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lowQualScore                  :        ...    . ...  .  .  ... .  . .  ....           .  .  ... ...    ..  ...  ...  . .   . .. ...  . .   .  . . .  . ... ... .   .....  ..    . . .....   .   .    . .       
lowQualScore                  :        222    9 444  9  7  999 9  9 9  8888           7  3  111 888    44  777  777  7 7   7 77 333  7 6   7  7 3 7  7 111 333 7   77777  33    7 7 88888   7   7    6 9       
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Reference ( gi|4 )            :    AAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-A-ATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
gi|15                         :    AAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-G----ATACCGGCCTAG-AA-CG---C-A-GACA-ACC---TG---AA-ATAT--G--A---AC-CAAA---A-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-----TTCA-G-T-----AAA-AGG-GGGTGGCGAGG
gi|1                          :    AAACACACAGA-G---TT-AC-CGAGGC-GA-C-GG-A--TACCGGCCTGG-AA-CGAG-C-A-GACAGACC---TG---AA-A-ATA-G--A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G-C-A---GAAACAGAT-TG--TCCA-G-TCGTAAAAA-AGGCGGGTGG-GAGtgg
gi|13                         :    AACC---CAGA-G--ATT-AC-CA---C--A-T-AG-AGAGACGTCCCCTG-AA-CG-G-C-A-GAC----C---CG---TA-A-ATA-G--A---AC-C-AAAACA-A-GCCA-G-C-A---G-AAC--G--TG--TCCA-G-T-------A-AGG-GGGT-G-GAGGGTGtg
gi|5                          :    aAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GACC-GG-A-GTACCGGCC-GG-AA-CG-G-C----GCA-ACCAAATG---AA-A-AGC-A--A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G---A---G-AAC--GT-TG--TCCC-G-------AAA-AGG-GTGT-G-GAGGGTG
gi|12                         : aaacAACA--CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-CGGG-A-GTACCGGCCTGG--A-CG-GCC-A-GACC-ACC----G---AT-A-AT-----G---AC-C--AAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC---T-TGTCTCCA-G-T----TAAA-A-G-GGGT-G-GAGGGTg
gi|3                          :      AC---CAGA-G--ATT-ACGCG---C-GA-C-GG-A-A-ACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-A-ATA-G--A---AC-C---AACAGA-G-CA-G-CGA---G-AAC--GT-TGT-TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGT-G-GAGGGTG
gi|2                          :  aaacAC---CAGAAG--ATT-ACACG---CCGA-C-GG-A--TACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-AGGACA-ACC---TG---AA-A-ATA-GAAA---AC-CACAAACA-AGG-CA-G---A---G-AAC--GTATG--TCCA-G-T-----AAA-AGG-GGGTGG-GAGAGT
gi|6                          :  aaacAC---CAGA-G---TT-AC-CGG--C-GA-C-GG-A--TACCGGCCTG--AA-CG-G-G-A-GATA-ACC---TG---AA-A-ATA----A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G-C-G---A-AACAAAT-TG--TCCA-GTT----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGG
gi|14                         :  aaacAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG---ATACCG--CTGG-AA-CG-G-C-A-AGAA-ACC---TG------A-ATA-G--A---ACTCAAAAA-A-A-G-CG-C-C-A---G---C--GG-TG--TCCA-G-T----AAAA-A-G-GGGTGA-GAGGGTGt
gi|11                         :    ccAC---CAGA-T--ATTTAC-CG-----GA-C-GG-A--TACCGGCCTGGGAA-CG-G-C-A-GA-A-ACC---TG---AA-A-ATA-G--AG--AC-CACAAACA-A-G-CA-GCC-A---G-AAC--GT-T---TGCA-G-T----AAAA-A-G-AGGTGG-
gi|7                          :  aaacAC---CAGA-GTTATT-AC-CA---C-GA------A-AGATCGA---GG-AG----------AACA-ACC---TG---AT-A-ATAAG--A---AC-CAAAACCA-A-G-CA-G-C-AAGAG-GAC--GT-TG--TCCACG-T----AAAA--GG-GGGTGG-GAGGGTG
gi|10                         :  aaacAC---CAGA-G---TT-AC-CG---C-GA-C-GG-GCATACCGGCCTGG-AA-GG-T-C-C-GACA---C---TGTTCAA-A-GTA-A--ACAGAC-CACAAGCA-A-G-CA-T-T-AC--G-ATT--G--TG--TCCA---T----AAAA-AGA-G
gi|9                          :         aaacGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-AGTA-ATAC-GTCCAGG-AAACG-A-C-A-GAC---CC---TG---AA-A--TA-G--A---AC-CAAAA-CA-A-G-CA-G-C-A---T-GAC--A--TA--TCCA-G-T----AAAATAGG-GGATGG-GAGGGTGtg
