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Reference ( gi|1 ) : TCC-C-T-GAAA--CA----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-G-C-------------AG----A---G--C---GA----A--C----G---------G-T-G-A---C-T-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--A-C--AA-T-TTG-G--TGA----AC--G----G----TGA----A----A--G----CA---T-G---GA---GA-AC---A-A-A-C---G---------G--T--GAA------------C-A--C---A-CG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AA---A--A-TG------ACT-----G-A-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-GCA---------A-----AAA-----T-----G---TGA---A-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-TGC-------A--A--A-A-CG---C-A---TG-G--T--GA-C-C------G--CA--TG--GAAA-A-------ATG-G-T-AA------AGT---AGAA-CG-TTTCAG-GGATTGTATATGTACATCTGTCAACACAGGATTCTTAAGG
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gi|8 : TCC-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-CCG-C-------------AG----A---A--C---GC----A--C----G-----------T-G-A---C-C-G-T--A-C-GG-T----------G-AC--C--G-C--AA-T-TTG-G------------------------------------------------------------G-AC---------C---G---------C--T--GAC------------C-G--C---A-CG-C--------T--A---A----A----C----CG-----C-GA----C-C---GG------ACCGCA--A-TG--------T-----G-A-AC-G----------------G-T---G-A--C-CG--A-C-CG--C-T-G--A----C-C-GC------------------A-----C-----G---TGA---C-----C--G----ACCGCT--G-A--CC-G-C-A-CGC-------T--G--A-A-CG---C-A---
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gi|26 : agTCC-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----T-T---T---T---A-C------------C---A-----CTTGAACGATGAGCAAACGCTGAA-CGC--A------CA--G-----T--G--A--GCG-C--A-C-G-C-------------AG----A---G--C---GA----A--C----A---------G-T-G-A---G-C-G-C--A-C-GT-T----------G-AA--C--G-C--AA-T-at
gi|26 : aaTCC-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----T-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------T-TGA--A------CG--A-----T------------------------------------G----A---G--C---AA----A--C----G---------------------------------C-T----------G-AA--C--G-C--A-------------------C--A----G----TGA----G----C--G----CA---C-G---CA---GA-GC---G-A-A-C---A---------G--T--GAG------------C-G--C---A-CG-T--------T--G---A----A----C----
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gi|43 : agtTCC-C-T-GAAA--C-----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----CG---------------------A-AGC--A------CG--G-----T--G--A---CG-C--A-C-G-C-------------AG----AG--G--C---GA----C--C----G---------G-T-G-AACGC-T-G----A-C-GC-T----------T-GA--C--G-C--AA-
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gi|27 : agTCC-C-T-GAAA--TG----GT--CT-G----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CAC--A------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-T-G-G-------------AG----A---A--C---GC----A--C----G-------------------C-T-G-A--A-C-AA-T----------G-AA--TGAA-C--AA----TGAG--TGACCGCAC--G----G----TGA----T----A--G----CA---
gi|40 : agTCC-C-T-GAAA--AG----TTT-CT-A----C-T---T-------A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CC--G-----G--G--A--CCG-C--A-C-G-C-------------AG--------G--C---AACGCCA--C----G---------G-T-G-A---C-C-G-T--A-C-GG-T----------G-AC--C--G-C--AA-T-Tc
gi|59 : cagTCC-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------T---G----------------------------A-C-----------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-G-G-------------AG----A---C--C---GC----A--CT---G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-GC-
gi|57 : agTCC-C-T-GAAA--CG----TT--TT-A----C-T---T---TA--A-C------------C---A-----C----------------------A-TGCA-A------CG--G-----T--G--T--CCG-C--A-C-G-C-------------TG----A---A--C---GCT---A--C----G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-ga
gi|57 : gTCC-C-T-GAAA--CG----TT--TT-A----C-T---T---T---A-----------------------------------------------------------------------------A--CCA-C--A-T-G-C-------------A----------------------A--C----G---------G-T-G-T---C-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--G-C-----T-ACG-G--TGA----CC--G----
gi|38 : gTCC-C-T-GAAA--AACGTTTT--CTTA----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-C-C--A------CG--G-----T--G--A--CCT-C--A-C-GCC-------------AG----A---AC-C---GC----A--C----G---------ATT-G-A---C-C-G-T----C-GT-T----------G-AC--C--G-C--AA-T-TTG-ca
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gi|47 : agTCC-T-T-GAAA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------T-TGA--A------CG--G---------------------A-C-G-A-------------TG----A---G--T---GA----A--C----------------------------G-C--A-C-GG-T----------G-AA--T--G-C--AA-T-TTG-G--TGA----GC--G----G----
gi|29 : agTCC-C-T-GAAA--CG----TT--TG-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------T-TGA--A------CG--G-----T--G--A--GCG-C--A-C-G-C-------------TG----A---A--C---GC----AGTT----G---------G-T-G-AG--C-G-G-T--T-C-G--T----------G-AA--C--------------G-G--TGG----AC--G----C----TGA----A----C--G----CA---C-G---G
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gi|69 : TCCAC-T-GAAAT-CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CG--G-----T--GA-A--CCA-C--A-C-G-aa
gi|24 : gTCC-C-T-AAAA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-NNN--N------NN--N-----N--N--N--NNN-N--N-N-N-N-------------NN----N---N--N---NN----N--N----N---------N-N-N-N---N-N-N-N--N-N-NN-N----------N-NN--N--A-C--AA-T-TTG-G--TGA----TC--T----G----TGA----
gi|77 : agTCC-C-T-GAAA--CG----TT--TT-A----C-T---T-------A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CG--G-----T--G--A--CCA-C--tcggtgaccgc
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gi|19 : agTCC-C-TCGAAA--CT----CT--CT-A----C-T---T---T---A-CGGTTTAC-----C---A-----CG---------------------A-CGC--A------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-T-G-G-------------AG----ACACG--C---CAC---G--C----G---------T-T-G-A---C-C-A-C--A-C-GC------------G-AA-----G-C--AA-T-g
gi|87 : gTCC-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------gaataaaaatgaactaagcacggaactcacggaagataaat
gi|78 : cagTCC-C-T-GAGAAGCG----TTT-CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CG--G-----T--G--
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gi|30 : cagTCT-C-T-GAAA--CG----TT--C--A----T-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CG--GGAAGTT--G--AT-CCT-C--A-C-G----------------G----A-----------A----A--C----------------------------G-C--ATC-GC-T----------G-AA--C--A-TG-AA-T-----A--TGA----AA--A----GATACTGA----A----C--G----CA---C-G---G
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gi|89 : agTCC-C-T-GAAA--TG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--atgaatgaa
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gi|76 : cagTCC-C-T-GAAA--CG----TTA-TT-A----C-T---TTAAT---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGCA-A------CG--G-----T--
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gi|66 : cagTCC-CAT-GAAA--CA----TT--CT-A----T-C---T---T---A--------------C---A-----CG---------------------A-AGC--A------C---G-----T--G--G--ACG-CA-A-C-G-C-------------AG----tcaacgcaatttgttaagcg
gi|53 : acgTCC-C-T-G-AA--CGT---TT--CT-A----C-TA--T---T---A-C------------C---A-----CA---------------------A-TGC--A------TG--GT----T--G--A--CCA-C--ATC-G-------------------------G--C---G-----A--C----A---------A-T-G-A---C-
gi|13 : tacagCC-C-T-GAAA--CG----T---CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A----------------------------A--GC--A------CG--G-----T--G--A--CCG----A-C-G-C-------------AT----A---GG-C---AA----G--C----G---------G-T-G-A---C-C-GGC--A-C-GC-T----------G-AAAGC--G-C--AA-T-TTG-T--TGA----AC--G----G-----GA----A----T--G----CA---C-G---GA---GA-AA---G-A-ATC---G---------G--T--GAA------------A-G--C---A-CGAC--------T--G---A----A----C----AA-----T-AA----------GA------AA---A--A-TG------ACT-----G-A-AT-GC---A-------CA--G-cagcgaac
gi|23 : agCC-C-T-GAAA--CA----TT--CT-T----A-T---T---T---A-C------------C---C-----C----------------------A-TG----------CT--G-----T--G--A--CCG-CA-A-C-G-C-------------AG----A---G--T---GA----A--T----G---------G-T-GAA---C-T-G-C--A-C-GC-T----------GAAA--T--G-C--AA-T-TAG-G--TGA----AC--G----G----AGA----A----C--G----CA---T-G---AA----------------------------------T--GAA------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----
gi|64 : CC-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------CA--A-----C----------------------A-CGC--A------TG--G-----T--G--A--
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gi|74 : agtcCC-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----atttggt
gi|82 : CC-C-T-AAAG--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------T-TTA--A------CG--G-----T--G--tctgtattattaagctggaa
gi|3 : agcC-C-C-GAAA--CG----TTGTCT-A----C-T---T---T---A-C----------------------C----------------------A-CGC--G------CG--G-----T--GAAA--CCG-C--A-C-G-C-------------AG----A---A--C---GA----G--A----A---------G-T-G-G---C-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AC--G--G-C--AG-T-TTG---------------G----G----TG-----A----A--G----C----T-----GA---GA-AC---A-C-A-C---G---------G--TTGGAAC-----------C-A--CGCAA-CG-C--------TCGA---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GAAC----AA---G--A-TG------ACT-----A-A-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-TGG--A----A-C-CCATGG------T-----GAG-----T-----C---CGA---T-----C--G----A----T----A--CC-G-C-A-TTT-------G--T--A-C-CGAT-C-A---CG-GC-T--GA-A-C------G--CACTTAC-GAAA-ACAACACTAGA-G-T-AACCAAGTAGT---AGAA-CG-TTT
gi|2 : agtC-C-T--AAA--CG----TTA-CT-A----C-T---T---T---A-CAACGCACGGTGCC---G-----C----------------------A-CGC--AGAAGAACG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-G-C-------------AG----A---A--C---GA----A--C----G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-TC--------------AA-----A-C--GA-A-TCG-T--GGA----AC--GCAC-C----TGA----C----C--G----CAAT-T-G---G----GA-ACGG-A-A-A-CAAAG---------G--T--GAA------------C-G--C---A-CA-C-----------G---A----A----CA---AA-----T-GAC---A-T----A------AA---A--A-TG------ACT-----A-A-A--GC---A-------CGA-G-T---G-A--C-CC--G-A-CG--C---G--A----A----CA---------A-----AAA-----T-----GAAATGA---A--------A----A----T--G-A--CT-------TAC-------A--A-----------C-A---CC-G--T--GA-C-C------GA-CGC-TG--AAAC-A-------ATG-
gi|18 : agtaC-C-T-GAGA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CG--G-----T--G--A--TCG-C--A-C-G-C-------------AG----A---G--C---GA----A--T----GAGCCGCATCG-T-G-A---T-T-G-C--A-CGGC-T----------G--------A-C--AA------------G----AC------------TGA----A----A--A-----A---T-----GACT-GA-AC---G-C-A-C---G---------G--T--G-A------------C-G--C---A-CG-C--------A--G---A----A----C----GC-----T-G-----G-T---GA------Aaatgaaaatgcataaacacatggtg
gi|22 : C-C-T-GAAA--CG----TT--CT-AA---C-TA--T---T---A-C------------C---------C----------------------A-CGCCAA------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-G-C-------------AG----A---AC-C---GC----A--C----G---------G-T-G-C---C-T------------------------------C--G-C--AA-T-TTG-G--TGAC---CC--G----T----TGACCGCA----AC-G----CA---C-C---GC---GA-A----A-A-A-C---G---------GC-T--GAC------------C-G--C---A-cgcat
gi|5 : C-C-T-GAAAAACG----TT--CT-A----C-TC--T---T---A-A------------C---------C----------------------A-CGA--A------TG--------T--G--A--C-G-C--G-A-G-C-------------A-----A---G--C----A----A--C----G---------A-T-G-A---C-C-G------------------------AA--C--A-------------G--TGA----CT--G----G------------------------CA---T-G---CA----A-GC---G-A-A-C---G---------A--T--GAC------------C-A--C---G--G-T--------A--G---A----A----CTGC-AG-----C-GA----G-T---GA------AC---G--A--G------ACC----------C-GC---A-------CG----T---G-A--C-AA--C-A-TG--C-A-G--A----G-T-GCC---------G-----A------------------GA---A---------------------A-A--CC-G-C-A-CAG-------A--G--A-A-CG---C-G---AC-A--T--GA-C-C------G--CA--T
gi|54 : gtcaC-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----CCT---T---T---C-C------------C---A-----A----------------------G-CCC---------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-G---------------AGAA--A---G--C----C----A--C----G---------G-T-G-A---ctgaacaagaataaaaatgagtaaacgctcggt
gi|75 : agtC-C-T-GAAA--CG----TT--CT------C-TAACT---T---A-C----------------A-----C----------------------A-CGC--A------CG--G-----T--G--agcaatgaaat
gi|46 : cagtC-C-C-GAAA--CG----TT--TG-A----C-T---T-------A-C------------C---A-----C------------------------TGA--AG-----CG--G-----T--G--A--GCG-C--A-C-G-C-------------TG----A---A--C---GC----AGTT----G---------G-T-G-G---C-G-G-T--T-C-G--T----------G-AA--C--gacg
gi|58 : agt-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----C-T---T---T---A-C------------CC--A-----C----------------------G-CGC--AA-----CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-G-C-------------GA----C---C--C---GC----A--C----G---------G-T-G-C---C-C-G-C--A-tggt
gi|39 : -C-T-GAAA--CG----TTT-CT-AG---C-T---C---T---A-CAC----------CTA-A-----T----------------------A-CGC--A------CG--G-----T--G--A----G-A--T-C-A-C-------------AG----A---A--C---GA----A--C----G---------C-T-G-A---C-TCG-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--A-atttg
gi|73 : t-C-T-GAAA--CG----TT--CT-A----T-T---T---T---A-C------------C---A-----A----------------------A-TGC--A------CG--G-----T--A--A--TCG-T--A-A-G-C-------------AG----atgaagaaa
gi|33 : -GAAA--CG----AT--TT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----A----------------------AACGCC-A------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-T-A-C-------------AG----ACT-G--CGCGGA----A--C----G---------G-C---A---T-C-G-C--A-C-GC-T----------A-AA--C--G-C--AA-T-TTG-AGTTGA----AC--G----G----TGA----
gi|15 : AAA--CG----TT--GT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-CACCGA------CG--G-----T--G--A--C-G-C--A-C-A-C-------------AG----A---G--C---GA----C--C----G---------G-T-G-A---C-C-G-CA-A-C-GT-TC---------G-AC--C--G-C---G-T-TTG-G--TCA----TC--G----G----C--------------G----CA---C-----------C-AC---A-C-A-CT--G---------G--T--GTC------------C-G--CT--ATCG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-TATCGA------AA---A--ATTG------ACT-------A-AC-GC---A-------
gi|20 : AAA--CG----TT--TT-A----C-T---T---T---A-C------------C------------------------------------C--A------CA--A-----T--G-----CC------------------------------------------------A--C----G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-T-GC-TG---------G-AA--A--A-C--A-----TG-GAATGA----A---------------A----A----A--GGGGACATACT-G---AA---AA-GC-------A-C---G---------GT-T--GAAC-----------C-G--C---A-TG-C--------T--G---A----A----C----AAT----T-GA----A-T---GA------AA---A--acg
gi|4 : agtcctgaaacaaaT--TT-A----C-T---T---TTAAA-C------------C---A-----C----------------------A-CGC--A------CG--T-----A--G--A--CCG-C--A-C-G-C-------------AA----A---G--T---GA----A--C----------------T-G-A---C-T-GCC--A-C-GC-T----------G-AGATC--G-CCAAA-TCTTG-G--TGA----AC--G----G----TGA----GCCGCC--G----CA---C-GGCTGA---GA-GT---GCA-G-C---G---------GACT--GAA------------C----------CG-C---------------A----A----A----AA-----T-TA----C-TA--GT------AA---A--A-------------------A-AA-AC---A-------GG--G-T---G-A--C-GT--C-A-CG--C-A-G--A----A-C-GCA---------
