lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 3333333333333 222222222222222222222222222222222222222222222222 88888888888888888888888888888888 222222 44444444444 111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 444444444444444444444444444444444 444444444444444444 22 11 1 1111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111111 77777777777777777777777777777777 11111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 111111111111 111111 33 222222222222222222222222222 444 111111 111111 111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111111 1111111 66666666666666666666666666666666666 1111111111111111111111111 111111
lowQualScore : 3 2 4444444444444 7 888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 55555555555555555555555555555555 888888 66 0 00000000000 666666 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 555 0 555 3 4444 6 0000000 999999 555 88888 1 777777777777777777777777777777777 0 777 44 3 4 8 222222222222222222 11 555 3 3 22 9 2 5555 4 555 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55 0 55 5 1 1 6 0000 5 33333333333 2 2 999999999 44444444444444444444444444444444 4 55 11111 333 2 2 888888888 2 22 2 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 5 333 000000000000 3 555 111111 555555 1 33 2 3 1 22 66 4 6 4444 77777 1 1 1 1 666666666666666666666666666 44 333 1 22 1 8 1 1 333 555555 22 1 888 4444 1 333 3333 1 1 66666666 555555 1 6666 888888 222 88888 1 1 1 444444444444 22 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 666 44444444444444444 2 0000000 5555 33 8888888888 77777 1 99999999999999999999999999999999999 33333 55555555 6666666666666666666666666 6666666 11 1 6 1 11 1 88 4 555555 3 3333 44 0
lowQualScore : . . ............. . ................................................ . . ................................ ...... .. . ........... ...... ............................................................................................................................................................................................................................................................. . ... . ... . .... . ....... ...... ... ..... . ................................. . ... .. . . . .................. .. ... . . .. . . .... . ... ..................................................................... .. . .. . . . . .... . ........... . . ......... ................................ . .. ..... ... . . ......... . .. . . .................................................................................................................................................... .... . ... ............ . ... ...... ...... . .. . . . .. .. . . .... ..... . . . . ........................... .. ... . .. . . . . ... ...... .. . ... .... . ... .... . . ........ ...... . .... ...... ... ..... . . . ............ .. ....................................................................................................................................................... ... ................. . ....... .... .. .......... ..... . ................................... ..... ........ ......................... ....... .. . . . .. . .. . ...... . .... .. .
lowQualScore : 2 0 0000000000000 8 000000000000000000000000000000000000000000000000 4 2 66666666666666666666666666666666 777777 99 4 44444444444 000000 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 888 5 444 3 3333 2 8888888 666666 888 33333 0 222222222222222222222222222222222 8 888 88 6 0 0 666666666666666666 55 888 3 3 55 2 2 5555 0 222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 55 8 11 4 0 8 0 4444 2 77777777777 5 4 999999999 00000000000000000000000000000000 0 88 11111 777 1 1 444444444 1 99 2 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7777 1 999 000000000000 4 222 000000 555555 9 11 0 8 9 66 88 0 0 2222 00000 9 9 9 9 777777777777777777777777777 11 000 8 55 8 9 8 8 222 222222 55 9 666 0000 9 000 5555 7 7 00000000 444444 1 0000 888888 999 11111 7 7 7 444444444444 44 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555 22222222222222222 4 9999999 0000 22 0000000000 55555 8 33333333333333333333333333333333333 77777 22222222 2222222222222222222222222 0000000 88 4 3 3 88 3 44 6 000000 1 3333 66 7
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACAAT------TAAGTTATAGATGNTTTGAA--TGTT-T-AAT-G-TCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT--A--CAATATGGAAAT----AN---T--T--CCTGTAA----ATACGGGTATGCAGATGCAG--TATATAT-------N--GTGAGCAGA-----CACT-NATTANCGACGAANAGA-A-TACAATG-------A-C-GATTT--ATGG-G-CCA-CATCTCGCGTA-AA---A---NAAATAG-TTGNAAG----G-AAATA-GAGAG--AAAAA--TA-TACG--ACATGCGGG-TGNTTT-TA----ACGAGAT--TTA----NTGA-TATCTT---TAT---AA-GAAAA-G--ATAAANGAAGANCATGTTTTTTTA-TTTTCATAAGTAAAA--T--A--TG-TA-ATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AA---A-----GTCGA----A--AGCGT-GGGGGA-A-AATGAGA--T-AAATT---AATAT-CAA-GT-ATA-TCAA--NT----TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---AT-G-A-GTTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-C-AAACTA---------------T------G------CCANAA-TATAT--TAC--AACCCTCTTTNTNTCTTA-TTTTATTC-TTGCATTGG-GTGTCCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATGG-----------AAAAGAAC---------CGAAANA--T-----TT---C-TT-CACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTAT-----T--------------T--------CA------------------G--------------T---GT-----TA----AAAGATA----A------------C----------AT----------------G---G---T-----TCTGAG----CTGCACGT---GTAAGTTATA------A----GTATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-C-ACTA-AT-AC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCTAA-A-A-A-G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTGT-AG-A---AAC------T--TC-TGTC-A----AGAGAGAC-AG--TT----AT-TAAA-GG--------TG-T----AGTAGTTAG---AA-----GC---AGT-----TGCTG-TCGA-A-G------------AGAAT--A---CTG------TTG---------------AGAT------------------------C-------G-----------------A---T-----------------NT---------AC--------------CA-G--------------A---TTTC--------A--------TG-TTTCA-------ATT----T--A----------TN----T-AA---------C-------------A-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCG-CCTAACA-----GTATT-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( gi|1 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAA-AATAAAATATAAGTTATAGATGTTTTGAA--TGTTTTGAATGG-CATAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT--A--AAATATGGAAAT----AT---T--TTGCCTGTCA----ATACGGGTATGCAGATGCAG--TATATAC-------T--GTGAGCAGA-----TACT-TACTACTGATGATCAGA-ATCACAATG-------A-CTGATTT--ATGGAG-CCATCACCTCTCTTA-AA---A---TAAATAGGTTGTAAG----G-AAATA-AACAG--TAGGA--CC-TACG--ACATGCGG--TGATTT-TA----ACGAGAT--TTA----AAGAATATCTT---TAT---AA-GACAATG-TATAAATGAAAAACATTTTTTTTTT-TTTTCATAAGTAAAA--TCAA--TG-TA-ATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AA---A-----GTCGA---CA--AG-GT-GGGGGATA-AATTATA--C-AAATT---AATAT-CAA-GT-ATA-TCAA--AT----TTC-------GAGTTTG-ATAGAAAATTC---AT-G-A-TTTATTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-C-AAACCA---------------T------A------CCATAA-TATAT--TGC--AGCTCTCTTTTTTTCTTC-TTTTATTT-TTGCATTGG-GTGCCTTTCTGATGCAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATGG----------GAAAAAAAC-------C-CGAAAGA--T-----TT---C-TT-CACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTAT-----T--------------T--------CA------------------G--------------T---GT-----TA----AAA-ATA----A------------C----------AT----------------G---G---T-----TCTGAG----CTTCACGT---GTAAGTTATA------A----ATACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--C-ACTA-AT-AC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCTAA-A-A-A-G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTGT-AG-A---AAC------T--TC-TG---A----AGAGAGAC-AG--TT----AT-TAAA-GG--------TG-A----AGTAGTTAA---AT-----GC---AGT-----TGCTG-TCGA-A-G------------AGAAT--A---TCT------TTG---------------AGAT------------------------C-------G-----------------A---T-----------------GT---------AC--------------C-----------------A---TTTC--------A--------TG-TTTCA-------ATT----T--A----------TG----T-AA---------C-------------A-----------T-----TT--------TCGG---------C--------------AA-------A--CAAA-CACGC-T--T-CCG-TCTAATA-----ATATT-C----TCA--ATACTTTGATCTC
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT---AAGA-GAGTAAAACAAA-AA---------AGTTA-----GTT--GAACATGTTTTGAATTG-TCCAAAAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT--ACTAAA-----------------------GCCTGTAA----ATACAGATATGCAGATGCAG--TATATAT-------A--ACGAGTAGA-----CA
gi|14 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataagaATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGTA---T---A-AATCAATAAAACAAACAAC------TAAGTTATAGATGATTTGAA--T--------------------AGT-TTAGAATCCTAAATTATTT--------TCC-----T----AA---T--T--CTTGTAA----ATACGGGTATGCAGATGCAGTATATATAT-------T--GTGAGCAGACAGCGTATT-CATAAACAACGAAGAGACATTA-AACGAATTAATA-CTGGTTG--GTAGTG-CCAGCATCTACCGTA-CATGTAGGTTACATAAATTAAAAG----T-AAATT-GGGAG--AAGAG-----TACGCTGCATGCGGA-TGTTCT-CA----GCCGG-----TG----A-----GTCTT---TGT---AA-G---------TAAAGGAAGACCATGTTTTTTTTATTTTCA----CAAAA--T--------------------------------ATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AA---T-----GTCGata
gi|56 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagtACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT----------ATTAGACA-----------ATAAGTTATAGATGATTTGAT--TG
gi|43 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggtATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTAA-GA-AAAT-AAACAAACAAT------TAATTTATAGATGTTTT------------AACAG-TATAAAAGAAGGTTGGGAGCTT----------------ATATGGAAAT----CT---TA-ATCCCTGTAA----ATACAGGTAT
gi|8 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataa---A-GA-CAATAAAACAAATAATTAACTA------ATAGATGTTTTGAA--TA---------G-TCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT--A--CGATATGGTAAT----ACAAAT--T--CCTGTAA----ATACGGGAATTCAGGTGCAG--TATAAAT-------A--GTGAGCAGA-----CATTGTAAT-CTGAACAAAAGA-AATGCGTTG-------AACAAATTTTCATGA---CCA-CATCTTGCATG-GA---A---GGAAT---TTGTAGGACGGG-AAATG-GAGTGGATAAAA--TA-AACG--ATATGCAT--TTGTTT-TA----ACGAGAT-------------GTATGTTGTGTATGGAAATAAAAATG-CATAAAGGAAGAACATGTT----------------GTAAA---TC-------TA-ATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TA---A-----GTCGA---AAGCAG-GT-GG-----A-AATGAGA--T-AAATC---AATAT-CAA-GT-AAA-ACAA--TG----TTT-------GAGTTTT-ATAGAAAATTA---AT-G-A-GTTCTTTATTCTATCTGTCCTT----G-TAAG-C-AAA------------------------------------AA-TATAT--TAC--AAC-CAATT------TTA-TTTTATTC-TTGAATTGG-GTGTCCGCCTGATACTG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AAT------------------------------TGATGAA--T-----TT---C-TC-CACATTT---------TCC-G--TT
gi|46 : ata-CAATTAAACAAA-CATAAA---TA-GCTATATACGAAT---A--TGTTGTAAATCGTCA-AAAAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT--A--CAACATTGAAATCCTAAT---T--T---CTGTAA----ATACGGGTATGCAGCTGCAG--TATATAT-------A--ATAAGCAGG-----CACttcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|21 : AA--TGTCTTTCCTAG-TCTAAATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT--A--CAG------AAT----AA---T--T--CCTGCCA----ATACGGGTATGCAGATGCAG--TATGTACATTTGTATA-GTGAGCAGA-----CACC--ATTAGGCACAA-CGAA-A--ACAAT-------------ATTT--A--GAGTCCA-CACGTTTAGTA-AC---A---TGAATGGTTTATAAG----T-GAATA-AAGAG--AAAAA--TA-TTCA--ACATGTGGG-TGATTT-TA----ACGAGAT--TTA----TTGAATACATT---TTT---AA-GAAAAGGGTATAAAGGAAGACTATATTTTTTAT-TTT-CATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AA---A-----GTTCA----A--AGCGT-AAGGGAaaat
gi|27 : ttatgaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT--A--CAATATGGAAATCCCAAT---T-----CCTGT-AGTTTATACGGATATGCAGATGCAG--TATA--------------TGAGCTGA-----CACaatgagataa
gi|23 : TGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTC--AAATATGGAAATCA--AT---T--T--CCTGT-ATTT-ATACGGATATGCAGATGCAG--TATATagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|51 : TAAATCAGTT--A--CAATATAGAAAT----GA---TAATTAC-TGTAC----ATACGGGAATGCAGA---AG--TATATCC-------TTAGTGAGCGGA-----TACT-GATTAgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgtaaaactattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|2 : ctaaggaagcggaataTTATCTCGCATAGAA---A---GAAATAG-TAGGAAG----GGAAATAGAATGG--AAAAA--ATATACG--ACGTGCAG--TTGTTG-TA----ACGAGAT--gcacaatggacgat
gi|22 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccAAAT-GGTGGGAAG----G-AAA-A-TAGAG--TGGAAAGTA-TACA--ACACGC------ACTT-TATGTAACGAGATGATTG----T----TGTCTT---TG----AA-AAAAA-G-TATTAACAAAGAACATGCTG----------CATA---------------TG-TA-ATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GCggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|5 : gaaggTAAG----G-AAATA-GAGAA--AAAAA--TA-TACA--ATATG--------TCTATA----ACGAGAT--TTA----ATGACTATCTT---TA--------------------A-GAAAGGC--TTTTTTTAA-TTTTCATAA-TAAA------------------------------------ATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AC---A-----GTCGA----A--AGCAT-GGGGGA---AATGTGA--T-AAATT---AATTT-CAG-GT-ATA-GCAAC-AT----TT--------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---AT-G-A-GTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNN-N-NNNNNN---------------N------N------NNNNNN-NNNNN--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNAT-------CCTTCAGGTACAGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GATGG----------AAGAA-------------CAAAATA--T-----TT---C-TT-CACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTAT-----C--------------T--------CA------------------AACACAGTATACTTAT---GT-----TA----AAAGAAA----A------------C----------ATTTTTATGAA-------A---G---T-----TCTGAG----CTGCACGT---GGAAGTTATA------A----GTGTG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--TAACTT-ATAAC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT------CTAA-A-A-ATGAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTGT-AG-A---AAC------T--TC-TGTC-A----AGAGAGAA-AG--TT----AT-TAAA-GG--------TG-C----AGTAGTTAT---AA-----GC---AGT-----TGCTG-TCGA-A-G------------GCAAT--A---CTG------TTG---------------AATT------------------------T-------G-----------------A---TTTTGCC-----------AT---------ACACGGAACATCAAA-T-----------------A---TTTC--------A--------TG-TTTTC-------ATC----T--A----------TT----TCAATTTTTTTTTT-------------A-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATGC-T--T-C-----------------ATT-C----TCA--ATGCTTTAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|27 : tATGCGGG-TGTTTT-TA----ACGAGGT--TTA----CTGAGTATCCT---T-T----------------TAAATGAACACCA-TATATTTTA-ATTTCATAAGGAAAA--TAAATGTG-TA-ATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GA---A-----GTAGA----A--AGCGT-GGGG---A-AATGAGA--T-AAATtc
gi|23 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactattATGCGGGTTGTTTT-TA----AC-AGGT--TTACTGGAAG--TATCCT---TAT----------------TAAATGAAC--CCTATATTGTTA-ATTTCATAAGGAAAAAGT-AA--TGGTGTATTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GA---A-----GTAGA----A--AG-CT-GGGGAATAGAAAGATAATT-AAGTTATGAATATCCAA-G
gi|63 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgtaaaactattTAAGTAAAA--TAGA--TT-TG-ATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AA---A-----GTCGA---TA--GT-GT-GTGGGA
gi|2 : ctAAAA--T--A--TG-TA-ATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAA---A-----GTCGAAAGCG--AG-G---GGGGGTG-AGATATA-------TT---GATAT-CAA-GT-ATA-TCAA--TG----TTT-------GAGTTC------AGAGTTC------------T-TTTAT-CTATCTGTCCTT----A-TAAG-C-AAACTACATGTATGCTAAGAAT------A------CAATG--TATAT--TAC--AACCCACTTTATTTC--------ATTC-TTGCATTAG-GTCTCCGTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGAAC-------C---AAAGC--T-----TT---C-TT-CAGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TTAT-----T--------------T--------CAATCACAGTACATTAA---G--------------T---GT-----TA----AAAGATA----AACTATTTC----C----------AT----------------GAAAG---T-----TCTGAG----CTACATGT---GTAAGTTTTA------A----GTACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGAAATAT-C-ACCA-AT-CC--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCTAA-A-A---G---------A---T---------ATC-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTGC-TG-A---AAC------T--TC-TATC-A----AGAGAGAC-AG--TT----AT-TAAA-GG--------TG-T----AGTAGTTAG---AA-----GC---AGC-----TGCTG-TCGA-A-G------------AGAAT--A---CTG------TTG---------------AGAT------------------------T-------G-----------------A---T-----------------
gi|4 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacgaAA--TG-TA-ATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AATTAA-----AT-GA---TA--AA-AA-AAATG-TA-AAGAATG--CTAAATT---AATAT-CA---T-A-A-TCAC--ATATGATTT-------GTGTTTCTATGAAATATTCTGCAT-G-A-GTT-CTTATTCTATCTGTCCTA----AATAAGGC-AAGCTA---------------T------G------CCAAAAATATGT--TTC---GTACTTTTTTAACCTTA-TTTTATCTCTTGCATTGG--TGTCCGTCTGAAACAAA---TATCTAAGAAC-TTT----CAT----TGAA-T----C----AATGA----------TGAAAGAAC-------CATAGAAGA--T-----TT---CCTT-CACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT-T-----T--------------T--------CA------------------tttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|18 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctttaaattagtttacgttaattcgtgtagttaggcgtattatgcttaactagcaatgggtaattaataactcctctaaatagggaagttagcccagcggcatatatatcactggagagacaatcatataaaaaaaacgttgacccataacatcactattgaccacaatctcgcagatggagggtgaaagaggaaggttagactaatggattgcgtaaggaatcatatcgacatggcaggttttctgttataatcgagatgttttactggtttatgggaaaaggttaaacgaagaaacattgcag-TA-ATTT-TTATA-A-GTA---AAATA--CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AA---ATTAAAGTCGA-------AA-GT-GTGGGAGA-AATGGGA--T-AAATT---AATCT-TAA-GT-CTA-TCAAC-AT----TT--------GAATTTC-ATAGAATATCT---AT-G-G-ATTCTTTATTATGCATNNNNNN----N-NNNN-N-NNNNNN---------------N------N------NNNNNN-NNNNN--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNAGAGT-ATGCCTTT-TAATACAT----TATCTAAGAA----------------------------------------------GAA---------------CAAAATA--T-----TT---C-TT-CAAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TTAT-----T--------------T--------CA------------------acacagtatttca
gi|7 : tttgagcaagatttgttaaatatcattttctaaaaaaaagtggggggggggtaac-ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AG---A-----GTTGA----A--AGCGT-GGGGGA---AATGAAA--T-GA-TT---GATA---AATGT-ATT-TCAA--CG----CTT-------GAGTTCC-ATAGAAAGTTC---AT-C-A-GTTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTATA-TAAA-C-AAACTA---------------T------GTATATGCCAAAA-TATAT--TAC--ACCCCTGTTT-------------ATTC-T-ACATTGG-GCGTCCTTATAATATAG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GATGG------------AAAGAAC------------AAGACGT-----TT---C-TT-CACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTACACGACT--------------T--------CAAATACATAATGAATATTAG--------------T---GT-----GA----AAAGATA----A------------CCATTATTTCCAT----------------G---AA--TAA---TCGGAG----CTGCACGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAGCTAAGAATAT-C-ACTG-AT-AC--TTTGA--T-TTAC----ATTTCTT-----CCTAA-A-A-A-GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACGCAAAACGTTGT-AA-A---AAT------T--TC-TGTC-A----AGAGAGAA-AG--TTATTAAT-TAAA-GG--------TGTA----CATAGTTAA---AA-----AC---AGA-----TGCTG-TCGA-A-T------------GGAAT--A---GTG------TTG---------------AGTTG-----------------------C-------GTTTGCCACACGCGAA--A---C-----------------AT---------AC--------------CAAGATTTCAAC------A---TTTC--------A--------TT-TTTCA-------ATT----T--A----------TT----T-TA---------T-------------T-----------T-----TT--------TC-----------C--------------------------TTAA-C---T-T--T-CCG-CCTAACA-----GTATT-C----TCA--GTACTTGGATaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|6 : TTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AA---A-----CTCGA----A--AGCGTAGGGGGAAA-AATGA-G--T-AAAT----AATTT-CAA-GTTATAGCCCA--ATG---TTCTGCCACAGATCTTC-CTA--AAAGTC---ATAG-G-TTT--TTATTTTATCT-TCCTT----A-TAAG-CCAAACTA---------------TGGCCAAA------CCATA--TATAC--TA---A--TCTCTGCATGT-TTA-TTTTATGT-T-GCA--GGAGTGTCCATCTCATACAG----TATTTTCGAAATTTT-----ATAATGT-AAGT----T----GATGG------------AAAGAAC-----------AAATA--T-----TT---C-TTTCACATCT---------TC--G--TTCC-TTTAT-TTAC-----T--------------TAAACA---CA------------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG-GTA----T------------T----------A-----------------A---G---T-----TTTGAG----CTGTACAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-C-ACTA-AT-AC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCTAA-A-A-A-G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTGC-AG-A---AAC------T--TC-TGTC-A----ACAGAGAC-AA--TT----AT-TAAA-GG--------AG-T----AGTAGTTAG---AA-----GC---AGT-----TGCTG-TCAA-A-G------------AGAAT--G---CTG------TTG---------------AGAC------------------------T-------G-----------------AGTTT-----------------GC---------AA--------------CACACGGAACATACAAAGA---TTTCA-------A--------CA-TTTCA-------ATT----T--A----------TT----T-AG---------CATTTCTTGAA---A-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------G--CAAA-CATGC-T--T-TTA-ACTAACA-----GCATT-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|33 : TT---AATA----A-AT-GTA-T------T----TTT-------GAATTTC-ATAGGAAACTA---AT-G-A-GTTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTA-A-TAAA-C-ACACTA---------------T------G------CCAAAAATATAT--TGC--AACCCT----TTTTCTTTATTTCATTT-TTGCATTGG-GTGTCTTTATGAAAGTG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT------------------------------TGATATA--T-----TT---C-TT-CACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT
gi|69 : T-CAA-AT-ATA-TCAA--CG----TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---AT-G-A-GTTCTTTATTCTATcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|67 : AA-AT-ATACTCAACGGT----TT--------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---AT-G-AGTTTCTTTATTCTA
gi|10 : tATTC---AT-G-A-GTTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TCAG-C-AAACTA---------------T------G------CCAAAA-TATATCATGTTGAACCCTCTTTATTT--TA-TTTTATTC-TTACATTGG-GTGTCTTTCTGATACTG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGATGG----------AAAGAA------------CAAAATA--T-----TT---C-TT-CACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TTAT-----T--------------T--------CA------------------AACA-----------C---AG-----TA----CAA-GTG----A------------A----------A---------------------G---T-----ACTGAG----CTGCACGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-C-ACTA-AT-AC--TTCAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCTAA-A-A-A-G---------A---T---------ATAAA--A---TTTTA-C--GCTC-AAGCTTTGT-AT-A---AAC------T--TC-TGTC-A----AGAGAGAC-AG--CT----GT-TAAA-GG--------TA-T----AGTATTTAG---AA-----GC---AGT-----TGCTG-TTGA-A-G------------AGAAT--A---CTG------TTG---------------AGATTGATTTTGCCACACACGGAACATAC-------A-----------------A---T-----------------GT---------AC--------------CAAG--------------A---TTTCAACATTTCA--------TT-TTTCA-------ATT----T--A----------TT----G-AA---------CTTTTTTTTTTTT-T-----------T-----TT--------TCCA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATAC-T--T-CCG-CCTAACA-----GTATT-C----
gi|35 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgTC---AT-ATA-TTTATTTTTTC-ATTT----TT----A-TGAA----------------------------------------ATTA-TTTAT--TA---AGTCATCTTTTTAT-TGC-TGTTGTTG-TTGCATTGG--TGTTTTGTTGATACGC----TATCCAAGAACATTT----AAT----C-TA-T----T----GA----------------AAGAAC-------A-C-ATAGA--TATTTCTT---C-TT-CGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TTAC-----T--------------CTGTGTACACA------------------G--------------T---AT-----CA----AAAGATA----A------------C----------ATA---------------A---G---T-----TCT
gi|11 : AA-TATAT--TGC--AA-TCTCTTT-------C-TTTTATTC-TTGCATTGG-GTGTACTTATGATACAG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GATGG----------AAAGAA------------CAAGACA--T-----TT---C-TT-CACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATTAT-----A--------------T--------TA------------------G--------------T---GT-----GA----AAAGATACATTATTTC--------C----------AT----------------G---AATAT-----TCGTAG----CTGCACGT---GTAAGTTATA------A----GCATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-C-ACAA-AT-AC--TTTAAT-T-T-ACATGAATTTCTT-----CTTAG-A-A-A-GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATGTTGT-CG-A---AAA------T--TC-TGTC-A----CGAGAGAC-AG--T--------------------------A----AGTACTTAG---AA-----GC---AAT-----TGCTG-TCGG-A-A------------AGAAT--A---CTG------TTG---------------AGCT------------------------T-------GCTTTTGCCACACACGGAA---C-----------------AT---------AC--------------CAAGATTTTAGC------A---TTTC--------A--------TG-TTTCA-------GTT----T--ATTTCACCCTTTG----T-AGGTCTACT--C-------------C-----------T-----TT--------TTGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCG-CCTAAaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|31 : aaAA-TATAT--TAC--AAA-CTCATTATTTC--A-TTTTATTC-TTGCATTGG-GTGTCCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AATGG----------AAAGAA------------CAAAAGT--T-----TT---C-TT-CAAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TTAT-----TTTAAACACAGTATAT--------TA------------------G--------------T---GT-----TA----AAAGATA----ACTTTATTTC---C----------AT----------------GAAAG---T-----TCTGAG----CTGCACAT---GTAAGTTATA------A----GTATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-C-ACTA-CT-AC--TATAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCTAA-A-A-A-G---------A---
gi|44 : ctaTT----AAT----T-AA-T----TT---GATG------------AAAAGAAC------------AAGACGT-----GT---C-TT-CACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTA
gi|30 : atatctatataaccttataatataataT----T-CA-T----T----GATG-------------AAAGAAC-------C--GAGATA--T-----TTATTC-TT-CACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTAC-----T--------------cacgacttcaaatacatattgaatattagtgtgaaaagataataattatttccatgaataatctgagctgcat
gi|47 : catT----T-AA-T----T----GATGG-------------AAAGAG-------C-AGAGATA--TTTC--TT---C-TT-CACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TTAT-----gtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|16 : tcgaaatgtttagcaatac-AA-T----C----GATAG----------AAAGAA------------CAGAAGA--T-----TC---C-T--CACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TTAT-----T--------------T--------CAAACACATATACTTA----G--------------T---GT-----TA----AAA-GTG----AAAACATTATTTCC----------AT----------------GAAAG---T-----CTTGAGAGCTCTGCACGT---GTAAGTTATA------A----GCATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-C-ACTA-AT-AC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCTAA-A-A-A-T---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-A--ACTC-AAACTCTGT-AG-A---AAC------C--TC-TGTC-A----AAAGAGAC-AG--CT----AT-TA----------------------------------------GC---AGT-----TGCTG-TCGA-A-G------------AAAAT--A---CTG------TTG---------------AGAT------------------------T-------G-----------------A---TTTTGCCACAC-------AT---------ACCAAGATTTCAA---C-----------------A---TTTC--------A--------TG-TTTCA-------ATT----T--T----------TG------AA-----------------------A-----------T-----TT--------TCGA---------C---------------A-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCG-CATAATcgtatacacgatttttaatacatatcaatgttaaaagataacattattttcatgactgttctcagctga
gi|19 : A-T----T----GATAG-----------AAAGAAGC-------T----AAGA--T-----TT---C-TT-AGCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TTAT-----T--------------T--------CA----------------------------------------------------A-ACA-----------------C----------AT----------------GTA-G---TAGAGATCTAAG----TTGTATATAATGTAAGTTTTA------A----GTATG---GTTGATC------A------TT-GCAACGAGGAATAT-C-ACCA-AT-AC--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCTAA-A-A-A-AT--------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-GATCTTTGT-AG-A---AAC------T--TC-TGTC-A----AGAGAGAC-AG--TT----AT-TAAA-GG--------TG-T----AGTATTTAG---AA-----GC---AGT-----TGCTA-TCGA-A-GACAATACTGTTGAGAAT--G---GTT------TTGCCACACACGGAACATAAATAA----------------------CAA-----G-----------------A---T------------------T---------ACAA------------C-----------------A---TTTC--------A--------TG-TTTCA-------ATT----T--A----------TT----T-AA---------C-------------A-----------CTGATGTT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAggt
gi|3 : c----GATGG----------AAAGAACACATATATAC-CGGTATA--TC----TT---C-TT-CACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----------------------------------------------------------------------T-----TA----AAAGATA----GCCTTATTTC---C----------AT----------------GAATG---T-----CCTGAG----CTtg
gi|13 : -CAAAATA--T-----TT---C-TT-CACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TCAT-----T--------------T--------CA------------------AA-------------TACAGT-----AA----AAAGATA----A------------C----------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T-----TTTGAG----CTGCCCGT---GTAAGTTATA------A----GTACG---GCTGATC------A------TT-ACAACTAGGAATAT-C-ACTA-AT-AC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CTTAA-A-A-A-G---------A---TATC------A---A--A---TTTTA-C--ACT--AAACTTTGT-AG-A---AAC------G--TC-TGTC-A----AGGGAAAC-GG--TA----GT-TAAA-GG--------TG-T----TGTAGTTAG---AA-----GC---CGT-----TGCTG-TTGA-C-T------------AGAAT--A---TTG------TTG---------------AGATTGATCATGCCACACAGGGAACATAC-------A-----------------A---T-----------------GT---------AA--------------C-----------------AAAATTTCA-------A--------CA-TTTCATGTTTCAATT----T--A----------TT----T-AG---------C-------------ATTTTCTTGAAAT-----TT--------TCGA---------C--------------TA-------A--GAAA-CATGT-G--T-CAG-CTTAACA-----GTATT-G----TCA--ATACTTTGATgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|40 : TAT-----T------------------------A------------------G--------------T---GT-----TA----AAAGATA----A------------C----------ATTATTTCCAT-------G---AATAT-----TCTGAG----TTGCACGT---GTAAGTCATA------A----GTATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATA--ta
gi|15 : ---G---T-----TCTGAG----CTGCAAGT---GTAAATTATACATGTAA----GTATG---GTTGATC------A------AT-ACCACTAGGAATAT-C-ACTA-AT-AC--TT---------------------------CCCAA-A-A-C-G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-ATACTTTGG-AG-A---AAC------T--TC-TGTC-A----AGAGAGAC-AG--TT----AT-TAAA-AA--------TG-T----AGTAGTTAG---A-----------AGT-----TGCTG-TCAA-A-G------------AAAAT--A---CTG------TTG---------------AGAT------------------------T-------G-----------------A---T-----------------TTTTTC-----ACACACAAGATTTCAAC-----------------A---TTTC--------A--------TG-TTTTA-------ATT----T--A----------TT----T-CA---------CATCTTTTTTTGAAA-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCG-CCTAACA-----GTATT-C----TCA--ATACCTTGATCtcanaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|20 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa---G---T-----TTTGAG----CAGCACGT---GTAATTTATA------A----GTATGATAGTTGACC------A------TT-GCAATTAGGAATGT-C-AGTA-AT-AA--TTTGA--T-T-AC----ATT-CTT-----CATAA-A-A-A-G---------A---T---------A---T--G---TTTTA-C--ACTC-AAAC--TGTCAG-------C------------------------AGAGTC-AG--CT----AT-TAAA-GG--------TG-T----AGTAGTTAG---AA-----GC---AGT-----TGCTG-TCAA-A-GACAAT-------AGAAT--A---CCG------TTG---------------AGAT------------------------T-------G-----------------A---TTTTGCCACACACGGAACAT---------AC--------------CAAGATTTCAAC------A---TTTT--------A--------TG-TACCA-------ATCTACAT--A----------TGTATTT-AA---------C-------------AT----------T-----TT--------TCGGAATTTTCAAC--------------AA-------G--CAAA-CATGT-T--T-CCG-CCTAACAGTAT-ATATT-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|29 : cattaaatccacgaaaCTGAG----CTGCACAT---GAAGGTTATA------A----GTACA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-C-ACTA-AT-------------------------TCTT-----CCTAA-A-A-A-G---------A---T---------AT--AC-A---TTTTA-T--ACTC-AAACGTTGT-AA-A---AAC------C--TC-TGTC-A----AAAGAGGC-GG--TT----AT-TAAA-GG--------TG-T----AGTAGTTAA---CA-----GC---AGT-----GGCTG-TTGA-A-G------------AGAAT--A---CTG------TTG---------------AGAT------------------------T-------G-----------------A---TTTTGCCACACACGGAACAT---------AC--------------CAAG--------------A---TTTC--------AGCATTTCCTG-TTTCA-------ATT----T--A----------TG----T-AA---------C-------------AT----------T-----TT--------TTTT---------T--------------AAATTTTTGA--CAAA-CATGC-T--T-CCG-CCTAACA-----t
gi|3 : ACAT---GTAAGTTACA------A----GCATG---GTTGATC------ATTGCAATT-GCAACTAGGAATAT-C-ACTA-AT-ACTTTTTAAATT-T-AC----ATTTCTT-----CCTAACA-A-G-G---------A---T---------AT--A--A---ATTTA-C--ACTC-AGATGCTGT-AA-A---AAA------T--TC-TGTC-A----AGAGATACTAT--TT----TT-TAAA-GG--------TG-T----AATACATAG---AA-----GCCATAAT-------CTG-TTGA-CTG------------AGATT--G---CCTTAAAAGTTGCAACACGCGGAT---AAAC------------------------CAA-----G-----------------A---T-----------------TTC--------AA--------------C-----------------A---TTTC--------C--------TG-TTTAA-------ATT----TAAA----------TT----T-AAG--------C-------------A-----------T-----TT--------TTG
gi|9 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaACGT---GTAAGCCATA------A----GCTTG---GTTGATCAATGCAA------TT-ACAATTAGGAATAT-C-ACTA-AT-AT--TTTAA--TGT-AC----ACTTCTT-------TAA-A-A-A-G---------A---TTTATATGCGA---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATATTGT-TGAA---AAA------T--TC-TGTC-C----AGAGGGAC-AT--TT----GTGCAGG-AG--------TG-A------TACTCGA---AT-----GT---AATTACAGTACTG-TCGA-A-G------------ATAAT--A---CTG------TTG---------------Atttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|53 : aatgaatgtATGT---GCAAGTTATA------A----GCATG---GTTTGGC------A------TT-TCAACTAGGGATAT-C-ACTA-AT-AC--TTTAAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCAAA-A-A-A-GAT-------A---T---------A---A--A---TTacttatttctgtcatacacagaacataccaagatttaaacatttcatgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
gi|30 : ttattagaagtctccatatatACGT---GTAAGTTATA------T----GCATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAACTAGGAA------ATTG-AT-AC--TTTAc
gi|17 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtTAAATTG-A------A----GTATGT--GTTGATC------A------TTTGCATCTAGGAATGTTC-AC-A-AT-AC--TT-AA--T-T-AC----ATATCTTT----CCTAA-A-A-A-G---------AGATT---------AC--A--A---TGTTAAC--ACTC-AAACTTTGT-AG------AC------T--TC-TGTCCA----AGAGAGAC-CATTTT----AT-CAAA-GG--------T---------TAGTTAATTTATAGAGAGC---AGC-----TGCTG-CCGA-C-G------------ACAAT--A---CTTG-----TTG---------------GGA
gi|54 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAATTACA------A----ATGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--AGAAACA--C-AAAATAT-AT--TTCAA--T-TTAC----ATTTCTT-----CATTG-A-A-A-G---------A---C---------A---A--AGTATTTTA-C--GCTG-AAACTTTGT-AG-A---AAA------T--Tgaatgattttggccacacacgaacaataccagatatttcaatatttcacgtttctatatttattttatcactatgatgttttgaaatgtctacaatacaaagcaacaaacatgcttccacctaatagtactcaataatctgataa
gi|45 : agA------A----ACATG---GTTTATC------A------TT-GCAACTAGCAACAT-C-ACTA-AT-AT--TTTGA--T-TGAC----ATTTTTT-----CTTTA-A-A-A-A---------T---T---------A---AAGA---TCTGA-A--ATTT-ACAC----T-AA-A---AAC------T--GCATG---T----GAACAGAC-AG--TT----GT-TA----------------A----CGTACTTGG---AA-----GC---AAT-----TACTG-TCGA-A-T------------AGAAtgg
gi|26 : gcCTACAT-AC--TTTAA--TCT-CC----ATATCTTAATCTCTTAC-ACA-A-ACCTCGCACTA---T---------AC--A--A---TTTTA-CCCACTC-AACCTTTGT-AG-ACACAAC------T--TC-TGTC-AACTTAGAGAGAC-A----T----AC-TAAATGGCCCCTTCTCG-ATCCCAGTAA--GA---AA-----GC---AAT-----CGCTGCTCAACA-GC-----------AGAATTCAC--TCC------TTGC--------------AGAT--------------------------------G-----------------A---T-----------------TTTGCCTGCAAACGGAAAA--------C-----------------AC--TTTC--------A--------AG-CATCA-------A-A----C--A----------TG----T-CA---------C-------------ATTT--------T-----TT--------TCAA---------CTTCTTTTCGAAACAAA-------A--CAAA-CATGT-T--TGCCG-CCTACAC-----ATATT-C----TCC--ATACTTTGAT
gi|39 : tatcacaatcAA-A-ATA-T---------A---T---------A---A--A---TTGTA-C--ACAT-AAACGTTGT-AG-A---AAA------TTATC-TC---A----AGAGATAC-TT--TT----GT-TAAA-GA--------CG-T----TGTACTTAG---AA-----GC---AATA----TTCTG-CCGA-A-A------------AGAAT--ACTGTTT------TTGCCACACAC-------AGAA------------------------CAAACCAAG-----------------A---T-----------------TTC--------AA--------------C-----------------A---TTTC--------A--------CG-TTTCA-------ATT----T--A----------TT----T-CC---------C-------------T-----------T-----TTTGAAATACTCGT---------C--------------AA-------A--CAAt
gi|38 : a---------A---T---------C---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTGT-AG-A---AAC------T--TC-TATC-A----AGAAAGAC-A---TT----AT-CAAA------------G-A----AGCAGT--A---AT-----------GT-----TGCTG-TCGA-A-G------------AGAAT--A---CTG------TTG---------------AGAT------------------------T-------G-----------------A---T-----------------TTTGCA-----ACACATGGAA------C-----------------A---TACC--------A--------AGATTTCAGC-----ATT----T-------------------C-A------------------------A-----------T-----TT--------TTGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATGC-T--C-CCG-TCTAACA-----GTATT-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|58 : at---------A---T---------A---T--G---TTTTA-A--ACTC-AAACGTTGT-AG-A---GACAGACAGT--TG-TAGACA----GGAGAGAC----------------AA-GA--------TG-T----AGTCCTTAG---AA-----GT---AAT-----TGCTG-ACAA-A-A------------AAAAT--a
gi|36 : ---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTGT-AG-A---AAC------T--TC-TGTC-A----AGAGAGAC-AG--TT----AT-TAAA-CA--------TG-C----AGTAGTTAG---AA-----GC---AGT-----TGCTG-TCGA-A-G------------AGAAT--A---TTG------TTG---------------AGAT------------------------T-------G-----------------A---TTTTGCTACACACGGAACAT---------AC--------------CAAGATTTCAAC------A---TTTC--------A--------TG-TTTCA-------ATT----T--A----------TT----T-AA---------CATTTTTGGAA---A-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCG-CTTGACA-----GTATT-CTCTATCA--ATATTTTGATTT
gi|12 : G--TT----GT-TAAG-GA--------TG-T----AGTATTTCG---AA-----GC---AATAT---TGCTG-TCGA-A-T------------AGAAT--G---CTG------TTG---------------GGAT------------------------T-------G-----------------ttc
gi|48 : ----AT-TAAA-GG--------TG-T----AGTAGTTAG---AA-----GA---AGT-----TGCTG-TCGA-A-G------------ACAAT--A----CTGTG---TTG---------------AGAA------------------------T-------G-----------------A---T-----------------ttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|49 : cgcaaagccttctagcaggagtgtcaaaa----AT-TAAA-GG--------TG-T----AGTAGTTAG---AA-----GA---AGT-----TGCTG-TCGA-A-G------------ACAAT--A----CTGTG---TTG---------------AGAT--------------------------------G-----------------A---T-----------------tttgccacacacggaacataacaatatttcaatatatcacgtttcaattta
gi|57 : cgcaaagccttctagcaggagtgtcaaaa--------------C-----------------A---TTTC--------A--------TG-TTTTA-------ATT----T--A----------TT----T-CA---------CTTTTTTGTTTTA-A-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATAACA-----GTATC-C----TCA--ATACTTCGATTTtttgccacacacggaacataacaatatttcaatatatcacgtttcaattta
gi|9 : ttcaa----------TG----T-AA-----------------------------------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------G--CAAA-CATGC-G--T-CCG-CCCAATA-----ATACG-C----TCA--CTA
gi|60 : aatgaatgtacgtgtaagccataagcttggttgatcaatgcaattacaattaggaatatcactaatattttaatgtacacttctttaaaaagatttatatgcgaaattttacactcaaatattgttgaaaaattctgtccagagggacatttgtgcaggagtgatactcgaatgtaattacagtactgtcgaagataatactgttgaacttatttctgtcatacacagaacataccaagatttaaacatttcatgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggc----------TG----T-AA-----------------------------------T-----TC--------TCGA---------C--------------CA-------A--AAAA-CATGC-T--T-CCA-CCTAACA-----GTAGT-C----TCA--ATACTTTgat
gi|34 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggc----------TG----T-AA-----------------------------------T-----TT--------TAAC---------C--------------AA-------A----AA-CATGC-T--T-CCC-ACTACCA-----GTACT-C----TCA--ATACTTTGA
gi|25 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaactagagacagtgattatcttcaagagtattgacccttattgatctcaggacacaagatcaaaagtcgcgc----------TG----T-AA-----------------------------------T-----TC--------TCGA---------C--------------AA-------A---AAG-CATGC-T--T-CCG-ACTAACA-----GTATT-T----T
gi|50 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc----------TG----T-AA-----------------------------------T-----TA--------TCGA---------CCAAA----------AA-------A--AAAA-CATGC-T--T-CCG-CCTAACA-----GTAga
gi|28 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggc-------------A-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------ATTT-----A--CAAA-CATGC-T--T-CCG-CCTAACA-----GTACT-C----TCA--ATACTTTGATgattttatttgca
gi|24 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaactagaggcagtgattgctctttaagatccttattggtatgcaggacacaagaccaaaagtcaagcttta-------------A-----------T-----TC--------TCGA---------C--------------CA-------A--AAAA-CATGC-T--T-CCG-CCCAACA-----GTAGT-C----TCA--ATACTTTGta
gi|41 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A-----------T-----TT--------TCG----------------------------------A--CAAT-CATAC-T--T-CCG-CCTAACA-----GTACT-C----CCA--TTACTTTGAT
gi|61 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggcttta-------------A-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCG-CCAAACAGCGATATATTCC----TCATTATATTTtc
gi|62 : gacgttttgaa-------------A-----------T-----TT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCG--CCAACAGCGATATATTCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|55 : cgttttgaaT--------TCGA---------C--------------AA-------A--CAAA-CATTC-TAAT-TCT-CCTAACG------TACT-C----TCA--ATACTTTGATactgtactgctt
gi|32 : tcagagtatatgactatcaatttattgattttcaagacacatag---------C--------------AA-------AATCAAAGCATGCCT--T-CCG-CCTAACA-----GTAGT-C----TCA--ATACTTTGATCtatttt
gi|12 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggaca--------------AA-------A--AAAA-AATGC-T--T-CCG-CCAAACA-----GTACT-C----TCA--GTACTTTGAT
gi|17 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttA-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCA-CCTAATA-----GTA---C----TCA--ATAATCTGAT
gi|70 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaattgaagtatgtgttgatcatttgcatctaggaatgttcacaatacttaattacatatctttcctaaaaagagattacaatgttaacactcaaactttgtagacttctgtccaagagagaccattttatcaaaggttagttaatttatagagagcagctgctgccgacgacaatacttgttgggagaatgattttggccacacacgaacaataccagatatttcaatatttcacgtttctatatttattttatcactatgatgttttgaaatgtctacaatacaaagcA-------A--CAAA-CATGC-T--T-CTA-TCTATCA-----GTACT-C----TTA--GTACTTTGATaa
gi|71 : actATGC-T--T-CCA-CCTAATA-----GTATT-C----TCA--ATAATCTGATtat
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|42 ): TTTTCATTTCTTTTTGGGAGAGATATGATAGATTTAACCTCAGTTGAGCAGAATTCTACTCCAGGAGAGGTAGTTATGTTGTTAAGGTGTGTAGAGGCAATTTCAATCAAGGGGAGCAACTATTCAGACTGTTTGATTCTAAAACAAGAAACATACCAACATTTCAATAT
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|59 ): ATTGCAGATTCTTGATCGATCTTCACACCAAAAGTAGGGCTGTAATTTTTGACCAAAAGCATGCTTCTACCTATCAGTAGATATTTCAATT
Unaligned ( gi|64 ): TTGAATAACTATTTATGAAAAAGGTATCAAGGAAGACCATAACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAATACTGC
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 111 111111111 2222222222222 888888888888 2222222222222222 111 222222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 333333333333333333 1111111 222222222 11 111111111 1111 333333333333333333333333333333333 222222222 2222222222222 1111111 2222222 11111111 11111111111111 11111111 3333333 1111 111111111 333333333333333333333333333333333333 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222222222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 0 444 111111111 1111111111111 1 0 222222222222 66 777777 22 2222222222222222 55 111 55 55 55 222222222222 55 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 5 5 111111111111111111 4 1 1 8888888 1 222222222 66 5 33 66 4 66 4 55 0 222222222 4444 3 666 6 777777777777777777777777777777777 55 2 0 2 000000000 2 33 6666666666666 0 2 2 555 1 33 5 0000000 888888 77777 3 44 44 77 3 666 7777 0 3 3 77 3333333 7777 55 3 555 3 11111111 4 8 55555555555555 4 2 77777777 3 6666 3 7777777 2 2 1 2 2 9999 55 88888 0000 2 2 222222222 555555555555555555555555555555555555 0 1 2 333 4 777 888888888 2 22 2 2 00000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 22 4444 1 333 555555 3333 444 000000 555555 1 1 1 333 1 22 88 3 3 3333 66666 333 1 1 1 444 222222222222222222222222222 33 222 1 22 1 4 22 1 222 444444 1 1 22 1 3333 1 333 3333 4444 1 33333 1 6666666 4444 1 222 1 1 222 33 1 1 1 55555 33 66 444444 444 22 77777777 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44444 88888888 11 9999999999999999 666666666 22 1 1 11 1 1 1 99999 11 1 2 3333 44
lowQualScore : . ... ......... ............. . . ............ .. ...... .. ................ .. ... .. .. .. ............ .. . ........................................................................................ . . . .................. . . . ....... . ......... .. . .. .. . .. . .. . ......... .... . ... . ................................. .. . . . ......... . .. ............. . . . ... . .. . ....... ...... ..... . .. .. .. . ... .... . . . .. ....... .... .. . ... . ........ . . .............. . . ........ . .... . ....... . . . . . .... .. ..... .... . . ......... .................................... . . . ... . ... ......... . .. . . ..... ................................................................................................................................................................ .. .. .... . ... ...... .... ... ...... ...... . . . ... . .. .. . . .... ..... ... . . . ... ........................... .. ... . .. . . .. . ... ...... . . .. . .... . ... .... .... . ..... . ....... .... . ... . . ... .. . . . ..... .. .. ...... ... .. ........ ............................................................................................................................................................................................................................................................................ ..... ........ .. ................ ......... .. . . .. . . . ..... .. . . .... ..
