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Reference ( gi|2 )            :                                                 CCCCCACTATA--ATGCCA--CCCCCGC-------------ATATCGCCAAAT-AATTTCAAAGTCCCGTTTTCC-T-ACTATATAAAA---C-CCCG-TTATA------AC------ACCAT-CCCCCGCA--TA-----A--C-GCC-A-T-------C-------------GC----AT-TTG-C-A-G-TA-CAAA-TTGGTCAAATA---CT-G--TTATA-A-TCATTC-CTGA-TAATTA-TCGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACAATGAGA-CAC-TCTCAGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGT--TTG-CCCTGCAG--------GTAAAAATTTGGAGTAGGTGATA-TGTTCCGTAATTTA---A-A-TTA-G--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG-------------GT-------G-------C--------------GAA-CA--CGCTAT--AAA-CATATTTACCGTAA-ACTA--AT-GCATG---T-ACACTGTT----TG--G--A---AT--TG--TTTAGACAAA-A-A---A-GT-GGACCAATTGTAGTACT-C----AGTG-AAG-TAT-TCGC-TTGATCA-AACTA-CGC-C-GGTAAATT----AAAGAATAAAA-TATGT--ATGATTTATTT-TCAT-GACA---GCTG--TACA------TTTA--------C----T---------C--------T-------G------CACA---TCCCCC-TCCCC-GAA-A---T-AATGCCACCCCATTTAATATAATGCC-----AA---ATTCACCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACAGGG-GA--TTACTGT
gi|4                          :                                                 CCCCCGTTATA--ATGCCA--CCCCCGC-------------ATATTGCCATAT-AATTTCAAAGTCCCGTTTTCC-TTACTATAAAAAC---C-CCCA-TTATACATGTAAC------GCCAT-CCCCCACA--TA-----C--T-GCC-AAG-------C-------------GT----AT-TTGTC-A-GGTAACAAAATTGGTCCAATA---CC-A--ATATT-A-TCACCC-CCGA-TAATTA-TCGCC-AATTTTATC-CT-ACGTTCAACTGTGAGAACACCTCTGGGTGAA-CA-TGCTAAAGTAAAATTT--TCCGCTTGT--TTG-TCCTGCAG--------GTTAAAGTTTGGAGTAGGTGATA-GGTTGCATAATCTAT--A-A-TTA-G--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG-------------GT-------G-------CAATCCGAGTGTAGCGAA-TA--CGCTGA--AAT-CATATT-AGCGTAA-ACTAC-AT-GCAT----T-ACACTGTT----TG--GTGA---AT--TG--TTTTGACAAA-A-TT--A-GT-GGACCAATTGTAGTACT-C----AGAG-AAGCTAT-TTGC-TTGATCA-AACTA-GCC-C-AGTAAATT----AAAGAATAAAA-T
gi|3                          : attttgtttagagtgaaatacatgtacagtgctcccccgctatattgcCCCCCGTTATATAATGCCA--CCTCAGC-------------ATATCG-CAAATCAATTTCAAAGT-CCGTTTTCCTT-ACTATTGCAAATTTC-CCCGCTTATA------CCCG----CCCAC-CCCCCGCACTTATGGCCA--CAGCC-A-A-------C-------------GT----AT-T-----G-G-TA-CAAA-CTGGTCAAAAACACCT-GTTTTATATT-TCA-CC-CCAA-TAATTATTCG-C-AATT--A-C-CT-ATA--AAACTTTGAGA-CAC-TCTCGGTGAGCCACGGCGTAGGCAA--GTATTTCCG-TTGTGATTG-CCCTGCAG--------GT-AAAGTTTGGAGTAGGTGATAGCGTTACGTAATTTATTTATA-TTACG--TTGAGTTCAAATATAAGGTGCAAACCTAGT------------GTA------G-------C--------------GAATCA--CCCTGA--AAATCATA-TTACCGTTA-ATTGGCAT-GCAT----T-ACACTGTTTTGGTG--A--A---AT--TGGTTTTTGATCGA-A-ATATA-GC-GAACCAACTG-AATATTAC----AGTG-AAGCCAT-TCGCTTTGATCATAACTACCCC-C-GGTAAATTAAAAAAAAAACAAAAGTATAT--ATGATT
gi|9                          :       taatacagtgttcccccgctatatccccccccccccccccccCCACCGCTATA--GCACCA--CCCCCACCCAACGCCTGATTATAATGCCAAAC-AAGTTCAGCGTCCCGTTTTCC-TTACGATGTAAAA---C-CCTG-TTTTA------AT------GTCAT-TCCCCGCA--TA-----C--C-GTC-A-T-------CCGCCAAC------GT----AT-TAA-C-G-GGTA-CTAA-TTGGTCAAATA---CC-G--TTAT----TCGACC-CCGC-TAGCTA-TCGCT-AATT--A-CTCT-TTAT-CAACTGTGAGA-AAC-TTTCAGTGAA-CT-GGTTTAGGCAA--TTA--TCAG-TTGT--TAG-TCCCTCGA--------GTAAAG-TCTGGAGTAGGTCATA-AGTTATGCAGTTTAT--A-A-TTA-T--TCGATTTCAAAT-------------CTAG-------------CT-------G-------
gi|10                         :                                          cggtgatCCCCCGTTATA--ATGCCA--CCCCTGC-------------ATATTGCCAAAA-AATTGAAAAGTCCTGTTTTCCTT-ACTATGTTAAA---T-CCTG-TTATA------AT------GATAT-CCCCCACA--TACTGCCATCC-ACC-A-T-------C-------------GT----GT-TAG-A-G-G-TA-CAAA-TGGGTCAAATA---CC-G--TTATA-T-TCACCC-ACAC-TAATTA-TCGCC-AATT--ACC-CT-TTAT-CTACAGCGAGA-AAC-TTTTAGTAAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTaaatatgag
gi|15                         :                             agtgatcccctgctatattgtCCCCGTTATA--ATGCCA--CCCC---------------------GCCAAGA-AATTTAAAAGTCCCGTTTTCC-TTACTATGTAAAA---C-CCCG-TTATA------AC------GCCAT-CCCCCGCA--TG-----C--C-GCC-A-T-------CCACCAACATACATGT----AT-TTA-CAA-G-TA-CAAA-TTGGTCAATGC---CC-G--TTATA-
gi|18                         :                        ttctctgctatgttgtactgcagtaaCCCCGTTATA--ATGTCA--CCTCCGC-------------ATATCGCCAAAT-AAATTCAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTATGTAAAA---C-ACCG-TTATA------AC------GCCATCCCCCCGCA--TA-----C--C-GCC-A-T-------C-------------ttaac
gi|6                          :                                       attgcccctctCCCCGTTATA--ATGCCA--CCCTCGT-------------AT-------------TTTCG----CACTTTCTCC-TTACTGTGTAAAT---C-TATA-TTATA------ACCCGCATACCAA-CACCCGC-------------------------------------------------AT-TTA-C-AGG-TA-CAAA-TTAGTCAAACA---CC-A--TCAGA-T-TCGCCCTCTCA-T-TTTT-TCACC-AATT--A-CTCT-TTAT-CAACAGAGAAA-AAC-TTTCAGAGAG-CA-TGATGAATCAA--TTA--TCTT-TCGT--TAG-CCCTGCAT--------GT-AAAGTTTGAGGGAAATGTTA-TAT---GTAATTCAT--G-A-TTT-T--TTAAGTTAAAAT-------------CAAG-------------ATTAAATCCGACTTTTTC--------------GAA-CA--CACTG---AAA-TTTTATTACCATAC-ACT----TCACATGT--T-ACACTATcgccatcatatct
gi|12                         :                        tgtacagtgatcgtcaactatattgaCCCCGTTATT--ATTACA--CACCCGC-------------ATATCGCCAAAA-AA--TCAAAGT-CCGATTCCT-T-GCCATTTAAAA---CACAGG-TTATG------AC------ATCA-----CCGTA--TA-----AC-C-GCCAA-C-------C-------------GCACGTAT-TTA-C-AGG-TA-CGAA-TTGGTCAATTA---CTCG--TTATA-CTTCACTC-CAG--CAATTG-TCGCCAAATT--C-C-CT-ATAg
gi|1                          :                                 tatacattgaccacgctatattgTATA--ACGCCATCCCCCCGC-------------ATACCGCCAa
gi|22                         :                                                     cgtTATA--ACGCCA--TTCCCGC-------------ATACCGCCAtccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgcaactgtacatttaccccatctccaccccgcacgtttccctccccagttataacgccaccctctttataatgtcaaattgccgaggtacaaatgctggggttataacggggggttac
gi|23                         :                                                                 CCA--CACCCGC-------------ATATCGCCAAA--A-----AAAATCCCGATTTCCTT-GCCATTTAAAA---CACATG-TTAtcctcctacgtattacaggtacaaattggtcaatttccgtcaatag
gi|1                          :                                                                                                                                                 CG-TTATA------AC------GCCATCCCCCCGCA--TA-----C--C-GCC-A-T-------C-------------
gi|13                         :                                                                                                                                                  G-TTATA------AC------GCCAT-CCCCTACA--TA-----T--C-ACC-A-TTCGCCAAC-------------GT----AT-TTA-CTA-G-TA-CAAA-TTGGTCAATTA---C--------------CAC--------TAATTA-TCACC-AATT--ACC-CT-ATAT-CAACAGCAAGA-AAC-TTTCAGTGAA-CA-GA-TTAAGCAA--TTA--TATA-TTGT--TAGTCCCTA-AGTCCCATTCGT-AAAGCTTGGAGTAAATAATA-AGTCATGTAATTcgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgcaactgtacatttaccccatctccaccccgcacgtttccctccccagttataacgccaccctctttataatgtcaaattgccgaggtacaaatgctggggttataacggggggttac
gi|22                         :                                                                                                                                                   aaTATA------AC------GCCAT-TCCC-GCA--TA-----C--C-GCC-A-T-------CCTCCT--------AC----GTATTA-C-A-GGTA-CAAA-TTGGTCAATTT---CC-G--TCAa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                  -GCT-A-A-------C-------------GT----AT-TTA-C-A-GGTA-GAAA-TTGGTCAAATA---CC-G--TTatag
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                    CT-A-T-------C--------------T----AT-TTG-C-A-GGTA-CTAA-TTAGTCGATTA---AC-G--TGATA-T-TCACCC-C--ACTAATTA-ACGTC-AATT--A-C-CTTAAAA-CAATAGCGAGA-AAC-TTTCGTTGAA-CT-TGTTTACGCAA--TAA--TTCA-GTGT--CAG-TCCTCAAG--------GTA-AAGCTTGGAGTAGATAATA-AATTATATAATTTAT--A-A-TTA-T--TTGAACTCCAAT-------------CTA-----------------------G-------C--------------GGA-CATTCG-TGTGAAAA-CACA-TTACTGCAATCCTC--AT-GCGT----T-ACACTATT----TAGTG--A---GT--AG--TTTTAACAAA-ATT---A-TC-GGTCAAACTGTACTACT-C----AGTGAAAA-TAT-TCGC-TTTACCA-AACTA--GC-CTTGTAAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                  cgttataacgccatccccccgcataccgccatccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactac-CAC-GTTCGGTGAT-CA-GGCTTAAGCGA--TTA--TATG-TTGT--TAG-TTCTGTAG--------GCAAgtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgcaactgtacatttaccccatctccaccccgcacgtttccctccccagttataacgccaccctctttataatgtcaaattgccgaggtacaaatgctggggttataacggggggttac
