lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 3333333 11111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111 1 111 11 11 444444444444444444 111 2222222222 11111 55555555555 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 22222222222 111 111111 111 1 22222 1111 11 1 111 111 2222 22222222222222 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555 111 22222 4444444444444444444444444444444444 11111 66666666666666666666666666666666666666666666666 444444444444444444444444444444 1111111111111 222222222 22 11111111111 1111111 11 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222 111 333
lowQualScore : 3 7 2 0000000 5 55555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 5 9999999999999 3 66 66 6 222 5 66 11 0 11 666666666666666666 444 5 0000000000 9999 11111 55555555555 8888 888 5 0 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44 88888 88 0 4 3 55 22222222222 222 555555 55 333 88888 0 3 55 4 88 7 33333 3 4444 555 33 88 3 3 66 1 2 2 2 2 5 2 33 2 2 2 333 555 77 2 444 0000 2 2 2 55 5555 11111111111111 2 777 2 0000000 666666 444 8888888888888888888888888888888888888888888888 333 99 2 55555 2 777 33 4 55 2 55555 33 2 88888 8888888888888888888888888888888888 2 33 00000 888 4 88888888888888888888888888888888888888888888888 2 6 2 7777 000000000000000000000000000000 1 1 3 22 1 1 1 1 333 33 1 2222222222222 1 1 1 1 777777777 22 1 1 1 66 3 22 6666 1 1 000000000 1 44 88888888 333 22 888 22 3 33 22 88888888888 1 22 3333 33 22 1 222 22 222 66666 55555 00 2 44 77 22 333 88888888888 333 1 1 55 1 3 1111111 44 22 2 4444 66666 2 2 0 33 2 2 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 66666 2 999999999999999999 3 111 3 3 666 55 2
lowQualScore : . . . ....... . ..... ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. . . ............. . .. .. . ... . .. .. . .. .................. ... . .......... .... ..... ........... .... ... . . ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... .. ..... .. . . . .. ........... ... ...... .. ... ..... . . .. . .. . ..... . .... ... .. .. . . .. . . . . . . . .. . . . ... ... .. . ... .... . . . .. .... .............. . ... . ....... ...... ... .............................................. ... .. . ..... . ... .. . .. . ..... .. . ..... .................................. . .. ..... ... . ............................................... . . . .... .............................. . . . .. . . . . ... .. . ............. . . . . ......... .. . . . .. . .. .... . . ......... . .. ........ ... .. ... .. . .. .. ........... . .. .... .. .. . ... .. ... ..... ..... .. . .. .. .. ... ........... ... . . .. . . ....... .. .. . .... ..... . . . .. . . . ........................................................... ..... . .................. . ... . . ... .. .
lowQualScore : 3 3 5 0000000 7 33333 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 0 6666666666666 2 99 11 8 000 0 99 99 1 99 000000000000000000 555 0 2222222222 4444 11111 66666666666 1111 888 0 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22 77777 66 1 3 6 33 88888888888 555 555555 00 888 33333 2 3 00 3 55 0 55555 6 1111 888 88 44 3 3 11 9 9 9 9 8 7 9 77 7 7 7 666 333 33 7 777 5555 4 4 4 66 0000 99999999999999 4 444 4 0000000 888888 111 7777777777777777777777777777777777777777777777 999 77 2 66666 2 444 11 4 33 2 66666 11 2 88888 8888888888888888888888888888888888 2 11 88888 888 4 00000000000000000000000000000000000000000000000 5 1 2 6666 444444444444444444444444444444 9 9 8 55 8 8 8 8 222 99 8 0000000000000 9 9 9 9 666666666 77 9 9 9 44 6 66 6666 9 9 666666666 9 55 88888888 333 66 111 33 3 77 00 22222222222 5 00 1111 55 00 5 666 00 666 00000 88888 44 5 00 99 33 000 44444444444 222 8 8 99 7 3 7777777 11 88 0 2222 11111 1 1 1 99 2 2 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777 7 999999999999999999 1 444 6 6 444 00 5
consensus : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACTCTGAGCC---------T---TT----AGTTC-TTT----T---------TT-TGC-C-----------GAAA--AC-----A-------ATT-----T-ACG--ACCA--CCGCGCCGAC--C--CAATA-T--ATT-TT-CAGA--AATC--AAA-CAC-------------G-TTGT----------------GT-TT-TT----TNT--TTTTANAA----TTATTTN----T------------TT--TT-A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GAC--A-TG----T-----A-----TTA-TC-GA-AN-T-NT--ATCGTGT--CG--AAAAAAACA--TTTTAATT-T--A--CATTGG--ATA-----TANTANTA----TTTGTC-AGAC-AG--------T-CCCGATTAA----CGATT-----TGA----AAT-N--TG--C-TTTT---T-CTCCCAAATATTCGTATGG----CACC-GTATACAT-GTG--------T-TTG--TGTA-----GGAGGNGTGGCTTTCNT-CAAATAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGCTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CTAAATATTCCGTT-ATCA-CAT-GTGGA-GTGCTTT------TC------ATT--CA---CTT-A-TA--ATATC-ACA-TTCA---A---CATTCAA-GTAC--A-AACATGTN-C-A-CATT--G--CTAA--TTATTATGATT-ATT-AA-AC-GTGAAATTT---AAGAAT---A--T--TTT---ATGG-----AAGA-AAT-TAAAGANAG-GCATTAA--ATAAAA-TCTG-TC-A---AAA-CCAGG-T-T-TCTTC-ATAAAC-A-TA-TAT-A-GTGTTT--GG-T-A-TCGTT--GGAATT-G-TCT--CA-A---TAT--G-CTG-A-AA-ATCAAT--A----T--------GCA-T-ATC-AG---AA-AA----A--AA------A---AT--C-----G---------AAAAA-AA-----AA-AT---T--G--TTT---T--A-A-----A-AAA-CGG--CC-TTA--T-C--T--TGAT--TT-T-T---TA---C-CTG---AG---AC--AC--TTT-NN----ACACG-GC--C-----CG-C-AA-G------TCG---A-TCG-CAAG-GC---G-GG-CG--A--T---AG-CCTC-GGC-AGT---TATCAG--CCA-----ATTA---------A--C-AGCA-A-T-TA--TC-A-G-T-A---CC-CACAG-T----A-CTT----TCA-C-A-GT-A---------CA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCA--G--A-A-C-C-----CACAG-TAA--AA--------A---C--CA-C-AGT--A-AA--TA--T-----------C-AG--C----A--AT--TA-T---CA--G---C-----ACC-----CA-CAGTA--ATT--AT--CAG---TACC-----A-----A---C-A-GT-AAA-A-T-A-T---CA--GTACT--T-T----A--T--CAG-T-AATTA-TC-AG-C-ACCAAC-AGC----A-------------C--A-----------T------T---A---------ATT-----AT-CAG-----------T------AAA-AA---T-GA-CACT-C--TCAGTACATTTTNCGT
Reference ( gi|1 ) : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCA-GATTCTGAGCC---------T---TT----AGTTC-TTT----T---------TT-TGC-C-----------GAAA--AC-----A-------ATT-----T-ACA--ATCA--CCGCACCAAC--C--CAATA-T--ATT-TT-CAGA--AAGC--AAA-CAC-------------G-TTGT----------------AT-TT-TT----TGT--TTTTATAA----TTATTTT----T------------TT--TT-A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCTGTTCGAC--A-TG----T-----A-----TTA-TC-GA-AA-T-AT--ATTGTGT--CG--AAAAAAGCA--TTTTAATT-T--A--CATTGG--ATA-----TAAAACTG----TTTGTC-ATAC-AG--------T-CCCGATTAA----CGATT-----TGA----A---C--TG--C-TTTT---T-CTCTCATATATTCATATGAACCCCATTCGTATACAT-GTA--------T-TTG--TGTA-----GGGGGGGCGGCTTTCATGCAGATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGGTA--ATCTGTAATTTTAAAAAATA-CTAAATACTCCCTTCATCA-CAT-GTGGA-GTGCTTG------TC------ATT--CA---CTT-A-TA--ATATC-ACA-TTCA---A---CATTCAA-GTAT--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TTATCATGATT-ATC-AA-AC-GTGAAATTT---AAGAAT---A--T--TTT---ATGG-----AAGA-AAT-TAAAGAGAG-GCAATAA--ATTAAA-TCTG-CT-A---AAA-CCAGG-T-T-TCTTA-ATAAAC-A-TA-TGT-A-GTGTTT--GG-T-A-TCGTT--AGAATT-T-TCT--CA-A---TAT--A-CTG-A-AA-ATCAAT--A----T--------GCA-A-ATC-AG---AA-AA----A--AA------A---AT--C-----G---------AAAAT-AG-----AA-AT---T--A--TTT---T--A-A-----A-AAT-CGG--CC-TTA--T-C--G--TGAT--TT-T-T---TA---A-GTG---AG---AC-TAC--TTT-CA----ACACG-GC--C-----CG-T-AA-G------TCG---G-TCG-GAAG-GC---A-GA-CG--A--G---AA-CCTC-GAC-AGT---TATCAG--TCA-----ATTA---------A--C-AGCA-A-T-TA--TC-A-G-T-A---CC-CACAG-T----A-CTT----TCA-C-A-GT-A---------CA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCA--G--A-A-C-C-----CAGAG-TAA--AA--------A---C--CA-T-AGT--A-AA--TA--T-----------C-AG--C----A--AT--TA-T---CA--G---C-----ACC-----CA-GAGTA--ATT--AT--CAG---TACC-----G-----A---C-A-GT-AAA-A-T-A-T---CA--GTACT--T-T----A--T--CAG-T-AATTC-TC-AG-C-ACCAAG-AGC----A-------------C--A-----------T------T---A---------ATT-----AT-CAG-----------T------AAA-AA---T-GA-CA---C--TCAGTACATTTTGCGT
gi|4 : GGAAGTC-AA--------------CAGAT-TAGCC-GGCACTGAGCTCTGGTTTGTT---TT----AGTTT-TTT----TGTTTTTGTTTT-TGG-G-----------GAAA--AC-----ACCCCCGAATTATGCGTGACT--ATCAAACCGGACGA----T--CAATA-T--ATT-T--CAGA--AA-T--AAA-CAC-------------A-T-GT----------------GT-TT-TA----AGT--TTTTAAAAATATTTATTTTA---T------------TTA-TT-ATTTAATA-GG--CGAT-TT----GTTTA-----CCCTG----AC--A-TG----T-----T-----TTAATC-GA-AT-T--T--GTCGTGT--CG--AAGAAAACAAACATTAATT-T--A--C-TTGG--ATA-------ATACTA----GTTGTCCAGAC-AG--------T-CC-GATTAA----CGATT-----TGA----AATAT--TG--C-TTTT---T-CTCCCAAATAT------------CACT-GTATACAT-GTGTGTGTGACT-TTGCATGCAATATTGGAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA----TATCATCT-TAAATTTAAAA-----CTAA-TA-TCCGT--ATCA-CAT-ATGGA--TGCTT-------TA------AGA--AA---ATT-C-CA--ATATC-AC--TTCAT--AT--CATTCAC-AT-T--A-GTCATAT----A-TATT--G--CTA---TTAT-ATGATT-ATT-ACCAT-TTGAATTTA---AAGAAT---A--T--TTTT--ATGG-----A-GA-AAA-TAAAGATAG-ACATTGACAATAAAA-TCTG-TC-A---AAATCCAGGGT-T-TCTTC--TAAAC-A-TAATAT-A-AGGTTT--GG-T-T-TCGTT--GGAATT-G-TTT--TA-A----AT--AGCTG-A-AA-ATCACT--A----T--------GCA-T-ATC-AG---AA-AA----A------------------C-----G---------ATAA--AA-----AA-AA---T--G--TTA---T--G-A-----A-AAA-CGGATCC-TTA--T-C--T--TGAT--GT-T-T---TA---ACCTG---AGAC-AC-TAA--TTT-GC----ACACG-GC--C-----CG-C-AATG------TCG---A-TCG-CAGG-GC---
gi|40 : tacgtcaaaggttggtatctccgttgaattccaatataaatttgtagcactcttaGGGAGTC-AAACACTGGATA-CTACAGCTGTAGCG-GACTCTGAGCC---------T---TT----AGTgaggga
gi|36 : GAAGTCTAAACAATGGAAAACC-CAGAT-TAGCG-GACTC-AAG-C---------T---TT----AG----TCT----G---------TT-TGC-C-----------GAGA--A
gi|8 : CTGGGT--CC-CAGAT-TAGCG-G--TCTGAGCA---------T---GTCGAAAACAC-CCTCGAAT---------AT-TGCGT-----------GGAATTGC-----T-------TTT-----T-AAG--ACCA--CAG-AGCGGC--C--CAATA-TGTATTGTT-CAGA--AATC--AAA-CACAT-----------G-TGGT----------------GT-TT-TT----TTT--TTTTAAGATATTTTATTTA----T------------TTACTT-C---AATAGGG--CGGTGTTA---GTTTA-----ACCT----AAC--A-TG----TTAAGAG-----TTA--G-GA-AT-T-CT--A-TGTGT---G--AAAAAAATA--TTTTAATA-T--AG-CATTGG--AT
gi|17 : AGAT-TAGCG-GA--CTGGGTT---------TGGTTT----TGTTG-TTT----TGTT------TT-TGT-CTTTATTTCGGGAAAA--ACCTCCGA-------ATT-----T-GCGTGATTA--CATAA--AAC--CGGCACCA-T--ATT-TT-CAGA--A--C--AAA--------------------TGT----------------AT-TTATT----TTT--TTTTAAAA----TAATTCTATGAT------------AT--TT-AGTTAATA--G--CGAT--------TTGA------------CGAC--A--G----------A-----TTA-TCTG---A-T-AT--CATG-GT--CG--AAAAAA-CA---TCTAATTAT--A--CATTGT--AT------TACTATTA----TTTGTC-CAACGAG--------T-CCCGATAAA------ATT-----TGA----AAT-CG-TG--C-TTTT---T--TC-CAAATATtattaacaatttaaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgagctaatctgtaattacatgtaataactaaatttcttatcacatgtggagtggttcatcggtacttcatatcatttacattctcaatactgaaagcgcacagtgagctcattatcatgactactaaacaatgattttgcaagaatcattgtttatggacggcgttaaataaaattgcaaaacggtaatctgtc
gi|41 : tacgtcaaagtgatctctgtatacgaattattaacgtctcgggaagctcaGAT-TAGCGTGACTCTGAGTC---------T---TT----AGTTCTTTT----T---------TT-TGC-T-----------GAAA--A
gi|27 : GAT-TAGCG-GACTCTGAGTC-------------TT----AGTTC-TTT----T---------TTATGC-T-----------GAAA--AA-----A-------Aaa
gi|2 : cc--ACCA--CCGCGCCGACAAC--CAAGG-TT-ATT-TTGCAGACTAAGTCAAAA-CAT-------------GATTGTTGCTTCTTTAAAGAAAATATT-TT----TAT--TCTTA-AG----TTATATA----T------------CT--TA-AT--AATA-CGAACGATATCATAGGTTGAAGAAGCCCTG---GACCCACTG----T-----AGATCGTAA-TC-GG-AA-TTACTGATCGTGT--CG--AAAAA--CA--TTTAAGTC-TTAA--CATTGG--ATAATACATAGTA-TA----TTGGTC-TTGC-AGACTAAATGT-TCCGATTAA----CGATTTTAAATGA----A------TG--A-TTTT---T-CTCCCA-ATATTC----GAA---------TATACATAGTG--------TGTTG--TGTA-----Gccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccacccatgtattttcagaaaccaaacactggtgtttcgtttttgtttatttgtt
gi|31 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagatagA--TCACGCCGAC--C--CAATA-T--ATT-TT-TAGA--AATC--AAA-CACATGTGGTTTGTTTG-CTGT----------------TT-TT-TT----TTTACTTTTATG------TATTTT----T------------TT--TTCA---AATA-TG--CGaactgcactacttttcatcaaaaatcattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatctgtatgtataaatacttataatatccagtacgcacatgtgaattcattctaaagaattttcataacattttctatatcaaattcacattagtaccatcttcaatattgcaaattatttaacattgaatcttaagaattcaattttttataggacaaaagagaataaaatagaccattaaattaaaatctgtccaaagacaggtgtgtcttcaaaaacatatatcagtgtttggtagtcgttggaatcgttctcaaatctgaaaaatcataaggttgcatatcgagataagaccaaaaatttaaaaaaggaaaaaaatatctgttttaaacgacctgctttatacatttgatcttatacctgagaacacaattgcgacacgtgcccgcaagtcatcgcaggagctcgagcgatacagcctcggcaataatgtcagccaattactcaagtataccaatactgtttccacagtcactttatcagttaattcatcaagcaacaaacagcacagtattctagtacattatcagcaat
gi|27 : tCACCA-C--C--CA-TG-T--ATT-TT-CAGA--AACC--AAA-CAC----------------TG-----------------GT-GT-TT----CGT--TTTTGT------TTATTTG----T------------T
gi|24 : ccgattagcggactctgagtcttagttcttttttatgctgaaaaaaaccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaa--C--CAATA-T--ATT-T--CATA--AATC--AAAACAC-------------A-T-GTG---------------AT-GT-TT----AGT--TTTTAAAAAA--TTATTTT----TATTTATTTAATCTT--TT-A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----ACCT----GAC--A-TG----T-----A-----TTA-TC-GA-AATT-AT--ATCGTGT--CGAAAAAAAAACA---TTTAA---T--A--CATGTG--ATA-----TACTAGTAT---TTTGT--AGAC-AG--------TACCCGATTAA----CGATT-----TGAAATGA---T--TG--C-TTTT---TGCTCCCA-ATATT
gi|3 : AATAAT--ATT-TT--AGA--AAT----AA-CACTGTGATT------G-TTGT-----------------T-TT-TTAAAATAT--TTTTAT------TTATTTA----T------------TT--TT-A---AAAT-GG--CGAT-T-A---GTTGA-----CCCTG----AC--A-TG----T-----A-----TTA-TC-GA-AT-T-CT--ATCG-GT--CG--AAAAAA-CA--TTTAAATT-T--A----TTGGTAATA-----CTAGACTAAGTATTTGTC-AGAC-AG--------T-CCCGATTAA----CGATT-----TGA-----------TGATC-TTTT---T-CTCCCA-A-----AGATGG-------CCGTATACAT-GTG----------TTA--TGT-------GATGTGTGACTTTCAT-CA-ATAATTgtataca
gi|29 : TTTTA---T------------TT--TC-A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCC----CGAT--A-CGCAGTT-----A-----TTA-TC-GATTA-T--T--ACTGTGC--CG--AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcatctgtattcaaatactaatatccgtatcaacattggaatgctttaaaaattattcacttcatatcaaatcacatttagtacatgtcaatatatgctaattaatatgaaaaaaataagatagacattaaataaaatctgtcaaaaccagtttcttcaaaaacatattggtgtttggtatcgttggaattgttgcaatatgctggcaaatcataatgcaattcagaaaaaaaaattgtaaaaaaaaaattgtttttaaaaaacggccttatttgattttgttacctgagacaatttgcacaggccgcagtgatcgcagggcgagcgatagctcgcagatatcagaattatacattatagtacccacagtactttcacagtacattcagtaaatatcagtaccacgaaaaaccacagtagataagcagcattatagtaccacaagtactttcacagtactttatcagtatttcaagcaccgaagcacaatatcagtaagttatcagattatcagtaacaatggacactctcagtacattttgcgtca
gi|5 : t-GA-AT-T-CT--ACCGTGCTGCG--AGAAAAACA--TTTTAATT-C--GATCATTGGA-ATA-----TCAA--TG-----TTGTC-AGAC-AG----------ACCGATTAA----CGGTT-----TAA----A---TGATG--CTTTTT---T-CTTCCAAATATTCGTATcccagtgttagtcagacagtcccgataaacgatt
gi|21 : g--AAAAAACCA--TTTTAATT-T--A--CATTTG--ATA-----TACTAGTG----TTTGTC-AGAC-AG--------T-CTCGATTAACGATCGATT-----TGA----A---A--CG--A-TTCTCTAT-CTCCCATATGCATATATG-----CATT-ATGTGCGT-GTG--------T-GTG--TGT---------GCGGTGGCTTTCCT-CAAATAATTTcacatgtgattgttagatgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaatcatttcatattcattcacatcacttacataaaatgcccaattctagatttattatgataatttgacagttaattgtaagaatattttatggaagaaattaaagatgatcattaaataaatctgcgaaaagtttgttcaaaacaatatgtagttttggctctcgtggaattatctactacatatagctaagaatatatgcaatatcagaaaaaaaaaaatttaaaagaatatcgtttttataaaaacgccttaattcattcttattactaaacacatttgcacacgcctgcaagtatcacaaggcgagcgaattcagcctggagttatcagcaccaaaaacaagcaattatagtacccaagtttattcacatgtacattgtcagtaaatatcagaaccacaataaaaacaacagtatatatatctagaagaccagcaaatcatcacagtaattagatgagtaccatcagtaaatatcataattcagccaaaacagtcacaaatcaacaagtatcagt
gi|29 : TG----TTAGTC-AGAC-AG--------T-CCCGATAAA----CGATT-----aaagagaaagagagagttcatctgtgattaaatactaattatccttagcacatgtgaagtgctttcattcatttcttataaattcaaattgaatacataaaatgcacacatt
gi|32 : tttttattttcaaataggcggtttagttgaccccgatacgcagttattatcgattattactgtgccgaacccagA----CGATT-----TGA----AATTA--TG--C-CTTT---T-CTTCCAAATATTCGTATG
gi|21 : AGAGAGTTC--ATCTGTGATT-----AAATA-CTAATTAT--CCTT-AGCA-CAT-GTGAA-GTGCTT-------TC------ATT--CATTTCTT-A-TA--A-------A-TTCA---A----ATTGAATACAT--A-AA-ATGCA-C-A-CATT--catgtgtatgtgtgagacttcatcaaaaaactttaagagagagagagag
gi|8 : aaaaaaccattttaatttacatttgatatactagtgtttgtcagacagtctcgattaacgatcgatttgaaacgattctctatctcccatatgcatatatgcattatgtgcgtgtgtgtgtgtgcggtggctttcctcaaataatttaaagagaaag-AGCTA--ATCTGTAATTACATGTAATAACTAAAT---TTCTT-ATCA-CAT-GTGGA-GTGGT--------TC------ATCGGTA---CTTCA-TATCAT-TT-ACA-TTC-----------TCAA--TACTGA-AA---GCG-C-A-CAGTGAG--CTCA--TTATCATGACT-ACT-AA-ACAATG--ATTTTGCAAGAATC--A--TTGTTT---ATGG-----ACGG-CGT-TAAA
gi|6 : ctgggtcccagattagcggtctgagcatgtcgaaaacaccctcgaatattgcgtggaattgctttttaagaccacagagcggcccaatatgtattgttcagaaatcaaacacatgtggtgttttttttttttaagatattttatttatttacttcaatagggcggtgttagtttaacctaacatgttaagagttaggaattctatgtgtgaaaaaaatattttaatatagcattggattattaacaatttaaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttg--ATCTGTAATT-----AAATA-CTAGATAT--CCTT-ATCA-CAT-GGTGA--TGCTT--------C------ATT--CA---CTT-C-----ATATC-A-A-TT-----A---CATTTAA--TAC--A-A---TGTC-A-A-CATT--G--C-AA--TTATTATGATTTATT-AA-CA-TTGAATTTT---AA--AT---A--T--TTT---AAAG-----GAAA-AAA-TAAAGATAG-GCATTAA--AA-AAA-TC-G-TTCA---AAA-GCAG----T-TTTTC-ATAAAC-A-T----T-A-GTGTTT--GG-T-A-TC-TT---GAATT-G-TCT--CA-A---TAT----CTG-A-AA--TCATA--A----T--------GCA-T-ATC-AC---AA-AAC---A--AA------A---AT--T-----GTAAA-----AAAAA-AA-----AA-AG---T-----TTT---T--A-A-----A-AA--CGG--CC-T-A--T-C--T--TGAT--TT-T-T---TA---C--TG---AG---ACATA---TTT-GA----ACACG--C--C-----CA-C-AA-G------TCG---A-TCG-CAAGTGG---A-G--CG--A--TT--AG-CCTC-GCA-AAA---TATCAA--TCAGCACAATTA---------T--C-AGCA-A-T-TA--TC-A-G-T-C---CC-CACAG-T----A-CTC----CCA-C-A-GT-A---------CT-T-TA-TC-AGC--AAA-TATTA--G--T-A-C-C-----CACAG-TAA--AA--------AAACC--CA-C-AGT--A-TA--TA--T-----------C-AG--C----A--AT--TA-T---CA--G---T-----ACC-----CA-CAGTA--ATT--AT--CAG---TACC-----A-----A---C-ACTT-AAA-A-T-A-T---CA--GTACT--T-T----A--T--CAG-T-AATTA-TC-AG-C-ACCAAA-ATC----A-------------C--A-----------CTATCAGT---A---------ATT-----AT-CAGTAATTATCAGTT------AAA-AA---T-GA-CACT-C--TCAGTCCATTTTTCGTtaaaattgcaaaacggtaatctgtc
gi|3 : agagaagagagagagattc--ATCTGTA--TTCAAA---TA-CTAA-TA-TCCGT--ATCAACAT--TGGA-ATGCTT---------------------------T-A-AA--A-ATT-A---TTCA-------C-TTCA---TAT--C-AA-AT----C-A-CATT------TAG--T-A-CATG-----TC-AATAT-ATGCTAATT---AA---------------T---ATGA-----AAAA-AAT---AAGATAG-ACATTAA--ATAAAA-TCTG-TC-A---AAA-CCAG--T-T-TCTTC-AAAAAC-A-TA-T-T-G-GTGTTT--GG-T-A-TCGTT--GGAATT-G-TTG--CA-A---TAT--G-CTG-GCAA-ATCATA--A----T--------GCA-A-TTC-AG---AA-AA----A--AA------A---AT--T-----GT--------AAAAA-AA-----AA-AT---T--G--TTT---TT-A-A-----A-AAA-CGG--CC-TTA--T-T-----TGAT--TT-TGT---TA---C-CTG---AG---AC-AAT--TT--------GCACA-GG--C-----CG-C-A--G------T-G---A-TCG-CAGG-GC---G-AG-CG--A--T---AG-C-TC-G-C-AGA---TATCAG----A-----ATTAT--------A--C-A------T-TA--T--A-G-T-A---CC-CACAG-T----A-CTT----TCA-C-A-GT-A---------CA-T----TC-AGT--AAA-TATCA--G--T-A-C-C-----ACG----AA--AA--------A---C--CA-C-AGT--A-GA--TA----------------AG--C----AGCAT--TA-T----A--G---T-----ACCA----CA--AGTA--CTT---T--CA--------------------------------------------CA--GTACT--T-T----A--T--CAG-T-ATTTC--A-AG-C-ACCGA--AGC----A-------------C--AATATCAGTAAGT------T---ATCAG-----ATT-----AT-CAG-----------T------AAC-AA---TGGA-CACT-C--TCAGTACATTTTGCGTcg
gi|9 : aataatattttagaaataacactgtgattgttgttttttaaaatatttttatttatttatttttaaaatggcgattagttgaccctgacatgtattatcgaattctatcggtcgaaaaaacatttaaatttattggtaatactagactaagtatttgtcagacagtcccgattaacgatttgatgatctttttctcccaaagatggccgtatacatgtgttatgtgatgtgtgactttcatcaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcAAATA-CTAAATA-TCCGT--ATCA-CAT-GTGGATATGCCTT------TTTAAAAAATT--TA---TTC-ACTAC-ATATCAACA-TTC----A---CATT--A-GTAC------CATGTT-CAA-TATT--G--CTAAT-TTATTATG-TT-ATCTAA-AC-TTG--ATTTAA-AAGAAT---AT-T--TTT---ATGG-----AATA-AAA-TAAGATAAG-ACATCAA--AAAAAA-TCTG-TC-AAACAAA-CCAGGTT-T-TCTTC-AACAAC-A-TA-TAT-G-GTGTTT--GG---A-TCGTTG-GGAATT-G-TTG--CA-A---TATTGC-CTG-C-AA-ATCAATA-A----T--------GCG-ATATC-AG---AA-AAC---A--AA------A---AT--T-----GTTAAAAAAAAAAAA-AA-----AA-AT---T--GT-TTT---T--A-A-----A-AAA-CGG--CC-TTA--T-C--GT-TGAT--TT-T-T---TA---C-CTGA--AG---AC-AAT--TTG-C-----ACACG-GC--C-----CG-C-AA-G------TCG---GATCGCGAGG-GC---G-GAGCG--A--T---AAGCCTCGGAC-AGA---TATCAG--AC------ATTA---------AT-C-AGCA-A-T-TA--TC-A-G-T-A---CCGCCCAA-TTA--A-CTT----TCA-C-A-GT-A---------CT-TATA-TC-AGTA-AAA-TATCA--GT-A-A-C-C-----------------A--------A---T--TA-T-A-T--A-AC--TA--T-----------T-AGATG----A--A----A-T---CA--G---CAT---ACC-----CA-CATTG--ATTG-AT--Cca
gi|15 : attcAGATA-CTAAATA-TCCGTT-ATCA-CATTGTGGA-ATGCTTTAAAAATTC------ATT--CA---CTT--------------CA-TTCA---ATTCCATTTA--GTAC------CATGTC-A-A-TATT--G--CTAA--TTATTATGATT--TT-AA-AC-ATTGAATTT---AAGAAT---AATT--TTT---ATGG-----AAAA-AAAACAAAGATAG-ACATTTA--AT-AAA-TCTG-TC-A---AAA-C-AGG-T-T-TCTTC-AAAAAC-G-TA-TATGA-GTGTTT--GG-T-A-TCGTT--GGAATA-T-GTT--GC-A---TATT-G-CTG-A-AA-A--AA---A----T--------GCA-T-ATC-AG---AA-AA----ACAAA------A---AT--T-----GT--------AAAAA-AA-----AA-AT---T--G--TTT---TTTA-A-----A-AAC-GGG--CC-TTA--T-C--T--TGAT--TT-TGT---TACCTA-ATG----G---ACACAT--TTG-CAC---CCACG-G---C-----CG-C-AA-G------TCG---A-TCtaa
gi|7 : ttcTAAAAATTGTCTT-ATCA--AC-GTGGA-GTGTTTT------TC------ATT--CA---CTT-C-----ATATT-AGAATTCG---A-----TTCAACACAT--A-AA-ATGGAAC-A-CATT--GGGCTAA--T----AT--TT-ATT-AA-ACAGT-AGATTT---AAGAAT---A--T--TTTTTTATTG-----AAGA-AAT-TAAA-AGAGCGCATTGA----TAA---TTG-CC-A---AAA-CCAGG-T-T-TTTTATATACAT-ACTA-T-T-A-GTCTTTATGG-TGA-TCGCTTGAGAATT-A-GCT--CA-A---TAT--G-CTT-G-AA-ATCAAT--A----T--------GCA-T-ATC-AA---AA-AA----A--AATTTTTTA---AA--C-----A---------AAAA---------GA-AT---T--G--TCT---T--A-A-----A-AAA-ACG--TC-TTA--T-C--T--TGAT--TCGT-T---TA---ACCTG---AGC--AC--AT--TT--------GCACC-GA--C-----CG-CAAA-G------TCG---A-TCGCAAAG-GC---C-AG-CG--A--T---AAGCCTC-GGCAAGA---TATCG----CA-----CTTT---------T--C-AGCA-A-TATA--TC-A-GAT-A---CC-CACAG-TAGA-A-CTTA---T---C-A-GC-A---------CT-T-TA-TC-AGC--AAT-TATCA--GC-A-A-C-C-----CACAG-TAA--AA--------A---C--CA-C-AGT--A-AA--TAGTT-----------C-AG--C----A--AT--TA-T---CA--G---T-----ACC-----CA-ATG-A--ATT--AT---AG---TA-C-----A-----A---C-A-GTAAAA-A-T-A-TA--CA--GTACT--T-T----ATCT--CAG-T-AATTA-TC-AG-C-A-CAAC-AGT----A-------------C--A-----------A------T---ACAGT-----ATT-----ATCCAG-----------T------AAA-AAAT-T-GA-CACT-C--TCAGTACATTTTGCGTtggggttcttttctccatcaatgattacaat