lowQualScore : 8 888 888888888 9999999999999 0 7 777777777777 00 777777 33 3333333333333333 00 444 00 55 55 777777777777 00 6 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 0 0 111111111111111111 4 0 4 3333333 0 555555555 99 0 88 00 4 11 4 44 9 222222222 1111 6 444 3 444444444444444444444444444444444 00 3 5 3 222222222 0 33 4444444444444 3 9 9 000 7 99 7 0000000 888888 77777 3 66 66 00 5 444 7777 1 3 3 99 9999999 7777 00 6 888 3 11111111 0 0 33333333333333 0 3 33333333 1 5555 4 1111111 9 9 5 9 9 6666 55 11111 6666 4 2 000000000 111111111111111111111111111111111111 5 7 0 555 0 000 000000000 0 88 1 1 00000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 99 5555 9 555 000000 7777 888 000000 000000 7 7 8 222 8 55 00 6 6 9999 44444 000 7 7 7 888 444444444444444444444444444 88 888 7 33 7 1 33 7 999 444444 6 6 22 6 4444 6 222 3333 8888 5 88888 5 5555555 8888 5 777 5 5 777 77 5 5 5 44444 88 22 888888 666 33 77777777 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222 33333333 77 4444444444444444 555555555 99 3 2 77 2 2 2 55555 88 4 9 0000 22
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTATAGATGNTTTGAATG----------CGTC-TAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---AA---TT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAG--TATATA--------TAGT--GAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTAC---C--AAC---GAANAGA-AT-A-----CANTG-A-C-GA---T--T--TA----TGG--------NCCA-CA-TC-T------CGC---------GTA-AAAGAAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCATA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCAA-CG----TTTG----AG--TTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCT----T---A-TAAG-CAAAC------TA------T-GCCAAAA--------TATAT-TAC----AACCCTCTTTNTNT-TTATT-TTAT-TCTTGCATTGG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-CG--AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCGA-A-G-----AGAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-T------------------------NT----------------------AC--CA-----------------------AG----------A------TT--------T------C--------A--------CGT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TT-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( family-198 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTATAGATGNTTTGAATGTT-T--AA--TGTC-TAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---AN---TT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAG--TATATA--------TNGT--GAGCAG-AC-----A-C--T-N--ATTAN---C--GAC---GAANAGA-AT-A-----CAATG-A-C-GA---T--T--TA----TGG--------GCCA-CA-TC-T------CGC---------GTA-AAANAAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GNTTT----TAA-CGAGAT---TTANTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCATG-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCAA-NT----TTTG----AG--TTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCT----T---A-TAAG-CAAAC------TA------T-GCCANAA--------TATAT-TAC----AACCCTCTTTNTNTCTTATT-TTAT-TCTTGCATTGG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-CG--AAANAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCGA-A-G-----AGAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAT-C-------G------------------A-T------------------------NT----------------------AC--C------------------------AG----------A------TT--------T------C--------A--------TGT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-NT-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|1 : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAA-A---ATAAAATATAAGTTATAGATGTTTTGAATGTT-TTGAA--TGGCATAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---AAAATATGGAA---A---T---AT---TTTGCCTGTCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAG--TATATA--------CTGT--GAGCAG-AT-----A-C--T-T--ACTAC---T--GAT---GATCAGA-ATCA-----CAATG-A-CTGA---T--T--TA----TGGA-------GCCATCA-CC-T------CTC---------TTA-AAATAAAT-AGGTT-GTAAG----G----A--AA-TAAA--C-AGT-AG--GAC-CTA-CGACATG-CGG-T-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAAAG-AA--TATC--TTT----ATAAGACAATGT--AT-AAATGAAAAACATT-TTTTTTTTTTTTCATAAGTAAAA--TCAA----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGACAAG-GT--GG--GGGATAAATT---ATA----CAAATTAATATCAA-G-TATA--TCAA-AT----TTCG----AG--TTTG-ATAGAAAATTC---ATGAT-TTATTTATTCTATCTGTCCT----T---A-TAAG-CAAAC------CA------T-ACCATAA--------TATAT-TGC----AGCTCTCTTTTTTTCTTCTT-TTAT-TTTTGCATTGG-GTGC-CTTTCTGATGCAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GGAAAAA---------AACC-CG--AAAGAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AA---AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTTCA-CGT---GTAAGTTATA------AA----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G-----AA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-AA-------G----TAGT---TAAA-T-GC---AGT--TGCTG-TCGA-A-G-----AGAAT--AT--C------T---TT--G--------AGAT-C-------G------------------A-T------------------------GT----------------------AC--C------------------------------------A------TT--------T------C--------A--------TGT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-GT-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGG--C----------A-----A---------A--CAAA-CACGC-T--T-CCGTC-TA-ATAA-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATCT
gi|10 : ATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCT----T---A-TCAG-CAAAC------TA------T-GCCAAAA--------TATAT-CATGTTGAACCCTCTTTATTT--TATT-TTAT-TCTTACATTGG-GTGT-CTTTCTGATACTG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGATG-----------GAAA-GA---------A--C--A--AAATAT-TT---C-TTC---ACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AACA-----------C---AG-TAC-------AAG---T--G----A----------A---------A---------------------G---T--ACTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTCAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------ATAAA--A---TTTTA-C--GCTC-AAGCTTT--GTAT-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--CT----GT----TAAA-GG-----TA-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TTGA-A-G-----AGAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-TTTTGCCACACACGGAACATACAATGT----------------------AC--CA-----------------------AG----------A------TTTCAACATTT------C--------A--------TTT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TG-A----------A---------CTTTTTTTTTTTT-T----------T-----TT--------TCCA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----c
gi|11 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgAAAA--------TATAT-TGC----AATC-TCTTTCT-------T-TTAT-TCTTGCATTGG-GTGT-ACTTATGATACAG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C--A--AGACAT-TT---C-TTC---ACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATT-----ATA-----------------------T--------T------------------A---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--ACATTATTTC------C---------AT----------------G---AATAT--TCGTA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACAA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-ACATGAATTTCTT-----CTT---AG-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATGTT--GTCG-A---AAA------TTC-T-G--T-CAC----GAGAGAC-AG---T----A---------------------A-------G----TACT---TAGA-A-GC---AAT--TGCTG-TCGG-A-A-----AGAAT--AC--T------G---TT--G--------AGCT-T-------GCTTTTGCCACACACGGA-A-C------------------------AT----------------------AC--C------------------------AAGATTTTAGC-A------TT--------T------C--------A--------TGT-----TTC-------A-G-----------TT--------T--A---------T-TT-C----------A---------CCCTTTGT------AGGTCTACTCCT-----TT--------TTGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-A
gi|12 : G--TT----GT----TAAG-GA-----TG-TA-------G----TATT---TCGA-A-GC---AATATTGCTG-TCGA-A-T-----AGAAT--GC--T------G---TT--G--------GGAT-T-------GTTATTTGTTACGCACGGAA-C------------------------AT----------------------AC--CA-----------------------AG----------A------TT--------TCAA---C--------A--------TGTGATGATTC-------A-A-----------TT--------T--G---------TAGT-T----------A---------CA------------A----------T-----TT--------T
gi|12 : -------------A----------T-----TT--------TCGA--CCAAATAATTTA-----A---------A--AAAA-AATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--GTACTTTGATatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|13 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtg-CA--AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TC-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AA-------------TACAGT-AAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T--TTTGA--G----CTGCC-CGT---GTAAGTTATA------AG----TACG---GCTGATC------A------TT-ACAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CTT---AA-A-A-A---G---------A---TATC------A---A--A---TTTTA-C--ACT--AAACTTT--GTAG-A---AAC------GTC-T-G--T-CAA----GGGAAAC-GG--TA----GT----TAAA-GG-----TG-TT-------G----TAGT---TAGA-A-GC---CGT--TGCTG-TTGA-C-T-----AGAAT--AT--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-TC-----------------------AT----------------------GC--CACACAGGGAACATACAATGTAACAAA----------A------TT--------T------CA-------A--------CAT-----TTCATGTTTCA-A-----------TT--------T--A---------T-TT-A----------G---------CATTTTCTTGAA--A----------T-----TT--------TCGA--C----------T-----A---------A--GAAA-CATGT-G--T-CAGCT-TA-ACAG-----T--AT-T-G----TCA--ATACTTTGATT
gi|14 : ATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGT---AT---A-AATCAATAAAACAAACA---AC------TAAGTTATAGATGATTTGAAT----------------------AGT-TTAGAATCCTAAATTATTT---TC------------C---T---AA---TT--CTTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATATA--------TTGT--GAGCAG-ACAGCGTA-T--T-C--ATAAA---C--AAC---GAAGAGACAT-------TAA---A-C-GA---A--T--TAATACTGGTTGGTAGTGCCAGCA-TC-TACCGTACAT---------GTA-GGTTACATAAA-TT-AAAAG----T----A--AA-TTGG--G-AGA-AG--AGT-ACG-CTGCATG-CGGAT-GTTCT----CAG-CCGG---------TG-A----GTC--TTT----GTAAG----------T-AAAGGAAGACCATGTTTTTTTTATTTTCA----------------------------------C-AAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AAT-----GTCGa
gi|15 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagt---G---T--TCTGA--G----CTGCA-AGT---GTAAATTATACATGTAAG----TATG---GTTGATC------A------AT-ACCACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TT---------------------------CCC---AA-A-A-C---G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-ATACTTT--GGAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-AA-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA--------AGT--TGCTG-TCAA-A-G-----AAAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-T------------------------TTTTTCACAC--------------AC--A------------------------AGATTTCAAC--A------TT--------T------C--------A--------TGT-----TTT-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TT-C----------A---------CATCTTTTTTTGAAA----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACCTTGAT
gi|16 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa-AA-T----C----GATA-----------GAAA-GA---------A--C-AG--AAGA---TT---C-CTC---ACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AAACACATATACTTA-G--------------T---GT-TAA-------AAGTGAA--A----A----------C---------ATTATTTCCATGAA----A---G---T--CTTGA--GAGCTCTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---T---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-A--ACTC-AAACTCT--GTAG-A---AAC------CTC-T-G--T-CAA----AAGAGAC-AG--CT----AT----TA-----------------------------------------GC---AGT--TGCTG-TCGA-A-G-----AAAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-TTTTGCCACAC--------------AT----------------------AC--C------------------------AAGATTTCAAC-A------TT--------T------C--------A--------TGT-----TTC-------A-A-----------TT---------------------T-TT-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------------A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCA-TA-ATGG-----T--c
gi|17 : TAAATTG-A------AG----TATGT--GTTGATC------A------TTTGCATCTAGGAATGTTCAC-A-A---TA-C--TT-AA--T-T-AC----ATATCTTT----CCT---AA-A-A-A---G---------AGATT---------AC--A--A---TGTTAAC--ACTC-AAACTTT--GTAG------AC------TTC-T-G--TCCAA----GAGAGAC-CATTTT----AT----CAAA-GG-----T--TA-------GT---TAATTTATAGAGA-GC---AGC--TGCTG-CCGA-C-G-----ACAAT--ACT-T------G---TTGGG--------AGAA-T-------G------------------A-TTTTGGCCACACACGAACA------AT----------------------AC--C------------------------AGATATTTCAATA------TT--------T------C--------A--------CGT-----TTCT------ATA-----------TT--------T--ATTTTATCACT-AT-G----------A---------T-------------G----------T-----TTTGAAATG-TCTA--C----------A-----ATACAAAGCAA--CAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--A----C----TCA--ATAATCTGAT
gi|18 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT----GAG-CAAGAT---TTGTTA-AA--TATCATTTT----CTAAAAAAA-A---GT-GGGGGGGGGGTAA------CTAATTTTTATAAGTAAAA--T--A----aa
gi|18 : TAATTT-TTATA-A-GTA---AAATA--CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AAATTAAAGTCGA-AAGTGT--GG--GAGA-AA-TG---GGA----TAAATTAATCTTAA-G-TCTA--TCAA-CA----TTTG----AA--TTTC-ATAGAATATCT---ATGGA-TTCTTTATTATGCATNNNNN----N---N-NNNN-NNNNN------NN------N-NNNNNNN--------NNNNN-NNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNA--GA-GTATGCCTTTTAATACAT----TATCTAAGAA----------------------------------------------GAA------------------CA--AAATAT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------ctgtagaattttcaaataaattaaagtcgaaagtgtgggagaaatgggataaattaatcttaagtctatcaacatttgaatttcatagaatatctatggattctttattatgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagagtatgccttttaatacattatctaagaagaacaaaatatttcttcaaattttccattcctttatttatttcaaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|19 : tttgagcaagatttgttaaatatcattttctaaaaaaaagtggggggggggtaacA-T----T----GATA-----------GAAAGAA---------G--C-T----AAGAT-TT---C-TTA---GCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A--------------------------------------AA-------CAC--ATGTA----G----------T---------AG----------------A---G---A--TCTAA--G----TTGTA-TATAATGTAAGTTTTA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACGAGGAATAT-CACCA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-A---AT--------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-GATCTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTA-TCGA-A-G-----ACAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAA-T-------G------------------G-T------------------------TTTGCCACACACGGAACATAAATAAC--A------------------------AG----------A------TTACAACATTT------C--------A--------TGT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TT-A----------A---------C-------------A----------CTGATGTT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|2 : cT--GAGCAG-AC-----ATC--T-TGAATTAC-------AC-----ACAGG-AC-AGG---CGTTG-AGC-GA---A------A----TGA---------CCT-TA-TC-T------CGC---------ATAGAAAGAAAT-AG-TA-GGAAG----GG---A--AA-TAGAATG-GAA-AA--AAT-ATA-CGACGTG-CAGTT-G-TTG----TAA-CGAGAT---tg
gi|2 : ataaaAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAAA-----GTCGA-AAGCGA--GG--GGGG-G--TG---AGA----TATATTGATATCAA-G-TATA--TCAA-TG----TTTG----AG--TT-------------C---A-GAG-TTCTTTTATCTATCTGTCCT----T---A-TAAG-CAAAC------TACATGTAT-GCTAAGAATACAATGTATAT-TAC----AACCCACTTT-------ATT-TCAT-TCTTGCATTAG-GTCT-CCGTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGA---------A--C-C---AAAGCT-TT---C-TTC---AGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AATCACAGTACATTAAG--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----AACTATTTC--C---------AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTACA-TGT---GTAAGTTTTA------AG----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGAAATAT-CACCA-A---TC-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-----G---------A---T---------ATC-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GCTG-A---AAC------TTC-T-A--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGC--TGCTG-TCGA-A-G-----AGAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-T------------------------TTTGCCAC----------------AC--A------------------------AGGA--------A------CA--------TACCAAGC--------A--------TGT-----TTT-------A-A-----------TT--------T--A---------ggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|20 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacga---G---T--TTTGA--G----CAGCA-CGT---GTAATTTATA------AG----TATGATAGTTGACC------A------TT-GCAATTAGGAATGT-CAGTA-A---TA-A--TTTGA--T-T-AC----A-TTCTT-----CAT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---T--G---TTTTA-C--ACTC-AAA--------------------------C-T-G--T-CAG----CAGAGTC-AG--CT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCAA-A-GACAATAGAAT--AC--C------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-TTTTGCCACACACGGAAC-------AT----------------------AC--CA-----------------------AG----------A------TT--------T------CAACATTTTA--------TGT-----ACC-------A-A-----------TCTACATATGT--A---------T-TT-A----------A---------CATTTTTCGGA---A----------T-----TT--------TCAA--C----------A-----A---------G--CAAA-CATGT-T--T-CCGCC-TA-ACAGTATA-T--AT-T-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|21 : cattaaatccacgaaaGTC-TAAATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT---ACAG------A---A---T---AA---TT--CCTGCCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAG--TATGTACATTTGTATAGT--GAGCAG-AC-----A-C----C--ATTAGGCAC--AAC---GAAAA------------CAAT-------A---T--T--TA----GAG--------TCCA-CA-CG-T------TTA---------GTA-ACATGAAT-GG-TTTATAAG----T----G--AA-TAAA--G-AGA-AA--AAT-ATT-CAACATG-TGGGT-GATTT----TAA-CGAGAT---TTATTGAA---TACA--TTT----TTAAGAAAA-GGGTAT-AAAGGAAGACTATA--TTTTTTATTTTCATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AAA-----GTTCA-AAGCGT--AA--GGG--AAATG---AGA----TAAt
gi|22 : ttatgaaatgtctttccta-AAGGAAAT-GG-TG-GGAAG----G----A--AAATAGA--G-TGG-AA--AGT-ATA-CAACACG-C-----ACTTTATG-TAA-CGAGA----TGATTG-T---TGTC--TTT----G-AAAAAAA-GT--AT-TAACAAAGAACATG-CT---------------GC---A--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GC
gi|22 : gACCCTCTTTATGTA--ATT-TTAT-TCTTGCATTGG-GTTT-CCGTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|23 : gaaggaaatggtgggaaggaaaatagagtggaaagtatacaacacgcactttatgtaacgagatgattgttgtctttgaaaaaaagtattaacaaagaacatgctgcatatgtaatttattgtgcgtaacatatcgtagaatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTCA-AATATGGAA---A---TCA-AT---TT--CCTGTATTT-ATACGG--ATATGC--AGATGCAG--TATA-------------T--GAGCTGCAC-----A-G--TAC--ATTGC---A--AACCTTGAACAT---T-A-----CATTGAA-C-GA---TA-A--TG----CGG--------CCCA-CA-TTAT------C-C---------GTA-AAA
gi|23 : A-AA--ACT-AT-----TATG-CGGGTTGTTTT----TAA-C-AGGT---TTACTG-GAAGTATC--CTT----AT-------------T-AAATGAA--CCCTA-TATTGTTAATTTCATAAGGAAAAAGT--AATGGTGTA-TTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGC-T--GG--GGAA-TAGAA---AGA----T-AATTAA-GTTAT-G-AATA--TCctattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|24 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgt-------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------C-----A---------A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-CA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGcaag
gi|25 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------A-----A---------A---AAG-CATGC-T--T-CCGAC-TA-ACAG-----T--AT-T-T----T
gi|26 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtaAT-C-CTACA---TA-C--TTTAA--TCT-CC----ATATCTTAATCTCTT---AC-ACA-A---ACCTCGCACTA---T---------AC--A--A---TTTTA-CCCACTC-AACCTTT--GTAG-ACACAAC------TTC-T-G--T-CAACTTAGAGAGAC-A----T----AC----TAAATGGCCCCTTC-TC-------GATCCCAGT---AAGA-AAGC---AAT--CGCTGCTCAACA-GC----AGAATTCAC--T------CC--TT--GC-------AGAT---------G------------------A-T------------------------TTTGCCTGCA--------------AA--C------------------------GG----------AAAACACTT--------T------C--------A--------AGC-----ATC-------A-AACATGTCACATTT--------T--T---------T-TC-A----------A---------CTT-----------C----------T-----TT--------TCGAAAC----------A-----A---------AA-CAAA-CATGT-T--TGCCGCC-TACACA------T--AT-T-C----TCC--ATACTTTGATTga
gi|27 : tatcacaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---TCCCAA---TT--CCTGTAGTTTATACGG--ATATGC--AGATGCAG--TATA-------------T--GAGCTG-AC-----A-CAGTAC--ATTGC-------ACCTTGAA---A-AT-A-----CATTGAA-C-GA---TAAC--TA----GCG--------CCCA-CA-TA-T------CCC---------GTA-AA
gi|27 : ATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGGT---TTACTG-AG--TATC--CTT-----T-------------T-AAATGAACACCATA-TATTTTAATTT-CATAAGGAAAA--T--AAATGTGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGCGT--GG--GG---AAATG---AGA----TAAATctattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|28 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactatt-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----TTT-------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATT
gi|29 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaactagaggcagtgattgctctttaagatccttattggtatgcaggacacaagaccaaaagtcaagctttaCTGA--G----CTGCA-CAT---GAAGGTTATA------AG----TACA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---T-------------------------TCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------AT--AC-A---TTTTA-T--ACTC-AAACGTT--GTAA-A---AAC------CTC-T-G--T-CAA----AAGAGGC-GG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAAC-A-GC---AGT--GGCTG-TTGA-A-G-----AGAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-TTTTGCCACACACGGAAC-------AT----------------------AC--CA-----------------------AG----------A------TT--------T------C--------AGCATTTCCTGT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-GT-A----------A---------C-------------ATTT-------T-----TT--------TTTA--A----------ATTTTTG---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAa
gi|3 : ----GATG-----------GAAAGAACACATATATA--C-CG--GTATATCTT---C-TTC---ACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----------------------------------------------------------------------------------------------T-TAA-------AAG--AT--A----GCCTTATTTC-C---------AT----------------GAATG---T--CCTGA--G----CTG
gi|3 : TGCAACAT---GTAAGTTACA------AG----CATG---GTTGATCATTGCAA------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTTTTAAATT-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AACA-A-G---G---------A---T---------AT--A--A---ATTTA-C--ACTC-AGATGCT--GTAA-A---AAA------TTC-T-G--T-CAA----GAGATACTAT--TT----TT----TAAA-GG-----TG-TA-------A----TACA---TAGA-A-GCCATAAT----CTG-TTGA-CTG-----AGATT--GC--CTTAAAAG---TT--G--------CAACACGCG----G------------------A-T------------------------AA----------------------AC--CA-----------------------AG----------A------TT--------T------C--------AACATTTCCTGT-----TTA-------A-A-----------TT--------TAAA---------T-TT-A----------AG--------C-------------A----------T-----TT--------TTGaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattatT----T-CA-T----T----GATG-------------AAAGA---------A--C-CG--AGATAT-TTATTC-TTC---ACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACTGTATACATGATTTTTAATACATGT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------GT----------------tttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : cat---T--TCTAATTG----ATGTA-CGT---GTAAGTTATA------TG----CATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAACTAGGAA-----ATTG-A---TA-C--TTTAtatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|31 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttAA--------TATAT-TAC----AAAC-TCATTATTTC--ATT-TTAT-TCTTGCATTGG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AATG-----------GAAA-GA---------A--C--A--AAAGTT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------T------------------AAACACAGTATATTA-G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------CTTTATTTCCAT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTGCA-CAT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-C---TA-C--TATAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---
gi|32 : ctaA--C----------A-----A---------AATCAAAGCATGCCT--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|33 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggacTTAATA---A-A-TGTA--T-----T----TTTG----AA--TTTC-ATAGGAAACTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCT----TTTAA-TAAA-CACAC------TA------T-GCCAAAAA-------TATAT-TGC----AACCCTTTTTCT---TTATT-TCAT-TTTTGCATTGG-GTGT-CTTTATGAAAGTG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT---------------------------------TG--ATATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----c
gi|34 : -----TT--------TTAA--C----------C-----A---------A---AAA-CATGC-T--T-CCCAC-TA-CCAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGAcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|35 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaactagagacagtgattatcttcaagagtattgacccttattgatctcaggacacaagatcaaaagtcgcgctgtaaA--------TTTAT-TA-----AGTCATCTTTTTAT--TGCTGTTGT-TGTTGCATTGG--TGT-TTTGTTGATACGC----TATCCAAGAACATTT----AAT----C-TA-T----T----GA----------------AAGA---------A--CACAT-AGATAT-TT---C-TTCTTCGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TT-----ACT-----------------------CTGTGTACAC------------------A---------------G--------------T---AT-CAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATA---------------A---G---T--TCT
gi|36 : tcatatatttattttttcatttttatgaaatt---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-CA-----TG-CA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCGA-A-G-----AGAAT--AT--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-TTTTGCTACACACGGAAC-------AT----------------------AC--C------------------------AAGATTTCAAC-A------TT--------T------C--------A--------TGT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TT-A----------A---------CATTTTTGGAA---A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCT-TG-ACAG-----T--AT-T-CTCTATCA--ATATTTTGATTTaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT---AAGA-GAGTAAAACAAAAA---AG------TTAGTTGAACATGTTTTGAAT-----------TGTC-CAAAAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT---AC--TA---AA---G----------------CCTGTAA---ATACAG--ATATGC--AGATGCAG--TATATA--------TAAC--GAGTAG-AC-----A-ttc
gi|38 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataaga---------A---T---------C---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-A--T-CAA----GAAAGAC-A---TT----AT----CAAA-GA-----AG-CA-------G----TAAT----------------GT--TGCTG-TCGA-A-G-----AGAAT--AC--T------G---TT--G--------AGAT-T-------G------------------A-TTTTGCAACACATGGAAC-------AT----------------------AC--CA-----------------------AG----------A------TT--------T------C--------AG-------CAT-----TTC-------A----------------------------------------------------------------------------A----------T-----TT--------TTGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--C-CCGTC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATata
gi|39 : at---AA-A-ATA---T---------A---T---------A---A--A---TTGTA-C--ACAT-AAACGTT--GTAG-A---AAA------TTA-T-C--T-CAA----GAGATAC-TT--TT----GT----TAAA-GA-----CG-TT-------G----TACT---TAGA-A-GC---AATA-TTCTG-CCGA-A-A-----AGAAT--AC--T------GTTTTT--GCCACACACAGAA-CAAACCAAG------------------A-T------------------------TT-----------------------C--A------------------------AC----------A------TT--------T------C--------A--------CGT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TT-C----------C---------C-------------T----------T-----TTTGAAATACTCGT--C----------A-----A---------A--CAAa
gi|4 : aA---A---T---AA---CT--CCTCTAA---ATAGGGAAGTTAGCCCAGCGGCA---TATATA--------TCACTGGAG-AG-AC-----A-A--T-C--AT----------AT---AAAAAAA-AC-GTTGACCCATA-A-C--A---T--CACTA----TTG--------ACCA-CAATC-T------CGCAGATGGAGGGTG-AAAGA----------GGAAG----GTTAGACTAA-TGGATTG-CGT-AAGGAATCATATCGACATGGCAGGT-TTTCTGTTATAATCGAGATGTTTTACTG-G---T------TT----ATGGGAAAA-G---GTTAAACGAAGAA-ACA-TT---------------GCAGAA--T--------GTAATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AA-------TTAA-A----T--GATAAAAA-AAATGTAAAGAATGCTAAATTAATATCA----TA-A--TCAC-ATATGATTTG----TG--TTTCTATGAAATATTCTGCATGAG-TTCTT-ATTCTATCTGTCCT----A---AATAAGGCAAGC------TA------T-GCCAAAAA-------TATGT-TTC----GTACTTTTTTA-ACCTTATT-TTATCTCTTGCATTGG--TGT-CCGTCTGAAACAAA---TATCTAAGAAC-TTT----CAT----TGAA-TCAA-T----GATG-------------AAAGA---------A--C-CATAGAAGAT-TT---CCTTC---ACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT------TT-----------------------T--------C------------------A---------------
gi|40 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctttaaattagtttacgttaattcgtgtagttaggcgtattatgcttaactagcaatgggtaattT-----ATT---------------------------------------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CAacacagtatttca
gi|40 : AA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CACnaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|41 : tattagtgttaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcan-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------T--CA-----TAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----CCA--TTACTTTGATT
gi|42 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggcttta--T-T-TC----ATTTCTT-----TTTGGGAG-A-G-ATATG---------A---T---------A---G--A---TTTAA-C---CTC-AG---TTGAGCAG-A---A--------TTC-T-ACTC-CAG----GAGAGGT-AG--TT----ATGTTGTTAA-GG-----TG-TG-------------------TAGA-G-GC---AAT--TTCAA-TCAA-G-G-----GGAGCA-AC--T------A---TT--C--------AGAc
gi|43 : tATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTAA-GA-AAATAAA-CAAACA---AT------TAATTTATAGATGTTTT-AACA-----------GTA-TAAAAGAAGGTTGGGAGCTT---------------ATATGGAA---ATCTT---AA---TC--CCTGTAA---ATACAG--GTATctgtttgattctaaaacaagaaacataccaacatttcaatat
gi|44 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataaTT----AAT----T-AA-T----TT---GATG------------AAAAGA---------A--C--A--AGACGT-GT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATATTGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ATAATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCTGA--G----CTGCA-
gi|45 : atatctatataaccttataatataataA------AA----CATG---GTTTATC------A------TT-GCAACTAGCAACAT-CACTA-A---TA-T--TTTGA--T-TGAC----ATTTTTT-----CTT---TA-A-A-A---A---------T---T---------A---AAGA---TCTGA-A--ATTT-ACAC------TAA-A---AAC------TGCAT-G--T-GA------ACAGAC-AG--TT----GT----TAA-------------C-------G----TACT---TGGA-A-GC---AAT--TACTG-TCGA-A-T-----AGAAt
gi|46 : gc-CAATTAAACAAACATAAAT--------AGCTATATACGAAT---ATGTTGT--AAATCGTC-AAAAAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT---ACAACATTGAA---A---TCCTAA---TT--TCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGCTGCAG--TATATA--------TAAT--AAGCAG-GC-----A-C--
gi|47 : T----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------G--C-AG--AGATAT-TT---C-TTCTTCACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TT-----ATCGTATACACGATTTTTAATACATAT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------aaat
gi|48 : tcgaaatgtttagcaatacC------TTC-T-A--G-CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCGA-A-G-----ACAAT--ACTGT------G---TT--G--------AGAA-T-------G------------------A-T------------------------TT----------------------tattttcatgactgttctcagctga
gi|49 : cgcaaagcC------TTC-T-A--G-CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCGA-A-G-----ACAAT--ACTGT------G---TT--G--------AGAT---------G------------------A-T------------------------TT----------------------tgccacacacggaacataacaatatttcaatatatcacgtttcaattta
gi|5 : cgcaaagcAAG----G----A--AA-TAGA--G-AAA-AA--AAT-ATA-CAATATG--------TCTA----TAA-CGAGAT---TTAATG-AC--TATC--TTT----A--AGAAAG-G---CT----------------TTTTTTAATTTTCATAA-TAAAA--T--A----------------------------------CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------ACA-----GTCGA-AAGCAT--GG--GGGA-AA-TG---TGA----TAAATTAATTTCAG-G-TATA--GCAA-CA----TTTG----AG--TTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTNNNNNNNNNNNNNN----N---N-NNNN-NNNNN------NN------N-NNNNNNN--------NNNNN-NNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNN-------AT-CCTTCAGGTACAGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GATG-----------GAA--GA---------A--C--A--AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATC-----------------------T--------C------------------A---------------AACACAGTATACTTAT---GT-TAA-------AAG--AA--A----A----------C---------ATTTTTATGAA-------A---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GGAAGTTATA------AG----TGTG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-AACTT-A---TAAC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----C-T---AA-A-A-AT--G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAA-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-CA-------G----TAGT---TATA-A-GC---AGT--TGCTG-TCGA-A-G-----GCAAT--AC--T------G---TT--G--------AATT-T-------G------------------A-T------------------------TTTGCCATACACGGAAC-------AT--C------------------------AAAT--------A------TT--------T------C--------A--------TGT-----TTT-------C-A-----------TC--------T--A---------T-TTCA----------ATTTTTTTTTT-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-C--------------------AT-T-C----TCA--ATGCTTTAATTtgccacacacggaacataacaatatttcaatatatcacgtttcaattta
gi|50 : tt-------------A----------T-----TA--------TCGA--CCAAA------A-----A---------A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--Ac
gi|51 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaTAAATCAGTT---ACAATATAGAAATGA---T---AA---TT--ACTGTAC---ATACGG--GAATGC--AGA---AG--TATATCCT------TAGT--GAGCGG-AT-----A-C--T-G--ATTAG---C--gattttatttgca
gi|53 : ctaaggaagcggaataA-TGT---GCAAGTTATA------AG----CATG---GTTTGGC------A------TT-TCAACTAGGGATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCA---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTacaatggacgat
gi|54 : ttattagaagtctccatatatAATTACA------AA----TGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--AGAAA----CACAA-AATATA-T--TTCAA--T-TTAC----ATTTCTT-----CAT---TG-A-A-A---G---------A---C---------A---A--AGTATTTTA-C--GCTG-AAACTTT--GTAG-A---AAA------TTc
gi|55 : agTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TG-ATTTTCAAGACA---------C-------------A----------TA----GT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATTC-TAAT-TCTCC-TA-AC-G-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATTtgg
gi|56 : tcagagtatatgactaACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-------TTAGACAA--------------TAAGTTATAGATGATTTGATTGatttt
gi|57 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggt----------A------TT--------T------C--------A--------TGT-----TTT-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TT-C----------A---------CTTTTTTGTTTTA-A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATA-ACAG-----T--AT-C-C----TCA--ATACTTCGATTT
gi|58 : ttcaac---------A---T---------A---T--G---TTTTA-A--ACTC-AAACGTT--GTAG-A---GACAGACAGTTG-TAG--A-CAG----GAGAGAC-A------------------A-GA-----TG-TA-------G----TCCT---TAGA-A-GT---AAT--TGCTG-ACAA-A-A-----AAAAT--
gi|59 : -------------A----------T-----TT--------TTGA--C----------C-----A---------A---AAG-CATGC-T--T-CTACC-TA-TCAG-----TAGATAT-T----TCA--AT
gi|6 : attgcagattcttgatcgatcttcacaccaaaagtagggctgtaTTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AAA-----CTCGA-AAGCGTAGGG--GGAA-AAATG---AG-----TAAA-TAATTTCAA-GTTATAGCCCAATGT----TCTGCCACAGATCTTC-CT--AAAAGTC---ATAGG-TT-TTTATTTTATCT-TCCT----T---A-TAAGCCAAAC------TA------TGGCCAAAC--------CATATATAC----TAATCTCTGCATGT-TTATT-TTA--TGTTGCA--GGAGTGT-CCATCTCATACAG----TATTTTCGAA-ATTT----TATAATGT-AAGT----T----GATG-----------G-AAAGA---------A--C-----AAATAT-TT---CTTTC---ACATCT---------T-C-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACT-----------------------TAAACA---C------------------A---------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG--GT--A----T----------T---------A-----------------A---G---T--TTTGA--G----CTGTA-CAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GCAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----CAGAGAC-AA--TT----AT----TAAA-GG-----AG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCAA-A-G-----AGAAT--GC--T------G---TT--G--------AGAC-T-------G------------------AGT------------------------TT----------------------GCAACACACGGAACATACAA---------AG----------A------TT--------T------CA-------A--------CAT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TT-A----------G---------CATTTCTTGAA---A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------G--CAAA-CATGC-T--T-TTAAC-TA-ACAG-----C--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTTt
gi|60 : -------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------C-----A---------A--AAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTT
gi|61 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgta---------T-TT-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTT
gi|62 : gacgt---------T-TT-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC--A-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|63 : cgtTAAGTAAAA--T--AGA--TTTGATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AAA-----GTCGA-TAGTGT--GT--GGGA-actgtactgctt
gi|64 : ct--TTT----ATGAAAAAG-GT--AT-CAAGGAAGACCATA-ACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAA--T--A----
gi|67 : ttgaataactaAA-A-TATAC-TCAA-CGG---TTTG----AG--TTTC-ATAGAAAATTC---ATGAGTTTCTTTATTCTActgc
gi|69 : tTCAA-A-TATA--TCAA-CG----TTTG----AG--TTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTAT
gi|7 : ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AGA-----GTTGA-AAGCGT--GG--GGG--AAATG---AAA----T-GATTGATA--AATG-TATT--TCAA-CG----CTTG----AG--TTCC-ATAGAAAGTTC---ATCAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTAT---A-TAAA-CAAACTATGTATA------T-GCCAAAA--------TATAT-TAC----ACCCCT------------GT-TTAT-TC-TACATTGG-GCGT-CCTTATAATATAG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GATG-----------G-AAAGA---------A----CA--AGACGT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATAATGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ACCATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCGGA--G----CTGCA-CGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAGCTAAGAATAT-CACTG-A---TA-C--TTTGAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACGCAAAACGTT--GTAA-A---AAT------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAA-AG--TTATTAAT----TAAA-GG-----TG-TAC------A----TAGT---TAAA-A-AC---AGA--TGCTG-TCGA-A-T-----GGAAT--AG--T------G---TT--G--------AGTTGC-------GTTTGCCACACGCGAA---A-C------------------------AT----------------------AC--C------------------------AAGATTTCAAC-A------TT--------T------C--------A--------TTT-----TTC-------A-A-----------TT--------T--A---------T-TT-T----------A---------T-------------T----------T-----TT--------TC----C-----------------------------TTAA-C---T-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--GTACTTGGAT
gi|70 : A--C----------T-----A---------A--CAAA-CATGC-T--T-CTATC-TA-TCAG-----T--AC-T-C----TTA--GTACTTTGATT
gi|71 : ATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--AT-T-C----TCA--ATAATCTGATat
gi|8 : ---A-GA-CAATAAAACAAATA---AT------TAACTAATAGATGTTTTGAATA-----------GTC-TAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACGATATGGTA---A---T---ACAAATT--CCTGTAA---ATACGG--GAATTC--AGGTGCAG--TATAAA--------TAGT--GAGCAG-AC-----A-T--T-G---TAAT---CTGAAC---AAAAGAA-AT-G-----CGTTG-AAC-AAATTT--T--CA----TGA---------CCA-CA-TC-T------TGC---------ATG-GAAGGAAT----TT-GTAGGACGGG----A--AA-TGGA--GTGGATAA--AAT-AAA-CGATATG-CATTT-G-TTT----TAA-CGAGAT---GTA-TG-T---TGTG--TATGGAAATAAAAATG-C---AT-AAAGGAAGAACATG-TT---------------GTAAA-----------TCTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TAA-----GTCGA-AAGCA----G--GTGG-AAATG---AGA----TAAATCAATATCAA-G-TAAA--ACAA-TG----TTTG----AG--TTTT-ATAGAAAATTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCT----T---G-TAAG-CAAA----------------------AA--------TATAT-TAC----AACCA-------ATTTTATT-TTAT-TCTTGAATTGG-GTGT-CCGCCTGATACTG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AATT-----------GA-------------------TG--A---AT-TT---C-TCC---ACATTT---------TCC-G--TTatgacaaa
gi|9 : ataTGTA-CGT---GTAAGCCATA------AG----CTTG---GTTGATC------AATGCAATT-ACAATTAGGAATAT-CACTA-A---TA-T--TTTAA--TGT-AC----ACTTCTT-------T---AA-A-A-A---G---------A---TTTATATGCGA---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATATT--GTTGAA---AAA------TTC-T-G--T-CCA----GAGGGAC-AT--TT----GTG---CAGG-AG-----TGATACTCGAATG----TAAT---TA------C---AG---TACTG-TCGA-A-G-----ATAAT--AC--T------G---TT--G--------Attcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|9 : aatgaa-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A-----A---------G--CAAA-CATGC-G--T-CCGCC-CA-ATAA-----T--AC-G-C----TCA--CTAacttatttctgtcatacacagaacataccaagatttaaacatttcatgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1111111111111 2222222222222 111 111 5555555555 111 111 22222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 22222222222 111 1111111 222222222 11 1111 333333333333333333333333333333333 11111111 3333333333333333 1111111 1111111 1111 111111111111111 11111111 111 1111 111111111 33333333333333333333333333333333333333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111
lowQualScore : 0 4444444444444 1111111111111 000 000 1 2222222222 11 77777777 1 0 8888888 666 666 88 111 55 55 2 66666666666666 3 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 5 5 11111111111 4 777 000 1 8888888 1 222222222 66 5 33 66 4 66 4 55 0 77777 4 2 4444 3 666 7 777777777777777777777777777777777 55 2 0 2 55 88888888 2 33 2222222222222222 2 2 555 1 33 5 0000000 888888 77777 3 44 44 3 7 666 7777 0 3 3 77 666 0 7 1111111 3 555 3 5555 4 8 0 555555555555555 77777777 44 3 6666 5 1 444 2 2 2 2 2 2 3 6666 55 88888 0000 2 2 222222222 11111111111111111111111111111111111111 22 1 2 333 2 777 888888888 2 22 2 2 55555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 22 4444 1 333 555555 3333 444 000000 555555 1 1 1 333 1 22 88 3 3 3333 66666 333 1 1 1 444 222222222222222222222222222 33 222 1 22 1 4 22 1 222 444444 1 1 33 3333 1 333 3333 4444 1 33333 1 6666666 4444 1 222 1 1 222 33 1 22 1 1 55555 44 1 66 444 22 77777777 222 5555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44444 88888888 11 33333333333333333333 11 22 1 1 11 1 1 1 99999 11 1 2 3333 44
lowQualScore : . ............. ............. ... ... . .......... .. ........ . . ....... ... ... .. ... .. .. . .............. . ............................................................................................ . . . ........... . ... ... . ....... . ......... .. . .. .. . .. . .. . ..... . . .... . ... . ................................. .. . . . .. ........ . .. ................ . . ... . .. . ....... ...... ..... . .. .. . . ... .... . . . .. ... . . ....... . ... . .... . . . ............... ........ .. . .... . . ... . . . . . . . .... .. ..... .... . . ......... ...................................... .. . . ... . ... ......... . .. . . ..... .......................................................................................................................................................................... .. .. .... . ... ...... .... ... ...... ...... . . . ... . .. .. . . .... ..... ... . . . ... ........................... .. ... . .. . . .. . ... ...... . . .. .... . ... .... .... . ..... . ....... .... . ... . . ... .. . .. . . ..... .. . .. ... .. ........ ... .... ................................................................................................................................................................................................................................................................. ..... ........ .. .................... .. .. . . .. . . . ..... .. . . .... ..
