lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 4 2 4444 11 11 1 111111 111 111 3333333333333 333 2 111 111111 2222222 1111111 44444444444444444444444444444444444444 11 22222 222222 33 1111111 11111 111 3333333333 22222222222 111 111 1 22222222222 1 1 1111 2222 1 1 333 22 11 111 4 3 1 3333 1111 11 2 555555555555555 1111 111111 1111111111111111111111111111111111 1 22222222222 55555555555555555555555555555555555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22222 22222 111111 1 222222222 33 1 11 11111 1 1111 11 11 44444444444444444444444444444
lowQualScore : 33 0 99 5 3 66 5 2222 6 55 5 5 0 888 99 1 5 666666 0 000 555 1111111111111 5 222 6 6 6 6 1 6 6 9 3 6 777 3 6 222 111111 0000000 4 7777777 55 99999999999999999999999999999999999999 11 55 3 4 4 99999 999999 4 4 3 00 1111111 22222 3 111 3 5555555555 44 2 77777777777 3 55 55 3 3 3 3 1 3 999 7 3 555 0 77 1 1 5 7 5 66666666666 6 0 8888 0 7 4444 3 6 5 3 6 000 00 66 444 0 8 8 0 6 0000 0000 8 11 8 4 0 000000000000000 8 7777 666666 8 8 8 8 8 0 8 2 8 5 5 6 5 77 5 5 4444444444444444444444444444444444 5 1 5 5 5 5 11111111111 55555555555555555555555555555555555 5 5 5 6 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 000 0 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 00000 44444 5 5 666666 77 1 5 222222222 5 55 5 7 33 888 44444 1 0 5 0000 66 11 11 66 66 99999999999999999999999999999 77 5
lowQualScore : .. . .. . . .. . .... . .. . . . ... .. . . ...... . ... ... ............. . ... . . . . . . . . . . ... . . ... ...... ....... . ....... .. ...................................... .. .. . . . ..... ...... . . . .. ....... ..... . ... . .......... .. . ........... . .. .. . . . . . . ... . . ... . .. . . . . . ........... . . .... . . .... . . . . . ... .. .. ... . . . . . .... .... . .. . . . ............... . .... ...... . . . . . . . . . . . . . .. . . .................................. . . . . . . ........... ................................... . . . . .................................................................................... ... . . ....................................................................... . ..... ..... . . ...... .. . . ......... . .. . . .. ... ..... . . . .... .. .. .. .. .. ............................. .. .
lowQualScore : 88 0 00 0 0 99 0 1111 7 88 7 7 9 666 33 4 7 444444 6 000 777 4444444444444 7 777 7 7 7 7 7 7 7 8 7 7 555 0 7 333 555555 0000000 0 0000000 55 33333333333333333333333333333333333333 00 55 6 0 0 77777 000000 0 0 6 55 8888888 33333 0 444 6 7777777777 22 0 33333333333 9 00 00 6 6 6 6 9 6 222 3 6 888 0 66 1 3 7 3 3 66666666666 0 0 2222 8 0 0000 2 7 0 3 7 333 00 88 000 0 0 0 2 0 8888 0000 0 00 0 0 8 000000000000000 0 0000 000000 0 0 0 0 0 8 0 8 0 7 7 3 7 11 7 7 9999999999999999999999999999999999 7 4 7 7 7 7 77777777777 66666666666666666666666666666666666 0 0 7 7 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 000 1 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 00000 33333 7 7 444444 99 4 7 999999999 7 33 0 1 66 000 33333 6 1 0 6666 99 99 99 99 99 00000000000000000000000000000 99 7
consensus : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGGCG-AGTG--CATTGCGT-CATA-TGCTCGC--AA--TTTT-AGCG-AC------TTCATCT---ACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAG-TTCCGGTTTGAA-TCA-TTAT-TTTCCT-AAAATTCCTA-TCGCAAAAGCGCTTGAATGATCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATNTA-GTCA-A-ATTG------GT-------TGT-CGAAAA-------CTGTCCGT--GTT-----C----CCG-AT---A---------A--------AAAA--T--CCNC-T-GGAC---TTGACAAC-T--CGC-T-A-GAAAAC-GT-------CGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-GGG-AT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-TAAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCACGTA--GGA-ANACTTGTCGTGGT-AACGTTCCTTTTGCAACC-GGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAACAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGTA-TTGGTAC-CATGATTACGA-TATTTTGTTT--ATTAATAAATAGAAA-G--CTTAA-TGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT----------A----AATGAATTGTGTGA-CC-A-GA-TG-ATATC-GA---T-------GAATCT-----CA-GTC-N-G------------ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CA--GAA---A---C-AGA--GTC---AGG------AGA------A-CA--T--GTCTTTT-T--AACTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAA-CGG-AT--GAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----ATT---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--ATTT-CTGAA-AAT---------AGCTAGT-GA-TTTTTCAATTTT--GCT--AGT-----AAAAANTTTT-TGG----CA--CT--AGCT--A--AAATTTGCTTGTG--GTA-------------------ANT--TAAAAGT--TAA-TTTTAAACCCCT
Reference ( gi|2 ) : AGGGTTTCAAATTAA-TGAGAATACTCGCTA-AAGTGCGAC--CAT-AAATATATTT--A-CG-AGTG--CATTGCGT-CATA-TACTCGC--AA--TTTT-AGCG-AC------TTCATCT---ACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTC-G-TTCCGGTTTGAA-TCA-TTAT-TTTCCT-AAAATTCCTA-TCGCAAAAGCGCTTGAATGATTGCGCAATGAC-CTCAAAACGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------GT-------TGT-CGAAAA-------CTGTCCGT--GTT-----C----TTG-AT---A---------A--------AAAA--T--CCAC-T-GGAC---TTGACAAC-T--C-C-T-A-GAAAA--GT-------CGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-GAG-AT-A-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-TAAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAAGTCACGTA--GAATATAC-TGTCGT-GT-AACGTTCCTTTTGCAA-C-GGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTAAAAAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTT-TATGGTG---ACAACCGCGTA-TTGGTAC-CATGATTACGAATATTT-GTT---ATTAATAGATAGAAA-G--CTTAA-TGACA-TAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AGTA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT--------AAA----AATGAATTATGTGA-TC-A-GA-TG-ATATT-GA---T-------GAATCT-----CA-GTC-T-G------------ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CA--AGA---A---C-AGA--GTC---A-G------AGA------A-CA--T--GTCTTTT-T--AACTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAA-TGA-AT--GAAATCG-T-----------T---TA--TA------TGAA-T-----ATT---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--ATTT-CTGAA-AAT---------AGCTAGT-GATTTTTTCAA-TTT--GCT--AGT-----AAAAATTTTT-TGG----CA--CT--AGCT--A--AAATTTGCTTGTG--GTA-------------------AAT--TAATAGT--TAA-TTTTAAACCCCT
gi|22 : AGGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-CG-AGTG--CATTGCGT-TATA-TGCTCGA--AAT-TTTT-AGCG-AC------TTCATCT---ACCGAGGGCGATT-------------CATGGAT
gi|12 : gtccAGGGTTAGAATTTAAATGGAAATACTCGCTA-AAAC-CATC--CAT-AAAAATATTT--AGCG-AGTG--TATTCCAT-TATA-TCCTCGA--AAA-TTTT-ATCT-AC------TATATTT---ATCGT---CTATTTTTATCGAAAATTC-CGGATTTCTAATGTCAGTC-AATTCCGACTTGAG-TTG-CTAT-CTTTCT-AGA-TTACTAATCACAAAAGCCTTTGAATGATTG-ACAATAA
gi|21 : attacGGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCTACAAATGCGAC--CAT-AAATATTTTT--AGCG-AGTGG-CATTGCGT-CATA-TGCTCGC--AA--TTTTTAGCG-AC------TTCATCT---ACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAG-TACCGGTTTGAA-TTA-TTAT-TTTCCT-AAAATTCCTA-TCGCTAAAGCGCTTGAATGATTGCGCAATGttcgcacacttacctcaaatgtacattccacatttaatcgtcttgtcaa
gi|6 : TTCAAATTAAGTGAAATTAACCGCTA-AAATGCGACGCCATGAAATATATTT--AGCG-AGTG--CATTGCGTGCATA-TACTCGC--AA--TTTT-TGCG-AC------TTCATCT---ACCGA---CTATT-------------C-CG-ATTTCTGTTGTCAGTCAG-TTTCCGTTTGAAATCA-TTAT-TTTCCTAAAAATCCCTA-T-GCAAAAGCGCTTGAATGATTGCGCAATGACGCTC-AAACGTTA-ATTTAAGCAAAAGATATAGGTCA-A-ATTG------GT-------TGT-CGAAAA-------CTGTCCGT--GTT-----C----CTGCAT---A---------A--------AAAA--T--CCAC-T-GGAC---TTGACAACTT--C-C-TAA-GAAAC--GT-------CGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATACTCCGG--A-T--GT--ATCGT---AG---A--TGTTTT---GAA--CTC-GGAA-TGC-GAGAAT-G-CACA-G-G-GAAGGT-CAC-TAAGAAAAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCACGTA--GGATAAAC-
gi|30 : ggAAATTAAGTGGAAATACTCGTTA-AA-TGCGAT--CAT-AAATAT
gi|8 : AATACTCACTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTT--g
gi|1 : acgagtcatCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-CGCAGTGTGCATTGCGT-CATA-TGCTCGA--AAATTTTT-AGCGTAC------TCCATCT---ACCGAG--CTAAT-------------T-CGGATTTCTGTTGTCAGTC-GGTTCCGGTTTGAA-TCA-TTATCTTTCCT-AAAATTCCTA-TCGCAAAAGCGCTTGAATGATCACGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTG------GTACT----TGT-CGAAAAA------CTGTCCGT--GTT-----C----TGA-AT---A---------A--------AAAAAAT--CCAC-T-GGAC---TTGACAAC-TTCC-C-T-A-GAAAA--GTAAACAGTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TT--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-GAG-AT-G-CA-A-G-GTGAAG--TCAC-TAAGAAG-AAAAATGGCCCCG-TGTTAAAGGT-ACGTA--GGA-ATACTTGTCGTGGT-AACGTTCCTTTTGCAA-C-CGGGAGTCGTG--TTCCATT---CTACCGCAGATGTGTCACACCATAtagaccgactattccagatttctgttgtcagtcagttccggtttgaatcattatcttcctaaaattcctatcacaaaagcgcttgaatgatcgtgcaatgacctcaaacattaatttaacaaagatctagtcacattggtgacagttgttgaaaactgtccgtgttctgataaaatccactggactgacaactttctatgaaaacgtcggtcccaaagaattagtcaaaaatatcgatcagtgatcgtattataatttaagaaactcggaataggagtgcacagttgaaggtca
gi|14 : CGCTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-CG-AGTG--CATTGCGT-CATA-TACTCGC--AA--TTTTTAGCG-AC------TTCATCT---ACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAG-TTCCGGTTTGAA-TCAATTAT-TTTCCT-AAAAT-CCTA-GCGCAAAAGCGCTTGAATGATTGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------GT-------TGT-CGAAAA-------CTGTCCGT--GTT-----C-----TG-AT---A---------A--------AAtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttcatcagtgtaagaaaagaaacaactctatggtgacaacgcgtaattggtacatgattacgatattttgttattaataaatagaaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaataccgatagcacaagcgcctagccaaaaataggttaaaaccgagggcgattcatggattgttgtgaaacttatccagaaattatcgcaaatttgcagttgagttaaaattgtgtatcagattgatataatgaatctcagtctagatagtgtttatcttgccagaaacggagtcaggagaacattctttcataatgaacatcatcagtaacggagacattgtctgtttaactattgtaccggcttgaataaaaaattaatgaaatcgtttatatatgaatattgaaatcttttactatctttgaataattctgaaaatagctagtgatttttcaattttgctagtaaaaaattttgggcactagctacaaaatttgcttgtggtattaaagttatttttatggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|8 : GT-CATAATACTCACTAAA--T-----GCG-ACCATAAATATATTTTAGACCGA---CTATT-------------C-CAGATTTCTGTTGTCAGTCAG-TTCCGGTTTGAA-TCA-TTAT-CTTCCT-AAAATTCCTA-TCACAAAAGCGCTTGAATGATCGTGCAATGAC-CTC-AAACATTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTGGTGACAGT-------TGT-TGAAAA-------CTGTCCGT--GTT-----C-----TG-AT----------------------AAAA--T--CCAC-T-GGAC----TGACAACTT--T-C-T-ATGAAAAC-GT-------CGGTCCCAAAGAATT-AG-TCAAAA---ATA-TC--G--A-TCAGT-GATCGT---ATT--A--TAATTTAAGAAA--CTC-GGAA-T-A-GGA-GT-G-CACA-G-TTGAAGGTCg
gi|10 : acgaCTAGAACGATT-CGC-----T-CCCAAA-CACTACAT--AA-A-AAAGATCTA-GTCACACATTG------GTGCAGAGTTGT-CGGAAA-------TTGTCCGT--TTTGCCGACAGGGCTG-AT---A---------A--------AAAA--AAACCAC-TAGGGC-----GACAAC-T--TGC-T-A-GAAAAC-GT-------CGGTCCAAATGAAAG-A--TTAAAA---ATA-TCA-G--A-CTGAT-AATCGT---A----T--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-GGA-AT-G-CACA-G-TTGAAGG-CCGCTTAA----AAAACATGGCCGCC-TGTTAACGGTCACGTACGGAA---ACTTGTCTTGGT-AGCGTTCCTTTTGTAG-C-a
gi|3 : attgtcaaatcgttcCAATGAC-CTCGAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------GT-------TGT-CGAAAA-------CTGTCCGT--GTT-----C-----TG-ATAAAA---------A--------AAAA--T--CCAC-T-GGAC---TTGACAACTT--C-C-T-A-GAAAAC-GT-------CGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAAAT-ATA-TCG-G--A-A--GT-GATC-TAAAA----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-GAG-AT-A-CACA-G-GTGAAGGT-CAC-TAAGAAGAAAAAATGGCCGCG--GTTAAAGGTCACGTA--GGA-ATACTTGTCTG-GT-AACGTTCCTTTTGCAACC-AGGAGGTCGTGATTTCCATTCTACTACCGCAGCTGTGTCACACCA
gi|17 : ------GT-------TGT-CGAAAAACCGGATCGGTCC-T--GTCAG---CAGGGCCG-AT---A---------A--------AAAAAAT--CCCC-T-GGAC-----AACAAC-T--AGC-T-G-GAAAAC-GT-------CGGTCCAAAT-AACC-AATTTAAAA---ATA-TC--GG-A-C--GG-GATCAT---A----T--TATTTAA--GAA--CTC-GGGATT-C-GGG-AT-GCCACA-GCGTGAAGGT-CAC-T---AAAAAAACATGGCCGCGTTGTGAAAGGTTAGCTA--CAACATAC-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaaacaaacgacctttcatcagtggtaaaaagaaaaaactctatggtggtgacaacgcgtattggtaccatgattacgatattttgtttattataaatagaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaaataggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaatttgttggaccagatgcatattcgaaattgaatctatttgcacatcagatgtgttctctctt
gi|16 : ------GT-------TGTTCGAAAA-------CTGTCAGT--CCT-----G----TCG-GC---AGGTGCCGATA--------AAAA--T--CCCCAT-GGAC-----GACAAC-TA-C-C-T-G-GAAAAC-GT-------CGGTCCAAATGAGCCGA--TTAAAATATATA-TC--GTAA-CG-GT-GATCAT---T----ATTTATCTAA--GAA--CTCGGGAA-T-C-GGG-AT-GCCACA-G-GTGAAG--TCAC-TA--AAAAAAACATGTGCGCA-TGTGATACGGTACG-A--ACACAGAC-TGCCGT-Gcttgcca
gi|20 : ------GT-------TGT-CGAAAA-------CTATCTGCAAGGG-----C------A-AT---A---------A--------GAAA--T--TCTC-T-TGAC---T-GGTAAC-T--TGT-T-A-GAAAAT-GT-------TGATCCAAATTACTT----T--AAA---ATA-CCT-G--G-C--GT-GATCCT---ATTACA--TATTTAA--GAT--CTC-AGAA-T-T-GGG-GT-GGCACA-G-GTGACGATCgt
gi|19 : ------GT-------TGC-TGAAAA-------TTGTTGGT--CCT-----G----TTG-GC---A---------AGGTTGTTAAGGA--T--TCTG-T-GGGC---T-GATAAC-T--T-GAT-A-GATAAT-GT-------CAGACCAAATGACCG-T--TTGAAA---ATA-TT--G--GGC--AT--ATCCT---A---------TTCTA--GAG--CTG-GGGA-T-A-GGG-AT-G-CACA-A-GTGAAGCTC-AC-TAAAAAAAAAAAATGGCattcaaataacgtggtcacaaggctgataaaatttgtgaaaggttttctacccag
gi|27 : ---A---------A--------AAAA--T--CCTC-C-GGACCAACAAACAAC-T--TGC-T-A-GAAAA--AT-------C-GTCCAAAttcctggccgaccaaatatgttaaacttctctacccagtga
gi|28 : cagggcgataa-GAAAAACGT-------TGGTCCAAATGAACC-A--TTGAAA---ATA-TCGTG--G-C--GT-GATCGag
gi|26 : AAA---ATA-TCCGGC-A-C--ATCGATCGT---A----T--TATTTTA--GAAGGCTC-GGAA-T-CAGGG-ATGG-CACGTG-TTAAAGGT
gi|23 : --TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-GGG-AT-G-CACGTG-TTAAAGGT-AACGTACGAAGAa
gi|23 : atCACG-TGTTAAAGGTAACGTAC-GAAGAC-T-TGTCGT-GTAAACATTCCTTTTGCAACC-AGGCGGTCGTGGTTTCCATT---TT--CG-AGCTcttgtcgtgtaaacattccttttgcaaccaggcggtcgtggtttccattttcgagctcaact
gi|29 : attattttagaactcggaatcgggatgTTGTAA-CCGGGAGGTCGTGATTACCATT----TACcaact
gi|3 : CTAAACAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAA---AAAGAAAA--AACTC-TATGGTGGTGACAAC-GCGTA-TTGGTAC-CATGATTACGA-TATTTTGTTT--ATTA-TAAATAGAAA-G--CTTAA-TGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT-----------------TG--TTG---GA-CC-A-GA-TGCATATTCGAAATT-------GAATCTATTTGCACATC-A-G------------AT-G----TGTTCTCT-CTT-gagctcatcttcta
gi|1 : caatgacctcgaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttctgataaaaaaaaatccactggacttgacaacttcctagaaaacgtcggtccaaatgaattatcaaaaatatatcggaagtgatctaaaaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtcactaagaagaaaaaatggccgcggttaaaggtcacgtaggaatacttgtctggtaacgttccttttgcaaccaggaggtcgtgatttccattctactaccgcagctgtgtcacaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTTCATCA-GTG-TAAG--AAAAGAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGTAATTGGTAC--ATGATTACGA-TATTTTGTT---ATTAATAAATAGAAAAG--CTTAA-TGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTTTAAT--AC-CGATAGCACAAG--C-G-CCTAG-CC-AAA-AATA-GGTT-AAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATTGTTGTGAAACTTATC-CAGAAA--TTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTA------------------------AAATTGTGT-A-TC-A-GATTG-ATA-T-AA---T-------GAATCT-----CA-GTC-TAG------------ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CA--GAA---A---C-GGA--GTC---AGG------AGA------A-CA--T---TCTTTCAT--AA----------TGAA-CAT-CAT---CAGT----AA-CGG-A---GACATTG-TCTGTTTAACTAT---TG--TACCGGCTTGAA-TAAAAAATTAATG--------AAA-TCGTT--T--ATATATGAATATT-G-AAATCTTTTACTATCT-TTGAATAATTCTGAAAATAGCTAGT-GA-TTTTTCAATTTT--GCT--AGT-----AAAAAATTTT-GGG----CA--CT--AGCTACA--AAATTTGCTTGTG--GTATTAAAGTTATTTTTATGGTAAT--TAA-AGT--TAA-TTTTAAACCC
