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Reference ( gi|8 ) : TTATCTA-GC-TTC-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG-TAC--GT----CCTTTC----CCCCT--T-T-G-A--C-T-ACA------A-A----G--G--A-AA----T-----T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-T---CC---------------------TC-----C----C--T--G---A-TTTG-TA--------A--AAA---------C-TA-C----AC----AA-A--A-T-A--T----AT-----GG--A--GA---------T---T----T------TT--A-----C----A-----A-A--A-A--T--CA----G---TT--T----GA----T--A--C---------A-------T---AT-A-T-A--T----T--C-T------------A-A--G--T--A--T----T-TT------------------TTTTC--C---T-AT---TA-T-C--AT--A-----A-A-AGT-T-----AT-A-CAA------T----A-AAT---------A-GA-AAAGA-ATC---A-G---TA-A----------TC-A---A---T-A---AA----TT--G--A-T-A-T-G--CC---TG--TTT--T--C-A--T-G-T---AAT-AT-A-A----TC-TT----C----G-G-T-G-TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C------------CT------G-GA-A-G--------------C-T--C---------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--C-C-TT-C---------AGT-A------T-GA-AA--G-G---GGT--A-AGTA-G---C--GT-C-TAA-AAGC-T-GG-ATAAAT
gi|9 : TTATCTA-GG-TTC-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG-TAC---------CTTTT----CCCCT--A-T-G-A--C-A-ACA------A-A----G--GG-A-AA----T-----T----T------CCC-T-T---CT-ACG--G---G-T--A---AA-C---A-T---TC---------------------AA-----CA---C--T--G---A-TTTA-TA--------A--AAA---------C-CA-C----AC----AA-A--A-T-A--T----AT-----GG--A--GA---------T---T----T------TT--A-----C----A-----A-A--A-A--T--CA----G---TT--C----GA----T--A--C---------A-------T---GT-A-T-A--T----T--C-T------------A-A--G--T--A--T----T-TT------------------TTTT---------AT---TA-T-C--AT--A-----A-A-AGT-T-----TT-A-CAACAATTAT----A-AAT---------A-GA-AAAGA-ATC---A-G---TA-A----------TC-A---A---T-A---AA----TT--G--A-T-A-T-G--CC---TG--TTT--T--C-A--T-G-T---GAT-AT-A-A----TC-TT----A----G-A-T-G-CC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C------------CT------G-GA-A-G--------------C-T--C---------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--C-C-TT-C---------AAT-A------T-AA-AA--A-G---GGT----AGTA-G---C--AT-C-TAA-ATGC-T-GG-ATAA
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gi|6 : TATCTA-GG-TTC-T---TTTTT---A-C-------T--A-CC-GCGTAAA-G-GC-TAC---------CTTTC----CC--T--T-T-G-AGGC-A-ACA------A-A----G--GCTA-AA----TAA---T----T---T-CCC--T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---AAT---CC---------------------CC-----T----C--T--G---A-TTTG-AA--------C--AAA---------C-CA-C----AC----AA-A--A-T-AG-T----AT-----GG-----TA---------T---T----T------TACAA-----C----A-----A-A--A-A--TA-CA----G---TTG-T----GA----T--A--C---------A-------TGATAT-A-T-A--T----G--C-T------------A-A--G--T--A--T----T-TT-------------------------C---T-AT---AA-C-T--AA--A-----A-A-AGT-T-----TT-A-CAA------T----A-AAT---------AAGA-AAAGA-ATC---G-G---TA-A----------GC-C---A---T-ATAGAA----TT--G--A-T-A-A-G--CC---TG--TTT--T--T-A--T-G-T---AAT-AT-A-A----TC-AT----TAATAG-A-T-G--C-G-A----T---C-C--T--CA---C--CCTTCC---C------------CT------GAGA-A-G--------------C-T--TCG-------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--C-C-TT-C---------AAT-A------A-GA-AA--T-A---GGT----AGTA-G---C--AT-C-TAA-AAGC-T-GG-ATAAATc
gi|14 : ATCTA-TG-TTC-T---TTTT----G-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG-TAC---------CTTTC----CCACT--A-T-G-A--C-A-ACA------A-A----G--G--A-AA----A-----T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---GA-A---A-T---CC---------------------CC-----T----C--T--G---A-TTTG-TA--------A--AAA---------C-CA-C----AC----AA-A--A-T-A--G----AT-----GG--A--AA---------T---T----T------TT--A-----CC---A-----A-A--A-A--T--CA----G---TT--G----GA----T--A--C---------A-------T---GT-A-T-A--T----T--T-T------------A-A--G--T--A--T----T-TC------------------TT-----C---T-AT---TA-T-C--AT--A-----A-A-AGT-T-----TT-A-CAA------T----A-AAT---------A-GA-AAATA-ATT---G-G---TA-A----------TC-A---A---T-A---AA----TT--G--A-T-A-T-G--CC---TG--TTT--T--C-A--T-G-C---GAT-AT-T-A----TC-TT----A----C-A-T-G-TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C------------CT------G-GA-A-G--------------C-T--A---------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--C-C-TT-C---------AAT-A------T-GA-AA--T-G---GGT----AGTA-G---T--AT-C-CAA-AAGC-T-AG-ATAA
gi|10 : ATCAA-GG-TTC-T---TTT-----A-C----------A-CC-G--TAAA-G-GT-TA---G-----CCTTTC----CCCCT--A-T-G-A--C-A-ACA------A-A----G--G--A-AAA---T-----T----T---C-CCCC-TGT---CC-ACA--A---G-T--T---AA-A---A-T---CC---------------------CC-----T----C--T--G---A-TT-G-TA--------G--AAA---------C----C----AC----AA-A--A-T-A--T----AT-----GG--A--GA---------T---T----T------TT--A-----C----A-----A-A--A-------CA----T---GT--T----GA----T--A--C---------A-------T---GT-AGT-AGTT----C--C-T------------A-A--G--T--A--T----T-TT------------------TT-----C---T-AT---TA-T-C--AT--A-----A-AGAGG-T-----TT-A-CAA------C----A-GAA---------A-GA-AAAAA-TCC---A-GGGTTA-A----------TC-AT--A---T-A---GG----AT--G--A-T-A-T-G--CC---TG--TTT--T----A----G-T---GA-----A-A----TC-AT----T----G-A-T-G-TC-A-A----T---T-CATT-CCA-C-------TTC---C------------CT------G-GA-A-G--------------C-G--C---------------A-------------ATA-----ATAT-TCGGGC--C-C-TT-CA--------AATAA------T-AA-AAATG-G---AGT--A---TA-G---C--AT-C-TAATAAGC-T-GG-A-AAAT
gi|17 : ATCTA-G---TC-T---TTTT----AAC-------T--A-CC-G-TAAAA-G-GG-TAC---------CTTTC----CCCCT--T---G-A--C-A-ACA-------------G--G--A-AA----A-----T----T---T-CCCC-TCT---CC-ACA--G---A-T------AA-A---A-T---CC----------------------C-----C----C--T--G---A-ATTG-TA--------G--AAA---------C-CA-C-------------A--A-C-A--T----TT-----GA--A-----------------T----T------TA--A-----C----A-----ATA--A-A--T--CA----G---TT--T----T-----T--AACC---------A-------T---GT-A-T-A--T----T--A-C------------A-A--------A--A----T-TG------------------TTTCC--A---T-AT---TA-T----AT--T-----A-A-AGT-T------T-A-CAA-----------A-TAT---------A-GA-CAAGA---T---A-G---TA-A----------TC-A---A---TGA---GA----TTGGG--A---A-T-G--CC---TG--TTT--T--TAA--T-G-T---AAT-AT-A-A----TT-TT----A----GAG-C-T-TC-GAA----T---C-C--T-CTT-C-C--TCTT-A---C------------CT------G-G--A-G--------------C-T--C---------------A-------------A-A-----A-TT-TC---C--C-C-CT-A---------AAT-A------C-GA-AA----T---GGT--A-GCTA-G---T--AT-C-TAA-AAAC-C-GG-ATAAATc
gi|32 : A-GG-TTC-T---ATTT----A-C-------T--T-CC-A-GTATA-G-GG-TAC--A------CTTTC----CATTT--CCT-G-A--C-A-AAA------A-A----T--T--A-AT----T-----T----T---T-CTTC-T-T---TT-ACA--G---G-T--A---AC-A---A-TTTCCC---------------------TT-----C----C---------A-TTGT-TG--------A--AAA---------C--A-C-----C----AA-A--A-T-cc
gi|5 : aaggaatctactc-GT-TTC-T---TTTA----A-C-------TT-A-CG-G-GTAAT-G-GG-TAC---------CTTTC----CCCCT--A-T-G-A--CAA-ACA------A-A----G--G--A-AA----A-----T----T---T-CCCC---T---CC-ACA------G-T--A---AA-A---A-T---CC---------------------CC-----CT---C--T--G---A-TTTG-TA--------A--A-------------TC-C----ACAGA-AA-A--A-T-A--T----AT-----GG--A--GAT--------T---T----T------TT--A-----CGA--A-----A-A--A-A--T--CA----GT--TT--T----GA----T--A--C---------A-------T---GT-A-T-A--T----T--C-T------------A-A--G--T--A--T----T-TT------------------TT-----C---T-AT---AATT-C--AT--T-----A-A-AGT-T-----TT-A-CAA------C----ATAAT---------A-GA-AAAAC-ATC---A-GT--TA-AT---------TC-A---A---T------A----TT--G--A-T-ATT-G--CC---TG--TTT--T--C-ATTT-G-C---AAT-TT-A-A----TC-TT----A----A-T-T-G-TC-G-A----T---T-T--T-CCA-C-C--CTCTCC---C------------CTTCCGTGA-GA-A-A--------------C-T------------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--C-C-TT-C---------AAT-A------T-GA-AA--T-G---GGTAGA-ATTAGG---C--AT-C-TAA-AAGC-TGGG-ATAAAttt
gi|7 : atcaag-TTC-T---TTTTTTACA-C-------T--A-CCTG-GTAA--G-GG-TAC--CA----TTTTCT----CCCCT--T-T-G-A--C-A-ACACTAAATA-G----G--G--G-AG----T-----T----T---T-CGCT-C-T---CC-ACG--G---A-T--A---AA-A---A-G---TC---------------------CC-----C----C--T--G---A-ATTG-TAGT------A--GAG---------A-TA-CC---AC----AA-A--A-A-A--T----GG-----GG--GATGA---------T---TGTAGT------TG--A-----C----A-----A-A--A-AAAT--CA----G---TT--TT---GA----T--A--C---------A-------T---GTTA-T-A--T----T--CAT------------A-A--G--T--AGATAG--T-AT------------------TTTTC--C------------------------------A-AAT-T-----AT------------T----A-TAT---------A-TA-AG------------G---TT-A----------T--G---A---T-A---AC----TC--C-------------CC---TG--CCT--C--C-T--T-A-TTG-AATTAT-A-A-----C-TTAAGAT----G-G---G-TC-G-ACC--T---C-C--T-CC----C--CCTTCC---C------------CT------G-GATA-G--------------T-TA-G---------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--C-C-TT-A---------AAT-A------C-GA-TA--T-GACCAGT--A-A-TA-GA--T--AT-C-TAA-AAGC-G-GG-atcc
gi|29 : gg-TCC-T---TTTT----A-TACTACTGT--A-CT-G-GTAAA-A-TG-TAT---------CTTTT----ACCCT--T-T-G-A--C-A-ACA------A-A----T--G--A-AT----G-----T----T---T-CCCC-T-T---CC-ATA--G---G-T--A---AA-A---A-G---CC---------------------TC-----T----T--T--C---A-ATAG-TA--------G--AAA---------C-TA-C----AC----AA-A--ATT-G--T----AT------G--A--G--------------T----G------CA--A-----G----A-----A-A--A-A--T--TA----T---TT--T----TA----T--A--T---------A-------A---TT-A-T-G--T----T--A-C------------A-T--G--T--A--A----A-TC------------------ATTTT--C---T-AT---AA-T-C--gatc
gi|21 : tatggttttttg-TTT-T---TTTT----A-AA------T--A-CC-A-GTAAAAG-GG-TACCTTT----CCTTTC----CCTC
gi|27 : ttacccatcaata-TTC-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-A-GG-TAT--A-----CCGTTC----CCCTA--G-T-C-A--G-TGACA------A-AACATG--G--A-TA----------T----T---T-CGCC-T-T---CC-ACA--C---G-T--A---AA-A---G-T----G---------------------TC-----C----C--TTAA---A-ATTG-T------------AGA---------C-TA-C----AC----AAGA--G-T-A--T----aggtaaatgtagcaactagattctacacaaaatcatatgggaattttaacaaaaatcattacagtgaatttattttcttattttcttataataagtctcaatatagcaagaatcattactcaatcgatatgcctattcttatatctgagtgtcccccaacccctctccaaaagctcacgactgtattctcaaataatttctttaattctgaaatggggctagtaacatctg
gi|23 : catgcaaagttagagccattccagggatttacatggC-T---GTTT----G-C-------T--A-CG-G-TTAAATG-GGCTAC---------CTTTC----CCCCTATT-T-G-AG-C-A-ACA------A-A----G--G--G-AAGAATT-----T----T---T-CCCC-T-TATCTC-ACA--GCGCG-T--A---GATA---A-T---CCCCGAGGCAACACTTGCTTTCTTC-----CGACTC--T--G---ATTTTG-TAG-------A--AAA---------C-CA-CGA--ACA---AA-A--A-T-A--G----ATAGC--GA--A--AA---------T---T----T------TTTCAC----C----A-----A-G--A-A--T--CA----G---TT--GCGCAGT----C--A--CT--------A-------T---GT-A-T-A--T----T--T-A------------A-A--G--T--T--A----T-TT------------------GCTTC--T---TAAT---TA-T-C--tgtcgttagctgataggtctacacgtgattattttgaagtgtttgtacgtaaaa
gi|42 : -T---TGTT----A-C-------C--A-CT-G-GTAAA-G-GG-TA---------TCTTTC----CCCAT--T-T-G-A--C-A-ACA------A-A----tatgttagaaacgtatatattgaacacatgtattggaaatc
gi|18 : ---TTTT----A-C-------T--A-CT-G-GTAAA-G-GG-TAC---------CTCTC----CCC-T--T-C-G-A--C-A-ACA------A-A----G--G--A-AA----T-----T----T-----CCCC-T-T---CC-A----G---A-T--A---AA-A---A-T---CC----------------------C-----C----C--T--G---A-ATTG-TA--------G--AAA---------C-CA-C----AC----AA-A--A---A--T----AT-----GG--A--AA---------T---G----T------TT--A-----A----C-----A-A--A-T--T--CA----G---TT--T----TA----T--A--C---------A-------T---GT-A-T-A--T----T--C-C------------A-A--A--T--A--T----T-AT------------------G---C--T---T-AT---TA-T----AT--A-----A-A-AGT-T-----TT-A-CAA------T----A-CAT---------A-----AAGA-ATT---A-G---TA-A----------TC-A---A---T-A---AA----TT--G--A-T-A-T-G--CC---TG--TTT--T----A--T-G-T---AAT-CT-A-A----TC-TT----A----G-A-A-G-TC-G-A----T---C-C--T-CCT-T-C--CCTT-C---C------------CT------G-TA-A-G--------------C-T--C---------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--C-C-TT-A---------AAT-A------C-GA-AA--T-G---GGT----AGTA-G---T--AT-C-TAA-AAGC-TCGG-ATAAa
gi|34 : ---TTTT----G-C-------T--A-CG-G-GTAAA-G-G--TAC----------TTTT----CTCCT--T-AAG-A--C-A-AGA------A-A----T--G--A-AA----TGA---T----TG--TATTCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AG-A---A-T---TC---------------------CC-----C----T--T--GA--A-ATCG-TA--------G--AAA---------
gi|15 : gggaatttattgttaaaaa-GG-TAA--AT----ACTTTCTAATCCCCT--T-T-A-A--C-A-ACA------A-A----G--G--A-AA----A----------------CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---A------------------------------------------------------------------------------AA---------C-CA-C----AC----AA-G--A-T-A--T----AT-----AG--G--GA---------T---T----T------TA--A-----C----A-----A-A--A-A--T--CA----A---CT--T----CA----T--A--T---------A-------T---GT-A-TTA--T----T--T-T------------A-A--G--T--A--T----T-TT------------------TTCAA--A---A-AT---TA-T-C--AT--A----------GT-TTTACAAT-A-TAA------T----A-AATTATATCTATA-GA-CACAA-ATC---A-G---TA-A----------TCCA---A---T-C---AA----TT--G--A-T-A-T-G--CC---TGTTTTT--T--T-T--T-G-T---TTT-AT-A--------------------G-A-T-A-TCTG-AAAAGG---C-C--T-CAA-C-C--CCTTCT---C------------CC------A-GG-A-GTCAAAGACCACATTC-T--C---------------A-------------A-A-----A-AT-TC---A--C-T-TT-A---------AAT-A------T-GA-AA--T-G---GGT----AGTA-A---C--AT-C-TAA-AACC-T-GG-ATA
gi|26 : tttataatctaga-GG-TAC---------CTTTC----CCTTT--T-A-G-A--C-T-A-A------A-A----GT-G--A-AC----A-----T----A---T-CCCC-T-T---TC-ACA--G---G-T--A---AA-A---C-T---TT---------------------CC-----C----C--A--C---A-ATTG-TAG-------A--AAA---------C-T--C----AT-----A-T--A-T-G--T----ATTGTCAGG--A--GA---------A---T----TAACTCCCT--A-----C----ATAATTA-A--C-A--TTGCA--------TT--T----GAAATTT--AT-C---------AAAAATCCT---AT-A-T-A--T----T--C-T------------A-CT-A--T--A--T----TATT------------------TTCTC--T---C-AT---TA-T-C------------A-A-AGTCT-----A--A-CAAAT----C----A-AATGG-------A-GA-TAAGA-A-----A-T---TA---------------A---A---T-T---CA----TT--T--A-T-A-T-A---C---TG--TTT--
gi|13 : atG-TAC---T----ACTTTA----CTCTC--T-T-G-A----T-AAA------A-AC---A--A--A-AA----TA----T----T---T-CCCC-T-T---CC-AAA--G---G-TAAA---AA-A---A-T----C---------------------TC-----T----T--C--A---A-ATTG-TA--------G--AAA---------C-TA-T----A-----AA-ATTG-T-G--T----AT-----GT--T--AA---------T---T----T------TA--A-----C----A-----A-A--A-A--C--CA----T---TT--C----CG----T--A--T---------A-------T----T-C-T-G--T----T--C-T------------A-A----------------T-TC------------------ATTTT--C---A-AT---TA-T-T--AT--
gi|30 : gtagatagggccagggatttatcaaagttctttCTTTC----CCC----T-T-C-A--C-A-AAA------T-A----A--A--A-AA----T-----TATGAT---T-CCCC-T-T---TC-ACA--G---G-T-------A-A---A-TG--CC---------------------TCT----C----T--T--C---A-GTTG-TA--------G--AAA---------C-T--------C----TA-A--A-C-AACT-----T-----GA--A--AA---------T---C----TTCC---TT--A-----C----A-----C-A--ATA--T--T-----G---TT--T--------------------------A-------T---GA-G-T-A--T----T--CAT------------A-A--A-----A--T----C-CT------------------TTTTtgaaatctactggtttggatatagctagcaatctgtggactccccaccccaccccacccccacagcttaagactgcattctcaaaaaaaaaaatcctatcaaaaatccccttaaatactactatgaaataggtagcaacatcttaaagctggata
gi|22 : ttatcacgactcttctccactactgaaataagctaaTTTC----CCCCT--T-T-G-A--C-A-ATG------A-A----T--T--A-AT----A-----T----T---T-CCCC-G-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-C---A-T---TT---------------------CC-----C----T--T--C---A-ATTG-TA--------G--AAA---------C-TA-C----GC----AA-A--ATT-G--T----AT------G--A--GA---------A---T----T------TT--A-----G----C-----A-A--A-A--T--AA----T---TT--TTA--TA----T--A--C---------A-------T---GT-A-T-A--T----C--C-T------------A-A--GGTC--A--T----C-TT------------------CTATT--A---T-AT---TA-T-C--a
gi|38 : taatTTTT----CCCCT--T-T-A-A----T-AGA------C-A----A--G--A-AA----TGAATAT----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---GTT--A---AA-ATTGA-T---TC---------------------CC-----C----T--T--G---A-AATG-TT--------G--AAA---------G-T--C----ACT---AA-A--G-A-A--T----GT-----GG--gaagtcttccactttacccctgcctccccaccccaccctctcctttgaaagctcaatactgcattctttaaaaactccccttttaatattgaaatatgaaatggtttttgtaacatctcaatgctggat
