lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       11111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
lowQualScore                  :            22                   11    11                              2222     222                           1111                       1            111                  111             11111111                  222                    111                111111                                  11          222222222       444444444444                                         111111                           111             2222222222                  11111         11       11                                                    2222222222                1111111                   33                    2222222   1                     1111     11   222                   22222222222             11111111                                                                       1111        222222           444444                    11                    222          11         11111111111    1111111111111111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                    22222222     11111                                               11                1111111111           1111  1111                                    1111      6666666666666666666666666666666666666666666       111111111             22                                                                                                1111                        3333333                                                          111111                                    111      1111      11111111111111      1111111111     333333333                                           1         111                111111                                                    11   11111111111111      11111111111             999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999           11111111111                                                                11                 11111          11    22222           1111111                 22222222222        2222                                                                  1111111111111        11111    11            111   111111                                2  1    111   3333333333333                                         111111       1111      1111111              11                          1111                      111111111                                          111111111                  111111  11111111       11111         1111     333                       11        111111  44444444444444444444444444              2222222222222222222                                                     22222222             11  1111111   222                        11  11111             555555555555555555             111111           1  11                  11   111111111111                                   1111111111111                    111111111                     11111111111                          111       222222           1111               
lowQualScore                  :            66        3       55 33    22     88       2          55   9999     444    5  2      3 3       3  1111    666            3   5    3       111    3          55 000        4 55 44444444   777  4 4   4   000  55 4    99  4     111      3  3  77  222222   44    3    44 88  888888     1 77          111111111  3    111111111111  33 3 66      8        2 2      2 2 2 2 111111 2 888888 33 2 2  66  8888 333   2   66 33 1111111111   33   6   6 44  00000   9     00   3   33 3 3  2 33     7777777  2  2 99   5  2 2  8888   7  7777777777   7  5555   2  3333333   5 99999999 2    22     7    5     33  7777777   8 33    444 2    444  3333 33  66   333  2 2     2        44444444444 2 2 33 5555 44444444 2  5555 2 8888888  2  5 777777  2     666 2   88  55   5555  2    0   7777  33 2  444444   5  55   222222    5  77 22 8 2 22 55   2  333 2   77 2  333  4444 2  00  2 333  22222222222 2  5555555555555555555  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     22 6666 666666   4   2 2    6666 2 6 33  2  2  00000000     33333   9 22  1 1 333 888 55555  888888   333 2   2 00  55 0     2 2  8888888888  33 22    4444  3333  55 8888888    2     2    2 8 8 33 4444   2  9999999999999999999999999999999999999999999     5 111111111 5 2 666666  66   2  5555 7    2  444  2      77 2  2  2   2   7777     2 2  2 55  77777777 444   4 33      4  4444 2   8888 444 2 1 999   3333333  99999   55 33   777  2 1  2 2 5    2 33  8888888 2  5   222222  2  2 33  88  2     2  5   33      444  555 0000 33   66666666666666      6666666666   5 000000000   9999999 2   33      33        66  6666  1    33   000  2 5 5 2   99  333333  33 2 2    2    2   666 33    2 2  5555555   0 444 22 2 88888888888888  2 2 00000000000   7777 2    111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2  2    33333333333 2  33       2  2  2 5  3 3      55  55 66666 7     7 3   3 88  77    7    66   55 88888   4   4  11    22222   4   4 4 5555555  4    3 55 99   33333333333        3333 6     4   99999 3 1   88  88     3  3   55   3  3 3  999    3 3  8888888888888   44   00000    00 3  77   44 000   000000 3 3 55555   3     666  3  5555 3  0    777   7777777777777    44 3  3   666   3 6666         3  55 000000   3   5555      1111111 3 7777    3  55 44 555  6  3 44  3  3 3  0000  3  8888   3    77   666666666 3   44 66666 3  3    77  6 44  3  555  3 666666666    7    3  3  7  333333  33333333  3  3 88888  666    1111  3  555  0    666 55 4     3  33 44 3 0 222222  66666666666666666666666666    3  77  3  3333333333333333333 7777 44  3 6 99     44    888 3    555  6  3  44    11111111 44 3  555 3 11  0000000 3 888   3  3 44 888 3  3  3  22  00000 3    44 0   777777777777777777  99   3 3 3 444444     6  3  8  00 3     88888888   66   666666666666 3  555 44  555 2 999  44    3 555 8888888888888 6 44   999  6  9   888888888  77  3   888    44  88888888888  3 666   3   3           444       111111 3 55   55 1111  3 3   99     
lowQualScore                  :            ..        .       .. ..    ..     ..       .          ..   ....     ...    .  .      . .       .  ....    ...            .   .    .       ...    .          .. ...        . .. ........   ...  . .   .   ...  .. .    ..  .     ...      .  .  ..  ......   ..    .    .. ..  ......     . ..          .........  .    ............  .. . ..      .        . .      . . . . ...... . ...... .. . .  ..  .... ...   .   .. .. ..........   ..   .   . ..  .....   .     ..   .   .. . .  . ..     .......  .  . ..   .  . .  ....   .  ..........   .  ....   .  .......   . ........ .    ..     .    .     ..  .......   . ..    ... .    ...  .... ..  ..   ...  . .     .        ........... . . .. .... ........ .  .... . .......  .  . ......  .     ... .   ..  ..   ....  .    .   ....  .. .  ......   .  ..   ......    .  .. .. . . .. ..   .  ... .   .. .  ...  .... .  ..  . ...  ........... .  ...................  .........................................................     .. .... ......   .   . .    .... . . ..  .  .  ........     .....   . ..  . . ... ... .....  ......   ... .   . ..  .. .     . .  ..........  .. ..    ....  ....  .. .......    .     .    . . . .. ....   .  ...........................................     . ......... . . ......  ..   .  .... .    .  ...  .      .. .  .  .   .   ....     . .  . ..  ........ ...   . ..      .  .... .   .... ... . . ...   .......  .....   .. ..   ...  . .  . . .    . ..  ....... .  .   ......  .  . ..  ..  .     .  .   ..      ...  ... .... ..   ..............      ..........   . .........   ....... .   ..      ..        ..  ....  .    ..   ...  . . . .   ..  ......  .. . .    .    .   ... ..    . .  .......   . ... .. . ..............  . . ...........   .... .    .................................................................. . .  .    ........... .  ..       .  .  . .  . .      ..  .. ..... .     . .   . ..  ..    .    ..   .. .....   .   .  ..    .....   .   . . .......  .    . .. ..   ...........        .... .     .   ..... . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .. .  ..   .. ...   ...... . . .....   .     ...  .  .... .  .    ...   .............    .. .  .   ...   . ....         .  .. ......   .   ....      ....... . ....    .  .. .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ....   .    ..   ......... .   .. ..... .  .    ..  . ..  .  ...  . .........    .    .  .  .  ......  ........  .  . .....  ...    ....  .  ...  .    ... .. .     .  .. .. . . ......  ..........................    .  ..  .  ................... .... ..  . . ..     ..    ... .    ...  .  .  ..    ........ .. .  ... . ..  ....... . ...   .  . .. ... .  .  .  ..  ..... .    .. .   ..................  ..   . . . ......     .  .  .  .. .     ........   ..   ............ .  ... ..  ... . ...  ..    . ... ............. . ..   ...  .  .   .........  ..  .   ...    ..  ...........  . ...   .   .           ...       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :            88        6       00 66    33     66       8          00   2222     555    1  0      3 3       6  4444    444            6   0    6       888    6          00 000        0 55 00000000   000  0 0   0   222  55 0    55  0     888      3  3  99  999999   22    1    22 55  888888     7 88          444444444  1    333333333333  99 6 88      6        9 9      9 9 9 9 111111 9 222222 99 9 9  88  9999 666   9   88 99 4444444444   99   2   2 22  88888   2     44   1   55 1 1  9 77     6666666  7  7 00   3  7 7  3333   5  2222222222   5  3333   5  9999999   0 11111111 5    99     5    3     77  3333333   7 77    777 7    333  4444 77  00   777  7 7     7        66666666666 7 7 77 7777 11111111 7  7777 7 7777777  7  3 777777  7     222 5   44  99   5555  5    1   8888  44 5  222222   0  99   444444    0  11 99 8 1 99 00   1  777 1   11 1  999  5555 1  66  2 777  11111111111 1  5555555555555555555  000000000000000000000000000000000000000000000000000000000     88 9999 444444   4   2 2    9999 2 7 22  4  4  55555555     33333   5 66  9 9 333 222 00000  222222   555 0   2 66  33 6     2 2  1111111111  11 99    7777  3333  00 3333333    2     2    2 9 9 11 4444   2  3333333333333333333333333333333333333333333     9 888888888 4 4 333333  88   5  3333 5    5  444  5      66 5  4  2   4   6666     4 4  4 66  33333333 111   7 22      7  6666 5   8888 666 5 4 111   5555555  44444   00 44   333  7 5  7 7 3    7 77  7777777 7  3   999999  7  7 77  00  9     9  7   99      666  000 0000 99   99999999999999      4444444444   7 777777777   3333333 7   77      77        33  0000  0    77   555  7 3 3 7   00  000000  11 2 2    2    2   111 11    2 2  9999999   6 111 66 4 55555555555555  2 2 66666666666   8888 2    555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 4  4    22222222222 2  22       4  4  5 7  6 6      00  00 88888 3     3 6   6 66  00    3    33   55 00000   0   0  00    66666   0   0 0 3333333  0    2 55 55   00000000000        8888 6     0   11111 6 8   66  66     6  6   00   6  6 3  777    3 3  3333333333333   77   88888    88 3  99   66 444   555555 6 6 55555   6     444  6  1111 4  7    777   1111111111111    22 6  6   444   6 8888         6  00 555555   6   5555      8888888 6 7777    6  22 66 888  7  3 66  3  3 3  4444  3  8888   3    99   777777777 3   66 00000 3  3    99  7 66  3  888  3 555555555    3    6  6  3  888888  11111111  6  6 88888  444    4444  6  000  3    444 99 5     3  77 66 3 4 999999  22222222222222222222222222    3  99  3  7777777777777777777 1111 66  3 7 99     66    444 3    888  7  3  66    55555555 66 3  888 3 22  8888888 3 333   1  1 22 555 1  1  1  99  88888 1    22 8   666666666666666666  11   1 1 1 888888     2  1  3  44 1     99999999   55   000000000000 1  444 22  444 1 666  22    1 444 6666666666666 2 22   666  2  5   888888888  33  1   555    22  44444444444  3 333   3   3           555       000000 6 00   00 4444  6 6   55     
consensus                     : AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTG--GAATNNTAAATT-AATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----GAAA---TTCCAAAGAAAT-TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--T-CATG--CA-GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--TA------CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAAAAAATATTAAATGATAA---T---TT-TTTT----A---A--NAC--ACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------T-A------T--A-T-CA--TT----G---TTT-TTT--A--A----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT--A-T-GA-T--ATTTT----GG-GG-GC-T--GAT-AT-T-TG----AAG-AAA-G-------TAG-GT-C--AAA-TT--T----CGG-T--------C-TTTC-TAGAAT-ATGA-AAAAT--TG-G-A---CACAT--TACC---T-CCAG-T-AA-T--T--AA-AAAAA--TG-T-ATCGT-TCAATTTT---N-AA---NA-A-A--A----A--C-----T-AA----A-G-------GA-AT-A------TG-AAGTA-A-T-CAT--CC--TGC-T--TT-CATTTACAG---AA--A-TTT---N-AAA-AA--AAT--CT--AACC-TA--T--TTT-T--AC-AGA-GT---A-ATT--G-CACA-TT----C-TA--TT-A---CC-----------C-TA---------C---------CC-----------C--------------------CC--------A------T--G----CGTAA-TT----T------GAC-GTC-A-GTTG----G-C-A--AT-TT-GG-T-TGT--ATGTA--A--CCC-G--AT-A-T---A---T-----TC------TTT---A-AAA-A--TA--TTAAATG-A-TA-G--------AA--T--TTTT----ACT---TA--C-----G-AATA-AGATG-GTTT-G-A-A--A----GGA-TA-C----A---CA------------TATATATCA-TTGG--TTTTTTTTNA---------AAG-T-G----AAA-TTG-AA----A-CGTT-TC---AG-TGACCTC-A-TG-AT-ATT-TTG-G--GGGCT-G-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GT-C--A-AAT----TT--C-GGT-CTTTC--G----AA--A--TAA-CA--AAA---TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AA-A--AAAATG-TATCG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----A--AAA-----------G--TAAAGG----------AAT-AT-A-A----GTA---G---T-CAT--CCTGCT--TTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA--CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTACT---A--C-C--------------TA-C-C-----------CCC----C-CCCC----CAC-CA-CG--C------CG-----------------------G---C--------------G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTT--GGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T--TTA-CACA-TGAAA-TCT--A-----CTT-AAT-TT--AAAAA----AAT-ATA-T-GA-AT---AG-ATAATA--A--ATA-----------TTTATCAATT--AATAATA-CAT-----A-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAATT-G-TA--TTA--A---ATT------T-A-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA-A--GGCAAAAGT-T-AAAC---------CA-CCTG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTG--GCCATGAG-------C-C----ACAG-TGG-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--A-GGG-GGAA--ATT---------C-AAA--G-G---C-TC-CCAG--TG-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-----AGC-A-G--T-AG-GT-AA----CTG--TCGC----AG-TGA-TATTTTTT---TT-TTAAATG-TTT-G--A-ACC------CC-C-CCCCCCCCCC----------CTTTTCC-TTC-AA-AG--A--------A-------A----A--AT-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---GA-TA-CA--TTTT-A----A-T--A-AT---A-T--AA-------A-T---AAA-TC-T--A---T-TA-TC-TA-TTT-----T-ATTA--TAAATATA-C-AT---AAAA---AAN-AAT-A-A-TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAA---C----AATA-AAA---A-C------A-AA---C--AA---ATA---AA--AAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC---AA--AA-ACA---CACA--AA-A----A-TT-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGCA--CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( gi|5 )            : AGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTG--GAATTTTAAATT-A-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAAA---TTCCAAAGAAAT-TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--T-CATG--CA-GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--TA------CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAAAAAATATTAAATGATCA---T---TT-TTTT----A---A--AAC--ACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------T-A------T--A-T-CA--TT----G---TTT-TTT--A--A----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT--A-T-GA-T--ATTTT----GG-GG-GC-T--GAT-AT-T-TG----AAG-AA--G-------TAG-GT-C--AAA-TT--T----CGG-T--------C-TTTCATAGAAT-ATGA-AAAAT--TG-A-A---CAC-T--TACC---T-CCAG-T-AA-T--T--AA-CAAA---TG-T-ATCGT-TCAATTTT---T-AC---CA-A-A--A----A--C-----T-AA----A-G-------GA-AT-A------TG-AAGTA-A-T-CAT--CC--TGC-T--TT-CATTTACAC---AA--A-TTT---G-AAA-AA--AAT--C---AACC-TA--T--TCT-T--AA-AGA-GT---A-ATT--G-CA-A-TT----C-TA--TT-A---CC-----------C-TA---------C---------CC-----------C--------------------CC--------A------T--G----CGTAA-TT----T------GAC-GTC-A-GTTG----G-C-A--AT-TT-GG-T-TG---ATGTA--A--CCC-G--AT-A-T---A---T-----TC------TTT---A-AAA-A--TA--TTAAATG-A-TA-G--------AA--T--TTTT----ACA---TA--C-----G-AATA-AGATG-GTTT-G-A-A--A----GGA-TA-C---TA---CA------------TGTATATCA-TCGGGTTTTTTTTTTA---------AAG-T-G----AA--TTG-AA----A-CGTT-TC---AG-TGACCTC-A-TG-AT-ATT-TTG-G--GGGCT-G-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GT-G--A-AAT----TT--C-GGT-TCTTC--G----AA--A--TAA-CA--AAA---TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AA-A--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----A--AAA-----------G--TAAAGG----------AAT-AT---A----GTA---G---T-CAT--CCTGCT--TTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA--CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTACT---A--C-C--------------TA-C-C-----------CCC----C-CCCC----TAC-CA-CA--C------CA-----------------------G---C--------------G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTT--GGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T--TTT-CACA-TGAAA-TCT--A-----CTT-AAT-TT--AAAAC----AAT-ATA-T-GG-AT---AG-ATAATA--A--ATA-----------TTTATCAATT--ATTAATA-CAT-----A-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAATC-G-TA--TTA--A---ATT------T-A-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA-A--GTCAGAAGT-C-AAAC---------CACCCTG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTG--ATCATGAG-------C-C----ACAG-TGA-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--A-GGG-GGAA--ATT---------C-AAA--G-G---C-TC-CCAG--TG-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-----GGC-A-G--T-AG-GT-AG----CTG--TCGC----AG-TG--TATTTTTT---TT-TTAAATG-TTC-G--A-ACC------CCACTCCCCCCCCCCTCTCTCT-CTCTTTTCC-TTC-AA-AG--A--------A-------A----A--AT-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---GA-TA-CA--TTTT-G----A-T--A-AT---A-T--AA-------A-T---AAA-TC-T--A---T-TA-TC-TA-TTT-----T-ATTA--TAAATAGA-T-AT--GAAAA---AAA-AAT-A-A-TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAA---C----AAT--AAA---A-C------A-AA---C--AA---ATA---AA--AAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC---AA--AA-ACA---CACA--AA-A----A-TG-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGCA--CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|12                         : AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTG--GAATTT-AAATT-AATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAAA---TTCCAAAGAAAT-TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTT---CG--T-CATG--CA-GAAAAA--TAAGCC--G--A--TA------CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAAAAAATATTAAATGATCA---T---TT-TTTT----A---A--AAC--ACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------T-A------T--A-T-CA--TT----G---TTT-TTT--A--A----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT--A-T-GA-T--ATTTT----GG-GG-GC-T--GAT-AT-T-TG----AAGAAA--G-------TAG-GT-C--AAA-TT--T----CGG-T--------C-TTTC-TAGAAT-ATGA-AAAAT--TG---A---CACAT--TACC---T-CCAG-T-AA-T--T--AA-CAAA---TG-T-ATCGT-TCAATTTT---T-AC---CA-A-A--A----A--C-----T-AA----A-G-------GA-AT-A------TG-AAGTA-A-T-CAT--CC--TGC-T--TT-CATTTACAC---AA--A-TTT---G-AAA-AA--AAT--CT--AACC-TA--T--TCT-T--AC-AGA-GT---A-ATT--G-CACA-TT----C-TA--TT-A---CC-----------C-TA---------C---------CC-----------C--------------------CC--------A------T--G----CGTAA-TT----T------GAC-GTC-A-GTTG----G-C-A--AT-TT-GG-T-TGT--ATGTA--AC-CCC-G--AT-A-T---A---T-----TC------TTT---A-AAA-A--TA--TTAAATG-A-TA-G--------AA--T--TTTT----ACA---TA--C-----G-AATA-AGATG-GTTT-GAA-A--A----GGA-TA-CA--TA---CA------------TGTATATCA-TCGGGTTTTTTTTTTA---------AAG-T-G----AA--TTG-AA----A-CGTT-TC---AG-TGACCTC-A-TG-AT-A
gi|2                          : AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTG--GAATAT-AAATT-AATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC----AAAAATCTTCAAAAGAAAT--CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C---AAAATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--T-CATG--CA-GAAAA---TAAGCC-TG-TA--TA------CTC--GATA-TATTATC--TT------AAAAAAAAATTTGAATGATAA---T---TT-TTTT----T---A--CAC--AGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------T-A------TTCA-T-CA--TT----G---TTT-TTTT-A--A----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTCAGC-TGA-CCT--A-T-GAAT--ATTTT----TG-GG-GC-TTTGA--AT-T-TG----AAG-AAA-G-------TAG-GT-C--AAA-TT--T----CGT-C--------C-TTTC-TAGAAT-ATGA-AAAAT--TT-A-----CACAT--TACC-----CCAG-T-AA-T--T--AA-AAAAA--TG-T-ATCGT-TCAATTAT---T-AA---CA-A-A--A----AA-C-----T-AA----AAG-------GA-AT-A------TG-ACGTA---T-CATT-CC--TGC-T--TTTCATTTACAG---AA--A-TT----A-AAG-AA--AATGCT---AACC-TA--T--T---T--AC-AGA-GT---A-AT---G-CACA-TT----C-TA--TT-A-------------------A---------C---------CT-----------C--------------------CC---------------T--G----CGTA--TT----T------GAC-GTC-A-GTTG----G-CTA--GT-TT-GG-T-GT---ATGTA--A--CCC-G--AT-A-T---T---T-----TT------TTT---T-AAA-A--AA--TTAAATG-A-TA-G--------AA--TCTTTTT----ACT---TA--C-----G-AATC-AGATG--TTT-G-A-A--A----GGA-TA-C---------A------------TATAT-CCA-TTGG----TTTTTTAA---------AAG-T-A----AAA-TTG-AA----G-TTTT-TA---AG-TGACCTC-A--G-AT-ATT-TTG-GAAGGGCT-G-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AA-TAG-GT-C--A-ATT----TT--C-GGT-CTTTC--A----AA--AA-TAA-CA--AAA---TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA---------AA-A--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG---AA---A----A--AAA-----------G--TAAAGG----------AAT-TA---A----GTA---G---T--AT--CCTGCT--TTCATTTA--C----AAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAG--CT------TA--T-T-TTTA-CAGA-AGA---AAGTTGC-GTCA-TT----ATAC-------C-C--------------TC-C-C-----------CCC----C-CCCC----
gi|13                         : AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTC--GAATAATAAATT-AATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC-----AAA---TTTCAAAGAAAT-TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A---TT---TT-A-TGA-TTTC--CA--T-CATG--CA-GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--TA------CTC--GATA-TATT--C--TT------TAAAAAAAAATTAAATGATAA---T---TT-TTTTTTACA---AC-AGC--AGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------T-A------T--A-T-CA--TT----G-----T-TTT--A--A----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT--A---GA-T--ATTTT----TG-GG-GC-T--GAT-AT-T-TG----AAGAAA--G-------TAG-GT-C--AAA-TT--T----CGG-T--------C-TTTCTAAGAAT-ATG--AAAAT--TG---A---CACAT--TACC---T-CCAG-T-AATT--T--AA-AAAA---TG-T-ATCGT-TCAATTTT---A-AC---AA-A-A--A----A--C-----T-AA----A-G-------GA-AG-A------TGAAAGTA-A-T-CAT--CC--TGC----TT-CATTTACAG---AA--A-TTTA--A-AAA-AA--AAT--CTA-AACC-TA--T--TTT-T--AC-AGA-GT---A-ATT--G-CACA-TA----A-AA--TT-A---CC-----------C-TA---------C---------CC-----------C--------------------CC--------A------T--G----CGCAA-TT----T------GAC-GTC-A-GTTG----G-C-A--AT-TT-GG-T-TGT--ATGTA--AC-CCC-G--AT-A-T---A---T-----TC------TTT---A-AAA-A--TA--TTAAATG-A-TA-A--------AA--C--TTTT----ACT---TA--C-----G-AATA-AGATG-GTTT-GAA-A--A----GGA-TA-C----A---TAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TTG----TTTTTTTAA---------AAG-T-A----AA--cccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|1                          : tGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTG--GAATAT-AAATT-AATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAAA---TTTCAAAGAATT-TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATT-CATG--TA-GAAAAAAATAAGCCGTG-TA---A------CTCAAGATA-TATT--C--TTTTATATAGTAAGAA-ATTAA-TGATAA---T---TT-TTTT----CTTTA--CAC--AGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCT-A------T--A-T-CA--TTTGTAG---TTC-ATT--A--ATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTCAGGGTGAACCT--A-TTGA-TGGATTCTTAATGG-GA-ACCT--GAT-ATCT-TG----AAA-AAA-G-------TAGTGT-C--AGG-ATGAT----TGG-TGCCTGTAAC-TTTCA--GAATTATGA-AAAAGAATG-A-C---CAC-TAATACTCTAT-CCAG-TCAG-TCCT--AAGCAAAAT-TG-T--TCGT-CAAATTTTA--T-AA---CA-A-ATAA----A--C-----T-AA----A-GCCGCAAGGA-AT-AACAGGGCG-AAGT----C-CAT--CCGTTGC-G--TT-CACT-ACAG---AA--A-TTG---GTAAA-AAGGAATGGCTAAAACC-TA--TCTTCTAC--AG-AAA-GT---A-TTT--G----A-TT----C-TAG-TT-A---CC-----------C-TA---------C---------CC-----------C--------------------CC--------CCCCCCCT--G----CGTAA-TT----T------GA--GTC-A--TTG----G-C-ATTATGTT-GG-T-GT---ATGTA--A--CCT-GCAGT-A-T---GAT-T-----TC------TTT---A-AAA-AA-TA--TAAAATG-A--A-GTACCCAATAA--T--AATT----ACT---TA--C-----G-AATA-AGGTG-GTTTAG-A-A--AAAGAGGAGTAAC---CAGGGTAG-----------TGCAT-TCA-CTGG-----TTTTTTAGGAAACGGTAAC-T-A----AA--TTG-GATATAA-CGTTATC---AC-TGACCTC-A-TG-AT---T-TTG-T--AGGCT-G-AT-A--TT------------GAG-A--AAATAG-GT-A--ACAGTGTCCTT--C-G-T-TCTTT--GCAAGAA--A--TAA-CA--AGAAAGTT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AA-ATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG---AA---A----A--GAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAAAAAT-A----A----GTATGTG---T-CAT--CCTCTT--TTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAAC-CC------TA--TGT-TTTA-CAGACGTAATGA--TTGC-G-CAGTT----CTACTTACA--C-C--------------TA-C-CGGACACTAACACCCCCGTC-CCCC----TCC-C------C------CA-----------------------G---C--------------G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTT--GGCTCTA-TG-TA-AGCAGT-GACATT--AAGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATA-TTA-CACA-TGAAA-TTT--A-----CTT-AA--TT--ACAAA----AAT-ATA-T-GA-AC---GG-ATAA-A--A--GTT-----------GTTATCAA-T--AATAATA-CAT-----AGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-ATT-G-TA--TCA--A---ATT------T-A-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AATG--GTAAAGCGT-A-AGA-------------CCTG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTG--GCCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--TG--A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATA-GGG-TAAG--ATC---------C-AAA--GCG---C-TC-CCCGATTG-T--AG-AG---GA-T-A-G-AGGCAAAG-AAGA-GG-GC-AATAGTCGGG-A-GT-T-AT-GT-AGTTA-CTG--TC-C----AG-TG--GATATTTTGAATT-TTTGATG-TTT-G--A-A-C------CCACCACCCCCACCCT----------TTTCTC-TTC-AA-GG--A--------A-------ACACCA--AT-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---GA-TA-CATGTTTC-A----A-T--ATAT---A-T--AA-------A-TCA-AAA-TA-TGGA---T-TA-TCATA-TTT-----T-ATTA---AAAT--A-T-AC--GATAA---AAA-ATT-A-A-T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAAACT----AAT--AAACAGA-C------A-AA---CTAAA---AGAGT-AA--AAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG--AA--AA-ACA---CACA--AA-A----ATTT-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGCA---CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CCat
gi|28                         :  GGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTG--GAG-TATGAATTAA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|32                         :  GGTAGTAGTC--ACCCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|11                         :   GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTG--GAAA---AAATT-AATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC----GAAA---TTCCAAAGAAAT-TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CC--AAACTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--T-CATG--CA-GAAAA---TAAGCC-TG-TAAATAG-----CCC--G-TA-TATT--C--TT------AAAAAAA-TAT---ATGATAA---T---TT-TTTTT---A---A--GAC--ACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------T-A------T--A-TGCA--TT----G---TTT-TTT--A--A----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTCAAA-TGA-CCT--A-T-GA-T--ATTTT----GT-GG-GC-TT-GAT-AT-T-TG----AAG-AAA-G-------TAG-GT-C--AAAATT--T----CGG-T--------C-TTTC-TGGAAT-ATGA-AAAAT-----G-A---CACAT--TACC---T-CCAG-T-AAAT--T--AA-AAAAAA-TG-T-ATTGT-TCAATTTT---A-AC---AA-AGA--A----A--C-----T-AA----C-G-------AA-AT-A------TG-AAGTA-A-T-CAT--CT--TGC-T--TT-TATTTACAG---AA--A-TTA---A-AAA-AA--AAT--CT--AACC-TA--T--ATT-T---A-AGA-GT---A-ATT--G-CACA-TT----C-TA--TA-A---CC-----------C-TA-------------------CC-----------C--------------------CC--------A------T--G----CGTAA-TT----T------GAC-ATC-A-GTTG----G-C-A--GT-TTGGG-T-TGT--ATGTAT-C--CCC-G--AT-A-T---A---T-----TC------TTT---A-AAA-A--TA--TTAAATG-ATTA-G--------AA--T--ATTT----ACT---TA--C-----GAAATA-AGATG-GTTT-GAA-A--A----AGA-TA-C---AA-------------------TATATCA-TTGGG-GGGTTTTTGA---------AAGTT-A----AA--TTT-AA----A-CG-T-TC---AG-TGACCTC-A-TA-AT-A-T-TTG-G--GGGCC-GAAT-A--TT-T------G---AAGAA--AAATAG-GT-C--A-AAT----TT--A-GGT-CATTC--------A--A--TAA--A--AAA---TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AA-A--AA
gi|14                         :   GTAGTAGTC-AACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTG--GAATATTAAATT-A-----ATAATAATACCA-TGTTTTG-TC----AAAT---TTCCAA-GAAAT-TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TTC---CA--T-CATG--CA--AAAAA--TAAGCC-TG-TA--TA------CT---AATACTAT---C--TT------AAAAA-----TTAAATGATAT---T---TT-TTTT----T---A--CAC--A-G--GATAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----T-A------T--A-T-CA--T-----G---TTT-TTT--A--A----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--T-A-CCT--A-T-GA-T--ATTTT----GG-CG-G---------AG-T-TG----AAG-AAA-G-------TAG--T-C--AAA-TT-------CGG-T--------C-TTTCATTAAA--ATGA-AAAA------------CAT-T--TAC----T-CCAG-T-AA-AAAT--AA--AAA---TG-T-ATCGT-TCAATTT------AA---CA-A-A--ATAGAA--C-----T-AA----A-G-------GA-ATTA------TG-AATTA-A-T-CAT--CC--TG--T--TT-C--TTACAG---AC--A-TT------AAA-CA--AAA--CTAAAACC-TA--T--T-T-T--AGCAGA-GT---A-ATT--GACC-A-CT----C-TA--TT-A---CC-----------C-TA---------C---------CC-----------T------------------------------A------G--G----CGCAA-ATA---T------GAC-GTC-A-GT------G-C-A--AT-TT-GG-T-T----ATGTATTA--CCCCG--ATTA-T---A---T-----CT------TTA---A-AAA-A--TA--T-AAATG-A-TA-G--------AA--T--TCT-----ACT---TA--C-----G-AATA-AGATG--TTT-G-A-A--AAA--GGA-T-----------CA------------T--ATATCA-TTG---TTTTTTTTAA---------AAA-T-A----AAA-TTG-AA----AATGTT------AA-TGACCTC-A-TC-AT-ATT-TT--G--AGGCT---AT-AT-TT-T------G---AGG-A--AAATAG-tgt
gi|21                         :   GTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGCAAAA---TAAATTAA-TAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC----GAAA---TTCCAACGAAAT-TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--T-CGTG--CA-GAAAAA--TAAGCT-TG-TA--TA------CCC--GATA-TATT--C--TT------TTAAAAA--ATTAAATGATAAGAGT---TT-TACT-------------C--ACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------T-ATACATGT--A-C-CA--TT----G----TT-TTT--A--A----------GTG--t
gi|3                          :     AGTAGCACA-CACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTG--GGAATATGAATT-AATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAAA---TT-CAAAGAAATAGTAACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATGCACA-GAAAAA--ATAGCC-TG-TAT-TA------CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAATAAA-ATTAAATGAATAAT-T---TT-TTTT----T---A--CAC--AGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------T-A------T--A-T-CAT-TT----GT--TTT-TTT--A--A----------GTG--AAA-TTGAA--AA-----CG--TTCAG---GA-CCT--ATT-GA-T--ATTTT----TG-GG-GC-TG-GAT-AT-T-TG----AAG-AAAGA-------TAG-GTCC--AAA-TT--T----CGATT--------C-TTTC--AGGATGATGA-AAAAT--TG---A---CACAT--TACC---T-CCAG-C-AATT--T--AA-AAAAC--TG-T-ATCGTCTCAA-TTT---T-AC---AA-A-A--A----A--C-----TAAA----A-A-------GA-AT-A------TG-AAGTA-A-T-CAT--CC--TGC-T--TT-CA-TTACAG---AA--A-TTCTTAA-AAA-AA--AAT--CCT-AACC-TAT-T--TTT-T--AC-AGA-GT---A-ATT--G-CACA-TT----CGTA---T-A---CC-----------C-TA---------C---------CC-----------C--------------------CC--------A------T-------CGCAATTT----T------GACGGTCAA-GTTG----GCC-A--AA-TT-GG-T-TGT--ATGTA--ACCCCC-G--AT-A-T---A---------TC------TTT---A-AAA-A--TAC-CTAAATG-A-TA-G--------AA--T--TTTT----ACT---TA--CA----A-AATA-AGATG-GTTT-G-ACA--A----TGA-TA------A---CG-------------ATATTTCA-TTGGG---TTTTTGAA---------AAG-TAA----AA--TTG-AA----A-CGTT-TT---AG-TGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCT-G-AT-C--AT-T------G---AAG-A--AAATAGCGT-C--A-AAT----TT--CAGGT-CTTTCA-A----AA--A--TAA-CAACAAA---TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAA-A--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA-AA---A----A--AAA-----------G--GAAAGA----------AAT-ATAA-A----GTA-------T-CGT--CCTGTT--TTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-C-TAA--CC------TA------TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-GT----CTACT---AC-C-C--------------TA-C-C-----------CCC----CACCCC----CAC-C--CC--C------AA-----------------------G---C--------------GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTT--GGCTCTA-TT-TA-A-CA-T-GCCATT--AA--A-------ACTTT-A-AGT-T--TTA-TACA-AGAAA-TCT--T-----CTTAAAT-TTAAAAAAA----AAT-ATA-T-G-----------------------A-----------TTTATCCATTA-AATAATACCAC-----A-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAAT--G-TA---TA--A---ATTTAGTGCT-A-C--T--CCA--TGAA---AC-AA-A--GGCAAAAGT-T-AAAC---------CA---TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTG--CCCATGAG-------A-C----ACAG-TGG-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--G-CGC-GGGA--ATT---------C-AAA--G-G---CTTC-CCAG--TG-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAGAAAGA-GGAACAAA-----AGC-A-GACT-AGCGTAAA----CTG--TCGCA---AG-TGA-TATTTTTT---TTCTTAAATG-TTT-G--ATACC------CC-CACCCCACCCC------CA-CCCTTTTCC-TTCGAA-AG--A--------A-------A----A--AT-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---AA-TA-CA--TTTT-A----ACT--A-AT---A-TA-AA-------A-TA--AAA-TC-T--A---T-TA--C-TA--TT-----T-A-TA--TAAATATA-C-ATCCAAAAACATAAT-AAT-A-A-TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA---------AAC--AAA---A--------A-AA---C--AA---ATT---AA--AAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC---AA--AA-ACA---CACA--AA-A----A-TGTGT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGCA---CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|6                          :           agcgCCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTG--GAATATAAAATT---TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TCG---AAAA---TTCCAAAAAAAT-TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--CAAAAAACTC-T-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--T-CATGC-CATGAAAAA--TAAACC-TATTA--TA------CCC---ATA-TATC--C--TT------TACCAACATATTAAATGATAAG--T---TTGTTTC----A---T--AA-----G--AATAAAGAT-GTTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------T-A------T--A-T-CACCTT----G---TCT-TTTTAA--A----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGTCTCCAG--TGA-CATC-A-T-GA-T--ATTTT----AG-GGCGC-T--TGTCAT-T-TG----AA--------------TAGCGT----AAA-CT--TGCGGCGG-T--------CGTTT--TAGAATAATTA-AAAAT--TG-A-C---CAC-T--TACC---T--CAG-T-AA-T--TAAAA-AAAA---CG-C-ATCGT-TTAATTTT---TGAC---CACA-A--A----G--C-----T-AA----A-C-------GA-AT-A------TG-GAGTT-A-TCCAT--CCA-TGCTT--TT-CATGTACAG---AA--A-T-------AAA-AA--AAA--CAT-AACT-TA--T--TTT-TTCAC-AGA-GTCAGA-ATT--G-CACA-TT----C-TACTTT-T---CC-----------C-TA-------------------CC-----------C--------------------CC--------A------T--GCA--CATAA-TT----TGCACGCGAC-GTC-ATGTTG----G-CAA--AT-TT-GG-TCTG---TAGTA--AC-CCC-G--AT---T---A---T-----TC------CTGAAAA-AAA-A--TA--TTTAATGTA-TT-A--------GA--T--TTTT----ACT---TA--C-------AATA-AACTG-TCTT-G-A-A--A----GGA-T------TA---CA------------TA-ATATCG-TTGG--TTGTTTGTAA---------AAG-TCGAAACAA--ATG-AA----ACCGTT-TC---AG-TTATCTT-A-T--AT-ATTCTTT-T--GGGCT-G--C-A---T-T------G---AAGAA--AAACAT-GT-C--A-AAT----TC--C-AATATTTTC--GACC-AA--A--TAA-CA--AAAG--TT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----T-TA-AG-A--AACATA-TATTG-TT--AA--TTTTGA---AA---A----A--AAA-----------AGTTAAAGG----------AAT-AT---A----AAA---GAACT-CAT--CCTGCT--TTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA--TC------CA--T-G-TTTAGC--A-GTA---A--T--C-G-CA-TC----TTACT---AC-C-C--------------TA-C-C-----------CCC----C-CCCCCCTTTAT-CA-GG--A------AA-----------------------GTGAC--------------G-T-CA-ATGG-----CCA---CATT--GGCTCTA-TGCTA-ACCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AGT-T--TAC-AATA-TGAAATTTT--A-----CTT-ATC-CT--AGAG-----AATCAAA-T-GATAT---AG-ATAATA--A--ATAC----------TCTATCAACTGCATCAATA-C-T-----A-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAATT-GTTA--TTA--A---CAT------T-A-C-----CCA-CTAAA---AC-AA-A--G-CAAAAGT-TAAAAC---------CACCCTA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTG--ACCAT--G-------C-C----GCAG--GC-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--A-GCG-GGAACTATT---------C-AAA--G-G---C-TC-CCAGC-TG-T--GC-AAATCAA-T-A-A-A---A
gi|4                          :                                                             cccTG--GAACTATAAATA-A-TAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG---TTTCAAGAAAAT-TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC---GAACTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TTC---CA--T-CATG--CA-AAAAAAAATAAGCC-TG-TA--TA------CT---GATA-TATT--CCTTT------AAAAAAA---TTAGATGATAA---T---TT-TTTTTAT-A---A--CAC--ACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------T-A------T--AAT-CA--TTT---G---TTT-TTT--A--AAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTCAG--TGA-CCT--A-G-GA-T--ATTTT----TT-GG-CA-A--GAT-AT-T-TGG---AAG-AAA-G-------TAG-GT-C--AAA-TT--T----CGG-T--------A-TCTC-TAAGAT-ATTG-GAAAT--TG-ACA---CAT-T--TACC---T-CCAG-T-AA-T--T--AA-CAAAAAATG-TTATCGT-TCA--TTT---T-AAAAACA-A-A--A----A--A-----T-AA----C-G-------GA-ATTA------TG-TAGTATA-T-C----CC--TAC-T--TT-CATTTACAG---AA--AATTT---T-AAA-AA--AAT--TCT-AACC-TA--T--TTT-T--AC-AGA-GT---A-ATT--G-CATA-TT----C-TA--TTTA---CC-----------CCTAAACCTCCCCC---------CC-----------C--------------------CC--------A------T--G----CGTAA-AT----T------GAC-GCA-A-GTTGTATGG-C-A--AT-TT-AG-T-TG---TTGTA--A--CCCCG--AT-A-T---AA--T-----TC------TTT---A-AAA-A--TA--C-AGATG-A-TA-A--------AA--T--GTAT----ACGACTTA--C-----G-AATATAGATGAGT---A-A-A--A----GGA---------A---CA------------T--ATATCAGTTGG--TTTTTTTTAA---------AAG-T-G----AAA-TTG-AA----A-CGTT-TTTAAGG-TGACCTAGA-TGGAT-ATC---A-G--GGGCT-G-AC-AATTT-T------G---AAG-ACAGAATAG-GT-T--A-AATAT--TT--C-G---TCTTT--GCGAAAA--A--TAA-CA--AAA---TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AA-A--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAAAA---A----A--AAA-----------G--TAAAGG----------GAT-AT---AAAAAGTA---A---T-CAT--CCTGCT--TTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGT-TTA--CCGTCAGGTA--T-TATTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TC----CTACT---A--C-C-------------------------------CCC----C-ACTC----CGC-TA-AG--T------TG-----------------------A---C--------------G-T-CA--TTG-----GCA---AGTT--GGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACAT---AA--A-A---T-CCTTT-A--GT-T--TTTACACA-TGAAA-TCT--A-----CTT-CAT-TT--AAAAA----AAT-ATA-TTGA-AT---AG-ATAA-A--A--ATA-----------TTTATCAA----AT-AATA-CAT-----A-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AATT-G-TAA-TTA--ATT-ATT------TTA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA-G--G-CAAAGGT-T-AAAC----------GCCTTG-TC-CA--GC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTA--ACCATG-G-------C-C----ACAG-TGG-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--A-GGG-GGAA--TTTTTTTCCCCCC-AAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGGT--GG-GA---AA-T-G-G----------------G-GC-AA-----AGC-A-T--A-AG-GT-AA----CT---TCGC----AG-TGA-TATTTTTT---T----AAATGGTTG-G--A-ACC------CC--------CCCCCT------------TTCC-TTC-AA-AG--A--------A-------A----A--ATGC-A-TTACTT--TA-C-A-T-ATCA---GAATA-CA--TTTT-A----AAT--A-AT---A-T--AA-------AAT---AAAATC-T--A---T-TAATC-TT-TTT-----TTATTA--TAAATATA-CCAT--AAAAA---AAT-AAT-A-A-TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAA---C----AAT--AAA---A--------A-AA---C--AA---ACA---AATAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAAAA--AA-ACA---CACA--AA-T----A-TT-GA-ATA-AAT-AAA-AA-TAAATGCAAACCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|30                         :                                                                                              aAC-A-TGTTTTG-TC----GAAA---TTCCAAAGAAAT-TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAAcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                    C-TG-TA--TATCTAACCCC--GATA-TATT--G--TT------CAAAATA-TATTAAATGAT-G---T---TA-CTT-----------------ACC--AATAAG-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------T-A------T--A-T-CA--TT----GG--TTTATTT--A--A----------GTA--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCTC-A-T-GA-T--A-TTT----GT-GG-AC-T--GAT-AT-T-TG----AAGAAA--A-------TTG-GT-C--AAA-TT--T----CGA-T----------TTNC--AGAAT-A
gi|7                          :                                                                                                                                                                          aatttggctgtatattntcccccccccccccccccccccccctcatgcgtgatttgacaaaagttggcaatttgg-TG-TA--AC------CCC--GATA-TATT--CCTTT------AAAAA---TATTAA-TGATAA---GAAATT-TTTT----A---CTTAAC---CG--AATAAG-GTGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------T-A------T--A-T-CA--CT----GG--TTT-TTT--A--AAAA-------GTG--AAAATTG-A--AA-----CGT-TTTAG--TGA-CCT--C-T-GA-T--ATT------GATGG-GC-T--GAT----T-TG----GAG-------------T---GT--------TT--TA---CGGAT--------C-TTTTG-------ATAA-CAAAT--TG-GCA---CAC-T--TACC---T-AAAG-A-AA-T--A--AA-AAAA---TG-T-AT-GT-TCAATTTT---G-GA---AA-G-A--A----A----------AAGAGTA-G-------GA-AT--------TA-AAGTA-G-T-CATTCCC--TGC-T--TT-CATTTACAG---AA--A-TTT---C-AAA-TA--AAT--C---TACC-TATTT--TTT-T--AC-AGA-GT---ATATT--G-CGCA-TTCGTCC-TA--CT-A---CCGGCTAGCCGCGC-TA---------CA--------CCCCCCGCCCCCGC--------------------CC--------A------C--GCTATCGTAA-GT----T------GAT-GT--A-GTTG----G-C-caattacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|17                         :             aaagtaggtcaaatttccgtctttctagaatatgaaaaattgaatcacattgacctccaggtaattagaaaatgtatcgttcaattttaaacaaaaaaactaaaggaatataaagcaatcatacctgctttcatttacaagataatttaaaaaagaatctaacctaatttttacagaagtaatttgcacttctattaccgctacccccccccccctgcgtaatttgacgtcagttggccaatttggttgta--GATA-TATT--C--TT------AAAAAAGATATTAAATGATAA---A---AT-TTT-------------ACTTACG--AATAAG-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------T-A------T--A-T-CA--TT----G---TTA-TTT--A--A----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TCCAG--TCA-CCTC-A-T-GA-T--ATTTT----TG-GG-GC-T--GAT-AT-T-TGAAAAAAA-AA--A-------TAG-GT-G--AAA-TT--T----TGG-T--------C-TTTCG-AAAAT-A-GC-AAAAT--TG---G---CACAT--TCCC---T-ATAG-T-AA-T--T--AA--AAA---TG-C-ATCGT-TCAATTTT---G-AC---AA-A-A--A----A--TAAAAAT-AA----A-G-------GA-AT-A------TA-AAGTA-G-T-TGC--CC--TGC-C--TT-CATTTACAG---AA--A-TTT---C-TAA-CA--AAT--CT--AGCT-TA--T--TTT-T--AC-AGA-GT---A-TAT--G-CA-C-AT----C-GA--CT-A---CC-----------C-TT---------C---------CCAA---------C--------------------CC--------C------T--A----CGTAT-GT----T------GAC-GCG-A-GTTGT---G-T-A-----TT-GGCT-CT---ATGTA--A--CAT-G--AC-A-T---tctatgtacatgacattaaactccctttatagtttattttatctggtcttgatggtccttcgtgttacaacatgaaatctacttaattaaaaatgatatgaatagataataaatatttatcaataataatacaatttatattcagaattggaccggtaggttataaatagaaatttttaattaacgaattgtatcaagaatttacttaccacctaatacaaaggcaacgttaaaagccgccgcagcatgaatagtatgaaaaccagtggccatgagcgcacagtggacttgtcgcttggagaaggaagggtgaaattcaaaggctccagtgtgggaaataaggaaagaagagggcaaaagcagtagttaactgtcgcagtggatatttttttttttattgtttggaacccccaccccaccctttccttcaaagataaaaattaattattttaacatatcagatcattttaaatgaattaataaatatatttatctatttattataatatactaataataataagatagaatagtaacaataaaatcaaacaaataaaaaaataaccacaaaacaattttcaataaacacacaaattgaacaaataaaaaataaatgcacctctagcgcttgtgtccaaaacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atgtaatcca--ATG--AATAAG-ATGGTT-G-A-AAAATA-T-A-C-A------TTA------T--A-T-CA--TG----GGTTTTT-TTT--ACGA----------GTG--AAA-TTA-A--AAA----CGT-TTCAG--TGA-TCTCAA-T-AA-T--ATTTT----TG-GG-GC-T--CAT-AT-T-GA----AAG-AA--GAAGAAAATAGCGT-A--AAA-TT-------CG-------------CTTC---GAAT-ATAACAAAAG--TG-C-A---CAC-T--TACC---TACCAG-A-AAAT--T--AA-AAAAA--TG-T-ATTGT--CAATTTG---A-AA---AA-A-A--A----A--G-----T-AA----A-A-------GT-AA-A------TA-AAGTA-G-T-CAT--C---TGC-TCTTT-CATT-ACAG---AA--C-TGT---C-AAT-AA--AATGCT---AACT-TA--T--TGT-T--AC-AGA-GT---A-ATTATG-CA----T----C-TAC-TT-A---CC-----------C-CC---------C---------CC-----------C--------------------CCCCCCCCCCAGC----C--G----CGAAA-GT----T------GACCGTC-A-GTTG----G-C-A--AG-TT-GGCT-CT---ATGTAT-A--C------AT-A-C---A---T-----Ttaaactcctctaagttttacacatg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttacttaA-T--ATTTT----GA-GG-G--T--GATGAT-TATG----AAG-AAC-A-------TAG-GT-CTCAAA-TT-------CGG-T--------C-TTTCA-AAAAT--TAACAAAGT--TG-G-----CACAT--TACT---T-ACAG-A-AA-T--A--AA-AAAAAA-TG-T-ATTGT-TCAATTGG---G-GA----A-A-A--A----A--G-----T-AA----A-G-------AA-AT-A------TA-AAGTA-G-T-CAT--CC--TGC-T--TT-CATTGACA----AA--A-TTT---C-AAATAA--AAT--CT--AACCATA--T--TTT-T--AC-AGA-GT---A-ATTC-G-CA----T----C-TAACCT-AACCCC-----------C-CC---------C---------CC-----------C--------------------CC--------A------G--C----CGTAA--G----T------GA---------TTG----G-C-----T-CT-----------ATGTA--A--CAT-G--AC-A-TTAAA---C-----TC------TTT---T-AAaaactccctttaagttttacacattgaactacttgatttcgaaaaaaatatatggataatagaataaagatatctatcaattaataaacatataatacacggaaaattaacgtaagtataatagaaaaattataatttgtattttaaatttactccactaaaacaaagcaaagtataaaccacctccccaagctggatattctgaaaaccagtgccatgagccacagtggactcgctttggaggaaggaaggggaaattcaaaaggactcccagtgtggaaaaataataaaaaggagagcaagcaggaaataacggattccagtgattttttattaaatatgaaaccaccaccctcttttcctaaaaaaacaagaaataaaatgattattttaacataatcagatacattttaattgaataaaaataaaatttatgtttatctatttacattatagtaaaaattaatgaataaaatagaataataaaataaaaacaaactataaaaaaaaattaccaacaaataacaaattaaaaaacaaaacaccacataataaataaaaaataaagtacccctagcggcaagcttggatgtccaaaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --ATTTT----GA-GG-GC-T--GAT-A--T-TG----AAG-AAC-A-------TA--GT-C--GAA-TTC-T----CGG-T--------C-TTTCA-AAAAT-AAAC-AAAGT--TGCG-A---CA--T--TACT---T-ACAG-A-AA-TA-A--AA-AAAA---TGCT-ATTGT-TCAATTTTGGGG-GG---GA-A-A--A----A--G-----T-TA----A-G-------GATAT-A-------A-AAGTA-GTT-CAT--CC---GC----TT-CATTGA-ACAGAAA--A-TTT---C-AAATAA--AAT--CT--AACCATA--T--TTT-T--AC-AGA-GT---A-ATT--G-CC-G-CA----T-CA---C-A---CC-----------C-TA---------A---------CC-----------C--------------------CC--------gttttacacatgaaatatacttaattaaaaaatatatatgaaagataataaataattataattaataaatacattatatacagaaaattgacgtaggattaataggtaaattataatcaaattatattaaatttactccactgaaacaaaggcaaaagttaaacctgccaaacatggaatagttctgaaaccagtggccatgagccacagtggactcgcttggagaaggaagagtgggaaattcaaaggcttccagtgtgggaaataagaaaagaaggaggcaaaacgagtaaggtaactgtcgcagtgatattttttttaaatgtttgaaccccccaccccccacccaccttttcctttcaaagaaaaaatatttattttaacatatcagatacattttaataatataaaataaaatctattatctatttattataaatatacataaaaaataataataataagtgaatagtaacaataaaaacaaacaaataaaaaaaaacccaacaaacaacaaatttcaaaaacacacaaaaatggaacaaataaaaaataaatgacccctagctgcttcaagtgtgccaaaaccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AA--G-------TAG-GT-C--AAA-TT--T----CCG-T--------C-TTTC-TAGAAT-ATGA-AAAAT--TG-A-ATCACAT-T--GACC---T-CCAGGT-AA-T--T--AG-AAAA---TG-T-ATCGT-TCAATTTT---A-AA---CA-A-A--A----AAAC-----T-AA----A-G-------GA-AT-A------TA-AAGCA-A-T-CATA-CC--TGC-T--TT-CATTTACAA---GATAA-TTT---A-AAA-AAG-AAT--CT--AACC-TAA-T--TTT-T--AC-AGAAGT---A-ATTT-G-CA-C-TT----C-TA--TT-A---CCG----------C-TA---------C---------CC-----------C--------------------CC--------CCCCCC-T--G----CGTAA-TT----T------GAC-GTC-A-GTTG----G-CCA--AT-TT-GG-T-TGT--ATGTA--A--CCCCG--AT-A-T---A---T-----TCC-----TTT---A-AAA-A--TA--TTAA-TG-A-TAAG--------AAATT--TTTT----ACT---TAACC-----G-AATA-AGGTG-GTTT-G-A-A--AA---GGA-TA-C-----------------------ATATATCA-CTGG---TTTTTTAAA---------AAG-T-G----AAAATTG-AA----A-CGTT-TT---AG-TGACCTC---TG-AT-ATT---G-AT-GGGCT-G-AT-----T-T------G---GAG------------T-G------T----TTTAC-GGA-TCTTTT-G----A------TAA-CA--AA----TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----TAAA-AA-A--A---TG-TAT-G-TT-CAA--TTTTGG---AA---AGA--A--AAA-----------G--AGTAGG----------AATTAA---A----GTA---G---T-CATTCCCTGCT--TTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-T-A--CC------TATTT-T-TTTA-CAGA-GTAT--A--TTGC-G-CA-TTCGTCCTACT---A--C-CGGCTAGCCGCGCTACA-C-C-----------CCCCG--C-CCCC----GCC-CA-CG--C------TA-----------------------T---C--------------G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTT--GGCTCTA-TG-T--A-CA-T-GACATT--AA--A-C---TCCCTTT-ATAGT-TTATTT-TATC-TG--G-TCTTGATGGTCCTT-CGTGTT--ACAACATGAAAT-CTACT-TA-ATTAAAA-ATGATATGA--ATAGATAATAAATATTTATCAA-T--AATAATA-CAA-----T-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAATT-G-TA--TCAAGA---ATT------T-A-C--TTACCACCTAAT---AC-AA-A--GGCA-ACGT-T-AAA-----------AGCC-G-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTG--GCCATGAG-------CGC----ACAG-TGG-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--A-GGG-TGAA--ATT---------C-AAA--G-G---C-T--CCAG--TG-T--GG-GA---AA-TAA-G-G---AAAG-AAGA-GG-GCAAA-----AGC-A-G--T-AG-TT-AA----CTG--TCGC----AG-TGGATATTTTTT---TT-TTTATTG-TTTGG--A-ACC------CC---CACCCCACCC------------TTTCC-TTC-AA-AGATA--------A-------A----A--AT-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---GA-T--CA--TTTTAA----A-T--G-A----A-T--TA-------A-T---AAA-TA-T--AT--T-TA-TC-TA--TT-----T-ATTA--TA-----A-T-AT----------ACT-AAT-A-A-T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAA---C----AAT--AAA---ATC------A-AA---C--AA---ATA---AA--AAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC---AAT-AA-ACA---CAC----A-A----A-TT-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGCA--CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCcccccccccagccgatagtctgatttggctctaatgtaacattgacattaaatctgtcttaagttttaacactgagtaacttattaaaaataataatgaaggataataacatatttatccaattaatatatcaataattatacaacaattgacgtaggttataatagtaaattataacaaattatattaaatttactccactgaacaaggcaaaagtttaaacctgccaactcatgggaatagtctgaacacagtggccatgagccacagtgagactcagcttggagaaggaaagtgggaaattcaaagctcccagtgtgggaaataagaaaagaagaggggcaaagcgtagtaaacttcgcagtgatatttttttttaaaatgtttgacccccacccccccccacccttttcctcaagaaaaattaattatttaacatatcaatacattttaagtaatataaaaaaatctataatctatttattataaatatacataaaaaataatatataaataataggaaaatgaataacccataataaaaccacaacccaaaaaaaaaacctcaccaaaaacaattccgaccacaaaaattgaacaataaaaattaaatgccgccatagctgcttgcagttgtccaaaac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          a-CAT--CC--TGC-T--TT-CATTTACAG---AA--A-TT------AAA-AA-----------------------TTT-T--GC-AGA-GT---A-ATT--G-CACA-TT----C-Tcg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T--TGT-T--AT-AGA-GT---A-ATT--G-CG-C-AT----C-TA--CT-A---CT-----------C-TA---------C---------CC-----------CTCCCACCACCACCACCACCCCC--------A------TCAG----CGTAA-TTAAGTT------GAC-GTC-A-GTTG----G-C-A--AG-TT-GGCT-CT---ATGTA--A--CAT-G--AC-ATT---AAACT-----CC------TTT---A-A
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T--TTT-T--AC-AGA-GT---A-ATT--G-CACA-TT----C-TA--TT-A---CC-----------C-TA---------C---------CC-----------C------------------------------A------T--G----CATAA-TT----T------GAC-ATC-A-GTTG----A-C-A--AT-TT-GG-T-TGT--ATGTA--AC-CCC-G--AT-A-T---A---TATGGGTCATATATTCT---AGAAA-A--TA--TTAAATG-A-TA-A--------AA--T--TTTT----ACT---TA--C-----gttttacaaaagaaatctacttaatttagaaaaatatatggatagataataaatatctatcaattaataatacatataatacagaaatttgacgtaagtataatagaaaataagaattgtattaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                t--T--TTT-T--AC-AAA-GT---A-ATT--G-CA-AATT----T-TA--TT-A---CC-----------C-TA---------CACCCCCCCCCC-----------C--------------------TC--------A------T--G----CGTGA-TT----T------GAC-GTC-A-GTTG----G-C-A--AT-TT-GG-C-TG---
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---CC-----------C-CC---------C---------CC-----------C--------------------TC--------A------T--G----CGTGA-TT----T------GAC-AAA-A-GTTG----G-C-A--AT-TT-GG-C-TGTATATCTA--A--CCCCG--AT-A-T---A---T-----TG------TTC---A-AAATA--TA--TTAAATG-A-TG-------------------TT----ACT---TA--C-----C-AATA-AGATG-GTTT-G-A-A--AA---GGA-TA-C-----------------------ATATATCA-TTGG----TTTATTTA---------A-G-T-A----AAA-TTG-AA----A-CGTT-TC---AG-TGACCTC-A-TG-AT-A-T-TTG-T--GGACT-G-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATTG-GT-C--A-AAT----TT--C-GAT-T-TNC--A----GA--A--T-A-CA--Atatat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatttggctgtatattntccccccccccccccc---ATGTA--A--TCCAG--AT-A-T---A---T-----TC------TTA---A-AAA-AGATA--TTAAATG-A-TA-A--------AA--T--TTT-----ACT---TA--C-----G-AATA-AGATG-GTTT-G-A-A--AA---GGA-TA-C-----------------------ATATATCA-TTG------TTATTTA---------A-G-T-G----AAA-TTG-AA----A-CGTT-CC---AG-TCACCTC-A-TG-AT-ATT-TTT-G--GGGCT-G-AT-A--TT-T------GAAAAAA-A--AAATAG-GT-G--A-AAT----TT--T-GGT-CTTTC--GA---AA--A--TAG-CA--AAA---TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----T-----T-A--AAAATG-CATCG-TT-CAA--TTTTGAC--AA---AAAATA--AAA-----------A--TAAAGG----------AAT-ATAA-A----GTA---G---T-TGC--CCTGCC--TTCATTTA--CA--G-AAATTTC--TAAC--AA-A-T-C-TAG--CT------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---T--ATGC-A-CA--T----CGACT---A--C-C--------------CT-T-C-----------CCA----A-CCCC----TACGTA-TG--T------TG-----------------------A---C--------------G-C-GA-GTTGT----GTA-----TT--GGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T--TTA-CACA-TGttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTAT-A--CTC-G--AT-A-T---A---T-----TC------TTT---A-AAA-A--AAAATTAAATG-A-TA-----------A--T--TTTTTTTTACA----A--CAGCAGG-AATA-AAATG-GTTT-G-ACA--A----GGA-TA-C-----------------------ATATATCA-TTG--------TTTTA---------A-G-T-G----AAA-TTG-AA----A-CGTT-TC---AG-TGACCT--A--G-AT-ATT-TTT-G--GGGCT-G-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAGTAG-GT-C--A-AAT----TT--C-GGT-CTTTC--T----AAGAA--TAT-GA--AAA---TT-GACA-C-A-TTAC-C--TC-------C-AG-TAA----TTTA-AA-A--AA--TG-TATCG-TT-CAA--TTTTAA---CA---A----A--AAA-----------C--TAAAGG----------AAG-ATGAAA----GTA---A---T-CAT--CCTGCT--T-CATTTA--CA--GAAATTTAA--AAAA--AA-A-T-C-TAAA-CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-A-CA-TA----AAATT---A--C-C-----------------C-T-----------ACC----C-CCCA----TGCGCA-AT--T------TG-----------------------A---C--------------G-T-CA-GTTG-----GCA---ATTT--GGTTGTA-TG-TA-A-C
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taggtagtagtcacaccctacccccttttatcccccatgttcaattgtcttcataattcgaataataaattaatagtgtggtaatacatgttttgtcaaatttcaaagaaattcaaccaagctttttcgtaggttgctagtcaaactcttcaattttatgatttccatcatgcagaaaaataagccTGTAT-A--CCC-G--AT-A-T---A---T-----TC------TTT---T-AAA-A--AA--TTAAATG-A-TA-A--------GA--G--TTTT----ACT---CA--C-----C-AATA-AAATG-GTTT-GAA-A--A----GGA-TA-CATATA---CA------------TG--TACCA-TT--GTTTTTcccgatatattctttaaaaatattaaatgataaaacttttacttacgaataagatggtttgaaaaggatacataacttcgcctttttgtatatcattgtttttttaaaagtaaaat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtagtagtctcaccctacccctttttccccacgttcaatgttattcataattgcaaaataaattaatagtgttgtaatacatgttatttcgaaattccaacgaaatttaaccaagcgtttttcgtacgttgccagtcaaactcttcattttttatgatttccgtcgtgcagaaaaataagctTA--G--CCC-G---T-A-T---A---T-----TC------TTA---A-AAA-AA-TA--T---ATG-A-TA-----------A--T--TTTTTTTAAGA---CA--C-----GTAATA-AAA-G-GTTT-G-A-ACAG----GGA-TG------A---CA------------TATATG-CA-TTG------TTTTTTA---------A-G-T-G----AAA-TTGGAA----A-CGTT-TC---AAATGACCT--A-TG-AT-ATT-TTG-T--GGGCTTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAGTAG-GTCA--A-AAT----TT--C-GGT-CTTTCT-G----GA--A--TAT-GA--AAA---AT-GACA-C-A-TTAC-C--TC-------C-AGTAAA----TTAA-AA-A--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTTTAAC--AA---A----G--AAA-----------C--TAACGA----------AAT-ATGA-A----GTA---A---T-CAT--CTTGCT--TTTATTTA--CA--G-AAATTAA--AAAA--AA-A-T-C-TAA--CC------TA--T-A-TTTA--AGA-GTA---A--TTGC-A-CA-TT----CTA-T---AACC-C--------------TA-C-C-----------CCC----A-TGCG----TA------A--T------TT-----------------------GA--C--------------A-T-CA-GTTG-----GC----AGTTTGGGTTGTA-TG-TA-aagtg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtagtagtcacaccctaccccctttttcccccatgttcaattttcttcataattggaaaaaattaatagtgtaataatacaatgttttggtcgaaattccaaagaaatttaaccaagcgtttttttcgtaggttgccagtccaaactcttcaaattttttatgattttttcgtcatgcagaaaataagcctgtaaa--A--CTC-G--AT-A-T---A---T-----TC------TTA---A-AAA-AAATA--TTAAATG-A-TC-----------A--T--TTTTTTA-AAA---CA--C-----G-AATA-AAATG-GTTT-G-ACA--A----GGA-TA-C-----------------------ATATATCA-TTG------TTTTTTA---------A-G-T-G----AAA-TTG-AA----A-CGTT-TC---AG-TGACCT--A-TG-AT-ATT-TTG-G--GGGCT-G-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAGTAG-GT-C--A-AAT----TT--C-GGT-CTTTCTAG----AAT-A--TGA--A--AAA---TT-GACA-C-A-TTAC-C--TC-------C-AG-TAA----TTAA-CA-A--A---TG-TATCG-TT-CAA--TTTTTA---CC---A----A--AAA-----------C--TAAAGG----------AAT-ATGA-A----GTA---A---T-CAT--CCTGCT--TTCATTTA--CA--CAAA-TTTG--AAAA--AA-A-T-C-TAA--CC------TA--T-T-CTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-A-CA-TT----CTATT---A--C-CC-------------TA-C-C-----------CCC----C-ATGCG---TA------A--T------TT-----------------------GA--C--------------G-T-CA-GTTG-----GCA---ATTT--GGTTGTA-TG-TA-A-Ctccccgatatattctttaaaaatattaaatgattagaatatttacttacgaaataagatggtttgaaaaagatacaatatatcattggggggtttttgaaagttaaatttaaacgttcagtgacctcataatatttgggggccgaatatttgaagaaaaataggtcaaatttaggtcattcaataaaaaattgggcacatatctacagaaattaaaaaaatgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aggtagtagtcacaccctaccccctttttccccatgttcaattttcttcataattggaatttaaattaatagtgtggtaatacatgttttgtcaaaattccaaagaaattcaaccaagcgtttttcgtaggttgccagtcaaactcttcaatttttatgatttcgtcatgcagaaaaataagccgatTT---A-AAA-A--T----TAAATG-A-TA-T--------TT--T--TTTTT---ACA---CA--------G-GATA-AAATG--TTT-A-ACA--A----GGA-TA------A---CA-------------ATATATCA-T---GTTTTTT--------------AAG-T-G----AAA-TTG-AA----A-CGTT-TC---AG-T-ACCT--A-TG-AT-ATT-TTG-G--CGG--------A--GT-T------G---AAG-A--AAGTAG--T-C--A-AAT----T---C-GGT-CTTTC--ATTA-AA--A--TGA-----AAA---------A-C-A-TTTA-C--TC-------C-AG--------TAAA-AATA--AAAATG-TATCG-TT-CAA--TTTAAC---AA---A----ATAGAA-----------C--TAAAGG----------AATTATGA-A----TTA---A---T-CAT--CCTG-T--TTC--TTA--CA--GACA---TT--AAAC--AA-A-A-C-TAAAACC------TA--T-T-TTAG-CAGA-GTA---A--TTGA-C-CA-CT----CTATT---AC-C-C--------------TA-C-C-----------CTA----G-GCGC----AA---A-TA--T------GA---------------------------C--------------G-T-CA-GT-------GCA---ATTT--GG--TTA-TG-TA-cccgatatattctttaaaaatattaaatgatagaatttttacatacgaataagatggtttgaaaaggatacatacatgtatatcatcgggttttttttttaaagtgaattgaaacgtttcagtgacctcatgata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtagtagtcaaccctgcccccttttttccccatattgtcagttttttcataattggaatattaaattaataataataccatgttttgtcaaatttccaagaaattcaaccaagcgtttcgtacgtccagtcaaactcttcaattttatgattccatcatgcaaaaaataagcctgtatactaatactatc--TTTT----ACT---TAA-T-----G-AATA-AGATG-GTT--G-A-A--A----A-A-TA-----TA---CA------------T-TATATCA-T-GGGTTTTTTTT--AC--------GAG-T-G----AAA-TTA-AA----AACGTT-TC---AG-TGATCTC-AATA-AT-ATT-TTT-G--GGGCT-C-AT-A--TT-GAAAGAAG---AAG-A--AAATAGCGT-A--A-AAT----T---C-G----CTTC--G----AAT-A--TAA-CA--AAA---GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AA-A--AAAATG-TATTG-T--CAA--TTTGAA---AA---A----A--AAA-----------G--TAAAAGTA--------AAT-AA---A----GTA---G---T-CAT--C-TGCTCTTTCATT-A--CA--GAAC-TGTC--AATA--AA-A-TGC-TAA--CT------TA--T-T-GTTA-CAGA-GTA---A--TTAT-G-CA-T--------CT---A--C-T--------------TA-C-C-----------CCC----C-CCCC----CCC-CC-CC--C------CA-----------------------G---CCGCGAAAGTTGACCG-T-CA-GTTG-----GCA---AGTT--GGCTCTA-TG-TATA-CA-T--ACATT--AA--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T--TTA-CACATTGAA---CT--A-----CTT-GAT-TTCGAAAAA----AAT-ATA-T-GG-AT---AATAGAATA--AAGATA-----------TCTATCAATT--AATAA-A-CAT-----A-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------TT-G-TATTTTA--A---ATT------T-A-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA-A--G-CA-AAGTAT-AAAC---------CA-CCTC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GTG---CCATGAG-------C-C----ACAG-TGG-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA-----GG-GGAA--ATT---------C-AAAAGG-A---C-TC-CCAG--TG-T--GGAAA---AA-T-A-A-T---AAAA-AGGA-GA-GC-AA------GC-A-G--G-AA-AT-AA----CGGATTC-C----AG-TG---A-TTTTT---TA-TTAAATA-T---G--A-A-A------CCACCACC---------------CTCTTTTCC-TAA-AA-AA--ACAAGAAATA-------A----A--AT-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---GA-TA-CA--TTTT-A----A-TTGA-AT---A-A--AA-------A-TA--AAA-TT-T--ATGTT-TA-TC-TA-TTTA----C-ATTA--T-AGT--------------A---AAA-ATT-A-A-TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA--------AATA-AAA---A-C------A-AA---C---T---ATA---AA--AAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T-----AA--AA-A------ACA--AA-ACACCA-CA-TA-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GTA--CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAttaccccgattatatctttaaaaaatataaatgatagaattctacttacgaataagatgtttgaaaaaggatcatatatcattgttttttttaaaaataaaattgaaaatgttaatgacctcatcatattttgaggctatattttgaggaaaatagt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -AT-ATT-TTG-A--GGG-T-G-ATGA--TTAT------G---AAG-A--ACATAG-GT-CTCA-AAT----T---C-GGT-CTTTC--A----AA--AATTAA-CA--AAG---TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AA-A--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG---GA---A----A--AAA-----------G--TAAAGA----------AAT-AT---AAA--GTA---G---T-CAT--CCTGCT--TTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA--CCA-----TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TT-C-G-CA-T-----CTA-----A--C-C--------------TA-A-C-----------CCC----C-CCCC------C-C------C------CA-----------------------G---CC-------------G-T-AA-GT-------------GATT--GGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T--TTA-CACA-TGAAA-TAT--A-----CTT-AAT-TA--AAAAA----TAT-ATA-T-GA-A----AG-ATAATA--A--ATA-----------ATTAT-AATTA-ATAAATA-CAT-----T-ATATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAATT-A-TA--TTA--A---ATT------T-A-C--T--CCA-CTGAA---AC-AA-A--GGCAAAAGT-T-AAA-------------CCTG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTG--GCCATGAG-------C-C----ACAG-TGG-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-A-GTG-GGAA--ATT---------C-AAA--G-G---C-TT-CCAG--TG-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGG-AG-GC-AA-----AACGA-G--TAAG-GT-AA----CTG--TCGC----AG-TG---ATATTTT---TT-TTAAATG-TTT-G--A-ACC------CCCCACCCCCCACCCAC--------CTTTTCCTTTC-AA-AG--A--------A-------A----A--AA-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---GA-TA-CA--TTTT-A----A-T--A-AT---A-TA-AA-------A-TA--AAA-TC-T--A---T-TA-TC-TA--TT-----T-ATTA--TAAATATA-C-AT---AAAA---AAT-AAT-A-A-T------AAT-A-AG-TG-AA--T-AGTAA---C----AATA-AAA---A-C------A-AA---C--AA---ATA---AA--AAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC---AA--AA-ACA---CACA--AA-A----A-TG-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG-A--CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -ATT-TTG-A--GGGCT-G-AT-A--TT--------G---AAG-A--ACATAG-TC-G--A-ATT----CT--C-GGT-CTTTC--A----AA--AA-TAAACA--AAG---TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AA-A--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG---GGGGGA----A--AAA-----------G--TTAAGG----------A-T-AT---AAAA-GTA---G---TTCAT--CC-GCT--T-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA--CCA-----TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGCCG-CA-TC----ACAC-------C-C--------------TAAC-C-----------CCC----C-CCCC------C-C------C------CA-----------------------G---CC-------------G-A-TA-GTCT-----G-----ATTT--GGCTCTAATG-TA-A-CA-TTGACATT--AA--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T--TT--AACACTGAG----T--AA----CTT-A-T-TA--AAAAT----AAT-A-A-T-GA-A----GG-ATAATA--AC-ATA-----------TTTATCCA----ATTAATA-TATCAATAA-TTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAATT-A-TA--TTA--A---ATT------T-A-C--T--CCA-CTGAA----C-AA-G--G-CAAAAGT-TTAAAC---------C----TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTG--GCCATGAG-------C-C----ACAG-TGAGA--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--A-GTG-GGAA--ATT---------C-AAA----G---C-TC-CCAG--TG-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGAGGG-GC-AA-----AGC---G--T-AG-TA-AA----CT---TCGC----AG-TGA-TATTTTTT---TT-TAAAATG-TTT-G--A-CCC------CCACCCCCCCCCACC----------CTTTTCC-TC---A-AG--A--------A-------A----A--AT-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA----A-TA-CA--TTTT-A----AGT--A-AT---A-T--AA-------A-A---AAA-TC-T--A---T-AA-TC-TA--TT-----T-ATTA--TAAATATA-C-AT---AAAA---AAT-AAT-ATA-TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAA---CCCATAAT--AAA---A-C--------CA---C--AACCCA-A---AA--AAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC--------G-AC----CACA--AA-A----A-TT-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGCC--GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAACc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -CAT--CCTGCT--TTCATTTA--CA--GAAA---TT--AAA---AA--------------------------T-TTTG-CAGA-GTA---A--TTGC-A-CA-TT----CT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --T-T-GTTA-TAGA-GTA---A--TTGC-G-CA--T----CTACT---A--CTC--------------TA-C-C-----------CCT----C-CCAC----CAC-CACCA--C------CACCCCCATCAGCGTAATTAAGTTGA---C--------------G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTT--GGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T--TTA-CAAA-AGAAA-TCT--A-----CTT-AAT-TT--AGAAA----AAT-ATA-T-GG-AT---AG-ATAATA--A--ATA-----------TCTATCAATT--AATAATA-CAT-----A-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAATT-G-TA--TTA--A---