gi|11 : cgctaaaatgcgaccataaatatattttagcgcagtgtgcattgcgtcatatgctcgaaaatttttagcgtactccatctaccgagctaattcggatttctgttgtcagtcggttccggtttgaatcattatctttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgatcacgcaatgacctcaaacgttaatttaacaaagatctagtcacattggtacttgtcgaaaaactgtccgtgttctgaataaaaaaaatccactggacttgacaacttccctagaaaagtaaacagtcggtccaaatgaattatcaaaaatattgacgtgatcgtaatattttagaactcggaatcgagatgcaaggtgaagtcactaagaagaaaaatggccccgtgttaaaggtacgtaggaatacttgtcgtggtaacgttccttttgcaaccgggagtcgtgttccattctaccgcagatgtgtcacaccatatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTCATCAAGTGGTAAAGAAAAGAAAAACAACTCCTATGGTG---ACAAC-GCGTA-TTGGTAC-CATGATTACGA-TATTT-GTTTTTATTAATCAATAGAAA-G--CTTAAATGAAA-T-GCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-TGATAGCACAAGCCC-GCCCTAG-CCTTAACAGTAGGGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTCAATGGATGGTTGTGAAATTCATCTCAGAAA-TTTATCGCAAATTTTGCGAGATGAGTTACAAATT--------AAA----AATGAATTtg
gi|4 : CTA-TATGGTG---ACAAC-GCGTA-TTGGTACACATGATTACGA-TATTT-GTT----TTAA---ATAGAAA-GGCCTTAA-TGCAA-TAGCAAGTAAGGAATATATTGTAAGCAAGGGCATCAGTTT---TTTACGCGATAGCACAAG-CCAG-CCTAGGCCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGATTTC-ATGAATGGTTGTG--ATTTATC-CAGAAATTTTATCGC-AA-TTTGC-AGTTGAGTT----------------AA----AAT---TTGTG-GA-TCAA-GA-TG-ATATC-GA---T-------GAATCT--------GT-------------------------TGCT-TAT-CTT-GC-GC--AGA---AAGGC-AGA--GTCCCGG-G------AGA------A-tg
gi|13 : ct-TATG-TG---ACAAC-ACGTA-TTGGTAC-CATGATTAACTATATTT-GTTT--ATTAATAAATAGAAA-G--CTTAA-TGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGGTAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAATCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AAT----------------------TTGTG-GA-CC-A-GA-TG-ATATT-GA---T-------GAATTT-----CA-GTC-TAG------------ATAG----TGTT-TAT-attctgtctcatatgcagatctatcatccagttacggaagcagttgtctctttcaagctaaaataattgtagcttgaataataaattttatgaaatcgtgtatatgaattattgaaatttttttttatatcttttgaataattttctgaaaatagctagtgattttcaattttggctagtaaaagtttttggggcaggctgaggctgaaaatttgcttgtggtaatttaaagattaaattaagaccgctga
gi|22 : aACCGAGGGCGA-TTC-ATGGAT
gi|7 : gtccagggttcaaaattaagtggaaatactcgctaaatgcgaccataaatatattttagcgagtgcattgcgttatatgctcgaaatttttagcgacttcatctCCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATT--------------TATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAA-AATTTGTGGATCAGATATCAATGAATC---TCAGTCTA-GA-TA-GTATT-TA---TCTTGCCAGAAACG-----GA-GTCAG-G------------AGAG----CATT-----CTT-TCATA--TGG---A---C-ATC--ATC---A-GTAACTGAGA------A-AT--T--GTTTTTT-T--AACTA------TTGTATCGG-CTT---GAATGA-AAA-TTA-AA--GAAATAG-T-----------T---TT--TA------TGAA-T-----ATT---C--------AAATTATTC--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--ATTT-CTGAA-AAT---------AGCTAGT-GA-TTTTTCAATTTT--GCT--AGT-----AAGATTTTTT-TGG----CA--CT--AGCT--A--AAATTTGCTTGTG--GT--------------------AAT--TAG-AGT--TAA-TTTTAAACCC
gi|18 : GGATGGTTGTGAAATGTATC-CAGAAA-TTTATCACAAA-TTTGC-GTTTGAGTTAA-ACTT---------------------TTGTG-GA-CC-A-GA-TG-ACATC-AA---T-------AAATCT-----CA-GCT-A-G------------GTGG----TTGT-TAT-CTA-GC-CA--GAG---A---CAAAA--GTC---AGG------AAA------A-CA--A--ACATTCT-T-------------TTATA-TGGACAT---CAACAG-AAA-CGG-AT---ATATTG-T-----------C---TT--TT------TAAC-T-----ATT---G--------Atgatgtcacacctaaatatgtcacaactgaaaacggcacaatcctcacacactctaggc
gi|9 : TGTGTGG-TC-AAGA-TG-GTATT-GG---C-------GAATTT-----CA-GCC-C-AGGGGAGCAGTAAATAGGCGGTGGT-TAT-CTA-GC-CA--G-----------AGA--GTC---AGG------AGA------A-CA--ttgattaacaagaaatttaatg
gi|5 : tgaggatttataGTT-TATACTTAGC-CAGTAAACGTA---C-AAATGGTT---A-G------GGAGATGAAA-CA--TTTGTCTTTT-T--AACTAAT----CTGTACCGG-CTTATGGAATAA-AAA---G-AT--GAAAT-G-T-----------TTTATA--TA------TGAA-T-----ATT---GAGACGATTAAATGCCTT--C--CTATTTATA--TT-ACAA------AA--ATTA-CTGAA-Aattaaactttctcccataccgacctcatcaatgacggtgacgaagtctatttttattattttctaaacagtggacttgaataaaaaaaaaaatagtgaaatcatttaatacatcattgaataatttctgaaaacagctgataaattatcaattttgctgtaaaaaaaaaattggcacaagctaaaaattgcttacggtaatttga
gi|4 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttgA--GTT---A-C------GGA------AGCAGTT--GTCTCTT-TCAAGCTAAAATAATTGTA---G-CTT---GAATAATAAA-TTTTAT--GAAATCG-T-----------G---TA--TA------TGAA-TT----ATT---G--------AAATTTTTT--TTTATATCT-----TTTG-AA------TA--ATTTTCTGAA-AAT---------AGCTAGT-GA--TTTTCAA-TTTTGGCT--AGT-----AAAAGTTTTTGGGG----CAGGCTGAGGCTG-A--AAATTTGCTTGTG--GTA-------------------ATT--TAAAGAT--TAA-ATTAAGACCGCTtggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagaaaatttggcacttagctataaaatttgcttgtggtaatcataaaagtatcaattttaaaaccctgacttccttaaa
gi|9 : ctctatatggtgacaacgcgtattggtacacatgattacgatatttgttttaaatagaaaggccttaatgcaatagcaagtaaggaatatattgtaagcaagggcatcagttttttacgcgatagcacaagccagcctaggccttaaaataggttcaaaaccgagggcgatttcatgaatggttgtgatttatccagaaattttatcgcaatttgcagttgagttaaaatttgtggatcaagatgatatcgatgaatctgttgcttatcttgcgcagaaaggcagagtcccgggagaaattctgtctcatatgcagatctatcatccTTTC-T--AAACA------GTG----GA-CTT---GAATAA-AAA----------AAA---------------------------------AAA-T-----AGT---G--------AAATCATTTAAT--ACATCA-----TT-G-AA------TA--ATTT-CTGAA-AAC---------AGCTGAT-AA-ATTATCAATTTT--GCT---GTAAAAAAAAAA----T-TGG----CA--CA--AGCT--A--AAAATTGCTTACG--GTA-------------------ATT--TGAga
gi|15 : tgaggatttatatgtgtggtcaagatggtattggcgaatttcagcccaggggagcagtaaataggcggtggttatctagccagagagtcaggagaacaattaaactttctcccataccgacctcatcaatgacggtgacgaagtctatttttattat---GAATAA-AAAATGA-ATATGAAATCGAT-----------T---TACATA------TGAAAT-----ATTTTAA--------AAATTCTTT-----ATATCT-----TT-G-AA------TA--ATTT-CTGAA-A-T---------AGCTAGT-GA-TTTTTCAT-TTT--GCTTAAGT-----AAAAAATTTT-TGG----CA--CT---GCT--A--AAATTTGCTTGTG--GTA-------------------ATT--CAAAAGT--TAATTTTTAAACCC
gi|24 : aattaaaaatgaatttgagTCT-----TT-G-AA------TG--GTTTTCTGAA-AAC---------AGCTAGT-GAAATTT-CAA-TTTT-GGT--AGT-----AAAAA-TTTT-TGGCACTCA--CT--AGCT--A--AAATTTGCTTATG--GTA-------------------ATT--TTA-AGT--TAA-TTTTGAACCCtggtccacagaaaatgccaattgtttgcaaaaccctg
gi|25 : AT---------AGCTAGCAGAATTTT--AA-TAT--GAT--GGC-----ATAAACGTTT-TGG----CA--TT--AGCT--A--TAACTTGCTTATGCCGT--------------------AAT--TCATACT--TAA-TTTCAt
gi|5 : AAAATTT----GG----CA--CTT-AGCT--ATAAAATTTGCTTGTG--GTA-------------------A-TCATAAAAGTATCAA-TTTTAAAACCCTtgaac
Alignments
lowQualScore : 1 22222 11 1 111 2222222222222 22222222222 111111 1111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444 11 11 111 3333333333 2222222 111 1 1111 1111 1 222 11 111 11 444444444444444 1111 111111 88888888888888888888888888888 11 11111111111 11111 333333333333333 1111 1 1111111111 1111111 1111 111111 4444444444444444444444 11 222222222 333333333333333333333333333 2222222222222222222222222 11111 11111 111111 11111 1111111111 111111 222222 2222222222222222222
lowQualScore : 1 1 66 3 66 4 44444 5 5 5 0 0 99 1 5 333 7777777777777 5 0 5 5 5 5 5 77777777777 5 5 5 5 5 1 5 999 000000 666 1111111 3 3 1111111 7777 666 55555555555555555555555555555555555555555 55 1 3 3 99 666 3 00 3 88888 44 3 88 1 000 3 0000000000 3 1 666 3333333 44 44 3 3 3 3 3 6 6 6 3 666 4 5555 5 0 7 5 0 1 1 1111 2 3 7777 0 2 2 0 2 000 22 6 111 6 6 6 6 6 44 3 6 99 6 111111111111111 6 4444 111111 6 6 6 6 6 6 6 5 5 5 55 5 5 66666666666666666666666666666 4 0 44 5 5 5 5 5 4 77777777777 22222 5 888888888888888 2 0000 4 4 5 1 7777777777 5 66 66 3333333 0000 666666 5 2222222222222222222222 0 11 5 777 0 4 333333333 6 4 666666666666666666666666666 3333333333333333333333333 33 22222 88888 4 4 222222 66 11111 8 9999999999 111111 777 4 000000 4 66 4 1 666 99 6666 4 8888 55 99 99 55 4 55 55 8888 9999999999999999999 66 5
lowQualScore : . . .. . .. . ..... . . . . . .. . . ... ............. . . . . . . . ........... . . . . . . . ... ...... ... ....... . . ....... .... ... ......................................... .. . . . .. ... . .. . ..... .. . .. . ... . .......... . . ... ....... .. .. . . . . . . . . . ... . .... . . . . . . . .... . . .... . . . . . ... .. . ... . . . . . .. . . .. . ............... . .... ...... . . . . . . . . . . .. . . ............................. . . .. . . . . . . ........... ..... . ............... . .... . . . . .......... . .. .. ....... .... ...... . ...................... . .. . ... . . ......... . . ........................... ......................... .. ..... ..... . . ...... .. ..... . .......... ...... ... . ...... . .. . . ... .. .... . .... .. .. .. .. . .. .. .... ................... .. .
lowQualScore : 4 0 33 6 11 4 22222 0 7 7 4 7 33 4 7 888 5555555555555 0 1 7 7 7 7 7 11111111111 0 0 0 0 0 0 7 333 555555 444 8888888 6 6 8888888 7777 444 00000000000000000000000000000000000000000 00 0 6 6 00 444 6 66 6 33333 33 6 66 8 444 3 3333333333 3 0 444 5555555 66 66 3 3 3 3 3 7 7 7 3 555 4 6666 0 1 6 7 7 4 0 7777 5 8 2222 8 5 5 0 5 222 55 7 777 7 7 7 7 7 00 2 7 22 7 777777777777777 7 2222 888888 7 7 7 7 7 7 7 7 7 0 11 0 0 00000000000000000000000000000 4 4 99 0 0 0 0 0 2 99999999999 55555 0 555555555555555 0 6666 4 4 0 4 7777777777 7 99 99 8888888 6666 000000 0 5555555555555555555555 4 44 0 888 8 4 000000000 4 4 888888888888888888888888888 4444444444444444444444444 44 88888 99999 4 4 888888 11 11111 9 4444444444 555555 888 4 777777 4 11 4 1 999 55 0000 0 5555 55 55 55 55 0 55 55 5555 4444444444444444444 11 0
consensus : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T--N----CCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAAC-TTNCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC-AG------------ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--GT----AATT-TA--------------AAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
Reference ( family-1769 ) : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATNTA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T--C----CCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAAC-TCGCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAACAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC-NG------------ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--GT----AANT-TA--------------AAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
gi|1 : CGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCGCAGTGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGAAAATTTTT-AGCGTACTCCATCTACCGAG--CTAAT-------------T-CGGATTTCTGTTGTCAGTCGGTTCCGGTTTG-AATC-ATTATCTTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCACGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTG------GTACT-------TGT-CGAAAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T--C----TGA-A-----TAA-A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTTCCCTA-GAAAAGTAAACAGTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TT--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-G-CA-A-G-GTGAAG--TCAC-T-AAGAAG-AAAAATGGCCCCG-TGTTAAAGGT-AC-GTAGGA-ATAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGA-GTCGTG--TTCCATT---CTACCGCAGATGTGTCACACCATA
gi|1 : CCTTTCATCA-GTG-TAAG--AAAAGAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGTAATTGGTA--CATGATT-ACGA-TATTT-TG-TTATTAATAAATAGAAAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTTTAAT--AC-CGATAGCACAAG--C-G-CCTAG-CC-AAA-AATA-GGTT-AAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATTGTTGTGAAACTTATC-CAGAAA--TTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTA--------------------------AAAT-TGTGT-ATC-A-GATTG-ATA-T-AA---T-------GAATCT-----CA-GTCTAG------------ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-GGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T---TCTTTCAT--AA-------------------TGAA-CAT-CAT---CAGT----AACGG-A----GACATTG-TCTGTTTAACTAT---TG--TACCGGCTTGAA-TAAAAAATTAAT---G--------AAA-TCGTT--T--ATATATGAATATT-G-AAATCTTTTACTA-----TCT-TTGAATAATTCTGAAA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAAATTT----T-GGG----CA--CT--AGCTACA--A-AATTTGC--TTGTG--GTATTAAAGT-TATTTTTATGGTAATTAAAG--TTAA-TTTTAAACCCtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttcatcagtgtaagaaaagaaacaactctatggtgacaacgcgtaattggtacatgattacgatattttgttattaataaatagaaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaataccgatagcacaagcgcctagccaaaaataggttaaaaccgagggcgattcatggattgttgtgaaacttatccagaaattatcgcaaatttgcagttgagttaaaattgtgtatcagattgatataatgaatctcagtctagatagtgtttatcttgccagaaacggagtcaggagaacattctttcataatgaacatcatcagtaacggagacattgtctgtttaactattgtaccggcttgaataaaaaattaatgaaatcgtttatatatgaatattgaaatcttttactatctttgaataattctgaaaatagctagtgatttttcaattttgctagtaaaaaattttgggcactagctacaaaatttgcttgtggtattaaagttatttttatggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|10 : cgctaaaatgcgaccataaatatattttagcgcagtgtgcattgcgtcatatgctcgaaaatttttagcgtactccatctaccgagctaattcggatttctgttgtcagtcggttccggtttgaatcattatctttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgatcacgcaatgacctcaaacgttaatttaacaaagatctagtcacattggtacttgtcgaaaaactgtccgtgttctgaataaaaaaaatccactggacttgacaacttccctagaaaagtaaacagtcggtccaaatgaattatcaaaaatattgacgtgatcgtaatattttagaactcggaatcgagatgcaaggtgaagtcactaagaagaaaaatggccccgtgttaaaggtacgtaggaatacttgtcgtggtaacgttccttttgcaaccgggagtcgtgttccattctaccgcagatgtgtcacaccatatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CCCAAA-CACTACAT--AA-A-AAAGATCTA-GTCACACATTG------G---TGCAGAGTTGT-CG-GAAA-------TTGT----CCGT---TT-------T--G----CCG-A-----C---AGGGCTGATAAAAAAAA--ACCAC-TAGGGC--G---ACAAC-TTGCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAAAG-A--TTAAAA---ATA-TCA-G--A-CTGAT-AATCGT---A----T--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GAAT-G-CACA-G-TTGAAGG-CCGC-TTAA----AAAACATGGCCGCC-TGTTAACGGTCAC-GTACGG-AAAC---TTGTCTTGGTAGCGTTCCTTTTGTAGCtg
gi|11 : attgtcaaatcgttcctagaacgattcgctTTTCATCAAGTGGTAAAGAAAAGAAAAACAACTCCTATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTTGTTTTTATTAATCAATAG-AAAG--CTTAAATGA-AAT-GCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-TGATAGCACAAGCCC-GCCCTAG-CCTTAACAGTAGGGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTCAATGGATGGTTGTGAAATTCATCTCAGAAA-TTTATCGCAAATTTTGCGAGATGAGTTACAAATTAA----------A--AA--TGAAT-T
gi|12 : AGGGTTAGAATTTAAATGGAAATACTCGCTA-AAAC-CATC--CAT-AAAAATATTT--A-GC-GAGTG-TATTCCAT-TATATCCTCGAAAA-TTTT-ATCT-ACTATATTTATCGT---CTATTTTTATCGAAAATTC-CGGATTTCTAATGTCAGTCAATTCCGACTTG-AGTT-GCTAT-CTTTCT--AGATTACTAATCACAAAAGCCTTTGAATGATTGACAATAATTCGCACACTTAC-CTCAAA-TGTAC-ATTCCA-C-Atg
gi|13 : attac-TATG-TG---ACAAC-ACGT-ATTGGTAC-CATGATTAACTA-TA-TT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGGTAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAATCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AAT------------------------T-TGTG-GACC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATTT-----CA-GTCTAG------------ATAG----TGTT-TAT-tttaatcgtcttgtcaa
gi|14 : aCGCTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG--C-GAGTG-CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATCAATTAT-TTTCCT-AAAA-TCCT-AGCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----T---A-----------AAA
gi|15 : ---GAATAA-AAAATG-AATATGAAATCGAT-----------T---TACATA------TGAAAT-----AT---TTTAA--------AAATTCTTT-----ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA-------T---AGCTAGT-GA-----TTTTTC--A--TTTT-GCTTAAGTAAAAAATTT----T-TGG----CA--CT---GCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--GT----AATT-CA--------------AAAG--TTAATTTTTAAACCCg
