lowQualScore                  :                                     22222222222222                     1111111111                11111111                                             
lowQualScore                  :           1    1 1     3333    3    44444444444444 55555  1       22   6666666666        1  1 22 00000000  22    666666666  3333     1 1              
lowQualScore                  :           .    . .     ....    .    .............. .....  .       ..   ..........        .  . .. ........  ..    .........  ....     . .              
lowQualScore                  :           8    7 7     5555    3    33333333333333 88888  7       33   0000000000        7  7 33 33333333  33    777777777  5555     7 7              
consensus                     :      AAATT-GTAG-C-TCTCC----GGAA-AAAA----------T---A-----TG-TTGACAG--ACC-----G---GTCTGTCAA-CA-T--A--A-----TT--TTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAG
Reference ( gi|7 )            :      AAATT-GTAG-C-TCTCC----GGAA-AAAA----------T---A-----TG-TTGACAG--ACC-----G---ATCTGTCAA-CA-T--A--A-----TT--TTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAG
gi|3                          :      AAATTTGTAG-C-TCTCC----GGAA-AAAAAAA-------T---A-----CG-TTGACAG--ACC-----G---GTCTGTCAA-CA-T--A--A-----TT--TTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAG
gi|3                          :    gcAAATT-GTAG-C-TCTCC----GGAA-AAAA----------TT--A-----TG-TTGACAG--ACC-----G---GTCTGTCAA-CG-T--ATTT-----TT--TTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAAATTTGC
gi|1                          :      AAATT-GTAG-C-TATCC----GGAA-AAAAA---------T---A-----TG-TTGACAG--ACCAGTCTG---GTCTGTCAA-CA-T--A--A-----TT--TTGT---------CC----GAAGA-G-CTACAATTTTGCAGtgcag
gi|1                          :    caAAATT-GTAG-C-TCTTC----GGAC-AAAA----------TT--A-----TG-TTGACAG--ACCAGACTG---GTCTGTCAA-CA-T--A--T-----TT--TTTT---------CC----GGATA-G-CTACAATTTTGc
gi|2                          :      AAATT-GTAG-T-TCTCC----GAAA-AAAA----------TC--A-----TG-TTGACAG--GCT-----G---TTCTGTTAA-CA-T--A--A-----TT--TTTT---------CC----GGAGA-G-CTAAAATTTTGCAGtgcagc
gi|2                          :      AAATT-TTAG-C-TCTCC----GGAA-AAAA----------TT--A-----TG-TTAACAG--AAC-----A---GCCTGTCAA-CA-T--G--A-----TT--TTTT---------TC----GGAGA-A-CTACAATTTTACAGtacag
gi|6                          : ctgcaAAATT-GCAG-C-TC--C----GGAA-AAAACT--------T---A-----TG-TTGACAG--ACC-----G---GTCTGTCGA-CA-T--A--A-----TTTTTTTT---------CC----GGAAA-G-CTACAA
gi|5                          :      AAATT-GTAGGC-TCTCG----GAAA-AAAA----------T---A-----TG-TTGACAGTCTCC-----G---GTCTGTCAA-CA-T--AT-T-----TT--TTTT---------TT----GGAGA-G-CTAAAATTtgcagc
gi|9                          :      AAATT-GTAG-C-TCTCC----GGAA-AA----------------------TA-TTGG------------------TCTGTCAA-CA-T--A--A-----TA--TTTT---------CC----GGAGATG-CTAtgctagc
gi|16                         :      AAATT-ATAG-C-TCTCC----GGAA-AAAA----------T---A-----TG-TTAACAG--ttcagc
gi|12                         : ctgcaAAATT-GTAG-C-TCTCCTGTTGGAATAAAT----------T---A-----TG-CTGACAG--ACg
gi|17                         :      AAATT-GTAG-C-TCTCC----GGAAAAAAA----------T---A-----TG-tgcagct
gi|15                         :      AAATT-GTAG-C-GCTCC----GGAA-AAAAT---------T---T-----TGTTTGACAG--AAC-----G---tgcagct
gi|11                         :     cAAATT-GTAG-C-TCTCT----GGAA-AAAAGAAAAAAAATT---AT----TG-TTGACAG--CCC-----G---
gi|5                          :       AATT-TTAG-C-TCTCC----AAAA-AAAAAA--------T---A-----TG-TTGACAG--ACC-----GGAGA-CTGTCAA-CA-T--A--T-----TT--TTTT---------CC-----GAGA-GCCTACAATTTTGCtgcagc
