lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111 1111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111
lowQualScore : 11111111111 1 11 111111 11 1111111111111 44444444444444444444444444444444 2222222 11111111 222222222 1 11 1111 1 1 1 33333333 22222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 222 22222222222 444444444 11 1 1111 1 1 1 2222222222222222222222 1 11 22222 111 111 111 1 5555 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111 3333333333333333333333 1 111111111 1111111 111111 111111111111 2 1111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 2222222 3 111 3333333333333 9999999999999999 8888888888888888888888888888888888888888888888888 111 11 333 1 6666666666666666 1 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 2 1 3 4 44444 22 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 11111 1 0000000000000000 1 11 1
lowQualScore : 3 3 77777 33 555 6 55555555555 3 3 3 0 3 44 3 0 3 5555 3 6 2 2 2 2 444 2 11 2 5555 444 888888 2 5 33 2 2 5 2 7777777777777 3 3 99999999999999999999999999999999 3 555 44 3 4444444 8 3 3 6 55555555 1 3 55 8 4 555555555 555 0 0 6 66 00 3 777 9999 6 8 4 4 66 0000 5 2 3 3 6 3 6 33333333 6 6 2 11111111 6 8 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 9 111 00000000000 000000000 3 3 33 2 0 7777 0 0 3 0 5555555555555555555555 0 3 3 33 55555 444 3 000 777 0 8 8 8 0 6 6666 1 66 0 4 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 66 5 22222 2 44 0 0 9999999999999999999999 888 55 5 5 7 4 4 77 444444444 3 2 0000000 3 444444 2 666666666666 4 66 4 3 5 2 5 6 8 0 1111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22 66 1111111 3 666 1111111111111 6 2222222222222222 6 6666666666666666666666666666666666666666666666666 0 777 3 66 000 2 0 8888888888888888 6 77 3 3 8 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 2 3 0 3 0 22222 44 0 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 6 55555 6 6 6 99 6 5 7 1 5555555555555555 8 8 6 8 11 3
lowQualScore : . . ..... .. ... . ........... . . . . . .. . . . .... . . . . . . ... . .. . .... ... ...... . . .. . . . . ............. . . ................................ . ... .. . ....... . . . . ........ . . .. . . ......... ... . . . .. .. . ... .... . . . . .. .... . . . . . . . ........ . . . ........ . . .......................................................................... . ... ........... ......... . . .. . . .... . . . . ...................... . . . .. ..... ... . ... ... . . . . . . .... . .. . . . .................................................... .. . ..... . .. . . ...................... ... .. . . . . . .. ......... . . ....... . ...... . ............ . .. . . . . . . . . .... ........................................................................................................................ .. .. ....... . ... ............. . ................ . ................................................. . ... . .. ... . . ................ . .. . . . ..................................................... . . . . . . ..... .. . .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. ... . ..... . . . .. . . . . ................ . . . . .. .
lowQualScore : 1 1 77777 99 999 2 00000000000 3 3 3 4 3 66 3 0 3 1111 1 2 9 9 9 7 777 7 00 7 7777 777 333333 7 3 33 7 7 5 7 3333333333333 1 1 22222222222222222222222222222222 1 444 22 1 2222222 9 1 1 2 66666666 2 6 00 9 0 111111111 444 6 3 0 11 66 9 888 4444 0 9 4 4 99 6666 0 6 2 3 7 3 7 33333333 7 7 2 00000000 7 0 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 555 55555555555 888888888 2 2 88 5 0 8888 0 0 2 0 2222222222222222222222 0 2 2 22 00000 000 2 555 555 0 0 0 0 8 7 8888 7 99 0 4 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 99 0 44444 3 88 1 1 4444444444444444444444 888 44 0 0 8 4 4 33 555555555 6 1 5555555 6 555555 3 999999999999 4 11 4 1 7 9 7 7 0 8 8888 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22 99 7777777 3 555 4444444444444 7 7777777777777777 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222 2 555 2 55 000 5 0 8888888888888888 7 55 3 2 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 8 5 0 2 0 22222 00 0 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 777 7 22222 7 7 7 22 7 5 3 4 0000000000000000 0 0 0 0 00 6
consensus : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--T-C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAAAAATG-G-AA-GAAT-GAGTG-T-------------AA-A-AANTTT-----T--------------TTA-A---CTA-A---A--A-T---A---AAAATTNCA-C-AGG-ATGAATAAAA--TTTATT-G--GANTTTT-CCTGCCTCTTTTA-T-CTGCANTCCGAAA--CG--ATNT---TAC----GATGGCGA-CAC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANGTATGTAT-TAATTGCA-T-A-GTATA------ATG-TA-TATNT-TACTT-AAATATGTA-TGTGT-GTT---GT-------------T-TTAA-----------GTTCTA--A-GT--TCNT--A----T-TAA--------TTTGTTTTCAT--NAAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT-----------C--TT-AG---TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATATG-C-TTCAAAGC-ATT---CA-CAAA-GATC-T-ACTAAAGA-AACAATTT----AATTTTTAAGTCG--T-A-AC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCATC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--NATACATGT-----------ATGTGCAACCC---AATAT-ATTT-CTT-T-A-AAAT-CG-AGT---------A-AAGAAACC-----A-TTN-----AATTTCAAA--GTCGT-AAC-AT--T-TCCTAAATC-GAAAA-CGTATC-GTTA-AAAAGAGAGAGA-GA-GAG----------------------AG-CAC---G-CTAA---AT--GATACA--------T-GTA-GT------AGACATG---------------TTCTTTCA-AA----ATC------GAAAAA--ATCATT--AG-------AGAGAGAGAGAGAGA--GGGCAC-------------GT-GTAACCC-T--------T--TCTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CC-----------------A----------AGTCG---------TTCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGNTGTC-AATCACATTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCTT-GAAATGCNCGAGC-GCACACC-A-TACTTTTAGA-C-T-GGACCATGCAG-CTGC--TTGATT-CGACGCGTTTGA----TTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTNTACAATCTCT-GAATGCAAA--GTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATC-T-CGGT--AATATTCA-GTCCCCCCT-CACC----GG-TC--TAATTG-AGAAGCGATTA---GAA--A----TATAC--AAAGC-AAA------TTAG--AGA-ATT-TCTA-CACC--T-------------A-----------------CCTTTGTTTTG--AC--AA-GCTAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------AATT-CCTATGA--AAACAC---CG-GGGTT-CGGT-ATGTCGTAANTAAT-CCAAC----GTGTAGCATTAC---AA--TGGTTTCA-AC-C-AT---CAA-AGTTTCT-CCGCC-GC-GAT---GAATTG-TTG----TT-GAAA-AATAAG-AAACAA--AATCCAAAGA-GGTAAATAAATA-ACAC-ACTA--CTCTGT-AAG-TATTT-T--TAGTCGTCATTGA
Reference ( gi|2 ) : AAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--T-C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAAAAATG-G-TA-GAAT-GAGTG-T-------------AA-A-AATTTT-----T--------------TTATA---CTA-A---A--A-T---G---AAAATTACA-C-AGG-ATGAATAAAA--TTTATT-G--GATTTTT-CCTGCCTCTTTTA-T-CTGCAATTCAAAA--CG--ATCT---TAC----GGTGGCGA-CAC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAAAGTATGTAT-TAATTGCA-T-A-GTATA-----AATG-TA-TATTTATACTT-GAATATGTA-TGTGT-GT----GT-------------T-TTA------------GTTTTA--A-GT--TCGT--A----T-T----------TTTGTTTTCAT--AAAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT-----------C----------TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATATG-C-TTCAAAGC-ATT---CA-CAAA-GATC-T-ACTAAAGA-AACAATTTTAAAAATTTTTAAATCA--T-A-AC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-A--TA---TTGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCC---AATAT-ATTT-CTT-T-A-AAAT-CG-AGT---------A-AAGAAATC-----A-TTT-----AATTTCATA--GTGGT-AAC-AT--T-TTCTAAATC-G-AAA-CGTATC-GTTA-AGAAGAGAGAGA-AG-GAG----------------------AG-CAC---T-CTAA---AT--GATACA--------T-GTA-GT------AGACATG---------------TTCTTTCA-AA----ATC------AAAAAA--ATCATT--AG-------AGAGAGA-AGAGAGA--GAGCAT-------------GT-GTAA-------------T--TCTTTCAAGATCCAATAAAG-G-CC-----------------A----------AGTTG---------TTCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGT-C-GTGCAGTGTC-AATCACA----------------ACTACTAGATTGTCTT-GAAATGCTTGAGC-GCACACCGA-TACTTTTAGAAGGTCGGACCATGCAGACTGC--TTGATTACAACACGTTTGA----TTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGAGTTATA-AATCTCTGGAATGC--A--GTGATATTGTTGT-AATGC-------GTA------AATC-T-TGG---AAT-TTCAGGTCCCTCTTGCACCACCTGGCTCTATAATTG-AGAAGCG--TA---AGA--T----TAT-C--AAAGCTCAA------TTAG--AGA-ATT-TCTA-CACC----------------A-----------------CCTTTGTTTTG--AC--AA-GCTAGGGGGAAAGCA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------AATTCCCTATG---AAACAT---CG-GGATTACGGTAATGTCATGATTAAT-CCAGC-CCAGTGTAGCATTACCCTAAATTGGTTTCACACACAAT---CAA-AGTTTCT-CCGCCTGC-GAT---GAATTG-TTA----TT-GAAA-AATAAG-AAACAA--AATCCAAAGA-GGTAAATAAATAGACACTCCTAATCTCTGT-AAG-TA-TT-T--CAGTCGTCATTGA
gi|12 : AAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--TTG-T---GT-T-GG-TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--T-C-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---AC----ACAAAAAATG-G-AA-GAAT-GAGTG-T-------------AA-A-AA----AAAAAT--------------TTAAA---CTA-A---A--A-T---A---AAGATTACA-C-AGGGATGAATAAAA--TTTATT-G--GATTTTTTCCTGC-TCTTT-A-T-CTGCAATTCGAAA--CG--ATAT---TAC----GATGGCGA-CAC-TGACGGTAA-TCAAA----AAG-AAAGGTATGTAT-TAATTGCA-TAA-GTAC-------ATG-TA-TATATTTACTTAGAATATGTA-TGTGT-GT----GT-------------T-TTA------------
gi|17 : taAAGTCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TTAGGTG-CCTAAC-A-A--TGCG-CACC-C-CCAAC-TTTCGCG-------------------C-GGAAA-AAC-C-TTAGTCCAT---AT-GTATT--GCT----GCGCC---CCCAT-A-AAAAAATGTG-TA-AAA---A------------------AA-A-AATTA-----------------------AAA---CTA-T---A--G-T---A---AAAATTACT-C-AGG-ATGAATAAAA--TTTATT-G--GAATTTT-CCTACTCTTTTTA-A-CTGCATTCCGAAA--CG--ATCT---TGC----GATGGAGA-CAC-TGACGATAA-taattattcatttagttctaagtt
gi|21 : cgtaAAGTATCGTGTA-TC-AT-----GCGCAC--TC--GCG-TA--AT-T-AACTGCA--ACC-C-AACAT-T-----GAA--CAA-A-T-AATC-C-C-CCAAA-AAC-C-TTGGTCC-T---AT-GTATT--A-T----GCGCA---TC----C-AAAATTTG-A-CA-AAAT-G-GTG-T-------------GC-A-AATTTTG----T--------------TTA-A---TTA-A---G--A-TAAAA---AAAATTGCA-G-AGT-A-GTAT-AAC--TTTATT-GAAAATTCCT-CCTca
gi|34 : taAAATCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TT--
gi|6 : cgtaAGTCCCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TC--ATG-T---AC-A-A--TGCG-CACC-A-CC-AC-TTTGGGGGAGTAAA-A-C-A----C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTC--T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---TATA--A-AAAAAATG-G-AA-AAAGAGAG-G-T-------------AACA-AATTTT-----C--------------TTAAAACTCTA-A---A--A-T---ATT-AAAAGTCCA-T-AGG-ATGA--------TTTG---G--AAATAGT-CTTGCATGTT---------CA---CGAAA--CA--TTGT---TAC----GAT-------AA-TGACGGTAA-TC--A----TAGTAAACGTATG-ATATAATTGCA-T-ATGTATATGTTTAATG-T--TATTT-TAT----AATATGTAATGTGTTGT----GT-------------C-TTAAGATTATTATTAGTTCTA--ACGT--TCTT--AATAAT-TAA--------TTTGTTTTCAT--TAACAAAA--A-TTGT-------TTCTGGACATTACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-TCAGAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATATTGTTTAAACGGC----------TGCA-TTAA-CAAGT--TTG-----AATGAGTATATATGGC-T--AAGAC-ATT---CA-CAAGTAATA-T-AC-AAAGA-TATAATTTTAA---TTTTTAAGTCA--TTA-AC-A-T--TA-CTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA------TC----AGAGA--GAGAGGAGAGAGAGAGAGAGCACAAATGCTAATGATACATGT-----------A
gi|23 : gtatAGTCCCGTGTAATT-GT-----GCGCAT--TT--ATG-TTA-AT-T-G--CG----ACC-C-CCCAC-TTTGGGGAA--A-------A--T-C-T-GGAAACAAC-C-TTAGTCC-T---ATCGTATCTGG-T----GCGCA---TT----C-AAAAAATG-GAAA-GAAT-GAGGG-TA------------AA-A-AAATTT-----C--------------TTA-A---CCT-A---A--A-T---A---AAAATC-CA-T-AGG-gtaagacatgtgccgaatgttttgcttctatatt
gi|1 : gtatATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CC-AC-T--GGGGGA--AAA-A-CTA--TTC-T-GGAAA-A-C-C-TTAGTC--T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAAAA-TG-G-AA-GA-T-GAGT--T-------------AA-A-AAAATT-----T--------------AAAT----CTAGA---A--A-T---AGA-AAAATTACAAC-AGG-ATGAATAAAA--TTTATT-G--GATTTTT-CCTGC-TCTTTTA-T-CTGCAATTCGAAA--TG--ATCT---TAC----GATGGCGAGCAC-TGACGGTAA-TC--A----AAA-AAGGGTAT--AT-TAATTGCA-T-A-GTA-A-----TATG-TA-TATCT-TACTT-GA-TATGTA-T-TGT-GTT---GT-------------T-TTAA-----------GTTTTATAA-GTCTTTGT--A----T-T----------TA-GTTTTCAT--GAAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTA-TAAT--TTACGT-TGTACTATATAC--GATGAACTAATACAGTAAATCCATAT-----------C----------TGCA-TTATACAAGTA-TCG-----AATGAATATATATG-TGTTCAAAGTGATT---CATCAAA-GATCTT-ACTAAAGATAACAATT-----AATTTTTAAATCA--T-A-AC-A-T--TTCCTATAT-----------T-G-AAA--CTG--TA---TCGTC----NNNNN--NNNN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-----------NNNNGCGACGC---AACA--A--------T-G-AAATACA-TGT---------ATGTGCAACCCATATA-TTTTTGAAAATTTCAAAAGGT-GT-AAC-AT--T-TCCT-AATC-GAAAA-CGTATC-GTTG-AAAAGAGAGAGAGAGAGAG----------------------AG-CA----T-C-AA---AT--GATACA--------TGGTA-GT------A-AC-TG----------------TCTTTCA-AA----ATC------ATAAAA--ATCATT--
gi|14 : taaatATCTCATGTA-TTTGT-----GCGCAC--TT---TG-T---AT-TTG--TGCGGCACC-CACCCAT-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--T-C-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC----TCA---A-AAAAAATG-G-AA-GAAT-GGATGCT-------------AA-ACAAAATT-----T--------------ATAAA---CTA-A---A--A-G---G---AAAATTACA-C-AGGCATGAATAAAA--TTTATTGG--GATTTTT-CCTGC--CTTCTATT-CTG-AATTCGAAA--CG--ATCT---TAC----GATGGCGA-CACTTGACGGTAA-TC--A----AAA-AGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|5 : TCGTGTA-TA-GG-----GTGCAC--TT--GTG-T---GC-A-A--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-T--T-C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AC-GTATT--G-T----GCGCA---TCTAAAA-AAAAAATG-G-AA-GAAT-GAGGG-T-------------AA-A-AATTTC-----T--------------TAA-A---CTA-A---A--AAT---A---AAAATTCCA-C-AGG-ATGA------------TT-G--GAATTTT-CCT-CCTATTT-A-T-CTGCATTCCGAAA--CA--ATGT---TAC----GATGACGA-CAC-TGCCGGTAA-TC--A----AAG-AAACGTATGTAT-TAATTGCA-T-A-GTATA-------TG-TA-TATATTTACTT-AAATATGTG-TGTGT-TTTAAAAT-------------TATTA------------ATTT----A-GT--TCTT--A----A-TATACATGTACTTTGTTTTCATTTAAAAAAAA--AAT---AGTCAATT----------ACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT-----------CGTTTAAGGC-TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATGTG-C-TTCAAAGC-ATT---CA-CAAA-GATC-T-ACTAAAGA-AACAATTT----AATTTTTAAGTCA--T-A-AC-A-T--TTCCTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA---TCATTAGAGAGAGA--GAGA-GAGAGAG---ACGCGCA-AAAGGATAG-GATACAAGT-----------ATGTGCAACCA---AATAT-ATTT-CTT-T-ATATAT-CG-AGT---------A-AAAAAATC-----A-TTC-----AATTTCA
gi|15 : cgtatagtaTCGTGTA-TA-GG-----GCACAC--TT--GTG-T---AC-A-A--TGTG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-A--T-C-T-GGTAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCACA---TA----A-AAAAAATG-G-AA-GAAT-GAGGG-T-------------AA-A-AAATTC-----T--------------TTA-A---CTA-A---A--A-T---A---AAAATTCCA-C-AGG-ATG------------ATT-G--GAATTTT-CCT-CCTA-TTTA-T-TTGCATTCCGAAA--CA--ATGTTAATAC----GATGAGGA-CAT-TGACGGTAA-TC--A----AAG-A
gi|8 : ccgtatagtaCGTGTA-TT-GT-----G-GCGC--TT--ATGAT---AT-T-G----CG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--T-AAT-GGAAA-AAC-CATTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCG-A---TC----A-AAAAA-TG-G-AA-GAAT-GAG-G-T-------------AA-A-AAATTC-----T--------------T---A---ATA-A---A--A-T-------AAAATT-CA-T-AGG-ATGA------------TT-G--GAAT----------------A-T-CTGCA-TCCGAAA--CAT-ATGT---TA-----GATGACCAGCAA-TGACGGTAA-TA--A----TAG-AAC-GTATGTAT-TA-TTGCAAT-A-GTATA-----TGTA-TA-TATTTAT-TTT-AAATATGTA-TGTGT-GT----GTCTTAATTATTCATT-TTA------------GTTCTA--A-GT--TCATTAA----TATAA--------TTGGTCTTCAT--TAAAAAAATTGATTCTA--CAATT-ATA-----TAA-AATTATATTTAAGTCTCTAAC-TAT-C--GAT-AAC-A-T-CACGAAATCCATAT-----------TCGTTTAACGGTGCAATTAAACA-GTAATTGGGAAAAATGAGTATATATG-C-TTCAAA-C-ATTGGGAA-CAAA-GATC-TAACTAAAGA-TATAATTT----AATTTTTAAGTCGACT-A-ACAA-T--TTACT-AAT-----------T-G-AAA--
gi|11 : atcgtcATGTA-TT-GCTTTTAGCGCACCCTT--GTGGC---ACAC-A--TGCG-CACCTC-CCCACGTTTGGGGAA--ACATA-C-A--T-T-T-G-AAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-G-ATT--G-TCAGTGCGCGGGTCC----A-AAACAATAAG-TGCGAAT-TAATG-CTAGTTAGTTTACAAA-A-GATTTT-----TAAATCTTTAAACAGTTATAT--CCA-ATCCG--A-T---G-------TGACA-CCAGG-ATGAATAAAA--TTTATT-G--GA--TTT-CCTG-CTC-TTTA-TCCTGCAATTCGAAACCCGCCATCT---TACCGCTGATGGCGA-CAC-TGACGGTAACTC--AACAGAAG-AAACGTATGTATCCAATGGCA-TGA-GT-TA-----CATGCTACTATTTA-A-TT-AAAC-TGTA-TGTaacg
gi|32 : aTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--ATG-T---AT-T-A--TGC
gi|22 : aataccataaagtatggAC--TC--ATG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--T-C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAAAAATG-G-AA-GAAT-GAGGG-T-------------AA-A-AA-TTT-----C--------------TTAAA---CTA-A---A--A-T---A---TAAATTCCT-T-AGG-ATGATTGGAA--T
gi|13 : gtaaaa--T-C-T-CAGAA-AACAC-TTCATCC-T---AT-GCAAT--G-T----GTACA---TC----C-TAAAAATG-A-CA-ACAT-GGGTG-T-------------TC-A-GATTTC----------------------------CTA-A---ATTA-T---GGTCAAAATTCCA-C-AGG-AT-AATAAAACCTTT-TT-G--AAatctgcattctgaaa
gi|27 : gggggggggggAA-AAT-C-CAAGTCC-----AT-GTATT--G-T----GTGCA---TC----C-AAAAATCA-A-CA-AAAT-AGGTG-T-------------aatacagtaccatattggtatatttatttgctttcatgagatcatgttaatgatgatgacaacttccataaaaggctgtgtacttaatgcacttatagacatgcttattttcatatttattcattttgtaatgaggtattatagataattagttt
gi|31 : ccaacatttgaaaaaaagattccagatttcttcGTCC-TTCAAT-GTATT--G-T----GCACA---TC----C-AAAAATCA-A-CA-AAAT-TGGTG-T-------------
gi|18 : gAA-GATA-T-ACTAAAAA-AACACTTT----AATTTGTTTGTCA--T-A-AC-ATT--TT-CTAAAT-----------TAA-AAA--C-G--TA---Tg
gi|26 : AAAGA-AACAACTTTAA---TTTTTAAGTCT--TTA-AC-A-TGTTC-CTAAATGTGCAATTACTT-G-AAAACC-A--TA---TCATG----AGAGAAGGAGA-GAGAGAG---catttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattttcttacaagatccaataaagaaccagtcataattg
gi|19 : TTTCAAATTG--T-A-AC-A----------AA--------------G-AAA--C-AATTAGATTTTTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG----CACGCT-AAATGATA--CATGTATGTGTGTAGTAGACATGTGCAACCC---AATGA-ATTT-CTTAC-A-AAAT-CT-AATTTAAAAAAAA-AAAAAAAC-----A-GTT-----AAATT-----------------T--T-TTTTAAATT-G-AAA-aa
gi|3 : agagagagagagagagagcgcaaaatgatagtagacatgtgcaacccaatatatttcA--T-AGAC-A-TG-TT-CT---T-----------T-C-AAA--------A---TCATT----AGAGA--GAGA-GAGAAAG---GGGC----------------------------------ATGTGTAACCC---GTTATTATTTTCTT-TCA-AGAT-CC-AAT---------A-AAG-AACC-----A-TTG-----AG--TCATA--ATTGA-AAA-AT--TGTTCCA
gi|4 : gggggggcgggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgatacatgt-AC-A-TG-TT-CT---T-----------T-C-AAA--------A---TCATT----AGAGA--GAGA-GAGAAAG---GGGC----------------------------------ATGTGTAACCCGTTAATAT--TTT-CTT-TCA-AGAT-CC-AAT---------A-AAG-AACC-----A-TTG-----AA-GTCATA--ATTGA-AAA-ATTGT-TTCCAgttatgttgacaggtaaagtccgtgcgttgtcaaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttgaaatgcacgagcggcacaccataatctaccatgcagctgcggcgtttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgtttacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggttaacatcaggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaattgagaagcgattagaaatatacaaaagcaaaattagcagaatttctaccacctctacagctggctgcagcctttgttttgacaagctagggggaacaggtgtttattacacgcacgtgggaaattcctatgaaaacaccgagttggttatgtcgtaaataccaacatgtagcatgtttctcccgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaacaaaatccaaagaggtaataattacacatacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgttcccaaatattactactagagacgggtcttatgagaatttcgagctaccgctgattttgccgactgtatgtacccgtacatcgtcgaccttttagtt
gi|19 : gcggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcgatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgataatgtagtag----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---A-GCGCA-AAATGATA--G-TAGA--C-----------ATGTGCAACCC---AATAT-ATTT-CTT-T-C-AAAT-TGTAAC---------A-AAGAAACA-----A-TTA-----GATTTgttatgttgacggtaaagtccgtgcgttgtcaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttggaaatgcacgagcggcacaccatatctaccatgcagctgcgtgctttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgacaatgtgtattacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggtaaatcggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaaattgagaagcgattagaaatatacaaagcaaattagcagaatttctactcacctctacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatgtttctccacgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaaacaaaatccaaagaggtaataattacactacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|3 : G---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCC---AATAT-ATTT-CTT-TAA-AAAT-CG-AGT---------A-AAGAAATC-----A-TTC-----AATTTCAAA--GTGGT-AGC-AT--T-TCCTAAATC-GAAAA-CGCATC-GTTN-NNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAA-CAC---G-CTAA---AT--GATACA--------T-GTA--T------AGACATG---------------TTCTTTC--------------------AAA--ATCATT--AG-------AGAGAGAGAGAAAG---GGGCAT-------------GT-GTAACCCGTTATTATT-T--TCTTTCAAGATCCAATAAAGAA-CCATTGAGTCATAATTGAAA----------AATTG---------TTCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAAATCACATTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCTT-GAAATGCACGAGCGGCACACC-A-TAATCT-----------ACCATGCAG-CTGC----G--------GCGTTTGATTTTTTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTT-TACAATCTCT-GAATGCAAA--GTGATATTTGTGT-AATGCA------GTACCGGTTAACA-T-CAGGTAAATATTCA-GTCCCTCCT-CACC----GG-TC--TAATTG-AGAAGCGATTAG--AAA--TA---TAC-A--AAAGCAAAA------TTAGC-AGA-ATT-TCTACCACCTCTACAGCTGGCTGCAG-----------------CCTTTGTTTTG--AC--AA-GCTAGGGGGAA--CA-GG-TGT-----------TTAT-TACACGCACGTGGGAAATT-CCTATGA--AAACAC---CG-AG-TT--GGTTATGTCGTAAATA---CCAAC----ATGTAGCAT------------GTTTC--------T---C-----------CCGC---C-GAT---GAATTG-TTG----TT-GAAA-AATAAG-AAACAA--AATCCAAAGA-GGT-AATAATTACACA----TA--CT-TGT-AAG-TATTT-T--TAGTCG-CATTGAttcagagagagagagagagcacgctaaatgatacatgtatgtgtgtagtagacatgtgcaacccaatgaatttcttacaaaatctaatttaaaaaaaaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|4 : gggggggcgG---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCC---AATAT-ATTT-CTT-TAA-AAAT-CG-AGT-----------AAGAAATC-----A-TTC-----AATTTCAAA--GTGGT-AGCGAT--T-TCCTAAATC-GAAAA-CGCATC-GTTN-NNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA-AA-CAC---G-CTAA---AT--GATA-A--------T-GTA-GT------AGACATG---------------TTCTTTC--------------------AAA--ATCATT--AG-------AGAGAGAGAGAAAG---GGGCAT-------------GT-GTAACCCGTTAATATT-T--TCTTTCAAGATCCAATAAAGAA-CC-----------------ATTGAAGTCATAATTGAAAAATTGTTTCCAGTT---ATGTTGAC-GG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTC-AATCACATTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCTTGGAAATGCACGAGCGGCACACC-A-TATCT------------ACCATGCAG-CTGC--GTGCTT-TGAT---TTT------TTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGACAATGTGTATTACAATCTCT-GAATGCAAA--GTGATATTTGTGT-AATGCAGTACCGGTA------AATC----GGTA-AATATTCA-GTCCCTCCT-CACC----GG-TCTA-AATTG-AGAAGCGATTA---GAA--A----TATAC--AAAGC-AAA------TTAGC-AGA-ATT-TCTA-C-TC----------------A-----------------CCTCTagttgttcccaaatattactactagagacgggtcttatgagaatttcgagctaccgctgattttgccgactgtatgtacccgtacatcgtcgaccttttagtt
gi|5 : gc-A-AGAT-CT-ACT---------A-AAGAAACA-----A-TTT-----AATTTTTAA--GTCAT-AAC-AT--T-TCCTAAATT-GAAAA-CGTATC-ATTA-GAGAGAGAGAGA-GA-GAG----------------------AGACGC---G-CAAAAGGATAGGATACA--------A-GTATGTGCAACCAAATATA---------------TTTCTTTATAT----ATCGAGT--AAAAAA--ATCATT--acagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatgtttctccacgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaaacaaaatccaaagaggtaataattacactacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|18 : cgtatagtatcgtgtatagggtgcacttgtgtgcaatgcgcaccccccactttggggggaaaacttctggaaaaaccttagtcctacgtattgtgcgcatctaaaaaaaaaatggaagaatgagggtaaaaatttcttaaactaaaaataaaaattccacaggatgattggaattttcctcctatttatctgcattccgaaacaatgttacgatgacgacactgccggtaatcaaagaaacgtatgtattaattgcatagtatatgtatatatttacttaaatatgtgtgtgttttaaaattattaatttagttcttaatatacatgtactttgttttcatttaaaaaaaaaatagtcaattactaattatttacgtctgtacctatcgataacaatcagtaaatccatatcgtttaaggctgcattaaacaagtatcgaatgagtatatgtgcttcaaagcattcacaT---------A-AAAAAA-C-----ACTTT-----AATTTGTTT--GTCAT-AAC-AT--T-TTCTAAATTAA-AAA-CGTATC-ATTcaatttca
gi|6 : aagatatac---------A-AAGATATA-----A-TTTT----AATTTTTAA--GTCATTAAC-AT--T-A-CTAAATT-G-AAAACGTATCAGAGAGAGAGGAGAGAGA-GA-GAG----------------------AG-CACAAATGCT-A---AT--GATACA--------T-GTA-GTA-----AGACATG---------------Ttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattttcttacaagatccaataaagaaccagtcataattg
