lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                        1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                             1111                2                         111     33              4444444    1111      11       3333333  1111                      1111                     3333333333333333333333333333333333        1111111  111111                       11111111   2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                               111111111  33333333333333333                          11                                 66666666666666                   11111111111111        11111111111111111                                               22222          11111111111      2222222222222222222222                 1111                                 2222          111                                            111                     22222222   2222                   111111111111                 88888888888888888888888888888888888888888888888888    2222222                   444444444                    555555555555555              44                     111                                 
lowQualScore                  :             77   3  2  66 4 3333 5  33 2 2  2   9  44 999     5  77   6   777 3   11  0  0  2     8888888  2 3333  2   33  33 2 5555555  3333     88   555 44 888  3333   77777 3 6666   6  6666666666666666666666666666666666     3  0000000  666666 666 0   3 44  6   3   00000000   8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888  33    2 5 2 444 7777  33 444 2 4 444 2 2 55  333333333  11111111111111111 33 33 2  33 2 333 2   4  00   2 4    2 2 2 2 2 33   4444    33333333333333  7  222 2   33  2 22222222222222  55    55555555555555555 2 2 2 2 55 2 8888  2 88   4 2 8888    33  66  22222 2 5 2    66666666666 2 2  2222222222222222222222  66666 7  2  7  2222 2  2    2 33  777777   33 2     5555  5     2 111 33 7 7   4  2 444 4 2 2 2 333 3   2 8888 2 111 2 2 9999999999 2    11111111   5555 4 22 22 333   4   111111111111 2     33 33  2  77777777777777777777777777777777777777777777777777    9999999 444  444  33  99  444444444 2 33 5   2  5  33  777777777777777      2 333   22    2   2  55     2  555 33 5   2 2 33   8  33 2         
lowQualScore                  :             ..   .  .  .. . .... .  .. . .  .   .  .. ...     .  ..   .   ... .   ..  .  .  .     .......  . ....  .   ..  .. . .......  ....     ..   ... .. ...  ....   ..... . ....   .  ..................................     .  .......  ...... ... .   . ..  .   .   ........   ................................................................  ..    . . . ... ....  .. ... . . ... . . ..  .........  ................. .. .. .  .. . ... .   .  ..   . .    . . . . . ..   ....    ..............  .  ... .   ..  . ..............  ..    ................. . . . . .. . ....  . ..   . . ....    ..  ..  ..... . . .    ........... . .  ......................  ..... .  .  .  .... .  .    . ..  ......   .. .     ....  .     . ... .. . .   .  . ... . . . . ... .   . .... . ... . . .......... .    ........   .... . .. .. ...   .   ............ .     .. ..  .  ..................................................    ....... ...  ...  ..  ..  ......... . .. .   .  .  ..  ...............      . ...   ..    .   .  ..     .  ... .. .   . . ..   .  .. .         
lowQualScore                  :             22   1  9  88 4 6666 7  99 9 9  9   8  44 111     7  11   2   333 1   99  8  7  9     1111111  9 9999  9   66  99 9 1111111  9999     55   444 22 666  2222   77777 1 5555   2  6666666666666666666666666666666666     3  8888888  999999 999 5   1 22  2   1   44444444   3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333  77    5 0 5 444 8888  44 444 5 7 111 4 4 66  666666666  88888888888888888 11 11 2  11 2 999 2   4  77   2 4    2 2 2 2 2 11   7777    33333333333333  1  555 4   22  4 33333333333333  66    44444444444444444 4 4 4 4 66 4 2222  4 88   7 4 4444    22  55  55555 5 0 5    88888888888 5 5  8888888888888888888888  22222 5  5  5  8888 5  5    5 44  555555   77 5     6666  0     5 999 44 5 1   7  4 111 7 4 4 2 999 4   1 7777 1 666 1 1 4444444444 1    88888888   1111 0 99 99 777   2   444444444444 2     22 22  4  00000000000000000000000000000000000000000000000000    7777777 444  444  44  00  111111111 5 44 0   5  0  44  666666666666666      3 777   77    5   5  99     5  666 44 0   5 5 77   0  77 7         
consensus                     :     GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TAA-N--T-GA--C-G-TT-TGA-TAT-G-A-TAGTT-TT-AATA-AAAAT-A-ATTG-CGCGGGTA-TGTTT-------GA-T-G--TT-TCC--AA--T-A----C-GGT----AAAAT--AAA---C--TCC-AA--C-TTA-----A-A----ATG-ACTA--AT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---TCCTAA-TT-------AA-A----T-GGAACGA-A--AG-AAA-ATT--------ACA--A-------A-----------T----------TTA-CGA-ATA-A------A------T-A--TA--TTCA-T-T-T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---ATA----GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAAC----GTCG-----TA-CC-C-A-GCT--CA-A---T-GTC--TC--TG--AAAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A---CGTTT--TC--CT-T---A-C-A-TTAA--TT----C--G-T-TT---T-C-C-T---T-TG-----AT-----A-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--TA-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-A-T---TTATT-T----A-C-G-G-A-T--G-G-----T-TTAT--TT----AATT---TCT--A--T---GAT-GGA------------A-ACGTT--A--TG-TAT-GTG----TAGTA--GCGG---------G-A------TAC--G-----GACACA---A--C---CC---AA--GGACCT--ATC--ACT-G--G-TAC-GT-TG--TA--A-G-T-T-AT---GAAAAAAT--TATT--TAAA-TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
Reference ( gi|4 )            :     GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TGA-A--T-GA--C-G-TT-TGACTAT-G-A-TAGTT-TT-AATA-AAAAT-A-ATTGGCGCGGGTA-TGTTT-TG----GA-T-G--TT-TCC--AA--T-A----C-AGT----AAAAT--AAA---C--TCC-AA--C-TTA-----A-A----ATG-ACTA--AT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---TCCTAA-TT-------AA-A----T-GAAACGA-A--AG-AAA-ATT--------ACA--A-------A-----------T----------TTA-TGA-ATA-A-----CA------TGG--TA--TTCA-T-T-T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---GTA----G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-CCAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAACAA--GTTGA----TA-CC-C-A-GCT--CA-A---T-GTT--TT--TG--AAAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A---TGTTT--TC--CT-TA--A-C-A-TTAA--TT----C--G-T-TT---T-C-C-T---T-TC-----AT-----A-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--TA-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-A-T---TCATT-T----A-C-A-G-A-T--G-G-----T-TTAT--TA----AATT--CTCT--A--T---GAT-GGA------------A-ACGTT--A--TG-TA--GT-----TAGT---GCAG---------G-A------TAT--G-----AACAC----A--C---CC---AA--GGATCTA-ATC--CAT-G--G-TAC-GT-TG--TA--GCA-T-T-ATTA-GAAAAAAT--TATTCGTAAA-TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|7                          :     GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TAA-A--TTGA--CCG-TT-TGA-TAT-G-AATAGTT-T--AATA-AAAA--A-ATTG-CGCGG-TA-TGTTT-------GA-T-GGTTT-TCCCCAA--T-A----CTGGT----AAAAT--AAA---C--TT--AA--C-TTA-----A-A----ATG-ACTA--A--A-AT--G-AC-TACAAT-G---A-----CTAA-TA-------AA-A----T-GAACCGA-A--GA-AAA-ATT--------ACA--A-------C-----------A----------TTA--GA-ATATA-----CA------ATG--TAATTTCA-T-T-T---T----TA--T---A-C-T---G-A----CT--GTG---GTA----G-----G--T-T-T--G--C-AA--T-A-----GAA-TG-CCAG-A-ACCA-C-C-G-A-AAAGAA----AAAAC----GTTG-----TA-CC---A-GCT--CA-A---T-GTT--TC--TG--AAAA----A-CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A---TGTTT--TC--CTCTT--T-C-A-TTAA--TT----TT-G-T-TT---T-C-CCT---T-TC-----AT-----A-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--TA-T----TAA--A-T-CAT---GCA-TTGAT-----C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-A-T---TCATT-T----A-C-A---A-T--G-G-----T-CTAT--CA----AAT----TCT--A--T---GAT-GGA------------A-TCGTT--A--TG-TA--G------TAG----GCAG---------G-A------TAT--G------ACACA---A--C---CC---AA--TGATCT--ATC--ACT-G--G-TAC-GT-TG--T--------------------AAAT--TATT--TAAA-TAT-AA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC----TTACTTTTA
gi|3                          : ggctGGGTTTAT-CAAT-GC-AT--TAA-T--T-GA--C-G-TT-TGA-TAT-G-A-TAGTT-TT-AATA-AAA-T-A-ATTG-CACAGGTA-TGTTT-------GA-TCG--TT-TCC--AA--T-A----C-CGT----TAAAT--AAA---C--TCC-AA--C-TTA-----A-A----ATG-ACT---AT-ACAT--G-TA-----------------CCTAA-TT-------AA-A----T-TGAACAA-A--AG-TAA-ATT--------ATA--A-------A-----------C----------AAA-CAA-ATT-A------A------TGATTTA--TTCA-T-T-T---T----TA--T---A-C-T---GTA-A--CT--GTG---ATA----GT----T--A-ATT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TGTCCAG-A-CACA-C-CTG-A-A--GAA----AAAAACG--GTCG-----TA-CC-T-A-GCT--TC-A---TCGTC--TC--TG--AAAA----A-CG-GATCT-G-A-T-A-T-C--GTT----TG-T--AAATT-A---CGTTT--TT--CT-TT--A-C-A-TTAA--TT----C--G-T-TG---T-CTC-T---T-TG-----AT-----A-T---A-TT----C-AG-TGTG-TTATA-T----TAA--A--ATACT--GCA-TTGAT-AC--C--ACA-AGC-TG-T---C-T-T-ATT---TCATTCT----A-C-G-G-A-TTGG-A-----G-TTAT--------GAT----TCT--A--T---GAT-GGG------------A-ACGTT--A--TG-TATTGTG----TAGTAAGGCGG---------G-A------TAC---------ACAC----AT-C---CC---AA--GGA-CTT-ATC--ACT-G--G-TAC-GT-TG--TA--A-G-T-T-AC---GAAAAATT--TATT--TAAA-TAT-TA--ATTTT-ATA-CA----AAA-T-C--CTT-TC--T-TCACTTTTA
gi|9                          :  actGGGTTTAT-TGAT-GC-AC--TAA-T--T-GA--C-G-TT-TA--TAT-G-A-TAGTT-TT-CATA-AAA-T-A-ATTG-CACGGGTA-TGTTT-------GA-T-GG-TT-TCC--AA--T-A----CCGGA----AAAAT--AAA---T--TCC-AA--C-TTA-----A-A----ATG-ACTA---T-A--------------------------CCTAA-TT-------AA-T----T-GAA-CAA-A--TG-AAA-ATT--------ACA--A-------ACACACAAA---T----------TTA-TGA-TT---------------------TA--TTCA-T-T-T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---ATA----GG----T--A-A-T--G--G-AA--T-A---A-GAA-TG-TCAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAA-AC--GTCG-----TA-CC-C-A-GCT--CA-A---T-GCC--TC--CG--AAAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C-----------------------------T--TC--CT-T---A-C-A-TTAA--------C--GAT-TT---T-C-T-C---T-TG-----AT-----A-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--TA--------------------------TGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-A-T---TTATT-T----A-C-G-C-A-T--G-C-----T-TTAT--TT----AATT--CT-------T---GAT-GGA------------A-A-GTT--A--TG-TATTGTG----TAGTAG-GC-G---------G-A------TAC--G-----AACAC-------T---CC---AA--GG-T------------------TAC-GT-TG--TA---CAGT-T-AT---GAAAAAAT--TATT--TAAA-TAT-TA--ATTTC-AT--CA--C--AA-T-C--CTTCTC--T-TTACTTTTA
gi|8                          : gactGGGTTTATTCAATTGC--C--TAACG--T-GA--C-G-TT-TGACTA----G-TAGTT-TT-CATA-AAA-T-A-ATTCTCGCGG-TA-TGGTT-TT----GA-T-G--GT-TCC--AG--T-A----C-GGT----AAAAT--AAA---C--TAC-AA--C-TTA-----A-A----ATG-ATCT--AT---AT--G-AACGA-GAT-G---C----CCT---TT-------AA-T----T-G-AACGA-A--AG-AAT-A-T--------ACA--AACAAAACA-----------T----------TTA-TG--AT------------------G--TA--TTCA---T-C---T----TA--T---A-C-T---G-ATA--CT---CG---ATAT---G-----TC-ATA-T--G--C-AA--T-A---A-TAAGTG-TCAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAA-AC--GT--G----TA-CC-C-A-GCT--CA-A---T--TC--TC--TG--AAAA----A-CG-G-----GTA-T-A-T-C--G------TG-T--AAATT-A---CGTTT--TC--CT-T---A-C-A--TAC--TT----C--A-T-TT---T-C-T-C---T-TT-----GT-----CTTG-CATTT----A-AG-TCTA--------------------------------TGAT-A---T--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-A-TTTATTATT-T----A-C-G-G-A-T--G-A-----T-TTAT--TT----AAT----TCT--A--T---GAT-GGA------------A-ACGTT--A--TA-TATTGTG----TAGTAG-GCGG---------G-A------TAC--G------ACACA---A--C---CC---AA--GGACCT--ATC--ACT-G--G-TAC-GT-TG--TA--A-A-T-T-A--G-GAAAAAAT--AATT--TAAA-TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-
gi|11                         :   ctGGGTTTAT-CAAT-GC-ACT-TGA-AATT-GA--T-G-TT-TGA-TAT-GAA-TAGTT-TTAAATC-AAA---A-ATT--CGCGGGTA-TGTTT-T-----GA-T-G--TTGTCC--AAATT-ACT--C-GGT----AACAT--AAA---C--TCCAAA--C-TTA-----A-A----ATG-AT----AT-A-AT--G--A-GA-GGC-G---C---TCGTAT-AT-------AA-A----TAGGAACAA-A--AG--AA-ATT--------ACC--G-------A------------------------A-CAA-A-A-A-----CACATTTTTGAT-TT--TTCA-T-T-T---TA---TA--T-----C-T---G-A-A--CT--GCGC--ATA----G-----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCAA-A-ACCACC-C-G-A-G--GAA----AAAAC----GTC-A----TACCC-C-A-TCT--CA-A---TGGTC--TC--TGA-AAAA----A-CG-G-----GTA-T-G-TGC--G-T----TG-T--AAA-T-A---CGTTT--TC--CTGTA--C-C-A-TTAAT-TT----C--G-T-TT---T-C-C-T---T-TTTG---AA-----A-TGCCA-TT----C-AA-TTTG-T--TA-T----TAA--A-TGCATT--GC--TTGAT-A---C--AGA-AGCATG-T---C-T-T-A-T---TTATT-T----A-CGG-G-A-TG-G-G-----T-TTAT--TT----AGTT-----T--A--T---GAT-G
gi|17                         : gactGGGTTT---CAAT-GCCAC--CTA-A--TTGA--C-G-TT-TGA-TAT-G-A-TAGTT-TT-CATG-GAAATCA-ATT-TCGCAGGTA-TGTTT-------GATT-G--TT-TCC--AA--T-AC---C-GGT----AAAAT--AAA---C--TAC-AA--C-TTA-----A-A----ATG-ACT---AT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---CTT-TCCTAATTT-------AA-A----T-G-AACGA-A--AG-AAA-ATTACAAACAAACA--A-------A-----------T----------TTA-TGA-TT---------------------TA--TTCG-T-TCT---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---ATAG---G-----TA-A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCAG-A-ACCA-C-C-A-T-A--AGA----AAAAC----GTCCG----TACCC-C-A-GCT--CA-A---T-GTC--TC--TG--AAAA----A-CG-GC----G-A---A-T-C--G-T----TG-TA-AAA-T-A---CGTTT--TC--CT-T---A-C-A-TTACTTTT----C--A-T-TTTTCT-C-T-T---T-TG-----AT-----A-TG-CA-TT----ATAGTTTTG-T--TA-tgactttat
gi|12                         :     GGCTTTAT--AAT-AC-AC--TAA-T--T-GA--C-G-TTATGATCATTG-A-TAGTT-AT-AATATAAGAT-A-ATTTGCGCGG-TAGTGTTT-------GA-TCG--TT-TCCTCAA--TTA----CCGGG----AAAAT--AAA---C--TC---A--CATTA-----A-A----ATG-ACGA--AT-A--T--G-AG-AG-GGT-GT--C---TCCTAA-TT-------A-------T-AACTCGA-A--AG-CAATAAT--------ACAC-G-------A-----------T------------ACTAA-ACA-AATTTCTA------TG----A--TTTA-T-T-TCATT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG----TA----G-----TT-A-A-T--G--CCAA--TTA---ACGAA-TA-TCAG-A--CCA-C-C-G-A-A--GAA----GAA-C----GTC-------A-CCTC-A-GCT--CA-A---T-GTC--TCAGTG--AAAA----AACG-G-----G-A-T---T-CTTG-T----TG-T--AAA-T-A---CGTTT--TC--CT-TT--A-C-A-TTTG--CT----T--G-TATT---T-CTC-T---TGTG-----AT-----A-TG-GA-TA----A-GG---TG-T--TA-T----T
gi|25                         :  gctGGGTTTAT-CATT-GC-AA--TAA-T--T-GA--C-G-TT-TGA-TAT-G-A-TAGTT-Ttatcttacgcgtggttactttaattctatgatggaaactatataactgccgtatggtag
gi|20                         : ggactGGTTT-C-CAAT-GC-AC--TAA-T--T-GA--T-G-TT-TGA-TAT-GAA-TAGTT-TT--AT--AAAAT-A-A-TG--ATGGGTA-TGCTT-------GA-TGG--TT-TCC--AA--T-AC---C-GGTA---AAAAT--AAA---C--TCC-AA--CTTTA-----A-A----CTG-GATA--GT-A-AT--G-
gi|5                          :      ttTTTAT--AAT-GC-AC--TAA-A--T-TA--C-G-TT-TGA-TA--G-G-CAGTTATT-AACA-AATA--A-ATTGCCG---GTA-TGTTT-------GA-T-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC-GGT----AAAATTAAAA---C--TC--AA----TTA-----A-A----ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---TCCTAA-TT-------AA-ACT--T-AGAACGA-A--AGGAAA-ATT--------ACACAA-------A-----------C----------ATA-CAA-AT----------------TTA--TA--T-CA-T-T-T---C-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---ATA----GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TT-ATAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--GAA----AAAACG-----TGG----TA-CC-C-A-CTT--CA-A---G-ATT--CT--TG--AAAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A---ATTTT--TC--CT-----A-CGA-ATAA--TTT---C--G-T-AC---T-G-C-TCTAT-TG-----AT-----ACTG-CAGTC----A-AG-TT-G-T--TAAT----CAA--A-TGCATG---CA-TTCAT-AA--C--A-ACAGC-TG-T---C-T-T-A-T---TTATT-T----A-C---G-A-T--G-G-----T-TTTT--TTTT--AATT---TCT--G--T---GAT-TGA------------A-AC--------CG-TA--CT-----TACT---GT-G---------T-A------TAT--GCGTACGACAC----AATC---CC---AA----ATCT-------CAC-T--G-TAC-GTCTG--TA----A-G-T-ATTG-GAAAAAAT---ATTTAAAAA-TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTACTcaataagaatgtcagaaccacgacgaaaa
gi|6                          :       aTTTAT--AAT-GC-AC--TAA-A--T-TA--C-G-TT-TGA-TA--G-G-CAGTTATT-AACA-AATA--A-ATTGCCG---GTA-TGTTT-------GA-T-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC-GGT----AAAATTAAAA---C--TC--AA----TTA-----A-A----ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---TCCTAA-TT-------AA-ACT--T-AGAACGA-A--AGGAAA-ATT--------ACACAA-------A-----------C----------ATA-CAA-AT----------------TTA--TA--T-CA-T-T-T---C-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---ATA----GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TT-ATAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--GAA----AAAACG-----TGG----TA-CC-C-A-CTT--CA-A---G-ATT--CT--TG--AAAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A---ATTTT--TC--CT-----A-CGA-ATAA--TTT---C--G-T-AC---T-G-C-TCTAT-TG-----AT-----ACTG-CAGTC----A-AG-TT-G-T--TAAT----CAA--A-TGCATG---CA-TTCAT-AA--C--A-ACAGC-TG-T---C-T-T-A-T---TTATT-T----A-C---G-A-T--G-G-----T-TTTT--TTTT--AATT---TCT--G--T---GAT-TGA------------A-AC--------CG-TA--CT-----TACT---GT-G---------T-A------TAT--GCGTACGACAC----AATC---CC---AA----ATCT-------CAC-T--G-TAC-GTCTG--TA----A-G-T-ATTG-GAAAAAAT---ATTTAAAAA-TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTAC
gi|2                          :         aTAT-CAAT-GC-AC--TAA-T--T-GA--C-G-TT-TGA-TAT-A----AGTT-TT-AATA-AAATA-A-ATT---GCGAGTA-TGTTGATGCCATGA-TAG--TT-TCC--AA--T-A----CTGGT----TAAAT---AA---C--TTC-GA----TTA-----A-A----ATG-ACT----T-A-ATTGG-AA-GATGGT-G---C---TCCTAA-TT-------AA-A----T-TGAACGA-A--GA-AAA-ATT--------ACA--A-------ACAACAAAG---T----------TTA-TTG-ATT-T-----CA------T--------TTCATT-T-T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCGTGAATAGG--G-----T--A-ACT--GGTC-AA--T-A---A-GAAGTG--TAG-A-ACAA-C-C-GCA-A--GAA----AAAAC----GTCG-----TAGTC-C-ATGCT--C--------GTC--T-------GACA----A-CA-GCATATG-ATT-A-T-C--G-A----TG-T--AAA-T-A---TCTTTTGTC--AT-T---A-C-ATTTAAT-TT----C--G-T-TT---CAT-C-T---T-TG-----AT-----A--G-TG-TG----A-AG-TTTG-T--TA-TCTTCTAA--ATTGC-TC--TCA-TTTAC-A---C--G-A----------------T-A-T---TTGTT-T----G-C-A-G-A----G-AAGCATC-TCATG-TT----AATT--CTTT--ATTT---TAT-GGAACTGATCGATAGA-ACGTC--G--TA-TA--G-------------GC-----------G-A------T-T---------ACACCA--A--C---TC---AA--GG-CCT--GTC--ACTGG--G-TCC-GT-TGGATA--GGA-A-T-AT----AAAGAATGATATTTAAAAATTAT-TA--ATGTT-AAT-CA--C-AAA---G--CTT-TCTGT-TTACTT
gi|16                         :           gactggT-GC-ACGCTAA-T--T-GAACC-GATT-TGA-TAT-G-A-TAGTC-TT-CATA-AAAAT-A-ATTT-CGCGTGTA-TGTTT-------GA-T-GG-TT-TCC--AA--T-A----C-CGCGTCAAAAAT--AAA---CACTAC-AA--T-TTACAAAAA-ATTACATG-ATTA--ATGA-AT--T-AG-GA-GTC-G---T---TTCTAA-TTTAATTTTAATA----T-GAACCGA-TTTAG-AAA-ATT--------ACA--A-------A-----------CAAGATCTCAATTA-T---ATA-T-----CA------TTT--TT--TTTC-TCT-T---T----TA--TCAAA-CGT---G-A-A--CTA-GCG---ATA----AGGCTCT--A-C-A--G--C-AACTT-A---A-GAA-TGGTCAG-ACACCA-C-C-A-A-A--GAAGAGAAAAACGT--GGTCACTTTTA-CC-C-A-GCT--CA-A---T-GTTCCTC--TG--TAGACATTA-CGTG-----G-A-TAA-T-CA-G-TATTATA-C--AAA-TAA---CGTTT--TC--C
gi|1                          :                     -AT--TGA-C--T-GT--T-G-TT-TGATT-T-G-AGTTGTT-TT-C-TATAAAAT-ATATTTCCGAGGGTG-TGTTT-TG-----A-T-G--TT-TCC--A---T-A----CCGGTTAA-AAAAT--AGAGAGC--TAC-AAGAC-TTA-----ATA----ATG-AC-ACTAT-A-AT--GGAA-GA-GGTTG---CACTTCCTAA-TC-------GA-AATCAT-GACACGAGA--AG-AAA-ATA--------ACA--A-------ACAAAACAAATTT----------TCA-T-------A-----TA------TTA--TA--ATCA-TAT-C---T----TAAGT---A-T-TCTAG-A-AACCT--AGGC--GTATCAGG-----A--A-A-CCGG--C-AA--T-A---G-AAA-TG-C-AGTA-ACCC-C-C-G-ACA--TAA----AAAACCG--TCT---------CC-C-A-GCT--CA-AAGGT-GTC--TC--TGGCAAAA----A-TG---------A-A-A-T-C--G-T----TGAT--AAA-T-ACGTTGTTC--CC--CT-TG--AGC-A-TTGA--CTTTCTC--A-T-GTCAAT-C-A-T---T-TG-----AT-----A-TG-CC-AT----A-AG-TTTG-T--AA-C-----AATTA-TGCATG---CA-C--AC-A---C--AGA-AGC-TG-T---C-TGTGA-T---TTATT-TG---A-C-A-G-GGT--GCGAT---T-TTATCTTA----AATT--CTAT--G------GAT-GGA------------A-ACATT--A--TA-TA--ATC----TGGT---GTAGCGTAGGCGAG-A------TATTCG-----ACCACATCTA--C---CCTAAAA--GGA-CT--ATC--ACT-GCCG-TA--GT-TG--TA--A-G-T-T-ATGA-AAAAGAGT--TATTTAT-AA-TAT-TA--TTTTT-ATC-AAACC-AAATT-C--CTT-TC--T-TTA
gi|26                         :                                                                      gtggcgttcatgctatcataGTA-TGTTT-------GA-T-GG-TT-TCC--AA--T-AC---C-AGT----AAAgct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                          AACAA-A--A--AAA-ATT--------ACA--A-------A-----------C---------------AA-ACA-AATT--TA------TGA--TT--TTTA-T-T-T---T----TG--T---A-T-G---G-A-A--CT--GCG---ATA----GG----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCAT-G-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAAAAC--GTT------TT-TC-----GCT--C-----------------TG--AAAA-------G-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----CG-T--AAA-T-A---CCGCT--TCAACG-TT--A-C-A-TTAA--TT----A--G-T-TT---T-CTC-T---C-TG-----AT-----A-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--TA-T----T-A--A-TGCAT---GCA-TTGAT-A---C--A-ATAGC-TG-T---CTT-T-A-T---T-ATT--------------A-C--C-T-----T-TTAT--TT----AAT----TCT--A--T---GATGGGA------------A-ACGTT--A--TG-TATTGTGTAGGTAG----GCGG---------G-A------TAC--C-----GACAT----A--C---CC---AA--GA--CTT-ATC--ACT-G--G-TACTGT-TA---A--G---T-T-AT----GAAAATT--TATT--TAAA-GAT-TA--ATTTTCATA-AA--A-AAA-T-C----T-TC--T-TTACTTTTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           tg--------ACA--A-------A-----------T----------TTA-TTG-AT---------------------TA--TTCA-T-T-T---TAATGTA--T---G-CCT---G-A-AA-CTAGGCG---ATA----GGT---T--A-AGT--G--C-AA--T-AGAAA-GAA-TG-TCAA-ATGCCA-C---G-A-A--GAA----AAAAAAAC-GTTTT----TA-CC-T----CTGACA-A---C---------------AAA----A-GA-G-----G-A-T-A-T-C--G-TAA--CG-T--AAA-T-A---CGCAT---CAACG-TATTA-C-A-TTAA--TA----TAAG-T-TT---A-T-C-T---C-TT-----ATTAGATA-TG-CA-ATGTCAA-AG-TGTGAT--TA-T----TCA--A-TG-ACGATGCA-TTGAT-A---CCAA-A-GGC-TG-TTTTC-T-T-A-T---TCATT-TCACCG-C-A-C-A-TT-G-G-----TCTTAC--AA----AATTAATTCTGAA--G---AAT-GGA------------A-A-GTT--AAATG-TG--AT-------GT---GTAG---------G-AGCGGAGTAC--C-----GACAT----A--C---CC---AA--GGA-CTT-ATCAACAT-G--G-TAC-GT-TG--GA--A-G-T-TAACTA-GAAAAATT--TATT--TAAA-GAT-TAATATTTT-ATC-AC--C-AAA-TACAACTTATC--T-TTACTTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                           aattgaacaacaaaggacacaattacaaacaa-------A-----------T----------TTA-TGATATA-G------A------TG---TA--TTCA-T-T-T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---GTA----GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--GAA----AAA-C----GTTG-----TA-CC-C-A-GCT--CA-A---T-GTT--TC--TG--AAAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--A---T-A---TGTTT--TC--CT-TA----C-A-TTAA--TTT---C--G-T-TT---TGC-C-T---T-TG-----AT-----A-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--TA-T----TAA--A-TGCATG---CA-TTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-A-T---TCATT-T----A-C-G-G-A-T--G-G-----T-TTAT--TA----AAT----TCT--A--T---GAT-GGA------------A-ACGTT--A--TA-TA--G------TAG----ACAG---------G-A------TAC--G------ACACA---A--C---CC---AA--GGATCTATATC--ACT-G--G-TAC-GT-TG--TA--A-G-T-T-AATATGAAAAAAT--TATT--TAAA-TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-T-G-T---T----TA--C---AAC-T---G------CT--GCG---ATA----G-----TTAA-G-T--G--C-AA--T-A---A-AGA-TG-TCAG-A-ACCA-CGC-G-A-A--GA---------CAATCGTCG-----TA-CC-CCA-GCT--CAGA---T-GTC--TC--TG--AAAA----AGCG-G-----G-A-T-AGT-C--G-T----TG-T--AAG-T-A---CGTTT--TT--CC-TT--A-C-A-TTAC--TTT---C--A-T-TT---T-C-G-T---C-TTGTGGAAT-----A-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--TA-T----TAA--A-TGCATG--CGATTTGAT-A---C--A-A-AGC-TGTT---C-C-T-A-T---TTATT-T----A-C-G-G-A-T--G-A-----T-TTAT--CT----AAT----TCT--A--T---GATGGGA------------A-ACGTTAGA--TA-TA--GTGTAAGTAG----GCGG---------G-A------TAC--G------ACACA---A--C---CC---AA--GGACCT--ATC--ACT-G--GTTAC-GT-TG---A--AAG-T-T-AT---GAAAAA----TATT--TAAA-TAT-TA--A-TTT-ATC-AA--CGAAA-T-A--CTT-TC--TGTTACTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            catacaacatatatctataattgttaaga-T---A-A-A--CT--G-G---ATA----G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCAG-A-ACCA---C-G-A-C--GAA----AA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttggtttccaatgcactaattgatgtttgatatgaatagttttataaaataatgatgggtatgcttgatggtttccaataccggtaaaaataaactccaacttG---ATA----G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCAG-A-ACCA---C-G-A-C--GAA----AAAAC----GT-------CA-CC-C-A-GCT--CA-A---T-GTC--TC--TG---AAA----A-C--G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A---CG-TT--TC--CT-TT--A-C-A-TTACT-TT----C--A-T-TT---T-T-C-TCA-T-TG-----AT-----A-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--TA-T----TAA--A-TGCAT---GCA-TTGAT-AAATA--A-A-AGC-TG-T---T-T-T-A-T---TTATT-TA---A-CGA-G-A-T----G-----T-TTAT--TT----AAT----TCT--A--T---GAT--GA------------A-ACGTT--A--TA-TAT-GTG----TAGT-----AG---------GCG------TAC--G------ACACA---A--C---CC---AA--GGACCGT-ATC--ACT-G--G--AT-GT-TG--TA--AAG-T-T-AT---GAAAAAAT--TATT--TAAA-TAT-TAC-ATTTT-GAT-TA--CAAAA-T-T--CTTATC--T-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgAA--A-TGCATG---CACTTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---CAT-T-A-T---TTATT-T----A-C-G-GCA-T--G-G-----T-TTAT--TT----AATT--CT----A--T---GAT-GGA------------A--CGT---A--TGGTA--TTGCTG-TAGTA--GCGG---------G-A------TAG--C-----GACAC----AG-C---CC---AATTGACTCTA--TCA-CTT-G--GCTAC-GT-TG--TAAAGTA-TAT-GCTA------AAT--TATT---AAA-TATCTA--ATTTT-ATCACA--C-AA--T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAacactct
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tta-TGCATG---CA-TTGATGA---C--A-A-AGCCTG-T---C-T-T-A-T---TTAGT-G----AGC-AGG-G-T--GTG-----T-TTAT--TATTTTAATT--GTCT--A--TCGCGAT-GGA------------ACACGT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttatc-AGC-TA-T---C-T-T-A-T---TCATT-T----A-C-G-G-A-T--G-G-----T-TTAA--TT----AAT----TCT--A--T---GAT-GGG------------A-ACGTT--G--TA-TATTGTG----TAGTAG-GCGG---------G-A------TAC--G------ACACA---A--C---CC---AA--GGACCT--ATC--ACT-G--G-TAC-GT-TG--TA--A-G-T-T-ATGA-AAAAAAAgttataat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T---TTATA-T----A-C-G-G-A-T--G-G-----T-TTAT--TT----AATT--CT----A--T---GAT-GGA------------A-ACGTT--A--TA-TATTGTG----TAGTAG-GCAG---------G-A------T-----------ACAC----A--CAAACC---AA--GGACCT--ATC--ACC-G--G-TAC-GT-TT--TA--A-G-T-T-AT---GAAAA-----------------AT-TT--ATTTC-AT--CA--C-AAA-T-C--C-T-TC--T-TTACTTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-T----A-C-G-C-G-T--G-G-----T-TACT--TT----AATT--CT----A--T---GAT-GGA------------A-AC--T--A--TA-TA--a
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gctggctttataatacactaattgacgttatgatcattgatagttataatataagataatttgcgcggtagtgtttgatcgtttcctcaattaccgggaaaataaactcacattaaaatgacgaatatgagagggtgtctcctaattataactcgaaagcaataatacacgatactaaacaaatttctatgatttatttcatttatactgaactgcgtagttaatgccaattaacgaatatcagaccaccgaagaagaacgtcacctcagctcaatgtctcagtgaaaaaacgggattcttgttgtaaatacgttttcctttacatttgcttgtatttctcttgtgatatggataaggtgttatttatcAAATT--TATT--TAAA-TAT-TG--ATTTT-ATC--A--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAactgccgtatggtag





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                  1111                                   1         11       2222222   1111                      1111                     222222222222222222222222222222222222        1111111   1111111111                        11  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                  111111111111111                        11                  111111                                                                           111111111                                        111111    1111111                                          1111                    11              111111111111111                      1111                                 2222                                                                1111111111     111111111    1111                                      3333333              22             2                                                                                                                         11                                  
