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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGGATGGTC--TCCC-----------AAT-GTC-CAA-----TTTCG---TCA----T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC-AT-C-TGA-AT---A-T--A-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-A-T-C-GTCAT-T-T---A-CCTCG-TAT-A--A-T-AATTCG--T-T-A-C--A-A------T--C--------GGA----C-C--CA--A-CT---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--AA---G------------T----A-ACC-AC-G---AA--GCCT-G-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T---TAAC-ACGA-A-CAT--C-------GTAGA-TAGC-GCT--GCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT--A-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-GA------ATT-T--CGA---A--GTCGC-CG-----------AAGACA-G---CC--G-----A-G--TGGGATT-----T---T-AT--G-AC--CAAAAAAAAAAAAAAAT-TG-T-GTAGAAAATAAAAT-T-A--T-GA-T--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TTT-C-AT-TCT--CAAAAGT-T-GCA----TG-T-GGAC---AT-TG-GCCAACT-T--A-A---TAA-C-GA-CA----CAGAAAAAGAAAATGACGA-T---------GGC-A--CTTC--T--G-A-CATTAT-CTG-CAA--TT----AATTGGAAACAT--GAC--AAG-AA--ACT-TTT-ACAGG-CACAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTATTTGAT-AA--CCTAATTTG-TGAT-TTATT--CTAATTTTTCTAGAA-GGACG-TCTATT-TA-TC----ATG---AT--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGC-AC--GAAACA---G--TGAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAAC-GTTTGTC-A-CT------------GTG----AT-AC-ACGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATAAGATA---TTCT-TCTT----A---TTA----TGAAT-----CTG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-TG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GA-G--ACT-GTGCCG---AGACT-AC-A-T-TA--GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TAT-C-GTGTG-ACCTG---GCTTC-GT--G-T-AG-C--A-TT--CG-T-AT----GTT-CTTCTT----ATT---T-AGA--AC------G-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TG-A-TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--TCTTC-TG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAC-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGGATGGTC--TCCCG----------AAT-GTC-CAA-----TTTCG---TAA----T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA---------CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC-AT-C-T-A-AT---A-T--A-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T---GTT-T-T-T---A-CATCG-TAT-A--A-T-AAT-CG--T-T-A-C--A-A---------C--------GG-----C-C--CA--A-CT---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--A----G------------T----A-ACC-AC-G---AA--GC-T-G-C-CCG-ATT----G---T-CTT--A----GATGT------G---TAAT-ACGA---CAT--T-------GTAT--TAG--GTTC-GCA---A--TGC-GA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-AT-AG-A--G-GA------A-T-C--CGA---A--GTCGC-CG-----------A--ACA-G---CC--GA----A-G--TGGGTTT-----T---T-AT--G-AC------AAAAAAAAGAACT-TG-T-CTAAAAAAT--AAT-T-A--T-GG-T--G-AAAAT--G-TCG-AT----A-T-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-G-CCA----TG-T-GGAC---AA-TC-GCCAAAT-T--A-AT--TAA-C-GA-CA----CA-AAAAAG-AAATGACGA-T---------GCCAA--CTAC--T--G----ATTAT--TG-GAAC-TT----A---GGGAACAT--GAC--GAA-AA--ACT-CTT-ACAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGGATGGTC--TCCC-----------AATCGTC--AA-----TT-CG---TAA----T-AA--T-TCG--T--A---T-G----------CA-GCTT---C--TC--G-T--CG-G-A-----TATG-A---A-T-CGT--GAA-GAC------TAATAT---A-T--A-TT-C---G-T-GGTTT-C--C-G-T-C-GTC-T-T-T------CTCG-TAT-G----T-AA--AG--T-T-A-C--A-A------T--C--------GG-----T-C--CA--A-CT---T-----C---AGATA-T-CAGC-G-AACTGG-AA------------T---CGA--A----G------------T----A-ACC-AC-G---AA--GC-T-G-C-C-G-ATT----G---T-TTA--AG---GATGG------T----AAC-ACG-----AC--C-------G----------------------------------A------G--G------AC--GGTG-------------C--C----A-T--C-G-T-ATA--A-GAG----------TA----G-ATTGG-GCA-T-CT-TG-AGTG-GA------ATT-C--CGT---A---TC-----------------AGACA-G---CC--G-----A-AGTTGGGTTT-----T---T-AT--GCAC--CAAGATAATAA-----T-TG-TCATATA---TAAGAT-T-A----GA-T--G-CAACT-AG-TCG-AT-C--ATT-TTT-C-AT-TTT--C-AAAGTGT-GC-----TG---GGAC---AA-TG-G-CAACT-T----A---TAA-CTGA-CA----CAGATAA--TAAATG-CGA-TG--------GGC-A---TTC--T--G-A-CGTTA--GTG-CAACGTT----AGGCGG--ACAT--GAC------AA--ACT-CTT-ACAGA-CACA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGGATG-TC--TCCCG----------AAT-G-C-CAA-----TTTCG---TAA----T-AA--T-TCG--T--A---T-GAT------T-CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-A------A-G-A-C-A-T-CGG--GAA-GAC-AT-C-T-A-AT---A-T--A-TTGC---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GTCTA-T-A---A-CCTCGCTAT-A--G-T-AA-TCG----T-A-C--A-A---------C--------GGtgcctattgtttttaggtaaatgtattgattaacctaatttggtggtttattttcttatttttctagaagacattatttatgaagattaagagagtaaacagaccgacacagggtgggaattatttattagaattgtgctaccaaaaacaagaatagttggtcgactgtatacgacgatatgacatttacttgtactttcacatctacatataatattcttctttagcgctatatctgaaacttaaccgtataaacagtaatcgacacaagttacataataaggtgtcatggtatgcttcgagactgcgcagactacattctgggtgcgaccgttacttatacgatatgtgtgacttcatgctagccatcggtatgttttcttatttaagaagtgctttcgtatattgcattcggagtcaccgtatgaccttcatgttcggtatctggattgtctatcgtgtgacgtctttgaccttcgttgtgcttctcagtgatatttgcctttttgtctaaagttcggcggcatttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGGATGGTC--TCCCG----------AAT-G----A----------------A----T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC-AT-C-T-A-AT---A-T--A-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GTC-T-T-T---A-CATCG-TAT-A--A-T-AA-TCG--T-T-A-C--A-A------T--C--------GG-----C-C--CA--A-CT---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A----G-AA-A----------TA--CG---AA---G------------T----A-ACC-AC-G---AA--G-CT-G-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG----------TAAT-ACG--A-CAT--C-------GTA-A-TAG--GCTC-GCA---T--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-GA------ACT-C--CGA---A--GTCGC-CG-----------AAGACA-G---CC--G-----A-A--TGGGTTT-----T---T-AT--G-AC--------AAAAAAGAACT-TG-T-CT-CAAAAT-AAAT-T-A--TGGG-T--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TTT-C-AT-TC---CAAAGTT-T-GCA----TG-T-GGAC---AA-TG-GCCAACT-T--A-A---TAA-C-GA-CA----CAGAAAA--GAAATG-CGA-T---------GGC-A--CTTC--T--G-A-CATTAT--TG-CAAC-TT----A---GGGAACAT--GAC--GAA-AA--ACT-CTT-ACAGG-CAcc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgcgGGATGGTC--TCCCG----------AAT-GTC-CAA-----TTTCG---TAA----T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC-AT-C-T-A-AT---A-T--A-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GTT-T-T-T---A-CATCG-TAT-A--A-T-AA-TCG--T-T-A-C--A-A------T--C--------GG-----C-C--CA--A-CT---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CG---AA---G------------T----A-ACC-AC-G---AA--G-CT-G-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG----------TAAT-ACG--A-CAT--T-------GTAT--TAG--GTTC-GCA---A--TGC-GA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-TATT-AG-A--G-GA------A-T-C--CGA---A--GTCGC-CG-----------AAGACA-G---CC--GA----A-G--TGGGTTT-----T---T-AT--G-AC-----AAAAAAAAAGAACT-TG-T-CTA-AAAATAAAAT-T-A--T-GG-T--GAAAAAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TTT-C-AT-TC---CAAAG---T-GC-----TG-T-GGAC---AA-TC-GCCAACT-T--A-A---TAA-C-GA--A----CAAAAAAAG-AAATG-CGA-T---------GGC-A--CTAC--T--G-A-CATTAT--TG-GAAC-TT----A---GGGAACAT--GAC--GAA-AA--ACT-CTT-ACAGacaacatctattgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgattttttctaatttttctagaagga
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcgGGATGGTC--TCCCG----------AAT-GTCACAA-----TTTCG---T-A----T-AA-GT-TC---T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-------TA-G-AAC-A-T-CGTTGGAA-GAC-AT-C-T---AT---A-T--A-TTTC---G-T-G-TTTGC--C-A-T-C-GTC-T-T-T---A-CATCG-TAT-A--A-T-TAATCG--T-T-A-CC-A-A------T--C--------GG-----C-C--CATAA-CT---T-----C---A--AC-T-CA-C-A-A--TGG-AA-A----------TATACGA--G----G------------T----A-ACC-AC-G---AA--GCTT-G-C-CCG--TT----G---T-CTT--AA---GATGG------T-----AT-ACGA---CAT--C-------ATAAA-TAGG-GCTC-GCA------TGC-AAATC-A------G--A------AC--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT----GAG----------TA-C--G-ATCGGTGCA-A-TA-AG-A-TG-GA------ACT-C--CGA---A--GTCGC-CG-----------A-GACA-AAGCCC--G-----A-AGTTGGGTTT-----T---T-AT--G-AC---------AAAAAAAACT-TG-T-CTA--AAATAAAAT-T-A--T-GG-T--G-AAAAT-AG-TCG-AT-CATA-T-TTT-C-AT-TTTACCAAAGGT-C-G-A----TG-T--GACA--AT-GG-GCCAACT-T--A-A---TAACC-GA-CAGCCCCAGAATGGAAATATG-CGA-T---------GAC-A--CTTC--T--GAA-CATTAT-TTG-AAC--TT----AG-TGAGAACAT--GA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgcgGGATGGTT--TTCCCG---------AAT-GTC-CAA-----TTTCG---TAAA---T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-AAC-A-T-CGT--GAA-GAC-AT-C-T-A-AT---A-T----TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GTC-T-T-T---A-CCTCG-TAT-A--A-A-AAT-CG--T-T-A-C--A-A------T--C--------GG-----C-C--CA--A-CT---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--A----G------------T----A-ACC-AC-G---AA--GCTT---C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T----AAC-ACGA-A-CAT--C-------GTA-A-TAG--GCTC-GCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--A----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT--A-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-GA------ATT-C--CGA---A--GTCGC-CG-----------AAGACA-G---CA--G-----A-A--TTGGGTT-----acgaa
