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Reference ( gi|3 )            :                                                                                            TTTACACAAATA-TTATTA-GTTACACAGTCAG-TTT--GAC-A-AATC--C-----TTACAA-C--ATAATACTTA-TTA-G-----T--A-CAC--AGT-C-A-GT--T-T---GG--AC-AT-AA---T----A----C-G---GAG-T-C-A---T-C--G-AGG----G---TG-T-G--AA-AT-G--GA-AAATCC----G-TA--T-T---GG--G----CG---AGG-CGA---A-GC--CGA---G-T--------------C---GC----A-A-T-AC----G-G--ATTT--C-C-AT-TT--C-A-C-A----C-C--T----G---CG--T-G-A-CTC---C-G--T----A---TT-AT-GTC-CC--A-A-A--CT-G-A-CT--GT-G---T-A-A--CG-----AA---T---TATAT-CCTGCTGA----A-GACC-TTT-------AGG-A--AA--T-T---A--A------TCAGA-T-T---TCA-A-T---CTA-G-----CA---TC-TT--------T-TA---------T-----A--------AA---------------TTA-T----------G----AA-ATTGAA----A-C-A--A----A---GAGGCAT-----TGTATCATGTG------CA----TTGA-ACAT-A-A-TA--ATT-A-T--------ATAA-T------CACAAT--T--A-AAA---AC-A-TA--A-A-----G-TCAA----GA--C--T------A--AT-GTA---------T--G-T--T----G-TT--G-AA-A-C--------T---GA-A-------TG-C--A--GAAA------T-A-------------A--A-T-CT-A-CA---TT-G-AA-AG------C---ATGT---A---AG-GTG-----T--T-------TTA-AGT----G----A---C--G---T-----C-----A--------CA--G-T-------T-A-A--A-A------------GGAG-AC--G-T--AATA-TTGAA-A-AT--TTCG-G-GA----C-GTCGT--A-T---G-A--C-TCGGT--GGT-GACA-T-C-A-C-A-A-T-TGA--AAGG-AG--AC--C----TAAT---A-TT-GA---AAA-T--TTCGG-GG----CG-TCATGTGA-T-TCGTTTT-----TG---TCCAA-TCA-T-AAATCGAC-AAAT-TTGTCTGAAGCAGG-AT-AATGAAT-AT-TA---------------T--------TTTGTAGAT------AT---GTT--TCT-T---TAAATG--ATA---TACATGAAAAG-AAACAAT---TA-----AATTCAATTGCAGTTATGAAATTATACCTGTGTACTCTAACGTACTTTAGCGTACTCTATTTAGTAGTAC
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gi|1                          :                                                                                       aaatctacctcaatATA-CTATTA-GTTACACAGTCAGTTTT--GAC-cttgggacataatacggagtacaatccagggtgtggtaaatggataaatcccaagatatttgggcgagggcgaaagctccgtgtttctcatattcacacccctgagatgactcaatcgtattatgtcccaaatactgaactgggtatacgaatttgatcccgctgaacgcctatagattaattataatcagatttcaatcttatgagaca
gi|2                          :                                  ataaatttttaaaaagattactagaatgtggacagcctttagatctgtcggattgtgtggtataggtATA-CTATTA-GTTACACAGTCAA-TTttcaatacggagtcatccgggttgaaatggaaatcctattggaggcgaagaccagtggaatcaatcgtctcgcctccaatcgcgttttccatttcacacctggaatgatccgtttatattatgtccccacaactgaactgtgtatacgaatttatccgctgaagacctttaggaaaatttcactggtgtctaatttcatatctcgcagaatctttctataaattattcagttatgaaaatgaacacatatatgaagcattattaatgtgacttgaacatgaattaatataattcacaatataaaacaaataagatcaaacatagctgttttgaactgaatgcagaaataaactatgcgaaataatctaacatttttgaagagtcatatataggtgcttctaatgttataataaaaaactaaaacatcctgctagggagatggttatgttaaaaattcaagttcggtaagtgagtcacaattaaaaggaagactaatatagaaatttcggaagcgctcataactcttattgaaaattttggggcgttgtatgactcgtaattgaaaattttggggcgttgtatgacgcgtttgtgacatcacaattgaaaggagacctaatattgaaaatatcagggtgtcatgtgattcgtttttgtccaatcataaatcaacaaatttgtctgaagtgggataaatgtatatatattcacagcataggacttttatagatgccttaattgagttgatctgttaataaatgcaataatttacatgaataatacttattttcaatttgaatacctgtatatttaaacttggtgctggatttaaattt
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gi|8                          :                                                                                   cctggatgactccgtaatatgtccATTC-GTAACACAGTCAG-TTTGGGAC-ATAATA--C-----TTATAA-ttatcccgctgaagaccattaggaaatttagtcagatttcaatcaggtatctttttataatttattcaattatgaaattgaacaccatataggcaagtgtcatgtgcattgaacataattattatataatcacattataaaacaataagactcaaaataataatgtttgttgaaactgaatgtagaaataaatcctagcatcaaaagcatatagggttaatttataataaagactaaacattcccgcatggagataggtgtattgaaattccgagcgtcttttaagtgagtcatcaataaaaggaacctatattagaaagaaatttcgggacgttgttgactcatttctgtcgacctcacatatggaacaggagagaccataactatttgaattgctccaacatcatagatcaacaaattttgtct
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gi|20                         :                                                                                              gttattagtgtacacagtacagtttggtgactgtaatgacgacaggagccaatccaggggtgaaatgtagataaccgtaattgggcgagg-CAC--AAT-C-A-GC--T-TC--GG--AC-GT-AA---T----AAA--C-G----AT-C-C-A---T-C--CCAGG----G----G-T-A--AA-AT-G---A-AAGTC-----G-TAA-T-T---G--------CA---AGG-CGA---A-----CG----G-T--------------C---CC----A-A-T-AC----G-G--ATTT--C-C-AT-TCCAC-A-C-A----C-C--T----G---GA--T-G-A--TC---C-G--T----A---TT--T-GT--CC--A-A-A--TT-G-A-CT--GT-G---TGA-A--CG-----AT---TTCCTCTAT-CCCGCTGA----A-GACC-TTT--------GG-A--AA--T-gtcacgaatttatacccgctagagaccttttgggaaaatttaatcaaaatttcaatctaggcaatgttttataaattatttctatttatgaaattgaacctataggcatgtacatgtatcatgtgcattgaacataattattatatttcacattaaacaataagatcaaaattaaataatgttctgttgaactgaattcagaaataaatctacccttaaagcaataataggtgaagccaaaacattcctgcataggagcatggtgtattgaaatttaaagccttttggttaaatgatgtcacaattaaaaggagcgtaatattgaaaatttcggggcgtcctatgactttgttggtgcgtcagcaattggaagtgagactaataataaaattttgggggcgcttgtatgactcgttgtagacatcacaattgaaaggagactctaatat
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TC---C-G--T----A---TT-GG-G---CG--A-A-G--CT-G-A-CT--GT-------A-A--CG-----TA---T---T-TAT-CCCACTGA----A-GACC-TTT-------AGG-A--AA--T-T---G--AG-----TCCGA-T-T---TCA-A-T---GTA-G-----CA---TT-TT--------T-TAAATTGT---T-----A--------AG---------------TTA-C----------G----AA-GTTGAAC---A-C-T--AT---A---TAGGTAT------GTGTCATGTG------CA----TTGA-ACAT-A-A-TT--ATG-A-T--------ATGA-T------CACAAT--gacctcacatatggaacaggagagaccataactatttgaattgctccaacatcatagatcaacaaattttgtct