gi|8                          :         aacatA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A--TACCGTCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-C-ATA-G--A---AT-TAAAA-CA-A-A-CA-G-C-A---G-AGC--AT-TG--TCCG-G-T----AAAA-AGG-GGATTG-GAGGGT
gi|16                         :                                    aacatc-ATACGTGCCTGG-AAACG-A-CGA-GACA--CC---TG---AAGA-ATA-G--A---CC-TAGAAACA-ATA-CAAG-C-A---G-AAC--GTGCG--CACA-G-A----AAAA-GGG-AGGT-G-GAGTGTG





Alignments
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lowQualScore                  :         888    2 444  2  5  777 2  2 2  2 33           2  5  333 2 2    22  444  444  2    5555 666  2 9   1  2 5 2  2 2 2 666 2   00000  55    2 2 88888   2   2    8 2       
lowQualScore                  :         ...    . ...  .  .  ... .  . .  . ..           .  .  ... . .    ..  ...  ...  .    .... ...  . .   .  . . .  . . . ... .   .....  ..    . . .....   .   .    . .       
lowQualScore                  :         555    7 555  7  3  333 7  7 7  7 22           5  0  222 5 5    66  444  444  5    1111 999  5 4   1  5 0 5  5 5 5 999 5   77777  99    5 5 66666   5   5    3 7       
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Reference ( family-2260 )     :     AAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
gi|1                          :     AAACACACAGA-G---TT-AC-CGAGGC-GA-C-GG-A--TACCGGCCTGG-AA-CGAG-C-A-GACAGACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G-C-A---GAAACAGAT-TG--TCCA-G-TCGTAAAAA-AGGCGGGTGG-GAG
gi|10                         :       AC---CAGA-G---TT-AC-CG---C-GA-C-GG-GCATACCGGCCTGG-AA-GG-T-C-C-GACA---C---TGTTCAA-AGTA-A--ACAGAC-CACAAGCA-A-G-CA-T-T-AC--G-ATT--G--TG--TCCA---T----AAAA-AGA-Gtg
gi|11                         :   aaacAC---CAGA-T--ATTTAC-CG-----GA-C-GG-A--TACCGGCCTGGGAA-CG-G-C-A-GA-A-ACC---TG---AA-AATA-G--AG--AC-CACAAACA-A-G-CA-GCC-A---G-AAC--GT-T---TGCA-G-T----AAAA-A-G-AGGTGG-tg
gi|12                         :  aaacAACA--CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-CGGG-A-GTACCGGCCTGG--A-CG-GCC-A-GACC-ACC----G---AT-AAT-----G---AC-C--AAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC---T-TGTCTCCA-G-T----TAAA-A-G-GGGT-G-GAGGGT
gi|13                         :     AACC---CAGA-G--ATT-AC-CA---C--A-T-AG-AGAGACGTCCCCTG-AA-CG-G-C-A-GAC----C---CG---TA-AATA-G--A---AC-C-AAAACA-A-GCCA-G-C-A---G-AAC--G--TG--TCCA-G-T-------A-AGG-GGGT-G-GAGGGTG
gi|14                         :      aAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG---ATACCG--CTGG-AA-CG-G-C-A-AGAA-ACC---TG------AATA-G--A---ACTCAAAAA-A-A-G-CG-C-C-A---G---C--GG-TG--TCCA-G-T----AAAA-A-G-GGGTGA-GAGGGTG
gi|15                         :   ccAAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-G----ATACCGGCCTAG-AA-CG---C-A-GACA-ACC---TG----A-AATATG--A---AC-CAAA---A-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-----TTCA-G-T-----AAA-AGG-GGGTGGCGAGG
gi|16                         :                                           -ATACGTGCCTGG-AAACG-A-CGA-GACA--CC---TG---AAGAATA-G--A---CC-TAGAAACA-ATA-CAAG-C-A---G-AAC--GTGCG--CACA-G-A----AAAA-GGG-AGGT-G-GAGTGTGtgg
gi|2                          :       AC---CAGAAG--ATT-ACACG---CCGA-C-GG-A--TACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-AGGACA-ACC---TG---AA-AATA-GAAA---AC-CACAAACA-AGG-CA-G---A---G-AAC--GTATG--TCCA-G-T-----AAA-AGG-GGGTGG-GAGAGTg
gi|3                          :   aaacAC---CAGA-G--ATT-ACGCG---C-GA-C-GG-A-A-ACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-C---AACAGA-G-CA-G-CGA---G-AAC--GT-TGT-TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGT-G-GAGGGTG