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcgGGATGGTC--TCCCG----------AAT-GTC-CAAATCATTTTCG---TAA----T-AAAGTATCG--T--A---T-GA---------CA-TTAT--AC--TT--A-T--CG-T-ACGACATA-G-A-CCA-T-CGT--GAAAGACTAC-C-TAA-ATGATA-T--A-TTTC---GAT-G-TT--C--C-G-T-C-GTCTT-T-T---A-CT--G-TAT-ACCA-T-AATGCG--T-T-A-T--ATA------T--CTAGTCACTGGG----C-CATCA--A-CTAATT-----TGCAA--TC-T-CAAC-GCA--TGG-AATA----------TC--CGGTGAC---A------------T----A-ACT--T-A---AA--GCTT-G-C-CCG-ATT----AGTAT-CTT--AA---TAAGA------C---TAGA-GCAA-A-AAT--CAACCACTGTAAAATAGAAGCTC-GCA---A--TGCTAA-TC-A------GCCA------AT--GTACCGTGAATTAATTCC--C----A-T--C-G-T-ATT--A-GAGAGGTTAAGACTA-T--G-AT--A-AAA-T-TT-CG-T-AG-GATCGTACATT-C--CGA---A--GTCGCACG-------------GACACG---CCATA-----A-GA-TGTGGTTTA---T---T-AT--G-AC--CAAAAAAAAAA-------TG-T-TTA-AAAATAAAATGTAA--T-GA-TAAG-AAAAT-AG-TAC-AT-C--ATT-TTT-C-AT-T-T--C-AAAGT-T-GCA----TC-T--GACTCAAT-TG-G-CAACTAT--A-ATCTTCA-C-GA-CA----C--GAAATGACAATATCGA-T---------GGC-C--TTTC--TCAGTA-CATTAT--TG-CAA--CTTCTAGA--GGAACCAT--GAC------AA--ACT-CTT-ACA-G-CA--------------AACACATCTAATTTGTTTTAGGTTAAATGTATTGATAACTAAATTTGTGAATTT--------CTTAATT---TCAT-TTAT------ATGCT--TAGAACGGTCC-TCTTTA-TA-TCTCTTATGAATAT--TTATAGAGGTAGT-AACA-G-TGCAACAGAAAACAGTTG--TAAAACA-TTTTTGTTATTAGAATTGTG--GAACAACAAACAAGAG--GTTGATC-A-CTTCAAACCAAATAGTG----ATAACAACTTATATTGACATTAT-ACTTGTCACATTCC-------TTTACTATA-AAGTTAAGTTTCTATCT---------TTAACACTGAATTGTGGTTG-AACTT-AACCTG-CGTGAATAACAGTA-TATA-CA-ACAG-AGCTT-AC-ACTATATTCAAGGTAGTA-------T-TGGTAATTGAACTAGCAGA---CTCCAT-TA-GA-G--AAC-G-GTCG----GA-T-ACAA-T-TAACGGAT-C-T-CC-GTACAACTTAAT-AC--GATTAT-CTGCGTG-A---A---AC-TC-GTA-G-T-AG-C--ACTT--CG-T-AT----GTT-CTTCTTTCCAATTTTAT-AGATGAC------GATG-TG-CT-TTTCGTAGCA-AG-G-TTC-AAAG---CCGAT-GTTCGGG-CG-TT-CGTG--CTCCTATACAGTGTTTTCTGG-ATC-GA-T-TGTG-ATGGTG----T-GAGTCCTTC-TGATATCGTTTTT-GACA-TCG-GAAATGT-GCTAT-T-A-GT-GAT-CA-TTGGGCTATGCCGG-TTT--TTAAT--C--AAATTAACACGGTAC-GGCCATTTTC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgcaGGATGGTC--TCCG-----------AATCGTC-CAA-----TTTCG---TAA----TTAA-AT-TCG--TGAA---T-GA---------CA-TCGT--AC--TC--G-T--C--T-A-----TA-TCA-C-A-T--GT--GA--GAC-AT-C-T-A-AT---AAT--A-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-CCGTTCT-TCT---AGCCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CG--T---A-C--A-A------TG-C--------GGA---------------------------------TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-AAT--------CA--CG--------G------------T----A-ACC-ACCG---AA--GT-T-G-C-CCG-ATT----G---T--TT--AA---GA--G------T---CAAC-ACGA---CAT--C-------GTA-A-TAG--GTC--GCA---A--TAC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-TTTC-G-T-TTA--A-GAG----------TT-CA-G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-AA------CTC-G--CGG---A--GTC----------------------------C--G-----ACG--TGGGTTT-----T---TTAT--G-AC---------AAAAAGAACT-TG-T-CCA---AACAAAAT-T-A--TTGG-T--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TTT-C-AT-T-T--C-AAAGT-T-GCA----TGTT-AGACA--AA-AG-GCCAACT-TTCA-A---TAA-C-GA-CA----CAGAAAAAAGAAATG-CGATT---------GGC-A--C-TC--T--G-ACCAT--T-TTG-AAC--TT----A---GGGAACAT--GAC--GA--AA--ACT-CAT-ACAGG-CACAtagccgaccacccgaatttgcacaaatttcaaatcttcgtgttcatcttgattgtcacaatcctggggacagtgtcaaggcaggca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcgGGATGGTC--TCCCTAAATCCTCCGAAT-GTC-GAATT---TTTCG---TAA----T-AA-GT-TCGGTC--AAATT-GA-------T-CA-T-TT--AC--TC--G-T--CG-TAA-----TA-G-A-C-ATT-CGT--GAA-GAC-AT-C-TAA-TT---A-T--A-TTCC---G-T-G-TTTCC--C-G-T-C-GTC-T-T-TAAAA-CCTCG-TAT-A--A-T-AA-TCGTAT-T-A-CAAA-A------T--C--------GGC----C-C--CA--ACCT---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG----A----------TA--CG---AA---G------------T------ACC-AC-A---AA--AGCT-GCC-CCG-ATT----G---T-CTTA-AA---GATGG----------TAAC-ACGACA-GAT--CG------GTA-A-TAG--GCTTCGCA---ATTTG--AA-TC-A------G--G------ACAAA----------------C--C----A-T--CGG-T-ATT--A-GAG----------TA-C--GAAT--G-GAA-T-CT-AG-A-TT---------ATT-C--CGA---AG-GTCGC-CG------------AGACA-G---CA--G-----A-A--TTGGGTT-----T---T-aaacatctttgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatatttctattttttctagaagaacattctattgtactgatgtagttaagagagtaaacagtctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgcttaaactaaatctgaactttaacagcgtataacagtatatcgtacgttaacataataaggtagtctcctcttctggtaaacgcaccttcgagactgcgcccggactggctttcggatgcattcgtacacttaatataatatcgtggacctttcggtgtagccattcgtatttcttcttatttagatggtgcttttcgtattatggttcggaagtcaccgtttgccttcgtgttcgagtcggattgtcatcgtgtagaccttctgttggacattgatatgtggcttcttagtgatcatttgccgttttttacaaattcggctggttatttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgcgGGATGGTC--TCCCG----------AAT-GTC-CAA-----TTTGG---TCAGTAAT-GA-AG-TCGATC--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC----T--CG-TTA-----TA-G-AAC-A-T-CAT--GA--GAC-AT-C-TAA-AT---T-T--A-T--C---G-TTG-TTC-G--C-GCT-C-GTC---T-T---A-CCCTG-TATCA--A-TTGATTCA--T-T-ATC--A-AACTGTGT--C--------TCT----C-C--CA--A-CT---T-----C---A--TC-T-CA-CCG-C--TGA-CA-A----------TA--CGAGTAA---GGGATGTTTTTGTT----ATATC-AC-TTTTA-----CTAG-CGCCG-ATT----G---T-CTT--TATTTGATTG------G---TAAC-ACGA-T-TAT--C-------ATAAG-TAGG-CCTACGCA---A---AT-AA-TC-AAATATCG--GC-----AC--G----------------C--C---------T-G-T-ATT--A-GAG-----------A-C--G-AT--G-ACACT-CT-AG-A-TGCGA------ATT-C--C-A---A--GCCGC-CG-----------AAGACA-G---CC--GA----A-G--TGGGTTTAAAAAT---T-AT--G-AC--C----AAAAAATAAAAT-CG-T-CTAAAAAtt
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtgGGATGGTC--TCTTG----------AAT-GTC-CAA-----TTTCG---TAA----T-AA-GT-TC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgcgATGGTCCCTCCG-----------AAT-GTC--AA-----TTTCG---TAG----T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----AT-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--T-C-TAA-TT---A-T--A-T--C---G-T-G-TTT-A--C-G-T-C-GTC-T-T-T---A-CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CG--T-T-A-C--A--------T--C--------GG-------C--CA--A-CT---T-----C---A--TC-A-CA-CTA-A--TGG-AA-T----------AA--CGA--A----G------------T----A-ACA-AC-G---AA--GC-T-G-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T----AAC-G----A-CAT--C-------GTA-A-TA-----T--GCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT--A-GA-----------TA-C--G-AT--GTGCA-T-CT-AG-A-TG-GA------ATT-C--CGA---A--GTCGC-CG-----------AAGACA-G---TC--GA----A-G--TGGGTTT-----T---T-AT--G-AC--CAAAAAAA----------TG-T-CTA-AAAATAAAAT-T-A--T-GA-T--G-AATAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TTT-C-AT-T-T--CAAAAGT-T--CA----TG-T-GGAC---AA-TG-ACCAACT-T--A-A---TAA-C-G---A----CAGAAAA--GAAATG-C-A-T---------GGC-A--CTTC--T--G-A-CATTAT--TG-CAAC-TT----AA----GAACAT--GAC--A---AA--ACT-CCT-ACAGG-CACAGC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGGTC--TCCCG----------AAT-GTC-CCA-----TTACG---TAA----T-AA-GT-TCG--TTGA---TTGA-------T-CAATCTT--AC--TC--GGT--CG-T-A-----TA-GGA-C-A-TACGT--GAA-GAC-AT-C-TAA-CTT--A-T--A-TT-CTTCG-T-G-TTT-C--C-G-TTC-GTC-T-T-T---A-CCTCGATAT-A--A-TTAATTCG--T-TTA-C--A-A------T--C--------GG-----C-C--CA--A-CT---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGGAAA-A----------TA--CGA--AG---A------------T----A-ACC-AC-G---AAG-GCTT-G-C-CCC-ATT----G---T-C-T--AA---GATGG----------TAAC-AC---A-CAT--C-------GTAAG-GAG--GCTC-GCA---A--TGC--A-TC-A------G--G------AC--A----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT--T-AAG----------TAGC--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-GA------ATT-C--CGA---AT-GTCGC-CG-----------AGGACA-G---CA--G-----A-A--TTGGGTT-----T---T-atctattgttttaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatttattctaattttctagaatgacatctattattatgatatttaagagagtaaacagtgcacgaaacagtgaaaattatttgattagaatgtgctaccaacaaacaagaaagtttgtcctctgtgatgcacgtattgacatttaattgtacatttccacatcttactatataaaatattcttgttaacttaaccgcgtataacagtatattgacacagttacataataggtagtcatggtaacgccttcggagactgcgcgagactacattcggatgcaccgtacacttgatacgatatcgtgtgaccttcgtgagtgcatccatatgttcttcttatttagaacgtgtgcttttcgtatatggttggaagtcaccgtggtgaccttttattaacatcgtatgtgcttctcagtgatcatttgccgttttttcaaattcggcggcattttca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ga-----------AAT-GTC-CAA-----TGTTGCGGTAA----T-AA-GT-TCG-----A---T-GAATGAAGTT-AA-TATT--ACATTC--G-T--CGGT-A-----TA-GGA-C-A-TACGT--GAAAGAC-GTGC-T-A-AT---A-G--A-TT-C---G-T-G-TTT-C--CCG-TAC-GTC-T-T-A---A-CCTCG-TAT-A--AAT-AAT-CG--TAT-A-C--A-A------TTCC--------GGAACCCT-C--CT--A-CT---TAGTAGC---AA-TCATGCA-C-G-AGATCG-AA-AACTTGATAATTA--AAA--AA---C------------TCAAGA-ACAGAC-C---AA--GACT-G-CGCCGTACTTTATG---T-CCTTGAA---GATGGATTGTAT---TAAC-ACGG-C-AATTAC-------GTA-A-TAG--GCTC-GCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--GAATCC-----------C--T----A-T--C-G-T-ATC--ATAAG----------TA-C--G-A---G-GCA-T-CT-AGTA-TG-GG------AAT-T--CGA---AAGGTCAT-CGTTCCGATTAAGAAGACATG---CC--GTGTTCACG--TTGATTT-----T---T-ATTAG-AC--CAAAATAAAAATA---T-TGGT-CTGAAAAATAAATG-T-AGAT-GA-T--G-CAAATTAGATCT-GTGC--A-T-TTG-C-ATATTT--CAAAAGT-T-GCAGAA-TG-CCGGAC---AAATG-GCCAA-T-T--A-A---TTA-C-GAGCA----CAGAAAAAGATT-TGACGG-TCTACCCTGAGG--A--CTTTCAT--G-A-CAATAT-TTGACAC--CC----AATTAGGGA-AT--GAA--AAATAATTACTACTT-ACAGGGCACAGCAATCTATTGTTTTAGGCCTCAATGACATATGATAACTTATATTTATTTGGAGAGTCTCTCA---AAT-AT--TCTAATTT----------TT--C---------TAGAA-GGATA-TCTATT-TA-CT----ATGAT-AT--TTA-AGAG--AGTAGACA-G-TGC-AC--GAAACA---G--TGAAA-A-TCATT-TTATTAG--------------ACAAACAAGAAA-GTTTGTC-A-CT------------GTG----AT-AC-ACGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCGAC-AT-CTTACTATACAAAGTA---TTCT-TCTT----A---CAC----TGAAT-----CTG-AAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgcgggaccttttctacaccgtaaa-----------AGT-GTC-CAA-----TTTCG---T-A----T-AA-GTCTCT--G--G---T-GA-------TACA-TCT---AC--TC--G-TATCG-T-A-----TG-G-A-C-A-T-CG---GTA-AACGAT-C-T---AT---A-T--A-TT-C-----T-G-TTT-C--C-G-T-C-GTCTG-T-T---A-CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CG--T-T-AAC--A-A------T--T--------CGG----C-C--CA--A-CT---T---------A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-AG---------TA--CGA--A----G------------T----A-AC--AC-G---AAAAGCC--G-C-CCG-ATT----G---TTCTT--AA---GATG-----------TAACTACTA---CAT--C-------GTTAA-T--CAGCTA-GCA------TGC-AA-TC-A------G--G------GC--A----------------C--CTGACA-T--C-G-T-ATT--A--AG----------TA----G-AT--G-GCA-TTCT-AG-A-TG-GA------ACC-C--CGA---A----CGC-CG-----------AAG--------------------------GGTT-----T---T-ATTAG-AC---------AAAAAAAACT-TG-T-CTA-AAAATAAA-T-T-AG-T-GG-T--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TCT-C-AT-T-T--CAAGA---T-GCA----TG---GGAC---AA-TG-GCCAACT-T--A-A---TAA-C-GA-CA----CAG-AAAAGAAATTG-CGATT---------GGC-ACGCTTT--T--GAA-CATTTT-GCG-CAAACTT----A---GGGAACAT--GAC--GAA-AA--AC--TCT-AAAGG-CACAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcgggatgggtctcggtgttgaAT-GTC-CAA-----TTTCG---TAA----T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-ttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cccgg----T-GA-AT-TCG--T--A---T-GT-------T-CG-TTTTGAA-------G-T--CG-T-A------A-G-G-C-AAT-CGT--GAG-GGT-AT-C-T----T---G-TCAA-AT-C---G-T-G-TCT-CATC-T-T-C-GTC-T-T-G---A-CTACG-TGT-G--A-T-CAT-CG--C-T-G-C--C-A------T-----------GAG----T-T--TT--T-TT---T-----T---G--TC-T-CA-C-G-A--CGA-CA-A----------TA--CGA--AG---G------------A----A-ACA-AA-G---AG----CT-G-C-CTG-ATA----T---C-CGT--AA---GAT-G------C---CAAC-ACGA-C-TA---C-------GT-GA--AGT-CCT---C------------------------G--G------AT--G----------------C--T----G-T--C-A-T----------G----------TA-T--G-AT------A-T-CG-AA-A-TG-AG------ACC-A--CAA---T--GTCGG-CG-----------AAGACA-G---CC--G-----A-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gt-GT-TCG--T--G---T-TA-------C-CA-TCTT--A------------------------A-G-A-C-AAT-CGG--GAA-G-C-TT-CGTGG-TT---A-C----TT-C---G-T-A-TTT-C--C-A-T-C-GTa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                        gcgggatggttttcccgaatgtccaatttcgtaaataagttcgtatgatcatcttactcgtcgtatagaacatcgtgaagacatctaatatttcgtgtttccgtcgtctttacctcgtataaaaatcgttacaatcggcccaacttcatctc-TCG--T--A---T-TA-------C-CA-TCTT--A------------------------A-G-A-C-AAT-CGG--GCA-G-C-TT-CGTGG-TT---A-C----TT-C---G-T-A-TTT-C--C-A-T-C-GTatcgtaataggctcgcaatgcaatcaggacaccatcgtattagagtacgatggcatctagatggaattccgaagtcgccgaagacagcagaattgggtt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                              gcgggatggtctcccgaatgtccaatttcgtaataagttcgtatgatcatcttgctcgtcgtatagacatcgtgaagacatctaatatattcgtgtttccgtcgtttttacatcgtataataatcgttacaatcggcccaacttcatctc--T--A---T-GA-------T-CA-TCT---AC--TCCGG-TT-CG-T-A-----TG-G-A-C-AAT-CGT--GTA-AAG-AT-C---A-AT---A-T--AGTT-C-----T-G-TTT-C----G-T-C-GTTCTGT-T---A-CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CG--T-T-AAC--A-A------T--C--------TGG----CGC--CA--A-CT---T-----T---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--AAAAGA------------T----A-ACA-AC-G---AA--AGCC-G-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---TATG-----------TAAT-CT---A-CAT--C-------GTTAA-CAGC-TC---GCAC--A--TGC-AC-TC-A------G--GGCATCTAC--T----------------CAGC----A-T--C-G-T-ATT-----AA----------TA----G-AT--G-GCA-T-TT-AG-A-TG-AA-------------C------------C-CG-----------AA-ACG------C--G-----A-A--TGG--TT-----TATGT-AT--G-AC--------AAAAAAGAACT-TG-T-CTA-AAAAT-AAAT-T-A--T-GG-T--G-AAAAT-AG-TCGAAT-C--A-T-TCT-C-AT---T--CAA-----T-GCA-------T-GGGC---AA-TG-GCCAACT-T--A-A---TAA-C--A-CA----CAGAAA---AGAATTGCGA-T---------GGC-A--C--G--T--G-A-CATTATGGTG-CCA--------ACTTAGGAACAT--GACGAAAA-GA--ACT-CTT-A-AGG-CACAGCcattgtattaggttcgcaatgcgatcaggacgccatcgtatttgagtacgatggcatattagaggaatccgaagtcgccgaagacagccgaagtgggtttttatgacaaaaaaaaagaacttgtctaaaaataaaattatggtgaaaaatagtcgatcattttcattccaaagtgctgtggacaatcgccaacttaataacgaacaaaaaaagaaatgcgatggcactactgacattattggaacttagggaacatgacgaaaaactcttacag
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttatttttagacaagttctttttgtcataaatacccacttcggcgacttcgggactcA-C-G-A--CGG-AA-A----------CA--CGC--AA----------------T----ATATT-A--G---AT--GTCT-T-C-CCG-AT-----G---T-CTT--AC---GACGA------G---CAAG-ATGA-ATCAT--ttctattgtttcaggtaaa
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcggatgtctcccgaatgccaatttcgtaataattcgt-AC-G---AA--GC-T-G-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------ctataacctcgctatagtaatcgtacaacggcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TT----G---TTCTT--AA---AGTAG------TATTTTGT-ACGA---CAT--C-------GTA-A-TAG--GCTT-GCATGTA--TGT-AA-TCGA------G--G------AC-------------------C--C----ACT--C-G-TGATTTGA-GAG----------TA-CAGG-ATT-G-GCA-T-CTTAG-A-TG-AA------CTCCT--CGA---A--GTCGC--G-----------AAGACA-G---CC--G-----A-G--TGCTGTT-----T---T-CT--G-ATGACACAAATATAAAAAACTCTG-T-CTTAAAAATAAAAT---A--T-GGGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TTTGCGAA-TCG--C-AAAGT-T-GCGTTATTG-T-GGACTAGAA-TG-GC--ACT-T--ATA---TAcaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---TAAG-AAGA-A-CAT----------ATGGA-T-GC-ACT---CA--------C-GA----A------G--GTCAC--AC--G----------------A--T----A-T--C-G-T-ATCA-A-GTG----------TA-C--G-GT----GCA-T-CC-GA-A-TG-TA------GTC-TCGCGC---A--GTCTC-CG-----------AAGGC
gi|18                         : aatggtccctccgaatgtcaatttcgtagtaagttcgtatgatcatcttactcgtcgtaatgacatcgtgaagactctaattatatcgtgtttacgtcgtctttacctcgtataataatcgttacatcggccaacttcatcacactaatggaataacgaagtaacaacgaagctgcccgattgtcttaagatggtaacgacatcgtaatatgcaatgcaatcaggacgccatcgtattagatacgatgtgcatctagatggaattccgaagtcgccgaagacagtcgaagtgggtttttatgaccaaaaaaatgtctaaaaataaaattatgatgaatatagtcgatcattttcatttcaaaagttcatgtggacaatgaccaacttaataacgacagaaaagaaatgcatggcacttctgacattattgcaacttaagaacatgacaaaactcctacaggcacagcatctattgttttaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatttattctaattttctagaatgacatctattattatgatatttaagagagtaaacagtgcacgaaacagtgaaaattatttgattagaatgtgctaccaacaaacaagaaagtttgtcctctgtgatgcacgtattgacatttaattgtacatttccacatcttactatataaaatattcttgttaacttaaccgcgtataacagtatattgacacagttacataataggtagtcatggtaac---TAAG-AAGA-A-CATA-C-------G------AAT-GCT--ACA---A--CGA-AGGTC-A------C---------AC--G----------------A--T----A-T--C-G-T-ATTA-A-GTG----------TA-C--G-AT----GCA-T-CC-GA-A-TG-TA------GTC-C--CGGCGCA--GTC-T-CG-----------AAGGCtttagaacgtgtgcttttcgtatatggttggaagtcaccgtggtgaccttttattaacatcgtatgtgcttctcagtgatcatttgccgttttttcaaattcggcggcattttca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caacatagttacatcatggtatacgtaac--GCA---A--TGC-GA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-AT-AG-A-TG-GA------ACT-C--CGA---A--GTCGC-CG-----------AAGACA-G---CC--GA----A-G--TGGGTTT-----T---T-AT--G-AC-----AAAAAAAAAGAACT-TG-T-CTA-AAAATAAAAT-T-A--T-GG-T--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-T-GCA----TG-T-GGAC---AA-TC-GCCAACT-T--A-A---TAA-C-GA-CA----CAAAAAAAG-AAATG-CGA-T---------GGC-A--CTAC--T--G-A-CATTAT--TG-GAAC-TT----A---GGGAACAT--GAtttagaacgtgtgcttttcgtatatggttcggaagtcaccgtgtgaccttcgtgttcgggtcggatgtcatcgtgtgacattctgttgacatcgtatgtgcttctagtgatcatttgccgttttttcaaattcggcagtattttc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aggttcA---A--TTC-CA-TC-T------A--G------AT--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ACT--C-TAA----------TA-C--G-AT--G-GTG-T-CC-TG-A-TT-GC------ATT-G--CGA---