lowQualScore                  :              55   2  2  66 444  33 2  33 8888 2  2   2 2  2 2 8     5  55 2 33   2222    999 0   6  2  33  8888888 99   6 99  2   22  33 2 6666666   3333     77   555 33  33  3333   77777 2 6666   5  000000000000000000000000000000000000 3      2222222 2 8888888888     2 33  5 2 2 2      00  666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666   666666 2 2 444 777777777777777 33 444 2 4 333 2 2 55  22   777  2 2 55555 111111 22 22 2  22 2 333 2   4  2 2   2 4    2 2 2 2 2 22 6  4444    33 77  5555 000000000  2 4 2     2 44444  33   33  55 4444   111111  2 5555555 2 2 2 2 55 2 7777  2 88   4 2 22 2  2 33 0000  33 55 4 55 4 2    55  9999 55 2   777777777777777 2 5555 33   4  2  7  2222 2  2    2 33 4  77777  33 2     0000  4     6 666 33 6 6   4  2 333 2 2 2  333  2  2 2 6 2 9999999  3333333333 2   000000000    3333  22 22 333 2  4    555 2     33  2 2 2222222 4 2  2 3333  00 2  1  2  33 1      55555 4444  333  33   2 55 2    2 2 5555 4     4  55 2 2 4 2 666  33 55     33 4444    33 66 2  444   2  55     2  66  33 4   2 2 33   7  33 2         
lowQualScore                  :              ..   .  .  .. ...  .. .  .. .... .  .   . .  . . .     .  .. . ..   ....    ... .   .  .  ..  ....... ..   . ..  .   ..  .. . .......   ....     ..   ... ..  ..  ....   ..... . ....   .  .................................... .      ....... . ..........     . ..  . . . .      ..  ..................................................................   ...... . . ... ............... .. ... . . ... . . ..  ..   ...  . . ..... ...... .. .. .  .. . ... .   .  . .   . .    . . . . . .. .  ....    .. ..  .... .........  . . .     . .....  ..   ..  .. ....   ......  . ....... . . . . .. . ....  . ..   . . .. .  . .. ....  .. .. . .. . .    ..  .... .. .   ............... . .... ..   .  .  .  .... .  .    . .. .  .....  .. .     ....  .     . ... .. . .   .  . ... . . .  ...  .  . . . . .......  .......... .   .........    ....  .. .. ... .  .    ... .     ..  . . ....... . .  . ....  .. .  .  .  .. .      ..... ....  ...  ..   . .. .    . . .... .     .  .. . . . . ...  .. ..     .. ....    .. .. .  ...   .  ..     .  ..  .. .   . . ..   .  .. .         
lowQualScore                  :              88   9  9  33 777  77 7  77 3333 7  7   7 7  7 7 0     3  99 9 66   4444    333 6   7  7  77  7777777 00   0 00  7   77  77 7 3333333   0000     99   000 99  66  3333   11111 9 1111   7  999999999999999999999999999999999999 1      1111111 9 2222222222     7 77  3 7 7 7      00  999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   888888 4 4 111 333333333333333 22 111 4 4 999 2 2 33  88   999  1 1 00000 777777 99 99 1  99 1 777 1   2  1 1   1 2    1 1 1 1 1 99 3  5555    11 55  6666 888888888  2 4 2     2 77777  11   11  33 7777   111111  2 7777777 2 2 2 2 33 2 8888  2 33   4 2 77 2  2 11 0000  11 66 7 66 7 4    00  7777 66 4   444444444444444 4 0000 22   7  4  1  1111 4  4    4 22 7  33333  22 2     6666  4     7 111 11 7 3   2  1 777 1 1 1  555  0  0 0 0 0 7777777  5555555555 0   555555555    5555  88 88 555 0  0    888 1     11  2 2 5555555 4 2  2 6666  88 2  2  4  22 9      77777 7777  999  99   2 33 2    2 2 1111 4     4  33 2 2 4 2 111  11 33     11 5555    22 55 4  111   4  66     4  77  22 7   4 4 44   5  44 5         
consensus                     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAT-T-GA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GGAACGA-A--AG-A-A-A-ATTACA--AA---------C-TAC-GA-AT---A---A-A---T------A---T--A------------T-----TCA------T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT-TCT--A--T---G-AT-GGAA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GT-A-G--TA--G-CGGGA-TA--C-GACACA---A-C----CC---AAG-GAC-C--T-ATCA-C-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
Reference ( family-2091 )     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAN-T-GA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GGAACGA-A--AG-A-A-A-ATTACA--AA---------TTTAC-GA-AT---A---A-A---T------A---T--A------------T-----TCA------T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT-TCT--A--T---G-AT-GGAA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GT-A-G--TA--G-CGGGA-TA--CGGACACA---A-C----CC---AAG-GAC-C--T-ATCA-C-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|1                          :                         --T---AAT-T-GA--CTGTTG-TT-TGA-T-TT-G-AGTTGTT-TTCTA-TA-AAATAT-ATTT-C-CGAGGGTG-TG--TT-------TT-GAT-G--TT-TCC--A---T-A----CC-GGTTAA-AAAAT--AGAGAGC--TA-CAAGAC-TTA-----ATA----ATG-ACACTA-T-A-AT--GGAA-GA-GGTTG---CACTT--C-CTAATC-------G-A-AATCAT-GACACGAGA--AG-A-A-A-ATAACA--AACAAAACAAATTTTC----AT---A---T-A---TT-----A---T--A------------A-----TCA------TAT-C---T----T----------AAGT---A-T-TCTAG-A-AACCTAGGCGT--ATCA-GG----A--A-A-CCGG--C-AA--T-A---G-AAA-TG---CAGTA-ACCC-C-C-G-ACA--T-AA----AAAA--CC-GTC---T---------CC-C-A-GCTCA-AAGGT-GT--CTC--TGGCA----AAA----A-TG---------A-A-A-T-C--G-T----TGAT--AAA-T-A-CG-TTGT--T----CCCCT--T-GAGC-A-TTGA--CTTTCTC--A-TGTCAAT-C--A--T---T-T----G--ATA-TG-CC-AT----A-AG-TTTG-T--A-AC-----AATTA-TGCATG---CA-C--AC-A---C--AGA-AGC-TG-T---C-TGTGAT---TT-AT-T-TGA-CAG-G---GT--GCGAT---T-TTA----TC---TTAAAT-TCT--A--T---GGAT-GGAA---A-CATTA--TA-T-AATC--T-GGT-GT-A-GCGTA--GGCGAGA-TATTCGACCACATCTA-C----CCTAAAAG-GAC----T-ATCA-C-T-GCCG-TA-GT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAAAGAGT--TATT--T--ATAA---TAT-TA--TTTTT-ATC-AAACC-AAATT-C--CTT-TC--T-TTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                               gtggcgttcatgctatcaAATT-------G-A-A----C---AACAA-A--GG-ACACA-ATTACA--AA-------------C-AA-AC---A---A-A---TTTATTGA---TT-A------------T-----TCA------T-T-T---TAATGT----------A--T---G-CCT---G-A-AA-CTAGGCG---AT-A-GG----TTAA-G-T--G--C-AA--T-AGAAA-GAA-TG-T-CAA-ATGCCA-C---G-A-A--G-AA----AAAA--A--AAC-G-T-----------------TTT------T-AC--CTC--TG--ACAACAAA----A-GA-G-----G-A-T-A-T-C--G-TAA--CG-T--AAA-T-A-CG-CA-T--CAACGTA--T--T-A--C-A-TTAA--TA----TAAG-TTTA--T-C--T--C---T-TATTAG--ATA-TG-CA-ATGTCAA-AG-TGTGAT--T-AT----TCA--A-TG-ACGATGCA-TTGAT-A---CCAA-A-GGC-TG-TTTTC-T-T-AT---TC-AT-T-TCA-C-C-GCACATT-G-G-----TCTTA----CAAAATTAATT--CTGAA--G---A-AT-GGAA---A--GTTAAATG-TGA-----T-G-T-GT-A-G--GA--G-CGGAG-TA--CCGACATA-----C----CC---AAG-GAC-T--T-ATCAACAT-G--G-TACGT-TG--G-A-A-G-T---TAACTA-GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TAATATTTT-ATC-AC--C-AAA-TACAACTTATC--T-TTACTTTTgct
gi|11                         :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TTGAAAT-T-GA--T----G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-TTA-AATC-AAA-A---ATT---CGCGGGTA-TG--TT-------TT-GAT-G--TTGTCC--AAATT-A----CTCGGT----AACAT--AAA---C--TC-CAAA-C-TTA-----A-A----ATG-AT----AT-A-AT--G-A--GA-GGC-G---C---T--C-GTATAT-------A-A-A----TAGGAACAA-A--AG-A-A-A--TTAC------------------C-GA-AC---A---A-A---A------A---C--ACATTTTTGATTTT-----TCA------T-T-T---TA---T----------A--T-----C-T---G-A-A--CT--GCGC--AT-A-GT----T--A---T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAA-A-ACCACC-C-G-A-G--G-AA----AAAA--C--GTC-A-T-------ACCC-C-A-TCTCA-A---TGGT--CTC--TGA-A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-G-TGC--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--TG-T-AC-C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---T-C--CTTT---T-T----G--AAA-TGCCA-TT----C-AA-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATT--GC--TTGAT-A---C--AGA-AGCATG-T---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-CGG-G---ATG-G-G-----T-TTA----T----TTAGTT---T--A--T---G-AT-G
gi|12                         :  gactGGCTTTAT--AAT-AC-AC--T---AAT-T-GA--C----G-TTATGA-TCATTG-A-TAGTT-ATA-A-TATAAG-AT-AATTTG-CGCGG-TAGTG--TT-------T--GATCG--TT-TCCTCAA--TTA----CC-GGG----AAAAT--AAA---C--TCACA-----TTA-----A-A----ATG-AC--GAAT-A--T--G-AG-AG-GGT-GT--C---T--C-CTAATT-------ATA-A----C-T---CGA-A--AG-C-A-ATAATACAC-GA---------T--ACTAA-AC---A---A-A---TTTCT--A---TG-A------------T-----TTA------T-T-TCATT----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG----T-A-GT----T--A-A-T--G--CCAA--TTA---ACGAA-TA-T-CAG-A--CCA-C-C-G-A-A--G-AA----GAA---C--GTC-----------A-CCTC-A-GCTCA-A---T-GT--CTCAGTG--A----AAA----AACG-G-----G-A-T---T-CTTG-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--TTA--C-A-TTTG--CT----T--G-TAT---T-T--C--T---C-T------------------------------TG-T--G-AT--------------ATG--G------AT-A----------AGG-TG-T-------T-AT---TT-ATCT-T-A-C-G-C---GT--G-G-----T-TAC----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GGAA---A-C--TA--TA-T-AACTGCC-G-T-AT-G-G--TA--G-tgactttat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gctA------T-G-T---T----T----------A--C---AAC-T---G------CT--GCG---AT-A-GT----T--A-AGT--G--C-AA--T-A---A-AGA-TG-T-CAG-A-ACCA-CGC-G-A-A--G-AC----AAT---C--GTC-G-T-------A-CC-CCA-GCTCAGA---T-GT--CTC--TG--A----AAA----AGCG-G-----G-A-T-AGT-C--G-T----TG-T--AAG-T-A-CG-TT-T--TT---CC--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-CGTC--T---TGT----GGAATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--CGATTTGAT-A---C--A-A-AGC-TGTT---C-C-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----CTAA-T-TCT--A--T---G-ATGGGAA---A-CGTTA--GA-T-A-----TAG-T-GTAA-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-GACACA---A-C----CC---AAG-GAC-C--T-ATCA-C-T-G--GTTACGT-TG--A-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--A----TATT--T--A-AA---TAT-TA--A-TTT-ATC-AA--CGAAA-T-A--CTT-TC--TGTTACTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                           catacaacatatatctataattgttaagaGAACAA-A--A--A-A-A-ATTACA--AA-------------C-AA-AC---A---A-A---T------T---T--A------------TGATTTTTA------T-T-T---T----T----------G--T---A-T-G---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAT-G-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAAAAC--GTT-T-T------------------TCG-----------CTC--TG--A----AAA-------G-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----CG-T--AAA-T-ACCG-CT-T--CAA--CG--T--T-A--C-A-TTAA--TT----A--G-TTT---T-CT-C--T---C-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-AT----T-A--A-TGCAT---GCA-TTGAT-A---C--A-ATAGC-TG-T---C-T-T-TA---TT-AT-T-------------AC--C-T-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-ATGGGAA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GT-AGG--TAG-G-CGGGA-TA--CCGACAT----A-C----CC---AA--GAC-T--T-ATCA-C-T-G--G-TAC---TGT-T-A-A-G-T---TA--T--G-AAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TA--ATTTTCATA-AA--A-AAA-T-C----T-TC--T-TTACTTTTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tA---------TTTAT-GATAT---A---G-A---T------G---T--A------------T-----TCA------T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---GT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-AA----AAA---C--GTT-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T----A-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---TGC--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCAT---GCA-TTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA---------TTAAAT-TCT--A--T---G-AT-GGAA---A-CGTTA--TA-T-A-----------GT-A-G------A-CAGGA-TA--C-GACACA---A-C----CC---AAG-GAT-CTAT-ATCA-C-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-TTAATA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|16                         :                  T-GC-ACGCT---AAT-T-GAACC----GATT-TGA-T-AT-G-A-TAGTC-TTC-A-TA-AAA-AT-AATT-T-CGCGTGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----C--CGCGTCAAAAAT--AAA---CACTA-CAA--T-TTACAAAAA-ATTACATG-AT--TAATGA-AT--T-AG-GA-GTC-G---T---T--T-CTAATTTAATTTTA-ATA----T-GAACCGA-TTTAG-A-A-A-ATTACA--AA-------------C-AAGATCTCA---A-T---T------A---T--A------------TA----TCA------T-T-T---T----TTTTCTCTTTTA--TCAAA-CGT---G-A-A--CTA-GCG---AT-A-AGGCTCT--A-C-A--G--C-AACTT-A---A-GAA-TGGT-CAG-ACACCA-C-C-A-A-A--G-AAGAGAAAAA--C--GTG-G-TCACTTTTA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GTTCCTC--TG--T----AGACATTA-CGTG-----G-A-TAA-T-CA-G-TATTATA-C--AAA-TAA-CG-TT-T--T----CC--
gi|17                         :      GGGTTT---CAAT-GCCACC-T---AAT-T-GA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TG-GAA-ATCAATT-T-CGCAGGTA-TG--TT-------T--GATTG--TT-TCC--AA--T-A----CC-GGT----AAAAT--AAA---C--TA-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TA-T-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---TTTC-CTAATTT------A-A-A----T-G-AACGA-A--AG-A-A-A-ATTACA--AA---------CAAAC-AA-ATTT-AT--G-A---T------T---T--A------------T-----TCG------T-TCT---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-A-T-A--A-GA----AAAA--C--GTCCG-T-------A-CC-CCA-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GC----G-A---A-T-C--G-T----TG-TA-AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTACTTTT----C--A-TTTTTCT-C--T--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----ATAGTTTTG-T--T-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C---G-A-C--G-AA----AAAA--C--GTC-----------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA------CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--C----CT--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-T--C--TCA-T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCAT---GCA-TTGAT-AAATA--A-A-AGC-TG-T---T-T-T-AT---TT-AT-T-TAA-C-GAG---AT----G-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT--GAA---A-CGTTA--TA-T-A-----T-G-T-GT-A-G--TAG-G-CG----TA--C-GACACA---A-C----CC---AAG-GAC-CG-T-ATCA-C-T-G--G--ATGT-TG--TAA-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TAC-ATTTT-GAT-TA--CAAAA-T-T--CTTATC--T-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgAA--A-TGCATG---CACTTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---CAT-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-GC--AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GGAA-----CGT-A--TGGT-A-----TTGCT-GT-A-G--TA--G-CGGGA-TA--GCGACACA---G-C----CC---AATTGACTC--T-ATCA-C-TTG--GCTACGT-TG--T-A-AAG-TA--TA--T--GCTAA--A-T--TATT-----A-AA---TATCTA--ATTTT-ATCACA--C-AA--T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAacactct
gi|2                          :        ttaTAT-CAAT-GC-AC--T---AAT-T-GA--C----G-TT-TGA-T-AT-A-A---GTT-TTA-A-TA-AAA-TA-AATT-G-CG--AGTA-TG--TTGATGCCAT--GATAG--TT-TCC--AA--T-A----CT-GGT----TAAAT---AA---C--TT-CGA----TTA-----A-A----ATG-AC--T--T-A-ATTGG-AA-GATGGT-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-TGAACGA-A--GA-A-A-A-ATTACA--AA---------C------A-AC---A---A-AGTTT------A---TTGAT-----------T-----TCATTTCATT-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCGTGAAT-AGGG----T--A-ACT--GGTC-AA--T-A---A-GAAGTG-T--AG-A-ACAA-C-C-GCA-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------AGTC-C-ATGCTC--------GT--CT-------G----ACA----A-CA-GCATATG-ATT-A-T-C--G-A----TG-T--AAA-T-A-TC-TT-TTGT----CA--T--T-A--C-ATTTAAT-TT----C--G-TTT---CAT--C--T---T-T----G--ATA--G-TG-TG----A-AG-TTTG-T--T-ATCTTCTAA--ATTGC-TC--TCA-TTTAC-A---C--G-A----------------T-AT---TT-GT-T-T-G-C-A-G---A---G-AAGCATC-TCA----TG---TTAATTCTTT--ATTT---T-AT-GGAACTGATCGATA---G-A-A-----C-G-TCGT-A----TA--G--GCGATTA--C--AC-CA---A-C----TC---AAG-G-C-C--T-GTCA-C-TGG--G-TCCGT-TGGAT-A-G-GAA---TA--T---AAAG--AATGATATT--T--A-AAAATTAT-TA--ATGTT-AAT-CA--C-AAA---G--CTT-TCTGT-TTACTT
gi|20                         : gactggGGTTT-C-CAAT-GC-AC--T---AAT-T-GA--T----G-TT-TGA-T-AT-GAA-TAGTT-TT--A-T--AAA-AT-AA-T-G--ATGGGTA-TG--CT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--GGTA---AAAAT--AAA---C--TC-CAA--CTTTA-----A-A----CTG-GA--TAGT-A-AT--G-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tt-T---A-A-A--CT--G-G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA---C-G-A-C--G-AA----AAcaataagaatgtcagaaccacgacgaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttggtttccaatgcactaattgatgtttgatatgaatagttttataaaataatgatgggtatgcttgatggtttccaataccggtaaaaataaactccaacttT---TT-AT-A-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GGAA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GT-A-G--TAG-G-CAGGA-TA--C--ACACA---A-A----CC---AAG-GAC-C--T-ATCA-C-C-G--G-TACGT-TT--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--------ATT--T-----------------ATTTC-AT--CA--C-AAA-T-C--C-T-TC--T-TTACTTTTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AGC-TA-T---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----A----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT-GGGA---A-CGTTG--TA-T-AT----T-G-T-GT-A-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-GACACA---A-C----CC---AAG-GAC-C--T-ATCA-C-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACACA---A-CNNNNNN---NNN-NNN-N--N-NNNN-N-N-N--N-NNNNN-NN--N-N-N-N-N---NN--N--NNNAA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TG--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TGCATG---CA-TTGATGA---C--A-A-AGCCTG-T---C-T-T-AT---TT-AG-T-G-AGCAG-G---GT--GTG-----T-TTATTATT----TTAATTGTCT--A--TCGCG-AT-GGAAC--A-CGTa
gi|25                         : ttatcGGGTTTAT-CATT-GC-AA--T---AAT-T-GA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-Tgttataat
gi|26                         :                                                                                             ggactGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--AGT----AAA
gi|3                          :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AT--T---AAT-T-GA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-T--AAA-AT-AATT-G-CACAGGTA-TG--TT-------T--GATCG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGT----TAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--T-AT-ACAT--G-TA-------------------C-CTAATT-------A-A-A----T-TGAACAA-A--AG-T-A-A-ATTATA--AA---------CAAAC-AA-AT---T---A-A---T------GATTT--A------------T-----TCA------T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---GTA-A--CT--GTG---AT-A-GT----T--A-ATT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCCAG-A-CACA-C-CTG-A-A--GAAA----AAAA--CG-GTC-G-T-------A-CC-T-A-GCTTC-A---TCGT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GATCT-G-A-T-A-T-C--GTT----TG-T--AAATT-A-CGTTT-T--T----CT--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTG---T-CT-C--T---T-T----G--ATA-T---A-TT----C-AG-TGTG-TTAT-AT----TAA--A--ATACT--GCA-TTGAT-AC--C--ACA-AGC-TG-T---C-T-T-AT---TTCAT-TCT-A-C-G-G---ATTGG-A-----G-TTA----------TGA-T-TCT--A--T---G-AT-GGGA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GT-A-G--TAAGG-CGGGA-TA--C--ACACA---T-C----CC---AAG-GAC-T--T-ATCA-C-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--C--GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATA-CA----AAA-T-C--CTT-TC--T-TCACTTTTA
gi|4                          :   actGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---GAA-T-GA--C----G-TT-TGACT-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-GGCGCGGGTA-TG--TT-------TTGGAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--AGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GAAACGA-A--AG-A-A-A-ATTACA--AA---------TTTAT-GA-AT---A---ACA---TG-----G---T--A------------T-----TCA------T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---GT-A--G----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-C-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--CAAGTT-GAT-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTT--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--TAA--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TTGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TAAATTCTCT--A--T---G-AT-GGAA---A-CGTTA--TG-T-A-------G-T--T-A-G--T---G-CAGGA-TA--TGAACAC----A-C----CC---AAG-GAT-C--TAATCC-A-T-G--G-TACGT-TG--T-A-GCA-T---TA--TTAGAAAA--AAT--TATTCGT--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|5                          :         TTTAT--AAT-GC-AC--T---AAA-T-TA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAAA---C--TC--AA----TTA-----A-A----ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAATT-------A-A-ACT--T-AGAACGA-A--AGGA-A-A-ATTACACAAA---------CATAC-AA-AT---T---------T------A---T--A------------T------CA------T-T-T---C---------------A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----TA-A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TT-A-TAG-A-A-CA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTG-G-T-------A-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAAT----CAA--A-TGCAT---GCA-TTCATAA---C--A-ACAGC-TG-T---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TTAATT-TCT--G--T---G-AT-TGAA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GT-A----TAT-G-CG----TA--C-GACACA---ATC----CC---AA---AT-C-----TCA-C-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTACT
gi|6                          :        aTTTAT--AAT-GC-AC--T---AAA-T-TA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAAA---C--TC--AA----TTA-----A-A----ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAATT-------A-A-ACT--T-AGAACGA-A--AGGA-A-A-ATTACACAAA---------CATAC-AA-AT---T---------T------A---T--A------------T------CA------T-T-T---C---------------A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----TA-A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TT-A-TAG-A-A-CA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTG-G-T-------A-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAAT----CAA--A-TGCAT---GCA-TTCATAA---C--A-ACAGC-TG-T---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TTAATT-TCT--G--T---G-AT-TGAA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GT-A----TAT-G-CG----TA--C-GACACA---ATC----CC---AA---AT-C-----TCA-C-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTAC
gi|7                          :     aGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAA-TTGA--CC---G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-T-A-A-TA-AAA-A--AATT-G-CGCGG-TA-TG--TT-------T--GAT-GGTTT-TCCCCAA--T-A----CT-GGT----AAAAT--AAA---C--TT--AA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAA--A-AT--G-AC-TA---C-A---A---T--GACTAATA-------A-A-A----T-GAACCGA-A--GA-A-A-A-ATTACA--AC---------ATTA--GA-AT---ATACA-A---T------G---T--AAT----------T-----TCA------T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A----CT--GTG---GT-A-GG----T--T---T--G--C-AA--T-A-----GAA-TG-C-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-AAAG-AA----AAAA--C--GTT-G-T-------A-CC---A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--TCTT-T--C-A-TTAA--TT----TT-G-TTT---T-C--CC-T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-T-CATG---CA-TTGAT-----C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-----AT--G-G-----T-CTA----T----CAAATT--CT--A--T---G-AT-GGAA---T-CGTTA--TG-T-A-----------GT-A-G------G-CAGGA-TA--TG-ACACA---A-C----CC---AAT-GAT-C--T-ATCA-C-T-G--G-TACGT-TG--T----------------------A--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-AA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC----TTACTTTTA
gi|8                          :  ggctGGGTTTATTCAATTGC--C--T---AACGT-GA--C----G-TT-TGA-C--T-A-G-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-CTCGCGG-TA-TGGTTT-------T--GAT-G--GT-TCC--AG--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TA-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AT--CTAT-A--T--G-AACGA-GAT-G---C------C-CT--TT-------A-A------T-TGAACGA-A--AG-A-A-T-AT-ACA--AACAAAACA--TTTAT-GA----------------T------G---T--A------------T-----TCA------T-C-T---T---------------A--T---A-C-T---G-ATA--CT---CG---AT-A-TG----TC-ATA-T--G--C-AA--T-A---A-TAAGTG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAAA----AAAA--C--GT--G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T--T--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-A-T-C--G------TG-T--AAATT-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A--TAC--TT----C--A-TTT---T-CT-C--T---T-T----G--TCT-TG-CATTT----A-AG-TCTA--------------------------------TGAT-A---T--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-ATTTATT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT-GGAA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GT-A-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-GACACA---A-C----CC---AAG-GAC-C--T-ATCA-C-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-A-T---TA--G--GAAAA--AAT--AATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-
gi|9                          :    ctGGGTTTAT-TGAT-GC-AC--T---AAT-T-GA--C----G-TT-T-A-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-G-CACGGGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----CC-GGA----AAAAT--AAA---T--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TA-T-A----------------------------C-CTAATT-------A-A------T-TGAACAA-A--TG-A-A-A-ATTACA--AA---------CACAC-AA-ATTT-AT--G-A---T------T---T--A------------T-----TCA------T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--G-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAAA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GC--CTC--CG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C-----------------------------T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--------C--GATTT---T-C--T--C---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-------------------------TGAT-A---C--A-A-AGC-TG-T---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-C---AT--G-C-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT-----T---G-AT-GGAA---A--GTTA--TG-T-AT----T-G-T-GT-A-G--TA--G-GCGGA-TA--CGAACAC------T----CC---AAG-G------T---------------TACGT-TG--T-ACA-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTC-AT--CA--C--AA-T-C--CTTCTC--T-TTACTTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                  1111                                   1         11       2222222   1111                      1111                     222222222222222222222222222222222222        1111111   1111111111                              88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888            111111111111111                        11                  111111                                                                           111111111                                        111111    1111111                                          1111                    11              111111111111111                      1111                                 2222                                                                1111111111     111111111      11                                       3333333             11                                                                                                                                     11                                  
lowQualScore                  :              55   2  2  66 444  2 2   33 8888 2  2   2 2  2 2 8     5  55 2 33   2222    999 0   6  2  33  8888888 99   6 99  2   22  33 2 6666666   3333     77   555 33  33  3333   77777 2 6666   5  000000000000000000000000000000000000 3      2222222 2 8888888888     2 33  5 2 2 2      77 2  00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000  2 2 2 444 777777777777777 33 444 2 4 333 2 2 55  22   777  2 2 77777 111111 22 22 2  22 2 333 2   4  2 2   2 4    2 2 2 2 2 22 6  4444    33 77  5555 000000000  2 4 2     2 44444  33   33  55 4444   111111  2 5555555 2 2 2 2 55 2 7777  2 88   4 2 22 2  2 33 0000  33 55 2 77 4 2    55  9999 55 2   777777777777777 2 5555 33   4  2  7  2222 2  2    2 33 4  77777  33 2     0000  2  2   6 666 33 6 6   4   555 2 2 2  333  2  2 2 6 2 9999999  3333333333 2   000000000    8 44  22 22 333 2  2  2  555 2     33  2 2 2222222 4 2   5555  66 6  1  2  77 333  2   66666   444  44   2 55 2   2  2 5555 4     4  55 2 2 4 2 666  33 55     33 4444    33 66 2  444   2  55     2  33  33 4   2 2 33   7  33 2         
lowQualScore                  :              ..   .  .  .. ...  . .   .. .... .  .   . .  . . .     .  .. . ..   ....    ... .   .  .  ..  ....... ..   . ..  .   ..  .. . .......   ....     ..   ... ..  ..  ....   ..... . ....   .  .................................... .      ....... . ..........     . ..  . . . .      .. .  .................................................................  . . . ... ............... .. ... . . ... . . ..  ..   ...  . . ..... ...... .. .. .  .. . ... .   .  . .   . .    . . . . . .. .  ....    .. ..  .... .........  . . .     . .....  ..   ..  .. ....   ......  . ....... . . . . .. . ....  . ..   . . .. .  . .. ....  .. .. . .. . .    ..  .... .. .   ............... . .... ..   .  .  .  .... .  .    . .. .  .....  .. .     ....  .  .   . ... .. . .   .   ... . . .  ...  .  . . . . .......  .......... .   .........    . ..  .. .. ... .  .  .  ... .     ..  . . ....... . .   ....  .. .  .  .  .. ...  .   .....   ...  ..   . .. .   .  . .... .     .  .. . . . . ...  .. ..     .. ....    .. .. .  ...   .  ..     .  ..  .. .   . . ..   .  .. .         