gi|28 : CCCT--T-T-A-A--C---AAA------A-A----G--G--A-AA---------------------ACCC-T-T---CC-ACA--G---G--------AA-A---A-C---C------------------------------------------------------------------A---------C-TA-C----A--------G--A-T-A--T----AT-----GG--G--GA---------T---T----T------TA--A-----C----------A-A--A-A--T--CA----A---TT--TC---AA----T--A--T---------A-------T---GT-ATT-A--T----T----T------------ATA--G--T--A--A----T-AT------------------TTT----CAAAA-AT---TA-T-C--AT--AGTTTTA-A-ATT-T-----AT----AA------T----A-AAT---------A-gtgcacaag
gi|21 : -T-AAA------A-G----G--G--T-AC----C-----T----T---T-CCTT-T-C---CC-TCA--G---G-T--A---AA-T---G-T---AG---------------------CA-----A----C--TA-G---A-TT----------------------------C-TA-C----AC----AA-A--A-TCA--T----AT-----GG--G--AA---------T---T----T------TA--A-----C----A-----A-A--A-A--T--CA--------T--------------T--A--C--------------------------------------------------------A--G--TGAA--T----T-TA------------------TTTTC--T---T-AT---TT-T-CTTAT--A-----ATA-AGT-C------T---CAA------T-------AT---------A-G--CAAGA-ATC---A-T---TA-C----------TC---------------AA----TC--G--A-T-A-T-G--CC---TA--TTC--T--T-A--T----------------A----TC-T----------GAG-T-G-TC------------C-C--C-CAA-C-C--CCTCTC---CAAAAGCTCACGACT------G-TA-T-T--------------C-T--C---------------A-------------A-AT----A-AT-T----T--C-T-TT-A---------ATT-C------T-GA-AAT-G-G---GGC--T-AGTA-A---C--AT-C-Tttataatcttataggatttgtttagtcacattccaagcagtttattgtta
gi|20 : ttacccatcaatattttttttaaataccag-A----G--G--A-AA----A-----T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-T---GC---------------------CC-----C----A--T--G---A-ATTG-TA--------G--AAA---------T-CA-C----AC----AA-T--A-T-A--T----GT-----GG--G--GA---------T---T----T------TA--A-----T----A-----A-A--A-A--T--CA----G---TT--T----GA----T--A--C-----------------T---GT-A-T-A--T----T--C-C------------ACAATG--C--A--T----T-TTTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTTC--C---T-ATTAATA-T-C--TT--A-----A-G-TAT-T------T-A-CAA------T----ATAAT---------A-GACAAAGA-ATT---A-G---TA-A----------TC-A---A---TAA---AA----TT--G--A-TAA-T-G--CCACTTG--TTTCAT--C-A--T-G-T---GAT-AT-ACA----TCATT----A----G-A-TGG-TC-G-ACTTTT---C-CTAT-CTA-C-C--TCCACCCATC------------TT------G-GA-A-GCCCC----------C-T--C---------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--g
gi|36 : -CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---A------------------------------------------------------------------------------AA---------C-CA-C----AC----AA-G--A-G-A--T----AT-----AG--G--GA---------T---T----T------TA--A-----C----A-----A-A--A-A--T--CA----A---CT--T----CA----T--A--T---------A-------T---GT-A-
gi|25 : ggaaaa----C--T--G---A-TTTG-TA--------G--CAA---------C-CA-AGAG-AC----AA-A----T-A--T----G------GG--G--GA---------T---T----T------TTTAA-----C----A-----A-A--A-A--T--CA----C---TT--TC---GA----T--A--CG--------A-------T---GT-A-T-A--T----T--C-C------------A-A--A--T--A--T----G-TT------------------TTCCT--C---T--T---TA-T----AT--A-----A-A--GT-T-----TC-A-CA-------T--------T---------A-GA-CAAGA-ATT---A-G---TT-A-----------C-A---A---T-A---AA----TTT-G--A-T-A---G--CC---TG--TTT--TTTC----T-G-T---AAT-AT-A-A----TC-TT----TA---G-A-T-G-TT-G-A----T-----C--T-CC--T-C--CCTTCC---CA-----------CT------G-GA-A-G----------------T--C---------------A-------------G-A-----A-CT-TC---C--C-T-TA-A---------ACT-A------C--C-AA--T-G---GGT--A-GTTA-G---T--AT-C-TAA-AAGC-TGGG-ATAAcgacaattatcaaaatcatcatcatcaattatca
gi|24 : cccat--T--G---A-TTTG-TG--------A--AAC---------C-CAGC----AC----AA-A---------T----CT-----GG--G--GA---------T---T----T------TA--A-----C----A-----A-AGAA-A--TG-CA----C---TT--CTG--GA----T--A------------A-------T---GT---T-A--T----T--C-C------------A-A--A--T--A--T----T-TT------------------TC--C--C---T-AT---TA-T-TT-AT--ATC---A-A-AGT-T------C-A-CAA------T----A-TTT---------A-GA-CA-GA-ATT---A-G---TA-AA---------TC-A---A---T-A---AA----TT--G--A-T-A-A-G--CC---TG--TTT--TTTC----T-G-T---AA-------A----TC-TT----A----G-GAT-G-TC-G-A----T---C-C--TGCCT-C-C--CCTTCC---C------------CT------G-GA-AGG--------------C-T--C---------------A-------------ACA-----A-ATGTC---C--C-CGTT-A---------AAT-AC-----C-AA-AA--T-G---GGT--A-GTTA-G---T--AT-CGGAA-AAGC-T-GG-ATCAAt
gi|39 : gA------T----A-TAT---------A-GA-CAAGA-ATC---A--------------------------A---T-A---AA----TT--G--A-T-A-T-G-----------TTT--T--T-A--T-G-T---AAT-AT-A-A----TC-CA----A----G-A-T-G-TC-G-A----T---C-C--T-CCT-T-C--TCTTCC---C------------CT------G-GA-A-G--------------C-T--C---------------A-------------A-A-----A-AT-TC---C--C-C-Tgat
gi|31 : ---A---T-C---AA----TT--GC-A-T-A-T-G--CC---TA--TTT--T--C-A--A-AAT---ATT-GT-G-A----TC-TA----G----G-A-T-G----A-A----TGTAC-C--T-T-A-T-C--CCCTCC---C------------CT------G-AA-A-G--------------CTT--C---------------ATGACTGTATTGTCA-A-----A-AT-TC---C--C-C-TT-A---------AAT-A------T-AA-AT--A-G---TGT----AGTA-A---C--AT-C-TCA-A
gi|22 : -C--C-CCA-C-C--CTCTCC---T------------TT------G-AA-A-G--------------C-T--CAATACTGCATTCTTTA-------------A-A-----A-AC-TC---C--C-C-TT-TTAATATTGAAAT-A------T-GA-AAT-G-G---TTT--T-TGTA-A---C--AT-C-TCA-ATGC-T-GG-AT
gi|13 : taattttccccctttgacaatgaattaatatttccccgtccacagataaacatttcccttcaattgtagaaactacgcaaaattgtatgagaattttagcaaaataatttttatatacatgtatatcctaaggtcatcttctattatattatcgaagtcttccactttacccctgcctcccca-T--C---------------A-------------A-A-----A-AT--C---C--C-C-TT-A---------AAT-ACTACTAT-GA-AA--T-A---GGT--A--GCA-A---C--AT-C-TTA-AAGC-T-GG-ATA
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Reference ( family-1745 ) : TTATCNA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----T--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---A-NTTG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------A---AT--A-GA-NAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---AA----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--C-A--T-G-T---AAT--AT-A-A----TC-T---T-NGAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--N---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
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gi|16 : tttataatctagaTTATCAA-G-GTT-C-TGTATTTC----A---------T--A-CCTG-GTAAA-G-G---------TA-C------TTTC----CCC----T--AT-G----G-A--C-AACA------A-A-GCAA--AAA----T--T----T---T-CCCCCT-T---CC-ACA--G---G----A---TA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-----A-TTTG-T--TA--------AA-----A--------TG--CC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-AG---------TATTT----T------TT--A-----C--A-----A----AC-A-A--T--CA--G---TT------GA----TTAA--C---------A-------TG---TTA-T-A--TT-C-TA-A--G--TTA--T-----G-TT------------------TT-TCT--T---T-AT---CA-TC--G-A-----A-A-AGT-TTGCTAGCA------A--CA-----------A---GA--G-AA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---AA----TT-G--AAT-A-TG--CC---TG--TTT--T--C-A--TTG-T---GAT--AT-A-A----TC-T---T-AGAT-G--TC-G-A----T---T-C--T-CCAACAC--CCTCCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--G-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------T-TT--C---------AA-TA------T----G-A-
gi|17 : gatATCTA-G---T-C-T---TTTT----AAC-------T--A-CC-G-TAAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C---T-T----G-A--C-AAC---------A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-TCT---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A------TC-CC--------------------C-C-----T-G---A-ATTG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC-----------------A--A-C-A-T----T--T-----GA-A----------------T----T------TA--A-----C--A-----AT---A--A-A--T--CA--G---TT-T----T-----T--AACC---------A-------TG---T-A-T-A--TT-A-CA-A-------A--A-----T-TG------------------TT-TCC--A---T-AT---TA-T---ATT-----A-A-AG--TT--TA-CA------A---A-----------T---AT--A-GA-CAAGA---TA-G---TA-A-T----------C-A---A---TGA---GA----TT-G--G-GAA-TG--CC---TG--TTT--T--TAA--T-G-T---AAT--AT-A-A----TT-T---T-AGA--GCTTC-GAA----T---C-C--T-CTT-C-C--TCTT-A---C-C-T------G-G--A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----TT-TC---C--C---------C-CT--A---------AA-TA------C----G-A-AAT----G-G--T--A-G-CTA-G---T--AT-C-TAA-AAA-C-C-GG-ATAAAT
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gi|19 : TTATCTA-G-GTT-C-T---TTTT----A-------------------ATAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---A-ATTG-C--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A---A-T----A--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TC--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--G--T-G--TGAAG-T-AT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-T---ATT-----A-A-AGA-TT--TA-CA------A--TA-----------T---AT--A-GA-CAAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---AA----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--T-A--T-T-T---AAT--AT-A-A----TC-T---A-AGAT-G--TC-A-A----T---C-C--T-CCA-C-C--TCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-TAAA--A-------------A---------------A-----A----AT-CC---C--C---------C-TT--A---------AA-CA------
gi|2 : atTTATCTA-G-GTT-G-T---TTT-----A-C-------TGTA-CT-A-GGAAA-A-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----T--TA-T----G-G--A-AAAT------A-A-G--A--AAA----T--T----T---C-CCCG-T-G---CC-ACAAAG---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G---A-A-------AA--------AA-----AAAGAAAACCC--ACCCAAA-C----A---A-A--AAC-A-T----A--TT----GG-A-GAAGAGAATGTT---TA---T------TT--ATCGCGC--G-----A----A--A-A--T--CA--GCTCTT-G----GA----G--A--CTCAACCGAAA-------TG---TTA-T-A--TT-C-CG-A--A--T-A--T-----T-TC------------------TT-TCC--A---T-ATGT-CA-TC---TA-----G-C-AGT-TT--TA-CA---------TA-----------A---AT--A-GG-AAAGAGATCATG---TTTA-T----------C-A---AAGAT-A---AAAATATT-G--AAT-A--G--CC---TG--TTA--T----A--T-C-T---TAT---T-A-AACGCTA-T---A-TGAT-G--TC-G------T---C-C--T-CCA-C-CACCCTTTT---C-C-T------T-GA-A-AAGCTT---------C-T--C--A-------------A---------------ATTAGAA----ATATC---C--C---------T-TC--C---------AA-TACC----T----G-TTAATG---G-G--T--C-A-GTA-G---G--AT-C-TAA-AGG-C-T-GG-AT
gi|20 : -A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-TGC-CC--------------------C-A-----T-G---A-ATTG-T--AG--------AA-----A--------TC--AC----A-C----A---A-T--A-T-A-T----G--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----T--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C-----------------TG---T-A-T-A--TT-C-CACAATG--C-A--T-----T-TTTTTCTTTCTTTCTTTCTCTT-TTC--C---T-ATTAATA-TC--TT--------A-AGTATT--TA-CA------A--TAT----------A---AT--A-GACAAAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---TAA---AA----TT-G--A-TAA-TG--CCACTTG--TTTCAT--C-A--T-G-T---GAT--AT-ACA----TCAT---T-AGATGG--TC-G-ACTTTT---C-CTAT-CTA-C-C--TCCACCCATC-T-T------G-GA-A-GCCCC----------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--gtgaaaatcc
gi|21 : ATCAA-T-ATT-T-T---TTTT----A-AA------T--A-CC-A-GTAAAAG-GG--------TA-C---C--TTTC----C-----------------------------------------------------------T---T-TCCC-T---------CA--G---G-T--A---AA---------------------------------------------------TG-T--AG--------CA-----ACTAGATT-CT--AC----A-C----A---A-A--A-TCA-T----A--T-----GG-G-AA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA------T-------------T--A--C---------A--------G---T-------------------G--A-A--T-----T-TA------------------TT-TTC--T---T-AT---TT-TCTTATA-----ATA-AGT-CT-----CA------A--T----------------AT--A-G--CAAGA-ATCA-T---TA-C-T----------C---------------AA----TC-G--A-T-A-TG--CC---TA--TTC--T--T-A--T-----------------A----TC-T---G-AG-T-G--TC------------C-C--C-CAA-C-C--CCT--C---T-C-C------A-AA-A-G--------------C-T--C--A-------------C---------------G-----ACTGTAT-TC---T--CAAATAATTTC-TT--T---------AATTC------T----G-A-AATG---G-GGCT----A-GTA-A---C--AT-C-T
gi|22 : ttaccc--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AATG------A-A-T--T--AAT----A--T----T---T-CCCC-G-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-C---A-TTT-CC--------------------C-T-----T-C---A-ATTG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----G-C----A---A-A--ATT-G-T----A--T------G-A-GA---------A---T----T------TT--A-----G--C-----A----A--A-A--T--AA--T---TT-TTA--TA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TC-C-TA-A--GGTC-A--T-----C-TT------------------CT-ATT--A---T-AT---TA-TC----------G-A-AGT-CT--TC-CA------g
gi|22 : taat-C--C-CCA-C-C--CTCTCC---T-T-T------G-AA-A-G--------------C-T--C--A-------------ATACTGCATTCTTTAAA-----A----AC-TC---C--C---------C-TT--TTAATATTGAAA-TA------T----G-A-AATG---G-T--T--T-TTGTA-A---C--AT-C-TCA-ATG-C-T-GG-ATctttacccctgcctccccaccccaccctctcctttgaaagctcaatactgcattctttaaaaactccccttttaatattgaaatatgaaatggtttttgtaacatctcaatgctggat
gi|23 : taattttccccctttgacaatgaattaatatttccccgtccacagataaacatttcccttcaattgtagaaactacgcaaaattgtatgagaattttagcaaaataatttttatatacatgtatatcctaaggtcatcttctattatattatcgaagtcttccactttacccctgcctcccca-C-T---GTTT----G-C-------T--A-CG-G-TTAAATG-GGC-------TA-C---C--TTTC----CCC----CTATT-T----G-AG-C-AACA------A-A-G--G--GAAGAATT--T----T---T-CCCC-T-TATCTC-ACA--GCGCG-T--A---GATA---A-TCC-CCGAGGCAACACTTGCTTTCTTC-CGACTCT-G---ATTTTG-T--AGA-------AA-----A--------CC--ACGA--A-CA---A---A-A--A-T-A-G----A--TAGC--GA-A-AA---------T---T----T------TTTCAC----C--A-----A----G--A-A--T--CA--G---TT-GCGCAGT----C--A--CT--------A-------TG---T-A-T-A--TT-T-AA-A--G--T-T--A-----T-TT------------------GC-TTC--T---TAAT---TA-TC--
gi|24 : -----T-G---A-TTTG-T---G--------AA-----A--------CCCAGC----A-C----A---A-A--------T----C--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----AGAA-A--TG-CA--C---TT-CTG--GA----T--A------------A-------TG---T---T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----T-TT------------------TC---C--C---T-AT---TA-TTT-ATATC---A-A-AGT-TC---A-CA------A--TA-----------T---TT--A-GA-CA-GA-ATTA-G---TA-AAT----------C-A---A---T-A---AA----TT-G--A-T-A-AG--CC---TGTTTTT--T--C----T-G-T---A-------A-A----TC-T---TAGGAT-G--TC-G-A----T---C-C--TGCCT-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-AGG--------------C-T--C--A-------------AC--------------A-----A----ATGTC---C--C---------CGTT--A---------AA-TAC-----C----A-A-AATG---G-G--T--A-G-TTA-G---T--AT-CGGAA-AAG-C-T-GG-ATCAAtatgttagaaacgtatatattgaacacatgtattggaaatc
gi|25 : gCC-CA--------------------T-C-----T-G---A-TTTG-T--AG--------CA-----A--------CC--AAGAG-A-C----A---A-A----T-A-T----G--------GG-G-GA---------T---T----T------TTTAA-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--C---TT-TC---GA----T--A--CG--------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----G-TT------------------TT-CCT--C---T--T---TA-T---ATA-----A-A--GT-TT--CA-CA---------T-----------------T--A-GA-CAAGA-ATTA-G---TT-A------------C-A---A---T-A---AA----TTTG--A-T-A--G--CC---TG--TTT--TTTC----T-G-T---AAT--AT-A-A----TCTT---T-AGAT-G--TT-G-A----T-----C--T-CC--T-C--CCTTCC---CAC-T------G-GA-A-G----------------T--C--A-------------G---------------A-----A----CT-T----C--C---------C-TT--A---------AACTA------C------C-AATG---G-G--T--A-G-TTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-TGGG-ATAAgat
gi|26 : -GG--------TA-C---C--TTTC----CCT----T--TT-A----G-A--C-TA-A------A-A-GT-G--AAC----A--T----A---T-CCCC-T-T---TC-ACA--G---G-T--A---AA-A---C-TTT-CC--------------------C-C-----A-C---A-ATTG-T--AG--------AA-----A------------AC----T-C----AT--A-T--A-T-G-T----A--TTGTCAGG-A-GA---------A---T----TAACTCCCT--A-----C--ATAATTA----A--C-A--TTGCA------TT-T----GAAATTT--AT-C---------AAAAATCCTA---T-A-T-A--TT-C-TA-CT-A--T-A--T-----TATT------------------TT-CTC--T---C-AT---TA-TC----------A-A-AGT-CT--AA-CA------AATCA-----------A---ATGGA-GA-TAAGA-A--A-T---TA----------------A---A---T-T---CA----TT-T--A-T-A-TA---C---TG--TTT--t
