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lowQualScore                  :          ..   ..   ..  .  ....  . .  .. ...... ..........  .     ..... ...... .  ..  . . .. ..... . .. . . ..      .   .......     .........   .. .. ..... ...  . . .  ......  ............ ... .. . .    . .............   . . .... .  .   ....... .. . .  .  .. .. .  . . .   . ..... . ... .    ..........  .   ... ..   .... .  . ................ . ....  . . ..... ..    ... . ............  ...  .   . ... .  . .... . . .. ......  ...   . . . ..     .. .... .. .  .  .....   .   ...     ... .....  .   ... . .      ......   .............  . .   ....  ...  ..... .   .  .   .... .   . . .. ........   . ........................................ .   ...... ... .   .   .......   ..  ......         
lowQualScore                  :          33   11   33  1  6666  1 2  99 111111 0000000000  2     66666 111111 1  99  1 2 99 44444 1 22 1 1 99      2   4444444     555555555   99 00 44444 888  1 2 1  666666  444444444444 111 11 2 2    4 3333333333333   2 2 8888 4  2   2222222 33 2 1  1  00 00 1  1 2 2   1 55555 1 777 1    8888888888  2   777 99   3333 1  1 3333333333333333 2 5555  1 1 44444 00    777 1 888888888888  888  0   1 555 2  1 9999 2 1 00 111111  888   1 2 1 11     00 5555 00 1  1  99999   3   555     555 00000  0   555 0 0      666666   5555555555555  0 0   4444  333  88888 1   0  0   4444 0   0 0 88 22222222   7 8888888888888888888888888888888888888888 1   888888 555 3   7   2222222   66  888888         
consensus                     :   AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC-A-TA--T------G---CGT-T-GGC-CCCTT-----T------T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA--A--CTACTAC---------ACT--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TTT-T-T-------T---A--C-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTTCC--------CT-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T-C--T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AAT------A---G-ACC-GCG---N---GCG--AT-T--C-CCGTTTGTA
Reference ( gi|11 )           :   AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC-A-TA--T------G---TGC-T-AGC-CCCTT-----T------T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA--A--CGACTAC---------ACT--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TTG-T-T-------T---A--C-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTTGT--------CT-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T-C--T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AAT------A---G-ACC-GCG---A---GCG--AT-T--T-CCGTTTGTA
gi|13                         :   AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC-A-TA--T------G---CGT----GC-CCCTT-----T------T-TA--CA-T-C--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA--A--CTA-TAC----------CT--A--A-----A---GT-T-A-GA------TTT-T-T-------T---G--C-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT-C--------CT-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T-C--T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----AT---AA-A---G-GAG-TG-GGC----G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AAT------A---G-ACC-GC----A---GCG--ATAT--T-CCGTTTGTA
gi|15                         :   AGGATGA--AGT--GAA--GT-AT----CC-A-TA--CATGTAAG---TGC-T-GGC-CCCTT-----T------T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA--A--CTAATAC---------ACTTAATTA-----A---GT-T-A-AA-A----CT--T-TAGGCCTAT---A--C-A-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-AA-GGA-------T--G-A-CC-TC--T--G-AA-A-A-CGT-T-T---G-A---T-AGTTCC--------CT-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AA-TCT-A---C-TG-A---TT-T-C--T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGA--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---ATTA-A----AT-A-ATa
gi|5                          :   AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC-A-TA--T------G---CGC-T-GGC-CCCTT-----T------T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA--A--CTACTAC---------ACT--A--T-----A---GT-T-A-GA-A----TTT-T-T-------T---A--C-A-CAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TT--CGAG-AA-A-A-CTC-TAT---G-A---T-A-TT-C--------CC-TTG---T--TTACTCGT-TG-TTCCCCCCCC-AAATATT-G----TA-A-AAAAATA--TCCTCGAG-A------------AAT--AA-TCG-A---C-AG-A---AT-T-C--T---A--AA---CCT-CAA-T--ACACG--G----C--C-GT-CT-----TCC-TCA---AGGTT---T-----G--AAT---C-T-CACATT-CC----TC---A-TG-A----AT-A-A-G----A-A--AA-A---G-GA--TG-GGCG---T-CTC-T-A--A--------A-A-C--------------A-A------------------A----G-AAT------AG--G-ACC-GCG---A----CG--A-----T-CCGTTTGTA
gi|18                         :   AGGATGAC-AGT--G----GT-TT----C--A-TA--T------G---TG--T-GGC-T--TT-----T------T-TA-----T-T--G----------T-A----GGACTC-AA-----------------------CT--A--T-----A---GA-T-A-G-------TTGAT-T-------T---A--T--------T-------------GTA-G-C----A-AG-G---------T--GTA-TT-T---T--G-AA-AGA-CTT-T-T---G-A---T-AGT--T--------CTGTTG---T--TTT----C-GG-T--------A-A-----T-G----TG-GAA-----A--TCAT---G-A------------AA---AA-TCG-A-----TG-G----T-T-C--T---AATAA---CTT-T-A-T------G--G----C--A-GT-AT-----T-G-T------AGTT---T-----GT--GT---C-T-TT-ACT---------------------------ATG----AT------T---G-GAG-TG-G--G---G-GTT-T-A--AGAGAGTTTACC-G--------------ATA------------------T----G-AAT------A---aatcaa
gi|25                         :   AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC-A-TA--T------G---
gi|8                          :  aaGGATGA--AGT--GCA--GT-CTG---CC-A-TA--T------G---CGC-T-GGC-CCCTT-----T------T-TA--CA-T----G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA--A--ACACTAC---------ACT--A--A-----A---GT-TTA-GA-T----TTT-T-T-------TT--A--C-A-TAAA-C-------------GCC-A-CCC--ACAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-AACTT-T-T---G-A---T-AGTTCC--------CT-TTG---T--TTA----T-T--T--------C-------T-G----TG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AAATCG-AA--C-TG-A---TT-T-C--T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--AAGT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-T-----------------G-AG-A----TT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-TG-G-CG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AAT------A---G-TCCTGCG---T---ACG--AT-T--c
gi|7                          :   cGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC-A-TA--T------G---TGT-T-GGC-CCTTT-----T------T-----CA-T-T--GG----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-----CTACTAC---------ACT--A--AC----A---GT-T-A-AC-A----TTT-T-A-------T---A----A-TAAAGC-------------GCC-A-C----A-AA-ACA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTTCC--------TT-TTG---T--TTAT---T-TG-T--------C-A-----T-G----TA-T-A-----A--TGTT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T-TA-T---A--AA---CCT-C-A-TA-ATTGG--G----C-----T-TT-----TCGCTCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC---A-TG------AT-A-ATG----ATAAGAA-G---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--T--------ACA-G--------------A-A------------------ataaattaacccgctttgtaaataa
gi|4                          :    GGATGA---GT--GCAAAGT-CT----TCTA-TA--T------GGC-TGT-T-GGC-CCCTT-----T------T-AT--CA-T-TTGG-----A-C--T-A-C--CTACTC-AAA--------CTACT--------ACT--A--A-----ATAAGT-T-A-AG-A----C-G-T-T-------T---ATAC-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-ATTT-TT--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT-C--------CC-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----C-G----AG-G-A-----A--TGTT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-TAC--T------AA---CCT-C-A-T--ACCGG--A----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GTGAAT---C-T-TTCGCT-C--------------------------------ATA--AA-C---GTAAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------GCACGATTGTTAAGGATATA-A------------------T----G-AAT------A---A-ACC-GCGTT-A---GCGGAAT-C--C-CCGTTTgttttacgaagcatgcgatcccccgtttacatagatcaaat
gi|9                          :    GGATGACTAGT---CA--GT-CT----C--A-TA--T------G----GT-T-GGC-CCCTT-----T------T-TAAACAGT-T--G-----A-C--CCA-CCCAAACTC-AAA--A--C---TAC---------ACC--AT-A-----A---GT-T-ACGACA----TTT-TAT-------T---A--C-A-TAAA-C--------------CC-A-C----ATAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--TT-G-AA-A-A-CGT-T-C---G-A---T-AGTT-C--------CT-TT----T--TTA----T-TGGT--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TGTT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-AT--TT-T-C--T---A--AA---CCT-C-A-T--ACTGG--G----C--A-GT-TG-----TCG-TCA---G---T---T-----GT-ACT---CGT-TTCACT-GCTT-TTC---A-TG-AC---AT-AGATG----AT---AA-A---G-GA--T--GGC----G-GTC-T-A--A--------CCA-G--------------G-A------------------acatcactagtagaatcaaa
gi|17                         :     GATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC---TA--T------G---TGT-T-GGC-CCATT-----T------T--A--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-TAA--A--CTACTAC----------CT--A--A-----A---GT-T-A-TA-A----TTT-T-A-------T---A--C-A-TAGA-T-------------GCC-A-C----A-AC-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CCT-T-----G-A---T-AGTTCC--------CT-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T-C--T---A--AC---CCT-C-A-T--ACC-G--G----C--A-GT-TT-----TCGTTCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCGTT---------------------------ATG----ATA--AA-AT--G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------agttacaaagcatgcgatctgtttactagatcaatat