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcgggatggttttcccgaatgtccaatttcgtaaataagttcgtatgatcatcttactcgtcgtatagaacatcgtgaagacatctaatatttcgtgtttccgtcgtctttacctcgtataaaaatcgttacaatcggcccaacttcatctcacgatggaaatacgaagtaaccacgaagcttcccgattgtcttaagatggtaacacgaacatcgtaataggcA---A--TTC-CA-TC-T------A--G------AT--G----------------C--C----A-T--C-GCT-ACT--T-AAA----------TA-C--G-AT--G-GTG-T-CC-TG-A-T--GC------ATT-G--CGA---ccgaagtcgccgaagacagcagaattgggtt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaggtctcccgaatgtcccattacgtaataagttcgttgattgatcaatcttactcggtcgtataggacatacgtgaagacatctaacttatattcttcgtgtttccgttcgtctttacctcgatataattaattcgtttacaatcggcccaacttcatctcacgatggaaaatacgaagataaccacgaaggcttgccccattgtctaagatggtaacacacatcgtaaggaggcA-TC-T------A--G------AT--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ACT--C-AAA----------TA-C--G-AT--G-GCG-T-CC-TG-A-Tccgaatgtcgccgaggacagcagaattgggtttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgcgggatggtctcccgaatgaataagttcgtatgatcatcttgctcgtcgtatagacatcgtgaagacatctaatatattcgtgtttccgtcgtctttacatcgtataataatcgttacaatcggcccaacttcatctcacgagaaatacgaagtaaccacgaagctgcccgattgtcttaagatggtaatacgacatcgtaataggctcgcattgca------AT--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ACT--C-AAA----------TA-C--G-AT--G-GCG-T-CC-TG-A-TC-GC------ATT-G--CGA---A--ggaactccgaagtcgccgaagacagccgaatgggtttttatgacaaaaaagaacttgtctcaaaataaattatgggtgaaaatagtcgatcattttcattccaaagtttgcatgtggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaatgcgatggcacttctgacattattgcaacttagggaacatgacgaaaaactcttacaggcaacaacatctattgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgattttttctaatttttctagaagga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcgggatggtctcccgaatgtccaatttcgtaataagttcgtatgatcatcttgctcgtcgtatagacatcgtgaagacatctaatatattcgtgtttccgtcgtttttacatcgtataataatcgttacaatcggcccaacttcatctcacgatggaaatacgaagtaaccacgaagctgcccgattgtcttaagatggtaatacgacattgtattagg------AT--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ACT--C-AAA----------TA-C--G-AT--G-GCG-T-CC-TG-A-TC-GC------ATT-G--CGA---A--attagaggaatccgaagtcgccgaagacagccgaagtgggtttttatgacaaaaaaaaagaacttgtctaaaaataaaattatggtgaaaaatagtcgatcattttcattccaaagtgctgtggacaatcgccaacttaataacgaacaaaaaaagaaatgcgatggcactactgacattattggaacttagggaacatgacgaaaaactcttacag
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cggatggtctcccgaatgtccaatttcgtaataagttcgtatgacatcttgctcgtcgtatagacatcgtgaagacatctaatatattcgtgtttccgtgtttttacatcgtataataatcgttacaacggcccaacttcatctcacgatggaaatacgaagtaaccacgaagctgcccgattgtcttagatgtgtaatacgacattgtattagg------AC--G----------------A--T----A-T--C-G-T-ATTA-A-GTG----------TA-C--G-AT----GCA-T-CC-GA-A-TG-atagaggaatccgaagtcgccgaacagccgaagtgggtttttatgacaaaaaaaagaacttgtctaaaaaataattatggtgaaaatgtcgatattttcattccaaagtgccatgtggacaatcgccaaattaattaacgacacaaaaaagaaatgacgatgccaactactgattattggaacttagggaacatgacgaaaaactcttacag
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttgtacaattccacatcttactatataaatattcttcttaaacttaatctgaacttaaccgcgtataacagtatatcgacacagttacataataaggtagtcatggtaacgccgttgagactgcactgggacta------AT--G----------------C--C----A-T--C-G-T-ACT--C-AAA----------TA-C--G-AT--G-GCG-T-CC-TG-A-TC-GC------ATT-G--CGA---A--gtgaccttcgtgtagcaatcgtatgttcttattcagaacgtgtgcttttcgtatat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agg----------------C--C----A-TA-C-G-A-ACC--G-GAG----------TA----G-AT--G---A-T-C-----A-TA-GA------GTC-C--CGA---A--GTCGC-CG-----------A--------------------A-G--TGGGTAT-----T---T-AT--G-AC---------AAAAAGAACT-TG-T-CTA-AAAATAAatagatggaactccgaagtcgccgaagacagccgaagtgggtttttatgacaaaaaaaaagaacttgtctaaaaataaaattatggtgaaaatagtcgatcattttcattccaaagttgcatgtggacaatcgccaacttaataacgacacaaaaaaagaaatgcgatggcactactgacattattggaacttagggaacatga
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTTT-----T---T-AT--G-AC--------AAAAACAAGCT-TG-T-CTA-AAAATAAAAT-T-A--T-GG-T--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--A-T-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-T-GCA----TG-T-GGAC---AA-TG-GCCAACT-T--A-A---TAA-C-GA-CA----CAGAAAA--GAAATG-CAA-T---------GGC-A--CGCC--T--G-A-CATTAT--TG-GAAC-TT----A---GGGAACAT--GAC--acaatcgtgtaaagatcaatatagttctgtttcgtcgttctgttacctcgtataataatcgttaacaatctggcgccaactttatctcacgatggaaatacgaaaaagataacaacgaaagccgcccgattgtcttaatatgtaatctacatcgttaacagctcgcacatgcactcagggcatctactcagcatcgtattaatagatggcatttagatgaacccgaaacgcgaatggtttatgtatgacaaaaaagaacttgtctaaaaataaattatggtgaaaatagtcgaatcattctcattcaatgcatgggcaatggccaacttaataacacacagaaaagaattgcgatggcacgtgacattatggtgccaacttaggaacatgacgaaaagaactcttaaggcacagcttctattgtttcaggtaaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TT-----T---T-AT--G-AC--T-------TAAAAAAAT-TG-T-CTA-AAAATAAAAT-TCAT-T-GA-T--G-AAAAT-GG-C---ATAC--A-TGTTC-C-AT---T--CAAATGT-TGGCA----TG-T-GGAC---AA-TGAGCCAACT-T--ACA---TAGCC-GA-CA----CAGAAA---AGAATG-CGA-T---------GGT-A--CTTA--T--G-A-CA-TAT-CTG-CAA--CT----TAGCGGACACATGAGAC--AA--AA--ACT-CTTAACAGG-CACAGC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AT-AG-TCG-AT-C--A-T-TAT-C-AT-T-T--CAAA-GT-T-GCA----TG-T-GGAC---AA-TG-GCCactattgtatttaggtaaatgtatgtatgacctaatttgatgttgattctaatttttctagaagggcatctatat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTATT-GAT-AA--CCTAATTTG-TGAT-TTTTT--CTAATTTTTCTAGAA-GGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgcgggatggtctcccgaatgaataagttcgtatgatcatcttgctcgtcgtatagacatcgtgaagacatctaatatattcgtgtttccgtcgtctttacatcgtataataatcgttacaatcggcccaacttcatctcacgagaaatacgaagtaaccacgaagctgcccgattgtcttaagatggtaatacgacatcgtaataggctcgcattgcaatcaggacgccatcgtatttgagtacgatggcatctagatggaactccgaagtcgccgaagacagccgaatgggtttttatgacaaaaaagaacttgtctcaaaataaattatgggtgaaaatagtcgatcattttcattccaaagtttgcatgtggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaatgcgatggcacttctgacattattgcaacttagggaacatgacgaaaaactcttacaggcaacaacatctattgtttcaggtaaaTGTATT-GAT-AA--CCTAATTTG-TGAT-TTATT--CTAATTTT-CTAGAA-TGACA-TCTATT--A-TT----ATG---ATATTTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGC-AC--GAAACA---G--TGAAA-A-TTATT-TGATTAGAAT-GTGC-TACCAACAAACAAGAAA-GTTTGTC-CTCT------------GTG----AT-GC-ACGTAT--TGACATT-T-AATTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATAAAATA---TTCT-TGTT----A-------------------------ACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--TG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--A-GGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TCGGA-G--ACT-GCG-CG---AGACT-AC-A-T-TC--GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTGAT-AC--GA-TAT-C-GTGTG-AC-------CTTC-GTGAG-T--G-C--A-TC--CA-T-AT----GTT-CTTCTT----ATT---T-AGA--AC------G-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TG-G-TT-GGAAGTCACCG-TGGT---GA-CC-TT-T-TA--TT-------------------------A-A----C-ATCGTA----T-GT--GCTTC-T------------------------------------C-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatggtccctccgaatgtcaatttcgtagtaagttcgtatgatcatcttactcgtcgtaatgacatcgtgaagactctaattatatcgtgtttacgtcgtctttacctcgtataataatcgttacatcggccaacttcatcacactaatggaataacgaagtaacaacgaagctgcccgattgtcttaagatggtaacgacatcgtaatatgcaatgcaatcaggacgccatcgtattagatacgatgtgcatctagatggaattccgaagtcgccgaagacagtcgaagtgggtttttatgaccaaaaaaatgtctaaaaataaaattatgatgaatatagtcgatcattttcatttcaaaagttcatgtggacaatgaccaacttaataacgacagaaaagaaatgcatggcacttctgacattattgcaacttaagaacatgacaaaactcctacaggcacagcatctattgttttaggtaaaTGTATT-GATTAA--CCTAATTTGGTGGT-TTATTTTCTTATTTTTCTAGAA-G-ACA-T-TATT-TA-TG----AAG---AT--T-A-AGAG--AGTAAACA-G--AC--C--GACACA---GGGTGGGA-A-TTATT-T-ATTAGAATTGTGC-TACCAA-AAACAAGAATAGTTGGTCGA-CT------------GT-----AT-ACGACG-AT-ATGACATT-T-ACTTGT-AC--TTTCAC-AT-C-TAC-ATATA--ATA---TTCT-TCTTTAGCG---CTA----T--AT-----CTGAAACTT-AACC-G-TAT--A-AACAGTA--AT--CG-ACACAAG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGT-GTC-------A-TGGT--------------A---TG-C-T-TC-GA-G--ACT-GCGC-----AGACT-AC-A-T-TCT-GGGTGCGA-CC-GT-T-ACTT-AT-AC--GA-TAT---GTGTG-A--------CTTC-AT--GCT-AGCC--A-TC--GG-T-AT----GTT--TTCTT----ATT---TAAGA--A----------G-TG-C--TTTCGTA-TATTGCA-TTCGG-AGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GGTATCTGG-ATTGTCTATCGTG----T-GA---CGTC-T----------TT-GACCTTCG-T---TGT-GCTTC-TCA-GT-GA--TA-TT------TGCC-T-TTT--TG--T--CTAAAGTT----CGG--C-GG-CATTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cggatggtctcccaatcgtcaattcgtaataattcgtatgcagcttctcgtcggatatgaatcgtgaagactaatatatattcgtggtttccgtcgtctttctcgtatgtaaagttacaatcggtccaacttcagatatcagcgaactggaatcgaagtaaccacgaagctgccgattgtttaaggatggtaacacgaccgaggacggtgccatcgtataagagtagattgggcatcttgagtggaattccgtatcagacagccgaagttgggtttttatgcaccaagataataattgtcatatataagattagatgcaactagtcgatcatttttcattttcaaagtgtgctgggacaatggcaacttataactgacacagataataaatgcgatgggcattctgacgttagtgcaacgttaggcggacatgacaaactcttacagacacatgcctattgtttttaggtaaaTGTATT-GAT-AA--CCTAATTTG-TGAT-AT-TT--CTATTTTTTCTAGAA-GAACATTCTATTGTACTG----ATGT--AG--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcgggatggtctccgaatcgtccaatttcgtaattaaattcgtgaatgacatcgtactcgtctatatcacatgtgagacatctaataatattcgtgtttccgtccgttcttctagcctcgtataataatcgtacaatgcggatctcacgatggaaaatcacggtaaccaccgaagttgcccgattgtttaagagtcaacacgacatcgtaataggtcgcaatacaatcaggacgccatttcgtttaagagttcagatggcatctagatgaactcgcggagtccgacgtgggttttttatgacaaaaagaacttgtccaaacaaaattattggtgaaaatagtcgatcattttcatttcaaagttgcatgttagacaaaaggccaactttcaataacgacacagaaaaaagaaatgcgattggcactctgaccattttgaacttagggaacatgacgaaaactcatacaggcacaaaacatctttgtttcaggtaaaTGTATGT-AT-GA--CCTAATTTGATG-T-TGATT--CTAATTTTTCTAGAA-GGGCA-TCTATctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgcttaaactaaatctgaactttaacagcgtataacagtatatcgtacgttaacataataaggtagtctcctcttctggtaaacgcaccttcgagactgcgcccggactggctttcggatgcattcgtacacttaatataatatcgtggacctttcggtgtagccattcgtatttcttcttatttagatggtgcttttcgtattatggttcggaagtcaccgtttgccttcgtgttcgagtcggattgtcatcgtgtagaccttctgttggacattgatatgtggcttcttagtgatcatttgccgttttttacaaattcggctggttatttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttttatgacttaaaaaaattgtctaaaaataaaattcattgatgaaaatggcatacatgttccattcaaatgttggcatgtggacaatgagccaacttacatagccgacacagaaaagaatgcgatggtacttatgacatatctgcaacttagcggacacatgagacaaaaactcttaacaggcacagcactattgtatttaggtaaaTTGAT-AAACCCTAATTTG-TGATCTTTTT--CTAGATTTTCTAG-A-GGACGATCTATT-TA-TT----ATG---ATA-TTT-AGAG--AGTAAGCA-GTTGC-CC--GAAACA---G--TGAAA-GTTTATT-Tat
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtacgaagtaacacgaaaagccgcccgattgttcttaagatgtaactactacatcgttaatcagctagcatgcaatcagggcacctgacatcgtattaagtagatggcattctagatggaaccccgaacgccgaagggttttattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatga--CCTAATTTG-TGAT-TTATT--CTAATTTTTCTAGTA-GGAagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAA-GGACA-TCTATT-TA-TT----ATG---AT----A-AGAG--AGTAAACA-A-TGC-AC--GAAACT---G--TGAAA-A-TT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GACA-TCTATT-TA-TT----ATG---AT----A-AGCG--AGTAAAAA-G-TGC-AC--AAAACT---G--TGAAA-A-TTATT-TTATTAGAAT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----TAAAT-----CTG-AACTTTAACA-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG--TAC--G-TTAAC-A-TA-AT--AAGGTAGTCTCCTCTTC-TGGTA-------------AACGCACC-T-TC-GA-G--ACT-GCGCCC---GGACTGGC-T-T-TC--GGATGC-ATTC-GTAC-ACTTAAT-AT--AA-TAT-C-GTG-G-ACCT------TTCGGT--G-T-AGCC--A-TT--CG-T-AT-----TT-CTTCTT----ATT---T-AG---AT------G--G-TG-CT-TTTCGTATTA-TG-G-TTCGGAAGTCACCG-T-TT---G--CC-TT-CGTG--TTC----------------GA-GTC-GG-ATTGTC-ATCGTG----TAGA--CCTTC-TG---------TTGGACA-TTGAT--ATGTGGCTTCTT-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---TTAC--AAATT----CGG--CTGGTTATTTT
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtacgaagtaacacgaaaagccgcccgattgttcttaagatgtaactactacatcgttaatcagctagcatgcaatcagggcacctgacatcgtattaagtagatggcattctagatggaaccccgaacgccgaagggttttattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgcAACAGTA-TATATTG-AC-C-AG-TT-AC-A-TA-AT--A-GGTAGTC-------A-TGGT--------------------------------------GCGCCG---GGAC--A--A-T-TC--G-ATGC-A-TC-GTAC-ACT-AA--AC--GA--ATAC-GTGTG-AC---------TC-GT--G-T-AG-C--A-TTG-CG-T-AT----G-T-CTTCTT----ATT---T-AGA--AC------G-T--TGCCT-TTTCGTA-TA-TG-G-TTC-GAATTCACCG-T-GT---GA-CCTTT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GGAA-TGTC-ATCCTGCTGTT-GA--ACTTA-TG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-G
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --CA-ACAT-AG-TT-AC-A-TC-AT----GGTATAC-----------GTA-------------A---CGCC-T-TC-GA-G--ACT-GCGCCG---GGACT-AC-A-T-TC--GGATGC-A-TC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TAT-C-GTGTG-ACCT-------TC-GTT-G-T-AG-C--A-TT--CG-T-AT----GTT-CTTCTT----ATT---T-AGA--AC------G-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TG-G-TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CATTC-TG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-AG-TATTTTC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GA-G--ACT-GCGCCC---AGACT-AC-A-T-TC--GGGTGC-A-CC-GTAT-ACTTAAT-AC--GA-TAT-C-GTGTG-ACCT-------TC-AT--G-T-AG-C--A-TT--CG-T-AT----GTT-TTTCTT----ATT---T-AGA--AC------G-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TG-A-TTCGGAAGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GG-ATC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA---CCTC-TG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-T-TTT--TTG-T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-------------A---C-CC-T-TC-GG------C-GT-TCG---GGGTT-CC-A-TCTA--GAATGC----C-ATCT-ACTTAAT-AC--GA-TGT-C-AGGTG-CCCTG---ATTGC-AT--GCT-AG-CTGA-TTAACGAT-GTAGTAGTTACATCTT----A-------AGA--ACAATCGGG-CG--G-CT-TTTCGTG-T--TA-C-TTCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtaGTC-T-TC-GGCG--ACT----TCG---GAATT-CC-A-T-CT--AGATGCCA-TC-GTAC-TCT-AAT-AC--GA-TG----GTGT---CCTGATTGCATT-GC--G---AG-CCTA-TTA-CG---AT----GTT-CGTGTT----Attattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcgggatggttttcccgaatgtccaatttcgtaaataagttcgtatgatcatcttactcgtcgtatagaacatcgtgaagacatctaatatttcgtgtttccgtcgtctttacctcgtataaaaatcgttacaatcggcccaacttcatctcacgatggaaatacgaagtaaccacgaagcttcccgattgtcttaagatggAAT-AC--GA-TAT-C-GTATG-ACCT-------TC-GT--G-T-AG-C--A-AT--CG-T-AT----GTT-CTTCTT----ATT---T-AGagcagaattgggtt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -ATCGTG----T-GA--CCTTCGTG---------TA-GCAA-TCG-T--ATGT-TCTT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgtacaattccacatcttactatataaatattcttcttaaacttaatctgaacttaaccgcgtataacagtatatcgacacagttacataataaggtagtcatggtaacgccgttgagactgcactgggactacattcggatgcatcgtacacttaatacgat-ATCGTA----T-GA--CCTTCGTG---------TA-GCAA-TCG-T--ATGT-TCTTC-T-attcagaacgtgtgcttttcgtatat
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatacgatCA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCCTG-TTT--T---T--C--AAATT----CGA--C-GG-TATTTTCAtatttag
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): AATGGCATAGTTTGATGATGGGAAAAAGACAGCAGCAGCGCTACTTATTTTGATGCTACGCAGAGAACATGATGGACAACTCTTACAGGTCCAACATCTCCTCTGACAAGTAAACATTGGTG
Unaligned ( gi|30 ): TCAACGATACTTGGATAATTTCTAATTCCTGTGTCATCTTGTTGTCAAAATTCGGACAGGTGACGCGCAGGC






Alignments