gi|27 : at-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-A-GGTA------TA-C---C--GTTC----CCCTAGTC--AG-T----G-A--C-AAAA------C-ATG--G--ATA-------T----T---T-CGCC-T-T---CC-ACA--C---G-T--A---AA-A---G-TGT-CC--------------------C-T-----TAA---A-ATTG-T--AG---------------A--------CT--AC----A-C----A---AGA--G-T-A-T----
gi|28 : catgcaaagttagagccattccagggatttacatCC----C--TT-T----A-A--C-AA-A------A-A-G--G--AAA------------------ACCC-T-T---CC-ACA--G---G--------AA-A---A-CC-----------------------------------------------------------------A--------CT--AC----A------------G--A-T-A-T----A--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--------A----A--A-A--T--CA--A---TT-TC---AA----T--A--T---------A-------TG---T-ATT-A--TT---TATA--G--T-A--A-----T-AT------------------TT-T----CAAAA-AT---TA-TC--ATAGTTTTA-A-A---TT--TA-TA------A--TA-----------A---AT--A-tgtcgttagctgataggtctacacgtgattattttgaagtgtttgtacgtaaaa
gi|29 : -GTC-C-T---TTTT----A-TACTACTGT--A-CT-G-GTAAA-A-TG--------TA-T---C--TTTT----ACC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-T--G--AAT----G--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ATA--G---G-T--A---AA-A---A-GCC-TC--------------------T-T-----T-C---A-ATAG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----A-C----A---A-A--ATT-G-T----A--T------G-A-G--------------T----G------CA--A-----G--A-----A----A--A-A--T--TA--T---TT-T----TA----T--A--T---------A-------AT---T-A-T-G--TT-A-CA-T--G--T-A--A-----A-TC------------------AT-TTT--C---T-AT---AA-TC--ttataatcttataggatttgtttagtcacattccaagcagtttattgtta
gi|3 : tatggttttttTTATTTAAG-GTT-C-T---TTT-----A-C-------T--AACC-G-GTACA-A-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TA-C----GCA--C-AACA------A-A-G--G--AA-----T--T----TATAT-CACC-T-T---CCCACA--G---A-T--A---AAGA---A-TCC-CC--------------------C-CAT---T-G---A-ATTG-GCAAG--------AA-----A--------AC--AC----A-C----ACAAA-A--A-T-A-T----G--G-----GG-A-GA---------T---T----T------TC--A-----C--A-----ATTAAA--A-A--T--CA--T---TA-T----GT----T--A--CTGTACA---A-------TG---T-A-T-T--TTAC-CA-A--GA-T-A--TGGAAGT-AT------------------TTATTC--C---T-AT---TA-T---ATT-----A-A--GT-TT--TA-CA------A--AT-----------A---AT--A-TA-TGACA-ATCA-A---TA-A-TTTAGCTAATTC-AT--A---T-C---AACG--TT-GTTA-T-A-TGACTC---TG--TTT--T--T-T--T-A-TTTGGAT--ATTA-C----TC-A---G-AGAT-G--TC-A-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-A-T------G-GA-A-G--------------C-A--A--A-------------A---------------A-----AC---AT-TC---CTTC---------C-TTA-A---------AA-TAT-----T----G-ATAATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-T-GGAATAAAT
gi|30 : atTTATCAC-G-ACT-C-T---TCTCC---A-C-------T--A-CT-G-AAATA-A-GC--------TA-A---C--TTTC----CCC--------T-T----C-A--C-AAAA------T-A-A--A--AAA----T--TATGAT---T-CCCC-T-T---TC-ACA--G---G-T--A---AA-T---G-CCT-CT--------------------C-T-----T-C---A-GTTG-T--AG--------AA-----A--------CT----------C----T---A-A--A-C-A------ACTT-----GA-A-AA---------T---C----TTCC---TT--A-----C--A-----C----A--ATA--T--T---G---TT-T--------------------------A-------TG---A-G-T-A--TT-CATA-A--A----A--T-----C-CT------------------TT-TTcc
gi|31 : ---A---T-C---AA----TT-GC-A-T-A-TG--CC---TA--TTT--T--C-A--A-AAT---ATT--GT-G-A----TC-T---A-GGAT-G-----A-A----TGTAC-C--T-T-A-T-C--CCCTCC---C-C-T------G-AA-A-G--------------CTT--C--ATGACTGTATTGTCA---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TA------T------A-AATA---GTG--T----A-GTA-A---C--AT-C-TCA-Aa
gi|32 : TACTCA-G-GTT-C-T---ATTT----A-C-------T--T-CC-A-GTATA-G-GG--------TA-CA--C--TTTC----CAT----T--TCCT----G-A--C-AAAA------A-A-T--T--AAT----T--T----T---T-CTTC-T-T---TT-ACA--G---G-T--A---AC-A---A-TTT-CC--------------------C-T-----T-C---C-ATTG-T--TG--------AA-----A--------AC--AC------C----A---A-A--A-T-
gi|34 : aaggaatc---TTTT----G-C-------T--A-CG-G-GTAAA-G-G---------TA-C---T--TTTC----TCC----T--TA-A----G-A--C-AAGA------A-A-T--G--AAA----TGAT----TG--TATTCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AG-A---A-TTC-CC--------------------C-T-----T-GA--A-ATCG-T--AG--------AA-----A--------ttt
gi|35 : gggaatttattgttaaaaa--A-------------A---------------A-----A----ATATC---C--C---------A-----A---------AA-TA------T----A-T-AATG---G-G--T--T---GCA-A---C--AT-C-TAA-AAG-T-T-GA-ATAAA
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gi|37 : ggaaaa-T--C--A-------------A---------------G-----A----AT-TC---C--T---------C-TT--G---------AA-TA------T----G-ATAATG---G-A--T--A---TTG-A---T--AT-C-TAA-AAA-C-T-GG-cgacaattatcaaaatcatcatcatcaattatca
gi|38 : gtgtaatatgaaaagggttgccctaacccctctttgggagctcatgtctacatct--TTTT----CCC----C--TT-TAATAG-A--C-AAGA------A-A-T--G--AAT----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---GTT--A---AA-ATTGA-TTC-CC--------------------C-T-----T-G---A-AATG-T--TG--------AA-----AG-------TC--AC------T----A---A-A--G-A-A-T----G--T-----GG-
gi|39 : ------A--TA-----------T---AT--A-GA-CAAGA-ATCA---------------------------A---T-A---AA----TT-G--A-T-A-TG-----------TTT--T--T-A--T-G-T---AAT--AT-A-A----TC-C---A-AGAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCT-T-C--TCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-Tgtgcacaag
gi|4 : TTCTCAA-G-ACT-C-T---TTTT----A-C-------G--T-CT-A-GCAAA-A-GGGTACTTAATA-C---C--TTTC----CCC----T--TT-T----G-A--C-AAAG------A-A-T--G--A---------T----TATAT-CCCC-T-T---TT-AGA--G---C-T--A---AA-AC--A-TTC-CCATTCA---------------C-C-----T-GCACA-GTTG-T--AGAATTCTGAAA-----A--------CT--CCTAA-A-CTGGGA---A-A--A-C-T-TCCCCA--T-----GA-A-AG---------A---T----T------GT--A-----T--AT----A----A--G-A--T--TATTT---TT-T----TA----T--AT-C---------A-------CG---T-G-T-A---A-C-TA-T--G----A--T-----T-TT------------------CT-ATC--T------T---TA-TC--ATATTTC-A-A---T-TA--TG-C-------A--TG-----------T---AT--A-GA-T-----ATCA-G---TG-A-T--------------------------------TT-GTCA-T-A-TT--TA---TA--TTG--T--C-A--T-G-T---GAC--TC-A-G----T---------GAA-G-----G-A----T---TGC--T-CTA-G-A--CATCCT---T-G-T------G-GG-A-G--------------C-TCAC--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-CT--C---------AA-TA------T----GAA-AATG---A-G--T----A-GTA-A---T--ATAT-TAA-AAG-C-T-TG-
gi|40 : gat--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--CA--------C-----A---------AG-TA------T----A-A-AGTA---G-G--T--A---GTA-A---C--AT-C-TAA-ATG-C-T-AG-ATAAA
gi|41 : ttccctgttcaggagctcacacttgcatcctT-TC---C--C---------C-TT--CC--------AA-TA------TT---G-A-AATGA--G-G--T--ATA-GTA-GGGGCTAGT-C-TAA-AAA-CCT-GG-ATAAATcccctg
gi|42 : -T---TGTT----A-C-------C--A-CT-G-GTAAA-G-GG--------TA-T---C--TTTC----CCC----A--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-ccct
gi|5 : ATCAA-G-GTTTC-T---TTTA----A-C-------TT-A-CG-G-GTAAT-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TA-T----G-A--CAAACA------A-A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC---T---CC-ACA------G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------CTC-----T-G---A-TTTG-T--A---------AA-----T--------CC--AC----AGA----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GAT--------T---T----T------TT--A-----CGAA-----A----A--A-A--T--CA--GT--TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT------C---T-AT---AATTC--ATT-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--CAT----------A---AT--A-GA-AAAAC-ATCA-GT--TA-ATT----------C-A---A---T------A----TT-G--A-T-ATTG--CC---TG--TTT--T--C-ATTT-G-C---AAT--TT-A-A----TC-T---T-AATT-G--TC-G-A----T---T-T--T-CCA-C-C--CTCTCC---C-C-TTCCGTGA-GA-A-A--------------C-T-----A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--TAGA-A-TTAGG---C--AT-C-TAA-AAG-C-TGGG-ATAAAa
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gi|9 : TTATCTA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTT----CCC----C--TA-T----G-A--C-AACA------A-AGG--G--AAA----T--T----T------CCC-T-T---CT-ACG--G---G-T--A---AA-C---A-TTCAAC--------------------A-C-----T-G---A-TTTA-T--AA--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-C----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-T--------T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CAACAATTA--TA-----------A---AT--A-GA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---AA----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--C-A--T-G-T---GAT--AT-A-A----TC-T---T-AGAT-G--CC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----A-A-AAAG---G-G--T----A-GTA-G---C--AT-C-TAA-ATG-C-T-GG-ATAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1745 ) : TTATCNA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----T--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------A---AT--A-GA-NAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--N---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
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gi|10 : taaacagtgttgtaattgatcataaatctgactcaagatatgaaactcagagaattagaatattaaggaaacaatattttgttgtaggtcaggtctgtcatcaaagatATCAA-G-GTT-C-T---TTT-----A-C----------A-CC-G--TAAA-G-GT--------TAGC---C--TTTC----CCC----C--TA-T----G-A--C-AACA------A-A-G--GA-AAA----T--T----T---C-CCCC-TGT---CC-ACA--A---G-T--T---AA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G----AT-TG-T--AG--------AA-----A--------C----C----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-------CA--T---GT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-AGT-AGTTC-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT------C---T-AT---TA-TC--ATA-----A-AGAGG-TT--TA-CA------A--CA-----------G---AA--A-GA-AAAAA-TCCA-GGGTTA-A-T----------C-AT--A---T-A---G-G----AT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T---A----G-T---GA------A-ATC-A---T-T---GAT-G--TC-A-A----T---T-CATT-CCA-C-------TTC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-G--C--A-------------AT--------------A-----AT---AT-TCGGGC--C---------C-TT--C---------AA--A------TAATAA-A-AATG---GAG--T--A----TA-G---C--AT-C-TAATAAG-C-T-GG-A-AAATc
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gi|12 : aTATCAA-G-GTT-C-T---TTTT----AAC-------T--A-CC-G-GTAAG-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TA-T----G-A--C-AACA------A-G-A--A--AAA----T--T----T------CCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--T---AA-A---T-TCC-CC----------------------------T-G---ATT-TGGT--AA--------AA-----A--------AG--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------C---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--T---------A-------TG---T-A-T-A--TT---TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-CTC---------T---TA-TA--ATG-----A-A-AGT-TT--TA-CA------C--CA-----------A---AT--A-GA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-TG--AAT--ATAA-ATC-T---T-A---GCT-G--TC-G-A----T---T-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----G-A-AAAT---G-G--T----A-GTA-G---G--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
gi|13 : TTATCAA-A-GTT-C-T---TTGT----A-C-------T--A-C--------------------------------TTTA----CTC----T--CT-T----G-A--T-AAAA------A-C-A--A--AAA----TA-T----T---T-CCCC-T-T---CC-AAA--G---G-TAAA---AA-A---A-TCT-CT--------------------T-C-------A---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CT--AT----A------A---A-ATTG-T-G-T----A--T-----GT-T-AA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----A--A-A--C--CA--T---TT-C----CG----T--A--T---------A-------T----T-C-T-G--TT-C-TA-A----------------T-TC------------------AT-TTT--C---A-AT---TA-TT--ATT-----G-A-AAT-CT--c
gi|13 : gtagatagggccagggat-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT--C---C--C---------C-TT--A---------AA-TACTACTAT----G-A-AATA---G-G--T--A---GCA-A---C--AT-C-TTA-AAG-C-T-GG-ATAactggtttggatatagctagcaatctgtggactccccaccccaccccacccccacagcttaagactgcattctcaaaaaaaaaaatcctatcaaaaatccccttaaatactactatgaaataggtagcaacatcttaaagctggata
gi|14 : gtagatagggccagggatttatcaaagttctttgtactactttactctcttgataaaaacaaaaatatttccccttccaaaggtaaaaaaatctcttcaaattgtagaaactataaaattgtgtatgttaattttaacaaaaaccatttccgtatattctgttctaattcattttcaattattattgaaatctactggtttggatatagctagcaatctgtggactccccaccccaccccacccccacagcttaagactgcattctcaaaaaaaaaaatcctaATCTA-T-GTT-C-T---TTTT----G-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCA----C--TA-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---GA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G---ATT-TG-T--AA--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-G----A--T-----GG-A-AA---------T---T----T------TT--A-----CC-A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-G----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-T-TA-A--G--T-A--T-----T-TC------------------TT------C---T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------A---AT--A-GA-AAATA-ATTG-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-C---GAT--AT-T-ATC-T---T-A---CAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--A--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-CAA-AAG-C-T-AG-ATAA
gi|15 : -G-GTAAA-------------TA-C------TTTCTAATCCC----C--TT-T----A-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----A-------------CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---------------------------------------------------------------------------------CC--AC----A-C----A---A-G--A-T-A-T----A--T-----AG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--A---CT-T----CA----T--A--T---------A-------TG---T-A-TTA--TT-T-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-CAA--A---A-AT---TA-TC--ATA----------GT-TT--TA-CA------A--TATAATAAATTATATCTAT--A-GA-CACAA-ATCA-G---TA-A-T----------CCA---A---T-C---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--TT--T-T-T---GTT--TT-A---------T-A---GAT-A--TCTG-AAAAGG---C-C--T-CAA-C-C--CCTTCT---C-C-C------A-GG-A-GTCAAAGACCACATTC-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---A--C---------T-TT--A---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-A---C--AT-C-TAA-AAC-C-T-GG-ATA
gi|16 : tttataatctagaTTATCAA-G-GTT-C-TGTATTTC----A---------T--A-CCTG-GTAAA-G-G---------TA-C------TTTC----CCC----T--AT-G----G-A--C-AACA------A-A-GCAA--AAA----T--T----T---T-CCCCCT-T---CC-ACA--G---G----A---TA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-----ATT-TG-T--TA--------AA-----A--------TG--CC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-AG---------TATTT----T------TT--A-----C--A-----A----AC-A-A--T--CA--G---TT------GA----TTAA--C---------A-------TG---TTA-T-A--TT-C-TA-A--G--TTA--T-----G-TT------------------TT-TCT--T---T-AT---CA-TC--G-A-----A-A-AGT-TTGCTAGCA------A--CA-----------A---GA--G-AA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--AAT-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--TTG-T---GAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---T-C--T-CCAACAC--CCTCCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--G-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------T-TT--C---------AA-TA------T----G-A-
gi|17 : gatATCTA-G---T-C-T---TTTT----AAC-------T--A-CC-G-TAAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT------G-A--C-AACA----------G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-TCT---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A------TC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A---------------A-C-A-T----T--T-----GA-A----------------T----T------TA--A-----C--A-----AT---A--A-A--T--CA--G---TT-T----T-----T--AACC---------A-------TG---T-A-T-A--TT-A-CA-A-------A--A-----T-TG------------------TT-TCC--A---T-AT---TA-T---ATT-----A-A-AGT-TT---A-CA------A---A-----------T---AT--A-GA-CAAGA---TA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-G---AGA----TT-G--G-G-AATG--CC---TG--TTT--T--TAA-T-G-T---AAT--AT-A-ATT-T---T-A---GA--GCTTC-GAA----T---C-C--T-CTT-C-C--TCTT-A---C-C-T------G-G--A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----TT-TC---C--C---------C-CT--A---------AA-TA------C----G-A-AAT----G-G--T--A-G-CTA-G---T--AT-C-TAA-AAA-C-C-GG-ATAAAT