gi|67 : accatgaacctacttttc--CT-A----C-T---T---T---A-C------------C---A-----C----------------------A-TGCA-A------TG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C---C-------------AGC---A---A--T---GA----A--C----G---------G-T-G-ctgggaccgacagaaaaatgttaaaagagaacgttttcgggagagctcatctgtca
gi|7 : ta---A-----C----------------------A-CGA--A------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-A-C-------------AG----A---G--C---GA----A--C----G---------A-T-G-A---C-C-G-C--A-C-AT-T----------G-AA--C--A-------------A--TGA----A-------------TGA----A----A--A-----A---T-G-----------ACT--A-A-A-C---GCA-------G--T--GAC------------C-AGCC---A-CG-C--------TA-G---A----AGG--C----AA-----CGGG----G-T---GT------AT---C--C-TT------GCTAGTAAG-A-AC-GA---A-------CG--A-T---G-A--C-CG--C-A-TG--C-
gi|44 : -----C----------------------A-CGC--A------CG--------T--G--A--CCG-C--A-A-G-C-------------AG----A---A--C---GC----A--C----GT--------G-T-G-A---C-C-G-C--A-atacggagaaaacgctcgaaatggaaaatatggtaattagaga
gi|34 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------------------A-TGC--A------CA--G-----T--G--A--TCG-C--A-T-G-G-------------AG----A---A--C---GC----A--C----G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A---GC-T----------A-A----------------TTA-A--TGA----A-------------TGA----A----A--A-----A---T-----GACT-GA-AC---G-C-A-C---G---------G--T--GAC------------C-G--C---A-CA-------------G---A----A----A----AA-----T-Gattttggtgacc
gi|31 : -CGA--A------CG--G-----T--C--A--AGG-C--G-C-G-G-------------AG----A---A--C---GA----A--C----G---------G-T-G-A---A-C-G-C--A-C-TC-T----------G-AA--C--A-
gi|17 : gaccgtgaccgcacgctgaacgcaatttggGC--A------CA--C-----T--G--A--AAG-C--A-T-G-C-------------AG----A---G--C---GA----A--C----T---------G-T-G-A---G-C-G-C--A-T-GC-T----------G-AA--C--G-------T-GTG-G--TGA----GT--GATTAG----TGA----A----A--G----CA---T-G---CA---GA-GC---A-A-A-C---G---------G--T--GAG------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----atgaatgaaaaatgattgaa
gi|28 : ttaccacttgaacggcgagtgcatgctgaacgcatggtgagtC--A------CG--G-----T--G--A--CCA-C--A-C-G-G-------------AG----A---A--C---GC----C--T----G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-GG-A----------G-AA--T--G-C--A-----CG-G--TGACC--AC--G----GC---TGA----AC---AATG----AA---T-G---AA---GA-AT-----G-A-C----------------T--GAA------------C-A--
gi|55 : cacggtgacctC--A------TG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-G-CTGATTATGCATGGAG----A---A--C---GC----A--C----G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A---GC-T----------G-AA--C--A-
gi|11 : --A------CG--G-----T--G--A--ACG-C--A-C-G-C-------------AG----A---G--G---GA----A--C----G---------G-T-G-A---T-A-G-C--A-C-GC-A----------G-Aatgaatgaaaaat
gi|21 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna------CG--G-----T--G--A--CCG-C--A-C-G-C-------------AG----A---C--C---GC----A--C----G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-Ggagaaagtgagcgcatg
gi|32 : accgctgaccgcgaacagtgaccgcacgctgaccgcaaaactgtgac------CG--G-----T--G--A--GTG-T--A-C-A-C-------------AG----A---G--C---AA----A--C----G---------G-T-G-A---G-C-G-CNNN-N-NN-N----------N-NN--N--N-N--NN-N-NNN-N--NNN----NC--G----G----TGA----G----T--G----TA---C-A---CA---GA-GC---A-A-A-C---G---------G--T--GAG------------T-G--C---A-CA-C--------A--G---A----gaaaaatggtaaagtagaacgtttcagggactgtatgtt
gi|51 : ------CG--G-----T--G--A--ACG-C--A-C-G-C-------------AG----A---G--C---GA----A--T----G---------A-T-G-A---
gi|21 : cagtccttgatccgtttttcttttccaccttaacagtgagtggg-C-G-C-------------TG----ACC-G--C---GA----A--C----A---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AC--C--G-C--AA-A-ACT-G--TGA----CC--G----G----TGA----C----C--G----CA---C-G---CA---GA-CC---G-C-A-C---G---------G--T--GAC------------C-G--C---A-CG-------------G---A----A----A----AA-----T-G
gi|35 : ac-C-------------GG----A---G--C------------C----A---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--A-gtaaagtagaacgtttcagggactgtatgtt
gi|63 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaacttta----A---A--C---GC----A--C----A---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--A-tgaatgtga
gi|72 : caataaatgaaaaatgacta----A---G--C---GA----A--C----G---------G-T-G-A---G-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--G-C--AA-T-TTG-G--TGA----GC--G----G----Tatgaatgaaaaatga
gi|17 : at---GA----A--C----G---------G-C-G-A---G-T-G-C--A-T-GC-T----------G-AA--C--G-C--A-----TG-G--TGAGTGCAC--A----C----TGA----A----A--G----CA---T-G---CA---GA-GC---G-A-A-C---T---------G--T--GAG------------C-G--C---A-TG-C--------T--G---A----A----CGTGTGG-----T-GA----G-T---GATTAGTGAA---AGCA-TG-------CA-----G-A-GC-AA---A-------CG--G-T---G-A--G-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-
gi|14 : ttaccacttA----A--C----G---------G-T-G-A---A-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--A-
gi|46 : aaagcaatttggtaA----G--C----G---------G-T-G-A---G-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--G-C--AG---TTG-G--TG-----GC--G----G----Tatgaatgacaaaatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatggtaaagaagaacgtttcaaggactgta
gi|31 : agtcccgaaacgtttgacttaccactga----A--C----C---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--G-C--AA-T-TTG-G--CGA----AC--G----G----TCA----A----G--G----CG---C-G---GA---GA-AC---G-A-A-C---G---------G--T--GAA------------C-G--C---A-CT-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AA---A--A-TG------ATT-----G-A-Atcgtgaactggt
gi|28 : g----A--C----G---------G-T-G-A---C-C-T-C--A-C-GG-T----------G-AC--C--A-C--A-----CG-G--AGA----AC--GCCTGG----TGA----C----C--G----CA---C-G---GA---GA-AT---G-C-A-C---G---------G--T--GAC------------C-A--C---G--G-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AG---A--A-TG------ACT-----G-A-AC-
gi|55 : c----A--T----G---------G-T-G-A---C-C-G-C--A-C-GC-T----------G--------------A-T-T----------------------------------A----T--G----CA---T-G---GA---GA-AC---G-C-A-C---G---------G--T--GAC------------C-G--C---A--G-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AA---A--A-Ta
gi|61 : c----A--C----G---------G-T-G-A---G-T-G-A--A-C-GA-T----------G-A------A-C--AA-T-TT--G--TGA----A---A----G----CGA----G----C--G----GT---T-G---GT---G---------A-A-C---G---------G--T--GAA------------C-G--C---A-
gi|52 : taactc-G-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--G-C--AATT-TTA-G--TGA----AC--G----
gi|6 : agtccctgaaaacgttctacttagc-C--A-C-GC-T----------G-AA--C--G-C--A----TTG----TGA----CC--G-----------------------------CA---C-G---GA---GA-AC---G-CCA-C---G---------G--T--GGA------------C----------CG-CCAGGTTCTT--G---A----A----T----TA-----T-GATAGTA-T---TA------AT---A----TG--------------G-AGAC-G----A-------CC--A-T---G-A--C-CG--CCA-CC--C-T-G--A----C-CCGCA---------------------------------------------T--G----G----TTGG-A--CC-GGC-A-TTT-------G--ATGA-A-AG---C-A---CG-GGTT--GA-T-T------A--AA------AAAG-A-------ATG-G-T-AA------AGT---AGAA-CC-ATTCA--GGACTGTATCTGTcacgctgaacaatgaatgaa
gi|34 : --TGC----AC--A----G----TGA----T----C--G----CA---T-G---GA---GA-AC---G-C-A-C---G---------G--T--GAC------------C-G--C---A--G-C--------T--A---A----T----T----AA-----T-GA----A-T---GA------AA---A--A-TG------ACT-----G-A-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-C
gi|7 : aGA----AC--G----G----TGA----C----C--G----CA---C-A---CA---GA-GC---G-A-A-C---G---------A--T--GAC------------C-G--C---A-CA-T--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AA---A--A-TG------ACT-----A-A-AC-GC---A-----------G-T---G-A--C-CAGCC-A-CG--C-TAG--A----A-G-GCA---------A-----------------------CGG------------G----G----T--GTA--TC---C-T-TGCTAGTA--A--G--A-A-CG---A-A---CG-A--T--GA-C-C------G--CA--TG--agaaaaatg
gi|13 : acac----AC--G----G----TGACCG-A----C--G----CA---T-A---GG-------C---A-A-G-C---G---------G--T--GAC------------C-GG-C---A-CG-C--------T--G---A----AAGCGC----AATTTGTT-GA----A-C---G-------GG---A--A-TGC-----ACGGA---G-A-AA-GA---AT------CG--G-T---G-A--A-AG--C-A-CGA-C-T-G--A----A-C--------------------AA-----T-----A---AGA---A-----A--A----A----T--G-A--CT-G-A-A-TGC-------A--catacggagaaaacgctcgaaatggaaaatatggtaattagaga
gi|45 : agccctgaaacgtctactttaccaagc----AC--G----G----TGA----C----C--G----CA---C-G---TA---GA-GC---G-A-C-C---G---------T--T--GAC------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---ACC--A----C----AA-----T-cag
gi|18 : gtccctgaaatgttctactttatcacacgc----AC--G----G----TGA----T----C--G----CA---C-G---CA---GA-GC---G-A-A-T---GAGCCGCATCG--T--GAT------------T-G--C---A-CGGC--------T--G---A---------C----AA-------GA----C-T---GA------AA---A--A-TG------ACT-----G-A-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A----CG--C-A-CG--C-A-G--A----A-C-GC------------------------TG----G---TGA---A-----C--G----
gi|41 : cctgagacgttctactttaccacacgc----AC--G----G----TGA----ATT--C--G----CA---C-G---AG---AA-AC---A-A-A-C---G---------G--T--GAC------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---ACC--A----C----AA-----cat
gi|27 : agtccctgaacgttctactttaccacaagc----AC--G----G----TGA----C----C--G----CA---T-G---GA---GA-AC---G---------------------------------------------C---A-CG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AC---A--A-TG------AGT-----G-A-CC-GC---A-------CG--G-T---G-A--T-AG--C-A-Cat
gi|39 : agtccctgaaatggtctgctttaccacacac----AC--G----G----TGA----G----A--T----CA---C------A---GA-AC---G-A-A-C---G---------C--T--GACT-----------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-----GA------AA---
gi|19 : tctgaaacgtttctagctctacacctaatacgc----AC--G----G----TGA----C----C--G----CA---T-G---GA---GACACGCCA-C-G-C---G---------T--T--GAC------------C-A--C---A-CG-C--------G--A---A----G----C----AA-----T-GA----A-T----A------AA---A--A-TGA-----ACT-----A-A----GC---A-------CG--G-
gi|23 : gtccctcgaaactctctactttacggtttaccacgacgc----G----TGA----C----C--G----CAA--C-G---CA---GA-GT---G-A-A-T---G---------G--T--GAA------------CTG--C---A-CG-C--------T--G---A----AATG-C----AA-----T-TA----GGT---GA------AC---G-----G------A-------G-A-AC-GC---A-------TG--AAT---G-A--A-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-aactcacggaagataaat
gi|14 : ccctgaaacattcttatttaccccatgctA----A----A--G----CAATTT-G---G--------T---A-A-A-C---G---------G--T--GAA------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GAC-----AA---A--A-TG------AC------------------------------N-N---N-N--N-NN--N-N-NN--N-N-N--N----N-N-NNN---------N-----NNN-----N-----N---NNN---N-----N--N----N----N--N-N--NN-N-N-N-NNN-------N--N--N-N-NN---N-N---NN-N--N--NN-N-N------N--NN--NN--NAAA-A-------ATG-G-T-AA------AGA---AGAA-CG-TTTCAA-GGACTGTA
gi|63 : A-AC---G-C-A-C---A---------G--T--GAC------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AA---A--A-TG------A
gi|26 : caataaatgaaaaatgacta-A-A-C---G---------A--T--GAG------------C-A--A---A-CG-C--------T--G---AACGCA----C----AG-----T-GA----G-C---G------------C--A-CG-------CA-----G-A-GC-GA---A-------CA--G-T---G-A--G-CG--C-A-CG--T-T-G--A----A-C-GCA---------A-----
gi|29 : aatccctgaaacgttctattttaccacttg-A-A-C---G---------G--T--GAG------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----ACG--C----AG-----T-TG----G-T---GA------GC---G--G-TT------CGT-----G-A---------A-------CG--G-T---G-G----------A-CG--C-T-G--A----A-C-GCA---------t
gi|31 : cagtccctgaaacgtttgactttaccacttg-A-C---C---------G--T--GAC------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----CGC--AA-----T-T-------T---GG------CG---A--A-CG------G-T-----C-A-AG-GC---G-------CG--G-A---G-A--A-CG--A-A-CG--G-T-G--A----A-C-GC-----------------AC-----T-----C---TGA---A-----C--A----A----T--G-A---------A-TGA-------A--A--A-A-TG---cggt
gi|18 : g-A-C---G---------G--T--GAT------------C-G--C---A-CG-C--------A--G---A----G----C-------------GA----A-T---GA------G------------------C-----------C-GC---A-------TC--G-T---G-A--T-TG--C-A-CGG-C-T-G--ACAAGA-C-TGA---------A-----AAA-----T-----GAC-TGA---A-----C--GCACGG----T--G-A---C-G-C-A-CGC-------A--G--A-A-CG---C-----TG-G--T--GA-A-C------G--CA--Tattgaa
gi|70 : cctgagacgttctactttaccacacgc-A-C---G---------G--T--GAA------------A-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AA---A--A-TG------ACT-----A-A-AC-AC---A-------
gi|55 : gc-A-T---G---------G--T--GAC------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----T----T----A------T-GC----A-T---GG------A-------------------------G-A-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A--G--C-T-G--A----A-C-
gi|20 : c-A-C---G---------G--T--GAC------------C-G--C---A-TG-C--------T--GGAAA----A----C----AT-----G-GA----A-T---GA------AA---A--A-GGGGACATACT-----G-A-AAAGC---A-------CG--G-TTG-A-A--C-CG--C-A-TG--C-T-G--A----A-C-aatgaatgaaaaat
gi|30 : agtcctgaaacaaaaaacgttttactttacccacaatgcc-A-C---G---------G-----AAA------------C-G--C---ATCG-C--------T--G---A----A----C----A------T-GA----A-TAT-GA------AA---AG-A-T-------ACT-----G-A-AC-GC---A-------CG--G-aattgaatgaaaa
gi|35 : agtctctgaaacgttcattttaccacacgcacgggaagttgatcctc-C---A---------G--T--GAC------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----C-----A-----T-GA----A-T---G
gi|52 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaactttacggagc---------G--T--GAA------------C-G--C---A-CG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------Atga
gi|81 : agtccctgaaaacgttctacttagcgcacgctgaacgcaatttta-CG-C--------T--G---A----A----C----AA-----T-GA----A-T---GA------AA---A--A-TT------ACT-----G-A-AT-G----A-------CG--G-T---G-
gi|63 : ----C----AA-----T-AA----A-T---GA------AA---A--A-TG------ACT-----A-A-AC-GC---A-------CA--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-
gi|47 : -----T-GA----A-C---GG------AC---G--A-TG------AGT-----G-A-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--A-TG--C-A-aatgaatgaaaaatga
gi|39 : agtccttgaaacgttctactttaccactA---G--A-TC------ACA-----G-A-AC-GA---A-------CG--C-T---G-A--CTCG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-atttggtgagcgg
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gi|33 : ccctgaaacattcttatttaccccatgctgG------ACT-----G----C-GCGGAA-------CG--G-C-----A--T-CG--C-A-CG--C-T-A--A----A-C-GCA---------ATTT--GAG-----T---------TGA---A-----C--G----G----T--G-A--a
gi|46 : gaaacgatttactttaccaaaacgccacggtgaccgcataca------ACT-----G-A-A-------G-------CG--G-T---G-A--G-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-GCA---------
gi|21 : agtcccgaaacgtttgacttaccCT-----G-A-CC-GCGA-A-------CA--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-T-G--A----C-C-GCA---------A-----AAC-----T-----G---TGA---C-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-CGC-------A--G--A-C-CG---C-A---CG-G--T--GA-C-C------G--CA--CG--GAAA-A-------ATG-G-T-AA------AGT---AGAA-CG-TTTCAG-GGACTGTATGTgttggtggcggttcgtgaactggt
gi|57 : accgCT-----G-A-AC-GCT--A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-t
gi|52 : gtccctgaaacgttttactttaaccacatgcaacggtgtccgcacgCT-----G-A-AC-GC---AATTT---TA--G-T---G-A--A-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-