gi|19 : gtatagtcccgtgtattgtgcgcactcatgtacaatgcgcaccaccactttgggggagtaaaacactggaaaaaccttagtctatgtatttggtgcgcatataaaaaaaatggaaaaagagaggtaacaaattttcttaaaactctaaaatattaaaagtccataggatgatttggaaatagtcttgcatgttcacgaaacattgttacgataatgacggtaatcatagtaaacgtatgatataattgcatatgtatatgtttaatgttattttataatatgtaatgtgttgtgtcttaagattattattagttctaacgttcttaataattaatttgttttcattaacaaaaattgtttctggacattactaattatttacgtctgtacctattcagataacaatcagtaaatccatattgtttaaacggctgcattaacaagtttgaatgagtatatatggctaagacattcacaagtaatatacAGAGAGAGA-GA-GAG----------------------AG-CAC---G-CTAA---AT--GATACATGTATGTGT-GTA-GT------AGACATGTGCAACCCAATGAATTTCTTACA-AA----ATCTAATTTAAAAAA--Agccgaatgttttgcttctatatt
gi|19 : agagagagagagagagagcgcaaaatgatagtagacatgtgcaacccaatatatttctttcaaattgtaacaaagaaacaattagatttttcAGAGAGAGA-GA-GAG----------------------AG-AGC---G-CAAA---AT--GA---------------TA-GT------AGACATGTGCAACCCAATATATTTCTTTCA-AATTGTAAC------AAAGAA--ACAATT--AGATTTTTCAGAGAG--AGAGAGA--GAGCAC-------------Gaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|28 : GAGG-AG-AAA----------------------AA-CAC---T---AA---ATT-GAT-CA--------T-GTA-GTA-----AGACATG---------------ctaaatgatacatgtatgtgtgtagtagacatgtgcaacccaatgaatttcttacaaaatctaatttaaaaaaaaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|1 : -GT------A-ACAT----------------TTCCT-----A----ATC------GAAAACGTATCGTTGAAA-------AGAGAGAGAGAGAGA--GAGCATCAAATGATACATGGTAGTAA-------------CTGTCTTTCAAAATC--ATAAAA-A-TC-----------------A----------gttgcacgaacgttttctttctaataattt
gi|5 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtACAT----------------TTCCT----AA----ATT------GAAAACGTATCATT--AG-------AGAGAGAGAGAGAGA--GAG-AC-------------GC-GCAA-------------ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|16 : cgtatagtatcgtgtatagggtgcacttgtgtgcaatgcgcaccccccactttggggggaaaacttctggaaaaaccttagtcctacgtattgtgcgcatctaaaaaaaaaatggaagaatgagggtaaaaatttcttaaactaaaaataaaaattccacaggatgattggaattttcctcctatttatctgcattccgaaacaatgttacgatgacgacactgccggtaatcaaagaaacgtatgtattaattgcatagtatatgtatatatttacttaaatatgtgtgtgttttaaaattattaatttagttcttaatatacatgtactttgttttcatttaaaaaaaaaatagtcaattactaattatttacgtctgtacctatcgataacaatcagtaaatccatatcgtttaaggctgcattaaacaagtatcgaatgagtatatgtgcttcaaagcattcacaaagatctactaaagaaacaatttaatttttaagtcataAAAA--A--ATG--AG-------AGAAAGAGAGAGAGAAGGGGCAC-------------GT-GTAACCCTTATTAGAATT--TCTTTCAAGATC-AATAAGA-G-CC-----------------A----------AGTCA---------T---AATTGAAAAATTCACAA---AAAGT-CCGTGCAGTGTC-AAACACAGTTGATAG--------ACTACAAGATTGTCTT-GAAATGCTTGAGC-Gaaggataggatacaagtatgtgcaaccaaatatatttctttatatatcgagtaaaaaaatcattcaatttca
gi|1 : aaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaccatgtgtaaacccgttatagatatcttttCAT-------------GT-GTAA-------------T--TCTTTCA-GATCCAATAAAG-GACC-----------------A----------AGTTG---------ATCCACTT---ATGTTGACAGACTAAAGT-CCGTGCAGTGTC-AATCACA----------------ACTACTAGATTGTCTT-GAAATGCTCGAGC-GCACACCGATTACTTTTAGACCGTCGGA-CGT-CAG-CTCA--TTGATT--AACGCGTTTGA-----TTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATA-A--CTCT-GAATGCA-A--GTGATATTG-TGT-AATGCA------GTA------ACTCGT-T-----AATATTCATGTCCTCCT--CAC--CCCG--TC--TAATTGCAGAAGCGA-TT---AGA--A----TAT-C--AAAAGCAAA------TTAG--AGA-ATT-TCTA--A-C----------------A-----------------CCTTTGTTTTG--AC--AA-GCTAGGGGGAA--CA-GGTTGT-----------ACAT-T--------------AAT--CCTATG---AAACAT---CG-GGATT-C-GT-ATGTCATAATTA---CCAGC----ATGTAGCATTACC--AAATTGGTTTCACAC-CAAT---CAA-AGATTCT-CCGC---C-GAT---GAATTG-TTA----TT-GAAA-AATAAG-AAACAA--AATCCAAAGAGGGTAAAT-AATA-ACA---CTA----CCGT-AAG-TA-TT-T--CAGTCGTCAT
gi|18 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-------------T--TCTTACAAGATCCAATAAAG-A-AC-----------------C----------AGTgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|7 : aagatatactaaaaaaacactttaatttgtttgtcataacattttctaaattaaaaacgtatcatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattAGATTGTCTT-GAAATGCTCGAGC-GCACACCAA-TACTTTTAGAACAT-GGACCATGCAG-CTGCA-TTGATTACA-----CTGGA--------TTTCCCTTTCGAAAATGACTTGTTTG-AATT-GTTGTATAATCTCT-GAATGC--AAGATGATATCTTTGTAAATGCA------GTA------AATC-TCTGGT--AATATTCA-ATCCTCCT--CACC----GAATC--TAATTG-AGAA-CGA-TA---GAA--A----TATAC--AAAGCAAAA------TAAG--AGA-ATT-TCTA--A-C----------------A-----------------CCTTTGTTTTG--AC--AA-GCTTAGGGGGATGCACGG-TG------------ACAT-T--------------AATT-CCTATG---AAA-ACGGACG-GAGTT-CGGT-ATGTCATAAT--AT-CCAG---CAGTAATGCATAAC---AA--TGGTTTCA-ACCCCATATACAATAGTTTCT--CGCC-G--GAG---CAATTGTTTA----TA-GAAT-AATA---GAACAA--AATCCAAAGA--GTATAT-AATA-ACA---CTGA--CCTGTAAAG-TA-TTCT--TGATCTCCATTGAcataattg
gi|29 : GATTGTCTT-GAAATGCACGAGC-GCACACC-A-TACT-------------ACCATGCAG-CTGCGTTTGATTtgtcctaaatatactactagagctggtctaatgagtcgagttaaaaccgcgatacgaagaatggcgacttactgtatcaccgtac
gi|10 : AATTG-AGAAGCGATTA---GAA--A----TATAC--AAATTTTAAAGCAAATTAG--AGA-ATT-TCTA-CACC----------------ATTAGAGCCGGTAACAG-CCTTTGTTTTG--AC--AA-GCTAGGGAGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-TACACCCACGTGGA-AATT-CCTATGA--AAACA----CA-GAGTT---GT-ATGTCGTAAATA---CCAACATTTGT-TAGCAT------------GTTTC---------------------CT--CGCC----GAT---GAATTG-TTGTGGTTT-GAAA-AATAAG-AAACAA--AATCCAAAGA-GGC---TAAATATTCAC-ACTA--CTTTGT-AAGTTA-TT-TTCCAGTCGTCGTTGAtt
gi|9 : AATTG-AGAAGCG--TAGTTAGAAGTAAAATAT-TTAAAAGC-AAA------TTAGTAAGAGATTGTCTA-CACC----------------ATTAGAGCCCGTAACCAGCCTTTGTTTTGATAC--AATGCTAGGGAGGAACAA-GG-TGTTATTACGACCCACGTGT--------------AATTGCTGATGAAAAAACAC---CGAGGAGTTTTGTAGTGT-A-----AATACCAAA-C--ATGTAGCATTagttgtttcctaaatatttactactagagcggtcttatgaatttgagctaccgcgttatttgccgacaagatgttttgtgtatgtactcgcgacctttatttct
gi|25 : --AGA-ATT-TCTA-CACCCTTCACA---------G-----------------CTTTTGTTTTG--ACCAAA-GCTAGGGGGAAgtattctaccagccgagatatagaattgttgtttgaaacaataagaaacaaagaatccaagaggtaattaattcagtacaacatgtaaaatgtcttcgtcgtcgggtgaagtgttgttctaaataattactacttaactgcgtcttatgatatttttgaagctaccgcttattgtggccgactgtagtgttactcgccgacctttttag
gi|20 : A-ATT-TCTA-CATCTATGCA----------G-----------------CCTTTG-TTTG--AC--AA-A--AGAG---AAACA-GG-TGT-----------AAAT-T--------------AAATGCACGTG---GAA-AT---CG-GGgaagtaaacatatgttttattaacaagctaccatcacgtttgaaatt
gi|4 : gattagaataatagaaatattcaGTTTCT-CCAC--GCCGAT---GAATTG-TTG----TT-GAAA-AATAAGAAAACAA--AATCCAAAGA-GGT-AATAATT--ACACTACT------TGT-AAG-TATTT-T--TAGTCG-CATTGAgcttcatataagcaactggtatgtccgaatttgttgtgaataccagtgtgaggcaccaattattgttgaaaagtacggaacaaaaaccaaag
gi|9 : gcggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcgatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgataatgtagtagacatgttctttcaaaatcattagagagagagagaaaggggcatgtgtaacccgttaatattttctttcaagatccaataaagaaccattgaagtcataattgaaaaattgtttccagttatgttgacggtaaagtccgtgcgttgtcaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttggaaatgcacgagcggcacaccatatctaccatgcagctgcgtgctttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgacaatgtgtattacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggtaaatcggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaaattgagaagcgattagaaatatacaaagcaaattagcagaatttctactcacctctacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatTTCTACCAGCCGA-GATATAGAATTG-TTG----TTTGAAACAATAAG-AAACAAAGAATCC-AAGA-GGTAATTAAagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GTCGTCATTGAAGTTGTTCCCAAATATTACTACTAGAGCGGTCTTATGAAATTTCGAGCTACCGCTGATTTTGCCGACTGTATGTACCCGGTACTCGTCGACCTTTTAGTTTC
Unaligned ( gi|30 ): CACAAACGCTAATGATACATACATGTAGTAGACAGTCCCGAAAGTTTTCTCCCTA
Unaligned ( gi|33 ): TAAAGTAAAAATTCCACAGGATGATTGGAATT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 11 111111 1111 1111111 33333333333333 111 222222 11 1 222 222222222 99999999999999999999999999999999999999 333333333333 11 222222222 11 1111 999999999999999999 22222 111 1 1111 111 1111111 222222222222222 222222222222 111 22222222222 1 2222222222 11111 111111 1 1 7777777777777777777777 11 333333333 1 888888888888 111 2222 77777777777777777777777777777777 111 11 222 66666666666666666 1111 777777777777777777 111 333333 1111 1 1 2222222 2222222222222 1 1 22222222 11 2222222 1 11 1111 1111111111111111111111111111111111 1 1 222222222222 6666666666666666666666666666 111 33 1111 11111111111111111111111111111111111111 11111 111 1111 1 1 33333 22222 11
lowQualScore : 2 2 77777 33 444 5 111 000000 3 3 3 3 44 3 9 3 66 2 5 2 2 2 2 444 2 00 2 5555 444 999999 5555 5 2 2 2 777777 5 2 2 2 66 1 5555 7 2 2222 2 66666 2 1111111 444 2 33 2 2 2 2 99999999 0 3 77 44 22222222222222 3 3 8 3 55 88 1 666 3 7777 7 3 3 3 55 8888 4 1 5 5 5 5 5 222 888888 5 5 5 00 5 0 333 5 666666666 99 11111111111111111111111111111111111111 99 6 1 666666666666 8 99 11 11 666 555555555 11 11 8 2222 8 8 0 8 888888888888888888 8 0 0 88 00000 8 8 0 3 8 444 8 6 6 6 5 1 2222 555 5 5 7777777 0 444444444444444 66 5 777777777777 77 5 666 5 222 1 33333333333 1 5 5 1 5 5 5555555555 5 1 44444 555555 77 6 2 0 3 3 3333333333333333333333 11 8 8 0 3 777777777 0 2 9 2 555555555555 666 5555 55555555555555555555555555555555 444 0 11 555 1 8 88888888888888888 5 5 1 5 5 6666 555555555555555555 6 999 111111 5 0 0 7777 8 8 3 0 8 0 0 8 3333333 3333333333333 88 8 0 6 0 6 8 8 11111111 11 5 5 66 0 888 0 888 1111111 0 5 55 4 4 1111 7777777777777777777777777777777777 66 66 5 5 0 5 0 5 444444444444 5 1111111111111111111111111111 5 5 7 77 5 0 77 777 6 1 00 6 5555 99 33333333333333333333333333333333333333 33 77777 000 0000 5 5 5 5 66 5 2 2 66666 5 0 55555 5 5 00 5 7
lowQualScore : . . ..... .. ... . ... ...... . . . . .. . . . .. . . . . . . ... . .. . .... ... ...... .... . . . . ...... . . . . .. . .... . . .... . ..... . ....... ... . .. . . . . ........ . . .. .. .............. . . . . .. .. . ... . .... . . . . .. .... . . . . . . . ... ...... . . . .. . . ... . ......... .. ...................................... .. . . ............ . .. .. .. ... ......... .. .. . .... . . . . .................. . . . .. ..... . . . . . ... . . . . . . .... ... . . ....... . ............... .. . ............ .. . ... . ... . ........... . . . . . . .......... . . ..... ...... .. . . . . . ...................... .. . . . . ......... . . . . ............ ... .... ................................ ... . .. ... . . ................. . . . . . .... .................. . ... ...... . . . .... . . . . . . . . ....... ............. .. . . . . . . . ........ .. . . .. . ... . ... ....... . . .. . . .... .................................. .. .. . . . . . . ............ . ............................ . . . .. . . .. ... . . .. . .... .. ...................................... .. ..... ... .... . . . . .. . . . ..... . . ..... . . .. . .
lowQualScore : 9 9 11111 77 777 7 888 000000 1 1 1 1 22 1 2 1 88 9 7 7 7 7 5 444 5 33 5 3333 444 777777 3333 3 7 7 7 777777 5 7 7 9 88 0 0000 4 9 1111 7 77777 7 3333333 777 7 77 7 7 7 7 66666666 3 3 66 66 33333333333333 6 6 1 6 00 66 0 444 6 7777 3 6 6 6 55 5555 0 0 0 0 0 0 0 111 555555 0 0 0 99 0 0 000 7 555555555 22 77777777777777777777777777777777777777 22 7 0 000000000000 0 00 00 66 444 222222222 66 00 0 2222 0 0 8 0 666666666666666666 0 8 8 88 00000 0 0 8 2 0 000 0 7 7 7 7 4 1111 000 0 0 1111111 1 888888888888888 99 7 666666666666 99 7 888 0 999 6 88888888888 7 7 7 4 7 7 0000000000 7 7 33333 333333 99 7 8 0 2 2 8888888888888888888888 00 0 0 8 2 444444444 8 5 2 8 000000000000 000 8888 00000000000000000000000000000000 000 8 22 000 0 0 44444444444444444 0 0 0 7 7 0000 333333333333333333 7 000 777777 0 8 8 0000 0 8 2 8 0 6 8 0 8888888 6666666666666 88 0 8 0 0 0 0 0 22222222 00 7 7 99 1 888 1 888 2222222 0 0 00 4 4 7777 7777777777777777777777777777777777 99 99 0 0 8 0 0 0 111111111111 0 7777777777777777777777777777 7 7 1 99 7 4 99 555 7 0 77 7 0000 22 77777777777777777777777777777777777777 77 11111 000 6666 0 0 0 0 99 7 0 0 11111 7 7 99999 7 7 77 7 1
consensus : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G------AGTG-T-A-A--AAANTT--T-TTNA-A----CTA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATT-GGA-ATTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTA---A-----TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-GTATCG------TC----AGAGA--GA-GAGAGAGAG-GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTC-AAAGTGGTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAG-------------------C--AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACCC-T----A--TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG-A---C-CG---GACCATGCAG-CTGC--TTGATT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-CGGT-ATGTCGTAANTA--CCAG-C---ATGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGTAAATAAAT-A--CAC-ACTA--CTCTGT-AAG-TAT-TTT-CAGTCGTCATTGA
Reference ( family-2342 ) : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G------AGTG-T-A-A--AAANTT--T-TTTA-A----CTA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATT-GGA-NTTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATN-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTA---G-----TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-GTATCA------TC----AGAGA--GA-GAGAGAGAG-GCGCGCA-AAATGATA--NATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTC-AAAGTCGTAAC-ATTTCCTAAATCGAAAACGTATCGTTAAAAAGAGAGAGAGAGAG----------------------AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCGAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCACGTGTAACCC---------TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGNTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCNCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG-A---C-TG---GACCATGCAG-CTGC--TTGATT-CGACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTNTACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCCCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-CGGT-ATGTCGTAANTAATCCAA-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGTAAATAAAT-A-ACAC-ACTA--CTCTGT-AAG-TAT-TTT-TAGTCGTCATTGA
gi|1 : TCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CA-C-C-CCCAC---TGGGGGA--AAA-A-CTAT-TC-T-GG-AA-AAC-C-TTAGT-C-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC------AAA----AAATG-G-AAG--AT-G------AGT--T-A-A--AAAAAT--T-TAAA-T----CTAGAA-----A-TAG-A---AA---AAT-TA-CAAC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATT-GGA-TTTT--TCCTG-C-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--TG--ATCT---T-AC----GATGGCGAGC-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAA-AAGGG-TA---TA-T-TAATTGCA-T-A-GTAAT---A-TG-TA-TA-T-CT-T-ACTT---GATATGTA-T-TGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTTTATAA-GTCTTT--G----T---ATTTAGTTTTCATG-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACT-ATAAT--TTACGT-TGTACTATATAC--GATGAACTAATACAGTAAATCCATAT--C---------------TGCA-TTATACAAGTA-TCG-----AATGAATATATAT-GTGTTCAAAGTGATTC---ATCAAA-GATCTTA-CTAAAGATAACAA--TT----AATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TTCCTATAT-----------T-G-AAA--CTGTATCG------TC----NNNNN--NN-NNNNNNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-----------NNNNGCGACGCAACA-A-------TG-AAA-TACA-TGT----------ATGTGCAACCCATATATTTTTGAAAA--TTTCAAAAGGTGTAAC-ATTTCCT-AATCGAAAACGTATCGTTGAAAAGAGAGAGAGAGAG----------------------AGAGCATCAA--ATG-ATACATGGTAGTA-AC-TG-TCTTTCAAAATCATAAAAATCATT
gi|1 : taaataCATGTGTAA-------------TTCTTTCA-GATCCAATAAAGGA-CCA----AGTT--------------GA---------------TCCACTT---ATGTTGACAGACTAAAGTCC-GTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-GATTACTTTTAG-A---C-CGTCGGAC-GT-CAG-CTCA--TTGATT--AACGCGTTTGATTTT-TT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATA-A--CTCT-GAATGC-AAGTGATA-TTGTGT-AATGCA------GTA------A--CTC-GTT-AA-TATTCATGT-CCTCCT-CACCC----C-G-TC--T-AATTGCAGAAGCG--ATTAG-AATA---TCA---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GGTTGT-----------ACAT-T--------------A-------------A-T-CCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TT-C-GT-ATGTCATAATTA--CCAG-C---ATGTA--GCATTACC---AAATTGGTTTCAC--A--CCAAT---CAA-AGATTCTCCGC----CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGAGGGTAAAT-AAT-A---AC-ACTA----CCGT-AAG-TA--TTT-CAGTCGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|1 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTACTACTAGAGTGTCTAT-GAAAT-TTCGAGgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|10 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaat-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAATTTTAAAGC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACCATTAGAGCCGGT---------------AACAG-CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGAGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-T--------------ACACCCACGTGGAAATT-CCT-ATGAAAA--C-AC-AGAG--TT---GT-ATGTCGTAAATA--CCAA-C---AT--------TT------------GTT------A--GC-AT--------GTTTCCTCGCC-G---AT---GAATTGTTGTGGTTT-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGC---TAAAT-ATTCAC-ACTA--CTTTGT-AAGTTAT-TTTCCAGTCGTCGTTGAttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|11 : TGTA-TT-GCTTTTAGCGCACCCTT--GTGGC---ACAC-A--TGCG-CACCTC-CCCACGTTTGGGGAA--ACATA-C-A--TT-T-G-AAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-G-ATT--G-TCAGTGCGCGGGTCC----A-AAACAATAAGTGCG-AATTAAT-GCTAGTTAGTT-T-ACA--AAAGAT--T-TTTA-AATCTTTA-AACAGTTA-T---ATCCAATCCGATGTGAC-ACCA-GG-ATGAATAAAA--TTTATT-GGA---TT--TCCTG-C-TC--------TTTA-TCCTGCAATT-CGAAACCCGCCATCT---T-ACCGCTGATGGCGA-C-AC-TGACGGTAACTC--AACAGAAG-AAACG-TATG-TA-TCCAATGGCA-TGA-GT-TAC--A-TGCTACTA-T--T-T-AATT-A-AAC-TGTA-TGTagttgtttcctaaatatttactactagagcggtcttatgaatttgagctaccgcgttatttgccgacaagatgttttgtgtatgtactcgcgacctttatttct
gi|12 : aaAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--TTG-T---GT-T-GG-TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---AC----ACAAA----AAATG-G-AAG-AAT-G------AGTG-T-A-A--AAAAAAAAT-TTAA-A----CTA-AA-----A-T---A---AA---GAT-TA-C-AC-AGGG-ATGAATAAAA--TTTATT-GGATTTTT--TCCTG-C-TC--------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--CG--ATAT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TCAAA----AAG-AAAGG-TATG-TA-T-TAATTGCA-TAA-GTAC----A-TG-TA-TA-TATT-T-ACTT-AGAATATGTA-TGTGT------G-TGTT--TTATAATTATTCATTTA------------G-----------TTC--TAA-GTT
gi|13 : ta--TC-T-CAGAA-AACAC-TTCATCC-T---AT-GCAAT--G-T----GTACA---TC----C-TAA----AAATG-A-CAA-CAT-G------GGTG-T-T-C--AGATTT--C-CTAA-A----TTA-TG-----G-T---C---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-AT-AATAAAACCTTT-TT-GAA-AATA--CAGTACCATATTGGTATATTTA-T-TTGCTTTCATGAGA--TC--ATGT---TAAT----GATGATGA-CAAC-T---------TC--C----ATA-AAAGGCTGTG-TACT-TAA-TGCA-C---TTATAGACA-TG-CT-TA-T-TT-T-
gi|14 : gggggggggggTCTCATGTA-TTTGT-----GCGCAC--TT---TG-T---AT-TTG--TGCGGCACC-CACCCAT-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC----TCA---A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G------GATGCT-A-AACAAAATT--T-ATAA-A----CTA-AA-----A-G---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GGCATGAATAAAA--TTTATTGGGA-TTTT--TCCTGC---CT-------TCTATT-CTG-AATT-CGAAA--CG--ATCT---T-AC----GATGGCGA-C-ACTTGACGGTAA-TC--A----AAA-AGAcatatttattcattttgtaatgaggtattatagataattagttt
gi|15 : aAGTATCGTGTA-TA-GG-----GCACAC--TT--GTG-T---AC-A-A--TGTG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-A--TC-T-GGTAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCACA---TA----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G------AGGG-T-A-A--AAAATT--C-TTTA-A----CTA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATG------------ATT-GGA-ATTT--TCCT-CC-TA--------TTTA-T-TTGCATTC-CGAAA--CA--ATGTTAAT-AC----GATGAGGA-C-AT-TGACGGTAA-TC--A----AAG-Aa
gi|16 : ccgtatAAAAAATGAG-AGAAAGAGAGAGAGAAGGGGCACGTGTAACCCTTATTAGAATTTCTTTCAAGAT-CAATAAGA-G-CCA----AGTC--------------AT------------------AATTGAAAAATTCACAA---AAAGT-CCGTGCAGTGTCAA-ACACAGTTGATAG---------ACTACAAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-
gi|17 : aaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaccatgtgtaaacccgttatagatatcttttAAGTCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TTAGGTG-CCTAAC-A-A--TGCG-CACC-C-CCAAC-TTTCGCG------------------C-GGAAA-AAC-C-TTAGTCCAT---AT-GTATT--GCT----GCGCC---CCCAT-A-AAA----AAATGTG-TAA-AA----------------A-A--AAAATT--A-A--A-A----CTA-TA-----G-T---A---AA---AAT-TA-C-TC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATT-GGA-ATTT--TCCTACT-CTT-------TTTA-A-CTGCATTC-CGAAA--CG--ATCT---T-GC----GATGGAGA-C-AC-TGACGATAA-
gi|18 : cgtaAA-GATA-TA-CTAAAAA-AACAC-TTT----AATTTGTTTGTCA--T-AAC-ATT--TT-CTAAAT-----------TAA-AAA--C-GTATCA------Tca
gi|18 : ---------TTTCTTACAAGATCCAATAAAG-A-ACC----AGTC--------------AT---------------ttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattttcttacaagatccaataaagaaccagtcataattg
gi|19 : aagatatactaaaaaaacactttaatttgtttgtcataacattttctaaattaaaaacgtatcatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatat----AGAGA--GA-GAGAGAGAG-A-GCGCA-AAATGATA--G-TAGA--C-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TC-AAA-T-TGTAAC----------A-AAGAAACA-----ATT-----AGATTTTTC-AGAGaattg
gi|19 : TTTCAAATTG--T-AAC-A----------AA--------------G-AAA--C-A-ATTAGATTTTTC----AGAGA--GA-GAGAGAGAG--CACGCT-AAATGATA--CATGTATGTGTGTAGTAGACATGTGCAACCCAATGAATTTCTTACA-AAA-T-CT-AATTTAAAAAAAAA-AAAAAACA-----GTT-----AAA--TTTagagagagagagcacgctaaatgatacatgtatgtgtgtagtagacatgtgcaacccaatgaatttcttacaaaatctaatttaaaaaaaaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|2 : agagagagagagagagagcgcaaaatgatagtagacatgtgcaacccaatatatttcAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-TAG-AAT-G------AGTG-T-A-A--AAATTT--T-TTTATA----CTA-AA-----A-T---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATT-GGA-TTTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CAAAA--CG--ATCT---T-AC----GGTGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAAAG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---AATG-TA-TA-T-TTAT-ACTT-G-AATATGTA-TGTGT------GT-GTT--TTA--------------------------G-----------TTT--TAA-GTTCGT--A----T-T--TTT-GTTTTCATA-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---------------TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTTTAAAAATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-ATATTG------TC----AGAGA--GA-GAGAGAGAG-GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----TAA--TTTC-ATAGTGGTAAC-ATTTTCTAAATCG-AAACGTATCGTTAAGAAGAGAGAGAAGGAG----------------------AGCACTCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGA-AGAGAGAGAGCATGTGTAA-------------TTCTTTCAAGATCCAATAAAG-G-CCA----AGTT--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGT--CGTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-CACACCGA--TACTTTTAG-AAGGT-CG---GACCATGCAGACTGC--TTGATTACAACACGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGAGTTATA-AATCTCTGGAATGC--AGTGATATTGTTGT-AATGC-------GTA------AATCTT-GG--AA-T-TTCAGGTCCCTCTTGCA-CCACCTG-GCTCTAT-AATTG-AGAAGCG----TAAGATTA---T-C---AAA-------GCTCAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC---------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGAAAGCA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATTCCCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TTACGGTAATGTCATGATTAATCCAG-CCCAGTGTA--GCATTA-CCCTAAATTGGTTTCACACA--CA-AT---CAA-AGTTTCTCCGCCTG-CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGTAAATAAAT-AGACACTCCTAATCTCTGT-AAG-TA--TTT-CAGTCGTCATTGAtttttaaattgaaa
gi|20 : G--ATTAGAATAA---TAG---AAA-------T----A-TTCA--A---ATT-TCTA--C-ATC-----------T---------------ATGCAGCCTTTG-TTTGA--C--A------AAAGAGAAA-CA-GG-TGT-----------AAAT-TA-------------A-------------ATG-CAC-GTGGAA-----ATCGGGG--CT-
gi|20 : AATTATTGT----T-GAAA-AGTACG-G-AACAA--AAACCAAAGtcatataagcaactggtatgtccgaatttgttgtgaataccagtgtgaggcaccaattattgttgaaaagtacggaacaaaaaccaaag
gi|21 : gattagaataatagaaatattcaaatttctacatctatgcagcctttgtttgacaaaagagaaacaggtgtaaattaaatgcacgtggaaatcggggcttcatataagcaactggtatgtccgaatttgttgtgaataccagtgtgaggcaccAAGTATCGTGTA-TC-AT-----GCGCAC--TC--GCG-TA--AT-T-AACTGCA--ACC-C-AACAT-T-----GAA--CAA-A-T-AATCC-C-CCAAA-AAC-C-TTGGTCC-T---AT-GTATT--A-T----GCGCA---TC----C-AAA----ATTTG-A-CAA-AAT-G-------GTG-T-G-C--AAATTT--TGTTTA-A----TTA-AG-----A-TAAAA---AA---AAT-TG-C-AG-A-GT-A-GTAT-AAC--TTTATT-GAA-AATTCCTCCT
gi|22 : taAC--TC--ATG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G------AGGG-T-A-A--AAATTT--C-TTAA-A----CTA-AA-----A-T---A---TA---AAT-TC-C-TT-A-GG-ATGATTGGAA--T
gi|23 : gtaaaaAGTCCCGTGTAATT-GT-----GCGCAT--TT--ATG-TTA-AT-T-G--CG----ACC-C-CCCAC-TTTGGGGAA--A-------A--TC-T-GGAAACAAC-C-TTAGTCC-T---ATCGTATCTGG-T----GCGCA---TT----C-AAA----AAATG-GAAAG-AAT-G------AGGG-TAA-A--AAAATT--T-CTTA-A----CCT-AA-----A-T---A---AA---AA--TC-C-AT-A-GG-atctgcattctgaaa