gi|16                         :     GATGA--AG---GCAA-GT-CT----CC-AGTA--T------G---TGT-T-GGC-CCCAT-----T------T-TA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTCTAAA--A--CTACTAC---------CTT--A--A-----A---TT-A-A-TA-A----TTT-T-A-------T---A--C-A-TAGA-T-------------GC--A-C----A-AC-GAA-------T----A-TT-TC--T--G-AACA-A-CCT-T-----G-A---T-A----T--------CC-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TGCT---GAA------------AA---AA-TCG-A---C-TG-A----T-T-C--T------AA---CCT-C-ACT--ACC-G--G----C--A-GT-TT-----TCGTTCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCG---------TT---A-TG-A----A--A-ATG----------------G-AGG-TG-GGC----G-GTC-T-ATCA--------ACA-G--------------a
gi|20                         :     GATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC-A-TA--T------G---CGC-T-GGC-CC--T-----T------T-TA--TA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTT-AAA--A--CTACTAC---------ACG--A--A-----A---GT-T-T-GA-GATT-TTT-T-T-------T---A--C-A-TAAA-C-------------GCC-GCC----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---GAA---TAAGTTCC--------CT-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----TGG----TG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AA-ca
gi|14                         :    aGATGA--AGC--A-A--GT-CT----CC-C-GA--T------T---T-T-T-GGC-CTCTT---------------A--CA-T-T--G-----A-C--T-A----AAAC-C-AAACTA--CGAC--C---------ACT--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TTT-T-G-------T---A--T-ACTAAA-C-------------GCC-A-C----C-GA-----------T--G-A-TT-TC--T--G-A------CCC---------------AATTAT-----------------T--ATA----T-TG-T--------C-ACC---T-G----TG-A-C-----A--T--T---G-A------------AA------TCG-A---C-TGCA---TT-T-C--T---A--AA---TCT--------ATTGGC-G----C--A----TT-----TC--TCA---AAGTT---TC----GT-AAT---CGTATTCACT-CC---TTC---A--G-A----AT-A-A------GTA--AA-A---G-GAGTTG-CGCA---G-ATC-T-A--A--------Aatcctcgatctaa
gi|12                         :      ATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC-A-TA--T------G---CGC-T-GGC-CCCTT-----T------T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA--A--CTACTAT---------ACT--A--A-----A---TT-T-A-GA-TGGTTTTT-T-T-------T---A--C-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTTCC--------CT-TTG---T--TTA----T-TG-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-G---TT-T-C--T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------AC------------------------------------------------------A---G-ACC-GCG---T---GCT--AT-T--C-CCATTTGTAgctataaagagtcattctcaacatcatcccagttacatatatcaacactaaa
gi|1                          :      ATGA--AGTTGACA--GTTCT----CC-A-TAATT------GAAGCGCAT-AGG-CCCCT-----TAAAATAT-TA--CC-C-T--ATAAGAA-CA-T-ATC--AAACTC-AAA--AGTCTACTAC---------ACT--A--ACAAAAG---GT-T-A-GA-A----TTT-T-TCTT----T---C--C-A-TAAAGCAA-----------GTC-A-C----A-AAAGAAAACATAGT--G-A-TT-TTCTT--G-AA-A-AACTT-T-TCAAG-A---T-AG--GC--------CCCTTGCCCT--TTAAAA-TATG-T--------CCA-----T-AAAAATG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AACAAAG-TCG-GAATC-TG-ACCTTTGT-C--T---A--AAACGCTG-C-A-TT-ACCGG--C----CCAG-GT-TTAAT--TCG-TCA---AGTTG---T-----AT-AAC---A-T-TTCATT-CC---TTCAAAA-TGAA----AT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-GT-GGCGTCCG-GTCTT-C--A--------ACA-GAC------------A-A------------------A----A-AAT------A---GAACC-TCG---ACGTGCA--AT-TTCT-CCGTTAGTaataaa
gi|23                         : aggaaATGT--AGT--GAA--GT-C-----CC-A-GA--T------G---AGC-T--GC-CCGTT-----T------TGTA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTC-AAA--A--CTACTAC---------ACTA-A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TTccaaaat
gi|6                          :       TGA--AGCTGGCA--GT-CTACACCC-A-T---T------G---TTT-TTGGCACCCTT-----T------T-TA--AC-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAA-TC-AAA--A--CTACTAC---------AT------A-----A---GTAT-A-GA-A----TTT-T-A-------T---A--C-A-TAAA-CACGAAAACTCCTGGCT-G-C----A-AA-GAA-------TT-G-A-TTGTT--C--G-AA-A-A-CTTAT-T---G-AATTT-AGTTATATATACTCCT-TTG---TATTTA----T-TG-T--------CCA-----T-G----TG-G-A-----AA-TGTT---G-A------------AA---AA-TCG-A---CTTG-A---TTAT-C--TTAAA--AA---CCT-C-A-T--ATTGG--ATTCTC--A-AT-TTCGAGATCT-TCA---AAGTT---TACATAGT-AAT---C-G-TTC-CTACT---TTC---A-TG-A----ATAA-ATG----ATA--AA-AG--G-GAG-TG-G--A---G-GT--T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------
gi|10                         :        GA--AGT--GCA--GT-CT----CC-AGTA--T------G---TTT-T-GGC-CCCTT-----T------T-TA--CA-T-T--G-----AAC--T-A-C--AAACTC-AAA--A--CTACTA----------ACCAAA--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--T-A-------T---A--C-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------TCAG-A-TT-TC--T--GAAA-A-A-CTT-T-G---G-A---T-AGTTCC--------CT-TTG------TTA----T-TG-T--------C-A-----TCG----TG-G-A-----T--T--T---G--------------AA---AA-TCGCA---C-TG-A----T-T-C--T---A--AA----CT-C-A-T--A-CGG--A----C--A-GG-TT-----TCG-TCA---AA--T---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC-----TG-A----AT-A-ATG----ATA--AAGG---G-GAG-TG-GGGC---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------A----G-TTT------AC--G-ACCAGCA---G---GCG--ATCT--C-CCGTTTa
gi|2                          :                       a-CT----CC-A-TA--T------G---TTT-T--GC-CCCTTCGGATT------T-TA--CA-TAT--G-----G-CATT-A-C--AAAATCCAAAT-A--CTACTAC---------ACT--A--A-----AT--GT-T-A-GA-A----TTA-T-T-------TTATA--C-A-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-A--GAA-------T--G-A-TT--C--T--G-AA-ACA-TTT-T-T---T-A---T-AGTTCC--------CT-TTG---T--TTA----T-TG-CTTCA----C-A-----T-G----TGCG-AT----A--TG-T---G-ACTTTTTTACTTGAA---AA-TCG-GATTC-TG-A---TT-T-TCTT---A--AA---CCT-CCA-T--ACTGG--G----CG-A-GT-TT-----TCG-TCACTTAAGTT---T-----GT-AATTCGC-T-TTCACT-TCCGTTTCTG-A-TC-A----AT-A-ATG----ATT--AA-AGGTG-GAGTTG-GGC----G-GTC-T-A--A--------ACacagataaaca
gi|3                          :                                                                gcagctca------T-TA--CT-TCT--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA--AA-CCACTACCTTACACCTATT--A--A-----A---GT-TTA-GA-A----TT--T-A-------T---A--CCA-TAAA-C-------------GCCCA-CCATAA-GG-GAA-------T--G-A-TT-TCT-T--G-AA-A-A-CTT-T-G---C-A---T-AGTT-C--------CC-TTG---T--TTA----T-TG-C----------------T-G----AG-G-A-----ATTTGCT---G-A------------AA---AA--CG-A---CTTG-A---TT-T-C--T---A--AAC--CCT-C-A-T--TACGA--G----C--A-G--TT-----TCG-TCG---AGGTTCTGT-----GT-GAT---C-T-TTCACT--C---TTC---A-TG-A----AT-A-ATGAAATATA--AA-C---A-GAT-TG-GGCG---G-GTC-TAA--A--------ACA-G--------------A-AACGTAATTAGGGAATAATT----G-AAT------A---G-ACC-GTG---AT--GCG--AT-C--C-CCGTTTttaaccagttcacgagcctggcgatcccgtattccatcagatcaaatcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                              ccatatcgcgtctggccaacccgagata-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---A-A---T-AGTTCC--------CT-TTG---T--T-A----T-TG-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TGCT---G-A------------AA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT------------------------------CCGG--A----A--A-GT-TT-----TCG-TCA---CGGTT---T-----GA-GAT---C-T-TTCAC--CC---TCC---A-TG-AATGAAT-A-ATG----ATA--AA-C---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-AAG----------------TTTAGG-AATATTAAAA---G-ACC-GCG---T---GCG--AT-acaatagatcaaa
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Reference ( family-2497 )     :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A------A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GCG--NGCG--A------T-T---------CCCG-TTTGTA
gi|1                          :          ATGA--AGTTGACA--GTTCT----CC--A-TAATTGAAGC------G--CAT-A-GGC-C--CCT----TAAAA-TAT-TA--CC-C-T--ATAAGAA-CA-T-ATC--AAACTC-AAA-AGT--CTAC--TAC-AC----T--A--ACAAAAG---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----TCTTT-CCA-TAAAGCAA-----------GTC-A-C----A-AAAGAAAACATAGT--G-A-TT-TTCTT--G-AA-A-AACTT-T-TCAAG-A---T-AGGC--------CCC-TT-GCCCT--T-TAAAA-TATG-T--------CCA-----T-AAAAATG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAACAAAG-TCG-GAATC-TG-ACCTTTGT--C-T---A--AAACGCTG-C-A-TT-ACCGG--C----CCAG-GT-TTAAT--TCG-TCA---AGTTG---T-----AT-AAC---A-T-TTCATT-CC---TTCAAAA-TGAA----AT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-GT-GGCGTCCG-GTCTT-C--A--------ACA-GAC------------A------A------------------A----A-AA--T------A---GAACCTCGACG--TGCA--A------T-TTC-------TCCG-TTAGT
gi|10                         :       aggaaGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--AGTA-------T------G--TTT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----AAC--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TA--AC----CAAA--A-----A---GT-T-A-GA-A-----T--TT-----A---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------TCAG-A-TT-TC--T--GAAA-A-A-CTT-T-G---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG------T-TA----T-TG-T--------C-A-----TCG----TG-G-A-----T--T-------------T---G--AA---AA-TCGCA---C-TG-A----T-T--C-T---A--AA----CT-C-A-T--A-CGG--A----C--A-GG-TT-----TCG-TCA---AA--T---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC-----TG-A----AT-A-ATG----ATA--AAGG---G-GAG-TG-GGGC---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A------A------------------A----G-TT--T------AC--G-ACCA--GCA--GGCG--A------TCT---------CCCG-TTTccaaaat
gi|11                         :      aAGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--TGC-T-AGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CGAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--GT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------GTC-TTTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A------A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GCG--AGCG--A------T-T---------TCCG-TTTGTAacagataaaca