gi|4                          : aaacAAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
gi|5                          :      AAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GACC-GG-A-GTACCGGCC-GG-AA-CG-G-C----GCA-ACCAAATG---AA-AAGC-A--A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G---A---G-AAC--GT-TG--TCCC-G-------AAA-AGG-GTGT-G-GAGGGTG
gi|6                          :   aaacAC---CAGA-G---TT-AC-CGG--C-GA-C-GG-A--TACCGGCCTG--AA-CG-G-G-A-GATA-ACC---TG---AA-AATA----A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G-C-G---A-AACAAAT-TG--TCCA-GTT----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGg
gi|7                          :   aaacAC---CAGA-GTTATT-AC-CA---C-GA------A-AGATCGA---GG-AG----------AACA-ACC---TG---AT-AATAAG--A---AC-CAAAACCA-A-G-CA-G-C-AAGAG-GAC--GT-TG--TCCACG-T----AAAA--GG-GGGTGG-GAGGGTGt
gi|8                          :           aaacA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A--TACCGTCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-CATA-G--A---AT-TAAAA-CA-A-A-CA-G-C-A---G-AGC--AT-TG--TCCG-G-T----AAAA-AGG-GGATTG-GAGGGT
gi|9                          :        aacatcGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-AGTA-ATAC-GTCCAGG-AAACG-A-C-A-GAC---CC---TG---AA-A-TA-G--A---AC-CAAAA-CA-A-G-CA-G-C-A---T-GAC--A--TA--TCCA-G-T----AAAATAGG-GGATGG-GAGGGTG





Alignments
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lowQualScore                  :         888    2 444  2  5  777 2  2 2  2 33           2  5  333 2 2    22  444  444  2    5555 666  2 9   1  2 5 2  2 2 2 666 2   00000  55    2 2 88888   2   2    8 2       
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Reference ( family-2260 )     :     AAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
gi|1                          :     AAACACACAGA-G---TT-AC-CGAGGC-GA-C-GG-A--TACCGGCCTGG-AA-CGAG-C-A-GACAGACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G-C-A---GAAACAGAT-TG--TCCA-G-TCGTAAAAA-AGGCGGGTGG-GAG
gi|10                         :       AC---CAGA-G---TT-AC-CG---C-GA-C-GG-GCATACCGGCCTGG-AA-GG-T-C-C-GACA---C---TGTTCAA-AGTA-A--ACAGAC-CACAAGCA-A-G-CA-T-T-AC--G-ATT--G--TG--TCCA---T----AAAA-AGA-Gtg
gi|11                         :   aaacAC---CAGA-T--ATTTAC-CG-----GA-C-GG-A--TACCGGCCTGGGAA-CG-G-C-A-GA-A-ACC---TG---AA-AATA-G--AG--AC-CACAAACA-A-G-CA-GCC-A---G-AAC--GT-T---TGCA-G-T----AAAA-A-G-AGGTGG-tg
gi|12                         :  aaacAACA--CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-CGGG-A-GTACCGGCCTGG--A-CG-GCC-A-GACC-ACC----G---AT-AAT-----G---AC-C--AAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC---T-TGTCTCCA-G-T----TAAA-A-G-GGGT-G-GAGGGT
gi|13                         :     AACC---CAGA-G--ATT-AC-CA---C--A-T-AG-AGAGACGTCCCCTG-AA-CG-G-C-A-GAC----C---CG---TA-AATA-G--A---AC-C-AAAACA-A-GCCA-G-C-A---G-AAC--G--TG--TCCA-G-T-------A-AGG-GGGT-G-GAGGGTG
gi|14                         :      aAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG---ATACCG--CTGG-AA-CG-G-C-A-AGAA-ACC---TG------AATA-G--A---ACTCAAAAA-A-A-G-CG-C-C-A---G---C--GG-TG--TCCA-G-T----AAAA-A-G-GGGTGA-GAGGGTG
gi|15                         :   ccAAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-G----ATACCGGCCTAG-AA-CG---C-A-GACA-ACC---TG----A-AATATG--A---AC-CAAA---A-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-----TTCA-G-T-----AAA-AGG-GGGTGGCGAGG
gi|16                         :                                           -ATACGTGCCTGG-AAACG-A-CGA-GACA--CC---TG---AAGAATA-G--A---CC-TAGAAACA-ATA-CAAG-C-A---G-AAC--GTGCG--CACA-G-A----AAAA-GGG-AGGT-G-GAGTGTGtgg
gi|2                          :       AC---CAGAAG--ATT-ACACG---CCGA-C-GG-A--TACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-AGGACA-ACC---TG---AA-AATA-GAAA---AC-CACAAACA-AGG-CA-G---A---G-AAC--GTATG--TCCA-G-T-----AAA-AGG-GGGTGG-GAGAGTg