gi|5 : acgaaa-A-TC--ATTTC-ATA-TTCATTCA---CAT-CAC-TTAC--ATAAAATGCC-C-A--ATT-----CTAGATTTATTATGATA-ATT-TG-ACAGTTAATTGT---AAGAAT---A--T--TTT---ATGG-----AAGA-AAT-TAAAGATGA-TCATTAA--A-TAAA-TCTG-CG-A---AAA-----G-T-T-TGTTC-A-AAACAA-TA-TGT-A-GT-TTT--GGCT-C-TCG-T--GGAATT-A-TCTACTACA---TAT--AGCTA-A-GA-AT--AT--A----T--------GCA-ATATC-AGAA-AA-AA----A--AA------A---AT--T-----T---------AAA---AG-----AATAT---C--G--TTTTTAT--A-A-----A-AAC---G--CC-TTAATT-C-------AT--TC-T-TA--TT---A-CT----AA---AC--ACA-TTT-GC----ACAC--GC--C-----TG-C-AA-G------T-----A-TCA-CAAG-GC---G-AG-CG--A--ATTCAG-CCTG-G---AGT---TATCAGCACCA-----A-AA---------A--CAAGCA-A-T-TA--T--A-G-T-A---CC-CA-AG-T----T-TAT----TCA-C-ATGT-A---------CA-T-TG-TC-AGT--AAA-TATCA--G--A-A---C-----CACAA-TAA--AA--------A---C--AA-C-AGT--A-TA--TA--TATCTAGAAGACC-AG--C----A--A----A-T---CA--T---C-----AC----------AGTA--ATTAGAT--GAG---TACC-----A-----T---C-A-GT--AA-A-T-A-T---CA--ccag
gi|2 : ggaattctaccgtgctgcgagaaaaacattttaattcgatcattggaatatcaatgttgtcagacagaccgattaacggtttaaatgatgcttttttcttccaaatattcgtatcacatgtgattgttagatgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatatta--ATATC-AAA-TTCA-------CATT--A-GTAC------CATCTT-C-AATATT--G--CAAA--TTAT-----TT-AAC-A-----TTGAATCTT---AAGAATTCAA--T--TTTTT-ATAGGACAAAAGAGAAT-AAAATAGAC--CATTAA--ATTAAAATCTGTCC-A---AAG-ACAGG-TGTGTCTTC-AAAAAC-A-TA-TATCA-GTGTTT--GG-T-AGTCGTT--GGAATCGT-TCT--CA-A----AT----CTGAA-AA-ATC-AT--AAGGTT--------GCA-T-ATCGAG---AT-AAGACCA--AA------A---AT--T-----T---------AAAAA-AGGAAAAAA-ATATCT--G--TTT---T--A-A-----ACGAC-CTG--CT-TTA--TAC--ATTTGAT--CT-T-A---TA---C-CTG---AG---AA-CACAATTG-CG----ACACGTGC--C-----CG-C-AA-G------TC----A-TCG-CAGGAGCTCGA-G--CGATA--C---AG-CCTC-GGC-AATAA-TGTCAG--CCA-----ATTA---------C--T---CA-A-G-TA---------T-A---CC-AATAC-T----G-TTT----CCA-C-A-GTCA---------CT-T-TA-TC-AGT--TAA-T-TCA-----------T-----CA-AG-CAAC-AA--------A---CAGCA-C-AGT-----A--TT--C-----------T-AG--T----AC-AT--TA-T---CA--G---C-----Ataattcagccaaaacagtcacaaatcaacaagtatcagt
gi|34 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagatagaccaccgcgccgacaaccaaggttattttgcagactaagtcaaaacatgattgttgcttctttaaagaaaatatttttattcttaagttatatatcttaataatacgaacgatatcataggttgaagaagccctggacccactgtagatcgtaatcggaattactgatcgtgtcgaaaaacatttaagtcttaacattggataatacatagtatattggtcttgcagactaaatgttccgattaacgattttaaatgaatgatttttctcccaatattcgaatatacatagtgtgttgtgtagaactgcactacttttcatcaaaaatcattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatctgtatgtataaatacttataatatccagtacgcacatgtgaattcattctaaagaattttcataacattttct--ATATC-A-A-TTCA-------CATTTA--GTAC------CATGTG-A-A-TATT--G--CTAA--TTATTATGATT-ATT-AT-AC-ATat
gi|22 : cttcT--A-AAT-TGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TTATTATGACT-ATT-AA-ACAGTG-AATTT---AAGAAT---AT-T--TTT---ATGG-----AAGG-AAT-TTAAGAGAG-GCATTAA--ATAAAA-TAGG-TC-A---AAA-CCAGG-T-T-TCTTC-AT-AAC-A-TA-AAT-A-GTGTTT--GG-T-A-TCGTT--GGAATT-G-TCT--TA-A---TAT--G-CTG-A-AA-ATCAAT--A----T--------GCA-T-ATC-GG---GA-AA----A--AA------A---AC--C-----G---------AAAA---------AATGT---T--G--TTT---TA-A-A-----A-AAA-CGG--TC-TTA--T-C--T--TGAT--TT-T-T---
gi|20 : T---A--T--GCT---ATGA-----AA----AT-TAAAGAAAG-GCATTAA--TTAAAA-TATG-TC-A------------------CTTC-ATAAAT-A-TA-TAT-A-GTGTTT--GG-T-A-TCGTT--GGAATT-G-TCT--CA-A---TAT--A-CTG-A-AA-ATCAAT--A----T--------GCA-T-ATC-AG---AA-GA----G--AA------A---A---------A---------AAAAT---------A-AT---------TTC---T--A-A-----A-AAA-CGG--CC-TTA--C-C--T--TGAT--AT-C-T---TA---T-CTG---AG---AC--ACA-TTT-GC----ACACG-GC--C-----CA-C-AA-G------GCG-----------AG-----------CG--A--T---AAGCCTC-GGA-AGT---TATCAA--TAT-----ATTA---------
gi|38 : atgttaacttcgcctttttgtatatatatgatcT---ATGG-----AAGA-----TAAAGAG---TCATTAA--A---AA-TATG-TC-A---AAA-CCAGG-T-T-TCTTC-ATAAt
gi|14 : -A---GAA-CCAGA-T-A-TTTTC-ATAAAC-A-TG-TAT-G-GTGTTT--GA-T-A-TCGTT--GGAATT-G-TCT--CG-A---TAT--G-CTG-A-AA-ATCAAT--A----TTTACATATGTA-T-ATC-AG---AAGAA----A--AA------A---AT--A-----G---------AGGG---A-----AA-AT---TG-A--TTT---T--A-T-----A-ATA-CGG--TC-TTA--T-C--T--TGAT--TT-T-T---CA---C-CTG---AG---AC--ACA-TTT-GC----ACACG-GC--C-----TG-C-AA-G------GCG-------------------A-G--CG--A--T---AG-CCTC-GGC-AGT---TATCAG--C--------------------------GC----T-TC--TC-A-G-T-A---CC----------------------TA-C-A-GT-A---------CA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCA--G--A-A-C-C-----CACTG-TAA--AT--------A---C--CA-C-AGT--A-AA--TA--T-----------C-AG--C----A--AT--TA-T---CA--G---C-----ACC-----CA-CAGCA--ATT--AT--CAG---AACC-----A-----A---C-A-GT-AAA-ATT-C-T---CA--GTACT--T-T----A--T--CAA-T-A-----TC-AG-----------------------------------------------------T---A---------ATT-----AT-CAG-----------TAAAAAAAAA-AA---T-GA-CA---C--TCGGTACATTTTCCGT
gi|11 : gaattcaTTC-ATAAAC-A-TA-TAT-A-GTGTTT--GG-T-A-TGGTT--GAAATT-T-TTT--CA-A---TAT--G-CTG-A-AA-ATCAAT--A----T--------GTA-T-ATC-AG---AT-AA----AT-AA------A---AT--C-----G---------AAAAA-AA-----AA-A-------G--TTT---T--A-C-----A-AAA-CGG--AC-TTA--T-T--T--TGAT--TT-C-T---TA---C-ATA---AA---ACGCAA--TTG-CA-----CACT-GC--C-----TG-C-AA-G------TCG---A-CTG-CAAG-GC---G-AA-CG--A--T---AAGCCTC-AGC-AGA---TATCAG------------------------------CA-A-T-TA--TC-A-G-T-A---CC-CACAG-T----A-CTT----CCA-C-A-GT-A---------CA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCA--G--A-A-C-A-----CACAG-TAA--AA--------A---C--CA-C-TGT--A-AA--TA--T-----------C-AG--C----A--AC--TG-T---CA--G---C-----ACC-----CA-CAGTA--ATT--AT--CAG---TACC-----A-----A---C-A-GTAAAA-A-T-C-T---CA--GTACT--T-T----A--T--CAG-T-AATTA-TC-AG-C-ACCAAC-AGC----A-------------CA-A-----------TATCAG-T---A---------ATT-----AT-CAG-----------T------AGATAA---T-GA-CACT-C--TCAGTACATTTTGCGTccag
gi|12 : TTC-ATAAAC-A-TG-TAT-G-GTGTTT--GG-T-A-TCGTT--GGAATT-G-TCT--CG-A---TAT--G-CTG-A-AA-ATCAAT--A----TATACATATGTA-T-ATG-AG---AA-GA----A--GA------A---A---------A---------AAAATGAGGGA--AA-AT---TGAA--TTT--------A-----A-AATACGG--TC-TTA--T-C--T--TGAT--TT-T-T---CA---C-CTG---AG---A--TACA-TTT-GC----ATACG-GC--C-----CG-C-AA-G------GCG-------------------A-G--CG--A--T---AG-CCTC-GGC-AGT---T--C----TCA-----ATT-----------------C----T-TC--TC-A-G-T-A---CC-TACAG-T----A-CAT----TAT-C-A-GT-AAATTACTGATA-T-TA-TC-AGT--AAAATATCA--G--A-A-C-C-----CACTG-TAA--AT--------A---C--CA-C-AGT--A-AA------------------------------------TA-T---CA--G---C-----ACC-----CA-CAGCA--TTT--AT--CAG---AATC-----A-----A---C-A-GT-AAA-ATT-C-T---CA--GTACT--T-T----A-----------------TC-AG-C-ACCAAC-AGC----A-------------CA-A-----------TATCAG-T---A---------ATT-----AT-CAG-----------TAAAA--AAA-AA---T-GA-CA-------CGGTACATTTTCCGTccagt
gi|10 : -A-TA-T-T-ATGTGGTT--GG-T-A-TCGTT--GGAATT-TGTCT--CA-AATTTAT--T-CTG---AA-ATCAATTAA----T--------G-A-T-ATC-AG---AA-AA----C--AA------ACAGAT--TTGTAAA---------AAAAA-AA-----AA-AA---T--G--TTT---TG-A-A-----A-AAA-C-G--CC-TTA--T-CCTT--TGAT--CT-TAT---TA---C-CTG---AG---AC--ACA-TTT-GC----ACACG-GC--CT----CGCC-AA-G--------G---GATCG-CAGG-GC---G-AG-CA--ACTA---AG-CCTC-GGC-AGA---TATC--------------TA---------ACCC-CCCA-A-TCTACTTC-A---T-A---CC-CACAG-T----A-TCTATCCTCA-CTA-GT-A---------C--T-TA-TC-AGTGAAAG-TA-CA--GATA-A-C-CCAT--CACAG-T-A--AA--------A---C--CA-C-AAT--A--------------------------------A--AC--TA-T----A--C---C-----ACC-----TA-------------AT--CAG---TACCTTTCAC-----A---C-A-GT-ACT-T-TCA-C---CA--GTACT--T-T----A--T--CAG-T-AATAT-TC-AGTC-ACCAAC-AACCACAA-------------T--A-----------TCAGA--T---A---------ACT-----TT-CAG-----------T------AAA-AATACT-GACCACCTC--TCAGTACACTTTcaag
gi|13 : ttcaaaatacaattTT--GG-T-A-TCGTT--GGAATT-TGTCTTCCA-A---TAT--G-CTG-A-AA-ATCAAT--A----TC-------GCATT-ATC-AGAAAAA-AA----A--AA------A---ATTAC-----GTATA-----AAAAT--------AA-AT---T--GCCTTT---T--ATATATATA-AAC-GGG--CCTTTAT-T-C--T--TGAT--TT-T-T---TG---T-TTGCTTAG---ACACAT--TTG-CA----CAACG-GCCTC-----CG-C-AATGTTTTCCTCGATCA-TCG-CAAG-GCTT-A-AA-CA--T--A---GC-CCTC-GGC-GTT---TATCAG--CCAAC---ATTA---------T--CAAGCA-A-T-TA--TC-AGG-TAA---CC-CTCAGCT----ACCTT----TTA-C-A-GT-A---------CATT-TA-TCAAGT--AAATTATCA--G--ATACC-C-----CACAGTTAA--AA--------A---A--CA-C-AGT--A-AGATTA--T-----------CAAG--C----A--AT--TA-TTCGCATTG---C-----ACC-----CACAAGTA--ATTAAAT--TAG---TACC-----A-----A---T-A-GT-AAA-A-T-AGT---CA--GTACT--T-T----tt
gi|23 : -A-AT-ATAAAT--G----T--------ACA-T-ATC-GG---AA-AA----A--TA------A---A---------G---------AAAA--AG-----TA-AT---T-----TTT---T--A-A-----A-----CAG--CCATGA--T-C--T--TAAT--TA-T-C---TA---C-CTG---AG---AC--AC--ATT-TAC---ACTCG-GA--C-----CG-C-AA-G------TCG---A-TCG-CAAG-AC---G-CG-CG--G--T---AT-CCTC-GGC-AGA---GATTAG---CAC----ATTA---------T--C-AGCA-A-T--------A-G-T-A---CC-CACAG-T----A-CTT----TCA-C-A-AA-A---------CA-T-CA-TT-AGT--AAA-TATCA--G--A-A-C-C-----CACGG-TAA--AA--------A---C--CT-C-AGT--A-AA--TA--T-----------cttttcagttaa
gi|16 : c-A-AATATCTAT--A----T----------A-T-ATC-AG---AA-AA----C--AA------G---AT--TTTT--G---------AAAC---------AA-GT---T--TCTTTT---T--A-A-----C-TAT--GG--CC-TTA--T-T-----TGAT--TT-T------A---A-CCG---AG---AC--AT--TTG-GC----ACACG-GC--CACAAGCT-T-AA-G-------CG---A-GTG-GA----------TA-CG------------CCTC-GGC-AGT---TAT-AG---CA-----ATTA---------A--T-AGCA-A-T-TA--TC-A-G-T-A---C------G----------------CA-C-A-AT-A---------CA-T-TA-TC-AGT---AA-TATC---G--A-A-C-CA----CAG----AA--AT--------A---C-------AGT--A-AAT-TA--TG----------A-AG--C----A--AT--TA-T----A--G---C-----A-T-----CA-CAGCA--ATTA-AT--CAG---TA-C-----A-----A---C-A-GT--AA-A-T-A-T---CG--GTAacg
gi|18 : taaaaacttatatagtaacttaaattatttaagttatacaaccaaca--TTT---C--A-A-----A-AA---GG--C--TCA--T-T--T--TGATAATT-T-TCTGTA---C-CTG---AGCCAAC-TAG--TTTGCA----AC-TG-GC--GAA---TG-C-AA-G------TCG---A-TCG-CAAG-GCT--A-G---------------------GAT-AGC---TAGCAA--T--------TTA---------A--C-A-C----T-TC--CCGA-G-T-A---CT----AG-T----A-ATT----TCA-A-A-GT-A---------CA-T-TATTC-AAT--AAA-TATTA--G--A-A-T-T-----C--AG-TAA--AA--------C---C--CA-G-GTT--A-TA--TA--T--------------G--C----A--GT--TG-T---CA--G---C-----ACC-----CA--AGAA--ATT--AT--TAG---TAAC-----A-----A-----A-AT-AAT-A-G-G-A---CA--GTATA--T-T----A--TAACAG-C---TTA-TT-AG-C-ACCCAGCAAC----A-------------CAAA-----------TTCA---T---A---------ATC-----AT-CAG-----------aacagcaacctatattatttaatcgcaattatccaaaaatgacgcgtcttt
gi|25 : ttgtt-TAC--TTT-CACAGTACATT-AT--C-----AG-T-AA-A------T-----A-TCA-GAAC-CC---ACGA-TA--A--A---AA-CC----AC-AGTAAATATCAG---CA-----ATTATCAGCACCCA--C-AGTA-A-T-TA--TC-A-G-T-A---CC-AACAA-C----A-AATA---TCT-C-A-GT-A---------CT-T-TA-TC-AGT--AAT-CATCA--G--C-A-C-C-----------------A--------A---C-------AGC--ACAA--TA--T-----------C-AG--T----A--TT--TA-T---CA--G---T-----A--------A-AAATGACACT--CT--CAG---TACc
gi|26 : agttagcacattatcagtacccacagAC-A-T---TATCAG--TTA-----AATA---------T--T-AGAA-AAC-CA---C-A-G-T-AAAACC-CACAG-T----A-AATA---TCAAC-A-CC-G---------CA-------C-AGC--AAT-TACCA--G--T-A-C-C-----AACAG-TAA--AATCTCAGTAA---T--TA-TCAGC--ATAA--TA--T-----------C-AG--T----G--AT--TA-T---CA--G---attttgcgtccagt
gi|39 : ctcagaacccacactattttcacagtAC-AAT---TATCAG--C-------ACCC---------A--C-AACA-A-T-TA--TC-A-G-C-A---CC-AACAG-C----A-Ctcaaatgacactttcagtaaatttcccgtcca
gi|28 : atgtaaT---TATCAA--AGA-----ACAA---------A--C-AA-A-A-T-AA--TC-A-A-T-A---CC-AACAG-TTAAAA-CAT--------C-T-GT-A----------A-T--A-TC-AGC--AAT-TAGCA--G--T-A-C-CAACAGCAGAA-TAA--GA--------A---T--GA-T------------TG--T-----------C-GG--C----A--TT--TA-T---CA--G---C-----Aaa
gi|30 : ---TATCAG--T-A-----ATTA---------A--C-CGAA-C-T-TA--TC-A-G-T-A---CC-AACAA-TA---A-CAT----TTA---A-TT-T---------AA-T-GA-TC-AGT--AAA-aattaatgatctttttatattttccatcc
gi|19 : -----ATTA---------T--C-AGCA-A-T-TC--TC-A-G-T-A---CC-CACAG-T----A-CTT----TTA-C-A-TT-A---------CT-T-AA-TC-A-T--AAA-TATCA--G--A-A-C-C-----CACAG-TAG--AA--------T---C--CA-C-AGA--A-AA--TA--T-----------C-AG--C----A--AT--TA-T---CA--G---C-----ACC-----CA-AAGCA--ATC--AT--CAG---TACC-----A-----A---C-G-GT-AGA-A-T-A-T---CA--TTACC--T-T----A--T------T-GA----TC-AG-C-ACCAAC-AGC----ATACAATCAGTAATC--A-----------T------TATCA---------ATT-----AT-CAG-----------T------AAA-AA---T-GA-CA---C--TGAGTACATTTTaaaaaaaatgacactctcagtatattatctgtccagt
gi|25 : ttgcgaggttgccttagtaatcccttgaaatctatctacat-AGCACA-T-TA--TC-A-G-T-A---CC-CACAG-T----A-CTT----TCA-C-A-GT-A---------CA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCA--G--A-A-C-C-----CACGA-TAA--AA--------A---C--CA-C-AGT--A-AA--TA--T-----------C-AG--C----A--AT--TA-T---CA--G---C-----ACC-----CA-CAGTA--ATT--AT--CAG---TACC-----A-----A---C-A-AC-AAATA-T-C-T---CA--GTACT--T-T----A--T--CAG-T-AATCA-TC-AG-C-ACCAAC-AGC----A-------------CA-A-----------TATCAG-T---A---------TTT-----AT-CAG-----------T------AAA-AA---T-GA-CACT-C--TCAGTACATTTTGCGTctgaccagtag
gi|26 : agtt--TC-A-G-A-A---CC-CACAC-T----A-TTT----TCA-C-A-GT-A---------CA-T-TA-TC-AGTT-AAA-TATTA--G--A-A-AAC-----CACAG-TAA--AA--------C---C--CA-C-AGT--A-AA--TA--T-----------C-AA--C----A-------------CC--G---C-----AC----------AGCA--ATT--AC--CAG---TACC-----A-----A---C-A-GT-AAA-A-T--------------CT---------------CAG-T-AATTA-TC-AG-C-A-TAAT-AT-------------------C--A-----------G------T---G---------ATT-----AT-CAG-----------T-------CA-AA---T-GA-CA---CTTTCAGTAAATTTCCCGTccagt
gi|28 : c-TATCAAAG--A-A-C-AAA---CAAAA-TAATCAAT-------A---C--CAAC-AGTTAA-AA--CA--T-----------C-TG--T----A--AT---A-T---CA--G---C-----A-----------------ATT--AG--CAG---TACC-----A-----A---C-A-GC-AGA-A-T-A------A--G-AATGAT-T----G--T--CGG-C-ATTTA-TC-AG-C-Acca
gi|16 : tA-T-AGC--A-AT--TA--A-----------T-AG--C----A--AT--TA-T---CA--G---T-----ACG-----CA-CAATAC-ATT--AT--CAGTAATATC-----GAACC-A---C-A-G---AA-A-T-A-----CA--GTAAA--T-T----A--TG-AAG-C-AATTA-T--AG-C-ATC-AC-AGC----A----------------A-----------T------T---A-----------------AT-CAG-----------T------ACA-Aaattaatgatctttttatattttccatcc
gi|5 : taaaaacttatatagtaacttaaattatttaagttatacaaccaacaaaatatctatatatatcagaaaacaagatttttgaaacaagtttctttttaactatggccttatttgattttaaccgagacatttggcacacggccacaagcttaagcgagtggatacgcctcggcagtt-AGC--G-AA--T---T-----------C-AG--CCTGGA--GT--TA-T---CA--G---C-----ACCAAAAACA--AGCA--ATT--AT---AG---TACC-----C-----A-----A-GT-T-----T-A-TTCACAT-GTACA--T-T----G--T--CAG-T-AAATA-TC-AG-A-ACCAcagtaaatatcggtaaacagcaacctatattatttaatcgcaattatccaaaaatgacgcgtcttt
gi|9 : ggaattctaccgtgctgcgagaaaaacattttaattcgatcattggaatatcaatgttgtcagacagaccgattaacggtttaaatgatgcttttttcttccaaatattcgtatcacatgtgattgttagatgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaatcatttcatattcattcacatcacttacataaaatgcccaattctagatttattatgataatttgacagttaattgtaagaatattttatggaagaaattaaagatgatcattaaataaatctgcgaaaagtttgttcaaaacaatatgtagttttggctctcgtggaattatctactacatatagctaagaatatatgcaatatcagaaaaaaaaaaatttaaaagaatatcgtttttataaaaacgccttaattcattcttattactaaacacatttgcacacgcctgcaagtatcacaaggcg--A-GA--TA--T-----------C-AG--A----C--AT--TAAT---CA--G---C-----A-----------------ATT--AT--CAG---TACC-----G-----C---CCA-AT-TAA-C-T-T-T---CACAGTACT--TAT----A--T--CAG-TAAAATA-TC-AG-TAACCA---ATT----A-------------T--A------------------T---A---------ACT-----AT-TAGA----------T------GAA-Acaataaaaacaacagtatatatatctagaagaccagcaaatcatcacagtaattagatgagtaccatcagtaaatatcataattcagccaaaacagtcacaaatcaacaagtatcagt
gi|39 : attcaaatactaaatatccgtatcacatgtggatatgcctttttaaaaaatttattcactacatatcaacattcacattagtaccatgttcaatattgctaatttattatgttatctaaacttgatttaaaagaatatttttatggaataaaataagataagacatcaaaaaaaatctgtcaaacaaaccaggttttcttcaacaacatatatggtgtttggatcgttgggaattgttgcaatattgcctgcaaatcaataatgcgatatcagaaaacaaaaattgttaaaaaaaaaaaaaaaaattgtttttaaaaaacggccttatcgttgattttttacctgaagacaatttgcacacggcccgcaagtcggatcgcgagggcggagcgataagcctcggacA--TG--T-----------A-AA--C----A--AT--TA-T---CA--G---C-----ACC-----CA-CAACA--ATT--AT--CAG---CACC-----A-----A---C-A-GC-ACA-A-tcagcatacccacattgattgatctaa
gi|30 : --TA--T-----------C-AG--T----A--AT--TA-------------------ACC--------GA--A--CTT--AT--CAG---TACC-----A-----A---C-A-AT-AAC-A-T---T--------TAAT--T-TAATGA--T--CAG-T-AA
gi|9 : A--T-----------C-AG--C----A--AT--TA-T---CA--GTACC-----GCC-----CA--ATTA--ACT--TTCACAG---TACT-----T-----ATATC-A-GT-AAA-A-T-A-T---CA--GTAaaaaaaaaatgacactctcagtatattatctgtccagt
gi|2 : attcaaatactaaatatccgtatcacatgtggatatgcctttttaaaaaatttattcactacatatcaacattcacattagtaccatgttcaatattgctaatttattatgttatctaaacttgatttaaaagaatatttttatggaataaaataagataagacatcaaaaaaaatctgtcaaacaaaccaggttttcttcaacaacatatatggtgtttggatcgttgggaattgttgcaatattgcctgcaaatcaataatgcgatatcagaaaacaaaaattgttaaaaaaaaaaaaaaaaattgtttttaaaaaacggccttatcgttgattttttacctgaagacaatttgcacacggcccgcaagtcggatcgcgagggcggagcgataagcctcggacagatatcagacatta--T-----------C-GG--C----A--ATAATG-T---CA--G---CCAATTACT-----CA--AGTA----T--AC--CAA---TACT-----GTTTCCA---C-A-GT--------------------CACT--T-T----A--T--CAGTT-AATTCATCAAG-C-AACAAACAGC----A-------------C--A-----------G------T---ATTCTAGTACATT-----AT-CAG-----------C------AAaccaattatataactattagatgaaatcagcatacccacattgattgatctaa
gi|39 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagatagaccaccgcgccgacaaccaaggttattttgcagactaagtcaaaacatgattgttgcttctttaaagaaaatatttttattcttaagttatatatcttaataatacgaacgatatcataggttgaagaagccctggacccactgtagatcgtaatcggaattactgatcgtgtcgaaaaacatttaagtcttaacattggataatacatagtatattggtcttgcagactaaatgttccgattaacgattttaaatgaatgatttttctcccaatattcgaatatacatagtgtgttgtgtagaactgcactacttttcatcaaaaatcattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatctgtatgtataaatacttataatatccagtacgcacatgtgaattcattctaaagaattttcataacattttctatatcaaattcacattagtaccatcttcaatattgcaaattatttaacattgaatcttaagaattcaattttttataggacaaaagagaataaaatagaccattaaattaaaatctgtccaaagacaggtgtgtcttcaaaaacatatatcagtgtttggtagtcgttggaatcgttctcaaatctgaaaaatcataaggttgcatatcgagataagaccaaaaatttaaaaaaggaaaaaaatatctgttttaaacgacctgctttatacatttgatcttatacctgagaacacaattgcgacacgtgcccgcaagtcatcgcaggagctcgagcgatacagccAA-T-T-A-T---CA--GCACC--C------A-----CAA-C-AATTA-TC-AG-C-ACCAAC-AGC----A-------------C--A-----------t
gi|30 : atgtaaac-T-A-T---CA--GTAAT--T-A----A--C--C-G-A-ACTTA-TC-AG-T-ACCAAC-AAT----AA------------C--A-----------T------TT--A---------ATTTAATGAT-CAG-----------TAAAAAAAAA-AA---T-GA-CACT-C--TCAGTATATTa
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TGTTAACTTCGCCTTTTTGTATAGTATTGATCTATGATCAATAGCGTGAAAGGAGACATTCGATTAGAATTTATT
Unaligned ( gi|35 ): GAACAAAAAAGTTTTTTAAAAAAAACGACCTAATCTTGATTTTTCACCTGAGACACATTTGC
Unaligned ( gi|37 ): GATGTTACTGGTATCTTGAATCTTCTCGATATATTGAGAATCATATTTACATGTGTATA
Unaligned ( gi|42 ): ATGTTAACTTCGCCTTTTTGTATATTAGCCTGTGATTCATAGCA
Alignments
lowQualScore : 1 111111 1111 222222222 1111 22222222222222 3333333333333 4444444444444 1 33333 1111 11 44444444444444444444444444444444444444444444 4444444444444444 111111 3333333333333333333 1 1111 11111 22222 22222222222 1111 111111 1111111 3333 6666666666666666666 2222222222 333333333333333333 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222 2222222 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222222 111 11111111 44444444444444444444444 1111111 222 1111111111111 11 1111111 2222222222222222222 111111111 1111111111111 11 11111111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111111111 111
lowQualScore : 0 3 555555 5 5 0000 2 000000000 5 0000 5 99999999999999 5 3333333333333 77 2222222222222 0 11111 4444 6 999 33 8 66 4 66 777 55 4 44444444444444444444444444444444444444444444 9999999999999999 4 111111 1 4444444444444444444 4 66 0 2222 22222 55555 66 5 66666666666 0000 4 888 66 1 4 66 55 7 777 4 4 55 99 3 333333 1 6666666 4 4 0 9999 4 8 777 4 8888 4 5555 4 4 4 7 6666666666666666666 5 8888888888 77 111111111111111111 1 6 0 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 888 5 4444444 4 4 4 3 2222222 4 4 7777 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9999 44 55555 44 3 1 3 3 333 44444444 666 55 3 77 44 111 77777 1 77 0 5 666 44444 0 2 2 555 2 33 3 3 3 2 2 2 33 5 8 33 33 2 2 2 2 2 2 2 5 2 66 5 666 5 2 2 2 2 66666666 33 6666 2 4 2 2 333 2 9999 55 333 22222222222222222222222 2 555 55555 55555 2 333 88 4444444 2 22 77 2 2 666666 22 22 88 333 2 555 22 2 2 2 777 555 22 33 2 2 2 33 999 2 2 4 5555555555555 4 444 33 77 2 444 66 5 2 2 2 1111111 2 2 6666666666666666666 2 4 33 2 2 2 2 2 2 666 2 4444 2 2 2 111111111 33 2 2 2 99 2 77 2 666 333 2 2 333 33 333 55 22 4444444444444 55 22 333 55 22 77777 4 1 00 1 2 7 2 4444 2 2 44444 33 444 2 2 2 11111111111 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 66666 2 2 333333 66 1111111111 2 2 111 1
lowQualScore : . . ...... . . .... . ......... . .... . .............. . ............. .. ............. . ..... .... . ... .. . .. . .. ... .. . ............................................ ................ . ...... . ................... . .. . .... ..... ..... .. . ........... .... . ... .. . . .. .. . ... . . .. .. . ...... . ....... . . . .... . . ... . .... . .... . . . . ................... . .......... .. .................. . . . . ............................................................. . ... . ....... . . . . ....... . . .... ...................................................................................... .... .. ..... .. . . . . ... ........ ... .. . .. .. ... ..... . .. . . ... ..... . . . ... . .. . . . . . . .. . . .. .. . . . . . . . . . .. . ... . . . . . ........ .. .... . . . . ... . .... .. ... ....................... . ... ..... ..... . ... .. ....... . .. .. . . ...... .. .. .. ... . ... .. . . . ... ... .. .. . . . .. ... . . . ............. . ... .. .. . ... .. . . . . ....... . . ................... . . .. . . . . . . ... . .... . . . ......... .. . . . .. . .. . ... ... . . ... .. ... .. .. ............. .. .. ... .. .. ..... . . .. . . . . .... . . ..... .. ... . . . ........... . ................................................................. ... ..... . . ...... .. .......... . . ... .