gi|18 : ---TTTT----A-C-------T--A-CT-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TCTC----CCC-------TT-C----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----T--T----T-----CCCC-T-T---CC-A----G---A-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-------T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A---A-T----A--T-----GG-A-AA---------T---G----T------TT--A-----A--C-----A----A--A-T--T--CA--G---TT-T----TA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----T-AT------------------G----C--T---T-AT---TA-T---ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------C---AT--A-----AAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T---A--T-G-T---AAT--CT-A-ATC-T---T-A---GAA-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCT-T-C--CCTTCC---C---T------G-TA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TA------C----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-TCGG-ATAAcc
gi|19 : TTATCTA-G-GTT-C-T---TTTT----A-------------------ATAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-C--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A---A-T----A--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TC--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--G--T-G--TGAAG-T-AT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-T---ATT-----A-A-AGA-TT--TA-CA------A--TA-----------T---AT--A-GA-CAAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--TA--T-T-T---AAT--AT-A-ATC-T---A-A---GAT-G--TC-A-A----T---C-C--T-CCA-C-C--TCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-TAAA--A-------------A---------------A-----A----AT-CC---C--C---------C-TT--A---------AA-CA------
gi|2 : atTTATCTA-G-GTT-G-T---TTT-----A-C-------TGTA-CT-A-GGAAA-A-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----T--TA-T----G-G--A-AAAT------A-A-G--A--AAA----T--T----T---C-CCCG-T-G---CC-ACAAAG---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G---AA--------AA--------AA-----AAAGAAAACCC--ACCCAAA-C----A---A-A--AAC-A-T----A--TT----GG-A-GAAGAGAATGTT---TA---T------TT--ATCGCGC--G-----A----A--A-A--T--CA--GCTCTT-G----GA----G--A--CTCAACCGAAA-------TG---TTA-T-A--TT-C-CG-A--A--T-A--T-----T-TC------------------TT-TCC--A---T-ATGT-CA-TC---TA-----G-C-AGT-TT--TA-CA---------TA-----------A---AT--A-GG-AAAGAGATCATG---TTTA-T----------C-A---AAGAT-A---A-AAATATT-G--AAT-A--G--CC---TG--TTA--T---A--T-C-T---TAT---T-A-AACGC---T-ATATGAT-G--TC-G------T---C-C--T-CCA-C-CACCCTTTT---C-C-T------T-GA-A-AAGCTT---------C-T--C--A-------------A---------------ATTAGAA----ATATC---C--C---------T-TC--C---------AA-TACC----T----G-TTAATG---G-G--T--C-A-GTA-G---G--AT-C-TAA-AGG-C-T-GG-AT
gi|20 : -A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-TGC-CC--------------------C-A-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------TC--AC----A-C----A---A-T--A-T-A-T----G--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----T--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C-----------------TG---T-A-T-A--TT-C-CACAATG--C-A--T-----T-TTTTTCTTTCTTTCTTTCTCTT-TTC--C---T-ATTAATA-TC--TT--------A-AGTATT--TA-CA------A--TAT----------A---AT--A-GACAAAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---TAA---A-A----TT-G--A-TAA-TG--CCACTTG--TTTCAT--CA--T-G-T---GAT--AT-ACATCAT---T-A---GATGG--TC-G-ACTTTT---C-CTAT-CTA-C-C--TCCACCCATC-T-T------G-GA-A-GCCCC----------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--gtgaaaatcc
gi|21 : ATCAA-T-ATT-T-T---TTTT----A-AA------T--A-CC-A-GTAAAAG-GG--------TA-C---C--TTTC----C-----------------------------------------------------------T---T-TCCC-T---------CA--G---G-T--A---AA-T---G-TAG-CA--------------------A-C-----T-A---GAT-T-------------------------------CT--AC----A-C----A---A-A--A-TCA-T----A--T-----GG-G-AA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA------T-------------T--A--C---------A--------G---T-------------------G--A-A--T-----T-TA------------------TT-TTC--T---T-AT---TT-TCTTATA-----ATA-AGT-CT-----CA------A--T----------------AT--A-G--CAAGA-ATCA-T---TA-C-T----------C---------------A-A----TC-G--A-T-A-TG--CC---TA--TTC--T--TA--T-----------------ATC-T---G-A---G-T-G--TC------------C-C--C-CAA-C-C--CCT--C---T-C-C------A-AA-A-G--------------C-T--C--A-------------C---------------G-----ACTGTAT-TC---T--CAAATAATTTC-TT--T---------AATTC------T----G-A-AATG---G-GGCT----A-GTA-A---C--AT-C-T
gi|22 : ttaccc--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AATG------A-A-T--T--AAT----A--T----T---T-CCCC-G-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-C---A-TTT-CC--------------------C-T-----T-C---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----G-C----A---A-A--ATT-G-T----A--T------G-A-GA---------A---T----T------TT--A-----G--C-----A----A--A-A--T--AA--T---TT-TTA--TA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TC-C-TA-A--GGTC-A--T-----C-TT------------------CT-ATT--A---T-AT---TA-TC----------G-A-AGT-CT--TC-CA------g
gi|22 : taat-C--C-CCA-C-C--CTCTCC---T-T-T------G-AA-A-G--------------C-T--C--A-------------ATACTGCATTCTTTAAA-----A----AC-TC---C--C---------C-TT--TTAATATTGAAA-TA------T----G-A-AATG---G-T--T--T-TTGTA-A---C--AT-C-TCA-ATG-C-T-GG-ATctttacccctgcctccccaccccaccctctcctttgaaagctcaatactgcattctttaaaaactccccttttaatattgaaatatgaaatggtttttgtaacatctcaatgctggat
gi|23 : taattttccccctttgacaatgaattaatatttccccgtccacagataaacatttcccttcaattgtagaaactacgcaaaattgtatgagaattttagcaaaataatttttatatacatgtatatcctaaggtcatcttctattatattatcgaagtcttccactttacccctgcctcccca-C-T---GTTT----G-C-------T--A-CG-G-TTAAATG-GGC-------TA-C---C--TTTC----CCC----CTATT-T----G-AG-C-AACA------A-A-G--G--GAAGAATT--T----T---T-CCCC-T-TATCTC-ACA--GCGCG-T--A---GATA---A-TCC-CCGAGGCAACACTTGCTTTCTTC-CGACTCT-G---ATTTTG-T--AGA-------AA-----A--------CC--ACGA--A-CA---A---A-A--A-T-A-G----A--TAGC--GA-A-AA---------T---T----T------TTTCAC----C--A-----A----G--A-A--T--CA--G---TT-GCGCAGT----C--A--CT--------A-------TG---T-A-T-A--TT-T-AA-A--G--T-T--A-----T-TT------------------GC-TTC--T---TAAT---TA-TC--
gi|24 : -----T-G---ATT-TG-T---G--------AA-----A--------CCCAGC----A-C----A---A-A--------T----C--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----AGAA-A--TG-CA--C---TT-CTG--GA----T--A------------A-------TG---T---T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----T-TT------------------TC---C--C---T-AT---TA-TTT-ATATC---A-A-AGT-TC---A-CA------A--TA-----------T---TT--A-GA-CA-GA-ATTA-G---TA-AAT----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-AG--CC---TGTTTTT--T--C---T-G-T---A-------A-ATC-T---T-AG--GAT-G--TC-G-A----T---C-C--TGCCT-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-AGG--------------C-T--C--A-------------AC--------------A-----A----ATGTC---C--C---------CGTT--A---------AA-TAC-----C----A-A-AATG---G-G--T--A-G-TTA-G---T--AT-CGGAA-AAG-C-T-GG-ATCAAtatgttagaaacgtatatattgaacacatgtattggaaatc
gi|25 : gCC-CA--------------------T-C-----T-G---ATT-TG-T--AG--------CA-----A--------CC--AAGAG-A-C----A---A-A----T-A-T----G--------GG-G-GA---------T---T----T------TTTAA-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--C---TT-TC---GA----T--A--CG--------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----G-TT------------------TT-CCT--C---T--T---TA-T---ATA-----A-A--GT-TT--CA-CA---------T-----------------T--A-GA-CAAGA-ATTA-G---TT-A------------C-A---A---T-A---A-A----TTTG--A-T-A--G--CC---TG--TTT--TTTC---T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---TTA---GAT-G--TT-G-A----T---C----T-CC--T-C--CCTTCC---CAC-T------G-GA-A-G----------------T--C--A-------------G---------------A-----A----CT-TC---C--C-----------TT--A---------AACTA------C----C-A-A-TG---G-G--T--A-G-TTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-TGGG-ATAAgat
gi|26 : -GG--------TA-C---C--TTTC----CCT----T--TT-A----G-A--C-TA-A------A-A-GT-G--AAC----A--T----A---T-CCCC-T-T---TC-ACA--G---G-T--A---AA-A---C-TTT-CC--------------------C-C-----A-C---AAT-TG-T--AG--------AA-----A------------AC----T-C----AT--A-T--A-T-G-T----A--TTGTCAGG-A-GA---------A---T----TAACTCCCT--A-----C--ATAATTA----A--C-A--TTGCA------TT-T----GAAATTT--AT-C---------AAAAATCCTA---T-A-T-A--TT-C-TA-CT-A--T-A--T-----TATT------------------TT-CTC--T---C-AT---TA-TC----------A-A-AGT-CT--AA-CA------AATCA-----------A---ATGGA-GA-TAAGA-A--A-T---TA----------------A---A---T-T---C-A----TT-T--A-T-A-TA---C---TG--TTT--t
gi|27 : at-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-A-GGTA------TA-C---C--GTTC----CCCTAGTC--AG-T----G-A--C-AAAA------C-ATG--G--ATA-------T----T---T-CGCC-T-T---CC-ACA--C---G-T--A---AA-A---G-TGT-CC--------------------C-T-----TAA---AAT-TG-T--AG---------------A--------CT--AC----A-C----A---AGA--G-T-A-T----
gi|28 : catgcaaagttagagccattccagggatttacatCC----C--TT-T----A-A--C-AA-A------A-A-G--G--AAA------------------ACCC-T-T---CC-ACA--G---G--------AA-A---A-CC-----------------------------------------------------------------A--------CT--AC----A------------G--A-T-A-T----A--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--------A----A--A-A--T--CA--A---TT-TC---AA----T--A--T---------A-------TG---T-ATT-A--TT---TATA--G--T-A--A-----T-AT------------------TT-T----CAAAA-AT---TA-TC--ATAGTTTTA-A-A---TT--TA-TA------A--TA-----------A---AT--A-tgtcgttagctgataggtctacacgtgattattttgaagtgtttgtacgtaaaa
gi|29 : -GTC-C-T---TTTT----A-TACTACTGT--A-CT-G-GTAAA-A-TG--------TA-T---C--TTTT----ACC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-T--G--AAT----G--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ATA--G---G-T--A---AA-A---A-GCC-TC--------------------T-T-----T-C---AAT-AG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----A-C----A---A-A--ATT-G-T----A--T------G-A-G--------------T----G------CA--A-----G--A-----A----A--A-A--T--TA--T---TT-T----TA----T--A--T---------A-------AT---T-A-T-G--TT-A-CA-T--G--T-A--A-----A-TC------------------AT-TTT--C---T-AT---AA-TC--ttataatcttataggatttgtttagtcacattccaagcagtttattgtta
gi|3 : tatggttttttTTATTTAAG-GTT-C-T---TTT-----A-C-------T--AACC-G-GTACA-A-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TA-C----GCA--C-AACA------A-A-G--G--AA-----T--T----TATAT-CACC-T-T---CCCACA--G---A-T--A---AAGA---A-TCC-CC--------------------C-CAT---T-G---AAT-TG-GCAAG--------AA-----A--------AC--AC----A-C----ACAAA-A--A-T-A-T----G--G-----GG-A-GA---------T---T----T------TC--A-----C--A-----ATTAAA--A-A--T--CA--T---TA-T----GT----T--A--CTGTACA---A-------TG---T-A-T-T--TTAC-CA-A--GA-T-A--TGGAAGT-AT------------------TTATTC--C---T-AT---TA-T---ATT-----A-A--GT-TT--TA-CA------A--AT-----------A---AT--A-TA-TGACA-ATCA-A---TA-A-TTTAGCTAATTC-AT--A---T-C---A-ACG--TT-GTTA-T-A-TGACTC---TG--TTT--T--TT--T-A-TTTGGAT--ATTA-CTC-A---G-A---GAT-G--TC-A-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-A-T------G-GA-A-G--------------C-A--A--A-------------A---------------A-----AC---AT-TC---CTTC---------C-TTA-A---------AA-TAT-----T----G-ATAATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-T-GGAATAAAT
gi|30 : atTTATCAC-G-ACT-C-T---TCTCC---A-C-------T--A-CT-G-AAATA-A-GC--------TA-A---C--TTTC----CCC--------T-T----C-A--C-AAAA------T-A-A--A--AAA----T--TATGAT---T-CCCC-T-T---TC-ACA--G---G-T--A---AA-T---G-CCT-CT--------------------C-T-----T-C---AGT-TG-T--AG--------AA-----A--------CT----------C----T---A-A--A-C-A------ACTT-----GA-A-AA---------T---C----TTCC---TT--A-----C--A-----C----A--ATA--T--T---G---TT-T--------------------------A-------TG---A-G-T-A--TT-CATA-A--A----A--T-----C-CT------------------TT-TTcc
gi|31 : ---A---T-C---A-A----TT-GC-A-T-A-TG--CC---TA--TTT--T--CA--A-AAT---ATT--GT-G-ATC-T---A-G---GAT-G-----A-A----TGTAC-C--T-T-A-T-C--CCCTCC---C-C-T------G-AA-A-G--------------CTT--C--ATGACTGTATTGTCA---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TA------T------A-AATA---GTG--T----A-GTA-A---C--AT-C-TCA-Aa
gi|32 : TACTCA-G-GTT-C-T---ATTT----A-C-------T--T-CC-A-GTATA-G-GG--------TA-CA--C--TTTC----CAT----T--TCCT----G-A--C-AAAA------A-A-T--T--AAT----T--T----T---T-CTTC-T-T---TT-ACA--G---G-T--A---AC-A---A-TTT-CC--------------------C-T-----T-C---CAT-TG-T--TG--------AA-----A--------AC--AC------C----A---A-A--A-T-
gi|34 : aaggaatc---TTTT----G-C-------T--A-CG-G-GTAAA-G-G---------TA-C---T--TTTC----TCC----T--TA-A----G-A--C-AAGA------A-A-T--G--AAA----TGAT----TG--TATTCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AG-A---A-TTC-CC--------------------C-T-----T-GA--AAT-CG-T--AG--------AA-----A--------ttt
gi|35 : gggaatttattgttaaaaa--A-------------A---------------A-----A----ATATC---C--C---------A-----A---------AA-TA------T----A-T-AATG---G-G--T--T---GCA-A---C--AT-C-TAA-AAG-T-T-GA-ATAAA
gi|36 : ctcccctcccttcaaagcttcatggatgcatttttttaaa-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---------------------------------------------------------------------------------CC--AC----A-C----A---A-G--A-G-A-T----A--T-----AG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--A---CT-T----CA----T--A--T---------A-------TG---T-A-accctgcagtgcaaata
gi|37 : ggaaaa-T--C--A-------------A---------------G-----A----AT-TC---C--T---------C-TT--G---------AA-TA------T----G-ATAATG---G-A--T--A---TTG-A---T--AT-C-TAA-AAA-C-T-GG-cgacaattatcaaaatcatcatcatcaattatca
gi|38 : gtgtaatatgaaaagggttgccctaacccctctttgggagctcatgtctacatct--TTTT----CCC----C--TT-TAATAG-A--C-AAGA------A-A-T--G--AAT----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---GTT--A---AA-ATTGA-TTC-CC--------------------C-T-----T-G---AAA-TG-T--TG--------AA-----AG-------TC--AC------T----A---A-A--G-A-A-T----G--T-----GG-
gi|39 : ------A--TA-----------T---AT--A-GA-CAAGA-ATCA---------------------------A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG-----------TTT--T--TA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-C---A-A---GAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCT-T-C--TCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-Tgtgcacaag
gi|4 : TTCTCAA-G-ACT-C-T---TTTT----A-C-------G--T-CT-A-GCAAA-A-GGGTACTTAATA-C---C--TTTC----CCC----T--TT-T----G-A--C-AAAG------A-A-T--G--A---------T----TATAT-CCCC-T-T---TT-AGA--G---C-T--A---AA-AC--A-TTC-CCATTCA---------------C-C-----T-GCACAGT-TG-T--AGAATTCTGAAA-----A--------CT--CCTAA-A-CTGGGA---A-A--A-C-T-TCCCCA--T-----GA-A-AG---------A---T----T------GT--A-----T--AT----A----A--G-A--T--TATTT---TT-T----TA----T--AT-C---------A-------CG---T-G-T-A---A-C-TA-T--G----A--T-----T-TT------------------CT-ATC--T------T---TA-TC--ATATTTC-A-A---T-TA--TG-C-------A--TG-----------T---AT--A-GA-T-----ATCA-G---TG-A-T---------------------------------TT-GTCA-T-A-TT--TA---TA--TTG--T--CA--T-G-T---GAC--TC-A-GT------------GAA-G-----G-A----T---TGC--T-CTA-G-A--CATCCT---T-G-T------G-GG-A-G--------------C-TCAC--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-CT--C---------AA-TA------T----GAA-AATG---A-G--T----A-GTA-A---T--ATAT-TAA-AAG-C-T-TG-
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gi|42 : -T---TGTT----A-C-------C--A-CT-G-GTAAA-G-GG--------TA-T---C--TTTC----CCC----A--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-ccct
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1745 ) : TTATCNA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----T--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------A---AT--A-GA-NAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--N---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