gi|3                          :   aaacAC---CAGA-G--ATT-ACGCG---C-GA-C-GG-A-A-ACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-C---AACAGA-G-CA-G-CGA---G-AAC--GT-TGT-TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGT-G-GAGGGTG
gi|4                          : aaacAAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
gi|5                          :      AAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GACC-GG-A-GTACCGGCC-GG-AA-CG-G-C----GCA-ACCAAATG---AA-AAGC-A--A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G---A---G-AAC--GT-TG--TCCC-G-------AAA-AGG-GTGT-G-GAGGGTG
gi|6                          :   aaacAC---CAGA-G---TT-AC-CGG--C-GA-C-GG-A--TACCGGCCTG--AA-CG-G-G-A-GATA-ACC---TG---AA-AATA----A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G-C-G---A-AACAAAT-TG--TCCA-GTT----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGg
gi|7                          :   aaacAC---CAGA-GTTATT-AC-CA---C-GA------A-AGATCGA---GG-AG----------AACA-ACC---TG---AT-AATAAG--A---AC-CAAAACCA-A-G-CA-G-C-AAGAG-GAC--GT-TG--TCCACG-T----AAAA--GG-GGGTGG-GAGGGTGt
gi|8                          :           aaacA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A--TACCGTCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-CATA-G--A---AT-TAAAA-CA-A-A-CA-G-C-A---G-AGC--AT-TG--TCCG-G-T----AAAA-AGG-GGATTG-GAGGGT
gi|9                          :        aacatcGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-AGTA-ATAC-GTCCAGG-AAACG-A-C-A-GAC---CC---TG---AA-A-TA-G--A---AC-CAAAA-CA-A-G-CA-G-C-A---T-GAC--A--TA--TCCA-G-T----AAAATAGG-GGATGG-GAGGGTG


blockSeqs                     :         A      A TTA  T  A  G   C  C G  T CA           G  A  GC  G G    A   AAA  TTC  G    GAA  CAG  T A   G  G T C  A C G AGA .   AAAT   TC    C T A       T   .    G C
blockSeqs                     :         .      . A    .  G  .   .  . .  . GA           .  A  T   . .    A   .    .    .    TG   G    . A   A  . G .  . . . C   .   GTG    T     . . A       .   .    G .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . G            .  .  G   . .    A   .    .    .    AG   .    . A   A  . . .  . . . .   .   GTA    .     . . T       .   .    G .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . A            .  .  G   . .    A   .    .    .    A    .    . A   A  . . .  . . . .   .   GT     .     . . A       .   .    G .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . A            .  .  G   . .    A   .    .    .    G    .    . A   A  . . .  . . . .   .   GG     .     . . A       .   .    G .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . A            .  .  A   . .    A   .    .    .    G    .    . A   A  . . .  . . . .   .   GT     .     . . A       .   .    G .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . A            .  .  G   . .    A   .    .    .    G    .    . A   A  . . .  . . . .   .   GT     .     . . A       .   .    G .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . A            .  .  G   . .    A   .    .    .    G    .    . A   A  . . .  . . . .   .   GT     .     . . A       .   .    T .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . G            .  .  G   . .    A   .    .    .    G    .    . A   A  . . .  . . . .   .   GT     .     . . A       .   .    G .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . A            .  .  G   . .    A   .    .    .    G    .    . A   A  . . .  . . . .   .   GT     .     . . A       .   .    . .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . A            .  .  G   . .    A   .    .    .    A    .    . .   A  . . .  . . . .   .   AT     .     . . A       .   .    . .
