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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTCTTGGACACATG-AC--TTGAT-TGTT-CT--TCTTTGGACAGT-ATGAACTGGACTTTGGGTTGGAT---TCCA-GTCGATTCCATG----ACTA---TGTTTCAT-G---ACACATA-T---TT-CTGTTAAAGAACACTC-TTGTGTATGTAG-TTTGC-CATG-------GACACAT--AT-----TTTCTG-TTAAA-GACA--CGTC-TGT-TA-TGTA--GT-T-TT-GC-AT-GTGCTGCCTTTGGGTAGA-AGT-G-ATA-T---TTT---A------C-ATG-----A-AATTAATCAT---C--TATA-AGCAC-TCGTCTT--A-----T--GCTA-CCC-----T---C---TG--CA-TG-CAT-GTTATATA--CTA-CAGACAGAAGT-TCA--GTTT-----T----TTCA-GATTTC---ATCACTTT--G--AT-------GTT-T-AAA-TGTATC------TCTATACA-TTA--GTA-TCTGA-TTAT-TCTAACA--TGA-G-CAGACGGT---GGA-TCTC-TA------GT--TTTGTA-TCCATTTAGCA-CA-GACTCT--TGCT--T--CCTCTTG---TGACTG--GTA-TCA--GAC-----TAT-TACAAGATAT---T----ATATAAT--AT-GTATG---TA-TGCTAC-A----CCTC--ATA-CAGA--TGTG--ATTGT----TTGATTA---TAGGTGTG-----T-C-TGATATGGCA--AC--TGTTATAATCTGACACGACAACAA-CTTAA-----T--GTTTCA-----------AATTTATTACAAACTGT---TT-CACATA-GACATGT--ATATTTTCTC-TTA--AA--G--------C-----TGTGTTATGTAGTAT--CTGTATA-GC--GCTTTGCGGGTTAGAAGTTGGATATTT--T-T--A-CA---A----------CGT----------TCCTA-TAG-A-C--GTCT---TCTTGCTA--CCCCA---CAGCAT--TC-ATG-T-ATAATCT-----A-CAGAC---ACAA-TCTT-G------TGTTTTCAT--AGT---T-----C-A--ACT--T---TAT-TACAAA---AAGTTT-ACAGCA-GTG-C---ATGT--ATCT-----TTC--GTTTAAGACACAATATT---GTAGGCTA----GGTT-TTGTATATG--------------C--GCTTTGGGTAGA-AGTGGG-A-TTATTT--TAC-AT--------A--AT-----AATTTTG--TC-C-TATCAGCACCGCTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTG-----ATCAT--TTA--TAATCTA-CAGAC--CATTAATCTCATTACT--AA----TTTTAAA-GCT-TATAAC--CA--T-C-TA-G-AAAAAAAC--TTAT--ATT-----TAT-C------TCTATAC-ATT-ATATA-TCTG----T--A-T--G-TACAGG------AGG-A---GAAGT------GGA-C-------T----GT------T-TC-GT-GTCC-TT--AGCAT--TGACTCCTATACTG-CC---CTTGTTGG---G--TGT-ATCA--GACA-------ATATATTG--TGCAATC--TA--GGA----------TAAC--GATACCTACCACTGACTAGCCACAGTGT-ATTAATTAACTTG---TGTATT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                         tgtttgatatatgtgtgtctgttatgcaacattgttttaatctacagacacaatcttaatgtttcatagtttcaatttattacaaactgtttcacatatacatgtattttctcttaaagactgtgtatgtagtatgtatatgctgctttggggtagaaagtggatattttacaatcgtcctatagcaccgtctcttgctaccctcagcatctatgttataatctacaacacagtcttgtgtttcatagtttatcaatttattacaaactG-TTTGCACATA-------TA-ACAT--GTCAATTTTTCTC-TTAAAAGAC-----TG-TGT-AA-TG-A--GTGTATT-GT-AT-ATGCTGGCTTTGGGTAGA-AGTGG-ATATT---TTT---A------A-ATA-----A-A--TAATTGT---CCTTAT--AGCAC--CGTCTC--------T--GCTA-CCC-----T---C---TG--CA-TT-CAT-GT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gatattttA-TATT--GT-T-T-----AT-GT-TTGTTTTTG--TAGA-AGT-GTATA-T---TTC---A------CCACT-----G-GACTGATCCTGTAC--TATA--GCAC-GTGTCTC--T-----T--GCTA-CCT-----A---CACATG--TACTG-TATCATTATA-A--TTA-CAAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCTGC-TTTGGGTAGA-AGT-GGATA-T---TTT---A------C-ATGTACATA-AAATAATTGT---C--T-TATAGCAC--CGTCT---AGAGCTT--GCTA-CCC-----T---C---TG--CA-T--CAT-G-TAT-TA--CTA-C
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aatcgaatatattgctatatcttctcggagGCAC--CATCTC--T-----T--GCTA-CCC-----T---T---TG--CA-T--CAT-GTTATAAT--CTA-CAGACACAA----CA--ATCT-----TGTTACTAA-AGTTTC---ACCATATTAGA--AA-------ATT-T-ATA-TTTATCCCAGAGTCTATACA-TTAT-GTA-TCTGT-TTA------------GA--------AGT---GGA--CT----------GT--TTTGTG-TCC-TTTAGCA-TC-GACTCC--TACT--G--CC-CTTGT--TGAT----GTA-TCA--GAC-----tactactactactaattata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TT-C-ATA-TTTATC------TCTTTACA-TCAT-GTA-TCTGT-TTAT-TGT-ACA--TGA-GACAGAagatat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttcacagatacatgtattttctgtaaacaaaatgtaggtagttttgtatgctgttttgggtagaagtggatattttacataacataattgtcctatagcaccgtctcttaagtttaaccatataatagaaaaaTA-TCTGT-TTAT-TGTA-CA--TGA-GGCAGA-AGT---GGA----C-T-------GT--TTCGTG-TCC-TTTAGCA-TT-GACTCCTATACT--G--CCCCTTG---T---TGGTGTA-TCA--GACATATATAT-TGCAAa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A-TCTGA-TTAT-TCT-ACA--CGAGG-CAGA-AGT---GGG-CCTC-TAATT---GT--TTTGTA-TCC-TTTAtcacaggggataacaatactaccactgactagtcacagtgtattaattaacttgtgtattgtctgtatttgtattaacgattatatatgttacatgtttatgcccatttgggccctgatttggtaaataaatactact
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGT----TTGAT-A---TATGTGTG-----T-C-TGTTATG-CA--ACATTGTTTTAATCT-ACA-GACA-CAATCTTAA-----T--GTTTCATAGTTTC----AATTTATTACAAACTGT---TT-CACATA-TACATG----TATTTTCTC-TTA--AA--GA-------C-----TGTG-TATGTAGTAT--GTATATG-CT--GCTTTG-GGG-TAGAAAGTGGATA-TT--T-T--A-CA---AT---------CG-----------TCCTA-TAGCACC--GTC----TCTTGCTA--CCCT----CAGCAT--CT-ATGTT-ATAATCT-----A-CA-AC---ACAG-TCTT-G------TG-TTTCAT--AGTTTAT-----C-A--A-T--T---TAT-TACAAA---CTGTTTCACAG---ATG-C---ATGT--A--T-----TTC--TGTTAAGACAC-ATA-----GTAG--TA----GTTT-TTGTATATA--------------T--GCTTTGGGTAGA-AGTGGA----TATTT--TAC-AT--------A--A------AATAATG--TC-C-TAT-AGCACCG-TCT----CTT------GCTA--CC-----T---CTGC----ATCATG-TTA--TAATCTA-CAGACA-CATTAATCTTATTACT--AA-----------------ATAAC--CATGT-CATA-G--AAAAAAC--TTAT--ATT-----TAT-C------TCTATAC-ATTAATATA-TCTGTTCAT--G-T--G-TACATG------AGGCA---GA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATGA-CTTGG-----TTGGTTTCC-----------A--TCATTCCA---TGTATATT-TTCAT--GACAC----ATATTTTCTG-TTA--AA--G--------CAGTCTTGTGT-ATGTAGTTTTGCTGT----GCT-GCTTTG--GGT--GAAGT-GGATATTTATT-T--AATA---AATCATGAAATCAT----------CTCTACTAG-C-CCTGTCT----CTTGCTA--CCCT----CTGCAT---C-ATG-TTATAATCT-----A-CAGAC---AGAAGTGTTAG------T-TTTTCA---ATT---T-----C-ATCACT--T---CAT-CAC--------TTTT-A-------TG-TTTAAAGT--ATCT-----CT----------ATACATTA-T---GTA-TCT-----GATTATTCTACATG----------------------AGGCAGA-AGTGG------ATCT--C-----------------T-----AGTTTTGTATC-C-T-TTAGCACCGA-CT----CTT------GCTT-CCC-----TTG-TTG-----AT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atattaccttcagtaagcatatgtcaacacaagtatttaatatgtactcttggacaatggacttgattgttctctttggacagtatgTATAATTTGT---TT-CA--TG-GACACAT--ATATTTTCTG-TTA--AA--GACAACTCCT-----TGTG-TATGTAGTgttcagacatatacgagatatttataatataatttgtatgtatgtacaccttcaatacaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctagcctaattatgacaccttctcgagagtaagctatatgttcaacaatcaagtacttaatatgtttactctttggaatatggaccattgatctgtttctcatcattggacagtcatgaatggacttggttggtctatccattcattccatgTGT---TT-CACA---GACAC----ATATTTTCTG-TTC--AA--GACACTC--T-----TGTGT-ATGTAGT-T--TTGCATGTGCT-GCTTTG--GGT-AGAAGT-GGATATTT--TAC--A-TA---A----------AATAATTG-----TCCTA-TAGCA-CT-GTCT----CTTGCTA--CCCT----CTGCAG---C-ATG-TTATAATCT-----A-CAGAC---tgctggacacatattttctggttaaagacaaacgcttgtgtatgtaaagtttgcatgtgctgctttgggtagaatggatattctttaacatgaaataatcatcctagtagctgtcttatgctaacctctgcagcatttataatctagcagacaaagtttcagtttttcaatttctgtctttgatgttttaaatgtaattctatacaattatgtatctgattattcgtacatgagcagaagtttcgggatcttatagttttgtatcctttagcaaacgactttgcttcccctcttgttgatgtatcagaacatatacgagatatttatatataattaatggtatatgtacaactgcttaatatcaggattgtgaatgtttgatatatgtgtgtcctgattgaacagtttaatctc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tctttggacagtgtgaatggacaaggttggtttccatgtatatgtttttccaT---TT-CACAGA-TACATG----TATTTTCTG-TAAACAA--A--------A-----TG---TAGGTAGT-T--TTGTATG-CT--GTTTTG-GG--TAGAAG-TGGATATTT--TAC--A-TA---A----------CATAATTG-----TCCTA-TAGCACC--GTC----TCTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TG-GACAC----ATATTTTCTGGTTA--AA--GACAAACGCT-----TGTGT-ATGTAAAGT--TTGCATGTGCT-GCTTTG--GGT-AGAA--TGGATATTC--T-T----TA---A----------CATGAAATAATCATCCTAGTAG-C-T--GTCT---TAT-GCTAACCTCTG---CAGCAT--T------T-ATAATCT-----AGCAGAC---AAAG-TTTCAG------T-TTTTCA---ATT---T-----CTG--TCT--TTGATGT-TTTAAATGTAATTCT-ATA-CA-AT--T---ATGT--ATCTGATTATTC--GTaagtttaaccatataatagaaaaattcatatttatctctttacatcatgtatctgtttattgtacatgagacagaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctagcctaattatgacaccttctcgagagtaagctatatgttcaacaatcaagtacttaatatgtttactctttggaatatggaccattgatctgtttctcatcattggacagtcatgaatggacttggttggtctatccattcattccatgtataatttgtttcatggacacatatattttctgttaaagacaactccttgtgtatgtagttgc--GCTTTG--GGT-AGAAGT-GGATATTT--T----A-CATGTA----------CATAAAATAATTGTCTTA-TAGCA-CC-GTCTAGAGCTTGCTA--CCCT----CTGCA---TC-ATG-T-ATTA-CT-----A-Cacatgagcagaagtttcgggatcttatagttttgtatcctttagcaaacgactttgcttcccctcttgttgatgtatcagaacatatacgagatatttatatataattaatggtatatgtacaactgcttaatatcaggattgtgaatgtttgatatatgtgtgtcctgattgaacagtttaatctc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatcgaatatattgctatatcttctcggaggct---TCTTGCTA--CCCTT---T-GCAT---C-ATG-TTATAATCT-----A-CAGACACAACAA-TCT---------TGTTACTAA--AGT---T-----T-C--ACC--A---TAT-TAGAAA---A--TTT-ATAtactactactactaattata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcaccatcCTTTCTA--CCCCAAAGCAGCAT-----ATA-C-ATA--CT-----A-CATAC---ACAG-TCTT-tttatcccagagtctatacattatgtatctgtttagaagtggactgttttgtgtcctttagcatcgactcctactgcccttgttgatgtatcagacagatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtttgatatatgtgtgtctgttatgcaacattgttttaatctacagacacaatcttaatgtttcatagtttcaatttattacaaactgtttcacatatacatgtattttctcttaGCATCATC-GT--T-ATAATCT-----A-AAAGC---ACAA-TCTT-AATTAATTGTTC-CATGGAGTCCAT-----C-A--ATT--T---AAT---CAAA---CTGTTT-GCA-CATATAAC---ATGTCAATTT-----TTC--TCTTAAAAGACTGTGTA---ATGAGT-------GTA-TTGTATATG--------------CTGGCTTTGGGTAGA-AGT-GG-A-TATTTT--TAA-ATA-------A--AT-----AA--TTG--TC-CTTAT-AGCACCG-TCT----C-T------GCTA-CCC-----T---CTG-------CAT--TCA--Ttggatattttacaatcgtcctatagcaccgtctcttgctaccctcagcatctatgttataatctacaacacagtcttgtgtttcatagtttatcaatttattacaaactgtttcacagatgcatgtatttctgttaagacacatagtagtagtttttgtatatatgctttgggtagaagtggatattttacataaaataatgtcctatagcaccgtctcttgctacctctgcatcatgttataatctacagacacattaatcttattactaaataaccatgtcatagaaaaaacttatatttatctctatacattaatatatctgttcatgtgtacatgaggcaga
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctagcctaattatgacaccttctcgagagtaagctatatgttcaacaatcaagtacttaatatgtttactctttggaatatggaccattgatctgtttctcatcattggacagtcatgaatggacttggttggtctatccattGTTT-CCATCA-TTC-C---ATGT--ATAT-----T-----TTCATGACAC-ATATT---TTCTGTTAAAGCAGTC-TTGTGTATGTAGTTTTGCTGTGCT--GCTTTGGGT-GA-AGTGGATATTTATTTAATAA-AT--------C--AT-----GAAATCA--TCTC-TACTAGCCCTG-TCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----ATCATG-TTA--TAATCTA-CAGA---CAGAAGT---GTTAGT--------TTTTCAA-TTT-CATCACTTCA--T-C------------ACTTTTAT--GTTTAAAGTAT-C------TCTATAC-ATT-ATGTA-TCTGAT--T--ATT--C-TACATG------AGGCA---GAAGT------GGATC-------TCTA-GT------T-TT-GT-ATCCTTT--AGCAC--CGACTCT--TGCTT-CC---CTTGTT-G---A--TGT--TCA--GAC--------ATATAcgagatatttatatataattaatggtatatgtacaactgcttaatatcaggattgtgaatgtttgatatatgtgtgtcctgattgaacagtttaatctc
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tctttggacagtgtgaatggacaaggttggtttccatgtatatgtttttccatgtTTC-ACAG---ATA-C---ATGT--ATTT-----TCT--GT---AAACAAAAT------GTAGG-TA----G-TT-TTGTAT--G--------------CT-GTTTTGGGTAGA-AGTGGA----TATTT--TAC-AT--------AACAT-----AA--TTG--TC-C-TAT-AGCACCG-TCT----CTT------
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agatttgccat--GCTTTGGGTAGA-AGTGGA----TATTT--TAC-ATGTACATAAA--AT-----AA--TTG--TC-T-TAT-AGCACCG-TCTAGAGCTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----ATCAT--GTA--T----TA-C-TAC--TACTA--CT-ACTACT--AA----TTATAatggcttattggtacatgaccttcatagtgcgtggtattatgatattgttaacgtagatatgatatatcttgatatgcatcatcgttataatctaaaagcacaatcttaattaattgttccatggagtccatcaatttaatcaaactgtttgcacatataacatgtcaatttttctcttaaaagactgtgtaatgagtgtattgtatatgctggctttgggtagaagtggatatttttaaataaataattgtccttatagcaccgtctctgctaccctctgcattcatgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatcgaatatattgctatatcttctcggaggctAGA-AGTAGA----CATTT--CAC-A---------A--ATTACTAAATTTTG--TC-C-CAT-AGCACCA-TCT----CTT------G
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTA-CTGACATC-TTAATCTTATTACTTAAG----TTTTAAACGC-----AAT---G--T-CATA-G-AGAAAAAC--TTAT--ATT-----TGTCC------TCTATAC-ATT-AT-TA-TCTA----T--G-T--T-TATTGT------AGC-A---AAAGC----------C-------T----ATCCTTACT-TC-GT-GT--------GCAT--TTACT--TA-ACTG-
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7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): ATTTCTTCATTGGCTATTGAATATATTATATATGTTGACATGTTATGCCATTTGGGCCATGATTTTAAGTAAATAAGATACTACTAG
Unaligned ( gi|20 ): GAAGTAGACATTTCACAAATTACTAAATTATGTCCCATAGCACCATCTCTTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTATTATTGGACACCTTCAGTTAAGCATAGTTCAACACAGTATTTAATATT
Unaligned ( gi|22 ): TTACATGTTTATATAAATGCCCATTTGGGCCCTGTTTTGGTAAATAA
Unaligned ( gi|23 ): CATGTTTATGCCCATTTGGGCCCTGCTTTGATAAATAAATACT
Unaligned ( gi|24 ): ATTTGGGTCCTGCTTTGGTAAATAAATACTACTACAT