lowQualScore : 0 2 888888 0 0 6666 2 000000000 0 6666 7 44444444444444 7 3333333333333 99 2222222222222 0 00000 2222 7 222 88 9 11 4 33 888 66 4 00000000000000000000000000000000000000000000 9999999999999999 4 555555 0 7777777777777777777 4 11 0 0000 55555 11111 99 0 11111111111 4444 4 999 11 9 4 11 55 1 888 0 0 55 55 2 222222 0 4444444 0 0 7 4444 4 9 888 4 5555 4 3333 4 4 4 3 7777777777777777777 7 1111111111 99 777777777777777777 0 7 8 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 555 0 3333333 4 0 0 4 5555555 0 0 4444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888 33 11111 66 3 6 3 3 888 33333333 444 00 3 99 66 555 77777 4 88 8 1 222 66666 8 9 9 000 9 99 1 1 1 2 5 7 77 3 0 44 44 5 5 5 5 5 5 5 0 5 99 0 999 0 5 2 2 2 11111111 11 9999 2 4 2 2 999 2 2222 33 999 00000000000000000000000 1 888 33333 33333 1 555 88 0000000 0 88 55 0 0 999999 88 88 88 555 1 888 99 1 1 1 666 888 00 11 2 2 2 11 111 2 2 4 2222222222222 7 111 22 00 4 111 99 0 5 5 5 0000000 5 5 6666666666666666666 4 7 11 2 2 2 2 2 2 999 2 7777 2 2 2 111111111 22 2 2 2 77 2 55 2 444 999 2 2 999 11 777 00 99 4444444444444 33 99 777 88 99 88888 4 5 66 2 4 1 4 7777 4 5 99999 11 444 5 5 5 99999999999 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444 22222 5 5 333333 88 6666666666 9 9 888 0
consensus : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-T----AGTTC-TTT----T---------TT-TGC-C-----------GAAA--AC-----A-------ATT-TGCGTG---ACC----ACCGCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAG---AAATC-AAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TT----------TN-----TTTTTA-----NAA--------T-TATT------TATTT------T------T-A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GA--CA-TGT-----A-----TTA-TC-G-AATT-T--ATCGTG-T--CG--AAAAAAACA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGAT-----ATANTAN------T-A-TTTGT----C-AGAC-A---GT-CCCGATTAA----CGATTTGA-AATG-N-T-GC-TTTTT-CTCCCAAATATTCGTATG------CAC-CGTATACAT-GTG--------T-TTG--TGTA-----GGA--GGNGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATATCCCGTT-ATCA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC------AT-T--CA---CTT-N-T---ATATCA-CA-TTCA---A---CATTCAAGTAC--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-CA--T---TTGCA--C-AC-G-GC--C--CG-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GA-GCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-CA--ATTA-N-C-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACAG-TAA-AAA---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
Reference ( family-1808 ) : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-T----AGTTC-TTT----T---------TT-TGC-C-----------GAAA--AC-----A-------ATT-TACG-----ACC----ACCGCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAG---AAATC-AAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TT----------TN-----TTTTTA-----NAA--------T-TATT------TNTTT------T------T-A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GA--CA-TGT-----A-----TTA-TC-G-AANTNT--ATCGTG-T--CG--AAAAAAACA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGAT-----ATANTAN------T-A-TTTGT----C-AGAC-A---GT-CCCGATTAA----CGATTTGA-AAT--N-T-GC-TTTTT-CTCCCAAATATTCGTATG-G----CAC-CGTATACAT-GTG--------T-TTG--TGTA-----GGA--GGNGTGGCTTTCNT-CAAATAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGCTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATATTCCGTT-ATCA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC------AT-T--CA---CTT-A-TA--ATATCA-CA-TTCA---A---CATTCAAGTAC--A-AACATGTN-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C---T---TTNNA--C-AC-G-GC--C--CG-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GG-GCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-CA--ATTA-A-C-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACAG-TAA-AAA---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTNCGT
gi|1 : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCA-GATT----CTGAGCC---------TT-T----AGTTC-TTT----T---------TT-TGC-C-----------GAAA--AC-----A-------ATT-TACA-----ATC----ACCGCACCA-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAG---AAAGC-AAA-CAC----G-T-TG---T-ATT-----T-TT----------TG-----TTTTTA-----TAA--------T-TATT------TTTTT------T------T-A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCTGTTCGA--CA-TGT-----A-----TTA-TC-G-AAATAT--ATTGTG-T--CG--AAAAAAGCA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGAT-----ATAAAAC------T-G-TTTGT----C-ATAC-A---GT-CCCGATTAA----CGATTTGA-A----C-T-GC-TTTTT-CTCTCATATATTCATATG-AACCCCATTCGTATACAT-GTA--------T-TTG--TGTA-----GGG--GGGGCGGCTTTCATGCAGATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGGTA--ATCTGTAATTTTAAAAAATA-CT-A-AATACTCCCTTCATCA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTG--------TC------AT-T--CA---CTT-A-TA--ATATCA-CA-TTCA---A---CATTCAAGTAT--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATCATGATT-AT-CAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGAGAG-G-CAATAA--A-TTAAATCTGC-TAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTAATAA-AC-A--TA-TGT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTA-G-AAT-T-T-TCT--CA-A---TAT-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-AATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AT-----AGAA-AT---TA--TTTT-A-----AA-AAT--CGG--CC-TTA-T---C--GTGAT--T--TT--T---T-AAGTG---A--G-ACTA-C---T---TTCAA--C-AC-G-GC--C--CG-T-AA-G------TC-G---GTCGG-AAGG---C--AG-ACG-A---G--A-A-CCTCGA-C-AG----T--TA-TC-AG--T-CA--ATTA-A-C-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CAGAG-TAA-AAA---C--CATAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAG-AGTAATT--ATCAGTACCGACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TCTC-AG-CA-CCAA-----------GAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTCAGTACATTTTGCGT
gi|10 : TTCAAAATAC-AATTA-TAT-TATGTGGTT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCT--CA-AATTTAT-TC-TG-A-AA--TCA--------ATTAA----T-G--A-TATC-AG---AA-AA----C--AAACAGA----T--TTGTAAA---------A-A---A-----AA-----AAAA-AA---TG--TTTTGA-----AA-AAA--C-G--CC-TTA-T---CCTTTGAT--C--TTA-T---T-ACCTG---A--G-AC-A-CA--T---TTGCA--C-AC-G-GC--CT-CGCC-AA-G-------G-G---ATCGC-AGGG---C--GA-GCA-A---CTAA-G-CCTCGG-C-AG----A--TA-TCTAA--C-C----------C-CCCA-ATCTACTTC-A---T-ACC-CACAG-T---A-TCTATCCTCA-CTA-GT---------AC--T-TA-TC-AGTGAAAG-TA-CAGATA-A-C-CCATCACAG-T-A-AAA---C--CACAATAAACTA--TA--C-----------C-ACC----TA--AT---CA--GT--ACCTTTCACAC-AGTACTT---TC---------------------A-C-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---ATTC-AGTCA-CCAA-----------CAA-CCACAA-------------T--A-----------TCAGA-T---A----A----------------C---T-----TT-CAG-T------AAA--A------ATACT-GACCACC-TCTCAGTACACTTT
gi|11 : TTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TGG-TTG-A-AAT-T-T-TTT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GT-A-TATC-AG---AT-AA----AT-AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-A-----G--TTTT-A-----CA-AAA--CGG--AC-TTA-T---T--TTGAT--T--TC--T---T-ACATA---A--A-AC-G-C---AA--TTGCA--C-AC-T-GC--C--TG-C-AA-G------TC-G---ACTGC-AAGG---C--GA-ACG-A---T--AAG-CCTCAG-C-AG----A--TA-TC-AG--C-----------------A-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----CCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-A---CACAG-TAA-AAA---C--CACTGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ACT--GT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GTAAAA-A-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AGAT-A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTtt
gi|12 : TTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCAATATATACAT--A----T-GT-A-TATG-AG---AA-GA----A--GAA---A-----------------------A-A---A-----AATGAGGGAAA-AT---TGA-ATTT-A-----AA-ATA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AT-A-CA--T---TTGCA--T-AC-G-GC--C--------------------------CGC-AAGG---C--GA-GCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TC-T--------CA--ATT----C-------T-TC--TC-A-G-T-ACC-TACAG-T---A-CAT----TAT-C-A-GTAAATTACTGATA-T-TA-TC-AGTA-AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACTG-TAA-ATA---C--CACAGTAA---A----------------------------T--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCATTT--ATCAGAATCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACT--------------T---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAA--AAA--A------A---T-GA-CA------CGGTACATTTTCCGTccagt
gi|13 : --TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCTTCCA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----TCGC-ATTATC-AGAAAAA-AA----A--AAA---A----TTAC-----GT--------ATA---A-----AA-----ATAA-AT---TGCCTTTT-ATATATAT-AAA--CGGGCCT-TTATT---C--TTGAT--T--TT--T---T-GTTTGCTTA--G-AC-A-CA--T---TTGCA--CAAC-G-GCCTC--CG-C-AATGTTTTCCTC-GATCATCGC-AAGG---CTTAA-AC--A---T--A-GCCCTCGG-C-GT----T--TA-TC-AG--C-CAACATTA-T-CAAGCA-AT-TA--TC-AGG-TAACC-CTCAGCT---ACCTT----TTA-C-A-GT---------ACATT-TA-TCAAGT--AAATTATCAG--ATACC-C---CACAGTTAA-AAA---A--CACAGTAA---GATTA--T-----------CAAGCA--ATT--ATTCGCATTGC--ACC-----CACAAGTAATTAAATTAGTACCAATA-GT-AAA-A-TAGT-CAGTACTTTcaag
gi|14 : T-CAAGA---A-CCAGA-T-A-T-TTTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GA-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCAATATTTACAT--A----T-GT-A-TATC-AG---AAGAA----A--AAA---A----T------------------A-G---A-----GG-----GAAA-AT---TGA-TTTT-A-----TA-ATA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-CA--T---TTGCA--C-AC-G-GC--C--------------------------TGC-AAGG---C--GA-GCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C---------------GC---T-TC--TC-A-G-T-ACC---------------------TA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACTG-TAA-ATA---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCAATT--ATCAGAACCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACTTTA--T--CAA-------TATC-AG---------------------------------------------------------------T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAAAAAAA--A------A---T-GA-CA----CTCGGTACATTTTCCGTcttttcagttaa
gi|15 : gaatAGATA-CT-A-AATAT-CCGTT-ATCA-CATTGTGGA---ATGC-------TTTAAAAAT--TC------AT-T--CA---CTT--------------CA-TTCA---ATTCCATTTA-GTAC------CATGTC-A-A-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT--T-TAA-A-C-ATTG-AATTT---AA--GAAT-AATT--TTT---ATGG-----AAAAAAAACAAAGATAG-A-CATTTA--A-TAAA-TCTGT-CAA-A---A-C-AGG-T-T-T-CTTCAAAA-AC-G--TA-TATGAGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AATAT-G-TTG--CATA---T-T-GC-TG-A-AA-A--A--------A---A----T-GC-A-TATC-AG---AA-AA----ACAAAA---A----T--T-----GT--------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-TT----AA-AAA--CGGG-CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTA---ATGG-AC-A-CA--T---TTGCACCC-AC-G-G---C--CG-C-AA-G------TC-G---ATCccag
gi|16 : ttc-A-AATATCT--------AT--A----T----A-TATC-AG---AA-AA----C--AAG---A----T--TTTT--G---------A-A---A-----CA-----AGT---T---TC--TTTT-T-----AA-CTA--TGG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TT--------AACCG---A--G-AC-A-T---T---TGGCA--C-AC-G-GC--C---A-C-AA-G---------------CTT-AAG----C--GA-GTGGA---T--ACG-CCTCGG-C-AG----T--TA-T--AG--C--A--ATTA-A-T-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-AC------G---------------CA-C-A-AT---------ACA-T-TA-TC-AGT---AA-TATC-G--A-A---C---CACAG--AA-A--------TACAGTAA---AT-TA--TG----------A-AGCA--ATT--AT----A--GC--A-T-----CAC-AGCAATTA-ATCAGTA-CAACA-GT--AA-A-TA-T-CGGTA----A--A--CAGCAACCTATATT-AT----TTAA-----------TCG-C-------------------------------------------A----A----------------T---T-----AT-C---C------AAA--A------A---T-GA-CG-CGTCTtggggttcttttctccatcaatgattacaat
gi|17 : taaaaacttatatagtaacttaaattatttaagttatacaaccaacaAGAT-TAGCG-GACTGGGTTTG-GTT---------TTGT----TGTTT-TGT----T---------TT-TGT-CTTTATTTCGGGAAAA--ACCTCCGA-------ATT-TGCGTGATTACATAAAACCG-GC---AC--C----A-T--ATT-TT-CAG---AA--C-AAA------------TG---T-ATT-----TATT----------TT-----TTTTTA-----AAA--------T-AATTCTATGATATTTAG----T------T-A---A-TA-G---CGAT-TT-------GA-----C-------GA--CA--G------A-----TTA-TCTG-A----T--ATCATGGT--CG--AAAAAA-CA---T-CTAATTAT--A--CATTGTAT------TACTAT------T-A-TTTGT----C-CAACGA---GT-CCCGATAAA------ATTTGA-AATC-G-T-GC-TTTT---TTCCAAATATtt
gi|18 : tacgtcaaagtgatctctgtatacgaattattaacgtctcgggaagctcaT---TG--TTTT-T-----CA-AAA--AGG--C--TCA-T---T--TTGATAAT--TT--TCTGT-ACCTG---A--G-CC-AAC---TAGTTTGCA----ACTG-GC--GAATG-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--TA-G-G-A---T--A-G-C---------------------T-AG--C-AA--TTTA-A-C-A-C---T-TC--CCGA-G-T-AC----TAG-T---A-ATT----TCA-A-A-GT---------ACA-T-TATTC-AAT--AAA-TATTAG--A-A-T-T-----CAG-TAA-AAC---C--CAGGTTAT---A--TA--T--------------GCA--GTT--GT---CA--GC--ACC-----CA--AGAAATT--ATTAGTAACAA-A-AT-AAT-A-GG-A-CAGTATATTA--TAACAGC--T---TATT-AG-CACCCAG-----------CAA-C----A-------------CAAA-----------TTCA--T---A----A----------------T---C-----AT-CAG-
gi|19 : --ATTA-T-C-AGCA-AT-TC--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TTA-C-A-TT---------ACT-T-AA-TC-A-T--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACAG-TAG-AAT---C--CACAGAAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAA-AGCAATC--ATCAGTACCAACG-GT-AGA-A-TA-T-CATTACCTTA--T--------T---GATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----ATACAATCAGTAATC--A-----------T-----TATCA----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTGAGTACATTTTCTGc
gi|2 : ttgcgaggttgccttagtaatcccttgaaatctatctacatG-----ACC----ACCGCGCCG-ACAACCAAGGTT--ATT-TTGCAGACTAAGTCAAAA-CAT----GAT-TGT--T-GCT-----T-CTTTAAAGAAAATA-----TTTTTATTCTTAAG--------T-TATA------TATCT------T------A-AT--AATA-CGAACGATATCATAGGTTGAAGAAGCCCTG---GACCCACTGT-----AGATCGTAA-TCGG-AATTACTGATCGTG-T--CG----AAAAACA--TT-TAAGTC-TTAA--CATTGGATAATACATAGTA-------T-A-TTGGTCTTGC-AGACTAAATGT-TCCGATTAA----CGATTTTA-AATGAA-T-GA-TTTTT-CTCCC-AATATTCGAA--------------TATACATAGTG--------TGTTG--TGTA-----GAACTGCACTACTTTTCAT-CAAA-AATaccagtag
gi|2 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagata--ATCTGTA-TGT--ATAAATA-CTTATAATATCCAGTA-CGCA-CAT-GTGAATTCATTCTAAAGAATTT--------TC------ATAA--CA---TTT-T-CT--ATATCA-AA-TTC----A---CATT--AGTAC------CATCTT-CAA-TATT--G--CAAA--TT-ATT-TAA-C-AT-TGA-ATC-TTAAGAATTC--------AAT-T--T--TTT---ATAGGACAAAAGAGAA-TAAA-ATAG-ACCATTAA--ATTAAAATCTGTCCAA-A---G-ACAGG-TGTGT-CTTCAAAA-AC-A--TA-TATCAGTGT--TT--GG-T-AGTCG-TTG-G-AAT-C-GTTCT--CA-A----AT--C-TGAA-AA-ATC---------AT--AAGGTT-GC-A-TATCGAG---AT-AAGACCA--AAA---A----T--T-----T---------A-A---AAAAGGAA-----AAAA-ATATCTG--TTTT-A-----AACGAC--CTG--CT-TTA-TACAT--TTGAT--C--TT--A---T-ACCTG---A--GAAC-A-CAA-T---TGCGA--C-AC-GTGC--C--CG-C-AA-G------TC-----ATCGC-AGGAGCTC--GA-GCG-A---TACA-G-CCTCGG-C-AA----TAATG-TC-AG--C-CA--ATTA-C-T---CA-AG-TA---------T-ACC-AATAC-T---G-TTT----CCA-C-A-GTC--------ACT-T-TA-TC-AGT--TAA-T-TCA---------T---CA-AG-CAACAAA---CAGCACAGT-----A--TT--C-----------T-AGTAC-ATT--AT---CA--GC--Acattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatctgtatgtataaatacttataatatccagtacgcacatgtgaattcattctaaagaattttcataacattttctatatcaaattcacattagtaccatcttcaatattgcaaattatttaacattgaatcttaagaattcaattttttataggacaaaagagaataaaatagaccattaaattaaaatctgtccaaagacaggtgtgtcttcaaaaacatatatcagtgtttggtagtcgttggaatcgttctcaaatctgaaaaatcataaggttgcatatcgagataagaccaaaaatttaaaaaaggaaaaaaatatctgttttaaacgacctgctttatacatttgatcttatacctgagaacacaattgcgacacgtgcccgcaagtcatcgcaggagctcgagcgatacagcctcggcaataatgtcagccaattactcaagtataccaatactgtttccacagtcactttatcagttaattcatcaagcaacaaacagcacagtattctagtacattatcagcaat
gi|20 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagatagaccaccgcgccgacaaccaaggttattttgcagactaagtcaaaacatgattgttgcttctttaaagaaaatatttttattcttaagttatatatcttaataatacgaacgatatcataggttgaagaagccctggacccactgtagatcgtaatcggaattactgatcgtgtcgaaaaacatttaagtcttaacattggataatacatagtatattggtcttgcagactaaatgttccgattaacgattttaaatgaatgatttttctcccaatattcgaatatacatagtgtgttgtgtagaactgcactacttttcatcaaaaatcattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtT-A--T--GCT---ATGA-----AA---AT-TAAAGAAAG-G-CATTAA--T-TAAAATATGT-CA--------------------CTTCATAA-AT-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-AG---AA-GA----G--AA----------------------------A-A---A-----AA-----AATA-AT-------TTCT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-C---C--TTGAT--A--TC--T---T-ATCTG---A--G-AC-A-CA--T---TTGCA--C-AC-G-GC--C--------------------------CAC-AAGG---C--GA-GCG-A---TA-A-G-CCTCGG-A-AG----T--TA-TC-Aat
gi|21 : atgttaacttcgcctttttgtatatatatgatc--AAAAAACCA--TT-TTAATT-T--A--CATTTGAT-----ATACTAG------T-G-TTTGT----C-AGAC-A---GT-CTCGATTAACGATCGATTTGA-AACG-A-T-TC-TCTAT-CTCCC--ATATGCATATATG----CAT-TATGTGCGT-GTG--------T-GTG--TGT-----------GCGGTGGCTTTCCT-CAAATAATTTatatattat
gi|21 : AGAGAGTTC--ATCTGTGATT-----AAATA-CT-A-ATTATCC--TT-AGCA-CAT-GTGAA---GTGC--------TT--------TC------AT-T--CATTTCTT-A-TA--A-------A-TTCA---A----ATTGAA-TAC--ATAAAATGCA-C-A-CATT--aaagagaaagagagagttcatctgtgattaaatactaattatccttagcacatgtgaagtgctttcattcatttcttataaattcaaattgaatacataaaatgcacacatt
gi|22 : aaaaaaccattttaatttacatttgatatactagtgtttgtcagacagtctcgattaacgatcgatttgaaacgattctctatctcccatatgcatatatgcattatgtgcgtgtgtgtgtgtgcggtggctttcctcaaataatttaaagagaaagTGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGACT-AT-TAA-A-CAGTG--AATTT---AA--GAAT-AT-T--TTT---ATGG-----AAGGAAT-TTAAGAGAG-G-CATTAA--A-TAAAATAGGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCAT-A-AC-A--TA-AAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--TA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-GG---GA-AA----A--AAA---A----C--C-----G---------------A-----AA-----AAAT-GT---TG--TTTTAA-----AA-AAA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---
gi|23 : taaat-A-AT-ATAA--------AT--G----T-AC-A-TATC-GG---AA-AA----A--TAA---A-----------------------G-A---A-----AA-----AGTA-AT---T---TTTT-A-----AA------CAG--CCATGA-T---C--TTAAT--T--AT--C---T-ACCTG---A--G-AC-A-CA--T---TTACA--C-TC-G-GA--C--CG-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGA---C--GC-GCG-G---T--A-T-CCTCGG-C-AG----A--GA-TT-AG--C-AC--ATTA-T-C-AGCA-AT--------A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-AA---------ACA-T-CA-TT-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACGG-TAA-AAA---C--CTCAGTAA---A--TA--T-----------
gi|24 : c--CCAATA-T--ATT-T--CAT---AAATC-AAAACAC----A-T--G---T-GAT-----G-TT----------TAG----TTTTTA-----AAAAATTATTTT-TATT------TATTTAATCTTT------T-A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----ACCT----GA--CA-TGT-----A-----TTA-TC-GAAATTAT--ATCGTG-T--CGAAAAAAAAACA---T-TTAA---T--A--CATGTGAT-----ATACTAG------T-ATTTTGT------AGAC-A---GTACCCGATTAA----CGATTTGA-AATGAT-T-GC-TTTTTGCTCCC-AATATT-GTATacg
gi|25 : -AGCACAT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACGA-TAA-AAA---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-AC-AAATA-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---CATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----T----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTaca
gi|26 : agtt--TC-A-G-A-ACC-CACAC-T---A-TTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGTT-AAA-TATTAG--A-A-AAC---CACAG-TAA-AAC---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AACA---------------------CCG----CAC-AGCAATT--ACCAGTACCAACA-GT-AAA-A-T---------CT--------CAGTAAT---TATC-AG-CA-T-AA-----------TAT-C----A-------------G--------------------T---G----A----------------T---T-----AT-CAG-T------CAA--A----------T-GA-CA-C-TTTCAGTAAATTTCCCGTccagt
gi|27 : cGAT-TAGCG-GACT----CTGAGTC----------T-T----AGTTC-TTT----T---------TTATGC-T-----------GAAA--AA-----A-------Acca
gi|27 : cc-AC--CCA-TG-T--ATT-TT-CAG---AAACC-AAA-CAC--------TG-----GTG-----T-TT----------CG-----TTTTTG-----T----------T-TATT------TGTTccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccacccatgtattttcagaaaccaaacactggtgtttcgtttttgtttatttgtt
gi|28 : ccgattagcggactctgagtcttagttcttttttatgctgaaaaaaaccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccTT--AT---CAAAGA--ACA-----AAC-AA-AATA--ATCAATACCAACA-GTTAAA-A-CA-T-CTGTAAT--A--T--CAGCAAT---TAGC-AG-TA-CCAA-----------CAG-C----A-------------G--A-----------A-----T---A----AGAATGATTGTCGGCATT---T-----AT-CAG-C------AAATTA------A---T-GA------TCTTTTTATATTTTCCAT
gi|29 : TT------TATTT------T------C-A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCCG----A--TA-CGC-----AG----TTA-T---------T--ATCG------------------A--TTATTACTG-T--G--C--CGAAC-----CCAGTGT------T-A----GT----C-AGAC-A---GT-CCCGATAAA----CGATTcc
gi|3 : ttAATAAT--ATT-TT--AG---AAAT---AA-CACTGTGA-T-TG---TTGTT-----T-TT----------TAAAATATTTTTA-----T----------T-TATT------TATTT------T------T-A---AAAT-GG--CGAT-T-A---GTTGA-----CCCTG----A--CA-TGT-----A-----TTA-TC-G-AATTCT--ATCG-G-T--CG--AAAAAA-CA--TT-TAAATT-T--A----TTGGTA-----ATACTAGACTAAGT-A-TTTGT----C-AGAC-A---GT-CCCGATTAA----CGATTTGATGAT-------C-TTTTT-CTCCCAAA-----G-ATG-G------C-CGTATACAT-GTG----------TTA--TGT-------GA--TGTGTGACTTTCAT-C-AATAATT
gi|3 : --ATCTGTA--TTCAAA---TA-CT-A-A-TAT-CCGT--ATCAACAT--TGGA---ATGC-------TTTAAAAA---TT------AT-T--CA---CTT-C-----ATATCA-AA-TC-----A---CATTTA-GTAC-------ATGTC-A-A-TAT------------------ATGCTA-AT-TAA-----------------------------------T---ATGA-----AAAAAAT---AAGATAG-A-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAG--T-T-T-CTTCAAAA-AC-A--TA-T-T-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTG--CA-A---TAT-GC-TG-GCAA-ATCA--------TA--A----T-GC-A-ATTC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--T-----GT--------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTTTA-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTG---A--G-AC-A-A---T---TTGCA--C-A--G-G---C--CG-C--A-G------T--G---ATCGC-AGGG---C--GA-GCG-A---T--A-G--CTC-G-C-AG----A--TA-TC-AG-----A--ATTATA-C------AT-TA--T--A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T----TC-AGT--AAA-TATCAG--T-A---C---CACG---AA-AAA---C--CACAGTAG---A--TA----------------AGCAGCATT--AT----A--GT--A-C-----CACAAGTACTT---TCA------------------------CAGTACTTTA--T--CAGT-AT---T-TCAAG-CA-CCGA------------AG-C----A-------------C--AATATCAGTAAGT-----T---ATCAGA----------------T---T-----AT-CAG-T------AAC--A------A---TGGA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcatctgtattcaaatactaatatccgtatcaacattggaatgctttaaaaattattcacttcatatcaaatcacatttagtacatgtcaatatatgctaattaatatgaaaaaaataagatagacattaaataaaatctgtcaaaaccagtttcttcaaaaacatattggtgtttggtatcgttggaattgttgcaatatgctggcaaatcataatgcaattcagaaaaaaaaattgtaaaaaaaaaattgtttttaaaaaacggccttatttgattttgttacctgagacaatttgcacaggccgcagtgatcgcagggcgagcgatagctcgcagatatcagaattatacattatagtacccacagtactttcacagtacattcagtaaatatcagtaccacgaaaaaccacagtagataagcagcattatagtaccacaagtactttcacagtactttatcagtatttcaagcaccgaagcacaatatcagtaagttatcagattatcagtaacaatggacactctcagtacattttgcgtca
gi|30 : aataatattttagaaataacactgtgattgttgttttttaaaatatttttatttatttatttttaaaatggcgattagttgaccctgacatgtattatcgaattctatcggtcgaaaaaacatttaaatttattggtaatactagactaagtatttgtcagacagtcccgattaacgatttgatgatctttttctcccaaagatggccgtatacatgtgttatgtgatgtgtgactttcatcaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttc-TA-T-CAGTAATTAA--C--C-GAACT---TATC-AG-TA-CCAA-----------CAA-T----AA------------C--A-----------T-----TT--A----A----------------T---TTAATGAT-CAG-T------AAA--AAAAAAAA---T-GA-CA-C-TCTCAGTATATTATCTGTca
gi|31 : ----ATCACGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-TAG---AAATC-AAA-CAC----A-TGTGGTTT-GTTTGCTGT-TT----------TT-----TTTTTACTT--TTA--------TGTATT------TTTTT------T------TCA---AATA-TG--CGccagt
gi|32 : tA----CGATTTGA-AAT--TAT-GC-CTTTT-CTTCCAAATATTCGTATG----------------CAT-GTG--------T-ATG--TGT-------GA--GAC------TTCAT-CAAAAAACTT
gi|34 : --ATATCA--A-TTCA-------CATTTA-GTAC------CATGTG-A-A-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAT-A-C-ATtaagagagagagagag
gi|35 : cttc-----G---------A-A---C-----AA-----AAAA-GT---T---TTTT-A-----AA-AAAAACGA--CC-TAA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-CA--T---TT
gi|36 : GAAGTCTAAACAATGGAAAACC-CAGAT-TAGCG-GACT----C-AAG-C---------TT-T----AG----TCT----G---------TT-TGC-C-----------GAGA--Agc
gi|38 : T---ATGG-----AAGA----TAAAGA--G-T-CATTAA--A----AATATGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-
gi|39 : ---A--TG--T-----------A-AACA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AACAATT--ATCAGCACCAACA-GC-ACA-A-
gi|4 : GGAAGTC-AA--------------CAGAT-TAGCC-GGCA----CTGAGCTCTGGTTTGTTT-T----AGTTT-TTT----TGTTTTTGTTTT-TGG-G-----------GAAA--AC-----ACCCCCGAATTATGCGTG---ACT----ATCAAACCGGACGATCAATA-T--ATT-T--CAG---AAAT--AAA-CAC----A-T--G---T-GTT-----T-TA----------AG-----TTTTTA-----AAA--------A-TATT------TATTT------TATTTATT-ATTTAATA-GG--CGAT-TT----GTTTA-----CCCTG----A--CA-TGT-----T-----TTAATC-G-AATT-T--GTCGTG-T--CG--AAGAAAACAAACA-TTAATT-T--A--C-TTGGAT-----A--ATAC------T-A-GTTGT----CCAGAC-A---GT-CC-GATTAA----CGATTTGA-AAT--A-TTGC-TTTTT-CTCCCAAATAT-------------CAC-TGTATACAT-GTGTGTGTGACT-TTGCATGCAATATTGGA--GGNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---AGATATCATCT-TAAATTTAAAA-----CT-A-A-TAT-CCGT--ATCA-CAT-ATGGA----TGC-------TTTAAGAAAATTCCA----ATAT--CA---CTT-C-----ATATCA----TTCA-------CATT--AGT--------CATAT----A-TATT--G--CTA---TT-AT-ATGATT-AT-TACCA-T-TTGA-ATTTA---AA--GAAT-A--T--TTTT--ATGG-----A-GAAAA-TAAAGATAG-A-CATTGACAA-TAAAATCTGT-CAA-A---ATCCAGGGT-T-T-CTTC-TAA-AC-A--TAATAT-AAGGT--TT--GG-T-T-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTT--TA-AA--TA--GC-TG-A-AA-ATCA--------CT--A----T-GC-A-TATC-AG---AA-AA----A----------------C-----G---------A-T---A-----AA-----AAAA-A----TG--TTAT-G-----AA-AAA--CGGATCC-TTA-T---C--TTGAT--G--TT--T---TAACCTG---A--G-AC-A-CTAAT---TTGCA--C-AC-G-GC--C--CG-C-AATG------TC-G---ATCGC-AGGG---C--GA-GGG-A---
gi|40 : tacgtcaaaggttggtatctccgttgaattccaatataaatttgtagcactcttaGGGAGTC-AAACACTGGATA-CTACAGCTGTAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-T----AGT
gi|41 : GAT-TAGCGTGACT----CTGAGTC---------TT-T----AGTTCTTTT----T---------TT-TGC-T-----------GAAA--A
gi|5 : -G-AATTCT--ACCGTG-CTGCG--AGAAAAACA--TT-TTAATT-C--GATCATTGGA------ATATCAA------T-G-TT-GT----C-AGAC-A---G--ACCGATTAA----CGGTTT-A-AATG-A-T-GCTTTTTT-CTTCCAAATATTCGTAT---------------CACAT-GTG--------A-TTG--T-TA-----Gaa
gi|5 : g-A-TC--ATTTCA-TA-TTCATTCA---CAT-CACTTAC--ATAAAATGCC-C-A--ATT-----CTAGATTT-ATTATGATA-AT-TTG-A-CAGTTA-ATTGT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGATGA-T-CATTAA--A-T-AAATCTGC-GAA-A---A-----G-T-T-T-GTTCA-AA-ACAA--TA-TGT-AGT-T--TT--GGCT-C-TCG--TG-G-AAT-T-A-TCTACTACA---TATAGC-TA-A-GA-AT----------AT--A----T-GCAA-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A-----------------------A-ATTTA-----AA-----AGAATAT---CGT-TTTT-AT----AA-AAA--C-G--CC-TTA-----A--TTCAT--T--CTTAT---T-ACT-----A--A-AC-A-CA--T---TTGCA--C-AC---GC--C--TG-C-AA-G------T------ATCAC-AAGG---C--GA-GCG-AATTC--A-G-CCT-GG---AG----T--TA-TC-AGCAC-CA--A-AA-A-CAAGCA-AT-TA--T--A-G-T-ACC-CA-AG-T---T-TAT----TCA-C-ATGT---------ACA-T-TG-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A---C---CACAA-TAA-AAA---C--AACAGTAT---A--TA--TATCTAGAAGACC-AGCA--A----AT---CA--------T-----CAC-AGTAATTAGATGAGTACCATCA-GT--AA-A-TA-T-CA----------------TAAT-----TC-AG-CC-AAAA-----------CAGTC----A-------------CAAA-----------T-----C---A----A----------------CAAGT-----AT-CAG-T------atgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaatcatttcatattcattcacatcacttacataaaatgcccaattctagatttattatgataatttgacagttaattgtaagaatattttatggaagaaattaaagatgatcattaaataaatctgcgaaaagtttgttcaaaacaatatgtagttttggctctcgtggaattatctactacatatagctaagaatatatgcaatatcagaaaaaaaaaaatttaaaagaatatcgtttttataaaaacgccttaattcattcttattactaaacacatttgcacacgcctgcaagtatcacaaggcgagcgaattcagcctggagttatcagcaccaaaaacaagcaattatagtacccaagtttattcacatgtacattgtcagtaaatatcagaaccacaataaaaacaacagtatatatatctagaagaccagcaaatcatcacagtaattagatgagtaccatcagtaaatatcataattcagccaaaacagtcacaaatcaacaagtatcagt
gi|6 : ggaattctaccgtgctgcgagaaaaacattttaattcgatcattggaatatcaatgttgtcagacagaccgattaacggtttaaatgatgcttttttcttccaaatattcgtatcacatgtgattgttagatgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaAGA-GATTC--ATCTGTAATT-----AAATA-CT-A-GATATCC--TT-ATCA-CAT-GGTGA----TGC-------TT----------C------AT-T--CA---CTT-C-----ATATCA--A-TT-----A---CATTTAA-TAC--A-A---TGTC-A-A-CATT--G--C-AA--TT-ATTATGATTTAT-TAA-C-A-TTGA-ATTTT---AA----AT-A--T--TTT---AAAG-----GAAAAAA-TAAAGATAG-G-CATTAA--A--AAAATCGTT-CAA-A---A-GCAG----T-T-TTTCATAA-AC-A--T----T-AGTGT--TT--GG-T-A-TC--TTG---AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT--C-TG-A-AA--TCA--------TA--A----T-GC-A-TATC-AC---AA-AAC---A--AAA---A----T--T-----GTA-------A-A---A-----AA-----AAAA-AA---AG--TTTT-T-----AA-AAA--CGG--CC-T-A-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-AC-TG---A--G-AC-A-TA--T---TTGAA--C-AC-G--C--C--CA-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGT---G--GA-GCG-A---TT-A-G-CCTCG--C-AAAATAT--CAATC-AG--CACA--ATTA-T-C-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-CCC-CACAG-T---A-CTC----CCA-C-A-GT---------ACT-T-TA-TC-AGC--AAA-TATTAG--T-A-C-C---CACAG-TAA-AAAAACC--CACAGTAT---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACACTT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAAAATCACACTATCAG-T----AATTAT--------C--A-----------G-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAGTT------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTCCATTTTTCGT
gi|7 : agagaagagagT-A-AAAATTGTCTT-ATCA--AC-GTGGA---GTGT-------TTT--------TC------AT-T--CA---CTT-C-----ATATTA-GAATTCG---A-----TTCAA-CAC--ATAAAATGGAAC-A-CATT--GGGCTAA--T-----AT--TT-AT-TAA-A-CAGT-A-GATTT---AA--GAAT-A--T--TTTTTTATTG-----AAGAAAT-TAAA-AGAGCG-CATTGA----TAA---TTGC-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-TTT-ATAT-AC-A--TACTATTAGTCT--TTATGG-TGA-TCGCTTGAG-AAT-T-A-GCT--CA-A---TAT-GC-TT-G-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC------AA-AA----A--AAA---ATTTTT--T-----A---------A-AC--A-----AA-----AAGA-AT---TG--TCTT-A-----AA-AAA--ACG--TC-TTA-T---C--TTGAT--TCGTT--T---A-ACCTG---A--G--C-A-C---A---TTTG---C-AC-C-GA--C--CG-CAAA-G------TC-G---ATCGCAAAGG---C--CA-GCG-A---TA-A-G-CCTCGG-CAAG----A--TA-TC-G-----CA--CTTT-T-C-AGCA-ATATA--TC-A-GAT-ACC-CACAG-TAGAA-CTT------ATC-A-GC---------ACT-T-TA-TC-AGC--AAT-TATCAGC-A-A-C-C---CACAG-TAA-AAA---C--CACAGTAA---A--TAGTT-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CA--ATGAATT--AT-AGTA-CAACA-GTAAAA-A-TA-TACAGTACTTTATCT--CAGTAAT---TATC-AG-CA--CAA-----------CAG-T----A-------------C--A-----------A-----T---ACAGTA----------------T---T-----ATCCAG-T------AAA--A------AAT-T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTcg
gi|8 : acgaaaCTGGGT--CC-CAGAT-TAGCG-G--T----CTGAGCA---------TG-TCGAAAACAC-CCTCGAAT---------AT-TGCGT-----------GGAATTGC-----T-------TTT-TAAG-----ACC----ACAGAGC-G-GC--CCAATA-TGTATTGTT-CAG---AAATC-AAA-CACAT--G-T-GG---T-GTT-----T-TT----------TT-----TTTTTA-----AGATATT----T-TATT------TATTTAC----T------T-C---AATAGGG--CGGTGTTA---GTTTA-----ACCT----AA--CA-TGTTAAGAG-----TTA--G-G-AATTCT--AT-GTG-T---G--AAAAAAATA--TT-TTAATA-T--AG-CATTGGAT------TATTAA------CAA-TTTccag
gi|8 : -AGCTA--ATCTGTAATTACATGTAATAACT-A-AAT-TTC--TT-ATCA-CAT-GTGGA---GTG---------GT--------TC------AT-CGGTA---CTTCA-TATCAT-TTA-CA-TTC-----------TCAA-TACTGA-AA---GCG-C-A-CAGTGAG--CTCA--TT-ATCATGACT-AC-TAA-A-CAATG---ATTTTGCAA--GAATCA--TTGTTT---ATGG-----A--------------CG-G-CGTTAA--A-TAAAAT-TG--CAA-A---A-Caaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgagctaatctgtaattacatgtaataactaaatttcttatcacatgtggagtggttcatcggtacttcatatcatttacattctcaatactgaaagcgcacagtgagctcattatcatgactactaaacaatgattttgcaagaatcattgtttatggacggcgttaaataaaattgcaaaacggtaatctgtc
gi|9 : ctgggtcccagattagcggtctgagcatgtcgaaaacaccctcgaatattgcgtggaattgctttttaagaccacagagcggcccaatatgtattgttcagaaatcaaacacatgtggtgttttttttttttaagatattttatttatttacttcaatagggcggtgttagtttaacctaacatgttaagagttaggaattctatgtgtgaaaaaaatattttaatatagcattggattattaacaatttaaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgAAATA-CT-A-AATAT-CCGT--ATCA-CAT-GTGGAT--ATGC-------CTT--------TTTAAAAAAT-T--TA---TTC-ACTAC-ATATCAACA-TTCA-------CATT--AGTAC------CATGTT-C-AATATT--G--CTAA--TTTATTATG-TT-ATCTAA-A-C-TTGA---TTT---AAAAGAAT-A--T--TTTT--ATGG-----AATAAAA-TAAGATAAG-A-CATCAA--A-AAAAATCTGT-CAA-ACAAA-CCAGG-T-T-TTCTTCAACA-AC-A--TA-TAT-GGTGT--TT--GG---A-TCG-TTG-GGAAT-T-G-TTG--CA-A---TATTGCCTG-C-AA-ATCA--------AT--AA---T-GCGA-TATC-AG---AA-AAC---A--AAA---A----T--T-----GTTAAAAAAAA-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTTTA-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---CG-TTGAT--T--TT--T---T-ACCTGA--A--G-AC-A-A---T---TTGCA--C-AC-G-GC--C--CG-C-AA-G------TCGG---ATCGCGAGGG---C--GGAGCG-A---TA-A-G-CCTCGGAC-AG----A--TA-TC-AG--A-C---ATTA-ATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACCGCCCAA-TTA-A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACT-TATA-TC-AGTA-AAA-TATCAGT-A-A-C-C--------------AA---T--TATA-TAA---C--TA--T-----------T-AG----ATGAAAT---CA--GCATACC-----CAC-ATTGATTG-ATCggtaatctgtc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TGTTAACTTCGCCTTTTTGTATAGTATTGATCTATGATCAATAGCGTGAAAGGAGACATTCGATTAGAATTTATT
Unaligned ( gi|37 ): GATGTTACTGGTATCTTGAATCTTCTCGATATATTGAGAATCATATTTACATGTGTATA
Unaligned ( gi|42 ): ATGTTAACTTCGCCTTTTTGTATATTAGCCTGTGATTCATAGCA
Alignments
lowQualScore : 1 111111 1111 222222222222 222222222 22222222222 777777777777777777777777777777777777777 11 11 444444444444444444444444444444444444444 4444444444444444 111111 44444444444444444444444 1 1111 11111 22222 22222222222 22 111111 1111111 1111 111 111 444444444444444444 222222222 55555555555555555555555555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222 3333 1111 555555555555555555555555555555 22 222222222 444444444444444 222222 111 11111111 44444444444444444444444 1111111 1111111111111 11 1111111 1111111111111111 111111111 1111111111111 11 11111111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111111111 111
lowQualScore : 0 3 555555 5 5 0000 222222222222 5 0 77 222222222 5 77777777777 333333333333333333333333333333333333333 9999 5 88 1 4 00 4 66 777 1 8 444444444444444444444444444444444444444 5555555555555555 111111 11111111111111111111111 4 66 0 2222 22222 55555 66 5 66666666666 5555 8 88 4 1 4 66 55 9 777 4 4 55 99 3 333333 1 6666666 4 4 0 3333 222 4 4 8888 000 8 1 888888888888888888 5 888888888 77 22222222222222222222222222 5 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 888 5 44444 4 4 4 6 4 0000 4 4 7777 000000000000000000000000000000 7 55 3 33 3 111111111 222222222222222 99999 55 55555 44 3 1 3 3 3 3 000000 0 666 55 3 77 44 111 77777 1 66 0 5 666 44444 0 2 2 555 2 33 3 3 3 2 2 2 33 5 8 33 33 2 2 2 2 2 2 2 5 2 66 5 666 5 2 2 2 2 88888888 33 6666 00000000 4 2 2 333 2 9999 55 333 22222222222222222222222 2 555 55555 55555 2 333 88 4444444 2 22 77 2 2 666666 22 22 88 333 2 555 22 2 2 2 55 2 33 2 2 2 33 999 4 4 5555555555555 4 444 55 2 444 66 5 2 2 2 2222222 2 9999999999999999 2 4 33 2 2 2 2 2 2 666 2 4444 2 2 2 111111111 33 2 2 2 6 55 4 55 666 333 2 2 333 33 888 22 4444444444444 55 22 333 55 22 77777 4 1 00 1 2 7 2 6666 2 2 44444 33 444 2 2 2 11111111111 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 66666 2 2 333333 66 1111111111 2 2 111 1
lowQualScore : . . ...... . . .... ............ . . .. ......... . ........... ....................................... .... . .. . . .. . .. ... . . ....................................... ................ ...... ....................... . .. . .... ..... ..... .. . ........... .... . .. . . . .. .. . ... . . .. .. . ...... . ....... . . . .... ... . . .... ... . . .................. . ......... .. .......................... . . ........................................................... . ... . ..... . . . . . .... . . .... .............................. . .. . .. . ......... ............... ..... .. ..... .. . . . . . . ...... . ... .. . .. .. ... ..... . .. . . ... ..... . . . ... . .. . . . . . . .. . . .. .. . . . . . . . . . .. . ... . . . . . ........ .. .... ........ . . . ... . .... .. ... ....................... . ... ..... ..... . ... .. ....... . .. .. . . ...... .. .. .. ... . ... .. . . . .. . .. . . . .. ... . . ............. . ... .. . ... .. . . . . ....... . ................ . . .. . . . . . . ... . .... . . . ......... .. . . . . .. . .. ... ... . . ... .. ... .. ............. .. .. ... .. .. ..... . . .. . . . . .... . . ..... .. ... . . . ........... . ................................................................. ... ..... . . ...... .. .......... . . ... .