lowQualScore                  :              88   9  9  33 777  7 7   77 3333 7  7   7 7  7 7 0     3  99 9 66   4444    333 6   7  7  77  7777777 00   0 00  7   77  77 7 3333333   0000     99   000 99  66  3333   11111 9 1111   7  999999999999999999999999999999999999 1      1111111 9 2222222222     7 77  3 7 7 7      33 7  77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  4 4 4 111 333333333333333 22 111 4 4 999 2 2 33  88   999  1 1 66666 777777 99 99 1  99 1 777 1   2  1 1   1 2    1 1 1 1 1 99 3  5555    11 55  6666 888888888  2 4 2     2 77777  11   11  33 7777   111111  2 7777777 2 2 2 2 33 2 8888  2 33   4 2 77 2  2 11 0000  11 66 4 99 7 4    00  7777 66 4   444444444444444 4 0000 22   7  4  1  1111 4  4    4 22 7  33333  22 2     6666  2  2   7 111 11 7 3   2   888 1 1 1  555  0  0 0 0 0 7777777  5555555555 0   555555555    3 22  88 88 555 0  0  1  888 1     11  2 2 5555555 4 2   8888  44 7  2  4  99 555  4   55555   111  11   4 66 4   4  4 3333 7     7  66 4 4 7 4 555  22 66     11 5555    22 55 4  111   4  66     4  88  22 7   4 4 44   5  44 5         
consensus                     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GGAACGA-A--AG-A-A-A-ATTACA--A-AC-N-A-C-GA-A---T---A-----A-AT------A---T-A------------T-----T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
Reference ( family-2091 )     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GGAACGA-A--AG-A-A-A-ATTACA--A-AC-T-A-C-GA-A---T---A-----A-AT------A---T-A------------T-----T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|1                          :                         --T---AA-T-TGA--CTGTTG-TT-TGA-T-TT-G-AGTTGTT-TTCTA-TA-AAATAT-ATTT-C-CGAGGGTG-TG--TT-------TT-GAT-G--TT-TCC--A---T-A----CC-GGTTAA-AAAAT--AGAGAGC--TA-CAAGAC-TTA-----ATA----ATG-ACACTA-T-A-AT--GGAA-GA-GGTTG---CACTT--C-CTAATC-------G-A-AATCAT-GACACGAGA--AG-A-A-A-ATAACA--A-AC-A-A----A-A---C---A-----A-ATTTTCATA---T-A------------T-----TATAATCA-TAT-C---T----T----------AAGT---A-T-TCTAG-A-AACCTAGGCGT--ATCA-GG----A--A-A-CCGG--C-AA--T-A---G-AAA-TG---CAGTA-ACCC-C-C-G-ACA--T-AA----AAAA--CC-GTC---T---------CC-C-A-GCTCA-AAGGT-GT--CTC--TGGCA----AAA----A-TG---------A-A-A-T-C--G-T----TGAT--AAA-T-A-CG-TTGT--T----CCCCT--T-GAGC-A-TTGA--CTTTCTC--A-TGTCAAT-C--A--T---T-T----G--ATA-TG-CC-AT----A-AG-TTTG-T--A-AC-----AATTA-TGCATG---CA-C---AC-A---C--AGA-AGC-TGT---C-TGTGAT---TT-AT-T-TGA-CAG-G---GT--GCGAT---T-TTA----TC---TTAAAT-TCT--A--T---GGAT-GG-AA---A-CATTA--TA-T-AATC--T-GGT-GTA-GCGTA--GGCGAGA-TATTC-G-ACCACATCTA-CCCTAAAAG-GAC----T-ATC-AC-T-GCCG-TA-GT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAAAGAGT--TATT--T--ATAA---TAT-TA--TTTTT-ATC-AAACC-AAATT-C--CTT-TC--T-TTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                               gtggcgttcatgctatcaAATT-------G-A-A----C---AACAA-A--GG-ACACA-ATTACA--A-AC-------AA-A---C---A-----A-ATTTATTGA---TTA------------T-----T-----CA-T-T-T---TAATGT----------A--T---G-CCT---G-A-AA-CTAGGCG---AT-A-GG----TTAA-G-T--G--C-AA--T-AGAAA-GAA-TG-T-CAA-ATGCCA-C---G-A-A--G-AA----AAAA--A--AAC-G-T-----------------TTT------T-AC--CTC--TG--ACAACAAA----A-GA-G-----G-A-T-A-T-C--G-TAA--CG-T--AAA-T-A-CG-CA-T--CAACGTA--T--T-A--C-A-TTAA--TA----TAAG-TTTA--T-C--T--C---T-TATTAG--ATA-TG-CA-ATGTCAA-AG-TGTGAT--T-AT----TCA--A-TG-ACGATGCA-TT-GAT-A---CCAA-A-GGC-TGTTTTC-T-T-AT---TC-AT-T-TCA-C-C-GCACATT-G-G-----TCTTA----CAAAATTAATT--CTGAA--G---A-AT-GG-AA---A--GTTAAATG-TGA-----T-G-T-GTA-G--GA--G-CGGAG-TA--CCG-AC-ATA-----CCC---AAG-GAC-T--T-ATCAACAT-G--G-TACGT-TG--G-A-A-G-T---TAACTA-GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TAATATTTT-ATC-AC--C-AAA-TACAACTTATC--T-TTACTTTTgct
gi|11                         :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TTGAAA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-TTA-AATC-AAA-A---ATT---CGCGGGTA-TG--TT-------TT-GAT-G--TTGTCC--AAATT-A----CTCGGT----AACAT--AAA---C--TC-CAAA-C-TTA-----A-A----ATG-AT----AT-A-AT--G-A--GA-GGC-G---C---T--C-GTATAT-------A-A-A----TAGGAACAA-A--AG-A-A-A--TTAC------------C-GA-A---C---A-----A-AA------A---C-ACATTTTTGATTTT-----T-----CA-T-T-T---TA---T----------A--T-----C-T---G-A-A--CT--GCGC--AT-A-GT----T--A---T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAA-A-ACCACC-C-G-A-G--G-AA----AAAA--C--GTC-A-T-------ACCC-C-A-TCTCA-A---TGGT--CTC--TGA-A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-G-TGC--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--TG-T-AC-C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---T-C--CTTT---T-T----G--AAA-TGCCA-TT----C-AA-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATT--GC--TT-GAT-A---C--AGA-AGCATGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-CGG-G---ATG-G-G-----T-TTA----T----TTAGTT---T--A--T---G-AT-G
gi|12                         :  gactGGCTTTAT--AAT-AC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TTATGA-TCATTG-A-TAGTT-ATA-A-TATAAG-AT-AATTTG-CGCGG-TAGTG--TT-------T--GATCG--TT-TCCTCAA--TTA----CC-GGG----AAAAT--AAA---C--TCACA-----TTA-----A-A----ATG-AC--GAAT-A--T--G-AG-AG-GGT-GT--C---T--C-CTAATT-------ATA-A----C-T---CGA-A--AG-C-A-ATAATACA--C-GA-T-A-CTAA-A---C---A-----A-ATTTCT--A---TGA------------T-----T-----TA-T-T-TCATT----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG----T-A-GT----T--A-A-T--G--CCAA--TTA---ACGAA-TA-T-CAG-A--CCA-C-C-G-A-A--G-AA----GAA---C--GTC-----------A-CCTC-A-GCTCA-A---T-GT--CTCAGTG--A----AAA----AACG-G-----G-A-T---T-CTTG-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--TTA--C-A-TTTG--CT----T--G-TAT---T-T--C--T---C-T------------------------------TG-T--G-AT--------------ATG--G-------AT-A----------AGG-TGT-------T-AT---TT-ATCT-T-A-C-G-C---GT--G-G-----T-TAC----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---A-C--TA--TA-T-AACTGCC-G-T-ATG-G--TA--G-tgactttat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gctA-T-G-T---T----T----------A--C---AAC-T---G------CT--GCG---AT-A-GT----T--A-AGT--G--C-AA--T-A---A-AGA-TG-T-CAG-A-ACCA-CGC-G-A-A--G-AC----AAT---C--GTC-G-T-------A-CC-CCA-GCTCAGA---T-GT--CTC--TG--A----AAA----AGCG-G-----G-A-T-AGT-C--G-T----TG-T--AAG-T-A-CG-TT-T--TT---CC--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-CGTC--T---TGT----GGAATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--CGA-TTTGAT-A---C--A-A-AGC-TGTT--C-C-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----CTAATT--CT--A--T---G-AT-GGGAA---A-CGTTA--GA-T-A-----TAG-T-GTAAG--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--GTTACGT-TG--A-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--A----TATT--T--A-AA---TAT-TA--A-TTT-ATC-AA--CGAAA-T-A--CTT-TC--TGTTACTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                           catacaacatatatctataattgttaagaGAACAA-A--A--A-A-A-ATTACA--A-AC-------AA-A---C---A-----A-AT------T---T-A------------TGATTTT-----TA-T-T-T---T----T----------G--T---A-T-G---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAT-G-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAAAAC--GTT-T-T------------------TCG-----------CTC--TG--A----AAA-------G-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----CG-T--AAA-T-ACCG-CT-T--CAA--CG--T--T-A--C-A-TTAA--TT----A--G-TTT---T-CT-C--T---C-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-AT----T-A--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-ATAGC-TGT---C-T-T-TA---TT-AT-T-------------AC--C-T-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-ATGGG-AA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTAGG--TAG-G-CGGGA-TAC-C-G-AC-AT----A-CCC---AA--GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TAC---TGT-T-A-A-G-T---TA--T--G-AAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TA--ATTTTCATA-AA--A-AAA-T-C----T-TC--T-TTACTTTTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      t-T-A-T-GATA---T---A-----G-AT------G---T-A------------T-----T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---GT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-AA----AAA---C--GTT-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T----A-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---TGC--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA---------TTAAAT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----------GTA-G------A-CAGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAT-CTAT-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-TTAATA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|16                         :               attT-GC-ACGCT---AA-T-TGAACC----GATT-TGA-T-AT-G-A-TAGTC-TTC-A-TA-AAA-AT-AATT-T-CGCGTGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----C--CGCGTCAAAAAT--AAA---CACTA-CAA--T-TTACAAAAA-ATTACATG-AT--TAATGA-AT--T-AG-GA-GTC-G---T---T--T-CTAATTTAATTTTA-ATA----T-GAACCGA-TTTAG-A-A-A-ATTACA--A-AC-A-A----G-A---TCTCA-----A-TT------A---T-A------------TA----T-----CA-T-T-T---T----TTTTCTCTTTTA--TCAAA-CGT---G-A-A--CTA-GCG---AT-A-AGGCTCT--A-C-A--G--C-AACTT-A---A-GAA-TGGT-CAG-ACACCA-C-C-A-A-A--G-AAGAGAAAAA--C--GTG-G-TCACTTTTA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GTTCCTC--TG--T----AGACATTA-CGTG-----G-A-TAA-T-CA-G-TATTATA-C--AAA-TAA-CG-TT-T--T----CC--
gi|17                         :      GGGTTT---CAAT-GCCACC-T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TG-GAA-ATCAATT-T-CGCAGGTA-TG--TT-------T--GATTG--TT-TCC--AA--T-A----CC-GGT----AAAAT--AAA---C--TA-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TA-T-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---TTTC-CTAATTT------A-A-A----T-G-AACGA-A--AG-A-A-A-ATTACA--A-AC-A-AAC-AA-A---TTT-AT----G-AT------T---T-A------------T-----T-----CG-T-TCT---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-A-T-A--A-GA----AAAA--C--GTCCG-T-------A-CC-CCA-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GC----G-A---A-T-C--G-T----TG-TA-AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTACTTTT----C--A-TTTTTCT-C--T--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----ATAGTTTTG-T--T-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C---G-A-C--G-AA----AAAA--C--GTC-----------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA------CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--C----CT--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-T--C--TCA-T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-AAATA--A-A-AGC-TGT---T-T-T-AT---TT-AT-T-TAA-C-GAG---AT----G-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT--G-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-CG-T-ATC-AC-T-G--G--ATGT-TG--TAA-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TAC-ATTTT-GAT-TA--CAAAA-T-T--CTTATC--T-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgAA--A-TGCATG---CACTT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---CAT-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-GC--AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA-----CGT-A--TGGT-A-----TTGCT-GTA-G--TA--G-CGGGA-TAG-C-G-AC-ACA---G-CCC---AATTGACTC--T-ATC-AC-TTG--GCTACGT-TG--T-A-AAG-TA--TA--T--GCTAA--A-T--TATT-----A-AA---TATCTA--ATTTT-ATCACA--C-AA--T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAacactct
gi|2                          :        ttaTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-A-A---GTT-TTA-A-TA-AAA-TA-AATT-G-CG--AGTA-TG--TTGATGCCAT--GATAG--TT-TCC--AA--T-A----CT-GGT----TAAAT---AA---C--TT-CGA----TTA-----A-A----ATG-AC--T--T-A-ATTGG-AA-GATGGT-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-TGAACGA-A--GA-A-A-A-ATTACA--A-AC-A-A-C-AA-AGTTT---ATT---G-ATTTC---A---T--------------T-----T-----CATT-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCGTGAAT-AGGG----T--A-ACT--GGTC-AA--T-A---A-GAAGTG-T--AG-A-ACAA-C-C-GCA-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------AGTC-C-ATGCTC--------GT--CT-------G----ACA----A-CA-GCATATG-ATT-A-T-C--G-A----TG-T--AAA-T-A-TC-TT-TTGT----CA--T--T-A--C-ATTTAAT-TT----C--G-TTT---CAT--C--T---T-T----G--ATA--G-TG-TG----A-AG-TTTG-T--T-ATCTTCTAA--ATTGC-TC--TCA-TT-TAC-A---C--G-A---------------T-AT---TT-GT-T-T-G-C-A-G---A---G-AAGCATC-TCA----TG---TTAATTCTTT--ATTT---T-AT-GG-AACTGATCGATA---G-A-A-----C-G-TCGTA----TA--G--GCGATTA--C---AC--CA---A-CTC---AAG-G-C-C--T-GTC-AC-TGG--G-TCCGT-TGGAT-A-G-GAA---TA--T---AAAG--AATGATATT--T--A-AAAATTAT-TA--ATGTT-AAT-CA--C-AAA---G--CTT-TCTGT-TTACTT
gi|20                         : gactggGGTTT-C-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-GAA-TAGTT-TT--A-T--AAA-AT-AA-T-G--ATGGGTA-TG--CT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--GGTA---AAAAT--AAA---C--TC-CAA--CTTTA-----A-A----CTG-GA--TAGT-A-AT--G-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tt-T---A-A-A--CT--G-G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA---C-G-A-C--G-AA----AAcaataagaatgtcagaaccacgacgaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttggtttccaatgcactaattgatgtttgatatgaatagttttataaaataatgatgggtatgcttgatggtttccaataccggtaaaaataaactccaacttT---TT-AT-A-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CAGGA-TA--C---AC-ACA---A-ACC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-C-G--G-TACGT-TT--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--------ATT--T-----------------ATTTC-AT--CA--C-AAA-T-C--C-T-TC--T-TTACTTTTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AGC-TAT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----A----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTG--TA-T-A-----TTG-T-GTA-G--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TG--ATTTT-ATC--A--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggacacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGCATG---CA-TT-GATGA---C--A-A-AGCCTGT---C-T-T-AT---TT-AG-T-G-AGCAG-G---GT--GTG-----T-TTATTATT----TTAATTGTCT--A--TCGCG-AT-GG-AAC--A-CGTa
gi|25                         : ttatcGGGTTTAT-CATT-GC-AA--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-Tgttataat
gi|26                         :                                                                                             ggactGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--AGT----AAA
gi|3                          :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AT--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-T--AAA-AT-AATT-G-CACAGGTA-TG--TT-------T--GATCG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGT----TAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--T-AT-ACAT--G-TA-------------------C-CTAATT-------A-A-A----T-TGAACAA-A--AG-T-A-A-ATTATA--A-ACAA-A-C-AA-A---T---T-----A-AT------GATTT-A------------T-----T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---GTA-A--CT--GTG---AT-A-GT----T--A-ATT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCCAG-A-CACA-C-CTG-A-A--GAAA----AAAA--CG-GTC-G-T-------A-CC-T-A-GCTTC-A---TCGT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GATCT-G-A-T-A-T-C--GTT----TG-T--AAATT-A-CGTTT-T--T----CT--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTG---T-CT-C--T---T-T----G--ATA-T---A-TT----C-AG-TGTG-TTAT-AT----TAA--A--ATACT--GCA-TT-GAT-AC--C--ACA-AGC-TGT---C-T-T-AT---TTCAT-TCT-A-C-G-G---ATTGG-A-----G-TTA----------TGA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAAGG-CGGGA-TA--C---AC-ACA---T-CCC---AAG-GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--C--GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATA-CA----AAA-T-C--CTT-TC--T-TCACTTTTA
gi|4                          :   actGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---GA-A-TGA--C----G-TT-TGACT-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-GGCGCGGGTA-TG--TT-------TTGGAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--AGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GAAACGA-A--AG-A-A-A-ATTACA--A-AT-TTA-T-GA-A---T---A-----ACAT------GG--T-A------------T-----T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---GT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-C-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--CAAGTT-GAT-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTT--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-AA-C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TAAATTCTCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-------G-T--TA-G--T---G-CAGGA-TA--T-GAAC-AC----A-CCC---AAG-GAT-C--TAATC-CA-T-G--G-TACGT-TG--T-A-GCA-T---TA--TTAGAAAA--AAT--TATTCGT--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|5                          :         TTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAAA---C--TC--AA----TTA-----A-A----ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAATT-------A-A-ACT--T-AGAACGA-A--AGGA-A-A-ATTACACAA-ACAT-A-C-AA-A---T---T--------T------A---T-A------------T-----------CA-T-T-T---C---------------A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----TA-A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TT-A-TAG-A-A-CA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTG-G-T-------A-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAAT----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTACT
gi|6                          :        aTTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAAA---C--TC--AA----TTA-----A-A----ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAATT-------A-A-ACT--T-AGAACGA-A--AGGA-A-A-ATTACACAA-ACAT-A-C-AA-A---T---T--------T------A---T-A------------T-----------CA-T-T-T---C---------------A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----TA-A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TT-A-TAG-A-A-CA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTG-G-T-------A-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAAT----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTAC
gi|7                          :     aGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAAT-TGA--CC---G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-T-A-A-TA-AAA-A--AATT-G-CGCGG-TA-TG--TT-------T--GAT-GGTTT-TCCCCAA--T-A----CT-GGT----AAAAT--AAA---C--TT--AA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAA--A-AT--G-AC-TA---C-A---A---T--GACTAATA-------A-A-A----T-GAACCGA-A--GA-A-A-A-ATTACA--ACAT-T-A---GA-A---T---ATAC--A-AT------G---T-AAT----------T-----T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A----CT--GTG---GT-A-GG----T--T---T--G--C-AA--T-A-----GAA-TG-C-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-AAAG-AA----AAAA--C--GTT-G-T-------A-CC---A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--TCTT-T--C-A-TTAA--TT----TT-G-TTT---T-C--CC-T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-T-CATG---CA-TT-GAT-----C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-----AT--G-G-----T-CTA----T----CAAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---T-CGTTA--TG-T-A-----------GTA-G------G-CAGGA-TA--T-G-AC-ACA---A-CCC---AAT-GAT-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T----------------------A--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-AA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC----TTACTTTTA
gi|8                          :  ggctGGGTTTATTCAATTGC--C--T---AA-CGTGA--C----G-TT-TGA-C--T-A-G-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-CTCGCGG-TA-TGGTTT-------T--GAT-G--GT-TCC--AG--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TA-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AT--CTAT-A--T--G-AACGA-GAT-G---C------C-CT--TT-------A-A------T-TGAACGA-A--AG-A-A-T-AT-ACA--A-AC-A-A----A-A---C---ATTTATG-AT------G---T-A------------T-----T-----CA-T-C-T---T---------------A--T---A-C-T---G-ATA--CT---CG---AT-A-TG----TC-ATA-T--G--C-AA--T-A---A-TAAGTG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAAA----AAAA--C--GT--G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T--T--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-A-T-C--G------TG-T--AAATT-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A--TAC--TT----C--A-TTT---T-CT-C--T---T-T----G--TCT-TG-CATTT----A-AG-TCTA--------------------------------T-GAT-A---T--A-A-AGC-TGT---C-T-T-ATTTATT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-A-T---TA--G--GAAAA--AAT--AATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-
gi|9                          :    ctGGGTTTAT-TGAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-T-A-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-G-CACGGGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----CC-GGA----AAAAT--AAA---T--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TA-T-A----------------------------C-CTAATT-------A-A------T-TGAACAA-A--TG-A-A-A-ATTACA--A-ACAC-A-C-AA-A---TTT-AT----G-AT------T---T-A------------T-----T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--G-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAAA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GC--CTC--CG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C-----------------------------T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--------C--GATTT---T-C--T--C---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-------------------------T-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-C---AT--G-C-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT-----T---G-AT-GG-AA---A--GTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TA--G-GCGGA-TA--C-G-A--ACA---C-TCC---AAG-G------T---------------TACGT-TG--T-ACA-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTC-AT--CA--C--AA-T-C--CTTCTC--T-TTACTTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                  1111                                   1         11       2222222   1111                      1111                     222222222222222222222222222222222222        1111111   1111111111                            555555555555555555555555555555555555555555      11111            111111111111111                        11                  111111                                                                           111111111                                        111111    1111111                                          1111                    11              111111111111111                      1111                                 2222                                                                1111111111     111111111      11                                       3333333             11                                                                                                                                     11                                  
lowQualScore                  :              55   2  2  66 444  2 2   33 8888 2  2   2 2  2 2 8     5  55 2 33   2222    999 0   6  2  33  8888888 99   6 99  2   22  33 2 6666666   3333     77   555 33  33  3333   77777 2 6666   5  000000000000000000000000000000000000 3      2222222 2 8888888888     2 33  5 2 2 2     2  2 888888888888888888888888888888888888888888 33 7 00000  2 2 2 444 777777777777777 33 444 2 4 333 2 2 55  22   777  2 2 77777 111111 22 22 2  22 2 333 2   4  2 2   2 4    2 2 2 2 2 22 6  4444    33 77  5555 000000000  2 4 2     2 44444  33   33  55 4444   111111  2 5555555 2 2 2 2 55 2 7777  2 88   4 2 22 2  2 33 0000  33 55 2 77 4 2    55  9999 55 2   777777777777777 2 5555 33   4  2  7  2222 2  2    2 33 4  77777  33 2     0000  2  2   6 666 33 6 6   4   555 2 2 2  333  2  2 2 6 2 9999999  3333333333 2   000000000    8 44  22 22 333 2  2  2  555 2     33  2 2 2222222 4 2   5555  66 6  1  2  77 333  2   66666   444  44   2 55 2   2  2 5555 4     4  55 2 2 4 2 666  33 55     33 4444    33 66 2  444   2  55     2  33  33 4   2 2 33   7  33 2         
lowQualScore                  :              ..   .  .  .. ...  . .   .. .... .  .   . .  . . .     .  .. . ..   ....    ... .   .  .  ..  ....... ..   . ..  .   ..  .. . .......   ....     ..   ... ..  ..  ....   ..... . ....   .  .................................... .      ....... . ..........     . ..  . . . .     .  . .......................................... .. . .....  . . . ... ............... .. ... . . ... . . ..  ..   ...  . . ..... ...... .. .. .  .. . ... .   .  . .   . .    . . . . . .. .  ....    .. ..  .... .........  . . .     . .....  ..   ..  .. ....   ......  . ....... . . . . .. . ....  . ..   . . .. .  . .. ....  .. .. . .. . .    ..  .... .. .   ............... . .... ..   .  .  .  .... .  .    . .. .  .....  .. .     ....  .  .   . ... .. . .   .   ... . . .  ...  .  . . . . .......  .......... .   .........    . ..  .. .. ... .  .  .  ... .     ..  . . ....... . .   ....  .. .  .  .  .. ...  .   .....   ...  ..   . .. .   .  . .... .     .  .. . . . . ...  .. ..     .. ....    .. .. .  ...   .  ..     .  ..  .. .   . . ..   .  .. .         
