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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-223 ) : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGG---GC-TATTTGGTG-AA-GATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GG-GGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTC--TACCCC--ATC--TTNA-TGGA-CT-G-T-GATGTT-G-G-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCC-CATATC-TGGT-AGTNGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAATA-CAG-ATGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-ATCT-GCCT-T-CACCCTGGCGTCAACTGTA-CGCAATA---CCCTCC---CNCTTTAAT-G-GTGCAA--CCCC-AC-GGGC-AT---CCGT-GCGC-TTGC-TT-TT--GATA-AAGCTCC-A-CAG-G--C-G-TTTTGGTTTA-TGGTCCTCATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CACATACTCCT-G-GTATCC-G-AGTTTGCATTG--CA--CATGTACAGCATTTTAA-GGTCTTT--AT---------AG---ACG----A---------ATC------------------AC-GTG---TGGAG-TTGGTCTTC-GAGTATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACCG-TTTA--AG-GTCTCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCTGTGA-TGTCA-TCTTC-GAT-GGTACA-T----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC-A--GCC-GCT-CTT-AAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGGTT-TG------TGG-TGTCATGACTT--GATGTG--A-A---TGA-CTGACTGAAGGTG--GCC-ATGCNG---TC--T-CTGAG-TC-C-CTC-CAA-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTCGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGC--TTGACCTGGACGTCACTGTC-GATAAATA---AT-GCCTCGT-GGTCGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTACTA-GCGA-GGG-TCGGTTTGTGAGGAATAGGTC-A-AAAGTTGNGTTATT-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGC-AGT-AGACCGGT-GTCAGCAAA-TAA-GTT-CATGAAGG-TGTTGTTCACCCCTAAGGGG-TTTCTATTCCCAATAACGGAGT-TGG-TTGACCA-----CGAAA-TATGCGGTAAGT----TGAAGTCTCCGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTTTGGGTTTGCCTGGATAAGGCCGTGTAGCTCTTCACAGATACGTTCTGCTTCCCCTGGTTACTACTGG-GTGG-TCTGTATAGTCCTGCTATGTTCAGTGGTGGGTGTGTCCCTC-TCTTCACTGATATTGCAACTATCTCAGAT-GTTTTTGAGACGTGGAG-TTNATCGCATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATGA-TAATAACACCTCCATAACCATCCTGGCGGTCCCTCCTAGCCTTAACAGCATAACCTGGCG--GCAGGAATTCACTA-TCA--TGAACAT-CTGGC-----CGCAACCA-TGTTTCAGTGCCTACAACAATATCTGGGTCTGCCGAGTACATGAGA-T-CATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATGCGGAATTTATG-TTGTGGCGGTTTTGCTNTGGCGCCTGGCCCCCTTTTGGGTGAGG---ATG-------TG-------GCGATCCAGGATCTCCTGTACTACT-CATGCTCGTGTTGGTATTC-AAGCTGTCGATAAGTGTTGGATGT-ATCAATGGTGGAAGA-----------AGTG---TAGCAAAGTTTGGCAGT-CGC-AT--GAACAGCA--TAT--CCC--AGCTNACATCAGGGTTAGCGT-GGTATTTG-TAGACCTGACTAGGCATATCT-AG------GCGGTCTACATGGTACCACTGG---------TCA---------CAA--GCAA-TGGCACGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACA-TATCTGACCACGGGTATCTGG-------------GTGGAC----GCTGGGTTAAGCTCGC-AGTCAAGCTGATCTCGGTAGT
gi|1 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGA---GC-TATT-GGTG-AA-AATGTTGCC--TTTCA-GTA--GTC-T--TGA-TG--AAAGACCT--CGTC-GGGCCGTGTA-GCTT---TAT----GG-CT-TTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCGT--CACCCT--ATC--TTCA-TGGA-CT-G-TTGATTTT-G-G-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCC-CATATC-TGGT-AGTCGTCTCCGC-AGCGTGCT-CTCCGAG--G-TGA-TA-CAG-ATGTAAAAAT-TGCTTG-A---AAGGATGATCTTGCCT-TTCACCCTGGCGC--ACTGTA-CGCGATA---CCCTCC----TCTTTAATAG-GTGCAA--CCCCCAC-AGGTTAT---CCGT-GCGC-T-GC-TT-TTTGAATATAAGCTCC-C-C-G-G--C-G-TTTTGGCTTA-TGGTCCTCATCCAT-GATAAT--GTTGTT-CACATACTCCT-TCATATCC-GCAGTTTGCATTG---A--CATGTACAGCATTTTTATGGTCTTT--AT---------AGCTCAAGT---A---------ATC------------------AC-GTG---TG-AG-TTGGTCTTTTGAGTATTGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACCG-TTTA--AG-GTCT-TAGTGACCCAGGGCTTGTTATAGCGCTGTAAATGTCA-T--TC--AT-GGTACA-T----TTGTGTTG-GAACATCAAGGC-A--GCCCGC--CTT-TAAGCTG-TCCAGAGAT-CTCAAACTGGGTT-TG------TGG-TGTCATGACTTTTGATGTG--A-A---TGAGCTGACTGAAGGTG--GCCGATGCAG---TC--T-CTGAGCTC-C-CTC-CAA-G-TTCGGCTGCTGATTCCAC-------------------TAGTGGGTCGCT-----GAAG---TTGACCTG-ACGTCAC-GTC-TATAAATA---GT-GCCTCGT-GGTAGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTA-TA-GCGA-GGG-TCGGTTGCTGAGAATCAGGT--A-AGAGTTGCGTTA-T-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGCAAGT-AGACCGGT-GTCAGCAAATTAA-GTTCCATG-AGG-TGTTGTTCACTCC-AAGGGA-TTTCTATTCCCAATAAT-GAGTCTGGTTTGACCA-----TGAAAGTCTG-GGTAAGT----TGAAGTCTCCGGTCCGCCAGCAGAATGCGGCGAGTTTGGGTTTGCCT-GACAAGGCCGTGTA-CTCTTCACAGATACGTTCTGC--------------ACTGGCGTGGTTCTGTATAGTCCTGCAATGTTCAGTGGT-AGT-TGTCCCTCTTCTTCACTGA-ATTGCAACTA--TCATATGGTTTTTGAGACGTGAAGTTTCATCACATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATGATTAATAACACCTCCA-AACCACCCTGGCGGTCC--TCTAGCTTTAACAGCATAACCTGGGGGTGCAGACATTCACTATTCACTTGAACATCCTGGC-----CGCAACCATTGTTTCAGTGCC-AC-ACATAATCTGGGTCTGCTGAGTACATGAGA-T-CATAAAGCTTGCCTTTTCTCGCACTTATACTCTTGCGATGTTCAGTGAGATGATGCAGAATTT-TGTTTGTGGCGGTTTTGCTCTGGCGCCTGGCCCCCTTTTGGGTGAGATGTATG-------TAAC-----GCGATCCCAGATCTCCTGTATTACTGCATGCTCGTGTTGGTATTCAAAGCTGTCGATAAGTGTTGGATGTGATCAATGGTGAAAGACTCAAACAGTGAGTG---TAGCAAAG-TTGGCAAT-CGCGATTGGATCAGCA--TAT--CTCCAAGCTGATACCAGAGTTAGCGTGGGTATTTGCCAGACCTGGCTA-GCATATCTCAG------GCGGTCTACATGGTACCACTGGTCACCATTATCA---------CAA--GCAATTAGCACGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACACTGTCTGA-CACGGGTA-CTGG-------------GTGGGCGTGGGCTGGGTTAAGCTCGCGAGTCAAGCTGATCTCAGTAGT
gi|10 : cttgcaaacagaggtcagtgagcacggtcgatagattgactgggtgcaccttcgtctcccttcttgaatagcggcacgtgattattgccgacccattcagtctagaccttgccttgatcagtgaagctga--TTAA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-GTG-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCT-AATATC-TGGT-AGTCGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAA-A-CAGAATGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-AT-T-GCCT-T-CACCCT-GCATCAACTGCA-TGCAATA---CCTTCC---CAC-TTAAT-G-GTGCAA--CCCC-ACAGGGC-ACCGACCAT-GTGT-TAGC--T-TT--AAT--AAGCTCC-A--AA-G--C-G-TTTTGGTTTA-TGGGTCT-ATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CA-ACACTCCT-G-GTA--C-G-GATTTGCATTG--CGACCATGTACAGCATTGTAA-GGTCTTTA-AT---------AGGCAGCG----A---------ATCGTAATGATCAGTTAATTGAC-GTGGTTTGGAG-TTGGTCTTCAGAGT-T--TTT--TAAACCAT-GTTCCC--TCTCT-CACTGTGACAACCG-TTTG--Ag
