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gi|3 : tGTCAATTCATCA-TCAGCCC---ACT------ACCGTT--T-CAT-CAG-GA-AT--CC-TCC-GGGAA-CTGCCCT-AGAT-CC----GC-T-GCTCTTCCTGA------T-TTATCAA----ACG---AC-TGC-ATCATCAGTGTCCAT-CTAC-CACAG---------------ACTCTT-TG---CTGAT-GA--T---TGTCTGA-TGTACA-GGA-GGATTA--GACAC-CCA--G-GACCAGG-AGAT-TTGCAGA-GCGA-C-GCCTC---AATAA------CTACAGCAGTGGTAGGACCAGATG-ACGTGTTGCA-GTTCAAAC-CCGGA------CC--GTGGAG--TGCTTACGGGTTAA--CAATC--------C-GGA---ATCCC-AATATACTCG-CCGACT--ACAAAT--T-CAACGGCCAAGGT----CTAA---AACA-G-G-TT-GACT-CTGGCGAA----AGTACCT------TGG--CTGTCTATT-CA--TAAGAACC--TT-AGCT-G----GGA-T-ACGCCAACATA--GATAA-G-AT-----CACC-A-AA-AGAGGC-AAAA--CTC----CCACA---------T-CT-GG--CCTTC-TTAAG--AG-AA--A--CATC--AGCC-----GATGCCCTACCACCCCATGCACAG------TGCT---A-A--CTC-ACTC-------T-TGT-GCGACC--TAC----TATC--GA-AAT-ATGCC-TCC-GCGTTGT-G-GA--GT-TAGC--CAAAGAAAG---GAAGAGCA-TCAACACA-TTCGT--GCC-------ATT----CAACG--TGGGAC-AGC-CAGAATTC--GCC----A-TTGGAG---ATTA--C-C---AACG-CA---A-CAGTGTAAACAT---CTATGCT----ACGGAG---AAC-TCCAGT--GCGCA--GCCA--CT---CCAG---C-T-C-GTCAGTATTAGTGTA---GAA-----------CT---A--------------ATAGT-TTGAT--CA-AATT-GTGGGAC-ATCCC-G--GCG-GTGAG--CG--A-CCT-A-----CAACCAGCAT--CAAAACTAC-GG-ACCAGA---GGCCACG-CCC-T---GC-GATTTC-TT-GTTAC--CA-CAC----------ACCAAGGAACGAC-ATGTTAACAA-G--A-A-C-CTCCTTCTTTC--CCCA-G--CACC----CGGCTC-TGG-ACA-A-ATTA----A---------GC-TA-C-CAG------GACC-AA-----GGAACATGGACAGCT-TT-A---AGACCC----AGCCGTTTA-AG--TGCCCACCAAGCCTGGCC-AG-ACA---AAT-C----TG-CG----G----T--------GTTT---T---TTTTA-----ACTT-------TATCTA-TTTTTAAACGT-GCACTGTA--
gi|2 : atA--CC---GACT-----ACCGTTATT-CATCAAG-GA-TCCCCCGTCAAGGGAA-CTG-CCT-AAG--CC----GCAT-GCTCTTCCTAAATT---TATCATCAA----ACA---ACCTGTC--CATCAGTGTCA-T-CTGCCACCAA---------------ACT-CT-TG---CTGATCA-------TGTCTGGATGTACATGGG-G-ATAAATGACAC-C-ACAA-GACCAAAG-GCTCTTGCAGA-GC-A-C-C--T----AATAAAGTACCTAACAG-AGGGAGA----CCGA-AGCTTTAT-GCA--TTCAA-T-CCGGA-TAAG--T--GCGAAG--TGCT-ACGG-TTA---CAA-C----------GAA---ATCCCCAATGGC--CGCCCGAAT--TCAAAA--TCCA-CGGC-CAAGT----CCTAAATATCA-A-GTTT-GACT-CTA-CAAAGTATA---CCGT-----TGGTCTTGACTATTTC---TAAGAAAC--CT-AGCT-T----T-A-T-ACAC--ACACATCGATAA-GAAT-----CACT-A-AGAA-AGGCAAAA---CT-----CCA-C---------A-CT-GG--CCTTCC-TCGGCCAG-ATAAATACAT--GAGCC------ATGCCCAACCACCC-ATCAA-AG------GCAT---C-AGTGCT-ACTTGC--CAC--GGT-GCGA-C--TAC----CATCAAGA-AT--ATGCC-TCCAGCTTTGT-G-GA--GC-CAGC---CCAAGAAGGGAGA-T-ACA-TCAATAAAACTCA-AGG-C-------GCA----CAGC---CGTAGC-ATA-CAG-ATTC--GCC----ATT-GGAG-A---TA--C-CT--AACG-CACAAGCCAGTGT--ACAT---CAATGCTAGAAAC--AGATAACC-TCCA-T-GGCAGT--TCCA--CT---CCAG---CTTCC-GTT--GA-AAAGGCCGCGGAAGTCATTAAT--CTA--A----T----AGGAGAGAAG-TTAAT--CAGGATA-GT-GA---AT-CCTG--GTGAGTGAGGCTT--ACCTACA-----AACCCAGCAT-ACAC--TTGCGA----CAAA---AGC--CATCCCTT---GC-GATTGTCTT-GTT-C--CA--------------------GGACGAACA-GCGTATAG-A--A-A-CGCTCC-TCCTCC--CTCACATCCTTC----CAGCTC-T-GAACA-A-ATTACC--A---------GA-GG-AGCAGATGG-A-GCC-AC-----AGACCCTGGACAACTATT-A---A-AACC----AGCTGT-C--GG--T--CTGCCCAG-CTG--T-A--AC----GACTC----TG-TG----GTAACT--------TTTT---TAAA----------ACTTTTT----TATCTA---TTTAAAGAT-GCA-CG-A--C----ATGTA-----TTCA-C----C-ACC-CTACA-AC-AGATGCGATA-ATAC--T------GTC----AG-TGC-A
gi|4 : gtccataatcccacaaCAGTGA-GC--CC-TCA-AGGAAACTGTCCTTAGG--CCTCTCGC-T--CTCTTCCTAA-----TT-TCAC--A----TTG---ATCTGCCATCAT-AGCCTCT-TAC--C-ACCAG---------------ACTATTATG---CTGAATG-------TG-ATGACT------AGA-G-A-TAAAGACACTCCACA--AACCAGG----C-CTG-AGC-ACGA-CTA--TCCCAAAT-TA----CTT-CAACAGTGAGAGA---CGATTGCT--AT--CA-GATCAATC-CCAAGATAAGTTTTAGCGGAAGG-GCTCAC-AGT---ACCAA-C--------C-GAAAGGATCCCCAAT-GC-TCG-CCGAATTCACAAAAAGC-CA-CGCT-AAAATGTTCCTTA---ACAC-A-G-TT-TACT--CG-CGAA----AAT-CCGACTTCCCGTCCCTGACTATGGCAGTTAAGAACC--GCATACT-GTTAAG-G-TAACAA--ACAGA--GAGAACA-ATTCAGCCACC-ATAA-A-AAGC-AAAC--CTA-----CATC---------TGCT-CGTTCCTAACTGCTA-CAA-A---A--CATTCAAGTACATAAGA-GCCCAACCTACC-TATCA-AGCTAAACTGCCATGA-AGAT---ACT--C--CACTCGGCTGC-ACCCTCAA----CA-C--GA-CCA-ATGCT-TCT--CAGTCG-GTGA--CC-CAGCCTAGAAAAGAG---AACTAATA-ACGCGAAGGCCTTCAGTAC-------TTGTTCATAACGTCCTAAGCAAGTACAC-ATTTTACTCATAAA-T-GGGAT-AGCTA--C-C---AACG-CACAAG-CAaata
gi|19 : taatcattcagtctcttcctttagCGA-C-C--TC---AATAAA----CT-ACAGCAGTGGGAGGA-CCGATGGCTGA-T-GCA-GTTCAA-C-CC-GAATAAG--T--GT---AG-TGCT-ACAGGTT--ACCAA-C--------CGGAA---ATCCCCAAT---T-------AAT---------------CGGC-CAAGT----CCTA---AATACA-A-TT-GACTtgaaa
gi|13 : -CA-CGGC-AAAGT----CCTA---AACACA-G-TT-GAC-GCTG-CAAAGT--A---CCT------TGG-CTTGACTATT-CA--TAAGAACC--TT-CGCTAG----G-A-T-GCGC--ACATA--AATAA-G-AT-----CAC-----------------------------------------T-CT-GA--CCTTCCT-CAG-CAG-AA--A--CATC--AGCC-----GATGCCCAACCA-CC-AC-CA-AG--------GC---ATCGTGCT-ACTC-CA-CGCT-GGT-GCGACC--CAC----CATC--GA-AT--ATATT-TCCAGC-GTGT-GGAA--CC-CAGC----CAAAAAG---GA-GAATA-TCAct
gi|7 : AAGT----CCTA---AACA-CTG-TT-GACT-CTG-CAAA----G---TATC-----TTGGCTTGACTATT-CA--TAAGAACT--TT-CGCT-G----GGA-T-ACGC--ACATA--GATAA-G-AT-----CACC-A-AG-A-AGAC-AAA---CT-----CCA-C---------T-CT-GG--CCTTCC-TCGG-CAG-A---AA-CATC--AG-CC----GATGCCCAACC-ACC-A-TCA-AG------GCAC-----TGTGCT-ACTC-CA-CGCT-GGT-GCAACC--TAC----CATC--GA-AT--ATGCT-TCCAGC-GTGT-G
gi|8 : ttgggcgcgcacaacgtgttgtactcgatgttcaatcgtcatcagccactaccgtttcatcaggaggccctcgggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgatgtacaggaggatcaagacaccacagggccaggagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCACC-TTTCA--CAGGAGCA--TC-GGCT-GA---G-A-T-ATGA--ACATA--GACGA-T-AT-----CACC-A-AG-A-AGGC-AAA---C-G----CCACT---------T-TT-----CCTCC
gi|12 : ttttgacttttcaaaggcctttaacaaggtcccacacattcgactgctgataaagctacatcattatgacatccgaggacgcatccatgacaagataacaagttacagggtgtacagaacgtgtttgtcctttgatagtcaatcattgcccgctaccatcatttcatccagagtcaggaaaacatttatcttcttgatgtacataaatgagaaattgtctcatcaaccactcgactatttgcaagacgactgtcttatgcacagaaggaccaggtcatcttatagggataactcaaaaagctccaacagtgattaatggagaatcaagtgcacaaaagagtccccactacttgttggctagcttatccatggccatgtactttttatgatcaactgtgttaaatacctccaTTGACTATT-CA--TAAGTACT--TT--GCT-G----G-AAT-ATGC--ACATA--GAGAA---AT-----CACC-A-AG-A-AGGT-AAA---CT-----CCACT-----------AT-GG--CCTTC-TTCGG-TAG-AA--A--CATC--AGCC-----GATGCC----CAACC-----------------------------------------CT-GGTGG--ACC--TAC----CAAC--AA-ATA--TGCC-TCCAGC-GTGT-GTGG--CC-TA-----ACCAATAG---GA-GAACA-TCAATAAAA-TCG--AGCC-------GTA----CAGCG--TAGGGG-AAC-CA--AATCC-GCG----ACT-GGAG---ATTA--C-CAAAAACG-CA
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gi|22 : taaatacttgggtatcaacattcaccCTTCCT-CGA-CAG-AA--A--CATC--AGCC-----AATGCCCAACC-ACC-A-TCG-AG------GCAC-----TGTGCT-ATTC-CA-CGCT-AGT-GCGACC--CAC----Ccagaaaactaaagatatttgccacaaggcactggta
gi|5 : cttcggtaatgtcccacacaaccgactactaatgaaa-ACTC-CAGC-CT-GGT-GCGACC--CGCTAGCCATC--GA--TGTATGCCGTCCAGGCGTGT-GGGGAGCC-CAGC--C-CAGAAAG---GA-GAATAATCAAGAA--CTCG-AGGCCTTTATTTATGA---TAG------GGGC-AGT-CAG-ATTC--GCC----A-TAGGAG---ATTAAACGC---AACGGCACA-G-TAGTGTA--CATGCGTTATGCT----CT--AGC--AGCACCCAGTTGGC-TAGTTCCAGGCTGGGCCGGATGC-TCCCGTCGGGAGAAGGGCTTA-GAGGTCATTACAGTCT---AAAACTAGGGATGGGAGGCTGTTATTGCTA-GATAGGT-GGAT-TT-CC-G--GCG-GTGGA------A-CTA-ACCTTGCAACCAGC-T-C----ATTGCGGATCCCAGA---GGCCACTTCCC-TTGGACTG-TC---TT-GTTACTGCAACACATTATCGCCTACC-A-GGACGGA-A-GTG-GTAC-A--A-A-C-CTCCTTC--CCGGCCGG-AGCCATTTGGGCCGGTCTTGG-ACA-AGGTCACCGAA---------GG-GG-CGCAG-TGGAAGGCC-AA-----GGTCC--GGACAGCT-T--------AACC----AGCTGTCCGGGG--TG-CCGGCCAG-CTG--T-ATGAAGCTCGA--CTTCATGCTG----G----G--------TTAT---T---TTTAA-----AC---TA----AATCTA--TTTTAC-TGT-GCACTGTAGGC----AT-ACGAATGTTCA-CGGATC-ACC-CT-CACACAGAGTGCGATA-ATACTTTA--AGTGTCG--TAAGCGC-AC
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gi|20 : -AAGGGCC----AAATGACTAAA--CT---A----TA---ACGAGATAAG-TTA-T--CA-GATT-GT--GAC-AT-CC-GATGCA-TGTAG--CT--A-C-A-A-----AAA-CAGCATACTGCA--TGT-AG-ACCAGATCGAGCC-CATAAC-T---GCga
gi|25 : gTATG--CT---A----T----AAAGGATAGT-TTA-T--CA-GATT-GC-AAAC-ATCCC-G--GCG-GTGAG--CTTAA-CCT-A-----CAACCAGCAT-Caatttcttataccaca
gi|15 : CC-AGG-ACGAC-G-GTG--TAC-AAGG-A-C-CCC----TTCC--CCCA-AG--GTC------------AGAACA-AG-TTACC--A---------GG-GGGCGCAG-TGG-AGGCCAA-------GACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACCAGCTAGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-Ca