lowQualScore                  :              88   9  9  33 777  7 7   77 3333 7  7   7 7  7 7 0     3  99 9 66   4444    333 6   7  7  77  7777777 00   0 00  7   77  77 7 3333333   0000     99   000 99  66  3333   11111 9 1111   7  999999999999999999999999999999999999 1      1111111 9 2222222222     7 77  3 7 7 7     7  7 666666666666666666666666666666666666666666 44 5 66666  4 4 4 111 333333333333333 22 111 4 4 999 2 2 33  88   999  1 1 66666 777777 99 99 1  99 1 777 1   2  1 1   1 2    1 1 1 1 1 99 3  5555    11 55  6666 888888888  2 4 2     2 77777  11   11  33 7777   111111  2 7777777 2 2 2 2 33 2 8888  2 33   4 2 77 2  2 11 0000  11 66 4 99 7 4    00  7777 66 4   444444444444444 4 0000 22   7  4  1  1111 4  4    4 22 7  33333  22 2     6666  2  2   7 111 11 7 3   2   888 1 1 1  555  0  0 0 0 0 7777777  5555555555 0   555555555    3 22  88 88 555 0  0  1  888 1     11  2 2 5555555 4 2   8888  44 7  2  4  99 555  4   55555   111  11   4 66 4   4  4 3333 7     7  66 4 4 7 4 555  22 66     11 5555    22 55 4  111   4  66     4  88  22 7   4 4 44   5  44 5         
consensus                     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GGAACGA-A--AG-A-A-A-ATTAC-AA-AC-A-A-C-AAA---T---A-----A-AT------N---T---A--T-T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
Reference ( family-2091 )     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GGAACGA-A--AG-A-A-A-ATTAC-AA-AC-N-A-C-GAA---T---A-----A-AT------A---T---A--T-T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|1                          :                         --T---AA-T-TGA--CTGTTG-TT-TGA-T-TT-G-AGTTGTT-TTCTA-TA-AAATAT-ATTT-C-CGAGGGTG-TG--TT-------TT-GAT-G--TT-TCC--A---T-A----CC-GGTTAA-AAAAT--AGAGAGC--TA-CAAGAC-TTA-----ATA----ATG-ACACTA-T-A-AT--GGAA-GA-GGTTG---CACTT--C-CTAATC-------G-A-AATCAT-GACACGAGA--AG-A-A-A-ATAAC-AA-AC-A-A----AA---C---A-----A-ATTTTCATA---T---A--T-TATAATCA-TAT-C---T----T----------AAGT---A-T-TCTAG-A-AACCTAGGCGT--ATCA-GG----A--A-A-CCGG--C-AA--T-A---G-AAA-TG---CAGTA-ACCC-C-C-G-ACA--T-AA----AAAA--CC-GTC---T---------CC-C-A-GCTCA-AAGGT-GT--CTC--TGGCA----AAA----A-TG---------A-A-A-T-C--G-T----TGAT--AAA-T-A-CG-TTGT--T----CCCCT--T-GAGC-A-TTGA--CTTTCTC--A-TGTCAAT-C--A--T---T-T----G--ATA-TG-CC-AT----A-AG-TTTG-T--A-AC-----AATTA-TGCATG---CA-C---AC-A---C--AGA-AGC-TGT---C-TGTGAT---TT-AT-T-TGA-CAG-G---GT--GCGAT---T-TTA----TC---TTAAAT-TCT--A--T---GGAT-GG-AA---A-CATTA--TA-T-AATC--T-GGT-GTA-GCGTA--GGCGAGA-TATTC-G-ACCACATCTA-CCCTAAAAG-GAC----T-ATC-AC-T-GCCG-TA-GT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAAAGAGT--TATT--T--ATAA---TAT-TA--TTTTT-ATC-AAACC-AAATT-C--CTT-TC--T-TTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                               gtggcgttcatgctatcaAATT-------G-A-A----C---AACAA-A--GG-ACACA-ATTAC-AA-AC-A-AAC-AAA---T---T-----T-ATTG----A---TT--A--T-T-----CA-T-T-T---TAATGT----------A--T---G-CCT---G-A-AA-CTAGGCG---AT-A-GG----TTAA-G-T--G--C-AA--T-AGAAA-GAA-TG-T-CAA-ATGCCA-C---G-A-A--G-AA----AAAA--A--AAC-G-T-----------------TTT------T-AC--CTC--TG--ACAACAAA----A-GA-G-----G-A-T-A-T-C--G-TAA--CG-T--AAA-T-A-CG-CA-T--CAACGTA--T--T-A--C-A-TTAA--TA----TAAG-TTTA--T-C--T--C---T-TATTAG--ATA-TG-CA-ATGTCAA-AG-TGTGAT--T-AT----TCA--A-TG-ACGATGCA-TT-GAT-A---CCAA-A-GGC-TGTTTTC-T-T-AT---TC-AT-T-TCA-C-C-GCACATT-G-G-----TCTTA----CAAAATTAATT--CTGAA--G---A-AT-GG-AA---A--GTTAAATG-TGA-----T-G-T-GTA-G--GA--G-CGGAG-TA--CCG-AC-ATA-----CCC---AAG-GAC-T--T-ATCAACAT-G--G-TACGT-TG--G-A-A-G-T---TAACTA-GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TAATATTTT-ATC-AC--C-AAA-TACAACTTATC--T-TTACTTTTgct
gi|11                         :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TTGAAA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-TTA-AATC-AAA-A---ATT---CGCGGGTA-TG--TT-------TT-GAT-G--TTGTCC--AAATT-A----CTCGGT----AACAT--AAA---C--TC-CAAA-C-TTA-----A-A----ATG-AT----AT-A-AT--G-A--GA-GGC-G---C---T--C-GTATAT-------A-A-A----TAGGAACAA-A--AG-A-A-A--TTACCGA-AC-A-A---AAA---C---A-----C-AT------T---TTTGA--T-TTTT--CA-T-T-T---TA---T----------A--T-----C-T---G-A-A--CT--GCGC--AT-A-GT----T--A---T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAA-A-ACCACC-C-G-A-G--G-AA----AAAA--C--GTC-A-T-------ACCC-C-A-TCTCA-A---TGGT--CTC--TGA-A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-G-TGC--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--TG-T-AC-C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---T-C--CTTT---T-T----G--AAA-TGCCA-TT----C-AA-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATT--GC--TT-GAT-A---C--AGA-AGCATGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-CGG-G---ATG-G-G-----T-TTA----T----TTAGTT---T--A--T---G-AT-G
gi|12                         :  gactGGCTTTAT--AAT-AC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TTATGA-TCATTG-A-TAGTT-ATA-A-TATAAG-AT-AATTTG-CGCGG-TAGTG--TT-------T--GATCG--TT-TCCTCAA--TTA----CC-GGG----AAAAT--AAA---C--TCACA-----TTA-----A-A----ATG-AC--GAAT-A--T--G-AG-AG-GGT-GT--C---T--C-CTAATT-------ATA-A----C-T---CGA-A--AG-C-A-ATAATAC-AC-GA-T-A-CTAAA---C---A-----A-ATTTCT--A---TG--A--T-T-----TA-T-T-TCATT----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG----T-A-GT----T--A-A-T--G--CCAA--TTA---ACGAA-TA-T-CAG-A--CCA-C-C-G-A-A--G-AA----GAA---C--GTC-----------A-CCTC-A-GCTCA-A---T-GT--CTCAGTG--A----AAA----AACG-G-----G-A-T---T-CTTG-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--TTA--C-A-TTTG--CT----T--G-TAT---T-T--C--T---C-T------------------------------TG-T--G-AT--------------ATG--G-------AT-A----------AGG-TGT-------T-AT---TT-ATCT-T-A-C-G-C---GT--G-G-----T-TAC----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---A-C--TA--TA-T-AACTGCC-G-T-ATG-G--TA--G-tgactttat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gctA-T-G-T---T----T----------A--C---AAC-T---G------CT--GCG---AT-A-GT----T--A-AGT--G--C-AA--T-A---A-AGA-TG-T-CAG-A-ACCA-CGC-G-A-A--G-AC----AAT---C--GTC-G-T-------A-CC-CCA-GCTCAGA---T-GT--CTC--TG--A----AAA----AGCG-G-----G-A-T-AGT-C--G-T----TG-T--AAG-T-A-CG-TT-T--TT---CC--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-CGTC--T---TGT----GGAATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--CGA-TTTGAT-A---C--A-A-AGC-TGTT--C-C-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----CTAATT--CT--A--T---G-AT-GGGAA---A-CGTTA--GA-T-A-----TAG-T-GTAAG--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--GTTACGT-TG--A-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--A----TATT--T--A-AA---TAT-TA--A-TTT-ATC-AA--CGAAA-T-A--CTT-TC--TGTTACTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                           catacaacatatatctataattgttaagaGAACAA-A--A--A-A-A-ATTAC-AA-AC-A-AAC-AAA---T---T-----T-ATG-----A---T---T--T-T-----TA-T-T-T---T----T----------G--T---A-T-G---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAT-G-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAAAAC--GTT-T-T------------------TCG-----------CTC--TG--A----AAA-------G-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----CG-T--AAA-T-ACCG-CT-T--CAA--CG--T--T-A--C-A-TTAA--TT----A--G-TTT---T-CT-C--T---C-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-AT----T-A--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-ATAGC-TGT---C-T-T-TA---TT-AT-T-------------AC--C-T-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-ATGGG-AA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTAGG--TAG-G-CGGGA-TAC-C-G-AC-AT----A-CCC---AA--GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TAC---TGT-T-A-A-G-T---TA--T--G-AAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TA--ATTTTCATA-AA--A-AAA-T-C----T-TC--T-TTACTTTTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tA---T---A-----G-AT------G---T---A--T-T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---GT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-AA----AAA---C--GTT-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T----A-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---TGC--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA---------TTAAAT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----------GTA-G------A-CAGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAT-CTAT-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-TTAATA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|16                         :         atttatgatT-GC-ACGCT---AA-T-TGAACC----GATT-TGA-T-AT-G-A-TAGTC-TTC-A-TA-AAA-AT-AATT-T-CGCGTGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----C--CGCGTCAAAAAT--AAA---CACTA-CAA--T-TTACAAAAA-ATTACATG-AT--TAATGA-AT--T-AG-GA-GTC-G---T---T--T-CTAATTTAATTTTA-ATA----T-GAACCGA-TTTAG-A-A-A-ATTAC-AA-AC-A-A----GA---TCTCA-----A-TT------A---T---A--TAT-----CA-T-T-T---T----TTTTCTCTTTTA--TCAAA-CGT---G-A-A--CTA-GCG---AT-A-AGGCTCT--A-C-A--G--C-AACTT-A---A-GAA-TGGT-CAG-ACACCA-C-C-A-A-A--G-AAGAGAAAAA--C--GTG-G-TCACTTTTA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GTTCCTC--TG--T----AGACATTA-CGTG-----G-A-TAA-T-CA-G-TATTATA-C--AAA-TAA-CG-TT-T--T----CC--
gi|17                         :      GGGTTT---CAAT-GCCACC-T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TG-GAA-ATCAATT-T-CGCAGGTA-TG--TT-------T--GATTG--TT-TCC--AA--T-A----CC-GGT----AAAAT--AAA---C--TA-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TA-T-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---TTTC-CTAATTT------A-A-A----T-G-AACGA-A--AG-A-A-A-ATTAC-AA-AC-A-AAC-AAA---TTT-AT----G-AT------T---T---A--T-T-----CG-T-TCT---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-A-T-A--A-GA----AAAA--C--GTCCG-T-------A-CC-CCA-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GC----G-A---A-T-C--G-T----TG-TA-AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTACTTTT----C--A-TTTTTCT-C--T--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----ATAGTTTTG-T--T-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C---G-A-C--G-AA----AAAA--C--GTC-----------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA------CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--C----CT--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-T--C--TCA-T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-AAATA--A-A-AGC-TGT---T-T-T-AT---TT-AT-T-TAA-C-GAG---AT----G-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT--G-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-CG-T-ATC-AC-T-G--G--ATGT-TG--TAA-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TAC-ATTTT-GAT-TA--CAAAA-T-T--CTTATC--T-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgAA--A-TGCATG---CACTT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---CAT-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-GC--AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA-----CGT-A--TGGT-A-----TTGCT-GTA-G--TA--G-CGGGA-TAG-C-G-AC-ACA---G-CCC---AATTGACTC--T-ATC-AC-TTG--GCTACGT-TG--T-A-AAG-TA--TA--T--GCTAA--A-T--TATT-----A-AA---TATCTA--ATTTT-ATCACA--C-AA--T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAacactct
gi|2                          :        ttaTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-A-A---GTT-TTA-A-TA-AAA-TA-AATT-G-CG--AGTA-TG--TTGATGCCAT--GATAG--TT-TCC--AA--T-A----CT-GGT----TAAAT---AA---C--TT-CGA----TTA-----A-A----ATG-AC--T--T-A-ATTGG-AA-GATGGT-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-TGAACGA-A--GA-A-A-A-ATTAC-AA-AC-A-A-C-AAAGTTT---ATT---G-ATTTC---A---T------T-T-----CATT-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCGTGAAT-AGGG----T--A-ACT--GGTC-AA--T-A---A-GAAGTG-T--AG-A-ACAA-C-C-GCA-A--G-AA----AAAA--C--GTC-G-T-------AGTC-C-ATGCTC--------GT--CT-------G----ACA----A-CA-GCATATG-ATT-A-T-C--G-A----TG-T--AAA-T-A-TC-TT-TTGT----CA--T--T-A--C-ATTTAAT-TT----C--G-TTT---CAT--C--T---T-T----G--ATA--G-TG-TG----A-AG-TTTG-T--T-ATCTTCTAA--ATTGC-TC--TCA-TT-TAC-A---C--G-A---------------T-AT---TT-GT-T-T-G-C-A-G---A---G-AAGCATC-TCA----TG---TTAATTCTTT--ATTT---T-AT-GG-AACTGATCGATA---G-A-A-----C-G-TCGTA----TA--G--GCGATTA--C---AC--CA---A-CTC---AAG-G-C-C--T-GTC-AC-TGG--G-TCCGT-TGGAT-A-G-GAA---TA--T---AAAG--AATGATATT--T--A-AAAATTAT-TA--ATGTT-AAT-CA--C-AAA---G--CTT-TCTGT-TTACTT
gi|20                         : gactggGGTTT-C-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-GAA-TAGTT-TT--A-T--AAA-AT-AA-T-G--ATGGGTA-TG--CT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--GGTA---AAAAT--AAA---C--TC-CAA--CTTTA-----A-A----CTG-GA--TAGT-A-AT--G-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tt-T---A-A-A--CT--G-G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA---C-G-A-C--G-AA----AAcaataagaatgtcagaaccacgacgaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggtttccaatgcactaattgatgtttgatatgaatagttttataaaataatgatgggtatgcttgatggtttccaataccggtaaaaataaactccaacttT---TT-AT-A-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CAGGA-TA--C---AC-ACA---A-ACC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-C-G--G-TACGT-TT--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--------ATT--T-----------------ATTTC-AT--CA--C-AAA-T-C--C-T-TC--T-TTACTTTTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -AGC-TAT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----A----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTG--TA-T-A-----TTG-T-GTA-G--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TG--ATTTT-ATC--A--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggacacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGCATG---CA-TT-GATGA---C--A-A-AGCCTGT---C-T-T-AT---TT-AG-T-G-AGCAG-G---GT--GTG-----T-TTATTATT----TTAATTGTCT--A--TCGCG-AT-GG-AAC--A-CGTa
gi|25                         : ttatcGGGTTTAT-CATT-GC-AA--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-Tgttataat
gi|26                         :                                                                                             ggactGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--AGT----AAA
gi|3                          :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AT--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-T--AAA-AT-AATT-G-CACAGGTA-TG--TT-------T--GATCG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGT----TAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--T-AT-ACAT--G-TA-------------------C-CTAATT-------A-A-A----T-TGAACAA-A--AG-T-A-A-ATTAT-AA-ACAA-A-C-AAA---T---T-----A-AT------GATTT---A--T-T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---GTA-A--CT--GTG---AT-A-GT----T--A-ATT--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-TCCAG-A-CACA-C-CTG-A-A--GAAA----AAAA--CG-GTC-G-T-------A-CC-T-A-GCTTC-A---TCGT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GATCT-G-A-T-A-T-C--GTT----TG-T--AAATT-A-CGTTT-T--T----CT--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTG---T-CT-C--T---T-T----G--ATA-T---A-TT----C-AG-TGTG-TTAT-AT----TAA--A--ATACT--GCA-TT-GAT-AC--C--ACA-AGC-TGT---C-T-T-AT---TTCAT-TCT-A-C-G-G---ATTGG-A-----G-TTA----------TGA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAAGG-CGGGA-TA--C---AC-ACA---T-CCC---AAG-GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--C--GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATA-CA----AAA-T-C--CTT-TC--T-TCACTTTTA
gi|4                          :   actGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---GA-A-TGA--C----G-TT-TGACT-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-GGCGCGGGTA-TG--TT-------TTGGAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--AGT----AAAAT--AAA---C--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---T--C-CTAATT-------A-A-A----T-GAAACGA-A--AG-A-A-A-ATTAC-AA-AT-TTA-T-GAA---T---A-----ACAT------GG--T---A--T-T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---GT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TG-C-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--CAAGTT-GAT-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTT--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-AA-C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TAAATTCTCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-------G-T--TA-G--T---G-CAGGA-TA--T-GAAC-AC----A-CCC---AAG-GAT-C--TAATC-CA-T-G--G-TACGT-TG--T-A-GCA-T---TA--TTAGAAAA--AAT--TATTCGT--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|5                          :         TTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAAA---C--TC--AA----TTA-----A-A----ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAATT-------A-A-ACT--T-AGAACGA-A--AGGA-A-A-ATTAC-AC-A--A-A-C-ATA---C---A-----A-AT------T---T---A--TAT-----CA-T-T-T---C---------------A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----TA-A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TT-A-TAG-A-A-CA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTG-G-T-------A-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAAT----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTACT
gi|6                          :        aTTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAAA---C--TC--AA----TTA-----A-A----ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAATT-------A-A-ACT--T-AGAACGA-A--AGGA-A-A-ATTAC-AC-A--A-A-C-ATA---C---A-----A-AT------T---T---A--TAT-----CA-T-T-T---C---------------A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----TA-A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-TT-A-TAG-A-A-CA-C-C-G-A-A--G-AA----AAAA--C--GTG-G-T-------A-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAAT----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTAC
gi|7                          :     aGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAAT-TGA--CC---G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-T-A-A-TA-AAA-A--AATT-G-CGCGG-TA-TG--TT-------T--GAT-GGTTT-TCCCCAA--T-A----CT-GGT----AAAAT--AAA---C--TT--AA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TAA--A-AT--G-AC-TA---C-A---A---T--GACTAATA-------A-A-A----T-GAACCGA-A--GA-A-A-A-ATTAC-AACAT-T-A---GAA---T---ATAC--A-AT------G---T---AATT-T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A----CT--GTG---GT-A-GG----T--T---T--G--C-AA--T-A-----GAA-TG-C-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-AAAG-AA----AAAA--C--GTT-G-T-------A-CC---A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--TCTT-T--C-A-TTAA--TT----TT-G-TTT---T-C--CC-T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-T-CATG---CA-TT-GAT-----C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-----AT--G-G-----T-CTA----T----CAAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---T-CGTTA--TG-T-A-----------GTA-G------G-CAGGA-TA--T-G-AC-ACA---A-CCC---AAT-GAT-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T----------------------A--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-AA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC----TTACTTTTA
gi|8                          :  ggctGGGTTTATTCAATTGC--C--T---AA-CGTGA--C----G-TT-TGA-C--T-A-G-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-CTCGCGG-TA-TGGTTT-------T--GAT-G--GT-TCC--AG--T-A----C--GGT----AAAAT--AAA---C--TA-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AT--CTAT-A--T--G-AACGA-GAT-G---C------C-CT--TT-------A-A------T-TGAACGA-A--AG-A-A-T-AT-AC-AA-AC-A-A----AA---C---ATTTATG-AT------G---T---A--T-T-----CA-T-C-T---T---------------A--T---A-C-T---G-ATA--CT---CG---AT-A-TG----TC-ATA-T--G--C-AA--T-A---A-TAAGTG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAAA----AAAA--C--GT--G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T--T--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-A-T-C--G------TG-T--AAATT-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A--TAC--TT----C--A-TTT---T-CT-C--T---T-T----G--TCT-TG-CATTT----A-AG-TCTA--------------------------------T-GAT-A---T--A-A-AGC-TGT---C-T-T-ATTTATT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-A-T---TA--G--GAAAA--AAT--AATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-
gi|9                          :    ctGGGTTTAT-TGAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-T-A-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-G-CACGGGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----CC-GGA----AAAAT--AAA---T--TC-CAA--C-TTA-----A-A----ATG-AC--TA-T-A----------------------------C-CTAATT-------A-A------T-TGAACAA-A--TG-A-A-A-ATTAC-AA-AC-ACA-C-AAA---TTT-AT----G-AT------T---T---A--T-T-----CA-T-T-T---T----T----------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--G-AA--T-A---A-GAA-TG-T-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAAA----AAAA--C--GTC-G-T-------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GC--CTC--CG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C-----------------------------T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--------C--GATTT---T-C--T--C---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-------------------------T-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-C---AT--G-C-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT-----T---G-AT-GG-AA---A--GTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TA--G-GCGGA-TA--C-G-A--ACA---C-TCC---AAG-G------T---------------TACGT-TG--T-ACA-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTC-AT--CA--C--AA-T-C--CTTCTC--T-TTACTTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                  1111                                   1         11       2222222   1111                      1111       11111111      222222222222222222222222222222222222             2222222222222222                                44444444444444444444444444444444444444444444444444444                                                   11                     111                                                                      1111111111                                           11111111111111111                                          1111                    11111111        111111111111111                      1111                                  2222                                                                1111111111     111111111        11                                       3333333             11                                                                                                                                     11                                  
lowQualScore                  :              55   2  2  66 444  2 2   33 8888 2  2   2 2  2 2 8     5  55 2 33   2222    999 0   6  2  33  8888888 99   8 66  2   22  33 2 6666666   3333     77  33 555   33  3333   2 2 00000000   5  000000000000000000000000000000000000 3    2  2 2 4444444444444444     66   5 2 2 2     2 2   2 5 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 333  2 2 9999999 333 6666  33 333 2 4 333 2 2 55  22   777  2 2 77777 55 222 22 22 2  22 2 333 2   4 2  2   2 4    2 2 2 2 2 22 6 4444     33 77  2222222222  4  2 4 2     2 44444  33   33  55 4444   55555555555555555 2 2 2 2 55 2 7777  2 88   4 2 22 2  2 33 0000  33 55 2 77 4 2    44444444 55 2   777777777777777 2 5555 33   4  2  7  2222 2  2    2 33 2 2 77777  33 2     0000  2  2   4 888 33 6 6   4   555 2 2 2  333  2  2 2 6 2 9999999  0000000000 2   000000000  22  8 44  22 22 333 2  2  2  555 2     33  2 2 2222222 4 2   5555  66 6  1  2  77 333  2   66666   444  44   2 55 2   2  2 4 33 4     4  55 2 2 4 2 666  33 55     33 4444    33 33 2  777   2  55     2  33  33 4   2 2 33   7  33 2         
lowQualScore                  :              ..   .  .  .. ...  . .   .. .... .  .   . .  . . .     .  .. . ..   ....    ... .   .  .  ..  ....... ..   . ..  .   ..  .. . .......   ....     ..  .. ...   ..  ....   . . ........   .  .................................... .    .  . . ................     ..   . . . .     . .   . . ..................................................... ...  . . ....... ... ....  .. ... . . ... . . ..  ..   ...  . . ..... .. ... .. .. .  .. . ... .   . .  .   . .    . . . . . .. . ....     .. ..  ..........  .  . . .     . .....  ..   ..  .. ....   ................. . . . . .. . ....  . ..   . . .. .  . .. ....  .. .. . .. . .    ........ .. .   ............... . .... ..   .  .  .  .... .  .    . .. . . .....  .. .     ....  .  .   . ... .. . .   .   ... . . .  ...  .  . . . . .......  .......... .   .........  ..  . ..  .. .. ... .  .  .  ... .     ..  . . ....... . .   ....  .. .  .  .  .. ...  .   .....   ...  ..   . .. .   .  . . .. .     .  .. . . . . ...  .. ..     .. ....    .. .. .  ...   .  ..     .  ..  .. .   . . ..   .  .. .         
