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Reference ( gi|6 ) : CCCAGGG-CTG-A--CAA-AT-A--TTT-TTTTAG-AG-AC-CTTGCC--A-CG--G-------------GCAA-GT-G-CA-GGACC---AA----AATTCCACT--TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CACAATTGTG---AATATAAAACT---AA-AA--------A-CGTAGT--------TCGTGACATT-CATTTATTTTT-GCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCTCA--TG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGA-GAT--TTA------------------T-TGT---GCTT-T-G-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGCT-GCCAATT----TGT-C-A-----A----CCAA--TACA-TATTGAA--------TCTG-C-CTA-TATA------A-A---TT-------ATTA--------T----ATTGG-TAAGG---------AAATCTCATAATG--A--CA-G----ATT----AAACTG----GTT--CACAT-----AG----CTA--GT-----------------------A------T-GATGATAT--ACT--TCC---GATTTC-AATGC----GAAT-GT--ATGA-A---TGT----TTTAT--TCT---A-TTTTT--ACTGAC---TG-----A-ATTTT--T-A--AG-TT--ACT--TGCCCA-CGGGC-A--G-T-G-AT-TA-T-GA-AA-ATTC-AC-TTGCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA---CCT-------G-------------CGT-C------GGGCATTGG-GA-TTTGTCAGCCCC
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gi|4 : tCAGGGATTG-A--CAA-AT-A--GAT-TTTAAG-AG-CA-CTTGCCC-A-CG--G-------------GTAT-GT-G-CA-TGACC---AA----AATTC-ACT--T-GCC-CTTCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTCAA-CAAAATTATG----ACACAAAACA---AATAA--------A-TGTAGT--------TTGTAATATT-CATATATTATT-GCTGC-CCAAC--------------------TTTG----GA-A-CCCG--TG-AAGC-TTAAC-TAGTCTC-ACGA-GA---TTA------------------A-AGT---TCTT-C-A-AGTTATT-TGTGCTTTC-ATG-T-CAG-CCTTCTGCC-GCCAATT----TGT-T-T-----A----CCAA--TAAA-TGTTGAA--------CCTG---ATC-TATA------A-A---TT-------ATCA--------TTCAAGCTGG-TAAGA---------AAATCTCGTAACGACA--CA-G----ATT----AAACTG----GTT--CATAC-----AGCTGACTA--GTTTACATAGCGAAAGACAACTCGTA------C-GATGATAT--ACT--TCC---GATTTC-AGTCC----GAAT-GT--ACGACA---TGT----TTTAT--TCT---A-TTTTTTCACTAAT---TG-----G-ATTTT--TCA--AG-TT--ACT--TGCCCA-CGGGCAA--G-T-G-GT-TA-T-TA-AATATTT-CC-TTGTC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA---CTT-------G-------------CCC-C------GGGCAATGGAAA-ATTGTCAGCgtttggtcgttggtggtgtgaggtttggggcctgctccactttagaactcccatgactttaactagtttcatgaggatttattttgttgtgcttgtggaaatttcttttaagtcagtcctttggctcgccaatttgtctaaccaatacagtattggaatgtaaattctgtcctatataaaatgctattgtattggtaaggaatcctcatgacagattgaaactggttcacatagctcgtagtgcactgatgatataaacttccgatttcagtgccggaatgtatgaacagtgttttttctgaggtctttactgactggatttttcaagttacttctgccacgggcagtggattatgaaattcactttgccctgccagaagaatccactgcaccgggggtgggcaatgggattttgtcagcccct
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gi|1 : aCAGGGACTG-AAATAG-AT-A--TTT-TCT----AG-GCACTCGCCC-A-CG--GCGGCAACCACAATGCAA-TC-G-CA-G--CCTTTAATACTAATTC-ACT--T-GCC-CTGCC---TGT--CA---TCTTAATACT-TGCCTTACTTTTAA-CAAAATTAAC---AAAATAAA-CT---AA-A--------------------------C---ACATT-CATT-ATTCT--GCTGC-CT-ACCCTTATAAACGGCTCATTCTTTTATAAGAA-CTCCCAGTCG-AA-CTTTGACTTAGTTTCAATGA-GAT--TTA--------------------AGT---GCTT-A-G-AA--GTTAT---TTT-------T-C-G-CCTTTTGaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccc
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gi|13 : acagggactgaaatagatattttctaggcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactT-----------------------A------C-GATGATAT--ATT----C---GATTTC-AGTCC----GAAT-AT--AC---A---TGT----TTTAT--TCT-----CTTTT--ACTAAC---TG-----G-ATTTT--C-A--A------AAT--TG---G-CAAGT-G--G-T-T-AT-TA-T--A-AA-TTTT-AC-TT-CC-CT-CCAGAA-AAT-C---CA---CATGCCCCGGG-------------CGT-C------GGGCAAT-G-GA-TTTGTCAGCCCCct
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Reference ( family-1953 ) : NCCAGGG-CTG-ACAA-AT-ANNT-TTTTAG-AGGCAC-TTGCCCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CN-G-GACC---A-A----AATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CAAAATT-ANG--AANATAAAACT---AA-AA--------A-CGTAGT--------TCGTGACATT-CATTTATTTTT-GCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCCCG--CG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGA-GAT--TT---------------------A-------------T----TNGCGCTT-T-G-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTC------T-A----CCAA--TA-AA-TGTTGAA--------TCTGCTCTATATA------AA-TT--TATT----------ATT---ATTGG-TAAGG---------AAATCTC---GTAACG--ACA-GATT----AA----ACTG----GTT--CACAT-----AG----C---TA--GT-----------------------AC----GATGATAT--ACT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--GAATGTACG-ACA--TG----TTTTAT--TCT---A---TTTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTT--C-AAGT--CACTTGC--CCGCGGGC-A-G-TGG-T-TA-TNA-AA-A-TTCAC-TTGCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CNT-------G-------------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCC
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Reference ( family-1953 ) : NCCAGGG-CTG-ACAA-ATANAT-TT---T-TAG-AGGCAC-TTGCCCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CN-G-GACC---A-A----AATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CAAAATTA--AGAAAAT-AAAACT---AA-AA--------A-CGTAGTT--------CGTGACATT-CATTTATTTTT-GCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCCCG--CG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGA-GAT--TT---------------------A-------------T----TNGCGCTT-T-G-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTC------T-A----CCAA--TA-AA-TGTTGAA--------TCTGCTCTA----------TATA------AATTATTAT--T---ATTG----G-TAAGG---------AAATCTC---GTAACG--ACA-GATT----AA----ACTG----GTT--CACAT-----AG----C---TA--GT-----------------------AC----GATGATAT--ACT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--GAATGTACG-ACA--TG----TTTTAT--TCT---A---TTTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTT--C-AAGT--CACTTGC--CCACGGGC-A-G-TGG-T-TA-TNA-AA-A-TTCAC-TTGCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CNT-------G-------------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCC
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Reference ( family-1953 ) : NCCAGGG-CTG-ACAA-ATANAT-TT---T-TAG-AGGCAC-TTGCCCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CN-G-GACC---A-A----AATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CAAAATTA--AGAAAAT-AAAACT---AA-AA--------A-CGTAGTT--------CGTGACATT-CATTTATTTTT-GCTGC-CC-A-C--------------------TTTA----GA-CTCCCG--CG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGA-GAT--TT---------------------A-------------T----TNGCGCTT-T-G-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTC------T-A----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------TCTGCTCTA-TATA------AANTATTAT--T---ATTG-----------GTAA---GG---------A--AATCTC---GT-AACG-ACA--GAT---T----A---A----ACTG----GTT--C-----------------ACAT-----AG-------------C---TA----------GTAC----GATGATAT--ACT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--GAATGTACG-ACA--TG----TTTTAT--TCT---A---TTTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTT--C-AAGT--CACTTGC--CCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TNA-AA-A-TTCAC-TTGCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CNT-------------G-------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCC
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gi|2 : acagggactgacaaatagatttttctagcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgc-------------C---TC----------GTAC----GATGATAT---CT--TCC---GAT-TTCCAGT-C----CCCGATTGT-CG-ACAAATG----TTTTAT--TCT---A---TTTTT--A----CTAAC---TGGATTTAA-TTTT--C-CAGTTACACTTGC--CCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-A-ATAACATTGCC-CTGTCAGAA-AAT-CTTACAATGCCCCGG-------------G-------CGT-C------GGGCAGTGG-G-A-TTTGTCAGCCCCagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccc
gi|20 : acagggactgacaaatagatttttctagcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactCTA----GTT--C-----------------AGAT-----AA-------------C---C-----------GTAC----AACAATAT--TCT--TCC---TAT-TTC-AGT-CAAATC--GCATGAATG-ACc
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gi|3 : tCTGCTCC-A-C--------------------TTTA----GAACTCCCA--TG-AC-T-TTAAC-TAGTTTC-ATGAGGAT--TT---------------------A-------------TTTTGTTGTGCTTGTGG-AA--ATT-T---CTTTTAA-G-T-CAGTCCTTTGGCTCGCCAATT----TGTC------TAA----CCAA--TACAG-TAT-----------TGGAATGTAAATTCTGTCCTA-TATA------AAATGCTATTGT---ATTG-----------GTAA---GG---------A--ATCCTC-------ATG-ACA--GAT---TG---A---A----ACTG----GTT--C-----------------ACAT-----AG-------------CTCGTA----------GTGCACT-GATGATATAAACT--TCC---GAT-TTC-AGTGC----CG-GAATGTATGAACAG-TG----TTTT-T--TCTGAGG---TCTTT--A----CTGAC---TGG-----ATTTTT--C-AAGT--TACTT-CTGCCACGGGC-AGTGGAT-T-A-TG--AA-A-TTCACTTTGCC-CTGCCAGAAGAAT-C---CA------C-T-------------G-------CAC-CGGGGGTGGGCAATGG-G-ATTTTGTCAGCCCCgtttggtcgttggtggtgtgaggtttggggcctgctccactttagaactcccatgactttaactagtttcatgaggatttattttgttgtgcttgtggaaatttcttttaagtcagtcctttggctcgccaatttgtctaaccaatacagtattggaatgtaaattctgtcctatataaaatgctattgtattggtaaggaatcctcatgacagattgaaactggttcacatagctcgtagtgcactgatgatataaacttccgatttcagtgccggaatgtatgaacagtgttttttctgaggtctttactgactggatttttcaagttacttctgccacgggcagtggattatgaaattcactttgccctgccagaagaatccactgcaccgggggtgggcaatgggattttgtcagcccct
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Alignments
