC--TA-GCGTTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCTGGGGGTTT-GGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------
gi|21 : gttttaatGGGGGTCCAGGATGC-G----AAGCTCCC------------GGAAGCA---GGTG-C-AA--TTTAG--ACA-------------------------------TT-TCAA-AGTC-T-CTGATA-CAC-AATTTT--C-ATTA----------ATT----Taatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgatacacaattttcattaattttaaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|21 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgat-------TC----T-TA-C-C--------CC-AT-T-G-TGCCTAGCT--GTG---T--T-T-AAA-A--TTA-----------ATGAA--AA---T-T-GTG--TA--taaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|22 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgaAAGATT-------TAACTTCTTTC------AAGAAAACAAAAAA-AA--AGAG---G---G----------------G----GAGGGGAGGG-----------------GG--------------GAGGATTGTCCAATAATTAGTT---T-T----A-C--T---------G---CAATTTTTGTTTTT----TTTGG---T------TT--T---------------TT-----------G-TATTT----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-CT--------------------------ATAAACAACTA-AATA--GA-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-AC--------AAC-T-T-----C-A-T-A-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GTA-CC-TTA---A----TG--TAA-A-TAG-----A----T-AGC-A------GTC---G-AATC-------T--A---AG----------T--------AGTT-T------A-------GATAAA--------A---C---TT---TG--ACC--AGAG-TTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----agattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|23 : aacacaaacacatggggtaagGAG-TTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------AT---------A-----G--AAG-------TA-A---------A------TA------C----GT-GT-AAA--A-A-A----AAT-------GCAG--TTAATCT--AA--T---T-GAT------------------------T--T-T---------T---G----TT-TTTAA----------AAA--A--TA-AA-A--TGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TT----T-TA-C-C--------CC-A--T-T-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-------------------------------------------TA-----------TA----C--------------GTG--C-T-ACA---------------------------------------TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAC-TATC-----TT-A--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-GAA-----------A--T--T-TAA--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGAC-TTTAA-T-TTAT-T-T-CA-------------------TTTTTTAC-T-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-G---C-A------CA--TG-C--TTCCG-TGC-TT-C-ATACGAAG-C-C-ACGCCgtta
gi|24 : A-AA-A--TGAAGAGG--GCAT---------T--A--C---GA----T---GATCC-G-G-------TC----T-TCTC-C--------CC-A--T-GCTGCCT--TT--G-A---A--T-T-TAA-A--AAA-----------AAAAA--AA---
gi|24 : aaAA-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-T-ATA--TA--TACACA--CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----TT---AT----AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-CATGTATTTCTTTC-TT----CTTTT--TTTTTTT--T-T-TT-TTTTTTTTTA----A--T--T-T-A--AAATTCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-ATTTA--T-T-CA-----------T---ATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-G---C-A------CA--TG-C--TTCC--TGC-TT-aaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagaaaaaagaaaagattatatatacacactaggggcctagtacattataaataaaattttcgaccaaatatctacatgtatttctttcttcttttttttttttttttttttttttaatttaaaattcgaattttatttgattttaaatttattcatattttttttaaccgcaacaatgtggaagcacatgcttcctgctt
gi|25 : aaaaaatgaagagggcattacgatgatccggtcttctccccatgctgcctttgaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaag--------------------T---T-T----A-A--T---------G---CA----------TT----TTG-----T------TT--T---------------TA-----------C-T---T----------------T---A-------AG--ACATTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----GT---T-----ATAA-CAACTA-AATA--AG-GTGTGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--CTACATGT-A--C--------T-ATAA-GT--CG-----------A-T-GCA-TC-TAA---AT---TG--AAG-G-AA
gi|26 : ccgatacacatttctttaattttaaacacaggcatatggaggtaaaggcatcgtaacttccttcaattaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgctGGG--GCGAC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGTCT--TT--G-A---T--T----GA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-TTATA--TA-----------TA----C--------------ATA--T-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-CT-T----AGTATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTTTTT--T-T-AA-A-------------A--T--T-G-A--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTT----A-TT---T-T-C------------T---CTCTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTTGTTCAAA-G---C-A------CAT-C--C--TTCCG-TGC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|27 : --------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--TG-AA-A--TGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-T-G-------CC----T-TA-C-C--------TC-A--T-G-TGCCT--TT--G-G---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T--TA------------------------------------ATA--C-T-AAA----G----AT----AA-------AGA-T--AA--A-A-CA-A-TT-A----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTGTT------TTT--A-T-AT-T-------------A--T--T-T-A--AAC-TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-G---C-A------C---TTGC--TTCCG-TGC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGTCA
gi|28 : --GCGGG------A-T--A--T---GA----TCATG-TCT-G-G-------CC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T----------T-----------AGATA--GA---T-T-G-A--TA--AACA----TTA----C-----------------------ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----ATTATA-TT-CTA---CT---AAC-TATT-----TA-----------------T----CATTTAAAATCTATAAT-A-TT-C-------------A--T--T-T-G--AA--CTT--A--AT------T---TTTAAA----AA-A-AAA--T-T-C-------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GT--AAC-AA-TGTGG----AA-G---C-A-------------------CA-TGC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|29 : CAGCGGCG-TA-GC-TAGGGGTAG-GT-A--GATATGGAA-GT-AGAAA-GAGCAGGGAGTTTGGGGGCC-ACCC--AGGTCCT------------Ggtac
gi|3 : CAGTGGCG-TATGC-TTGGGGTAATAT-G--CATATGGAATGCAAGAAA-Gatcgattcccccaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|3 : gatCCCA------------GGAAGCT---GGTG-C-AT--TTCAACAACAACCCCACACCCACTTAA-TTAGATAG-T-ATCTGTCAA--GTC-T-CCGATAGCATCATTTTT--T---TA----------ATGGG--TAAA--TGATCG--TAACTTCCTTA------GA------AAAACA-AA--AGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGG----G-------GG-----------------GG--------------GAGTCCATTAGT---------T---T-T----ACT--T---------G---CA----------TT----TTG-----T------TT--C---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------GG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGGTTT-T-AAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------T-AAAA-TTTTCG-----------A-T-GTA-TC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TGA-C-A------ATC---G-AATC-------T--A---A-----------------------------------------GT-----------A---G---TTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------TA-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--AA--T---T-GATAAA-T--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--TA-AA-A--ACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---GA----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CC-A--T-G-TGCTT--TT--G-A---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|3 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactcCA----G----AT----AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A-G--------------TT----ACTTT--CTTCGTG--T-T-A----------------A--A--T-C-A--AA--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---T---TTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-G---C-A------TA--TG-C--TTCCG-TGC-TTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|30 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcagg--TAACTTTCTTT------CA------AGAAAA-AG--GGGG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GATTGTCCATTAATTAG--------------------T---T-TTAATA-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--TGGGGGGGTGGGGGGGTT-----------A-T---T----------------TT--G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGTTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-ATT-T-AAAG--C------T-A--C--------T--AAA-TT--CG-----------A-T-GTA-
gi|31 : aatacaggcgcatggggtaaagaaagt-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-TTATA--TA--CACA----CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----T----AT----AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-CATGTATTTCTTTTCTT----CTTTT--TTTTTTT--T-T-TT-TTTTTTTTTTTTTAA--T--T-T-A--AAA-TCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-----------T---ATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-G---C-A------CA--TG-C--TTCC--TGC-TT-
gi|32 : CAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAT-AT-ATGAATATGGAA-GC-AGAAA-GGG
gi|34 : tt--------------------T---T-T----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T---------------------------A-----------A-C---T----------------------------------GTTC---T-G-T----CG------CT-T-----TT---T-----ACGA-CAACTA-A-TT--AG-ATGCGTTTTGT-GAAT-----TT-CCTTGA-A---------AGC-CAT-----T-A-T-T-AAAtccccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|35 : caaaacaaaaacaaaaaaccccaaaaaacaaaaaacaacaaacaacaaacagataagttcaataagtA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTTTTT--T-T-CC-T-------------A--T--T-T-AAGAA--TCT--A--AT------TTCATTTGAC-TTTAA-A-TCA--T-T-TAAT----TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAT-GA-TGTTG----AA-G---C-A------CA--TG-C--TTCCG-TGC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|36 : ----TAAGATT-------TAACTTTTTTC------AA------GAAAAA-AA--AGGG---A---T----------------T----GTCCAATAAT-----------------AA--------------G--------------------T---TAT----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TTTAAAAAATTCTA-T---T----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--A-TT------A--T-----TT---T-T---ATAA-CAA
gi|37 : aacacaggcacatagggTTCTTT--T-AATT-T-------------AGGC--T-C-A--AG--TCT--ATAAT------TTTATT-GACTTTTAA-A-TTA--T-G-------------------TTATTTTTAACGC-GCAGACC-AAATGTGG----AATG---C-A------CATTTG-T--TTCCG-TGC-TT-C-ATAGG-AG-C-TAACGC
gi|38 : acat--------------------T---T-C----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----G------TT--T---------------AT-------------T---T----------------T---G-------AGG-ACGTTT---T---T--A-CT------AT-A-----TT---T-----ATAA-CACATATAATACAAG-AAGCGTTTTCT-GAA------TT-CCTT----------------------------------AAA--C------T----T--------T-AAAA-TT--CG-----------ATT-GTA-TC-TAA---A----TG--AAA-a
gi|4 : gtCAGTGGCGGTA--C-TTGGGTT-G-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAATGGGCGAGGGGTT-GGGGGCCGGCCCTAAGCCCc
gi|4 : GGGTCCGGGG--C-G------AGCCCC------------G-AAGCT---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAA------------GTAA-A-AGA-GGTT-ATTT-TCAAGAGTC-TCC-GATA-GGC-AGTTTCAATAATTAAAAACAGGACATTGGGGTAAGATTAACCT--T--CTT-TTTC------AA------GAAAAACAA--AGGG---G---A----------------A----A-------AGATTTGTCCATCTAATTTAG--------------T--------------------T---T-T----A-TACT---------G---TT----------TT----TTTTTTTTT------TT--T---------------TT-----------ATT---T----------------T---G-------AG--A-GTTT---T-GTT--A-CT------AG-A-----TT---T-T---ATAA-CAACTATAATT--AG-ATGCG---T-T-GAA------TT-ACTTGA-A---------AGC-T-T-----TCA-T-A-AAAA--C------TAA--C--------TAAAAA-TT--CG---------------GTA-TCGTAA---AT---TG---AA-T-AAGATTT-A----T-A-CGA------GTC---G-AATC-------T--ATTGA-----------T--------G----T--------------AGTTTCCAGATAAAA---C---TT---GC--A-C--A-AG-TTC--G------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----CGTTG---T----T--------------AT---------G-----A--ATCGCG----TA-A---------A------TA------C----GTGTCCAAA--A-A-A----TA----------AG--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T---G--------------TT--T-TCC-------C---G----TT-T--------------AAA--A--AATAA-A--TGAGAAGG--TCGGCGAAGCAA-T--A--C----A----T---G--CC-G-G-------TC----T-TA-CGC--------TC-T--TAG-T-CCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------GATAATCAA---T-T--TG--TA--GGG-----CTT----A--------------TTG--C-T-ACAC---G----AT----TT-------AAA-T--GA--A-A-TCAA-TT-C----A-CATT-TT-CGAATCCC-----A-TATC-----TA-TG-------------TT----CTTTT--CTTCCTT--TGT-TT-T-------------G--CTAT-T-A--AA--TCT--A--AT------TTT-TTTGACTCTTAATA-TCA--T-T-TAGACTTCTT---T---TTTTTTTTATAC-C-GCAAAACGAA-TGTGG----AG-G---CGA------C---A--T--GCTCG-TGC-TT-CAATAGGAAG-CAT-ACGCaatggtcatgcagagccctgtggcgggtccggggcgagccccgaagctggtgcattttagacaagtaaaagaggttattttcaagagtctccgataggcagtttcaataattaaaaacaggacattggggtaagattaaccttctttttcaagaaaaacaaaggggaaaagatttgtccatctaatttagttttatactgttttttttttttttttttattttgagagttttgttactagattttataacaactataattagatgcgttgaattacttgaaagctttcataaaaactaactaaaaattcggtatcgtaaattgaataagatttatacgagtcgaatctattgatgtagtttccagataaaacttgcacaagttcgaagcacattcgttgttatgaatcgcgtaaatacgtgtccaaaaaataagttaatctaattgataatgttttcccgtttaaaaaataaatgagaaggtcggcgaagcaatacatgccggtcttacgctcttagtcctttgatttaaaaaaagataatcaatttgtagggcttattgctacacgatttaaatgaaatcaattcacattttcgaatcccatatctatgttcttttcttcctttgttttgctattaaatctaatttttttgactcttaatatcatttagacttctttttttttttataccgcaaaacgaatgtggaggcgacatgctcgtgcttcaataggaagcatacgc
gi|41 : cagtggcggtacttgggttgattaatatggaagcagaaatgggcgaggggttgggggccggccctaagcccaatggtcatgcagagccctgtggcAAGATT-------TAACTTC-TTC------AA------GAAAAA-AAT-GGGG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GT--------------G--------------------T---C-C----A-T--T---------A----A----------TTAG--TTT-----TATAGCATT--T---------------TT-----------G-T---T----------------T---G---------------TT---T-G-T--T-TT------TT-G-----TT---T-T---
gi|42 : taaacacaggcacttggggtaagCG-TA-GC-TCGGGTT-G-AT-G--AAAATGGAG-GC-AGAA---GACAGGG--TTTGGGG-CC-GCCCTAAGGCCCC------------ATAGGCt
gi|44 : cagttgcCT--A--AT------TTTATTTGACTTT-AA-A-T--------CA------TT---TAAATTTTTCTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-G---C-A------C---A--TGGTTCCA-TGC-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGgtcaagggcaggcctaggggcgaagcccccggaagc
gi|45 : GGGGCC-GCCCTAAGATTCCCAATGGGTCCAGGGAAGCG---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAA------------TTAA-G-AGA-GG-T-ATTT-TCAA-AGTTAC-C-AATA-CAC-ATTTtacgc
gi|46 : T------TTTATTTGACTTGAGA-T-TTA--T---CA------TT---A---TTTT------GC-C-GCAAG-C-AA-TGTGA----AA-G---C-A------CA--T--C--TTCCGTTGCTTT-C-ATACGACGCC-T-ACGCC
gi|47 : c-A--AA--TATC-A--AA------TTTAT--GACTTT-AA-A-TTA--G-T-C-------------------TCATTTTAC-CAGCAA--C-AA-TGTGG----AA-G---C-A------C---TTGC--TT-CG-TGC-TT-C-ATAGGA---C-T-ACGCc
gi|49 : --T-T-A--AA--TATCAA--AT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-TTA--TCT-CA-------------------TTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-G---C-A------CA--TG-C--TTTCG-TGC-TT-
gi|5 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCA
gi|51 : gacgttacaattttgcaacatatgcacattcttgttaaagttctctaggcgagtcaaaaaataacattatctaaattagaatcatttctatttccttcaaaacaaaacttctgatattttcacggtccaagcattacttgcacataacaatgttttcaggtggtggttgggagggagggggtggggttgaagtggaatttcagaacggggaggagggtagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaattcttacaaacaagaggttatctttatttttatcaaaagcttatacaaacaatttaaaaaaaaagaatcattcggggtgggggctggggtgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgagcatgtttaccgatagtatttacggtaaaagttttatatcctgcaggccagacgcctaagtcgaatttcatgtgccacttttgacagtggtgatattatttctacacaaataaaaaacaagtttattacagaatctctcagttattgaaaaataaaaccaactttttaatgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-A
gi|52 : tgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGAAAGGGGTTTGGGGGCT-G
gi|55 : CAGCGACG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATGG-A-GC-A
gi|56 : ttttttctattaaccg-----------------GG--------------T--------------------T---T-T----A-C--T---------G---CA----------TT----TTG-----T------TT--T---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------GG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------C
gi|57 : cattGGTG-TA-AC-TTAGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-
gi|6 : cattCAGTGGCG-TA-GC-ATGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAAGGGGTTTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAGCCT---GATG-C-A---TTTAG--ACA-------------TTAA-A-ATA-GG-T-ATTT-TCAA-AGTC-T-C-GATA-CAG-ATTTTT--TAATTA----------ACT----TAA---TAATCT--CCCCCCCCCCC------AA------AAAAAA-AA--AGGG---G---G----------------G----A-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-T----C-T--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TC-----------A-T---T----------------T---G-------AG--ACATTT---T-G-T--A-CTAGATATCTAT-----TT---T-T---ATAA-CAAATA-AATT--AG-ATGCATTTT-T-GAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAT-TT--CG-----------A-T-GTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------GTCTTCG-AATT-------T--A---A-----------T--------A----T------A-------AGT-----------A---C---TT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAA--TTAATCT--AA--T---T-GAT-AA-T--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--TA-AA-A--TGAAGGGG--GCAGT------A-T--A--C---CA----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--A-T-TGCCT--TT--G-A---T--T-TAAAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------CTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GG--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TTCT-------------A--T--T-T-A--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TCA--T-T-CAATTTTTTT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-G---C-A------C---T---------A-TGC-TT---ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|60 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-AC-AG
gi|61 : tCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATAGAA-GC-A
gi|62 : tGG----AA-G---C-A------CA--TG-C--TTCTG-TGC-TT-C-ATAGGAA
gi|7 : ----TAAAAT-GATCG--TAACTTCCTTA------GA------AAAACA-AA--AGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGG----G-------GG-----------------GG--------------GAGTCCATTAGT---------T---T-T----ACT--T---------G---CA----------TT----TTG-----T------TT--C---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------GG--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AATT--AG-ATGCGGTTT-T-AAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------T-AAAA-TTTTCG-----------A-T-GTA-TC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TGA-C-A------ATC---G-AATC-------T--A---A-----------------------------------------GT-----------A---G---TTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------TA-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--AA--T---T-GATAAA-T--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--TA-AA-A--ACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---GA----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CC-A--T-G-TGCTT--TT--G-A---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----Act
gi|7 : tggggCA----G----AT----AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A-G--------------TT----ACTTT--CTTCGTG--T-T-A----------------A--A--T-C-A--AA--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---T---TTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-G---C-A------TA--TG-C--TTCCG-TGC-TTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|8 : tggggtaaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcagg--------------------T---T-T----A-T--T-------------CA----------TT----TGT-----T------TT--T---------------AT-----------T-T---T----------------T---G-------AG--ACGTTT---TTG-TTTG-CT------TC-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT---AGTATGTGCTTT---GAA------TT-CCTTGATA---------GGC-T-T-----TTA-T-T-AAAAAAC------T-AACT--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GTA-TC-TAA---TT---TG--AAA-A-AAG-----A------A-C-A------AT---AG-AATC-------T--A---A-----------TTA------G----T------ACGGTGATAGTTTCACGATGAAA---C---TT---GG--G-C--AGAG-TTCGGA------------AGC-CATGC--------------A------T-----T-----GGTGGCATTACCGT--------------GT---------A-----A--A------------A---------A-------------------------AAA--A-A-A----AAT-------GCGG--TTAATTT--AA--T---T---T-AA-T--AA--------------TTATT-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--TA-AA-A--TGAAGGGG---CGGC------A-T--A--CCGGAA----T---G-TCT---G-------TC----T-T--C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TTTGG-A---T--T-T-AAATA--AAA-----------ATTTA--CA---T-T-ATATTTA--CAC-----ACA----A--------------TTG--CTT-AC-----G----AT----TA-------AGA-T--GA--A-G-TC-ACTT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TATT--------------TT----CTTTT--CTTCTTC--T-T-TTAA-------------A--T--TAT-A--AAT-TCT--A--AA------TTTATTT-ACTTTAAA-A-T----T-T-CA-----------------TTTTTTTCAC-C-GC--AAC-AC-TGTGG----AG-GCAAC-A------T---G--C--TTCCG-TGT-TT-C-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|9 : aacacaggcacatgggtaagaagatccgtaacttaattctttcataaaaagaaaaaaaaagaaaaaaagatttgccatctgttATCG--TAACTTCCTTC------AATTT---AAAAAA-AA---------------------------------------------------------------G--------------A--------------------T---T-C----A-T--TTAATA----GTTCCA----------CT----GCT-----T------TT--T---------------TG-----------A-TATTT----------------T---G-------AG--ACGTTT---T-G-T--AACT------CT-T-----TT---T-T---ATGA-CAACTA-GATT--AG-GTGTGTTTT-T-GAA------TT-CCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-AAT-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AGAA-TT--CG-----------A-T-GTA-TC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------ATC---G-AATC-------T--A---AG----------T--------ACTTTT------A-------GAT-----------AAAGC---TT---AG--A-T--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--C--------------A------T-----T-----AAG-----T----TGTTATGATTAGA--GT---------A-----A--A---------TATA---------A------A-------T----GT-C---AA--C-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--AA--T---T-AAT-CA-T--AAGATTTTGGGTTAGTTT--T-T---------T---GTTTTTT-T--------------TAA--A--CA-AATA--TATA----------T------A-T--A--C----A----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-T-TGCGT--TT--G-ATATT--T-T-GA---------------------------------T-ATA--TT--GAT-----AAA----C--------------ATA--A-T-ACA----G----ATAA--AA-------AGA-T--GA--A-G-CC-A-TT-C----AGCATT-TT-TGA---CC---AAA-TATT-----TA-A--------------TT----ATTTC--TGTCTTT--A-C-AT-T-------------A--T--T-TAA--AA--TCT--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-------T---T---TTTTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-C---C-A------CA--TG-C--TTGTG-TGC-TT-C-AGAGGAAG-C-T-ACGCCac
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AAGAGCAAGAGTCACGAATAGATCCAAAATGGACGCCATTTGCTGAGACAGTTGATATCATTTCATAGATCAGTAGATCAAGAAAAGTGTTAATTTTCAAATATACTTCCCTTTTTCGATATCGTATCAATTTATTTAGTTATATAGACGTTTCAAAGTTAGTCATTTGTTATTTCTTGGGCCAATTTTTGTTTTTGACGTAAAACACTTTTACAACGTATGTATCTAGTATCAAAACATATACATATATATTCGTCATTTCTTTACATACAAAAATCTAGATTATGTTCACTGTTCCAGACTCACTACTTTGTCACTTTGCAATGTTTTTCAAGAGTGGTGGTTGGAAAGAACGGGGGAGGGTGATCGTTGCTGTATCTAACGAATTTCAAGAAGAGGAGGGGTGGGTGTGTAGAAAGGTCAGGGGGTATAACAATTCTGCATTGAAACTCCTTTAGTGGATCTTCAGGTAGACGAGTTATTAAAAGGCAATAGGTAAGGTGATATTTAATTATTTTTAATCA
Unaligned ( gi|33 ): TCAGGAATTTCAGAAACAGTGGGAGGGGGAGAAGGTGAGTTGCTTGAAGCTCCCAGAGGACAGAGCGAGACCCCCGGAAAGCTGACACATTCTCTACACAAGCAAAAGTTTTTATTTTTAATTTTTTTAAGAAATGCTTTGTTCGGCACAAACACTTTTTTAAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CCCCAGTAGGTCCAGGACAGAAACCCTGTTTGTGGGCCAGCAGGGGCGAAGGCCCCCGGGAAGCAGCATGGAACTTCTTTTACAAGAACGATTTCGCTAAACATTTTTATTTTTTA
Unaligned ( gi|40 ): GGGGTCTGGCAGCCGCTTAAAAATAGGCCGCCCAGTGGGTCAGAACTTGCCCTATATAGTAGCCTAGGGGGTCCAGGGGGCGAAGCTCCCGGAAACTGAGAGGTTTTAGAATTC
Unaligned ( gi|43 ): AAAAAACAAAAAAAACAAACAAACAAGATAGTTCATAAGTTTTACTGCATTTTTTTACTGTTCTGTACAGCTTTTTAGAACAACTAAATTAGATGCGTTTTTGAATTC
Unaligned ( gi|48 ): GGCGAAGCCCCTGAAAGCTGACAAATTCTTACAAACAAGAAGTTTTTGTTTTATCAAATGCTTGTTGTACAAACAAAATG
Unaligned ( gi|50 ): AAGGTACTAGTATGGGAGCCGCCCTAAGGCCTTGGTGAGTCCAGGACAAAGCCTTGGTTGAGGCCCTGGGGGC
Unaligned ( gi|53 ): TTGGGGCTGCCATGAGACCAGCCCCGAGGGTCCAGGACTAAGTCCTAGTAGGGGTCCAG
Unaligned ( gi|54 ): TAAATTCTTACAAGCAAGAGGTTTTTAAAAAATTAAATGCTTGTTGTACAAACTA
Unaligned ( gi|58 ): TGAGTATGAGTACGGTAAAAGTTTTATAACCTCCAGGCC
Unaligned ( gi|59 ): AGGTGCATTTGACTATTTCAAAAGGTTCCCGAACCATTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111111111111 111 1 111 44444444444444444444 2222222 11111 111 555555555555555555555555555555555555555555 222222 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111 1111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 222222222222222222 111111111111111111 22222222222222 11111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 1111111 22222222222222222222222 33333333333333333333 11 1 44444444444444444444444444 111
lowQualScore : 2 2 2 2 6666 2 2 44 0 00 1 3 0 2 888888888888 777 0 5 999 0 66 22222222222222222222 5 5 1111111 5 888 55 22222 4 111 4 4 66 66 222222222222222222222222222222222222222222 0 888888 111111 3 000 555 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 333 1 3 22 1 222222222222222 666666666 1 5 22 1 5 666666 3 1 999999999 1 3 3333333 3 1 3 66 555555 4 22 99999999 2 2 55 99999999999 2 2 2 2 333 3333 55 2 2 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 55 2 2 6666 00000000 33 33 33 333 2 6 111111111111111111 22 2 444444444444444444 2 66666666666666 33 33 33 2 2 333 555555555 1 22 44 4444444 4444 333 1 00000000000 7777 1 5 1 99999999 1 44 1 1 44 55 1 555 77 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 111111111 22 8888888 2 77 22 2 2 44 2 2 4444 2 2 4 666 333 22 88888888888888888888888 4444 0 22 33 55555555555555555555 66666 2 2 22 11 44 22 555555 22 4 1 1 00000000000000000000000000 0 4444 1 1 333 1 5 3333 1 3 1 22 44444 1 5 2 2 2 2
lowQualScore : . . . . .... . . .. . .. . . . . ............ ... . . ... . .. .................... . . ....... . ... .. ..... . ... . . .. .. .......................................... . ...... ...... . ... ... .............................................................................................................................................................................................................................. .. ... . . .. . ............... ......... . . .. . . ...... . . ......... . . ....... . . . .. ...... . .. ........ . . .. ........... . . . . ... .... .. . . ................................................................................................................................................................................................................................................................................................ .. . . .... ........ .. .. .. ... . . .................. .. . .................. . .............. .. .. .. . . ... ......... . .. .. ....... .... ... . ........... .... . . . ........ . .. . . .. .. . ... .. . .................................................................................... . ......... .. ....... . .. .. . . .. . . .... . . . ... ... .. ....................... .... . .. .. .................... ..... . . .. .. .. .. ...... .. . . . .......................... . .... . . ... . . .... . . . .. ..... . . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 9999 2 2 44 9 33 4 6 7 8 666666666666 555 0 0 666 5 99 11111111111111111111 0 0 2222222 0 888 11 00000 4 777 4 4 99 66 000000000000000000000000000000000000000000 8 222222 111111 1 000 444 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 000 7 5 44 7 999999999999999 555555555 9 5 55 8 2 777777 5 9 555555555 9 8 0000000 8 9 8 88 888888 0 88 22222222 0 0 55 55555555555 0 0 0 1 777 9999 88 1 2 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 2 2 9999 44444444 11 11 11 999 2 7 999999999999999999 99 1 333333333333333333 4 88888888888888 22 22 11 2 2 555 999999999 9 66 55 6666666 0000 333 9 22222222222 5555 8 5 8 11111111 8 33 8 8 55 22 9 222 11 9 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 333333333 66 2222222 1 11 99 1 1 77 1 1 5555 2 2 4 666 777 22 33333333333333333333333 5555 4 99 11 11111111111111111111 99999 2 1 99 33 88 88 555555 22 4 9 9 44444444444444444444444444 4 0000 9 9 999 9 7 9999 8 6 8 55 55555 8 5 1 4 4 4