gi|11 : --TTAA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-GTG-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCT-AATATC-TGGT-AGTCGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAA-A-CAGAATGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-AT-T-GCCT-T-CACCCT-GCATCAACTGCA-TGCAATA---CCTTCC---CAC-TTAAT-G-GTGCAACGCCCC-ACAGGGC-ACCGACCAT-GTGT-TAGC--T-TT--AAT--AAGCTCCAA-CAG-G--C-GTTTTTGGTTTA-TGGGTCT-ATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CAC--ACTCCT-G-GTAT-C-G-A-TTTGCATTGCCCAC-CATGTACAGCATTGTAA-GGTCTTTA-AT---------AGC--ACG----ATCAGTAATGATCAGTTAATTG---------AC-GGT---TGGAG-TTGGTCTTC-GAG-GTTTTTT--AAACCCAT-GTC-CC--TCTCT-C-CTGTGACAACCG-TTT
gi|12 : --AAAAGCCC-GCT-TT--TTCCG-C-CTA-GACATGCGCTTTA--AGTGTCCATT-T-ATCCAGGGTTGACTAAAGCGAGTTGA-TGTCA-TCTTG-GAT-GGAACA-TGATCTTCCAT---GATCAT-AAGGC-ACGGCC-A---TTT-AAA---AGT------AT-CCC--AC---GTC-TGAGGAACTGG-TGT-AT--TCT--GAGGCG--ATA---TGA-TCG-CTGA--GTT--TTG-ATGCT----TCCGC-CTTAA-TCGT-TTC-CAT-G-T-CTGCA-TTT-TCCCACAAAAGT---ACTTTCCTCTTAATGGATCGTTTTCGGGGAACATTTG-TCTGGA---------C-GATA-------------TCAT-GATCACTGACTCC-CGGTA---------TCGGA--TG--TTGCCATGTGACGAG-AC--TTTGC-CGGATT--GTC-ACAAA---GAGTT-TT-CTTCTTGTT-GAAA-CGTCAACCG-T-CTGt
gi|13 : A-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTTGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGC--TTGACTTAGACATCATTGTT-GATAAACA---AT-GCCTTGT-AGTCGCTGTTTCT-TGGAAGTG-GC--TTCCGA--C-ATTCACTT-GTGA-GGG-TTGGTTTGTGAGAAATAGATTGA-AAGGTTGAGTTATTCC--CTTGTTGGGAT-C-TCCATCA-T-CTGC-AGT-AGGCTGGT-TTCAGCAAA-TAA-GTT-CATGAAGG-TGTTTTTCACCCCTAGGGGT-TTTCTATTCCCAATAACGGAGT-TGG-
gi|14 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGA---GC-TATTTGGTG-AA--ATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-TCTT---TAT----GG-GGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTT--TACCCC--ATC--TTTA-TGGG-CT-G-T-GATGTTGG-G-AAC-TGTTCGATGTGAGCTAATTCC-CATATC-TGAT-AGTGGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGGG--G-TGAA
gi|15 : TCCTAGCCTTAACAGTATAACCTGGTT--GCAGGAATTCACTA-TCA--TGATCAT-CCGGC-----CGCAACCA-TGTTTTAGTGCCTACAACAATATCTGGGTCTGCTGAGTACATGAGA-TCCATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATTTGAAATTTATG-CTGTGG
gi|16 : C-A-TAG-G--C-G-TTTTGGTTTA-TGGGTCTCATCCAC-GATAAT--GTTGTT-CACA--CTCCT-G-GTATCC-A-AGTTTGCATTG--CA--CATGTACAGCATTGTAA-AGTCTTTAAAT---------AGC--ACG----ATCAGTAATGATCAGTAATG-----------AC-GTG---TGGAG-TTGGTCTTC-GAGTATTTTTT--AAAACCAT-GTT-CC--TCTCT-C-CTG-GACAACCG-TTTA--tagagttagcgtggta
gi|17 : CAGGATTGGCTATACCGTTGAGA-TGTCA-TCTTT-GTC-GGCACA-TTC--TTCTGTAGTGCA-ATC-AGGCAA--GTT-G-T-CTT-AAAAATTAACCAAAGTT-GGTCAACTGG----TGAGA---CGG-TGTTGTGGTTT--GCTATG--A-ACTGTAA---GAC--AAAACG--GC---TGGGGTCTTC--T-CTCAT-GC-C-ATC-AAC-G-T-TTG-T-CTGTTTCCAC--AAGT
gi|18 : TATT-C--CTTGTT-GGAA-T-TCCGCCA-TCCTGC-AGT-AGGCCGGTGGTCAGCAAA-TAA-TTT-CATGACGA-T-TTGTTCA-CCCTAAGGGGTTTTCTATTCCC--TA--GGCGT-TAG-TTG-CCATGGATCGAAA-TAT-CAA-AAGTGTAGTGAAGTCTCC-GTCAGC---CAGAATG-GG-GA
gi|2 : AAAAGTA-GTGTCAAAATTGGA---AC-TATTTGGTGTAATAATGTTTCC--TT-CA-GTA--ATC-T--TGA-TG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-ACTC---TAT----GA-GGGTAGAG-C-TGA-CCTAGGA-GTTTCTC--TAACCC--ATC--TTAA-TGGA-TT-G-T-GATG---G-G-GAC-TGTTGAATGTGGGCTAATTCC-CATATC-GGGT-ATAGGT-TCCAA-AG--TGTT-CTCCGAG--G-TGAATA-CAG-ATGTAAA--T-TGCT-G-GTT-AAGAAT-ATCT-GCCT-T-CACCCTGGCGTCA-CTGTA-CGCAATA---CCCTAC---AGCATTAAG-G-GTACAA--CCCC-AC-TGGC-AT---CTGT-GCGT-TTGC-TT-TT--GATA-AAGCTTC-A-CAG-G--G-G-TTTTGGCTTA-TGGTCCTCATCCAT-GACAAT--GTTGTT-CACAAACTCCT-C-ATATCTTG-AGTTTGCATTC--CA--CATGTACAGCATTTTAAAGGTC----------------------------A---------ATC------------------AC-GTA---TGGAG-CAGGTCTTA-GAGTATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTTT-C-CTA-GACAACC--TTTA--AG-GTATCTTGTGATTCAGGGCTGGTTAAAGCGATGTTA-TGTCA-TCTTC-GAT-GGTACA-T----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC-A--ATC-GCT-CTT-AAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGGTT-TA------TGG-TGTCATGACTT--GATG----A-A---TTA-CTGACTGAAGGTG--GTC-ATGCCC---TC--T-CTGAG-TC-C-CTC-CAA-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTCGAC-AAGTGGACTGCT-----GGAGT--TTGACCTGGACATCACTGTC-GATAAATA---AT-GCCTCGT-GGTCGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTACTA-GTGA-GGA-TTGATTTGTGAGGAATAGGTC-A-AAAGTTGAGTTATT-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGC-AGT-AGACCGGT-GTCAGCAAA-TAA-GAT-CATGAAGG----TGTTCAATCCTAAGGGG-TTTCTATTCCCAATAATGGAGT-TGG-CTGACCA-----TGAAA-TATGTGGTAAGT----TGAAGTCTCTGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTTTGGGTTTGCCTGGATAAGGCTTTGTAGCTCTTCACAGATACGTTCTGCTTCCCCTGGTTACTACTGG-GTGG-TCTGTATAG--CTA-TATGTTCAGTGGTGGGTGTGTTCCTC-TCTTTACAGATATTGCAACTATCTCAGAT-GTTTTTGAGGCATGGAG-TTCATCGCATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATAA-TAATAACACCTCCATATCCATCCTGGCGGTCCCTCCTACCCTTAACAGCATAATCTGGTG--GCAGGAATTCACTA-TCA--TAAACAT-CTGGC-----CGCAACCA-TTTTTCAGTGCCTACAACAATATTTGGGTCTGTCAAGTATATGAGATT-CATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATGCGGAATTTATG-TTGTGGCGGTTTTGCTGTGGTGCCTGGTCCCCTTTTAGGTGAGG---A---------TG-------GCGATCCAGGATCTCCTGTACTTCT-CATGCTCGTGTTGGTATTC-AAGCTGTCT-TAAGGTTTGGATGT-ATCAGTGGTG---AA-----------AATG---TAGCAAAGTTTGGCAGTCCAC-AT--GAACAGCATTTATTACCC--AGCTAACATCAGGGTTAGCGT-TGTATTTG-TAGACCTCACTAGGCAATTCT-AG------GCAGTCTACATAGTGCCACTGG---------TCACAGCTGTTGCAA--GTAA-TGGCACGCTTACCCCACCTACAGGCTTTGTGACA-TATCTGA-CACGGGTATTTGG-------------GTGGAC-----CTCGCTTAAGCTCAC-AGTC-AGCTGATCTCGGTAGT
gi|21 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGG---GC-TATTTGGTG-A--GATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GG-AGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTC--TA
gi|22 : AGAGTTAGCGT-GGTATTTG-CAGACCTGACTAGGCATATCT-AG------GCAGTCTACATGGTACCACTGG---------TCA---------TAA--GCAA-TAGCATGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACA-T
gi|23 : TATTGG-TAGGCGTAACT-TGCCTGTCT-TGTACATTGCGGTCT----GGTACCACTGG---------TTA---------CAAACGCAA-T--CATGCTG---TCAGCT--AAGCCTT---ACA-TACC
gi|24 : ATCA-----CGAAA-TGTCCGGTAAGT----TGACGTCACCGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTCTGGGCTTGCTTGGATAAGACTGTG