gi|28 : agtccctgaaaacgttctacttagcgcacgT-----G-A-CC-TC---A-------CG--G-T---G-A--C-CA--C-A-CG--G-A-G--A----A-C-GC----------------------------------------------CT-G----G----T--G-A--CC-G-C-A-CGG-------A--G--A-A-TG---C-A---CG-G--T--GA-C-C------A--CG---GCTGAAC-A-------ATG-----AA------TGA---AGAA-TG-aatgaatgaa
gi|16 : cacgg-----G-A-AC-G-------------G--G-T---G-A--CGCG--C-A-CG--CCT-G--A----A-C-GCA---------A-----TTA-----G-----G---TGA---T-----A--G----G----T--GAA--AC-G-C-ATTGG-------A--G--A-A-CG---A-A----A-G--T--GA-A-C------G--CA--CG--actgaaca
gi|34 : tcccagaaccgatctacttttaccacacgcagctagtgaccgatacgcagagc-----G-A-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A--G--C-T-A--A----T-T--------------------AA-----T-----GAA-TGA---A-----A--A----A----T--G-A--CT-G---------------------A-A-CG---C-A---CG-G--T--GA-C-C------G--CA--CA--GAAA-A-------ATG-ctgatcaatgattgaaa
gi|41 : atgcacagtgatcgcatgga-A-AC-AA---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-T-G--A----C-C-ACA---------A-----A
gi|33 : agtccctgaacgttctactttaccacaagcacggtgaattcgcacgaga-A-AC-GCC--A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-TA--C-A-G--ACT--G-C-GCG----------------------------------GA---A-----C--G----G----C----A--TC-G-C-A-CGC-------T--A--A-A-CG---C-A---t
gi|72 : gaaacgatttactttaccaa-A-GC-GA---A-------CG--G-T---G-A--G-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-GC-----------------AA-----TTTG--G---TGA---G-----C--G----G----T--atttgagttgaacggtga
gi|45 : at-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--T-A-G--A----G-C-G-------------------------------------A---C-----C--G----T----T--G-A--CC-G-C-A-CGC-------
gi|42 : gtccctgaaatgttctactttatcac-AC-GC---A-------CG--G-T---GCA--C-CG--C-A-CG--C-A-G--A----A-C-GCA---------C-----G-------------G---TGACGTA-----C--G----G----T--G-----C-G-A-A-CGC-------A--A--tgaccacaat
gi|36 : tccctgaaacgttctactttaccac-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-----------G--A----A-C-GCAG--------A-----GAA-----C-----G---AGC---A-----CG-G----G----T--G-G--AC-G-C-G-TAC-------ttt
gi|27 : agtccctgaaacgttctaaaactttaccac-AC-AC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-TG--G-A-G--A----A-C-GC------------------A-----C-----GC--TGA---A-----C--A----A----T--G-A---------A-TG--------------A-A-CA-----A---TGAG--T--GA-C-C------G--CA--CG--Gggtgaatac
gi|40 : agtccctgaaatggtctgctttaccac-AC-GC---A-------CC--G-G---G-A--C-CG--C-A-CG--C-A-GGCA----A-C-GCC---------A-----CGG-----T-----GAC-CGT---A-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-tgatagcac
gi|22 : cagtccctgaaaagtttctacttaccac-AC-GCCA-A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-A-G--A----ACC-GCACGGTGCCTCG-----CAA-----TTTG--G---TGAC--C-----C--G----T----T--G-A--CC-G-CAA-CGCACCGCGAA--A--A-A-CG----------G-C--T--GA-C-C------G--CA--att
gi|68 : cctgaaacgttctaactattaccc-AC-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-
gi|37 : agtccactgaaacgttctaatttaccac-AC-GC---A-------CGCGG-T---G-A--C---------CG--C-T---------A-C-GCA---------G-----AAA-----C-----A---CAA------------G----G----T--G-A--CC-G-C-A-
gi|44 : agtcccctgaaacggttctaatcactttagccgaaac-AC-GC---A-------CG----T---G-A--C-CG--C-A-AG--C-A-G--A----A-C-GC------------------A-----C-----G---T-------------------G----T--G-A--CC-G-C-A-atttggt
gi|4 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncC-GC---A-------CG--G-CTGAG-A--G-TG--C-AGCGGAC-T-G--A----A-CCGCA---------A-----AAA-----TTACTAG---TAA---AAAAAACAGG----G----T--G-A--CG-T-C-A-CGC-------A--G--A-A-CG---C-AC--TG-G-----GA-C-C------G---A--CA--GAAA-A-------ATG-T-T-AA------AAG---AGAA-CG-TTTTCG-GGA--G-A---GCTCATCTGTCAattttggtgacc
gi|13 : accatgaacctacttttctttacttttaaaccacacgcacgtagaccgcacgcaaagtgaactgactgccacgctgagatcgccaaatcttggtgaacggtgagccgc-GC---A-------CG--G-T---G-A--C-CG----------------------A-C-GCA---------T-----AG------------G---CAA---G-----C--G----G----T--G-A--CCGG-C-A-CGCTG-----A--A--A-G-CG---C-AATTTG-T--T--GA-A-CGGGAATG--CA--CG--GAGA-A-------A
gi|41 : agccctgaaacgtctactttaccaa-GC---A-------CG--G-T---G-AATT-CG--C-A-CG--------------------A---------G-----AAA-----C-----A-----A---A-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-CGC-------gaatcggtgaaagcacgactgaacaataagaaaaatgactgaatgcacag
gi|70 : agtccctgaacgttctactttaccacaa-GC---A-------CG--G-T---G-A--A-AG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C--------------------AA-----T-----GAA-TGA---A-----A--A----A----T--G-A--Ctgaccacaaat
gi|55 : C---A-------TG--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-T-G--A---------------------------------------------------------------------T--T-A--T--G-C-A-TGG-------A--G--A-A-CG---C-A---CG-G--T--GA-C-C------G--CA---GCTGAAC-A-------ATG-taaacaca
gi|20 : C---A-------CG--G-T---G-A--C-CG--C-A-TG--C-TGG--A----A-A-ACAT--------G-----GAA-----T-----G---AAA---A-----A--G----G----G--G-A-------C-A-TACT------G--A--A-A-AG---C-A---CG-G--TTGAA-C-C------G--CA--TGCTGAAC-A-------ATaatgaaaaat
gi|31 : agtcctgaaacaaaaaacgttttactttacccacaatgc---A-------CC--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-GC-----------------AA-----TTTG--G---CGA---A-----C--G----G----T--C-A--AG-G-C-G-CGG-------A--G--A-A-CG---A-A---CG-G--T--GA-A-C------G--CA--tgaatgaaaa
gi|57 : g---A-------CG--G-T---G-T--C-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-GC------------------------T---------------A-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-ctctgaacaatgaatgaaaaatgattgaa
gi|29 : gtccctgaaacgttttactttaaccacatgca---A-------CG--G-T---G-A--G-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A-C-GCA---------GTTGGTGAGCGGTTC-----G---TGA---A-----C--G----G----T--G-G--AC-G-C---TG--------------A-A-CG---C-A---CG-G--T--
gi|11 : cagtccctgaaacgtttgactttaccacttga---A-------CG--G-T---G-A--A-CG--C-A-CG--C-A-G--A----------------------------------------G---GGA---A-----C--G----G----T--G-A--TA-G-C-A-CGC-------A--G--A-G-AG---A-A----A-G--T--GA-G-C------G--CA--TG--
gi|35 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna-------CA--G-T---G-A--C-CG--C-A-CG--C-T-G--A----A----CA---------T-----GAA-----T-----G---TGA---
gi|12 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaactttacggagc-CA--C-A-CG--C-T-G--A----A-C--------------------AA-----T-----GAA-TGA---A-----A--A----A----T--G-A--CT-G---------------------A-A-CG---C-A---CG-G--T--GA-C-C------
gi|49 : tccctcgaacgttctactttaccacacggagcgaatggtgaccgcacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt-----T-----A---TGA---C-----C--G----G----T--G-A--GC-G-T-A-CGC-------ATAG--A-G-CA---C-A---CC-G--T--GAACAC------A--CA--TG--GA-------------GCG-C-AC------AG----AGAA-CG-TCTCAG-GGACT
gi|72 : agc-----G---CGA---A-----C--G----G----T--G-A--GC-G-C-A-CGC-------T--G--A-A-CG---C-AATTTG-G--T--GA-G-C------G--
gi|59 : ata---TGA---C-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-CGG-------A--G--A-C-CG---C-AC--TG-G--T--GA-C-C------G--CA--CG--gt
gi|62 : agtccctgaaacgttctactttac---TGA---A-----C--G----G----T--G-A--GA-G-C-A-GGC-------T--G--A-A-CG---C-A---TT-G--T--GA-cga
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gi|57 : cctgaaacgttctaactattacccacgccA---A-----C--G----G----T--G-T--CC-G-C-A-CGC-------T--G--A-A-CG---CTA---CG-G--T--GA-C-C------G--CA--atttggtgacccgttgaccgcaacgcaccgcgaaaaacggctgaccgca
gi|58 : gtccctgaaacgttttactttaaccacatgcA---A-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-CGC-------G--A--C-C-CG---C-A---CG-G--T--GC-C-C------G--CA--
gi|45 : ctgaaacgttctactttacccacgcgc---A-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-CGT-------A--G--A-G-CG---A-C---CG-T--T--GA-C-C------G--CA--CG--atttg
gi|15 : gtccctgaaatgttctactttatcacacgc---A-----C--G----G----T--G-A--C--G-C-A-CAC-------A--G--A-G-CG---A-C---CG-G--T--GA-C-C------G--CA--ctgaccacaat
gi|41 : aaacgttgtactttaccacacaccg---A-----C--G----G----T--G-AATTC-G-C-A-CGA-------G--A--A-A-CA---A-A---CG-G--T--GA-C-C------G--CA--CG--acgttcgaccgcgtttggtcatcggcgcaccacacactggtgtccgctatcgctgaacaatgaatatcgaaaaattgactaacgcaacg
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gi|19 : cacggtgacctc---A-----C--G----G----T--G-A--CC-G-C-A-TGG-------A--G--ACA-CGCCAC-G---CG-T--T--GA-C-C------A--CA--CGC-GAAGCA-------ATGAA-T-AA------Atgcacggtgaccacggctgaacaatgaatgaagaatgactgaaca
gi|40 : gtccctcgaaactctctactttacggtttaccacgacgc-----C--G----G-------G-A--CC-G-C-A-CGC-------A--GGCA-A-CG---CCA---CG-G--T--GA-C-C------G--TA--CG--Gaatgaactaagcacggaactcacggaagataaat
gi|37 : cagtccctgaaaagtttctacttaccacacgcac-----C--G----G----T--G-A--CC-G-CTA-CGC-------AG-A--A-A-CA---C-A---AG-G--T--GA-C-C------G--CA--tgaccgcaatt
gi|50 : agtcccctgaaacggttctaatcactttagccgaaacacgcacg-----C--A----G----T--G-A--AT-G-C-A--GC-------A--G--A-G-CG---C-AA--CGTG--T--GA-G-C------G--AAA-CG--AAAA-A-------ATG-AAT-AA------AAT---TGGA-CG-TTTCAT-GGACTGCAatttggt
gi|44 : ----G----T--G-A--CC-G-C-A-AGC-------A--G--A-A-CG---C-A---CGTG--T--GA-C-C------G--CA--
gi|33 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacgcacC-------A--A--A-A-CG---CCA---CG-G--T--GA-C-C------G--CA--Tattttggtgacc
gi|45 : gaaacgatttactttac-A-CG---T-G---CG-G--T--CA-C-C------GTGCG--TG----------------TG-A-T-AA------AGT---AGAA-CA-TTTCAG-GGAacagactgcgcggaacggcatcgcacgctaaacgcaatttgagttgaacggtga
gi|19 : g-A-CG---C-A---CG-G--T--GA-C-C------G--CA--TG--GAGA-agagcgaccgttgaccgcacgctgaccacaat
gi|77 : gtccctcgaaactctctactttacggtttaccacg---TG-G--T--CA-C-C------GTGCG--TG----------------TG-G-T-AA-------GT---AAAA-CG-TTTCAG-GGACTcacgccacgcgttgaccacacgcgaagcaatgaataaaaatgaactaagcacggaactcacggaagataaat
gi|71 : -G--T--CA-C-C------GTGCA--TG----------------TG-G-T-AA------AGT---AGAA-CA-TTTCAG-GGACTc
gi|82 : AA-A-------GTG-G-T-AA------AGT---AGAA-CG-CTTTAG-GGtgcacg
gi|26 : agcA-A-------GTG-G-T-AA------AAT---AGAA-CG-TTTCAG-GGATTaacggtg
gi|47 : A-A-------GTG-G-T-AA------AGT---AGAA-CG-TTTCAA-GGACTgaacgatgagcaaacgctgaacgcacagtgagcgcacgcagagcgaacagtgagcgcacgttgaacgcaat
gi|29 : A-A-------GTG-G-T-AA------AGT---CAAA-CG-TTTCAG-GGACTGgaacggacgatgagtgaacgcacggtgaatgcaatttggtgagcgg
gi|62 : A-A-------GTG-G-T-AA------AGT---AGAA-CG-TTTCAG-GGAgaacggtgagcgcacgctgaacgcagttggtgagcggttcgtgaacggtggacgctgaacgcacggt
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gi|8 : agTG-G-T-AA------AGT---AGAA-CG-TTTCAG-GGAagcacggtgaccgacgcataggcaagcggtgaccggcacgctgaaagcgcaatttgttgaacgggaatgcacggagaaagaatcggtgaaagcacgactgaacaataagaaaaatgactgaatgcacag
gi|42 : gTG-G-T-AA------AGT---AGAA-CG-TTTCAG-GGAcacgcacggtgaccgcaccgcagaacgcacgtgaccgtacggtgaccgcaatttgggaccgctgaccgcacgctaaaccgcgaccggaccgcaatgtgaacggtgaccgaccgctgaccgcacgtgaccgaccgctgaccgcacgctgaacgcaa
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consensus : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-ANC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GC--A-----AA--TG---TGANCGGT--G-ACCGCACGC-----A------GAACG--C-A-CG-G--TGACCG-C------A-C---GGAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-TGCTCATCTGTCA
Reference ( family-190 ) : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-ANC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GC--A-----AA--TG---TGAACGGT--G-ACCGCACGC-----A------GAACG--C-A-CG-G--TGACCG-C------A-C---GGAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-TGCTCATCTGTCA
gi|1 : TCC-CT-GAAA--CA-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-T-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-AC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----A---GCA--T-G---G--AG------AAC-----A--A-A-C---GG--T--G-AAC-----AC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GCAAA-----AA--TG---TGAACGGT--G-ACCGCATGC-----A------AAACG--C-A-TG-G--TGACCG-C------A-T---GGAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGATTGTATATGTACATCTGTCA
gi|10 : TCC-CT-GAAA--TGGTTG-TT---A----CT--T-------A-T------------T---A-----------------------G-C-------GC--A------C-----------------------A-CG-CAG------------C----------T----G---------G-TTGAA-C-C-G-C--A---C-G------------CAG----GA-----A--C-G---AAC---GT-GCAA--T-G--G----A-CCGCTAGGG----G----GG-----GA----G---GAA--C-G---C--GG------AACTAGGTG--A-A-CCT-GG--C--G-ACCGGAGGGC-G-TG-G-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--G-TGACTA-A-ACGC--ACG-GTGA-Cacacaggattcttaagg
gi|11 : agt--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---C--AG------AGG-----G--A-A-C---GG--T--G-ATA-----GC-A-CG-C-A---GA
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gi|12 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCC-CT-CGAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------G-----------------------------------------G----A----G--CG-A----A--T----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-GATNNNNNNNNNNN-N----NN-----N--N-NN--NNN---NN-N--N--N-N--N----N-N-------N----N----NN-----NN----N---NNN--N-N---N--NN------NNN-----N--N-N-N---NN--N--N-NTC-----AC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCcatg
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gi|15 : aaagcaatttggtaAAA--CG-TT--GT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------ACCGA------CG--G-----TG--A--C-G-C--A-CA-CAG----A----G--CG-A----C--C----G---------G-T--GA-C-C-G-CA-A---C-G------------T-TC---GA-----C--C-GC---GT---TT-G--G--T-C--A----T-C-------G----G----CG-----CA----C----CA--C-----------------AC----------A-CT--GG--T--G-TCC-----GCTATCG-C-T---GAAC----AA-TGA----ATATCGA------AAA--ATTGACT--A-ACGC--A
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gi|18 : ttaccacttgaacggcgagtgcatgctgaacgcatggtgagtC-CT-GAGA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--TCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--T----GAGCCGCATCG-T--GA-T-T-G-C--A---CGG------------C-T----GACAAG-A--CTGA--AAA---AT-G--AC-T-G--AACGCA-C-------G----G----TG------A----C---GCA--C-G---C--AG------AAC-----G------CT--GG--T--G-AAC-----GC-A-
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gi|21 : agtcctgaaacaaaCTG-A-CCGCGAACA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GACC-GC--A-----AAACTG---TGACCGGT--G-ACCGCACGC-----A------GACCG--C-A-CG-G--TGACCG-C------A-C---GGAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-
gi|22 : accgC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AA---CTA-T---T---A-C------------C----C----------------------A-C-------GCCAA------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A---------------------------------------A-C-C-G-C--A---C-G------------G-T----GC-----CT-C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--AC---C-C-------G----T----TGACCGCAA----C---GCA--C-C---G--CG------AA------A--A-A-C---GGC-T--G-ACC-----GC-A-gtt
gi|23 : CC-CT-GAAA--CA-TT--CT---T----AT--T---T---A-C------------C---CC----------------------A-T-------GC----------T--G-----TG--A--CCG-C--AACG-CAG----A----G--TG-A----A--T----G---------G-T--GAAC-T-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----AA-T-GC--AAT---TA-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----AG-----AA----C---GCA--T-G---A--A------------------------------T--G-AAC-----GC-A-CG-C-T---GAA