lowQualScore : 0 2 888888 0 0 6666 666666666666 0 1 44 999999999 7 11111111111 222222222222222222222222222222222222222 7777 7 88 9 4 66 4 33 888 1 9 000000000000000000000000000000000000000 0000000000000000 555555 33333333333333333333333 4 11 0 0000 55555 11111 99 0 11111111111 9999 9 33 4 9 4 11 55 5 888 0 0 55 55 2 222222 0 4444444 0 0 7 9999 222 4 4 5555 000 9 9 555555555555555555 7 111111111 99 44444444444444444444444444 7 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 555 0 11111 0 0 0 0 0 8888 0 0 4444 111111111111111111111111111111 3 00 6 11 3 666666666 333333333333333 11111 00 11111 66 3 6 3 3 3 3 777777 3 444 00 3 99 66 555 77777 4 22 8 1 222 66666 8 9 9 000 9 99 1 1 1 2 5 7 77 3 0 44 44 5 5 5 5 5 5 5 0 5 99 0 999 0 5 2 2 2 11111111 11 9999 33333333 4 2 2 999 2 2222 33 999 00000000000000000000000 1 888 33333 33333 1 555 88 0000000 0 88 55 0 0 999999 88 88 88 555 1 888 99 1 1 1 88 1 11 2 2 2 11 111 4 4 2222222222222 7 111 66 4 111 99 0 5 5 5 6666666 5 4444444444444444 4 7 11 2 2 2 2 2 2 999 2 7777 2 2 2 111111111 22 2 2 2 7 33 4 33 444 999 2 2 999 11 777 99 4444444444444 33 99 777 88 99 88888 4 5 66 2 4 1 4 2222 4 5 99999 11 444 5 5 5 99999999999 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444 22222 5 5 333333 88 6666666666 9 9 888 8
consensus : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC-----------GAAAAC-----ACCC-CGAAT-T-TGCGTG---------------ACCACC--GCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TTTN----------TTTTTAN-----AA--------TTATT------TATTT------T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AATT--T-ATCGTG-T--CG--AAAAAAACA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-A-TTTGTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-ATGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGTATGCACC------GTATACAT-GTGT--------TTG--TGTA-----GG-------A--GNGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATA-TCC-GTTATCA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC----------AT-T--CA-CTTC-A-TATCA--A-TTCAACATTC-AAGTAC--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TCAG--C-CA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
Reference ( family-1808 ) : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC-----------GAAAAC-----A-------AT-T-TGCGTG---------------ACCACC--GCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TTTN----------TTTTTAN-----AA--------TTATT------TATTT------T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AATT--T-ATCGTG-T--CG--AAAAAAACA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-A-TTTGTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-NTGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGTATGCACC------GTATACAT-GTGT--------TTG--TGTA-----GG-------A--GGNGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATA-TCCCGTTATCA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC----------AT-T--CA-CTTNTA-TATCA-CA-TTCAACATTC-AAGTAC--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TCAG--C-CA--ATTANC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
gi|1 : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCA-GATT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC-----------GAAAAC-----A-------AT-T-TACA-----------------ATCACC--GCACCA-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AAGCAAA-CAC----G-T-TG---T-ATT-----T-TTTG----------TTTTTAT-----AA--------TTATT------TTTTT------T------T-----A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCTGTTCGAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AAATA-T-ATTGTG-T--CG--AAAAAAGCA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TAAAAC------T-G-TTTGTC----ATAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAA----CTGCTTTTT-CTCTCATATATTCATATGAACCCCATTCGTATACAT-GTAT--------TTG--TGTA-----GG-------G--GGGGCGGCTTTCATGCAGATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGGTA--ATCTGTAATTTTAAAAAATA-CT-A-AATACTCCCTTCATCA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTG--------TC----------AT-T--CA-CTTATAATATCA-CA-TTCAACATTC-AAGTAT--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATCATGATT-AT-CAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGAGAG-G-CAATAA--A-TTAAATCTGC-TAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTAATAA-AC-A--TA-TGT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTA-G-AAT-T-T-TCT--CA-A---TAT-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-AATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AT-----AGAA-AT---TA--TTTT-A-----AA-AAT--CGG--CC-TTA-T---C--GTGAT--T--TT--T---T-AAGTG---A--G-ACTA-C---TTTCA-A--C-AC-G-GC--C--CGT-AA-G------TC-G---GTCGG-AAGG---C--AGACG-A---G--A-A-CCTCGA-C-AG----T--TA-TCAG--T-CA--ATTAAC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---GAG-TAA-AAA---C--CATAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAG-AGTAATT--ATCAGTACCGACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TCTC-AG-CA-CCAA-----------GAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTCAGTACATTTTGCGT
gi|10 : TTCAAAATAC-AATTA-TAT-TATGTGGTT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCT--CA-AATTTAT-TC-TG-A-AA--TCA--------ATTAA----T--------G--A-TATC-AG---AA-AA----C--AAACAGA----T--TTGTAAA---------A-A---A-----AA-----AAAA-AA---TG--TTTTGA-----AA-AAA--CG---CC-TTA-T---CCTTTGAT--C--TTA-T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--CT-CGCCAA-G------G--G---ATCGC-AGGG---C--GAGCA-A---CTAA-G-CCTCGG-C-AG----A--TA-TC------TA--ACCCCC---CA-ATCTACTTC-A---T-ACC-CACAG-T---A-TCTATCCTCA-CTA-GT---------AC--T-TA-TC-AGT-GAAAGTA-CAG-ATAA-C-CCATCACAG-TAA-AA----C--CACAATAAACTATA--C-----------C-ACCT--A----AT---CA--GT--ACCTTTCACAC-AGTACTT---TCA----------------------C-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---ATTC-AGTCA-CCAA-----------CAA-CCACAA-------------T--A-----------TCAGA-T---A----A----------------C---T-----TT-CAG-T------AAA--A------ATACT-GACCACC-TCTCAGTACACTTT
gi|11 : TTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TGG-TTG-A-AAT-T-T-TTT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GT-A-TATC-AG---AT-AA----AT-AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-A-----G--TTTT-A-----CA-AAA--CGG--AC-TTA-T---T--TTGAT--T--TC--T---T-ACATA---A--A-AC-G-C--AATTGC-A--C-AC-T-GC--C--TGC-AA-G------TC-G---ACTGC-AAGG---C--GAACG-A---T--AAG-CCTCAG-C-AG----A--TA-TCAG--C---------------A-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----CCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-ACA---CAG-TAA-AAA---C--CACTGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ACT--GT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GTAAAA-A-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AGAT-A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTtt
gi|12 : TTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCAATATATACAT--A----T--------GT-A-TATG-AG---AA-GA----A--GAA---A-----------------------A-A---A-----AATGAGGGAAA-AT---TGA-ATTT-A-----AA-ATA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AT-A-C--ATTTGC-A--T-AC-G-GC--C-------------------------CGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TC-T-------CA--ATT--C-------T-TC--TC-A-G-T-ACC-TACAG-T---A-CAT----TAT-C-A-GTAAATTACTGATA-T-TA-TC-AGTAAAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CTG-TAA-ATA---C--CACAGTAAA-----------------------------T--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCATTT--ATCAGAATCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACT--------------T---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAA--AAA--A------A---T-GA-CA------CGGTACATTTTCCGTccagt
gi|13 : --TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCTTCCA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----TC-------GC-ATTATC-AGAAAAA-AA----A--AAA---A----TTAC-----GT--------ATA---A-----AA-----ATAA-AT---TGCCTTTT-ATATATAT-AAA--CGGGCCT-TTATT---C--TTGAT--T--TT--T---T-GTTTGCTTA--G-AC-A-C--ATTTGC-A--CAAC-G-GCCTC--CGC-AATGTTTTCCTC-GATCATCGC-AAGG---CTTAAAC--A---T--A-GCCCTCGG-C-GT----T--TA-TCAG--C-CAACATTATCAAGCA-AT-TA--TC-AGG-TAACC-CTCAGCT---ACCTT----TTA-C-A-GT---------ACATT-TA-TCAAGT-AAAT-TATCAG-AT-ACC-CCA---CAGTTAA-AAA---A--CACAGTAAGAT-TA--T-----------CAAGCA--ATT--ATTCGCATTGC--ACC-----CACAAGTAATTAAATTAGTACCAATA-GT-AAA-A-TAGT-CAGTACTTTcaag
gi|14 : T-CAAGA---A-CCAGA-T-A-T-TTTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GA-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----TTTACATATGT-A-TATC-AG---AAGAA----A--AAA---A----T------------------A-G---A-----GG-----GAAA-AT---TGA-TTTT-A-----TA-ATA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C-------------------------TGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TCAG--C-------------GC---T-TC--TC-A-G-T-ACC---------------------TA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CTG-TAA-ATA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCAATT--ATCAGAACCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACTTTA--T--CAA-------TATC-AG---------------------------------------------------------------T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAAAAAAA--A------A---T-GA-CA----CTCGGTACATTTTCCGTcttttcagttaa
gi|15 : gaatAGATA-CT-A-AATA-TCC-GTTATCA-CATTGTGGA---ATGC-------TTTAAAAAT--TC----------AT-T--CA-CTTC-A-T-TCA--A-TTC--CATTT-A-GTAC------CATGTC-A-A-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT--T-TAA-A-C-ATTG-AATTT---AA--GAAT-AATT--TTT---ATGG-----AAAAAAAACAAAGATAG-A-CATTTA--A-TAAA-TCTGT-CAA-A---A-C-AGG-T-T-T-CTTCAAAA-AC-G--TA-TATGAGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AATAT-G-TTG--CATA---T-T-GC-TG-A-AA-A--A--------A---A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----ACAAAA---A----T--T-----GT--------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-TT----AA-AAA--CGGG-CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTA---ATGG-AC-A-C--ATTTGC-ACCC-AC-G-G---C--CGC-AA-G------TC-G---ATCccag
gi|16 : ttc-A-AATATCT--------AT--A----T-----------A-TATC-AG---AA-AA----C--AAG---A----T--TTTT--G---------A-A---A-----CA-----AGT---T---TC--TTTT-T-----AA-CTA--TGG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TT--------AACCG---A--G-AC-A-T---TTGGC-A--C-AC-G-GC--C---AC-AA-G---------------CTT-AAG----C--GAGTGGA---T--ACG-CCTCGG-C-AG----T--TA-T-AG--C--A--ATTAAT-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-AC------G---------------CA-C-A-AT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AA--TATC-G-A--A---CCA---CAG--AA-A--------TACAGTAAAT--TA--TG----------A-AGCA--ATT--AT----A--GC--A-T-----CAC-AGCAATTA-ATCAGTA-CAACA-GT--AA-A-TA-T-CGGTA----A--A--CAGCAACCTATATT-AT----TTAA-----------TCG-C-------------------------------------------A----A----------------T---T-----AT-C---C------AAA--A------A---T-GA-CG-CGTCTtggggttcttttctccatcaatgattacaat
gi|17 : taaaaacttatatagtaacttaaattatttaagttatacaaccaacaAGAT-TAGCG-GACTGGGTTTG-GTT---------TTGTTGTTT-TGTT---------TT-TGTCTTTATTTCGGGAAAAACCTCCGA-------AT-T-TGCGTG---------------ATTACATAAAACCG-GCA-CCA----T--ATT-TT-CAGA---A--CAAA------------TG---T-ATT-----TATTTT----------TTTTTAA-----AA--------TAATTCTATGATATTTAG----T------T-----A---A-TA-G---CGAT-TT-------GA-----C-------GAC--A--G------A-----TTA-TCTG-A-----T-ATCATGGT--CG--AAAAAA-CA---T-CTAATTAT--A--CATTGTAT------TACTAT------T-A-TTTGTC----CAACG--A-GT-CCCGATAAA------ATTTGAAATC-GTGCTTTT---TTCCAAATATtt
gi|18 : tacgtcaaagtgatctctgtatacgaattattaacgtctcgggaagctcaT---TG--TTTT-T-----CA-AAA--AGG--C--TCA-T---T--TTGATAAT--TT--TCTGT-ACCTG---A--G-CC-AACTAGTTTGC-A----ACTG-GC--GAATGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--TAG-G-A---T--A-G-C------T-AG------------------CA--ATT--T-AACA-CT-TC--CCGA-G-T-AC----TAG-T---A-ATT----TCA-A-A-GT---------ACA-T-TATTC-AAT-AAA--TATTAG-A--A-T-T-----CAG-TAA-AAC---C--CAGGTTATA---TA--T--------------GCA--GTT--GT---CA--GC--ACC-----CA--AGAAATT--ATTAGTAACAA-A-AT-AAT-A-GG-A-CAGTATATTA--TAACAGC--T---TATT-AG-CACCCAG-----------CAA-C----A-------------CAAA-----------TTCA--T---A----A----------------T---C-----AT-CAG-
gi|19 : --ATTATC-AGCA-AT-TC--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TTA-C-A-TT---------ACT-T-AA-TC-A-T-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAG-AAT---C--CACAGAAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAA-AGCAATC--ATCAGTACCAACG-GT-AGA-A-TA-T-CATTACCTTA--T--------T---GATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----ATACAATCAGTAATC--A-----------T-----TATCA----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTGAGTACATTTTCTGc
gi|2 : ttgcgaggttgccttagtaatcccttgaaatctatctacatG---------------ACCACC--GCGCCG-ACAACCAAGG-TT-ATT-TTGCAGACTAAGTCAAAACAT----GAT-TG---TTGCT-----T-CTTTAAAGAAAATATTTTTATTCTTAAG--------TTATA------TATCT------T------A-----AT--AATA-CGAACGATATCATAGGTTGAAGAAGCCCTG---GACCCACTGT-----AGATCGTAA-TC-GGAATTACTGATCGTG-T--CG--AAAAA--CA--TT-TAAGTC-TTAA--CATTGGATAATACATAGTA-------T-A-TTGGTCTTGCAGACTAAATGT-TCCGATTAA----CGATTTTAAATGAATGATTTTT-CTCCC-AATATTCGAA-------------TATACATAGTGTG-------TTG--TGTA-----GA-------ACTGCACTACTTTTCAT-CAAA-AATaccagtag
gi|2 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagata--ATCTGTA-TGT--ATAAATA-CTTATAATA-TCCAGTACGCA-CAT-GTGAATTCATTCTAAAGAATTT--------TC----------ATAA--CATTTTCTA-TATCA-AA-TTC-ACATT---AGTAC------CATCTT-CAA-TATT--G--CAAA--TT-ATT-TAA-C-AT-TGA-ATC-TTAAGAATTC--------AAT-T--T--TTT---ATAGGACAAAAGAGAA-TAAA-ATAG-ACCATTAA--ATTAAAATCTGTCCAA-A---G-ACAGG-TGTGT-CTTCAAAA-AC-A--TA-TATCAGTGT--TT--GG-T-AGTCG-TTG-G-AAT-C-GTTCT--CA-A----AT--C-TGAA-AA-ATC---------AT--AAGGTT--------GC-A-TATCGAG---AT-AAGACCA--AAA---A----T--T-----T---------A-A---AAAAGGAA-----AAAA-ATATCTG--TTTT-A-----AACGAC--CTG--CT-TTA-TACAT--TTGAT--C--TT--A---T-ACCTG---A--GAAC-A-C--AATTGCGA--C-AC-GTGC--C--CGC-AA-G------TC-----ATCGC-AGGAGCTC--GAGCG-A---TACA-G-CCTCGG-C-AA----TAATG-TCAG--C-CA--ATTACT---CA-AG-TA---------T-ACC-AATAC-T---G-TTT----CCA-C-A-GTC--------ACT-T-TA-TC-AGT-TAA--T-TCA---------TCA----AG-CAACAAA---CAGCACAGT--A---TT--C-----------T-AGTAC-ATT--AT---CA--GC--Acattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatctgtatgtataaatacttataatatccagtacgcacatgtgaattcattctaaagaattttcataacattttctatatcaaattcacattagtaccatcttcaatattgcaaattatttaacattgaatcttaagaattcaattttttataggacaaaagagaataaaatagaccattaaattaaaatctgtccaaagacaggtgtgtcttcaaaaacatatatcagtgtttggtagtcgttggaatcgttctcaaatctgaaaaatcataaggttgcatatcgagataagaccaaaaatttaaaaaaggaaaaaaatatctgttttaaacgacctgctttatacatttgatcttatacctgagaacacaattgcgacacgtgcccgcaagtcatcgcaggagctcgagcgatacagcctcggcaataatgtcagccaattactcaagtataccaatactgtttccacagtcactttatcagttaattcatcaagcaacaaacagcacagtattctagtacattatcagcaat
gi|20 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagatagaccaccgcgccgacaaccaaggttattttgcagactaagtcaaaacatgattgttgcttctttaaagaaaatatttttattcttaagttatatatcttaataatacgaacgatatcataggttgaagaagccctggacccactgtagatcgtaatcggaattactgatcgtgtcgaaaaacatttaagtcttaacattggataatacatagtatattggtcttgcagactaaatgttccgattaacgattttaaatgaatgatttttctcccaatattcgaatatacatagtgtgttgtgtagaactgcactacttttcatcaaaaatcattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtT-A--T--GCT---ATGA-----AA---AT-TAAAGAAAG-G-CATTAA--T-TAAAATATGT-CA--------------------CTTCATAA-AT-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-GA----G--AA----------------------------A-A---A-----AA-----AATA-AT-------TTCT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-C---C--TTGAT--A--TC--T---T-ATCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C-------------------------CAC-AAGG---C--GAGCG-A---TA-A-G-CCTCGG-A-AG----T--TA-TCAat
gi|21 : atgttaacttcgcctttttgtatatatatgatc--AAAAAACCA--TT-TTAATT-T--A--CATTTGATA-----TACTAG------T-G-TTTGTC----AGAC---A-GT-CTCGATTAACGATCGATTTGAAACG-ATTCTCTAT-CTCCCATATGCATATATGCATT------ATGTGCGT-GTGT--------GTG--TGT------------------GCGGTGGCTTTCCT-CAAATAATTTatatattat
gi|21 : AGAGAGTTC--ATCTGTGATT-----AAATA-CT-A-ATTA-TCC--TTAGCA-CAT-GTGAA---GTGC--------TT--------TC----------AT-T--CA-TTTCT--TAT-A-AA-TTCAA-ATTG-AA-TAC--ATAAAATGCA-C-A-CATT--aaagagaaagagagagttcatctgtgattaaatactaattatccttagcacatgtgaagtgctttcattcatttcttataaattcaaattgaatacataaaatgcacacatt
gi|22 : aaaaaaccattttaatttacatttgatatactagtgtttgtcagacagtctcgattaacgatcgatttgaaacgattctctatctcccatatgcatatatgcattatgtgcgtgtgtgtgtgtgcggtggctttcctcaaataatttaaagagaaagTGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGACT-AT-TAA-A-CAGTG--AATTT---AA--GAAT-AT-T--TTT---ATGG-----AAGGAAT-TTAAGAGAG-G-CATTAA--A-TAAAATAGGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCAT-A-AC-A--TA-AAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--TA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-GG---GA-AA----A--AAA---A----C--C-----G---------------A-----AA-----AAAT-GT---TG--TTTTAA-----AA-AAA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---
gi|23 : taaat-A-AT-ATAA--------AT--G----T--------AC-A-TATC-GG---AA-AA----A--TAA---A-----------------------G-A---A-----AA-----AGTA-AT---T---TTTT-A-----AA------CAG--CCATGA-T---C--TTAAT--T--AT--C---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTAC-A--C-TC-G-GA--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGA---C--GCGCG-G---T--A-T-CCTCGG-C-AG----A--GA-TTAG--C-AC--ATTATC-AGCA-AT--------A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-AA---------ACA-T-CA-TT-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CGG-TAA-AAA---C--CTCAGTAAA---TA--T-----------
gi|24 : c--CCAATA-T--ATT-T--CATA---AATCAAAACAC----A-T--G---T-GAT-----G-TTTAG---------TTTTTAA-----AAAATTATTTTTATT------TATTTAATCTTT------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----ACCT----GAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-GAAATTA-T-ATCGTG-T--CGAAAAAAAAACA---T-TTAA---T--A--CATGTGATA-----TACTAG------T-ATTTTGT-----AGAC---A-GTACCCGATTAA----CGATTTGAAATGATTGCTTTTTGCTCCC-AATATT-GTATACAacg
gi|25 : -AGCACAT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CGA-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-AC-AAATA-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---CATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----T----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGT
gi|26 : agtt--TC-A-G-A-ACC-CACAC-T---A-TTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGTTAAA--TATTAG-A--A-AACCA---CAG-TAA-AAC---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AACA---------------------CCG----CAC-AGCAATT--ACCAGTACCAACA-GT-AAA-A-T---------CT--------CAGTAAT---TATC-AG-CA-T-AA-----------TAT-C----A-------------G--------------------T---G----A----------------T---T-----AT-CAG-T------CAA--A----------T-GA-CA-C-TTTCAGTAAATTTCCCGTccagt
gi|27 : cGAT-TAGCG-GACT----CTGAGTC----------T-TAGTTC-TTTT---------TTATGCT-----------GAAAAA-----A-------Acca
gi|27 : cc-AC--CCA-TG-T--ATT-TT-CAGA---AACCAAA-CAC--------TG-----GTG-----T-TTCG----------TTTTTGT---------------TTATT------TGTTccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccacccatgtattttcagaaaccaaacactggtgtttcgtttttgtttatttgtt
gi|28 : ccgattagcggactctgagtcttagttcttttttatgctgaaaaaaaccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccTT--AT---CAAAGA--ACA-----AAC-AA-AATA--ATCAATACCAACA-GTTAAA-A-CA-T-CTGTAAT--A--T--CAGCAAT---TAGC-AG-TA-CCAA-----------CAG-C----A-------------G--A-----------A-----T---A----AGAATGATTGTCGGCATT---T-----AT-CAG-C------AAATTA------A---T-GA------TCTTTTTATATTTTCCAT
gi|29 : TT------TATTT------T------C-----A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCCG----AT--A-CGC-----AG----TTA-T----------T-ATCG------------------A--TTATTACTG-T--G--C--CGAACC-----CAGTGT------T-A----GTC----AGAC---A-GT-CCCGATAAA----CGATTcc
gi|3 : ttAATAAT--ATT-TT--AGA---AAT--AA-CACTGTGA-T-TG---TTGTT-----T-TTTAAAATA-----TTTTTAT---------------TTATT------TATTT------T------T-----A---AAAT-GG--CGAT-T-A---GTTGA-----CCCTG----AC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AATTC-T-ATCG-G-T--CG--AAAAAA-CA--TT-TAAATT-T--A----TTGGTAA-----TACTAGACTAAGT-A-TTTGTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTG--ATG-AT-CTTTTT-CTCCCAAA-----G-ATG-GCC------GTATACAT-GTG---------TTA--TGT-------G-------A--TGTGTGACTTTCAT-C-AATAATT
gi|3 : --ATCTGTA--TTCAAA---TA-CT-A-A-TA-TCC-GT-ATCAACAT--TGGA---ATGC-------TTTAAAAA---TT----------AT-T--CA-CTTC-A-TATCA-AA-TC--ACATTT-A-GTA-------CATGTC-A-A-TAT------------------ATGCT------------------AATT---------AAT-A--T-----------G-----AAAAAAA-TAA-GATAG-A-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAG--T-T-T-CTTCAAAA-AC-A--TA-T-T-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTG--CA-A---TAT-GC-TG-GCAA-ATCA--------TA--A----T--------GC-A-ATTC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--T-----GT--------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTTTA-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTG---A--G-AC-A----ATTTGC-A--C-A--G-G---C--CGC--A-G------T--G---ATCGC-AGGG---C--GAGCG-A---T--A-G--CTC-G-C-AG----A--TA-TCAG-----A--ATTAT---AC--AT-TA--T--A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T----TC-AGT-AAA--TATCAG-T--A---CCA---CG---AA-AAA---C--CACAGTAGA---TA----------------AGCAGCATT--AT----A--GT--A-C-----CACAAGTACTT---TCA------------------------CAGTACTTTA--T--CAGT-AT---T-TCAAG-CA-CCGA------------AG-C----A-------------C--AATATCAGTAAGT-----T---ATCAGA----------------T---T-----AT-CAG-T------AAC--A------A---TGGA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcatctgtattcaaatactaatatccgtatcaacattggaatgctttaaaaattattcacttcatatcaaatcacatttagtacatgtcaatatatgctaattaatatgaaaaaaataagatagacattaaataaaatctgtcaaaaccagtttcttcaaaaacatattggtgtttggtatcgttggaattgttgcaatatgctggcaaatcataatgcaattcagaaaaaaaaattgtaaaaaaaaaattgtttttaaaaaacggccttatttgattttgttacctgagacaatttgcacaggccgcagtgatcgcagggcgagcgatagctcgcagatatcagaattatacattatagtacccacagtactttcacagtacattcagtaaatatcagtaccacgaaaaaccacagtagataagcagcattatagtaccacaagtactttcacagtactttatcagtatttcaagcaccgaagcacaatatcagtaagttatcagattatcagtaacaatggacactctcagtacattttgcgtca
gi|30 : aataatattttagaaataacactgtgattgttgttttttaaaatatttttatttatttatttttaaaatggcgattagttgaccctgacatgtattatcgaattctatcggtcgaaaaaacatttaaatttattggtaatactagactaagtatttgtcagacagtcccgattaacgatttgatgatctttttctcccaaagatggccgtatacatgtgttatgtgatgtgtgactttcatcaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttc-TA-T-CAGTAATTAA--C--C-GAACT---TATC-AG-TA-CCAA-----------CAA-T----AA------------C--A-----------T-----TT--A----A----------------T---TTAATGAT-CAG-T------AAA--AAAAAAAA---T-GA-CA-C-TCTCAGTATATTATCTGTca
gi|31 : ATC--ACGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-TAGA---AATCAAA-CAC----A-TGTGGTTT-GTTTGCTGT-TTTT----------TTTTTAC-----TT--------TTATG------TATTT------T------TTTTTCA---AATA-TG--CGccagt
gi|32 : tA----CGATTTGAAATT-ATGCCTTTT-CTTCCAAATATTCGTATG---------------CAT-GTGT--------ATG--TGT-------G-------A--GAC------TTCAT-CAAAAAACTTTA
gi|34 : TTCA-TATCA--A-TTCA-CATTT-A-GTAC------CATGTG-A-A-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAT-A-C-ATagagagagagagag
gi|35 : c-----G---------A-A---C-----AA-----AAAA-GT---T---TTTT-A-----AA-AAAAACGA--CC-TAA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-
gi|36 : GAAGTCTAAACAATGGAAAACC-CAGAT-TAGCG-GACT----C-AAG-C---------TT-TAG----TCTG---------TT-TGCC-----------GAGAA
gi|38 : T---ATGG-----AAGA----TAAAGA--G-T-CATTAA--A----AATATGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-
gi|39 : A---TG--T-----------A-AACA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AACAATT--ATCAGCACCAACA-GC-ACA-A-
gi|4 : GGAAGTC-AA--------------CAGAT-TAGCC-GGCA----CTGAGCTCTGGTTTGTTT-TAGTTT-TTTTGTTTTTGTTTT-TGGG-----------GAAAAC-----ACCCCCGAAT-TATGCGTG---------------ACTATC--AAACCGGACGATCAATA-T--ATT-T--CAGA---AAT-AAA-CAC----A-T--G---T-GTT-----T-TAAG----------TTTTTAA-----AA--------ATATT------TATTT------TATTTATT-----ATTTAATA-GG--CGAT-TT----GTTTA-----CCCTG----AC--A-TGT-----T-----TTAATC-G-AATT--T-GTCGTG-T--CG--AAGAAAACAAACA-TTAATT-T--A--C-TTGGATA-------ATAC------T-A-GTTGTCC---AGAC---A-GT-CC-GATTAA----CGATTTGAAATA-TTGCTTTTT-CTCCCAAATAT-------CACT------GTATACAT-GTGTGTGTGACTTTGCATGCAATATTGG-------A--GGNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---AGATATCATCT-TAAATTTAAAA-----CT-A-A-TA-TCC-GT-ATCA-CAT-ATGGA----TGC-------TTTAAGAAAATTCCA--------ATAT--CA-CTTC-A-TATCA----TTCA-CATT---AGT-C--A-TATAT---------ATT--G--CTA---TT-AT-ATGATT-AT-TACCA-T-TTGA-ATTTA---AA--GAAT-A--T--TTTT--ATGG-----A-GAAAA-TAAAGATAG-A-CATTGACAA-TAAAATCTGT-CAA-A---ATCCAGGGT-T-T-CTTC-TAA-AC-A--TAATAT-AAGGT--TT--GG-T-T-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTT--TA-AA--TA--GC-TG-A-AA-ATCA--------CT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A----------------C-----G---------A-T---A-----AA-----AAAA-A----TG--TTAT-G-----AA-AAA--CGGATCC-TTA-T---C--TTGAT--G--TT--T---TAACCTG---A--G-AC-A-CTAATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AATG------TC-G---ATCGC-AGGG---C--GAGGG-A---
gi|40 : tacgtcaaaggttggtatctccgttgaattccaatataaatttgtagcactcttaGGGAGTC-AAACACTGGATA-CTACAGCTGTAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGT
gi|41 : GAT-TAGCGTGACT----CTGAGTC---------TT-TAGTTCTTTTT---------TT-TGCT-----------GAAAA
gi|5 : -G-AATTC-T-ACCGTG-CTGCG--AGAAAAACA--TT-TTAATT-C--GATCATTGGA-A-----TATCAA------T-G-TT-GTC----AGAC---A-G--ACCGATTAA----CGGTTT-AAATG-ATGCTTTTTTCTTCCAAATATTCGTAT--------------CACAT-GTGA--------TTG--T-TA-----GATGTCGTCA--GCGGGGG----CAT-CAAATAAaa
gi|5 : g-T--CA-TTTC-A-TATT--CA-TTCA-CAT-C-ACTTAC--ATAAAATGCC-C-A--ATT-----CTAGATTT-ATTATGATA-AT-TTG-A-CAGTTA-ATTGT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGATGA-T-CATTAA--A-T-AAATCTGC-GAA-A---A-----G-T-T-T-GTTCA-AA-ACAA--TA-TGT-AGT-T--TT--GGCT-C-TCG--TG-G-AAT-T-A-TCTACTACA---TATAGC-TA-A-GA-AT----------AT--A----T--------GCAA-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A-----------------------A-ATTTA-----AA-----AGAATAT---CGT-TTTT-AT----AA-AAA--C-G--CC-TTA-----A--TTCAT--T--CTTAT---T-ACT-----A--A-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC---GC--C--TGC-AA-G------T------ATCAC-AAGG---C--GAGCG-AATTC--A-G-CCT-GG---AG----T--TA-TCAGCAC-CA--AAAACA-AGCA-AT-TA--T--A-G-T-ACC-CA-AG-T---T-TAT----TCA-C-ATGT---------ACA-T-TG-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A---CCA---CAA-TAA-AAA---C--AACAGTATA---TA--TATCTAGAAGACC-AGCA--A----AT---CA--------T-----CAC-AGTAATTAGATGAGTACCATCA-GT--AA-A-TA-T-CA----------------TAAT-----TC-AG-CC-AAAA-----------CAGTC----A-------------CAAA-----------T-----C---A----A----------------CAAGT-----AT-CAG-T------atacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaatcatttcatattcattcacatcacttacataaaatgcccaattctagatttattatgataatttgacagttaattgtaagaatattttatggaagaaattaaagatgatcattaaataaatctgcgaaaagtttgttcaaaacaatatgtagttttggctctcgtggaattatctactacatatagctaagaatatatgcaatatcagaaaaaaaaaaatttaaaagaatatcgtttttataaaaacgccttaattcattcttattactaaacacatttgcacacgcctgcaagtatcacaaggcgagcgaattcagcctggagttatcagcaccaaaaacaagcaattatagtacccaagtttattcacatgtacattgtcagtaaatatcagaaccacaataaaaacaacagtatatatatctagaagaccagcaaatcatcacagtaattagatgagtaccatcagtaaatatcataattcagccaaaacagtcacaaatcaacaagtatcagt
gi|6 : ggaattctaccgtgctgcgagaaaaacattttaattcgatcattggaatatcaatgttgtcagacagaccgattaacggtttaaatgatgcttttttcttccaaatattcgtatcacatgtgattgttagatgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaaAGA-GATTC--ATCTGTAATT-----AAATA-CT-A-GATA-TCC--TTATCA-CAT-GGTGA----TGC-------TT----------C----------AT-T--CA-CTTC-A-TATCA--A-TT--ACATTT-AA-TAC--A-A---TGTC-A-A-CATT--G--C-AA--TT-ATTATGATTTAT-TAA-C-A-TTGA-ATTTT---AA----AT-A--T--TTT---AAAG-----GAAAAAA-TAAAGATAG-G-CATTAA--A--AAAATCGTT-CAA-A---A-GCAG----T-T-TTTCATAA-AC-A--T----T-AGTGT--TT--GG-T-A-TC--TTG---AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT--C-TG-A-AA--TCA--------TA--A----T--------GC-A-TATC-AC---AA-AAC---A--AAA---A----T--T-----GTA-------A-A---A-----AA-----AAAA-AA---AG--TTTT-T-----AA-AAA--CGG--CC-T-A-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-AC-TG---A--G-AC-A-T--ATTTGA-A--C-AC-G--C--C--CAC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGT---G--GAGCG-A---TT-A-G-CCTCG--C-AAAATAT--CAATCAG--CACA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-CCC-CACAG-T---A-CTC----CCA-C-A-GT---------ACT-T-TA-TC-AGC-AAA--TATTAG-T--A-C-CCA---CAG-TAA-AAAAACC--CACAGTATA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACACTT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAAAATCACACTATCAG-T----AATTAT--------C--A-----------G-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAGTT------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTCCATTTTTCGT
gi|7 : agagaagagagAAATA-AA-A-ATTG-TC---TTATCA--AC-GTGGA---GTGT-------TTT--------TC----------AT-T--CA-CTTC-A-TATTA-GAATTCGA--TTC-AA-CAC--ATAAAATGGAAC-A-CATT--GGGCTAA--T-----AT--TT-AT-TAA-A-CAGT-A-GATTT---AA--GAAT-A--T--TTTTTTATTG-----AAGAAAT-TAAA-AGAGCG-CATTGA----TAA---TTGC-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-TTT-ATAT-AC-A--TACTATTAGTCT--TTATGG-TGA-TCGCTTGAG-AAT-T-A-GCT--CA-A---TAT-GC-TT-G-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC------AA-AA----A--AAA---ATTTTT--T-----A---------A-AC--A-----AA-----AAGA-AT---TG--TCTT-A-----AA-AAA--ACG--TC-TTA-T---C--TTGAT--TCGTT--T---A-ACCTG---A--G--C-A-C--ATTTGC-A--C--C-G-A---C--CGCAAA-G------TC-G---ATCGCAAAGG---C--CAGCG-A---TA-A-G-CCTCGG-CAAG----A--TA-TCG-----CA--CTTTTC-AGCA-ATATA--TC-A-GAT-ACC-CACAG-TAGAA-CTT------ATC-A-GC---------ACT-T-TA-TC-AGC-AAT--TATCAGCA--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TAGTT-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CA--ATGAATT--AT-AGTA-CAACA-GTAAAA-A-TA-TACAGTACTTTATCT--CAGTAAT---TATC-AG-CA--CAA-----------CAG-T----A-------------C--A-----------A-----T---ACAGTA----------------T---T-----ATCCAG-T------AAA--A------AAT-T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTcg
gi|8 : acgCTGGGT--CC-CAGAT-TAGCG-G--T----CTGAGC--------------A---------------------TGTC-----------GAAAAC-----ACCCTCGAATAT-TGCGTGGAATTGCTTTTTAAGACCACA--GAGC-G-GC--CCAATA-TGTATTGTT-CAGA---AATCAAA-CACAT--G-T-GG---T-GTT-----T-TTTT----------TTTTTAA-----GATATT----TTATT------TATTTAC----T------T-----C---AATAGGG--CGGTGTTA---GTTTA-----ACCT----AAC--A-TGTTAAGAG-----TTA--G-G-AATTC-T-AT-GTG-T---G--AAAAAAATA--TT-TTAATA-T--AG-CATTGGAT------TATTAA------CAA-TTTccag
gi|8 : -AGCTA--ATCTGTAATTACATGTAATAACT-A-AATT-TC---TTATCA-CAT-GTGGA---GTG---------GT--------TC----------AT-CGGTA-CTTC-A-TATCA-T--TT--ACATTCTCAATACTGA-AA---GCG-C-A-CAGTGAG--CTCA--TT-ATCATGACT-AC-TAA-A-CAATG---ATTTTGCAA--GAATCA--TTGTTT---ATGG-----A--------------CG-G-CGTTAA--A-TAAAAT-TG--CAA-A---A-Caaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgagctaatctgtaattacatgtaataactaaatttcttatcacatgtggagtggttcatcggtacttcatatcatttacattctcaatactgaaagcgcacagtgagctcattatcatgactactaaacaatgattttgcaagaatcattgtttatggacggcgttaaataaaattgcaaaacggtaatctgtc
gi|9 : ctgggtcccagattagcggtctgagcatgtcgaaaacaccctcgaatattgcgtggaattgctttttaagaccacagagcggcccaatatgtattgttcagaaatcaaacacatgtggtgttttttttttttaagatattttatttatttacttcaatagggcggtgttagtttaacctaacatgttaagagttaggaattctatgtgtgaaaaaaatattttaatatagcattggattattaacaatttaaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgAAATA-CT-A-AATA-TCC-GT-ATCA-CAT-GTGGAT--ATGC-------CTT--------TTTAAAAAATTTAT-T--CA-CT-ACA-TATCAACA-TTCA-CATT---AGTAC------CATGTT-C-AATATT--G--CTAA--TTTATTATG-TT-ATCTAA-A-C-TTGA---TTT---AAAAGAAT-A--T--TTTT--ATGG-----AATAAAA-TAAGATAAG-A-CATCAA--A-AAAAATCTGT-CAA-ACAAA-CCAGG-T-T-TTCTTCAACA-AC-A--TA-TAT-GGTGT--TT--GG---A-TCG-TTG-GGAAT-T-G-TTG--CA-A---TATTGCCTG-C-AA-ATCA--------AT--AA---T--------GCGA-TATC-AG---AA-AAC---A--AAA---A----T--T-----GTTAAAAAAAA-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTTTA-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---CG-TTGAT--T--TT--T---T-ACCTGA--A--G-AC-A----ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TCGG---ATCGCGAGGG---CG-GAGCG-A---TA-A-G-CCTCGGAC-AG----A--TA-TCAG--A-CA--TTAATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACCGCCCAA-TTA-A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACT-TATA-TC-AGTAAAA--TATCAGTA--A-C-C--------------AA---T--TATA-TAAC---TA--T-----------T-AG----ATGAAAT---CA--GCATACC-----CAC-ATTGATTG-ATCggtaatctgtc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TGTTAACTTCGCCTTTTTGTATAGTATTGATCTATGATCAATAGCGTGAAAGGAGACATTCGATTAGAATTTATT
Unaligned ( gi|37 ): GATGTTACTGGTATCTTGAATCTTCTCGATATATTGAGAATCATATTTACATGTGTATA
Unaligned ( gi|42 ): ATGTTAACTTCGCCTTTTTGTATATTAGCCTGTGATTCATAGCA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 111111 1111 222222222222 222222222 2222222222 2222222 1 0000000000000000000000000000000000000 11 11 11 444444444444444444444444444444444444444 4444444444444444 111111 44444444444444444444444 1111111 11111 2222 22222222222 22 111 11111111 111111 1111111 1111 111 444444444444444444 222222222 44444444444444 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222 1111 1111 1111111 55555555555555555555 11 444444444444444 222222 111 11111111 44444444444444444444444 1111111 1111111111111 11 11111111111111111111111 111111111 1111111111111 11 11111111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111111111 111
lowQualScore : 0 3 555555 5 5 0000 222222222222 5 0 77 222222222 5 5555555555 2 2 0000000 6 3 0000000000000000000000000000000000000 11 2 5 88 4 00 4 66 777 1 8 444444444444444444444444444444444444444 5555555555555555 111111 66666666666666666666666 55 66 8888888 22222 5555 66 5 66666666666 5555 4 4 88 4 66 66 000 55 4 1 00000000 3 333333 1 6666666 4 44 3333 222 4 4 8888 999 1 8 1 888888888888888888 5 888888888 77 99999999999999 44 1 55 5 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 1 888 5 44444 4 4 4 6 4 2222 4 4 4 7777 3333333 00000000000000000000 7 55 44 44 3 99999 77 222222222222222 99999 55 55555 44 3 1 3 3 3 3 000000 0 666 55 3 77 44 111 77777 1 66 0 5 666 44444 0 2 2 555 2 33 3 3 3 2 2 2 33 5 8 33 33 2 2 2 2 2 2 2 5 2 66 5 666 5 2 2 2 2 88888888 33 6666 00000000 4 2 2 333 2 9999 55 333 22222222222222222222222 2 555 55555 55555 2 333 88 4444444 2 22 77 2 2 666666 22 22 88 333 2 555 22 2 2 2 55 2 33 2 2 2 33 999 4 4 5555555555555 4 444 55 2 444 66 5 2 2 2 77777777777777777777777 5 33 2 4 33 2 2 2 2 2 2 666 2 4444 2 2 2 111111111 33 2 2 2 6 55 4 55 666 333 2 2 333 33 888 22 4444444444444 55 22 333 55 22 77777 4 1 00 1 2 7 2 6666 2 2 44444 33 444 2 2 2 11111111111 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 66666 2 2 333333 66 1111111111 2 2 111 1
lowQualScore : . . ...... . . .... ............ . . .. ......... . .......... . . ....... . . ..................................... .. . . .. . .. . .. ... . . ....................................... ................ ...... ....................... .. .. ....... ..... .... .. . ........... .... . . .. . .. .. ... .. . . ........ . ...... . ....... . .. .... ... . . .... ... . . . .................. . ......... .. .............. .. . .. . . ....................................................... . . ... . ..... . . . . . .... . . . .... ....... .................... . .. .. .. . ..... .. ............... ..... .. ..... .. . . . . . . ...... . ... .. . .. .. ... ..... . .. . . ... ..... . . . ... . .. . . . . . . .. . . .. .. . . . . . . . . . .. . ... . . . . . ........ .. .... ........ . . . ... . .... .. ... ....................... . ... ..... ..... . ... .. ....... . .. .. . . ...... .. .. .. ... . ... .. . . . .. . .. . . . .. ... . . ............. . ... .. . ... .. . . . . ....................... . .. . . .. . . . . . . ... . .... . . . ......... .. . . . . .. . .. ... ... . . ... .. ... .. ............. .. .. ... .. .. ..... . . .. . . . . .... . . ..... .. ... . . . ........... . ................................................................. ... ..... . . ...... .. .......... . . ... .