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gi|11 : TTATTGA-GTGTT-CAT---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-ATGG--------TA-C---T--TT------CCC----C--TT-A----G-A--C-AAGA------A-A-T--G--AAT----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AT-A---T-TCC-CC--------------------T-T-----T-A---AAA-TG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----A-T----A---A-A--T-T-G-T----A--T-----GG---GA---------A---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A----------------------A----T--C--C---------A-------T----T-A-T-A--TT-G-CA-A--G--T-A-----------C------------------TT-CTCAAC---G-AT---TA-TC----------A-A-AGC-CT--TC-CA------A--TA-----------T---GA--A-GACAAAAA-ATCA-G---TA-C-T----------C-A---A---T-C---A-A----TT-C--A-T-A-TG--CC---TA--TTT--T--AA--T---T---ATTTAGT-G-ATT-G---A-G---GAT-G--TC--------T---C-C--C-TC--C-C--CC--GC---C-C-T------G-GA-A-GATCTGACAACATT-C-T--C----------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TG-----------G-A-AATG---G-G--G--T-A-GTA-A---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-GTAAGTc
gi|12 : aTATCAA-G-GTT-C-T---TTTT----AAC-------T--A-CC-G-GTAAG-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TA-T----G-A--C-AACA------A-G-A--A--AAA----T--T----T------CCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--T---AA-A---T-TCC-CC----------------------------T-G---ATT-TGGT--AA--------AA-----A--------AG--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------C---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--T---------A-------TG---T-A-T-A--TT---TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-CTC---------T---TA-TA--ATG-----A-A-AGT-TT--TA-CA------C--CA-----------A---AT--A-GA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-TG--AAT--ATAA-ATC-T---T-A---GCT-G--TC-G-A----T---T-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----G-A-AAAT---G-G--T----A-GTA-G---G--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
gi|13 : TTATCAA-A-GTT-C-T---TTGT----A-C-------T--A-C--------------------------------TTTA----CTC----T--CT-T----G-A--T-AAAA------A-C-A--A--AAA----TA-T----T---T-CCCC-T-T---CC-AAA--G---G-TAAA---AA-A---A-TCT-CT--------------------T-C-------A---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CT--AT----A------A---A-ATTG-T-G-T----A--T-----GT-T-AA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----A--A-A--C--CA--T---TT-C----CG----T--A--T---------A-------T----T-C-T-G--TT-C-TA-A----------------T-TC------------------AT-TTT--C---A-AT---TA-TT--ATT-----G-A-AAT-CT--c
gi|13 : gtagatagggccagggat-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT--C---C--C---------C-TT--A---------AA-TACTACTAT----G-A-AATA---G-G--T--A---GCA-A---C--AT-C-TTA-AAG-C-T-GG-ATAactggtttggatatagctagcaatctgtggactccccaccccaccccacccccacagcttaagactgcattctcaaaaaaaaaaatcctatcaaaaatccccttaaatactactatgaaataggtagcaacatcttaaagctggata
gi|14 : gtagatagggccagggatttatcaaagttctttgtactactttactctcttgataaaaacaaaaatatttccccttccaaaggtaaaaaaatctcttcaaattgtagaaactataaaattgtgtatgttaattttaacaaaaaccatttccgtatattctgttctaattcattttcaattattattgaaatctactggtttggatatagctagcaatctgtggactccccaccccaccccacccccacagcttaagactgcattctcaaaaaaaaaaatcctaATCTA-T-GTT-C-T---TTTT----G-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCA----C--TA-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---GA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G---ATT-TG-T--AA--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-G----A--T-----GG-A-AA---------T---T----T------TT--A-----CC-A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-G----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-T-TA-A--G--T-A--T-----T-TC------------------TT------C---T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------A---AT--A-GA-AAATA-ATTG-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-C---GAT--AT-T-ATC-T---T-A---CAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--A--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-CAA-AAG-C-T-AG-ATAA
gi|15 : -G-GTAAA-------------TA-C------TTTCTAATCCC----C--TT-T----A-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----A-------------CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---------------------------------------------------------------------------------CC--AC----A-C----A---A-G--A-T-A-T----A--T-----AG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--A---CT-T----CA----T--A--T---------A-------TG---T-A-TTA--TT-T-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-CAA--A---A-AT---TA-TC--ATA----------GT-TT--TA-CA------A--TATAATAAATTATATCTAT--A-GA-CACAA-ATCA-G---TA-A-T----------CCA---A---T-C---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--TT--T-T-T---GTT--TT-A---------T-A---GAT-A--TCTG-AAAAGG---C-C--T-CAA-C-C--CCTTCT---C-C-C------A-GG-A-GTCAAAGACCACATTC-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---A--C---------T-TT--A---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-A---C--AT-C-TAA-AAC-C-T-GG-ATA
gi|16 : tttataatctagaTTATCAA-G-GTT-C-TGTATTTC----A---------T--A-CCTG-GTAAA-G-G---------TA-C------TTTC----CCC----T--AT-G----G-A--C-AACA------A-A-GCAA--AAA----T--T----T---T-CCCCCT-T---CC-ACA--G---G----A---TA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-----ATT-TG-T--TA--------AA-----A--------TG--CC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-AG---------TATTT----T------TT--A-----C--A-----A----AC-A-A--T--CA--G---TT------GA----TTAA--C---------A-------TG---TTA-T-A--TT-C-TA-A--G--TTA--T-----G-TT------------------TT-TCT--T---T-AT---CA-TC--G-A-----A-A-AGT-TTGCTAGCA------A--CA-----------A---GA--G-AA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--AAT-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--TTG-T---GAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---T-C--T-CCAACAC--CCTCCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--G-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------T-TT--C---------AA-TA------T----G-A-
gi|17 : gatATCTA-G---T-C-T---TTTT----AAC-------T--A-CC-G-TAAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT------G-A--C-AACA----------G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-TCT---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A------TC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A---------------A-C-A-T----T--T-----GA-A----------------T----T------TA--A-----C--A-----AT---A--A-A--T--CA--G---TT-T----T-----T--AACC---------A-------TG---T-A-T-A--TT-A-CA-A-------A--A-----T-TG------------------TT-TCC--A---T-AT---TA-T---ATT-----A-A-AGT-TT---A-CA------A---A-----------T---AT--A-GA-CAAGA---TA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-G---AGA----TT-G--G-G-AATG--CC---TG--TTT--T--TAA-T-G-T---AAT--AT-A-ATT-T---T-A---GA--GCTTC-GAA----T---C-C--T-CTT-C-C--TCTT-A---C-C-T------G-G--A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----TT-TC---C--C---------C-CT--A---------AA-TA------C----G-A-AAT----G-G--T--A-G-CTA-G---T--AT-C-TAA-AAA-C-C-GG-ATAAAT
gi|18 : ---TTTT----A-C-------T--A-CT-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TCTC----CCC-------TT-C----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----T--T----T-----CCCC-T-T---CC-A----G---A-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-------T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A---A-T----A--T-----GG-A-AA---------T---G----T------TT--A-----A--C-----A----A--A-T--T--CA--G---TT-T----TA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----T-AT------------------G----C--T---T-AT---TA-T---ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------C---AT--A-----AAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T---A--T-G-T---AAT--CT-A-ATC-T---T-A---GAA-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCT-T-C--CCTTCC---C---T------G-TA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TA------C----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-TCGG-ATAAcc
gi|19 : TTATCTA-G-GTT-C-T---TTTT----A-------------------ATAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-C--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A---A-T----A--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TC--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--G--T-G--TGAAG-T-AT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-T---ATT-----A-A-AGA-TT--TA-CA------A--TA-----------T---AT--A-GA-CAAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--TA--T-T-T---AAT--AT-A-ATC-T---A-A---GAT-G--TC-A-A----T---C-C--T-CCA-C-C--TCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-TAAA--A-------------A---------------A-----A----AT-CC---C--C---------C-TT--A---------AA-CA------
gi|2 : atTTATCTA-G-GTT-G-T---TTT-----A-C-------TGTA-CT-A-GGAAA-A-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----T--TA-T----G-G--A-AAAT------A-A-G--A--AAA----T--T----T---C-CCCG-T-G---CC-ACAAAG---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G---AA--------AA--------AA-----AAAGAAAACCC--ACCCAAA-C----A---A-A--AAC-A-T----A--TT----GG-A-GAAGAGAATGTT---TA---T------TT--ATCGCGC--G-----A----A--A-A--T--CA--GCTCTT-G----GA----G--A--CTCAACCGAAA-------TG---TTA-T-A--TT-C-CG-A--A--T-A--T-----T-TC------------------TT-TCC--A---T-ATGT-CA-TC---TA-----G-C-AGT-TT--TA-CA---------TA-----------A---AT--A-GG-AAAGAGATCATG---TTTA-T----------C-A---AAGAT-A---A-AAATATT-G--AAT-A--G--CC---TG--TTA--T---A--T-C-T---TAT---T-A-AACGC---T-ATATGAT-G--TC-G------T---C-C--T-CCA-C-CACCCTTTT---C-C-T------T-GA-A-AAGCTT---------C-T--C--A-------------A---------------ATTAGAA----ATATC---C--C---------T-TC--C---------AA-TACC----T----G-TTAATG---G-G--T--C-A-GTA-G---G--AT-C-TAA-AGG-C-T-GG-AT
gi|20 : -A-G--G--AAA----A--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-TGC-CC--------------------C-A-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------TC--AC----A-C----A---A-T--A-T-A-T----G--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----T--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C-----------------TG---T-A-T-A--TT-C-CACAATG--C-A--T-----T-TTTTTCTTTCTTTCTTTCTCTT-TTC--C---T-ATTAATA-TC--TT--------A-AGTATT--TA-CA------A--TAT----------A---AT--A-GACAAAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---TAA---A-A----TT-G--A-TAA-TG--CCACTTG--TTTCAT--CA--T-G-T---GAT--AT-ACATCAT---T-A---GATGG--TC-G-ACTTTT---C-CTAT-CTA-C-C--TCCACCCATC-T-T------G-GA-A-GCCCC----------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--gtgaaaatcc
gi|21 : ATCAA-T-ATT-T-T---TTTT----A-AA------T--A-CC-A-GTAAAAG-GG--------TA-C---C--TTTC----C-----------------------------------------------------------T---T-TCCC-T---------CA--G---G-T--A---AA-T---G-TAG-CA--------------------A-C-----T-A---GAT-T-------------------------------CT--AC----A-C----A---A-A--A-TCA-T----A--T-----GG-G-AA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA------T-------------T--A--C---------A--------G---T-------------------G--A-A--T-----T-TA------------------TT-TTC--T---T-AT---TT-TCTTATA-----ATA-AGT-CT-----CA------A--T----------------AT--A-G--CAAGA-ATCA-T---TA-C-T----------C---------------A-A----TC-G--A-T-A-TG--CC---TA--TTC--T--TA--T-----------------ATC-T---G-A---G-T-G--TC------------C-C--C-CAA-C-C--CCT--C---T-C-C------A-AA-A-G--------------C-T--C--A-------------C---------------G-----ACTGTAT-TC---T--CAAATAATTTC-TT--T---------AATTC------T----G-A-AATG---G-GGCT----A-GTA-A---C--AT-C-T
gi|22 : ttaccc--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AATG------A-A-T--T--AAT----A--T----T---T-CCCC-G-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-C---A-TTT-CC--------------------C-T-----T-C---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----G-C----A---A-A--ATT-G-T----A--T------G-A-GA---------A---T----T------TT--A-----G--C-----A----A--A-A--T--AA--T---TT-TTA--TA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TC-C-TA-A--GGTC-A--T-----C-TT------------------CT-ATT--A---T-AT---TA-TC----------G-A-AGT-CT--TC-CA------g
gi|22 : taat-C--C-CCA-C-C--CTCTCC---T-T-T------G-AA-A-G--------------C-T--C--A-------------ATACTGCATTCTTTAAA-----A----AC-TC---C--C---------C-TT--TTAATATTGAAA-TA------T----G-A-AATG---G-T--T--T-TTGTA-A---C--AT-C-TCA-ATG-C-T-GG-ATctttacccctgcctccccaccccaccctctcctttgaaagctcaatactgcattctttaaaaactccccttttaatattgaaatatgaaatggtttttgtaacatctcaatgctggat
gi|23 : taattttccccctttgacaatgaattaatatttccccgtccacagataaacatttcccttcaattgtagaaactacgcaaaattgtatgagaattttagcaaaataatttttatatacatgtatatcctaaggtcatcttctattatattatcgaagtcttccactttacccctgcctcccca-C-T---GTTT----G-C-------T--A-CG-G-TTAAATG-GGC-------TA-C---C--TTTC----CCC----CTATT-T----G-AG-C-AACA------A-A-G--G--GAAGAATT--T----T---T-CCCC-T-TATCTC-ACA--GCGCG-T--A---GATA---A-TCC-CCGAGGCAACACTTGCTTTCTTC-CGACTCT-G---ATTTTG-T--AGA-------AA-----A--------CC--ACGA--A-CA---A---A-A--A-T-A-G----A--TAGC--GA-A-AA---------T---T----T------TTTCAC----C--A-----A----G--A-A--T--CA--G---TT-GCGCAGT----C--A--CT--------A-------TG---T-A-T-A--TT-T-AA-A--G--T-T--A-----T-TT------------------GC-TTC--T---TAAT---TA-TC--
gi|24 : -----T-G---ATT-TG-T---G--------AA-----A--------CCCAGC----A-C----A---A-A--------T----C--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--A-----A----AGAA-A--TG-CA--C---TT-CTG--GA----T--A------------A-------TG---T---T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----T-TT------------------TC---C--C---T-AT---TA-TTT-ATATC---A-A-AGT-TC---A-CA------A--TA-----------T---TT--A-GA-CA-GA-ATTA-G---TA-AAT----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-AG--CC---TGTTTTT--T--C---T-G-T---A-------A-ATC-T---T-AG--GAT-G--TC-G-A----T---C-C--TGCCT-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-AGG--------------C-T--C--A-------------AC--------------A-----A----ATGTC---C--C---------CGTT--A---------AA-TAC-----C----A-A-AATG---G-G--T--A-G-TTA-G---T--AT-CGGAA-AAG-C-T-GG-ATCAAtatgttagaaacgtatatattgaacacatgtattggaaatc
gi|25 : gCC-CA--------------------T-C-----T-G---ATT-TG-T--AG--------CA-----A--------CC--AAGAG-A-C----A---A-A----T-A-T----G--------GG-G-GA---------T---T----T------TTTAA-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--C---TT-TC---GA----T--A--CG--------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----G-TT------------------TT-CCT--C---T--T---TA-T---ATA-----A-A--GT-TT--CA-CA---------T-----------------T--A-GA-CAAGA-ATTA-G---TT-A------------C-A---A---T-A---A-A----TTTG--A-T-A--G--CC---TG--TTT--TTTC---T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---TTA---GAT-G--TT-G-A----T---C----T-CC--T-C--CCTTCC---CAC-T------G-GA-A-G----------------T--C--A-------------G---------------A-----A----CT-TC---C--C-----------TT--A---------AACTA------C----C-A-A-TG---G-G--T--A-G-TTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-TGGG-ATAAgat
gi|26 : -GG--------TA-C---C--TTTC----CCT----T--TT-A----G-A--C-TA-A------A-A-GT-G--AAC----A--T----A---T-CCCC-T-T---TC-ACA--G---G-T--A---AA-A---C-TTT-CC--------------------C-C-----A-C---AAT-TG-T--AG--------AA-----A------------AC----T-C----AT--A-T--A-T-G-T----A--TTGTCAGG-A-GA---------A---T----TAACTCCCT--A-----C--ATAATTA----A--C-A--TTGCA------TT-T----GAAATTT--AT-C---------AAAAATCCTA---T-A-T-A--TT-C-TA-CT-A--T-A--T-----TATT------------------TT-CTC--T---C-AT---TA-TC----------A-A-AGT-CT--AA-CA------AATCA-----------A---ATGGA-GA-TAAGA-A--A-T---TA----------------A---A---T-T---C-A----TT-T--A-T-A-TA---C---TG--TTT--t
gi|27 : at-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-A-GGTA------TA-C---C--GTTC----CCCTAGTC--AG-T----G-A--C-AAAA------C-ATG--G--ATA-------T----T---T-CGCC-T-T---CC-ACA--C---G-T--A---AA-A---G-TGT-CC--------------------C-T-----TAA---AAT-TG-T--AG---------------A--------CT--AC----A-C----A---AGA--G-T-A-T----