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-A-CA-TT----CTATT---A--C-CC-------------TA-C-C-----------CC----------------ATGCA-TAATT------TG-----------------------A---C--------------A-T-CA-GTTG-----ACA---ATTT--GGTTGTA-TG-TA-A-C
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            t--T-T-TTTA-CAAA-GTA---A--TTGC-A-AA-TT----TTATT---AC-C-C--------------TA-CAC-----------CCC----C-CCCC----CCT-CA-TG--CGTGATTTG-----------------------A---C--------------G-T-CA-GTTG-----GCA---ATTT--GGCTGTA-TA-Tcccgatatatatgggtcatatattctagaaaatattaaatgataaaatttttacttac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -C-C-----------CCC----C-CCCC----CCC-CC-CC--C------CC-----------------------G---C--------------G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTT--GGCTCTA-TG-TA---CA-T-AACATT--AA--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T--TTA-CACA-TGAAA-TCT--AA----CTT-AAT-TT--AAAAA----AAT-ACA-T-GA-AT---AG-ATA-TA--A--ATA-----------TT-ATCA--T--AATAATA-CAT-----A-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-TA--TTA--A-----T------T-A-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA-G--G-CAAAAGC-T-AAAC---------C----TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTT--GTCATGAG-------C-C----ACAGATGG-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--G-GGG-GGAA--ATTT--------C-AAA--G-G---C-TC-C-AG--TGGT--GG-GA---AAAT-AAG-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-----AGC-A-G--T-AG-GT-AA----CTG--TCGC----AG-TGA-TA---TTT---TT-TAAAATG-TT--G--A-ACC------CC-CACCCCCCACC-----------CTTTTCC-TTC-AA-AGA-A--------A-------A----A--AT-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA----A-TA-CA--TT--------A-T--A-AT---A-TTGAA-------A-TA--AAA-TC-T--A---T-TA-TC-TATTTT-----T-ATTA--AGAATATA-C-ATA-GAAAAT--AAT-AAT-A-AGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAA---C----AATA-AAA---A-C------A-AA---C--AA---ATA---AA--GAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC---AA--AA-ACA---CACA--AACA----A-TT-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGCAG-CCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccAT-----A-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAATT-G-TA--TTA--A---ATC------T-A-C--T--GCA-CTAAA---AC-AA-A--GGCAAACGT-T-AAACCATCCAGATCATCCTA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTG--GCCATGAA-------C-CATGTACAA-TGG-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--A-GGA-GG-A--ATT---------C-AAA--G-G---G-CC-CAAG--TG-T--TG-GA---AA-T-ATG-A---GAAG-GAGA-GG-GC-AT-----GGC-A-G--G-AG-GT-AT----CTG--TCGC----TG-TG---ATTTTTT---T------ATG-TTT-G-----CC------CC-CTCCCCC------------------TTCC-TT--AA-AA--A--------A-------A----A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---GA-TA-CA--TTTT-A----A-T--A-AT---G-T--AA-------A-TTA-AAA-TC-T--A---T-TA-TC-TA-TTT-----C-ATTA--TGAAT--A-T---------A---AAA-AAT---A-TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAA---C----AAT--AAAT--A-T------A-AAAGCC--AA---AC-----A--AAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C---AAACAA-ACA---CACA--AA-A----A-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAATT-G-TA--TTA--ATAAATT------T-AAC--T--CCA-CTAAA---ACTAA-ATGGCAAGAAGT-T-AC-C---------CACCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TGGTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGGG-GGAA--ATT---------CAAAA--G-A---C-TCTCCAG--TG-T--GG-AA---AA-T-A-ATA---AAAGCGAGA-GG-AC-AA-----GGC------C-AG-GC-AGCATACTG--TCGC----AG-TG---ATTTTTT---TT-T--AATG-TTT-GATA-ACCA-----CCA--------CCCCTCT--------TATTCC-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATA----A--AA-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---GAGTA--A--TTTT-A----A-T--A-ATATAA-T--AA-------A-TTAAGAA-TT-T--A---T-TA-TC-TA--TT-----A-ATTA--T-AGTAAA-T--T----------------C-A-A-TG------ATTA-AA-TA-GA--T-A-TAA---C----AAT--ATC---A-C------ACAA---C--TA---ATA---AA--AAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC----A-AACAAA-T-T------A--AA-ACAAATCACATTAC-A----CTTT-GA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGTA--CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--A-CGGTGGAAC-ATT---------C-AAA--G-----C-TC-CCAG--TG-TTGAG-GA---AA-T-A-A-G---AAAA-AAGA-GG--C-AA-----AGC-AAG--T-AG-GT--------TC--TCGCGACTAGCTG---ATATTTT---TT-TTAAATG-TTT-G--A-ACCTTCGGGCCGCGCCACCC-----------------TTCC-TTC-GATAG--GCGAATG--A-------A----A--AT-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCGA-TAGTA--TTTT-A----AAT--A-A----A-T--GATCAAAGAA-T---AAA-CCCT--A---TGTA-TG-TA-TTTCTATCT-ATCA--CATATACACT-AA--GAAAT---AAGTAATGA-A-TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAA---C----AAT--AAA------------A-AA---C--AA---AAACATAA--AAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC---AA--AACACAG--CGCA--AAGA----A-TT-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGCA---CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAATG-TTT-G--A-----------------CCCCCCCCCCCCTCGACCCGGTTCT-TCA-AA-AG--A--------A-------A----AACAT-T-A--TATTT--CAAC-ACT-ATCA---GA-TA-CA--TTTT-AAAATA-T--A-AT---ATT--AA-------A-T-----A-TC-T------T-TA-TC-TA-TTT-----T-ATTAATCAAGTAAA-A-AT-----AA---TAA-AAT-A-A-TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAA---C----AATACAAA---A-CCAAACAA-AA---T--AA---ACA---AA--AAAA-A---AAT--------T--T-C--AAA--AAA-AAAAAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-A----ACTT-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGCA--CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataA-TC-T--A---T-TA-TC-TA-TTT-----T-ATTA--TAAATA------T----AAA---AAA-AAA-A-A-TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAG---C----AATA-AAA---A-C------A-AA---C--TA---ATA---AA--AAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T-------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C----ATTT-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGc
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11    11                            222                                   1111   111                                                                    11111111                                          11                                       111111       11                     33333333                1                         111111  111111             1111       11  2222222222                  11111          11                      11111                                                       11111111                         2222222                                11                         11111111     1111         1111111       111111                                            2222222          11                                                                2222222222222222222                                                                                1   11                                    111                 11111111                                        11    1111      44444444444444444444             111                                                                                              11111111                             1111                 1111111111111                                     1111111        111111                                   111  111        11111111111          11111111         111                                                   11               111111                                    1111111    11111     222222222222222222222222222222                  55555555555555555555555555555555555555555555555             22222222222                                                                                          11111111111  11                   1111111111                22222222222                                                                             1111111111111                                11111                                                   22222222222222                                                                 1111111                                                                     111111111       11111                              111111111                                 1111    1111          1111                                                          33333333333333                      22222222  1111111                                                    1111         3333333333333333                                               11111111    111111111111111        111111                                                       11111111        11111111111111111                          222222222222                                                                        111111           1111               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       44 22    11     77       1             000            6  1      3 3       3  0000   222            44        3        44    3          44 3   555     3 55 11111111   666 44 3   3    55  55  3    3 88      00      3   3 55 3 3   55    3    55 55  000000       77         3       3   22222222 1 3  5 88      0        3 3      3 3 3 3 444444  000000 55 3 3  55  5555       22  0000000000   55   4   4 55  44444   8   4  33   4   4  8  4 55     00000   4  4 99 4  4  4   4       3   7   3   3  8888888    66666666     88  3    7 3        1111111   3   7   666    3  3  3 55 55 00     7   3     3      3  77777777 88  2222       3 5555555   3 3 000000    3   3   3  6  77      6       3   3  3  2222222     6  3 11 5555  77   3     2 66    2 33  555  2          2  77  3   2 2  7777777777777777777      888888    33 2     2 888888   2   5    6666 2 5 33 2 2  2   66       33 2 1   55 33 2    66 77777 2 888888    2   2 111   2      2 2 2  00000000  77       444   66  2  2  2     2    2 55 2  1111   2  55555555555555555555       2  2  222      66   33  7777777   555  3  6666 3 3   3  555         3 3  2   44 2  99999      2  2 66  44444444 555   4444   2   5  777 3   0000 555 3 55 3    6 5555555555555   3 555  44  3  3    3 3 6    3 44  0000000 3  3   222222  3   44   2  3   7 3  7   55      555  111 7777   77777777777  55      88888888 3   77  555   666  3   55 55             88  8888  2    55    00  3 7 7  3  3  777777  44 3 3    3    3   999 44    3 3  4444444    00000 3 3 555555555555555555555555555555    6 44 77777 3  00000000000000000000000000000000000000000000000 3 3 33 3    77777777777           3  3  3 3 3 3 3       44 44 3 555 6     6 3   3 3   3  3  3    3    3 88   3   77777777777  00    7777 3      7  1111111111  3    6 55 3   00000000000      3  5 3 3  7 3   3  3  6 4   77  77     3  3   44   3  3 3  888    3 3  6666666666666   33   88888    3  3 3 44   44 00000  999999  3 44 44   3     555  3  44     3    3 3  33333333333333  3  3  3  3   555   3 5555         3  44 999999   3    44       0000000 3 7777    3  3 3 44 555  6  3 44  3  3 3  9999  3  77    3  3  77   555555555    44 00000 3  3    77 3 3 44  3  555  3 555555555    6    3  3  6  3  3 99999999  0000  3 2222   555    0000  3 6   88   555    333    3    3  77     888888888   3   11111111111111   3   3 3  66  3  77 00000000  6666666  44 3 6 6      44    777 3    77777 3  3  44    6  5555 44 3    0000000000000000     2 33 777 2 2   5  77 33 5   2  33   2     33333333    111111111111111 2 6666 333333     5  2     99 2      6666   7777 2  33     555    2 22222222      2 44444444444444444 5 33   66   5      5 2 2 222222222222  66  2   777    33  9999999999 444  3   3   3   3          44 77       888888 3 44   44 0000  3 3   88     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .. ..    ..     ..       .             ...            .  .      . .       .  ....   ...            ..        .        ..    .          .. .   ...     . .. ........   ... .. .   .    ..  ..  .    . ..      ..      .   . .. . .   ..    .    .. ..  ......       ..         .       .   ........ . .  . ..      .        . .      . . . . ......  ...... .. . .  ..  ....       ..  ..........   ..   .   . ..  .....   .   .  ..   .   .  .  . ..     .....   .  . .. .  .  .   .       .   .   .   .  .......    ........     ..  .    . .        .......   .   .   ...    .  .  . .. .. ..     .   .     .      .  ........ ..  ....       . .......   . . ......    .   .   .  .  ..      .       .   .  .  .......     .  . .. ....  ..   .     . ..    . ..  ...  .          .  ..  .   . .  ...................      ......    .. .     . ......   .   .    .... . . .. . .  .   ..       .. . .   .. .. .    .. ..... . ......    .   . ...   .      . . .  ........  ..       ...   ..  .  .  .     .    . .. .  ....   .  ....................       .  .  ...      ..   ..  .......   ...  .  .... . .   .  ...         . .  .   .. .  .....      .  . ..  ........ ...   ....   .   .  ... .   .... ... . .. .    . .............   . ...  ..  .  .    . . .    . ..  ....... .  .   ......  .   ..   .  .   . .  .   ..      ...  ... ....   ...........  ..      ........ .   ..  ...   ...  .   .. ..             ..  ....  .    ..    ..  . . .  .  .  ......  .. . .    .    .   ... ..    . .  .......    ..... . . ..............................    . .. ..... .  ............................................... . . .. .    ...........           .  .  . . . . .       .. .. . ... .     . .   . .   .  .  .    .    . ..   .   ...........  ..    .... .      .  ..........  .    . .. .   ...........      .  . . .  . .   .  .  . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .  . . ..   .. .....  ......  . .. ..   .     ...  .  ..     .    . .  ..............  .  .  .  .   ...   . ....         .  .. ......   .    ..       ....... . ....    .  . . .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ..    .  .  ..   .........    .. ..... .  .    .. . . ..  .  ...  . .........    .    .  .  .  .  . ........  ....  . ....   ...    ....  . .   ..   ...    ...    .    .  ..     .........   .   ..............   .   . .  ..  .  .. ........  .......  .. . . .      ..    ... .    ..... .  .  ..    .  .... .. .    ................     . .. ... . .   .  .. .. .   .  ..   .     ........    ............... . .... ......     .  .     .. .      ....   .... .  ..     ...    . ........      . ................. . ..   ..   .      . . . ............  ..  .   ...    ..  .......... ...  .   .   .   .          .. ..       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       66 55    22     99       8             111            7  8      1 1       3  8888   555            66        3        66    3          66 3   888     6 00 99999999   444 99 6   6    00  00  6    6 66      00      6   6 00 6 6   00    6    00 00  555555       77         6       6   55555555 0 6  9 66      9        6 6      6 6 6 6 111111  555555 00 6 6  00  0000       33  9999999999   00   0   0 55  00000   0   0  55   0   0  0  0 55     11111   0  0 55 0  0  0   0       6   3   6   6  2222222    88888888     66  6    3 6        5555555   6   3   444    6  6  6 00 99 00     3   6     6      6  00000000 66  7777       6 5555555   6 6 555555    6   6   3  7  99      7       3   3  3  4444444     7  3 22 0000  99   3     9 88    9 99  000  9          9  33  1   9 9  1111111111111111111      222222    99 9     9 222222   9   7    1111 9 7 99 9 9  9   88       77 9 4   44 99 9    88 11111 9 222222    9   9 888   9      9 9 9  44444444  99       777   33  9  9  9     9    9 44 9  8888   9  22222222222222222222       9  9  777      44   99  4444444   000  1  5555 1 1   1  444         1 1  9   22 9  66666      9  9 88  33333333 000   8888   9   7  000 1   8888 888 1 22 1    2 1111111111111   1 444  22  3  3    3 3 7    3 66  8888888 3  3   222222  3   66   1  6   6 6  3   00      000  444 7777   33333333333  00      22222222 6   55  000   444  6   00 00             66  4444  5    00    00  6 3 3  6  6  777777  66 3 3    3    3   222 66    3 3  5555555    33333 3 3 666666666666666666666666666666    2 22 77777 1  22222222222222222222222222222222222222222222222 3 3 88 3    55555555555           3  3  3 3 3 3 3       66 66 3 888 7     7 3   3 3   3  3  3    6    6 66   6   33333333333  00    7777 6      3  2222222222  6    5 00 6   99999999999      6  6 6 6  3 6   6  3  7 2   99  99     3  3   66   3  3 1  222    1 1  9999999999999   66   55555    1  1 1 22   22 00000  666666  3 66 66   3     888  3  77     3    3 3  88888888888888  3  3  3  3   888   3 5555         3  66 666666   3    66       8888888 3 1111    3  3 1 22 444  2  1 22  1  1 1  6666  1  33    1  1  33   444444444    22 55555 1  1    33 1 1 22  1  444  1 777777777    7    3  3  7  3  3 66666666  4444  3 9999   000    4444  3 7   44   888    888    1    1  33     999999999   1   33333333333333   1   1 1  55  1  33 00000000  5555555  22 1 2 2      22    111 1    44444 1  1  22    2  8888 22 1    3333333333333333     9 99 999 9 9   7  99 99 7   9  99   9     55555555    666666666666666 9 1111 000000     7  9     66 9      1111   0000 9  99     000    9 66666666      9 99999999999999999 7 99   88   7      7 9 5 555555555555  88  9   999    99  8888888888 666  1   1   1   1          66 99       555555 3 66   66 4444  3 3   66     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGGAATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAAAAAA-ATTAAATGA-TAATTTT-TTT----A---ACA-CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TA-GAAT-A-TGAAAAAT--TGAA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TTA-A--AN-A--AA----AACTAAA-G-------GAA-T-A------TGAA-GTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-AGA-AA-TT--TA---AAAAA-AA-T--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAA-TAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G-A---A-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT-AA---GTA---GT-CAT--C--CTGCTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AA-CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--C-----C-CC----N-C-CACGC---C------------------G-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-C-A-T-GACATTA--A--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-CA-CA-TGAA-ATCT-A--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( family-1826 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGGAATNNTAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAAAAAATATTAAATGA-TAATTTT-TTT----A---ANA-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TA-GAAT-A-TGAAAAAT--TGGA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TTN-A--AN-A--AA----AACTAAA-G-------GAA-T-A------TGAA-GTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-AGA-AA-TT--TN---AAAAA-AA-T--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTNAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAA-TAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G-A---A-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATCG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT-AA---GTA---GT-CAT--C--CTGCTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AA-CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--C-----C-CC----A-C-CACGC---C------------------G-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-C-A-T-GACATTA--A--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-CA-CA-TGAA-ATCT-A--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AANAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGGAATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTTCAAAGAATT--TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATTC-ATGT-A--GAAAAAAATAAGCCGTGT-A----A-CTCAAGATA-TATT--C--TTTTATATAGTAAGAA-ATTAA-TGA-TAATTTT-TTT----CTTTACA-CAGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCTA------T--A-T-CA--TTTGTAGTTCATT--AATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTC-AGGGTGAACCT-ATTGA-TGGATTCTTAATGGGA-ACCT--G-AT-ATCTTG-AAAAAAG-TAGTGTC-AGG-ATGAT----TGGTGCCTGTAACTTTC---A-GAATTA-TGAAAAAGAATGAC-CACTAAT-ACTCTATCCA-GTCAG-TCCT-AAGCAAAAT-TGT--TCGT-CAAATT-TTATA--AC-A--AATA--AACTAAA-GCCGCAAGGAA-T-AACAGGGCGAA-GT---CC-AT-CCGTTGCGTT-CACT-AC-AGA-AA-TTGGTA---AAAAGGAA-TGGC-T--AAAACCT-ATCTTCT--ACAG-AAAGT---AT-TTG---ATTC-TAG-TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCCCCCCCCTGCG--T-AATTT-G------A-G-TCA--TTG----G-C-ATTA-TGTT-GGT---GTATGT--A-A-CCT--GCAG-TATGATT-----T-C------TTTA-AAA-AA--TAT-AAAATG-A---AGTACCCAATAA--TAATTAC---TTA--CG-AA-TA-AGGTG-GTTTAG--A-AAAAGAGGAGTAA--CCAGGGTAG------TGCAT-TCA-CT-GG--TTTTTTAGGAAACGGT-A-ACTAAAT---TG-GATATAA-C-GTTATC---ACTGACCTC-A-TG---A-TT-TTG-T--AGGCTG-AT-A--TT------------GAG-A--AAA-TAG-GTA--ACAGTGTCCT-T-C-GT-T-CTTTGCAAG-A---A-A--TAA-CAAGAA--AG-TT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AAATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG---AA---A----AGAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAA-AAAT-AA---GTATGTGT-CAT--C--CTCTTTTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AACCC------TA--TGT-TTTA-CAGACGTAATGA--TTGC-G-CAGTT----CTAC-TTACA-C-C--------------TA-CCGGACACTAACACCCC-CGTC-----C-CC------C-TCCCC---C------------------A-G---------C-G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTTGGCTCTA-TG-TA-AGC-AGT-GACATTA--AGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATATTA-CA-CA-TGAA-ATTT-A--CTT-AA------------TT--ACAA----A-AATATA-TG---A-AC---GG-ATAA-A--A-GTT-----------GTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-TAGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-AT-TG-T-A--TCA--A---A-TT------TA-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AAT-GGTAA-AGCG-T-AAG--A----------CC-TG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTGG--CCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--T--G-A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATAGGG-TA-AG--ATC---------CAAA--GCG---C-TC-CCCGATT-G-T--AG-AG---GA-T-A-G-AGGCAAAG-AAGA-GG-GC-AATAGTC-G-G--G-AGTTATGT-AGTT-ACTG--TC-C----AG-TGGATATTTTGAATTTT-T--GAT-GTTT-GA--ACCCA---C---C-ACC-CCC-A--------C--CCTT-TTCTC-TTC-AA-GG--A--------AACACC---AA--T-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---G-A-TA-CATGTTTC-AA----T--ATATAT--AA-------ATCA-AAATA-TGGA---T-T-ATCATA-TT--T-TAT-TA---AA-ATATA-CGA-T--AAAA----AAT------T-A-A----T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAA----ACT--A-ATAA--ACAGA---CAAACTAAAAGAGTAAAAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG-----------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------ATT-T-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGC--A--CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ATA-TT-TTG-A--GGG-TG-ATGA--TTAT------G---AAG-A--ACA-TAG-GTCTCA-AAT----T---C-GG-T-CTTT-C--A-A---A-AATTAA-C---AA--AG-TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG---GA---A----AAA-----------AG--TAAAGA--------A-ATAT-AAA--GTA---GT-CAT--C--CTGCTTTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-CT-AA-CCA-----TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TT-C-G-CA-T-----CTA------A-C-C--------------TA-AC-----------CCCC-C--C-----C-CC----C-C-CA-GC---C------------------G---------------T-AA-GT-------------GATTGGCTCTA-TG-TA-A-C-A-T-GACATTA--A--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T-TTA-CA-CA-TGAA-ATAT-A--CTT-AAT-----------TA--AAAA----A-TATATA-TG---A-A----AG-ATAATA--A-ATA-----------ATTAT--AATT-A-ATAA-ATA-CATTA-T-ATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AA---A----------CC-TG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TT-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGG-AG-GC-AA-AA-CGA-G--TAAG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA--TT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---CACCC-CCCAC--------CCACCTT-TTC-CTTTC-AA-AG--A--------AA-------AA--A-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----T------AAT-A-AG-T-GAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG---A-CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGGAAA---AAATTAATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CCAAA---CTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--TC-ATGC-A--GAAAA---TAAGCC-TGT-AAAT-AGCCC--G-TA-TATT--C--TT------AAAAAAA-TAT---ATGA-TAATTTT-TTTT---A---AGA-CACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------TA------T--A-TGCA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTC-AAA-TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GTGG-GC-TT-G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAAATT--T----CGGT--------CTTTC--TG-GAAT-A-TGAAAAAT----GA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AAAT--T-AA--AAAAAATGT-ATTGT-TCAATT-TTA-AC-AA-A--GA----AACTAAC-G-------AAA-T-A------TGAA-GTA-ATC-AT-CT--TGCTTT-TATTTAC-AGA-AA-TT--AA---AAAAA-AA-T--C-T--AA--CCT-ATATT-T--A-AG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TA-ACC-C-TA-------------------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACA-TCA-GTTG----G-C-A--G-T-TTGGGT--TGTATGT--ATC-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-ATT-AG--------AA--TATTTAC---TTA--CGAAA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----AGA-TAC--A---------------ATATATCA-TTGGG--GGGTTTTTGAAA--GT-T-A---AAT---TT-AA----A-C-G-T-TC---AGTGACCTC-A-TA-ATA--T-TTG-G--GGGCCGAAT-A--TT-T------G---AAGAA--AAA-TAG-GTC--A-AAT----T-T-A-GG-T-CATT-C--------A-A--TAA-----AA--AA-TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AAA--AAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGGAATT-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC---G--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC--G--A--T-A-CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAAAAAATATTAAATGA-TCATTTT-TTT----A---AAA-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TA-GAAT-A-TGAAAAAT--T-GA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T--A--ACAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TTT-A--CC-A--AA----AACTAAA-G-------GAA-T-A------TGAA-GTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-ACA-AA-TT--TG---AAAAA-AA-T--C-T--AA--CCT-ATTCT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TACATACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-tgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTCGAATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCAAAGAAAT--TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TTTC--CA--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATT--C--TT------TAAAAAAAAATTAAATGA-TAATTTT-TTTTTACA---ACAGCAGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTT----AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-A--GA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TAAGAAT-A-TGAAAA-T--TG-A-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-TA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TTA-A--CA-A--AA----AACTAAA-G-------GAA-G-A------TGAAAGTA-ATC-AT-CC--TGCTT--CATTTAC-AGA-AA-TT--TA---AAAAA-AAAT--C-T--AAA-CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATAA-AA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--C-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--CTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC--ATAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TT-G----TTTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAGTAGTCA-ACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTGGAATATTAAATTAATAAT-----AATACCA-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCCAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TT-C--CA--TC-ATGC-A---AAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CT---AATACTAT---C--TT------AAAAA-----TTAAATGA-TATTTTT-TTT----T---ACA-CA-G--GATAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----TA------T--A-T-CA--T-----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--T-A-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGCG-G----------AG-TTG-AAGAAAG-TAG--TC-AAA-TT-------CGGT--------CTTTCATTA-AAAT----GAAAAA----------C-ATT-TAC---TCCA-GT-AA-A--A-AT--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T---A--AC-A--AAATAGAACTAAA-G-------GAATT-A------TGAA-TTA-ATC-AT-CC--TG-TTT-C--TTAC-AGA-CA-TT-------AAACA-AA-A--C-TAAAA--CCT-ATTTT-A--GCAG-A--GT---AA-TTGACCACTC-TA--TT-ACC-C-TA--------------------CCCTA------GGCG--CAAATAT-G------ACG-TCA-GT------G-C-A--A-T-TT-GGTTATGTAT-T--A-C-CCC--G--ATTATA--T-----C-T------TTAA-AAA-A---TA--TAAATG-A-T-AG--------AA---TTCTAC---TTA--CG-AA-TA-AGAT--GTTT-GAAA-AA----GGA-T-------------------CATATATCA-TT--G--TTTTTTTTAAAA--AT-A-A---AAT---TGAAA----A-T-GTT------AATGACCTC-A-TC-ATA-TT-TT--G--AGGCT--AT-AT-TT-T------G---AGG-A--AAA-TAG-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAAT-TG-T-A--TTA--ATAAA-TT------TAAC--T--CCA-CTAAA---ACTAAATGGCAAGAAGT-T-AC-CCA----------CCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TG-GTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GGGAA--ATT---------CAAA--A-GA--C-TCTCCAG--T-G-T--GG-AA---AA-T-A-ATA---AAAGCGAGA-GG-AC-AA-GG-C------C-AG----GC-AGCATACTG--TCGC----AG-T-GAT---TT---TTTT-TTAA-T-GTTT-GATAACCAC---C---A-CCC-CTC---------------TTATTC-C-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATAAA--A-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---G-AGTA--A--TTTT-AA----T--A-ATAT--AATAA----ATTAAGAATT-T--A---T-T-ATC-TA-TTAAT-TAT-AG--TAA-AT--------T-------------------C-A-A----TG-----ATTAA-A--TAGA---T-A-TAAC----AAT--ATC-AC--ACAA----CTAA-TA-------AAAAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC--AAA---CAAA-T-T---------------A--AA-ACAAATCACATTAC-A------C-T-TTGA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGT--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-TA-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TC------TA-C--T--GCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-ACGT-T-AAACCATCCAGATCATCC-TA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAA-------C-CATGTACAA-TG-G-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGA-GG--A--ATT---------CAAA--G-G---G-CC-CAAG--T-G-T--TG-GA---AA-T-ATG-A---GAAG-GAGA-GG-GC-AT-GG-C-A-G--G-AG----GT-A----TCTG--TCGC----TG-T-GAT-TTTT---TT-------AT-GTTT-G----CCCC---C---T-CCC-CC-------------------TTC-C-TT--AA-AA--A--------AA-------A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATGT--AA-------ATTA-AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-CAT-TA--TGA-AT------A-T--AAAA----AAT----------A----TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAAC----AAT--A-A-AT--ATAAAAGCCAAA-C---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C------------AAACAA-ACA---CACA--AA-A------A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGT--A-A-TCCA-G--A-TATA--T-----T-C------TTAA-AAA-AGA-TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--TTTT-AC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-G-----TTATTT--AA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-CC---AGTCACCTC-A-TG-ATA-TT-TTT-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAAAAA-A--AAA-TAG-GTG--A-AAT----T-T-T-GG-T-CTTT-C--GAA---A-A--TAG-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----T-----TA--AAAATG-CATCG-TT-CAA--TTTTGAC--AA---AAAATAAA-----------AA--TAAAGG--------A-ATATAAA---GTA---GT-TGC--C--CTGCCTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--TAAC--AA-A-T-CT-AG-CT------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---T--ATGC-A-CA--T----CGAC-T---A-C-C--------------CT-TC-----------CCAA-C--C-----C-CT----A-CGTATGT---T------------------G-A---------C-G-C-GA-GTTGT----GTA-----TTGGCTCTA-TG-TA-A-C-A-T-GACATTA--A--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T-TTA-CA-CA-TGaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--ACGGTGG-AAC-ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-TTGAG-GA---AA-T-A-A-G---AAAA-AAGA-GG--C-AA-AG-C-AAG--T-AG----GT--------TC--TCGCGACTAGCT-GATATTTT---TTTT---AAAT-GTTT-GA--ACCTT---CGGGC-CGC-GCC-A--------C--CCTT---C-C-TTC-GATAG--GCGAATG--AA-------AA--T-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCG-A-TAGTA--TTTT-AAA---T--A-A-AT--GATCAAAGAAT---AAACCCT--A---TGT-ATG-TA-TT--TCTATCTA--TCACATATA-C-ACT--AAGA----AATAAGTAATGA-A----TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAAC----AATA-A-A-AA--ACAAA---AACA-T--------AAAAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC------------AA--AACACAG--CGCA--AAGA------A-T-T-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGC--A--CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CC-C-CC---------C---------CCCTCA------TGCG--T-GATTT-G------ACA-AAA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGC--TGTATATCTA-A-CCCC-G--A-TATA--T-----T-G------TTCA-AAATA---TAT-TAAATG-A-T-G----------------TTAC---TTA--CC-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-GG--TTTATTT---AA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA--T-TTG-T--GGACTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAA-TTG-GTC--A-AAT----T-T-C-GA-T--TTN-C--A-G---A-A--T-A-C---AA--gcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatttggctgtatattntcccccccccccccccAGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTGGAATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC---AAAAATCTTCAAAAGAAAT---CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C-AAA---ATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--TC-ATGC-A--GAAAA---TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATTATC--TT------AAAAAAAAATTTGAATGA-TAATTTT-TTT----T---ACA-CAGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------TA------TTCA-T-CA--TT----GTTTTTTT-AA----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTC-AGC-TGA-CCT-AT-GAAT--ATTTT----TGGG-GC-TTTG-A--AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGTC--------CTTTC--TA-GAAT-A-TGAAAAAT--TT-A-CAC-ATT-ACC----CCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATTATTA-A--CA-A--AA----AACTAAAAG-------GAA-T-A------TGAC-GTA--TC-ATTCC--TGCTTTTCATTTAC-AGA-AA-TT---A---AAGAA-AA-TG-C-T--AA--CCT-ATTT-----ACAG-A--GT---AA-T-GCACATTC-TA--TT-A------A---------C---------CTCCC-------TGCG--T-A-TTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-CTA--G-T-TT-GG---TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATT--T-----T-T------TTTT-AAA-A---AAT-TAAATG-A-T-AG--------AATCTTTTTAC---TTA--CG-AA-TC-AGAT--GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ATA------------TAT---CCA-TT-GG----TTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----G-T-TTT-TA---AGTGACCTC-A--G-ATA-TT-TTG-GAAGGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG----AAA-TAG-GTC--A-ATT----T-T-C-GG-T-CTTT-CA-A-A---A-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG---------AAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-AT-T-AA---GTA---GT--AT--C--CTGCTTTCATTTA--C----AAAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AG-CT------TA--T-T-TTTA-CAGA-AGA---AAGTTGC-GTCA-TT----ATAC-------C-C--------------TC-CC-----------CCCC-C--C-----C-CC----C-C-Cttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -CC-----------CCCC-C--C-----C-CC----C-C-CCCCC---C------------------C-G---------C-G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTTGGCTCTA-TG-TA---C-A-T-AACATTA--A--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T-TTA-CA-CA-TGAA-ATCT-AA-CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATACA-TG---A-AT---AG-ATA-TA--A-ATA-----------TT-ATC-A--T-A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-T-A--TTA--A------T------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA--GGCAA-AAGC-T-AAACC--------------TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTTG--TCATGAG-------C-C----ACAGATG-G-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--GGGG-GG-AA--ATTT--------CAAA--G-G---C-TC-C-AG--T-GGT--GG-GA---AAAT-AAG-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TAAAAT-G-TT-GA--ACCCC---C---A-CCC-CCC-A--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AGA-A--------AA-------AA--T-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TT----A----T--A-ATATTGAA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TATTT--T-TAT-TA--AGA-ATATA-C-A-T--AGAA----AATAA----T-A-ATAAGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAGAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AACA------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGC--AGCCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAACcctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|21                         : aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccGTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGCAA-AATAAATTAATAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC---GAAA---TTCCAACGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-GTGC-A--GAAAAA--TAAGCT-TGT-A--T-A-CCC--GATA-TATT--C--TT------TTAAAAA--ATTAAATGA-TAAGAGT-TTT----A---CT--CACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------TATACATGT--A-C-CA--TT----G-TTTTT--AA----------GTG--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T-T-GTTA-TAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-T-----CTAC-T---A-CTC--------------TA-CC-----------CCTC-C--CACCACCACC----A-C-CACCC---CCATCAGCGTAATTAAGTTG-A---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-C-A-T-GACATTA--A--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-CA-AA-AGAA-ATCT-A--CTT-AAT-----------TT--AGAA----A-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAAT-TG-T-A--TTA--A---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA---------AAA----AAAAA------A-A----TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAGC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CTAA-TA-------AAAAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T----------------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C------ATT-T-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCC--A------TGCA--T-AATTT-G------ACA-TCA-GTTG----A-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--TATGGGT-CATATATTCTAGAAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--TTTTTAC---TTA--C
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTGGAGT-ATGAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTT-T--ACAA-A--GT---AA-TTGCAAATTT-TA--TT-ACC-C-TA---------CACCCCCCCCCCCTCA------TGCG--T-GATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGC--TGTATAT--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTAG-CACACACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTGGGAATATGAATTAATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTC-AAAGAAATAGT-AACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATGC-ACAGAAAAA--ATAGCC-TGT-A--TTA-CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAATAAA-ATTAAATGAATAATTTT-TTT----TT--ACA-CAGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------TA------T--A-T-CA--TTT---GTTTTTTT-AA----------GTG--AAA-TTG-A--AAA----CGT-T-C-AG---GA-CCT-ATTGA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--GGAT-AT-TTG-AAGAAAGATAG-GTCCAAA-TT--T----CGATT-------CTTTC---A-GGATGA-TGAAAAAT--TG-A-CAC-ATT-ACC---TCCA-GC-AA-T--TTAA--AAAAC-TGT-ATCGTCTCAATT-TTA-C--A--A--AA----AACTAAA-AA------GAA-T-A------TGAA-GTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATT-AC-AGA-AA-TT--CTTAAAAAAA-AA-T--CCT--AA--CCT-ATTTT-TT-ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTCGTA--T--ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------T-CG--C-AATTTTG------ACGGTCAAGTTG----G-CCA--A-A-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCCCCG--A-TATA--T-------C------TTTA-AAA-A---TACCTAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CA-AAATA-AGATG-GTTT-G--ACAA----TGA-TA---ACG-------------ATATTTCA-TT-GG--GTTTTTG-AAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TT---AGTGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCTG-AT-C--AT-T------G---AAG-A--AAA-TAGCGTC--A-AAT----T-T-CAGG-T-CTTT-C--A-A---A-AA-TAA-C---AACAAA-TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAAA--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA-AA---A----AAA-----------AG--GAAAGA--------A-ATATAAA---GTA----T-CGT--C--CTGTTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-CT-AA-CC------TA------TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-GT----CTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCCAC--C-----C-CC----A-C-C-CCC---A------------------A-G---------C-GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTTGGCTCTA-TT-TA-A-C-A-T-GCCATTA--A--A-------ACTTT-A-AGT-T-TTA-TA-CA-AGAA-ATCT-T--CTTAAAT-----------TTAAAAAA----A-AATATA-TG-------------------------A-----------TTTATC-CATTAA-AT-A-ATACCA-CA-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAA--TG-T-A---TA--A---A-TTTAGTGCTA-C--T--CCA--TGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA-------------TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTGC--CCATGAG-------A-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--GCGC-GG-GA--ATT---------CAAA--G-G---CTTC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAGAAAGA-GGAACAAA-AG-C-A-GACT-AGC---GTAA----ACTG--TCGCA---AG-T-GATATTTT---TTTTCTTAAAT-GTTT-GAT-ACCCC---CA--C-CCCACCC-CCA------C--CCTT-TTC-C-TTCGAA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---A-A-TA-CA--TTTT-AAC---T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-A-C-TA--T--T-TA--TA--TAA-ATATA-C-A-TCCAAAAACATAATAA----T-A-A----TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA------AAC--A-A-AA----AAA---CAAA-TT-------AAAAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-TGT-GT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGC--A--CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agcgAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-AGA-AA-TT-------AAAAA----------------------TTT-T--GCAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCAC--CCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGAACTATAAAT-AATAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG--TTTCAAGAAAAT--TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC-GAA---CTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TT-C--CA--TC-ATGC-A--AAAAAAAATAAGCC-TGT-A--T-A-CT---GATA-TATT--CCTTT------AAAAAAA---TTAGATGA-TAATTTT-TTTTAT-A---ACA-CACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--AAT-CA--TTT---GTTTTTT--AAAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTC-AG--TGA-CCT-AG-GA-T--ATTTT----TTGG-CA-A--G-AT-AT-TTGGAAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------ATCTC--TA-AGAT-A-TTGGAAAT--TG-A-CAC-ATTTACC---TCCA-GT-AA-T--T-AACAAAAAA-TGTTATCGT-TCA-TT-TTA-A--AA-ACAAA----AAATAAC-G-------GAA-TTA------TGTA-GTATATC----CC--TACTTT-CATTTAC-AGA-AAATT--TT---AAAAA-AA-TT-C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCATATTC-TA--TTTACC-CCTAAACCTCCCCC---------CCCCCA------TGCG--T-AAATT-G------ACG-CAA-GTTGTATGG-C-A--A-T-TT-AGT--TGT-TGT--A-A-CCCC-G--A-TATAA-T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAC--AGATG-A-T-AA--------AA--TGTATACGACTTA--CG-AA-TATAGATGAGT---A--A-AA----GGA--------A------------CATATATCAGTT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TTTAAGGTGACCTAGA-TGGATA-TC---A-G--GGGCTG-AC-AATTT-T------G---AAG-ACAGAA-TAG-GTT--A-AATAT--T-T-C-G--T-CTTTGC--G-A---A-AAATAA-C---AA--AA-TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AAA--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAAAA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------G-ATAT-AAAAAGTA---AT-CAT--C--CTGCTTTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGTT-TA-CCGTCAGGTA--T-TATTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TC----CTAC-T---A-C-C------------------------------CCCC-A--C-----T-CC----G-C-TAAGT---T------------------G-A---------C-G-T-CA--TTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-C-A-T-GACAT-A--A--A-A---T-CCTTT-A-GTT-T-TTA-CA-CA-TGAA-ATCT-A--CTT-CAT-----------TT--AAAA----A-AATATATTG---A-AT---AG-ATAA-A--A-ATA-----------TTTATC-A----A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AAT-TG-TAA--TTA--ATT-ATTT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC--AA-GGCAA-AGGT-T-AAACGC----------CT-TG-TC-C--AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTAA--CCATG-G-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--AGGG-GG-AA--TTTTTTTCCCCCCAAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGG-T--GG-GA---AA-T-----------------G-GG-GC-AA-AG-C-A-T--A-AG----GT-A----ACT---TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TTAAATGGTTG-GA--ACCCC---C---C-CCC--------------------T-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--TGC-A-TTACTT--T-AC-A-T-ATCA---GAA-TA-CA--TTTTAAA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-TAATCTTT-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACC-A-TA-AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAAC----AATAAA-A-AA--ACAAA---CAAA-T---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-T------A-T-T-GA-ATA-AAT--AA-AAATAAATGCAAA-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGGAATTTTAAATTA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATT--C--TT------AAAAAAAATATTAAATGA-TCATTTT-TTT----A---AAA-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAA-G-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTCA-TA-GAAT-A-TGAAAAAT--TGAA-CAC--TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-TTT-A--CC-A--AA----AACTAAA-G-------GAA-T-A------TGAA-GTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-ACA-AA-TT--TG---AAAAA-AA-T--C----AA--CCT-ATTCT-T--AAAG-A--GT---AA-TTGCA-ATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TG-ATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACT-ACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAA-TAG-GTG--A-AAT----T-T-C-GG-T-TCTT-C--G-A---A-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--A---GTA---GT-CAT--C--CTGCTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AA-CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--C-----C-CT----A-C-CACAC---C------------------A-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-C-A-T-GACATTA--A--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTT-CA-CA-TGAA-ATCT-A--CTT-AAT-----------TT--AAAA----C-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-TT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-CG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GTCAG-AAGT-C-AAACCAC---------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGA--TCATGAG-------C-C----ACAG-TG-A-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-GG-C-A-G--T-AG----GT-A----GCTG--TCGC----AG-T-G-TATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTC-GA--ACCCCACTC---C-CCC-CCC-CCTCTCTCTC--TCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-GA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATAGA-T-A-TG-AAAA----AAAAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAAC----AAT----A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTGGAATATAAAATT--TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TC---GAAAA--TTCCAAAAAAAT--TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--C-AAAAAACTCT--C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGCCAT-GAAAAA--TAAACC-TATTA--T-A-CCC---ATA-TATC--C--TT------TACCAACATATTAAATGA-TAAGTTTGTTT---------CA-TAAG--AATAAAGATG-TTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CACCTT----GTCTTTTTAAA----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGT-CTCCAG--TGA-CATCAT-GA-T--ATTTT----AGGGCGC-T--T-GTCAT-TTG-AA------TAGCGT--AAA-CT--TGCGGCGGT--------CGTTT--TA-GAAT-AATTAAAAAT--TGAC-CAC--TT-ACC---TC-A-GT-AA-T--T-AA--AAAAAACGC-ATCGT-TTAATT-TTT-G--ACCAC-AA----AGCTAAA-C-------GAA-T-A------TGGA-GTT-ATCCAT-CCA-TGCTTTTCATGTAC-AGA-AA-T----A---AAAAA-AA-C--A-T--AA--CTT-ATTTT-TTCACAG-A--GTCAGAA-TTGCACATTC-TACTTT-TCC-C-TA---------C---------CCCC-A------TGCACAT-AATTT-GCACGCGACG-TCATGTTG----G-C-A--AAT-TT-GGTC-TGTA-GT--A-A-CCCC-G--A-T-TA--T-----T-C------CTGA-AAA-AAAATAT-TTAATGTA-T-TA--------GA--TTTTTAC---TTA--C--AA-TA-AACTG-TCTT-G--A-AA----GGA-T-T--ACA------------TA-ATATCG-TT-GG--TTGTTTGTAAAA--GTCG-A---AACAAATG-AA----A-CCGTT-TC---AGTTATCTT-A-T--ATA-TTCTTT-T--GGGCTG--C-A--TT--------G---AAG-A--AAAACAT-GTC--A-AAT----T-C-C-AA-TATTTT-C--G-ACCAA-A--TAA-C---AA--AAGTT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----TTAA-GAA--ACA-TA-TATTG-TT--AA--TTTTGA---AA---A----AAA-----------AAGTTAAAGG--------A-ATAT-AAAA-GAA---CT-CAT--C--CTGCTTTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA-TC------CA--T-G-TTTAGCAG---TA---A--T--C-G-CA-TC----TTAC-T---A-C-CC-------------TA-CC-----------CCCC-C--C-----C-CCCTTTA-T-CAGGAAAGT------------------G-A---------C-G-T-CA-ATGG-----CCA---CATTGGCTCTA-TGCTA-A-CCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AGT-T-T-A-CAATA-TGAA-ATTTTA--CTT-ATC-----------CT--AGAG----A-ATCAAA-TG---ATAT---AG-ATAATA--A-ATAC----------TCTATC-AACT-GCATCA-ATA-C--TA-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAAT-TGTT-A--TTA--A---C-AT------TA-C-----CCA-CTAAA---AC-AAA--GCAA-AAGT-TAAAACCAC---------CC-TA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTGA--CCAT--G-------C-C----GCAG--G-C-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--AGCG-GG-AACTATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAGC-T-G-T--GC-AAATCAA-T-A-A-A---A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cccAAAT-GTTT-GA--CCCCC---C---C-CCC-CCT-CGA------C--CCGG-TTC-T-TCA-AA-AG--A--------AA-------AACAT-T-A-T-ATTT--CAAC-ACT-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AAAATAT--A-ATATT-AA-------AT---A--TC-T------T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TAATCAA-GTAAA-A-A-T--AATA----AA--A----T-A-A----TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAAC----AAT--ACA-AA--AC------CAAA-CA-------AAATAA-A-------------------C--AA---AAA-AA-AAA-T-TTCAAAAAAAAAAAAAA--AA-ACA---CACA--AA-A------ACT-T-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGC--A-CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                          cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CCGT--------CTTTC--TA-GAAT-A-TGAAAAAT--TGAATCAC-ATTGACC---TCCAGGT-AA-T--T--A--GAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TTA-AACAA-A--AA----AACTAAA-G-------GAA-T-A------TAAA-GCA-ATC-ATACC--TGCTTT-CATTTACAAGATAA-TT--TA---AAAAAGAA-T--C-T--AA--CCTAATTTT-T--ACAGAA--GT---AATTTGCAC-TTC-TA--TT-ACCGC-TACCCCC----C---------CCCCCC------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----GCC-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----TCC------TTTA-AAA-A---TAT-T-AATG-A-TAAG--------AAATTTTTTAC---TTAACCG-AA-TA-AGGTG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC------------------ATATATCA-CT-GG---TTTTTTAAAAA--GT-GAA---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TT---AGTGACCTC---TG-ATA----TTG-AT-GGGCTG----A--TT-T------G---GAG--------T---GT-------T----T-TAC-GGAT-CTTT-T--G-------A--TAA-C----A--AA-TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----T----AAA--AAAATG-TAT-G-TT-CAA--TTTTGG---AAAG-A----AAA-----------AG--AGTAGG--------A-ATTA-AA---GTA---GT-CATTCC--CTGCTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT--A-CC------TATTT-T-TTTA-CAGA-GTAT--A--TTGC-G-CA-TTCGTCCTAC-T---A-C-CGGCTAGCCGCGCTACA-CC-----------CCCCGC--C-----C-CC----GCC-CACGC---T------------------A-T---------C-G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTTGGCTCTA-TG-T--A-C-A-T-GACATTA--A--A-C---TCCCTTT-ATAGT-T-T-------A-TTTT-ATCT-GGTCTT-GATGGTCCTTCGTGTT--ACAACATGA-AATCTACTT---A-ATTAAAA-ATGATATGA-ATAGATAATAAATATTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-AT-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAAT-TG-T-A--TCAAGA---A-TT------TA-C--TTACCACCTAAT---AC-AAA-GGC-A-ACGT-T-AAA--A----------GC-CG-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------CGC----ACAG-TG-G-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--AGGG-TG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-T--CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-G---AAAG-AAGA-GG-GCAAA-AG-C-A-G--T-AG----TT-A----ACTG--TCGC----AG-TGGATATTTT---TTTT-TTTATT-GTTTGGA--ACCCC---C---A-CCC-CAC-C--------C-----T-TTC-C-TTC-AA-AGATA--------AA-------AA--T-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-T--CA--TTTTAAA----T--G-A-AT--TA-------AT---AAATA-T--AT--T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--T-A-ATATA-C----------------TAA----T-A-A----T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--TCAAA---CAAA-TA-------AAAAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC------------AAT-AA-ACA---CAC----A-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTAC---TTAA-TG-AA-TA-AGATG-GTT--G--A-AA----A-A-TAT--ACA------------T-TATATCA-TG-GG--TTTTTTTTACGA--GT-G-A---AAT---TA-AA----AAC-GTT-TC---AGTGATCTC-AATA-ATA-TT-TTT-G--GGGCTC-AT-A--TT-GAAAGAAG---AAG-A--AAA-TAGCGTA--A-AAT----T---C-G-----CTT-C--G-A---ATA--TAA-C---AA--AA-GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AAA--AAAATG-TATTG-T--CAA--TTTGAA---AA---A----AAA-----------AG--TAAAAGTA------A-ATA--AA---GTA---GT-CAT--CTGCT-CTTTCATT-A--CA--GAAC-TGTC--AATA--AA-A-TGCT-AA-CT------TA--T-T-GTTA-CAGA-GTA---A--TTAT-G-CA--T----CTACTT---A-C-C--------------CC-CC-----------CCCC-C--C-----C-CC----C-C-CCAGC---C------------------GCGAAAGTTGACC-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TATA-C-A-T--ACATTA--A--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T-TTA-CA-CATTGAA---CT-A--CTT-GAT-----------TTCGAAAA----A-AATATA-TGGATA-AT---AGAATAA-A--G-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-A-A-CA-TA-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------T-TG-T-ATTTTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA--GC-A-AAGTAT-AAACCA----------CC-TC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GT-G--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA----GG-GG-AA--ATT---------CAAAAGG-A---C-TC-CCAG--T-G-T--GGAAA---AA-T-A-A-T---AAAA-AGGA-GA-GC--A-AG-C-A-G--G-AA----AT-A----ACGGATTC-C----AG-T-GA---TTT---TTTA-TTAAAT-A--T-GA--A-------A---C-CAC-CAC-C--------C--TCTT-TTC-C-TAA-AA-AA--ACAAGAAATAA-------AA--T-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----TTGA-ATAA--AA-------ATA--AAATT-T--ATGTT-T-ATC-TA-TT--TACAT-TA--TA----------G-T--AAAA-------AT----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA-----AAT--A-A-AA--ACAAA---C-TA-TA-------AAAAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T--------------AA--AA-A------ACA--AA-ACACCACA-T----A-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GT--A-CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-TT-TTG-A--GGGCTG-AT-A--TT--------G---AAG-A--ACA-TAG--TC--G-AAT----TCT-C-GG-T-CTTT-C--A-A---A-AA-TAAAC---AA--AG-TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG---GGGGGA----AAA-----------AG--TTAAGG--------ATATAA-AA---GTA---GTTCAT--C--C-GCTT-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-CT-AA-CCA-----TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGCCG-CA-TC----ACAC-------C-C--------------TAACC-----------CCCC-C--C-----C-CC----C-C-CA-GC---C------------------G-A---------TAG-T-C----TG-----------ATTTGGCTCTAATG-TA-A-C-A-TTGACATTA--A--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T-TTAACA-C--TGAGTA----A--CTT-A-------------TT--AAAA----ATAATA-A-TG---A-A----GG-ATAATA--ACATA-----------TTTATCCAATT-A-AT-ATATC-AA-TAATTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA----C-AA--GGCAA-AAGT-T-TAA--A----------CC-TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TGAG-A--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGAGGG-GC-AA-AG-C---G--T-AG----TA-A----ACT---TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TAAAAT-GTTT-GA--CCCCCA--C---C-CCC-CCC-CA-------C--CCTT-TTC-C-TC---A-AG--A--------AA-------AA--T-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TTTT-AAG---T--A-ATAT--AA-------AA---AAATC-T--A---T-A-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-ATA----TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAACCCATAAT--A-A-AACCACAAC---CCA---A-------AAAAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC-----------------G-AC----CACA--AA-A------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGC--C-GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11    11                             111                                   1111   111                                                                    11111111                                          11                                     1111111       1                      33333333                1                         111111  111111             1111       11  2222222222                  11111          11                      11111                                                       11111111     1111                    111                                11                               1111111             1111111       111111                                             111111          1111111                                                           2222222222222222222                                                                                1   11                                    111                 11111111                                        11    1111      44444444444444444444             111                                                                                              11111111                             1111                 1111111111111                                     1111111        111111                                   111  111        11111111111          11111111         111                                  1111             11               111111                                    1111111    11111     222222222222222222222222222222     111          66666666666666666666666666666666666666666             22222222222                                                                                         11111111111  11                   1111111111                22222222222                                                                             1111111111111                                11111                                                   22222222222222                                                                 1111111                                                                     111111111       11111                              111111111                                 1111    1111          1111                                                          33333333333333                      22222222  1111111                                                    1111         3333333333333333                                               11111111           11111111        111111                                                       11111111        11111111111111111                          222222222222                                                                        111111           1111               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       44 22    11     77       1           3  777            6  1      3 3       3  0000   222            44        3        44    3          44 3   555     3 55 11111111   666 44 3   3    55  55  3    3 88      00      3   3 55 3 3   55    3    55   4444444       0   3      3       3   66666666   3  1 88      0        3 3      3 3 3 3 444444  000000 55 3 3  55  5555       22  0000000000   55   4   4 55  44444   8   4  33   4   4  8  4 55     00000   4  4 99 4  4  4   4       3   7   3   3  8888888    66666666     2222     7 3        55  888   3   7   666    3  3  3 55 55 00     7   3     3      3 55 444 7777777  55       3 5555555   3 3 000000  3     3   3  6  77      6       3   3  44  444444      6   0000000  44   3     2 66    2 33  555  2          2  77  3   2 2  7777777777777777777      888888    33 2     2 888888   2   5    6666 2 5 33 2 2  2   66       33 2 1   55 33 2    66 77777 2 888888    2   2 111   2      2 2 2  00000000  77       444   66  2  2  2     2    2 55 2  1111   2  55555555555555555555       2  2  222      1    33  7777777   555  3  6666 3 3   3  555         3 3  2   44 2  99999      2  2 66  44444444 555   4444   2   5  777 3   0000 555 3 55 3    6 5555555555555   3 555  44  3  3    3 3 6    3 44  0000000 3  3   222222  3   44   2  3     3  7   55      555  111 7777   77777777777  55      88888888 3   77  555   666  3   55    55      2   88  2222  0    55    00  3 7 7  3  3  777777  44 3 3    3    3   999 44    3 3  4444444    00000 3 3 555555555555555555555555555555  3  111     44 3 44444444444444444444444444444444444444444 3 3 33 3    77777777777           3  3  3 6  3 3      44  44 3 555 6     6 3   3 3   3 3   3    3 3    88   3   77777777777  00    7777 3      7  1111111111  3    6 55 3   00000000000      3  5 3 3  7 3   3  3  6 4   77  77     3  3   44   3  3 3  888    3 3  6666666666666   33   88888    3  3 3 44   44 00000  999999  3 44 44   3     555  3  44     3    3 3  33333333333333  3  3  3  3   555   3 5555         3  44 999999   3    44       0000000 3 7777    3  3 3 44 555  6  3 44  3  3 3  9999  3  77    3  3  77   555555555    44 00000 3  3    77 3 3 44  3  555  3 555555555    6    3  3  6  3  3 99999999  0000  3 2222   555    0000  3 6   88   555    333    3    3  77     888888888   3   11111111111111   3   3 3  66  3  77 00000000  6666666  44 3 6 6      44    777 3    77777 3  3  44    6  5555 44 3    0000000000000000     2 33 777 2 2   5  77 33 5   2  33 1 2  1  77777777    6666   00000000 2 6666 333333     5  2     99 2      6666   7777 2  33     555    2 22222222      2 44444444444444444 5 33   66   5      5 2 2 222222222222  66  2   777    33  9999999999 444  3   3   3   3          44 77       888888 3 44   44 0000  3 3   88     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .. ..    ..     ..       .           .  ...            .  .      . .       .  ....   ...            ..        .        ..    .          .. .   ...     . .. ........   ... .. .   .    ..  ..  .    . ..      ..      .   . .. . .   ..    .    ..   .......       .   .      .       .   ........   .  . ..      .        . .      . . . . ......  ...... .. . .  ..  ....       ..  ..........   ..   .   . ..  .....   .   .  ..   .   .  .  . ..     .....   .  . .. .  .  .   .       .   .   .   .  .......    ........     ....     . .        ..  ...   .   .   ...    .  .  . .. .. ..     .   .     .      . .. ... .......  ..       . .......   . . ......  .     .   .  .  ..      .       .   .  ..  ......      .   .......  ..   .     . ..    . ..  ...  .          .  ..  .   . .  ...................      ......    .. .     . ......   .   .    .... . . .. . .  .   ..       .. . .   .. .. .    .. ..... . ......    .   . ...   .      . . .  ........  ..       ...   ..  .  .  .     .    . .. .  ....   .  ....................       .  .  ...      .    ..  .......   ...  .  .... . .   .  ...         . .  .   .. .  .....      .  . ..  ........ ...   ....   .   .  ... .   .... ... . .. .    . .............   . ...  ..  .  .    . . .    . ..  ....... .  .   ......  .   ..   .  .     .  .   ..      ...  ... ....   ...........  ..      ........ .   ..  ...   ...  .   ..    ..      .   ..  ....  .    ..    ..  . . .  .  .  ......  .. . .    .    .   ... ..    . .  .......    ..... . . ..............................  .  ...     .. . ......................................... . . .. .    ...........           .  .  . .  . .      ..  .. . ... .     . .   . .   . .   .    . .    ..   .   ...........  ..    .... .      .  ..........  .    . .. .   ...........      .  . . .  . .   .  .  . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .  . . ..   .. .....  ......  . .. ..   .     ...  .  ..     .    . .  ..............  .  .  .  .   ...   . ....         .  .. ......   .    ..       ....... . ....    .  . . .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ..    .  .  ..   .........    .. ..... .  .    .. . . ..  .  ...  . .........    .    .  .  .  .  . ........  ....  . ....   ...    ....  . .   ..   ...    ...    .    .  ..     .........   .   ..............   .   . .  ..  .  .. ........  .......  .. . . .      ..    ... .    ..... .  .  ..    .  .... .. .    ................     . .. ... . .   .  .. .. .   .  .. . .  .  ........    ....   ........ . .... ......     .  .     .. .      ....   .... .  ..     ...    . ........      . ................. . ..   ..   .      . . . ............  ..  .   ...    ..  .......... ...  .   .   .   .          .. ..       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       66 55    22     99       8           3  888            7  8      1 1       3  8888   555            66        3        66    3          66 3   888     6 00 99999999   444 99 6   6    00  00  6    6 66      00      6   6 00 6 6   00    6    00   3333333       9   6      6       6   99999999   6  0 66      9        6 6      6 6 6 6 111111  555555 00 6 6  00  0000       33  9999999999   00   0   0 55  00000   0   0  55   0   0  0  0 55     11111   0  0 55 0  0  0   0       6   3   6   6  2222222    88888888     2222     3 6        00  000   6   3   444    6  6  6 00 99 00     3   6     6      6 00 444 1111111  00       6 5555555   6 6 555555  6     6   3  7  99      7       3   3  66  222222      7   4444444  66   3     9 88    9 99  000  9          9  33  1   9 9  1111111111111111111      222222    99 9     9 222222   9   7    1111 9 7 99 9 9  9   88       77 9 4   44 99 9    88 11111 9 222222    9   9 888   9      9 9 9  44444444  99       777   33  9  9  9     9    9 44 9  8888   9  22222222222222222222       9  9  777      6    99  4444444   000  1  5555 1 1   1  444         1 1  9   22 9  66666      9  9 88  33333333 000   8888   9   7  000 1   8888 888 1 22 1    2 1111111111111   1 444  22  3  3    3 3 7    3 66  8888888 3  3   222222  3   66   1  6     6  3   00      000  444 7777   33333333333  00      22222222 6   55  000   444  6   00    00      1   66  8888  3    00    00  6 3 3  6  6  777777  66 3 3    3    3   222 66    3 3  5555555    33333 3 3 666666666666666666666666666666  1  555     11 1 22222222222222222222222222222222222222222 3 3 88 3    55555555555           3  3  3 7  3 3      66  66 3 888 7     7 3   3 3   3 3   3    6 6    66   6   33333333333  00    7777 6      3  2222222222  6    5 00 6   99999999999      6  6 6 6  3 6   6  3  7 2   99  99     3  3   66   3  3 1  222    1 1  9999999999999   66   55555    1  1 1 22   22 00000  666666  3 66 66   3     888  3  77     3    3 3  88888888888888  3  3  3  3   888   3 5555         3  66 666666   3    66       8888888 3 1111    3  3 1 22 444  2  1 22  1  1 1  6666  1  33    1  1  33   444444444    22 55555 1  1    33 1 1 22  1  444  1 777777777    7    3  3  7  3  3 66666666  4444  3 9999   000    4444  3 7   44   888    888    1    1  33     999999999   1   33333333333333   1   1 1  55  1  33 00000000  5555555  22 1 2 2      22    111 1    44444 1  1  22    2  8888 22 1    3333333333333333     9 99 999 9 9   7  99 99 7   9  99 9 9  5  66666666    1111   88888888 9 1111 000000     7  9     66 9      1111   0000 9  99     000    9 66666666      9 99999999999999999 7 99   88   7      7 9 5 555555555555  88  9   999    99  8888888888 666  1   1   1   1          66 99       555555 3 66   66 4444  3 3   66     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATT--CTT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTT-TTT----N---ACA-CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-A-TGAAAAAT--TGAA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--T-A-A--AAA--AA--AACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAA-TAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G-A---A-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT-AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AA-CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CC-CC---CCCCC-CC-CAC------------------------GCCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( family-1826 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATT--CTT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTT-TTT----A---ACA-CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-A-TGAAAAAT--TGAA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--T-A-A--ANA--AA--AACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAA-TAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G-A---A-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT-AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AA-CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CC-CC---CCCCC-NC-CAC------------------------GCCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTTCAAAGAATT--TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATTC-ATGT-A--GAAAAAAATAAGCCGTGT-A----A-CTCAAGATA-TATT--CTTTTATATAGTAAGAA-ATT-AA-TGA-TAATTTT-TTT----CTTTACA-CAGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCTA------T--A-T-CA--TTTGTAGTTCATT--AATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTC-AGGGTGAACCT-ATTGA-TGGATTCTTAATGGGA-ACCT--G-AT-ATCTTG-AAAAAAG-TAGTGTC-AGG-ATGAT----TGGTGCCTGTAACTTTC----AGAATTA-TGAAAAAGAATGAC-CACTAAT-ACTCTATCCA-GTCAG-TCCT-AAGCAAAAT-TGT--TCGT-CAAATT-T--T-ATA--ACA--AATAAACTAAA-GCCGCAAGGAA-T-AACAGGGCG-AAGT---CC-AT-CCGTTGCGTT-CACT-AC-AGA-AA--TTGGT---AAAAAGGAATGGC-T--AAAACCT-ATCTTCT--ACAG-AAAGT---AT-TTG---ATTC-TAG-TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCCCCCCCCTGCG--T-AATTT-G------A-G-TCA--TTG----G-C-ATTA-TGTT-GGT---GTATGT--A-A-CCT--GCAG-TATGATT-----T-C------TTTA-AAA-AA--TAT-AAAATG-A---AGTACCCAATAA--TAATTAC---TTA--CG-AA-TA-AGGTG-GTTTAG--A-AAAAGAGGAGTAA--CCAGGGTAG------TGCAT-TCA-CT-GG--TTTTTTAGGAAACGGT-A-ACTAAAT---TG-GATATAA-C-GTTATC---ACTGACCTC-A-TG---A-TT-TTG-T--AGGCTG-AT-A--TT------------GAG-A--AAA-TAG-GTA--ACAGTGTCCT-T-C-GT-T-CTTTGCAAG-A---A-A--TAA-CAAGAA--AG-TT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AAATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG---AA---A----AGAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAA-AAAT-AA---GTATGTGT-CAT--CCTC--TTTTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AACCC------TA--TGT-TTTA-CAGACGTAATGA--TTGC-G-CAGTT----CTAC-TTACA-C-C--------------TA-CCGGACACTAACACC-CCCGTCCCCC-TC-C-C-------------------------CCA-G---------C-G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTTGGCTCTA-TG-TA-AGCAGT-GACATT--AAGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATATTA-C-ACA-TGAA-A-TTTA--CTT-AA------------TT--ACAA----A-AATATA-TG---A-AC---GG-ATAA-A--A-GTT-----------GTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-TAGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-AT-TG-T-A--TCA--A---A-TT------TA-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AAT-GGTAA-AGCG-T-AAG--A----------CC-TG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTGG--CCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--T--G-A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATAGGG-TA-AG--ATC---------CAAA--GCG---C-TC-CCCGATT-G-T--AG-AG---GA-T-A-G-AGGCAAAG-AAGA-GG-GC-AATAGTC-G-G--G-AGTTATGT-AGTT-ACTG--TC-C----AG-TGGATATTTTGAATTTT-T--GAT-GTTT-GA--ACCCA---C---C-ACC-CCC-A--------C--CCTT-TTCTC-TTC-AA-GG--A--------AACACC---AA--T-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---G-A-TA-CATGTTTC-AA----T--ATATAT--AA-------ATCA-AAATA-TGGA---T-T-ATCATA-TT--T-TAT-TA---AA-ATATA-CGA-T--AAAA----AAT------T-A-A----T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAA----ACT--A-ATAA--ACAGA---CAAACTAAAAGAGTAAAAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG-----------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------ATT-T-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGC--A--CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ATA-TT-TTG-A--GGG-TG-ATGA--TTAT------G---AAG-A--ACA-TAG-GTCTCA-AAT----T---C-GG-T-CTTT-C--A-A---A-AATTAA-C---AA--AG-TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG---GA---A----AAA-----------AG--TAAAGA--------A-ATAT-AAA--GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-CT-AA-CCA-----TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TT-C-G-CA-T-----CTA------A-C-C--------------TA-AC-----------CC-CC---CCCCC-CC-CA-------------------------GCCG---------------T-AA-GT-------------GATTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TATA--CTT-AAT-----------TA--AAAA----A-TATATA-TG---A-A----AG-ATAATA--A-ATA-----------ATTAT--AATT-A-ATAA-ATA-CATTA-T-ATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AA---A----------CC-TG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TT-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGG-AG-GC-AA-AA-CGA-G--TAAG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA--TT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---CACCC-CCCAC--------CCACCTT-TTC-CTTTC-AA-AG--A--------AA-------AA--A-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----T------AAT-A-AG-T-GAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG---A-CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA--A-AAATTAATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CCAAA---CTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--TC-ATGC-A--GAAAA---TAAGCC-TGT-AAAT-AGCCC--G-TA-TATT--CTT------AAAAAAAT-AT----ATGA-TAATTTT-TTTT---A---AGA-CACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------TA------T--A-TGCA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTC-AAA-TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GTGG-GC-TT-G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAAATT--T----CGGT--------CTTTC--T-GGAAT-A-TGAAAAAT----GA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AAAT--T-AA--AAAAAATGT-ATTGT-TCAATT-T--T-A-AC-AAA--GA--AACTAAC-G-------AAA-T-A------TG-AAGTA-ATC-AT-CT--TGCTTT-TATTTAC-AGA-AA--TT--A---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATATT-T--A-AG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TA-ACC-C-TA-------------------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACA-TCA-GTTG----G-C-A--G-T-TTGGGT--TGTATGT--ATC-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-ATT-AG--------AA--TATTTAC---TTA--CGAAA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----AGA-TAC--A---------------ATATATCA-TTGGG--GGGTTTTTGAAA--GT-T-A---AAT---TT-AA----A-C-G-T-TC---AGTGACCTC-A-TA-ATA--T-TTG-G--GGGCCGAAT-A--TT-T------G---AAGAA--AAA-TAG-GTC--A-AAT----T-T-A-GG-T-CATT-C--------A-A--TAA-----AA--AA-TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AAA--AAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATT-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC---G--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC--G--A--T-A-CTC--GATA-TATT--CTT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCATTTT-TTT----A---AAA-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-A-TGAAAAAT--TG-A-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T--A--ACAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--T-T-A--CCA--AA--AACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTCT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TACATACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-tgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTCG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCAAAGAAAT--TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TTTC--CA--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATT--CTTT-----AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTT-TTTTTACA---ACAGCAGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTT----AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-A--GA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TAAGAAT-A-TG-AAAAT--TG-A-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-TA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--T-A-A--CAA--AA--AACTAAA-G-------GAA-G-A------TGAAAGTA-ATC-AT-CC--TGC-TT-CATTTAC-AGA-AA--TT--TA--AAAAAA-AAT--C-TA-AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATAA-AA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--C-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--CTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC--ATAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TT-G----TTTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAGTAGTCA-ACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTGG-AATATTAAATTAATAAT-----AATACCA-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCCAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TT-C--CA--TC-ATGC-A---AAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CT---AATACTAT---CTT------AAAAA-----TT-AAATGA-TATTTTT-TTT----T---ACA-CAGG--A-TAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----TA------T--A-T-CA--T-----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--T-A-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGCG-G----------AG-TTG-AAGAAAG-TAG--TC-AAA-TT-------CGGT--------CTTTCATT-AAAAT----GAAAAA----------C-ATT-TAC---TCCA-GT-AA-A--A-AT--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TAAC-A-A--AAT--AG--AACTAAA-G-------GAATT-A------TG-AATTA-ATC-AT-CC--TG-TTT-C--TTAC-AGA-CA---T--T---AAACAA-AA---C-TAAAA--CCT-ATTTT-A--GCAG-A--GT---AA-TTGACCACTC-TA--TT-ACC-C-TA--------------------CCCTA------GGCG--CAAATAT-G------ACG-TCA-GT------G-C-A--A-T-TT-GGTTATGTAT-T--A-C-CCC--G--ATTATA--T-----C-T------TTAA-AAA-A---TA--TAAATG-A-T-AG--------AA---TTCTAC---TTA--CG-AA-TA-AGAT--GTTT-GAAA-AA----GGA-T-------------------CATATATCA-TT--G--TTTTTTTTAAAA--AT-A-A---AAT---TGAAA----A-T-GTT------AATGACCTC-A-TC-ATA-TT-TT--G--AGGCT--AT-AT-TT-T------G---AGG-A--AAA-TAG-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAAT-TG-T-A--TTA--ATAAA-TT------TAAC--T--CCA-CTAAA---ACTAAATGGCAAGAAGT-T-AC-CCA----------CCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TG-GTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GGGAA--ATT---------CAAA--A-GA--C-TCTCCAG--T-G-T--GG-AA---AA-T-A-ATA---AAAGCGAGA-GG-AC-AA-GG-C------C-AG----GC-AGCATACTG--TCGC----AG-T-GAT---TT---TTTT-TTAA-T-GTTT-GATAACCAC---C---A-CCC-CTC---------------TTATTC-C-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATAAA--A-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---G-AGTA--A--TTTT-AA----T--A-ATAT--AATAA----ATTAAGAATT-T--A---T-T-ATC-TA-TTAAT-TAT-AG--TAA-AT---------------------T------C-A-A----TG-----ATTAA-A--TAGA---T-A-TAAC----AAT--ATC-AC--ACAA----CTAA-TA-------AAAAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC--AAA---CAAA-T-T---------------A--AA-ACAAATCACATTAC-A------C-T-TTGA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGT--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TA-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TC------TA-C--T--GCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-ACGT-T-AAACCATCCAGATCATCC-TA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAA-------C-CATGTACAA-TG-G-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGA-GG--A--ATT---------CAAA--G-G---G-CC-CAAG--T-G-T--TG-GA---AA-T-ATG-A---GAAG-GAGA-GG-GC-AT-GG-C-A-G--G-AG----GT-A----TCTG--TCGC----TG-T-GAT-TTTT---TT-------AT-GTTT-G----CCCC---C---T-CCC-CC-------------------TTC-C-TT--AA-AA--A--------AA-------A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATGT--AA-------ATTA-AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-CAT-TA--TGA-AT------A-T--AAAA----AAT----------A----TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAAC----AAT--A-A-AT--ATAAAAGCCAAA-C---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C------------AAACAA-ACA---CACA--AA-A------A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGT--A-A-TCCA-G--A-TATA--T-----T-C------TTAA-AAA-AGA-TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--TTTT-AC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-G-----TTATTTAA----GT-G-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-CC---AGTCACCTC-A-TG-ATA-TT-TTT-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAAAAA-A--AAA-TAG-GTG--A-AAT----T-T-T-GG-T-CTTT-C--GAA---A-A--TAG-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----T-----TA--AAAATG-CATCG-TT-CAA--TTTTGAC--AA---AAAATAAA-----------AA--TAAAGG--------A-ATATAAA---GTA---GT-TGC--CCTG--CCTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--TAAC--AA-A-T-CT-AG-CT------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---T--ATGC-A-CA--T----CGAC-T---A-C-C--------------CT-TC-----------CC-AA---CCCCT-ACGTAT------------------------GTTG-A---------C-G-C-GA-GTTGT----GTA-----TTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--ACGGTGG-AAC-ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-TTGAG-GA---AA-T-A-A-G---AAAA-AAGA-GG--C-AA-AG-C-AAG--T-AG----GT--------TC--TCGCGACTAGCT-GATATTTT---TTTT---AAAT-GTTT-GA--ACCTT---CGGGC-CGC-GCC-A--------C--CCTT---C-C-TTC-GATAG--GCGAATG--AA-------AA--T-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCG-A-TAGTA--TTTT-AAA---T--A-A-AT--GATCAAAGAAT---AAACCCT--A---TGT-ATG-TA-TT--TCTATCTA--TCACATATA-C-ACT--AAGA----AATAAGTAATGA-A----TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAAC----AATA-A-A-AA--ACAAA---AACA-T--------AAAAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC------------AA--AACACAG--CGCA--AAGA------A-T-T-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGC--A--CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CC-C-CC---------C---------CCCTCA------TGCG--T-GATTT-G------ACA-AAA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGC--TGTATATCTA-A-CCCC-G--A-TATA--T-----T-G------TTCA-AAATA---TAT-TAAATG-A-T-G----------------TTAC---TTA--CC-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-GG--TTTATTT---AA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA--T-TTG-T--GGACTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAA-TTG-GTC--A-AAT----T-T-C-GA-T--TTN-C--A-G---A-A--T-A-C---AA--gcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatttggctgtatattntcccccccccccccccAGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC---AAAAATCTTCAAAAGAAAT---CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C-AAA---ATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--TC-ATGC-A--GAAAA---TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATTATCTT------AAAAAAAA-ATTTGAATGA-TAATTTT-TTT----T---ACA-CAGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------TA------TTCA-T-CA--TT----GTTTTTTT-AA----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTC-AGC-TGA-CCT-AT-GAAT--ATTTT----TGGG-GC-TTTG-A--AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGTC--------CTTTC--T-AGAAT-A-TGAAAAAT--TTA--CAC-ATT-ACC----CCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATTAT--T-A-A--CAA--AA--AACTAAAAG-------GAA-T-A------TG-ACGTA--TC-ATTCC--TGCTTTTCATTTAC-AGA-AA--TT------AAAGAA-AATG-C-T--AA--CCT-ATTT-----ACAG-A--GT---AA-T-GCACATTC-TA--TT-A------A---------C---------CTCCC-------TGCG--T-A-TTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-CTA--G-T-TT-GG---TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATT--T-----T-T------TTTT-AAA-A---AAT-TAAATG-A-T-AG--------AATCTTTTTAC---TTA--CG-AA-TC-AGAT--GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ATA------------TAT---CCA-TT-GG----TTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----G-T-TTT-TA---AGTGACCTC-A--G-ATA-TT-TTG-GAAGGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG----AAA-TAG-GTC--A-ATT----T-T-C-GG-T-CTTT-CA-A-A---A-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG---------AAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-AT-T-AA---GTA---GT--AT--CCTG--CTTTCATTTA--C----AAAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AG-CT------TA--T-T-TTTA-CAGA-AGA---AAGTTGC-GTCA-TT----ATAC-------C-C--------------TC-CC-----------CC-CC---CCCCC-CC-Cttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -CC-----------CC-CC---CCCCC-CC-CCC------------------------CCCC-G---------C-G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTTGGCTCTA-TG-TA---CA-T-AACATT--AA--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTAA-CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATACA-TG---A-AT---AG-ATA-TA--A-ATA-----------TT-ATC-A--T-A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-T-A--TTA--A------T------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA--GGCAA-AAGC-T-AAACC--------------TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTTG--TCATGAG-------C-C----ACAGATG-G-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--GGGG-GG-AA--ATTT--------CAAA--G-G---C-TC-C-AG--T-GGT--GG-GA---AAAT-AAG-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TAAAAT-G-TT-GA--ACCCC---C---A-CCC-CCC-A--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AGA-A--------AA-------AA--T-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TT----A----T--A-ATATTGAA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TATTT--T-TAT-TA--AGA-ATATA-C-A-T--AGAA----AATAA----T-A-ATAAGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAGAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AACA------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGC--AGCCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAACcctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|21                         : aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccGTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGC-AA-AATAAATTAATAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC---GAAA---TTCCAACGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-GTGC-A--GAAAAA--TAAGCT-TGT-A--T-A-CCC--GATA-TATT--CTT-------TTAAAAA-ATT-AAATGA-TAAGAGT-TTT--------ACT-CACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------TATACATGT--A-C-CA--TT----G-TTTTT--AA----------GTG--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T-T-GTTA-TAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-T-----CTAC-T---A-CTC--------------TA-CC-----------CC-TC---CCACC-AC-CACCACCACCCCCATCAGCGTAATTAAGTTG-A---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-AAA-AGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AGAA----A-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAAT-TG-T-A--TTA--A---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA--------AAAA----AA-AA------A-A----TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAGC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CTAA-TA-------AAAAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T----------------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C------ATT-T-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCC--A------TGCA--T-AATTT-G------ACA-TCA-GTTG----A-C-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--TATGGGT-CATATATTCTAGAAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--TTTTTAC---TTA--C
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTGG-AGT-ATGAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTT-T--ACAA-A--GT---AA-TTGCAAATTT-TA--TT-ACC-C-TA---------CACCCCCCCCCCCTCA------TGCG--T-GATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGC--TGTATAT--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTAG-CACACACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTGGGAATA-TGAATTAATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTC-AAAGAAATAGT-AACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATGC-ACAGAAAAA--ATAGCC-TGT-A--TTA-CTC--GATA-TATT--CTT------AAAATAAA-ATT-AAATGAATAATTTT-TTT----TT--ACA-CAGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------TA------T--A-T-CA--TTT---GTTTTTTT-AA----------GTG--AAA-TTG-A--AAA----CGT-T-C-AG---GA-CCT-ATTGA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--GGAT-AT-TTG-AAGAAAGATAG-GTCCAAA-TT--T----CGATT-------CTTTC----AGGATGA-TGAAAAAT--TGA--CAC-ATT-ACC---TCCA-GC-AA-T--TTAA--AAAAC-TGT-ATCGTCTCAATT-T--T-A-C--A-A--AA--AACTAAA-AA------GAA-T-A------TG-AAGTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATT-AC-AGA-AA--TT--CTTAAAAAAA-AAT--CCT--AA--CCT-ATTTT-TT-ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTCGTA--T--ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------T-CG--C-AATTTTG------ACGGTCAAGTTG----G-CCA--A-A-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCCCCG--A-TATA--T-------C------TTTA-AAA-A---TACCTAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CA-AAATA-AGATG-GTTT-G--ACAA----TGA-TA---ACG-------------ATATTTCA-TT-GG--GTTTTTG-AAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TT---AGTGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCTG-AT-C--AT-T------G---AAG-A--AAA-TAGCGTC--A-AAT----T-T-CAGG-T-CTTT-C--A-A---A-AA-TAA-C---AACAAA-TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAAA--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA-AA---A----AAA-----------AG--GAAAGA--------A-ATATAAA---GTA----T-CGT--CCTG--TTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-CT-AA-CC------TA------TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-GT----CTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CC-CCA--CCCCC-AC-C-C------------------------CCAA-G---------C-GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTTGGCTCTA-TT-TA-A-CA-T-GCCATT--AA--A-------ACTTT-A-AGT-T-TTA-T-ACA-AGAA-A-TCTT--CTTAAAT-----------TTAAAAAA----A-AATATA-TG-------------------------A-----------TTTATC-CATTAA-AT-A-ATACCA-CA-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAA--TG-T-A---TA--A---A-TTTAGTGCTA-C--T--CCA--TGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA-------------TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTGC--CCATGAG-------A-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--GCGC-GG-GA--ATT---------CAAA--G-G---CTTC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAGAAAGA-GGAACAAA-AG-C-A-GACT-AGC---GTAA----ACTG--TCGCA---AG-T-GATATTTT---TTTTCTTAAAT-GTTT-GAT-ACCCC---CA--C-CCCACCC-CCA------C--CCTT-TTC-C-TTCGAA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---A-A-TA-CA--TTTT-AAC---T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-A-C-TA--T--T-TA--TA--TAA-ATATA-C-A-TCCAAAAACATAATAA----T-A-A----TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA------AAC--A-A-AA----AAA---CAAA-TT-------AAAAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-TGT-GT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGC--A--CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agcgAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-AGA-AA---T--T---AAAAA----------------------TTT-T--GCAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCAC--CCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-AACTATAAAT-AATAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG--TTTCAAGAAAAT--TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC-GAA---CTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TT-C--CA--TC-ATGC-A--AAAAAAAATAAGCC-TGT-A--T-A-CT---GATA-TATT--CCT------TTAAAAAA-ATT-AGATGA-TAATTTT-TTTTAT-A---ACA-CACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--AAT-CA--TTT---GTTTTTT--AAAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTC-AG--TGA-CCT-AG-GA-T--ATTTT----TTGG-CA-A--G-AT-AT-TTGGAAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------ATCTC--T-AAGAT-A-TTGGAAAT--TGA--CAC-ATTTACC---TCCA-GT-AA-T--T-AACAAAAAA-TGTTATCGT-TCA-TT-T--T-A-A--AAACAAA--AAATAAC-G-------GAA-TTA------TG-TAGTATATC----CC--TACTTT-CATTTAC-AGA-AAATTT--T---AAAAAA-ATT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCATATTC-TA--TTTACC-CCTAAACCTCCCCC---------CCCCCA------TGCG--T-AAATT-G------ACG-CAA-GTTGTATGG-C-A--A-T-TT-AGT--TGT-TGT--A-A-CCCC-G--A-TATAA-T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAC--AGATG-A-T-AA--------AA--TGTATACGACTTA--CG-AA-TATAGATGAGT---A--A-AA----GGA--------A------------CATATATCAGTT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TTTAAGGTGACCTAGA-TGGATA-TC---A-G--GGGCTG-AC-AATTT-T------G---AAG-ACAGAA-TAG-GTT--A-AATAT--T-T-C-G--T-CTTTGC--G-A---A-AAATAA-C---AA--AA-TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AAA--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAAAA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------G-ATAT-AAAAAGTA---AT-CAT--CCTG--CTTTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGTT-TA-CCGTCAGGTA--T-TATTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TC----CTAC-T---A-C-C------------------------------CC-CC---ACTCC-GC-TAA------------------------GTTG-A---------C-G-T-CA--TTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACAT---AA--A-A---T-CCTTT-A-GTT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-CAT-----------TT--AAAA----A-AATATATTG---A-AT---AG-ATAA-A--A-ATA-----------TTTATC-A----A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AAT-TG-TAA--TTA--ATT-ATTT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC--AA-GGCAA-AGGT-T-AAACGC----------CT-TG-TC-C--AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTAA--CCATG-G-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--AGGG-GG-AA--TTTTTTTCCCCCCAAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGG-T--GG-GA---AA-T-----------------G-GG-GC-AA-AG-C-A-T--A-AG----GT-A----ACT---TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TTAAATGGTTG-GA--ACCCC---C---C-CCC--------------------T-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--TGC-A-TTACTT--T-AC-A-T-ATCA---GAA-TA-CA--TTTTAAA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-TAATCTTT-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACC-A-TA-AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAAC----AATAAA-A-AA--ACAAA---CAAA-T---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-T------A-T-T-GA-ATA-AAT--AA-AAATAAATGCAAA-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATTTTAAATTA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C-AAA---CTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--TC-ATGC-A--GAAAAA--TAAGCC-TGT-A--T-A-CTC--GATA-TATT--CTT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCATTTT-TTT----A---AAA-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTC-AG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAA-G-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTCA-T-AGAAT-A-TGAAAAAT--TGAA-CAC--TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-T--T-T-A--CCA--AA--AACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-ATC-AT-CC--TGCTTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C----AA--CCT-ATTCT-T--AAAG-A--GT---AA-TTGCA-ATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----G-C-A--A-T-TT-GGT--TG-ATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTTA-AAA-A---TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACT-ACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-C-GTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAA-TAG-GTG--A-AAT----T-T-C-GG-T-TCTT-C--G-A---A-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--A---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT-AA-CC------TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CC-CC---CCCCT-AC-CAC------------------------ACCA-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTT-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----C-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-TT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-CG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GTCAG-AAGT-C-AAACCAC---------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGA--TCATGAG-------C-C----ACAG-TG-A-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-GG-C-A-G--T-AG----GT-A----GCTG--TCGC----AG-T-G-TATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTC-GA--ACCCCACTC---C-CCC-CCC-CCTCTCTCTC--TCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-GA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATAGA-T-A-TG-AAAA----AAAAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAAC----AAT----A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTGG-AATATAAAATT--TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TC---GAAAA--TTCCAAAAAAAT--TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--C-AAAAAACTCT--C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGCCAT-GAAAAA--TAAACC-TATTA--T-A-CCC---ATA-TATC--CTT------TACCAACATATT-AAATGA-TAAGTTTGTTT---------CA-TAAG--AATAAAGATG-TTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CACCTT----GTCTTTTTAAA----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGT-CTCCAG--TGA-CATCAT-GA-T--ATTTT----AGGGCGC-T--T-GTCAT-TTG-AA------TAGCGT--AAA-CT--TGCGGCGGT--------CGTTT--T-AGAAT-AATTAAAAAT--TGAC-CAC--TT-ACC---TC-A-GT-AA-T--T-AA--AAAAAACGC-ATCGT-TTAATT-T--TTG-A--CCAC-AA--AGCTAAA-C-------GAA-T-A------TG-GAGTT-ATCCAT-CCA-TGCTTTTCATGTAC-AGA-AA--T-------AAAAAA-AAC--A-T--AA--CTT-ATTTT-TTCACAG-A--GTCAGAA-TTGCACATTC-TACTTT-TCC-C-TA---------C---------CCCC-A------TGCACAT-AATTT-GCACGCGACG-TCATGTTG----G-C-A--AAT-TT-GGTC-TGTA-GT--A-A-CCCC-G--A-T-TA--T-----T-C------CTGA-AAA-AAAATAT-TTAATGTA-T-TA--------GA--TTTTTAC---TTA--C--AA-TA-AACTG-TCTT-G--A-AA----GGA-T-T--ACA------------TA-ATATCG-TT-GG--TTGTTTGTAAAA--GTCG-A---AACAAATG-AA----A-CCGTT-TC---AGTTATCTT-A-T--ATA-TTCTTT-T--GGGCTG--C-A--TT--------G---AAG-A--AAAACAT-GTC--A-AAT----T-C-C-AA-TATTTT-C--G-ACCAA-A--TAA-C---AA--AAGTT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----TTAA-GAA--ACA-TA-TATTG-TT--AA--TTTTGA---AA---A----AAA-----------AAGTTAAAGG--------A-ATAT-AAAA-GAA---CT-CAT--CCTG--CTTTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA-TC------CA--T-G-TTTAGCAG---TA---A--T--C-G-CA-TC----TTAC-T---A-C-CC-------------TA-CC-----------CCCCC---CCCCC-TT-TAT-------------------------CAG-GAAAGTGA--C-G-T-CA-ATGG-----CCA---CATTGGCTCTA-TGCTA-ACCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AG--T-TTA-CAATA-TGAA-ATTTTA--CTT-ATC-----------CT--AGAG----A-ATCAAA-TG---ATAT---AG-ATAATA--A-ATAC----------TCTATC-AACT-GCATCA-ATA-C--TA-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAAT-TGTT-A--TTA--A---C-AT------TA-C-----CCA-CTAAA---AC-AAA--GCAA-AAGT-TAAAACCAC---------CC-TA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTGA--CCAT--G-------C-C----GCAG--G-C-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--AGCG-GG-AACTATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAGC-T-G-T--GC-AAATCAA-T-A-A-A---A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cccAAAT-GTTT-GA--CCCCC---C---C-CCC-CCT-CGA------C--CCGG-TTC-T-TCA-AA-AG--A--------AA-------AACAT-T-A-T-ATTT--CAAC-ACT-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AAAATAT--A-ATATT-AA-------AT---A--TC-T------T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TAATCAA-GTAAA-A-A-T--AATA----AA--A----T-A-A----TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAAC----AAT--ACA-AA--AC------CAAA-CA-------AAATAA-A-------------------C--AA---AAA-AA-AAA-T-TTCAAAAAAAAAAAAAA--AA-ACA---CACA--AA-A------ACT-T-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGC--A-CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                          cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CCGT--------CTTTC--T-AGAAT-A-TGAAAAAT--TGAATCAC-ATTGACC---TCCAGGT-AA-T--T--A--GAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--T-A-AACAAA--AA--AACTAAA-G-------GAA-T-A------TA-AAGCA-ATC-ATACC--TGCTTT-CATTTACAAGATAA--TT--T---AAAAAAGAAT--C-T--AA--CCTAATTTT-T--ACAGAA--GT---AATTTGCAC-TTC-TA--TT-ACCGC-TACCCCC----C---------CCCCCC------TGCG--T-AATTT-G------ACG-TCA-GTTG----GCC-A--A-T-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----TCC------TTTA-AAA-A---TAT-T-AATG-A-TAAG--------AAATTTTTTAC---TTAACCG-AA-TA-AGGTG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC------------------ATATATCA-CT-GG---TTTTTTAAAAA--GT-GAA---AAT---TG-AA----A-C-GTT-TT---AGTGACCTC---TG-ATA----TTG-AT-GGGCTG----A--TT-T------G---GAG--------T---GT-------T----T-TAC-GGAT-CTTT-T--G-------A--TAA-C----A--AA-TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----T----AAA--AAAATG-TA-TG-TT-CAA--TTTTGG---AAAG-A----AAA-----------AG--AGTAGG--------A-ATTA-AA---GTA---GT-CATTCCCTG--CTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-CT--A-CC------TATTT-T-TTTA-CAGA-GTAT--A--TTGC-G-CA-TTCGTCCTAC-T---A-C-CGGCTAGCCGCGCTACA-CC-----------CC-CCG--CCCCCGCC-CAC------------------------GCTA-T---------C-G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTTGGCTCTA-TG-T--A-CA-T-GACATT--AA--A-C---TCCCTTT-ATAGT-T-T-------A-TTTT-A-TCTGGTCTT-GATGGTCCTTCGTGTT--ACAACATGA-AATCTACTT---A-ATTAAAA-ATGATATGA-ATAGATAATAAATATTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-AT-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAAT-TG-T-A--TCAAGA---A-TT------TA-C--TTACCACCTAAT---AC-AAA-GGC-A-ACGT-T-AAA--A----------GC-CG-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------CGC----ACAG-TG-G-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--AGGG-TG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-T--CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-G---AAAG-AAGA-GG-GCAAA-AG-C-A-G--T-AG----TT-A----ACTG--TCGC----AG-TGGATATTTT---TTTT-TTTATT-GTTTGGA--ACCCC---C---A-CCC-CAC-C--------C-----T-TTC-C-TTC-AA-AGATA--------AA-------AA--T-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-T--CA--TTTTAAA----T--G-A-AT--TA-------AT---AAATA-T--AT--T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--T-A-ATATA-C----------------TAA----T-A-A----T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--TCAAA---CAAA-TA-------AAAAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC------------AAT-AA-ACA---CAC----A-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTAC---TTAA-TG-AA-TA-AGATG-GTT--G--A-AA----A-A-TAT--ACA------------T-TATATCA-TG-GG--TTTTTTTTACGA--GT-G-A---AAT---TA-AA----AAC-GTT-TC---AGTGATCTC-AATA-ATA-TT-TTT-G--GGGCTC-AT-A--TT-GAAAGAAG---AAG-A--AAA-TAGCGTA--A-AAT----T---C-G-----CTT-C--G-A---ATA--TAA-C---AA--AA-GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AAA--AAAATG-TATTG--T-CAA--TTTGAA---AA---A----AAA-----------AG--TAAAAGTA------A-ATA--AA---GTA---GT-CAT---CTGCTCTTTCA-TTA--CA--G-AACTGTC--AATA--AA-A-TGCT-AA-CT------TA--T-T-GTTA-CAGA-GTA---A--TTAT-G-CA--T----CTACTT---A-C-C--------------CC-CC-----------CC-CC---CCCCC-CC-CCA------------------------GCCGCGAAAGTTGACC-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TATA-CA-T--ACATT--AA--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACATTGAA----CTA--CTT-GAT-----------TTCGAAAA----A-AATATA-TGGATA-AT---AGAATAA-A--G-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-A-A-CA-TA-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------T-TG-T-ATTTTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA--GC-A-AAGTAT-AAACCA----------CC-TC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GT-G--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA----GG-GG-AA--ATT---------CAAAAGG-A---C-TC-CCAG--T-G-T--GGAAA---AA-T-A-A-T---AAAA-AGGA-GA-GC--A-AG-C-A-G--G-AA----AT-A----ACGGATTC-C----AG-T-GA---TTT---TTTA-TTAAAT-A--T-GA--A-------A---C-CAC-CAC-C--------C--TCTT-TTC-C-TAA-AA-AA--ACAAGAAATAA-------AA--T-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----TTGA-ATAA--AA-------ATA--AAATT-T--ATGTT-T-ATC-TA-TT--TACAT-TA--T-A-GT------------AAA----AAT------T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA-----AAT--A-A-AA--ACAAA---C-TA-TA-------AAAAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T--------------AA--AA-A------ACA--AA-ACACCACA-T----A-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GT--A-CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-TT-TTG-A--GGGCTG-AT-A--TT--------G---AAG-A--ACA-TAG--TC--G-AAT----TCT-C-GG-T-CTTT-C--A-A---A-AA-TAAAC---AA--AG-TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG---GGGGGA----AAA-----------AG--TTAAGG--------ATATAA-AA---GTA---GTTCAT--CC-G--CTT-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-CT-AA-CCA-----TA--T-T-TTTA-CAGA-GTA---A--TTGCCG-CA-TC----ACAC-------C-C--------------TAACC-----------CC-CC---CCCCC-CC-CA-------------------------GCCG-A---------TAG-T-C----TG-----------ATTTGGCTCTAATG-TA-A-CA-TTGACATT--AA--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T-TTAAC-AC--TGAGTA----A--CTT-A-------------TT--AAAA----ATAATA-A-TG---A-A----GG-ATAATA--ACATA-----------TTTATCCAATT-A-AT-ATATC-AA-TAATTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA----C-AA--GGCAA-AAGT-T-TAA--A----------CC-TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TGAG-A--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGAGGG-GC-AA-AG-C---G--T-AG----TA-A----ACT---TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TAAAAT-GTTT-GA--CCCCCA--C---C-CCC-CCC-CA-------C--CCTT-TTC-C-TC---A-AG--A--------AA-------AA--T-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TTTT-AAG---T--A-ATAT--AA-------AA---AAATC-T--A---T-A-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-ATA----TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAACCCATAAT--A-A-AACCACAAC---CCA---A-------AAAAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC-----------------G-AC----CACA--AA-A------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGC--C-GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11    11                             111                                   1111   111                                                                   11111111                                          11                                      111111                              22222222222              1                         111111  111111             1111       11  2222222222                  11111   1     11                      11111                                                       11111111     1111     1             111                             11111                              11111                1111111       111111                                          1111111111          1111111                                                           3333333333333333333                         111111                                               1   11                                                          11111111                                        11    1111      44444444444444444444             111                                                                                             11111111                            1111                 111111    11                                     1111111        111111111                                111  111        11111111111          11111111     111  111                                  1111             11               111111                                    1111111    1111111   11111111111111     11111111111                    44444444444444444444444444444444444444444444             22222222222                                                                                         11111111111  11                   1111111111                22222222222                                                                             1111111111111                                11111                                                   22222222222222                                                                 1111111                                                                     111111111       11111                              111111111                                 1111    1111          1111                                                          33333333333333                      22222222  1111111                                                    1111         3333333333333333                                               11111111           11111111        111111                                                       11111111        11111111111111111                          222222222222                                                                        111111           1111               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       44 22    11     77       1           3  777            6  1      3 3       3  0000   222            44        3        44    3          44 999        3 55 11111111   666 44 3   3    55  55  3   3  88      00      3  3  55 3 3   55    3    55 3  444444        7   3      3          44444444444 3  1 88      0        3 3      3 3 3 3 444444  000000 55 3 3  55  5555       22  0000000000   55   4   4 55  44444   2     33   4   4  8  4 55     00000   4  4 99 4  4  4   4       3   7   3   3  8888888    66666666     2222     0         55  888   3   7   666    3  3  3 55 22222     3   3     3      3 55  3 77777  55 3        3 5555555   3 3 000000  3     3  3   6  77   3   3       3   3  3333333333      6   0000000  44   3     2 66    2 33  555  2          2  77  3   2 2  0000000000000000000      888888  33   2     111111    2   5    6666 2 8 33  2  2   66       33 2 4   22 33 2    66 77777 2 888888   555 2   2 66   2      2 2 2  00000000  77       444   66  2  2  2     2    2 55 2  1111   2  55555555555555555555       2  2  222      1    33  7777777   555  3  6666 6    3  555         3 3  2   44 2  99999      2  2 66  00000000 555   7777      5  777 3   0000 555 3 55 3    6 555555  3 44   3 555  44  3  3    3 3 6    3 44  0000000 3  3   555555555   44      3     3  7   55      555  111 7777   77777777777  55      88888888 3   222  000   666  3   55    55      2   88  2222  0    55    00  3 7 7 3   3  777777  44 3 3       3 3   999 44    3 3  4444444    5555555 3 99999999999999  2  33333333333    2 33    2 6666  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 33 3    77777777777           3  3  3 6  3 3      44  44 3 555 6     6 3   3 3   3 3   3    3 3    88   3   77777777777  00    7777 3      7  1111111111  3    6 55 3   00000000000      3  5 3 3  7 3   3  3  6 4   77  77     3  3   44   3  3 3  888    3 3  6666666666666   33   88888    3  3 3 44   44 00000  999999  3 44 44   3     555  3  44     3    3 3  33333333333333  3  3  3  3   555   3 5555         3  44 999999   3    44       0000000 3 7777    3  3 3 44 555  6  3 44  3  3 3  9999  3  77    3  3  77   555555555    44 00000 3  3    77 3 3 44  3  555  3 555555555    6    3  3  6  3  3 99999999  0000  3 2222   555    0000  3 6   88   555    333    3    3  77     888888888   3   11111111111111   3   3 3  66  3  77 00000000  6666666  44 3 6 6      44    777 3    77777 3  3  44    6  5555 44 3    0000000000000000     2 33 777 2 2   5  77 33 5   2  33 1 2  1  77777777    6666   00000000 2 6666 333333     5  2     99 2      6666   7777 2  33     555    2 22222222      2 44444444444444444 5 33   66   5      5 2 2 222222222222  66  2   777    33  9999999999 444  3   3   3   3          44 77       888888 3 44   44 0000  3 3   88     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .. ..    ..     ..       .           .  ...            .  .      . .       .  ....   ...            ..        .        ..    .          .. ...        . .. ........   ... .. .   .    ..  ..  .   .  ..      ..      .  .  .. . .   ..    .    .. .  ......        .   .      .          ........... .  . ..      .        . .      . . . . ......  ...... .. . .  ..  ....       ..  ..........   ..   .   . ..  .....   .     ..   .   .  .  . ..     .....   .  . .. .  .  .   .       .   .   .   .  .......    ........     ....     .         ..  ...   .   .   ...    .  .  . .. .....     .   .     .      . ..  . .....  .. .        . .......   . . ......  .     .  .   .  ..   .   .       .   .  ..........      .   .......  ..   .     . ..    . ..  ...  .          .  ..  .   . .  ...................      ......  ..   .     ......    .   .    .... . . ..  .  .   ..       .. . .   .. .. .    .. ..... . ......   ... .   . ..   .      . . .  ........  ..       ...   ..  .  .  .     .    . .. .  ....   .  ....................       .  .  ...      .    ..  .......   ...  .  .... .    .  ...         . .  .   .. .  .....      .  . ..  ........ ...   ....      .  ... .   .... ... . .. .    . ......  . ..   . ...  ..  .  .    . . .    . ..  ....... .  .   .........   ..      .     .  .   ..      ...  ... ....   ...........  ..      ........ .   ...  ...   ...  .   ..    ..      .   ..  ....  .    ..    ..  . . . .   .  ......  .. . .       . .   ... ..    . .  .......    ....... . ..............  .  ...........    . ..    . ....  ............................................ . . .. .    ...........           .  .  . .  . .      ..  .. . ... .     . .   . .   . .   .    . .    ..   .   ...........  ..    .... .      .  ..........  .    . .. .   ...........      .  . . .  . .   .  .  . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .  . . ..   .. .....  ......  . .. ..   .     ...  .  ..     .    . .  ..............  .  .  .  .   ...   . ....         .  .. ......   .    ..       ....... . ....    .  . . .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ..    .  .  ..   .........    .. ..... .  .    .. . . ..  .  ...  . .........    .    .  .  .  .  . ........  ....  . ....   ...    ....  . .   ..   ...    ...    .    .  ..     .........   .   ..............   .   . .  ..  .  .. ........  .......  .. . . .      ..    ... .    ..... .  .  ..    .  .... .. .    ................     . .. ... . .   .  .. .. .   .  .. . .  .  ........    ....   ........ . .... ......     .  .     .. .      ....   .... .  ..     ...    . ........      . ................. . ..   ..   .      . . . ............  ..  .   ...    ..  .......... ...  .   .   .   .          .. ..       