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acccgactacgcattaaacaccccgcacacaattataaT-G---T-A-AA-CGGA---AA---T---TAT---CCCGCTGA----A-GACCCTTT-------AGG-A--AA--T-T---A--G------T-AGA-TAT---TCA-A-T---CTA-G------A----C-TT--------T-TAGTGAATCGTT-----C--------AA---------------TTA-TCGT-------G----AA---TGAA----A-CTATCA----ATT-GGAACAT-----CGTATCATGT-------CA----TTGA-ACAT-A-A-T----TT-A-T--------ATAA-T------CACAAT--TTTATAAA---AC-A-GATTA-A-----A-TCAA----AAA-C--TGATTAAA--AT-GTT---------TTGG-T--TT---G-TT--T-GA-A-C--------T---GA-A-------TG-CCAG--GAAAAAATAAT-A-------------A--A-T-CTTA-CA---TTTG-AA-AG------G---ATAT---A----G-GTGTTAGTT--T-------TTATAAA----G----A---CTAGAACT-----C-----C--------CT--G-C-----------A--A-G------------GAAG-AC--GGT----TA-TTGGA-A-----TT------A----A-GT-GC--A-A---G-A--C--------GG---------------A-A-TATAA--AAGG-AG--AC--G----TAAT---A-TG-AA---AAA-T--TTC-T-GG----CG-Tgaccagttgtgaatcacatgtgagaagagacctaatattgaaaatttcagggcgtcatgtgattcgtttttgtccaatcataaatcaacaaatttgtctgaagcgggataa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 cgttttaaattgtcggtaaatattttaaattttttattgcctagatgtcgatcctattgaaataaaaatttaatgtaacattaaatattcttaggcccatactattagttacacagtcaattgggacgtaaacgagtcatccaggggttgaaatggaaatccgttatgcgaggtgaacgaagtcccaatacacatttccatttcgcacccctgtatgacccgtattattcccaaactgactgtgtttattctttgcgataggtgttgtatcttttttGCTGA----A-GACA-TTTTTAAAACAGGTA--AA--T-TTGTA--G------TCAGA-T-G---TCG-AGT---CCA-------CA---TC-TT--------T-TT---------T-----A--------AAATTTTTATTTGCACATTA-T----------A----GA-GTTGAAC---A-C-C--ATACTA---G-----T-----TGCATCATGT-------CAG---CCGATACATTA-A-TC--ATTTA-T--------ATAACT------CAGA----T--ATAAA---AC-A-TA--A-A-----A-TTAA----AAAGC--T------A--ATCATA---------G--T-T--T----G-TTTAA-AA-A-T--------T---GA-A-------TG-C--A--GAAA-------------------------A-C-TT-A-CA---TT-G-AA-AG------C---AGGT--------G-GTG-----T--tgtagacctcgtaggtggacatcacaatttgaaaggagacctaatatttgaaaagtttaatggccatgtgactctttttgttcaatcataaatcaacaaattgtctgaacggataaaaacacatgtaacatatataatatttgactgcaattaccatgatttatttggggg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtggcatagttaattaggttacagtcagttctggacgtaatacggatcatgctcagaggtgtgaaatcggagtgttcgatacttgggcaggccacaG-A--AA--T-TT--A--G------TCAGA-T-T---TCA-A-T---CTA-G-----CA---TC-TT--------T-TA---------T-----A--------A----------------TTA-T----------G----AA-ATTGAAC---ATC-A--GT---A---TAGGCAT-----GGTATCATATG------CA----TTGA-ACAT-A-A-TT--ATT-A-T--------ATAA-T------CACAAT----------------A-TA--A-A-----GATCAA----AA--CTAT------A--AT-GT---------------T--