gi|25 : ATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-TACAACCG-TTTC--AG-GTATCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCTGgcctccccata
gi|3 : AAAAGTAAGTGTCAAAGCTGGAA--GC-TATTTGGTG-A--GATGTTTCC--TT-CAAGTACAGTCCT--TGA--G--A--GAC-T--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GGTGGGTTGAG-C-TGAACGTAGGAAGTTTCTC--TACACCTGATTCTTTTA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-G-GGAAC-TGTTGGAGTTGCACTAATTCC-CATATCCTGGT-AGTCGT-TCCGCCAG--TGCTTCTCCGCGTGG-TGAATATCAG-GTGTAAA--T-TGCT-G-ATTTAAGGAT-ATCT-GCTTAT-TTTCTGGGCGTCA-CTGTA-CGCAATA---CCTCCCTTTCATTTAAAT-G-G-GCAA--CCC--AC-AGGC-AT---C-GT-GCGC-TTGCCTT-TT--TATA-AAGCTCC-A-CAG-G--CCG-TTTTGGCTTAATGGTCCTCATCCATTGATAATTTGTTGTTTCA-ATACTCCTCA-ATATCT-G--GTGTGCATTG--CAG-CA-GTACAGCATTTTAA-GGTCTTT--ATTTATTGCTCAA---AGT----A---------ATC------------------AC-GTG---TGGAGGTTAGTCTTT-GAGTATCGTTTT-AAAAGCAC-GAT-CCCTTTTCTTC-CTATGGCGAATG-TTTATAAG-GTCTCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCT-TGA-TGT-A-TTTTC-GATGGGTACATT----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC----GCC-TCT-CTTGAAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGATTGTG------TGGTTGTCATGACTT--GATGTGTAA-G---TGA-TGGACTGAAGGTGTTGCC-ATGCAG---TC--TCCTGAG-TC-C-CTC-CAACGCT-CGGCT-GT--TTCCAC--AGGTACAATTTCCGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGT--TTGATCTGGACGTCAC-GTCTTATAAA-A---CTCGCCTTGTGGGTCGCTAATACC-TGG-AGTGCGCCTTTCAGAACCG--TTACTACGCGA-GGGATCGG-TTGTGAGGAATAGG------ATGTTGCGTTATT----CTTGTTGGGAAGC-TCCACAAGT-CTGC-AGTAAGACCCGT-GTCAGCAAA-TAACGTT-CCTGAAGGTTGTTGTTCACCCT--AGGGA-TT--TATTC
gi|4 : tgtatgaaacggtaagtggtgactgacgactgaccatcggtacaacacgttgtgctgcgcccaataagaaagctcgagatccacatctatgggtgaggcccctgaatcgcgtatatgctgatgccagttttatcaggtatagtcggtttgtggtgggactttatcaaaggccttggagaagtcaaaaagcacacagtctactgttccctattgtttaggctctttgctgagggtccactgaacttgacaggaatgatgttgggttcaagttgagcgacgcttcctgaattccatgctgactattcagatgagggagtccataactgtccaagtgatcttatgatattggctgtggatatatgttccatgaaccttgccctgcaaacagaggtcagtgacacgggtcgatattggtgtgttagctacttcggggttctcccttcttgaatagcgagcgtgaaatattgggccgacttccattcatctgggccttggcttgtctaatatgaaacttgga-GTA--ATC-T--TGAATG--A--GACCTGCCGTGCGGGCC-TGTA-GCTT----AT----GG-GGGTTGAAAC-TGC-CGTAGGA-GT-------------------------------------GATGTT-G-G-GACCTGGTTGATGTAGACTAATTCC-AACATC-TGGT-AGTGCT-TCCGCTAT--TCTT-CTCTGAG--G----AT--CAG-ATGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAG-AT-AT-T-GCCT-TTCACCTTGGCGTCA-CTGTA-GGCAATAATACCCTCC---GCTTTTAAT-G-GTGCAA--CCTC-AC-AGGC-ATT--CCGT-GCGC-TTGC-TT-TT--GATA-C-GCTCA-C-CAG-GTCC-G-CTTTGGTTTA-TGGTCCTCATTCAT-GTCAAT--GTTGTTACACATACTCCT-G-GTATCC-G-AATCTGCAATG--CA--CATGTACAGGTTTTTAA-GGTCTTT--AT---------AGA--ACGGGGTA---------ATA------------------ACGGTG---TACAA-TTTATCTTC-CTGCATCATTT--AAAAGTACGGAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACC-----------GTCTCGTATGATCCGGGGCTGGTTAAAGCACTGTAA-TGTCAGTCTTTGGAT-GGTATA-T----TTGTGCTGAGAACACCAAGGC-A--TCC-GCTCCTT-AAAGCTGGTCCAGAGATACCTC-ACTGGGTC-TG------TGG-TATCATTACTG--AAT-TG--A-A---TGA-CTGACTGAAGGTA--GTC-ATGCTG---TC--T-CTGAG-TC-TGCTCGTAA-G-T-CGACT-CTG-TTCTAT--AGGTACAACTTTTGAC-TAAC-GGTCGCT-----GGAAC--TTGATTTGGACATAACTGTC-GATAAATAATTAT-GTCTCGT-GGTCGCTGGTACCTTGCAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTCATTA-GTTA-GGA-TCGGTTTGTGAGGA
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Reference ( family-223 ) : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGG---GC-TATTTGGTG-AA-GATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GG-GGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTC--TACCCC--ATC--TTNA-TGGA-CT-G-T-GATGTT-G-G-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCC-CATATC-TGGT-AGTNGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAATA-CAGA-TGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-ATCT-GCCT-T-CACCCTGGCGTCAACTGTA-CGCAATA---CCCTCC---CNCTTTAAT-G-GTGCAAC--CCC-AC-GGGC-AT-C---CGT-GCGC-TTGC-TT-TT--GATA-AAGCTCCA-CAG-G--C-GTTTT-GGTTTA-TGGTCCTCATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CACATACTCCT-G-GTATC-CG-AGTTTGCATTGC--A--C-ATGTACAGCATTTTAA-GGTCTTTA---A-TAG---------C---AC-GA--TCA------ATCA---------C-GTG---TGGAG-TTGGTCTTC-GAGTATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACCG-TTTA--AG-GTCTCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCTGTGA-TGTCA-TCTTC-GAT-GGTACA-T----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC-A--GCC-GCT-CTT-AAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGGTT-TG------TGG-TGTCATGACTT--GATGTG--A-A---TGA-CTGACTGAAGGTG--GCC-ATGCNG---TC--T-CTGAG-TC-C-CTC-CAA-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTCGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGC--TTGACCTGGACGTCACTGTC-GATAAATA---AT-GCCTCGT-GGTCGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTACTA-GCGA-GGG-TCGGTTTGTGAGGAATAGGTC-A-AAAGTTGAGTTATT-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGC-AGT-AGACCGGT-GTCAGCAAA-TAA-GTT-CATGAAGG-TGTTGTTCACCCCTAAGGGG-TTTCTATTCCCAATAATGGAGT-TGG-TTGACCA-----CGAAA-TATGCGGTAAGT----TGAAGTCTCCGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTTTGGGTTTGCCTGGATAAGGCCGTGTAGCTCTTCACAGATACGTTCTGCTTCCCCTGGTTACTACTGG-GTGG-TCTGTATAGTCCTGCTATGTTCAGTGGTGGGTGTGTCCCTC-TCTTCACTGATATTGCAACTATCTCAGAT-GTTTTTGAGACGTGGAG-TTCATCGCATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATGA-TAATAACACCTCCATAACCATCCTGGCGGTCCCTCCTAGCCTTAACAGCATAACCTGGCG--GCAGGAATTCACTA-TCA--TGAACAT-CTGGC-----CGCAACCA-TGTTTCAGTGCCTACAACAATATCTGGGTCTGCCGAGTACATGAGA-T-CATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATGCGGAATTTATG-TTGTGGCGGTTTTGCTNTGGCGCCTGGCCCCCTTTTGGGTGAGG---ATG-------TG-------GCGATCCAGGATCTCCTGTACTACT-CATGCTCGTGTTGGTATTC-AAGCTGTCGATAAGTGTTGGATGT-ATCAATGGTGAAAGACTC-AAC----AGTG---TAGCAAAGTTTGGCAGT-CGC-AT--GAACAGCA--TAT--CCC--AGCTNACATCAGGGTTAGCGT-GGTATTTG-TAGACCTGACTAGGCATATCT-AG------GCGGTCTACATGGTACCACTGG---------TCA---------CAA--GCAA-TGGCACGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACA-TATCTGA-CACGGGTATCTGG-------------GTGGAC----GCTGGGTTAAGCTCGC-AGTC-AGCTGATCTCGGTAGT