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Reference ( family-1730 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AATTCGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------C-C--C-A--AC-T---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--AA---G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GCCTG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T---TAAC-ACGA-ACAT--C-------G-T-A-A--TAG--G-C-T--CGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATTN-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----G-----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-CAAAAA-AAAGA-AC---T-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCT--CAAAAGT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAGAAAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-ACG--AAA--A-----ACT-CTT-ACAGG-C-ACAGCA-ATCTATTGTNNCACGCCTNANTNGCNTNNGGTNANNTGTATTNATNNNNAGANTCGTGTATTTGATAACCTAATTTG-TGATTTATT--CTAATTTTTCTAGAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG--A---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TCT-T--AC-T-TGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGG---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT--CTTCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-AGAG--AGTAAATACG-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-T-ATT-TTATTAGAATTGTGCGTACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTGTGAGGTA---A-CGTAT-CTGACATT-TTACTTGT-ACATTTCCACCATTCTTACTATATA---AAAATTTCA-TCTAC--AC-T--GAATC-----TG-AACTT-AACC-GGCGT--ATAACAGT--TAT--CT-ACAC-AG-TT-ACCA-TA-AT--AAGATAGTC-------ACTGATA-------------A---AGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGA---GACT-AC-AGTT--C-GGATGC-A-CCCGTAC-ACATAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT----TCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGTGATCTTCTTCTT----ATT---T-AGA--AC--TG-TG-CT-TTTCTTA-TA-TGGC-TTCGGAAGTCACCGAT-GT---GA-CC-TTTCGTG--TTC----------------GG-TCC-GA-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTATGA---------TT-GACA-TAG-T--ATGT-GC-TC-T-AGGT-GAT-CATTT------TGCC-G-TTTTCT---T--T--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTC
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCA---GACT-AC-A-TT--C-GGGTGC-A-CC-GTAT-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT----TCAT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTTTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GG-ATC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CC-TCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-T-TTT--TTG-T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCa
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g---AA-T-G-GCATAGTT-T--G-A-TG---A-T-GG---------GAAAAAGACA--G-CAG-CAG-C-----------G--CTAC--T--T-A-TTTTGA--T--G-C---TAC---GC----A---G-A-GA-ACATG-ATG--GAC--A-----ACT-CTT-ACAGG-T-CCAAC--ATCT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AACA-G-TGCA-CG--AAACTG--T---GAAA-A-TTATT-T-ATTAGAATTGTGC-TACCAAGAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-Ccctctgacaagtaaacattggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----C-----------GAA-TCGTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-TTAA-AT-TCG--TGAA---T-GA---------CA-TCGT--AC--TC--G-T--C--T-A-----TA-TCA-C-A-T--GT--GA--GAC--AT-CT-A-A----T-AATA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-CCGTTC-T-TCTAG--CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT----A-C-A-A--TG-C---------GG----------------------------------A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-AAT--------CA--CG--------G------------T----A-ACC-ACCG---A--A--GT-TG-C-CCG-ATT----G---T--TT--AA---GA--G------T---CAAC-ACGA--CAT--C-------G-T-A-A--TAG--G---T--CGCA---A--TAC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-TTTC-GT-TTAA-GAG----------TT-CA-G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG---A------ACTCGCGGA-G----TC-------------------------C----G-----ACG--TGG-GTT-T-----T--TT-AT--G-AC-----AA-AAAGA-AC---T-TGTCC-A-AA--CAAAAT-T-A--TTGGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--C-AAAGT-TG-CA----TGTT-AGA-CA--AA-A-G-GC-CAACT-TTCA-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAAGAAATG-CGATTGG-C-----------A--C-TC--T--G-ACCATT-T--T--G-----AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-ACG---AA--A-----ACT-CAT-ACAGG-C-ACAAAACATCT-TTGTTTCA----------------GGT-AAATGTATTGAT---------------------AACCTAATTTG-TGATAT-TT--CTATTTTTTCTAGAA-GAAC-ATTCT----ATTGTACTGATGT-A---G--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-T
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gcgggatggtctccgaatcgtccaatttcgtaattaaattcgtgaatgacatcgtactcgtctatatcacatgtgagacatctaataatattcgtgtttccgtccgttcttctagcctcgtataataatcgtacaatgcggatctcacgatggaaaatcacggtaaccaccgaagttgcccgattgtttaagagtcaacacgacatcgtaataggtcgcaatacaatcaggacgccatttcgtttaagagttcagatggcatctagatgaactcgcggagtccgacgtgggttttttatgacaaaaagaacttgtccaaacaaaattattggtgaaaatagtcgatcattttcatttcaaagttgcatgttagacaaaaggccaactttcaataacgacacagaaaaaagaaatgcgattggcactctgaccattttgaacttagggaacatgacgaaaactcatacaggcacaaaacatctttgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatatttctattttttctagaagaacattctattgtactgatgtagttaagagagtaaacagtctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgcttaaacGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG--A---T----A-AGCG--AGTAAAAA-G-TGCA-CA--AAACTG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG--A---T----A-AGAG--AGTAAACA-A-TGCA-CG--AAACTG--T---GAAA-A-TT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCCTG-TTT--T---T--C--AAATT----CGA--C-GG-TATTTTCA
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AT-AG-TCG-AT-C--AT-TAT-C-AT-T-T--CAAA-GT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-C
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----TT----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TC
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgcgCCTAATTTG-TGATTTATT--CTAATTTTTCTAGTA-GGA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcgTT-----TA-AACTG-AATC-G--GT--ATAATAGTAATAT--CGGACAC-A--CT-AC-A------------------------A-TAGTA------------------GCC-TATC-GAGGGACTTGCGCCGGAGAGA-T-AC-A-TT--C-G-ATGT-A-TC-GTAC-ACTTAATTACCGGACTATT-GTGTGG-ACCT---TTCGT-G-TTA--G-CA-T--CGT-GTGTC-----T----ATT---T-AGA--AAG-TGGTG-CTGTTTCGTA-AAATGG--TTCAGAAGTCACCG-TTGT---GAGCC-TT-CATGATTTC----------------GG--TC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-AC--CTTTCTG---------TT-TACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GTAGATGCA-TT------TGCC-G-TTT--T---TC-C--CAATT----CGG--CGGG-TATTTTCagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|5                          : gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtacgaagtaacacgaaaagccgcccgattgttcttaagatgtaactactacatcgttaatcagctagcatgcaatcagggcacctgacatcgtattaagtagatggcattctagatggaaccccgaacgccgaagggttttattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgcCGGATGG-TCT-C----CC----------AAT-C-GTC--AA-----TT----C-G---TAA-T-AA--T-TCG--T--A---T-G----------CA-GCTT---C--TC--G-T--CG-G-A-----TATG-A---A-T-CGT--GAA-GACTAAT------A----T-A-TA-TT-C---G-T-GGTTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-T-----CTCG-TAT-G----T-AA--AGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------T-C--C-A--AC-T---T-----C---AGATA-T-CAGC-G-AACTGG-AA------------T---CGA--A----G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GC-TG-C-C-G-ATT----G---T-TTA--AG---GATGG------T----AAC-ACGA----C--C-------G---------AG--G--------------------------A------C--G------GT--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATAA-GAG----------TA----G-ATTGG-GCA-T-CT-TG-AGTG-G-A------ATTC-CGTA------TC--------------AGACA-G---CC----G-----A-AGTTGG-GTT-T-----T--T--AT--GCAC-CAAGAT-AATAA------T-TGTC--A-TATATAAGAT-T-A----GAT--G-CAACT-AG-TCG-AT-C--AT-TTTTC-AT-TTT--CAAA-GTGTG-C-----TG---GGA-C---AA-T-G-GC--AACT-T--A---TA---A-CTGA-CA----CAGATAAT--AAATG-CGA-TGGGC-----------A---TTC--T--G-A-CGTTAG--T--G-C---AACG--TT----A---G-GCGG-ACATG-AC-----A--A-----ACT-CTT-ACAGA-C-AC-----------------ATGCCT-ATTGTTTTTAGGTAAA-TGTATTGAT--------------------TAACCTAATTTGGTGGTTTATTTTCTTATTTTTCTAGAA-G-AC-A-T-T----ATT-TATG-AAG--A---T--T-A-AGAG--AGTAAACA-G--AC--CG--ACACAGGGT---GGGA-A-TTATT-T-ATTAGAATTGTGC-TACCAA-AAACAAGAATAGTTGGTCGA-CT------------GT-----ATA-CGA-CG-AT-ATGACATT-T-ACTTGT-AC--TTTCAC-AT-C-TAC-ATAT-----AATATTCT-TCT-TTAGCGC-TATATC-----TGAAACTT-AACC-G-TAT--A-AACAGTA--AT--CG-ACACAAG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGT-GTC-------A-TGGT--------------A---TG-C-T-TC-GAG--ACT-GCGC--A---GACT-AC-A-TT--CTGGGTGCGA-CC-GT-T-ACTT-AT-AC--GA-TAT--GTGTG--A-----CTTCAT-GCT-A--GCCA-TC-GGT-ATGTT-TTCTT----ATT---TAAGA--A----G-TG-C--TTTCGTA-TA-TTGCATTCGG-AGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GGTATCTGG-ATTGTCTATCGTG----T-GA---CGTCT----------TT-GACCTTCG-T---TGT-GCTTC-TCA-GT-GAT--A-TT------TGCC-T-TTT--TG--T--CTAAAGTT----CGG--C-GG-CATTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGG-TCC-CT---CC----------GAA-T-GTC--AA-----TTT---C-G---TAG-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----AT-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC---T-CT-A-A----TTA-TA-T--C---G-T-G-TTT-A--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT--T-A-C-A----T--C---------GG-------C-C----A--AC-T---T-----C---A--TC-A-CA-CTA-A--TGG-AA-T----------AA--CGA--A----G------------T----A-ACA-AC