gi|11 : -A-GTG--TAC-AA-G-A-C-CTCCTTCTTTC--CCCA-AGCTATC----TGGCTC-TGGAACA-AG-TAACC--A---------GGAGG-CGCAG-TGG-AGGCCAAGACCCTGGACCCTGGAC-CCT-GG-ACCCAGAACC----A-CTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-TTG--T-AG-A-G---GA--C----TC-TG-------------------------T---TTTTTAAAAAACTTTT-----TATCTA-TTTTAAC-CGT-GCACTGTA--C----A--TAAAT-GTTCATT----C-ACCTCT-CACACAGCGTGTGATA-ATACT-TA--A--GTGG--T-A-TGC-ACTAAACCGGAAGAAGcttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgttttaaacttatctactttaacgtgcaccgtacatagatgtttacc
gi|14 : -A-GTG--TAC-A--ATA-C-CTTCTTCTTCC--CCCA--GCAAT--------------AAATACAGATTACC--A---------G-----------TTG-AGGCCAA-------GACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG--T-A--------GA--C----TA-----------CT--------CTGT---G---TTTTTAAAA-ACTTTT-----TATCTA---TTTAAACGT-GCACTGTA--C----A--TAGAT-GTTCA-T----C-ACT-AT-CACACAGCGTGCGATA-ATACT-TA--A--GTGG--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGA
gi|16 : GGAACA-AG-TTACT--ATAGTAGCTGGG-GG-CGCAG-TGG-AGGCCAA-------GACCCTGGACAGTT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-TTGTCGAG-CTG--T-AG-AC----GACTC----TG-TGAGGAGTTTTTAAAAAAAA---------------------ACTTTT-----TATCTA--TTTTA-ACGT-GCACTGTA--C----A--CAGAT-GTTCA-C----C-ACC-CT-CACA--GAGAGCGATA-ATA----A--A--GTGG--TAA-TGC-ACTAAACCGcg
gi|21 : GGAACA-A-ACTACC--A---------GGAGG-AGCAG-TAG-AGGACTAG-----G--CCCTGGACAGAT-TT-A---AGACCA----AGCTGTCC--TGAATG-CCTCACAG-CTG--T-AC-ATGA--GT--C----TG-TG----TTTTTT--------ATCT---A---TTTTC-----Aga
gi|17 : acacgG-CGCAG-TGG-AGGCCAA-------GATCCTGG-CAGCT-TTCA---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG--TGAG-AC----GA--C----TC-TGC---GAGTTG--------TTTT---T---TTAAA-----ACTTTTT----TATCT-CTTTTAAC-CGTGGCACTGTA--C-----T-TAGAT-GTTCA-C----CAACC-CT-CACACAGTGTGCG-TA-ATAC--TT--A--ATGGTATAA-TGCAACTAAACCG--AAAAGG
gi|24 : G-CGCAG-TGG-AGGTCAA-------GACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG--T-AG-AC----GA--C----TC-TG------TCTT--------ATCT---T---TATCT-----ATTTTa
gi|15 : TTTTAAACTTATCTAC--TTTA-ACGT-GCACCGTA--C----A--TAGAT-GTTTA-C----C-aac
gi|26 : ccaggacgacggtgtacaaggaccccttcccccaaggtcagaacaagttaccagggggcgcagtggaggccaagaccctggacagctttaagaaccagctagctgtccggtgccgcccagccttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgC-CT-CACACAGAGTGCGATA-ATACT-TA--G--GTGG--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGAA
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gi|14 : -AGT-G--T--AC-A--AT-AC-CTTCTTCTTCC--CCCA--GCAAT---------------AAATACAGATTACC--A---------G-----------TTG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-TA--CT--CTG-------------TGTTTTT-------AAAAAC-TTTT-TATCTA--TTTA--A-A-CGT-GCACTGTA--C----AT--AGATGTTCA-T----C-ACT-ATCAC-ACAGCGTGCGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGA
gi|15 : CCAGG-ACGAC-GGT-G--T--AC-A--AGGAC-CCC----TTCC--CCCA-AG--GT-----C--------AGAACA-AG-TTACC--A---------GG-GGGCGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACCAGCTAGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-Ccg
gi|15 : TTTTA-------AA---C-TT----ATCTA--CTTT--A-A-CGT-GCACCGTA--C----A--TAGATGTTTA-C----C-cttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgttttaaacttatctactttaacgtgcaccgtacatagatgtttacc
gi|16 : ccaggacgacggtgtacaaggaccccttcccccaaggtcagaacaagttaccagggggcgcagtggaggccaagaccctggacagctttaagaaccagctagctgtccggtgccgcccagccttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgGGAACA-AG-TTACT--ATAGTAGCTGGG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGTT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-TTGTCGAG-CTG----T-A-GA----C-GACTCT--GTGAGGAG----------TTTTTAAAAAAAAA---C-TTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--C----A--CAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-AGAGA--GCGATA-ATA-----A--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGA
gi|17 : G-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ATCCTGG-CAGCT-TTCA---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----TGA-GA----C-GACTCT--GCG----A-GTTGT-TTTTTTAA-------AA---CTTTTT-TATCTC--TTTT--A-ACCGTGGCACTGTA--C-----T-TAGATGTTCA-C----CAACC-CTCAC-ACAGTGTGCG-TA-ATAC-T-TA--A-TG--GTATAA-TGCAACTAAACCGAAA
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gi|19 : taaatacttgggtatcaacattcaccCGA-CC--TC---AATAAACT-AC--AGCAGTGGGAGGA-CC-GATGGC-TG-ATGCA-GTTCAA-C-CC-GAATAAG--T----GT---AG-TGCT-ACAGGTT-A-CCAAC--------CGGAAA---TCCCCAAT---T-------AAT---------------CGGCCAAGT---CCTAAATAC--AA-TT-GACT-CTcagaaaactaaagatatttgccacaaggcactggta
gi|2 : CT-----ACCGTTATT-CATCAAG-GA-TC--CCCCGTCAAGG-GAA-CTG-CCT-AAG--CC----GCAT-GCTCTTCCTAAA---TTTATCATCAAA----CA---ACCTGTC--CATCAGTGTCA-TCTGCCACCAA---------------ACTCTT--G---CTGATCA-------TGTCTGGA-TGTACATGGG-G-ATAAATGACAC-C-ACAA-GACCAAAG-G-CTCTT-GCAGA-GC-A-CC--T----AATAAAGT-ACCTAACAGAGGGAG-A-CC-GA-AGC-TTTATGCA--TTCAA-T-CCGGA-TAAG--T----GCG-AAG-TGCT-ACGG-TTA---CAAC----------GAAA---TCCCCAATGGC--CGCCCGAAT--TCAAAA--TCCA-CGGCCAAGT---CCTAAATATCAAG-TTTGACT-CTA-CAAAGTAT--A---CCGTT-GGT-CTTGACTATTTC---TAAGAAAC--CT-AGCT-T----T-A-T-ACAC--ACACATCGATAA-GAAT-----CACT-A-AGA-AAGGCAAAACT-CC-AC----------------A-CT-GGCC-TTCCT-----CGGCCAGATAAATA-CATG--AGCC-----------ATGCCCAACCACCCATCAAAGGCATCAGT-GC--------TACTTGCCA-CG----GT-GCGACT---AC----CATCAAGA--A-T-A-TGCC-TC-CAG-C-T-TTGT-GGAG--CC--AGC--CCAAGA--AGGGA-GATACA-TCAATAAAACTCA-AGGC--------GCA-CAGC-CGTAGCATACAGA-TTC--GCCA-TTGGAG---AT---AC-CT--AAC-GCACAAGCCAGTGTA--CAT---CAATGCTAGAAACAGAT--AACCTCCA--TG-GC-AGTTCCA--CT---CCA---GCTTCCGTTG--A-AAAGGCC--GCGGAAGTCATTAAT--CT---AA---TA-GGAGAGAAG-----T-TA-A-T---CAGGAT-AGT-GAA--TCCTGGTGAGT-G-AGGCTT--A--CCTACAAACCCAGCATA--CACTTGCG---A----CAAA----AGCCAT-CCCTTGC-GATTGTCTTGTT----------------------CCAGG-ACGAACAGC-G--T--AT-AGAA--ACGCTCCTCCT-CC--CTCACATCCTT-----CCAGCTC-TG-AACA-A-ATTACC--A---------GA-GG-AGCAGATGG-AG-CC-AC------AGACCCTGGACAACTATT-A---A-AACC----AGCTGT-C--GG--T--CTGCCCAG-CTG----T-A--A----C-GACTCT--GTG----G--TAAC-TTTTTTAA-------AA---CTTTTT-TATCTA--TTTA--A-A-GAT-GCAC-G-A--C----AT----GTATTCA-C----C-ACC-CT-ACAACAGA-TGCGATA-ATAC-TGTC--AGTG--
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gi|22 : acacgCTTCGGTAATGTCCCAC-ACAA-CCGACTA---CTAATGAAACT
gi|22 : C-TTCCT-----CGAC-AGA---A-A-CATC--AGCC----------AATGCCCAACCA-CCAT-CGAGGCAC-TGT-GC--------TATT--CCA-CGC-TAGT-GCGACC--CAC----Ctcctcgacagaaacatcagccaatgcccaaccaccatcgaggcactgtgctattccacgctagtgcgacccacc
gi|23 : cttcggtaatgtcccacacaaccgactactaatgaaaAT---CTATGCTA----CAG-CC-AAC-TCCAG-TG-GC-AG--TCA--CT---CCA---GCT-CCATCGGGA-AAGGGCC--C---AAGTCATTATG--CTATAA----TA-AAAGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-TGC-AAACATCCCGGCG-
gi|24 : G-CGCAG-TGG-AGGTC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-GA--CT--CTG-----------------TCT-------TA-----TCTT-TATCTA--TTTT--A-A-C
gi|25 : TATG--CT---A----TA-AAGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-TGC-AAACATCCCGGCG-GT-G-AG--CTTAA--CCTACAA--CCAGCATC--
gi|26 : C-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATAC-T-TA--GGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGAAa
gi|27 : CTT----ATTGGGCGTA-CACAACGTG-TTGTAC-TCGATGGTCAGT-CG
gi|3 : cGTCAATTCATC-ATCAGCCC--AC-T-----ACCGTT--T-CATC-AG-GA-AT--CCTC----CGG-GAA-CTGCCCT-AGAT-CC----GC-T-GCTCTTCCTGA----TTT---ATCAAA----CG---AC-TGC-ATCATCAGTGTCCATCTACCAC-AG---------------ACTCTT-TG---CTGAT-GA--T---TGTCTG-A-TGTACA-GGA-GGATTA--GACAC-CCA--G-GACCAGGA-GATT--T-GCAGA-GCGA-CGCCTC---AATAA--CTAC--AGCAGTGGTAGGA-CCAGATGACGTGT-TGCA-GTTCAAAC-CCGGACC----------GTGGA-G-TGCTTACGGGTTAA-CAATC--------C-GGAA---TCCC-AATATACTCGCC-GACT--ACAAAT--TC-AACGGCCAAGG---TCTAAA-AC--AGGTT-GACT-CTGGCGAA------AGTACCT-T-GG--CT-GTCTATT-CA--TAAGAACC--TT-AGCT-G----GGA-T-ACGCCAACATA--GATAA-GA-T-----CACC-A-AAAGA-GGCAAAACT-CCCAC----------------ATCT-GGCC-TTC-T---T-AAG--AGA---A-A-CATC--AGCC----------GATGCCCTACCACCC---CATG-CACA-GT-GC--------TAAC--TCA-CTC-TTGT-GCGACC--TAC----TATC--GA--AAT-A-TGCC-TC-C-G-C-G-TTGT-GGAG--TT--AGC--C--AAAGAAAGGAAGA-GCA-TCAACACA-TTCG--TGCC-------ATT-CAACGTGGGACAGCCAGAATTC--GCCA-TTGGAG---ATT--AC-C---AAC-GCA---AC-AGTGTAAACAT---CTATGCTA----CGGAG--AAC-TCCAG-TGCGC-AG--CCA--CT---CCA---GCT--CGTCAGTATTAGTGTA--G---AA-----------CT---A-----------ATA-G-----T-TTGA-T---CAA-AT-TGTGGGACATCCCGGCG-GT-G-AG--CG--A--CCTACAA--CCAGCATCA-AAACTAC----GG-ACCAGA----GGCCAC-GCCCTGC-GATT-TCTTGTTAC-----CA-CA--------CACCAAGGAACGA-CAT-G--TTAAC-AAGA--AC-CTCCTTCTTTC--CCCA-G--CAC-----CCGGCTC-TGG-ACA-A-ATTA----A---------GC-TA-C-CAG------GACC-AA------GGAACATGGACAGCT-TT-A---AGACCC----AGCCGTTTA-AG--TGCCCACCAAGCCTGGC--C-A-GA----C-AAATCT--GCG----G----TG-TTTTTTTT-------AA---C---TT-TATCTA--TTTTTAA-A-CGT-GCACTGTA--
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Reference ( family-2330 ) : NNNNTTTTGACTTCTCNAAGGCCTTCGATAANGTCCCAC-ACAA-CCGACTA---CTGATAAAACTGGCATCANCATGTACGCGATCCAGGGGNCNCACCCATAGACGTGGATNNCGAGCTT----ATTGGGCGCA-CACAACGTG-TTGTAC-TCGATGGTCAAT-CGTC-GTCCGNCC--ACCT-----ACCGTT--T-CATCCAG-GA-GC--CCTC----AGG--GAA-CTGTCCT-AGG--CC----GC-T-GCTCTTCCTAA-----TT-T-CATCAAN----CG---ACCTGCCATCATCAGCGTCN-TCT--CACCAG---------------ACTNTT-TG---CTGANCGA--T---TGTCTG-A-TGTACA-GGA-G-ATCAAGGACAC-CCACAG-GACCAGG-AG-CT--T-GCAGA-GCGA-CN--TC---AATAAACTTAC--AGCAGTGGGAGGA-CC-GATGGC-TGTATGCA-GTTCAA-C-CCGGAATAAG--T----GCGGAAG-TGCT-ACGGGTTAA-CCAAC--------C-GAAA---TCCCCA-ATG--TTCGCC-GAAT--ACAAAA--TC-A-CGGCAAAG---TCCTAAACAC--AG-TT-GACT-CTG-CGAA------A---CCTCT-GG--CTTGACTATTTCA--TAAGAACC--TT-CGCT-G----G-A-T-ACGC--ACATA--GATAA-GA-T-----CACC-A-AGA-A-GGCAAA-CT-CC-AC----------------NTCT-GGCC-TTCCT---T-CGGC-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CC------AACCAA---------CC-A-T-CAA-GGCA-C-NGTG---C--------TACT--CCA-CGC-TGGT-GCGACC--C----AC-CATC--GA--A-T-ATGCC-TC-CA-G-C-G-T-GTGG-G--GCC-CAG-C--C--AAA--AAGGA-GA-AC-ATCAATAAAACTCG-AGGCC----GTGC--------A-GCG--CGGGGC-AGC-CAGA-TTC--GC-CAT---TGGAG---AT---T--AC-C---AAC-GCACAAGC-AGTGTAAACAT---CTATGCTA----CAG--CAAC-TCCAG-TG-GC-A-G-T-CCA--CT---CCA---GCT-CCGTCGGGA-AAGGGCC--G---AAGTCATTATG--CT---A----TA-CGGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-NGT-GGACATCCCGGCG-GT-G-AG--CT--A--CCTACAA--CCAGCAT---C--AACTGCG---GG-ACCAGA---GGCCAC-TCCCTGC-GATT-TCTTGTTAC-----CA-CA--------CACCAGGGACGGA-AGT-G--T--AC-A--A--AC-CTCCTTCTTCC--CCCA-AGCCAT-----CCGGCTC-TGGAACA-AGATTACC--A---------GG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------GGACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-GA--TC-TG-TG----G---TTTTTTTTT---TT-------AA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--C----AT-TAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGAAGG
gi|1 : TTTTGACTTCTCCAAGGCCTTTGATAAAGTCCCACCACAAACCGACTATACCTGATAAAACTGGCATCAGCATATACGCGATTCAGGGGCCTCACCCATAGATGTGGATCTCGAGCTTTCTTATTGGGCGCAGCACAACGTG-TTGTAC--CGATGGTCAGT-CGTCAGTC--ACC--ACTT-----ACCGTT--T-CATACAG-GA-GCTACCTC----AGG--GAA-CTGTCCT-AGG--CC----GC-T-GCTCTTCCTAAATTGTCT-T-CATCAAT----TG---ACCTGCCATCATCAGTGTCT-TCTA-CACCAG---------------ACTATT-TGT--CTGATTGA--T---TGTCTG-ACTGTACA-AGA-G-ACCAAGGACAC-CCACAG-GACCAGGGAG-CT--TTGCAGA-GCGA-CA--TC---AATAAACTTAC--AGCAGTGAGAGGAGCC-GATGGA-CGAATGCA-GTTCAA-C-CCGGAATAAGGTT----GCGAAAGATACT-ACGGGTTGAGCCAAC--------C-GAAA---TCCCCA-ATAGCTTCGCC-GAAT--ACAAAA--TC-A-CGGCAAAG---TCCTAACCA---AG-TT-GACTACTG-CAAA------A---CCTAT-GGG-CTTGACTATTTCA--TAAGAACC--TT-CGCT-G----G-A-T-ACGC--ATATA--GATAA-GA-T-----CACC-A-AGA-A-GGCAAA-CTACC-AT----------------TTCT-GGCC-TCCCT---T-CGGC-AGAT--A-TCATCGAAGCCCGAT----GC-CC------AACCAA---------CC-ATT-CAA-GTGA-CAAGTT---T--------CACT--CC--CAC-TGGTAGCGACC--C----AC-CATC--GA--A-TAATGCT-TC-CA-G-CAG-T-GTGA-G--ACC-CAG-CAAC--AAA--AAGGA-TA-AT-ATCAAGAAAACTCGCAGGCC----GTGC--------A-GCG--CAGGGC-AGC-CA-A-TTTAAGC-CA----TGGAGTAAAT---T--AC-C---AAC-GCACAAGC-AGTGTAAACAT---CTATGCTA----CAGCCCAAC-TCCAG-TG-GC-ATA-T-TCA--CT---CCA---GCT-CCGTTGGGA-AAGGGCC--G---AAGTCATTATG--CT---A----TA-CGGGAGA-G-----T-TT-ATT---CAG-AT-AGT-GGACAT-CCGGCG-TT-G-AG--TT--A--CTAAAAA--CCAGCATCCAC--AATTGCG---GG-ACCAGA---GGCCACATCCCTGCTGATT---CTGTT-C-----CAGCA--------CACCAGGGACGGA-AGT-GAAT--AC-A--G--AC-CTCCTTCTTCC--CCCA-AGCCAT-----CCTGCTCGTGGAACA-AGATTACC--A---------GG-GG-CGCAG-TGG-AGGCCGAA------GGACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCAAG-CTG----T-A-TA----C-GG--AC-TG-TG----GTTTTTTTTTTTT---TT-------TA---CTTTTATATCTACTTTTT--ACA-CGT-GCA-TGTA--C----AT-TAGAAGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-AC-GAGTGCGATAGATAC---TA--AGTC--G--TAA-TGC-ACGAACCCGCAAGAAGG
gi|10 : tgct---CCA---GCT-CCGTCGGGA-AAGGGCC--C---AAGTCAATATG--CT---A----TA-CAGGATA-G-----T-TT-A-T---CAA-AT-AGT-GGACAAACCGGCG-GT-G-AG--CT--A--CCTACAA--CCAGCAT---C---ACTGC----GG-ACCAGA---GGCCAC-TCCCTGC-GATT-TCTTGTT-C-----CG-CA--------CACCA-GGACGGA-AGT-G--T--AC-A--AG-AC-CTCCATCTTTC--CCCA-AGCCAT-----CCGGCTC-TGGAACA-AG-TTACC--A---------GG-GG-CGCAG-AGG-AGGCC-AA-------GACCCTGGAAAGCT-TT-A---GGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-GAC-TC-TG-TG----G---GTTTTTTTT---AA-------AA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--CTAGTATATAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--CAA-TGC-ACTAAACCGGA
gi|11 : -AGT-G--T--AC-A--AG-AC-CTCCTTCTTTC--CCCA-AGCTAT-----CTGGCTC-TGGAACA-AG-TAACC--A---------GGAGG-CGCAG-TGG-AGGCC-AAGACCCTGGACCCTGGAC-CCT-GG-ACCCAGAACC----A-CTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-TTG----T-A-GA----G-GAC-TC-TG----------------TTTT---TTAAAA---AA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-ACCGT-GCACTGTA--C----A--TAAATGTTCATT----C-ACCTCTCAC-ACAGCGTGTGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--T-A-TGC-ACTAAACCGGAAGAAG
gi|12 : TTGACTATT-CA--TAAGTACT--TT--GCT-G----G-AAT-ATGC--ACATA--GAGAA--A-T-----CACC-A-AGA-A-GGTAAA-CT-CC-AC-----------------TAT-GGCC-TTC-T---T-CGGT-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CC----------AA---------CC--------------------------------------------C-TGGT-G-GACC--T----AC-CAAC--AA--A-T-ATGCC-TC-CA-G-C-G-T-GTGT-G--GCC-TAA-C--C---AA--TAGGA-GA-AC-ATCAATAAAA-TCG-A-GCC----GTAC--------A-GCG--TAGGGG-AAC-CAAA-TCC--GC-GAC---TGGAG---AT---T--AC-CAAAAAC-GCA
gi|13 : tC-A-CGGCAAAG---TCCTAAACAC--AG-TT-GACG-CTG-CAAAGT----A---CCT-T-GG--CTTGACTATT-CA--TAAGAACC--TT-CGCTAG----G-A-T-GCGC--ACATA--AATAA-GA-T-----CAC------------------------------------------TCT-GACC-TTCCT-----CAGC-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CC------AACCA----------CC-A-C-CAA-GGCA-T-CGTG---C--------TACT--CCA-CGC-TGGT-GCGACC--C----AC-CATC--GA--A-T-ATATT-TC-CA-G-C-G-T-GTGG-A--ACC-CAG-C--C--AAA--AAGGA-GA-AT-ATCAat
gi|14 : -AGT-G--T--AC-A--AT-AC-CTTCTTCTTCC--CCCA--GCAAT---------------AAATACAGATTACC--A---------G-----------TTG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-TAC-TC-TG-TG--------------TTT---TT-------AAAAACTTTT-TATCTA--TTTA--A-A-CGT-GCACTGTA--C----AT--AGATGTTCA-T----C-ACT-ATCAC-ACAGCGTGCGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGA
gi|15 : CCAGG-ACGAC-GGT-G--T--AC-A--AGGAC-CCC----TTCC--CCCA-AG--GT-----C--------AGAACA-AG-TTACC--A---------GG-GGGCGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACCAGCTAGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-Ccg
gi|15 : TTT---TA-------AA---CTT----ATCTA--CTTT--A-A-CGT-GCACCGTA--C----A--TAGATGTTTA-C----C-cttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgttttaaacttatctactttaacgtgcaccgtacatagatgtttacc
gi|16 : ccaggacgacggtgtacaaggaccccttcccccaaggtcagaacaagttaccagggggcgcagtggaggccaagaccctggacagctttaagaaccagctagctgtccggtgccgcccagccttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgGGAACA-AG-TTACT--ATAGTAGCTGGG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGTT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-TTGTCGAG-CTG----T-A-GA----C-GAC-TC-TG-TGAGGAG---------TTT---TTAAAAAAAAA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--C----A--CAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-AGAGA--GCGATA-ATA-----A--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGA
gi|17 : G-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ATCCTGG-CAGCT-TTCA---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----TGA-GA----C-GAC-TC-TG-CG----A---GTTGTTTTT---TT-------AAAACTTTTT-TATCTC--TTTT--A-ACCGTGGCACTGTA--C-----T-TAGATGTTCA-C----CAACC-CTCAC-ACAGTGTGCG-TA-ATAC-T-TA--A-TG--GTATAA-TGCAACTAAACCGAAA
gi|18 : GAACCCTTT-CAAG-G----A-A-T-ACAC--ACATA--AACCA-AG-T-----GGTC-A-AGA-A-GGCAAA-CA-AC-AC-----------------TCG-AGCC-TTCCT---A-TAG--AGG---A-ACATC--TA-CCAGT----GC-CCACAGAAAACTAAAGATATTTGCC-A---CAA-GGCA-C-TGagga
gi|19 : taaatacttgggtatcaacattcaccCGA-CC--TC---AATAAACT-AC--AGCAGTGGGAGGA-CC-GATGGC-TG-ATGCA-GTTCAA-C-CC-GAATAAG--T----GT---AG-TGCT-ACAGGTT-A-CCAAC--------CGGAAA---TCCCCA-AT---T-------AAT---------------CGGCCAAG---TCCTAAATAC--AA-TT-GACT-CTgta
gi|2 : CT-----ACCGTTATT-CATCAAG-GA-TC--CCCCGTCAAGG--GAA-CTG-CCT-AAG--CC----GCAT-GCTCTTCCTAAAT---TTAT-CATCAAA----CA---ACCTGTC--CATCAGTGTCA-TCTGCCACCAA---------------ACTCTT--G---CTGATCA-------TGTCTGGA-TGTACATGGG-G-ATAAATGACAC-C-ACAA-GACCAAA-GG-CTCTT-GCAGA-GC-A-CC--T----AATAAAGT-ACCTAACAGAGGGAG-A-CC-GA-AGC-TTTATGCA--TTCAA-T-CCGGA-TAAG--T----GCG-AAG-TGCT-ACGG-TTA---CAAC----------GAAA---TCCCCA-ATG--GCCGCCCGAAT--TCAAAA--TCCA-CGGCCAAG---TCCTAAATATCAAG-TTTGACT-CTA-CAAAGTAT--A---CCGTT-GGT-CTTGACTATTTC---TAAGAAAC--CT-AGCT-T----T-A-T-ACAC--ACACATCGATAA-GAAT-----CACT-A-AGA-AAGGCAAAACT-CC-AC----------------A-CT-GGCC-TTCCT-----CGGCCAGATAAATACATG--AG-CC-AT----GC-CC------AACCAC---------CC-A-T-CAAAGGCATC-AGTG---C--------TACTTGCCA-CG----GT-GCGACT-------AC-CATCAAGA--A-T-ATGCC-TC-CA-G-C-T-TTGTGG-A--GCC--AG-C--CCAAGA--AGGGA-GATAC-ATCAATAAAACTCA-AGGC-----GCAC--------A-GC---CGTAGC-ATA-CAGA-TTC--GC-CAT---TGGAG---AT------AC-CT--AAC-GCACAAGCCAGTGTA--CAT---CAATGCTAGAAACAGA-TAACCTCCA--TG-GC-A-G-TTCCA--CT---CCA---GCTTCCGTTG--A-AAAGGCC--GCGGAAGTCATTAAT--CT---AA---TA-GGAGAGAAG-----T-TA-A-T---CAGGAT-AGT-GAA--TCCTGGTGAGT-G-AGGCTT--A--CCTACAAACCCAGCATA--C--ACTTGCG---A----CAAA---AGCCAT-CCCTTGC-GATTGTCTTGTT----------------------CCAGG-ACGAACAGC-G--T--AT-AGAA--ACGCTCCTCCT-CC--CTCACATCCTT-----CCAGCTC-TG-AACA-A-ATTACC--A---------GA-GG-AGCAGATGG-AG-CC-AC------AGACCCTGGACAACTATT-A---A-AACC----AGCTGTC---GG--T--CTGCCCAG-CTG----T-A--A----C-GAC-TC-TG-TG----G---TAACTTTTT---TA-------AAAC-TTTTT-TATCTA--TTTA--A-A-GAT-GCAC-G-A--C----AT----GTATTCA-C----C-ACC-CT-ACAACAGA-TGCGATA-ATAC-TGTC--AGTG--
gi|20 : gtccataatcccacaaaccga-AAGGGCC--A---AA-TGACTAAA--CT---A----TAACGAGATA-A-----G-TT-A-T---CAG-AT-TGT--GACAT-CCGATGCAT-GTAG--CT--A--C--AAAA--ACAGCAT-------ACTGCATGTAG-ACCAGATCGAGCCCA-TAACTGC-AATT-TCTTA-TAC-----CA-CA--------caaata
gi|21 : gGGAACA-A-ACTACC--A---------GGAGG-AGCAG-TAG-AGGAC-TA------GG-CCCTGGACAGAT-TT-A---AGACCA----AGCTGTCC--TGAATG-CCTCACAG-CTG----T-A-CA----T-GAG-TC-TG-TG---------TTTTTTAT---CT-------A-----TTTT-CA
gi|22 : acacgCTTCGGTAATGTCCCAC-ACAA-CCGACTA---CTAATGAAACT
gi|22 : C-TTCCT-----CGAC-AGA---A-ACATC--AG-CCAAT----GC-CC------AACCA----------CC-A-T-CGA-GGCA-C-TGTG---C--------TATT--CCA-CGC-TAGT-GCGACC--C----AC-Ctcctcgacagaaacatcagccaatgcccaaccaccatcgaggcactgtgctattccacgctagtgcgacccacc
gi|23 : cttcggtaatgtcccacacaaccgactactaatgaaaAT---CTATGCTA----CAGC-CAAC-TCCAG-TG-GC-A-G-T--CA--CT---CCA---GCT-CCATCGGGA-AAGGGCC--C---AAGTCATTATG--CTATAA----TA-AAAGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-TGC-AAACATCCCGGCG-
gi|24 : G-CGCAG-TGG-AGGTC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-GAC-TC-TG-T-----------------C---TT-------A-----TCTT-TATCTA--TTTT--A-A-C
gi|25 : TATG--CT---A----TA-AAGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-TGC-AAACATCCCGGCG-GT-G-AG--CTTAA--CCTACAA--CCAGCAT---C--A
gi|26 : C-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATAC-T-TA--GGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGAA
gi|27 : CTT----ATTGGGCGTA-CACAACGTG-TTGTAC-TCGATGGTCAGT-CG
gi|3 : cGTCAATTCATC-ATCAGCCC--AC-T-----ACCGTT--T-CATC-AG-GA-AT--CCTC----CGG--GAA-CTGCCCT-AGAT-CC----GC-T-GCTCTTCCTGA-----TT-T--ATCAAA----CG---AC-TGC-ATCATCAGTGTCCATCTACCAC-AG---------------ACTCTT-TG---CTGAT-GA--T---TGTCTG-A-TGTACA-GGA-GGATTA--GACAC-CCA--G-GACCAGG-AGATT--T-GCAGA-GCGA-CGCCTC---AATAA--CTAC--AGCAGTGGTAGGA-CCAGATGACGTGT-TGCA-GTTCAAAC-CCGGACC----------GTGGA-G-TGCTTACGGGTTAA-CAATC--------C-GGAA---TCCCAATATA--CTCGCC-GACT--ACAAAT--TC-AACGGCCAAG---GTCTAAA-AC--AGGTT-GACT-CTGGCGAA------AGTACCT-T-GG--CT-GTCTATT-CA--TAAGAACC--TT-AGCT-G----GGA-T-ACGCCAACATA--GATAA-GA-T-----CACC-A-AAAGA-GGCAAAACT-CCCAC----------------ATCT-GGCC-TTC-T---T-AAG--AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CC------TACCAC---------CCCA-T------GCA-C-AGTG---C--------TAAC--TCA-CTC-TTGT-GCGACC--T----AC-TATC--GA--AAT-ATGCC-TC-C--G-C-G-TTGTGG-A--GTT--AG-C--C--AAAGAAAGGAAGA-GC-ATCAACACA-TTCG--TGCC----ATTC--------A-ACG--TGGGAC-AGC-CAGAATTC--GC-CAT---TGGAG---AT---T--AC-C---AAC-GC---AAC-AGTGTAAACAT---CTATGCTA----CGGA-GAAC-TCCAG-TGCGC-A-G---CCA--CT---CCA---GCT--CGTCAGTATTAGTGTA--G---AA-----------CT---A-----------ATA-G-----T-TTGA-T---CAA-AT-TGTGGGACATCCCGGCG-GT-G-AG--CG--A--CCTACAA--CCAGCAT---CAAAACTAC----GG-ACCAGA---GGCCAC-GCCCTGC-GATT-TCTTGTTAC-----CA-CA--------CACCAAGGAACGA-CAT-G--TTAAC-AAGA--AC-CTCCTTCTTTC--CCCA-G--CAC-----CCGGCTC-TGG-ACA-A-ATTA----A---------GC-TA-C-CAG------GACC-AA------GGAACATGGACAGCT-TT-A---AGACCC----AGCCGTTTA-AG--TGCCCACCAAGCCTGGC--C-A-GA----CAAA--TC-TG-CG----G----TGTTTTTT---TT-------AA---C--TT-TATCTA--TTTTTAA-A-CGT-GCACTGTA--
gi|4 : atCAGTGA-GC--CCTC----AAG--GAAACTGTCCTTAGG--CCTCTCGC-T--CTCTTCCTAA-----TT-T-CAC--AT----TG---ATCTGCCATCAT-AGCCTCT-TAC--CACCAG---------------ACTATTATG---CTGAATG-----------TG-A-TG-ACT-AGA-G-AT-AAAGACACTCCACAA--ACCAGG----CC--T-G-AGC-ACGA-CTA-TCCCAAATTA-CTT-C--AACAGTGAGAGA---C-GATTGC-TAT---CA-GATCAATC-CCAAGATAAG--TTTTAGCGGAAG-GGCTCACAG--TA--CCAAC--------C-GAAAGGATCCCCA-ATG--CTCGCC-GAATTCACAAAAAGCC-A-CGCTAAAATGTTCCTTAACAC--AG-TT-TACT-C-G-CGAAAATCCGA---CTTCC-CGTCCCTGACTATGGCAGTTAAGAACC--GCATACT-GTTAAG-G-TAACAA--ACAGA--GAGAACAA-TTCAGCCACC-ATAAA-A-AGCAAA-C--CT-AC----------------ATCT-GCTCGTTCCTAACTGCTAC-A-A---A-ACATTCAAG-TACATAAGAGC-CC------AACCTA---------CCTA-T-CAA-GCTA-A-ACTG---CCATGAAGATACT--CCA-CTC-GGCT-GC-ACCCTC----AA-CA-C--GA--C-CAATGCT-TCTCA-GTC-G---GT---G--ACC-CAG-C--CT-AGA--AAAGA-GA-AC---TAAT--AACGCGAAGGCCTTCAGTACTTGTTCATA-ACGTCCTAAGCAAGTACACATTTT--ACTCATAAATGG-G---ATAGCT--AC-C---AAC-GCACAAGC-A
gi|5 : taatcattcagtctcttcctttagGTG---CG-------TACT--CCA-GCC-TGGT-GCGACC--CGCTAGC-CATC--GAT-G-T-ATGCCGTC-CAGG-C-G-T-GTGG-GGAGCC-CAGCC--C--AGA--AAGGA-GA-ATAATCA--AGAACTCG-AGGCCTTT-ATTT--------ATGAT--AGGGGC-AGT-CAGA-TTC--GC-CAT---AGGAG---AT---TAAACGC---AACGGCAC-AGT-AGTGT--ACATGCGTTATGCTC----TAG--CAGCACCCAGTTG-GCTA-GTT-CCAGGCTGGGCCGGATGCTCCCGTCGGGAGAAGGGCTTAG---AGGTCATTACAGTCT---AAAACTA--GGGATG-GGAGGCTGTT-A-TTGCTAG-ATAGGT-GGAT-TTCCGGCG-GTGG-AA--CT--AACCTTGCAA--CCAGC-T---C---ATTGCG---GATCCCAGA---GGCCACTTCCCTTG-GACTGTCTTGTTACTGCAACA-CATTATCGCCTACCA-GGACGGA-AGTGG--T--AC-A--A--AC-CTCCTTC--CCGGCCGG-AGCCATTTGGGCCGG-TC-TTGGACA-AGGTCACCGAA---------GG-GG-CGCAG-TGGAAGGCC-AA------GGTCC--GGACAGCT-T--------AACC----AGCTGTCCGGGG--TG-CCGGCCAG-CTG----T-ATGAAGCTC-GACTTCATGCTG----G---GTTATTTTTAAACT-------AA----------ATCTA--TTTT--A-C-TGT-GCACTGTAGGC----ATACGAATGTTCA-CGGATC-ACC-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATACTT-TA--AGTGTCG--TAAGCGC-ACtgaaa
gi|6 : a-TCGATGGTCCAT-CGTC-ATCCGCCCTAACCTCGGTCACTGTT--TTCATC-AGTGA-TC--CCTC----AGG--GAA-CTGTCAT-AGGTTCC----AC-CAGCTCT-CCTAA-----TT-T-CATCAGGTTCTCT---ACC--CCACTGGCAGCGCCA-CCC--CGCCCGTCCCGGGCGCCCTCCACTCTT-TGAGGCTGAGTGAATTCGATGTCTG-A-TGTACA-GGA-GGATCAAG-ACAC-C-ACAGTGACCAGG-A--CT--T-GCAGAAGCGATCA--TC---TATAAA--------GCAGTGGGAG-A-CC-GATGGC-T-TATGCAAGTTCAAGCGCCGGA-TAA---T----GCGAAAG-TGCT-ACGGGTTA--CCAACATGCCGGACAGGAA---TTCC-A-ATG--TTCGCC-GACT--A--------------ACAAGA---TCCTAAACAC--AG-TTCGACT-CTG-CGTA----------CCTCT-GG--CTTGACT--TTC---TAAGA-CC--TT-CGCG-G----G-A-T-ACTC--ACATA--GATAA-GA-T-----CACCAA-AGC-A-AGCAAAGCT-CC-ACTCTCCACTCCACTGAACTCTGGGCT-TTCCC---T-CGGC-AG----A-ACATC--AG-CCGATC---GCGAT------AAC--A---------CC-A-TGCAA--GCA-C-CG-GTCCC--------TACT--CCATCGCTTGTT-GCGA-C--T----ACTCATC--GATGT-T-ATG----C-CA-G-C-GTT-GTGGAG--GCCGCAG-C--C--AAA--