gi|24 : TCC-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-N-------NN--N------NN--N-----NN--N--NNN-N--N-NN-NNN----N----N--NN-N----N--N----N---------N-N--NN-N-N-N-N--N---N-N------------N-N----NN-----N--N-AC--AAT---TT-G--G--T-G--A----T-C-------T----G----TG-----AT----C---G
gi|25 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--G---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------AC--A------CG--G-----TT--A--CTT-C--A-CA-CAA----A----G--CG-A----A--C----G---------G-G--GA-C-C-A-C--A---C-G------------C-T----TA-----C--A-GC--ATT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------T----G----AG-----AA----C---ACA--C-G---gtgaccgc
gi|26 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----TT--T---T---A-C------------C---ACTTGAACGATGAGCAAACGCTGAA-C-------GC--A------CA--G-----TG--A--GCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----A---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------T-T----GA-----A--C-GC--AAT---ct
gi|27 : aaTCC-CT-GAAA--TG-GT--CT---G----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------AC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TG-GAG----A----A--------------------------------------C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A-----C--AA-----T-GA-A--T-G--A----A-C-------A----A----TG-----A--------------------G--TG------ACC-----G--C-A-C---GG--T--G-ATA-----GC-A-C
gi|28 : ag----A--C----G---------G-T--GA-C-C-T-C--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-AC--A------C-G--G--A-G--A----A-C-------GCCTGG----TG-----AC----C---GCA--C-G---G--AG------AAT-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----AC-G--G-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AGA--A-TGACTG-A-AC
gi|29 : cTCC-CT-GAAA--CG-TT--TG---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-----TG--A--GCG-C--A-CG-CTG----A----A--CG-C----AGTT----G---------G-T--GAGC-G-G-T--T---C-G--------------T----GA-----A--C--------------G--G--T-G--G----A-C-------G----C----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--a
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gi|31 : ag----A--C----C---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--C-G--A----A-C-------G----G----TC-----AA----G---GCG--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-AAC-----GC-A-CT-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGATTG-A-A
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gi|33 : -GAAA--CG-AT--TT---A----CT--T---T---A-C------------C---AA----------------------AAC-------GCC-A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TA-CAG----ACTGCG--CGGA----A--C----G---------G-C---A-T-C-G-C--A---C-G------------C-T----AA-----A--C-GC--AAT---TT-G--AGTT-G--A----A-C-------G----G----TG-----A
gi|34 : --T-G--C----A-C-------A----G----TG-----AT----C---GCA--T-G---G--AG------AAC-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----GC-A--G-C-T---AATT----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACA---GAA------A-----AA--TG---
gi|35 : aA--C-G---G--AG--------C------------C---AG--T--G-ACC-----GC-A-CG-C-T---GAAC-----A-TGA----AT---G
gi|35 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaactttCA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-AT--G-----AA--TG---TGAtga
gi|36 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaactttacggagcTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AAAA-CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-CGAA-CG-CAG----A----GAACG-A----G--CACG-G---------G-TG-GA-CGC-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----A--
gi|37 : agCC-CT-GAAA--CGGTT--CT---AATCACT--T---T---AGC------------CGAAAC----------------------A-C-------GC--A------CGCGG-----TG--A--CCG-CT-A-CG-CAG----A----------A----A--CACAAG---------G-T--GA-C-C-G-C--A---tac
gi|38 : agtcTCC-CT-GAAAAACG-TT--TTCTTA----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C--------C--A------CG--G-----TG--A--CCT-C--A-CGCCAG----A----AC-CG-C----A--C----G---------ATT--GA-C-C-G-T------C-G------------T-T----GA-----C--C-GC--AAT---TT-G--atttggt
gi|39 : g-CT-GAAA--CG-TTT-CT---AG---CT--C---T---A-CAC----------CTA-AT----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A----G-A--T-CA-CAG----A----A--CG-A----A--C----G---------C-T--GA-CTC-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-
gi|4 : tT--TT---A----CT--T---TTAAA-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--T-----AG--A--CCG-C--A-CG-CAA----A----G--TG-A----A--C----------------T--GA-C-T-GCC--A---C-G------------C-T----GA-----GATC-GCCAAATC--TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AGCCGCC---GCA--C-GGCTG--AG------AGT-----GC-A-G-C---GGACT--G-AAC----------CG-C------AAA----AA-TTA----CTA--GT------AAA--A--------A-AAAC--AGG-GTGA-CGT--C-ACGCA-GAAC-GC--------------------ACTGG--G-ACCG---AC-----A------GA--------------------------------------AA-A-------ATG-T-TAA------AAGAGAACGTTTTCGGGA--G-A---GCTCATCTGTCAaatgaagaaa
gi|40 : accatgaacctacttttcTCC-CT-GAAA--AG-TTT-CT---A----CT--T-------A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CC--G-----GG--A--CCG-C--A-CG-CAG---------G--CA-ACGCCA--C----G---------G-T--GA-C-C-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-GC--AAT---T
gi|41 : cagTCC-CT-GAA---CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-A-------GC--A------CG--G-----TG--AATTCG-C--A-CG-AGA----A----A--CA-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--C-AC--AA
gi|42 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TGC-A--CCG-C--A-CG-CAG----A----A--CG-C----A--C----G---------G-T--GA---C-G-T--A---C-G------------G-TGC--GA-----A--C-GC--AAT---TT-at
gi|43 : TCC-CT-GAAA--C--TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---ACG---------------------A-A-------GC--A------CG--G-----TG--A---CG-C--A-CG-CAG----AG---G--CG-A----C--C----G---------G-T--GA-A-C-G-CTGA---C-G------------C-T----TG-----A--C-GC--AA
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gi|45 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacgcacTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-T------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-TAG----A----G--CG-A----C--C----G---------T-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--C-AC--AAT---attttggtgacc
gi|46 : gC-CC-GAAA--CG-TT--TG---A----CT--T-------A-C------------C---AC-----------------------------------------------------TG--A--------------------------------A----G--C----G---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AG----TT-G--G--T-G-------G-C-------G----G----T
gi|47 : agtTCC-TT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-------------------A-CG-ATG----A----G--TG-A----A---------------------------C-G-C--A---C-G------------G-T----GA-----A--T-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----G-C-------G----G----tcgtgaactggt
gi|48 : ag-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T-------A-C------------A---AC----------------------GTC-------AT--AATT---CA--G-----TGT-A--CCG-C--ATCG-CAG----A-----------------------------------------C-C-G-C--A---T-G------------CGTGGGGGA-----T--C-GC--AAT---TT-
gi|49 : t--TA---TGACCGGT--G-AGCGTACGC-----ATA----GAGCA--C-A-CC-G--TGAACA-C------A-CAT-GGA-------------GCG-CAC------AG-AGAACGTCTCAGGGACT
gi|5 : agcC-CT-GAAAAACG-TT--CT---A----CTC-T---T---A-A------------C----C----------------------A-C-------GA--A------T---G-----TG--A---CG-C--G-AG-CA-----A----G--C--A----A--C----G---------A-T--GA-C-C-G-A--A---C-A------------G-T----GACTGGCA--T-GC--AA----------G--C-G--A----A-C-------G----A----TG------A----C----CA--C-G---GT-AG------AAC--------------------T--GCAGC-----G---------------------AG-TGA----AC---GA--------------GACC-----CGC--AC--GTGA-CAA--C-ATGCA-GAGT-GC--C-----GA--------GAA------A-ACCGCACAG-----A------GAACG--CGA-C--A--TGACCG-C------ATC---TGAAC-A-------AGA-A-TAA------A
gi|5 : gtcaC--A------CG--G-----TAGAA--CTG-C--A--G-C-G----A----G--TG-A----A--C----G---------A----GA-C-CCG-C--A---C-G--------------T----GA-----------C--AAC---AT-G--C--A-G--A----G-T-------GCC--G----AG-----AAAAC-C---GCA--C-A---G--AG------AAC-----GC-G-A-C---A---T--G-ACC-----GC-A-T--C-T---GAAC----AA--GA----AT----A------AAA--A-TGAGTA-A-ACGC--TCG-GTaatgagtaaacgctcggt
gi|50 : gtcacctgaaaaacgttctactcttaaccacgaatgtgacgcgagcaagcaacgatgaccgaacagtgactggcatgcaagcgaacgatgacCAGT--G-AATGCA-GC-----A------GAGCG--C-AACGTG--TGAGCG-A------AAC---GAAAA-A-------ATG-AATAA------AATTGGACGTTTCATGGACTGCA
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gi|52 : cagTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---A----C---T---T---A------------------------------------------G-C-------GC--A------CG--C-----TG--A---------A-CG-CAATTTTA----G--TG-A----A---------------------------C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-
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gi|53 : agtccctgaaaacgttctacttTCC-CT-G-AA--CGTTT--CT---A----CTA-T---T---A-C------------C---ACA---------------------A-T-------GC--A------TG--GT----TG--A--CCA-C--ATCG-------------G--CG------A--C----A---------A-T--GA-C-C-
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gi|55 : agt----A--T----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA--------------------TT---------------------------------------------A----T---GCA--T-G---G--AG------AAC-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----GC-A--G-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-Tagcaatgaaat
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gi|62 : taactTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-----TG--A--GAG-C--A-GG-CTG----A----A--CG-C----A--T----T---------G-T--GA-
gi|63 : C----AA-TAA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACGC--ACA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-----------AA--TGAA-TGAAAAAT--G-Attgaa
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-190 ) : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-ANC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GC--A-----A----A--TG---TGANCGGTGACCGCACGC--A------GAACG--C-A-CG-G--TGACCG-C------A-C---GGAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-TGCTCATCTGTCA
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gi|17 : G-A----A--C----G---------G-C--GA-G-T-G-C--A---T-G------------C-T----GA-----A--C-GC--A------T-G--G--T-G--AGTGCA-C-------A----C----TG-----AA----A---GCA--T-G---C--AG------AGC-----G--A-A-C---TG--T--G-AGC-----GC-A-TG-C-T---GAACGTGTGG-TGA----GT---GATTAGTGAAAGCA-TG-CAG-A-GCAA--ACG-GTGA-GCG--C-ACGCT-GAA
gi|17 : ttaccactt-------GC--A------CA--C-----TG--A--AAG-C--A-TG-CAG----A----G--CG-A----A--C----T---------G-T--GA-G-C-G-C--A---T-G------------C-T----GA-----A--C-G-----T---GT-G--G--T-G--A----G-T-------GATTAG----TG-----AA----A---GCA--T-G---C--AG------AGC-----A--A-A-C---GG--T--G-AGC-----GC-A-CG-C-T---GAA
gi|18 : ttaccacttgaacggcgagtgcatgctgaacgcatggtgagtC-CT-GAGA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--TCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--T----GAGCCGCATCG-T--GA-T-T-G-C--A---CGG------------C-T----GACAAG-A--CTGA--AAA---AT-G--AC-T-G--AACGCA-C-------G----G----TG------A----C---GCA--C-G---C--AG------AAC-----G------CT--GG--T--G-AAC-----GC-A-
gi|19 : TCC-CTCGAAA--CT-CT--CT---A----CT--T---T---A-CGGTTTAC-----C---ACG---------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TG-GAG----ACAC-G--CC-AC---G--C----G---------T-T--GA-C-C-A-C--A---C-G------------C------GA-----A----GC--AA-----T-G--A--A-T--A----A-A-------A----A----TG-----AA----CTAAGCA--C-G---G--At
gi|2 : gC-CT--AAA--CG-TTA-CT---A----CT--T---T---A-CAACGCACGGTGCC---GC----------------------A-C-------GC--AGAAGAACG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----A--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-T------------C------AA-----A--C-G---AAT---C-----G--TGG--A----A-C-------GCAC-C----TG-----AC----C---GCAATT-G---G---G------AAC-----GGAA-A-CAAAGG--T--G-AAC-----GC-A-CA-C-----GAACA---AA-TGAC---AT----A------AAA--A-TGACTA-A-A-GC--ACGAGTGA-CCC--G-ACGC--GAAC-AA--A-----A----A--TGAAATGAA-AATGACT-TAC------------AA----C-A-CC-G--TGACCGAC------G-C---TGAAACA-------ATG-actcacggaagataaat
gi|20 : agtaAAA--CG-TT--TT---A----CT--T---T---A-C------------C--------------------------------------C--A------CA--A-----TG-----CC---------------------------------A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---T-G------------C-TG---GA-----A--A-AC--A------T-G--GAAT-GAAA----A-A-------G----G-----G-----GA----C---ATA--C-T---G--AA------AA------G--C-A-C---GG--TTGA-ACC-----GC-A-TG-C-T---GAAC----AATTGA----AT---GA------AAA--aatgaaaatgcataaacacatggtg
gi|21 : agtcctgaaacaaaCTG-A-CCGCGAACA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GACC-GC--A-----A----AACTG---TGACCGGTGACCGCACGC--A------GACCG--C-A-CG-G--TGACCG-C------A-C---GGAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-
gi|22 : accgC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AA---CTA-T---T---A-C------------C----C----------------------A-C-------GCCAA------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A---------------------------------------A-C-C-G-C--A---C-G------------G-T----GC-----CT-C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--AC---C-C-------G----T----TGACCGCAA----C---GCA--C-C---G--CG------AA------A--A-A-C---GGC-T--G-ACC-----GC-A-gtt
gi|23 : CC-CT-GAAA--CA-TT--CT---T----AT--T---T---A-C------------C---CC----------------------A-T-------GC----------T--G-----TG--A--CCG-C--AACG-CAG----A----G--TG-A----A--T----G---------G-T--GAAC-T-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----AA-T-GC--AAT---TA-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----AG-----AA----C---GCA--T-G---A--A------------------------------T--G-AAC-----GC-A-CG-C-T---GAA
gi|24 : TCC-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-N-------NN--N------NN--N-----NN--N--NNN-N--N-NN-NNN----N----N--NN-N----N--N----N---------N-N--NN-N-N-N-N--N---N-N------------N-N----NN-----N--N-AC--AAT---TT-G--G--T-G--A----T-C-------T----G----TG-----AT----C---G
gi|25 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--G---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------AC--A------CG--G-----TT--A--CTT-C--A-CA-CAA----A----G--CG-A----A--C----G---------G-G--GA-C-C-A-C--A---C-G------------C-T----TA-----C--A-GC--ATT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------T----G----AG-----AA----C---ACA--C-G---gtgaccgc
gi|26 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----TT--T---T---A-C------------C---ACTTGAACGATGAGCAAACGCTGAA-C-------GC--A------CA--G-----TG--A--GCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----A---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------T-T----GA-----A--C-GC--AAT---ct
gi|27 : aaTCC-CT-GAAA--TG-GT--CT---G----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------AC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TG-GAG----A----A--------------------------------------C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A-----C--AA-----T-GA-A--T-G--A----A-C-------A----A----TG-----A--------------------G--TG------ACC-----G--C-A-C---GG--T--G-ATA-----GC-A-C