gi|1 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGA---GC-TATT-GGTG-AA-AATGTTGCC--TTTCA-GTA--GTC-T--TGA-TG--AAAGACCT--CGTC-GGGCCGTGTA-GCTT---TAT----GG-CT-TTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCGT--CACCCT--ATC--TTCA-TGGA-CT-G-TTGATTTT-G-G-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCC-CATATC-TGGT-AGTCGTCTCCGC-AGCGTGCT-CTCCGAG--G-TGA-TA-CAGA-TGTAAAAAT-TGCTTG-A---AAGGATGATCTTGCCT-TTCACCCTGGCGC--ACTGTA-CGCGATA---CCCTCC----TCTTTAATAG-GTGCAAC--CCCCAC-AGGTTAT-C---CGT-GCGC-T-GC-TT-TTTGAATATAAGCTCCC-C-G-G--C-GTTTT-GGCTTA-TGGTCCTCATCCAT-GATAAT--GTTGTT-CACATACTCCT-TCATATC-CGCAGTTTGCATTG---A--C-ATGTACAGCATTTTTATGGTCTTTA-----TAG---------C---TC-AA--GTA------ATCA---------C-GTG---TG-AG-TTGGTCTTTTGAGTATTGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACCG-TTTA--AG-GTCT-TAGTGACCCAGGGCTTGTTATAGCGCTGTAAATGTCA-T--TC--AT-GGTACA-T----TTGTGTTG-GAACATCAAGGC-A--GCCCGC--CTT-TAAGCTG-TCCAGAGAT-CTCAAACTGGGTT-TG------TGG-TGTCATGACTTTTGATGTG--A-A---TGAGCTGACTGAAGGTG--GCCGATGCAG---TC--T-CTGAGCTC-C-CTC-CAA-G-TTCGGCTGCTGATTCCAC-------------------TAGTGGGTCGCT-----GAAG---TTGACCTG-ACGTCAC-GTC-TATAAATA---GT-GCCTCGT-GGTAGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTA-TA-GCGA-GGG-TCGGTTGCTGAGAATCAGGT--A-AGAGTTGCGTTA-T-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGCAAGT-AGACCGGT-GTCAGCAAATTAA-GTTCCATG-AGG-TGTTGTTCACTCC-AAGGGA-TTTCTATTCCCAATAAT-GAGTCTGGTTTGACCA-----TGAAAGTCTG-GGTAAGT----TGAAGTCTCCGGTCCGCCAGCAGAATGCGGCGAGTTTGGGTTTGCCT-GACAAGGCCGTGTA-CTCTTCACAGATACGTTCTGC--------------ACTGGCGTGGTTCTGTATAGTCCTGCAATGTTCAGTGGT-AGT-TGTCCCTCTTCTTCACTGA-ATTGCAACTA--TCATATGGTTTTTGAGACGTGAAGTTTCATCACATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATGATTAATAACACCTCCA-AACCACCCTGGCGGTCC--TCTAGCTTTAACAGCATAACCTGGGGGTGCAGACATTCACTATTCACTTGAACATCCTGGC-----CGCAACCATTGTTTCAGTGCC-AC-ACATAATCTGGGTCTGCTGAGTACATGAGA-T-CATAAAGCTTGCCTTTTCTCGCACTTATACTCTTGCGATGTTCAGTGAGATGATGCAGAATTT-TGTTTGTGGCGGTTTTGCTCTGGCGCCTGGCCCCCTTTTGGGTGAGATGTATG-------TAAC-----GCGATCCCAGATCTCCTGTATTACTGCATGCTCGTGTTGGTATTCAAAGCTGTCGATAAGTGTTGGATGTGATCAATGGTGAAAGACTCAAACAGTGAGTG---TAGCAAAG-TTGGCAAT-CGCGATTGGATCAGCA--TAT--CTCCAAGCTGATACCAGAGTTAGCGTGGGTATTTGCCAGACCTGGCTA-GCATATCTCAG------GCGGTCTACATGGTACCACTGGTCACCATTATCA---------CAA--GCAATTAGCACGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACACTGTCTGA-CACGGGTA-CTGG-------------GTGGGCGTGGGCTGGGTTAAGCTCGCGAGTCAAGCTGATCTCAGTAGT
gi|10 : cttgcaaacagaggtcagtgagcacggtcgatagattgactgggtgcaccttcgtctcccttcttgaatagcggcacgtgattattgccgacccattcagtctagaccttgccttgatcagtgaagctga--TTAA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-GTG-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCT-AATATC-TGGT-AGTCGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAA-A-CAGAATGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-AT-T-GCCT-T-CACCCTG-CATCAACTGCA-TGCAATA---CCTTCC---CACTT-AAT-G-GTGCAAC--CCC-ACAGGGC-AC-CGACCAT-GTGT-TAGC-TT-T---AATA-A-GCTCCA--AA-G--C-GTTTT-GGTTTA-TGGGTCT-ATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CA-ACACTCCT-G-GTA---CG-GATTTGCATTGC--GACC-ATGTACAGCATTGTAA-GGTCTTTA---A-TAGGCAGCGAATCGTAAT-GA--TCA------GTTAATTGA----C-GTGGTTTGGAG-TTGGTCTTCAGAGT-T--TTT--TAAACCAT-GTTCCC--TCTCT-CACTGTGACAACCG-TTTG--Ag
gi|11 : --TTAA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-GTG-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCT-AATATC-TGGT-AGTCGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAA-A-CAGAATGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-AT-T-GCCT-T-CACCCTG-CATCAACTGCA-TGCAATA---CCTTCC---CACTT-AAT-G-GTGCAACGCCCC-ACAGGGC-AC-CGACCAT-GTGT-TAGC-TT-T---AATA-A-GCTCCAACAG-G--C-GTTTTTGGTTTA-TGGGTCT-ATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CACA--CTCCT-G-GTATC--G-A-TTTGCATTGCCCA--CCATGTACAGCATTGTAA-GGTCTTTA---A-TAG---------C---AC-GA--TCAGTAATGATCAGTTAATTGAC-GGT---TGGAG-TTGGTCTTC-GAG-GTTTTTT--AAACCCAT-GTC-CC--TCTCT-C-CTGTGACAACCG-TTT
gi|12 : --AAAAGCCC-GCT-TT--TTCCG-C-CTA-GACATGCGCTTTA--AGTGTCCATT-T-ATCCAGGGTTGACTAAAGCGAGTTGA-TGTCA-TCTTG-GAT-GGAACA-TGATCTTCCAT---GATCAT-AAGGC-ACGGCC-A---TTT-AAA---AGT------AT-CCC--AC---GTC-TGAGGAACTGG-TGT-AT--TCT--GAGGCG--ATA---TGA-TCG-CTGA--GTT--TTG-ATGCT----TCCGC-CTTAA-TCGT-TTC-CAT-G-T-CTGCA-TTT-TCCCACAAAAGT---ACTTTCCTCTTAATGGATCGTTTTCGGGGAACATTTG-TCTGGA---------C-GATA-------------TCAT-GATCACTGACTCC-CGGTA---------TCGGA--TG--TTGCCATGTGACGAG-AC--TTTGC-CGGATT--GTC-ACAAA---GAGTT-TT-CTTCTTGTT-GAAA-CGTCAACCG-T-CTGt
gi|13 : A-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTTGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGC--TTGACTTAGACATCATTGTT-GATAAACA---AT-GCCTTGT-AGTCGCTGTTTCT-TGGAAGTG-GC--TTCCGA--C-ATTCACTT-GTGA-GGG-TTGGTTTGTGAGAAATAGATTGA-AAGGTTGAGTTATTCC--CTTGTTGGGAT-C-TCCATCA-T-CTGC-AGT-AGGCTGGT-TTCAGCAAA-TAA-GTT-CATGAAGG-TGTTTTTCACCCCTAGGGGT-TTTCTATTCCCAATAACGGAGT-TGG-
gi|14 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGA---GC-TATTTGGTG-AA--ATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-TCTT---TAT----GG-GGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTT--TACCCC--ATC--TTTA-TGGG-CT-G-T-GATGTTGG-G-AAC-TGTTCGATGTGAGCTAATTCC-CATATC-TGAT-AGTGGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGGG--G-TGAA
gi|15 : TCCTAGCCTTAACAGTATAACCTGGTT--GCAGGAATTCACTA-TCA--TGATCAT-CCGGC-----CGCAACCA-TGTTTTAGTGCCTACAACAATATCTGGGTCTGCTGAGTACATGAGA-TCCATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATTTGAAATTTATG-CTGTGG
gi|16 : CA-TAG-G--C-GTTTT-GGTTTA-TGGGTCTCATCCAC-GATAAT--GTTGTT-CACA--CTCCT-G-GTATC-CA-AGTTTGCATTGC--A--C-ATGTACAGCATTGTAA-AGTCTTTA---AATAG---------C---AC-GA--TCAGTAATGATCAGTAATGA--C-GTG---TGGAG-TTGGTCTTC-GAGTATTTTTT--AAAACCAT-GTT-CC--TCTCT-C-CTG-GACAACCG-TTTA--tagagttagcgtggta
gi|17 : CAGGATTGGCTATACCGTTGAGA-TGTCA-TCTTT-GTC-GGCACA-TTC--TTCTGTAGTGCA-ATC-AGGCAA--GTT-G-T-CTT-AAAAATTAACCAAAGTT-GGTCAACTGG----TGAGA---CGG-TGTTGTGGTTT--GCTATG--A-ACTGTAA---GAC--AAAACG--GC---TGGGGTCTTC--T-CTCAT-GC-C-ATC-AAC-G-T-TTG-T-CTGTTTCCAC--AAGT
gi|18 : TATT-C--CTTGTT-GGAA-T-TCCGCCA-TCCTGC-AGT-AGGCCGGTGGTCAGCAAA-TAA-TTT-CATGACGA-T-TTGTTCA-CCCTAAGGGGTTTTCTATTCCC--TA--GGCGT-TAG-TTG-CCATGGATCGAAA-TAT-CAA-AAGTGTAGTGAAGTCTCC-GTCAGC---CAGAATG-GG-GA