lowQualScore : 0 2 888888 0 0 6666 666666666666 0 1 44 999999999 7 0000000000 5 5 0000000 7 3 8888888888888888888888888888888888888 00 5 7 88 4 66 4 33 888 1 9 000000000000000000000000000000000000000 0000000000000000 555555 88888888888888888888888 66 11 0000000 55555 8888 99 0 11111111111 9999 4 4 33 4 33 11 111 55 0 1 33333333 2 222222 0 4444444 0 77 9999 222 4 4 5555 999 1 9 9 555555555555555555 7 111111111 99 77777777777777 00 4 66 7 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 555 0 11111 0 0 0 0 0 2222 0 0 0 4444 0000000 55555555555555555555 3 00 66 66 3 88888 88 333333333333333 11111 00 11111 66 3 6 3 3 3 3 777777 3 444 00 3 99 66 555 77777 4 22 8 1 222 66666 8 9 9 000 9 99 1 1 1 2 5 7 77 3 0 44 44 5 5 5 5 5 5 5 0 5 99 0 999 0 5 2 2 2 11111111 11 9999 33333333 4 2 2 999 2 2222 33 999 00000000000000000000000 1 888 33333 33333 1 555 88 0000000 0 88 55 0 0 999999 88 88 88 555 1 888 99 1 1 1 88 1 11 2 2 2 11 111 4 4 2222222222222 7 111 66 4 111 99 0 5 5 5 33333333333333333333333 5 44 4 7 11 2 2 2 2 2 2 999 2 7777 2 2 2 111111111 22 2 2 2 7 33 4 33 444 999 2 2 999 11 777 99 4444444444444 33 99 777 88 99 88888 4 5 66 2 4 1 4 2222 4 5 99999 11 444 5 5 5 99999999999 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444 22222 5 5 333333 88 6666666666 9 9 888 8
consensus : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACACC-C---C-GAAT-T-TGCGT--------------------G---------------AC--CACCGCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TTTN----------TTTTTAN-----AA--------TTATT------TATTT------T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-TT--T-ATCGT-GT--CGAAAAAAA--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-ATTT-GTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-A-TGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGTATGCACC------GTATACAT-GTGT--------TTG--TGTAGG-------A---GNGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATA-TCCGTT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--TTCAACATTC-AAGTAC--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-CA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
Reference ( family-1808 ) : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACACC-C---C-GAAT-T-TGCGT--------------------G---------------AC--CACCGCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TTTN----------TTTTTAN-----AA--------TTATT------TATTT------T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-TT--T-ATCGT-GT--CGAAAAAAA--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-ATTT-GTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-A-TGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGTATGCACC------GTATACAT-GTGT--------TTG--TGTAGG-------A---GNGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATA-TCCGTT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--TTCAACATTC-AAGTAC--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-CA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
gi|1 : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCA-GATT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACA-----------AT-T-TACA-------------------------------------AT--CACCGCACCA-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AAGCAAA-CAC----G-T-TG---T-ATT-----T-TTTG----------TTTTTAT-----AA--------TTATT------TTTTT------T------T-----A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCTGTTCGAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-ATA-T-ATTGT-GT--CGAAAAAAG--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TAAAAC------T-GTTT-GTC----ATAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAACTG-----CTTTTT-CTCTCATATATTCATATGAACCCCATTCGTATACAT-GTAT--------TTG--TGTAGG-------G---GGGGCGGCTTTCATGCAGATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGGTA--ATCTGTAATTTTAAAAAATA-CT-A-AATACTCCCTTCAT-CA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTG--------TC----------AT-T--CACTT--ATAATATC-AC-A--TTCAACATTC-AAGTAT--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATCATGATT-AT-CAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGAGAG-G-CAATAA--A-TTAAATCTGC-TAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTAATAA-AC-A--TA-TGT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTA-G-AAT-T-T-TCT--CA-A---TAT-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-AATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AT-----AGAA-AT---TA--TTTT-A-----AA-AAT--CGG--CC-TTA-T---C--GTGAT--T--TT--T---T-AAGTG---A--G-ACTA-C---TTTCA-A--C-AC-G-GC--C--CGT-AA-G------TC-G---GTCGG-AAGG---C--AGACG-A---G--A-A-CCTCGA-C-AG----T--TA-TC-AG--T-CA--ATTAAC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---GAG-TAA-AAA---C--CATAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAG-AGTAATT--ATCAGTACCGACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TCTC-AG-CA-CCAA-----------GAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTCAGTACATTTTGCGT
gi|10 : TTCAAAATAC-AATTA-TAT-TATGTGGTT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCT--CA-AATTTAT-TC-TG-A-AA--TCA--------ATTAA----T--------G--A-TATC-AG---AA-AA----C--AAACAGA----T--TTGTAAA---------A-A---A-----AA-----AAAA-AA---TG--TTTTGA-----AA-AAA--CG---CC-TTA-T---CCTTTGAT--C--TTA-T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--CT-CGCCAA-G------G--G---ATCGC-AGGG---C--GAGCA-A---CTAA-G-CCTCGG-C-AG----A--TA-TCTAA--C-C--------C-CCCA-ATCTACTTC-A---T-ACC-CACAG-T---A-TCTATCCTCA-CTA-GT---------AC--T-TA-TC-AGT-GAAAGTA-CAG-ATAA-C-CCATCACAG-TAA-AA----C--CACAATAAACTATA--C-----------C-ACCT--A----AT---CA--GT--ACCTTTCACAC-AGTACTT---TCA----------------------C-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---ATTC-AGTCA-CCAA-----------CAA-CCACAA-------------T--A-----------TCAGA-T---A----A----------------C---T-----TT-CAG-T------AAA--A------ATACT-GACCACC-TCTCAGTACACTTT
gi|11 : TTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TGG-TTG-A-AAT-T-T-TTT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GT-A-TATC-AG---AT-AA----AT-AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-A-----G--TTTT-A-----CA-AAA--CGG--AC-TTA-T---T--TTGAT--T--TC--T---T-ACATA---A--A-AC-G-C--AATTGC-A--C-AC-T-GC--C--TGC-AA-G------TC-G---ACTGC-AAGG---C--GAACG-A---T--AAG-CCTCAG-C-AG-----------------------AT-ATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----CCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-ACA---CAG-TAA-AAA---C--CACTGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ACT--GT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GTAAAA-A-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AGAT-A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTtt
gi|12 : TTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCAATATATACAT--A----T--------GT-A-TATG-AG---AA-GA----A--GAA---A-----------------------A-A---A-----AATGAGGGAAA-AT---TGA-ATTT-A-----AA-ATA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AT-A-C--ATTTGC-A--T-AC-G-GC--C-------------------------CGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TC-T--------CA--AT--TC-------T-TC--TC-A-G-T-ACC-TACAG-T---A-CAT----TAT-C-A-GTAAATTACTGATA-T-TA-TC-AGTAAAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CTG-TAA-ATA---C--CACAGTAAA-----------------------------T--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCATTT--ATCAGAATCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACT--------------T---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAA--AAA--A------A---T-GA-CA------CGGTACATTTTCCGTccagt
gi|13 : --TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCTTCCA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----TC-------GC-ATTATC-AGAAAAA-AA----A--AAA---A----TTAC-----GT--------ATA---A-----AA-----ATAA-AT---TGCCTTTT-ATATATAT-AAA--CGGGCCT-TTATT---C--TTGAT--T--TT--T---T-GTTTGCTTA--G-AC-A-C--ATTTGC-A--CAAC-G-GCCTC--CGC-AATGTTTTCCTC-GATCATCGC-AAGG---CTTAAAC--A---T--A-GCCCTCGG-C-GT----T--TA-TC-AG--C-CAACATTATCAAGCA-AT-TA--TC-AGG-TAACC-CTCAGCT---ACCTT----TTA-C-A-GT---------ACATT-TA-TCAAGT-AAAT-TATCAG-AT-ACC-CCA---CAGTTAA-AAA---A--CACAGTAAGAT-TA--T-----------CAAGCA--ATT--ATTCGCATTGC--ACC-----CACAAGTAATTAAATTAGTACCAATA-GT-AAA-A-TAGT-CAGTACTTTcaag
gi|14 : T-CAAGA---A-CCAGA-T-A-T-TTTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GA-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----TTTACATATGT-A-TATC-AG---AAGAA----A--AAA---A----T------------------A-G---A-----GG-----GAAA-AT---TGA-TTTT-A-----TA-ATA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C-------------------------TGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-------------GC---T-TC--TC-A-G-T-ACC---------------------TA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CTG-TAA-ATA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCAATT--ATCAGAACCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACTTTA--T--CAA-------TATC-AG---------------------------------------------------------------T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAAAAAAA--A------A---T-GA-CA----CTCGGTACATTTTCCGTcttttcagttaa
gi|15 : gaatAGATA-CT-A-AATA-TCCGTT-AT-CA-CATTGTGGA---ATGC-------TTTAAAAAT--TC----------AT-T--CACTT--C--AT-TC-A--A--TTC--CATTT-A-GTAC------CATGTC-A-A-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT--T-TAA-A-C-ATTG-AATTT---AA--GAAT-AATT--TTT---ATGG-----AAAAAAAACAAAGATAG-A-CATTTA--A-TAAA-TCTGT-CAA-A---A-C-AGG-T-T-T-CTTCAAAA-AC-G--TA-TATGAGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AATAT-G-TTG--CATA---T-T-GC-TG-A-AA-A--A--------A---A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----ACAAAA---A----T--T-----GT--------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-TT----AA-AAA--CGGG-CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTA---ATGG-AC-A-C--ATTTGC-ACCC-AC-G-G---C--CGC-AA-G------TC-G---ATCccag
gi|16 : ttc-A-AATATCT--------AT--A----T-----------A-TATC-AG---AA-AA----C--AAG---A----T--TTTT--G---------A-A---A-----CA-----AGT---T---TC--TTTT-T-----AA-CTA--TGG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TT--------AACCG---A--G-AC-A-T---TTGGC-A--C-AC-G-GC--C---AC-AA-G---------------CTT-AAG----C--GAGTGGA---T--ACG-CCTCGG-C-AG----T--TA-T--AG--C--A--ATTAAT-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-AC------G---------------CA-C-A-AT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AA--TATC-G-A--A---CCA---CAG--AA-A--------TACAGTAAAT--TA--TG----------A-AGCA--ATT--AT----A--GC--A-T-----CAC-AGCAATTA-ATCAGTA-CAACA-GT--AA-A-TA-T-CGGTA----A--A--CAGCAACCTATATT-AT----TTAA-----------TCG-C-------------------------------------------A----A----------------T---T-----AT-C---C------AAA--A------A---T-GA-CG-CGTCTtggggttcttttctccatcaatgattacaat
gi|17 : taaaaacttatatagtaacttaaattatttaagttatacaaccaacaAGAT-TAGCG-GACTGGGTTTG-GTT---------TTGTTGTTT-TGTT---------TT-TGTCTTTATTTCGGGAAAA-ACCTC---C-GAAT-T-TGCGT--------------------G---------------ATTACATAAAACCG-GCA-CC---A-T--ATT-TT-CAGA---A--CAAA------------TG---T-ATT-----TATTTT----------TTTTTAA-----AA--------TAATTCTATGATATTTAG----T------T---------AATA--G--CGAT--------TTGA-----C-------GAC--A--G------A-----TTA-TCTG-A------T-ATCATGGT--CG-AAAAAA--CA---T-CTAATTAT--A--CATTGTAT------TACTAT------T-ATTT-GTC----CAACG--A-GT-CCCGATAAA------ATTTGAAATC-G-TGCTTTT---TTCCAAATATtt
gi|18 : tacgtcaaagtgatctctgtatacgaattattaacgtctcgggaagctcaT---TG--TTTT-T-----CA-AAA--AGG--C--TCA-T---T--TTGATAAT--TT--TCTGT-ACCTG---A--G-CC-AACTAGTTTGC-A----ACTG-GC--GAATGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--TAG-G-A---T--A-G-C------T-AG-------------------CA--AT--TT-AACA-CT-TC--CCGA-G-T-AC----TAG-T---A-ATT----TCA-A-A-GT---------ACA-T-TATTC-AAT-AAA--TATTAG-A--A-T-T-----CAG-TAA-AAC---C--CAGGTTATA---TA--T--------------GCA--GTT--GT---CA--GC--ACC-----CA--AGAAATT--ATTAGTAACAA-A-AT-AAT-A-GG-A-CAGTATATTA--TAACAGC--T---TATT-AG-CACCCAG-----------CAA-C----A-------------CAAA-----------TTCA--T---A----A----------------T---C-----AT-CAG-
gi|19 : --ATTATC-AGCA-AT-TC--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TTA-C-A-TT---------ACT-T-AA-TC-A-T-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAG-AAT---C--CACAGAAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAA-AGCAATC--ATCAGTACCAACG-GT-AGA-A-TA-T-CATTACCTTA--T--------T---GATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----ATACAATCAGTAATC--A-----------T-----TATCA----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTGAGTACATTTTCTGc
gi|2 : ttgcgaggttgccttagtaatcccttgaaatctatctacatACCCC-C---C-GAAT-T-TGCGCATGCTGGACTTGTACAGATAG---------------AC--CACCGCGCCG-ACAACCAAGG-TT-ATT-TTGCAGACTAAGTCAAAACAT----GAT-TG---TTGCT-----T-CTTTAAAGAAAATATTTTTATTCTTAAG--------TTATA------TATCT------T------A-----AT--AATA-CGAACGATATCATAGGTTGAAGAAGCCCTG---GACCCACTGT-----AGATCGTAA-TC-GGAA-TTACTGATCGT-GT--CGAAAAA----CA--TT-TAAGTC-TTAA--CATTGGATAATACATAGTA-------T-ATTG-GTCTTGCAGACTAAATGT-TCCGATTAA----CGATTTTAAATGAA-TGATTTTT-CTCCC-AATATTCGAA-------------TATACATAGTGTG-------TTG--TGTAGA-------ACT-GCACTACTTTTCAT-CAAA-AATaccagtag
gi|2 : ac--ATCTGTA-TGT--ATAAATA-CTTATAATA-TCCAGT-ACGCA-CAT-GTGAATTCATTCTAAAGAATTT--------TC----------ATAA--CATTTTCT--ATATCAA--A--TTC-ACATT---AGTAC------CATCTT-CAA-TATT--G--CAAA--TT-ATT-TAA-C-AT-TGA-ATC-TTAAGAATTC--------AAT-T--T--TTT---ATAGGACAAAAGAGAA-TAAA-ATAG-ACCATTAA--ATTAAAATCTGTCCAA-A---G-ACAGG-TGTGT-CTTCAAAA-AC-A--TA-TATCAGTGT--TT--GG-T-AGTCG-TTG-G-AAT-C-GTTCT--CA-A----AT--C-TGAA-AA-ATC---------AT--AAGGTT--------GC-A-TATCGAG---AT-AAGACCA--AAA---A----T--T-----T---------A-A---AAAAGGAA-----AAAA-ATATCTG--TTTT-A-----AACGAC--CTG--CT-TTA-TACAT--TTGAT--C--TT--A---T-ACCTG---A--GAAC-A-C--AATTGCGA--C-AC-GTGC--C--CGC-AA-G------TC-----ATCGC-AGGAGCTC--GAGCG-A---TACA-G-CCTCGG-C-AA----TAATG-TC-AG--C-CA--ATTACT---CA-AG-TA---------T-ACC-AATAC-T---G-TTT----CCA-C-A-GTC--------ACT-T-TA-TC-AGT-TAA--T-TCA---------TCA----AG-CAACAAA---CAGCACAGT--A---TT--C-----------T-AGTAC-ATT--AT---CA--GC--Acattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatctgtatgtataaatacttataatatccagtacgcacatgtgaattcattctaaagaattttcataacattttctatatcaaattcacattagtaccatcttcaatattgcaaattatttaacattgaatcttaagaattcaattttttataggacaaaagagaataaaatagaccattaaattaaaatctgtccaaagacaggtgtgtcttcaaaaacatatatcagtgtttggtagtcgttggaatcgttctcaaatctgaaaaatcataaggttgcatatcgagataagaccaaaaatttaaaaaaggaaaaaaatatctgttttaaacgacctgctttatacatttgatcttatacctgagaacacaattgcgacacgtgcccgcaagtcatcgcaggagctcgagcgatacagcctcggcaataatgtcagccaattactcaagtataccaatactgtttccacagtcactttatcagttaattcatcaagcaacaaacagcacagtattctagtacattatcagcaat
gi|20 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagatagaccaccgcgccgacaaccaaggttattttgcagactaagtcaaaacatgattgttgcttctttaaagaaaatatttttattcttaagttatatatcttaataatacgaacgatatcataggttgaagaagccctggacccactgtagatcgtaatcggaattactgatcgtgtcgaaaaacatttaagtcttaacattggataatacatagtatattggtcttgcagactaaatgttccgattaacgattttaaatgaatgatttttctcccaatattcgaatatacatagtgtgttgtgtagaactgcactacttttcatcaaaaatcattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtT-A--T--GCT---ATGA-----AA---AT-TAAAGAAAG-G-CATTAA--T-TAAAATATGT-CA--------------------CTTCATAA-AT-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-GA----G--AA----------------------------A-A---A-----AA-----AATA-AT-------TTCT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-C---C--TTGAT--A--TC--T---T-ATCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C-------------------------CAC-AAGG---C--GAGCG-A---TA-A-G-CCTCGG-A-AG----T--TA-TC-AA--T-AT--ATTATat
gi|21 : atgttaacttcgcctttttgtatatatatgatcAAAAAAC--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTTGATA-----TACTAG------T-GTTT-GTC----AGAC---A-GT-CTCGATTAACGATCGATTTGAAACG-A-TTCTCTAT-CTCCCATATGCATATATGCATT------ATGTGCGT-GTGT--------GTG--TGT--------------GCGGTGGCTTTCCT-CAAATAATTT
gi|21 : AGAGAGTTC--ATCTGTGATT-----AAATA-CT-A-ATTA-TCC-TT-AG-CA-CAT-GTGAA---GTGC-------TTT---------C----------AT-T--CATTT--C--TTATA-A--A--TTCAA-ATTG-AA-TAC--ATAAAATGCA-C-A-CATT--aaagagaaagagagagttcatctgtgattaaatactaattatccttagcacatgtgaagtgctttcattcatttcttataaattcaaattgaatacataaaatgcacacatt
gi|22 : aaaaaaccattttaatttacatttgatatactagtgtttgtcagacagtctcgattaacgatcgatttgaaacgattctctatctcccatatgcatatatgcattatgtgcgtgtgtgtgtgtgcggtggctttcctcaaataatttaaagagaaagTGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGACT-AT-TAA-A-CAGTG--AATTT---AA--GAAT-AT-T--TTT---ATGG-----AAGGAAT-TTAAGAGAG-G-CATTAA--A-TAAAATAGGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCAT-A-AC-A--TA-AAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--TA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-GG---GA-AA----A--AAA---A----C--C-----G---------------A-----AA-----AAAT-GT---TG--TTTTAA-----AA-AAA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---
gi|23 : taaat-A-AT-ATAA--------AT--G----T--------AC-A-TATC-GG---AA-AA----A--TAA---A-----------------------G-A---A-----AA-----AGTA-AT---T---TTTT-A-----AA------CAG--CCATGA-T---C--TTAAT--T--AT--C---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTAC-A--C-TC-G-GA--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGA---C--GCGCG-G---T--A-T-CCTCGG-C-AG----A--GA-TT-AG--C-AC--ATTATC-AGCA-AT--------A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-AA---------ACA-T-CA-TT-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CGG-TAA-AAA---C--CTCAGTAAA---TA--T-----------
gi|24 : c--CCAATA-T--ATT-T--CATA---AATCAAAACAC----A-T--G---T-GAT-----G-TTTAG---------TTTTTAA-----AAAATTATTTTTATT------TATTTAATCTTT------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----ACCTG----AC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AAATTA-T-ATCGT-GT--CGAAAAAAAAACA--TT-T-AAT-----A--CATGTGATA-----TACTAG------T-ATTTTGT-----AGAC---A-GTACCCGATTAA----CGATTTGAAATG-ATTGCTTTTTGCTCCC-AATATT-GTATACAacg
gi|25 : TT-AGCACAT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CGA-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-AC-AAATA-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---CATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----T----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGT
gi|26 : ag--TC-A-G-A-ACC-CACAC-T---A-TTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGTTAAA--TATTAG-A--A-AACCA---CAG-TAA-AAC---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AACA---------------------CCG----CAC-AGCAATT--ACCAGTACCAACA-GT-AAA-A-T---------CT--------CAGTAAT---TATC-AG-CA-T-AA-----------TAT-C----A-------------G--------------------T---G----A----------------T---T-----AT-CAG-T------CAA--A----------T-GA-CA-C-TTTCAGTAAATTTCCCGTccagt
gi|27 : cGAT-TAGCG-GACT----CTGAGTC----------T-TAGTTC-TTTT---------TTATGCT----------GAAAAAAAC-CGTTC-GAAT-TATGCAT--------------------cca
gi|27 : cc-AC--CCA-TG-T--ATT-TT-CAGA---AACCAAA-CAC--------TG-----GTG-----T-TTCG----------TTTTTGT---------------TTATT------TGTTttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccacccatgtattttcagaaaccaaacactggtgtttcgtttttgtttatttgtt
gi|28 : ccgattagcggactctgagtcttagttcttttttatgctgaaaaaaaccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccTT--AT---CAAAGA--ACA-----AAC-AA-AATA--ATCAATACCAACA-GTTAAA-A-CA-T-CTGTAAT--A--T--CAGCAAT---TAGC-AG-TA-CCAA-----------CAG-C----A-------------G--A-----------A-----T---A----AGAATGATTGTCGGCATT---T-----AT-CAG-C------AAATTA------A---T-GA------TCTTTTTATATTTTCCAT
gi|29 : TT------TATTT------T------C-----A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCCG----AT--A-CGC-----AG----TTA-T-----------T-ATCG------------------A--TTATTACTG-T--G--C--CGAACC-----CAGTGT------T-A----GTC----AGAC---A-GT-CCCGATAAA----CGATTcc
gi|3 : ttAATAAT--ATT-TT--AGA---AAT--AA-CACTGTGA-T-TG---TTGTT-----T-TTTAAAATA-----TTTTTAT---------------TTATT------TATTT------T------T-----A---AAAT-GG--CGAT-T-A---GTTGA-----CCCTG----AC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-TTC-T-ATCG--GT--CGAAAAAA---CA--TT-TAAATT-T--A----TTGGTAA-----TACTAGACTAAGT-ATTT-GTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTG--ATG-A-T-CTTTTT-CTCCCAAA-----G-ATG-GCC------GTATACAT-GTG---------TTA--TGT--G-------A---TGTGTGACTTTCAT-C-AATAATT
gi|3 : --ATCTGTA--TTCAAA---TA-CT-A-A-TA-TCCGT--AT-CAACAT--TGGA---ATGC-------TTTAAAAA---TT----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--ATCA-CATTT-A-GTA-------CATGTC-A-A-TAT------------------ATGCT------------------AATT---------AAT-A--T-----------G-----AAAAAAA-TAA-GATAG-A-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAG--T-T-T-CTTCAAAA-AC-A--TA-T-T-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTG--CA-A---TAT-GC-TG-GCAA-ATCA--------TA--A----T--------GC-A-ATTC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--T-----GT--------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTTTA-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTG---A--G-AC-A----ATTTGC-A--C-A--G-G---C--CGC--A-G------T--G---ATCGC-AGGG---C--GAGCG-A---T--A-G--CTC-G-C-AG----A--TA-TC-AG-----A--ATTAT---AC--AT-TA--T--A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T----TC-AGT-AAA--TATCAG-T--A---CCA---CG---AA-AAA---C--CACAGTAGA---TA----------------AGCAGCATT--AT----A--GT--A-C-----CACAAGTACTT---TCA------------------------CAGTACTTTA--T--CAGT-AT---T-TCAAG-CA-CCGA------------AG-C----A-------------C--AATATCAGTAAGT-----T---ATCAGA----------------T---T-----AT-CAG-T------AAC--A------A---TGGA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcatctgtattcaaatactaatatccgtatcaacattggaatgctttaaaaattattcacttcatatcaaatcacatttagtacatgtcaatatatgctaattaatatgaaaaaaataagatagacattaaataaaatctgtcaaaaccagtttcttcaaaaacatattggtgtttggtatcgttggaattgttgcaatatgctggcaaatcataatgcaattcagaaaaaaaaattgtaaaaaaaaaattgtttttaaaaaacggccttatttgattttgttacctgagacaatttgcacaggccgcagtgatcgcagggcgagcgatagctcgcagatatcagaattatacattatagtacccacagtactttcacagtacattcagtaaatatcagtaccacgaaaaaccacagtagataagcagcattatagtaccacaagtactttcacagtactttatcagtatttcaagcaccgaagcacaatatcagtaagttatcagattatcagtaacaatggacactctcagtacattttgcgtca
gi|30 : aataatattttagaaataacactgtgattgttgttttttaaaatatttttatttatttatttttaaaatggcgattagttgaccctgacatgtattatcgaattctatcggtcgaaaaaacatttaaatttattggtaatactagactaagtatttgtcagacagtcccgattaacgatttgatgatctttttctcccaaagatggccgtatacatgtgttatgtgatgtgtgactttcatcaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttc-TA-T-CAGTAATTAA--C--C-GAACT---TATC-AG-TA-CCAA-----------CAA-T----AA------------C--A-----------T-----TT--A----A----------------T---TTAATGAT-CAG-T------AAA--AAAAAAAA---T-GA-CA-C-TCTCAGTATATTATCTGTca
gi|31 : ATCACGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-TAGA---AATCAAA-CAC----A-TGTGGTTT-GTTTGCTGT-TTTT----------TTTTTAC-----TT--------TTATG------TATTT------T------TTTTTCA---AATA-TG--CGccagt
gi|32 : tA----CGATTTGAAATT-A-TGCCTTTT-CTTCCAAATATTCGTATG---------------CAT-GTGT--------ATG--TGT--G-------A---GA------CTTCAT-CAAAAAACTTTA
gi|34 : CTT--C--ATATC-A--A--TTCA-CATTT-A-GTAC------CATGTG-A-A-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAT-A-C-ATagagagagagagag
gi|35 : -----G---------A-A---C-----AA-----AAAA-GT---T---TTTT-A-----AA-AAAAACGA--CC-TAA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-
gi|36 : GAAGTCTAAACAATGGAAAACC-CAGAT-TAGCG-GACT----C-AAG-C---------TT-TAG----TCTG---------TT-TGCC----------GAGAA
gi|38 : T---ATGG-----AAGA----TAAAGA--G-T-CATTAA--A----AATATGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-
gi|39 : A---TG--T-----------A-AACA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AACAATT--ATCAGCACCAACA-GC-ACA-A-
gi|4 : GGAAGTC-AA--------------CAGAT-TAGCC-GGCA----CTGAGCTCTGGTTTGTTT-TAGTTT-TTTTGTTTTTGTTTT-TGGG----------GAAAACACC-C---CCGAAT-TATGCGT--------------------G---------------AC--TATCAAACCGGACGATCAATA-T--ATT-T--CAGA---AAT-AAA-CAC----A-T--G---T-GTT-----T-TAAG----------TTTTTAA-----AA--------ATATT------TATTT------TATTTATT-----ATTTAATA-GG--CGAT-TT----GTTTA-----CCCTG----AC--A-TGT-----T-----TTAATC-G-AA-TT--T-GTCGT-GT--CGAAGAAAA--CAAACA-TTAATT-T--A--C-TTGGATA-------ATAC------T-AGTT-GTCC---AGAC---A-GT-CC-GATTAA----CGATTTGAAATA-T-TGCTTTTT-CTCCCAAATAT-------CACT------GTATACAT-GTGTGTGTGACTTTGCATGCAAT-------ATTGGAGGNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-AGATATCATCT-TAAATTTAAAA-----CT-A-A-TA-TCCGT--AT-CA-CAT-ATGGA----TGC-------TTTAAGAAAATTCCA--------ATAT--CACTT--C--ATATC-A-----TTCA-CATT---AGT-C--A-TATAT---------ATT--G--CTA---TT-AT-ATGATT-AT-TACCA-T-TTGA-ATTTA---AA--GAAT-A--T--TTTT--ATGG-----A-GAAAA-TAAAGATAG-A-CATTGACAA-TAAAATCTGT-CAA-A---ATCCAGGGT-T-T-CTTC-TAA-AC-A--TAATAT-AAGGT--TT--GG-T-T-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTT--TA-AA--TA--GC-TG-A-AA-ATCA--------CT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A----------------C-----G---------A-T---A-----AA-----AAAA-A----TG--TTAT-G-----AA-AAA--CGGATCC-TTA-T---C--TTGAT--G--TT--T---TAACCTG---A--G-AC-A-CTAATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AATG------TC-G---ATCGC-AGGG---C--GAGGG-A---
gi|40 : tacgtcaaaggttggtatctccgttgaattccaatataaatttgtagcactcttaGGGAGTC-AAACACTGGATA-CTACAGCTGTAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGT
gi|41 : GAT-TAGCGTGACT----CTGAGTC---------TT-TAGTTCTTTTT---------TT-TGCT----------GAAAA
gi|5 : -G-AA-TTC-T-ACCGT-GCTGCGAGAAAAA--CA--TT-TTAATT-C--GATCATTGGA-A-----TATCAA------T-GTT--GTC----AGAC---A-G--ACCGATTAA----CGGTTT-AAATG-A-TGCTTTTTTCTTCCAAATATTCGTAT--------------CACAT-GTGA--------TTG--T-TAGATGTCGTCA---GCGGGGG----CAT-CAAATAAaa
gi|5 : g-T--CATTT--C--ATATT-C--A--TTCA-CAT-C-ACTTAC--ATAAAATGCC-C-A--ATT-----CTAGATTT-ATTATGATA-AT-TTG-A-CAGTTA-ATTGT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGATGA-T-CATTAA--A-T-AAATCTGC-GAA-A---A-----G-T-T-T-GTTCA-AA-ACAA--TA-TGT-AGT-T--TT--GGCT-C-TCG--TG-G-AAT-T-A-TCTACTACA---TATAGC-TA-A-GA-AT----------AT--A----T--------GCAA-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A-----------------------A-ATTTA-----AA-----AGAATAT---CGT-TTTT-AT----AA-AAA--C-G--CC-TTA-----A--TTCAT--T--CTTAT---T-ACT-----A--A-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC---GC--C--TGC-AA-G------T------ATCAC-AAGG---C--GAGCG-AATTC--A-G-CCT-GG---AG----T--TA-TC-AGCAC-CA--AAAACA-AGCA-AT-TA--T--A-G-T-ACC-CA-AG-T---T-TAT----TCA-C-ATGT---------ACA-T-TG-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A---CCA---CAA-TAA-AAA---C--AACAGTATA---TA--TATCTAGAAGACC-AGCA--A----AT---CA--------T-----CAC-AGTAATTAGATGAGTACCATCA-GT--AA-A-TA-T-CA----------------TAAT-----TC-AG-CC-AAAA-----------CAGTC----A-------------CAAA-----------T-----C---A----A----------------CAAGT-----AT-CAG-T------atacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaatcatttcatattcattcacatcacttacataaaatgcccaattctagatttattatgataatttgacagttaattgtaagaatattttatggaagaaattaaagatgatcattaaataaatctgcgaaaagtttgttcaaaacaatatgtagttttggctctcgtggaattatctactacatatagctaagaatatatgcaatatcagaaaaaaaaaaatttaaaagaatatcgtttttataaaaacgccttaattcattcttattactaaacacatttgcacacgcctgcaagtatcacaaggcgagcgaattcagcctggagttatcagcaccaaaaacaagcaattatagtacccaagtttattcacatgtacattgtcagtaaatatcagaaccacaataaaaacaacagtatatatatctagaagaccagcaaatcatcacagtaattagatgagtaccatcagtaaatatcataattcagccaaaacagtcacaaatcaacaagtatcagt