consensus : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GG-T-------ATTT-T---CAA-AGTC-T-C-GATA-CA--CA-TTT-TT--TAATT---A----------ATT----TAAG-AT-TG-----------ATCGTAACTTCCTTC------AA------AAAAAA-AA--AGGG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-T----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TN-----------A-T---T----------------T---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------GT--C---G-AA-----TC-------T--A---A------T--------A----T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTTCT--TCTTT--T-T-TT-T-------------A--T--T-T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
Reference ( family-2559 ) : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GG-T-------ATTT-T---CAA-AGTC-T-C-GATA-CA--CA-TTT-TT--TAATT---A----------ATT----TAAG-AT-TG-----------ATCGTAACTTCCTTC------AA------AAAAAA-AA--AGGG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-T----A-T--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TN-----------A-T---T----------------T---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------GT--C--AG-AA-----TC-------T--A---A------T--------A----T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTTCT--TCTTT--T-T-TT-T-------------A--T--T-T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|1 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAG--CCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GG-TGATCTTTATTT-TTATCAA-AAGC-T-T-G-TA-CAAACAATTT-TT--TAA
gi|1 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-ATAT--AATATGGAA-GC-AGAGA-Gaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaatataatatggaagcagagag
gi|10 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgagcccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaacaattttttaaaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactac----A-T--T---------G---CA----------TTAAGATTT-----T------TT------------------------------------------------------------------A-G--ACGTTA---T-T-T--A-CT------AT-A-----CTGAGT-T---ATGA-TAACTATAAT--CAT-ATGGCTTTC-TTAA------TT-CTATCG-A---------AGC-T-T-----T-A-T-TCAAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-T---------------------C-ATC-CAA---TT---T----------AG-----A----T-G-C-A-------T--C---G-AA-----TT-------T-------------T--------A----C------C-------AGT----------------TT---TA--A-T---GAA-TTCA-A------------AAA-CA--C--------------ATTTAATT-----T-----AGTTG---T----T--------------AT---------A-----A--G---------AA-A---------A------CTACAATAC----GT---CAAAC-A-A-A----AAA------TGCAG--TAAAGCT--A--ATGCATGGAT-AAT--CG--------------GT--T-TGTTGCATTAT---G----TT-TTTAAATTTTTTTAAAAA--A--T--A-AA-TTGAAGGAA--AT-----------T--A--C---G---A----T---G-TCC-
gi|10 : aa--------------------T---T-T----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------GT--T---------------T-------------------------------------------------G--ACGTAT---T-G-T--A-GT-------T-T-----TC---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAA-ATGTGTTTT-TGAA------TT-C------------------------------A-T-T-AAAA--C------T-G--G--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GC-ATC-TAA---AT---TG------G-ATG-----A----T------------TT--T--AGTAG-----TT-------TTGA---A------T--------A-----------A-------AG----------------CTT---CG--A-T--AGAA-TTAAGA------------AAGCCA--T--------------A------TGATTAT-----AGT-----TA---TCATAACTCAGTATAGT---------A-----A--A---------TA-A------------------------C----G--TCTAAA--A-A-ATCTTAA-------TGCAA--TTA--CT--A--A------GA--AATCCAA--------------GT--T-T---------T--------TT-----------------------------AA-ATGAA-GGG--GCGGG------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------CC----T-GA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCC--TT--G-A---T--TCT-AAA-T--AGATTGTCATTTTTAAAGA--CA---C-T-A-----A--GAC-----CAA---------------------G------ACA----G----AT--AA-------AGA-T--------A-TA-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---AC---AAA-TAAT-----TA-T--------------TT----C---------------T-G-TT-T-------------A--A--T-C-AA--A-------A--A-------TTCA--TAAC-ATTAA-A-TTA--C-T-TA------------------ATTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-------------------------GC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCtactaagaaatccaagttttttaaatgaaggggcgggatacgatgtccggcctgaccccatgtgcccttgattctaaatagattgtcatttttaaagacactaagaccaagacagataaagatataattcagcattttcgaacaaataattatttctgtttaatcaaaaattcataacattaaattacttaattttttaccgcaacaatgtggaagcttcataggaagctacgcc
gi|12 : aaggacatcgtaatttccttcaatttattttttaaaaaaatttaaaaacataatgcaacaaaccgattatccatgcattagcG-----------ATCGTGACTTCCTTG------GG------GAAAAA-AA----GG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GG--------------G--------------------TCCAT-T----A-T--TAGTTTTACAG---CA----------TT----TTT-----AAAA---TT--T---------------TA-----------T-T---T----------------T---G-------A-A--ACGTTT---T-G-T--A-TT------CT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AAT--GAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCCTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--A------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TG--AAA-G-AAGATGACA----T-G-C-A------GT--C---G-AA-----TC-------T--A---AG-----TAGTTTTTGA----T------A-------AA------------A---TTT---GG--A-C--AGAG-TTCAG-------------AAG-AA--C--------------G------T-----T-----AGT-----T----G--------------TT---------A-----A--AAAATTAGAGTA-A---------A------CA------T----GTGTC---A--A-C-A----AAT------TGCAG--T-----T--G--AT---T-GAT-AAT--TA--------------TT--T-T---------T---
gi|12 : aacacaagcacatgtggcaagaaC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-C-------TC----T-TA-C-T--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---TC-T-T----------A-----------AAAAA--GATTTT-T-ATA--TACGAGCACATACTA----CAATTCAATTTCAGTTTA--C-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATacacggtaaaggctatctatagcctccacctttttacatacgatgtccgctcttactccatgtgcctttgatcttaaaaaagatttttatatacgagcacatactacaattcaatttcagtttactacagataaagatgaaatcattcagcat
gi|13 : aacacaagcacatgtggcaagaagatcgtgacttccttggggaaaaaaagggggggggggtccattattagttttacagcatttttaaaattttattttgaaacgttttgtattctttttataacaactaaatgagatgcgtttttgaattccctgaaagctttattaaaaatactaaaattcgatgtatctaaaatgaaagaagatgacatgcagtcgaatctaagtagtttttgataaaatttggacagagttcagaagaacgttagttgttaaaaaattagagtaaacatgtgtcaacaaattgcagttgattgataattatttttacacggtaaaggctatctatagcctccaccttttta----TAAG-AA--G-----------ATCGTAGCTTCCTTTTAATTTAA------AAAAAA-AA--AAGGTTCGTCTA----------------G----G-------TT-----------------AG--------------T--------------------T---T-C----ACT--T---------C---CT----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TT-----------C-T---TCAGTTTTTTTAACTTAT---G-------A-G---CGCTT---T-G-C--A-CT------CT-C-----TT---T-TTCAATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTC-T---------TT-TCTT
gi|13 : aacacagcacatggggA-----TC-------T--C---A------T--------A-----------A-------A-------------A---CTT---GG--A-G--AGAC-TTCACG------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T-------------------AT---------A-----A--T---------TA-G---------A-------------------GT-------------A----AAT-------ACA----CAATCT--A--AA---T-GAT-A-T--A---------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--G-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------T-A--A--C---G---A----T---G-TCC-T-G--------C----C-TA-C-T--------CT----T-G-TGCCT--TT--G-G---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T-TCA------------------------------------ATA--C-T-AAA----A----AT--AA-------AG--------------C-A--------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----GTGTT------TTT--TAT-AT-T-------------A--T--T-T-AA--C--TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-AC-TT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGTCACttttttttttatctcataaaacttggagagacttcacgaagcacattagttataattagagtaaatacacaatctaaatgatatatttttgtttaaaatgaaatgaagggggcggctaacgatgtcctgcctactcttgtgcctttggttttaaaaagatttcaatactaaaaataaagcatttcgaccaaatatctatttgtgttttttatattatttaactctacttttatttgactttaaaaccgcaacattgtgaagcacttgcttccgtgcttcataggaagctacgtcac
gi|14 : aacacagcacatggggtaagaagatcgtagcttccttttaatttaaaaaaaaaaaaggttcgtctaggttagtttcacttccttttttttttttcttcagtttttttaacttatgagcgctttgcactctctttttcaataacaactaaattagatgcgtttcttttcttttttttttttT-----T------AT--T---------------TC-----------A-T---T----------------T---GTAAATAAA-GGCACATAT---T---T--A-CT------CT-A-----GT---T-----ATAA-CAA------T--TAC-ATGTGTTTC-GGAAACCGAGTT-C--TGA-ACTCTATCCAACC-T-T-----C-A-TCT-AAAA--C------T-A--C--------C-TAAA-TT--CT-----------A-TTGT-ATC-TTC---TT---TC--AAT-T-TAG-----A----C-A-C-ATCAAATGT--T--AGTAG-----TT-------T--T---A------T--------T----T------A-------AG----------------CTT---TG--G-T--GGAA-TTCAAA------------AAA-CA--C--------------A------TC----T-----AAT-----T----TA-------------GT---------T-----GTTA---------TA-A---------A-------------------GTCTTTAAA--A-A---------------TACAT--TCAAACT--G--AT---G-GAT-AAT--G---------------TT--G-T---------T---T----TT-T--------------AA------T--------TGAAGAAA--GT-----------T--A--T---G---G----T---G-TCC-----------------T-TG-C-C--------CCCA--T-G-TTCC----T--G-AG--T--T-T-AAA-ATTAAG-----------AAA
gi|14 : tccgtacacaaGTTTGAAT-G-T--A-TT------TT-TAAAGACT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGTGTTTTTTGAA------TT-CCACCA-A---------AGC-T-T-----A-A-A-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AACA-TT--TG-----------A-T-GT-GTC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------AT-----AG-AA-----TT-------T--AG--G------T--------AGTTTT------A-------GATGAA--------G---GTT---GG--A-T--AGAG-TTCAGAACTCGGTTTCCGAAA-CA--C--------------A------TG----T-----AATTG---T----T--------------AT---------AACTAGA--G---------TA-A---------ATATGTGC-------CTTTATT-TACAAATGA-A-AT---AAT------TGCAG--GT-ATCT--A--AT---T-GAT-AAT--CA--------------TT--T-T---------T---G----Tttgcaggtatctaattgataatcatttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|15 : tccgtacacaatttcttaattttaaactcaggaacatgggggcaaggacaccataactttcttcaattaaaaaacaacattatccatcaATTA-ATT--TAA-ATGCATATT-T---------TT---TTGA-A---------CGT-TGT-----T-G-T-T-A-----C------TCA--CA-------T-AAAA-T---CG-----------G-T-----TC-AAA---AT---TG--AAA-G-AAGTTGGCA----TTA-T-A------GTATC--TG-AAGAGCTTA-------C--A---G------T--------A----TTC----A-------AAC-----------A---CTT---GGCGA-CTCAGAG-CTCAGA------------AA--CA--CT-------------A------T-----T-----A-T-----T----T--------------GTTATCACTAAA-----A--G---------TA-T---------A------CTA-----C----GT-GTAAAA--T-ATA----AAT------C-CAG--TTAATCCTGG--AT---T-TGT-ATT--AA--------------CT--TATG--------T---G----TT-TTG------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGAG--GCAGC------A-T--A--C---CTACA----T---G-TCC-C-G-------TC----T-TA-C-C--------CA-T--T-G-TGACT------G-A---T--T-T-AAA-A--AA--------------AAA--TA---T-T-AC---TT--GGC-------A----C--------------A-G----T-ATA----A----GG--AA-------GGA-TGGGA--A-ATTC-A-TT-CGTATGACATT-TT-CGA---TCTGGTAA-TATC------A-TA-------------TT----CCTTTCT--TCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|16 : aaaaaataaaatgtctATTA-ATT--TAA-ATGCATTTT-T-------------TTTAG-A---------CGT-T-T-----T-G-T------A--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-G-C-A------GT-----AG-AA-----TC-------T--A---AGTAGTTTCAG-----A----T------A-------AA------------A---CTT---GG--A-C--AGAG-CTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------ATCACTA----A-----A--G---------TA-A---------A------TA------C----GT-GTCAAA--A-A-A----AAT------C-CAG--TTAACCT--G--AT---T-GAT-AAT--TA--------------TT--G-T-------------A----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG---CAGC------A-T--ATAC---G---A----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGACT------G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA----------T-T-ATA--TA-----------------C--------------TTG--G-C-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AACATT-TT-CGA---CC---TAA-TATC-----TA-T--------------TT----CCTTTC
gi|17 : ttttctttaattttaaacagatcataaattctctaaaaaataaaatgtct-----------ATCGTAACTTCCTTC------AATT----AAAAAA-AA--CAAC---A---------------------------------------------------------------------------------------------T-T----A-T--C-------------CA----------TT----AGT-----T------TGAAT---------------GC-----------A-T---T----------------TCTGG-------A-G--ACGCTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGTGGTTT-TAAA------TT-TCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--C------T-T--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAATACATGTATG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------AT-----AG-AA-----TT-------T--G-------------------------------A-------AG----------------CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--CGTGTAATTGTTATAA------C-----T-----AGT-----A----T--------------AT---------ATAG--A--G---------TA-A---------A------TA------C----GTGTAC-AA--A-A-T----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--CA--------------TT--T-T---------T---GT---TT-T--------------TAA--A--C--A-AA-ATGAAGGGG--GTGGG------A-T--A--C---G---A----T---G-CCC-A-A-------TCAAGAG-TA-C-C--------CC-A--T-G-T
gi|18 : aacacaggcacatgggggtaaggacAAGCCCCC------------GGAAGCT---GCTG-CAAT--TTTCG--AC-A------------TTAA-G-AGA-GG-T-------ATTT-T---CAA-AGTC-A-C-GATA-CA---A-TTT-CT--TTAT
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctggggga----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--GT--G-T---T--C-T-AGA-T--AAA-----------GAA-----A---T-T-GTA--Tctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacg---CA----------AT----TTT-----T------GT--T---------------TG-----------T-T---T----------------T---G-------A-A--ACCTTT---T-TCT--A-CT------CG-T-----TT---CAT---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTA-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGCTT-T-----T-A-T-CAAAAA--C------T-A--C--------T-AACA-TT--CGATAAACGGTGCA-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-ACG-----ATATGT-A-C-A------GT--C---G-GA-----TC-------T--agtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|19 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacgatacaatttctttatctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactTT-TGAA------TT-CCGTGA-C---------AGC---G-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--CACGTTAAGT-AAAAGTT--CG-----------A-T-GCAATC-TAA---AT---TG--GAATGTAAG-----A----TAA-C-A------GT--C---G-AA-----TCCTATTAGT--A---G------T--------A----TTGATAAA-------AAA-----------A---CTTAGAGG--A-A--AAAGATTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------C-----T-----AGT--------------------------T---------A-----A--A----------------------------------------------CTAGA--ATA-A----AATATAACATACAGATTCAATCT--AAGAT---T-AATAAAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TTAC--------------AAT--A--TAAA-AA-ATTAAGGGG--GCGGC------A-TAAA--C---G---AAAATT---C-TCT-A-T-------GC----TATA-C-CGT------CT-AATT-T-TTACT--TT--G-A---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---TGT-ATA--TA-----------CA----T--------------GTG--T-TGAAA----GGAATAT--AATACT---AAA-C--AA--A-A-T--A-TTCC----AGCATT-TC-CGA---CC---AAT-TATC--------T--------------TT----ATTTTCC--TGTTT--T-T-
gi|2 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAAGCCCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GG-TG------ATCT-T---TA------------------------TT-TT--TA-TC---A----------A-------AAG-CT-TG-----------TACAAAATTT--TTT------AA------AAAAGA-AATCACGG---G---G----------------GGGTTG-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-a
gi|2 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAGA-Ggaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaataaatatggaagcagagag
gi|20 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgaagccccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaaattttttaaaaaagaaatcacgggggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactac-------C----GTGTCCAAA--A-A-A------T------TGCAA--TTAAT----A--AC---T-----------A--------------TT--T-T---------CTGGG----GT-T--------------AAACAACCT--A-AT-ATGAAGGGGCGACGCC------AGT--AA-C---G---A----T---G-TCCCG-GCTCTCCTTC----C-TA-C-CTCCCCGAACC-C--T-C-TCCCTA-TTCCG-G---T--T-----A-A--AAT-----------AGAAA--GA---T-T-CTAATTA--GGC-----CT--------------------GGG--C-T-TCACCGGA----AT--GA-------AGAGT--GACTACA-TCTA-TT-C----AGCAATATT-CGAAG-CC---AAAATATGAGTGGTA-T--------------TTTCACCTTCTCT--CTTTT--T-T-TT-TCCCAT--------A--T--T-T-AA--A----T--A--ATAAGAAATCT-TTTGA-----GA-A-TCAGTT-T-CT------TTTTAT---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-AA-AT--GTTCCCGTCCCG-TGC-TTC-
gi|21 : CAGTAGC--TA-GCGTTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCTGGGGGTTT-GGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------
gi|21 : gttttaatGGGGGTCCAGGATGC-G----AAGCTCCC------------GGAAGCA---GGTG-C-AA--TTTAG--ACA-------------------------------------TT-T---CAA-AGTC-T-CTGATA-CA--CA-ATT-TT--C-ATT---A----------ATT----Taatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgatacacaattttcattaattttaaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|21 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgat-------TC----T-TA-C-C--------CC-AT-T-G-TGCCTAGCT--GTG---T--T-T-AAA-A--TTA-----------ATGAA--AA---T-T-GTG--TA--taaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|22 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgaAAG-AT-T----------------TAACTTCTTTC------AAGAAAACAAAAAA-AA--AGAG---G---G----------------G----GAGGGGAGGG-----------------GG--------------GAGGATTGTCCAATAATTAGTT---T-T----A-C--T---------G---CAATTTTTGTTTTT----TTTGG---T------TT--T---------------TT-----------G-TATTT----------------T---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT--------------------------ATAAACAACTA-AAT--AGA-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-AC--------AAC-T-T-----C-A-T-A-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ACC-TTA---A----TG--TAA-A-TAG-----A----T-AGC-A------GT--C---G-AA-----TC-------T--A---AG-----T--------AGTT-T------A-------GATAAA--------A---CTT---TG--ACC--AGAG-TTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----agattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|23 : aacacaaacacatggggtaagGAG-TTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------AT---------A-----G--AAG-------TA-A---------A------TA------C----GT-GT-AAA--A-A-A----AAT-------GCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-----------------------T--T-T---------T---G----TT-TTTAA----------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------TT----T-TA-C-C--------CC-A--T-T-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-------------------------------------------TA-----------TA----C--------------GTG--C-T-ACA-------------------------------------TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAC-TATC-----TT-A--------------TT----CTTTTCT--TCTTT--T-T-TT-G-------------AAAT--T-T-AA--AA-TCT--A--AT------TTTATTTGACTTT-AA-T-TTA--T-TTCA------TT---T---TTT-------AC-T-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATACGAAG-C-C-ACGCCgtta
gi|24 : --A-AA-ATGAAGAGG--GCAT---------T--A--C---G---A----T---GATCC-G-G-------TC----T-TCTC-C--------CC-A--T-GCTGCCT--TT--G-A---A--T-T-TAA-A--AAA-----------AAAAA--AA---
gi|24 : aaAA-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-T-ATA--TA--TACACA--CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----TT---AT--AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-CATGTATTTCTTTC-TT----CTTTTTT--TTTTT--T-T-TT-TTTTTTTTTA----A--T--T-T-AA--AATTCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-ATTTA--T-T-CA-----------T---ATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCC--TGC-TTaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagaaaaaagaaaagattatatatacacactaggggcctagtacattataaataaaattttcgaccaaatatctacatgtatttctttcttcttttttttttttttttttttttttaatttaaaattcgaattttatttgattttaaatttattcatattttttttaaccgcaacaatgtggaagcacatgcttcctgctt
gi|25 : aaaaaatgaagagggcattacgatgatccggtcttctccccatgctgcctttgaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaag-C-GATA-CA--CA-TTTCTT--TAATTTTAA----------ACA----CAGGCATATGGAGGTAAAGGCATCGTAACTTCCTTC------AATT----AAAA
gi|25 : c--------------------T---T-T----A-A--T---------G---CA----------TT----TTG-----T------TT--T---------------TA-----------C-T---T----------------T---A-------A-G--ACATTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----GT---T-----ATAA-CAACTA-AAT--AAG-GTGTGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--CTACATGT-A--C--------T-ATAA-GT--CG-----------A-T-GC-ATC-TAA---AT---TG--AAG-G-AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgcttttaatgcattttgtttttactttaagacattttgtactcttgttataacaactaaataaggtgtgtttttgaattccttgaaagcttaattaaaactacatgtactataagtcgatgcatctaaattgaaggaa
gi|26 : ccgatacacatttctttaattttaaacacaggcatatggaggtaaaggcatcgtaacttccttcaattaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgctGGG--GCGAC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGTCT--TT--G-A---T--T----GA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-TTATA--TA-----------TA----C--------------ATA--T-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-CT-T----AGTATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTTCT--TTTTT--T-T-AA-A-------------A--T--T-G-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTT----A-TT---T-T-C------------T---CTCTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTTGTTCAAA-GC-AC-AT--CC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|27 : --------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--G-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-T-G-------CC----T-TA-C-C--------TC-A--T-G-TGCCT--TT--G-G---T--T-T-TAA-A--AA-------------------GA---T-T-------------------TA-------------------ATA--C-T-AAA----G----AT--AA-------AGA-T--AA--A-A-CA-A-TT-A----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTGTT------TTT--A-T-AT-T-------------A--T--T-T-AA--AC-TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-AC-TT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGTCA
gi|28 : --GCGGG------A-T--A--T---G---A----TCATG-TCT-G-G-------CC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-TAG-A--TA-------------------GA---T-T-G-A--TA--AACA----TTA----C-----------------------ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----ATTATA-TT-CTA---CT---AAC-TATT-----TA-T--------------------CATTTAAAATCTATAAT-A-TT-C-------------A--T--T-T-GA--A--CTT--A--AT------TTT---TAAA----AA-A-AAA--T-T-C-------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GTAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A----------------TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|29 : CAGCGGCG-TA-GC-TAGGGGTAG-GT-A--GATATGGAA-GT-AGAAA-GAGCAGGGAGTTTGGGGGCC-ACCC--AGGTCCT------------Ggtac
gi|3 : CAGTGGCG-TATGC-TTGGGGTAATAT-G--CATATGGAATGCAAGAAA-Gatcgattcccccaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|3 : gatCCCA------------GGAAGCT---GGTG-C-AT--TTCAACAACAACCCCACACCCACTTAA-TTAGATAG-T-------ATCTGT---CAA--GTC-T-CCGATAGCAT-CA-TTT-TT--T---T---A----------ATGGG--TAAA----TG-----------ATCGTAACTTCCTTA------GA------AAAACA-AA--AGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGG----G-------GG-----------------GG--------------GAGTCCATTAGT---------T---T-T----ACT--T---------G---CA----------TT----TTG-----T------TT--C---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGGTTT-TAAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------T-AAAA-TTTTCG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TGA-C-A------AT--C---G-AA-----TC-------T--A---A------------------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------TA-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--A--AT---T-GATAAAT--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--T--A-AA-AACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---G---A----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CC-A--T-G-TGCTT--TT--G-A---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT--Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|3 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactcCA----G----AT--AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A-G--------------TT----ACTTTCT--TCGTG--T-T-A----------------A--A--T-C-AA--A--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---T---TTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-AT-AT--GC-----TTCCG-TGCTTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|30 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggTAACTTTCTTT------CA------AGAAAA-AG--GGGG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GATTGTCCATTAATTAG--------------------T---T-TTAATA-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--TGGGGGGGTGGGGGGGTT-----------A-T---T----------------TT--G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-ATT-T-AAAG--C------T-A--C--------T--AAA-TT--CG-----------A-T-GT-A
gi|31 : aatacaggcgcatggggtaaagaaagt-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-TTATA--TA--CACA----CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----T----AT--AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-CATGTATTTCTTTTCTT----CTTTTTT--TTTTT--T-T-TT-TTTTTTTTTTTTTAA--T--T-T-AA--AA-TCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-----------T---ATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCC--TGC-TT
gi|32 : CAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAT-AT-ATGAATATGGAA-GC-AGAAA-GGG
gi|34 : tt--------------------T---T-T----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T---------------------------A-----------A-C---T-----------------------------------GTTC---T-G-T----CG------CT-T-----TT---T-----ACGA-CAACTA-A-T--TAG-ATGCGTTTTGTGAAT-----TT-CCTTGA-A---------AGC-CAT-----T-A-T-T-AAAtccccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|35 : caaaacaaaaacaaaaaaccccaaaaaacaaaaaacaacaaacaacaaacagataagttcaataagtA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTTCT--TTTTT--T-T-CC-T-------------A--T--T-T-AAGAA--TCT--A--AT------TTCATTTGACTTT-AA-A-TCA--T-T-TAAT----TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAT-GA-TGTTG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|36 : ----TAAG-AT-T----------------TAACTTTTTTC------AA------GAAAAA-AA--AGGG---A---T----------------T----GTCCAATAAT-----------------AA--------------G--------------------T---TAT----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TTTAAAAAATTCTA-T---T----------------T---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-TT------A--T-----TT---T-T---ATAA-CAA