gi|2 : AAAAGTA-GTGTCAAAATTGGA---AC-TATTTGGTGTAATAATGTTTCC--TT-CA-GTA--ATC-T--TGA-TG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-ACTC---TAT----GA-GGGTAGAG-C-TGA-CCTAGGA-GTTTCTC--TAACCC--ATC--TTAA-TGGA-TT-G-T-GATG---G-G-GAC-TGTTGAATGTGGGCTAATTCC-CATATC-GGGT-ATAGGT-TCCAA-AG--TGTT-CTCCGAG--G-TGAATA-CAGA-TGTAAA--T-TGCT-G-GTT-AAGAAT-ATCT-GCCT-T-CACCCTGGCGTCA-CTGTA-CGCAATA---CCCTAC---AGCATTAAG-G-GTACAAC--CCC-AC-TGGC-AT-C---TGT-GCGT-TTGC-TT-TT--GATA-AAGCTTCA-CAG-G--G-GTTTT-GGCTTA-TGGTCCTCATCCAT-GACAAT--GTTGTT-CACAAACTCCT-C-ATATCTTG-AGTTTGCATTCC--A--C-ATGTACAGCATTTTAA-A-------------------------------GG--TCA------ATCA---------C-GTA---TGGAG-CAGGTCTTA-GAGTATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTTT-C-CTA-GACAACC--TTTA--AG-GTATCTTGTGATTCAGGGCTGGTTAAAGCGATGTTA-TGTCA-TCTTC-GAT-GGTACA-T----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC-A--ATC-GCT-CTT-AAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGGTT-TA------TGG-TGTCATGACTT--GA--TG--A-A---TTA-CTGACTGAAGGTG--GTC-ATGCCC---TC--T-CTGAG-TC-C-CTC-CAA-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTCGAC-AAGTGGACTGCT-----GGAGT--TTGACCTGGACATCACTGTC-GATAAATA---AT-GCCTCGT-GGTCGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTACTA-GTGA-GGA-TTGATTTGTGAGGAATAGGTC-A-AAAGTTGAGTTATT-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGC-AGT-AGACCGGT-GTCAGCAAA-TAA-GAT-CATGAAGG----TGTTCAATCCTAAGGGG-TTTCTATTCCCAATAATGGAGT-TGG-CTGACCA-----TGAAA-TATGTGGTAAGT----TGAAGTCTCTGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTTTGGGTTTGCCTGGATAAGGCTTTGTAGCTCTTCACAGATACGTTCTGCTTCCCCTGGTTACTACTGG-GTGG-TCTGTATAG--CTA-TATGTTCAGTGGTGGGTGTGTTCCTC-TCTTTACAGATATTGCAACTATCTCAGAT-GTTTTTGAGGCATGGAG-TTCATCGCATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATAA-TAATAACACCTCCATATCCATCCTGGCGGTCCCTCCTACCCTTAACAGCATAATCTGGTG--GCAGGAATTCACTA-TCA--TAAACAT-CTGGC-----CGCAACCA-TTTTTCAGTGCCTACAACAATATTTGGGTCTGTCAAGTATATGAGATT-CATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATGCGGAATTTATG-TTGTGGCGGTTTTGCTGTGGTGCCTGGTCCCCTTTTAGGTGAGG---A---------TG-------GCGATCCAGGATCTCCTGTACTTCT-CATGCTCGTGTTGGTATTC-AAGCTGTCT-TAAGGTTTGGATGT-ATCAGTGGTGAA--------------AATG---TAGCAAAGTTTGGCAGTCCAC-AT--GAACAGCATTTATTACCC--AGCTAACATCAGGGTTAGCGT-TGTATTTG-TAGACCTCACTAGGCAATTCT-AG------GCAGTCTACATAGTGCCACTGG---------TCACAGCTGTTGCAA--GTAA-TGGCACGCTTACCCCACCTACAGGCTTTGTGACA-TATCTGA-CACGGGTATTTGG-------------GTGGAC-----CTCGCTTAAGCTCAC-AGTC-AGCTGATCTCGGTAGT
gi|21 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGG---GC-TATTTGGTG-A--GATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GG-AGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTC--TA
gi|22 : AGAGTTAGCGT-GGTATTTG-CAGACCTGACTAGGCATATCT-AG------GCAGTCTACATGGTACCACTGG---------TCA---------TAA--GCAA-TAGCATGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACA-T
gi|23 : TATTGG-TAGGCGTAACT-TGCCTGTCT-TGTACATTGCGGTCT----GGTACCACTGG---------TTA---------CAAACGCAA-T--CATGCTG---TCAGCT--AAGCCTT---ACA-TACC
gi|24 : ATCA-----CGAAA-TGTCCGGTAAGT----TGACGTCACCGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTCTGGGCTTGCTTGGATAAGACTGTG
gi|25 : ATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-TACAACCG-TTTC--AG-GTATCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCTGgcctccccata
gi|3 : AAAAGTAAGTGTCAAAGCTGGAA--GC-TATTTGGTG-A--GATGTTTCC--TT-CAAGTACAGTCCT--TGA--G--A--GAC-T--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GGTGGGTTGAG-C-TGAACGTAGGAAGTTTCTC--TACACCTGATTCTTTTA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-G-GGAAC-TGTTGGAGTTGCACTAATTCC-CATATCCTGGT-AGTCGT-TCCGCCAG--TGCTTCTCCGCGTGG-TGAATATCAGG-TGTAAA--T-TGCT-G-ATTTAAGGAT-ATCT-GCTTAT-TTTCTGGGCGTCA-CTGTA-CGCAATA---CCTCCCTTTCATTTAAAT-G-G-GCAAC--CC--AC-AGGC-AT-C----GT-GCGC-TTGCCTT-TT--TATA-AAGCTCCA-CAG-G--CCGTTTT-GGCTTAATGGTCCTCATCCATTGATAATTTGTTGTTTCA-ATACTCCTCA-ATATC-TG--GTGTGCATTGC--AG-C-A-GTACAGCATTTTAA-GGTCTTTATTTA-TTG---------C---TC-AAAGT-A------ATCA---------C-GTG---TGGAGGTTAGTCTTT-GAGTATCGTTTT-AAAAGCAC-GAT-CCCTTTTCTTC-CTATGGCGAATG-TTTATAAG-GTCTCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCT-TGA-TGT-A-TTTTC-GATGGGTACATT----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC----GCC-TCT-CTTGAAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGATTGTG------TGGTTGTCATGACTT--GATGTGTAA-G---TGA-TGGACTGAAGGTGTTGCC-ATGCAG---TC--TCCTGAG-TC-C-CTC-CAACGCT-CGGCT-GT--TTCCAC--AGGTACAATTTCCGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGT--TTGATCTGGACGTCAC-GTCTTATAAA-A---CTCGCCTTGTGGGTCGCTAATACC-TGG-AGTGCGCCTTTCAGAACCG--TTACTACGCGA-GGGATCGG-TTGTGAGGAATAGG------ATGTTGCGTTATT----CTTGTTGGGAAGC-TCCACAAGT-CTGC-AGTAAGACCCGT-GTCAGCAAA-TAACGTT-CCTGAAGGTTGTTGTTCACCCT--AGGGA-TT--TATTC
gi|4 : tgtatgaaacggtaagtggtgactgacgactgaccatcggtacaacacgttgtgctgcgcccaataagaaagctcgagatccacatctatgggtgaggcccctgaatcgcgtatatgctgatgccagttttatcaggtatagtcggtttgtggtgggactttatcaaaggccttggagaagtcaaaaagcacacagtctactgttccctattgtttaggctctttgctgagggtccactgaacttgacaggaatgatgttgggttcaagttgagcgacgcttcctgaattccatgctgactattcagatgagggagtccataactgtccaagtgatcttatgatattggctgtggatatatgttccatgaaccttgccctgcaaacagaggtcagtgacacgggtcgatattggtgtgttagctacttcggggttctcccttcttgaatagcgagcgtgaaatattgggccgacttccattcatctgggccttggcttgtctaatatgaaacttgga-GTA--ATC-T--TGAATG--A--GACCTGCCGTGCGGGCC-TGTA-GCTT----AT----GG-GGGTTGAAAC-TGC-CGTAGGA-GT-------------------------------------GATGTT-G-G-GACCTGGTTGATGTAGACTAATTCC-AACATC-TGGT-AGTGCT-TCCGCTAT--TCTT-CTCTGAG--G----AT--CAGA-TGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAG-AT-AT-T-GCCT-TTCACCTTGGCGTCA-CTGTA-GGCAATAATACCCTCC---GCTTTTAAT-G-GTGCAAC--CTC-AC-AGGC-ATTC---CGT-GCGC-TTGC-TT-TT--GATA-C-GCTCAC-CAG-GTCC-GCTTT-GGTTTA-TGGTCCTCATTCAT-GTCAAT--GTTGTTACACATACTCCT-G-GTATC-CG-AATCTGCAATGC--A--C-ATGTACAGGTTTTTAA-GGTCTTT----A-TAG---------A---ACGGG--GTA------ATAA---------CGGTG---TACAA-TTTATCTTC-CTGCATCATTT--AAAAGTACGGAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACC-----------GTCTCGTATGATCCGGGGCTGGTTAAAGCACTGTAA-TGTCAGTCTTTGGAT-GGTATA-T----TTGTGCTGAGAACACCAAGGC-A--TCC-GCTCCTT-AAAGCTGGTCCAGAGATACCTC-ACTGGGTC-TG------TGG-TATCATTACTG--AAT-TG--A-A---TGA-CTGACTGAAGGTA--GTC-ATGCTG---TC--T-CTGAG-TC-TGCTCGTAA-G-T-CGACT-CTG-TTCTAT--AGGTACAACTTTTGAC-TAAC-GGTCGCT-----GGAAC--TTGATTTGGACATAACTGTC-GATAAATAATTAT-GTCTCGT-GGTCGCTGGTACCTTGCAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTCATTA-GTTA-GGA-TCGGTTTGTGAGGA