gi|28 : ag----A--C----G---------G-T--GA-C-C-T-C--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-AC--A------C-G--G--A-G--A----A-C-------GCCTGG----TG-----AC----C---GCA--C-G---G--AG------AAT-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----AC-G--G-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AGA--A-TGACTG-A-AC
gi|29 : cTCC-CT-GAAA--CG-TT--TG---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-----TG--A--GCG-C--A-CG-CTG----A----A--CG-C----AGTT----G---------G-T--GAGC-G-G-T--T---C-G--------------T----GA-----A--C--------------G--G--T-G--G----A-C-------G----C----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--a
gi|3 : cagC-CC-GAAA--CG-TTGTCT---A----CT--T---T---A-C-----------------C----------------------A-C-------GC--G------CG--G-----TGAAA--CCG-C--A-CG-CAG----A----A--CG-A----G--A----A---------G-T--GG-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--G-GC--AGT---TTGG--G--T-G--A----AGC-------T----G----AG-----AA----C---ACA--C-G---GTTGG------AAC-----C--A------------------C-----GCAA-CG-C-TCG-AAAC----AA-TGA----AT---GAAC----AAG--A-TGACTA-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCTGGAAC-CC--ATGGTGA----G--TC---CGATCGAT-ACCGCATTT--G------TACCGATC-A-CG-GC-TGAACG-C------A-CTTACGAAA-ACAACACTAGA-G-TAACCAAGTAGTAGAACGTTTt
gi|30 : agtTCT-CT-GAAA--CG-TT--C----A----TT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--GGAAGTTG--AT-CCT-C--A-CG-GAA----A-------------------------------------------C-G-C--AT--C-G------------C-T----GA-----A--C-ATG-AAT---------A--T-G--A----A-A-------A----GATACTG-----AA----C---GCA--C-G---G--
gi|31 : ag----A--C----C---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--C-G--A----A-C-------G----G----TC-----AA----G---GCG--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-AAC-----GC-A-CT-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGATTG-A-A
gi|32 : g------CG--G-----TG--A--GTG-T--A-CA-CAG----A----G--CA-A----A--C----G---------G-T--GA-G-C-G-CNNN---N-N------------N-N----NN-----N--N-NN--NNN---NN-N--N--N-N--N----N-C-------G----G----TG-----AG----T---GTA--C-A---C--AG------AGC-----A--A-A-C---GG--T--G-AGT-----GC-A-CA-C-A---GA
gi|33 : -GAAA--CG-AT--TT---A----CT--T---T---A-C------------C---AA----------------------AAC-------GCC-A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TA-CAG----ACTGCG--CGGA----A--C----G---------G-C---A-T-C-G-C--A---C-G------------C-T----AA-----A--C-GC--AAT---TT-G--AGTT-G--A----A-C-------G----G----TG-----A
gi|34 : --T-G--C----A-C-------A----G----TG-----AT----C---GCA--T-G---G--AG------AAC-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----GC-A--G-C-T---AATT----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACA---GAA------A-----A----A--TG---
gi|35 : aA--C-G---G--AG--------C------------C---AG--T--G-ACC-----GC-A-CG-C-T---GAAC-----A-TGA----AT---G
gi|35 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaactttCA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-AT--G-----A----A--TG---TGAtga
gi|36 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaactttacggagcTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AAAA-CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-CGAA-CG-CAG----A----GAACG-A----G--CACG-G---------G-TG-GA-CGC-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----A--
gi|37 : agCC-CT-GAAA--CGGTT--CT---AATCACT--T---T---AGC------------CGAAAC----------------------A-C-------GC--A------CGCGG-----TG--A--CCG-CT-A-CG-CAG----A----------A----A--CACAAG---------G-T--GA-C-C-G-C--A---tac
gi|38 : agtcTCC-CT-GAAAAACG-TT--TTCTTA----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C--------C--A------CG--G-----TG--A--CCT-C--A-CGCCAG----A----AC-CG-C----A--C----G---------ATT--GA-C-C-G-T------C-G------------T-T----GA-----C--C-GC--AAT---TT-G--atttggt
gi|39 : g-CT-GAAA--CG-TTT-CT---AG---CT--C---T---A-CAC----------CTA-AT----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A----G-A--T-CA-CAG----A----A--CG-A----A--C----G---------C-T--GA-CTC-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-
gi|4 : tT--TT---A----CT--T---TTAAA-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--T-----AG--A--CCG-C--A-CG-CAA----A----G--TG-A----A--C----------------T--GA-C-T-GCC--A---C-G------------C-T----GA-----GATC-GCCAAATC--TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AGCCGCC---GCA--C-GGCTG--AG------AGT-----GC-A-G-C---GGACT--G-AAC----------CG-C------AAA----AA-TTA----CTA--GT------AAA--A--------A-AAAC--AGG-GTGA-CGT--C-ACGCA-GAAC-GC-----------------------ACTGG-GACCG---AC--A------GA--------------------------------------AA-A-------ATG-T-TAA------AAGAGAACGTTTTCGGGA--G-A---GCTCATCTGTCAaatgaagaaa
gi|40 : accatgaacctacttttcTCC-CT-GAAA--AG-TTT-CT---A----CT--T-------A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CC--G-----GG--A--CCG-C--A-CG-CAG---------G--CA-ACGCCA--C----G---------G-T--GA-C-C-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-GC--AAT---T
gi|41 : cagTCC-CT-GAA---CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-A-------GC--A------CG--G-----TG--AATTCG-C--A-CG-AGA----A----A--CA-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--C-AC--AA
gi|42 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TGC-A--CCG-C--A-CG-CAG----A----A--CG-C----A--C----G---------G-T--GA---C-G-T--A---C-G------------G-TGC--GA-----A--C-GC--AAT---TT-at
gi|43 : TCC-CT-GAAA--C--TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---ACG---------------------A-A-------GC--A------CG--G-----TG--A---CG-C--A-CG-CAG----AG---G--CG-A----C--C----G---------G-T--GA-A-C-G-CTGA---C-G------------C-T----TG-----A--C-GC--AA
gi|44 : gGTGACCGCAAGC--A------GAACG--C-A-CGTG--TGACCG-C------A-c
gi|45 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacgcacTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-T------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-TAG----A----G--CG-A----C--C----G---------T-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--C-AC--AAT---attttggtgacc
gi|46 : gC-CC-GAAA--CG-TT--TG---A----CT--T-------A-C------------C---AC-----------------------------------------------------TG--A--------------------------------A----G--C----G---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AG----TT-G--G--T-G-------G-C-------G----G----T
gi|47 : agtTCC-TT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-------------------A-CG-ATG----A----G--TG-A----A---------------------------C-G-C--A---C-G------------G-T----GA-----A--T-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----G-C-------G----G----tcgtgaactggt
gi|48 : ag-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T-------A-C------------A---AC----------------------GTC-------AT--AATT---CA--G-----TGT-A--CCG-C--ATCG-CAG----A-----------------------------------------C-C-G-C--A---T-G------------CGTGGGGGA-----T--C-GC--AAT---TT-
gi|49 : t--TA---TGACCGGTGAGCGTACGCATA------GAGCA--C-A-CC-G--TGAACA-C------A-CAT-GGA-------------GCG-CAC------AG-AGAACGTCTCAGGGACT
gi|5 : agcC-CT-GAAAAACG-TT--CT---A----CTC-T---T---A-A------------C----C----------------------A-C-------GA--A------T---G-----TG--A---CG-C--G-AG-CA-----A----G--C--A----A--C----G---------A-T--GA-C-C-G-A--A---C-A------------G-T----GACTGGCA--T-GC--AA----------G--C-G--A----A-C-------G----A----TG------A----C----CA--C-G---GT-AG------AAC--------------------T--GCAGC-----G---------------------AG-TGA----AC---GA--------------GACC-----CGC--AC--GTGA-CAA--C-ATGCA-GAGT-GC--C-----G----A--------GAA----AACCGCACAG--A------GAACG--CGA-C--A--TGACCG-C------ATC---TGAAC-A-------AGA-A-TAA------A
gi|5 : gtcaC--A------CG--G-----TAGAA--CTG-C--A--G-C-G----A----G--TG-A----A--C----G---------A----GA-C-CCG-C--A---C-G--------------T----GA-----------C--AAC---AT-G--C--A-G--A----G-T-------GCC--G----AG-----AAAAC-C---GCA--C-A---G--AG------AAC-----GC-G-A-C---A---T--G-ACC-----GC-A-T--C-T---GAAC----AA--GA----AT----A------AAA--A-TGAGTA-A-ACGC--TCG-GTaatgagtaaacgctcggt
gi|50 : gtcacctgaaaaacgttctactcttaaccacgaatgtgacgcgagcaagcaacgatgaccgaacagtgactggcatgcaagcgaacgatgacCAGTGAATGCA-GC--A------GAGCG--C-AACGTG--TGAGCG-A------AAC---GAAAA-A-------ATG-AATAA------AATTGGACGTTTCATGGACTGCA
gi|51 : TCC-TT-GATC--CG-TT--TT---T----CT--T---T---T-C------------C---ACCTTA------------------A-CAGTGAGTGG--G------CG--G-----TG--A--ACG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--T----G---------A-T--GA-
gi|52 : cagTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---A----C---T---T---A------------------------------------------G-C-------GC--A------CG--C-----TG--A---------A-CG-CAATTTTA----G--TG-A----A---------------------------C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-
gi|52 : ag-----AG----C---GCA--C-G---C--TG------AAC-----GC-A-A-TTTTAG--T--G-AAC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------Aaatgaatgaa
gi|53 : agtccctgaaaacgttctacttTCC-CT-G-AA--CGTTT--CT---A----CTA-T---T---A-C------------C---ACA---------------------A-T-------GC--A------TG--GT----TG--A--CCA-C--ATCG-------------G--CG------A--C----A---------A-T--GA-C-C-
gi|54 : tacagC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AC---CT--T---T---C-C------------C---AA----------------------G-C--------C--C------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG--AGAA--A----G--C--C----A--C----G---------G-T--GA-agcgaac
gi|55 : agt----A--T----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA--------------------TT---------------------------------------------A----T---GCA--T-G---G--AG------AAC-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----GC-A--G-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-Tagcaatgaaat
gi|56 : cTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---T----CTTAT---T---A-C------------T---AC----------------------A-C-------GC---------CG--G-----TG-----CC-------------------------TG-A----A--C----G---------G-------C-C-G-C--T---C-G------------G-T-----------A--C-CC--AAT---TT-G--G--
gi|57 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--TT---A----CT--T---TA--A-C------------C---AC----------------------A-T-------GCA-A------CG--G-----TG--T--CCG-C--A-CG-CTG----A----A--CG-CT---A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---
gi|58 : g-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------CC--AC----------------------G-C-------GC--AA-----CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CGA----C----C--CG-C----A--C----G---------G-T--GC-C-C-G-C--A---
gi|59 : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------T---G-----------------------A-C------------------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-GAG----A----C--CG-C----A--CT---G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-atttg
gi|6 : ag-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--A-----TT-G-----------------------------------TG-----AC----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--CCA-C---GG--T--GGACC-----GCCA-GG-T-TCTTGAAT----TA-TGATAGTAT---TA------ATA----TG---G-AGACG---ACC-ATGA-CCG--CCACCCT-GACCCGC--A------------------TGGTTGG--ACCG---GC--ATTTGATGAAAG--C-A-CG-GGTTGATTA-A------A------AAAG-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACCATTCA-GGACTGTAT-ga
gi|60 : TTC-CT-GAAA--CG-TT--CT---T----CT--T---C---A-C------------C---AC-----------------------------------------------------T---------------------------------TG-A----A--C----T---------T-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----CA-----A--C-GC--AAT---TT-G--T--T-A--A----G-C-------G----ctgt
gi|61 : cag-C--A-CG-GTG----A----G--TG-A----A--C----G---------A-T--GA-----A-C--AATTT-G--------------T----GA-----A--A-GC--GAGCGGTT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--
gi|62 : taactTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-----TG--A--GAG-C--A-GG-CTG----A----A--CG-C----A--T----T---------G-T--GA-
gi|63 : C----AA-TAA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACGC--ACA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-----------A----A--TG---ttgaa
gi|63 : ------AAC-----G--C-A-C---AG--T--G-ACC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGAaatgaaaaatga
gi|64 : caataaatgaaaaatgactaCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------CA--AC----------------------A-C-------GC--A------TG--G-----TG--A--
gi|65 : agtcTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---A-----------------------A-C-------GC--A------TG--G-----TG--A--CC-------CG-CA------------------------C----G---------G-T--GA-C-C-G-A--C---C-G------------C-T----Gaaaaccacccgttgaatgca
gi|67 : --CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-T-------GCA-A------TG--G-----TG--A--CCG-C--A-C--CAGC---A----A--TG-A----A--C----G---------G-T--G
gi|68 : taTCCACT-GAAA--CG-TT--CT---A----AT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-C
gi|69 : agTCCACT-GAAAT-CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TGA-A--CCA-C--A-CG-
gi|7 : g-G--A----A-C-------G----G----TG-----AC----C---GCA--C-A---C--AG------AGC-----G--A-A-C---GA--T--G-ACC-----GC-A-CA-T-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACGC--A---GTGA-CCAGCC-ACGCTAGAAG-GC--A-----ACGGGG--TG---T-ATCCTTGCTAGTA-----A------GAACG--A-A-CG-A--TGACCG-CATGCATA-C---GGAGA-A-------A
gi|70 : acac-A-C---GG--T--G-AAA-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACAC--Aacgctcgaaatggaaaatatggtaattagaga
gi|71 : gcTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-T-------GC--A------CG--G-----TG--A--CTG-C--A-CG-
gi|72 : ag----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----G-C-------G----G----T
gi|73 : at-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----TT--T---T---A-C------------C---AA----------------------A-T-------GC--A------CG--G-----TA--A--TCG-T--A-AG-CAG----
gi|74 : TG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGTCTGTAT-TATTAAGCTG
gi|75 : C-CT-GAAA--CG-TT--CTCTAA----CT--T-------A-C----------------AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--gaa
gi|76 : cagtTCC-CT-GAAA--CG-TTA-TT---A----CT--TTAAT---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GCA-A------CG--G-----Tgacg
gi|77 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--TT---A----CT--T-------A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCA-C--
gi|78 : agTCC-CT-GAGAAGCG-TTT-CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--
gi|79 : agTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---AA---CT--T---T---A-C------------CC--AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----T
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15 : aaagcaatttggtaAAA--CG-TT--GT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------ACCGA------CG--G-----TG--A--C-G-C--A-CA-CAG----A----G--CG-A----C--C----G---------G-T--GA-C-C-G-CA-A---C-G------------T-TC---GA-----C--C-GC---GT---TT-G--G--T-C--A----T-C-------G----G----CG-----CA----C----CA--C-----------------AC----------A-CT--GG--T--G-TCC-----GCTATCG-C-T---GAAC----AA-TGA----ATATCGA------AAA--ATTGACT--A-ACGC--A