gi|7 : TTGGGCGCG-CACAACGTG-TTGTAC-TCGATGTTCAAT-CGTC-ATCAG-CC--A-CT-----ACCGTT--T-CAT-CAG-GAGGC--CCTC----GGGNNNNN-NNNNNNN-NNN--NN----NN-N-NNNNNNNNNNN-----NN-N-NNNNNNN----NN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNNNN---------------NNNNNN-NN---NNNNNNNN--N---NNNCTG-A-TGTACA-GGAGG-ATCAA-GACA--CCACAG-GGCCAGG-AG-
gi|7 : AAG---TCCTAAACAC--TG-TT-GACT-CTG-CAAA------G---TATCTTGG--CTTGACTATT-CA--TAAGAACT--TT-CGCT-G----GGA-T-ACGC--ACATA--GATAA-GA-T-----CACC-A-AGA-A-GACAAA-CT-CC-AC-----------------TCT-GGCC-TTCCT-----CGGC-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CC------AACCA----------CC-A-T-CAA-GGCA-C-TGTG---C--------TACT--CCA-CGC-TGGT-GCAACC--T----AC-CATC--GA--A-T-ATGCT-TC-CA-G-C-G-T-GTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtcctaaacactgttgactctgcaaagtatcttggcttgactattcataagaactttcgctgggatacgcacatagataagatcaccaagaagacaaactccactctggccttcctcggcagaaacatcagccgatgcccaaccaccatcaaggcactgtgctactccacgctggtgcaacctaccatcgaatatgcttccagcgtgtg
gi|8 : ttgggcgcgcacaacgtgttgtactcgatgttcaatcgtcatcagccactaccgtttcatcaggaggccctcgggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgatgtacaggaggatcaagacaccacagggccaggagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTGACTTTTCAAAGGCCTTTAACAAGGTCCCAC-ACAT-TCGACTG---CTGATAAAGCT-ACATCATTATG-AC---ATCC-GAGGACGCATCCAT-GACA-AGATAACAAG-TT----ACAGGGTGTA-CAGAACGTGTTTGTCCTTTGATAGTCAAT-CATT-GCCCG-CT--ACC------ATCATT--T-CATCCA--GA-G-----TC----AGG--AAA-ACAT-TT-A-----------------TCTTCTTGA-----TG-TACAT-AAA----TGAGAAATTGTC-TCATCAAC----------CACTCG---------------ACTATT-TG---CAAGACGA--C---TGTCTT-A-TGCACA-G--------AAGGAC------CAG-GTC-----AT-CT--T-ATAGG-GATA-AC--TC---AAAAAGCTC-C--AACAGTG
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gi|9 : ttttgacttttcaaaggcctttaacaaggtcccacacattcgactgctgataaagctacatcattatgacatccgaggacgcatccatgacaagataacaagttacagggtgtacagaacgtgtttgtcctttgatagtcaatcattgcccgctaccatcatttcatccagagtcaggaaaacatttatcttcttgatgtacataaatgagaaattgtctcatcaaccactcgactatttgcaagacgactgtcttatgcacagaaggaccaggtcatcttatagggataactcaaaaagctccaacagtgattaatggagaatcaagtgcacaaaagagtccccactacttgttggctagcttatccatggccatgtactttttatgatcaactgtgttaaat---AT---T--AC-T---AAC-GCACAAGT-AGTGTAA-CAT---CTATGCTA----CAG--CAAC-TCCAG-TG-GC-A-G-T-C-A--CT---CCA---GCT-CCGTCGGGA-AAGGGCC--C---AAGTCATTATG--CT---A----TA-GAGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-AGT-GGACATCCCGGTG-GT-G-AG--CT--A--CCTACAA--CCAGCAT---C---ACTGCG---GG--CCAGA---GGCCAC-TCCCTGC-AATT-TCTTGTT-C-----CA-CA--------CACCA-GGACGGA-AGT-G--T--ACAA--A--AT-CTCCTTCCTCC--CCAA-AGCCAT-----CCGGCCC-TGGAACA-A-ATTACC--AG--------GG-GG-TGCAG-TGG-AGGGC-AA-------GACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTGTACAT-A-GA----C-GAC-TC-TG-T-----G---TTATTTTT-------------------TTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CTT-GCACTGTA--C----A--TAGATGTTCA-C----T-ACC-CTCAC-ACAGAGTGTGATA-ATAC-T-TATTAGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAG
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Reference ( family-2330 ) : NNNNTTTTGACTTCTCNAAGGCCTTCGATAANGTCCCAC-ACAA-CCGACTA---CTGATAAAACTGGCATCANCATGTACGCGATCCAGGGGNCNCACCCATAGACGTGGATNNCGAGCTT----ATTGGGCGCA-CACAACGTG-TTGTAC-TCGATGGTCAAT-CGTC-GTCNGCCC--ACCT-----ACCGTT--T-CATCCAG-GA-GC--CCTC----AGG--GAA-CTGTCCT-AGG--CC----GC-T-GCTCTTCCTAA-----TT-T-CATCAAN----CG---ACCTGCCATCATCAGCGTCN-TCT--CACCAG---------------ACTNTT-TG---CTGANCGA--T---TGTCTG-A-TGTACA-GGA-G-ATCAAGGACAC-CCACAG-GACCAGG-AG-CT--T-GCAGA-GCGA-CN--TC---AATAAACTTAC--AGCAGTGGGAGGA-CC-GATGGC-TGTATGCA-GTTCAA-C-CCGGAATAAG--T----GCGGAAG-TGCT-ACGGGTTAA-CCAAC--------C-GAAA---TCCCCA-ATG--TTCGCC-GAAT--ACAAAA--TC-A-CGGCAAAG---TCCTAAACAC--AG-TT-GACT-CTG-CGAA------A---CCTCT-GG--CTTGACTATTTCA--TAAGAACC--TT-CGCT-G----G-A-T-ACGC--ACATA--GATAA-GA-T-----CACCA-A-GA-A-GGCAAA--------CT-CC-A-C-TCT-----------GGCC-TTCCT---T-CGGC-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CC------AACCAA---------CC-A-T-CAA-GGCA-C-NGTG---C--------TACT--CCA-CGC-TGGT-GCGACC--CAC----CATC--GA--A-T-ATGCC-TC-CAG-C-G-T-GTGG-GG--CC-CAGC--C--AAA--AAGGA-GA-ACA-TCAATAAAACTCG-AGGCC---GTNCA-GCGCGGGGCAGCCAGA-TTC--GCCATTGGAG---ATT--AC-C---AAC-GCACAAGC-AGTGTAAACAT---CTATGCTA----CAG--CAAC-TCCAG-TG-GC-A-G-T-CCA--CT---CCA---GCT-CCGTCGGGA-AAGGGCC--G---AAGTCATTATG--CT---A----TA-CGGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-NGT-GGACATCCCGGCG-GT-G-AG--CT--A--CCTACAA--CCAGCAT---C--AACTGCG---GG-ACCAGA----GGCCAC-TCCCTGC-GATT-TCTTGTTAC-----CA-CA--------CACCAGGGACGGA-AGT-G--T--AC-A--A--AC-CTCCTTCTTCC--CCCA-AGCCAT-----CCGGCTC-TGGAACA-AGATTACC--A---------GG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------GGACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-GACTC--TG-TG----G----TTTTTTTTT-T-------AA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--C----AT-TAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGAAGG
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gi|11 : -AGT-G--T--AC-A--AG-AC-CTCCTTCTTTC--CCCA-AGCTAT-----CTGGCTC-TGGAACA-AG-TAACC--A---------GGAGG-CGCAG-TGG-AGGCC-AAGACCCTGGACCCTGGAC-CCT-GG-ACCCAGAACC----A-CTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-TTG----T-A-GA----G-GACTC--TG----------------TTTTT-TAAAA---AA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-ACCGT-GCACTGTA--C----A--TAAATGTTCATT----C-ACCTCTCAC-ACAGCGTGTGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--T-A-TGC-ACTAAACCGGAAGAAG
gi|12 : TTGACTATT-CA--TAAGTACT--TT--GCT-G----G-AAT-ATGC--ACATA--GAGAA--A-T-----CACCA-A-GA-A-GGTAAA--------CT-CC-A-C-TAT-----------GGCC-TTC-T---T-CGGT-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CC----------AA---------CC--------------------------------------------C-TGGT-G-GACC--TAC----CAAC--AA--A-T-ATGCC-TC-CAG-C-G-T-GTGT-GG--CC-TAAC--C---AA--TAGGA-GA-ACA-TCAATAAAA-TCG-A-GCC---GTACA-GCGTAGGGGAACCAAA-TCC--GCGACTGGAG---ATT--AC-CAAAAAC-GCA
gi|13 : tC-A-CGGCAAAG---TCCTAAACAC--AG-TT-GACG-CTG-CAAAGT----A---CCT-T-GG--CTTGACTATT-CA--TAAGAACC--TT-CGCTAG----G-A-T-GCGC--ACATA--AATAA-GA-T-----CAC----------------------------------TCT-----------GACC-TTCCT-----CAGC-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CC------AACCA----------CC-A-C-CAA-GGCA-T-CGTG---C--------TACT--CCA-CGC-TGGT-GCGACC--CAC----CATC--GA--A-T-ATATT-TC-CAG-C-G-T-GTGG-AA--CC-CAGC--C--AAA--AAGGA-GA-ATA-TCAat
gi|14 : -AGT-G--T--AC-A--AT-AC-CTTCTTCTTCC--CCCA--GCAAT---------------AAATACAGATTACC--A---------G-----------TTG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-TACTC--TG-TG--------------TTTT-TAAA----AA---CTTTT-TATCTA--TTTA--A-A-CGT-GCACTGTA--C----A--TAGATGTTCA-T----C-ACT-ATCAC-ACAGCGTGCGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGA
gi|15 : CCAGG-ACGAC-GGT-G--T--AC-A--AGGAC-CCC----TTCC--CCCA-AG--GT-----C--------AGAACA-AG-TTACC--A---------GG-GGGCGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACCAGCTAGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-Ccg
gi|15 : TTTT-A-------AA---CTT----ATCTA--CTTT--A-A-CGT-GCACCGTA--C----A--TAGATGTTTA-C----C-cttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgttttaaacttatctactttaacgtgcaccgtacatagatgtttacc
gi|16 : ccaggacgacggtgtacaaggaccccttcccccaaggtcagaacaagttaccagggggcgcagtggaggccaagaccctggacagctttaagaaccagctagctgtccggtgccgcccagccttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgGGAACA-AG-TTACT--ATAGTAGCTGGG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGTT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-TTGTCGAG-CTG----T-A-GA----C-GACTC--TG-TGAGGAG---------TTTT-TAAAAAAAAA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--C----A--CAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-AGAGA--GCGATA-ATA-----A--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGA
gi|17 : G-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ATCCTGG-CAGCT-TTCA---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----TGA-GA----C-GACTC--TG-CGA---G----TTGTTTTTT-T-------AAAACTTTTT-TATCTC--TTTT--A-ACCGTGGCACTGTA--C-----T-TAGATGTTCA-C----CAACC-CTCAC-ACAGTGTGCG-TA-ATAC-T-TA--A-TG--GTATAA-TGCAACTAAACCGAAA