gi|6 : ggaattctaccgtgctgcgagaaaaacattttaattcgatcattggaatatcaatgttgtcagacagaccgattaacggtttaaatgatgcttttttcttccaaatattcgtatcacatgtgattgttagatgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaaAGA-GATTC--ATCTGTAATT-----AAATA-CT-A-GATA-TCC-TT-AT-CA-CAT-GGTGA----TGC-------TT----------C----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--TT--ACATTT-AA-TAC--A-A---TGTC-A-A-CATT--G--C-AA--TT-ATTATGATTTAT-TAA-C-A-TTGA-ATTTT---AA----AT-A--T--TTT---AAAG-----GAAAAAA-TAAAGATAG-G-CATTAA--A--AAAATCGTT-CAA-A---A-GCAG----T-T-TTTCATAA-AC-A--T----T-AGTGT--TT--GG-T-A-TC--TTG---AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT--C-TG-A-AA--TCA--------TA--A----T--------GC-A-TATC-AC---AA-AAC---A--AAA---A----T--T-----GTA-------A-A---A-----AA-----AAAA-AA---AG--TTTT-T-----AA-AAA--CGG--CC-T-A-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-AC-TG---A--G-AC-A-T--ATTTGA-A--C-AC-G--C--C--CAC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGT---G--GAGCG-A---TT-A-G-CCTCG--C-AAAATAT--CAATC-AG--CACA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-CCC-CACAG-T---A-CTC----CCA-C-A-GT---------ACT-T-TA-TC-AGC-AAA--TATTAG-T--A-C-CCA---CAG-TAA-AAAAACC--CACAGTATA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACACTT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAAAATCACACTATCAG-T----AATTAT--------C--A-----------G-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAGTT------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTCCATTTTTCGT
gi|7 : agagaagagagAAATA-AA-A-ATTG-TC--TT-AT-CA--AC-GTGGA---GTGT-------TTT--------TC----------AT-T--CACTT--C--ATATT-AGAA--TTCGA--TTC-AA-CAC--ATAAAATGGAAC-A-CATT--GGGCTAA--T-----AT--TT-AT-TAA-A-CAGT-A-GATTT---AA--GAAT-A--T--TTTTTTATTG-----AAGAAAT-TAAA-AGAGCG-CATTGA----TAA---TTGC-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-TTT-ATAT-AC-A--TACTATTAGTCT--TTATGG-TGA-TCGCTTGAG-AAT-T-A-GCT--CA-A---TAT-GC-TT-G-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC------AA-AA----A--AAA---ATTTTT--T-----A---------A-AC--A-----AA-----AAGA-AT---TG--TCTT-A-----AA-AAA--ACG--TC-TTA-T---C--TTGAT--TCGTT--T---A-ACCTG---A--G--C-A-C--ATTTGC-A--C--C-G-A---C--CGCAAA-G------TC-G---ATCGCAAAGG---C--CAGCG-A---TA-A-G-CCTCGG-CAAG----A--TA-TC-G-----CA--CTTTTC-AGCA-ATATA--TC-A-GAT-ACC-CACAG-TAGAA-CTT------ATC-A-GC---------ACT-T-TA-TC-AGC-AAT--TATCAGCA--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TAGTT-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CA--ATGAATT--AT-AGTA-CAACA-GTAAAA-A-TA-TACAGTACTTTATCT--CAGTAAT---TATC-AG-CA--CAA-----------CAG-T----A-------------C--A-----------A-----T---ACAGTA----------------T---T-----ATCCAG-T------AAA--A------AAT-T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTcg
gi|8 : acgCTGGGT--CC-CAGAT-TAGCG-G--T----CTGAGC--------------A---------------------TGTC----------GAAAACACC-CT--C-GAATAT-TGCGT--------------------GGAATTGCTTTTTAAGAC--CACAGAGC-G-GC--CCAATA-TGTATTGTT-CAGA---AATCAAA-CACAT--G-T-GG---T-GTT-----T-TTTT----------TTTTTAA-----GATATT----TTATT------TATTTAC----T------T-----C---AATAGGG--CGGTGTTA---GTTTA-----ACCT----AAC--A-TGTTAAGAG-----TTA--G-G-AA-TTC-T-AT-GT-GT---GAAAAAAA--TA--TT-TTAATA-T--AG-CATTGGAT------TATTAA------CAATTT-ccag
gi|8 : -AGCTA--ATCTGTAATTACATGTAATAACT-A-AATT-TC--TT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTG---------GT--------TC----------AT-CGGTACTT--C--ATATC-A--T--TT--ACATTCTCAATACTGA-AA---GCG-C-A-CAGTGAG--CTCA--TT-ATCATGACT-AC-TAA-A-CAATG---ATTTTGCAA--GAATCA--TTGTTT---ATGG-----A--------------CG-G-CGTTAA--A-TAAAAT-TG--CAA-A---A-Caaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgagctaatctgtaattacatgtaataactaaatttcttatcacatgtggagtggttcatcggtacttcatatcatttacattctcaatactgaaagcgcacagtgagctcattatcatgactactaaacaatgattttgcaagaatcattgtttatggacggcgttaaataaaattgcaaaacggtaatctgtc
gi|9 : ctgggtcccagattagcggtctgagcatgtcgaaaacaccctcgaatattgcgtggaattgctttttaagaccacagagcggcccaatatgtattgttcagaaatcaaacacatgtggtgttttttttttttaagatattttatttatttacttcaatagggcggtgttagtttaacctaacatgttaagagttaggaattctatgtgtgaaaaaaatattttaatatagcattggattattaacaatttaaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgAAATA-CT-A-AATA-TCCGT--AT-CA-CAT-GTGGAT--ATGC-------CTT--------TTTAAAAAATTTAT-T--CACTA--C--ATATC-A--ACATTCA-CATT---AGTAC------CATGTT-C-AATATT--G--CTAA--TTTATTATG-TT-ATCTAA-A-C-TTGA---TTT---AAAAGAAT-A--T--TTTT--ATGG-----AATAAAA-TAAGATAAG-A-CATCAA--A-AAAAATCTGT-CAA-ACAAA-CCAGG-T-T-TTCTTCAACA-AC-A--TA-TAT-GGTGT--TT--GG---A-TCG-TTG-GGAAT-T-G-TTG--CA-A---TATTGCCTG-C-AA-ATCA--------AT--AA---T--------GCGA-TATC-AG---AA-AAC---A--AAA---A----T--T-----GTTAAAAAAAA-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTTTA-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---CG-TTGAT--T--TT--T---T-ACCTGA--A--G-AC-A----ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TCGG---ATCGCGAGGG---CG-GAGCG-A---TA-A-G-CCTCGGAC-AG----A--TA-TC-AG--A-CA--TTAATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACCGCCCAA-TTA-A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACT-TATA-TC-AGTAAAA--TATCAGTA--A-C-C--------------AA---T--TATA-TAAC---TA--T-----------T-AG----ATGAAAT---CA--GCATACC-----CAC-ATTGATTG-ATCggtaatctgtc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TGTTAACTTCGCCTTTTTGTATAGTATTGATCTATGATCAATAGCGTGAAAGGAGACATTCGATTAGAATTTATT
Unaligned ( gi|37 ): GATGTTACTGGTATCTTGAATCTTCTCGATATATTGAGAATCATATTTACATGTGTATA
Unaligned ( gi|42 ): ATGTTAACTTCGCCTTTTTGTATATTAGCCTGTGATTCATAGCA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 111111 1111 222222222222 222222222 2222222222 2222222 1 0000000000000000000000000000000000000 11 11 11 444444444444444444444444444444444444444 4444444444444444 111111 44444444444444444444444 1111111 11111 2222 22222222222 22 111 11111111 111111 1111111 1111 111 444444444444444444 222222222 44444444444444 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222 1111 1111 1111111 55555555555555555555 11 444444444444444 222222 111 11111111 44444444444444444444444 1111111 1111111111111 11 11111111111111111111111 111111111 1111111111111 11 11111111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111111111 111
lowQualScore : 0 3 555555 5 5 0000 222222222222 5 0 77 222222222 5 5555555555 2 2 0000000 6 3 0000000000000000000000000000000000000 11 2 5 88 4 00 4 66 777 1 8 444444444444444444444444444444444444444 5555555555555555 111111 66666666666666666666666 55 66 8888888 22222 5555 66 5 66666666666 5555 4 4 88 4 66 66 000 55 4 1 00000000 3 333333 1 6666666 4 44 3333 222 4 4 8888 999 1 8 1 888888888888888888 5 888888888 77 99999999999999 44 1 55 5 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 1 888 5 44444 4 4 4 6 4 2222 4 4 4 7777 3333333 00000000000000000000 7 55 44 44 3 99999 77 222222222222222 99999 55 55555 44 3 1 3 3 3 3 000000 0 666 55 3 77 44 111 77777 1 66 0 5 666 44444 0 2 2 555 2 33 3 3 3 2 2 2 33 5 8 33 33 2 2 2 2 2 2 2 5 2 66 5 666 5 2 2 2 2 88888888 33 6666 00000000 4 2 2 333 2 9999 55 333 22222222222222222222222 2 555 55555 55555 2 333 88 4444444 2 22 77 2 2 666666 22 22 88 333 2 555 22 2 2 2 55 2 33 2 2 2 33 999 4 4 5555555555555 4 444 55 2 444 66 5 2 2 2 77777777777777777777777 5 33 2 4 33 2 2 2 2 2 2 666 2 4444 2 2 2 111111111 33 2 2 2 6 55 4 55 666 333 2 2 333 33 888 22 4444444444444 55 22 333 55 22 77777 4 1 00 1 2 7 2 6666 2 2 44444 33 444 2 2 2 11111111111 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 66666 2 2 333333 66 1111111111 2 2 111 1
lowQualScore : . . ...... . . .... ............ . . .. ......... . .......... . . ....... . . ..................................... .. . . .. . .. . .. ... . . ....................................... ................ ...... ....................... .. .. ....... ..... .... .. . ........... .... . . .. . .. .. ... .. . . ........ . ...... . ....... . .. .... ... . . .... ... . . . .................. . ......... .. .............. .. . .. . . ....................................................... . . ... . ..... . . . . . .... . . . .... ....... .................... . .. .. .. . ..... .. ............... ..... .. ..... .. . . . . . . ...... . ... .. . .. .. ... ..... . .. . . ... ..... . . . ... . .. . . . . . . .. . . .. .. . . . . . . . . . .. . ... . . . . . ........ .. .... ........ . . . ... . .... .. ... ....................... . ... ..... ..... . ... .. ....... . .. .. . . ...... .. .. .. ... . ... .. . . . .. . .. . . . .. ... . . ............. . ... .. . ... .. . . . . ....................... . .. . . .. . . . . . . ... . .... . . . ......... .. . . . . .. . .. ... ... . . ... .. ... .. ............. .. .. ... .. .. ..... . . .. . . . . .... . . ..... .. ... . . . ........... . ................................................................. ... ..... . . ...... .. .......... . . ... .
lowQualScore : 0 2 888888 0 0 6666 666666666666 0 1 44 999999999 7 0000000000 5 5 0000000 7 3 8888888888888888888888888888888888888 00 5 7 88 4 66 4 33 888 1 9 000000000000000000000000000000000000000 0000000000000000 555555 88888888888888888888888 66 11 0000000 55555 8888 99 0 11111111111 9999 4 4 33 4 33 11 111 55 0 1 33333333 2 222222 0 4444444 0 77 9999 222 4 4 5555 999 1 9 9 555555555555555555 7 111111111 99 77777777777777 00 4 66 7 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 555 0 11111 0 0 0 0 0 2222 0 0 0 4444 0000000 55555555555555555555 3 00 66 66 3 88888 88 333333333333333 11111 00 11111 66 3 6 3 3 3 3 777777 3 444 00 3 99 66 555 77777 4 22 8 1 222 66666 8 9 9 000 9 99 1 1 1 2 5 7 77 3 0 44 44 5 5 5 5 5 5 5 0 5 99 0 999 0 5 2 2 2 11111111 11 9999 33333333 4 2 2 999 2 2222 33 999 00000000000000000000000 1 888 33333 33333 1 555 88 0000000 0 88 55 0 0 999999 88 88 88 555 1 888 99 1 1 1 88 1 11 2 2 2 11 111 4 4 2222222222222 7 111 66 4 111 99 0 5 5 5 33333333333333333333333 5 44 4 7 11 2 2 2 2 2 2 999 2 7777 2 2 2 111111111 22 2 2 2 7 33 4 33 444 999 2 2 999 11 777 99 4444444444444 33 99 777 88 99 88888 4 5 66 2 4 1 4 2222 4 5 99999 11 444 5 5 5 99999999999 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444 22222 5 5 333333 88 6666666666 9 9 888 8
consensus : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACACC-C---C-GAAT-T-TGCGT--------------------G---------------AC--CACCGCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TTTN----------TTTTTAN-----AA--------TTATT------TATTT------T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-TT--T-ATCGT-GT--CGAAAAAAA--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-ATTT-GTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-A-TGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGTATGCACC------GTATACAT-GTGT--------TTG--TGTAGG-------A---GNGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATA-TCCGTT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--TTCAACATTC-AAGTAC--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-CA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
Reference ( family-1808 ) : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACACC-C---C-GAAT-T-TGCGT--------------------G---------------AC--CACCGCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TTTN----------TTTTTAN-----AA--------TTATT------TATTT------T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-TT--T-ATCGT-GT--CGAAAAAAA--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-ATTT-GTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-A-TGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGTATGCACC------GTATACAT-GTGT--------TTG--TGTAGG-------A---GNGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATA-TCCGTT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--TTCAACATTC-AAGTAC--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-CA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
gi|1 : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCA-GATT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACA-----------AT-T-TACA-------------------------------------AT--CACCGCACCA-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AAGCAAA-CAC----G-T-TG---T-ATT-----T-TTTG----------TTTTTAT-----AA--------TTATT------TTTTT------T------T-----A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCTGTTCGAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-ATA-T-ATTGT-GT--CGAAAAAAG--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TAAAAC------T-GTTT-GTC----ATAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAACTG-----CTTTTT-CTCTCATATATTCATATGAACCCCATTCGTATACAT-GTAT--------TTG--TGTAGG-------G---GGGGCGGCTTTCATGCAGATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGGTA--ATCTGTAATTTTAAAAAATA-CT-A-AATACTCCCTTCAT-CA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTG--------TC----------AT-T--CACTT--ATAATATC-AC-A--TTCAACATTC-AAGTAT--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATCATGATT-AT-CAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGAGAG-G-CAATAA--A-TTAAATCTGC-TAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTAATAA-AC-A--TA-TGT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTA-G-AAT-T-T-TCT--CA-A---TAT-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-AATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AT-----AGAA-AT---TA--TTTT-A-----AA-AAT--CGG--CC-TTA-T---C--GTGAT--T--TT--T---T-AAGTG---A--G-ACTA-C---TTTCA-A--C-AC-G-GC--C--CGT-AA-G------TC-G---GTCGG-AAGG---C--AGACG-A---G--A-A-CCTCGA-C-AG----T--TA-TC-AG--T-CA--ATTAAC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---GAG-TAA-AAA---C--CATAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAG-AGTAATT--ATCAGTACCGACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TCTC-AG-CA-CCAA-----------GAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTCAGTACATTTTGCGT
gi|10 : TTCAAAATAC-AATTA-TAT-TATGTGGTT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCT--CA-AATTTAT-TC-TG-A-AA--TCA--------ATTAA----T--------G--A-TATC-AG---AA-AA----C--AAACAGA----T--TTGTAAA---------A-A---A-----AA-----AAAA-AA---TG--TTTTGA-----AA-AAA--CG---CC-TTA-T---CCTTTGAT--C--TTA-T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--CT-CGCCAA-G------G--G---ATCGC-AGGG---C--GAGCA-A---CTAA-G-CCTCGG-C-AG----A--TA-TCTAA--C-C--------C-CCCA-ATCTACTTC-A---T-ACC-CACAG-T---A-TCTATCCTCA-CTA-GT---------AC--T-TA-TC-AGT-GAAAGTA-CAG-ATAA-C-CCATCACAG-TAA-AA----C--CACAATAAACTATA--C-----------C-ACCT--A----AT---CA--GT--ACCTTTCACAC-AGTACTT---TCA----------------------C-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---ATTC-AGTCA-CCAA-----------CAA-CCACAA-------------T--A-----------TCAGA-T---A----A----------------C---T-----TT-CAG-T------AAA--A------ATACT-GACCACC-TCTCAGTACACTTT
gi|11 : TTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TGG-TTG-A-AAT-T-T-TTT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GT-A-TATC-AG---AT-AA----AT-AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-A-----G--TTTT-A-----CA-AAA--CGG--AC-TTA-T---T--TTGAT--T--TC--T---T-ACATA---A--A-AC-G-C--AATTGC-A--C-AC-T-GC--C--TGC-AA-G------TC-G---ACTGC-AAGG---C--GAACG-A---T--AAG-CCTCAG-C-AG-----------------------AT-ATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----CCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-ACA---CAG-TAA-AAA---C--CACTGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ACT--GT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GTAAAA-A-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AGAT-A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTtt
gi|12 : TTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCAATATATACAT--A----T--------GT-A-TATG-AG---AA-GA----A--GAA---A-----------------------A-A---A-----AATGAGGGAAA-AT---TGA-ATTT-A-----AA-ATA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AT-A-C--ATTTGC-A--T-AC-G-GC--C-------------------------CGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TC-T--------CA--AT--TC-------T-TC--TC-A-G-T-ACC-TACAG-T---A-CAT----TAT-C-A-GTAAATTACTGATA-T-TA-TC-AGTAAAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CTG-TAA-ATA---C--CACAGTAAA-----------------------------T--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCATTT--ATCAGAATCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACT--------------T---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAA--AAA--A------A---T-GA-CA------CGGTACATTTTCCGTccagt
gi|13 : --TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCTTCCA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----TC-------GC-ATTATC-AGAAAAA-AA----A--AAA---A----TTAC-----GT--------ATA---A-----AA-----ATAA-AT---TGCCTTTT-ATATATAT-AAA--CGGGCCT-TTATT---C--TTGAT--T--TT--T---T-GTTTGCTTA--G-AC-A-C--ATTTGC-A--CAAC-G-GCCTC--CGC-AATGTTTTCCTC-GATCATCGC-AAGG---CTTAAAC--A---T--A-GCCCTCGG-C-GT----T--TA-TC-AG--C-CAACATTATCAAGCA-AT-TA--TC-AGG-TAACC-CTCAGCT---ACCTT----TTA-C-A-GT---------ACATT-TA-TCAAGT-AAAT-TATCAG-AT-ACC-CCA---CAGTTAA-AAA---A--CACAGTAAGAT-TA--T-----------CAAGCA--ATT--ATTCGCATTGC--ACC-----CACAAGTAATTAAATTAGTACCAATA-GT-AAA-A-TAGT-CAGTACTTTcaag
gi|14 : T-CAAGA---A-CCAGA-T-A-T-TTTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GA-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----TTTACATATGT-A-TATC-AG---AAGAA----A--AAA---A----T------------------A-G---A-----GG-----GAAA-AT---TGA-TTTT-A-----TA-ATA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C-------------------------TGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-------------GC---T-TC--TC-A-G-T-ACC---------------------TA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CTG-TAA-ATA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCAATT--ATCAGAACCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACTTTA--T--CAA-------TATC-AG---------------------------------------------------------------T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAAAAAAA--A------A---T-GA-CA----CTCGGTACATTTTCCGTcttttcagttaa
gi|15 : gaatAGATA-CT-A-AATA-TCCGTT-AT-CA-CATTGTGGA---ATGC-------TTTAAAAAT--TC----------AT-T--CACTT--C--AT-TC-A--A--TTC--CATTT-A-GTAC------CATGTC-A-A-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT--T-TAA-A-C-ATTG-AATTT---AA--GAAT-AATT--TTT---ATGG-----AAAAAAAACAAAGATAG-A-CATTTA--A-TAAA-TCTGT-CAA-A---A-C-AGG-T-T-T-CTTCAAAA-AC-G--TA-TATGAGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AATAT-G-TTG--CATA---T-T-GC-TG-A-AA-A--A--------A---A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----ACAAAA---A----T--T-----GT--------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-TT----AA-AAA--CGGG-CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTA---ATGG-AC-A-C--ATTTGC-ACCC-AC-G-G---C--CGC-AA-G------TC-G---ATCccag
gi|16 : ttc-A-AATATCT--------AT--A----T-----------A-TATC-AG---AA-AA----C--AAG---A----T--TTTT--G---------A-A---A-----CA-----AGT---T---TC--TTTT-T-----AA-CTA--TGG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TT--------AACCG---A--G-AC-A-T---TTGGC-A--C-AC-G-GC--C---AC-AA-G---------------CTT-AAG----C--GAGTGGA---T--ACG-CCTCGG-C-AG----T--TA-T--AG--C--A--ATTAAT-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-AC------G---------------CA-C-A-AT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AA--TATC-G-A--A---CCA---CAG--AA-A--------TACAGTAAAT--TA--TG----------A-AGCA--ATT--AT----A--GC--A-T-----CAC-AGCAATTA-ATCAGTA-CAACA-GT--AA-A-TA-T-CGGTA----A--A--CAGCAACCTATATT-AT----TTAA-----------TCG-C-------------------------------------------A----A----------------T---T-----AT-C---C------AAA--A------A---T-GA-CG-CGTCTtggggttcttttctccatcaatgattacaat
gi|17 : taaaaacttatatagtaacttaaattatttaagttatacaaccaacaAGAT-TAGCG-GACTGGGTTTG-GTT---------TTGTTGTTT-TGTT---------TT-TGTCTTTATTTCGGGAAAA-ACCTC---C-GAAT-T-TGCGT--------------------G---------------ATTACATAAAACCG-GCA-CC---A-T--ATT-TT-CAGA---A--CAAA------------TG---T-ATT-----TATTTT----------TTTTTAA-----AA--------TAATTCTATGATATTTAG----T------T---------AATA--G--CGAT--------TTGA-----C-------GAC--A--G------A-----TTA-TCTG-A------T-ATCATGGT--CG-AAAAAA--CA---T-CTAATTAT--A--CATTGTAT------TACTAT------T-ATTT-GTC----CAACG--A-GT-CCCGATAAA------ATTTGAAATC-G-TGCTTTT---TTCCAAATATtt
gi|18 : tacgtcaaagtgatctctgtatacgaattattaacgtctcgggaagctcaT---TG--TTTT-T-----CA-AAA--AGG--C--TCA-T---T--TTGATAAT--TT--TCTGT-ACCTG---A--G-CC-AACTAGTTTGC-A----ACTG-GC--GAATGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--TAG-G-A---T--A-G-C------T-AG-------------------CA--AT--TT-AACA-CT-TC--CCGA-G-T-AC----TAG-T---A-ATT----TCA-A-A-GT---------ACA-T-TATTC-AAT-AAA--TATTAG-A--A-T-T-----CAG-TAA-AAC---C--CAGGTTATA---TA--T--------------GCA--GTT--GT---CA--GC--ACC-----CA--AGAAATT--ATTAGTAACAA-A-AT-AAT-A-GG-A-CAGTATATTA--TAACAGC--T---TATT-AG-CACCCAG-----------CAA-C----A-------------CAAA-----------TTCA--T---A----A----------------T---C-----AT-CAG-
gi|19 : --ATTATC-AGCA-AT-TC--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TTA-C-A-TT---------ACT-T-AA-TC-A-T-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAG-AAT---C--CACAGAAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAA-AGCAATC--ATCAGTACCAACG-GT-AGA-A-TA-T-CATTACCTTA--T--------T---GATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----ATACAATCAGTAATC--A-----------T-----TATCA----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTGAGTACATTTTCTGc
gi|2 : ttgcgaggttgccttagtaatcccttgaaatctatctacatACCCC-C---C-GAAT-T-TGCGCATGCTGGACTTGTACAGATAG---------------AC--CACCGCGCCG-ACAACCAAGG-TT-ATT-TTGCAGACTAAGTCAAAACAT----GAT-TG---TTGCT-----T-CTTTAAAGAAAATATTTTTATTCTTAAG--------TTATA------TATCT------T------A-----AT--AATA-CGAACGATATCATAGGTTGAAGAAGCCCTG---GACCCACTGT-----AGATCGTAA-TC-GGAA-TTACTGATCGT-GT--CGAAAAA----CA--TT-TAAGTC-TTAA--CATTGGATAATACATAGTA-------T-ATTG-GTCTTGCAGACTAAATGT-TCCGATTAA----CGATTTTAAATGAA-TGATTTTT-CTCCC-AATATTCGAA-------------TATACATAGTGTG-------TTG--TGTAGA-------ACT-GCACTACTTTTCAT-CAAA-AATaccagtag
gi|2 : ac--ATCTGTA-TGT--ATAAATA-CTTATAATA-TCCAGT-ACGCA-CAT-GTGAATTCATTCTAAAGAATTT--------TC----------ATAA--CATTTTCT--ATATCAA--A--TTC-ACATT---AGTAC------CATCTT-CAA-TATT--G--CAAA--TT-ATT-TAA-C-AT-TGA-ATC-TTAAGAATTC--------AAT-T--T--TTT---ATAGGACAAAAGAGAA-TAAA-ATAG-ACCATTAA--ATTAAAATCTGTCCAA-A---G-ACAGG-TGTGT-CTTCAAAA-AC-A--TA-TATCAGTGT--TT--GG-T-AGTCG-TTG-G-AAT-C-GTTCT--CA-A----AT--C-TGAA-AA-ATC---------AT--AAGGTT--------GC-A-TATCGAG---AT-AAGACCA--AAA---A----T--T-----T---------A-A---AAAAGGAA-----AAAA-ATATCTG--TTTT-A-----AACGAC--CTG--CT-TTA-TACAT--TTGAT--C--TT--A---T-ACCTG---A--GAAC-A-C--AATTGCGA--C-AC-GTGC--C--CGC-AA-G------TC-----ATCGC-AGGAGCTC--GAGCG-A---TACA-G-CCTCGG-C-AA----TAATG-TC-AG--C-CA--ATTACT---CA-AG-TA---------T-ACC-AATAC-T---G-TTT----CCA-C-A-GTC--------ACT-T-TA-TC-AGT-TAA--T-TCA---------TCA----AG-CAACAAA---CAGCACAGT--A---TT--C-----------T-AGTAC-ATT--AT---CA--GC--Acattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatctgtatgtataaatacttataatatccagtacgcacatgtgaattcattctaaagaattttcataacattttctatatcaaattcacattagtaccatcttcaatattgcaaattatttaacattgaatcttaagaattcaattttttataggacaaaagagaataaaatagaccattaaattaaaatctgtccaaagacaggtgtgtcttcaaaaacatatatcagtgtttggtagtcgttggaatcgttctcaaatctgaaaaatcataaggttgcatatcgagataagaccaaaaatttaaaaaaggaaaaaaatatctgttttaaacgacctgctttatacatttgatcttatacctgagaacacaattgcgacacgtgcccgcaagtcatcgcaggagctcgagcgatacagcctcggcaataatgtcagccaattactcaagtataccaatactgtttccacagtcactttatcagttaattcatcaagcaacaaacagcacagtattctagtacattatcagcaat
gi|20 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagatagaccaccgcgccgacaaccaaggttattttgcagactaagtcaaaacatgattgttgcttctttaaagaaaatatttttattcttaagttatatatcttaataatacgaacgatatcataggttgaagaagccctggacccactgtagatcgtaatcggaattactgatcgtgtcgaaaaacatttaagtcttaacattggataatacatagtatattggtcttgcagactaaatgttccgattaacgattttaaatgaatgatttttctcccaatattcgaatatacatagtgtgttgtgtagaactgcactacttttcatcaaaaatcattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtT-A--T--GCT---ATGA-----AA---AT-TAAAGAAAG-G-CATTAA--T-TAAAATATGT-CA--------------------CTTCATAA-AT-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-GA----G--AA----------------------------A-A---A-----AA-----AATA-AT-------TTCT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-C---C--TTGAT--A--TC--T---T-ATCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C-------------------------CAC-AAGG---C--GAGCG-A---TA-A-G-CCTCGG-A-AG----T--TA-TC-AA--T-AT--ATTATat
gi|21 : atgttaacttcgcctttttgtatatatatgatcAAAAAAC--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTTGATA-----TACTAG------T-GTTT-GTC----AGAC---A-GT-CTCGATTAACGATCGATTTGAAACG-A-TTCTCTAT-CTCCCATATGCATATATGCATT------ATGTGCGT-GTGT--------GTG--TGT--------------GCGGTGGCTTTCCT-CAAATAATTT
gi|21 : AGAGAGTTC--ATCTGTGATT-----AAATA-CT-A-ATTA-TCC-TT-AG-CA-CAT-GTGAA---GTGC-------TTT---------C----------AT-T--CATTT--C--TTATA-A--A--TTCAA-ATTG-AA-TAC--ATAAAATGCA-C-A-CATT--aaagagaaagagagagttcatctgtgattaaatactaattatccttagcacatgtgaagtgctttcattcatttcttataaattcaaattgaatacataaaatgcacacatt
gi|22 : aaaaaaccattttaatttacatttgatatactagtgtttgtcagacagtctcgattaacgatcgatttgaaacgattctctatctcccatatgcatatatgcattatgtgcgtgtgtgtgtgtgcggtggctttcctcaaataatttaaagagaaagTGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGACT-AT-TAA-A-CAGTG--AATTT---AA--GAAT-AT-T--TTT---ATGG-----AAGGAAT-TTAAGAGAG-G-CATTAA--A-TAAAATAGGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCAT-A-AC-A--TA-AAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--TA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-GG---GA-AA----A--AAA---A----C--C-----G---------------A-----AA-----AAAT-GT---TG--TTTTAA-----AA-AAA--CGG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---
gi|23 : taaat-A-AT-ATAA--------AT--G----T--------AC-A-TATC-GG---AA-AA----A--TAA---A-----------------------G-A---A-----AA-----AGTA-AT---T---TTTT-A-----AA------CAG--CCATGA-T---C--TTAAT--T--AT--C---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTAC-A--C-TC-G-GA--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGA---C--GCGCG-G---T--A-T-CCTCGG-C-AG----A--GA-TT-AG--C-AC--ATTATC-AGCA-AT--------A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-AA---------ACA-T-CA-TT-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CGG-TAA-AAA---C--CTCAGTAAA---TA--T-----------
gi|24 : c--CCAATA-T--ATT-T--CATA---AATCAAAACAC----A-T--G---T-GAT-----G-TTTAG---------TTTTTAA-----AAAATTATTTTTATT------TATTTAATCTTT------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----ACCTG----AC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AAATTA-T-ATCGT-GT--CGAAAAAAAAACA--TT-T-AAT-----A--CATGTGATA-----TACTAG------T-ATTTTGT-----AGAC---A-GTACCCGATTAA----CGATTTGAAATG-ATTGCTTTTTGCTCCC-AATATT-GTATACAacg
gi|25 : TT-AGCACAT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CGA-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-AC-AAATA-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---CATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----T----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGT
gi|26 : ag--TC-A-G-A-ACC-CACAC-T---A-TTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGTTAAA--TATTAG-A--A-AACCA---CAG-TAA-AAC---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AACA---------------------CCG----CAC-AGCAATT--ACCAGTACCAACA-GT-AAA-A-T---------CT--------CAGTAAT---TATC-AG-CA-T-AA-----------TAT-C----A-------------G--------------------T---G----A----------------T---T-----AT-CAG-T------CAA--A----------T-GA-CA-C-TTTCAGTAAATTTCCCGTccagt
gi|27 : cGAT-TAGCG-GACT----CTGAGTC----------T-TAGTTC-TTTT---------TTATGCT----------GAAAAAAAC-CGTTC-GAAT-TATGCAT--------------------cca
