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Reference ( family-241 ) : ATCCAA--GTATTTATTCACAC--AATATATACA-AATA--CACCGGGTTCCACGGACTACCACGCTCCCTGCCGTC--GGTCTTCTA-CCATGNGCTCCGCCGCGCCGTNC----G----GCTAGCTTNATATNCGCGGGNAAACTC-CTCGTGCTCCGGAAGTCGTACTGGTTGCC-AT-C-GGGGCTGGACAAGTCGTACCGGGGTAGGACT-CCCCAGATACTAT-ACCACATTC----ATTTTCTCCA-AAGGAC-GGAGCGACGCGGT-CC-TTC-AA---T-GGTTCGGGTGG-GCGNAATACGCGCCCTCGGAAGAGACTA--TCTGAGAGCGCCGGAGCANGCTCC-GCNAAAACAA-TCNCGGAAANATTC--C--GGA--C-C--CTAACTGGGANNTTCCTGGCANNTCCAAATNCAGCTAGG-TGTCAG-GAGCCCCATAGCTGTCTCNAAGTGGGGNCCAGAGTAACTTGATGTCTCGCAGCCCGTCTNANTTGGGTCCTCAGTAAGTCATA-C-CCG-CAAGGTCTCTCTCCAGGTCCAAC---TCA-CCCTT--GGTCCAANCTGTTTACA----CCCGAGAAGTTCCCGGGAGAAACAGTTCAAAACCGCCTTG-CCAC--------CAAC----GA-----CTNCCGCACCGACTTTN-TCTCCAAAGTTGGTCGGTGCG-TGGGGAAAAT-CT-CCCCACTGTCNAACAANGGCTNCTTGGCATCCGGGCTAACTGCCAAG-T-CCTC-CAACTCCCNATCCA-AATGACTGGGACACTGGATG-ACTG-ACACGGTGGGAACCCGGACGGTCTTCGTCAAGGAAACAT-G---GCNTCCTG--TT-TTTC-CTG-GGNCGTC-CGAGTGTCACAGGAACNGTCTCCTCGCCTATNAAAGGAGTCC-CATACTCGAGGTTTAGCCGATCTCTCTATCGCCACANGAACCCAATGNCCAGCAACATCTNGTCTCGCAATTGGGCCACGTACANGTCCNNGGNCCGCTCTGTACCTCCCACGNNAACTCTCACAGGGCCAATAATNNATGCCGTCATCCGGGCATTCTCCCCNGCCTNCGCNAGAGTCGCNTGTTGCCTAATNNGCGGCCTGGGGTTGAGCTNCTCGTNAACCCGAGTGGAGACAAGGATGCTGACTTCTGTCCCGGTGTCCACAACCGCNTGNAGTCCTATTCCTTGCACCTCCATCTCTACCACAAGCCGGGTGGTCGGGCG--AATCCGTTCAATGGGAGCAGCCG---GGTATTCCCGGCGTTCTCCNANAGGACAACAGGGCATNCCCTTGGCTCCTTCNTCTGTCTGCA-CTAT-TCCC-GNAGTCAACTCTGGTTCTNGCGG---T------CACTAGACGCTGNGTCT-TCGCAGGACA-TCGCC-TGATCT--CA--TCCTCTGGATCGTCCCGGGAATCGCCCCTGTTCTCCTGGTTCCCCGCACTA-GGCCC-GG-------TCCTCAGAGAACCTTAACCT-CCCGGGACACATGGCTCATCCTTGGGAGCGGGGTCGTACCTGTCC--TCCTCCCACCCAGTGACCATG-T-CCTCAGATTCCTCGTCCTCTTCCTC-GGTGCCTCCTGGAACCGAACCTGGAGTGTGTCCTTCCTGGATCGGCGCATGCAAGAGGGCGCATGGCTGTGACNCTTCC---ATGACTTGTTTCCCCCGGCGCATCCAC---------CAGTGTCCCTCACCTCCACCGGTGTA-GGCC------CTT----CA--CTGGCT----AA-----GCTGG-----GTCTCTCCC--C--TGCNTCC----AC-ATGT-TCC-CTG-CAGCTCC-G-GCAGCCGGTNTAGGCCC----TT---TG-GACAAGCTG---G----CT-TCTGGATCC-----TTGC----TGGCTTC-TGTCTCTCC----TCTGCCCCCT-G--------TTCCAG-----CTGCAGATCCGGGCAGT--CTCT-TTNAA-AT-GACCCGGAACTC-CACACTTGA-AG---CACCCCGCC--GG----C------TTC-TGNT--C--G-----CT-ACT-GGT--GAT--GAGAAG-GAGAG-GTTTCCG--GG--G---AGG-GGTCTCGCCCC-CGG----AGTTCCTT---CTC---CAAC--TCCTCAATTCT-CTGACG
gi|1 : ATTCAA--GTATTTATTCACAC--TATATATACA-AATA--CACCGGGTTCCACGGACCACCACGCTCCCTGCCGTC--GGTCTTTTA-TCATGGGCTCCGCCGTGCCGTGT----GTATTGCTAGCTTCATTTCCGCGGGAAAACTC-CTAATGCTCCGGAAGTCGCACTGATTGCC-AT-CCGGGGCTAGACAAGTCGTATCGGGGTAAAACT-CCCCAGATACTATTACCCCCCCCCCCCATTTTCTCTA-AAGGAC-TGAGTAAAGGGAT-CC-TTCCAA---T-AGTCCGGGTGG-CCGCAACACGCGCCCTCGGAAGAGACTAGATCTGAGAATGCTAAAGTAAAAT---GCAAAAACAA-TCCGGGAAACATTCACC--AGAACCAC--CTGACTGGGAATTTCCTGGCAACTCCAAATCCAGGTGGG-GGCCAA-GGGTCCCTGAGCTGTCTCAAGGTGGGGGCCAGAGTAGCCTGATACCTCGGAGCT-GTCTCACTTGGGTCCTCCATGAACCATG-C-TCGGCAAGGTCTCTCTCCAGGTTCAAC---TCAGCCCTTTGGGACCAATCTATTTACAGAAACCCGGAAAGTTCCCGGGAGACATAGTTCAAAACCGCCTTGTCCACTGTAGGGCCAACAGATGAGGCTTCTACCGCACCAACTCCG-TCTCCAAAGTTGGTCGGTGCG-TGGGGAAAGT-CC-CCCTACTGTCTAACAAGGACTTTCTGGCATCCGGGCTGAGTACCACG-T-CCTC-CAACTCCCTATCCA-AATGACTGGGACACTGGATG-AGTG-AGACGGTGGGAAACCGGACGGTCTTCATTAAGGAAACAT-G---GTGTCCTG--TT-CTTC-CTGTGGACATCACCA-TGTCACAAGAACTGTCTCCTTGCTCATGGACAGTGTGT-CATACTTCAGGTCTAGCCGGGCTTTCTGGCGGCACAGAAACCCAATGCCCAGCAACATCTGGTCTCGCAA-TGGGCCACGTACAAGTCCAAGGACTGCTCTGTACCTCTCATGCCA--TC-CACA--------AATCCAT----TCATCCGGGCATTCTCCCCAACTTGCGCAAGAGTAATCTGTTGCCTAATGAGCCGTCTGGGGTTGAGCTTCTCGTACACCCGTGTTGACAT---GATGCTGACTTCCGCCCCGGTATCCACAACCGCATGGAATCCTATTCCTTGCACCTCCATCCCTGCCACAAGCTGGGTGGTCGGGCG--AATCCATTCAATGGGAGCAGCCGGGAGGTATTCCCGGCATTCTCCCACAGGACAACAGGGCATGCTCTTGGCTCCTTCCTCTGTCTGCAGCTGT-TCCT-GTA-TCAACTCTGGTTCTGGCAG---T------CACTAGACGCTGGGTC---CGC---AC--TCGCC-T-----------CCCCCTGT-TCCTTCCGGGAATCACCCCTATTCTCCTGGTTCCCCGCACTA-GGCCCTGGCACCATATCCTCGGAGAACCTGAACCT-----GGAAACATGGTTCATCCTTTGAAGCGGGGTCGTACCTGTCC--TCCCCCCACCCAGTGACCATG-T-CCTCAGATTCCTTGTCCTCTTCCCCTGGTTCCTCCTGCAACCGAACCTGGAATGTGCCCTTCCAGGATCGGTGCATGCAAAATGGCGCATGGCGGTGACTCTTCC---ATGACTTGTTCCTCCCGGTGCATCCAC---------CAGTGTTCCTCATTTCCACTGGTGTA-CGCC------CTT----CA--CTGGCT----AA-----GCTGG-----GTCTCTCCC--C--TGCCCCC--------TGT-TCC-CTG-CAGCTCCGG-GTAGTNGGTGTACGCCT----TT--------CA--CTG---G----CT-----AA----------GC----TGG------GTCTCTCC----TCTGCCCCCT-G--------TTCC-------CTGCAGCTCCGGGTAGT--CTCT-TTGAACAT-GGTCCGAAAATC-CACACTTAA-AA---CACCCTGCC--AG----C------TTC-TGAT--T--G-----CT-ACTCGAT--GAT--GAAAAGAAAAAG-GTTTCCG--GGA-G---AGG-GGTCTCGCCCC-CGG----AGTTCCTT---CTC---CAAC--TCCTCAAGTCG-CTGGCG
gi|10 : CTGCCCCTT-GATACCATATTCCC------CTGCAGCTCCGGGCAAT--CTCT-TCCAA-ATTGACCCGGCAATCGCAC-TTTGA-AG---CACCCTGCC--T-----C------TTC-TGGT--CCAG-----CTGACT-GGT--GA----AGAAG-GAG---GCTTCTG--AGAAG---AGT-GGTTT-ATCCC-CGG----AGTTCCTTATCCTC---CAACTATCCTCAAGTCGACTGGCG
gi|11 : -TGTCCCTTCAGGGCTTGGCTCCT-----------TCCAG-----TCA-AGATCTGGACAGT--TCCTCTTGAA-AT-GGCCTAGAGCCC-CACACTTGACAGTTACAACATGCTAAGG----CTGAGTGTTCATGCT--C--------CT-ACT--GT--GAT--GAGGAG-caaatgccaccacacatccctcgcaaacgttgggtgtaaaaagcttgcgcatacctgtcttacatctcctctggtcaagtatgactgccgacgggatgctggaatacttcatcctattcacacggcctcctccactgtctacggctggcccatccagtgcgtatagttccagcagccccatccctgcgcac
gi|12 : ctgggcttttccatagagtgctccgatgtcaatatccatacctccaagtggtggacggatcatcgttcgtcatccaggagtctcaaatgttcattgatggggctcggaattctcttaggacatctccatCTGCACCAACTTTC-TCTCCATAGTGGGTCGGTGCT-AGGGGAAAAT-CTGCCCCACTGTCCAATAACGGTCTCGGGGCGTCCGGGCTCAGTACCACG-T-CCTC-CAACTCCCTATCCA-AATGACTGGGACACTGGATG-ACTG-AGACGGTGGGAACCCGGACAGTCTTCATCAAGGAAACATGG---GCATCATG--TTCTTCC-CTG-GGACATC-CGCATGTCACAGGAACCGTCTCCTCACCtgcatctaggggaaaaga
gi|13 : aggctctcaC-CACACTTGA-AG---TACCATGAC--GG----T------CTC-TGTTTAT--G-----CC--CT-TGTTGGAT--GAG------GGGTGCATCTG--GG--G---AAG-GATCTTTCCTTGCAGTTTTAGTTTTTT---CTC---CAGT--TCCTCAATTAT-CTGAC
gi|14 : cATCCAAAGGT-TTTATTTACAT--AATATATACA-AATA--CACCGGGTTCCACGGGCTACCACGCTCCCTGCCGCT--AGTCTGCTA-TATTGGGTTCTGCCGCGCCATGCGTCAG----ACTAGCTCAGAATCCGCGGGTAAACTG-CTCGTTCTCAGGAAGTCGTA--GG-----------GGGGCTGGATAAGTCGTACCGGGGTA-GACT-CCCCAGATACTAattagtcccttgtatctttctccaatgctgctgttcccatcgagtgctggacccgttccttgactaccaccactacttccttcatgggcttaaatagg
gi|15 : aagtATCCAA--TGATTTATTTACAG--AATATATACATAATA--CACCGGGTTCCACGG-------------------TC--GGACT---A-CCA--CGCTCC-CTGCG---TCT----G----GCTACCTTCAGATTCGCTGGTAAACTC-CTT---CTCCGGAAGTCGTAC-G------------GGGGCTGGATATGTCGTACCGGGGTA-GACT-CCCCAGATACTA
gi|2 : gtCACATGAACTC--TGACCAGCAACATCTCGTCTTGCAATTGGATTATGTACACGTCCTTGGTCCGCTCTGTACCTCCCACGGGAACTCTCACAGGGCCAATAATGGATGCCGTCATCTGGGTATTCTCCCCTGCCTTTACCAGAGTCGCATGTTGCCTAATTTGTGGCTTGGGGTTGAGCTATTCATCAACCTGAATG--GACAATG-TTCTTACCTCTGACCCAGTATCTACAACTGCGTGCAGTTGTATATAATGTACTGCAATATCTACTATAAGTCGGGTGGTTGGGTG--AATATGTTAAATGGGAGCAGCCG---GGTATT
gi|2 : CTTCTGTCT--A-CTAT-TGTT-GC-GTCAACTCTGAT-CTAG-GAAAAT------CACCGGCTGCTTCGTCTATTGCAGGACAATCGCCCTGATCTGCCAAGTCCTCTGGATCGTCCTAGGAATCGCCC--GTTTTTCTGGTTCTCTGTACTA-GGCCC-------------TCAGAAAACATTAATCTACCCGGGACAGATGGCTTATCCTTGGGAGCGGGGACGTACCTGTCC--TCCTCCCATCAAGTACTCATG-TGTCTCA-----CTC-TCCT--TCCTC-GATGCCTCTTGGGAGTGAACCTGAAGTGTGTCATTTCTGGATCAGCGCATGCAATAGGGTGTATGGCTGTGACACTTCC---CTGACTTGTTTTCCCCGATGCATCCAC---------AAGTGTCCCTCACCTCCACCAGTTTA-GGCC------CTT----CA--CTGGTC----AA-----GCTGGCTTCTGTGTTCTCC--T--TGTTTCT--------TG--TCT-CTGTCTGCTCC-A-GC------TCTAGGCacacttctgtctactattgttgcgtcaactctgatctaggaaaatcaccggctgcttcgtctattgcaggacaatcgccctgatctgccaagtcctctggatcgtcctaggaatcgcccgtttttctggttctctgtactaggccctcagaaaacattaatctacccgggacagatggcttatccttgggagcggggacgtacctgtcctcctcccatcaagtactcatgtgtctcactctccttcctcgatgcctcttgggagtgaacctgaagtgtgtcatttctggatcagcgcatgcaatagggtgtatggctgtgacacttccctgacttgttttccccgatgcatccacaagtgtccctcacctccaccagtttaggcccttcactggtcaagctggcttctgtgttctccttgtttcttgtctctgtctgctccagctctaggcgatctctcttaaatgacccggaattcagtacttgaaacatcctaccagtttcctgttgattgtgatgagaaggaatgtttccggggagatggtctcactcctggaatttcttctccaactccccatgtcgcaactccntttccggggagatggtctcactcctggaattccttcttcaactcctcatgtcgcaactctttgttagaatgttcggtctctgctggtgccgcctgccccacatccctcctgggcctggaagacacaatctgccgtgaatgctggtcataatgcatcctgtcctgggtctcacctactctgtcattataggtggccatccagatgcatataattccagcatccccgtttctcggcaccatcacagaacatgtacacctgtatagacagggaagccaggtgacaaaggccaagtacacgttccaccccacattctgagatgctgac