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAA--TTA--TCTG-TTGT--TAG-TCCAGCAG--------GCAAAG-TTTGAAGTAGATGATA-AGGTATGTAATTTAC--A-A-TTA-T--TTGAGTTCAAATATAGCTGAAATC-CTAGT------------GTA------G-------C--------------GAA-CG--CGCTGG--AAT-CATATT-ACCACAA-ACTAC-AT-GCGT----T-ATACGATC----TG--GTGA---AT--TG--TTCTGACAAATA-C---A-TC-GGACGAATTGTAGTAAT-C----AGTG-AAGCTAT-TCGC-TTGATCA-AACTA-GAC-T-GGTTAATC----AAAGAATAAAA-TATG-----GATT-ATTTCTCAC-GACA---GCTG--TCCA------TTTA--------CC---T---------C--------C-------ATCCCACCACACGCTCCGCA-CCCCC-TAT-A---T-AGTGCT-CCACAGTTA---TAGTGCC-----AA---ATTCGCCGAGGTACACATTTTGGCGTTATAATGGAT-GA--TTACTGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G-TTGT--TAG-TCCTGCAG--------GTAAAG-TTTGGAGTAGGTGATA-AATTATGTAATTTAT--A-A-TTA-TATTTGAGTTCCAAT-------------CTAGCAAAAATCTGA--GTATA----G-------C--------------GAA-CG--CGCTGA--AAC-CATATT-ATTGCAA-ACTAC-AT-ATATG---TTACACTATT----T-----------T--TG----------AA-A-T---A-TT-GGACCAATTGTAGTACT-C----AGTG-AAGCTAT-TCAC-TTGATCA-AACTA--GC-CTGTTTAATT----AAAGAATAAAA-TATGTACACGAT---TTC-CCAT-AACAGCTGCTG--CACA------TTTACCCCCATCC----C---------C--------T-------T------CACACT-TCCCCCATCCCC-GTT-A---T-AATGa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTGAAGTAGATGATA-AATTATGTAATTTA---A-AATTA-T--TTGAGTTCAA-T-------------CTAGCTGAACTCCTGGTGTA------G-------T--------------GAA-CT--CGCCGA--AGT-CATATT-AC-ACAA-A-----AT-GCATGCGTT-ATACGAGT----TG--A--ATGCATCTTA--TTT-GACACA-A-A---ACAT-CGACCAATT-T-GTAAT-C----AGTA-AAC-TAT-TC----TGATCA-AATTA--GC-CTGGTTAATT----AAAGAATGAAA-TATG---AT--TTTTTTC-TCAC-GACA---GCTG--TACT------TTTG--------C----CTCCATCCCAC--------C-------A------CACG---GCCCGC-TCCCC-CTATA---T-AGTGC-ACCC-ATGT--TATAATGCC-----AA---ATTCGCCGAGGTGCACATGTTGGTGTTATAACGGAG-GA--TTACTGTgggaattactgtacctgatgccacaatgcaaaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTTAT--A-A-TAA-A--TTGAGTTCAAAT-------------CTAGTGACATCACC---AT-------A-------CAGT-----------GGA-TA--CGCTG---GAT-CATATT-ACTGCAA-TCTCC-AT-GCGTT---T-ATACTATT----TG-----------------TTTTGACCAA-A-A---ATATCAGACAAAT-GTAGTGCT-CTGACAGTG-AAA-GCTGTCGC-TTTATCA-AACTA--GC-CTAGTAAAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attttcAA-ACTA---T-GTG-G---T-GAACTATT----T-----------T--TT--TTTA-ACAAA-C-TT--A-TC-GGACCAAA---AGTAAT-C----AGGG-AAGCTGT-TTGG-TTTATCA-AACTA-cgtttcgcctgttg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -C----AGTG-AAAATAT-TCGC-TTCATGA-AGCTA--GCAT-GTTTAATT----AAAGAATAGAA-TGCAT--ATGAC---TTC-TCAT-GGCA---GCTG--TACA------ACTAG-------C----TATCAC----C--------C-------G------CAC-----CCCCC-TCTC---AA-ACTTT-AATACCACCC---TTGTTATAATGAC-----AA---A-------ATGTACAAATGTTTACGATATAAT-GGG-GA--GTACTGTggatcggaaagtgctacgcctggtacgataaggatattcagtgtaactgatataaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TATGT--ACGAT--AATC-TCATTGGCA---GCTGATTACACCACCCTCCA--------C----C---------CACCTTGCTT-------GT-----CACG---TCCCCC--CCAC-GAT-A---TTAAT---AACCCAGG-AGGATACTACTGGAGAAA---AATAGCCGAGGTACAAATGTTGGCG-TATAACGGGGAGATGTTACTGTactagatttacacacttacccacgttatccacacttatatt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atCA---ACTG--TACA------TTTA--------CCCCAT---------C--------TCCACCCCG------CACG---TTTCCC-TCCCCAGTT-A---T-AACGCCACCCTCTTTA---TAATGTC-----AA---ATT-GCCGAGGTACAAATGCTGGGGTTATAACGGGG-GG--TTACac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgttataacgccatccccccgcataccgccatccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgTATAACACC-----AACATGTGCACCTCGG--CGAAT-TTGGCATTATAACATGG-G
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttgaagtagatgataaattatgtaatttaaaattatttgagttcaatctagctgaactcctggtgtagtgaactcgccgaagtcatattacacaaaatgcatgcgttatacgagttgaatgcatcttatttgacacaaaacatcgaccaatttgtaatcagtaaactattctgatcaaattagcctggttaattaaagaatgaaatatgatttttttctcacgacagctgtacttttgcctccatcccaccacacggcccgctccccctatatagtgcaTGCC-----AA---ATTCTCTGAGGTACAGATGTTGGCATTATAAGGAGG-GA--TTACTGTacggaggattactgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGTTATAATGGGG-AA--TTACTGTac
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TTTTCCTTGCGTCCAACTGTGAGAAGCTTTCAGCGAAAAGGTTTTAGCATTTCCCTTTTGTTAGTCAATTGGGTAAAGCTTGGAATAAATAATAAGTTATGTAAATTATAATTATT
Unaligned ( gi|20 ): TGTTACAATGGCAACAACTGTACACGGTGTTTACCGGGATATTACGGAGTATACTGTACTAGCACATGTTACACAAACTGTTACAACTGCACTTCATAT
Unaligned ( gi|21 ): AACTGAAATAGACGGACAAAATGTCATTTAAAGTGAAACATCACTAAAACGGATAAAATATGAGACAAGAGGACAAAGTTT
Unaligned ( gi|27 ): CTTTGTATTTTACATGAAACATATGGCATGATA






Alignments
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gi|10                         : cgttataacgccatccccccgcataccgccatccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgTCCCCTGCTA-TATTGT--CC-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCCTGCA--------T-A-------TTGCCA-----
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtgaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCTGC-------------ATATTGCCAAAAAATTGAAAAGTCCTGTTTTCC-TTACTA-TGTTAA--AT-CCTG-TTATA------ATG-ATAT-CCCCCACA--------T-ACTGCCATCCACCA-----T-------C-------------GTG-TTA-GAGGTA-CAAA-TGGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCA-CACTAATTA-T--CGCC-AATT--ACC-CT-TTAT-CTACAGCGAGAA-ACTT-TTAGTAAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTaaaaattgaaaagtcctgttttccttactatgttaaatcctgttataatgatatcccccacatactgccatccaccatcgtgttagaggtacaaatgggtcaaataccgttatattcacccacactaattatcgccaattaccctttatctacagcgagaaacttttagtaaacaggcttaagcaatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agtgatcccctgctatattgt-C----AGTGAA-AATATTCGC-TTCATGA-AGCTA-GCATGTTTAATT----AAAGAATAGAA-TGCA--TAT--GA-C---TTCTCAT-GGCAGCTG--T---ACA------AC--TAGCTATCAC---------C--------C-----------G-C-AC---CCCCC-TCTCAA-AC-TTT-AATACCACCCT-----TGT-----TATAATGAC-----AAA-------ATGTACAAATGTTTACGATATAAT-GGG-GA--GTACTGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATT--ATTACACACCCGC-------------ATATCGCCAAAAAA--TCAAAGTCCGATT---CCTTGCCA-TTTAAA--ACACAGG-TTATG------ACA-TCA-----CCGTA--------TAA-------CCGCCAACCGCA-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-CGAA-TTGGTC--AATTACTC-G--TTATACTTCACTCC-AG-CAATTG-T--CGCCAAATT--C-C-CT-ATAactagatttacacacttacccacgttatccacacttatatt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatacattgaccacgctatattgG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCTACA--------T-A-------TCACCA-----TTCGCCAAC-------------GTATTTA-CTAGTA-CAAA-TTGGTC--AATTAC--------------CAC-------TAATTA-T--CACC-AATT--ACC-CT-ATAT-CAACAGCAAGAA-ACTT-TCAGTGAA-CA-GA-TTAAGCAA--TTA--TATA-TTGTTA--GTC--CCTAAGTCCCATTCGT-AAAGCTTGGAGTAAATAATAA-GTCATGTAATTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaATTTA--TA-ATAAA--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------T------------GACATCACCATA-CAG------------TGGA-TA--CGC-TG-GA-TCATATT-ACTGCAATCT-CCATGCGTTT-ATACTATT----TG---------------T-TTTGA-CCA-AAA-ATATCAGACAAAT-GTAGTGCT-CTGACAGTGAAAGCTGT-CGC-TTTATCA-AACTA-GCCTAGTAAATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attttcTGGCATTATAACGGGG-----TTACTGcgtttcgcctgttg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttctctgctatgttgtactgCCCCGTTATA--ATGCCACCCC---------------------GCCAAGAAATTTAAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------T-G-------CCGCCA-----T-------CCACCAACATACATGTATTTA-CAAGTA-CAAA-TTGGTC--AATGCC-C-G--TTATA-TTAACccccgccaagaaatttaaaagtcccgttttccttactatgtaaaaccccgttataacgccatcccccgcatgccgccatccaccaacatacatgtatttacaagtacaaattggtcaatgcccgttatattaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttctctgctatgttgtactgcagtaa-TATG--TAC--GA-TAA-T-CTCATTGGCAGCTGATT---ACACCACCCTC--CA-C-----C---------CACCTTGCTT-----------GTC-ACG-TCCCCC--CCA-C-GA-TATTAAT---AACCC-----AGG--A-GGATACTACTGGAGAAAAATAGCCGAGGTACAAATGTTGGCG-TATAACGGGGAGATGTTACTGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atAAACT-ATGTG---GT-GAACTATT----T-----------TT---T-TTTAA-C-A-AAC-TTATCGGACCAAA---AGTAAT-C----AGGGAA-GCTGTTTGG-TTTATCA-AACTA-Gac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATA--ATGTCACCTCCGC-------------ATATCGCCAAATAAATTCAAAGTCCCGTTTTCC-TTACTA-TGTAAA--AC-ACCG-TTATA------ACG-CCATCCCCCCGCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------C-------------gatcggaaagtgctacgcctggtacgataaggatattcagtgtaactgatataaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attgcccctct-CAACTGTGAGAA-GCTT-TCAGCGAA-AA-GGTTTTAGCAT--TTC--CCTT-TTGTTA--GTCAATTG--G--------GTAAA-GCTTGGAATAAATAATAA-GTTATGTAAATTA--TA-ATTAT--Tcgccatcatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttttccttgcgtcCCCCCACTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCT--ACTA-TATAAA--AC-CCCG-TTATA------ACA-CCAT-CCCCCGCA--------T-A-------ACGCCA-----T-------C-------------GCATTTG-CAG-TA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-T-G--TTATA-ATCATTCC-TGATAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACAATGAGAC-ACTC-TCAGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTT--GCC--CTGCAG--------GTAAAAATTTGGAGTAGGTGATAT-GTTCCGTAATTTA---A-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG-------------------------G------------T-G------------CGAA-CA--CGC-TA-TAAACATATTTACCGTAAACT-A-ATGCATGT-ACACTGTT----TG--G--A---ATTG--T-TTAGA-C-A-AAA-A-AGTGGACCAATTGTAGTACT-C----AGTGAA-G-TATTCGC-TTGATCA-AACTACGCC-GGTAAATT----AAAGAATAAAA-TATG--TAT--GATTTA-TTTTCAT-GACAGCTG--T---ACA------TT--TA-C-----T---------C--------T-----------G-C-ACA-TCCCCC-TCCC-C-GA-AAT-AATGCCACCCC-----ATT--TAATATAATGCC-----AAATTCACCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACAGGG-GA--TTACTGT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATA------ACG-CCAT-TCCC-GCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------CCTCCTAC------GTATT-A-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AATTTC-C-G--TCA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCACACCCGC-------------ATATCGCCAAAA------AAAATCCCGATTTCC-TTGCCA-TTTAAA--ACACATG-TTAatag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGCC-----AAATTCTCTGAGGTACAGATGTTGGCATTATAAGGAGG-GA--TTACTGT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -ACGT-TCGGTGAT-CA-GGCTTAAGCGA--TTA--TATG-TTGTTA--GTT--CTGTAG--------GCAAac