gi|16 : aattaaaaatgaatttgag------G---T-------TGTTCG-AAAA-------CTGT----CAGTCCTGTCGGCAGGT--G----CCG-A-----T---A-----------AAAA---TCCCCAT-GGAC--G---ACAAC-TACCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAGCCGA--TTAAAATATATA-TC--GTAA-CG-GT-GATCAT---T----ATTTATCTAA--GAA--CTCGGGAA-T-C-G-GGAT-GCCACA-G-GTGAAG--TCAC-T-A--AAAAAAACATGTGCGCA-TGT----GAT-ACGGTACGA-ACACAGACTGCCGTGGTtggtccacagaaaatgccaattgtttgcaaaaccctg
gi|17 : ------G---T-------TGT-CG-AAAAACCGGATCGGT----CC-T---GT-------CAGCAGGGCCG-A-----TAA-A-----------AAAAA--TCCCC-T-GGAC--A---ACAAC-TAGCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAAT-AACC-AATTTAAAA---ATA-TCG-G--A-C--GG-GATCAT---A----T--TATTTAA--GAA--CTC-GGGATT-C-G-GGAT-GCCACA-GCGTGAAGGT-CAC-T----AAAAAAACATGGCCGCGTTGTGAAAGGTTA
gi|18 : GGATGGTTGTGAAATGTATC-CAGAAA-TTTATCACAAA-TTTGC-GTTTGAGTTAA-ACTT-----------------------T-TGTG-GACC-A-GA-TG-ACA-TCAA---T-------AAATCT-----CA-GCT-AG------------GTGG----TTGT-TAT-CTA-GC-CAG--AG---A--CAAAA--GT--CAG-----G-AAA----ACA--A--ACATTCT-T----------------------TTATA-TGGACAT---CAACAG-AAACGG-A---T-ATATTG-T-----------C---TT--TT------TAAC-T-----AT---T---G--------Agctacaacataccttgcca
gi|19 : ------G---T-------TGC-TG-AAAA-------TTGTTGGTCC-T---GT-------T--G----GCA-AGGTTGT---T-----------AAGGA--TTCTG-T-GGGCT-G---ATAAC-TTGATA-GA-----TAAT-GTCAGACCAAATGACCG-T--TTGAAA---ATA-TT--G--GGC--AT--ATCCT---A---------TTCTA--GAG--CTG-GGGA-T-A-G-GGAT-G-CACA-A-GTGAAGCT-CAC-T-AAAAAAAAAAAATGGCttgattaacaagaaatttaatg
gi|2 : AGGGTTTCAAATTAA-TGAGAATACTCGCTA-AAGTGCGAC--CAT-AAATATATTT----AC-GAGTG-CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTC-GTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAAACGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T--C----TTG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAAC-TC-CTA-GA-----AAA--GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAAGTCAC-GTAGAATATAC----TGTCGT-GTAACGTTCCTTTTGCAA-CGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATAttcctggccgaccaaatatgttaaacttctctacccagtga
gi|2 : CTAAAAAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTT-TATGGTG---ACAACCGCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGAATATTT--GTT-ATTAATAGATAG-AAAG--CTT-AATGACA-TAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AGTA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AAAATGAAT-TATGTGATC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATCT-----CA-GTC-TG------------ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAA--GA---A--C-AGA--GT--CAG-------AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAATGA-A---TGAAATCG-T-----------T---TA--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GAT----TTTTTCA-A---TTT-GCT--AGTAAAAATTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--GT----AAAT-TA--------------ATAG--TTAA-TTTTAAACCCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctaaaaaaacgacctttcatcagtggtaagaaagaaaacaactttatggtgacaaccgcgtattggtaccatgattacgaatatttgttattaatagatagaaagcttaatgacatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaagtaggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaattaaaaatgaattatgtgatcagatgatattgatgaatctcagtctgatagtgtttatcttgccaagaacagagtcagagaacatgtctttttaactattgtacggcttgaataaaaatgaatgaaatcgtttatatgaatattgaaattcttttatatctttgaataatttctgaaaatagctagtgattttttcaatttgctagtaaaaattttttggcactagctaaaatttgcttgtggtaaattaatagttaattttaaacccct
gi|20 : agggtttcaaattaatgagaatactcgctaaagtgcgaccataaatatatttacgagtgcattgcgtcatatactcgcaattttagcgacttcatctaccgactattccggatttctgttgtcagtcgttccggtttgaatcattattttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgattgcgcaatgacctcaaaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttcttgataaaaaatccactggacttgacaactcctagaaaagtcggtccaaatgaattatcaaaaatatcgacgtgatcgtaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtccactaagaagaaaaaatggccgcgtgttaaaagtcacgtagaatatactgtcgtgtaacgttccttttgcaacgggaggtcgtgatttccattctaccgcagctgtgtcacaccatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntc------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTAT----CTGC---AA-------G--G----GCA-A-----T---A-----------AGAAA--TTCTC-T-TGACT-G---GTAAC-TTGTTA-GA-----AAAT-GTTGATCCAAATT-ACT-T--T--AAA---ATA-CCT-G--G-C--GT-GATCCT---ATTACA--TATTTAA--GAT--CTC-AGAA-T-T-G-GGGTGG-CACA-G-GTGACGATC
gi|21 : GGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCTACAAATGCGAC--CAT-AAATAT-TTTTAG--C-GAGTGGCATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTACCGGTTTG-AATT-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCTAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGattcaaataacgtggtcacaaggctgataaaatttgtgaaaggttttctacccag
gi|22 : AGGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCT--AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTA--GC-GAGTG-CATTGCGT-TATATGCTCGAAAT-TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGAGGGCGATT-------------CATGGAT
gi|23 : gtcc--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACGTG-TTAAAGGT-AACGT-ACGAAGA
gi|23 : atCACG-TGTTAAAGGTAAC-GTACGA-AGAC---TTGTCGTGTAAACATTCCTTTTGCAACCAGGCGGTCGTGGTTTCCATT---TT--CG-AGCTcttgtcgtgtaaacattccttttgcaaccaggcggtcgtggtttccattttcgagctcaact
gi|24 : attattttagaactcggaatcgggatgTCT-----TT-G-AA------TG--G-----TTTTCTGA----------AA------AC---AGCTAGT-GA-----AATTTCA-A--TTTT-GGT--AGTAAAAA-TTT----T-TGGCACTCA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTATG--GT----AATT-T---------------TAAG--TTAA-TTTTGAACCCcaact
gi|25 : ------AT---AGCTAGCAGA-----ATTTT-A-A--TAT--GAT--GGCATAAACGTT----T-TGG----CA--TT--AGCT--A--T-AACTTGC--TTATGCCGT----AA-T-TC--------------ATAC--TTAA-TTTCAt
gi|26 : AAA---ATA-TCCGGC-A-C--ATCGATCGT---A----T--TATTTTA--GAAGGCTC-GGAA-T-CAG-GGATGG-CACGTG-TTAAAGGTtgaac
gi|27 : CG-A-----T---A-----------AAAAAAATCCTC-C-GGACCAACAAACAAC-TTGCTA-GA-----AAA--ATC-GTCCAAAa
gi|28 : cagggA-----AAAC-GTTGGTCCAAATGAACC-A--TTGAAA---ATA-TCGTG--G-C--GT-GATCGag
gi|29 : gaTTGTAACCGGGAGGTCGTGATTACCATT----TAC
gi|3 : CAATGAC-CTCGAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----TAAAA-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAAC-TTCCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAAAT-ATA-TCG-G--A-A--GT-GATC-TAAAA----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGT-CAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG--GTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ATAC---TTGTC-TGGTAACGTTCCTTTTGCAACCAGGAGGTCGTGATTTCCATTCTACTACCGCAGCTGTGTCACACCAgagctcatcttcta
gi|3 : CTAAACAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAA---AAAGAAAA--AACTC-TATGGTGGTGACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTA-TAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT-------------------TG--T-TG---GACC-A-GA-TGCATATTCGAAATT-------GAATCTATTTGCACATC-AG------------AT-G----TGTTCTCT-CTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaaacaaacgacctttcatcagtggtaaaaagaaaaaactctatggtggtgacaacgcgtattggtaccatgattacgatattttgtttattataaatagaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaaataggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaatttgttggaccagatgcatattcgaaattgaatctatttgcacatcagatgtgttctctctt
gi|30 : caatgacctcgaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttctgataaaaaaaaatccactggacttgacaacttcctagaaaacgtcggtccaaatgaattatcaaaaatatatcggaagtgatctaaaaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtcactaagaagaaaaaatggccgcggttaaaggtcacgtaggaatacttgtctggtaacgttccttttgcaaccaggaggtcgtgatttccattctactaccgcagctgtgtcacaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATTAAGTGGAAATACTCGTT--AAATGCGAT--CAT-AAATAT
gi|4 : CTA-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTACACATGATT-ACGA-TATTT--GTTT-----TAAATAG-AAAGGCCTT-AATG-CAATAGCAAGTAAGGAATATATTGTAAGCAAGGGCATCAGTTT---TTTACGCGATAGCACAAG-CCAG-CCTAGGCCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGATTTC-ATGAATGGTTGTG--ATTTATC-CAGAAATTTTATCGC-AA-TTTGC-AGTTGAGTTA------------------A--AA--T---T-TGTG-GATCAA-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT--------GT------------------------TGCT-TAT-CTT-GCGCAG--AA---AGGC-AGA--GTCCCGG-----G-AGA----A-A--T---TCTGTC-T--CATATGCAGATCTA------TCATC-CAG-TT-------------ACGG-A---AGCAGTTG-T-----------C---TC--TT------TCAA-------GC---T---A--------AAATAA--T--T--GTAGC------TT-G-AA------TA--ATAAATTTT-ATGA----------AATCGTGTATATGAATTATT-GAAATTTTTTTTTATATCTTTT-G-------AATAATTTT----C-TGA----AA--AT--AGCT--A--GTGATTTTCAATTTTG--GC----TAG--TA--------------AAAG--TTg
gi|4 : ctA--GT--TAC-----G-GAA----GCAGTT--GTCTCTT-TCAAG---------CTAAAATAATTGTA---G-CTT---GAATAATAAATTTTA---TGAAATCG-T-----------G---TA--TA------TGAA-TT----AT---T---G--------AAATTTTTT--TTTATATCT-----TTTG-AA------TA--A-----TTTTCTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA------TTTTCA-A--TTTTGGCT--AGTAAAAGTTTT----TGGGG----CAGGCTGAGGCTG-A--A-AATTTGC--TTGTG--GT----AATT-TA--------------AAGA--TTAA-ATTAAGACCGCTtttggggcaggctgaggctgaaaatttgcttgtggtaatttaaagattaaattaagaccgctga
gi|5 : ctctatatggtgacaacgcgtattggtacacatgattacgatatttgttttaaatagaaaggccttaatgcaatagcaagtaaggaatatattgtaagcaagggcatcagttttttacgcgatagcacaagccagcctaggccttaaaataggttcaaaaccgagggcgatttcatgaatggttgtgatttatccagaaattttatcgcaatttgcagttgagttaaaatttgtggatcaagatgatatcgatgaatctgttgcttatcttgcgcagaaaggcagagtcccgggagaaattctgtctcatatgcagatctatcatccGTT-TATACTTAGC-CAGTAAACGTA--C-AAATGGT--TAG-----GGAGATGAAACA--TTTGTCTTTT-T--AA---------CTAAT----CTGTACCGG-CTTATGGAATAA-AAA--G-A---TGAAAT-G-T-----------TTTATA--TA------TGAA-T-----AT---T---GAGACGATTAAATGCCTT--C--CTATTTATA--TT-ACAA------AA--A-----TTA-CTGA----------AA------ga
gi|5 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttgAAAA---T----T-TGG----CA--CTT-AGCT--ATAA-AATTTGC--TTGTG--GT----AATCATA--------------AAAGTATCAA-TTTTAAAACCCTtggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagaaaatttggcacttagctataaaatttgcttgtggtaatcataaaagtatcaattttaaaaccctgacttccttaaa
gi|6 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttggtttatacttagccagtaaacgtacaaatggttagggagatgaaacatttgtctttttaactaatctgtaccggcttatggaataaaaagatgaaatgttttatatatgaatattgagacgattaaatgccttcctatttatattacaaaaattactgaaatggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagGGTTC-AAATTAAGTGAAATTAACCGCTA-AAATGCGACGCCATGAAATATATTT--A-GC-GAGTG-CATTGCGTGCATATACTCGCAA--TTTT-TGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-C-GATTTCTGTTGTCAGTCAGTTTCCGTTTGAAATC-ATTAT-TTTCCTAAAAATCCCT-AT-GCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGACGCTCAAA-CGTTA-ATTTAAGCAAAAGATATAGGTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T--C----CTGCA-----T---A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAAC-TTCCTA-AG-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATACTCCGG--A-T--GT--ATCGT---AG---A--TGTTTT---GAA--CTC-GGAA-TGC-GAGAAT-G-CACA-G-G-GAAGGT-CAC-T-AAGAAAAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGATAAAC---gacttccttaaa
gi|7 : CCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC--------------GCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAA-AATTTGTGGATCAGATATCAA--TGAATCTCAGT--CT-A-GA-TA-GTA-TTTA---TCTTGCCAGAAACG-----GA-GTC-AGG-----------AGAG----CATT-----CTT-TCATAT--GG---A--C-ATC--AT--CAGTAACTG-AGA----AAT--T--GTTTTTT-T--AA---------CTA------TTGTATCGG-CTT---GAATGA-AAATTA-A---AGAAATAG-T-----------T---TT--TA------TGAA-T-----AT---T---C--------AAATTATTC--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAGATTTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--GT----AATT-----------------AGAG--TTAA-TTTTAAACCC
gi|8 : AATACTCACTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-AC-tgatgtcacacctaaatatgtcacaactgaaaacggcacaatcctcacacactctaggc
gi|8 : acgagtcatACCGA---CTATT-------------C-CAGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-CTTCCT-AAAATTCCT-ATCACAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGTGCAATGAC-CTCAAA-CATTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTGGTGACAG---T-------TGT-TG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----T----------------AAAA--TCCAC-T-GGAC-TG---ACAAC-TTTCTATGA-----AAAC-GTCGGTCCCAAAGAATT-AG-TCAAAA---ATA-TC--G--A-TCAGT-GATCGT---ATT--A--TAATTTAAGAAA--CTC-GGAA-T-A-G-GAGT-G-CACA-G-TTGAAGGTCcgactattccagatttctgttgtcagtcagttccggtttgaatcattatcttcctaaaattcctatcacaaaagcgcttgaatgatcgtgcaatgacctcaaacattaatttaacaaagatctagtcacattggtgacagttgttgaaaactgtccgtgttctgataaaatccactggactgacaactttctatgaaaacgtcggtcccaaagaattagtcaaaaatatcgatcagtgatcgtattataatttaagaaactcggaataggagtgcacagttgaaggtca
gi|9 : acgagtcataatactcactaaatgcgaccataaatatattttag-TGTGTGGTC-AAGA-TG-GTA-TTGG---C-------GAATTT-----CA-GCC-CAGGGGAGCAGTAAATAGGCGGTGGT-TAT-CTA-GC-CAG--A----------GA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--a
gi|9 : tgaggatttataTTTC-T--AA---------ACA------GTG----GA-CTT---GAATAA-AAA----------AAA---------------------------------AAA-T-----AG---T---G--------AAATCATTTAAT--ACATCA-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AC---AGCTGAT-AA-----ATTATCA-A--TTTT-GCT---GTAAAAAA---AAAAT-TGG----CA--CA--AGCT--A--A-AAATTGC--TTACG--GT----AATT-TG--------------Aattaaactttctcccataccgacctcatcaatgacggtgacgaagtctatttttattattttctaaacagtggacttgaataaaaaaaaaaatagtgaaatcatttaatacatcattgaataatttctgaaaacagctgataaattatcaattttgctgtaaaaaaaaaattggcacaagctaaaaattgcttacggtaatttga
Alignments
lowQualScore : 1 22222 11 1 111 2222222222222 22222222222 111111 1111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444 11 111 3333333333 2222222 111 1 1111 1111 1 222 11 111 11 444444444444444 1111 111111 88888888888888888888888888888 11 11111111111 11111 333333333333 1111 1 1111111111 1111111 1111 111111 4444444444444444444444 11 222222222 333333333333333333333333333 2222222222222222222222222 11111 11111 111111 11111 1111111111 111111 222222 111
lowQualScore : 1 1 66 3 66 4 44444 5 5 5 0 0 99 1 5 333 7777777777777 5 0 5 5 5 5 5 77777777777 5 5 5 5 5 1 5 999 000000 666 1111111 3 3 1111111 7777 666 11111111111111111111111111111111111111111 55 1 3 3 99 666 444 3 88888 44 3 88 1 000 3 0000000000 3 1 666 3333333 44 44 3 3 3 3 3 6 6 6 3 666 4 5555 5 0 7 5 0 1 1 1111 2 3 7777 0 2 1 0 2 000 22 6 111 6 6 6 6 6 44 3 6 99 6 111111111111111 6 4444 111111 6 6 6 6 6 6 6 5 5 5 55 5 5 66666666666666666666666666666 4 0 44 5 5 5 5 5 4 77777777777 22222 5 555555555555 5 2 0000 4 4 5 1 7777777777 5 66 66 3333333 0000 666666 5 2222222222222222222222 0 11 5 777 0 4 333333333 6 4 666666666666666666666666666 3333333333333333333333333 33 22222 88888 4 4 222222 66 11111 8 9999999999 111111 777 4 000000 4 66 4 1 666 99 6666 4 8888 55 99 99 55 4 55 55 4 444 66 5
lowQualScore : . . .. . .. . ..... . . . . . .. . . ... ............. . . . . . . . ........... . . . . . . . ... ...... ... ....... . . ....... .... ... ......................................... .. . . . .. ... ... . ..... .. . .. . ... . .......... . . ... ....... .. .. . . . . . . . . . ... . .... . . . . . . . .... . . .... . . . . . ... .. . ... . . . . . .. . . .. . ............... . .... ...... . . . . . . . . . . .. . . ............................. . . .. . . . . . . ........... ..... . ............ . . .... . . . . .......... . .. .. ....... .... ...... . ...................... . .. . ... . . ......... . . ........................... ......................... .. ..... ..... . . ...... .. ..... . .......... ...... ... . ...... . .. . . ... .. .... . .... .. .. .. .. . .. .. . ... .. .