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Reference ( family-1953 ) : NCCAGGG-CTG-ACAA-ATANAT-TT---T-TAG-AGGCAC-TTGCCCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CN-G-GACC---A-A----AATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CAAAATTA--AGAAAAT-AAAACT---AA-AA--------A-CGTAGTT--------CGTGACATT-CATTTATTTTT-GCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCCCG--CG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGAG-AT--TT---------------------A-------------TTN----GCGCTT-TG-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTC------TA----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------TCTGCTC-TA-TATA------AA-TATTATT---ATTG-----------GTAA---GG---------A--AATCTC---GT-AACG--ACA-GAT---T----A---A----ACTG----GTT--CACAT-----AG-------------CT---A--GT-----------------------AC----GATGATATA--CT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATGTACGA-CA--TG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTT--C-AAGT--CACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TNA-AA-A-TTCAC-TT-GCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CNT-------G-------------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCC
gi|1 : CAGGGACTG-A--A-ATAGATATT---T-TCT-AGGCAC-TCGCCCA-CGGCGGCAACCACAATGCAA-TC-G-CA-G---CCTTTA-ATACTAATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--CA---TCTTAATACT-TGCCTTACTTTTAA-CAAAATTA--ACAAAAT-AAA-CT---AA-A--------------------------C---ACATT-CATT-ATTCT--GCTGC-CT-ACCCTTATAAACGGCTCATTCTTTTATAAGAA-CTCCCAGTCG-AA-CTTTGACTTAGTTTCAATGAG-AT--TT---------------------A---------------A----GTGCTT-AG-AA--GTTAT---TTT-------T-C-G-CCTTTTG
gi|1 : aC-CACTAATT----TGTC------TATTTTCCAAATTA-AAATGT-----------TGAAGG------TCTGCTC-TA-GATACCTGAAAA-CTTTATT---ATTGAATA-------GTAA---AGGAGTCTCGAA--AATCTC---GT-AACG--ACAGGAT---T----A---A----AC-G----ATTCCCACAT-----AG-------------aaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccct
gi|1 : acagggactgaaatagatattttctaggcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgc-------------CT---C--GT-----------------------AC----GATGATAT---CT--TCC---GAT-TTCCAGT-C----CCCG-ATTGT-CGA-CAAATG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTAAC---TGGATTTAA-TTTT--C-CAGTTACACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-A-ATAACATT-GCC-CTGTCAGAA-AAT-CTTACAATGCCCCGG-------G-------------CGT-C------GGGCAGTGG-G-A-TTTGTCAGCCCCagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccct
gi|10 : acagggactgaaatagatattttctaggcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactAAT-AAAACT---AA-AA--------AATGTAGTT--------CTCGACATT-CGTTTATTTTTTGCTGC-CCTAC--------------------TTTA----GAACTCCCG--TG-AA-C-TCAAT-TAGTTTC-ATGAG-AT--TT---------------------AAGTGTTCAAGTTATTT----GCTCTT-TG-AA--ATT-T---TTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-TGCCAATT----TGTCCACATATA----CCAA--TA-AA-TAA-----------TGAA--------TCTGCTC-TA-TATA------A---ATTATT---ATTG-----------GTAA---GA---------G--AATCTct
gi|11 : CAGGG-CTG-ACAA-ATTAAC-TT---A-TAA-GAGTAC-T-GCCCGGTGG-------------GCAA-GT-G-CA-T-GACC---A-A----TATT-CTA-C---TTGCC-CTGTC---TGT--AA---TTTTA---CT-TGCCCTAC---TAA-CAAAATT----GCAAATTAAGACT---AA-AAGAAACTATA-CCTAATTTTACTTGTCGTGACATTCCATTTA
gi|12 : T-----------------------AC----GATGATATA--TT----C---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATAT---A-CA--TG----TTTTAT--TCT----CTTTT--A----CTAAC---TGG-----A-TTTT--C-AA-----AATT---------GGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-ATTTTAC-TT--CC-CT-CCAGAA-AAT-C---CA------CATGCCCCGGG-------------CGT-C------GGGCAAT-G-G-A-TTTGTCAGCCCCcggatttcact
gi|13 : T-----------------------AC----GATGATATA--TT----C---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATAT---A-CA--TG----TTTTAT--TCT----CTTTT--A----CTAAC---TGG-----A-TTTT--C-AA-----AATT---------GGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-ATTTTAC-TT--CC-CT-CCAGAA-AAT-C---CA------CATGCCCCGGG-------------CGT-C------GGGCAAT-G-G-A-TTTGTCAGCCCC
gi|14 : G-CTG-ACAA-ATACAT-TT---T---G-AGGCACTTTGCCT--CGG-------------GCAA-ATCG-CT-GCGTCA---A-A----AATT-A-G-C---TTCCG-CTACC---TTTAAGA----TCTG---GT-TGCCCTACC------CGAAATTG--AAAAA
gi|15 : -C----C--G-AATGTACGA-CA--TG----GTTTAT--TCTA---ATTTT--A----CTGAT---TGA-----ATTTTT--C-AAGT--TACTT--GCC------CAAGTGG-T-T-ATTAA-AA-A-TTCAC-TT-GCC-CTGCCACAA-AAT-C---CA------CAT-------GCCCCGGA------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCCgatcacagttgtatactatttttgtgtttttgcttatttcat
gi|16 : TTTC--A----CTGAC---TGGG----A-TTTTGTC-AAGT--CACGT--GCC-ACGG-CAAGTGG-TAT-A-TTA-AA---TTCAC-TT-GCCACTGCCTAAG-AATGC---CATGCCC-CGG-------G-------------CGT-C------GG-CAATGG-GGA-TTTGTCAGCCC
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gi|2 : acagggactgacaaatagatttttctagcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgc-------------CT---C--GT-----------------------AC----GATGATAT---CT--TCC---GAT-TTCCAGT-C----CCCG-ATTGT-CGA-CAAATG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTAAC---TGGATTTAA-TTTT--C-CAGTTACACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-A-ATAACATT-GCC-CTGTCAGAA-AAT-CTTACAATGCCCCGG-------G-------------CGT-C------GGGCAGTGG-G-A-TTTGTCAGCCCCagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccc
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Reference ( family-1953 ) : NCCAGGG-CTG-ACAA-ATANAT-TT---T-TAG-AGGCAC-TTGCCCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CN-G-GACC---A-A----AATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CAAAATTA--AGAAAAT-AAAACT---AA-AA--------A-CGTAGTT--------CGTGACATT-CATTTATTTTT-GCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCCCG--CG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGAG-AT--TT---------------------A-------------TTN----GCGCTT-TG-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTC------TA----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------TCTGCTC-TA-TATA------AA-TATTATT---ATTG-----------GTAA---GG---------A--AATCTC---GT-AACG--ACA-GAT---T----A---A----ACTG----GTT--CACAT-----AG-------------CT---A--GT-----------------------AC----GATGATATA--CT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATGTACGA-CA--TG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTT--C-AAGT--CACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TNA-AA-A-TTCAC-TT-GCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CNT-------G-------------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCC
gi|1 : CAGGGACTG-A--A-ATAGATATT---T-TCT-AGGCAC-TCGCCCA-CGGCGGCAACCACAATGCAA-TC-G-CA-G---CCTTTA-ATACTAATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--CA---TCTTAATACT-TGCCTTACTTTTAA-CAAAATTA--ACAAAAT-AAA-CT---AA-A--------------------------C---ACATT-CATT-ATTCT--GCTGC-CT-ACCCTTATAAACGGCTCATTCTTTTATAAGAA-CTCCCAGTCG-AA-CTTTGACTTAGTTTCAATGAG-AT--TT---------------------A---------------A----GTGCTT-AG-AA--GTTAT---TTT-------T-C-G-CCTTTTG
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gi|1 : acagggactgaaatagatattttctaggcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgc-------------CT---C--GT-----------------------AC----GATGATAT---CT--TCC---GAT-TTCCAGT-C----CCCG-ATTGT-CGA-CAAATG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTAAC---TGGATTTAA-TTTT--C-CAGTTACACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-A-ATAACATT-GCC-CTGTCAGAA-AAT-CTTACAATGCCCCGG-------G-------------CGT-C------GGGCAGTGG-G-A-TTTGTCAGCCCCagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccct
gi|10 : acagggactgaaatagatattttctaggcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactAAT-AAAACT---AA-AA--------AATGTAGTT--------CTCGACATT-CGTTTATTTTTTGCTGC-CCTAC--------------------TTTA----GAACTCCCG--TG-AA-C-TCAAT-TAGTTTC-ATGAG-AT--TT---------------------AAGTGTTCAAGTTATTT----GCTCTT-TG-AA--ATT-T---TTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-TGCCAATT----TGTCCACATATA----CCAA--TA-AA-TAA-----------TGAA--------TCTGCTC-TA-TATA------A---ATTATT---ATTG-----------GTAA---GA---------G--AATCTct
gi|11 : CAGGG-CTG-ACAA-ATTAAC-TT---A-TAA-GAGTAC-T-GCCCGGTGG-------------GCAA-GT-G-CA-T-GACC---A-A----TATT-CTA-C---TTGCC-CTGTC---TGT--AA---TTTTA---CT-TGCCCTAC---TAA-CAAAATT----GCAAATTAAGACT---AA-AAGAAACTATA-CCTAATTTTACTTGTCGTGACATTCCATTTA
gi|12 : T-----------------------AC----GATGATATA--TT----C---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATAT---A-CA--TG----TTTTAT--TCT----CTTTT--A----CTAAC---TGG-----A-TTTT--C-AA-----AATT---------GGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-ATTTTAC-TT--CC-CT-CCAGAA-AAT-C---CA------CATGCCCCGGG-------------CGT-C------GGGCAAT-G-G-A-TTTGTCAGCCCCcggatttcact
gi|13 : T-----------------------AC----GATGATATA--TT----C---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATAT---A-CA--TG----TTTTAT--TCT----CTTTT--A----CTAAC---TGG-----A-TTTT--C-AA-----AATT---------GGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-ATTTTAC-TT--CC-CT-CCAGAA-AAT-C---CA------CATGCCCCGGG-------------CGT-C------GGGCAAT-G-G-A-TTTGTCAGCCCC
gi|14 : G-CTG-ACAA-ATACAT-TT---T---G-AGGCACTTTGCCT--CGG-------------GCAA-ATCG-CT-GCGTCA---A-A----AATT-A-G-C---TTCCG-CTACC---TTTAAGA----TCTG---GT-TGCCCTACC------CGAAATTG--AAAAA
gi|15 : -C----C--G-AATGTACGA-CA--TG----GTTTAT--TCTA---ATTTT--A----CTGAT---TGA-----ATTTTT--C-AAGT--TACTT--GCC------CAAGTGG-T-T-ATTAA-AA-A-TTCAC-TT-GCC-CTGCCACAA-AAT-C---CA------CAT-------GCCCCGGA------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCCgatcacagttgtatactatttttgtgtttttgcttatttcat
gi|16 : TTTC--A----CTGAC---TGGG----A-TTTTGTC-AAGT--CACGT--GCC-ACGG-CAAGTGG-TAT-A-TTA-AA---TTCAC-TT-GCCACTGCCTAAG-AATGC---CATGCCC-CGG-------G-------------CGT-C------GG-CAATGG-GGA-TTTGTCAGCCC
gi|17 : attccatttacggaG-AGGCAC-TTGCCCG-AGG-------------GCAAAGT-GGCT-G-G-TC---A-A----AATT-T-A-C---TTGCC-CTGCC---TTT--AA---AGTTA---CT-TGCCCTAC-------CAAAATAA--AAAAAAG-AA
gi|18 : C---A-A----AATT-T-A-C---TTGCC-CTGCC---TTT--AA---AGTTA---CT-TGCCCTAC-------CAAAATAA--AAAAAAG-AAtcacatttgtacactatgtttgtgttcttgtttatatca
gi|19 : ctggtGGG-CTGGACAA--TACAT-TT---T-TAGCAGGCAC-TTGC---------------------CAA-GTGG-CT-G-GTCA---ATA----AGTT-T-A-C---TTG-C-CTACT---T-T--AA---CTCTG---CT-TGCCCTtcacatttgtacactatgtttgtgttcttgtttatatca