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cGCTA-----A-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-GAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCCCGTTATATAATGCCACCTCAGC-------------ATATCGCAAATCAATTTCAAAGT-CCGTTTTCC-TTACTATTGCAAATTTC-CCCGCTTATAC-----CCGCCCAC-CCCCCGCACTTATGGCC-A-------CAGCCA-----A-------C-------------GTATT-----GGTA-CAAA-CTGGTCAAAAACAC-CTGTTTTATATTTCA-CCC-CAATAATTATT--CG-C-AATT--A-C-CT-ATA--AAACTTTGAGAC-ACTC-TCGGTGAGCCACGGCGTAGGCAA--GTATTTCCG-TTGTGATTGCC--CTGCAG--------GT-AAAGTTTGGAGTAGGTGATAGCGTTACGTAATTTATTTATATTACG-TTGAGTTCAAATATAAGGTGCAAACCTAG------------T------------G------------TAG------------CGAATCA--CCC-TGAAAATCATA-TTACCGTTAATTGGCATGCAT-T-ACACTGTTTTGGTG--A--A---ATTGGTT-TTTGATC-G-AAATATAGCGAACCAACTG-AATATTAC----AGTGAA-GCCATTCGCTTTGATCATAACTACCCCCGGTAAATTAAAAAAAAAACAAAAGTATA--TAT--GA-TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taatacagtgttcccccgctatatccccccccccccccccccTG--T---ACA------GTGCTC-C-----C---------C--------C-----------G-CTATA-TTGCCC---CC-C-GT-TAT-AATGCCACCCCCGCATATTGCC-ATATAATTTC-----AAAGTC-CCG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attttgtttagagtgaaatacaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATTGCCATATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TAAAAA--CC-CCCA-TTATACATGTAACG-CCAT-CCCCCACA--------T-A-------CTGCCAA----G-------C-------------GTATTTGTCAGGTAACAAAATTGGTC--CAATAC-C-A--ATATT-ATCACCCC-CGATAATTA-T--CGCC-AATTTTATC-CT-ACGTTCAACTGTGAGAACACCTCTGGGTGAA-CA-TGCTAAAGTAAAATTT--TCCGCTTGTTT--GTC--CTGCAG--------GTTAAAGTTTGGAGTAGGTGATAG-GTTGCATAATCTA--TA-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAGGTGCAATCCGAGT------------G------------TAG------------CGAA-TA--CGC-TG-AAATCATATT-AGCGTAAACT-ACATGCAT-T-ACACTGTT----TG--GTGA---ATTG--T-TTTGA-C-A-AAA-TTAGTGGACCAATTGTAGTACT-C----AGAGAA-GCTATTTGC-TTGATCA-AACTA-GCCCAGTAAATT----AAAGAATAAAA-Tttttccttactataaaaacccccattatacatgtaacgccatcccccacatactgccaagcgtatttgtcaggtaacaaaattggtccaataccaatattatcacccccgataattatcgccaattttatcctacgttcaactgtgagaacacctctgggtgaacatgctaaagtaaaattttccgcttgtttgtcctgcaggttaaagtttggagtaggtgataggttgcataatctataattagttgagttcaaatctaggtgcaatccgagtgtagcgaatacgctgaaatcatattagcgtaaactacatgcattacactgtttggtgaattgttttgacaaaattagtggaccaattgtagtactcagagaagctatttgcttgatcaaactagcccagtaaattaaagaataaaat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTA-TATTGA---C-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCTCGTA--------T-a
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aG-TTGTTA--GTC--CTGCAG--------GTAAA-GTTTGGAGTAGGTGATAA-ATTATGTAATTTA--TA-ATTATATTTGAGTTCCAAT-------------CTAG------------C------------AAAAATCTGAGTATAG------------CGAA-CG--CGC-TG-AAACCATATT-ATTGCAAACT-ACATATATGTTACACTATT----T-------------------TTGA-------A-ATATTGGACCAATTGTAGTACT-C----AGTGAA-GCTATTCAC-TTGATCA-AACTA-GCCTGTTTAATT----AAAGAATAAAA-TATG--TACACGA-TT---TCCCAT-AACAGCTG--CTGCACA------TT--TA-C-----C---------C--------CCATCCCCTTC-A-C-ACT-TCCCCCATCCC-C-GT-TAT-AATG
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2511 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAANAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTTTACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------TA-------CCGCCA-T-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCCCG-TAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACNGCGAGAA-ACTT-TCGGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTA--GTC--CTGCAG--------GTAAAAGTTTGGAGTAGGTGATAA-GTTACGTAATTTA--TA-ATTAT--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------C------------G------------TAG------------CGAA-CA--CGC-TG-AAATCATATTTACCGCAAACT-NCATGC--GT-T-ACACTATT----TGG--A---ATTG--T-TTTGAC-A-AAAATAT--CGGACCAATTGTAGTACT-C----AGTGAA-GCTATTCGC-TTGATCA-AACTA-GCCTGGTNAATT----AAAGAATAAAA-TATG--T--ACGA-TTA-TTCTCAC-GACA---GCTG--TACA------TT--TA-C-----C---------C----------C-----------G-C-ACG-TCCCCC-TCCC-C-GN-TAT-AATGCCACCCCANTT--TATAATGCC-----AAATTCGCCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACGGGG-GA--TTACTGT
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gi|10                         : cgttataacgccatccccccgcataccgccatccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgTCCCCTGCTA-TATTGT--CC-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCCTGCA--------TA-------TTGCCA-
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtgaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCTGC-------------ATATTGCCAAAAAATTGAAAAGTCCTGTTTTCC-TTACTA-TGTTAA--AT-CCTG-TTATA------ATG-ATAT-CCCCCACA--------TACTGCCATCCACCA-T-------C-------------GTG-TTA-GAGGTA-CAAA-TGGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCACACTAATTA-T--CGCC-AATT--ACC-CT-TTAT-CTACAGCGAGAA-ACTT-TTAGTAAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTaaaaattgaaaagtcctgttttccttactatgttaaatcctgttataatgatatcccccacatactgccatccaccatcgtgttagaggtacaaatgggtcaaataccgttatattcacccacactaattatcgccaattaccctttatctacagcgagaaacttttagtaaacaggcttaagcaatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agtgatcccctgctatattgt-C----AGTGAA-AATATTCGC-TTCATGA-AGCTA-GCATGTTTAATT----AAAGAATAGAA-TGCA--T--ATGA-C---TTCTCAT-GGCA---GCTG--TACA------AC--TAGCTATCAC---------C----------C-----------G-C-AC---CCCCC-TCTCAA-AC-TTT-AATACCACCCT-TGT--TATAATGAC-----AAA-------ATGTACAAATGTTTACGATATAAT-GGG-GA--GTACTGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATT--ATTACACACCCGC-------------ATATCGCCAAAAAAT--CAAAGTCCGATT---CCTTGCCA-TTTAAA--AC-ACAGGTTATG------ACA-TCA-----CCGTA--------TAA------CCGCCA-A-------CCGCAC--------GTATTTA-CAGGTA-CGAA-TTGGTC--AATTACTC-G--TTATACTTCACTCCAG-CAATTG-T--CGCCAAATT--C-C-CT-ATAactagatttacacacttacccacgttatccacacttatatt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatacattgaccacgctatattgG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCTACA--------TA-------TCACCA-TTCGCCAAC-------------GTATTTA-CTAGTA-CAAA-TTGGTC--AATTAC--------------CAC------TAATTA-T--CACC-AATT--ACC-CT-ATAT-CAACAGCAAGAA-ACTT-TCAGTGAA-CA-GA-TTAAGCAA--TTA--TATA-TTGTTA--GTC--CCTAAGTCCCATTCGT-AAAGCTTGGAGTAAATAATAA-GTCATGTAATTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaATTTA--TA-ATAAA--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------T------------GACATCACCATA-CAG------------TGGA-TA--CGC-TG-GA-TCATATT-ACTGCAATCT-CCATGC--GT-TTATACTATT----TG-------------T-TTTGACCA-AAAATAT--CAGACAAAT-GTAGTGCT-CTGACAGTGAAAGCTGT-CGC-TTTATCA-AACTA-GCCTAGTAAATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attttcTGGCATTATAACGGGG-----TTACTGcgtttcgcctgttg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttctctgctatgttgtactgCCCCGTTATA--ATGCCACCCC---------------------GCCAAGAAATTTAAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------TG-------CCGCCA-T-------CCACCAACATACATGTATTTA-CAAGTA-CAAA-TTGGTC--AATGCC-C-G--TTATA-TTAACccccgccaagaaatttaaaagtcccgttttccttactatgtaaaaccccgttataacgccatcccccgcatgccgccatccaccaacatacatgtatttacaagtacaaattggtcaatgcccgttatattaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttctctgctatgttgtactgcagtaa-TATG--T--ACGA-TAA-T-CTCATTGGCA---GCTGATTACACCACCCTC--CA-C-----C---------CACCTTGCT--T-----------GTC-ACG-TCCCCC--CCA-C-GA-TATTAATA--ACCCAGGAG--GATACTACTGGAGAAAAATAGCCGAGGTACAAATGTTGGCG-TATAACGGGGAGATGTTACTGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atAAACT---ATGT--GG-T-GAACTATT----T---------TT---T-TTTAAC-A-AACTTAT--CGGACCAAA---AGTAAT-C----AGGGAA-GCTGTTTGG-TTTATCA-AACTA-Gac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATA--ATGTCACCTCCGC-------------ATATCGCCAAATAAATTCAAAGTCCCGTTTTCC-TTACTA-TGTAAA--AC-ACCG-TTATA------ACG-CCATCCCCCCGCA--------TA-------CCGCCA-T-------C-------------gatcggaaagtgctacgcctggtacgataaggatattcagtgtaactgatataaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attgcccctct-CAACTGTGAGAA-GCTT-TCAGCGAA-AA-GGTTTTAGCAT--TTC--CCTT-TTGTTA--GTCAATTG--G--------GTAAA-GCTTGGAATAAATAATAA-GTTATGTAAATTA--TA-ATTAT--Tcgccatcatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttttccttgcgtcCCCCCACTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCT--ACTA-TATAAA--AC-CCCG-TTATA------ACA-CCAT-CCCCCGCA--------TA-------ACGCCA-T-------C-------------GCATTTG-CA-GTA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-T-G--TTATA-ATCATTCCTGATAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACAATGAGAC-ACTC-TCAGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTT--GCC--CTGCAG--------GTAAAAATTTGGAGTAGGTGATAT-GTTCCGTAATTTA---A-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG-------------------------G------------T-G------------CGAA-CA--CGC-TA-TAAACATATTTACCGTAAACT-A-ATGC--ATGT-ACACTGTT----TGG--A---ATTG--T-TTAGAC-A-AAAA-AG--TGGACCAATTGTAGTACT-C----AGTGAA-G-TATTCGC-TTGATCA-AACTACGCC-GGTAAATT----AAAGAATAAAA-TATG--T--ATGATTTA-TTTTCAT-GACA---GCTG--TACA------TT--TA-C-----T---------C----------T-----------G-C-ACA-TCCCCC-TCCC-C-GA-AAT-AATGCCACCCCATTTAATATAATGCC-----AAATTCACCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACAGGG-GA--TTACTGT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATA------ACG-CCAT-TCCC-GCA--------TA-------CCGCCA-T-------CCTCCTAC------GTATT-A-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AATTTC-C-G--TCA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCACACCCGC-------------ATATCGCCAAAA------AAAATCCCGATTTCC-TTGCCA-TTTAAA--ACACATG-TTAatag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGCC-----AAATTCTCTGAGGTACAGATGTTGGCATTATAAGGAGG-GA--TTACTGT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -ACGT-TCGGTGAT-CA-GGCTTAAGCGA--TTA--TATG-TTGTTA--GTT--CTGTAG--------GCAAac