gi|12                         :          ATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAT-AC----T--A--A-----A---TT-T-A-GA-TGGTTTT--TT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-G---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------AC-------------------------------------------------------------A---G-ACC---GCG--TGCT--A------T-T---------CCCA-TTTGTA
gi|13                         :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGT----GC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-C--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTA---TAC--C----T--A--A-----A---GT-T-A-GA------TT--TT-----T---T-GCA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CC--TTTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----AT---AA-A---G-GAG-TG-GGC----G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A------A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GC---AGCG--A------TAT---------TCCG-TTTGTAaataaa
gi|14                         :         GATGA--AGC--A-A--GT-CT----CCCGA-TT-------T-----------T-T-GGC-C--TCT----T----------A--CA-T-T--G-----A-C--T-A----AAACC---AA-A----CTAC--GACCAC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----G---T-ATACTAAA-C-------------GCC-A-C---------CGA-------T--G-A-TT-TC--T--G-A------------------------------------CCCAATTA---T--TATA----T-TG-T--------C-ACC---T-G----TG-A-C-----A--T-------------T---G---A---AA-TCG-A---C-TGCA---TT-T--C-T---A--AA---TC------T--ATTGGC-G----C--A----TT-----TC--TCA---AAGTT---TC----GT-AAT---CGTATTCACT-CC---TTC---A--G-A----AT-A-A------GTA--AA-A---G-GAGTTG-CGCA---G-ATC-T-A--A--------Aa
gi|15                         :       AGGATGA--AGT--GAA--GT-AT----CC--A-TA-------CATGTAAG--TGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAA--TAC-AC----TTAATTA-----A---GT-T-A-AA-A----CT--TTAGGCCTA--T-ACA-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-AA-GGA-------T--G-A-CC-TC--T--G-AA-A-A-CGT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCT-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGA--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---ATTA-A----AT-A-ATgctataaagagtcattctcaacatcatcccagttacatatatcaacactaaa
gi|16                         :         GATGA--AG---GCAA-GT-CT----CC--AGTA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CCA----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTCTAAA-A----CTAC--TAC-CT----T--A--A-----A---TT-A-A-TA-A----TT--TT-----A---T-ACA-TAGA-T-------------GC--A-C----A-AC-GAA-------T----A-TT-TC--T--G-AACA-A-CCT-T-----G-A---T-A--T--------CC---TTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---GAAAA---AA-TCG-A---C-TG-A----T-T--C-T------AA---CCT-C-ACT--ACC-G--G----C--A-GT-TT-----TCGTTCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCG---------TT---A-TG-A----A--A-ATG----------------G-AGG-TG-GGC----G-GTC-T-ATCA--------ACA-G--------------
gi|17                         :         GATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC----TA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CAT----T-----T-T--A--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-TAA-A----CTAC--TAC--C----T--A--A-----A---GT-T-A-TA-A----TT--TT-----A---T-ACA-TAGA-T-------------GCC-A-C----A-AC-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CCT-T-----G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AC---CCT-C-A-T--ACC-G--G----C--A-GT-TT-----TCGTTCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCGTT---------------------------ATG----ATA--AA-AT--G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A------A------------------ca
gi|18                         :       AGGATGAC-AGT--G----GT-TT----C---A-TA-------T------G--TGT---GGC-T----T----T-----T-T-TA-----T-T--G----------T-A----GGACTC-AA-------CTA---TAG-AT----------------A---GT-T-G----A----TT--TA-----T---T-GTA------------------------G-C----A-AG-G---------T--GTA-TT-T---T--G-AA-AGA-CTT-T-T---G-A---T-AGTT---------CT-GTTG---T--T-TT----C-GG-T--------A-A-----T-G----TG-GAA-----A--TC-----------AT---G-AAA---AA-TCG-A-----TG-G----T-T--C-T---AATAA---CTT-T-A-T------G--G----C--A-GT-AT-----T-G-T------AGTT---T-----GT--GT---C-T-TT-ACT---------------------------ATG----AT------T---G-GAG-TG-G--G---G-GTT-T-A--AGAGAGTTTACC-G--------------AT-----A------------------T----G-AA--T------A---a
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                               -TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---A-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T--A----T-TG-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT------------------------------CCGG--A----A--A-GT-TT-----TCG-TCA---CGGTT---T-----GA-GAT---C-T-TTCAC--CC---TCC---A-TG-AATGAAT-A-ATG----ATA--AA-C---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A------AAG----------------TTTAGG-AA--TATTAAAA---G-ACC---GCG--TGCG--A------T-C---------C
gi|2                          :                            -CT----CC--A-TA-------T------G--TTT-T-G-C-C--CCT----TCGGATT-T-TA--CA-TAT--G-----G-CATT-A-C--AAAATCCAAATA----CTAC--TAC-AC----T--A--A-----AT--GT-T-A-GA-A----TTATTT-----TA--T-ACA-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-A--GAA-------T--G-A-TT--C--T--G-AA-ACA-TTT-T-T---T-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-TG-CTTCA----C-A-----T-G----TGCG-AT----A--TGTGACTTTTTTACT---T-GAA---AA-TCG-GATTC-TG-A---TT-TTCT-T---A--AA---CCTCC-A-T--ACTGG--G----CG-A-GT-TT-----TCG-TCACTTAAGTT---T-----GT-AATTCGC-T-TTCACT-TCCGTTTCTG-A-TC-A----AT-A-ATG----ATT--AA-AGGTG-GAGTTG-GGC----G-GTC-T-A--A--------ACagtgtacatagatcaaatc
gi|20                         : gcagctcaGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--C------T-----T-T-TA--TA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTT-AAA-A----CTAC--TAC-AC----G--A--A-----A---GT-T-T-GA-GATT-TT--TT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-GCC----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---GAA---TAAGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----TGG----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-ttaaccagttcacgagcctggcgatcccgtattccatcagatcaaatcc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-TA--A--AA---CCTCC-A-TTCACCGGGCG----C--A-GTGTT-----TCG-TCA---AGTTTC--T-----GTCAAT---C-TGGTCGCT-CC---TTC---C-TA-A----AT-A-ATGTC--ATA--AC-G---G-GAG-TGCGGGG---G-GTC-T-A--A--------ACACG--------------A--------------------------------AG--T------A---G-ACC---GC---TGCG--A------T-A---------CCCG-TTTatcctcgatctaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaacc---AGTTT---T-----GT-AAT---C-TGTTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-A-G----ATA--AA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A------A------------------T----GAAA--T------A---G-ACC---GCA--TGCA--ATGCGATT-T---------CCCG-TTTacatccttatacagactgtagatcaaatc
gi|23                         :      gttcATGT--AGT--GAA--GT-C-----CC--A-GA-------T------G--AGC-T-G-C-C--CGT----T-----T-TGTA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----TA-A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--ttgtaaata
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-TG-GGCG---GCGGC-A-A--A--------ACAAG--------------A------AAGTTT-------------T----A-GA--T------AAATG-ACC---GCG--TGCG--A------T-C---------TCCG-TT
gi|25                         :  aaatgAGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--Ccacgatcaaacgtca
gi|3                          :                             aa----CC--A-TA-------TC-----G--CGTCT-GGC-CAACCCGAGAT-----A-T-TA--CT-TCT--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-AACCACTACCTTAC-ACCTATT--A--A-----A---GT-TTA-GA-A----TT--TA-----T---A-CCA-TAAA-C-------------GCCCA-CCATAA-GG-GAA-------T--G-A-TT-TCT-T--G-AA-A-A-CTT-T-G---C-A---T-AGTT--------CCC--TTG---T--T-TA----T-TG-C----------------T-G----AG-G-A-----ATTTG-----------CT---G-AAA---AA--CG-A---CTTG-A---TT-T--C-T---A--AAC--CCT-C-A-T--TACGA--G----C--A-G--TT-----TCG-TCG---AGGTTCTGT-----GT-GAT---C-T-TTCACT--C---TTC---A-TG-A----AT-A-ATGAAATATA--AA-C---A-GAT-TG-GGCG---G-GTC-TAA--A--------ACA-G--------------A------AACGTAATTAGGGAATAATT----G-AA--T------A---G-ACC---GTGA-TGCG--A------T-C---------CCCG-TTT
gi|4                          :        GGATGA---GT--GCAAAGT-CT----TCT-A-TA-------T------GGCTGT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-AT--CA-T-TTGG-----A-C--T-A-C--CTACTC-AAA------CTAC--TAC-------T--A--A-----ATAAGT-T-A-AG-A----CG--TT-----TA--T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-ATTT-TT--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC--TTG---T--T-TA----T-TG-T--------C-A-----C-G----AG-G-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-TA-C-T------AA---CCT-C-A-T--ACCGG--A----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GTGAAT---C-T-TTCGCT-C--------------------------------ATA--AA-C---GTAAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------GCACGATTGTTAAGGATATA------A------------------T----G-AA--T------A---A-ACC---GCGTTAGCGGAA------T-C---------CCCG-TTTacaatagatcaaa