gi|2 : cacatgaactctgaccagcaacatctcgtcttgcaattggattatgtacacgtccttggtccgctctgtacctcccacgggaactctcacagggccaataatggatgccgtcatctgggtattctcccctgcctttaccagagtcgcatgttgcctaatttgtggcttggggttgagctattcatcaacctgaatggacaatgttcttacctctgacccagtatctacaactgcgtgcagttgtatataatgtactgcaatatctactataagtcgggtggttgggtgaatatgttaaatgggagcagccgggtattacaGGTGTATGGCTGTGACACTT----CC--CTGACT-------------TG--------TTTTCCC--CGATGCATCC----AC-AAGTGTCC-CT--CACCTCC-A-----CCAGTTTAGGCCC----TTCACTG-GTCAAGCTG---G----CT-TCTGTGTTC-----TC-C----TTGTTTCTTGTCTCT-G----TCTGC----------------TCCAG-----C------TCTAGGCGAT--CTCT-CTTAA-AT-GACCCGGAATTC-AGTACTTGA-AA---CATCCTACC--AG----T------TTC-CTGT--T--G--------ATT--GT--GAT--GAGAAG-GA-AT-GTTTCCG--GG--G---AGATGGTCTCACTCC-TGG----AATTTCTT---CTC---CAAC--TCCCCAgatctctcttaaatgacccggaattcagtacttgaaacatcctaccagtttcctgttgattgtgatgagaaggaatgtttccggggagatggtctcactcctggaatttcttctccaactccccatgtcgcaactccntttccggggagatggtctcactcctggaattccttcttcaactcctcatgtcgcaactctttgttagaatgttcggtctctgctggtgccgcctgccccacatccctcctgggcctggaagacacaatctgccgtgaatgctggtcataatgcatcctgtcctgggtctcacctactctgtcattataggtggccatccagatgcatataattccagcatccccgtttctcggcaccatcacagaacatgtacacctgtatagacagggaagccaggtgacaaaggccaagtacacgttccaccccacattctgagatgctgac
gi|2 : cacatgaactctgaccagcaacatctcgtcttgcaattggattatgtacacgtccttggtccgctctgtacctcccacgggaactctcacagggccaataatggatgccgtcatctgggtattctcccctgcctttaccagagtcgcatgttgcctaatttgtggcttggggttgagctattcatcaacctgaatggacaatgttcttacctctgacccagtatctacaactgcgtgcagttgtatataatgtactgcaatatctactataagtcgggtggttgggtgaatatgttaaatgggagcagccgggtattacacttctgtctactattgttgcgtcaactctgatctaggaaaatcaccggctgcttcgtctattgcaggacaatcgccctgatctgccaagtcctctggatcgtcctaggaatcgcccgtttttctggttctctgtactaggccctcagaaaacattaatctacccgggacagatggcttatccttgggagcggggacgtacctgtcctcctcccatcaagtactcatgtgtctcactctccttcctcgatgcctcttgggagtgaacctgaagtgtgtcatttctggatcagcgcatgcaatagTTTCCG--GG--G---AGATGGTCTCACTCC-TGG----AATTCCTT---CTT---CAAC--TCCTCAtgtcgcaactccntttccggggagatggtctcactcctggaattccttcttcaactcctcatgtcgcaactctttgttagaatgttcggtctctgctggtgccgcctgccccacatccctcctgggcctggaagacacaatctgccgtgaatgctggtcataatgcatcctgtcctgggtctcacctactctgtcattataggtggccatccagatgcatataattccagcatccccgtttctcggcaccatcacagaacatgtacacctgtatagacagggaagccaggtgacaaaggccaagtacacgttccaccccacattctgagatgctgac
gi|3 : cacatgaactctgaccagcaacatctcgtcttgcaattggattatgtacacgtccttggtccgctctgtacctcccacgggaactctcacagggccaataatggatgccgtcatctgggtattctcccctgcctttaccagagtcgcatgttgcctaatttgtggcttggggttgagctattcatcaacctgaatggacaatgttcttacctctgacccagtatctacaactgcgtgcagttgtatataatgtactgcaatatctactataagtcgggtggttgggtgaatatgttaaatgggagcagccgggtattacacttctgtctactattgttgcgtcaactctgatctaggaaaatcaccggctgcttcgtctattgcaggacaatcgccctgatctgccaagtcctctggatcgtcctaggaatcgcccgtttttctggttctctgtactaggccctcagaaaacattaatctacccgggacagatggcttatccttgggagcggggacgtacctgtcctcctcccatcaagtactcatgtgtctcactctccttcctcgatgcctcttgggagtgaacctgaagtgtgtcatttctggatcagcgcatgcaatagggtgtatggctgtgacacttccctgacttgttttccccgatgcatccacaagtgtccctcacctccaccagtttaggcccttcactggtcaagctggcttctgtgttctccttgtttcttgtctctgtctgctccagctctaggcgatctctcttaaatgacccggaattcagtacttgaaacatcctaccagtttcctgttgattgtgatgagaaggaatgtttccggggagatggtctcactcctggaatttcttctccaactccccatgtcgcaactccnTTTATT-ACTCCAAACATATATA-AACA--T---GAGTTTTACGGACTAC-ACGCATAATGTCATC--GCTTTCCTA-CCATGCGCTCTGCCGTGC----------------TAGTTTAATGTACGCAGGGAATCGC-TTCGTGCTATGGAAGTGGTATTGGTTGCC-ATAC-GGGACTGGACAGATCGTACTGAAATAG--CTTCCCCAGATACTAT-ACCACATTC----ATTTTCTCCA-AAGGAC-AGAACGACACAGT-CC-ATC-TA---CAGGTTGGGGTTG-GCGGAATACGC-CCCTCGAAAGAAACTA--TCTAAAAGCTCCGGAGCATGCTCC-GCCAAAACAA-TCACAGAAAAATT-------------C--CTAACTGGGACGTTCCTGGCATATCCAAATACAGCTAGC-TGTCAG-TAACCACATAGCTGTCTCCAAGTGGGGCCCAGAGTAACTTGATGTCTTGCAG-CCATCTAATTTGGGTCCTCAGTAAGTCATACC-CCA-CAAGGTCTCTCTCCAAGTCCAACTTATCG-CCTTC--GGTCCAACCTGTTT--A----CCCGAGAAGTTCCCGGGAGAAACAGTTCAAAAAACCCTT--------------TAA---------------CCACACCGACTTCC-TCTCCAAAGTTGATTGGTGCGTTGGGGAAAATATT-CCCCACTGTCAAACATAGGCTGTTTGGTATCCGAACTAACTGTCAAG-T-CCTC-AAACTTCCAATCCA-AATGACAGGGACACTGGCTGAACTGCACATCGTGTTAACCCGGACGGTCTTCGTCAA--AAATAT-GTGAGCCTCCAA--AT-TTTCACTG-GGTTGTT-CGAGTGTCAT-GGAACAGTCTCCTTGCCTATCAAAGGAGTCC-CATACTCGAGGTTAAGCCGATCTCTCTATCGCCtgtcgcaactctttgttagaatgttcggtctctgctggtgccgcctgccccacatccctcctgggcctggaagacacaatctgccgtgaatgctggtcataatgcatcctgtcctgggtctcacctactctgtcattataggtggccatccagatgcatataattccagcatccccgtttctcggcaccatcacagaacatgtacacctgtatagacagggaagccaggtgacaaaggccaagtacacgttccaccccacattctgagatgctgac
gi|4 : TTCAT--GTATT-ACTC-CA---AACATA-ACT-AA-A--CATGAGGTTTAACGGACTACCGC----CATAATGTCACGGCTTTCCAACCATGTGCT-------ACTGTTC----GC---GCAAGTTTAATGTACGCAGGGAA--TCGCTTGTGCTATCGAAGT-GTAT--GTTGCCCATAC-GGGACTGGACAGATCGTACTGAAATAG-ATT-CCCCAGATAC----ACCACATTC----ATTTTCTCCACAAGGACCAGAACGACACAGTATC-TAC-AGGTTT-GGTTTGG-TGGTGTAGAATACGC-CCCTAGAAAGAAACTA--TCTAAAAGCTCCGGAGCATGCTCA-GGCAAAACAAATCACAGAAAAATTC--C-------------TAACTGGGACTTTCCTGGCATATCCAAATACAGCTAGGCTGTCAGTGAGCACCATAGCTGTCT-TAAGTGGG-TCCAGAGTAACTTGATGTCTTGCAGCCCATCTTAA--GGTTCCTCAGTAAGTTATA-CTCCA-CAA------------GGT---------------------TCCAAACTGTTTAC------CCGAGAAGTTCCCGGGAGAAACATTCCAAGAC-GCCTT--------------CAAC---------------CACACCGACTTTACTCTCCAAAGTTGATTGGTGCG-TGGGGAAACC-CA-CCCCACTGTCAAACTATGACTGCTTGGTATCCGAGCTAACTGTCAAGTT-CCTC-CAACTCCCGATCCACAATGACTGGGACAC-GGATG-ACTG--CATGGT-GGAACCCGGACGGTCTTCGTCAAAAAAATGT-GA--GCTTCCTACTTT-TTTA-CTG-GGTTTTC-CGAGTGTCAC-GGAACAGTCCCCTTGCCTATTAAAAGAATTCATATACTCGAGGTTTAACCGATCTCTCTATCGCC
gi|5 : AATCCAAGTGGAGACAAGGATGCTGACTTTTGTCCCGGTGTCCACAACCGCCTGAAGTCCCATTCCTTGCACCTCCATCTCTACCACAAGCCGAGGGGTGTGGCGCAAATCTGTCCAATGCT-CCAGCTG---GGTATTCCCGGTGTTCTCCAAAAGAACAACAGGGCATTCCCTTAGCTCTTTCGTCTGTCTGCACCCATCTCCCGGAAATCACCCCT-GTTCTCCTGG---TTCCCCGCACTAGACCCTGAACCT-TCCCAGGACA----CA-TGA-CT--CA--TCCTTGGGAGCG----GGG--TCGTACTTGTCCTCCT-----CCCACCCAATGACCA-AG-------TCCTCAGA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-241 ) : ATCCAA--GTATTTATTCACAC--AATATATACA-AATA--CACCGGGTTCCACGGACTACCACGCTCCCTGCCGTC--GGTCTTCTA-CCATGNGCTCCGCCGCGCCGTNC----G----GCTAGCTTNATATNCGCGGGNAAACTC-CTCGTGCTCCGGAAGTCGTACTGGTTGCC-AT-CGGGGCTGGACAAGTCGTACCGGGGTAGGACT-CCCCAGATACTA-TA----CCACATTCATTTTCTCCA-AAGGAC-GGAGCGACGCGGT-CC-TT-CGA---T-GGTTCGGGTGG-GCGNAATACGCGCCCTCGGAAGAGACT--ATCTGAGAGCGCCGGAGCANGCTCC-GCNAAAACAA-TCNCGGAAANATTC-CCAGAAC--C--CTAACTGGGANNTTCCTGGCANNTCCAAATNCAGCTAGG-TGTCAG-GAGCCCCATAGCTGTCTCNAAGTGGGGNCCAGAGTAACTTGATGTCTCGCAGCC-GTCTNANTTGGGTCCTCAGTAAGTCATA-C-CC-GCAAGGTCTCTCTCCAGGTCCAAC---TC-GCCCTC--GGTCCAANCTGTTTAC----ACCCGAGAAGTTCCCGGGAGAAACAGTTC--AAAA-CGCCTT--------------CAAC---------------CGCACCGACTTC-CTCTCCAAAGTTGGTCGGTGCG-TGGGGAAAAT-CT-CCCCACTGTCNAACAANGGCTNCTTGGCATCCGGGCTAACTGCCAAG-T-CCTC-CAACTCCCNATCCA-AATGACTGGGACACTGGATG-ACTG-ACACGGTGGGAACCCGGACGGTCTTCGTCAAGGAAACAT-G---GCNTCCTG--TT-TTTC-CTG-GGNCGTC-CGAGTGTCACAGGAACNGTCTCCTCGCCTATNAAAAGAGTNC-CATACTCGAGGTTTAGCCGATCTCTCTATCGCCACANGAACCCAATGNCCAGCAACATCTNGTCTCGCAATTGGGCCACGTACANGTCCNNGGNCCGCTCTGTACCTCCCACGNNAACTCTCACAGGGCCAATAATNNATGCCGTCATCCGGGCATTCTCCCCNGCCTNCGCNAGAGTCGCNTGTTGCCTAATNNGCGGCCTGGGGTTGAGCTNCTCGTNAACCCGAGTGGAGACAAGGATGCTGACTTCTGTCCCGGTGTCCACAACCGCNTGNAGTCCTATTCCTTGCACCTCCATCTCTACCACAAGCCGGGTGGTCGGGCG--AATCCGTTCAATGGGAGCAGCCG---GGTATTCCCGGCGTTCTCCNANAGGACAACAGGGCATNCCCTTGGCTCCTTCNTCTGTCTGCA-CTAT-TCCC-GNAGTCAACTCTGGTTCTNGCGG---T------CACTAGACGCTGNGTCT-TCGCAGGACA-TCGCC-TGATCTGC---GCCCTCTGGATCGTCCCGGGAATCGCCCCTGTTCTCCTGGTTCCCCGCACTA-GGCCC-GG-------TCCTCGGAGAAC-CT-AACCT-CCCGGGACACATGGCTCATCCTTGGGAGCGGGGTCGTACCTGTCC--TCCTCCCACCCAGTGACCATG-T-CCTCAGATTCCTCGTCCTCTTCCTC-GGTGCCTCCTGGAACCGAACCTGGAGTGTGTCCTTCCTGGATCGGCGCATGCAAGAGGGCGCATGGCTGTGACNCTTCC---ATGACTTGTTTCCCCCGGCGCATCCAC---------CAGTGTCCCTCACCTCCACCGGTGTA-GGCC------CTT----CA--CTGGCT----AA-----GCTGG-----GTCTCTCCC--C--TGCNTCC----AC-ATGT-TCC-CTG-CAGCTCC-G-GCAGCCGGTNTAGGCCC----TT---TG-GACAAGCTG---G----CT-TCTGGATCC-----TTGC----TGGCTTC-TGTCTCTCC----TCTGCCCCCT-G--------TTCCAG-----CTGCAGATCCGGGCAGT--CTCT-TTNAA-AT-GGCCCGGAACTC-CACACTTGA-AG---CACCCCGCC--GG----C------TTC-TGNTC--G-----CT-ACT-GGT--GATGAGAAG-GNGCGGTTTCCG--GG--G---AGG-GGTCTCGCCCC-CGG----AGTTCCTT---CTC---CAAC--TCCTCAATTCT-CTGACG
gi|1 : ATTCAA--GTATTTATTCACAC--TATATATACA-AATA--CACCGGGTTCCACGGACCACCACGCTCCCTGCCGTC--GGTCTTTTA-TCATGGGCTCCGCCGTGCCGTGT----GTATTGCTAGCTTCATTTCCGCGGGAAAACTC-CTAATGCTCCGGAAGTCGCACTGATTGCC-ATCCGGGGCTAGACAAGTCGTATCGGGGTAAAACT-CCCCAGATACTATTACCCCCCCCCCCCATTTTCTCTA-AAGGAC-TGAGTAAAGGGAT-CC-TTCCAA---T-AGTCCGGGTGG-CCGCAACACGCGCCCTCGGAAGAGACTAGATCTGAGAATGCTAAAGTAAAAT---GCAAAAACAA-TCCGGGAAACATTCACCAGAACCAC--CTGACTGGGAATTTCCTGGCAACTCCAAATCCAGGTGGG-GGCCAA-GGGTCCCTGAGCTGTCTCAAGGTGGGGGCCAGAGTAGCCTGATACCTCGGAGCT-GTCTCACTTGGGTCCTCCATGAACCATG-C-TCGGCAAGGTCTCTCTCCAGGTTCAAC---TCAGCCCTTTGGGACCAATCTATTTACAGAAACCCGGAAAGTTCCCGGGAGACATAGTTC--AAAACCGCCTTGTCCACTGTAGGGCCAACAGATGAGGCTTCTACCGCACCAACTCC-GTCTCCAAAGTTGGTCGGTGCG-TGGGGAAAGT-CC-CCCTACTGTCTAACAAGGACTTTCTGGCATCCGGGCTGAGTACCACG-T-CCTC-CAACTCCCTATCCA-AATGACTGGGACACTGGATG-AGTG-AGACGGTGGGAAACCGGACGGTCTTCATTAAGGAAACAT-G---GTGTCCTG--TT-CTTC-CTGTGGACATCACCA-TGTCACAAGAACTGTCTCCTTGCTCATGGACAGTGTGT-CATACTTCAGGTCTAGCCGGGCTTTCTGGCGGCACAGAAACCCAATGCCCAGCAACATCTGGTCTCGCAA-TGGGCCACGTACAAGTCCAAGGACTGCTCTGTACCTCTCATGCCA--TC-CACA--------AATCCAT----TCATCCGGGCATTCTCCCCAACTTGCGCAAGAGTAATCTGTTGCCTAATGAGCCGTCTGGGGTTGAGCTTCTCGTACACCCGTGTTGACAT---GATGCTGACTTCCGCCCCGGTATCCACAACCGCATGGAATCCTATTCCTTGCACCTCCATCCCTGCCACAAGCTGGGTGGTCGGGCG--AATCCATTCAATGGGAGCAGCCGGGAGGTATTCCCGGCATTCTCCCACAGGACAACAGGGCATGCTCTTGGCTCCTTCCTCTGTCTGCAGCTGT-TCCT-GTA-TCAACTCTGGTTCTGGCAG---T------CACTAGACGCTGGGTC---CGC---AC--TCGCC-T-----------CCCCCTGT-TCCTTCCGGGAATCACCCCTATTCTCCTGGTTCCCCGCACTA-GGCCCTGGCACCATATCCTCGGAGAAC-CTGAACCT-----GGAAACATGGTTCATCCTTTGAAGCGGGGTCGTACCTGTCC--TCCCCCCACCCAGTGACCATG-T-CCTCAGATTCCTTGTCCTCTTCCCCTGGTTCCTCCTGCAACCGAACCTGGAATGTGCCCTTCCAGGATCGGTGCATGCAAAATGGCGCATGGCGGTGACTCTTCC---ATGACTTGTTCCTCCCGGTGCATCCAC---------CAGTGTTCCTCATTTCCACTGGTGTA-CGCC------CTT----CA--CTGGCT----AA-----GCTGG-----GTCTCTCCC--C--TGCCCCC--------TGT-TCC-CTG-CAGCTCCGG-GTAGTNGGTGTACGCCT----TT--------CA--CTG---G----CT-----AA----------GC----TGG------GTCTCTCC----TCTGCCCCCT-G--------TTCC-------CTGCAGCTCCGGGTAGT--CTCT-TTGAACAT-GGTCCGAAAATC-CACACTTAA-AA---CACCCTGCC--AG----C------TTC-TGATT--G-----CT-ACTCGAT--GATGAAAAGAAAAAGGTTTCCG--GGA-G---AGG-GGTCTCGCCCC-CGG----AGTTCCTT---CTC---CAAC--TCCTCAAGTCG-CTGGCG
gi|10 : CTGCCCCTT-GATACCATATTCCC------CTGCAGCTCCGGGCAAT--CTCT-TCCAA-ATTGACCCGGCAATCGCAC-TTTGA-AG---CACCCTGCC--T-----C------TTC-TGGTCCAG-----CTGACT-GGT--GA--AGAAG-GAG--GCTTCTG--AGAAG---AGT-GGTTT-ATCCC-CGG----AGTTCCTTATCCTC---CAACTATCCTCAAGTCGACTGGCG
gi|11 : -TGTCCCTTCAGGGCTTGGCTCCT-----------TCCAG-----TCA-AGATCTGGACAGT--TCCTCTTGAA-AT-GGCCTAGAGCCC-CACACTTGACAGTTACAACATGCTAAGG----CTGAGTGTTCATGCTC--------CT-ACT--GT--GATGAGGAG-caaatgccaccacacatccctcgcaaacgttgggtgtaaaaagcttgcgcatacctgtcttacatctcctctggtcaagtatgactgccgacgggatgctggaatacttcatcctattcacacggcctcctccactgtctacggctggcccatccagtgcgtatagttccagcagccccatccctgcgcac