T----G-TT--G-AA-A-C--------T---GA-A-------TG-C--A--GAA-----------------------------------------T-G-AA-AG------C---ATAT-------AG-GTG-----T--TAGGTATATAA-AGTCTAAA----A---C--A---T-----C-----C--------C-------------T-G-C--A-A------------GGAG-AT--G-G--TGTA-TTG-A-A-AT--TTC----AA----A-GCC---------------C-TCTGTTAAGT-GACG-T-C-A-C-A-A-T-TAA--AAGG-AG--AC--G----TAAT---A-TT-G----AAA-T--TTCGG-GG----CG-TCGTATGA-C-TCGTTGG-----TG---AC--A-TCA-C-AAggtggttatactcggtttagttcggacgaaacatttctgcggactagcgctttacttaaatt
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         c-A-T---CTA-G-----CA---TC-TTATGAAAAAT-TA---------TT----C--------AA---------------TTA-T----------G----AA-GTTAAC----A-C-C--A----T---GCG-CGTGA---TGTATCA------------------GA-ACAT-A-ACTC--ATT-A-T--------ATAA-T------CACAATAAT--A-AAA---CCAA-TA--G-A-----T-TAAA----AAT-C--T------A--AT-TTAATCAT----T--GTT--T----G-TT--GAAA-A-C--------T---G--A-------TGCC--A--GAAA------TAA-------------A--A-T-CT-A-cttttgtccaatcatcatcaacaaaatttgtctaaagtgggata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agAGGCGTCC---TGTATCATGTGGCACGCCACGTCTTGA-ACAT-ATA-TG--ACT-A-T--------ACAC-T------AATTAT--T--A-AAACGGAA-A-TA--A-G-----A-TCAACCAAAA--C--T------ATAAT-AT----------T--G-T--T----GGTT--G-AACA-C--------T---GA-AC------TG-CC-A--GATA------T-A-------------A--A-T-CT-A-TA---TT-GTAA-AG------C---ATAA---A---AC-GTG-----T--T-------acccaaaattcaaaaaacacatagcgaaacaacccctgcaacggagagtgtaaaaatggaaaattccgaacgcctccgtgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atcggttcgggtcgttttgtttgcatattcagcttacaccaagttcagtttgggacgtaaaatcatggagctcatccagggggttgttggaatgaaagttccgtattcggcgaggcgaagccgagttcccaatacggatttccattcacactctggatggactccgttattacgtcccaaaatggactggtgtatcgtgctcaagtgttatgacgtgctcagcatagacctttgagaggctctctctcaggatatctgatactcctagtgtgaaacctctttatcgtattcaccaaattatttatgttactttagtctctcctctcgcaaatgcaatacccacccatcatatAT-----AGTATCATGTG------CA----CTGA-ACAT-A-C-TT--ACT-A-T--------ATAA-T------AACAATA-T--A-AAA---CA-A-TA--A-A-----A-TCAA----AA--C--T------G--AT--CA---------T--G-T--TT---A-TT--G-AA-A-C--------T---GA-A-------TG-C--A--GAAA------T-A-------------A--A-T-CT-A-TA---TT-G-AA-AGCAAATAC---ATGCCCGA---AT-ACA-----T--G-------TTA-ATA----A----A---C--A---T-----CCCTCCA--------CA--A-A-------T-A-T--A-----------------------G-T--G-TA-TTGGA-A--T--TCCG-A-AG----C-CTC-T--G-T---T-A--C-ATGTA--AGT-GATA-T-C-A-A-A-A-T-GAA--AAGG-AG--AC--A----TGAT---A-Taggttataagactaaaacatcctgcacgggagatgacccgatagtaacatatactctcgaagcctcacggtgttaatgcccccgtcacagattacttaacgagactccaaataattgaaaatttggggcgttgtaatgaaacatcagttggtgacattcacgaattgaaaggagaaaccaaaataattggaaaatta