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cGCTA-A-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-GAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCCCGTTATATAATGCCACCTCAGC-------------ATATCGCAAATCAATTTCAAAGT-CCGTTTTCC-TTACTATTGCAAATTTC-CCCGCTTATAC-----CCGCCCAC-CCCCCGCACTTATGGCCA-------CAGCCA-A-------C-------------GTATT-----GGTA-CAAA-CTGGTCAAAAACAC-CTGTTTTATATTTCACCCCAA-TAATTATT--CG-C-AATT--A-C-CT-ATA--AAACTTTGAGAC-ACTC-TCGGTGAGCCACGGCGTAGGCAA--GTATTTCCG-TTGTGATTGCC--CTGCAG--------GT-AAAGTTTGGAGTAGGTGATAGCGTTACGTAATTTATTTATATTACG-TTGAGTTCAAATATAAGGTGCAAACCTAG------------T------------G------------TAG------------CGAATCA--CCC-TGAAAATCATA-TTACCGTTAATTGGCATGC--AT-T-ACACTGTTTTGGTGA--A---ATTGGTT-TTTGAT-C-GAAATATAGCGAACCAACTG-AATATTAC----AGTGAA-GCCATTCGCTTTGATCATAACTACCCCCGGTAAATTAAAAAAAAAACAAAAGTATA--T--ATGA-TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taatacagtgttcccccgctatatccccccccccccccccccTG--TACA------GTGCTC-C-----C---------C----------C-----------G-CTATA-TTGCCC---CC-C-GT-TAT-AATGCCACCCCCG----CATATTGCC-----ATAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attttgtttagagtgaaatacaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATTGCCATATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TAAAAA--CC-CCCA-TTATACATGTAACG-CCAT-CCCCCACA--------TA-------CTGCCAAG-------C-------------GTATTTGTCAGGTAACAAAATTGGTC--CAATAC-C-A--ATATT-ATCACCCCCGATAATTA-T--CGCC-AATTTTATC-CT-ACGTTCAACTGTGAGAACACCTCTGGGTGAA-CA-TGCTAAAGTAAAATTT--TCCGCTTGTTT--GTC--CTGCAG--------GTTAAAGTTTGGAGTAGGTGATAG-GTTGCATAATCTA--TA-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAGGTGCAATCCGAGT------------G------------TAG------------CGAA-TA--CGC-TG-AAATCATATT-AGCGTAAACT-ACATGC--AT-T-ACACTGTT----TGGTGA---ATTG--T-TTTGAC-A-AAATTAG--TGGACCAATTGTAGTACT-C----AGAGAA-GCTATTTGC-TTGATCA-AACTA-GCCCAGTAAATT----AAAGAATAAAA-Taatttcaaagtcccgttttccttactataaaaacccccattatacatgtaacgccatcccccacatactgccaagcgtatttgtcaggtaacaaaattggtccaataccaatattatcacccccgataattatcgccaattttatcctacgttcaactgtgagaacacctctgggtgaacatgctaaagtaaaattttccgcttgtttgtcctgcaggttaaagtttggagtaggtgataggttgcataatctataattagttgagttcaaatctaggtgcaatccgagtgtagcgaatacgctgaaatcatattagcgtaaactacatgcattacactgtttggtgaattgttttgacaaaattagtggaccaattgtagtactcagagaagctatttgcttgatcaaactagcccagtaaattaaagaataaaat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTA-TATTGA---C-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCTCGTA--------Ta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtacagtgatcgtcaCCCCGTTATA--ATGCCACCCTCGT-------------AT------------TTTCG----CACTTTCTCCTT-ACTG-TGTAAA--TC-TATA-TTATA------AC----------CCGCA--------TA-------CCAACA-C-------CC------------GCATTTA-CAGGTA-CAAA-TTAGTC--AAACAC-C-A--TCAGA-TTCGCCCTC--TCATTT-TTTCACC-AATT--A-CTCT-TTAT-CAACAGAGAAAA-ACTT-TCAGAGAG-CA-TGATGAATCAA--TTA--TCTT-TCGTTA--GCC--CTGCAT--------GT-AAAGTTTGAGGGAAATGTTA----TATGTAATTCA--TG-ATTTT--TTAAGTTAAAAT-------------CAAG------------A------------T------------TAAATCCGACTTTTTCGAA-CA--CAC-TG-AAATTTTA-TTACCATACACT-TCACAT--GT-T-ACACTATtttcgcactttctccttactgtgtaaatctatattataacccgcataccaacacccgcatttacaggtacaaattagtcaaacaccatcagattcgccctctcattttttcaccaattactctttatcaacagagaaaaactttcagagagcatgatgaatcaattatctttcgttagccctgcatgtaaagtttgagggaaatgttatatgtaattcatgattttttaagttaaaatcaagattaaatccgactttttcgaacacactgaaattttattaccatacacttcacatgttacactatg
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2511 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAANAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTTTACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCCCG-TAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACNGCGAGAA-ACTT-TCGGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTA--GTC--CTGCAG--------GTAAAAGTTTGGAGTAGGTGATAA-GTTACGTAATTTA--TA-ATTAT--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------C------------G------------TAG------------CGAA-CA--CGC-TG-AAATCATA-TTACCGCAAACT-NCATGC--G-T-TACACTATT----TGG--A---ATTG--T-TTTGA-CA-AAAATAT--CGGACCAATTGTAGTACT----CAGTG-AAGCTATTCGC-TTGATCA-AACTA-GCCTGGTNAATT----AAAGAATAAAA-TATG--TAC--GA-TTA-TTCTCAC-GACAGCTG--T---ACA------TT--TA-C-----C---------C--------C-----------G-C-ACG-TCCCCC-TCCC-C-GN-TAT-AATGCCACCC---CANNT-----TATAATGCC-----AAATTCGCCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACGGGG-GA--TTACTGT
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gi|10                         : cgttataacgccatccccccgcataccgccatccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgTCCCCTGCTA-TATTGT--CC-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCCTGCA--------T-A-------TTGCCA-----
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtgaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCTGC-------------ATATTGCCAAAAAATTGAAAAGTCCTGTTTTCC-TTACTA-TGTTAA--AT-CCTG-TTATA------ATG-ATAT-CCCCCACA--------T-ACTGCCATCCACCA-----T-------C-------------GTG-TTA-GAGGTA-CAAA-TGGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCACACTAATTA-T--CGCC-AATT--ACC-CT-TTAT-CTACAGCGAGAA-ACTT-TTAGTAAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTaaaaattgaaaagtcctgttttccttactatgttaaatcctgttataatgatatcccccacatactgccatccaccatcgtgttagaggtacaaatgggtcaaataccgttatattcacccacactaattatcgccaattaccctttatctacagcgagaaacttttagtaaacaggcttaagcaatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agtgatcccctgctatattgt----CAGTG-AAAATATTCGC-TTCATGA-AGCTA-GCATGTTTAATT----AAAGAATAGAA-TGCA--TAT--GA-C---TTCTCAT-GGCAGCTG--T---ACA------AC--TAGCTATCAC---------C--------C-----------G-C-AC---CCCCC-TCTCAA-AC-TTT-AATACCACCC---T-TGT-----TATAATGAC-----AAA-------ATGTACAAATGTTTACGATATAAT-GGG-GA--GTACTGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATT--ATTACACACCCGC-------------ATATCGCCAAAAAA--TCAAAGTCCGATT---CCTTGCCA-TTTAAA--ACACAGG-TTATG------ACA-TCA-----CCGTA--------TAA-------CCGCCAACCGCA-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-CGAA-TTGGTC--AATTACTC-G--TTATACTTCACTCCAG-CAATTG-T--CGCCAAATT--C-C-CT-ATAactagatttacacacttacccacgttatccacacttatatt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatacattgaccacgctatattgG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCTACA--------T-A-------TCACCA-----TTCGCCAAC-------------GTATTTA-CTAGTA-CAAA-TTGGTC--AATTAC--------------CAC------TAATTA-T--CACC-AATT--ACC-CT-ATAT-CAACAGCAAGAA-ACTT-TCAGTGAA-CA-GA-TTAAGCAA--TTA--TATA-TTGTTA--GTC--CCTAAGTCCCATTCGT-AAAGCTTGGAGTAAATAATAA-GTCATGTAATTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaATTTA--TA-ATAAA--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------T------------GACATCACCATA-CAG------------TGGA-TA--CGC-TG-GA-TCATA-TTACTGCAATCT-CCATGC--GTT-TATACTAT---------------TTG--T-TTTGACCA-AAAATAT--CAGACAAA-TGTAGTGCTCTGACAGTGAAAGCTG-TCGC-TTTATCA-AACTA-GCCTAGTAAATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attttcTGGCATTATAACGGGG-----TTACTGcgtttcgcctgttg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttctctgctatgttgtactgCCCCGTTATA--ATGCCACCCC---------------------GCCAAGAAATTTAAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------T-G-------CCGCCA-----T-------CCACCAACATACATGTATTTA-CAAGTA-CAAA-TTGGTC--AATGCC-C-G--TTATA-TTAACccccgccaagaaatttaaaagtcccgttttccttactatgtaaaaccccgttataacgccatcccccgcatgccgccatccaccaacatacatgtatttacaagtacaaattggtcaatgcccgttatattaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttctctgctatgttgtactgcagtaa-TATG--TAC--GA-TAA-T-CTCATTGGCAGCTGATT---ACACCACCCTC--CA-C-----C---------CACCTTGCTT-----------GTC-ACG-TCCCCC--CCA-C-GA-TATTAATA--ACCC---AGGAG-----GATACTACTGGAGAAAAATAGCCGAGGTACAAATGTTGGCG-TATAACGGGGAGATGTTACTGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atAAACT---ATGT--G-G-TGAACTATT----T---------TT---T-TTTAA-CA-AACTTAT--CGGACCAAA---AGTAAT----CAGGG-AAGCTGTTTGG-TTTATCA-AACTA-Gac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATA--ATGTCACCTCCGC-------------ATATCGCCAAATAAATTCAAAGTCCCGTTTTCC-TTACTA-TGTAAA--AC-ACCG-TTATA------ACG-CCATCCCCCCGCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------C-------------gatcggaaagtgctacgcctggtacgataaggatattcagtgtaactgatataaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attgcccctct-CAACTGTGAGAA-GCTT-TCAGCGAA-AA-GGTTTTAGCAT--TTC--CCTT-TTGTTA--GTCAATTG--G--------GTAAA-GCTTGGAATAAATAATAA-GTTATGTAAATTA--TA-ATTAT--Tcgccatcatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttttccttgcgtcCCCCCACTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCT--ACTA-TATAAA--AC-CCCG-TTATA------ACA-CCAT-CCCCCGCA--------T-A-------ACGCCA-----T-------C-------------GCATTTG-CA-GTA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-T-G--TTATA-ATCATTCCTGATAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACAATGAGAC-ACTC-TCAGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTT--GCC--CTGCAG--------GTAAAAATTTGGAGTAGGTGATAT-GTTCCGTAATTTA---A-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG-------------------------G------------T-G------------CGAA-CA--CGC-TA-TAAACATATTTACCGTAAACT-A-ATGC--A-TGTACACTGTT----TGG--A---ATTG--T-TTAGA-CA-AAAA-AG--TGGACCAATTGTAGTACT----CAGTG-AAG-TATTCGC-TTGATCA-AACTACGCC-GGTAAATT----AAAGAATAAAA-TATG--TAT--GATTTA-TTTTCAT-GACAGCTG--T---ACA------TT--TA-C-----T---------C--------T-----------G-C-ACA-TCCCCC-TCCC-C-GA-AAT-AATGCCACCC---CATTTAA---TATAATGCC-----AAATTCACCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACAGGG-GA--TTACTGT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATA------ACG-CCAT-TCCC-GCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------CCTCCTAC------GTATT-A-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AATTTC-C-G--TCA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCACACCCGC-------------ATATCGCCAAAA------AAAATCCCGATTTCC-TTGCCA-TTTAAA--ACACATG-TTAatag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGCC-----AAATTCTCTGAGGTACAGATGTTGGCATTATAAGGAGG-GA--TTACTGT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -ACGT-TCGGTGAT-CA-GGCTTAAGCGA--TTA--TATG-TTGTTA--GTT--CTGTAG--------GCAAac