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       66 55    22     99       8           3  888            7  8      1 1       3  8888   555            66        3        66    3          66 222        6 00 99999999   444 99 6   6    00  00  6   6  66      00      6  6  00 6 6   00    6    00 6  111111        3   6      6          55555555555 6  0 66      9        6 6      6 6 6 6 111111  555555 00 6 6  00  0000       33  9999999999   00   0   0 55  00000   0     55   0   0  0  0 55     11111   0  0 55 0  0  0   0       6   3   6   6  2222222    88888888     2222     9         00  000   6   3   444    6  6  6 00 99999     6   6     6      6 00  6 00000  00 6        6 5555555   6 6 555555  6     6  3   7  99   3   3       3   3  1111111111      7   4444444  66   3     9 88    9 99  000  9          9  33  1   9 9  7777777777777777777      222222  99   9     111111    9   7    1111 9 6 99  9  9   88       77 9 3   55 99 9    88 11111 9 222222   000 9   9 88   9      9 9 9  44444444  99       777   33  9  9  9     9    9 44 9  8888   9  22222222222222222222       9  9  777      6    99  4444444   000  1  5555 2    1  444         1 1  9   22 9  66666      9  9 88  88888888 000   6666      7  000 1   8888 888 1 22 1    2 888888  1 66   1 444  22  3  3    3 3 7    3 66  8888888 3  3   222222222   66      6     6  3   00      000  444 7777   33333333333  00      22222222 6   555  000   444  6   00    00      1   66  8888  3    00    00  6 3 3 6   6  777777  66 3 3       3 3   222 66    3 3  5555555    3333333 3 66666666666666  9  66666666666    9 99    9 1111  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 88 3    55555555555           3  3  3 7  3 3      66  66 3 888 7     7 3   3 3   3 3   3    6 6    66   6   33333333333  00    7777 6      3  2222222222  6    5 00 6   99999999999      6  6 6 6  3 6   6  3  7 2   99  99     3  3   66   3  3 1  222    1 1  9999999999999   66   55555    1  1 1 22   22 00000  666666  3 66 66   3     888  3  77     3    3 3  88888888888888  3  3  3  3   888   3 5555         3  66 666666   3    66       8888888 3 1111    3  3 1 22 444  2  1 22  1  1 1  6666  1  33    1  1  33   444444444    22 55555 1  1    33 1 1 22  1  444  1 777777777    7    3  3  7  3  3 66666666  4444  3 9999   000    4444  3 7   44   888    888    1    1  33     999999999   1   33333333333333   1   1 1  55  1  33 00000000  5555555  22 1 2 2      22    111 1    44444 1  1  22    2  8888 22 1    3333333333333333     9 99 999 9 9   7  99 99 7   9  99 9 9  5  66666666    1111   88888888 9 1111 000000     7  9     66 9      1111   0000 9  99     000    9 66666666      9 99999999999999999 7 99   88   7      7 9 5 555555555555  88  9   999    99  8888888888 666  1   1   1   1          66 99       555555 3 66   66 4444  3 3   66     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTTT----A---C-A-CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( family-1826 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTTN----A---C-A-CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTTCAAAGAATT--TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATTC-ATG-TA--GAAAAAAATAAGCCGTG-TA----A-CTCAAGATA-TATT--C-TTTTATATAGTAAGAA-ATT-AA-TGA-TAATTTTTTTCTTT-A---C-A-CAGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCTA------T--A-T-CA--TTTGTAGTTCATT--AATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTCAGGGTGAACCT-ATTGA-TGGATTCTTAATGGGA-ACCT--G-AT-ATCTTG-AAAAAAG-TAGTGTC-AGG-ATGAT----TGGTGCCTGTAACTTTC----AGAATTATGAAAAAGAATGAC-CACTAAT-ACTCTATCCA-GTCAG-TCCT-AAGCAAAAT-TGT--TCGT-CAAATT-T--TATA--AC-AA--ATAAACTAAA-GCCGCAAGGAA-T-AACAGGGCG-AAGT---C-CAT-CCGTTGC-GTT-CACT-AC-AGA-AA--TTGGT---AAAAAGGAATGGC-T--AAAACCT-ATCTTCT--ACAG-AAAGT---AT-TTG---ATTC-TAG-TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCCCCCCCCTG--CGT-AATTT------GA-G-TCA--TTG----G-C-ATTATGTT-GGT---GTATGT--A-A-CCT--GCAG-TATGATT-----T-C------TTT---A-AAA-AA-TAT-AAAATG-A---AGTACCCAATAA--TAATTAC---TTA--CG-AA-TA-AGGTG-GTTTAG--A-AAAAGAGGAGTAA--CCAGGGTAG------TGCAT-TCA-CT-GG--TTTTTTAGGAAACGGT-A-ACTAAAT---TG-GATATAA-CGTTATC---ACTGACCTC-A-TG---A-TT-TTG-T--AGGCTG-AT-A--TT------------GAG-A--AAATAG-GTA--ACAGTGTCCT-T-C-GT-T-CTTTGCAAG---AA-A--TAA-CAAGAA--AG-TT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AAATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG---AA---A----AGAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAA-AAAT--AA---GTATGTGT-CAT--CCTC--TTTTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAACCC------TA--TGT-TTTACAG-ACGTAATGA--TTGC-G-CAGTT----CTAC-TTACA-C-C--------------TA-CCGGACACTAACACCCC-CGTCCCC-C----TC-C------------------------C---CCA-G---------C-G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTTGGCTCTA-TG-TA-AGCAGT-GACATT--AAGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATATTA-C-ACA-TGAA-A-TTTA--CTT-AA------------TT--ACAA----A-AATATA-TG---A-AC---GG-ATAA-A--A-GTT-----------GTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-TAGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-AT-TG-T-A--TCA--A---A-TT------TA-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AAT-GGTAA-AGCG-T-AAG--A----------CC-TG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTGG--CCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--T--G-A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATAGGG-TA-AG--ATC---------CAAA--GCG---C-TC-CCCGATT-G-T--AG-AG---GA-T-A-G-AGGCAAAG-AAGA-GG-GC-AATAGTC-G-G--G-AGTTATGT-AGTT-ACTG--TC-C----AG-TGGATATTTTGAATTTT-T--GAT-GTTT-GA--ACCCA---C---C-ACC-CCC-A--------C--CCTT-TTCTC-TTC-AA-GG--A--------AACACC---AA--T-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---G-A-TA-CATGTTTC-AA----T--ATATAT--AA-------ATCA-AAATA-TGGA---T-T-ATCATA-TT--T-TAT-TA---AA-ATATA-CGA-T--AAAA----AAT------T-A-A----T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAA----ACT--A-ATAA--ACAGA---CAAACTAAAAGAGTAAAAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG-----------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------ATT-T-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGC--A--CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATA-TT-TTG-A--GGG-TG-ATGA--TTAT------G---AAG-A--ACATAG-GTCTCA-AAT----T---C-GG-T-CTTT-C--A---AA-AATTAA-C---AA--AG-TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG---GA---A----AAA-----------AG--TAAAGA--------A-ATAT--AAA--GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TT-C-G-CA-T-----CTA------A-C-C--------------TA-AC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG---------------T-AA-GT-------------GATTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TATA--CTT-AAT-----------TA--AAAA----A-TATATA-TG---A-A----AG-ATAATA--A-ATA-----------ATTAT--AATT-A-ATAA-ATA-CATTA-T-ATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AA---A----------CC-TG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TT-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGG-AG-GC-AA-AA-CGA-G--TAAG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA--TT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---CACCC-CCCAC--------CCACCTT-TTC-CTTTC-AA-AG--A--------AA-------AA--A-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----T------AAT-A-AG-T-GAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG---A-CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA--A-AAATTAATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CC--AAACTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TAAAT-AGCCC--G-TA-TATT--C-TT------AAAAAAAT-AT----ATGA-TAATTTTTTTT----A---AGA-CACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------TA------T--A-TGCA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTCAAA-TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GTGG-GC-TT-G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAAATT--T----CGGT--------CTTTC--T-GGAAT-ATGAAAAAT----GA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AAAT--T-AA--AAAAAATGT-ATTGT-TCAATT-T--TA-AC-A--AA--G-AAACTAAC-G-------AAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CT--TGC-TTT-TATTTAC-AGA-AA--TT--A---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATATT-T--A-AG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TA-ACC-C-TA-------------------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----G-C-A--GT-TTGGGT--TGTATGT--ATC-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-ATT-AG--------AA--TATTTAC---TTA--CGAAA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----AGA-TAC--A---------------ATATATCA-TTGGG--GGGTTTTTGAAA--GT-T-A---AAT---TT-AA----A-CG-T-TC---AGTGACCTC-A-TA-ATA--T-TTG-G--GGGCCGAAT-A--TT-T------G---AAGAA--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-A-GG-T-CATT-C-------A-A--TAA-----AA--AA-TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AAA--AAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATT-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC---G--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC--G--A--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCATTTTTTTA----A---A-A-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TG-A-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T--A--ACAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTCT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TACATACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-tgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTCG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCAAAGAAAT--TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TTT-----AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTTTTACAA---C-AGCAGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTT----AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-A--GA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TAAGAAT-ATG-AAAAT--TG-A-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-TA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--C--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-G-A------TGAAAGTA-AT-CAT-CC--TGC--TT-CATTTAC-AGA-AA--TT--TA--AAAAAA-AAT--C-TA-AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATAA-AA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGC-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--CTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC--ATAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TT-G----TTTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAGTAGTCA-ACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTGG-AATATTAAATTAATAAT-----AATACCA-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCCAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA---AAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CT---AATACTAT---C-TT------AAAAA-----TT-AAATGA-TATTTTTTTTT----A---C-A-CAGG--A-TAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----TA------T--A-T-CA--T-----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--T-A-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGCG-G----------AG-TTG-AAGAAAG-TAG--TC-AAA-TT-------CGGT--------CTTTCATT-AAAAT---GAAAAA----------C-ATT-TAC---TCCA-GT-AA-A--A-AT--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TAACA-A--A--AT--A-GAACTAAA-G-------GAATT-A------TG-AATTA-AT-CAT-CC--TG--TTT-C--TTAC-AGA-CA---T--T---AAACAA-AA---C-TAAAA--CCT-ATTTT-A--GCAG-A--GT---AA-TTGACCACTC-TA--TT-ACC-C-TA--------------------CCCTA------GG--CGCAAATAT------GACG-TCA-GT------G-C-A--AT-TT-GGTTATGTAT-T--A-C-CCC--G--ATTATA--T-----C-T------TTA---A-AAA-A--TA--TAAATG-A-T-AG--------AA---TTCTAC---TTA--CG-AA-TA-AGAT--GTTT-GAAA-AA----GGA-T-------------------CATATATCA-TT--G--TTTTTTTTAAAA--AT-A-A---AAT---TGAAA----A-TGTT------AATGACCTC-A-TC-ATA-TT-TT--G--AGGCT--AT-AT-TT-T------G---AGG-A--AAATAG-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAAT-TG-T-A--TTA--ATAAA-TT------TAAC--T--CCA-CTAAA---ACTAAATGGCAAGAAGT-T-AC-CCA----------CCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TG-GTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GGGAA--ATT---------CAAA--A-GA--C-TCTCCAG--T-G-T--GG-AA---AA-T-A-ATA---AAAGCGAGA-GG-AC-AA-GG-C------C-AG----GC-AGCATACTG--TCGC----AG-T-GAT---TT---TTTT-TTAA-T-GTTT-GATAACCAC---C---A-CCC-CTC---------------TTATTC-C-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATAAA--A-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---G-AGTA--A--TTTT-AA----T--A-ATAT--AATAA----ATTAAGAATT-T--A---T-T-ATC-TA-TTAAT-TAT-AG--TAA-AT---------------------T------C-A-A----TG-----ATTAA-A--TAGA---T-A-TAAC----AAT--ATC-AC--ACAA----CTAA-TA-------AAAAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC--AAA---CAAA-T-T---------------A--AA-ACAAATCACATTAC-A------C-T-TTGA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGT--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-TA-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TC------TA-C--T--GCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-ACGT-T-AAACCATCCAGATCATCC-TA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAA-------C-CATGTACAA-TG-G-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGA-GG--A--ATT---------CAAA--G-G---G-CC-CAAG--T-G-T--TG-GA---AA-T-ATG-A---GAAG-GAGA-GG-GC-AT-GG-C-A-G--G-AG----GT-A----TCTG--TCGC----TG-T-GAT-TTTT---TT-------AT-GTTT-G----CCCC---C---T-CCC-CC-------------------TTC-C-TT--AA-AA--A--------AA-------A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATGT--AA-------ATTA-AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-CAT-TA--TGA-AT------A-T--AAAA----AAT----------A----TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAAC----AAT--A-A-AT--ATAAAAGCCAAA-C---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C------------AAACAA-ACA---CACA--AA-A------A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGT--A-A-TCCA-G--A-TATA--T-----T-C------TTA---A-AAA-AGATAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--TTTT-AC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-G-----TTATTTAA----GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-CC---AGTCACCTC-A-TG-ATA-TT-TTT-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAAAAA-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-T-GG-T-CTTT-C--GA--AA-A--TAG-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----T-----TA--AAAATG-CATCG-TT-CAA--TTTTGAC--AA---AAAATAAA-----------AA--TAAAGG--------A-ATATA-AA---GTA---GT-TGC--CCTG--CCTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--TAAC--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---T--ATGC-A-CA--T----CGAC-T---ACC-C--------------TT-CC-----------CAAC-C--CCTA-C----GTAT------------------------G---TTG-A---------C-G-C-GA-GTTGT----GTA-----TTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--ACGGTGG-AAC-ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-TTGAG-GA---AA-T-A-A-G---AAAA-AAGA-GG--C-AA-AG-C-AAG--T-AG----GT--------TC--TCGCGACTAGCT-GATATTTT---TTTT---AAAT-GTTT-GA--ACCTT---CGGGC-CGC-GCC-A--------C--CCTT---C-C-TTC-GATAG--GCGAATG--AA-------AA--T-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCG-A-TAGTA--TTTT-AAA---T--A-A-AT--GATCAAAGAAT---AAACCCT--A---TGT-ATG-TA-TT--TCTATCTA--TCACATATA-C-ACT--AAGA----AATAAGTAATGA-A----TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAAC----AATA-A-A-AA--ACAAA---AACA-T--------AAAAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC------------AA--AACACAG--CGCA--AAGA------A-T-T-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGC--A--CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CC-C-CC---------C---------CCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACA-AAA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATATCTA-A-CCCC-G--A-TATA--T-----T-G------TTC---A-AAATA--TAT-TAAATG-A-T-G----------------TTAC---TTA--CC-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-GG--TTTATTT---AA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA--T-TTG-T--GGACTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATTG-GTC--A-AAT----T-T-C-GA-T--TTN-C--A---GA-A--T-A-C---AA--gcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatttggctgtatattntcccccccccccccccAGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC---AAAAATCTTCAAAAGAAAT---CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C---AAAATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATTATC-TT------AAAAAAAA-ATTTGAATGA-TAATTTTTTTT----A---C-A-CAGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------TA------TTCA-T-CA--TT----GTTTTTTT-AA----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTCAGC-TGA-CCT-AT-GAAT--ATTTT----TGGG-GC-TTTG-A--AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGTC--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TTA--CAC-ATT-ACC----CCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATTAT--TA-A--C--AA--A-AAACTAAAAG-------GAA-T-A------TG-ACGTA--T-CATTCC--TGC-TTTTCATTTAC-AGA-AA--TT------AAAGAA-AATG-C-T--AA--CCT-ATTT-----ACAG-A--GT---AA-T-GCACATTC-TA--TT-A------A---------C---------CTCCC-------TG--CGT-A-TTT------GACG-TCA-GTTG----G-CTA--GT-TT-GG---TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATT--T-----T-T------TTT---T-AAA-A--AAT-TAAATG-A-T-AG--------AATCTTTTTAC---TTA--CG-AA-TC-AGAT--GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ATA------------TAT---CCA-TT-GG----TTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----G-TTTT-TA---AGTGACCTC-A--G-ATA-TT-TTG-GAAGGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG----AAATAG-GTC--A-ATT----T-T-C-GG-T-CTTT-CA-A---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG---------AAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-AT-T--AA---GTA---GT--AT--CCTG--CTTTCATTTA--C----AAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-AGA---AAGTTGC-GTCA-TT----ATAC-------C-C--------------TC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------cctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacaccccccc-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCC------------------------C---CCC-G---------C-G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTTGGCTCTA-TG-TA---CA-T-AACATT--AA--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTAA-CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATACA-TG---A-AT---AG-ATA-TA--A-ATA-----------TT-ATC-A--T-A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-T-A--TTA--A------T------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA--GGCAA-AAGC-T-AAACC--------------TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTTG--TCATGAG-------C-C----ACAGATG-G-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--GGGG-GG-AA--ATTT--------CAAA--G-G---C-TC-C-AG--T-GGT--GG-GA---AAAT-AAG-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TAAAAT-G-TT-GA--ACCCC---C---A-CCC-CCC-A--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AGA-A--------AA-------AA--T-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TT----A----T--A-ATATTGAA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TATTT--T-TAT-TA--AGA-ATATA-C-A-T--AGAA----AATAA----T-A-ATAAGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAGAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AACA------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGC--AGCCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAACcccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|21                         : aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccGTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGC-AA-AATAAATTAATAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC---GAAA---TTCCAACGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-GTG-CA--GAAAAA--TAAGCT-TG-TA--T-A-CCC--GATA-TATT--C-TT-------TTAAAAA-ATT-AAATGA-TAAGAGTTTT-----A---C-T-CACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------TATACATGT--A-C-CA--TT----G-TTTTT--AA----------GTG--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --T-T-GTTATAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-T-----CTAC-T---A-CTC--------------TA-CC-----------CCTC-C--CACC-A----CCACCACCACCCCCATCAGCGTAATTAAG---TTG-A---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-AAA-AGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AGAA----A-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAAT-TG-T-A--TTA--A---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA--------AAAA----AA-AA------A-A----TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAGC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CTAA-TA-------AAAAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T----------------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C------ATT-T-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCC--A------TG--CAT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----A-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--TATGGGT-CATATATTCT---AGAAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--TTTTTAC---TTA--C
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTGG-AGT-ATGAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTT-T--ACAA-A--GT---AA-TTGCAAATTT-TA--TT-ACC-C-TA---------CACCCCCCCCCCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATAT--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTAG-CACACACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTGGGAATA-TGAATTAATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTC-AAAGAAATAGT-AACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATG-CACAGAAAAA--ATAGCC-TG-TA--TTA-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAATAAA-ATT-AAATGAATAATTTTTTTTT---A---C-A-CAGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------TA------T--A-T-CA--TTT---GTTTTTTT-AA----------GTG--AAA-TTG-A--AAA----CGT-T-CAG---GA-CCT-ATTGA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--GGAT-AT-TTG-AAGAAAGATAG-GTCCAAA-TT--T----CGATT-------CTTTC----AGGATGATGAAAAAT--TGA--CAC-ATT-ACC---TCCA-GC-AA-T--TTAA--AAAAC-TGT-ATCGTCTCAATT-T--TA-C--A--AA--A-AA-CTAAA-AA------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATT-AC-AGA-AA--TT--CTTAAAAAAA-AAT--CCT--AA--CCT-ATTTT-TT-ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTCGTA--T--ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------T---CGC-AATTTT-----GACGGTCAAGTTG----G-CCA--AA-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCCCCG--A-TATA--T-------C------TTT---A-AAA-A--TACCTAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CA-AAATA-AGATG-GTTT-G--ACAA----TGA-TA---ACG-------------ATATTTCA-TT-GG--GTTTTTG-AAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCTG-AT-C--AT-T------G---AAG-A--AAATAGCGTC--A-AAT----T-T-CAGG-T-CTTT-C--A---AA-AA-TAA-C---AACAAA-TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAAA--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA-AA---A----AAA-----------AG--GAAAGA--------A-ATATA-AA---GTA----T-CGT--CCTG--TTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-C-TAA-CC------TA------TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-GT----CTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-A--CCCC-C----ACCC------------------------C---CAA-G---------C-GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTTGGCTCTA-TT-TA-A-CA-T-GCCATT--AA--A-------ACTTT-A-AGT-T-TTA-T-ACA-AGAA-A-TCTT--CTTAAAT-----------TTAAAAAA----A-AATATA-TG-------------------------A-----------TTTATC-CATTAA-AT-A-ATACCA-CA-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAA--TG-T-A---TA--A---A-TTTAGTGCTA-C--T--CCA--TGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA-------------TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTGC--CCATGAG-------A-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--GCGC-GG-GA--ATT---------CAAA--G-G---CTTC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAGAAAGA-GGAACAAA-AG-C-A-GACT-AGC---GTAA----ACTG--TCGCA---AG-T-GATATTTT---TTTTCTTAAAT-GTTT-GAT-ACCCC---CA--C-CCCACCC-CCA------C--CCTT-TTC-C-TTCGAA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---A-A-TA-CA--TTTT-AAC---T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-A-C-TA--T--T-TA--TA--TAA-ATATA-C-A-TCCAAAAACATAATAA----T-A-A----TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA------AAC--A-A-AA----AAA---CAAA-TT-------AAAAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-TGT-GT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGC--A--CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agcgAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA---T--T---AAAAA----------------------TTT-T--GCAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCAC--CCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-AACTATAAAT-AATAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG--TTTCAAGAAAAT--TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC---GAACTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA--AAAAAAAATAAGCC-TG-TA--T-A-CT---GATA-TATT--C-CT------TTAAAAAA-ATT-AGATGA-TAATTTTTTTT----ATAAC-A-CACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--AAT-CA--TTT---GTTTTTT--AAAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTCAG--TGA-CCT-AG-GA-T--ATTTT----TTGG-CA-A--G-AT-AT-TTGGAAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------ATCTC--T-AAGAT-ATTGGAAAT--TGA--CAC-ATTTACC---TCCA-GT-AA-T--T-AACAAAAAA-TGTTATCGT-TCA-TT-T--TA-A--A--AACAA-AAAATAAC-G-------GAA-TTA------TG-TAGTATAT-C---CC--TAC-TTT-CATTTAC-AGA-AAATTT--T---AAAAAA-ATT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCATATTC-TA--TTTACC-CCTAAACCTCCCCC---------CCCCCA------TG--CGT-AAATT------GACG-CAA-GTTGTATGG-C-A--AT-TT-AGT--TGT-TGT--A-A-CCCC-G--A-TATAA-T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAC--AGATG-A-T-AA--------AA--TGTATACGACTTA--CG-AA-TATAGATGAGT---A--A-AA----GGA--------A------------CATATATCAGTT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TTTAAGGTGACCTAGA-TGGATA-TC---A-G--GGGCTG-AC-AATTT-T------G---AAG-ACAGAATAG-GTT--A-AATAT--T-T-C-G--T-CTTTGC--G---AA-AAATAA-C---AA--AA-TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AAA--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAAAA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------G-ATAT--AAAAAGTA---AT-CAT--CCTG--CTTTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGT-TTA-CCGTCAGGTA--T-TATTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TC----CTAC-T---A-C-C------------------------------CCCC-A--CTCC-G----CTAA------------------------G---TTG-A---------C-G-T-CA--TTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACAT---AA--A-A---T-CCTTT-A-GTT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-CAT-----------TT--AAAA----A-AATATATTG---A-AT---AG-ATAA-A--A-ATA-----------TTTATC-A----A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AAT-TG-TAA--TTA--ATT-ATTT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC--AA-GGCAA-AGGT-T-AAACGC----------CT-TG-TC-C--AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTAA--CCATG-G-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--AGGG-GG-AA--TTTTTTTCCCCCCAAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGG-T--GG-GA---AA-T-----------------G-GG-GC-AA-AG-C-A-T--A-AG----GT-A----ACT---TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TTAAATGGTTG-GA--ACCCC---C---C-CCC--------------------T-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--TGC-A-TTACTT--T-AC-A-T-ATCA---GAA-TA-CA--TTTTAAA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-TAATCTTT-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACC-A-TA-AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAAC----AATAAA-A-AA--ACAAA---CAAA-T---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-T------A-T-T-GA-ATA-AAT--AA-AAATAAATGCAAA-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATTTTAAATTA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCATTTTTTTA----A---A-A-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAA-G-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTCA-T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-CAC--TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C----AA--CCT-ATTCT-T--AAAG-A--GT---AA-TTGCA-ATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TG-ATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACT-ACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-C-GG-T-TCTT-C--G---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT---A---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCT-A----CCAC------------------------A---CCA-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTT-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----C-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-TT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-CG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GTCAG-AAGT-C-AAACCAC---------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGA--TCATGAG-------C-C----ACAG-TG-A-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-GG-C-A-G--T-AG----GT-A----GCTG--TCGC----AG-T-G-TATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTC-GA--ACCCCACTC---C-CCC-CCC-CCTCTCTCTC--TCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-GA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATAGA-T-A-TG-AAAA----AAAAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAAC----AAT----A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTGG-AATATAAAATT--TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TC---GAAAA--TTCCAAAAAAAT--TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--CAAAAAACTC-T-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGCCAT-GAAAAA--TAAACC-TATTA--T-A-CCC---ATA-TATC--CTTT------ACCAACAT-ATT-AAATGA-TAAGTTTGTTT--------C-A-TAAG--AATAAAGAT-GTTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CACCTT----GTCTTTTTAAA----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGTCTCCAG--TGA-CATCAT-GA-T--ATTTT----AGGGCGC-T--T-GTCAT-TTG-AA------TAGCGT--AAA-CT--TGCGGCGGT--------CGTTT--T-AGAATAATTAAAAAT--TGAC-CAC--TT-ACC---T-CA-GT-AA-T--TAAA--AAAAA-CGC-ATCGT-TTAATT-T--TT-G--ACCAC--A-AAGCTAAA-C-------GAA-T-A------TG-GAGTT-ATCCAT-CCA-TGCTTTT-CATGTAC-AGA-AA------T---AAAAAA-AAC--A-T--AA--CTT-ATTTT-TTCACAG-A--GTCAGAA-TTGCACATTC-TACTTT-TCC-C-TA-------------------CCCCCA------TGCACAT-AATTTGCACGCGACG-TCATGTTG----G-CAA--AT-TT-GGTC-TGTA-GT--A-ACCCC--G--A-T-TA--T-----T-C------CTGAAAA-AAA-A--TAT-TTAATGTA-T-TA--------GA--TTTTTAC---TTA--C--AA-TA-AACTG-TCTT-G--A-AA----GGA-T-T--ACA------------TA-ATATCG-TT-GG--TTGTTTGTAAAA--GTCG-A---AACAAATG-AA----ACCGTT-TC---AGTTATCTT-A-T--ATA-TTCTTT-T--GGGCTG--C-A---T-T------G---AAGAA--AAACAT-GTC--A-AAT----T-C-C-AA-TATTTT-C--GACCAA-A--TAA-C---AA--AAGTT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----T-TA-AGA--AACATA-TATTG-TT--AA--TTTTGA---AA---A----AAA-----------AAGTTAAAGG--------A-ATATAAAA---GAA---CT-CAT--CCTG--CTTTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA-TC------CA--T-G-TTT--AGCA-GTA---A--T--C-G-CA-TC----TTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-CTTTATCAG------------------------GAAAGTG-A---------C-G-T-CA-ATGG-----CCA---CATTGGCTCTA-TGCTA-ACCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AG--T-TTA-CAATA-TGAA-ATTTTA--CTT-ATC-----------CT--AGAG----A-ATCAAA-TG---ATAT---AG-ATAATA--A-ATAC----------TCTATC-AACT-GCATCA-ATA-C--TA-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAAT-TGTT-A--TTA--A---C-AT------TA-C-----CCA-CTAAA---AC-AAA--GCAA-AAGT-TAAAACCAC---------CC-TA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTGA--CCAT--G-------C-C----GCAG--G-C-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--AGCG-GG-AACTATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAGC-T-G-T--GC-AAATCAA-T-A-A-A---A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cccAAAT-GTTT-GA--CCCCC---C---C-CCC-CCT-CGA------C--CCGG-TTC-T-TCA-AA-AG--A--------AA-------AACAT-T-A-T-ATTT--CAAC-ACT-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AAAATAT--A-ATATT-AA-------AT---A--TC-T------T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TAATCAA-GTAAA-A-A-T--AATA----AA--A----T-A-A----TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAAC----AAT--ACA-AA--AC------CAAA-CA-------AAATAA-A-------------------C--AA---AAA-AA-AAA-T-TTCAAAAAAAAAAAAAA--AA-ACA---CACA--AA-A------ACT-T-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGC--A-CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                         cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CCGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAATCAC-ATTGACC---TCCAGGT-AA-T--T--A--GAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-AACA--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TA-AAGCA-AT-CATACC--TGC-TTT-CATTTACAAGATAA--TT--T---AAAAAAGAAT--C-T--AA--CCTAATTTT-T--ACAGAA--GT---AATTTGCAC-TTC-TA--TT-ACCGC-TACCCCC----C---------CCCCCC------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----GCC-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----TCC------TTT---A-AAA-A--TAT-T-AATG-A-TAAG--------AAATTTTTTAC---TTAACCG-AA-TA-AGGTG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC------------------ATATATCA-CT-GG---TTTTTTAAAAA--GT-GAA---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC---TG-ATA----TTG-AT-GGGCTG----A--TT-T------G---GAG-------T---GT-------T----T-TAC-GGAT-CTTT-T--G------A--TAA-C----A--AA-TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----T----AAA--AAAATG-TA-TG-TT-CAA--TTTTGG---AAAG-A----AAA-----------AG--AGTAGG--------A-ATTA--AA---GTA---GT-CATTCCCTG--CTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-T-A-CC------TATTT-T-TTTACAG-A-GTAT--A--TTGC-G-CA-TTCGTCCTAC-T---A-C-CGGCTAGCCGCGCTACA-CC-----------CCCCGC--CCCCGC----CCAC------------------------G---CTA-T---------C-G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTTGGCTCTA-TG-T--A-CA-T-GACATT--AA--A-C---TCCCTTT-ATAGT-T-T-------A-TTTT-A-TCTGGTCTT-GATGGTCCTTCGTGTT--ACAACATGA-AATCTACTT---A-ATTAAAA-ATGATATGA-ATAGATAATAAATATTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-AT-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAAT-TG-T-A--TCAAGA---A-TT------TA-C--TTACCACCTAAT---AC-AAA-GGC-A-ACGT-T-AAA--A----------GC-CG-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------CGC----ACAG-TG-G-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--AGGG-TG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-T--CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-G---AAAG-AAGA-GG-GCAAA-AG-C-A-G--T-AG----TT-A----ACTG--TCGC----AG-TGGATATTTT---TTTT-TTTATT-GTTTGGA--ACCCC---C---A-CCC-CAC-C--------C-----T-TTC-C-TTC-AA-AGATA--------AA-------AA--T-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-T--CA--TTTTAAA----T--G-A-AT--TA-------AT---AAATA-T--AT--T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--T-A-ATATA-C----------------TAA----T-A-A----T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--TCAAA---CAAA-TA-------AAAAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC------------AAT-AA-ACA---CAC----A-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTTAC---TTAA-TG-AA-TA-AGATG-GTT--G--A-AA----A-A-TAT--ACA------------T-TATATCA-TG-GG--TTTTTTTTACGA--GT-G-A---AAT---TA-AA----AACGTT-TC---AGTGATCTC-AATA-ATA-TT-TTT-G--GGGCTC-AT-A--TT-GAAAGAAG---AAG-A--AAATAGCGTA--A-AAT----T---C-G-----CTT-C--G---AATA--TAA-C---AA--AA-GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AAA--AAAATG-TATTG--T-CAA--TTTGAA---AA---A----AAA-----------AG--TAAAAGTA------A-ATA---AA---GTA---GT-CAT---CTGCTCTTTCA-TTA--CA--G-AACTGTC--AATA--AA-A-TGC-TAA-CT------TA--T-T-GTTACAG-A-GTA---A--TTAT-G-CA--T----CTACTT---A-C-C--------------CC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCA------------------------G---CCGCGAAAGTTGACC-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TATA-CA-T--ACATT--AA--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACATTGAA----CTA--CTT-GAT-----------TTCGAAAA----A-AATATA-TGGATA-AT---AGAATAA-A--G-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-A-A-CA-TA-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------T-TG-T-ATTTTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA--GC-A-AAGTAT-AAACCA----------CC-TC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GT-G--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA----GG-GG-AA--ATT---------CAAAAGG-A---C-TC-CCAG--T-G-T--GGAAA---AA-T-A-A-T---AAAA-AGGA-GA-GC--A-AG-C-A-G--G-AA----AT-A----ACGGATTC-C----AG-T-GA---TTT---TTTA-TTAAAT-A--T-GA--A-------A---C-CAC-CAC-C--------C--TCTT-TTC-C-TAA-AA-AA--ACAAGAAATAA-------AA--T-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----TTGA-ATAA--AA-------ATA--AAATT-T--ATGTT-T-ATC-TA-TT--TACAT-TA--T-A-GT------------AAA----AAT------T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA-----AAT--A-A-AA--ACAAA---C-TA-TA-------AAAAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T--------------AA--AA-A------ACA--AA-ACACCACA-T----A-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GT--A-CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-TT-TTG-A--GGGCTG-AT-A--TT--------G---AAG-A--ACATAG--TC--G-AAT----TCT-C-GG-T-CTTT-C--A---AA-AA-TAAAC---AA--AG-TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG---GGGGGA----AAA-----------AG--TTAAGG--------ATATAA--AA---GTA---GTTCAT--CC-G--CTT-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGCCG-CA-TC----ACAC-------C-C--------------TAACC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG-A---------TAG-T-C----TG-----------ATTTGGCTCTAATG-TA-A-CA-TTGACATT--AA--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T-TTAAC-AC--TGAGTA----A--CTT-A-------------TT--AAAA----ATAATA-A-TG---A-A----GG-ATAATA--ACATA-----------TTTATCCAATT-A-AT-ATATC-AA-TAATTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA----C-AA--GGCAA-AAGT-T-TAA--A----------CC-TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TGAG-A--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGAGGG-GC-AA-AG-C---G--T-AG----TA-A----ACT---TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TAAAAT-GTTT-GA--CCCCCA--C---C-CCC-CCC-CA-------C--CCTT-TTC-C-TC---A-AG--A--------AA-------AA--T-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TTTT-AAG---T--A-ATAT--AA-------AA---AAATC-T--A---T-A-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-ATA----TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAACCCATAAT--A-A-AACCACAAC---CCA---A-------AAAAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC-----------------G-AC----CACA--AA-A------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGC--C-GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11    11                             111                                   1111   111                                                                   11111111                                          11                                      111111                              11111111111111              1                         111111  111111             1111       11  2222222222                  11111   1     11                      11111                                                       11111111     1111     1              11                                11                              11111                1111111       111111                                          1111111111          1111111                                                           3333333333333333333                         111111                                               1   11                                                          11111111                                        11    1111      44444444444444444444             111                                                                                             11111111                            1111                 111111    11                                     1111111        111111111                                111  111        11111111111          11111111     111  111                                  1111             11               111111                                    1111111    1111111   11111111111111     11111111111                    44444444444444444444444444444444444444444444             22222222222                                                                                         11111111111  11                   1111111111                22222222222                                                                             1111111111111                                11111                                                   22222222222222                                                                 1111111                                                                     111111111       11111                              111111111                                 1111    1111          1111                                                          33333333333333                      22222222  1111111                                                    1111         3333333333333333                                               11111111           11111111        111111                                                       11111111        11111111111111111                          222222222222                                                                        111111           1111               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       44 22    11     77       1           3  777            6  1      3 3       3  0000   222            44        3        44    3          44 999        3 55 11111111   666 44 3   3    55  55  3   3  88      00      3  3  55 3 3   55    3    55 3  444444        7   3      3          55555555555555 3  1 88      0        3 3      3 3 3 3 444444  000000 55 3 3  55  5555       22  0000000000   55   4   4 55  44444   2     33   4   4  8  4 55     00000   4  4 99 4  4  4   4       3   7   3   3  8888888    66666666     2222     0         55   99   3   7   666    3  3  3 55 7  00    88   3     3      3 55  3 77777  55 3        3 5555555   3 3 000000  3     3  3   6  77   3   3       3   3  3333333333      6   0000000  44   3     2 66    2 33  555  2          2  77  3   2 2  0000000000000000000      888888  33   2     111111    2   5    6666 2 8 33  2  2   66       33 2 4   22 33 2    66 77777 2 888888   555 2   2 66   2      2 2 2  00000000  77       444   66  2  2  2     2    2 55 2  1111   2  55555555555555555555       2  2  222      1    33  7777777   555  3  6666 6    3  555         3 3  2   44 2  99999      2  2 66  00000000 555   7777      5  777 3   0000 555 3 55 3    6 555555  3 44   3 555  44  3  3    3 3 6    3 44  0000000 3  3   555555555   44      3     3  7   55      555  111 7777   77777777777  55      88888888 3   222  000   666  3   55    55      2   88  2222  0    55    00  3 7 7 3   3  777777  44 3 3       3 3   999 44    3 3  4444444    5555555 3 99999999999999  2  33333333333    2 33    2 6666  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 33 3    77777777777           3  3  3 6  3 3      44  44 3 555 6     6 3   3 3   3 3   3    3 3    88   3   77777777777  00    7777 3      7  1111111111  3    6 55 3   00000000000      3  5 3 3  7 3   3  3  6 4   77  77     3  3   44   3  3 3  888    3 3  6666666666666   33   88888    3  3 3 44   44 00000  999999  3 44 44   3     555  3  44     3    3 3  33333333333333  3  3  3  3   555   3 5555         3  44 999999   3    44       0000000 3 7777    3  3 3 44 555  6  3 44  3  3 3  9999  3  77    3  3  77   555555555    44 00000 3  3    77 3 3 44  3  555  3 555555555    6    3  3  6  3  3 99999999  0000  3 2222   555    0000  3 6   88   555    333    3    3  77     888888888   3   11111111111111   3   3 3  66  3  77 00000000  6666666  44 3 6 6      44    777 3    77777 3  3  44    6  5555 44 3    0000000000000000     2 33 777 2 2   5  77 33 5   2  33 1 2  1  77777777    6666   00000000 2 6666 333333     5  2     99 2      6666   7777 2  33     555    2 22222222      2 44444444444444444 5 33   66   5      5 2 2 222222222222  66  2   777    33  9999999999 444  3   3   3   3          44 77       888888 3 44   44 0000  3 3   88     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .. ..    ..     ..       .           .  ...            .  .      . .       .  ....   ...            ..        .        ..    .          .. ...        . .. ........   ... .. .   .    ..  ..  .   .  ..      ..      .  .  .. . .   ..    .    .. .  ......        .   .      .          .............. .  . ..      .        . .      . . . . ......  ...... .. . .  ..  ....       ..  ..........   ..   .   . ..  .....   .     ..   .   .  .  . ..     .....   .  . .. .  .  .   .       .   .   .   .  .......    ........     ....     .         ..   ..   .   .   ...    .  .  . .. .  ..    ..   .     .      . ..  . .....  .. .        . .......   . . ......  .     .  .   .  ..   .   .       .   .  ..........      .   .......  ..   .     . ..    . ..  ...  .          .  ..  .   . .  ...................      ......  ..   .     ......    .   .    .... . . ..  .  .   ..       .. . .   .. .. .    .. ..... . ......   ... .   . ..   .      . . .  ........  ..       ...   ..  .  .  .     .    . .. .  ....   .  ....................       .  .  ...      .    ..  .......   ...  .  .... .    .  ...         . .  .   .. .  .....      .  . ..  ........ ...   ....      .  ... .   .... ... . .. .    . ......  . ..   . ...  ..  .  .    . . .    . ..  ....... .  .   .........   ..      .     .  .   ..      ...  ... ....   ...........  ..      ........ .   ...  ...   ...  .   ..    ..      .   ..  ....  .    ..    ..  . . . .   .  ......  .. . .       . .   ... ..    . .  .......    ....... . ..............  .  ...........    . ..    . ....  ............................................ . . .. .    ...........           .  .  . .  . .      ..  .. . ... .     . .   . .   . .   .    . .    ..   .   ...........  ..    .... .      .  ..........  .    . .. .   ...........      .  . . .  . .   .  .  . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .  . . ..   .. .....  ......  . .. ..   .     ...  .  ..     .    . .  ..............  .  .  .  .   ...   . ....         .  .. ......   .    ..       ....... . ....    .  . . .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ..    .  .  ..   .........    .. ..... .  .    .. . . ..  .  ...  . .........    .    .  .  .  .  . ........  ....  . ....   ...    ....  . .   ..   ...    ...    .    .  ..     .........   .   ..............   .   . .  ..  .  .. ........  .......  .. . . .      ..    ... .    ..... .  .  ..    .  .... .. .    ................     . .. ... . .   .  .. .. .   .  .. . .  .  ........    ....   ........ . .... ......     .  .     .. .      ....   .... .  ..     ...    . ........      . ................. . ..   ..   .      . . . ............  ..  .   ...    ..  .......... ...  .   .   .   .          .. ..       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       66 55    22     99       8           3  888            7  8      1 1       3  8888   555            66        3        66    3          66 222        6 00 99999999   444 99 6   6    00  00  6   6  66      00      6  6  00 6 6   00    6    00 6  111111        3   6      6          77777777777777 6  0 66      9        6 6      6 6 6 6 111111  555555 00 6 6  00  0000       33  9999999999   00   0   0 55  00000   0     55   0   0  0  0 55     11111   0  0 55 0  0  0   0       6   3   6   6  2222222    88888888     2222     9         00   00   6   3   444    6  6  6 00 3  00    11   6     6      6 00  6 00000  00 6        6 5555555   6 6 555555  6     6  3   7  99   3   3       3   3  1111111111      7   4444444  66   3     9 88    9 99  000  9          9  33  1   9 9  7777777777777777777      222222  99   9     111111    9   7    1111 9 6 99  9  9   88       77 9 3   55 99 9    88 11111 9 222222   000 9   9 88   9      9 9 9  44444444  99       777   33  9  9  9     9    9 44 9  8888   9  22222222222222222222       9  9  777      6    99  4444444   000  1  5555 2    1  444         1 1  9   22 9  66666      9  9 88  88888888 000   6666      7  000 1   8888 888 1 22 1    2 888888  1 66   1 444  22  3  3    3 3 7    3 66  8888888 3  3   222222222   66      6     6  3   00      000  444 7777   33333333333  00      22222222 6   555  000   444  6   00    00      1   66  8888  3    00    00  6 3 3 6   6  777777  66 3 3       3 3   222 66    3 3  5555555    3333333 3 66666666666666  9  66666666666    9 99    9 1111  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 88 3    55555555555           3  3  3 7  3 3      66  66 3 888 7     7 3   3 3   3 3   3    6 6    66   6   33333333333  00    7777 6      3  2222222222  6    5 00 6   99999999999      6  6 6 6  3 6   6  3  7 2   99  99     3  3   66   3  3 1  222    1 1  9999999999999   66   55555    1  1 1 22   22 00000  666666  3 66 66   3     888  3  77     3    3 3  88888888888888  3  3  3  3   888   3 5555         3  66 666666   3    66       8888888 3 1111    3  3 1 22 444  2  1 22  1  1 1  6666  1  33    1  1  33   444444444    22 55555 1  1    33 1 1 22  1  444  1 777777777    7    3  3  7  3  3 66666666  4444  3 9999   000    4444  3 7   44   888    888    1    1  33     999999999   1   33333333333333   1   1 1  55  1  33 00000000  5555555  22 1 2 2      22    111 1    44444 1  1  22    2  8888 22 1    3333333333333333     9 99 999 9 9   7  99 99 7   9  99 9 9  5  66666666    1111   88888888 9 1111 000000     7  9     66 9      1111   0000 9  99     000    9 66666666      9 99999999999999999 7 99   88   7      7 9 5 555555555555  88  9   999    99  8888888888 666  1   1   1   1          66 99       555555 3 66   66 4444  3 3   66     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTT---T----A---C-A-CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( family-1826 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTT---T----A---C-A-CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTTCAAAGAATT--TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATTC-ATG-TA--GAAAAAAATAAGCCGTG-TA----A-CTCAAGATA-TATT--C-TTTTATATAGTAAGAA-ATT-AA-TGA-TAATTTTTTTCTTT----A---C-A-CAGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCTA------T--A-T-CA--TTTGTAGTTCATT--AATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTCAGGGTGAACCT-ATTGA-TGGATTCTTAATGGGA-ACCT--G-AT-ATCTTG-AAAAAAG-TAGTGTC-AGG-ATGAT----TGGTGCCTGTAACTTTC----AGAATTATGAAAAAGAATGAC-CACTAAT-ACTCTATCCA-GTCAG-TCCT-AAGCAAAAT-TGT--TCGT-CAAATT-T--TATA--AC-AA--ATAAACTAAA-GCCGCAAGGAA-T-AACAGGGCG-AAGT---C-CAT-CCGTTGC-GTT-CACT-AC-AGA-AA--TTGGT---AAAAAGGAATGGC-T--AAAACCT-ATCTTCT--ACAG-AAAGT---AT-TTG---ATTC-TAG-TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCCCCCCCCTG--CGT-AATTT------GA-G-TCA--TTG----G-C-ATTATGTT-GGT---GTATGT--A-A-CCT--GCAG-TATGATT-----T-C------TTT---A-AAA-AA-TAT-AAAATG-A---AGTACCCAATAA--TAATTAC---TTA--CG-AA-TA-AGGTG-GTTTAG--A-AAAAGAGGAGTAA--CCAGGGTAG------TGCAT-TCA-CT-GG--TTTTTTAGGAAACGGT-A-ACTAAAT---TG-GATATAA-CGTTATC---ACTGACCTC-A-TG---A-TT-TTG-T--AGGCTG-AT-A--TT------------GAG-A--AAATAG-GTA--ACAGTGTCCT-T-C-GT-T-CTTTGCAAG---AA-A--TAA-CAAGAA--AG-TT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AAATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG---AA---A----AGAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAA-AAAT--AA---GTATGTGT-CAT--CCTC--TTTTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAACCC------TA--TGT-TTTACAG-ACGTAATGA--TTGC-G-CAGTT----CTAC-TTACA-C-C--------------TA-CCGGACACTAACACCCC-CGTCCCC-C----TC-C------------------------C---CCA-G---------C-G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTTGGCTCTA-TG-TA-AGCAGT-GACATT--AAGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATATTA-C-ACA-TGAA-A-TTTA--CTT-AA------------TT--ACAA----A-AATATA-TG---A-AC---GG-ATAA-A--A-GTT-----------GTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-TAGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-AT-TG-T-A--TCA--A---A-TT------TA-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AAT-GGTAA-AGCG-T-AAG--A----------CC-TG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTGG--CCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--T--G-A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATAGGG-TA-AG--ATC---------CAAA--GCG---C-TC-CCCGATT-G-T--AG-AG---GA-T-A-G-AGGCAAAG-AAGA-GG-GC-AATAGTC-G-G--G-AGTTATGT-AGTT-ACTG--TC-C----AG-TGGATATTTTGAATTTT-T--GAT-GTTT-GA--ACCCA---C---C-ACC-CCC-A--------C--CCTT-TTCTC-TTC-AA-GG--A--------AACACC---AA--T-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---G-A-TA-CATGTTTC-AA----T--ATATAT--AA-------ATCA-AAATA-TGGA---T-T-ATCATA-TT--T-TAT-TA---AA-ATATA-CGA-T--AAAA----AAT------T-A-A----T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAA----ACT--A-ATAA--ACAGA---CAAACTAAAAGAGTAAAAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG-----------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------ATT-T-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGC--A--CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -ATA-TT-TTG-A--GGG-TG-ATGA--TTAT------G---AAG-A--ACATAG-GTCTCA-AAT----T---C-GG-T-CTTT-C--A---AA-AATTAA-C---AA--AG-TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG---GA---A----AAA-----------AG--TAAAGA--------A-ATAT--AAA--GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TT-C-G-CA-T-----CTA------A-C-C--------------TA-AC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG---------------T-AA-GT-------------GATTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TATA--CTT-AAT-----------TA--AAAA----A-TATATA-TG---A-A----AG-ATAATA--A-ATA-----------ATTAT--AATT-A-ATAA-ATA-CATTA-T-ATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AA---A----------CC-TG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TT-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGG-AG-GC-AA-AA-CGA-G--TAAG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA--TT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---CACCC-CCCAC--------CCACCTT-TTC-CTTTC-AA-AG--A--------AA-------AA--A-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----T------AAT-A-AG-T-GAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG---A-CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA--A-AAATTAATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CC--AAACTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TAAAT-AGCCC--G-TA-TATT--C-TT------AAAAAAAT-AT----ATGA-TAATTTTTTT---T----A---AGA-CACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------TA------T--A-TGCA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTCAAA-TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GTGG-GC-TT-G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAAATT--T----CGGT--------CTTTC--T-GGAAT-ATGAAAAAT----GA-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AAAT--T-AA--AAAAAATGT-ATTGT-TCAATT-T--TA-AC-A--AA--G-AAACTAAC-G-------AAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CT--TGC-TTT-TATTTAC-AGA-AA--TT--A---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATATT-T--A-AG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TA-ACC-C-TA-------------------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----G-C-A--GT-TTGGGT--TGTATGT--ATC-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-ATT-AG--------AA--TATTTAC---TTA--CGAAA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----AGA-TAC--A---------------ATATATCA-TTGGG--GGGTTTTTGAAA--GT-T-A---AAT---TT-AA----A-CG-T-TC---AGTGACCTC-A-TA-ATA--T-TTG-G--GGGCCGAAT-A--TT-T------G---AAGAA--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-A-GG-T-CATT-C-------A-A--TAA-----AA--AA-TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AAA--AAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATT-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC---G--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC--G--A--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCATTTTTTT---A----A---A-A-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTCT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TACATACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-tgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTCG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCAAAGAAAT--TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TTT-----AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTT---TTACAA---C-AGCAGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTT----AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-A--GA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TAAGAAT-ATG-AAAAT--TG-A-CAC-ATT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-TA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--C--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-G-A------TGAAAGTA-AT-CAT-CC--TGC--TT-CATTTAC-AGA-AA--TT--TA--AAAAAA-AAT--C-TA-AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATAA-AA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGC-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--CTTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC--ATAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TT-G----TTTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAGTAGTCA-ACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTGG-AATATTAAATTAATAAT-----AATACCA-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCCAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA---AAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CT---AATACTAT---C-TT------AAAAA-----TT-AAATGA-TATTTTTTTT---T----A---C-A-CAGG--A-TAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----TA------T--A-T-CA--T-----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--T-A-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGCG-G----------AG-TTG-AAGAAAG-TAG--TC-AAA-TT-------CGGT--------CTTTCATT-AAAAT---GAAAAA----------C-ATT-TAC---TCCA-GT-AA-A--A-AT--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TAACA-A--A--AT--A-GAACTAAA-G-------GAATT-A------TG-AATTA-AT-CAT-CC--TG--TTT-C--TTAC-AGA-CA---T--T---AAACAA-AA---C-TAAAA--CCT-ATTTT-A--GCAG-A--GT---AA-TTGACCACTC-TA--TT-ACC-C-TA--------------------CCCTA------GG--CGCAAATAT------GACG-TCA-GT------G-C-A--AT-TT-GGTTATGTAT-T--A-C-CCC--G--ATTATA--T-----C-T------TTA---A-AAA-A--TA--TAAATG-A-T-AG--------AA---TTCTAC---TTA--CG-AA-TA-AGAT--GTTT-GAAA-AA----GGA-T-------------------CATATATCA-TT--G--TTTTTTTTAAAA--AT-A-A---AAT---TGAAA----A-TGTT------AATGACCTC-A-TC-ATA-TT-TT--G--AGGCT--AT-AT-TT-T------G---AGG-A--AAATAG-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAAT-TG-T-A--TTA--ATAAA-TT------TAAC--T--CCA-CTAAA---ACTAAATGGCAAGAAGT-T-AC-CCA----------CCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TG-GTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GGGAA--ATT---------CAAA--A-GA--C-TCTCCAG--T-G-T--GG-AA---AA-T-A-ATA---AAAGCGAGA-GG-AC-AA-GG-C------C-AG----GC-AGCATACTG--TCGC----AG-T-GAT---TT---TTTT-TTAA-T-GTTT-GATAACCAC---C---A-CCC-CTC---------------TTATTC-C-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATAAA--A-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---G-AGTA--A--TTTT-AA----T--A-ATAT--AATAA----ATTAAGAATT-T--A---T-T-ATC-TA-TTAAT-TAT-AG--TAA-AT---------------------T------C-A-A----TG-----ATTAA-A--TAGA---T-A-TAAC----AAT--ATC-AC--ACAA----CTAA-TA-------AAAAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC--AAA---CAAA-T-T---------------A--AA-ACAAATCACATTAC-A------C-T-TTGA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGT--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-TA-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TC------TA-C--T--GCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-ACGT-T-AAACCATCCAGATCATCC-TA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAA-------C-CATGTACAA-TG-G-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGA-GG--A--ATT---------CAAA--G-G---G-CC-CAAG--T-G-T--TG-GA---AA-T-ATG-A---GAAG-GAGA-GG-GC-AT-GG-C-A-G--G-AG----GT-A----TCTG--TCGC----TG-T-GAT-TTTT---TT-------AT-GTTT-G----CCCC---C---T-CCC-CC-------------------TTC-C-TT--AA-AA--A--------AA-------A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATGT--AA-------ATTA-AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-CAT-TA--TGA-AT------A-T--AAAA----AAT----------A----TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAAC----AAT--A-A-AT--ATAAAAGCCAAA-C---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C------------AAACAA-ACA---CACA--AA-A------A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGT--A-A-TCCA-G--A-TATA--T-----T-C------TTA---A-AAA-AGATAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--TTTT-AC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-G-----TTATTTAA----GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-CC---AGTCACCTC-A-TG-ATA-TT-TTT-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAAAAA-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-T-GG-T-CTTT-C--GA--AA-A--TAG-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----T-----TA--AAAATG-CATCG-TT-CAA--TTTTGAC--AA---AAAATAAA-----------AA--TAAAGG--------A-ATATA-AA---GTA---GT-TGC--CCTG--CCTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--TAAC--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---T--ATGC-A-CA--T----CGAC-T---ACC-C--------------TT-CC-----------CAAC-C--CCTA-C----GTAT------------------------G---TTG-A---------C-G-C-GA-GTTGT----GTA-----TTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--ACGGTGG-AAC-ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-TTGAG-GA---AA-T-A-A-G---AAAA-AAGA-GG--C-AA-AG-C-AAG--T-AG----GT--------TC--TCGCGACTAGCT-GATATTTT---TTTT---AAAT-GTTT-GA--ACCTT---CGGGC-CGC-GCC-A--------C--CCTT---C-C-TTC-GATAG--GCGAATG--AA-------AA--T-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCG-A-TAGTA--TTTT-AAA---T--A-A-AT--GATCAAAGAAT---AAACCCT--A---TGT-ATG-TA-TT--TCTATCTA--TCACATATA-C-ACT--AAGA----AATAAGTAATGA-A----TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAAC----AATA-A-A-AA--ACAAA---AACA-T--------AAAAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC------------AA--AACACAG--CGCA--AAGA------A-T-T-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGC--A--CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CC-C-CC---------C---------CCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACA-AAA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATATCTA-A-CCCC-G--A-TATA--T-----T-G------TTC---A-AAATA--TAT-TAAATG-A-T-G----------------TTAC---TTA--CC-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-GG--TTTATTT---AA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA--T-TTG-T--GGACTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATTG-GTC--A-AAT----T-T-C-GA-T--TTN-C--A---GA-A--T-A-C---AA--gcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatttggctgtatattntcccccccccccccccAGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC---AAAAATCTTCAAAAGAAAT---CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C---AAAATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATTATC-TT------AAAAAAAA-ATTTGAATGA-TAATTTTTTT---T----A---C-A-CAGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------TA------TTCA-T-CA--TT----GTTTTTTT-AA----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTCAGC-TGA-CCT-AT-GAAT--ATTTT----TGGG-GC-TTTG-A--AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGTC--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TTA--CAC-ATT-ACC----CCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATTAT--TA-A--C--AA--A-AAACTAAAAG-------GAA-T-A------TG-ACGTA--T-CATTCC--TGC-TTTTCATTTAC-AGA-AA--TT------AAAGAA-AATG-C-T--AA--CCT-ATTT-----ACAG-A--GT---AA-T-GCACATTC-TA--TT-A------A---------C---------CTCCC-------TG--CGT-A-TTT------GACG-TCA-GTTG----G-CTA--GT-TT-GG---TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATT--T-----T-T------TTT---T-AAA-A--AAT-TAAATG-A-T-AG--------AATCTTTTTAC---TTA--CG-AA-TC-AGAT--GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ATA------------TAT---CCA-TT-GG----TTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----G-TTTT-TA---AGTGACCTC-A--G-ATA-TT-TTG-GAAGGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG----AAATAG-GTC--A-ATT----T-T-C-GG-T-CTTT-CA-A---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG---------AAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-AT-T--AA---GTA---GT--AT--CCTG--CTTTCATTTA--C----AAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-AGA---AAGTTGC-GTCA-TT----ATAC-------C-C--------------TC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------cctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacaccccccc-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCC------------------------C---CCC-G---------C-G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTTGGCTCTA-TG-TA---CA-T-AACATT--AA--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTAA-CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATACA-TG---A-AT---AG-ATA-TA--A-ATA-----------TT-ATC-A--T-A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-T-A--TTA--A------T------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA--GGCAA-AAGC-T-AAACC--------------TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTTG--TCATGAG-------C-C----ACAGATG-G-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--GGGG-GG-AA--ATTT--------CAAA--G-G---C-TC-C-AG--T-GGT--GG-GA---AAAT-AAG-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TAAAAT-G-TT-GA--ACCCC---C---A-CCC-CCC-A--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AGA-A--------AA-------AA--T-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TT----A----T--A-ATATTGAA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TATTT--T-TAT-TA--AGA-ATATA-C-A-T--AGAA----AATAA----T-A-ATAAGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAGAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AACA------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGC--AGCCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAACcccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|21                         : aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccGTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGC-AA-AATAAATTAATAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC---GAAA---TTCCAACGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-GTG-CA--GAAAAA--TAAGCT-TG-TA--T-A-CCC--GATA-TATT--C-TT-------TTAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-GAGTTT---T----A---C-T-CACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------TATACATGT--A-C-CA--TT----G-TTTTT--AA----------GTG--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T-T-GTTATAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-T-----CTAC-T---A-CTC--------------TA-CC-----------CCTC-C--CACC-A----CCACCACCACCCCCATCAGCGTAATTAAG---TTG-A---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-AAA-AGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AGAA----A-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAAT-TG-T-A--TTA--A---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA--------AAAA----AA-AA------A-A----TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAGC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CTAA-TA-------AAAAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T----------------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C------ATT-T-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCC--A------TG--CAT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----A-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--TATGGGT-CATATATTCT---AGAAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--TTTTTAC---TTA--C