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ataaatttttaaaaagattactagaatgtggacagcctttagatctgtcggattgtgtggtataggtatactattagttacacagtcagttttgacttcaatacggagtcatccgggttgaaatggaaatcctattggaggcgaagaccagtggaatcaatcgtctcgcctccaatcgcgttttccatttcacacctggaatgatccgtttatattatgtccccacaactgaactgtgtatacgaatttatccgctgaagacctttaggaaaatttcactggtgtctaatttcatatctcgcagaatctttctataaattattcagttatgaaaatgaacacatatatgaagcattattaatgtgacttgaacatgaattaatataattcacaatataaaacaaataagatcaaacatagctgttttgaactgaatgcagaaataaactatgcgaaataatctaacatttttgaagagtcatatataggtgcttctaatgttataataaaaaactaaaacatcctgctagggagatggttatgttaaaaattcaagttcggtaagtgACAATA-T--A-AAA---CA-A-TA--A-G-----A-TCAA----AA--G--T------G--AT-AT---------------T--T----G-TT--G-AA-A-C--------T---GA-A-------TG-C--A--GAAA------T-A-------------A--A-T-CT-G-AA---TT-G-AA-AG------C---ATAT-------AG-GTG-----T--TAG-----TTA-TAT----G----A---A--G---A-----CTAG--A--------CATCC-C-------T-G-C--A-C------------GGAG-AT--G-G--TGTA-TTG-A-A-AT--TGCG-A-AAG---C-CTC-T--A-T---T-A-----------AGT-GACG-T-C-A-C-A-A-T-T-A--AAAG-AG--AC--T----AAAT---A-TT-GA---AAA-T--TTTGGAGA----CG-TCGTATGA-C-TCGTTGG-----TG---AC--A-TCA-C-AAaattt
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --AT-ATA---------T--G-T--CTCTGG-TT--A-AA-A-CA-------T---CC-C-------TG-C--ACGGATA------T-G-------------A-------T-G-TA---TT-G-AA-AT------T---CCG----A---AGCGTC-----T--G-------TTA-AGT----T----A---C--G---T-----C-----A--------CA--A-T-------T-A-A--A-A------------GGAG-AC--T-T--AATA-TTGAA-A-AT--TTCG-G-GA----C-ATCGT--A-T---G-A--C-TCGTT--GGT-GACA-T-C-A-C-A-A-T-TGA--AAGG-AG--AC--C----TAAT---A-TT-GA---AAA-T--TTCAG-GG----CG-TCATGTGA-T-TCGTTTT-----TG---TCCAA-TCA-T-AAATCAAC-AAAT-TTGTCTGAAGCGGG-AT-AGTGcggcctgacccaattcacaattttgatactggagacctaatttgaacaatttaggggccgtcatacatcgacttgtgatgacatccacaagtgaaagggagacctcatctgataaaaaaattcaggacgctcatgcgatcgttagtcaaataaaatttgtcgaagcaggaataatggatattcaatcaaaaggtcaaatgttacctatgcctaggcgctttctcgcttaaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttgttgaaactgaatgcagaataaatctacattaaaaggtgttagttaaaacagagacatgtt-------TTA-AGT----G----A---C--G---T-----C-----A--------CA--A-T-------T-A-A--A-A-------------GAG-AC--T-A--AATA-TTGAA-A-AT--TTTG-GAGA----C-GTCGT--A-T---G-A--C-TCGTT--GGT-GACA-T-C-A-C-A-A-T-TGA--AAGG-AG--AC--C----TAAT---A-TT-GATG-AAATT--TTCAG-GG----CG-TCA------------TTT-----AC---TCCAA-TTA-TAAAATCAAC-AAAT-TTGTCTGAA-CGGG-AT-Attgactgttgactataattatatgattccatgaatttcgcacataattttatttt