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cGCTA-----A-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-GAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCCCGTTATATAATGCCACCTCAGC-------------ATATCGCAAATCAATTTCAAAGT-CCGTTTTCC-TTACTATTGCAAATTTC-CCCGCTTATAC-----CCGCCCAC-CCCCCGCACTTATGGCC-A-------CAGCCA-----A-------C-------------GTATT-----GGTA-CAAA-CTGGTCAAAAACAC-CTGTTTTATATTTCACCCCAA-TAATTATT--CG-C-AATT--A-C-CT-ATA--AAACTTTGAGAC-ACTC-TCGGTGAGCCACGGCGTAGGCAA--GTATTTCCG-TTGTGATTGCC--CTGCAG--------GT-AAAGTTTGGAGTAGGTGATAGCGTTACGTAATTTATTTATATTACG-TTGAGTTCAAATATAAGGTGCAAACCTAG------------T------------G------------TAG------------CGAATCA--CCC-TGAAAATCATA-TTACCGTTAATTGGCATGC--A-T-TACACTGTTTTGGTGA--A---ATTGGTT-TTTGA-TC-GAAATATAGCGAACCAACTG-AATATTA---CAGTG-AAGCCATTCGCTTTGATCATAACTACCCCCGGTAAATTAAAAAAAAAACAAAAGTATA--TAT--GA-TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taatacagtgttcccccgctatatccccccccccccccccccTG--T---ACA------GTGCTC-C-----C---------C--------C-----------G-CTATA-TTGCCC---CC-C-GT-TAT-AATGCCACCCCCGCATATTGCCATATAATTTC-----AAAGTC-CCG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attttgtttagagtgaaatacaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATTGCCATATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TAAAAA--CC-CCCA-TTATACATGTAACG-CCAT-CCCCCACA--------T-A-------CTGCCAA----G-------C-------------GTATTTGTCAGGTAACAAAATTGGTC--CAATAC-C-A--ATATT-ATCACCCCCGATAATTA-T--CGCC-AATTTTATC-CT-ACGTTCAACTGTGAGAACACCTCTGGGTGAA-CA-TGCTAAAGTAAAATTT--TCCGCTTGTTT--GTC--CTGCAG--------GTTAAAGTTTGGAGTAGGTGATAG-GTTGCATAATCTA--TA-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAGGTGCAATCCGAGT------------G------------TAG------------CGAA-TA--CGC-TG-AAATCATA-TTAGCGTAAACT-ACATGC--A-T-TACACTGTT----TGGTGA---ATTG--T-TTTGA-CA-AAATTAG--TGGACCAATTGTAGTACT----CAGAG-AAGCTATTTGC-TTGATCA-AACTA-GCCCAGTAAATT----AAAGAATAAAA-Tttttccttactataaaaacccccattatacatgtaacgccatcccccacatactgccaagcgtatttgtcaggtaacaaaattggtccaataccaatattatcacccccgataattatcgccaattttatcctacgttcaactgtgagaacacctctgggtgaacatgctaaagtaaaattttccgcttgtttgtcctgcaggttaaagtttggagtaggtgataggttgcataatctataattagttgagttcaaatctaggtgcaatccgagtgtagcgaatacgctgaaatcatattagcgtaaactacatgcattacactgtttggtgaattgttttgacaaaattagtggaccaattgtagtactcagagaagctatttgcttgatcaaactagcccagtaaattaaagaataaaat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTA-TATTGA---C-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCTCGTA--------T-a
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aG-TTGTTA--GTC--CTGCAG--------GTAAA-GTTTGGAGTAGGTGATAA-ATTATGTAATTTA--TA-ATTATATTTGAGTTCCAAT-------------CTAG------------C------------AAAAATCTGAGTATAG------------CGAA-CG--CGC-TG-AAACCATA-TTATTGCAAACT-ACATATATG-T-TACACTATT----T-----------------TTGA------AATAT--TGGACCAATTGTAGTACT----CAGTG-AAGCTATTCAC-TTGATCA-AACTA-GCCTGTTTAATT----AAAGAATAAAA-TATG--TACACGA-TT---TCCCAT-AACAGCTG--CTGCACA------TT--TA-C-----C---------C--------CCATCCCCTTC-A-C-ACT-TCCCCCATCCC-C-GT-TAT-AATG
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         : cgttataacgccatccccccgcataccgccatccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgTCCCCTGCTA-TATTGT--CC-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCCTGCA--------T-A-------TTGCCA-----
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtgaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCTGC-------------ATATTGCCAAAAAATTGAAAAGTCCTGTTTTCC-TTACTA-TGTTAA--AT-CCTG-TTATA------ATG-ATAT-CCCCCACA--------T-ACTGCCATCCACCA-----T-------C-------------GTG-TTA-GAGGTA-CAAA-TGGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCACACTAATTA-T--CGCC-AATT--ACC-CT-TTAT-CTACAGCGAGAA-ACTT-TTAGTAAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTaaaaattgaaaagtcctgttttccttactatgttaaatcctgttataatgatatcccccacatactgccatccaccatcgtgttagaggtacaaatgggtcaaataccgttatattcacccacactaattatcgccaattaccctttatctacagcgagaaacttttagtaaacaggcttaagcaatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agtgatcccctgctatattgt----CAGTG-AAAATATTCGC-TTCATGA-AGCTA-GCATGTTTAATT----AAAGAATAGAA-TGCA--T--ATGA-C---TTCTCAT-GGCA---GCTG--TACA------AC--TAGCTATCAC---------C----------C-----------G-C-AC---CCCCC-TCTCAA-AC-TTT-AATA--------C--CACCC---T-TG-T-----TATAATGAC-----AAA-------ATGTACAAATGTTTACGATATAAT-GGG-GA--GTACTGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATT--ATTACACACCCGC-------------ATATCGCCAAAAAA--TCAAAGTCCGATT---CCTTGCCA-TTTAAA--ACACAGG-TTATG------ACA-TCA-----CCGTA--------TAA-------CCGCCAACCGCA-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-CGAA-TTGGTC--AATTACTC-G--TTATACTTCACTCCAG-CAATTG-T--CGCCAAATT--C-C-CT-ATAactagatttacacacttacccacgttatccacacttatatt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatacattgaccacgctatattgG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCTACA--------T-A-------TCACCA-----TTCGCCAAC-------------GTATTTA-CTAGTA-CAAA-TTGGTC--AATTAC--------------CAC------TAATTA-T--CACC-AATT--ACC-CT-ATAT-CAACAGCAAGAA-ACTT-TCAGTGAA-CA-GA-TTAAGCAA--TTA--TATA-TTGTTA--GTC--CCTAAGTCCCATTCGT-AAAGCTTGGAGTAAATAATAA-GTCATGTAATTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaATTTA--TA-ATAAA--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------T------------GACATCACCATA-CAG------------TGGA-TA--CGC-TG-GA-TCATA-TTACTGCAATCT-CCATGC--GTT-TATACTAT---------------TTG--T-TTTGACCA-AAAATAT--CAGACAAA-TGTAGTGCTCTGACAGTGAAAGCTG-TCGC-TTTATCA-AACTA-GCCTAGTAAATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attttcTGGCATTATAACGGGG-----TTACTGcgtttcgcctgttg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttctctgctatgttgtactgCCCCGTTATA--ATGCCACCCC---------------------GCCAAGAAATTTAAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------T-G-------CCGCCA-----T-------CCACCAACATACATGTATTTA-CAAGTA-CAAA-TTGGTC--AATGCC-C-G--TTATA-TTAACccccgccaagaaatttaaaagtcccgttttccttactatgtaaaaccccgttataacgccatcccccgcatgccgccatccaccaacatacatgtatttacaagtacaaattggtcaatgcccgttatattaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttctctgctatgttgtactgcagtaa-TATG--T--ACGA-TAA-T-CTCATTGGCA---GCTGATTACACCACCCTC--CA-C-----C---------CACCTTGCT--T-----------GTC-ACG-TCCCCC--CCA-C-GA-TATTAAT-------------AACC---CAGGAG-----GATACTACTGGAGAAAAATAGCCGAGGTACAAATGTTGGCG-TATAACGGGGAGATGTTACTGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atAAACT---ATGT--G-G-TGAACTATT----T---------TT---T-TTTAA-CA-AACTTAT--CGGACCAAA---AGTAAT----CAGGG-AAGCTGTTTGG-TTTATCA-AACTA-Gac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATA--ATGTCACCTCCGC-------------ATATCGCCAAATAAATTCAAAGTCCCGTTTTCC-TTACTA-TGTAAA--AC-ACCG-TTATA------ACG-CCATCCCCCCGCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------C-------------gatcggaaagtgctacgcctggtacgataaggatattcagtgtaactgatataaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attgcccctct-CAACTGTGAGAA-GCTT-TCAGCGAA-AA-GGTTTTAGCAT--TTC--CCTT-TTGTTA--GTCAATTG--G--------GTAAA-GCTTGGAATAAATAATAA-GTTATGTAAATTA--TA-ATTAT--Tcgccatcatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttttccttgcgtcCCCCCACTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCT--ACTA-TATAAA--AC-CCCG-TTATA------ACA-CCAT-CCCCCGCA--------T-A-------ACGCCA-----T-------C-------------GCATTTG-CA-GTA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-T-G--TTATA-ATCATTCCTGATAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACAATGAGAC-ACTC-TCAGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTT--GCC--CTGCAG--------GTAAAAATTTGGAGTAGGTGATAT-GTTCCGTAATTTA---A-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG-------------------------G------------T-G------------CGAA-CA--CGC-TA-TAAACATATTTACCGTAAACT-A-ATGC--A-TGTACACTGTT----TGG--A---ATTG--T-TTAGA-CA-AAAA-AG--TGGACCAATTGTAGTACT----CAGTG-AAG-TATTCGC-TTGATCA-AACTACGCC-GGTAAATT----AAAGAATAAAA-TATG--T--ATGATTTA-TTTTCAT-GACA---GCTG--TACA------TT--TA-C-----T---------C----------T-----------G-C-ACA-TCCCCC-TCCC-C-GA-AAT-AATG--------C--CACCC---CATT-TAA---TATAATGCC-----AAATTCACCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACAGGG-GA--TTACTGT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATA------ACG-CCAT-TCCC-GCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------CCTCCTAC------GTATT-A-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AATTTC-C-G--TCA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCACACCCGC-------------ATATCGCCAAAA------AAAATCCCGATTTCC-TTGCCA-TTTAAA--ACACATG-TTAatag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCC-----AAATTCTCTGAGGTACAGATGTTGGCATTATAAGGAGG-GA--TTACTGT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -ACGT-TCGGTGAT-CA-GGCTTAAGCGA--TTA--TATG-TTGTTA--GTT--CTGTAG--------GCAAac