lowQualScore : 8 6666666666666 9999999999999 000 000 0 9999999999 00 22222222 6 8 1111111 444 444 66 444 00 55 3 99999999999999 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 99999999999 4 888 000 4 3333333 0 555555555 99 0 88 00 4 11 4 44 9 00000 0 6 1111 6 444 3 444444444444444444444444444444444 00 3 5 3 00 99999999 0 33 1111111111111111 9 9 000 7 99 7 0000000 888888 77777 3 66 66 3 9 444 7777 1 3 3 99 444 4 3 8888888 6 888 3 5555 0 0 3 333333333333333 33333333 22 1 5555 2 6 777 9 1 9 9 9 9 1 5555 55 11111 6666 4 2 000000000 44444444444444444444444444444444444444 55 3 0 555 0 000 000000000 0 88 1 1 00000 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 88 99 5555 9 555 000000 7777 888 000000 000000 7 7 8 222 8 55 00 6 6 9999 44444 000 7 7 7 888 444444444444444444444444444 88 888 7 33 7 1 33 7 999 444444 6 6 88 4444 6 222 3333 8888 5 88888 5 5555555 8888 5 666 5 5 666 55 5 00 5 5 22222 22 6 00 444 22 44444444 888 0000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222 33333333 77 55555555555555555555 77 99 3 2 77 2 2 2 55555 88 4 9 0000 22
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTATA---GA---TGTTTTGAATGC--------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TC-TCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATAC-AG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AA-ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------C------------------A------------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C----------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------AT---G--------------------AT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-C-A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( family-198 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTATA---GA---TGNTTTGAATGC--------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CANT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TC-TCGC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTNTNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATAC-AG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AA-ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------C------------------A------------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C----------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------AT------------------------NT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-C-A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|1 : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAA-A---ATAAAATATAAGTTATA---GA---TGTTTTGAATGTTTTGAATGGCATAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---AAAATATGGAA---A---T---A---TTTTGCCTGTCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------C-T--GTGAGCAG-AT-----A-C--T-T--ACTA--C-T--GAT---GATCAGAATCA--CAAT-G-A-CTG------A---T--T--TA----TGG--------AGCCATCA-CC-TCTC---------TTA-AA---AT---AAAT-AGGTT-GTAAG----G----A--AA-TAAA--C-AGT-AG--GAC-CTA-CGACATG-CGG-T-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAAAG-AA--TATC--TTT----ATAAGACAATGT--AT-AAATGAAAAACA--TT-TTTTTTTTTTTTCATAAGTAAAA--TCAA----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGACAAG-GT--GG--GGGATAAATT---ATA----CAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---AAT-TTC-------GAGTTTG-ATAGAAAATTC---ATGAT-TTATTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACCA------T-A------CCATAA--------TAT--AT-TGC----AGCTCTCTTTTTTTCTTCTTTTAT-TTTTGCATT-GG-GTGC-CTTTCTGATGC-AG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GGAAAAA---------AACC-C---G-AA-AGAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------C------------------A------------------G--------------T---GT-TAA-------AA---AT--A----A----------C----------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTTCA-CGT---GTAAGTTATA------AA----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-G----AA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-AA-------G----TAGT---TAAA-T-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-T--CT---TT--G--------AG---A----TC--------------G------------------AT------------------------GT---------------AC-----------------C--------------------A----TT--------T-C-A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGG--C----------A---------A--A--CAAA-CACGC-T--T-CCGTC-TA-ATAA-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATCT
gi|10 : ATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TCAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-CATGTTGAACCCTCTTTAT-T-TTATTTTAT-TCTTACATT-GG-GTGT-CTTTCTGATAC-TG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AA-ATAT-TT---C-TTC---ACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------C------------------A------------------AACA-----------C---AG-TAC-------AAG---T--G----A----------A----------A---------------------G---T--ACTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTCAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------ATAAA--A---TTTTA-C--GCTC-AAGCTTTG--TAT-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--CT----GT----TAAA-GG-----TA-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TTG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------ATTTTGCCACACACGGAACATACAATGT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-CAA---------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-A----------A---------CTTTTTTTTTTTT-T----------T-----TT--------TCCA--C----------A---------A--A--CAAA-CATAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----c
gi|11 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgAAAA--------TAT--AT-TGC----AATC-TCTTTCT-------TTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-ACTTATGATAC-AG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AG-ACAT-TT---C-TTC---ACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATT-----AT-----A-----------------------T--------T------------------A------------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--ACATTATTTC------C----------AT----------------G---AATAT--TCGTA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACAA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-ACATGAATTTCTT-----CTT---AG-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATGTTG--TCG-A---AAA------TTC-T-GT--CAC----GAGAGAC-AG---T----A---------------------A-------G----TACT---TAGA-A-GC---AAT--TGCTG-TCG--G-A-A-----AGAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---C----TT--------------GCTTTTGCCACACACGGA-AC------------------------AT---------------AC-----------------C---------AAGATTTTAGCA----TT--------T-C-A---------TG-------T-------TT-------C-------A-GTT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CCCTTTGT------AGGTCTACTCCT-----TT--------TTGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-A
gi|12 : G--TT----GT----TAAG-GA-----TG-TA-------G----TATT---TCGA-A-GC---AATATTGCTG-TCG--A-A-T-----AGAAT--G-C--TG---TT--G--------GG---A----TT--------------GTTATTTGTTACGCACGGAAC------------------------AT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-CAA---------CA-------TGTGATGATT-------C-------A-ATT--------T--GTAGT---------T-A----------C---------A-------------A----------T-----TT--------T
gi|12 : -------------A----------T-----TT--------TCGA--CCAAATAATTTA---------A--A--AAAA-AATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--GTACTTTGATatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|13 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtg-C---A-AA-ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TC-----AT-----T-----------------------T--------C------------------A------------------AA-------------TACAGT-AAA-------AAG--AT--A----A----------C----------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T--TTTGA--G----CTGCC-CGT---GTAAGTTATA------AG----TACG---GCTGATC------A------TT-ACAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CTT---AA-A-A-A---G---------A---TATC------A---A--A---TTTTA-C--ACT--AAACTTTG--TAG-A---AAC------GTC-T-GT--CAA----GGGAAAC-GG--TA----GT----TAAA-GG-----TG-TT-------G----TAGT---TAGA-A-GC---CGT--TGCTG-TTG--A-C-T-----AGAAT--A-T--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------ATCATGCCACACAGGGAAC-------AT---------------ACAATGTAA----------C---------AAA--------A----TTTCAACATTT-C-A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTTCTTGAA--A----------T-----TT--------TCGA--C----------T---------A--A--GAAA-CATGT-G--T-CAGCT-TA-ACAG-----T--AT-T-G----TCA--ATACTTTGATT
gi|14 : ATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGTA---T---A-AATCAATAAAACAAACA---AC------TAAGTTATA---GA---TGATTTGAAT-------------------AGT-TTAGAATCCTAAATTATTT---TCC---------------T---A---ATT--CTTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-ATTGTGAGCAG-ACAGCGTA-T--T-C--ATAA--A-C--AAC---GAAGAG----A--CATTAA-A-C-G------A---A--T--TAATACTGGTTGGTAGTG-CCAGCA-TC-TACC---------GTA-CATGTAGGTTACATAAA-TT-AAAAG----T----A--AA-TTGG--G-AGA-AG--AGT-ACG-CTGCATG-CGGAT-GTTCT----CAG-CCGG---------TG-A----GTC--TTT----GTAAG----------T-AAAGGAAGACCA--TGTTTTTTTTATTTTCA----------------------------------C-AAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AAT-----GTCGa
gi|15 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagt---G---T--TCTGA--G----CTGCA-AGT---GTAAATTATACATGTAAG----TATG---GTTGATC------A------AT-ACCACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TT---------------------------CCC---AA-A-A-C---G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-ATACTTTG--GAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-AA-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA--------AGT--TGCTG-TCA--A-A-G-----AAAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------AT------------------------TTTTTC-----------ACACA--------------C---------AAGATTTCAACA----TT--------T-C-A---------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CATCTTTTTTTGAAA----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACCTTGAT
gi|16 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa-AA-T----C----GATA-----------GAAA-GA---------A--C-A---G-AA-G-AT-TC---C-T-C---ACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------C------------------AAACACATATACTTA----G--------------T---GT-TAA-------AAGTGAA--A----A----------C----------ATTATTTCCATGAA----A---G---T--CTTGA--GAGCTCTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---T---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-A--ACTC-AAACTCTG--TAG-A---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGAC-AG--CT----AT----TA-----------------------------------------GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AAAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------ATTTTGCCACAC--------------AT---------------AC-----------------C---------AAGATTTCAACA----TT--------T-C-A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT------------T--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C--------------------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCA-TA-ATGG-----T--c
gi|17 : TAAATTG-A------AG----TATGT--GTTGATC------A------TTTGCATCTAGGAATGTTCAC-A-A---TA-C--TT-AA--T-T-AC----ATATCTTT----CCT---AA-A-A-A---G---------AGATT---------AC--A--A---TGTTAAC--ACTC-AAACTTTG--TAG------AC------TTC-T-GTC-CAA----GAGAGAC-CATTTT----AT----CAAA-GG-----T--TA-------GT---TAATTTATAGAGA-GC---AGC--TGCTG-CCG--A-C-G-----ACAAT--A-CT-TG---TTGGG--------AG---A----AT--------------G------------------ATTTTGGCCACACACGAACA------AT---------------AC-----------------CAGATATTTCAAT--------A----TT--------T-C-A---------CG-------T-------TT-------CT------ATATT--------T--AT--TTTATCACTAT-G----------A---------T-------------G----------T-----TTTGAAATG-TCTA--C----------AATACAAAGCA--A--CAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--A----C----TCA--ATAATCTGAT
gi|18 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT----GAG-CAAGAT---TTGTTA-AA--TATCATTTT----CTAAAAAAA-A---GT-GGGGGGGGGGTAACTA--------ATTTTTATAAGTAAAA--T--A----------------------------------CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AAATTAAAGTCGA-AAGTGT--GG--GAGA-AA-TG---GGA----TAAATTAATCTTAA-G-TCTA--TCA---ACA-TTT-------GAATTTC-ATAGAATATCT---ATGGA-TTCTTTAT--TATGCATNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGA-GTATGCCTTTTAATAC-AT----TATCTAAGAA----------------------------------------------GAA------------------C---A-AA-ATAT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------C------------------A------------------aa
gi|19 : A-T----T----GATA-----------GAAA-GA---------A--G-C---T-AA-G-AT-TT---C-TTA---GCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------C------------------A-----------------------------------------AA-------CAC--ATGTA----G----------T----------AG----------------A---G---A--TCTAA--G----TTGTA-TATAATGTAAGTTTTA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACGAGGAATAT-CACCA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-A---AT--------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-GATCTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTA-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----AT--------------G------------------GT------------------------TTTGCC-----------ACACACGGAACATAAATAAC---------AAGATTACAACA----TT--------T-C-A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------CTGATGTT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|2 : cATA----------A--ATGAGCAG-AC-----ATC--T-TGAATTA--C-----AC-----ACAGGAC-AGGCGTT-G-AGC-G------A---A------A----TG---------A-CCT-TA-TC-TCGC---------ATAGAA---AG---AAAT-AG-TA-GGAAG----GG---A--AA-TAGAATG-GAA-AA--AAT-ATA-CGACGTG-CAGTT-G-TTG----TAA-CGAGAT---tg
gi|2 : AAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAAA-----GTCGA-AAGCGA--GG--GGGG-G--TG---AGA----TATATTGATATCAA-G-TATA--TCA---ATG-TTT-------GAGTT-------------C---A-GAG-TTCTTTTATCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTACATGTAT-G------CTAAGAATACAATGTAT--AT-TAC----AACCCACTTT-------ATTTCAT-TCTTGCATT-AG-GTCT-CCGTCTGATAC-AG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGA---------A--C-C---A-AA-GC-T-TT---C-TTC---AGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------C------------------AATCACAGTACATTAA---G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----AACTATTTC--C----------AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTACA-TGT---GTAAGTTTTA------AG----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGAAATAT-CACCA-A---TC-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-----G---------A---T---------ATC-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CTG-A---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGC--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------ATTTTGCCACACAAGGAAC-------AT---------------AC-----------------C---------AAG-------------------------C-A---------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--Aggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|20 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacga---G---T--TTTGA--G----CAGCA-CGT---GTAATTTATA------AG----TATGATAGTTGACC------A------TT-GCAATTAGGAATGT-CAGTA-A---TA-A--TTTGA--T-T-AC----A-TTCTT-----CAT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---T--G---TTTTA-C--ACTC-AAA--------------------------C-T-GT--CAG----CAGAGTC-AG--CT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-A-GACAATAGAAT--A-C--CG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------ATTTTGCCACACACGGAAC-------AT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-CAA---------CA-------T-------TTTATGTACC-------A-ATCTACATATGT--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTCGGA---A----------T-----TT--------TCAA--C----------A---------A--G--CAAA-CATGT-T--T-CCGCC-TA-ACAGTATA-T--AT-T-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|21 : cattaaatccacgaaa--------GTCTAAATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT---ACAG------A---A---T---A---ATT--CCTGCCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATGTACATTTGTAT-A--GTGAGCAG-AC-----A-C----C--ATTAGGCAC--AAC---GAAAACAAT-A------------------------T--T--TA----GAG--------T-CCA-CA-CG-TTTA---------GTA-AC---AT---GAAT-GG-TTTATAAG----T----G--AA-TAAA--G-AGA-AA--AAT-ATT-CAACATG-TGGGT-GATTT----TAA-CGAGAT---TTATTGAA---TACA--TTT----TTAAGAAAA-GGGTAT-AAAGGAAGACTA--TA--TTTTTTATTTTCATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AAA-----GTTCA-AAGCGT--AA--GGG--AAATG---AGA----TAAt
gi|22 : ttatgaaatgtctttccta-AA---GG---AAAT-GG-TG-GGAAG----G----A--AAATAGA--G-TGG-AA--AGT-ATA-CAACACG-C-----ACTTTATG-TAA-CGAGA----TGATTG-T---TGTC--TTT----G-AAAAAAA-GT--AT-TAACAAAGAACA--TG-CT---------------GC---A--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GC
gi|22 : gACCCTCTTTATGT-A-ATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTTT-CCGTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|23 : gaaggaaatggtgggaaggaaaatagagtggaaagtatacaacacgcactttatgtaacgagatgattgttgtctttgaaaaaaagtattaacaaagaacatgctgcatatgtaatttattgtgcgtaacatatcgtagaatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTCA-AATATGGAA---A---TC--A---ATTT-CCTGTATTT-ATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTGCAC-----A-G--TAC--ATTG--C-A--AACCTTGAACAT--T-A--CATT-GAA-C-G------A---TA-A--TG----CGG--------C-CCA-CA-TTATC-C---------GTA-AA---A
gi|23 : A-AA--ACT-AT-----TATG-CGGGTTGTTTT----TAA-C-AGGT---TTACTG-GAAGTATC--CTT----AT-------------T-AAATGAA--CCC--TA-TATTGTTAATTTCATAAGGAAAAAGT--AATGGTGTA-TTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGC-T--GG--GGAA-TAGAA---AGA----T-AATTAA-GTTAT-G-AATA--TCctattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|24 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgt-------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------C---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-CA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGcaag
gi|25 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------A---------A--A---AAG-CATGC-T--T-CCGAC-TA-ACAG-----T--AT-T-T----T
gi|26 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtaAT-C-CTACA---TA-C--TTTAA--TCT-CC----ATATCTTAATCTCTT---AC-ACA-A---ACCTCGCACTA---T---------AC--A--A---TTTTA-CCCACTC-AACCTTTG--TAG-ACACAAC------TTC-T-GT--CAACTTAGAGAGAC-A----T----AC----TAAATGGCCCCTTC-TC-------GATCCCAGT---AAGA-AAGC---AAT--CGCTGCTCA--ACA-GC----AGAATTCA-C--TCC--TT--GC-------AG---A----T---------------G------------------AT------------------------TTT--------------GC-----------------CTGCAAACGGAAA--------ACAC-TT--------T-C-AAGCATCAAACA-------T-------GT-------C-------ACATT--------T--TT--T---------TCA----------A---------CTT-----------C----------T-----TT--------TCGAAAC----------A---------A--AA-CAAA-CATGT-T--TGCCGCC-TACACA------T--AT-T-C----TCC--ATACTTTGATTga
gi|27 : tatcacaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---TCCCA---ATT--CCTGTAGTTTATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTG-AC-----A-CAGTAC--ATTG--C-----ACCTTGAA---AAT-A--CATT-GAA-C-G------A---TAAC--TA----GCG--------C-CCA-CA-TA-TCCC---------GTA-AA---
gi|27 : ATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGGT---TTACTG-AG--TATC--CTT-----T-------------T-AAATGAACACCA--TA-TATTTTAATTT-CATAAGGAAAA--T--AAATGTGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGCGT--GG--GG---AAATG---AGA----TAAATctattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|28 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactattT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCGA--C----------A---------TTTA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATT
gi|29 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaactagaggcagtgattgctctttaagatccttattggtatgcaggacacaagaccaaaagtcaagcCTGA--G----CTGCA-CAT---GAAGGTTATA------AG----TACA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---T-------------------------TCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------AT--AC-A---TTTTA-T--ACTC-AAACGTTG--TAA-A---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGGC-GG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAAC-A-GC---AGT--GGCTG-TTG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------ATTTTGCCACACACGGAAC-------AT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-C-AGCATTTCC-TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------ATTT-------T-----TT--------TTTA--A----------ATTTTT----G--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAa
gi|3 : ----GATG-----------GAAAGAACACATATATA--C-C---G-GT-ATATCTT---C-TTC---ACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-------------------------------------------------------------------------------------------------------T-TAA-------AAG--AT--A----GCCTTATTTC-C----------AT----------------GAATG---T--CCTGA--G----CTG
gi|3 : TGCAACAT---GTAAGTTACA------AG----CATG---GTTGATCATTGCAA------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTTTTAAATT-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AACA-A-G---G---------A---T---------AT--A--A---ATTTA-C--ACTC-AGATGCTG--TAA-A---AAA------TTC-T-GT--CAA----GAGATACTAT--TT----TT----TAAA-GG-----TG-TA-------A----TACA---TAGA-A-GCCATAAT----CTG-TTG--A-CTG-----AGATT--G-C--C----TT--A--------AA---AG---TTGCAACACGCG----G------------------AT------------------------AA---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-CAA---------CA-------T-------TT-------CCTGTTTAA-ATT--------TAAAT--T---------T-A----------AG--------C-------------A----------T-----TT--------TTGaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattatT----T-CA-T----T----GATG-------------AAAGA---------A--C-C---G-AG-ATAT-TTATTC-TTC---ACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----AC-----TGTATACATGATTTTTAATACATGT--------C------------------A------------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C----------GT----------------tttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : cat---T--TCTAATTG----ATGTA-CGT---GTAAGTTATA------TG----CATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAACTAGGAA-----ATTG-A---TA-C--TTTAtatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|31 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttAAA--------TAT--AT-TAC----AAAC-TCATTAT-T-TCATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATAC-AG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AATG-----------GAAA-GA---------A--C-A---A-AA-GT-T-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----AT-----T-----------------------T--------T------------------AAACACAGTATATTA----G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------CTTTATTTCC-AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTGCA-CAT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-C---TA-C--TATAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---
gi|32 : ctA--C----------A---------A--AATCAAAGCATGCCT--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|33 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggacTTAATA---A-A-TGTA--TT--------TTT-------GAATTTC-ATAGGAAACTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTA-A-TAAA-CACACTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--AT-TGC----AACCCT--TTTTCT-TTATTTCAT-TTTTGCATT-GG-GTGT-CTTTATGAAAG-TG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT---------------------------------T---G-AT-ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----c
gi|34 : ---TAGA-G-AC---AGT--GATTA-TCTTCA-A-G-----AGTATTGA-C--CC---TT----------------A----TT--------------G------------------AT------------------------CTCAGG-----------ACA----------------C---------AAG--------A----TCAAAAG---T-C-G---------CG-------C-------TG-------T-------A-ATT--------T----------------T-A----------A---------C----------------------------------------------C----------A---------A--A----AA-CATGC-T--T-CCCAC-TA-CCAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGAcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|35 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaacTA------T-G--------AAAT--------TATTTAT-TA-----AGTCATCTTTTTAT-TGCTGTTGT-TGTTGCATT-GG--TGT-TTTGTTGATAC-GC----TATCCAAGAACATTT----AAT----C-TA-T----T----GA----------------AAGA---------A--CAC---ATAG-ATAT-TT---C-TTCTTCGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TT-----AC-----T-----------------------CTGTGTACAC------------------A------------------G--------------T---AT-CAA-------AAG--AT--A----A----------C----------ATA---------------A---G---T--TCT
gi|36 : tcatatatttattttttcatttt---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-CA-----TG-CA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-T--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------ATTTTGCTACACACGGAAC-------AT---------------AC-----------------C---------AAGATTTCAACA----TT--------T-C-A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTGGAA---A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCT-TG-ACAG-----T--AT-T-CTCTATCA--ATATTTTGATTTaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT---AAGA-GAGTAAAACAAAAA---AG------TTAGTTGAA---CA---TGTTTTGAAT-T--------GTCCAAAAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT---AC----------------T---A---AAG--CCTGTAA---ATACAG--ATATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--ACGAGTAG-AC-----A-ttc
gi|38 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataaga---------A---T---------C---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAAAGAC-A---TT----AT----CAAA-GA-----AG-CA-------G----TAAT----------------GT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG---TT--G--------AG---A----TT--------------G------------------ATTTTGCAACACATGGAAC-------AT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-C-AG--------CA-------T-------TT-------C-------A------------------------------------------------------------------A----------T-----TT--------TTGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--C-CCGTC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATata
gi|39 : at---AA-A-ATA---T---------A---T---------A---A--A---TTGTA-C--ACAT-AAACGTTG--TAG-A---AAA------TTA-T-CT--CAA----GAGATAC-TT--TT----GT----TAAA-GA-----CG-TT-------G----TACT---TAGA-A-GC---AATA-TTCTG-CCG--A-A-A-----AGAAT--A-C--TGTTTTT--GCCACACACAG---A---------------------------------------AC------------------------AA---------------AC-----------------C---------AAGATTTCAACA----TT--------T-C-A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------C---------C-------------T----------T-----TTTGAAATACTCGT--C----------A---------A--A--CAAa
gi|4 : aA---A---T---A---ACT--CCTCTAA---ATAGGGAAGTTAGCCCAGCGGCA-TATATA--------TCA--CTGGAGAG-AC-----A-A--T-C--AT----------AT---AAAAAAAA-----CGTT-G-A-C-CCATAACA---T--CACTA----TTG--------A-CCA-CAATC-TCGCAGATGGAGGGTG-AA---AG---A----------GGAAG----GTTAGACTAA-TGGATTG-CGT-AAGGAATCATATCGACATGGCAGGT-TTTCTGTTATAATCGAGATGTTTTACTG-G---T------TT----ATGGGAAAA-G---GTTAAACGAAGAA-A--CA-TT---------------GCAGAA--T--------GTAATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AA-------TTAA-A----T--GATAAAAA-AAATGTAAAGAATGCTAAATTAATATCA----TA-A--TCACATATGATTT-------GTGTTTCTATGAAATATTCTGCATGAG-TTCTT-ATTCTATCTGTCCTA----AATAAGGCAAGCTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--GT-TTC----GTACTTTTTTAACC-TTATTTTATCTCTTGCATT--G-GTGT-CCGTCTGAAACAAA----TATCTAAGAA-CTTT----CAT----TGAA-TCAA-T----GATG-------------AAAGA---------A--C-CATAG-AAGAT-T-TC---C-TTC---ACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT------T-----T-----------------------T--------C------------------A------------------
gi|40 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctttaaattagtttacgttaattcgtgtagttaggcgtattatgcttaactagcaatgggtaattT-----AT-----T---------------------------------------------------A------------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C----------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CAacacagtatttca
gi|40 : AA-------AAG--AT--A----A----------C----------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CACnaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|41 : tattagtgttaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcanT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--T--CA-----TAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----CCA--TTACTTTGATT
gi|42 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggc--T-T-TC----ATTTCTT-----TTTGGGAG-A-G-ATATG---------A---T---------A---G--A---TTTAA-C---CTC-AG---TTGAGCAG-A---A--------TTC-T-ACTCCAG----GAGAGGT-AG--TT----ATGTTGTTAA-GG-----TG-TG-------------------TAGA-G-GC---AAT--TTCAA-TCA--A-G-G-----GGAGC--AAC--TA---TT--C--------AG---ACTGTTT--------------G------------------AT------------------------TCTAA------------AA-----------------C---------AAG--------AAACATA--------C-C-AA--------CA-------T-------TT-------C-------A-ATc
gi|43 : tATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTAA-GA-AAATAAA-CAAACA---AT------TAATTTATA---GA---TGTTTT-AACA---------GTATAAAAGAAGGTTGGGAGCTT---------------ATATGGAA---ATCTT---A---ATC--CCTGTAA---ATACAG--GTATat
gi|44 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataaTT----AAT----T-AA-T----TT---GATG------------AAAAGA---------A--C-----A-AG-ACGT-GT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTACACGAC-----T-----------------------T--------CAAATACATATTGAATATTA------------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ATAATTATTTCC----------AT----------------GA--A---TAATCTGA--G----CTGCA-
gi|45 : atatctatataaccttataatataataA------AA----CATG---GTTTATC------A------TT-GCAACTAGCAACAT-CACTA-A---TA-T--TTTGA--T-TGAC----ATTTTTT-----CTT---TA-A-A-A---A---------T---T---------A---AAGA---TCTGA-A--ATTT-ACAC------TAA-A---AAC------TGCAT-GT--GA------ACAGAC-AG--TT----GT----TAA-------------C-------G----TACT---TGGA-A-GC---AAT--TACTG-TCG--A-A-T-----AGAAt
gi|46 : gc-CAATTAAACAAACATAAAT--------AGCTATATACGAATATGTTGTAAAT-C--------GTCAAAAAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT---ACAACATTGAA---A---TCCTA---ATT--TCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGCTGCAGTATATA--------T-A--ATAAGCAG-GC-----A-C--
gi|47 : T----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------G--C-A---G-AG-ATAT-TT---C-TTCTTCACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TT-----AT-----CGTATACACGATTTTTAATACATAT--------C------------------A------------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C----------AT----------------aaat
gi|48 : tcgaaatgtttagcaatacC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-CTGTG---TT--G--------AG---A----AT--------------G------------------AT------------------------TTTGCC-----------ACACACGGAACATAA----C---------AAT--------A----TTTCAATATAT-C-A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--Atattttcatgactgttctcagctga
gi|49 : cgcaaagcC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-CTGTG---TT--G--------AG---A-----T--------------G------------------AT------------------------TTTGCC-----------ACACACGGAACATAA----C---------AAT--------A----TTTCAATATAT-C-A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--A
gi|5 : cgcaaagcAAG----G----A--AA-TAGA--G-AAA-AA--AAT-ATA-CAATATG--------TCTA----TAA-CGAGAT---TTAATG-AC--TATC--TTT----A--AGAAAG-G---CT------------------TTTTTTAATTTTCATAA-TAAAA--T--A----------------------------------CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------ACA-----GTCGA-AAGCAT--GG--GGGA-AA-TG---TGA----TAAATTAATTTCAG-G-TATA--GCA---ACA-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNN-------AT-CCTTCAGGTAC-AGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GATG-----------GAA--GA---------A--C-----A-AA-ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----AT-----C-----------------------T--------C------------------A------------------AACACAGTATACTTAT---GT-TAA-------AAG--AA--A----A----------C----------ATTTTTATGAA-------A---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GGAAGTTATA------AG----TGTG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-AACTT-A---TAAC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----C-T---AA-A-A-AT--G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-CA-------G----TAGT---TATA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----GCAAT--A-C--TG---TT--G--------AA---T----TT--------------G------------------AT------------------------TTTGCCATACACGGAACAT-----------------C---------AAAT-------A----TT--------T-C-A---------TG-------T-------TT-------T-------C-ATC--------T--AT--T---------TCA----------ATTTTTTTTTT-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-C--------------------AT-T-C----TCA--ATGCTTTAATT
gi|50 : tt-------------A----------T-----TA--------TCGA--CCAAA------A---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--Ac
gi|51 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaTAAATCAGTT---ACAATATAGAAATGA---T---A---ATT--ACTGTAC---ATACGG--GAATGC--AGA---AGTATATCCT------T-A--GTGAGCGG-AT-----A-C--T-G--ATTA--G-C--Agattttatttgca
gi|53 : ctaaggaagcggaataA-TGT---GCAAGTTATA------AG----CATG---GTTTGGC------A------TT-TCAACTAGGGATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCA---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTcaatggacgat
gi|54 : ttattagaagtctccatatatAATTACA------AA----TGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--AGAAA----CACAA-AATATA-T--TTCAA--T-TTAC----ATTTCTT-----CAT---TG-A-A-A---G---------A---C---------A---A--AGTATTTTA-C--GCTG-AAACTTTG--TAG-A---AAA------TTc
gi|55 : agT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-ATTTTCAAGACA---------C-------------A----------TA----GT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATTC-TAAT-TCTCC-TA-AC-G-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATTtgg
gi|56 : tcagagtatatgactaACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-------TTAGACAA--------------TAAGTTATA---GA---TGATTTGATTGatttt
gi|57 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggt-----------------C---------AAC--------A----TT--------T-C-A---------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CTTTTTTGTTTTA-A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATA-ACAG-----T--AT-C-C----TCA--ATACTTCGATTT
gi|58 : tt---------A---T---------A---T--G---TTTTA-A--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---GACAGACAGTTG-TAGA--CAG----GAGAGAC-A------------------A-GA-----TG-TA-------G----TCCT---TAGA-A-GT---AAT--TGCTG-ACA--A-A-A-----AAAAT--
gi|59 : -------------A----------T-----TT--------TTGA--C----------C---------A--A---AAG-CATGC-T--T-CTACC-TA-TCAG-----TAGATAT-T----TCA--AT
gi|6 : attgcagattcttgatcgatcttcacaccaaaagtagggctgtaTTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AAA-----CTCGA-AAGCGTAGGG--GGAA-AAATG---AG-----TAAA-TAATTTCAA-GTTATAGCCCA---ATG-TTCTGCCACAGATCTTC-CT--AAAAGTC---ATAGG-TT-TTTATTTTATCT-TCCTT----A-TAAGCCAAACTA------TGG------CCAAAC--------CAT--ATATAC----TAATCTCTGCATGT-TTATTTTA--TGTTGCA---GGAGTGT-CCATCTCATAC-AG----TATTTTCGAA-ATTT----TATAATGT-AAGT----T----GATG-----------G-AAAGA---------A--C-------AA-ATAT-TT---CTTTC---ACATCT---------T-C-G--TTCC-TTTAT-TT-----AC-----T-----------------------TAAACA---C------------------A------------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG--GT--A----T----------T----------A-----------------A---G---T--TTTGA--G----CTGTA-CAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----CAGAGAC-AA--TT----AT----TAAA-GG-----AG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-A-G-----AGAAT--G-C--TG---TT--G--------AG---A----CT--------------GAGTTTGCAACACACGGA-AC------------------------AT---------------AC-----------------A---------AAG--------A----TT--------T-CAA---------CA-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTCTTGAA---A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--G--CAAA-CATGC-T--T-TTAAC-TA-ACAG-----C--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTTt
gi|60 : -------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------C---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTT
gi|61 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTT
gi|62 : gacgtT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC--A-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|63 : cgtTAAGTAAAA--T--AGA--TTTGATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AAA-----GTCGA-TAGTGT--GT--GGGA-actgtactgctt
gi|64 : ct--TTT----ATGAAAAAG-GT--AT-CAAGGAAGACCA--TA-ACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAA--T--A----
gi|67 : ttgaataactaAA-A-TATAC-TCA---ACGGTTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAGTTTCTTTATTCTActgc
gi|69 : tTCAA-A-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTAT
gi|7 : ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AGA-----GTTGA-AAGCGT--GG--GGGA-AA-TG---AAA----TGA-TTGATA--AATG-TATT--TCA---ACG-CTT-------GAGTTCC-ATAGAAAGTTC---ATCAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTATA-TAAA-CAAACTA------T-GTATATGCCAAAA--------TAT--AT-TAC----ACCCCT------GT-TTATTCTA-------CATT-GG-GCGT-CCTTATAATAT-AG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AG-ACGT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACACGACT-----------------------T--------C------------------AAATACATAATGAATATTAG--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----A----------CCATTATTTCCAT----------------G---AA--TAATCGGA--G----CTGCA-CGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAGCTAAGAATAT-CACTG-A---TA-C--TTTGAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACGCAAAACGTTG--TAA-A---AAT------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TTATTAAT----TAAA-GG-----TG-TAC------A----TAGT---TAAA-A-AC---AGA--TGCTG-TCG--A-A-T-----GGAAT--A-G--TG---TT--G--------AG--------TT--------------GCGTTTGCCACACGCGAA-AC------------------------AT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------T-CAA---------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-T----------A---------T-------------T----------T-----TT--------TC----C--------------------------TTAA-C---T-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--GTACTTGGAT
gi|70 : A--C----------T---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CTATC-TA-TCAG-----T--AC-T-C----TTA--GTACTTTGATT
gi|71 : ATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--AT-T-C----TCA--ATAATCTGATat
gi|8 : ---A-GA-CAATAAAACAAATA---AT------TAACTAATA---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACGATATGGTA---A---T---ACAAATT--CCTGTAA---ATACGG--GAATTC--AGGTGCAGTATAAA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-T--T----GTAA--T-CTGAAC---AAAAGAAAT-G--CGTT-G-AAC-A------AATTT--T--CA----TG---------A-CCA-CA-TC-TTGC---------ATG-GA---AG---GAAT----TT-GTAGGACGGG----A--AA-TGGA--GTGGATAA--AAT-AAA-CGATATG-CATTT-GTTTT-----AA-CGAGAT---GTA-TG-T---TGTG--TATGGAAATAAAAATG-C---AT-AAAGGAAGAACA--TG-TT---------------GTAAA-----------TCTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TAA-----GTCGA-AAGCA----G--GTGG-AAATG---AGA----TAAATCAATATCAA-G-TAAA--ACA---ATG-TTT-------GAGTTTT-ATAGAAAATTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----G-TAAG-CA----------------------AAAA--------TAT--AT-TAC----AACC------AATT-TTATTTTAT-TCTTGAATT-GG-GTGT-CCGCCTGATAC-TG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AATT-----------GA-------------------T---G-A----AT-TT---C-TCC---ACATTT---------TCC-G--TTatgacaaa
gi|9 : ataTGTA-CGT---GTAAGCCATA------AG----CTTG---GTTGATC------AATGCAATT-ACAATTAGGAATAT-CACTA-A---TA-T--TTTAA--TGT-AC----ACTTCTT-------T---AA-A-A-A---G---------A---TTTATATGCGA---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATATTG--TTGAA---AAA------TTC-T-GT--CCA----GAGGGAC-AT--TT----GTG---CAGG-AG-----TGATACTCGAATG----TAAT---TA------C---AG---TACTG-TCG--A-A-G-----ATAAT--A-C--TG---TT--G--------AACTTA----TTTCTGTCATACACAGA------------------AC------------------------AT---------------AC-----------------C---------AAG--------A----TT--------TAA-A---------CA-------T-------TT-------C-------A-ttcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|9 : aatgaa-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------A--G--CAAA-CATGC-G--T-CCGCC-CA-ATAA-----T--AC-G-C----TCA--CTAtgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1111111111111 1111111111111 5555555555 22222222222 111 22222222222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 222222222 111 1111111 222222222 11 1111 333333333333333333333333333333333 11111111 3333333333333333 1111111 1111111 1111 111111111111111 11111111 111111111 1111 111111111 33333333333333333333333333333333333333 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111
lowQualScore : 0 4444444444444 8888888888888 4 777 777 777 5 0000000000 2 66 0 666 111 0 11111111111 666 88 111 55 55 2 66666666666666 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 5 1 000000000 4 777 000 1 8888888 1 222222222 66 5 33 66 4 66 4 55 0 77777 4 2 4444 3 666 7 777777777777777777777777777777777 55 2 0 2 55 88888888 2 33 2222222222222222 2 2 555 1 33 5 0000000 888888 77777 3 44 44 3 7 666 7777 0 3 3 77 666 0 7 1111111 3 555 3 5555 4 8 0 555555555555555 77777777 44 3 6666 333333333 2 0 2 2 2 2 9999 55 88888 0000 2 2 222222222 11111111111111111111111111111111111111 0 3 2 333 4 777 888888888 2 22 2 2 00000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 22 4444 1 333 555555 3333 444 000000 555555 1 1 1 333 1 22 88 3 3 3333 66666 333 1 1 1 444 222222222222222222222222222 33 222 1 22 1 4 22 1 222 444444 1 1 22 1 3333 1 333 3333 4444 1 33333 1 6666666 4444 1 222 1 1 222 555 1 22 1 1 55555 55 55 1 444 22 4444 222 999999 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44444 88888888 11 44444444444444444444 22 1 1 11 1 1 1 99999 11 1 2 3333 44
lowQualScore : . ............. ............. . ... ... ... . .......... . .. . ... ... . ........... ... .. ... .. .. . .............. . ............................................................................................ . . . ......... . ... ... . ....... . ......... .. . .. .. . .. . .. . ..... . . .... . ... . ................................. .. . . . .. ........ . .. ................ . . ... . .. . ....... ...... ..... . .. .. . . ... .... . . . .. ... . . ....... . ... . .... . . . ............... ........ .. . .... ......... . . . . . . .... .. ..... .... . . ......... ...................................... . . . ... . ... ......... . .. . . ..... ................................................................................................................................................................ .. .. .... . ... ...... .... ... ...... ...... . . . ... . .. .. . . .... ..... ... . . . ... ........................... .. ... . .. . . .. . ... ...... . . .. . .... . ... .... .... . ..... . ....... .... . ... . . ... ... . .. . . ..... .. .. . ... .. .... ... ...... ........................................................................................................................................................................................................................................................................ ..... ........ .. .................... .. . . .. . . . ..... .. . . .... ..