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTGG-AGT-ATGAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTT-T--ACAA-A--GT---AA-TTGCAAATTT-TA--TT-ACC-C-TA---------CACCCCCCCCCCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATAT--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTAG-CACACACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTGGGAATA-TGAATTAATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTC-AAAGAAATAGT-AACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATG-CACAGAAAAA--ATAGCC-TG-TA--TTA-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAATAAA-ATT-AAATGAATAATTTTTTT---TT---A---C-A-CAGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------TA------T--A-T-CA--TTT---GTTTTTTT-AA----------GTG--AAA-TTG-A--AAA----CGT-T-CAG---GA-CCT-ATTGA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--GGAT-AT-TTG-AAGAAAGATAG-GTCCAAA-TT--T----CGATT-------CTTTC----AGGATGATGAAAAAT--TGA--CAC-ATT-ACC---TCCA-GC-AA-T--TTAA--AAAAC-TGT-ATCGTCTCAATT-T--TA-C--A--AA--A-AA-CTAAA-AA------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATT-AC-AGA-AA--TT--CTTAAAAAAA-AAT--CCT--AA--CCT-ATTTT-TT-ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTCGTA--T--ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------T---CGC-AATTTT-----GACGGTCAAGTTG----G-CCA--AA-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCCCCG--A-TATA--T-------C------TTT---A-AAA-A--TACCTAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---TTA--CA-AAATA-AGATG-GTTT-G--ACAA----TGA-TA---ACG-------------ATATTTCA-TT-GG--GTTTTTG-AAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCTG-AT-C--AT-T------G---AAG-A--AAATAGCGTC--A-AAT----T-T-CAGG-T-CTTT-C--A---AA-AA-TAA-C---AACAAA-TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAAA--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA-AA---A----AAA-----------AG--GAAAGA--------A-ATATA-AA---GTA----T-CGT--CCTG--TTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-C-TAA-CC------TA------TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-GT----CTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-A--CCCC-C----ACCC------------------------C---CAA-G---------C-GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTTGGCTCTA-TT-TA-A-CA-T-GCCATT--AA--A-------ACTTT-A-AGT-T-TTA-T-ACA-AGAA-A-TCTT--CTTAAAT-----------TTAAAAAA----A-AATATA-TG-------------------------A-----------TTTATC-CATTAA-AT-A-ATACCA-CA-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAA--TG-T-A---TA--A---A-TTTAGTGCTA-C--T--CCA--TGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA-------------TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTGC--CCATGAG-------A-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--GCGC-GG-GA--ATT---------CAAA--G-G---CTTC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAGAAAGA-GGAACAAA-AG-C-A-GACT-AGC---GTAA----ACTG--TCGCA---AG-T-GATATTTT---TTTTCTTAAAT-GTTT-GAT-ACCCC---CA--C-CCCACCC-CCA------C--CCTT-TTC-C-TTCGAA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---A-A-TA-CA--TTTT-AAC---T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-A-C-TA--T--T-TA--TA--TAA-ATATA-C-A-TCCAAAAACATAATAA----T-A-A----TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA------AAC--A-A-AA----AAA---CAAA-TT-------AAAAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-TGT-GT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGC--A--CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agcgAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA---T--T---AAAAA----------------------TTT-T--GCAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCAC--CCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-AACTATAAAT-AATAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG--TTTCAAGAAAAT--TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC---GAACTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA--AAAAAAAATAAGCC-TG-TA--T-A-CT---GATA-TATT--C-CT------TTAAAAAA-ATT-AGATGA-TAATTTTTTT---T----ATAAC-A-CACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--AAT-CA--TTT---GTTTTTT--AAAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTCAG--TGA-CCT-AG-GA-T--ATTTT----TTGG-CA-A--G-AT-AT-TTGGAAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------ATCTC--T-AAGAT-ATTGGAAAT--TGA--CAC-ATTTACC---TCCA-GT-AA-T--T-AACAAAAAA-TGTTATCGT-TCA-TT-T--TA-A--A--AACAA-AAAATAAC-G-------GAA-TTA------TG-TAGTATAT-C---CC--TAC-TTT-CATTTAC-AGA-AAATTT--T---AAAAAA-ATT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCATATTC-TA--TTTACC-CCTAAACCTCCCCC---------CCCCCA------TG--CGT-AAATT------GACG-CAA-GTTGTATGG-C-A--AT-TT-AGT--TGT-TGT--A-A-CCCC-G--A-TATAA-T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAC--AGATG-A-T-AA--------AA--TGTATACGACTTA--CG-AA-TATAGATGAGT---A--A-AA----GGA--------A------------CATATATCAGTT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TTTAAGGTGACCTAGA-TGGATA-TC---A-G--GGGCTG-AC-AATTT-T------G---AAG-ACAGAATAG-GTT--A-AATAT--T-T-C-G--T-CTTTGC--G---AA-AAATAA-C---AA--AA-TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AAA--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAAAA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------G-ATAT--AAAAAGTA---AT-CAT--CCTG--CTTTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGT-TTA-CCGTCAGGTA--T-TATTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TC----CTAC-T---A-C-C------------------------------CCCC-A--CTCC-G----CTAA------------------------G---TTG-A---------C-G-T-CA--TTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACAT---AA--A-A---T-CCTTT-A-GTT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-CAT-----------TT--AAAA----A-AATATATTG---A-AT---AG-ATAA-A--A-ATA-----------TTTATC-A----A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AAT-TG-TAA--TTA--ATT-ATTT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC--AA-GGCAA-AGGT-T-AAACGC----------CT-TG-TC-C--AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTAA--CCATG-G-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--AGGG-GG-AA--TTTTTTTCCCCCCAAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGG-T--GG-GA---AA-T-----------------G-GG-GC-AA-AG-C-A-T--A-AG----GT-A----ACT---TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TTAAATGGTTG-GA--ACCCC---C---C-CCC--------------------T-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--TGC-A-TTACTT--T-AC-A-T-ATCA---GAA-TA-CA--TTTTAAA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-TAATCTTT-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACC-A-TA-AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAAC----AATAAA-A-AA--ACAAA---CAAA-T---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-T------A-T-T-GA-ATA-AAT--AA-AAATAAATGCAAA-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATTTTAAATTA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCATTTTTTT---A----A---A-A-CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAA-G-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTCA-T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-CAC--TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C----AA--CCT-ATTCT-T--AAAG-A--GT---AA-TTGCA-ATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TG-ATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TTTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACT-ACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-C-GG-T-TCTT-C--G---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT---A---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCT-A----CCAC------------------------A---CCA-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTT-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----C-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-TT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-CG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GTCAG-AAGT-C-AAACCAC---------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGA--TCATGAG-------C-C----ACAG-TG-A-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-GG-C-A-G--T-AG----GT-A----GCTG--TCGC----AG-T-G-TATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTC-GA--ACCCCACTC---C-CCC-CCC-CCTCTCTCTC--TCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-GA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATAGA-T-A-TG-AAAA----AAAAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAAC----AAT----A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTGG-AATATAAAATT--TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TC---GAAAA--TTCCAAAAAAAT--TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--CAAAAAACTC-T-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGCCAT-GAAAAA--TAAACC-TATTA--T-A-CCC---ATA-TATC--CTTT------ACCAACAT-ATT-AAATGA-TAAGTTTGTT---T--------C-A-TAAG--AATAAAGAT-GTTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CACCTT----GTCTTTTTAAA----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGTCTCCAG--TGA-CATCAT-GA-T--ATTTT----AGGGCGC-T--T-GTCAT-TTG-AA------TAGCGT--AAA-CT--TGCGGCGGT--------CGTTT--T-AGAATAATTAAAAAT--TGAC-CAC--TT-ACC---T-CA-GT-AA-T--TAAA--AAAAA-CGC-ATCGT-TTAATT-T--TT-G--ACCAC--A-AAGCTAAA-C-------GAA-T-A------TG-GAGTT-ATCCAT-CCA-TGCTTTT-CATGTAC-AGA-AA------T---AAAAAA-AAC--A-T--AA--CTT-ATTTT-TTCACAG-A--GTCAGAA-TTGCACATTC-TACTTT-TCC-C-TA-------------------CCCCCA------TGCACAT-AATTTGCACGCGACG-TCATGTTG----G-CAA--AT-TT-GGTC-TGTA-GT--A-ACCCC--G--A-T-TA--T-----T-C------CTGAAAA-AAA-A--TAT-TTAATGTA-T-TA--------GA--TTTTTAC---TTA--C--AA-TA-AACTG-TCTT-G--A-AA----GGA-T-T--ACA------------TA-ATATCG-TT-GG--TTGTTTGTAAAA--GTCG-A---AACAAATG-AA----ACCGTT-TC---AGTTATCTT-A-T--ATA-TTCTTT-T--GGGCTG--C-A---T-T------G---AAGAA--AAACAT-GTC--A-AAT----T-C-C-AA-TATTTT-C--GACCAA-A--TAA-C---AA--AAGTT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----T-TA-AGA--AACATA-TATTG-TT--AA--TTTTGA---AA---A----AAA-----------AAGTTAAAGG--------A-ATATAAAA---GAA---CT-CAT--CCTG--CTTTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA-TC------CA--T-G-TTT--AGCA-GTA---A--T--C-G-CA-TC----TTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-CTTTATCAG------------------------GAAAGTG-A---------C-G-T-CA-ATGG-----CCA---CATTGGCTCTA-TGCTA-ACCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AG--T-TTA-CAATA-TGAA-ATTTTA--CTT-ATC-----------CT--AGAG----A-ATCAAA-TG---ATAT---AG-ATAATA--A-ATAC----------TCTATC-AACT-GCATCA-ATA-C--TA-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAAT-TGTT-A--TTA--A---C-AT------TA-C-----CCA-CTAAA---AC-AAA--GCAA-AAGT-TAAAACCAC---------CC-TA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTGA--CCAT--G-------C-C----GCAG--G-C-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--AGCG-GG-AACTATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAGC-T-G-T--GC-AAATCAA-T-A-A-A---A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cccAAAT-GTTT-GA--CCCCC---C---C-CCC-CCT-CGA------C--CCGG-TTC-T-TCA-AA-AG--A--------AA-------AACAT-T-A-T-ATTT--CAAC-ACT-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AAAATAT--A-ATATT-AA-------AT---A--TC-T------T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TAATCAA-GTAAA-A-A-T--AATA----AA--A----T-A-A----TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAAC----AAT--ACA-AA--AC------CAAA-CA-------AAATAA-A-------------------C--AA---AAA-AA-AAA-T-TTCAAAAAAAAAAAAAA--AA-ACA---CACA--AA-A------ACT-T-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGC--A-CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                            cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CCGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAATCAC-ATTGACC---TCCAGGT-AA-T--T--A--GAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-AACA--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TA-AAGCA-AT-CATACC--TGC-TTT-CATTTACAAGATAA--TT--T---AAAAAAGAAT--C-T--AA--CCTAATTTT-T--ACAGAA--GT---AATTTGCAC-TTC-TA--TT-ACCGC-TACCCCC----C---------CCCCCC------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----GCC-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----TCC------TTT---A-AAA-A--TAT-T-AATG-A-TAAG--------AAATTTTTTAC---TTAACCG-AA-TA-AGGTG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC------------------ATATATCA-CT-GG---TTTTTTAAAAA--GT-GAA---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC---TG-ATA----TTG-AT-GGGCTG----A--TT-T------G---GAG-------T---GT-------T----T-TAC-GGAT-CTTT-T--G------A--TAA-C----A--AA-TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----T----AAA--AAAATG-TA-TG-TT-CAA--TTTTGG---AAAG-A----AAA-----------AG--AGTAGG--------A-ATTA--AA---GTA---GT-CATTCCCTG--CTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-T-A-CC------TATTT-T-TTTACAG-A-GTAT--A--TTGC-G-CA-TTCGTCCTAC-T---A-C-CGGCTAGCCGCGCTACA-CC-----------CCCCGC--CCCCGC----CCAC------------------------G---CTA-T---------C-G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTTGGCTCTA-TG-T--A-CA-T-GACATT--AA--A-C---TCCCTTT-ATAGT-T-T-------A-TTTT-A-TCTGGTCTT-GATGGTCCTTCGTGTT--ACAACATGA-AATCTACTT---A-ATTAAAA-ATGATATGA-ATAGATAATAAATATTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-AT-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAAT-TG-T-A--TCAAGA---A-TT------TA-C--TTACCACCTAAT---AC-AAA-GGC-A-ACGT-T-AAA--A----------GC-CG-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------CGC----ACAG-TG-G-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--AGGG-TG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-T--CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-G---AAAG-AAGA-GG-GCAAA-AG-C-A-G--T-AG----TT-A----ACTG--TCGC----AG-TGGATATTTT---TTTT-TTTATT-GTTTGGA--ACCCC---C---A-CCC-CAC-C--------C-----T-TTC-C-TTC-AA-AGATA--------AA-------AA--T-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-T--CA--TTTTAAA----T--G-A-AT--TA-------AT---AAATA-T--AT--T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--T-A-ATATA-C----------------TAA----T-A-A----T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--TCAAA---CAAA-TA-------AAAAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC------------AAT-AA-ACA---CAC----A-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTAC---TTAA-TG-AA-TA-AGATG-GTT--G--A-AA----A-A-TAT--ACA------------T-TATATCA-TG-GG--TTTTTTTTACGA--GT-G-A---AAT---TA-AA----AACGTT-TC---AGTGATCTC-AATA-ATA-TT-TTT-G--GGGCTC-AT-A--TT-GAAAGAAG---AAG-A--AAATAGCGTA--A-AAT----T---C-G-----CTT-C--G---AATA--TAA-C---AA--AA-GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AAA--AAAATG-TATTG--T-CAA--TTTGAA---AA---A----AAA-----------AG--TAAAAGTA------A-ATA---AA---GTA---GT-CAT---CTGCTCTTTCA-TTA--CA--G-AACTGTC--AATA--AA-A-TGC-TAA-CT------TA--T-T-GTTACAG-A-GTA---A--TTAT-G-CA--T----CTACTT---A-C-C--------------CC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCA------------------------G---CCGCGAAAGTTGACC-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TATA-CA-T--ACATT--AA--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACATTGAA----CTA--CTT-GAT-----------TTCGAAAA----A-AATATA-TGGATA-AT---AGAATAA-A--G-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-A-A-CA-TA-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------T-TG-T-ATTTTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA--GC-A-AAGTAT-AAACCA----------CC-TC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GT-G--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA----GG-GG-AA--ATT---------CAAAAGG-A---C-TC-CCAG--T-G-T--GGAAA---AA-T-A-A-T---AAAA-AGGA-GA-GC--A-AG-C-A-G--G-AA----AT-A----ACGGATTC-C----AG-T-GA---TTT---TTTA-TTAAAT-A--T-GA--A-------A---C-CAC-CAC-C--------C--TCTT-TTC-C-TAA-AA-AA--ACAAGAAATAA-------AA--T-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----TTGA-ATAA--AA-------ATA--AAATT-T--ATGTT-T-ATC-TA-TT--TACAT-TA--T-A-GT------------AAA----AAT------T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA-----AAT--A-A-AA--ACAAA---C-TA-TA-------AAAAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T--------------AA--AA-A------ACA--AA-ACACCACA-T----A-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GT--A-CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-TT-TTG-A--GGGCTG-AT-A--TT--------G---AAG-A--ACATAG--TC--G-AAT----TCT-C-GG-T-CTTT-C--A---AA-AA-TAAAC---AA--AG-TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG---GGGGGA----AAA-----------AG--TTAAGG--------ATATAA--AA---GTA---GTTCAT--CC-G--CTT-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGCCG-CA-TC----ACAC-------C-C--------------TAACC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG-A---------TAG-T-C----TG-----------ATTTGGCTCTAATG-TA-A-CA-TTGACATT--AA--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T-TTAAC-AC--TGAGTA----A--CTT-A-------------TT--AAAA----ATAATA-A-TG---A-A----GG-ATAATA--ACATA-----------TTTATCCAATT-A-AT-ATATC-AA-TAATTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA----C-AA--GGCAA-AAGT-T-TAA--A----------CC-TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TGAG-A--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGAGGG-GC-AA-AG-C---G--T-AG----TA-A----ACT---TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TAAAAT-GTTT-GA--CCCCCA--C---C-CCC-CCC-CA-------C--CCTT-TTC-C-TC---A-AG--A--------AA-------AA--T-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TTTT-AAG---T--A-ATAT--AA-------AA---AAATC-T--A---T-A-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-ATA----TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAACCCATAAT--A-A-AACCACAAC---CCA---A-------AAAAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC-----------------G-AC----CACA--AA-A------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGC--C-GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11    11                             111                                   1111   111                                                                   11111111                                          11                                      111111                                                           1                         111111  111111             1111       11  2222222222                  11111   1     11                      11111                                                       11111111     1111     1                                               11111                              11111                1111111       111111                                          1111111111          1111111                                                           3333333333333333333                         111111                                               1   11                                                          11111111                                          11    1111      44444444444444444444                                                                                                             11111111                            1111                 111111    11                                     1111111        222222222                                111  111        11111111111          11111111     111  111                                  1111             11               111111                                    1111111    1111111   22222222222222222  11111111111                    44444444444444444444444444444444444444444444             22222222222                                                                                         11111111111  11                   1111111111                22222222222                                                                             1111111111111                                11111                                                   22222222222222                                                                 1111111                                                                     111111111       11111                              111111111                                 1111    1111          1111                                                          33333333333333                      22222222  1111111                                                    1111         3333333333333333                                               11111111           11111111        111111                                                       11111111        11111111111111111                          222222222222                                                                        111111           1111               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       44 22    11     77       1           3  777            6  1      3 3       3  0000   222            44        3        44    3          44 999        3 55 11111111   666  3 3   3    55  55  3   3  88      00      3  3  55 3 3   55    3    55 7  000000        7   3      3   3       9999999999999999  1 88      0        3 3      3 3 3 3 444444  000000 55 3 3  55  5555       22  0000000000   55   4   4 55  44444   2     33   4   4  8  4 55     00000   4  4 99 4  4  4   4       3   7   3   3  8888888    66666666     2222     0         55   88 3  3 3  7   666    3  3  3 55 22222     3   3     3      3 55  3 77777  55 3        3 5555555   3 3 000000  3     3  3   6  77   3   3       3   3  3333333333      6   0000000  44   3     2 66    2 33  555  2          2  77  3   2 2  0000000000000000000      888888  33   2     111111    2   5    6666 2 8 33  2  2   66       33 2 4   22 33 2    66 77777 2 888888   555 2   2 66   2      2 2 2  00000000  44444      444   66  2  2  2     2    2 55 2  1111   2  55555555555555555555       2  2  999      3    33  7777777   555  3  6666 6    3  555         3 3  2   44 2  99999      2  2 66  00000000 555   5 33      5  777 3   0000 555 3 55 3    6 222222  3 77   3 555  44  3  3    3 3 6    3 44  0000000 3  3   333333333   44      3     3  7   55      555  111 7777   77777777777  55      88888888 3   222  000   666  3   55    55      2   88  7777  0    55    00  3 7 7 3   3  777777  44 3 3       3 3   999 44    3 3  4444444    2222222 3 00000000000000000  33333333333    2 33    2 6666  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 33 3    77777777777           3  3  3 6  3 3      44  44 3 555 6     6 3   3 3   3 3   3    3 3    88   3   77777777777  00    7777 3      7  1111111111  3    6 55 3   00000000000      3  5 3 3  7 3   3  3  6 4   77  77     3  3   44   3  3 3  888    3 3  6666666666666   33   88888    3  3 3 44   44 00000  999999  3 44 44   3     555  3  44     3    3 3  33333333333333  3  3  3  3   555   3 5555         3  44 999999   3    44       0000000 3 7777    3  3 3 44 555  6  3 44  3  3 3  9999  3  77    3  3  77   555555555    44 00000 3  3    77 3 3 44  3  555  3 555555555    6    3  3  6  3  3 99999999  0000  3 2222   555    0000  3 6   88   555    333    3    3  77     888888888   3   11111111111111   3   3 3  66  3  77 00000000  6666666  44 3 6 6      44    777 3    77777 3  3  44    6  5555 44 3    0000000000000000     2 33 777 2 2   5  77 33 5   2  33 1 2  1  77777777    6666   00000000 2 6666 333333     5  2     99 2      6666   7777 2  33     555    2 22222222      2 44444444444444444 5 33   66   5      5 2 2 222222222222  66  2   777    33  9999999999 444  3   3   3   3          44 77       888888 3 44   44 0000  3 3   88     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .. ..    ..     ..       .           .  ...            .  .      . .       .  ....   ...            ..        .        ..    .          .. ...        . .. ........   ...  . .   .    ..  ..  .   .  ..      ..      .  .  .. . .   ..    .    .. .  ......        .   .      .   .       ................  . ..      .        . .      . . . . ......  ...... .. . .  ..  ....       ..  ..........   ..   .   . ..  .....   .     ..   .   .  .  . ..     .....   .  . .. .  .  .   .       .   .   .   .  .......    ........     ....     .         ..   .. .  . .  .   ...    .  .  . .. .....     .   .     .      . ..  . .....  .. .        . .......   . . ......  .     .  .   .  ..   .   .       .   .  ..........      .   .......  ..   .     . ..    . ..  ...  .          .  ..  .   . .  ...................      ......  ..   .     ......    .   .    .... . . ..  .  .   ..       .. . .   .. .. .    .. ..... . ......   ... .   . ..   .      . . .  ........  .....      ...   ..  .  .  .     .    . .. .  ....   .  ....................       .  .  ...      .    ..  .......   ...  .  .... .    .  ...         . .  .   .. .  .....      .  . ..  ........ ...   . ..      .  ... .   .... ... . .. .    . ......  . ..   . ...  ..  .  .    . . .    . ..  ....... .  .   .........   ..      .     .  .   ..      ...  ... ....   ...........  ..      ........ .   ...  ...   ...  .   ..    ..      .   ..  ....  .    ..    ..  . . . .   .  ......  .. . .       . .   ... ..    . .  .......    ....... . .................  ...........    . ..    . ....  ............................................ . . .. .    ...........           .  .  . .  . .      ..  .. . ... .     . .   . .   . .   .    . .    ..   .   ...........  ..    .... .      .  ..........  .    . .. .   ...........      .  . . .  . .   .  .  . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .  . . ..   .. .....  ......  . .. ..   .     ...  .  ..     .    . .  ..............  .  .  .  .   ...   . ....         .  .. ......   .    ..       ....... . ....    .  . . .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ..    .  .  ..   .........    .. ..... .  .    .. . . ..  .  ...  . .........    .    .  .  .  .  . ........  ....  . ....   ...    ....  . .   ..   ...    ...    .    .  ..     .........   .   ..............   .   . .  ..  .  .. ........  .......  .. . . .      ..    ... .    ..... .  .  ..    .  .... .. .    ................     . .. ... . .   .  .. .. .   .  .. . .  .  ........    ....   ........ . .... ......     .  .     .. .      ....   .... .  ..     ...    . ........      . ................. . ..   ..   .      . . . ............  ..  .   ...    ..  .......... ...  .   .   .   .          .. ..       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       66 55    22     99       8           3  888            7  8      1 1       3  8888   555            66        3        66    3          66 222        6 00 99999999   444  6 6   6    00  00  6   6  66      00      6  6  00 6 6   00    6    00 3  555555        3   6      6   6       1111111111111111  0 66      9        6 6      6 6 6 6 111111  555555 00 6 6  00  0000       33  9999999999   00   0   0 55  00000   0     55   0   0  0  0 55     11111   0  0 55 0  0  0   0       6   3   6   6  2222222    88888888     2222     9         00   66 6  6 6  3   444    6  6  6 00 99999     6   6     6      6 00  6 00000  00 6        6 5555555   6 6 555555  6     6  3   7  99   3   3       3   3  1111111111      7   4444444  66   3     9 88    9 99  000  9          9  33  1   9 9  7777777777777777777      222222  99   9     111111    9   7    1111 9 6 99  9  9   88       77 9 3   55 99 9    88 11111 9 222222   000 9   9 88   9      9 9 9  44444444  99999      777   33  9  9  9     9    9 44 9  8888   9  22222222222222222222       9  9  222      3    99  4444444   000  1  5555 2    1  444         1 1  9   22 9  66666      9  9 88  88888888 000   7 99      7  000 1   8888 888 1 22 1    2 777777  1 77   1 444  22  3  3    3 3 7    3 66  8888888 3  3   333333333   66      6     6  3   00      000  444 7777   33333333333  00      22222222 6   555  000   444  6   00    00      1   66  3333  3    00    00  6 3 3 6   6  777777  66 3 3       3 3   222 66    3 3  5555555    5555555 3 44444444444444444  66666666666    9 99    9 1111  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 88 3    55555555555           3  3  3 7  3 3      66  66 3 888 7     7 3   3 3   3 3   3    6 6    66   6   33333333333  00    7777 6      3  2222222222  6    5 00 6   99999999999      6  6 6 6  3 6   6  3  7 2   99  99     3  3   66   3  3 1  222    1 1  9999999999999   66   55555    1  1 1 22   22 00000  666666  3 66 66   3     888  3  77     3    3 3  88888888888888  3  3  3  3   888   3 5555         3  66 666666   3    66       8888888 3 1111    3  3 1 22 444  2  1 22  1  1 1  6666  1  33    1  1  33   444444444    22 55555 1  1    33 1 1 22  1  444  1 777777777    7    3  3  7  3  3 66666666  4444  3 9999   000    4444  3 7   44   888    888    1    1  33     999999999   1   33333333333333   1   1 1  55  1  33 00000000  5555555  22 1 2 2      22    111 1    44444 1  1  22    2  8888 22 1    3333333333333333     9 99 999 9 9   7  99 99 7   9  99 9 9  5  66666666    1111   88888888 9 1111 000000     7  9     66 9      1111   0000 9  99     000    9 66666666      9 99999999999999999 7 99   88   7      7 9 5 555555555555  88  9   999    99  8888888888 666  1   1   1   1          66 99       555555 3 66   66 4444  3 3   66     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G---AA-AA-TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( family-1826 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--G---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTTCAAAGAATT--TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATTC-ATG-TA--GAAAAAAATAAGCCGTG-TA----A-CTCAAGATA-TATT--C-TTTTATATAGTAAGAA-ATT-AA-TGA-TAA-TTTTTTTCTTT-A---C-A----CAGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCTA------T--A-T-CA--TTTGTAGTTCATT--AATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTCAGGGTGAACCT-ATTGA-TGGATTCTTAATGGGA-ACCT--G-AT-ATCTTG-AAAAAAG-TAGTGTC-AGG-ATGAT----TGGTGCCTGTAACTTTC----AGAATTATGAAAAAGAATGA--CCACTA-AT-ACTCTATCCA-GTCAG-TCCT-AAGCAAAAT-TGT--TCGT-CAAATT-T--TATA--AC-AA--ATAAACTAAA-GCCGCAAGGAA-T-AACAGGGCG-AAGT---C-CAT-CCGTTGC-GTT-CACT-AC-AGA-AA--TTGGT---AAAAAGGAATGGC-T--AAAACCT-ATCTTCT--ACAG-AAAGT---AT-TTG---ATTC-TAG-TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCCCCCCCCTG--CGT-AATTT------GA-G-TCA--TTG----G-C-ATTATGTT-GGT---GTATGT--A-A-CCT--GCAG-TATGATT-----T-C------TTT---A-AAA-AA-TAT-AAAATG-A---AGTACCCAATAA--T--AATTAC---TTA--CG-AA-TA-AGGTG-GTTTAG--A-AAAAGAGGAGTAA--CCAGGGTAG------TGCAT-TCA-CT-GG--TTTTTTAGGAAACGGT-A-ACTAAAT---TG-GATATAA-CGTTATC---ACTGACCTC-A-TG---A-TT-TTG-T--AGGCTG-AT-A--TT------------GAG-A--AAATAG-GTA--ACAGTGTCCT-T-C-GT-T-CTTTGCAAG---AA-A--TAA-CAAGAA--AG-TT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AAATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG---AA---A----AGAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAA-AAAT--AA---GTATGTGT-CAT--CCTC--TTTTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAACCC------TA--TGT-TTTACAG-ACGTAATGA--TTGC-G-CAGTT----CTAC-TTACA-C-C--------------TA-CCGGACACTAACACCCC-CGTCCCC-C----TC-C------------------------C---CCA-G---------C-G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTTGGCTCTA-TG-TA-AGCAGT-GACATT--AAGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATATTA-C-ACA-TGAA-A-TTTA--CTT-AA------------TT--ACAA----A-AATATA-TG---A-AC---GG-ATAA-A--A-GTT-----------GTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-TAGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-AT-TG-T-A--TCA--A---A-TT------TA-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AAT-GGTAA-AGCG-T-AAG--A----------CC-TG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTGG--CCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--T--G-A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATAGGG-TA-AG--ATC---------CAAA--GCG---C-TC-CCCGATT-G-T--AG-AG---GA-T-A-G-AGGCAAAG-AAGA-GG-GC-AATAGTC-G-G--G-AGTTATGT-AGTT-ACTG--TC-C----AG-TGGATATTTTGAATTTT-T--GAT-GTTT-GA--ACCCA---C---C-ACC-CCC-A--------C--CCTT-TTCTC-TTC-AA-GG--A--------AACACC---AA--T-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---G-A-TA-CATGTTTC-AA----T--ATATAT--AA-------ATCA-AAATA-TGGA---T-T-ATCATA-TT--T-TAT-TA---AA-ATATA-CGA-T--AAAA----AAT------T-A-A----T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAA----ACT--A-ATAA--ACAGA---CAAACTAAAAGAGTAAAAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG-----------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------ATT-T-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGC--A--CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -ATA-TT-TTG-A--GGG-TG-ATGA--TTAT------G---AAG-A--ACATAG-GTCTCA-AAT----T---C-GG-T-CTTT-C--A---AA-AATTAA-C---AA--AG-TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG---GA---A----AAA-----------AG--TAAAGA--------A-ATAT--AAA--GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TT-C-G-CA-T-----CTA------A-C-C--------------TA-AC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG---------------T-AA-GT-------------GATTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TATA--CTT-AAT-----------TA--AAAA----A-TATATA-TG---A-A----AG-ATAATA--A-ATA-----------ATTAT--AATT-A-ATAA-ATA-CATTA-T-ATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AA---A----------CC-TG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TT-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGG-AG-GC-AA-AA-CGA-G--TAAG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA--TT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---CACCC-CCCAC--------CCACCTT-TTC-CTTTC-AA-AG--A--------AA-------AA--A-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----T------AAT-A-AG-T-GAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG---A-CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA--A-AAATTAATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CC--AAACTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TAAAT-AGCCC--G-TA-TATT--C-TT------AAAAAAAT-AT----ATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---AGA----CACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------TA------T--A-TGCA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTCAAA-TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GTGG-GC-TT-G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAAATT--T----CGGT--------CTTTC--T-GGAAT-ATGAAAAAT---GA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AAAT--T-AA--AAAAAATGT-ATTGT-TCAATT-T--TA-AC-A--AA--G-AAACTAAC-G-------AAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CT--TGC-TTT-TATTTAC-AGA-AA--TT--A---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATATT-T--A-AG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TA-ACC-C-TA-------------------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----G-C-A--GT-TTGGGT--TGTATGT--ATC-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-ATT-AG--------AA--T--ATTTAC---TTA--CGAAA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----AGA-TAC--A---------------ATATATCA-TTGGG--GGGTTTTTGAAA--GT-T-A---AAT---TT-AA----A-CG-T-TC---AGTGACCTC-A-TA-ATA--T-TTG-G--GGGCCGAAT-A--TT-T------G---AAGAA--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-A-GG-T-CATT-C-------A-A--TAA-----AA--AA-TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AAA--AAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATT-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC---G--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC--G--A--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCA-TTTTTTT---A-A---A-A----CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T--A--ACAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTCT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TACATACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-tgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTCG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCAAAGAAAT--TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A---TT---TT-A-TGA-TTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--CTTT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTTT---T-A---C-AACAGCAGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----G--TTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-A--GA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TAAGAAT-ATG-AAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-TA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--C--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-G-A------TGAAAGTA-AT-CAT-CC--TGC--TT-CATTTAC-AGA-AA--TT--TA--AAAAAA-AAT--C-TA-AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATAA-AA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGC-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--C--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC--ATAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TT-G----TTTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAGTAGTCA-ACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTGG-AATATTAAATTAATAAT-----AATACCA-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCCAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA---AAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CT---AATACTAT---C-TT------AAAAA-----TT-AAATGA-TAT-TTTTTTT---T-A---C-A----CAGG--A-TAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----TA------T--A-T-CA--T-----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--T-A-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGCG-G----------AG-TTG-AAGAAAG-TAG--TC-AAA-TT-------CGGT--------CTTTCATT-AAAAT---GAAAAA-----------C-A-TT-TAC---TCCA-GT-AA-A--A-AT--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TAACA-A--A--AT--A-GAACTAAA-G-------GAATT-A------TG-AATTA-AT-CAT-CC--TG--TTT-C--TTAC-AGA-CA---T--T---AAACAA-AA---C-TAAAA--CCT-ATTTT-A--GCAG-A--GT---AA-TTGACCACTC-TA--TT-ACC-C-TA--------------------CCCTA------GG--CGCAAATAT------GACG-TCA-GT------G-C-A--AT-TT-GGTTATGTAT-T--A-C-CCC--G--ATTATA--T-----C-T------TTA---A-AAA-A--TA--TAAATG-A-T-AG--------AA-----TTCTAC---TTA--CG-AA-TA-AGAT--GTTT-GAAA-AA----GGA-T-------------------CATATATCA-TT--G--TTTTTTTTAAAA--AT-A-A---AAT---TGAAA----A-TGTT------AATGACCTC-A-TC-ATA-TT-TT--G--AGGCT--AT-AT-TT-T------G---AGG-A--AAATAG-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAAT-TG-T-A--TTA--ATAAA-TT------TAAC--T--CCA-CTAAA---ACTAAATGGCAAGAAGT-T-AC-CCA----------CCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TG-GTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GGGAA--ATT---------CAAA--A-GA--C-TCTCCAG--T-G-T--GG-AA---AA-T-A-ATA---AAAGCGAGA-GG-AC-AA-GG-C------C-AG----GC-AGCATACTG--TCGC----AG-T-GAT---TT---TTTT-TTAA-T-GTTT-GATAACCAC---C---A-CCC-CTC---------------TTATTC-C-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATAAA--A-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---G-AGTA--A--TTTT-AA----T--A-ATAT--AATAA----ATTAAGAATT-T--A---T-T-ATC-TA-TTAAT-TAT-AG--TAA-AT---------------------T------C-A-A----TG-----ATTAA-A--TAGA---T-A-TAAC----AAT--ATC-AC--ACAA----CTAA-TA-------AAAAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC--AAA---CAAA-T-T---------------A--AA-ACAAATCACATTAC-A------C-T-TTGA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGT--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-TA-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TC------TA-C--T--GCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-ACGT-T-AAACCATCCAGATCATCC-TA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAA-------C-CATGTACAA-TG-G-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGA-GG--A--ATT---------CAAA--G-G---G-CC-CAAG--T-G-T--TG-GA---AA-T-ATG-A---GAAG-GAGA-GG-GC-AT-GG-C-A-G--G-AG----GT-A----TCTG--TCGC----TG-T-GAT-TTTT---TT-------AT-GTTT-G----CCCC---C---T-CCC-CC-------------------TTC-C-TT--AA-AA--A--------AA-------A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATGT--AA-------ATTA-AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-CAT-TA--TGA-AT------A-T--AAAA----AAT----------A----TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAAC----AAT--A-A-AT--ATAAAAGCCAAA-C---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C------------AAACAA-ACA---CACA--AA-A------A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGT--A-A-TCCA-G--A-TATA--T-----T-C------TTA---A-AAA-AGATAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--T--TTT-AC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-G-----TTATTTAA----GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-CC---AGTCACCTC-A-TG-ATA-TT-TTT-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAAAAA-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-T-GG-T-CTTT-C--GA--AA-A--TAG-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----T-----TA--AAAATG-CATCG-TT-CAA--TTTTGAC--AA---AAAATAAA-----------AA--TAAAGG--------A-ATATA-AA---GTA---GT-TGC--CCTG--CCTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--TAAC--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---T--ATGC-A-CA--T----CGAC-T---ACC-C--------------TT-CC-----------CAAC-C--CCTA-C----GTAT------------------------G---TTG-A---------C-G-C-GA-GTTGT----GTA-----TTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--ACGGTGG-AAC-ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-TTGAG-GA---AA-T-A-A-G---AAAA-AAGA-GG--C-AA-AG-C-AAG--T-AG----GT--------TC--TCGCGACTAGCT-GATATTTT---TTTT---AAAT-GTTT-GA--ACCTT---CGGGC-CGC-GCC-A--------C--CCTT---C-C-TTC-GATAG--GCGAATG--AA-------AA--T-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCG-A-TAGTA--TTTT-AAA---T--A-A-AT--GATCAAAGAAT---AAACCCT--A---TGT-ATG-TA-TT--TCTATCTA--TCACATATA-C-ACT--AAGA----AATAAGTAATGA-A----TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAAC----AATA-A-A-AA--ACAAA---AACA-T--------AAAAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC------------AA--AACACAG--CGCA--AAGA------A-T-T-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGC--A--CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CC-C-CC---------C---------CCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACA-AAA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATATCTA-A-CCCC-G--A-TATA--T-----T-G------TTC---A-AAATA--TAT-TAAATG-A-T-G------------------TTAC---TTA--CC-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-GG--TTTATTT---AA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA--T-TTG-T--GGACTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATTG-GTC--A-AAT----T-T-C-GA-T--TTN-C--A---GA-A--T-A-C---AA--gcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatttggctgtatattntcccccccccccccccAGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC---AAAAATCTTCAAAAGAAAT---CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C---AAAATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATTATC-TT------AAAAAAAA-ATTTGAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CAGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------TA------TTCA-T-CA--TT----GTTTTTTT-AA----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTCAGC-TGA-CCT-AT-GAAT--ATTTT----TGGG-GC-TTTG-A--AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGTC--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TTA--C-AC-A-TT-ACC----CCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATTAT--TA-A--C--AA--A-AAACTAAAAG-------GAA-T-A------TG-ACGTA--T-CATTCC--TGC-TTTTCATTTAC-AGA-AA--TT------AAAGAA-AATG-C-T--AA--CCT-ATTT-----ACAG-A--GT---AA-T-GCACATTC-TA--TT-A------A---------C---------CTCCC-------TG--CGT-A-TTT------GACG-TCA-GTTG----G-CTA--GT-TT-GGT---GTATGT--A-A-CCC--G--A-TATT--T-----T-T------TTT---T-AAA-A--AAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TCTTTTTAC---TTA--CG-AA-TC-AGATG--TTT-G--A-AA----GGA-TAC--ATA------------TAT---CCA-TT-GG--TTTTTT--AAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----G-TTTT-TA---AGTGACCTC-A--G-ATA-TT-TTG-GAAGGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AA-TAG-GTC--A-ATT----T-T-C-GG-T-CTTT-C--A---AA-AA-TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA---------AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-AT-T--AA---GTA---GT--AT--CCTG--CTTTCATTTA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-AGA---AAGTTGC-GTCA-TT----ATAC-C---C-T-C--------------CC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------taaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacaccccccc-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCC------------------------C---CCC-G---------C-G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTTGGCTCTA-TG-TA---CA-T-AACATT--AA--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTAA-CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATACA-TG---A-AT---AG-ATA-TA--A-ATA-----------TT-ATC-A--T-A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-T-A--TTA--A------T------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA--GGCAA-AAGC-T-AAACC--------------TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTTG--TCATGAG-------C-C----ACAGATG-G-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--GGGG-GG-AA--ATTT--------CAAA--G-G---C-TC-C-AG--T-GGT--GG-GA---AAAT-AAG-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TAAAAT-G-TT-GA--ACCCC---C---A-CCC-CCC-A--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AGA-A--------AA-------AA--T-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TT----A----T--A-ATATTGAA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TATTT--T-TAT-TA--AGA-ATATA-C-A-T--AGAA----AATAA----T-A-ATAAGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAGAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AACA------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGC--AGCCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAACcccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|21                         : aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccGTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGC-AA-AATAAATTAATAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC---GAAA---TTCCAACGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-GTG-CA--GAAAAA--TAAGCT-TG-TA--T-A-CCC--GATA-TATT--C-TT-------TTAAAAA-ATT-AAATGA-TAA--GAGTTT---T-A---C-T----CACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------TATACATGT--A-C-CA--TT----G-TTTTT--AA----------GTG--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T-T-GTTATAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-T-----CTAC-T---A-CTC--------------TA-CC-----------CCTC-C--CACC-A----CCACCACCACCCCCATCAGCGTAATTAAG---TTG-A---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-AAA-AGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AGAA----A-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAAT-TG-T-A--TTA--A---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA--------AAAA----AA-AA------A-A----TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAGC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CTAA-TA-------AAAAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T----------------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C------ATT-T-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCC--A------TG--CAT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----A-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--TATGGGT-CATATATTCT---AGAAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--T--TTTTAC---TTA--C
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTGG-AGT-ATGAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTT-T--ACAA-A--GT---AA-TTGCAAATTT-TA--TT-ACC-C-TA---------CACCCCCCCCCCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATAT--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTAG-CACACACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTGGGAATA-TGAATTAATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTC-AAAGAAATAGT-AACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATG-CACAGAAAAA--ATAGCC-TG-TA--TTA-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAATAAA-ATT-AAATGAATAA-TTTTTTT---TTA---C-A----CAGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------TA------T--A-T-CA--TTT---GTTTTTTT-AA----------GTG--AAA-TTG-A--AAA----CGT-T-CAG---GA-CCT-ATTGA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--GGAT-AT-TTG-AAGAAAGATAG-GTCCAAA-TT--T----CGATT-------CTTTC----AGGATGATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GC-AA-T--TTAA--AAAAC-TGT-ATCGTCTCAATT-T--TA-C--A--AA--A-AA-CTAAA-AA------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATT-AC-AGA-AA--TT--CTTAAAAAAA-AAT--CCT--AA--CCT-ATTTT-TT-ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTCGTA--T--ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------T---CGC-AATTTT-----GACGGTCAAGTTG----G-CCA--AA-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCCCCG--A-TATA--T-------C------TTT---A-AAA-A--TACCTAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CA-AAATA-AGATG-GTTT-G--ACAA----TGA-TA---ACG-------------ATATTTCA-TT-GG--GTTTTTG-AAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCTG-AT-C--AT-T------G---AAG-A--AAATAGCGTC--A-AAT----T-T-CAGG-T-CTTT-C--A---AA-AA-TAA-C---AACAAA-TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAAA--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA-AA---A----AAA-----------AG--GAAAGA--------A-ATATA-AA---GTA----T-CGT--CCTG--TTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-C-TAA-CC------TA------TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-GT----CTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-A--CCCC-C----ACCC------------------------C---CAA-G---------C-GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTTGGCTCTA-TT-TA-A-CA-T-GCCATT--AA--A-------ACTTT-A-AGT-T-TTA-T-ACA-AGAA-A-TCTT--CTTAAAT-----------TTAAAAAA----A-AATATA-TG-------------------------A-----------TTTATC-CATTAA-AT-A-ATACCA-CA-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAA--TG-T-A---TA--A---A-TTTAGTGCTA-C--T--CCA--TGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA-------------TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTGC--CCATGAG-------A-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--GCGC-GG-GA--ATT---------CAAA--G-G---CTTC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAGAAAGA-GGAACAAA-AG-C-A-GACT-AGC---GTAA----ACTG--TCGCA---AG-T-GATATTTT---TTTTCTTAAAT-GTTT-GAT-ACCCC---CA--C-CCCACCC-CCA------C--CCTT-TTC-C-TTCGAA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---A-A-TA-CA--TTTT-AAC---T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-A-C-TA--T--T-TA--TA--TAA-ATATA-C-A-TCCAAAAACATAATAA----T-A-A----TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA------AAC--A-A-AA----AAA---CAAA-TT-------AAAAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-TGT-GT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGC--A--CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agcgAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA---T--T---AAAAA----------------------TTT-T--GCAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCAC--CCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-AACTATAAAT-AATAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG--TTTCAAGAAAAT--TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC---GAACTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA--AAAAAAAATAAGCC-TG-TA--T-A-CT---GATA-TATT--C-CT------TTAAAAAA-ATT-AGATGA-TAA-TTTTTTT---T-ATAAC-A----CACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--AAT-CA--TTT---GTTTTTT--AAAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTCAG--TGA-CCT-AG-GA-T--ATTTT----TTGG-CA-A--G-AT-AT-TTGGAAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------ATCTC--T-AAGAT-ATTGGAAAT--TGA--C-AC-A-TTTACC---TCCA-GT-AA-T--T-AACAAAAAA-TGTTATCGT-TCA-TT-T--TA-A--A--AACAA-AAAATAAC-G-------GAA-TTA------TG-TAGTATAT-C---CC--TAC-TTT-CATTTAC-AGA-AAATTT--T---AAAAAA-ATT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCATATTC-TA--TTTACC-CCTAAACCTCCCCC---------CCCCCA------TG--CGT-AAATT------GACG-CAA-GTTGTATGG-C-A--AT-TT-AGT--TGT-TGT--A-A-CCCC-G--A-TATAA-T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAC--AGATG-A-T-AA--------AA--T--GTATACGACTTA--CG-AA-TATAGATGAGT---A--A-AA----GGA--------A------------CATATATCAGTT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TTTAAGGTGACCTAGA-TGGATA-TC---A-G--GGGCTG-AC-AATTT-T------G---AAG-ACAGAATAG-GTT--A-AATAT--T-T-C-G--T-CTTTGC--G---AA-AAATAA-C---AA--AA-TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AAA--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAAAA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------G-ATAT--AAAAAGTA---AT-CAT--CCTG--CTTTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGT-TTA-CCGTCAGGTA--T-TATTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TC----CTAC-T---A-C-C------------------------------CCCC-A--CTCC-G----CTAA------------------------G---TTG-A---------C-G-T-CA--TTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACAT---AA--A-A---T-CCTTT-A-GTT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-CAT-----------TT--AAAA----A-AATATATTG---A-AT---AG-ATAA-A--A-ATA-----------TTTATC-A----A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AAT-TG-TAA--TTA--ATT-ATTT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC--AA-GGCAA-AGGT-T-AAACGC----------CT-TG-TC-C--AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTAA--CCATG-G-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--AGGG-GG-AA--TTTTTTTCCCCCCAAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGG-T--GG-GA---AA-T-----------------G-GG-GC-AA-AG-C-A-T--A-AG----GT-A----ACT---TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TTAAATGGTTG-GA--ACCCC---C---C-CCC--------------------T-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--TGC-A-TTACTT--T-AC-A-T-ATCA---GAA-TA-CA--TTTTAAA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-TAATCTTT-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACC-A-TA-AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAAC----AATAAA-A-AA--ACAAA---CAAA-T---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-T------A-T-T-GA-ATA-AAT--AA-AAATAAATGCAAA-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATTTTAAATTA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCA-TTTTTTT---A-A---A-A----CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAA-G-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTCA-T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-C-AC---TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C----AA--CCT-ATTCT-T--AAAG-A--GT---AA-TTGCA-ATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TG-ATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACT-ACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-C-GG-T-TCTT-C--G---AA-A--TAA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT---A---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCT-A----CCAC------------------------A---CCA-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTT-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----C-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-TT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-CG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GTCAG-AAGT-C-AAACCAC---------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGA--TCATGAG-------C-C----ACAG-TG-A-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-GG-C-A-G--T-AG----GT-A----GCTG--TCGC----AG-T-G-TATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTC-GA--ACCCCACTC---C-CCC-CCC-CCTCTCTCTC--TCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-GA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATAGA-T-A-TG-AAAA----AAAAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAAC----AAT----A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTGG-AATATAAAATT--TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TC---GAAAA--TTCCAAAAAAAT--TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--CAAAAAACTC-T-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGCCAT-GAAAAA--TAAACC-TATTA--T-A-CCC---ATA-TATC--CTTT------ACCAACAT-ATT-AAATGA-TAA-GTTTGTT---T-----C-A----TAAG--AATAAAGAT-GTTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CACCTT----GTCTTTTTAAA----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGTCTCCAG--TGA-CATCAT-GA-T--ATTTT----AGGGCGC-T--T-GTCAT-TTG-AA------TAGCGT--AAA-CT--TGCGGCGGT--------CGTTT--T-AGAATAATTAAAAAT--TGA--C--C-ACTT-ACC---T-CA-GT-AA-T--TAAA--AAAAA-CGC-ATCGT-TTAATT-T--TT-G--ACCAC--A-AAGCTAAA-C-------GAA-T-A------TG-GAGTT-ATCCAT-CCA-TGCTTTT-CATGTAC-AGA-AA------T---AAAAAA-AAC--A-T--AA--CTT-ATTTT-TTCACAG-A--GTCAGAA-TTGCACATTC-TACTTT-TCC-C-TA-------------------CCCCCA------TGCACAT-AATTTGCACGCGACG-TCATGTTG----G-CAA--AT-TT-GGTC-TGTA-GT--A-ACCCC--G--A-T-TA--T-----T-C------CTGAAAA-AAA-A--TAT-TTAATGTA-T-TA--------GA--T--TTTTAC---TTA--C--AA-TA-AACTG-TCTT-G--A-AA----GGA-T-T--ACA------------TA-ATATCG-TT-GG--TTGTTTGTAAAA--GTCG-A---AACAAATG-AA----ACCGTT-TC---AGTTATCTT-A-T--ATA-TTCTTT-T--GGGCTG--C-A---T-T------G---AAGAA--AAACAT-GTC--A-AAT----T-C-C-AA-TATTTT-C--GACCAA-A--TAA-C---AA--AAGTT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----T-TA-AGA--AACATA-TATTG-TT--AA--TTTTGA---AA---A----AAA-----------AAGTTAAAGG--------A-ATATAAAA---GAA---CT-CAT--CCTG--CTTTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA-TC------CA--T-G-TTT--AGCA-GTA---A--T--C-G-CA-TC----TTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-CTTTATCAG------------------------GAAAGTG-A---------C-G-T-CA-ATGG-----CCA---CATTGGCTCTA-TGCTA-ACCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AG--T-TTA-CAATA-TGAA-ATTTTA--CTT-ATC-----------CT--AGAG----A-ATCAAA-TG---ATAT---AG-ATAATA--A-ATAC----------TCTATC-AACT-GCATCA-ATA-C--TA-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAAT-TGTT-A--TTA--A---C-AT------TA-C-----CCA-CTAAA---AC-AAA--GCAA-AAGT-TAAAACCAC---------CC-TA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTGA--CCAT--G-------C-C----GCAG--G-C-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--AGCG-GG-AACTATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAGC-T-G-T--GC-AAATCAA-T-A-A-A---A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cccAAAT-GTTT-GA--CCCCC---C---C-CCC-CCT-CGA------C--CCGG-TTC-T-TCA-AA-AG--A--------AA-------AACAT-T-A-T-ATTT--CAAC-ACT-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AAAATAT--A-ATATT-AA-------AT---A--TC-T------T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TAATCAA-GTAAA-A-A-T--AATA----AA--A----T-A-A----TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAAC----AAT--ACA-AA--AC------CAAA-CA-------AAATAA-A-------------------C--AA---AAA-AA-AAA-T-TTCAAAAAAAAAAAAAA--AA-ACA---CACA--AA-A------ACT-T-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGC--A-CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                             cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CCGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAATC-AC-A-TTGACC---TCCAGGT-AA-T--T--A--GAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-AACA--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TA-AAGCA-AT-CATACC--TGC-TTT-CATTTACAAGATAA--TT--T---AAAAAAGAAT--C-T--AA--CCTAATTTT-T--ACAGAA--GT---AATTTGCAC-TTC-TA--TT-ACCGC-TACCCCC----C---------CCCCCC------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----GCC-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----TCC------TTT---A-AAA-A--TAT-T-AATG-A-TAAG--------AAATT--TTTTAC---TTAACCG-AA-TA-AGGTG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC------------------ATATATCA-CT-GG---TTTTTTAAAAA--GT-GAA---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC---TG-ATA----TTG-AT-GGGCTG----A--TT-T------G---GAG-------T---GT-------T----T-TAC-GGAT-CTTT-T--G------A--TAA-C----A--AA-TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----T----AAA--AAAATG-TA-TG-TT-CAA--TTTTGG---AAAG-A----AAA-----------AG--AGTAGG--------A-ATTA--AA---GTA---GT-CATTCCCTG--CTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-T-A-CC------TATTT-T-TTTACAG-A-GTAT--A--TTGC-G-CA-TTCGTCCTAC-T---A-C-CGGCTAGCCGCGCTACA-CC-----------CCCCGC--CCCCGC----CCAC------------------------G---CTA-T---------C-G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTTGGCTCTA-TG-T--A-CA-T-GACATT--AA--A-C---TCCCTTT-ATAGT-T-T-------A-TTTT-A-TCTGGTCTT-GATGGTCCTTCGTGTT--ACAACATGA-AATCTACTT---A-ATTAAAA-ATGATATGA-ATAGATAATAAATATTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-AT-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAAT-TG-T-A--TCAAGA---A-TT------TA-C--TTACCACCTAAT---AC-AAA-GGC-A-ACGT-T-AAA--A----------GC-CG-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------CGC----ACAG-TG-G-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--AGGG-TG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-T--CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-G---AAAG-AAGA-GG-GCAAA-AG-C-A-G--T-AG----TT-A----ACTG--TCGC----AG-TGGATATTTT---TTTT-TTTATT-GTTTGGA--ACCCC---C---A-CCC-CAC-C--------C-----T-TTC-C-TTC-AA-AGATA--------AA-------AA--T-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-T--CA--TTTTAAA----T--G-A-AT--TA-------AT---AAATA-T--AT--T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--T-A-ATATA-C----------------TAA----T-A-A----T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--TCAAA---CAAA-TA-------AAAAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC------------AAT-AA-ACA---CAC----A-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --TTTTAC---TTAA-TG-AA-TA-AGATG-GTT--G--A-AA----A-A-TAT--ACA------------T-TATATCA-TG-GG--TTTTTTTTACGA--GT-G-A---AAT---TA-AA----AACGTT-TC---AGTGATCTC-AATA-ATA-TT-TTT-G--GGGCTC-AT-A--TT-GAAAGAAG---AAG-A--AAATAGCGTA--A-AAT----T---C-G-----CTT-C--G---AATA--TAA-C---AA--AA-GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AAA--AAAATG-TATTG--T-CAA--TTTGAA---AA---A----AAA-----------AG--TAAAAGTA------A-ATA---AA---GTA---GT-CAT---CTGCTCTTTCA-TTA--CA--G-AACTGTC--AATA--AA-A-TGC-TAA-CT------TA--T-T-GTTACAG-A-GTA---A--TTAT-G-CA--T----CTACTT---A-C-C--------------CC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCA------------------------G---CCGCGAAAGTTGACC-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TATA-CA-T--ACATT--AA--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACATTGAA----CTA--CTT-GAT-----------TTCGAAAA----A-AATATA-TGGATA-AT---AGAATAA-A--G-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-A-A-CA-TA-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------T-TG-T-ATTTTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA--GC-A-AAGTAT-AAACCA----------CC-TC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GT-G--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA----GG-GG-AA--ATT---------CAAAAGG-A---C-TC-CCAG--T-G-T--GGAAA---AA-T-A-A-T---AAAA-AGGA-GA-GC--A-AG-C-A-G--G-AA----AT-A----ACGGATTC-C----AG-T-GA---TTT---TTTA-TTAAAT-A--T-GA--A-------A---C-CAC-CAC-C--------C--TCTT-TTC-C-TAA-AA-AA--ACAAGAAATAA-------AA--T-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----TTGA-ATAA--AA-------ATA--AAATT-T--ATGTT-T-ATC-TA-TT--TACAT-TA--T-A-GT------------AAA----AAT------T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA-----AAT--A-A-AA--ACAAA---C-TA-TA-------AAAAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T--------------AA--AA-A------ACA--AA-ACACCACA-T----A-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GT--A-CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-TT-TTG-A--GGGCTG-AT-A--TT--------G---AAG-A--ACATAG--TC--G-AAT----TCT-C-GG-T-CTTT-C--A---AA-AA-TAAAC---AA--AG-TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG---GGGGGA----AAA-----------AG--TTAAGG--------ATATAA--AA---GTA---GTTCAT--CC-G--CTT-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGCCG-CA-TC----ACAC-------C-C--------------TAACC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG-A---------TAG-T-C----TG-----------ATTTGGCTCTAATG-TA-A-CA-TTGACATT--AA--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T-TTAAC-AC--TGAGTA----A--CTT-A-------------TT--AAAA----ATAATA-A-TG---A-A----GG-ATAATA--ACATA-----------TTTATCCAATT-A-AT-ATATC-AA-TAATTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA----C-AA--GGCAA-AAGT-T-TAA--A----------CC-TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TGAG-A--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGAGGG-GC-AA-AG-C---G--T-AG----TA-A----ACT---TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TAAAAT-GTTT-GA--CCCCCA--C---C-CCC-CCC-CA-------C--CCTT-TTC-C-TC---A-AG--A--------AA-------AA--T-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TTTT-AAG---T--A-ATAT--AA-------AA---AAATC-T--A---T-A-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-ATA----TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAACCCATAAT--A-A-AACCACAAC---CCA---A-------AAAAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC-----------------G-AC----CACA--AA-A------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGC--C-GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11    11                             111                                   1111   111                                                                   11111111                                          11                                      111111                                                           1                         111111  111111             1111       11  2222222222                  11111   1     11                      11111                                                       11111111     1111     1                                               11111                              11111                1111111       111111                                          1111111111          1111111                                                           3333333333333333333                         111111                                               1   11                                                          11111111                                          11    1111      44444444444444444444                                                                                                             11111111                            1111                 1111                                          1111111        111111111                                111  111        11111111111          11111111     111  111                                  1111             11               111111                                    1111111    1111111   11111111111111     11111111111                    44444444444444444444444444444444444444444444             22222222222                                                                                         11111111111  11                   1111111111                22222222222                                                                             1111111111111                                11111                                                   22222222222222                                                                 1111111                                                                     111111111       11111                              111111111                                 1111    1111          1111                                                          33333333333333                      22222222  1111111                                                    1111         3333333333333333                                               11111111           11111111        111111                                                       11111111        11111111111111111                          222222222222                                                                        111111           1111               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       44 22    11     77       1           3  777            6  1      3 3       3  0000   222            44        3        44    3          44 999        3 55 11111111   666  3 3   3    55  55  3   3  88      00      3  3  55 3 3   55    3    55 7  000000        7   3      3   3       9999999999999999  1 88      0        3 3      3 3 3 3 444444  000000 55 3 3  55  5555       22  0000000000   55   4   4 55  44444   2     33   4   4  8  4 55     00000   4  4 99 4  4  4   4       3   7   3   3  8888888    66666666     2222     0         55   88 3  3 3  7   666    3  3  3 55 22222     3   3     3      3 55  3 77777  55 3        3 5555555   3 3 000000  3     3  3   6  77   3   3       3   3  3333333333      6   0000000  44   3     2 66    2 33  555  2          2  77  3   2 2  0000000000000000000      888888  33   2     111111    2   5    6666 2 8 33  2  2   66       33 2 4   22 33 2    66 77777 2 888888   555 2   2 66   2      2 2 2  00000000  44444      444   66  2  2  2     2    2 55 2  1111   2  55555555555555555555       2  2  999      1    33  7777777   555  3  6666 6    3  555         3 3  2   44 2  99999      2  2 66  00000000 555   7777      5  777 3   0000 555 3 55 3    6 1111   3 3  3 555  44  3  3    3 3 6    3 44  0000000 3  3   555555555   44      3     3  7   55      555  111 7777   77777777777  55      88888888 3   222  000   666  3   55    55      2   88  2222  0    55    00  3 7 7 3   3  777777  44 3 3       3 3   999 44    3 3  4444444    5555555 3 99999999999999  2  33333333333    2 33    2 6666  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 33 3    77777777777           3  3  3 6  3 3      44  44 3 555 6     6 3   3 3   3 3   3    3 3    88   3   77777777777  00    7777 3      7  1111111111  3    6 55 3   00000000000      3  5 3 3  7 3   3  3  6 4   77  77     3  3   44   3  3 3  888    3 3  6666666666666   33   88888    3  3 3 44   44 00000  999999  3 44 44   3     555  3  44     3    3 3  33333333333333  3  3  3  3   555   3 5555         3  44 999999   3    44       0000000 3 7777    3  3 3 44 555  6  3 44  3  3 3  9999  3  77    3  3  77   555555555    44 00000 3  3    77 3 3 44  3  555  3 555555555    6    3  3  6  3  3 99999999  0000  3 2222   555    0000  3 6   88   555    333    3    3  77     888888888   3   11111111111111   3   3 3  66  3  77 00000000  6666666  44 3 6 6      44    777 3    77777 3  3  44    6  5555 44 3    0000000000000000     2 33 777 2 2   5  77 33 5   2  33 1 2  1  77777777    6666   00000000 2 6666 333333     5  2     99 2      6666   7777 2  33     555    2 22222222      2 44444444444444444 5 33   66   5      5 2 2 222222222222  66  2   777    33  9999999999 444  3   3   3   3          44 77       888888 3 44   44 0000  3 3   88     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .. ..    ..     ..       .           .  ...            .  .      . .       .  ....   ...            ..        .        ..    .          .. ...        . .. ........   ...  . .   .    ..  ..  .   .  ..      ..      .  .  .. . .   ..    .    .. .  ......        .   .      .   .       ................  . ..      .        . .      . . . . ......  ...... .. . .  ..  ....       ..  ..........   ..   .   . ..  .....   .     ..   .   .  .  . ..     .....   .  . .. .  .  .   .       .   .   .   .  .......    ........     ....     .         ..   .. .  . .  .   ...    .  .  . .. .....     .   .     .      . ..  . .....  .. .        . .......   . . ......  .     .  .   .  ..   .   .       .   .  ..........      .   .......  ..   .     . ..    . ..  ...  .          .  ..  .   . .  ...................      ......  ..   .     ......    .   .    .... . . ..  .  .   ..       .. . .   .. .. .    .. ..... . ......   ... .   . ..   .      . . .  ........  .....      ...   ..  .  .  .     .    . .. .  ....   .  ....................       .  .  ...      .    ..  .......   ...  .  .... .    .  ...         . .  .   .. .  .....      .  . ..  ........ ...   ....      .  ... .   .... ... . .. .    . ....   . .  . ...  ..  .  .    . . .    . ..  ....... .  .   .........   ..      .     .  .   ..      ...  ... ....   ...........  ..      ........ .   ...  ...   ...  .   ..    ..      .   ..  ....  .    ..    ..  . . . .   .  ......  .. . .       . .   ... ..    . .  .......    ....... . ..............  .  ...........    . ..    . ....  ............................................ . . .. .    ...........           .  .  . .  . .      ..  .. . ... .     . .   . .   . .   .    . .    ..   .   ...........  ..    .... .      .  ..........  .    . .. .   ...........      .  . . .  . .   .  .  . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .  . . ..   .. .....  ......  . .. ..   .     ...  .  ..     .    . .  ..............  .  .  .  .   ...   . ....         .  .. ......   .    ..       ....... . ....    .  . . .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ..    .  .  ..   .........    .. ..... .  .    .. . . ..  .  ...  . .........    .    .  .  .  .  . ........  ....  . ....   ...    ....  . .   ..   ...    ...    .    .  ..     .........   .   ..............   .   . .  ..  .  .. ........  .......  .. . . .      ..    ... .    ..... .  .  ..    .  .... .. .    ................     . .. ... . .   .  .. .. .   .  .. . .  .  ........    ....   ........ . .... ......     .  .     .. .      ....   .... .  ..     ...    . ........      . ................. . ..   ..   .      . . . ............  ..  .   ...    ..  .......... ...  .   .   .   .          .. ..       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       66 55    22     99       8           3  888            7  8      1 1       3  8888   555            66        3        66    3          66 222        6 00 99999999   444  6 6   6    00  00  6   6  66      00      6  6  00 6 6   00    6    00 3  555555        3   6      6   6       1111111111111111  0 66      9        6 6      6 6 6 6 111111  555555 00 6 6  00  0000       33  9999999999   00   0   0 55  00000   0     55   0   0  0  0 55     11111   0  0 55 0  0  0   0       6   3   6   6  2222222    88888888     2222     9         00   66 6  6 6  3   444    6  6  6 00 99999     6   6     6      6 00  6 00000  00 6        6 5555555   6 6 555555  6     6  3   7  99   3   3       3   3  1111111111      7   4444444  66   3     9 88    9 99  000  9          9  33  1   9 9  7777777777777777777      222222  99   9     111111    9   7    1111 9 6 99  9  9   88       77 9 3   55 99 9    88 11111 9 222222   000 9   9 88   9      9 9 9  44444444  99999      777   33  9  9  9     9    9 44 9  8888   9  22222222222222222222       9  9  222      6    99  4444444   000  1  5555 2    1  444         1 1  9   22 9  66666      9  9 88  88888888 000   6666      7  000 1   8888 888 1 22 1    2 5555   1 1  1 444  22  3  3    3 3 7    3 66  8888888 3  3   222222222   66      6     6  3   00      000  444 7777   33333333333  00      22222222 6   555  000   444  6   00    00      1   66  8888  3    00    00  6 3 3 6   6  777777  66 3 3       3 3   222 66    3 3  5555555    3333333 3 66666666666666  9  66666666666    9 99    9 1111  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 88 3    55555555555           3  3  3 7  3 3      66  66 3 888 7     7 3   3 3   3 3   3    6 6    66   6   33333333333  00    7777 6      3  2222222222  6    5 00 6   99999999999      6  6 6 6  3 6   6  3  7 2   99  99     3  3   66   3  3 1  222    1 1  9999999999999   66   55555    1  1 1 22   22 00000  666666  3 66 66   3     888  3  77     3    3 3  88888888888888  3  3  3  3   888   3 5555         3  66 666666   3    66       8888888 3 1111    3  3 1 22 444  2  1 22  1  1 1  6666  1  33    1  1  33   444444444    22 55555 1  1    33 1 1 22  1  444  1 777777777    7    3  3  7  3  3 66666666  4444  3 9999   000    4444  3 7   44   888    888    1    1  33     999999999   1   33333333333333   1   1 1  55  1  33 00000000  5555555  22 1 2 2      22    111 1    44444 1  1  22    2  8888 22 1    3333333333333333     9 99 999 9 9   7  99 99 7   9  99 9 9  5  66666666    1111   88888888 9 1111 000000     7  9     66 9      1111   0000 9  99     000    9 66666666      9 99999999999999999 7 99   88   7      7 9 5 555555555555  88  9   999    99  8888888888 666  1   1   1   1          66 99       555555 3 66   66 4444  3 3   66     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( family-1826 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTTCAAAGAATT--TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATTC-ATG-TA--GAAAAAAATAAGCCGTG-TA----A-CTCAAGATA-TATT--C-TTTTATATAGTAAGAA-ATT-AA-TGA-TAA-TTTTTTTCTTT-A---C-A----CAGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCTA------T--A-T-CA--TTTGTAGTTCATT--AATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTCAGGGTGAACCT-ATTGA-TGGATTCTTAATGGGA-ACCT--G-AT-ATCTTG-AAAAAAG-TAGTGTC-AGG-ATGAT----TGGTGCCTGTAACTTTC----AGAATTATGAAAAAGAATGA--CCACTA-AT-ACTCTATCCA-GTCAG-TCCT-AAGCAAAAT-TGT--TCGT-CAAATT-T--TATA--AC-AA--ATAAACTAAA-GCCGCAAGGAA-T-AACAGGGCG-AAGT---C-CAT-CCGTTGC-GTT-CACT-AC-AGA-AA--TTGGT---AAAAAGGAATGGC-T--AAAACCT-ATCTTCT--ACAG-AAAGT---AT-TTG---ATTC-TAG-TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCCCCCCCCTG--CGT-AATTT------GA-G-TCA--TTG----G-C-ATTATGTT-GGT---GTATGT--A-A-CCT--GCAG-TATGATT-----T-C------TTT---A-AAA-AA-TAT-AAAATG-A---AGTACCCAATAA--T--AATTAC---TTA--CG-AA-TA-AGGTG-GTTTAG--A-AAAAGAGGAGTAA--CCAGGGTAG------TGCAT-TCA-CT-GG--TTTTTTAGGAAACGGT-A-ACTAAAT---TG-GATATAA-CGTTATC---ACTGACCTC-A-TG---A-TT-TTG-T--AGGCTG-AT-A--TT------------GAG-A--AAATAG-GTA--ACAGTGTCCT-T-C-GT-T-CTTTGCAAG-AAA-T-AA-CAAGAA--AG-TT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AAATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG---AA---A----AGAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAA-AAAT--AA---GTATGTGT-CAT--CCTC--TTTTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAACCC------TA--TGT-TTTACAG-ACGTAATGA--TTGC-G-CAGTT----CTAC-TTACA-C-C--------------TA-CCGGACACTAACACCCC-CGTCCCC-C----TC-C------------------------C---CCA-G---------C-G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTTGGCTCTA-TG-TA-AGCAGT-GACATT--AAGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATATTA-C-ACA-TGAA-A-TTTA--CTT-AA------------TT--ACAA----A-AATATA-TG---A-AC---GG-ATAA-A--A-GTT-----------GTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-TAGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-AT-TG-T-A--TCA--A---A-TT------TA-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AAT-GGTAA-AGCG-T-AAG--A----------CC-TG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTGG--CCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--T--G-A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATAGGG-TA-AG--ATC---------CAAA--GCG---C-TC-CCCGATT-G-T--AG-AG---GA-T-A-G-AGGCAAAG-AAGA-GG-GC-AATAGTC-G-G--G-AGTTATGT-AGTT-ACTG--TC-C----AG-TGGATATTTTGAATTTT-T--GAT-GTTT-GA--ACCCA---C---C-ACC-CCC-A--------C--CCTT-TTCTC-TTC-AA-GG--A--------AACACC---AA--T-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---G-A-TA-CATGTTTC-AA----T--ATATAT--AA-------ATCA-AAATA-TGGA---T-T-ATCATA-TT--T-TAT-TA---AA-ATATA-CGA-T--AAAA----AAT------T-A-A----T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAA----ACT--A-ATAA--ACAGA---CAAACTAAAAGAGTAAAAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG-----------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------ATT-T-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGC--A--CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -ATA-TT-TTG-A--GGG-TG-ATGA--TTAT------G---AAG-A--ACATAG-GTCTCA-AAT----T---C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-TTAA-C---AA--AG-TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG---GA---A----AAA-----------AG--TAAAGA--------A-ATAT--AAA--GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TT-C-G-CA-T-----CTA------A-C-C--------------TA-AC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG---------------T-AA-GT-------------GATTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TATA--CTT-AAT-----------TA--AAAA----A-TATATA-TG---A-A----AG-ATAATA--A-ATA-----------ATTAT--AATT-A-ATAA-ATA-CATTA-T-ATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AA---A----------CC-TG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TT-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGG-AG-GC-AA-AA-CGA-G--TAAG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA--TT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---CACCC-CCCAC--------CCACCTT-TTC-CTTTC-AA-AG--A--------AA-------AA--A-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----T------AAT-A-AG-T-GAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG---A-CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA--A-AAATTAATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CC--AAACTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TAAAT-AGCCC--G-TA-TATT--C-TT------AAAAAAAT-AT----ATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---AGA----CACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------TA------T--A-TGCA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTCAAA-TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GTGG-GC-TT-G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAAATT--T----CGGT--------CTTTC--T-GGAAT-ATGAAAAAT---GA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AAAT--T-AA--AAAAAATGT-ATTGT-TCAATT-T--TA-AC-A--AA--G-AAACTAAC-G-------AAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CT--TGC-TTT-TATTTAC-AGA-AA--TT--A---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATATT-T--A-AG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TA-ACC-C-TA-------------------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----G-C-A--GT-TTGGGT--TGTATGT--ATC-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-ATT-AG--------AA--T--ATTTAC---TTA--CGAAA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----AGA-TAC--A---------------ATATATCA-TTGGG--GGGTTTTTGAAA--GT-T-A---AAT---TT-AA----A-CG-T-TC---AGTGACCTC-A-TA-ATA--T-TTG-G--GGGCCGAAT-A--TT-T------G---AAGAA--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-A-GG-T-CATT-C-----AA-T-AA-----AA--AA-TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AAA--AAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATT-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC---G--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC--G--A--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCA-TTTTTTT---A-A---A-A----CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T--A--ACAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTCT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TACATACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-tgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTCG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCAAAGAAAT--TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A---TT---TT-A-TGA-TTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--CTTT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTTT---T-A---C-AACAGCAGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----G--TTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-A--GA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TAAGAAT-ATG-AAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-TA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--C--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-G-A------TGAAAGTA-AT-CAT-CC--TGC--TT-CATTTAC-AGA-AA--TT--TA--AAAAAA-AAT--C-TA-AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATAA-AA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGC-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--C--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC--ATAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TT-G----TTTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAGTAGTCA-ACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTGG-AATATTAAATTAATAAT-----AATACCA-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCCAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA---AAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CT---AATACTAT---C-TT------AAAAA-----TT-AAATGA-TAT-TTTTTTT---T-A---C-A----CAGG--A-TAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----TA------T--A-T-CA--T-----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--T-A-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGCG-G----------AG-TTG-AAGAAAG-TAG--TC-AAA-TT-------CGGT--------CTTTCATT-AAAAT---GAAAAA-----------C-A-TT-TAC---TCCA-GT-AA-A--A-AT--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TAACA-A--A--AT--A-GAACTAAA-G-------GAATT-A------TG-AATTA-AT-CAT-CC--TG--TTT-C--TTAC-AGA-CA---T--T---AAACAA-AA---C-TAAAA--CCT-ATTTT-A--GCAG-A--GT---AA-TTGACCACTC-TA--TT-ACC-C-TA--------------------CCCTA------GG--CGCAAATAT------GACG-TCA-GT------G-C-A--AT-TT-GGTTATGTAT-T--A-C-CCC--G--ATTATA--T-----C-T------TTA---A-AAA-A--TA--TAAATG-A-T-AG--------AA-----TTCTAC---TTA--CG-AA-TA-AGAT--GTTT-GAAA-AA----GGA-T-------------------CATATATCA-TT--G--TTTTTTTTAAAA--AT-A-A---AAT---TGAAA----A-TGTT------AATGACCTC-A-TC-ATA-TT-TT--G--AGGCT--AT-AT-TT-T------G---AGG-A--AAATAG-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAAT-TG-T-A--TTA--ATAAA-TT------TAAC--T--CCA-CTAAA---ACTAAATGGCAAGAAGT-T-AC-CCA----------CCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TG-GTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GGGAA--ATT---------CAAA--A-GA--C-TCTCCAG--T-G-T--GG-AA---AA-T-A-ATA---AAAGCGAGA-GG-AC-AA-GG-C------C-AG----GC-AGCATACTG--TCGC----AG-T-GAT---TT---TTTT-TTAA-T-GTTT-GATAACCAC---C---A-CCC-CTC---------------TTATTC-C-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATAAA--A-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---G-AGTA--A--TTTT-AA----T--A-ATAT--AATAA----ATTAAGAATT-T--A---T-T-ATC-TA-TTAAT-TAT-AG--TAA-AT---------------------T------C-A-A----TG-----ATTAA-A--TAGA---T-A-TAAC----AAT--ATC-AC--ACAA----CTAA-TA-------AAAAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC--AAA---CAAA-T-T---------------A--AA-ACAAATCACATTAC-A------C-T-TTGA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGT--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-TA-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TC------TA-C--T--GCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-ACGT-T-AAACCATCCAGATCATCC-TA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAA-------C-CATGTACAA-TG-G-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGA-GG--A--ATT---------CAAA--G-G---G-CC-CAAG--T-G-T--TG-GA---AA-T-ATG-A---GAAG-GAGA-GG-GC-AT-GG-C-A-G--G-AG----GT-A----TCTG--TCGC----TG-T-GAT-TTTT---TT-------AT-GTTT-G----CCCC---C---T-CCC-CC-------------------TTC-C-TT--AA-AA--A--------AA-------A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATGT--AA-------ATTA-AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-CAT-TA--TGA-AT------A-T--AAAA----AAT----------A----TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAAC----AAT--A-A-AT--ATAAAAGCCAAA-C---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C------------AAACAA-ACA---CACA--AA-A------A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGT--A-A-TCCA-G--A-TATA--T-----T-C------TTA---A-AAA-AGATAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--T--TTT-AC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-G-----TTATTTAA----GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-CC---AGTCACCTC-A-TG-ATA-TT-TTT-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAAAAA-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-T-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AG-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----T-----TA--AAAATG-CATCG-TT-CAA--TTTTGAC--AA---AAAATAAA-----------AA--TAAAGG--------A-ATATA-AA---GTA---GT-TGC--CCTG--CCTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--TAAC--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---T--ATGC-A-CA--T----CGAC-T---ACC-C--------------TT-CC-----------CAAC-C--CCTA-C----GTAT------------------------G---TTG-A---------C-G-C-GA-GTTGT----GTA-----TTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--ACGGTGG-AAC-ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-TTGAG-GA---AA-T-A-A-G---AAAA-AAGA-GG--C-AA-AG-C-AAG--T-AG----GT--------TC--TCGCGACTAGCT-GATATTTT---TTTT---AAAT-GTTT-GA--ACCTT---CGGGC-CGC-GCC-A--------C--CCTT---C-C-TTC-GATAG--GCGAATG--AA-------AA--T-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCG-A-TAGTA--TTTT-AAA---T--A-A-AT--GATCAAAGAAT---AAACCCT--A---TGT-ATG-TA-TT--TCTATCTA--TCACATATA-C-ACT--AAGA----AATAAGTAATGA-A----TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAAC----AATA-A-A-AA--ACAAA---AACA-T--------AAAAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC------------AA--AACACAG--CGCA--AAGA------A-T-T-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGC--A--CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CC-C-CC---------C---------CCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACA-AAA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATATCTA-A-CCCC-G--A-TATA--T-----T-G------TTC---A-AAATA--TAT-TAAATG-A-T-G------------------TTAC---TTA--CC-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-GG--TTTATTT---AA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA--T-TTG-T--GGACTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATTG-GTC--A-AAT----T-T-C-GA-T--TTN-C-A--GAA-T--A-C---AA--gcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatttggctgtatattntcccccccccccccccAGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC---AAAAATCTTCAAAAGAAAT---CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C---AAAATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATTATC-TT------AAAAAAAA-ATTTGAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CAGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------TA------TTCA-T-CA--TT----GTTTTTTT-AA----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTCAGC-TGA-CCT-AT-GAAT--ATTTT----TGGG-GC-TTTG-A--AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGTC--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TTA--C-AC-A-TT-ACC----CCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATTAT--TA-A--C--AA--A-AAACTAAAAG-------GAA-T-A------TG-ACGTA--T-CATTCC--TGC-TTTTCATTTAC-AGA-AA--TT------AAAGAA-AATG-C-T--AA--CCT-ATTT-----ACAG-A--GT---AA-T-GCACATTC-TA--TT-A------A---------C---------CTCCC-------TG--CGT-A-TTT------GACG-TCA-GTTG----G-CTA--GT-TT-GGT---GTATGT--A-A-CCC--G--A-TATT--T-----T-T------TTT---T-AAA-A--AAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TCTTTTTAC---TTA--CG-AA-TC-AGATG--TTT-G--A-AA----GGA-TAC--ATA------------TAT---CCA-TT-GG--TTTT--TTAAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----G-TTTT-TA---AGTGACCTC-A--G-ATA-TT-TTG-GAAGGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG----AAATAG-GTC--A-ATT----T-T-C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG---------AAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-AT-T--AA---GTA---GT--AT--CCTG--CTTTCATTTA--C----AAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-AGA---AAGTTGC-GTCA-TT----ATAC-------C-C--------------TC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------cctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacaccccccc-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCC------------------------C---CCC-G---------C-G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTTGGCTCTA-TG-TA---CA-T-AACATT--AA--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTAA-CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATACA-TG---A-AT---AG-ATA-TA--A-ATA-----------TT-ATC-A--T-A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-T-A--TTA--A------T------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA--GGCAA-AAGC-T-AAACC--------------TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTTG--TCATGAG-------C-C----ACAGATG-G-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--GGGG-GG-AA--ATTT--------CAAA--G-G---C-TC-C-AG--T-GGT--GG-GA---AAAT-AAG-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TAAAAT-G-TT-GA--ACCCC---C---A-CCC-CCC-A--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AGA-A--------AA-------AA--T-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TT----A----T--A-ATATTGAA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TATTT--T-TAT-TA--AGA-ATATA-C-A-T--AGAA----AATAA----T-A-ATAAGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAGAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AACA------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGC--AGCCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAACcccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|21                         : aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccGTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGC-AA-AATAAATTAATAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC---GAAA---TTCCAACGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-GTG-CA--GAAAAA--TAAGCT-TG-TA--T-A-CCC--GATA-TATT--C-TT-------TTAAAAA-ATT-AAATGA-TAA--GAGTTT---T-A---C-T----CACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------TATACATGT--A-C-CA--TT----G-TTTTT--AA----------GTG--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-T-GTTATAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-T-----CTAC-T---A-CTC--------------TA-CC-----------CCTC-C--CACC-A----CCACCACCACCCCCATCAGCGTAATTAAG---TTG-A---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-AAA-AGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AGAA----A-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAAT-TG-T-A--TTA--A---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA--------AAAA----AA-AA------A-A----TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAGC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CTAA-TA-------AAAAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T----------------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C------ATT-T-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCC--A------TG--CAT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----A-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--TATGGGT-CATATATTCT---AGAAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--T--TTTTAC---TTA--C
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTGG-AGT-ATGAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTT-T--ACAA-A--GT---AA-TTGCAAATTT-TA--TT-ACC-C-TA---------CACCCCCCCCCCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATAT--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTAG-CACACACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTGGGAATA-TGAATTAATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTC-AAAGAAATAGT-AACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATG-CACAGAAAAA--ATAGCC-TG-TA--TTA-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAATAAA-ATT-AAATGAATAA-TTTTTTT---TTA---C-A----CAGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------TA------T--A-T-CA--TTT---GTTTTTTT-AA----------GTG--AAA-TTG-A--AAA----CGT-T-CAG---GA-CCT-ATTGA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--GGAT-AT-TTG-AAGAAAGATAG-GTCCAAA-TT--T----CGATT-------CTTTC----AGGATGATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GC-AA-T--TTAA--AAAAC-TGT-ATCGTCTCAATT-T--TA-C--A--AA--A-AA-CTAAA-AA------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATT-AC-AGA-AA--TT--CTTAAAAAAA-AAT--CCT--AA--CCT-ATTTT-TT-ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTCGTA--T--ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------T---CGC-AATTTT-----GACGGTCAAGTTG----G-CCA--AA-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCCCCG--A-TATA--T-------C------TTT---A-AAA-A--TACCTAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CA-AAATA-AGATG-GTTT-G--ACAA----TGA-TA---ACG-------------ATATTTCA-TT-GG--GTTTTTG-AAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCTG-AT-C--AT-T------G---AAG-A--AAATAGCGTC--A-AAT----T-T-CAGG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AA-C---AACAAA-TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAAA--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA-AA---A----AAA-----------AG--GAAAGA--------A-ATATA-AA---GTA----T-CGT--CCTG--TTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-C-TAA-CC------TA------TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-GT----CTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-A--CCCC-C----ACCC------------------------C---CAA-G---------C-GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTTGGCTCTA-TT-TA-A-CA-T-GCCATT--AA--A-------ACTTT-A-AGT-T-TTA-T-ACA-AGAA-A-TCTT--CTTAAAT-----------TTAAAAAA----A-AATATA-TG-------------------------A-----------TTTATC-CATTAA-AT-A-ATACCA-CA-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAA--TG-T-A---TA--A---A-TTTAGTGCTA-C--T--CCA--TGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA-------------TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTGC--CCATGAG-------A-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--GCGC-GG-GA--ATT---------CAAA--G-G---CTTC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAGAAAGA-GGAACAAA-AG-C-A-GACT-AGC---GTAA----ACTG--TCGCA---AG-T-GATATTTT---TTTTCTTAAAT-GTTT-GAT-ACCCC---CA--C-CCCACCC-CCA------C--CCTT-TTC-C-TTCGAA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---A-A-TA-CA--TTTT-AAC---T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-A-C-TA--T--T-TA--TA--TAA-ATATA-C-A-TCCAAAAACATAATAA----T-A-A----TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA------AAC--A-A-AA----AAA---CAAA-TT-------AAAAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-TGT-GT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGC--A--CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agcgAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA---T--T---AAAAA----------------------TTT-T--GCAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCAC--CCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-AACTATAAAT-AATAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG--TTTCAAGAAAAT--TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC---GAACTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA--AAAAAAAATAAGCC-TG-TA--T-A-CT---GATA-TATT--C-CT------TTAAAAAA-ATT-AGATGA-TAA-TTTTTTT---T-ATAAC-A----CACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--AAT-CA--TTT---GTTTTTT--AAAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTCAG--TGA-CCT-AG-GA-T--ATTTT----TTGG-CA-A--G-AT-AT-TTGGAAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------ATCTC--T-AAGAT-ATTGGAAAT--TGA--C-AC-A-TTTACC---TCCA-GT-AA-T--T-AACAAAAAA-TGTTATCGT-TCA-TT-T--TA-A--A--AACAA-AAAATAAC-G-------GAA-TTA------TG-TAGTATAT-C---CC--TAC-TTT-CATTTAC-AGA-AAATTT--T---AAAAAA-ATT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCATATTC-TA--TTTACC-CCTAAACCTCCCCC---------CCCCCA------TG--CGT-AAATT------GACG-CAA-GTTGTATGG-C-A--AT-TT-AGT--TGT-TGT--A-A-CCCC-G--A-TATAA-T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAC--AGATG-A-T-AA--------AA--T--GTATACGACTTA--CG-AA-TATAGATGAGT---A--A-AA----GGA--------A------------CATATATCAGTT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TTTAAGGTGACCTAGA-TGGATA-TC---A-G--GGGCTG-AC-AATTT-T------G---AAG-ACAGAATAG-GTT--A-AATAT--T-T-C-G--T-CTTTGCGA--AAAAT-AA-C---AA--AA-TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AAA--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAAAA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------G-ATAT--AAAAAGTA---AT-CAT--CCTG--CTTTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGT-TTA-CCGTCAGGTA--T-TATTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TC----CTAC-T---A-C-C------------------------------CCCC-A--CTCC-G----CTAA------------------------G---TTG-A---------C-G-T-CA--TTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACAT---AA--A-A---T-CCTTT-A-GTT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-CAT-----------TT--AAAA----A-AATATATTG---A-AT---AG-ATAA-A--A-ATA-----------TTTATC-A----A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AAT-TG-TAA--TTA--ATT-ATTT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC--AA-GGCAA-AGGT-T-AAACGC----------CT-TG-TC-C--AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTAA--CCATG-G-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--AGGG-GG-AA--TTTTTTTCCCCCCAAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGG-T--GG-GA---AA-T-----------------G-GG-GC-AA-AG-C-A-T--A-AG----GT-A----ACT---TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TTAAATGGTTG-GA--ACCCC---C---C-CCC--------------------T-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--TGC-A-TTACTT--T-AC-A-T-ATCA---GAA-TA-CA--TTTTAAA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-TAATCTTT-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACC-A-TA-AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAAC----AATAAA-A-AA--ACAAA---CAAA-T---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-T------A-T-T-GA-ATA-AAT--AA-AAATAAATGCAAA-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATTTTAAATTA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCA-TTTTTTT---A-A---A-A----CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAA-G-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTCA-T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-C-AC---TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C----AA--CCT-ATTCT-T--AAAG-A--GT---AA-TTGCA-ATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TG-ATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACT-ACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-C-GG-T-TCTT-CG---AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT---A---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCT-A----CCAC------------------------A---CCA-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTT-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----C-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-TT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-CG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GTCAG-AAGT-C-AAACCAC---------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGA--TCATGAG-------C-C----ACAG-TG-A-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-GG-C-A-G--T-AG----GT-A----GCTG--TCGC----AG-T-G-TATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTC-GA--ACCCCACTC---C-CCC-CCC-CCTCTCTCTC--TCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-GA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATAGA-T-A-TG-AAAA----AAAAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAAC----AAT----A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTGG-AATATAAAATT--TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TC---GAAAA--TTCCAAAAAAAT--TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--CAAAAAACTC-T-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGCCAT-GAAAAA--TAAACC-TATTA--T-A-CCC---ATA-TATC--CTTT------ACCAACAT-ATT-AAATGA-TAA-GTTTGTT---T-----C-A----TAAG--AATAAAGAT-GTTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CACCTT----GTCTTTTTAAA----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGTCTCCAG--TGA-CATCAT-GA-T--ATTTT----AGGGCGC-T--T-GTCAT-TTG-AA------TAGCGT--AAA-CT--TGCGGCGGT--------CGTTT--T-AGAATAATTAAAAAT--TGA--C--C-ACTT-ACC---T-CA-GT-AA-T--TAAA--AAAAA-CGC-ATCGT-TTAATT-T--TT-G--ACCAC--A-AAGCTAAA-C-------GAA-T-A------TG-GAGTT-ATCCAT-CCA-TGCTTTT-CATGTAC-AGA-AA------T---AAAAAA-AAC--A-T--AA--CTT-ATTTT-TTCACAG-A--GTCAGAA-TTGCACATTC-TACTTT-TCC-C-TA-------------------CCCCCA------TGCACAT-AATTTGCACGCGACG-TCATGTTG----G-CAA--AT-TT-GGTC-TGTA-GT--A-ACCCC--G--A-T-TA--T-----T-C------CTGAAAA-AAA-A--TAT-TTAATGTA-T-TA--------GA--T--TTTTAC---TTA--C--AA-TA-AACTG-TCTT-G--A-AA----GGA-T-T--ACA------------TA-ATATCG-TT-GG--TTGTTTGTAAAA--GTCG-A---AACAAATG-AA----ACCGTT-TC---AGTTATCTT-A-T--ATA-TTCTTT-T--GGGCTG--C-A---T-T------G---AAGAA--AAACAT-GTC--A-AAT----T-C-C-AA-TATTTT-CGACCAAA-T-AA-C---AA--AAGTT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----T-TA-AGA--AACATA-TATTG-TT--AA--TTTTGA---AA---A----AAA-----------AAGTTAAAGG--------A-ATATAAAA---GAA---CT-CAT--CCTG--CTTTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA-TC------CA--T-G-TTT--AGCA-GTA---A--T--C-G-CA-TC----TTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-CTTTATCAG------------------------GAAAGTG-A---------C-G-T-CA-ATGG-----CCA---CATTGGCTCTA-TGCTA-ACCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AG--T-TTA-CAATA-TGAA-ATTTTA--CTT-ATC-----------CT--AGAG----A-ATCAAA-TG---ATAT---AG-ATAATA--A-ATAC----------TCTATC-AACT-GCATCA-ATA-C--TA-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAAT-TGTT-A--TTA--A---C-AT------TA-C-----CCA-CTAAA---AC-AAA--GCAA-AAGT-TAAAACCAC---------CC-TA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTGA--CCAT--G-------C-C----GCAG--G-C-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--AGCG-GG-AACTATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAGC-T-G-T--GC-AAATCAA-T-A-A-A---A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cccAAAT-GTTT-GA--CCCCC---C---C-CCC-CCT-CGA------C--CCGG-TTC-T-TCA-AA-AG--A--------AA-------AACAT-T-A-T-ATTT--CAAC-ACT-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AAAATAT--A-ATATT-AA-------AT---A--TC-T------T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TAATCAA-GTAAA-A-A-T--AATA----AA--A----T-A-A----TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAAC----AAT--ACA-AA--AC------CAAA-CA-------AAATAA-A-------------------C--AA---AAA-AA-AAA-T-TTCAAAAAAAAAAAAAA--AA-ACA---CACA--AA-A------ACT-T-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGC--A-CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                             cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CCGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAATC-AC-A-TTGACC---TCCAGGT-AA-T--T--A--GAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-AACA--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TA-AAGCA-AT-CATACC--TGC-TTT-CATTTACAAGATAA--TT--T---AAAAAAGAAT--C-T--AA--CCTAATTTT-T--ACAGAA--GT---AATTTGCAC-TTC-TA--TT-ACCGC-TACCCCC----C---------CCCCCC------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----GCC-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----TCC------TTT---A-AAA-A--TAT-T-AATG-A-TAAG--------AAATT--TTTTAC---TTAACCG-AA-TA-AGGTG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC------------------ATATATCA-CT-GG---TTTTTTAAAAA--GT-GAA---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC---TG-ATA----TTG-AT-GGGCTG----A--TT-T------G---GAG-------T---GT-------T----T-TAC-GGAT-CTTT-TG-----A-T-AA-C----A--AA-TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----T----AAA--AAAATG-TA-TG-TT-CAA--TTTTGG---AAAG-A----AAA-----------AG--AGTAGG--------A-ATTA--AA---GTA---GT-CATTCCCTG--CTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-T-A-CC------TATTT-T-TTTACAG-A-GTAT--A--TTGC-G-CA-TTCGTCCTAC-T---A-C-CGGCTAGCCGCGCTACA-CC-----------CCCCGC--CCCCGC----CCAC------------------------G---CTA-T---------C-G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTTGGCTCTA-TG-T--A-CA-T-GACATT--AA--A-C---TCCCTTT-ATAGT-T-T-------A-TTTT-A-TCTGGTCTT-GATGGTCCTTCGTGTT--ACAACATGA-AATCTACTT---A-ATTAAAA-ATGATATGA-ATAGATAATAAATATTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-AT-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAAT-TG-T-A--TCAAGA---A-TT------TA-C--TTACCACCTAAT---AC-AAA-GGC-A-ACGT-T-AAA--A----------GC-CG-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------CGC----ACAG-TG-G-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--AGGG-TG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-T--CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-G---AAAG-AAGA-GG-GCAAA-AG-C-A-G--T-AG----TT-A----ACTG--TCGC----AG-TGGATATTTT---TTTT-TTTATT-GTTTGGA--ACCCC---C---A-CCC-CAC-C--------C-----T-TTC-C-TTC-AA-AGATA--------AA-------AA--T-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-T--CA--TTTTAAA----T--G-A-AT--TA-------AT---AAATA-T--AT--T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--T-A-ATATA-C----------------TAA----T-A-A----T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--TCAAA---CAAA-TA-------AAAAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC------------AAT-AA-ACA---CAC----A-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --TTTTAC---TTAA-TG-AA-TA-AGATG-GTT--G--A-AA----A-A-TAT--ACA------------T-TATATCA-TG-GG--TTTTTTTTACGA--GT-G-A---AAT---TA-AA----AACGTT-TC---AGTGATCTC-AATA-ATA-TT-TTT-G--GGGCTC-AT-A--TT-GAAAGAAG---AAG-A--AAATAGCGTA--A-AAT----T---C-G-----CTT-CGA--ATA-T-AA-C---AA--AA-GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AAA--AAAATG-TATTG--T-CAA--TTTGAA---AA---A----AAA-----------AG--TAAAAGTA------A-ATA---AA---GTA---GT-CAT---CTGCTCTTTCA-TTA--CA--G-AACTGTC--AATA--AA-A-TGC-TAA-CT------TA--T-T-GTTACAG-A-GTA---A--TTAT-G-CA--T----CTACTT---A-C-C--------------CC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCA------------------------G---CCGCGAAAGTTGACC-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TATA-CA-T--ACATT--AA--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACATTGAA----CTA--CTT-GAT-----------TTCGAAAA----A-AATATA-TGGATA-AT---AGAATAA-A--G-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-A-A-CA-TA-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------T-TG-T-ATTTTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA--GC-A-AAGTAT-AAACCA----------CC-TC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GT-G--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA----GG-GG-AA--ATT---------CAAAAGG-A---C-TC-CCAG--T-G-T--GGAAA---AA-T-A-A-T---AAAA-AGGA-GA-GC--A-AG-C-A-G--G-AA----AT-A----ACGGATTC-C----AG-T-GA---TTT---TTTA-TTAAAT-A--T-GA--A-------A---C-CAC-CAC-C--------C--TCTT-TTC-C-TAA-AA-AA--ACAAGAAATAA-------AA--T-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----TTGA-ATAA--AA-------ATA--AAATT-T--ATGTT-T-ATC-TA-TT--TACAT-TA--T-A-GT------------AAA----AAT------T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA-----AAT--A-A-AA--ACAAA---C-TA-TA-------AAAAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T--------------AA--AA-A------ACA--AA-ACACCACA-T----A-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GT--A-CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-TT-TTG-A--GGGCTG-AT-A--TT--------G---AAG-A--ACATAG--TC--G-AAT----TCT-C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AAAC---AA--AG-TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG---GGGGGA----AAA-----------AG--TTAAGG--------ATATAA--AA---GTA---GTTCAT--CC-G--CTT-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGCCG-CA-TC----ACAC-------C-C--------------TAACC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG-A---------TAG-T-C----TG-----------ATTTGGCTCTAATG-TA-A-CA-TTGACATT--AA--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T-TTAAC-AC--TGAGTA----A--CTT-A-------------TT--AAAA----ATAATA-A-TG---A-A----GG-ATAATA--ACATA-----------TTTATCCAATT-A-AT-ATATC-AA-TAATTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA----C-AA--GGCAA-AAGT-T-TAA--A----------CC-TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TGAG-A--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGAGGG-GC-AA-AG-C---G--T-AG----TA-A----ACT---TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TAAAAT-GTTT-GA--CCCCCA--C---C-CCC-CCC-CA-------C--CCTT-TTC-C-TC---A-AG--A--------AA-------AA--T-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TTTT-AAG---T--A-ATAT--AA-------AA---AAATC-T--A---T-A-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-ATA----TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAACCCATAAT--A-A-AACCACAAC---CCA---A-------AAAAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC-----------------G-AC----CACA--AA-A------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGC--C-GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11    11                             111                                   1111   111                                                                   11111111                                          11                                      111111                                                           1                         111111  111111             1111       11  2222222222                  11111   1     11                      11111                                                       11111111     1111     1                                               11111                              11111                1111111       111111                                          1111111111          1111111                                                           3333333333333333333                         111111                                               1   11                                                          11111111                                          11    1111      44444444444444444444                                                                                                             11111111                            1111                 1111                                          1111111        111111111                                111  111        11111111111          11111111     111  111                                  1111             11               111111                                    1111111    1111111   11111111111111     11111111111                    44444444444444444444444444444444444444444444             22222222222                                                                                         11111111111  11                   1111111111                22222222222                                                                             1111111111111                                11111                                                   22222222222222                                                                 1111111                                                                     111111111       11111                              111111111                                 1111    1111          1111                                                          33333333333333                      22222222  1111111                                                    1111         3333333333333333                                               11111111           11111111        111111                                                       11111111        11111111111111111                          222222222222                                                                        111111           1111               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       44 22    11     77       1           3  777            6  1      3 3       3  0000   222            44        3        44    3          44 999        3 55 11111111   666  3 3   3    55  55  3   3  88      00      3  3  55 3 3   55    3    55 7  000000        7   3      3   3       9999999999999999  1 88      0        3 3      3 3 3 3 444444  000000 55 3 3  55  5555       22  0000000000   55   4   4 55  44444   2     33   4   4  8  4 55     00000   4  4 99 4  4  4   4       3   7   3   3  8888888    66666666     2222     0         55   88 3  3 3  7   666    3  3  3 55 22222     3   3     3      3 55  3 77777  55 3        3 5555555   3 3 000000  3     3  3   6  77   3   3       3   3  3333333333      6   0000000  44   3     2 66    2 33  555  2          2  77  3   2 2  0000000000000000000      888888  33   2     111111    2   5    6666 2 8 33  2  2   66       33 2 4   22 33 2    66 77777 2 888888   555 2   2 66   2      2 2 2  00000000  44444      444   66  2  2  2     2    2 55 2  1111   2  55555555555555555555       2  2  999      1    33  7777777   555  3  6666 6    3  555         3 3  2   44 2  99999      2  2 66  00000000 555   7777      5  777 3   0000 555 3 55 3    6 1111   3 3  3 555  44  3  3    3 3 6    3 44  0000000 3  3   555555555   44      3     3  7   55      555  111 7777   77777777777  55      88888888 3   222  000   666  3   55    55      2   88  2222  0    55    00  3 7 7 3   3  777777  44 3 3       3 3   999 44    3 3  4444444    5555555 3 99999999999999  2  33333333333    2 33    2 6666  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 33 3    77777777777           3  3  3 6  3 3      44  44 3 555 6     6 3   3 3   3 3   3    3 3    88   3   77777777777  00    7777 3      7  1111111111  3    6 55 3   00000000000      3  5 3 3  7 3   3  3  6 4   77  77     3  3   44   3  3 3  888    3 3  6666666666666   33   88888    3  3 3 44   44 00000  999999  3 44 44   3     555  3  44     3    3 3  33333333333333  3  3  3  3   555   3 5555         3  44 999999   3    44       0000000 3 7777    3  3 3 44 555  6  3 44  3  3 3  9999  3  77    3  3  77   555555555    44 00000 3  3    77 3 3 44  3  555  3 555555555    6    3  3  6  3  3 99999999  0000  3 2222   555    0000  3 6   88   555    333    3    3  77     888888888   3   11111111111111   3   3 3  66  3  77 00000000  6666666  44 3 6 6      44    777 3    77777 3  3  44    6  5555 44 3    0000000000000000     2 33 777 2 2   5  77 33 5   2  33 1 2  1  77777777    6666   00000000 2 6666 333333     5  2     99 2      6666   7777 2  33     555    2 22222222      2 44444444444444444 5 33   66   5      5 2 2 222222222222  66  2   777    33  9999999999 444  3   3   3   3          44 77       888888 3 44   44 0000  3 3   88     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .. ..    ..     ..       .           .  ...            .  .      . .       .  ....   ...            ..        .        ..    .          .. ...        . .. ........   ...  . .   .    ..  ..  .   .  ..      ..      .  .  .. . .   ..    .    .. .  ......        .   .      .   .       ................  . ..      .        . .      . . . . ......  ...... .. . .  ..  ....       ..  ..........   ..   .   . ..  .....   .     ..   .   .  .  . ..     .....   .  . .. .  .  .   .       .   .   .   .  .......    ........     ....     .         ..   .. .  . .  .   ...    .  .  . .. .....     .   .     .      . ..  . .....  .. .        . .......   . . ......  .     .  .   .  ..   .   .       .   .  ..........      .   .......  ..   .     . ..    . ..  ...  .          .  ..  .   . .  ...................      ......  ..   .     ......    .   .    .... . . ..  .  .   ..       .. . .   .. .. .    .. ..... . ......   ... .   . ..   .      . . .  ........  .....      ...   ..  .  .  .     .    . .. .  ....   .  ....................       .  .  ...      .    ..  .......   ...  .  .... .    .  ...         . .  .   .. .  .....      .  . ..  ........ ...   ....      .  ... .   .... ... . .. .    . ....   . .  . ...  ..  .  .    . . .    . ..  ....... .  .   .........   ..      .     .  .   ..      ...  ... ....   ...........  ..      ........ .   ...  ...   ...  .   ..    ..      .   ..  ....  .    ..    ..  . . . .   .  ......  .. . .       . .   ... ..    . .  .......    ....... . ..............  .  ...........    . ..    . ....  ............................................ . . .. .    ...........           .  .  . .  . .      ..  .. . ... .     . .   . .   . .   .    . .    ..   .   ...........  ..    .... .      .  ..........  .    . .. .   ...........      .  . . .  . .   .  .  . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .  . . ..   .. .....  ......  . .. ..   .     ...  .  ..     .    . .  ..............  .  .  .  .   ...   . ....         .  .. ......   .    ..       ....... . ....    .  . . .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ..    .  .  ..   .........    .. ..... .  .    .. . . ..  .  ...  . .........    .    .  .  .  .  . ........  ....  . ....   ...    ....  . .   ..   ...    ...    .    .  ..     .........   .   ..............   .   . .  ..  .  .. ........  .......  .. . . .      ..    ... .    ..... .  .  ..    .  .... .. .    ................     . .. ... . .   .  .. .. .   .  .. . .  .  ........    ....   ........ . .... ......     .  .     .. .      ....   .... .  ..     ...    . ........      . ................. . ..   ..   .      . . . ............  ..  .   ...    ..  .......... ...  .   .   .   .          .. ..       