lowQualScore : 4 0 33 6 11 4 22222 0 7 7 4 7 33 4 7 888 5555555555555 0 1 7 7 7 7 7 11111111111 0 0 0 0 0 3 7 333 555555 444 8888888 6 6 8888888 7777 444 77777777777777777777777777777777777777777 00 0 6 6 00 444 888 6 33333 33 6 66 8 444 3 3333333333 3 0 444 5555555 66 66 3 3 3 3 3 7 7 7 3 555 4 6666 0 1 6 7 7 4 0 7777 5 8 2222 8 5 0 0 5 222 55 7 777 7 7 7 7 7 00 2 7 22 7 777777777777777 7 2222 888888 7 7 7 7 7 7 7 7 7 0 11 0 0 00000000000000000000000000000 4 4 99 0 0 0 0 0 2 99999999999 55555 0 666666666666 0 0 6666 4 4 0 4 7777777777 7 99 99 8888888 6666 000000 0 5555555555555555555555 4 44 0 888 8 4 000000000 4 4 888888888888888888888888888 4444444444444444444444444 44 88888 99999 4 4 888888 11 11111 9 4444444444 555555 888 4 777777 4 11 4 1 999 55 0000 0 5555 55 55 55 55 0 55 55 0 999 11 0
consensus : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------TG------CCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-NCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAGT--TAA-TTTTAAACCCCT
Reference ( family-1769 ) : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------TN------CCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-NCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAGT--TAA-TTTTAAACCCCT
gi|1 : CGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCGCAGTGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGAAAATTTTT-AGCGTACTCCATCTACCGAG--CTAAT-------------T-CGGATTTCTGTTGTCAGTCGGTTCCGGTTTG-AATC-ATTATCTTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCACGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTG------GTACT-------TGT-CGAAAAA-------CTGT----CCGT---GT-------TC------TGA-A-----TAA-A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTTCCCTA-GAAAAGTAAACAGTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TT--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-G-CA-A-G-GTGAAG--TCAC-T-AAGAAG-AAAAATGGCCCCG-TGTTAAAGGT-AC-GTAGGA-ATAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGA-GTCGTG--TTCCATT---CTACCGCAGATGTGTCACACCATA
gi|1 : CCTTTCATCA-GTG-TAAG--AAAAGAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGTAATTGGTA--CATGATT-ACGA-TATTT-TG-TTATTAATAAATAGAAAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTTTAAT--AC-CGATAGCACAAG--C-G-CCTAG-CC-AAA-AATA-GGTT-AAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATTGTTGTGAAACTTATC-CAGAAA--TTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTA--------------------------AAAT-TGTGT-ATC-A-GATTG-ATA-T-AA---T-------GAATCT-----CA-GTCT-----------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-GGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T---TCTTTCAT--AA-------------------TGAA-CAT-CAT---CAGT----AACGG-A----GACATTG-TCTGTTTAACTAT---TG--TACCGGCTTGAA-TAAAAAATTAAT---G--------AAA-TCGTT--T--ATATATGAATATT-G-AAATCTTTTACTA-----TCT-TTGAATAATTCTGAAA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAAATTT----T-GGG----CA--CT--AGCTACA--A-AATTTGC--TTGTG--G-T-ATT---AAAGT--TAT-TTTTAtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttcatcagtgtaagaaaagaaacaactctatggtgacaacgcgtaattggtacatgattacgatattttgttattaataaatagaaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaataccgatagcacaagcgcctagccaaaaataggttaaaaccgagggcgattcatggattgttgtgaaacttatccagaaattatcgcaaatttgcagttgagttaaaattgtgtatcagattgatataatgaatctcagtctagatagtgtttatcttgccagaaacggagtcaggagaacattctttcataatgaacatcatcagtaacggagacattgtctgtttaactattgtaccggcttgaataaaaaattaatgaaatcgtttatatatgaatattgaaatcttttactatctttgaataattctgaaaatagctagtgatttttcaattttgctagtaaaaaattttgggcactagctacaaaatttgcttgtggtattaaagttatttttatggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|10 : cgctaaaatgcgaccataaatatattttagcgcagtgtgcattgcgtcatatgctcgaaaatttttagcgtactccatctaccgagctaattcggatttctgttgtcagtcggttccggtttgaatcattatctttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgatcacgcaatgacctcaaacgttaatttaacaaagatctagtcacattggtacttgtcgaaaaactgtccgtgttctgaataaaaaaaatccactggacttgacaacttccctagaaaagtaaacagtcggtccaaatgaattatcaaaaatattgacgtgatcgtaatattttagaactcggaatcgagatgcaaggtgaagtcactaagaagaaaaatggccccgtgttaaaggtacgtaggaatacttgtcgtggtaacgttccttttgcaaccgggagtcgtgttccattctaccgcagatgtgtcacaccatatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CCCAAA-CACTACAT--AA-A-AAAGATCTA-GTCACACATTG------G---TGCAGAGTTGT-CG-GAAA-------TTGT----CCGT---TT-------TG------CCG-A-----C---AGGGCTGATAAAAAAAA--ACCAC-TAGGGC--G---ACAACTT-GCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAAAG-A--TTAAAA---ATA-TCA-G--A-CTGAT-AATCGT---A----T--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GAAT-G-CACA-G-TTGAAGG-CCGC-TTAA----AAAACATGGCCGCC-TGTTAACGGTCAC-GTACGG-AAAC---TTGTCTTGGTAGCGTTCCTTTTGTAGCtggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|11 : attgtcaaatcgttcctagaacgattcgctTTTCATCAAGTGGTAAAGAAAAGAAAAACAACTCCTATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTTGTTTTTATTAATCAATAG-AAAG--CTTAAATGA-AAT-GCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-TGATAGCACAAGCCC-GCCCTAG-CCTTAACAGTAGGGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTCAATGGATGGTTGTGAAATTCATCTCAGAAA-TTTATCGCAAATTTTGCGAGATGAGTTACAAATTAA----------A--AA--TGAAT-T
gi|12 : AGGGTTAGAATTTAAATGGAAATACTCGCTA-AAAC-CATC--CAT-AAAAATATTT--A-GC-GAGTG-TATTCCAT-TATATCCTCGAAAA-TTTT-ATCT-ACTATATTTATCGT---CTATTTTTATCGAAAATTC-CGGATTTCTAATGTCAGTCAATTCCGACTTG-AGTT-GCTAT-CTTTCT--AGATTACTAATCACAAAAGCCTTTGAATGATTGACAATAATTCGCACACTTAC-CTCAAA-TGTAC-ATTCCA-C-Atg
gi|13 : attac-TATG-TG---ACAAC-ACGT-ATTGGTAC-CATGATTAACTA-TA-TT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGGTAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAATCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AAT------------------------T-TGTG-GACC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATTT-----CA-GTCT-----------AG-ATAG----TGTT-TAT-tttaatcgtcttgtcaa
gi|14 : aCGCTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG--C-GAGTG-CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATCAATTAT-TTTCCT-AAAA-TCCT-AGCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----T---A-----------AAA
gi|15 : ---GAATAA-AAAATG-AATATGAAATCGAT-----------T---TACATA------TGAAAT-----AT---TTTAA--------AAATTCTTT-----ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA-------T---AGCTAGT-GA-----TTTTTC--A--TTTT-GCTTAAGTAAAAAATTT----T-TGG----CA--CT---GCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-CAAAAGT--TAATTTTTAAACCCg
gi|16 : aattaaaaatgaatttgag------G---T-------TGTTCG-AAAA-------CTGT----CAGTCCTGTCGGCAGGTG------CCG-A-----T---A-----------AAAA---TCCCCAT-GGAC--G---ACAACTA-CCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAGCCGA--TTAAAATATATA-TC--GTAA-CG-GT-GATCAT---T----ATTTATCTAA--GAA--CTCGGGAA-T-C-G-GGAT-GCCACA-G-GTGAAG--TCAC-T-A--AAAAAAACATGTGCGCA-TGT----GAT-ACGGTACGA-ACACAGACTGCCGTGGTtggtccacagaaaatgccaattgtttgcaaaaccctg
gi|17 : ------G---T-------TGT-CG-AAAAACCGGATCGGT----CC-T---GT-------CAGCAGGGCCG-A-----TAA-A-----------AAAAA--TCCCC-T-GGAC--A---ACAACTA-GCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAAT-AACC-AATTTAAAA---ATA-TCG-G--A-C--GG-GATCAT---A----T--TATTTAA--GAA--CTC-GGGATT-C-G-GGAT-GCCACA-GCGTGAAGGT-CAC-T----AAAAAAACATGGCCGCGTTGTGAAAGGTTA
gi|18 : GGATGGTTGTGAAATGTATC-CAGAAA-TTTATCACAAA-TTTGC-GTTTGAGTTAA-ACTT-----------------------T-TGTG-GACC-A-GA-TG-ACA-TCAA---T-------AAATCT-----CA-GCT------------AG-GTGG----TTGT-TAT-CTA-GC-CAG--AG---A--CAAAA--GT--CAG-----G-AAA----ACA--A--ACATTCT-T----------------------TTATA-TGGACAT---CAACAG-AAACGG-A---T-ATATTG-T-----------C---TT--TT------TAAC-T-----AT---T---G--------Agctacaacataccttgcca
gi|19 : ------G---T-------TGC-TG-AAAA-------TTGTTGGTCC-T---GT-------TG------GCA-AGGTTGT---T-----------AAGGA--TTCTG-T-GGGCT-G---ATAACTT-GATA-GA-----TAAT-GTCAGACCAAATGACCG-T--TTGAAA---ATA-TT--G--GGC--AT--ATCCT---A---------TTCTA--GAG--CTG-GGGA-T-A-G-GGAT-G-CACA-A-GTGAAGCT-CAC-T-AAAAAAAAAAAATGGCttgattaacaagaaatttaatg
gi|2 : AGGGTTTCAAATTAA-TGAGAATACTCGCTA-AAGTGCGAC--CAT-AAATATATTT----AC-GAGTG-CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTC-GTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAAACGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------TC------TTG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACT--CCTA-GA-----AAA--GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAAGTCAC-GTAGAATATAC----TGTCGT-GTAACGTTCCTTTTGCAA-CGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATAttcctggccgaccaaatatgttaaacttctctacccagtga
gi|2 : CTAAAAAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTT-TATGGTG---ACAACCGCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGAATATTT--GTT-ATTAATAGATAG-AAAG--CTT-AATGACA-TAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AGTA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AAAATGAAT-TATGTGATC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------TG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAA--GA---A--C-AGA--GT--CAG-------AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAATGA-A---TGAAATCG-T-----------T---TA--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GAT----TTTTTCA-A---TTT-GCT--AGTAAAAATTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAAAT-TAATAGT--TAA-TTTTAAACCCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctaaaaaaacgacctttcatcagtggtaagaaagaaaacaactttatggtgacaaccgcgtattggtaccatgattacgaatatttgttattaatagatagaaagcttaatgacatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaagtaggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaattaaaaatgaattatgtgatcagatgatattgatgaatctcagtctgatagtgtttatcttgccaagaacagagtcagagaacatgtctttttaactattgtacggcttgaataaaaatgaatgaaatcgtttatatgaatattgaaattcttttatatctttgaataatttctgaaaatagctagtgattttttcaatttgctagtaaaaattttttggcactagctaaaatttgcttgtggtaaattaatagttaattttaaacccct
gi|20 : agggtttcaaattaatgagaatactcgctaaagtgcgaccataaatatatttacgagtgcattgcgtcatatactcgcaattttagcgacttcatctaccgactattccggatttctgttgtcagtcgttccggtttgaatcattattttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgattgcgcaatgacctcaaaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttcttgataaaaaatccactggacttgacaactcctagaaaagtcggtccaaatgaattatcaaaaatatcgacgtgatcgtaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtccactaagaagaaaaaatggccgcgtgttaaaagtcacgtagaatatactgtcgtgtaacgttccttttgcaacgggaggtcgtgatttccattctaccgcagctgtgtcacaccatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntc------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTAT----CTGC---AA-------GG------GCA-A-----T---A-----------AGAAA--TTCTC-T-TGACT-G---GTAACTT-GTTA-GA-----AAAT-GTTGATCCAAATT-ACT-T--T--AAA---ATA-CCT-G--G-C--GT-GATCCT---ATTACA--TATTTAA--GAT--CTC-AGAA-T-T-G-GGGTGG-CACA-G-GTGACGATC
gi|21 : GGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCTACAAATGCGAC--CAT-AAATAT-TTTTAG--C-GAGTGGCATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTACCGGTTTG-AATT-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCTAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGattcaaataacgtggtcacaaggctgataaaatttgtgaaaggttttctacccag
gi|22 : AGGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCT--AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTA--GC-GAGTG-CATTGCGT-TATATGCTCGAAAT-TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGAGGGCGATT-------------CATGGAT
gi|23 : gtcc--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACGTG-TTAAAGGT-AACGT-ACGAAGA
gi|23 : atCACG-TGTTAAAGGTAAC-GTACGA-AGAC---TTGTCGTGTAAACATTCCTTTTGCAACCAGGCGGTCGTGGTTTCCATT---TT--CG-AGCTcttgtcgtgtaaacattccttttgcaaccaggcggtcgtggtttccattttcgagctcaact
gi|24 : attattttagaactcggaatcgggatgTCT-----TT-G-AA------TG--G-----TTTTCTGA----------AA------AC---AGCTAGT-GA-----AATTTCA-A--TTTT-GGT--AGTAAAAA-TTT----T-TGGCACTCA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTATG--G-TAATT-T-TAAGT--TAA-TTTTGAACCCcaact
gi|25 : ------AT---AGCTAGCAGA-----ATTTT-A-A--TAT--GAT--GGCATAAACGTT----T-TGG----CA--TT--AGCT--A--T-AACTTGC--TTATGCCG-TAATT-C-ATACT--TAA-TTTCAt
gi|26 : AAA---ATA-TCCGGC-A-C--ATCGATCGT---A----T--TATTTTA--GAAGGCTC-GGAA-T-CAG-GGATGG-CACGTG-TTAAAGGTtgaac
gi|27 : CG-A-----T---A-----------AAAAAAATCCTC-C-GGACCAACAAACAACTT-GCTA-GA-----AAA--ATC-GTCCAAAa
gi|28 : cagggA-----AAAC-GTTGGTCCAAATGAACC-A--TTGAAA---ATA-TCGTG--G-C--GT-GATCGag
gi|29 : gaTTGTAACCGGGAGGTCGTGATTACCATT----TAC
gi|3 : CAATGAC-CTCGAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----TAAAA-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTT-CCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAAAT-ATA-TCG-G--A-A--GT-GATC-TAAAA----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGT-CAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG--GTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ATAC---TTGTC-TGGTAACGTTCCTTTTGCAACCAGGAGGTCGTGATTTCCATTCTACTACCGCAGCTGTGTCACACCAgagctcatcttcta
gi|3 : CTAAACAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAA---AAAGAAAA--AACTC-TATGGTGGTGACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTA-TAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT-------------------TG--T-TG---GACC-A-GA-TGCATATTCGAAATT-------GAATCTATTTGCACATC------------AG-AT-G----TGTTCTCT-CTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaaacaaacgacctttcatcagtggtaaaaagaaaaaactctatggtggtgacaacgcgtattggtaccatgattacgatattttgtttattataaatagaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaaataggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaatttgttggaccagatgcatattcgaaattgaatctatttgcacatcagatgtgttctctctt
gi|30 : caatgacctcgaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttctgataaaaaaaaatccactggacttgacaacttcctagaaaacgtcggtccaaatgaattatcaaaaatatatcggaagtgatctaaaaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtcactaagaagaaaaaatggccgcggttaaaggtcacgtaggaatacttgtctggtaacgttccttttgcaaccaggaggtcgtgatttccattctactaccgcagctgtgtcacaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATTAAGTGGAAATACTCGTT--AAATGCGAT--CAT-AAATAT
gi|4 : CTA-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTACACATGATT-ACGA-TATTT--GTTT-----TAAATAG-AAAGGCCTT-AATG-CAATAGCAAGTAAGGAATATATTGTAAGCAAGGGCATCAGTTT---TTTACGCGATAGCACAAG-CCAG-CCTAGGCCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGATTTC-ATGAATGGTTGTG--ATTTATC-CAGAAATTTTATCGC-AA-TTTGC-AGTTGAGTTA------------------A--AA--T---T-TGTG-GATCAA-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT--------GT------------------------TGCT-TAT-CTT-GCGCAG--AA---AGGC-AGA--GTCCCGG-----G-AGA----A-A--T---TCTGTC-T--CATATGCAGATCTA------TCATC-CAG-TT-------------ACGG-A---AGCAGTTG-T-----------C---TC--TT------TCAA-------GC---T---A--------AAATAA--T--T--GTAGC------TT-G-AA------TA--ATAAATTTT-ATGA----------AATCGTGTATATGAATTATT-GAAATTTTTTTTTATATCTTTT-G-------AATAATTTT----C-TGA----AA--AT--AGCT--A--GTGATTTTCAATTTTG--GCTAG---TAAAAGT--Tg
gi|4 : ctA--GT--TAC-----G-GAA----GCAGTT--GTCTCTT-TCAAG---------CTAAAATAATTGTA---G-CTT---GAATAATAAATTTTA---TGAAATCG-T-----------G---TA--TA------TGAA-TT----AT---T---G--------AAATTTTTT--TTTATATCT-----TTTG-AA------TA--A-----TTTTCTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA------TTTTCA-A--TTTTGGCT--AGTAAAAGTTTT----TGGGG----CAGGCTGAGGCTG-A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAGAT--TAA-ATTAAGACCGCTtttggggcaggctgaggctgaaaatttgcttgtggtaatttaaagattaaattaagaccgctga
gi|5 : ctctatatggtgacaacgcgtattggtacacatgattacgatatttgttttaaatagaaaggccttaatgcaatagcaagtaaggaatatattgtaagcaagggcatcagttttttacgcgatagcacaagccagcctaggccttaaaataggttcaaaaccgagggcgatttcatgaatggttgtgatttatccagaaattttatcgcaatttgcagttgagttaaaatttgtggatcaagatgatatcgatgaatctgttgcttatcttgcgcagaaaggcagagtcccgggagaaattctgtctcatatgcagatctatcatccGTT-TATACTTAGC-CAGTAAACGTA--C-AAATGGT--TAG-----GGAGATGAAACA--TTTGTCTTTT-T--AA---------CTAAT----CTGTACCGG-CTTATGGAATAA-AAA--G-A---TGAAAT-G-T-----------TTTATA--TA------TGAA-T-----AT---T---GAGACGATTAAATGCCTT--C--CTATTTATA--TT-ACAA------AA--A-----TTA-CTGA----------AA------ga
gi|5 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttgAAAA---T----T-TGG----CA--CTT-AGCT--ATAA-AATTTGC--TTGTG--G-TAATCATAAAAGTATCAA-TTTTAAAACCCTtggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagaaaatttggcacttagctataaaatttgcttgtggtaatcataaaagtatcaattttaaaaccctgacttccttaaa
gi|6 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttggtttatacttagccagtaaacgtacaaatggttagggagatgaaacatttgtctttttaactaatctgtaccggcttatggaataaaaagatgaaatgttttatatatgaatattgagacgattaaatgccttcctatttatattacaaaaattactgaaatggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagGGTTC-AAATTAAGTGAAATTAACCGCTA-AAATGCGACGCCATGAAATATATTT--A-GC-GAGTG-CATTGCGTGCATATACTCGCAA--TTTT-TGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-C-GATTTCTGTTGTCAGTCAGTTTCCGTTTGAAATC-ATTAT-TTTCCTAAAAATCCCT-AT-GCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGACGCTCAAA-CGTTA-ATTTAAGCAAAAGATATAGGTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------TC------CTGCA-----T---A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTT-CCTA-AG-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATACTCCGG--A-T--GT--ATCGT---AG---A--TGTTTT---GAA--CTC-GGAA-TGC-GAGAAT-G-CACA-G-G-GAAGGT-CAC-T-AAGAAAAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGATAAAC---gacttccttaaa
gi|7 : CCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC--------------GCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAA-AATTTGTGGATCAGATATCAA--TGAATCTCAGT--CT-A-GA-TA-GTA-TTTA---TCTTGCCAGAAACG-----GA-GTC------------AGGAGAG----CATT-----CTT-TCATAT--GG---A--C-ATC--AT--CAGTAACTG-AGA----AAT--T--GTTTTTT-T--AA---------CTA------TTGTATCGG-CTT---GAATGA-AAATTA-A---AGAAATAG-T-----------T---TT--TA------TGAA-T-----AT---T---C--------AAATTATTC--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAGATTTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT---AGAGT--TAA-TTTTAAACCC
gi|8 : AATACTCACTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-AC-tgatgtcacacctaaatatgtcacaactgaaaacggcacaatcctcacacactctaggc
gi|8 : acgagtcatACCGA---CTATT-------------C-CAGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-CTTCCT-AAAATTCCT-ATCACAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGTGCAATGAC-CTCAAA-CATTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTGGTGACAG---T-------TGT-TG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----T----------------AAAA--TCCAC-T-GGAC-TG---ACAACTT-TCTATGA-----AAAC-GTCGGTCCCAAAGAATT-AG-TCAAAA---ATA-TC--G--A-TCAGT-GATCGT---ATT--A--TAATTTAAGAAA--CTC-GGAA-T-A-G-GAGT-G-CACA-G-TTGAAGGTCcgactattccagatttctgttgtcagtcagttccggtttgaatcattatcttcctaaaattcctatcacaaaagcgcttgaatgatcgtgcaatgacctcaaacattaatttaacaaagatctagtcacattggtgacagttgttgaaaactgtccgtgttctgataaaatccactggactgacaactttctatgaaaacgtcggtcccaaagaattagtcaaaaatatcgatcagtgatcgtattataatttaagaaactcggaataggagtgcacagttgaaggtca
gi|9 : acgagtcataatactcactaaatgcgaccataaatatattttag-TGTGTGGTC-AAGA-TG-GTA-TTGG---C-------GAATTT-----CA-GCCCAGGGGAGCAGTAA-ATAGGCGGTGGT-TAT-CTA-GC-CAG--A----------GA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--a
gi|9 : tgaggatttataTTTC-T--AA---------ACA------GTG----GA-CTT---GAATAA-AAA----------AAA---------------------------------AAA-T-----AG---T---G--------AAATCATTTAAT--ACATCA-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AC---AGCTGAT-AA-----ATTATCA-A--TTTT-GCT---GTAAAAAA---AAAAT-TGG----CA--CA--AGCT--A--A-AAATTGC--TTACG--G-TAATT-TGAattaaactttctcccataccgacctcatcaatgacggtgacgaagtctatttttattattttctaaacagtggacttgaataaaaaaaaaaatagtgaaatcatttaatacatcattgaataatttctgaaaacagctgataaattatcaattttgctgtaaaaaaaaaattggcacaagctaaaaattgcttacggtaatttga
Alignments
lowQualScore : 1 22222 11 1 111 2222222222222 22222222222 111111 1111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444 11 111 3333333333 2222222 111 1 1111 1111 1 222 11 111 11 444444444444444 1111 111111 88888888888888888888888888888 11 11111111111 11111 333333333333 1111 1 1111111111 1111111 1111 111111 4444444444444444444444 11 222222222 333333333333333333333333333 2222222222222222222222222 11111 11111 111111 11111 1111111111 111111 222222 111
lowQualScore : 1 1 66 3 66 4 44444 5 5 5 0 0 99 1 5 333 7777777777777 5 0 5 5 5 5 5 77777777777 5 5 5 5 5 1 5 999 000000 666 1111111 3 3 1111111 7777 666 22222222222222222222222222222222222222222 55 1 3 3 99 666 444 3 88888 44 3 88 1 000 3 0000000000 3 1 666 3333333 44 44 3 3 3 3 3 6 6 6 3 666 4 5555 5 0 7 5 0 1 1 1111 2 3 7777 0 2 1 0 2 000 22 6 111 6 6 6 6 6 44 3 6 99 6 111111111111111 6 4444 111111 6 6 6 6 6 6 6 5 5 5 55 5 5 66666666666666666666666666666 4 0 44 5 5 5 5 5 4 77777777777 22222 5 555555555555 5 2 0000 4 4 5 1 7777777777 5 66 66 3333333 0000 666666 5 2222222222222222222222 0 11 5 777 0 4 333333333 6 4 666666666666666666666666666 3333333333333333333333333 33 22222 88888 4 4 222222 66 11111 8 9999999999 111111 777 4 000000 4 66 4 1 666 99 6666 4 8888 55 99 99 55 4 55 55 4 444 66 5
lowQualScore : . . .. . .. . ..... . . . . . .. . . ... ............. . . . . . . . ........... . . . . . . . ... ...... ... ....... . . ....... .... ... ......................................... .. . . . .. ... ... . ..... .. . .. . ... . .......... . . ... ....... .. .. . . . . . . . . . ... . .... . . . . . . . .... . . .... . . . . . ... .. . ... . . . . . .. . . .. . ............... . .... ...... . . . . . . . . . . .. . . ............................. . . .. . . . . . . ........... ..... . ............ . . .... . . . . .......... . .. .. ....... .... ...... . ...................... . .. . ... . . ......... . . ........................... ......................... .. ..... ..... . . ...... .. ..... . .......... ...... ... . ...... . .. . . ... .. .... . .... .. .. .. .. . .. .. . ... .. .