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Reference ( family-2365 )     : CTCCTTGGACATATGGACCATTGATCTGTTTCT--TCTTTGGACAGT-ATGAA-TGGACTT--GGTTGGTTT--CCANTC-ATTCCATGTNT----A---TGTTTCAC-G---ACACGTATTTTCTGTTAAAGA-CA-CTC-TTGTGTATGT------A-GTTTGCCACGGACACATATTTTCTG-TTAAAGACA--CGT-TTGTGTATGTA--GTTTTGC-AT-GTGCTGCCTTTGGGTAGA-AGTGGATATTT------T---A---CA-TG------AAA-TAAT-C--GT-C-T--A-T-AGCA-C-CGTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GTTA--TAANCTA-CAGACANA-A-T-TT-A--GTTTTTTCA-ATTTC-------TATCACTTTNATG-TT-TANA-TNTATC---TCTATAC-ATTATGTA-TCTG-NTTATTC-T-ACA--CGAGGCA-GA-AGT----GGA-TCTC-TA------GT--TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-CNCGACTCTTGCT--T--CCTCTT-GT-TGATTGGTATCA--G-ACATATTACGAGATAT---T----ATATAA-T-TGTAT--G---TATG-T-AC----GC--TTNATA-CAGGATCGTGGTANTGT----TTGATT-------ATATG-TGTGT-C-TGATAT-GCA--AC--CGTT-T-AATCTAANAGNACAACGACTTAA-----TGTTTCATGG------T--CAATTTATTACAAACTGTTT-CACATA-GACA---CG-ATATTTTCTGTTAAAGACACTGTGTTATGTAGTGT-TTGTATGTGCT-GCTTTG-GGGTTAGAAGTTGGATATTTTT--ATAA-CGTAAT----CCTATAGCACCGTCTTCTTGCTACCCT-CNGCATTCATGT-ATAATCTACAGACACAGTCTTGTGTTTTCATAGTT---CAACTTTATTAC--AAA--GTTT-ACAGCA-TACACGTATTTTTCGTTCAAGACACAATATTGTANGTTAGGTTTTGT-ATATGCTGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTTA-CA---T--------A--A--T-----AA--TT-C-GTCCTAT-AGCAC-CG-TCT----CTTGCTACCC-----T---CTGCATCATGTTATAATCTACA-GACACANTAATCTTAT--TAC-TAATTTTCAAGTTTAT-A-CC--GT-C-TAG-AGAAAAACTTATATTTAT-C------TCTATACATT-ATGTATCTGAT--TA-TN-TACATGAGGCAGAAGTGGACTGT------TTCGTGTCCTTTTAGCATCGACTCCTATGCTGCCC-TTG-TT-GGTGT-ATCAGACA-ATATATTGTGCAATCA-TAGG--A----------TAAC--GATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTG---TGTATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                       GT-TTGTTAATATT--GTTT----AT-GT-TTGTTTTTTGGTAGA-AGTGTATATTT------C---AC--CACTG------GAC-TGAT-CCTGTAC-T--A-T-AGCA-CGTGTCT----CTT------GCTA-CCTACACATGTACTGT----AT-CAT-ATTA--TAAT-TA-CAAActtaactg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatattttTTGT-TTATGTTTGTTTT-TGT------AGAAGTGTA--TATTTCACCA---CTGG-----A--C--T-----GA--TC-CTGTACTAT-AGCACGTG-TCT----CTTGCTACCTACACATGTACTGTATCA--TTATAAT-TACA-AA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aataTTTGTTATGTACTGTGTTGTGATTGCATAAGAAGTAGA--CATTTCA-CAAATT--------A--C--T-----AAATTT-T-GTCCCAT-AGCAC-CA-TCT----CTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-TCTG-ATTATTC-T-ACA--CGAGGCA-GA-AGT----GGG-CCTC-TAATT---GT--TTTGTA-TCC-TTT-Aaaacca
gi|2                          : CTCTTTGGA-ATATGGACCATTGATCTGTTTCTCATCATTGGACAGTCATGAA-TGGACTT--GGTTGGTCTATCCATTC-ATTCCATGTAT----AATTTGTTTCAT-GGACACATATATTTTCTGTTAAAGA-CAACTCCTTGTGTATGT------A-GTT-GCT--GGACACATATTTTCTGGTTAAAGACAAACGC-TTGTGTATGTAAAGTTT-GC-AT-GTGCTGC-TTTGGGTAGA-A-TGGATATTC------TTTAA---CA-TG------AAA-TAAT-C--AT-C-C----T-AGTAGC-TGTCT----TAT------GCTA-ACC-----T---CTGC----AG-CAT--TTA--TAATCTAGCAGACAAA-G-T-TTCA--G-TTTTTCA-ATTTC-------TGT--CTTTGATGTTT-TAAA-TGTAAT---TCTATACAATTATGTA-TCTG-ATTATTCGT-ACA--TGA-GCA-GA-AGTTTCGGGA-TCTTATA------GT--TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-AACGACT-TTGCT--TCCCCTCTT-GT-TGAT--GTATCA--GAACATA-TACGAGATATTTAT----ATATAA-T-TA-AT--GGTATATG-T-ACAACTGC--TTAATATCAGGATTGTG--AATGT----TTGA-T-------ATATG-TGTGTCC-TGAT-T-G-A--AC--AGTT-T-AATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctagcctaattatgacaccttctcgagagtaagctatatgttcaacaatcaagtacttaatatgtttaGAAGTAGA--CATTTCA-CA------------A--A--TTACTAAA--TTAT-GTCCCAT-AGCAC-CA-TCT----CTTGc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                    A--GATTTGCCATTGTGCTGGCTTTGGGTAGACAGTGGATG------------------------------A-TAATTC--AT-C-CTAA-T-AGCG-T--GTCT----CTTTAATTGGCTAGCCC-----T---CTGTGCATAT-CATTGTTAGTTAATCTA-CAGACAAATA-T-AT-AAAGTTTTTTCA-ATTTC-------TATCACTTTTATG-TTATAAATTGTATCCGATATATGC-ATTATGTATTCTGAGTTATTC-T-ACAGGCGAGGCAGGA-GGT----GGAGTCTC-TAAGGATTGTTATCTGTAGTCC-TTTAAGCACCACGACTCTTGCTGGT--CATCTTGGTATGATT-GTATCAGGG-ACATATTAATATATAT---T----GTATGG-C-T-TATTGG---TACA-TGAC-----C--TTCATA----GTGCGTGGTATTATGATATTG-TTAACGTAGATATGATATAT-CTTGATAT-GCATCAT--CGTTAT-AATCTAAAAGCACAAT--CTTAATTAATTGTTCCATGGAGTCCAT--CAATTTAAT-CAAACTGTTTGCACATATAACATGTCA-AT-TTTTCTCTTAAA-AGACTGTGTAATG-AGTGTATTGTATATGCTGGCTTTG-GG--TAGAAG-TGGATATTTTTAAATAA--ATAATTGTCCTTATAGCACCGTCT--CTGCTACCCT-CTGCATTCATGT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGT----TTGAT--------ATATG-TGTGT-C-TGTTAT-GCA--ACATTGTT-TTAATCTACAGACACAAT--CTTAA-----TGTTTCATAG------TTTCAATTTATTACAAACTGTTT-CACATA-TACA---TG--TATTTTCTCTTAAAGAC--TGTGT-ATGTAGTAT---GTATATGCT-GCTTTG-GGGT-AGAAAGTGGATATTTT---ACAATCGT-------CCTATAGCACCGTCT-CTTGCTACCCT-CAGCATCTATGTTATAATCTACA-ACACAGTCTTGTGTTT-CATAGTTTATCAA-TTTATTAC--AAACTGTTTCACAG-A-TGCATGTATTTCT-GTT-AAGACACA-TA--GTAG--TAGTTTTTGT-ATATA-TGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTTA-CA---T--------A--AAAT-----AA--T----GTCCTAT-AGCAC-CG-TCT----CTTGCTACC------T---CTGCATCATGTTATAATCTACA-GACACATTAATCTTAT--TAC-TAA-----------AT-AACCATGT-CATAG-A-AAAAACTTATATTTAT-C------TCTATACATTAATATATCTGTTCATG-TG-TACATGAGGCAGA
gi|5                          :    CTTGGACA-ATGGAC--TTGAT-TGTTC----TCTTTGGACAGT-ATGAA-TG-ACTT--GGTTGGTTT--CCA-TC-ATTCCATGTAT----A---T-TTTCAT-G---ACACATATTTTCTGTTAAAG--CA-GTC-TTGTGTATGT------A-GTTT
gi|5                          :                                                                                                  atattaccttcagtaagcatatgtcaacacaagtatttaatatgtactTGTATAT---------TTT--CATG-ACACATATTTTCTG-TTAAAG-CA---GTCTTGTGTATGTA--GTTTTGC--T-GTGCTGC-TTTGGGT-GA-AGTGGATATTTATTTAAT---AAATCA-TG------AAA-TCAT-C---T-C-T--ACT-AGCC-C-TGTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACAGA-AGTGTT-A--GTTTTT-CA-ATTTCATCACTTCATCACTTTTATG-TT-TAAA--GTATC---TCTATAC-ATTATGTA-TCTG-ATTATTC-T-ACA--TGAGGCA-GA-AGT----GGA-TCTC-TA------GT--TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-C-CGACTCTTGCT--T--CC-CTT-GT-TGAT--GT-TCA--G-ACATA-TACGAGATAT---TTATAATATAATT-TGTAT--G---TATG-T-AC----ACCTTCAATA-CAtgctgtgctgctttgggtgaagtggatatttatttaataaatcatgaaatcatctctactagccctgtctcttgctaccctctgcatcatgttataatctacagacagaagtgttagtttttcaatttcatcacttcatcacttttatgtttaaagtatctctatacattatgtatctgattattctacatgaggcagaagtggatctctagttttgtatcctttagcaccgactcttgcttcccttgttgatgttcagacatatacgagatatttataatataatttgtatgtatgtacaccttcaatacaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atattaccttcagtaagcatatgtcaacacaagtatttaatatgtactcttggacaatggacttgattgttctctttggacagtatgaatgacttggttggtttccatcattccaGTGT-ATCAGACA--TATATTG--CTTTCA-TAGG--AGATAAGTTCATAAC--GATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTA---TGTATTa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATCTGTT--TA-TTGTACATGAGGCAGAAGTGGACTGT------TTCGTGTCCTTT-AGCATTGACTCCTATACTGCCCCTTG-TT-GGTGT-ATCAGACATATATATTG--CAATCA-CAGGGGA----------TAAC--AATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTG---TGTATTgtctgtatttgtattaacgattatatatgttacatgtttatgcccatttgggccctgatttggtaaataaatactactacttatcatggcggccgatgacgtacaagaggcaattcattatacggctgctgtgcctacatagcatcaaacacattccattatccattaaaatgcc
gi|8                          :                                  --TCTTTGGACAGT-GTGAA-TGGACAA--GGTTGGTTT--CCATGT-AT---ATGTTTTTCCA---TGTTTCACAG---ACACATATTTTCTGTTCAAGA-CA-CTC-TTGTGTATGT------A-GTTTgtctgtatttgtattaacgattatatatgttacatgtttatgcccatttgggccctgatttggtaaataaatactact