gi|28 : catgcaaagttagagccattccagggatttacatCC----C--TT-T----A-A--C-AA-A------A-A-G--G--AAA------------------ACCC-T-T---CC-ACA--G---G--------AA-A---A-CC-----------------------------------------------------------------A--------CT--AC----A------------G--A-T-A-T----A--T-----GG-G-GA---------T---T----T------TA--A-----C--------A----A--A-A--T--CA--A---TT-TC---AA----T--A--T---------A-------TG---T-ATT-A--TT---TATA--G--T-A--A-----T-AT------------------TT-T----CAAAA-AT---TA-TC--ATAGTTTTA-A-A---TT--TA-TA------A--TA-----------A---AT--A-tgtcgttagctgataggtctacacgtgattattttgaagtgtttgtacgtaaaa
gi|29 : -GTC-C-T---TTTT----A-TACTACTGT--A-CT-G-GTAAA-A-TG--------TA-T---C--TTTT----ACC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-T--G--AAT----G--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ATA--G---G-T--A---AA-A---A-GCC-TC--------------------T-T-----T-C---AAT-AG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----A-C----A---A-A--ATT-G-T----A--T------G-A-G--------------T----G------CA--A-----G--A-----A----A--A-A--T--TA--T---TT-T----TA----T--A--T---------A-------AT---T-A-T-G--TT-A-CA-T--G--T-A--A-----A-TC------------------AT-TTT--C---T-AT---AA-TC--ttataatcttataggatttgtttagtcacattccaagcagtttattgtta
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gi|6 : TATCTA-G-GTT-C-T---TTTTT---A-C-------T--A-CC-GCGTAAA-G-GC--------TA-C---C--TTTC----CC--------TT-T----G-AGGC-AACA------A-A-G--GCTAAA----TAAT----T---T-CCC--T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---AATCC-CC--------------------T-C-----T-G---ATT-TG-A--AC--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-AGT----A--T-----GG---TA---------T---T----T------TACAA-----C--A-----A----A--A-A--TA-CA--G---TTGT----GA----T--A--C---------A-------TGATAT-A-T-A--TG-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT--------------------------C---T-AT---AA-CT--AAA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------A---AT--AAGA-AAAGA-ATCG-G---TA-A-G----------C-C---A---T-ATAGA-A----TT-G--A-T-A-AG--CC---TG--TTT--T--TA--T-G-T---AAT--AT-A-ATCATTAAT-A---GAT-G---C-G-A----T---C-C--T--CA---C--CCTTCC---C-C-T------GAGA-A-G--------------C-T--TCGA-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------A----G-A-AATA---G-G--T----A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAATatcc
gi|7 : -G-GTT-C-T---TTTTTTACA-C-------T--A-CCTG-GTAA--G-GG--------TA-C---CATTTTCT---CCC----C--TT-T----G-A--C-AACACTAAATA-G-G--G--GAG----T--T----T---T-CGCT-C-T---CC-ACG--G---A-T--A---AA-A---A-GTC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------TAGAGATA--------CC--AC----A-A----A---A-A--A-T-G-G----G--------GG-ATGA---------T---TGTAGT------TG--A-----C--A-----A----A--A-AAAT--CA--G---TT-TT---GA----T--A--C---------A-------TG---TTA-T-A--TT-CATA-A--G--T-AGATAG---T-AT------------------TT-TTC--C-------------------------A-A-ATT-AT--TA------------------------------T--A-TA-TAAG-------G---TT-A-T------------G---A---T-A---A-C----TC-C------------CC---TG--CCT--C--CT--T-A-TTG-AATT-AT-A-ACT-T---A-A---GAT-GGGTC-G-ACC--T---C-C--T-CC----C--CCTTCC---C-C-T------G-GATA-G--------------T-T--AG-A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TA------C----G-A-TATGACCA-G--T--A-A--TA-GA--T--AT-C-TAA-AAG-C-G-GG-
gi|8 : TTATCTA-G-CTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-CGTCC--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-TACA------A-A-G--G--AAA----T--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-TC--------------------C-C-----T-G---ATT-TG-T--AA--------AA-----A--------CT--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TA---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TA--TA-CA------A--TA-----------A---AT--A-GA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---T-C---GGT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AG-TA------T----G-A-AAGG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--GT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAATgatc
gi|9 : TTATCTA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTT----CCC----C--TA-T----G-A--C-AACA------A-AGG--G--AAA----T--T----T------CCC-T-T---CT-ACG--G---G-T--A---AA-C---A-TTCAAC--------------------A-C-----T-G---ATT-TA-T--AA--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-C----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-T--------T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CAACAATTA--TA-----------A---AT--A-GA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---GAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--CC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----A-A-AAAG---G-G--T----A-GTA-G---C--AT-C-TAA-ATG-C-T-GG-ATAA
blockSeqs : A A T T A GTA TTAC A ACTACTG GT A T C A T GTACTTAA G GTC AT TAAT TAGTC C AATA C GG A C CTAAAT . GCA CT AGAATT ATGA ATA A C G ATC C AA CGC T AA . T TTGA A GAGGCAACACTTGCTTTCTTCCGACTC GCAC A T G CA AATTCTGA GAGAT AAGAAAAC CA CCAA G TGGG CAA G TT A C G CCCC CT TGTCA AT AGAGAATGT ATT GTAG AACTCC TTC TCGCG GA TAATT TTAA GA T AA TG GCTC G GAGACTCAACCGAA AAAATCC ATA AG T GT A A C ATG T GA GGAAG A TTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTTCCT TAA T CATAGTTTT T G A GC G ATATAATAAATTATATCT GG A CA G T GGT T A TTAGCTAATTCAT AGA ATAG G AATA T TT A A A AC ACT TT CA CATT TG TTG TAG A C ATTAAT TAT G CT T A AAAG GTA G AT G AA A AC CAT A . TCCGTG A T G CTCAATACTGCATTCTTTAA TTAGA CTGT A GGG TT AAATAATTT G TTAATATTGA T CTACTAT A T ACC A GC AGAA G GGG TA A G T . C C A
blockSeqs : G . . . . . C A A T . T . T . TA . A . T CTA . . . G . G . . GT A ATGA . ATA . . C . . . . . . . G CA . ATTCACC AA A . . . A . G . GAG . A T . . T . . . . AGC A T . A TCC TTA C C T T C . . G TTT . GTTACTGTACA . . TA . . . A T GGT . . GAAG . TTCTCAACG GT . CATATTTC . . . . . ACAATTATAA . . CA . . T . T CAT . AA . CG . TC A . T . . . . TAA AA TG TA T . GCT G . GG . . CTTT . . TA . A . . . . . . . . . TCAAAGACCACATTCTCAA . T G . . A . AA C TAATA . T A T . TTT . A . . . . . . G .
blockSeqs : A . . . . . T . . . . . . . . C . . . . C . . . . . C . . TG . ATAA . G . . . . . . . . . . . AA . CCAT GA T . . . . . . . TAA . . . . . T . . . . T A . . . . ACA . . . . . . . A GT . CGCAGTCACT . . TA . . . . . TA . . AG . GCTTCTTA . . TTATATC . . . . . AATCAA . . A . . . . . CCA . A . . . C . . . . . . . TTC G G A . . ATT . . . . . CC . . . . A . . . . . . . . . CTTCATGACTGTATTGTCA . C A . . . . CC . CCT . T . . . ATA . . . . . . . . G .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . GG . ATA . . . . . . . . . . . . . A . CTC G A . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . T . GAAATTTATC . . AT . . . . . GA . . . . TTTCAAAA . . CTTATA . . . . . ATATA . . A . . . . . CA . C . . . . . . . . . . . AA G . A . . TTT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . ATCTGACAACATTCTCA . . . . . . . C . CC . . . . . TA . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . G . AT . . . . . . . . . . . . . T . TC A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . G . GATTAAC . . TA . . . . . G . . . . TTATTCCT . . CATA . . . . . ACATA . . A . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . CA G . T . . AT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . AGCTTCTCAA . . . . . . . A . TT . . . . . AG . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . T . TA . . . . . . . . . . . . . T . TT G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . T . TATATAC . . A . . . . . G . . . . ATTTTCA . . AATG . . . . . ACAG . . C . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . CA T . A . . GA . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . CCCCCTCAA . . . . . . . C . TT . . . . . CA . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . A . AT . . . . . . . . . . . . . A . TC A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . G . CGATACG . . A . . . . . G . . . . TTCAAAA . . TATT . . . . . ATAT . . A . . . . . CA . C . . . . . . . . . . . TT G . A . . TT . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . CTAAAAA . . . . . . . A . T . . . . . AG . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . A . AA . . . . . . . . . . . . . A . TC G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . A . TTAACC . . C . . . . . G . . . . TTTCTTT . . CATA . . . . . CCAA . . C . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . CA G . C . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTCACAA . . . . . . . C . T . . . . . AG . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . G . AA . . . . . . . . . . . . . A . TC G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . G . TGGATA . . A . . . . . G . . . . TTTCCAT . . CATA . . . . . ATAA . . C . . . . . CA . G . . . . . . . . . . . TA T . A . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTTCGAA . . . . . . . A . T . . . . . AA . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . G . AT . . . . . . . . . . . . . A . CC G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . G . CAATAT . . A . . . . . G . . . . TTTTCCT . . CATT . . . . . ACAA . . A . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . CA C . A . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CGCAAT . . . . . . . C . T . . . . . AA . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . G . AA . . . . . . . . . . . . . A . CC G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . G . TATATC . . A . . . . . A . . . . TTTCCAT . . TAAA . . . . . ATAC . . C . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . TA G . A . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTCAAC . . . . . . . A . C . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . G . AT . . . . . . . . . . . . . A . TC G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . G . TGATAC . . A . . . . . G . . . . TTTTCTT . . CATA . . . . . ATAT . . C . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . TT G . A . . TA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . TTAGAA . . . . . . . A . C . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . G . AA . . . . . . . . . . . . . A . CA G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . G . GATAC . . A . . . . . A . . . . CTATTAT . . CATA . . . . . ATAT . . C . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . CA G . G . . TG . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . CTCAA . . . . . . . A . T . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . G . AT . . . . . . . . . . . . . G . AC A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . T . GATAT . . A . . . . . G . . . . TTCCTCT . . CGA . . . . . ATAA . . T . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . TA A . A . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTAAA . . . . . . . C . T . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . G . AA . . . . . . . . . . . . . A . CT C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . G . CGTAT . . A . . . . . G . . . . TTCTCTC . . ATT . . . . . AATA . . T . . . . . CA . T . . . . . . . . . . . CA G . T . . AG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTCGA . . . . . . . T . C . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . T . TA . . . . . . . . . . . . . A . TC G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . C . GATAC . . A . . . . . A . . . . ATTTTCT . . ATA . . . . . ATAT . . C . . . . . CC . C . . . . . . . . . . . TA G . T . . TA . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . CTCAA . . . . . . . A . T . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . G . CA . . . . . . . . . . . . . C . CC G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . C . CATAT . . A . . . . . A . . . . TTTTCCT . . ATT . . . . . ATGT . . T . . . . . CA . C . . . . . . . . . . . CT G . A . . CA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTCAA . . . . . . . A . T . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . G . TG . . . . . . . . . . . . . G . CT G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . A . TATAC . . A . . . . . G . . . . CTATCT . . CTA . . . . . ATAA . . A . . . . . CA . A . . . . . . . . . . . CA G . A . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTCAC . . . . . . . A . T . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . T . AT . . . . . . . . . . . . . A . TT C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . T . GATAC . . A . . . . . G . . . . TTTTCC . . CTT . . . . . ATAA . . A . . . . . C . A . . . . . . . . . . . CA A . A . . TA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CAAAA . . . . . . . A . T . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . G . . G . TT . . . . . . . . . . . . . A . CT C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . T . GATAC . . A . . . . . A . . . . TTCTC . . ATA . . . . . AAT . . T . . . . . A . A . . . . . . . . . . . A G . . . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTCAA . . . . . . . G . T . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . A . TA . . . . . . . . . . . . . A . CT G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . G . TATAT . . G . . . . . G . . . . TCCCT . . ATT . . . . . TAA . . A . . . . . G . A . . . . . . . . . . . A G . . . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CTCAA . . . . . . . C . T . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . . T . AA . . . . . . . . . . . . . G . CT C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . CATAT . . A . . . . . G . . . . TTCT . . C . . . . . AT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTCAA . . . . . . . A . A . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . T . GT . . . . . . . . . . . . . A . CT C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . G . GATAC . . G . . . . . G . . . . TTCT . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCAG . . . . . . . C . C . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . T . AT . . . . . . . . . . . . . A . TC G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . G . GATAC . . A . . . . . G . . . . GCTT . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTAA . . . . . . . C . T . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . T . AT . . . . . . . . . . . . . A . CC G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . G . GATAC . . A . . . . . G . . . . TTCT . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . C . . G . A . . . . . . . . . . . . . A . CC G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . G . GATAC . . A . . . . . G . . . . TTTT . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . G . A . . . . . . . . . . . . . A . AC G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . . . . . ATCC . . A . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . A . C G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . TAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : G*** AN****** *** *** A** GATAC********************* A** G**** TTTTCCT************************* ATAN********************** CA************** CA**** ********* N***********
originalCons : TTATCNA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-A-G--G--AAA----T--T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-----------A---AT--A-GA-NAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--N---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