gi|2 : cagCAGGGACTG-ACAA-ATAGAT-TT---T-TCT-AG-CAC-TCGCCCA-CGGCGGCAACCACAATGCAA-TC-G-CA-G---CCTTTA-ATACTAATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--CA---TCTTAATACT-TGCCTTACTTTTAA-CAAAATTA--ACAAAAT-AAA-CT---AA-A--------------------------C---ACATT-CATT-ATTCT--GCTGC-CT-ACCCTTATAAACGGCTCATTCTTTTATAAGAA-CTCCCAGTCG-AA-CTTTGACTTAGTTTCAATGAG-AT--TT---------------------A---------------A----GTGCTT-AG-AA--GTTAT---TTT-------T-C-G-CCTTTTG
gi|2 : aC-CACTAATT----TGTC------TATTTTCCAAATTA-AAATGT-----------TGAAGG------TCTGCTC-TA-GATACCTGAAAA-CTTTATT---ATTGAATA-------GTAA---AGGAGTCTCGAA--AATCTC---GT-AACG--ACAGGAT---T----A---A----AC-G----ATTCCCACAT-----AG-------------aaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccc
gi|2 : acagggactgacaaatagatttttctagcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgc-------------CT---C--GT-----------------------AC----GATGATAT---CT--TCC---GAT-TTCCAGT-C----CCCG-ATTGT-CGA-CAAATG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTAAC---TGGATTTAA-TTTT--C-CAGTTACACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-A-ATAACATT-GCC-CTGTCAGAA-AAT-CTTACAATGCCCCGG-------G-------------CGT-C------GGGCAGTGG-G-A-TTTGTCAGCCCCagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccc
gi|20 : acagggactgacaaatagatttttctagcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactCTA----GTT--CAGAT-----AA-------------CC------GT-----------------------AC----AACAATATT--CT--TCC---TAT-TTC-AGT-CAAATC--G-CATGAATGA-Cc
gi|21 : acagagaaaacggttcgtatggcgcgAGT--CACTA--GCCCCCGAGCAAGTAG-T-T-A-TAA-AATA-TTTAC-TT-GCC-CGACCAGAA-AAT-C---CT------CTT-------
gi|22 : GCCAGAA-AAT-C---CA------CAT-------GGCATTGCCCCGGGCGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTTAGTCCCtatt
gi|3 : CCAGGG-GTG--CAA--TATAT-TTCTTT-TAG-AG-CAC-TTGCCCA-CGGC------------GCAA-GT-G-CA-T-GACA---A-A----AATT-C-AACGAGTTGCCACTGTCCCTTGT--GAGTGTTCTA---CTGTGCCC-ACCTTTAA-CAAAATTGTGCGAAATT-CAAACTTAAAA-AA--------A-CGTAGTT--------AGTGACATT-AATGT-TTTTT-CTTGC-t
gi|3 : tCTGCTCC-AC--------------------TTTA----GAACTCCCA--TG-AC-T-TTAAC-TAGTTTC-ATGAGGAT--TT---------------------A-------------TTTTGTTGTGCTTGTGGAA--ATT-T---CTTTTAA-G-T-CAGTCCTTTGGCTCGCCAATT----TGTC------TAA---CCAA--TACAG-TAT-----------TGGAATGTAAATTCTGTCC-TA-TATA------AAATGCTATTGT-ATTG-----------GTAA---GG---------A--ATCCTC---AT----G--ACA-GAT---TG---A---A----ACTG----GTT--CACAT-----AG-------------CTCGTA--GT-----------------------GCACT-GATGATATAAACT--TCC---GAT-TTC-AGTGC----C--GGAATGTATGAACAG-TG----TTTT-T--TCTGAGGTCTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTTT-C-AAGT--TACTTCTGCC-ACGGGCA-GTGGAT-T-A-TGA-AA---TTCAC-TTTGCC-CTGCCAGAAGAAT-C---CA------C-T-------G-------------CAC-CGGGGGTGGGCAATGG-G-ATTTTGTCAGCCCCgtttggtcgttggtggtgtgaggtttggggcctgctccactttagaactcccatgactttaactagtttcatgaggatttattttgttgtgcttgtggaaatttcttttaagtcagtcctttggctcgccaatttgtctaaccaatacagtattggaatgtaaattctgtcctatataaaatgctattgtattggtaaggaatcctcatgacagattgaaactggttcacatagctcgtagtgcactgatgatataaacttccgatttcagtgccggaatgtatgaacagtgttttttctgaggtctttactgactggatttttcaagttacttctgccacgggcagtggattatgaaattcactttgccctgccagaagaatccactgcaccgggggtgggcaatgggattttgtcagcccct
gi|4 : tccaggggtgcaatatatttcttttagagcacttgcccacggcgcaagtgcatgacaaaaattcaacgagttgccactgtcccttgtgagtgttctactgtgcccacctttaacaaaattgtgcgaaattcaaacttaaaaaaacgtagttagtgacattaatgttttttcttgcgtttggtcgttggtggtgtgaggtttggggcCAGGGATTG-ACAA-ATAGAT-TT---T-AAG-AG-CAC-TTGCCCA-CGG-------------GTAT-GT-G-CA-T-GACC---A-A----AATT-C-A-C---TTGCC-CTTCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTCAA-CAAAATTA--TG-ACAC-AAAACA---AATAA--------A-TGTAGTT--------TGTAATATT-CATATATTATT-GCTGC-CCAAC--------------------TTTG----GA-A-CCCG--TG-AAGC-TTAAC-TAGTCTC-ACGAG-AT--TA---------------------A---------------A----GTTCTT-CA-AGTTATT-TGTGCTTTC-ATG-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTT------TA----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------CCTGATC-TA-TA-A------AT-TATCATTCAAGCTG-----------GTAA---GA---------A--AATCTC---GT-AACGACACA-GAT---T----A---A----ACTG----GTT--CATAC-----AGCTGA---------CT---A--GTTTACATAGCGAAAGACAACTCGTAC----GATGATATA--CT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATGTACGA-CA--TG----TTTTAT--TCTA---TTTTTTCA----CTAAT---TGG-----ATTTTT--C-AAGT--TACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTA-AATA-TTTCC-TT-GTC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CTT-------G-------------CCC-C------GGGCAATGGAA-A-ATTGTCAGCt