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gi|21 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGG---GC-TATTTGGTG-A--GATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GG-AGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTC--TA
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Reference ( family-223 ) : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGG---GC-TATTTGGTG-AA-GATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GG-GGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTC--TACCCC--ATC--TTNA-TGGA-CT-G-T-GATGTT-G-G-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCC-CATATC-TGGT-AGTNGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAATA-CAG-A-TGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-ATCT-GCCT-T-CACCCTGGCGTCAACTGTA-CGCAATA---CCCTCC---CNCTTTAAT-G-GTGCAAC--CCC-AC-GGGC-AT---C---CGT-GCGC-TTGC-TT-TT--GATA-AAGCTCCA-CAG-G--C-GTTTT-GGTTTA-TGGTCCTCATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CACATACTCCT-G-GTATC-CG-AGTTTGCATTGC--A--C-ATGTACAGCATTTT-AA-GGTCTTTA---A-TA-GC-----------AC-GATCAA-TAAT--------------C--GTG---TG-GAG-TTGGTCTTC-GAGTATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACCG-TTTA--AG-GTCTCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCTGTGA-TGTCA-TCTTC-GAT-GGTACA-T----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC-A--GCC-GCT-CTT-AAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGGTT-TG------TGG-TGTCATGACTT--GATGTG--A-A---TGA-CTGACTGAAGGTG--GCC-ATGCNG---TC--T-CTGAG-TC-C-CTC-CAA-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTCGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGC--TTGACCTGGACGTCACTGTC-GATAAATA---AT-GCCTCGT-GGTCGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTACTA-GCGA-GGG-TCGGTTTGTGAGGAATAGGTC-A-AAAGTTGAGTTATT-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGC-AGT-AGACCGGT-GTCAGCAAA-TAA-GTT-CATGAAGG-TGTTGTTCACCCCTAAGGGG-TTTCTATTCCCAATAATGGAGT-TGG-TTGACCA-----CGAAA-TATGCGGTAAGT----TGAAGTCTCCGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTTTGGGTTTGCCTGGATAAGGCCGTGTAGCTCTTCACAGATACGTTCTGCTTCCCCTGGTTACTACTGG-GTGG-TCTGTATAGTCCTGCTATGTTCAGTGGTGGGTGTGTCCCTC-TCTTCACTGATATTGCAACTATCTCAGAT-GTTTTTGAGACGTGGAG-TTCATCGCATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATGA-TAATAACACCTCCATAACCATCCTGGCGGTCCCTCCTAGCCTTAACAGCATAACCTGGCG--GCAGGAATTCACTA-TCA--TGAACAT-CTGGC-----CGCAACCA-TGTTTCAGTGCCTACAACAATATCTGGGTCTGCCGAGTACATGAGA-T-CATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATGCGGAATTTATG-TTGTGGCGGTTTTGCTNTGGCGCCTGGCCCCCTTTTGGGTGAGG---ATG-------TG-------GCGATCCAGGATCTCCTGTACTACT-CATGCTCGTGTTGGTATTC-AAGCTGTCGATAAGTGTTGGATGT-ATCAATGGTGAAAGACTC-AAC----AGTG---TAGCAAAGTTTGGCAGT-CGC-AT--GAACAGCA--TAT--CCC--AGCTNACATCAGGGTTAGCGT-GGTATTTG-TAGACCTGACTAGGCATATCT-AG------GCGGTCTACATGGTACCACTGG---------TCA---------CAA--GCAA-TGGCACGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACA-TATCTGA-CACGGGTATCTGG-------------GTGGAC----GCTGGGTTAAGCTCGC-AGTC-AGCTGATCTCGGTAGT
gi|1 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGA---GC-TATT-GGTG-AA-AATGTTGCC--TTTCA-GTA--GTC-T--TGA-TG--AAAGACCT--CGTC-GGGCCGTGTA-GCTT---TAT----GG-CT-TTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCGT--CACCCT--ATC--TTCA-TGGA-CT-G-TTGATTTT-G-G-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCC-CATATC-TGGT-AGTCGTCTCCGC-AGCGTGCT-CTCCGAG--G-TGA-TA-CAG-A-TGTAAAAAT-TGCTTG-A---AAGGATGATCTTGCCT-TTCACCCTGGCGC--ACTGTA-CGCGATA---CCCTCC----TCTTTAATAG-GTGCAAC--CCCCAC-AGGTTAT---C---CGT-GCGC-T-GC-TT-TTTGAATATAAGCTCCC-C-G-G--C-GTTTT-GGCTTA-TGGTCCTCATCCAT-GATAAT--GTTGTT-CACATACTCCT-TCATATC-CGCAGTTTGCATTG---A--C-ATGTACAGCATTTT-TATGGTCTTTA-----TA-GC----------------TCAAGTAAT--------------C--ACG---TGTGAG-TTGGTCTTTTGAGTATTGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACCG-TTTA--AG-GTCT-TAGTGACCCAGGGCTTGTTATAGCGCTGTAAATGTCA-T--TC--AT-GGTACA-T----TTGTGTTG-GAACATCAAGGC-A--GCCCGC--CTT-TAAGCTG-TCCAGAGAT-CTCAAACTGGGTT-TG------TGG-TGTCATGACTTTTGATGTG--A-A---TGAGCTGACTGAAGGTG--GCCGATGCAG---TC--T-CTGAGCTC-C-CTC-CAA-G-TTCGGCTGCTGATTCCAC-------------------TAGTGGGTCGCT-----GAAG---TTGACCTG-ACGTCAC-GTC-TATAAATA---GT-GCCTCGT-GGTAGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTA-TA-GCGA-GGG-TCGGTTGCTGAGAATCAGGT--A-AGAGTTGCGTTA-T-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGCAAGT-AGACCGGT-GTCAGCAAATTAA-GTTCCATG-AGG-TGTTGTTCACTCC-AAGGGA-TTTCTATTCCCAATAAT-GAGTCTGGTTTGACCA-----TGAAAGTCTG-GGTAAGT----TGAAGTCTCCGGTCCGCCAGCAGAATGCGGCGAGTTTGGGTTTGCCT-GACAAGGCCGTGTA-CTCTTCACAGATACGTTCTGC--------------ACTGGCGTGGTTCTGTATAGTCCTGCAATGTTCAGTGGT-AGT-TGTCCCTCTTCTTCACTGA-ATTGCAACTA--TCATATGGTTTTTGAGACGTGAAGTTTCATCACATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATGATTAATAACACCTCCA-AACCACCCTGGCGGTCC--TCTAGCTTTAACAGCATAACCTGGGGGTGCAGACATTCACTATTCACTTGAACATCCTGGC-----CGCAACCATTGTTTCAGTGCC-AC-ACATAATCTGGGTCTGCTGAGTACATGAGA-T-CATAAAGCTTGCCTTTTCTCGCACTTATACTCTTGCGATGTTCAGTGAGATGATGCAGAATTT-TGTTTGTGGCGGTTTTGCTCTGGCGCCTGGCCCCCTTTTGGGTGAGATGTATG-------TAAC-----GCGATCCCAGATCTCCTGTATTACTGCATGCTCGTGTTGGTATTCAAAGCTGTCGATAAGTGTTGGATGTGATCAATGGTGAAAGACTCAAACAGTGAGTG---TAGCAAAG-TTGGCAAT-CGCGATTGGATCAGCA--TAT--CTCCAAGCTGATACCAGAGTTAGCGTGGGTATTTGCCAGACCTGGCTA-GCATATCTCAG------GCGGTCTACATGGTACCACTGGTCACCATTATCA---------CAA--GCAATTAGCACGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACACTGTCTGA-CACGGGTA-CTGG-------------GTGGGCGTGGGCTGGGTTAAGCTCGCGAGTCAAGCTGATCTCAGTAGT