gi|5                          :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----T--A--T-----A---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----T---T-ACA-CAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TT--CGAG-AA-A-A-CTC-TAT---G-A---T-A-TT--------CCC--TTG---T--T-TACTCGT-TG-TTCCCCCCCC-AAATATT-G----TA-A-AAAAATA--TC-----------CTCGAG-AAAT--AA-TCG-A---C-AG-A---AT-T--C-T---A--AA---CCT-CAA-T--ACACG--G----C--C-GT-CT-----TCC-TCA---AGGTT---T-----G--AAT---C-T-CACATT-CC----TC---A-TG-A----AT-A-A-G----A-A--AA-A---G-GA--TG-GGCG---T-CTC-T-A--A--------A-A-C--------------A------A------------------A----G-AA--T------AG--G-ACC---GCG--A-CG--A------T------------CCG-TTTGTAacatcactagtagaatcaaa
gi|6                          :           TGA--AGCTGGCA--GT-CTACACCC--A-T--------T------G--TTT-TTGGCAC--CCT----T-----T-T-TA--AC-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAA-TC-AAA-A----CTAC--TAC-AT----------A-----A---GTAT-A-GA-A----TT--TT-----A---T-ACA-TAAA-CACGAAAACTCCTGGCT-G-C----A-AA-GAA-------TT-G-A-TTGTT--C--G-AA-A-A-CTTAT-T---G-AATTT-AGTTATATATACTCC-TTTG---TATT-TA----T-TG-T--------CCA-----T-G----TG-G-A-----AA-TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---CTTG-A---TTAT--C-TTAAA--AA---CCT-C-A-T--ATTGG--ATTCTC--A-AT-TTCGAGATCT-TCA---AAGTT---TACATAGT-AAT---C-G-TTC-CTACT---TTC---A-TG-A----ATAA-ATG----ATA--AA-AG--G-GAG-TG-G--A---G-GT--T-A--A--------ACA-G--------------A------A------------------aatcaa
gi|7                          :        GGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CTT----T-----T-T-----CA-T-T--GG----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA------CTAC--TAC-AC----T--A--AC----A---GT-T-A-AC-A----TT--TT-----A---T-A-A-TAAAGC-------------GCC-A-C----A-AA-ACA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCT-TTTG---T--T-TAT---T-TG-T--------C-A-----T-G----TA-T-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--TAT---A--AA---CCT-C-A-TA-ATTGG--G----C-----T-TT-----TCGCTCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC---A-TG------AT-A-ATG----ATAAGAA-G---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--T--------ACA-G--------------AAGTTTTA------------------C----G-AA---------------------GCA--TGCG--A------TCC---------CCCG-TTTa
gi|8                          :        GGATGA--AGT--GCA--GT-CTG---CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T----G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----ACAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-TTA-GA-T----TT--TT-----T---TTACA-TAAA-C-------------GCC-A-CCC--ACAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-AACTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T--T--------C-------T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AAATCG-AA--C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--ACCGG--G----C--AAGT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-T-----------------G-AG-A----TT-A-ATG----ATA--AA-A---G-GAG-TG-G-CG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A------A------------------T----G-AA--T------A---G-TCCT--GCG--TACG--A------T-TATAAATTAACCCGCTTTGTAacatagatcaaat
gi|9                          :       cGGATGACTAGT---CA--GT-CT----C---A-TA-------T------G---GT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TAAACAGT-T--G-----A-C--CCA-CCCAAACTC-AAA-A----CTAC------AC----C--AT-A-----A---GT-T-ACGACA----TT--TTA----T---T-ACA-TAAA-C--------------CC-A-C----ATAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--TT-G-AA-A-A-CGT-T-C---G-A---T-AGTT--------CCT-TTT-------T-TA----T-TGGT--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-AT--TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--ACTGG--G----C--A-GT-TG-----TCG-TCA---G---T---T-----GT-ACT---CGT-TTCACT-GCTT-TTC---A-TG-AC---AT-AGATG----AT---AA-A---G-GA--T--GGC----G-GTC-T-A--A--------CCA-G---------------------------------------------G-AAGTT------A---C-AAA---GCA--TGCG--A------T------------CTG-TTTaataa





Alignments
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lowQualScore                  :              00   88   00  0  0000  55 8  2222222 444444 000  0 0   0 88   2222 22222 0 0  88  0 0 88 00000 0 88 0 0 88      0   0 0000    88   0  4444444 88 00000 555  0 0 0  0 8888  88  555555555 1   1    2 5555555555555   1 1 4444 2  1   8888888 00 1 0  0  88 88 0  0 0 0   0 88888 0 555 0    22222222   00   555 88 0  8888 0 0 0 6666666666666666 0 2222  0 0 00000 88  55555555555  555 0   555  9   0 000 0  0 555  0 88 0 555 88  555   0 0 0 88 0    88 2222 88 0  0  55555   0   333     222 77777  8   333 8 7      222222   55555  9 0000  9 9   0000  9  99999 0   8  9   6666 9   9 9 66 99999999   3 9999999999999999999999999999999999999999 5  44 222222 444 7   000   2222   77 4444444444   1       
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Reference ( family-2497 )     :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GCG-T--GCG--A------T-C-CCC-GTTTGTA
gi|1                          :          ATGA--AGTTGACA--GTTCT----CC--A-TAATTGAAGC------G--CAT-A-GGC-C--CCT----TAAAA-TAT-TA--CC-C-T--ATAAGAA-CA-T-ATC--AAACTC-AAA-AGT--CTAC--TAC-AC----T--A--ACAAAAG---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----TCTTT-CCA-TAAAGCAA-----------GTC-A-C----A-AAAGAAAACATAGT--G-A-TT-TTCTT--G-AA-A-AACTT-T-TCAAG-A---T-AGGC--------CCC-TT-GCCCT--T-TAAAA-TAT-G-T--------CCA-----T-AAAAATG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAACAAAG-TCG-GAATC-TG-ACCTTTGT--C-T---A--AAACGCTG-C-A-TT-A-CCGG--C----CCAG-GT-TTAAT--TCG-TCA---AGTTG---T-----AT-AAC---A-T-TTCATT-CC---TTCAAAA-TGAA----AT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-GT-GGCGTCCG-GTCTT-C--A--------ACA-GAC------------A-A------------------A----A-AA--T------A---GAACCTCGACG-T--GCA--ATT----T-C-TCC-GTTAGT
gi|10                         :       aggaaGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--AGTA-------T------G--TTT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----AAC--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TA--AC----CAAA--A-----A---GT-T-A-GA-A-----T--TT-----A---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------TCAG-A-TT-TC--T--GAAA-A-A-CTT-T-G---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG------T-TA----T-T-G-T--------C-A-----TCG----TG-G-A-----T--T-------------T---G--AA---AA-TCGCA---C-TG-A----T-T--C-T---A--AA----CT-C-A-T--A--CGG--A----C--A-GG-TT-----TCG-TCA---AA--T---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC-----TG-A----AT-A-ATG----ATAAAGG---G-GAG-TG-GGGC---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------A----G-TT--T------AC--G-ACCA--GCA-G--GCG--A------T-CTCCC-GTTTccaaaat
gi|11                         :      aAGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--TGC-T-AGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CGAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--GT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------GTC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GCG-A--GCG--A------T-T-TCC-GTTTGTAacagataaaca
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gi|14                         :         GATGA--AGC--A-A--GT-CT----CCCGA-TT-------T-----------T-T-GGC-C--TCT----T----------A--CA-T-T--G-----A-C--T-A----AAACC---AA-A----CTAC--GACCAC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----G---T-ATACTAAA-C-------------GCC-A-C---------CGA-------T--G-A-TT-TC--T--G-A------------------------------------CCCAATTA---T--TATA----T-T-G-T--------C-ACC---T-G----TG-A-C-----A--T-------------T---G---A---AA-TCG-A---C-TGCA---TT-T--C-T---A--AA---TC------T--A-TTGGC-G----C--A----TT-----TC--TCA---AAGTT---TC----GT-AAT---CGTATTCACT-CC---TTC---A--G-A----AT-A-A------GTAAA-A---G-GAGTTG-CGCA---G-ATC-T-A--A--------Aa
gi|15                         :       AGGATGA--AGT--GAA--GT-AT----CC--A-TA-------CATGTAAG--TGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAA--TAC-AC----TTAATTA-----A---GT-T-A-AA-A----CT--TTAGGCCTA--T-ACA-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-AA-GGA-------T--G-A-CC-TC--T--G-AA-A-A-CGT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCT-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGA--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---ATTA-A----AT-A-ATgctataaagagtcattctcaacatcatcccagttacatatatcaacactaaa
gi|16                         :         GATGA--AG---GCAA-GT-CT----CC--AGTA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CCA----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTCTAAA-A----CTAC--TAC-CT----T--A--A-----A---TT-A-A-TA-A----TT--TT-----A---T-ACA-TAGA-T-------------GC--A-C----A-AC-GAA-------T----A-TT-TC--T--G-AACA-A-CCT-T-----G-A---T-A--T--------CC---TTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---GAAAA---AA-TCG-A---C-TG-A----T-T--C-T------AA---CCT-C-ACT--A-CC-G--G----C--A-GT-TT-----TCGTTCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCG---------TT---A-TG-A----A--A-ATG--------------G-AGG-TG-GGC----G-GTC-T-ATCA--------ACA-G--------------
gi|17                         :         GATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC----TA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CAT----T-----T-T--A--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-TAA-A----CTAC--TAC--C----T--A--A-----A---GT-T-A-TA-A----TT--TT-----A---T-ACA-TAGA-T-------------GCC-A-C----A-AC-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CCT-T-----G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AC---CCT-C-A-T--A-CC-G--G----C--A-GT-TT-----TCGTTCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCGTT---------------------------ATG----ATAAA-AT--G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------ca