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gi|8 : ttgggcgcgcacaacgtgttgtactcgatgttcaatcgtcatcagccactaccgtttcatcaggaggccctcgggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgatgtacaggaggatcaagacaccacagggccaggagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTGACTTTTCAAAGGCCTTTAACAAGGTCCCAC-ACAT-TCGACTG---CTGATAAAGCT-ACATCATTATG-AC---ATCC-GAGGACGCATCCAT-GACA-AGATAACAAG-TT----ACAGGGTGTA-CAGAACGTGTTTGTCCTTTGATAGTCAAT-CATT-GCCCG-CT--ACC------ATCATT--T-CATCCA--GA-G-----TC----AGG--AAA-ACAT-TT-A-----------------TCTTCTTGA-----TG-TACAT-AAA----TGAGAAATTGTC-TCATCAAC----------CACTCG---------------ACTATT-TG---CAAGACGA--C---TGTCTT-A-TGCACA-G--------AAGGAC------CAG-GTC-----AT-CT--T-ATAGG-GATA-AC--TC---AAAAAGCTC-C--AACAGTG
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gi|14 : -AGT-G--T--AC-A--AT-AC-CTTCTTCTTCC--CCCA--GCAAT---------------AAATACAGATTACC--A---------G-----------TTG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-TACTC--TG-TG--------------TTTT-TAAA----AA---CTTTT-TATCTA--TTTA--A-A-CGT-GCACTGTA--C----A--TAGATGTTCA-T----C-ACT-ATCAC-ACAGCGTGCGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGA
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gi|15 : TTTT-A-------AA---CTT----ATCTA--CTTT--A-A-CGT-GCACCGTA--C----A--TAGATGTTTA-C----C-cttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgttttaaacttatctactttaacgtgcaccgtacatagatgtttacc
gi|16 : ccaggacgacggtgtacaaggaccccttcccccaaggtcagaacaagttaccagggggcgcagtggaggccaagaccctggacagctttaagaaccagctagctgtccggtgccgcccagccttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgGGAACA-AG-TTACT--ATAGTAGCTGGG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGTT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-TTGTCGAG-CTG----T-A-GA----C-GACTC--TG-TGAGGAG---------TTTT-TAAAAAAAAA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--C----A--CAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-AGAGA--GCGATA-ATA-----A--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGA
gi|17 : G-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ATCCTGG-CAGCT-TTCA---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----TGA-GA----C-GACTC--TG-CGA---G----TTGTTTTTT-T-------AAAACTTTTT-TATCTC--TTTT--A-ACCGTGGCACTGTA--C-----T-TAGATGTTCA-C----CAACC-CTCAC-ACAGTGTGCG-TA-ATAC-T-TA--A-TG--GTATAA-TGCAACTAAACCGAAA
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gi|23 : cttcggtaatgtcccacacaaccgactactaatgaaaAT---CTATGCTA----CAGC-CAAC-TCCAG-TG-GC-A-G-T--CA--CT---CCA---GCT-CCATCGGGA-AAGGGCC--C---AAGTCATTATG--CTATAA----TA-AAAGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-TGC-AAACATCCCGGCG-
gi|24 : G-CGCAG-TGG-AGGTC-AA------G-ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-GACTC--TG------------------TCT-T-------A-----TCTT-TATCTA--TTTT--A-A-C
gi|25 : TATG--CT---A----TA-AAGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-TGC-AAACATCCCGGCG-GT-G-AG--CTTAA--CCTACAA--CCAGCAT---C--A
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gi|27 : CTT----ATTGGGCGTA-CACAACGTG-TTGTAC-TCGATGGTCAGT-CG
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gi|15 : TTTT-A-------AA---CTT----ATCTA--CTTT--A-A-CGT-GCACCGTA--C----A--TAGATGTTTA-C----C-cttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgttttaaacttatctactttaacgtgcaccgtacatagatgtttacc
gi|16 : ccaggacgacggtgtacaaggaccccttcccccaaggtcagaacaagttaccagggggcgcagtggaggccaagaccctggacagctttaagaaccagctagctgtccggtgccgcccagccttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgGGAACA-AG-TTACT--ATAGTAGCTGGG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------G-ACCCTGGACAGTT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-TTGTCGAG-CTG----T-A-GA----C-GACTC--TG-TGAGGAG---------TTTT-TAAAAAAAAA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--C----A--CAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-AGAGA--GCGATA-ATA-----A--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGA
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gi|4 : atCAGTGA-GC--CCTC----AAG--GAAACTGTCCTTAGG--CCTCTCGC-T--CTCTTCCTAA-----TT-T-CAC--AT----TG---ATCTGCCATCAT-AGCCTCT-TAC--CACCAG---------------ACTATTATG---CTGAATG-----------TG-A-TG-ACT-AGA-G-AT-AAAGACACTCCACAA--ACCAGG----CC--T-G-AGC-ACGA-CTA-TCCCAAATTA-CTT-C--AACAGTGAGAGA---C-GATTGC-TAT---CA-GATCAATC-CCAAGATAAG--TTTTAGCGGAAG-GGCTCACAG--TA--CCAAC--------C-GAAAGGATCCCCA-ATG--CTCGCC-GAATTCACAAAAAGCC-A-CGCTAAAATGTTCCTTAACAC--AG-TT-TACT-C-G-CGAAAATCCGA---CTTCC-CGTCCCTGACTATGGCAGTTAAGAACC--GCATACT-GTTAAG-G-TAACAA--ACAGA--GAGAACAA-TTCAGCCACCATA-AA-A-AGCAAA--------C--CT-A-CATCT-----------GCTCGTTCCTAACTGCTAC-A-A---A-ACATTCAAG-TACATAAGAGC-CCA------ACCTA---------CCTA-T-CAA-GCTA-A-ACTG---CCATGAAGATACT--CCA-CTC-GGCT-GC-ACCCTCAA----CA-C--GA--C-CAATGCT-TCTCAGTC-G---GT---GA--CC-CAGC--CT-AGA--AAAGA-GA-AC---TAAT--AACGCGAAGGCC----TTCA-G
gi|4 : taatcattcagtctcttcctttagT--AC-C---AAC-GCACAAGC-Atacttgttcataacgtcctaagcaagtacacattttactcataaatgggatagctaccaacgcacaagcatgaaa
gi|5 : taatcattcagtctcttcctttagcagtgagccctcaaggaaactgtccttaggcctctcgctctcttcctaatttcacattgatctgccatcatagcctcttaccaccagactattatgctgaatgtgatgactagagataaagacactccacaaaccaggcctgagcacgactatcccaaattacttcaacagtgagagacgattgctatcagatcaatcccaagataagttttagcggaagggctcacagtaccaaccgaaaggatccccaatgctcgccgaattcacaaaaagccacgctaaaatgttccttaacacagtttactcgcgaaaatccgacttcccgtccctgactatggcagttaagaaccgcatactgttaaggtaacaaacagagagaacaattcagccaccataaaaagcaaacctacatctgctcgttcctaactgctacaaaacattcaagtacataagagcccaacctacctatcaagctaaactgccatgaagatactccactcggctgcaccctcaacacgaccaatgcttctcagtcggtgacccagcctagaaaagagaactaataacgcgaaggccttcagtacttgttcataacgtcctaagcaagtacacattttactcataaatgggatagcGTG---CG-------TACT--CCA-GCC-TGGT-GCGACC--CGCTAGCCATC--GAT-G-T-ATGCCGTC-CAGGC-G-T-GTGG-GGAGCC-CAGC--CC-AGA--AAGGA-GA-ATAATCAA--GAACTCG-AGGCCTTTATTTATGATAGGGGCAGTCAGA-TTC--GCCATAGGAG---ATTAAACGC---AACGGCAC-AGT-AGTGT--ACATGCGTTATGCTC----TAG--CAGCACCCAGTTG-GCTA-GTT-CCAGGCTGGGCCGGATGCTCCCGTCGGGAGAAGGGCTTAG---AGGTCATTACAGTCT---AAAACTA--GGGATG-GGAGGCTGTT-A-TTGCTAG-ATAGGT-GGAT-TTCCGGCG-GTGG-AA--CT--AACCTTGCAA--CCAGC-T---C---ATTGCG---GATCCCAGA---GGCCACTTCCCTTG-GACTGTCTTGTTACTGCAACA-CATTATCGCCTACCA-GGACGGA-AGTGG--T--AC-A--A--AC-CTCCTTC--CCGGCCGG-AGCCATTTGGGCCGG-TC-TTGGACA-AGGTCACCGAA---------GG-GG-CGCAG-TGGAAGGCC-AA------GGTCC--GGACAGCT-T--------AACC----AGCTGTCCGGGG--TG-CCGGCCAG-CTG----T-ATGAAGCTC-GACTTCATGCTG----G----GTTATTTTT-A-------AA---C--TA-AATCTA--TTTT--A-C-TGT-GCACTGTAGGC----ATACGAATGTTCA-CGGATC-ACC-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATACTT-TA--AGTGTCG--TAAGCGC-ACtgaaa
gi|6 : a-TCGATGGTCCAT-CGTC-ATCCGCCCTAACCTCGGTCACTGTT--TTCATC-AGTGA-TC--CCTC----AGG--GAA-CTGTCAT-AGGTTCC----AC-CAGCTCT-CCTAA-----TT-T-CATCAGGTTCTCT---ACC--CCACTGGCAGCGCCA-CCC--CGCCCGTCCCGGGCGCCCTCCACTCTT-TGAGGCTGAGTGAATTCGATGTCTG-A-TGTACA-GGA-GGATCAAG-ACAC-C-ACAGTGACCAGG-A--CT--T-GCAGAAGCGATCA--TC---TATAAA--------GCAGTGGGAG-A-CC-GATGGC-T-TATGCAAGTTCAAGCGCCGGA-TAA---T----GCGAAAG-TGCT-ACGGGTTA--CCAACATGCCGGACAGGAA---TTCC-A-ATG--TTCGCC-GACT--A--------------ACAAGA---TCCTAAACAC--AG-TTCGACT-CTG-CGTA----------CCTCT-GG--CTTGACT--TTC---TAAGA-CC--TT-CGCG-G----G-A-T-ACTC--ACATA--GATAA-GA-T-----CACCA-AAGC-A-AGCAAAGCTCCACTCT-CC-A-C-TCCACTGAACTCTGGGCT-TTCCC---T-CGGC-AG----A-ACATC--AG-CCGATC---GCGATA------AC--A---------CC-A-TGCAA--GCA-C-CG-GTCCC--------TACT--CCATCGCTTGTT-GCGA-C--TACT---CATC--GATGT-T-ATG----C-CAG-C-GTT-GTGGAGG--CCGCAGC--C--AAA--
gi|7 : TTGGGCGCG-CACAACGTG-TTGTAC-TCGATGTTCAAT-CGTC-ATCAG-CC--A-CT-----ACCGTT--T-CAT-CAG-GAGGC--CCTC----GGGNNNNN-NNNNNNN-NNN--NN----NN-N-NNNNNNNNNNN-----NN-N-NNNNNNN----NN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNNNN---------------NNNNNN-NN---NNNNNNNN--N---NNNCTG-A-TGTACA-GGAGG-ATCAA-GACA--CCACAG-GGCCAGG-AG-