gi|12 : ctgggcttttccatagagtgctccgatgtcaatatccatacctccaagtggtggacggatcatcgttcgtcatccaggagtctcaaatgttcattgatggggctcggaattctcttaggacatctccatGCTCT--------------CA-C---------------TGCACCAACTTT-CTCTCCATAGTGGGTCGGTGCT-AGGGGAAAAT-CTGCCCCACTGTCCAATAACGGTCTCGGGGCGTCCGGGCTCAGTACCACG-T-CCTC-CAACTCCCTATCCA-AATGACTGGGACACTGGATG-ACTG-AGACGGTGGGAACCCGGACAGTCTTCATCAAGGAAACATGG---GCATCATG--TTCTTCC-CTG-GGACATC-CGCATGTCACAGGAACCGTCTCCTCACCtgcatctaggggaaaaga
gi|13 : agC-CACACTTGA-AG---TACCATGAC--GG----T------CTC-TGTTTATG-----CC--CT-TGTTGGATGAGG-G-GTGCA---TCTG--GG--G---AAG-GATCTTTCCTTGCAGTTTTAGTTTTTT---CTC---CAGT--TCCTCAATTAT-CTGAC
gi|14 : cATCCAAAGGT-TTTATTTACAT--AATATATACA-AATA--CACCGGGTTCCACGGGCTACCACGCTCCCTGCCGCT--AGTCTGCTA-TATTGGGTTCTGCCGCGCCATGCGTCAG----ACTAGCTCAGAATCCGCGGGTAAACTG-CTCGTTCTCAGGAAGTCGTA--GG----------GGGGCTGGATAAGTCGTACCGGGGTA-GACT-CCCCAGATACTA-attagtcccttgtatctttctccaatgctgctgttcccatcgagtgctggacccgttccttgactaccaccactacttccttcatgggcttaaatagg
gi|15 : aagtATCCAA--TGATTTATTTACAG--AATATATACATAATA--CACCGGGTTCCACGG-------------------TC--GGACT---A-CCA--CGCTCC-CTGCG---TCT----G----GCTACCTTCAGATTCGCTGGTAAACTC-CTT---CTCCGGAAGTCGTAC-G-----------GGGGCTGGATATGTCGTACCGGGGTA-GACT-CCCCAGATACTA-
gi|2 : gtCACATGAACTC--TGACCAGCAACATCTCGTCTTGCAATTGGATTATGTACACGTCCTTGGTCCGCTCTGTACCTCCCACGGGAACTCTCACAGGGCCAATAATGGATGCCGTCATCTGGGTATTCTCCCCTGCCTTTACCAGAGTCGCATGTTGCCTAATTTGTGGCTTGGGGTTGAGCTATTCATCAACCTGAATG--GACAATG-TTCTTACCTCTGACCCAGTATCTACAACTGCGTGCAGTTGTATATAATGTACTGCAATATCTACTATAAGTCGGGTGGTTGGGTG--AATATGTTAAATGGGAGCAGCCG---GGTATT
gi|2 : CTTCTGTCT--A-CTAT-TGTT-GC-GTCAACTCTGAT-CTAG-GAAAAT------CACCGGCTGCTTCGTCTATTGCAGGACAATCGCCCTGATCTGCCAAGTCCTCTGGATCGTCCTAGGAATCGCCC--GTTTTTCTGGTTCTCTGTACTA-GGCCC-------------TCAGAAAACATT-AATCTACCCGGGACAGATGGCTTATCCTTGGGAGCGGGGACGTACCTGTCC--TCCTCCCATCAAGTACTCATG-TGTCTCA-----CTC-TCCT--TCCTC-GATGCCTCTTGGGAGTGAACCTGAAGTGTGTCATTTCTGGATCAGCGCATGCAATAGGGTGTATGGCTGTGACACTTCC---CTGACTTGTTTTCCCCGATGCATCCAC---------AAGTGTCCCTCACCTCCACCAGTTTA-GGCC------CTT----CA--CTGGTC----AA-----GCTGGCTTCTGTGTTCTCC--T--TGTTTCT--------TG--TCT-CTGTCTGCTCC-A-GC------TCTAGGCacacttctgtctactattgttgcgtcaactctgatctaggaaaatcaccggctgcttcgtctattgcaggacaatcgccctgatctgccaagtcctctggatcgtcctaggaatcgcccgtttttctggttctctgtactaggccctcagaaaacattaatctacccgggacagatggcttatccttgggagcggggacgtacctgtcctcctcccatcaagtactcatgtgtctcactctccttcctcgatgcctcttgggagtgaacctgaagtgtgtcatttctggatcagcgcatgcaatagggtgtatggctgtgacacttccctgacttgttttccccgatgcatccacaagtgtccctcacctccaccagtttaggcccttcactggtcaagctggcttctgtgttctccttgtttcttgtctctgtctgctccagctctaggcgatctctcttaaatgacccggaattcagtacttgaaacatcctaccagtttcctgttgattgtgatgagaaggaatgtttccggggagatggtctcactcctggaatttcttctccaactccccatgtcgcaactccntttccggggagatggtctcactcctggaattccttcttcaactcctcatgtcgcaactctttgttagaatgttcggtctctgctggtgccgcctgccccacatccctcctgggcctggaagacacaatctgccgtgaatgctggtcataatgcatcctgtcctgggtctcacctactctgtcattataggtggccatccagatgcatataattccagcatccccgtttctcggcaccatcacagaacatgtacacctgtatagacagggaagccaggtgacaaaggccaagtacacgttccaccccacattctgagatgctgac
gi|2 : cacatgaactctgaccagcaacatctcgtcttgcaattggattatgtacacgtccttggtccgctctgtacctcccacgggaactctcacagggccaataatggatgccgtcatctgggtattctcccctgcctttaccagagtcgcatgttgcctaatttgtggcttggggttgagctattcatcaacctgaatggacaatgttcttacctctgacccagtatctacaactgcgtgcagttgtatataatgtactgcaatatctactataagtcgggtggttgggtgaatatgttaaatgggagcagccgggtattacaGGTGTATGGCTGTGACACTT----CC--CTGACT-------------TG--------TTTTCCC--CGATGCATCC----AC-AAGTGTCC-CT--CACCTCC-A-----CCAGTTTAGGCCC----TTCACTG-GTCAAGCTG---G----CT-TCTGTGTTC-----TC-C----TTGTTTCTTGTCTCT-G----TCTGC----------------TCCAG-----C------TCTAGGCGAT--CTCT-CTTAA-AT-GACCCGGAATTC-AGTACTTGA-AA---CATCCTACC--AG----T------TTC-CTGTT--G--------ATT--GT--GATGAGAAG-GAAT-GTTTCCG--GG--G---AGATGGTCTCACTCC-TGG----AATTTCTT---CTC---CAAC--TCCCCAgatctctcttaaatgacccggaattcagtacttgaaacatcctaccagtttcctgttgattgtgatgagaaggaatgtttccggggagatggtctcactcctggaatttcttctccaactccccatgtcgcaactccntttccggggagatggtctcactcctggaattccttcttcaactcctcatgtcgcaactctttgttagaatgttcggtctctgctggtgccgcctgccccacatccctcctgggcctggaagacacaatctgccgtgaatgctggtcataatgcatcctgtcctgggtctcacctactctgtcattataggtggccatccagatgcatataattccagcatccccgtttctcggcaccatcacagaacatgtacacctgtatagacagggaagccaggtgacaaaggccaagtacacgttccaccccacattctgagatgctgac