lowQualScore : 4 0 33 6 11 4 22222 0 7 7 4 7 33 4 7 888 5555555555555 0 1 7 7 7 7 7 11111111111 0 0 0 0 0 3 7 333 555555 444 8888888 6 6 8888888 7777 444 55555555555555555555555555555555555555555 00 0 6 6 00 444 888 6 33333 33 6 66 8 444 3 3333333333 3 0 444 5555555 66 66 3 3 3 3 3 7 7 7 3 555 4 6666 0 1 6 7 7 4 0 7777 5 8 2222 8 5 0 0 5 222 55 7 777 7 7 7 7 7 00 2 7 22 7 777777777777777 7 2222 888888 7 7 7 7 7 7 7 7 7 0 11 0 0 00000000000000000000000000000 4 4 99 0 0 0 0 0 2 99999999999 55555 0 666666666666 0 0 6666 4 4 0 4 7777777777 7 99 99 8888888 6666 000000 0 5555555555555555555555 4 44 0 888 8 4 000000000 4 4 888888888888888888888888888 4444444444444444444444444 44 88888 99999 4 4 888888 11 11111 9 4444444444 555555 888 4 777777 4 11 4 1 999 55 0000 0 5555 55 55 55 55 0 55 55 0 999 11 0
consensus : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------GCCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-NCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
Reference ( family-1769 ) : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------GCCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-NCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
gi|1 : CGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCGCAGTGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGAAAATTTTT-AGCGTACTCCATCTACCGAG--CTAAT-------------T-CGGATTTCTGTTGTCAGTCGGTTCCGGTTTG-AATC-ATTATCTTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCACGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTG------GTACT-------TGT-CGAAAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTGAA-----TAA-A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTTCCCTA-GAAAAGTAAACAGTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TT--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-G-CA-A-G-GTGAAG--TCAC-T-AAGAAG-AAAAATGGCCCCG-TGTTAAAGGT-AC-GTAGGA-ATAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGA-GTCGTG--TTCCATT---CTACCGCAGATGTGTCACACCATA
gi|1 : CCTTTCATCA-GTG-TAAG--AAAAGAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGTAATTGGTA--CATGATT-ACGA-TATTT-TG-TTATTAATAAATAGAAAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTTTAAT--AC-CGATAGCACAAG--C-G-CCTAG-CC-AAA-AATA-GGTT-AAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATTGTTGTGAAACTTATC-CAGAAA--TTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTA--------------------------AAAT-TGTGT-ATC-A-GATTG-ATA-T-AA---T-------GAATCT-----CA-GTCT-----------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-GGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T---TCTTTCAT--AA-------------------TGAA-CAT-CAT---CAGT----AACGG-A----GACATTG-TCTGTTTAACTAT---TG--TACCGGCTTGAA-TAAAAAATTAAT---G--------AAA-TCGTT--T--ATATATGAATATT-G-AAATCTTTTACTA-----TCT-TTGAATAATTCTGAAA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAAATTT----T-GGG----CA--CT--AGCTACA--A-AATTTGC--TTGTG--G-T-ATT---AAAG--TTAT-TTTTAtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttcatcagtgtaagaaaagaaacaactctatggtgacaacgcgtaattggtacatgattacgatattttgttattaataaatagaaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaataccgatagcacaagcgcctagccaaaaataggttaaaaccgagggcgattcatggattgttgtgaaacttatccagaaattatcgcaaatttgcagttgagttaaaattgtgtatcagattgatataatgaatctcagtctagatagtgtttatcttgccagaaacggagtcaggagaacattctttcataatgaacatcatcagtaacggagacattgtctgtttaactattgtaccggcttgaataaaaaattaatgaaatcgtttatatatgaatattgaaatcttttactatctttgaataattctgaaaatagctagtgatttttcaattttgctagtaaaaaattttgggcactagctacaaaatttgcttgtggtattaaagttatttttatggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|10 : cgctaaaatgcgaccataaatatattttagcgcagtgtgcattgcgtcatatgctcgaaaatttttagcgtactccatctaccgagctaattcggatttctgttgtcagtcggttccggtttgaatcattatctttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgatcacgcaatgacctcaaacgttaatttaacaaagatctagtcacattggtacttgtcgaaaaactgtccgtgttctgaataaaaaaaatccactggacttgacaacttccctagaaaagtaaacagtcggtccaaatgaattatcaaaaatattgacgtgatcgtaatattttagaactcggaatcgagatgcaaggtgaagtcactaagaagaaaaatggccccgtgttaaaggtacgtaggaatacttgtcgtggtaacgttccttttgcaaccgggagtcgtgttccattctaccgcagatgtgtcacaccatatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CCCAAA-CACTACAT--AA-A-AAAGATCTA-GTCACACATTG------G---TGCAGAGTTGT-CG-GAAA-------TTGT----CCGT---TT-------T------GCCG-A-----C---AGGGCTGATAAAAAAAA--ACCAC-TAGGGC--G---ACAACTT-GCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAAAG-A--TTAAAA---ATA-TCA-G--A-CTGAT-AATCGT---A----T--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GAAT-G-CACA-G-TTGAAGG-CCGC-TTAA----AAAACATGGCCGCC-TGTTAACGGTCAC-GTACGG-AAAC---TTGTCTTGGTAGCGTTCCTTTTGTAGCtggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|11 : attgtcaaatcgttcctagaacgattcgctTTTCATCAAGTGGTAAAGAAAAGAAAAACAACTCCTATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTTGTTTTTATTAATCAATAG-AAAG--CTTAAATGA-AAT-GCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-TGATAGCACAAGCCC-GCCCTAG-CCTTAACAGTAGGGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTCAATGGATGGTTGTGAAATTCATCTCAGAAA-TTTATCGCAAATTTTGCGAGATGAGTTACAAATTAA----------A--AA--TGAAT-T
gi|12 : AGGGTTAGAATTTAAATGGAAATACTCGCTA-AAAC-CATC--CAT-AAAAATATTT--A-GC-GAGTG-TATTCCAT-TATATCCTCGAAAA-TTTT-ATCT-ACTATATTTATCGT---CTATTTTTATCGAAAATTC-CGGATTTCTAATGTCAGTCAATTCCGACTTG-AGTT-GCTAT-CTTTCT--AGATTACTAATCACAAAAGCCTTTGAATGATTGACAATAATTCGCACACTTAC-CTCAAA-TGTAC-ATTCCA-C-Atg
gi|13 : attac-TATG-TG---ACAAC-ACGT-ATTGGTAC-CATGATTAACTA-TA-TT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGGTAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAATCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AAT------------------------T-TGTG-GACC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATTT-----CA-GTCT-----------AG-ATAG----TGTT-TAT-tttaatcgtcttgtcaa
gi|14 : aCGCTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG--C-GAGTG-CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATCAATTAT-TTTCCT-AAAA-TCCT-AGCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----T---A-----------AAA
gi|15 : ---GAATAA-AAAATG-AATATGAAATCGAT-----------T---TACATA------TGAAAT-----AT---TTTAA--------AAATTCTTT-----ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA-------T---AGCTAGT-GA-----TTTTTC--A--TTTT-GCTTAAGTAAAAAATTT----T-TGG----CA--CT---GCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-CAAAAG--TTAATTTTTAAACCCg
gi|16 : aattaaaaatgaatttgag------G---T-------TGTTCG-AAAA-------CTGT----CAGTCCTGTCGGCAGGT------GCCG-A-----T---A-----------AAAA---TCCCCAT-GGAC--G---ACAACTA-CCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAGCCGA--TTAAAATATATA-TC--GTAA-CG-GT-GATCAT---T----ATTTATCTAA--GAA--CTCGGGAA-T-C-G-GGAT-GCCACA-G-GTGAAG--TCAC-T-A--AAAAAAACATGTGCGCA-TGT----GAT-ACGGTACGA-ACACAGACTGCCGTGGTtggtccacagaaaatgccaattgtttgcaaaaccctg
gi|17 : ------G---T-------TGT-CG-AAAAACCGGATCGGT----CC-T---GT-------CAGCAGGGCCG-A-----TAA-A-----------AAAAA--TCCCC-T-GGAC--A---ACAACTA-GCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAAT-AACC-AATTTAAAA---ATA-TCG-G--A-C--GG-GATCAT---A----T--TATTTAA--GAA--CTC-GGGATT-C-G-GGAT-GCCACA-GCGTGAAGGT-CAC-T----AAAAAAACATGGCCGCGTTGTGAAAGGTTA
gi|18 : GGATGGTTGTGAAATGTATC-CAGAAA-TTTATCACAAA-TTTGC-GTTTGAGTTAA-ACTT-----------------------T-TGTG-GACC-A-GA-TG-ACA-TCAA---T-------AAATCT-----CA-GCT------------AG-GTGG----TTGT-TAT-CTA-GC-CAG--AG---A--CAAAA--GT--CAG-----G-AAA----ACA--A--ACATTCT-T----------------------TTATA-TGGACAT---CAACAG-AAACGG-A---T-ATATTG-T-----------C---TT--TT------TAAC-T-----AT---T---G--------Agctacaacataccttgcca
gi|19 : ------G---T-------TGC-TG-AAAA-------TTGTTGGTCC-T---GT-------T------GGCA-AGGTTGT---T-----------AAGGA--TTCTG-T-GGGCT-G---ATAACTT-GATA-GA-----TAAT-GTCAGACCAAATGACCG-T--TTGAAA---ATA-TT--G--GGC--AT--ATCCT---A---------TTCTA--GAG--CTG-GGGA-T-A-G-GGAT-G-CACA-A-GTGAAGCT-CAC-T-AAAAAAAAAAAATGGCttgattaacaagaaatttaatg
gi|2 : AGGGTTTCAAATTAA-TGAGAATACTCGCTA-AAGTGCGAC--CAT-AAATATATTT----AC-GAGTG-CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTC-GTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAAACGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------CTTG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACT--CCTA-GA-----AAA--GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAAGTCAC-GTAGAATATAC----TGTCGT-GTAACGTTCCTTTTGCAA-CGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATAttcctggccgaccaaatatgttaaacttctctacccagtga
gi|2 : CTAAAAAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTT-TATGGTG---ACAACCGCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGAATATTT--GTT-ATTAATAGATAG-AAAG--CTT-AATGACA-TAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AGTA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AAAATGAAT-TATGTGATC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------TG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAA--GA---A--C-AGA--GT--CAG-------AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAATGA-A---TGAAATCG-T-----------T---TA--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GAT----TTTTTCA-A---TTT-GCT--AGTAAAAATTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAAAT-TAATAG--TTAA-TTTTAAACCCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctaaaaaaacgacctttcatcagtggtaagaaagaaaacaactttatggtgacaaccgcgtattggtaccatgattacgaatatttgttattaatagatagaaagcttaatgacatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaagtaggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaattaaaaatgaattatgtgatcagatgatattgatgaatctcagtctgatagtgtttatcttgccaagaacagagtcagagaacatgtctttttaactattgtacggcttgaataaaaatgaatgaaatcgtttatatgaatattgaaattcttttatatctttgaataatttctgaaaatagctagtgattttttcaatttgctagtaaaaattttttggcactagctaaaatttgcttgtggtaaattaatagttaattttaaacccct
gi|20 : agggtttcaaattaatgagaatactcgctaaagtgcgaccataaatatatttacgagtgcattgcgtcatatactcgcaattttagcgacttcatctaccgactattccggatttctgttgtcagtcgttccggtttgaatcattattttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgattgcgcaatgacctcaaaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttcttgataaaaaatccactggacttgacaactcctagaaaagtcggtccaaatgaattatcaaaaatatcgacgtgatcgtaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtccactaagaagaaaaaatggccgcgtgttaaaagtcacgtagaatatactgtcgtgtaacgttccttttgcaacgggaggtcgtgatttccattctaccgcagctgtgtcacaccatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntc------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTAT----CTGC---AA-------G------GGCA-A-----T---A-----------AGAAA--TTCTC-T-TGAC-TG---GTAACTT-GTTA-GA-----AAAT-GTTGATCCAAATT-ACT-T--T--AAA---ATA-CCT-G--G-C--GT-GATCCT---ATTACA--TATTTAA--GAT--CTC-AGAA-T-T-G-GGGTGG-CACA-G-GTGACGATC
gi|21 : GGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCTACAAATGCGAC--CAT-AAATAT-TTTTAG--C-GAGTGGCATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTACCGGTTTG-AATT-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCTAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGattcaaataacgtggtcacaaggctgataaaatttgtgaaaggttttctacccag
gi|22 : AGGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCT--AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTA--GC-GAGTG-CATTGCGT-TATATGCTCGAAAT-TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGAGGGCGATT-------------CATGGAT
gi|23 : gtcc--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACGTG-TTAAAGGT-AACGT-ACGAAGA
gi|23 : atCACG-TGTTAAAGGTAAC-GTACGA-AGAC---TTGTCGTGTAAACATTCCTTTTGCAACCAGGCGGTCGTGGTTTCCATT---TT--CG-AGCTcttgtcgtgtaaacattccttttgcaaccaggcggtcgtggtttccattttcgagctcaact
gi|24 : attattttagaactcggaatcgggatgTCT-----TT-G-AA------TG--G-----TTTTCTGA----------AA------AC---AGCTAGT-GA-----AATTTCA-A--TTTT-GGT--AGTAAAAA-TTT----T-TGGCACTCA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTATG--G-TAATT-T-TAAG--TTAA-TTTTGAACCCcaact
gi|25 : ------AT---AGCTAGCAGA-----ATTTT-A-A--TAT--GAT--GGCATAAACGTT----T-TGG----CA--TT--AGCT--A--T-AACTTGC--TTATGCCG-TAATT-C-ATAC--TTAA-TTTCAt
gi|26 : AAA---ATA-TCCGGC-A-C--ATCGATCGT---A----T--TATTTTA--GAAGGCTC-GGAA-T-CAG-GGATGG-CACGTG-TTAAAGGTtgaac
gi|27 : CG-A-----T---A-----------AAAAAAATCCTC-C-GGACCAACAAACAACTT-GCTA-GA-----AAA--ATC-GTCCAAAa
gi|28 : cagggA-----AAAC-GTTGGTCCAAATGAACC-A--TTGAAA---ATA-TCGTG--G-C--GT-GATCGag
gi|29 : gaTTGTAACCGGGAGGTCGTGATTACCATT----TAC
gi|3 : CAATGAC-CTCGAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----TAAAA-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTT-CCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAAAT-ATA-TCG-G--A-A--GT-GATC-TAAAA----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGT-CAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG--GTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ATAC---TTGTC-TGGTAACGTTCCTTTTGCAACCAGGAGGTCGTGATTTCCATTCTACTACCGCAGCTGTGTCACACCAgagctcatcttcta
gi|3 : CTAAACAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAA---AAAGAAAA--AACTC-TATGGTGGTGACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTA-TAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT-------------------TG--T-TG---GACC-A-GA-TGCATATTCGAAATT-------GAATCTATTTGCACATC------------AG-AT-G----TGTTCTCT-CTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaaacaaacgacctttcatcagtggtaaaaagaaaaaactctatggtggtgacaacgcgtattggtaccatgattacgatattttgtttattataaatagaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaaataggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaatttgttggaccagatgcatattcgaaattgaatctatttgcacatcagatgtgttctctctt
gi|30 : caatgacctcgaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttctgataaaaaaaaatccactggacttgacaacttcctagaaaacgtcggtccaaatgaattatcaaaaatatatcggaagtgatctaaaaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtcactaagaagaaaaaatggccgcggttaaaggtcacgtaggaatacttgtctggtaacgttccttttgcaaccaggaggtcgtgatttccattctactaccgcagctgtgtcacaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATTAAGTGGAAATACTCGTT--AAATGCGAT--CAT-AAATAT
gi|4 : CTA-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTACACATGATT-ACGA-TATTT--GTTT-----TAAATAG-AAAGGCCTT-AATG-CAATAGCAAGTAAGGAATATATTGTAAGCAAGGGCATCAGTTT---TTTACGCGATAGCACAAG-CCAG-CCTAGGCCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGATTTC-ATGAATGGTTGTG--ATTTATC-CAGAAATTTTATCGC-AA-TTTGC-AGTTGAGTTA------------------A--AA--T---T-TGTG-GATCAA-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT--------GT------------------------TGCT-TAT-CTT-GCGCAG--AA---AGGC-AGA--GTCCCGG-----G-AGA----A-A--T---TCTGTC-T--CATATGCAGATCTA------TCATC-CAG-TT-------------ACGG-A---AGCAGTTG-T-----------C---TC--TT------TCAA-------GC---T---A--------AAATAA--T--T--GTAGC------TT-G-AA------TA--ATAAATTTT-ATGA----------AATCGTGTATATGAATTATT-GAAATTTTTTTTTATATCTTTT-G-------AATAATTTT----C-TGA----AA--AT--AGCT--A--GTGATTTTCAATTTTG--GCTAG---TAAAAG--TTg
gi|4 : ctA--GT--TAC-----G-GAA----GCAGTT--GTCTCTT-TCAAG---------CTAAAATAATTGTA---G-CTT---GAATAATAAATTTTA---TGAAATCG-T-----------G---TA--TA------TGAA-TT----AT---T---G--------AAATTTTTT--TTTATATCT-----TTTG-AA------TA--A-----TTTTCTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA------TTTTCA-A--TTTTGGCT--AGTAAAAGTTTT----TGGGG----CAGGCTGAGGCTG-A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAGA--TTAA-ATTAAGACCGCTtttggggcaggctgaggctgaaaatttgcttgtggtaatttaaagattaaattaagaccgctga
gi|5 : ctctatatggtgacaacgcgtattggtacacatgattacgatatttgttttaaatagaaaggccttaatgcaatagcaagtaaggaatatattgtaagcaagggcatcagttttttacgcgatagcacaagccagcctaggccttaaaataggttcaaaaccgagggcgatttcatgaatggttgtgatttatccagaaattttatcgcaatttgcagttgagttaaaatttgtggatcaagatgatatcgatgaatctgttgcttatcttgcgcagaaaggcagagtcccgggagaaattctgtctcatatgcagatctatcatccGTT-TATACTTAGC-CAGTAAACGTA--C-AAATGGT--TAG-----GGAGATGAAACA--TTTGTCTTTT-T--AA---------CTAAT----CTGTACCGG-CTTATGGAATAA-AAA--G-A---TGAAAT-G-T-----------TTTATA--TA------TGAA-T-----AT---T---GAGACGATTAAATGCCTT--C--CTATTTATA--TT-ACAA------AA--A-----TTA-CTGA----------AA------ga
gi|5 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttgAAAA---T----T-TGG----CA--CTT-AGCT--ATAA-AATTTGC--TTGTG--G-TAATCATAAAAGTATCAA-TTTTAAAACCCTtggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagaaaatttggcacttagctataaaatttgcttgtggtaatcataaaagtatcaattttaaaaccctgacttccttaaa
gi|6 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttggtttatacttagccagtaaacgtacaaatggttagggagatgaaacatttgtctttttaactaatctgtaccggcttatggaataaaaagatgaaatgttttatatatgaatattgagacgattaaatgccttcctatttatattacaaaaattactgaaatggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagGGTTC-AAATTAAGTGAAATTAACCGCTA-AAATGCGACGCCATGAAATATATTT--A-GC-GAGTG-CATTGCGTGCATATACTCGCAA--TTTT-TGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-C-GATTTCTGTTGTCAGTCAGTTTCCGTTTGAAATC-ATTAT-TTTCCTAAAAATCCCT-AT-GCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGACGCTCAAA-CGTTA-ATTTAAGCAAAAGATATAGGTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------CCTGCA-----T---A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTT-CCTA-AG-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATACTCCGG--A-T--GT--ATCGT---AG---A--TGTTTT---GAA--CTC-GGAA-TGC-GAGAAT-G-CACA-G-G-GAAGGT-CAC-T-AAGAAAAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGATAAAC---gacttccttaaa
gi|7 : CCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC--------------GCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAA-AATTTGTGGATCAGATATCAA--TGAATCTCAGT--CT-A-GA-TA-GTA-TTTA---TCTTGCCAGAAACG-----GA-GTC------------AGGAGAG----CATT-----CTT-TCATAT--GG---A--C-ATC--AT--CAGTAACTG-AGA----AAT--T--GTTTTTT-T--AA---------CTA------TTGTATCGG-CTT---GAATGA-AAATTA-A---AGAAATAG-T-----------T---TT--TA------TGAA-T-----AT---T---C--------AAATTATTC--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAGATTTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT---AGAG--TTAA-TTTTAAACCC
gi|8 : AATACTCACTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-AC-tgatgtcacacctaaatatgtcacaactgaaaacggcacaatcctcacacactctaggc
gi|8 : acgagtcatACCGA---CTATT-------------C-CAGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-CTTCCT-AAAATTCCT-ATCACAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGTGCAATGAC-CTCAAA-CATTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTGGTGACAG---T-------TGT-TG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----T----------------AAAA--TCCAC-T-GGAC-TG---ACAACTT-TCTATGA-----AAAC-GTCGGTCCCAAAGAATT-AG-TCAAAA---ATA-TC--G--A-TCAGT-GATCGT---ATT--A--TAATTTAAGAAA--CTC-GGAA-T-A-G-GAGT-G-CACA-G-TTGAAGGTCcgactattccagatttctgttgtcagtcagttccggtttgaatcattatcttcctaaaattcctatcacaaaagcgcttgaatgatcgtgcaatgacctcaaacattaatttaacaaagatctagtcacattggtgacagttgttgaaaactgtccgtgttctgataaaatccactggactgacaactttctatgaaaacgtcggtcccaaagaattagtcaaaaatatcgatcagtgatcgtattataatttaagaaactcggaataggagtgcacagttgaaggtca
gi|9 : acgagtcataatactcactaaatgcgaccataaatatattttag-TGTGTGGTC-AAGA-TG-GTA-TTGG---C-------GAATTT-----CA-GCCCAGGGGAGCAGTAA-ATAGGCGGTGGT-TAT-CTA-GC-CAG--A----------GA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--a
gi|9 : tgaggatttataTTTC-T--AA---------ACA------GTG----GA-CTT---GAATAA-AAA----------AAA---------------------------------AAA-T-----AG---T---G--------AAATCATTTAAT--ACATCA-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AC---AGCTGAT-AA-----ATTATCA-A--TTTT-GCT---GTAAAAAA---AAAAT-TGG----CA--CA--AGCT--A--A-AAATTGC--TTACG--G-TAATT-TGAattaaactttctcccataccgacctcatcaatgacggtgacgaagtctatttttattattttctaaacagtggacttgaataaaaaaaaaaatagtgaaatcatttaatacatcattgaataatttctgaaaacagctgataaattatcaattttgctgtaaaaaaaaaattggcacaagctaaaaattgcttacggtaatttga
Alignments
lowQualScore : 1 22222 11 1 111 2222222222222 22222222222 111111 1111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444 11 111 3333333333 2222222 111 1 1111 1111 1 222 11 111 11 444444444444444 1111 111111 88888888888888888888888888888 11 11111111111 11111 333333333333 1111 1 1111111111 1111111 1111 111111 4444444444444444444444 11 222222222 333333333333333333333333333 2222222222222222222222222 11111 11111 111111 11111 1111111111 111111 222222 111
lowQualScore : 1 1 66 3 66 4 44444 5 5 5 0 0 99 1 5 333 7777777777777 5 0 5 5 5 5 5 77777777777 5 5 5 5 5 1 5 999 000000 666 1111111 3 3 1111111 7777 666 22222222222222222222222222222222222222222 55 1 3 3 99 666 444 3 88888 44 3 88 1 000 3 0000000000 3 1 666 3333333 44 44 3 3 3 3 3 6 6 6 3 666 4 5555 5 0 7 5 0 1 1 1111 2 3 7777 0 2 1 0 2 000 22 6 111 6 6 6 6 6 44 3 6 99 6 111111111111111 6 4444 111111 6 6 6 6 6 6 6 5 5 5 55 5 5 66666666666666666666666666666 4 0 44 5 5 5 5 5 4 77777777777 22222 5 555555555555 5 2 0000 4 4 5 1 7777777777 5 66 66 3333333 0000 666666 5 2222222222222222222222 0 11 5 777 0 4 333333333 6 4 666666666666666666666666666 3333333333333333333333333 33 22222 88888 4 4 222222 66 11111 8 9999999999 111111 777 4 000000 4 66 4 1 666 99 6666 4 8888 55 99 99 55 4 55 55 4 444 66 5
lowQualScore : . . .. . .. . ..... . . . . . .. . . ... ............. . . . . . . . ........... . . . . . . . ... ...... ... ....... . . ....... .... ... ......................................... .. . . . .. ... ... . ..... .. . .. . ... . .......... . . ... ....... .. .. . . . . . . . . . ... . .... . . . . . . . .... . . .... . . . . . ... .. . ... . . . . . .. . . .. . ............... . .... ...... . . . . . . . . . . .. . . ............................. . . .. . . . . . . ........... ..... . ............ . . .... . . . . .......... . .. .. ....... .... ...... . ...................... . .. . ... . . ......... . . ........................... ......................... .. ..... ..... . . ...... .. ..... . .......... ...... ... . ...... . .. . . ... .. .... . .... .. .. .. .. . .. .. . ... .. .