gi|7 : AAG---TCCTAAACAC--TG-TT-GACT-CTG-CAAA------G---TATCTTGG--CTTGACTATT-CA--TAAGAACT--TT-CGCT-G----GGA-T-ACGC--ACATA--GATAA-GA-T-----CACCA-A-GA-A-GACAAA--------CT-CC-A-C-TCT-----------GGCC-TTCCT-----CGGC-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CCA------ACCA----------CC-A-T-CAA-GGCA-C-TGTG---C--------TACT--CCA-CGC-TGGT-GCAACC--TAC----CATC--GA--A-T-ATGCT-TC-CAG-C-G-T-GTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtcctaaacactgttgactctgcaaagtatcttggcttgactattcataagaactttcgctgggatacgcacatagataagatcaccaagaagacaaactccactctggccttcctcggcagaaacatcagccgatgcccaaccaccatcaaggcactgtgctactccacgctggtgcaacctaccatcgaatatgcttccagcgtgtg
gi|8 : ttgggcgcgcacaacgtgttgtactcgatgttcaatcgtcatcagccactaccgtttcatcaggaggccctcgggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgatgtacaggaggatcaagacaccacagggccaggagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTGACTTTTCAAAGGCCTTTAACAAGGTCCCAC-ACAT-TCGACTG---CTGATAAAGCT-ACATCATTATG-AC---ATCC-GAGGACGCATCCAT-GACA-AGATAACAAG-TT----ACAGGGTGTA-CAGAACGTGTTTGTCCTTTGATAGTCAAT-CATT-GCCCG-CT--ACC------ATCATT--T-CATCCA--GA-G-----TC----AGG--AAA-ACAT-TT-A-----------------TCTTCTTGA-----TG-TACAT-AAA----TGAGAAATTGTC-TCATCAAC----------CACTCG---------------ACTATT-TG---CAAGACGA--C---TGTCTT-A-TGCACA-G--------AAGGAC------CAG-GTC-----AT-CT--T-ATAGG-GATA-AC--TC---AAAAAGCTC-C--AACAGTG
gi|8 : ------A---CCTCC-A---CTTCACC-TTTCA--CAGGAGCA--TC-GGCT-GA---G-A-T-ATGA--ACATA--GACGA-TA-T-----CACCA-A-GA-A-GGCAAA--------CG-CC-A-C-TTT-----------attaatggagaatcaagtgcacaaaagagtccccactacttgttggctagcttatccatggccatgtactttttatgatcaactgtgttaaatacctccacttcacctttcacaggagcatcggctgagatatgaacatagacgatatcaccaagaaggcaaacgccacttttcctcc
gi|9 : ttttgacttttcaaaggcctttaacaaggtcccacacattcgactgctgataaagctacatcattatgacatccgaggacgcatccatgacaagataacaagttacagggtgtacagaacgtgtttgtcctttgatagtcaatcattgcccgctaccatcatttcatccagagtcaggaaaacatttatcttcttgatgtacataaatgagaaattgtctcatcaaccactcgactatttgcaagacgactgtcttatgcacagaaggaccaggtcatcttatagggataactcaaaaagctccaacagtgattaatggagaatcaagtgcacaaaagagtccccactacttgttggctagcttatccatggccatgtactttttatgatcaactgtgttaaat---ATT--AC-T---AAC-GCACAAGT-AGTGTAA-CAT---CTATGCTA----CAG--CAAC-TCCAG-TG-GC-A-G-T-C-A--CT---CCA---GCT-CCGTCGGGA-AAGGGCC--C---AAGTCATTATG--CT---A----TA-GAGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-AGT-GGACATCCCGGTG-GT-G-AG--CT--A--CCTACAA--CCAGCAT---C---ACTGCG---GG--CCAGA---GGCCAC-TCCCTGC-AATT-TCTTGTT-C-----CA-CA--------CACCA-GGACGGA-AGT-G--T--ACAA--A--AT-CTCCTTCCTCC--CCAA-AGCCAT-----CCGGCCC-TGGAACA-A-ATTACC--AG--------GG-GG-TGCAG-TGG-AGGGC-AA-------GACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTGTACAT-A-GA----C-GACTC--TG-T-----G----TTATTTTT----------------TTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CTT-GCACTGTA--C----A--TAGATGTTCA-C----T-ACC-CTCAC-ACAGAGTGTGATA-ATAC-T-TATTAGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGtcctcc
blockSeqs : A T . . . . T . . . A G . . AA C . . T TT T . AGC TAACCTCGGTC AT T CA T GGC GTCA NN A C T A CCTCTCGCT AT A A C GTTCTCT C A G CATCTAC C TCCCGGGCGCCCTCC C A AGG GTGAATTCGA G . T G G A T CTCC T AGA CT . C A T GCC CCA AGTACCT GA A TTTA A A G G A GTTTTA G . T G AA ATGCCGGACA GGA C T GGC C TCACAAAAAGCCA A TGT CA G T . G AATCCGA T T TC A T AGT CT AT A TTAAG A A CA TC CA A TCAGC T A G A GCTCCACT T C . A ACTGAACTCTG G AACTG CC TAA T CA . AAGA G CAGAAA AAGATATTTG CAT A TCA CCATGAAGA TG T G T . CTC TAGC AA TGTT G T T . TT A AG GC . CA GA A T A TAA C AAG TTTA A T GT A A . C . AA G AAA G A C AAA GCG GAAA A C T C T . TTC GG GGG GAT T T GCGG G CAGT ATA AAACTA A GAGGC G G . TGC G AG G A A G T GC TA AC AC CAAA ATGTAGA TCG T . G ACTGCAACACATTATCGCC G G C G . TA A AGG G GG C TTGGG C . C GA GA TAGTAGCTG A G A A . GACCCTGG A C CCC AGCT GG AA C C TACA G T AGCT . CA TGAGGAGTTTTTAAAAAAAAA . . TA . C G GG TAGTATA T GGAT A T A . TG TT TC TA G A
blockSeqs : G . . . . . . . T . . CGC ACT . . CC T TC . . . T . G TTCCACCAG . . . C ATGAGA C A G ATCTGC C . C . . NNNNN . . . . G T A CCC . GG . . C . . TA . ACTAC GA . GTGT . T . G C GT G . C G A CG . C . ACT . TCAAAATCCA C . . . C . . GTATA C . T A G A . C . GG . . . . G . . . . . . A A . . A . . T T . . . . C . . A TAT . TC TCCC . . G . . T T . AAT . . G . TT . . T . T . . . . TAA T AG G A . GT G . . T . . . T . A . AA . . C A . . . . TTC . . . C G TAG G TG . ATAG . . . . . . . A . C C . . . . . . ACA GGATC . . . G ACCACA G G . . . . . GAA . . . . C . . GG . G A . . . . AG . . . . A . . . GC . . . . . CGAGTTGTTTTTTTAAAAC . . . . C . . ATA . . . . . . TT . . . . .
blockSeqs : . . T . . AG ACT . . C . AT . . . T . G CCGCATG . . . C ACA C A C TTAC C . A . . ACGAC . . . . . C G CC . AG . . C . . C . GCTCC A . TGA . G . A A GT A . . G A C . A . GCT . ACAAATTCAA C . . . . . . AGTA C . . A T A . C . GG . . . . A . . . . . . A T . . . . . A C . . . . . . . C ATG . CT CG . . G . . C . . CCA . . . . TT . . C . C . . . . CAC C AG G T . TA G . . T . . . . . A . A . . A . . . . . TC . . . . . C G AT . TAAC . . . . . . . A . C . . . . . . . CA GGA . . . . ACCACA A G . . . . . AGA . . . . C . . G . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . TGGTAACTTTTTTAAAAC . . . . . . . AT . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : T . . CG ACC . . C . GC . . . N . G TCCGCTG . . . N ACG N N G ACCC N . C . . TGAT . . . . . C G CC . AT . . T . . C . CTAC A . TAT . . . G . T . . . . A C . C . GTT . A C . . . . . . GTA C . . A T A . A . AG . . . . G . . . . . . . T . . . . . T C . . . . . . . C AC . CT C . . T . . C . . TGT . . . . T . . C . . . . . . T C A A T . C G . . T . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . A G AA . TAC . . . . . . . T . C . . . . . . . C GGA . . . . CCGCA . G . . . . . AG . . . . C . . G . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . TGGGTTTTTTTTAAAA . . . . . . . A . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . C . TC . . . T . N NNNNNN . . . . TTG T . N NNNN T . N . . TCA . . . . . . . CC . A . . . . . A . CTTC A . TTA . . . . . . . . . . A . . . . T . . A . . . . . . G C . . A . A . A . G . . . . G . . . . . . . T . . . . . T C . . . . . . . A AT . CA C . . T . . T . . AT . . . . T . . C . . . . . . G . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C G TG . TAA . . . . . . . T . C . . . . . . . C GGG . . . . CCACA . . . . . . . AG . . . . C . . G . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . CTGGGTTATTTTTAAA . . . . . . . A . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . NNN . . . . . . A . . ATG . . . . . . . . . . . C . A A . . . . . . A . . . A . A . C . G . . . . G . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . A AT . AA C . . C . . C . . AT . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TG . TAA . . . . . . . T . T . . . . . . . C GA . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . CGGTGTTTTTTTTAA . . . . . . . A . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . G . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . AT . CC C . . G . . T . . AT . . . . T . . . . . . . C . TG . TAG . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TGTTTTTTATCTA . . . . . . . A . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . G . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CT C . . G . . T . . AT . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TTTTTTAAAAAA . . . . . . . T . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TGTTTTTAAAAA . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TGTTATTTTT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TCTTA . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqCons : T* AG* ACT******** C* NC*** CCCGCTG******* ***** CTNC*** *** NCGAC***** CC** AG** ACTNC*** A** TNA** GT****** A** GCT** CAAACA********* ** T* *** ** AT*** CN** AT**** ** AG* ** *** AA* A* TC** CA***** GGA***** ** AG*** G* G******* TGGGTTTTTTTTAAAA******************* ** A****** T**