gi|25 : gtat--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------CTTCACA---------G-----CTTTTGTTTTGA--CCAAA-GC-TA-GGGGGAA-GA-AG-TAA-----------ACAT-
gi|26 : AAAGA-AACAACTTT----AATTTTTAAGTCT--TTAAC-A-TGTTC-CTAAATGTGCAATTACTT-G-AAAACC-ATATCA------TG----AGAGAAGGA-GAGAGAGAG-atgttttattaacaagctaccatcacgtttgaaatt
gi|27 : AA-AAT-C-CAAGTCC-----AT-GTATT--G-T----GTGCA---TC----C-AAA----AATCA-A-CAA-AAT-A------GGTG-T-aa
gi|29 : ccaacatttgaaaaaaagattccagatttcttcGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-G-CACACC-A--TACT------------------ACCATGCAG-CTGCGTTTGATT-
gi|3 : G-GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----CAA--TTTC-AAAGTGGTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAACACGCTAA--ATG-ATACAT-GTA-TAGACATGTTCTTTCAAAATC---------ATTAGAGAGAGAGAGAAAG-GGGCATGTGTAACCCGTTATTAT-TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTG-AGTCATAATTGAAAAATTGT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAAATCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-GGCACACC-A--TAATCT----------------ACCATGCAG-CTGC----------G--GCGTTTGATTTTTTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTT-TACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTACCGGTTAACATCAGGT-AAATATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAAA------GC-AAAATTAGC-AGA-ATT-TCTA--CCACC-----------TCTACAGCTGGCTGCAG-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-TACACGCACGTGGGAA-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACC-GAG--TT-GGTT-ATGTCGTAAATA--CCAA-C---ATGTA--GCAT--------------------------------------GTTTCTC--CC-GCCGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGT-AAT-AAT-T-ACAC-A-TA--CT-TGT-AAG-TAT-TTT-TAGTCG-CATTGAtt
gi|30 : gggggggcgACGCTAATGATACATACAT-GTAGTAGACAagttgttcccaaatattactactagagacgggtcttatgagaatttcgagctaccgctgattttgccgactgtatgtacccgtacatcgtcgaccttttagtt
gi|31 : cacaaGTCC-TTCAAT-GTATT--G-T----GCACA---TC----C-AAA----AAgtcccgaaagttttctcccta
gi|32 : gAAGTATGGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--ATG-T---AT-T-A--TGCtcaacaaaattggtgtg
gi|33 : aataccataTA-AA-----G-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGATTGGAA--TT
gi|34 : AAATCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TT--
gi|4 : cgtaG-GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-A-GAAATC-----ATT-----CAA--TTTC-AAAGTGGTAGCGATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA-AACACGCTAA--ATG-ATA-AT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATC---------ATTAGAGAGAGAGAGAAAG-GGGCATGTGTAACCCGTTAATAT-TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTGAAGTC--------------ATAATTGAAAAATTGTTTCCAGTT---ATGTTGAC-GG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-TGGAAATGCACGAGCGG-CACACC-A--TATCT-----------------ACCATGCAG-CTGC--GTGCTT-TGAT---TTT--TTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGACAATGTGTATTACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCAGTACCGGTA------AA--TC-GGTAAA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--TAAATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAGC-AGA-ATT-TCTACTC-ACC-----------T---------------
gi|4 : gcGTTTCTCCACG-C-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAGAA-AACAA--AATCCAAAGA-GGT-AATAATT-----AC-ACTA--CT-TGT-AAG-TAT-TTT-TAGTCG-CATTGActacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatgtttctccacgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaaacaaaatccaaagaggtaataattacactacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|5 : gcggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcgatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgataatgtagtagacatgttctttcaaaatcattagagagagagagaaaggggcatgtgtaacccgttaatattttctttcaagatccaataaagaaccattgaagtcataattgaaaaattgtttccagttatgttgacggtaaagtccgtgcgttgtcaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttggaaatgcacgagcggcacaccatatctaccatgcagctgcgtgctttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgacaatgtgtattacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggtaaatcggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaaattgagaagcgattagaaatatacaaagcaaattagcagaatttctactcacctctacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatAGTATCGTGTA-TA-GG-----GTGCAC--TT--GTG-T---GC-A-A--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-T--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AC-GTATT--G-T----GCGCA---TCTAAAA-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G------AGGG-T-A-A--AAATTT--C-TTAA-A----CTA-AA-----AAT---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGA------------TT-GGA-ATTT--TCCT-CC-TAT-------TT-A-T-CTGCATTC-CGAAA--CA--ATGT---T-AC----GATGACGA-C-AC-TGCCGGTAA-TC--A----AAG-AAACG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTACTT-A-AATATGTG-TGTGTTTTAAAATTATTAATTT-------------A------------G-----------TTC--TTA-ATATAC--A----TGTACTTT-GTTTTCATTTAAAAAAA--AA--ATAGTCAATT----------ACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--CGT-TTA---AGGC--TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATGT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCA--T-AAC-A-T--TTCCTAAAT-----------T-GAAAA--C-GTATCA------TTAGAGAGAGA--GA-GAGAGAGAG-ACGCGCA-AAAGGATAG-GATACAAGT-----------ATGTGCAACCAAATATATTTCTT-TATATA-T-CG-AGT----------A-AAAAAATC-----ATT-----CAA--TTTC-Aagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|6 : cgtatAGTCCCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TC--ATG-T---AC-A-A--TGCG-CACC-A-CC-AC-TTTGGGGGAGTAAA-A-C-A---C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTC--T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---TATA--A-AAA----AAATG-G-AAA-AAGAG------AG-G-T-A-AC-AAATTT--T-CTTA-AAACTCTA-AA-----A-T---ATT-AA---AAG-TC-C-AT-A-GG-ATGA--------TTTG---GAA-ATAG--TCTTGCA-TGT-------T---------CA----CGAAA--CA--TTGT---T-AC----GAT--------AA-TGACGGTAA-TC--A----TAGTAAACG-TATGATA-T--AATTGCA-T-ATGTATA-----TG-TT-TAAT-GT-T-ATTTTATAATATGTAATGTGT------TGTGTC--TTA-------------A------------GATTATTATTAGTTC--TAACGTTCTT--AATAAT-TAATTT-GTTTTCATT-AACAAAA--A-TTGT-------TTCTGGACATTACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-TCAGAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATATTGT---TTA---AACGGCTGCA-TT-AACAAGT--TTG-----AATGAGTATATATGGC-T--AAGAC-ATTC---A-CAAGTAATA-TA-C-AAAGA-TATAATTTT----AATTTTTAAGTCAT-T-AAC-A-T--TA-CTAAAT-----------T-GAAAA--C-GTATCA-------G----AGAGA--GAGGAGAGAGAGAGAGAGCACAAATGCTAATGATACATGT-----------A
gi|7 : gtatAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACCAA--TACTTTTAGAA---CATG---GACCATGCAG-CTGCA-TTGATT---ACAC--TGGA----TTT----CCCTTTCGAAAATGACTTGTTTG-AAT-TGTTGTATAATCTCT-GAATGCAAGATGATATCTTTGTAAATGCA------GTA------AATCTCTGGT-AA-TATTCA-AT-CCTCCT-CA-CC----GAA-TC--T-AATTG-AGAA-CG--A-TAGAAATA---TAC---AAA-------GCAAAA-TAAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GCTTAGGGGGATG-CACGG-TG------------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--CGGACGGAG--TT-CGGT-ATGTCATAAT--ATCCAG-C---A-GTAATGCATAA-C---AA--TGGTTTCA---ACCCC-ATATACAATAGTTTCT-CGCC-G--GAG---CAATTGT--T----T-ATAG-AATAAT-AGAACAA--AATCCAAAGA--GTATAT-AAT-A---AC-ACTG--ACCTGTAAAG-TAT-TCT-TGATCTCCATTGAgtaagacatgtgccgaatgttttgcttctatatt
gi|8 : GTC-CGTGTA-TT-GT-----G-GCGC--TT--ATGAT---AT-T-G----CG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TAAT-GGAAA-AAC-CATTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCG-A---TC----A-AAA----AA-TG-G-AAG-AAT-G------AG-G-T-A-A--AAAATT--C-TT-A-A-----TA-AA-----A-T---A---AA---A---TT-C-AT-A-GG-ATGA------------TT-GGA-AT-------------------------A-T-CTGCA-TC-CGAAA--CAT-ATGT---T-A-----GATGACCAGC-AA-TGACGGTAA-TA--A----TAG-AA-CG-TATG-TA-T-TA-TTGCAAT-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTATTTTA-AATATGTA-TGTGT------GT-GTC--TTA-------------ATTATTCATTTTAG-----------TTC--TAA-GTTCATTAA----TATAATTG-GTCTTCATT-AAAAAAATTGATTCTA--CAATT-ATA-----TAA-AATTATATTTAAGTCTCTAAC-TAT-C--GAT-AAC-A-T-CACGAAATCCATAT--TCGTTTAACGG-----TGCAATTAAACA-GTAATTGGGAAAAATGAGTATATAT-GC-TTCAAA-C-ATTGGGAA-CAAA-GATC-TAACTAAAGA-TATAA-TTT----AATTTTTAAGTCGACT-AACAA-T--TTACT-AAT-----------T-G-AAA--tgtcctaaatatactactagagctggtctaatgagtcgagttaaaaccgcgatacgaagaatggcgacttactgtatcaccgtac
gi|9 : atc-AATTG-AGAAGCGTAGTTAGAAGTAAAATATTTAAAA-------GC-AAA-TTAGTAAGAGATTGTCTA--C-ACCATTAGAGCCCGT---------------AACCAGCCTTTGTTTTGATAC--AATGC-TAGGGAGGAA-CAAGG-TGTTATTACGACCCACGTGT--------------A-------------ATT-GCTGATGAAAAAAC-ACCGAGGAGTT-TTGT-A-GT-GTAAATA--CCAAAC---ATGTA--GCATTG-T---A-------TTCT---A--CC-A-----------------GCC-G-AGATATAGAATTGTTGT----TTGAAACAATAAG-A-AACAAAGAATCC-AAGA-GGTAATTAATTCA-GTAC-AACA-----TGT-AAA--ATGTCT-TCGTCGTaacg
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GTCGTCATTGAAGTTGTTCCCAAATATTACTACTAGAGCGGTCTTATGAAATTTCGAGCTACCGCTGATTTTGCCGACTGTATGTACCCGGTACTCGTCGACCTTTTAGTTTC
Unaligned ( gi|28 ): GAGGAGAAAAACACTAAATTGATCATGTAGTAAGACATGGTTGCACGAACGTTTTCTTTCTAATAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 11 111111 1111111 11111111 33333333333333 111 222222 11 1 222 222222222 99999999999999999999999999999999999999 333333333333 11 222222222 11 1111 999999999999999 22222 111 1 1111 111 1111111 222222222222222 1111 111111 1111 11111 111 22222222222 1 2222222222 11111 111111 1 1 8888888888888888888888 11 222222222 1 7777777777777777777777 1 111 2222 77777777777777777777777777777777 111 11 222 66666666666666666 1111 66666666666666666 222222222222222 1 1111 1 1 2222222 2222222222222 1 1 22222222 11 2222222 1 11 1111 1111111111111111111111111111111111 1 1 222222222222 6666666666666666666666666666 11 444444444444444 2222222222 11 111 00000000000000000000000000000000000000 11111 111 1111 1 22 1111 2222222 1
lowQualScore : 2 2 77777 33 444 5 111 000000 3 3 3 3 44 3 9 3 66 2 5 2 2 2 2 444 2 00 2 5555 444 999999 5555 5 2 2 2 33 999 2 8888 66 1 5555 1 2 6666 444 2 66666 2 1111111 444 2 33 2 2 2 2 55555555 88888888 77777777777777 0 3 3 7 3 44 88 1 666 3 7777 7 3 3 3 55 8888 4 1 5 5 5 5 5 222 888888 5 5 5 00 5 0 333 5 666666666 99 11111111111111111111111111111111111111 99 6 1 666666666666 8 99 11 11 666 555555555 11 11 8 2222 8 8 0 8 222222222222222 8 0 0 88 00000 8 8 0 3 8 444 8 6 6 6 5 1 2222 555 5 5 7777777 0 444444444444444 66 0000 000000 2222 77 5 00000 5 222 1 33333333333 1 5 5 1 5 5 5555555555 5 1 44444 555555 77 0 0 3 3 6666666666666666666666 11 8 8 0 3 555555555 0 2 5 9999999999999999999999 3 666 5555 55555555555555555555555555555555 444 0 11 555 8 88888888888888888 5 5 0 5 5 6666 77777777777777777 6 444444444444444 5 0 7777 8 9 3 0 8 0 0 8 3333333 3333333333333 88 8 0 6 0 8 8 11111111 11 5 5 66 0 888 0 888 1111111 0 5 55 4 4 1111 7777777777777777777777777777777777 66 66 5 5 0 5 0 5 444444444444 5 1111111111111111111111111111 5 5 7 77 5 0 33 222222222222222 5 5555555555 6 33 5 000 77 88888888888888888888888888888888888888 33 77777 000 0000 5 5 5 5 66 5 5 5 2 2 33 0000 5555555 1 5 5 5 0 7
lowQualScore : . . ..... .. ... . ... ...... . . . . .. . . . .. . . . . . . ... . .. . .... ... ...... .... . . . . .. ... . .... .. . .... . . .... ... . ..... . ....... ... . .. . . . . ........ ........ .............. . . . . . .. .. . ... . .... . . . . .. .... . . . . . . . ... ...... . . . .. . . ... . ......... .. ...................................... .. . . ............ . .. .. .. ... ......... .. .. . .... . . . . ............... . . . .. ..... . . . . . ... . . . . . . .... ... . . ....... . ............... .. .... ...... .... .. . ..... . ... . ........... . . . . . . .......... . . ..... ...... .. . . . . ...................... .. . . . . ......... . . . ...................... . ... .... ................................ ... . .. ... . ................. . . . . . .... ................. . ............... . . .... . . . . . . . . ....... ............. .. . . . . . . ........ .. . . .. . ... . ... ....... . . .. . . .... .................................. .. .. . . . . . . ............ . ............................ . . . .. . . .. ............... . .......... . .. . ... .. ...................................... .. ..... ... .... . . . . .. . . . . . .. .... ....... . . . . . .
lowQualScore : 9 9 11111 77 777 7 888 000000 1 1 1 1 22 1 2 1 88 9 7 7 7 7 5 444 5 33 5 3333 444 777777 3333 3 7 7 7 77 222 7 3333 88 0 0000 0 9 1111 777 7 77777 7 3333333 777 7 77 7 7 7 7 99999999 99999999 11111111111111 3 3 3 5 3 66 66 0 444 6 7777 3 6 6 6 55 5555 0 0 0 0 0 0 0 111 555555 0 0 0 99 0 0 000 7 555555555 22 77777777777777777777777777777777777777 22 7 0 000000000000 0 00 00 66 444 222222222 66 00 0 2222 0 0 8 0 888888888888888 0 8 8 88 00000 0 0 8 2 0 000 0 7 7 7 7 4 1111 000 0 0 1111111 1 888888888888888 99 4444 111111 1111 99 7 22222 0 666 6 88888888888 7 7 7 4 7 7 0000000000 7 7 33333 333333 99 0 0 2 2 8888888888888888888888 00 0 0 8 2 000000000 8 5 0 0000000000000000000000 3 000 8888 00000000000000000000000000000000 000 8 22 000 0 44444444444444444 0 0 8 7 7 0000 33333333333333333 7 888888888888888 0 6 0000 0 0 2 8 0 6 8 0 8888888 6666666666666 88 0 8 0 0 0 0 22222222 00 7 7 99 1 888 1 888 2222222 0 0 00 4 4 7777 7777777777777777777777777777777777 99 99 0 0 8 0 0 0 111111111111 0 7777777777777777777777777777 7 7 1 99 7 4 66 333333333333333 7 0000000000 6 66 7 000 99 22222222222222222222222222222222222222 77 11111 000 6666 0 0 0 0 99 7 7 0 0 1 77 7777 3333333 4 7 0 7 1 1
consensus : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAANTT--T-TTAA-A----C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA-GG--TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAG-------------------C--AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAGA----C--G--GACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAANTA-ACA---CTA--C--TCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
Reference ( family-2342 ) : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAANTT--T-TTNA-A----C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA-----TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAGC---------------------AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAGA---CC--G--GACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAANTA--CCAG-C---ATGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAAATACACA---CTA--C--TCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
gi|1 : TCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CA-C-C-CCCAC---TGGGGGA--AAA-A-CTAT-TC-T-GG-AA-AAC-C-TTAGT-C-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC------AAA----AAATG-G-AAG--AT-G--AGT----T----AA--AAAAAT--T-TAAA-T----C---TAGAA-----A-TAG-A---AA---AAT-TA-CAAC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-T-TTT--TCCTG-C-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--TG--ATCT---T-AC----GATGGCGAGC-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAA-AAGGG-TA---TA-T-TAATTGCA-T-A-GTAAT---A-TG-TA-TA-T-CT-T-ACTT---GATATGTA-T-TGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTTTATAA-GTCTTT--G----T---ATTTAGTTTTCATG-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACT-ATAAT--TTACGT-TGTACTATATAC--GATGAACTAATACAGTAAATCCATAT--C------------TGCA-TTATACAAGTA-TCG-----AATGAATATATAT-GTGTTCAAAGTGATTC---ATCAAA-GATCTTA-CTAAAGATAACAA--TT----AATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TTCCTATAT-----------T-G-AAA--CTG--TA---TCGTC----NNNNN--NNNN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-----------NNNNGCGACGCAACA-A-------TG-AAA-TACA-TGT----------ATGTGCAACCCATATATTTTTGAAAA--TTTCAAAAGGTGTAAC-ATTTCCT-AATCGAAAACGTATCGTTGAAAAGAGAGAGAGAGAG----------------------AGAGCATCAA--ATG-ATACATGGTAGTA-AC-TG-TCTTTCAAAATCATAAAAATCATT
gi|1 : taaataCATGTGTAA----------------------TT-CTTTCA-GATCCAATAAAGGA-CCA----AGTT--------------GA---------------TCCACTT---ATGTTGACAGACTAAAGTCC-GTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-GATTACTTTTAGA---CC--GTCGGACGT-CAG-CTCA--TTGA-TT--AACGCGTTTGA-TTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATA-A--CTCT-GAATGC-AAGTGATA-TTGTGT-AATGCA------GTA------A--CTC-GTT-AA-TATTCATGT-CCTCCT-CACCC----C-G-TC--T-AATTGCAGAAGCG--ATTAG-AATA---TCA---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GGTTGT-----------ACAT-T--------------A-------------A-T-CCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TT-C-------------GT-ATGTC----------ATAATTA--CCAG-C---ATGTA--GCATTACC---AAATTGGTTTCAC--A--CCAAT---CAA-AGATTCTCCGC----CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGAGGG-TAAAT-AATA-ACA---CTA------CCGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|1 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTACTACTAGAGTGTCTAT-GAAAT-TTCGAGgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|10 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaat-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAATTTTAAAGC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACCATTAGAGCCGGT---------------AACAG-CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGAGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-T--------------ACACCCACGTGGAAATT-CCT-ATGAAAA--C-AC-AGAG--TT---------------GT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C---AT--------TT------------GTT------A--GC-AT--------GTTTCCTCGCC-G---AT---GAATTGTTGTGGTTT-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGCTAAAT--ATTCACA---CTA--C--TTTGT-AAGTTATTTTCCAGTCGTCGTTGAttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|11 : TGTA-TT-GCTTTTAGCGCACCCTT--GTGGC---ACAC-A--TGCG-CACCTC-CCCACGTTTGGGGAA--ACATA-C-A--TT-T-G-AAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-G-ATT--G-TCAGTGCGCGGGTCC----A-AAACAATAAGTGCG-AATTAAT-GCTAGTTAG-TTTACAA--AAGATT--T-TTAA-A----TCTTTA-AACAGTTA-T---ATCCAATCCGATGTGAC-ACCA-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA----TT--TCCTG-C-TC--------TTTA-TCCTGCAATT-CGAAACCCGCCATCT---T-ACCGCTGATGGCGA-C-AC-TGACGGTAACTC--AACAGAAG-AAACG-TATG-TA-TCCAATGGCA-TGA-GT-TAC--A-TGCTACTA-T--T-T-AATT-A-AAC-TGTA-TGTagttgtttcctaaatatttactactagagcggtcttatgaatttgagctaccgcgttatttgccgacaagatgttttgtgtatgtactcgcgacctttatttct
gi|12 : aaAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--TTG-T---GT-T-GG-TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---AC----ACAAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAAAAAAT-TTAA-A----C---TA-AA-----A-T---A---AA---GAT-TA-C-AC-AGGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGATT-TTT--TCCTG-C-TC--------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--CG--ATAT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TCAAA----AAG-AAAGG-TATG-TA-T-TAATTGCA-TAA-GTAC----A-TG-TA-TA-TATT-T-ACTT-AGAATATGTA-TGTGT------G-TGTT--TTATAATTATTCATTTA------------G-----------TTC--TAA-GTT
gi|13 : ta--TC-T-CAGAA-AACAC-TTCATCC-T---AT-GCAAT--G-T----GTACA---TC----C-TAA----AAATG-A-CAA-CAT-G--GGT--G-T----TC--AGATTT--C-CTAA-A----T---TA-TG-----G-T---C---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-AT-AATAAAACCTTT-TTGAA-A-ATA--CAGTACCATATTGGTATATTTA-T-TTGCTTTCATGAGA--TC--ATGT---TAAT----GATGATGA-CAAC-T---------TC--C----ATA-AAAGGCTGTG-TACT-TAA-TGCA-C---TTATAGACA-TG-CT-TA-T-TT-T-
gi|14 : gggggggggggTCTCATGTA-TTTGT-----GCGCAC--TT---TG-T---AT-TTG--TGCGGCACC-CACCCAT-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC----TCA---A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--GAT--GCT----AAACAAAATT--T-ATAA-A----C---TA-AA-----A-G---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GGCATGAATAAAA--TTTATTGGG-ATTTT--TCCTGC---CT-------TCTATT-CTG-AATT-CGAAA--CG--ATCT---T-AC----GATGGCGA-C-ACTTGACGGTAA-TC--A----AAA-AGAcatatttattcattttgtaatgaggtattatagataattagttt
gi|15 : aAGTATCGTGTA-TA-GG-----GCACAC--TT--GTG-T---AC-A-A--TGTG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-A--TC-T-GGTAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCACA---TA----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAAATT--C-TTTA-A----C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATG------------ATTGGA-A-TTT--TCCT-CC-TA--------TTTA-T-TTGCATTC-CGAAA--CA--ATGTTAAT-AC----GATGAGGA-C-AT-TGACGGTAA-TC--A----AAG-Aa
gi|16 : ccgtatAAAAAATGAG-AGAAAGAGAGAGAGAAGGGGCACGTGTAACC-C-----TTATTAGAAT---TT-CTTTCAAGAT-CAATAAGA-G-CCA----AGTC--------------AT------------------AATTGAAAAATTCACAA---AAAGT-CCGTGCAGTGTCAA-ACACAGTTGATAG---------ACTACAAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-
gi|17 : aaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaccatgtgtaaacccgttatagatatcttttAAGTCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TTAGGTG-CCTAAC-A-A--TGCG-CACC-C-CCAAC-TTTCGCG------------------C-GGAAA-AAC-C-TTAGTCCAT---AT-GTATT--GCT----GCGCC---CCCAT-A-AAA----AAATGTG-TAA-AA-----------------AA--AAAATT--A---AA-A----C---TA-TA-----G-T---A---AA---AAT-TA-C-TC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTACT-CTT-------TTTA-A-CTGCATTC-CGAAA--CG--ATCT---T-GC----GATGGAGA-C-AC-TGACGATAA-
gi|18 : cgtaAA-GATA-TA-CTAAAAA-AACAC-TTT----AATTTGTTTGTCA--T-AAC-ATT--TT-CTAAAT-----------TAA-AAA--C-G--TA---TCATca
gi|18 : ATGTGCAACTGT-----T-------ATATTTT-CTTACAAGATCCAATAAAG-A-ACC----AGTC--------------AT---------------ttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattttcttacaagatccaataaagaaccagtcataattg
gi|19 : aagatatactaaaaaaacactttaatttgtttgtcataacattttctaaattaaaaacgtatcatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---A-GCGCA-AAATGATA--G-TAGA--C-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TC-AAA-T-TGTAAC----------A-AAGAAACA-----ATT-----AGATTTTTCAGAGaattg
gi|19 : TTTCAAATTG--T-AAC-A----------AA--------------G-AAA--C-AATTAGATTTTTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG----CACGCT-AAATGATA--CATGTATGTGTGTAGTAGACATGTGCAACCCAATGAATTTCTTACA-AAA-T-CT-AATTTAAAAAAAAA-AAAAAACA-----GTT-----AAA--TTTagagagagagagcacgctaaatgatacatgtatgtgtgtagtagacatgtgcaacccaatgaatttcttacaaaatctaatttaaaaaaaaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|2 : agagagagagagagagagcgcaaaatgatagtagacatgtgcaacccaatatatttcAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-TAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAATTT--T-TTTATA----C---TA-AA-----A-T---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-T-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CAAAA--CG--ATCT---T-AC----GGTGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAAAG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---AATG-TA-TA-T-TTAT-ACTT-G-AATATGTA-TGTGT------GT-GTT--TTA--------------------------G-----------TTT--TAA-GTTCGT--A----T-T--TTT-GTTTTCATA-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C------------TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTTTAAAAATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-A--TA---TTGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----TAA--TTTCATAGTG-GTAAC-ATTTTCTAAATCG-AAACGTATCGTTAAGAAGAGAGAGAAGGAG----------------------AGCACTCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGA-AGAGAGAGAGCATGTGTAA----------------------TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-G-CCA----AGTT--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGT--CGTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-CACACCGA--TACTTTTAGAAGGTC--G--GACCATGCAGACTGC--TTGA-TTACAACACGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGAGTTATA-AATCTCTGGAATGC--AGTGATATTGTTGT-AATGC-------GTA------AATCTT-GG--AA-T-TTCAGGTCCCTCTTGCA-CCACCTG-GCTCTAT-AATTG-AGAAGCG----TAAGATTA---T-C---AAA-------GCTCAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC---------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGAAAGCA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATTCCCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TTAC------------GGTAATGTC----------ATGATTAATCCAG-CCCAGTGTA--GCATTA-CCCTAAATTGGTTTCACACA--CA-AT---CAA-AGTTTCTCCGCCTG-CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAAATAGACACTCCTAATC--TCTGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATTGAtttttaaattgaaa
gi|20 : G--ATTAGAATAA---TAG---AAA-------T----A-TTCA--A---ATT-TCTA--C-ATC-----------T---------------ATGCAGCCTTTG-TTTGA--C--A------AAAGAGAAA-CA-GG-TGT-----------AAAT-TA-------------A-------------ATG-CAC-GTGGAA-----ATCGGGGC-TT-CATATAAGCAACTGGT-ATGTCCGAATTTGTTGTGAATA--CCAG-T---GTGAG--GCAC---C---AA--T
gi|20 : AATTATTGT----T-GAAA-AGTACG-G-AACAA--AAACCAAAGtattgttgaaaagtacggaacaaaaaccaaag