gi|18                         :       AGGATGAC-AGT--G----GT-TT----C---A-TA-------T------G--TGT---GGC-T----T----T-----T-T-TA-----T-T--G----------T-A----GGACTC-AA-------CTA---TAG-AT----------------A---GT-T-G----A----TT--TA-----T---T-GTA------------------------G-C----A-AG-G---------T--GTA-TT-T---T--G-AA-AGA-CTT-T-T---G-A---T-AGTT---------CT-GTTG---T--T-TT----C-G-G-T--------A-A-----T-G----TG-GAA-----A--TC-----------AT---G-AAA---AA-TCG-A-----TG-G----T-T--C-T---AATAA---CTT-T-A-T-------G--G----C--A-GT-AT-----T-G-T------AGTT---T-----GT--GT---C-T-TT-ACT---------------------------ATG----AT----T---G-GAG-TG-G--G---G-GTT-T-A--AGAGAGTTTACC-G--------------ATA------------------T----G-AA--T------A---a
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                               -TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---A-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T--A----T-T-G-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-------------------------------CCGG--A----A--A-GT-TT-----TCG-TCA---CGGTT---T-----GA-GAT---C-T-TTCAC--CC---TCC---A-TG-AATGAAT-A-ATG----ATAAA-C---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-AAG----------------TTTAGG-AA--TATTAAAA---G-ACC---GCG-T--GCG--A------T-C-C
gi|2                          :                            -CT----CC--A-TA-------T------G--TTT-T-G-C-C--CCT----TCGGATT-T-TA--CA-TAT--G-----G-CATT-A-C--AAAATCCAAATA----CTAC--TAC-AC----T--A--A-----AT--GT-T-A-GA-A----TTATTT-----TA--T-ACA-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-A--GAA-------T--G-A-TT--C--T--G-AA-ACA-TTT-T-T---T-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-CTTCA----C-A-----T-G----TGCG-AT----A--TGTGACTTTTTTACT---T-GAA---AA-TCG-GATTC-TG-A---TT-TTCT-T---A--AA---CCTCC-A-T--A-CTGG--G----CG-A-GT-TT-----TCG-TCACTTAAGTT---T-----GT-AATTCGC-T-TTCACT-TCCGTTTCTG-A-TC-A----AT-A-ATG----ATTAA-AGGTG-GAGTTG-GGC----G-GTC-T-A--A--------ACagtgtacatagatcaaatc
gi|20                         : gcagctcaGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--C------T-----T-T-TA--TA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTT-AAA-A----CTAC--TAC-AC----G--A--A-----A---GT-T-T-GA-GATT-TT--TT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-GCC----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---GAA---TAAGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----TGG----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-ttaaccagttcacgagcctggcgatcccgtattccatcagatcaaatcc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-TA--A--AA---CCTCC-A-TTCA-CCGGGCG----C--A-GTGTT-----TCG-TCA---AGTTTC--T-----GTCAAT---C-TGGTCGCT-CC---TTC---C-TA-A----AT-A-ATGTC--ATAAC-G---G-GAG-TGCGGGG---G-GTC-T-A--A--------ACACG--------------A---------------------------AG--T------A---G-ACC---GC--T--GCG--A------T-A-CCC-GTTTatcctcgatctaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaacc---AGTTT---T-----GT-AAT---C-TGTTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-A-G----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----GAAA--T------A---G-ACC---GCA-T--GCA--ATGCGATT-T-CCC-GTTTacatccttatacagactgtagatcaaatc
gi|23                         :      gttcATGT--AGT--GAA--GT-C-----CC--A-GA-------T------G--AGC-T-G-C-C--CGT----T-----T-TGTA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----TA-A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--ttgtaaata
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-TG-GGCG---GCGGC-A-A--A--------ACAAG--------------A-AAGTTT-------------T----A-GA--T------AAATG-ACC---GCG-T--GCG--A------T-C-TCC-GTT
gi|25                         :  aaatgAGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--Ccacgatcaaacgtca
gi|3                          :                             aa----CC--A-TA-------TC-----G--CGTCT-GGC-CAACCCGAGAT-----A-T-TA--CT-TCT--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-AACCACTACCTTAC-ACCTATT--A--A-----A---GT-TTA-GA-A----TT--TA-----T---A-CCA-TAAA-C-------------GCCCA-CCATAA-GG-GAA-------T--G-A-TT-TCT-T--G-AA-A-A-CTT-T-G---C-A---T-AGTT--------CCC--TTG---T--T-TA----T-T-G-C----------------T-G----AG-G-A-----ATTTG-----------CT---G-AAA---AA--CG-A---CTTG-A---TT-T--C-T---A--AAC--CCT-C-A-T--T-ACGA--G----C--A-G--TT-----TCG-TCG---AGGTTCTGT-----GT-GAT---C-T-TTCACT--C---TTC---A-TG-A----AT-A-ATGAAATATAAA-C---A-GAT-TG-GGCG---G-GTC-TAA--A--------ACA-G--------------A-AACGTAATTAGGGAATAATT----G-AA--T------A---G-ACC---GTGAT--GCG--A------T-C-CCC-GTTT
gi|4                          :        GGATGA---GT--GCAAAGT-CT----TCT-A-TA-------T------GGCTGT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-AT--CA-T-TTGG-----A-C--T-A-C--CTACTC-AAA------CTAC--TAC-------T--A--A-----ATAAGT-T-A-AG-A----CG--TT-----TA--T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-ATTT-TT--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC--TTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----C-G----AG-G-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-TA-C-T------AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--A----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GTGAAT---C-T-TTCGCT-C--------------------------------ATAAA-C---GTAAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------GCACGATTGTTAAGGATATA-A------------------T----G-AA--T------A---A-ACC---GCG-TTAGCGGAA------T-C-CCC-GTTTacaatagatcaaa
gi|5                          :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----T--A--T-----A---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----T---T-ACA-CAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TT--CGAG-AA-A-A-CTC-TAT---G-A---T-A-TT--------CCC--TTG---T--T-TACTCGT-T-G-TTCCCCCCCC-AAATATT-G----TA-A-AAAAATA--TC-----------CTCGAG-AAAT--AA-TCG-A---C-AG-A---AT-T--C-T---A--AA---CCT-CAA-T--A-CACG--G----C--C-GT-CT-----TCC-TCA---AGGTT---T-----G--AAT---C-T-CACATT-CC----TC---A-TG-A----AT-A-A-G----A-AAA-A---G-GA--TG-GGCG---T-CTC-T-A--A--------A-A-C--------------A-A------------------A----G-AA--T------AG--G-ACC---GCG----ACG--A------T----CC-GTTTGTAacatcactagtagaatcaaa
gi|6                          :           TGA--AGCTGGCA--GT-CTACACCC--A-T--------T------G--TTT-TTGGCAC--CCT----T-----T-T-TA--AC-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAA-TC-AAA-A----CTAC--TAC-AT----------A-----A---GTAT-A-GA-A----TT--TT-----A---T-ACA-TAAA-CACGAAAACTCCTGGCT-G-C----A-AA-GAA-------TT-G-A-TTGTT--C--G-AA-A-A-CTTAT-T---G-AATTT-AGTTATATATACTCC-TTTG---TATT-TA----T-T-G-T--------CCA-----T-G----TG-G-A-----AA-TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---CTTG-A---TTAT--C-TTAAA--AA---CCT-C-A-T--A-TTGG--ATTCTC--A-AT-TTCGAGATCT-TCA---AAGTT---TACATAGT-AAT---C-G-TTC-CTACT---TTC---A-TG-A----ATAA-ATG----ATAAA-AG--G-GAG-TG-G--A---G-GT--T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------aatcaa
gi|7                          :        GGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CTT----T-----T-T-----CA-T-T--GG----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA------CTAC--TAC-AC----T--A--AC----A---GT-T-A-AC-A----TT--TT-----A---T-A-A-TAAAGC-------------GCC-A-C----A-AA-ACA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCT-TTTG---T--T-TA----T-TTG-T--------C-A-----T-G----TA-T-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--TAT---A--AA---CCT-C-A-T--AATTGG--G----C-----T-TT-----TCGCTCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A-----T-A-ATG----ATAAG-AAG-G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--T--------ACA-G--------------A-AGTTTTA------------C----G-AA---------------------GCA-T--GCG--A------T-C-CCCCGTTTa
gi|8                          :        GGATGA--AGT--GCA--GT-CTG---CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T----G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----ACAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-TTA-GA-T----TT--TT-----T---TTACA-TAAA-C-------------GCC-A-CCC--ACAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-AACTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T---T--------C-------T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AAATCG-AA--C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--AAGT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-T-----------------G-AG-A----TT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-G-CG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-TCCT--GCG-T--ACG--A------T-acatagatcaaat
gi|9                          :       cGGATGACTAGT---CA--GT-CT----C---A-TA-------T------G---GT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TAAACAGT-T--G-----A-C--CCA-CCCAAACTC-AAA-A----CTAC------AC----C--AT-A-----A---GT-T-ACGACA----TT--TTA----T---T-ACA-TAAA-C--------------CC-A-C----ATAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--TT-G-AA-A-A-CGT-T-C---G-A---T-AGTT--------CCT-TTT-------T-TA----T-T-GGT--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-AT--TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CTGG--G----C--A-GT-TG-----TCG-TCA---G---T---T-----GT-ACT---CGT-TTCACT-GCTT-TTC---A-TG-AC---AT-AGATG----AT-AA-A---G-GA--T--GGC----G-GTC-T-A--A--------CCA-G----------------------------------------G-AAGTT------A---C-AAA---GCA-T--GCG--A------T----CT-GTTTtataaattaacccgctttgtaaataa





Alignments
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Reference ( family-2497 )     :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GCG-T--GCG--A------T-C-CCC-GTTTGTA