originalCons : NNNNTTTTGACTTCTCNAAGGCCTTCGATAANGTCCCAC-ACAA-CCGACTA---CTGATAAAACTGGCATCANCATGTACGCGATCCAGGGGNCNCACCCATAGACGTGGATNNCGAGCTT----ATTGGGCGCA-CACAACGTG-TTGTAC-TCGATGGTCAAT-CGTC-GTCAGCCC--ACCT-----ACCGTT--T-CATCCAG-GA-GC--CCTC----AGG--GAA-CTGTCCT-AGG--CC----GC-T-GCTCTTCCTAA-----TT-T-CATCAAN----CG---ACCTGCCATCATCAGCGTCN-TCT--CACCAG---------------ACTNTT-TG---CTGANCGA--T---TGTCTG-A-TGTACA-GGA-G-ATCAAGGACAC-CCACAG-GACCAGG-AG-CT--T-GCAGA-GCGA-CN--TC---AATAAACTTAC--AGCAGTGGGAGGA-CC-GATGGC-TGTATGCA-GTTCAA-C-CCGGAATAAG--T----GCGGAAG-TGCT-ACGGGTTAA-CCAAC--------C-GAAA---TCCCCA-ATG--TTCGCC-GAAT--ACAAAA--TC-A-CGGCAAAG---TCCTAAACAC--AG-TT-GACT-CTG-CGAA------A---CCTCT-GG--CTTGACTATTTCA--TAAGAACC--TT-CGCT-G----G-A-T-ACGC--ACATA--GATAA-GA-T-----CACCA-A-GA-A-GGCAAA--------CT-CC-A-C-TCT-----------GGCC-TTCCT---T-CGGC-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CCA------ACCAA---------CC-A-T-CAA-GGCA-C-NGTG---C--------TACT--CCA-CGC-TGGT-GCGACC--CAC----CATC--GA--A-T-ATGCC-TC-CAG-C-G-T-GTGG-GG--CC-CAGC--C--AAA--AAGGA-GA-ACA-TCAATAAAACTCG-AGGCC---GTNCA-GCGCGGGGCAGCCAGA-TTC--GCCATTGGAG---ATT--AC-C---AAC-GCACAAGC-AGTGTAAACAT---CTATGCTA----CAG--CAAC-TCCAG-TG-GC-A-G-T-CCA--CT---CCA---GCT-CCGTCGGGA-AAGGGCC--G---AAGTCATTATG--CT---A----TA-CGGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-NGT-GGACATCCCGGCG-GT-G-AG--CT--A--CCTACAA--CCAGCAT---C--AACTGCG---GG-ACCAGA---GGCCAC-TCCCTGC-GATT-TCTTGTTAC-----CA-CA--------CACCAGGGACGGA-AGT-G--T--AC-A--A--AC-CTCCTTCTTCC--CCCA-AGCCAT-----CCGGCTC-TGGAACA-AGATTACC--A---------GG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AA------GGACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-GACTC--TG-TG----G----TTTTTTTTT-T-------AA---CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--C----AT-TAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATAC-T-TA--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGAAGG
finalCons : NNNNTTTTGACTTCTCNAAGGCCTTCGATAANGTCCCAC-ACAA-CCGACTA---CTGATAAAACTGGCATCANCATGTACGCGATCCAGGGGNCNCACCCATAGACGTGGATNNCGAGCTT----ATTGGGCGCA-CACAACGTG-TTGTACT-CGATGGTCAAT-CGTC-GTCAG-CCACT--------ACCGTT--T-CATC-AG-GANC---CCTC----AGG--GAA-CTGTCCT-AGGCCCGCTG-------CTCTTCCTAA-----TT-T-CATCAAN----CG---ACCTGCCATCATCAGCGTCCTNC---CACCAG---------------ACTNTT-TG---CTGANCGAC-----TGTCTG-A-TGTACA-GGA-G-ATCAAGGACACC--ACAG-GACCAGGAG--CT--T-GCAGA-GCGA-CN--TC---AATAAACTNC---AGCAGTGGGAGA--CC-GATGGCTNA--TGCA-GTTCAA-C-CCGGAATAAGT------GCGGAAG-TGCT-ACGGGTTA--CCAAC--------C-GAAA---TCCCCA-ATGCT--CGCC-GAATCAAACA---------CGGCAAAG---TCCTAAACAC--AG-TT-GACT-CTG-CGAA------A---CCTCT-GG--CTTGACTATTTCA--TAAGAACC--TT-CGCT-G----G-A-T-ACGC--ACATA--GATAA-GA-T-----CACCA-A-GA-A-GGCAAA--------CT-CC-A-C-TCT-----------GGCC-TTCCT---T-CGGC-AGA---A-ACATC--AG-CCGAT----GC-CCA------ACCAA---------CCAT---CAA-GGCACN--GTG---C--------TACT--CCA-CGC-TGGT-GCGACC--CAC----CATC--GAAT----ATGCC-TC-CAG-C-G-T-GTGG-GG--CC-CAGC--C--AAA--AAGGA-GA-ACA-TCAATAAAACTCGAG-GCC---GTNCA-GCGCGGGGCAGCCAGA-TTC--GCCATTGGAG---ATT--AC-C---AAC-GCACAAGC-AGTGTAA-CAT---CTATGCTA----CAGA-CAAC-TCCAG-TG-GC-A-GTC--CA--CT---CCA---GCT-CCGTCGGGA-AAGGGCC--G---AAGTCATTATG--CT---A----TA-CGGGATA-G-----T-TT-A-T---CAG-AT-NGT-GGACATCCCGGCG-GT-G-AG--CT--A--CCTACAA--CCAGCATCA-----ACTGCGGA-----CCAGA---GGCCAC-TCCCTGC-GATT-TCTTGTTAC-----CA-CA--------CACCAGGGACGGA-AGT-G--T--AC-AAG---AC-CTCCTTCTTCC--CCCA-AGCCAT-----CCGGCTC-TGGAACA-AG-TTACC--A---------GG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC-AAG-------ACCCTGGACAGCT-TT-A---AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----T-A-GA----C-GACTC--TGTGGGTTTTTTTTAAAA-------------------CTTTT-TATCTA--TTTT--A-A-CGT-GCACTGTA--CA------TAGATGTTCA-C----C-ACC-CTCAC-ACAGAGTGCGATA-ATACT--TA--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGAAGG
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gi|15 : TTTT-----AAA-----------CT-TATCTA--CTTT--A-A-C-GT-GCACCGTA--C------A-TA--GATGTTTAC----C-cttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgttttaaacttatctactttaacgtgcaccgtacatagatgtttacc
gi|16 : ccaggacgacggtgtacaaggaccccttcccccaaggtcagaacaagttaccagggggcgcagtggaggccaagaccctggacagctttaagaaccagctagctgtccggtgccgcccagccttttggttttaagaaaaaaaaaaaaaaaccggaccttccctgtaaaatgGGA-ACAA-G-TTACT--ATAGTAGCTGGG-GG-CGCAG-TGG-AGGCC--A-A-GACCCTGGAC----AGTT-TT-A-----AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-TTGTCGAG-CTG----T-A-GA----C-GACTC--TG-TGA-GG--AGTTTTTAAAAAAAA------AC-TTTT-TATCTA--TTTT--A-A-C-GT-GCACTGTA--C------A-CA--GATGTTCAC----C-ACC-CTCAC-AGAGA--GCGATA-ATA-----A--AGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGA
gi|17 : G-CGCAG-TGG-AGGCC--A-A-GATCCTGG-C----AGCT-TTCA-----AGAACC----AGCTGCCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTG----TGA-GA----C-GACTC--TG-CGA-GTTGTTTTTTT-----AAA------ACTTTTT-TATCTC--TTTT--A-ACC-GTGGCACTGTA--C------T-TA--GATGTTCAC----CAACC-CTCAC-ACAGTGTGCG-TA-ATAC-T-TA--A-TG--GTATAA-TGCAACTAAACCGAAA
gi|18 : GAACCCTTT-CAAG-G----A-A-T-ACAC--ACATA--AACCA-AG-T-----GGTCA-A-GA-A-GGC-AAA--------CA-ACA-C-TCG-----------AGCC-TTCCT---A-TAG--AGG---A-ACATC--TA-CCAGT----GC-CCACAGAAAACTA-AAGATATTTGCC-A---CAA-GGCA-C-TGagga
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gi|2 : ---ACT------ACCGTTATT-CAT-CAAG-GA-TC--CCCCGTCAAGG-GAA-CTG-CCT-AAGC-C----GCAT-GCTCTTCCTAAAT---TTAT-CATCAAA----CA---ACCTGTC--CATCAGTGTCAT-CTGC-CACCAA---------------ACTCTT--G---CTGATCA-------TGTCTGGA-TGTACATGGG-G-ATAAATGACAC--C-ACAA-GACCAAA-GG-CTCTT-GCAGA-GC-A--CC-T----AATAAAGTA-CCTAACAGAGGGA-G-A--CC-GAAGC-T-TTATGCA--TTC-AA-T-CCGGA-TAAG--T----GCG-AAG-TGC-T-ACGG-TTA--C-AA-C----------G-AAA---TCCCCA-AT-GGC-CGCCCGAATT--CAAAATC-C---ACGGCCAAG---TCCTAAATATCAA-GTTTGACT-CT-ACAAAGTAT--ACCGTT-GGT-CTTGACTATTTC---TAAGAAAC--CT-AGCT-T----T-A-T-ACAC--ACACATCGATAA-GAAT-----CACTA-A-GA-AAGGC-AAAA-------CT-CCA-C-ACT-----------GGCC-TTCCT-----CGGCCAGATAAATACATG--AG-CC-AT----GC-CCA------ACCA-C---------CC-A-T-CAAAGGCATC-AGTG---C--------TACTTGCCA-CG----GT-GCGACT---AC----CATCAAG-A--AT-ATGCC-TC-CAG-C-T-TTGTGG-AG--CC--AGC--CCAAG--AAGGG-AGATACA-TCAATAAAACTCA-AGGC----GCACA-GC-CGTAGCATACAG-ATTC--GCCATTGGAG---A-T--AC-CT--AAC-GCACAAGCCAGTGT--ACAT---CAATGCTAGAAACAG-ATAACC-TCCA--TG-GC-A-GTTCCA--CT---CCA---GCTT-CCGTT--GA-AAAGGCCGCGGAAGTCATTAAT--CTA--A----TA-GGAGAGAAG-----T-TA-A-T---CAGGAT-AGT-GA--ATCCTGGTGAGT-G-AGGCTT--A--CCTACAAACCCAGCATA--C--ACTTGC----GA----CAAA---AGCCAT-CCCTTGC-GATTGTCTTGTT-C-----CA-----------------GGACGAACAGC-G--T--ATAGAA-ACGCTCC-TCCTCC--CTCACATCCTT-----CCAGCTC-T-GA-ACAA-A-TTACC--A---------GA-GG-AGCAGATGG-A-GCC--ACA-GACCCTGGAC----AACTATT-A-----A-AACC----AGCTGT-C--GG--T--CTGCCCAG-CTG----T-A--A----C-GACTC--TG-T-G-GTAACTTTTTT-----AAA------ACTTTTT-TATCTA--TTTA--A-A-G-AT-GCAC-G-A--C------A-T----GTATTCAC----C-ACC-CT-ACAACAGA-TGCGATA-ATAC-TGTC--AGTG--
gi|20 : gtccataatcccacaaaccg-AAGGGCC---AAA-TGACTAAA--CT---A----TAACGAGAT-AA-----G-TT-A-T---CA-GAT-TGT--GACAT-CCGATGCAT-GTAG--CT--A--C--AAAA--ACAGCAT-------ACTGCATGTAGA--CCAGATCGAGCCCA-TAACTGC-AATT-TCTTA-TAC-----CA-CA--------caaata
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gi|9 : ttttgacttttcaaaggcctttaacaaggtcccacacattcgactgctgataaagctacatcattatgacatccgaggacgcatccatgacaagataacaagttacagggtgtacagaacgtgtttgtcctttgatagtcaatcattgcccgctaccatcatttcatccagagtcaggaaaacatttatcttcttgatgtacataaatgagaaattgtctcatcaaccactcgactatttgcaagacgactgtcttatgcacagaaggaccaggtcatcttatagggataactcaaaaagctccaacagtgattaatggagaatcaagtgcacaaaagagtccccactacttgttggctagcttatccatggccatgtactttttatgatcaactgtgttaaat---ATT--AC-T---AAC-GCACAAG-TAGTGT-AACAT---CTATGCT----ACAG--CAA-C-TCCAG-TG-GC-A-G-TC-A--CT---CCA---GC-T-CCGTCGGGA-AAGGGCC---CAAGTCATTATG--CT---A----TA-GAGGAT-AG-----T-TT-A-T---CA-GAT-AGT-GGACATCCCGGTG-GT-G-AG--CT--A--CCTACAA--CCAGCAT---C---ACTGC----GGG--CCAGA---GGCCAC-TCCCTGC-AATT-TCTTGTT-C-----CA-CA--------CACCA-GGACGGA-AGT-G--T--ACA-AA-AT-CTCCTTCCTCC--CCAA-AGCCAT-----CCGGCCC-TGGA-ACAA-A-TTACC--AG--------GG-GG-TGCAG-TGG-AGGGC--A-A-GACCCTGGAC----AGCT-TT-A-----AGAACC----AGCTGTCC--GG--TG-CCGCCCAG-CTGTACAT-A-GA----C-GACTC--TG-T---GT--TATTTTT-----------------TTTT-TATCTA--TTTT--A-A-C-TT-GCACTGTA--C------A-TA--GATGTTCAC----T-ACC-CTCAC-ACAGAGTGTGATA-ATAC-T-TATTAGTG--G--TAA-TGC-ACTAAACCGGAAGtcctcc