gi|4                          :       AACT-GT-----TCCCA----AAAA-AAAA----------T---AAATTGTG-TTGTCAG--ACT-----G---ATCTGTGAA-CA-TTAA--A-----TT--TTTT---------T-----GGAGA-G-CTACAATTCTGCtagc
gi|4                          : ctgaagAATT-GTAG-C-TCTCC-----AAA-AAAA----------TTTAA-----TG-TTCACAG--ATC-----A---GTCTGACAA-CA-C--A--ATTTATTT--TTTT---------TT----GG-GA-----ACAGTTCTTCAG
gi|13                         :       AACT-GTAG-C-TCTCG----GGAA-AT------------T---A-----TG-TTGAGAG--ACC-----G---GTCTctgc
gi|8                          :      tAACT-ATAT-C-TCTCT----GACA-AAAA----------T---A-----TT-TAGACAA--A-------G---ATCTGTCCC-AA-T--A---------T--TTTT---------TC----AGAGA-G-ctgcag
gi|10                         :       AACT-GTAG-C-TCTCC----AAAA-ACAT----------T---A-----TG-TTGACAG--ACctgcagct
gi|14                         :    aagAACT-GTAG-C-TCTCC-------A-AAAT----------T---A-----T--TTGACAG--ACC-----gggagggtgcgtcaaatgt
gi|6                          :         TT-GTAG-C-TTTCC----GGAA-AAAAAAT-------T---A-----TG-TCGACAG--ACC-----G---GTCTGTCAA-CA-T--A--AG----TT--TTTT---------CC----G--GA-G-CTGCAATTTTGCAGctgtagcta
gi|9                          :             TAG-CATCTCC----GGAA-AATA----------TT--A-----TG-TTGACAG--ACC-------------------------A--A-----TA--TTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTTCAGc
gi|8                          :               G-C-TCTCT----G-AA-AAAA----------T---A-----TT-GGGACAG--ATC----------TTTGTCTA-AA-T-----A-----TT--TTTG---------TC----AGAGA-G-ATATAGTTCTGCAGc
gi|13                         :                                                                 AG--ACC-----G---GTCTCTCAA-CA-T--A--A-----TT--T------------CC----CGAGA-G-CTACAGTTCTGCAGct
gi|15                         :                                                                     tCC-----G---TTCTGTCAAACA-A--A--A-----TT--TTTT---------CC----GGAGC-G-CTACAATTT
gi|10                         :                                                                      CC-----G----TCTGTCAA-CA-T--A--A-----TG--TTTT----------T----GGAGA-G-CTACAGTTCT
gi|14                         :                                                                       a-----G---GTCTGTCAA--A-T--A--A-----TT--TT-----------------GGAGA-G-CTACAGTTCTGTAGgagggtgcgtcaaatgt
gi|12                         :                                                                                  TCTGTCAG-CA-T--A--A-----TT--TATT---------CCAACAGGAGA-G-CTACAATTTTGCAGcta
gi|16                         :                                                                                  gCTGTTAA-CA-T--A--------TT--TTTT---------CC----GGAGA-G-CTATAATTTTGCAGct
gi|11                         :                                                                                   CTGTCAA-CAAT--A--A-----TT--TTTTTTCTTTTTTCC----AGAGA-G-CTACAATTTTGCAGg
gi|17                         :                                                                                      cggg-CA-T--A--T-----TT--TTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAGc





Alignments
lowQualScore                  :                              22222222222                                                                                  
lowQualScore                  :           5           0      99999999999            77777   33       2  2 33  2      999999999  5555     2 2              
lowQualScore                  :           .           .      ...........            .....   ..       .  . ..  .      .........  ....     . .              