gi|37 : aacacaggcacatagggT--TCTTT--T-AATT-T-------------AGGC--T-C-AA--G--TCT--ATAAT------TTTATT-GACTTTTAA-A-TTA--T-G-------------------TTATTTTTAACGC-GCAGACC-AAATGTGG----AATGC-AC-ATTTGT-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGG-AG-C-TAACGC
gi|38 : acat--------------------T---T-C----A-C--T---------G---CA----------TT-----TT-----T------GT--T---------------TA-----------T-T---T----------------T---G-------AGG--ACGTTT---T---T--A-CT------A--T-----AT---T-T---ATAA-CACATATAATACAAG-AAGCGTTTTCTGAA------TT-CCTT----------------------------------AAA--C------T----T--------T-AAAA-TT--CG-----------ATT-GT-ATC-TAA---A----TG--AAA-a
gi|4 : gtCAGTGGCGGTA--C-TTGGGTT-G-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAATGGGCGAGGGGTT-GGGGGCCGGCCCTAAGCCCc
gi|4 : GGGTCCGGGG--C-G------AGCCCC------------G-AAGCT---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAA------------GTAA-A-AGA-GGTT-------ATTT-T---CAAGAGTC-TCC-GATA-GG--CA-GTT-TCAATAATT---AAAAACAGGACATTGGGGTAAG-AT-TA-----------ACCTT--CTT-TTTC------AA------GAAAAACAA--AGGG---G---A----------------A----A-------AGATTTGTCCATCTAATTTAG--------------T--------------------T---T-T----A-TACT---------G---TT----------TT----TTTTTTTTT------TT--T---------------TT-----------ATT---T----------------T---G-------A-G--A-GTTT---T-GTT--A-CT------AG-A-----TT---T-T---ATAA-CAACTATAAT--TAG-ATGCG---T-TGAA------TT-ACTTGA-A---------AGC-T-T-----TCA-T-A-AAAA--C------TAA--C--------TAAAAA-TT--CG---------------GT-ATCGTAA---AT---TG---AA-T-AAGATTT-A----T-A-CGA------GT--C---G-AA-----TC-------T--ATTGA------T--------G----T--------------AGTTTCCAGATAAAA---CTT---GC--A-C--A-AG-TTC--G------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----CGTTG---T----T--------------AT---------G-----A--ATCGCG----TA-A---------A------TA------C----GTGTCCAAA--A-A-A----TA----------AG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT---G--------------TT--T-TCC-------C---G----TT-T--------------AAA--A--A--ATAA-ATGAGAAGG--TCGGCGAAGCAA-T--A--C-------A----T---G--CC-G-G-------TC----T-TA-CGC--------TC-T--TAG-T-CCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------GATAATCAA---T-T--TG--TA--GGG-----CTT----A--------------TTG--C-T-ACAC---G----AT--TT-------AAA-T--GA--A-A-TCAA-TT-C----A-CATT-TT-CGAATCCC-----A-TATC-----TA-TG-------------TT----CTTTTCT--TCCTT--TGT-TT-T-------------G--CTAT-T-AA--A--TCT--A--AT------TTT-TTTGACTCTTAATA-TCA--T-T-TAGACTTCTT---T---TTTTTTTTATAC-C-GCAAAACGAA-TGTGG----AG-GCGAC-AT--GC-----T--CG-TGC-TTCAATAGGAAG-CAT-ACGCaatggtcatgcagagccctgtggcgggtccggggcgagccccgaagctggtgcattttagacaagtaaaagaggttattttcaagagtctccgataggcagtttcaataattaaaaacaggacattggggtaagattaaccttctttttcaagaaaaacaaaggggaaaagatttgtccatctaatttagttttatactgttttttttttttttttttattttgagagttttgttactagattttataacaactataattagatgcgttgaattacttgaaagctttcataaaaactaactaaaaattcggtatcgtaaattgaataagatttatacgagtcgaatctattgatgtagtttccagataaaacttgcacaagttcgaagcacattcgttgttatgaatcgcgtaaatacgtgtccaaaaaataagttaatctaattgataatgttttcccgtttaaaaaataaatgagaaggtcggcgaagcaatacatgccggtcttacgctcttagtcctttgatttaaaaaaagataatcaatttgtagggcttattgctacacgatttaaatgaaatcaattcacattttcgaatcccatatctatgttcttttcttcctttgttttgctattaaatctaatttttttgactcttaatatcatttagacttctttttttttttataccgcaaaacgaatgtggaggcgacatgctcgtgcttcaataggaagcatacgc
gi|41 : cagtggcggtacttgggttgattaatatggaagcagaaatgggcgaggggttgggggccggccctaagcccaatggtcatgcagagccctgtggcAAG-AT-T----------------TAACTTC-TTC------AA------GAAAAA-AAT-GGGG---G---G----------------G----G-------GG-----------------GT--------------G--------------------T---C-C----A-T--T---------A----A----------TTAG--TTT-----TATAGCATT--T---------------TT-----------G-T---T----------------T---G----------------TT---T-G-T--T-TT------TT-G-----TT---T-T---
gi|42 : taaacacaggcacttggggtaagCG-TA-GC-TCGGGTT-G-AT-G--AAAATGGAG-GC-AGAA---GACAGGG--TTTGGGG-CC-GCCCTAAGGCCCC------------ATAGGCt
gi|43 : cagttgc--------------------T---T-T----A-C--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------T--------------------------------A-C---T-----------------------------------GTTC---T-G-T--A-CA------GC-T-----TT---T-T---AGAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-Cgtcaagggcaggcctaggggcgaagcccccggaagc
gi|44 : aaaaaacaaaaaaaacaaacaaacaagatagttcataagtCT--A--AT------TTTATTTGACTTT-AA-A-T--------CA------TT---TAAATTTTTCTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GG-----TTCCA-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|45 : GGGGCC-GCCCTAAGATTCCCAATGGGTCCAGGGAAGCG---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAA------------TTAA-G-AGA-GG-T-------ATTT-T---CAA-AGTTAC-C-AATA-CA--CA-TTT-tacgc
gi|46 : T------TTTATTTGACTTGAGA-T-TTA--T---CA------TT---A---TTTT------GC-C-GCAAG-C-AA-TGTGA----AA-GC-AC-AT---C-----TTCCGTTGCTTTC-ATACGACGCC-T-ACGCC
gi|47 : c-AA--A--TATC-A--AA------TTTAT--GACTTT-AA-A-TTA--G-T-C-------------------TCATTTTAC-CAGCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-TT--GC-----TT-CG-TGC-TTC-ATAGGA---C-T-ACGCc
gi|49 : --T-T-AA--A--TATCAA--AT------TTTATTTGACTTT-AA-A-TTA--TCT-CA------TT---T---TTT-------AC-C-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTTCG-TGC-TT
gi|5 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCA
gi|51 : gacgttacaattttgcaacatatgcacattcttgttaaagttctctaggcgagtcaaaaaataacattatctaaattagaatcatttctatttccttcaaaacaaaacttctgatattttcacggtccaagcattacttgcacataacaatgttttcaggtggtggttgggagggagggggtggggttgaagtggaatttcagaacggggaggagggtagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaattcttacaaacaagaggttatctttatttttatcaaaagcttatacaaacaatttaaaaaaaaagaatcattcggggtgggggctggggtgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgagcatgtttaccgatagtatttacggtaaaagttttatatcctgcaggccagacgcctaagtcgaatttcatgtgccacttttgacagtggtgatattatttctacacaaataaaaaacaagtttattacagaatctctcagttattgaaaaataaaaccaactttttaatgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-A
gi|52 : tgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGAAAGGGGTTTGGGGGCT-G
gi|55 : CAGCGACG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATGG-A-GC-A
gi|56 : ttttttctattaaccg-----------------GG--------------T--------------------T---T-T----A-C--T---------G---CA----------TT----TTG-----T------TT--T---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------C
gi|57 : cattGGTG-TA-AC-TTAGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-
gi|6 : cattCAGTGGCG-TA-GC-ATGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAAGGGGTTTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAGCCT---GATG-C-A---TTTAG--ACA-------------TTAA-A-ATA-GG-T-------ATTT-T---CAA-AGTC-T-C-GATA-CA--GA-TTT-TT--TAATT---A----------ACT----TAA-----TA-----------ATCTCCCCCCCCCCC------AA------AAAAAA-AA--AGGG---G---G----------------G----A-------GG-----------------GG--------------G--------------------T---T-T----C-T--T---------G---CA----------TT----TTT-----T------TT--T---------------TC-----------A-T---T----------------T---G-------A-G--ACATTT---T-G-T--A-CTAGATATCTAT-----TT---T-T---ATAA-CAAATA-AAT--TAG-ATGCATTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AAAT-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------GT--CTTCG-AA-----TT-------T--A---A------T--------A----T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------TA-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAA--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCAGT------A-T--A--C---C---A----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--A-T-TGCCT--TT--G-A---T--T-TAAAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------CTG--C-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GG--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTTCT--TCTTT--T-T-TTCT-------------A--T--T-T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TCA--T-T-CAATTTTTTT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-ACTAT--GC-----TT------------ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|60 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-AC-AG
gi|61 : tCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATAGAA-GC-A
gi|62 : tGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCTG-TGC-TTC-ATAGGAA
gi|7 : ----TAAA-AT--G-----------ATCGTAACTTCCTTA------GA------AAAACA-AA--AGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGG----G-------GG-----------------GG--------------GAGTCCATTAGT---------T---T-T----ACT--T---------G---CA----------TT----TTG-----T------TT--C---------------TA-----------A-T---T----------------T---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGGTTT-TAAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------T-AAAA-TTTTCG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TGA-C-A------AT--C---G-AA-----TC-------T--A---A------------------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------TA-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--A--AT---T-GATAAAT--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--T--A-AA-AACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---G---A----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CC-A--T-G-TGCTT--TT--G-A---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT--Act
gi|7 : tggggCA----G----AT--AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A-G--------------TT----ACTTTCT--TCGTG--T-T-A----------------A--A--T-C-AA--A--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---T---TTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-AT-AT--GC-----TTCCG-TGCTTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|8 : tggggtaaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcagg--------------------T---T-T----A-T--T-------------CA----------TT----TGT-----T------TT--T---------------AT-----------T-T---T----------------T---G-------A-G--ACGTTT---TTG-TTTG-CT------TC-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT---AGTATGTGCTTT--GAA------TT-CCTTGATA---------GGC-T-T-----TTA-T-T-AAAAAAC------T-AACT--------T-AAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---TT---TG--AAA-A-AAG-----A------A-C-A------AT-----AG-AA-----TC-------T--A---A------TTA------G----T------ACGGTGATAGTTTCACGATGAAA---CTT---GG--G-C--AGAG-TTCGGA------------AGC-CATGC--------------A------T-----T-----GGTGGCATTACCGT--------------GT---------A-----A--A------------A---------A-------------------------AAA--A-A-A----AAT-------GCGG--TTAATTT--A--AT---T---T-AAT--AA--------------TTATT-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG---CGGC------A-T--A--CCGGA---A----T---G-TCT---G-------TC----T-T--C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TTTGG-A---T--T-T-AAATA--AAA-----------ATTTA--CA---T-T-ATATTTA--CAC-----ACA----A--------------TTG--CTT-AC-----G----AT--TA-------AGA-T--GA--A-G-TC-ACTT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TATT--------------TT----CTTTTCT--TCTTC--T-T-TTAA-------------A--T--TAT-AA--AT-TCT--A--AA------TTTATTT-ACTTTAAA-A-T----T-T-CA-----------------TTTTTTTCAC-C-GC--AAC-AC-TGTGG----AG-GCAAC-AT--GC-----TTCCG-TGT-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|9 : aacacaggcacatgggtaagaagatccgtaacttaattctttcataaaaagaaaaaaaaagaaaaaaagatttgccatctgtt-----------ATCGTAACTTCCTTC------AATTT---AAAAAA-AA---------------------------------------------------------------G--------------A--------------------T---T-C----A-T--TTAATA----GTTCCA----------CT----GCT-----T------TT--T---------------TG-----------A-TATTT----------------T---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--AACT------CT-T-----TT---T-T---ATGA-CAACTA-GAT--TAG-GTGTGTTTT-TGAA------TT-CCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-AAT-T-AAAA--C------T-A--C--------T-AGAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T-A-C-A------AT--C---G-AA-----TC-------T--A---AG-----T--------ACTTTT------A-------GAT-----------AAAGCTT---AG--A-T--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--C--------------A------T-----T-----AAG-----T----TGTTATGATTAGA--GT---------A-----A--A---------TATA---------A------A-------T----GT-C---AA--C-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-AAT-CAT--AAGATTTTGGGTTAGTTT--T-T---------T---GTTTTTT-T--------------TAA--A--C--A-AATATATA----------T------A-T--A--C-------A----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-T-TGCGT--TT--G-ATATT--T-T-GA---------------------------------T-ATA--TT--GAT-----AAA----C--------------ATA--A-T-ACA----G----ATAAAA-------AGA-T--GA--A-G-CC-A-TT-C----AGCATT-TT-TGA---CC---AAA-TATT-----TA-A--------------TT----ATTTCTG--TCTTT--A-C-AT-T-------------A--T--T-TAAA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-------T---T---TTTTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-CC-AC-AT--GC-----TTGTG-TGC-TTC-AGAGGAAG-C-T-ACGCCac
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AAGAGCAAGAGTCACGAATAGATCCAAAATGGACGCCATTTGCTGAGACAGTTGATATCATTTCATAGATCAGTAGATCAAGAAAAGTGTTAATTTTCAAATATACTTCCCTTTTTCGATATCGTATCAATTTATTTAGTTATATAGACGTTTCAAAGTTAGTCATTTGTTATTTCTTGGGCCAATTTTTGTTTTTGACGTAAAACACTTTTACAACGTATGTATCTAGTATCAAAACATATACATATATATTCGTCATTTCTTTACATACAAAAATCTAGATTATGTTCACTGTTCCAGACTCACTACTTTGTCACTTTGCAATGTTTTTCAAGAGTGGTGGTTGGAAAGAACGGGGGAGGGTGATCGTTGCTGTATCTAACGAATTTCAAGAAGAGGAGGGGTGGGTGTGTAGAAAGGTCAGGGGGTATAACAATTCTGCATTGAAACTCCTTTAGTGGATCTTCAGGTAGACGAGTTATTAAAAGGCAATAGGTAAGGTGATATTTAATTATTTTTAATCA
Unaligned ( gi|33 ): TCAGGAATTTCAGAAACAGTGGGAGGGGGAGAAGGTGAGTTGCTTGAAGCTCCCAGAGGACAGAGCGAGACCCCCGGAAAGCTGACACATTCTCTACACAAGCAAAAGTTTTTATTTTTAATTTTTTTAAGAAATGCTTTGTTCGGCACAAACACTTTTTTAAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CCCCAGTAGGTCCAGGACAGAAACCCTGTTTGTGGGCCAGCAGGGGCGAAGGCCCCCGGGAAGCAGCATGGAACTTCTTTTACAAGAACGATTTCGCTAAACATTTTTATTTTTTA
Unaligned ( gi|40 ): GGGGTCTGGCAGCCGCTTAAAAATAGGCCGCCCAGTGGGTCAGAACTTGCCCTATATAGTAGCCTAGGGGGTCCAGGGGGCGAAGCTCCCGGAAACTGAGAGGTTTTAGAATTC
Unaligned ( gi|48 ): GGCGAAGCCCCTGAAAGCTGACAAATTCTTACAAACAAGAAGTTTTTGTTTTATCAAATGCTTGTTGTACAAACAAAATG
Unaligned ( gi|50 ): AAGGTACTAGTATGGGAGCCGCCCTAAGGCCTTGGTGAGTCCAGGACAAAGCCTTGGTTGAGGCCCTGGGGGC
Unaligned ( gi|53 ): TTGGGGCTGCCATGAGACCAGCCCCGAGGGTCCAGGACTAAGTCCTAGTAGGGGTCCAG
Unaligned ( gi|54 ): TAAATTCTTACAAGCAAGAGGTTTTTAAAAAATTAAATGCTTGTTGTACAAACTA
Unaligned ( gi|58 ): TGAGTATGAGTACGGTAAAAGTTTTATAACCTCCAGGCC
Unaligned ( gi|59 ): AGGTGCATTTGACTATTTCAAAAGGTTCCCGAACCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111111111111 111 1 111 44444444444444444444 2222222 1 111 111 5555555555555555555555555555555555555 222222222222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111 1111111 111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 222222222222222222 111111111111111111 22222222222222 11111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 1111111 33333333333333333333333 33333333333333333333 11 1 44444444444444444444444444 11
lowQualScore : 2 2 2 2 6666 2 2 44 0 00 1 3 0 2 888888888888 777 0 5 999 0 66 22222222222222222222 5 6666666 5 888 55 5 3 4 111 4 4 66 66 111 6666666666666666666666666666666666666 22 5555 1 000000000000000000 444 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 333 1 1 44 1 222222222222222 666666666 1 5 22 1 5 666666 3 1 999999999 1 3 3333333 3 1 3 66 555555 2 44 99999999 4 55 99999999999 2 2 2 2 333 3333 55 2 2 999999999999999 2 2 1 8888888 55555 2 7777777 33 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55 2 2 6666 00000000 33 33 33 333 2 6 111111111111111111 22 2 444444444444444444 2 66666666666666 33 33 33 2 2 333 555555555 1 22 44 666 4444 333 1 00000000000 7777 1 5 1 99999999 1 44 1 1 44 55 1 555 77 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 222222222 6666 8888888 2 77 22 2 2 22 4 2 4444 2 2 4 666 333 33 00000000000000000000000 4444 333 33 55555555555555555555 66 55 2 22 11 44 22 555555 22 4 1 1 00000000000000000000000000 0 4444 1 1 66 1 5 3333 1 3 1 22 44444 1 5 2 2 2 2
lowQualScore : . . . . .... . . .. . .. . . . . ............ ... . . ... . .. .................... . ....... . ... .. . . . ... . . .. .. ... ..................................... .. .... . .................. ... .......................................................................................................................................................................................................................... .. ... . . .. . ............... ......... . . .. . . ...... . . ......... . . ....... . . . .. ...... . .. ........ . .. ........... . . . . ... .... .. . . ............... . . . ....... ..... . ....... .. .................................................................................................................................................................................................................................................... .. . . .... ........ .. .. .. ... . . .................. .. . .................. . .............. .. .. .. . . ... ......... . .. .. ... .... ... . ........... .... . . . ........ . .. . . .. .. . ... .. . .................................................................................... . ......... .... ....... . .. .. . . .. . . .... . . . ... ... .. ....................... .... ... .. .................... .. .. . .. .. .. .. ...... .. . . . .......................... . .... . . .. . . .... . . . .. ..... . . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 9999 2 2 44 9 33 4 6 7 8 666666666666 555 0 0 666 5 99 11111111111111111111 0 2222222 0 888 11 0 3 4 777 4 4 99 66 777 7777777777777777777777777777777777777 99 7777 5 666666666666666666 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 000 7 7 11 7 999999999999999 555555555 9 5 55 8 2 777777 5 9 555555555 9 8 0000000 8 9 8 88 888888 0 88 22222222 0 55 55555555555 0 0 0 1 777 9999 88 1 2 333333333333333 4 4 5 0000000 66666 2 2222222 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 2 2 9999 44444444 11 11 11 999 2 7 999999999999999999 99 1 333333333333333333 4 88888888888888 22 22 11 2 2 555 999999999 9 66 55 777 0000 333 9 22222222222 5555 8 5 8 11111111 8 33 8 8 55 22 9 222 11 9 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 555555555 7777 2222222 1 11 99 1 1 66 2 1 5555 2 2 4 666 777 44 99999999999999999999999 5555 333 11 11111111111111111111 55 33 1 99 33 88 88 555555 22 4 9 9 44444444444444444444444444 4 0000 9 9 33 9 7 9999 8 6 8 55 55555 8 5 1 4 4 4
consensus : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--CA-TTT-TT--TAATT---AA----------TT----TAAG-AT-TG-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----A------AAAAAAAA--AGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TN-----------AT---TT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---A------T--------A--------T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-T-------------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
Reference ( family-2559 ) : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--CA-TTT-TT--TAATT---AA----------TT----TAAG-AT-TG-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----A------AAAAAAAA--AGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TN-----------AT---TT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---A------T--------A--------T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-T-------------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|1 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAG--CCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GGTGATCTTTATTT-TTATCAA-AAGC-TT-G-TA-CAAACAATTT-TT--TAA
gi|1 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-ATAT--AATATGGAA-GC-AGAGA-Gaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaatataatatggaagcagagag
gi|10 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgagcccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaacaattttttaaaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactac----AT----T-----G--------CA----------TTAAGATTT--T------TT-------------------------------------------------A-G--ACGTTA---T-T-T--A-CT------AT-A-----CTGAGT-T---ATGA-TAACTATAAT--CAT-ATGGCTTTC-TTAA------TT-CTATCG-A---------AGC-T-T-----T-A-T-TCAAAA--C------T-A--C--------TAAAA-T---------------------C-ATC-CAA---TT---T----------AG-----A----T----G-C-A-T---C---GAA-----T-T-------T-------------T--------A--------C------C-------AGT----------------TT---TA--A-T---GAA-TTCA-A------------AAA-CA--C--------------ATTTAATT-----T-----AGTTG---T----T--------------AT---------A-----A--G---------A-----A-A---------A------CTACAATAC----GT---CAAAC-A-A-A----AAA------TGCAG--TAAAGCT--A--ATGCATGGAT-AAT--CG--------------GT--T-TGTTGCATTAT---G----TT-TTTAAATTTTTTTAAAAA--A--T--A-AA-TTGAAGGAA--AT-----------T--A--C---GA----T---G-TCC-
gi|10 : aa--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------GT--T---------------T--------------------------------G--ACGTAT---T-G-T--A-GT-------T-T-----TC---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAA-ATGTGTTTT-TGAA------TT-C------------------------------A-T-T-AAAA--C------T-G--G--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GC-ATC-TAA---AT---TG------G-ATG-----AT---T----T-T-AGT--------AG-----T-T-------TTGA---A------T--------A---------------A-------AG----------------CTT---CG--A-T--AGAA-TTAAGA------------AAGCCA--T--------------A------TGATTAT-----AGT-----TA---TCATAACTCAGTATAGT---------A-----A--A---------T-----A-A------------------------C----G--TCTAAA--A-A-ATCTTAA-------TGCAA--TTA--CT--A--A------GA--AATCCAA--------------GT--T-T---------T--------TT-----------------------------AA-ATGAA-GGG--GCGGG------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------CC----T-GA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCC--TT--G-A---T--TCT-AAA-T--AGATTGTCATTTTTAAAGA--CA---C-T-A-----A--GAC-----CAA---------------------G------ACA----G----AT----AA-------AGA-T--------A-TA-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---AC---AAA-TAAT-----TA-T--------------TT----C---------------T-G-TT-T-------------A--AT--C-AA--A-------A--A-------TTCA--TAAC-ATTAA-A-TTA--C-T-TA------------------ATTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-------------------------GC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCtactaagaaatccaagttttttaaatgaaggggcgggatacgatgtccggcctgaccccatgtgcccttgattctaaatagattgtcatttttaaagacactaagaccaagacagataaagatataattcagcattttcgaacaaataattatttctgtttaatcaaaaattcataacattaaattacttaattttttaccgcaacaatgtggaagcttcataggaagctacgcc
gi|12 : aaggacatcgtaatttccttcaatttattttttaaaaaaatttaaaaacataatgcaacaaaccgattatccatgcattagcG-----------ATC-GTGACTT----CCTTG------G----G------GAAAAAAA--GGGG---G---G----------------G----G-------GGGTCCATTATTAG--------------T--------------------TT---------------------T----AC----A-----G--------CA----------TT----TTT--AAAA---TT--T---------------TA-----------TT---TT---G-------A-A--ACGTTT---T-G-T--A-TT------CT-T-----TT---T-----ATAA-CAACTA-AAT--GAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCCTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--A------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TG--AAA-G-AAGATGACA----T----G-C-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---AG-----TAGTTTTTGA--------T------A-------AA------------A---TTT---GG--A-C--AGAG-TTCAG-------------AAG-AA--C--------------G------T-----T-----AGT-----T----G--------------TT---------A-----A--AAAATTAGAGT-----A-A---------A------CA------T----GTGTC---A--A-C-A----AAT------TGCAG--T-----T--G--AT---T-GAT-AAT--TA--------------TT--T-T---------T---
gi|12 : aacacaagcacatgtggcaagaaC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-C-------TC----T-TA-C-T--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---TC-T-T----------A-----------AAAAA--GATTTT-T-ATA--TACGAGCACATACTA----CAATTCAATTTCAGTTTA--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATacacggtaaaggctatctatagcctccacctttttacatacgatgtccgctcttactccatgtgcctttgatcttaaaaaagatttttatatacgagcacatactacaattcaatttcagtttactacagataaagatgaaatcattcagcat
gi|13 : aacacaagcacatgtggcaagaagatcgtgacttccttggggaaaaaaagggggggggggtccattattagttttacagcatttttaaaattttattttgaaacgttttgtattctttttataacaactaaatgagatgcgtttttgaattccctgaaagctttattaaaaatactaaaattcgatgtatctaaaatgaaagaagatgacatgcagtcgaatctaagtagtttttgataaaatttggacagagttcagaagaacgttagttgttaaaaaattagagtaaacatgtgtcaacaaattgcagttgattgataattatttttacacggtaaaggctatctatagcctccaccttttta----TAAG-AA--G-----------ATC-GTAGCTT----CCTTTTAATTTA----A------AAAAAAAA--AAGGTTCGTCTA----------------G----G-------TTA----------G--------------T--------------------TT---------------------C----AC----T-----T--------CC----------TT----TTT--T------TT--TTTTCTTCAGTTTTTTTA-----------AC---TTAT-G-------A-G---CGCTT---T-G-C--A-CT------CT-C-----TT---T-TTCAATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTC-T---------TT-TCTT
gi|13 : aacacagcacatggggA-----T-C-------T--C---A------T--------A---------------A-------A-------------A---CTT---GG--A-G--AGAC-TTCACG------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T-------------------AT---------A-----A--T---------T-----A-G---------A-------------------GT-------------A----AAT-------ACA----CAATCT--A--AA---T-GAT-A-T--A---------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--G-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------T-A--A--C---GA----T---G-TCC-T-G--------C----C-TA-C-T--------CT----T-G-TGCCT--TT--G-G---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T-TCA------------------------------------ATA--C-T-AAA----A----AT----AA-------AG--------------C-A--------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----GTGTT------TTT--TAT-AT-T-------------A--TT--T-AA--C--TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-AC-TT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGTCACttttttttttatctcataaaacttggagagacttcacgaagcacattagttataattagagtaaatacacaatctaaatgatatatttttgtttaaaatgaaatgaagggggcggctaacgatgtcctgcctactcttgtgcctttggttttaaaaagatttcaatactaaaaataaagcatttcgaccaaatatctatttgtgttttttatattatttaactctacttttatttgactttaaaaccgcaacattgtgaagcacttgcttccgtgcttcataggaagctacgtcac
gi|14 : aacacagcacatggggtaagaagatcgtagcttccttttaatttaaaaaaaaaaaaggttcgtctaggttagtttcacttccttttttttttttcttcagtttttttaacttatgagcgctttgcactctctttttcaataacaactaaattagatgcgtttcttttcttttttttttttT--T------AT--T---------------TC-----------AT---TT---GTAAATAAA-GGCACATAT---T---T--A-CT------CT-A-----GT---T-----ATAA-CAA------T--TAC-ATGTGTTTC-GGAAACCGAGTT-C--TGA-ACTCTATCCAACC-T-T-----C-A-TCT-AAAA--C------T-A--C--------CTAAA-TT--CT-----------A-TTGT-ATC-TTC---TT---TC--AAT-T-TAG-----A----C----A-C-A-T---C---AAA-----TGT-------T--A---G------T--------AGTTTTATTT------A-------AG----------------CTT---TG--G-T--GGAA-TTCAAA------------AAA-CA--C--------------A------TC----T-----AAT-----T----TA-------------GT---------T-----GTTA---------T-----A-A---------A-------------------GTCTTTAAA--A-A---------------TACAT--TCAAACT--G--AT---G-GAT-AAT--G---------------TT--G-T---------T---T----TT-T--------------AA------T--------TGAAGAAA--GT-----------T--A--T---GG----T---G-TCC-----------------T-TG-C-C--------CCCA--T-G-TTCC----T--G-AG--T--T-T-AAA-ATTAAG-----------AAA