gi|8                          :                                                                                                                                                TGTATATGTTTTTCCATGTTT--CACAGACACATATTTTCTG-TTCAAGACA--CTC-TTGTGTATGTA--GTTTTGC-AT-GTGCTG-CTTTGGGTAGA-AGTGGATATTT------T---A---CA-TA------AAA-TAAT-T--GTCC-T--A-T-AGCA-C-TGTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AG-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACtgcatgtgctgctttgggtagaagtggatattttacataaaataattgtcctatagcactgtctcttgctaccctctgcagcatgttataatctacagac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tctttggacagtgtgaatggacaaggttggtttccaACTGT------TTCGTGTCCTTTGAGCATTGACTCCTATACTCCCC-ACATTT-GGTGTAATCAGACA-TTATATATTGCAATCATTAGG--G----------GAATCAGATA-CTACCACTGACTAGTC-CAGTGTGAT---TTAACTTGTTTTGTATT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                tttcacagatacatgtattttctgtaaacaaaatgtaggtagttttgtatgctgttttgggtagaagtggGCTGC-TTTGGGTAGA-AGTGGATATTT------T---A---CA-TGTACATAAAA-TAAT-T--GT-CTT--A-T-AGCA-C-CGTCTAGAGCTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aatcgaatatattgctatatcttctcggagGCTGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTTA-CA---TGTACATAAA--A--T-----AA----T-TGTCTTAT-AGCAC-CG-TCTAGAGCTTGCTACCC-----T---CTGCATCATG-TATTA-CTAC------TACTA---CTAC--TACT-AATTattactactactactactactaattata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatcgaatatattgctatatcttctcggagCTACT-GACATCTTAATCTTAT--TACTTAAGTTTTAAAC--GC-AAT--GTCATAG-AGAAAAACTTATATTTGTCC------TCTATACATT-AT-TATCTATGTT--TATT-GTA------GCAAAAGC---CTATCCTTACTTCGTGTGCATTTAata
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                         GT-TTGTTAATATT--GTTT----AT-GT-TTGTTTTTTGGTAGA-AGTGTATATTT------C---AC--CACTG------GAC-TGAT-CCTGTAC-T--A-T-AGCA-CGTGTCT----CTT------GCTA-CCTACACATGTACTGT----AT-CAT-ATTA--TAAT-TA-CAAActtaactg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatattttTTGT-TTATGTTTGTTTT-TGT------AGAAGTGTA--TATTTCACCA---CTGG-----A--C--T-----GA--TCC-TGTACTAT-AGCACGTG-TCT----CTTGCTACCTACACATGTACTGTATCA--TTATAAT-TACA-AA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aataTTTGTTATGTACTGTGTTGTGATTGCATAAGAAGTAGA--CATTTCA-CAAATT--------A--C--T-----AAATT-T-TGTCCCAT-AGCAC-CA-TCT----CTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-TCTGA-TTATTC-T-ACA--CGAGGCA-GA-AGT----GGG-CCTCTA-ATTG--T-----TTTGTA-TCC-TTT-Aaaacca
gi|2                          : CTCTTTGGA-ATATGGACCATTGATCTGTTTCTCATCATTGGACAGTCATGAA-TGGACTT--GGTTGGTCTATCCATTC-ATTCCATGTAT----AATTTGTTTCAT-GGACACATA--TATTTTCTGTTAAAG-ACAACTCCTTGTGTATGT------A-GTT-GCT--GGACACATATTTTCTGGTTAAAGACAAACGC-TTGTGTATGTAAAGTTT-GC-AT-GTGCTGC-TTTGGGTAGA-A-TGGATATTC------TTTAA---CA-TG------AAA-TAAT-C--AT-C-C----T-AGTAGC-TGTCT----TAT------GCTA-ACC-----T---CTGC----AG-CAT--TTA--TAATCTAGCAGACA-AAGT-TTCA--GTTTTT-CA-ATTTC-------TGTC--TTTGATGTT-TTAAA-TGTAAT---TCTATACAATTATGTA-TCTGA-TTATTCGT-ACA--TGAG-CA-GA-AGTTTCGGGA-TCT-TATA--G--T-----TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-AACGACT-TTGCT--TCCCCTCTT-GT-TGA-T-GTATCA--GAACATA-TACGAGATATTTAT----ATATAA-T-TA-AT--GGTATATG-T-ACAACTGC--TTAATATCAGGATTGTG--AATGT----TTGA-T-------ATATG-TGTGTCC-TGAT-T-G-A--AC--AGTT-TAATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctagcctaattatgacaccttctcgagagtaagctatatgttcaacaatcaagtacttaatatgtttaGAAGTAGA--CATTTCA-CA------------A--A--TTACTAAA--T-TATGTCCCAT-AGCAC-CA-TCT----CTTGc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                      A--GATTTGCCATTGTGCTGGCTTTGGGTAGACAGTGGATG------------------------------A-TAATTC--AT-C-CTAA-T-AGCG-T--GTCT----CTTTAATTGGCTAGCCC-----T---CTGTGCATAT-CATTGTTAGTTAATCTA-CAGACAAATAT-AT-AAAGTTTTTTCA-ATTTC-------TATCACTTTTATGTTAT-AAATTGTATCCGATATATGCA-TTATGTATTCTGAGTTATTC-T-ACAGGCGAGGCAGGA-GGT----GGAGTCTCTA-A--GGATTGTTATCTGTAGTCC-TTTAAGCACCACGACTCTTGCTGGT--CATCTTGGTATGATT-GTATCAGGG-ACATATTAATATATAT---T----GTATGG-C-T-TATTGG---TACA-TGAC-----C--TTCAT---A-GTGCGTGGTATTATGATATTG-TTAACGTAGATATGATATAT-CTTGATAT-GCATCAT--CGTTATAATCTAAAAGCACAAT--CTTAATTAATTGTTCCATGGAGTCCAT--CAATTTAAT-CAAACTGTTTGCACATATAACATGTCA-AT-TTTTCTCTTAAAAGACTGTG-TAATG-AGTGTATTGTATATGCTGGCTTTG-GG--TAGAAG-TGGATATTTTTAAATAAATAATTGTCCTTATAGCACCGTC-TC-TGCTACCCT-CTGCATTCATGT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGT----TTGAT--------ATATG-TGTGT-C-TGTTAT-GCA--ACATTGTTTTAATCTACAGACACAAT--CTTAA-----TGTTTCATAG------TTTCAATTTATTACAAACTGTTT-CACATA-TACA---TG--TATTTTCTCTT-AAAGACTGTG-T-ATGTAGTAT---GTATATGCT-GCTTTG-GGGTAGAAAG-TGGATATTTT---ACAAT----CGT-CCTATAGCACCGTC-TCTTGCTACCCT-CAGCATCTATGTTATAATCTACA-ACACAGTCTTGTGTTT-CATAGTTTATCAA-TTTATTACAAA--CTGTTTCACAG--ATGCATGTATTTCT-G-TTAAGACACA-TA--GTAG--TAGTTTTTGT-ATATA-TGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTTA-CA---T--------A--AAAT-----AA--T----GTCCTAT-AGCAC-CG-TCT----CTTGCTACC------T---CTGCATCATGTTATAATCTACA-GACACATTAATCTTAT--TACT-AA------A---TA--ACCATGTCATAG-A-AAAAACTTATATTTAT-C------TCTATACATTAATATATC--TGTTCATG-T-GTACATGAGGCAGA
gi|5                          :         ACACAAGTAT--TTAATATGTAC----TCTT-GGACA-------A-TGGACTT--GATTG--TT--C---TC-TTTGGACA-GT----A---TG---AAT-G---ACTTGGTTGGTTTCCAT-------CA-TTC-C-ATGTATAT---------TTT--CATG-ACACATATTTTCTG-TTAAAG-CA---GTCTTGTGTATGTA--GTTTTGC--T-GTGCTGC-TTTGGGT-GA-AGTGGATATTTATTTAAT---AAATCA-TG------AAA-TCAT-C---T-C-T--ACT-AGCC-C-TGTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACAGAAGTGTT-A--G-TTTTTCA-ATTTCATCACTTCATCACTTTTATGTT-T-AAA--GTATC---TCTATACA-TTATGTA-TCTGA-TTATTC-T-ACA--TGAGGCA-GA-AGT----GGA-TCTCT--A--G--T-----TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-C-CGACTCTTGCT--T--CC-CTT-GT-TGA-T-GT-TCA--G-ACATA-TACGAGATAT---TTATAATATAATT-TGTAT--G---TATG-T-AC----ACCTTCAATA-CA-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atattaccttcagtaagcatatgtcaGTGT-ATCAGACA--TATATTG--CTTTCA-TAGG--AGATAAGTTCATAAC--GATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTA---TGTATTa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATC--TGTT--TA-TTGTACATGAGGCAGAAGTGGACTGT------TTCGTGTCCTTT-AGCATTGACTCCTATACTGCCCCTTG-TT-GGTGT-ATCAGACATATATATTG--CAATCA-CAGGGGA----------TAAC--AATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTG---TGTATTgtctgtatttgtattaacgattatatatgttacatgtttatgcccatttgggccctgatttggtaaataaatactactacttatcatggcggccgatgacgtacaagaggcaattcattatacggctgctgtgcctacatagcatcaaacacattccattatccattaaaatgcc
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gi|8                          :                                                                                                                                                  TGTATATGTTTTTCCATGTTT--CACAGACACATATTTTCTG-TTCAAGACA--CTC-TTGTGTATGTA--GTTTTGC-AT-GTGCTG-CTTTGGGTAGA-AGTGGATATTT------T---A---CA-TA------AAA-TAAT-T--GTCC-T--A-T-AGCA-C-TGTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AG-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACtgcatgtgctgctttgggtagaagtggatattttacataaaataattgtcctatagcactgtctcttgctaccctctgcagcatgttataatctacagac