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gi|21 : agtcctgaaacaaaCTG-A-CCGCGAACA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GACC-GC--A-----A----AACTG---TGACCGGTGACCGCACGC--A------GACCG--C-A-CG-G--TGACCG-C------A-C---GGAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-
gi|22 : accgC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AA---CTA-T---T---A-C------------C----C----------------------A-C-------GCCAA------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A---------------------------------------A-C-C-G-C--A---C-G------------G-T----GC-----CT-C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--AC---C-C-------G----T----TGACCGCAA----C---GCA--C-C---G--CG------AA------A--A-A-C---GGC-T--G-ACC-----GC-A-gtt
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gi|27 : aaTCC-CT-GAAA--TG-GT--CT---G----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------AC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TG-GAG----A----A--------------------------------------C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A-----C--AA-----T-GA-A--T-G--A----A-C-------A----A----TG-----A--------------------G--TG------ACC-----G--C-A-C---GG--T--G-ATA-----GC-A-C
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gi|37 : agCC-CT-GAAA--CGGTT--CT---AATCACT--T---T---AGC------------CGAAAC----------------------A-C-------GC--A------CGCGG-----TG--A--CCG-CT-A-CG-CAG----A----------A----A--CACAAG---------G-T--GA-C-C-G-C--A---tac
gi|38 : agtcTCC-CT-GAAAAACG-TT--TTCTTA----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C--------C--A------CG--G-----TG--A--CCT-C--A-CGCCAG----A----AC-CG-C----A--C----G---------ATT--GA-C-C-G-T------C-G------------T-T----GA-----C--C-GC--AAT---TT-G--atttggt
gi|39 : g-CT-GAAA--CG-TTT-CT---AG---CT--C---T---A-CAC----------CTA-AT----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A----G-A--T-CA-CAG----A----A--CG-A----A--C----G---------C-T--GA-CTC-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-
gi|4 : tT--TT---A----CT--T---TTAAA-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--T-----AG--A--CCG-C--A-CG-CAA----A----G--TG-A----A--C----------------T--GA-C-T-GCC--A---C-G------------C-T----GA-----GATC-GCCAAATC--TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AGCCGCC---GCA--C-GGCTG--AG------AGT-----GC-A-G-C---GGACT--G-AAC----------CG-C------AAA----AA-TTA----CTA--GT------AAA--A--------A-AAAC--AGG-GTGA-CGT--C-ACGCA-GAAC-GC-----------------------ACTGG-GACCG---AC--A------GA--------------------------------------AA-A-------ATG-T-TAA------AAGAGAACGTTTTCGGGA--G-A---GCTCATCTGTCAaatgaagaaa
gi|40 : accatgaacctacttttcTCC-CT-GAAA--AG-TTT-CT---A----CT--T-------A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CC--G-----GG--A--CCG-C--A-CG-CAG---------G--CA-ACGCCA--C----G---------G-T--GA-C-C-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-GC--AAT---T
gi|41 : cagTCC-CT-GAA---CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-A-------GC--A------CG--G-----TG--AATTCG-C--A-CG-AGA----A----A--CA-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--C-AC--AA
gi|42 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TGC-A--CCG-C--A-CG-CAG----A----A--CG-C----A--C----G---------G-T--GA---C-G-T--A---C-G------------G-TGC--GA-----A--C-GC--AAT---TT-at
gi|43 : TCC-CT-GAAA--C--TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---ACG---------------------A-A-------GC--A------CG--G-----TG--A---CG-C--A-CG-CAG----AG---G--CG-A----C--C----G---------G-T--GA-A-C-G-CTGA---C-G------------C-T----TG-----A--C-GC--AA
gi|44 : gGTGACCGCAAGC--A------GAACG--C-A-CGTG--TGACCG-C------A-c
gi|45 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacgcacTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-T------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-TAG----A----G--CG-A----C--C----G---------T-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--C-AC--AAT---attttggtgacc
gi|46 : gC-CC-GAAA--CG-TT--TG---A----CT--T-------A-C------------C---AC-----------------------------------------------------TG--A--------------------------------A----G--C----G---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AG----TT-G--G--T-G-------G-C-------G----G----T
gi|47 : agtTCC-TT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-------------------A-CG-ATG----A----G--TG-A----A---------------------------C-G-C--A---C-G------------G-T----GA-----A--T-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----G-C-------G----G----tcgtgaactggt
gi|48 : ag-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T-------A-C------------A---AC----------------------GTC-------AT--AATT---CA--G-----TGT-A--CCG-C--ATCG-CAG----A-----------------------------------------C-C-G-C--A---T-G------------CGTGGGGGA-----T--C-GC--AAT---TT-
gi|49 : t--TA---TGACCGGTGAGCGTACGCATA------GAGCA--C-A-CC-G--TGAACA-C------A-CAT-GGA-------------GCG-CAC------AG-AGAACGTCTCAGGGACT
gi|5 : agcC-CT-GAAAAACG-TT--CT---A----CTC-T---T---A-A------------C----C----------------------A-C-------GA--A------T---G-----TG--A---CG-C--G-AG-CA-----A----G--C--A----A--C----G---------A-T--GA-C-C-G-A--A---C-A------------G-T----GACTGGCA--T-GC--AA----------G--C-G--A----A-C-------G----A----TG------A----C----CA--C-G---GT-AG------AAC--------------------T--GCAGC-----G---------------------AG-TGA----AC---GA--------------GACC-----CGC--AC--GTGA-CAA--C-ATGCA-GAGT-GC---------------------CGA--GAAAACCGCACAG--A------GAACG--CGA-C--A--TGACCG-C------ATC---TGAAC-A-------AGA-A-TAA------A
gi|5 : gtcaC--A------CG--G-----TAGAA--CTG-C--A--G-C-G----A----G--TG-A----A--C----G---------A----GA-C-CCG-C--A---C-G--------------T----GA-----------C--AAC---AT-G--C--A-G--A----G-T-------GCC--G----AG-----AAAAC-C---GCA--C-A---G--AG------AAC-----GC-G-A-C---A---T--G-ACC-----GC-A-T--C-T---GAAC----AA--GA----AT----A------AAA--A-TGAGTA-A-ACGC--TCG-GTaatgagtaaacgctcggt
gi|50 : gtcacctgaaaaacgttctactcttaaccacgaatgtgacgcgagcaagcaacgatgaccgaacagtgactggcatgcaagcgaacgatgacCAGTGAATGCA-GC--A------GAGCG--C-AACGTG--TGAGCG-A------AAC---GAAAA-A-------ATG-AATAA------AATTGGACGTTTCATGGACTGCA
gi|51 : TCC-TT-GATC--CG-TT--TT---T----CT--T---T---T-C------------C---ACCTTA------------------A-CAGTGAGTGG--G------CG--G-----TG--A--ACG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--T----G---------A-T--GA-
gi|52 : cagTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---A----C---T---T---A------------------------------------------G-C-------GC--A------CG--C-----TG--A---------A-CG-CAATTTTA----G--TG-A----A---------------------------C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-
gi|52 : ag-----AG----C---GCA--C-G---C--TG------AAC-----GC-A-A-TTTTAG--T--G-AAC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------Aaatgaatgaa
gi|53 : agtccctgaaaacgttctacttTCC-CT-G-AA--CGTTT--CT---A----CTA-T---T---A-C------------C---ACA---------------------A-T-------GC--A------TG--GT----TG--A--CCA-C--ATCG-------------G--CG------A--C----A---------A-T--GA-C-C-
gi|54 : tacagC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AC---CT--T---T---C-C------------C---AA----------------------G-C--------C--C------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG--AGAA--A----G--C--C----A--C----G---------G-T--GA-agcgaac
gi|55 : agt----A--T----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA--------------------TT---------------------------------------------A----T---GCA--T-G---G--AG------AAC-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----GC-A--G-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-Tagcaatgaaat
gi|56 : cTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---T----CTTAT---T---A-C------------T---AC----------------------A-C-------GC---------CG--G-----TG-----CC-------------------------TG-A----A--C----G---------G-------C-C-G-C--T---C-G------------G-T-----------A--C-CC--AAT---TT-G--G--
gi|57 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--TT---A----CT--T---TA--A-C------------C---AC----------------------A-T-------GCA-A------CG--G-----TG--T--CCG-C--A-CG-CTG----A----A--CG-CT---A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---
gi|58 : g-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------CC--AC----------------------G-C-------GC--AA-----CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CGA----C----C--CG-C----A--C----G---------G-T--GC-C-C-G-C--A---
gi|59 : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------T---G-----------------------A-C------------------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-GAG----A----C--CG-C----A--CT---G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-atttg
gi|6 : ag-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--A-----TT-G-----------------------------------TG-----AC----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--CCA-C---GG--T--GGACC-----GCCA-GG-T-TCTTGAAT----TA-TGATAGTAT---TA------ATA----TG---G-AGACG---ACC-ATGA-CCG--CCACCCT-GACCCGC--A------------------TGGTTGG--ACCG---GC--ATTTGATGAAAG--C-A-CG-GGTTGATTA-A------A------AAAG-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACCATTCA-GGACTGTAT-ga
gi|60 : TTC-CT-GAAA--CG-TT--CT---T----CT--T---C---A-C------------C---AC-----------------------------------------------------T---------------------------------TG-A----A--C----T---------T-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----CA-----A--C-GC--AAT---TT-G--T--T-A--A----G-C-------G----ctgt
gi|61 : cag-C--A-CG-GTG----A----G--TG-A----A--C----G---------A-T--GA-----A-C--AATTT-G--------------T----GA-----A--A-GC--GAGCGGTT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--
gi|62 : taactTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-----TG--A--GAG-C--A-GG-CTG----A----A--CG-C----A--T----T---------G-T--GA-
gi|63 : C----AA-TAA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACGC--ACA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-----------A----A--TG---ttgaa
gi|63 : ------AAC-----G--C-A-C---AG--T--G-ACC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGAaatgaaaaatga
gi|64 : caataaatgaaaaatgactaCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------CA--AC----------------------A-C-------GC--A------TG--G-----TG--A--
gi|65 : agtcTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---A-----------------------A-C-------GC--A------TG--G-----TG--A--CC-------CG-CA------------------------C----G---------G-T--GA-C-C-G-A--C---C-G------------C-T----Gaaaaccacccgttgaatgca
gi|67 : --CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-T-------GCA-A------TG--G-----TG--A--CCG-C--A-C--CAGC---A----A--TG-A----A--C----G---------G-T--G
gi|68 : taTCCACT-GAAA--CG-TT--CT---A----AT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-C
gi|69 : agTCCACT-GAAAT-CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TGA-A--CCA-C--A-CG-
gi|7 : g-G--A----A-C-------G----G----TG-----AC----C---GCA--C-A---C--AG------AGC-----G--A-A-C---GA--T--G-ACC-----GC-A-CA-T-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACGC--A---GTGA-CCAGCC-ACGCTAGAAG-GC--A-----ACGGGG--TG---T-ATCCTTGCTAGTA-----A------GAACG--A-A-CG-A--TGACCG-CATGCATA-C---GGAGA-A-------A
gi|70 : acac-A-C---GG--T--G-AAA-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACAC--Aacgctcgaaatggaaaatatggtaattagaga
gi|71 : gcTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-T-------GC--A------CG--G-----TG--A--CTG-C--A-CG-
gi|72 : ag----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----G-C-------G----G----T
gi|73 : at-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----TT--T---T---A-C------------C---AA----------------------A-T-------GC--A------CG--G-----TA--A--TCG-T--A-AG-CAG----
gi|74 : TG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGTCTGTAT-TATTAAGCTG
gi|75 : C-CT-GAAA--CG-TT--CTCTAA----CT--T-------A-C----------------AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--gaa
gi|76 : cagtTCC-CT-GAAA--CG-TTA-TT---A----CT--TTAAT---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GCA-A------CG--G-----Tgacg
gi|77 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--TT---A----CT--T-------A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCA-C--
gi|78 : agTCC-CT-GAGAAGCG-TTT-CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--
gi|79 : agTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---AA---CT--T---T---A-C------------CC--AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----T
gi|8 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--ACCG-CAG----A----A--CG-C----A--C--------------G-T--GA-C-C-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-GC--AAT---TT-G--G----G--A----C-C-------G----C----TG-----AC----C---GCA--C-G----------------CT----A--A-A-C---CG--C--G-ACC-----GG-A-C--C-------GC----AA-TG------T---GA------ACG--G-TGACCG-A-CCGC-------TGA-CCG--C-ACG-T-GACC-------------------------GACCGCTGACCGCACGC--T------GAACG--C-A-
gi|80 : gTCC-CT-TAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--a
gi|81 : ag-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TTACTG-A-ATG---ACG-GTGg
gi|82 : AA-A-------GTG-G-TAA------AGTAGAACGCTTTAGGGGCT
gi|83 : TCC-TT-GAAA--CG-TT--TT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------TG--G-----aacggtg
gi|85 : cagTCC-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---GC----------------------A-C-------GC--A------
gi|87 : cagTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------
gi|88 : cag-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTA--GGCTCA
gi|89 : TCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--
gi|9 : agTCA-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T----------------------------------------------------------------A-----------------G--A--C-A-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--CC---G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------CCT----GA-----A----GC--AAT---T----------------------------G----G----TA-----AA----C---GCA--C-G---AGAAGGACCTAAAC-----G--T-A-C---GG--T--G-AAC-----GCTA-CG-CCT---GAAC----AAACGA----A-----G------AAA--A-TGACTGTA-ACGC---CG-GTAATCCG--C-ACG-T-GCAC-GC--A-----G----G--TG-----------GACCGCATGC--T------GAAC
blockSeqs : A AA G GT CTT ATCA TA TAA TAA AACGCACGGTGC GAA TTGAACGATGAGCAAACGCTGA A AGTGAGT CG GAAGAA GAAGT AA ATT GA A TTTT CTGCG CGCC ACAA AGCCGCATC G TG A G G NN ATT ATNNNNNNNNNNN GGGG CTGGCA CA GCGG CA AA G AA GTGC CGCTAGG ATTA ATAC ACCGC CCGC TAA AT T GCTG GACCTA TAGGTGAACCT AC TG C C GGAGG T T A C CTT GTGT T TAGT ATC TTAGTG GC T GT G GA A T GC C CTG CCATGGTGAGTCCGAT N N GCATTTGAT AT G A GGGT CATGCATACG C CAACACT C A CCAAGT TT
blockSeqs : A AA G G CTA AAA A . T GGTTTAC TA CTTA T . CA ATT T GA TC T T AA CACG C ACG . T G G G C TG T CA GC CAAGA G TC A GT . . ACGC . CCTG . . AAC . . . GTT . GGAAACAAA C . G T . A . . . CG A A C A AC . . A . . . . . . CTA GCAACGGGGTGTAT T T CGCATA . . . GGC CACTTAC . . . . . G
blockSeqs : . AG T A . A C . A AC C G . . C GC . C A . T C GAA T T . . . . T . A . CC C AAG . C . C . . C . CAC . . A . . . AGA . GCAATTTT . . . T . C . . . . . . . . C . . G . . . . . . NN AAAAATGAAATGA T C NNNN . . . GTG CACATG . . . . . .