lowQualScore                  :              88   9  9  33 777  7 7   77 3333 7  7   7 7  7 7 0     3  99 9 66   4444    333 6   7  7  77  7777777 00   7 33  7   77  77 7 3333333   0000     99  99 000   66  3333   9 9 44444444   7  999999999999999999999999999999999999 1    9  9 9 6666666666666666     33   3 7 7 7     5 5   5 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 999  2 2 4444444 999 9999  11 999 2 4 999 2 2 33  88   999  1 1 66666 00 999 99 99 1  99 1 777 1   2 1  1   1 2    1 1 1 1 1 99 3 5555     11 55  8888888888  4  2 4 2     2 77777  11   11  33 7777   99999999999999999 2 2 2 2 33 2 8888  2 33   4 2 77 2  2 11 0000  11 66 4 99 7 4    33333333 66 4   444444444444444 4 0000 22   7  4  1  1111 4  4    4 22 4 4 33333  22 2     6666  2  2   4 333 11 7 3   2   888 1 1 1  555  0  0 0 0 0 7777777  7777777777 0   555555555  88  3 22  88 88 555 0  0  1  888 1     11  2 2 5555555 4 2   8888  44 7  2  4  99 555  4   55555   111  11   4 66 4   4  4 7 22 7     7  66 4 4 7 4 555  22 66     11 5555    22 22 4  444   4  66     4  88  22 7   4 4 44   5  44 5         
consensus                     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GGAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--A---T----A---N--A-----TT---T-----A--T-----T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
Reference ( family-2091 )     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GGAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--A---T----A---A--A-----TN---T-----A--T-----T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|1                          :                         --T---AA-T-TGA--CTGTTG-TT-TGA-T-TT-G-AGTTGTT-TTCTA-TA-AAATAT-ATTT-C-CGAGGGTG-TG--TT-------TT-GAT-G--TT-TCC--A---T-A----CC-GGTTAA-AAAAT--AG--AGAGCTA-CAAGAC-TTA-ATA--------ATG-ACACTA-T-A-AT--GGAA-GA-GGTTG---CACTT--C-CTAA-TC-G-A-------AATCAT-GACACGAG-AAG-A-A-A-ATAAC-A-AAC-A-AAA---CA-A--A---TTTTCA---T--A-----TA---TT----A--TAA---T---CA-TAT-------C---T----TAAGT---A-T-TCTAG-A-AACCTAGGCGT--ATCA-GG----A--A-A-CCGG--C-AA--T-A---G-AAA-T-G--CAGTA-ACCC-C-C-G-ACA--T-A----AAAAA--CC-GTC---------T--CC-C-A-GCTCA-AAGGT-GT--CTC--TGGCA----AAA----A-TG---------A-A-A-T-C--G-T----TGAT--AAA-T-A-CG-TTGT--T----CCCCT--T-GAGC-A-TTGA--CTTTCTC--A-TGTCAAT-C--A--T---T-T----G--ATA-TG-CC-AT----A-AG-TTTG-T--A-A-C-----AATTA-TGCATG---CA-C---AC-A---C--AGA-AGC-TGT---C-TGTGAT---TT-AT-T-TGA-CAG-G---GT--GCGAT---T-TTA----TC---TT--AAAT-TCT--A--T---GGAT-GG-AA---A-CATTA--TA-T-AATC--T-GGT-GTA-GCGTA--GGCGAGA-TATTC-G-ACCACATCTA-CCCTAAAAG-GAC----T-ATC-AC-T-GCCG-TA-GT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAAAGAGT--TATT--T--ATAA---TAT-TA--TTTTT-ATC-AAACC-AAATT-C--CTT-TC--T-TTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                               gtggcgttcatgctatcaAA-TT-G-A-------A----C---AACAA--AGG-ACACA-ATTAC-A-AAC-A-AA----CA-A--A---T----T---T--A-----TTGATT-----A--T-----T---CA-T-T-------T---TAATGTA--T---G-CCT---G-A-AA-CTAGGCG---AT-A-GG----TTAA-G-T--G--C-AA--T-AGAAA-GAA-T-GT-CAA-ATGCCA-C---G-A-A--G-A----AAAAA--A--AAC-G-------T----------TTT------T-AC--CTC--TG--ACAACAAA----A-GA-G-----G-A-T-A-T-C--G-TAA--CG-T--AAA-T-A-CG-CA-T--CAACGTA--T--T-A--C-A-TTAA--TA----TAAG-TTTA--T-C--T--C---T-TATTAG--ATA-TG-CA-ATGTCAA-AG-TGTGAT--T-A-T----TCA--A-TG-ACGATGCA-TT-GAT-A---CCAA-A-GGC-TGTTTTC-T-T-AT---TC-AT-T-TCA-C-C-GCACATT-G-G-----TCTTA----CAAAATT--AATT--CTGAA--G---A-AT-GG-AA---A--GTTAAATG-TGA-----T-G-T-GTA-G--GA--G-CGGAG-TA--CCG-AC-ATA-----CCC---AAG-GAC-T--T-ATCAACAT-G--G-TACGT-TG--G-A-A-G-T---TAACTA-GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TAATATTTT-ATC-AC--C-AAA-TACAACTTATC--T-TTACTTTTgct
gi|11                         :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TTGAAA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-TTA-AATC-AAA-A---ATT---CGCGGGTA-TG--TT-------TT-GAT-G--TTGTCC--AAATT-A----CTCGGT----AACAT--AA--A---CTC-CAAA-C-TTA-A-A--------ATG-AT----AT-A-AT--G-A--GA-GGC-G---C---T--C-GTAT-AT-A-A-------A----TAGGAACAA--AAG-A-A-A--TTACCG-AAC-A-A------A-A--A---C----A---C--A-----TT---TTTG--A--T-----TTTTCA-T-T-------T---TA---TA--T-----C-T---G-A-A--CT--GCGC--AT-A-GT----T--A---T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAA-A-ACCACC-C-G-A-G--G-A----AAAAA--C--GTC-A-------TACCC-C-A-TCTCA-A---TGGT--CTC--TGA-A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-G-TGC--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--TG-T-AC-C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---T-C--CTTT---T-T----G--AAA-TGCCA-TT----C-AA-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATT--GC--TT-GAT-A---C--AGA-AGCATGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-CGG-G---ATG-G-G-----T-TTA----T----TT--AGTT---T--A--T---G-AT-G
gi|12                         :  gactGGCTTTAT--AAT-AC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TTATGA-TCATTG-A-TAGTT-ATA-A-TATAAG-AT-AATTTG-CGCGG-TAGTG--TT-------T--GATCG--TT-TCCTCAA--TTA----CC-GGG----AAAAT--AA--A---CTCACA-----TTA-A-A--------ATG-AC--GAAT-A--T--G-AG-AG-GGT-GT--C---T--C-CTAA-TT-ATA-------A----C-T---CGA--AAG-C-A-ATAATAC-ACGAT-A-C-----TA-A--A---C----A---A--A-----TT---TCTATGA--T-----T---TA-T-T-------TCATT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG----T-A-GT----T--A-A-T--G--CCAA--TTA---ACGAA-T-AT-CAG-A--CCA-C-C-G-A-A--G-A----AGAA---C--GTC----------A-CCTC-A-GCTCA-A---T-GT--CTCAGTG--A----AAA----AACG-G-----G-A-T---T-CTTG-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--TTA--C-A-TTTG--CT----T--G-TAT---T-T--C--T---C-T------------------------------TG-T--G-A-T--------------ATG--G-------AT-A----------AGG-TGT-------T-AT---TT-ATCT-T-A-C-G-C---GT--G-G-----T-TAC----T----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---A-C--TA--TA-T-AACTGCC-G-T-ATG-G--TA--G-tgactttat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            gctC-A-TAC-A-A-----CA-T--A---T----A---T--C-----TA---T-----A--A-----T---TG-T-TAAGAATGT---T----TA--C---AAC-T---G------CT--GCG---AT-A-GT----T--A-AGT--G--C-AA--T-A---A-AGA-T-GT-CAG-A-ACCA-CGC-G-A-A--G-A----CAAT---C--GTC-G-------TA-CC-CCA-GCTCAGA---T-GT--CTC--TG--A----AAA----AGCG-G-----G-A-T-AGT-C--G-T----TG-T--AAG-T-A-CG-TT-T--TT---CC--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-CGTC--T---TGT----GGAATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--CGA-TTTGAT-A---C--A-A-AGC-TGTT--C-C-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----CT--AATT--CT--A--T---G-AT-GGGAA---A-CGTTA--GA-T-A-----TAG-T-GTAAG--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--GTTACGT-TG--A-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--A----TATT--T--A-AA---TAT-TA--A-TTT-ATC-AA--CGAAA-T-A--CTT-TC--TGTTACTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         GAACAA--AA--A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----------A---C----A---A--A-----TT---T-----A--TGATTTT---TA-T-T-------T---T----TG--T---A-T-G---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAT-G-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAAAAC--GTT-T-------T-----------TCG-----------CTC--TG--A----AAA-------G-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----CG-T--AAA-T-ACCG-CT-T--CAA--CG--T--T-A--C-A-TTAA--TT----A--G-TTT---T-CT-C--T---C-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-T----T-A--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-ATAGC-TGT---C-T-T-TA---TT-AT-T-------------AC--C-T-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-ATGGG-AA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTAGG--TAG-G-CGGGA-TAC-C-G-AC-AT----A-CCC---AA--GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TAC---TGT-T-A-A-G-T---TA--T--G-AAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TA--ATTTTCATA-AA--A-AAA-T-C----T-TC--T-TTACTTTTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  t--A---T----A---G--A-----TG---T-----A--T-----T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---GT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAA---C--GTT-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T----A-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---TGC--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA---------TT--AAAT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----------GTA-G------A-CAGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAT-CTAT-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-TTAATA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|16                         :         atttatgatT-GC-ACGCT---AA-T-TGAACC----GATT-TGA-T-AT-G-A-TAGTC-TTC-A-TA-AAA-AT-AATT-T-CGCGTGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGCGTCAAAAAT--AAACA---CTA-CAA--T-TTACA-AAAAATTACATG-AT--TAATGA-AT--T-AG-GA-GTC-G---T---T--T-CTAATTT-A-ATTTTAATA----T-GAACCGATTTAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AGATCTCA-ATTA---T----A---T--ATCATTTT---T-----T--T-----T---CT-C-T-------T---T----TA--TCAAA-CGT---G-A-A--CTA-GCG---AT-A-AGGCTCT--A-C-A--G--C-AACTT-A---A-GAA-TGGT-CAG-ACACCA-C-C-A-A-A--G-AAGAGAAAAA--C--GTG-GTCACTTTTA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GTTCCTC--TG--T----AGACATTA-CGTG-----G-A-TAA-T-CA-G-TATTATA-C--AAA-TAA-CG-TT-T--T----CC--
gi|17                         :      GGGTTT---CAAT-GCCACC-T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TG-GAA-ATCAATT-T-CGCAGGTA-TG--TT-------T--GATTG--TT-TCC--AA--T-A----CC-GGT----AAAAT--AA--A---CTA-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TA-T-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---TTTC-CTAA-TTTA-A-------A----T-G-AACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AA----CA-A--A---TTT--AT--G--A-----TT---T-----A--T-----T---CG-T-TC------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-A-T-A--A-G----AAAAA--C--GTCCG-------TA-CC-CCA-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GC----G-A---A-T-C--G-T----TG-TA-AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTACTTTT----C--A-TTTTTCT-C--T--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----ATAGTTTTG-T--T-A-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C---G-A-C--G-A----AAAAA--C--GTC----------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA------CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--C----CT--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-T--C--TCA-T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-AAATA--A-A-AGC-TGT---T-T-T-AT---TT-AT-T-TAA-C-GAG---AT----G-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT--G-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-CG-T-ATC-AC-T-G--G--ATGT-TG--TAA-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TAC-ATTTT-GAT-TA--CAAAA-T-T--CTTATC--T-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgAA--A-TGCATG---CACTT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---CAT-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-GC--AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA-----CGT-A--TGGT-A-----TTGCT-GTA-G--TA--G-CGGGA-TAG-C-G-AC-ACA---G-CCC---AATTGACTC--T-ATC-AC-TTG--GCTACGT-TG--T-A-AAG-TA--TA--T--GCTAA--A-T--TATT-----A-AA---TATCTA--ATTTT-ATCACA--C-AA--T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAacactct
gi|2                          :        ttaTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-A-A---GTT-TTA-A-TA-AAA-TA-AATT-G-CG--AGTA-TG--TTGATGCCAT--GATAG--TT-TCC--AA--T-A----CT-GGT----TAAAT---A--A---CTT-CGA----TTA-A-A--------ATG-AC--T--T-A-ATTGG-AA-GATGGT-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-TGAACGA--AGA-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--AGTTT----ATT-G--A-----TT---TC----AT-T-----T---CATT-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCGTGAAT-AGGG----T--A-ACT--GGTC-AA--T-A---A-GAAGT-GT--AG-A-ACAA-C-C-GCA-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TAGTC-C-ATGCTC--------GT--CT-------G----ACA----A-CA-GCATATG-ATT-A-T-C--G-A----TG-T--AAA-T-A-TC-TT-TTGT----CA--T--T-A--C-ATTTAAT-TT----C--G-TTT---CAT--C--T---T-T----G--ATA--G-TG-TG----A-AG-TTTG-T--T-A-TCTTCTAA--ATTGC-TC--TCA-TT-TAC-A---C--G-A---------------T-AT---TT-GT-T-T-G-C-A-G---A---G-AAGCATC-TCA----TG---TT--AATTCTTT--ATTT---T-AT-GG-AACTGATCGATA---G-A-A-----C-G-TCGTA----TA--G--GCGATTA--C---AC--CA---A-CTC---AAG-G-C-C--T-GTC-AC-TGG--G-TCCGT-TGGAT-A-G-GAA---TA--T---AAAG--AATGATATT--T--A-AAAATTAT-TA--ATGTT-AAT-CA--C-AAA---G--CTT-TCTGT-TTACTT
gi|20                         : gactggGGTTT-C-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-GAA-TAGTT-TT--A-T--AAA-AT-AA-T-G--ATGGGTA-TG--CT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--GGTA---AAAAT--AA--A---CTC-CAA--CTTTA-A-A--------CTG-GA--TAGT-A-AT--G-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttA-A--A---T----A---A--A-----C-------------T-----C---CA-A-C-------T---T----TA----------------A-A--CT--G-G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA---C-G-A-C--G-A----AAAcaataagaatgtcagaaccacgacgaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttggtttccaatgcactaattgatgtttgatatgaatagttttataaaataatgatgggtatgcttgatggtttccaataccggtaaT---TT-AT-A-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CAGGA-TA--C---AC-ACA---A-ACC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-C-G--G-TACGT-TT--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--------ATT--T-----------------ATTTC-AT--CA--C-AAA-T-C--C-T-TC--T-TTACTTTTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AGC-TAT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----A----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTG--TA-T-A-----TTG-T-GTA-G--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TG--ATTTT-ATC--A--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggacacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGCATG---CA-TT-GATGA---C--A-A-AGCCTGT---C-T-T-AT---TT-AG-T-G-AGCAG-G---GT--GTG-----T-TTATTATT----TT--AATTGTCT--A--TCGCG-AT-GG-AAC--A-CGTa
gi|25                         : ttatcGGGTTTAT-CATT-GC-AA--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-Tgttataat
gi|26                         :                                                                                             ggactGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--AGT----AAA
gi|3                          :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AT--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-T--AAA-AT-AATT-G-CACAGGTA-TG--TT-------T--GATCG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGT----TAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--T-AT-ACAT--G-TA-------------------C-CTAA-TT-A-A-------A----T-TGAACAA--AAG-T-A-A-ATTAT-A-AACAA-A-----CA-A--AT--T----A---ATGA-----TT---T-----A--T-----T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---GTA-A--CT--GTG---AT-A-GT----T--A-ATT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GTCCAG-A-CACA-C-CTG-A-A--GAA----AAAAA--CG-GTC-G-------TA-CC-T-A-GCTTC-A---TCGT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GATCT-G-A-T-A-T-C--GTT----TG-T--AAATT-A-CGTTT-T--T----CT--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTG---T-CT-C--T---T-T----G--ATA-T---A-TT----C-AG-TGTG-TTAT-A-T----TAA--A--ATACT--GCA-TT-GAT-AC--C--ACA-AGC-TGT---C-T-T-AT---TTCAT-TCT-A-C-G-G---ATTGG-A-----G-TTA----------T--GA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAAGG-CGGGA-TA--C---AC-ACA---T-CCC---AAG-GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--C--GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATA-CA----AAA-T-C--CTT-TC--T-TCACTTTTA
gi|4                          :   actGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---GA-A-TGA--C----G-TT-TGACT-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-GGCGCGGGTA-TG--TT-------TTGGAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--AGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GAAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAT-TTA-----TG-A--A---T----A---AC-A-----TGG--T-----A--T-----T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---GT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GC-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--CAAGTT-GA------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTT--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-AA-C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TA--AATTCTCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-------G-T--TA-G--T---G-CAGGA-TA--T-GAAC-AC----A-CCC---AAG-GAT-C--TAATC-CA-T-G--G-TACGT-TG--T-A-GCA-T---TA--TTAGAAAA--AAT--TATTCGT--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|5                          :         TTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAA--A---CTC--AA----TTA-A-A--------ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAA-TT-A-A-------ACT--T-AGAACGA--AAGGA-A-A-ATTAC-A-CA--A-A-----CA-T--A---C----A---A--A-----TT---T-----A--TA----T---CA-T-T-------T---C-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-TA-TAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTG-G-------TA-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAAT---A----------A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAA--TTT---C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG-TT-G-T--T-AAT----CAA--A-TGCATG---CA-TT-CAT-AA--C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-----AT--G-G-----T-TTT----T----TTTTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C--T---C-AC-T-G----TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--T--A-AAAA-TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTACT
gi|6                          :        aTTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAA--A---CTC--AA----TTA-A-A--------ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAA-TT-A-A-------ACT--T-AGAACGA--AAGGA-A-A-ATTAC-A-CA--A-A-----CA-T--A---C----A---A--A-----TT---T-----A--TA----T---CA-T-T-------T---C-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-TA-TAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTG-G-------TA-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAA-T----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TT--AATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTAC
gi|7                          :     aGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAAT-TGA--CC---G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-T-A-A-TA-AAA-A--AATT-G-CGCGG-TA-TG--TT-------T--GAT-GGTTT-TCCCCAA--T-A----CT-GGT----AAAAT--AA--A---CTT--AA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAA--A-AT--G-AC-TA---C-A---A---T--GACTAA-TA-A-A-------A----T-GAACCGA--AGA-A-A-A-ATTAC-A-A-C-A-T-----TAGA--A---T----ATACA--A-----TG---T-----AATT-----T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A----CT--GTG---GT-A-GG----T--T---T--G--C-AA--T-A-----GAA-T-GC-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-AAAG-A----AAAAA--C--GTT-G-------TA-CC---A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--TCTT-T--C-A-TTAA--TT----TT-G-TTT---T-C--CC-T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-T-CATG---CA-TT-GAT-----C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-----AT--G-G-----T-CTA----T----CA--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---T-CGTTA--TG-T-A-----------GTA-G------G-CAGGA-TA--T-G-AC-ACA---A-CCC---AAT-GAT-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T----------------------A--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-AA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC----TTACTTTTA
gi|8                          :  ggctGGGTTTATTCAATTGC--C--T---AA-CGTGA--C----G-TT-TGA-C--T-A-G-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-CTCGCGG-TA-TGGTTT-------T--GAT-G--GT-TCC--AG--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTA-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AT--CTAT-A--T--G-AACGA-GAT-G---C------C-CT---TT-A-A------------T-TGAACGA--AAG-A-A-T-AT-AC-A-AAC-A-A-----AA-C--A---TTT--AT--G--A-----TG---T-----A--T-----T---CA-T-C-------T---T-----A--T---A-C-T---G-ATA--CT---CG---AT-A-TG----TC-ATA-T--G--C-AA--T-A---A-TAAGT-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAAA--C--GT--G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T--T--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-A-T-C--G------TG-T--AAATT-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A--TAC--TT----C--A-TTT---T-CT-C--T---T-T----G--TCT-TG-CATTT----A-AG-TCTA---------------------------------T-GAT-A---T--A-A-AGC-TGT---C-T-T-ATTTATT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-A-T---TA--G--GAAAA--AAT--AATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-
gi|9                          :    ctGGGTTTAT-TGAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-T-A-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-G-CACGGGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----CC-GGA----AAAAT--AA--A---TTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TA-T-A----------------------------C-CTAA-TT-A-A------------T-TGAACAA--ATG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-ACA-----CA-A--A---TTT--AT--G--A-----TT---T-----A--T-----T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--G-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GC--CTC--CG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C-----------------------------T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--------C--GATTT---T-C--T--C---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A--------------------------T-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-C---AT--G-C-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT-----T---G-AT-GG-AA---A--GTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TA--G-GCGGA-TA--C-G-A--ACA---C-TCC---AAG-G------T---------------TACGT-TG--T-ACA-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTC-AT--CA--C--AA-T-C--CTTCTC--T-TTACTTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                  1111                                   1         11       2222222   1111                      1111       11111111      222222222222222222222222222222222222             2222222222222222                                33333333333333333333333333333333333333333333333333          1111111                                  11                     111                                                                      1111111111                                           11111111111111111                                          1111                    11111111        111111111111111                      1111                                  2222                                                                1111111111     111111111        11                                       3333333             11                                                                                                                                     11                                  
lowQualScore                  :              55   2  2  66 444  2 2   33 8888 2  2   2 2  2 2 8     5  55 2 33   2222    999 0   6  2  33  8888888 99   8 66  2   22  33 2 6666666   3333     77  33 555   33  3333   2 2 00000000   5  000000000000000000000000000000000000 3    2  2 2 4444444444444444     66   5 2 2 2     2 2   2 5 88888888888888888888888888888888888888888888888888 444  2 2 0000000 444 7777  33 444 2 4 333 2 2 55  22   777  2 2 77777 55 222 22 22 2  22 2 333 2   4 2  2   2 4    2 2 2 2 2 22 6 4444     33 77  2222222222  4  2 4 2     2 44444  33   33  55 4444   55555555555555555 2 2 2 2 55 2 7777  2 88   4 2 22 2  2 33 0000  33 55 2 77 4 2    44444444 55 2   777777777777777 2 5555 33   4  2  7  2222 2  2    2 33 2 2 77777  33 2     0000  2  2   4 888 33 6 6   4   555 2 2 2  333  2  2 2 6 2 9999999  0000000000 2   000000000  22  8 44  22 22 333 2  2  2  555 2     33  2 2 2222222 4 2   5555  66 6  1  2  77 333  2   66666   444  44   2 55 2   2  2 4 33 4     4  55 2 2 4 2 666  33 55     33 4444    33 33 2  777   2  55     2  33  33 4   2 2 33   7  33 2         
lowQualScore                  :              ..   .  .  .. ...  . .   .. .... .  .   . .  . . .     .  .. . ..   ....    ... .   .  .  ..  ....... ..   . ..  .   ..  .. . .......   ....     ..  .. ...   ..  ....   . . ........   .  .................................... .    .  . . ................     ..   . . . .     . .   . . .................................................. ...  . . ....... ... ....  .. ... . . ... . . ..  ..   ...  . . ..... .. ... .. .. .  .. . ... .   . .  .   . .    . . . . . .. . ....     .. ..  ..........  .  . . .     . .....  ..   ..  .. ....   ................. . . . . .. . ....  . ..   . . .. .  . .. ....  .. .. . .. . .    ........ .. .   ............... . .... ..   .  .  .  .... .  .    . .. . . .....  .. .     ....  .  .   . ... .. . .   .   ... . . .  ...  .  . . . . .......  .......... .   .........  ..  . ..  .. .. ... .  .  .  ... .     ..  . . ....... . .   ....  .. .  .  .  .. ...  .   .....   ...  ..   . .. .   .  . . .. .     .  .. . . . . ...  .. ..     .. ....    .. .. .  ...   .  ..     .  ..  .. .   . . ..   .  .. .         