gi|21 : gattagaataatagaaatattcaaatttctacatctatgcagcctttgtttgacaaaagagaaacaggtgtaaattaaatgcacgtggaaatcggggcttcatataagcaactggtatgtccgaatttgttgtgaataccagtgtgaggcaccAAGTATCGTGTA-TC-AT-----GCGCAC--TC--GCG-TA--AT-T-AACTGCA--ACC-C-AACAT-T-----GAA--CAA-A-T-AATCC-C-CCAAA-AAC-C-TTGGTCC-T---AT-GTATT--A-T----GCGCA---TC----C-AAA----ATTTG-A-CAA-AAT-G---GT--G-T----GC--AAATTT--TGTTTA-A----T---TA-AG-----A-TAAAA---AA---AAT-TG-C-AG-A-GT-A-GTAT-AAC--TTTATTGAA-A-ATTCCTCCT
gi|22 : taAC--TC--ATG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAATTT--C-TTAA-A----C---TA-AA-----A-T---A---TA---AAT-TC-C-TT-A-GG-ATG------------ATTGGA-A--------------------------TA-T-CTGCATTC-TGAAA--
gi|23 : gtaaaaAGTCCCGTGTAATT-GT-----GCGCAT--TT--ATG-TTA-AT-T-G--CG----ACC-C-CCCAC-TTTGGGGAA--A-------A--TC-T-GGAAACAAC-C-TTAGTCC-T---ATCGTATCTGG-T----GCGCA---TT----C-AAA----AAATG-GAAAG-AAT-G--AGG--G-TA---AA--AAAATT--T-CTTA-A----C---CT-AA-----A-T---A---AA---AA--TC-C-AT-A-GG-
gi|25 : gtat--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------CTTCACA---------G-----CTTTTGTTTTGA--CCAAA-GC-TA-GGGGGAA-GA-AG-TAA-----------ACAT-
gi|26 : AAAGA-AACAACTTT----AATTTTTAAGTCT--TTAAC-A-TGTTC-CTAAATGTGCAATTACTT-G-AAAACC-A--TA---TCATG----AGAGAAGGAGA-GAGAGAG---atgttttattaacaagctaccatcacgtttgaaatt
gi|27 : AA-AAT-C-CAAGTCC-----AT-GTATT--G-T----GTGCA---TC----C-AAA----AATCA-A-CAA-AAT-A--GGT--G-T----aa
gi|29 : ccaacatttgaaaaaaagattccagatttcttcGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-G-CACACC-A--TACT-----------------ACCATGCAG-CTGCGTTTGA-TT--
gi|3 : G---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAACACGCTAA--ATG-ATACAT-GTA-TAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACC-CGTTATT-------AT---TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTG-AGTCATAATTGAAAAATTGT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAAATCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-GGCACACC-A--TAATCT---------------ACCATGCAG-CTGC-----------G--GCGTTTGATTTTTTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTT-TACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTACCGGTTAACATCAGGT-AAATATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAAA------GC-AAAATTAGC-AGA-ATT-TCTA--CCACC-----------TCTACAGCTGGCTGCAG-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-TACACGCACGTGGGAA-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACC-GAG--TT-G------------GTT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C---ATGTA--GCAT--------------------------------------GTTTCTC--CC-GCCGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATTACACA----TA--C--T-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGAtt
gi|30 : gggggggcgACGCTAATGATACATACAT-GTAGTAGACAagttgttcccaaatattactactagagacgggtcttatgagaatttcgagctaccgctgattttgccgactgtatgtacccgtacatcgtcgaccttttagtt
gi|31 : cacaaGTCC-TTCAAT-GTATT--G-T----GCACA---TC----C-AAA----AAgtcccgaaagttttctcccta
gi|32 : gAAGTATGGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--ATG-T---AT-T-A--TGCtcaacaaaattggtgtg
gi|33 : aataccata---TA-AA-----G-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGATTGGAA--TT
gi|34 : AAATCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TT--
gi|4 : cgtaG---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-A-GAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAAAGTG-GTAGCGATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA-AACACGCTAA--ATG-ATA-AT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACC-CGTTAAT-------AT---TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTGAAGTC--------------ATAATTGAAAAATTGTTTCCAGTT---ATGTTGAC-GG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-TGGAAATGCACGAGCGG-CACACC-A--TATCT----------------ACCATGCAG-CTGC--GTGCTTT--GAT---TTT--TTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGACAATGTGTATTACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCAGTACCGGTA------AA--TC-GGTAAA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--TAAATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAGC-AGA-ATT-TCTACTC-ACC-----------T---------------
gi|4 : gcGTTTCTCCACG-C-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAGAA-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT--ACA---CTA--C--T-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGActacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatgtttctccacgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaaacaaaatccaaagaggtaataattacactacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|5 : gcggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcgatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgataatgtagtagacatgttctttcaaaatcattagagagagagagaaaggggcatgtgtaacccgttaatattttctttcaagatccaataaagaaccattgaagtcataattgaaaaattgtttccagttatgttgacggtaaagtccgtgcgttgtcaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttggaaatgcacgagcggcacaccatatctaccatgcagctgcgtgctttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgacaatgtgtattacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggtaaatcggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaaattgagaagcgattagaaatatacaaagcaaattagcagaatttctactcacctctacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatAGTATCGTGTA-TA-GG-----GTGCAC--TT--GTG-T---GC-A-A--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-T--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AC-GTATT--G-T----GCGCA---TCTAAAA-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAATTT--C-TTAA-A----C---TA-AA-----AAT---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGA------------TTGGA-A-TTT--TCCT-CC-TAT-------TT-A-T-CTGCATTC-CGAAA--CA--ATGT---T-AC----GATGACGA-C-AC-TGCCGGTAA-TC--A----AAG-AAACG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTACTT-A-AATATGTG-TGTGTTTTAAAATTATTAATTT-------------A------------G-----------TTC--TTA-ATATAC--A----TGTACTTT-GTTTTCATTTAAAAAAA--AA--ATAGTCAATT----------ACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--CGT-TTAAGGC--TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATGT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCA--T-AAC-A-T--TTCCTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA---TCATTAGAGAGAGA--GAGA-GAGAGAG---ACGCGCA-AAAGGATAG-GATACAAGT-----------ATGTGCAACCAAATATATTTCTT-TATATA-T-CG-AGT----------A-AAAAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|6 : cgtatAGTCCCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TC--ATG-T---AC-A-A--TGCG-CACC-A-CC-AC-TTTGGGGGAGTAAA-A-C-A---C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTC--T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---TATA--A-AAA----AAATG-G-AAA-AAGAG--AG---G-T----AAC-AAATTT--T-CTTA-AAACTC---TA-AA-----A-T---ATT-AA---AAG-TC-C-AT-A-GG-ATGA--------TTTG--GAA-A-TAG--TCTTGCA-TGT-------T---------CA----CGAAA--CA--TTGT---T-AC----GAT--------AA-TGACGGTAA-TC--A----TAGTAAACG-TATGATA-T--AATTGCA-T-ATGTATA-----TG-TT-TAAT-GT-T-ATTTTATAATATGTAATGTGT------TGTGTC--TTA-------------A------------GATTATTATTAGTTC--TAACGTTCTT--AATAAT-TAATTT-GTTTTCATT-AACAAAA--A-TTGT-------TTCTGGACATTACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-TCAGAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATATTGT---TTAAACGGCTGCA-TT-AACAAGT--TTG-----AATGAGTATATATGGC-T--AAGAC-ATTC---A-CAAGTAATA-TA-C-AAAGA-TATAATTTT----AATTTTTAAGTCAT-T-AAC-A-T--TA-CTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA------TC----AGAGA--GAGAGGAGAGAGAGAGAGAGCACAAATGCTAATGATACATGT-----------A
gi|7 : gtatAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACCAA--TACTTTTAGA---ACATG--GACCATGCAG-CTGCA-TTGA-TT---ACAC--TGGA----TTT----CCCTTTCGAAAATGACTTGTTTG-AAT-TGTTGTATAATCTCT-GAATGCAAGATGATATCTTTGTAAATGCA------GTA------AATCTCTGGT-AA-TATTCA-AT-CCTCCT-CA-CC----GAA-TC--T-AATTG-AGAA-CG--A-TAGAAATA---TAC---AAA-------GCAAAA-TAAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GCTTAGGGGGATG-CACGG-TG------------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--CGGACGGAG--TT-C------------GGT-ATGTC----------ATAA-TAT-CCAG-C---A-GTAATGCATAA-C---AA--TGGTTTCA---ACCCC-ATATACAATAGTTTCT-CGCC-G--GAG---CAATTGT--T----T-ATAG-AATAAT-AGAACAA--AATCCAAAGA--G-TATAT-AATA-ACA---CTG--A--CCTGTAAAG-TATTCT-TGATCTCCATTGAgtaagacatgtgccgaatgttttgcttctatatt
gi|8 : GTC-CGTGTA-TT-GT-----G-GCGC--TT--ATGAT---AT-T-G----CG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TAAT-GGAAA-AAC-CATTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCG-A---TC----A-AAA----AA-TG-G-AAG-AAT-G--AG---G-T----AA--AAAATT--C-TTAA----------TA-AA-----A-T---A---AA---A---TT-C-AT-A-GG-ATGA------------TTGGA-A-T-------------------------A-T-CTGCA-TC-CGAAA--CAT-ATGT---T-A-----GATGACCAGC-AA-TGACGGTAA-TA--A----TAG-AA-CG-TATG-TA-T-TA-TTGCAAT-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTATTTTA-AATATGTA-TGTGT------GT-GTC--TTA-------------ATTATTCATTTTAG-----------TTC--TAA-GTTCATTAA----TATAATTG-GTCTTCATT-AAAAAAATTGATTCTA--CAATT-ATA-----TAA-AATTATATTTAAGTCTCTAAC-TAT-C--GAT-AAC-A-T-CACGAAATCCATAT--TCGTTTAACGG--TGCAATTAAACA-GTAATTGGGAAAAATGAGTATATAT-GC-TTCAAA-C-ATTGGGAA-CAAA-GATC-TAACTAAAGA-TATAA-TTT----AATTTTTAAGTCGACT-AACAA-T--TTACT-AAT-----------T-G-AAA--tgtcctaaatatactactagagctggtctaatgagtcgagttaaaaccgcgatacgaagaatggcgacttactgtatcaccgtac
gi|9 : atc-AATTG-AGAAGCGTAGTTAGAAGTAAAATATTTAAAA-------GC-AAA-TTAGTAAGAGATTGTCTA--C-ACCATTAGAGCCCGT---------------AACCAGCCTTTGTTTTGATAC--AATGC-TAGGGAGGAA-CAAGG-TGTTATTACGACCCACGTGT--------------A-------------ATT-GCTGATGAAAAAAC-ACCGAGGAGTT-T------------TGT-A-GT-----------GTAAATA--CCAAAC---ATGTA--GCATTG-T---A-------TTCT---A--CC-A-----------------GCC-G-AGATATAGAATTGTTGT----TTGAAACAATAAG-A-AACAAAGAATCC-AAGA-GG-TAATTAATT---CA---GTA--CAACATGTAAAA-TGTCTT-C-GTCGTaacg
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GTCGTCATTGAAGTTGTTCCCAAATATTACTACTAGAGCGGTCTTATGAAATTTCGAGCTACCGCTGATTTTGCCGACTGTATGTACCCGGTACTCGTCGACCTTTTAGTTTC
Unaligned ( gi|28 ): GAGGAGAAAAACACTAAATTGATCATGTAGTAAGACATGGTTGCACGAACGTTTTCTTTCTAATAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 11 111111 1111111 11111111 33333333333333 111 222222 11 1 222 222222222 99999999999999999999999999999999999999 333333333333 11 222222222 11 1111 777777777777777 22222 111 1 1111 111 1111111 222222222222222 1111 111111 1111 11111 111 22222222222 1 2222222222 11111 111111 1 1 8888888888888888888888 11 222222222 1 7777777777777777777777 1 111 2222 77777777777777777777777777777777 111 11 222 66666666666666666 1111 77777777777777777777 222222222222222 1111 1 1 2222222 2222222222222 1 1 22222222 11 2222222 1 11 1111 1111111111111111111111111111111111 1 1 222222222222 6666666666666666666666666666 11 444444444444444 2222222222 11 1111 00000000000000000000000000000000000000 11111 111 1111 22222 111 22222 1
lowQualScore : 2 2 77777 33 444 5 111 000000 3 3 3 3 44 3 9 3 66 2 5 2 2 2 2 444 2 00 2 5555 444 999999 5555 5 2 2 2 33 999 2 9999 66 1 8888 55555 444 2 66666 2 1111111 444 2 33 2 2 2 2 55555555 88888888 77777777777777 0 3 3 7 3 44 88 1 666 3 7777 7 3 3 3 55 8888 4 1 5 5 5 5 5 222 888888 5 5 5 00 5 0 333 5 666666666 99 11111111111111111111111111111111111111 99 6 1 666666666666 8 99 11 11 666 555555555 11 11 8 2222 8 8 0 8 555555555555555 8 0 0 88 00000 8 8 0 3 8 444 8 6 6 6 5 1 2222 555 5 5 7777777 0 444444444444444 66 0000 000000 2222 77 5 00000 5 222 1 33333333333 1 5 5 1 5 5 5555555555 5 1 44444 555555 77 0 0 3 3 6666666666666666666666 11 8 8 0 3 555555555 0 2 5 9999999999999999999999 3 666 5555 55555555555555555555555555555555 444 0 11 555 8 88888888888888888 5 5 0 5 5 6666 00000000000000000000 6 444444444444444 5 0 0 7777 8 9 3 0 8 0 0 8 3333333 3333333333333 88 8 0 6 0 8 8 11111111 11 5 5 66 0 888 0 888 1111111 0 5 55 4 4 1111 7777777777777777777777777777777777 66 66 5 5 0 5 0 5 444444444444 5 1111111111111111111111111111 5 5 7 77 5 0 33 222222222222222 5 5555555555 2 33 5 1111 77 88888888888888888888888888888888888888 33 77777 000 0000 5 5 5 5 66 5 5 5 33333 000 5 22222 1 5 5 5 0 7
lowQualScore : . . ..... .. ... . ... ...... . . . . .. . . . .. . . . . . . ... . .. . .... ... ...... .... . . . . .. ... . .... .. . .... ..... ... . ..... . ....... ... . .. . . . . ........ ........ .............. . . . . . .. .. . ... . .... . . . . .. .... . . . . . . . ... ...... . . . .. . . ... . ......... .. ...................................... .. . . ............ . .. .. .. ... ......... .. .. . .... . . . . ............... . . . .. ..... . . . . . ... . . . . . . .... ... . . ....... . ............... .. .... ...... .... .. . ..... . ... . ........... . . . . . . .......... . . ..... ...... .. . . . . ...................... .. . . . . ......... . . . ...................... . ... .... ................................ ... . .. ... . ................. . . . . . .... .................... . ............... . . . .... . . . . . . . . ....... ............. .. . . . . . . ........ .. . . .. . ... . ... ....... . . .. . . .... .................................. .. .. . . . . . . ............ . ............................ . . . .. . . .. ............... . .......... . .. . .... .. ...................................... .. ..... ... .... . . . . .. . . . ..... ... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 9 9 11111 77 777 7 888 000000 1 1 1 1 22 1 2 1 88 9 7 7 7 7 5 444 5 33 5 3333 444 777777 3333 3 7 7 7 77 222 7 3333 88 0 9999 99999 777 7 77777 7 3333333 777 7 77 7 7 7 7 99999999 99999999 11111111111111 3 3 3 5 3 66 66 0 444 6 7777 3 6 6 6 55 5555 0 0 0 0 0 0 0 111 555555 0 0 0 99 0 0 000 7 555555555 22 77777777777777777777777777777777777777 22 7 0 000000000000 0 00 00 66 444 222222222 66 00 0 2222 0 0 8 0 000000000000000 0 8 8 88 00000 0 0 8 2 0 000 0 7 7 7 7 4 1111 000 0 0 1111111 1 888888888888888 99 4444 111111 1111 99 7 22222 0 666 6 88888888888 7 7 7 4 7 7 0000000000 7 7 33333 333333 99 0 0 2 2 8888888888888888888888 00 0 0 8 2 000000000 8 5 0 0000000000000000000000 3 000 8888 00000000000000000000000000000000 000 8 22 000 0 44444444444444444 0 0 8 7 7 0000 77777777777777777777 7 888888888888888 0 8 8 0000 0 0 2 8 0 6 8 0 8888888 6666666666666 88 0 8 0 0 0 0 22222222 00 7 7 99 1 888 1 888 2222222 0 0 00 4 4 7777 7777777777777777777777777777777777 99 99 0 0 8 0 0 0 111111111111 0 7777777777777777777777777777 7 7 1 99 7 4 66 333333333333333 7 0000000000 3 66 7 4444 99 22222222222222222222222222222222222222 77 11111 000 6666 0 0 0 0 99 7 7 0 00000 000 7 33333 4 7 0 7 1 1
consensus : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAANTT--C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAG-------------------C--AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG---A----C----GGACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATT-A-ACA---C-TA--CTCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
Reference ( family-2342 ) : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAANTT--T-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA--GG-TGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAGC---------------------AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG---A----C----GGACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAANT-A-ACA---C-TA--CTCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
gi|1 : TCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CA-C-C-CCCAC---TGGGGGA--AAA-A-CTAT-TC-T-GG-AA-AAC-C-TTAGT-C-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC------AAA----AAATG-G-AAG--AT-G--AGT----T----AA--AAAAAT--T-TAAA-T---C---TAGAA-----A-TAG-A---AA---AAT-TA-CAAC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-T-TTT--TCCTG-C-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--TG--ATCT---T-AC----GATGGCGAGC-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAA-AAGGG-TA---TA-T-TAATTGCA-T-A-GTAAT---A-TG-TA-TA-T-CT-T-ACTT---GATATGTA-T-TGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTTTATAA-GTCTTT--G----T---ATTTAGTTTTCATG-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACT-ATAAT--TTACGT-TGTACTATATAC--GATGAACTAATACAGTAAATCCATAT--C------------TGCA-TTATACAAGTA-TCG-----AATGAATATATAT-GTGTTCAAAGTGATTC---ATCAAA-GATCTTA-CTAAAGATAACAA--TT----AATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TTCCTATAT-----------T-G-AAA--CTG--TA---TCGTC----NNNNN--NNNN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-----------NNNNGCGACGCAACA-A-------TG-AAA-TACA-TGT----------ATGTGCAACCCATATATTTTTGAAAA--TTTCAAAAGGTGTAAC-ATTTCCT-AATCGAAAACGTATCGTTGAAAAGAGAGAGAGAGAG----------------------AGAGCATCAA--ATG-ATACATGGTAGTA-AC-TG-TCTTTCAAAATCATAAAAATCATT
gi|1 : taaataCATGTGTAA----------------------TT-CTTTCA-GATCCAATAAAGGA-CCA----AGTT--------------GA---------------TCCACTT---ATGTTGACAGACTAAAGTCC-GTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-GATTACTTTTAG---A----CCGTCGGAC-GT-CAG-CTCA--TTGA-TT--AACGCGTTTGATTTT-TT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATA-A--CTCT-GAATGC-AAGTGATA-TTGTGT-AATGCA------GTA------A--CTC-GTT-AA-TATTCATGT-CCTCCT-CACCC----C-G-TC--T-AATTGCAGAAGCG--ATTAG-AATA---TCA---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GGTTGT-----------ACAT-T--------------A-------------A-T-CCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TT-C-------------GT-ATGTC----------ATAATTA--CCAG-C---ATGTA--GCATTACC---AAATTGGTTTCAC--A--CCAAT---CAA-AGATTCTCCGC----CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGAGGG-TAAATAA-T-A-ACA---C-TA----CCGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|1 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTACTACTAGAGTGTCTAT-GAAAT-TTCGAGgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|10 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaat-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAATTTTAAAGC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACCATTAGAGCCGGT---------------AACAG-CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGAGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-T--------------ACACCCACGTGGAAATT-CCT-ATGAAAA--C-AC-AGAG--TT---------------GT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C---AT--------TT------------GTT------A--GC-AT--------GTTTCCTCGCC-G---AT---GAATTGTTGTGGTTT-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGCTAAAT-ATT-C-ACA---C-TA--CTTTGT-AAGTTATTTTCCAGTCGTCGTTGAttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|11 : TGTA-TT-GCTTTTAGCGCACCCTT--GTGGC---ACAC-A--TGCG-CACCTC-CCCACGTTTGGGGAA--ACATA-C-A--TT-T-G-AAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-G-ATT--G-TCAGTGCGCGGGTCC----A-AAACAATAAGTGCG-AATTAAT-GCTAGTTAG-TTTACAA--AAGATT--T-TTAA-A---TCTTTA-AACAGTTA-T---ATCCAATCCGATGTGAC-ACCA-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA----TT--TCCTG-C-TC--------TTTA-TCCTGCAATT-CGAAACCCGCCATCT---T-ACCGCTGATGGCGA-C-AC-TGACGGTAACTC--AACAGAAG-AAACG-TATG-TA-TCCAATGGCA-TGA-GT-TAC--A-TGCTACTA-T--T-T-AATT-A-AAC-TGTA-TGTagttgtttcctaaatatttactactagagcggtcttatgaatttgagctaccgcgttatttgccgacaagatgttttgtgtatgtactcgcgacctttatttct
gi|12 : aaAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--TTG-T---GT-T-GG-TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---AC----ACAAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAAAAAAT-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---GAT-TA-C-AC-AGGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGATT-TTT--TCCTG-C-TC--------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--CG--ATAT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TCAAA----AAG-AAAGG-TATG-TA-T-TAATTGCA-TAA-GTAC----A-TG-TA-TA-TATT-T-ACTT-AGAATATGTA-TGTGT------G-TGTT--TTATAATTATTCATTTA------------G-----------TTC--TAA-GTT
gi|13 : ta--TC-T-CAGAA-AACAC-TTCATCC-T---AT-GCAAT--G-T----GTACA---TC----C-TAA----AAATG-A-CAA-CAT-G--GGT--G-T----TC--AGATTT--C-CTAA-A---T---TA-TG-----G-T---C---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-AT-AATAAAACCTTT-TTGAA-A-ATA--CAGTACCATATTGGTATATTTA-T-TTGCTTTCATGAGA--TC--ATGT---TAAT----GATGATGA-CAAC-T---------TC--C----ATA-AAAGGCTGTG-TACT-TAA-TGCA-C---TTATAGACA-TG-CT-TA-T-TT-T-
gi|14 : gggggggggggTCTCATGTA-TTTGT-----GCGCAC--TT---TG-T---AT-TTG--TGCGGCACC-CACCCAT-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC----TCA---A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--GAT--GCT----AAACAAAATT--T-ATAA-A---C---TA-AA-----A-G---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GGCATGAATAAAA--TTTATTGGG-ATTTT--TCCTGC---CT-------TCTATT-CTG-AATT-CGAAA--CG--ATCT---T-AC----GATGGCGA-C-ACTTGACGGTAA-TC--A----AAA-AGAcatatttattcattttgtaatgaggtattatagataattagttt
gi|15 : aAGTATCGTGTA-TA-GG-----GCACAC--TT--GTG-T---AC-A-A--TGTG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-A--TC-T-GGTAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCACA---TA----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAAATT--C-TTTA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATG------------ATTGGA-A-TTT--TCCT-CC-TA--------TTTA-T-TTGCATTC-CGAAA--CA--ATGTTAAT-AC----GATGAGGA-C-AT-TGACGGTAA-TC--A----AAG-Aa
gi|16 : ccgtatAAAAAATGAG-AGAAAGAGAGAGAGAAGGGGCACGTGTAACC-C-----TTATTAGAAT---TT-CTTTCAAGAT-CAATAAGA-G-CCA----AGTC--------------AT------------------AATTGAAAAATTCACAA---AAAGT-CCGTGCAGTGTCAA-ACACAGTTGATAG---------ACTACAAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-
gi|17 : aaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaccatgtgtaaacccgttatagatatcttttAAGTCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TTAGGTG-CCTAAC-A-A--TGCG-CACC-C-CCAAC-TTTCGCG------------------C-GGAAA-AAC-C-TTAGTCCAT---AT-GTATT--GCT----GCGCC---CCCAT-A-AAA----AAATGTG-TAA-AA-----------------AA--AAAATT--A---AA-A---C---TA-TA-----G-T---A---AA---AAT-TA-C-TC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTACT-CTT-------TTTA-A-CTGCATTC-CGAAA--CG--ATCT---T-GC----GATGGAGA-C-AC-TGACGATAA-
gi|18 : cgtaAA-GATA-TA-CTAAAAA-AACAC-TTT----AATTTGTTTGTCA--T-AAC-ATT--TT-CTAAAT-----------TAA-AAA--C-G--TA---TCATca
gi|18 : ATGTGCAACTGT-----T-------ATATTTT-CTTACAAGATCCAATAAAG-A-ACC----AGTC--------------AT---------------ttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattttcttacaagatccaataaagaaccagtcataattg
gi|19 : aagatatactaaaaaaacactttaatttgtttgtcataacattttctaaattaaaaacgtatcatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---A-GCGCA-AAATGATA--G-TAGA--C-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TC-AAA-T-TGTAAC----------A-AAGAAACA-----ATT-----AGATTTTTCAGAGaattg
gi|19 : TTTCAAATTG--T-AAC-A----------AA--------------G-AAA--C-AATTAGATTTTTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG----CACGCT-AAATGATA--CATGTATGTGTGTAGTAGACATGTGCAACCCAATGAATTTCTTACA-AAA-T-CT-AATTTAAAAAAAAA-AAAAAACA-----GTT-----AAA--TTTagagagagagagcacgctaaatgatacatgtatgtgtgtagtagacatgtgcaacccaatgaatttcttacaaaatctaatttaaaaaaaaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|2 : agagagagagagagagagcgcaaaatgatagtagacatgtgcaacccaatatatttcAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-TAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAATTT--T-TTTATA---C---TA-AA-----A-T---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-T-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CAAAA--CG--ATCT---T-AC----GGTGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAAAG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---AATG-TA-TA-T-TTAT-ACTT-G-AATATGTA-TGTGT------GT-GTT--TTA--------------------------G-----------TTT--TAA-GTTCGT--A----T-T--TTT-GTTTTCATA-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---T---------GCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTTTAAAAATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-A--TA---TTGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----TAA--TTTCATAGTG-GTAAC-ATTTTCTAAATCG-AAACGTATCGTTAAGAAGAGAGAGAAGGAG----------------------AGCACTCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGA-AGAGAGAGAGCATGTGTAA----------------------TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-G-CCA----AGTT--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGT--CGTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-CACACCGA--TACTTTTAG---AAGGTC----GGACCATGCAGACTGC--TTGA-TTACAACACGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGAGTTATA-AATCTCTGGAATGC--AGTGATATTGTTGT-AATGC-------GTA------AATCTT-GG--AA-T-TTCAGGTCCCTCTTGCA-CCACCTG-GCTCTAT-AATTG-AGAAGCG----TAAGATTA---T-C---AAA-------GCTCAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC---------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGAAAGCA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATTCCCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TTAC------------GGTAATGTC----------ATGATTAATCCAG-CCCAGTGTA--GCATTA-CCCTAAATTGGTTTCACACA--CA-AT---CAA-AGTTTCTCCGCCTG-CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAAAT-AGACACTCC-TAATCTCTGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATTGAtttttaaattgaaa
gi|20 : G--ATTAGAATAA---TAG---AAA-------T----A-TTCA--A---ATT-TCTA--C-ATC-----------T---------------ATGCAGCCTTTG-TTTGA--C--A------AAAGAGAAA-CA-GG-TGT-----------AAAT-TA-------------A-------------ATG-CAC-GTGGAA-----ATCGGGGC-TT-CATATAAGCAACTGGT-ATGTCCGAATTTGTTGTGAATA--CCAG-T---GTGAG--GCAC---C---AA--T
gi|20 : AATTATTGT----T-GAAA-AGTACG-G-AACAA--AAACCAAAGtattgttgaaaagtacggaacaaaaaccaaag
gi|21 : gattagaataatagaaatattcaaatttctacatctatgcagcctttgtttgacaaaagagaaacaggtgtaaattaaatgcacgtggaaatcggggcttcatataagcaactggtatgtccgaatttgttgtgaataccagtgtgaggcaccAAGTATCGTGTA-TC-AT-----GCGCAC--TC--GCG-TA--AT-T-AACTGCA--ACC-C-AACAT-T-----GAA--CAA-A-T-AATCC-C-CCAAA-AAC-C-TTGGTCC-T---AT-GTATT--A-T----GCGCA---TC----C-AAA----ATTTG-A-CAA-AAT-G---GT--G-T----GC--AAATTT--TGTTTA-A---T---TA-AG-----A-TAAAA---AA---AAT-TG-C-AG-A-GT-A-GTAT-AAC--TTTATTGAA-A-ATTCCTCCT
gi|22 : taAC--TC--ATG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAATTT--C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---TA---AAT-TC-C-TT-A-GG-ATG------------ATTGGA-A--------------------------TA-T-CTGCATTC-TGAAA--
gi|23 : gtaaaaAGTCCCGTGTAATT-GT-----GCGCAT--TT--ATG-TTA-AT-T-G--CG----ACC-C-CCCAC-TTTGGGGAA--A-------A--TC-T-GGAAACAAC-C-TTAGTCC-T---ATCGTATCTGG-T----GCGCA---TT----C-AAA----AAATG-GAAAG-AAT-G--AGG--G-TAA--AA--AAATTT--C-TTAA-C---C---T--AA-----A-T---A---AA---AA--TC-C-AT-A-GG-
gi|25 : gtat--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------CTTCACA---------G-----CTTTTGTTTTGA--CCAAA-GC-TA-GGGGGAA-GA-AG-TAA-----------ACAT-
gi|26 : AAAGA-AACAACTTT----AATTTTTAAGTCT--TTAAC-A-TGTTC-CTAAATGTGCAATTACTT-G-AAAACC-A--TA---TCATG----AGAGAAGGAGA-GAGAGAG---atgttttattaacaagctaccatcacgtttgaaatt
gi|27 : AA-AAT-C-CAAGTCC-----AT-GTATT--G-T----GTGCA---TC----C-AAA----AATCA-A-CAA-AAT-A--GGT--G-T----aa
gi|29 : ccaacatttgaaaaaaagattccagatttcttcGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-G-CACACC-A--TACT--------------------ACCATGCAG-CTGCGTTTGA-TT--
gi|3 : G---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAACACGCTAA--ATG-ATACAT-GTA-TAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACC-CGTTATT-------AT---TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTG-AGTCATAATTGAAAAATTGT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAAATCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-GGCACACC-A--TAATCT------------------ACCATGCAG-CTGC-----------G--GCGTTTGATTTTTTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTT-TACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTACCGGTTAACATCAGGT-AAATATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAAA------GC-AAAATTAGC-AGA-ATT-TCTA--CCACC-----------TCTACAGCTGGCTGCAG-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-TACACGCACGTGGGAA-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACC-GAG--TT-G------------GTT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C---ATGTA--GCAT--------------------------------------GTTTCTC--CC-GCCGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT---ACA---CATA--CT-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGAtt
gi|30 : gggggggcgACGCTAATGATACATACAT-GTAGTAGACAagttgttcccaaatattactactagagacgggtcttatgagaatttcgagctaccgctgattttgccgactgtatgtacccgtacatcgtcgaccttttagtt
gi|31 : cacaaGTCC-TTCAAT-GTATT--G-T----GCACA---TC----C-AAA----AAgtcccgaaagttttctcccta
gi|32 : gAAGTATGGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--ATG-T---AT-T-A--TGCtcaacaaaattggtgtg
gi|33 : aataccata---TA-AA-----G-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGATTGGAA--TT
gi|34 : AAATCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TT--
gi|4 : cgtaG---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-A-GAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAAAGTG-GTAGCGATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA-AACACGCTAA--ATG-ATA-AT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACC-CGTTAAT-------AT---TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTGAAGTC--------------ATAATTGAAAAATTGTTTCCAGTT---ATGTTGAC-GG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-TGGAAATGCACGAGCGG-CACACC-A--TATCT-------------------ACCATGCAG-CTGC--GTGCTTT--GAT---TTT--TTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGACAATGTGTATTACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCAGTACCGGTA------AA--TC-GGTAAA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--TAAATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAGC-AGA-ATT-TCTACTC-ACC-----------T---------------
gi|4 : gcGTTTCTCCACG-C-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAGAA-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT---ACA---C-TA--CT-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGActacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatgtttctccacgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaaacaaaatccaaagaggtaataattacactacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|5 : gcggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcgatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgataatgtagtagacatgttctttcaaaatcattagagagagagagaaaggggcatgtgtaacccgttaatattttctttcaagatccaataaagaaccattgaagtcataattgaaaaattgtttccagttatgttgacggtaaagtccgtgcgttgtcaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttggaaatgcacgagcggcacaccatatctaccatgcagctgcgtgctttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgacaatgtgtattacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggtaaatcggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaaattgagaagcgattagaaatatacaaagcaaattagcagaatttctactcacctctacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatAGTATCGTGTA-TA-GG-----GTGCAC--TT--GTG-T---GC-A-A--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-T--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AC-GTATT--G-T----GCGCA---TCTAAAA-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAATTT--C-TTAA-A---C---TA-AA-----AAT---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGA------------TTGGA-A-TTT--TCCT-CC-TAT-------TT-A-T-CTGCATTC-CGAAA--CA--ATGT---T-AC----GATGACGA-C-AC-TGCCGGTAA-TC--A----AAG-AAACG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTACTT-A-AATATGTG-TGTGTTTTAAAATTATTAATTT-------------A------------G-----------TTC--TTA-ATATAC--A----TGTACTTT-GTTTTCATTTAAAAAAA--AA--ATAGTCAATT----------ACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--CGT-TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATGT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCA--T-AAC-A-T--TTCCTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA---TCATTAGAGAGAGA--GAGA-GAGAGAG---ACGCGCA-AAAGGATAG-GATACAAGT-----------ATGTGCAACCAAATATATTTCTT-TATATA-T-CG-AGT----------A-AAAAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|6 : cgtatAGTCCCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TC--ATG-T---AC-A-A--TGCG-CACC-A-CC-AC-TTTGGGGGAGTAAA-A-C-A---C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTC--T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---TATA--A-AAA----AAATG-G-AAA-AAGAG--AG---G-T----AAC-AAATTT--TCTTAA-AACTC---TA-AA-----A-T---ATT-AA---AAG-TC-C-AT-A-GG-ATGA--------TTTG--GAA-A-TAG--TCTTGCA-TGT-------T---------CA----CGAAA--CA--TTGT---T-AC----GAT--------AA-TGACGGTAA-TC--A----TAGTAAACG-TATGATA-T--AATTGCA-T-ATGTATA-----TG-TT-TAAT-GT-T-ATTTTATAATATGTAATGTGT------TGTGTC--TTA-------------A------------GATTATTATTAGTTC--TAACGTTCTT--AATAAT-TAATTT-GTTTTCATT-AACAAAA--A-TTGT-------TTCTGGACATTACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-TCAGAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATATTGT---TTAAACGGCTGCA-TT-AACAAGT--TTG-----AATGAGTATATATGGC-T--AAGAC-ATTC---A-CAAGTAATA-TA-C-AAAGA-TATAATTTT----AATTTTTAAGTCAT-T-AAC-A-T--TA-CTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA------TC----AGAGA--GAGAGGAGAGAGAGAGAGAGCACAAATGCTAATGATACATGT-----------A
gi|7 : gtatAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACCAA--TACTTTTAGAACA----T----GGACCATGCAG-CTGCA-TTGA-TT---ACAC--TGGA----TTT----CCCTTTCGAAAATGACTTGTTTG-AAT-TGTTGTATAATCTCT-GAATGCAAGATGATATCTTTGTAAATGCA------GTA------AATCTCTGGT-AA-TATTCA-AT-CCTCCT-CA-CC----GAA-TC--T-AATTG-AGAA-CG--A-TAGAAATA---TAC---AAA-------GCAAAA-TAAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GCTTAGGGGGATG-CACGG-TG------------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--CGGACGGAG--TT-C------------GGT-ATGTC----------AT-AATAT-CCAG-C---A-GTAATGCATAA-C---AA--TGGTTTCA---ACCCC-ATATACAATAGTTTCT-CGCC-G--GAG---CAATTGT--T----T-ATAG-AATAAT-AGAACAA--AATCCAAAGA--G-TATATAA-T-A-ACA---C-TG--ACCTGTAAAG-TATTCT-TGATCTCCATTGAgtaagacatgtgccgaatgttttgcttctatatt
gi|8 : GTC-CGTGTA-TT-GT-----G-GCGC--TT--ATGAT---AT-T-G----CG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TAAT-GGAAA-AAC-CATTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCG-A---TC----A-AAA----AA-TG-G-AAG-AAT-G--AG---G-T----AA--AAAATT--C-TTAA---------TA-AA-----A-T---A---AA---A---TT-C-AT-A-GG-ATGA------------TTGGA-A-T-------------------------A-T-CTGCA-TC-CGAAA--CAT-ATGT---T-A-----GATGACCAGC-AA-TGACGGTAA-TA--A----TAG-AA-CG-TATG-TA-T-TA-TTGCAAT-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTATTTTA-AATATGTA-TGTGT------GT-GTC--TTA-------------ATTATTCATTTTAG-----------TTC--TAA-GTTCATTAA----TATAATTG-GTCTTCATT-AAAAAAATTGATTCTA--CAATT-ATA-----TAA-AATTATATTTAAGTCTCTAAC-TAT-C--GAT-AAC-A-T-CACGAAATCCATAT--TCGTTTAAC-GG-TGCAATTAAACA-GTAATTGGGAAAAATGAGTATATAT-GC-TTCAAA-C-ATTGGGAA-CAAA-GATC-TAACTAAAGA-TATAA-TTT----AATTTTTAAGTCGACT-AACAA-T--TTACT-AAT-----------T-G-AAA--tgtcctaaatatactactagagctggtctaatgagtcgagttaaaaccgcgatacgaagaatggcgacttactgtatcaccgtac
gi|9 : atc-AATTG-AGAAGCGTAGTTAGAAGTAAAATATTTAAAA-------GC-AAA-TTAGTAAGAGATTGTCTA--C-ACCATTAGAGCCCGT---------------AACCAGCCTTTGTTTTGATAC--AATGC-TAGGGAGGAA-CAAGG-TGTTATTACGACCCACGTGT--------------A-------------ATT-GCTGATGAAAAAAC-ACCGAGGAGTT-T------------TGT-A-GT-----------GTAAATA--CCAAAC---ATGTA--GCATTG-T---A-------TTCT---A--CC-A-----------------GCC-G-AGATATAGAATTGTTGT----TTGAAACAATAAG-A-AACAAAGAATCC-AAGA-GG-TAATTAATTCA-GTA---C-AA--C-ATGTAAAA-TGTCTT-C-GTCGTaacg
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GTCGTCATTGAAGTTGTTCCCAAATATTACTACTAGAGCGGTCTTATGAAATTTCGAGCTACCGCTGATTTTGCCGACTGTATGTACCCGGTACTCGTCGACCTTTTAGTTTC
Unaligned ( gi|28 ): GAGGAGAAAAACACTAAATTGATCATGTAGTAAGACATGGTTGCACGAACGTTTTCTTTCTAATAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 11 111111 1111111 11111111 33333333333333 111 222222 11 1 222 222222222 99999999999999999999999999999999999999 333333333333 11 222222222 11 1111 6666666666666 22222 111 1 1111 111 1111111 222222222222222 1111 111111 1111 11111 111 22222222222 1 2222222222 11111 111111 1 1 8888888888888888888888 11 222222222 1 7777777777777777777777 1 111 2222 77777777777777777777777777777777 111 11 222 66666666666666666 1111 77777777777777777777 222222222222222 1111 1 1 2222222 2222222222222 1 1 22222222 11 2222222 1 11 1111 1111111111111111111111111111111111 1 1 222222222222 6666666666666666666666666666 11 444444444444444 2222222222 11 1111 00000000000000000000000000000000000000 11111 111 1111 111 111 22222 1
lowQualScore : 2 2 77777 33 444 5 111 000000 3 3 3 3 44 3 9 3 66 2 5 2 2 2 2 444 2 00 2 5555 444 999999 5555 5 2 2 2 33 999 2 9999 66 77777 999 2 777 444 2 66666 2 1111111 444 2 33 2 2 2 2 55555555 88888888 77777777777777 0 3 3 7 3 44 88 1 666 3 7777 7 3 3 3 55 8888 4 1 5 5 5 5 5 222 888888 5 5 5 00 5 0 333 5 666666666 99 11111111111111111111111111111111111111 99 6 1 666666666666 8 99 11 11 666 555555555 11 11 8 2222 8 8 0 8 1111111111111 8 0 0 88 00000 8 8 0 3 8 444 8 6 6 6 5 1 2222 555 5 5 7777777 0 444444444444444 66 0000 000000 2222 77 5 00000 5 222 1 33333333333 1 5 5 1 5 5 5555555555 5 1 44444 555555 77 0 0 3 3 6666666666666666666666 11 8 8 0 3 555555555 0 2 5 9999999999999999999999 3 666 5555 55555555555555555555555555555555 444 0 11 555 8 88888888888888888 5 5 0 5 5 6666 00000000000000000000 6 444444444444444 5 0 0 7777 8 9 3 0 8 0 0 8 3333333 3333333333333 88 8 0 6 0 8 8 11111111 11 5 5 66 0 888 0 888 1111111 0 5 55 4 4 1111 7777777777777777777777777777777777 66 66 5 5 0 5 0 5 444444444444 5 1111111111111111111111111111 5 5 7 77 5 0 33 222222222222222 5 5555555555 2 33 5 1111 77 88888888888888888888888888888888888888 33 77777 000 0000 5 5 5 5 66 5 5 5 8 999 000 5 22222 1 5 5 5 0 7
lowQualScore : . . ..... .. ... . ... ...... . . . . .. . . . .. . . . . . . ... . .. . .... ... ...... .... . . . . .. ... . .... .. ..... ... . ... ... . ..... . ....... ... . .. . . . . ........ ........ .............. . . . . . .. .. . ... . .... . . . . .. .... . . . . . . . ... ...... . . . .. . . ... . ......... .. ...................................... .. . . ............ . .. .. .. ... ......... .. .. . .... . . . . ............. . . . .. ..... . . . . . ... . . . . . . .... ... . . ....... . ............... .. .... ...... .... .. . ..... . ... . ........... . . . . . . .......... . . ..... ...... .. . . . . ...................... .. . . . . ......... . . . ...................... . ... .... ................................ ... . .. ... . ................. . . . . . .... .................... . ............... . . . .... . . . . . . . . ....... ............. .. . . . . . . ........ .. . . .. . ... . ... ....... . . .. . . .... .................................. .. .. . . . . . . ............ . ............................ . . . .. . . .. ............... . .......... . .. . .... .. ...................................... .. ..... ... .... . . . . .. . . . . ... ... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 9 9 11111 77 777 7 888 000000 1 1 1 1 22 1 2 1 88 9 7 7 7 7 5 444 5 33 5 3333 444 777777 3333 3 7 7 7 77 222 7 3333 88 11111 222 9 999 777 7 77777 7 3333333 777 7 77 7 7 7 7 99999999 99999999 11111111111111 3 3 3 5 3 66 66 0 444 6 7777 3 6 6 6 55 5555 0 0 0 0 0 0 0 111 555555 0 0 0 99 0 0 000 7 555555555 22 77777777777777777777777777777777777777 22 7 0 000000000000 0 00 00 66 444 222222222 66 00 0 2222 0 0 8 0 0000000000000 0 8 8 88 00000 0 0 8 2 0 000 0 7 7 7 7 4 1111 000 0 0 1111111 1 888888888888888 99 4444 111111 1111 99 7 22222 0 666 6 88888888888 7 7 7 4 7 7 0000000000 7 7 33333 333333 99 0 0 2 2 8888888888888888888888 00 0 0 8 2 000000000 8 5 0 0000000000000000000000 3 000 8888 00000000000000000000000000000000 000 8 22 000 0 44444444444444444 0 0 8 7 7 0000 77777777777777777777 7 888888888888888 0 8 8 0000 0 0 2 8 0 6 8 0 8888888 6666666666666 88 0 8 0 0 0 0 22222222 00 7 7 99 1 888 1 888 2222222 0 0 00 4 4 7777 7777777777777777777777777777777777 99 99 0 0 8 0 0 0 111111111111 0 7777777777777777777777777777 7 7 1 99 7 4 66 333333333333333 7 0000000000 3 66 7 4444 99 22222222222222222222222222222222222222 77 11111 000 6666 0 0 0 0 99 7 7 0 7 999 000 7 33333 4 7 0 7 1 1
consensus : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAN----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAG-------------------C--AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG---A----C----GGACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATT-A-ACA---C-TA--CTCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
Reference ( family-2342 ) : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAN----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAGC---------------------AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG---A----C----GGACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATT-A-ACA---C-TA--CTCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
gi|1 : TCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CA-C-C-CCCAC---TGGGGGA--AAA-A-CTAT-TC-T-GG-AA-AAC-C-TTAGT-C-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC------AAA----AAATG-G-AAG--AT-G--AGT----T----AA--AAAA----AT---TTAA-AT--C---TAGAA-----A-TAG-A---AA---AAT-TA-CAAC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-T-TTT--TCCTG-C-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--TG--ATCT---T-AC----GATGGCGAGC-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAA-AAGGG-TA---TA-T-TAATTGCA-T-A-GTAAT---A-TG-TA-TA-T-CT-T-ACTT---GATATGTA-T-TGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTTTATAA-GTCTTT--G----T---ATTTAGTTTTCATG-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACT-ATAAT--TTACGT-TGTACTATATAC--GATGAACTAATACAGTAAATCCATAT--------------CTGCA-TTATACAAGTA-TCG-----AATGAATATATAT-GTGTTCAAAGTGATTC---ATCAAA-GATCTTA-CTAAAGATAACAA--TT----AATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TTCCTATAT-----------T-G-AAA--CTG--TA---TCGTC----NNNNN--NNNN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-----------NNNNGCGACGCAACA-A-------TG-AAA-TACA-TGT----------ATGTGCAACCCATATATTTTTGAAAA--TTTCAAAAGGTGTAAC-ATTTCCT-AATCGAAAACGTATCGTTGAAAAGAGAGAGAGAGAG----------------------AGAGCATCAA--ATG-ATACATGGTAGTA-AC-TG-TCTTTCAAAATCATAAAAATCATT
gi|1 : taaataCATGTGTAA----------------------TT-CTTTCA-GATCCAATAAAGGA-CCA----AGTT--------------GA---------------TCCACTT---ATGTTGACAGACTAAAGTCC-GTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-GATTACTTTTAG---A----CCGTCGGAC-GT-CAG-CTCA--TTGA-TT--AACGCGTTTGATTTT-TT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATA-A--CTCT-GAATGC-AAGTGATA-TTGTGT-AATGCA------GTA------A--CTC-GTT-AA-TATTCATGT-CCTCCT-CACCC----C-G-TC--T-AATTGCAGAAGCG--ATTAG-AATA---TCA---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GGTTGT-----------ACAT-T--------------A-------------A-T-CCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TT-C-------------GT-ATGTC----------ATAATTA--CCAG-C---ATGTA--GCATTACC---AAATTGGTTTCAC--A--CCAAT---CAA-AGATTCTCCGC----CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGAGGG-TAAATAA-T-A-ACA---C-TA----CCGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|1 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTACTACTAGAGTGTCTAT-GAAAT-TTCGAGgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|10 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaat-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAATTTTAAAGC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACCATTAGAGCCGGT---------------AACAG-CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGAGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-T--------------ACACCCACGTGGAAATT-CCT-ATGAAAA--C-AC-AGAG--TT---------------GT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C---AT--------TT------------GTT------A--GC-AT--------GTTTCCTCGCC-G---AT---GAATTGTTGTGGTTT-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGCTAAAT-ATT-C-ACA---C-TA--CTTTGT-AAGTTATTTTCCAGTCGTCGTTGAttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|11 : TGTA-TT-GCTTTTAGCGCACCCTT--GTGGC---ACAC-A--TGCG-CACCTC-CCCACGTTTGGGGAA--ACATA-C-A--TT-T-G-AAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-G-ATT--G-TCAGTGCGCGGGTCC----A-AAACAATAAGTGCG-AATTAAT-GCTAGTTAG-TTTACAA--AAGA----TT-T-TTAA-A---TCTTTA-AACAGTTA-T---ATCCAATCCGATGTGAC-ACCA-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA----TT--TCCTG-C-TC--------TTTA-TCCTGCAATT-CGAAACCCGCCATCT---T-ACCGCTGATGGCGA-C-AC-TGACGGTAACTC--AACAGAAG-AAACG-TATG-TA-TCCAATGGCA-TGA-GT-TAC--A-TGCTACTA-T--T-T-AATT-A-AAC-TGTA-TGTagttgtttcctaaatatttactactagagcggtcttatgaatttgagctaccgcgttatttgccgacaagatgttttgtgtatgtactcgcgacctttatttct
gi|12 : aaAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--TTG-T---GT-T-GG-TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---AC----ACAAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAAAAAATT----TAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---GAT-TA-C-AC-AGGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGATT-TTT--TCCTG-C-TC--------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--CG--ATAT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TCAAA----AAG-AAAGG-TATG-TA-T-TAATTGCA-TAA-GTAC----A-TG-TA-TA-TATT-T-ACTT-AGAATATGTA-TGTGT------G-TGTT--TTATAATTATTCATTTA------------G-----------TTC--TAA-GTT
gi|13 : ta--TC-T-CAGAA-AACAC-TTCATCC-T---AT-GCAAT--G-T----GTACA---TC----C-TAA----AAATG-A-CAA-CAT-G--GGT--G-T----TC--AGAT----TT-C-CTAA-A---T---TA-TG-----G-T---C---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-AT-AATAAAACCTTT-TTGAA-A-ATA--CAGTACCATATTGGTATATTTA-T-TTGCTTTCATGAGA--TC--ATGT---TAAT----GATGATGA-CAAC-T---------TC--C----ATA-AAAGGCTGTG-TACT-TAA-TGCA-C---TTATAGACA-TG-CT-TA-T-TT-T-
gi|14 : gggggggggggTCTCATGTA-TTTGT-----GCGCAC--TT---TG-T---AT-TTG--TGCGGCACC-CACCCAT-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC----TCA---A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--GAT--GCT----AAACAAAA----TT-T-ATAA-A---C---TA-AA-----A-G---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GGCATGAATAAAA--TTTATTGGG-ATTTT--TCCTGC---CT-------TCTATT-CTG-AATT-CGAAA--CG--ATCT---T-AC----GATGGCGA-C-ACTTGACGGTAA-TC--A----AAA-AGAcatatttattcattttgtaatgaggtattatagataattagttt
gi|15 : aAGTATCGTGTA-TA-GG-----GCACAC--TT--GTG-T---AC-A-A--TGTG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-A--TC-T-GGTAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCACA---TA----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAAA----TT-C-TTTA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATG------------ATTGGA-A-TTT--TCCT-CC-TA--------TTTA-T-TTGCATTC-CGAAA--CA--ATGTTAAT-AC----GATGAGGA-C-AT-TGACGGTAA-TC--A----AAG-Aa
gi|16 : ccgtatAAAAAATGAG-AGAAAGAGAGAGAGAAGGGGCACGTGTAACC-C-----TTATTAGAAT---TT-CTTTCAAGAT-CAATAAGA-G-CCA----AGTC--------------AT------------------AATTGAAAAATTCACAA---AAAGT-CCGTGCAGTGTCAA-ACACAGTTGATAG---------ACTACAAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-
gi|17 : aaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaccatgtgtaaacccgttatagatatcttttAAGTCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TTAGGTG-CCTAAC-A-A--TGCG-CACC-C-CCAAC-TTTCGCG------------------C-GGAAA-AAC-C-TTAGTCCAT---AT-GTATT--GCT----GCGCC---CCCAT-A-AAA----AAATGTG-TAA-AA-----------------AA--AAAA----TT-A---AA-A---C---TA-TA-----G-T---A---AA---AAT-TA-C-TC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTACT-CTT-------TTTA-A-CTGCATTC-CGAAA--CG--ATCT---T-GC----GATGGAGA-C-AC-TGACGATAA-
gi|18 : cgtaAA-GATA-TA-CTAAAAA-AACAC-TTT----AATTTGTTTGTCA--T-AAC-ATT--TT-CTAAAT-----------TAA-AAA--C-G--TA---TCATca
gi|18 : ATGTGCAACTGT-----T-------ATATTTT-CTTACAAGATCCAATAAAG-A-ACC----AGTC--------------AT---------------ttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattttcttacaagatccaataaagaaccagtcataattg
gi|19 : aagatatactaaaaaaacactttaatttgtttgtcataacattttctaaattaaaaacgtatcatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---A-GCGCA-AAATGATA--G-TAGA--C-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TC-AAA-T-TGTAAC----------A-AAGAAACA-----ATT-----AGATTTTTCAGAGaattg