gi|14 : tccgtacacaaGTTTGAAT-G-T--A-TT------TT-TAAAGACT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGTGTTTTTTGAA------TT-CCACCA-A---------AGC-T-T-----A-A-A-T-AAAA--C------T-A--C--------TAACA-TT--TG-----------A-T-GT-GTC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---A---GAA-----T-T-------T--AG--G------T--------AGTTT----T------A-------GATGAA--------G---GTT---GG--A-T--AGAG-TTCAGAACTCGGTTTCCGAAA-CA--C--------------A------TG----T-----AATTG---T----T--------------AT---------AACTAGA--G---------T-----A-A---------ATATGTGC-------CTTTATT-TACAAATGA-A-AT---AAT------TGCAG--GT-ATCT--A--AT---T-GAT-AAT--CA--------------TT--T-T---------T---G----Tttgcaggtatctaattgataatcatttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|15 : tccgtacacaatttcttaattttaaactcaggaacatgggggcaaggacaccataactttcttcaattaaaaaacaacattatccatcaATTA-ATT--TAA-ATGCATATT-T---------TT---TTGA-A---------CGT-TGT-----T-G-T-T-A-----C------TCA--CA-------TAAAA-T---CG-----------G-T-----TC-AAA---AT---TG--AAA-G-AAGTTGGCA----TT---A-T-AGTATCT---GAAGAGCTT-A-------C--A---G------T--------A--------TTC----A-------AAC-----------A---CTT---GGCGA-CTCAGAG-CTCAGA------------AA--CA--CT-------------A------T-----T-----A-T-----T----T--------------GTTATCACTAAA-----A--G---------T-----A-T---------A------CTA-----C----GT-GTAAAA--T-ATA----AAT------C-CAG--TTAATCCTGG--AT---T-TGT-ATT--AA--------------CT--TATG--------T---G----TT-TTG------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGAG--GCAGC------A-T--A--CCTACA----T---G-TCC-C-G-------TC----T-TA-C-C--------CA-T--T-G-TGAC----T--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA------------T-AT----------------TA----C--------------TTG--G-C-ACA----GT---ATAAGGAA-------GGA-TGGGA--A-ATTC-A-TT-CGTATGACATT-TT-CGA---TCTGGTAA-TATC------A-TA-------------TT----CCTTT--CTTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|16 : aaaaaataaaatgtctATTA-ATT--TAA-ATGCATTTT-T-------------TTTAG-A---------CGT-T-T-----T-G-T------A--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----G-C-AGT---A---GAA-----T-C-------T--A---AGTAGTTTCAG-----A--------T------A-------AA------------A---CTT---GG--A-C--AGAG-CTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------ATCACTA----A-----A--G---------T-----A-A---------A------TA------C----GT-GTCAAA--A-A-A----AAT------C-CAG--TTAACCT--G--AT---T-GAT-AAT--TA--------------TT--G-T-------------A----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG---CAGC------A-T--ATAC---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGACT------G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA----------T-T-ATA--TA-----------------C--------------TTG--G-C-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AACATT-TT-CGA---CC---TAA-TATC-----TA-T--------------TT----CCTTT--C
gi|17 : ttttctttaattttaaacagatcataaattctctaaaaaataaaatgtct-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----ATT----AAAAAAAA--CAAC---A-----------------------------------------------------------------------------------T---------------------T----A-----T-----C--------CA----------TT----AGT--T------TGAAT---------------GC-----------AT---TTCTGG-------A-G--ACGCTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGTGGTTT-TAAA------TT-TCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--C------T-T--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAATACATGTATG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---A---GAA-----T-T-------T--G-----------------------------------A-------AG----------------CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--CGTGTAATTGTTATAA------C-----T-----AGT-----A----T--------------AT---------ATAG--A--G---------T-----A-A---------A------TA------C----GTGTAC-AA--A-A-T----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--CA--------------TT--T-T---------T---GT---TT-T--------------TAA--A--C--A-AA-ATGAAGGGG--GTGGG------A-T--A--C---GA----T---G-CCC-A-A-------TCAAGAG-TA-C-C--------CC-A--T-G-T
gi|18 : aacacaggcacatgggggtaaggacAAGCCCCC------------GGAAGCT---GCTG-CAAT--TTTCG--AC-A------------TTAA-G-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-AC-GATA-CA---A-TTT-CT--TTAT
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctggggga----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--GT--G-T---T--C-T-AGA-T--AAA-----------GAA-----A---T-T-GTA--Tctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacg---------------------T----AC----T--------------CA----------AT----TTT--T------GT--T---------------TG-----------TT---TT---G-------A-A--ACCTTT---T-TCT--A-CT------CG-T-----TT---CAT---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTA-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGCTT-T-----T-A-T-CAAAAA--C------T-A--C--------TAACA-TT--CGATAAACGGTGCA-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-ACG-----ATATGT----A-C-AGT---C---GGA-----T-C-------T--agtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|19 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacgatacaatttctttatctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttaTT-TGAA------TT-CCGTGA-C---------AGC---G-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--CACGTTAAGTAAAAGTT--CG-----------A-T-GCAATC-TAA---AT---TG--GAATGTAAG-----A----TA---A-C-AGT---C---GAA-----T-CCTATTAGT--A---G------T--------A--------TTGATAAA-------AAA-----------A---CTTAGAGG--A-A--AAAGATTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------C-----T-----AGT--------------------------T---------A-----A--A---------------------------------------------------CTAGA--ATA-A----AATATAACATACAGATTCAATCT--AAGAT---T-AATAAAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TTAC--------------AAT--A--TAAA-AA-ATTAAGGGG--GCGGC------A-TAAA--C---GAAAATT---C-TCT-A-T-------GC----TATA-C-CGT------CT-AATT-T-TTACT--TT--G-A---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---TGT-ATA--TA-----------CA----T--------------GTG--T-TGAAA----GGAATAT----AATACT---AAA-C--AA--A-A-T--A-TTCC----AGCATT-TC-CGA---CC---AAT-TATC--------T--------------TT----ATTTT--CCTGTTT--T-T-
gi|2 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAAGCCCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GGTG------ATCT-T---TA-----------------------TT-TT--TA-TC---AA-----------------AAG-CT-TG-----------TAC-AAAATTT------TTT------A----A------AAAAGAAATCACGG---G---G----------------GGGTTG-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------a
gi|2 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAGA-Ggaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaataaatatggaagcagagag
gi|20 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgaagccccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaaattttttaaaaaagaaatcacgggggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactac-------C----GTGTCCAAA--A-A-A------T------TGCAA--TTAAT----A--AC---T-----------A--------------TT--T-T---------CTGGG----GT-T--------------AAACAACCT--A-AT-ATGAAGGGGCGACGCC------AGT--AA-C---GA----T---G-TCCCG-GCTCTCCTTC----C-TA-C-CTCCCCGAACC-C--T-C-TCCCTA-TTCCG-G---T--T-----A-A--AAT-----------AGAAA--GA---T-T-CTAATTA--GGC-----CT--------------------GGG--C-T-TCACCGGA----AT----GA-------AGAGT--GACTACA-TCTA-TT-C----AGCAATATT-CGAAG-CC---AAAATATGAGTGGTA-T--------------TTTCACCTTCT--CTCTTTT--T-T-TT-TCCCAT--------A--TT--T-AA--A----T--A--ATAAGAAATCT-TTTGA-----GA-A-TCAGTT-T-CT------TTTTAT---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-AA-AT--GTTCCCGTCCCG-TGC-TTC-
gi|21 : CAGTAGC--TA-GCGTTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCTGGGGGTTT-GGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------
gi|21 : gttttaatGGGGGTCCAGGATGC-G----AAGCTCCC------------GGAAGCA---GGTG-C-AA--TTTAG--ACA------------------------------------TT-T---CAA-AGTC-TCTGATA-CA--CA-ATT-TT--C-ATT---AA----------TT----Taatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgatacacaattttcattaattttaaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|21 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgat-------TC----T-TA-C-C--------CC-AT-T-G-TGCCTAGCT--GTG---T--T-T-AAA-A--TTA-----------ATGAA--AA---T-T-GTG--TA--taaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|22 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgaAAG-AT-T-----------------TAACTT----CTTTC------A----AGAAAACAAAAAAAA--AGAG---G---G----------------G----GAGGGGAGGGG----------G--------------GAGGATTGTCCAATAATTAGTTT---------------------T----AC----T-----G--------CAATTTTTGTTTTT----TTTGGT------TT--T---------------TT-----------GTATTTT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT--------------------------ATAAACAACTA-AAT--AGA-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-AC--------AAC-T-T-----C-A-T-A-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ACC-TTA---A----TG--TAA-A-TAG-----A----T----AGC-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---AG-----T--------AGTT-----T------A-------GATAAA--------A---CTT---TG--ACC--AGAG-TTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----agattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|23 : aacacaaacacatggggtaagGAG-TTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------AT---------A-----G--AAG-------T-----A-A---------A------TA------C----GT-GT-AAA--A-A-A----AAT-------GCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-----------------------T--T-T---------T---G----TT-TTTAA----------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TT----T-TA-C-C--------CC-A--T-T-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-------------------------------------------TA-----------TA----C--------------GTG--C-T-ACA---------------------------------------TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAC-TATC-----TT-A--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-G-------------AAATT--T-AA--AA-TCT--A--AT------TTTATTTGACTTT-AA-T-TTA--T-TTCA------TT---T---TTT-------AC-T-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATACGAAG-C-C-ACGCCgtta
gi|24 : --A-AA-ATGAAGAGG--GCAT---------T--A--C---GA----T---GATCC-G-G-------TC----T-TCTC-C--------CC-A--T-GCTGCCT--TT--G-A---A--T-T-TAA-A--AAA-----------AAAAA--AA---
gi|24 : aaAA-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-T-ATA--TA--TACACA--CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----TT---AT----AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-CATGTATTTCTTTC-TT----CTTTT--TTTTTTT--T-T-TT-TTTTTTTTTA----A--TT--T-AA--AATTCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-ATTTA--T-T-CA-----------T---ATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCC--TGC-TTaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagaaaaaagaaaagattatatatacacactaggggcctagtacattataaataaaattttcgaccaaatatctacatgtatttctttcttcttttttttttttttttttttttttaatttaaaattcgaattttatttgattttaaatttattcatattttttttaaccgcaacaatgtggaagcacatgcttcctgctt
gi|25 : aaaaaatgaagagggcattacgatgatccggtcttctccccatgctgcctttgaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagC-GATA-CA--CA-TTTCTT--TAATTTTAAA----------CA----CAGGCATATGGAGGTAAAGGCATC-GTAACTT----CCTTC------A----ATT----AAAA
gi|25 : c--------------------TT---------------------T----AA----T-----G--------CA----------TT----TTG--T------TT--T---------------TA-----------CT---TT---A-------A-G--ACATTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----GT---T-----ATAA-CAACTA-AAT--AAG-GTGTGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--CTACATGT-A--C--------TATAA-GT--CG-----------A-T-GC-ATC-TAA---AT---TG--AAG-G-AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgcttttaatgcattttgtttttactttaagacattttgtactcttgttataacaactaaataaggtgtgtttttgaattccttgaaagcttaattaaaactacatgtactataagtcgatgcatctaaattgaaggaa
gi|26 : ccgatacacatttctttaattttaaacacaggcatatggaggtaaaggcatcgtaacttccttcaattaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgctGGG--GCGAC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGTCT--TT--G-A---T--T----GA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-TTATA--TA-----------TA----C--------------ATA--T-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-CT-T----AGTATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTTTTT--T-T-AA-A-------------A--TT--G-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTT----A-TT---T-T-C------------T---CTCTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTTGTTCAAA-GC-AC-AT--CC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|27 : --------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--G-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-T-G-------CC----T-TA-C-C--------TC-A--T-G-TGCCT--TT--G-G---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T--TA------------------------------------ATA--C-T-AAA----G----AT----AA-------AGA-T--AA--A-A-CA-A-TT-A----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTGTT------TTT--A-T-AT-T-------------A--TT--T-AA--AC-TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-AC-TT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGTCA
gi|28 : --GCGGG------A-T--A--T---GA----TCATG-TCT-G-G-------CC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T----------T-----------AGATA--GA---T-T-G-A--TA--AACA----TTA----C-----------------------ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----ATTATA-TT-CTA---CT---AAC-TATT-----TA-----------------T----CATTTAAAATCTATAAT-A-TT-C-------------A--TT--T-GA--A--CTT--A--AT------T---TTTAAA----AA-A-AAA--T-T-C-------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GT--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A----------------TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|29 : CAGCGGCG-TA-GC-TAGGGGTAG-GT-A--GATATGGAA-GT-AGAAA-GAGCAGGGAGTTTGGGGGCC-ACCC--AGGTCCT------------Ggtac
gi|3 : CAGTGGCG-TATGC-TTGGGGTAATAT-G--CATATGGAATGCAAGAAA-Gatcgattcccccaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|3 : gatCCCA------------GGAAGCT---GGTG-C-AT--TTCAACAACAACCCCACACCCACTTAA-TTAGATAGT-------ATCTGT---CAA--GTC-TCCGATAGCAT-CA-TTT-TT--T---T---AA----------TGGG--TAAA----TG-----------ATC-GTAACTT----CCTTA------G----A------AAAACAAA--AGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGG----G-------GGG----------G--------------GAGTCCATTAGT---------TT---------------------T----AC----TT----G--------CA----------TT----TTG--T------TT--C---------------TA-----------AT---TT---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGGTTT-TAAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------TAAAA-TTTTCG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TG---A-C-AAT---C---GAA-----T-C-------T--A---A----------------------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------T-----A-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--A--AT---T-GATAAAT--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--T--A-AA-AACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---GA----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CC-A--T-G-TGCTT--TT--G-A---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|3 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactcCA----G----AT----AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A-G--------------TT----ACTTT--CTTCGTG--T-T-A----------------A--AT--C-AA--A--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---T---TTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-AT-AT--GC-----TTCCG-TGCTTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|30 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggTAACTT----TCTTT------C----A------AGAAAAAG--GGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------ATTGTCCATTAATTAG--------------------TT---------------------TTAATAC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--TGGGGGGGTGGGGGGGTT-----------AT---TTT--G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-ATT-T-AAAG--C------T-A--C--------T-AAA-TT--CG-----------A-T-GT-A
gi|31 : aatacaggcgcatggggtaaagaaagt-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-TTATA--TA--CACA----CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----T----AT----AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-CATGTATTTCTTTTCTT----CTTTT--TTTTTTT--T-T-TT-TTTTTTTTTTTTTAA--TT--T-AA--AA-TCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-----------T---ATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCC--TGC-TT
gi|32 : CAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAT-AT-ATGAATATGGAA-GC-AGAAA-GGG
gi|34 : tt--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T---------------------------A-----------AC---T-------------------GTTC---T-G-T----CG------CT-T-----TT---T-----ACGA-CAACTA-A-T--TAG-ATGCGTTTTGTGAAT-----TT-CCTTGA-A---------AGC-CAT-----T-A-T-T-AAAtccccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|35 : caaaacaaaaacaaaaaaccccaaaaaacaaaaaacaacaaacaacaaacagataagttcaataagtA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTTTTT--T-T-CC-T-------------A--TT--T-AAGAA--TCT--A--AT------TTCATTTGACTTT-AA-A-TCA--T-T-TAAT----TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAT-GA-TGTTG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|36 : ----TAAG-AT-T-----------------TAACTT----TTTTC------A----A------GAAAAAAA--AGGG---A---T----------------T----GTCCAATAATA----------A--------------G--------------------TTA--------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TTTAAAAAATTCTAT---TT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-TT------A--T-----TT---T-T---ATAA-CAA
gi|37 : aacacaggcacatagggTTCTTT--T-AATT-T-------------AGGCT--C-AA--G--TCT--ATAAT------TTTATT-GACTTTTAA-A-TTA--T-G-------------------TTATTTTTAACGC-GCAGACC-AAATGTGG----AATGC-AC-ATTTGT-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGG-AG-C-TAACGC
gi|38 : acat--------------------TT---------------------C----AC----T-----G--------CA-----------T----TTT--T------GT--T---------------TA-----------TT---TT---G-------AGG--ACGTTT---T---T--A-CT------A--T-----AT---T-T---ATAA-CACATATAATACAAG-AAGCGTTTTCTGAA------TT-CCTT----------------------------------AAA--C------T----T--------TAAAA-TT--CG-----------ATT-GT-ATC-TAA---A----TG--AAA-a
gi|4 : gtCAGTGGCGGTA--C-TTGGGTT-G-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAATGGGCGAGGGGTT-GGGGGCCGGCCCTAAGCCCc
gi|4 : GGGTCCGGGG--C-G------AGCCCC------------G-AAGCT---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAA------------GTAA-A-AGA-GGTT------ATTT-T---CAAGAGTC-TCCGATA-GG--CA-GTT-TCAATAATT---AAAAACAGGACATTGGGGTAAG-AT-TA-----------ACC-TT--CTT----T-TTC------A----A------GAAAAACA--AAG----G---G----------------G----A-------AAA----------G--------------A--------------------TTTGTCCATCTAATTTAGTTTTAT----AC----T-----G--------TT----------TT----TTT--T------TT--T---------------TTTTTTT------AT---TTT--G-------A-G--A-GTTT---T-G-TT-A-CT------AG-A-----TT---T-T---ATAA-CAACTATAAT--TAG-ATGCGTT----GAA------TT-ACTTGA-A---------AGC-T-T-----TCA-T-A-AAAA--C------T-AA-C--------TAAAAATT--CG---------------GT-ATCGTAA---AT---TG--AA--T-AAG-----A----TTTATA-CGAGT---C---GAA-----T-C-------T--ATTGA------T--------G--------T------A--------GTTTCCAGATAAAA---CTT---GC--A-C--A-AG-TTCG--------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----CGT-----TGT--T--------------AT---------G-----A--A---------TCGCGTA-A---------A------TA------C----GTGTCCAAA--A-A-A----TA----------AG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--G---------------TT--T-T---------CCC-G----TT-T--------------AAA--A--A--ATAA-ATGAGAAGG--TCGGCGAAGCAA-T--A--C----A----T---G--CC-G-G-------TC----T-TA-CGC--------TC-T--TAG-T-CCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------GATAATCAA---T-T--TG--TA--GGG-----CTT----A--------------TTG--C-T-ACAC---G----AT----TT-------AAA-T--GA--A-A-TC-AATT-C----A-CATT-TT-CGAATCCC---A---TATC-----TA-TG-------------TT----CTTTT--CTTCCTT--TGT-TT-T-------------G--CTATT-AA--A--TCT--A--AT------TTT-TTTGACTCTTAATA-TCA--T-T-TAGACTTCTT---T---TTTTTTTTATAC-C-GCAAAACGAA-TGTGG----AG-GCGAC-AT--GC-----T--CG-TGC-TTCAATAGGAAG-CAT-ACGCaatggtcatgcagagccctgtggcgggtccggggcgagccccgaagctggtgcattttagacaagtaaaagaggttattttcaagagtctccgataggcagtttcaataattaaaaacaggacattggggtaagattaaccttctttttcaagaaaaacaaaggggaaaagatttgtccatctaatttagttttatactgttttttttttttttttttattttgagagttttgttactagattttataacaactataattagatgcgttgaattacttgaaagctttcataaaaactaactaaaaattcggtatcgtaaattgaataagatttatacgagtcgaatctattgatgtagtttccagataaaacttgcacaagttcgaagcacattcgttgttatgaatcgcgtaaatacgtgtccaaaaaataagttaatctaattgataatgttttcccgtttaaaaaataaatgagaaggtcggcgaagcaatacatgccggtcttacgctcttagtcctttgatttaaaaaaagataatcaatttgtagggcttattgctacacgatttaaatgaaatcaattcacattttcgaatcccatatctatgttcttttcttcctttgttttgctattaaatctaatttttttgactcttaatatcatttagacttctttttttttttataccgcaaaacgaatgtggaggcgacatgctcgtgcttcaataggaagcatacgc
gi|41 : cagtggcggtacttgggttgattaatatggaagcagaaatgggcgaggggttgggggccggccctaagcccaatggtcatgcagagccctgtggcAAG-AT-T-----------------TAACTT----C-TTC------A----A------GAAAAAAA--TGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------GT-------------G--------------------TC---------------------C----AT----T-----A---------A----------TTAG--TTT--TATAGCATT--T---------------TT-----------GT---TT---G----------------TT---T-G-T--T-TT------TT-G-----TT---T-T---
gi|42 : taaacacaggcacttggggtaagCG-TA-GC-TCGGGTT-G-AT-G--AAAATGGAG-GC-AGAA---GACAGGG--TTTGGGG-CC-GCCCTAAGGCCCC------------ATAGGCt
gi|43 : cagttgc--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TT--------------T---------------TT-----------AC---T-------------------GTTC---T-G-T--A-CA------GC-T-----TT---T-T---AGAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-Cgtcaagggcaggcctaggggcgaagcccccggaagc
gi|44 : aaaaaacaaaaaaaacaaacaaacaagatagttcataagtCT--A--AT------TTTATTTGACTTT-AA-A-T--------CA------TT---TAAATTTTTCTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GG-----TTCCA-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|45 : GGGGCC-GCCCTAAGATTCCCAATGGGTCCAGGGAAGCG---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAA------------TTAA-G-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTTACC-AATA-CA--CA-TTT-tacgc
gi|46 : T------TTTATTTGACTTGAGA-T-TTA--T---CA------TT---A---TTTT------GC-C-GCAAG-C-AA-TGTGA----AA-GC-AC-AT---C-----TTCCGTTGCTTTC-ATACGACGCC-T-ACGCC
gi|47 : c-AA--A--TATC-A--AA------TTTAT--GACTTT-AA-A-TTA--G-T-C-------------------TCATTTTAC-CAGCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-TT--GC-----TT-CG-TGC-TTC-ATAGGA---C-T-ACGCc
gi|49 : T--T-AA--A--TATCAA--AT------TTTATTTGACTTT-AA-A-TTA--TCT-CA------TT---T---TTT-------AC-C-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTTCG-TGC-TT
gi|5 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCA
gi|51 : gacgttacaattttgcaacatatgcacattcttgttaaagttctctaggcgagtcaaaaaataacattatctaaattagaatcatttctatttccttcaaaacaaaacttctgatattttcacggtccaagcattacttgcacataacaatgttttcaggtggtggttgggagggagggggtggggttgaagtggaatttcagaacggggaggagggtagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaattcttacaaacaagaggttatctttatttttatcaaaagcttatacaaacaatttaaaaaaaaagaatcattcggggtgggggctggggtgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgagcatgtttaccgatagtatttacggtaaaagttttatatcctgcaggccagacgcctaagtcgaatttcatgtgccacttttgacagtggtgatattatttctacacaaataaaaaacaagtttattacagaatctctcagttattgaaaaataaaaccaactttttaatgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-A
gi|52 : tgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGAAAGGGGTTTGGGGGCT-G
gi|55 : CAGCGACG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATGG-A-GC-A
gi|56 : ttttttctattaaccgG----------G--------------T--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTG--T------TT--T---------------TA-----------AT---TT---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------C
gi|57 : cattGGTG-TA-AC-TTAGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-
gi|6 : cattCAGTGGCG-TA-GC-ATGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAAGGGGTTTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAGCCT---GATG-C-A---TTTAG--ACA-------------TTAA-A-ATA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--GA-TTT-TT--TAATT---AA----------CT----TAA-----TA-----------ATC-TCCCCCC----CCCCC------A----A------AAAAAAAA--AGGG---G---G----------------G----A-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------T----CT----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TC-----------AT---TT---G-------A-G--ACATTT---T-G-T--A-CTAGATATCTAT-----TT---T-T---ATAA-CAAATA-AAT--TAG-ATGCATTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------TAAAT-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---CTTCGAA-----T-T-------T--A---A------T--------A--------T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAA--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCAGT------A-T--A--C---CA----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--A-T-TGCCT--TT--G-A---T--T-TAAAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------CTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GG--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TTCT-------------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TCA--T-T-CAATTTTTTT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-ACTAT--GC-----TT------------ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|60 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-AC-AG
gi|61 : tCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATAGAA-GC-A
gi|62 : tGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCTG-TGC-TTC-ATAGGAA
gi|7 : ----TAAA-AT--G-----------ATC-GTAACTT----CCTTA------G----A------AAAACAAA--AGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGG----G-------GGG----------G--------------GAGTCCATTAGT---------TT---------------------T----AC----TT----G--------CA----------TT----TTG--T------TT--C---------------TA-----------AT---TT---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGGTTT-TAAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------TAAAA-TTTTCG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TG---A-C-AAT---C---GAA-----T-C-------T--A---A----------------------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------T-----A-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--A--AT---T-GATAAAT--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--T--A-AA-AACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---GA----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CC-A--T-G-TGCTT--TT--G-A---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----Act