lowQualScore : 4 0 33 6 11 4 22222 0 7 7 4 7 33 4 7 888 5555555555555 0 1 7 7 7 7 7 11111111111 0 0 0 0 0 3 7 333 555555 444 8888888 6 6 8888888 7777 444 55555555555555555555555555555555555555555 00 0 6 6 00 444 888 6 33333 33 6 66 8 444 3 3333333333 3 0 444 5555555 66 66 3 3 3 3 3 7 7 7 3 555 4 6666 0 1 6 7 7 4 0 7777 5 8 2222 8 5 0 0 5 222 55 7 777 7 7 7 7 7 00 2 7 22 7 777777777777777 7 2222 888888 7 7 7 7 7 7 7 7 7 0 11 0 0 00000000000000000000000000000 4 4 99 0 0 0 0 0 2 99999999999 55555 0 666666666666 0 0 6666 4 4 0 4 7777777777 7 99 99 8888888 6666 000000 0 5555555555555555555555 4 44 0 888 8 4 000000000 4 4 888888888888888888888888888 4444444444444444444444444 44 88888 99999 4 4 888888 11 11111 9 4444444444 555555 888 4 777777 4 11 4 1 999 55 0000 0 5555 55 55 55 55 0 55 55 0 999 11 0
consensus : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------GCCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-NCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
Reference ( family-1769 ) : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------GCCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-NCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
gi|1 : CGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCGCAGTGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGAAAATTTTT-AGCGTACTCCATCTACCGAG--CTAAT-------------T-CGGATTTCTGTTGTCAGTCGGTTCCGGTTTG-AATC-ATTATCTTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCACGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTG------GTACT-------TGT-CGAAAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTGAA-----TAA-A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTTCCCTA-GAAAAGTAAACAGTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TT--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-G-CA-A-G-GTGAAG--TCAC-T-AAGAAG-AAAAATGGCCCCG-TGTTAAAGGT-AC-GTAGGA-ATAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGA-GTCGTG--TTCCATT---CTACCGCAGATGTGTCACACCATA
gi|1 : CCTTTCATCA-GTG-TAAG--AAAAGAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGTAATTGGTA--CATGATT-ACGA-TATTT-TG-TTATTAATAAATAGAAAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTTTAAT--AC-CGATAGCACAAG--C-G-CCTAG-CC-AAA-AATA-GGTT-AAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATTGTTGTGAAACTTATC-CAGAAA--TTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTA--------------------------AAAT-TGTGT-ATC-A-GATTG-ATA-T-AA---T-------GAATCT-----CA-GTCT-----------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-GGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T---TCTTTCAT--AA-------------------TGAA-CAT-CAT---CAGT----AACGG-A----GACATTG-TCTGTTTAACTAT---TG--TACCGGCTTGAA-TAAAAAATTAAT---G--------AAA-TCGTT--T--ATATATGAATATT-G-AAATCTTTTACTA-----TCT-TTGAATAATTCTGAAA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAAATTT----T-GGG----CA--CT--AGCTACA--A-AATTTGC--TTGTG--G-T-ATT---AAAG--TTAT-TTTTAtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttcatcagtgtaagaaaagaaacaactctatggtgacaacgcgtaattggtacatgattacgatattttgttattaataaatagaaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaataccgatagcacaagcgcctagccaaaaataggttaaaaccgagggcgattcatggattgttgtgaaacttatccagaaattatcgcaaatttgcagttgagttaaaattgtgtatcagattgatataatgaatctcagtctagatagtgtttatcttgccagaaacggagtcaggagaacattctttcataatgaacatcatcagtaacggagacattgtctgtttaactattgtaccggcttgaataaaaaattaatgaaatcgtttatatatgaatattgaaatcttttactatctttgaataattctgaaaatagctagtgatttttcaattttgctagtaaaaaattttgggcactagctacaaaatttgcttgtggtattaaagttatttttatggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|10 : cgctaaaatgcgaccataaatatattttagcgcagtgtgcattgcgtcatatgctcgaaaatttttagcgtactccatctaccgagctaattcggatttctgttgtcagtcggttccggtttgaatcattatctttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgatcacgcaatgacctcaaacgttaatttaacaaagatctagtcacattggtacttgtcgaaaaactgtccgtgttctgaataaaaaaaatccactggacttgacaacttccctagaaaagtaaacagtcggtccaaatgaattatcaaaaatattgacgtgatcgtaatattttagaactcggaatcgagatgcaaggtgaagtcactaagaagaaaaatggccccgtgttaaaggtacgtaggaatacttgtcgtggtaacgttccttttgcaaccgggagtcgtgttccattctaccgcagatgtgtcacaccatatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CCCAAA-CACTACAT--AA-A-AAAGATCTA-GTCACACATTG------G---TGCAGAGTTGT-CG-GAAA-------TTGT----CCGT---TT-------T------GCCG-A-----C---AGGGCTGATAAAAAAAA--ACCAC-TAGGGC--G---ACAACTT-GCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAAAG-A--TTAAAA---ATA-TCA-G--A-CTGAT-AATCGT---A----T--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GAAT-G-CACA-G-TTGAAGG-CCGC-TTAA----AAAACATGGCCGCC-TGTTAACGGTCAC-GTACGG-AAAC---TTGTCTTGGTAGCGTTCCTTTTGTAGCtggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|11 : attgtcaaatcgttcctagaacgattcgctTTTCATCAAGTGGTAAAGAAAAGAAAAACAACTCCTATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTTGTTTTTATTAATCAATAG-AAAG--CTTAAATGA-AAT-GCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-TGATAGCACAAGCCC-GCCCTAG-CCTTAACAGTAGGGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTCAATGGATGGTTGTGAAATTCATCTCAGAAA-TTTATCGCAAATTTTGCGAGATGAGTTACAAATTAA----------A--AA--TGAAT-T
gi|12 : AGGGTTAGAATTTAAATGGAAATACTCGCTA-AAAC-CATC--CAT-AAAAATATTT--A-GC-GAGTG-TATTCCAT-TATATCCTCGAAAA-TTTT-ATCT-ACTATATTTATCGT---CTATTTTTATCGAAAATTC-CGGATTTCTAATGTCAGTCAATTCCGACTTG-AGTT-GCTAT-CTTTCT--AGATTACTAATCACAAAAGCCTTTGAATGATTGACAATAATTCGCACACTTAC-CTCAAA-TGTAC-ATTCCA-C-Atg
gi|13 : attac-TATG-TG---ACAAC-ACGT-ATTGGTAC-CATGATTAACTA-TA-TT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGGTAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAATCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AAT------------------------T-TGTG-GACC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATTT-----CA-GTCT-----------AG-ATAG----TGTT-TAT-tttaatcgtcttgtcaa
gi|14 : aCGCTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG--C-GAGTG-CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATCAATTAT-TTTCCT-AAAA-TCCT-AGCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----T---A-----------AAA
gi|15 : ---GAATAA-AAAATG-AATATGAAATCGAT-----------T---TACATA------TGAAAT-----AT---TTTAA--------AAATTCTTT-----ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA-------T---AGCTAGT-GA-----TTTTTC--A--TTTT-GCTTAAGTAAAAAATTT----T-TGG----CA--CT---GCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-CAAAAG--TTAATTTTTAAACCCg
gi|16 : aattaaaaatgaatttgag------G---T-------TGTTCG-AAAA-------CTGT----CAGTCCTGTCGGCAGGT------GCCG-A-----T---A-----------AAAA---TCCCCAT-GGAC--G---ACAACTA-CCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAGCCGA--TTAAAATATATA-TC--GTAA-CG-GT-GATCAT---T----ATTTATCTAA--GAA--CTCGGGAA-T-C-G-GGAT-GCCACA-G-GTGAAG--TCAC-T-A--AAAAAAACATGTGCGCA-TGT----GAT-ACGGTACGA-ACACAGACTGCCGTGGTtggtccacagaaaatgccaattgtttgcaaaaccctg
gi|17 : ------G---T-------TGT-CG-AAAAACCGGATCGGT----CC-T---GT-------CAGCAGGGCCG-A-----TAA-A-----------AAAAA--TCCCC-T-GGAC--A---ACAACTA-GCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAAT-AACC-AATTTAAAA---ATA-TCG-G--A-C--GG-GATCAT---A----T--TATTTAA--GAA--CTC-GGGATT-C-G-GGAT-GCCACA-GCGTGAAGGT-CAC-T----AAAAAAACATGGCCGCGTTGTGAAAGGTTA
gi|18 : GGATGGTTGTGAAATGTATC-CAGAAA-TTTATCACAAA-TTTGC-GTTTGAGTTAA-ACTT-----------------------T-TGTG-GACC-A-GA-TG-ACA-TCAA---T-------AAATCT-----CA-GCT------------AG-GTGG----TTGT-TAT-CTA-GC-CAG--AG---A--CAAAA--GT--CAG-----G-AAA----ACA--A--ACATTCT-T----------------------TTATA-TGGACAT---CAACAG-AAACGG-A---T-ATATTG-T-----------C---TT--TT------TAAC-T-----AT---T---G--------Agctacaacataccttgcca
gi|19 : ------G---T-------TGC-TG-AAAA-------TTGTTGGTCC-T---GT-------T------GGCA-AGGTTGT---T-----------AAGGA--TTCTG-T-GGGCT-G---ATAACTT-GATA-GA-----TAAT-GTCAGACCAAATGACCG-T--TTGAAA---ATA-TT--G--GGC--AT--ATCCT---A---------TTCTA--GAG--CTG-GGGA-T-A-G-GGAT-G-CACA-A-GTGAAGCT-CAC-T-AAAAAAAAAAAATGGCttgattaacaagaaatttaatg
gi|2 : AGGGTTTCAAATTAA-TGAGAATACTCGCTA-AAGTGCGAC--CAT-AAATATATTT----AC-GAGTG-CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTC-GTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAAACGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------CTTG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACT--CCTA-GA-----AAA--GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAAGTCAC-GTAGAATATAC----TGTCGT-GTAACGTTCCTTTTGCAA-CGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATAttcctggccgaccaaatatgttaaacttctctacccagtga
gi|2 : CTAAAAAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTT-TATGGTG---ACAACCGCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGAATATTT--GTT-ATTAATAGATAG-AAAG--CTT-AATGACA-TAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AGTA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AAAATGAAT-TATGTGATC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------TG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAA--GA---A--C-AGA--GT--CAG-------AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAATGA-A---TGAAATCG-T-----------T---TA--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GAT----TTTTTCA-A---TTT-GCT--AGTAAAAATTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAAAT-TAATAG--TTAA-TTTTAAACCCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctaaaaaaacgacctttcatcagtggtaagaaagaaaacaactttatggtgacaaccgcgtattggtaccatgattacgaatatttgttattaatagatagaaagcttaatgacatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaagtaggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaattaaaaatgaattatgtgatcagatgatattgatgaatctcagtctgatagtgtttatcttgccaagaacagagtcagagaacatgtctttttaactattgtacggcttgaataaaaatgaatgaaatcgtttatatgaatattgaaattcttttatatctttgaataatttctgaaaatagctagtgattttttcaatttgctagtaaaaattttttggcactagctaaaatttgcttgtggtaaattaatagttaattttaaacccct
gi|20 : agggtttcaaattaatgagaatactcgctaaagtgcgaccataaatatatttacgagtgcattgcgtcatatactcgcaattttagcgacttcatctaccgactattccggatttctgttgtcagtcgttccggtttgaatcattattttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgattgcgcaatgacctcaaaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttcttgataaaaaatccactggacttgacaactcctagaaaagtcggtccaaatgaattatcaaaaatatcgacgtgatcgtaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtccactaagaagaaaaaatggccgcgtgttaaaagtcacgtagaatatactgtcgtgtaacgttccttttgcaacgggaggtcgtgatttccattctaccgcagctgtgtcacaccatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntc------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTAT----CTGC---AA-------G------GGCA-A-----T---A-----------AGAAA--TTCTC-T-TGAC-TG---GTAACTT-GTTA-GA-----AAAT-GTTGATCCAAATT-ACT-T--T--AAA---ATA-CCT-G--G-C--GT-GATCCT---ATTACA--TATTTAA--GAT--CTC-AGAA-T-T-G-GGGTGG-CACA-G-GTGACGATC
gi|21 : GGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCTACAAATGCGAC--CAT-AAATAT-TTTTAG--C-GAGTGGCATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTACCGGTTTG-AATT-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCTAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGattcaaataacgtggtcacaaggctgataaaatttgtgaaaggttttctacccag
gi|22 : AGGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCT--AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTA--GC-GAGTG-CATTGCGT-TATATGCTCGAAAT-TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGAGGGCGATT-------------CATGGAT
gi|23 : gtcc--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACGTG-TTAAAGGT-AACGT-ACGAAGA
gi|23 : atCACG-TGTTAAAGGTAAC-GTACGA-AGAC---TTGTCGTGTAAACATTCCTTTTGCAACCAGGCGGTCGTGGTTTCCATT---TT--CG-AGCTcttgtcgtgtaaacattccttttgcaaccaggcggtcgtggtttccattttcgagctcaact
gi|24 : attattttagaactcggaatcgggatgTCT-----TT-G-AA------TG--G-----TTTTCTGA----------AA------AC---AGCTAGT-GA-----AATTTCA-A--TTTT-GGT--AGTAAAAA-TTT----T-TGGCACTCA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTATG--G-TAATT-T-TAAG--TTAA-TTTTGAACCCcaact
gi|25 : ------AT---AGCTAGCAGA-----ATTTT-A-A--TAT--GAT--GGCATAAACGTT----T-TGG----CA--TT--AGCT--A--T-AACTTGC--TTATGCCG-TAATT-C-ATAC--TTAA-TTTCAt
gi|26 : AAA---ATA-TCCGGC-A-C--ATCGATCGT---A----T--TATTTTA--GAAGGCTC-GGAA-T-CAG-GGATGG-CACGTG-TTAAAGGTtgaac
gi|27 : CG-A-----T---A-----------AAAAAAATCCTC-C-GGACCAACAAACAACTT-GCTA-GA-----AAA--ATC-GTCCAAAa
gi|28 : cagggA-----AAAC-GTTGGTCCAAATGAACC-A--TTGAAA---ATA-TCGTG--G-C--GT-GATCGag
gi|29 : gaTTGTAACCGGGAGGTCGTGATTACCATT----TAC
gi|3 : CAATGAC-CTCGAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----TAAAA-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTT-CCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAAAT-ATA-TCG-G--A-A--GT-GATC-TAAAA----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGT-CAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG--GTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ATAC---TTGTC-TGGTAACGTTCCTTTTGCAACCAGGAGGTCGTGATTTCCATTCTACTACCGCAGCTGTGTCACACCAgagctcatcttcta
gi|3 : CTAAACAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAA---AAAGAAAA--AACTC-TATGGTGGTGACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTA-TAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT-------------------TG--T-TG---GACC-A-GA-TGCATATTCGAAATT-------GAATCTATTTGCACATC------------AG-AT-G----TGTTCTCT-CTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaaacaaacgacctttcatcagtggtaaaaagaaaaaactctatggtggtgacaacgcgtattggtaccatgattacgatattttgtttattataaatagaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaaataggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaatttgttggaccagatgcatattcgaaattgaatctatttgcacatcagatgtgttctctctt
gi|30 : caatgacctcgaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttctgataaaaaaaaatccactggacttgacaacttcctagaaaacgtcggtccaaatgaattatcaaaaatatatcggaagtgatctaaaaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtcactaagaagaaaaaatggccgcggttaaaggtcacgtaggaatacttgtctggtaacgttccttttgcaaccaggaggtcgtgatttccattctactaccgcagctgtgtcacaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATTAAGTGGAAATACTCGTT--AAATGCGAT--CAT-AAATAT
gi|4 : CTA-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTACACATGATT-ACGA-TATTT--GTTT-----TAAATAG-AAAGGCCTT-AATG-CAATAGCAAGTAAGGAATATATTGTAAGCAAGGGCATCAGTTT---TTTACGCGATAGCACAAG-CCAG-CCTAGGCCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGATTTC-ATGAATGGTTGTG--ATTTATC-CAGAAATTTTATCGC-AA-TTTGC-AGTTGAGTTA------------------A--AA--T---T-TGTG-GATCAA-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT--------GT------------------------TGCT-TAT-CTT-GCGCAG--AA---AGGC-AGA--GTCCCGG-----G-AGA----A-A--T---TCTGTC-T--CATATGCAGATCTA------TCATC-CAG-TT-------------ACGG-A---AGCAGTTG-T-----------C---TC--TT------TCAA-------GC---T---A--------AAATAA--T--T--GTAGC------TT-G-AA------TA--ATAAATTTT-ATGA----------AATCGTGTATATGAATTATT-GAAATTTTTTTTTATATCTTTT-G-------AATAATTTT----C-TGA----AA--AT--AGCT--A--GTGATTTTCAATTTTG--GCTAG---TAAAAG--TTg
gi|4 : ctA--GT--TAC-----G-GAA----GCAGTT--GTCTCTT-TCAAG---------CTAAAATAATTGTA---G-CTT---GAATAATAAATTTTA---TGAAATCG-T-----------G---TA--TA------TGAA-TT----AT---T---G--------AAATTTTTT--TTTATATCT-----TTTG-AA------TA--A-----TTTTCTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA------TTTTCA-A--TTTTGGCT--AGTAAAAGTTTT----TGGGG----CAGGCTGAGGCTG-A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAGA--TTAA-ATTAAGACCGCTtttggggcaggctgaggctgaaaatttgcttgtggtaatttaaagattaaattaagaccgctga
gi|5 : ctctatatggtgacaacgcgtattggtacacatgattacgatatttgttttaaatagaaaggccttaatgcaatagcaagtaaggaatatattgtaagcaagggcatcagttttttacgcgatagcacaagccagcctaggccttaaaataggttcaaaaccgagggcgatttcatgaatggttgtgatttatccagaaattttatcgcaatttgcagttgagttaaaatttgtggatcaagatgatatcgatgaatctgttgcttatcttgcgcagaaaggcagagtcccgggagaaattctgtctcatatgcagatctatcatccGTT-TATACTTAGC-CAGTAAACGTA--C-AAATGGT--TAG-----GGAGATGAAACA--TTTGTCTTTT-T--AA---------CTAAT----CTGTACCGG-CTTATGGAATAA-AAA--G-A---TGAAAT-G-T-----------TTTATA--TA------TGAA-T-----AT---T---GAGACGATTAAATGCCTT--C--CTATTTATA--TT-ACAA------AA--A-----TTA-CTGA----------AA------ga
gi|5 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttgAAAA---T----T-TGG----CA--CTT-AGCT--ATAA-AATTTGC--TTGTG--G-TAATCATAAAAGTATCAA-TTTTAAAACCCTtggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagaaaatttggcacttagctataaaatttgcttgtggtaatcataaaagtatcaattttaaaaccctgacttccttaaa