lowQualScore                  :           0           9      00000000000            11111   44       4  4 22  4      444444444  0000     4 4              
consensus                     :      AAATT-GTAGCTCTCCGGAAAAAAA--T-A-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAG
Reference ( family-1954 )     :      AAATT-GTAGCTCTCCGGAAAAAA---T-A-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAG
gi|1                          :      AAATT-GTAGCTATCCGGAAAAAAA--T-A-----TGTTGACAGACCAGTCTGGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTGT---------CC----GAAGA-G-CTACAATTTTGCAG
gi|10                         :                                                 caCC-----CGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TGTTTT----------T----GGAGA-G-CTACAGTTCTc
gi|11                         :                                                   aC-----GGG--CTGTCAA-CAAT--AA-TTTTTTTTCTTTTTTCC----AGAGA-G-CTACAATTTTGCAGagggtgcgtcaaatgt
gi|12                         :                                                           GT--CTGTCAG-CA-T--AA-TTTATT---------CCAACAGGAGA-G-CTACAATTTTGCAGc
gi|13                         :                                                AGACC-----GGT--CTCTCAA-CA-T--AA----TTT---------CC----CGAGA-G-CTACAGTTCTGCAGct
gi|14                         :                                                    t-----GGT--CTGTCAA--A-T--AA-TTTT-----------------GGAGA-G-CTACAGTTCTGTAG
gi|15                         :                                                   CC-----GTT--CTGTCAAACA-A--AA-TTTTTT---------CC----GGAGC-G-CTACAATTTcta
gi|16                         :                                                             --CTGTTAA-CA-T--A--TTTTTT---------CC----GGAGA-G-CTATAATTTTGCAG
gi|17                         :                                                                      -CA-T--AT-TTTTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAGg
gi|2                          :      AAATT-GTAGTTCTCCGAAAAAAA---TCA-----TGTTGACAGGCT-----GTT--CTGTTAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGA-G-CTAAAATTTTGCAGct
gi|3                          :      AAATTTGTAGCTCTCCGGAAAAAAAAAT-A-----CGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAGtacag
gi|4                          :     gcAACT-GT---TCCCAAAAAAAAA---T-AAATTGTGTTGTCAGACT-----GAT--CTGTGAA-CA-TTAAA-TTTTTT---------T-----GGAGA-G-CTACAATTCTGC
gi|5                          : ctgaagAATT-TTAGCTCTCCAAAAAAAAAA-T-A-----TGTTGACAGACC-----GGAGACTGTCAA-CA-T--AT-TTTTTT---------CC-----GAGA-GCCTACAATTTTGC
gi|6                          :         TT-GTAGCTTTCCGGAAAAAAAATT-A-----TGTCGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AAGTTTTTT---------CC----G--GA-G-CTGCAATTTTGCAGtagc
gi|7                          :      AAATT-GTAGCTCTCCGGAAAAAA---T-A-----TGTTGACAGACC-----GAT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGA-G-CTACAATTTTGCAGc
gi|8                          :               GCTCTCTG-AAAAAA---T-A-----TTGGGACAGATC-------T--TTGTCTA-AA-T---A-TTTTTG---------TC----AGAGA-G-ATATAGTTCTGCAG
gi|9                          :      AAATT-GTAGCTCTCCGGAAAA-------------TATTG-------------GT--CTGTCAA-CA-T--AA-TATTTT---------CC----GGAGATG-CTAct





Alignments
lowQualScore                  :                                        11  11111                                                                                 
lowQualScore                  :                   6     5      0       66  11111            77777   33       2  2 33  2      999999999  5555      2              
lowQualScore                  :                   .     .      .       ..  .....            .....   ..       .  . ..  .      .........  ....      .              