gi|2 : cacatgaactctgaccagcaacatctcgtcttgcaattggattatgtacacgtccttggtccgctctgtacctcccacgggaactctcacagggccaataatggatgccgtcatctgggtattctcccctgcctttaccagagtcgcatgttgcctaatttgtggcttggggttgagctattcatcaacctgaatggacaatgttcttacctctgacccagtatctacaactgcgtgcagttgtatataatgtactgcaatatctactataagtcgggtggttgggtgaatatgttaaatgggagcagccgggtattacacttctgtctactattgttgcgtcaactctgatctaggaaaatcaccggctgcttcgtctattgcaggacaatcgccctgatctgccaagtcctctggatcgtcctaggaatcgcccgtttttctggttctctgtactaggccctcagaaaacattaatctacccgggacagatggcttatccttgggagcggggacgtacctgtcctcctcccatcaagtactcatgtgtctcactctccttcctcgatgcctcttgggagtgaacctgaagtgtgtcatttctggatcagcgcatgcaatagTTTCCG--GG--G---AGATGGTCTCACTCC-TGG----AATTCCTT---CTT---CAAC--TCCTCAtgtcgcaactccntttccggggagatggtctcactcctggaattccttcttcaactcctcatgtcgcaactctttgttagaatgttcggtctctgctggtgccgcctgccccacatccctcctgggcctggaagacacaatctgccgtgaatgctggtcataatgcatcctgtcctgggtctcacctactctgtcattataggtggccatccagatgcatataattccagcatccccgtttctcggcaccatcacagaacatgtacacctgtatagacagggaagccaggtgacaaaggccaagtacacgttccaccccacattctgagatgctgac
gi|3 : cacatgaactctgaccagcaacatctcgtcttgcaattggattatgtacacgtccttggtccgctctgtacctcccacgggaactctcacagggccaataatggatgccgtcatctgggtattctcccctgcctttaccagagtcgcatgttgcctaatttgtggcttggggttgagctattcatcaacctgaatggacaatgttcttacctctgacccagtatctacaactgcgtgcagttgtatataatgtactgcaatatctactataagtcgggtggttgggtgaatatgttaaatgggagcagccgggtattacacttctgtctactattgttgcgtcaactctgatctaggaaaatcaccggctgcttcgtctattgcaggacaatcgccctgatctgccaagtcctctggatcgtcctaggaatcgcccgtttttctggttctctgtactaggccctcagaaaacattaatctacccgggacagatggcttatccttgggagcggggacgtacctgtcctcctcccatcaagtactcatgtgtctcactctccttcctcgatgcctcttgggagtgaacctgaagtgtgtcatttctggatcagcgcatgcaatagggtgtatggctgtgacacttccctgacttgttttccccgatgcatccacaagtgtccctcacctccaccagtttaggcccttcactggtcaagctggcttctgtgttctccttgtttcttgtctctgtctgctccagctctaggcgatctctcttaaatgacccggaattcagtacttgaaacatcctaccagtttcctgttgattgtgatgagaaggaatgtttccggggagatggtctcactcctggaatttcttctccaactccccatgtcgcaactccnTTTATT-ACTCCAAACATATATA-AACA--T---GAGTTTTACGGACTAC-ACGCATAATGTCATC--GCTTTCCTA-CCATGCGCTCTGCCGTGC----------------TAGTTTAATGTACGCAGGGAATCGC-TTCGTGCTATGGAAGTGGTATTGGTTGCC-ATACGGGACTGGACAGATCGTACTGAAATAG--CTTCCCCAGATACTA-TA----CCACATTCATTTTCTCCA-AAGGAC-AGAACGACACAGT-CC-AT-CTA---CAGGTTGGGGTTG-GCGGAATACGC-CCCTCGAAAGAAACT--ATCTAAAAGCTCCGGAGCATGCTCC-GCCAAAACAA-TCACAGAAAAATTC-C------------TAACTGGGACGTTCCTGGCATATCCAAATACAGCTAGC-TGTCAG-TAACCACATAGCTGTCTCCAAGTGGGGCCCAGAGTAACTTGATGTCTTGCAGCC-ATCTAATTTGGGTCCTCAGTAAGTCATACC-CC-ACAAGGTCTCTCTCCAAGTCCAACTTATC-GCCTTC--GGTCCAACCTGTTT------ACCCGAGAAGTTCCCGGGAGAAACAGTTCAAAAAA-C-CCTT--------------TAAC---------------CACACCGACTTC-CTCTCCAAAGTTGATTGGTGCGTTGGGGAAAATATT-CCCCACTGTCAAACATAGGCTGTTTGGTATCCGAACTAACTGTCAAG-T-CCTC-AAACTTCCAATCCA-AATGACAGGGACACTGGCTGAACTGCACATCGTGTTAACCCGGACGGTCTTCGTCAA--AAATAT-GTGAGCCTCCAA--AT-TTTCACTG-GGTTGTT-CGAGTGTCAT-GGAACAGTCTCCTTGCCTATCAAAGGAGTCC-CATACTCGAGGTTAAGCCGATCTCTCTATCGCCtgtcgcaactctttgttagaatgttcggtctctgctggtgccgcctgccccacatccctcctgggcctggaagacacaatctgccgtgaatgctggtcataatgcatcctgtcctgggtctcacctactctgtcattataggtggccatccagatgcatataattccagcatccccgtttctcggcaccatcacagaacatgtacacctgtatagacagggaagccaggtgacaaaggccaagtacacgttccaccccacattctgagatgctgac