gi|19 : TTTCAAATTG--T-AAC-A----------AA--------------G-AAA--C-AATTAGATTTTTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG----CACGCT-AAATGATA--CATGTATGTGTGTAGTAGACATGTGCAACCCAATGAATTTCTTACA-AAA-T-CT-AATTTAAAAAAAAA-AAAAAACA-----GTT-----AAA--TTTagagagagagagcacgctaaatgatacatgtatgtgtgtagtagacatgtgcaacccaatgaatttcttacaaaatctaatttaaaaaaaaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|2 : agagagagagagagagagcgcaaaatgatagtagacatgtgcaacccaatatatttcAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-TAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAT----TT-T-TTTATA---C---TA-AA-----A-T---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-T-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CAAAA--CG--ATCT---T-AC----GGTGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAAAG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---AATG-TA-TA-T-TTAT-ACTT-G-AATATGTA-TGTGT------GT-GTT--TTA--------------------------G-----------TTT--TAA-GTTCGT--A----T-T--TTT-GTTTTCATA-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---T---------GCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTTTAAAAATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-A--TA---TTGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----TAA--TTTCATAGTG-GTAAC-ATTTTCTAAATCG-AAACGTATCGTTAAGAAGAGAGAGAAGGAG----------------------AGCACTCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGA-AGAGAGAGAGCATGTGTAA----------------------TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-G-CCA----AGTT--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGT--CGTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-CACACCGA--TACTTTTAG---AAGGTC----GGACCATGCAGACTGC--TTGA-TTACAACACGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGAGTTATA-AATCTCTGGAATGC--AGTGATATTGTTGT-AATGC-------GTA------AATCTT-GG--AA-T-TTCAGGTCCCTCTTGCA-CCACCTG-GCTCTAT-AATTG-AGAAGCG----TAAGATTA---T-C---AAA-------GCTCAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC---------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGAAAGCA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATTCCCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TTAC------------GGTAATGTC----------ATGATTAATCCAG-CCCAGTGTA--GCATTA-CCCTAAATTGGTTTCACACA--CA-AT---CAA-AGTTTCTCCGCCTG-CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAAAT-AGACACTCC-TAATCTCTGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATTGAtttttaaattgaaa
gi|20 : G--ATTAGAATAA---TAG---AAA-------T----A-TTCA--A---ATT-TCTA--C-ATC-----------T---------------ATGCAGCCTTTG-TTTGA--C--A------AAAGAGAAA-CA-GG-TGT-----------AAAT-TA-------------A-------------ATG-CAC-GTGGAA-----ATCGGGGC-TT-CATATAAGCAACTGGT-ATGTCCGAATTTGTTGTGAATA--CCAG-T---GTGAG--GCAC---C---AA--T
gi|20 : AATTATTGT----T-GAAA-AGTACG-G-AACAA--AAACCAAAGtattgttgaaaagtacggaacaaaaaccaaag
gi|21 : gattagaataatagaaatattcaaatttctacatctatgcagcctttgtttgacaaaagagaaacaggtgtaaattaaatgcacgtggaaatcggggcttcatataagcaactggtatgtccgaatttgttgtgaataccagtgtgaggcaccAAGTATCGTGTA-TC-AT-----GCGCAC--TC--GCG-TA--AT-T-AACTGCA--ACC-C-AACAT-T-----GAA--CAA-A-T-AATCC-C-CCAAA-AAC-C-TTGGTCC-T---AT-GTATT--A-T----GCGCA---TC----C-AAA----ATTTG-A-CAA-AAT-G---GT--G-T----GC--AAAT----TT-TGTTTA-A---T---TA-AG-----A-TAAAA---AA---AAT-TG-C-AG-A-GT-A-GTAT-AAC--TTTATTGAA-A-ATTCCTCCT
gi|22 : taAC--TC--ATG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAAT----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---TA---AAT-TC-C-TT-A-GG-ATG------------ATTGGA-A--------------------------TA-T-CTGCATTC-TGAAA--
gi|23 : gtaaaaAGTCCCGTGTAATT-GT-----GCGCAT--TT--ATG-TTA-AT-T-G--CG----ACC-C-CCCAC-TTTGGGGAA--A-------A--TC-T-GGAAACAAC-C-TTAGTCC-T---ATCGTATCTGG-T----GCGCA---TT----C-AAA----AAATG-GAAAG-AAT-G--AGG--G-TAA--AA--AAAT----TT-C-TTAA-C---C---T--AA-----A-T---A---AA---AA--TC-C-AT-A-GG-
gi|25 : gtat--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------CTTCACA---------G-----CTTTTGTTTTGA--CCAAA-GC-TA-GGGGGAA-GA-AG-TAA-----------ACAT-
gi|26 : AAAGA-AACAACTTT----AATTTTTAAGTCT--TTAAC-A-TGTTC-CTAAATGTGCAATTACTT-G-AAAACC-A--TA---TCATG----AGAGAAGGAGA-GAGAGAG---atgttttattaacaagctaccatcacgtttgaaatt
gi|27 : AA-AAT-C-CAAGTCC-----AT-GTATT--G-T----GTGCA---TC----C-AAA----AATCA-A-CAA-AAT-A--GGT--G-T----aa
gi|29 : ccaacatttgaaaaaaagattccagatttcttcGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-G-CACACC-A--TACT--------------------ACCATGCAG-CTGCGTTTGA-TT--
gi|3 : G---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAACACGCTAA--ATG-ATACAT-GTA-TAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACC-CGTTATT-------AT---TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTG-AGTCATAATTGAAAAATTGT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAAATCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-GGCACACC-A--TAATCT------------------ACCATGCAG-CTGC-----------G--GCGTTTGATTTTTTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTT-TACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTACCGGTTAACATCAGGT-AAATATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAAA------GC-AAAATTAGC-AGA-ATT-TCTA--CCACC-----------TCTACAGCTGGCTGCAG-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-TACACGCACGTGGGAA-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACC-GAG--TT-G------------GTT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C---ATGTA--GCAT--------------------------------------GTTTCTC--CC-GCCGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT---ACA---CATA--CT-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGAtt
gi|30 : gggggggcgACGCTAATGATACATACAT-GTAGTAGACAagttgttcccaaatattactactagagacgggtcttatgagaatttcgagctaccgctgattttgccgactgtatgtacccgtacatcgtcgaccttttagtt
gi|31 : cacaaGTCC-TTCAAT-GTATT--G-T----GCACA---TC----C-AAA----AAgtcccgaaagttttctcccta
gi|32 : gAAGTATGGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--ATG-T---AT-T-A--TGCtcaacaaaattggtgtg
gi|33 : aataccata---TA-AA-----G-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGATTGGAA--TT
gi|34 : AAATCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TT--
gi|4 : cgtaG---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-A-GAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAAAGTG-GTAGCGATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA-AACACGCTAA--ATG-ATA-AT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACC-CGTTAAT-------AT---TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTGAAGTC--------------ATAATTGAAAAATTGTTTCCAGTT---ATGTTGAC-GG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-TGGAAATGCACGAGCGG-CACACC-A--TATCT-------------------ACCATGCAG-CTGC--GTGCTTT--GAT---TTT--TTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGACAATGTGTATTACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCAGTACCGGTA------AA--TC-GGTAAA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--TAAATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAGC-AGA-ATT-TCTACTC-ACC-----------T---------------
gi|4 : gcGTTTCTCCACG-C-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAGAA-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT---ACA---C-TA--CT-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGActacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatgtttctccacgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaaacaaaatccaaagaggtaataattacactacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|5 : gcggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcgatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgataatgtagtagacatgttctttcaaaatcattagagagagagagaaaggggcatgtgtaacccgttaatattttctttcaagatccaataaagaaccattgaagtcataattgaaaaattgtttccagttatgttgacggtaaagtccgtgcgttgtcaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttggaaatgcacgagcggcacaccatatctaccatgcagctgcgtgctttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgacaatgtgtattacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggtaaatcggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaaattgagaagcgattagaaatatacaaagcaaattagcagaatttctactcacctctacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatAGTATCGTGTA-TA-GG-----GTGCAC--TT--GTG-T---GC-A-A--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-T--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AC-GTATT--G-T----GCGCA---TCTAAAA-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAAT----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----AAT---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGA------------TTGGA-A-TTT--TCCT-CC-TAT-------TT-A-T-CTGCATTC-CGAAA--CA--ATGT---T-AC----GATGACGA-C-AC-TGCCGGTAA-TC--A----AAG-AAACG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTACTT-A-AATATGTG-TGTGTTTTAAAATTATTAATTT-------------A------------G-----------TTC--TTA-ATATAC--A----TGTACTTT-GTTTTCATTTAAAAAAA--AA--ATAGTCAATT----------ACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--CGT-TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATGT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCA--T-AAC-A-T--TTCCTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA---TCATTAGAGAGAGA--GAGA-GAGAGAG---ACGCGCA-AAAGGATAG-GATACAAGT-----------ATGTGCAACCAAATATATTTCTT-TATATA-T-CG-AGT----------A-AAAAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|6 : cgtatAGTCCCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TC--ATG-T---AC-A-A--TGCG-CACC-A-CC-AC-TTTGGGGGAGTAAA-A-C-A---C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTC--T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---TATA--A-AAA----AAATG-G-AAA-AAGAG--AG---G-T----AAC-AAAT----TTTC-TTAA-AACTC---TA-AA-----A-T---ATT-AA---AAG-TC-C-AT-A-GG-ATGA--------TTTG--GAA-A-TAG--TCTTGCA-TGT-------T---------CA----CGAAA--CA--TTGT---T-AC----GAT--------AA-TGACGGTAA-TC--A----TAGTAAACG-TATGATA-T--AATTGCA-T-ATGTATA-----TG-TT-TAAT-GT-T-ATTTTATAATATGTAATGTGT------TGTGTC--TTA-------------A------------GATTATTATTAGTTC--TAACGTTCTT--AATAAT-TAATTT-GTTTTCATT-AACAAAA--A-TTGT-------TTCTGGACATTACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-TCAGAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATATTGT---TTAAACGGCTGCA-TT-AACAAGT--TTG-----AATGAGTATATATGGC-T--AAGAC-ATTC---A-CAAGTAATA-TA-C-AAAGA-TATAATTTT----AATTTTTAAGTCAT-T-AAC-A-T--TA-CTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA------TC----AGAGA--GAGAGGAGAGAGAGAGAGAGCACAAATGCTAATGATACATGT-----------A
gi|7 : gtatAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACCAA--TACTTTTAGAACA----T----GGACCATGCAG-CTGCA-TTGA-TT---ACAC--TGGA----TTT----CCCTTTCGAAAATGACTTGTTTG-AAT-TGTTGTATAATCTCT-GAATGCAAGATGATATCTTTGTAAATGCA------GTA------AATCTCTGGT-AA-TATTCA-AT-CCTCCT-CA-CC----GAA-TC--T-AATTG-AGAA-CG--A-TAGAAATA---TAC---AAA-------GCAAAA-TAAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GCTTAGGGGGATG-CACGG-TG------------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--CGGACGGAG--TT-C------------GGT-ATGTC----------AT-AATAT-CCAG-C---A-GTAATGCATAA-C---AA--TGGTTTCA---ACCCC-ATATACAATAGTTTCT-CGCC-G--GAG---CAATTGT--T----T-ATAG-AATAAT-AGAACAA--AATCCAAAGA--G-TATATAA-T-A-ACA---C-TG--ACCTGTAAAG-TATTCT-TGATCTCCATTGAgtaagacatgtgccgaatgttttgcttctatatt
gi|8 : GTC-CGTGTA-TT-GT-----G-GCGC--TT--ATGAT---AT-T-G----CG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TAAT-GGAAA-AAC-CATTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCG-A---TC----A-AAA----AA-TG-G-AAG-AAT-G--AG---G-T----AA--AAAA----TT-C-TTAA---------TA-AA-----A-T---A---AA---A---TT-C-AT-A-GG-ATGA------------TTGGA-A-T-------------------------A-T-CTGCA-TC-CGAAA--CAT-ATGT---T-A-----GATGACCAGC-AA-TGACGGTAA-TA--A----TAG-AA-CG-TATG-TA-T-TA-TTGCAAT-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTATTTTA-AATATGTA-TGTGT------GT-GTC--TTA-------------ATTATTCATTTTAG-----------TTC--TAA-GTTCATTAA----TATAATTG-GTCTTCATT-AAAAAAATTGATTCTA--CAATT-ATA-----TAA-AATTATATTTAAGTCTCTAAC-TAT-C--GAT-AAC-A-T-CACGAAATCCATAT--TCGTTTAA--CGGTGCAATTAAACA-GTAATTGGGAAAAATGAGTATATAT-GC-TTCAAA-C-ATTGGGAA-CAAA-GATC-TAACTAAAGA-TATAA-TTT----AATTTTTAAGTCGACT-AACAA-T--TTACT-AAT-----------T-G-AAA--tgtcctaaatatactactagagctggtctaatgagtcgagttaaaaccgcgatacgaagaatggcgacttactgtatcaccgtac
gi|9 : atc-AATTG-AGAAGCGTAGTTAGAAGTAAAATATTTAAAA-------GC-AAA-TTAGTAAGAGATTGTCTA--C-ACCATTAGAGCCCGT---------------AACCAGCCTTTGTTTTGATAC--AATGC-TAGGGAGGAA-CAAGG-TGTTATTACGACCCACGTGT--------------A-------------ATT-GCTGATGAAAAAAC-ACCGAGGAGTT-T------------TGT-A-GT-----------GTAAATA--CCAAAC---ATGTA--GCATTG-T---A-------TTCT---A--CC-A-----------------GCC-G-AGATATAGAATTGTTGT----TTGAAACAATAAG-A-AACAAAGAATCC-AAGA-GG-TAATTAATTCA-GTA---C-AA--C-ATGTAAAA-TGTCTT-C-GTCGTaacg
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GTCGTCATTGAAGTTGTTCCCAAATATTACTACTAGAGCGGTCTTATGAAATTTCGAGCTACCGCTGATTTTGCCGACTGTATGTACCCGGTACTCGTCGACCTTTTAGTTTC
Unaligned ( gi|28 ): GAGGAGAAAAACACTAAATTGATCATGTAGTAAGACATGGTTGCACGAACGTTTTCTTTCTAATAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 11 111111 1111111 11111111 33333333333333 111 222222 11 1 222 222222222 99999999999999999999999999999999999999 333333333333 11 222222222 11 1111 6666666666666 22222 111 1 1111 111 1111111 222222222222222 1111 111111 1111 11111 111 22222222222 1 2222222222 11111 111111 1 1 8888888888888888888888 11 222222222 1 7777777777777777777777 1 111 2222 77777777777777777777777777777777 111 11 222 66666666666666666 1111 77777777777777777777 222222222222222 1111 1 1 2222222 2222222222222 1 1 22222222 11 2222222 1 11 1111 1111111111111111111111111111111111 1 1 222222222222 6666666666666666666666666666 11 444444444444444 2222222222 11 1111 00000000000000000000000000000000000000 11111 111 1111 111 111 22222 1
lowQualScore : 2 2 77777 33 444 5 111 000000 3 3 3 3 44 3 9 3 66 2 5 2 2 2 2 444 2 00 2 5555 444 999999 5555 5 2 2 2 33 999 2 9999 66 77777 999 2 777 444 2 66666 2 1111111 444 2 33 2 2 2 2 55555555 88888888 77777777777777 0 3 3 7 3 44 88 1 666 3 7777 7 3 3 3 55 8888 4 1 5 5 5 5 5 222 888888 5 5 5 00 5 0 333 5 666666666 99 11111111111111111111111111111111111111 99 6 1 666666666666 8 99 11 11 666 555555555 11 11 8 2222 8 8 0 8 1111111111111 8 0 0 88 00000 8 8 0 3 8 444 8 6 6 6 5 1 2222 555 5 5 7777777 0 444444444444444 66 0000 000000 2222 77 5 00000 5 222 1 33333333333 1 5 5 1 5 5 5555555555 5 1 44444 555555 77 0 0 3 3 6666666666666666666666 11 8 8 0 3 555555555 0 2 5 9999999999999999999999 3 666 5555 55555555555555555555555555555555 444 0 11 555 8 88888888888888888 5 5 0 5 5 6666 00000000000000000000 6 444444444444444 5 0 0 7777 8 9 3 0 8 0 0 8 3333333 3333333333333 88 8 0 6 0 8 8 11111111 11 5 5 66 0 888 0 888 1111111 0 5 55 4 4 1111 7777777777777777777777777777777777 66 66 5 5 0 5 0 5 444444444444 5 1111111111111111111111111111 5 5 7 77 5 0 33 222222222222222 5 5555555555 2 33 5 1111 77 88888888888888888888888888888888888888 33 77777 000 0000 5 5 5 5 66 5 5 5 8 999 000 5 22222 1 5 5 5 0 7
lowQualScore : . . ..... .. ... . ... ...... . . . . .. . . . .. . . . . . . ... . .. . .... ... ...... .... . . . . .. ... . .... .. ..... ... . ... ... . ..... . ....... ... . .. . . . . ........ ........ .............. . . . . . .. .. . ... . .... . . . . .. .... . . . . . . . ... ...... . . . .. . . ... . ......... .. ...................................... .. . . ............ . .. .. .. ... ......... .. .. . .... . . . . ............. . . . .. ..... . . . . . ... . . . . . . .... ... . . ....... . ............... .. .... ...... .... .. . ..... . ... . ........... . . . . . . .......... . . ..... ...... .. . . . . ...................... .. . . . . ......... . . . ...................... . ... .... ................................ ... . .. ... . ................. . . . . . .... .................... . ............... . . . .... . . . . . . . . ....... ............. .. . . . . . . ........ .. . . .. . ... . ... ....... . . .. . . .... .................................. .. .. . . . . . . ............ . ............................ . . . .. . . .. ............... . .......... . .. . .... .. ...................................... .. ..... ... .... . . . . .. . . . . ... ... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 9 9 11111 77 777 7 888 000000 1 1 1 1 22 1 2 1 88 9 7 7 7 7 5 444 5 33 5 3333 444 777777 3333 3 7 7 7 77 222 7 3333 88 11111 222 9 999 777 7 77777 7 3333333 777 7 77 7 7 7 7 99999999 99999999 11111111111111 3 3 3 5 3 66 66 0 444 6 7777 3 6 6 6 55 5555 0 0 0 0 0 0 0 111 555555 0 0 0 99 0 0 000 7 555555555 22 77777777777777777777777777777777777777 22 7 0 000000000000 0 00 00 66 444 222222222 66 00 0 2222 0 0 8 0 0000000000000 0 8 8 88 00000 0 0 8 2 0 000 0 7 7 7 7 4 1111 000 0 0 1111111 1 888888888888888 99 4444 111111 1111 99 7 22222 0 666 6 88888888888 7 7 7 4 7 7 0000000000 7 7 33333 333333 99 0 0 2 2 8888888888888888888888 00 0 0 8 2 000000000 8 5 0 0000000000000000000000 3 000 8888 00000000000000000000000000000000 000 8 22 000 0 44444444444444444 0 0 8 7 7 0000 77777777777777777777 7 888888888888888 0 8 8 0000 0 0 2 8 0 6 8 0 8888888 6666666666666 88 0 8 0 0 0 0 22222222 00 7 7 99 1 888 1 888 2222222 0 0 00 4 4 7777 7777777777777777777777777777777777 99 99 0 0 8 0 0 0 111111111111 0 7777777777777777777777777777 7 7 1 99 7 4 66 333333333333333 7 0000000000 3 66 7 4444 99 22222222222222222222222222222222222222 77 11111 000 6666 0 0 0 0 99 7 7 0 7 999 000 7 33333 4 7 0 7 1 1
consensus : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAN----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAG-------------------C--AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG---A----C----GGACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATT-A-ACA---C-TA--CTCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
Reference ( family-2342 ) : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAN----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAGC---------------------AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG---A----C----GGACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATT-A-ACA---C-TA--CTCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
gi|1 : TCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CA-C-C-CCCAC---TGGGGGA--AAA-A-CTAT-TC-T-GG-AA-AAC-C-TTAGT-C-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC------AAA----AAATG-G-AAG--AT-G--AGT----T----AA--AAAA----AT---TTAA-AT--C---TAGAA-----A-TAG-A---AA---AAT-TA-CAAC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-T-TTT--TCCTG-C-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--TG--ATCT---T-AC----GATGGCGAGC-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAA-AAGGG-TA---TA-T-TAATTGCA-T-A-GTAAT---A-TG-TA-TA-T-CT-T-ACTT---GATATGTA-T-TGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTTTATAA-GTCTTT--G----T---ATTTAGTTTTCATG-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACT-ATAAT--TTACGT-TGTACTATATAC--GATGAACTAATACAGTAAATCCATAT--------------CTGCA-TTATACAAGTA-TCG-----AATGAATATATAT-GTGTTCAAAGTGATTC---ATCAAA-GATCTTA-CTAAAGATAACAA--TT----AATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TTCCTATAT-----------T-G-AAA--CTG--TA---TCGTC----NNNNN--NNNN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-----------NNNNGCGACGCAACA-A-------TG-AAA-TACA-TGT----------ATGTGCAACCCATATATTTTTGAAAA--TTTCAAAAGGTGTAAC-ATTTCCT-AATCGAAAACGTATCGTTGAAAAGAGAGAGAGAGAG----------------------AGAGCATCAA--ATG-ATACATGGTAGTA-AC-TG-TCTTTCAAAATCATAAAAATCATT
gi|1 : taaataCATGTGTAA----------------------TT-CTTTCA-GATCCAATAAAGGA-CCA----AGTT--------------GA---------------TCCACTT---ATGTTGACAGACTAAAGTCC-GTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-GATTACTTTTAG---A----CCGTCGGAC-GT-CAG-CTCA--TTGA-TT--AACGCGTTTGATTTT-TT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATA-A--CTCT-GAATGC-AAGTGATA-TTGTGT-AATGCA------GTA------A--CTC-GTT-AA-TATTCATGT-CCTCCT-CACCC----C-G-TC--T-AATTGCAGAAGCG--ATTAG-AATA---TCA---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GGTTGT-----------ACAT-T--------------A-------------A-T-CCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TT-C-------------GT-ATGTC----------ATAATTA--CCAG-C---ATGTA--GCATTACC---AAATTGGTTTCAC--A--CCAAT---CAA-AGATTCTCCGC----CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGAGGG-TAAATAA-T-A-ACA---C-TA----CCGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|1 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTACTACTAGAGTGTCTAT-GAAAT-TTCGAGgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|10 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaat-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAATTTTAAAGC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACCATTAGAGCCGGT---------------AACAG-CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGAGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-T--------------ACACCCACGTGGAAATT-CCT-ATGAAAA--C-AC-AGAG--TT---------------GT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C---AT--------TT------------GTT------A--GC-AT--------GTTTCCTCGCC-G---AT---GAATTGTTGTGGTTT-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGCTAAAT-ATT-C-ACA---C-TA--CTTTGT-AAGTTATTTTCCAGTCGTCGTTGAttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|11 : TGTA-TT-GCTTTTAGCGCACCCTT--GTGGC---ACAC-A--TGCG-CACCTC-CCCACGTTTGGGGAA--ACATA-C-A--TT-T-G-AAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-G-ATT--G-TCAGTGCGCGGGTCC----A-AAACAATAAGTGCG-AATTAAT-GCTAGTTAG-TTTACAA--AAGA----TT-T-TTAA-A---TCTTTA-AACAGTTA-T---ATCCAATCCGATGTGAC-ACCA-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA----TT--TCCTG-C-TC--------TTTA-TCCTGCAATT-CGAAACCCGCCATCT---T-ACCGCTGATGGCGA-C-AC-TGACGGTAACTC--AACAGAAG-AAACG-TATG-TA-TCCAATGGCA-TGA-GT-TAC--A-TGCTACTA-T--T-T-AATT-A-AAC-TGTA-TGTagttgtttcctaaatatttactactagagcggtcttatgaatttgagctaccgcgttatttgccgacaagatgttttgtgtatgtactcgcgacctttatttct
gi|12 : aaAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--TTG-T---GT-T-GG-TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---AC----ACAAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAAAAAATT----TAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---GAT-TA-C-AC-AGGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGATT-TTT--TCCTG-C-TC--------TTTA-T-CTGCAATT-CGAAA--CG--ATAT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TCAAA----AAG-AAAGG-TATG-TA-T-TAATTGCA-TAA-GTAC----A-TG-TA-TA-TATT-T-ACTT-AGAATATGTA-TGTGT------G-TGTT--TTATAATTATTCATTTA------------G-----------TTC--TAA-GTT
gi|13 : ta--TC-T-CAGAA-AACAC-TTCATCC-T---AT-GCAAT--G-T----GTACA---TC----C-TAA----AAATG-A-CAA-CAT-G--GGT--G-T----TC--AGAT----TT-C-CTAA-A---T---TA-TG-----G-T---C---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-AT-AATAAAACCTTT-TTGAA-A-ATA--CAGTACCATATTGGTATATTTA-T-TTGCTTTCATGAGA--TC--ATGT---TAAT----GATGATGA-CAAC-T---------TC--C----ATA-AAAGGCTGTG-TACT-TAA-TGCA-C---TTATAGACA-TG-CT-TA-T-TT-T-
gi|14 : gggggggggggTCTCATGTA-TTTGT-----GCGCAC--TT---TG-T---AT-TTG--TGCGGCACC-CACCCAT-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC----TCA---A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--GAT--GCT----AAACAAAA----TT-T-ATAA-A---C---TA-AA-----A-G---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GGCATGAATAAAA--TTTATTGGG-ATTTT--TCCTGC---CT-------TCTATT-CTG-AATT-CGAAA--CG--ATCT---T-AC----GATGGCGA-C-ACTTGACGGTAA-TC--A----AAA-AGAcatatttattcattttgtaatgaggtattatagataattagttt
gi|15 : aAGTATCGTGTA-TA-GG-----GCACAC--TT--GTG-T---AC-A-A--TGTG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-A--TC-T-GGTAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCACA---TA----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAAA----TT-C-TTTA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATG------------ATTGGA-A-TTT--TCCT-CC-TA--------TTTA-T-TTGCATTC-CGAAA--CA--ATGTTAAT-AC----GATGAGGA-C-AT-TGACGGTAA-TC--A----AAG-Aa
gi|16 : ccgtatAAAAAATGAG-AGAAAGAGAGAGAGAAGGGGCACGTGTAACC-C-----TTATTAGAAT---TT-CTTTCAAGAT-CAATAAGA-G-CCA----AGTC--------------AT------------------AATTGAAAAATTCACAA---AAAGT-CCGTGCAGTGTCAA-ACACAGTTGATAG---------ACTACAAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-
gi|17 : aaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaccatgtgtaaacccgttatagatatcttttAAGTCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TTAGGTG-CCTAAC-A-A--TGCG-CACC-C-CCAAC-TTTCGCG------------------C-GGAAA-AAC-C-TTAGTCCAT---AT-GTATT--GCT----GCGCC---CCCAT-A-AAA----AAATGTG-TAA-AA-----------------AA--AAAA----TT-A---AA-A---C---TA-TA-----G-T---A---AA---AAT-TA-C-TC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTACT-CTT-------TTTA-A-CTGCATTC-CGAAA--CG--ATCT---T-GC----GATGGAGA-C-AC-TGACGATAA-
gi|18 : cgtaAA-GATA-TA-CTAAAAA-AACAC-TTT----AATTTGTTTGTCA--T-AAC-ATT--TT-CTAAAT-----------TAA-AAA--C-G--TA---TCATca
gi|18 : ATGTGCAACTGT-----T-------ATATTTT-CTTACAAGATCCAATAAAG-A-ACC----AGTC--------------AT---------------ttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattttcttacaagatccaataaagaaccagtcataattg
gi|19 : aagatatactaaaaaaacactttaatttgtttgtcataacattttctaaattaaaaacgtatcatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---A-GCGCA-AAATGATA--G-TAGA--C-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TC-AAA-T-TGTAAC----------A-AAGAAACA-----ATT-----AGATTTTTCAGAGaattg