lowQualScore : 8 6666666666666 7777777777777 4 888 888 888 7 4444444444 5 99 7 444 444 5 88888888888 444 66 444 00 55 3 99999999999999 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 000000000 4 888 000 4 3333333 0 555555555 99 0 88 00 4 11 4 44 9 00000 0 6 1111 6 444 3 444444444444444444444444444444444 00 3 5 3 00 99999999 0 33 1111111111111111 9 9 000 7 99 7 0000000 888888 77777 3 66 66 3 9 444 7777 1 3 3 99 444 4 3 8888888 6 888 3 5555 0 0 3 333333333333333 33333333 22 1 5555 333333333 9 4 9 9 9 9 6666 55 11111 6666 4 2 000000000 44444444444444444444444444444444444444 5 8 0 555 0 000 000000000 0 88 1 1 00000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 99 5555 9 555 000000 7777 888 000000 000000 7 7 8 222 8 55 00 6 6 9999 44444 000 7 7 7 888 444444444444444444444444444 88 888 7 33 7 1 33 7 999 444444 6 6 22 6 4444 6 222 3333 8888 5 88888 5 5555555 8888 5 555 4 4 555 999 4 00 4 4 00000 66 88 5 222 11 8888 777 888888 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222 33333333 77 22222222222222222222 99 3 2 77 2 2 2 55555 88 4 9 0000 22
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTT---TGAAT-C--------GTCTAA--AAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--AC--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------A---T------------------------GC-ACACA------A----------T--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-C--------A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( family-198 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTT---TGAATGC--------GTCTAA--AAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--AC--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------A---T------------------------G-------------A----------T--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-C--------A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|1 : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAA-A---ATAAAATATAAGTTAT-A---GA---TGTTT---TGAATGTTTTGAATGGCATAA--AAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---AAAATATGGAA---A---T---A---TTTTGCCTGTCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------C-T--GTGAGCAG-AT-----A-C--T-T--ACTA--C-T--GAT---GATCAGAATCA--CAAT-G-A-CTG------A---T--T--TA----TGG--------AGCCATCA-CCTCTC---------TTA-AA---AT---AAAT-AGGTT-GTAAG----G----A--AA-TAAA--C-AGT-AG--GAC-CTA-CGACATG-CGG-T-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAAAG-AA--TATC--TTT----ATAAGACAATGT--AT-AAATGAAAAACA--TT-TTTTTTTTTTTTCATAAGTAAAA--TCAA----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGACAAG-GT--GG--GGGATAAATT---ATA----CAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---AAT-TTC-------GAGTTTG-ATAGAAAATTC---ATGAT-TTATTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACCA------T-A------CCATAA--------TAT--AT-TGC----AGCTCTCTTTTTTTCTTCTTTTAT-TTTTGCATT-GG-GTGC-CTTTCTGATGCAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GGAAAAA---------AACC-C---G-AAAGAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AA---AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTTCA-CGT---GTAAGTTATA------AA----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G-----AA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-AA-------G----TAGT---TAAA-T-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--AT--C-T---TT--G----AG---A------TCG------------A---T------------------------G------------------------T--A--C---------C----------------------------------A---TT--------T-C--------A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCGG--C----------A---------AA--CAAA-CACGC-T--T-CCGTC-TA-ATAA-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATCT
gi|10 : ATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TCAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-CATGTTGAACCCTCTTTAT-T-TTATTTTAT-TCTTACATT-GG-GTGT-CTTTCTGATACTG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AACA-----------C---AG-TAC-------AAG---T--G----A----------A---------A---------------------G---T--ACTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTCAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------ATAAA--A---TTTTA-C--GCTC-AAGCTTT--GTAT-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--CT----GT----TAAA-GG-----TA-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TTG--A-A-G-----AGAAT--AC--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------A---TTTTGCCACACACG-----------G-------------AACATACAATGT--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-CA-------A---------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-A----------A---------CTTTTTTTTTTTT-T----------T-----TT--------TCCA--C----------A---------AA--CAAA-CATAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----c
gi|11 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgAAAA--------TAT--AT-TGC----AATC-------TCT-TTCTTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-ACTTATGATACAG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACAT-TT---C-TTC---ACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATT-----ATA-----------------------T--------T------------------A---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--ACATTATTTC------C---------AT----------------G---AATAT--TCGTA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACAA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-ACATGAATTTCTT-----CTT---AG-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATGTT--GTCG-A---AAA------TTC-T-G--T-CAC----GAGAGAC-AG---T----A---------------------A-------G----TACT---TAGA-A-GC---AAT---TGCTG-TCG--G-A-A-----AGAAT--AC--T-G---TT--G----AG---C------TTGCTTTTGCCACACA---C------------------------GGAAC---------A----------T--A--C---------C-----------------------AAGATTTTAGCA---TT--------T-C--------A---------TG-------T-------TT-------C-------A-GTT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CCCTTTGT------AGGTCTACTCCT-----TT--------TTGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-A
gi|12 : G--TT----GT----TAAG-GA-----TG-TA-------G----TATT---TCGA-A-GC---AATAT-TGCTG-TCG--A-A-T-----AGAAT--GC--T-G---TT--G----GG---A------TTGTTATTTGTT---A---C------------------------GCACGGAAC-----A----------T--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-CA-------A---------CA-------TGTGATGATT-------C-------A-ATT--------T--GTAGT---------T-A----------C---------A-------------A----------T-----TT--------T
gi|12 : -------------A----------T-----TT--------TCGA--CCAAATAATTTA---------AA--AAAA-AATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--GTACTTTGATatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|13 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtg-C---A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TC-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AA-------------TACAGT-AAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T--TTTGA--G----CTGCC-CGT---GTAAGTTATA------AG----TACG---GCTGATC------A------TT-ACAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CTT---AA-A-A-A---G---------A---TATC------A---A--A---TTTTA-C--ACT--AAACTTT--GTAG-A---AAC------GTC-T-G--T-CAA----GGGAAAC-GG--TA----GT----TAAA-GG-----TG-TT-------G----TAGT---TAGA-A-GC---CGT---TGCTG-TTG--A-C-T-----AGAAT--AT--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------A---T------------------------C-------------A----------T--G--C---------CACACAGGGAACATACAATGTAACAAA--------A---TT--------T-CAACATTTCA---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTTCTTGAA--A----------T-----TT--------TCGA--C----------T---------AA--GAAA-CATGT-G--T-CAGCT-TA-ACAG-----T--AT-T-G----TCA--ATACTTTGATT
gi|14 : ATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGTA---T---A-AATCAATAAAACAAACA---AC------TAAGTTAT-A---GA---TGATT---TGAAT---------------------AGT-TTAGAATCCTAAATTATTT---TCC---------------T---A---ATT--CTTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-ATTGTGAGCAG-ACAGCGTA-T--T-C--ATAA--A-C--AAC---GAAGAG----A--CATTAA-A-C-G------A---A--T--TAATACTGGTTGGTAGTG-CCAGCA-TCTACC---------GTA-CATGTAGGTTACATAAA-TT-AAAAG----T----A--AA-TTGG--G-AGA-AG--AGT-ACG-CTGCATG-CGGAT-GTTCT----CAG-CCGG---------TG-A----GTC--TTT----GTAAG----------T-AAAGGAAGACCA--TGTTTTTTTTATTTTCA----------------------------------C-AAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AAT-----GTCGa
gi|15 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagt---G---T--TCTGA--G----CTGCA-AGT---GTAAATTATACATGTAAG----TATG---GTTGATC------A------AT-ACCACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TT---------------------------CCC---AA-A-A-C---G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-ATACTTT--GGAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-AA-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA--------AGT---TGCTG-TCA--A-A-G-----AAAAT--AC--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------A---TTTTTTCACACACAA----------G-------------A----------T--T--T---------C-----------------------AAC--------A---TT--------T-C--------A---------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CATCTTTTTTTGAAA----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACCTTGAT
gi|16 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa-AA-T----C----GATA-----------GAAA-GA---------A--C-A---G-AAG-AT-TC---C-T-C---ACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AAACACATATACTTA-G--------------T---GT-TAA-------AAGTGAA--A----A----------C---------ATTATTTCCATGAA----A---G---T--CTTGA--GAGCTCTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---T---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-A--ACTC-AAACTCT--GTAG-A---AAC------CTC-T-G--T-CAA----AAGAGAC-AG--CT----AT----TA-----------------------------------------GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AAAAT--AC--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------ATTTT------------------------GCCACAC-------A----------T--A--C---------C-----------------------AAGATTTCAACA---TT--------T-C--------A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT------------T--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C--------------------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCA-TA-ATGG-----T--c
gi|17 : TAAATTG-A------AG----TATGT--GTTGATC------A------TTTGCATCTAGGAATGTTCAC-A-A---TA-C--TT-AA--T-T-AC----ATATCTTT----CCT---AA-A-A-A---G---------AGATT---------AC--A--A---TGTTAAC--ACTC-AAACTTT--GTAG------AC------TTC-T-G--TCCAA----GAGAGAC-CATTTT----AT----CAAA-GG-----T--TA-------GT---TAATTTATAGAGA-GC---AGC---TGCTG-CCG--A-C-G-----ACAAT--ACT-T-G---TTGGG----AG---A------ATG------------A---TTTTGGCCACACACGAACAATACCAG-------------A----------T--ATTT---------C-----------------------AAT--------A---TT--------T-C--------A---------CG-------T-------TT-------CT------ATATT--------T--AT--TTTATCACTAT-G----------A---------T-------------G----------T-----TTTGAAATG-TCTA--C----------AATACAAAGCAA--CAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--A----C----TCA--ATAATCTGAT
gi|18 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT----GAG-CAAGAT---TTGTTA-AA--TATCATTTT----CTAAAAAAA-A---GT-GGGGGGGGGGTAACTA--------ATTTTTATAAGTAAAA--T--A----------------------------------CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AAATTAAAGTCGA-AAGTGT--GG--GAGA-AA-TG---GGA----TAAATTAATCTTAA-G-TCTA--TCA---ACA-TTT-------GAATTTC-ATAGAATATCT---ATGGA-TTCTTTAT--TATGCATNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGA-GTATGCCTTTTAATACAT----TATCTAAGAA----------------------------------------------GAA------------------C---A-AAATAT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------aa
gi|19 : A-T----T----GATA-----------GAAA-GA---------A--G-C---T-AAG-AT-TT---C-TTA---GCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A--------------------------------------AA-------CAC--ATGTA----G----------T---------AG----------------A---G---A--TCTAA--G----TTGTA-TATAATGTAAGTTTTA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACGAGGAATAT-CACCA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-A---AT--------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-GATCTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTA-TCG--A-A-G-----ACAAT--AC--T-G---TT--G----AG---AATGGTTTTGCCACAC------A---C------------------------GGAACATAA-----A----------T--A--A---------C-----------------------AAGATTACAACA---TT--------T-C--------A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------CTGATGTT--------TCGA--C----------A---------AA--CAaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|2 : cATA----------A--ATGAGCAG-AC-----ATC--T-TGAATTA--C-----AC-----ACAGGAC-AGGCGTT-G-AGC-G------A---A------A----TG---------A-CCT-TA-TCTCGC---------ATAGAA---AG---AAAT-AG-TA-GGAAG----GG---A--AA-TAGAATG-GAA-AA--AAT-ATA-CGACGTG-CAGTT-G-TTG----TAA-CGAGAT---tg
gi|2 : AAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAAA-----GTCGA-AAGCGA--GG--GGGG-G--TG---AGA----TATATTGATATCAA-G-TATA--TCA---ATG-TTT-------GAGTT-------------C---A-GAG-TTCTTTTATCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTACATGTAT-G------CTAAGAATACAATGTAT--AT-TAC----AACCCACTTTAT-------TTCAT-TCTTGCATT-AG-GTCT-CCGTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGA---------A--C-C---A-AAGC-T-TT---C-TTC---AGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AATCACAGTACATTAAG--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----AACTATTTC--C---------AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTACA-TGT---GTAAGTTTTA------AG----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGAAATAT-CACCA-A---TC-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-----G---------A---T---------ATC-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GCTG-A---AAC------TTC-T-A--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGC---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--AC--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------ATTTT------------------------GCCACACAAGGAACA----------T--A--C---------C-----------------------AAG------------------------C--------A---------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--Aggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|20 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacga---G---T--TTTGA--G----CAGCA-CGT---GTAATTTATA------AG----TATGATAGTTGACC------A------TT-GCAATTAGGAATGT-CAGTA-A---TA-A--TTTGA--T-T-AC----A-TTCTT-----CAT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---T--G---TTTTA-C--ACTC-AAA--------------------------C-T-G--T-CAG----CAGAGTC-AG--CT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCA--A-A-GACAATAGAAT--AC--C-G---TT--G----AG---A------TTG------------ATTTT------------------------GCCACACACGGAACA----------T--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-CA-------A---------CA-------T-------TTTATGTACC-------A-ATCTACATATGT--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTCGGA---A----------T-----TT--------TCAA--C----------A---------AG--CAAA-CATGT-T--T-CCGCC-TA-ACAGTATA-T--AT-T-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|21 : cattaaatccacgaaaTTATGA---AA---TGTCT---T---TCCTA------GTCTAA--ATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT---ACAG------A---A---T---A---ATT--CCTGCCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATGTACATTTGTAT-A--GTGAGCAG-AC-----A-C----C--ATTAGGCAC--AAC---GAAAACAAT-A------------------------T--T--TA----GAG--------T-CCA-CA-CGTTTA---------GTA-AC---AT---GAAT-GG-TTTATAAG----T----G--AA-TAAA--G-AGA-AA--AAT-ATT-CAACATG-TGGGT-GATTT----TAA-CGAGAT---TTATTGAA---TACA--TTT----TTAAGAAAA-GGGTAT-AAAGGAAGACTA--TA--TTTTTTATTTTCATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AAA-----GTTCA-AAGCGT--AA--GGG--AAATG---AGA----TAAt
gi|22 : -AA---GG---AAAT-GG-TG-GGAAG----G----A--AAATAGA--G-TGG-AA--AGT-ATA-CAACACG-C-----ACTTTATG-TAA-CGAGA----TGATTG-T---TGTC--TTT----G-AAAAAAA-GT--AT-TAACAAAGAACA--TG-CT---------------GC---A--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GC
gi|22 : gACCCTCTTTATGT-A-ATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTTT-CCGTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|23 : gaaggaaatggtgggaaggaaaatagagtggaaagtatacaacacgcactttatgtaacgagatgattgttgtctttgaaaaaaagtattaacaaagaacatgctgcatatgtaatttattgtgcgtaacatatcgtagaatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTCA-AATATGGAA---A---TC--A---ATTT-CCTGTATTT-ATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTGCAC-----A-G--TAC--ATTG--C-A--AACCTTGAACAT--T-A--CATT-GAA-C-G------A---TA-A--TG----CGG--------C-CCA-CA-TTATCC---------GTA-AA---A
gi|23 : A-AA--ACT-AT-----TATG-CGGGTTGTTTT----TAA-C-AGGT---TTACTG-GAAGTATC--CTT----AT-------------T-AAATGAA--CCC--TA-TATTGTTAATTTCATAAGGAAAAAGT--AATGGTGTA-TTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGC-T--GG--GGAA-TAGAA---AGA----T-AATTAA-GTTAT-G-AATA--TCctattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|24 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgt-------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------C---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-CA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGcaag
gi|25 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------A---------AA---AAG-CATGC-T--T-CCGAC-TA-ACAG-----T--AT-T-T----T
gi|26 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtaAT-C-CTACA---TA-C--TTTAA--TCT-CC----ATATCTTAATCTCTT---AC-ACA-A---ACCTCGCACTA---T---------AC--A--A---TTTTA-CCCACTC-AACCTTT--GTAG-ACACAAC------TTC-T-G--T-CAACTTAGAGAGAC-A----T----AC----TAAATGGCCCCTTC-TC-------GATCCCAGT---AAGA-AAGC---AAT---CGCTGCTCA--ACA-GC----AGAATTCAC--T-CC--TT--GC---AG---A------T-G------------A---T------------------------T-------------T----------T--G--C---------CTGCAAACGG--------------AAA--------ACACTT--------T-C--------AAGCATCAAACA-------T-------GT-------C-------ACATT--------T--TT--T---------TCA----------A---------CTT-----------C----------T-----TT--------TCGAAAC----------A---------AAA-CAAA-CATGT-T--TGCCGCC-TACACA------T--AT-T-C----TCC--ATACTTTGATTga
gi|27 : tatcacaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---TCCCA---ATT--CCTGTAGTTTATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTG-AC-----A-CAGTAC--ATTG--C-----ACCTTGAA---AAT-A--CATT-GAA-C-G------A---TAAC--TA----GCG--------C-CCA-CA-TATCCC---------GTA-AA---
gi|27 : ATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGGT---TTACTG-AG--TATC--CTT-----T-------------T-AAATGAACACCA--TA-TATTTTAATTT-CATAAGGAAAA--T--AAATGTGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGCGT--GG--GG---AAATG---AGA----TAAATctattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|28 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactatt---TAGA-G-GC---AGTGATTGCTC-TTT--A-A-G-----A---T--CC--TTA---TT--G----GT---A------TGC------------A---G------------------------G-------------A----------C--A--C---------------------------------AAG--------A---CCAAAAG---T-C--------A---------AG-------C-------TT-------T-------A-ATT--------T------T---------C-G----------A---------C-------------A----------T-----TT------------------------------------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATT
gi|29 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaacCTGA--G----CTGCA-CAT---GAAGGTTATA------AG----TACA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---T-------------------------TCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------AT--AC-A---TTTTA-T--ACTC-AAACGTT--GTAA-A---AAC------CTC-T-G--T-CAA----AAGAGGC-GG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAAC-A-GC---AGT---GGCTG-TTG--A-A-G-----AGAAT--AC--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------ATTTT------------------------GCCACACACGGAACA----------T--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-C--------AGCATTTCC-TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------ATTT-------T-----TT--------TTTA--A----------ATTTTT----GA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAa
gi|3 : ----GATG-----------GAAAGAACACATATATA--C-C---G-GTATATCTT---C-TTC---ACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----------------------------------------------------------------------------------------------T-TAA-------AAG--AT--A----GCCTTATTTC-C---------AT----------------GAATG---T--CCTGA--G----CTG
gi|3 : TGCAACAT---GTAAGTTACA------AG----CATG---GTTGATCATTGCAA------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTTTTAAATT-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AACA-A-G---G---------A---T---------AT--A--A---ATTTA-C--ACTC-AGATGCT--GTAA-A---AAA------TTC-T-G--T-CAA----GAGATACTAT--TT----TT----TAAA-GG-----TG-TA-------A----TACA---TAGA-A-GCCATAAT-----CTG-TTG--A-CTG-----AGATT--GC--C-----TT--A----AA---AG-----TTGCA----------A---CACGCG-------------------G-------------A----------TAAA--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-CA-------A---------CA-------T-------TT-------CCTGTTTAA-ATT--------TAAAT--T---------T-A----------AG--------C-------------A----------T-----TT--------TTGaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattatT----T-CA-T----T----GATG-------------AAAGA---------A--C-C---G-AGATAT-TTATTC-TTC---ACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACTGTATACATGATTTTTAATACATGT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------GT----------------tttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : cat---T--TCTAATTG----ATGTA-CGT---GTAAGTTATA------TG----CATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAACTAGGAA-----ATTG-A---TA-C--TTTAtatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|31 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttAAA--------TAT--AT-TAC----AAAC-TCATTAT-T-TCATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AATG-----------GAAA-GA---------A--C-A---A-AAGT-T-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------T------------------AAACACAGTATATTA-G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------CTTTATTTCCAT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTGCA-CAT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-C---TA-C--TATAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---
gi|32 : ctA--C----------A---------AAATCAAAGCATGCCT--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|33 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggacTTAATA---A-A-TGTA--TT--------TTT-------GAATTTC-ATAGGAAACTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTA-A-TAAA-CACACTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--AT-TGC----AACCCTTTTT--CT-TTATTTCAT-TTTTGCATT-GG-GTGT-CTTTATGAAAGTG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT---------------------------------T---G-ATATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----c
gi|34 : ---TAGA-G-AC---AGT---GATTA-TCTTCA-A-G-----AGTATTGAC--C-C---TT------------A------TTG------------A---TCTCAG-------------------G-------------A----------C--A--C---------------------------------AAG--------A---TCAAAAG---T-C--------G---------CG-------C-------TG-------T-------A-ATT--------T----------------T-A----------A---------C----------------------------------------------C----------A---------AA----AA-CATGC-T--T-CCCAC-TA-CCAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGAcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|35 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaacTA------T-G--------AAAT--------TATTTAT-TA-----AGTCATCTTTTTAT-TGCTGTTGT-TGTTGCATT-GG--TGT-TTTGTTGATACGC----TATCCAAGAACATTT----AAT----C-TA-T----T----GA----------------AAGA---------A--CAC---ATAGATAT-TT---C-TTCTTCGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TT-----ACT-----------------------CTGTGTACAC------------------A---------------G--------------T---AT-CAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATA---------------A---G---T--TCT
gi|36 : tcatatatttattttttcatttt---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-CA-----TG-CA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--AT--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------ATTTT------------------------GCTACACACGGAACA----------T--A--C---------C-----------------------AAGATTTCAACA---TT--------T-C--------A---------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTGGAA---A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCT-TG-ACAG-----T--AT-T-CTCTATCA--ATATTTTGATTTaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT---AAGA-GAGTAAAACAAAAA---AG------TTAGTTGA-A---CA---TGTTT---TGAAT-T--------GTCCAA--AAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT---AC----------------T---A---AAG--CCTGTAA---ATACAG--ATATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--ACGAGTAG-AC-----A-ttc
gi|38 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataaga---------A---T---------C---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-A--T-CAA----GAAAGAC-A---TT----AT----CAAA-GA-----AG-CA-------G----TAAT----------------GT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--AC--T-G---TT--G----AG---A------TTG------------ATTTT------------------------GCAACACATGGAACA----------T--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-C--------AG--------CA-------T-------TT-------C-------A------------------------------------------------------------------A----------T-----TT--------TTGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--C-CCGTC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATata
gi|39 : at---AA-A-ATA---T---------A---T---------A---A--A---TTGTA-C--ACAT-AAACGTT--GTAG-A---AAA------TTA-T-C--T-CAA----GAGATAC-TT--TT----GT----TAAA-GA-----CG-TT-------G----TACT---TAGA-A-GC---AATA--TTCTG-CCG--A-A-A-----AGAAT--AC--T-GTTTTT--GCCACAC---A------CAG------------A---A------------------------C-------------A----------A--A--C---------C-----------------------AAGATTTCAACA---TT--------T-C--------A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------C---------C-------------T----------T-----TTTGAAATACTCGT--C----------A---------AA--CAAa
gi|4 : aT------TAAATTA------------GTTTACGTTAATTC--------GTGTAGTTAGGCGTATT---ATGCTTAACTAG------CAATGGGTAATTAA---T---A---ACT--CCTCTAA---ATAGGGAAGTTAGCCCAGCGGCA-TATATA--------TCA--CTGGAGAG-AC-----A-A--T-C--AT----------AT---AAAAAAAA-----CGTT-G-A-C-CCATAACA---T--CACTA----TTG--------A-CCA-CAATCTCGCAGATGGAGGGTG-AA---AG---A----------GGAAG----GTTAGACTAA-TGGATTG-CGT-AAGGAATCATATCGACATGGCAGGT-TTTCTGTTATAATCGAGATGTTTTACTG-G---T------TT----ATGGGAAAA-G---GTTAAACGAAGAA-A--CA-TT---------------GCAGAA--T--------GTAATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AA-------TTAA-A----T--GATAAAAA-AAATGTAAAGAATGCTAAATTAATATCA----TA-A--TCACATATGATTT-------GTGTTTCTATGAAATATTCTGCATGAG-TTCTT-ATTCTATCTGTCCTA----AATAAGGCAAGCTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--GT-TTC----GTACTTTTTTAACC-TTATTTTATCTCTTGCATT-GG--TGT-CCGTCTGAAACAAA---TATCTAAGAAC-TTT----CAT----TGAA-TCAA-T----GATG-------------AAAGA---------A--C-CATAG-AAG-AT-TT---CCTTC---ACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT------TT-----------------------T--------C------------------A---------------
gi|40 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctT-----ATT---------------------------------------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CAacacagtatttca
gi|40 : AA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CACnaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|41 : tattagtgttaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcanT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AT--CA-----TAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----CCA--TTACTTTGATT
gi|42 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggc--T-T-TC----ATTTCTT-----TTTGGGAG-A-G-ATATG---------A---T---------A---G--A---TTTAA-C---CTC-AG---TTGAGCAG-A---A--------TTC-T-ACTC-CAG----GAGAGGT-AG--TT----ATGTTGTTAA-GG-----TG-TG-------------------TAGA-G-GC---AAT---TTCAA-TCA--A-G-G-----GGAGCA-AC--T-A---TT--C----AG---A------CTGT-----------T---T------------------------G-------------A----------T--T--C---------T-----------------------AAA--------A---c
gi|43 : tATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTAA-GA-AAATAAA-CAAACA---AT------TAATTTAT-A---GA---TGTTT---T-AACA---------GTATAA--AAGAAGGTTGGGAGCTT---------------ATATGGAA---ATCTT---A---ATC--CCTGTAA---ATACAG--GTATcaagaaacataccaacatttcaatat
gi|44 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataaTT----AAT----T-AA-T----TT---GATG------------AAAAGA---------A--C-----A-AGACGT-GT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATATTGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ATAATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCTGA--G----CTGCA-
gi|45 : atatctatataaccttataatataataA------AA----CATG---GTTTATC------A------TT-GCAACTAGCAACAT-CACTA-A---TA-T--TTTGA--T-TGAC----ATTTTTT-----CTT---TA-A-A-A---A---------T---T---------A---AAGA---TCTGA-A--ATTT-ACAC------TAA-A---AAC------TGCAT-G--T-GA------ACAGAC-AG--TT----GT----TAA-------------C-------G----TACT---TGGA-A-GC---AAT---TACTG-TCG--A-A-T-----AGAAt
gi|46 : gc-CAATTAAACAAACATAAAT--------AGCTAT-ATACGAATATGTTG---TAAAT-C--------GTCAAA--AAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT---ACAACATTGAA---A---TCCTA---ATT--TCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGCTGCAGTATATA--------T-A--ATAAGCAG-GC-----A-C--
gi|47 : T----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------G--C-A---G-AGATAT-TT---C-TTCTTCACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TT-----ATCGTATACACGATTTTTAATACATAT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------aaat
gi|48 : tcgaaatgtttagcaatacC------TTC-T-A--G-CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----ACAAT--ACTGT-G---TT--G----AG---A------ATG------------ATTTT------------------------GCCACACACGGAACA----------T--A--A---------C-----------------------AAT--------A---TTTCAATATAT-C--------A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--Atattttcatgactgttctcagctga
gi|49 : cgcaaagcC------TTC-T-A--G-CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----ACAAT--ACTGT-G---TT--G----AG---ATGATT-TTGCCACAC------A---C------------------------GGAAC---------A----------T--A--A---------C-----------------------AAT--------A---TTTCAATATAT-C--------A---------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--A
gi|5 : cgcaaagcAAG----G----A--AA-TAGA--G-AAA-AA--AAT-ATA-CAATATG--------TCTA----TAA-CGAGAT---TTAATG-AC--TATC--TTT----A--AGAAAG-G---CT------------------TTTTTTAATTTTCATAA-TAAAA--T--A----------------------------------CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------ACA-----GTCGA-AAGCAT--GG--GGGA-AA-TG---TGA----TAAATTAATTTCAG-G-TATA--GCA---ACA-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNN-------AT-CCTTCAGGTACAGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GATG-----------GAA--GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATC-----------------------T--------C------------------A---------------AACACAGTATACTTAT---GT-TAA-------AAG--AA--A----A----------C---------ATTTTTATGAA-------A---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GGAAGTTATA------AG----TGTG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-AACTT-A---TAAC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----C-T---AA-A-A-AT--G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GTAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAA-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-CA-------G----TAGT---TATA-A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----GCAAT--AC--T-G---TT--G----AA---T------TTG------------ATTTT------------------------GCC-----------A----------T--A--CACGGAACATC-----------------------AAAT-------A---TT--------T-C--------A---------TG-------T-------TT-------T-------C-ATC--------T--AT--T---------TCA----------ATTTTTTTTTT-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-C--------------------AT-T-C----TCA--ATGCTTTAATT
gi|50 : tt-------------A----------T-----TA--------TCGA--CCAAA------A---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--Ac
gi|51 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaTAAATCAGTT---ACAATATAGAAATGA---T---A---ATT--ACTGTAC---ATACGG--GAATGC--AGA---AGTATATCCT------T-A--GTGAGCGG-AT-----A-C--T-G--ATTA--G-C--Agattttatttgca
gi|53 : ctaaggaagcggaataA-TGT---GCAAGTTATA------AG----CATG---GTTTGGC------A------TT-TCAACTAGGGATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCA---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTcaatggacgat
gi|54 : ttattagaagtctccatatatAATTACA------AA----TGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--AGAAA----CACAA-AATATA-T--TTCAA--T-TTAC----ATTTCTT-----CAT---TG-A-A-A---G---------A---C---------A---A--AGTATTTTA-C--GCTG-AAACTTT--GTAG-A---AAA------TTc
gi|55 : agT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-ATTTTCAAGACA---------C-------------A----------TA----GT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-CATTC-TAAT-TCTCC-TA-AC-G-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATTtgg
gi|56 : tcagagtatatgactaACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-------TTAGACAA--------------TAAGTTAT-A---GA---TGATT---TGATTGatttt
gi|57 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggt---------C-----------------------AAC--------A---TT--------T-C--------A---------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CTTTTTTGTTTTA-A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATA-ACAG-----T--AT-C-C----TCA--ATACTTCGATTT
gi|58 : tt---------A---T---------A---T--G---TTTTA-A--ACTC-AAACGTT--GTAG-A---GACAGACAGTTG-TAG--A-CAG----GAGAGAC-A------------------A-GA-----TG-TA-------G----TCCT---TAGA-A-GT---AAT---TGCTG-ACA--A-A-A-----AAAAT--
gi|59 : -------------A----------T-----TT--------TTGA--C----------C---------AA---AAG-CATGC-T--T-CTACC-TA-TCAG-----TAGATAT-T----TCA--AT
gi|6 : attgcagattcttgatcgatcttcacaccaaaagtagggctgtaTTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AAA-----CTCGA-AAGCGTAGGG--GGAA-AAATG---AG-----TAAA-TAATTTCAA-GTTATAGCCCA---ATG-TTCTGCCACAGATCTTC-CT--AAAAGTC---ATAGG-TT-TTTATTTTATCT-TCCTT----A-TAAGCCAAACTA------TGG------CCAAAC--------CAT--ATATAC----TAATCTCTGCATGT-TTATTTTA--TGTTGCA---GGAGTGT-CCATCTCATACAG----TATTTTCGAA-ATTT----TATAATGT-AAGT----T----GATG-----------G-AAAGA---------A--C-------AAATAT-TT---CTTTC---ACATCT---------T-C-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACT-----------------------TAAACA---C------------------A---------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG--GT--A----T----------T---------A-----------------A---G---T--TTTGA--G----CTGTA-CAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTT--GCAG-A---AAC------TTC-T-G--T-CAA----CAGAGAC-AA--TT----AT----TAAA-GG-----AG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCA--A-A-G-----AGAAT--GC--T-G---TT--G----AG---A------CTG------------AGTTT------------------------GCAACACACGGAACA----------T--A--C---------A-----------------------AAG--------A---TT--------T-CA-------A---------CA-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTCTTGAA---A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AG--CAAA-CATGC-T--T-TTAAC-TA-ACAG-----C--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTTt
gi|60 : -------------A----------T-----TC--------TCGA--C----------C---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTT
gi|61 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTT
gi|62 : gacgtT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC--A-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|63 : cgtTAAGTAAAA--T--AGA--TTTGATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AAA-----GTCGA-TAGTGT--GT--GGGA-actgtactgctt
gi|64 : ct--TTT----ATGAAAAAG-GT--AT-CAAGGAAGACCA--TA-ACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAA--T--A----
gi|67 : ttgaataactaAA-A-TATAC-TCA---ACGGTTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAGTTTCTTTATTCTActgc
gi|69 : tTCAA-A-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTAT
gi|7 : ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AGA-----GTTGA-AAGCGT--GG--GGGA-AA-TG---AAA----TGA-TTGATA--AATG-TATT--TCA---ACG-CTT-------GAGTTCC-ATAGAAAGTTC---ATCAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTATA-TAAA-CAAACTA------T-GTATATGCCAAAA--------TAT--AT-TAC----ACCCCT------GT-TTATTCTA-------CATT-GG-GCGT-CCTTATAATATAG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACGT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATAATGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ACCATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCGGA--G----CTGCA-CGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAGCTAAGAATAT-CACTG-A---TA-C--TTTGAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACGCAAAACGTT--GTAA-A---AAT------TTC-T-G--T-CAA----GAGAGAA-AG--TTATTAAT----TAAA-GG-----TG-TAC------A----TAGT---TAAA-A-AC---AGA---TGCTG-TCG--A-A-T-----GGAAT--AG--T-G---TT--G----AG----------TTGCGTTTGCCAC--A---C------------------------GCGAAAC-------A----------T--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------T-CA-------A---------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-T----------A---------T-------------T----------T-----TT--------TC----C------------------------TTAA-C---T-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--GTACTTGGAT
gi|70 : A--C----------T---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CTATC-TA-TCAG-----T--AC-T-C----TTA--GTACTTTGATT
gi|71 : ATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--AT-T-C----TCA--ATAATCTGATat
gi|8 : ---A-GA-CAATAAAACAAATA---AT------TAACTAAT-A---GA---TGTTT---TGAATA---------GTCTAA--AAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACGATATGGTA---A---T---ACAAATT--CCTGTAA---ATACGG--GAATTC--AGGTGCAGTATAAA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-T--T----GTAA--T-CTGAAC---AAAAGAAAT-G--CGTT-G-AAC-A------AATTT--T--CA----TG---------A-CCA-CA-TCTTGC---------ATG-GA---AG---GAAT----TT-GTAGGACGGG----A--AA-TGGA--GTGGATAA--AAT-AAA-CGATATG-CATTT-GTTTT-----AA-CGAGAT---GTA-TG-T---TGTG--TATGGAAATAAAAATG-C---AT-AAAGGAAGAACA--TG-TT---------------GTAAA-----------TCTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TAA-----GTCGA-AAGCA----G--GTGG-AAATG---AGA----TAAATCAATATCAA-G-TAAA--ACA---ATG-TTT-------GAGTTTT-ATAGAAAATTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----G-TAAG-CA----------------------AAAA--------TAT--AT-TAC----AACC------AATT-TTATTTTAT-TCTTGAATT-GG-GTGT-CCGCCTGATACTG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AATT-----------GA-------------------T---G-A---AT-TT---C-TCC---ACATTT---------TCC-G--TTatgacaaa
gi|9 : ataTGTA-CGT---GTAAGCCATA------AG----CTTG---GTTGATC------AATGCAATT-ACAATTAGGAATAT-CACTA-A---TA-T--TTTAA--TGT-AC----ACTTCTT-------T---AA-A-A-A---G---------A---TTTATATGCGA---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATATT--GTTGAA---AAA------TTC-T-G--T-CCA----GAGGGAC-AT--TT----GTG---CAGG-AG-----TGATACTCGAATG----TAAT---TA------C---AG----TACTG-TCG--A-A-G-----ATAAT--AC--T-G---TT--G----AACTTA------TTT------------C---T------------------------GTCATACACAGAACA----------T--A--C---------C-----------------------AAG--------A---TT--------TAA--------A---------CA-------T-------TT-------C-------A-ttcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|9 : aatgaa-------------A----------T-----TT--------TCGA--C----------A---------AG--CAAA-CATGC-G--T-CCGCC-CA-ATAA-----T--AC-G-C----TCA--CTAtgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111111 2222222222222 333333333333333 111 111 22222222222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 222222222 111 1111111 222222222 11 1111 333333333333333333333333333333333 11111111 3333333333333333 1111111 1111111 1111 111111111111111 11111111 111111111 1111 111111111 33333333333333333333333333333333333333 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111
lowQualScore : 0 4444444444444 1111111111111 5 888 888 1 000000000000000 77777777 1 0 8888888 666 666 88 111 55 55 2 66666666666666 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 5 1 000000000 4 777 000 1 8888888 1 222222222 66 5 33 66 4 66 4 55 0 77777 4 2 4444 3 666 7 777777777777777777777777777777777 55 2 0 2 55 88888888 2 33 2222222222222222 2 2 555 1 33 5 0000000 888888 77777 3 44 44 3 7 666 7777 0 3 3 77 666 0 7 1111111 3 555 3 5555 4 8 0 555555555555555 77777777 44 3 6666 333333333 2 0 2 2 2 2 9999 55 88888 0000 2 2 222222222 11111111111111111111111111111111111111 0 3 2 333 4 777 888888888 2 22 2 2 00000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 22 4444 1 333 555555 3333 444 000000 555555 1 1 1 333 1 22 88 3 3 3333 66666 333 1 1 44 444 000000000000000000000000000 33 222 1 22 1 3 22 1 222 444444 1 1 33 3333 1 333 3333 4444 1 33333 1 6666666 4444 1 222 1 1 222 555 1 11 1 1 44444 33 1 55 1 22 1 888888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44444 88888888 222 11 33333333333333333333 22 1 1 11 1 1 1 99999 11 1 2 2222 44
lowQualScore : . ............. ............. . ... ... . ............... ........ . . ....... ... ... .. ... .. .. . .............. . ............................................................................................ . . . ......... . ... ... . ....... . ......... .. . .. .. . .. . .. . ..... . . .... . ... . ................................. .. . . . .. ........ . .. ................ . . ... . .. . ....... ...... ..... . .. .. . . ... .... . . . .. ... . . ....... . ... . .... . . . ............... ........ .. . .... ......... . . . . . . .... .. ..... .... . . ......... ...................................... . . . ... . ... ......... . .. . . ..... ................................................................................................................................................................ .. .. .... . ... ...... .... ... ...... ...... . . . ... . .. .. . . .... ..... ... . . .. ... ........................... .. ... . .. . . .. . ... ...... . . .. .... . ... .... .... . ..... . ....... .... . ... . . ... ... . .. . . ..... .. . .. . .. . ...... ............................................................................................................................................................................................................................................ ..... ........ ... .. .................... .. . . .. . . . ..... .. . . .... ..
lowQualScore : 8 6666666666666 9999999999999 0 888 888 4 000000000000000 22222222 6 8 1111111 444 444 66 444 00 55 3 99999999999999 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 000000000 4 888 000 4 3333333 0 555555555 99 0 88 00 4 11 4 44 9 00000 0 6 1111 6 444 3 444444444444444444444444444444444 00 3 5 3 00 99999999 0 33 1111111111111111 9 9 000 7 99 7 0000000 888888 77777 3 66 66 3 9 444 7777 1 3 3 99 444 4 3 8888888 6 888 3 5555 0 0 3 333333333333333 33333333 22 1 5555 333333333 9 4 9 9 9 9 6666 55 11111 6666 4 2 000000000 44444444444444444444444444444444444444 5 8 0 555 0 000 000000000 0 88 1 1 00000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 99 5555 9 555 000000 7777 888 000000 000000 7 7 8 222 8 55 00 6 6 9999 44444 000 7 7 11 888 222222222222222222222222222 88 888 7 33 7 1 33 7 999 444444 6 6 88 4444 6 222 3333 6666 5 77777 5 3333333 6666 0 444 4 4 444 777 4 99 4 4 88888 99 5 66 5 00 5 999999 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 11111111 000 66 55555555555555555555 88 2 2 77 2 2 2 22222 88 4 8 9999 11
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATAGTCT----------AAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A--A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA------TTG---------A-TTT---------------G-C---A---C----AC--------A-GGAACA------TA--C---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( family-198 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATCGTCT----------AAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A--A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA------TTG---------A---T---------------G-C---A---C----AC--------A------A------TA--C---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|1 : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAA-A---ATAAAATATAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAAT-GTTTTGAATGGCATAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---AAAATATGGAA---A---T---A---TTTTGCCTGTCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------C-T--GTGAGCAG-AT-----A-C--T-T--ACTA--C-T--GAT---GATCAGAATCA--CAAT-G-A-CTG------A---T--T--TA----TGG--------AGCCATCA-CCTCTC---------TTA-AA---AT---AAAT-AGGTT-GTAAG----G----A--AA-TAAA--C-AGT-AG--GAC-CTA-CGACATG-CGG-T-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAAAG-AA--TATC--TTT----ATAAGACAATGT--AT-AAATGAAAAACA--TT-TTTTTTTTTTTTCATAAGTAAAA--TCAA----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGACAAG-GT--GG--GGGATAAATT---ATA----CAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---AAT-TTC-------GAGTTTG-ATAGAAAATTC---ATGAT-TTATTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACCA------T-A------CCATAA--------TAT--AT-TGC----AGCTCTCTTTTTTTCTTCTTTTAT-TTTTGCATT-GG-GTGC-CTTTCTGATGCAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GGAAAAA---------AACC-C---G-AAAGAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AA---AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTTCA-CGT---GTAAGTTATA------AA----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A--A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-G----AA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-AA-------G----TAGT---TAAA-T-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-T--CT-TT--G-AGA------TCG---------A---T---------------G--------------------------------------TA--C---------------C-----------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---G--C----------A---------AA--CAAA-CACGC-T--T-CCGTC-TA-ATAA-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATCT
gi|10 : ATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TCAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-CATGTTGAACCCTCTTTAT-T-TTATTTTAT-TCTTACATT-GG-GTGT-CTTTCTGATACTG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AACA-----------C---AG-TAC-------AAG---T--G----A----------A---------A---------------------G---T--ACTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTCAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A--A---G---------A---T---------ATAAA--A---TTTTA-C--GCTC-AAGCTTTG--TAT-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--CT----GT----TAAA-GG-----TA-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TTG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA------TTG---------A---TTTTGCCACACACGGAA-C---A---T----AC--------A------ATG----TA--C---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-A----------A---------CTTTTTTTTTTTT-T----------T-----TT--------TCC---A--C----------A---------AA--CAAA-CATAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----c
gi|11 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgAAAA--------TAT--AT-TGC----AATC-------TCT-TTCTTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-ACTTATGATACAG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACAT-TT---C-TTC---ACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATT-----ATA-----------------------T--------T------------------A---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--ACATTATTTC------C---------AT----------------G---AATAT--TCGTA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACAA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-ACATGAATTTCTT-----CTT---AG-A-A--A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATGTTG--TCG-A---AAA------TTC-T-GT--CAC----GAGAGAC-AG---T----A---------------------A-------G----TACT---TAGA-A-GC---AAT---TGCTG-TCG--G-A-A-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGC------TTG---------CTTTT---------------GCC---A---C----AC--------ACGGAACA------TA--C---------------CAAGATTTTAGCATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-GTT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CCCTTTGT------AGGTCTACTCCT-----TT--------TTG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-A
gi|12 : G--TT----GT----TAAG-GA-----TG-TA-------G----TATT---TCGA-A-GC---AATAT-TGCTG-TCG--A-A-T-----AGAAT--G-C--TG-TT--G-GGA------TTGTTATTTGTTA---C---------------G-C---A---CGGA-AC---------------A------TA--C---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------TGTGATGATT-------C-------A-ATT--------T--GTAGT---------T-A----------C---------A-------------A----------T-----TT--------T
gi|12 : -------------A----------T-----TT--------TCG---A--CCAAATAATTTA---------AA--AAAA-AATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--GTACTTTGATatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|13 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtg-C---A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TC-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AA-------------TACAGT-AAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T--TTTGA--G----CTGCC-CGT---GTAAGTTATA------AG----TACG---GCTGATC------A------TT-ACAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CTT---AA-A-A--A---G---------A---TATC------A---A--A---TTTTA-C--ACT--AAACTTTG--TAG-A---AAC------GTC-T-GT--CAA----GGGAAAC-GG--TA----GT----TAAA-GG-----TG-TT-------G----TAGT---TAGA-A-GC---CGT---TGCTG-TTG--A-C-T-----AGAAT--A-T--TG-TT--G-AGA------TTGATC------A---T---------------GCC---A---C----AC--------AGGGAACA------TA--CAATGTAACAAAATTTCAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTTCTTGAA--A----------T-----TT--------TCG---A--C----------T---------AA--GAAA-CATGT-G--T-CAGCT-TA-ACAG-----T--AT-T-G----TCA--ATACTTTGATT
gi|14 : ATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGTA---T---A-AATCAATAAAACAAACA---AC------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAAT--------------------AGT-TTAGAATCCTAAATTATTT---TCC---------------T---A---ATT--CTTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-ATTGTGAGCAG-ACAGCGTA-T--T-C--ATAA--A-C--AAC---GAAGAG----A--CATTAA-A-C-G------A---A--T--TAATACTGGTTGGTAGTG-CCAGCA-TCTACC---------GTA-CATGTAGGTTACATAAA-TT-AAAAG----T----A--AA-TTGG--G-AGA-AG--AGT-ACG-CTGCATG-CGGAT-GTTCT----CAG-CCGG---------TG-A----GTC--TTT----GTAAG----------T-AAAGGAAGACCA--TGTTTTTTTTATTTTCA----------------------------------C-AAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AAT-----GTCGa
gi|15 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagt---G---T--TCTGA--G----CTGCA-AGT---GTAAATTATACATGTAAG----TATG---GTTGATC------A------AT-ACCACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TT---------------------------CCC---AA-A-A--C---G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-ATACTTTG--GAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-AA-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA--------AGT---TGCTG-TCA--A-A-G-----AAAAT--A-C--TG-TT--G-AGA------TTG---------A---TTTTTTC---------A-C---A---C----AC--------A------A------GATTT---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CATCTTTTTTTGAAA----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACCTTGAT
gi|16 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa-AA-T----C----GATA-----------GAAA-GA---------A--C-A---G-AAG-AT-TC---C-T-C---ACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AAACACATATACTTA-G--------------T---GT-TAA-------AAGTGAA--A----A----------C---------ATTATTTCCATGAA----A---G---T--CTTGA--GAGCTCTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-AATA---T---------A---T---------A---A--A---TTTTA-A--ACTC-AAACTCTG--TAG-A---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGAC-AG--CT----AT----T----------------------------------------A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AAAAT--A-C--TG-TT--G-AGA------TTG---------ATTTT---------------G-C-------C----AC--------AC-----A------TA--C---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT------------T--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C--------------------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCA-TA-ATGG-----T--c
gi|17 : TAAATTG-A------AG----TATGT--GTTGATC------A------TTTGCATCTAGGAATGTTCAC-A-A---TA-C--TT-AA--T-T-AC----ATATCTTT----CCT---AA-A-A--A---G---------AGATT---------AC--A--A---TGTTAAC--ACTC-AAACTTTG--TAG------AC------TTC-T-GTC-CAA----GAGAGAC-CATTTT----AT----CAAA-GG-----T--TA-------GT---TAATTTATAGAGA-GC---AGC---TGCTG-CCG--A-C-G-----ACAAT--A-CT-TG-TTGGG-AGA------ATG---------A---TTTTGGCC--------A-C---A---CACGAAC--------A------A------TA--CCAGATATTT------CAAT--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------CT------ATATT--------T--AT--TTTATCACTAT-G----------A---------T-------------G----------T-----TTTGAAATG-TCT---A--C----------AATACAAAGCAA--CAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--A----C----TCA--ATAATCTGAT
gi|18 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT----GAG-CAAGAT---TTGTTA-AA--TATCATTTT----CTAAAAAAA-A---GT-GGGGGGGGGGTAACTA--------ATTTTTATAAGTAAAA--T--A----------------------------------CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AAATTAAAGTCGA-AAGTGT--GG--GAGA-AA-TG---GGA----TAAATTAATCTTAA-G-TCTA--TCA---ACA-TTT-------GAATTTC-ATAGAATATCT---ATGGA-TTCTTTAT--TATGCATNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGA-GTATGCCTTTTAATACAT----TATCTAAGAA----------------------------------------------GAA------------------C---A-AAATAT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------aa
gi|19 : A-T----T----GATA-----------GAAA-GA---------A--G-C---T-AAG-AT-TT---C-TTA---GCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A--------------------------------------AA-------CAC--ATGTA----G----------T---------AG----------------A---G---A--TCTAA--G----TTGTA-TATAATGTAAGTTTTA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACGAGGAATAT-CACCA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A--A---AT--------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-GATCTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTA-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-C--TG-TT--G-AGAATGGTTTTG---------C---C---------------A-C---A---C----ACGGAACATAA------A------TA--A---------------CAAGATTACAACATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------CTGATGTT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|2 : cATA----------A--ATGAGCAG-AC-----ATC--T-TGAATTA--C-----AC-----ACAGGAC-AGGCGTT-G-AGC-G------A---A------A----TG---------A-CCT-TA-TCTCGC---------ATAGAA---AG---AAAT-AG-TA-GGAAG----GG---A--AA-TAGAATG-GAA-AA--AAT-ATA-CGACGTG-CAGTT-G-TTG----TAA-CGAGAT---tg
gi|2 : AAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAAA-----GTCGA-AAGCGA--GG--GGGG-G--TG---AGA----TATATTGATATCAA-G-TATA--TCA---ATG-TTT-------GAGTT-------------C---A-GAG-TTCTTTTATCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTACATGTAT-G------CTAAGAATACAATGTAT--AT-TAC----AACCCACTTTAT-------TTCAT-TCTTGCATT-AG-GTCT-CCGTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGA---------A--C-C---A-AAGC-T-TT---C-TTC---AGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AATCACAGTACATTAAG--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----AACTATTTC--C---------AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTACA-TGT---GTAAGTTTTA------AG----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGAAATAT-CACCA-A---TC-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A------G---------A---T---------ATC-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CTG-A---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGC---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA------TTG---------ATTTT---------------GCC---A---C----AC--------AAGGAACA------TA--C---------------CAAG---------------------C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--Aggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|20 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacga---G---T--TTTGA--G----CAGCA-CGT---GTAATTTATA------AG----TATGATAGTTGACC------A------TT-GCAATTAGGAATGT-CAGTA-A---TA-A--TTTGA--T-T-AC----ATT-CTT-----CAT---AA-A-A--A---G---------A---T---------A---T--G---TTTTA-C--ACTC-AAACT----------------------------GT--CAG----CAGAGTC-AG--CT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCA--A-A-GACAATAGAAT--A-C--CG-TT--G-AGA------TTG---------ATTTT---------------GCC---A---C----AC--------ACGGAACA------TA--C---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TTTATGTACC-------A-ATCTACATATGT--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTCGGA---A----------T-----TT--------TCA---A--C----------A---------AG--CAAA-CATGT-T--T-CCGCC-TA-ACAGTATA-T--AT-T-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|21 : cattaaatccacgaaaTTATGA---AA---TGTCTTTCCTAGTCT----------AAATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT---ACAG------A---A---T---A---ATT--CCTGCCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATGTACATTTGTAT-A--GTGAGCAG-AC-----A-C----C--ATTAGGCAC--AAC---GAAAACAAT-A------------------------T--T--TA----GAG--------T-CCA-CA-CGTTTA---------GTA-AC---AT---GAAT-GG-TTTATAAG----T----G--AA-TAAA--G-AGA-AA--AAT-ATT-CAACATG-TGGGT-GATTT----TAA-CGAGAT---TTATTGAA---TACA--TTT----TTAAGAAAA-GGGTAT-AAAGGAAGACTA--TA--TTTTTTATTTTCATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AAA-----GTTCA-AAGCGT--AA--GGG--AAATG---AGA----TAAt
gi|22 : -AA---GG---AAAT-GG-TG-GGAAG----G----A--AAATAGA--G-TGG-AA--AGT-ATA-CAACACG-C-----ACTTTATG-TAA-CGAGA----TGATTG-T---TGTC--TTT----G-AAAAAAA-GT--AT-TAACAAAGAACA--TG-CT---------------GC---A--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GC
gi|22 : gACCCTCTTTATGT-A-ATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTTT-CCGTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|23 : gaaggaaatggtgggaaggaaaatagagtggaaagtatacaacacgcactttatgtaacgagatgattgttgtctttgaaaaaaagtattaacaaagaacatgctgcatatgtaatttattgtgcgtaacatatcgtagaatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTCA-AATATGGAA---A---TC--A---ATTT-CCTGTATTT-ATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTGCAC-----A-G--TAC--ATTG--C-A--AACCTTGAACAT--T-A--CATT-GAA-C-G------A---TA-A--TG----CGG--------C-CCA-CA-TTATCC---------GTA-AA---A
gi|23 : A-AA--ACT-AT-----TATG-CGGGTTGTTTT----TAA-C-AGGT---TTACTG-GAAGTATC--CTT----AT-------------T-AAATGAA--CCC--TA-TATTGTTAATTTCATAAGGAAAAAGT--AATGGTGTA-TTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGC-T--GG--GGAA-TAGAA---AGA----T-AATTAA-GTTAT-G-AATA--TCctattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|24 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgt-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-CA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGcaag
gi|25 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------A---------AA---AAG-CATGC-T--T-CCGAC-TA-ACAG-----T--AT-T-T----T
gi|26 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtaAT-C-CTACA---TA-C--TTTAA--TCT-CC----ATATCTTAATCTCTT---AC-ACA--A---ACCTCGCACTA---T---------AC--A--A---TTTTA-CCCACTC-AACCTTTG--TAG-ACACAAC------TTC-T-GT--CAACTTAGAGAGAC-A----T----AC----TAAATGGCCCCTTC-TC-------GATCCCAGT---AAGA-AAGC---AAT---CGCTGCTCA--ACA-GC----AGAATTCA-C--TCCTT--GCAGA------T-G---------A---TTTTGCCT--------G-C---A---A----ACGGAA----A------A------CA--CTTT------------CAAGC-------ATC--------A-A-A--------CA-------T-------GT-------C-------ACATT--------T--TT--T---------TCA----------A---------CTT-----------C----------T-----TT--------TCG---AAAC----------A---------AAA-CAAA-CATGT-T--TGCCGCC-TACACA------T--AT-T-C----TCC--ATACTTTGATTga
gi|27 : tatcacaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---TCCCA---ATT--CCTGTAGTTTATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTG-AC-----A-CAGTAC--ATTG--C-----ACCTTGAA---AAT-A--CATT-GAA-C-G------A---TAAC--TA----GCG--------C-CCA-CA-TATCCC---------GTA-AA---
gi|27 : ATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGGT---TTACTG-AG--TATC--CTT-----T-------------T-AAATGAACACCA--TA-TATTTTAATTT-CATAAGGAAAA--T--AAATGTGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGCGT--GG--GG---AAATG---AGA----TAAATctattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|28 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactatt---TAGA-G-GC---AGTGATTGCTC-TTT--A-A-G-----A---T--C-C--T---T------A------TTGGT-------A---T---------------G-C---AGGAC----AC--------A------A------GA--C---------------CAAA--------AGT----------C-A--------AG-------C-------TT-------T-------A-ATT--------T------T---------C-G----------A---------C-------------A----------T-----TT---------------------------------------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATT
gi|29 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaacCTGA--G----CTGCA-CAT---GAAGGTTATA------AG----TACA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---T-------------------------TCTT-----CCT---AA-A-A--A---G---------A---T---------AT--AC-A---TTTTA-T--ACTC-AAACGTTG--TAA-A---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGGC-GG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAAC-A-GC---AGT---GGCTG-TTG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA------TTG---------A---TTTT------------G-CC--A---C----AC--------ACGGAACA------TA--C---------------CAAG--------ATT--------T-C-AGCATTTCCTG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TTTTTTA--A----------ATTTTT----GA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAa
gi|3 : ----GATG-----------GAAAGAACACATATATA--C-C---G-GTATATCTT---C-TTC---ACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----------------------------------------------------------------------------------------------T-TAA-------AAG--AT--A----GCCTTATTTC-C---------AT----------------GAATG---T--CCTGA--G----CTG