gi|27 : cc-AC--CCA-TG-T--ATT-TT-CAGA---AACCAAA-CAC--------TG-----GTG-----T-TTCG----------TTTTTGT---------------TTATT------TGTTttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccacccatgtattttcagaaaccaaacactggtgtttcgtttttgtttatttgtt
gi|28 : ccgattagcggactctgagtcttagttcttttttatgctgaaaaaaaccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccTT--AT---CAAAGA--ACA-----AAC-AA-AATA--ATCAATACCAACA-GTTAAA-A-CA-T-CTGTAAT--A--T--CAGCAAT---TAGC-AG-TA-CCAA-----------CAG-C----A-------------G--A-----------A-----T---A----AGAATGATTGTCGGCATT---T-----AT-CAG-C------AAATTA------A---T-GA------TCTTTTTATATTTTCCAT
gi|29 : TT------TATTT------T------C-----A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCCG----AT--A-CGC-----AG----TTA-T-----------T-ATCG------------------A--TTATTACTG-T--G--C--CGAACC-----CAGTGT------T-A----GTC----AGAC---A-GT-CCCGATAAA----CGATTcc
gi|3 : ttAATAAT--ATT-TT--AGA---AAT--AA-CACTGTGA-T-TG---TTGTT-----T-TTTAAAATA-----TTTTTAT---------------TTATT------TATTT------T------T-----A---AAAT-GG--CGAT-T-A---GTTGA-----CCCTG----AC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-TTC-T-ATCG--GT--CGAAAAAA---CA--TT-TAAATT-T--A----TTGGTAA-----TACTAGACTAAGT-ATTT-GTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTG--ATG-A-T-CTTTTT-CTCCCAAA-----G-ATG-GCC------GTATACAT-GTG---------TTA--TGT--G-------A---TGTGTGACTTTCAT-C-AATAATT
gi|3 : --ATCTGTA--TTCAAA---TA-CT-A-A-TA-TCCGT--AT-CAACAT--TGGA---ATGC-------TTTAAAAA---TT----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--ATCA-CATTT-A-GTA-------CATGTC-A-A-TAT------------------ATGCT------------------AATT---------AAT-A--T-----------G-----AAAAAAA-TAA-GATAG-A-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAG--T-T-T-CTTCAAAA-AC-A--TA-T-T-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTG--CA-A---TAT-GC-TG-GCAA-ATCA--------TA--A----T--------GC-A-ATTC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--T-----GT--------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTTTA-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTG---A--G-AC-A----ATTTGC-A--C-A--G-G---C--CGC--A-G------T--G---ATCGC-AGGG---C--GAGCG-A---T--A-G--CTC-G-C-AG----A--TA-TC-AG-----A--ATTAT---AC--AT-TA--T--A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T----TC-AGT-AAA--TATCAG-T--A---CCA---CG---AA-AAA---C--CACAGTAGA---TA----------------AGCAGCATT--AT----A--GT--A-C-----CACAAGTACTT---TCA------------------------CAGTACTTTA--T--CAGT-AT---T-TCAAG-CA-CCGA------------AG-C----A-------------C--AATATCAGTAAGT-----T---ATCAGA----------------T---T-----AT-CAG-T------AAC--A------A---TGGA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcatctgtattcaaatactaatatccgtatcaacattggaatgctttaaaaattattcacttcatatcaaatcacatttagtacatgtcaatatatgctaattaatatgaaaaaaataagatagacattaaataaaatctgtcaaaaccagtttcttcaaaaacatattggtgtttggtatcgttggaattgttgcaatatgctggcaaatcataatgcaattcagaaaaaaaaattgtaaaaaaaaaattgtttttaaaaaacggccttatttgattttgttacctgagacaatttgcacaggccgcagtgatcgcagggcgagcgatagctcgcagatatcagaattatacattatagtacccacagtactttcacagtacattcagtaaatatcagtaccacgaaaaaccacagtagataagcagcattatagtaccacaagtactttcacagtactttatcagtatttcaagcaccgaagcacaatatcagtaagttatcagattatcagtaacaatggacactctcagtacattttgcgtca
gi|30 : aataatattttagaaataacactgtgattgttgttttttaaaatatttttatttatttatttttaaaatggcgattagttgaccctgacatgtattatcgaattctatcggtcgaaaaaacatttaaatttattggtaatactagactaagtatttgtcagacagtcccgattaacgatttgatgatctttttctcccaaagatggccgtatacatgtgttatgtgatgtgtgactttcatcaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttc-TA-T-CAGTAATTAA--C--C-GAACT---TATC-AG-TA-CCAA-----------CAA-T----AA------------C--A-----------T-----TT--A----A----------------T---TTAATGAT-CAG-T------AAA--AAAAAAAA---T-GA-CA-C-TCTCAGTATATTATCTGTca
gi|31 : ATCACGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-TAGA---AATCAAA-CAC----A-TGTGGTTT-GTTTGCTGT-TTTT----------TTTTTAC-----TT--------TTATG------TATTT------T------TTTTTCA---AATA-TG--CGccagt
gi|32 : tA----CGATTTGAAATT-A-TGCCTTTT-CTTCCAAATATTCGTATG---------------CAT-GTGT--------ATG--TGT--G-------A---GA------CTTCAT-CAAAAAACTTTA
gi|34 : CTT--C--ATATC-A--A--TTCA-CATTT-A-GTAC------CATGTG-A-A-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAT-A-C-ATagagagagagagag
gi|35 : -----G---------A-A---C-----AA-----AAAA-GT---T---TTTT-A-----AA-AAAAACGA--CC-TAA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-
gi|36 : GAAGTCTAAACAATGGAAAACC-CAGAT-TAGCG-GACT----C-AAG-C---------TT-TAG----TCTG---------TT-TGCC----------GAGAA
gi|38 : T---ATGG-----AAGA----TAAAGA--G-T-CATTAA--A----AATATGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-
gi|39 : A---TG--T-----------A-AACA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AACAATT--ATCAGCACCAACA-GC-ACA-A-
gi|4 : GGAAGTC-AA--------------CAGAT-TAGCC-GGCA----CTGAGCTCTGGTTTGTTT-TAGTTT-TTTTGTTTTTGTTTT-TGGG----------GAAAACACC-C---CCGAAT-TATGCGT--------------------G---------------AC--TATCAAACCGGACGATCAATA-T--ATT-T--CAGA---AAT-AAA-CAC----A-T--G---T-GTT-----T-TAAG----------TTTTTAA-----AA--------ATATT------TATTT------TATTTATT-----ATTTAATA-GG--CGAT-TT----GTTTA-----CCCTG----AC--A-TGT-----T-----TTAATC-G-AA-TT--T-GTCGT-GT--CGAAGAAAA--CAAACA-TTAATT-T--A--C-TTGGATA-------ATAC------T-AGTT-GTCC---AGAC---A-GT-CC-GATTAA----CGATTTGAAATA-T-TGCTTTTT-CTCCCAAATAT-------CACT------GTATACAT-GTGTGTGTGACTTTGCATGCAAT-------ATTGGAGGNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-AGATATCATCT-TAAATTTAAAA-----CT-A-A-TA-TCCGT--AT-CA-CAT-ATGGA----TGC-------TTTAAGAAAATTCCA--------ATAT--CACTT--C--ATATC-A-----TTCA-CATT---AGT-C--A-TATAT---------ATT--G--CTA---TT-AT-ATGATT-AT-TACCA-T-TTGA-ATTTA---AA--GAAT-A--T--TTTT--ATGG-----A-GAAAA-TAAAGATAG-A-CATTGACAA-TAAAATCTGT-CAA-A---ATCCAGGGT-T-T-CTTC-TAA-AC-A--TAATAT-AAGGT--TT--GG-T-T-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTT--TA-AA--TA--GC-TG-A-AA-ATCA--------CT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A----------------C-----G---------A-T---A-----AA-----AAAA-A----TG--TTAT-G-----AA-AAA--CGGATCC-TTA-T---C--TTGAT--G--TT--T---TAACCTG---A--G-AC-A-CTAATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AATG------TC-G---ATCGC-AGGG---C--GAGGG-A---
gi|40 : tacgtcaaaggttggtatctccgttgaattccaatataaatttgtagcactcttaGGGAGTC-AAACACTGGATA-CTACAGCTGTAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGT
gi|41 : GAT-TAGCGTGACT----CTGAGTC---------TT-TAGTTCTTTTT---------TT-TGCT----------GAAAA
gi|5 : -G-AA-TTC-T-ACCGT-GCTGCGAGAAAAA--CA--TT-TTAATT-C--GATCATTGGA-A-----TATCAA------T-GTT--GTC----AGAC---A-G--ACCGATTAA----CGGTTT-AAATG-A-TGCTTTTTTCTTCCAAATATTCGTAT--------------CACAT-GTGA--------TTG--T-TAGATGTCGTCA---GCGGGGG----CAT-CAAATAAaa
gi|5 : g-T--CATTT--C--ATATT-C--A--TTCA-CAT-C-ACTTAC--ATAAAATGCC-C-A--ATT-----CTAGATTT-ATTATGATA-AT-TTG-A-CAGTTA-ATTGT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGATGA-T-CATTAA--A-T-AAATCTGC-GAA-A---A-----G-T-T-T-GTTCA-AA-ACAA--TA-TGT-AGT-T--TT--GGCT-C-TCG--TG-G-AAT-T-A-TCTACTACA---TATAGC-TA-A-GA-AT----------AT--A----T--------GCAA-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A-----------------------A-ATTTA-----AA-----AGAATAT---CGT-TTTT-AT----AA-AAA--C-G--CC-TTA-----A--TTCAT--T--CTTAT---T-ACT-----A--A-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC---GC--C--TGC-AA-G------T------ATCAC-AAGG---C--GAGCG-AATTC--A-G-CCT-GG---AG----T--TA-TC-AGCAC-CA--AAAACA-AGCA-AT-TA--T--A-G-T-ACC-CA-AG-T---T-TAT----TCA-C-ATGT---------ACA-T-TG-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A---CCA---CAA-TAA-AAA---C--AACAGTATA---TA--TATCTAGAAGACC-AGCA--A----AT---CA--------T-----CAC-AGTAATTAGATGAGTACCATCA-GT--AA-A-TA-T-CA----------------TAAT-----TC-AG-CC-AAAA-----------CAGTC----A-------------CAAA-----------T-----C---A----A----------------CAAGT-----AT-CAG-T------atacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaatcatttcatattcattcacatcacttacataaaatgcccaattctagatttattatgataatttgacagttaattgtaagaatattttatggaagaaattaaagatgatcattaaataaatctgcgaaaagtttgttcaaaacaatatgtagttttggctctcgtggaattatctactacatatagctaagaatatatgcaatatcagaaaaaaaaaaatttaaaagaatatcgtttttataaaaacgccttaattcattcttattactaaacacatttgcacacgcctgcaagtatcacaaggcgagcgaattcagcctggagttatcagcaccaaaaacaagcaattatagtacccaagtttattcacatgtacattgtcagtaaatatcagaaccacaataaaaacaacagtatatatatctagaagaccagcaaatcatcacagtaattagatgagtaccatcagtaaatatcataattcagccaaaacagtcacaaatcaacaagtatcagt
gi|6 : ggaattctaccgtgctgcgagaaaaacattttaattcgatcattggaatatcaatgttgtcagacagaccgattaacggtttaaatgatgcttttttcttccaaatattcgtatcacatgtgattgttagatgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaaAGA-GATTC--ATCTGTAATT-----AAATA-CT-A-GATA-TCC-TT-AT-CA-CAT-GGTGA----TGC-------TT----------C----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--TT--ACATTT-AA-TAC--A-A---TGTC-A-A-CATT--G--C-AA--TT-ATTATGATTTAT-TAA-C-A-TTGA-ATTTT---AA----AT-A--T--TTT---AAAG-----GAAAAAA-TAAAGATAG-G-CATTAA--A--AAAATCGTT-CAA-A---A-GCAG----T-T-TTTCATAA-AC-A--T----T-AGTGT--TT--GG-T-A-TC--TTG---AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT--C-TG-A-AA--TCA--------TA--A----T--------GC-A-TATC-AC---AA-AAC---A--AAA---A----T--T-----GTA-------A-A---A-----AA-----AAAA-AA---AG--TTTT-T-----AA-AAA--CGG--CC-T-A-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-AC-TG---A--G-AC-A-T--ATTTGA-A--C-AC-G--C--C--CAC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGT---G--GAGCG-A---TT-A-G-CCTCG--C-AAAATAT--CAATC-AG--CACA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-CCC-CACAG-T---A-CTC----CCA-C-A-GT---------ACT-T-TA-TC-AGC-AAA--TATTAG-T--A-C-CCA---CAG-TAA-AAAAACC--CACAGTATA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACACTT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAAAATCACACTATCAG-T----AATTAT--------C--A-----------G-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAGTT------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTCCATTTTTCGT
gi|7 : agagaagagagAAATA-AA-A-ATTG-TC--TT-AT-CA--AC-GTGGA---GTGT-------TTT--------TC----------AT-T--CACTT--C--ATATT-AGAA--TTCGA--TTC-AA-CAC--ATAAAATGGAAC-A-CATT--GGGCTAA--T-----AT--TT-AT-TAA-A-CAGT-A-GATTT---AA--GAAT-A--T--TTTTTTATTG-----AAGAAAT-TAAA-AGAGCG-CATTGA----TAA---TTGC-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-TTT-ATAT-AC-A--TACTATTAGTCT--TTATGG-TGA-TCGCTTGAG-AAT-T-A-GCT--CA-A---TAT-GC-TT-G-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC------AA-AA----A--AAA---ATTTTT--T-----A---------A-AC--A-----AA-----AAGA-AT---TG--TCTT-A-----AA-AAA--ACG--TC-TTA-T---C--TTGAT--TCGTT--T---A-ACCTG---A--G--C-A-C--ATTTGC-A--C--C-G-A---C--CGCAAA-G------TC-G---ATCGCAAAGG---C--CAGCG-A---TA-A-G-CCTCGG-CAAG----A--TA-TC-G-----CA--CTTTTC-AGCA-ATATA--TC-A-GAT-ACC-CACAG-TAGAA-CTT------ATC-A-GC---------ACT-T-TA-TC-AGC-AAT--TATCAGCA--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TAGTT-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CA--ATGAATT--AT-AGTA-CAACA-GTAAAA-A-TA-TACAGTACTTTATCT--CAGTAAT---TATC-AG-CA--CAA-----------CAG-T----A-------------C--A-----------A-----T---ACAGTA----------------T---T-----ATCCAG-T------AAA--A------AAT-T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTcg
gi|8 : acgCTGGGT--CC-CAGAT-TAGCG-G--T----CTGAGC--------------A---------------------TGTC----------GAAAACACC-CT--C-GAATAT-TGCGT--------------------GGAATTGCTTTTTAAGAC--CACAGAGC-G-GC--CCAATA-TGTATTGTT-CAGA---AATCAAA-CACAT--G-T-GG---T-GTT-----T-TTTT----------TTTTTAA-----GATATT----TTATT------TATTTAC----T------T-----C---AATAGGG--CGGTGTTA---GTTTA-----ACCT----AAC--A-TGTTAAGAG-----TTA--G-G-AA-TTC-T-AT-GT-GT---GAAAAAAA--TA--TT-TTAATA-T--AG-CATTGGAT------TATTAA------CAATTT-ccag
gi|8 : -AGCTA--ATCTGTAATTACATGTAATAACT-A-AATT-TC--TT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTG---------GT--------TC----------AT-CGGTACTT--C--ATATC-A--T--TT--ACATTCTCAATACTGA-AA---GCG-C-A-CAGTGAG--CTCA--TT-ATCATGACT-AC-TAA-A-CAATG---ATTTTGCAA--GAATCA--TTGTTT---ATGG-----A--------------CG-G-CGTTAA--A-TAAAAT-TG--CAA-A---A-Caaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgagctaatctgtaattacatgtaataactaaatttcttatcacatgtggagtggttcatcggtacttcatatcatttacattctcaatactgaaagcgcacagtgagctcattatcatgactactaaacaatgattttgcaagaatcattgtttatggacggcgttaaataaaattgcaaaacggtaatctgtc
gi|9 : ctgggtcccagattagcggtctgagcatgtcgaaaacaccctcgaatattgcgtggaattgctttttaagaccacagagcggcccaatatgtattgttcagaaatcaaacacatgtggtgttttttttttttaagatattttatttatttacttcaatagggcggtgttagtttaacctaacatgttaagagttaggaattctatgtgtgaaaaaaatattttaatatagcattggattattaacaatttaaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgAAATA-CT-A-AATA-TCCGT--AT-CA-CAT-GTGGAT--ATGC-------CTT--------TTTAAAAAATTTAT-T--CACTA--C--ATATC-A--ACATTCA-CATT---AGTAC------CATGTT-C-AATATT--G--CTAA--TTTATTATG-TT-ATCTAA-A-C-TTGA---TTT---AAAAGAAT-A--T--TTTT--ATGG-----AATAAAA-TAAGATAAG-A-CATCAA--A-AAAAATCTGT-CAA-ACAAA-CCAGG-T-T-TTCTTCAACA-AC-A--TA-TAT-GGTGT--TT--GG---A-TCG-TTG-GGAAT-T-G-TTG--CA-A---TATTGCCTG-C-AA-ATCA--------AT--AA---T--------GCGA-TATC-AG---AA-AAC---A--AAA---A----T--T-----GTTAAAAAAAA-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTTTA-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---CG-TTGAT--T--TT--T---T-ACCTGA--A--G-AC-A----ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TCGG---ATCGCGAGGG---CG-GAGCG-A---TA-A-G-CCTCGGAC-AG----A--TA-TC-AG--A-CA--TTAATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACCGCCCAA-TTA-A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACT-TATA-TC-AGTAAAA--TATCAGTA--A-C-C--------------AA---T--TATA-TAAC---TA--T-----------T-AG----ATGAAAT---CA--GCATACC-----CAC-ATTGATTG-ATCggtaatctgtc
blockSeqs : T A AAACC G T GGGT CTCTGGTTTGTT G CT GTTTTTGTT A TTTATTTCGG C C CGTTC A A CATGCTGGACTTGTACAGATAG TA A G AA A GT G TG CTA C A GATTGTTGCTTCTTTAAAGAAAATA AAAAATTATTT CTATGA TATTTATTATTT GG AA ATCATAG AGAAG G CC C AGATCG TCT G A AC G TG TG AAA AA A T CTTAA A AATACA C GACTAAG A TT TTGC TAA T A CGAT AA G G A ATATATGCATTA A TGTGTGACT CA AGATGTCGTCA CA T CT . T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN G T ATC A TCAAA A T T A . GTT G A T TTCA TAAAGAA AAGAAAATTCCA A GG TC . A GAA AA CTCAATACTGAAA TTCA AT GGG AT T T T C C T TTAAG TGC AA C AT TG TTT GACAA A AA T AC CAAT C G CAA T GG G G T A T A AT A G GG AT C G G C A G A T T TC T ATT A C A C T ATATATAC TA AGGT TTACATAT A T G AAA G GACC CA CAG TTGTTAAAAAAA T TTT AAAGG TGAGG T ATC CC ATATAT C AA GC A T ACAT AA CG TA CTG A CTT TG A . A TA G CC A T T CT AAT C T TTTTCCTCGATC A GCT TT G ATT TA A C A A AATATCAATCAGCACA T AA C C CT G G A A G C AGA C ATCC T T T AAATTACTG AT A T A A AG C TA CC TCA T C AAC AG CTA GT ATCTAGAAGACC GC AA TCG TT AT TTTCA A T AA C C A T TTC A T TAA TA CTA A T C AATCACACTAT T ATACAATCAGTAATCATTATCAA AAG TAATG C T AAAAAA TT AAAAAAA G C CC G
blockSeqs : . A TACTA . . . TTT . T . . . A C TCC . A TGGAATTGCTTTTTAAG . C . GA . T . T . C A TGTGATTGTTGTTTTTTAAAATA TTCTTAAG . AATCTTTTA C . GTTA . G . . TAAGAG ATC . . A . T . A . . A TCGAT A A G T . T C G . . . AT G T A GATGGCCG . TG . AATATTG CG T GC . T . A C A TTAAA . . . A . AGT . . . TA . TTTAAAAAATTT A . . . . ACA GA CACTTACATAAA GAAC T GAG . . T . . . . AGTTA . . . T . T . G A T CG ATT . . . . A . . . T . . . C C . . . . . . . . . T . AC C A T . . . . . . A C G . . . . C T . TTTGTAAA . C . . . . A GA . . AT . . CCT . . A . . A . . . . TA . . . . . . TC A T TCGG G . G . . AC C . . . TTATCAGCCAAC T C . A . . . . . . . TA . . . . . C A . . . T T T T AA . . . . . AT . CA C . . AA . G A T AG T . T . TAG . T TCT TA . . . . . . AGAATAAGAATGATTGTCGGCAT . . . . AAAA T ATAC . . CG C
blockSeqs : . . TCC . . . CCT . C . . . C A CCC . . TG . C . A . . . T . C . ATGTGGTTTGTTTGCTGTTTTT AGATATT . TTTTTTCA G . TTA . A . . AG TC . . C . T . C . . T TATA A A C G . G . . . . . G T . A TCGTATG . T . AGAACT GT T AC . A . T C A ACATG . . . T . TT . . . A . AAAAATTC . . . . . A A GAATACATAAA TCA T G . . T . . . . ATTG . . . . . T . G T A A AT . . . . G . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TTTTTTA . . . . . . A TT . . G . . CG . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . TCG . . . . . A . . . . TAATGTCAGCCA T A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . C . . . . . T . GA . . . . . . . C A C . A . TTC . T T CA . . . . . . ACAATATCAGTAAGTTATCAGA . . . . . . AAT . . C C
blockSeqs : . . . . TCT . T . . . C C CTC . . TG . A . . . . . T . C . ATGTGGTGTTTTTTT AAA . ACTTC G . TTA . . . . A TC . . C . T . A . . T ATAG A C C G . T . . . . . A G . A TCGTAT . T . GA AG N NN . N . C A A TAT . . . A . GT . . . G . AAAAATT . . . . . A A CAACACATAAA CAC C G . . T . . . . AGTG . . . . . . . A T G G TT . . . . G . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTACGT . . . . . . T AA . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . TCG . . . . . T . . . . TTATCAGCACCA T A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . C . . . . . . . T G C . . . TC . T T TA . . . . . . CACAATATCAGATAA . . . . . . A . . C C
blockSeqs : . . . TC . . . . . . C CC . . A . . . . . T . C . ATGTGATGTTTAG CTT . AGTT G . TA . . . . A TC . . C . T . A . . A TTA A A G T . T . . . . . A G . A TCGAA . A . GA CG G G . T . . . . . T . GT . . . A . TC . . . . . A A AGTCATAT CCC C G . . T . . . . TTGA . . . . . . . G A T G AT . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTTTG . . . . . . . TA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TCG . . . . . A . . . . ATATCTAACC T A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . C . . . . . . . C . A . . . TA . T T TA . . . . . . ACAATATCAGTAA . . . . . . A . . C G
blockSeqs : . . . CT . . . . . . . . . . T . C . TGTATTTATTTT AAA . TAAT T . TT . . . . A T . . . . T . A . . T GTG A A C C . T . . . . . A G . A CACTG . . . . A . . . . . . . . . A . TT . . . G . TC . . . . . A A TAATACAA TCA T G . . T . . . . TTGA . . . . . . . G A T A AT . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGTA . . . . . . . AT . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TCG . . . . . A . . . . TTATCAATAT T A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . C . . . . . . . C . C . . . GG . T A CA . . . . . . ACAATATCAGTAA . . . . . . A . . C C
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . ATGTGTTTTAAG T . TCA G . . . . . . T G . . . . . . . . . T TTA . A A A . T . . . . . T G . . . . . A . TT . . . G . TC . . . . . A A TAGTACC TGA T G . . C . . . . AGTA . . . . . . . G T T T AT . . . . G . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGT . . . . . . . TA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TCG . . . . . . . . . . AGATTAGCAC T A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . A . C . . . TA . T T AA . . . . . . ACAATATCAGTAT . . . . . . A . . C C
blockSeqs : . . . . . . . TGGTGTTTCG T . TTA . . . . . . . . . . . T TTA . . T A . . . . . . . A . . . . . . . . TT . . . . . C . . . . . A A TAGTACC CCC C G . . T . . . . AATG . . . . . . . A A T A AT . . . . G . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGT . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TCG . . . . . . . . . . ATATCAGACA A A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . C . C . . . TC . T T TA . . . . . . ACAAATTCATAA . . . . . . A . . C G
blockSeqs : . . . . . A . . T . . . . . . . . . GT . . . . . C . . . . . A A AGTACC TCA C G . . . . . . . TTGA . . . . . . . G T G T AA . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCG . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TCG . . . . . . . . . . TTATCAGC T A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . C . . . . . . . T . C . . . CA . T T TA . . . . . . AATTATCAGTAA . . . . . . A . . C C
blockSeqs : . . . . . T A TAGTAC CGC C . . . . . . . . . . . . . . . . T A A G A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . GG . . . . . . . . . . TTATAGCA T A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . C . . . . . . . C . C . . . TA . T T TA . . . . . . ACAATACAGTA . . . . . . A . . . T
blockSeqs : . . . . . AGTACC TTC . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCG . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TC . . . . . . . . . . ATATCAGA A A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . T . C . . . TA . T C C . . . . . . AACATTTAA . . . . . . A . . . G
blockSeqs : . . . . . . . A T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . TG . . . . . . . . . . ATATCGCA . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . C . . . . . . . C . C . . . TA . . T T . . . . . . ACAAATCAA . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . TTCTCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . TA . . . . . . . . . . AGTGA . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . TAA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . .
blockSeqCons : C***** CCC**** CGGTGCTTTAG************************** ATGTGGTGTTTTTTT************************ **** A** TCGCATG*********** GAT*********** TT** ** A**** A* CAGTACAN******* TTGT******************* NTATCAGCA************** C**
originalCons : GGAAGTC-AAACACTGGATA-CC-CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACACC-C---C-GAAT-T-TGCGT--------------------G---------------AC--CACCGCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CAC----G-T-TG---T-GTT-----T-TTTN----------TTTTTAN-----AA--------TTATT------TATTT------T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG---GAC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-TT--T-ATCGT-GT--CGAAAAAAA--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-ATTT-GTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-A-TGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGTATGCACC------GTATACAT-GTGT--------TTG--TGTAGG-------A---GNGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATA-TCCGTT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC----------AT-T--CACTT--C--ATATC-A--A--TTCAACATTC-AAGTAC--A-AACATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---A----T--C-----G---------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AG----T--TA-TC-AG--C-CA--ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
finalCons : GGAAGTC-AAACACTGGAC-----CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACACCCCC----GAAT-T-TGCGCGGTGCTTTAG--------------------------AC--CACCGCGCCG-AC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CACATGTGGTGTTTTTTT------------------------TTTTTAN-----AA--------TTATT------TATTT------T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG----AC--A-TGT-----A-----TTA-TC-G-AA-TT--T-ATCGT-GT--CGAAAAAAA--CA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-ATTT-GTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATGA--TGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGCATG-----------TATACAT-GTGT--------TTG--TGTGAT-----------GNGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAATA-CT-A-AATA-TCCTT--AT-CA-CAT-GTGGA---GTGC-------TTT--------TC----------AT-T--CACTT--C--ATATC-AA----TTCA-CATTCAGTACAN-------ATGCC-C-A-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-G-CATTAA--A-TAAAATCTGT-CAA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TAT-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T--------GC-A-TATC-AG---AA-AA----A--AAA---ATTGT-------------------A-A---A-----AA-----AAAA-AT---TG--TTTT-A-----AA-AAA--CGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CGC-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-AGNTATCAGCA--------------ATTATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT-AAA--TATCAG-A--A-C-CCA---CAG-TAA-AAA---C--CACAGTAAA---TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CAC--TCTCAGTACATTTTCCGT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TGTTAACTTCGCCTTTTTGTATAGTATTGATCTATGATCAATAGCGTGAAAGGAGACATTCGATTAGAATTTATT
Unaligned ( gi|37 ): GATGTTACTGGTATCTTGAATCTTCTCGATATATTGAGAATCATATTTACATGTGTATA
Unaligned ( gi|42 ): ATGTTAACTTCGCCTTTTTGTATATTAGCCTGTGATTCATAGCA
Alignments
lowQualScore : 1 555555555 1111 222222222222 222222222 2222222222 1 888888888888888888888888888888 1 11 11111 111111111 3333333333333333333333333333333333 111111 3333333333333333333 1111111 11111 11111111 22222222222 22 111111 1111111 1111 111 3333333333333333333 2222222 66666666666666666666666666 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222 1111 55555555555555555555555555555 11111 333333333333333333 222222 111 11111111 1111 222222222222222222222 11111111 1111111 1111111111111 11 2222222222222222222 111111111 1111111111111 11 11111111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111111111 111
lowQualScore : 0 3 777777777 5 5 0000 222222222222 5 0 77 222222222 5 5555555555 2 2 99999 6 3 888888888888888888888888888888 0 6 66 2 4 00 4 66 777 1 4 00000 888 4 777777777 7777777777777777777777777777777777 111111 55 4444444444444444444 55 66 8888888 22222 22222222 5 66666666666 5555 8 88 4 66 66 55 4 777 4 4 55 99 3 333333 1 6666666 4 4 0 3333 222 4 4 8888 999 1 8 7 8888888888888888888 4444444 999 44444444444444444444444444 66 1 33 5 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 1 888 5 44444 4 4 4 3 55 88 4 4 4 4 7777 00000000000000000000000000000 3 88 99 00000 3 44 9 3 3 777777777777777777 44 44 44 3 3 44 3 3 3 000000 0 666 666 3 77 44 111 77777 1 66 0 5 3 3 44444 0 2 2 555 2 33 3 3 3 2 2 2 33 5 8 33 33 2 2 2 2 2 2 2 5 2 66 2 666 2 5 2 2 2 2 66666666 33 6666 2 4 2 2 333 2222 2 999999999999999999999 2 22 55555 55555 333 33333333 0000000 2 22 2 55 2 2 666666 22 22 88 333 2 555 22 2 2 2 55 2 33 2 2 2 33 999 2 2 4 5555555555555 4 444 55 2 444 66 5 2 333 33 1 2 3333333333333333333 2 4 33 2 2 2 2 2 2 666 2 4444 2 2 2 111111111 33 2 2 2 99 2 77 2 666 333 2 2 333 33 333 55 22 4444444444444 55 22 333 55 22 77777 4 1 00 1 2 7 2 4444 2 2 44444 33 444 2 2 2 11111111111 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 66666 2 2 333333 66 1111111111 2 2 111 1
lowQualScore : . . ......... . . .... ............ . . .. ......... . .......... . . ..... . . .............................. . . .. . . .. . .. ... . . ..... ... . ......... .................................. ...... .. ................... .. .. ....... ..... ........ . ........... .... . .. . .. .. .. . ... . . .. .. . ...... . ....... . . . .... ... . . .... ... . . . ................... ....... ... .......................... .. . .. . . ....................................................... . . ... . ..... . . . . .. .. . . . . .... ............................. . .. .. ..... . .. . . . .................. .. .. .. . . .. . . . ...... . ... ... . .. .. ... ..... . .. . . . . ..... . . . ... . .. . . . . . . .. . . .. .. . . . . . . . . . .. . ... . . . . . . ........ .. .... . . . . ... .... . ..................... . .. ..... ..... ... ........ ....... . .. . .. . . ...... .. .. .. ... . ... .. . . . .. . .. . . . .. ... . . . ............. . ... .. . ... .. . . ... .. . . ................... . . .. . . . . . . ... . .... . . . ......... .. . . . .. . .. . ... ... . . ... .. ... .. .. ............. .. .. ... .. .. ..... . . .. . . . . .... . . ..... .. ... . . . ........... . ................................................................. ... ..... . . ...... .. .......... . . ... .