lowQualScore                  :              88   9  9  33 777  7 7   77 3333 7  7   7 7  7 7 0     3  99 9 66   4444    333 6   7  7  77  7777777 00   7 33  7   77  77 7 3333333   0000     99  99 000   66  3333   9 9 44444444   7  999999999999999999999999999999999999 1    9  9 9 6666666666666666     33   3 7 7 7     5 5   5 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111  4 4 0000000 111 4444  22 111 4 4 999 2 2 33  88   999  1 1 66666 00 999 99 99 1  99 1 777 1   2 1  1   1 2    1 1 1 1 1 99 3 5555     11 55  8888888888  4  2 4 2     2 77777  11   11  33 7777   99999999999999999 2 2 2 2 33 2 8888  2 33   4 2 77 2  2 11 0000  11 66 4 99 7 4    33333333 66 4   444444444444444 4 0000 22   7  4  1  1111 4  4    4 22 4 4 33333  22 2     6666  2  2   4 333 11 7 3   2   888 1 1 1  555  0  0 0 0 0 7777777  7777777777 0   555555555  88  3 22  88 88 555 0  0  1  888 1     11  2 2 5555555 4 2   8888  44 7  2  4  99 555  4   55555   111  11   4 66 4   4  4 7 22 7     7  66 4 4 7 4 555  22 66     11 5555    22 22 4  444   4  66     4  88  22 7   4 4 44   5  44 5         
consensus                     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GGAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--A---T----A--N-A-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
Reference ( family-2091 )     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GGAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--A---T----A--N-A-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|1                          :                         --T---AA-T-TGA--CTGTTG-TT-TGA-T-TT-G-AGTTGTT-TTCTA-TA-AAATAT-ATTT-C-CGAGGGTG-TG--TT-------TT-GAT-G--TT-TCC--A---T-A----CC-GGTTAA-AAAAT--AG--AGAGCTA-CAAGAC-TTA-ATA--------ATG-ACACTA-T-A-AT--GGAA-GA-GGTTG---CACTT--C-CTAA-TC-G-A-------AATCAT-GACACGAG-AAG-A-A-A-ATAAC-A-AAC-A-AAA---CA-A--A---TTTTCA--T-A-----TA-T---T-----A--TAAT---CA-TAT-------C---T----TAAGT---A-T-TCTAG-A-AACCTAGGCGT--ATCA-GG----A--A-A-CCGG--C-AA--T-A---G-AAA-T-G--CAGTA-ACCC-C-C-G-ACA--T-A----AAAAA--CC-GTC---------T--CC-C-A-GCTCA-AAGGT-GT--CTC--TGGCA----AAA----A-TG---------A-A-A-T-C--G-T----TGAT--AAA-T-A-CG-TTGT--T----CCCCT--T-GAGC-A-TTGA--CTTTCTC--A-TGTCAAT-C--A--T---T-T----G--ATA-TG-CC-AT----A-AG-TTTG-T--A-A-C-----AATTA-TGCATG---CA-C---AC-A---C--AGA-AGC-TGT---C-TGTGAT---TT-AT-T-TGA-CAG-G---GT--GCGAT---T-TTA----TC---TT--AAAT-TCT--A--T---GGAT-GG-AA---A-CATTA--TA-T-AATC--T-GGT-GTA-GCGTA--GGCGAGA-TATTC-G-ACCACATCTA-CCCTAAAAG-GAC----T-ATC-AC-T-GCCG-TA-GT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAAAGAGT--TATT--T--ATAA---TAT-TA--TTTTT-ATC-AAACC-AAATT-C--CTT-TC--T-TTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                               gtggcgttcatgctatcaAA-TT-G-A-------A----C---AACAA--AGG-ACACA-ATTAC-A-AAC-A-AA----CA-A--A---T----T--T-A-----T--TGATT-----A--T--T---CA-T-T-------T---TAATGTA--T---G-CCT---G-A-AA-CTAGGCG---AT-A-GG----TTAA-G-T--G--C-AA--T-AGAAA-GAA-T-GT-CAA-ATGCCA-C---G-A-A--G-A----AAAAA--A--AAC-G-------T----------TTT------T-AC--CTC--TG--ACAACAAA----A-GA-G-----G-A-T-A-T-C--G-TAA--CG-T--AAA-T-A-CG-CA-T--CAACGTA--T--T-A--C-A-TTAA--TA----TAAG-TTTA--T-C--T--C---T-TATTAG--ATA-TG-CA-ATGTCAA-AG-TGTGAT--T-A-T----TCA--A-TG-ACGATGCA-TT-GAT-A---CCAA-A-GGC-TGTTTTC-T-T-AT---TC-AT-T-TCA-C-C-GCACATT-G-G-----TCTTA----CAAAATT--AATT--CTGAA--G---A-AT-GG-AA---A--GTTAAATG-TGA-----T-G-T-GTA-G--GA--G-CGGAG-TA--CCG-AC-ATA-----CCC---AAG-GAC-T--T-ATCAACAT-G--G-TACGT-TG--G-A-A-G-T---TAACTA-GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TAATATTTT-ATC-AC--C-AAA-TACAACTTATC--T-TTACTTTTgct
gi|11                         :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TTGAAA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-TTA-AATC-AAA-A---ATT---CGCGGGTA-TG--TT-------TT-GAT-G--TTGTCC--AAATT-A----CTCGGT----AACAT--AA--A---CTC-CAAA-C-TTA-A-A--------ATG-AT----AT-A-AT--G-A--GA-GGC-G---C---T--C-GTAT-AT-A-A-------A----TAGGAACAA--AAG-A-A-A--TTACCG-AAC-A-A------A-A--A---C----A--C-A-----T--T---TTTG--A--T--TTTTCA-T-T-------T---TA---TA--T-----C-T---G-A-A--CT--GCGC--AT-A-GT----T--A---T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAA-A-ACCACC-C-G-A-G--G-A----AAAAA--C--GTC-A-------TACCC-C-A-TCTCA-A---TGGT--CTC--TGA-A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-G-TGC--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--TG-T-AC-C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---T-C--CTTT---T-T----G--AAA-TGCCA-TT----C-AA-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATT--GC--TT-GAT-A---C--AGA-AGCATGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-CGG-G---ATG-G-G-----T-TTA----T----TT--AGTT---T--A--T---G-AT-G
gi|12                         :  gactGGCTTTAT--AAT-AC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TTATGA-TCATTG-A-TAGTT-ATA-A-TATAAG-AT-AATTTG-CGCGG-TAGTG--TT-------T--GATCG--TT-TCCTCAA--TTA----CC-GGG----AAAAT--AA--A---CTCACA-----TTA-A-A--------ATG-AC--GAAT-A--T--G-AG-AG-GGT-GT--C---T--C-CTAA-TT-ATA-------A----C-T---CGA--AAG-C-A-ATAATAC-ACGAT-A-C-----TA-A--A---C----A--A-A-----T--T---TCTATGA--T--T---TA-T-T-------TCATT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG----T-A-GT----T--A-A-T--G--CCAA--TTA---ACGAA-T-AT-CAG-A--CCA-C-C-G-A-A--G-A----AGAA---C--GTC----------A-CCTC-A-GCTCA-A---T-GT--CTCAGTG--A----AAA----AACG-G-----G-A-T---T-CTTG-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--TTA--C-A-TTTG--CT----T--G-TAT---T-T--C--T---C-T------------------------------TG-T--G-A-T--------------ATG--G-------AT-A----------AGG-TGT-------T-AT---TT-ATCT-T-A-C-G-C---GT--G-G-----T-TAC----T----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---A-C--TA--TA-T-AACTGCC-G-T-ATG-G--TA--G-tgactttat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            gctC-A-TAC-A-A-----CA--------T----A--T-A-----T--C---T-----A--TAAT---TG-T-TAAGAATGT---T----TA--C---AAC-T---G------CT--GCG---AT-A-GT----T--A-AGT--G--C-AA--T-A---A-AGA-T-GT-CAG-A-ACCA-CGC-G-A-A--G-A----CAAT---C--GTC-G-------TA-CC-CCA-GCTCAGA---T-GT--CTC--TG--A----AAA----AGCG-G-----G-A-T-AGT-C--G-T----TG-T--AAG-T-A-CG-TT-T--TT---CC--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-CGTC--T---TGT----GGAATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--CGA-TTTGAT-A---C--A-A-AGC-TGTT--C-C-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----CT--AATT--CT--A--T---G-AT-GGGAA---A-CGTTA--GA-T-A-----TAG-T-GTAAG--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--GTTACGT-TG--A-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--A----TATT--T--A-AA---TAT-TA--A-TTT-ATC-AA--CGAAA-T-A--CTT-TC--TGTTACTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         GAACAA--AA--A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AA----CA-A--A---T----T--T-A-----TGAT---T--------T--T---TA-T-T-------T---T----TG--T---A-T-G---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAT-G-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAAAAC--GTT-T-------T-----------TCG-----------CTC--TG--A----AAA-------G-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----CG-T--AAA-T-ACCG-CT-T--CAA--CG--T--T-A--C-A-TTAA--TT----A--G-TTT---T-CT-C--T---C-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-T----T-A--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-ATAGC-TGT---C-T-T-TA---TT-AT-T-------------AC--C-T-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-ATGGG-AA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTAGG--TAG-G-CGGGA-TAC-C-G-AC-AT----A-CCC---AA--GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TAC---TGT-T-A-A-G-T---TA--T--G-AAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TA--ATTTTCATA-AA--A-AAA-T-C----T-TC--T-TTACTTTTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  t--A---T----A--G-A-----T--G---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---GT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAA---C--GTT-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T----A-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---TGC--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA---------TT--AAAT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----------GTA-G------A-CAGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAT-CTAT-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-TTAATA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|16                         :         atttatgatT-GC-ACGCT---AA-T-TGAACC----GATT-TGA-T-AT-G-A-TAGTC-TTC-A-TA-AAA-AT-AATT-T-CGCGTGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGCGTCAAAAAT--AAACA---CTA-CAA--T-TTACA-AAAAATTACATG-AT--TAATGA-AT--T-AG-GA-GTC-G---T---T--T-CTAATTT-A-ATTTTAATA----T-GAACCGATTTAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AGATCTCA-ATTA---T----A--T-ATCATTT--T---T-----T--T--T---CT-C-T-------T---T----TA--TCAAA-CGT---G-A-A--CTA-GCG---AT-A-AGGCTCT--A-C-A--G--C-AACTT-A---A-GAA-TGGT-CAG-ACACCA-C-C-A-A-A--G-AAGAGAAAAA--C--GTG-GTCACTTTTA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GTTCCTC--TG--T----AGACATTA-CGTG-----G-A-TAA-T-CA-G-TATTATA-C--AAA-TAA-CG-TT-T--T----CC--
gi|17                         :      GGGTTT---CAAT-GCCACC-T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TG-GAA-ATCAATT-T-CGCAGGTA-TG--TT-------T--GATTG--TT-TCC--AA--T-A----CC-GGT----AAAAT--AA--A---CTA-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TA-T-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---TTTC-CTAA-TTTA-A-------A----T-G-AACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AA----CA-A--A---TTT--A--TGA-----T--T---T-----A--T--T---CG-T-TC------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-A-T-A--A-G----AAAAA--C--GTCCG-------TA-CC-CCA-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GC----G-A---A-T-C--G-T----TG-TA-AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTACTTTT----C--A-TTTTTCT-C--T--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----ATAGTTTTG-T--T-A-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C---G-A-C--G-A----AAAAA--C--GTC----------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA------CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--C----CT--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-T--C--TCA-T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-AAATA--A-A-AGC-TGT---T-T-T-AT---TT-AT-T-TAA-C-GAG---AT----G-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT--G-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-CG-T-ATC-AC-T-G--G--ATGT-TG--TAA-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TAC-ATTTT-GAT-TA--CAAAA-T-T--CTTATC--T-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgAA--A-TGCATG---CACTT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---CAT-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-GC--AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA-----CGT-A--TGGT-A-----TTGCT-GTA-G--TA--G-CGGGA-TAG-C-G-AC-ACA---G-CCC---AATTGACTC--T-ATC-AC-TTG--GCTACGT-TG--T-A-AAG-TA--TA--T--GCTAA--A-T--TATT-----A-AA---TATCTA--ATTTT-ATCACA--C-AA--T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAacactct
gi|2                          :        ttaTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-A-A---GTT-TTA-A-TA-AAA-TA-AATT-G-CG--AGTA-TG--TTGATGCCAT--GATAG--TT-TCC--AA--T-A----CT-GGT----TAAAT---A--A---CTT-CGA----TTA-A-A--------ATG-AC--T--T-A-ATTGG-AA-GATGGT-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-TGAACGA--AGA-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--AGTTT----ATTG-A-----T--T---TC----AT-T--T---CATT-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCGTGAAT-AGGG----T--A-ACT--GGTC-AA--T-A---A-GAAGT-GT--AG-A-ACAA-C-C-GCA-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TAGTC-C-ATGCTC--------GT--CT-------G----ACA----A-CA-GCATATG-ATT-A-T-C--G-A----TG-T--AAA-T-A-TC-TT-TTGT----CA--T--T-A--C-ATTTAAT-TT----C--G-TTT---CAT--C--T---T-T----G--ATA--G-TG-TG----A-AG-TTTG-T--T-A-TCTTCTAA--ATTGC-TC--TCA-TT-TAC-A---C--G-A---------------T-AT---TT-GT-T-T-G-C-A-G---A---G-AAGCATC-TCA----TG---TT--AATTCTTT--ATTT---T-AT-GG-AACTGATCGATA---G-A-A-----C-G-TCGTA----TA--G--GCGATTA--C---AC--CA---A-CTC---AAG-G-C-C--T-GTC-AC-TGG--G-TCCGT-TGGAT-A-G-GAA---TA--T---AAAG--AATGATATT--T--A-AAAATTAT-TA--ATGTT-AAT-CA--C-AAA---G--CTT-TCTGT-TTACTT
gi|20                         : gactggGGTTT-C-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-GAA-TAGTT-TT--A-T--AAA-AT-AA-T-G--ATGGGTA-TG--CT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--GGTA---AAAAT--AA--A---CTC-CAA--CTTTA-A-A--------CTG-GA--TAGT-A-AT--G-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tt-T---A-A-A--CT--G-G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA---C-G-A-C--G-A----AAAcaataagaatgtcagaaccacgacgaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttggtttccaatgcactaattgatgtttgatatgaatagttttataaaataatgatgggtatgcttgatggtttccaataccggtaaaaataaactccaacttT---TT-AT-A-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CAGGA-TA--C---AC-ACA---A-ACC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-C-G--G-TACGT-TT--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--------ATT--T-----------------ATTTC-AT--CA--C-AAA-T-C--C-T-TC--T-TTACTTTTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AGC-TAT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----A----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTG--TA-T-A-----TTG-T-GTA-G--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TG--ATTTT-ATC--A--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggacacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGCATG---CA-TT-GATGA---C--A-A-AGCCTGT---C-T-T-AT---TT-AG-T-G-AGCAG-G---GT--GTG-----T-TTATTATT----TT--AATTGTCT--A--TCGCG-AT-GG-AAC--A-CGTa
gi|25                         : ttatcGGGTTTAT-CATT-GC-AA--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-Tgttataat
gi|26                         :                                                                                             ggactGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--AGT----AAA
gi|3                          :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AT--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-T--AAA-AT-AATT-G-CACAGGTA-TG--TT-------T--GATCG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGT----TAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--T-AT-ACAT--G-TA-------------------C-CTAA-TT-A-A-------A----T-TGAACAA--AAG-T-A-A-ATTAT-A-AACAA-A-----CA-A--AT--T----AATG-A-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---GTA-A--CT--GTG---AT-A-GT----T--A-ATT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GTCCAG-A-CACA-C-CTG-A-A--GAA----AAAAA--CG-GTC-G-------TA-CC-T-A-GCTTC-A---TCGT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GATCT-G-A-T-A-T-C--GTT----TG-T--AAATT-A-CGTTT-T--T----CT--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTG---T-CT-C--T---T-T----G--ATA-T---A-TT----C-AG-TGTG-TTAT-A-T----TAA--A--ATACT--GCA-TT-GAT-AC--C--ACA-AGC-TGT---C-T-T-AT---TTCAT-TCT-A-C-G-G---ATTGG-A-----G-TTA----------T--GA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAAGG-CGGGA-TA--C---AC-ACA---T-CCC---AAG-GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--C--GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATA-CA----AAA-T-C--CTT-TC--T-TCACTTTTA
gi|4                          :   actGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---GA-A-TGA--C----G-TT-TGACT-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-GGCGCGGGTA-TG--TT-------TTGGAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--AGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GAAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAT-TTA-----TG-A--A---T----A--ACA-----T--GG--T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---GT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GC-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--CAAGTT-GA------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTT--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-AA-C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TA--AATTCTCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-------G-T--TA-G--T---G-CAGGA-TA--T-GAAC-AC----A-CCC---AAG-GAT-C--TAATC-CA-T-G--G-TACGT-TG--T-A-GCA-T---TA--TTAGAAAA--AAT--TATTCGT--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|5                          :         TTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAA--A---CTC--AA----TTA-A-A--------ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAA-TT-A-A-------ACT--T-AGAACGA--AAGGA-A-A-ATTAC-A-CA--A-A-----CA-T--A---C----A--A-A-----T--T---T-----A--TA-T---CA-T-T-------T---C-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-TA-TAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTG-G-------TA-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAAT---A----------A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAA--TTT---C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG-TT-G-T--T-AAT----CAA--A-TGCATG---CA-TT-CAT-AA--C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-----AT--G-G-----T-TTT----T----TTTTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C--T---C-AC-T-G----TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--T--A-AAAA-TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTACT
gi|6                          :        aTTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAA--A---CTC--AA----TTA-A-A--------ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAA-TT-A-A-------ACT--T-AGAACGA--AAGGA-A-A-ATTAC-A-CA--A-A-----CA-T--A---C----A--A-A-----T--T---T-----A--TA-T---CA-T-T-------T---C-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-TA-TAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTG-G-------TA-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAA-T----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TT--AATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTAC
gi|7                          :     aGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAAT-TGA--CC---G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-T-A-A-TA-AAA-A--AATT-G-CGCGG-TA-TG--TT-------T--GAT-GGTTT-TCCCCAA--T-A----CT-GGT----AAAAT--AA--A---CTT--AA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAA--A-AT--G-AC-TA---C-A---A---T--GACTAA-TA-A-A-------A----T-GAACCGA--AGA-A-A-A-ATTAC-A-A-C-A-T-----TAGA--A---T----A--T-ACAA--T--G---T-----AATT--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A----CT--GTG---GT-A-GG----T--T---T--G--C-AA--T-A-----GAA-T-GC-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-AAAG-A----AAAAA--C--GTT-G-------TA-CC---A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--TCTT-T--C-A-TTAA--TT----TT-G-TTT---T-C--CC-T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-T-CATG---CA-TT-GAT-----C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-----AT--G-G-----T-CTA----T----CA--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---T-CGTTA--TG-T-A-----------GTA-G------G-CAGGA-TA--T-G-AC-ACA---A-CCC---AAT-GAT-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T----------------------A--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-AA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC----TTACTTTTA
gi|8                          :  ggctGGGTTTATTCAATTGC--C--T---AA-CGTGA--C----G-TT-TGA-C--T-A-G-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-CTCGCGG-TA-TGGTTT-------T--GAT-G--GT-TCC--AG--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTA-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AT--CTAT-A--T--G-AACGA-GAT-G---C------C-CT---TT-A-A------------T-TGAACGA--AAG-A-A-T-AT-AC-A-AAC-A-A-----AA-C--A---TTT--A--TGA-----T--G---T-----A--T--T---CA-T-C-------T---T-----A--T---A-C-T---G-ATA--CT---CG---AT-A-TG----TC-ATA-T--G--C-AA--T-A---A-TAAGT-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAAA--C--GT--G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T--T--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-A-T-C--G------TG-T--AAATT-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A--TAC--TT----C--A-TTT---T-CT-C--T---T-T----G--TCT-TG-CATTT----A-AG-TCTA---------------------------------T-GAT-A---T--A-A-AGC-TGT---C-T-T-ATTTATT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-A-T---TA--G--GAAAA--AAT--AATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-
gi|9                          :    ctGGGTTTAT-TGAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-T-A-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-G-CACGGGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----CC-GGA----AAAAT--AA--A---TTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TA-T-A----------------------------C-CTAA-TT-A-A------------T-TGAACAA--ATG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-ACA-----CA-A--A---TTT--A--TGA-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--G-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GC--CTC--CG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C-----------------------------T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--------C--GATTT---T-C--T--C---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A--------------------------T-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-C---AT--G-C-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT-----T---G-AT-GG-AA---A--GTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TA--G-GCGGA-TA--C-G-A--ACA---C-TCC---AAG-G------T---------------TACGT-TG--T-ACA-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTC-AT--CA--C--AA-T-C--CTTCTC--T-TTACTTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                  1111                                   1         11       2222222   1111                      1111       11111111      222222222222222222222222222222222222             2222222222222222                                33333333333333333333333333333333333333333333333333          1111111                                  11                     111                                                                      1111111111                                           11111111111111111                                          1111                    11111111        111111111111111                      1111                                  2222                                                                1111111111     111111111        11                                       3333333             11                                                                                                                                     11                                  
lowQualScore                  :              55   2  2  66 444  2 2   33 8888 2  2   2 2  2 2 8     5  55 2 33   2222    999 0   6  2  33  8888888 99   8 66  2   22  33 2 6666666   3333     77  33 555   33  3333   2 2 00000000   5  000000000000000000000000000000000000 3    2  2 2 4444444444444444     66   5 2 2 2     2 2   2 5 88888888888888888888888888888888888888888888888888 444  2 2 0000000 444 7777  33 444 2 4 333 2 2 55  22   777  2 2 77777 55 222 22 22 2  22 2 333 2   4 2  2   2 4    2 2 2 2 2 22 6 4444     33 77  2222222222  4  2 4 2     2 44444  33   33  55 4444   55555555555555555 2 2 2 2 55 2 7777  2 88   4 2 22 2  2 33 0000  33 55 2 77 4 2    44444444 55 2   777777777777777 2 5555 33   4  2  7  2222 2  2    2 33 2 2 77777  33 2     0000  2  2   4 888 33 6 6   4   555 2 2 2  333  2  2 2 6 2 9999999  0000000000 2   000000000  22  8 44  22 22 333 2  2  2  555 2     33  2 2 2222222 4 2   5555  66 6  1  2  77 333  2   66666   444  44   2 55 2   2  2 4 33 4     4  55 2 2 4 2 666  33 55     33 4444    33 33 2  777   2  55     2  33  33 4   2 2 33   7  33 2         
lowQualScore                  :              ..   .  .  .. ...  . .   .. .... .  .   . .  . . .     .  .. . ..   ....    ... .   .  .  ..  ....... ..   . ..  .   ..  .. . .......   ....     ..  .. ...   ..  ....   . . ........   .  .................................... .    .  . . ................     ..   . . . .     . .   . . .................................................. ...  . . ....... ... ....  .. ... . . ... . . ..  ..   ...  . . ..... .. ... .. .. .  .. . ... .   . .  .   . .    . . . . . .. . ....     .. ..  ..........  .  . . .     . .....  ..   ..  .. ....   ................. . . . . .. . ....  . ..   . . .. .  . .. ....  .. .. . .. . .    ........ .. .   ............... . .... ..   .  .  .  .... .  .    . .. . . .....  .. .     ....  .  .   . ... .. . .   .   ... . . .  ...  .  . . . . .......  .......... .   .........  ..  . ..  .. .. ... .  .  .  ... .     ..  . . ....... . .   ....  .. .  .  .  .. ...  .   .....   ...  ..   . .. .   .  . . .. .     .  .. . . . . ...  .. ..     .. ....    .. .. .  ...   .  ..     .  ..  .. .   . . ..   .  .. .         
lowQualScore                  :              88   9  9  33 777  7 7   77 3333 7  7   7 7  7 7 0     3  99 9 66   4444    333 6   7  7  77  7777777 00   7 33  7   77  77 7 3333333   0000     99  99 000   66  3333   9 9 44444444   7  999999999999999999999999999999999999 1    9  9 9 6666666666666666     33   3 7 7 7     5 5   5 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111  4 4 0000000 111 4444  22 111 4 4 999 2 2 33  88   999  1 1 66666 00 999 99 99 1  99 1 777 1   2 1  1   1 2    1 1 1 1 1 99 3 5555     11 55  8888888888  4  2 4 2     2 77777  11   11  33 7777   99999999999999999 2 2 2 2 33 2 8888  2 33   4 2 77 2  2 11 0000  11 66 4 99 7 4    33333333 66 4   444444444444444 4 0000 22   7  4  1  1111 4  4    4 22 4 4 33333  22 2     6666  2  2   4 333 11 7 3   2   888 1 1 1  555  0  0 0 0 0 7777777  7777777777 0   555555555  88  3 22  88 88 555 0  0  1  888 1     11  2 2 5555555 4 2   8888  44 7  2  4  99 555  4   55555   111  11   4 66 4   4  4 7 22 7     7  66 4 4 7 4 555  22 66     11 5555    22 22 4  444   4  66     4  88  22 7   4 4 44   5  44 5         
consensus                     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GGAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--A---T----A--N-A-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
Reference ( family-2091 )     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GGAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--A---T----A--N-A-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|1                          :                         --T---AA-T-TGA--CTGTTG-TT-TGA-T-TT-G-AGTTGTT-TTCTA-TA-AAATAT-ATTT-C-CGAGGGTG-TG--TT-------TT-GAT-G--TT-TCC--A---T-A----CC-GGTTAA-AAAAT--AG--AGAGCTA-CAAGAC-TTA-ATA--------ATG-ACACTA-T-A-AT--GGAA-GA-GGTTG---CACTT--C-CTAA-TC-G-A-------AATCAT-GACACGAG-AAG-A-A-A-ATAAC-A-AAC-A-AAA---CA-A--A---TTTTCA--T-A-----TA-T---T-----A--TAAT---CA-TAT-------C---T----TAAGT---A-T-TCTAG-A-AACCTAGGCGT--ATCA-GG----A--A-A-CCGG--C-AA--T-A---G-AAA-T-G--CAGTA-ACCC-C-C-G-ACA--T-A----AAAAA--CC-GTC---------T--CC-C-A-GCTCA-AAGGT-GT--CTC--TGGCA----AAA----A-TG---------A-A-A-T-C--G-T----TGAT--AAA-T-A-CG-TTGT--T----CCCCT--T-GAGC-A-TTGA--CTTTCTC--A-TGTCAAT-C--A--T---T-T----G--ATA-TG-CC-AT----A-AG-TTTG-T--A-A-C-----AATTA-TGCATG---CA-C---AC-A---C--AGA-AGC-TGT---C-TGTGAT---TT-AT-T-TGA-CAG-G---GT--GCGAT---T-TTA----TC---TT--AAAT-TCT--A--T---GGAT-GG-AA---A-CATTA--TA-T-AATC--T-GGT-GTA-GCGTA--GGCGAGA-TATTC-G-ACCACATCTA-CCCTAAAAG-GAC----T-ATC-AC-T-GCCG-TA-GT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAAAGAGT--TATT--T--ATAA---TAT-TA--TTTTT-ATC-AAACC-AAATT-C--CTT-TC--T-TTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                               gtggcgttcatgctatcaAA-TT-G-A-------A----C---AACAA--AGG-ACACA-ATTAC-A-AAC-A-AA----CA-A--A---T----T--T-A-----T--TGATT-----A--T--T---CA-T-T-------T---TAATGTA--T---G-CCT---G-A-AA-CTAGGCG---AT-A-GG----TTAA-G-T--G--C-AA--T-AGAAA-GAA-T-GT-CAA-ATGCCA-C---G-A-A--G-A----AAAAA--A--AAC-G-------T----------TTT------T-AC--CTC--TG--ACAACAAA----A-GA-G-----G-A-T-A-T-C--G-TAA--CG-T--AAA-T-A-CG-CA-T--CAACGTA--T--T-A--C-A-TTAA--TA----TAAG-TTTA--T-C--T--C---T-TATTAG--ATA-TG-CA-ATGTCAA-AG-TGTGAT--T-A-T----TCA--A-TG-ACGATGCA-TT-GAT-A---CCAA-A-GGC-TGTTTTC-T-T-AT---TC-AT-T-TCA-C-C-GCACATT-G-G-----TCTTA----CAAAATT--AATT--CTGAA--G---A-AT-GG-AA---A--GTTAAATG-TGA-----T-G-T-GTA-G--GA--G-CGGAG-TA--CCG-AC-ATA-----CCC---AAG-GAC-T--T-ATCAACAT-G--G-TACGT-TG--G-A-A-G-T---TAACTA-GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TAATATTTT-ATC-AC--C-AAA-TACAACTTATC--T-TTACTTTTgct
gi|11                         :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TTGAAA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-TTA-AATC-AAA-A---ATT---CGCGGGTA-TG--TT-------TT-GAT-G--TTGTCC--AAATT-A----CTCGGT----AACAT--AA--A---CTC-CAAA-C-TTA-A-A--------ATG-AT----AT-A-AT--G-A--GA-GGC-G---C---T--C-GTAT-AT-A-A-------A----TAGGAACAA--AAG-A-A-A--TTACCG-AAC-A-A------A-A--A---C----A--C-A-----T--T---TTTG--A--T--TTTTCA-T-T-------T---TA---TA--T-----C-T---G-A-A--CT--GCGC--AT-A-GT----T--A---T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAA-A-ACCACC-C-G-A-G--G-A----AAAAA--C--GTC-A-------TACCC-C-A-TCTCA-A---TGGT--CTC--TGA-A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-G-TGC--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--TG-T-AC-C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---T-C--CTTT---T-T----G--AAA-TGCCA-TT----C-AA-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATT--GC--TT-GAT-A---C--AGA-AGCATGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-CGG-G---ATG-G-G-----T-TTA----T----TT--AGTT---T--A--T---G-AT-G
gi|12                         :  gactGGCTTTAT--AAT-AC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TTATGA-TCATTG-A-TAGTT-ATA-A-TATAAG-AT-AATTTG-CGCGG-TAGTG--TT-------T--GATCG--TT-TCCTCAA--TTA----CC-GGG----AAAAT--AA--A---CTCACA-----TTA-A-A--------ATG-AC--GAAT-A--T--G-AG-AG-GGT-GT--C---T--C-CTAA-TT-ATA-------A----C-T---CGA--AAG-C-A-ATAATAC-ACGAT-A-C-----TA-A--A---C----A--A-A-----T--T---TCTATGA--T--T---TA-T-T-------TCATT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG----T-A-GT----T--A-A-T--G--CCAA--TTA---ACGAA-T-AT-CAG-A--CCA-C-C-G-A-A--G-A----AGAA---C--GTC----------A-CCTC-A-GCTCA-A---T-GT--CTCAGTG--A----AAA----AACG-G-----G-A-T---T-CTTG-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--TTA--C-A-TTTG--CT----T--G-TAT---T-T--C--T---C-T------------------------------TG-T--G-A-T--------------ATG--G-------AT-A----------AGG-TGT-------T-AT---TT-ATCT-T-A-C-G-C---GT--G-G-----T-TAC----T----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---A-C--TA--TA-T-AACTGCC-G-T-ATG-G--TA--G-tgactttat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            gctC-A-TAC-A-A-----CA--------T----A--T-A-----T--C---T-----A--TAAT---TG-T-TAAGAATGT---T----TA--C---AAC-T---G------CT--GCG---AT-A-GT----T--A-AGT--G--C-AA--T-A---A-AGA-T-GT-CAG-A-ACCA-CGC-G-A-A--G-A----CAAT---C--GTC-G-------TA-CC-CCA-GCTCAGA---T-GT--CTC--TG--A----AAA----AGCG-G-----G-A-T-AGT-C--G-T----TG-T--AAG-T-A-CG-TT-T--TT---CC--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-CGTC--T---TGT----GGAATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--CGA-TTTGAT-A---C--A-A-AGC-TGTT--C-C-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----CT--AATT--CT--A--T---G-AT-GGGAA---A-CGTTA--GA-T-A-----TAG-T-GTAAG--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--GTTACGT-TG--A-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--A----TATT--T--A-AA---TAT-TA--A-TTT-ATC-AA--CGAAA-T-A--CTT-TC--TGTTACTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         GAACAA--AA--A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AA----CA-A--A---T----T--T-A-----TGAT---T--------T--T---TA-T-T-------T---T----TG--T---A-T-G---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAT-G-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAAAAC--GTT-T-------T-----------TCG-----------CTC--TG--A----AAA-------G-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----CG-T--AAA-T-ACCG-CT-T--CAA--CG--T--T-A--C-A-TTAA--TT----A--G-TTT---T-CT-C--T---C-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-T----T-A--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-ATAGC-TGT---C-T-T-TA---TT-AT-T-------------AC--C-T-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-ATGGG-AA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTAGG--TAG-G-CGGGA-TAC-C-G-AC-AT----A-CCC---AA--GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TAC---TGT-T-A-A-G-T---TA--T--G-AAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TA--ATTTTCATA-AA--A-AAA-T-C----T-TC--T-TTACTTTTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  t--A---T----A--G-A-----T--G---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---GT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAA---C--GTT-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T----A-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAAT-TT----C--G-TTT---TGC--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA---------TT--AAAT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----------GTA-G------A-CAGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAT-CTAT-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-TTAATA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|16                         :         atttatgatT-GC-ACGCT---AA-T-TGAACC----GATT-TGA-T-AT-G-A-TAGTC-TTC-A-TA-AAA-AT-AATT-T-CGCGTGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGCGTCAAAAAT--AAACA---CTA-CAA--T-TTACA-AAAAATTACATG-AT--TAATGA-AT--T-AG-GA-GTC-G---T---T--T-CTAATTT-A-ATTTTAATA----T-GAACCGATTTAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AGATCTCA-ATTA---T----A--T-ATCATTT--T---T-----T--T--T---CT-C-T-------T---T----TA--TCAAA-CGT---G-A-A--CTA-GCG---AT-A-AGGCTCT--A-C-A--G--C-AACTT-A---A-GAA-TGGT-CAG-ACACCA-C-C-A-A-A--G-AAGAGAAAAA--C--GTG-GTCACTTTTA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GTTCCTC--TG--T----AGACATTA-CGTG-----G-A-TAA-T-CA-G-TATTATA-C--AAA-TAA-CG-TT-T--T----CC--
gi|17                         :      GGGTTT---CAAT-GCCACC-T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TG-GAA-ATCAATT-T-CGCAGGTA-TG--TT-------T--GATTG--TT-TCC--AA--T-A----CC-GGT----AAAAT--AA--A---CTA-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TA-T-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---TTTC-CTAA-TTTA-A-------A----T-G-AACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AA----CA-A--A---TTT--A--TGA-----T--T---T-----A--T--T---CG-T-TC------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-A-T-A--A-G----AAAAA--C--GTCCG-------TA-CC-CCA-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GC----G-A---A-T-C--G-T----TG-TA-AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTACTTTT----C--A-TTTTTCT-C--T--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----ATAGTTTTG-T--T-A-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C---G-A-C--G-A----AAAAA--C--GTC----------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA------CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--C----CT--T--T-A--C-A-TTAC--TTT---C--A-TTT---T-T--C--TCA-T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-AAATA--A-A-AGC-TGT---T-T-T-AT---TT-AT-T-TAA-C-GAG---AT----G-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT--G-AA---A-CGTTA--TA-T-A-----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-CG-T-ATC-AC-T-G--G--ATGT-TG--TAA-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TAC-ATTTT-GAT-TA--CAAAA-T-T--CTTATC--T-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgAA--A-TGCATG---CACTT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---CAT-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-GC--AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA-----CGT-A--TGGT-A-----TTGCT-GTA-G--TA--G-CGGGA-TAG-C-G-AC-ACA---G-CCC---AATTGACTC--T-ATC-AC-TTG--GCTACGT-TG--T-A-AAG-TA--TA--T--GCTAA--A-T--TATT-----A-AA---TATCTA--ATTTT-ATCACA--C-AA--T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAacactct
gi|2                          :        ttaTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-A-A---GTT-TTA-A-TA-AAA-TA-AATT-G-CG--AGTA-TG--TTGATGCCAT--GATAG--TT-TCC--AA--T-A----CT-GGT----TAAAT---A--A---CTT-CGA----TTA-A-A--------ATG-AC--T--T-A-ATTGG-AA-GATGGT-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-TGAACGA--AGA-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--AGTTT----ATTG-A-----T--T---TC----AT-T--T---CATT-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCGTGAAT-AGGG----T--A-ACT--GGTC-AA--T-A---A-GAAGT-GT--AG-A-ACAA-C-C-GCA-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TAGTC-C-ATGCTC--------GT--CT-------G----ACA----A-CA-GCATATG-ATT-A-T-C--G-A----TG-T--AAA-T-A-TC-TT-TTGT----CA--T--T-A--C-ATTTAAT-TT----C--G-TTT---CAT--C--T---T-T----G--ATA--G-TG-TG----A-AG-TTTG-T--T-A-TCTTCTAA--ATTGC-TC--TCA-TT-TAC-A---C--G-A---------------T-AT---TT-GT-T-T-G-C-A-G---A---G-AAGCATC-TCA----TG---TT--AATTCTTT--ATTT---T-AT-GG-AACTGATCGATA---G-A-A-----C-G-TCGTA----TA--G--GCGATTA--C---AC--CA---A-CTC---AAG-G-C-C--T-GTC-AC-TGG--G-TCCGT-TGGAT-A-G-GAA---TA--T---AAAG--AATGATATT--T--A-AAAATTAT-TA--ATGTT-AAT-CA--C-AAA---G--CTT-TCTGT-TTACTT
gi|20                         : gactggGGTTT-C-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-GAA-TAGTT-TT--A-T--AAA-AT-AA-T-G--ATGGGTA-TG--CT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--GGTA---AAAAT--AA--A---CTC-CAA--CTTTA-A-A--------CTG-GA--TAGT-A-AT--G-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tt-T---A-A-A--CT--G-G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA---C-G-A-C--G-A----AAAcaataagaatgtcagaaccacgacgaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttggtttccaatgcactaattgatgtttgatatgaatagttttataaaataatgatgggtatgcttgatggtttccaataccggtaaaaataaactccaacttT---TT-AT-A-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CAGGA-TA--C---AC-ACA---A-ACC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-C-G--G-TACGT-TT--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--------ATT--T-----------------ATTTC-AT--CA--C-AAA-T-C--C-T-TC--T-TTACTTTTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AGC-TAT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----A----TT--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTG--TA-T-A-----TTG-T-GTA-G--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TG--ATTTT-ATC--A--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggacacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGCATG---CA-TT-GATGA---C--A-A-AGCCTGT---C-T-T-AT---TT-AG-T-G-AGCAG-G---GT--GTG-----T-TTATTATT----TT--AATTGTCT--A--TCGCG-AT-GG-AAC--A-CGTa
gi|25                         : ttatcGGGTTTAT-CATT-GC-AA--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-Tgttataat
gi|26                         :                                                                                             ggactGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--AGT----AAA
gi|3                          :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AT--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-T--AAA-AT-AATT-G-CACAGGTA-TG--TT-------T--GATCG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGT----TAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--T-AT-ACAT--G-TA-------------------C-CTAA-TT-A-A-------A----T-TGAACAA--AAG-T-A-A-ATTAT-A-AACAA-A-----CA-A--AT--T----AATG-A-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---GTA-A--CT--GTG---AT-A-GT----T--A-ATT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GTCCAG-A-CACA-C-CTG-A-A--GAA----AAAAA--CG-GTC-G-------TA-CC-T-A-GCTTC-A---TCGT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GATCT-G-A-T-A-T-C--GTT----TG-T--AAATT-A-CGTTT-T--T----CT--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTG---T-CT-C--T---T-T----G--ATA-T---A-TT----C-AG-TGTG-TTAT-A-T----TAA--A--ATACT--GCA-TT-GAT-AC--C--ACA-AGC-TGT---C-T-T-AT---TTCAT-TCT-A-C-G-G---ATTGG-A-----G-TTA----------T--GA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-GA---A-CGTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAAGG-CGGGA-TA--C---AC-ACA---T-CCC---AAG-GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--C--GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATA-CA----AAA-T-C--CTT-TC--T-TCACTTTTA
gi|4                          :   actGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---GA-A-TGA--C----G-TT-TGACT-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-GGCGCGGGTA-TG--TT-------TTGGAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--AGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GAAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAT-TTA-----TG-A--A---T----A--ACA-----T--GG--T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---GT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GC-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--CAAGTT-GA------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTT--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-AA-C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TA--AATTCTCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-------G-T--TA-G--T---G-CAGGA-TA--T-GAAC-AC----A-CCC---AAG-GAT-C--TAATC-CA-T-G--G-TACGT-TG--T-A-GCA-T---TA--TTAGAAAA--AAT--TATTCGT--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|5                          :         TTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAA--A---CTC--AA----TTA-A-A--------ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAA-TT-A-A-------ACT--T-AGAACGA--AAGGA-A-A-ATTAC-A-CA--A-A-----CA-T--A---C----A--A-A-----T--T---T-----A--TA-T---CA-T-T-------T---C-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-TA-TAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTG-G-------TA-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAAT---A----------A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAA--TTT---C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG-TT-G-T--T-AAT----CAA--A-TGCATG---CA-TT-CAT-AA--C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-----AT--G-G-----T-TTT----T----TTTTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C--T---C-AC-T-G----TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--T--A-AAAA-TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTACT
gi|6                          :        aTTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAA--A---CTC--AA----TTA-A-A--------ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAA-TT-A-A-------ACT--T-AGAACGA--AAGGA-A-A-ATTAC-A-CA--A-A-----CA-T--A---C----A--A-A-----T--T---T-----A--TA-T---CA-T-T-------T---C-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-TA-TAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTG-G-------TA-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAAT-TT----C--G-TAC---T-G--C--TCTAT-T----G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAA-T----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TT--AATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA---A-CCGTA--CT-T-AC----T-G-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTAC
gi|7                          :     aGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAAT-TGA--CC---G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-T-A-A-TA-AAA-A--AATT-G-CGCGG-TA-TG--TT-------T--GAT-GGTTT-TCCCCAA--T-A----CT-GGT----AAAAT--AA--A---CTT--AA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAA--A-AT--G-AC-TA---C-A---A---T--GACTAA-TA-A-A-------A----T-GAACCGA--AGA-A-A-A-ATTAC-A-A-C-A-T-----TAGA--A---T----A--T-ACAA--T--G---T-----AATT--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A----CT--GTG---GT-A-GG----T--T---T--G--C-AA--T-A-----GAA-T-GC-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-AAAG-A----AAAAA--C--GTT-G-------TA-CC---A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--TCTT-T--C-A-TTAA--TT----TT-G-TTT---T-C--CC-T---T-T----C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-T-CATG---CA-TT-GAT-----C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-----AT--G-G-----T-CTA----T----CA--AATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA---T-CGTTA--TG-T-A-----------GTA-G------G-CAGGA-TA--T-G-AC-ACA---A-CCC---AAT-GAT-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T----------------------A--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-AA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC----TTACTTTTA
gi|8                          :  ggctGGGTTTATTCAATTGC--C--T---AA-CGTGA--C----G-TT-TGA-C--T-A-G-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-CTCGCGG-TA-TGGTTT-------T--GAT-G--GT-TCC--AG--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTA-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AT--CTAT-A--T--G-AACGA-GAT-G---C------C-CT---TT-A-A------------T-TGAACGA--AAG-A-A-T-AT-AC-A-AAC-A-A-----AA-C--A---TTT--A--TGA-----T--G---T-----A--T--T---CA-T-C-------T---T-----A--T---A-C-T---G-ATA--CT---CG---AT-A-TG----TC-ATA-T--G--C-AA--T-A---A-TAAGT-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAAA--C--GT--G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T--T--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-A-T-C--G------TG-T--AAATT-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A--TAC--TT----C--A-TTT---T-CT-C--T---T-T----G--TCT-TG-CATTT----A-AG-TCTA---------------------------------T-GAT-A---T--A-A-AGC-TGT---C-T-T-ATTTATT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TA-T-AT----T-G-T-GTA-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-A-T---TA--G--GAAAA--AAT--AATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-
gi|9                          :    ctGGGTTTAT-TGAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-T-A-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-G-CACGGGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----CC-GGA----AAAAT--AA--A---TTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TA-T-A----------------------------C-CTAA-TT-A-A------------T-TGAACAA--ATG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-ACA-----CA-A--A---TTT--A--TGA-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--G-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GAA----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GC--CTC--CG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C-----------------------------T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--------C--GATTT---T-C--T--C---T-T----G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A--------------------------T-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-C---AT--G-C-----T-TTA----T----TT--AA-T-TCT-----T---G-AT-GG-AA---A--GTTA--TG-T-AT----T-G-T-GTA-G--TA--G-GCGGA-TA--C-G-A--ACA---C-TCC---AAG-G------T---------------TACGT-TG--T-ACA-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTC-AT--CA--C--AA-T-C--CTTCTC--T-TTACTTTTA


blockSeqs                     :              TC   T  C  GC TGA  A G   AC C    A  A   C C  T A A     A  A  A AT   ATC     TG      G  G  GT  GATGCCA TG   C GT  G   TC  AT T ATCCC     GTCA     TA  AC .     AC  AC     C . AAAATTAC   T  TAATGAATTAGGAGTCGTT                  A    T  T T TTTTAATATGA          TT   G C C T     C C   A T GATCTCAATTATATATCATTTTTTT                          TTT  T . AAGAATG CAT AATG  .  CAA A C .   T T A   AG   TGA  . G GGCTC TA AG  .  GT C  CT T GAA C   G G  C   . T    C G T C . AA A AGAG     AA AA  GGTCACTTT   C  T C T     G TG     TC   AG  A  CAAC   CATTACGTGG        T A G G TT T ATTA  . TG   T A CC T  . TG AACG  .  CT T C  G T    TTTT     AA A   TTCTCTT         G ATTA GA   C  C  G  GTCA T  T    A TA A A CTTCT  .  T     GATG  C  T   G AAT CA G T   A   TTT A . .  TTA  C  C C C G CGCAC    GAAGCAT    C   CAAAA      TT  T CT  GA TT CGC .  G  G  CTG T     AA  G G ACTGCC  C C   AG    AG G  G  T  C  CG   .   AT      .    TT   T TA A   A  A T .  T     C  GA A C A A TAA  AC TA     .  ATGA    CG AA .  AAT   C  AT     C  CA  .  G   . A AA   A  TG G
blockSeqs                     :              C    .  .  C  .    . .   .  .    .  .   . .  . . A     A  A  . C    AT      GG      G  .  .   .       T    G G   .   CC  .  . ATCCC     A        TA  .  .     C   CT     . . .          T  TATAATGAAGAGGTGCTTT                  .    .  . . ACTTAG               .    G . . .     . .   . C CAAAGTTTATTGATTTCATT                               .    . . C       .   A     .  .   . G .   . . .   A    C    . . G     C  AA  .  .  .  .  . .   .   G .  .   . C    . . . . . .  A .        .  G   CCG         G  . C .     . TC     .    .   .  .      ACAGCATATG        . . . . A  . AA    . TG   T . C  .  . .  AA    .  G  . A  G .    TTT      T  .   TGCTCTA         . .    .    C  .  G  C    .  .    . .  . . T      .  .     TG    .  .   A C   .  C C   C   T   . . .  .    .  . . A . GGG      TGGA       .   TTATT      .   T GT  .  .  .   .  .  .  C   .     .   . . TA      . .   GG    G  G  G  .  G  GA   .   AT      .    G    . G  .   .  . G .  C     C  T  . . C . A    .  A      .  TT      .  .  .  AA    .  C      .  C   .  A   . . .    A  .  .
blockSeqs                     :              C    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  C  . A    AT      CT      G  .  .   .       .    T .   .   C   .  . CTC       .        .   .  .     C   T      . . .          .  TTAATTGGAAGATGGTGCT                  .    .  . . ACTTAG               .    . . . .     . .   . . TAGAATATACAATGTAATT                                .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   T    .    . . T     .  AC  .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  A .        .  .   TGA         .  . . .     . T      .    .   .  .      ACGGATCTG         . . . . .  . .     . A    . . C  .  . .  T     .  .  . .  . .    TTT      .  .   TGCTCTA         . .    .    .  .  T  C    .  .    . .  . . T      .  .     GG    .  .   . A   .  . C   .   .   . . .  .    .  . . . . GAG      GGTT       .   TG         .   T CT  .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . TT      . .   G     G  .  G  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  TT      .  .  .  .     .  .      .  C   .  .   . . .    C  .  .
blockSeqs                     :              C    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  C  . G    TA      T       G  .  .   .       .    A .   .   C   .  . CC        .        .   .  .     C   C      . . .          .  ATTATGAAGAGGCAGCACT                  .    .  . . ATAGG                .    . . . .     . .   . . TAAACAAATTTCTATGAT                                 .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   T    .    . . T     .  AT  .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   CG          .  . . .     . T      .    .   .  .      ACGGGT            . . . . .  . .     . .    . . C  .  . .  .     .  .  . .  . .    TTT      .  .   TCCTTT          . .    .    .  .  .  C    .  .    . .  . . T      .  .     GC    .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GGC      TGG        .   T          .   T T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . TT      . .   G     G  .  G  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  AT      .  .  .  .     .  .      .  A   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :              C    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  A  . A    AT      T       G  .  .   .       .    G .   .   .   .  . CC        .        .   .  .     C   C      . . .          .  ATTATGAAGAGGCAGCACT                  .    .  . . ATTG                 .    . . . .     . .   . . ACAAATTTATTGATTAT                                  .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . T     .  AA  .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   CA          .  . . .     . T      .    .   .  .      AACGGG            . . . . .  . .     . .    . . C  .  . .  .     .  .  . .  . .    TTT      .  .   TCGTCT          . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . T      .  .     CT    .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . AGG      GGG        .   T          .   A T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . TT      . .   G     T  .  G  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  AT      .  .  .  .     .  .      .  T   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :              C    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  A  . A    AT      G       G  .  .   .       .    G .   .   .   .  . CT        .        .   .  .     C   C      . . .          .  GAATATGAGAGGGTGTCT                   .    .  . . ATTG                 .    . . . .     . .   . . ACAAATTTATGATTTAT                                  .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  AA  .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   CG          .  . . .     . T      .    .   .  .      AGCGGG            . . . . .  . .     . .    . . T  .  . .  .     .  .  . .  . .    TTT      .  .   TTCTCA          . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . T      .  .     TG    .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GC       GTG        .   T          .   T T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . TT      . .   G     T  .  C  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  TT      .  .  .  .     .  .      .  T   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :              C    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  A  . A    AT      G       G  .  .   .       .    C .   .   .   .  . CC        .        .   .  .     C   C      . . .          .  TAATAATGAAGAGGTGCT                   .    .  . . ATGA                 .    . . . .     . .   . . CAAATTAATGATTTAT                                   .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  TA  .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   TT          .  . . .     . T      .    .   .  .      ACGGCG            . . . . .  . .     . .    . . C  .  . .  .     .  .  . .  . .    TTT      .  .   ATCTC           . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . T      .  .     GG    .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GG       GG         .   T          .   T T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . TT      . .   G     G  .  G  .  .  G    .   G       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  TT      .  .  .  .     .  .      .  C   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :              C    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  A  . A    A       G       G  .  .   .       .    . .   .   .   .  . CC        .        .   .  .     C   C      . . .          .  CTATATGAACGAGATGC                    .    .  . . ATGA                 .    . . . .     . .   . . AACATTTATGATGTAT                                   .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  G   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   TG          .  . . .     . T      .    .   .  .      ACGGGT            . . . . .  . .     . .    . . C  .  . .  .     .  .  . .  . .    TTT      .  .   TCTCT           . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . T      .  .     G     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GG       GA         .   T          .   T T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . CT      . .   G     .  .  G  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  AT      .  .  .  .     .  .      .  A   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :              T    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  A  . A    A       G       G  .  .   .       .    . .   .   .   .  . CT        .        .   .  .     C   C      . . .          .  ATAATGAGAGGCGCT                      .    .  . . ACT                  .    . . . .     . .   . . CAAATTTATGATTTAT                                   .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  A   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   CG          .  . . .     . T      .    .   .  .      AGAGG             . . . . .  . .     . .    . . C  .  . .  .     .  .  . .  . .    TA       .  .   TGCCT           . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . T      .  .     G     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . AG       CT         .   T          .   T T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . CT      . .   G     .  .  G  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  AA      .  .  .  .     .  .      .  C   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :              .    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  A  . A    A       G       .  .  .   .       .    . .   .   .   .  . CC        .        .   .  .     C   .      . . .          .  TAAAATGACTACAAT                      .    .  . . ATG                  .    . . . .     . .   . . AAACACATTTTTGAT                                    .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . T     .  A   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   CG          .  . . .     . T      .    .   .  .      ACGGG             . . . . .  . .     . .    . . T  .  . .  .     .  .  . .  . .    CT       .  .   CATCT           . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . C      .  .     G     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GG       GG         .   T          .   T T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . TT      . .   G     .  .  G  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  AA      .  .  .  .     .  .      .  T   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :              .    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  C  . A    A       G       .  .  .   .       .    . .   .   .   .  . C         .        .   .  .     .   .      . . .          .  TATACATGTA                           .    .  . . TTG                  .    . . . .     . .   . . ACAAATTTATGATTT                                    .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  A   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   GG          .  . . .     . G      .    .   .  .      ACGGG             . . . . .  . .     . .    . . C  .  . .  .     .  .  . .  . .    TT       .  .   TCTCT           . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . C      .  .     G     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GG       GG         .   A          .   T T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . TT      . .   G     .  .  G  .  .  G    .   T       .    T    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  AT      .  .  .  .     .  .      .  T   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :              .    .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  C  . .    T       G       .  .  .   .       .    . .   .   .   .  . C         .        .   .  .     .   .      . . .          .  TATA                                 .    .  . . TTG                  .    . . . .     . .   . . TGAATAACATGGTAT                                    .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  C   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   GG          .  . . .     . G      .    .   .  .      ACGGG             . . . . .  . .     . .    . . T  .  . .  .     .  .  . .  . .    TT       .  .   TCCCT           . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . T      .  .     G     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GG       GG         .   T          .   T T   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . T       . .   G     .  .  G  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  AT      .  .  .  .     .  .      .  .   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :                   .  .  .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .  .  . .    T       .       .  .  .   .       .    . .   .   .   .  . C         .        .   .  .     .   .      . . .          .                                            .  . . AC                   .    . . . .     . .   . . CATACAAATTTATA                                     .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  A   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   TG          .  . . .     . T      .    .   .  .      ACGG              . . . . .  . .     . .    . . T  .  . .  .     .  .  . .  . .    TT       .  .   TCTCT           . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . .      .  .     G     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . AG       GG         .   T          .   T .   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . T       . .   G     .  .  G  .  .  G    .   A       .    G    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  AT      .  .  .  .     .  .      .  .   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :                         .  .    . .   .  .    .  .   . .  . . .     .                            .  .  .   .       .    . .   .   .   .  . C         .                                                                                                                        .    . . . .     . .   . . CATACAAATTTATA                                     .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  A   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   CG          .  . . .     . T      .    .   .  .      GGG               . . . . .  . .     . .    . . C  .  . .  .     .  .  . .  . .    TT       .  .   TTCT            . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . .      .  .     G     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GG       GG         .   T          .   . .   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . C       . .   G     .  .  .  .  .  .    .   A       .    .    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  T       .  .  .  .     .  .      .  .   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                . .   . . CATATATCTATAA                                      .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . G     .  A   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   C           .  . . .     . T      .    .   .  .      CGG               . . . . .  . .     . .    . . .  .  . .  .     .  .  . .  . .    TT       .  .   TCCT            . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . . .      .  .     G     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . GC       GG         .   T          .   . .   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . .       . .   .     .  .  .  .  .  .    .   C       .    .    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  .       .  .  .  .     .  .      .  .   .  .   . . .    .  .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .    . . .       .   .     .  .   . . .   . . .   .    .    . . .     .  A   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   C           .  . . .     . .      .    .   .  .      TAA               . . . . .  . .     . .    . . .  .  . .  .     .  .  . .  . .    .        .  .   TCTC            . .    .    .  .  .  .    .  .    . .  . .        .  .     .     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . G        GG         .   T          .   . .   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . .       . .   .     .  .  .  .  .  .    .   .       .    .    . .  .   .  . . .  .     .  .  . . . . .    .  .      .  .       .  .  .  .     .  .      .  .   .  .   . .             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 . .   . . .   .    .    . . .     .  .   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .        .  .   G           .  . . .     . .      .    .   .  .      TAA               . . . . .  . .     . .    . . .  .  . .  .     .                                                                                                      .     .     .  .   . .   .  . .   .   .   . . .  .    .  . . . . G        GA         .   T          .   . .   .  .  .   .  .  .  .   .     .   . . .       . .   .     .  .                                                                                            .                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    . . .     .  .   .  .  .  .  . .   .   . .  .   . .    . . . . . .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .   .   . . .  .    .  . . . . A        GC         .   .          .   . .   .  .  .   .  .  .  .   .                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .    .  . . . . .        G          .   .          .   . .   .  .  .   .  .                                                                                                                                                                                                             


blockSeqCons                  :                                          ****                          A*        AT**                              **                                ****            ***       C***                     TAATAATGAAGAGGCGCT******************             ATTG************     **                         ACAAATTTATGATTTAT*********************************                            **         ***     **  **   ***                   **                                                               **  CG********                 T****           **        ACGGG************                                                **      **        TTT*****        TCTCT**********                                            T****  **                                                                  GG*****  GG********     T********                                                 TT*****       G***              **          A****   ***                       **                                    **                                         **
originalCons                  :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAA-TT-A-A-------A----T-GGAACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-A-----CA-A--A---T----A--N-A-----T--T---T-----A--T--T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTC-G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA--TT----C--G-TTT---T-C--C--T---T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-T----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TT--AATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-A-----T-G-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
finalCons                     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAAAT--AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAAC---TTA-A-A--------ATG-ACTAATAATGAAGAGGCGCT------------------C-CTAA-TT-A-AATTG------------AACGA--AAG-A-A-A-ATTAC-A-AAC-A-AACAAATTTATGATTTAT---------------------------------T---CA-T-T-------T---T----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G-A----AAAAA--C--GTCG--------TA-CC-C-A-GCTCA-AT----GT--CTC--TG--A----AAAACGGG------------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAATTT-----C--G-TTTTCTCT----------T-T----G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-A-TT----AA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-CGG-----ATGG--------T-TTAT--------TT--AATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA---A-CGTTA--TG-T-ATT-----G-T-GTAG---TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACAA----CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                  1111                                   1         11       2222222   1111                      1111       11111111      222222222222222222222222222222222222              1111111111                               1111       1111                     222222222222222222                                           11                  111111                                                                     1111111111                                           111111    1111111                                          1111                             11                                 1111                                 2222                                                                1111111111     111111111      11                                     11111              11                                                                                                                                     11                                  
lowQualScore                  :              55   2  2  66 444  2 2   33 8888 2  2   2 2  2 2 8     5  55 2 33   2222    999 0   6  2  33  8888888 99   8 66  2   22  33 2 6666666   3333     77  33 555   33  3333   2 2 00000000   5  000000000000000000000000000000000000 3      3 2   9999999999  2  2  66 444  5  444 2     2 2222     2 1111   33 2   66 2 2  33 555555555555555555 33 2  2 2 2  88888 33 444 2 4 333 2 2 55  22   777  2 2 55555 111111 22 22 2  22 2 333 2   4 2  2   2 4    2 2 2 2 2 22 99 4444      77  2222222222  6  2 2 2     2 44444  33   33  55 4444   111111  2 5555555 2 2 2 2 55 2 7777  2 88   4 2 22 2  2 33 0000  33 55 4 55 4 2    77   2 4 00  2 4 55  777 55 2 33   4  2  7  2222 2  2    2 33 4  77777  33 2     0000  2  2   6 666 33 6 6   4   555 2 2 2  333  2  2 2 6 2 9999999  3333333333 2   000000000    5 66  22 22 333 2  2  2  2     33 33 33  55555  2 2   5555  66 6  1  2  77 333  2   66666   444  44   2 55 2   2  2 5555 4     4  55 2 2 4 2 666  33 55     33 4444    33 66 2  444   2  55     2  33  33 4   2 2 33   7  33 2         
lowQualScore                  :              ..   .  .  .. ...  . .   .. .... .  .   . .  . . .     .  .. . ..   ....    ... .   .  .  ..  ....... ..   . ..  .   ..  .. . .......   ....     ..  .. ...   ..  ....   . . ........   .  .................................... .      . .   ..........  .  .  .. ...  .  ... .     . ....     . ....   .. .   .. . .  .. .................. .. .  . . .  ..... .. ... . . ... . . ..  ..   ...  . . ..... ...... .. .. .  .. . ... .   . .  .   . .    . . . . . .. .. ....      ..  ..........  .  . . .     . .....  ..   ..  .. ....   ......  . ....... . . . . .. . ....  . ..   . . .. .  . .. ....  .. .. . .. . .    ..   . . ..  . . ..  ... .. . ..   .  .  .  .... .  .    . .. .  .....  .. .     ....  .  .   . ... .. . .   .   ... . . .  ...  .  . . . . .......  .......... .   .........    . ..  .. .. ... .  .  .  .     .. .. ..  .....  . .   ....  .. .  .  .  .. ...  .   .....   ...  ..   . .. .   .  . .... .     .  .. . . . . ...  .. ..     .. ....    .. .. .  ...   .  ..     .  ..  .. .   . . ..   .  .. .         