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acccgactacgcattaaacaccccgcacacaattataagtattatgtcccaaactgactgtgttacgaatttatcccgctgaagacctttaagaaatctagcaagattttaatctaccatcttttataaattattcagttatgaattgaacacatataggcagtgtatgtgcttgaacataatattatagatgaacatgtaaaattagataacactaatgattgtttgctgaatgatattcagaataaattacaatgaaagcatattaggtatagttaagtgaagactaataccactgcacagatatgattcgttg---C--G---T-----C-----A--------CA--GAT-------T-A-CTTA-A------------CGAG-AC--T-CCAAATAATTGAA-A-AT--TT-G-G-GG----C-GTTGT--AAT---G-AAACATCAGTT-GGT-GACA-TTC-A-CGA-A-T-TGA--AAGG-AGAAAC--CAAAATAAT-----TG-GA---AAA-T--T
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaacaataagattgaaactaatatatgcttggcttaaactgatgcagaaataaattctacgttgacgcatataggtgttagttattccattaaagactaaaacatcgcatgcacggagatggtgtattggaaatgcgatggcctcagtgacgcgtcacatttaaaggagactattatgatactttcagggcgtcgtatgacatcgttcggcctgacccaattcacaattttgatactCG-T-C-A-C-AGA-T-TACTTAACG-AG--ACTCC----AAAT---AATT-GA---AAA-T--TT-GG-GG----CG-T--TGTAA-T-caatcaaaaggtcaaatgttacctatgcctaggcgctttctcgcttaaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atcggttcgggtcgttttgtttgcatattcagcttacaccaagttcagtttgggacgtaaaatcatggagctcatccagggggttgttggaatgaaagttccgtattcggcgaggcgaagccgagttcccaatacggatttccattcacactctggatggactccgttattacgtcccaaaatggactggtgtatcgtgctcaagtgttatgacgtgctcagcatagacctttgagaggctctctctcaggatatctgatactcctagtgtgaaacctctttatcgtattcaccaaattatttatgttactttagtctctcctctcgcaaatgcaatacccacccatcatataggcgtcctgtatcatgtggcacgccacgtcttgaacatatatgactatacactaattattaaaacggaaataagatcaaccaaaactataatattgttggttgaacactgaactgccagatataaatctatattgtaaagcataaaacgtgttaggttataagactaaaacatcctgcacgggagatgacccgatagtaacatatactctcgaagcctcacggtgttaatgccccA--ACGG-AG--ACG-T----TACT---A-T--GA---AAA-TGGCACAG-GG----CG-TCTTGTGA-T-TTGCTTT-----TG---TCCAA-TCA-T--CATCAACAAAAT-TTGTCTAAAGTGGG-AT-Agaaacatcagttggtgacattcacgaattgaaaggagaaaccaaaataattggaaaatta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgaaatttcagattcagtcaattgccaagttaatcatgttttacataaaattcaatttataaaattgaaacaccatataggcaacatgtatcattaacaatagatttaatataactaatgatgttttgttgaaaactgaatgtagaaaatcaactttgaacatatagctaagtcggacaaatgcattcctgcatggaaaatcagttatGG-AG--AC--A----GTGT---A-CT-GA---AAA-T--TGAAA-GG----CA-CCATGTGA-T-TCACTTTAATTTTA---TCTCA-TCC-T-ACATCTAA-AAAT-TTGTCTGAAGTGGG-AT-A---GGT-CT-TA---------------T--------TTCA-AGTG------AT---GCT--T-T-A---TAAATG--
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tAAT---C-CT-GA---AAA-T--TACAG-GG----C-----------------TTT-----TG---TCCAA-TCA-T-AATTCAAC---AT-TTGTCTGTAGCGGG-AT-AAtgactgaacctttaggtttctg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTTTT-----TG---TCCAA-TCA-T-TAATCAAC-AAAT-TTTTCTGAAGCGGG-AT-Aat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTTTT-----TG---TCCAAATCAAT-AAATCAAC-AAATCTTGTCTGAAGCGGG-AT-AA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AC-AAAT-TTGTCTGAAGCGGG-AT-AGTG-----T-TA---------------T--------TT