blockSeqs                     :         .      . A    .  .  .   .  . .  . .            .  .  G   . .    .   .    .    .    G    .    . .   C  . . .  . . . .   .   G      .     . . .       .   .    . .
blockSeqs                     :                . .    .  .  .   .  . .  . .            .  .  A   . .    .   .    .    .    G    .    . .   .  . . .  . . . .   .   T      .     . . .       .   .    . .
blockSeqs                     :                . .    .  .  .   .  . .  . .            .  .  .   . .    .   .    .    .    .    .    . .   .  . . .  . . . .   .   G      .     . . .       .   .    . .
blockSeqs                     :                                           .            .  .  .   . .    .   .    .    .    .    .    . .   .  . . .  . . . .   .   A      .     . . .       .   .       


blockSeqCons                  :         ***      A**        ***           A*                 G**        A*                                                         GT***            A****
originalCons                  :     AAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
finalCons                     :     AAAC---CAGA-GA--TT-AC-CG---C-GA-C-GG-AA-TACCGGCCTGG-AA-CGG--C-A-GACAA-CC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AACGT---TG--TCCA-G-TA----AAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG





Alignments
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lowQualScore                  :         888    2 444  2  5  777 2  2 2  2 33           2  5  333 2 2    22  444  444  2    5555 666  2 9   1  2 5 2  2 2 2 666 2   00000  55    2 2 88888   2   2    8 2       
lowQualScore                  :         ...    . ...  .  .  ... .  . .  . ..           .  .  ... . .    ..  ...  ...  .    .... ...  . .   .  . . .  . . . ... .   .....  ..    . . .....   .   .    . .       
lowQualScore                  :         555    7 555  7  3  333 7  7 7  7 22           5  0  222 5 5    66  444  444  5    1111 999  5 4   1  5 0 5  5 5 5 999 5   77777  99    5 5 66666   5   5    3 7       
consensus                     :     AAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
Reference ( family-2260 )     :     AAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
gi|1                          :     AAACACACAGA-G---TT-AC-CGAGGC-GA-C-GG-A--TACCGGCCTGG-AA-CGAG-C-A-GACAGACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G-C-A---GAAACAGAT-TG--TCCA-G-TCGTAAAAA-AGGCGGGTGG-GAG
gi|10                         :       AC---CAGA-G---TT-AC-CG---C-GA-C-GG-GCATACCGGCCTGG-AA-GG-T-C-C-GACA---C---TGTTCAA-AGTA-A--ACAGAC-CACAAGCA-A-G-CA-T-T-AC--G-ATT--G--TG--TCCA---T----AAAA-AGA-Gtg
gi|11                         :   aaacAC---CAGA-T--ATTTAC-CG-----GA-C-GG-A--TACCGGCCTGGGAA-CG-G-C-A-GA-A-ACC---TG---AA-AATA-G--AG--AC-CACAAACA-A-G-CA-GCC-A---G-AAC--GT-T---TGCA-G-T----AAAA-A-G-AGGTGG-tg