gi|6 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttggtttatacttagccagtaaacgtacaaatggttagggagatgaaacatttgtctttttaactaatctgtaccggcttatggaataaaaagatgaaatgttttatatatgaatattgagacgattaaatgccttcctatttatattacaaaaattactgaaatggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagGGTTC-AAATTAAGTGAAATTAACCGCTA-AAATGCGACGCCATGAAATATATTT--A-GC-GAGTG-CATTGCGTGCATATACTCGCAA--TTTT-TGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-C-GATTTCTGTTGTCAGTCAGTTTCCGTTTGAAATC-ATTAT-TTTCCTAAAAATCCCT-AT-GCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGACGCTCAAA-CGTTA-ATTTAAGCAAAAGATATAGGTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------CCTGCA-----T---A-----------AAAAA--TCCAC-T-GGACTTG---ACAACTT-CCTA-AG-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATACTCCGG--A-T--GT--ATCGT---AG---A--TGTTTT---GAA--CTC-GGAA-TGC-GAGAAT-G-CACA-G-G-GAAGGT-CAC-T-AAGAAAAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGATAAAC---gacttccttaaa
gi|7 : CCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC--------------GCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAA-AATTTGTGGATCAGATATCAA--TGAATCTCAGT--CT-A-GA-TA-GTA-TTTA---TCTTGCCAGAAACG-----GA-GTC------------AGGAGAG----CATT-----CTT-TCATAT--GG---A--C-ATC--AT--CAGTAACTG-AGA----AAT--T--GTTTTTT-T--AA---------CTA------TTGTATCGG-CTT---GAATGA-AAATTA-A---AGAAATAG-T-----------T---TT--TA------TGAA-T-----AT---T---C--------AAATTATTC--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAGATTTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT---AGAG--TTAA-TTTTAAACCC
gi|8 : AATACTCACTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-AC-tgatgtcacacctaaatatgtcacaactgaaaacggcacaatcctcacacactctaggc
gi|8 : acgagtcatACCGA---CTATT-------------C-CAGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-CTTCCT-AAAATTCCT-ATCACAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGTGCAATGAC-CTCAAA-CATTA-ATTTAA-C-AAAGATCTA-GTCA-C-ATTGGTGACAG---T-------TGT-TG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------CTG-A-----T----------------AAAA--TCCAC-T-GGAC-TG---ACAACTT-TCTATGA-----AAAC-GTCGGTCCCAAAGAATT-AG-TCAAAA---ATA-TC--G--A-TCAGT-GATCGT---ATT--A--TAATTTAAGAAA--CTC-GGAA-T-A-G-GAGT-G-CACA-G-TTGAAGGTCcgactattccagatttctgttgtcagtcagttccggtttgaatcattatcttcctaaaattcctatcacaaaagcgcttgaatgatcgtgcaatgacctcaaacattaatttaacaaagatctagtcacattggtgacagttgttgaaaactgtccgtgttctgataaaatccactggactgacaactttctatgaaaacgtcggtcccaaagaattagtcaaaaatatcgatcagtgatcgtattataatttaagaaactcggaataggagtgcacagttgaaggtca
gi|9 : acgagtcataatactcactaaatgcgaccataaatatattttag-TGTGTGGTC-AAGA-TG-GTA-TTGG---C-------GAATTT-----CA-GCCCAGGGGAGCAGTAA-ATAGGCGGTGGT-TAT-CTA-GC-CAG--A----------GA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--a
gi|9 : tgaggatttataTTTC-T--AA---------ACA------GTG----GA-CTT---GAATAA-AAA----------AAA---------------------------------AAA-T-----AG---T---G--------AAATCATTTAAT--ACATCA-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AC---AGCTGAT-AA-----ATTATCA-A--TTTT-GCT---GTAAAAAA---AAAAT-TGG----CA--CA--AGCT--A--A-AAATTGC--TTACG--G-TAATT-TGAattaaactttctcccataccgacctcatcaatgacggtgacgaagtctatttttattattttctaaacagtggacttgaataaaaaaaaaaatagtgaaatcatttaatacatcattgaataatttctgaaaacagctgataaattatcaattttgctgtaaaaaaaaaattggcacaagctaaaaattgcttacggtaatttga
blockSeqs : C G AC A GC G TAGA . G G A T . GGG TTTATCGAAAATT A A A . A A TTGACAATAAT G A C G A C G CAC GTGACA . GCAGAGT T . ACCGGAT TGGT CCT TGCCGACAGGGCTGATAAA AA A A A TT CAA TG T . C G AT T TAT C AGACTG C G AAA TTACA AG GG G T G A A G C T C GTC G TAA T C G T A AGAC T A CTAC C C A G AGA AC C GTG C . A A A GT A . GC A GTAAGGAATATATTG G AGGG TTT G C A C G C G T A T TT T G AAATTTGTGGATCAGATATCAATGAA C TG A A . C T T TCTTGCCA ATTTG C CAGGGGAGCAGT G A GCGG C A A G TAAACGTA A TG CC TAACTG TGAA GTTG . CATATGCAGATCTA CC A ATG T ATGAATAT C A TTTATATA TATTGAGACGATT CT TTT ATA T C . . TAAAT T . TCGTGT ATG A AATTTT T TC G C TAA AT AAAA G CACT GG GA G TA T AA CC C ATA TA T
blockSeqs : A G A G . . TAG . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . CAGCAGGGCCGATAAA . C . . CA . AC . . C . G T AT . GTAACG . A . ATT . . . . . . . G C T . ATC . AAA . T . T C T G G C C . G G C . . . . . . . T A . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . CAAATTAAAAATGAA . TG . . . . . C AATT . . T . G . . . . A AAAGG . . . GG . TTTG . CAAGCTAAAATAA TC . . . TTTTAT T . TTACATA ATATTTTAA CT AAT . . . . . . T . . . . TT . . . C A TT . . . . T . . . . . . CA . .
blockSeqs : A G A A . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . CGGCAGGTGCCGATA . C . . TT . AG . . C . . T . . CGGCAC . A . TTA . . . . . . . . . . . GTC . AAG . C . . T T G A T . . G . . . . . . . . . T A . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . CAATTAAAAATGAA . G . . . . . T T . . . . A . . . . . AGA . . . G . AA . AACTAAT T . . . CGGAT C . CTTTT TTATTG TT T . . . . . . . . . . . T . . . G A CG . . . . . . . . . . . TA . .
blockSeqs : . G A A . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . TGGCAAGGTTGTT . T . . TT . TG . . T . . T . . GTGGC . C . GA . . . . . . . . . . . GC . ACG . A . . G T G A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . CAATTTG . G . . . . . C T . . . . A . . . . . GAA . . . G . TG . AACTA C . . . TGAAT T . TTATA TATTG CC T . . . . . . . . . . . A . . . A G TT . . . . . . . . . . . TA . .
blockSeqs : . A A . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . TCTGATAAAA . A . . T . TG . . T . . C . . CGGAT . G . T . . . . . . . . . . . GT . AAG . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . AACTT . G . . . . . C T . . . . A . . . . . GGA . . . G . TG . AACTA C . . . CGGAA C . CTCTT TATTG AT C . . . . . . . . . . . A . . . C A TT . . . . . . . . . . . TA . .
blockSeqs : A A . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . TCCTGCATA . T . . T . TG . . C . . T . . GATCA . C . T . . . . . . . . . . . CT . AAG . C . . A . . . T . . CAAT . G . . . . . T T . . . . . . . . . . A . . . G . T . AAACA . . . . TTAAA A . GTATA TATTC AT T . . . . . . . . . . . T . . . C A TT . . . . . . . . . . . TG . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . TCTTGATA . T . . T . TC . . C . . C . . GGAC . G . A . . . . . . . . . . . GT . A . . . . . . AAAT . T . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . TTTTA TAGTG A . . . . . . . . . . . . A . . . C . T . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GGGCAATA . A . . . . TC . . C . . C . . GGGC . G . T . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . GCTA . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . TCTGATA . A . . . . TT . . C . . C . . TGGC . G . A . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCTGAT . A . . . . C . . . . . . . . GGAA . G . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . GAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TAG** ** *** *** TGCCTGATA******************************** TG* ***** C* GGAC****** GT* T***** T* CAATTAAATG******************* ************ TG**** AACTA***************** CGGAT**** CTNTA********************** TATTG******************** ***** ****** ** ********** ** TA*
originalCons : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG-GC-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T------GCCG-A-----T---A-----------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-NCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TC--G--A-C--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT------------A--AA--TGAAT-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-T-----------T---TN--TA------TGAA-T-----AT---T---G--------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
finalCons : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAG--C-GAGTG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTG-AATC-ATTAT-TTTCCT-AAAATTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-C-AAAGATATA-GTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GTTGCCTGATA--------------------------------AAAAA--TCCNC-T-GGACTTG---ACAACTTG-CTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA-TCGGAC------GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGT-CAC-T-AAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTTT-----AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAAT-TTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTACAATTAAATG-------------------T-TGTGTGACC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACATG----TCTTTT-TAACTA-----------------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGGAT----GAAATCG-TCTNTA----------------------TGAATATTG--------------------AAATTCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGA----------AA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATTTA-AAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
Alignments
lowQualScore : 1 11 11 1 111 2222222222222 22222222222 111111 1111111 1111111 5555555555555555555555555 111 11 111 11 2222222 1 111 1111 1 222 11 111 11 444444444444444 1111 111111 66666666666666666666666 11111111111 11111111111 11111 333333333333 1111 1 1111111111 1111111 1111 111111 4444444444444444444444 11 222222222 11111111 44444444444444444444 22222222222 11111 11111 111111 11111 22222222222222222 222222 111
lowQualScore : 1 1 4 9 66 4 9 5 33 5 0 0 99 1 5 333 7777777777777 5 0 5 5 5 5 5 77777777777 5 5 5 5 5 1 5 999 000000 666 1111111 3 3 1111111 7777 666 3333333333333333333333333 7 000 55 55 1 3 3 99 666 99 3 88888 44 3 88 1 000 44 77777 11 3 1 666 3333333 44 44 3 3 3 3 3 6 6 6 3 3 8 44 5 0 7 5 0 1 1 000 2 2 3 7777 0 2 1 0 2 000 22 6 111 6 6 6 6 6 44 3 6 99 6 111111111111111 6 4444 111111 6 6 6 6 6 6 6 5 5 5 55 5 5 66666666666666666666666 3 99999999999 5 5 5 5 5 4 77777777777 22222 5 555555555555 5 2 0000 4 4 5 1 7777777777 5 66 66 3333333 0000 666666 5 2222222222222222222222 0 11 5 777 0 4 333333333 6 4 22222222 2 555 99999999999999999999 00000000000 22222 88888 4 4 222222 66 11111 8 11111111111111111 777 4 000000 4 66 4 1 666 99 6666 4 8888 55 99 99 55 4 55 55 4 444 66 5
lowQualScore : . . . . .. . . . .. . . . .. . . ... ............. . . . . . . . ........... . . . . . . . ... ...... ... ....... . . ....... .... ... ......................... . ... .. .. . . . .. ... .. . ..... .. . .. . ... .. ..... .. . . ... ....... .. .. . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . ... . . . .... . . . . . ... .. . ... . . . . . .. . . .. . ............... . .... ...... . . . . . . . . . . .. . . ....................... . ........... . . . . . . ........... ..... . ............ . . .... . . . . .......... . .. .. ....... .... ...... . ...................... . .. . ... . . ......... . . ........ . ... .................... ........... ..... ..... . . ...... .. ..... . ................. ... . ...... . .. . . ... .. .... . .... .. .. .. .. . .. .. . ... .. .
lowQualScore : 4 0 4 0 11 4 4 7 66 7 4 7 33 4 7 888 5555555555555 0 1 7 7 7 7 7 11111111111 0 0 0 0 7 3 7 333 555555 444 8888888 6 6 8888888 7777 444 6666666666666666666666666 3 444 00 00 0 6 6 00 444 55 6 33333 33 6 66 8 444 66 77777 22 3 0 444 5555555 66 66 3 3 3 3 3 7 7 7 3 6 0 77 0 1 6 7 7 4 0 000 5 5 8 2222 8 5 0 0 5 222 55 7 777 7 7 7 7 7 00 2 7 22 7 777777777777777 7 2222 888888 7 7 7 7 7 7 7 7 7 0 11 0 0 44444444444444444444444 2 66666666666 0 0 0 0 0 2 99999999999 55555 0 666666666666 0 0 6666 4 4 0 4 7777777777 7 99 99 8888888 6666 000000 0 5555555555555555555555 4 44 0 888 8 4 000000000 4 4 88888888 3 333 77777777777777777777 66666666666 88888 99999 4 4 888888 11 11111 9 99999999999999999 888 4 777777 4 11 4 1 999 55 0000 0 5555 55 55 55 55 0 55 55 0 999 11 0
consensus : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCG-AGTG--CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTGAA-TC-ATTAT-TTTCCTAAAA-TTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-CAAA-GATATAG-TCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-GC----C--------TG-AT---AAAAAA--T--CCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-NCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA--TC-G-G-AC--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTC-AC-TAAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT--------AAA--T---TTGTGTGA--------CC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-TC---TN--TATGAA-T-ATT---G----------------AAAT--------TCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGAA----------A------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
Reference ( family-1769 ) : AGGGTTCGAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCG-AGTG--CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTGAA-TC-ATTAT-TTTCCTAAAA-TTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-CAAA-GATATAG-TCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-GC----C--------TG-AT---AAAAAA--T--CCNC-T-GGACTTG---ACAACTT-GCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAACT-A--TCAAAA---ATA--TC-G-G-AC--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACA-G-GTGAAGGTC-AC-TAAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ANAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAANAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT--------AAA--TG--TTGTGTGA--------CC-A-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-AGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAACGG-A---TGAAATCG-TC---TN--TATGAA-T-ATT---G----------------AAAT--------TCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGAA----------A------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAANTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAAG--TTAA-TTTTAAACCCCT
gi|1 : CGCTA-AAATGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCGCAGTGTGCATTGCGT-CATATGCTCGAAAATTTTT-AGCGTACTCCATCTACCGAG--CTAAT-------------T-CGGATTTCTGTTGTCAGTCGGTTCCGGTTTGAA-TC-ATTATCTTTCCTAAAA-TTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCACGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-CAAA-GATCTAG-TCA-C-ATTG------GTACT-------TGT-CGAAAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------C--------TGAATAA-AAAAAA--T--CCAC-T-GGACTTG---ACAACTTCCCTA-GAAAAGTAAACAGTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA--TT---G-AC--GT-GATCGT---A----A--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-G-CA-A-G-GTGAA-GTC-AC-TAAGAAG-AAAAATGGCCCCG-TGTTAAAGGT-AC-GTAGGA-ATAC---TTGTCGTGGTAACGTTCCTTTTGCAACCGGGA-GTCGTG--TTCCATT---CTACCGCAGATGTGTCACACCATA
gi|1 : CCTTTCATCA-GTG-TAAG--AAAAGAAA-CAACTC-TATGGTG---ACAAC-GCGTAATTGGTA--CATGATT-ACGA-TATTT-TG-TTATTAATAAATAGAAAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTTTAAT--AC-CGATAGCACAAG--C-G-CCTAG-CC-AAA-AATA-GGTT-AAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATTGTTGTGAAACTTATC-CAGAAA--TTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTA--------------AAA------TTGTGT-A--------TC-A-GATTG-ATA-T-AA---T-------GAATCT-----CA-GTCT-----------AG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAG--AA---A--C-GGA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--T---TCTTTCAT--AA-------------------TGAA-CAT-CAT---CAGT----AACGG-A----GACATTG-TC---TG--TTTAAC-T-ATT---GTACCGGCTTGAATAAAAAATTAATGAAATCGTT--T--ATATATGAATATT-G-AAATCTTTTACTA-----TCT-TTGAATAATTCTGAAA------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAAAAATTT----T-GGG----CA--CT--AGCTACA--A-AATTTGC--TTGTG--G-T-ATT---AAAG--TTAT-TTTTAtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttcatcagtgtaagaaaagaaacaactctatggtgacaacgcgtaattggtacatgattacgatattttgttattaataaatagaaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaataccgatagcacaagcgcctagccaaaaataggttaaaaccgagggcgattcatggattgttgtgaaacttatccagaaattatcgcaaatttgcagttgagttaaaattgtgtatcagattgatataatgaatctcagtctagatagtgtttatcttgccagaaacggagtcaggagaacattctttcataatgaacatcatcagtaacggagacattgtctgtttaactattgtaccggcttgaataaaaaattaatgaaatcgtttatatatgaatattgaaatcttttactatctttgaataattctgaaaatagctagtgatttttcaattttgctagtaaaaaattttgggcactagctacaaaatttgcttgtggtattaaagttatttttatggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|10 : cgctaaaatgcgaccataaatatattttagcgcagtgtgcattgcgtcatatgctcgaaaatttttagcgtactccatctaccgagctaattcggatttctgttgtcagtcggttccggtttgaatcattatctttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgatcacgcaatgacctcaaacgttaatttaacaaagatctagtcacattggtacttgtcgaaaaactgtccgtgttctgaataaaaaaaatccactggacttgacaacttccctagaaaagtaaacagtcggtccaaatgaattatcaaaaatattgacgtgatcgtaatattttagaactcggaatcgagatgcaaggtgaagtcactaagaagaaaaatggccccgtgttaaaggtacgtaggaatacttgtcgtggtaacgttccttttgcaaccgggagtcgtgttccattctaccgcagatgtgtcacaccatatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CCCAAA-CACTACAT--AA-AAAA-GATCTAG-TCACACATTG------G---TGCAGAGTTGT-CG-GAAA-------TTGT----CCGT---TT-------T-GC----CGACAGGGCTG-AT---AAAAAA--AAACCAC-TAGGGC--G---ACAACTT-GCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAAAG-A--TTAAAA---ATA--TC-A-G-ACTGAT-AATCGT---A----T--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GAAT-G-CACA-G-TTGAAGGCC-GCTTAA----AAAACATGGCCGCC-TGTTAACGGTCAC-GTACGG-AAAC---TTGTCTTGGTAGCGTTCCTTTTGTAGCtggtaattaaagttaattttaaaccctg