blockSeqs : . A . T . G A . . . A G . . A A . T C . C . GG . C . . . . . . . . CG G GAT . N . . . . . . CC . . . . . . GT . GAATC . . . A . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . CT GCAAAACTGTGAC T C CGCA . . . GTG ACGCT . . . . .
blockSeqs : . A . T . C . . . . C A . . A . . A C . . . AC . . . . . . . . . . CC . CT . T . . . . . . . . . . . . . C . GCAGC . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CT NNNNNNNNNNN T C TTTG . . . NN CATCT . . . . .
blockSeqs : . T . A . A . . . . . . . . A . . . C . . . GG . . . . . . . . . . C . AA . T . . . . . . . . . . . . . C . GCGAC . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CT CGCATGGT T T AGCA . . . CG AAACG . . . . .
blockSeqs : . A . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . . . . C . A . T . . . . . . . . . . . . . N . GCCAC . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CA GCAGGTG A C CAGA . . . GG NNNN . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . T . G . T . . . . . . . . . . . . . G . TAAAC . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CA GCCGA T C CGCT . . . CG CACG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . N . T . . . . . . . . . . . . . G . GAAC . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CT GCAC T T TGCT . . . GA AA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . A . A . . . . . . . . . . . . . C . NNNN . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CT GAC T C ACA . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . C . T . . . . . . . . . . . . . C . GAAC . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . C GCA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . A . T . . . . . . . . . . . . . C . AAAC . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . C . A . T . . . . . . . . . . . . . G . GCAC . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . G . . . . . . . . . . C . A . T . . . . . . . . . . . . . G . AAAC . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . N . . . . . . . . . . G . A . T . . . . . . . . . . . . . G . GCAC . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . C . A . T . . . . . . . . . . . . . G . GCAC . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . N . A . T . . . . . . . . . . . . . A . GAAC . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . C . N . T . . . . . . . . . . . . . G . AAAC . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . T . C . T . . . . . . . . . . . . . G . GCAC . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . C . A . N . . . . . . . . . . . . . G . GCAC . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . G . A . T . . . . . . . . . . . . . G . GCAC . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . C . C . T . . . . . . . . . . . . . G . GAAC . . . G . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . C . T . . . . . . . . . . . . . G . ACT . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . N . A . T . . . . . . . . . . . . . G . GAA . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . C . A . T . . . . . . . . . . . . . G . GCT . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . G . N . T . . . . . . . . . . . . . C . CA . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . T . A . C . . . . . . . . . . . . . G . C . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . A . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . C . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . . . . G . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . G . C . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . C . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . G . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : CACN***********
originalCons : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-ANC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GC--A-----A----A--TG---TGACCGGTGACCGCACGC--A------GAACG--C-A-CG-G--TGACCG-C------A-C---GGAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-TGCTCATCTGTCA
finalCons : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-ANC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GC--A-----A----A--TG---TGACCGGTGACCGCACGC--A------GAACG--C-A-CG-G--TGACCGCACN-----------GAAA-A-------ATG-G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-TGCTCATCTGTCA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|66 ): ACGTCCCATGAAACATTCTATCTTACACGAAGCACGTGGACGCAACGCAG
Unaligned ( gi|84 ): GCTGAACGACGGTGAACCTCTCAAAGTTCTAAAAA
Unaligned ( gi|86 ): CCCGTTGACCGCAAACGCTACCGCGAAACGGAC
Alignments
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lowQualScore : . . .. . .. ... .... .. ... ... . ............ ... ...................... . ....... .. ...... .. ..... .. ... . .. . . .... ....... . .... .. .... ......... . .. . . . . .. ... . .............. .... ........ . .. .... . .. .. . .. .... . ....... .... .... ..... .... ... .. . ...... ...... ................ .. .. . . ..... . . . . ... .... . .... ... ...... .. . .. . .. . . .. . ... ......................... . . . ............ . .. . . ..... . . ...... . ....... .... . ...... ...
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consensus : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-ANC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GC--A-----A----A--TG---TGACCGGTGACCGCACGC--A------GAACG--C-A-CG-G--TGACCG-CA-C---NGAAA-A-------ATG----G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-TGCTCATCTGTCA
Reference ( family-190 ) : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-ANC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GC--A-----A----A--TG---TGACCGGTGACCGCACGC--A------GAACG--C-A-CG-G--TGACCG-CA-C---NGAAA-A-------ATG----G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-TGCTCATCTGTCA
gi|1 : TCC-CT-GAAA--CA-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-T-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-AC--AAT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----A---GCA--T-G---G--AG------AAC-----A--A-A-C---GG--T--G-AAC-----AC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-GCAAA-----A----A--TG---TGAACGGTGACCGCATGC--A------AAACG--C-A-TG-G--TGACCG-CA-T---GGAAA-A-------ATG----G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGATTGTATATGTACATCTGTCA
gi|10 : TCC-CT-GAAA--TGGTTG-TT---A----CT--T-------A-T------------T---A-----------------------G-C-------GC--A------C-----------------------A-CG-CAG------------C----------T----G---------G-TTGAA-C-C-G-C--A---C-G------------CAG----GA-----A--C-G---AAC---GT-GCAA--T-G--G----A-CCGCTAGGG----G----GG-----GA----G---GAA--C-G---C--GG------AACTAGGTG--A-A-CCT-GG--C--G-ACCGGAGGGC-G-TG-G-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--G-TGACTA-A-ACGC--ACG-GTGA-Cacacaggattcttaagg
gi|11 : agt--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---C--AG------AGG-----G--A-A-C---GG--T--G-ATA-----GC-A-CG-C-A---GA
gi|11 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A------CG--G-----TG--A--ACG-C--A-CG-CAG----A----G--GG-A----A--C----G---------G-T--GA-T-A-G-C--A---C-G------------C-A----GA-----G--A-GA--AA----------G--T-G--A----G-C-------G----gagaaagtgagcgcatg
gi|12 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCC-CT-CGAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------G-----------------------------------------G----A----G--CG-A----A--T----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-GATNNNNNNNNNNN-N----NN-----N--N-NN--NNN---NN-N--N--N-N--N----N-N-------N----N----NN-----NN----N---NNN--N-N---N--NN------NNN-----N--N-N-N---NN--N--N-NTC-----AC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCcatg
gi|13 : CC-CT-GAAA--CG-T---CT---A----CT--T---T---A-C------------C---A-----------------------A---------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG----A-CG-CAT----A----GG-CA-A----G--C----G---------G-T--GA-C-C-GGC--A---C-G------------C-T----GA-----AAGC-GC--AAT---TT-G--T--T-G--A----A-C-------G----G-----G-----AA----T---GCA--C-G---G--AG------AAA-----G--A-ATC---GG--T--G-AAA-----GC-A-CGAC-T---GAAC----AA-TAA---------GA------AAA--A-TGACTG-A-ATGC--ACA-G
gi|14 : agA-----A--A-GC--AAT---TT-G--G--T-A--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--C-G---
gi|14 : --A-A-C---GG--T--G-AAC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GAC-----AAA--A-TGAC------------NN-NNNN-NNN--N-NNNNN-NNNN-NN--N-----N----N--NN---NNNNNNNNNNNNNNNNNN--N------NNNNN--N-N-NN-N--NNNNNN-NN-N---NNAAA-A-------ATG----G-TAA------AGAAGAACGTTTCAAGGACTGTActgaacaatgaatgacaaaatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatggtaaagaagaacgtttcaaggactgta
gi|15 : aaagcaatttggtaAAA--CG-TT--GT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------ACCGA------CG--G-----TG--A--C-G-C--A-CA-CAG----A----G--CG-A----C--C----G---------G-T--GA-C-C-G-CA-A---C-G------------T-TC---GA-----C--C-GC---GT---TT-G--G--T-C--A----T-C-------G----G----CG-----CA----C----CA--C-----------------AC----------A-CT--GG--T--G-TCC-----GCTATCG-C-T---GAAC----AA-TGA----ATATCGA------AAA--ATTGACT--A-ACGC--A
gi|16 : TCC-CA-GAAC--CG-AT--CT---A----CT--T---TT--A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--AGC----TA--G-----TG--A--CCGAT--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----G---------GGT--GA-CGC-G-C--A---C-G------------CCT----GA-----A--C-GC--AAT---TA-G--G--T-G--A----T-A-------G----G----TG-----AAA---C---GCA--TTG---G--AG------AAC-----G--A-A-----AG--T--G-AAC-----GC-A-CG-C-T---GATC----AA-TGA----TT---GA------AAacg
gi|17 : G-A----A--C----G---------G-C--GA-G-T-G-C--A---T-G------------C-T----GA-----A--C-GC--A------T-G--G--T-G--AGTGCA-C-------A----C----TG-----AA----A---GCA--T-G---C--AG------AGC-----G--A-A-C---TG--T--G-AGC-----GC-A-TG-C-T---GAACGTGTGG-TGA----GT---GATTAGTGAAAGCA-TG-CAG-A-GCAA--ACG-GTGA-GCG--C-ACGCT-GAA
gi|17 : ttaccactt-------GC--A------CA--C-----TG--A--AAG-C--A-TG-CAG----A----G--CG-A----A--C----T---------G-T--GA-G-C-G-C--A---T-G------------C-T----GA-----A--C-G-----T---GT-G--G--T-G--A----G-T-------GATTAG----TG-----AA----A---GCA--T-G---C--AG------AGC-----A--A-A-C---GG--T--G-AGC-----GC-A-CG-C-T---GAA
gi|18 : ttaccacttgaacggcgagtgcatgctgaacgcatggtgagtC-CT-GAGA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--TCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--T----GAGCCGCATCG-T--GA-T-T-G-C--A---CGG------------C-T----GACAAG-A--CTGA--AAA---AT-G--AC-T-G--AACGCA-C-------G----G----TG------A----C---GCA--C-G---C--AG------AAC-----G------CT--GG--T--G-AAC-----GC-A-
gi|19 : TCC-CTCGAAA--CT-CT--CT---A----CT--T---T---A-CGGTTTAC-----C---ACG---------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TG-GAG----ACAC-G--CC-AC---G--C----G---------T-T--GA-C-C-A-C--A---C-G------------C------GA-----A----GC--AA-----T-G--A--A-T--A----A-A-------A----A----TG-----AA----CTAAGCA--C-G---G--At
gi|2 : gC-CT--AAA--CG-TTA-CT---A----CT--T---T---A-CAACGCACGGTGCC---GC----------------------A-C-------GC--AGAAGAACG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A----A--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-T------------C------AA-----A--C-G---AAT---C-----G--TGG--A----A-C-------GCAC-C----TG-----AC----C---GCAATT-G---G---G------AAC-----GGAA-A-CAAAGG--T--G-AAC-----GC-A-CA-C-----GAACA---AA-TGAC---AT----A------AAA--A-TGACTA-A-A-GC--ACGAGTGA-CCC--G-ACGC--GAAC-AA--A-----A----A--TGAAATGA-AAATGACT-TAC------------AA----C-A-CC-G--TGACCGACG-C---TGAAACA-------ATG----actcacggaagataaat
gi|20 : agtaAAA--CG-TT--TT---A----CT--T---T---A-C------------C--------------------------------------C--A------CA--A-----TG-----CC---------------------------------A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---T-G------------C-TG---GA-----A--A-AC--A------T-G--GAAT-GAAA----A-A-------G----G-----G-----GA----C---ATA--C-T---G--AA------AA------G--C-A-C---GG--TTGA-ACC-----GC-A-TG-C-T---GAAC----AATTGA----AT---GA------AAA--aatgaaaatgcataaacacatggtg
gi|21 : agtcctgaaacaaaCTG-A-CCGCGAACA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GACC-GC--A-----A----AACTG---TGACCGGTGACCGCACGC--A------GACCG--C-A-CG-G--TGACCG-CA-C---GGAAA-A-------ATG----G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTAT-
gi|22 : accgC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AA---CTA-T---T---A-C------------C----C----------------------A-C-------GCCAA------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CAG----A---------------------------------------A-C-C-G-C--A---C-G------------G-T----GC-----CT-C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--AC---C-C-------G----T----TGACCGCAA----C---GCA--C-C---G--CG------AA------A--A-A-C---GGC-T--G-ACC-----GC-A-gtt
gi|23 : CC-CT-GAAA--CA-TT--CT---T----AT--T---T---A-C------------C---CC----------------------A-T-------GC----------T--G-----TG--A--CCG-C--AACG-CAG----A----G--TG-A----A--T----G---------G-T--GAAC-T-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----AA-T-GC--AAT---TA-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----AG-----AA----C---GCA--T-G---A--A------------------------------T--G-AAC-----GC-A-CG-C-T---GAA
gi|24 : TCC-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-N-------NN--N------NN--N-----NN--N--NNN-N--N-NN-NNN----N----N--NN-N----N--N----N---------N-N--NN-N-N-N-N--N---N-N------------N-N----NN-----N--N-AC--AAT---TT-G--G--T-G--A----T-C-------T----G----TG-----AT----C---G
gi|25 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--G---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------AC--A------CG--G-----TT--A--CTT-C--A-CA-CAA----A----G--CG-A----A--C----G---------G-G--GA-C-C-A-C--A---C-G------------C-T----TA-----C--A-GC--ATT---TT-G--G--T-G--A----A-C-------T----G----AG-----AA----C---ACA--C-G---gtgaccgc
gi|26 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----TT--T---T---A-C------------C---ACTTGAACGATGAGCAAACGCTGAA-C-------GC--A------CA--G-----TG--A--GCG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--C----A---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------T-T----GA-----A--C-GC--AAT---ct
gi|27 : aaTCC-CT-GAAA--TG-GT--CT---G----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------AC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TG-GAG----A----A--------------------------------------C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A-----C--AA-----T-GA-A--T-G--A----A-C-------A----A----TG-----A--------------------G--TG------ACC-----G--C-A-C---GG--T--G-ATA-----GC-A-C
gi|28 : ag----A--C----G---------G-T--GA-C-C-T-C--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-AC--A------C-G--G--A-G--A----A-C-------GCCTGG----TG-----AC----C---GCA--C-G---G--AG------AAT-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----AC-G--G-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AGA--A-TGACTG-A-AC
gi|29 : cTCC-CT-GAAA--CG-TT--TG---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-----TG--A--GCG-C--A-CG-CTG----A----A--CG-C----AGTT----G---------G-T--GAGC-G-G-T--T---C-G--------------T----GA-----A--C--------------G--G--T-G--G----A-C-------G----C----TG-----AA----C---GCA--C-G---G--a
gi|3 : cagC-CC-GAAA--CG-TTGTCT---A----CT--T---T---A-C-----------------C----------------------A-C-------GC--G------CG--G-----TGAAA--CCG-C--A-CG-CAG----A----A--CG-A----G--A----A---------G-T--GG-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--G-GC--AGT---TTGG--G--T-G--A----AGC-------T----G----AG-----AA----C---ACA--C-G---GTTGG------AAC-----C--A------------------C-----GCAA-CG-C-TCG-AAAC----AA-TGA----AT---GAAC----AAG--A-TGACTA-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACGCTGGAAC-CC--ATGGTGA----G--TC---CGATCGAT-ACCGCATTT--G------TACCGATC-A-CG-GC-TGAACG-CA-CTTACGAAA-ACAACACTAGA----G-TAACCAAGTAGTAGAACGTTTt