gi|7 : tggggCA----G----AT----AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A-G--------------TT----ACTTT--CTTCGTG--T-T-A----------------A--AT--C-AA--A--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---T---TTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-AT-AT--GC-----TTCCG-TGCTTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|8 : tggggtaaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcagg----TAAG-AA--G-----------ATCCGTAACTTAATTCTTTC------ATAAAA------AGAAAAAA--AAAG---A---A----------------A----A-------AAA----------G--------------A--------------------TT---------------------T----GCCATCT-----GTTTTTATTCA----------TT----TGT--T------TT--T---------------AT-----------TT---TT---G-------A-G--ACGTTT---TTG-TTTG-CT------TC-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT---AGTATGTGCTTT--GAA------TT-CCTTGATA---------GGC-T-T-----TTA-T-T-AAAAAAC------T-AACT--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---TT---TG--AAA-A-AAG-----A---------A-C-AAT---A---GAA-----T-C-------T--A---A------TTA------G--------T------ACGGTGATAGTTTCACGATGAAA---CTT---GG--G-C--AGAG-TTCGGA------------AGC-CATGC--------------A------T-----T-----GGTGGCATTACCGT--------------GT---------A-----A--A-----------------A---------A-------------------------AAA--A-A-A----AAT-------GCGG--TTAATTT--A--AT---T---T-AAT--AA--------------TTATT-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG---CGGC------A-T--A--CCGGAA----T---G-TCT---G-------TC----T-T--C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TTTGG-A---T--T-T-AAATA--AAA-----------ATTTA--CA---T-T-ATATTTA--CAC-----ACA----A--------------TTG--CTT-AC-----G----AT----TA-------AGA-T--GA--A-G-TC-ACTT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TATT--------------TT----CTTTT--CTTCTTC--T-T-TTAA-------------A--TTA-T-AA--AT-TCT--A--AA------TTTATTT-ACTTTAAA-A-T----T-T-CA-----------------TTTTTTTCAC-C-GC--AAC-AC-TGTGG----AG-GCAAC-AT--GC-----TTCCG-TGT-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|9 : aacacaggcacatggg-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----ATTT---AAAAAAAA--------------------------------------------------------G--------------A--------------------TT---------------------C----AT----TTAATAGTTC-----CA----------CT----GCT--T------TT--T---------------TG-----------ATATTTT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--AACT------CT-T-----TT---T-T---ATGA-CAACTA-GAT--TAG-GTGTGTTTT-TGAA------TT-CCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-AAT-T-AAAA--C------T-A--C--------TAGAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---C---GAA-----T-C-------T--A---AG-----T--------ACTTT----T------A-------GAT-----------AAAGCTT---AG--A-T--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--C--------------A------T-----T-----AAG-----T----TGTTATGATTAGA--GT---------A-----A--A---------T-----ATA---------A------A-------T----GT-C---AA--C-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-AAT-CAT--AAGATTTTGGGTTAGTTT--T-T---------T---GTTTTTT-T--------------TAA--A--C--A-AATATATA----------T------A-T--A--C----A----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-T-TGCGT--TT--G-ATATT--T-T-GA---------------------------------T-ATA--TT--GAT-----AAA----C--------------ATA--A-T-ACA----G----ATAA--AA-------AGA-T--GA--A-G-CC-A-TT-C----AGCATT-TT-TGA---CC---AAA-TATT-----TA-A--------------TT----ATTTC--TGTCTTT--A-C-AT-T-------------A--TT--TAAA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-------T---T---TTTTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-CC-AC-AT--GC-----TTGTG-TGC-TTC-AGAGGAAG-C-T-ACGCCac
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AAGAGCAAGAGTCACGAATAGATCCAAAATGGACGCCATTTGCTGAGACAGTTGATATCATTTCATAGATCAGTAGATCAAGAAAAGTGTTAATTTTCAAATATACTTCCCTTTTTCGATATCGTATCAATTTATTTAGTTATATAGACGTTTCAAAGTTAGTCATTTGTTATTTCTTGGGCCAATTTTTGTTTTTGACGTAAAACACTTTTACAACGTATGTATCTAGTATCAAAACATATACATATATATTCGTCATTTCTTTACATACAAAAATCTAGATTATGTTCACTGTTCCAGACTCACTACTTTGTCACTTTGCAATGTTTTTCAAGAGTGGTGGTTGGAAAGAACGGGGGAGGGTGATCGTTGCTGTATCTAACGAATTTCAAGAAGAGGAGGGGTGGGTGTGTAGAAAGGTCAGGGGGTATAACAATTCTGCATTGAAACTCCTTTAGTGGATCTTCAGGTAGACGAGTTATTAAAAGGCAATAGGTAAGGTGATATTTAATTATTTTTAATCA
Unaligned ( gi|33 ): TCAGGAATTTCAGAAACAGTGGGAGGGGGAGAAGGTGAGTTGCTTGAAGCTCCCAGAGGACAGAGCGAGACCCCCGGAAAGCTGACACATTCTCTACACAAGCAAAAGTTTTTATTTTTAATTTTTTTAAGAAATGCTTTGTTCGGCACAAACACTTTTTTAAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CCCCAGTAGGTCCAGGACAGAAACCCTGTTTGTGGGCCAGCAGGGGCGAAGGCCCCCGGGAAGCAGCATGGAACTTCTTTTACAAGAACGATTTCGCTAAACATTTTTATTTTTTA
Unaligned ( gi|40 ): GGGGTCTGGCAGCCGCTTAAAAATAGGCCGCCCAGTGGGTCAGAACTTGCCCTATATAGTAGCCTAGGGGGTCCAGGGGGCGAAGCTCCCGGAAACTGAGAGGTTTTAGAATTC
Unaligned ( gi|48 ): GGCGAAGCCCCTGAAAGCTGACAAATTCTTACAAACAAGAAGTTTTTGTTTTATCAAATGCTTGTTGTACAAACAAAATG
Unaligned ( gi|50 ): AAGGTACTAGTATGGGAGCCGCCCTAAGGCCTTGGTGAGTCCAGGACAAAGCCTTGGTTGAGGCCCTGGGGGC
Unaligned ( gi|53 ): TTGGGGCTGCCATGAGACCAGCCCCGAGGGTCCAGGACTAAGTCCTAGTAGGGGTCCAG
Unaligned ( gi|54 ): TAAATTCTTACAAGCAAGAGGTTTTTAAAAAATTAAATGCTTGTTGTACAAACTA
Unaligned ( gi|58 ): TGAGTATGAGTACGGTAAAAGTTTTATAACCTCCAGGCC
Unaligned ( gi|59 ): AGGTGCATTTGACTATTTCAAAAGGTTCCCGAACCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111111111111 111 1 111 44444444444444444444 2222222 1 111 111 5555555555555555555555555555555555555 222222222222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111 1111111 111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 222222222222222222 111111111111111111 22222222222222 11111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 1111111 33333333333333333333333 33333333333333333333 11 1 44444444444444444444444444 11
lowQualScore : 2 2 2 2 6666 2 2 44 0 00 1 3 0 2 888888888888 777 0 5 999 0 66 22222222222222222222 5 6666666 5 888 55 5 3 4 111 4 4 66 66 111 6666666666666666666666666666666666666 22 5555 1 000000000000000000 444 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 333 1 1 44 1 222222222222222 666666666 1 5 22 1 5 666666 3 1 999999999 1 3 3333333 3 1 3 66 555555 2 44 99999999 4 55 99999999999 2 2 2 2 333 3333 55 2 2 999999999999999 2 2 1 8888888 55555 2 7777777 33 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55 2 2 6666 00000000 33 33 33 333 2 6 111111111111111111 22 2 444444444444444444 2 66666666666666 33 33 33 2 2 333 555555555 1 22 44 666 4444 333 1 00000000000 7777 1 5 1 99999999 1 44 1 1 44 55 1 555 77 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 222222222 6666 8888888 2 77 22 2 2 22 4 2 4444 2 2 4 666 333 33 00000000000000000000000 4444 333 33 55555555555555555555 66 55 2 22 11 44 22 555555 22 4 1 1 00000000000000000000000000 0 4444 1 1 66 1 5 3333 1 3 1 22 44444 1 5 2 2 2 2
lowQualScore : . . . . .... . . .. . .. . . . . ............ ... . . ... . .. .................... . ....... . ... .. . . . ... . . .. .. ... ..................................... .. .... . .................. ... .......................................................................................................................................................................................................................... .. ... . . .. . ............... ......... . . .. . . ...... . . ......... . . ....... . . . .. ...... . .. ........ . .. ........... . . . . ... .... .. . . ............... . . . ....... ..... . ....... .. .................................................................................................................................................................................................................................................... .. . . .... ........ .. .. .. ... . . .................. .. . .................. . .............. .. .. .. . . ... ......... . .. .. ... .... ... . ........... .... . . . ........ . .. . . .. .. . ... .. . .................................................................................... . ......... .... ....... . .. .. . . .. . . .... . . . ... ... .. ....................... .... ... .. .................... .. .. . .. .. .. .. ...... .. . . . .......................... . .... . . .. . . .... . . . .. ..... . . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 9999 2 2 44 9 33 4 6 7 8 666666666666 555 0 0 666 5 99 11111111111111111111 0 2222222 0 888 11 0 3 4 777 4 4 99 66 777 7777777777777777777777777777777777777 99 7777 5 666666666666666666 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 000 7 7 11 7 999999999999999 555555555 9 5 55 8 2 777777 5 9 555555555 9 8 0000000 8 9 8 88 888888 0 88 22222222 0 55 55555555555 0 0 0 1 777 9999 88 1 2 333333333333333 4 4 5 0000000 66666 2 2222222 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 2 2 9999 44444444 11 11 11 999 2 7 999999999999999999 99 1 333333333333333333 4 88888888888888 22 22 11 2 2 555 999999999 9 66 55 777 0000 333 9 22222222222 5555 8 5 8 11111111 8 33 8 8 55 22 9 222 11 9 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 555555555 7777 2222222 1 11 99 1 1 66 2 1 5555 2 2 4 666 777 44 99999999999999999999999 5555 333 11 11111111111111111111 55 33 1 99 33 88 88 555555 22 4 9 9 44444444444444444444444444 4 0000 9 9 33 9 7 9999 8 6 8 55 55555 8 5 1 4 4 4
consensus : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--CA-TTT-TT--TAATT---AA----------TT----TAAG-AT-TG-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----A------AAAAAAAA--AGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TN-----------AT---TT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---A------T--------A--------T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-T-------------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
Reference ( family-2559 ) : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--CA-TTT-TT--TAATT---AA----------TT----TAAG-AT-TG-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----A------AAAAAAAA--AGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TN-----------AT---TT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---A------T--------A--------T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-T-------------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|1 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAG--CCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GGTGATCTTTATTT-TTATCAA-AAGC-TT-G-TA-CAAACAATTT-TT--TAA
gi|1 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-ATAT--AATATGGAA-GC-AGAGA-Gaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaatataatatggaagcagagag
gi|10 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgagcccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaacaattttttaaaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactac----AT----T-----G--------CA----------TTAAGATTT--T------TT-------------------------------------------------A-G--ACGTTA---T-T-T--A-CT------AT-A-----CTGAGT-T---ATGA-TAACTATAAT--CAT-ATGGCTTTC-TTAA------TT-CTATCG-A---------AGC-T-T-----T-A-T-TCAAAA--C------T-A--C--------TAAAA-T---------------------C-ATC-CAA---TT---T----------AG-----A----T----G-C-A-T---C---GAA-----T-T-------T-------------T--------A--------C------C-------AGT----------------TT---TA--A-T---GAA-TTCA-A------------AAA-CA--C--------------ATTTAATT-----T-----AGTTG---T----T--------------AT---------A-----A--G---------A-----A-A---------A------CTACAATAC----GT---CAAAC-A-A-A----AAA------TGCAG--TAAAGCT--A--ATGCATGGAT-AAT--CG--------------GT--T-TGTTGCATTAT---G----TT-TTTAAATTTTTTTAAAAA--A--T--A-AA-TTGAAGGAA--AT-----------T--A--C---GA----T---G-TCC-
gi|10 : aa--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------GT--T---------------T--------------------------------G--ACGTAT---T-G-T--A-GT-------T-T-----TC---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAA-ATGTGTTTT-TGAA------TT-C------------------------------A-T-T-AAAA--C------T-G--G--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GC-ATC-TAA---AT---TG------G-ATG-----AT---T----T-T-AGT--------AG-----T-T-------TTGA---A------T--------A---------------A-------AG----------------CTT---CG--A-T--AGAA-TTAAGA------------AAGCCA--T--------------A------TGATTAT-----AGT-----TA---TCATAACTCAGTATAGT---------A-----A--A---------T-----A-A------------------------C----G--TCTAAA--A-A-ATCTTAA-------TGCAA--TTA--CT--A--A------GA--AATCCAA--------------GT--T-T---------T--------TT-----------------------------AA-ATGAA-GGG--GCGGG------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------CC----T-GA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCC--TT--G-A---T--TCT-AAA-T--AGATTGTCATTTTTAAAGA--CA---C-T-A-----A--GAC-----CAA---------------------G------ACA----G----AT----AA-------AGA-T--------A-TA-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---AC---AAA-TAAT-----TA-T--------------TT----C---------------T-G-TT-T-------------A--AT--C-AA--A-------A--A-------TTCA--TAAC-ATTAA-A-TTA--C-T-TA------------------ATTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-------------------------GC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCtactaagaaatccaagttttttaaatgaaggggcgggatacgatgtccggcctgaccccatgtgcccttgattctaaatagattgtcatttttaaagacactaagaccaagacagataaagatataattcagcattttcgaacaaataattatttctgtttaatcaaaaattcataacattaaattacttaattttttaccgcaacaatgtggaagcttcataggaagctacgcc
gi|12 : aaggacatcgtaatttccttcaatttattttttaaaaaaatttaaaaacataatgcaacaaaccgattatccatgcattagcG-----------ATC-GTGACTT----CCTTG------G----G------GAAAAAAA--GGGG---G---G----------------G----G-------GGGTCCATTATTAG--------------T--------------------TT---------------------T----AC----A-----G--------CA----------TT----TTT--AAAA---TT--T---------------TA-----------TT---TT---G-------A-A--ACGTTT---T-G-T--A-TT------CT-T-----TT---T-----ATAA-CAACTA-AAT--GAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCCTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--A------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TG--AAA-G-AAGATGACA----T----G-C-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---AG-----TAGTTTTTGA--------T------A-------AA------------A---TTT---GG--A-C--AGAG-TTCAG-------------AAG-AA--C--------------G------T-----T-----AGT-----T----G--------------TT---------A-----A--AAAATTAGAGT-----A-A---------A------CA------T----GTGTC---A--A-C-A----AAT------TGCAG--T-----T--G--AT---T-GAT-AAT--TA--------------TT--T-T---------T---
gi|12 : aacacaagcacatgtggcaagaaC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-C-------TC----T-TA-C-T--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---TC-T-T----------A-----------AAAAA--GATTTT-T-ATA--TACGAGCACATACTA----CAATTCAATTTCAGTTTA--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATacacggtaaaggctatctatagcctccacctttttacatacgatgtccgctcttactccatgtgcctttgatcttaaaaaagatttttatatacgagcacatactacaattcaatttcagtttactacagataaagatgaaatcattcagcat
gi|13 : aacacaagcacatgtggcaagaagatcgtgacttccttggggaaaaaaagggggggggggtccattattagttttacagcatttttaaaattttattttgaaacgttttgtattctttttataacaactaaatgagatgcgtttttgaattccctgaaagctttattaaaaatactaaaattcgatgtatctaaaatgaaagaagatgacatgcagtcgaatctaagtagtttttgataaaatttggacagagttcagaagaacgttagttgttaaaaaattagagtaaacatgtgtcaacaaattgcagttgattgataattatttttacacggtaaaggctatctatagcctccaccttttta----TAAG-AA--G-----------ATC-GTAGCTT----CCTTTTAATTTA----A------AAAAAAAA--AAGGTTCGTCTA----------------G----G-------TTA----------G--------------T--------------------TT---------------------C----AC----T-----T--------CC----------TT----TTT--T------TT--TTTTCTTCAGTTTTTTTA-----------AC---TTAT-G-------A-G---CGCTT---T-G-C--A-CT------CT-C-----TT---T-TTCAATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTC-T---------TT-TCTT
gi|13 : aacacagcacatggggA-----T-C-------T--C---A------T--------A---------------A-------A-------------A---CTT---GG--A-G--AGAC-TTCACG------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T-------------------AT---------A-----A--T---------T-----A-G---------A-------------------GT-------------A----AAT-------ACA----CAATCT--A--AA---T-GAT-A-T--A---------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--G-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------T-A--A--C---GA----T---G-TCC-T-G--------C----C-TA-C-T--------CT----T-G-TGCCT--TT--G-G---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T-TCA------------------------------------ATA--C-T-AAA----A----AT----AA-------AG--------------C-A--------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----GTGTT------TTT--TAT-AT-T-------------A--TT--T-AA--C--TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-AC-TT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGTCACttttttttttatctcataaaacttggagagacttcacgaagcacattagttataattagagtaaatacacaatctaaatgatatatttttgtttaaaatgaaatgaagggggcggctaacgatgtcctgcctactcttgtgcctttggttttaaaaagatttcaatactaaaaataaagcatttcgaccaaatatctatttgtgttttttatattatttaactctacttttatttgactttaaaaccgcaacattgtgaagcacttgcttccgtgcttcataggaagctacgtcac
gi|14 : aacacagcacatggggtaagaagatcgtagcttccttttaatttaaaaaaaaaaaaggttcgtctaggttagtttcacttccttttttttttttcttcagtttttttaacttatgagcgctttgcactctctttttcaataacaactaaattagatgcgtttcttttcttttttttttttT--T------AT--T---------------TC-----------AT---TT---GTAAATAAA-GGCACATAT---T---T--A-CT------CT-A-----GT---T-----ATAA-CAA------T--TAC-ATGTGTTTC-GGAAACCGAGTT-C--TGA-ACTCTATCCAACC-T-T-----C-A-TCT-AAAA--C------T-A--C--------CTAAA-TT--CT-----------A-TTGT-ATC-TTC---TT---TC--AAT-T-TAG-----A----C----A-C-A-T---C---AAA-----TGT-------T--A---G------T--------AGTTTTATTT------A-------AG----------------CTT---TG--G-T--GGAA-TTCAAA------------AAA-CA--C--------------A------TC----T-----AAT-----T----TA-------------GT---------T-----GTTA---------T-----A-A---------A-------------------GTCTTTAAA--A-A---------------TACAT--TCAAACT--G--AT---G-GAT-AAT--G---------------TT--G-T---------T---T----TT-T--------------AA------T--------TGAAGAAA--GT-----------T--A--T---GG----T---G-TCC-----------------T-TG-C-C--------CCCA--T-G-TTCC----T--G-AG--T--T-T-AAA-ATTAAG-----------AAA
gi|14 : tccgtacacaaGTTTGAAT-G-T--A-TT------TT-TAAAGACT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGTGTTTTTTGAA------TT-CCACCA-A---------AGC-T-T-----A-A-A-T-AAAA--C------T-A--C--------TAACA-TT--TG-----------A-T-GT-GTC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---A---GAA-----T-T-------T--AG--G------T--------AGTTT----T------A-------GATGAA--------G---GTT---GG--A-T--AGAG-TTCAGAACTCGGTTTCCGAAA-CA--C--------------A------TG----T-----AATTG---T----T--------------AT---------AACTAGA--G---------T-----A-A---------ATATGTGC-------CTTTATT-TACAAATGA-A-AT---AAT------TGCAG--GT-ATCT--A--AT---T-GAT-AAT--CA--------------TT--T-T---------T---G----Tttgcaggtatctaattgataatcatttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|15 : tccgtacacaatttcttaattttaaactcaggaacatgggggcaaggacaccataactttcttcaattaaaaaacaacattatccatcaATTA-ATT--TAA-ATGCATATT-T---------TT---TTGA-A---------CGT-TGT-----T-G-T-T-A-----C------TCA--CA-------TAAAA-T---CG-----------G-T-----TC-AAA---AT---TG--AAA-G-AAGTTGGCA----TT---A-T-AGTATCT---GAAGAGCTT-A-------C--A---G------T--------A--------TTC----A-------AAC-----------A---CTT---GGCGA-CTCAGAG-CTCAGA------------AA--CA--CT-------------A------T-----T-----A-T-----T----T--------------GTTATCACTAAA-----A--G---------T-----A-T---------A------CTA-----C----GT-GTAAAA--T-ATA----AAT------C-CAG--TTAATCCTGG--AT---T-TGT-ATT--AA--------------CT--TATG--------T---G----TT-TTG------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGAG--GCAGC------A-T--A--CCTACA----T---G-TCC-C-G-------TC----T-TA-C-C--------CA-T--T-G-TGAC----T--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA------------T-AT----------------TA----C--------------TTG--G-C-ACA----GT---ATAAGGAA-------GGA-TGGGA--A-ATTC-A-TT-CGTATGACATT-TT-CGA---TCTGGTAA-TATC------A-TA-------------TT----CCTTT--CTTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|16 : aaaaaataaaatgtctATTA-ATT--TAA-ATGCATTTT-T-------------TTTAG-A---------CGT-T-T-----T-G-T------A--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----G-C-AGT---A---GAA-----T-C-------T--A---AGTAGTTTCAG-----A--------T------A-------AA------------A---CTT---GG--A-C--AGAG-CTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------ATCACTA----A-----A--G---------T-----A-A---------A------TA------C----GT-GTCAAA--A-A-A----AAT------C-CAG--TTAACCT--G--AT---T-GAT-AAT--TA--------------TT--G-T-------------A----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG---CAGC------A-T--ATAC---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGACT------G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AA----------T-T-ATA--TA-----------------C--------------TTG--G-C-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AACATT-TT-CGA---CC---TAA-TATC-----TA-T--------------TT----CCTTT--C
gi|17 : ttttctttaattttaaacagatcataaattctctaaaaaataaaatgtct-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----ATT----AAAAAAAA--CAAC---A-----------------------------------------------------------------------------------T---------------------T----A-----T-----C--------CA----------TT----AGT--T------TGAAT---------------GC-----------AT---TTCTGG-------A-G--ACGCTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGTGGTTT-TAAA------TT-TCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--C------T-T--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAATACATGTATG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---A---GAA-----T-T-------T--G-----------------------------------A-------AG----------------CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--CGTGTAATTGTTATAA------C-----T-----AGT-----A----T--------------AT---------ATAG--A--G---------T-----A-A---------A------TA------C----GTGTAC-AA--A-A-T----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--CA--------------TT--T-T---------T---GT---TT-T--------------TAA--A--C--A-AA-ATGAAGGGG--GTGGG------A-T--A--C---GA----T---G-CCC-A-A-------TCAAGAG-TA-C-C--------CC-A--T-G-T
gi|18 : aacacaggcacatgggggtaaggacAAGCCCCC------------GGAAGCT---GCTG-CAAT--TTTCG--AC-A------------TTAA-G-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-AC-GATA-CA---A-TTT-CT--TTAT
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctggggga----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--GT--G-T---T--C-T-AGA-T--AAA-----------GAA-----A---T-T-GTA--Tctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacg---------------------T----AC----T--------------CA----------AT----TTT--T------GT--T---------------TG-----------TT---TT---G-------A-A--ACCTTT---T-TCT--A-CT------CG-T-----TT---CAT---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTA-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGCTT-T-----T-A-T-CAAAAA--C------T-A--C--------TAACA-TT--CGATAAACGGTGCA-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-ACG-----ATATGT----A-C-AGT---C---GGA-----T-C-------T--agtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|19 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacgatacaatttctttatctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttaTT-TGAA------TT-CCGTGA-C---------AGC---G-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--CACGTTAAGTAAAAGTT--CG-----------A-T-GCAATC-TAA---AT---TG--GAATGTAAG-----A----TA---A-C-AGT---C---GAA-----T-CCTATTAGT--A---G------T--------A--------TTGATAAA-------AAA-----------A---CTTAGAGG--A-A--AAAGATTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------C-----T-----AGT--------------------------T---------A-----A--A---------------------------------------------------CTAGA--ATA-A----AATATAACATACAGATTCAATCT--AAGAT---T-AATAAAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TTAC--------------AAT--A--TAAA-AA-ATTAAGGGG--GCGGC------A-TAAA--C---GAAAATT---C-TCT-A-T-------GC----TATA-C-CGT------CT-AATT-T-TTACT--TT--G-A---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---TGT-ATA--TA-----------CA----T--------------GTG--T-TGAAA----GGAATAT----AATACT---AAA-C--AA--A-A-T--A-TTCC----AGCATT-TC-CGA---CC---AAT-TATC--------T--------------TT----ATTTT--CCTGTTT--T-T-
gi|2 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAAGCCCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GGTG------ATCT-T---TA-----------------------TT-TT--TA-TC---AA-----------------AAG-CT-TG-----------TAC-AAAATTT------TTT------A----A------AAAAGAAATCACGG---G---G----------------GGGTTG-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------a
gi|2 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAGA-Ggaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaataaatatggaagcagagag
gi|20 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgaagccccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaaattttttaaaaaagaaatcacgggggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactac-------C----GTGTCCAAA--A-A-A------T------TGCAA--TTAAT----A--AC---T-----------A--------------TT--T-T---------CTGGG----GT-T--------------AAACAACCT--A-AT-ATGAAGGGGCGACGCC------AGT--AA-C---GA----T---G-TCCCG-GCTCTCCTTC----C-TA-C-CTCCCCGAACC-C--T-C-TCCCTA-TTCCG-G---T--T-----A-A--AAT-----------AGAAA--GA---T-T-CTAATTA--GGC-----CT--------------------GGG--C-T-TCACCGGA----AT----GA-------AGAGT--GACTACA-TCTA-TT-C----AGCAATATT-CGAAG-CC---AAAATATGAGTGGTA-T--------------TTTCACCTTCT--CTCTTTT--T-T-TT-TCCCAT--------A--TT--T-AA--A----T--A--ATAAGAAATCT-TTTGA-----GA-A-TCAGTT-T-CT------TTTTAT---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-AA-AT--GTTCCCGTCCCG-TGC-TTC-
gi|21 : CAGTAGC--TA-GCGTTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCTGGGGGTTT-GGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------
gi|21 : gttttaatGGGGGTCCAGGATGC-G----AAGCTCCC------------GGAAGCA---GGTG-C-AA--TTTAG--ACA------------------------------------TT-T---CAA-AGTC-TCTGATA-CA--CA-ATT-TT--C-ATT---AA----------TT----Taatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgatacacaattttcattaattttaaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|21 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgat-------TC----T-TA-C-C--------CC-AT-T-G-TGCCTAGCT--GTG---T--T-T-AAA-A--TTA-----------ATGAA--AA---T-T-GTG--TA--taaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|22 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgaAAG-AT-T-----------------TAACTT----CTTTC------A----AGAAAACAAAAAAAA--AGAG---G---G----------------G----GAGGGGAGGGG----------G--------------GAGGATTGTCCAATAATTAGTTT---------------------T----AC----T-----G--------CAATTTTTGTTTTT----TTTGGT------TT--T---------------TT-----------GTATTTT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT--------------------------ATAAACAACTA-AAT--AGA-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-AC--------AAC-T-T-----C-A-T-A-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ACC-TTA---A----TG--TAA-A-TAG-----A----T----AGC-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---AG-----T--------AGTT-----T------A-------GATAAA--------A---CTT---TG--ACC--AGAG-TTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----agattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|23 : aacacaaacacatggggtaagGAG-TTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------AT---------A-----G--AAG-------T-----A-A---------A------TA------C----GT-GT-AAA--A-A-A----AAT-------GCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-----------------------T--T-T---------T---G----TT-TTTAA----------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TT----T-TA-C-C--------CC-A--T-T-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-------------------------------------------TA-----------TA----C--------------GTG--C-T-ACA---------------------------------------TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAC-TATC-----TT-A--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-G-------------AAATT--T-AA--AA-TCT--A--AT------TTTATTTGACTTT-AA-T-TTA--T-TTCA------TT---T---TTT-------AC-T-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATACGAAG-C-C-ACGCCgtta
gi|24 : --A-AA-ATGAAGAGG--GCAT---------T--A--C---GA----T---GATCC-G-G-------TC----T-TCTC-C--------CC-A--T-GCTGCCT--TT--G-A---A--T-T-TAA-A--AAA-----------AAAAA--AA---