lowQualScore                  :              88   9  9  33 777  7 7   77 3333 7  7   7 7  7 7 0     3  99 9 66   4444    333 6   7  7  77  7777777 00   7 33  7   77  77 7 3333333   0000     99  99 000   66  3333   9 9 44444444   7  999999999999999999999999999999999999 1      1 9   8888888888  7  7  33 777  3  777 7     5 2222     5 2222   22 4   55 4 4  22 333333333333333333 22 4  4 4 4  44444 22 111 4 4 999 2 2 33  88   999  1 1 00000 777777 99 99 1  99 1 777 1   2 1  1   1 2    1 1 1 1 1 99 22 5555      55  8888888888  7  2 2 2     2 77777  11   11  33 7777   111111  2 7777777 2 2 2 2 33 2 8888  2 33   4 2 77 2  2 11 0000  11 66 7 66 7 4    55   4 7 33  4 7 66  777 66 4 22   7  4  1  1111 4  4    4 22 7  33333  22 2     6666  2  2   7 111 11 7 3   2   888 1 1 1  555  0  0 0 0 0 7777777  5555555555 0   555555555    8 66  88 88 555 0  0  1  1     11 11 00  99999  2 2   8888  44 7  2  4  99 555  4   55555   111  11   4 66 4   4  4 3333 7     7  66 4 4 7 4 555  22 66     11 5555    22 55 4  111   4  66     4  88  22 7   4 4 44   5  44 5         
consensus                     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAATT-A-AAT-------T--GA-AC-GA--A---AG-AA---A-ATTAC-A----AACAA-A----CAA--A-TTT--A-T-GA--T-----T-------T-A--T--T-CA-T-T-TT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G--A----AAAAAC--GT-CG-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA-TTTC-G-T--TT-T-C--TC-T-T--T-G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA-ACGTT--A--TG-TA----TTG-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
Reference ( family-2091 )     :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-G-CGCGGGTA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGC-G---C---T--C-CTAATT-A-AAT-------T--GA-AC-GA--A---AG-AA---A-ATTAC-A----AACAA-A----CAA--A-TTT--A-T-GA--T-----T-------T-A--T--T-CA-T-T-TT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G--A----AAAAAC--GT-CG-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA-TTTC-G-T--TT-T-C--TC-T-T--T-G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA-ACGTT--A--TG-TA----TTG-T-GTA-G--TA--G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|1                          :                         --T---AA-T-TGA--CTGTTG-TT-TGA-T-TT-G-AGTTGTT-TTCTA-TA-AAATAT-ATTT-C-CGAGGGTG-TG--TT-------TT-GAT-G--TT-TCC--A---T-A----CC-GGTTAA-AAAAT--AG--AGAGCTA-CAAGAC-TTA-ATA--------ATG-ACACTA-T-A-AT--GGAA-GA-GGTTG---CACTT--C-CTAATCGA-AATCA-----T--GACAC-GAG-A---AG-AA---A-ATAAC-A----AACAA-AA---CAA--A-TTTTCA-T--A--TA----T-------T-A--TAAT-CA-TAT-CT----TAAGT---A-T-TCTAG-A-AACCTAGGCGT--ATCA-GG----A--A-A-CCGG--C-AA--T-A---G-AAA-T-G--CAGTA-ACCC-C-C-G-ACA--T--A----AAAAACC-GT-C--------T--CC-C-A-GCTCA-AAGGT-GT--CTC--TGGCA----AAA----A-TG---------A-A-A-T-C--G-T----TGAT--AAA-T-A-CG-TTGT--T----CCCCT--T-GAGC-A-TTGA-CTTT-C-TCATG-T-CAATCAT-T--T-G--ATA-TG-CC-AT----A-AG-TTTG-T--A-AC-----AATTA-TGCATG---CA-C---AC-A---C--AGA-AGC-TGT---C-TGTGAT---TT-AT-T-TGA-CAG-G---GT--GCGAT---T-TTA----TC---TTAAAT-TCT--A--T---GGAT-GG-AA-ACATT--A--TA-TAATC-TGG-T-GTA-GCGTA--GGCGAGA-TATTC-G-ACCACATCTA-CCCTAAAAG-GAC----T-ATC-AC-T-GCCG-TA-GT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAAAGAGT--TATT--T--ATAA---TAT-TA--TTTTT-ATC-AAACC-AAATT-C--CTT-TC--T-TTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                     gtggcgttcatgctatca-AAT-------T--GA-AC-AACAA---AG-GACACA-ATTAC-A----AACAA-A----CAA--A-TTT--A-TTGA--T-----T---------A--T--T-CA-T-T-TTAATGTA--T---G-CCT---G-A-AA-CTAGGCG---AT-A-GG----TTAA-G-T--G--C-AA--T-AGAAA-GAA-T-GT-CAA-ATGCCA-C---G-A-A--G--A----AAAAAA--AA-CG-------T----------TTT------T-AC--CTC--TG--ACAACAAA----A-GA-G-----G-A-T-A-T-C--G-TAA--CG-T--AAA-T-A-CG-CA-T--CAACGTA--T--T-A--C-A-TTAA-TATAAG-T--TTAT-C--TC-T-TATTAG--ATA-TG-CA-ATGTCAA-AG-TGTGAT--T-AT----TCA--A-TG-ACGATGCA-TT-GAT-A---CCAA-A-GGC-TGTTTTC-T-T-AT---TC-AT-T-TCA-C-C-GCACATT-G-G-----TCTTA----CAAAATTAATT--CTGAA--G---A-AT-GG-AA-A-GTT--AAATG-TG----ATG-T-GTA-G--GA--G-CGGAG-TA--CCG-AC-ATA-----CCC---AAG-GAC-T--T-ATCAACAT-G--G-TACGT-TG--G-A-A-G-T---TAACTA-GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TAATATTTT-ATC-AC--C-AAA-TACAACTTATC--T-TTACTTTTgct
gi|11                         :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AC--TTGAAA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-TTA-AATC-AAA-A---ATT---CGCGGGTA-TG--TT-------TT-GAT-G--TTGTCC--AAATT-A----CTCGGT----AACAT--AA--A---CTC-CAAA-C-TTA-A-A--------ATG-AT----AT-A-AT--G-A--GA-GGC-G---C---T--C-GTATAT-A-AATA------G--GA-AC-AA--A---AG-AA---A--TTACCG----AACAA-AAA--CAC--A-TTT--T-T-GA--T-----T-------T----T--T-CA-T-T-TTA---TA--T-----C-T---G-A-A--CT--GCGC--AT-A-GT----T--A---T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAA-A-ACCACC-C-G-A-G--G--A----AAAAAC--GT-CA-------TACCC-C-A-TCTCA-A---TGGT--CTC--TGA-A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-G-TGC--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--TG-T-AC-C-A-TTAA-TTTC-G-T--TT-TCC--TT-T-T--T-G--AAA-TGCCA-TT----C-AA-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATT--GC--TT-GAT-A---C--AGA-AGCATGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-CGG-G---ATG-G-G-----T-TTA----T----TTAGTT---T--A--T---G-AT-G
gi|12                         :  gactGGCTTTAT--AAT-AC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TTATGA-TCATTG-A-TAGTT-ATA-A-TATAAG-AT-AATTTG-CGCGG-TAGTG--TT-------T--GATCG--TT-TCCTCAA--TTA----CC-GGG----AAAAT--AA--A---CTCACA-----TTA-A-A--------ATG-AC--GAAT-A--T--G-AG-AG-GGT-GT--C---T--C-CTAATT-ATAAC-------T------C-GA--A---AG-CA---ATAATAC-ACGATACTAA-A----CAA--A-TTTCTA-T-GA--T-----T-------T-A--T--TTCA-T-T-T------A--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG----T-A-GT----T--A-A-T--G--CCAA--TTA---ACGAA-T-AT-CAG-A--CCA-C-C-G-A-A--G--A----AGAA-C--GT-C---------A-CCTC-A-GCTCA-A---T-GT--CTCAGTG--A----AAA----AACG-G-----G-A-T---T-CTTG-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--TTA--C-A-TTTG-CTT--G-TA-TT-T-C--TC---------------------------------TTG-T--G-AT--------------ATG--G-------AT-A----------AGG-TGT-------T-AT---TT-ATCT-T-A-C-G-C---GT--G-G-----T-TAC----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA-AC--T--A--TA-TAACTGCCG-T-ATG-G--TA--G-tgactttat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              gctC-A----TACAACA----TAT--A-TCT--A-T-AA--T-----TGT-----T-A--A--G-AA-T-G-TT----TA--C---AAC-T---G------CT--GCG---AT-A-GT----T--A-AGT--G--C-AA--T-A---A-AGA-T-GT-CAG-A-ACCA-CGC-G-A-A--G--A----CAAT-C--GT-CG-------TA-CC-CCA-GCTCAGA---T-GT--CTC--TG--A----AAA----AGCG-G-----G-A-T-AGT-C--G-T----TG-T--AAG-T-A-CG-TT-T--TT---CC--T--T-A--C-A-TTAC-TTTC-A-T--TT-T-CG-TC-T-TG-T-GGAATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--CGA-TTTGAT-A---C--A-A-AGC-TGTT--C-C-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----CTAATT--CT--A--T---G-AT-GGGAA-ACGTT--A--GA-TA----TAG-T-GTAAG--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--GTTACGT-TG--A-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--A----TATT--T--A-AA---TAT-TA--A-TTT-ATC-AA--CGAAA-T-A--CTT-TC--TGTTACTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                           -------T--GA-AC-AA--A---A--AA---A-ATTAC-A----AACAA-A----CAA--A-TTT--A-T-GA--T-----T------------T--T-TA-T-T-TT----TG--T---A-T-G---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----T--T-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAT-G-ACCA-C-C-G-A-A--GAAA----AAAAAC--GT-TT-------T-----------TCG-----------CTC--TG--A----AAA-------G-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----CG-T--AAA-T-ACCG-CT-T--CAA--CG--T--T-A--C-A-TTAA--TTA-G-T--TT-T-C--TC-T-C--T-G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-AT----T-A--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-ATAGC-TGT---C-T-T-TA---TT-AT-T-------------AC--C-T-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-ATGGG-AA-ACGTT--A--TG-TA----TTG-T-GTAGG--TAG-G-CGGGA-TAC-C-G-AC-AT----A-CCC---AA--GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TAC---TGT-T-A-A-G-T---TA--T--G-AAA--ATT--TATT--T--A-AA---GAT-TA--ATTTTCATA-AA--A-AAA-T-C----T-TC--T-TTACTTTTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --A-TTT--A-T-GA--TATAGATG------T-A--T--T-CA-T-T-TT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---GT-A-GG----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G--A----AAAA-C--GT-TG-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--A---T-A-TG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA-TTTC-G-T--TT-T-G--CC-T-T--T-G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA---------TTAAAT-TCT--A--T---G-AT-GG-AA-ACGTT--A--TA-TA----------GTA-G------A-CAGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAT-CTAT-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-TTAATA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|16                         :                  T-GC-ACGCT---AA-T-TGAACC----GATT-TGA-T-AT-G-A-TAGTC-TTC-A-TA-AAA-AT-AATT-T-CGCGTGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGCGTCAAAAAT--AAACA---CTA-CAA--T-TTACA-AAAAATTACATG-AT--TAATGA-AT--T-AG-GA-GTC-G---T---T--T-CTAATT-T-AATTTTAATAT--GA-AC-CG--ATTTAG-AA---A-ATTAC-A----AACAA-GATCTCAATTA-TAT--A-T-CATTT-----T-------T-T--T--T-CT-C-T-TT----TA--TCAAA-CGT---G-A-A--CTA-GCG---AT-A-AGGCTCT--A-C-A--G--C-AACTT-A---A-GAA-TGGT-CAG-ACACCA-C-C-A-A-A--G--AAGAGAAAAAC--GT-GGTCACTTTTA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GTTCCTC--TG--T----AGACATTA-CGTG-----G-A-TAA-T-CA-G-TATTATA-C--AAA-TAA-CG-TT-T--T----CC--
gi|17                         :      GGGTTT---CAAT-GCCACC-T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TG-GAA-ATCAATT-T-CGCAGGTA-TG--TT-------T--GATTG--TT-TCC--AA--T-A----CC-GGT----AAAAT--AA--A---CTA-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TA-T-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---TTTC-CTAATT-T-AAA-------T--GA-AC-GA--A---AG-AA---A-ATTAC-A----AACAA-A----CAA--A-TTT--A-T-GA--T-----T-------T-A--T--T-CG-T-TCTT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCG---AT-A-GG----TA-A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-A-T-A--A--G----AAAAAC--GTCCG-------TACCC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GC----G-A---A-T-C--G-T----TG-TA-AAA-T-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-TTACTTTTC-ATT--TT-T-C--TCTT-T--T-G--ATA-TG-CA-TT----ATAGTTTTG-T--T-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C---G-A-C--G--A----AAAAAC--GT-C---------A-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--CTC--TG--A----AAA------CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-CG-TT-T--C----CT--T--T-A--C-A-TTAC-TTTC-A-T--TT-TTC--TC-A-T--T-G--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCAT---GCA-TT-GAT-AAATA--A-A-AGC-TGT---T-T-T-AT---TT-AT-T-TAA-C-GAG---AT----G-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT--G-AA-ACGTT--A--TA-TA-----TG-T-GTA-G--TAG-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-CG-T-ATC-AC-T-G--G--ATGT-TG--TAA-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TAC-ATTTT-GAT-TA--CAAAA-T-T--CTTATC--T-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgAA--A-TGCATG---CACTT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---CAT-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-GC--AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA--CGT---A--TGGTA----TTGCT-GTA-G--TA--G-CGGGA-TAG-C-G-AC-ACA---G-CCC---AATTGACTC--T-ATC-AC-TTG--GCTACGT-TG--T-A-AAG-TA--TA--T--GCTAA--A-T--TATT-----A-AA---TATCTA--ATTTT-ATCACA--C-AA--T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAacactct
gi|2                          :        ttaTAT-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-A-A---GTT-TTA-A-TA-AAA-TA-AATT-G-CG--AGTA-TG--TTGATGCCAT--GATAG--TT-TCC--AA--T-A----CT-GGT----TAAAT---A--A---CTT-CGA----TTA-A-A--------ATG-AC--T--T-A-ATTGG-AA-GATGGT-G---C---T--C-CTAATT-A-AAT-------T--GA-AC-GA--A---GA-AA---A-ATTAC-A----AAC-A-A----CAA--AGTTT--ATT-GA--T-----T-------TCAT-T--T-CATT-T-TT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GCGTGAAT-AGGG----T--A-ACT--GGTC-AA--T-A---A-GAAGT-GT--AG-A-ACAA-C-C-GCA-A--G--A----AAAAAC--GT-CG-------TAGTC-C-ATGCTC--------GT--CT-------G----ACA----A-CA-GCATATG-ATT-A-T-C--G-A----TG-T--AAA-T-A-TC-TT-TTGT----CA--T--T-A--C-ATTTAA-TTTC-G-T--TT-C-A--TC-T-T--T-G--ATA--G-TG-TG----A-AG-TTTG-T--T-ATCTTCTAA--ATTGC-TC--TCA-TT-TAC-A---C--G-A---------------T-AT---TT-GT-T-T-G-C-A-G---A---G-AAGCATC-TCA----TG---TTAATTCTTT--ATTT---T-AT-GG-AA-CTGATCGA--TA-GA----ACG-TCGTA----TA--G--GCGATTA--C---AC--CA---A-CTC---AAG-G-C-C--T-GTC-AC-TGG--G-TCCGT-TGGAT-A-G-GAA---TA--T---AAAG--AATGATATT--T--A-AAAATTAT-TA--ATGTT-AAT-CA--C-AAA---G--CTT-TCTGT-TTACTT
gi|20                         : gactggGGTTT-C-CAAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--T----G-TT-TGA-T-AT-GAA-TAGTT-TT--A-T--AAA-AT-AA-T-G--ATGGGTA-TG--CT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--GGTA---AAAAT--AA--A---CTC-CAA--CTTTA-A-A--------CTG-GA--TAGT-A-AT--G-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tt-T---A-A-A--CT--G-G---AT-A-G-----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA---C-G-A-C--G--A----AAAcaataagaatgtcagaaccacgacgaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttggtttccaatgcactaattgatgtttgatatgaatagttttataaaataatgatgggtatgcttgatggtttccaataccggtaaaaataaactccaacttT---TT-AT-A-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA-ACGTT--A--TA-TA----TTG-T-GTA-G--TAG-G-CAGGA-TA--C---AC-ACA---A-ACC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-C-G--G-TACGT-TT--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--------ATT--T-----------------ATTTC-AT--CA--C-AAA-T-C--C-T-TC--T-TTACTTTTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AGC-TAT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-G-----T-TTA----A----TTAATT--CT--A--T---G-AT-GG-GA-ACGTT--G--TA-TA----TTG-T-GTA-G--TA--GGCGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--T--GAAAA--AAa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TG--ATTTT-ATC--A--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTAaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggacacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGCATG---CA-TT-GATGA---C--A-A-AGCCTGT---C-T-T-AT---TT-AG-T-G-AGCAG-G---GT--GTG-----T-TTATTATT----TTAATTGTCT--A--TCGCG-AT-GG-AACACGTa
gi|25                         : ttatcGGGTTTAT-CATT-GC-AA--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-Tgttataat
gi|26                         :                                                                                             ggactGTA-TG--TT-------T--GATGG--TT-TCC--AA--T-AC---C--AGT----AAA
gi|3                          :      GGGTTTAT-CAAT-GC-AT--T---AA-T-TGA--C----G-TT-TGA-T-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-T--AAA-AT-AATT-G-CACAGGTA-TG--TT-------T--GATCG--TT-TCC--AA--T-A----C--CGT----TAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--T-AT-ACAT--G-TA-------------------C-CTAATT-A-AAT-------T--GA-AC-AA--A---AG-TA---A-ATTAT-A----AACAA-A----CAA--A-TTA--A-T-GA--T-----T-------T-A--T--T-CA-T-T-TT----TA--T---A-C-T---GTA-A--CT--GTG---AT-A-GT----T--A-ATT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GTCCAG-A-CACA-C-CTG-A-A--GA-A----AAAAACG-GT-CG-------TA-CC-T-A-GCTTC-A---TCGT--CTC--TG--A----AAA----A-CG-GATCT-G-A-T-A-T-C--GTT----TG-T--AAATT-A-CGTTT-T--T----CT--T--T-A--C-A-TTAA--TTC-G-T--TG-T-C--TC-T-T--T-G--ATA-T---A-TT----C-AG-TGTG-TTAT-AT----TAA--A--ATACT--GCA-TT-GAT-AC--C--ACA-AGC-TGT---C-T-T-AT---TTCAT-TCT-A-C-G-G---ATTGG-A-----G-TTA----------TGA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-GA-ACGTT--A--TG-TA----TTG-T-GTA-G--TAAGG-CGGGA-TA--C---AC-ACA---T-CCC---AAG-GAC-T--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-G-T---TA--C--GAAAA--ATT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATA-CA----AAA-T-C--CTT-TC--T-TCACTTTTA
gi|4                          :   actGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---GA-A-TGA--C----G-TT-TGACT-AT-G-A-TAGTT-TTA-A-TA-AAA-AT-AATT-GGCGCGGGTA-TG--TT-------TTGGAT-G--TT-TCC--AA--T-A----C--AGT----AAAAT--AA--A---CTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAAT-A-AT--G-AA-GA-GGT-G---C---T--C-CTAATT-A-AAT-------G--AA-AC-GA--A---AG-AA---A-ATT--------------A----CAA--A-TTT--A-T-GA--A-----TAACATGGT-A--T--T-CA-T-T-TT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---GT-A--G----T--A-A-T--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-GC-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--G--A----AAAAACAAGT-TGA------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GT--TTT--TG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--T--TAA--C-A-TTAA--TTC-G-T--TT-T-C---C-T-T--T-C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-TGCATG--GCA-TT-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-G---AT--G-G-----T-TTA----T----TAAATTCTCT--A--T---G-AT-GG-AA-ACGTT--A--TG-TA------G-T--TA-G--T---G-CAGGA-TA--T-GAAC-AC----A-CCC---AAG-GAT-C--TAATC-CA-T-G--G-TACGT-TG--T-A-GCA-T---TA--TTAGAAAA--AAT--TATTCGT--A-AA---TAT-TA--ATTTT-ATC-CA--C-AAA-T-C--CTT-TC--T-TTACTTTTA
gi|5                          :         TTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAA--A---CTC--AA----TTA-A-A--------ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAATT-A-AAC-------TTAGA-AC-GA--A---AGGAA---A-ATTAC-ACA--AACAT-A----CAA--A-TTT--A-T-A-------------------------T-CA-T-T-TC-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-TA-TAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G--A----AAAAAC--GT-GG-------TA-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAA-TTTC-G-TA-CT-G-C--TC-TAT--T-G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAAT----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA-ACCGT--A--CT-TA----CTG-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTACT
gi|6                          :        aTTTAT--AAT-GC-AC--T---AA-A-TTA--C----G-TT-TGA-T-A--G-G-CAGTTATTA-A-CA-AAT-A--AATT-G-C-CGG-TA-TG--TT-------T--GAT-G--TT-TCCC-AA--T-AATCCC--GGT----AAAATTAAA--A---CTC--AA----TTA-A-A--------ATGTAC----AT-T-AT--G-AA-GA-GGC-AGCAC---T--C-CTAATT-A-AAC-------TTAGA-AC-GA--A---AGGAA---A-ATTAC-ACA--AACAT-A----CAA--A-TTT--A-T-A-------------------------T-CA-T-T-TC-----A--T---A-C-T---G-T-A--CTT-GCG---AT-A-GG----T--A-AAT--G--C-AA--T-A---A-GAA-T-TA-TAG-A-AC-A-C-C-G-A-A--G--A----AAAAAC--GT-GG-------TA-CC-C-A-CTTCA-A---G-AT--TCT--TG--A----AAA-------T-A-----A-A-T-G-T-T--G-T----TC-TTGAAA-T-A--A-TT-T--T----TC--C--T-A--CGA-ATAA-TTTC-G-TA-CT-G-C--TC-TAT--T-G--ATACTG-CAGTC----A-AG--TTG-T--TAAT----CAA--A-TGCAT---GCA-TT-CATAA---C--A-ACAGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C---G---AT--G-GTT---T-TTT----T----TTAATT-TCT--G--T---G-AT-TG-AA-ACCGT--A--CT-TA----CTG-T-GTA----TAT-G-CG----TA--C-G-AC-ACA---ATCCC---AA---AT-C-----TC-AC-T----G-TACGTCTG--T-A-A-G-T---AT--T--GGAAA--AAA--TATT--TAAA-AA---TAT-TA--AATTT-AAT-CA--C-AAA-T-C--AGT-TC--T-TTAC
gi|7                          :     aGGGTTTAT-CAAT-GC-AC--T---AAAT-TGA--CC---G-TT-TGA-T-AT-G-AATAGTT-T-A-A-TA-AAA-A--AATT-G-CGCGG-TA-TG--TT-------T--GAT-GGTTT-TCCCCAA--T-A----CT-GGT----AAAAT--AA--A---CTT--AA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TAA--A-AT--G-AC-TA---C-A---A---T--GACTAATA-A-AAT----------GA-ACCGA--A---GA-AA---A-ATTAC-A----A-CAT-T----AGA--A-TAT--A-C-AA--T-----G-------T-AATT--T-CA-T-T-TT----TA--T---A-C-T---G-A----CT--GTG---GT-A-GG----T--T---T--G--C-AA--T-A-----GAA-T-GC-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-AAAG--A----AAAAAC--GT-TG-------TA-CC---A-GCTCA-A---T-GT--TTC--TG--A----AAA----A-CG-G-------A-T-A-T-C--G-T----TG-T--AAA-T-A-TG-TT-T--T----CC--TCTT-T--C-A-TTAA-TTTT-G-T--TT-T-C--CC-T-T--T-C--ATA-TG-CA-TT----A-AG-TTTG-T--T-AT----TAA--A-T-CATG---CA-TT-GAT-----C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TC-AT-T-T-A-C-A-----AT--G-G-----T-CTA----T----CAAATT--CT--A--T---G-AT-GG-AA-TCGTT--A--TG-TA----------GTA-G------G-CAGGA-TA--T-G-AC-ACA---A-CCC---AAT-GAT-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T----------------------A--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-AA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-C--CTT-TC----TTACTTTTA
gi|8                          :  ggctGGGTTTATTCAATTGC--C--T---AA-CGTGA--C----G-TT-TGA-C--T-A-G-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-CTCGCGG-TA-TGGTTT-------T--GAT-G--GT-TCC--AG--T-A----C--GGT----AAAAT--AA--A---CTA-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AT--CTAT-A--T--G-AACGA-GAT-G---C------C-CT--TT-A-A-T-------T--GA-AC-GA--A---AG-AA---T-AT-AC-A----AACAA-A-----AC--A-TTT--A-T-GA--T-----G-------T-A--T--T-CA-T-C-TT-----A--T---A-C-T---G-ATA--CT---CG---AT-A-TG----TC-ATA-T--G--C-AA--T-A---A-TAAGT-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GA-A----AAAAAC--GT--G-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T--T--CTC--TG--A----AAA----A-CG-G-----GTA-T-A-T-C--G------TG-T--AAATT-A-CG-TT-T--T----CC--T--T-A--C-A-T--A-CTTC-A-T--TT-T-C--TC-T-T--T-G--TCT-TG-CATTT----A-AG-TCTA--------------------------------T-GAT-A---T--A-A-AGC-TGT---C-T-T-ATTTATT-AT-T-T-A-C-G-G---AT--G-A-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT--A--T---G-AT-GG-AA-ACGTT--A--TA-TA----TTG-T-GTA-G--TAG-G-CGGGA-TA--C-G-AC-ACA---A-CCC---AAG-GAC-C--T-ATC-AC-T-G--G-TACGT-TG--T-A-A-A-T---TA--G--GAAAA--AAT--AATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTT-AT--CA--C-AAA-T-
gi|9                          :    ctGGGTTTAT-TGAT-GC-AC--T---AA-T-TGA--C----G-TT-T-A-T-AT-G-A-TAGTT-TTC-A-TA-AAA--T-AATT-G-CACGGGTA-TG--TT-------T--GAT-GG-TT-TCC--AA--T-A----CC-GGA----AAAAT--AA--A---TTC-CAA--C-TTA-A-A--------ATG-AC--TA-T-A----------------------------C-CTAATT-A-A-T-------T--GA-AC-AA--A---TG-AA---A-ATTAC-A----AACAC-A----CAA--A-TTT--A-T-GA--T-----T-------T-A--T--T-CA-T-T-TT----TA--T---A-C-T---G-A-A--CT--GTG---AT-A-GG----T--A-A-T--G--G-AA--T-A---A-GAA-T-GT-CAG-A-ACCA-C-C-G-A-A--GA-A----AAAAAC--GT-CG-------TA-CC-C-A-GCTCA-A---T-GC--CTC--CG--A----AAA----A-CG-G-----G-A-T-A-T-C-----------------------------T--T----CC--T--T-A--C-A-TTAA----C-GAT--TT-T-C--TC---T--T-G--ATA-TG-CA-TTC---A-AG-TTTG-T--T-A-------------------------T-GAT-A---C--A-A-AGC-TGT---C-T-T-AT---TT-AT-T-T-A-C-G-C---AT--G-C-----T-TTA----T----TTAA-T-TCT-----T---G-AT-GG-AA-A-GTT--A--TG-TA----TTG-T-GTA-G--TA--G-GCGGA-TA--C-G-A--ACA---C-TCC---AAG-G------T---------------TACGT-TG--T-ACA-G-T---TA--T--GAAAA--AAT--TATT--T--A-AA---TAT-TA--ATTTC-AT--CA--C--AA-T-C--CTTCTC--T-TTACTTTTA