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       66 55    22     99       8           3  888            7  8      1 1       3  8888   555            66        3        66    3          66 222        6 00 99999999   444  6 6   6    00  00  6   6  66      00      6  6  00 6 6   00    6    00 3  555555        3   6      6   6       1111111111111111  0 66      9        6 6      6 6 6 6 111111  555555 00 6 6  00  0000       33  9999999999   00   0   0 55  00000   0     55   0   0  0  0 55     11111   0  0 55 0  0  0   0       6   3   6   6  2222222    88888888     2222     9         00   66 6  6 6  3   444    6  6  6 00 99999     6   6     6      6 00  6 00000  00 6        6 5555555   6 6 555555  6     6  3   7  99   3   3       3   3  1111111111      7   4444444  66   3     9 88    9 99  000  9          9  33  1   9 9  7777777777777777777      222222  99   9     111111    9   7    1111 9 6 99  9  9   88       77 9 3   55 99 9    88 11111 9 222222   000 9   9 88   9      9 9 9  44444444  99999      777   33  9  9  9     9    9 44 9  8888   9  22222222222222222222       9  9  222      6    99  4444444   000  1  5555 2    1  444         1 1  9   22 9  66666      9  9 88  88888888 000   6666      7  000 1   8888 888 1 22 1    2 5555   1 1  1 444  22  3  3    3 3 7    3 66  8888888 3  3   222222222   66      6     6  3   00      000  444 7777   33333333333  00      22222222 6   555  000   444  6   00    00      1   66  8888  3    00    00  6 3 3 6   6  777777  66 3 3       3 3   222 66    3 3  5555555    3333333 3 66666666666666  9  66666666666    9 99    9 1111  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 88 3    55555555555           3  3  3 7  3 3      66  66 3 888 7     7 3   3 3   3 3   3    6 6    66   6   33333333333  00    7777 6      3  2222222222  6    5 00 6   99999999999      6  6 6 6  3 6   6  3  7 2   99  99     3  3   66   3  3 1  222    1 1  9999999999999   66   55555    1  1 1 22   22 00000  666666  3 66 66   3     888  3  77     3    3 3  88888888888888  3  3  3  3   888   3 5555         3  66 666666   3    66       8888888 3 1111    3  3 1 22 444  2  1 22  1  1 1  6666  1  33    1  1  33   444444444    22 55555 1  1    33 1 1 22  1  444  1 777777777    7    3  3  7  3  3 66666666  4444  3 9999   000    4444  3 7   44   888    888    1    1  33     999999999   1   33333333333333   1   1 1  55  1  33 00000000  5555555  22 1 2 2      22    111 1    44444 1  1  22    2  8888 22 1    3333333333333333     9 99 999 9 9   7  99 99 7   9  99 9 9  5  66666666    1111   88888888 9 1111 000000     7  9     66 9      1111   0000 9  99     000    9 66666666      9 99999999999999999 7 99   88   7      7 9 5 555555555555  88  9   999    99  8888888888 666  1   1   1   1          66 99       555555 3 66   66 4444  3 3   66     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( family-1826 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTTCAAAGAATT--TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATTC-ATG-TA--GAAAAAAATAAGCCGTG-TA----A-CTCAAGATA-TATT--C-TTTTATATAGTAAGAA-ATT-AA-TGA-TAA-TTTTTTTCTTT-A---C-A----CAGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCTA------T--A-T-CA--TTTGTAGTTCATT--AATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTCAGGGTGAACCT-ATTGA-TGGATTCTTAATGGGA-ACCT--G-AT-ATCTTG-AAAAAAG-TAGTGTC-AGG-ATGAT----TGGTGCCTGTAACTTTC----AGAATTATGAAAAAGAATGA--CCACTA-AT-ACTCTATCCA-GTCAG-TCCT-AAGCAAAAT-TGT--TCGT-CAAATT-T--TATA--AC-AA--ATAAACTAAA-GCCGCAAGGAA-T-AACAGGGCG-AAGT---C-CAT-CCGTTGC-GTT-CACT-AC-AGA-AA--TTGGT---AAAAAGGAATGGC-T--AAAACCT-ATCTTCT--ACAG-AAAGT---AT-TTG---ATTC-TAG-TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCCCCCCCCTG--CGT-AATTT------GA-G-TCA--TTG----G-C-ATTATGTT-GGT---GTATGT--A-A-CCT--GCAG-TATGATT-----T-C------TTT---A-AAA-AA-TAT-AAAATG-A---AGTACCCAATAA--T--AATTAC---TTA--CG-AA-TA-AGGTG-GTTTAG--A-AAAAGAGGAGTAA--CCAGGGTAG------TGCAT-TCA-CT-GG--TTTTTTAGGAAACGGT-A-ACTAAAT---TG-GATATAA-CGTTATC---ACTGACCTC-A-TG---A-TT-TTG-T--AGGCTG-AT-A--TT------------GAG-A--AAATAG-GTA--ACAGTGTCCT-T-C-GT-T-CTTTGCAAG-AAA-T-AA-CAAGAA--AG-TT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AAATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG---AA---A----AGAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAA-AAAT--AA---GTATGTGT-CAT--CCTC--TTTTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAACCC------TA--TGT-TTTACAG-ACGTAATGA--TTGC-G-CAGTT----CTAC-TTACA-C-C--------------TA-CCGGACACTAACACCCC-CGTCCCC-C----TC-C------------------------C---CCA-G---------C-G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTTGGCTCTA-TG-TA-AGCAGT-GACATT--AAGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATATTA-C-ACA-TGAA-A-TTTA--CTT-AA------------TT--ACAA----A-AATATA-TG---A-AC---GG-ATAA-A--A-GTT-----------GTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-TAGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-AT-TG-T-A--TCA--A---A-TT------TA-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AAT-GGTAA-AGCG-T-AAG--A----------CC-TG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTGG--CCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--T--G-A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATAGGG-TA-AG--ATC---------CAAA--GCG---C-TC-CCCGATT-G-T--AG-AG---GA-T-A-G-AGGCAAAG-AAGA-GG-GC-AATAGTC-G-G--G-AGTTATGT-AGTT-ACTG--TC-C----AG-TGGATATTTTGAATTTT-T--GAT-GTTT-GA--ACCCA---C---C-ACC-CCC-A--------C--CCTT-TTCTC-TTC-AA-GG--A--------AACACC---AA--T-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---G-A-TA-CATGTTTC-AA----T--ATATAT--AA-------ATCA-AAATA-TGGA---T-T-ATCATA-TT--T-TAT-TA---AA-ATATA-CGA-T--AAAA----AAT------T-A-A----T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAA----ACT--A-ATAA--ACAGA---CAAACTAAAAGAGTAAAAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG-----------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------ATT-T-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGC--A--CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -ATA-TT-TTG-A--GGG-TG-ATGA--TTAT------G---AAG-A--ACATAG-GTCTCA-AAT----T---C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-TTAA-C---AA--AG-TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG---GA---A----AAA-----------AG--TAAAGA--------A-ATAT--AAA--GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TT-C-G-CA-T-----CTA------A-C-C--------------TA-AC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG---------------T-AA-GT-------------GATTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TATA--CTT-AAT-----------TA--AAAA----A-TATATA-TG---A-A----AG-ATAATA--A-ATA-----------ATTAT--AATT-A-ATAA-ATA-CATTA-T-ATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AA---A----------CC-TG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TT-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGG-AG-GC-AA-AA-CGA-G--TAAG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA--TT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---CACCC-CCCAC--------CCACCTT-TTC-CTTTC-AA-AG--A--------AA-------AA--A-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----T------AAT-A-AG-T-GAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG---A-CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA--A-AAATTAATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CC--AAACTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TAAAT-AGCCC--G-TA-TATT--C-TT------AAAAAAAT-AT----ATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---AGA----CACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------TA------T--A-TGCA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTCAAA-TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GTGG-GC-TT-G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAAATT--T----CGGT--------CTTTC--T-GGAAT-ATGAAAAAT---GA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AAAT--T-AA--AAAAAATGT-ATTGT-TCAATT-T--TA-AC-A--AA--G-AAACTAAC-G-------AAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CT--TGC-TTT-TATTTAC-AGA-AA--TT--A---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATATT-T--A-AG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TA-ACC-C-TA-------------------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----G-C-A--GT-TTGGGT--TGTATGT--ATC-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-ATT-AG--------AA--T--ATTTAC---TTA--CGAAA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----AGA-TAC--A---------------ATATATCA-TTGGG--GGGTTTTTGAAA--GT-T-A---AAT---TT-AA----A-CG-T-TC---AGTGACCTC-A-TA-ATA--T-TTG-G--GGGCCGAAT-A--TT-T------G---AAGAA--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-A-GG-T-CATT-C-----AA-T-AA-----AA--AA-TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AAA--AAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATT-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC---G--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC--G--A--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCA-TTTTTTT---A-A---A-A----CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T--A--ACAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTCT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TACATACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-tgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTCG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCAAAGAAAT--TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A---TT---TT-A-TGA-TTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--CTTT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTTT---T-A---C-AACAGCAGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----G--TTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-A--GA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TAAGAAT-ATG-AAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-TA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--C--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-G-A------TGAAAGTA-AT-CAT-CC--TGC--TT-CATTTAC-AGA-AA--TT--TA--AAAAAA-AAT--C-TA-AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATAA-AA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGC-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--C--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC--ATAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TT-G----TTTTTTTAAAA--GT-A-A---AAT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAGTAGTCA-ACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTGG-AATATTAAATTAATAAT-----AATACCA-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCCAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA---AAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CT---AATACTAT---C-TT------AAAAA-----TT-AAATGA-TAT-TTTTTTT---T-A---C-A----CAGG--A-TAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----TA------T--A-T-CA--T-----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--T-A-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGCG-G----------AG-TTG-AAGAAAG-TAG--TC-AAA-TT-------CGGT--------CTTTCATT-AAAAT---GAAAAA-----------C-A-TT-TAC---TCCA-GT-AA-A--A-AT--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TAACA-A--A--AT--A-GAACTAAA-G-------GAATT-A------TG-AATTA-AT-CAT-CC--TG--TTT-C--TTAC-AGA-CA---T--T---AAACAA-AA---C-TAAAA--CCT-ATTTT-A--GCAG-A--GT---AA-TTGACCACTC-TA--TT-ACC-C-TA--------------------CCCTA------GG--CGCAAATAT------GACG-TCA-GT------G-C-A--AT-TT-GGTTATGTAT-T--A-C-CCC--G--ATTATA--T-----C-T------TTA---A-AAA-A--TA--TAAATG-A-T-AG--------AA-----TTCTAC---TTA--CG-AA-TA-AGAT--GTTT-GAAA-AA----GGA-T-------------------CATATATCA-TT--G--TTTTTTTTAAAA--AT-A-A---AAT---TGAAA----A-TGTT------AATGACCTC-A-TC-ATA-TT-TT--G--AGGCT--AT-AT-TT-T------G---AGG-A--AAATAG-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAAT-TG-T-A--TTA--ATAAA-TT------TAAC--T--CCA-CTAAA---ACTAAATGGCAAGAAGT-T-AC-CCA----------CCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TG-GTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GGGAA--ATT---------CAAA--A-GA--C-TCTCCAG--T-G-T--GG-AA---AA-T-A-ATA---AAAGCGAGA-GG-AC-AA-GG-C------C-AG----GC-AGCATACTG--TCGC----AG-T-GAT---TT---TTTT-TTAA-T-GTTT-GATAACCAC---C---A-CCC-CTC---------------TTATTC-C-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATAAA--A-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---G-AGTA--A--TTTT-AA----T--A-ATAT--AATAA----ATTAAGAATT-T--A---T-T-ATC-TA-TTAAT-TAT-AG--TAA-AT---------------------T------C-A-A----TG-----ATTAA-A--TAGA---T-A-TAAC----AAT--ATC-AC--ACAA----CTAA-TA-------AAAAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC--AAA---CAAA-T-T---------------A--AA-ACAAATCACATTAC-A------C-T-TTGA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGT--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-TA-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TC------TA-C--T--GCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-ACGT-T-AAACCATCCAGATCATCC-TA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAA-------C-CATGTACAA-TG-G-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGA-GG--A--ATT---------CAAA--G-G---G-CC-CAAG--T-G-T--TG-GA---AA-T-ATG-A---GAAG-GAGA-GG-GC-AT-GG-C-A-G--G-AG----GT-A----TCTG--TCGC----TG-T-GAT-TTTT---TT-------AT-GTTT-G----CCCC---C---T-CCC-CC-------------------TTC-C-TT--AA-AA--A--------AA-------A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATGT--AA-------ATTA-AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-CAT-TA--TGA-AT------A-T--AAAA----AAT----------A----TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAAC----AAT--A-A-AT--ATAAAAGCCAAA-C---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C------------AAACAA-ACA---CACA--AA-A------A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGT--A-A-TCCA-G--A-TATA--T-----T-C------TTA---A-AAA-AGATAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--T--TTT-AC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-G-----TTATTTAA----GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-CC---AGTCACCTC-A-TG-ATA-TT-TTT-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAAAAA-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-T-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AG-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----T-----TA--AAAATG-CATCG-TT-CAA--TTTTGAC--AA---AAAATAAA-----------AA--TAAAGG--------A-ATATA-AA---GTA---GT-TGC--CCTG--CCTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--TAAC--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---T--ATGC-A-CA--T----CGAC-T---ACC-C--------------TT-CC-----------CAAC-C--CCTA-C----GTAT------------------------G---TTG-A---------C-G-C-GA-GTTGT----GTA-----TTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--ACGGTGG-AAC-ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-TTGAG-GA---AA-T-A-A-G---AAAA-AAGA-GG--C-AA-AG-C-AAG--T-AG----GT--------TC--TCGCGACTAGCT-GATATTTT---TTTT---AAAT-GTTT-GA--ACCTT---CGGGC-CGC-GCC-A--------C--CCTT---C-C-TTC-GATAG--GCGAATG--AA-------AA--T-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCG-A-TAGTA--TTTT-AAA---T--A-A-AT--GATCAAAGAAT---AAACCCT--A---TGT-ATG-TA-TT--TCTATCTA--TCACATATA-C-ACT--AAGA----AATAAGTAATGA-A----TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAAC----AATA-A-A-AA--ACAAA---AACA-T--------AAAAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC------------AA--AACACAG--CGCA--AAGA------A-T-T-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGC--A--CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CC-C-CC---------C---------CCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACA-AAA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATATCTA-A-CCCC-G--A-TATA--T-----T-G------TTC---A-AAATA--TAT-TAAATG-A-T-G------------------TTAC---TTA--CC-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-GG--TTTATTT---AA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA--T-TTG-T--GGACTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATTG-GTC--A-AAT----T-T-C-GA-T--TTN-C-A--GAA-T--A-C---AA--gcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatttggctgtatattntcccccccccccccccAGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC---AAAAATCTTCAAAAGAAAT---CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C---AAAATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATTATC-TT------AAAAAAAA-ATTTGAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CAGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------TA------TTCA-T-CA--TT----GTTTTTTT-AA----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTCAGC-TGA-CCT-AT-GAAT--ATTTT----TGGG-GC-TTTG-A--AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGTC--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TTA--C-AC-A-TT-ACC----CCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATTAT--TA-A--C--AA--A-AAACTAAAAG-------GAA-T-A------TG-ACGTA--T-CATTCC--TGC-TTTTCATTTAC-AGA-AA--TT------AAAGAA-AATG-C-T--AA--CCT-ATTT-----ACAG-A--GT---AA-T-GCACATTC-TA--TT-A------A---------C---------CTCCC-------TG--CGT-A-TTT------GACG-TCA-GTTG----G-CTA--GT-TT-GGT---GTATGT--A-A-CCC--G--A-TATT--T-----T-T------TTT---T-AAA-A--AAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TCTTTTTAC---TTA--CG-AA-TC-AGATG--TTT-G--A-AA----GGA-TAC--ATA------------TAT---CCA-TT-GG--TTTT--TTAAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----G-TTTT-TA---AGTGACCTC-A--G-ATA-TT-TTG-GAAGGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG----AAATAG-GTC--A-ATT----T-T-C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG---------AAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-AT-T--AA---GTA---GT--AT--CCTG--CTTTCATTTA--C----AAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-AGA---AAGTTGC-GTCA-TT----ATAC-------C-C--------------TC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------cctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacaccccccc-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCC------------------------C---CCC-G---------C-G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTTGGCTCTA-TG-TA---CA-T-AACATT--AA--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTAA-CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATACA-TG---A-AT---AG-ATA-TA--A-ATA-----------TT-ATC-A--T-A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-T-A--TTA--A------T------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA--GGCAA-AAGC-T-AAACC--------------TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTTG--TCATGAG-------C-C----ACAGATG-G-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--GGGG-GG-AA--ATTT--------CAAA--G-G---C-TC-C-AG--T-GGT--GG-GA---AAAT-AAG-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TAAAAT-G-TT-GA--ACCCC---C---A-CCC-CCC-A--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AGA-A--------AA-------AA--T-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TT----A----T--A-ATATTGAA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TATTT--T-TAT-TA--AGA-ATATA-C-A-T--AGAA----AATAA----T-A-ATAAGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAGAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AACA------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGC--AGCCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAACcccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|21                         : aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccGTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGC-AA-AATAAATTAATAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC---GAAA---TTCCAACGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-GTG-CA--GAAAAA--TAAGCT-TG-TA--T-A-CCC--GATA-TATT--C-TT-------TTAAAAA-ATT-AAATGA-TAA--GAGTTT---T-A---C-T----CACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------TATACATGT--A-C-CA--TT----G-TTTTT--AA----------GTG--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-T-GTTATAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-T-----CTAC-T---A-CTC--------------TA-CC-----------CCTC-C--CACC-A----CCACCACCACCCCCATCAGCGTAATTAAG---TTG-A---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-AAA-AGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AGAA----A-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAAT-TG-T-A--TTA--A---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA--------AAAA----AA-AA------A-A----TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAGC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CTAA-TA-------AAAAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T----------------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C------ATT-T-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCC--A------TG--CAT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----A-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--TATGGGT-CATATATTCT---AGAAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--T--TTTTAC---TTA--C
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTGG-AGT-ATGAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTT-T--ACAA-A--GT---AA-TTGCAAATTT-TA--TT-ACC-C-TA---------CACCCCCCCCCCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATAT--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTAG-CACACACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTGGGAATA-TGAATTAATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTC-AAAGAAATAGT-AACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATG-CACAGAAAAA--ATAGCC-TG-TA--TTA-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAATAAA-ATT-AAATGAATAA-TTTTTTT---TTA---C-A----CAGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------TA------T--A-T-CA--TTT---GTTTTTTT-AA----------GTG--AAA-TTG-A--AAA----CGT-T-CAG---GA-CCT-ATTGA-T--ATTTT----TGGG-GC-T--GGAT-AT-TTG-AAGAAAGATAG-GTCCAAA-TT--T----CGATT-------CTTTC----AGGATGATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GC-AA-T--TTAA--AAAAC-TGT-ATCGTCTCAATT-T--TA-C--A--AA--A-AA-CTAAA-AA------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATT-AC-AGA-AA--TT--CTTAAAAAAA-AAT--CCT--AA--CCT-ATTTT-TT-ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTCGTA--T--ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------T---CGC-AATTTT-----GACGGTCAAGTTG----G-CCA--AA-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCCCCG--A-TATA--T-------C------TTT---A-AAA-A--TACCTAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CA-AAATA-AGATG-GTTT-G--ACAA----TGA-TA---ACG-------------ATATTTCA-TT-GG--GTTTTTG-AAAA--GT-A-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCTG-AT-C--AT-T------G---AAG-A--AAATAGCGTC--A-AAT----T-T-CAGG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AA-C---AACAAA-TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAAA--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA-AA---A----AAA-----------AG--GAAAGA--------A-ATATA-AA---GTA----T-CGT--CCTG--TTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-C-TAA-CC------TA------TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-GT----CTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-A--CCCC-C----ACCC------------------------C---CAA-G---------C-GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTTGGCTCTA-TT-TA-A-CA-T-GCCATT--AA--A-------ACTTT-A-AGT-T-TTA-T-ACA-AGAA-A-TCTT--CTTAAAT-----------TTAAAAAA----A-AATATA-TG-------------------------A-----------TTTATC-CATTAA-AT-A-ATACCA-CA-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAA--TG-T-A---TA--A---A-TTTAGTGCTA-C--T--CCA--TGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA-------------TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTGC--CCATGAG-------A-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--GCGC-GG-GA--ATT---------CAAA--G-G---CTTC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAGAAAGA-GGAACAAA-AG-C-A-GACT-AGC---GTAA----ACTG--TCGCA---AG-T-GATATTTT---TTTTCTTAAAT-GTTT-GAT-ACCCC---CA--C-CCCACCC-CCA------C--CCTT-TTC-C-TTCGAA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---A-A-TA-CA--TTTT-AAC---T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-A-C-TA--T--T-TA--TA--TAA-ATATA-C-A-TCCAAAAACATAATAA----T-A-A----TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA------AAC--A-A-AA----AAA---CAAA-TT-------AAAAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-TGT-GT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGC--A--CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agcgAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA---T--T---AAAAA----------------------TTT-T--GCAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCAC--CCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-AACTATAAAT-AATAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG--TTTCAAGAAAAT--TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC---GAACTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA--AAAAAAAATAAGCC-TG-TA--T-A-CT---GATA-TATT--C-CT------TTAAAAAA-ATT-AGATGA-TAA-TTTTTTT---T-ATAAC-A----CACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--AAT-CA--TTT---GTTTTTT--AAAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTCAG--TGA-CCT-AG-GA-T--ATTTT----TTGG-CA-A--G-AT-AT-TTGGAAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------ATCTC--T-AAGAT-ATTGGAAAT--TGA--C-AC-A-TTTACC---TCCA-GT-AA-T--T-AACAAAAAA-TGTTATCGT-TCA-TT-T--TA-A--A--AACAA-AAAATAAC-G-------GAA-TTA------TG-TAGTATAT-C---CC--TAC-TTT-CATTTAC-AGA-AAATTT--T---AAAAAA-ATT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCATATTC-TA--TTTACC-CCTAAACCTCCCCC---------CCCCCA------TG--CGT-AAATT------GACG-CAA-GTTGTATGG-C-A--AT-TT-AGT--TGT-TGT--A-A-CCCC-G--A-TATAA-T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAC--AGATG-A-T-AA--------AA--T--GTATACGACTTA--CG-AA-TATAGATGAGT---A--A-AA----GGA--------A------------CATATATCAGTT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TTTAAGGTGACCTAGA-TGGATA-TC---A-G--GGGCTG-AC-AATTT-T------G---AAG-ACAGAATAG-GTT--A-AATAT--T-T-C-G--T-CTTTGCGA--AAAAT-AA-C---AA--AA-TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AAA--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAAAA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------G-ATAT--AAAAAGTA---AT-CAT--CCTG--CTTTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGT-TTA-CCGTCAGGTA--T-TATTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TC----CTAC-T---A-C-C------------------------------CCCC-A--CTCC-G----CTAA------------------------G---TTG-A---------C-G-T-CA--TTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACAT---AA--A-A---T-CCTTT-A-GTT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-CAT-----------TT--AAAA----A-AATATATTG---A-AT---AG-ATAA-A--A-ATA-----------TTTATC-A----A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AAT-TG-TAA--TTA--ATT-ATTT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC--AA-GGCAA-AGGT-T-AAACGC----------CT-TG-TC-C--AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTAA--CCATG-G-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--AGGG-GG-AA--TTTTTTTCCCCCCAAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGG-T--GG-GA---AA-T-----------------G-GG-GC-AA-AG-C-A-T--A-AG----GT-A----ACT---TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TTAAATGGTTG-GA--ACCCC---C---C-CCC--------------------T-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--TGC-A-TTACTT--T-AC-A-T-ATCA---GAA-TA-CA--TTTTAAA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-TAATCTTT-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACC-A-TA-AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAAC----AATAAA-A-AA--ACAAA---CAAA-T---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-T------A-T-T-GA-ATA-AAT--AA-AAATAAATGCAAA-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATTTTAAATTA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCA-TTTTTTT---A-A---A-A----CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAA-G-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTCA-T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-C-AC---TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-T--TT-A--C--CA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C----AA--CCT-ATTCT-T--AAAG-A--GT---AA-TTGCA-ATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TG-ATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACT-ACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT-G-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTG--A-AAT----T-T-C-GG-T-TCTT-CG---AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT---A---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCT-A----CCAC------------------------A---CCA-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTT-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----C-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-TT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-CG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GTCAG-AAGT-C-AAACCAC---------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGA--TCATGAG-------C-C----ACAG-TG-A-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-GG-C-A-G--T-AG----GT-A----GCTG--TCGC----AG-T-G-TATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTC-GA--ACCCCACTC---C-CCC-CCC-CCTCTCTCTC--TCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-GA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATAGA-T-A-TG-AAAA----AAAAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAAC----AAT----A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTGG-AATATAAAATT--TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TC---GAAAA--TTCCAAAAAAAT--TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--CAAAAAACTC-T-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGCCAT-GAAAAA--TAAACC-TATTA--T-A-CCC---ATA-TATC--CTTT------ACCAACAT-ATT-AAATGA-TAA-GTTTGTT---T-----C-A----TAAG--AATAAAGAT-GTTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CACCTT----GTCTTTTTAAA----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGTCTCCAG--TGA-CATCAT-GA-T--ATTTT----AGGGCGC-T--T-GTCAT-TTG-AA------TAGCGT--AAA-CT--TGCGGCGGT--------CGTTT--T-AGAATAATTAAAAAT--TGA--C--C-ACTT-ACC---T-CA-GT-AA-T--TAAA--AAAAA-CGC-ATCGT-TTAATT-T--TT-G--ACCAC--A-AAGCTAAA-C-------GAA-T-A------TG-GAGTT-ATCCAT-CCA-TGCTTTT-CATGTAC-AGA-AA------T---AAAAAA-AAC--A-T--AA--CTT-ATTTT-TTCACAG-A--GTCAGAA-TTGCACATTC-TACTTT-TCC-C-TA-------------------CCCCCA------TGCACAT-AATTTGCACGCGACG-TCATGTTG----G-CAA--AT-TT-GGTC-TGTA-GT--A-ACCCC--G--A-T-TA--T-----T-C------CTGAAAA-AAA-A--TAT-TTAATGTA-T-TA--------GA--T--TTTTAC---TTA--C--AA-TA-AACTG-TCTT-G--A-AA----GGA-T-T--ACA------------TA-ATATCG-TT-GG--TTGTTTGTAAAA--GTCG-A---AACAAATG-AA----ACCGTT-TC---AGTTATCTT-A-T--ATA-TTCTTT-T--GGGCTG--C-A---T-T------G---AAGAA--AAACAT-GTC--A-AAT----T-C-C-AA-TATTTT-CGACCAAA-T-AA-C---AA--AAGTT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----T-TA-AGA--AACATA-TATTG-TT--AA--TTTTGA---AA---A----AAA-----------AAGTTAAAGG--------A-ATATAAAA---GAA---CT-CAT--CCTG--CTTTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA-TC------CA--T-G-TTT--AGCA-GTA---A--T--C-G-CA-TC----TTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-CTTTATCAG------------------------GAAAGTG-A---------C-G-T-CA-ATGG-----CCA---CATTGGCTCTA-TGCTA-ACCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AG--T-TTA-CAATA-TGAA-ATTTTA--CTT-ATC-----------CT--AGAG----A-ATCAAA-TG---ATAT---AG-ATAATA--A-ATAC----------TCTATC-AACT-GCATCA-ATA-C--TA-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAAT-TGTT-A--TTA--A---C-AT------TA-C-----CCA-CTAAA---AC-AAA--GCAA-AAGT-TAAAACCAC---------CC-TA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTGA--CCAT--G-------C-C----GCAG--G-C-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--AGCG-GG-AACTATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAGC-T-G-T--GC-AAATCAA-T-A-A-A---A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cccAAAT-GTTT-GA--CCCCC---C---C-CCC-CCT-CGA------C--CCGG-TTC-T-TCA-AA-AG--A--------AA-------AACAT-T-A-T-ATTT--CAAC-ACT-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AAAATAT--A-ATATT-AA-------AT---A--TC-T------T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TAATCAA-GTAAA-A-A-T--AATA----AA--A----T-A-A----TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAAC----AAT--ACA-AA--AC------CAAA-CA-------AAATAA-A-------------------C--AA---AAA-AA-AAA-T-TTCAAAAAAAAAAAAAA--AA-ACA---CACA--AA-A------ACT-T-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGC--A-CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                             cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CCGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAATC-AC-A-TTGACC---TCCAGGT-AA-T--T--A--GAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-AACA--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TA-AAGCA-AT-CATACC--TGC-TTT-CATTTACAAGATAA--TT--T---AAAAAAGAAT--C-T--AA--CCTAATTTT-T--ACAGAA--GT---AATTTGCAC-TTC-TA--TT-ACCGC-TACCCCC----C---------CCCCCC------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----GCC-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----TCC------TTT---A-AAA-A--TAT-T-AATG-A-TAAG--------AAATT--TTTTAC---TTAACCG-AA-TA-AGGTG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC------------------ATATATCA-CT-GG---TTTTTTAAAAA--GT-GAA---AAT---TG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC---TG-ATA----TTG-AT-GGGCTG----A--TT-T------G---GAG-------T---GT-------T----T-TAC-GGAT-CTTT-TG-----A-T-AA-C----A--AA-TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----T----AAA--AAAATG-TA-TG-TT-CAA--TTTTGG---AAAG-A----AAA-----------AG--AGTAGG--------A-ATTA--AA---GTA---GT-CATTCCCTG--CTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-T-A-CC------TATTT-T-TTTACAG-A-GTAT--A--TTGC-G-CA-TTCGTCCTAC-T---A-C-CGGCTAGCCGCGCTACA-CC-----------CCCCGC--CCCCGC----CCAC------------------------G---CTA-T---------C-G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTTGGCTCTA-TG-T--A-CA-T-GACATT--AA--A-C---TCCCTTT-ATAGT-T-T-------A-TTTT-A-TCTGGTCTT-GATGGTCCTTCGTGTT--ACAACATGA-AATCTACTT---A-ATTAAAA-ATGATATGA-ATAGATAATAAATATTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-AT-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAAT-TG-T-A--TCAAGA---A-TT------TA-C--TTACCACCTAAT---AC-AAA-GGC-A-ACGT-T-AAA--A----------GC-CG-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------CGC----ACAG-TG-G-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--AGGG-TG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-T--CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-G---AAAG-AAGA-GG-GCAAA-AG-C-A-G--T-AG----TT-A----ACTG--TCGC----AG-TGGATATTTT---TTTT-TTTATT-GTTTGGA--ACCCC---C---A-CCC-CAC-C--------C-----T-TTC-C-TTC-AA-AGATA--------AA-------AA--T-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-T--CA--TTTTAAA----T--G-A-AT--TA-------AT---AAATA-T--AT--T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--T-A-ATATA-C----------------TAA----T-A-A----T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--TCAAA---CAAA-TA-------AAAAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC------------AAT-AA-ACA---CAC----A-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --TTTTAC---TTAA-TG-AA-TA-AGATG-GTT--G--A-AA----A-A-TAT--ACA------------T-TATATCA-TG-GG--TTTTTTTTACGA--GT-G-A---AAT---TA-AA----AACGTT-TC---AGTGATCTC-AATA-ATA-TT-TTT-G--GGGCTC-AT-A--TT-GAAAGAAG---AAG-A--AAATAGCGTA--A-AAT----T---C-G-----CTT-CGA--ATA-T-AA-C---AA--AA-GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AAA--AAAATG-TATTG--T-CAA--TTTGAA---AA---A----AAA-----------AG--TAAAAGTA------A-ATA---AA---GTA---GT-CAT---CTGCTCTTTCA-TTA--CA--G-AACTGTC--AATA--AA-A-TGC-TAA-CT------TA--T-T-GTTACAG-A-GTA---A--TTAT-G-CA--T----CTACTT---A-C-C--------------CC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCA------------------------G---CCGCGAAAGTTGACC-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TATA-CA-T--ACATT--AA--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACATTGAA----CTA--CTT-GAT-----------TTCGAAAA----A-AATATA-TGGATA-AT---AGAATAA-A--G-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-A-A-CA-TA-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------T-TG-T-ATTTTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA--GC-A-AAGTAT-AAACCA----------CC-TC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GT-G--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA----GG-GG-AA--ATT---------CAAAAGG-A---C-TC-CCAG--T-G-T--GGAAA---AA-T-A-A-T---AAAA-AGGA-GA-GC--A-AG-C-A-G--G-AA----AT-A----ACGGATTC-C----AG-T-GA---TTT---TTTA-TTAAAT-A--T-GA--A-------A---C-CAC-CAC-C--------C--TCTT-TTC-C-TAA-AA-AA--ACAAGAAATAA-------AA--T-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----TTGA-ATAA--AA-------ATA--AAATT-T--ATGTT-T-ATC-TA-TT--TACAT-TA--T-A-GT------------AAA----AAT------T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA-----AAT--A-A-AA--ACAAA---C-TA-TA-------AAAAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T--------------AA--AA-A------ACA--AA-ACACCACA-T----A-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GT--A-CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-TT-TTG-A--GGGCTG-AT-A--TT--------G---AAG-A--ACATAG--TC--G-AAT----TCT-C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AAAC---AA--AG-TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG---GGGGGA----AAA-----------AG--TTAAGG--------ATATAA--AA---GTA---GTTCAT--CC-G--CTT-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGCCG-CA-TC----ACAC-------C-C--------------TAACC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG-A---------TAG-T-C----TG-----------ATTTGGCTCTAATG-TA-A-CA-TTGACATT--AA--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T-TTAAC-AC--TGAGTA----A--CTT-A-------------TT--AAAA----ATAATA-A-TG---A-A----GG-ATAATA--ACATA-----------TTTATCCAATT-A-AT-ATATC-AA-TAATTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA----C-AA--GGCAA-AAGT-T-TAA--A----------CC-TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TGAG-A--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAA-G-A---AAAG-AAGAGGG-GC-AA-AG-C---G--T-AG----TA-A----ACT---TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TAAAAT-GTTT-GA--CCCCCA--C---C-CCC-CCC-CA-------C--CCTT-TTC-C-TC---A-AG--A--------AA-------AA--T-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TTTT-AAG---T--A-ATAT--AA-------AA---AAATC-T--A---T-A-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-ATA----TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAACCCATAAT--A-A-AACCACAAC---CCA---A-------AAAAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC-----------------G-AC----CACA--AA-A------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGC--C-GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAAC


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T       AT TC    CC     GT       C           G  TAA            G  A      C A       G  CAAG   ATC            AG        A        TT    T          TT AAA        T TC AAT        .    T .   A    TT  .   C   C  CA      AA      .  T  AA T G   .     C    AT T  .             T   T      A   T       TACAACAG          C T       G        . A      . G A G A       TACATG TC A G  CC  T          TA  AA           .    A   G .   AATAC   C     A    .   C  T  A .      G       C  . TT G  C  .   G       A   C   C   A  TGCGG      T            ATT      G         .    AT .  . C  T   .      G  .  A .  AACA      A   T     C      A AA  . ACC    CA .        A A         T T .       A     T  C   T  A    T   T       A   T  TTCTTA          G   CTAA     .    A     . TC    A .   CAG  T          G  CT  T   G C  CACCCCCCCC               .       CA   A     GCACGC    G   A    TATG C T .   .  G   TA       CT T C   CC .  T    A  ATGGG C ATATAT   AAA G   T GA   C      T T A  .         TCT        GAC   AC  A  A  T     A    . AA C  A      .  CATAACTTCGCCTTTTTG         G  G  GTT      T    .   CGA       AAA  A  .    C    .  TAA         G A  G   AT C  GGAA       A  G AT  GAAAGAA  AAA   ACA       C  CTC .   AT   TA  A GA A    G GACC   A T  A .    CA  G  G    . G C    A CT  .       C  A   ATTAAG      .       C     .  A   AT      GAA  GGG AAAT   .            GT      TA       T   TAA  AAA   .    T   TC    CT      T   GG  CAGA       TA    TA  C A G T   .  GTCAGG  TT . A       C .   T   AG    C T  TTCGTC     TAC     T GGCTAGCCGCGCTA  A  .              G .     G TTTA  ACCACCACCCCCATCAGCGTAATTAAGTTGA              A C A  .    TTGATGTC              A  C  T C  . T      AC  .  T CTT C     T T   . .   A A   T    T T    GT   A   GGTCCTTCGTG  AA    CATG T      T  AATTAA      A    T TG C   GATAATAAATA      C  T A C  A T   C  T  A A   TT  CG     T  G   CG   C  T T  TA     A T  .               TA   TTAAC    C  T A TT   AG TAAA   TAGTGC  A .  TA   C     .    T  AT     G    A A  ACCATCCAGATCAT  C  T  T  T   .     C GGT          A  .  .        A    AA       .       G ATGT    A  A T AC TTG  A  T AC  C  G C  CTGA  C  G     T  G  CT   TTTTCCCCC    AG GGCC  T  T    C  G G TG  A  ATC  A AAGA         C    G  A  A  .  . GAGTA     C     A GCAT   GAT    GACT  C G   AT   .      CTT    G    G  TA     CGGGC       A   CCTCTCTCTCT      A   . T  CG  T  AT CAAGAAAT  GAAGATA  CA G A T      AA    GA  A    CTCG  G  G  .     A  AATA TG .    GATCAAAGAAT          C .  TGT G A   T  TT AA C   C  AT A C  A  CATCC       ACAT   AAGTAATG T TAAG GGGACC     G  C     A  G      CCAT   AAA  .  CC     AGC    . A             T AGAAAACAACCC      T AA   A    C      T C T AAAAAAAAAAAA  AC  C   AAT    TT  ACACCACA   TT   G   C   .   T          AA GC       GGCAA  C CT   AA CAGT  C G   GG
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  T     C      A        C           .  TAT            G  G      . .       .  G      G              .         .        .     .          .  C          . .  A          .    . .   .    .   .   .   .  T       .       .  .  .  . .   .     .    .  T  .             T   .      .   .       TATAACA           C .       T        . .      . . . . .       .      .  . .  .   T          T   .            .    .   . .   A       C     C    .   .  .  . .      G       .  . T  .  .  .   .       .   .   .   .  T          .            TA       A         .    A  .  . .  G   .      .  .  . .  TAA       .   .     .      . .   . ACA    .  .        . .         . . .       .     .  .   A  .    .   .       .   .  ATTTT           .   CTA      .    .     . T     . .   .    .          .  .   .   . .  AACCTCCCCC               .       .    .     T         .   T    .    . C .   .  .   C        .  . C   A  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         ATT        .     A   .  .  .     .    . A  .  A      .  CATACATG                   .  .  GTT      T    .   GAA       .    .  .    A    .  .           . .  .   T  .  GCA        .  . T   AT       .     AA        C  C   .   .    CT  . G  .    . AA     . .  . .    .   .  .    . . C    . .   .       .  .   TAAAG       .       .     .  T   .       TA   AG  .      .            .       .        .   TA   A     .    .   .     .       T   A   GA         .     GA  . A G .   .  A       .  . .       . .   .   .     . .  TT         TAC     . .               .  .              . .     . .     CAGCCGCGAAAGTTGAC                            . . G  .    ATGTC                 .  .  . .  . .      .   .  . .   C     C .   . .   . .   .    . .    A    .   .            CG    .    .      C  GATAAT      .    T .  .   C                .  T . .  C .   .  .  . T   .   G      .  .   .    .  . .  AC     . .  .               A    TC       .  . . .    .  TTAT   .       . .  .    .     .    .  A      .    . .  ACCAC           .  .  .  .   .     . GA           .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  C     .  .     .  .  C    T            .  GA    .  .    .  . . .   .  .    . AATA         A    .  .  A  .  . AGACT     .     . .      G      A     . .   AT   .      TT     .    .  T      ACTCC       .   ACCCAC           .   . .  C   .  A  CGAATG    .        .  . A .      .     AT  .    GA    .  .  .     A  A    .  .    AATAAATTAA           . .  T   . .   .  T  .  A   .  .  A .  A  CCATA       .      AAT      . .    GT         T  .     C  .      .      AT   .  .      .      . A             . TTTAC             T .    .    T      T . T CAA           T   .   G      .   GAA        GT   .   .   .   .          .  C        AT     . .    .  A     . .   C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     C      .        C           .  CTA            G  G      . .       .  A      A              .         .        .     .          .  .          . .  A          .    . .   .    .   .   .   .  .       .       .  .  .  . .   .     .    .  .  .             .   .      .   .       TAAGA             G .       G        . .      . . . . .       .      .  . .  .   .          T   .            .    .   . .   .       .     .    .   .  .  . .      T       .  . .  .  .  .   .       .   .   .   .  T          .            AT       .         .    .  .  . .  .   .      .  .  . .  AAA       .   .     .      . .   . CA     .  .        . .         . . .       .     .  .   .  .    .   .       .   .  TTTA            .   GCT      .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  CCCCCC                   .       .    .     .         .   .    .    . A .   .  .   .        .  . C   C  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         T          .     .   .  .  .     .    . A  .  .      .  CTACATG                    .  .  G        T    .   TA        .    .  .    .    .  .           . .  .   T  .  GAT        .  . .   T        .     AA        .  G   .   .    T   . G  .    . GA     . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   TAAA        .       .     .  .   .       C    .   .      .            .       .        .   TA   .     .    .   .     .       T   .   GA         .     .   . . . .   .  A       .  . .       . .   .   .     . .  GT         TAC     . .               .  .              . .     . .     AGGAAAGTGA                                   . . A  .    TGTA                  .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .    . .    .    .   .            .     .    .      .  ATAT        .    T .  .   .                .  T . .  . .   .  .  . A   .   .      .  .   .    .  . .  GT     . .  .               A    TT       .  . . .    .  A      .       . .  .    .     .    .  A      .    . .  ACCAC           .  .  .  .   .     . A            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  G     .  .    .  . . .   .  .    . ATGA         .    .  .  .  .  . AAGT      .     . .      G      .     . .   AT   .      TT     .    .  .      CCA         .   CCACC            .   . .  A   .  .  .         .        .  . . .      .     AC  .    G     .  .  .     .  C    .  .    TGAAATA              . .  .   . .   .  T  .  .   .  .  G .  A  CACT        .      AAT      . .    G          .  .     .  .      .      AA   .  .      .      . A             . ACAA              . .    .    .      . . T .             .   .   .      .   CAA        G    .   .   .   .          .  C        T      . .    .  .     . .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     .      .        C           .  TTT            G  G      . .       .  A      .              .         .        .     .          .  .          . .  A          .    . .   .    .   .   .   .  .       .       .  .  .  . .   .     .    .  .  .             .   .      .   .       TTACA             G .       .        . .      . . . . .       .      .  . .  .   .          .   .            .    .   . .   .       .     .    .   .  .  . .      G       .  . .  .  .  .   .       .   .   .   .  T          .            T        .         .    .  .  . .  .   .      .  .  . .  AA        .   .     .      . .   . C      .  .        . .         . . .       .     .  .   .  .    .   .       .   .  TTA             .   CCT      .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  C                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . C   C  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         T          .     .   .  .  .     .    . A  .  .      .  CATATA                     .  .  T        T    .   AA        .    .  .    .    .  .           . .  .   T  .  GA         .  . .   T        .     A         .  C   .   .    T   . G  .    . AA     . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   TTAA        .       .     .  .   .       .    .   .      .            .       .        .   T    .     .    .   .     .       T   .   GA         .     .   . . . .   .  .       .  . .       . .   .   .     . .  TC         TTA     . .               .  .              . .     . .     ATGTTGA                                      . . C  .    ATGT                  .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .    . .    .    .   .            .     .    .      .  AAT         .    T .  .   .                .  T . .  . .   .  .  . C   .   .      .  .   .    .  . .  AA     . .  .               A    TC       .  . . .    .  A      .       . .  .    .     .    .  A      .    . .  ACCA            .  .  .  .   .     . A            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  G     .  .    .  . . .   .  .    . AAGA         .    .  .  .  .  . AGG       .     . .      G      .     . .   AT   .      TA     .    .  .      CAC         .   CGACC            .   . .  C   .  .  .         .        .  . . .      .     A   .    G     .  .  .     .  G    .  .    AAAATA               . .  .   . .   .  T  .  .   .  .  C .  A  TATG        .      AAT      . .    A          .  .     .  .      .      AC   .  .      .      . A             . ATTA              . .    .    .      . . T .             .   .   .      .   CAT        T    .   .   .   .          .  C        A      . .    .  .     . .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     .      .        A           .  TAT            G  G      . .       .  G      .              .         .        .     .          .  .          . .  A          .    . .   .    .   .   .   .  .       .       .  .  .  . .   .     .    .  .  .             .   .      .   .       AAAA              G .       .        . .      . . . . .       .      .  . .  .   .          .   .            .    .   . .   .       .     .    .   .  .  . .      T       .  . .  .  .  .   .       .   .   .   .  T          .            T        .         .    .  .  . .  .   .      .  .  . .  TA        .   .     .      . .   . C      .  .        . .         . . .       .     .  .   .  .    .   .       .   .  TTT             .   CT       .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  C                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . C   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         C          .     .   .  .  .     .    . A  .  .      .  TACATA                     .  .  T        T    .   AA        .    .  .    .    .  .           . .  .   T  .  GG         .  . .   T        .     A         .  C   .   .    T   . A  .    . AA     . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   TAAA        .       .     .  .   .       .    .   .      .            .       .        .   T    .     .    .   .     .       T   .   G          .     .   . . . .   .  .       .  . .       . .   .   .     . .  TT         TA      . .               .  .              . .     . .     CCCCCCG                                      . . A  .    GCA                   .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .    . .    .    .   .            .     .    .      .  GAT         .    T .  .   .                .  C . .  . .   .  .  . T   .   .      .  .   .    .  . .  A      . .  .               A    TC       .  . . .    .  A      .       . .  .    .     .    .  A      .    . .  ACGC            .  .  .  .   .     . A            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  G     .  .    .  . . .   .  .    . AAGA         .    .  .  .  .  . AGT       .     . .      C      .     . .   AT   .      TT     .    .  .      ACC         .   CACC             .   . .  C   .  .  .         .        .  . . .      .     A   .    G     .  .  .     .  .    .  .    AAATTA               . .  .   . .   .  T  .  .   .  .  G .  A  CAT         .      AAT      . .    G          .  .     .  .      .      A    .  .      .      . T             . AC                . .    .    .      . . T .             .   .   .      .   AAC        T    .   .   .   .          .  C        A      . .    .  .     . .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     .      .        C           .  TT             G  G      . .       .  A      .              .         .        .     .          .  .          . .  T          .    . .   .    .   .   .   .  .       .       .  .  .  . .   .     .    .  .  .             .   .      .   .       TACA              C .       .        . .      . . . . .       .      .  . .  .   .          .   .            .    .   . .   .       .     .    .   .  .  . .      T       .  . .  .  .  .   .       .   .   .   .  T          .            T        .         .    .  .  . .  .   .      .  .  . .  AT        .   .     .      . .   . A      .  .        . .         . . .       .     .  .   .  .    .   .       .   .  TTT             .   CT       .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  C                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . .   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         T          .     .   .  .  .     .    . .  .  .      .  TACAT                      .  .  T        T    .   GA        .    .  .    .    .  .           . .  .   T  .  TG         .  . .   T        .     A         .  C   .   .    T   . G  .    . GA     . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   TAAA        .       .     .  .   .       .    .   .      .            .       .        .   T    .     .    .   .     .       T   .   A          .     .   . . . .   .  .       .  . .       . .   .   .     . .  TC         TA      . .               .  .              . .     . .     CCCCAAG                                      . . C  .    GCA                   .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .    . .    .    .   .            .     .    .      .  AAT         .    T .  .   .                .  T . .  . .   .  .  . T   .   .      .  .   .    .  . .  A      . .  .               A    TC       .  . . .    .  A      .       . .  .    .     .    .  A      .    . .  ACCA            .  .  .  .   .     . A            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  G     .  .    .  . . .   .  .    . AAGG         .    .  .  .  .  . ATA       .     . .      G      .     . .   A    .      TT     .    .  .      CA          .   ACC              .   . .  C   .  .  .         .        .  . . .      .     A   .    A     .  .  .     .  .    .  .    AAAATA               . .  .   . .   .  T  .  .   .  .  A .  A  CAT         .      AAT      . .    G          .  .     .  .      .      A    .  .      .      . A             . AC                . .    .    .      . . T .             .   .   .      .   AA         T    .   .   .   .          .  C        G      . .    .  .     . .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     .      .        C           .  TA             G  G      . .       .  G      .              .         .        .     .          .  .          . .  A          .    . .   .    .   .   .   .  .       .       .  .  .  . .   .     .    .  .  .             .   .      .   .       TACA              G .       .        . .      . . . . .       .      .  . .  .   .          .   .            .    .   . .   .       .     .    .   .  .  . .      T       .  . .  .  .  .   .       .   .   .   .  T          .            T        .         .    .  .  . .  .   .      .  .  . .  AA        .   .     .      . .   . C      .  .        . .         . . .       .     .  .   .  .    .   .       .   .  TTT             .   CT       .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  C                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . .   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         T          .     .   .  .  .     .    . .  .  .      .  ACGA                       .  .  G        T    .   AA        .    .  .    .    .  .           . .  .   T  .  GT         .  . .   T        .     A         .  T   .   .    T   . G  .    . GA     . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   AAA         .       .     .  .   .       .    .   .      .            .       .        .   T    .     .    .   .     .       T   .   G          .     .   . . . .   .  .       .  . .       . .   .   .     . .  TC         TA      . .               .  .              . .     . .     AAGTTGA                                      . . C  .    GCA                   .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .    . .    .    .   .            .     .    .      .  GAT         .    T .  .   .                .  T . .  . .   .  .  . A   .   .      .  .   .    .  . .  A      . .  .               A    TC       .  . . .    .  C      .       . .  .    .     .    .  A      .    . .  CCA             .  .  .  .   .     . A            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  G     .  .    .  . . .   .  .    . AAGA         .    .  .  .  .  . AGT       .     . .      G      .     . .   T    .      TT     .    .  .      CT          .   ACC              .   . .  C   .  .  .         .        .  . . .      .     A   .    G     .  .  .     .  .    .  .    AAAATA               . .  .   . .   .  T  .  .   .  .  A .  A  AAT         .      AAT      . .    G          .  .     .  .      .      A    .  .      .      . A             . GC                . .    .    .      . . T .             .   .   .      .   AC         T    .   .   .   .          .  C        A      . .    .  .     . .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     .      .        C           .  AA             .  G      . .       .  A      .              .         .        .     .          .  .          . .  A          .    . .   .    .   .   .   .  .       .       .  .  .  . .   .     .    .  .  .             .   .      .   .       TACT              C .       .        . .      . . . . .       .      .  . .  .   .          .   .            .    .   . .   .       .     .    .   .  .  . .      G       .  . .  .  .  .   .       .   .   .   .  T          .            T        .         .    .  .  . .  .   .      .  .  . .  AA        .   .     .      . .   . A      .  .        . .         . . .       .     .  .   .  .    .   .       .   .  TT              .   AT       .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  C                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . .   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         T          .     .   .  .  .     .    . .  .  .      .  CAA                        .  .  T        T    .   AA        .    .  .    .    .  .           . .  .   T  .  AG         .  . .   T        .     A         .  G   .   .    T   . G  .    . AA     . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   TTA         .       .     .  .   .       .    .   .      .            .       .        .   A    .     .    .   .     .       T   .   G          .     .   . . . .   .  .       .  . .       . .   .   .     . .  T          TA      . .               .  .              . .     . .     ACACCAG                                      . . C  .    CCA                   .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .    . .    .    .   .            .     .    .      .  AA          .    . .  .   .                .  . . .  . .   .  .  . T   .   .      .  .   .    .  . .  A      . .  .               T    T        .  . . .    .  A      .       . .  .    .     .    .  A      .    . .  ACC             .  .  .  .   .     . A            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  G     .  .    .  . . .   .  .    . AAG          .    .  .  .  .  . AGT       .     . .      G      .     . .   A    .      TT     .    .  .      CA          .   CCT              .   . .  A   .  .  .         .        .  . . .      .     A   .    G     .  .  .     .  .    .  .    TAAAT                . .  .   . .   .  T  .  .   .  .  A .  A  CAT         .      AAT      . .    G          .  .     .  .      .      A    .  .      .      . A             . AC                . .    .    .      . . T .             .   .   .      .   AA         G    .   .   .   .          .  C        A      . .    .  .     . .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     .      .        T           .  TA             .  .      . .       .  G      .              .         .        .     .          .  .          . .  A          .    . .   .    .   .   .   .  .       .       .  .  .  . .   .     .    .  .  .             .   .      .   .       AAAA              C .       .        . .      . . . . .       .      .  . .  .   .          .   .            .    .   . .   .       .     .    .   .  .  . .      A       .  . .  .  .  .   .       .   .   .   .  T          .            T        .         .    .  .  . .  .   .      .  .  . .  A         .   .     .      . .   . A      .  .        . .         . . .       .     .  .   .  .    .   .       .   .  TT              .   CT       .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  C                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . .   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         T          .     .   .  .  .     .    . .  .  .      .  ACA                        .  .  T        T    .   AA        .    .  .    .    .  .           . .  .   T  .  GG         .  . .   T        .     A         .  C   .   .    T   . A  .    . A      . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   ATT         .       .     .  .   .       .    .   .      .            .       .        .   A    .     .    .   .     .       .   .   G          .     .   . . . .   .  .       .  . .       . .   .   .     . .  T          A       . .               .  .              . .     . .     ACGCTAT                                      . . A  .    GCA                   .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .    . .    .    .   .            .     .    .      .  AA          .    . .  .   .                .  . . .  . .   .  .  . A   .   .      .  .   .    .  . .  A      . .  .               A    C        .  . . .    .  A      .       . .  .    .     .    .  A      .    . .  AA              .  .  .  .   .     . G            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  G     .  .    .  . . .   .  .    . AGA          .    .  .  .  .  . AGG       .     . .      G      .     . .   A    .      TA     .    .  .      CC          .   CC               .   . .  C   .  .  .         .        .  . . .      .     A   .    G     .  .  .     .  .    .  .    AAATA                . .  .   . .   .  T  .  .   .  .  A .  A  AT          .      AA       . .    G          .  .     .  .      .      A    .  .      .      . A             . AC                . .    .    .      . . C .             .   .   .      .   AA         T    .   .   .   .          .  G        T      . .    .  .     . .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     .      .        .           .  TA             .  .      . .       .  .      .              .         .        .     .          .  .          . .  .          .    . .   .    .   .   .   .  .       .       .  .  .  . .   .     .    .  .  .             .   .      .   .       TCA               A .       .        . .      . . . . .       .      .  . .  .   .          .   .            .                                                                                      .   .   .   .  .          .            .        .         .    .  .  . .  .   .      .  .  . .  A         .   .     .      . .   . C      .  .        . .         . . .       .     .  .   .  .    .   .       .   .  TT              .   C        .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  C                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . .   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         T          .     .   .  .  .     .    . .  .  .      .  CA                         .  .  T        A    .   GA        .    .  .    .    .  .           . .  .   T  .  TT         .  . .   T        .     A         .  A   .   .    C   . G  .    . G      . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   T           .       .     .  .   .       .    .   .      .            .       .        .   .    .     .    .   .     .       .   .   .          .     .   . . . .   .  .       .  . .       . .   .   .     . .  T          .       . .               .  .              . .     . .     AGCCGA                                       . . C  .    .                     .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .    . .    .    .   .            .     .    .      .  .           .    . .  .   .                .  . . .  . .   .  .  . T   .   .      .  .   .    .  . .  A      . .  .               A    .        .  . . .    .  A      .       . .  .    .     .    .  .      .    . .  AA              .  .  .  .   .     . A            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  A     .  .    .  . . .   .  .    . AAA          .    .  .  .  .  . GT        .     . .      .      .     . .   .    .      .      .    .  .      CC          .   .                .   . .  A   .  .  .         .        .  . . .      .     A   .    G     .  .  .     .  .    .  .    AAAT                 . .  .   . .   .  .  .  .   .  .  A .  A  C           .      AT       . .    G          .  .     .  .      .      A    .  .      .      . A             . AC                . .    .    .      . . . .             .   .   .      .   TA         T    .   .   .   .          .  .        .      . .    .  .     . .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .  .     .      .        .           .  A              .  .      . .       .  .      .              .         .        .     .          .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .   .  .    .   .       .   .  T               .   .        .    .     . .     . .   .    .          .  .   .   . .  .                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . .   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         T          .     .   .  .  .     .    . .  .  .      .  CA                         .  .  .        T    .   GA        .    .  .    .    .  .           . .  .   .  .  TG         .  . .   T        .     A         .  C   .   .    .   . .  .    . G      . .  . .    .   .  .    . . .    . .   .       .  .   T           .                                                                                                                                                                  .  . .       . .   .   .     . .  T          .       . .               .  .              . .     . .     AGCCG                                        . . C  .    .                     .  .  . .  . .      .   .  . .   .     . .   . .   . .   .                                                                                                                    .  . .   .   .      .  .   .    .  . .  A      . .  .               .    .        .  . . .    .  .      .       . .  .    .     .    .  .      .    . .  A               .  .  .  .   .     . .            .  .  .        .    .        .       . .       .  . . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  .     .  .    .  . . .   .  .    . AAT          .    .  .  .  .  . C         .     . .      .      .     . .   .    .      .      .    .  .      CA          .   .                .   . .  .   .  .  .         .        .  . . .      .     A   .    .     .  .  .     .  .    .  .    TAAT                 . .  .   . .   .  .  .  .   .  .  A .  .  .           .      C        . .    A          .  .     .  .      .      A    .  .      .      . .             . AC                . .    .    .      . . . .             .   .   .      .   AA         T    .   .   .   .          .  .        .      . .    .  .     . .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        . .     . .   .    .          .  .   .   . .  .                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . .   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         .          .     .   .  .  .     .    . .  .  .      .  CA                         .  .  .        .    .   G         .    .  .    .    .  .           . .  .   .  .  GA         .  . .   T        .     .         .  .   .   .    .   . .  .    . .      . .  . .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                               .  .              . .     . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  A      . .  .               .    .        .  . . .    .                                                                                                                                                                . .  .    .  . .   .  . .  .     .  .     .  .  .    .            .  .     .  .    .  . . .   .  .    . .                                                                                              .    .  .      AC          .   .                .   . .  .   .  .  .         .        .  . . .      .     .   .    .     .  .  .     .  .    .  .    AAAA                 . .  .   . .   .  .  .  .   .  .  . .  .  .           .      T        . .    .          .  .     .  .      .      A    .  .      .      . .             . AC                . .    .    .      . . . .             .   .   .      .   AA         .    .   .   .   .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     . .     . .   .    .          .          . .  .                        .       .    .     .         .   .    .    . . .   .  .   .        .  . .   .  .  .    .  .     . .        .   .   . .    .      . . .  .         .          .     .   .  .  .     .    . .  .  .      .  CA                         .  .  .        .    .   G         .                                     .   .  .  G          .  . .   .        .     .         .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .  .              . .     . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  . .  .   . .   .  .  .  .   .  .  . .  .  .           .      .        . .    .          .  .     .  .      .      .    .  .      .      . .             . .                 . .    .    .      . . . .             .   .   .      .   AA                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .                                                                                         .     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            **                                   TA*                                                                                                                A*******   ***                 **                 **                     **               ******                               TACA************    **                                ******                     ****           **********   **         **                **               **     N****                                            T******    ********     T***               **                  ***            ** AA***                              C****                *******       ******                  **                      TTT*******          CT*****  **                   **                     **                                    ******                                         **                              **      **                            **                 ********                                                ****      CACATA**************                           **  AA*****           ****                                                        T*******                            ****                 GA**          ***                             *******        TAAA*****   **                                           ***********          ********                ***                            GA**                                                         ***            TC*****    TA*****                      ***********      **            ACGCCGG*************************************     C*      GCA********                                   **                                                                                                                                                             **                             A**         *************                                                 **            ***                      ACCA**********               ***                     ** ******                 *******                                                    **                               G****         **                   AAGA*****                                 ****    ****                           ***    TT*                                   ACC***********                                *******                      A**                  **                                           **                                      CAT*****           AAT*****        G*****              **                                       A*******                                 **                ************                     AA********                                C*       A*****