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cGCTA-----A-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-GAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCCCGTTATATAATGCCACCTCAGC-------------ATATCGCAAATCAATTTCAAAGT-CCGTTTTCC-TTACTATTGCAAATTTC-CCCGCTTATAC-----CCGCCCAC-CCCCCGCACTTATGGCC-A-------CAGCCA-----A-------C-------------GTATT-----GGTA-CAAA-CTGGTCAAAAACAC-CTGTTTTATATTTCACCCCAA-TAATTATT--CG-C-AATT--A-C-CT-ATA--AAACTTTGAGAC-ACTC-TCGGTGAGCCACGGCGTAGGCAA--GTATTTCCG-TTGTGATTGCC--CTGCAG--------GT-AAAGTTTGGAGTAGGTGATAGCGTTACGTAATTTATTTATATTACG-TTGAGTTCAAATATAAGGTGCAAACCTAG------------T------------G------------TAG------------CGAATCA--CCC-TGAAAATCATA-TTACCGTTAATTGGCATGC--A-T-TACACTGTTTTGGTGA--A---ATTGGTT-TTTGA-TC-GAAATATAGCGAACCAACTG-AATATTA---CAGTG-AAGCCATTCGCTTTGATCATAACTACCCCCGGTAAATTAAAAAAAAAACAAAAGTATA--T--ATGA-TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taatacagtgttcccccgctatatccccccccccccccccccTG--TACA------GTGCTC-C-----C---------C----------C-----------G-CTATA-TTGCCC---CC-C-GT-TAT-AATG--------C--CACCCCCGCATA-TTGCCATATAATTTC-----AAAGTC-CCG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attttgtttagagtgaaatacaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATTGCCATATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TAAAAA--CC-CCCA-TTATACATGTAACG-CCAT-CCCCCACA--------T-A-------CTGCCAA----G-------C-------------GTATTTGTCAGGTAACAAAATTGGTC--CAATAC-C-A--ATATT-ATCACCCCCGATAATTA-T--CGCC-AATTTTATC-CT-ACGTTCAACTGTGAGAACACCTCTGGGTGAA-CA-TGCTAAAGTAAAATTT--TCCGCTTGTTT--GTC--CTGCAG--------GTTAAAGTTTGGAGTAGGTGATAG-GTTGCATAATCTA--TA-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAGGTGCAATCCGAGT------------G------------TAG------------CGAA-TA--CGC-TG-AAATCATA-TTAGCGTAAACT-ACATGC--A-T-TACACTGTT----TGGTGA---ATTG--T-TTTGA-CA-AAATTAG--TGGACCAATTGTAGTACT----CAGAG-AAGCTATTTGC-TTGATCA-AACTA-GCCCAGTAAATT----AAAGAATAAAA-Tttttccttactataaaaacccccattatacatgtaacgccatcccccacatactgccaagcgtatttgtcaggtaacaaaattggtccaataccaatattatcacccccgataattatcgccaattttatcctacgttcaactgtgagaacacctctgggtgaacatgctaaagtaaaattttccgcttgtttgtcctgcaggttaaagtttggagtaggtgataggttgcataatctataattagttgagttcaaatctaggtgcaatccgagtgtagcgaatacgctgaaatcatattagcgtaaactacatgcattacactgtttggtgaattgttttgacaaaattagtggaccaattgtagtactcagagaagctatttgcttgatcaaactagcccagtaaattaaagaataaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attttgtttagagtgaaatacatgtacagtgctcccccgctatattgcCAA--TTA--TCTG-TTGTTA--GTC--CAGCAG--------GCAAA-GTTTGAAGTAGATGATAA-GGTATGTAATTTA--CA-ATTAT--TTGAGTTCAAATATAGCTGAAATC-CTAG------------T------------G------------TAG------------CGAA-CG--CGC-TG-GAATCATA-TTACCACAAACT-ACATGC--G-T-TATACGATC----TGGTGA---ATTG--T-TCTGA-CA-AATACAT--CGGACGAATTGTAGTAAT----CAGTG-AAGCTATTCGC-TTGATCA-AACTA-GACTGGTTAATC----AAAGAATAAAA-TATG-------GA-TTATTTCTCAC-GACA---GCTG--TCCA------TT--TA-C-----CTCCATCCCAC----------C-----------A-C-ACGCTCCGCA-CCCC-C-TA-TAT-AGTG--------C--T-CCA---CA-G-T-----TATAGTGCC-----AAATTCGCCGAGGTACACATTTTGGCGTTATAATGGAT-GA--TTACTGT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTA-TATTGA---C-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCTCGTA--------T-a
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtacagtgatcgtcaCCCCGTTATA--ATGCCACCCTCGT-------------AT------------TTTCG----CACTTTCTCCTT-ACTG-TGTAAA--TC-TATA-TTATA------AC----------CCGCA--------T-A-------CCAACA-----C-------CC------------GCATTTA-CAGGTA-CAAA-TTAGTC--AAACAC-C-A--TCAGA-TTCGCCCTC--TCATTT-TTTCACC-AATT--A-CTCT-TTAT-CAACAGAGAAAA-ACTT-TCAGAGAG-CA-TGATGAATCAA--TTA--TCTT-TCGTTA--GCC--CTGCAT--------GT-AAAGTTTGAGGGAAATGTTA----TATGTAATTCA--TG-ATTTT--TTAAGTTAAAAT-------------CAAG------------A------------T------------TAAATCCGACTTTTTCGAA-CA--CAC-TG-AAATTTTA-TTACCATACACT-TCACAT--G-T-TACACTATtttcgcactttctccttactgtgtaaatctatattataacccgcataccaacacccgcatttacaggtacaaattagtcaaacaccatcagattcgccctctcattttttcaccaattactctttatcaacagagaaaaactttcagagagcatgatgaatcaattatctttcgttagccctgcatgtaaagtttgagggaaatgttatatgtaattcatgattttttaagttaaaatcaagattaaatccgactttttcgaacacactgaaattttattaccatacacttcacatgttacactatg
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         : cgttataacgccatccccccgcataccgccatccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgTCCCCTGCTA-TATTGT--CC-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCCTGCA--------T-A-------TTGCCA-----
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtgaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCTGC-------------ATATTGCCAAAAAATTGAAAAGTCCTGTTTTCC-TTACTA-TGTTAA--AT-CCTG-TTATA------ATG-ATAT-CCCCCACA--------T-ACTGCCATCCACCA-----T-------C-------------GTG-TTA-GAGGTA-CAAA-TGGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCACACTAATTA-T--CGCC-AATT--ACC-CT-TTAT-CTACAGCGAGAA-ACTT-TTAGTAAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTaaaaattgaaaagtcctgttttccttactatgttaaatcctgttataatgatatcccccacatactgccatccaccatcgtgttagaggtacaaatgggtcaaataccgttatattcacccacactaattatcgccaattaccctttatctacagcgagaaacttttagtaaacaggcttaagcaatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agtgatcccctgctatattgt----CAGTG-AAAATATTCGC-TTCATGA-AGCTA-GCATGTTTAATT----AAAGAATAGAA-TGCA--T--ATGA-C---TTCTCAT-GGCA---GCTG--TACA------AC--TAGCTATCAC---------C----------C-----------G-C-AC---CCCCC-TCTCAA-AC-TTT-AATA--------C--CACCC---T-TG-T-----TATAATGAC-----AAA-------ATGTACAAATGTTTACGATATAAT-GGG-GA--GTACTGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATT--ATTACACACCCGC-------------ATATCGCCAAAAAA--TCAAAGTCCGATT---CCTTGCCA-TTTAAA--ACACAGG-TTATG------ACA-TCA-----CCGTA--------TAA-------CCGCCAACCGCA-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-CGAA-TTGGTC--AATTACTC-G--TTATACTTCACTCCAG-CAATTG-T--CGCCAAATT--C-C-CT-ATAactagatttacacacttacccacgttatccacacttatatt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatacattgaccacgctatattgG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCTACA--------T-A-------TCACCA-----TTCGCCAAC-------------GTATTTA-CTAGTA-CAAA-TTGGTC--AATTAC--------------CAC------TAATTA-T--CACC-AATT--ACC-CT-ATAT-CAACAGCAAGAA-ACTT-TCAGTGAA-CA-GA-TTAAGCAA--TTA--TATA-TTGTTA--GTC--CCTAAGTCCCATTCGT-AAAGCTTGGAGTAAATAATAA-GTCATGTAATTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaATTTA--TA-ATAAA--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------T------------GACATCACCATA-CAG------------TGGA-TA--CGC-TG-GA-TCATA-TTACTGCAATCT-CCATGC--GTT-TATACTAT---------------TTG--T-TTTGACCA-AAAATAT--CAGACAAA-TGTAGTGCTCTGACAGTGAAAGCTG-TCGC-TTTATCA-AACTA-GCCTAGTAAATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attttcTGGCATTATAACGGGG-----TTACTGcgtttcgcctgttg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttctctgctatgttgtactgCCCCGTTATA--ATGCCACCCC---------------------GCCAAGAAATTTAAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------T-G-------CCGCCA-----T-------CCACCAACATACATGTATTTA-CAAGTA-CAAA-TTGGTC--AATGCC-C-G--TTATA-TTAACccccgccaagaaatttaaaagtcccgttttccttactatgtaaaaccccgttataacgccatcccccgcatgccgccatccaccaacatacatgtatttacaagtacaaattggtcaatgcccgttatattaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttctctgctatgttgtactgcagtaa-TATG--T--ACGA-TAA-T-CTCATTGGCA---GCTGATTACACCACCCTC--CA-C-----C---------CACCTTGCT--T-----------GTC-ACG-TCCCCC--CCA-C-GA-TATTAAT-------------AACC---CAGGAG-----GATACTACTGGAGAAAAATAGCCGAGGTACAAATGTTGGCG-TATAACGGGGAGATGTTACTGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atAAACT---ATGT--G-G-TGAACTATT----T---------TT---T-TTTAA-CA-AACTTAT--CGGACCAAA---AGTAAT----CAGGG-AAGCTGTTTGG-TTTATCA-AACTA-Gac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCGTTATA--ATGTCACCTCCGC-------------ATATCGCCAAATAAATTCAAAGTCCCGTTTTCC-TTACTA-TGTAAA--AC-ACCG-TTATA------ACG-CCATCCCCCCGCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------C-------------gatcggaaagtgctacgcctggtacgataaggatattcagtgtaactgatataaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attgcccctct-CAACTGTGAGAA-GCTT-TCAGCGAA-AA-GGTTTTAGCAT--TTC--CCTT-TTGTTA--GTCAATTG--G--------GTAAA-GCTTGGAATAAATAATAA-GTTATGTAAATTA--TA-ATTAT--Tcgccatcatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttttccttgcgtcCCCCCACTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCT--ACTA-TATAAA--AC-CCCG-TTATA------ACA-CCAT-CCCCCGCA--------T-A-------ACGCCA-----T-------C-------------GCATTTG-CA-GTA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-T-G--TTATA-ATCATTCCTGATAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACAATGAGAC-ACTC-TCAGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTT--GCC--CTGCAG--------GTAAAAATTTGGAGTAGGTGATAT-GTTCCGTAATTTA---A-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG-------------------------G------------T-G------------CGAA-CA--CGC-TA-TAAACATATTTACCGTAAACT-A-ATGC--A-TGTACACTGTT----TGG--A---ATTG--T-TTAGA-CA-AAAA-AG--TGGACCAATTGTAGTACT----CAGTG-AAG-TATTCGC-TTGATCA-AACTACGCC-GGTAAATT----AAAGAATAAAA-TATG--T--ATGATTTA-TTTTCAT-GACA---GCTG--TACA------TT--TA-C-----T---------C----------T-----------G-C-ACA-TCCCCC-TCCC-C-GA-AAT-AATG--------C--CACCC---CATT-TAA---TATAATGCC-----AAATTCACCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACAGGG-GA--TTACTGT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATA------ACG-CCAT-TCCC-GCA--------T-A-------CCGCCA-----T-------CCTCCTAC------GTATT-A-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AATTTC-C-G--TCA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCACACCCGC-------------ATATCGCCAAAA------AAAATCCCGATTTCC-TTGCCA-TTTAAA--ACACATG-TTAatag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCC-----AAATTCTCTGAGGTACAGATGTTGGCATTATAAGGAGG-GA--TTACTGT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -ACGT-TCGGTGAT-CA-GGCTTAAGCGA--TTA--TATG-TTGTTA--GTT--CTGTAG--------GCAAac