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tATATTTTACATAACATAATTGTCCTATAGCACC-GTCTCTTAAGTTTA--ACCAT-ATAATAGAAAAATTCATATTTAT-C------TCTTTACATC-ATGTATC--TGTT--TATT-GTACATGAGACAGAAaagtttaaccatataatagaaaaattcatatttatctctttacatcatgtatctgtttattgtacatgagacagaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                tttcacagatacatgtattttctgtaaacaaaatgtaggtagttttgtatgctgttttgggtagaagtggGCTGC-TTTGGGTAGA-AGTGGATATTT------T---A---CA-TGTACATAAAA-TAAT-T--GT-CTT--A-T-AGCA-C-CGTCTAGAGCTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatcgaatatattgctatatcttctcggagGCTGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTTA-CA---TGTACATAAA--A--T-----AA----T-TGTCTTAT-AGCAC-CG-TCTAGAGCTTGCTACCC-----T---CTGCATCATG-TATTA-CTAC------TACTA---CTAC--TACT-AATTattactactactactactactaattata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatcgaatatattgctatatcttctcggagCTACT-GACATCTTAATCTTAT--TACTTAAGTTTTAAAC--GC-AATGTCATAG-AGAAAAACTTATATTTGTCC------TCTATACATT-AT-TATCTATGTT--TATT-GTA------GCAAAAGC---CTATCCTTACTTCGTGTGCATTTAata
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                         GT-TTGTTAATATT--GTTT----AT-GT-TTGTTTTTTGGTAGA-AGTGTATATTT------C---AC--CACTG------GAC-TGAT-CCTGTAC-T--A-T-AGCA-CGTGTCT----CTT------GCTA-CCTACACATGTACTGT----AT-CAT-ATTA--TAAT-TA-CAAActtaactg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatattttTT-GT-TTATGTTTGTTTT-TGT------AGAAGTGTA--TATTTCACCA---CTGG-----A--C--T-----GA--TCC-TGTACTAT-AGCACGTG-TCT----CTTGCTACCTACACATGTACTGTATCA--TTATAAT-TACA-AA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aataTTT-GTTATGTACTGTGTTGTGATTGCATAAGAAGTAGA--CATTTCA-CAAATT--------A--C--T-----AAATT-T-TGTCCCAT-AGCAC-CA-TCT----CTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-TCTGA-TTATTC-T-ACA--CGAGGCA-GA-AGT----GGG-CCTCTA-ATTG--T-----TTTGTA-TCC-TTT-Aaaacca
gi|2                          : CTCTTTGGA-ATATGGACCATTGATCTGTTTCTCATCATTGGACAGTCATGAA-TGGACTT--GGTTGGTCTATCCATTC-ATTCCATGTAT----AATTTGTTTCAT-GGACACATA--TATTTTCTGTTAAAG-ACAACTCCTTGTGTATGT------A-GTT-GCT--GGACACATATTTTCTGGTTAAAGACAAACGC-TTGTGTATGTAAAGTTT-GC-AT-GTGCTGC-TTTGGGTAGA-A-TGGATATTC------TTTAA---CA-TG------AAA-TAAT-C--AT-C-C----T-AGTAGC-TGTCT----TAT------GCTA-ACC-----T---CTGC----AG-CAT--TTA--TAATCTAGCAGACA-AAGT-TTCA--GTTTTT-CA-ATTTC-------TGTC--TTTGATGTT-TTAAA-TGTAAT---TCTATACAATTATGTA-TCTGA-TTATTCGT-ACA--TGAG-CA-GA-AGTTTCGGGA-TCT-TATA--G--T-----TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-AACGACT-TTGCT--TCCCCTCTT-GT-TGA-T-GTATCA--GAACATA-TACGAGATATTTAT----ATATAA-T-TA-AT--GGTATATG-T-ACAACTGC--TTAATATCAGGATTGTG--AATGT----TTGA-T-------ATATG-TGTGTCC-TGAT-T-G-A--AC--AGTT-TAATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctagcctaattatgacaccttctcgagagtaagctatatgttcaacaatcaagtacttaatatgtttaGAAGTAGA--CATTTCA-CA------------A--A--TTACTAAA--T-TATGTCCCAT-AGCAC-CA-TCT----CTTGc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                      A--GATTTGCCATTGTGCTGGCTTTGGGTAGACAGTGGATG------------------------------A-TAATTC--AT-C-CTAA-T-AGCG-T--GTCT----CTTTAATTGGCTAGCCC-----T---CTGTGCATAT-CATTGTTAGTTAATCTA-CAGACAAATAT-AT-AAAGTTTTTTCA-ATTTC-------TATCACTTTTATGTTAT-AAATTGTATCCGATATATGCA-TTATGTATTCTGAGTTATTC-T-ACAGGCGAGGCAGGA-GGT----GGAGTCTCTA-A--GGATTGTTATCTGTAGTCC-TTTAAGCACCACGACTCTTGCTGGT--CATCTTGGTATGATT-GTATCAGGG-ACATATTAATATATAT---T----GTATGG-C-T-TATTGG---TACA-TGAC-----C--TTCAT---A-GTGCGTGGTATTATGATATTG-TTAACGTAGATATGATATAT-CTTGATAT-GCATCAT--CGTTATAATCTAAAAGCACAAT--CTTAATTAATTGTTCCATGGAGTCCAT--CAATTTAAT-CAAACTGTTTGCACATATAACATGTCA-AT-TTTTCTCTTAAAAGACTGTG-TAATG-AGTGTATTGTATATGCTGGCTTTG-GG--TAGAAG-TGGATATTTTTAAATAAATAATTGTCCTTATAGCACCGTC-TC-TGCTACCCT-CTGCATTCATGT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGT----TTGAT--------ATATG-TGTGT-C-TGTTAT-GCA--ACATTGTTTTAATCTACAGACACAAT--CTTAA-----TGTTTCATAG------TTTCAATTTATTACAAACTGTTT-CACATA-TACA---TG--TATTTTCTCTT-AAAGACTGTG-T-ATGTAGTAT---GTATATGCT-GCTTTG-GGGTAGAAAG-TGGATATTTT---ACAAT----CGTCC-TATAGCACCGTC-TCTTGCTACCCT-CAGCATCTATGTTATAATCTACA-ACACAGTCTTGTGTTT-CATAGTTTATCAA-TTTATTACAAA--CTGTTTCACAG--ATGCATGTATTTCT-G-TTAAGACACA-TA--GTAG--TA-GTTTTTGT-ATATA-TGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTTA-CA---T--------A--AAAT-----AA--T----GTCCTAT-AGCAC-CG-TCT----CTTGCTACC------T---CTGCATCATGTTATAATCTACA-GACACATTAATCTTAT--TACT-AAAT----AAC---C-AT-GTCATAG-A-AAAAACTTATATTTAT-C------TCTATACATTAATATATC--TGTTCATG-T-GTACATGAGGCAGA
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atattaccttcagtaagcatatgtcaGTGT-ATCAGACA--TATATTG--CTTTCA-TAGG--AGATAAGTTCATAAC--GATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTA---TGTATTa
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Reference ( family-2365 )     : CTCCTTGGACACATG-AC--TTGAT-TGTT-CT--TCTTTGGACAGT-ATGAA-TGGACTT--GGTTGGTTT--CCATTC-ATTCCACGTNT----A---TGTTTCAT-G---ACACA--TATTTTCCGTTAAAG-ACA-CTC-TTGTGTATGT------A-GTTTGCCACGGACACATATTTTCTG-TTAAAGACA--CGT-TTGTGTATGTA--GTTTTGC-AT-GTGCTGCCTTTGGGTAGA-AGTGGATATTT------T---A---CA-TG------AAA-TAAT-C--GT-C-T--A-T-AGCA-C-CGTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACAGAAGT-TT-A--GTTTTTTCA-ATTTC-------TATCACTTTNATGTT-T-AAA-TGTATC---TCTATACA-TTATGTA-TCTGA-TTATTC-T-ACA--CGAGGCA-GA-AGT----GGA-TCTCTA-A--G--T-----TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-CACGACTCTTGCT--T--CCTCTT-GT-TGACT-GTATCA--G-ACATATTACGAGATAT---T----ATATAA-T-TGTAT--G---TACG-T-AC----GC--TTNATA-CA-GATCGTG--ATTGT----TTGATT-------ATATG-TGTGT-C-TGATAT-GCA--AC--CGTTATAATCTAAAANCACAAT--CTTAA-----TGTTTCATGG------T--CAATTTATTACAAACTGTTT-CACATA-NACA---CG-ATATTTTCTCTT-AAAGACTGTG-T-ATGTAGTAT-CTGTATATGCT-GCTTTG-GGGTTAGAAG-TGGATATTTTT--ACAA-----CGTCCCTATAGCACCGTC-TCTTGCTACCCT-CAGCATTCATGT-ATAATCTACAGACACAGTCTTGTGTTTTCATAGTTTATCAACTTTATTACAAAAACTGTTT-ACAG--ATGCATGTATTTTTCG-TTAAGACACAATA--GTAGG-TA-GTTTT-GT-ATATGCTGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTCA-CA---T--------A--A--T-----AA--T-T-TGTCCTAT-AGCAC-CG-TCT----CTTGCTACCC-----T---CTGCATCATGTTATAATCTACA-GACACANTAATCTTAT--TACT-AANTTTTAAGCTTAC-ACCGTCATAG-AGAAAAACTTATATTTAT-C------TCTATACATT-ATGTATC--TGTT--TA-T-GTACATGAGGCAGAAGTGGACTGT------TTCGTGTCCTTTTAGCATTGACTCCTATACTGCCC-TCG-TT-GGTGT-ATCAGACA-ATATATTGTGCAATCA-TAGG--A----------TAAC--GATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTG---TGTATT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatcgaatatattgctatatcttctcggagCTACT-GACATCTTAATCTTAT--TACTTAAGTTTTAAAC--GC-AATGTCATAG-AGAAAAACTTATATTTGTCC------TCTATACATT-AT-TATCTATGTT--TATT-GTA------GCAAAAGC---CTATCCTTACTTCGTGTGCATTTAata