gi|3 : TGCAACAT---GTAAGTTACA------AG----CATG---GTTGATCATTGCAA------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTTTTAAATT-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AACA-A--G---G---------A---T---------AT--A--A---ATTTA-C--ACTC-AGATGCTG--TAA-A---AAA------TTC-T-GT--CAA----GAGATACTAT--TT----TT----TAAA-GG-----TG-TA-------A----TACA---TAGA-A-GCCATAAT-----CTG-TTG--A-CTG-----AGATT--G-C--C--TT--A-AAAG-----TTGCAAC-----A---C---------------G-C---G---G----AT--------A------A-------A--C---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------CCTGTTTAA-ATT--------TAAAT--T---------T-A----------AG--------C-------------A----------T-----TT--------TTG---aataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|3 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattat----TAAA-CT-----TG-TA-------A----CAGT-----GA----------T---TGCTC-TTA--A-A-G-----AGTAT--A-------------AAT------TTC---------A---G---------------G-----A---C----AC--------A------A------TA--T---------------CAAA--------AGT----------C-A--------GG-------C-------TG-------G-------A-ATT--------T-----------------------------------------------------------------------T--------TCG---A--C----------A---------A------A-CATGC-T--T-CCG---TT-GCG------------C-C----T----ATACTTTGATTtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagT----T-CA-T----T----GATG-------------AAAGA---------A--C-C---G-AGATAT-TTATTC-TTC---ACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACTGTATACATGATTTTTAATACATGT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------GT----------------
gi|30 : cat---T--TCTAATTG----ATGTA-CGT---GTAAGTTATA------TG----CATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAACTAGGAA-----ATTG-A---TA-C--TTTAtatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|31 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttAAA--------TAT--AT-TAC----AAAC-TCATTAT-T-TCATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AATG-----------GAAA-GA---------A--C-A---A-AAGT-T-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------T------------------AAACACAGTATATTA-G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------CTTTATTTCCAT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTGCA-CAT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-C---TA-C--TATAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A--A---G---------A---
gi|32 : ct---A--C----------A---------AAATCAAAGCATGCCT--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|33 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggacTTAATA---A-A-TGTA--TT--------TTT-------GAATTTC-ATAGGAAACTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTA-A-TAAA-CACACTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--AT-TGC----AACCCTTTTT--CT-TTATTTCAT-TTTTGCATT-GG-GTGT-CTTTATGAAAGTG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT---------------------------------T---G-ATATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----c
gi|34 : ---TAGA-G-AC---AGT---GATTA-TCTTCA-A-G-----AGTATTGA-C--CC-TT------A------TTG---------A---TCTCA-----------G-G---A---C----AC--------A------A------GA--T---------------CAAA--------AGT----------C-G--------CG-------C-------TG-------T-------A-ATT--------T----------------T-A----------A---------C-------------------------------------------------C----------A---------AA----AA-CATGC-T--T-CCCAC-TA-CCAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGAcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|35 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaacTA------T-G--------AAAT--------TATTTAT-TA-----AGTCATCTTTTTAT-TGCTGTTGT-TGTTGCATT-GG--TGT-TTTGTTGATACGC----TATCCAAGAACATTT----AAT----C-TA-T----T----GA----------------AAGA---------A--CAC---ATAGATAT-TT---C-TTCTTCGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TT-----ACT-----------------------CTGTGTACAC------------------A---------------G--------------T---AT-CAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATA---------------A---G---T--TCT
gi|36 : tcatatatttattttttcatttt---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-CA-----TG-CA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-T--TG-TT--G-AGA------TTG---------ATTTT---------------G-CT--A---C----AC--------ACGGAACA------TA--C---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTGGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCT-TG-ACAG-----T--AT-T-CTCTATCA--ATATTTTGATTTaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT---AAGA-GAGTAAAACAAAAA---AG------TTAGTTGA-A---CA---TGTTTTGAATTGTCC----------AAAAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT---AC----------------T---A---AAG--CCTGTAA---ATACAG--ATATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--ACGAGTAG-AC-----A-ttc
gi|38 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataaga---------A---T---------C---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAAAGAC-A---TT----AT----CAAA-GA-----AG-CA-------G----TAAT----------------GT---TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA------TTG---------ATTTT---------------G-CA--A---C----AC--------ATGGAACA------TA--C---------------CAAG--------ATT--------T-C-AG-------CA-------T-------TT-------C-------A------------------------------------------------------------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--C-CCGTC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATata
gi|39 : at---AA-A-AT-A---T---------A---T---------A---A--A---TTGTA-C--ACAT-AAACGTTG--TAG-A---AAA------TTA-T-CT--CAA----GAGATAC-TT--TT----GT----TAAA-GA-----CG-TT-------G----TACT---TAGA-A-GC---AATA--TTCTG-CCG--A-A-A-----AGAAT--A-C--TG-TT--T----------TTG---------C---C---------------A-C---A---C----AC--------AGAAC--A------AA--C---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------C---------C-------------T----------T-----TTTGAAATACTCG---T--C----------A---------AA--CAAa
gi|4 : aA---A---T---A---ACT--CCTCTAA---ATAGGGAAGTTAGCCCAGCGGCA-TATATA--------TCA--CTGGAGAG-AC-----A-A--T-C--AT----------AT---AAAAAAAA-----CGTT-G-A-C-CCATAACA---T--CACTA----TTG--------A-CCA-CAATCTCGCAGATGGAGGGTG-AA---AG---A----------GGAAG----GTTAGACTAA-TGGATTG-CGT-AAGGAATCATATCGACATGGCAGGT-TTTCTGTTATAATCGAGATGTTTTACTG-G---T------TT----ATGGGAAAA-G---GTTAAACGAAGAA-A--CA-TT---------------GCAGAA--T--------GTAATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AA-------TTAA-A----T--GATAAAAA-AAATGTAAAGAATGCTAAATTAATATCA----TA-A--TCACATATGATTT-------GTGTTTCTATGAAATATTCTGCATGAG-TTCTT-ATTCTATCTGTCCTA----AATAAGGCAAGCTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--GT-TTC----GTACTTTTTTAACC-TTATTTTATCTCTTGCATT-GG--TGT-CCGTCTGAAACAAA---TATCTAAGAAC-TTT----CAT----TGAA-TCAA-T----GATG-------------AAAGA---------A--C-CATAG-AAG-AT-TT---CCTTC---ACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT------TT-----------------------T--------C------------------A---------------
gi|40 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctttaaattagtttacgttaattcgtgtagttaggcgtattatgcttaactagcaatgggtaattT-----ATT---------------------------------------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CAacacagtatttca
gi|40 : AA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CACnaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|41 : tattagtgttaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcanT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AT--CA-----TAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----CCA--TTACTTTGATT
gi|42 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggc--T-T-TC----ATTTCTT-----TTTGGGAG-A-G--ATATG---------A---T---------A---G--A---TTTAA-C---CTC-AG---TTGAGCAG-A---A--------TTC-T-ACTCCAG----GAGAGGT-AG--TT----ATGTTGTTAA-GG-----TG-TG-------------------TAGA-G-GC---AAT---TTCAA-TCA--A-G-G-----GGAGC--AAC--TA-TT--C-AGACTGT--TTG---------A---T---------------T-CTA-A---A----AC--------A------AGAAACATA--C---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------c
gi|43 : tATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTAA-GA-AAATAAA-CAAACA---AT------TAATTTAT-A---GA---TGTTTT-AACAGTAT----------AAAAGAAGGTTGGGAGCTT---------------ATATGGAA---ATCTT---A---ATC--CCTGTAA---ATACAG--GTATatat
gi|44 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataaTT----AAT----T-AA-T----TT---GATG------------AAAAGA---------A--C-----A-AGACGT-GT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATATTGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ATAATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCTGA--G----CTGCA-
gi|45 : atatctatataaccttataatataataA------AA----CATG---GTTTATC------A------TT-GCAACTAGCAACAT-CACTA-A---TA-T--TTTGA--T-TGAC----ATTTTTT-----CTT---TA-A-A--A---A---------T---T---------A---AAGA---TCTGA-A--ATTT-ACAC------TAA-A---AAC------TGCAT-GT--GA------ACAGAC-AG--TT----GT----TAA-------------C-------G----TACT---TGGA-A-GC---AAT---TACTG-TCG--A-A-T-----AGAAt
gi|46 : gc-CAATTAAACAAACATAAAT--------AGCTAT-ATACGAATATGTTGTAAATCGTCA----------AAAAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT---ACAACATTGAA---A---TCCTA---ATT--TCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGCTGCAGTATATA--------T-A--ATAAGCAG-GC-----A-C--
gi|47 : T----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------G--C-A---G-AGATAT-TT---C-TTCTTCACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TT-----ATCGTATACACGATTTTTAATACATAT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------aaat
gi|48 : tcgaaatgtttagcaatacC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA------ATG---------ATTTT---------------GCC---A---C----AC--------ACGGAACA------TA--A---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--Atattttcatgactgttctcagctga
gi|49 : cgcaaagcC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA-------TG---------ATTTT---------------GCC---A---C----AC--------ACGGAACA------TA--A---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--A
gi|5 : cgcaaagcAAG----G----A--AA-TAGA--G-AAA-AA--AAT-ATA-CAATATG--------TCTA----TAA-CGAGAT---TTAATG-AC--TATC--TTT----A--AGAAAG-G---CT------------------TTTTTTAATTTTCATAA-TAAAA--T--A----------------------------------CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------ACA-----GTCGA-AAGCAT--GG--GGGA-AA-TG---TGA----TAAATTAATTTCAG-G-TATA--GCA---ACA-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNN-------AT-CCTTCAGGTACAGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GATG-----------GAA--GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATC-----------------------T--------C------------------A---------------AACACAGTATACTTAT---GT-TAA-------AAG--AA--A----A----------C---------ATTTTTATGAA-------A---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GGAAGTTATA------AG----TGTG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-AACTT-A---TAAC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----C-T---AA-A-A--AT--G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-CA-------G----TAGT---TATA-A-GC---AGT---TGCTG-TCG--A-A-G-----GCAAT--A-C--TG-TT--G-AAT------TTG---------ATTTT---------------G-CCATA---C----ACGG------A------A------CA--T---------------CAAAT-------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------C-ATC--------T--AT--T---------TCA----------ATTTTTTTTTT-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-C--------------------AT-T-C----TCA--ATGCTTTAATT
gi|50 : tt-------------A----------T-----TA--------TCG---A--CCAAA------A---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--Ac
gi|51 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaTAAATCAGTT---ACAATATAGAAATGA---T---A---ATT--ACTGTAC---ATACGG--GAATGC--AGA---AGTATATCCT------T-A--GTGAGCGG-AT-----A-C--T-G--ATTA--G-C--Agattttatttgca
gi|53 : ctaaggaagcggaataA-TGT---GCAAGTTATA------AG----CATG---GTTTGGC------A------TT-TCAACTAGGGATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCA---AA-A-A--A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTcaatggacgat
gi|54 : ttattagaagtctccatatatAATTACA------AA----TGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--AGAAA----CACAA-AATATA-T--TTCAA--T-TTAC----ATTTCTT-----CAT---TG-A-A--A---G---------A---C---------A---A--AGTATTTTA-C--GCTG-AAACTTTG--TAG-A---AAA------TTc
gi|55 : agT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-ATTTTCAAGACA---------C-------------A----------TA----GT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATTC-TAAT-TCTCC-TA-AC-G-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATTtgg
gi|56 : tcagagtatatgactaACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-------TTAGACAA--------------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAatttt
gi|57 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggt---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CTTTTTTGTTTTA-A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATA-ACAG-----T--AT-C-C----TCA--ATACTTCGATTTttg
gi|58 : tt---------A---T---------A---T--G---TTTTA-A--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---GACAGACAGTTG-TAGA--CAG----GAGAGAC-A------------------A-GA-----TG-TA-------G----TCCT---TAGA-A-GT---AAT---TGCTG-ACA--A-A-A-----AAAAT--
gi|59 : -------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------C---------AA---AAG-CATGC-T--T-CTACC-TA-TCAG-----TAGATAT-T----TCA--AT
gi|6 : attgcagattcttgatcgatcttcacaccaaaagtagggctgtaTTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AAA-----CTCGA-AAGCGTAGGG--GGAA-AAATG---AG-----TAAA-TAATTTCAA-GTTATAGCCCA---ATG-TTCTGCCACAGATCTTC-CT--AAAAGTC---ATAGG-TT-TTTATTTTATCT-TCCTT----A-TAAGCCAAACTA------TGG------CCAAAC--------CAT--ATATAC----TAATCTCTGCATGT-TTATTTTA--TGTTGCA---GGAGTGT-CCATCTCATACAG----TATTTTCGAA-ATTT----TATAATGT-AAGT----T----GATG-----------G-AAAGA---------A--C-------AAATAT-TT---CTTTC---ACATCT---------T-C-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACT-----------------------TAAACA---C------------------A---------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG--GT--A----T----------T---------A-----------------A---G---T--TTTGA--G----CTGTA-CAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A--A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----CAGAGAC-AA--TT----AT----TAAA-GG-----AG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT---TGCTG-TCA--A-A-G-----AGAAT--G-C--TG-TT--G-AGA------CTG---------AGTTT---------------G-CA--A---C----AC--------ACGGAACA------TA--C---------------AAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTCTTGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AG--CAAA-CATGC-T--T-TTAAC-TA-ACAG-----C--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTTt
gi|60 : -------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTT
gi|61 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTT
gi|62 : gacgtT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC--A-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|63 : cgtTAAGTAAAA--T--AGA--TTTGATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AAA-----GTCGA-TAGTGT--GT--GGGA-actgtactgctt
gi|64 : ct--TTT----ATGAAAAAG-GT--AT-CAAGGAAGACCA--TA-ACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAA--T--A----
gi|67 : ttgaataactaAA-A-TATAC-TCA---ACGGTTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAGTTTCTTTATTCTActgc
gi|69 : tTCAA-A-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTAT
gi|7 : ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AGA-----GTTGA-AAGCGT--GG--GGGA-AA-TG---AAA----TGA-TTGATA--AATG-TATT--TCA---ACG-CTT-------GAGTTCC-ATAGAAAGTTC---ATCAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTATA-TAAA-CAAACTA------T-GTATATGCCAAAA--------TAT--AT-TAC----ACCCCT------GT-TTATTCTA-------CATT-GG-GCGT-CCTTATAATATAG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACGT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATAATGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ACCATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCGGA--G----CTGCA-CGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAGCTAAGAATAT-CACTG-A---TA-C--TTTGAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A--A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACGCAAAACGTTG--TAA-A---AAT------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TTATTAAT----TAAA-GG-----TG-TAC------A----TAGT---TAAA-A-AC---AGA---TGCTG-TCG--A-A-T-----GGAAT--A-G--TG-TT--G-AG-------TTG---------CGTTT---------------GCC---A---C----AC--------GCGAAACA------TA--C---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-T----------A---------T-------------T----------T-----TT--------TC-------C------------------------TTAA-C---T-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--GTACTTGGAT
gi|70 : ---A--C----------T---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CTATC-TA-TCAG-----T--AC-T-C----TTA--GTACTTTGATT
gi|71 : ATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--AT-T-C----TCA--ATAATCTGATat
gi|8 : ---A-GA-CAATAAAACAAATA---AT------TAACTAAT-A---GA---TGTTTTGAATAGTCT----------AAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACGATATGGTA---A---T---ACAAATT--CCTGTAA---ATACGG--GAATTC--AGGTGCAGTATAAA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-T--T----GTAA--T-CTGAAC---AAAAGAAAT-G--CGTT-G-AAC-A------AATTT--T--CA----TG---------A-CCA-CA-TCTTGC---------ATG-GA---AG---GAAT----TT-GTAGGACGGG----A--AA-TGGA--GTGGATAA--AAT-AAA-CGATATG-CATTT-GTTTT-----AA-CGAGAT---GTA-TG-T---TGTG--TATGGAAATAAAAATG-C---AT-AAAGGAAGAACA--TG-TT---------------GTAAA-----------TCTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TAA-----GTCGA-AAGCA----G--GTGG-AAATG---AGA----TAAATCAATATCAA-G-TAAA--ACA---ATG-TTT-------GAGTTTT-ATAGAAAATTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----G-TAAG-CA----------------------AAAA--------TAT--AT-TAC----AACC------AATT-TTATTTTAT-TCTTGAATT-GG-GTGT-CCGCCTGATACTG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AATT-----------GA-------------------T---G-A---AT-TT---C-TCC---ACATTT---------TCC-G--TTatgacaaa
gi|9 : ataTGTA-CGT---GTAAGCCATA------AG----CTTG---GTTGATC------AATGCAATT-ACAATTAGGAATAT-CACTA-A---TA-T--TTTAA--TGT-AC----ACTTCTT-------T---AA-A-A--A---G---------A---TTTATATGCGA---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATATTG--TTGAA---AAA------TTC-T-GT--CCA----GAGGGAC-AT--TT----GTG---CAGG-AG-----TGATACTCGAATG----TAAT---TA------C---AG----TACTG-TCG--A-A-G-----ATAAT--A-C--TG-TT--G-AAC------TTATTTCTGTC-A---T---------------A-C---A---C----AG--------AAC----A------TA--C---------------CAAG--------ATT--------TAA-A--------CA-------T-------TT-------C-------A-ttcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|9 : aatgaa-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AG--CAAA-CATGC-G--T-CCGCC-CA-ATAA-----T--AC-G-C----TCA--CTAtgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111111 2222222222222 2222222222 111 111 22222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 222222222 111 111111 222222222 11 1111 333333333333333333333333333333333 11111111 3333333333333333 1111111 1111111 1111 111111111111111 11111111 111111111 1111 111111111 33333333333333333333333333333333333333 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222222222 3333333333333333 2 222222222222222 22222222 11111111 1111111111111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111111111111111
lowQualScore : 0 4444444444444 1111111111111 5 888 888 1 3333333333 2 77777777 1 0 8888888 666 666 88 111 55 55 2 66666666666666 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 5 1 000000000 4 777 000 1 888888 1 222222222 66 5 33 66 4 66 4 55 0 77777 4 2 4444 3 666 7 777777777777777777777777777777777 55 2 0 2 55 88888888 2 33 2222222222222222 2 2 555 1 33 5 0000000 888888 77777 3 44 44 3 7 666 7777 0 3 3 77 666 0 7 1111111 3 555 3 5555 4 8 0 555555555555555 77777777 44 3 6666 333333333 2 0 2 2 2 2 9999 55 88888 0000 2 2 222222222 11111111111111111111111111111111111111 0 3 2 333 4 777 888888888 2 22 2 2 00000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 22 4444 1 333 555555 3333 444 000000 555555 1 1 1 333 1 22 88 3 3 3333 66666 333 1 1 1 444 222222222222222222222222222 33 222 1 22 1 3 22 1 222 444444 1 1 33 3333 1 333 3333 4444 1 33333 1 6666666 4444 1 222 1 1 222 33 1 22 1 1 55555 44 1 66 1 22 1 5555555 33 0000000000000000 1 4 1 1 1 6666666666666 222222222222222 33333333 00000000 1 0000000000000000000 5555555 4444444 6666666 3 55555555 22 22 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44444 88888888 222 11 44444444444444444444 22 1 1 11 1 1 1 99999 11 1 2 3333 44
lowQualScore : . ............. ............. . ... ... . .......... . ........ . . ....... ... ... .. ... .. .. . .............. . ........................................................................................ . . . ......... . ... ... . ...... . ......... .. . .. .. . .. . .. . ..... . . .... . ... . ................................. .. . . . .. ........ . .. ................ . . ... . .. . ....... ...... ..... . .. .. . . ... .... . . . .. ... . . ....... . ... . .... . . . ............... ........ .. . .... ......... . . . . . . .... .. ..... .... . . ......... ...................................... . . . ... . ... ......... . .. . . ..... ................................................................................................................................................................ .. .. .... . ... ...... .... ... ...... ...... . . . ... . .. .. . . .... ..... ... . . . ... ........................... .. ... . .. . . .. . ... ...... . . .. .... . ... .... .... . ..... . ....... .... . ... . . ... .. . .. . . ..... .. . .. . .. . ....... .. ................ . . . . . ............. ............... ........ ........ . ................... ....... ....... ....... . ........ .. .. ......................................................... ..... ........ ... .. .................... .. . . .. . . . ..... .. . . .... ..
lowQualScore : 8 6666666666666 9999999999999 0 888 888 4 1111111111 0 22222222 6 8 1111111 444 444 66 444 00 55 3 99999999999999 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 000000000 4 888 000 4 333333 0 555555555 99 0 88 00 4 11 4 44 9 00000 0 6 1111 6 444 3 444444444444444444444444444444444 00 3 5 3 00 99999999 0 33 1111111111111111 9 9 000 7 99 7 0000000 888888 77777 3 66 66 3 9 444 7777 1 3 3 99 444 4 3 8888888 6 888 3 5555 0 0 3 333333333333333 33333333 22 1 5555 333333333 9 4 9 9 9 9 6666 55 11111 6666 4 2 000000000 44444444444444444444444444444444444444 5 8 0 555 0 000 000000000 0 88 1 1 00000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 99 5555 9 555 000000 7777 888 000000 000000 7 7 8 222 8 55 00 6 6 9999 44444 000 7 7 7 888 444444444444444444444444444 88 888 7 33 7 1 33 7 999 444444 6 6 88 4444 6 222 3333 8888 5 88888 5 5555555 8888 5 666 5 5 666 55 5 00 5 5 22222 22 6 00 5 11 5 2222222 77 3333333333333333 5 6 5 5 5 8888888888888 666666666666666 00000000 77777777 5 6666666666666666666 0000000 8888888 3333333 0 66666666 11 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222 33333333 111 77 22222222222222222222 99 3 2 77 2 2 2 55555 88 4 9 0000 22
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-ACA-----C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTTG-A-C-G------A---T--T--TA--------TGGN----CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAATAG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----T--TG--ATTT--T-----GC-C-ACAC-ACGGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( family-198 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-ACA-----C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTTG-A-C-G------A---T--T--TA--------TGGN----CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAATAG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----T--TG--A-TT--T-----G--C-ACAC-A-GGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|1 : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAA-A---ATAAAATATAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATGTTTTGAATGGCATAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---AAAATATGGAA---A---T---A---TTTTGCCTGTCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------C-T--GTGAGCAG-ATA-----C--T-T--ACTA--C-T--GAT---GATCAGAATCA--CAATG-A-CTG------A---T--T--TA--------TGGAG---CCATCA-CCTCTC---------TTA-AA---AT---AAATAGGTT-GTAAG----G----A--AA-TAAA--C-AGT-AG--GAC-CTA-CGACATG-CGG-T-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAAAG-AA--TATC--TTT----ATAAGACAATGT--AT-AAATGAAAAACA--TT-TTTTTTTTTTTTCATAAGTAAAA--TCAA----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGACAAG-GT--GG--GGGATAAATT---ATA----CAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---AAT-TTC-------GAGTTTG-ATAGAAAATTC---ATGAT-TTATTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACCA------T-A------CCATAA--------TAT--AT-TGC----AGCTCTCTTTTTTTCTTCTTTTAT-TTTTGCATT-GG-GTGC-CTTTCTGATGCAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GGAAAAA---------AACC-C---G-AAAGAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AA---AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTTCA-CGT---GTAAGTTATA------AA----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-G----AA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-AA-------G----TAGT---TAAA-T-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-T--CT-TT--G-AGA----T--CG--A-T-----------------------------G-------T-----AC---------------C-----------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---G--C----------A---------AA--CAAA-CACGC-T--T-CCGTC-TA-ATAA-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATCT
gi|10 : ATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TCAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-CATGTTGAACCCTCTTTAT-T-TTATTTTAT-TCTTACATT-GG-GTGT-CTTTCTGATACTG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AACA-----------C---AG-TAC-------AAG---T--G----A----------A---------A---------------------G---T--ACTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTCAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------ATAAA--A---TTTTA-C--GCTC-AAGCTTTG--TAT-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--CT----GT----TAAA-GG-----TA-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TTG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----T--TG--ATTT--T-----GC-C-ACAC-ACGGA-A-C-ATACAATGT-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-A----------A---------CTTTTTTTTTTTT-T----------T-----TT--------TCC---A--C----------A---------AA--CAAA-CATAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----c
gi|11 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgAAAA--------TAT--AT-TGC----AATC-------TCT-TTCTTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-ACTTATGATACAG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACAT-TT---C-TTC---ACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATT-----ATA-----------------------T--------T------------------A---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--ACATTATTTC------C---------AT----------------G---AATAT--TCGTA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACAA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-ACATGAATTTCTT-----CTT---AG-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATGTTG--TCG-A---AAA------TTC-T-GT--CAC----GAGAGAC-AG---T----A---------------------A-------G----TACT---TAGA-A-GC---AAT--TGCTG-TCG--G-A-A-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGC----T--TG--CTTT--T-----GC-C-ACAC-ACGGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAGATTTTAGCATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-GTT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CCCTTTGT------AGGTCTACTCCT-----TT--------TTG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-A
gi|12 : G--TT----GT----TAAG-GA-----TG-TA-------G----TATT---TCGA-A-GC---AATATTGCTG-TCG--A-A-T-----AGAAT--G-C--TG-TT--G-GGA----T--TGTTA-TT--T-----GT-T-ACGC-ACGGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------TGTGATGATT-------C-------A-ATT--------T--GTAGT---------T-A----------C---------A-------------A----------T-----TT--------T
gi|12 : -------------A----------T-----TT--------TCG---A--CCAAATAATTTA---------AA--AAAA-AATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--GTACTTTGATatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|13 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtg-C---A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TC-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AA-------------TACAGT-AAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T--TTTGA--G----CTGCC-CGT---GTAAGTTATA------AG----TACG---GCTGATC------A------TT-ACAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CTT---AA-A-A-A---G---------A---TATC------A---A--A---TTTTA-C--ACT--AAACTTTG--TAG-A---AAC------GTC-T-GT--CAA----GGGAAAC-GG--TA----GT----TAAA-GG-----TG-TT-------G----TAGT---TAGA-A-GC---CGT--TGCTG-TTG--A-C-T-----AGAAT--A-T--TG-TT--G-AGA----T--TG--A-TCA-T-----GC-C-ACAC-AGGGA-A-C-A-------T-----ACAATGTAACAAAATTTCAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTTCTTGAA--A----------T-----TT--------TCG---A--C----------T---------AA--GAAA-CATGT-G--T-CAGCT-TA-ACAG-----T--AT-T-G----TCA--ATACTTTGATT
gi|14 : ATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGTA---T---A-AATCAATAAAACAAACA---AC------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAATA---------GTTTA-----------GAATCCTAAATTATTT---TCC---------------T---A---ATT--CTTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-ATTGTGAGCAG-ACAGCGTAT--T-C--ATAA--A-C--AAC---GAAGAGA------CATTA-AAC-G------A---A--T--TAATACTGGTTGGTAGTGCCAGCA-TCTACC---------GTA-CATGTAGGTTACATAAATT-AAAAG----T----A--AA-TTGG--G-AGA-AG--AGT-ACG-CTGCATG-CGGAT-GTTCT----CAG-CCGG---------TG-A----GTC--TTT----GTAAG----------T-AAAGGAAGACCA--TGTTTTTTTTATTTTCA----------------------------------C-AAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AAT-----GTCGa
gi|15 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagt---G---T--TCTGA--G----CTGCA-AGT---GTAAATTATACATGTAAG----TATG---GTTGATC------A------AT-ACCACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TT---------------------------CCC---AA-A-A-C---G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-ATACTTTG--GAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-AA-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA--------AGT--TGCTG-TCA--A-A-G-----AAAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----T--TG--A-TT--TTTTC-A--C-ACAC-A-AG------A-------T-----TT---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CATCTTTTTTTGAAA----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACCTTGAT
gi|16 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa-AA-T----C----GATA-----------GAAA-GA---------A--C-A---G-AAG-AT-TC---C-T-C---ACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AAACACATATACTTA-G--------------T---GT-TAA-------AAGTGAA--A----A----------C---------ATTATTTCCATGAA----A---G---T--CTTGA--GAGCTCTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---T---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-A--ACTC-AAACTCTG--TAG-A---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGAC-AG--CT----AT----TA-----------------------------------------GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AAAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----T--TG--ATTT--T-----G--C--CAC-------A-C-A-------T-----AC---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT------------T--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C--------------------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCA-TA-ATGG-----T--c
gi|17 : TAAATTG-A------AG----TATGT--GTTGATC------A------TTTGCATCTAGGAATGTTCAC-A-A---TA-C--TT-AA--T-T-AC----ATATCTTT----CCT---AA-A-A-A---G---------AGATT---------AC--A--A---TGTTAAC--ACTC-AAACTTTG--TAG------AC------TTC-T-GTC-CAA----GAGAGAC-CATTTT----AT----CAAA-GG-----T--TA-------GT---TAATTTATAGAGA-GC---AGC--TGCTG-CCG--A-C-G-----ACAAT--A-CT-TG-TTGGG-AGA----A--TG--ATTT--T-----GGCC-ACAC-A-CGA-A-CAA-------T-----ACCAGATATTT------CAAT--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------CT------ATATT--------T--AT--TTTATCACTAT-G----------A---------T-------------G----------T-----TTTGAAATG-TCT---A--C----------AATACAAAGCAA--CAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--A----C----TCA--ATAATCTGAT
gi|18 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT----GAG-CAAGAT---TTGTTA-AA--TATCATTTT----CTAAAAAAA-A---GT-GGGGGGGGGGTAACTA--------ATTTTTATAAGTAAAA--T--A----------------------------------CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AAATTAAAGTCGA-AAGTGT--GG--GAGA-AA-TG---GGA----TAAATTAATCTTAA-G-TCTA--TCA---ACA-TTT-------GAATTTC-ATAGAATATCT---ATGGA-TTCTTTAT--TATGCATNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGA-GTATGCCTTTTAATACAT----TATCTAAGAA----------------------------------------------GAA------------------C---A-AAATAT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------aa
gi|19 : A-T----T----GATA-----------GAAA-GA---------A--G-C---T-AAG-AT-TT---C-TTA---GCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A--------------------------------------AA-------CAC--ATGTA----G----------T---------AG----------------A---G---A--TCTAA--G----TTGTA-TATAATGTAAGTTTTA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACGAGGAATAT-CACCA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-A---AT--------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-GATCTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTA-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----A--TG--GTTT--T-----GC-C-ACAC-ACGGA-A-C-A-------TAAATAACAAGATTA--------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------CTGATGTT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|2 : cATA----------A--ATGAGCAG-ACAT----C--T-TGAATTA--C-----AC-----ACAGGAC-AGGCGTTG-AGC-G------A---A------A--------TG-A----CCT-TA-TCTCGC---------ATAGAA---AG---AAATAG-TA-GGAAG----GG---A--AA-TAGAATG-GAA-AA--AAT-ATA-CGACGTG-CAGTT-G-TTG----TAA-CGAGAT---tg
gi|2 : AAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAAA-----GTCGA-AAGCGA--GG--GGGG-G--TG---AGA----TATATTGATATCAA-G-TATA--TCA---ATG-TTT-------GAGTT-------------C---A-GAG-TTCTTTTATCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTACATGTAT-G------CTAAGAATACAATGTAT--AT-TAC----AACCCACTTTAT-------TTCAT-TCTTGCATT-AG-GTCT-CCGTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGA---------A--C-C---A-AAGC-T-TT---C-TTC---AGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AATCACAGTACATTAAG--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----AACTATTTC--C---------AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTACA-TGT---GTAAGTTTTA------AG----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGAAATAT-CACCA-A---TC-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-----G---------A---T---------ATC-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CTG-A---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGC--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----T--TG--ATTT--T-----GC-C-ACACAA-GGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG---------------------C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--Aggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|20 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacga---G---T--TTTGA--G----CAGCA-CGT---GTAATTTATA------AG----TATGATAGTTGACC------A------TT-GCAATTAGGAATGT-CAGTA-A---TA-A--TTTGA--T-T-AC----ATT-CTT-----CAT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---T--G---TTTTA-C--ACTC-AAACT----------------------------GT--CAG----CAGAGTC-AG--CT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-A-GACAATAGAAT--A-C--CG-TT--G-AGA----T--TG--ATTT--T-----GC-C-ACAC-ACGGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TTTATGTACC-------A-ATCTACATATGT--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTCGGA---A----------T-----TT--------TCA---A--C----------A---------AG--CAAA-CATGT-T--T-CCGCC-TA-ACAGTATA-T--AT-T-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|21 : cattaaatccacgaaaTTATGA---AA---TGTCTTTCCTA---------GTCTAAATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT---ACAG------A---A---T---A---ATT--CCTGCCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATGTACATTTGTAT-A--GTGAGCAG-ACA-----C----C--ATTAGGCAC--AAC---GAAAACAAT-A-----------------------T--T--TA--------GAGT----CCA-CA-CGTTTA---------GTA-AC---AT---GAATGG-TTTATAAG----T----G--AA-TAAA--G-AGA-AA--AAT-ATT-CAACATG-TGGGT-GATTT----TAA-CGAGAT---TTATTGAA---TACA--TTT----TTAAGAAAA-GGGTAT-AAAGGAAGACTA--TA--TTTTTTATTTTCATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AAA-----GTTCA-AAGCGT--AA--GGG--AAATG---AGA----TAAt
gi|22 : -AA---GG---AAATGG-TG-GGAAG----G----A--AAATAGA--G-TGG-AA--AGT-ATA-CAACACG-C-----ACTTTATG-TAA-CGAGA----TGATTG-T---TGTC--TTT----G-AAAAAAA-GT--AT-TAACAAAGAACA--TG-CT---------------GC---A--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GC
gi|22 : gACCCTCTTTATGT-A-ATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTTT-CCGTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|23 : gaaggaaatggtgggaaggaaaatagagtggaaagtatacaacacgcactttatgtaacgagatgattgttgtctttgaaaaaaagtattaacaaagaacatgctgcatatgtaatttattgtgcgtaacatatcgtagaatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTCA-AATATGGAA---A---TC--A---ATTT-CCTGTATTT-ATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTGCACA-----G--TAC--ATTG--C-A--AACCTTGAACAT--T-A--CATTGAA-C-G------A---TA-A--TG--------CGGC----CCA-CA-TTATCC---------GTA-AA---A
gi|23 : A-AA--ACT-AT-----TATG-CGGGTTGTTTT----TAA-C-AGGT---TTACTG-GAAGTATC--CTT----AT-------------T-AAATGAA--CCC--TA-TATTGTTAATTTCATAAGGAAAAAGT--AATGGTGTA-TTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGC-T--GG--GGAA-TAGAA---AGA----T-AATTAA-GTTAT-G-AATA--TCctattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|24 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgt-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-CA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGcaag
gi|25 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------A---------AA---AAG-CATGC-T--T-CCGAC-TA-ACAG-----T--AT-T-T----T
gi|26 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtaAT-C-CTACA---TA-C--TTTAA--TCT-CC----ATATCTTAATCTCTT---AC-ACA-A---ACCTCGCACTA---T---------AC--A--A---TTTTA-CCCACTC-AACCTTTG--TAG-ACACAAC------TTC-T-GT--CAACTTAGAGAGAC-A----T----AC----TAAATGGCCCCTTC-TC-------GATCCCAGT---AAGA-AAGC---AAT--CGCTGCTCA--ACA-GC----AGAATTCA-C--TCCTT--GCAGA----T---G--A-TT--TTGCCTG--C-AAAC---GGA-A-A-A-------C-----ACTTT------------CAAGC-------ATC--------A-A-A--------CA-------T-------GT-------C-------ACATT--------T--TT--T---------TCA----------A---------CTT-----------C----------T-----TT--------TCG---AAAC----------A---------AAA-CAAA-CATGT-T--TGCCGCC-TACACA------T--AT-T-C----TCC--ATACTTTGATTga
gi|27 : tatcacaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---TCCCA---ATT--CCTGTAGTTTATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTG-ACA-----CAGTAC--ATTG--C-----ACCTTGAA---AAT-A--CATTGAA-C-G------A---TAAC--TA--------GCGC----CCA-CA-TATCCC---------GTA-AA---
gi|27 : ATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGGT---TTACTG-AG--TATC--CTT-----T-------------T-AAATGAACACCA--TA-TATTTTAATTT-CATAAGGAAAA--T--AAATGTGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGCGT--GG--GG---AAATG---AGA----TAAATctattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|28 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactatt-TT--A-AGA----TCCTT--A-TT--G-----G--T-ATGC-A-GGACA-C-AA------G-----AC---------------CAAA--------AGT----------C-A--------AG-------C-------TT-------T-------A-ATT--------T------T---------C-G----------A---------C-------------A----------T-----TT---------------------------------------A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATT
gi|29 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaactagaggcagtgattgctctCTGA--G----CTGCA-CAT---GAAGGTTATA------AG----TACA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---T-------------------------TCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------AT--AC-A---TTTTA-T--ACTC-AAACGTTG--TAA-A---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGGC-GG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAAC-A-GC---AGT--GGCTG-TTG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----T--TG--A-TT--TT----G--CCACAC-ACGGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AGCATTTCCTG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TTTTTTA--A----------ATTTTT----GA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAa
gi|3 : ----GATG-----------GAAAGAACACATATATA--C-C---G-GTATATCTT---C-TTC---ACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----------------------------------------------------------------------------------------------T-TAA-------AAG--AT--A----GCCTTATTTC-C---------AT----------------GAATG---T--CCTGA--G----CTG
gi|3 : TGCAACAT---GTAAGTTACA------AG----CATG---GTTGATCATTGCAA------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTTTTAAATT-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AACA-A-G---G---------A---T---------AT--A--A---ATTTA-C--ACTC-AGATGCTG--TAA-A---AAA------TTC-T-GT--CAA----GAGATACTAT--TT----TT----TAAA-GG-----TG-TA-------A----TACA---TAGA-A-GCCATAAT----CTG-TTG--A-CTG-----AGATT--G-C--C--TT--A-AAA--------G-----T--T-----G--CAACAC-G-CGG-A-T-A-------A-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------CCTGTTTAA-ATT--------TAAAT--T---------T-A----------AG--------C-------------A----------T-----TT--------TTG---aataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattatT----T-CA-T----T----GATG-------------AAAGA---------A--C-C---G-AGATAT-TTATTC-TTC---ACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACTGTATACATGATTTTTAATACATGT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------GT----------------tttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : cat---T--TCTAATTG----ATGTA-CGT---GTAAGTTATA------TG----CATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAACTAGGAA-----ATTG-A---TA-C--TTTAtatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|31 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttAAA--------TAT--AT-TAC----AAAC-TCATTAT-T-TCATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AATG-----------GAAA-GA---------A--C-A---A-AAGT-T-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------T------------------AAACACAGTATATTA-G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------CTTTATTTCCAT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTGCA-CAT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-C---TA-C--TATAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---
gi|32 : ct---A--C----------A---------AAATCAAAGCATGCCT--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|33 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggacTTAATA---A-A-TGTA--TT--------TTT-------GAATTTC-ATAGGAAACTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTA-A-TAAA-CACACTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--AT-TGC----AACCCTTTTT--CT-TTATTTCAT-TTTTGCATT-GG-GTGT-CTTTATGAAAGTG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT---------------------------------T---G-ATATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----c
gi|34 : ---TAGA-G-AC---AGT--GATTA-TCTTCA-A-G-----AGTATTGA-C--CC-TT------A----T--TG--A-TC--TCA---G--G-ACAC-A-AGA-T-C-A-------------A-----------------AAG-------------------T-C-G--------CG-------C-------TG-------T-------A-ATT--------T----------------T-A----------A---------C-------------------------------------------------C----------A---------AA----AA-CATGC-T--T-CCCAC-TA-CCAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGAcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|35 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaacTA------T-G--------AAAT--------TATTTAT-TA-----AGTCATCTTTTTAT-TGCTGTTGT-TGTTGCATT-GG--TGT-TTTGTTGATACGC----TATCCAAGAACATTT----AAT----C-TA-T----T----GA----------------AAGA---------A--CAC---ATAGATAT-TT---C-TTCTTCGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TT-----ACT-----------------------CTGTGTACAC------------------A---------------G--------------T---AT-CAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATA---------------A---G---T--TCT
gi|36 : tcatatatttattttttcatttt---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-CA-----TG-CA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-T--TG-TT--G-AGA----T--TG--ATTT--T-----G--CTACAC-ACGGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTGGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCT-TG-ACAG-----T--AT-T-CTCTATCA--ATATTTTGATTTaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT---AAGA-GAGTAAAACAAAAA---AG------TTAGTTGA-A---CA---TGTTTTGAATT---------GTCCAAAAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT---AC----------------T---A---AAG--CCTGTAA---ATACAG--ATATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--ACGAGTAG-ACA-----ttc
gi|38 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataaga---------A---T---------C---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAAAGAC-A---TT----AT----CAAA-GA-----AG-CA-------G----TAAT----------------GT--TGCTG-TCG--A-A-G-----AGAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----T--TG--ATTT--T-----G--CAACAC-ATGGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AG-------CA-------T-------TT-------C-------A------------------------------------------------------------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--C-CCGTC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATata
gi|39 : at---AA-A-ATA---T---------A---T---------A---A--A---TTGTA-C--ACAT-AAACGTTG--TAG-A---AAA------TTA-T-CT--CAA----GAGATAC-TT--TT----GT----TAAA-GA-----CG-TT-------G----TACT---TAGA-A-GC---AATA-TTCTG-CCG--A-A-A-----AGAAT--A-C--TG-TT--------------------TT--T-----GC-C-ACAC-ACAGA-A-C-A-------A-----AC---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------C---------C-------------T----------T-----TTTGAAATACTCG---T--C----------A---------AA--CAAa
gi|4 : aA---A---T---A---ACT--CCTCTAA---ATAGGGAAGTTAGCCCAGCGGCA-TATATA--------TCA--CTGGAGAG-ACA-----A--T-C--AT----------AT---AAAAAAAA-----CGTTG-A-C-CCATAACA---T--CACTA--------TTGA----CCA-CAATCTCGCAGATGGAGGGTG-AA---AG---A---------GGAAG----GTTAGACTAA-TGGATTG-CGT-AAGGAATCATATCGACATGGCAGGT-TTTCTGTTATAATCGAGATGTTTTACTG-G---T------TT----ATGGGAAAA-G---GTTAAACGAAGAA-A--CA-TT---------------GCAGAA--T--------GTAATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AA-------TTAA-A----T--GATAAAAA-AAATGTAAAGAATGCTAAATTAATATCA----TA-A--TCACATATGATTT-------GTGTTTCTATGAAATATTCTGCATGAG-TTCTT-ATTCTATCTGTCCTA----AATAAGGCAAGCTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--GT-TTC----GTACTTTTTTAACC-TTATTTTATCTCTTGCATT-GG--TGT-CCGTCTGAAACAAA---TATCTAAGAAC-TTT----CAT----TGAA-TCAA-T----GATG-------------AAAGA---------A--C-CATAG-AAG-AT-TT---CCTTC---ACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT------TT-----------------------T--------C------------------A---------------
gi|40 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctttaaattagtttacgttaattcgtgtagttaggcgtattatgcttaactagcaatgggtaattT-----ATT---------------------------------------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CAacacagtatttca
gi|40 : AA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CACnaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|41 : tattagtgttaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcanT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AT--CA-----TAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----CCA--TTACTTTGATT
gi|42 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggc--T-T-TC----ATTTCTT-----TTTGGGAG-A-G-ATATG---------A---T---------A---G--A---TTTAA-C---CTC-AG---TTGAGCAG-A---A--------TTC-T-ACTCCAG----GAGAGGT-AG--TT----ATGTTGTTAA-GG-----TG-TG-------------------TAGA-G-GC---AAT--TTCAA-TCA--A-G-G-----GGAGC--AAC--TA-TT--C-AGACTGTT--TG--A-TT--C-----T--A-AAAC-A-AGA-AAC-A-------T-----AC---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------c
gi|43 : tATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTAA-GA-AAATAAA-CAAACA---AT------TAATTTAT-A---GA---TGTTTT-AACA---------GTATAAAAGAAGGTTGGGAGCTT---------------ATATGGAA---ATCTT---A---ATC--CCTGTAA---ATACAG--GTATatat
gi|44 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataaTT----AAT----T-AA-T----TT---GATG------------AAAAGA---------A--C-----A-AGACGT-GT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATATTGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ATAATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCTGA--G----CTGCA-
gi|45 : atatctatataaccttataatataataA------AA----CATG---GTTTATC------A------TT-GCAACTAGCAACAT-CACTA-A---TA-T--TTTGA--T-TGAC----ATTTTTT-----CTT---TA-A-A-A---A---------T---T---------A---AAGA---TCTGA-A--ATTT-ACAC------TAA-A---AAC------TGCAT-GT--GA------ACAGAC-AG--TT----GT----TAA-------------C-------G----TACT---TGGA-A-GC---AAT--TACTG-TCG--A-A-T-----AGAAt
gi|46 : gc-CAATTAAACAAACATAAAT--------AGCTAT-ATACGAATATGTTGTAAATC---------GTCAAAAAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT---ACAACATTGAA---A---TCCTA---ATT--TCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGCTGCAGTATATA--------T-A--ATAAGCAG-GCA-----C--
gi|47 : T----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------G--C-A---G-AGATAT-TT---C-TTCTTCACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TT-----ATCGTATACACGATTTTTAATACATAT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------aaat
gi|48 : tcgaaatgtttagcaatacC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA----A--TG--ATTT--T-----GC-C-ACAC-ACGGA-A-C-A-------T-----AA---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--Atattttcatgactgttctcagctga
gi|49 : cgcaaagcC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----ACAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA-------TG--ATTT--T-----GC-C-ACAC-ACGGA-A-C-A-------T-----AA---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--A
gi|5 : cgcaaagcAAG----G----A--AA-TAGA--G-AAA-AA--AAT-ATA-CAATATG--------TCTA----TAA-CGAGAT---TTAATG-AC--TATC--TTT----A--AGAAAG-G---CT------------------TTTTTTAATTTTCATAA-TAAAA--T--A----------------------------------CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------ACA-----GTCGA-AAGCAT--GG--GGGA-AA-TG---TGA----TAAATTAATTTCAG-G-TATA--GCA---ACA-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNN-------AT-CCTTCAGGTACAGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GATG-----------GAA--GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATC-----------------------T--------C------------------A---------------AACACAGTATACTTAT---GT-TAA-------AAG--AA--A----A----------C---------ATTTTTATGAA-------A---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GGAAGTTATA------AG----TGTG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-AACTT-A---TAAC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----C-T---AA-A-A-AT--G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-CA-------G----TAGT---TATA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-A-G-----GCAAT--A-C--TG-TT--G-AAT----T--TG--ATTT--T-----GC-C-ATAC-ACGGA-A-C-A-------T------C---------------AAAT--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------C-ATC--------T--AT--T---------TCA----------ATTTTTTTTTT-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-C--------------------AT-T-C----TCA--ATGCTTTAATT
gi|50 : tt-------------A----------T-----TA--------TCG---A--CCAAA------A---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--Ac
gi|51 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaTAAATCAGTT---ACAATATAGAAATGA---T---A---ATT--ACTGTAC---ATACGG--GAATGC--AGA---AGTATATCCT------T-A--GTGAGCGG-ATA-----C--T-G--ATTA--G-C--Agattttatttgca
gi|53 : ctaaggaagcggaataA-TGT---GCAAGTTATA------AG----CATG---GTTTGGC------A------TT-TCAACTAGGGATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCA---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTcaatggacgat
gi|54 : ttattagaagtctccatatatAATTACA------AA----TGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--AGAAA----CACAA-AATATA-T--TTCAA--T-TTAC----ATTTCTT-----CAT---TG-A-A-A---G---------A---C---------A---A--AGTATTTTA-C--GCTG-AAACTTTG--TAG-A---AAA------TTc
gi|55 : agT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-ATTTTCAAGACA---------C-------------A----------TA----GT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATTC-TAAT-TCTCC-TA-AC-G-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATTtgg
gi|56 : tcagagtatatgactaACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-------TTAGACAA--------------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAatttt
gi|57 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggt---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CTTTTTTGTTTTA-A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATA-ACAG-----T--AT-C-C----TCA--ATACTTCGATTTttg
gi|58 : tt---------A---T---------A---T--G---TTTTA-A--ACTC-AAACGTTG--TAG-A---GACAGACAGTTG-TAGA--CAG----GAGAGAC-A------------------A-GA-----TG-TA-------G----TCCT---TAGA-A-GT---AAT--TGCTG-ACA--A-A-A-----AAAAT--
gi|59 : -------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------C---------AA---AAG-CATGC-T--T-CTACC-TA-TCAG-----TAGATAT-T----TCA--AT
gi|6 : attgcagattcttgatcgatcttcacaccaaaagtagggctgtaTTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AAA-----CTCGA-AAGCGTAGGG--GGAA-AAATG---AG-----TAAA-TAATTTCAA-GTTATAGCCCA---ATG-TTCTGCCACAGATCTTC-CT--AAAAGTC---ATAGG-TT-TTTATTTTATCT-TCCTT----A-TAAGCCAAACTA------TGG------CCAAAC--------CAT--ATATAC----TAATCTCTGCATGT-TTATTTTA--TGTTGCA---GGAGTGT-CCATCTCATACAG----TATTTTCGAA-ATTT----TATAATGT-AAGT----T----GATG-----------G-AAAGA---------A--C-------AAATAT-TT---CTTTC---ACATCT---------T-C-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACT-----------------------TAAACA---C------------------A---------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG--GT--A----T----------T---------A-----------------A---G---T--TTTGA--G----CTGTA-CAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CAG-A---AAC------TTC-T-GT--CAA----CAGAGAC-AA--TT----AT----TAAA-GG-----AG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-A-G-----AGAAT--G-C--TG-TT--G-AGA----C--TG--AGTT--T-----G--CAACAC-ACGGA-A-C-A-------T-----AC---------------AAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTCTTGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AG--CAAA-CATGC-T--T-TTAAC-TA-ACAG-----C--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTTt
gi|60 : -------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------AA--AAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTT
gi|61 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTT
gi|62 : gacgtT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC--A-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|63 : cgtTAAGTAAAA--T--AGA--TTTGATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AAA-----GTCGA-TAGTGT--GT--GGGA-actgtactgctt
gi|64 : ct--TTT----ATGAAAAAG-GT--AT-CAAGGAAGACCA--TA-ACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAA--T--A----
gi|67 : ttgaataactaAA-A-TATAC-TCA---ACGGTTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAGTTTCTTTATTCTActgc
gi|69 : tTCAA-A-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTAT
gi|7 : ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AGA-----GTTGA-AAGCGT--GG--GGGA-AA-TG---AAA----TGA-TTGATA--AATG-TATT--TCA---ACG-CTT-------GAGTTCC-ATAGAAAGTTC---ATCAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTATA-TAAA-CAAACTA------T-GTATATGCCAAAA--------TAT--AT-TAC----ACCCCT------GT-TTATTCTA-------CATT-GG-GCGT-CCTTATAATATAG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACGT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATAATGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ACCATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCGGA--G----CTGCA-CGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAGCTAAGAATAT-CACTG-A---TA-C--TTTGAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACGCAAAACGTTG--TAA-A---AAT------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TTATTAAT----TAAA-GG-----TG-TAC------A----TAGT---TAAA-A-AC---AGA--TGCTG-TCG--A-A-T-----GGAAT--A-G--TG-TT--G-AG-----T--TGC-G-TT--T-----GC-C-ACAC-GCGAA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-T----------A---------T-------------T----------T-----TT--------TC-------C------------------------TTAA-C---T-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--GTACTTGGAT
gi|70 : ---A--C----------T---------AA--CAAA-CATGC-T--T-CTATC-TA-TCAG-----T--AC-T-C----TTA--GTACTTTGATT
gi|71 : ATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--AT-T-C----TCA--ATAATCTGATat
gi|8 : ---A-GA-CAATAAAACAAATA---AT------TAACTAAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACGATATGGTA---A---T---ACAAATT--CCTGTAA---ATACGG--GAATTC--AGGTGCAGTATAAA--------T-A--GTGAGCAG-ACA-----T--T----GTAA--T-CTGAAC---AAAAGAAAT-G--CGTTG-AAC-A------AATTT--T--CA--------TG-A----CCA-CA-TCTTGC---------ATG-GA---AG---GAAT---TT-GTAGGACGGG----A--AA-TGGA--GTGGATAA--AAT-AAA-CGATATG-CATTT-GTTTT-----AA-CGAGAT---GTA-TG-T---TGTG--TATGGAAATAAAAATG-C---AT-AAAGGAAGAACA--TG-TT---------------GTAAA-----------TCTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TAA-----GTCGA-AAGCA----G--GTGG-AAATG---AGA----TAAATCAATATCAA-G-TAAA--ACA---ATG-TTT-------GAGTTTT-ATAGAAAATTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----G-TAAG-CA----------------------AAAA--------TAT--AT-TAC----AACC------AATT-TTATTTTAT-TCTTGAATT-GG-GTGT-CCGCCTGATACTG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AATT-----------GA-------------------T---G-A---AT-TT---C-TCC---ACATTT---------TCC-G--TTatgacaaa
gi|9 : ataTGTA-CGT---GTAAGCCATA------AG----CTTG---GTTGATC------AATGCAATT-ACAATTAGGAATAT-CACTA-A---TA-T--TTTAA--TGT-AC----ACTTCTT-------T---AA-A-A-A---G---------A---TTTATATGCGA---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATATTG--TTGAA---AAA------TTC-T-GT--CCA----GAGGGAC-AT--TT----GTG---CAGG-AG-----TGATACTCGAATG----TAAT---TA------C---AG---TACTG-TCG--A-A-G-----ATAAT--A-C--TG-TT--G-A-A----C--TT--A-TTTCT-----GT-C-ATAC-ACAGA-A-C-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------TAA-A--------CA-------T-------TT-------C-------A-ttcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|9 : aatgaa-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------AG--CAAA-CATGC-G--T-CCGCC-CA-ATAA-----T--AC-G-C----TCA--CTAtgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111111 2222222222222 2222222222 111 111 22222222222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 222222222 111 1111111 222222222 11 1111 333333333333333333333333333333333 11111111 3333333333333333 1111111 1111111 1111 111111111111111 11111111 111111111 1111 111111111 33333333333333333333333333333333333333 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222222222 222222222222222 111111111 11111111 1111111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111111111
lowQualScore : 0 444 111111111 1111111111111 5 888 888 1 3333333333 44 777777 2 1 0 8888888 666 666 88 111 55 55 2 66666666666666 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 5 1 000000000 4 777 000 1 8888888 1 222222222 66 5 33 66 4 66 4 55 0 77777 4 2 4444 3 666 7 777777777777777777777777777777777 55 2 0 2 55 88888888 2 33 2222222222222222 2 2 555 1 33 5 0000000 888888 77777 3 44 44 3 7 666 7777 0 3 3 77 666 0 7 1111111 3 555 3 5555 4 8 0 555555555555555 77777777 44 3 6666 333333333 2 0 2 2 2 2 9999 55 88888 0000 2 2 222222222 11111111111111111111111111111111111111 0 3 2 333 4 777 888888888 2 22 2 2 00000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 22 4444 1 333 555555 3333 444 000000 555555 1 1 1 333 1 22 88 3 3 3333 66666 333 1 1 1 444 222222222222222222222222222 33 222 1 22 1 3 22 222 666666 1 1 33 3333 1 333 3333 4444 1 33333 1 6666666 4444 1 222 1 1 222 33 1 22 1 1 33333 44 1 66 1 22 1 3333 1 444444 1 1 1 1 5555555 44444 333333333333333 333333333 11111111 1 6666666666666666666 5555555 5555555 6666666 3 55555555 22 22 666666666 11111111111111111111111111111111111111111111111 44444 88888888 222 11 33333333333333333333 11 22 1 1 11 1 1 1 99999 11 1 2 3333 44
lowQualScore : . ... ......... ............. . ... ... . .......... .. ...... . . . ....... ... ... .. ... .. .. . .............. . ............................................................................................ . . . ......... . ... ... . ....... . ......... .. . .. .. . .. . .. . ..... . . .... . ... . ................................. .. . . . .. ........ . .. ................ . . ... . .. . ....... ...... ..... . .. .. . . ... .... . . . .. ... . . ....... . ... . .... . . . ............... ........ .. . .... ......... . . . . . . .... .. ..... .... . . ......... ...................................... . . . ... . ... ......... . .. . . ..... ................................................................................................................................................................ .. .. .... . ... ...... .... ... ...... ...... . . . ... . .. .. . . .... ..... ... . . . ... ........................... .. ... . .. . . .. ... ...... . . .. .... . ... .... .... . ..... . ....... .... . ... . . ... .. . .. . . ..... .. . .. . .. . .... . ...... . . . . ....... ..... ............... ......... ........ . ................... ....... ....... ....... . ........ .. .. ......... ............................................... ..... ........ ... .. .................... .. .. . . .. . . . ..... .. . . .... ..