gi|5 : GGG-CTG-ACAAGATA-AT-TT---TGTAG-AG-CAC-TTGCCCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CGTG-GAC----A-A----AATT-C-A-C---T-GCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TTGCTTCCATTTAAACAAAATTT--AGAA--T-TAAACT---AA-AAG-------A-CGTA-CT--------CGTGCCATT-CATTCATTTTTTACTGC-CT-AC--------------------TTTG----AA-CTCCCA--TGGAA-C-TCAAC-T--CTTC-ATGAG-AT--TTAAGTGCTATCAAGTAATAGTTA-------------TTT-----CGCTT-TGGAA--ATT-T---CTT---A-GGT-CA---CCTCTGC-TGC-AATT----TGT-------TA----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------TGTGCTC-TAGTAT----------TAT-ATT---ATTG-----------TAAA---GG---------A--AATCTC---GT-A-CA--ACA-G-T---TCGCAA---A----GCTGACTAGTT--TACATCAGAAAG-------------AC---ATCGT-----------------------AC----GATGATATA--CT--TCC---GAC-T-C-AGT-C-------A-AATGTA-GA-C---TG----TTTTATCTTCTA---TTTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTTC-C-AAGT---ACTT--GCCCACGGGCAGTTGG-C-T-ATTAA-AA-A-TTCAC-TT-GCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CATGCCGG--G-------------CGTAC------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCa
gi|6 : agCCAGGG-CTG-ACAA-ATATTT-TT---T-TAG-AGAC-C-TTG-CCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CA-G-GACC---A-A----AATTCC-A-CT--TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CACAATTG--TGAATAT-AAAACT---AA-AA--------A-CGTAGTT--------CGTGACATT-CATTTATTTTT-GCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCTCA--TG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGAG-AT--TT---------------------A-------------TT-----GTGCTT-TG-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-TGCCAATT----TGTC------AA----CCAA--TA-CA-TAT-----------TGAA--------TCTGC-C-TA-TATA------AATTATTA-T---ATTG-----------GTAA---GG---------A--AATCTC---AT-AATG--ACA-GAT---T----A---A----ACTG----GTT--CACAT-----AG-------------CT---A--GT-----------------------AT----GATGATATA--CT--TCC---GAT-TTC-AAT-G----C--G-AATGTATGA--A--TG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTGAC---TGA-----A-TTTT--T-AAGT--TACTT--GCCCACGGGC-AGTGA-T-T-A-TGA-AA-A-TTCAC-TT-GCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CCT-------G-------------CGT-C------GGGCATTGG-G-A-TTTGTCAGCCCC
gi|7 : c-G-T-TAG-AATTCTGC-CACTAGTT----TGTT------TA----CCAA--TA-AG-TGTTCAACCTGTTCTAAA--------TTTGTTTGTA-T-TA------AA-GATTTGT---ATTGAATAAAGAAGCGTAACACAG---------ATTAAACTG---GTTCACAT-ACA-AATATGT----ATTTC----ACTA----GTT--CACAT-----AAGGGAAAATAACTCCT---T--GT-----------------------CC----TTTGATAAA--CT--CTT---GAT-TTC-AGT-C----T--G-ATTATACGA-CA--TGCAGCCTTTAT--TCTA---TTTTTC-A----ATCAC---TGG-----A-TTTT--TGAAGT--CACTA--GTCTGCAGACAAGTGG-T-T-A-TTA-GATA-TTCAC-TT-GCC-CAACCATAA-AAT-C---TA------CTT-------G-------------C
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gi|9 : ---GGT-TTC-AGT-T-------G-AAT-TACTG-CA--AA----TTTT-----CAAAACTTTTC--AGGGGCTGACAAATAC-----A-TTTT--T-GAGG--CACTT--GCCCTCAGGCAAGTGG-C-TGG-TCA-AA-A-TTTAC-TT-GCC-CTACCTTTA-AAT-C---TG------CTT-------G-------------C
gi|9 : tcatctgcataatactgttatttgcactgcgataaagtgtaagagtgatttgccctttaaatatGGG-CTG-ACAA-ATACAT-TT---T-T-G-AGGCAC-TTGCCCT-CAG-------------GCAA-GTGG-CT-G-G-TC---A-A----AATT-T-A-C---TTGCC-CTACC---TTT--AA---ATCTG---CT-TGCCCTAC-------CGAAATAA--AAAAAAT-cctaccgaaataaaaaaaatcacatttgtatactatgtttgtgtttatttcatt
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blockSeqs : . . A C . . TA . G . A . . G . ATGACC . . A . . . . T A A . . CTTTAA AAA . A . . AACGTAGTTAG . T T . . . . . AT . . . . . . . ATTTTGTT . . . TTTTA . . A . . . . . . . . . . C . . AAATGCTATTGTATTGGTAAGG . . AA . . . ATTTC T . . . TTGACTAGTTCAGTG A T . . . GCC . AT . . . . AT . . . . . C . C . CA . . . . A T TA . . . . . . CATGCCCCGGG . . . . .
blockSeqs : . . A G . . TC . G . A . . . . TGGTCA . . T . . . . T A A . . CTTCAA AAA . A . . AATGTAGTTTG . T T . . . . . GT . . . . . . . ATCT . . . ATTTT . . A . . . . . . . . . . T . . ATTATCATTCAAGCTGGTAAGA . . AA . . . GAA T . . . CTCGTAGTGCACT T T . . . CC . AC . . . . A . . . . . . . C . CA . . . . T . TA . . . . . . CATGCCCCGGA . . . . .
blockSeqs : . . A T . . TA . A . A . . . . ATGACA . . T . . . . G A C . . CTTTAA AAC . A . . AGACGTACTCG . C T . . . . . AT . . . . . . . ATT . . . TCTTA . . A . . . . . . . . . . T . . AATTATTATATTGGTAAGG . . AA . . . AA T . . . ACATCGTAC A T . . . CC . AT . . . . A . . . . . . . T . CA . . . . T . TA . . . . . . ATGCCCCGGG . . . . .
blockSeqs : . . A G . . AA . G . A . . . . ATGACC . . T . . . . G C T . . TAA ATG . A . . AACGTAGTTCG . T . . . . . . AT . . . . . . . AA . . . TCTTA . . A . . . . . . . . . . T . . AATTATTATTGGTAAGA . . A . . . AA T . . . CTCGTAC A T . . . CC . AC . . . . A . . . . . . . T . TG . . . . A . A . . . . . . TGCCCCGGG . . . . .
blockSeqs : . . A T . . TA . . . A . . . . GTGGAC . . C . . . . G G T . . C TAG . . . . C . . . . . . AA . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . TATATTATTGTAAAGG . . . . . . AA T . . . CTAGTAT A T . . . CC . AC . . . . A . . . . . . . T . CA . . . . G . A . . . . . . CATGCCGGG . . . . .