gi|4 : TTCAT--GTATT-ACTC-CA---AACATA-ACT-AA-A--CATGAGGTTTAACGGACTACCGC----CATAATGTCACGGCTTTCCAACCATGTGCT-------ACTGTTC----GC---GCAAGTTTAATGTACGCAGGGAA--TCGCTTGTGCTATCGAAGT-GTAT--GTTGCCCATACGGGACTGGACAGATCGTACTGAAATAG-ATT-CCCCAGATAC----A----CCACATTCATTTTCTCCACAAGGACCAGAACGACACAGTATC-TA-CAGGTTT-GGTTTGG-TGGTGTAGAATACGC-CCCTAGAAAGAAACT--ATCTAAAAGCTCCGGAGCATGCTCA-GGCAAAACAAATCACAGAAAAATTC-C------------TAACTGGGACTTTCCTGGCATATCCAAATACAGCTAGGCTGTCAGTGAGCACCATAGCTGTCT-TAAGTGGG-TCCAGAGTAACTTGATGTCTTGCAGCCCATCTTAA--GGTTCCTCAGTAAGTTATA-CTCC-ACAA------------GGT---------------------TCCAAACTGTTTAC------CCGAGAAGTTCCCGGGAGAAACATTCC--AAGA-CGCCTT--------------CAAC---------------CACACCGACTTTACTCTCCAAAGTTGATTGGTGCG-TGGGGAAACC-CA-CCCCACTGTCAAACTATGACTGCTTGGTATCCGAGCTAACTGTCAAGTT-CCTC-CAACTCCCGATCCACAATGACTGGGACAC-GGATG-ACTG--CATGGT-GGAACCCGGACGGTCTTCGTCAAAAAAATGT-GA--GCTTCCTACTTT-TTTA-CTG-GGTTTTC-CGAGTGTCAC-GGAACAGTCCCCTTGCCTATTAAAAGAATTCATATACTCGAGGTTTAACCGATCTCTCTATCGCC
gi|5 : AATCCAAGTGGAGACAAGGATGCTGACTTTTGTCCCGGTGTCCACAACCGCCTGAAGTCCCATTCCTTGCACCTCCATCTCTACCACAAGCCGAGGGGTGTGGCGCAAATCTGTCCAATGCT-CCAGCTG---GGTATTCCCGGTGTTCTCCAAAAGAACAACAGGGCATTCCCTTAGCTCTTTCGTCTGTCTGCACCCATCTCCCGGAAATCACCCCT-GTTCTCCTGG---TTCCCCGCACTAGACCCTGAACCT-TCCCAGGACA----CA-TGA-CT-C---ATCCTTGGGAGCG----GGG--TCGTACTTGTCCTCCT-----CCCACCCAATGACCA-AG-------TCCTCAGA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-241 ) : ATCCAA--GTATTTATTCACAC--AATATATACA-AATA--CACCGGGTTCCACGGACTACCACGCTCCCTGCCGTC--GGTCTTCTA-CCATGNGCT-CCGC-CG---CG-------TCTG----GCTAGCTTNATATNCGCGGGNAAACTC-CTCGTGCTCCGGAAGT------------CGTAC-G----------GGGGCTGGACAAGTCGTACCGGGGT-AGACTCCCCAGATACTA-TA----CCACATTCATTTTCTCCA-AAGGAC-GGAGCGACGCGGT-CC-TT-CGA---T-GGTTCGGGTGG-GCGNAATACGCGCCCTCGGAAGAGACT--ATCTGAGAGCGCCGGAGCANGCTCC-GCNAAAACAA-TCNCGGAAANATTC-CCAGAAC--C--CTAACTGGGANNTTCCTGGCANNTCCAAATNCAGCTAGG-TGTCAG-GAGCCCCATAGCTGTCTCNAAGTGGGGNCCAGAGTAACTTGATGTCTCGCAGCC-GTCTNANTTGGGTCCTCAGTAAGTCATA-C-CC-GCAAGGTCTCTCTCCAGGTCCAAC---TC-GCCCTC--GGTCCAANCTGTTTAC----ACCCGAGAAGTTCCCGGGAGAAACAGTTC--AAAA-CGCCTT--------------CAAC---------------CGCACCGACTTC-CTCTCCAAAGTTGGTCGGTGCG-TGGGGAAAAT-CT-CCCCACTGTCNAACAANGGCTNCTTGGCATCCGGGCTAACTGCCAAG-T-CCTC-CAACTCCCNATCCA-AATGACTGGGACACTGGATG-ACTG-ACACGGTGGGAACCCGGACGGTCTTCGTCAAGGAAACAT-G---GCNTCCTG--TT-TTTC-CTG-GGNCGTC-CGAGTGTCACAGGAACNGTCTCCTCGCCTATNAAAAGAGTNC-CATACTCGAGGTTTAGCCGATCTCTCTATCGCCACANGAACCCAATGNCCAGCAACATCTNGTCTCGCAATTGGGCCACGTACANGTCCNNGGNCCGCTCTGTACCTCCCACGNNAACTCTCACAGGGCCAATAATNNATGCCGTCATCCGGGCATTCTCCCCNGCCTNCGCNAGAGTCGCNTGTTGCCTAATNNGCGGCCTGGGGTTGAGCTNCTCGTNAACCCGAGTGGAGACAAGGATGCTGACTTCTGTCCCGGTGTCCACAACCGCNTGNAGTCCTATTCCTTGCACCTCCATCTCTACCACAAGCCGGGTGGTCGGGCG--AATCCGTTCAATGGGAGCAGCCG---GGTATTCCCGGCGTTCTCCNANAGGACAACAGGGCATNCCCTTGGCTCCTTCNTCTGTCTGCA-CTAT-TCCC-GNAGTCAACTCTGGTTCTNGCGG---T------CACTAGACGCTGNGTCT-TCGCAGGACA-TCGCC-TGATCTGC---GCCCTCTGGATCGTCCCGGGAATCGCCCCTGTTCTCCTGGTTCCCCGCACTA-GGCCC-GG-------TCCTCGGAGAAC-CT-AACCT-CCCGGGACACATGGCTCATCCTTGGGAGCGGGGTCGTACCTGTCC--TCCTCCCACCCAGTGACCATG-T-CCTCAGATTCCTCGTCCTCTTCCTC-GGTGCCTCCTGGAACCGAACCTGGAGTGTGTCCTTCCTGGATCGGCGCATGCAAGAGGGCGCATGGCTGTGACNCTTCC---ATGACTTGTTTCCCCCGGCGCATCCAC---------CAGTGTCCCTCACCTCCACCGGTGTA-GGCC------CTT----CA--CTGGCT----AA-----GCTGG-GTCT---CTCCC--C--TGCNTCC----C---TG--TCC-------CTG-CAGCTCC-AG-----CGGTNTAGGCCCTT---TGG-CAAGCTGG----CT-TCTGGATCC-----TTGC----TGGCTTC-TGTCTCTCCTCTGCCCCCT--TTCCAGTC-----G-AGATCCGGGCAGT--CTCT-TTNAA-A-TGGCCCGGAACTC-CACACTTGA-AG---CACCCCGCC--GG----C------TTC-TGNTC--G-----CT-ACT--GT--GATG-------AGAAGG--TGCATTCCG--GG--GAG-G-GGTCTCGCCCC-CGG----AGTTCCTT---CTC---CAAC--TCCTCAATTCT-CTGACG
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gi|9 : aagtCTAACTGGGAAA-TTCCTGGCAACTCCGAATCCA-AGTG---GAGACAA-GGATG--CTG-ACagtggagacaaggatgctgacttttgtcccggtgtccacaaccgcctg
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): CCTCCTCCACCGTTTTAGACTGGCCATCCAGTGCCTATAGTCAAGCATCCCCTTCCCCGGCATCATGGGACAGCATACTGGCGCAGACGTGAAAGCTCGGTGGTTAGAGTAAGCACCCAGTCTGCCCACTGTCTCAGTGACTCGCCCACATTCTGGGATGCTG
Unaligned ( gi|17 ): CAGTCCAGGAATGTAATGCGCATACATGTCAGGCACAGATAGGAAAACATGTATCAACCACCTATTAGTTCAGCAATTCTCCCAGATTTGGAGAAGCTGACTG