lowQualScore : 0 2 222222222 0 0 6666 666666666666 0 1 44 999999999 7 0000000000 5 5 55555 7 3 222222222222222222222222222222 8 7 99 5 4 66 4 33 888 1 4 77777 000 4 000000000 6666666666666666666666666666666666 555555 55 0000000000000000000 66 11 0000000 55555 22222222 0 11111111111 9999 9 33 4 33 11 55 6 888 0 0 55 55 2 222222 0 4444444 0 0 7 9999 222 4 4 5555 999 1 9 3 6666666666666666666 3333333 000 99999999999999999999999999 00 4 99 7 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 555 0 11111 0 0 0 4 55 66 0 0 0 0 4444 33333333333333333333333333333 6 66 22 99999 3 66 9 3 3 111111111111111111 22 66 66 3 7 77 3 3 3 777777 3 444 444 3 99 66 555 77777 4 22 8 1 1 1 66666 8 9 9 000 9 99 1 1 1 2 5 7 77 3 0 44 44 5 5 5 5 5 5 5 0 5 99 5 999 5 0 5 2 2 2 11111111 11 9999 2 4 2 2 999 2222 2 333333333333333333333 1 99 33333 33333 777 22222222 0000000 0 88 0 55 0 0 999999 88 88 88 555 1 888 99 1 1 1 88 1 11 2 2 2 11 111 2 2 4 2222222222222 7 111 66 4 111 99 0 4 555 22 8 6 1111111111111111111 4 7 11 2 2 2 2 2 2 999 2 7777 2 2 2 111111111 22 2 2 2 77 2 55 2 444 999 2 2 999 11 777 00 99 4444444444444 33 99 777 88 99 88888 4 5 66 2 4 1 4 7777 4 5 99999 11 444 5 5 5 99999999999 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444 22222 5 5 333333 88 6666666666 9 9 888 8
consensus : GGAAGTC-AAACACTGGATA--C----CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACACCC--CC-GAAT-T-TGCGT--GN---TG--CTT-------T---AGACCACCGCGCCGAC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CACATG--TGG--T-GTT-----T---TTTT----------TT------TTTAN-----AA----TTATT------TA--TTT--T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG----A---CA-TGT-----A-----TTA-TC-G-AATT--T-ATCGT-GT--CG--AAAAAAACA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-A-TTTGTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-A-TGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGCATG-----------TATACAT-------GTGT-TTGTG--------T-G----A--T-------GCGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAAT-ACT-A-AATAT--CC-TT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTGCT-------TT--------TC----------AT-T--CACTTC--ATATCA--A--TTCA-CAT--TCA-GT-AC---ACA---TGCC-CA-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-GC-ATTAA--AT-AAAATCTGTC-AA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TA-T-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-AG---AAAA----A-AAA---A---TT--GT--------A-A--A-----AA-----A---AAAAT---T-G--TTTT-A-----AA-AAA--C-GG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CG-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-A--GNTATCAG------CA--ATT-ATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACAG-TAA-AAA---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
Reference ( family-1808 ) : GGAAGTC-AAACACTGGA----C----CAGAT-TAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACACCC--CC-GAAT-T-TGCGC--GG---TG--CTT-------T---AGACCACCGCGCCGAC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AATCAAA-CACATG--TGG--T-GTT-----T---TTTT----------TT------TTTAN-----AA----TTATT------TA--TTT--T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----CCCTG----A---CA-TGT-----A-----TTA-TC-G-AATT--T-ATCGT-GT--CG--AAAAAAACA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TANTAN------T-A-TTTGTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAAATG-A-TGCTTTTT-CTCCCAAATATTCGCATG-----------TATACAT-------GTGT-TTGTG--------T-G----A--T-------GNGGTGGCTTTCAT-CAAATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGNTA--ATCTGTAATTTCAAAAAAT-ACT-A-AATAT--CC-TT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTGCT-------TT--------TC----------AT-T--CACTTC--ATATCA--A--TTCA-CAT--TCA-GT-AC---ANA---TGCC-CA-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAN-TAAAGANAG-GC-ATTAA--AT-AAAATCTGTC-AA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TA-T-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-AG---AAAA----A-AAA---A---TT--GT--------A-A--A-----AA-----A---AAAAT---T-G--TTTT-A-----AA-AAA--C-GG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CG-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-A--GNTATCAG------CA--ATT-ATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACAG-TAA-AAA---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTCCGT
gi|1 : GGAAGTC-AAACACTGGATAC-C----CAGAT-TAGCA-GATT----CTGAGCC---------TT-TAGTTC-TTTT---------TT-TGCC----------GAAAACA----------AT-T-TACA----------------------------ATCACCGCACCAAC--CCAATA-T--ATT-TT-CAGA---AAGCAAA-CAC--G--TTG--T-ATT-----T---TTTG----------TT------TTTAT-----AA----TTATT------TT--TTT--T------T-----A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCTGTTCGA---CA-TGT-----A-----TTA-TC-G-AAATA-T-ATTGT-GT--CG--AAAAAAGCA--TT-TTAATT-T--A--CATTGGATA-----TAAAAC------T-G-TTTGTC----ATAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTGAACTG-----CTTTTT-CTCTCATATATTCATATGAACCCCATTCGTATACAT-------GTAT-TTGTG--------TAG----G--G-------GGGGCGGCTTTCATGCAGATAATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-AGGTA--ATCTGTAATTTTAAAAAAT-ACT-A-AATACTCCC-TTCAT-CA-CAT-GTGGA---GTGCT-------TG--------TC----------AT-T--CACTTATAATATCAC-A--TTCAACAT--TCAAGT-AT---AAACA-TGCC-CA-CATT--G--CTAA--TT-ATCATGATT-AT-CAA-A-C-GTGA-AATTT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGAGAG-GC-AATAA--AT-TAAATCTGCT-AA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTAATAA-AC-A--TA-TGT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTA-G-AAT-T-T-TCT--CA-A---TA-T-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-AATC-AG---AAAA----A-AAA---A---TC--G---------A-A--A-----AT-----A---GAAAT---T-A--TTTT-A-----AA-AAT--C-GG--CC-TTA-T---C--GTGAT--T--TT--T---T-AAGTG---A--G-ACTA-C---TTTCA-A--C-AC-G-GC--C--CG-T-AA-G------TC-G---GTCGG-AAGG---C--AGACG-A---G--A-A-CCTCGA-C-A--GTTATCAGT-----CA--ATT-AAC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CAGAG-TAA-AAA---C--CATAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAG-AGTAATT--ATCAGTACCGACA-GT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TCTC-AG-CA-CCAA-----------GAG-C----A-------------C--A-----------T-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTCAGTACATTTTGCGT
gi|10 : TTCAAAATAC-AATTA-TAT-TATGTGGTT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCT--CA-AATTTA-T-TC-TG-A-AA--TCA--------ATTAA----T-G--A-TATC-AG---AAAA----C-AAACAGA---TTT-GT--------A-A--A-----AA-----AAAAAAAAA---T-G--TTTTGA-----AA-AAA--C--G--CC-TTA-T---CCTTTGAT--C--TTA-T---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--CT-CGCC-AA-G-------G-G---ATCGC-AGGG---C--GAGCA-A---CTAA-G-CCTCGG-C-A--GATATC--------TA--ACC-CCC---CA-ATCTACTTC-A---T-ACC-CACAG-T---A-TCTATCCTCA-CTA-GT---------AC--T-TA-TC-AGTGAAAG-TA-CAGATA-A-C-CCATCACAG-T-A-AAA---C--CACAATAAACTA--TA--C-----------C-ACC----TA--AT---CA--GT--ACCTTTCACAC-AGTACTT---TC---------------------A-C-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---ATTC-AGTCA-CCAA-----------CAA-CCACAA-------------T--A-----------TCAGA-T---A----A----------------C---T-----TT-CAG-T------AAA--A------ATACT-GACCACC-TCTCAGTACACTTT
gi|11 : TTCATAA-AC-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TGG-TTG-A-AAT-T-T-TTT--CA-A---TA-T-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GT-A-TATC-AG---ATAA----ATAAA---A---TC--G---------A-A--A-----AA-----A---AAAA------G--TTTT-A-----CA-AAA--C-GG--AC-TTA-T---T--TTGAT--T--TC--T---T-ACATA---A--A-AC-G-C--AATTGC-A--C-AC-T-GC--C--TG-C-AA-G------TC-G---ACTGC-AAGG---C--GAACG-A---T--AAG-CCTCAG-C-A--GATATC--------------------AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----CCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-A---CACAG-TAA-AAA---C--CACTGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ACT--GT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-GTAAAA-A-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AGAT-A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTtt
gi|12 : TTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TA-T-GC-TG-A-AA-ATCAATATATACAT--A----T-GT-A-TATG-AG---AAGA----A-GAA---A-----------------A-A--A-----AATGAGGG---AAAAT---T-GA-ATTT-A-----AA-ATA--C-GG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AT-A-C--ATTTGC-A--T-AC-G-GC--C--------------------------CGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-A--GTTCT---------CA--AT---TC-------T-TC--TC-A-G-T-ACC-TACAG-T---A-CAT----TAT-C-A-GTAAATTACTGATA-T-TA-TC-AGTA-AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACTG-TAA-ATA---C--CACAGTAA---A----------------------------T--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCATTT--ATCAGAATCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACT--------------T---TATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAA--AAA--A------A---T-GA-CA------CGGTACATTTTCCGTccagt
gi|13 : --TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-TTG-TCTTCCA-A---TA-T-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----TCGC-ATTATC-AGAAAAAAA----A-AAA---A---TTACGT--------ATA--A-----AA-----A---TAAAT---T-GCCTTTT-ATATATAT-AAA--C-GGGCCT-TTATT---C--TTGAT--T--TT--T---T-GTTTGCTTA--G-AC-A-C--ATTTGC-A--CAAC-G-GCCTC--CG-C-AATGTTTTCCTC-GATCATCGC-AAGG---CTTAAAC--A---T--A-GCCCTCGG-C-G--TTTATCAGC-----CAACATT-ATCAAGCA-AT-TA--TC-AGG-TAACC-CTCAGCT---ACCTT----TTA-C-A-GT---------ACATT-TA-TCAAGT--AAATTATCAG--ATACC-C---CACAGTTAA-AAA---A--CACAGTAA---GATTA--T-----------CAAGCA--ATT--ATTCGCATTGC--ACC-----CACAAGTAATTAAATTAGTACCAATA-GT-AAA-A-TAGT-CAGTACTTTcaag
gi|14 : TC-AAGA---A-CCAGA-T-A-T-TTTCATAA-AC-A--TG-TAT-GGTGT--TT--GA-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CG-A---TA-T-GC-TG-A-AA-ATCAATATTTACAT--A----T-GT-A-TATC-AG---AAGA----A-AAA---A-------AT--------A-G--A-----GG-----G---AAAAT---T-GA-TTTT-A-----TA-ATA--C-GG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--------------------------TGC-AAGG---C--GAGCG-A---T--A-G-CCTCGG-C-A--GTTATCAG------C------------GC---T-TC--TC-A-G-T-ACC---------------------TA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACTG-TAA-ATA---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGCAATT--ATCAGAACCAACA-GT-AAA-ATTC-T-CAGTACTTTA--T--CAA-------TATC-AG---------------------------------------------------------------T---A----A----------------T---T-----AT-CAG-TAAAAAAAAA--A------A---T-GA-CA----CTCGGTACATTTTCCGTcttttcagttaa
gi|15 : gaatAGAT-ACT-A-AATAT--CCGTT-AT-CA-CATTGTGGA---ATGCT-------TTAAAAAT--TC----------AT-T--CACTTC--AT-TCA--A--TTC--CAT--TTA-GT-AC----CA---TGTC-AA-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT--T-TAA-A-C-ATTG-AATTT---AA--GAAT-AATT--TTT---ATGG-----AAAAAAAACAAAGATAG-AC-ATTTA--AT-AAA-TCTGTC-AA-A---A-C-AGG-T-T-T-CTTCAAAA-AC-G--TA-TATGAGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AATAT-G-TTG--C--A---TATT-GC-TG-A-AA-A--A--------A---A----T-GC-A-TATC-AG---AAAAAC--A-AAA---A---TT--GT--------A-A--A-----AA-----A---AAAAT---T-GT-TTTT-T-----AA-AAA--CGGG--CC-TTA-T---C--TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTA---ATGG-AC-A-C--ATTTGC-ACCC-AC-G-G---C--CG-C-AA-G------TC-G---ATCccag
gi|16 : ttc-A-AATATCT--------AT--A----T----A-TATC-AG---AAAA----C-AAG---A---TT--TT--------T-G--A-----AA-----C---AAGTT---T-C--TTTT-T-----AA-CTA--T-GG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TT--------AACCG---A--G-AC-A-T---TTGGC-A--C-AC-G-GC--C---A-C-AA-G---------------CTT-AAG----C--GAGTGGA---T--ACG-CCTCGG-C-A--GTTAT-AG------CA--ATT-AAT-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-AC------G---------------CA-C-A-AT---------ACA-T-TA-TC-AGT---AA-TATC-G--A-A---C---CACAG--AA-A--------TACAGTAA---AT-TA--TG----------A-AGCA--ATT--AT----A--GC--A-T-----CAC-AGCAATTA-ATCAGTA-CAACA-GT--AA-A-TA-T-CGGTA----A--A--CAGCAACCTATATT-AT----TTAA-----------TCG-C-------------------------------------------A----A----------------T---T-----AT-C---C------AAA--A------A---T-GA-CG-CGTCTtggggttcttttctccatcaatgattacaat
gi|17 : taaaaacttatatagtaacttaaattatttaagttatacaaccaacaAGAT-TAGCG-GACTGGGTTTG-GTT---------TTGTTGTTT-TGTT---------TT-TGTCTTTATTTCGGGAAAA-ACCT--CC-GAAT-T-TGCGT--GA---TT--ACA-------T---AAA--ACCG-GC--AC--C----A-T--ATT-TT-CAGA---A--CAAA-T---------G--T-ATT-----TA--TTTT----------TT------TTTAA-----AA----TAATTCTATGATA--TTTAGT------T---------AATA--G--CGAT--------TTGA-----C---G----A---CA--G------A-----TTA-TCTG-A-----T-ATCATGGT--CG---AAAAAACA---T-CTAATTAT--A--CATTGTAT------TACTAT------T-A-TTTGTC----CAACG--A-GT-CCCGATAAA------ATTTGAAATC-G-TGCTTTT---TTCCAAATATtt
gi|18 : tacgtcaaagtgatctctgtatacgaattattaacgtctcgggaagctcaT---T-G--TTTT-T-----CA-AAA--A-GG--C--TCA-T---T--TTGATAAT--TT--TCTGT-ACCTG---A--G-CC-AACTAGTTTGC-A----ACTG-GC--GAATG-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGG---C--TAG-G-A---T--A-G-C----------------TAG------CA--AT---TT-AACA-CT-TC--CCGA-G-T-AC----TAG-T---A-ATT----TCA-A-A-GT---------ACA-T-TATTC-AAT--AAA-TATTAG--A-A-T-T-----CAG-TAA-AAC---C--CAGGTTAT---A--TA--T--------------GCA--GTT--GT---CA--GC--ACC-----CA--AGAAATT--ATTAGTAACAA-A-AT-AAT-A-GG-A-CAGTATATTA--TAACAGC--T---TATT-AG-CACCCAG-----------CAA-C----A-------------CAAA-----------TTCA--T---A----A----------------T---C-----AT-CAG-
gi|19 : -CCTTGA-A-A--TCTATCTA------CAT-ATT-ATC-AGCA-AT-TC--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TTA-C-A-TT---------ACT-T-AA-TC-A-T--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACAG-TAG-AAT---C--CACAGAAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAA-AGCAATC--ATCAGTACCAACG-GT-AGA-A-TA-T-CATTACCTTA--T--------T---GATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----ATACAATCAGTAATC--A-----------T-----TATCA----A----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA----CTGAGTACATTTTCTGc
gi|2 : ttgcgaggttgccttagtaatcACACCC--CCCGAAT-T-TGCGCATGC---TGGACTTGTACAGAT---AGACCACCGCGCCGACAACCAAGG-TT-ATT-TTGCAGACTAAGTCAAA--ACATGATTGT--T-GCT-----T---CTTTAAAGAAAATATT------TTTATTCTTAAG----TTATA------TA--TCT--T------A-----AT--AATA-CGAACGATATCATAGGTTGAAGAAGCCCTG----GACCCACTGT-----AGATCGTAA-TC-GGAATTACTGATCGT-GT--CG--AAAAA--CA--TT-TAAGTC-TTAA--CATTGGATAATACATAGTA-------T-A-TTGGTCTTGCAGACTAAATGT-TCCGATTAA----CGATTTTAAATGAA-TGATTTTT-CTCCC-AATATTCGAA-------------TATACATA------GTGTGTTGTG--------TAG----AACT-------GCACTACTTTTCAT-CAAA-AATaccagtag
gi|2 : --ATCTGTA-TGT--ATAAAT-ACTTATAATAT--CCAGT-ACGCA-CAT-GTGAATTCATTCTAAAGAATTT--------TC----------AT-AA-CATTTTCTATATCA--AA-TTCA-CAT--T-A-GT-AC----CA---TCTT-CAATATT--G--CAAA--TT-ATT-TAAC--AT-TGA-ATC-TTAAGAATTC---AA-----T-T--T--TTT---ATAGGACAAAAGAGAA-TAAA-ATAG-ACCATTAA--ATTAAAATCTGTCCAA-A---G-ACAGG-TGTGT-CTTCAAAA-AC-A--TA-TATCAGTGT--TT--GG-T-AGTCG-TTG-G-AAT-C-GTTCT--CA-A----A-T--C-TGAA-AA-ATC---------AT--AAGGTT-GC-A-TATCGAG---ATAAGACCA-AAA---A---TT---T--------A-A--AAAAGGAA-----A---AAAATATCT-G--TTTT-A-----AACGAC--C-TG--CT-TTA-TACAT--TTGAT--C--TT--A---T-ACCTG---A--GAAC-A-C--AATTGCGA--C-AC-GTGC--C--CG-C-AA-G------TC-----ATCGC-AGGAGCTC--GAGCG-A---TACA-G-CCTCGG-C-AATAATGTCAGC-----CA--ATT-ACT---CA-AG-TA---------T-ACC-AATAC-T---G-TTT----CCA-C-A-GTC--------ACT-T-TA-TC-AGT--TAA-T-TCA---------T---CA-AG-CAACAAA---CAGCACAGT-----A--TT--C-----------T-AGTAC-ATT--AT---CA--GC--Acattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatctgtatgtataaatacttataatatccagtacgcacatgtgaattcattctaaagaattttcataacattttctatatcaaattcacattagtaccatcttcaatattgcaaattatttaacattgaatcttaagaattcaattttttataggacaaaagagaataaaatagaccattaaattaaaatctgtccaaagacaggtgtgtcttcaaaaacatatatcagtgtttggtagtcgttggaatcgttctcaaatctgaaaaatcataaggttgcatatcgagataagaccaaaaatttaaaaaaggaaaaaaatatctgttttaaacgacctgctttatacatttgatcttatacctgagaacacaattgcgacacgtgcccgcaagtcatcgcaggagctcgagcgatacagcctcggcaataatgtcagccaattactcaagtataccaatactgtttccacagtcactttatcagttaattcatcaagcaacaaacagcacagtattctagtacattatcagcaat
gi|20 : acaccccccgaatttgcgcatgctggacttgtacagatagaccaccgcgccgacaaccaaggttattttgcagactaagtcaaaacatgattgttgcttctttaaagaaaatatttttattcttaagttatatatcttaataatacgaacgatatcataggttgaagaagccctggacccactgtagatcgtaatcggaattactgatcgtgtcgaaaaacatttaagtcttaacattggataatacatagtatattggtcttgcagactaaatgttccgattaacgattttaaatgaatgatttttctcccaatattcgaatatacatagtgtgttgtgtagaactgcactacttttcatcaaaaatcattataatgtgagtaagagtaatggatgaagacaggagacgagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtT-A--T--GCT---ATGA-----AA---AT-TAAAGAAAG-GC-ATTAA--TT-AAAATATGTC-A--------------------CTTCATAA-AT-A--TA-TAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--CA-A---TA-T-AC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-AG---AAGA----G-AA----------------------A-A--A-----AA-----A---ATAAT--------TTCT-A-----AA-AAA--C-GG--CC-TTA-C---C--TTGAT--A--TC--T---T-ATCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--------------------------CAC-AAGG---C--GAGCG-A---TA-A-G-CCTCGG-A-A--GTTATCAA------TAT-ATT-ATat
gi|21 : atgttaacttcgcctttttgtatatatatgatc--AAAAAACCA--TT-TTAATT-T--A--CATTTGATA-----TACTAG------T-G-TTTGTC----AGAC---A-GT-CTCGATTAACGATCGATTTGAAACG-A-TTCTCTAT-CTCCC--ATAT--GCATA-----------TATGCATTATGTGCGTGT-GTGTG--------T-G-------T-------GCGGTGGCTTTCCT-CAAATAATTT
gi|21 : AGAGAGTTC--ATCTGTGATT-----AAAT-ACT-A-ATTAT--CC-TT-AG-CA-CAT-GTGAA---GTGC--------TT--------TC----------AT-T--CATTTC--TTATAA--A--TTCA-AAT--TGA-AT-ACATAAAA---TGCA-CA-CATT--aaagagaaagagagagttcatctgtgattaaatactaattatccttagcacatgtgaagtgctttcattcatttcttataaattcaaattgaatacataaaatgcacacatt
gi|22 : aaaaaaccattttaatttacatttgatatactagtgtttgtcagacagtctcgattaacgatcgatttgaaacgattctctatctcccatatgcatatatgcattatgtgcgtgtgtgtgtgtgcggtggctttcctcaaataatttaaagagaaag---TGCC-CA-CATT--G--CTAA--TT-ATTATGACT-AT-TAA-A-CAGTG--AATTT---AA--GAAT-AT-T--TTT---ATGG-----AAGGAAT-TTAAGAGAG-GC-ATTAA--AT-AAAATAGGTC-AA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCAT-A-AC-A--TA-AAT-AGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TCT--TA-A---TA-T-GC-TG-A-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-GG---GAAA----A-AAA---A---CC--G--------------A-----AA-----A---AATGT---T-G--TTTTAA-----AA-AAA--C-GG--TC-TTA-T---C--TTGAT--T--TT--T---
gi|23 : taaat-A-AT-ATAA--------AT--G----T-AC-A-TATC-GG---AAAA----A-TAA---A-----------------G-A--A-----AA-----A---GTAAT---T----TTTT-A-----AA------C-AG--CCATGA-T---C--TTAAT--T--AT--C---T-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTAC-A--C-TC-G-GA--C--CG-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGA---C--GCGCG-G---T--A-T-CCTCGG-C-A--GAGATTAG------CAC-ATT-ATC-AGCA-AT--------A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-AA---------ACA-T-CA-TT-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACGG-TAA-AAA---C--CTCAGTAA---A--TA--T-----------
gi|24 : c--CCAATA-T--ATT-T--CATA---AATCAAAACACATG--TGA--T-GTT-----TAGTTTTTAAAAAATTA-TT------TTTAT-----------TTATT------TAATCTT--T------T-----A---AATA-GG--CGAT-TTA---GTTGA-----ACCTG----A---CA-TGT-----A-----TTA-TC-GAAATTA-T-ATCGT-GT--CGAAAAAAAAACA---T-TTAA---T--A--CATGTGATA-----TACTAG------T-ATTTTGT-----AGAC---A-GTACCCGATTAA----CGATTTGAAATG-ATTGCTTTTTGCTCCC-AATAT-----TG-----------TATACAacg
gi|25 : TT-AGCACAT-TA--TC-A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A-C-C---CACGA-TAA-AAA---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACA-AC-AAATA-TC-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---CATC-AG-CA-CCAA-----------CAG-C----A-------------CA-A-----------TATCAGT---A----T----------------T---T-----AT-CAG-T------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGT
gi|26 : ag--TC-A-G-A-ACC-CACAC-T---A-TTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T-TA-TC-AGTT-AAA-TATTAG--A-A-AAC---CACAG-TAA-AAC---C--CACAGTAA---A--TA--T-----------C-AACA---------------------CCG----CAC-AGCAATT--ACCAGTACCAACA-GT-AAA-A-T---------CT--------CAGTAAT---TATC-AG-CA-T-AA-----------TAT-C----A-------------G--------------------T---G----A----------------T---T-----AT-CAG-T------CAA--A----------T-GA-CA-C-TTTCAGTAAATTTCCCGTccagt
gi|27 : cGAT-TAGCG-GACT----CTGAGTC----------T-TAGTTC-TTTT---------TTATGCT----------GAAAAAAACCGTTC-GAAT-TATGCAT---T---TA--CTT-------T---AGcca
gi|27 : ccAC--CCA-TG-T--ATT-TT-CAGA---AACCAAA-CAC-----TGG--T-GTT-----T---CGTT----------TT------TGT-------------TTATT------TG--TTcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccacccatgtattttcagaaaccaaacactggtgtttcgtttttgtttatttgtt
gi|28 : ccgattagcggactctgagtcttagttcttttttatgctgaaaaaaaccgttcgaattatgcatttactttagcaatgttcaattctagcaatcccaataagcccacatcgaaaacaccTT--AT---CAAAGA--ACA-----AAC-AA-AATA--ATCAATACCAACA-GTTAAA-A-CA-T-CTGTAAT--A--T--CAGCAAT---TAGC-AG-TA-CCAA-----------CAG-C----A-------------G--A-----------A-----T---A----AGAATGATTGTCGGCATT---T-----AT-CAG-C------AAATTA------A---T-GA------TCTTTTTATATTTTCCAT
gi|29 : TT------TA--TTT--T------C-----A---AATA-GG--CGGT-TTA---GTTGA-----CCCCG----A---TA-CGC-----AG----TTA-T----------T-ATCG------------------A--TTATTACTG-T--G--C--CGAACC-----CAGTGT------T-A----GTC----AGAC---A-GT-CCCGATAAA----CGATTcc
gi|3 : ttAATAAT--ATT-TT--AGA---AAT--AA-CAC-TG--TGA--TTGTT-----G---TTTT----------TTAAAATATTTTT-----AT----TTATT------TA--TTT--T------T-----A---AAAT-GG--CGAT-T-A---GTTGA-----CCCTG----A---CA-TGT-----A-----TTA-TC-G-AATTC-T-ATCG--GT--CG--AAAAAA-CA--TT-TAAATT-T--A----TTGGTAA-----TACTAGACTAAGT-A-TTTGTC----AGAC---A-GT-CCCGATTAA----CGATTTG--ATG-A-T-CTTTTT-CTCCCAAAGA-TGGC-CG-----------TATACAT-------GTG--TTATG--------T-G----A--T-------GT-GTGACTTTCAT-C-AATAATT
gi|3 : --ATCTGTA--TTCAAA---T-ACT-A-A-TAT--CC-GT-AT-CAACAT--TGGA---ATGCT-------TTAAAAA---TT----------AT-T--CACTTC--ATATCA--A--ATCA-CAT--TTA-GT-AC---A----------------T--G--TCAA--T--AT-ATGCT------------------AATT---------AAT-A--T-----------G-----AAAAAAA-TAA-GATAG-AC-ATTAA--AT-AAAATCTGTC-AA-A---A-CCAG--T-T-T-CTTCAAAA-AC-A--TA-T-T-GGTGT--TT--GG-T-A-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTG--CA-A---TA-T-GC-TG-GCAA-ATCA--------TA--A----T-GC-A-ATTC-AG---AAAA----A-AAA---A---TT--GT--------A-A--A-----AA-----A---AAAAT---T-GT-TTTT-A-----AA-AAA--C-GG--CC-TTA-T------TTGAT--T--TTG-T---T-ACCTG---A--G-AC-A----ATTTGC-A--C-A--G-G---C--CG-C--A-G------T--G---ATCGC-AGGG---C--GAGCG-A---T--A-G--CTC-G-C-A--GATATCAG-------A--ATT-AT---AC--AT-TA--T--A-G-T-ACC-CACAG-T---A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACA-T----TC-AGT--AAA-TATCAG--T-A---C---CACG---AA-AAA---C--CACAGTAG---A--TA----------------AGCAGCATT--AT----A--GT--A-C-----CACAAGTACTT---TCA------------------------CAGTACTTTA--T--CAGT-AT---T-TCAAG-CA-CCGA------------AG-C----A-------------C--AATATCAGTAAGT-----T---ATCAGA----------------T---T-----AT-CAG-T------AAC--A------A---TGGA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcatctgtattcaaatactaatatccgtatcaacattggaatgctttaaaaattattcacttcatatcaaatcacatttagtacatgtcaatatatgctaattaatatgaaaaaaataagatagacattaaataaaatctgtcaaaaccagtttcttcaaaaacatattggtgtttggtatcgttggaattgttgcaatatgctggcaaatcataatgcaattcagaaaaaaaaattgtaaaaaaaaaattgtttttaaaaaacggccttatttgattttgttacctgagacaatttgcacaggccgcagtgatcgcagggcgagcgatagctcgcagatatcagaattatacattatagtacccacagtactttcacagtacattcagtaaatatcagtaccacgaaaaaccacagtagataagcagcattatagtaccacaagtactttcacagtactttatcagtatttcaagcaccgaagcacaatatcagtaagttatcagattatcagtaacaatggacactctcagtacattttgcgtca
gi|30 : aataatattttagaaataacactgtgattgttgttttttaaaatatttttatttatttatttttaaaatggcgattagttgaccctgacatgtattatcgaattctatcggtcgaaaaaacatttaaatttattggtaatactagactaagtatttgtcagacagtcccgattaacgatttgatgatctttttctcccaaagatggccgtatacatgtgttatgtgatgtgtgactttcatcaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttc-TA-T-CAGTAATTAA--C--C-GAACT---TATC-AG-TA-CCAA-----------CAA-T----AA------------C--A-----------T-----TT--A----A----------------T---TTAATGAT-CAG-T------AAA--AAAAAAAA---T-GA-CA-C-TCTCAGTATATTATCTGTca
gi|31 : ATCACGCCGAC--CCAATA-T--ATT-TT-TAGA---AATCAAA-CACATG--TGGTTT-GTTTGCTGT---TTTT----------TT------TTTAC-----TT----TTATG------TA--TTT--T------TTTTTCA---AATA-TG--CGccagt
gi|32 : tA----CGATTTGAAATT-A-TGCCTTTT-CTTCCAAATATTCGTATG---------------CAT-------GTGT-ATGTG--------T-G----A---------------GAC-TTCAT-CAAAAAACTTTA
gi|34 : CTTC--ATATCA--A--TTCA-CAT--TTA-GT-AC----CA---TGTG-AA-TATT--G--CTAA--TT-ATTATGATT-AT-TAT-A-C-ATagagagagagagag
gi|35 : --------A-A--C-----AA-----A---AAAGT---T----TTTT-A-----AA-AAAAAC-GA--CC-TAA-T---C--TTGAT--T--TT--T---C-ACCTG---A--G-AC-A-C--ATTTGC-
gi|36 : gGAAGTCTAAACAATGGAAAACC----CAGAT-TAGCG-GACT----C-AAG-C---------TT-TAG----TCTG---------TT-TGCC----------GAGAA
gi|38 : T---ATGG-----AAGA----TAAAGA--G-TC-ATTAA--A----AATATGTC-AA-A---A-CCAGG-T-T-T-CTTCATAA-
gi|39 : ---A--TG--T-----------A-AACA--ATT--AT---CA--GC--ACC-----CAC-AACAATT--ATCAGCACCAACA-GC-ACA-A-
gi|4 : GGAAGTC-AA-----------------CAGAT-TAGCC-GGCA----CTGAGCTCTGGTTTGTTT-TAGTTT-TTTTGTTTTTGTTTT-TGGG----------GAAAACACCC--CC-GAAT-TATGCGT--GA-------CTA-------T---CAA--ACCG-GACGAT--C-AATA-T--ATT-T--CAGA---AAT-AAA-CACATG--TG------TT-----T---TAAG----------TT------TTTAA-----AA----ATATT------TA--TTT--TATTTATT-----ATTTAATA-GG--CGAT-TT----GTTTA-----CCCTG----A---CA-TGT-----T-----TTAATC-G-AATT--T-GTCGT-GT--CG--AAGAAAACAAACA-TTAATT-T--A--C-TTGGATA-------ATAC------T-A-GTTGTCC---AGAC---A-GT-CC-GATTAA----CGATTTGAAATA-T-TGCTTTTT-CTCCCAAATAT-CAC-TG-----------TATACAT-------GTGT-GTGTGACTTTGCAT-GCAATA--TTG-----GAGGNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-AGATATCATCT-TAAATTTAAAA-----CT-A-A-TAT--CC-GT-AT-CA-CAT-ATGGA----TGCT-------TTAAGAAAATTCCA--------ATAT--CACTTC--ATATCA-----TTCA-CAT--T-A-GT--C---ATA---T-----A-TATT--G--CTA---TT-AT-ATGATT-AT-TACCA-T-TTGA-ATTTA---AA--GAAT-A--T--TTTT--ATGG-----A-GAAAA-TAAAGATAG-AC-ATTGACAAT-AAAATCTGTC-AA-A---ATCCAGGGT-T-T-CTTC-TAA-AC-A--TAATAT-AAGGT--TT--GG-T-T-TCG-TTG-G-AAT-T-G-TTT--TA-AA--TA---GC-TG-A-AA-ATCA--------CT--A----T-GC-A-TATC-AG---AAAA----A-CGA------------T--------A-A--A-----AA-----A---AA------T-G--TTAT-G-----AA-AAA--C-GGATCC-TTA-T---C--TTGAT--G--TT--T---TAACCTG---A--G-AC-A-CTAATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CG-C-AATG------TC-G---ATCGC-AGGG---C--GAGGG-A---
gi|40 : tacgtcaaaggttggtatctccgttgaattccaatataaatttgtagcactcttaGGGAGTC-AAACACTGGA----TACTACAGCTGTAGCG-GACT----CTGAGCC---------TT-TAGT
gi|41 : GAT-TAGCGTGACT----CTGAGTC---------TT-TAGTTCTTTTT---------TT-TGCT----------GAAAA
gi|5 : -G-AATTC-T-ACCGT-GCTGCG--AGAAAAACA--TT-TTAATT-C--GATCATTGGA-A-----TATCAA------T-G-TT-GTC----AGAC---A-G--ACCGATTAA----CGGTTT-AAATG-A-TGCTTTTTTCTTCCAAATATTCGTAT--------------CACAT-------GTGA-TTGTT--------A-G----A--TGTCGTCAGCGGGGG----CAT-CAAATAAaa
gi|5 : g-T--CATTTC--ATATTC--A--TTCA-CAT---CA-CTTAC---ATAAAATGCC-CA--ATT-----CTAGATTT-ATTATGATA-AT-TTG-A-CAGTTA-ATTGT---AA--GAAT-A--T--TTT---ATGG-----AAGAAAT-TAAAGATGA-TC-ATTAA--AT--AAATCTGCG-AA-A---A-----G-T-T-T-GTTCA-AA-ACAA--TA-TGT-AGT-T--TT--GGCT-C-TCG--TG-G-AAT-T-A-TCTACTACA---TA-TAGC-TA-A-GA-AT----------AT--A----T-GCAA-TATC-AG---AAAA----A-AAA---AAATTT--------------A--A-----AA-----G---AATAT---C-GT-TTTT-AT----AA-AAA--C--G--CC-TTA-----A--TTCAT--T--CTTAT---T-ACT-----A--A-AC-A-C--ATTTGC-A--C-AC---GC--C--TG-C-AA-G------T------ATCAC-AAGG---C--GAGCG-AATTC--A-G-CCT-GG---A--GTTATCAGCAC---CA--AAA-ACA-AGCA-AT-TA--T--A-G-T-ACC-CA-AG-T---T-TAT----TCA-C-ATGT---------ACA-T-TG-TC-AGT--AAA-TATCAG--A-A---C---CACAA-TAA-AAA---C--AACAGTAT---A--TA--TATCTAGAAGACC-AGCA--A----AT---CA--------T-----CAC-AGTAATTAGATGAGTACCATCA-GT--AA-A-TA-T-CA----------------TAAT-----TC-AG-CC-AAAA-----------CAGTC----A-------------CAAA-----------T-----C---A----A----------------CAAGT-----AT-CAG-T------atacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaatcatttcatattcattcacatcacttacataaaatgcccaattctagatttattatgataatttgacagttaattgtaagaatattttatggaagaaattaaagatgatcattaaataaatctgcgaaaagtttgttcaaaacaatatgtagttttggctctcgtggaattatctactacatatagctaagaatatatgcaatatcagaaaaaaaaaaatttaaaagaatatcgtttttataaaaacgccttaattcattcttattactaaacacatttgcacacgcctgcaagtatcacaaggcgagcgaattcagcctggagttatcagcaccaaaaacaagcaattatagtacccaagtttattcacatgtacattgtcagtaaatatcagaaccacaataaaaacaacagtatatatatctagaagaccagcaaatcatcacagtaattagatgagtaccatcagtaaatatcataattcagccaaaacagtcacaaatcaacaagtatcagt
gi|6 : ggaattctaccgtgctgcgagaaaaacattttaattcgatcattggaatatcaatgttgtcagacagaccgattaacggtttaaatgatgcttttttcttccaaatattcgtatcacatgtgattgttagatgtcgtcagcgggggcatcaaataaatacttaagagcacaggagagattatctaatattaatacataaaatatatataataaagagatattaaAGA-GATTC--ATCTGTAATT-----AAAT-ACT-A-GATAT--CC-TT-AT-CA-CAT-GGTGA----TGCT-------T----------C----------AT-T--CACTTC--ATATCA--A--TT-A-CAT--TTA-AT-AC---A-A---TGTC-AA-CATT--G--C-AA--TT-ATTATGATTTAT-TAA-C-A-TTGA-ATTTT---AA----AT-A--T--TTT---AAAG-----GAAAAAA-TAAAGATAG-GC-ATTAA--A--AAAATCGTTC-AA-A---A-GCAG----T-T-TTTCATAA-AC-A--T----T-AGTGT--TT--GG-T-A-TC--TTG---AAT-T-G-TCT--CA-A---TA-T--C-TG-A-AA--TCA--------TA--A----T-GC-A-TATC-AC---AAAAC---A-AAA---A---TT--GT--------A-A--A-----AA-----A---AAAAA---AAG--TTTT-T-----AA-AAA--C-GG--CC-T-A-T---C--TTGAT--T--TT--T---T-AC-TG---A--G-AC-A-T--ATTTGA-A--C-AC-G--C--C--CA-C-AA-G------TC-G---ATCGC-AAGT---G--GAGCG-A---TT-A-G-CCTCGC-A-A--AATATCAATCAGCACA--ATT-ATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-CCC-CACAG-T---A-CTC----CCA-C-A-GT---------ACT-T-TA-TC-AGC--AAA-TATTAG--T-A-C-C---CACAG-TAA-AAAAACC--CACAGTAT---A--TA--T-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CAC-AGTAATT--ATCAGTACCAACACTT-AAA-A-TA-T-CAGTACTTTA--T--CAGTAAT---TATC-AG-CA-CCAAAATCACACTATCAG-T----AATTAT--------C--A-----------G-----T---A----A----------------T---T-----AT-CAGTT------AAA--A------A---T-GA-CA-C-TCTCAGTCCATTTTTCGT
gi|7 : agagaagagagAAAT-AA--A-AATTG--TC-TT-AT-CA--AC-GTGGA---GTGTT-------TT--------TC----------AT-T--CACTTC--ATATTAGAA--TTCG--AT--TCA-AC-AC---ATAAAATGGAACA-CATT--GGGCTAA--T-----AT--TT-AT-TAA-A-CAGT-A-GATTT---AA--GAAT-A--T--TTTTTTATTG-----AAGAAAT-TAAA-AGAGCGC-ATTGA---T-AA---TTGCC-AA-A---A-CCAGG-T-T-T-TTT-ATAT-AC-A--TACTATTAGTCT--TTATGG-TGA-TCGCTTGAG-AAT-T-A-GCT--CA-A---TA-T-GC-TT-G-AA-ATCA--------AT--A----T-GC-A-TATC-AA---AAAA----A-AAT---T---TT--TT--------A-AACA-----AA-----A---AGAAT---T-G--TCTT-A-----AA-AAA--A-CG--TC-TTA-T---C--TTGAT--TCGTT--T---A-ACCTG---A--G--C-A-C--ATTTGC-A--C--C-G-A---C--CG-CAAA-G------TC-G---ATCGCAAAGG---C--CAGCG-A---TA-A-G-CCTCGG-CAA--GATATC-G------CA--CTT-TTC-AGCA-ATATA--TC-A-GAT-ACC-CACAG-TAGAA-CTT------ATC-A-GC---------ACT-T-TA-TC-AGC--AAT-TATCAGC-A-A-C-C---CACAG-TAA-AAA---C--CACAGTAA---A--TAGTT-----------C-AGCA--ATT--AT---CA--GT--ACC-----CA--ATGAATT--AT-AGTA-CAACA-GTAAAA-A-TA-TACAGTACTTTATCT--CAGTAAT---TATC-AG-CA--CAA-----------CAG-T----A-------------C--A-----------A-----T---ACAGTA----------------T---T-----ATCCAG-T------AAA--A------AAT-T-GA-CA-C-TCTCAGTACATTTTGCGTcg
gi|8 : acgCTGGGTC--C----CAGAT-TAGCG-G--T----CTGAGC--------------A---------------------TGTC----------GAAAACACCC--TC-GAATAT-TGCGT--GGAATTG--CTT-------TTTAAGACCACAGAGC-GGC--CCAATA-TGTATTGTT-CAGA---AATCAAA-CACATG--TGG--T-GTT-----T---TTTT----------TT------TTTAA-----GATATTTTATT------TA--TTTACT------T-----C---AATAGGG--CGGTGTTA---GTTTA-----ACCTA----A---CA-TGTTAAGAG-----TTA--G-G-AATTC-T-AT-GT-GT---G--AAAAAAATA--TT-TTAATA-T--AG-CATTGGAT------TATTAA------CAA-TTTccag
gi|8 : -AGCTA--ATCTGTAATTACATGTAATAACT-A-AAT-T--TC-TT-AT-CA-CAT-GTGGA---GTG---------GT--------TC----------AT-CGGTACTTC--ATATC---A--TTTA-CATTCTCA-AT-ACTG-AAA----GCG-CA-CAGTGAG--CTCA--TT-ATCATGACT-AC-TAA-A-CAATG---ATTTTGCAA--GAATCA--TTGTTT---ATGG-----A--------------CG-GC-GTTAA--AT-AAAAT-TG-C-AA-A---A-Caaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgagctaatctgtaattacatgtaataactaaatttcttatcacatgtggagtggttcatcggtacttcatatcatttacattctcaatactgaaagcgcacagtgagctcattatcatgactactaaacaatgattttgcaagaatcattgtttatggacggcgttaaataaaattgcaaaacggtaatctgtc
gi|9 : ctgggtcccagattagcggtctgagcatgtcgaaaacaccctcgaatattgcgtggaattgctttttaagaccacagagcggcccaatatgtattgttcagaaatcaaacacatgtggtgttttttttttttaagatattttatttatttacttcaatagggcggtgttagtttaacctaacatgttaagagttaggaattctatgtgtgaaaaaaatattttaatatagcattggattattaacaatttaaataatgttattccgtataatgtgtgtggatagggaggatttgtcatcagtcttggagagggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgAAAT-ACT-A-AATAT--CC-GT-AT-CA-CAT-GTGGAT--ATGCC-------TT--------TTTAAAAAATTTAT-T--CACTAC--ATATCA--ACATTCA-CAT--T-A-GT-AC----CA---TGTT-CAATATT--G--CTAA--TTTATTATG-TT-ATCTAA-A-C-TTGA---TTT---AAAAGAAT-A--T--TTTT--ATGG-----AATAAAA-TAAGATAAG-AC-ATCAA--AA-AAAATCTGTC-AA-ACAAA-CCAGG-T-T-TTCTTCAACA-AC-A--TA-TAT-GGTGT--TT--GG---A-TCG-TTG-GGAAT-T-G-TTG--CA-A---TA-TTGCCTG-C-AA-ATCA--------AT--AA---T-GCGA-TATC-AG---AAAAC---A-AAA---A---TT--GTTAAAAAAAA-A--A-----AA-----A---AAAAT---T-G--TTTTTA-----AA-AAA--C-GG--CC-TTA-T---CG-TTGAT--T--TT--T---T-ACCTGA--A--G-AC-A----ATTTGC-A--C-AC-G-GC--C--CG-C-AA-G------TCGG---ATCGCGAGGG---CG-GAGCG-A---TA-A-G-CCTCGGAC-A--GATATCAG------AC--ATTAATC-AGCA-AT-TA--TC-A-G-T-ACCGCCCAA-TTA-A-CTT----TCA-C-A-GT---------ACT-TATA-TC-AGTA-AAA-TATCAGT-A-A-C-C--------------AA---T--TATA-TAA---C--TA--T-----------T-AG----ATGAAAT---CA--GCATACC-----CAC-ATTGATTG-ATCggtaatctgtc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TGTTAACTTCGCCTTTTTGTATAGTATTGATCTATGATCAATAGCGTGAAAGGAGACATTCGATTAGAATTTATT
Unaligned ( gi|37 ): GATGTTACTGGTATCTTGAATCTTCTCGATATATTGAGAATCATATTTACATGTGTATA
Unaligned ( gi|42 ): ATGTTAACTTCGCCTTTTTGTATATTAGCCTGTGATTCATAGCA