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                         GT-TTGTTAATATT--GTTT----AT-GT-TTGTTTTTTGGTAGA-AGTGTATATTT------C---AC--CACTG------GAC-TGAT-CCTGTAC-T--A-T-AGCA-CGTGTCT----CTT------GCTA-CCTACACATGTACTGT----AT-CAT-ATTA--TAAT-TA-CAAActtaactg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatattttTT-GT-TTATGTTTGTTTT-TGT------AGAAGTGTA--TATTTCACCA---CTGG-----A--C--T-----GA--TCC-TGTACTAT-AGCACGTG-TCT----CTTGCTACCTACACATGTACTGTATCA--TTATAAT-TACA-AA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aataTTT-GTTATGTACTGTGTTGTGATTGCATAAGAAGTAGA--CATTTCA-CAAATT--------A--C--T-----AAATT-T-TGTCCCAT-AGCAC-CA-TCT----CTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-TCTGA-TTATTC-T-ACA--CGAGGCA-GA-AGT----GGG-CCTCTA-ATTG--T-----TTTGTA-TCC-TTT-Aaaacca
gi|2                          : CTCTTTGGA-ATATGGACCATTGATCTGTTTCTCATCATTGGACAGTCATGAA-TGGACTT--GGTTGGTCTATCCATTC-ATTCCATGTAT----AATTTGTTTCAT-GGACACATA--TATTTTCTGTTAAAG-ACAACTCCTTGTGTATGT------A-GTT-GCT--GGACACATATTTTCTGGTTAAAGACAAACGC-TTGTGTATGTAAAGTTT-GC-AT-GTGCTGC-TTTGGGTAGA-A-TGGATATTC------TTTAA---CA-TG------AAA-TAAT-C--AT-C-C----T-AGTAGC-TGTCT----TAT------GCTA-ACC-----T---CTGC----AG-CAT--TTA--TAATCTAGCAGACA-AAGT-TTCA--GTTTTT-CA-ATTTC-------TGTC--TTTGATGTT-TTAAA-TGTAAT---TCTATACAATTATGTA-TCTGA-TTATTCGT-ACA--TGAG-CA-GA-AGTTTCGGGA-TCT-TATA--G--T-----TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-AACGACT-TTGCT--TCCCCTCTT-GT-TGA-T-GTATCA--GAACATA-TACGAGATATTTAT----ATATAA-T-TA-AT--GGTATATG-T-ACAACTGC--TTAATATCAGGATTGTG--AATGT----TTGA-T-------ATATG-TGTGTCC-TGAT-T-G-A--AC--AGTT-TAATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctagcctaattatgacaccttctcgagagtaagctatatgttcaacaatcaagtacttaatatgtttaGAAGTAGA--CATTTCA-CA------------A--A--TTACTAAA--T-TATGTCCCAT-AGCAC-CA-TCT----CTTGc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                      A--GATTTGCCATTGTGCTGGCTTTGGGTAGACAGTGGATG------------------------------A-TAATTC--AT-C-CTAA-T-AGCG-T--GTCT----CTTTAATTGGCTAGCCC-----T---CTGTGCATAT-CATTGTTAGTTAATCTA-CAGACAAATAT-AT-AAAGTTTTTTCA-ATTTC-------TATCACTTTTATGTTAT-AAATTGTATCCGATATATGCA-TTATGTATTCTGAGTTATTC-T-ACAGGCGAGGCAGGA-GGT----GGAGTCTCTA-A--GGATTGTTATCTGTAGTCC-TTTAAGCACCACGACTCTTGCTGGT--CATCTTGGTATGATT-GTATCAGGG-ACATATTAATATATAT---T----GTATGG-C-T-TATTGG---TACA-TGAC-----C--TTCAT---A-GTGCGTGGTATTATGATATTG-TTAACGTAGATATGATATAT-CTTGATAT-GCATCAT--CGTTATAATCTAAAAGCACAAT--CTTAATTAATTGTTCCATGGAGTCCAT--CAATTTAAT-CAAACTGTTTGCACATATAACATGTCA-AT-TTTTCTCTTAAAAGACTGTG-TAATG-AGTGTATTGTATATGCTGGCTTTG-GG--TAGAAG-TGGATATTTTTAAATAAATAATTGTCCTTATAGCACCGTC-TC-TGCTACCCT-CTGCATTCATGT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGT----TTGAT--------ATATG-TGTGT-C-TGTTAT-GCA--ACATTGTTTTAATCTACAGACACAAT--CTTAA-----TGTTTCATAG------TTTCAATTTATTACAAACTGTTT-CACATA-TACA---TG--TATTTTCTCTT-AAAGACTGTG-T-ATGTAGTAT---GTATATGCT-GCTTTG-GGGTAGAAAG-TGGATATTTT---ACAAT----CGTCC-TATAGCACCGTC-TCTTGCTACCCT-CAGCATCTATGTTATAATCTACA-ACACAGTCTTGTGTTT-CATAGTTTATCAA-TTTATTACAAA--CTGTTTCACAG--ATGCATGTATTTCT-G-TTAAGACACA-TA--GTAG--TA-GTTTTTGT-ATATA-TGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTTA-CA---T--------A--AAAT-----AA--T----GTCCTAT-AGCAC-CG-TCT----CTTGCTACC------T---CTGCATCATGTTATAATCTACA-GACACATTAATCTTAT--TACT-AAAT----AAC---C-A-TGTCATAG-A-AAAAACTTATATTTAT-C------TCTATACATTAATATATC--TGTTCATG-T-GTACATGAGGCAGA
gi|5                          :         ACACAAGTAT--TTAATATGTA-CT--C--TTGGACA-------A-TGGACTT--GATTG--TT--C---TC-TTTGGACA-GT----A---TG---AAT-G---ACTTGGTTGGTTTCCAT-------CA-TTC-C-ATGTATAT---------TTT--CATG-ACACATATTTTCTG-TTAAAG-CA---GTCTTGTGTATGTA--GTTTTGC--T-GTGCTGC-TTTGGGT-GA-AGTGGATATTTATTTAAT---AAATCA-TG------AAA-TCAT-C---T-C-T--ACT-AGCC-C-TGTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACAGAAGTGTT-A--G-TTTTTCA-ATTTCATCACTTCATCACTTTTATGTT-T-AAA--GTATC---TCTATACA-TTATGTA-TCTGA-TTATTC-T-ACA--TGAGGCA-GA-AGT----GGA-TCTCT--A--G--T-----TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-C-CGACTCTTGCT--T--CC-CTT-GT-TGA-T-GT-TCA--G-ACATA-TACGAGATAT---TTATAATATAATT-TGTAT--G---TATG-T-AC----ACCTTCAATA-CA-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atattaccttcagtaagcatatgtcaGTGT-ATCAGACA--TATATTG--CTTTCA-TAGG--AGATAAGTTCATAAC--GATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTA---TGTATTa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATC--TGTT--TA-TTGTACATGAGGCAGAAGTGGACTGT------TTCGTGTCCTTT-AGCATTGACTCCTATACTGCCCCTTG-TT-GGTGT-ATCAGACATATATATTG--CAATCA-CAGGGGA----------TAAC--AATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTG---TGTATTgtctgtatttgtattaacgattatatatgttacatgtttatgcccatttgggccctgatttggtaaataaatactactacttatcatggcggccgatgacgtacaagaggcaattcattatacggctgctgtgcctacatagcatcaaacacattccattatccattaaaatgcc
gi|8                          :                                  --TCTTTGGACAGT-GTGAA-TGGACAA--GGTTGGTTT--CCATGT-AT---ATGTTTTTCCA---TGTTTCACAG---ACACA--TATTTTCTGTTCAAG-ACA-CTC-TTGTGTATGT------A-GTTTgtctgtatttgtattaacgattatatatgttacatgtttatgcccatttgggccctgatttggtaaataaatactact
gi|8                          :                                                                                                                                                  TGTATATGTTTTTCCATGTTT--CACAGACACATATTTTCTG-TTCAAGACA--CTC-TTGTGTATGTA--GTTTTGC-AT-GTGCTG-CTTTGGGTAGA-AGTGGATATTT------T---A---CA-TA------AAA-TAAT-T--GTCC-T--A-T-AGCA-C-TGTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AG-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACtgcatgtgctgctttgggtagaagtggatattttacataaaataattgtcctatagcactgtctcttgctaccctctgcagcatgttataatctacagac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tctttggacagtgtgaatggacaaggttggtttccaACTGT------TTCGTGTCCTTTGAGCATTGACTCCTATACTCCCC-ACATTT-GGTGTAATCAGACA-TTATATATTGCAATCATTAGG--G----------GAATCAGATA-CTACCACTGACTAGTC-CAGTGTGAT---TTAACTTGTTTTGTATT