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cGCTA-----A-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-GAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCCCGTTATATAATGCCACCTCAGC-------------ATATCGCAAATCAATTTCAAAGT-CCGTTTTCC-TTACTATTGCAAATTTC-CCCGCTTATAC-----CCGCCCAC-CCCCCGCACTTATGGCC-A-------CAGCCA-----A-------C-------------GTATT-----GGTA-CAAA-CTGGTCAAAAACAC-CTGTTTTATATTTCACCCCAA-TAATTATT--CG-C-AATT--A-C-CT-ATA--AAACTTTGAGAC-ACTC-TCGGTGAGCCACGGCGTAGGCAA--GTATTTCCG-TTGTGATTGCC--CTGCAG--------GT-AAAGTTTGGAGTAGGTGATAGCGTTACGTAATTTATTTATATTACG-TTGAGTTCAAATATAAGGTGCAAACCTAG------------T------------G------------TAG------------CGAATCA--CCC-TGAAAATCATA-TTACCGTTAATTGGCATGC--A-T-TACACTGTTTTGGTGA--A---ATTGGTT-TTTGA-TC-GAAATATAGCGAACCAACTG-AATATTA---CAGTG-AAGCCATTCGCTTTGATCATAACTACCCCCGGTAAATTAAAAAAAAAACAAAAGTATA--T--ATGA-TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taatacagtgttcccccgctatatccccccccccccccccccTG--TACA------GTGCTC-C-----C---------C----------C-----------G-CTATA-TTGCCC---CC-C-GT-TAT-AATG--------C--CACCCCCGCATA-TTGCCATATAATTTC-----AAAGTC-CCG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attttgtttagagtgaaatacaCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATTGCCATATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTT-ACTA-TAAAAA--CC-CCCA-TTATACATGTAACG-CCAT-CCCCCACA--------T-A-------CTGCCAA----G-------C-------------GTATTTGTCAGGTAACAAAATTGGTC--CAATAC-C-A--ATATT-ATCACCCCCGATAATTA-T--CGCC-AATTTTATC-CT-ACGTTCAACTGTGAGAACACCTCTGGGTGAA-CA-TGCTAAAGTAAAATTT--TCCGCTTGTTT--GTC--CTGCAG--------GTTAAAGTTTGGAGTAGGTGATAG-GTTGCATAATCTA--TA-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAGGTGCAATCCGAGT------------G------------TAG------------CGAA-TA--CGC-TG-AAATCATA-TTAGCGTAAACT-ACATGC--A-T-TACACTGTT----TGGTGA---ATTG--T-TTTGA-CA-AAATTAG--TGGACCAATTGTAGTACT----CAGAG-AAGCTATTTGC-TTGATCA-AACTA-GCCCAGTAAATT----AAAGAATAAAA-Tttttccttactataaaaacccccattatacatgtaacgccatcccccacatactgccaagcgtatttgtcaggtaacaaaattggtccaataccaatattatcacccccgataattatcgccaattttatcctacgttcaactgtgagaacacctctgggtgaacatgctaaagtaaaattttccgcttgtttgtcctgcaggttaaagtttggagtaggtgataggttgcataatctataattagttgagttcaaatctaggtgcaatccgagtgtagcgaatacgctgaaatcatattagcgtaaactacatgcattacactgtttggtgaattgttttgacaaaattagtggaccaattgtagtactcagagaagctatttgcttgatcaaactagcccagtaaattaaagaataaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attttgtttagagtgaaatacatgtacagtgctcccccgctatattgcCAA--TTA--TCTG-TTGTTA--GTC--CAGCAG--------GCAAA-GTTTGAAGTAGATGATAA-GGTATGTAATTTA--CA-ATTAT--TTGAGTTCAAATATAGCTGAAATC-CTAG------------T------------G------------TAG------------CGAA-CG--CGC-TG-GAATCATA-TTACCACAAACT-ACATGC--G-T-TATACGATC----TGGTGA---ATTG--T-TCTGA-CA-AATACAT--CGGACGAATTGTAGTAAT----CAGTG-AAGCTATTCGC-TTGATCA-AACTA-GACTGGTTAATC----AAAGAATAAAA-TATG-------GA-TTATTTCTCAC-GACA---GCTG--TCCA------TT--TA-C-----CTCCATCCCAC----------C-----------A-C-ACGCTCCGCA-CCCC-C-TA-TAT-AGTG--------C--T-CCA---CA-G-T-----TATAGTGCC-----AAATTCGCCGAGGTACACATTTTGGCGTTATAATGGAT-GA--TTACTGT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTA-TATTGA---C-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCTCGTA--------T-a
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtacagtgatcgtcaCCCCGTTATA--ATGCCACCCTCGT-------------AT------------TTTCG----CACTTTCTCCTT-ACTG-TGTAAA--TC-TATA-TTATA------AC----------CCGCA--------T-A-------CCAACA-----C-------CC------------GCATTTA-CAGGTA-CAAA-TTAGTC--AAACAC-C-A--TCAGA-TTCGCCCTC--TCATTT-TTTCACC-AATT--A-CTCT-TTAT-CAACAGAGAAAA-ACTT-TCAGAGAG-CA-TGATGAATCAA--TTA--TCTT-TCGTTA--GCC--CTGCAT--------GT-AAAGTTTGAGGGAAATGTTA----TATGTAATTCA--TG-ATTTT--TTAAGTTAAAAT-------------CAAG------------A------------T------------TAAATCCGACTTTTTCGAA-CA--CAC-TG-AAATTTTA-TTACCATACACT-TCACAT--G-T-TACACTATtttcgcactttctccttactgtgtaaatctatattataacccgcataccaacacccgcatttacaggtacaaattagtcaaacaccatcagattcgccctctcattttttcaccaattactctttatcaacagagaaaaactttcagagagcatgatgaatcaattatctttcgttagccctgcatgtaaagtttgagggaaatgttatatgtaattcatgattttttaagttaaaatcaagattaaatccgactttttcgaacacactgaaattttattaccatacacttcacatgttacactatg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgtacagtgatcgtcaactatattgaTTTGAAGTAGATGATAA-ATTATGTAATTTA--AA-ATTAT--TTGAGTTCAA-T-------------CTAG------------CTGAACTCCTGGTG------------TAG------------TGAA-CT--CGC-CG-AAGTCATA-TTAC-ACAAAAT-GCATGC--G-T-TATACGAGT----TGA--ATGCATCT--TATTTGA-CACAAAACAT--CG-ACCAATT-T-GTAAT----CAGTA-AA-CTATTC----TGATCA-AATTA-GCCTGGTTAATT----AAAGAATGAAA-TATGATT-------TTT-TTCTCAC-GACA---GCTG--TACT------TT--TG-C-----CTCCATCCCAC----------C-----------A-C-ACG-GCCCGC-TCCC-C-CTATAT-AGTG--------C---ACCC----ATG-T-----TATAATGCC-----AAATTCGCCGAGGTGCACATGTTGGTGTTATAACGGAG-GA--TTACTGTg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aG-TTGTTA--GTC--CTGCAG--------GTAAA-GTTTGGAGTAGGTGATAA-ATTATGTAATTTA--TA-ATTATATTTGAGTTCCAAT-------------CTAG------------C------------AAAAATCTGAGTATAG------------CGAA-CG--CGC-TG-AAACCATA-TTATTGCAAACT-ACATATATG-T-TACACTATT----T-----------------TTGA------AATAT--TGGACCAATTGTAGTACT----CAGTG-AAGCTATTCAC-TTGATCA-AACTA-GCCTGTTTAATT----AAAGAATAAAA-TATG--TACACGA-T---TTCCCAT-AACAGCTGCTG--CACA------TT--TA-C-----C---------CCCATCCCCTTC-----------A-C-ACT-TCCCCCATCCC-C-GT-TAT-AATGGGGAATTACTGTACCT---GATG-C-----CACAATGCA-----AAAT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2511 )     :                                 CCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAANAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTTACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------TA-------CCGCCA-T-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCCCG-TAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACNGCGAGAA-ACTT-TCGGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTA--GTC--CTGCAG--------GTAAAAGTTTGGAGTAGGTGATAA-GTTACGTAATTTA--TA-ATTAT--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------C------------G------------TAG------------CGAA-CA--CGC-TG-AAATCATA-TTACCGCAAACT-NCATGC--GT-T-ACACTATT----TGG--A---ATTG--T-TTTGAC-A-AAAATAT--CGGACCAATTGTAGTACT-C----AGTGAA-GCTATTCGC-TTGATCA-AACTA-GCCTGGTNAATT----AAAGAATAAAA-TATG--T--ACGA-TTA-TTCTCAC-GACA---GCTG--TACA------TTTA--C--C--C-ATC----C--C-C--CG-C-ACG-TCCCCC-TCCC-C-GN-TAT-AATG--------C--CACCC---CATG-T-----TATAATGCC-----AAATTCGCCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACGGGG-GA--TTACTGT
gi|1                          :                                                                                                                             CG-TTATA------ACG-CCATCCCCCCGCA--------TA-------CCGCCA-T-------C-------------
gi|1                          :                                                                                                                                                                                CTA-T-------C--------------TATTTG-CAGGTA-CTAA-TTAGTC--GATTAA-C-G--TGATA-TTCACCCCAC-TAATTA-A--CGTC-AATT--A-C-CTTAAAA-CAATAGCGAGAA-ACTT-TCGTTGAA-CT-TGTTTACGCAA--TAA--TTCA-GTGTCA--GTC--CTCAAG--------GTAAA-GCTTGGAGTAGATAATAA-ATTATATAATTTA--TA-ATTAT--TTGAACTCCAAT-------------CTAG------------C------------G-----------------------------GA-CATTCGTGTG-AAAACACA-TTACTGCAATCC-TCATGC--GT-T-ACACTATT----TAGTGA---GTAG--T-TTTAAC-A-AAATTAT--CGGTCAAACTGTACTACT-C----AGTGAA-AATATTCGC-TTTACCA-AACTA-GCCTTGTAAAcgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacctatctatttgcaggtactaattagtcgattaacgtgatattcaccccactaattaacgtcaattaccttaaaacaatagcgagaaactttcgttgaacttgtttacgcaataattcagtgtcagtcctcaaggtaaagcttggagtagataataaattatataatttataattatttgaactccaatctagcggacattcgtgtgaaaacacattactgcaatcctcatgcgttacactatttagtgagtagttttaacaaaattatcggtcaaactgtactactcagtgaaaatattcgctttaccaaactagccttgtaaagtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgcaactgtacatttaccccatctccaccccgcacgtttccctccccagttataacgccaccctctttataatgtcaaattgccgaggtacaaatgctggggttataacggggggttac
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgttataacgccatccccccgcataccgccatccgccatcatatctgctattgtcactttgtattttgttaatcacaagcataataacagatataacatgattgtttttctgaataaactacCA---ACTG--TACA------TTTA--C--C--CCATCTCCAC--C-C--CG-C-ACG-TTTCCC-TCCC-CAGT-TAT-AACG--------C--CACCC---TCT--T-----TATAATGTC-----AAATT-GCCGAGGTACAAATGCTGGGGTTATAACGGGG-GG--TTACgtgtatcgtctgttgaatccacggtgtctgataaaattcaaatatataaatataaataggtttggtgataatgaaacagactaataatctaataatattaataaaagacttgcaactgtacatttaccccatctccaccccgcacgtttccctccccagttataacgccaccctctttataatgtcaaattgccgaggtacaaatgctggggttataacggggggttac
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gi|10                         :                             agtgCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCTGC-------------ATATTGCCAAAAAATTGAAAAGTCCTGTTTTCCTTACTA-TGTTAA--AT-CCTG-TTATA------ATG-ATAT-CCCCCACA--------TACTGCCATCCACCA-T-------C-------------GTG-TTA-GAGGTA-CAAA-TGGGTC--AAATAC-C-G--TTATA-TTCACCCACACTAATTA-T--CGCC-AATT--ACC-CT-TTAT-CTACAGCGAGAA-ACTT-TTAGTAAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTaaattgaaaagtcctgttttccttactatgttaaatcctgttataatgatatcccccacatactgccatccaccatcgtgttagaggtacaaatgggtcaaataccgttatattcacccacactaattatcgccaattaccctttatctacagcgagaaacttttagtaaacaggcttaagcaatt
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gi|12                         :                                  CCCCGTTATT--ATTACACACCCGC-------------ATATCGCCAAAAAAT--CAAAGTCCGATT--CCTTGCCA-TTTAAA--AC-ACAGGTTATG------ACA-TCA-----CCGTA--------TAA------CCGCCA-A-------CCGCAC--------GTATTTA-CAGGTA-CGAA-TTGGTC--AATTACTC-G--TTATACTTCACTCCAG-CAATTG-T--CGCCAAATT--C-C-CT-ATAactagatttacacacttacccacgttatccacacttatatt
gi|13                         :                                                                                                       tatacattgaccacgctatattgG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCTACA--------TA-------TCACCA-TTCGCCAAC-------------GTATTTA-CTAGTA-CAAA-TTGGTC--AATTAC--------------CAC------TAATTA-T--CACC-AATT--ACC-CT-ATAT-CAACAGCAAGAA-ACTT-TCAGTGAA-CA-GA-TTAAGCAA--TTA--TATA-TTGTTA--GTC--CCTAAGTCCCATTCGT-AAAGCTTGGAGTAAATAATAA-GTCATGTAATTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaATTTA--TA-ATAAA--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG------------T------------GACATCACCATA-CAG------------TGGA-TA--CGC-TG-GA-TCATA-TTACTGCAATCT-CCATGC--GT-TTATACTATT----TG-------------T-TTTGACCA-AAAATAT--CAGACAAAT-GTAGTGCT-CTGACAGTGAAAGCTGT-CGC-TTTATCA-AACTA-GCCTAGTAAATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attttcTGGCATTATAACGGGG-----TTACTGcgtttcgcctgttg