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATAATAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTT----GGGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-A--A--AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT-G-A---AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA-TT----CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-T-A-G-A---AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCC-C--------C--CCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AATA-TAAATTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--AA-------TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTTTACA------------CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTTN----GGG-GC-T--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TTT------CGGT--------CTTTCT---AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--TAA---AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-T--TA-AC----AA--A-AAACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AATTT-------AAAAAA-AATCT-----AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACACATA--------------TATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GTAA-----AAT---TG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TTT-------G---AAG-A--AAATAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAATAAA-----AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG---AA---A----AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CAGA--AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CATC-----CTACTA-----C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCACGCCGG-------------------------------------C-G-TC-A-GTTGGCA--------AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-ATA--ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--GG----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GA---AA-TAAGA-----AAAG-AAGA-GG-GC-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTTTT-AAAT-GTTT-GA--ACCCC---C---C-CCC-CCCACC-----------CTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAACA--T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACAT-----AAAA----AATAAT-----A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AAAA--------T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--AC-CCCTAGCA-----G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11    11                                                                      1111   111                                                                   11111111                                          11                                      111111                                                           1                         111111  111111             1111       11  2222222222                  11111   1     11                              1111111                                             11111111     1111     1                                               11111                         111111111                   1111111       111111                                          1111111111          1111111                                                           3333333333333333333                         111111                                               1   11                                                          11111111                                          11    1111      44444444444444444444                               1111111                                                                    11111111                            1111                 1111                                          1111111        111111                                   1111  111     11111111111          11111111          111                                                   11               111111                                    111111111   222222222222222222222222     11111111111                    44444444444444444444444444444444444444444444             22222222222                                                                                         11111111111  11                   1111111111                22222222222                                                                             1111111111111                                11111                                                   22222222222222                                                                 1111111                                                                     111111111       11111                                                                  1111    1111          1111                                                             111111111111111111                      22222222  1111111                                                    1111         3333333333333333                                               11111111           11111111        111111                                                       11111111        11111111111111111                          222222222222                                                                        111111           1111               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       44 22    11     77       1           3  3  3 6   3        6  1      3 3       3  0000   222            44        3        44    3          44 999        3 55 11111111   666  3 3   3    55  55  3   3  88      00      3  3  55 3 3   55    3    55 7  000000        7   3      3   3       9999999999999999  1 88      0        3 3      3 3 3 3 444444  000000 55 3 3  55  5555       22  0000000000   55   4   4 55  44444   2     33   4   4  8  4 55     1 55  4 0000000 4  4  4   4       3   7   3   3  8888888    66666666     2222     0         55   88 3  3 3  7   666    3  3  3 55 22222     3   3     3      3  333333333 3   7 666       3 5555555   3 3 000000  3     3  3   6  77   3   3       3   3  3333333333      6   0000000  44   3     2 66    2 33  555  2          2  77  3   2 2  0000000000000000000      888888  33   2     111111    2   5    6666 2 8 33  2  2   66       33 2 4   22 33 2    66 77777 2 888888   555 2   2 66   2      2 2 2  00000000  44444      444   66  2  2  2     2    2 55 2  1111   2  55555555555555555555       2  2  999      1    33  1111111     3  6666 6    3  555         3 3  2   44 2  99999      2  2 66  00000000    7777   555   5  777 3   0000 555 3 55 3    6 1111   3 3  3 555  44  3  3    3 3 6    3 44  0000000 3  3   222222  3   44      3     3  7   55      9999  111 3   77777777777  55      88888888 3   888  333   666  3   55    55      2   88  8888  4    55    00  3 7 7 3   3  777777  44 3 3       3 3   999 44    3 3  111111111   111111111111111111111111  2  33333333333    2 33    2 6666  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 33 3    77777777777           3  3  3 6  3 3      44  44 3 555 6     6 3   3 3   3 3   3    3 3    88   3   77777777777  00    7777 3      7  1111111111  3    6 55 3   00000000000      3  5 3 3  7 3   3  3  6 4   77  77     3  3   44   3  3 3  888    3 3  6666666666666   33   88888    3  3 3 44   44 00000  999999  3 44 44   3     555  3  44     3    3 3  33333333333333  3  3  3  3   555   3 5555         3  44 999999   3    44       0000000 3 7777    3  3 3 44 555  6  3 44  3  3 3  9999  3  77    3  3  77   555555555    44 00000 3  3    77 3 3 44  3    3  3   3   77      333 6  3  3 99999999  0000  3 2222   555    0000  3 6   88   555    333    3      77    44 555 888 3 555     999999999999999999 0 3   3 3  66  3  77 00000000  6666666  44 3 6 6      44    777 3    77777 3  3  44    6  5555 44 3    0000000000000000     2 33 777 2 2   5  77 33 5   2  33 1 2  1  77777777    6666   00000000 2 6666 333333     5  2     99 2      6666   7777 2  33     555    2 22222222      2 44444444444444444 5 33   66   5      5 2 2 222222222222  66  2   777    33  9999999999 444  3   3   3   3          44 77       888888 3 44   44 0000  3 3   88     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .       .. ..    ..     ..       .           .  .  . .   .        .  .      . .       .  ....   ...            ..        .        ..    .          .. ...        . .. ........   ...  . .   .    ..  ..  .   .  ..      ..      .  .  .. . .   ..    .    .. .  ......        .   .      .   .       ................  . ..      .        . .      . . . . ......  ...... .. . .  ..  ....       ..  ..........   ..   .   . ..  .....   .     ..   .   .  .  . ..     . ..  . ....... .  .  .   .       .   .   .   .  .......    ........     ....     .         ..   .. .  . .  .   ...    .  .  . .. .....     .   .     .      .  ......... .   . ...       . .......   . . ......  .     .  .   .  ..   .   .       .   .  ..........      .   .......  ..   .     . ..    . ..  ...  .          .  ..  .   . .  ...................      ......  ..   .     ......    .   .    .... . . ..  .  .   ..       .. . .   .. .. .    .. ..... . ......   ... .   . ..   .      . . .  ........  .....      ...   ..  .  .  .     .    . .. .  ....   .  ....................       .  .  ...      .    ..  .......     .  .... .    .  ...         . .  .   .. .  .....      .  . ..  ........    ....   ...   .  ... .   .... ... . .. .    . ....   . .  . ...  ..  .  .    . . .    . ..  ....... .  .   ......  .   ..      .     .  .   ..      ....  ... .   ...........  ..      ........ .   ...  ...   ...  .   ..    ..      .   ..  ....  .    ..    ..  . . . .   .  ......  .. . .       . .   ... ..    . .  .........   ........................  .  ...........    . ..    . ....  ............................................ . . .. .    ...........           .  .  . .  . .      ..  .. . ... .     . .   . .   . .   .    . .    ..   .   ...........  ..    .... .      .  ..........  .    . .. .   ...........      .  . . .  . .   .  .  . .   ..  ..     .  .   ..   .  . .  ...    . .  .............   ..   .....    .  . . ..   .. .....  ......  . .. ..   .     ...  .  ..     .    . .  ..............  .  .  .  .   ...   . ....         .  .. ......   .    ..       ....... . ....    .  . . .. ...  .  . ..  .  . .  ....  .  ..    .  .  ..   .........    .. ..... .  .    .. . . ..  .    .  .   .   ..      ... .  .  . ........  ....  . ....   ...    ....  . .   ..   ...    ...    .      ..    .. ... ... . ...     .................. . .   . .  ..  .  .. ........  .......  .. . . .      ..    ... .    ..... .  .  ..    .  .... .. .    ................     . .. ... . .   .  .. .. .   .  .. . .  .  ........    ....   ........ . .... ......     .  .     .. .      ....   .... .  ..     ...    . ........      . ................. . ..   ..   .      . . . ............  ..  .   ...    ..  .......... ...  .   .   .   .          .. ..       ...... . ..   .. ....  . .   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 3       66 55    22     99       8           3  3  3 7   3        7  8      1 1       3  8888   555            66        3        66    3          66 222        6 00 99999999   444  6 6   6    00  00  6   6  66      00      6  6  00 6 6   00    6    00 3  555555        3   6      6   6       1111111111111111  0 66      9        6 6      6 6 6 6 111111  555555 00 6 6  00  0000       33  9999999999   00   0   0 55  00000   0     55   0   0  0  0 55     0 55  0 0000000 0  0  0   0       6   3   6   6  2222222    88888888     2222     9         00   66 6  6 6  3   444    6  6  6 00 99999     6   6     6      6  444444444 6   3 444       6 5555555   6 6 555555  6     6  3   7  99   3   3       3   3  1111111111      7   4444444  66   3     9 88    9 99  000  9          9  33  1   9 9  7777777777777777777      222222  99   9     111111    9   7    1111 9 6 99  9  9   88       77 9 3   55 99 9    88 11111 9 222222   000 9   9 88   9      9 9 9  44444444  99999      777   33  9  9  9     9    9 44 9  8888   9  22222222222222222222       9  9  222      6    99  9999999     1  5555 2    1  444         1 1  9   22 9  66666      9  9 88  88888888    6666   000   7  000 1   8888 888 1 22 1    2 5555   1 1  1 444  22  3  3    3 3 7    3 66  8888888 3  3   222222  3   66      6     6  3   00      1111  444 6   33333333333  00      22222222 6   888  666   444  6   00    00      1   66  4444  7    00    00  6 3 3 6   6  777777  66 3 3       3 3   222 66    3 3  333333333   000000000000000000000000  9  66666666666    9 99    9 1111  99999999999999999999999999999999999999999999 3 3 88 3    55555555555           3  3  3 7  3 3      66  66 3 888 7     7 3   3 3   3 3   3    6 6    66   6   33333333333  00    7777 6      3  2222222222  6    5 00 6   99999999999      6  6 6 6  3 6   6  3  7 2   99  99     3  3   66   3  3 1  222    1 1  9999999999999   66   55555    1  1 1 22   22 00000  666666  3 66 66   3     888  3  77     3    3 3  88888888888888  3  3  3  3   888   3 5555         3  66 666666   3    66       8888888 3 1111    3  3 1 22 444  2  1 22  1  1 1  6666  1  33    1  1  33   444444444    22 55555 1  1    33 1 1 22  1    1  1   1   11      555 7  3  3 66666666  4444  3 9999   000    4444  3 7   44   888    888    1      33    22 444 555 1 444     999999999999999999 3 1   1 1  55  1  33 00000000  5555555  22 1 2 2      22    111 1    44444 1  1  22    2  8888 22 1    3333333333333333     9 99 999 9 9   7  99 99 7   9  99 9 9  5  66666666    1111   88888888 9 1111 000000     7  9     66 9      1111   0000 9  99     000    9 66666666      9 99999999999999999 7 99   88   7      7 9 5 555555555555  88  9   999    99  8888888888 666  1   1   1   1          66 99       555555 3 66   66 4444  3 3   66     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA-TA-T-AAA-TTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTTNG--GG-G---CT--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TT--A--A---C-AAA-A---AACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT--AA---AATTG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAG-A--AAA---TAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG----AA---A-AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA----TC--CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GAAA-TA-AGA-AAAG-AAGAGG-G-C-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTTGA--ACCC--C---C---C-C---CCCCC---AC---C---------CTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
Reference ( family-1826 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA-TA-T-AAA-TTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CANG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTTNG--GG-G---CT--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TT--A--A---C-AAA-A---AACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA--TT--T---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TAC--ACA------------TATATATCA-TT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT--AA---AATTG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAG-A--AAA---TAG-GTC--A-AAT----T-T-C-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG----AA---A-AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT--AA---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA----TC--CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------G---CCG-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATATA-TG---A-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TNATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA----------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GAAA-TA-AGA-AAAG-AAGAGG-G-C-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTTGA--ACCC--C---C---C-C---CCCCC---AC---C---------CTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA-TA-T-AAA-TTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTTCAAAGAATT--TCAACCAA-TCGTTTTT--CGTA-GATTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--ATACAAA--TTTGGGTT-AGTGA-TTTC--CAATTC-ATG-TA--GAAAAAAATAAGCCGTG-TA----A-CTCAAGATA-TATT--C-TTTTATATAGTAAGAA-ATT-AA-TGA-TAA-TTTTTTTCTTT-A---C-A----CAGGTAAATAAA-ATGGTTTGCA-CACATACT-A-C-ACCACCCTA------T--A-T-CA--TTTGTAGTTCATT--AATCCTAAACCCGTGCCAAA-TAG-ACAGA-----CGAATTCAGGGTGAACCT-ATTGA-TGGATTCTTAATGG-GAACCT--G-AT-ATCTTG-AAAAAAG-TAGTGTC-AGG-ATGAT----TGGTGCCTGTAACTTTC----AGAATTATGAAAAAGAATGA--CCACTA-AT-ACTCTATCCA-GTCAG-TCCT-AAGCAAAAT-TGT--TCGT-CAAATT-TT--ATAA---C-AAATA---AACTAAA-GCCGCAAGGAA-T-AACAGGGCG-AAGT---C-CAT-CCGTTGC-GTT-CACT-AC-AGA-AA--TTGGT---AAAAAGGAATGGC-T--AAAACCT-ATCTTCT--ACAG-AAAGT---AT-TTG---ATTC-TAG-TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCCCCCCCCTG--CGT-AATTT------GA-G-TCA--TTG----G-C-ATTATGTT-GGT---GTATGT--A-A-CCT--GCAG-TATGATT-----T-C------TTT---A-AAA-AA-TAT-AAAATG-A---AGTACCCAATAA--T--AATTAC---TTA--CG-AA-TA-AGGTG-GTTTAG--A-AAAAGAGGAGTAA--CCAGGGTAG------TGCAT-TCA-CT-GG--TTTTTTAGGAAACGGT--AACTAAATTG-GATATAA-CGTTATC---ACTGACCTC-A-TG---A-TT-TTG-T--AGGCTG-AT-A--TT---------GAG-A--AAA---TAG-GTA--ACAGTGTCCT-T-C-GT-T-CTTTGCAAG-AAA-T-AA-CAAGAA--AG-TT-GGCAGC-A-TATC-C--TAAGAGCCCT-AG-ATACTGTTAAA-AAATTAAAATG-TATTGATT-CAT--AGTTGG----AA---A-AGAAAAGAGAACCGAG--TAAAGGCAGGTATAA-AAAT--AA---GTATGTGT-CAT--CCTC--TTTTCA-TTA--CA--GAAATTTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAACCC------TA--TGT-TTTACAG-ACGTAATGA--TTGC-G-CAG---TT--CTAC-TTACA-C-C--------------TA-CCGGACACTAACACCCC-CGTCCCC-C----TC-C------------------------C---CCA-G---------C-G-TACACGTTG-----ATAGTCAGTTGGCTCTA-TG-TA-AGCAGT-GACATT--AAGGA-C---T-CC-TT-A-AGTATATTA-C-ACA-TGAA-A-TTTA--CTT-AA------------TT--ACAA----A-AATATA-TG---A-AC---GG-ATAA-A--A-GTT-----------GTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-TAGTTATAT-CA--GAAAA-AT-GAT--GTA-GG-T-AT---ATAG-A-AAATTTATCTAAATCATT-ATAAT---CG-AT-TG-T-A--TCA--A---A-TT------TA-CTTT--CCA-CTGGAAGTAC-AAT-GGTAA-AGCG-T-AAG--A----------CC-TG--C-CA-AGCCGGATG-A-A--AGAGTTATG-AATGATGAGGTCCA-GTGG--CCCTGAGAAAATGTC-C----ACA--T--G-A--C---TCGGA-T--TG-GA-G-AT----TG-AAATAGGG-TA-AG--ATC---------CAAA--GCG---C-TC-CCCGATT-G-T--AG-AGGA-TAGAGGCAAAG-AAGAGG-G-C-AATAGTC-G-G--G-AGTTATGT-AGTT-ACTG--TC-C----AG-TGGATATTTTGAATTTT-T--GAT-GTTTGA--ACCC--A---C---C-A---CCCCC---AC---C---------CTT-TTCTC-TTC-AA-GG--A--------AACACC---AA--T-T-ATTTATTT--TAACTA-T-ATCA---G-A-TA-CATGTTTC-AA----T--ATATAT--AA-------ATCA-AAATA-TGGA---T-T-ATCATA-TT--T-TAT-TA---AA-ATATA-CGA-T--AAAA----AAT------T-A-A----T------AATAA-GA-TAGGAACT-AGTAAA----ACT--A-ATAA--ACAGA---CAAACTAAAAGAGTAAAAAA-A---G----------C--C-C--AACCAAAA-AACGAA-T-TTCG-----------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------ATT-T-GA-ACA-AATAAAA-AAATAAATGC--A--CTCTAGC----AGG-C--TTT--G----TG-T-CC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -ATA-TT-TTG-A--GGG-TG-ATGA--TTAT------GAAG-A--ACA---TAG-GTCTCA-AAT----T---C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-TTAA-C---AA--AG-TT-GGCA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAA-TG-TATTG-TT-CAA--TTG-GG----GA---A-AAA-----------AG--TAAAGA--------A-ATAT--AAA--GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTGA--CA----AAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TT-C-G-CA----TC---TA------A-C-C--------------TA-AC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG---------------T-AA-GT-------------GATTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CTTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TATA--CTT-AAT-----------TA--AAAA----A-TATATA-TG---A-A----AG-ATAATA--A-ATA-----------ATTAT--AATT-A-ATAA-ATA-CATTA-T-ATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-A-TT-A-ATAG-GTAA-------------ATT-ATAAT---CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AA---A----------CC-TG--C-CA-AAC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AAG-AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TT-CCAG--T-G-T--GG-GAAA-TA-AGA-AAAG-AAGGAG-G-C-AA-AA-CGA-G--TAAG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA--TT---TTTT-TTAAAT-GTTTGA--ACCC--C---C---CAC---CCCCC---ACCCAC---------CTT-TTC-CTTTC-AA-AG--A--------AA-------AA--A-T-ATTTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-A-A----T------AAT-A-AG-T-GAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAACAACAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATG---A-CCCCTAGC----T-G-C--TTCAAG----TG-TGCCA--AAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA--A---AAA-TTAATAGTGTAATAATAC-AATGTTTTGGTC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTTTTCGTA-GGTTGCCAGT--CC--AAACTCTT-C--A-----AATTTT---TT-A-TGA-TTTTTTCG--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TAAAT-AGCCC--G-TA-TATT--C-TT------AAAAAAAT-AT----ATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---AGA----CACGT-AATAAA-A-GGTTTG-AACAGGGA-TGA-C-A------TA------T--A-TGCA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTGGA--AA-----CGT-TTCAAA-TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTTGT--GG-G---CTT-G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAAATT--T----CGGT--------CTTTC--T-GGAAT-ATGAAAAAT---GA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AAAT--T-AA--AAAAAATGT-ATTGT-TCAATT-TT--A--A---C-AAAGA---AACTAAC-G-------AAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CT--TGC-TTT-TATTTAC-AGA-AA--TT--A---AAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATATT-T--A-AG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TA-ACC-C-TA-------------------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----G-C-A--GT-TTGGGT--TGTATGT--ATC-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-ATT-AG--------AA--T--ATTTAC---TTA--CGAAA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----AGA-TAC--A---------------ATATATCA-TTGGG--GGGTTTTTGAAA--GT--TA---AATTT-AA----A-CG-T-TC---AGTGACCTC-A-TA-ATA--T-TTG-G--GGGCCGAAT-A--TT-T------GAAGAA--AAA---TAG-GTC--A-AAT----T-T-A-GG-T-CATT-C-----AA-T-AA-----AA--AA-TTGGGCA-C-A--TAT-C--TA-------C-AG-AAA----TTAA-AAA--AAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA-TT-T-AAA-TTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC---G--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC--G--A--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCA-TTTTTTT---A-A---A-A----CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTTGG--GG-G---CT--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T--A--ACAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TT--T--A---C-CAA-A---AACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C-T--AA--CCT-ATTCT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TACATACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT---G---AATTG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-tgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTAGTAGTCACACCCTACC-CCCTTTTATC--CCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTCG-AA-TAAT-AAA-TTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCAAAGAAAT--TCAACCAA-GC-TTTTT--CGTA-GGTTGCTAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A---TT---TT-A-TGA-TTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--CTTT------AAAAAAAA-ATT-AAATGA-TAATTTTTTTT---T-A---C-AACAGCAGG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----G--TTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-A--GA-T--ATTTTTG--GG-G---CT--G-AT-AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTC--TAAGAAT-ATG-AAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-TA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TT--A--A---C-AAA-A---AACTAAA-G-------GAA-G-A------TGAAAGTA-AT-CAT-CC--TGC--TT-CATTTAC-AGA-AA--TT--TA--AAAAAA-AAT--C-TA-AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATAA-AA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGC-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--C--TTTTAC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC--ATAACTTCGCCTTTTTGTATATCA-TT-G----TTTTTTTAAAA--GT--AA---AAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAGTAGTCA-ACCCTGCC-CCCTTTT--TT-CCCC--ATATTGTCAGTTTT-TTCATAATTGG-AA-TA-TTAAA-TTAATAAT-----AATACCA-TGTTTTG-TC----AAA---TTTCCAAGAAAT--TCAACCAA-GCGTTT----CGTA-CGT--CCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---T--A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA---AAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CT---AATACTAT---C-TT------AAAAA-----TT-AAATGA-TAT-TTTTTTT---T-A---C-A----CAGG--A-TAAA-ATG-TTTA-A-CAAGGA-T-AAC-AA-----TA------T--A-T-CA--T-----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--T-A-CCT-AT-GA-T--ATTTTGG--CG-G------------AG-TTG-AAGAAAG-TAG--TC-AAA-TT-------CGGT--------CTTTCATT-AAAAT---GAAAAA-----------C-A-TT-TAC---TCCA-GT-AA-A--A-AT--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAA-T-TT--A--A---C-AAA-ATAGAACTAAA-G-------GAATT-A------TG-AATTA-AT-CAT-CC--TG--TTT-C--TTAC-AGA-CA---T--T---AAACAA-AA---C-TAAAA--CCT-ATTTT-A--GCAG-A--GT---AA-TTGACCACTC-TA--TT-ACC-C-TA--------------------CCCTA------GG--CGCAAATAT------GACG-TCA-GT------G-C-A--AT-TT-GGTTATGTAT-T--A-C-CCC--G--ATTATA--T-----C-T------TTA---A-AAA-A--TA--TAAATG-A-T-AG--------AA-----TTCTAC---TTA--CG-AA-TA-AGAT--GTTT-GAAA-AA----GGA-T-------------------CATATATCA-TT--G--TTTTTTTTAAAA--AT--AA---AATTGAAA----A-TGTT------AATGACCTC-A-TC-ATA-TT-TT--G--AGGCT--AT-AT-TT-T------GAGG-A--AAA---TAG-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -AT-A-ATAG-A-CA-------------ACT--TA------GAAT-TG-T-A--TTA--ATAAA-TT------TAAC--T--CCA-CTAAA---ACTAAATGGCAAGAAGT-T-AC-CCA----------CCCTA-CCTCC-AGC---ATG-G-GGTATAGTTTGA-AA--A------CCAAGTGGAACCATGAG-------C-C----ACAG-TG-GTA--C---TC-GC-T--GG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GGGAA--ATT---------CAAA--A-GA--C-TCTCCAG--T-G-T--GG-AAAA-TA-ATA-AAAGCGAGAGG-A-C-AA-GG-C------C-AG----GC-AGCATACTG--TCGC----AG-T-GAT---TT---TTTT-TTAA-T-GTTTGATAACCA--C---C---A-C---CCCTC-------------------TTATTC-C-TAA-AA-AA--A--------AAGAAGATAAA--A-G-A-TTATTT--TAACGA-T-ATCA---G-AGTA--A--TTTT-AA----T--A-ATAT--AATAA----ATTAAGAATT-T--A---T-T-ATC-TA-TTAAT-TAT-AG--TAA-AT---------------------T------C-A-A----TG-----ATTAA-A--TAGA---T-A-TAAC----AAT--ATC-AC--ACAA----CTAA-TA-------AAAAAA-ATTTA----------C--G-C--AAC--AAA---CAAA-T-T---------------A--AA-ACAAATCACATTAC-A------C-T-TTGA-ATACAAT-AAA-AAATAAATGT--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-TA-TAATA--CA--GAAAA-TT-GCC--GTA-GA-T-AT-A-ATAA-A-AC-------------ATT-ATAAT---TGAAT-TG-T-A--TTA--A---A-TC------TA-C--T--GCA-CTAAA---AC-AAA-GGCAA-ACGT-T-AAACCATCCAGATCATCC-TA-CC-CA-AGC---ATT-G-A--ATAACTCTG-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAA-------C-CATGTACAA-TG-G-A--C---TC-AC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGA-GG--A--ATT---------CAAA--G-G---G-CC-CAAG--T-G-T--TG-GAAA-TA-TGA-GAAG-GAGAGG-G-C-AT-GG-C-A-G--G-AG----GT-A----TCTG--TCGC----TG-T-GAT-TTTT---TT-------AT-GTTTG----CCC--C---C---T-C---CCCC-----------------------TTC-C-TT--AA-AA--A--------AA-------A-----T-A-TTATTA--TAAC-----ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----T--A-ATGT--AA-------ATTA-AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-CAT-TA--TGA-AT------A-T--AAAA----AAT----------A----TA-----AACAC-AA-TACAT--T-AGTAAC----AAT--A-A-AT--ATAAAAGCCAAA-C---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAA--AAA-AACAAA-----C------------AAACAA-ACA---CACA--AA-A------A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGT--A-A-TCCA-G--A-TATA--T-----T-C------TTA---A-AAA-AGATAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--T--TTT-AC---TTA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-G-----TTATTTAA----GT--GA---AATTG-AA----A-CGTT-CC---AGTCACCTC-A-TG-ATA-TT-TTT-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAA-A--AAAAAATAG-GTG--A-AAT----T-T-T-GG-T-CTTT-CGA--AAA-T-AG-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTCC-C--TA-------T-AG-TAA----TTAA-AAA------TG-CATCG-TT-CAA--TTTTGACAAAAA---ATAAA-----------AA--TAAAGG--------A-ATAT--AAA--GTA---GT-TGC--CCTG--CCTTCATTTA--CA--GAAA-TTTC--TAAC--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---T--ATGC-A-CA----TCGACTAC-------C-C--------------TT-CC-----------CAAC-C--CCTA-C----GTAT------------------------G---TTG-A---------C-G-C-GA-GTTGT----GTA-----TTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTCT-A-AGT-T-TTA-C-ACA-TGaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -A--C---TC-GC-CACTG-GA-GCAAC---GG-AA--ACGGTGG-AAC-ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-TTGAG-GAAA-TA-AGA-AAA--AAGAGG---C-AA-AG-C-AAG--T-AG----GT--------TC--TCGCGACTAGCT-GATATTTT---TTTT---AAAT-GTTTGA--ACCT--T---CGGGC-C---GCGCC---AC---C---------CTT---C-C-TTC-GATAG--GCGAATG--AA-------AA--T-T-A---ATTT--TAAC-A-T--TCACTCG-A-TAGTA--TTTT-AAA---T--A-A-AT--GATCAAAGAAT---AAACCCT--A---TGT-ATG-TA-TT--TCTATCTA--TCACATATA-C-ACT--AAGA----AATAAGTAATGA-A----TG-----AATAA-GA-TAGAAA-T-AGTAAC----AATA-A-A-AA--ACAAA---AACA-T--------AAAAAG-A---G----------C--C-CAAAAC--AAA-AA-AAC-TCTTC------------AA--AACACAG--CGCA--AAGA------A-T-T-GAGACA-AAT-AAA-AAAT-AATGC--A--CCCTAGC----A-G-CCTTTC--G----TG-T-CCA--AAAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CC-C-CC---------C---------CCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACA-AAA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATATCTA-A-CCCC-G--A-TATA--T-----T-G------TTC---A-AAATA--TAT-TAAATG-A-T-G------------------TTAC---TTA--CC-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AAA---GGA-TAC--A----------------TATATCA-TT-GG--TTTATTT---AA--GT--AA---AATTG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA--T-TTG-T--GGACTG-AT-A--TT-T------GAAG-A--AAA---TTG-GTC--A-AAT----T-T-C-GA-T--TTN-C-A--GAA-T--A-C---AA--gcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatttggctgtatattntcccccccccccccccAGGTAGTAGTCACACCCTACC-CTTTTTT--T--CCCCC-ATGTT--CAATTTCCTTCATAATTGG-AA-TA-T-AAA-TTAATAGTGTGGTAATA--A-TGTTTTG-TC---AAAAATCTTCAAAAGAAAT---CAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCA-T--C---AAAATCTT-CTCA-----A--TTT---TTTA-TGAATTTC--CA--TC-ATG-CA--GAAAA---TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATTATC-TT------AAAAAAAA-ATTTGAATGA-TAA-TTTTTTT---T-A---C-A----CAGG--AA-AAA-ATGGTTTG-A-CAAGG--T-A-C-A------TA------TTCA-T-CA--TT----GTTTTTTT-AA----------GTG--AAAATTG-A--AGAATACCGT-TTCAGC-TGA-CCT-AT-GAAT--ATTTTTG--GG-G---CTTTG-A--AT-TTG-AAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGTC--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TTA--C-AC-A-TT-ACC----CCA-GT-AA-T--T-AA--AAAAA-TGT-ATCGT-TCAATTATT--A--A---C-AAA-A---AACTAAAAG-------GAA-T-A------TG-ACGTA--T-CATTCC--TGC-TTTTCATTTAC-AGA-AA--TT------AAAGAA-AATG-C-T--AA--CCT-ATTT-----ACAG-A--GT---AA-T-GCACATTC-TA--TT-A------A---------C---------CTCCC-------TG--CGT-A-TTT------GACG-TCA-GTTG----G-CTA--GT-TT-GGT---GTATGT--A-A-CCC--G--A-TATT--T-----T-T------TTT---T-AAA-A--AAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--TCTTTTTAC---TTA--CG-AA-TC-AGATG--TTT-G--A-AA----GGA-TAC--ATA------------TAT---CCA-TT-GG--TTTT--TTAAAA--GT--AA---AATTG-AA----G-TTTT-TA---AGTGACCTC-A--G-ATA-TT-TTG-GAAGGGCTG-AT-A--TT-T------GAAG----AAA---TAG-GTC--A-ATT----T-T-C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-T-A-TTAC-C--TA-------C-AG---------AAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTGGG----AA---A-AAA-----------AG--TAAAGG--------A-AT-T--AA---GTA---GT--AT--CCTG--CTTTCATTTA--C----AAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAG-CT------TA--T-T-TTTACAG-A-AGA---AAGTTGC-GTCA----TT--ATAC-------C-C--------------TC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCttacggacaaacaggcaggcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttaaaaatatttattactctatatgaaagaggataag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCAC------------------------cctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacaccccccc-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCC------------------------C---CCC-G---------C-G-T-AA-GTTGTTGATGTC---AGTTGGCTCTA-TG-TA---CA-T-AACATT--AA--A-CCTTT-CCTTTTA-AGT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTAA-CTT-AAT-----------TT--AAAA----A-AATACA-TG---A-AT---AG-ATA-TA--A-ATA-----------TT-ATC-A--T-A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GTAAA-TT-GAC--GTACGG-T-ATTA-ATAG-A-AA-------------ATTTATAAT---CGAATCTG-T-A--TTA--A------T------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AA--GGCAA-AAGC-T-AAACC--------------TGTCC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTT-TG-AA--A------CCA-GTTG--TCATGAG-------C-C----ACAGATG-G-AACC---TC-GC-T--TG-GA-G-AACTGAGGCAA--GGGG-GG-AA--ATTT--------CAAA--G-G---C-TC-C-AG--T-GGT--GG-GAAAATA-AGA-AAAG-AAGAGG-G-C-AA-AG-C-A-G--T-AG----GT-A----ACTG--TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TAAAAT-G-TTGA--ACCC--C---C---A-C---CCCCC---AC---C---------CTT-TTC-C-TTC-AA-AGA-A--------AA-------AA--T-T-A--TATTT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TT----A----T--A-ATATTGAA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-ATC-TATTT--T-TAT-TA--AGA-ATATA-C-A-T--AGAA----AATAA----T-A-ATAAGTG-----AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAGAAA-A---A----------CAAC-C--CAC---AA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AACA------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AAAT-AATGC--AGCCCCTAGC------G-C--TTT--G----TG-T-CCAC-AAACcccccccccccccccccccccccccccgcgtaagttgttgatgtcagttggctctatgtacataacattaaacctttccttttaagttttacacatgaaatctaacttaatttaaaaaaatacatgaatagatataaatattatcataataatacatattatacagtaaattgacgtacggtattaatagaaaatttataatcgaatctgtattaattactccactaaaacaaggcaaaagctaaacctgtcccaagcatggaatagtttgaaaccagttgtcatgagccacagatggaacctcgcttggagaactgaggcaaggggggaaatttcaaaggctccagtggtgggaaaataagaaaagaagagggcaaagcagtaggtaactgtcgcagtgatattttttaaaatgttgaacccccaccccccacccttttccttcaaagaaaaaattatattttaacatatcaatacattataatattgaaataaaatctattatctatttttattaagaatatacatagaaaataataataagtgaataagatagaatagtaacaataaaaacaaacaaataaagaaaaacaacccacaaaacaaattttcaaaaacacacaaacaattgaacaataaaaaataatgcagcccctagcgctttgtgtccacaaac
gi|21                         : aggtagtagtcacaccctaccctttttttcccccatgttcaatttccttcataattggaatataaattaatagtgtggtaataatgttttgtcaaaaatcttcaaaagaaatcaaccaagcgtttttcgtaggttgccatcaaaatcttctcaattttttatgaatttccatcatgcagaaaataagcctgtatactcgatatattatcttaaaaaaaaatttgaatgataattttttttacacaggaaaaaatggtttgacaaggtacatattcatcattgtttttttaagtgaaaattgaagaataccgtttcagctgacctatgaatatttttggggctttgaatttgaagaaagtaggtcaaatttcgtcctttctagaatatgaaaaatttacacattaccccagtaattaaaaaaatgtatcgttcaattattaacaaaaaactaaaaggaatatgacgtatcattcctgcttttcatttacagaaattaaagaaaatgctaacctatttacagagtaatgcacattctattaacctccctgcgtatttgacgtcagttggctagtttggtgtatgtaacccgatatttttttttaaaaaattaaatgatagaatctttttacttacgaatcagatgtttgaaaggatacatatatccattggttttttaaaagtaaaattgaagtttttaagtgacctcagatattttggaagggctgatatttgaagaaataggtcaattttcggtctttcaaaaataacaaaattggcatattacctacagaaaaaaaaaatgtattgttcaatttgggaaaaaaagtaaaggaattaagtagtatcctgctttcatttacaaaatttcaaataaatctagcttatttttacagaagaaagttgcgtcattataccctccccccccccccccccctaaaatacacccccccccccccccccccccaccccccccGTAGTAGTCTCACCCTACC-CC-TTTT--T--CCCC--ACGTT--CAATGTTATTCATAATTGC-AA-AA-T-AAA-TTAATAGTGTTGTAATAC-A-TGTTATT-TC---GAAA---TTCCAACGAAAT--TTAACCAA-GCGTTTTT--CGTA-CGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----T--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-GTG-CA--GAAAAA--TAAGCT-TG-TA--T-A-CCC--GATA-TATT--C-TT-------TTAAAAA-ATT-AAATGA-TAA--GAGTTT---T-A---C-T----CACC--AATAAA-ATGGTTTG-A-AAAGGA-T-A-C-A------TATACATGT--A-C-CA--TT----G-TTTTT--AA----------GTG--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-T-GTTATAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA----TC---TAC-T---A-CTC--------------TA-CC-----------CCTC-C--CACC-A----CCACCACCACCCCCATCAGCGTAATTAAG---TTG-A---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTA-C-AAA-AGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AGAA----A-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-ATA-CA-TA-TAATA--CA--GAAAT-TT-GAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAG-A-AA-----------------ATAA-----GAAT-TG-T-A--TTA--A---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATA--------AAAA----AA-AA------A-A----TG-----AATGA-AA-TAGAA--T-AATAGC----AAT--A-A-AA--ACAAA---CTAA-TA-------AAAAAA-A---AGAAAACAACCC--C-C--AACA-AAA-AACGAA-T----------------AA--AA-AAA---CCCA--CA-C------ATT-T-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCC--A------TG--CAT-AATTT------GACA-TCA-GTTG----A-C-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--TATGGGT-CATATATTCT---AGAAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AA--------AA--T--TTTTAC---TTA--C
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGGTAGTAGTCACACCCTACCTCCCTTTT--TTCCCCC--ATGTT--CAATTGTCTTCATAATTGG-AG-TA-T-GAA-TTAATAGTGTGGTAATAC-A-TGTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTT-T--ACAA-A--GT---AA-TTGCAAATTT-TA--TT-ACC-C-TA---------CACCCCCCCCCCCTCA------TG--CGT-GATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGC--TGTATAT--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTAG-CACACACTACC-CCCCTTT--T--CCCCCCATGTTA-CAATTTC--TCATAATTGGGAA-TA-T-GAA-TTAATAGT-TG-TAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTC-AAAGAAATAGT-AACCAG-GCGTTTTT--TGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TC-A-TA---TTC--CA--TCCATG-CACAGAAAAA--ATAGCC-TG-TA--TTA-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAATAAA-ATT-AAATGAATAA-TTTTTTT---TTA---C-A----CAGG--AATAAAGATGGTTTA-A-CAAGCA-T-A-CGA------TA------T--A-T-CA--TTT---GTTTTTTT-AA----------GTG--AAA-TTG-A--AAA----CGT-T-CAG---GA-CCT-ATTGA-T--ATTTTTG--GG-G---CT--GGAT-AT-TTG-AAGAAAGATAG-GTCCAAA-TT--T----CGATT-------CTTTC----AGGATGATGAAAAAT--TGA--C-AC-A-TT-ACC---TCCA-GC-AA-T--TTAA--AAAAC-TGT-ATCGTCTCAATT-TT--A------C-AAA-A---AACTAAA-AA------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATT-AC-AGA-AA--TT--CTTAAAAAAA-AAT--CCT--AA--CCT-ATTTT-TT-ACAG-A--GT---AA-TTGCACATTCGTA--T--ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------T---CGC-AATTTT-----GACGGTCAAGTTG----G-CCA--AA-TT-GGT--TGTATGT--A-A-CCCCCG--A-TATA--T-------C------TTT---A-AAA-A--TACCTAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---TTA--CA-AAATA-AGATG-GTTT-G--ACAA----TGA-TA---ACG-------------ATATTTCA-TT-GG--GTTTTTG-AAAA--GT--AA---AATTG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC-A-TG-ATAATT-TTGCA--GGGCTG-AT-C--AT-T------GAAG-A--AAA---TAGCGTC--A-AAT----T-T-CAGG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AA-C---AACAAA-TT-GGCA-C-A-TTAC-CCTTA-------C-AGAAAA----TAAAGAAA--AAAATG-TATTG-TTACAA--TTTTGGTA--AA---A-AAA-----------AG--GAAAGA--------A-ATATA-AA---GTA----T-CGT--CCTG--TTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAATTAAA-A-T-C-TAA-CC------TA------TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA----GT--CTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-A--CCCC-C----ACCC------------------------C---CAA-G---------C-GCT-AA-GTTGAT---GTC---AGTTGGCTCTA-TT-TA-A-CA-T-GCCATT--AA--A-------ACTTT-A-AGT-T-TTA-T-ACA-AGAA-A-TCTT--CTTAAAT-----------TTAAAAAA----A-AATATA-TG-------------------------A-----------TTTATC-CATTAA-AT-A-ATACCA-CA-TCATA--CAG-GAAAA-TT-AAC--ATA-GG-T-AT-A-ATAG-G-AA-------------ATT-AT-AT---CGAA--TG-T-A---TA--A---A-TTTAGTGCTA-C--T--CCA--TGAA---AC-AAA-GGCAA-AAGT-T-AAACCA-------------TG-CC-CATAGT---AGG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A-------CA-GTGC--CCATGAG-------A-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--GCGC-GG-GA--ATT---------CAAA--G-G---CTTC-CCAG--T-G-T--GG-GAAA-TA-AGA-AAAGAAAGAGGAA-CAAA-AG-C-A-GACT-AGC---GTAA----ACTG--TCGCA---AG-T-GATATTTT---TTTTCTTAAAT-GTTTGAT-ACCC--C---CA--C-CCCACCCCC---AC---C---------CTT-TTC-C-TTCGAA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTTAATAAC-ATT-ATCA---A-A-TA-CA--TTTT-AAC---T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-T-A-C-TA--T--T-TA--TA--TAA-ATATA-C-A-TCCAAAAACATAATAA----T-A-A----TGGGACCACTAA-GACTAGAAC-T-AGTA------AAC--A-A-AA----AAA---CAAA-TT-------AAAAAA-G---A----------C--CTC--AAC--AAA-AACAAATT-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-TGT-GT-ACA-AAC-AAA-AAATAAATGC--A--CCCTAGC----G-GCC--TTT--G----TG-T-CCAGGAAACC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agcgAC-A-TGTTTTG-TC---GAAA---TTCCAAAGAAAT--TTTACCAA-GCGTTTTT--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-AGA-AA---T--T---AAAAA----------------------TTT-T--GCAG-A--GT---AA-TTGCACATTC-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAGTAGTCAC--CCTACT-TCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-AACTA-T-AAA-T-AATAGT-TGGTAATAT-A-TGTTTTG-TCCAAGAGAG--TTTCAAGAAAAT--TCAACCAAAGCGTGTTT--TGTATGATTGCCATTTTC---GAACTCTTTC--A---------TT---TT-A-TGA-TT-C--CA--TC-ATG-CA--AAAAAAAATAAGCC-TG-TA--T-A-CT---GATA-TATT--C-CT------TTAAAAAA-ATT-AGATGA-TAA-TTTTTTT---T-ATAAC-A----CACG--AATAAATATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--AAT-CA--TTT---GTTTTTT--AAAA--------GTG--AAA-TTG-A--AC-----CGTCTTCAG--TGA-CCT-AG-GA-T--ATTTTTT--GG-C---AA--G-AT-AT-TTGGAAGAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------ATCTC--T-AAGAT-ATTGGAAAT--TGA--C-AC-A-TTTACC---TCCA-GT-AA-T--T-AACAAAAAA-TGTTATCGT-TCA-TT-TT--A--AAAAC-AAA-A---AA-TAAC-G-------GAA-TTA------TG-TAGTATAT-C---CC--TAC-TTT-CATTTAC-AGA-AAATTT--T---AAAAAA-ATT--C-T--AA--CCT-ATTTT-T--ACAG-A--GT---AA-TTGCATATTC-TA--TTTACC-CCTAAACCTCCCCC---------CCCCCA------TG--CGT-AAATT------GACG-CAA-GTTGTATGG-C-A--AT-TT-AGT--TGT-TGT--A-A-CCCC-G--A-TATAA-T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAC--AGATG-A-T-AA--------AA--T--GTATACGACTTA--CG-AA-TATAGATGAGT---A--A-AA----GGA--------A------------CATATATCAGTT-GG--TTTTTTTTAAAA--GT--GA---AATTG-AA----A-CGTT-TTTAAGGTGACCTAGA-TGGATA-TC---A-G--GGGCTG-AC-AATTT-T------GAAG-ACAGAA---TAG-GTT--A-AATAT--T-T-C-G--T-CTTTGCGA--AAAAT-AA-C---AA--AA-TT-GCC--C-A-TTAC-C--GA-------C-AG-AAGAT--TAAG-AAA--AAAAGT-TATTG-TTTCGAATTTTTGGGAA-AA---A-AAA-----------AG--TAAAGG--------G-ATAT--AAAAAGTA---AT-CAT--CCTG--CTTTTATTTA--CACAGAAATTTTCTAAAATGAAA-A-TGT-TTA-CCGTCAGGTA--T-TATTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA----TC--CTAC-T---A-C-C------------------------------CCCC-A--CTCC-G----CTAA------------------------G---TTG-A---------C-G-T-CA--TTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACAT---AA--A-A---T-CCTTT-A-GTT-T-TTA-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-CAT-----------TT--AAAA----A-AATATATTG---A-AT---AG-ATAA-A--A-ATA-----------TTTATC-A----A-AT-A-ATA-CA-TA-TTATA---A--GAAAA-TT-GAC---TA-GG-T-AT-ACATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---C-AAT-TG-TAA--TTA--ATT-ATTT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC--AA-GGCAA-AGGT-T-AAACGC----------CT-TG-TC-C--AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTAA--CCATG-G-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GA-AA--AGGG-GG-AA--TTTTTTTCCCCCCAAA--G-GGCCC-TC-CCAG--TGG-T--GG-GAAA-T--------------GGG-G-C-AA-AG-C-A-T--A-AG----GT-A----ACT---TCGC----AG-T-GATA---T---TTTT-TTAAATGGTTGGA--ACCC--C---C---C-C---CC-----------------------T-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--TGC-A-TTACTT--T-AC-A-T-ATCA---GAA-TA-CA--TTTTAAA----T--A-ATATA-AA-------ATA--AAATC-T--A---T-TAATCTTT-TT--T-TAT-TA--TAA-ATATACC-A-TA-AAAA----AATAA----T-A-A----TG-----AATAAGAA-TAGAA--T-AGTAAC----AATAAA-A-AA--ACAAA---CAAA-T---------AAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-ACCAAA-T-TTTCAA---------AA--AA-ACA---CACA--AA-T------A-T-T-GA-ATA-AAT--AA-AAATAAATGCAAA-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGGTAGTAGTCCAACCCTACC-CCCTTTT--T--CCCC--ATGTT--CAATTTTCTTCATAATTGG-AA-TT-TTAAA-TTA-TAGTGTGGTAATAC-A-TGTTTTG-TC---AAAA---TTCCAAAGAAAT--TCACCCAA-GCGTTTTC--CGTA-GGTTGCCAGT--C---AAACTCTT-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTT--CG--TC-ATG-CA--GAAAAA--TAAGCC-TG-TA--T-A-CTC--GATA-TATT--C-TT------AAAAAAAATATT-AAATGA-TCA-TTTTTTT---A-A---A-A----CACG--AATAAA-ATGGTTTG-A-CAAGGA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CA--TT----GTTTTTT--AA----------GTG--AAA-TTG-A--AA-----CGT-TTCAG--TGA-CCT-AT-GA-T--ATTTTGG--GG-G---CT--G-AT-AT-TTG-AAGAA-G-TAG-GTC-AAA-TT--T----CGGT--------CTTTCA-T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAA-C-AC---TT-ACC---TCCA-GT-AA-T--T-AA--CAAA--TGT-ATCGT-TCAATT-TT--T--A---C-CAA-A---AACTAAA-G-------GAA-T-A------TG-AAGTA-AT-CAT-CC--TGC-TTT-CATTTAC-ACA-AA--TT--T---GAAAAA-AAT--C----AA--CCT-ATTCT-T--AAAG-A--GT---AA-TTGCA-ATTC-TA--TT-ACC-C-TA---------C---------CCCCCA------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----G-C-A--AT-TT-GGT--TG-ATGT--A-A-CCC--G--A-TATA--T-----T-C------TTT---A-AAA-A--TAT-TAAATG-A-T-AG--------AA--T--TTTTAC---ATA--CG-AA-TA-AGATG-GTTT-G--A-AA----GGA-TACT-ACA------------TGTATATCA-TC-GGGTTTTTTTTTTAAA--GT---G---AATTG-AA----A-CGTT-TC---AGTGACCTC-A-TG-ATA-TT-TTG-G--GGGCTG-AT-A--TT-T------GAAG-A--AAA---TAG-GTG--A-AAT----T-T-C-GG-T-TCTT-CG---AAA-T-AA-C---AA--AA-TT-GGCA-C-A-TTAC-C--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AAAATG-TATTG-TT-CAA--TTTTGG----AA---A-AAA-----------AG--TAAAGG--------A-ATAT---A---GTA---GT-CAT--CCTG--CTTTCATTTA--CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-TAA-CC------TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGC-G-CA----TT--CTAC-T---A-C-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCT-A----CCAC------------------------A---CCA-G---------C-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TA-A-CA-T-GACATT--AA--A-C---T-CCTTT-A-AGT-T-TTT-C-ACA-TGAA-A-TCTA--CTT-AAT-----------TT--AAAA----C-AATATA-TG---G-AT---AG-ATAATA--A-ATA-----------TTTATC-AATT-A-TT-A-ATA-CA-TA-TTATA--CA--GAAAA-TT-GAC--GTA-GG-T-AT-A-ATAG-A-AA-------------ATT-ATAAT---CGAAT-CG-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA-GTCAG-AAGT-C-AAACCAC---------CC-TG-CC-CA-AGC---ATG-G-A--ATAGTTCTG-AA--A------CCA-GTGA--TCATGAG-------C-C----ACAG-TG-A-A--C---TC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGGG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GAAA-T--AGA-AAAG-AAGAGG-G-C-AA-GG-C-A-G--T-AG----GT-A----GCTG--TCGC----AG-T-G-TATTTT---TTTT-TTAAAT-GTTCGA--ACCC--CACTC---C-C---CCCCC----C---CTCTCTCTCTCTT-TTC-C-TTC-AA-AG--A--------AA-------AA--T-T-A-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-GA----T--A-ATAT--AA-------AT---AAATC-T--A---T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TA--TAA-ATAGA-T-A-TG-AAAA----AAAAA----T-A-A----TG-----AATAA-AA-TATAA--T-AGTAAC----AAT----A-AA--ACAAA---CAAA-TA-------AAAAAA-A---A----------C--C-C--AAC--AAA-AATAAA-T-TTC------------AA--AA-ACA---CACA--AA-A------A-T-G-GA-ATA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCCCTAGC----A-G-C--TTT--G----TG-T-CCA--AAACCcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCT-CCCCC-------CCCC--AT-TT--CAATTTCTTTCATAATTGG-AA-TA-T-AAAATT--TAGT-TG-TAATAC-A-CCTTTTG-TC---GAAAA--TTCCAAAAAAAT--TTAACCAA-TCGTTTTT--CGGA-TGTTGCCAGT--CAAAAAACTC-T-C--A-----A--TTT---TT-A-TGA-TTTC--CG--TC-ATGCCAT-GAAAAA--TAAACC-TATTA--T-A-CCC---ATA-TATC--CTTT------ACCAACAT-ATT-AAATGA-TAA-GTTTGTT---T-----C-A----TAAG--AATAAAGAT-GTTTG-A-CAAGAA-T-A-C-A------TA------T--A-T-CACCTT----GTCTTTTTAAA----------GTA--TAA-TTG-A--AA-----CGTCTCCAG--TGA-CATCAT-GA-T--ATTTTAG--GGCG---CT--T-GTCAT-TTG-AA------TAGCGT--AAA-CT--TGCGGCGGT--------CGTTT--T-AGAATAATTAAAAAT--TGA--C--C-ACTT-ACC---T-CA-GT-AA-T--TAAA--AAAAA-CGC-ATCGT-TTAATT-TTTGA--C---C-ACA-A---AGCTAAA-C-------GAA-T-A------TG-GAGTT-ATCCAT-CCA-TGCTTTT-CATGTAC-AGA-AA------T---AAAAAA-AAC--A-T--AA--CTT-ATTTT-TTCACAG-A--GTCAGAA-TTGCACATTC-TACTTT-TCC-C-TA-------------------CCCCCA------TGCACAT-AATTTGCACGCGACG-TCATGTTG----G-CAA--AT-TT-GGTC-TGTA-GT--A-ACCCC--G--A-T-TA--T-----T-C------CTGAAAA-AAA-A--TAT-TTAATGTA-T-TA--------GA--T--TTTTAC---TTA--C--AA-TA-AACTG-TCTT-G--A-AA----GGA-T-T--ACA------------TA-ATATCG-TT-GG--TTGTTTGTAAAA--GTCGAAAC-AAATG-AA----ACCGTT-TC---AGTTATCTT-A-T--ATA-TTCTTT-T--GGGCTG--C-A---T-T------GAAGAA--AAA---CAT-GTC--A-AAT----T-C-C-AA-TATTTT-CGACCAAA-T-AA-C---AA--AAGTT-GGCA-CGA-TTACAC--AA-------C-AG-AAA----T-TA-AGA--AACATA-TATTG-TT--AA--TTTTGA----AA---A-AAA-----------AAGTTAAAGG--------A-ATATAAAA---GAA---CT-CAT--CCTG--CTTTC---TAGGCA--GAACTTTCC--AAAT--AACA-T-CTTAA-TC------CA--T-G-TTT--AGCA-GTA---A--T--C-G-CA----TC--TTAC-T---ACC-C--------------TA-CC-----------CCCC-C--CCCC-CTTTATCAG------------------------GAAAGTG-A---------C-G-T-CA-ATGG-----CCA---CATTGGCTCTA-TGCTA-ACCA-T-GCCATTACAA--A-C---T-CCTTTCA-AG--T-TTA-CAATA-TGAA-ATTTTA--CTT-ATC-----------CT--AGAG----A-ATCAAA-TG---ATAT---AG-ATAATA--A-ATAC----------TCTATC-AACT-GCATCA-ATA-C--TA-TAATA--CC--AAAAATTT-GAC--GTA-TG-T-AT-GTATAG-A-AA-------------ACT--TA------GAAT-TGTT-A--TTA--A---C-AT------TA-C-----CCA-CTAAA---AC-AAA--GCAA-AAGT-TAAAACCAC---------CC-TA-CC-TA-AGC---ATGCG-G--CTAGTTC---AA--A------CC--CTGA--CCAT--G-------C-C----GCAG--G-C-G--C---TC-GC-T--TGCGA-G-AA----GG-AA--AGCG-GG-AACTATT---------CAAA--G-G---C-TC-CCAGC-T-G-T--GC-AAAT-CA-ATA-AAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cccAAAT-GTTTGA---CCC--C---C---C-C---CCCCCTCGAC---C---------CGG-TTC-T-TCA-AA-AG--A--------AA-------AACAT-T-A-T-ATTT--CAAC-ACT-ATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AAAATAT--A-ATATT-AA-------AT---A--TC-T------T-T-ATC-TA-TT--T-TAT-TAATCAA-GTAAA-A-A-T--AATA----AA--A----T-A-A----TGT----AATAA-AC-TAGAA--T-ACGAAC----AAT--ACA-AA--AC------CAAA-CA-------AAATAA-A-------------------C--AA---AAA-AA-AAA-T-TTCAAAAAAAAAAAAAA--AA-ACA---CACA--AA-A------ACT-T-GA-A-A-GAT-AAATAACTAAATGC--A-CCCCTA-C----ATT-C--TTT--G----TGCT-TCA--AACCCtgtttgacccccccccccctcgacccggttcttcaaaagaaaaacattatatttcaacactatcagatacattttaaaatataatattaaatatctttatctattttattaatcaagtaaaaataataaaataatgtaataaactagaatacgaacaatacaaaaccaaacaaaataaacaaaaaaaaaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaacacacaaaaacttgaaagataaataactaaatgcacccctacattctttgtgcttcaaacccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                cccccctcctcccccccccatttcaatttctttcataattggaatataaaatttagttgtaatacaccttttgtcgaaaattccaaaaaaatttaaccaatcgtttttcggatgttgccagtcaaaaaactctcaatttttatgatttccgtcatgccatgaaaaataaacctattatacccatatatcctttaccaacatattaaatgataagtttgtttcataagaataaagatgtttgacaagaatacatatatcaccttgtctttttaaagtataattgaaacgtctccagtgacatcatgatattttagggcgcttgtcatttgaatagcgtaaacttgcggcggtcgttttagaataattaaaaattgaccacttacctcagtaattaaaaaaaacgcatcgtttaatttttgaccacaaagctaaacgaatatggagttatccatccatgcttttcatgtacagaaataaaaaaaacataacttattttttcacagagtcagaattgcacattctacttttccctacccccatgcacataatttgcacgcgacgtcatgttggcaaatttggtctgtagtaaccccgattattcctgaaaaaaaatatttaatgtattagatttttacttacaataaactgtcttgaaaggattacataatatcgttggttgtttgtaaaagtcgaaacaaatgaaaccgtttcagttatcttatatattcttttgggctgcattgaagaaaaacatgtcaaattccaatattttcgaccaaataacaaaagttggcacgattacacaacagaaattaagaaacatatattgttaattttgaaaaaaaaagttaaaggaatataaaagaactcatcctgctttctaggcagaactttccaaataacatcttaatccatgtttagcagtaatcgcatcttactaccctacccccccccccctttatcaggaaagtgacgtcaatggccacattggctctatgctaaccatgccattacaaactcctttcaagtttacaatatgaaattttacttatcctagagaatcaaatgatatagataataaatactctatcaactgcatcaatactataataccaaaaatttgacgtatgtatgtatagaaaacttagaattgttattaacattacccactaaaacaaagcaaaagttaaaaccaccctacctaagcatgcggctagttcaaaccctgaccatgccgcaggcgctcgcttgcgagaaggaaagcgggaactattcaaaggctcccagctgtgcaaatcaataAAAG-TAG-GTC-AAA-TT--T----CCGT--------CTTTC--T-AGAAT-ATGAAAAAT--TGAATC-AC-A-TTGACC---TCCAGGT-AA-T--T--A--GAAAA-TGT-ATCGT-TCAATT-TTA-A--A---CAAAA-A---AACTAAA-G-------GAA-T-A------TA-AAGCA-AT-CATACC--TGC-TTT-CATTTACAAGATAA--TT--T---AAAAAAGAAT--C-T--AA--CCTAATTTT-T--ACAGAA--GT---AATTTGCAC-TTC-TA--TT-ACCGC-TACCCCC----C---------CCCCCC------TG--CGT-AATTT------GACG-TCA-GTTG----GCC-A--AT-TT-GGT--TGTATGT--A-ACCCC--G--A-TATA--T-----TCC------TTT---A-AAA-A--TAT-T-AATG-A-TAAG--------AAATT--TTTTAC---TTAACCG-AA-TA-AGGTG-GTTT-GA-A-AA----GGA-TAC------------------ATATATCA-CT-GG---TTTTTTAAAAA--GTG-AA---AATTG-AA----A-CGTT-TT---AGTGACCTC---TG-ATA----TTG-AT-GGGCTG----A--TT-T------GGAG----------T---GT-------T----T-TAC-GGAT-CTTT-TG-----A-T-AA-C----A--AA-TT-GGCA-C-ACTTAC-C--TA-------A-AG-AAA----T----AAA--AAAATG-TA-TG-TT-CAA--TTTTGG----AAAG-A-AAA-----------AG--AGTAGG--------A-ATTA--AA---GTA---GT-CATTCCCTG--CTTTCATTTA--CA--G-AAATTTC--AAAT--AA-A-T-C-T-A-CC------TATTT-T-TTTACAG-A-GTAT--A--TTGC-G-CATTCGTC--CTAC-T---A-C-CGGCTAGCCGCGCTACA-CC-----------CCCCGC--CCCCGC----CCAC------------------------G---CTA-T---------C-G-T-AA-GTTG-----ATGT--AGTTGGCTCTA-TG-T--A-CA-T-GACATT--AA--A-C---TCCCTTT-ATAGT-T-T-------A-TTTT-A-TCTGGTCTT-GATGGTCCTTCGTGTT--ACAACATGA-AATCTACTT---A-ATTAAAA-ATGATATGA-ATAGATAATAAATATTTATC-AA-T-A-AT-A-ATA-CA-AT-TTATATTCA--G--AA-TTGGACCGGTA-GGTT-ATAA-ATAG-A-AA-------------TTT-TTAATTAACGAAT-TG-T-A--TCAAGA---A-TT------TA-C--TTACCACCTAAT---AC-AAA-GGC-A-ACGT-T-AAA--A----------GC-CG-CC-GC-AGC---AT--G-A--ATAGTATGA-AA--A------CCA-GTGG--CCATGAG-------CGC----ACAG-TG-G-A--CTTGTC-GC-T--TG-GA-G-AA----GG--A--AGGG-TG-AA--ATT---------CAAA--G-G---C-T--CCAG--T-G-T--GG-GAAA-TA-AGG-AAAG-AAGAGG-G-CAAA-AG-C-A-G--T-AG----TT-A----ACTG--TCGC----AG-TGGATATTTT---TTTT-TTTATT-GTTTGG--A-AC--C---C---C-C---ACCCC---AC---C---------C-T-TTC-C-TTC-AA-AGATA--------AA-------AA--T-TAA-TTATTT--TAAC-A-T-ATCA---G-A-T--CA--TTTTAAA----T--G-A-AT--TA-------AT---AAATA-T--AT--T-T-ATC-TA--T--T-TAT-TA--T-A-ATATA-C----------------TAA----T-A-A----T------AATAA-GA-TAGAA--T-AGTAAC----AAT--A-A-AA--TCAAA---CAAA-TA-------AAAAAATA---A----------C--C-----AC---AA-AACAAT-T-TTC------------AAT-AA-ACA---CAC----A-A------A-T-T-GA-ACA-AAT-AAA-AAATAAATGC--A-CCTCTAGC------G-C---TT--G----TG-T-CCA--AAACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TTTTAC---TTAA-TG-AA-TA-AGATG-GTT--G--A-AA----A-A-TAT--ACA------------T-TATATCA-TG-GG--TTTTTTTTACGA--GT--GA---AATTA-AA----AACGTT-TC---AGTGATCTC-AATA-ATA-TT-TTT-G--GGGCTC-AT-A--TT-GAAAGAAGAAG-A--AAA---TAGCGTA--A-AAT----T---C-G-----CTT-CGA--ATA-T-AA-C---AA--AA-GT-G-CA-C-ACTTAC-C--TA-------CCAG-AAA-----ATT-AAA--AAAATG-TATTG--T-CAA--TTTGAA----AA---A-AAA-----------AG--TAAAAGTA------A-ATA---AA---GTA---GT-CAT---CTGCTCTTTCA-TTA--CA--G-AACTGTC--AATA--AA-A-TGC-TAA-CT------TA--T-T-GTTACAG-A-GTA---A--TTAT-G-CA----T---CTACTT---A-C-C--------------CC-CC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCCA------------------------G---CCGCGAAAGTTGACC-G-T-CA-GTTG-----GCA---AGTTGGCTCTA-TG-TATA-CA-T--ACATT--AA--A-C---TCCCTTT-A-AGT-T-TTA-C-ACATTGAA----CTA--CTT-GAT-----------TTCGAAAA----A-AATATA-TGGATA-AT---AGAATAA-A--G-ATA-----------TCTATC-AATT-A-AT-A-A-A-CA-TA-TAATA--CACGGAAAA-TT-AAC--GTA-AG-T-AT-A-ATAGAA-AA-------------ATT-ATAAT-------T-TG-T-ATTTTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTAAA---AC-AAA--GC-A-AAGTAT-AAACCA----------CC-TC-CC-CA-AGC----TG-G----ATA-TTCTGAAA--A------CCA-GT-G--CCATGAG-------C-C----ACAG-TG-G-A--C---TC-GCTT--TG-GAGG-AA----GG-AA----GG-GG-AA--ATT---------CAAAAGG-A---C-TC-CCAG--T-G-T--GGAAAAA-TA-ATA-AAA--AGGAGA-G-C--A-AG-C-A-G--G-AA----AT-A----ACGGATTC-C----AG-T-GA---TTT---TTTA-TTAAAT-A--TGA--AACC--A---C---C-A---CC-------C---T---------CTT-TTC-C-TAA-AA-AA--ACAAGAAATAA-------AA--T-G-A-TTATTT--TAAC-A-TAATCA---G-A-TA-CA--TTTT-AA----TTGA-ATAA--AA-------ATA--AAATT-T--ATGTT-T-ATC-TA-TT--TACAT-TA--T-A-GT------------AAA----AAT------T-A-A----TG-----AATAA-AA-TAGAA--T-AATAA-----AAT--A-A-AA--ACAAA---C-TA-TA-------AAAAAA-A---A----------TTAC-C--AAC--AAATAACAAA-T-T--------------AA--AA-A------ACA--AA-ACACCACA-T----A-ATA-AAT-AAA-AAATAAA-GT--A-CCCCTAGCGGCAA-G-C--TTG--GA---TG-T-CCA--AAAcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-TT-TTG-A--GGGCTG-AT-A--TT--------GAAG-A--ACA---TAG--TC--G-AAT----TCT-C-GG-T-CTTT-CAA--AAA-T-AAAC---AA--AG-TT-GCGA-C-A-TTAC-T--TA-------C-AG-AAA----TAAA-AAA--AA--TGCTATTG-TT-CAA--TTTTGG----GGGGGA-AAA-----------AG--TTAAGG--------ATATAA--AA---GTA---GTTCAT--CC-G--CTT-CATTGAA-CA--GAAAATTTC--AAAT--AA-AAT-C-TAA-CCA-----TA--T-T-TTTACAG-A-GTA---A--TTGCCG-CA----TC--ACAC-------C-C--------------TAACC-----------CCCC-C--CCCC-C----CCA-------------------------G---CCG-A---------TAG-T-C----TG-----------ATTTGGCTCTAATG-TA-A-CA-TTGACATT--AA--ATC---T-GTCTT-A-AGT-T-TTAAC-AC--TGAGTA----A--CTT-A-------------TT--AAAA----ATAATA-A-TG---A-A----GG-ATAATA--ACATA-----------TTTATCCAATT-A-AT-ATATC-AA-TAATTATA--CA---ACAA-TT-GAC--GTA-GG-TTAT-A-ATAG-T-AA-------------ATT-ATAA----CAAAT-TA-T-A--TTA--A---A-TT------TA-C--T--CCA-CTGAA----C-AA--GGCAA-AAGT-T-TAA--A----------CC-TG-CC-AA-CTC---ATG-GGA--ATAGT-CTG-AA--C------ACA-GTGG--CCATGAG-------C-C----ACAG-TGAG-A--C---TCAGC-T--TG-GA-G-AA----GG-AA--AGTG-GG-AA--ATT---------CAAA--G-----C-TC-CCAG--T-G-T--GG-GAAA-TA-AGA-AAAG-AAGAGG-GGC-AA-AG-C---G--T-AG----TA-A----ACT---TCGC----AG-T-GATATTTT---TTTT-TAAAAT-GTTTGA--CCCCCAC---C---C-C---CCCCC---AC---C---------CTT-TTC-C-TC---A-AG--A--------AA-------AA--T-TAA-TTA-TT--TAAC-A-T-ATCA-----A-TA-CA--TTTT-AAG---T--A-ATAT--AA-------AA---AAATC-T--A---T-A-ATC-TA--T--T-TAT-TA--TAA-ATATA-C-A-T--AAAA----AATAA----T-ATA----TA-----AATAATAG-GAAAA--TGAATAACCCATAAT--A-A-AACCACAAC---CCA---A-------AAAAAA-A---A----------C--CTC--ACC--AAA-AAC-AA-T-TCC-----------------G-AC----CACA--AA-A------A-T-T-GA-AC--AAT-AAA-AATTAAATGC--C-GCCATAGC----T-G-C---TT--GCAGTTG-T-CCA--AAAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AATAATAAGAATTGAATTACCATAATGAAAAGCAAAAAGAAACAATGTTATTAGAGAGAAAATTGTTCTATAAAAAAAAGCAATACCTGCAAAGTACGATACATGAATTGATCTATATCACATTTTAATGAATATTAGCATTTTTCAATATTTTGCATAAAACAACATGTTGCGTTAGGACAGGGGGGGGGTAGCAATCCCCCCCCCCCCCCGCTTTGTGAAAGTCAGATGCAAAAATTGTATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|23 ): AAAAAAATAGATGTATTGTGGATGGTCAAATCTTGTTTTACGGAATTCAGAATAACAGGAGCCAGATACATCAGAAGACGTATACAGCTATATTTTCAAATATTATCAATCTGTCAGTACAAAGCACCAAAGTAGTGTCTTATATTCCCCCCCCCCCGCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|26 ): AAAGTGCGAACAGGACAGACCTTTCCCTTAGTCAGATATGACATAAATATTTCAGCTTTCGTATTTCATATTGCAATCCATTGGCGGATTTAGAAGGGAGGGGGAGCTCCCCTCACCCCC
Unaligned ( gi|27 ): AATTTAGGTAAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTCAGTCGTTATTTAGAAGAATTTGCCGCAAATATTACTATTGTACATAATGTTCACAATATA
Unaligned ( gi|33 ): GTACAGTGGCGGATTTAGAAAGGGGACGAGCTAAGCCCCCCCCCCC