blockSeqs : . . . C . . T . . . T . . . . AGGACC . . C . . . . G G T . . . GTG . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTTTTGAATA . . . . . CCGTAC A C . . . GC . AC . . . . A . . . . . . . C . CT . . . . T . A . . . . . . CTTG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TGGTC . . C . . . . G G T . . . AAA . A . . . . CT . C . . . . A . . . . . . . A . A . . . . A . A . . . . . . CCTG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TGGTC . . C . . . . T G A . . . G . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . C . A . . . . G . A . . . . . . CTTG . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . CTTG
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CTG
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ************* ATGACC***** **** *** AACGTAGTTCG***************** TT ******************** **** AT** **** ** ******** ** A** CC******* AC ** ***** C** A** *** CNTGCCCCGGG*******************
originalCons : NCCAGGG-CTG-ACAA-ATANAT-TT---T-TAG-AGGCAC-TTGCCCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CN-G-GACC---A-A----AATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CAAAATTA--AGAAAAT-AAAACT---AA-AA--------A-CGTAGTT--------CGTGACATT-CATTTATTTTT-GCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCCCG--CG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGAG-AT--TT---------------------A-------------TTN----GCGCTT-TG-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTC------TA----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------TCTGCTC-TA-TATA------AA-TATTATT---ATTG-----------GTAA---GG---------A--AATCTC---GT-AACG--ACA-GAT---T----A---A----ACTG----GTT--CACAT-----AG-------------CT---A--GT-----------------------AC----GATGATATA--CT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATGTACGA-CA--TG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTT--C-AAGT--CACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TNA-AA-A-TTCAC-TT-GCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CA------CNT-------G-------------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCC
finalCons : NCCAGGG-CTG-ACAA-ATANAT-TT---T-TAG-AGGCAC-TTGCCCA-CGG-------------GCAA-GT-G-CATGACC-----A-A----AATT-C-A-C---TTGCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CAAAATTA--AGAAAAT-AAAACT---AA-AAACGTAGTTCG-----------------TGACATT-CATTTATTTTTTGCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCCCAT--G-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGAG-AT--TT---------------------A-------------TTN----GCGCTT-TG-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTC------TA----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------TCTGCTC-TA-TATA------AA-TATTATT---ATTG-----------GTAA---GG---------A--AATCTC---GT-AACG--ACA-GAT---T----A---A----ACTG----GTT--CACAT-----AG-------------CT---A--GT-----------------------AC----GATGATATA--CT--TCC---GAT-TTC-AGTCC-------G-AATGTACGA-CA--TG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTGAC---TGG-----A-TTTT--C-AAGTC--ACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TNA-AAA--TTCAC-TT-GCC-CTGCCAGAA-AAT-C---CACNTGCCCCGGG-------------------CGT-C------GGGCAATGG-G-A-TTTGTCAGCCCC
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Reference ( family-1953 ) : NCCAGGG-CTG-ACAA-ATANAT-TT---T-TAG-AGGCAC-TTGCCCA-CGG--GCAA-----G----TGCA----TGACC---A--A----AATTC-A-C---TT-GCC-CTGCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTTAA-CAAAATTA--AGAAAAT-AAAACT---AA-AA--------A-CGTAGTT--------CGTGACATT-CAT-TTATTTTTTGCTGC-CC-AC--------------------TTTA----GA-CTCCCA--TG-AA-C-TTAAC-TAGTTTC-ATGAG-AT--TT---------------------A-------------TTN----GCGCTT-TG-AA--ATT-T---CTT---A-G-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTC------TA----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------TCTGCTC-TA-TATA------AA-T-ATTATT---ATTG-----------GTAA---GG---------A--AATCTC---GT-AACG--ACA-GAT---T----A---A----ACTG----GTT--CACAT-----AG-------------CT---A--GT-----------------------AC----GATGATATA--CT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATGTACGA-CA--TG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTGAC---TGG-A-TTT-----T--C-AAGT--CACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TNA-AA-A-TTCAC-TT-GCC-CTGCCAGAA-AATCC-ACN-TG------CCCCGGGCGT-CGGGCAAT-GG-GA-TTTGTCAGCCCC
gi|1 : CAGGGACTG-A--A-ATAGATATT---T-TCT-AGGCAC-TCGCCCA-CGGCGGCAACCACAA----TGCAATCGCAGCCTTTA--ATACTAATTC-A-C---TT-GCC-CTGCC---TGT--CA---TCTTAATACT-TGCCTTACTTTTAA-CAAAATTA--ACAAAAT-AAA-CT---AA-A--------------------------C---ACATT-CAT-T-ATTCT--GCTGC-CT-ACCCTTATAAACGGCTCATTCTTTTATAAGAA-CTCCCAGTCG-AA-CTTTGACTTAGTTTCAATGAG-AT--TT---------------------A---------------A----GTGCTT-AG-AA--GTTAT---TTT-------T-C-G-CCTTTTG
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gi|1 : acagggactgaaatagatattttctaggcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgc-------------CT---C--GT-----------------------AC----GATGATAT---CT--TCC---GAT-TTCCAGT-C----CCCG-ATTGT-CGA-CAAATG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTAAC---TGG-A-TTTAATTTT--C-CAGTTACACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-A-ATAACATT-GCC-CTGTCAGAA-AATCTTACAATG------CCCCGGGCGT-CGGGCAGT-GG-GA-TTTGTCAGCCCCagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccct
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gi|2 : aC-CACTAATT----TGTC------TATTTTCCAAATTA-AAATGT-----------TGAAGG------TCTGCTC-TA-GATACCTGAAAA-C-TTTATT---ATTGAATA-------GTAA---AGGAGTCTCGAA--AATCTC---GT-AACG--ACAGGAT---T----A---A----AC-G----ATTCCCACAT-----AG-------------aaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccc
gi|2 : acagggactgacaaatagatttttctagcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgc-------------CT---C--GT-----------------------AC----GATGATAT---CT--TCC---GAT-TTCCAGT-C----CCCG-ATTGT-CGA-CAAATG----TTTTAT--TCTA---TTTTT--A----CTAAC---TGG-A-TTTAATTTT--C-CAGTTACACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTATAA-A-ATAACATT-GCC-CTGTCAGAA-AATCTTACAATG------CCCCGGGCGT-CGGGCAGT-GG-GA-TTTGTCAGCCCCagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactctcgtacgatgatatcttccgatttccagtccccgattgtcgacaaatgttttattctatttttactaactggatttaattttccagttacacttgcccacgggcaagtggttattataaaataacattgccctgtcagaaaatcttacaatgccccgggcgtcgggcagtgggatttgtcagccccc
gi|20 : acagggactgacaaatagatttttctagcactcgcccacggcggcaaccacaatgcaatcgcagcctttaatactaattcacttgccctgcctgtcatcttaatacttgccttacttttaacaaaattaacaaaataaactaaacacattcattattctgctgcctacccttataaacggctcattcttttataagaactcccagtcgaactttgacttagtttcaatgagatttaagtgcttagaagttatttttcgccttttgaaaggtttacccttttatgtttgcatgggatccccgtctcgatgcccactaatttgtctattttccaaattaaaatgttgaaggtctgctctagatacctgaaaactttattattgaatagtaaaggagtctcgaaaatctcgtaacgacaggattaaacgattcccacatagagctgaactttagcatctacataatgaaaaaaagacaactCTA----GTT--CAGAT-----AA-------------CC------GT-----------------------AC----AACAATATT--CT--TCC---TAT-TTC-AGT-CAAATC--G-CATGAATGA-Cc
gi|21 : acagagaaaacggttcgtatggcgcgAGT--CACTA--GCCCCCGAGCAAGTAG-T-T-A-TAA-AATA-TTTAC-TT-GCC-CGACCAGAA-AATCC-TCT-T
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gi|3 : tCTGCTCC-AC--------------------TTTA----GAACTCCCA--TG-AC-T-TTAAC-TAGTTTC-ATGAGGAT--TT---------------------A-------------TTTTGTTGTGCTTGTGGAA--ATT-T---CTTTTAA-G-T-CAGTCCTTTGGCTCGCCAATT----TGTC------TAA---CCAA--TACAG-TAT-----------TGGAATGTAAATTCTGTCC-TA-TATA------AAAT-GCTATTGT-ATTG-----------GTAA---GG---------A--ATCCTC---AT----G--ACA-GAT---TG---A---A----ACTG----GTT--CACAT-----AG-------------CTCGTA--GT-----------------------GCACT-GATGATATAAACT--TCC---GAT-TTC-AGTGC----C--GGAATGTATGAACAG-TG----TTTT-T--TCTGAGGTCTTT--A----CTGAC---TGG-A-TTT-----TT-C-AAGT--TACTTCTGCC-ACGGGCA-GTGGAT-T-A-TGA-AA---TTCAC-TTTGCC-CTGCCAGAAGAATCC-AC--TG------CACCGGGGGT--GGGCAAT-GG-GATTTTGTCAGCCCCgtttggtcgttggtggtgtgaggtttggggcctgctccactttagaactcccatgactttaactagtttcatgaggatttattttgttgtgcttgtggaaatttcttttaagtcagtcctttggctcgccaatttgtctaaccaatacagtattggaatgtaaattctgtcctatataaaatgctattgtattggtaaggaatcctcatgacagattgaaactggttcacatagctcgtagtgcactgatgatataaacttccgatttcagtgccggaatgtatgaacagtgttttttctgaggtctttactgactggatttttcaagttacttctgccacgggcagtggattatgaaattcactttgccctgccagaagaatccactgcaccgggggtgggcaatgggattttgtcagcccct
gi|4 : tccaggggtgcaatatatttcttttagagcacttgcccacggcgcaagtgcatgacaaaaattcaacgagttgccactgtcccttgtgagtgttctactgtgcccacctttaacaaaattgtgcgaaattcaaacttaaaaaaacgtagttagtgacattaatgttttttcttgcgtttggtcgttggtggtgtgaggtttggggcCAGGGATTG-ACAA-ATAGAT-TT---T-AAG-AG-CAC-TTGCCCA-CGG--GTAT-----G----TGCA----TGACC---A--A----AATTC-A-C---TT-GCC-CTTCC---TGT--GA---TTTTA---CT-TGCCCTACCTTCAA-CAAAATTA--TG-ACAC-AAAACA---AATAA--------A-TGTAGTT--------TGTAATATT-CAT-ATA-TTATTGCTGC-CCAAC--------------------TTTG----GA-A-CCCG--TG-AAGC-TTAAC-TAGTCTC-ACGAG-AT--TA---------------------A---------------A----GTTCTT-CA-AGTTATT-TGTGCTTTC-ATG-T-CAG-CCTTCTGC-CGCCAATT----TGTT------TA----CCAA--TA-AA-TGT-----------TGAA--------CCTGATC-TA-TA-A------AT-T-ATCATTCAAGCTG-----------GTAA---GA---------A--AATCTC---GT-AACGACACA-GAT---T----A---A----ACTG----GTT--CATAC-----AGCTGA---------CT---A--GTTTACATAGCGAAAGACAACTCGTAC----GATGATATA--CT--TCC---GAT-TTC-AGT-C----C--G-AATGTACGA-CA--TG----TTTTAT--TCTA---TTTTTTCA----CTAAT---TGG-ATTTT-----T--C-AAGT--TACTT--GCCCACGGGCAAGTGG-T-T-A-TTA-AATA-TTTCC-TT-GTC-CTGCCAGAA-AATCC-ACT-TG------CCC--------CGGGCAAT-GGAAA-ATTGTCAGCt
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gi|7 : c-G-T-TAG-AATTCTGC-CACTAGTT----TGTT------TA----CCAA--TA-AG-TGTTCAACCTGTTCTAAA--------TTTGTTTGTA-T-TA------AA-G-ATTTGT---ATTGAATAAAGAAGCGTAACACAG---------ATTAAACTG---GTTCACAT-ACA-AATATGT----ATTTC----ACTA----GTT--CACAT-----AAGGGAAAATAACTCCT---T--GT-----------------------CC----TTTGATAAA--CT--CTT---GAT-TTC-AGT-C----T--G-ATTATACGA-CA--TGCAGCCTTTAT--TCTA---TTTTTC-A----ATCAC---TGG-A-TTT-----T--TGAAGT--CACTA--GTCTGCAGACAAGTGG-T-T-A-TTA-GATA-TTCAC-TT-GCC-CAACCATAA-AATCT-ACT-TG------CCCC
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gi|9 : ---GGT-TTC-AGT-T-------G-AAT-TACTG-CA--AA----TTTT-----CAAAACTTTTC--AGGGGCTGACAAATAC-A-TTT-----T--T-GAGG--CACTT--GCCCTCAGGCAAGTGG-C-TGG-TCA-AA-A-TTTAC-TT-GCC-CTACCTTTA-AATCT-GCT-TG------CCC
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