gi|10 : cttgcaaacagaggtcagtgagcacggtcgatagattgactgggtgcaccttcgtctcccttcttgaatagcggcacgtgattattgccgacccattcagtctagaccttgccttgatcagtgaagctga--TTAA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-GTG-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCT-AATATC-TGGT-AGTCGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAA-A-CAGAA-TGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-AT-T-GCCT-T-CACCCT-GCATCAACTGCA-TGCAATA---CCTTCC---CAC-TTAAT-G-GTGCAAC--CCC-ACAGGGC-ACCGAC---CAT-GTGT-TAGC--T-TT--AAT--AAGCTCCA--AA-G--C-GTTTT-GGTTTA-TGGGTCT-ATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CA-ACACTCCT-G-GTA---CG-GATTTGCATTGC--GACC-ATGTACAGCATTGT-AA-GGTCTTTA---A-TAGGCAGCGAATCGTAAT-GATCAGTTAATTGA-----------C--GTGGTTTG-GAG-TTGGTCTTCAGAGT-T--TTT--TAAACCAT-GTTCCC--TCTCT-CACTGTGACAACCG-TTTG--Ag
gi|11 : --TTAA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-GTG-AAC-TGTTGGATGTGGACTAATTCT-AATATC-TGGT-AGTCGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGAG--G-TGAA-A-CAG-AATGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAGGAT-AT-T-GCCT-T-CACCCTG-CATCAACTGCA-TGCAATA---CCTTCC---CACTT-AAT-G-GTGCAACGCCCC-ACAGGGC-AC---CGACCAT-GTGT-TAGC-TT-T---AATA-A-GCTCCAACAG-G--C-GTTTTTGGTTTA-TGGGTCT-ATCCAC-GACAAT--GTTGTT-CACA--CTCCT-G-GTATC--G-A-TTTGCATTGCCCA--CCATGTACAGCATTGT-AA-GGTCTTTA---A-TA-GC-----------AC-GATCAG-TAATGATCAGTTAATTGAC--GGT---TG-GAG-TTGGTCTTC-GAG-GTTTTTT--AAACCCAT-GTC-CC--TCTCT-C-CTGTGACAACCG-TTT
gi|12 : --AAAAGCCC-GCT-TT--TTCCG-C-CTA-GACATGCGCTTTA--AGTGTCCATT-T-ATCCAGGGTTGACTAAAGCGAGTTGA-TGTCA-TCTTG-GAT-GGAACA-TGATCTTCCAT---GATCAT-AAGGC-ACGGCC-A---TTT-AAA---AGT------AT-CCC--AC---GTC-TGAGGAACTGG-TGT-AT--TCT--GAGGCG--ATA---TGA-TCG-CTGA--GTT--TTG-ATGCT----TCCGC-CTTAA-TCGT-TTC-CAT-G-T-CTGCA-TTT-TCCCACAAAAGT---ACTTTCCTCTTAATGGATCGTTTTCGGGGAACATTTG-TCTGGA---------C-GATA-------------TCAT-GATCACTGACTCC-CGGTA---------TCGGA--TG--TTGCCATGTGACGAG-AC--TTTGC-CGGATT--GTC-ACAAA---GAGTT-TT-CTTCTTGTT-GAAA-CGTCAACCG-T-CTGt
gi|13 : A-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTTGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGC--TTGACTTAGACATCATTGTT-GATAAACA---AT-GCCTTGT-AGTCGCTGTTTCT-TGGAAGTG-GC--TTCCGA--C-ATTCACTT-GTGA-GGG-TTGGTTTGTGAGAAATAGATTGA-AAGGTTGAGTTATTCC--CTTGTTGGGAT-C-TCCATCA-T-CTGC-AGT-AGGCTGGT-TTCAGCAAA-TAA-GTT-CATGAAGG-TGTTTTTCACCCCTAGGGGT-TTTCTATTCCCAATAACGGAGT-TGG-
gi|14 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGA---GC-TATTTGGTG-AA--ATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-TCTT---TAT----GG-GGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTT--TACCCC--ATC--TTTA-TGGG-CT-G-T-GATGTTGG-G-AAC-TGTTCGATGTGAGCTAATTCC-CATATC-TGAT-AGTGGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGGG--G-TGAA
gi|15 : TCCTAGCCTTAACAGTATAACCTGGTT--GCAGGAATTCACTA-TCA--TGATCAT-CCGGC-----CGCAACCA-TGTTTTAGTGCCTACAACAATATCTGGGTCTGCTGAGTACATGAGA-TCCATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATTTGAAATTTATG-CTGTGG
gi|16 : CA-TAG-G--C-GTTTT-GGTTTA-TGGGTCTCATCCAC-GATAAT--GTTGTT-CACA--CTCCT-G-GTATC-CA-AGTTTGCATTGC--A--C-ATGTACAGCATTGT-AA-AGTCTTTA---AATA-GC-----------AC-GATCAG-TAATGATCAGTAATGA--C--GTG---TG-GAG-TTGGTCTTC-GAGTATTTTTT--AAAACCAT-GTT-CC--TCTCT-C-CTG-GACAACCG-TTTA--tagagttagcgtggta
gi|17 : CAGGATTGGCTATACCGTTGAGA-TGTCA-TCTTT-GTC-GGCACA-TTC--TTCTGTAGTGCA-ATC-AGGCAA--GTT-G-T-CTT-AAAAATTAACCAAAGTT-GGTCAACTGG----TGAGA---CGG-TGTTGTGGTTT--GCTATG--A-ACTGTAA---GAC--AAAACG--GC---TGGGGTCTTC--T-CTCAT-GC-C-ATC-AAC-G-T-TTG-T-CTGTTTCCAC--AAGT
gi|18 : TATT-C--CTTGTT-GGAA-T-TCCGCCA-TCCTGC-AGT-AGGCCGGTGGTCAGCAAA-TAA-TTT-CATGACGA-T-TTGTTCA-CCCTAAGGGGTTTTCTATTCCC--TA--GGCGT-TAG-TTG-CCATGGATCGAAA-TAT-CAA-AAGTGTAGTGAAGTCTCC-GTCAGC---CAGAATG-GG-GA
gi|2 : AAAAGTA-GTGTCAAAATTGGA---AC-TATTTGGTGTAATAATGTTTCC--TT-CA-GTA--ATC-T--TGA-TG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-ACTC---TAT----GA-GGGTAGAG-C-TGA-CCTAGGA-GTTTCTC--TAACCC--ATC--TTAA-TGGA-TT-G-T-GATG---G-G-GAC-TGTTGAATGTGGGCTAATTCC-CATATC-GGGT-ATAGGT-TCCAA-AG--TGTT-CTCCGAG--G-TGAATA-CAG-A-TGTAAA--T-TGCT-G-GTT-AAGAAT-ATCT-GCCT-T-CACCCTGGCGTCA-CTGTA-CGCAATA---CCCTAC---AGCATTAAG-G-GTACAAC--CCC-AC-TGGC-AT---C---TGT-GCGT-TTGC-TT-TT--GATA-AAGCTTCA-CAG-G--G-GTTTT-GGCTTA-TGGTCCTCATCCAT-GACAAT--GTTGTT-CACAAACTCCT-C-ATATCTTG-AGTTTGCATTCC--A--C-ATGTACAGCATTTTAAA-GGT---------------------------C-AATCA--------------------C--GTA---TG-GAG-CAGGTCTTA-GAGTATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTTT-C-CTA-GACAACC--TTTA--AG-GTATCTTGTGATTCAGGGCTGGTTAAAGCGATGTTA-TGTCA-TCTTC-GAT-GGTACA-T----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC-A--ATC-GCT-CTT-AAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGGTT-TA------TGG-TGTCATGACTT--GA--TG--A-A---TTA-CTGACTGAAGGTG--GTC-ATGCCC---TC--T-CTGAG-TC-C-CTC-CAA-G-T-CGGCT-CTG-TTCCAC--AGGTACAACTTTCGAC-AAGTGGACTGCT-----GGAGT--TTGACCTGGACATCACTGTC-GATAAATA---AT-GCCTCGT-GGTCGCTGATACC-TGGAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTTACTA-GTGA-GGA-TTGATTTGTGAGGAATAGGTC-A-AAAGTTGAGTTATT-C--CTTGTTGGGAA-C-TCCACCA-T-CTGC-AGT-AGACCGGT-GTCAGCAAA-TAA-GAT-CATGAAGG----TGTTCAATCCTAAGGGG-TTTCTATTCCCAATAATGGAGT-TGG-CTGACCA-----TGAAA-TATGTGGTAAGT----TGAAGTCTCTGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTTTGGGTTTGCCTGGATAAGGCTTTGTAGCTCTTCACAGATACGTTCTGCTTCCCCTGGTTACTACTGG-GTGG-TCTGTATAG--CTA-TATGTTCAGTGGTGGGTGTGTTCCTC-TCTTTACAGATATTGCAACTATCTCAGAT-GTTTTTGAGGCATGGAG-TTCATCGCATGGTAAGTTGGCCTTTGTTATAA-TAATAACACCTCCATATCCATCCTGGCGGTCCCTCCTACCCTTAACAGCATAATCTGGTG--GCAGGAATTCACTA-TCA--TAAACAT-CTGGC-----CGCAACCA-TTTTTCAGTGCCTACAACAATATTTGGGTCTGTCAAGTATATGAGATT-CATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATGCGGAATTTATG-TTGTGGCGGTTTTGCTGTGGTGCCTGGTCCCCTTTTAGGTGAGG---A---------TG-------GCGATCCAGGATCTCCTGTACTTCT-CATGCTCGTGTTGGTATTC-AAGCTGTCT-TAAGGTTTGGATGT-ATCAGTGGTGAA--------------AATG---TAGCAAAGTTTGGCAGTCCAC-AT--GAACAGCATTTATTACCC--AGCTAACATCAGGGTTAGCGT-TGTATTTG-TAGACCTCACTAGGCAATTCT-AG------GCAGTCTACATAGTGCCACTGG---------TCACAGCTGTTGCAA--GTAA-TGGCACGCTTACCCCACCTACAGGCTTTGTGACA-TATCTGA-CACGGGTATTTGG-------------GTGGAC-----CTCGCTTAAGCTCAC-AGTC-AGCTGATCTCGGTAGT
gi|21 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGG---GC-TATTTGGTG-A--GATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GG-AGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTC--TA