lowQualScore : 8 888 888888888 9999999999999 0 888 888 4 1111111111 66 777777 2 6 8 1111111 444 444 66 444 00 55 3 99999999999999 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 000000000 4 888 000 4 3333333 0 555555555 99 0 88 00 4 11 4 44 9 00000 0 6 1111 6 444 3 444444444444444444444444444444444 00 3 5 3 00 99999999 0 33 1111111111111111 9 9 000 7 99 7 0000000 888888 77777 3 66 66 3 9 444 7777 1 3 3 99 444 4 3 8888888 6 888 3 5555 0 0 3 333333333333333 33333333 22 1 5555 333333333 9 4 9 9 9 9 6666 55 11111 6666 4 2 000000000 44444444444444444444444444444444444444 5 8 0 555 0 000 000000000 0 88 1 1 00000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 99 5555 9 555 000000 7777 888 000000 000000 7 7 8 222 8 55 00 6 6 9999 44444 000 7 7 7 888 444444444444444444444444444 88 888 7 33 7 1 33 999 000000 6 6 88 4444 6 222 3333 8888 5 88888 5 5555555 8888 5 666 5 5 666 55 5 00 5 5 77777 22 6 00 6 22 6 4444 6 666666 6 6 6 6 2222222 00000 555555555555555 999999999 22222222 5 7777777777777777777 2222222 0000000 5555555 1 88888888 22 11 222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000 22222 33333333 111 77 55555555555555555555 77 99 3 2 77 2 2 2 55555 88 4 9 0000 22
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( family-198 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|1 : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAA-A---ATAAAATATAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATGTTTTGAATGGCATAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---AAAATATGGAA---A---T---A---TTTTGCCTGTCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------C-T--GTGAGCAG-AT-----A-C--T-T--ACTA--C-T--GAT---GATCAGAATCA--CAAT-G-A-CTG------A---T--T--TA----TGG--------AGCCATCA-CCTCTC---------TTA-AA---AT---AAAT-AGGTT-GTAAG----G----A--AA-TAAA--C-AGT-AG--GAC-CTA-CGACATG-CGG-T-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAAAG-AA--TATC--TTT----ATAAGACAATGT--AT-AAATGAAAAACA--TT-TTTTTTTTTTTTCATAAGTAAAA--TCAA----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGACAAG-GT--GG--GGGATAAATT---ATA----CAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---AAT-TTC-------GAGTTTG-ATAGAAAATTC---ATGAT-TTATTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACCA------T-A------CCATAA--------TAT--AT-TGC----AGCTCTCTTTTTTTCTTCTTTTAT-TTTTGCATT-GG-GTGC-CTTTCTGATGCAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GGAAAAA---------AACC-C---G-AAAGAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AA---AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTTCA-CGT---GTAAGTTATA------AA----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAGA---AAC------TTC-T-G----AA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-AA-------G----TAGT---TAAA-T-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-T--CT-TT--G-AGA----TCGAT----------------------------G-------T-----AC---------------C-----------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---G--C----------A---------A--A--CAAA-CACGC-T--T-CCGTC-TA-ATAA-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATCT
gi|10 : ATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TCAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-CATGTTGAACCCTCTTTAT-T-TTATTTTAT-TCTTACATT-GG-GTGT-CTTTCTGATACTG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AACA-----------C---AG-TAC-------AAG---T--G----A----------A---------A---------------------G---T--ACTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTCAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------ATAAA--A---TTTTA-C--GCTC-AAGCTTTG--TATA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--CT----GT----TAAA-GG-----TA-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TTG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-ATACAATGT-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-A----------A---------CTTTTTTTTTTTT-T----------T-----TT--------TCC---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----c
gi|11 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgAAAA--------TAT--AT-TGC----AATC-------TCT-TTCTTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-ACTTATGATACAG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACAT-TT---C-TTC---ACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATT-----ATA-----------------------T--------T------------------A---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--ACATTATTTC------C---------AT----------------G---AATAT--TCGTA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACAA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-ACATGAATTTCTT-----CTT---AG-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATGTTG--TCGA---AAA------TTC-T-GT--CAC----GAGAGAC-AG---T----A---------------------A-------G----TACT---TAGA-A-GC---AAT--TGCTG-TCG--G-AA-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGC----TTGCT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAGATTTTAGCATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-GTT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CCCTTTGT------AGGTCTACTCCT-----TT--------TTG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-A
gi|12 : G--TT----GT----TAAG-GA-----TG-TA-------G----TATT---TCGA-A-GC---AATATTGCTG-TCG--A-AT-A-----GAAT--G-C--TG-TT--G-GGA----TTGTTAT------TT-GTT-ACGCACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------TGTGATGATT-------C-------A-ATT--------T--GTAGT---------T-A----------C---------A-------------A----------T-----TT--------T
gi|12 : -------------A----------T-----TT--------TCG---A--CCAAATAATTTA---------A--A--AAAA-AATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--GTACTTTGATatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|13 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtg-C---A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TC-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AA-------------TACAGT-AAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T--TTTGA--G----CTGCC-CGT---GTAAGTTATA------AG----TACG---GCTGATC------A------TT-ACAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CTT---AA-A-A-A---G---------A---TATC------A---A--A---TTTTA-C--ACT--AAACTTTG--TAGA---AAC------GTC-T-GT--CAA----GGGAAAC-GG--TA----GT----TAAA-GG-----TG-TT-------G----TAGT---TAGA-A-GC---CGT--TGCTG-TTG--A-CT-A-----GAAT--A-T--TG-TT--G-AGA----TTGAT-C------AT-GCC-ACACAGG-GAAC-A-------T-----ACAATGTAACAAAATTTCAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTTCTTGAA--A----------T-----TT--------TCG---A--C----------T---------A--A--GAAA-CATGT-G--T-CAGCT-TA-ACAG-----T--AT-T-G----TCA--ATACTTTGATT
gi|14 : ATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGT---AT---A-AATCAATAAAACAAACA---AC------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAATA---------GT-----------TTAGAATCCTAAATTATTT---TC------------C---T---A---ATT--CTTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-ATTGTGAGCAG-ACAGCGTA-T--T-C--ATAA--A-C--AAC---GAAGAG----A--CATTAA-A-C-G------A---A--T--TAATACTGGTTGGTAGTG-CCAGCA-TCTACC---------GTA-CATGTAGGTTACATAAA-TT-AAAAG----T----A--AA-TTGG--G-AGA-AG--AGT-ACG-CTGCATG-CGGAT-GTTCT----CAG-CCGG---------TG-A----GTC--TTT----GTAAG----------T-AAAGGAAGACCA--TGTTTTTTTTATTTTCA----------------------------------C-AAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AAT-----GTCGa
gi|15 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagt---G---T--TCTGA--G----CTGCA-AGT---GTAAATTATACATGTAAG----TATG---GTTGATC------A------AT-ACCACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TT---------------------------CCC---AA-A-A-C---G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-ATACTTTG--GAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-AA-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA--------AGT--TGCTG-TCA--A-AG-A-----AAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-TTC-ACACAC---AAG-A-------T-----TT---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CATCTTTTTTTGAAA----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACCTTGAT
gi|16 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa-AA-T----C----GATA-----------GAAA-GA---------A--C-A---G-AAG-AT-TC---C-T-C---ACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AAACACATATACTTA-G--------------T---GT-TAA-------AAGTGAA--A----A----------C---------ATTATTTCCATGAA----A---G---T--CTTGA--GAGCTCTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---T---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-A--ACTC-AAACTCTG--TAGA---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGAC-AG--CT----AT----TA-----------------------------------------GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----AAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACATACCAAG-A-------T-----TT---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT------------T--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C--------------------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCA-TA-ATGG-----T--c
gi|17 : TAAATTG-A------AG----TATGT--GTTGATC------A------TTTGCATCTAGGAATGTTCAC-A-A---TA-C--TT-AA--T-T-AC----ATATCTTT----CCT---AA-A-A-A---G---------AGATT---------AC--A--A---TGTTAAC--ACTC-AAACTTTG--TAG-----AC------TTC-T-GTC-CAA----GAGAGAC-CATTTT----AT----CAAA-GG-----T--TA-------GT---TAATTTATAGAGA-GC---AGC--TGCTG-CCG--A-CG-A-----CAAT--A-CT-TG-TTGGG-AGA----ATGAT-T------TTGGCC-ACACAC--GAACAA-------T-----ACCAGATATTT------CAAT--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------CT------ATATT--------T--AT--TTTATCACTAT-G----------A---------T-------------G----------T-----TTTGAAATG-TCT---A--C----------AATACAAAGCA--A--CAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--A----C----TCA--ATAATCTGAT
gi|18 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT----GAG-CAAGAT---TTGTTA-AA--TATCATTTT----CTAAAAAAA-A---GT-GGGGGGGGGGTAACTA--------ATTTTTATAAGTAAAA--T--A----------------------------------CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AAATTAAAGTCGA-AAGTGT--GG--GAGA-AA-TG---GGA----TAAATTAATCTTAA-G-TCTA--TCA---ACA-TTT-------GAATTTC-ATAGAATATCT---ATGGA-TTCTTTAT--TATGCATNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGA-GTATGCCTTTTAATACAT----TATCTAAGAA----------------------------------------------GAA------------------C---A-AAATAT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------aa
gi|19 : A-T----T----GATA-----------GAAA-GA---------A--G-C---T-AAG-AT-TT---C-TTA---GCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A--------------------------------------AA-------CAC--ATGTA----G----------T---------AG----------------A---G---A--TCTAA--G----TTGTA-TATAATGTAAGTTTTA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACGAGGAATAT-CACCA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-A---AT--------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-GATCTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTA-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----ATGGT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------TAAATAACAAGATTA--------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------CTGATGTT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|2 : cATA----------A--ATGAGCAG-AC-----ATC--T-TGAATTA--C-----AC-----ACAGGAC-AGGCGTT-G-AGC-G------A---A------A----TG---------A-CCT-TA-TCTCGC---------ATAGAA---AG---AAAT-AG-TA-GGAAG----GG---A--AA-TAGAATG-GAA-AA--AAT-ATA-CGACGTG-CAGTT-G-TTG----TAA-CGAGAT---tg
gi|2 : AAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAAA-----GTCGA-AAGCGA--GG--GGGG-G--TG---AGA----TATATTGATATCAA-G-TATA--TCA---ATG-TTT-------GAGTT-------------C---A-GAG-TTCTTTTATCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTACATGTAT-G------CTAAGAATACAATGTAT--AT-TAC----AACCCACTTTAT-------TTCAT-TCTTGCATT-AG-GTCT-CCGTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGA---------A--C-C---A-AAGC-T-TT---C-TTC---AGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AATCACAGTACATTAAG--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----AACTATTTC--C---------AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTACA-TGT---GTAAGTTTTA------AG----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGAAATAT-CACCA-A---TC-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-----G---------A---T---------ATC-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CTGA---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGC--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACAAG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG---------------------C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--Aggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|20 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacga---G---T--TTTGA--G----CAGCA-CGT---GTAATTTATA------AG----TATGATAGTTGACC------A------TT-GCAATTAGGAATGT-CAGTA-A---TA-A--TTTGA--T-T-AC----ATT-CTT-----CAT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---T--G---TTTTA-C--ACTC-AAACT---------------------------GT--CAG----CAGAGTC-AG--CT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-AG-ACAATAGAAT--A-C--CG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TTTATGTACC-------A-ATCTACATATGT--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTCGGA---A----------T-----TT--------TCA---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGT-T--T-CCGCC-TA-ACAGTATA-T--AT-T-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|21 : cattaaatccacgaaaTTATGA---AA---TGTCTTTCCTA---------GTCTAAATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT---ACAG------A---A---T---A---ATT--CCTGCCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATGTACATTTGTAT-A--GTGAGCAG-AC-----A-C----C--ATTAGGCAC--AAC---GAAAACAAT-A------------------------T--T--TA----GAG--------T-CCA-CA-CGTTTA---------GTA-AC---AT---GAAT-GG-TTTATAAG----T----G--AA-TAAA--G-AGA-AA--AAT-ATT-CAACATG-TGGGT-GATTT----TAA-CGAGAT---TTATTGAA---TACA--TTT----TTAAGAAAA-GGGTAT-AAAGGAAGACTA--TA--TTTTTTATTTTCATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AAA-----GTTCA-AAGCGT--AA--GGG--AAATG---AGA----TAAt
gi|22 : -AA---GG---AAAT-GG-TG-GGAAG----G----A--AAATAGA--G-TGG-AA--AGT-ATA-CAACACG-C-----ACTTTATG-TAA-CGAGA----TGATTG-T---TGTC--TTT----G-AAAAAAA-GT--AT-TAACAAAGAACA--TG-CT---------------GC---A--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GC
gi|22 : gACCCTCTTTATGT-A-ATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTTT-CCGTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|23 : gaaggaaatggtgggaaggaaaatagagtggaaagtatacaacacgcactttatgtaacgagatgattgttgtctttgaaaaaaagtattaacaaagaacatgctgcatatgtaatttattgtgcgtaacatatcgtagaatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTCA-AATATGGAA---A---TC--A---ATTT-CCTGTATTT-ATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTGCAC-----A-G--TAC--ATTG--C-A--AACCTTGAACAT--T-A--CATT-GAA-C-G------A---TA-A--TG----CGG--------C-CCA-CA-TTATCC---------GTA-AA---A
gi|23 : A-AA--ACT-AT-----TATG-CGGGTTGTTTT----TAA-C-AGGT---TTACTG-GAAGTATC--CTT----AT-------------T-AAATGAA--CCC--TA-TATTGTTAATTTCATAAGGAAAAAGT--AATGGTGTA-TTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGC-T--GG--GGAA-TAGAA---AGA----T-AATTAA-GTTAT-G-AATA--TCctattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|24 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgt-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-CA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGcaag
gi|25 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------A---------A--A---AAG-CATGC-T--T-CCGAC-TA-ACAG-----T--AT-T-T----T
gi|26 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtaAT-C-CTACA---TA-C--TTTAA--TCT-CC----ATATCTTAATCTCTT---AC-ACA-A---ACCTCGCACTA---T---------AC--A--A---TTTTA-CCCACTC-AACCTTTG--TAGACACAAC------TTC-T-GT--CAACTTAGAGAGAC-A----T----AC----TAAATGGCCCCTTC-TC-------GATCCCAGT---AAGA-AAGC---AAT--CGCTGCTCA--ACAGCA-----GAATTCA-C--TCCTT--GCAGA----T-GAT-T------TT-GCCTGCAAACG-GAAA-A-------C-----ACTTT------------CAAGC-------ATC--------A-A-A--------CA-------T-------GT-------C-------ACATT--------T--TT--T---------TCA----------A---------CTT-----------C----------T-----TT--------TCG---AAAC----------A---------A--AA-CAAA-CATGT-T--TGCCGCC-TACACA------T--AT-T-C----TCC--ATACTTTGATTga
gi|27 : tatcacaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---TCCCA---ATT--CCTGTAGTTTATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTG-AC-----A-CAGTAC--ATTG--C-----ACCTTGAA---AAT-A--CATT-GAA-C-G------A---TAAC--TA----GCG--------C-CCA-CA-TATCCC---------GTA-AA---
gi|27 : ATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGGT---TTACTG-AG--TATC--CTT-----T-------------T-AAATGAACACCA--TA-TATTTTAATTT-CATAAGGAAAA--T--AAATGTGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGCGT--GG--GG---AAATG---AGA----TAAATctattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|28 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactattT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------TTTA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATT
gi|29 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaactagaggcagtgattgctctttaagatccttattggtatgcaggacacaagaccaaaagtcaagcCTGA--G----CTGCA-CAT---GAAGGTTATA------AG----TACA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---T-------------------------TCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------AT--AC-A---TTTTA-T--ACTC-AAACGTTG--TAAA---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGGC-GG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAAC-A-GC---AGT--GGCTG-TTG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AGCATTTCCTG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TTTTTTA--A----------ATTTTT----G--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAa
gi|3 : ----GATG-----------GAAAGAACACATATATA--C-C---G-GTATATCTT---C-TTC---ACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----------------------------------------------------------------------------------------------T-TAA-------AAG--AT--A----GCCTTATTTC-C---------AT----------------GAATG---T--CCTGA--G----CTG
gi|3 : TGCAACAT---GTAAGTTACA------AG----CATG---GTTGATCATTGCAA------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTTTTAAATT-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AACA-A-G---G---------A---T---------AT--A--A---ATTTA-C--ACTC-AGATGCTG--TAAA---AAA------TTC-T-GT--CAA----GAGATACTAT--TT----TT----TAAA-GG-----TG-TA-------A----TACA---TAGA-A-GCCATAAT----CTG-TTG--A------------------------CT--G-AGA----TTGCC-TTAAAAGTT-GCA-ACACGCG-G-AT-A-------A-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------CCTGTTTAA-ATT--------TAAAT--T---------T-A----------AG--------C-------------A----------T-----TT--------TTG---aataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattatT----T-CA-T----T----GATG-------------AAAGA---------A--C-C---G-AGATAT-TTATTC-TTC---ACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACTGTATACATGATTTTTAATACATGT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------GT----------------tttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : cat---T--TCTAATTG----ATGTA-CGT---GTAAGTTATA------TG----CATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAACTAGGAA-----ATTG-A---TA-C--TTTAtatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|31 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttAAA--------TAT--AT-TAC----AAAC-TCATTAT-T-TCATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AATG-----------GAAA-GA---------A--C-A---A-AAGT-T-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------T------------------AAACACAGTATATTA-G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------CTTTATTTCCAT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTGCA-CAT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-C---TA-C--TATAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---
gi|32 : ct---A--C----------A---------A--AATCAAAGCATGCCT--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|33 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggacTTAATA---A-A-TGTA--TT--------TTT-------GAATTTC-ATAGGAAACTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTA-A-TAAA-CACACTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--AT-TGC----AACCCTTTTT--CT-TTATTTCAT-TTTTGCATT-GG-GTGT-CTTTATGAAAGTG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT---------------------------------T---G-ATATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----c
gi|34 : ---TAGA-G-AC---AGT--GATTA-TCTTCA-AG-A-----GTATTGA-C--CC-TT------A----TTGAT-C------TC-AGG-ACACAAG--------------------AT---------------CAAA--------AGT----------C-G--------CG-------C-------TG-------T-------A-ATT--------T----------------T-A----------A---------C-------------------------------------------------C----------A---------A--A----AA-CATGC-T--T-CCCAC-TA-CCAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGAcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|35 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaacTA------T-G--------AAAT--------TATTTAT-TA-----AGTCATCTTTTTAT-TGCTGTTGT-TGTTGCATT-GG--TGT-TTTGTTGATACGC----TATCCAAGAACATTT----AAT----C-TA-T----T----GA----------------AAGA---------A--CAC---ATAGATAT-TT---C-TTCTTCGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TT-----ACT-----------------------CTGTGTACAC------------------A---------------G--------------T---AT-CAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATA---------------A---G---T--TCT
gi|36 : tcatatatttattttttcatttt---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-CA-----TG-CA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-T--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCT-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTGGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCT-TG-ACAG-----T--AT-T-CTCTATCA--ATATTTTGATTTaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT---AAGA-GAGTAAAACAAAAA---AG------TTAGTTGA-A---CA---TGTTTTGAATT---------GTCCAAAAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT---AC----------------T---A---AAG--CCTGTAA---ATACAG--ATATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--ACGAGTAG-AC-----A-ttc
gi|38 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataaga---------A---T---------C---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAGA---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAAAGAC-A---TT----AT----CAAA-GA-----AG-CA-------G----TAAT----------------GT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCA-ACACATG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AG-------CA-------T-------TT-------C-------A------------------------------------------------------------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--C-CCGTC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATata
gi|39 : at---AA-A-ATA---T---------A---T---------A---A--A---TTGTA-C--ACAT-AAACGTTG--TAGA---AAA------TTA-T-CT--CAA----GAGATAC-TT--TT----GT----TAAA-GA-----CG-TT-------G----TACT---TAGA-A-GC---AATA-TTCTG-CCG--A-AA-A-----GAAT--A-C--TG-TT-----------------T------TT-GCC-ACACACA-GAAC-A-------A-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AACATTTCACG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------C---------C-------------T----------T-----TTTGAAATACTCG---T--C----------A---------A--A--CAAa
gi|4 : aA---A---T---A---ACT--CCTCTAA---ATAGGGAAGTTAGCCCAGCGGCA-TATATA--------TCA--CTGGAGAG-AC-----A-A--T-C--AT----------AT---AAAAAAAA-----CGTT-G-A-C-CCATAACA---T--CACTA----TTG--------A-CCA-CAATCTCGCAGATGGAGGGTG-AA---AG---A----------GGAAG----GTTAGACTAA-TGGATTG-CGT-AAGGAATCATATCGACATGGCAGGT-TTTCTGTTATAATCGAGATGTTTTACTG-G---T------TT----ATGGGAAAA-G---GTTAAACGAAGAA-A--CA-TT---------------GCAGAA--T--------GTAATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AA-------TTAA-A----T--GATAAAAA-AAATGTAAAGAATGCTAAATTAATATCA----TA-A--TCACATATGATTT-------GTGTTTCTATGAAATATTCTGCATGAG-TTCTT-ATTCTATCTGTCCTA----AATAAGGCAAGCTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--GT-TTC----GTACTTTTTTAACC-TTATTTTATCTCTTGCATT-GG--TGT-CCGTCTGAAACAAA---TATCTAAGAAC-TTT----CAT----TGAA-TCAA-T----GATG-------------AAAGA---------A--C-CATAG-AAG-AT-TT---CCTTC---ACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT------TT-----------------------T--------C------------------A---------------
gi|40 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctttaaattagtttacgttaattcgtgtagttaggcgtattatgcttaactagcaatgggtaattT-----ATT---------------------------------------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CAacacagtatttca
gi|40 : AA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CACnaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|41 : tattagtgttaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcanT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--T--CA-----TAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----CCA--TTACTTTGATT
gi|42 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggc--T-T-TC----ATTTCTT-----TTTGGGAG-A-G-ATATG---------A---T---------A---G--A---TTTAA-C---CTC-AG---TTGAGCAGA---A--------TTC-T-ACTCCAG----GAGAGGT-AG--TT----ATGTTGTTAA-GG-----TG-TG-------------------TAGA-G-GC---AAT--TTCAA-TCA--A-GG-G-----GAGC--AAC--TA-TT--C-AGACTGTTTGAT-T------CT-A---AAACAAG-AAAC-A-------T-----AC---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------c
gi|43 : tATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTAA-GA-AAATAAA-CAAACA---AT------TAATTTAT-A---GA---TGTTTT-AACA---------GTATAAAAGAAGGTTGGGAGCTT---------------ATATGGAA---ATCTT---A---ATC--CCTGTAA---ATACAG--GTATatat
gi|44 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataaTT----AAT----T-AA-T----TT---GATG------------AAAAGA---------A--C-----A-AGACGT-GT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATATTGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ATAATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCTGA--G----CTGCA-
gi|45 : atatctatataaccttataatataataA------AA----CATG---GTTTATC------A------TT-GCAACTAGCAACAT-CACTA-A---TA-T--TTTGA--T-TGAC----ATTTTTT-----CTT---TA-A-A-A---A---------T---T---------A---AAGA---TCTGA-A--ATTT-ACAC------TAAA---AAC------TGCAT-GT--GA------ACAGAC-AG--TT----GT----TAA-------------C-------G----TACT---TGGA-A-GC---AAT--TACTG-TCG--A-AT-A-----GAAt
gi|46 : gc-CAATTAAACAAACATAAAT--------AGCTAT-ATACGAATATGTTGTAAATC---------GTCAAAAAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT---ACAACATTGAA---A---TCCTA---ATT--TCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGCTGCAGTATATA--------T-A--ATAAGCAG-GC-----A-C--
gi|47 : T----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------G--C-A---G-AGATAT-TT---C-TTCTTCACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TT-----ATCGTATACACGATTTTTAATACATAT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------aaat
gi|48 : tcgaaatgtttagcaatacC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA----ATGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AA---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--Atattttcatgactgttctcagctga
gi|49 : cgcaaagcC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA-----TGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AA---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--A
gi|5 : cgcaaagcAAG----G----A--AA-TAGA--G-AAA-AA--AAT-ATA-CAATATG--------TCTA----TAA-CGAGAT---TTAATG-AC--TATC--TTT----A--AGAAAG-G---CT------------------TTTTTTAATTTTCATAA-TAAAA--T--A----------------------------------CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------ACA-----GTCGA-AAGCAT--GG--GGGA-AA-TG---TGA----TAAATTAATTTCAG-G-TATA--GCA---ACA-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNN-------AT-CCTTCAGGTACAGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GATG-----------GAA--GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATC-----------------------T--------C------------------A---------------AACACAGTATACTTAT---GT-TAA-------AAG--AA--A----A----------C---------ATTTTTATGAA-------A---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GGAAGTTATA------AG----TGTG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-AACTT-A---TAAC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----C-T---AA-A-A-AT--G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-CA-------G----TAGT---TATA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-G-----CAAT--A-C--TG-TT--G-AAT----TTGAT-T------TT-GCC-ATACACG-GAAC-A-------T------C---------------AAAT--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------C-ATC--------T--AT--T---------TCA----------ATTTTTTTTTT-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-C--------------------AT-T-C----TCA--ATGCTTTAATT
gi|50 : tt-------------A----------T-----TA--------TCG---A--CCAAA------A---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--Ac
gi|51 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaTAAATCAGTT---ACAATATAGAAATGA---T---A---ATT--ACTGTAC---ATACGG--GAATGC--AGA---AGTATATCCT------T-A--GTGAGCGG-AT-----A-C--T-G--ATTA--G-C--Agattttatttgca
gi|53 : ctaaggaagcggaataA-TGT---GCAAGTTATA------AG----CATG---GTTTGGC------A------TT-TCAACTAGGGATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCA---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTcaatggacgat
gi|54 : ttattagaagtctccatatatAATTACA------AA----TGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--AGAAA----CACAA-AATATA-T--TTCAA--T-TTAC----ATTTCTT-----CAT---TG-A-A-A---G---------A---C---------A---A--AGTATTTTA-C--GCTG-AAACTTTG--TAGA---AAA------TTc
gi|55 : agT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-ATTTTCAAGACA---------C-------------A----------TA----GT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATTC-TAAT-TCTCC-TA-AC-G-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATTtgg
gi|56 : tcagagtatatgactaACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-------TTAGACAA--------------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAatttt
gi|57 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggt---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CTTTTTTGTTTTA-A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATA-ACAG-----T--AT-C-C----TCA--ATACTTCGATTTttg
gi|58 : tt---------A---T---------A---T--G---TTTTA-A--ACTC-AAACGTTG--TAGA---GACAGACAGTTG-TAGA--CAG----GAGAGAC-A------------------A-GA-----TG-TA-------G----TCCT---TAGA-A-GT---AAT--TGCTG-ACA--A-AA-A-----AAAT--
gi|59 : -------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------C---------A--A---AAG-CATGC-T--T-CTACC-TA-TCAG-----TAGATAT-T----TCA--AT
gi|6 : attgcagattcttgatcgatcttcacaccaaaagtagggctgtaTTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AAA-----CTCGA-AAGCGTAGGG--GGAA-AAATG---AG-----TAAA-TAATTTCAA-GTTATAGCCCA---ATG-TTCTGCCACAGATCTTC-CT--AAAAGTC---ATAGG-TT-TTTATTTTATCT-TCCTT----A-TAAGCCAAACTA------TGG------CCAAAC--------CAT--ATATAC----TAATCTCTGCATGT-TTATTTTA--TGTTGCA---GGAGTGT-CCATCTCATACAG----TATTTTCGAA-ATTT----TATAATGT-AAGT----T----GATG-----------G-AAAGA---------A--C-------AAATAT-TT---CTTTC---ACATCT---------T-C-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACT-----------------------TAAACA---C------------------A---------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG--GT--A----T----------T---------A-----------------A---G---T--TTTGA--G----CTGTA-CAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----CAGAGAC-AA--TT----AT----TAAA-GG-----AG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-AG-A-----GAAT--G-C--TG-TT--G-AGA----CTGAG-T------TT-GCA-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------AAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTCTTGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGC-T--T-TTAAC-TA-ACAG-----C--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTTt
gi|60 : -------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTT
gi|61 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTT
gi|62 : gacgtT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC--A-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|63 : cgtTAAGTAAAA--T--AGA--TTTGATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AAA-----GTCGA-TAGTGT--GT--GGGA-actgtactgctt
gi|64 : ct--TTT----ATGAAAAAG-GT--AT-CAAGGAAGACCA--TA-ACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAA--T--A----
gi|67 : ttgaataactaAA-A-TATAC-TCA---ACGGTTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAGTTTCTTTATTCTActgc
gi|69 : tTCAA-A-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTAT
gi|7 : ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AGA-----GTTGA-AAGCGT--GG--GGGA-AA-TG---AAA----TGA-TTGATA--AATG-TATT--TCA---ACG-CTT-------GAGTTCC-ATAGAAAGTTC---ATCAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTATA-TAAA-CAAACTA------T-GTATATGCCAAAA--------TAT--AT-TAC----ACCCCT------GT-TTATTCTA-------CATT-GG-GCGT-CCTTATAATATAG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACGT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATAATGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ACCATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCGGA--G----CTGCA-CGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAGCTAAGAATAT-CACTG-A---TA-C--TTTGAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACGCAAAACGTTG--TAAA---AAT------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TTATTAAT----TAAA-GG-----TG-TAC------A----TAGT---TAAA-A-AC---AGA--TGCTG-TCG--A-AT-G-----GAAT--A-G--TG-TT--G-AG-----TTGCG-T------TT-GCC-ACACGCG-AAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-T----------A---------T-------------T----------T-----TT--------TC-------C--------------------------TTAA-C---T-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--GTACTTGGAT
gi|70 : ---A--C----------T---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CTATC-TA-TCAG-----T--AC-T-C----TTA--GTACTTTGATT
gi|71 : ATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--AT-T-C----TCA--ATAATCTGATat
gi|8 : ---A-GA-CAATAAAACAAATA---AT------TAACTAAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACGATATGGTA---A---T---ACAAATT--CCTGTAA---ATACGG--GAATTC--AGGTGCAGTATAAA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-T--T----GTAA--T-CTGAAC---AAAAGAAAT-G--CGTT-G-AAC-A------AATTT--T--CA----TG---------A-CCA-CA-TCTTGC---------ATG-GA---AG---GAAT----TT-GTAGGACGGG----A--AA-TGGA--GTGGATAA--AAT-AAA-CGATATG-CATTT-GTTTT-----AA-CGAGAT---GTA-TG-T---TGTG--TATGGAAATAAAAATG-C---AT-AAAGGAAGAACA--TG-TT---------------GTAAA-----------TCTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TAA-----GTCGA-AAGCA----G--GTGG-AAATG---AGA----TAAATCAATATCAA-G-TAAA--ACA---ATG-TTT-------GAGTTTT-ATAGAAAATTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----G-TAAG-CA----------------------AAAA--------TAT--AT-TAC----AACC------AATT-TTATTTTAT-TCTTGAATT-GG-GTGT-CCGCCTGATACTG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AATT-----------GA-------------------T---G-A---AT-TT---C-TCC---ACATTT---------TCC-G--TTatgacaaa
gi|9 : ataTGTA-CGT---GTAAGCCATA------AG----CTTG---GTTGATC------AATGCAATT-ACAATTAGGAATAT-CACTA-A---TA-T--TTTAA--TGT-AC----ACTTCTT-------T---AA-A-A-A---G---------A---TTTATATGCGA---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATATTG--TTGA---AAAA-----TTC-T-GT--CCA----GAGGGAC-AT--TT----GTG---CAGG-AG-----TGATACTCGAATG----TAAT---TA------C---AGT---ACTG-TCG--A-AG-A-----TAAT--A-C--TG-TT--G-AAC----TTATT-T------CT-GTC-ATACACA-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------TAA-A--------CA-------T-------TT-------C-------A-ttcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|9 : aatgaa-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGC-G--T-CCGCC-CA-ATAA-----T--AC-G-C----TCA--CTAtgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111111 2222222222222 2222222222 111 111 22222222222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 222222222 111 1111111 222222222 11 1111 333333333333333333333333333333333 11111111 3333333333333333 1111111 1111111 1111 111111111111111 11111111 111111111 1111 111111111 33333333333333333333333333333333333333 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222222222 222222222222222 111111111 11111111 1111111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111111111
lowQualScore : 0 444 111111111 1111111111111 5 888 888 1 3333333333 44 777777 2 1 0 8888888 666 666 88 111 55 55 2 66666666666666 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 5 1 000000000 4 777 000 1 8888888 1 222222222 66 5 33 66 4 66 4 55 0 77777 4 2 4444 3 666 7 777777777777777777777777777777777 55 2 0 2 55 88888888 2 33 2222222222222222 2 2 555 1 33 5 0000000 888888 77777 3 44 44 3 7 666 7777 0 3 3 77 666 0 7 1111111 3 555 3 5555 4 8 0 555555555555555 77777777 44 3 6666 333333333 2 0 2 2 2 2 9999 55 88888 0000 2 2 222222222 11111111111111111111111111111111111111 0 3 2 333 4 777 888888888 2 22 2 2 00000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 22 4444 1 333 555555 3333 444 000000 555555 1 1 1 333 1 22 88 3 3 3333 66666 333 1 1 1 444 222222222222222222222222222 33 222 1 22 1 3 22 222 666666 1 1 33 3333 1 333 3333 4444 1 33333 1 6666666 4444 1 222 1 1 222 33 1 22 1 1 33333 44 1 66 1 22 1 3333 1 444444 1 1 1 1 5555555 44444 333333333333333 333333333 11111111 1 6666666666666666666 5555555 5555555 6666666 3 55555555 22 22 666666666 11111111111111111111111111111111111111111111111 44444 88888888 222 11 33333333333333333333 11 22 1 1 11 1 1 1 99999 11 1 2 3333 44
lowQualScore : . ... ......... ............. . ... ... . .......... .. ...... . . . ....... ... ... .. ... .. .. . .............. . ............................................................................................ . . . ......... . ... ... . ....... . ......... .. . .. .. . .. . .. . ..... . . .... . ... . ................................. .. . . . .. ........ . .. ................ . . ... . .. . ....... ...... ..... . .. .. . . ... .... . . . .. ... . . ....... . ... . .... . . . ............... ........ .. . .... ......... . . . . . . .... .. ..... .... . . ......... ...................................... . . . ... . ... ......... . .. . . ..... ................................................................................................................................................................ .. .. .... . ... ...... .... ... ...... ...... . . . ... . .. .. . . .... ..... ... . . . ... ........................... .. ... . .. . . .. ... ...... . . .. .... . ... .... .... . ..... . ....... .... . ... . . ... .. . .. . . ..... .. . .. . .. . .... . ...... . . . . ....... ..... ............... ......... ........ . ................... ....... ....... ....... . ........ .. .. ......... ............................................... ..... ........ ... .. .................... .. .. . . .. . . . ..... .. . . .... ..