gi|24 : aaAA-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-T-ATA--TA--TACACA--CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----TT---AT----AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-CATGTATTTCTTTC-TT----CTTTT--TTTTTTT--T-T-TT-TTTTTTTTTA----A--TT--T-AA--AATTCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-ATTTA--T-T-CA-----------T---ATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCC--TGC-TTaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagaaaaaagaaaagattatatatacacactaggggcctagtacattataaataaaattttcgaccaaatatctacatgtatttctttcttcttttttttttttttttttttttttaatttaaaattcgaattttatttgattttaaatttattcatattttttttaaccgcaacaatgtggaagcacatgcttcctgctt
gi|25 : aaaaaatgaagagggcattacgatgatccggtcttctccccatgctgcctttgaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagC-GATA-CA--CA-TTTCTT--TAATTTTAAA----------CA----CAGGCATATGGAGGTAAAGGCATC-GTAACTT----CCTTC------A----ATT----AAAA
gi|25 : c--------------------TT---------------------T----AA----T-----G--------CA----------TT----TTG--T------TT--T---------------TA-----------CT---TT---A-------A-G--ACATTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----GT---T-----ATAA-CAACTA-AAT--AAG-GTGTGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----A-A-T-T-AAAA--CTACATGT-A--C--------TATAA-GT--CG-----------A-T-GC-ATC-TAA---AT---TG--AAG-G-AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgcttttaatgcattttgtttttactttaagacattttgtactcttgttataacaactaaataaggtgtgtttttgaattccttgaaagcttaattaaaactacatgtactataagtcgatgcatctaaattgaaggaa
gi|26 : ccgatacacatttctttaattttaaacacaggcatatggaggtaaaggcatcgtaacttccttcaattaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgctGGG--GCGAC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGTCT--TT--G-A---T--T----GA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-TTATA--TA-----------TA----C--------------ATA--T-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-CT-T----AGTATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTTTTT--T-T-AA-A-------------A--TT--G-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTT----A-TT---T-T-C------------T---CTCTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTTGTTCAAA-GC-AC-AT--CC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|27 : --------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--G-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-T-G-------CC----T-TA-C-C--------TC-A--T-G-TGCCT--TT--G-G---T--T-T----------T-----------AAAAA--GA---T-T--TA------------------------------------ATA--C-T-AAA----G----AT----AA-------AGA-T--AA--A-A-CA-A-TT-A----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTGTT------TTT--A-T-AT-T-------------A--TT--T-AA--AC-TCT--A--CT------TTTATTTGAC-TTTAA-A-------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-AC-TT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGTCA
gi|28 : --GCGGG------A-T--A--T---GA----TCATG-TCT-G-G-------CC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T----------T-----------AGATA--GA---T-T-G-A--TA--AACA----TTA----C-----------------------ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----ATTATA-TT-CTA---CT---AAC-TATT-----TA-----------------T----CATTTAAAATCTATAAT-A-TT-C-------------A--TT--T-GA--A--CTT--A--AT------T---TTTAAA----AA-A-AAA--T-T-C-------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GT--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A----------------TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|29 : CAGCGGCG-TA-GC-TAGGGGTAG-GT-A--GATATGGAA-GT-AGAAA-GAGCAGGGAGTTTGGGGGCC-ACCC--AGGTCCT------------Ggtac
gi|3 : CAGTGGCG-TATGC-TTGGGGTAATAT-G--CATATGGAATGCAAGAAA-Gatcgattcccccaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|3 : gatCCCA------------GGAAGCT---GGTG-C-AT--TTCAACAACAACCCCACACCCACTTAA-TTAGATAGT-------ATCTGT---CAA--GTC-TCCGATAGCAT-CA-TTT-TT--T---T---AA----------TGGG--TAAA----TG-----------ATC-GTAACTT----CCTTA------G----A------AAAACAAA--AGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGG----G-------GGG----------G--------------GAGTCCATTAGT---------TT---------------------T----AC----TT----G--------CA----------TT----TTG--T------TT--C---------------TA-----------AT---TT---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGGTTT-TAAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------TAAAA-TTTTCG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TG---A-C-AAT---C---GAA-----T-C-------T--A---A----------------------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------T-----A-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--A--AT---T-GATAAAT--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--T--A-AA-AACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---GA----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CC-A--T-G-TGCTT--TT--G-A---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|3 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactcCA----G----AT----AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A-G--------------TT----ACTTT--CTTCGTG--T-T-A----------------A--AT--C-AA--A--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---T---TTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-AT-AT--GC-----TTCCG-TGCTTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|30 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggTAACTT----TCTTT------C----A------AGAAAAAG--GGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------ATTGTCCATTAATTAG--------------------TT---------------------TTAATAC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--TGGGGGGGTGGGGGGGTT-----------AT---TTT--G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------AT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-ATT-T-AAAG--C------T-A--C--------T-AAA-TT--CG-----------A-T-GT-A
gi|31 : aatacaggcgcatggggtaaagaaagt-A--AAA-----------GAAAA--GA---T-TTATA--TA--CACA----CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----T----AT----AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-CATGTATTTCTTTTCTT----CTTTT--TTTTTTT--T-T-TT-TTTTTTTTTTTTTAA--TT--T-AA--AA-TCG--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-----------T---ATTTTTTTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCC--TGC-TT
gi|32 : CAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAT-AT-ATGAATATGGAA-GC-AGAAA-GGG
gi|34 : tt--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T---------------------------A-----------AC---T-------------------GTTC---T-G-T----CG------CT-T-----TT---T-----ACGA-CAACTA-A-T--TAG-ATGCGTTTTGTGAAT-----TT-CCTTGA-A---------AGC-CAT-----T-A-T-T-AAAtccccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|35 : caaaacaaaaacaaaaaaccccaaaaaacaaaaaacaacaaacaacaaacagataagttcaataagtA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTTTTT--T-T-CC-T-------------A--TT--T-AAGAA--TCT--A--AT------TTCATTTGACTTT-AA-A-TCA--T-T-TAAT----TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAT-GA-TGTTG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|36 : ----TAAG-AT-T-----------------TAACTT----TTTTC------A----A------GAAAAAAA--AGGG---A---T----------------T----GTCCAATAATA----------A--------------G--------------------TTA--------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TTTAAAAAATTCTAT---TT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-TT------A--T-----TT---T-T---ATAA-CAA
gi|37 : aacacaggcacatagggTTCTTT--T-AATT-T-------------AGGCT--C-AA--G--TCT--ATAAT------TTTATT-GACTTTTAA-A-TTA--T-G-------------------TTATTTTTAACGC-GCAGACC-AAATGTGG----AATGC-AC-ATTTGT-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGG-AG-C-TAACGC
gi|38 : acat--------------------TT---------------------C----AC----T-----G--------CA-----------T----TTT--T------GT--T---------------TA-----------TT---TT---G-------AGG--ACGTTT---T---T--A-CT------A--T-----AT---T-T---ATAA-CACATATAATACAAG-AAGCGTTTTCTGAA------TT-CCTT----------------------------------AAA--C------T----T--------TAAAA-TT--CG-----------ATT-GT-ATC-TAA---A----TG--AAA-a
gi|4 : gtCAGTGGCGGTA--C-TTGGGTT-G-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAATGGGCGAGGGGTT-GGGGGCCGGCCCTAAGCCCc
gi|4 : GGGTCCGGGG--C-G------AGCCCC------------G-AAGCT---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAA------------GTAA-A-AGA-GGTT------ATTT-T---CAAGAGTC-TCCGATA-GG--CA-GTT-TCAATAATT---AAAAACAGGACATTGGGGTAAG-AT-TA-----------ACC-TT--CTT----T-TTC------A----A------GAAAAACA--AAG----G---G----------------G----A-------AAA----------G--------------A--------------------TTTGTCCATCTAATTTAGTTTTAT----AC----T-----G--------TT----------TT----TTT--T------TT--T---------------TTTTTTT------AT---TTT--G-------A-G--A-GTTT---T-G-TT-A-CT------AG-A-----TT---T-T---ATAA-CAACTATAAT--TAG-ATGCGTT----GAA------TT-ACTTGA-A---------AGC-T-T-----TCA-T-A-AAAA--C------T-AA-C--------TAAAAATT--CG---------------GT-ATCGTAA---AT---TG--AA--T-AAG-----A----TTTATA-CGAGT---C---GAA-----T-C-------T--ATTGA------T--------G--------T------A--------GTTTCCAGATAAAA---CTT---GC--A-C--A-AG-TTCG--------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----CGT-----TGT--T--------------AT---------G-----A--A---------TCGCGTA-A---------A------TA------C----GTGTCCAAA--A-A-A----TA----------AG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--G---------------TT--T-T---------CCC-G----TT-T--------------AAA--A--A--ATAA-ATGAGAAGG--TCGGCGAAGCAA-T--A--C----A----T---G--CC-G-G-------TC----T-TA-CGC--------TC-T--TAG-T-CCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------GATAATCAA---T-T--TG--TA--GGG-----CTT----A--------------TTG--C-T-ACAC---G----AT----TT-------AAA-T--GA--A-A-TC-AATT-C----A-CATT-TT-CGAATCCC---A---TATC-----TA-TG-------------TT----CTTTT--CTTCCTT--TGT-TT-T-------------G--CTATT-AA--A--TCT--A--AT------TTT-TTTGACTCTTAATA-TCA--T-T-TAGACTTCTT---T---TTTTTTTTATAC-C-GCAAAACGAA-TGTGG----AG-GCGAC-AT--GC-----T--CG-TGC-TTCAATAGGAAG-CAT-ACGCaatggtcatgcagagccctgtggcgggtccggggcgagccccgaagctggtgcattttagacaagtaaaagaggttattttcaagagtctccgataggcagtttcaataattaaaaacaggacattggggtaagattaaccttctttttcaagaaaaacaaaggggaaaagatttgtccatctaatttagttttatactgttttttttttttttttttattttgagagttttgttactagattttataacaactataattagatgcgttgaattacttgaaagctttcataaaaactaactaaaaattcggtatcgtaaattgaataagatttatacgagtcgaatctattgatgtagtttccagataaaacttgcacaagttcgaagcacattcgttgttatgaatcgcgtaaatacgtgtccaaaaaataagttaatctaattgataatgttttcccgtttaaaaaataaatgagaaggtcggcgaagcaatacatgccggtcttacgctcttagtcctttgatttaaaaaaagataatcaatttgtagggcttattgctacacgatttaaatgaaatcaattcacattttcgaatcccatatctatgttcttttcttcctttgttttgctattaaatctaatttttttgactcttaatatcatttagacttctttttttttttataccgcaaaacgaatgtggaggcgacatgctcgtgcttcaataggaagcatacgc
gi|41 : cagtggcggtacttgggttgattaatatggaagcagaaatgggcgaggggttgggggccggccctaagcccaatggtcatgcagagccctgtggcAAG-AT-T-----------------TAACTT----C-TTC------A----A------GAAAAAAA--TGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------GT-------------G--------------------TC---------------------C----AT----T-----A---------A----------TTAG--TTT--TATAGCATT--T---------------TT-----------GT---TT---G----------------TT---T-G-T--T-TT------TT-G-----TT---T-T---
gi|42 : taaacacaggcacttggggtaagCG-TA-GC-TCGGGTT-G-AT-G--AAAATGGAG-GC-AGAA---GACAGGG--TTTGGGG-CC-GCCCTAAGGCCCC------------ATAGGCt
gi|43 : cagttgc--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TT--------------T---------------TT-----------AC---T-------------------GTTC---T-G-T--A-CA------GC-T-----TT---T-T---AGAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-Cgtcaagggcaggcctaggggcgaagcccccggaagc
gi|44 : aaaaaacaaaaaaaacaaacaaacaagatagttcataagtCT--A--AT------TTTATTTGACTTT-AA-A-T--------CA------TT---TAAATTTTTCTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GG-----TTCCA-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|45 : GGGGCC-GCCCTAAGATTCCCAATGGGTCCAGGGAAGCG---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAA------------TTAA-G-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTTACC-AATA-CA--CA-TTT-tacgc
gi|46 : T------TTTATTTGACTTGAGA-T-TTA--T---CA------TT---A---TTTT------GC-C-GCAAG-C-AA-TGTGA----AA-GC-AC-AT---C-----TTCCGTTGCTTTC-ATACGACGCC-T-ACGCC
gi|47 : c-AA--A--TATC-A--AA------TTTAT--GACTTT-AA-A-TTA--G-T-C-------------------TCATTTTAC-CAGCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-TT--GC-----TT-CG-TGC-TTC-ATAGGA---C-T-ACGCc
gi|49 : T--T-AA--A--TATCAA--AT------TTTATTTGACTTT-AA-A-TTA--TCT-CA------TT---T---TTT-------AC-C-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTTCG-TGC-TT
gi|5 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCA
gi|51 : gacgttacaattttgcaacatatgcacattcttgttaaagttctctaggcgagtcaaaaaataacattatctaaattagaatcatttctatttccttcaaaacaaaacttctgatattttcacggtccaagcattacttgcacataacaatgttttcaggtggtggttgggagggagggggtggggttgaagtggaatttcagaacggggaggagggtagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaattcttacaaacaagaggttatctttatttttatcaaaagcttatacaaacaatttaaaaaaaaagaatcattcggggtgggggctggggtgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgagcatgtttaccgatagtatttacggtaaaagttttatatcctgcaggccagacgcctaagtcgaatttcatgtgccacttttgacagtggtgatattatttctacacaaataaaaaacaagtttattacagaatctctcagttattgaaaaataaaaccaactttttaatgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-A
gi|52 : tgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGAAAGGGGTTTGGGGGCT-G
gi|55 : CAGCGACG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATGG-A-GC-A
gi|56 : ttttttctattaaccgG----------G--------------T--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTG--T------TT--T---------------TA-----------AT---TT---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------C
gi|57 : cattGGTG-TA-AC-TTAGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-
gi|6 : cattCAGTGGCG-TA-GC-ATGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAAGGGGTTTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAGCCT---GATG-C-A---TTTAG--ACA-------------TTAA-A-ATA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--GA-TTT-TT--TAATT---AA----------CT----TAA-----TA-----------ATC-TCCCCCC----CCCCC------A----A------AAAAAAAA--AGGG---G---G----------------G----A-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------T----CT----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TC-----------AT---TT---G-------A-G--ACATTT---T-G-T--A-CTAGATATCTAT-----TT---T-T---ATAA-CAAATA-AAT--TAG-ATGCATTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------TAAAT-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---CTTCGAA-----T-T-------T--A---A------T--------A--------T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAA--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCAGT------A-T--A--C---CA----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--A-T-TGCCT--TT--G-A---T--T-TAAAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------CTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GG--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TTCT-------------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TCA--T-T-CAATTTTTTT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-ACTAT--GC-----TT------------ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|60 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-AC-AG
gi|61 : tCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATAGAA-GC-A
gi|62 : tGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCTG-TGC-TTC-ATAGGAA
gi|7 : ----TAAA-AT--G-----------ATC-GTAACTT----CCTTA------G----A------AAAACAAA--AGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGG----G-------GGG----------G--------------GAGTCCATTAGT---------TT---------------------T----AC----TT----G--------CA----------TT----TTG--T------TT--C---------------TA-----------AT---TT---T-------G-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGGTTT-TAAA------TTGCCTTGA-A---------AGC-T-TCTAAAT-A-T-T-AAAAA-C------T-A--C--------TAAAA-TTTTCG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TG---A-C-AAT---C---GAA-----T-C-------T--A---A----------------------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----A--A---------T-----A-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--A--AT---T-GATAAAT--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--T--A-AA-AACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---GA----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CC-A--T-G-TGCTT--TT--G-A---TGCT-T-CAA-A--AAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT----Act
gi|7 : tggggCA----G----AT----AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A-G--------------TT----ACTTT--CTTCGTG--T-T-A----------------A--AT--C-AA--A--CTA--A--AG------TTTATTTGACTTG-AA-A-TAA--T-TGCA------TT---T---TTTTTT----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-AT-AT--GC-----TTCCG-TGCTTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|8 : tggggtaaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcagg----TAAG-AA--G-----------ATCCGTAACTTAATTCTTTC------ATAAAA------AGAAAAAA--AAAG---A---A----------------A----A-------AAA----------G--------------A--------------------TT---------------------T----GCCATCT-----GTTTTTATTCA----------TT----TGT--T------TT--T---------------AT-----------TT---TT---G-------A-G--ACGTTT---TTG-TTTG-CT------TC-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT---AGTATGTGCTTT--GAA------TT-CCTTGATA---------GGC-T-T-----TTA-T-T-AAAAAAC------T-AACT--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---TT---TG--AAA-A-AAG-----A---------A-C-AAT---A---GAA-----T-C-------T--A---A------TTA------G--------T------ACGGTGATAGTTTCACGATGAAA---CTT---GG--G-C--AGAG-TTCGGA------------AGC-CATGC--------------A------T-----T-----GGTGGCATTACCGT--------------GT---------A-----A--A-----------------A---------A-------------------------AAA--A-A-A----AAT-------GCGG--TTAATTT--A--AT---T---T-AAT--AA--------------TTATT-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG---CGGC------A-T--A--CCGGAA----T---G-TCT---G-------TC----T-T--C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TTTGG-A---T--T-T-AAATA--AAA-----------ATTTA--CA---T-T-ATATTTA--CAC-----ACA----A--------------TTG--CTT-AC-----G----AT----TA-------AGA-T--GA--A-G-TC-ACTT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TATT--------------TT----CTTTT--CTTCTTC--T-T-TTAA-------------A--TTA-T-AA--AT-TCT--A--AA------TTTATTT-ACTTTAAA-A-T----T-T-CA-----------------TTTTTTTCAC-C-GC--AAC-AC-TGTGG----AG-GCAAC-AT--GC-----TTCCG-TGT-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|9 : aacacaggcacatggg-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----ATTT---AAAAAAAA--------------------------------------------------------G--------------A--------------------TT---------------------C----AT----TTAATAGTTC-----CA----------CT----GCT--T------TT--T---------------TG-----------ATATTTT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--AACT------CT-T-----TT---T-T---ATGA-CAACTA-GAT--TAG-GTGTGTTTT-TGAA------TT-CCGTGA-A---------AGC-T-T-----A-AAT-T-AAAA--C------T-A--C--------TAGAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---C---GAA-----T-C-------T--A---AG-----T--------ACTTT----T------A-------GAT-----------AAAGCTT---AG--A-T--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--C--------------A------T-----T-----AAG-----T----TGTTATGATTAGA--GT---------A-----A--A---------T-----ATA---------A------A-------T----GT-C---AA--C-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-AAT-CAT--AAGATTTTGGGTTAGTTT--T-T---------T---GTTTTTT-T--------------TAA--A--C--A-AATATATA----------T------A-T--A--C----A----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-T-TGCGT--TT--G-ATATT--T-T-GA---------------------------------T-ATA--TT--GAT-----AAA----C--------------ATA--A-T-ACA----G----ATAA--AA-------AGA-T--GA--A-G-CC-A-TT-C----AGCATT-TT-TGA---CC---AAA-TATT-----TA-A--------------TT----ATTTC--TGTCTTT--A-C-AT-T-------------A--TT--TAAA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGA-TTTTAA-A-TTAT-T-T-CA-------T---T---TTTTTTTTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-CC-AC-AT--GC-----TTGTG-TGC-TTC-AGAGGAAG-C-T-ACGCCac
blockSeqs : G T G T ATG T A AT AA G G C CAATGGGTCCAG CCA A A AAT CA ACCCCACACCCACTTAATT T G G . GA A T G TC . C AA TA TTA AAACAGGACATTGGGGTAAGATTA CG AATT C TAATTTAA TCA GGGGAGGGGAGGGGGGAGGATTGTCCAATAATTAGTTTTACTGCAATTTTTGTTTTTTTTGGTTTTTTGTATTTTGA GC GAA T C TT A AGATATCTAT TTTCA A T AC T T ACCGAG G T CTCTATCCA T G CTAAAT T C A AA TACATG C AC ACGTTAAG G TT ATAAACGGTGC T T A G TAC TGTA CG T T TTGGCATT G G G ATCT GAGCT G CTATTAG TG GGTAGTTTTAGATGAAGGTTGGATAGAGTTCAGAACTCGGTTTCCGAAACACATGTAATTGTTATAACTAGAGTAAATATGTGCCTTTATTTACA TG T T TCTT TATAACAT AT TG AG . . A AAGATTTTGGGTTAGT AT A TGTTTT A TTAA CA CC AA T T CGA GGCGAAGCA G AA TA CTA AAAT CAT A CGGCTCTCCT AAGA A T G TCCCCGAA C AT A C AG CC T TAT GC . AAAAAAGATTTTTATATACGAGCACATACTACAATTCAATTTCAGTTTAC G GGAAT AAGG GAACTTT G GG CT C T CT A C GTAT G A T ATC TGG AA TACATGTATTTCTTTTC TCAC AAA AA TTTTTTTTTTTTTTTTA AA AT A GA AT CA TA AAGAAA CT T T T CATTTAGACTTCTTTT TTTT G A AA G G TTCA T G T TT TCCCG T T A C A A
blockSeqs : . . . . A . . A CA G . G . . . . T . ATTAAG . T . . A . C . C . . . AA . CACAGGCATATGGAGGTAAAGGC G . C AAGAAAAC A GGGGGGGATTGTCCATTAATTAGTTTTAATACTGCATTTTTTTTTGGGGGGGTGGGGGGGTTATTTTGA . . . . T . TTTAAAGA CAT . T . . G T G . C . A CTAAAT A . . A . . A A A TT . . . . . . T CG . . ATGACAT . . G CTTC . . . . ATTAGTACGGTGATAGTTTCACGATGAAACTTGGGCAGAGTTCGGAAGCCATGCATTGGTGGCATTACCGTGTAAAAAA . . . T TT . . . . . A CCAA . . CTGGG . TG . . . . . G GGG . . A CGG . . . GAA T . C . GT . T . . A TG . G GC . AAATAAAAATTTACATTATATTTACACACAATTGCT . CCGGA AA GAACTTT . T . . . C C . . A . T AG . A TACATGTATTTCTTTC . C . TTTTTTTTTTTTA GG A . . A C . . CT T . . CATTCAATTTTTTTTT TTTA . . AA . A . . A . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . T . . A TG T . G . . . . A . AGTAAA . . . . A . C . C . . . AA . TGGGTAAATG G . T ATAAAA C GGGGGGGGAGCGGGGGGGGGGGGGGAGTCCATTAGTTTTACTTGCATTTTGTTTCTAATTTTG . . . . . . CTT TT . . . . C . . . . . . TC . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . ATATGT . . A C . . . . TTGATGTAGTTTCCAGATAAAACTTGCACAAGTTCGAAGCACATTCGTTGTTATGAATCGCGTAAATACGTGTCCA . . . . TT . . . . . A TA . . CCCG . A . . . . . G GGC . . . . . . . GAA T . C . . . . . . . . . . C . AAAAAAAGATAATCAATTTGTAGGGCTTATTGC . GT . TACT . T . . . C . . . A . . . . A AGTGGTAT . C . TTTTCCCAT . . . . C . . . CT T . . CAGTTTCTTTTTATT TTTT . . AA . G . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A CG G . C . . . . T . ATTAAG . . . . A . . . C . . . AA . CTTAATA A . C AATTT A GGGGGGGGAGCGGGGGGGGGGGGGGAGTCCATTAGTTTTACTTGCATTTTGTTTCTAATTTTG . . . . . . CTC TT . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . ATTTAT . . G C . . . . AGTACTTTTAGATAAAGCTTAGATAGAGTTCAGAAACACATTAAGTTGTTATGATTAGAGTAAATATAAATGTC . . . . TC . . . . . . CA . . GTG . A . . . . . G AGC . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . AAAAAAAAAAAAAGATTATATAGGCCTACCTGC . TT . . . . . . . C . . . G . . . . A TATG . C . ATATT . . . . A . . . CT T . . CATTTAATTTTT TTTT . . AG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . A TG G . G . . . . T . AAACA . . . . A . . . C . . . A . G . C AATT A GGGAAAAGATTTGTCCATCTAATTTAGTTTTATACTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTGA . . . . . . CTA AT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . ATT . . G A . . . . AGTAGTTTTTGATAAAATTTGGACAGAGTTCAGAAGAACGTTAGTTGTTAAAAAATTAGAGTAAACATGTGTC . . . . TC . . . . . . AA . . TGT . . . . . . . G AGC . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . AAAATAGAAAGATTCTAATTAGGCCTGGGC . CG . . . . . . . C . . . G . . . . T TATT . C . AATTT . . . . T . . . CT T . . TATTTCATTTT TTTA . . AA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . A TG G . C . . . . T . TTAAA . . . . . . . . G . . . A G . C AATT G TTCGTCTAGGTTAGTTTCACTTCCTTTTTTTTTTTTCTTCAGTTTTTTTAACTTATGA . . . . . . ATT TT . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . ATA . . A A . . . . GTATTCAAACACTTGGCGACTCAGAGCTCAGAAACACTATTATTTGTTATCACTAAAAGTATACTACGTGTAA . . . . TT . . . . . . TA . . TG . . . . . . . G GGG . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . GAAAAAAAAAAGATTTATATATACATAT . G . . . . . . . C . . . G . . . . C TAT . C . GTTTT . . . . . . . . CT T . . AATTGCATTTT TTTT . . AA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . A TT G . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T AA A ATTGTCCAATAATAAGTTATACTGCATTTTTTTTTTTTAAAAAATTCTATTTGA . . . . . . CGT TT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . ATG . . G A . . . . AGTAGTTTCAAGATAAAATTTGGACAGAAGCACATTTATTTAGTTCGTTAAATAACTAGAGTAAACGGGTGTC . . . . TT . . . . . . CA . . TT . . . . . . . G GGC . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . CAAAAAGTGTATGGCCTATATGCCC . A . . . . . . . C . . . G . . . . A ATA . T . TTTCT . . . . . . . . CT A . . TATCTCATTTT TTTA . . AA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A T G . G . . . . . . T . C GA A AAAAAAAGATTTGCCATCTGTTTTTATTCATTTGTTTTTATTTTTGA . . . . . . CTT TT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . ATG . . G C . . . . AGTAGTTTCAAGATAAAATTTGGACAGAAGCACATTTATTTAGTTCGTTAAATAACTAGAGTAAACGGGTGTC . . . . GT . . . . . . AA . . TG . . . . . . . G GCC . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . CAAAAAGTGTATGGCCTATATGCCC . G . . . . . . . A . . . G . . . . A TAT . C . TTTAA . . . . . . . . CT T . . AATTGCATTTT TTAT . . AA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A G . . A . G . C CA T GGGGGGGGTGTCCATTAATTAGTTTTATAGCATTTTTGTTTG . . . . . . CTT TT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . AC . . G C . . . . ATAAAGCTTCGATAGAATTAAGAAAGCCATATGATTATAGTTATCATAACTCAGTATAGTAAATAACGTCTA . . . . TT . . . . . . AT . . TG . . . . . . . G GGC . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . TAAAAAGATGTATATACATGTGT . G . . . . . . . C . . . T . . . . A TTA . C . TTTG . . . . . . . . CT A . . TATTTCATTT TTTT . . AA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . A . . G . G . T AA A GATTCATTTAATAGTTCCACTGCTTTTTTGATATTTTGA . . . . . . ATT TT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . AT . . A C . . . . AGTAGTTTCAGATAAAACTTGGACAGAGCTCAGAAGCACATTAGTTGTTATCACTAAAGTAAATACGTGTCA . . . . GT . . . . . . AA . . TG . . . . . . . G GAC . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . TAGATAGATTGATAAACATTAC . G . . . . . . . C . . . C . . . . C TAT . T . TAAA . . . . . . . . CT T . . AATTCTTTT TTTT . . AA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A . . C AA A GGGAGGGGGTTTCTTGCATTTTTTTTTTCATTTGA . . . . . . CTT TT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . AT . . G C . . . . AAGCTTGGACAGAGTTCAGAAACACGTGTAATTGTTATAACTAGTATATATAGAGTAAATACGTGTAC . . . . TT . . . . . . AT . . TG . . . . . . . G GGC . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . AAAAAAAAATTATATACTTGG . G . . . . . . . C . . . G . . . . A TAT . C . TATT . . . . . . . . CT . . . TATTTCATA TTTT . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . AA A ATTATCCATTAGTTTGAATGCATTTCTGGA . . . . . . AGA TT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . AT . . G C . . . . GTAGTTTTATTTAAGCTTTGGTGGAATTCAAAAAACACATCTAATTTAGTTGTTATAAAGTCTTTA . . . . T . . . . . . AA . . TG . . . . . . . G GGG . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . AAAAAAAAATATTACTTGG . T . . . . . . . C . . . C . . . . A TAT . C . ATTC . . . . . . . . CT . . . CATTTAAAT TTTC . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . AA . . . . . . . TTG AT . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . AT . . A C . . . . ATATAAGTACTTGGACAGAGTTCAGAAAGCACATTAGTTTGTAAATAAACCGTTCCA . . . . T . . . . . . A . . TG . . . . . . . A ATC . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . GATATATTGATAAACATAA . G . . . . . . . C . . . G . . . . A TAT . C . TCCT . . . . . . . . CT . . . TATCATTAT TTTT . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . GA . . . . . . GCT TT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . AT . . A A . . . . GTATTGATAAAAAAACTTAGAGGAAAAAGATTCAGAAGCACACTAGTTAAACTA . . . . T . . . . . . G . . TG . . . . . . . T AGT . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . TAAAAAGATTTCAATAC . T . . . . . . . C . . . G . . . . A TAA . C . CATT . . . . . . . . C . . . TATTCATA . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . CTT TT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . AT . . A C . . . . ATAAAACTTGGAGAGACTTCACGAAGCACATTAGTTATAATTAGAGT . . . . T . . . . . . A . . TG . . . . . . . G ATC . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . TAAAAAGATTTAATAC . G . . . . . . . C . . . . . . . . A TA . C . TA . . . . . . . . T . . . TTTCTC . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCT T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . G . . T . . . . . . . A GGC . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . TATACGTGC . T . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . T . TA . . . . . . . . C . . . TAGTC . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CTT T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . AT . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . A . . . TATG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . TTCA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : N*** A* *** T** ATTAAA************** ******* *** C** AGGACACGGGTAAATA********************* TT******* ** *** TG**************** ************** GGC****** C** CT TATTTCATTTT*************** AA