blockSeqs                     :          C     GACCA     C    T  CATCA       G CA    .       .      GT  AT C T  .  TCC T TTTTTCCA     T     A GAC     GT  T    T  TA   .   A   C          TTTTCCAT   TCAT   G              G      A  AAC  C    T      AA    T  C  T      TT          C           ATTTAATAAATCATG             .    CCTGTACTA      .    G GT    AGAG   TAATTG    G   ACACATGTA    GCAT  .   T    GT       G      A    ATAAA   T    T  .     ATCACTTC   A    G     TT    TT     CGA        A   T   T     G      G .   GG       G  .   TTCG   G     AAGGATTGTTA         G   .   A    CCAC    C     TCC    T   G TA   TT   A   GG A  A  T          TTATA         TTTGT   GGTA    T TG   AACTGC    A  AT  G   T   GT     GATA   TTAACGTAG      A     C T    A . C TC  ATT   A          G      .      TTAAT       TGGAGTCCAT           A          G      TA   TGTCAA  A         A    A     TA    T     AT      T  TG      .  G       .          TAA    ATAAT     T     C C    .  T         .            T          .                .      TTA    .           CT      C    .               TG  T        A A      G   .     T  T  A  C       T   TGCATA         .        C  TGTACATAAAATAAT                         .     G  .   AGAG         TACACATGTA   C    TGT          AT   A  A  A      AG    T  A T TAAGTTTA   C   AT   TAG                C CCAGAG          A  G    TA    CATGT     CAT    C      G      CCTTAC         A  T            T         CTTG   .     A        GA       TG     AT    AGATAAGTTCA      CA    .                A      G  T          TTT
blockSeqs                     :          .     TAT       A    .  TCT         G G     .       .      GT  .  C T  .  TGG C TATAATT      T     . .       .   G    C  TC   .   .   .          A          TCAC   G              .      A  C    .    G      .     T  .  .      GC          .           TACATGTACATA                .    TCATCCTAA      .    . C     .      .         .   T            .     .   .    .        .      G    TTCA    T    T  .     T          A    T     AT    T      .          .   T   .     .      . .   .        .  .   .      .     AATTGT              .   .   .    AAC     C     GGT    T   . T    T    A   .  .  A  .          TTAT          TTA     TGG     C T    ACCT      C  A   .   C   .      .      AT             .     . .    A . C .   A     T          A      .      .           TAGTTT               .          .      T    TG      .         .    A     T     .     .       T  T       .  .       .          .      T         .     C C    .  .         .            .                                                             .    .               G   .        . .      .   .     .  .  G  C       .   .              .        .  AATTACTAAATTT                           .     .  .   .            CT           C    TGT          A    A  A  G      .     .  C C TAAACGC    C   CA   AG                 . .               .  G    .     TATT      CAT    C      G      .              T  T            T         ACAT   .     .        TA       .      A     GGA              .     .                A      .  T          .  
blockSeqs                     :                                  C           . .     .       .      .   .  . .  .  .   T GTA          .     . .       .   T    T  .    .   .   .          A          GCT    .              .      .  .    .    G      .     T  .  .      C           .           TTTAACATG                   .    TGTCTTA        .    . T     .      .         .   T            .     .   .    .        .      .    GTTA    .    .  .     T          .    T     T     .      .          .   T   .     .      . .   .        .  .   .      .     ATAGT               .   .   .    CC      .     T      .   . T    T    .   .  .  A  .          T             CTT     G       T T    C         A  .   .              .      AT             .     . .    . . . .   C     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  .  A  T       .   .              .        .  AATTACTAAATTA                           .     .  .   .            CT           T    TG           T    A  C  A      .     .  T T AACC       A   CA   A                  . .               .  A    .     TATT      CAT    C      .      .              T  G            .         TTG    .     .        T        .      A     G                .     .                .      .  .          .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .                                               .    G      .     .  .  .      C           .           CACCACTG                    .    TGTCCTA        .    . T     .      .         .   T            .     .   .    .        .                                                                                       .     .      . .   .        .  .   .      .     AGT                 .   .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .  .  C       .   .              .        .  CTGGACTGATCC                            .     .  .   .            T            C    T            A    A  T  A      .     .  G . TC         .   A    .                  . .               .  .    .     TATT      .      C             .              .  .                                   .        .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .     .  .  .      C           .           TACATA                      .    CTCTAC         .    . T     .      .         .   T            .     .   .    .        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .       .   .              .        .  TAACATAAT                               .     .  .   .                                           A    .  T  .      .     .  A                                                                    .     T         .      .                                                                                                                                                                  
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Reference ( family-2365 )     : CTCCTTGGACACATG-AC--TTGAT-TGTT-CT--TCTTTGGACAGT-ATGAA-TGGACTT--GGTTGGTTT--CCATTC-ATTCCACGTNT----A---TGTTTCAT-G---ACACA--TATTTTCCGTTAAAG-ACA-CTC-TTGTGTATGT------A-GTTTGCCACGGACACATATTTTCTG-TTAAAGACA--CGT-TTGTGTATGTA--GTTTTGC-AT-GTGCTG-CTTTG-GGTAGA-AGTGGATATT--T------TA-----A--CA-TGAAA-TAAT-C--GTCCTA-T-AGCAC-T-GTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACAGAAGT-TT-A--GTTTTTTCA-ATTTC-------TATCACTTTNATGTT-T-AAA-TGTATC---TCTATACA-TTATGTA-TCTGA-TTATTC-T-ACA--CGAGGCA-GA-AGT----GGA-TCTCTA-----T-GT--TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-CACGACTCTTGCT--T--CCTCTT-GT-TGACT-GTATCA--G-ACATATTACGAGATAT---T----ATATAA-T-TGTAT--G---TACG-T-AC----GC--TTNATA-CA-GATCGTG--ATTGT----TTGATT-------ATATG-TGTGT-C-TGATAT-GCA--AC--CGTTATAATCTAAAANCACAAT--CTTAA-----TGTTTCATGG------T--CAATTTATTACAAACTGTTT-CACATA-NACA---CG-ATATTTTCTCTT-AAAGACTGTG-T-ATGTAGTAT-CTGTATATGCT-GCTTTG-GGGTTAGAAG-TGGATATTTTT--ACAA-----CGTCCCTATAGCACCGTC-TCTTGCTACCCT-CAGCATTCATGT-ATAATCTACAGACACAGTCTTGTGTTTTCATAGTTTATCAACTTTATTACAAAAACTGTTT-ACAG--ATGCATGTATTTTTCG-TTAAGACACAATA--GTAGG-TA-GTTTT-GT-ATATGCTGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTCACA---T--------A--A--T-----AA--TT-TGTCCTAT-AGCACCG-TCT----CTTGCTACCCTCTGCATCATGTTATAATCTACA-GACACANTAATCTTAT--TAC-------TAANTTT-TAGCC----AC--CGTCATAG-A-AAAAACTTATATTTAT-C------TCTATACATT-ATGTATC--TGTTTAT-TGTACATGAGGCAGAAGTGGACTGT------TTCGTGTCCTTTTAGCATTGACTCCTATACTG-CCCTCG-TT-GGTGT-ATCAGAC-A-TATATTGTGCAATCA-TA--GGA----------TAAC--GATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTG---TGTATT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatcgaatatattgctatatcttctcggagCTACT-GACATCTTAATCTTAT--TACT------TAAGTTT-TAAAC----GCAATGTCATAG-AGAAAAACTTATATTTGTCC------TCTATACATT-AT-TATCTATGTTTAT-TGTA------GCAAAAGC---CTATCCTTACTTCGTGTGCATTTAata