gi|30 : agtTCT-CT-GAAA--CG-TT--C----A----TT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--GGAAGTTG--AT-CCT-C--A-CG-GAA----A-------------------------------------------C-G-C--AT--C-G------------C-T----GA-----A--C-ATG-AAT---------A--T-G--A----A-A-------A----GATACTG-----AA----C---GCA--C-G---G--
gi|31 : ag----A--C----C---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--C-G--A----A-C-------G----G----TC-----AA----G---GCG--C-G---G--AG------AAC-----G--A-A-C---GG--T--G-AAC-----GC-A-CT-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGATTG-A-A
gi|32 : g------CG--G-----TG--A--GTG-T--A-CA-CAG----A----G--CA-A----A--C----G---------G-T--GA-G-C-G-CNNN---N-N------------N-N----NN-----N--N-NN--NNN---NN-N--N--N-N--N----N-C-------G----G----TG-----AG----T---GTA--C-A---C--AG------AGC-----A--A-A-C---GG--T--G-AGT-----GC-A-CA-C-A---GA
gi|33 : -GAAA--CG-AT--TT---A----CT--T---T---A-C------------C---AA----------------------AAC-------GCC-A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-TA-CAG----ACTGCG--CGGA----A--C----G---------G-C---A-T-C-G-C--A---C-G------------C-T----AA-----A--C-GC--AAT---TT-G--AGTT-G--A----A-C-------G----G----TG-----A
gi|34 : --T-G--C----A-C-------A----G----TG-----AT----C---GCA--T-G---G--AG------AAC-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----GC-A--G-C-T---AATT----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTG-A-ACGC--ACG-GTGA-CCG--C-ACA---GAA------A-----A----A--TG---
gi|35 : aA--C-G---G--AG--------C------------C---AG--T--G-ACC-----GC-A-CG-C-T---GAAC-----A-TGA----AT---G
gi|35 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaactttCA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-AT--G-----A----A--TG---TGAtga
gi|36 : acccagaactagcttaagaccgggcctgcattgcaggggaagacgagccaactttacggagcTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AAAA-CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-CGAA-CG-CAG----A----GAACG-A----G--CACG-G---------G-TG-GA-CGC-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----A--
gi|37 : agCC-CT-GAAA--CGGTT--CT---AATCACT--T---T---AGC------------CGAAAC----------------------A-C-------GC--A------CGCGG-----TG--A--CCG-CT-A-CG-CAG----A----------A----A--CACAAG---------G-T--GA-C-C-G-C--A---tac
gi|38 : agtcTCC-CT-GAAAAACG-TT--TTCTTA----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C--------C--A------CG--G-----TG--A--CCT-C--A-CGCCAG----A----AC-CG-C----A--C----G---------ATT--GA-C-C-G-T------C-G------------T-T----GA-----C--C-GC--AAT---TT-G--atttggt
gi|39 : g-CT-GAAA--CG-TTT-CT---AG---CT--C---T---A-CAC----------CTA-AT----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A----G-A--T-CA-CAG----A----A--CG-A----A--C----G---------C-T--GA-CTC-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-
gi|4 : tT--TT---A----CT--T---TTAAA-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--T-----AG--A--CCG-C--A-CG-CAA----A----G--TG-A----A--C----------------T--GA-C-T-GCC--A---C-G------------C-T----GA-----GATC-GCCAAATC--TT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AGCCGCC---GCA--C-GGCTG--AG------AGT-----GC-A-G-C---GGACT--G-AAC----------CG-C------AAA----AA-TTA----CTA--GT------AAA--A--------A-AAAC--AGG-GTGA-CGT--C-ACGCA-GAAC-GC-----------------------ACTGG-GACCG---AC--A------GA--------------------------------AA-A-------ATG----T-TAA------AAGAGAACGTTTTCGGGA--G-A---GCTCATCTGTCAaatgaagaaa
gi|40 : accatgaacctacttttcTCC-CT-GAAA--AG-TTT-CT---A----CT--T-------A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CC--G-----GG--A--CCG-C--A-CG-CAG---------G--CA-ACGCCA--C----G---------G-T--GA-C-C-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-GC--AAT---T
gi|41 : cagTCC-CT-GAA---CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-A-------GC--A------CG--G-----TG--AATTCG-C--A-CG-AGA----A----A--CA-A----A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--C-AC--AA
gi|42 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TGC-A--CCG-C--A-CG-CAG----A----A--CG-C----A--C----G---------G-T--GA---C-G-T--A---C-G------------G-TGC--GA-----A--C-GC--AAT---TT-at
gi|43 : TCC-CT-GAAA--C--TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---ACG---------------------A-A-------GC--A------CG--G-----TG--A---CG-C--A-CG-CAG----AG---G--CG-A----C--C----G---------G-T--GA-A-C-G-CTGA---C-G------------C-T----TG-----A--C-GC--AA
gi|44 : gGTGACCGCAAGC--A------GAACG--C-A-CGTG--TGACCG-CA-c
gi|45 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacgcacTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-T------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-TAG----A----G--CG-A----C--C----G---------T-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----C--C-AC--AAT---attttggtgacc
gi|46 : gC-CC-GAAA--CG-TT--TG---A----CT--T-------A-C------------C---AC-----------------------------------------------------TG--A--------------------------------A----G--C----G---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AG----TT-G--G--T-G-------G-C-------G----G----T
gi|47 : agtTCC-TT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-------------------A-CG-ATG----A----G--TG-A----A---------------------------C-G-C--A---C-G------------G-T----GA-----A--T-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----G-C-------G----G----tcgtgaactggt
gi|48 : ag-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T-------A-C------------A---AC----------------------GTC-------AT--AATT---CA--G-----TGT-A--CCG-C--ATCG-CAG----A-----------------------------------------C-C-G-C--A---T-G------------CGTGGGGGA-----T--C-GC--AAT---TT-
gi|49 : t--TA---TGACCGGTGAGCGTACGCATA------GAGCA--C-A-CC-G--TGAACA-CA-C-----------------ATGGAGCG-CAC------AG-AGAACGTCTCAGGGACT
gi|5 : agcC-CT-GAAAAACG-TT--CT---A----CTC-T---T---A-A------------C----C----------------------A-C-------GA--A------T---G-----TG--A---CG-C--G-AG-CA-----A----G--C--A----A--C----G---------A-T--GA-C-C-G-A--A---C-A------------G-T----GACTGGCA--T-GC--AA----------G--C-G--A----A-C-------G----A----TG------A----C----CA--C-G---GT-AG------AAC--------------------T--GCAGC-----G---------------------AG-TGA----AC---GA--------------GACC-----CGC--AC--GTGA-CAA--C-ATGCA-GAGT-GC---------------------CGA--GAAAACCGCACAG--A------GAACG--CGA-C--A--TGACCG-CATC---TGAAC-A-------AGA----A-TAA------A
gi|5 : gtcaC--A------CG--G-----TAGAA--CTG-C--A--G-C-G----A----G--TG-A----A--C----G---------A----GA-C-CCG-C--A---C-G--------------T----GA-----------C--AAC---AT-G--C--A-G--A----G-T-------GCC--G----AG-----AAAAC-C---GCA--C-A---G--AG------AAC-----GC-G-A-C---A---T--G-ACC-----GC-A-T--C-T---GAAC----AA--GA----AT----A------AAA--A-TGAGTA-A-ACGC--TCG-GTaatgagtaaacgctcggt
gi|50 : gtcacctgaaaaacgttctactcttaaccacgaatgtgacgcgagcaagcaacgatgaccgaacagtgactggcatgcaagcgaacgatgacCAGTGAATGCA-GC--A------GAGCG--C-AACGTG--TGAGCG-AAAC---GAAAA-A-------ATG----AATAA------AATTGGACGTTTCATGGACTGCA
gi|51 : TCC-TT-GATC--CG-TT--TT---T----CT--T---T---T-C------------C---ACCTTA------------------A-CAGTGAGTGG--G------CG--G-----TG--A--ACG-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--T----G---------A-T--GA-
gi|52 : cagTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---A----C---T---T---A------------------------------------------G-C-------GC--A------CG--C-----TG--A---------A-CG-CAATTTTA----G--TG-A----A---------------------------C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-
gi|52 : ag-----AG----C---GCA--C-G---C--TG------AAC-----GC-A-A-TTTTAG--T--G-AAC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------Aaatgaatgaa
gi|53 : agtccctgaaaacgttctacttTCC-CT-G-AA--CGTTT--CT---A----CTA-T---T---A-C------------C---ACA---------------------A-T-------GC--A------TG--GT----TG--A--CCA-C--ATCG-------------G--CG------A--C----A---------A-T--GA-C-C-
gi|54 : tacagC-CT-GAAA--CG-TT--CT---AC---CT--T---T---C-C------------C---AA----------------------G-C--------C--C------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG--AGAA--A----G--C--C----A--C----G---------G-T--GA-agcgaac
gi|54 : agtCCGGTGACCGCACG---A------GAAAGC-C-A-CG-G--TGA-AG-CA-A---TGAAA-agcaatgaaat
gi|55 : agtcctgaaacgttctacctttcccaagcc----A--T----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA--------------------TT---------------------------------------------A----T---GCA--T-G---G--AG------AAC-----G--C-A-C---GG--T--G-ACC-----GC-A--G-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-Tt
gi|56 : cTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---T----CTTAT---T---A-C------------T---AC----------------------A-C-------GC---------CG--G-----TG-----CC-------------------------TG-A----A--C----G---------G-------C-C-G-C--T---C-G------------G-T-----------A--C-CC--AAT---TT-G--G--
gi|57 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--TT---A----CT--T---TA--A-C------------C---AC----------------------A-T-------GCA-A------CG--G-----TG--T--CCG-C--A-CG-CTG----A----A--CG-CT---A--C----G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---
gi|58 : g-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------CC--AC----------------------G-C-------GC--AA-----CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-CGA----C----C--CG-C----A--C----G---------G-T--GC-C-C-G-C--A---
gi|59 : TCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------T---G-----------------------A-C------------------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-GAG----A----C--CG-C----A--CT---G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------C-atttg
gi|6 : ag-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--A-----TT-G-----------------------------------TG-----AC----C---GCA--C-G---G--AG------AAC-----G--CCA-C---GG--T--GGACC-----GCCA-GG-T-TCTTGAAT----TA-TGATAGTAT---TA------ATA----TG---G-AGACG---ACC-ATGA-CCG--CCACCCT-GACCCGC--A------------------TGGTTGG--ACCG---GC--ATTTGATGAAAG--C-A-CG-GGTTGATT---A-A---AAAAG-A-------ATG----G-TAA------AGTAGAACCATTCA-GGACTGTAT-ga
gi|60 : TTC-CT-GAAA--CG-TT--CT---T----CT--T---C---A-C------------C---AC-----------------------------------------------------T---------------------------------TG-A----A--C----T---------T-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----CA-----A--C-GC--AAT---TT-G--T--T-A--A----G-C-------G----ctgt
gi|61 : cag-C--A-CG-GTG----A----G--TG-A----A--C----G---------A-T--GA-----A-C--AATTT-G--------------T----GA-----A--A-GC--GAGCGGTT-G--G--T-G--A----A-C-------G----G----TG-----AA----C---GCA--
gi|62 : taactTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------T-T-------GA--A------CG--G-----TG--A--GAG-C--A-GG-CTG----A----A--CG-C----A--T----T---------G-T--GA-
gi|63 : C----AA-TAA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACGC--ACA-GTGA-CCG--C-ACGCT-GAAC-----------A----A--TG---ttgaa
gi|63 : ------AAC-----G--C-A-C---AG--T--G-ACC-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGAaatgaaaaatga
gi|64 : caataaatgaaaaatgactaCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------CA--AC----------------------A-C-------GC--A------TG--G-----TG--A--
gi|65 : agtcTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---A-----------------------A-C-------GC--A------TG--G-----TG--A--CC-------CG-CA------------------------C----G---------G-T--GA-C-C-G-A--C---C-G------------C-T----Gaaaaccacccgttgaatgca
gi|67 : --CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-T-------GCA-A------TG--G-----TG--A--CCG-C--A-C--CAGC---A----A--TG-A----A--C----G---------G-T--G
gi|68 : taTCCACT-GAAA--CG-TT--CT---A----AT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--A-CG-C
gi|69 : agTCCACT-GAAAT-CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TGA-A--CCA-C--A-CG-
gi|7 : g-G--A----A-C-------G----G----TG-----AC----C---GCA--C-A---C--AG------AGC-----G--A-A-C---GA--T--G-ACC-----GC-A-CA-T-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACGC--A---GTGA-CCAGCC-ACGCTAGAAG-GC--A-----ACGGGG--TG---T-ATCCTTGCTAGTA-----A------GAACG--A-A-CG-A--TGACCG-CA-
gi|70 : acac-A-C---GG--T--G-AAA-----GC-A-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TGACTA-A-ACAC--Atgcatacggagaaaacgctcgaaatggaaaatatggtaattagaga
gi|71 : gcTCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-T-------GC--A------CG--G-----TG--A--CTG-C--A-CG-
gi|72 : ag----A----G--CG-A----A--C----G---------G-T--GA-G-C-G-C--A---C-G------------C-T----GA-----A--C-GC--AAT---TT-G--G--T-G--A----G-C-------G----G----T
gi|73 : at-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----TT--T---T---A-C------------C---AA----------------------A-T-------GC--A------CG--G-----TA--A--TCG-T--A-AG-CAG----
gi|74 : TG----G-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGTCTGTAT-TATTAAGCTG
gi|75 : C-CT-GAAA--CG-TT--CTCTAA----CT--T-------A-C----------------AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--gaa
gi|76 : cagtTCC-CT-GAAA--CG-TTA-TT---A----CT--TTAAT---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GCA-A------CG--G-----Tgacg
gi|77 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--TT---A----CT--T-------A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCA-C--
gi|78 : agTCC-CT-GAGAAGCG-TTT-CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--
gi|79 : agTCC-CT-GAAAA-CG-TT--CT---AA---CT--T---T---A-C------------CC--AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----T
gi|8 : agTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--A--CCG-C--ACCG-CAG----A----A--CG-C----A--C--------------G-T--GA-C-C-G-T--A---C-G------------G-T----GA-----C--C-GC--AAT---TT-G--G----G--A----C-C-------G----C----TG-----AC----C---GCA--C-G----------------CT----A--A-A-C---CG--C--G-ACC-----GG-A-C--C-------GC----AA-TG------T---GA------ACG--G-TGACCG-A-CCGC-------TGA-CCG--C-ACG-T-GACC-------------------------GACCGCTGACCGCACGC--T------GAACG--C-A-
gi|80 : gTCC-CT-TAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------CG--G-----TG--a
gi|81 : ag-CG-C-T---GAAC----AA-TGA----AT---GA------AAA--A-TTACTG-A-ATG---ACG-GTGg
gi|82 : AA-A-------GTG----G-TAA------AGTAGAACGCTTTAGGGGCT
gi|83 : TCC-TT-GAAA--CG-TT--TT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------TG--G-----aacggtg
gi|85 : cagTCC-CT-AAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---GC----------------------A-C-------GC--A------
gi|87 : cagTCC-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--A------
gi|88 : cag-TAA------AGTAGAACGTTTCAGGGACTGTA--GGCTCA
gi|89 : TCC-CT-GAAA--TG-TT--CT---A----CT--T---T---A-C------------C---AC----------------------A-C-------GC--
gi|9 : agTCA-CT-GAAA--CG-TT--CT---A----CT--T----------------------------------------------------------------A-----------------G--A--C-A-C--A-CG-CAG----A----G--CG-A----A--CC---G---------G-T--GA-C-C-G-C--A---C-G------------CCT----GA-----A----GC--AAT---T----------------------------G----G----TA-----AA----C---GCA--C-G---AGAAGGACCTAAAC-----G--T-A-C---GG--T--G-AAC-----GCTA-CG-CCT---GAAC----AAACGA----A-----G------AAA--A-TGACTGTA-ACGC---CG-GTAATCCG--C-ACG-T-GCAC-GC--A-----G----G--TG-----------GACCGCATGC--T------GAAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|66 ): ACGTCCCATGAAACATTCTATCTTACACGAAGCACGTGGACGCAACGCAG
Unaligned ( gi|84 ): GCTGAACGACGGTGAACCTCTCAAAGTTCTAAAAA
Unaligned ( gi|86 ): CCCGTTGACCGCAAACGCTACCGCGAAACGGAC