finalCons : TTATCNA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--TT-T----G-A--C-AACA------A-AG---G--AAAN------T----T---T-CCCC-T-T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GGA--GA---------T---T----T------TT--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-TGATAC---------------------A-------TG---TA--T-A--TT-C-TA-AG----T-A--T-----T-TTTTTTCCT-------------------------AT---TA-TC--ATA-----A-A-AGT-TT--TA-CAATAN----------------------AT--A-GA-NAAGA-ATCA-G---TA-A-TCA--------------A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--TCA----T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TTN-----------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): AAGCAGTATTGTTATTTATATATTGTTTAAAAAATGAAAAGAAACTTTATTGTTGGACCTTACCAATTAGTTTCGTTCATTTGAGGTCAGATAATAGCAAAAACTTAGGTGGTTGCAAGGA
Unaligned ( gi|43 ): ATGCAAAAATAAATAGAATACAGTTCGCAGGG
Alignments
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consensus : TTATCNA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--T-T-T----G-A--C-AACA------AAG--GA-AA----A--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------T--T--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-TC--ATA----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-NA--------------T--AGA-NAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--N---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
Reference ( family-1745 ) : TTATCNA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--T-T-T----G-A--C-AACA------AAG--GA-AA----N--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------T--T--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-TC--ATA----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-NA--------------T--AGA-NAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--N---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
gi|1 : TTATCGA-G-GTT-C-T---TTCA----A-C-------A--A-CC-T-GTAAA-G-GG--------TA-T---C--TTTC----ACC----C--T-T-T----G-A--C-AAC-------------A-AC----A--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACT--GT--G-C--ACAGAA-A---A-TTG-TC--------------------A-T-----T-C---AAT-TG-T--AG---------A-----A--------CT--AC----A-C----A---ACA--A-T---T----A--T-----AGTA-CA---------A---T----T------C--T--A-----A--A-----A----G--A-A--T--AA--A---TT-T----------------T---------A-------TG---T---T-A---C-C-TC-A--GCCT-A--T-----T-TTCTATTA------------TT-ATC--C-----AT---TA-TT--ATC----A-C-AGT-CT--TG-AA------A--T---A--------------T--AGA-T---C-TTTA-G---TA-A-T----------C-AGTCA---T-A---A-A----TC-G--A-T-------TC---TA--TAT------A--G-G-C---AAA--GT-A-ATC-C---T-A---A---------G-A-----------------A-C-T--CCCTCT---C-TAT------G-AA-A-G---------------------------------------------------------------AT-TG---C--CACTAG----C-CTAAT---------AA-TG------T----G-A-ATTG---G-G--T----A-GCA-A---C--CT-C-CAA-AAGCC-T-GG-
gi|10 : taaacagtgttgtaattgatcataaatctgactcaagatatgaaactcagagaattagaatattaaggaaacaatattttgttgtaggtcaggtctgtcatcaaagatATCAA-G-GTT-C-T---TTT-----A-C----------A-CC-G--TAAA-G-GT--------TAGC---C--TTTC----CCC----C--T-A-T----G-A--C-AACA------AAG--GA-AA----A--T----T---T-CCCC-CTGT---CC-ACA--A---G-T--T---AA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G----AT-TG-T--AG--------AA-----A--------C----C----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------T--T--A-----C--A-----A----A--A-------CA--T---GT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-AGT-AGTTC-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT------C---T-AT---TA-TC--ATA----A-AGAGG-TT--TA-CA------A--CA-GA--------------A--AGA-AAAAA-TCCA-GGGTTA-A-T----------C-AT--A---T-A---G-G----AT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T---A----G-T---GA------A-ATC-A---T-T---GAT-G--TC-A-A----T---T-CATT-CCA-C-------TTC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-G--C--A-------------AT--------------A-----AT---AT-TCGGGC--C---------C-TT--C---------AA--A------TAATAA-A-AATG---GAG--T--A----TA-G---C--AT-C-TAATAAG-C-T-GG-A-AAATc
gi|11 : TTATTGA-GTGTT-CAT---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-ATGG--------TA-C---T--TT------CCC----C--T-T-A----G-A--C-AAGA------AAT--GA-AT----A--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---AT-A---T-TCC-CC--------------------T-T-----T-A---AAA-TG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----A-T----A---A-A--T-T-G-T----A--T-----GG---GA---------A---T----T------T--T--A-----C--A-----A----A--A-A----------------------A----T--C--C---------A-------T----T-A-T-A--TT-G-CA-A--G--T-A-----------C------------------TT-CTCAAC---G-AT---TA-TC---------A-A-AGC-CT--TC-CA------A--TA-TG--------------A--AGACAAAAA-ATCA-G---TA-C-T----------C-A---A---T-C---A-A----TT-C--A-T-A-TG--CC---TA--TTT--T--AA--T---T---ATTTAGT-G-ATT-G---A-G---GAT-G--TC--------T---C-C--C-TC--C-C--CC--GC---C-C-T------G-GA-A-GATCTGACAACATT-C-T--C----------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TG-----------G-A-AATG---G-G--G--T-A-GTA-A---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-GTAAGTc
gi|12 : aTATCAA-G-GTT-C-T---TTTT----AAC-------T--A-CC-G-GTAAG-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--T-A-T----G-A--C-AACA------A-G--AA-AA----A--T----T---T-CCC--T--T---CC-ACA--G---G-T--T---AA-A---T-TCC-CC----------------------------T-G---ATT-TGGT--AA--------AA-----A--------AG--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------C---T----T------T--T--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--T---------A-------TG---T-A-T-A--TT---TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-CTC---------T---TA-TA--ATG----A-A-AGT-TT--TA-CA------C--CA-AA--------------T--AGA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-TG--AAT--ATAA-ATC-T---T-A---GCT-G--TC-G-A----T---T-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----G-A-AAAT---G-G--T----A-GTA-G---G--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAAT
gi|13 : TTATCAA-A-GTT-C-T---TTGT----A-C-------T--A-C--------------------------------TTTA----CTC----T--C-T-T----G-A--T-AAAA------ACA--AA-AA----TA-T----T---T-CCCC-T--T---CC-AAA--G---G-TAAA---AA-A---A-TCT-CT--------------------T-C-------A---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CT--AT----A------A---A-ATTG-T-G-T----A--T-----GT-T-AA---------T---T----T------T--A--A-----C--A-----A----A--A-A--C--CA--T---TT-C----CG----T--A--T---------A-------T----T-C-T-G--TT-C-TA-A----------------T-TC------------------AT-TTT--C---A-AT---TA-TT--ATT----G-A-AAT-CT--c
gi|13 : gtagatagggccagggat-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT--C---C--C---------C-TT--A---------AA-TACTACTAT----G-A-AATA---G-G--T--A---GCA-A---C--AT-C-TTA-AAG-C-T-GG-ATAactggtttggatatagctagcaatctgtggactccccaccccaccccacccccacagcttaagactgcattctcaaaaaaaaaaatcctatcaaaaatccccttaaatactactatgaaataggtagcaacatcttaaagctggata
gi|14 : gtagatagggccagggatttatcaaagttctttgtactactttactctcttgataaaaacaaaaatatttccccttccaaaggtaaaaaaatctcttcaaattgtagaaactataaaattgtgtatgttaattttaacaaaaaccatttccgtatattctgttctaattcattttcaattattattgaaatctactggtttggatatagctagcaatctgtggactccccaccccaccccacccccacagcttaagactgcattctcaaaaaaaaaaatcctaATCTA-T-GTT-C-T---TTTT----G-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCA----C--T-A-T----G-A--C-AACA------AAG--GA-AA----A--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---GA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G---ATT-TG-T--AA--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-G----A--T-----GG-A-AA---------T---T----T------T--T--A-----CC-A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-G----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-T-TA-A--G--T-A--T-----T-TC------------------TT------C---T-AT---TA-TC--ATA----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-AA--------------T--AGA-AAATA-ATTG-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-C---GAT--AT-T-ATC-T---T-A---CAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--A--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-CAA-AAG-C-T-AG-ATAA
gi|15 : -G-GTAAA-------------TA-C------TTTCTAATCCC----C--T-T-T----A-A--C-AACA------AAG--GA-AA----A-------------CCCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---------------------------------------------------------------------------------CC--AC----A-C----A---A-G--A-T-A-T----A--T-----AG-G-GA---------T---T----T------T--A--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--A---CT-T----CA----T--A--T---------A-------TG---T-A-TTA--TT-T-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-CAA--A---A-AT---TA-TC--ATA---------GT-TT--TA-CA------A--TA-TAATAAATTATATCTAT--AGA-CACAA-ATCA-G---TA-A-T----------CCA---A---T-C---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--TT--T-T-T---GTT--TT-A---------T-A---GAT-A--TCTG-AAAAGG---C-C--T-CAA-C-C--CCTTCT---C-C-C------A-GG-A-GTCAAAGACCACATTC-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---A--C---------T-TT--A---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-A---C--AT-C-TAA-AAC-C-T-GG-ATA
gi|16 : tttataatctagaTTATCAA-G-GTT-C-TGTATTTC----A---------T--A-CCTG-GTAAA-G-G---------TA-C------TTTC----CCC----T--A-T-G----G-A--C-AACA------AAGCAAA-AA----T--T----T---T-CCCCCT--T---CC-ACA--G---G----A---TA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-----ATT-TG-T--TA--------AA-----A--------TG--CC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-AG---------TATTT----T------T--T--A-----C--A-----A----AC-A-A--T--CA--G---TT------GA----TTAA--C---------A-------TG---TTA-T-A--TT-C-TA-A--G--TTA--T-----G-TT------------------TT-TCT--T---T-AT---CA-TC--G-A----A-A-AGT-TTGCTAGCA------A--CA-AG--------------A--GAA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--AAT-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--TTG-T---GAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--TC-G-A----T---T-C--T-CCAACAC--CCTCCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--G-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------T-TT--C---------AA-TA------T----G-A-
gi|17 : gatATCTA-G---T-C-T---TTTT----AAC-------T--A-CC-G-TAAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--T-T------G-A--C-AACA--------G--GA-AA----A--T----T---T-CCCC-TC-T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A------TC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A---------------A-C-A-T----T--T-----GA-A----------------T----T------T--A--A-----C--A-----AT---A--A-A--T--CA--G---TT-T----T-----T--AACC---------A-------TG---T-A-T-A--TT-A-CA-A-------A--A-----T-TG------------------TT-TCC--A---T-AT---TA-T---ATT----A-A-AGT-TT---A-CA------A---A-TA--------------T--AGA-CAAGA---TA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-G---AGA----TT-G--G-G-AATG--CC---TG--TTT--T--TAA-T-G-T---AAT--AT-A-ATT-T---T-A---GA--GCTTC-GAA----T---C-C--T-CTT-C-C--TCTT-A---C-C-T------G-G--A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----TT-TC---C--C---------C-CT--A---------AA-TA------C----G-A-AAT----G-G--T--A-G-CTA-G---T--AT-C-TAA-AAA-C-C-GG-ATAAAT
gi|18 : ---TTTT----A-C-------T--A-CT-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TCTC----CCC-------T-T-C----G-A--C-AACA------AAG--GA-AA-------T----T---T-CCCC-T--T---CC-A----G---A-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-------T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A---A-T----A--T-----GG-A-AA---------T---G----T------T--T--A-----A--C-----A----A--A-T--T--CA--G---TT-T----TA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----T-AT------------------G----C--T---T-AT---TA-T---ATA----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-CA--------------T--A----AAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T---A--T-G-T---AAT--CT-A-ATC-T---T-A---GAA-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCT-T-C--CCTTCC---C---T------G-TA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TA------C----G-A-AATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-TCGG-ATAAcc
gi|19 : TTATCTA-G-GTT-C-T---TTTT----A-------------------ATAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--T-T-T----G-A--C-AACA------AAG--GA-AA----A--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-C--AG--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A---A-T----A--T-----GG-G-GA---------T---T----T------T--C--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--G--T-G--TGAAG-T-AT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-T---ATT----A-A-AGA-TT--TA-CA------A--TA-TA--------------T--AGA-CAAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--TA--T-T-T---AAT--AT-A-ATC-T---A-A---GAT-G--TC-A-A----T---C-C--T-CCA-C-C--TCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-TAAA--A-------------A---------------A-----A----AT-CC---C--C---------C-TT--A---------AA-CA------
gi|2 : atTTATCTA-G-GTT-G-T---TTT-----A-C-------TGTA-CT-A-GGAAA-A-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----T--TAT-G----G-A--A-AATA------A----GA-AA----A--T----T---T-CCCC-G--TG--CC-ACAAAG---G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------T-C-----T-G---AA--------AA--------AA-----AAAGAAAACCC--ACCCAAA-C----A---A-A--AAC-A-T----A--TT----GG-A-GAAGAGAATGTT---TA---T------T--T--ATCGCGC--G-----A----A--A-A--T--CA--GCTCTT-G----GA----G--A--CTCAACCGAAA-------TG---TTA-T-A--TT-C-CG-A--A--T-A--T-----T-TC------------------TT-TCC--A---T-ATGT-CA-TC---TA----G-C-AGT-TT--TA-CA---------TA-AA--------------T--AGG-AAAGAGATCATG---TTTA-T----------C-A---AAGAT-A---A-AAATATT-G--AAT-A--G--CC---TG--TTA--T---A--T-C-T---TAT---T-A-AACGC---T-ATATGAT-G--TC-G------T---C-C--T-CCA-C-CACCCTTTT---C-C-T------T-GA-A-AAGCTT---------C-T--C--A-------------A---------------ATTAGAA----ATATC---C--C---------T-TC--C---------AA-TACC----T----G-TTAATG---G-G--T--C-A-GTA-G---G--AT-C-TAA-AGG-C-T-GG-AT
gi|20 : AG--GA-AA----A--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-A---A-TGC-CC--------------------C-A-----T-G---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------TC--AC----A-C----A---A-T--A-T-A-T----G--T-----GG-G-GA---------T---T----T------T--A--A-----T--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C-----------------TG---T-A-T-A--TT-C-CACAATG--C-A--T-----T-TTTTTCTTTCTTTCTTTCTCTT-TTC--C---T-ATTAATA-TC--TT-------A-AGTATT--TA-CA------A--TATAA--------------T--AGACAAAGA-ATTA-G---TA-A-T----------C-A---A---TAA---A-A----TT-G--A-TAA-TG--CCACTTG--TTTCAT--CA--T-G-T---GAT--AT-ACATCAT---T-A---GATGG--TC-G-ACTTTT---C-CTAT-CTA-C-C--TCCACCCATC-T-T------G-GA-A-GCCCC----------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--gtgaaaatcc
gi|21 : ATCAA-T-ATT-T-T---TTTT----A-AA------T--A-CC-A-GTAAAAG-GG--------TA-C---C--TTTC----C---------------------------------------------------------T---T-TCCC-T----------CA--G---G-T--A---AA-T---G-TAG-CA--------------------A-C-----T-A---GAT-T-------------------------------CT--AC----A-C----A---A-A--A-TCA-T----A--T-----GG-G-AA---------T---T----T------T--A--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA------T-------------T--A--C---------A--------G---T-------------------G--A-A--T-----T-TA------------------TT-TTC--T---T-AT---TT-TCTTATA----ATA-AGT-CT-----CA------A--T---A--------------T--AG--CAAGA-ATCA-T---TA-C-T----------C---------------A-A----TC-G--A-T-A-TG--CC---TA--TTC--T--TA--T-----------------ATC-T---G-A---G-T-G--TC------------C-C--C-CAA-C-C--CCT--C---T-C-C------A-AA-A-G--------------C-T--C--A-------------C---------------G-----ACTGTAT-TC---T--CAAATAATTTC-TT--T---------AATTC------T----G-A-AATG---G-GGCT----A-GTA-A---C--AT-C-T