gi|15                         :              ttctctgctatgttgtactgCCCCGTTATA--ATGCCACCCC---------------------GCCAAGAAATTTAAAAGTCCCGTTTTCCTTACTA-TGTAAA--AC-CCCG-TTATA------ACG-CCAT-CCCCCGCA--------TG-------CCGCCA-T-------CCACCAACATACATGTATTTA-CAAGTA-CAAA-TTGGTC--AATGCC-C-G--TTATA-TTAACccccgccaagaaatttaaaagtcccgttttccttactatgtaaaaccccgttataacgccatcccccgcatgccgccatccaccaacatacatgtatttacaagtacaaattggtcaatgcccgttatattaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttctctgctatgttgtactgcagtaa-TATG--T--ACGA-TAA-T-CTCATTGGCA---GCTGATTACACCACCCTCCA--C--C--C-ACC----TTGC-T--TGTC-ACG-TCCCCC--CCA-C-GA-TATTAAT-------------AACC---CAGGAG-----GATACTACTGGAGAAAAATAGCCGAGGTACAAATGTTGGCG-TATAACGGGGAGATGTTACTGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atAAACT---ATGT--GG-T-GAACTATT----T---------TT---T-TTTAAC-A-AACTTAT--CGGACCAAA---AGTAAT-C----AGGGAA-GCTGTTTGG-TTTATCA-AACTA-Gac
gi|18                         :                                  CCCCGTTATA--ATGTCACCTCCGC-------------ATATCGCCAAATAAATTCAAAGTCCCGTTTTCCTTACTA-TGTAAA--AC-ACCG-TTATA------ACG-CCATCCCCCCGCA--------TA-------CCGCCA-T-------C-------------gatcggaaagtgctacgcctggtacgataaggatattcagtgtaactgatataaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        attgcccctct-CAACTGTGAGAA-GCTT-TCAGCGAA-AA-GGTTTTAGCAT--TTC--CCTT-TTGTTA--GTCAATTG--G--------GTAAA-GCTTGGAATAAATAATAA-GTTATGTAAATTA--TA-ATTAT--Tcgccatcatatct
gi|2                          :                    ttttccttgcgtcCCCCCACTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATCGCCAAATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCT-ACTA-TATAAA--AC-CCCG-TTATA------ACA-CCAT-CCCCCGCA--------TA-------ACGCCA-T-------C-------------GCATTTG-CA-GTA-CAAA-TTGGTC--AAATAC-T-G--TTATA-ATCATTCCTGATAATTA-T--CGCC-AATT--A-C-CT-ATAT-CAACAATGAGAC-ACTC-TCAGTGAA-CA-GGCTTAAGCAA--TTA--TCCG-TTGTTT--GCC--CTGCAG--------GTAAAAATTTGGAGTAGGTGATAT-GTTCCGTAATTTA---A-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAG-------------------------G------------T-G------------CGAA-CA--CGC-TA-TAAACATATTTACCGTAAACT-A-ATGC--ATGT-ACACTGTT----TGG--A---ATTG--T-TTAGAC-A-AAAA-AG--TGGACCAATTGTAGTACT-C----AGTGAA-G-TATTCGC-TTGATCA-AACTACGCC-GGTAAATT----AAAGAATAAAA-TATG--T--ATGATTTA-TTTTCAT-GACA---GCTG--TACA------TTTA-----------------C--T-C--TG-C-ACA-TCCCCC-TCCC-C-GA-AAT-AATG--------C--CACCC---CATT-TAA---TATAATGCC-----AAATTCACCGAGGTACAAATGTTGGCGTTATAACAGGG-GA--TTACTGT
gi|22                         :                                                                                                                                 TATA------ACG-CCAT-TCCC-GCA--------TA-------CCGCCA-T-------CCTCCTAC------GTATT-A-CAGGTA-CAAA-TTGGTC--AATTTC-C-G--TCA
gi|23                         :                                                 CCACACCCGC-------------ATATCGCCAAAA------AAAATCCCGATTTCCTTGCCA-TTTAAA--ACACATG-TTAatag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGCC-----AAATTCTCTGAGGTACAGATGTTGGCATTATAAGGAGG-GA--TTACTGT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -ACGT-TCGGTGAT-CA-GGCTTAAGCGA--TTA--TATG-TTGTTA--GTT--CTGTAG--------GCAAac
gi|26                         :                                                                                                                                                                              cGCTA-A-------C-------------GTATTTA-CAGGTA-GAAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--TT
gi|3                          :                                 CCCCCGTTATATAATGCCACCTCAGC-------------ATATCGCAAATCAATTTCAAAGT-CCGTTTTCCTTACTATTGCAAATTTC-CCCGCTTATAC-----CCGCCCAC-CCCCCGCACTTATGGCCA-------CAGCCA-A-------C-------------GTATT-----GGTA-CAAA-CTGGTCAAAAACAC-CTGTTTTATATTTCACCCCAA-TAATTATT--CG-C-AATT--A-C-CT-ATA--AAACTTTGAGAC-ACTC-TCGGTGAGCCACGGCGTAGGCAA--GTATTTCCG-TTGTGATTGCC--CTGCAG--------GT-AAAGTTTGGAGTAGGTGATAGCGTTACGTAATTTATTTATATTACG-TTGAGTTCAAATATAAGGTGCAAACCTAG------------T------------G------------TAG------------CGAATCA--CCC-TGAAAATCATA-TTACCGTTAATTGGCATGC--AT-T-ACACTGTTTTGGTGA--A---ATTGGTT-TTTGAT-C-GAAATATAGCGAACCAACTG-AATATTAC----AGTGAA-GCCATTCGCTTTGATCATAACTACCCCCGGTAAATTAAAAAAAAAACAAAAGTATA--T--ATGA-TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taatacagtgttcccccgctatatccccccccccccccccccTC----C--C-C--CG-CTATA-TTGCCC---CC-C-GT-TAT-AATG--------C--CACCCCCGCATA-TTGCCATATAATTTC-----AAAGTC-CCG
gi|4                          : attttgtttagagtgaaatacatgtacagtgcCCCCCGTTATA--ATGCCACCCCCGC-------------ATATTGCCATATAATTTCAAAGTCCCGTTTTCCTTACTA-TAAAAA--CC-CCCA-TTATACATGTAACG-CCAT-CCCCCACA--------TA-------CTGCCAAG-------C-------------GTATTTGTCAGGTAACAAAATTGGTC--CAATAC-C-A--ATATT-ATCACCCCCGATAATTA-T--CGCC-AATTTTATC-CT-ACGTTCAACTGTGAGAACACCTCTGGGTGAA-CA-TGCTAAAGTAAAATTT--TCCGCTTGTTT--GTC--CTGCAG--------GTTAAAGTTTGGAGTAGGTGATAG-GTTGCATAATCTA--TA-ATTAG--TTGAGTTCAAAT-------------CTAGGTGCAATCCGAGT------------G------------TAG------------CGAA-TA--CGC-TG-AAATCATA-TTAGCGTAAACT-ACATGC--AT-T-ACACTGTT----TGGTGA---ATTG--T-TTTGAC-A-AAATTAG--TGGACCAATTGTAGTACT-C----AGAGAA-GCTATTTGC-TTGATCA-AACTA-GCCCAGTAAATT----AAAGAATAAAA-Tttttccttactataaaaacccccattatacatgtaacgccatcccccacatactgccaagcgtatttgtcaggtaacaaaattggtccaataccaatattatcacccccgataattatcgccaattttatcctacgttcaactgtgagaacacctctgggtgaacatgctaaagtaaaattttccgcttgtttgtcctgcaggttaaagtttggagtaggtgataggttgcataatctataattagttgagttcaaatctaggtgcaatccgagtgtagcgaatacgctgaaatcatattagcgtaaactacatgcattacactgtttggtgaattgttttgacaaaattagtggaccaattgtagtactcagagaagctatttgcttgatcaaactagcccagtaaattaaagaataaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                          attttgtttagagtgaaatacatgtacagtgctcccccgctatattgcCAA--TTA--TCTG-TTGTTA--GTC--CAGCAG--------GCAAA-GTTTGAAGTAGATGATAA-GGTATGTAATTTA--CA-ATTAT--TTGAGTTCAAATATAGCTGAAATC-CTAG------------T------------G------------TAG------------CGAA-CG--CGC-TG-GAATCATA-TTACCACAAACT-ACATGC--GT-T-ATACGATC----TGGTGA---ATTG--T-TCTGAC-A-AATACAT--CGGACGAATTGTAGTAAT-C----AGTGAA-GCTATTCGC-TTGATCA-AACTA-GACTGGTTAATC----AAAGAATAAAA-TATG-------GA-TTATTTCTCAC-GACA---GCTG--TCCA------TTTA--CCTC--C-ATC----C--CAC--CA-C-ACGCTCCGCA-CCCC-C-TA-TAT-AGTG--------C--T-CCA---CA-G-T-----TATAGTGCC-----AAATTCGCCGAGGTACACATTTTGGCGTTATAATGGAT-GA--TTACTGT
gi|6                          :                                                                                                           ACTA-TATTGA---C-CCCG-TTATA------ATG-CCA--CCCTCGTA--------Ta
gi|6                          :                  tgtacagtgatcgtcaCCCCGTTATA--ATGCCACCCTCGT-------------AT------------TTTCG----CACTTTCTCCTTACTG-TGTAAA--TC-TATA-TTATA------AC----------CCGCA--------TA-------CCAACA-C-------CC------------GCATTTA-CAGGTA-CAAA-TTAGTC--AAACAC-C-A--TCAGA-TTCGCCCTC--TCATTT-TTTCACC-AATT--A-CTCT-TTAT-CAACAGAGAAAA-ACTT-TCAGAGAG-CA-TGATGAATCAA--TTA--TCTT-TCGTTA--GCC--CTGCAT--------GT-AAAGTTTGAGGGAAATGTTA----TATGTAATTCA--TG-ATTTT--TTAAGTTAAAAT-------------CAAG------------A------------T------------TAAATCCGACTTTTTCGAA-CA--CAC-TG-AAATTTTA-TTACCATACACT-TCACAT--GT-T-ACACTATtttcgcactttctccttactgtgtaaatctatattataacccgcataccaacacccgcatttacaggtacaaattagtcaaacaccatcagattcgccctctcattttttcaccaattactctttatcaacagagaaaaactttcagagagcatgatgaatcaattatctttcgttagccctgcatgtaaagtttgagggaaatgttatatgtaattcatgattttttaagttaaaatcaagattaaatccgactttttcgaacacactgaaattttattaccatacacttcacatgttacactatg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtacagtgatcgtcaactatattgaTTTGAAGTAGATGATAA-ATTATGTAATTTA--AA-ATTAT--TTGAGTTCAA-T-------------CTAG------------CTGAACTCCTGGTG------------TAG------------TGAA-CT--CGC-CG-AAGTCATA-TTAC-ACAAAAT-GCATGC--GT-T-ATACGAGT----TGA--ATGCATCT--TATTTGAC-ACAAAACAT--CG-ACCAATT-T-GTAAT-C----AGTAAA--CTATTC----TGATCA-AATTA-GCCTGGTTAATT----AAAGAATGAAA-TATGATT-------TTT-TTCTCAC-GACA---GCTG--TACT------TTTG--C--CTCC-ATC----C--CAC--CA-C-ACG-GCCCGC-TCCC-C-CTATAT-AGTG--------C---ACCC----ATG-T-----TATAATGCC-----AAATTCGCCGAGGTGCACATGTTGGTGTTATAACGGAG-GA--TTACTGTg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aG-TTGTTA--GTC--CTGCAG--------GTAAA-GTTTGGAGTAGGTGATAA-ATTATGTAATTTA--TA-ATTATATTTGAGTTCCAAT-------------CTAG------------C------------AAAAATCTGAGTATAG------------CGAA-CG--CGC-TG-AAACCATA-TTATTGCAAACT-ACATATATGT-T-ACACTATT----T-----------------TTGA------AATAT--TGGACCAATTGTAGTACT-C----AGTGAA-GCTATTCAC-TTGATCA-AACTA-GCCTGTTTAATT----AAAGAATAAAA-TATG--TACACGA-T---TTCCCAT-AACAGCTGCTG--CACA------TTTACCC--C--C-ATC----C--C-CTTCA-C-ACT-TCCCCCATCCC-C-GT-TAT-AATGGGGAATTACTGTACCT---GATG-C-----CACAATGCA-----AAAT
gi|9                          :                                 CCACCGCTATA--GCACCACCCCCACCCAACGCCTGATTATAATGCCAAACAAGTTCAGCGTCCCGTTTTCCTTACGA-TGTAAA--AC-CCTG-TTTTA------ATG-TCAT-TCCCCGCA--------TA-------CCGTCA-T-------CCGCCAAC------GTATTAA-CGGGTA-CTAA-TTGGTC--AAATAC-C-G--T--TA-TTCGACCCCGCTAGCTA-T--CGCT-AATT--A-CTCT-TTAT-CAACTGTGAGAA-ACTT-TCAGTGAA-CT-GGTTTAGGCAA--TTA--TCAG-TTGTTA--GTC--CCTCGA--------GT-AAAGTCTGGAGTAGGTCATAA-GTTATGCAGTTTA--TA-ATTAT--TCGATTTCAAAT-------------CTAG------------C------------
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGTTACAATGGCAACAACTGTACACGGTGTTTACCGGGATATTACGGAGTATACTGTACTAGCACATGTTACACAAACTGTTACAACTGCACTTCATAT
Unaligned ( gi|21 ): AACTGAAATAGACGGACAAAATGTCATTTAAAGTGAAACATCACTAAAACGGATAAAATATGAGACAAGAGGACAAAGTTT
Unaligned ( gi|27 ): CTTTGTATTTTACATGAAACATATGGCATGATA