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gi|2                          :                            -CT----CC--A-TA-------T------G--TTT-T-G-C-C--CCT----TCGGATT-T-TA--CA-TAT--G-----G-CATT-A-C--AAAATCCAAATA----CTAC--TAC-AC----T--A--A-----AT--GT-T-A-GA-A----TTATTT-----TA--T-ACA-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-A--GAA-------T--G-A-TT--C--T--G-AA-ACA-TTT-T-T---T-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-CTTCA----C-A-----T-G----TGCG-AT----A--TGTGACTTTTTTACT---T-GAA---AA-TCG-GATTC-TG-A---TT-TTCT-T---A--AA---CCTCC-A-T--A-CTGG--G----CG-A-GT-TT-----TCG-TCACTTAAGTT---T-----GT-AATTCGC-T-TTCACT-TCCGTTTCTG-A-TC-A----AT-A-ATG----ATTAA-AGGTG-GAGTTG-GGC----G-GTC-T-A--A--------ACagtgtacatagatcaaatc
gi|20                         : gcagctcaGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--C------T-----T-T-TA--TA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTT-AAA-A----CTAC--TAC-AC----G--A--A-----A---GT-T-T-GA-GATT-TT--TT-----T---T-ACA-TAAA-C-------------GCC-GCC----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---GAA---TAAGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----TGG----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-ttaaccagttcacgagcctggcgatcccgtattccatcagatcaaatcc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-TA--A--AA---CCTCC-A-TTCA-CCGGGCG----C--A-GTGTT-----TCG-TCA---AGTTTC--T-----GTCAAT---C-TGGTCGCT-CC---TTC---C-TA-A----AT-A-ATGTC--ATAAC-G---G-GAG-TGCGGGG---G-GTC-T-A--A--------ACACG--------------A---------------------------AG--T------A---G-ACC---GC--T--GCG--A------T-A-CCC-GTTTatcctcgatctaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaacc---AGTTT---T-----GT-AAT---C-TGTTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-A-G----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----GAAA--T------A---G-ACC---GCA-T--GCA--ATGCGATT-T-CCC-GTTTacatccttatacagactgtagatcaaatc
gi|23                         :      gttcATGT--AGT--GAA--GT-C-----CC--A-GA-------T------G--AGC-T-G-C-C--CGT----T-----T-TGTA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----TA-A--A-----A---GT-T-A-GA-A----TT--ttgtaaata
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-TG-GGCG---GCGGC-A-A--A--------ACAAG--------------A-AAGTTT-------------T----A-GA--T------AAATG-ACC---GCG-T--GCG--A------T-C-TCC-GTT
gi|25                         :  aaatgAGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--Ccacgatcaaacgtca
gi|3                          :                             aa----CC--A-TA-------TC-----G--CGTCT-GGC-CAACCCGAGAT-----A-T-TA--CT-TCT--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-AACCACTACCTTAC-ACCTATT--A--A-----A---GT-TTA-GA-A----TT--TA-----T---A-CCA-TAAA-C-------------GCCCA-CCATAA-GG-GAA-------T--G-A-TT-TCT-T--G-AA-A-A-CTT-T-G---C-A---T-AGTT--------CCC--TTG---T--T-TA----T-T-G-C----------------T-G----AG-G-A-----ATTTG-----------CT---G-AAA---AA--CG-A---CTTG-A---TT-T--C-T---A--AAC--CCT-C-A-T--T-ACGA--G----C--A-G--TT-----TCG-TCG---AGGTTCTGT-----GT-GAT---C-T-TTCACT--C---TTC---A-TG-A----AT-A-ATGAAATATAAA-C---A-GAT-TG-GGCG---G-GTC-TAA--A--------ACA-G--------------A-AACGTAATTAGGGAATAATT----G-AA--T------A---G-ACC---GTGAT--GCG--A------T-C-CCC-GTTT
gi|4                          :        GGATGA---GT--GCAAAGT-CT----TCT-A-TA-------T------GGCTGT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-AT--CA-T-TTGG-----A-C--T-A-C--CTACTC-AAA------CTAC--TAC-------T--A--A-----ATAAGT-T-A-AG-A----CG--TT-----TA--T-ACA-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-ATTT-TT--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC--TTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----C-G----AG-G-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-TA-C-T------AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--A----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GTGAAT---C-T-TTCGCT-C--------------------------------ATAAA-C---GTAAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------GCACGATTGTTAAGGATATA-A------------------T----G-AA--T------A---A-ACC---GCG-TTAGCGGAA------T-C-CCC-GTTTacaatagatcaaa
gi|5                          :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----T--A--T-----A---GT-T-A-GA-A----TT--TT-----T---T-ACA-CAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TT--CGAG-AA-A-A-CTC-TAT---G-A---T-A-TT--------CCC--TTG---T--T-TACTCGT-T-G-TTCCCCCCCC-AAATATT-G----TA-A-AAAAATA--TC-----------CTCGAG-AAAT--AA-TCG-A---C-AG-A---AT-T--C-T---A--AA---CCT-CAA-T--A-CACG--G----C--C-GT-CT-----TCC-TCA---AGGTT---T-----G--AAT---C-T-CACATT-CC----TC---A-TG-A----AT-A-A-G----A-AAA-A---G-GA--TG-GGCG---T-CTC-T-A--A--------A-A-C--------------A-A------------------A----G-AA--T------AG--G-ACC---GCG----ACG--A------T----CC-GTTTGTAacatcactagtagaatcaaa
gi|6                          :           TGA--AGCTGGCA--GT-CTACACCC--A-T--------T------G--TTT-TTGGCAC--CCT----T-----T-T-TA--AC-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAA-TC-AAA-A----CTAC--TAC-AT----------A-----A---GTAT-A-GA-A----TT--TT-----A---T-ACA-TAAA-CACGAAAACTCCTGGCT-G-C----A-AA-GAA-------TT-G-A-TTGTT--C--G-AA-A-A-CTTAT-T---G-AATTT-AGTTATATATACTCC-TTTG---TATT-TA----T-T-G-T--------CCA-----T-G----TG-G-A-----AA-TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---CTTG-A---TTAT--C-TTAAA--AA---CCT-C-A-T--A-TTGG--ATTCTC--A-AT-TTCGAGATCT-TCA---AAGTT---TACATAGT-AAT---C-G-TTC-CTACT---TTC---A-TG-A----ATAA-ATG----ATAAA-AG--G-GAG-TG-G--A---G-GT--T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------aatcaa
gi|7                          :        GGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CTT----T-----T-T-----CA-T-T--GG----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA------CTAC--TAC-AC----T--A--AC----A---GT-T-A-AC-A----TT--TT-----A---T-A-A-TAAAGC-------------GCC-A-C----A-AA-ACA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCT-TTTG---T--T-TA----T-TTG-T--------C-A-----T-G----TA-T-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--TAT---A--AA---CCT-C-A-T--AATTGG--G----C-----T-TT-----TCGCTCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A-----T-A-ATG----ATAAG-AAG-G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--T--------ACA-G--------------A-AGTTTTA------------C----G-AA---------------------GCA-T--GCG--A------T-C-CCCCGTTTa
gi|8                          :        GGATGA--AGT--GCA--GT-CTG---CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T----G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----ACAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-TTA-GA-T----TT--TT-----T---TTACA-TAAA-C-------------GCC-A-CCC--ACAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-AACTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T---T--------C-------T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AAATCG-AA--C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--AAGT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-T-----------------G-AG-A----TT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-G-CG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-TCCT--GCG-T--ACG--A------T-acatagatcaaat
gi|9                          :       cGGATGACTAGT---CA--GT-CT----C---A-TA-------T------G---GT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TAAACAGT-T--G-----A-C--CCA-CCCAAACTC-AAA-A----CTAC------AC----C--AT-A-----A---GT-T-ACGACA----TT--TTA----T---T-ACA-TAAA-C--------------CC-A-C----ATAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--TT-G-AA-A-A-CGT-T-C---G-A---T-AGTT--------CCT-TTT-------T-TA----T-T-GGT--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-AT--TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CTGG--G----C--A-GT-TG-----TCG-TCA---G---T---T-----GT-ACT---CGT-TTCACT-GCTT-TTC---A-TG-AC---AT-AGATG----AT-AA-A---G-GA--T--GGC----G-GTC-T-A--A--------CCA-G----------------------------------------G-AAGTT------A---C-AAA---GCA-T--GCG--A------T----CT-GTTTtataaattaacccgctttgtaaataa


blockSeqs                     :              CT   TG   AA  .  ACAC  CG G  .       ATGTAA GCT  C T   A AA   GAGA CGGAT . G  AA  G A TG G     A AT C . CC      T   T ACCA    CT   C  CTATT   TT C     TAA  A T C  C GGTT  AT  AGGCCTA   T   C    G ACGAAAACTCCTG   C C CATA C  .   .       CA T T  G  T  GA A  C G A   A AT    A ATT A    ATATATAC   AA   .   AT A  CTCG . T G TCCCCCCCCAAATAT  C .     C A AAAAT TT  TGACTTTTTTA  CGA A   T    A   C ATT T  C T    A TC A TAA AT  C     C A C TC A    GC TTCT G  A  G  CGAGA   T   CTT     CTG ACATA  C   TCG G A      TCCGT    TGA    . ATGA  A G   AAAT     AGGT  T   T  C   C    C   . A TC GAGAGTTT   C AAACGTAATTAGGGAATAATT                    A  GT ATTAAA AAT .   A     TTA    GA TGCGATTT     C
blockSeqs                     :              C    .    A   .  G     T  G  .       C      T    . .   . .    .    .     . .  .   . C .  .     . C  . . .       C   . .       .    .  CAA     T  .     T    . T .  . ATT   .   TA        .   .    . .               . . CC   T  .   .       T  . .  .  .  T  .  . C .   . G     . .   .    .          T    .   .  .  .    . . . TTCACA           G .     . . T     A   .            .   .   .    .   . A   T  . .    . A  . A   .   .     C . . .  .    C  .    .  .  .  .       T   .       C   C      G   .   G G      GCTT     AT     . C     . .   TC       AAG   .   T  .   G    .   . . .  .          A ATTGTTAAGGATATAAT                        .  .  .      C   .   T     AT     .  TCT          .