gi|22 : ttaccc--TTTC----CCC----C--T-T-T----G-A--C-AATG------AAT--TA-AT----A--T----T---T-CCCC-G--T---CC-ACA--G---A-T--A---AA-C---A-TTT-CC--------------------C-T-----T-C---AAT-TG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----G-C----A---A-A--ATT-G-T----A--T------G-A-GA---------A---T----T------T--T--A-----G--C-----A----A--A-A--T--AA--T---TT-TTA--TA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TC-C-TA-A--GGTC-A--T-----C-TT------------------CT-ATT--A---T-AT---TA-TC---------G-A-AGT-CT--TC-CA------g
gi|22 : taat-C--C-CCA-C-C--CTCTCC---T-T-T------G-AA-A-G--------------C-T--C--A-------------ATACTGCATTCTTTAAA-----A----AC-TC---C--C---------C-TT--TTAATATTGAAA-TA------T----G-A-AATG---G-T--T--T-TTGTA-A---C--AT-C-TCA-ATG-C-T-GG-ATctttacccctgcctccccaccccaccctctcctttgaaagctcaatactgcattctttaaaaactccccttttaatattgaaatatgaaatggtttttgtaacatctcaatgctggat
gi|23 : taattttccccctttgacaatgaattaatatttccccgtccacagataaacatttcccttcaattgtagaaactacgcaaaattgtatgagaattttagcaaaataatttttatatacatgtatatcctaaggtcatcttctattatattatcgaagtcttccactttacccctgcctcccca-C-T---GTTT----G-C-------T--A-CG-G-TTAAATG-GGC-------TA-C---C--TTTC----CCC----CTAT-T-T----G-AG-C-AACA------AAG--GG-AAGAATT--T----T---T-CCCC-T--TATCTC-ACA--GCGCG-T--A---GATA---A-TCC-CCGAGGCAACACTTGCTTTCTTC-CGACTCT-G---ATTTTG-T--AGA-------AA-----A--------CC--ACGA--A-CA---A---A-A--A-T-A-G----A--TAGC--GA-A-AA---------T---T----T------T--TTCAC----C--A-----A----G--A-A--T--CA--G---TT-GCGCAGT----C--A--CT--------A-------TG---T-A-T-A--TT-T-AA-A--G--T-T--A-----T-TT------------------GC-TTC--T---TAAT---TA-TC--
gi|24 : -----T-G---ATT-TG-T---G--------AA-----A--------CCCAGC----A-C----A---A-A--------T----C--T-----GG-G-GA---------T---T----T------T--A--A-----C--A-----A----AGAA-A--TG-CA--C---TT-CTG--GA----T--A------------A-------TG---T---T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----T-TT------------------TC---C--C---T-AT---TA-TTT-ATATC--A-A-AGT-TC---A-CA------A--TA-TT--------------T--AGA-CA-GA-ATTA-G---TA-AAT----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-AG--CC---TGTTTTT--T--C---T-G-T---A-------A-ATC-T---T-AG--GAT-G--TC-G-A----T---C-C--TGCCT-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-AGG--------------C-T--C--A-------------AC--------------A-----A----ATGTC---C--C---------CGTT--A---------AA-TAC-----C----A-A-AATG---G-G--T--A-G-TTA-G---T--AT-CGGAA-AAG-C-T-GG-ATCAAtatgttagaaacgtatatattgaacacatgtattggaaatc
gi|25 : gCC-CA--------------------T-C-----T-G---ATT-TG-T--AG--------CA-----A--------CC--AAGAG-A-C----A---A-A----T-A-T----G--------GG-G-GA---------T---T----T------T--TTAA-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--C---TT-TC---GA----T--A--CG--------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-CA-A--A--T-A--T-----G-TT------------------TT-CCT--C---T--T---TA-T---ATA----A-A--GT-TT--CA-CA---------T------------------T--AGA-CAAGA-ATTA-G---TT-A------------C-A---A---T-A---A-A----TTTG--A-T-A--G--CC---TG--TTT--TTTC---T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---TTA---GAT-G--TT-G-A----T---C----T-CC--T-C--CCTTCC---CAC-T------G-GA-A-G----------------T--C--A-------------G---------------A-----A----CT-TC---C--C-----------TT--A---------AACTA------C----C-A-A-TG---G-G--T--A-G-TTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-TGGG-ATAAgat
gi|26 : -GG--------TA-C---C--TTTC----CCT----T--T-T-A----G-A--C-TA-A------AAGT-GA-AC----A--T----A---T-CCCC-T--T---TC-ACA--G---G-T--A---AA-A---C-TTT-CC--------------------C-C-----A-C---AAT-TG-T--AG--------AA-----A------------AC----T-C----AT--A-T--A-T-G-T----A--TTGTCAGG-A-GA---------A---T----TAACTCCC--T--A-----C--ATAATTA----A--C-A--TTGCA------TT-T----GAAATTT--AT-C---------AAAAATCCTA---T-A-T-A--TT-C-TA-CT-A--T-A--T-----TATT------------------TT-CTC--T---C-AT---TA-TC---------A-A-AGT-CT--AA-CA------AATCA-AA--------------TGGAGA-TAAGA-A--A-T---TA----------------A---A---T-T---C-A----TT-T--A-T-A-TA---C---TG--TTT--t
gi|27 : at-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-A-GGTA------TA-C---C--GTTC----CCCTAGTC--A-G-T----G-A--C-AAAA------CAT--GG-AT----A--T----T---T-CGCC-T--T---CC-ACA--C---G-T--A---AA-A---G-TGT-CC--------------------C-T-----TAA---AAT-TG-T--AG---------------A--------CT--AC----A-C----A---AGA--G-T-A-T----
gi|28 : catgcaaagttagagccattccagggatttacatCC----C--T-T-T----A-A--C-AA-A------AAG--GA-AA----A--------------CCC-T--T---CC-ACA--G---G--------AA-A---A-CC-----------------------------------------------------------------A--------CT--AC----A------------G--A-T-A-T----A--T-----GG-G-GA---------T---T----T------T--A--A-----C--------A----A--A-A--T--CA--A---TT-TC---AA----T--A--T---------A-------TG---T-ATT-A--TT---TATA--G--T-A--A-----T-AT------------------TT-T----CAAAA-AT---TA-TC--AT---------AGT-TT--TA--A------A--TT-TA--------------T--A-A-TAAAT-ATTA-----TA-A-T----------C-tgtcgttagctgataggtctacacgtgattattttgaagtgtttgtacgtaaaa
gi|29 : -GTC-C-T---TTTT----A-TACTACTGT--A-CT-G-GTAAA-A-TG--------TA-T---C--TTTT----ACC----C--T-T-T----G-A--C-AACA------AAT--GA-AT----G--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ATA--G---G-T--A---AA-A---A-GCC-TC--------------------T-T-----T-C---AAT-AG-T--AG--------AA-----A--------CT--AC----A-C----A---A-A--ATT-G-T----A--T------G-A-G--------------T----G------C--A--A-----G--A-----A----A--A-A--T--TA--T---TT-T----TA----T--A--T---------A-------AT---T-A-T-G--TT-A-CA-T--G--T-A--A-----A-TC------------------AT-TTT--C---T-AT---AA-TC--ttataggatttgtttagtcacattccaagcagtttattgtta
gi|3 : tatggttttttTTATTTAAG-GTT-C-T---TTT-----A-C-------T--AACC-G-GTACA-A-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--T-A-C----GCA--C-AACA------AAG--GA-A-----T--T----TATAT-CACC-T--T---CCCACA--G---A-T--A---AAGA---A-TCC-CC--------------------C-CAT---T-G---AAT-TG-GCAAG--------AA-----A--------AC--AC----A-C----ACAAA-A--A-T-A-T----G--G-----GG-A-GA---------T---T----T------T--C--A-----C--A-----ATTAAA--A-A--T--CA--T---TA-T----GT----T--A--CTGTACA---A-------TG---T-A-T-T--TTAC-CA-A--GA-T-A--TGGAAGT-AT------------------TTATTC--C---T-AT---TA-T---ATT----A-A--GT-TT--TA-CA------AA-TA--A--------------T--ATA-TGACA-ATCA-A---TA-A-TTTAGCTAATTC-AT--A---T-C---A-ACG--TT-GTTA-T-A-TGACTC---TG--TTT--T--TT--T-A-TTTGGAT--ATTA-CTC-A---G-A---GAT-G--TC-A-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-A-T------G-GA-A-G--------------C-A--A--A-------------A---------------A-----AC---AT-TC---CTTC---------C-TTA-A---------AA-TAT-----T----G-ATAATG---G-G--T----A-GTA-G---T--AT-C-TAA-AAG-C-T-GGAATAAAT
gi|30 : atTTATCAC-G-ACT-C-T---TCTCC---A-C-------T--A-CT-G-AAATA-A-GC--------TA-A---C--TTTC----CCC---------T-T----C-A--C-AAAA------TAA--AA-AA----T--TATGAT---T-CCCC-T--T---TC-ACA--G---G-T--A---AA-T---G-CCT-CT--------------------C-T-----T-C---AGT-TG-T--AG--------AA-----A--------CT----------C----T---A-A--A-C-A------ACTT-----GA-A-AA---------T---C----TTCC---T--T--A-----C--A-----C----A--ATA--T--T---G---TT-T--------------------------A-------TG---A-G-T-A--TT-CATA-A--A----A--T-----C-CT------------------TT-TTcc
gi|31 : ---A---T-C---A-A----TT-GC-A-T-A-TG--CC---TA--TTT--T--CA--A-AAT---ATT--GT-G-ATC-T---A-G---GAT-G-----A-A----TGTAC-C--T-T-A-T-C--CCCTCC---C-C-T------G-AA-A-G--------------CTT--C--ATGACTGTATTGTCA---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TA------T------A-AATA---GTG--T----A-GTA-A---C--AT-C-TCA-Aa
gi|32 : TACTCA-G-GTT-C-T---ATTT----A-C-------T--T-CC-A-GTATA-G-GG--------TA-CA--C--TTTC----CAT----T--T-CCT----G-A--C-AAAA------AAT--TA-AT----T--T----T---T-CTTC-T--T---TT-ACA--G---G-T--A---AC-A---A-TTT-CC--------------------C-T-----T-C---CAT-TG-T--TG--------AA-----A--------AC--AC------C----A---A-A--A-T-
gi|34 : aaggaatc---TTTT----G-C-------T--A-CG-G-GTAAA-G-G---------TA-C---T--TTTC----TCC----T--T-A-A----G-A--C-AAGA------AAT--GA-AA----TGAT----TG--TATTCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---AG-A---A-TTC-CC--------------------C-T-----T-GA--AAT-CG-T--AG--------AA-----A--------ttt
gi|35 : gggaatttattgttaaaaa--A-------------A---------------A-----A----ATATC---C--C---------A-----A---------AA-TA------T----A-T-AATG---G-G--T--T---GCA-A---C--AT-C-TAA-AAG-T-T-GA-ATAAA
gi|36 : ctcccctcccttcaaagcttcatggatgcatttttttaaaG--GA-AA----A-------------CCCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---------------------------------------------------------------------------------CC--AC----A-C----A---A-G--A-G-A-T----A--T-----AG-G-GA---------T---T----T------T--A--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--A---CT-T----CA----T--A--T---------A-------TG---T-A-accctgcagtgcaaata
gi|37 : -T--C--A-------------A---------------G-----A----AT-TC---C--T---------C-TT--G---------AA-TA------T----G-ATAATG---G-A--T--A---TTG-A---T--AT-C-TAA-AAA-C-T-GG-cgacaattatcaaaatcatcatcatcaattatca
gi|38 : gtgtaatatgaaaagggttgccctaacccctctttgggagctcatgtctacatct--TTTT----CCC----C--T-T-TAATAG-A--C-AAGA------AAT--GA-AT----A--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACA--G---GTT--A---AA-ATTGA-TTC-CC--------------------C-T-----T-G---AAA-TG-T--TG--------AA-----AG-------TC--AC------T----A---A-A--G-A-A-T----G--T-----GG-
gi|39 : ------A--TA-TA--------------T--AGA-CAAGA-ATCA---------------------------A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG-----------TTT--T--TA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-C---A-A---GAT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCT-T-C--TCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-Tgtgcacaag
gi|4 : TTCTCAA-G-ACT-C-T---TTTT----A-C-------G--T-CT-A-GCAAA-A-GGGTACTTAATA-C---C--TTTC----CCC----T--T-T-T----G-A--C-AAAG------AAT--GA-TT----A--T----A---T-CCCC-T--T---TT-AGA--G---C-T--A---AA-AC--A-TTC-CCATTCA---------------C-C-----T-GCACAGT-TG-T--AGAATTCTGAAA-----A--------CT--CCTAA-A-CTGGGA---A-A--A-C-T-TCCCCA--T-----GA-A-AG---------A---T----T------G--T--A-----T--AT----A----A--G-A--T--TATTT---TT-T----TA----T--AT-C---------A-------CG---T-G-T-A---A-C-TA-T--G----A--T-----T-TT------------------CT-ATC--T------T---TA-TC--ATATTTCA-A---T-TA--TG-C-------A--TG-TA--------------T--AGA-T-----ATCA-G---TG-A-T---------------------------------TT-GTCA-T-A-TT--TA---TA--TTG--T--CA--T-G-T---GAC--TC-A-GT------------GAA-G-----G-A----T---TGC--T-CTA-G-A--CATCCT---T-G-T------G-GG-A-G--------------C-TCAC--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-CT--C---------AA-TA------T----GAA-AATG---A-G--T----A-GTA-A---T--ATAT-TAA-AAG-C-T-TG-
gi|40 : gat--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--CA--------C-----A---------AG-TA------T----A-A-AGTA---G-G--T--A---GTA-A---C--AT-C-TAA-ATG-C-T-AG-ATAAA
gi|41 : ttccctgttcaggagctcacacttgcatcctT-TC---C--C---------C-TT--CC--------AA-TA------TT---G-A-AATGA--G-G--T--ATA-GTA-GGGGCTAGT-C-TAA-AAA-CCT-GG-ATAAATcccctg
gi|42 : -T---TGTT----A-C-------C--A-CT-G-GTAAA-G-GG--------TA-T---C--TTTC----CCC----A--T-T-T----G-A--C-AACA------AAccct
gi|5 : ATCAA-G-GTTTC-T---TTTA----A-C-------TT-A-CG-G-GTAAT-G-GG--------TA-C---C--TTTC----CCC----C--T-A-T----G-A--CAAACA------AAG--GA-AA----A--T----T---T-CCCC----T---CC-ACA------G-T--A---AA-A---A-TCC-CC--------------------CTC-----T-G---ATT-TG-T--A---------AA-----T--------CC--AC----AGA----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GAT--------T---T----T------T--T--A-----CGAA-----A----A--A-A--T--CA--GT--TT-T----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT------C---T-AT---AATTC--ATT----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--CATAA--------------T--AGA-AAAAC-ATCA-GT--TA-ATT----------C-A---A---T-------A----TT-G--A-T-ATTG--CC---TG--TTT--T--CATTT-G-C---AAT--TT-A-ATC-T---T-A---ATT-G--TC-G-A----T---T-T--T-CCA-C-C--CTCTCC---C-C-TTCCGTGA-GA-A-A--------------C-T-----A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----G-A-AATG---G-G--TAGA-A-TTAGG---C--AT-C-TAA-AAG-C-TGGG-ATAAAa
gi|6 : TATCTA-G-GTT-C-T---TTTTT---A-C-------T--A-CC-GCGTAAA-G-GC--------TA-C---C--TTTC----CC--------T-T-T----G-AGGC-AACA------AAG--GCTAA----A--TAA--T---T-TCCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---AATCC-CC--------------------T-C-----T-G---ATT-TG-A--AC--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-AGT----A--T-----GG---TA---------T---T----T------TACA--A-----C--A-----A----A--A-A--TA-CA--G---TTGT----GA----T--A--C---------A-------TGATAT-A-T-A--TG-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT--------------------------C---T-AT---AA-CT--AAA----A-A-AGT-TT--TA-CA------A--TA-AA--------------TA-AGA-AAAGA-ATCG-G---TA-A-G----------C-C---A---T-ATAGA-A----TT-G--A-T-A-AG--CC---TG--TTT--T--TA--T-G-T---AAT--AT-A-ATCATTAAT-A---GAT-G---C-G-A----T---C-C--T--CA---C--CCTTCC---C-C-T------GAGA-A-G--------------C-T--TCGA-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------A----G-A-AATA---G-G--T----A-GTA-G---C--AT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAATatcc
gi|7 : -G-GTT-C-T---TTTTTTACA-C-------T--A-CCTG-GTAA--G-GG--------TA-C---CATTTTCT---CCC----C--T-T-T----G-A--C-AACACTAAATAGG--GG-AG----T--T----T---T-CGCT-C--T---CC-ACG--G---A-T--A---AA-A---A-GTC-CC--------------------C-C-----T-G---AAT-TG-T--AG--------TAGAGATA--------CC--AC----A-A----A---A-A--A-T-G-G----G--------GG-ATGA---------T---TGTAGT------T--G--A-----C--A-----A----A--A-AAAT--CA--G---TT-TT---GA----T--A--C---------A-------TG---TTA-T-A--TT-CATA-A--G--T-AGATAG---T-AT------------------TT-TTC--C------------------------A-A-A----T--TA-TT------A--TA-TA--------------T--A-----AG-------G---TT-A-T------------G---A---T-A---A-C----TC-C------------CC---TG--CCT--C--CT--T-A-TTG-AATT-AT-A-ACT-T---A-A---GAT-GGGTC-G-ACC--T---C-C--T-CC----C--CCTTCC---C-C-T------G-GATA-G--------------T-T--AG-A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--A---------AA-TA------C----G-A-TATGACCA-G--T--A-A--TA-GA--T--AT-C-TAA-AAG-C-G-GG-
gi|8 : TTATCTA-G-CTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-CGTCC--TTTC----CCC----C--T-T-T----G-A--C-TACA------AAG--GA-AA----T--T----T---T-CCCC-T--T---CC-ACA--G---G-T--A---AA-A---A-TCC-TC--------------------C-C-----T-G---ATT-TG-T--AA--------AA-----A--------CT--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------T--T--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-T----GA----T--A--C---------A-------TA---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-TTC--C---T-AT---TA-TC--ATA----A-A-AGT-TA--TA-CA------A--TA-AA--------------T--AGA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---AAT--AT-A-ATC-T---T-C---GGT-G--TC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AG-TA------T----G-A-AAGG---G-G--T--A-A-GTA-G---C--GT-C-TAA-AAG-C-T-GG-ATAAATgatc
gi|9 : TTATCTA-G-GTT-C-T---TTTT----A-C-------T--A-CC-G-GTAAA-G-GG--------TA-C---C--TTTT----CCC----C--T-A-T----G-A--C-AACA------AAG--GG-AA----A--T----T---T--CCC-T--T---CT-ACG--G---G-T--A---AA-C---A-TTCAAC--------------------A-C-----T-G---ATT-TA-T--AA--------AA-----A--------CC--AC----A-C----A---A-A--A-T-A-T----A--T-----GG-A-GA---------T---T----T------T--T--A-----C--A-----A----A--A-A--T--CA--G---TT-C----GA----T--A--C---------A-------TG---T-A-T-A--TT-C-TA-A--G--T-A--T-----T-TT------------------TT-T--------T-AT---TA-TC--ATA----A-A-AGT-TT--TA-CAACAATTA--TA-AA--------------T--AGA-AAAGA-ATCA-G---TA-A-T----------C-A---A---T-A---A-A----TT-G--A-T-A-TG--CC---TG--TTT--T--CA--T-G-T---GAT--AT-A-ATC-T---T-A---GAT-G--CC-G-A----T---C-C--T-CCA-C-C--CCTTCC---C-C-T------G-GA-A-G--------------C-T--C--A-------------A---------------A-----A----AT-TC---C--C---------C-TT--C---------AA-TA------T----A-A-AAAG---G-G--T----A-GTA-G---C--AT-C-TAA-ATG-C-T-GG-ATAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): AAGCAGTATTGTTATTTATATATTGTTTAAAAAATGAAAAGAAACTTTATTGTTGGACCTTACCAATTAGTTTCGTTCATTTGAGGTCAGATAATAGCAAAAACTTAGGTGGTTGCAAGGA
Unaligned ( gi|43 ): ATGCAAAAATAAATAGAATACAGTTCGCAGGG