lowQualScore : 8 888 888888888 9999999999999 0 888 888 4 1111111111 66 777777 2 6 8 1111111 444 444 66 444 00 55 3 99999999999999 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 000000000 4 888 000 4 3333333 0 555555555 99 0 88 00 4 11 4 44 9 00000 0 6 1111 6 444 3 444444444444444444444444444444444 00 3 5 3 00 99999999 0 33 1111111111111111 9 9 000 7 99 7 0000000 888888 77777 3 66 66 3 9 444 7777 1 3 3 99 444 4 3 8888888 6 888 3 5555 0 0 3 333333333333333 33333333 22 1 5555 333333333 9 4 9 9 9 9 6666 55 11111 6666 4 2 000000000 44444444444444444444444444444444444444 5 8 0 555 0 000 000000000 0 88 1 1 00000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 99 5555 9 555 000000 7777 888 000000 000000 7 7 8 222 8 55 00 6 6 9999 44444 000 7 7 7 888 444444444444444444444444444 88 888 7 33 7 1 33 999 000000 6 6 88 4444 6 222 3333 8888 5 88888 5 5555555 8888 5 666 5 5 666 55 5 00 5 5 77777 22 6 00 6 22 6 4444 6 666666 6 6 6 6 2222222 00000 555555555555555 999999999 22222222 5 7777777777777777777 2222222 0000000 5555555 1 88888888 22 11 222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000 22222 33333333 111 77 55555555555555555555 77 99 3 2 77 2 2 2 55555 88 4 9 0000 22
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( family-198 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|1 : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAA-A---ATAAAATATAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATGTTTTGAATGGCATAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---AAAATATGGAA---A---T---A---TTTTGCCTGTCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------C-T--GTGAGCAG-AT-----A-C--T-T--ACTA--C-T--GAT---GATCAGAATCA--CAAT-G-A-CTG------A---T--T--TA----TGG--------AGCCATCA-CCTCTC---------TTA-AA---AT---AAAT-AGGTT-GTAAG----G----A--AA-TAAA--C-AGT-AG--GAC-CTA-CGACATG-CGG-T-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAAAG-AA--TATC--TTT----ATAAGACAATGT--AT-AAATGAAAAACA--TT-TTTTTTTTTTTTCATAAGTAAAA--TCAA----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGACAAG-GT--GG--GGGATAAATT---ATA----CAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---AAT-TTC-------GAGTTTG-ATAGAAAATTC---ATGAT-TTATTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACCA------T-A------CCATAA--------TAT--AT-TGC----AGCTCTCTTTTTTTCTTCTTTTAT-TTTTGCATT-GG-GTGC-CTTTCTGATGCAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GGAAAAA---------AACC-C---G-AAAGAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AA---AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTTCA-CGT---GTAAGTTATA------AA----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATA--CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAGA---AAC------TTC-T-G----AA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-AA-------G----TAGT---TAAA-T-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-T--CT-TT--G-AGA----TCGAT----------------------------G-------T-----AC---------------C-----------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---G--C----------A---------A--A--CAAA-CACGC-T--T-CCGTC-TA-ATAA-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATCT
gi|10 : ATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TCAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-CATGTTGAACCCTCTTTAT-T-TTATTTTAT-TCTTACATT-GG-GTGT-CTTTCTGATACTG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AACA-----------C---AG-TAC-------AAG---T--G----A----------A---------A---------------------G---T--ACTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTCAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------ATAAA--A---TTTTA-C--GCTC-AAGCTTTG--TATA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--CT----GT----TAAA-GG-----TA-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TTG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-ATACAATGT-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-A----------A---------CTTTTTTTTTTTT-T----------T-----TT--------TCC---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----c
gi|11 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgAAAA--------TAT--AT-TGC----AATC-------TCT-TTCTTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-ACTTATGATACAG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACAT-TT---C-TTC---ACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATT-----ATA-----------------------T--------T------------------A---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--ACATTATTTC------C---------AT----------------G---AATAT--TCGTA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACAA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-ACATGAATTTCTT-----CTT---AG-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATGTTG--TCGA---AAA------TTC-T-GT--CAC----GAGAGAC-AG---T----A---------------------A-------G----TACT---TAGA-A-GC---AAT--TGCTG-TCG--G-AA-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGC----TTGCT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAGATTTTAGCATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-GTT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CCCTTTGT------AGGTCTACTCCT-----TT--------TTG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-A
gi|12 : G--TT----GT----TAAG-GA-----TG-TA-------G----TATT---TCGA-A-GC---AATATTGCTG-TCG--A-AT-A-----GAAT--G-C--TG-TT--G-GGA----TTGTTAT------TT-GTT-ACGCACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------TGTGATGATT-------C-------A-ATT--------T--GTAGT---------T-A----------C---------A-------------A----------T-----TT--------T
gi|12 : -------------A----------T-----TT--------TCG---A--CCAAATAATTTA---------A--A--AAAA-AATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--GTACTTTGATatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|13 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtg-C---A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TC-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AA-------------TACAGT-AAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T--TTTGA--G----CTGCC-CGT---GTAAGTTATA------AG----TACG---GCTGATC------A------TT-ACAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CTT---AA-A-A-A---G---------A---TATC------A---A--A---TTTTA-C--ACT--AAACTTTG--TAGA---AAC------GTC-T-GT--CAA----GGGAAAC-GG--TA----GT----TAAA-GG-----TG-TT-------G----TAGT---TAGA-A-GC---CGT--TGCTG-TTG--A-CT-A-----GAAT--A-T--TG-TT--G-AGA----TTGAT-C------AT-GCC-ACACAGG-GAAC-A-------T-----ACAATGTAACAAAATTTCAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTTCTTGAA--A----------T-----TT--------TCG---A--C----------T---------A--A--GAAA-CATGT-G--T-CAGCT-TA-ACAG-----T--AT-T-G----TCA--ATACTTTGATT
gi|14 : ATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGT---AT---A-AATCAATAAAACAAACA---AC------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAATA---------GT-----------TTAGAATCCTAAATTATTT---TC------------C---T---A---ATT--CTTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-ATTGTGAGCAG-ACAGCGTA-T--T-C--ATAA--A-C--AAC---GAAGAG----A--CATTAA-A-C-G------A---A--T--TAATACTGGTTGGTAGTG-CCAGCA-TCTACC---------GTA-CATGTAGGTTACATAAA-TT-AAAAG----T----A--AA-TTGG--G-AGA-AG--AGT-ACG-CTGCATG-CGGAT-GTTCT----CAG-CCGG---------TG-A----GTC--TTT----GTAAG----------T-AAAGGAAGACCA--TGTTTTTTTTATTTTCA----------------------------------C-AAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AAT-----GTCGa
gi|15 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagt---G---T--TCTGA--G----CTGCA-AGT---GTAAATTATACATGTAAG----TATG---GTTGATC------A------AT-ACCACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TT---------------------------CCC---AA-A-A-C---G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-ATACTTTG--GAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-AA-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA--------AGT--TGCTG-TCA--A-AG-A-----AAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-TTC-ACACAC---AAG-A-------T-----TT---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CATCTTTTTTTGAAA----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACCTTGAT
gi|16 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa-AA-T----C----GATA-----------GAAA-GA---------A--C-A---G-AAG-AT-TC---C-T-C---ACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AAACACATATACTTA-G--------------T---GT-TAA-------AAGTGAA--A----A----------C---------ATTATTTCCATGAA----A---G---T--CTTGA--GAGCTCTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---T---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-A--ACTC-AAACTCTG--TAGA---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGAC-AG--CT----AT----TA-----------------------------------------GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----AAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACATACCAAG-A-------T-----TT---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT------------T--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C--------------------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCA-TA-ATGG-----T--c
gi|17 : TAAATTG-A------AG----TATGT--GTTGATC------A------TTTGCATCTAGGAATGTTCAC-A-A---TA-C--TT-AA--T-T-AC----ATATCTTT----CCT---AA-A-A-A---G---------AGATT---------AC--A--A---TGTTAAC--ACTC-AAACTTTG--TAG-----AC------TTC-T-GTC-CAA----GAGAGAC-CATTTT----AT----CAAA-GG-----T--TA-------GT---TAATTTATAGAGA-GC---AGC--TGCTG-CCG--A-CG-A-----CAAT--A-CT-TG-TTGGG-AGA----ATGAT-T------TTGGCC-ACACAC--GAACAA-------T-----ACCAGATATTT------CAAT--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------CT------ATATT--------T--AT--TTTATCACTAT-G----------A---------T-------------G----------T-----TTTGAAATG-TCT---A--C----------AATACAAAGCA--A--CAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--A----C----TCA--ATAATCTGAT
gi|18 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT----GAG-CAAGAT---TTGTTA-AA--TATCATTTT----CTAAAAAAA-A---GT-GGGGGGGGGGTAACTA--------ATTTTTATAAGTAAAA--T--A----------------------------------CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AAATTAAAGTCGA-AAGTGT--GG--GAGA-AA-TG---GGA----TAAATTAATCTTAA-G-TCTA--TCA---ACA-TTT-------GAATTTC-ATAGAATATCT---ATGGA-TTCTTTAT--TATGCATNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGA-GTATGCCTTTTAATACAT----TATCTAAGAA----------------------------------------------GAA------------------C---A-AAATAT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------aa
gi|19 : A-T----T----GATA-----------GAAA-GA---------A--G-C---T-AAG-AT-TT---C-TTA---GCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A--------------------------------------AA-------CAC--ATGTA----G----------T---------AG----------------A---G---A--TCTAA--G----TTGTA-TATAATGTAAGTTTTA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACGAGGAATAT-CACCA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-A---AT--------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-GATCTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTA-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----ATGGT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------TAAATAACAAGATTA--------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------CTGATGTT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|2 : cATA----------A--ATGAGCAG-AC-----ATC--T-TGAATTA--C-----AC-----ACAGGAC-AGGCGTT-G-AGC-G------A---A------A----TG---------A-CCT-TA-TCTCGC---------ATAGAA---AG---AAAT-AG-TA-GGAAG----GG---A--AA-TAGAATG-GAA-AA--AAT-ATA-CGACGTG-CAGTT-G-TTG----TAA-CGAGAT---tg
gi|2 : AAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAAA-----GTCGA-AAGCGA--GG--GGGG-G--TG---AGA----TATATTGATATCAA-G-TATA--TCA---ATG-TTT-------GAGTT-------------C---A-GAG-TTCTTTTATCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTACATGTAT-G------CTAAGAATACAATGTAT--AT-TAC----AACCCACTTTAT-------TTCAT-TCTTGCATT-AG-GTCT-CCGTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGA---------A--C-C---A-AAGC-T-TT---C-TTC---AGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AATCACAGTACATTAAG--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----AACTATTTC--C---------AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTACA-TGT---GTAAGTTTTA------AG----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGAAATAT-CACCA-A---TC-C--TTTAA--T-T-AC----ATATCTT-----CCT---AA-A-A-----G---------A---T---------ATC-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CTGA---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGC--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACAAG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG---------------------C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--Aggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|20 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacga---G---T--TTTGA--G----CAGCA-CGT---GTAATTTATA------AG----TATGATAGTTGACC------A------TT-GCAATTAGGAATGT-CAGTA-A---TA-A--TTTGA--T-T-AC----ATT-CTT-----CAT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---T--G---TTTTA-C--ACTC-AAACT---------------------------GT--CAG----CAGAGTC-AG--CT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-AG-ACAATAGAAT--A-C--CG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TTTATGTACC-------A-ATCTACATATGT--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTCGGA---A----------T-----TT--------TCA---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGT-T--T-CCGCC-TA-ACAGTATA-T--AT-T-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|21 : cattaaatccacgaaaTTATGA---AA---TGTCTTTCCTA---------GTCTAAATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT---ACAG------A---A---T---A---ATT--CCTGCCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATGTACATTTGTAT-A--GTGAGCAG-AC-----A-C----C--ATTAGGCAC--AAC---GAAAACAAT-A------------------------T--T--TA----GAG--------T-CCA-CA-CGTTTA---------GTA-AC---AT---GAAT-GG-TTTATAAG----T----G--AA-TAAA--G-AGA-AA--AAT-ATT-CAACATG-TGGGT-GATTT----TAA-CGAGAT---TTATTGAA---TACA--TTT----TTAAGAAAA-GGGTAT-AAAGGAAGACTA--TA--TTTTTTATTTTCATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AAA-----GTTCA-AAGCGT--AA--GGG--AAATG---AGA----TAAt
gi|22 : -AA---GG---AAAT-GG-TG-GGAAG----G----A--AAATAGA--G-TGG-AA--AGT-ATA-CAACACG-C-----ACTTTATG-TAA-CGAGA----TGATTG-T---TGTC--TTT----G-AAAAAAA-GT--AT-TAACAAAGAACA--TG-CT---------------GC---A--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GC
gi|22 : gACCCTCTTTATGT-A-ATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTTT-CCGTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|23 : gaaggaaatggtgggaaggaaaatagagtggaaagtatacaacacgcactttatgtaacgagatgattgttgtctttgaaaaaaagtattaacaaagaacatgctgcatatgtaatttattgtgcgtaacatatcgtagaatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTCA-AATATGGAA---A---TC--A---ATTT-CCTGTATTT-ATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTGCAC-----A-G--TAC--ATTG--C-A--AACCTTGAACAT--T-A--CATT-GAA-C-G------A---TA-A--TG----CGG--------C-CCA-CA-TTATCC---------GTA-AA---A
gi|23 : A-AA--ACT-AT-----TATG-CGGGTTGTTTT----TAA-C-AGGT---TTACTG-GAAGTATC--CTT----AT-------------T-AAATGAA--CCC--TA-TATTGTTAATTTCATAAGGAAAAAGT--AATGGTGTA-TTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGC-T--GG--GGAA-TAGAA---AGA----T-AATTAA-GTTAT-G-AATA--TCctattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|24 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgt-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-CA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGcaag
gi|25 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------A---------A--A---AAG-CATGC-T--T-CCGAC-TA-ACAG-----T--AT-T-T----T
gi|26 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtaAT-C-CTACA---TA-C--TTTAA--TCT-CC----ATATCTTAATCTCTT---AC-ACA-A---ACCTCGCACTA---T---------AC--A--A---TTTTA-CCCACTC-AACCTTTG--TAGACACAAC------TTC-T-GT--CAACTTAGAGAGAC-A----T----AC----TAAATGGCCCCTTC-TC-------GATCCCAGT---AAGA-AAGC---AAT--CGCTGCTCA--ACAGCA-----GAATTCA-C--TCCTT--GCAGA----T-GAT-T------TT-GCCTGCAAACG-GAAA-A-------C-----ACTTT------------CAAGC-------ATC--------A-A-A--------CA-------T-------GT-------C-------ACATT--------T--TT--T---------TCA----------A---------CTT-----------C----------T-----TT--------TCG---AAAC----------A---------A--AA-CAAA-CATGT-T--TGCCGCC-TACACA------T--AT-T-C----TCC--ATACTTTGATTga
gi|27 : tatcacaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---TCCCA---ATT--CCTGTAGTTTATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTG-AC-----A-CAGTAC--ATTG--C-----ACCTTGAA---AAT-A--CATT-GAA-C-G------A---TAAC--TA----GCG--------C-CCA-CA-TATCCC---------GTA-AA---
gi|27 : ATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGGT---TTACTG-AG--TATC--CTT-----T-------------T-AAATGAACACCA--TA-TATTTTAATTT-CATAAGGAAAA--T--AAATGTGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGCGT--GG--GG---AAATG---AGA----TAAATctattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|28 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactattT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------TTTA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATT
gi|29 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaactagaggcagtgattgctctttaagatccttattggtatgcaggacacaagaccaaaagtcaagcCTGA--G----CTGCA-CAT---GAAGGTTATA------AG----TACA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---T-------------------------TCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------AT--AC-A---TTTTA-T--ACTC-AAACGTTG--TAAA---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGGC-GG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAAC-A-GC---AGT--GGCTG-TTG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AGCATTTCCTG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TTTTTTA--A----------ATTTTT----G--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAa
gi|3 : ----GATG-----------GAAAGAACACATATATA--C-C---G-GTATATCTT---C-TTC---ACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----------------------------------------------------------------------------------------------T-TAA-------AAG--AT--A----GCCTTATTTC-C---------AT----------------GAATG---T--CCTGA--G----CTG
gi|3 : TGCAACAT---GTAAGTTACA------AG----CATG---GTTGATCATTGCAA------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTTTTAAATT-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AACA-A-G---G---------A---T---------AT--A--A---ATTTA-C--ACTC-AGATGCTG--TAAA---AAA------TTC-T-GT--CAA----GAGATACTAT--TT----TT----TAAA-GG-----TG-TA-------A----TACA---TAGA-A-GCCATAAT----CTG-TTG--A------------------------CT--G-AGA----TTGCC-TTAAAAGTT-GCA-ACACGCG-G-AT-A-------A-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------CCTGTTTAA-ATT--------TAAAT--T---------T-A----------AG--------C-------------A----------T-----TT--------TTG---aataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattatT----T-CA-T----T----GATG-------------AAAGA---------A--C-C---G-AGATAT-TTATTC-TTC---ACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACTGTATACATGATTTTTAATACATGT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------GT----------------tttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : cat---T--TCTAATTG----ATGTA-CGT---GTAAGTTATA------TG----CATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAACTAGGAA-----ATTG-A---TA-C--TTTAtatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|31 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttAAA--------TAT--AT-TAC----AAAC-TCATTAT-T-TCATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AATG-----------GAAA-GA---------A--C-A---A-AAGT-T-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------T------------------AAACACAGTATATTA-G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------CTTTATTTCCAT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTGCA-CAT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-C---TA-C--TATAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---
gi|32 : ct---A--C----------A---------A--AATCAAAGCATGCCT--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|33 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggacTTAATA---A-A-TGTA--TT--------TTT-------GAATTTC-ATAGGAAACTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTA-A-TAAA-CACACTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--AT-TGC----AACCCTTTTT--CT-TTATTTCAT-TTTTGCATT-GG-GTGT-CTTTATGAAAGTG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT---------------------------------T---G-ATATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----c
gi|34 : ---TAGA-G-AC---AGT--GATTA-TCTTCA-AG-A-----GTATTGA-C--CC-TT------A----TTGAT-C------TC-AGG-ACACAAG--------------------AT---------------CAAA--------AGT----------C-G--------CG-------C-------TG-------T-------A-ATT--------T----------------T-A----------A---------C-------------------------------------------------C----------A---------A--A----AA-CATGC-T--T-CCCAC-TA-CCAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGAcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|35 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaacTA------T-G--------AAAT--------TATTTAT-TA-----AGTCATCTTTTTAT-TGCTGTTGT-TGTTGCATT-GG--TGT-TTTGTTGATACGC----TATCCAAGAACATTT----AAT----C-TA-T----T----GA----------------AAGA---------A--CAC---ATAGATAT-TT---C-TTCTTCGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TT-----ACT-----------------------CTGTGTACAC------------------A---------------G--------------T---AT-CAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATA---------------A---G---T--TCT
gi|36 : tcatatatttattttttcatttt---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-CA-----TG-CA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-T--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCT-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTGGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCT-TG-ACAG-----T--AT-T-CTCTATCA--ATATTTTGATTTaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT---AAGA-GAGTAAAACAAAAA---AG------TTAGTTGA-A---CA---TGTTTTGAATT---------GTCCAAAAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT---AC----------------T---A---AAG--CCTGTAA---ATACAG--ATATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--ACGAGTAG-AC-----A-ttc
gi|38 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataaga---------A---T---------C---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAGA---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAAAGAC-A---TT----AT----CAAA-GA-----AG-CA-------G----TAAT----------------GT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCA-ACACATG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AG-------CA-------T-------TT-------C-------A------------------------------------------------------------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--C-CCGTC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATata
gi|39 : at---AA-A-ATA---T---------A---T---------A---A--A---TTGTA-C--ACAT-AAACGTTG--TAGA---AAA------TTA-T-CT--CAA----GAGATAC-TT--TT----GT----TAAA-GA-----CG-TT-------G----TACT---TAGA-A-GC---AATA-TTCTG-CCG--A-AA-A-----GAAT--A-C--TG-TT-----------------T------TT-GCC-ACACACA-GAAC-A-------A-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AACATTTCACG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------C---------C-------------T----------T-----TTTGAAATACTCG---T--C----------A---------A--A--CAAa
gi|4 : aA---A---T---A---ACT--CCTCTAA---ATAGGGAAGTTAGCCCAGCGGCA-TATATA--------TCA--CTGGAGAG-AC-----A-A--T-C--AT----------AT---AAAAAAAA-----CGTT-G-A-C-CCATAACA---T--CACTA----TTG--------A-CCA-CAATCTCGCAGATGGAGGGTG-AA---AG---A----------GGAAG----GTTAGACTAA-TGGATTG-CGT-AAGGAATCATATCGACATGGCAGGT-TTTCTGTTATAATCGAGATGTTTTACTG-G---T------TT----ATGGGAAAA-G---GTTAAACGAAGAA-A--CA-TT---------------GCAGAA--T--------GTAATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AA-------TTAA-A----T--GATAAAAA-AAATGTAAAGAATGCTAAATTAATATCA----TA-A--TCACATATGATTT-------GTGTTTCTATGAAATATTCTGCATGAG-TTCTT-ATTCTATCTGTCCTA----AATAAGGCAAGCTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--GT-TTC----GTACTTTTTTAACC-TTATTTTATCTCTTGCATT-GG--TGT-CCGTCTGAAACAAA---TATCTAAGAAC-TTT----CAT----TGAA-TCAA-T----GATG-------------AAAGA---------A--C-CATAG-AAG-AT-TT---CCTTC---ACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT------TT-----------------------T--------C------------------A---------------
gi|40 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctttaaattagtttacgttaattcgtgtagttaggcgtattatgcttaactagcaatgggtaattT-----ATT---------------------------------------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CAacacagtatttca
gi|40 : AA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAACTACGAATAT-CACnaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|41 : tattagtgttaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcanT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--T--CA-----TAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----CCA--TTACTTTGATT
gi|42 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggc--T-T-TC----ATTTCTT-----TTTGGGAG-A-G-ATATG---------A---T---------A---G--A---TTTAA-C---CTC-AG---TTGAGCAGA---A--------TTC-T-ACTCCAG----GAGAGGT-AG--TT----ATGTTGTTAA-GG-----TG-TG-------------------TAGA-G-GC---AAT--TTCAA-TCA--A-GG-G-----GAGC--AAC--TA-TT--C-AGACTGTTTGAT-T------CT-A---AAACAAG-AAAC-A-------T-----AC---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------c
gi|43 : tATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTAA-GA-AAATAAA-CAAACA---AT------TAATTTAT-A---GA---TGTTTT-AACA---------GTATAAAAGAAGGTTGGGAGCTT---------------ATATGGAA---ATCTT---A---ATC--CCTGTAA---ATACAG--GTATatat
gi|44 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataaTT----AAT----T-AA-T----TT---GATG------------AAAAGA---------A--C-----A-AGACGT-GT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATATTGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ATAATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCTGA--G----CTGCA-
gi|45 : atatctatataaccttataatataataA------AA----CATG---GTTTATC------A------TT-GCAACTAGCAACAT-CACTA-A---TA-T--TTTGA--T-TGAC----ATTTTTT-----CTT---TA-A-A-A---A---------T---T---------A---AAGA---TCTGA-A--ATTT-ACAC------TAAA---AAC------TGCAT-GT--GA------ACAGAC-AG--TT----GT----TAA-------------C-------G----TACT---TGGA-A-GC---AAT--TACTG-TCG--A-AT-A-----GAAt
gi|46 : gc-CAATTAAACAAACATAAAT--------AGCTAT-ATACGAATATGTTGTAAATC---------GTCAAAAAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT---ACAACATTGAA---A---TCCTA---ATT--TCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGCTGCAGTATATA--------T-A--ATAAGCAG-GC-----A-C--
gi|47 : T----T-AA-T----T----GATG-----------GAAA-GA---------G--C-A---G-AGATAT-TT---C-TTCTTCACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TT-----ATCGTATACACGATTTTTAATACATAT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------aaat
gi|48 : tcgaaatgtttagcaatacC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA----ATGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AA---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--Atattttcatgactgttctcagctga
gi|49 : cgcaaagcC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA-----TGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AA---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--A
gi|5 : cgcaaagcAAG----G----A--AA-TAGA--G-AAA-AA--AAT-ATA-CAATATG--------TCTA----TAA-CGAGAT---TTAATG-AC--TATC--TTT----A--AGAAAG-G---CT------------------TTTTTTAATTTTCATAA-TAAAA--T--A----------------------------------CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------ACA-----GTCGA-AAGCAT--GG--GGGA-AA-TG---TGA----TAAATTAATTTCAG-G-TATA--GCA---ACA-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNN-------AT-CCTTCAGGTACAGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GATG-----------GAA--GA---------A--C-----A-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATC-----------------------T--------C------------------A---------------AACACAGTATACTTAT---GT-TAA-------AAG--AA--A----A----------C---------ATTTTTATGAA-------A---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GGAAGTTATA------AG----TGTG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-AACTT-A---TAAC--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----C-T---AA-A-A-AT--G---------A---T---------ATA-A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-CA-------G----TAGT---TATA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-G-----CAAT--A-C--TG-TT--G-AAT----TTGAT-T------TT-GCC-ATACACG-GAAC-A-------T------C---------------AAAT--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------C-ATC--------T--AT--T---------TCA----------ATTTTTTTTTT-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-C--------------------AT-T-C----TCA--ATGCTTTAATT
gi|50 : tt-------------A----------T-----TA--------TCG---A--CCAAA------A---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--Ac
gi|51 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaTAAATCAGTT---ACAATATAGAAATGA---T---A---ATT--ACTGTAC---ATACGG--GAATGC--AGA---AGTATATCCT------T-A--GTGAGCGG-AT-----A-C--T-G--ATTA--G-C--Agattttatttgca
gi|53 : ctaaggaagcggaataA-TGT---GCAAGTTATA------AG----CATG---GTTTGGC------A------TT-TCAACTAGGGATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCA---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTcaatggacgat
gi|54 : ttattagaagtctccatatatAATTACA------AA----TGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--AGAAA----CACAA-AATATA-T--TTCAA--T-TTAC----ATTTCTT-----CAT---TG-A-A-A---G---------A---C---------A---A--AGTATTTTA-C--GCTG-AAACTTTG--TAGA---AAA------TTc
gi|55 : agT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-ATTTTCAAGACA---------C-------------A----------TA----GT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATTC-TAAT-TCTCC-TA-AC-G-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATTtgg
gi|56 : tcagagtatatgactaACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-------TTAGACAA--------------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAatttt
gi|57 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggt---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CTTTTTTGTTTTA-A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATA-ACAG-----T--AT-C-C----TCA--ATACTTCGATTTttg
gi|58 : tt---------A---T---------A---T--G---TTTTA-A--ACTC-AAACGTTG--TAGA---GACAGACAGTTG-TAGA--CAG----GAGAGAC-A------------------A-GA-----TG-TA-------G----TCCT---TAGA-A-GT---AAT--TGCTG-ACA--A-AA-A-----AAAT--
gi|59 : -------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------C---------A--A---AAG-CATGC-T--T-CTACC-TA-TCAG-----TAGATAT-T----TCA--AT
gi|6 : attgcagattcttgatcgatcttcacaccaaaagtagggctgtaTTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AAA-----CTCGA-AAGCGTAGGG--GGAA-AAATG---AG-----TAAA-TAATTTCAA-GTTATAGCCCA---ATG-TTCTGCCACAGATCTTC-CT--AAAAGTC---ATAGG-TT-TTTATTTTATCT-TCCTT----A-TAAGCCAAACTA------TGG------CCAAAC--------CAT--ATATAC----TAATCTCTGCATGT-TTATTTTA--TGTTGCA---GGAGTGT-CCATCTCATACAG----TATTTTCGAA-ATTT----TATAATGT-AAGT----T----GATG-----------G-AAAGA---------A--C-------AAATAT-TT---CTTTC---ACATCT---------T-C-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACT-----------------------TAAACA---C------------------A---------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG--GT--A----T----------T---------A-----------------A---G---T--TTTGA--G----CTGTA-CAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----CAGAGAC-AA--TT----AT----TAAA-GG-----AG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-AG-A-----GAAT--G-C--TG-TT--G-AGA----CTGAG-T------TT-GCA-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------AAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTCTTGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGC-T--T-TTAAC-TA-ACAG-----C--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTTt
gi|60 : -------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTT
gi|61 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTT
gi|62 : gacgtT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC--A-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|63 : cgtTAAGTAAAA--T--AGA--TTTGATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AAA-----GTCGA-TAGTGT--GT--GGGA-actgtactgctt
gi|64 : ct--TTT----ATGAAAAAG-GT--AT-CAAGGAAGACCA--TA-ACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAA--T--A----
gi|67 : ttgaataactaAA-A-TATAC-TCA---ACGGTTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAGTTTCTTTATTCTActgc
gi|69 : tTCAA-A-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTAT
gi|7 : ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AGA-----GTTGA-AAGCGT--GG--GGGA-AA-TG---AAA----TGA-TTGATA--AATG-TATT--TCA---ACG-CTT-------GAGTTCC-ATAGAAAGTTC---ATCAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTATA-TAAA-CAAACTA------T-GTATATGCCAAAA--------TAT--AT-TAC----ACCCCT------GT-TTATTCTA-------CATT-GG-GCGT-CCTTATAATATAG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GATG-----------GAAA-GA---------A--C-----A-AGACGT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATAATGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ACCATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCGGA--G----CTGCA-CGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAGCTAAGAATAT-CACTG-A---TA-C--TTTGAT-T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GAT-------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACGCAAAACGTTG--TAAA---AAT------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TTATTAAT----TAAA-GG-----TG-TAC------A----TAGT---TAAA-A-AC---AGA--TGCTG-TCG--A-AT-G-----GAAT--A-G--TG-TT--G-AG-----TTGCG-T------TT-GCC-ACACGCG-AAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-T----------A---------T-------------T----------T-----TT--------TC-------C--------------------------TTAA-C---T-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--GTACTTGGAT
gi|70 : ---A--C----------T---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CTATC-TA-TCAG-----T--AC-T-C----TTA--GTACTTTGATT
gi|71 : ATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--AT-T-C----TCA--ATAATCTGATat
gi|8 : ---A-GA-CAATAAAACAAATA---AT------TAACTAAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACGATATGGTA---A---T---ACAAATT--CCTGTAA---ATACGG--GAATTC--AGGTGCAGTATAAA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-T--T----GTAA--T-CTGAAC---AAAAGAAAT-G--CGTT-G-AAC-A------AATTT--T--CA----TG---------A-CCA-CA-TCTTGC---------ATG-GA---AG---GAAT----TT-GTAGGACGGG----A--AA-TGGA--GTGGATAA--AAT-AAA-CGATATG-CATTT-GTTTT-----AA-CGAGAT---GTA-TG-T---TGTG--TATGGAAATAAAAATG-C---AT-AAAGGAAGAACA--TG-TT---------------GTAAA-----------TCTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TAA-----GTCGA-AAGCA----G--GTGG-AAATG---AGA----TAAATCAATATCAA-G-TAAA--ACA---ATG-TTT-------GAGTTTT-ATAGAAAATTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----G-TAAG-CA----------------------AAAA--------TAT--AT-TAC----AACC------AATT-TTATTTTAT-TCTTGAATT-GG-GTGT-CCGCCTGATACTG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AATT-----------GA-------------------T---G-A---AT-TT---C-TCC---ACATTT---------TCC-G--TTatgacaaa
gi|9 : ataTGTA-CGT---GTAAGCCATA------AG----CTTG---GTTGATC------AATGCAATT-ACAATTAGGAATAT-CACTA-A---TA-T--TTTAA--TGT-AC----ACTTCTT-------T---AA-A-A-A---G---------A---TTTATATGCGA---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAATATTG--TTGA---AAAA-----TTC-T-GT--CCA----GAGGGAC-AT--TT----GTG---CAGG-AG-----TGATACTCGAATG----TAAT---TA------C---AGT---ACTG-TCG--A-AG-A-----TAAT--A-C--TG-TT--G-AAC----TTATT-T------CT-GTC-ATACACA-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------TAA-A--------CA-------T-------TT-------C-------A-ttcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|9 : aatgaa-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGC-G--T-CCGCC-CA-ATAA-----T--AC-G-C----TCA--CTAtgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
blockSeqs : ATT CTAAGAA CATAAAT G TAC ATA G A CT TTCAA T G ATCT CCC CAA T TTT AA CC T CATTTGTATAG C AGCGTATTCATAAACAACGAAGAGACATTAAACGAATTAATACTGGTTGGTAGTG G A C AGATGGAGG G TGT GTT C AAATT A GTTAG CT A AT TG T GG C AT GCAGG T T GTTA T GTT T AATACATTTTTAAGAAAAGGGTA TA G C AC TTTTTTTT T TA AAGTAATGGTGTA C C GTA T GA T TGGACGA TACTCG TTAAA . AG TA . A TAA ATGC T T GC CAT A TGCCACA T TGC T TTAT A G CATGTATG ATACAATG TT A GTTG NNNNNNNNN . C A A G CGCT CA AATTT CAAC G G TAAGT NNNNNNNNNNNGGAAAGAACCA T C ATT C TTC AACAGAATA G AT T A ACACG TCAAATACATATTGAATATTAGTGTGAAAAGATAATAATTATTTCCATGAA AA TT AGCT A AAT CATGTA TATA ATA ATTGCA ATGCAA T T C ATA A TT AT C G ATGA AATCT GGG C C T TAT CCTCGCACTATAC AG GTA A CC A T AG CAC AGACAG A A TC CTTA T ATT ATTA GTTG T CCCCT A CTCGAAT ATCC T TTA G A CAT AT C TC C C CAATA TC A TG C GG C CTGT A TAAAAG G T C A TACAATG AAATA AATGTAACAAAATTT GATTTTAGC TCAATATA A AACATTTCATT GTGATGA TATGTAC CTGTTTA T TACATATG AA AG TTATCACTA CACCCTTTGTAGGTCTACTCC TGATG TGAAATAC TTT AA CAAATAATTTA TT AT G C AA G A C CGATA AG A C TCTA TT
blockSeqs : G AAATC CAAC . . . T A CC ACA T G ATGA CCT . . TT . . T TATTG . AGTACATTGCAAACCTTGAACATTACATTGAACGATAATGCGGC . . G . . . . A GGTTT G ACGGG . . TT A . . . G CGGA . A ATG . . T TTGTGTATGGAAATAAAAATGCA A G G . TATTGTT T TA ATAAATGTGTAA . . . T . A . . . . . . . G . . . . C . G . . . . TTA . C TGTATATG A . . . CTCTTTATG . . . . . A CT C AATG . . CAATT GAAAGAACACATATATACCG C . . T TTC . . . . . ACACG TCAAATACATAATGAATATTAGTGTGAAAAGATAACCATTATTTCCATGAA AA . . . . . . T TTTGCA . . . . . . . T G T . T . . . . T ATTTATATGCGA C . . . . G . . A . . C . . G . G . . . C T C . . . . A . . . . . TG . TG . . . . . . . . . . . . CAGATATTT GATTTCAAC TCAATATA . AGCATTTCCTG . . T C . . . . CACATCTTTTTTTGAAA A TGAAATG . . AATACAAAGC . A . . . . . . CGATA . . C . TT
blockSeqs : A AAGAG AAAG . . . G T AT ACA T G C C . . . . . T CTTAG . ACAGTACATTGCACCTTGAAAATACATTGAACGATAACTAGCGC . . T . . . . A AGTA T GG . . . G . . . A CAGT . C . . . T AATATCATTTTCTAAAAAAAAG G G C . TATTTTA T TA ATAGATTTGA . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TGG A . . . ATCTTTTTA . . . . . . CC N . . . CAAT AAAGAACCATAG T . . . . . . . . . . TCAAACACATATACTTAGTGTTAAAAGTGAAAACATTATTTCCATGAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AGATTAC . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AAGATTA GC . . AACATTTCACG . . . . . . . . AACTTTTTTTTTTTTT . . . . ATTTTT . . . . . . . . TATA . . . . .
blockSeqs : . AGAC CAAT . . . A A CA ACA C T A . . . . . . T TCAC . ATTGTAATCTGAACAAAAGAAATGCGTTGAACAAATTTTCATGA . . C . . . . A GGTG G T . . . A . . . T TGGG . T . . . C TTGTCTTTGAAAAAAAGTA A C A . TTTTTTA T TA ATATGTAA . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . TTTTTTAAC . . . . . . CC C . . . TT GAAAGAACAG T . . . . . . . . . . TCAATCACAGTACATTAAGTGTTAAAAGATAAACTATTTCCATGAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . ATATAA . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT G . . AACATTTCATT . . . . . . . . CACTTTTTTGTTTTAA . . . . CAAAA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A TAAT . . . G C CT ACA T A A . . . . . . T TAA . AATCATATAAAAAAAACGTTGACCCATAACATCACTATTGA . . C . . . . A TT G T . . . T . . . A CGGG . T . . . C ACTATCTTTAAGAAAGGC T T C . ACTTTTT T TA ATATGTAA . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . NN . . . . NNNNNNNNN . . . . . . CC A . . . GT GAAAGAAGCT C . . . . . . . . . . TTAAACACAGTATATTAGTGTTAAAAGATAACTTTATTTCCATGAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATCA . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . AACA . . . . . . . . AGCATTTTCTTGAAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G A . ACG T G A . . . . . . T TAA . ATCTTGAATTACACACAGGACAGGCGTTGAGCGAAATGA . . G . . . . . . T G . . . C . . . A CGGG . T . . . C GTTTATGGGAAAAGG A T C . TTTTTT T TA ATGTAA . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . CTCTGCATG . . . . . . CA A . . . T GAAAGAACAA T . . . . . . . . . . TCAAATACAGTAAAAAGATAACATTACAATGTATTTCCATGATTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATA . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . AACA . . . . . . . . AACATTTTTCGGAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . . A . . . . . . T TAG . ACCATTAGGCACAACGAAAACAATATTTAGAGT . . G . . . G . . . A . . . A CATT . T . . . A GAAGTATCCTTAT A C A . CT . GG TCTAA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . CTCTTTAT . . . . . . CC C . . . C AAGAACACAT T . . . . . . . . . . TCAAACACAGTATACTTATGTTAAAAGAAAACATTTTTATGAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATA . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . AACA . . . . . . . . AACATTTTTGGAAA . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AC . . A . . . . . . A AA . . . . . . . C . T . . . . AGTCTTTGTAAG C G C . TT . . ATA . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . CACTTTAT . . . . . . TC A . . . T GAAAGAGCAG T . . . . . . . . . . TAAACACAGTATATGAGTAGTGTAAGGTATTAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATA . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . AGCA . . . . . . . . CAATTTTTTTTTTA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . AGTATCCTTT A G A . TT . . ATA . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NN . . . . TCATTAT . . . . . . C C . . . N GAAAGAACA T . . . . . . . . . . TTAGTGTGAAAAGATACATTATTTCCATGAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATC . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . AACA . . . . . . . . ATTTTCAAGACACA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTTTTTC . . . . . . A T . . . T GAAAGAACA T . . . . . . . . . . AGTGTTAAAAGATAACATTATTTCCATGAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATA . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . ATG . . . . . . . . AGCATTTCTTGAAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTG . . . . . . . C . . . T AAAGAACCG C . . . . . . . . . . CTGTGTACACAGTATCAAAAGATAACATAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATA . . . . . G . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ATG . . . . . . . . CAACTTC . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . T AAAAGAACA T . . . . . . . . . . TTAAAAGATAGCCTTATTTCCATGAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATA . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ATG . . . . . . . . AAGCA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TC . . . . . . . . . T GAAAGAACA T . . . . . . . . . . TCAAACACAGTACAAGTGAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATA . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ATG . . . . . . . . ACAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T GAAGAACA T . . . . . . . . . . TCAAACACATGTAGTAGAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TATA . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ACG . . . . . . . . GAAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T GAAAGAAC C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAT . . . . . G . . . . . . . . G . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . ATG . . . . . . . . GATG . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C GAACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAT . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ATG . . . . . . . . AACA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATA . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ACA . . . . . . . . AACA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATC . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . GCG . . . . . . . . CCCT . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATA . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . ATG . . . . . . . . GAAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATA . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . ACG . . . . . . . . GAAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . ACG . . . . . . . . TATT . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . ATG . . . . . . . . AAC . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ATG . . . . . . . . AA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ACA . . . . . . . . AA . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : AAGAC**** CAAT********* A********* ** CGGG* AGTATCTTTTTAAGAAAAGG************* ATATGTAA******** GAAAGAACG***************************** ATATA********************** G********
originalCons : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT---A-GA-CAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTG-A---TATC--TTT----ATAAGAAAA-G---AT-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATG-----------GAAAAGA---------A--C-C---G-AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---G---------A---T---------A---A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
finalCons : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--ATAAGAC----AATAAAACAAACAAT---------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATGCGGG-T-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTACTGAGTATCTTTTTAAGAAAAGG-------------T-AAANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAATATGTAA--------TTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GATGGAAAGAACG-----------------------------AAATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-C--TTTAA--T-T-AC----ATTTCTT-----CCT---AA-A-A-A---GATATA----------------------A--A---TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222 2222222222 111 111 22222222222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 222222222 111 1111111 222222222 11 1111 111 2222222222222222 11111111 3333333333333333 1111111 1111111 1111 111111111111111 11111111 111111111 11111111111 111111111111111 111111111111111111111 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222 111111111 11111111 1111111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111111111
lowQualScore : 0 99 99999 1 444444444444444 5 888 888 1 3333333333 44 777777 2 1 0 8888888 666 666 88 111 55 55 2 66666666666666 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 5 1 000000000 4 777 000 1 8888888 1 222222222 66 5 33 66 4 66 4 55 0 77777 4 2 4444 3 111 888 9999999999 8 6666666666666666 2 0 2 55 88888888 2 33 2222222222222222 2 2 555 1 33 5 0000000 888888 77777 3 44 44 3 7 666 7777 0 3 3 77 666 0 7 1111111 3 555 3 5555 4 8 0 555555555555555 77777777 44 3 6666 333333333 2 0 2 2 2 2 9999 4 33333333333 2 2 999999999 111111111111111 6666 777777777777777777777 2 2 333 4 777 888888888 2 22 2 2 00000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 22 4444 1 333 555555 3333 444 555555 555555 1 555555 1 1 333 1 333 5 3 5 3333 66666 1 66666 1 1 66666666 3333 666 3 555 1 1 22 1 2 22 222 666666 1 1 33 3333 1 333 3333 4444 1 33333 1 6666666 4444 1 222 1 1 222 33 1 22 1 1 33333 44 1 66 1 22 1 3333 1 444444 1 1 1 1 5555555 44444 333333333333333 333333333 11111111 1 6666666666666666666 5555555 5555555 6666666 3 55555555 22 22 666666666 11111111111111111111111111111111111111111111111 44444 88888888 222 11 33333333333333333333 11 22 1 1 11 1 1 1 99999 11 1 2 3333 44
lowQualScore : . .. ..... . ............... . ... ... . .......... .. ...... . . . ....... ... ... .. ... .. .. . .............. . ............................................................................................ . . . ......... . ... ... . ....... . ......... .. . .. .. . .. . .. . ..... . . .... . ... ... .......... . ................ . . . .. ........ . .. ................ . . ... . .. . ....... ...... ..... . .. .. . . ... .... . . . .. ... . . ....... . ... . .... . . . ............... ........ .. . .... ......... . . . . . . .... . ........... . . ......... ............... .... ..................... . . ... . ... ......... . .. . . ..... ................................................................................................................................................................ .. .. .... . ... ...... .... ... ...... ...... . ...... . . ... . ... . . . .... ..... . ..... . . ........ .... ... . ... . . .. . . .. ... ...... . . .. .... . ... .... .... . ..... . ....... .... . ... . . ... .. . .. . . ..... .. . .. . .. . .... . ...... . . . . ....... ..... ............... ......... ........ . ................... ....... ....... ....... . ........ .. .. ......... ............................................... ..... ........ ... .. .................... .. .. . . .. . . . ..... .. . . .... ..