gi|12                         :  aaacAACA--CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-CGGG-A-GTACCGGCCTGG--A-CG-GCC-A-GACC-ACC----G---AT-AAT-----G---AC-C--AAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC---T-TGTCTCCA-G-T----TAAA-A-G-GGGT-G-GAGGGT
gi|13                         :     AACC---CAGA-G--ATT-AC-CA---C--A-T-AG-AGAGACGTCCCCTG-AA-CG-G-C-A-GAC----C---CG---TA-AATA-G--A---AC-C-AAAACA-A-GCCA-G-C-A---G-AAC--G--TG--TCCA-G-T-------A-AGG-GGGT-G-GAGGGTG
gi|14                         :      aAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG---ATACCG--CTGG-AA-CG-G-C-A-AGAA-ACC---TG------AATA-G--A---ACTCAAAAA-A-A-G-CG-C-C-A---G---C--GG-TG--TCCA-G-T----AAAA-A-G-GGGTGA-GAGGGTG
gi|15                         :   ccAAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-G----ATACCGGCCTAG-AA-CG---C-A-GACA-ACC---TG----A-AATATG--A---AC-CAAA---A-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-----TTCA-G-T-----AAA-AGG-GGGTGGCGAGG
gi|16                         :                                           -ATACGTGCCTGG-AAACG-A-CGA-GACA--CC---TG---AAGAATA-G--A---CC-TAGAAACA-ATA-CAAG-C-A---G-AAC--GTGCG--CACA-G-A----AAAA-GGG-AGGT-G-GAGTGTGtgg
gi|2                          :       AC---CAGAAG--ATT-ACACG---CCGA-C-GG-A--TACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-AGGACA-ACC---TG---AA-AATA-GAAA---AC-CACAAACA-AGG-CA-G---A---G-AAC--GTATG--TCCA-G-T-----AAA-AGG-GGGTGG-GAGAGTg
gi|3                          :   aaacAC---CAGA-G--ATT-ACGCG---C-GA-C-GG-A-A-ACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-C---AACAGA-G-CA-G-CGA---G-AAC--GT-TGT-TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGT-G-GAGGGTG
gi|4                          : aaacAAAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A-ATACCGGCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-AATA-G--A---AC-CAAAAACA-A-G-CA-G-C-A---G-AAC--GT-TG--TCCA-G-T----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGGTG
gi|5                          :      AAC---CAGA-G--ATT-AC-CG---C-GACC-GG-A-GTACCGGCC-GG-AA-CG-G-C----GCA-ACCAAATG---AA-AAGC-A--A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G---A---G-AAC--GT-TG--TCCC-G-------AAA-AGG-GTGT-G-GAGGGTG
gi|6                          :   aaacAC---CAGA-G---TT-AC-CGG--C-GA-C-GG-A--TACCGGCCTG--AA-CG-G-G-A-GATA-ACC---TG---AA-AATA----A---AC-C-AAAACA-A-G-CA-G-C-G---A-AACAAAT-TG--TCCA-GTT----AAAA-AGG-GGGTGG-GAGGg
gi|7                          :   aaacAC---CAGA-GTTATT-AC-CA---C-GA------A-AGATCGA---GG-AG----------AACA-ACC---TG---AT-AATAAG--A---AC-CAAAACCA-A-G-CA-G-C-AAGAG-GAC--GT-TG--TCCACG-T----AAAA--GG-GGGTGG-GAGGGTGt
gi|8                          :           aaacA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-GG-A--TACCGTCCTGG-AA-CG-G-C-A-GACA-ACC---TG---AA-CATA-G--A---AT-TAAAA-CA-A-A-CA-G-C-A---G-AGC--AT-TG--TCCG-G-T----AAAA-AGG-GGATTG-GAGGGT
gi|9                          :        aacatcGA-G--ATT-AC-CG---C-GA-C-AGTA-ATAC-GTCCAGG-AAACG-A-C-A-GAC---CC---TG---AA-A-TA-G--A---AC-CAAAA-CA-A-G-CA-G-C-A---T-GAC--A--TA--TCCA-G-T----AAAATAGG-GGATGG-GAGGGTG