gi|19 : TTTCAAATTG--T-AAC-A----------AA--------------G-AAA--C-AATTAGATTTTTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG----CACGCT-AAATGATA--CATGTATGTGTGTAGTAGACATGTGCAACCCAATGAATTTCTTACA-AAA-T-CT-AATTTAAAAAAAAA-AAAAAACA-----GTT-----AAA--TTTagagagagagagcacgctaaatgatacatgtatgtgtgtagtagacatgtgcaacccaatgaatttcttacaaaatctaatttaaaaaaaaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|2 : agagagagagagagagagcgcaaaatgatagtagacatgtgcaacccaatatatttcAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-TAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAT----TT-T-TTTATA---C---TA-AA-----A-T---G---AA---AAT-TA-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-T-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCAATT-CAAAA--CG--ATCT---T-AC----GGTGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAAAG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---AATG-TA-TA-T-TTAT-ACTT-G-AATATGTA-TGTGT------GT-GTT--TTA--------------------------G-----------TTT--TAA-GTTCGT--A----T-T--TTT-GTTTTCATA-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---T---------GCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTTTAAAAATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-A--TA---TTGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----TAA--TTTCATAGTG-GTAAC-ATTTTCTAAATCG-AAACGTATCGTTAAGAAGAGAGAGAAGGAG----------------------AGCACTCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGA-AGAGAGAGAGCATGTGTAA----------------------TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-G-CCA----AGTT--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGT--CGTGCAGTGTCAA-TCACA-----------------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTTGAGC-G-CACACCGA--TACTTTTAG---AAGGTC----GGACCATGCAGACTGC--TTGA-TTACAACACGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGAGTTATA-AATCTCTGGAATGC--AGTGATATTGTTGT-AATGC-------GTA------AATCTT-GG--AA-T-TTCAGGTCCCTCTTGCA-CCACCTG-GCTCTAT-AATTG-AGAAGCG----TAAGATTA---T-C---AAA-------GCTCAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC---------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGAAAGCA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATTCCCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TTAC------------GGTAATGTC----------ATGATTAATCCAG-CCCAGTGTA--GCATTA-CCCTAAATTGGTTTCACACA--CA-AT---CAA-AGTTTCTCCGCCTG-CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAAAT-AGACACTCC-TAATCTCTGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATTGAtttttaaattgaaa
gi|20 : G--ATTAGAATAA---TAG---AAA-------T----A-TTCA--A---ATT-TCTA--C-ATC-----------T---------------ATGCAGCCTTTG-TTTGA--C--A------AAAGAGAAA-CA-GG-TGT-----------AAAT-TA-------------A-------------ATG-CAC-GTGGAA-----ATCGGGGC-TT-CATATAAGCAACTGGT-ATGTCCGAATTTGTTGTGAATA--CCAG-T---GTGAG--GCAC---C---AA--T
gi|20 : AATTATTGT----T-GAAA-AGTACG-G-AACAA--AAACCAAAGtattgttgaaaagtacggaacaaaaaccaaag
gi|21 : gattagaataatagaaatattcaaatttctacatctatgcagcctttgtttgacaaaagagaaacaggtgtaaattaaatgcacgtggaaatcggggcttcatataagcaactggtatgtccgaatttgttgtgaataccagtgtgaggcaccAAGTATCGTGTA-TC-AT-----GCGCAC--TC--GCG-TA--AT-T-AACTGCA--ACC-C-AACAT-T-----GAA--CAA-A-T-AATCC-C-CCAAA-AAC-C-TTGGTCC-T---AT-GTATT--A-T----GCGCA---TC----C-AAA----ATTTG-A-CAA-AAT-G---GT--G-T----GC--AAAT----TT-TGTTTA-A---T---TA-AG-----A-TAAAA---AA---AAT-TG-C-AG-A-GT-A-GTAT-AAC--TTTATTGAA-A-ATTCCTCCT
gi|22 : taAC--TC--ATG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAAT----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---TA---AAT-TC-C-TT-A-GG-ATG------------ATTGGA-A--------------------------TA-T-CTGCATTC-TGAAA--
gi|23 : gtaaaaAGTCCCGTGTAATT-GT-----GCGCAT--TT--ATG-TTA-AT-T-G--CG----ACC-C-CCCAC-TTTGGGGAA--A-------A--TC-T-GGAAACAAC-C-TTAGTCC-T---ATCGTATCTGG-T----GCGCA---TT----C-AAA----AAATG-GAAAG-AAT-G--AGG--G-TAA--AA--AAAT----TT-C-TTAA-C---C---T--AA-----A-T---A---AA---AA--TC-C-AT-A-GG-
gi|25 : gtat--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------CTTCACA---------G-----CTTTTGTTTTGA--CCAAA-GC-TA-GGGGGAA-GA-AG-TAA-----------ACAT-
gi|26 : AAAGA-AACAACTTT----AATTTTTAAGTCT--TTAAC-A-TGTTC-CTAAATGTGCAATTACTT-G-AAAACC-A--TA---TCATG----AGAGAAGGAGA-GAGAGAG---atgttttattaacaagctaccatcacgtttgaaatt
gi|27 : AA-AAT-C-CAAGTCC-----AT-GTATT--G-T----GTGCA---TC----C-AAA----AATCA-A-CAA-AAT-A--GGT--G-T----aa
gi|29 : ccaacatttgaaaaaaagattccagatttcttcGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-G-CACACC-A--TACT--------------------ACCATGCAG-CTGCGTTTGA-TT--
gi|3 : G---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-AAGAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAACACGCTAA--ATG-ATACAT-GTA-TAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACC-CGTTATT-------AT---TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTG-AGTCATAATTGAAAAATTGT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAAATCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCACGAGC-GGCACACC-A--TAATCT------------------ACCATGCAG-CTGC-----------G--GCGTTTGATTTTTTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTT-TACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTACCGGTTAACATCAGGT-AAATATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAAA------GC-AAAATTAGC-AGA-ATT-TCTA--CCACC-----------TCTACAGCTGGCTGCAG-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GG-TGT-----------TTAT-TACACGCACGTGGGAA-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACC-GAG--TT-G------------GTT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C---ATGTA--GCAT--------------------------------------GTTTCTC--CC-GCCGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT---ACA---CATA--CT-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGAtt
gi|30 : gggggggcgACGCTAATGATACATACAT-GTAGTAGACAagttgttcccaaatattactactagagacgggtcttatgagaatttcgagctaccgctgattttgccgactgtatgtacccgtacatcgtcgaccttttagtt
gi|31 : cacaaGTCC-TTCAAT-GTATT--G-T----GCACA---TC----C-AAA----AAgtcccgaaagttttctcccta
gi|32 : gAAGTATGGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--ATG-T---AT-T-A--TGCtcaacaaaattggtgtg
gi|33 : aataccata---TA-AA-----G-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGATTGGAA--TT
gi|34 : AAATCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TT--
gi|4 : cgtaG---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AGT----------A-A-GAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAAAGTG-GTAGCGATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA-AACACGCTAA--ATG-ATA-AT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACC-CGTTAAT-------AT---TTTCTTTCAAGATCCAATAAAG-AACCATTGAAGTC--------------ATAATTGAAAAATTGTTTCCAGTT---ATGTTGAC-GG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-TGGAAATGCACGAGCGG-CACACC-A--TATCT-------------------ACCATGCAG-CTGC--GTGCTTT--GAT---TTT--TTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGACAATGTGTATTACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCAGTACCGGTA------AA--TC-GGTAAA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--TAAATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAGC-AGA-ATT-TCTACTC-ACC-----------T---------------
gi|4 : gcGTTTCTCCACG-C-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAGAA-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT---ACA---C-TA--CT-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGActacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatgtttctccacgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaaacaaaatccaaagaggtaataattacactacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|5 : gcggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcgatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgataatgtagtagacatgttctttcaaaatcattagagagagagagaaaggggcatgtgtaacccgttaatattttctttcaagatccaataaagaaccattgaagtcataattgaaaaattgtttccagttatgttgacggtaaagtccgtgcgttgtcaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttggaaatgcacgagcggcacaccatatctaccatgcagctgcgtgctttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgacaatgtgtattacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggtaaatcggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaaattgagaagcgattagaaatatacaaagcaaattagcagaatttctactcacctctacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatAGTATCGTGTA-TA-GG-----GTGCAC--TT--GTG-T---GC-A-A--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-T--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AC-GTATT--G-T----GCGCA---TCTAAAA-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGG--G-T----AA--AAAT----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----AAT---A---AA---AAT-TC-C-AC-A-GG-ATGA------------TTGGA-A-TTT--TCCT-CC-TAT-------TT-A-T-CTGCATTC-CGAAA--CA--ATGT---T-AC----GATGACGA-C-AC-TGCCGGTAA-TC--A----AAG-AAACG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTACTT-A-AATATGTG-TGTGTTTTAAAATTATTAATTT-------------A------------G-----------TTC--TTA-ATATAC--A----TGTACTTT-GTTTTCATTTAAAAAAA--AA--ATAGTCAATT----------ACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--CGT-TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATGT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCA--T-AAC-A-T--TTCCTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA---TCATTAGAGAGAGA--GAGA-GAGAGAG---ACGCGCA-AAAGGATAG-GATACAAGT-----------ATGTGCAACCAAATATATTTCTT-TATATA-T-CG-AGT----------A-AAAAAATC-----ATT-----CAA--TTTCAagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|6 : cgtatAGTCCCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TC--ATG-T---AC-A-A--TGCG-CACC-A-CC-AC-TTTGGGGGAGTAAA-A-C-A---C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTC--T---AT-GTATTTGG-T----GCGCA---TATA--A-AAA----AAATG-G-AAA-AAGAG--AG---G-T----AAC-AAAT----TTTC-TTAA-AACTC---TA-AA-----A-T---ATT-AA---AAG-TC-C-AT-A-GG-ATGA--------TTTG--GAA-A-TAG--TCTTGCA-TGT-------T---------CA----CGAAA--CA--TTGT---T-AC----GAT--------AA-TGACGGTAA-TC--A----TAGTAAACG-TATGATA-T--AATTGCA-T-ATGTATA-----TG-TT-TAAT-GT-T-ATTTTATAATATGTAATGTGT------TGTGTC--TTA-------------A------------GATTATTATTAGTTC--TAACGTTCTT--AATAAT-TAATTT-GTTTTCATT-AACAAAA--A-TTGT-------TTCTGGACATTACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-TCAGAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATATTGT---TTAAACGGCTGCA-TT-AACAAGT--TTG-----AATGAGTATATATGGC-T--AAGAC-ATTC---A-CAAGTAATA-TA-C-AAAGA-TATAATTTT----AATTTTTAAGTCAT-T-AAC-A-T--TA-CTAAAT-----------T-GAAAA--C-G--TA------TC----AGAGA--GAGAGGAGAGAGAGAGAGAGCACAAATGCTAATGATACATGT-----------A
gi|7 : gtatAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACCAA--TACTTTTAGAACA----T----GGACCATGCAG-CTGCA-TTGA-TT---ACAC--TGGA----TTT----CCCTTTCGAAAATGACTTGTTTG-AAT-TGTTGTATAATCTCT-GAATGCAAGATGATATCTTTGTAAATGCA------GTA------AATCTCTGGT-AA-TATTCA-AT-CCTCCT-CA-CC----GAA-TC--T-AATTG-AGAA-CG--A-TAGAAATA---TAC---AAA-------GCAAAA-TAAG--AGA-ATT-TCTA----AC----------------------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GCTTAGGGGGATG-CACGG-TG------------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--CGGACGGAG--TT-C------------GGT-ATGTC----------AT-AATAT-CCAG-C---A-GTAATGCATAA-C---AA--TGGTTTCA---ACCCC-ATATACAATAGTTTCT-CGCC-G--GAG---CAATTGT--T----T-ATAG-AATAAT-AGAACAA--AATCCAAAGA--G-TATATAA-T-A-ACA---C-TG--ACCTGTAAAG-TATTCT-TGATCTCCATTGAgtaagacatgtgccgaatgttttgcttctatatt
gi|8 : GTC-CGTGTA-TT-GT-----G-GCGC--TT--ATGAT---AT-T-G----CG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TAAT-GGAAA-AAC-CATTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCG-A---TC----A-AAA----AA-TG-G-AAG-AAT-G--AG---G-T----AA--AAAA----TT-C-TTAA---------TA-AA-----A-T---A---AA---A---TT-C-AT-A-GG-ATGA------------TTGGA-A-T-------------------------A-T-CTGCA-TC-CGAAA--CAT-ATGT---T-A-----GATGACCAGC-AA-TGACGGTAA-TA--A----TAG-AA-CG-TATG-TA-T-TA-TTGCAAT-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-AT-TTATTTTA-AATATGTA-TGTGT------GT-GTC--TTA-------------ATTATTCATTTTAG-----------TTC--TAA-GTTCATTAA----TATAATTG-GTCTTCATT-AAAAAAATTGATTCTA--CAATT-ATA-----TAA-AATTATATTTAAGTCTCTAAC-TAT-C--GAT-AAC-A-T-CACGAAATCCATAT--TCGTTTAA--CGGTGCAATTAAACA-GTAATTGGGAAAAATGAGTATATAT-GC-TTCAAA-C-ATTGGGAA-CAAA-GATC-TAACTAAAGA-TATAA-TTT----AATTTTTAAGTCGACT-AACAA-T--TTACT-AAT-----------T-G-AAA--tgtcctaaatatactactagagctggtctaatgagtcgagttaaaaccgcgatacgaagaatggcgacttactgtatcaccgtac
gi|9 : atc-AATTG-AGAAGCGTAGTTAGAAGTAAAATATTTAAAA-------GC-AAA-TTAGTAAGAGATTGTCTA--C-ACCATTAGAGCCCGT---------------AACCAGCCTTTGTTTTGATAC--AATGC-TAGGGAGGAA-CAAGG-TGTTATTACGACCCACGTGT--------------A-------------ATT-GCTGATGAAAAAAC-ACCGAGGAGTT-T------------TGT-A-GT-----------GTAAATA--CCAAAC---ATGTA--GCATTG-T---A-------TTCT---A--CC-A-----------------GCC-G-AGATATAGAATTGTTGT----TTGAAACAATAAG-A-AACAAAGAATCC-AAGA-GG-TAATTAATTCA-GTA---C-AA--C-ATGTAAAA-TGTCTT-C-GTCGTaacg
blockSeqs : A T TTTTA CC AGG G CTA TAAC G T A G GT T A . AT A T C A A A TCA C TG C CAGT GGT TAAAA CAAT C A T A CT TTA C TTAC AC AAAAA TG T ACT CTT . CAGTT A ATCC TCC G GA . C G C ATAAAACC AATTCC ACCATATTGGTATA T C A A CC CC C TAA A CGCT G A T C AA ACAG T C C A C C A GA AGACA C C A AT A T TAT A TTTAAAATT AA TAATTATTCATTTAG . C G AATAATTAA . TT TT AT AGT TCTGGACAT TA AT . TCA . . . TGTTTAAACG A AA GGAAA G . G . GGA . T . A . C TAAA GAC T A TGTTC GTGCAATTACTTG AC AAT GATTTT AGAG AG G AGAGA C ATG T GTGTAGTAGAC T A T A . T TTAAAAAAAA . A . A TT . G A A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA TG C . T AAAAAATGA G G CCCTTATTAGAAT T AA TTGA ATAATTGAAAAATTGTTT GAA G CC A TTGATAGAGTCAGACT A G G G GA TTTAGAAGGTCGG A TTGATTACAACA G TTTT C A C G A A AGTACCG CCGGTTAACATCA TA A G C G . ACCTGGC TA A . TA AAA TTA TTTTAAA T A TA G G CTC CATTAGAGCCCGTAACCAG TA CA T T G G C . TTATTACGACCC G ACACGCACGTGGGAA C G A AA G AG CATATAAGCAACTG A CGAATTTGTT A AT A CCAG AT TACCCTAAATTGGTTTCACACACAATCAAA TC CTGC ATA GGTT T C A G AG . C A T AG CTC A ATCTC A T T C T
blockSeqs : . . . . G A TA ACA . . . . . . A . . . T . . . . . . TG . . . CATA . T . . . . T . AA C A TC . . . . . . AAAA . . A . . . . ATAAAA TTTTT ACTCTT . . A . . T A . . . . . . . . . . G . . . . . AA ACA . . . T . T AG . TGT . ATTATTCATTTTAG . . A TAATATAA . A . AT AGT TATG TA . . C . . . TCGTTTAAC . A . . . G . . . . . . . T . AT . . TTTT TAA . G TCA . . . GC . GG T . A . . A . . . . A . A . . . A A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA . . . T AAAAAATCA G . CCCGTTATTAT T AA TTG ATAATTGAAAAATTGTT . G CC . TTGATAGAGTCAGACT . . . . AA TTTAGAACATGG . GTGCTTTGAT G . . T C . A . A AATCTCT T . . C . . GAA . . . . . . A A . C . . CC CATTAGAGCCGGTAACAG . . . . G . A . T . ACACCCACGTGGAA . . G . . C ACG . . G T . A . AACAATGGTTTCAACCCCATATACAATA CC CGCC . . . . . . . . . A A CA . . CTT A . T . T
blockSeqs : . . . . T . A TGG . . . . . . A . . . . . . . . . . TG . . . TAA . . . . . . T . . . T T . . . . . . ATT . . C . . . . ATAAAA ATTTT GCCTCT . . T . . . G . . . . . . . . . . G . . . . . AT AAA . . . T . . TA . GT . AGATTATTATTAG . . T ATGTAC . T . A A ATA TA . . C . . . CGTTTAAG . A . . . A . . . . . . . . . A . . TTTC TGA . A TTG . . . GC . G T . T . . . . . . . A . T . . . A . . . . . T . . . CCCGTTAATAT . G . GTT . G CC . GTTGATAG . . . . A CT . ATTGATTACA . . . G T . A . A AATCTT T . . C . . GG . . . . . . . . . C . . C CTCTACAGCTGGCTGCAG . . . . A . . . T . AA . . A . . . GG . . G . . G . TGTATTCTACCA CC GCC . . . . . . . . . A T C . . ACC . . T . C
blockSeqs : . . . . G . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . T . . . A C . . . . . . A . . A . . . . ATAAAA AATA GCATGT . . A . . . C . . . . . . . . . . A . . . . . A A . . . A . . A . GT . AG . . A ATT . T . T . . A . . C . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . G . . TTTA TGA . A TCA . . . GC . C T . T . . . . . . . A . C . . . . . CTGTTATATT . A . AT . . C . . . . . . A T . GG . . . . . . . . . AATC . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . C CCTTCACAG . . . . G . . . T . A . . A . . . CG . . A . . A . TGTTAGCAT C CGA . . . . . . . . . A T A . . CT . . T . T
blockSeqs : . . . . G . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . G . . . A T . . . . . . C . . C . . . . ATAAAA ATTT CCTAT . . T . . . G . . . . . . . . . . C . . . . . A A . . . G . . G . GT . G . . . . . . . . A . . TTT TG . G TCA . . . AC . G A . T . . . . . . . A . C . . . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C CTATGCAG . . . . G . . . A . A . . A . . . TT . . A . . A . . C CG . . . . . . . . . . T . . . CT . . T . .
blockSeqs : . . . . G . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . A C . . . . . . G . . A . . . . ATAAAA ATTT GCTC . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . . A A . . . A . . A . . . . T . . TTA TG . G . . . . A . T T . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C CA . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . . . . A . . CG . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . T A . . . . . . A . . A . . . . TTGGAA TTTT GCTC . . A . . . C . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . A . . . G . C . T . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . T T . . . . . . A . . G . . . . ATAAC ATTT GCCT . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . T C . . . . . . G . . C . . . . . ATAG CCTA . . T . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . T C . . . . . . A . . C . . . . . TT . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . T C . . . . . . A . . C . . . . . AT . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T C . . . . . . A . . C . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A .
blockSeqCons : ** N***** C** *** A****** GCTC********** A***** TA* GT******* ATTATTATTAG*************************** ** ATGTA******* AT TA C*** CGTTTAA****** TGG************ G*** ***** C***** CCCGTTATTAT*********** G** G* TTGATAG********** A*** TT****************** AATCT******** C*** CTTCCGCAG************************* CG************* TGTTTCNACCA*************************** CGC** A** ACT**
originalCons : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TC----A-AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAN----TT-C-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCC-TCT-------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA---A-TG-TA-TA-T-NT-T-ACTT-A-AATATGTA-TGTGT------GTTGTT--TTA-------------A------------G-----------TTC--TAA-GTTCNT--A----T-TAATTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATAT--C---TTAA--GGCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------T-G-AAA--C-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATT-----NAA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAG-------------------C--AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACC-C-----T-------AT---TT-CTTTCAAGATCCAATAAAG-A-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACC-A--TACTTTTAG---A----C----GGACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA------AATCTC-GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTA--C-ACC-----------T---------------A-----CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTA-C---AA--TGGTTTCA---A--CC-AT---CAA-AGTTTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATT-A-ACA---C-TA--CTCTGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
finalCons : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGCA---TCN-----AAA----AAATG-G-AAG-AAT-G--AGT--G-T----AA--AAAN----TTC--TTAA-A---C---TA-AA-----A-TA------AA---AAT-TN-C-AC-A-GG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA-A-TTT--TCCTGCTC----------TTTA-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATG-TA-T-TAATTGCA-T-A-GTATA-----TG-TA-TA-T-NT-T-ACTTTA-AATATGTA-TGTGTGT-------GTT--TTAATTATTATTAG---------------------------TTC--TAA-GTTCNTATGTA-------TTT-GTTTTCATT-AAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAATTAT--TTACGTCTGTACC-TATC---GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATATCGTTTAA------GCTGCA-TTAAACAAGTA-TCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATTC---A-CAAA-GATC-TA-CTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAATTGG------------AAA--CG---TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AGT----------A-AAGAAACC-----ATTC-----AA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAG-------------------C--AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACCCGTTATTAT-----------TT-CTTTCAAGATCCAATAAAGG--CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACATTGATAG----------ACTACTAGATTGTCT-T-GAAATGCTCGAGC-G-CACACCA---TACTTT------------------ACCATGCAG-CTGC--TTGA-TT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTAAATCT--------GGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CA-CC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAA-TTAG--AGA-ATT-TCTAC---ACCTTCCGCAG-------------------------CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GG-TGT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TTCG-------------GT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C---GTGTA--GCATTGTTTCNACCA---------------------------GTTTCTCCGCCGC--GAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATTA--ACA---C-TAACT--TGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GTCGTCATTGAAGTTGTTCCCAAATATTACTACTAGAGCGGTCTTATGAAATTTCGAGCTACCGCTGATTTTGCCGACTGTATGTACCCGGTACTCGTCGACCTTTTAGTTTC
Unaligned ( gi|28 ): GAGGAGAAAAACACTAAATTGATCATGTAGTAAGACATGGTTGCACGAACGTTTTCTTTCTAATAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 11 111 1111111 111111111 11111111111 11111111111111 1 1111 1 11 111 111 33333 44444444444 11 22222 11 1111 4444444444 22222 111 1 1111 111 1111111 22222222222 1111 111111 1111 11111 111 22222222222 1 11111 11111 1 1 8888888888888888888888 11 222222222 1 3333333333333 1 2 2222 77777777777777777777777777777777 111 11 222 666666666666666666 1 1111 77777777777 11111 111 222222 11111 1 2222222 333333333333 1 1 22222222 11 111 2222222222 11 111 99999999999999999999 1 222222222222 6666666666666666666666666666 111 11 33333333333333 2222222222 11 222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 111 111 1111111 1
lowQualScore : 2 2 77777 33 444 5 111 000000 3 3 3 3 44 3 9 3 66 2 5 2 2 2 2 444 2 00 2 5555 33 33 000 2 66666 5555 2 2 2 33 8888 2 9999 66 999999 55 2 777 444 2 66666 2 1111111 444 2 33 2 2 5 555555555 00000000000 3 77777777777777 3 3 3 7 3 44 88 1 666 3 7777 7 3 3 3 55 8888 4 1 5 5 0 0000 5 0 5 5 66 5 11 5 5 77 333 000 5 6 6 99999999 66666 6 1 11111111111 8 8 11 11 0 0 55 11 0 00000 11 11 8 2222 8 88 8 8 1111111111 8 0 0 88 00000 8 8 0 3 8 444 8 6 6 6 5 1 2222 555 5 5 7777777 0 33333333333 8 0000 000000 2222 77 5 00000 5 222 1 33333333333 1 5 5 1 5 5 77 5 1 0 66666 66666 99 0 0 3 3 6666666666666666666666 11 8 8 0 3 555555555 0 2 5 9999999999999 3 0 5555 55555555555555555555555555555555 444 0 11 555 8 555555555555555555 5 5 0 1 6666 2 22222222222 66666 6 6 999 777777 5 0 77777 8 9 3 0 8 0 3 5 8 3333333 111111111111 5 8 8 0 6 8 99999999 11 5 5 66 0 5 888 0 333 0000000000 55 4 4 111 11111111111111111111 66 66 5 5 5 2 5 0 5 444444444444 5 1111111111111111111111111111 77 5 0 222 5 0 33 88888888888888 0 5 5555555555 2 33 5 333333 55 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888 0000 5 5 5 5 66 5 5 5 8 999 000 1111111 1 5 5 5 0 7
lowQualScore : . . ..... .. ... . ... ...... . . . . .. . . . .. . . . . . . ... . .. . .... .. .. ... . ..... .... . . . .. .... . .... .. ...... .. . ... ... . ..... . ....... ... . .. . . . ......... ........... . .............. . . . . . .. .. . ... . .... . . . . .. .... . . . . . .... . . . . .. . .. . . .. ... ... . . . ........ ..... . . ........... . . .. .. . . .. .. . ..... .. .. . .... . .. . . .......... . . . .. ..... . . . . . ... . . . . . . .... ... . . ....... . ........... . .... ...... .... .. . ..... . ... . ........... . . . . . . .. . . . ..... ..... .. . . . . ...................... .. . . . . ......... . . . ............. . . .... ................................ ... . .. ... . .................. . . . . .... . ........... ..... . . ... ...... . . ..... . . . . . . . . . ....... ............ . . . . . . ........ .. . . .. . . ... . ... .......... .. . . ... .................... .. .. . . . . . . . ............ . ............................ .. . . ... . . .. .............. . . .......... . .. . ...... .. ............................................................... ... .... . . . . .. . . . . ... ... ....... . . . . . .