lowQualScore : 8 22 33333 4 999999999999999 0 888 888 4 1111111111 66 777777 2 6 8 1111111 444 444 66 444 00 55 3 99999999999999 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 000000000 4 888 000 4 3333333 0 555555555 99 0 88 00 4 11 4 44 9 00000 0 6 1111 6 444 999 6666666666 5 5555555555555555 3 5 3 00 99999999 0 33 1111111111111111 9 9 000 7 99 7 0000000 888888 77777 3 66 66 3 9 444 7777 1 3 3 99 444 4 3 8888888 6 888 3 5555 0 0 3 333333333333333 33333333 22 1 5555 333333333 9 4 9 9 9 9 6666 7 55555555555 4 2 777777777 999999999999999 2222 888888888888888888888 9 0 555 0 000 000000000 0 88 1 1 00000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 99 5555 9 555 000000 7777 888 000000 000000 7 000000 7 8 222 8 222 5 6 5 9999 44444 8 11111 7 7 00000000 5555 000 2 000 6 7 33 7 1 33 999 000000 6 6 88 4444 6 222 3333 8888 5 88888 5 5555555 8888 5 666 5 5 666 55 5 00 5 5 77777 22 6 00 6 22 6 4444 6 666666 6 6 6 6 2222222 00000 555555555555555 999999999 22222222 5 7777777777777777777 2222222 0000000 5555555 1 88888888 22 11 222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000 22222 33333333 111 77 55555555555555555555 77 99 3 2 77 2 2 2 55555 88 4 9 0000 22
consensus : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT--A--AGACAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTAC--TG--AGTATC--TTTNTAAGAAAA-GG---T-A--AANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GAT------------G--GAAAGAA----C-G---A---A-----------ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTT---AA-T-T-AC----ATTTCTT-----C-CTAA-----AA-A-GA--------T----AT---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
Reference ( family-198 ) : ATTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT--A--AGACAATAAAACAAACA---AT------TAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---T---A---ATT--CCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-C--T-C--ATTA--C-C--AAC---GAANAGAAT-A--CGTT-G-A-C-G------A---T--T--TA----TGG--------N-CCA-CA-TCTCNC---------GTA-AA---AG---AAAT-AG-TT-GNAAG----G----A--AA-TAGA--G-AGA-AA--AAT-ATA-CGACATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGAT---TTAC--TG--AGTATC--TTTTTAAGAAAA-GG---T-A--AANGAAGANCA--TA-TTTTTTTATTTTCATAAGTAAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGA-AAGCGT--GG--GGGA-AAATG---AGA----TAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-TAC----AACCCTCTTTATNT-TTATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GAT------------G--GAAAGAA----C-G---A---A-----------ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTT---AA-T-T-AC----ATTTCTT-----C-CTAA-----AA-A-GA--------T----AT---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTT
gi|1 : ATTGATTGAATAATGGTAACAGGAATTAATA--AT--A---GACAATAAAACAAA-A---ATAAAATATAAGTTAT-A---GA---TGTTTTGAATGTTTTGAATGGCATAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---AAAATATGGAA---A---T---A---TTTTGCCTGTCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------C-T--GTGAGCAG-AT-----A-C--T-T--ACTA--C-T--GAT---GATCAGAATCA--CAAT-G-A-CTG------A---T--T--TA----TGG--------AGCCATCA-CCTCTC---------TTA-AA---AT---AAAT-AGGTT-GTAAG----G----A--AA-TAAA--C-AGT-AG--GAC-CTA-CGACATG-CGG-T-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAA--AG--AATATC--TTTATAAGACAA-TG---T-ATAAATGAAAAACA--TT-TTTTTTTTTTTTCATAAGTAAAA--TCAA----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--CTGTAGAATTT-GCCA-------AT------AAA-----GTCGACAAG-GT--GG--GGGATAAATT---ATA----CAAATTAATATCAA-G-TATA--TCA---AAT-TTC-------GAGTTTG-ATAGAAAATTC---ATGAT-TTATTTATTCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACCA------T-A------CCATAA--------TAT--AT-TGC----AGCTCTCTTTTTTTCTTCTTTTAT-TTTTGCATT-GG-GTGC-CTTTCTGATGCAG----TATCTAAGAACCTTT----CAT----T-AA-T----T----GAT------------G--GGAAAAAAACCC-G---A---A-----------AGAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AA---AT--A----A----------C---------AT----------------G---G---T--TCTGA--G----CTTCA-CGT---GTAAGTTATA------AA----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATA--CACTA-A---TA-CTTT---AA-T-T-AC----ATTTCTT-----C-CTAA-----AA-A-G--------------AT---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAGA---AAC------TTC-T-G----AA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-AA-------G----TAGT---TAAA-T-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-T--CT-TT--G-AGA----TCGAT----------------------------G-------T-----AC---------------C-----------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TCG---G--C----------A---------A--A--CAAA-CACGC-T--T-CCGTC-TA-ATAA-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATCT
gi|10 : ATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----A-TCAG-CAAACTA------T-G------CCAAAA--------TAT--AT-CATGTTGAACCCTCTTTAT-T-TTATTTTAT-TCTTACATT-GG-GTGT-CTTTCTGATACTG----TATCTAAGAACATTT----CAT----T-AA-T----TAAGTGAT------------G--GAAAGAA----C-A---A---A-----------ATAT-TT---C-TTC---ACATCT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AACA-----------C---AG-TAC-------AAG---T--G----A----------A---------A---------------------G---T--ACTGA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------------------------TC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTC---AA-T-T-AC----ATTTCTT-----C-CTAA-----AA-A-GA--------T----AT---A-A---AATTTTA-C--GCTC-AAGCTTTG--TATA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--CT----GT----TAAA-GG-----TA-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TTG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-ATACAATGT-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-A----------A---------CTTTTTTTTTTTT-T----------T-----TT--------TCC---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----c
gi|11 : aaaacaggtttgactgtatttatcaagctttgAAAA--------TAT--AT-TGC----AATC-------TCT-TTCTTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-ACTTATGATACAG----TATCCAA-AACTTTTAATTTAT----T-AA-T----T----GAT------------G--GAAAGAA----C-A---A---G-----------ACAT-TT---C-TTC---ACATTTAACAGAATACAC-GATTTCA-AATACATT-----ATA-----------------------T--------T------------------A---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--ACATTATTTC------C---------AT----------------G---AATAT--TCGTA--G----CTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-CACAA-A---TA-CTTT---AATT-T-ACATGAATTTCTT-----C-TTAG-----AA-A-GA--------T----AT---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAATGTTG--TCGA---AAA------TTC-T-GT--CAC----GAGAGAC-AG---T----A---------------------A-------G----TACT---TAGA-A-GC---AAT--TGCTG-TCG--G-AA-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGC----TTGCT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAGATTTTAGCATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-GTT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CCCTTTGT------AGGTCTACTCCT-----TT--------TTG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-A
gi|12 : G--TT----GT----TAAG-GA-----TG-TA-------G----TATT---TCGA-A-GC---AATATTGCTG-TCG--A-AT-A-----GAAT--G-C--TG-TT--G-GGA----TTGTTAT------TT-GTT-ACGCACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------TGTGATGATT-------C-------A-ATT--------T--GTAGT---------T-A----------C---------A-------------A----------T-----TT--------T
gi|12 : -------------A----------T-----TT--------TCG---A--CCAAATAATTTA---------A--A--AAAA-AATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--GTACTTTGATatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtgattttcgaccaaataatttaaaaaaaaatgcttccgccaaacagtactctcagtactttgat
gi|13 : gttgttaaggatgtagtatttcgaagcaatattgctgtcgaatagaatgctgttgggattgttatttgttacgcacggaacataccaagatttcaacatgtgatgattcaatttgtagttacaattttatatgtacaccaagcattgtctacttgaaatgctaactacctcttaattgtttgatactatatatttaacattggaacagtgctatgttccaagaaagaagacgacccatggataacaatatactgtttcaaatgtcaaggtcaaactacaaaaatttcgaaaaatgtctgattaagaagcgtttgagagcgagtaaactaaagtcaattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactgtg----C-A---A---A-----------ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TC-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------AA-------------TACAGT-AAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTACAATGTATTTCCATGATTG---T--TTTGA--G----CTGCC-CGT---GTAAGTTATA------AG----TACG---GCTGATC------A------TT-ACAA------CTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTT---AA-T-T-AC----ATTTCTT-----C-TTAA-----AA-A-GA--------T----ATC--A-A---A-TTTTA-C--ACT--AAACTTTG--TAGA---AAC------GTC-T-GT--CAA----GGGAAAC-GG--TA----GT----TAAA-GG-----TG-TT-------G----TAGT---TAGA-A-GC---CGT--TGCTG-TTG--A-CT-A-----GAAT--A-T--TG-TT--G-AGA----TTGAT-C------AT-GCC-ACACAGG-GAAC-A-------T-----ACAATGTAACAAAATTTCAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTTCTTGAA--A----------T-----TT--------TCG---A--C----------T---------A--A--GAAA-CATGT-G--T-CAGCT-TA-ACAG-----T--AT-T-G----TCA--ATACTTTGATT
gi|14 : ATTGATTGAA-AATGGTAACAAGAATTTGTA---T--A--AATCAATAAAACAAACA---AC------TAAGTTAT-A---GA---TGATTTGAATA---------GT-----------TTAGAATCCTAAATTATTT---TC------------C---T---A---ATT--CTTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATATA--------T-ATTGTGAGCAG-ACAGCGTA-T--T-C--ATAA--A-C--AAC---GAAGAG----A--CATTAA-A-C-G------A---A--T--TAATACTGGTTGGTAGTG-CCAGCA-TCTACC---------GTA-CATGTAGGTTACATAAA-TT-AAAAG----T----A--AA-TTGG--G-AGA-AG--AGT-ACG-CTGCATG-CGGAT-GTTCT----CAG-CCGG-----------TG--AG--TC--TTTGTAA-------G---T-A--AAGGAAGACCA--TGTTTTTTTTATTTTCA----------------------------------C-AAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------GT------AAT-----GTCGa
gi|15 : tgagtgtaaatatcataatcaacatgtatgcataagt---G---T--TCTGA--G----CTGCA-AGT---GTAAATTATACATGTAAG----TATG---GTTGATC------A------AT-ACCA------CTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTT-----------------------------C-CCAA-----AA-C-GA--------T----AT---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-ATACTTTG--GAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-AA-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA--------AGT--TGCTG-TCA--A-AG-A-----AAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-TTC-ACACAC---AAG-A-------T-----TT---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CATCTTTTTTTGAAA----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACCTTGAT
gi|16 : tatttatttcaaacacagtatattagtgttaaaacttttaactggaaatataacattatttccacgaaa-AA-T----C----GAT------------A--GAAAGAA----C-A---G---A-----------AGAT-TC---C-T-C---ACATTT---------TCC-G--TTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AAACACATATACTTA-G--------------T---GT-TAA-------AAGTGAA--A----A----------C---------ATTATTTCCATGAA----A---G---T--CTTGA--GAGCTCTGCA-CGT---GTAAGTTATA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTT---AA-T-T-AC----ATTTCTT-----C-CTAA-----AA-A-TA--------T----AT---A-A---A-TTTTA-A--ACTC-AAACTCTG--TAGA---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGAC-AG--CT----AT----TA-----------------------------------------GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----AAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACATACCAAG-A-------T-----TT---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT------------T--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C--------------------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCA-TA-ATGG-----T--c
gi|17 : TAAATTG-A------AG----TATGT--GTTGATC------A------TTTGCAT------CTAGGAATGTTCAC-A-A---TA-CTT----AA-T-T-AC----ATATCTTT----C-CTAA-----AA-A-GA--------G----ATT--ACA---A-TGTTAAC--ACTC-AAACTTTG--TAG-----AC------TTC-T-GTC-CAA----GAGAGAC-CATTTT----AT----CAAA-GG-----T--TA-------GT---TAATTTATAGAGA-GC---AGC--TGCTG-CCG--A-CG-A-----CAAT--A-CT-TG-TTGGG-AGA----ATGAT-T------TTGGCC-ACACAC--GAACAA-------T-----ACCAGATATTT------CAAT--------ATT--------T-C-A--------CG-------T-------TT-------CT------ATATT--------T--AT--TTTATCACTAT-G----------A---------T-------------G----------T-----TTTGAAATG-TCT---A--C----------AATACAAAGCA--A--CAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--A----C----TCA--ATAATCTGAT
gi|18 : atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT----GAG-CAAGAT---TTGT--TA--AATATCATTTTCTAAAAAAA-AG---T-G--GGGGGGGGGTAACTA--------ATTTTTATAAGTAAAA--T--A----------------------------------CTGTAGAATTT-TCAA-------AT------AAATTAAAGTCGA-AAGTGT--GG--GAGA-AA-TG---GGA----TAAATTAATCTTAA-G-TCTA--TCA---ACA-TTT-------GAATTTC-ATAGAATATCT---ATGGA-TTCTTTAT--TATGCATNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGA-GTATGCCTTTTAATACAT----TATCTAAG-----------------------------------------------------AAGAA----C-A---A---A-----------ATAT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-A--TTCC-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A---------------aa
gi|19 : A-T----T----GAT------------A--GAAAGAAG---C-T---A---A-----------G-AT-TT---C-TTA---GCATTT---------TCC-G--CTCT-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------A--------------------------------------AA-------CAC--ATGTA----G----------T---------AG----------------A---G---A--TCTAA--G----TTGTA-TATAATGTAAGTTTTA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CGAGGAATAT-CACCA-A---TA-CTTT---AA-T-T-AC----ATATCTT-----C-CTAA-----AA-A--A--------T----AT---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-GATCTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TATT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTA-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----ATGGT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------TAAATAACAAGATTA--------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------C-------------A----------CTGATGTT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAaacacagtatactattgttaaaagtgatga
gi|2 : cATA----------A--ATGAGCAG-AC-----ATC--T-TGAATTA--C-----AC-----ACAGGAC-AGGCGTT-G-AGC-G------A---A------A----TG---------A-CCT-TA-TCTCGC---------ATAGAA---AG---AAAT-AG-TA-GGAAG----GG---A--AA-TAGAATG-GAA-AA--AAT-ATA-CGACGTG-CAGTT-G-TTG----TAA-CGAGAT---tg
gi|2 : AAAA--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAGAATTT-GCCA-------ATTACTCGAAA-----GTCGA-AAGCGA--GG--GGGG-G--TG---AGA----TATATTGATATCAA-G-TATA--TCA---ATG-TTT-------GAGTT-------------C---A-GAG-TTCTTTTATCTATCTGTCCTT----A-TAAG-CAAACTACATGTAT-G------CTAAGAATACAATGTAT--AT-TAC----AACCCACTTTAT-------TTCAT-TCTTGCATT-AG-GTCT-CCGTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTNN----NNN----N-NN-N----N----NNNNNNNNNNNNNNNG--GAAAGAA----C-C---A---A-----------AGCT-TT---C-TTC---AGATTT---------TCC-A--TTCC-TTGAT-TT-----ATT-----------------------T--------C------------------AATCACAGTACATTAAG--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----AACTATTTC--C---------AT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTACA-TGT---GTAAGTTTTA------AG----TACG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGAAATAT-CACCA-A---TC-CTTT---AA-T-T-AC----ATATCTT-----C-CTAA-----AA---GA--------T----AT---C-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CTGA---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGC--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACAAG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG---------------------C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--Aggtggggggggtgtttaaacgaaaaatatgtaatttattgtgcgaaatataccgtagaatttgccaattactcgaaagtcgaaagcgagggggggtgagatatattgatatcaagtatatcaatgtttgagttcagagttcttttatctatctgtccttataagcaaactacatgtatgctaagaatacaatgtatattacaacccactttatttcattcttgcattaggtctccgtctgatacagtatctaagaacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaagaaccaaagctttcttcagattttccattccttgatttatttcaatcacagtacattaagtgttaaaagataaactatttccatgaaagttctgagctacatgtgtaagttttaagtacggttgatcattgcaactagaaatatcaccaatcctttaattacatatcttcctaaaagatatcaattttacactcaaactttgctgaaacttctatcaagagagacagttattaaaggtgtagtagttagaagcagctgctgtcgaagagaatactgttgagattgattttgccacacaaggaacataccaagcatgttttaattta
gi|20 : ataaatgagcagacatcttgaattacacacaggacaggcgttgagcgaaatgaccttatctcgcatagaaagaaatagtaggaagggaaatagaatggaaaaaatatacgacgtgcagttgttgtaacgagatggtggggggggtgtttaaacga---G---T--TTTGA--G----CAGCA-CGT---GTAATTTATA------AG----TATGATAGTTGACC------A------TT-GCAA------TTAGGAATGT-CAGTA-A---TA-ATTT---GA-T-T-AC----ATT-CTT-----C-ATAA-----AA-A-GA--------T----AT---G-------TTTTA-C--ACTC-AAACT---------------------------GT--CAG----CAGAGTC-AG--CT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-AG-ACAATAGAAT--A-C--CG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TTTATGTACC-------A-ATCTACATATGT--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTCGGA---A----------T-----TT--------TCA---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGT-T--T-CCGCC-TA-ACAGTATA-T--AT-T-C----TTA--ATACTTTGATTT
gi|21 : cattaaatccacgaaaTTATGA---AA---TGTCTTTCCTA---------GTCTAAATGAGTG---GGATTCTAAATTAGTT---ACAG------A---A---T---A---ATT--CCTGCCA---ATACGG--GTATGC--AGATGCAGTATGTACATTTGTAT-A--GTGAGCAG-AC-----A-C----C--ATTAGGCAC--AAC---GAAAACAAT-A------------------------T--T--TA----GAG--------T-CCA-CA-CGTTTA---------GTA-AC---AT---GAAT-GG-TTTATAAG----T----G--AA-TAAA--G-AGA-AA--AAT-ATT-CAACATG-TGGGT-GATTT----TAA-CGAGAT---TTAT--TG--AATACA--TTTTTAAGAAAA-GGGTAT-A--AAGGAAGACTA--TA--TTTTTTATTTTCATAAGTAAA------------------------------------ATA--CCGTATAATTT-ACCA-------AT------AAA-----GTTCA-AAGCGT--AA--GGG--AAATG---AGA----TAAt
gi|22 : -AA---GG---AAAT-GG-TG-GGAAG----G----A--AAATAGA--G-TGG-AA--AGT-ATA-CAACACG-C-----ACTTTATG-TAA-CGAGATGA-TTGT--TG----------TCTTTGAAAAAA-AG---T-ATTAACAAAGAACA--TG-CT---------------GC---A--T--A----TGTAATTTATTGTG-C-GTA---ACATA--TCGTAGAATTT-GC
gi|22 : gACCCTCTTTATGT-A-ATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTTT-CCGTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccctctttatgtaattttattcttgcattgggtttccgtttga
gi|23 : gaaggaaatggtgggaaggaaaatagagtggaaagtatacaacacgcactttatgtaacgagatgattgttgtctttgaaaaaaagtattaacaaagaacatgctgcatatgtaatttattgtgcgtaacatatcgtagaatttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGGGATC-TAAATTAGTTTTCA-AATATGGAA---A---TC--A---ATTT-CCTGTATTT-ATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTGCAC-----A-G--TAC--ATTG--C-A--AACCTTGAACAT--T-A--CATT-GAA-C-G------A---TA-A--TG----CGG--------C-CCA-CA-TTATCC---------GTA-AA---A
gi|23 : A-AA--ACT-AT-----TATG-CGGGTTGTTTT----TAA-C-AGGT---TTAC--TGGAAGTATC--CTTAT-------------T-A--AATGAA--CCC--TA-TATTGTTAATTTCATAAGGAAAAAGT--AATGGTGTA-TTTATTGTGCC-GAA---ACATA---TGAAGAATTA-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGC-T--GG--GGAA-TAGAA---AGA----T-AATTAA-GTTAT-G-AATA--TCctattatgcgggttgtttttaacaggtttactggaagtatccttattaaatgaaccctatattgttaatttcataaggaaaaagtaatggtgtatttattgtgccgaaacatatgaagaattaaccaatgaagtagaaagctggggaatagaaagataattaagttatgaatatccaag
gi|24 : tgttgggatctaaattagttttcaaatatggaaatcaatttcctgtatttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgcacagtacattgcaaaccttgaacattacattgaacgataatgcggcccacattatccgt-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-CA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGcaag
gi|25 : tatgtaaaccaagcattgtctacttgacattctgagtgtacctcctgtttgatagtaatatatatctaagcattaattgttaaacagtcgcaagaaagaagaacaaccttatcaaatactgtttcaaatgccaggtcaagtaactaagaagtgccgcgaaaatttttgttttttcaggaaggtcgttgaattagaaacagtcattatccttcaaaatatatgacaggtgttagatccccaggactcaaaataaaaagtcactggctggta-------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------A---------A--A---AAG-CATGC-T--T-CCGAC-TA-ACAG-----T--AT-T-T----T
gi|26 : atatgtagaccaagcgttgtctacttgatattctaagtacctcttgtttgatagtatatctagcattccatgtaattgatacagtcccagtcccaagaaagaagacaacctttatcaatactgtttcaaatgccaaggtcaaagtactaaaatattaaaaaattgtggttgcttcagaagcgtttaagggtaagtgaatgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtaAT-C-CTACA---TA-CTTT---AA-TCT-CC----ATATCTTAATCTC-TTAC-----AC-A-AACCTCGCACT----AT---ACA---A-TTTTA-CCCACTC-AACCTTTG--TAGACACAAC------TTC-T-GT--CAACTTAGAGAGAC-A----T----AC----TAAATGGCCCCTTC-TC-------GATCCCAGT---AAGA-AAGC---AAT--CGCTGCTCA--ACAGCA-----GAATTCA-C--TCCTT--GCAGA----T-GAT-T------TT-GCCTGCAAACG-GAAA-A-------C-----ACTTT------------CAAGC-------ATC--------A-A-A--------CA-------T-------GT-------C-------ACATT--------T--TT--T---------TCA----------A---------CTT-----------C----------T-----TT--------TCG---AAAC----------A---------A--AA-CAAA-CATGT-T--TGCCGCC-TACACA------T--AT-T-C----TCC--ATACTTTGATTga
gi|27 : tatcacaGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACAATATGGAA---A---TCCCA---ATT--CCTGTAGTTTATACGG--ATATGC--AGATGCAGTATA----------------TGAGCTG-AC-----A-CAGTAC--ATTG--C-----ACCTTGAA---AAT-A--CATT-GAA-C-G------A---TAAC--TA----GCG--------C-CCA-CA-TATCCC---------GTA-AA---
gi|27 : ATG-CGGGT-GTTTT----TAA-CGAGGT---TTAC--TG--AGTATC--CTTTTAA-----------------ATGAACACCA--TA-TATTTTAATTT-CATAAGGAAAA--T--AAATGTGTAATTTATTGTG-C-GAA---ACATA--TTGAAGAATTT-ACCA-------AT------GAA-----GTAGA-AAGCGT--GG--GG---AAATG---AGA----TAAATctattatgcgggtgtttttaacgaggtttactgagtatccttttaaatgaacaccatatattttaatttcataaggaaaataaatgtgtaatttattgtgcgaaacatattgaagaatttaccaatgaagtagaaagcgtggggaaatgagataaat
gi|28 : gtgttgggatcctaaattagttacaatatggaaatcccaattcctgtagtttatacggatatgcagatgcagtatatgagctgacacagtacattgcaccttgaaaatacattgaacgataactagcgcccacatatcccgtaaactattT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------TTTA--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATT
gi|29 : gctgaataactaaagaaacatttttttccaaaggataactaagcttaactggtggcattgagcagagccagtcccaagaaagaagacaacccatatcaatactgtttcaaatgctactaaaataacgaaaaatggtgtctgtttttgaagcgtttgagagtgaataaactagaggcagtgattgctctttaagatccttattggtatgcaggacacaagaccaaaagtcaagcCTGA--G----CTGCA-CAT---GAAGGTTATA------AG----TACA---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-CACTA-A---T-------------------------TCTT-----C-CTAA-----AA-A-GA--------T----AT---A-C---A-TTTTA-T--ACTC-AAACGTTG--TAAA---AAC------CTC-T-GT--CAA----AAGAGGC-GG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAAC-A-GC---AGT--GGCTG-TTG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AGCATTTCCTG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--G---------T-A----------A---------C-------------A----------T-----TT--------TTTTTTA--A----------ATTTTT----G--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAa
gi|3 : ----GAT------------G--GAAAGAA----C-A---C---ATATATACCGGTATATCTT---C-TTC---ACGTTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----------------------------------------------------------------------------------------------T-TAA-------AAG--AT--A----GCCTTATTTC-C---------AT----------------GAATG---T--CCTGA--G----CTG
gi|3 : TGCAACAT---GTAAGTTACA------AG----CATG---GTTGATC------A------TT-GCAATTGCAACTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTTTTAAA-T-TTAC----ATTTCTT-----C-CTAAC----AA-G-GA--------T----AT---A-A---A--TTTA-C--ACTC-AGATGCTG--TAAA---AAA------TTC-T-GT--CAA----GAGATACTAT--TT----TT----TAAA-GG-----TG-TA-------A----TACA---TAGA-A-GCCATAAT----CTG-TTG--A------------------------CT--G-AGA----TTGCC-TTAAAAGTT-GCA-ACACGCG-G-AT-A-------A-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------CCTGTTTAA-ATT--------TAAAT--T---------T-A----------AG--------C-------------A----------T-----TT--------TTG---aataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattattgcaacatgtaagttacaagcatggttgatcattgcaattgcaactaggaatatcactaatactttttaaatttacatttcttcctaacaaggatataaatttacactcagatgctgtaaaaaattctgtcaagagatactattttttaaaggtgtaatacatagaagccataatctgttgactgagattgccttaaaagttgcaacacgcggataaaccaagatttcaacatttcctgtttaaatttaaatttaagcatttttgtttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : gatggaaagaacacatatataccggtatatcttcttcacgttatccgttcctttatttttaaaagatagccttatttccatgaatgtcctgagctgaataactgaagaaacaattttcaaaggagaactacgcttacttgtacagtctaagattaatttttcaccgacatataattatatgtatctttatctattttctaattatT----T-CA-T----T----GAT------------G---AAAGAA----CCG---A---G-----------ATAT-TTATTC-TTC---ACATTA---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACTGTATACATGATTTTTAATACATGT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------GT----------------tttgttgctacgatgttcaaagaacctcttgtcaatgttgatagtatatctagcattggtacaataaaaagactacccatattaatatattggttcaaattccaaggttgaaaaaatgttgtctgttagacgcgtttgaaaatgagtaaacttgtaacagtgattgctcttaaagagtataaatttcaggacacaatatcaaaagtcaggctggaatttttcgacaaacatgcttccgttgcgcctatactttgatt
gi|30 : cat---T--TCTAATTG----ATGTA-CGT---GTAAGTTATA------TG----CATG---ATTGATCTTTGCAA------TT-GCAA------CTAGGAA-----ATTG-A---TA-CTTT---Atatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttttctaattgatgtacgtgtaagttatatgcatgattgatctttgcaattgcaactaggaaattgatacttta
gi|31 : catttcattgatgaaagaaccgagatatttattcttcacattatccgttcctttatttactgtatacatgatttttaatacatgtcaatgttaaaagataacgttatttccatgaaagtcttgagctgaatgactaaagaaagatttttttttcaaaggaaaactattcttaactggtggtcgtaatctgtacaatataggatttgttAAA--------TAT--AT-TAC----AAAC-TCATTAT-T-TCATTTTAT-TCTTGCATT-GG-GTGT-CCTTCTGATACAG----TATCTAAGAACCTTT----CATCAACT-AA-T----T----AAT------------G--GAAAGAA----C-A---A---A-----------AGTT-TT---C-TTC---AAATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----ATT-----------------------T--------T------------------AAACACAGTATATTA-G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------CTTTATTTCCAT----------------GAAAG---T--TCTGA--G----CTGCA-CAT---GTAAGTTATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-CACTA-C---TA-CTAT---AA-T-T-AC----ATTTCTT-----C-CTAA-----AA-A-GA--------
gi|32 : ct---A--C----------A---------A--AATCAAAGCATGCCT--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTTGAT
gi|33 : cattgtctacttgatattctaagtacctctttttgatagtatttagccttaattgtacagtcccaatcccaagaacgaagcaacccttatcaatactgtttcaaatgccagggtcaagtactaaaatattcgaaaaatttggtttgtttcagaagctttgagtgaattagagacagtgattgccttcaagagtatattgatcggtattgatcctcaggacTTAATA---A-A-TGTA--TT--------TTT-------GAATTTC-ATAGGAAACTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTA-A-TAAA-CACACTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--AT-TGC----AACCCTTTTT--CT-TTATTTCAT-TTTTGCATT-GG-GTGT-CTTTATGAAAGTG----TATCTGAAAACCTTT----AAT----T-AA-T----T----AGT--------------------------T-G---A---T-----------ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCA-TTTAT-TT-----c
gi|34 : ---TAGA-G-AC---AGT--GATTA-TCTTCA-AG-A-----GTATTGA-C--CC-TT------A----TTGAT-C------TC-AGG-ACACAAG--------------------AT---------------CAAA--------AGT----------C-G--------CG-------C-------TG-------T-------A-ATT--------T----------------T-A----------A---------C-------------------------------------------------C----------A---------A--A----AA-CATGC-T--T-CCCAC-TA-CCAG-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGAcccgaatacgcgattttaaatgcaaataataactagttagtgctaaaagata
gi|35 : gtaccagtcccaagaaagaagacgacacatatcaatattgctccaaatgcaaaggtcaaaccactaaaacatcaaaaaatgtcgtctgtttgagaaaagcgctttgagtgaagtgggtaggcctaaacTA------T-G--------AAAT--------TATTTAT-TA-----AGTCATCTTTTTAT-TGCTGTTGT-TGTTGCATT-GG--TGT-TTTGTTGATACGC----TATCCAAGAACATTT-------------AA-T----C----TAT------------T--GAAAGAA----C-ACATA---G-----------ATAT-TT---C-TTCTTCGCATTG---------TCT-G--TTCA-TTTAT-TT-----ACT-----------------------CTGTGTACAC------------------A---------------G--------------T---AT-CAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATA---------------A---G---T--TCT
gi|36 : tcatatatttattttttcatttt---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAC-AG--TT----AT----TAAA-CA-----TG-CA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-T--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCT-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAGATTTCAACATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------A---------CATTTTTGGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCT-TG-ACAG-----T--AT-T-CTCTATCA--ATATTTTGATTTaccttaaactgaataactgatgaaatatttcgttcgtatttcatcct
gi|37 : ATTGTTTGAATAATGCTAACAGGAATTAATATTAT--A--AGAGAGTAAAACAAAAA---AG------TTAGTTGA-A---CA---TGTTTTGAATT---------GTCCAAAAGAGTGTTAGGCTTTTAAATTAGTT---AC----------------T---A---AAG--CCTGTAA---ATACAG--ATATGC--AGATGCAGTATATA--------T-A--ACGAGTAG-AC-----A-ttc
gi|38 : aatgtaaatatcataatcaacatttatgcataagaA--------T----AT---C-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAACGTTG--TAGA---AAC------TTC-T-AT--CAA----GAAAGAC-A---TT----AT----CAAA-GA-----AG-CA-------G----TAAT----------------GT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----GAAT--A-C--TG-TT--G-AGA----TTGAT-T------TT-GCA-ACACATG-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AG-------CA-------T-------TT-------C-------A------------------------------------------------------------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--C-CCGTC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATata
gi|39 : AA-----AA-A-TA--------T----AT---A-A---A-TTGTA-C--ACAT-AAACGTTG--TAGA---AAA------TTA-T-CT--CAA----GAGATAC-TT--TT----GT----TAAA-GA-----CG-TT-------G----TACT---TAGA-A-GC---AATA-TTCTG-CCG--A-AA-A-----GAAT--A-C--TG-TT-----------------T------TT-GCC-ACACACA-GAAC-A-------A-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-C-AACATTTCACG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------C---------C-------------T----------T-----TTTGAAATACTCG---T--C----------A---------A--A--CAAa
gi|4 : A---A---T---A---ACT--CCTCTAA---ATAGGGAAGTTAGCCCAGCGGCA-TATATA--------TCA--CTGGAGAG-AC-----A-A--T-C--AT----------AT---AAAAAAAA-----CGTT-G-A-C-CCATAACA---T--CACTA----TTG--------A-CCA-CAATCTCGCAGATGGAGGGTG-AA---AG---A----------GGAAG----GTTAGACTAA-TGGATTG-CGT-AAGGAATCATATCGACATGGCAGGT-TTTCTGTTATAATCGAGATGTTTTAC--TG--G-------TTTATGGGAAAA-GG---TTA--AACGAAGAA-A--CA-TT---------------GCAGAA--T--------GTAATTTATTGTG-CCGAA---ACATAGACCGTAAAATTTTGCCATGGACGAAT------AA-------TTAA-A----T--GATAAAAA-AAATGTAAAGAATGCTAAATTAATATCA----TA-A--TCACATATGATTT-------GTGTTTCTATGAAATATTCTGCATGAG-TTCTT-ATTCTATCTGTCCTA----AATAAGGCAAGCTA------T-G------CCAAAAA-------TAT--GT-TTC----GTACTTTTTTAACC-TTATTTTATCTCTTGCATT-GG--TGT-CCGTCTGAAACAAA---TATCTAAGAAC-TTT----CAT----TGAA-T----C----AAT------------GATGAAAGAA----C-C---ATAGA-----------AGAT-TT---CCTTC---ACATTT---------TCCGG--TTCCTTTTAT-TT------TT-----------------------T--------C------------------A---------------
gi|40 : taaaacaaatatattcaatgaatataagtatgtgttttgaaatagatctaaaagtagatgtgtaggggaagtctttaaattagtttacgttaattcgtgtagttaggcgtattatgcttaactagcaatgggtaattT-----ATT---------------------------------------------------A---------------G--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAA------CTACGAATAT-CAacacagtatttca
gi|40 : AA-------AAG--AT--A----A----------C---------ATTATTTCCAT-------G---AATAT--TCTGA--G----TTGCA-CGT---GTAAGTCATA------AG----TATG---GTTGATC------A------TC-GCAA------CTACGAATAT-CACnaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcac
gi|41 : tattagtgttaaaagataacattatttccatgaatattctgagttgcacgtgtaagtcataagtatggttgatcatcgcaactacgaatatcanT--T---------T-A----------A----------------------------------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--T--CA-----TAC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AC-T-C----CCA--TTACTTTGATT
gi|42 : ctataatatcgaaaaatgttgtctattacaagttaatagattgaaagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacggc-T-T-TC----ATTTCTT-----T-TTGG-----GAGA-GA--------T----AT---G-ATAGA-TTTAA-C---CTC-AG---TTGAGCAGA---A--------TTC-T-ACTCCAG----GAGAGGT-AG--TT----ATGTTGTTAA-GG-----TG-TG-------------------TAGA-G-GC---AAT--TTCAA-TCA--A-GG-G-----GAGC--AAC--TA-TT--C-AGACTGTTTGAT-T------CT-A---AAACAAG-AAAC-A-------T-----AC---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------c
gi|43 : tATTCAATAATGGTAACCAGAATGAATG--ATCTA--AGAAAATAAA-CAAACA---AT------TAATTTAT-A---GA---TGTTTT-AACA---------GTATAAAAGAAGGTTGGGAGCTT---------------ATATGGAA---ATCTT---A---ATC--CCTGTAA---ATACAG--GTATatat
gi|44 : tattataagttagcgttaataacataatcaacataaTT----AAT----T-AA-T----TT---GAT------------G--AAAAGAA----C-A---A---G-----------ACGT-GT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAC-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATATTGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ATAATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCTGA--G----CTGCA-
gi|45 : atatctatataaccttataatataataA------AA----CATG---GTTTATC------A------TT-GCAA------CTAGCAACAT-CACTA-A---TA-TTTT---GA-T-TGAC----ATTTTTT-----CTTTAAAAATTAA-A-GA--------T----CT---G-A---A-ATTTA-C--AC-------------TAAA---AAC------TGCAT-GT--GA------ACAGAC-AG--TT----GT----TAA-------------C-------G----TACT---TGGA-A-GC---AAT--TACTG-TCG--A-AT-A-----GAAt
gi|46 : gcCAATTAAACAAACATAAAT--------AGCTAT-ATACGAATATGTTGTAAATC---------GTCAAAAAGATTAATGAGCCTCTAAATTAAAT---ACAACATTGAA---A---TCCTA---ATT--TCTGTAA---ATACGG--GTATGC--AGCTGCAGTATATA--------T-A--ATAAGCAG-GC-----A-C--
gi|47 : T----T-AA-T----T----GAT------------G--GAAAGAG----CAG---A---G-----------ATAT-TT---C-TTCTTCACATCA---------TGC-G--TCCC-TTTAT-TT-----ATCGTATACACGATTTTTAATACATAT--------C------------------A---------------A--------------T---GT-TAA-------AAG--AT--A----A----------C---------AT----------------aaat
gi|48 : tcgaaatgtttagcaatacC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA----ATGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AA---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--Atattttcatgactgttctcagctga
gi|49 : cgcaaagcC------TTC-T-AG--CAG----GAGTGTC-AA--AA----AT----TAAA-GG-----TG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GA---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-A-----CAAT--A-CTGTG-TT--G-AGA-----TGAT-T------TT-GCC-ACACACG-GAAC-A-------T-----AA---------------CAAT--------ATTTCAATATAT-C-A--------CG-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--A
gi|5 : cgcaaagcAAG----G----A--AA-TAGA--G-AAA-AA--AAT-ATA-CAATATG--------TCTA----TAA-CGAGAT---TTAA--TG--ACTATC--TTT--AAGAAAG-GC---T--------------------TTTTTTAATTTTCATAA-TAAAA--T--A----------------------------------CCGTAGAATTT-GCCA-------AT------ACA-----GTCGA-AAGCAT--GG--GGGA-AA-TG---TGA----TAAATTAATTTCAG-G-TATA--GCA---ACA-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNN-NNNNNNN------N-N------NNNNNN--------NNN--NN-NNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNN-------AT-CCTTCAGGTACAGCGCTTATCTAAGAACCTTC----CAT----T-AA-TCAATT----GAT------------G--GAA-GAA----C-A---A---A-----------ATAT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TT-----ATC-----------------------T--------C------------------A---------------AACACAGTATACTTAT---GT-TAA-------AAG--AA--A----A----------C---------ATTTTTATGAA-------A---G---T--TCTGA--G----CTGCA-CGT---GGAAGTTATA------AG----TGTG---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-AACTT-A---TAACTTT---AA-T-T-AC----ATTTCTT-------CTAA-----AA-ATGA--------T----AT---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--TAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TT----AT----TAAA-GG-----TG-CA-------G----TAGT---TATA-A-GC---AGT--TGCTG-TCG--A-AG-G-----CAAT--A-C--TG-TT--G-AAT----TTGAT-T------TT-GCC-ATACACG-GAAC-A-------T------C---------------AAAT--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------C-ATC--------T--AT--T---------TCA----------ATTTTTTTTTT-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-C--------------------AT-T-C----TCA--ATGCTTTAATT
gi|50 : tt-------------A----------T-----TA--------TCG---A--CCAAA------A---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--Ac
gi|51 : ttgaattagaaacagtgattacgattcaaaagtatatgaccggtattgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaTAAATCAGTT---ACAATATAGAAATGA---T---A---ATT--ACTGTAC---ATACGG--GAATGC--AGA---AGTATATCCT------T-A--GTGAGCGG-AT-----A-C--T-G--ATTA--G-C--Agattttatttgca
gi|53 : ctaaggaagcggaataA-TGT---GCAAGTTATA------AG----CATG---GTTTGGC------A------TT-TCAA------CTAGGGATAT-CACTA-A---TA-CTTT---AATT-T-AC----ATTTCTT-----C-CAAA-----AA-A-GA--------T----AT---A-A---A-TTcaatggacgat
gi|54 : ttattagaagtctccatatatAATTACA------AA----TGTA---G--GAAT------A------TT-GCAA--------AGAAA----CACAA-AATATA-TTTC---AA-T-TTAC----ATTTCTT-----C-ATTG-----AA-A-GA--------C----A----A-AGT-A-TTTTA-C--GCTG-AAACTTTG--TAGA---AAA------TTc
gi|55 : agT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------G-ATTTTCAAGACA---------C-------------A----------TA----GT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATTC-TAAT-TCTCC-TA-AC-G-----T--AC-T-C----TCA--ATACTTTGATTtgg
gi|56 : tcagagtatatgactaACTGATTGAATAATGGTAACAAGAATTAATA--AT--ATTAGACAATAA----------------------GTTAT-A---GA---TGATTTGAatttt
gi|57 : aaacatcacaattatcaggtatatgcatcaaggt---------------CAAC--------ATT--------T-C-A--------TG-------T-------TT-------T-------A-ATT--------T--AT--T---------T-C----------A---------CTTTTTTGTTTTA-A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-AATGC-T--T-CCGCTATA-ACAG-----T--AT-C-C----TCA--ATACTTCGATTTttg
gi|58 : tt----AT---A-T---G-TTTTA-A--ACTC-AAACGTTG--TAGA---GACAGACAGTTG-TAGA--CAG----GAGAGAC-A------------------A-GA-----TG-TA-------G----TCCT---TAGA-A-GT---AAT--TGCTG-ACA--A-AA-A-----AAAT--
gi|59 : -------------A----------T-----TT--------TTG---A--C----------C---------A--A---AAG-CATGC-T--T-CTACC-TA-TCAG-----TAGATAT-T----TCA--AT
gi|6 : attgcagattcttgatcgatcttcacaccaaaagtagggctgtaTTTATTTTC-A-GAAGTAAAATA--CCGTTGAATCCAGCCA-------AT------AAA-----CTCGA-AAGCGTAGGG--GGAA-AAATG---AG-----TAAA-TAATTTCAA-GTTATAGCCCA---ATG-TTCTGCCACAGATCTTC-CT--AAAAGTC---ATAGG-TT-TTTATTTTATCT-TCCTT----A-TAAGCCAAACTA------TGG------CCAAAC--------CAT--ATATAC----TAATCTCTGCATGT-TTATTTTA--TGTTGCA---GGAGTGT-CCATCTCATACAG----TATTTTCGAA-ATTT----TATAATGT-AAGT----T----GAT------------G--GAAAGAA----C-----A---A-----------ATAT-TT---CTTTC---ACATCT---------T-C-G--TTCC-TTTAT-TT-----ACT-----------------------TAAACA---C------------------A---------------G--------------T---ATATGAGTAGTGTAAG--GT--A----T----------T---------A-----------------A---G---T--TTTGA--G----CTGTA-CAT---GTTAATTATA------AGTATATATA---GTTGATC------A------TT-GCAA------CTAGGAATAT-CACTA-A---TA-CTTT---AA-T-T-AC----ATTTCTT-----C-CTAA-----AA-A-GA--------T----AT---A-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAACTTTG--CAGA---AAC------TTC-T-GT--CAA----CAGAGAC-AA--TT----AT----TAAA-GG-----AG-TA-------G----TAGT---TAGA-A-GC---AGT--TGCTG-TCA--A-AG-A-----GAAT--G-C--TG-TT--G-AGA----CTGAG-T------TT-GCA-ACACACG-GAAC-A-------T-----AC---------------AAAG--------ATT--------T-CAA--------CA-------T-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-A----------G---------CATTTCTTGAA---A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGC-T--T-TTAAC-TA-ACAG-----C--AT-T-C----TCA--ATACTTTGATTTt
gi|60 : -------------A----------T-----TC--------TCG---A--C----------C---------A--A--AAAA-CATGC-T--T-CCACC-TA-ACAG-----T--AG-T-C----TCA--ATACTTT
gi|61 : gttgatccccaggactcaaaataaaaagtcaggctgtaT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC-AA-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTT
gi|62 : gacgtT--T---------T-G----------A---------A-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CCGCC--A-ACAGCGATAT--AT-TCC----TCATTATATTTactgtactgctt
gi|63 : cgtTAAGTAAAA--T--AGA--TTTGATTTATTGCG-C-GAA---ACATA--CCGTAGAATTT-GCCG-------AT------AAA-----GTCGA-TAGTGT--GT--GGGA-actgtactgctt
gi|64 : ct--TG--AATAAC--TATTTATGAAAAAGG---T-ATCAAGGAAGACCA--TA-ACTTTTTATTTTCAGGAGTAAAA--T--A----
gi|67 : tAA-A-TATAC-TCA---ACGGTTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAGTTTCTTTATTCTActgc
gi|69 : tTCAA-A-TATA--TCA---ACG-TTT-------GAGTTTC-ATAGAAAATTC---ATGAG-TTCTTTATTCTAT
gi|7 : ATTTATTGTG-C-AAA---ATGTT--TCGTAGAATTT-GCCA-------AT------AGA-----GTTGA-AAGCGT--GG--GGGA-AA-TG---AAA----TGA-TTGATA--AATG-TATT--TCA---ACG-CTT-------GAGTTCC-ATAGAAAGTTC---ATCAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTTTTATA-TAAA-CAAACTA------T-GTATATGCCAAAA--------TAT--AT-TAC----ACCCCT------GT-TTATTCTA-------CATT-GG-GCGT-CCTTATAATATAG----TATCTTA-------------------T-AA-TG---T----GAT------------G--GAAAGAA----C-A---A---G-----------ACGT-TT---C-TTC---ACATTT---------TCC-G--TTCC-TTTAT-TTACACGACT-----------------------T--------CAAATACATAATGAATATTA---------------G--------------T---GT-GAA-------AAG--AT--A----ACCATTATTTCC---------AT----------------GA--A---TAATCGGA--G----CTGCA-CGT---GTA-------------------TACG---GTTGATT------A------CT-GCAG------CTAAGAATAT-CACTG-A---TA-CTTT---GATT-T-AC----ATTTCTT-----C-CTAA-----AA-A-GA--------T----AT---A-A---A-TTTTA-C--ACGCAAAACGTTG--TAAA---AAT------TTC-T-GT--CAA----GAGAGAA-AG--TTATTAAT----TAAA-GG-----TG-TAC------A----TAGT---TAAA-A-AC---AGA--TGCTG-TCG--A-AT-G-----GAAT--A-G--TG-TT--G-AG-----TTGCG-T------TT-GCC-ACACGCG-AAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------T-CAA--------CATTTCATTT-------TT-------C-------A-ATT--------T--AT--T---------T-T----------A---------T-------------T----------T-----TT--------TC-------C--------------------------TTAA-C---T-T--T-CCGCC-TA-ACAG-----T--AT-T-C----TCA--GTACTTGGAT
gi|70 : ---A--C----------T---------A--A--CAAA-CATGC-T--T-CTATC-TA-TCAG-----T--AC-T-C----TTA--GTACTTTGATT
gi|71 : ATGC-T--T-CCACC-TA-ATAG-----T--AT-T-C----TCA--ATAATCTGATat
gi|8 : --AT--A--AGACAATAAAACAAATA---AT------TAACTAAT-A---GA---TGTTTTGAATA---------GTCTAAAAGAGTGTTGGGATCCTAAATTAGTT---ACGATATGGTA---A---T---ACAAATT--CCTGTAA---ATACGG--GAATTC--AGGTGCAGTATAAA--------T-A--GTGAGCAG-AC-----A-T--T----GTAA--T-CTGAAC---AAAAGAAAT-G--CGTT-G-AAC-A------AATTT--T--CA----TG---------A-CCA-CA-TCTTGC---------ATG-GA---AG---GAAT----TT-GTAGGACGGG----A--AA-TGGA--GTGGATAA--AAT-AAA-CGATATG-CATTT-GTTTT-----AA-CGAGAT---GTATGTTG--TGTATG--GAAATAAAAATG-CA---T-A--AAGGAAGAACA--TG-TT---------------GTAAA-----------TCTAATTTATTGTG-C-GAA---ATATA--CCGTAAAATTT-GCCA-------AT------TAA-----GTCGA-AAGCA----G--GTGG-AAATG---AGA----TAAATCAATATCAA-G-TAAA--ACA---ATG-TTT-------GAGTTTT-ATAGAAAATTA---ATGAG-TTCTTTATTCTATCTGTCCTT----G-TAAG-CA----------------------AAAA--------TAT--AT-TAC----AACC------AATT-TTATTTTAT-TCTTGAATT-GG-GTGT-CCGCCTGATACTG----TATCTAAGAATCTTT----CAT----T-AA-T----C----AAT------------T--G-----A----T-G---A-----------------AT-TT---C-TCC---ACATTT---------TCC-G--TTatgacaaa
gi|9 : TGTA-CGT---GTAAGCCATA------AG----CTTG---GTTGATC------AATGCAATT-ACAA------TTAGGAATAT-CACTA-A---TA-TTTT---AA-TGT-AC----ACTTCTT--------TAA-----AA-A-GA--------TTTATATGCGA-A---A-TTTTA-C--ACTC-AAATATTG--TTGA---AAAA-----TTC-T-GT--CCA----GAGGGAC-AT--TT----GTG---CAGG-AG-----TGATACTCGAATG----TAAT---TA------C---AGT---ACTG-TCG--A-AG-A-----TAAT--A-C--TG-TT--G-AAC----TTATT-T------CT-GTC-ATACACA-GAAC-A-------T-----AC---------------CAAG--------ATT--------TAA-A--------CA-------T-------TT-------C-------A-ttcaaacacagtatataagttttaagatt
gi|9 : aatgaa-------------A----------T-----TT--------TCG---A--C----------A---------A--G--CAAA-CATGC-G--T-CCGCC-CA-ATAA-----T--AC-G-C----TCA--CTAtgtttgtggcctagtacagttttatatgtagatcaagtattgtttgcttaatattctaaacacctcttgtttgatagtatatctaggcttggtgcaacgttagtctcaagaaagaagacgacccatatcaatattggttctaataacaagatcaaactgctataatattgaatattgttgtcagagtgagtaattagtcttaaaaaaatgtctaacccttattgttttgcaggttatacgatcaaaagtcaggctgtaattttcgacaagcaaacatgcgtccgcccaataatacgctcactagat
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52 ): CCATGAGTGTCCCCAGCTGAATAACTGAAGAAACATTTTTCTGAGGAGAACTACTGTTATACGCACACTTGGTGTCAGTTTTACACCGAATCATGTTTATATAATCTCTA
Unaligned ( gi|65 ): ACATACCAAGATTTCAACTATTTTGGTTGTAGCAGCAATTTTATATGTACACCAAGTAT
Unaligned ( gi|66 ): TATGTAGACCAAGCATTGTCTACTTGATATTCTGAGTGTACCTCCTGTTTGATAG
Unaligned ( gi|68 ): TAATTTATTTCCAATTTCCGAGCTCCAGAGAGAGGGCCATAGCAAAGGAAACAAA