originalCons : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AN--TTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--CA-TTT-TT--TAATT---AA----------TT----TAAG-AT-TG-----------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----A------AAAAAAAA--AGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TN-----------AT---TT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---A------T--------A--------T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTT--CTTCTTT--T-T-TT-T-------------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTA--T-T-CA------TT---T---TTTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
finalCons : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-ATN---AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-AT--TTTAG--ACAATTAAA--------------AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CAC--A-TTT-TT--TAATT---AAAGGACACGGGTAAATA---------------------ATC-GTAACTT----CCTTC------A----A------AAAAAAAA--AGGG---G---G----------------G----G-------GGG----------G--------------G--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TTT--T------TT--T---------------TN-----------AT---TT---G-------A-G--ACGTTT---T-G-T--A-CT------CT-T-----TTTT-------ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA------TT-CCTTGA-A---------AGC-T-T-----T-A-T-T-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-T-GT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---C---GAA-----T-C-------T--A---A------T--------A--------T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----A--A---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-TTG----------------TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---GA----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CC-A--T-G-TGCCT--TT--G-A---T--T-T-AAA-A--AAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT----AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA-T--------------TT----CTTTTC--TTCTTT--T-T-TT-T-------------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGACTTTTAA-A-TTATTTCATTTT---------------TTTTTTTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-AT--GC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AAGAGCAAGAGTCACGAATAGATCCAAAATGGACGCCATTTGCTGAGACAGTTGATATCATTTCATAGATCAGTAGATCAAGAAAAGTGTTAATTTTCAAATATACTTCCCTTTTTCGATATCGTATCAATTTATTTAGTTATATAGACGTTTCAAAGTTAGTCATTTGTTATTTCTTGGGCCAATTTTTGTTTTTGACGTAAAACACTTTTACAACGTATGTATCTAGTATCAAAACATATACATATATATTCGTCATTTCTTTACATACAAAAATCTAGATTATGTTCACTGTTCCAGACTCACTACTTTGTCACTTTGCAATGTTTTTCAAGAGTGGTGGTTGGAAAGAACGGGGGAGGGTGATCGTTGCTGTATCTAACGAATTTCAAGAAGAGGAGGGGTGGGTGTGTAGAAAGGTCAGGGGGTATAACAATTCTGCATTGAAACTCCTTTAGTGGATCTTCAGGTAGACGAGTTATTAAAAGGCAATAGGTAAGGTGATATTTAATTATTTTTAATCA
Unaligned ( gi|33 ): TCAGGAATTTCAGAAACAGTGGGAGGGGGAGAAGGTGAGTTGCTTGAAGCTCCCAGAGGACAGAGCGAGACCCCCGGAAAGCTGACACATTCTCTACACAAGCAAAAGTTTTTATTTTTAATTTTTTTAAGAAATGCTTTGTTCGGCACAAACACTTTTTTAAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CCCCAGTAGGTCCAGGACAGAAACCCTGTTTGTGGGCCAGCAGGGGCGAAGGCCCCCGGGAAGCAGCATGGAACTTCTTTTACAAGAACGATTTCGCTAAACATTTTTATTTTTTA
Unaligned ( gi|40 ): GGGGTCTGGCAGCCGCTTAAAAATAGGCCGCCCAGTGGGTCAGAACTTGCCCTATATAGTAGCCTAGGGGGTCCAGGGGGCGAAGCTCCCGGAAACTGAGAGGTTTTAGAATTC
Unaligned ( gi|48 ): GGCGAAGCCCCTGAAAGCTGACAAATTCTTACAAACAAGAAGTTTTTGTTTTATCAAATGCTTGTTGTACAAACAAAATG
Unaligned ( gi|50 ): AAGGTACTAGTATGGGAGCCGCCCTAAGGCCTTGGTGAGTCCAGGACAAAGCCTTGGTTGAGGCCCTGGGGGC
Unaligned ( gi|53 ): TTGGGGCTGCCATGAGACCAGCCCCGAGGGTCCAGGACTAAGTCCTAGTAGGGGTCCAG
Unaligned ( gi|54 ): TAAATTCTTACAAGCAAGAGGTTTTTAAAAAATTAAATGCTTGTTGTACAAACTA
Unaligned ( gi|58 ): TGAGTATGAGTACGGTAAAAGTTTTATAACCTCCAGGCC
Unaligned ( gi|59 ): AGGTGCATTTGACTATTTCAAAAGGTTCCCGAACCATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111111 111 11 5555555555555555555555555555555555 111 1 111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111111111 1111111 11111111111 222222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 222222222222222222 111111111111111111 22222222222222 11111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 1111111 222222222222222222222222222 444444444444444444444444444 11 1 333333333333333333333333333 111
lowQualScore : 2 2 2 2 6666 2 2 44 99 0 3 3 2 3 777777777777 555 8 4 22 1 66 1111111111111111111111111111111111 5 777 5 5 3 1 4 666666 8 66 66 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 88 5555 9999999999999999999999 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 999 1 1 1 44 1 333333333333333 666666666 2 6 22 2 5 0 1 3 2 2 2 4 3333333 4 4 77 666666 2 55 99999999 4 55 00000000000 2 2 2 333 4444 66 2 2 000000000000000 2 2 9999999 55555 7777777 33 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 2 2 7777 00000000 33 33 33 444 2 7 000000000000000000 33 2 444444444444444444 2 88888888888888 33 33 33 2 2 444 555555 2 22 44 5555555 4444 333 2 88888888888 8888 2 6 2 00000000 22 2 2 2 55 333 77 2 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 111111111 22 8888888 2 77 22 2 2 22 4 2 4444 2 2 4 666 333 33 111111111111111111111111111 4444 666666666666666666666666666 66 55 4 22 11 44 55 777777 222 3 4444 66666 0 444444444444444444444444444 1 1 333 3 3 3333 1 3 1 22 44444 1 5 2 2 2 2
lowQualScore : . . . . .... . . .. .. . . . . . ............ ... . . .. . .. .................................. . ... . . . . . ...... . .. .. ........................................................... .. .... ...................... . ................................................................................................................................................................................................................ ... . . . .. . ............... ......... . . .. . . . . . . . . . ....... . . .. ...... . .. ........ . .. ........... . . . ... .... .. . . ............... . . ....... ..... ....... .. .............................................................................................................................................................................................................................................. .. . . .... ........ .. .. .. ... . . .................. .. . .................. . .............. .. .. .. . . ... ...... . .. .. ....... .... ... . ........... .... . . . ........ .. . . . .. ... .. . .................................................................................. . ......... .. ....... . .. .. . . .. . . .... . . . ... ... .. ........................... .... ........................... .. .. . .. .. .. .. ...... ... . .... ..... . ........................... . . ... . . .... . . . .. ..... . . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 9999 2 2 44 00 4 3 6 0 8 111111111111 666 9 4 22 4 11 1111111111111111111111111111111111 0 555 0 0 3 9 0 555555 0 11 11 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 3333 2222222222222222222222 2 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333 9 9 9 55 9 777777777777777 666666666 1 0 88 0 7 6 9 8 0 0 0 0 4444444 0 0 11 111111 1 00 77777777 2 88 00000000000 1 1 2 999 7777 11 2 4 777777777777777 5 5 1111111 99999 6666666 22 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66 4 4 4444 77777777 22 22 22 111 4 1 444444444444444444 11 2 777777777777777777 5 44444444444444 44 44 22 4 4 222 888888 0 88 88 3333333 2222 555 0 22222222222 2222 0 0 0 00000000 88 0 0 1 88 777 99 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 333333333 66 2222222 1 11 99 1 1 66 2 1 5555 2 2 4 666 777 44 222222222222222222222222222 5555 222222222222222222222222222 55 33 2 99 33 88 55 444444 999 1 0000 33333 3 666666666666666666666666666 9 9 999 8 8 9999 8 6 8 55 55555 8 5 1 4 4 4
consensus : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-A--TTTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--C-A-TTT-T--T--TAA--TT---AA---A-------GG-A---CAC----G-G--G--TAA---------G-NA-ATC-GTAACTT----CCTT---C------A----A------AAAAAAAAAGGG---G---G----------------GG-------GG--------G----------G--------------G--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TT-T--T------TT--T---------------TN-----------AT---TT---GA-GACGTTTT-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----T-A-TT-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-TGT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---C---GAA-----TC-------T--A---A------T--------A----T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----AA---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CCA--T-G-TGCCT-TT--GA---T--T-T--AA-AAAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-------------TT----CTTTTCTTCTTTT-T-----------TT-T----------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGA-CTTTTAA----ATT---A-TTTCA--------TT---TTTT--TTT-TTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A--TGC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
Reference ( family-2559 ) : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-N--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAGGGGGTTCGGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAAGCT---GGTG-C-A--TTTTAG--ACAA------------TTAA-A-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--C-A-TTT-T--T--TAA--TT---AA---A-------GG-A---CAC----G-G--G--TAA---------A-TA-ATC-GTAACTT----CCTT---C------A----A------AAAAAAAAAGGG---G---G----------------GG-------GG--------G----------G--------------G--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TT-T--T------TT--T---------------TN-----------AT---TT---GA-GACGTTTT-G-T--A-CT------CT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----T-A-TT-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-TGT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---C---GAA-----TC-------T--A---A------T--------A----T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----AA---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CCA--T-G-TGCCT-TT--GA---T--T-T-AAA-AAAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------NTG--C-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-------------TT----CTTTTCTTCTTTT-T-----------TT-T----------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGA-CTTTTAA----ATT---A-TTTCA--------TT---TTTT--TTT-TTTTAC-C-GCAAAAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A--TGC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|1 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAG--CCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GGTGATCTTTATTT-TTATCAA-AAGC-TT-G-TA-CAAAC-AATTT-T--T--TAA--AA---AA---A-------GA-AT--CAC----G-G--G--
gi|1 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-ATAT--AATATGGAA-GC-AGAGA-Gggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaatataatatggaagcagagag
gi|10 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgtttagaacttaaattatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgtttttttcaatatctgttcaaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgtttgacgcttacaatttcgcaacatatgcacatttcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaataataacattgatctaaattagaaaatttctatttctttcaaaacaaaaattctgaattttcaactgtccaagtattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgagcccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaacaattttttaaaaaaagaatcacgggggttggggggttgaaattctttggctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagtttatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgagcagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcattattgaaaaagaaaaccaacctttattgagtgagggtgcattttttcttactac----AT----T-----G--------CA----------TTAAGATT-T--T------TT------------------------------------------A-GACGTTAT-T-T--A-CT------AT-A-----CTGAGT-T---ATGA-TAACTATAAT--CAT-ATGGCTTTC-TTAA-TT-CTATCG-A-AGC-T-T-----T-A-TTCAAAA--C------T-A--C--------TAAAA-T--------------------C-ATC-CAA---TT---T----------AG-----A----T----G-C-A-T---C---GAA-----TT-------T-------------T--------A----C------C-------AGT----------------TT---TA--A-T---GAA-TTCA-A------------AAA-CA--C--------------ATTTAATT-----T-----AGTTG---T----T--------------AT---------A-----AG---------A-----A-A---------A------CTACAATAC----GT---CAAAC-A-A-A----AAA------TGCAG--TAAAGCT--A--ATGCATGGAT-AAT--CG--------------GT--T-TGTTGCATTAT---G----TT-TTTAAATTTTTTTAAAAA--A--T--A-AA-TTGAAGGAA--AT-----------T--A--C---G---A----T---G-TCC-
gi|10 : aa--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TT-T--T------GT--T---------------T-------------------------GACGTATT-G-T--A-GT-------T-T-----TC---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAA-ATGTGTTTT-TGAA-TT-C----------------------A-TT-AAAA--C------T-G--G--------TAAAA-TT--CG-----------A-TGC-ATC-TAA---AT---TG------G-ATG-----AT---T----T-T-AGT--------AG-----TT-------TTGA---A------T--------A-----------A-------AG----------------CTT---CG--A-T--AGAA-TTAAGA------------AAGCCA--T--------------A------TGATTAT-----AGT-----TA---TCATAACTCAGTATAGT---------A-----AA---------T-----A-A------------------------C----G--TCTAAA--A-A-ATCTTAA-------TGCAA--TTA--CT--A--A------GA--AATCCAA--------------GT--T-T---------T--------TT-----------------------------AA-ATGAA-GGG--GCGGG------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------CC----T-GA-C-C--------CCA--T-G-TGCCC-TT--GA---T--TCT-AAA-TAGATTGTCATTTTTAAAGA--CA---C-T-A-----A--GAC-----CAA---------------------G------ACA----G----AT--AA-------AGA-T--------A-TA-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---AC---AAA-TAAT-----TA------T-------------TT----C-----------T-G-----------TT-T----------A--AT--C-AA--A-------A--A-------TTCA--TAA-C-ATTAA----ATT---A-CTTAA--------------------TT-TTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-------------------------GC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCtactaagaaatccaagttttttaaatgaaggggcgggatacgatgtccggcctgaccccatgtgcccttgattctaaatagattgtcatttttaaagacactaagaccaagacagataaagatataattcagcattttcgaacaaataattatttctgtttaatcaaaaattcataacattaaattacttaattttttaccgcaacaatgtggaagcttcataggaagctacgcc
gi|12 : aaggacatcgtaatttccttcaatttattttttaaaaaaatttaaaaacataatgcaacaaaccgattatccatgcattagcA---A-------GC-A---CAT----GTG--G--CAA---------G-AAGATC-GTGACTT----CCTT---G------G----G------GAAAAAAAGGGG---G---G----------------GG-------GG--------GTCCATTATTAG--------------T--------------------TT---------------------T----AC----A-----G--------CA----------TT----TT-T--AAAA---TT--T---------------TA-----------TT---TT---GA-AACGTTTT-G-T--A-TT------CT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AAT--GAG-ATGCGTTTT-TGAA-TT-CCCTGA-A-AGC-T-T-----T-A-TT-AAAA--A------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-TGT-ATC-TAA---AA---TG--AAA-G-AAGATGACA----T----G-C-AGT---C---GAA-----TC-------T--A---AG-----TAGTTTTTGA----T------A-------AA------------A---TTT---GG--A-C--AGAG-TTCAG-------------AAG-AA--C--------------G------T-----T-----AGT-----T----G--------------TT---------A-----AAAAATTAGAGT-----A-A---------A------CA------T----GTGTC---A--A-C-A----AAT------TGCAG--T-----T--G--AT---T-GAT-AAT--TA--------------TT--T-T---------T---
gi|12 : aacacC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-C-------TC----T-TA-C-T--------CCA--T-G-TGCCT-TT--GA---TC-T-T--------A-----------AAAAA--GATTTT-T-ATA--TACGAGCACATACTA----CAATTCAATTTCAGTTTA--C-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AGCATacacggtaaaggctatctatagcctccacctttttacatacgatgtccgctcttactccatgtgcctttgatcttaaaaaagatttttatatacgagcacatactacaattcaatttcagtttactacagataaagatgaaatcattcagcat
gi|13 : aacacaagcacatgtggcaagaagatcgtgacttccttggggaaaaaaagggggggggggtccattattagttttacagcatttttaaaattttattttgaaacgttttgtattctttttataacaactaaatgagatgcgtttttgaattccctgaaagctttattaaaaatactaaaattcgatgtatctaaaatgaaagaagatgacatgcagtcgaatctaagtagtttttgataaaatttggacagagttcagaagaacgttagttgttaaaaaattagagtaaacatgtgtcaacaaattgcagttgattgataattatttttacacggtaaaggctatctatagcctccaccttttta---A-------GC-A---CAT----G-G--GG-TAA---------G-AAGATC-GTAGCTT----CCTT---TTAATTTA----A------AAAAAAAAAAGGTTCGTCTA----------------GG-------TT--------A----------G--------------T--------------------TT---------------------C----AC----T-----T--------CC----------TT----TT-T--T------TT--TTTTCTTCAGTTTTTTTA-----------AC---TTAT-GA-G-CGCTTT-G-C--A-CT------CT-C-----TT---T-TTCAATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTC-T----TT-TCTT
gi|13 : aacacA-----TC-------T--C---A------T--------A-----------A-------A-------------A---CTT---GG--A-G--AGAC-TTCACG------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T-------------------AT---------A-----AT---------T-----A-G---------A-------------------GT-------------A----AAT-------ACA----CAATCT--A--AA---T-GAT-A-T--A---------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--G-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------T-A--A--C---G---A----T---G-TCC-T-G--------C----C-TA-C-T--------CT---T-G-TGCCT-TT--GG---T--T-T--------T-----------AAAAA--GA---T-T-TCA------------------------------------ATA--C-T-AAA----A----AT--AA-------AG--------------C-A--------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-------------TT----GTGTT----TTTTAT-----------AT-T----------A--TT--T-AA--C--TCT--A--CT------TTTATTTGA-C-TTTAA----A---------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-AC-T--TGC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGTCACttttttttttatctcataaaacttggagagacttcacgaagcacattagttataattagagtaaatacacaatctaaatgatatatttttgtttaaaatgaaatgaagggggcggctaacgatgtcctgcctactcttgtgcctttggttttaaaaagatttcaatactaaaaataaagcatttcgaccaaatatctatttgtgttttttatattatttaactctacttttatttgactttaaaaccgcaacattgtgaagcacttgcttccgtgcttcataggaagctacgtcac
gi|14 : aacacagcacatggggtaagaagatcgtagcttccttttaatttaaaaaaaaaaaaggttcgtctaggttagtttcacttccttttttttttttcttcagtttttttaacttatgagcgctttgcactctctttttcaataacaactaaattagatgcgtttcttttcttttttttttttTA-CA--C-AATTT-C--T--TAA--TTTT-AA---ACTCAG--GA-A---CAT----G-G--GGGCAA---------G-GACACC-ATAACTT----TCTT---C------A----A------TTAAAAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AC----A-----A--------CA----------TT----AT-C--C------AT--C----------------A-----------GT---TT---GA-A------T-G-T--A-TT------TT-TAAAGACT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGTGTTTTTTGAA-TT-CCACCA-A-AGC-T-T-----A-A-AT-AAAA--C------T-A--C--------TAACA-TT--TG-----------A-TGT-GTC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---A---GAA-----TT-------T--AG--G------T--------AGTTTT------A-------GATGAA--------G---GTT---GG--A-T--AGAG-TTCAGAACTCGGTTTCCGAAA-CA--C--------------A------TG----T-----AATTG---T----T--------------AT---------AACTAGAG---------T-----A-A---------ATATGTGC-------CTTTATT-TACAAATGA-A-AT---AAT------TGCAG--GT-ATCT--A--AT---T-GAT-AAT--CA--------------TT--T-T---------T---G----T
gi|15 : tccgATTA-ATT--TAA-ATGCATATT-T----TT---TTGA-A-CGT-TGT-----T-G-TT-A-----C------TCA--CA-------TAAAA-T---CG-----------G-T----TC-AAA---AT---TG--AAA-G-AAGTTGGCA----TT---A-T-AGTATCT---GAAGAGCTTA-------C--A---G------T--------A----TTC----A-------AAC-----------A---CTT---GGCGA-CTCAGAG-CTCAGA------------AA--CA--CT-------------A------T-----T-----A-T-----T----T--------------GTTATCACTAAA-----AG---------T-----A-T---------A------CTA-----C----GT-GTAAAA--T-ATA----AAT------C-CAG--TTAATCCTGG--AT---T-TGT-ATT--AA--------------CT--TATG--------T---G----TT-TTG------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGAG--GCAGC------A-T--A--C---CTACA----T---G-TCC-C-G-------TC----T-TA-C-C--------CAT--T-G-TGACT-----GA---T--T-T-AAA-AAA--------------AAA--TA---T-T-AC---TT--GGC-------A----C--------------A-G----T-ATA----A----GG--AA-------GGA-TGGGA--A-ATTC-A-TT-CGTATGACATT-TT-CGA---TCTGGTAA-TATC------A------TA------------TT----CCTTTCTTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttccgtttacacacgatatttta
gi|16 : aaaaaataaaatgtctATTA-ATT--TAA-ATGCATTTT-T--------TTTAG-A-CGT-T-T-----T-G-T-----A--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-TGT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----G-C-AGT---A---GAA-----TC-------T--A---AGTAGTTTCAG-----A----T------A-------AA------------A---CTT---GG--A-C--AGAG-CTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------ATCACTA----A-----AG---------T-----A-A---------A------TA------C----GT-GTCAAA--A-A-A----AAT------C-CAG--TTAACCT--G--AT---T-GAT-AAT--TA--------------TT--G-T-------------A----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG---CAGC------A-T--ATAC---G---A----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CCA--T-G-TGACT-----GA---T--T-T-AAA-AAAA-----------AA----------T-T-ATA--TA-----------------C--------------TTG--G-C-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----AACATT-TT-CGA---CC---TAA-TATC-----TA------T-------------TT----CCTTTC
gi|17 : ttttctttaattttaaacagatcataaattctctaaaaaataaaatgtct----G-G--G--TAA---------G-GACATC-GTAACTT----CCTT---C------A----ATT----AAAAAAAACAAC---A---------------------------------------------------------------------------------------T---------------------T----A-----T-----C--------CA----------TT----AG-T--T------TGAAT---------------GC-----------AT---TTCTGGA-GACGCTTT-G-T--A-CT------AT-T-----TT-----T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGTGGTTT-TAAA-TT-TCGTGA-A-AGC-T-T-----A-A-TT-AAAA--C------T-T--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-TGT-ATC-TAATACATGTATG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---A---GAA-----TT-------T--G-------------------------------A-------AG----------------CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--CGTGTAATTGTTATAA------C-----T-----AGT-----A----T--------------AT---------ATAG--AG---------T-----A-A---------A------TA------C----GTGTAC-AA--A-A-T----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--CA--------------TT--T-T---------T---GT---TT-T--------------TAA--A--C--A-AA-ATGAAGGGG--GTGGG------A-T--A--C---G---A----T---G-CCC-A-A-------TCAAGAG-TA-C-C--------CCA--T-G-T
gi|18 : aacacaggcacatggAAGCCCCC------------GGAAGCT---GCTG-CAA--TTTTCG--AC-A------------TTAA-G-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-AC-GATA-CA----A-TTTCT--T--TAT--CT--------A-------GA-A---CAC----A-G--G--CAC---------A-T
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctggggga----T-TA-C-C--------CCA--T-G-TGCCT-GT--GT---T--C-T-AGA-TAAA-----------GAA-----A---T-T-GTA--Tggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|18 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacg---------------------T----AC----T--------------CA----------AT----TT-T--T------GT--T---------------TG-----------TT---TT---GA-AACCTTTT-TCT--A-CT------CG-T-----TT---CAT---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTA-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGCTT-T-----T-A-TCAAAAA--C------T-A--C--------TAACA-TT--CGATAAACGGTGCA-TGT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-ACG-----ATATGT----A-C-AGT---C---GGA-----TC-------T--agtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttatactcaatttttgtttgttttgaaacctttttctactcgtttcataaacaactaaattagatgcgtttatgaattccttgaaagcttttatcaaaaactactaacattcgataaacggtgcatgtatctaaattgaaagacgatatgtacagtcggatct
gi|19 : ttgccctgtgatgtcctgggggaaagcccccggaagctgctgcaattttcgacattaagagaggtattttcaaagtcacgatacaatttctttatctagaacacaggcacatggggtaaagtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcgagattgtccatcttttaTT-TGAA-TT-CCGTGA-C-AGC---G-----T-A-TT-AAAA--C------T-A--CACGTTAAGTAAAAGTT--CG-----------A-TGCAATC-TAA---AT---TG--GAATGTAAG-----A----TA---A-C-AGT---C---GAA-----TCCTATTAGT--A---G------T--------A----TTGATAAA-------AAA-----------A---CTTAGAGG--A-A--AAAGATTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------C-----T-----AGT--------------------------T---------A-----AA---------------------------------------------------CTAGA--ATA-A----AATATAACATACAGATTCAATCT--AAGAT---T-AATAAAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TTAC--------------AAT--A--TAAA-AA-ATTAAGGGG--GCGGC------A-TAAA--C---G---AAAATT---C-TCT-A-T-------GC----TATA-C-CGT------CTAATT-T-TTACT-TT--GA---T--T-T--------T-----------AAAAA--GA---TGT-ATA--TA-----------CA----T--------------GTG--T-TGAAA----GGAATAT--AATACT---AAA-C--AA--A-A-T--A-TTCC----AGCATT-TC-CGA---CC---AAT-TATC-------------T-------------TT----ATTTTCCTGTTTT-T-----------
gi|2 : GGGG-GT-AGAA---GGCACGGGGTTAAGCGGCT-GCCTTGAAGCCCC------------AGCAGGTCCAGGTGAC-AAATTTCTT--ACAA--------------AACA-AGA-GGTGATCTTTATTT-TTATCAA-AAGC-TT-G-TA-CA--A-AATTT-T--T--TAA-------AA---A-------AG-AAATCAC----G-G--G--a
gi|2 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaaCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAGA-Gggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactaccagcggcgtagcttggggtaaataaatatggaagcagagag