lowQualScore : 9 9 11111 77 777 7 888 000000 1 1 1 1 22 1 2 1 88 9 7 7 7 7 5 444 5 33 5 3333 44 44 999 5 22222 7777 7 7 7 77 6666 7 3333 88 999999 77 9 999 777 7 77777 7 3333333 777 7 77 7 7 3 888888888 44444444444 1 11111111111111 3 3 3 5 3 66 66 0 444 6 7777 3 6 6 6 55 5555 0 0 0 0 0 6666 0 0 0 0 99 0 00 0 0 99 111 000 7 7 7 55555555 55555 7 0 00000000000 0 0 88 00 8 8 66 66 6 00000 66 00 0 2222 0 88 0 0 2222222222 0 8 8 88 00000 0 0 8 2 0 000 0 7 7 7 7 4 1111 000 0 0 1111111 1 88888888888 2 4444 111111 1111 99 7 22222 0 666 6 88888888888 7 7 7 4 7 7 99 7 7 7 77777 77777 22 0 0 2 2 8888888888888888888888 00 0 0 8 2 000000000 8 5 0 7777777777777 3 0 8888 00000000000000000000000000000000 000 8 22 000 0 333333333333333333 0 0 8 4 0000 5 55555555555 77777 7 7 000 666666 0 8 88888 0 0 2 8 0 8 8 6 0 8888888 888888888888 8 0 0 8 0 0 22222222 00 7 7 99 1 5 888 1 888 6666666666 00 4 4 777 33333333333333333333 99 99 0 0 6 2 0 0 0 111111111111 0 7777777777777777777777777777 11 7 1 999 7 4 66 00000000000000 7 7 0000000000 3 66 0 111111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 888 6666 0 0 0 0 99 7 7 0 7 999 000 0000000 4 7 0 7 1 1
consensus : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC--A--TC-C-A-AAA-----AA----TG-G-AAG-AATG--AG-T--G-T----AA--AAA-N----TTC-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-AGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGAA-TT----T--T-CC----TG--C-TC--TTT-A-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATGTA-T-TAATTGC----A-T-A-GT-ATA--TGTAT-AT-NT-T-AC--TTTA-AATA---TGT-ATGTG-TG-TGTTT--T--A--ATTATT-A--TTAGTTCTAA-GTTCNT-A--ATGT-A-TTT-GTTTTCA-TTAAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAAT--TATTTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATA-TCGTTTAA---GCTGC-ATTAAACAAGT-ATCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATT---CA-CAAA-GATC-T-ACTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------TGAAAAC-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AG--TA-AAGAAATC-----ATTC-----AA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAG-------------------C--AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACCCGTTATT---ATTT-CTTTCAAGATCCAATAAAGGACCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGA---------CTACTAGATTGTCT-TG-AAATGCTCGAGCG-CACACC-A--TACTTTTAG--------ACCAT-----G-CAG-CTGC--TTGATT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA-------A-A--TCTGGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CACC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAATTAG--AGA-ATT-TCTA--CACC-T-T---------CCG----CAGCCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GGT-GT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C------GTGTAGC-ATT-----------GT-TT------C--ACC-----------A-GT------TTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATT-A-ACA---CTAA-CT-TGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
Reference ( family-2342 ) : AAGTCTCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC--A--TC-N-A-AAA-----AA----TG-G-AAG-AATG--AG-T--G-T----AA--AAA-N----TTC-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TN-C-AC-AGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGAA-TT----T--T-CC----TG--C-TC--TTT-A-T-CTGCANTC-CGAAA--CG--ATNT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAANG-TATGTA-T-TAATTGC----A-T-A-GT-ATA--TGTAT-AT-NT-T-AC--TTTA-AATA---TGT-ATGTG-TG-TGTTT--T--A--ATTATT-A--TTAGTTCTAA-GTTCNT----ATGT-A-TTT-GTTTTCA-TTAAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAAT--TATTTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATA-TCGTTTAA---GCTGC-ATTAAACAAGT-ATCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATT---CA-CAAA-GATC-T-ACTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCG--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------TGGAAAC-G--TA---TCGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AG--TA-AAGAAACC-----ATTC-----AA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTGAGAAGAGAGAGAGGGAGC---------------------AGCACGCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCATGTGTAACCCGTTATT---ATTT-CTTTCAAGATCCAATAAAGG-CCA----AGTC--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCCCGTGCGGTGTCAA-TCACA-TTGATAGA---------CTACTAGATTGTCT-TG-AAATGCTCGAGCG-CACACC-A--TACTTT-----------ACCAT-----G-CAG-CTGC--TTGATT--GACGCGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTA-------A-A--TCTGGT-AA-TATTCA-GTCCCTCCT-CACC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAATTAG--AGA-ATT-TCTA--CACC-T-T---------CCG----CAGCCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGGAA-CA-GGT-GT-----------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACCGGGG--TT-C------------GGT-ATGTC----------GTAAATA--CCAG-C------GTGTAGC-ATT-----------GT-TT------CN-ACC-----------A-GT------TTCTCCGCC-G-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAATT-A-ACA---CTAA-CT-TGT-AAG-TATTTT-CAGTCGTCATTGA
gi|1 : TCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CA-C-C-CCCAC---TGGGGGA--AAA-A-CTAT-TC-T-GG-AA-AAC-C-TTAGT-C-T---AT-GTATT--G-T----GCGC--A--TC---A-AAA-----AA----TG-G-AAG--ATG--AG-T----T----AA--AAA-A----AT--TTAA-AT--C---TAGAA-----A-TAG-A---AA---AAT-TA-CAAC-AGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGAT-TT----T--T-CC----TG--C-TCT-TTT-A-T-CTGCAATT-CGAAA--TG--ATCT---T-AC----GATGGCGAGC-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAA-AAGGG-TA--TA-T-TAATTGC----A-T-A-GTAATA--TGTAT-AT-CT-T-AC--TT---GATA---TGT-AT-TG-TGTTGTTT--T--A--AGTTTT-A---------TAA-G-TCTT-----TGT-A-TTTAGTTTTCA-TGAAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACT-AT--AATTTACGT-TGTACTATATAC--GATGAACTAATACAGTAAATCCATA-T-----------CTGC-ATTATACAAGT-ATCG-----AATGAATATATAT-GTGTTCAAAGTGATT---CATCAAA-GATCTT-ACTAAAGATAACAA--TT----AATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TTCCTATAT-----------TGAAACT-G--TA---TCGTC----NNNNN--NNNN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-----------NNNNGCGACGCAACA-A-------TG-AAA-TACA-TG--TATGTGCAACCCATATATTTTTGAAAA--TTTCAAAAGGTGTAAC-ATTTCCT-AATCGAAAACGTATCGTTGAAAAGAGAGAGAGAGAG----------------------AGAGCATCAA--ATG-ATACATGGTAGTA-AC-TG-TCTTTCAAAATCATAAAAATCATT
gi|1 : taaataCATGTGTAA--------------TT-CTTTCA-GATCCAATAAAGGACCA----AGTT--------------GA---------------TCCACTT---ATGTTGACAGACTAAAGTCC-GTGCAGTGTCAA-TCACA--------A---------CTACTAGATTGTCT-TG-AAATGCTCGAGCG-CACACC-GATTACTTTTAG--------ACCGTCGGACGTCAG-CTCA--TTGATT--AACGCGTTTGATTTTTT-----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTTATA--A-CTCT-GAATGCAA-GTGATATT-GTGT-AATGCA------GTA-------A-C--TC-GTT-AA-TATTCATGTCC-TCCT-CACC----CCG-TC--T-AATTGCAGAAGCG--ATTAGAA-TA---TCA---AAA-------GC-AAATTAG--AGA-ATT-TCTA---------------------A----CA-CCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGG-AA-CA-GGTTGT-----------ACAT-T--------------A-------------AT--CCT-ATGAAA---C-ATCGGGA--TT-C------------G-T-ATGTC----------ATAATTA--CCAG-C------ATGTAGC-ATTACCAAATTG--GT-TT------CACACC-----------A-ATCAAAGATTCTCCGCC-G---AT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGAGGG-TAAATAA-T-A-ACA---CTAC-C---GT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|1 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA---------CTACTAGAGTGTCTATG-AAAT-TTCGAGgaagttgttcctaatattactactagagtgtctatgaaatttcgagttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|10 : taaatatctcatgtattgtgcgcacttgtgtattgtgcgcacccccactgggggaaaaactattctggaaaaccttagtctatgtattgtgcgcatcaaaaaatggaagatgagttaaaaaaatttaaatctagaaatagaaaaattacaacaggatgaataaaatttattggatttttcctgctcttttatctgcaattcgaaatgatcttacgatggcgagcactgacggtaatcaaaaaagggtatattaattgcatagtaatatgtatatcttacttgatatgtattgtgttgttttaagttttataagtctttgtatttagttttcatgaaaaaaaaattgtagtcaatttatgtactataatttacgttgtactatatacgatgaactaatacagtaaatccatatctgcattatacaagtatcgaatgaatatatatgtgttcaaagtgattcatcaaagatcttactaaagataacaattaatttttaaatcataacatttcctatattgaaactgtatcgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgacgcaacaatgaaatacatgtatgtgcaacccatatatttttgaaaatttcaaaaggtgtaacatttcctaatcgaaaacgtatcgttgaaaagagagagagagagagagcatcaaatgatacatggtagtaactgtctttcaaaatcataaaaatcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtgtaattctttcagatccaataaaggaccaagttgatccacttatgttgacagactaaagtccgtgcagtgtcaatcacaactactagattgtcttgaaatgctcgagcgcacaccgattacttttagaccgtcggacgtcagctcattgattaacgcgtttgattttttcccttttgaaaatgacttgttgaaatgtgttataactctgaatgcaagtgatattgtgtaatgcagtaactcgttaatattcatgtcctcctcaccccgtctaattgcagaagcgattagaatatcaaaagcaaattagagaatttctaacacctttgttttgacaagctagggggaacaggttgtacattaatcctatgaaacatcgggattcgtatgtcataattaccagcatgtagcattaccaaattggtttcacaccaatcaaagattctccgccgatgaattgttattgaaaaataagaaacaaaatccaaagagggtaaataataacactaccgtaagtatttcagtcgtcatgaagttgttcctaatatt-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAATTTTAAAGC-AAATTAG--AGA-ATT-TCTA--CACCAT-TAGAG-----CCGGTAACAGCCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGAGGAA-CA-GGT-GT-----------TTAT-T--------------ACACCCACGTGGAAATT-CCT-ATGAAAA--C-AC-AGAG--TT---------------GT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C------AT-------TT-----------GT-T----------AGC-----------ATGT------TTCCTCGCC-G---AT---GAATTGTTGTGGTTT-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GGCTAAAT-ATT-C-ACA---CTAC-TT-TGT-AAGTTATTTTCCAGTCGTCGTTGAttacccgctgaaacgaagaatatttgccggactgtatgtaactcgccgacctttagtt
gi|11 : TGTA-TT-GCTTTTAGCGCACCCTT--GTGGC---ACAC-A--TGCG-CACCTC-CCCACGTTTGGGGAA--ACATA-C-A--TT-T-G-AAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-G-ATT--G-TCAGTGCGC--GGGTC-C-A-AAACAATAAG----TGCG-AATTAATGCTAG-TTAG-TTTACAA--AAG-A----TTT-TTAA-A---TCTTTA-AACAGTTA-T---ATCCAATCCGATGTGAC-ACCAGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGA---T----T--T-CC----TG--C-TC--TTT-A-TCCTGCAATT-CGAAACCCGCCATCT---T-ACCGCTGATGGCGA-C-AC-TGACGGTAACTC--AACAGAAG-AAACG-TATGTA-TCCAATGGC----A-TGA-GT--------TAC-AT-GC-T-ACTATTTA-ATTAAACTGT-ATGTagttgtttcctaaatatttactactagagcggtcttatgaatttgagctaccgcgttatttgccgacaagatgttttgtgtatgtactcgcgacctttatttct
gi|12 : aaAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--TTG-T---GT-T-GG-TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATTTGG-T----GCGC--A--AC-ACA-AAA-----AA----TG-G-AAG-AATG--AG-T--G-T----AA--AAA-AAAAATT---TAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---GAT-TA-C-AC-AGGGATGAATAAAA--TTTATTGGAT-TT----T--TTCC----TG--C-TC--TTT-A-T-CTGCAATT-CGAAA--CG--ATAT---T-AC----GATGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TCAAA----AAG-AAAGG-TATGTA-T-TAATTGC----A-TAA-GT-ACA--TGTAT-ATATT-T-AC--TTAG-AATA---TGT-ATGTG-TG-TGTTTTAT--A--ATTATTCAT-TTAGTTCTAA-GTT
gi|13 : ta--TC-T-CAGAA-AACAC-TTCATCC-T---AT-GCAAT--G-T----GTAC--A--TC-C-T-AAA-----AA----TG-A-CAA-CATG--GG-T--G-T----TC--AGA-T----TTC-CTAA-A---T---TA-TG-----G-T---C---AA---AAT-TC-C-AC-AGG-AT-AATAAAACCTTT-TTGAAA-ATACAGT--A-CCATATTGGTA-TA--TTT-A-T-TTGCTTTCATGAGA--TC--ATGT---TAAT----GATGATGA-CAAC-T---------TC--C----ATA-AAAGGCTGTGTACT-TAA-TGCACTTA-T-A-G--ACA--TGCTT-AT-TT-T-
gi|14 : gggggggggggTCTCATGTA-TTTGT-----GCGCAC--TT---TG-T---AT-TTG--TGCGGCACC-CACCCAT-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TC-TTGGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC-----TCAA-A-AAA-----AA----TG-G-AAG-AATG--GA-T--GCT----AAACAAA-A----TTT-ATAA-A---C---TA-AA-----A-G---G---AA---AAT-TA-C-AC-AGGCATGAATAAAA--TTTATTGGGATTT----T--T-CC----TG--C-CT--TCT-ATT-CTG-AATT-CGAAA--CG--ATCT---T-AC----GATGGCGA-C-ACTTGACGGTAA-TC--A----AAA-AGAcatatttattcattttgtaatgaggtattatagataattagttt
gi|15 : aAGTATCGTGTA-TA-GG-----GCACAC--TT--GTG-T---AC-A-A--TGTG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-A--TC-T-GGTAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCAC--A--TA-A-A-AAA-----AA----TG-G-AAG-AATG--AG-G--G-T----AA--AAA-A----TTC-TTTA-A---C---TA-AA-----A-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-AGG-ATG------------ATTGGAA-TT----T--T-CC----TC--C-TA--TTT-A-T-TTGCATTC-CGAAA--CA--ATGTTAAT-AC----GATGAGGA-C-AT-TGACGGTAA-TC--A----AAG-Aa
gi|16 : ccgtatAAAAAATGAG-AGAAAGAGAGAGAGAAGGGGCACGTGTAACCC-TTATTAGAATTT-CTTTCAAGAT-CAATAAGAG-CCA----AGTC--------------AT------------------AATTGAAAAATTCACAA---AAAGT-CCGTGCAGTGTCAA-ACACAGTTGATAGA---------CTACAAGATTGTCT-TG-AAATGCTTGAGCG-
gi|17 : aaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaccatgtgtaaacccgttatagatatcttttAAGTCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TTAGGTG-CCTAAC-A-A--TGCG-CACC-C-CCAAC-TTTCGCG------------------C-GGAAA-AAC-C-TTAGTCCAT---AT-GTATT--GCT----GCGC--C--CC-C-ATAAA-----AA-------------AATG--TG-T--A-A----AA--AAA-A----AAT-TAAA-A---C---TA-TA-----G-T---A---AA---AAT-TA-C-TC-AGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGAA-TT----T--T-CC----TA--C-TCTTTTT-A-A-CTGCATTC-CGAAA--CG--ATCT---T-GC----GATGGAGA-C-AC-TGACGATAA-
gi|18 : cgtaAA-GATA-T-ACTAAAAA-AACAC-TTT----AATTTGTTTGTCA--T-AAC-ATT--TT-CTAAAT-----------TAAAAAC-G--TA---TCATca
gi|18 : ATGTGCAACT-GTTATA---TTTT-CTTACAAGATCCAATAAAGA-ACC----AGTC--------------AT---------------ttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgcaactgttatattttcttacaagatccaataaagaaccagtcataattg
gi|19 : aagatatactaaaaaaacactttaatttgtttgtcataacattttctaaattaaaaacgtatcatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---A-GCGCA-AAATGATA--G-TAGA--C-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TC-AAA-T-TGTAA--CA-AAGAAACA-----ATTA-----GATTTTTCAGAGaattg
gi|19 : TTTCAAATTG--T-AAC-A----------AA--------------GAAAC-AATTAGATTTTTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG----CACGCT-AAATGATA--CATGTATGTGTGTAGTAGACATGTGCAACCCAATGAATTTCTTACA-AAA-T-CT-AATTTA-AAAAAAagagagagagagcacgctaaatgatacatgtatgtgtgtagtagacatgtgcaacccaatgaatttcttacaaaatctaatttaaaaaaaaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|2 : agagagagagagagagagcgcaaaatgatagtagacatgtgcaacccaatatatttcAAATCTCATGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--GTG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC--A--TC-A-A-AAA-----AA----TG-G-TAG-AATG--AG-T--G-T----AA--AAA-T----TTT-TTTATA---C---TA-AA-----A-T---G---AA---AAT-TA-C-AC-AGG-ATGAATAAAA--TTTATTGGAT-TT----T--T-CC----TG--CCTC--TTTTA-T-CTGCAATT-CAAAA--CG--ATCT---T-AC----GGTGGCGA-C-AC-TGACGGTAA-TC--A----AAG-AAAAG-TATGTA-T-TAATTGC----A-T-A-GT-ATAAATGTAT-AT-TTAT-AC--TT-G-AATA---TGT-ATGTG-TG-TGTTT--T--A---------------GTTTTAA-GTTCGT----AT-T---TTT-GTTTTCA-TAAAAAAAA--AATTGTAGTCAATTTATG-----TACTAAT--TATTTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATA-TC-----------TGC-ATTAAACAAGT-ATCG-----AATGAGTATATAT-GC-TTCAAAGC-ATT---CA-CAAA-GATC-T-ACTAAAGA-AACAA-TTTTAAAAATTTTTAAATCA--T-AAC-A-T--TT-CTAAAT-----------TG-AAAC-A--TA---TTGTC----AGAGA--GAGA-GAGAGAG---GCGCGCA-AAATGATA--GATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAA-T-CG-AG--TA-AAGAAATC-----ATTT-----AA--TTTCATAGTG-GTAAC-ATTTTCTAAATCG-AAACGTATCGTTAAGAAGAGAGAGAAGGAG----------------------AGCACTCTAA--ATG-ATACAT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCAAAAAAATCATTAGAGAGAGA-AGAGAGAGAGCATGTGTAA--------------TT-CTTTCAAGATCCAATAAAGG-CCA----AGTT--------------GT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGT--CGTGCAGTGTCAA-TCACA--------A---------CTACTAGATTGTCT-TG-AAATGCTTGAGCG-CACACCGA--TACTTTTAGAAGGTCGGACCAT-----G-CAGACTGC--TTGATTACAACACGTTTGATTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGAGTTATA-AATCTCTGGAATGC--AGTGATATTGTTGT-AATGC-------GTA-------A-A--TCTTGG-AA-T-TTCAGGTCCCTCTTGCACCACCTG-GCTCTAT-AATTG-AGAAGCG----TAAGATTA---T-C---AAA-------GCTCAATTAG--AGA-ATT-TCTA--CACC----------------------ACCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TAGGGGGAAAGCA-GGT-GT-----------ACAT-T--------------A-------------ATTCCCT-ATG-AAA--C-ATCGGGA--TTAC------------GGTAATGTC----------ATGATTAATCCAG-CCCA---GTGTAGC-ATTACCCTAAATTGGT-TTCACACACA-ATCAA---------A-GT------TTCTCCGCCTG-CGAT---GAATTGTTAT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-TAAATAAAT-AGACACTCCTAATCTCTGT-AAG-TA-TTT-CAGTCGTCATTGAaaaaaaaacagttaaattttttttaaattgaaa
gi|20 : G--ATTAGAATAA---TAG---AAA-------T----ATTCA--A---ATT-TCTA--CATC-TAT-----------G----CAGCCTTTGTTT-GA--C--AA-A-----AGAGAAA-CA-GGT-GT-----------AAAT-TA-------------A-------------ATG-CAC-GTGGAA-----ATCGGGGC-TT-CATATAAGCAACTGGT-ATGTCCGAATTTGTTGTGAATA--CCAG-T------GTGAGGC-----------------------------ACC-----------A------------------------------ATTATTGT----T-GAAA-AGTACG-G-AACAA--AAACCAAAG
gi|21 : AAGTATCGTGTA-TC-AT-----GCGCAC--TC--GCG-TA--AT-T-AACTGCA--ACC-C-AACAT-T-----GAA--CAA-A-T-AATCC-C-CCAAA-AAC-C-TTGGTCC-T---AT-GTATT--A-T----GCGC--A--TC-C-A-AAA-----TT----TG-A-CAA-AATG---G-T--G-T----GC--AAA-T----TTTGTTTA-A---T---TA-AG-----A-TAAAA---AA---AAT-TG-C-AG-AGT-A-GTAT-AAC--TTTATTGAAA-AT----TCCT-CC----T
gi|22 : taAC--TC--ATG-T---AT-T-G--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-A-C-A--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCGC--A--TC-A-A-AAA-----AA----TG-G-AAG-AATG--AG-G--G-T----AA--AAA-T----TTC-TTAA-A---C---TA-AA-----A-T---A---TA---AAT-TC-C-TT-AGG-ATG------------ATTGGAA------------------------------T-A-T-CTGCATTC-TGAAA--
gi|23 : gtaaaaAGTCCCGTGTAATT-GT-----GCGCAT--TT--ATG-TTA-AT-T-G--CG----ACC-C-CCCAC-TTTGGGGAA--A-------A--TC-T-GGAAACAAC-C-TTAGTCC-T---ATCGTATCTGG-T----GCGC--A--TT-C-A-AAA-----AA----TG-GAAAG-AATG--AG-G--G-TAA--AA--AAA-T----TTC-TTAA-C---C---T--AA-----A-T---A---AA---AA--TC-C-AT-AGG-
gi|25 : gtat--AGA-ATT-TCTA--CACC-C-T---------TCA----CAGCTTTTGTTTTGA--CCAAA-GC-TA-GGGGGAA-GA-AGT-AA-----------ACAT-
gi|26 : AAAGA-AACAACTTT----AATTTTTAAGTCT--TTAAC-A-TGTTC-CTAAATGTGCAATTACTTGAAAACCA--TA---TCATG----AGAGAAGGAGA-GAGAGAG---atgttttattaacaagctaccatcacgtttgaaatt
gi|27 : AA-AAT-C-CAAGTCC-----AT-GTATT--G-T----GTGC--A--TC-C-A-AAA-----AT----CA-A-CAA-AATA--GG-T--G-T----aa
gi|29 : ccaacatttgaaaaaaagattccagatttcttcGATTGTCT-TG-AAATGCACGAGCG-CACACC-A--TAC--T-----------ACCAT-----G-CAG-CTGCGTTTGATT--
gi|3 : G---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AG--TA-AAGAAATC-----ATTC-----AA--TTTCAAAGTG-GTAGC-ATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAACACGCTAA--ATG-ATACAT-GTA-TAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACCCGTTATT---ATTTTCTTTCAAGATCCAATAAAGAACCATTG-AGTCATAATTGAAAAATTGT---------------TCCAGTT---ATGTTGACAGG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAAATCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-TG-AAATGCACGAGCGGCACACC-A--TAATCT-----------ACCAT-----G-CAG-CTGC----------G--GCGTTTGATTTTTTTTTTTCCCTTTTGAAAATGACTTGTTGA-AATGTGTT-TACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCA------GTACCGGTTAACA--TCAGGT-AAATATTCA-GTCCCTCCT-CACC----G-G-TC--T-AATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TACA--AAA-------GCAAAATTAGC-AGA-ATT-TCTAC-CACC-T-CTACAGCTGGCTG----CAGCCTTTGTTTTGA--C--AA-GC-TA-GGGGGAA-CA-GGT-GT-----------TTAT-TACACGCACGTGGGAA-------------ATT-CCT-ATGAAAA--C-ACC-GAG--TT-G------------GTT-ATGTC----------GTAAATA--CCAA-C------ATGTAGC-AT------------------------------------------GT------TTCTC--CC-GCCGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAG-A-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT---ACA---CATA-CT-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGAtt
gi|30 : gggggggcgACGCTAATGATACATACAT-GTAGTAGACAagttgttcccaaatattactactagagacgggtcttatgagaatttcgagctaccgctgattttgccgactgtatgtacccgtacatcgtcgaccttttagtt
gi|31 : cacaaGTCC-TTCAAT-GTATT--G-T----GCAC--A--TC-C-A-AAA-----Agtcccgaaagttttctcccta
gi|32 : gAAGTATGGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TT--ATG-T---AT-T-A--TGCtcaacaaaattggtgtg
gi|33 : aataccata---TA-AA-----G-T---A---AA---AAT-TC-C-AC-AGG-ATGATTGGAA--TT
gi|34 : AAATCTCATGTA-TT-GC-----GCGCAC--TT--
gi|4 : cgtaG---GCGCGCA-AAATGATA--TATACATGT-----------ATGTGCAACCCAATATATTTCTT-TA-AAAAT-CG-AG--TA-A-GAAATC-----ATTC-----AA--TTTCAAAGTG-GTAGCGATTTCCTAAATCGAAAACGCATCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA-AACACGCTAA--ATG-ATA-AT-GTAGTAGACATGTTCTTTCAAAATCA---------TTAGAGAGAGAGAGAAAGGGG-CATGTGTAACCCGTTAAT---ATTTTCTTTCAAGATCCAATAAAGAACCATTGAAGTC--------------ATAATTGAAAAATTGTTTCCAGTT---ATGTTGAC-GG-TAAAGTCC-GTGCGTTGTCAA-TCACA-TTGATAGAGTCAGACTACTACTAGATTGTCT-TGGAAATGCACGAGCGGCACACC-A--TA-TCT-----------ACCAT-----G-CAG-CTGC--GTGCTTT-GAT---TTT--TTTTTTT----CCCTTTTGAAAATGACTTGTTGACAATGTGTATTACAATCTCT-GAATGCAAAGTGATATTTGTGT-AATGCAGTACCGGTA-------A-A--TC-GGTAAA-TATTCA-GTCCCTCCT-CACC----G-G-TC--TAAATTG-AGAAGCG--ATTAGAAATA---TAC---AAA-------GC-AAATTAGC-AGA-ATT-TCTACTCACC---T---------CTA----CAGC
gi|4 : gcAA-C------ATGTAGC-AT------------------------------------------GT------TTCTCCACG-C-CGAT---GAATTGTTGT----T-GAAA-AATAAGAA-AACAA--AATCCAAAGA-GG-T-AATAATT---ACA---CT-A-CT-TGT-AAG-TATTTT-TAGTCG-CATTGAtggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtagcatgtttctccacgccgatgaattgttgttgaaaaataagaaaacaaaatccaaagaggtaataattacactacttgtaagtatttttagtcgcattgaagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|5 : gcggcgcgcaaaatgatatatacatgtatgtgcaacccaatatatttctttaaaaatcgagtaagaaatcattcaatttcaaagtggtagcgatttcctaaatcgaaaacgcatcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacacgctaaatgataatgtagtagacatgttctttcaaaatcattagagagagagagaaaggggcatgtgtaacccgttaatattttctttcaagatccaataaagaaccattgaagtcataattgaaaaattgtttccagttatgttgacggtaaagtccgtgcgttgtcaatcacattgatagagtcagactactactagattgtcttggaaatgcacgagcggcacaccatatctaccatgcagctgcgtgctttgatttttttttttcccttttgaaaatgacttgttgacaatgtgtattacaatctctgaatgcaaagtgatatttgtgtaatgcagtaccggtaaatcggtaaatattcagtccctcctcaccggtctaaattgagaagcgattagaaatatacaaagcaaattagcagaatttctactcacctctacagctggctgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGTATCGTGTA-TA-GG-----GTGCAC--TT--GTG-T---GC-A-A--TGCG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGG--AAA-A-C-T--TC-T-GGAAA-AAC-C-TTAGTCC-T---AC-GTATT--G-T----GCGC--A--TC-T-A-AAA-----AAAAAATG-G-AAG-AATG--AG-G--G-T----AA--AAA-T----TTC-TTAA-A---C---TA-AA-----AAT---A---AA---AAT-TC-C-AC-AGG-ATGA------------TTGGAA-TT----T--T-CC----TC--C-TA--TTT-A-T-CTGCATTC-CGAAA--CA--ATGT---T-AC----GATGACGA-C-AC-TGCCGGTAA-TC--A----AAG-AAACG-TATGTA-T-TAATTGC----A-T-A-GT-ATA--TGTAT-ATATT-T-AC---TTA-AA-------T-ATGTG-TG-TGTTT--TAAA--ATTATT-AATTTAGTTCTTA-ATATAC----ATGT-ACTTT-GTTTTCATTTAAAAAAA--AA--ATAGTCAAT----------TACTAAT--TATTTACGTCTGTACC-TAT-C--GAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATA-TCGTTTAAG--GCTGC-ATTAAACAAGT-ATCG-----AATGAGTATATGT-GC-TTCAAAGC-ATT---CA-CAAA-GATC-T-ACTAAAGA-AACAA-TTT----AATTTTTAAGTCA--T-AAC-A-T--TTCCTAAAT-----------TGAAAAC-G--TA---TCATTAGAGAGAGA--GAGA-GAGAGAG---ACGCGCA-AAAGGATAG-GATACAAGT-----------ATGTGCAACCAAATATATTTCTT-TATATA-T-CG-AG--TA-AAAAAATC-----ATTC-----AA--TTTCAagttgtcccaaatattactactgagacggtcttatgaattcgagctaccgctgattttgcgctgtatgtacccgtactcgtcgaccttttagtt
gi|6 : cgtatAGTCCCGTGTA-TT-GT-----GCGCAC--TC--ATG-T---AC-A-A--TGCG-CA-C-C-ACCAC-TTTGGGGGAGTAAA-A-C-A---C-T-GGAAA-AAC-C-TTAGT-C-T---AT-GTATTTGG-T----GCGCATA--TA-A-A-AAA-----AA----TG-G-AAA-AA-G--AGAG--G-T----AAC-AAATT----TTC-TTAA-AACTC---TA-AA-----A-T---ATT-AA---AAG-TC-C-AT-AGG-ATG------A--TTTG--GAAA-TA----G--T-CT----TG--C---------A-T-GTTCA----CGAAA--CA--TTGT---T-AC----GAT--------AA-TGACGGTAA-TC--A----TAGTAAACG-TATG-A-TATAATTGC----A-T-ATGT-ATA--TGTTTAAT-GT-T-AT--TTTATAATA---TGTAATGTGTTG-TGTCT--T--AAGATTATT-A--TTAGTTCTAACGTTCTTAATAATTA-A-TTT-GTTTTCA-TT-AACAAA--AATTG-------TTTCTGGACATTACTAAT--TATTTACGTCTGTACC-TAT-TCAGAT-AAC-AAT-CAGTAAATCCATA-TTGTTTAAACGGCTGC-ATT-AACAAGT--TTG-----AATGAGTATATATGGC-T--AAGAC-ATT---CA-CAAGTAATA-T-AC-AAAGA-TATAATTTT----AATTTTTAAGTCAT-T-AAC-A-T--TA-CTAAAT-----------TGAAAAC-G--TA------TC----AGAGA--GAGAGGAGAGAGAGAGAGAGCACAAATGCTAATGATACATGT-----------A
gi|7 : gtatAGATTGTCT-TG-AAATGCTCGAGCG-CACACCAA--TACTTTTAGAACATGG-ACCAT-----G-CAG-CTGCA-TTGATT---ACAC--TGGA----TTT----CCCTTTCGAAAATGACTTGTTTG-AAT-TGTTGTATAATCTCT-GAATGCAAGATGATATCTTTGTAAATGCA------GTA-------A-ATCTCTGGT-AA-TATTCA-AT-CCTCCT-CACC----GAA-TC--T-AATTG-AGAA-CG--A-TAGAAATA---TAC---AAA-------GCAAAATAAG--AGA-ATT-TCTA---AC-----------------------ACCTTTGTTTTGA--C--AA-GCTTAGGGGGATG-CACGGT-G------------ACAT-T--------------A-------------ATT-CCT-ATGAAAA--CGGACGGAG--TT-C------------GGT-ATGTC----------AT-AATAT-CCAG-CAGTAATGCATAACAATG-----------GT-TT------CA-ACCCCATATACAATA-GT------TTCT-CGCC-G--GAG---CAATTGT--T----T-ATAG-AATAAT-AGAACAA--AATCCAAAGA--G-TATATAA-T-A-ACA---CTGA-CC-TGTAAAG-TATTCT-TGATCTCCATTGAgtaagacatgtgccgaatgttttgcttctatatt
gi|8 : GTC-CGTGTA-TT-GT-----G-GCGC--TT--ATGAT---AT-T-G----CG-CACC-C-CCCAC-TTTGGGGGA--AAA-AAC-A--TAAT-GGAAA-AAC-CATTAGTCC-T---AT-GTATT--G-T----GCG---A--TC---A-AAA-----AA----TG-G-AAG-AATG--AG----G-T----AA--AAA-A----TTC-TTAA---------TA-AA-----A-T---A---AA---A---TT-C-AT-AGG-ATGA------------TTGGAA-T------------------------------A-T-CTGCA-TC-CGAAA--CAT-ATGT---T-A-----GATGACCAGC-AA-TGACGGTAA-TA--A----TAG-AA-CG-TATGTA-T-TA-TTGC----AAT-A-GT-ATA--TGTAT-AT-AT-TTAT--TTTA-AATA---TGT-ATGTG-TG-TGTCT--T--A--ATTATTCATTTTAGTTCTAA-GTTCATTA--ATATAA-TTG-GTCTTCA-TTAAAAAAATTGATTCTA--CAA-TTATA-----TAA-AATTATATTTAAGTCTCTAAC-TAT-C--GAT-AAC--AT-CACGAAATCCATATTCGTTTAAC--GGTGCAATTAAAC-AGTAATTGGGAAAAATGAGTATATAT-GC-TTCAAA-C-ATTGGGAA-CAAA-GATC-TAACTAAAGA-TATAA-TTT----AATTTTTAAGTCGACT-AACAA-T--TTACT-AAT-----------TGAAAAtgtcctaaatatactactagagctggtctaatgagtcgagttaaaaccgcgatacgaagaatggcgacttactgtatcaccgtac
gi|9 : atc-AATTG-AGAAGCGTAGTTAGAAGTAAAATATTTAAAA-------GC-AAATTAGTAAGAGATTGTCTA--CACCAT-TAGAGC----CCGTAACCAGCCTTTGTTTTGATAC--AATGC-TAGGGAGGAA-CAAGGT-GTTATTACGACCCACGTGT--------------A-------------ATT-GCTGATGAAAAAAC-ACCGAGGAGTT-T------------TGT-A-GT-----------GTAAATA--CCAAAC------ATGTAGC-ATT-----------GTATT------CT-ACC-----------A-G--------------CC-G-AGATATAGAATTGTTGT----TTGAAACAATAAG-A-AACAAAGAATCC-AAGA-GG-TAATTAATTCA-GTA---C-AA-CA-TGTAAAA-TGTCTT-C-GTCGTacg
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GTCGTCATTGAAGTTGTTCCCAAATATTACTACTAGAGCGGTCTTATGAAATTTCGAGCTACCGCTGATTTTGCCGACTGTATGTACCCGGTACTCGTCGACCTTTTAGTTTC
Unaligned ( gi|28 ): GAGGAGAAAAACACTAAATTGATCATGTAGTAAGACATGGTTGCACGAACGTTTTCTTTCTAATAATTT