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                         GT-TTGTTAATATT--GTTT----AT-GT-TTG-TTTTTTGGTAGA-AGTGTATATT--T------CA-----C--CACTGGAC-TGAT-CCTGTACTA-T-AGCACGT-GTCT----CTT------GCTA-CCTACACATGTACTGT----AT-CAT-ATTA--TAAT-TA-CAAActtaactg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                          gatattttATATT--GTTT----AT-GT-TTG-TTTTT-G-TAGA-AGTGTATATT--T------CA-----C--CACTGGAC-TGAT-CCTGTACTA-T-AGCACGT-GTCT----CTT------GCTA-CCTACACATGTACTGT----AT-CA---TTA--TAAT-TA-CAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aTTT-GTTATGTACTGTGTTGTGATTGCATAAGAAGTAGA--CATTTCACAAATT--------A--C--T-----AAATTT-TGTCCCAT-AGCACCA-TCT----CTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-TCTGA-TTATTC-T-ACA--CGAGGCA-GA-AGT----GGG-CCTCTAAT---T-GT--TTTGTA-TCC-TTT-Aaaacca
gi|2                          : CTCTTTGGA-ATATGGACCATTGATCTGTTTCTCATCATTGGACAGTCATGAA-TGGACTT--GGTTGGTCTATCCATTC-ATTCCATGTAT----AATTTGTTTCAT-GGACACATA--TATTTTCTGTTAAAG-ACAACTCCTTGTGTATGT------A-GTT-GCT--GGACACATATTTTCTGGTTAAAGACAAACGC-TTGTGTATGTAAAGTTT-GC-AT-GTGCTG-CTTTG-GGTAGA-A-TGGATATTCTT------TA-----A--CA-TGAAA-TAAT-C--ATCCTAGT-AGC---T-GTCT----TAT------GCTA-ACC-----T---CTGC----AG-CAT--TTA--TAATCTAGCAGACA-AAGT-TTCA--GTTTTT-CA-ATTTC-------TGTC--TTTGATGTT-TTAAA-TGTAAT---TCTATACAATTATGTA-TCTGA-TTATTCGT-ACA--TGAG-CA-GA-AGTTTCGGGA-TCT-TA-----TAGT--TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-AACGACT-TTGCT--TCCCCTCTT-GT-TGA-T-GTATCA--GAACATA-TACGAGATATTTAT----ATATAA-T-TA-AT--GGTATATG-T-ACAACTGC--TTAATATCAGGATTGTG--AATGT----TTGA-T-------ATATG-TGTGTCC-TGAT-T-G-A--AC--AGTT-TAATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctagcctaattatgacaccttctcgagagtaagctatatgttcaacaatcaagtacttaatatgtttaGAAGTAGA--CATTTCACA------------A--A--TTACTAAA--TTATGTCCCAT-AGCACCA-TCT----CTTGc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                      A--GATTTGCCATTGTGCTGGCTTTG-GGTAGACAGTGGATG----------------------------A-TAATTC--ATCCTAAT-AGCG--T-GTCT----CTTTAATTGGCTAGCCC-----T---CTGTGCATAT-CATTGTTAGTTAATCTA-CAGACAAATAT-AT-AAAGTTTTTTCA-ATTTC-------TATCACTTTTATGTTAT-AAATTGTATCCGATATATGCA-TTATGTATTCTGAGTTATTC-T-ACAGGCGAGGCAGGA-GGT----GGAGTCTCTAAGGATT-GTTATCTGTAGTCC-TTTAAGCACCACGACTCTTGCTGGT--CATCTTGGTATGATT-GTATCAGGG-ACATATTAATATATAT---T----GTATGG-C-T-TATTGG---TACA-TGAC-----C--TTCAT---A-GTGCGTGGTATTATGATATTG-TTAACGTAGATATGATATAT-CTTGATAT-GCATCAT--CGTTATAATCTAAAAGCACAAT--CTTAATTAATTGTTCCATGGAGTCCAT--CAATTTAAT-CAAACTGTTTGCACATATAACATGTCA-AT-TTTTCTCTTAAAAGACTGTG-TAATG-AGTGTATTGTATATGCTGGCTTTG-GG--TAGAAG-TGGATATTTTTAAATAAATAATTGTCCTTATAGCACCGTC-TC-TGCTACCCT-CTGCATTCATGT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGT----TTGAT--------ATATG-TGTGT-C-TGTTAT-GCA--ACATTGTTTTAATCTACAGACACAAT--CTTAA-----TGTTTCATAG------TTTCAATTTATTACAAACTGTTT-CACATA-TACA---TG--TATTTTCTCTT-AAAGACTGTG-T-ATGTAGTAT---GTATATGCT-GCTTTG-GGGTAGAAAG-TGGATATTTT---ACAAT----CGTCC-TATAGCACCGTC-TCTTGCTACCCT-CAGCATCTATGTTATAATCTACA-ACACAGTCTTGTGTTT-CATAGTTTATCAA-TTTATTACAAA--CTGTTTCACAG--ATGCATGTATTTCT-G-TTAAGACACA-TA--GTAG--TA-GTTTTTGT-ATATA-TGCTTTG-GGT------AGAAGTGGA--TATTTTACA---T--------A--AAAT-----AA--T---GTCCTAT-AGCACCG-TCT----CTTGCTACC-TCTGCATCATGTTATAATCTACA-GACACATTAATCTTAT--TAC-------TAAA----TAACC----A---TGTCATAG-A-AAAAACTTATATTTAT-C------TCTATACATTAATATATC--TGTTCATGTGTACATGAGGCAGA
gi|5                          :         ACACAAGTAT--TTAATATGTA-CT--C--TTGGACA-------A-TGGACTT--GATTG--TT--C---TC-TTTGGACA-GT----A---TG---AAT-G---ACTTGGTTGGTTTCCAT-------CA-TTC-C-ATGTATAT---------TTT--CATG-ACACATATTTTCTG-TTAAAG-CA---GTCTTGTGTATGTA--GTTTTGC--T-GTGCTG-CTTTG-GGT-GA-AGTGGATATT--TATTTAATA-----AATCA-TGAAA-TCAT-C----TCTACT-AGCCC-T-GTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AT-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACAGAAGTGTT-A--G-TTTTTCA-ATTTCATCACTTCATCACTTTTATGTT-T-AAA--GTATC---TCTATACA-TTATGTA-TCTGA-TTATTC-T-ACA--TGAGGCA-GA-AGT----GGA-TCTCTA-------GT--TTTGTA-TCC-TTT-AGCA-C-CGACTCTTGCT--T--CC-CTT-GT-TGA-T-GT-TCA--G-ACATA-TACGAGATAT---TTATAATATAATT-TGTAT--G---TATG-T-AC----ACCTTCAATA-CA-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atattaccttcagtaagcatatgtcaGTGT-ATCAGAC-A-TATATTG--CTTTCA-TA--GGAGATAAGTTCATAAC--GATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTA---TGTATTa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATC--TGTTTAT-TGTACATGAGGCAGAAGTGGACTGT------TTCGTGTCC-TTTAGCATTGACTCCTATACTGCCCCTTG-TT-GGTGT-ATCAGAC-A-TATATATTGCAATCA-CAGGGGA----------TAAC--AATA-CTACCACTGACTAGTCACAGTGT-ATTAATTAACTTG---TGTATTgtctgtatttgtattaacgattatatatgttacatgtttatgcccatttgggccctgatttggtaaataaatactactacttatcatggcggccgatgacgtacaagaggcaattcattatacggctgctgtgcctacatagcatcaaacacattccattatccattaaaatgcc
gi|8                          :                                  --TCTTTGGACAGT-GTGAA-TGGACAA--GGTTGGTTT--CCATGT-AT---ATGTTTTTCCA---TGTTTCACAG---ACACA--TATTTTCTGTTCAAG-ACA-CTC-TTGTGTATGT------A-GTTTgtctgtatttgtattaacgattatatatgttacatgtttatgcccatttgggccctgatttggtaaataaatactact
gi|8                          :                                                                                                                                                  TGTATATGTTTTTCCATGTTT--CACAGACACATATTTTCTG-TTCAAGACA--CTC-TTGTGTATGTA--GTTTTGC-AT-GTGCTG-CTTTG-GGTAGA-AGTGGATATT--T------T------A--CA-TAAAA-TAAT-T--GTCCTA-T-AGCAC-T-GTCT----CTT------GCTA-CCC-----T---CTGC----AG-CAT-GTTA--TAATCTA-CAGACtgcatgtgctgctttgggtagaagtggatattttacataaaataattgtcctatagcactgtctcttgctaccctctgcagcatgttataatctacagac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctttggacagtgtgaatggacaaggttggtttccaACTGT------TTCGTGTCCTTTGAGCATTGACTCCTATACTC-CCCACATTT-GGTGTAATCAGAC-ATTATATATTGCAATCATTA--GGG----------GAATCAGATA-CTACCACTGACTAGTC-CAGTGTGAT---TTAACTTGTTTTGTATT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): ATTTCTTCATTGGCTATTGAATATATTATATATGTTGACATGTTATGCCATTTGGGCCATGATTTTAAGTAAATAAGATACTACTAG
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Unaligned ( gi|24 ): ATTTGGGTCCTGCTTTGGTAAATAAATACTACTACAT