blockSeqs                     :              .    .    .   .  .     .  .  .       .      T    . .   . .    .    .     . .  .   . . .  .     . C  . . .       .   . .       .    .  TTA     .  .     .    . . .  . .     .   TA        .   .    . .               . . .    .  .   .       .  . .  .  .  .  .  . . .   . T     . .   .    .          T    .   .  .  .    . . . CACC             . .     . . .     .   .            .   .   .    .   . .   .  . .    . .  . .   .   .     . . . .  .    .  .    .  .  .  .       C   .       .   .      .   .   . G      ACT      A      . .     . .   .        GG    .   .  .   G    .   . . .  .          C AAAGTTTAG                                .  .  .      G   .   .     G      .  TAT          .
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blockSeqs                     :              .    .    .   .  .     .  .  .       .      C    . .   . .    .    .     . .  .   . . .  .     . .  . . .       .   . .       .    .  T       .  .     .    . . .  . .     .   A         .   .    . .               . . .    .  .   .       .  . .  .  .  .  .  . . .   . T     . .   .    .          T    .   .  .  .    . . . CA               . .     . . .     .   .            .   .   .    .   . .   .  . .    . .  . .   .   .     . . . .  .    .  .    .  .  .  .       .   .       .   .      .   .   . .      CC       A      . .     . .   .        AG    .   .  .   G    .   . . .  .          . AAAGTTTT                                 .  .  .      .   .   .     T      .  TT           .
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Reference ( family-2497 )     :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----T-T---TTN------T-AC-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GCG-T--GCG--A------T-C-CCC-GTTTGTA
gi|1                          :          ATGA--AGTTGACA--GTTCT----CC--A-TAATTGAAGC------G--CAT-A-GGC-C--CCT----TAAAA-TAT-TA--CC-C-T--ATAAGAA-CA-T-ATC--AAACTC-AAA-AGT--CTAC--TAC-AC----T--A--ACAAAAG---GT-T-A-GA-A----T-T---TTTCTT---T-CC-A-TAAAGCAA-----------GTC-A-C----A-AAAGAAAACATAGT--G-A-TT-TTCTT--G-AA-A-AACTT-T-TCAAG-A---T-AGGC--------CCC-TT-GCCCT--T-TAAAA-TAT-G-T--------CCA-----T-AAAAATG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAACAAAG-TCG-GAATC-TG-ACCTTTGT--C-T---A--AAACGCTG-C-A-TT-A-CCGG--C----CCAG-GT-TTAAT--TCG-TCA---AGTTG---T-----AT-AAC---A-T-TTCATT-CC---TTCAAAA-TGAA----AT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-GT-GGCGTCCG-GTCTT-C--A--------ACA-GAC------------A-A------------------A----A-AA--T------A---GAACCTCGACG-T--GCA--ATT----T-C-TCC-GTTAGT
gi|10                         :       aggaaGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--AGTA-------T------G--TTT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----AAC--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TA--AC----CAAA--A-----A---GT-T-A-GA-A------T---TTA------T-AC-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------TCAG-A-TT-TC--T--GAAA-A-A-CTT-T-G---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG------T-TA----T-T-G-T--------C-A-----TCG----TG-G-A-----T--T-------------T---G--AA---AA-TCGCA---C-TG-A----T-T--C-T---A--AA----CT-C-A-T--A--CGG--A----C--A-GG-TT-----TCG-TCA---AA--T---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC-----TG-A----AT-A-ATG----ATAAAGG---G-GAG-TG-GGGC---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------A----G-TT--T------AC--G-ACCA--GCA-G--GCG--A------T-CTCCC-GTTTccaaaat
gi|11                         :      aAGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--TGC-T-AGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CGAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----T-T---GTT------T-AC-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------GTC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GCG-A--GCG--A------T-T-TCC-GTTTGTAacagataaaca
gi|12                         :          ATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAT-AC----T--A--A-----A---TT-T-A-GA-TGGTTT-T---TTT------T-AC-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-G---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------AC--------------------------------------------------------A---G-ACC---GCG-T--GCT--A------T-T-CCC-ATTTGTA
gi|13                         :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGT----GC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-C--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTA---TAC--C----T--A--A-----A---GT-T-A-GA------T-T---TTT------T-GC-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CC--TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-TTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-ATG----AT-AA-A---G-GAG-TG-GGC----G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-ACC---GCA----GCG--A------TAT-TCC-GTTTGTAaataaa
gi|14                         :         GATGA--AGC--A-A--GT-CT----CCCGA-TT-------T-----------T-T-GGC-C--TCT----T----------A--CA-T-T--G-----A-C--T-A----AAACC---AA-A----CTAC--GACCAC----T--A--A-----A---GT-T-A-GA-A----T-T---TTG------T-AT-ACTAAA-C-------------GCC-A-C---------CGA-------T--G-A-TT-TC--T--G-A------------------------------------CCCAATTA---T--TATA----T-T-G-T--------C-ACC---T-G----TG-A-C-----A--T-------------T---G---A---AA-TCG-A---C-TGCA---TT-T--C-T---A--AA---TC------T--A-TTGGC-G----C--A----TT-----TC--TCA---AAGTT---TC----GT-AAT---CGTATTCACT-CC---TTC---A--G-A----AT-A-A------GTAAA-A---G-GAGTTG-CGCA---G-ATC-T-A--A--------Aa
gi|15                         :       AGGATGA--AGT--GAA--GT-AT----CC--A-TA-------CATGTAAG--TGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAA--TAC-AC----TTAATTA-----A---GT-T-A-AA-A----C-T---TTAGGCCTAT-AC-A-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-AA-GGA-------T--G-A-CC-TC--T--G-AA-A-A-CGT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCT-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGA--G----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCACT-CC---TTC---ATTA-A----AT-A-ATgctataaagagtcattctcaacatcatcccagttacatatatcaacactaaa
gi|16                         :         GATGA--AG---GCAA-GT-CT----CC--AGTA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CCA----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTCTAAA-A----CTAC--TAC-CT----T--A--A-----A---TT-A-A-TA-A----T-T---TTA------T-AC-A-TAGA-T-------------GC--A-C----A-AC-GAA-------T----A-TT-TC--T--G-AACA-A-CCT-T-----G-A---T-A--T--------CC---TTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---GAAAA---AA-TCG-A---C-TG-A----T-T--C-T------AA---CCT-C-ACT--A-CC-G--G----C--A-GT-TT-----TCGTTCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCG---------TT---A-TG-A----A--A-ATG--------------G-AGG-TG-GGC----G-GTC-T-ATCA--------ACA-G--------------
gi|17                         :         GATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC----TA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CAT----T-----T-T--A--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-TAA-A----CTAC--TAC--C----T--A--A-----A---GT-T-A-TA-A----T-T---TTA------T-AC-A-TAGA-T-------------GCC-A-C----A-AC-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CCT-T-----G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-T---A--AC---CCT-C-A-T--A-CC-G--G----C--A-GT-TT-----TCGTTCA---AGGTT---T-----GT-GAT---C-T-TTCGTT---------------------------ATG----ATAAA-AT--G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------ca
gi|18                         :       AGGATGAC-AGT--G----GT-TT----C---A-TA-------T------G--TGT---GGC-T----T----T-----T-T-TA-----T-T--G----------T-A----GGACTC-AA-------CTA---TAG-AT----------------A---GT-T---GA-T----T-TA--TTG------T-A---------------------------G-C----A-AG-G---------T--GTA-TT-T---T--G-AA-AGA-CTT-T-T---G-A---T-AGTT---------CT-GTTG---T--T-TT----C-G-G-T--------A-A-----T-G----TG-GAA-----A--TC-----------AT---G-AAA---AA-TCG-A-----TG-G----T-T--C-T---AATAA---CTT-T-A-T-------G--G----C--A-GT-AT-----T-G-T------AGTT---T-----GT--GT---C-T-TT-ACT---------------------------ATG----AT----T---G-GAG-TG-G--G---G-GTT-T-A--AGAGAGTTTACC-G--------------ATA------------------T----G-AA--T------A---a