lowQualScore                  :                   7     0      9       77  11111            11111   44       4  4 22  4      444444444  0000      4              
consensus                     :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAG
Reference ( family-1954 )     :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAG
gi|1                          :              AAATT-GTAGC-TATCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACCAGTCTGGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTGT---------CC----GAAGAG-CTACAATTTTGCAG
gi|10                         :                                                         caCC-----CGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TGTTTT----------T----GGAGAG-CTACAGTTCTc
gi|11                         :                                                           aC-----GGG--CTGTCAA-CAAT--AA-TTTTTTTTCTTTTTTCC----AGAGAG-CTACAATTTTGCAGagggtgcgtcaaatgt
gi|12                         :                                                                   GT--CTGTCAG-CA-T--AA-TTTATT---------CCAACAGGAGAG-CTACAATTTTGCAGc
gi|13                         :                                                        AGACC-----GGT--CTCTCAA-CA-T--AA----TTT---------CC----CGAGAG-CTACAGTTCTGCAGct
gi|14                         :                                                            t-----GGT--CTGTCAA--A-T--AA-TTTT-----------------GGAGAG-CTACAGTTCTGTAG
gi|15                         :                                                           CC-----GTT--CTGTCAAACA-A--AA-TTTTTT---------CC----GGAGCG-CTACAATTTcta
gi|16                         :                                                                     --CTGTTAA-CA-T--A--TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTATAATTTTGCAG
gi|17                         :                                                                              -CA-T--AT-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAGg
gi|2                          :              AAATT-GTAGT-TCTCCGAAAAAAAT--CA-----TGTTGACAGGCT-----GTT--CTGTTAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTAAAATTTTGCAGct
gi|3                          :              AAATTTGTAGC-TCTCCGGAAAAAAAAATA-----CGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAGtacag
gi|4                          :                           gcCCAAAAAAAAA--TAAATTGTGTTGTCAGACT-----GAT--CTGTGAA-CA-TTAAA-TTTTTT---------T-----GGAGAG-CTACAATTCTGC
gi|5                          : ctgaagaactgttcAATT-TTAGC-TCTCCAAAAAAAAAA-TA-----TGTTGACAGACC-----GGAGACTGTCAA-CA-T--AT-TTTTTT---------CC-----GAGAGCCTACAATTTTGC
gi|6                          :                 TT-GTAGC-TTTCCGGAAAAAAAATTA-----TGTCGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AAGTTTTTT---------CC----G--GAG-CTGCAATTTTGCAGtagc
gi|7                          :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAA-AA--TA-----TGTTGACAGACC-----GAT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAGc
gi|8                          :                       GC-TCTCTG--AAAAAA--TA-----TTGGGACAGATC-------T--TTGTCTA-AA-T---A-TTTTTG---------TC----AGAGAG-ATATAGTTCTGCAG
gi|9                          :                     TAGCATCTCCGGAAAATAT--TA-----TGTTGACAGACC------------------------AA-TATTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTTCAGct





Alignments
lowQualScore                  :                                        11  11111                                                                                 
lowQualScore                  :                   6     5      0       66  11111            77777   33       2  2 33  2      999999999  5555      2              
lowQualScore                  :                   .     .      .       ..  .....            .....   ..       .  . ..  .      .........  ....      .              
lowQualScore                  :                   7     0      9       77  11111            11111   44       4  4 22  4      444444444  0000      4              
consensus                     :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAG
Reference ( family-1954 )     :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAG
gi|1                          :              AAATT-GTAGC-TATCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACCAGTCTGGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTGT---------CC----GAAGAG-CTACAATTTTGCAG
gi|10                         :                                                         caCC-----CGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TGTTTT----------T----GGAGAG-CTACAGTTCTc
gi|11                         :                                                           aC-----GGG--CTGTCAA-CAAT--AA-TTTTTTTTCTTTTTTCC----AGAGAG-CTACAATTTTGCAGagggtgcgtcaaatgt
gi|12                         :                                                                   GT--CTGTCAG-CA-T--AA-TTTATT---------CCAACAGGAGAG-CTACAATTTTGCAGc
gi|13                         :                                                        AGACC-----GGT--CTCTCAA-CA-T--AA----TTT---------CC----CGAGAG-CTACAGTTCTGCAGct
gi|14                         :                                                            t-----GGT--CTGTCAA--A-T--AA-TTTT-----------------GGAGAG-CTACAGTTCTGTAG
gi|15                         :                                                           CC-----GTT--CTGTCAAACA-A--AA-TTTTTT---------CC----GGAGCG-CTACAATTTcta
gi|16                         :                                                                     --CTGTTAA-CA-T--A--TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTATAATTTTGCAG
gi|17                         :                                                                              -CA-T--AT-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAGg
gi|2                          :              AAATT-GTAGT-TCTCCGAAAAAAAT--CA-----TGTTGACAGGCT-----GTT--CTGTTAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTAAAATTTTGCAGct
gi|3                          :              AAATTTGTAGC-TCTCCGGAAAAAAAAATA-----CGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAGtacag
gi|4                          :                           gcCCAAAAAAAAA--TAAATTGTGTTGTCAGACT-----GAT--CTGTGAA-CA-TTAAA-TTTTTT---------T-----GGAGAG-CTACAATTCTGC
gi|5                          : ctgaagaactgttcAATT-TTAGC-TCTCCAAAAAAAAAA-TA-----TGTTGACAGACC-----GGAGACTGTCAA-CA-T--AT-TTTTTT---------CC-----GAGAGCCTACAATTTTGC
gi|6                          :                 TT-GTAGC-TTTCCGGAAAAAAAATTA-----TGTCGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AAGTTTTTT---------CC----G--GAG-CTGCAATTTTGCAGtagc
gi|7                          :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAA-AA--TA-----TGTTGACAGACC-----GAT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAGc
gi|8                          :                       GC-TCTCTG--AAAAAA--TA-----TTGGGACAGATC-------T--TTGTCTA-AA-T---A-TTTTTG---------TC----AGAGAG-ATATAGTTCTGCAG
gi|9                          :                     TAGCATCTCCGGAAAATAT--TA-----TGTTGACAGACC------------------------AA-TATTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTTCAGct


blockSeqs                     :                   T     A              AA  AATTG            .       GA       A  A TA  G      TTCTTTTTT  AACA      C
blockSeqs                     :                   .     .              AT  .                .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                   .     .              A   .                .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                   .     .              .   .                .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                   .     .              .   .                .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                         .              .   .                .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                         .              .   .                .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                                        .   .                .       .        .  . .   .      .          .         .