gi|11 : attgtcaaatcgttcctagaacgattcgctTTTCATCAAGTGGTAAAGAAAAGAAAAACAACTCCTATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTTGTTTTTATTAATCAATAG-AAAG--CTTAAATGA-AAT-GCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-TGATAGCACAAGCCC-GCCCTAG-CCTTAACAGTAGGGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTCAATGGATGGTTGTGAAATTCATCTCAGAAA-TTTATCGCAAATTTTGCGAGATGAGTTACAAATT--------AAA--
gi|12 : AGGGTTAGAATTTAAATGGAAATACTCGCTA-AAAC-CATC--CAT-AAAAATATTT-AGCG-AGTG--TATTCCAT-TATATCCTCGAAAA-TTTT-ATCT-ACTATATTTATCGT---CTATTTTTATCGAAAATTC-CGGATTTCTAATGTCAGTCAATTCCGACTTGAG-TT-GCTAT-CTTTCT-AGA-TTACTAATCACAAAAGCCTTTGAATGATTGACAATAATTCGCACACTTAC-CTCAAA-TGTAC-ATTCCA-CAaatgaatttg
gi|13 : attac-TATG-TG---ACAAC-ACGT-ATTGGTAC-CATGATTAACTA-TA-TT-TGTTTATTAATAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGGTAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAATCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AAT------------------TTGTG-GA--------CC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATTT-----CA-GTCT-----------AG-ATAG----TGTT-TAT-tttaatcgtcttgtcaa
gi|14 : aCGCTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCG-AGTG--CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTGAA-TCAATTAT-TTTCCTAAAA--TCCT-AGCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAA-CGTTA-ATTTAA-CAAA-GATATAG-TCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------C--------TG-AT---AAAA
gi|15 : ---GAATAA-AAAATG-AATATGAAATCGATT---TACATATGAAAT-ATTTTAA----------------AAAT--------TCTTT-----ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGAA----------A-------T---AGCTAGT-GA-----TTTTTC--A--TTTT-GCTTAAGTAAAAAATTT----T-TGG----CA--CT---GCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-CAAAAG--TTAATTTTTAAACCCg
gi|16 : aattaaaaatgaatttgag------G---T-------TGTTCG-AAAA-------CTGT----CAGTCCTGTCGGCAGGT-GC----C---------G-AT---AAAAA---T--CCCCAT-GGAC--G---ACAACTA-CCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAGCCGA--TTAAAATATATA--TC-GTA-ACG-GT-GATCAT---T----ATTTATCTAA--GAA--CTCGGGAA-T-C-G-GGAT-GCCACA-G-GTGAA-GTC-AC-TA--AAAAAAACATGTGCGCA-TGT----GAT-ACGGTACGA-ACACAGACTGCCGTGGTtggtccacagaaaatgccaattgtttgcaaaaccctg
gi|17 : ------G---T-------TGT-CG-AAAAACCGGATCGGT----CC-T---GT-------CAGCAGGGC--------CG-AT---AAAAAAAAT--CCCC-T-GGAC--A---ACAACTA-GCTG-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAAT-AACC-AATTTAAAA---ATA--TC-G-G-AC--GG-GATCAT---A----T--TATTTAA--GAA--CTC-GGGATT-C-G-GGAT-GCCACA-GCGTGAAGGTC-AC-T---AAAAAAACATGGCCGCGTTGTGAAAGGTTA
gi|18 : GGATGGTTGTGAAATGTATC-CAGAAA-TTTATCACAAA-TTTGC-GTTTGAGTTA--------------AAC--TT--TTGTG-GA--------CC-A-GA-TG-ACA-TCAA---T-------AAATCT-----CA-GCT------------AG-GTGG----TTGT-TAT-CTA-GC-CAG--AG---A--CAAAA--GT--CAG-----G-AAA----ACA--A--ACATTCT-T----------------------TTATA-TGGACAT---CAACAG-AAACGG-A---T-ATATTG-TC---TT--TTTAAC-T-ATT---G----------------Agctacaacataccttgcca
gi|19 : ------G---T-------TGC-TG-AAAA-------TTGTTGGTCC-T---GT-------T-GG----CAAGGT---TG-TT---AAGGA---T--TCTG-T-GGGCT-G---ATAACTT-GATA-GA-----TAAT-GTCAGACCAAATGACCG-T--TTGAAA---ATA--TT-G-G-GC--AT--ATCCT---A---------TTCTA--GAG--CTG-GGGA-T-A-G-GGAT-G-CACA-A-GTGAAGCTC-AC-TAAAAAAAAAAAATGGCttgattaacaagaaatttaatg
gi|2 : AGGGTTTCAAATTAA-TGAGAATACTCGCTA-AAGTGCGAC--CAT-AAATATATTT--ACG-AGTG--CATTGCGT-CATATACTCGCAA--TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTC-GTTCCGGTTTGAA-TC-ATTAT-TTTCCTAAAA-TTCCT-ATCGCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGAC-CTCAAAACGTTA-ATTTAA-CAAA-GATATAG-TCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T--C----T--------TG-AT---AAAAAA--T--CCAC-T-GGACTTG---ACAACTC--CTA-GA-----AAA--GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATA--TC-G---AC--GT-GATCGT---A----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGTCCAC-TAAGAAGAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAAGTCAC-GTAGAATATAC---T-GTCGTG-TAACGTTCCTTTTGCAAC-GGGAGGTCGTGATTTCCATT---CTACCGCAGCTGTGTCACACCATAttcctggccgaccaaatatgttaaacttctctacccagtga
gi|2 : CTAAAAAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAAG--AAAGAAAA-CAACTT-TATGGTG---ACAACCGCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGAATATTT--GTT-ATTAATAGATAG-AAAG--CTT-AATGACA-TAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AGTA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT--------AAAAATGAATTATGTGA--------TC-A-GA-TG-ATA-TTGA---T-------GAATCT-----CA-GTC------------TG-ATAG----TGTT-TAT-CTT-GC-CAA--GA---A--C-AGA--GT--CAG-------AGA----ACA--T--GTCTTTT-T--AA---------CTA------TTGTA-CGG-CTT---GAATAA-AAATGA-A---TGAAATCG-TT---TA--TATGAA-T-ATT---G----------------AAAT--------TCTTT--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGAA----------A------AT---AGCTAGT-GAT----TTTTTCA-A---TTT-GCT--AGTAAAAATTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAAAT-TAATAG--TTAA-TTTTAAACCCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctaaaaaaacgacctttcatcagtggtaagaaagaaaacaactttatggtgacaaccgcgtattggtaccatgattacgaatatttgttattaatagatagaaagcttaatgacatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaagtaggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaattaaaaatgaattatgtgatcagatgatattgatgaatctcagtctgatagtgtttatcttgccaagaacagagtcagagaacatgtctttttaactattgtacggcttgaataaaaatgaatgaaatcgtttatatgaatattgaaattcttttatatctttgaataatttctgaaaatagctagtgattttttcaatttgctagtaaaaattttttggcactagctaaaatttgcttgtggtaaattaatagttaattttaaacccct
gi|20 : agggtttcaaattaatgagaatactcgctaaagtgcgaccataaatatatttacgagtgcattgcgtcatatactcgcaattttagcgacttcatctaccgactattccggatttctgttgtcagtcgttccggtttgaatcattattttcctaaaattcctatcgcaaaagcgcttgaatgattgcgcaatgacctcaaaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttcttgataaaaaatccactggacttgacaactcctagaaaagtcggtccaaatgaattatcaaaaatatcgacgtgatcgtaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtccactaagaagaaaaaatggccgcgtgttaaaagtcacgtagaatatactgtcgtgtaacgttccttttgcaacgggaggtcgtgatttccattctaccgcagctgtgtcacaccatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntc------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTAT----CTGC---AA-------G-GG----C---------A-AT---AAGAAA--T--TCTC-T-TGACT-G---GTAACTT-GTTA-GA-----AAAT-GTTGATCCAAATT-ACT-T--T--AAA---ATA--CC-T-G-GC--GT-GATCCT---ATTACA--TATTTAA--GAT--CTC-AGAA-T-T-G-GGGTGG-CACA-G-GTGACGATC-AT-T
gi|21 : GGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCTACAAATGCGAC--CAT-AAATAT-TTTTAGCG-AGTGG-CATTGCGT-CATATGCTCGCAA--TTTTTAGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CGGATTTCTGTTGTCAGTCAGTACCGGTTTGAA-TT-ATTAT-TTTCCTAAAA-TTCCT-ATCGCTAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGcaaataacgtggtcacaaggctgataaaatttgtgaaaggttttctacccag
gi|22 : AGGGTTCAAAATTAAGTGGAAATACTCGCTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGCG-AGTG--CATTGCGT-TATATGCTCGAAAT-TTTT-AGCG-ACTTCATCTACCGAGGGCGATT-------------CATGGAT
gi|23 : gtcc--TATTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-GGAT-G-CACGTG-TTAAAGGTA-ACGTACGAAGA
gi|23 : atCACG-TGTTAAAGGTAAC-GTACGA-AGAC---TTGTCGTGTAAACATTCCTTTTGCAACCAGGCGGTCGTGGTTTCCATT---TT--CG-AGCTcttgtcgtgtaaacattccttttgcaaccaggcggtcgtggtttccattttcgagctcaact
gi|24 : attattttagaactcggaatcgggatgTCT-----TT-G-AA------TG--G-----TTTTCTGAA----------A------AC---AGCTAGT-GA-----AATTTCA-A--TTTT-GGT--AGTAAAAA-TTT----T-TGGCACTCA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTATG--G-TAATT-T-TAAG--TTAA-TTTTGAACCCcaact
gi|25 : ------AT---AGCTAGCAGA-----ATTTT-A-A--TAT--GAT--GGCATAAACGTT----T-TGG----CA--TT--AGCT--A--T-AACTTGC--TTATGCCG-TAATT-C-ATAC--TTAA-TTTCAt
gi|26 : AAA---ATA--TCCG-GCAC--ATCGATCGT---A----T--TATTTTA--GAAGGCTC-GGAA-T-CAG-GGATGG-CACGTG-TTAAAGGTtgaac
gi|27 : ---AAAAAA--T--CCTC-C-GGACCAACAAACAACTT-GCTA-GA-----AAA--ATC-GTCCAAAa
gi|28 : cagggcgataaA-----AAAC-GTTGGTCCAAATGAACC-A--TTGAAA---ATA--TC-GTG-GC--GT-GATCGag
gi|29 : gaTTGTAACCGGGAGGTCGTGATTACCATT----TAC
gi|3 : CAATGAC-CTCGAA-CGTTA-ATTTAA-CAAA-GATATAG-TCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------C--------TG-ATAAAAAAAAA--T--CCAC-T-GGACTTG---ACAACTT-CCTA-GA-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAAAT-ATA--TC-G-G-AA--GT-GATC-TAAAA----A--TGTTTTA--GAA--CTC-GGAA-T-C-G-AGAT-A-CACA-G-GTGAAGGTC-AC-TAAGAAGAAAAAATGGCCGCG--GTTAAAGGTCAC-GTAGGA-ATAC---TTGTC-TGGTAACGTTCCTTTTGCAACCAGGAGGTCGTGATTTCCATTCTACTACCGCAGCTGTGTCACACCAgagctcatcttcta
gi|3 : CTAAACAAACGACCTTTCATCA-GTGGTAA---AAAGAAAA--AACTC-TATGGTGGTGACAAC-GCGT-ATTGGTAC-CATGATT-ACGA-TATTT-TGTTTATTA-TAAATAG-AAAG--CTT-AATGACAATAGCAA---------------TAA-CA----CATCAGTTT---T--AC-CGATAGCACAAG-CC-G-CCTAG-CCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTCATC-CAGAAA-TTTATCGCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAC-AATT-------------TG--TTG---GA--------CC-A-GA-TGCATATTCGAAATT-------GAATCTATTTGCACATC------------AG-AT-G----TGTTCTCT-CTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaaacaaacgacctttcatcagtggtaaaaagaaaaaactctatggtggtgacaacgcgtattggtaccatgattacgatattttgtttattataaatagaaagcttaatgacaatagcaataacacatcagttttaccgatagcacaagccgcctagccttaaaataggttcaaaaccgagggcgattcatggatggttgtgaaattcatccagaaatttatcgcaaatttgcagttgagttacaatttgttggaccagatgcatattcgaaattgaatctatttgcacatcagatgtgttctctctt
gi|30 : caatgacctcgaacgttaatttaacaaagatatagtcaaattggttgtcgaaaactgtccgtgttctgataaaaaaaaatccactggacttgacaacttcctagaaaacgtcggtccaaatgaattatcaaaaatatatcggaagtgatctaaaaatgttttagaactcggaatcgagatacacaggtgaaggtcactaagaagaaaaaatggccgcggttaaaggtcacgtaggaatacttgtctggtaacgttccttttgcaaccaggaggtcgtgatttccattctactaccgcagctgtgtcacaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATTAAGTGGAAATACTCGTT--AAATGCGAT--CAT-AAATAT
gi|4 : CTA-TATGGTG---ACAAC-GCGT-ATTGGTACACATGATT-ACGA-TATTT--GTTT-----TAAATAG-AAAGGCCTT-AATG-CAATAGCAAGTAAGGAATATATTGTAAGCAAGGGCATCAGTTT---TTTACGCGATAGCACAAG-CCAG-CCTAGGCCTTAA-AATA-GGTTCAAAACCGAGGGCGATTTC-ATGAATGGTTGTG--ATTTATC-CAGAAATTTTATCGC-AA-TTTGC-AGTTGAGTTA--------------AAA--T---TTGTG-GA--------TCAA-GA-TG-ATA-TCGA---T-------GAATCT--------GT------------------------TGCT-TAT-CTT-GCGCAG--AA---AGGC-AGA--GTCCCGG-----G-AGA----A-A--T---TCTGTC-T--CATATGCAGATCTA------TCATC-CAG-TT-------------ACGG-A---AGCAGTTG-TC---TC--TTTCAA---GCT---A----------------AAAT--------AA--T--T--GTAGC------TT-G-AA------TA--ATAAATTTT-ATGAA----------ATCGTGTATATGAATTATT-GAAATTTTTTTTTATATCTTTT-G-------AATAATTTT----C-TGA----AA--AT--AGCT--A--GTGATTTTCAATTTTG--GCTAG---TAAAAG--TTg
gi|4 : ctA--GT--TAC-----G-GAA----GCAGTT--GTCTCTT-TCAAG---------CTAAAATAATTGTA---G-CTT---GAATAATAAATTTTA---TGAAATCG-TG---TA--TATGAA-TTATT---G----------------AAAT--------TTTTT--TTTATATCT-----TTTG-AA------TA--A-----TTTTCTGAA----------A------AT---AGCTAGT-GA------TTTTCA-A--TTTTGGCT--AGTAAAAGTTTT----TGGGG----CAGGCTGAGGCTG-A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT-TAAAGA--TTAA-ATTAAGACCGCTtttggggcaggctgaggctgaaaatttgcttgtggtaatttaaagattaaattaagaccgctga
gi|5 : ctctatatggtgacaacgcgtattggtacacatgattacgatatttgttttaaatagaaaggccttaatgcaatagcaagtaaggaatatattgtaagcaagggcatcagttttttacgcgatagcacaagccagcctaggccttaaaataggttcaaaaccgagggcgatttcatgaatggttgtgatttatccagaaattttatcgcaatttgcagttgagttaaaatttgtggatcaagatgatatcgatgaatctgttgcttatcttgcgcagaaaggcagagtcccgggagaaattctgtctcatatgcagatctatcatccGTT-TATACTTAGC-CAGTAAACGTA--C-AAATGGT--TAG-----GGAGATGAAACA--TTTGTCTTTT-T--AA---------CTAAT----CTGTACCGG-CTTATGGAATAA-AAA--G-A---TGAAAT-G-TTTTATA--TATGAA-T-ATT---GAGACGATT--------AAAT--------GCCTT--C--CTATTTATA--TT-ACAA------AA--A-----TTA-CTGAA----------A------ga
gi|5 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttgAAAA---T----T-TGG----CA--CTT-AGCT--ATAA-AATTTGC--TTGTG--G-TAATCATAAAAGTATCAA-TTTTAAAACCCTtggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagaaaatttggcacttagctataaaatttgcttgtggtaatcataaaagtatcaattttaaaaccctgacttccttaaa
gi|6 : agtttatcgttagacaatattatcgtcagaatatgaagaggcccagtcaatatgaacatgaatcttagatgaatgaatcagatgcatagttaaggacgccccattgtgcatgaattcgtatatcagtctagagcctagctacgttggtttatacttagccagtaaacgtacaaatggttagggagatgaaacatttgtctttttaactaatctgtaccggcttatggaataaaaagatgaaatgttttatatatgaatattgagacgattaaatgccttcctatttatattacaaaaattactgaaatggagatgaaattattattaagttcgtgtaaattaaagctatgttccagagatttttatttttttcataatttatttttttagatgctaatcctagaaatgagGGTTC-AAATTAAGTGAAATTAACCGCTA-AAATGCGACGCCATGAAATATATTT-AGCG-AGTG--CATTGCGTGCATATACTCGCAA--TTTT-TGCG-ACTTCATCTACCGA---CTATT-------------C-CG-ATTTCTGTTGTCAGTCAGTTTCCGTTTGAAATC-ATTAT-TTTCCTAAAAATCCCT-AT-GCAAAAGCGCTTGAATGA-----------TTGCGCAATGACGCTCAAA-CGTTA-ATTTAAGCAAAAGATATAGGTCA-A-ATTG------G---T-------TGT-CG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T--C----C--------TGCAT---AAAAAA--T--CCAC-T-GGACTTG---ACAACTT-CCTA-AG-----AAAC-GTCGGTCCAAATGAATT-A--TCAAAA---ATACTCC-G-G-AT--GT--ATCGT---AG---A--TGTTTT---GAA--CTC-GGAA-TGC-GAGAAT-G-CACA-G-G-GAAGGTC-AC-TAAGAAAAAAAAATGGCCGCG-TGTTAAAGGTCAC-GTAGGATAAAC---gacttccttaaa
gi|7 : CCGAGGGCGA-TTC-ATGGATGGTTGTGAAATTTATC--------------GCAAA-TTTGC-AGTTGAGTTAA-AATTTGTGGATCAGA--TA--TCA-ATGAATCTCAGTCT-A-GA-TA-GTA-TTTA---TCTTGCCAGAAACG-----GA-GTC------------AGGAGAG----CATT-----CTT-TCATAT--GG---A--C-ATC--AT--CAGTAACTG-AGA----AAT--T--GTTTTTT-T--AA---------CTA------TTGTATCGG-CTT---GAATGA-AAATTA-A---AGAAATAG-TT---TT--TATGAA-T-ATT---C----------------AAAT--------TATTC--T--ATATCT-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGAA----------A------AT---AGCTAGT-GA-----TTTTTCA-A--TTTT-GCT--AGTAAGATTTTT----T-TGG----CA--CT--AGCT--A--A-AATTTGC--TTGTG--G-TAATT---AGAG--TTAA-TTTTAAACCC
gi|8 : AATACTCACTA-AA-TGCGAC--CAT-AAATATATTTTAGtgatgtcacacctaaatatgtcacaactgaaaacggcacaatcctcacacactctaggc
gi|8 : acgagtcatACCGA---CTATT-------------C-CAGATTTCTGTTGTCAGTCAGTTCCGGTTTGAA-TC-ATTAT-CTTCCTAAAA-TTCCT-ATCACAAAAGCGCTTGAATGA-----------TCGTGCAATGAC-CTCAAA-CATTA-ATTTAA-CAAA-GATCTAG-TCA-C-ATTGGTGACAG---T-------TGT-TG-AAAA-------CTGT----CCGT---GT-------T-------C--------TG-AT-----AAAA--T--CCAC-T-GGAC-TG---ACAACTT-TCTATGA-----AAAC-GTCGGTCCCAAAGAATT-AG-TCAAAA---ATA--TC-G-A-TCA-GT-GATCGT---ATT--A--TAATTTAAGAAA--CTC-GGAA-T-A-G-GAGT-G-CACA-G-TTGAAGGTC-Aaccgactattccagatttctgttgtcagtcagttccggtttgaatcattatcttcctaaaattcctatcacaaaagcgcttgaatgatcgtgcaatgacctcaaacattaatttaacaaagatctagtcacattggtgacagttgttgaaaactgtccgtgttctgataaaatccactggactgacaactttctatgaaaacgtcggtcccaaagaattagtcaaaaatatcgatcagtgatcgtattataatttaagaaactcggaataggagtgcacagttgaaggtca
gi|9 : acgagtcataatactcactaaatgcgaccataaatatattttagTGTGTGG--------TC-AAGA-TG-GTA-TTGG---C-------GAATTT-----CA-GCCCAGGGGAGCAGTAA-ATAGGCGGTGGT-TAT-CTA-GC-CAG--A----------GA--GT--CAG-----G-AGA----ACA--
gi|9 : tgaggatttataTTTC-T--AA---------ACA------GTG----GA-CTT---GAATAA-AAA----------AAA----------------AAA-T-AGT---G----------------AAAT--------CATTTAAT--ACATCA-----TT-G-AA------TA--A-----TTT-CTGAA----------A------AC---AGCTGAT-AA-----ATTATCA-A--TTTT-GCT---GTAAAAAA---AAAAT-TGG----CA--CA--AGCT--A--A-AAATTGC--TTACG--G-TAATT-TGAattaaactttctcccataccgacctcatcaatgacggtgacgaagtctatttttattattttctaaacagtggacttgaataaaaaaaaaaatagtgaaatcatttaatacatcattgaataatttctgaaaacagctgataaattatcaattttgctgtaaaaaaaaaattggcacaagctaaaaattgcttacggtaatttga