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                -TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---A-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T--A----T-T-G-T--------C-A-----T-G----AG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-------------------------------CCGG--A----A--A-GT-TT-----TCG-TCA---CGGTT---T-----GA-GAT---C-T-TTCAC--CC---TCC---A-TG-AATGAAT-A-ATG----ATAAA-C---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-AAG----------------TTTAGG-AA--TATTAAAA---G-ACC---GCG-T--GCG--A------T-C-C
gi|2                          :                            -CT----CC--A-TA-------T------G--TTT-T-G-C-C--CCT----TCGGATT-T-TA--CA-TAT--G-----G-CATT-A-C--AAAATCCAAATA----CTAC--TAC-AC----T--A--A-----AT--GT-T-A-GA-A----T-TATTTTA------T-AC-A-TTAA-C-------------ACC-A-C----A-A--GAA-------T--G-A-TT--C--T--G-AA-ACA-TTT-T-T---T-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-CTTCA----C-A-----T-G----TGCG-AT----A--TGTGACTTTTTTACT---T-GAA---AA-TCG-GATTC-TG-A---TT-TTCT-T---A--AA---CCTCC-A-T--A-CTGG--G----CG-A-GT-TT-----TCG-TCACTTAAGTT---T-----GT-AATTCGC-T-TTCACT-TCCGTTTCTG-A-TC-A----AT-A-ATG----ATTAA-AGGTG-GAGTTG-GGC----G-GTC-T-A--A--------ACagtgtacatagatcaaatc
gi|20                         : gcagctcaGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--C------T-----T-T-TA--TA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTT-AAA-A----CTAC--TAC-AC----G--A--A-----A---GT-T-T-GA-GATT-T-T---TTT------T-AC-A-TAAA-C-------------GCC-GCC----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---GAA---TAAGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----TGG----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AA-ttaaccagttcacgagcctggcgatcccgtattccatcagatcaaatcc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               a-TCG-A---C-TG-A---TT-T--C-TA--A--AA---CCTCC-A-TTCA-CCGGGCG----C--A-GTGTT-----TCG-TCA---AGTTTC--T-----GTCAAT---C-TGGTCGCT-CC---TTC---C-TA-A----AT-A-ATGTC--ATAAC-G---G-GAG-TGCGGGG---G-GTC-T-A--A--------ACACG--------------A---------------------------AG--T------A---G-ACC---GC--T--GCG--A------T-A-CCC-GTTTatcctcgatctaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaacc---AGTTT---T-----GT-AAT---C-TGTTCATT-CC---TTC---A-TG-A----AT-A-A-G----ATAAA-A---G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----GAAA--T------A---G-ACC---GCA-T--GCA--ATGCGATT-T-CCC-GTTTacatccttatacagactgtagatcaaatc
gi|23                         :      gttcATGT--AGT--GAA--GT-C-----CC--A-GA-------T------G--AGC-T-G-C-C--CGT----T-----T-TGTA--CA-T-T--G-----A-CC-T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----TA-A--A-----A---GT-T-A-GA-A----T-T---ttgtaaata
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        G-TG-GGCG---GCGGC-A-A--A--------ACAAG--------------A-AAGTTT-------------T----A-GA--T------AAATG-ACC---GCG-T--GCG--A------T-C-TCC-GTT
gi|25                         :  aaatgAGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--Ccacgatcaaacgtca
gi|3                          :                             aa----CC--A-TA-------TC-----G--CGTCT-GGC-CAACCCGAGAT-----A-T-TA--CT-TCT--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-AACCACTACCTTAC-ACCTATT--A--A-----A---GT-TTA-GA-A----T-T---T-A------T-ACCA-TAAA-C-------------GCCCA-CCATAA-GG-GAA-------T--G-A-TT-TCT-T--G-AA-A-A-CTT-T-G---C-A---T-AGTT--------CCC--TTG---T--T-TA----T-T-G-C----------------T-G----AG-G-A-----ATTTG-----------CT---G-AAA---AA--CG-A---CTTG-A---TT-T--C-T---A--AAC--CCT-C-A-T--T-ACGA--G----C--A-G--TT-----TCG-TCG---AGGTTCTGT-----GT-GAT---C-T-TTCACT--C---TTC---A-TG-A----AT-A-ATGAAATATAAA-C---A-GAT-TG-GGCG---G-GTC-TAA--A--------ACA-G--------------A-AACGTAATTAGGGAATAATT----G-AA--T------A---G-ACC---GTGAT--GCG--A------T-C-CCC-GTTT
gi|4                          :        GGATGA---GT--GCAAAGT-CT----TCT-A-TA-------T------GGCTGT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-AT--CA-T-TTGG-----A-C--T-A-C--CTACTC-AAA------CTAC--TAC-------T--A--A-----ATAAGT-T-A-AG-A----CGT---TTA------T-AC-A-TAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-ATTT-TT--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC--TTG---T--T-TA----T-T-G-T--------C-A-----C-G----AG-G-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-TA-C-T------AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--A----C--A-GT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GTGAAT---C-T-TTCGCT-C--------------------------------ATAAA-C---GTAAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--A--------GCACGATTGTTAAGGATATA-A------------------T----G-AA--T------A---A-ACC---GCG-TTAGCGGAA------T-C-CCC-GTTTacaatagatcaaa
gi|5                          :       AGGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----CTAC--TAC-AC----T--A--T-----A---GT-T-A-GA-A----T-T---TTT------T-AC-A-CAAA-C-------------GCC-A-C----A-AA-GAA-------T--G-A-TT-TT--CGAG-AA-A-A-CTC-TAT---G-A---T-A-TT--------CCC--TTG---T--T-TACTCGT-T-G-TTCCCCCCCC-AAATATT-G----TA-A-AAAAATA--TC-----------CTCGAG-AAAT--AA-TCG-A---C-AG-A---AT-T--C-T---A--AA---CCT-CAA-T--A-CACG--G----C--C-GT-CT-----TCC-TCA---AGGTT---T-----G--AAT---C-T-CACATT-CC----TC---A-TG-A----AT-A-A-G----A-AAA-A---G-GA--TG-GGCG---T-CTC-T-A--A--------A-A-C--------------A-A------------------A----G-AA--T------AG--G-ACC---GCG----ACG--A------T----CC-GTTTGTAacatcactagtagaatcaaa
gi|6                          :           TGA--AGCTGGCA--GT-CTACACCC--A-T--------T------G--TTT-TTGGCAC--CCT----T-----T-T-TA--AC-T-T--G-----A-C--T-A-C--AAA-TC-AAA-A----CTAC--TAC-AT----------A-----A---GTAT-A-GA-A----T-T---TTA------T-AC-A-TAAA-CACGAAAACTCCTGGCT-G-C----A-AA-GAA-------TT-G-A-TTGTT--C--G-AA-A-A-CTTAT-T---G-AATTT-AGTTATATATACTCC-TTTG---TATT-TA----T-T-G-T--------CCA-----T-G----TG-G-A-----AA-TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---CTTG-A---TTAT--C-TTAAA--AA---CCT-C-A-T--A-TTGG--ATTCTC--A-AT-TTCGAGATCT-TCA---AAGTT---TACATAGT-AAT---C-G-TTC-CTACT---TTC---A-TG-A----ATAA-ATG----ATAAA-AG--G-GAG-TG-G--A---G-GT--T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------aatcaa
gi|7                          :        GGATGA--AGT--GCA--GT-CT----CC--A-TA-------T------G--TGT-T-GGC-C--CTT----T-----T-T-----CA-T-T--GG----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA------CTAC--TAC-AC----T--A--AC----A---GT-T-A-AC-A----T-T---TTA------T-A--A-TAAAGC-------------GCC-A-C----A-AA-ACA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-A-CTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCT-TTTG---T--T-TA----T-TTG-T--------C-A-----T-G----TA-T-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-A---TT-T--TAT---A--AA---CCT-C-A-T--AATTGG--G----C-----T-TT-----TCGCTCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-G-TTCACT-CC---TTC---A-TG-A-----T-A-ATG----ATAAG-AAG-G-GAG-TG-GGCG---G-GTC-T-A--T--------ACA-G--------------A-AGTTTTA------------C----G-AA---------------------GCA-T--GCG--A------T-C-CCCCGTTTa
gi|8                          :        GGATGA--AGT--GCA--GT-CTG---CC--A-TA-------T------G--CGC-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TA--CA-T----G-----A-C--T-A-C--AAACTC-AAA-A----ACAC--TAC-AC----T--A--A-----A---GT-TTA-GA-T----T-T---TTT------TTAC-A-TAAA-C-------------GCC-A-CCC--ACAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--T--G-AA-A-AACTT-T-T---G-A---T-AGTT--------CCC-TTTG---T--T-TA----T-T---T--------C-------T-G----TG-G-A-----A--TG-----------CT---G-AAA---AAATCG-AA--C-TG-A---TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CCGG--G----C--AAGT-TT-----TCG-TCA---AGGTT---T-----GT-AAT---C-T-T-----------------G-AG-A----TT-A-ATG----ATAAA-A---G-GAG-TG-G-CG---G-GTC-T-A--A--------ACA-G--------------A-A------------------T----G-AA--T------A---G-TCCT--GCG-T--ACG--A------T-acatagatcaaat
gi|9                          :       cGGATGACTAGT---CA--GT-CT----C---A-TA-------T------G---GT-T-GGC-C--CCT----T-----T-T-TAAACAGT-T--G-----A-C--CCA-CCCAAACTC-AAA-A----CTAC------AC----C--AT-A-----A---GT-T-ACGACA----T-T---TTA------TTAC-A-TAAA-C--------------CC-A-C----ATAA-GAA-------T--G-A-TT-TC--TT-G-AA-A-A-CGT-T-C---G-A---T-AGTT--------CCT-TTT-------T-TA----T-T-GGT--------C-A-----T-G----TG-G-A-----A--TG-----------TT---G-AAA---AA-TCG-A---C-TG-AT--TT-T--C-T---A--AA---CCT-C-A-T--A-CTGG--G----C--A-GT-TG-----TCG-TCA---G---T---T-----GT-ACT---CGT-TTCACT-GCTT-TTC---A-TG-AC---AT-AGATG----AT-AA-A---G-GA--T--GGC----G-GTC-T-A--A--------CCA-G----------------------------------------G-AAGTT------A---C-AAA---GCA-T--GCG--A------T----CT-GTTTtataaattaacccgctttgtaaataa