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blockSeqs                     :                                                             .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                                                             .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                                                             .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                                                             .       .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                                                                     .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                                                                     .        .  . .   .      .          .         .
blockSeqs                     :                                                                              .  . .   .      .          .         .


blockSeqCons                  :                                                             *****
originalCons                  :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAG
finalCons                     :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAG





Alignments
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lowQualScore                  :                   6     5      0       66  11111            77777   33       2  2 33  2      999999999  5555      2              
lowQualScore                  :                   .     .      .       ..  .....            .....   ..       .  . ..  .      .........  ....      .              
lowQualScore                  :                   7     0      9       77  11111            11111   44       4  4 22  4      444444444  0000      4              
consensus                     :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAG
Reference ( family-1954 )     :              AAATT-GTAGC-TCTCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAG
gi|1                          :              AAATT-GTAGC-TATCCGGAAAAAAA--TA-----TGTTGACAGACCAGTCTGGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTGT---------CC----GAAGAG-CTACAATTTTGCAG
gi|10                         :                                                         caCC-----CGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TGTTTT----------T----GGAGAG-CTACAGTTCTc
gi|11                         :                                                           aC-----GGG--CTGTCAA-CAAT--AA-TTTTTTTTCTTTTTTCC----AGAGAG-CTACAATTTTGCAGagggtgcgtcaaatgt
gi|12                         :                                                                   GT--CTGTCAG-CA-T--AA-TTTATT---------CCAACAGGAGAG-CTACAATTTTGCAGc
gi|13                         :                                                        AGACC-----GGT--CTCTCAA-CA-T--AA----TTT---------CC----CGAGAG-CTACAGTTCTGCAGct
gi|14                         :                                                            t-----GGT--CTGTCAA--A-T--AA-TTTT-----------------GGAGAG-CTACAGTTCTGTAG
gi|15                         :                                                           CC-----GTT--CTGTCAAACA-A--AA-TTTTTT---------CC----GGAGCG-CTACAATTTcta
gi|16                         :                                                                     --CTGTTAA-CA-T--A--TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTATAATTTTGCAG
gi|17                         :                                                                              -CA-T--AT-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAGg
gi|2                          :              AAATT-GTAGT-TCTCCGAAAAAAAT--CA-----TGTTGACAGGCT-----GTT--CTGTTAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTAAAATTTTGCAGct
gi|3                          :              AAATTTGTAGC-TCTCCGGAAAAAAAAATA-----CGTTGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AA-TTTTTT---------CC----GGAGAG-CTACAATTTTGCAGtacag
gi|4                          :                           gcCCAAAAAAAAA--TAAATTGTGTTGTCAGACT-----GAT--CTGTGAA-CA-TTAAA-TTTTTT---------T-----GGAGAG-CTACAATTCTGC
gi|5                          : ctgaagaactgttcAATT-TTAGC-TCTCCAAAAAAAAAA-TA-----TGTTGACAGACC-----GGAGACTGTCAA-CA-T--AT-TTTTTT---------CC-----GAGAGCCTACAATTTTGC
gi|6                          :                 TT-GTAGC-TTTCCGGAAAAAAAATTA-----TGTCGACAGACC-----GGT--CTGTCAA-CA-T--AAGTTTTTT---------CC----G--GAG-CTGCAATTTTGCAGtagc
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