gi|20 : aaagagcaagagccacgaatagccaaaaatggcccattgttagaacttaatatcatttacagagacagtagccaagaaaatgtaattttcaaatatgctttcgttttttcaatatctgttcaatttatttagttattgacgttcaaagtagtcattgtttttagccaatttattgttttgacgttacaatttcgcaacatatgcacattcacgttaaagttctctaggtaagtcaaaaaataacatgatctaaattagaatcatttctatttctttcaaaacaaaaattctgatattttcacttttcagtaattacttgcacattgtaatgttttcaggtagtggtgtggggagggggggggggctgaagtggaatttcagaagggggtagaaggcacggggttaagcggctgccttgaagccccagcaggtccaggtgacaaatttcttacaaaacaagaggtgatctttatttttatcaaaagcttgtacaaaattttttaaaaaagaaatcacgggggggttggggggttgaaattctttgctctgaatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttgagcatggttagtatttacggtaaaagttttatattctctaggccagacgcctaactcgaatttcctgtgccatttttgacagtggtgatattattttctaataaaatattaggattattacagaatctctcaattattgaaaaagaaaaccaacctttttattgagtgagggtgcattttttcttactac-------C----GTGTCCAAA--A-A-A------T------TGCAA--TTAAT----A--AC---T-----------A--------------TT--T-T---------CTGGG----GT-T--------------AAACAACCT--A-AT-ATGAAGGGGCGACGCC------AGT--AA-C---G---A----T---G-TCCCG-GCTCTCCTTC----C-TA-C-CTCCCCGAACCC--T-C-TCCCTATTCCGG---T--T-----A-AAAT-----------AGAAA--GA---T-T-CTAATTA--GGC-----CT--------------------GGG--C-T-TCACCGGA----AT--GA-------AGAGT--GACTACA-TCTA-TT-C----AGCAATATT-CGAAG-CC---AAAATATGAGTGGTA------T-------------TTTCACCTTCTCTCTTTTT-T-----------TT-TCCCAT-----A--TT--T-AA--A----T--A--ATAAGAAATCT-TTTGA------GA----ATC---AGTTTCT--------TTTTATTTT--TTT-TTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-AA-A--TGTTCCCGTCCCG-TGC-TTC-
gi|21 : CAGTAGC--TA-GCGTTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCTGGGGGTTT-GGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------
gi|21 : gttttaatGGGGGTCCAGGATGC-G----AAGCTCCC------------GGAAGCA---GGTG-C-A--ATTTAG--ACA------------------------------------TT-T---CAA-AGTC-TCTGATA-CA--CAA-TTT-TCAT--TAATTTT---AA---ACACAGCTAG-G---CACAATGG-G--G--TAAGAAGATTTTA-TA-AAT-AAAACT-------TT---C------A----A------GGGGAAAAAAGG---G---G----------------TG-------TACATTAATTA----------G--------------T--------------------TT---------------------T----ACT---T-----GC-------CA----------TT----TTGT--T------TT--T---------------TG-----------GC---TT---aatgggtccagggcaaagccctgatgggggtccaggatgcgaagctcccggaagcaggtgcaatttagacatttcaaagtctctgatacacaattttcattaattttaaacacagctaggcacaatggggtaagaagattttataaataaaactttcaaggggaaaaaaggggtgtacattaattagttttacttgccattttgttttttggctttttttttatgtg
gi|22 : gttttaatcagtagctagcgttggggtagattaatatggaagcagaaagggctgggggtttggggccgccctaaggccccaatgggtccagggcaaagccctgat-A---CACATG-G-G--G--TAA---------G-AAGATT--TAACTT----CTTT---C------A----AGAAAACAAAAAAAAAGAG---G---G----------------GGAGGGGAGGG--------G----------G--------------GAGGATTGTCCAATAATTAGTTT---------------------T----AC----T-----G--------CAATTTTTGTTTTT----TT-TGGT------TT--T---------------TT-----------GTATTTT---GA-GACGTTTT-G-T--A-CT--------------------------ATAAACAACTA-AAT--AGA-ATGCGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-ACAAC-T-T-----C-A-TA-AAAA--C------T-A--C--------TAAAA-TT--CG-----------A-TGT-ACC-TTA---A----TG--TAA-A-TAG-----A----T----AGC-AGT---C---GAA-----TC-------T--A---AG-----T--------AGTT-T------A-------GATAAA--------A---CTT---TG--ACC--AGAG-TTCAG-------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----tttttttatgtg
gi|23 : aacacaaGAG-TTCAGA------------A-G-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----TGT--T--------------AT---------A-----GAAG-------T-----A-A---------A------TA------C----GT-GT-AAA--A-A-A----AAT-------GCAG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-----------------------T--T-T---------T---G----TT-TTTAA----------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------TT----T-TA-C-C--------CCA--T-T-TGCCT-TT--GA---T--T-T-----------------------------------------TA-----------TA----C--------------GTG--C-T-ACA-------------------------------------TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAC-TATC-----TT------A-------------TT----CTTTTCTTCTTTT-T-----------TT-G----------AAATT--T-AA--AA-TCT--A--AT------TTTATTTGA-CTTT-AA----TTT---A-TTTCA--------TT---TTTT----------AC-T-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A--TGC-----TTCCG-TGC-TTC-ATACGAAG-C-C-ACGCCgtta
gi|24 : --A-AA-ATGAAGAGG--GCAT---------T--A--C---G---A----T---GATCC-G-G-------TC----T-TCTC-C--------CCA--T-GCTGCCT-TT--GA---A--T-T-TAA-AAAA-----------AAAAA--AA---
gi|24 : aaAA-AAAA-----------GAAAA--GA---T-T-ATA--TA--TACACA--CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----TT---AT--AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA------CATGTATTTCTTTCTT----CTTTTTTTTTTTT-T-----------TT-TTTTTTTTTA-A--TT--T-AA--AATTCG--A--AT------TTTATTTGA--TTTTAA----ATT---T-ATTCA--------TA---TTTT--TTT-TA--AC-C-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A--TGC-----TTCC--TGC-TTaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagaaaaaagaaaagattatatatacacactaggggcctagtacattataaataaaattttcgaccaaatatctacatgtatttctttcttcttttttttttttttttttttttttaatttaaaattcgaattttatttgattttaaatttattcatattttttttaaccgcaacaatgtggaagcacatgcttcctgctt
gi|25 : aaaaaatgaagagggcattacgatgatccggtcttctccccatgctgcctttgaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaaaaaaaaagC-GATA-CA--C-A-TTTCT--T--TAA--TTTTAAACACA-------GGCA---TAT----G-GAGG--TAA---------A-GGCATC-GTAACTT----CCTT---C------A----ATT----AAAA
gi|25 : c--------------------TT---------------------T----AA----T-----G--------CA----------TT----TT-G--T------TT--T---------------TA-----------CT---TT---AA-GACATTTT-G-T--A-CT------CT-T-----GT---T-----ATAA-CAACTA-AAT--AAG-GTGTGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----A-A-TT-AAAA--CTACATGT-A--C--------TATAA-GT--CG-----------A-TGC-ATC-TAA---AT---TG--AAG-G-AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgcttttaatgcattttgtttttactttaagacattttgtactcttgttataacaactaaataaggtgtgtttttgaattccttgaaagcttaattaaaactacatgtactataagtcgatgcatctaaattgaaggaa
gi|26 : ccgatacacatttctttaattttaaacacaggcatatggaggtaaaggcatcgtaacttccttcaattaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacaaacaacaaccccaaaccattatccccattgctGGG--GCGAC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-G-G-------TC----T-TA-C-C--------CCA--T-G-TGTCT-TT--GA---T--T----GA-AAAA-----------AAAAA--GA---T-TTATA--TA-----------TA----C--------------ATA--T-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-CT-T----AGTATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-------------TT----CTTTTCTTTTTTT-T-----------AA-A----------A--TT--G-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGA-CT----------TT---A-TTT----------TC---TCTC--TTT-TTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTTGTTCAAA-GC-AC-A--TCC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|27 : --------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--G-AA-ATGAAGGGG--GCGGC------A-T--A--C---G---A----T---G-TCC-T-G-------CC----T-TA-C-C--------TCA--T-G-TGCCT-TT--GG---T--T-T-TAA-AAA-------------------GA---T-T-------------------TA-------------------ATA--C-T-AAA----G----AT--AA-------AGA-T--AA--A-A-CA-A-TT-A----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-------------TT----CTGTT----TTTA-T-----------AT-T----------A--TT--T-AA--AC-TCT--A--CT------TTTATTTGA-C-TTTAA----A---------------------------------------AC-C-GC--AAC-AT-TGT-G----AA-GC-AC-T--TGC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGTCA
gi|28 : --GCGGG------A-T--A--T---G---A----TCATG-TCT-G-G-------CC----T-TA-C-C--------CCA--T-G-TGCCT-TT--GA---T--T-T-TAG-ATA-------------------GA---T-T-G-A--TA--AACA----TTA----C-----------------------ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GA--A-A-TC-A-TT-C----ATTATA-TT-CTA---CT---AAC-TATT-----TA------T-------------C---------------------------------------------A--TT--T-AA--AA-TCT--ATAATA-----TTCATTTGAACTT---A----ATT-----TTTAAAAAAAAATTC---TTTTTTTTT-TTTTAC-C-GT--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A----------------TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACG
gi|29 : CAGCGGCG-TA-GC-TAGGGGTAG-GT-A--GATATGGAA-GT-AGAAA-GAGCAGGGAGTTTGGGGGCC-ACCC--AGGTCCT------------Ggtac
gi|3 : CAGTGGCG-TATGC-TTGGGGTAATAT-G--CATATGGAATGCAAGAAA-Gatcgattcccccaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|3 : gatCCCA------------GGAAGCT---GGTG-C-A--TTTCAACAACAACCCCACACCCACTTAA-TTAGATAGT-------ATCTGT---CAA--GTC-TCCGATAGCAT-C-A-TTT-T--T--T-----T---AA--------------------T----G-G--G--TAA---------A-TG-ATC-GTAACTT----CCTT---A------G----A------AAAACAAAAGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGGG-------GG--------G----------G--------------GAGTCCATTAGT---------TT---------------------T----AC----TT----G--------CA----------TT----TT-G--T------TT--C---------------TA-----------AT---TT---TG-GACGTTTT-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGGTTT-TAAA-TTGCCTTGA-A-AGC-T-TCTAAAT-A-TT-AAAAA-C------T-A--C--------TAAAA-TTTTCG-----------A-TGT-ATC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TG---A-C-AAT---C---GAA-----TC-------T--A---A------------------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----AA---------T-----A-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--A--AT---T-GATAAAT--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--T--A-AA-AACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---G---A----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CCA--T-G-TGCTT-TT--GA---TGCT-T-CAA-AAAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT--Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|3 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactcCA----G----AT--AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A------G-------------TT----ACTTTCTTCGTGT-T-----------A-------------A--AT--C-AA--A--CTA--A--AG------TTTATTTGA-CTTG-AA----ATA---A-TTGCA--------TT---TTTT--TTT-----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-AT-A--TGC-----TTCCG-TGCTTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|30 : gatcagtggcgtatgcttggggtaatatgcatatggaatgcaagaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcgactccccaggaagctggtgcatttcaacaacaaccccacacccacttaattagatagtatctgtcaagtctccgatagcatcatttttttaatgggtaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcagg----G-G--G--TAA---------A-GA-AAG-TTAACTT----TCTT---T------C----A------AGAAAAAGGGGG---G---G----------------GG-------GG--------G----------ATTGTCCATTAATTAG--------------------TT---------------------TTAATAC----T-----G--------CA----------TT----TT-T--T------TT--TGGGGGGGTGGGGGGGTT-----------AT---TTT--GA-GACGTTTT-G-T--A-CT------AT-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGTTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----T-ATTT-AAAG--C------T-A--C--------T-AAA-TT--CG-----------A-TGT-A
gi|31 : aatacaggcgcatg-AAAA-----------GAAAA--GA---T-TTATA--TA--CACA----CTAGGGGC--------------CTA--G-T-ACA----T----AT--AA-------A---T--AA--A-A-T-----------------T-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TACATGTAT-------------TT----CTTTTCTTCTTTT-TTTTTTTTTTTTTT-TTTTTTTTTTAA--TT--TAAA--A--TCG--A--AT------TTTATTTGA--TTTTAA----ATT---A-TTTCA-------------TATT--TTT-TTTAAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A--TGC-----TTCC--TGC-TT
gi|32 : CAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAT-AT-ATGAATATGGAA-GC-AGAAA-GGG
gi|34 : tt--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TT-T--T---------------------------A-----------AC---T----------GTTCT-G-T----CG------CT-T-----TT---T-----ACGA-CAACTA-A-T--TAG-ATGCGTTTTGTGAATTT-CCTTGA-A-AGC-CAT-----T-A-TT-AAAtccccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|35 : caaaacaaaaacaaaaaaccccaaaaaacaaaaaacaacaaacaacaaacagataagttcaataagtA---CC---AAA-TATC-----TA------T-------------TT----CTTTTCTTTTTTT-T-----------CC-T----------A--TT--T-AAGAA--TCT--A--AT------TTCATTTGA-CTTT-AA----ATC---A-TTTAA--------TT---TTTT--TTTTTTTTAC-C-GCAAAAT-GA-TGTTG----AA-GC-AC-A--TGC-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|36 : ---A-------GGCA---CATA---G-G--G--TAA---------G----ATT--TAACTT----TTTT---C------A----A------GAAAAAAAAGGG---A---T----------------TGTCCAATAAT--------A----------A--------------G--------------------TTA--------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TT-T--T------TT--T---------------TTTAAAAAATTCTAT---TT---GA-GACGTTTT-G-T--A-TT------A--T-----TT---T-T---ATAA-CAA
gi|37 : aacacTTCTTTT-AA----------TT-T----------AGGCT--C-AA--G--TCT--ATAAT------TTTATT-GA-CTTTTAA----ATT---A-TGTTA--------------------TT-TTTAACGC-GCAGACCAAA-TGTGG----AATGC-AC-ATTTGT-----TTCCG-TGC-TTC-ATAGG-AG-C-TAACGC
gi|38 : acat--------------------TT---------------------C----AC----T-----G--------CA-----------T----TT-T--T------GT--T---------------TA-----------TT---TT---GAGGACGTTTT---T--A-CT------A--T-----AT---T-T---ATAA-CACATATAATACAAG-AAGCGTTTTCTGAA-TT-CCTT-------------------------AAA--C------T----T--------TAAAA-TT--CG-----------ATTGT-ATC-TAA---A----TG--AAA-a
gi|4 : gtCAGTGGCGGTA--C-TTGGGTT-G-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAATGGGCGAGGGGTT-GGGGGCCGGCCCTAAGCCCc
gi|4 : GGGTCCGGGG--C-G------AGCCCC------------G-AAGCT---GGTG-C-A--TTTTAG--ACAA------------GTAA-A-AGA-GGTT------ATTT-T---CAAGAGTC-TCCGATA-GG--C-A-GTT-T--CAATAA--TT---AA---AAACA---GG-A---CATTG--G-G--G--TAA---------G----AT---TAACCT----TCTTTTTC------A----A------GAAAAACAAAG----G---G----------------GA-------AA--------A----------G--------------A--------------------TTTGTCCATCTAATTTAGTTTTAT----AC----T-----G--------TT----------TT----TT-T--T------TT--T---------------TTTTTTT------AT---TTT--GA-GA-GTTTT-G-TT-A-CT------AG-A-----TT---T-T---ATAA-CAACTATAAT--TAG-ATGCGTT----GAA-TT-ACTTGA-A-AGC-T-T-----TCA-TA-AAAA--C------T-AA-C--------TAAAAATT--CG--------------GT-ATCGTAA---AT---TG--AA--T-AAG-----A----TTTATA-CGAGT---C---GAA-----TC-------T--ATTGA------T--------G----T------A--------GTTTCCAGATAAAA---CTT---GC--A-C--A-AG-TTCG--------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----CGT-----TGT--T--------------AT---------G-----AA---------TCGCGTA-A---------A------TA------C----GTGTCCAAA--A-A-A----TA----------AG--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--G---------------TT--T-T---------CCC-G----TT-T--------------AAA--A--A--ATAA-ATGAGAAGG--TCGGCGAAGCAA-T--A--C-------A----T---G--CC-G-G-------TC----T-TA-CGC--------TCT--TAG-T-CCT-TT--GA---T--T-T-AAA-AAAA-----------GATAATCAA---T-T--TG--TA--GGG-----CTT----A--------------TTG--C-T-ACAC---G----AT--TT-------AAA-T--GA--A-A-TC-AATT-C----A-CATT-TT-CGAATCCC---A---TATC-----TA------TG------------TT----CTTTTCTTCCTTTGT-----------TT-T----------G--CTATT-AA--A--TCT--A--AT------TTT-TTTGA-CTCTTAATATCATTTAGA-CTTC---------TT---TTTT--TTT-TTATAC-C-GCAAAACGAA-TGTGG----AG-GCGAC-A--TGC-----T--CG-TGC-TTCAATAGGAAG-CAT-ACGCaatggtcatgcagagccctgtggcgggtccggggcgagccccgaagctggtgcattttagacaagtaaaagaggttattttcaagagtctccgataggcagtttcaataattaaaaacaggacattggggtaagattaaccttctttttcaagaaaaacaaaggggaaaagatttgtccatctaatttagttttatactgttttttttttttttttttattttgagagttttgttactagattttataacaactataattagatgcgttgaattacttgaaagctttcataaaaactaactaaaaattcggtatcgtaaattgaataagatttatacgagtcgaatctattgatgtagtttccagataaaacttgcacaagttcgaagcacattcgttgttatgaatcgcgtaaatacgtgtccaaaaaataagttaatctaattgataatgttttcccgtttaaaaaataaatgagaaggtcggcgaagcaatacatgccggtcttacgctcttagtcctttgatttaaaaaaagataatcaatttgtagggcttattgctacacgatttaaatgaaatcaattcacattttcgaatcccatatctatgttcttttcttcctttgttttgctattaaatctaatttttttgactcttaatatcatttagacttctttttttttttataccgcaaaacgaatgtggaggcgacatgctcgtgcttcaataggaagcatacgc
gi|40 : cagtggcggtacttgggttgattaatatggaagcagaaatgggcgaggggttgggggccggccctaagcccaatggtcatgcagagccctgtggcAGGGGGTCCAGGGGGC-G----AAGCTCCC------------GGAAACT---GAGA-G-G--TTTTAG--A
gi|41 : ggggtctggcagccgcttaaaaataggccgcccagtgggtcagaacttgccctatatagtagcct----G-G--G--TAA---------G-AAGATT--TAACTT----C-TT---C------A----A------GAAAAAAATGGG---G---G----------------GG-------GG--------G----------GT-------------G--------------------TC---------------------C----AT----T-----A---------A----------TTAG--TT-T--TATAGCATT--T---------------TT-----------GT---TT---G-------TTT-G-T--T-TT------TT-G-----TT---T-T---attc
gi|42 : taaacacaggcacttgCG-TA-GC-TCGGGTT-G-AT-G--AAAATGGAG-GC-AGAA---GACAGGG--TTTGGGG-CC-GCCCTAAGGCCCC------------ATAGGCt
gi|44 : cagttgcCT--A--AT------TTTATTTGA-CTTT-AA----ATC---A-TTTAA--------AT---TTTT--CTT-TT--AC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-AC-A--TGG-----TTCCA-TGC-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGgtcaagggcaggcctaggggcgaagcccccggaagc
gi|45 : GGGGCC-GCCCTAAGATTCCCAATGGGTCCAGGGAAGCG---GGTG-C-A--TTTTAG--ACAA------------TTAA-G-AGA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTTACC-AATA-CA--C-A-TTT-tacgc
gi|46 : T------TTTATTTGA-CTTG-AG----ATT-----TATCA--------TT---ATTT--T-------GC-C-GCAAG-C-AA-TGTGA----AA-GC-AC-A--T-C-----TTCCGTTGCTTTC-ATACGACGCC-T-ACGCC
gi|47 : c-AA--A--TATC-A--AA------TTTAT--GA-CTTT-AA----ATT---AGTCTCA--------TT---TT------------AC-CAGCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-T--TGC-----TT-CG-TGC-TTC-ATAGGA---C-T-ACGCc
gi|49 : T--T-AA--A--TATCAA--AT------TTTATTTGA-CTTT-AA----ATT---A-TCTCA--------TT---TTTT----------AC-C-GCAA--C-AA-TGTGG----AA-GC-AC-A--TGC-----TTTCG-TGC-TT
gi|5 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCA
gi|51 : gacgttacaattttgcaacatatgcacattcttgttaaagttctctaggcgagtcaaaaaataacattatctaaattagaatcatttctatttccttcaaaacaaaacttctgatattttcacggtccaagcattacttgcacataacaatgttttcaggtggtggttgggagggagggggtggggttgaagtggaatttcagaacggggaggagggtagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaattcttacaaacaagaggttatctttatttttatcaaaagcttatacaaacaatttaaaaaaaaagaatcattcggggtgggggctggggtgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgagcatgtttaccgatagtatttacggtaaaagttttatatcctgcaggccagacgcctaagtcgaatttcatgtgccacttttgacagtggtgatattatttctacacaaataaaaaacaagtttattacagaatctctcagttattgaaaaataaaaccaactttttaatgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAA-AT-A--AATATGGAA-GC-A
gi|52 : tgagtgagggtgcatttttccttaatacCAGTGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGAAAGGGGTTTGGGGGCT-G
gi|55 : CAGCGACG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATGG-A-GC-A
gi|56 : ttttttctattaaccg--------G----------G--------------T--------------------TT---------------------T----AC----T-----G--------CA----------TT----TT-G--T------TT--T---------------TA-----------AT---TT---TG-GACGTTTT-G-T--A-CT------C
gi|57 : cattGGTG-TA-AC-TTAGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-
gi|6 : cattCAGTGGCG-TA-GC-ATGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-GC-AGAAA-GGGCAAGGGGTTTTGGGGCC-GCCCTAAGGCCCC------------GGAGCCT---GATG-C-A--TTT-AG--ACA-------------TTAA-A-ATA-GGT-------ATTT-T---CAA-AGTC-TC-GATA-CA--G-A-TTT-T--T--TAA--TT---AA--------------------C------------TTA---------A-TA-ATC-TCCCCCC----CCCC---C------A----A------AAAAAAAAAGGG---G---G----------------GA-------GG--------G----------G--------------G--------------------TT---------------------T----CT----T-----G--------CA----------TT----TT-T--T------TT--T---------------TC-----------AT---TT---GA-GACATTTT-G-T--A-CTAGATATCTAT-----TT---T-T---ATAA-CAAATA-AAT--TAG-ATGCATTTT-TGAA-TT-CCTTGA-A-AGC-T-T-----T-A-TT-AAAA--C------T-A--C--------TAAAT-TT--CG-----------A-TGT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AGT---CTTCGAA-----TT-------T--A---A------T--------A----T------A-------AGT-----------A---CTT---GG--A-C--AGAG-TTCAGA------------AAG-CA--C--------------A------T-----T-----AGT-----T----T--------------GT---------A-----AA---------T-----A-A---------A------C-------C----GT-TCCAAA--A-A-A----AAT------TGCAA--TTAATCT--A--AT---T-GAT-AAT--AA--------------TT--T-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG--GCAGT------A-T--A--C---C---A----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CCA--A-T-TGCCT-TT--GA---T--T-TAAAA-AAAA-----------AAAAA--GA---T-T-ATA--TA--GGC-----CTA----C--------------CTG--C-T-ACA----G----AT--AA-------AGA-T--GG--A-A-TC-A-TT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TA------T-------------TT----CTTTTCTTCTTTT-T-----------TTCT----------A--TT--T-AA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGA-CTTTTAA----ATC---A--TTCAATTTTT--TT---TTTT--TTT-TTTTAC-C-GCAAAAC-GA-TGTGG----AA-GC-ACTA--TGC-----TT------------ATAGGAAG-C-T-ACGCCAC
gi|60 : CAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-T--AATATGGAA-AC-AG
gi|61 : tCAGCGGCG-TA-GC-TTGGGGTAG-AT-A--AATATAGAA-GC-A
gi|62 : tGG----AA-GC-AC-A--TGC-----TTCTG-TGC-TTC-ATAGGAA
gi|7 : ----G-G--G--TAA---------AATG-ATC-GTAACTT----CCTT---A------G----A------AAAACAAAAGGG---G---GGGGGGGAGCGGGGGGGGG-------GG--------G----------G--------------GAGTCCATTAGT---------TT---------------------T----AC----TT----G--------CA----------TT----TT-G--T------TT--C---------------TA-----------AT---TT---TG-GACGTTTT-G-T--A-CT------CT-T-----TT---A-T---A-AA-CAACTA-AAT--TAG-ATGCGGTTT-TAAA-TTGCCTTGA-A-AGC-T-TCTAAAT-A-TT-AAAAA-C------T-A--C--------TAAAA-TTTTCG-----------A-TGT-ATC-TAA---AA---TGCGAAA-G-AAG-----A----TG---A-C-AAT---C---GAA-----TC-------T--A---A------------------------------------GT-----------A---GTTTCAAG--A-T--AAAA-TTTGGACAG---------AAG-CA--C--------------A------T-----TTATTTAGT-----T----C--------------GTT--------A-----AA---------T-----A-ACTAGAGTAAA------C-------G----GG-TGTCAA--A-A-A----AAG------TGTAG--TTAATCT--A--AT---T-GATAAAT--AT--------------TT--T-T---------T---G----TT-TA-------------AAA--A--T--A-AA-AACAAAAAT--ACATC------A-A--C--C---G---A----C---T-TCC-GAA-------TCT---T-TACC-C--------CCA--T-G-TGCTT-TT--GA---TGCT-T-CAA-AAAG-------------------------T-GTA--T---GGC-----CTA----T--------------ATGCCC-T-ATA----T----AT--Act
gi|7 : tgCA----G----AT--AAGAACTTTAGA-TT-GA--A-A-TC-A-TT-C----ACCATT-TTTCGA---AC---AA----TC------A------G-------------TT----ACTTTCTTCGTGT-T-----------A-------------A--AT--C-AA--A--CTA--A--AG------TTTATTTGA-CTTG-AA----ATA---A-TTGCA--------TT---TTTT--TTT-----AC-C----AAAC-AAGCGTGG----AA-GC-AT-A--TGC-----TTCCG-TGCTTTC-ATAGGAAG-T-T-ACGCCACtattatataattatatatataatagagtcaggcagataagaactttagattgaaatcattcaccatttttcgaacaatcagttactttcttcgtgttaaatcaaactaaagtttatttgacttgaaataattgcatttttttttaccaaacaagcgtggaagcatatgcttccgtgctttcataggaagttacgccac
gi|8 : tggggtaaaatgatcgtaacttccttagaaaaacaaaagggggggggggagcggggggggggggggagtccattagttttacttgcattttgtttctaattttggacgttttgtactcttttataaacaactaaattagatgcggttttaaattgccttgaaagcttctaaatattaaaaactactaaaattttcgatgtatctaaaatgcgaaagaagatgacaatcgaatctaagtagtttcaagataaaatttggacagaagcacatttatttagttcgttaaataactagagtaaacgggtgtcaaaaaaagtgtagttaatctaattgataaatattttttgtttaaaaataaaaacaaaaatacatcaaccgacttccgaatctttacccccatgtgcttttgatgcttcaaaaagtgtatggcctatatgccctatatatatattatataattatatatataatagagtcagg---A-------GGCA---CAT----G-G--G--TAA---------G-AAGATCCGTAACTTAATTCTTT---C------ATAAAA------AGAAAAAAAAAG---A---A----------------AA-------AA--------A----------G--------------A--------------------TT---------------------T----GCCATCT-----GTTTTTATTCA----------TT----TG-T--T------TT--T---------------AT-----------TT---TT---GA-GACGTTTTTG-TTTG-CT------TC-T-----TT---T-T---ATAA-CAACTA-AAT---AGTATGTGCTTT--GAA-TT-CCTTGATA-GGC-T-T-----TTA-TT-AAAAAAC------T-AACT--------TAAAA-TT--CG-----------A-TGT-ATC-TAA---TT---TG--AAA-A-AAG-----A---------A-C-AAT---A---GAA-----TC-------T--A---A------TTA------G----T------ACGGTGATAGTTTCACGATGAAA---CTT---GG--G-C--AGAG-TTCGGA------------AGC-CATGC--------------A------T-----T-----GGTGGCATTACCGT--------------GT---------A-----AA-----------------A---------A-------------------------AAA--A-A-A----AAT-------GCGG--TTAATTT--A--AT---T---T-AAT--AA--------------TTATT-T---------T---G----TT-T--------------AAA--A--T--A-AA-ATGAAGGGG---CGGC------A-T--A--CCGGA---A----T---G-TCT---G-------TC----T-T--C-C--------CCA--T-G-TGCCT-TTTGGA---T--T-T-AAATAAAA-----------ATTTA--CA---T-T-ATATTTA--CAC-----ACA----A--------------TTG--CTT-AC-----G----AT--TA-------AGA-T--GA--A-G-TC-ACTT-C----AGCATT-TT-CGA---CC---AAA-TATC-----TAT-----T-------------TT----CTTTTCTTCTTCT-T-----------TTAA----------A--TTA-T-AA--AT-TCT--A--AA------TTTATTT-A-C-TTTAA----A-----A-TTTCA----------------T--TTT-TTTCAC-C-GC--AAC-AC-TGTGG----AG-GCAAC-A--TGC-----TTCCG-TGT-TTC-ATAGGAAG-C-T-ACGC
gi|9 : aacacG-A---CACATG-G-G--G--TAG---------G-GACATC-GTAACTT----CCTT---C------A----ATTT---AAAAAAAA----------------------------------------------------------G--------------A--------------------TT---------------------C----AT----TTAATAGTTC-----CA----------CT----GC-T--T------TT--T---------------TG-----------ATATTTT---GA-GACGTTTT-G-T--AACT------CT-T-----TT---T-T---ATGA-CAACTA-GAT--TAG-GTGTGTTTT-TGAA-TT-CCGTGA-A-AGC-T-T-----A-AATT-AAAA--C------T-A--C--------TAGAA-TT--CG-----------A-TGT-ATC-TAA---AT---TG--AAA-G-AAG-----A----T----A-C-AAT---C---GAA-----TC-------T--A---AG-----T--------ACTTTT------A-------GAT-----------AAAGCTT---AG--A-T--AGAG-TTCAGA------------AA--CA--C--------------A------T-----T-----AAG-----T----TGTTATGATTAGA--GT---------A-----AA---------T-----ATA---------A------A-------T----GT-C---AA--C-A-A----AAT------TGCAG--TTAATCT--A--AT---T-AAT-CAT--AAGATTTTGGGTTAGTTT--T-T---------T---GTTTTTT-T--------------TAA--A--C--A-AATATATA----------T------A-T--A--C-------A----T---G-TCC-G-A-------TC----T-TA-C-C--------CCA--T-T-TGCGT-TT--GATATT--T-T-GA-------------------------------T-ATA--TT--GAT-----AAA----C--------------ATA--A-T-ACA----G----ATAAAA-------AGA-T--GA--A-G-CC-A-TT-C----AGCATT-TT-TGA---CC---AAA-TATT-----TA------A-------------TT----ATTTCTGTCTTTA-C-----------AT-T----------A--TT--TAAA--A--TCT--A--AT------TTTATTTGA--TTTTAA----ATT---A-TTTCA---------T---TTTT--TTT-TTTTAC-C-GC--AAC-AA-TGTGG----AA-CC-AC-A--TGC-----TTGTG-TGC-TTC-AGAGGAAG-C-T-ACGCCac
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AAGAGCAAGAGTCACGAATAGATCCAAAATGGACGCCATTTGCTGAGACAGTTGATATCATTTCATAGATCAGTAGATCAAGAAAAGTGTTAATTTTCAAATATACTTCCCTTTTTCGATATCGTATCAATTTATTTAGTTATATAGACGTTTCAAAGTTAGTCATTTGTTATTTCTTGGGCCAATTTTTGTTTTTGACGTAAAACACTTTTACAACGTATGTATCTAGTATCAAAACATATACATATATATTCGTCATTTCTTTACATACAAAAATCTAGATTATGTTCACTGTTCCAGACTCACTACTTTGTCACTTTGCAATGTTTTTCAAGAGTGGTGGTTGGAAAGAACGGGGGAGGGTGATCGTTGCTGTATCTAACGAATTTCAAGAAGAGGAGGGGTGGGTGTGTAGAAAGGTCAGGGGGTATAACAATTCTGCATTGAAACTCCTTTAGTGGATCTTCAGGTAGACGAGTTATTAAAAGGCAATAGGTAAGGTGATATTTAATTATTTTTAATCA
Unaligned ( gi|33 ): TCAGGAATTTCAGAAACAGTGGGAGGGGGAGAAGGTGAGTTGCTTGAAGCTCCCAGAGGACAGAGCGAGACCCCCGGAAAGCTGACACATTCTCTACACAAGCAAAAGTTTTTATTTTTAATTTTTTTAAGAAATGCTTTGTTCGGCACAAACACTTTTTTAAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CCCCAGTAGGTCCAGGACAGAAACCCTGTTTGTGGGCCAGCAGGGGCGAAGGCCCCCGGGAAGCAGCATGGAACTTCTTTTACAAGAACGATTTCGCTAAACATTTTTATTTTTTA
Unaligned ( gi|43 ): AAAAAACAAAAAAAACAAACAAACAAGATAGTTCATAAGTTTTACTGCATTTTTTTACTGTTCTGTACAGCTTTTTAGAACAACTAAATTAGATGCGTTTTTGAATTC
Unaligned ( gi|48 ): GGCGAAGCCCCTGAAAGCTGACAAATTCTTACAAACAAGAAGTTTTTGTTTTATCAAATGCTTGTTGTACAAACAAAATG
Unaligned ( gi|50 ): AAGGTACTAGTATGGGAGCCGCCCTAAGGCCTTGGTGAGTCCAGGACAAAGCCTTGGTTGAGGCCCTGGGGGC
Unaligned ( gi|53 ): TTGGGGCTGCCATGAGACCAGCCCCGAGGGTCCAGGACTAAGTCCTAGTAGGGGTCCAG
Unaligned ( gi|54 ): TAAATTCTTACAAGCAAGAGGTTTTTAAAAAATTAAATGCTTGTTGTACAAACTA
Unaligned ( gi|58 ): TGAGTATGAGTACGGTAAAAGTTTTATAACCTCCAGGCC
Unaligned ( gi|59 ): AGGTGCATTTGACTATTTCAAAAGGTTCCCGAACCATTT