gi|22 : AGAGTTAGCGT-GGTATTTG-CAGACCTGACTAGGCATATCT-AG------GCAGTCTACATGGTACCACTGG---------TCA---------TAA--GCAA-TAGCATGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACA-T
gi|23 : TATTGG-TAGGCGTAACT-TGCCTGTCT-TGTACATTGCGGTCT----GGTACCACTGG---------TTA---------CAAACGCAA-T--CATGCTG---TCAGCT--AAGCCTT---ACA-TACC
gi|24 : ATCA-----CGAAA-TGTCCGGTAAGT----TGACGTCACCGGTCAGC---CAGAATG-GG-GAGTCTGGGCTTGCTTGGATAAGACTGTG
gi|25 : ATCGTTT--AAAAGCAC-GAT-CC--TTTCT-C-CTA-TACAACCG-TTTC--AG-GTATCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCTGgcctccccata
gi|3 : AAAAGTAAGTGTCAAAGCTGGAA--GC-TATTTGGTG-A--GATGTTTCC--TT-CAAGTACAGTCCT--TGA--G--A--GAC-T--CGTCCGGGCC-TGTA-GCTT---TAT----GGTGGGTTGAG-C-TGAACGTAGGAAGTTTCTC--TACACCTGATTCTTTTA-TGGA-CTTG-T-GATGTT-G-GGAAC-TGTTGGAGTTGCACTAATTCC-CATATCCTGGT-AGTCGT-TCCGCCAG--TGCTTCTCCGCGTGG-TGAATATCAG-G-TGTAAA--T-TGCT-G-ATTTAAGGAT-ATCT-GCTTAT-TTTCTGGGCGTCA-CTGTA-CGCAATA---CCTCCCTTTCATTTAAAT-G-G-GCAAC--CC--AC-AGGC-AT---C----GT-GCGC-TTGCCTT-TT--TATA-AAGCTCCA-CAG-G--CCGTTTT-GGCTTAATGGTCCTCATCCATTGATAATTTGTTGTTTCA-ATACTCCTCA-ATATC-TG--GTGTGCATTGC--AG-C-A-GTACAGCATTTT-AA-GGTCTTTATTTA-TT-GC-----------TC-AA--AG-TAAT--------------CACGTG---TG-GAGGTTAGTCTTT-GAGTATCGTTTT-AAAAGCAC-GAT-CCCTTTTCTTC-CTATGGCGAATG-TTTATAAG-GTCTCTTGTGATCCAGGGCTGGTTAAAGCGCT-TGA-TGT-A-TTTTC-GATGGGTACATT----TTGTGTTGAGAACATCAAGGC----GCC-TCT-CTTGAAAGCTGGTCCAGAGAT-CCTCAACTGGATTGTG------TGGTTGTCATGACTT--GATGTGTAA-G---TGA-TGGACTGAAGGTGTTGCC-ATGCAG---TC--TCCTGAG-TC-C-CTC-CAACGCT-CGGCT-GT--TTCCAC--AGGTACAATTTCCGAC-TAGTGGGTCGCT-----GGAGT--TTGATCTGGACGTCAC-GTCTTATAAA-A---CTCGCCTTGTGGGTCGCTAATACC-TGG-AGTGCGCCTTTCAGAACCG--TTACTACGCGA-GGGATCGG-TTGTGAGGAATAGG------ATGTTGCGTTATT----CTTGTTGGGAAGC-TCCACAAGT-CTGC-AGTAAGACCCGT-GTCAGCAAA-TAACGTT-CCTGAAGGTTGTTGTTCACCCT--AGGGA-TT--TATTC
gi|4 : tgtatgaaacggtaagtggtgactgacgactgaccatcggtacaacacgttgtgctgcgcccaataagaaagctcgagatccacatctatgggtgaggcccctgaatcgcgtatatgctgatgccagttttatcaggtatagtcggtttgtggtgggactttatcaaaggccttggagaagtcaaaaagcacacagtctactgttccctattgtttaggctctttgctgagggtccactgaacttgacaggaatgatgttgggttcaagttgagcgacgcttcctgaattccatgctgactattcagatgagggagtccataactgtccaagtgatcttatgatattggctgtggatatatgttccatgaaccttgccctgcaaacagaggtcagtgacacgggtcgatattggtgtgttagctacttcggggttctcccttcttgaatagcgagcgtgaaatattgggccgacttccattcatctgggccttggcttgtctaatatgaaacttgga-GTA--ATC-T--TGAATG--A--GACCTGCCGTGCGGGCC-TGTA-GCTT----AT----GG-GGGTTGAAAC-TGC-CGTAGGA-GT-------------------------------------GATGTT-G-G-GACCTGGTTGATGTAGACTAATTCC-AACATC-TGGT-AGTGCT-TCCGCTAT--TCTT-CTCTGAG--G----AT--CAG-A-TGTAAA--T-TGCT-G-ATT-AAG-AT-AT-T-GCCT-TTCACCTTGGCGTCA-CTGTA-GGCAATAATACCCTCC---GCTTTTAAT-G-GTGCAAC--CTC-AC-AGGC-ATT--C---CGT-GCGC-TTGC-TT-TT--GATA-C-GCTCAC-CAG-GTCC-GCTTT-GGTTTA-TGGTCCTCATTCAT-GTCAAT--GTTGTTACACATACTCCT-G-GTATC-CG-AATCTGCAATGC--A--C-ATGTACAGGTTTTT-AA-GGTCTTT----A-TA-GA-----------ACGGGGTAA-TAAC--------------G--GTG---TA-CAA-TTTATCTTC-CTGCATCATTT--AAAAGTACGGAT-CC--TTTCT-C-CTA-GACAACC-----------GTCTCGTATGATCCGGGGCTGGTTAAAGCACTGTAA-TGTCAGTCTTTGGAT-GGTATA-T----TTGTGCTGAGAACACCAAGGC-A--TCC-GCTCCTT-AAAGCTGGTCCAGAGATACCTC-ACTGGGTC-TG------TGG-TATCATTACTG--AAT-TG--A-A---TGA-CTGACTGAAGGTA--GTC-ATGCTG---TC--T-CTGAG-TC-TGCTCGTAA-G-T-CGACT-CTG-TTCTAT--AGGTACAACTTTTGAC-TAAC-GGTCGCT-----GGAAC--TTGATTTGGACATAACTGTC-GATAAATAATTAT-GTCTCGT-GGTCGCTGGTACCTTGCAAGTG-GC--TTCAGA--CGATTCATTA-GTTA-GGA-TCGGTTTGTGAGGA
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gi|12 : --AAAAGCCC-GCT-TT--TTCCG-C-CTA-GACATGCGCTTTA--AGTGTCCATT-T-ATCCAGGGTTGACTAAAGCGAGTTGA-TGTCA-TCTTG-GAT-GGAACA-TGATCTTCCAT---GATCAT-AAGGC-ACGGCC-A---TTT-AAA---AGT------AT-CCC--AC---GTC-TGAGGAACTGG-TGT-AT--TCT--GAGGCG--ATA---TGA-TCG-CTGA--GTT--TTG-ATGCT----TCCGC-CTTAA-TCGT-TTC-CAT-G-T-CTGCA-TTT-TCCCACAAAAGT---ACTTTCCTCTTAATGGATCGTTTTCGGGGAACATTTG-TCTGGA---------C-GATA-------------TCAT-GATCACTGACTCC-CGGTA---------TCGGA--TG--TTGCCATGTGACGAG-AC--TTTGC-CGGATT--GTC-ACAAA---GAGTT-TT-CTTCTTGTT-GAAA-CGTCAACCG-T-CTGt
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gi|14 : AAAAGTA-GTGTCAAAGCTGGA---GC-TATTTGGTG-AA--ATGTTTCC--TT-CA-GTA--GTC-T--TGA-CG--A--GACCT--CGTCCGGGCC-TGTA-TCTT---TAT----GG-GGGTTGAG-C-TGA-CGTAGGA-GTTTCTT--TACCCC--ATC--TTTA-TGGG-CT-G-T-GATGTTGG-G-AAC-TGTTCGATGTGAGCTAATTCC-CATATC-TGAT-AGTGGT-TCCGC-AG--TGCT-CTCCGGG--G-TGAA
gi|15 : TCCTAGCCTTAACAGTATAACCTGGTT--GCAGGAATTCACTA-TCA--TGATCAT-CCGGC-----CGCAACCA-TGTTTTAGTGCCTACAACAATATCTGGGTCTGCTGAGTACATGAGA-TCCATGAAGCTTGCCTTCT-TCGCACGTATACT-TTGC-ATGTTCAGTGAGATGATTTGAAATTTATG-CTGTGG
gi|16 : CA-TAG-G--C-GTTTT-GGTTTA-TGGGTCTCATCCAC-GATAAT--GTTGTT-CACA--CTCCT-G-GTATCC-A-AGTTTGCATTGC--A--C-ATGTACAGCATTGTAA-AGTCTTTA---AATA-GC-----------ACGATCA-G-TAATGATCAGTAATGA--C--GTG---TG-GAG-TTGGTCTTC-GAGTATTTTTT--AAAACCAT-GTT-CC--TCTCT-C-CTG-GACAACCG-TTTA--tagagttagcgtggta
gi|17 : CAGGATTGGCTATACCGTTGAGA-TGTCA-TCTTT-GTC-GGCACA-TTC--TTCTGTAGTGCA-ATC-AGGCAA--GTT-G-T-CTT-AAAAATTAACCAAAGTT-GGTCAACTGG----TGAGA---CGG-TGTTGTGGTTT--GCTATG--A-ACTGTAA---GAC--AAAACG--GC---TGGGGTCTTC--T-CTCAT-GC-C-ATC-AAC-G-T-TTG-T-CTGTTTCCAC--AAGT
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gi|22 : AGAGTTAGCGT-GGTATTTG-CAGACCTGACTAGGCATATCT-AG------GCAGTCTACATGGTACCACTGG---------TCA---------TAA--GCAA-TAGCATGCTGGCCCCACCTACAAGCCTTGTGACA-T
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gi|12 : --AAAAGCCC-GCT-TT--TTCCG-C-CTA-GACATGCGCTTTA--AGTGTCCATT-T-ATCCAGGGTTGACTAAAGCGAGTTGA-TGTCA-TCTTG-GAT-GGAACA-TGATCTTCCAT---GATCAT-AAGGC-ACGGCC-A---TTT-AAA---AGT------AT-CCC--AC---GTC-TGAGGAACTGG-TGT-AT--TCT--GAGGCG--ATATGA-TCG-CTGA--GTT--TTG-ATGCT-TCCGC-CTTAA-TCGT-TTC-CAT-G-T-CTGCA-TTT-TCCCACAAAAGT---ACTTTCCTCTTAATGGATCGTTTTCGGGGAACATTTG-TCTGGA---------C-GATA-------------TCAT-GATCACTGACTCC-CGGTA---------TCGGA--TG--TTGCCATGTGACGAG-AC--TTTGC-CGGATT--GTC-ACAAA---GAGTT-TT-CTTCTTGTT-GAAA-CGTCAACCG-TC-TGt
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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