-G---A--A--GC-TG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T----AAC-G----ACAT--C-------G-T-A-A--TA----------TGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATTA-GA-----------TA-C--G-AT--GTGCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---TC----GA----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-CAAAAA-AA-----------TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GAT--G-AATAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--CAAAAGT-T--CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-AC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-G---A----CAGAAAA--GAAATG-C-A-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A-----A-GA-ACATG-AC----AA--A-----ACT-CCT-ACAGG-C-ACAGC--ATCTATTGT----------------TTTAGGT-AAATGTATTGA---------------------TAACCTAATTTG-TGATTTATT--CTAA-TTTTCTAGAA-TGAC-A-TCT----A-T-TATT-ATGATA---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TGATTAGAA-TGTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-CTCT------------GTG----ATG-C-A-CGTAT--TGACATT-T-AATTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TGT-T---------------------AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--TG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT---AGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TCGGAG--ACT-GCG-CGA---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTGAT-AC--GA-TATC-GTGTG--AC----CTTCGT-G---AGTG-CA-TC-CAT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TT-GGAAGTCACCG-TGGT---GA-CC-TT-T-TA--TT-------------------------A-A----C-ATCGTA----T-GT--GCTTCT------------------------------------C-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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Reference ( family-1730 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AATTCGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------C-C--C-A--AC-T---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--AA---G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GCCTG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T---TAAC-ACGA-ACAT--C-------G-T-A-A--TAG--G-C-T--CGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----G-----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCT--CAAAAGT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAGAAAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CGAAA--A-----ACT-CTTA-CAGG-C-ACA-GCA-ATCTATTGTTTCACTATTTTAGG--T-AAATGTATTGATATGATTTAA-CCTA----------ATTTG------T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TC-TT-AAC-CTGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGG---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT--CTTCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCA---GACT-AC-A-TT--C-GGGTGC-A-CC-GTAT-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT----TCAT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTTTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GG-ATC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CC-TCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-T-TTT--TTG-T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcgC-TT-AAA-CTAAATC-----TG-AACTTTAACA-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG--TAC--G-TTAAC-A-TA-AT--AAGGTAGTCTCCTCTTC-TGGTA-------------AACGCACC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCG---GACTGGC-T-TT--C-GGATGC-ATTC-GTAC-ACTTAAT-AT--AA-TATC-GTG-G--ACCT--TTCGGT-G-T-A--GCCA-TT-CGT-AT-TTCTTCTT----ATT---T-AG---ATG--G-TG-CT-TTTCGTATTA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-TT---G--CC-TT-CGTG--TTC----------------GA-GTC-GG-ATTGTC-ATCGTG----TAGA--CCTTCTG---------TTGGACA-TTGAT--ATGTGGCTTCTT-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---TTAC--AAATT----CGG--CTGGTTATTTTctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgcttaaactaaatctgaactttaacagcgtataacagtatatcgtacgttaacataataaggtagtctcctcttctggtaaacgcaccttcgagactgcgcccggactggctttcggatgcattcgtacacttaatataatatcgtggacctttcggtgtagccattcgtatttcttcttatttagatggtgcttttcgtattatggttcggaagtcaccgtttgccttcgtgttcgagtcggattgtcatcgtgtagaccttctgttggacattgatatgtggcttcttagtgatcatttgccgttttttacaaattcggctggttatttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcgggatggtctccgaatcgtccaatttcgtaattaaattcgtgaatgacatcgtactcgtctatatcacatgtgagacatctaataatattcgtgtttccgtccgttcttctagcctcgtataataatcgtacaatgcggatctcacgatggaaaatcacggtaaccaccgaagttgcccgattgtttaagagtcaacacgacatcgtaataggtcgcaatacaatcaggacgccatttcgtttaagagttcagatggcatctagatgaactcgcggagtccgacgtgggttttttatgacaaaaagaacttgtccaaacaaaattattggtgaaaatagtcgatcattttcatttcaaagttgcatgttagacaaaaggccaactttcaataacgacacagaaaaaagaaatgcgattggcactctgaccattttgaacttagggaacatgacgaaaactcatacaggcacaaaacatctttgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatatttctattttttctagaagaacattctattgtactgatgtagttaagagagtaaacagtctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T----A-AGCG--AGTAAAAA-G-TGCA-CA--AAACTG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T----A-AGAG--AGTAAACA-A-TGCA-CG--AAACTG--T---GAAA-A-TT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCCTG-TTT--T---T--C--AAATT----CGA--C-GG-TATTTTCA
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AT-AG-TCG-AT-C--AT-TAT-C-AT-T-T--CAAA-GT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-C
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----TT----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TC
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgcg-CCTA----------ATTTG------T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGTA-GGA
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -C----CC----------GGA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AC-G---A--A--GC-TG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gcgTT-----TA-AACTG-AATC-G--GT--ATAATAGTAATAT--CGGACAC-A--CT-AC-A------------------------A-TAGTA------------------GCC-TATC-GAGGGACTTGCGCCGGAGAGA-T-AC-A-TT--C-G-ATGT-A-TC-GTAC-ACTTAATTACCGGACTATT-GTGTGG-ACCT---TTCGT-G-TTA--G-CA-T--CGT-GTGTC-----T----ATT---T-AGA--AAG-TGGTG-CTGTTTCGTA-AAATGG--TTCAGAAGTCACCG-TTGT---GAGCC-TT-CATGATTTC----------------GG--TC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-AC--CTTTCTG---------TT-TACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GTAGATGCA-TT------TGCC-G-TTT--T---TC-C--CAATT----CGG--CGGG-TATTTTCagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|5                          : gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtacgaagtaacacgaaaagccgcccgattgttcttaagatgtaactactacatcgttaatcagctagcatgcaatcagggcacctgacatcgtattaagtagatggcattctagatggaaccccgaacgccgaagggttttattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgcCGGATGG-TCT-C----CC----------AAT-C-GTC--AA-----TT----C-G---TAA-T-AA--T-TCG--T--A---T-G----------CA-GCTT---C--TC--G-T--CG-G-A-----TATG-A---A-T-CGT--GAA-GACTAAT------A----T-A-TA-TT-C---G-T-GGTTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-T-----CTCG-TAT-G----T-AA--AGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------T-C--C-A--AC-T---T-----C---AGATA-T-CAGC-G-AACTGG-AA------------T---CGA--A----G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GC-TG-C-C-G-ATT----G---T-TTA--AG---GATGG------T----AAC-ACGA----C--C-------G---------AG--G--------------------------A------C--G------GT--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATA--A-GAG----------TA----G-ATTGG-GCA-T-CT-TG-AGTG-G-A------ATTC-CGTA------TC--------------AGACA-G---CC----G-----A-AGTTGG-GTT-T-----T--T--AT--GCAC-C---AAGAT-AATAA---T-TGTC--A-TATATAAGAT-T-A----GAT--G-CAACT-AG-TCG-AT-C--AT-TTTTC-AT-TTT--CAAA-GTGTG-C-----TG---GGA-C---AA-T-G-GC--AACT-T--A---TA---A-CTGA-CA----CAGATAAT--AAATG-CGA-TGGGC-----------A---TTC--T--G-A-CGTTAG--T--G-C---AACG--TT----A---G-GCGG-ACATG-A--C---A--A-----ACT-CTTA-CAGA-C-ACATGC----CTATTGTTT-------TTAGG--T-AAATGTATTGAT------TAA-CCTA----------ATTTGG-----T-----GGT-T--------TATTTTCTTATTT---TT------CTAGAA-G-AC-A-T-T----ATT-TATG-AAG-A---T--T-A-AGAG--AGTAAACA-G--AC--CG--ACACAGGGT---GGGA-A-TTATT-T-ATTAGAATTGTGC-TACCAA-AAACAAGAATAGTTGGTCGA-CT------------GT-----ATA-CGA-CG-AT-ATGACATT-T-ACTTGT-AC--TTTCAC-AT-C-TAC-ATAT-----AATATTCT-TCTTT-AGCGCTATATC-----TGAAACTT-AACC-G-TAT--A-AACAGTA--AT--CG-ACACAAG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGT-GTC-------A-TGGT--------------A---TG-C-T-TC-GAG--ACT-GCGC--A---GACT-AC-A-TT--CTGGGTGCGA-CC-GT-T-ACTT-AT-AC--GA-TAT--GTGTG--A-----CTTCAT-GCT-A--GCCA-TC-GGT-ATGTT-TTCTT----ATT---TAAGA--A----G-TG-C--TTTCGTA-TA-TTGCATTCGG-AGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GGTATCTGG-ATTGTCTATCGTG----T-GA---CGTCT----------TT-GACCTTCG-T---TGT-GCTTC-TCA-GT-GAT--A-TT------TGCC-T-TTT--TG--T--CTAAAGTT----CGG--C-GG-CATTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGG-TCC-CT---CC----------GAA-T-GTC--AA-----TTT---C-G---TAG-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----AT-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC---T-CT-A-A----TTA-TA-T--C---G-T-G-TTT-A--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT--T-A-C-A----T--C---------GG-------C-C----A--AC-T---T-----C---A--TC-A-CA-CTA-A--TGG-AA-T----------AA--CGA--A----G------------T----A-ACA-AC-G---A--A--GC-TG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T----AAC-G----ACAT--C-------G-T-A-A--TA----------TGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GA-----------TA-C--G-AT--GTGCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---TC----G-----AAG--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AA--------TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GAT--G-AATAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--CAAAAGT-T--CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-AC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA-------GAAAAGAAA-TG-C-A-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---A-G--A-ACATG-A--C--AA--A-----ACT-CCTA-CAGG-C-ACA-GCA--TCTATTGTTT--------TAGG--T-AAATGTATTGATA-------A-CCTA----------ATTTG------T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---T-------CTAGAA-TGAC-A-TCT----ATT--ATT-ATG-A---TATTTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TGATTAGAAT-GTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-CTCT------------GTG----ATG-C-A-CGTAT--TGACATT-T-AATTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TG-TT-AAC-------------------TT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--TG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--A-GGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TCGGAG--ACT-GCG-CGA---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTGAT-AC--GA-TATC-GTGTG--AC----CTTCGT-G---AGTG-CA-TC-CAT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TT-GGAAGTCACCG-TGGT---GA-CC-TT-T-TA--TT-------------------------A-A----C-ATCGTA----T-GT--GCTTCT------------------------------------C-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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Reference ( family-1730 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AATTCGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------C-C--C-A--AC-T---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--AA---G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GCCTG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T---TAAC-ACGA-ACAT--C-------G-T-A-A--TAG--G-C-T--CGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----G-----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCT--CAAAAGT-T-GCA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAGAAAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-ACG--AAA--A-----ACT-CTT-ACAGG-C-ACA-GCA-ATCTA--TTGTTTCTTAGG--T-AAATG-TAT-T-GATATAACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TC-TT-AAC-CTGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGG---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT--CTTCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcgCGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA---------CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T---GT-T-T-T-TA---CATCG-TAT-A--A-T-AA-TCGT--T-A-C-A-A-----C---------GG-------C-C--C-A--AC-T---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CG---AA---G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--G-CTG-C-CCG-ATT----G---T-CTT---A---GATGT------G---TAAT-ACG--ACAT--T-------G-T-A-T--TAG--G-T-T--CGCA---A--TGC-GA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-AT-AG-A--G-G-A------A-TC-CGAA-G----TCG--C-CGA--------ACA-G---CC----GA----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-A--C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAA-ATAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT--G-TCG-AT----AT-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-G-CCA----TG-T-GGA-C---AA-T-C-GC-CAAAT-T--A-ATTA---A-C-GA-CA----CA-AAAAAG-AAATGACGA-TGC-CA----------A--CTAC--T--G----ATTAT--T--G-G---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-ACG--AAA--A-----ACT-CTT-ACAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-AGAG--AGTAAATACG-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-T-ATT-TTATTAGAATTGTGCGTACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTGTGAGGTA---A-CGTAT-CTGACATT-TTACTTGT-ACATTTCCACCATTCTTACTATATA---AAAATTTCA-TC-T---ACACTGAATC-----TG-AACTT-AACC-GGCGT--ATAACAGT--TAT--CT-ACAC-AG-TT-ACCA-TA-AT--AAGATAGTC-------ACTGATA-------------A---AGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGA---GACT-AC-AGTT--C-GGATGC-A-CCCGTAC-ACATAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT----TCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGTGATCTTCTTCTT----ATT---T-AGA--AC--TG-TG-CT-TTTCTTA-TA-TGGC-TTCGGAAGTCACCGAT-GT---GA-CC-TTTCGTG--TTC----------------GG-TCC-GA-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTATGA---------TT-GACA-TAG-T--ATGT-GC-TC-T-AGGT-GAT-CATTT------TGCC-G-TTTTCT---T--T--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTC
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcg--CA-ACAT-AG-TT-AC-A-TC-AT----GGTATAC-----------GTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGG---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-TC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT----TCGTTG-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CATTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-AG-TATTTTC
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TG-TAT-TTGATA--ACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-G-TCT----ATT-TATC-ATG-A---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-CGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AGATATTCT-TC-TT-ATT-ATGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-TG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GTGCCGA---GACT-AC-A-TT--A-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCTGGCTTCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--TCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAC-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtatttgataacctaatttgtgatttattctaatttttctagaaggacgtctatttatcatgatttaagagagtaaacagtgcacgaaacagtgaaaattattttattagaattgtgctaccaacaaacaagaacgtttgtcactgtgatacacgtatctgacatttacttgtacatttccacatcttactatataagatattcttcttattatgaatctgaacttaaccgcgtataacagtatatcgacactgttacataataaggtagtcatggtaacgccttcgagactgtgccgagactacattaggatgcaccgtacacttaatacgatatcgtgtgacctggcttcgtgtagcattcgtatgttcttcttatttagaacgtgtgcttttcgtatatgattcggaagtcaccgtgtgaccttcgtgttcgggtcggatgtcatcgtgtgatcttctgttgacatcgtatgtgcttctagtgaccatttgccgtttttcaaattcggcggcattttca
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCA---GACT-AC-A-TT--C-GGGTGC-A-CC-GTAT-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT----TCAT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTTTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GG-ATC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CC-TCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-T-TTT--TTG-T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCa
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    g---AA-T-G-GCATAGTT-T--G-A-TG---A-T-GG---------GAAAAAGACA--G-CAG-CAG-C-----------G--CTAC--T--T-A-TTTTGA--T--G-C---TAC---GC----A---G-A-GA-ACATG-ATG--GAC--A-----ACT-CTT-ACAGG-T-CCA-AC--ATCT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----C-----------GAA-TCGTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-TTAA-AT-TCG--TGAA---T-GA---------CA-TCGT--AC--TC--G-T--C--T-A-----TA-TCA-C-A-T--GT--GA--GAC--AT-CT-A-A----T-AATA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-CCGTTC-T-TCTAG--CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT----A-C-A-A--TG-C---------GG----------------------------------A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-AAT--------CA--CG--------G------------T----A-ACC-ACCG---A--A--GT-TG-C-CCG-ATT----G---T--TT--AA---GA--G------T---CAAC-ACGA--CAT--C-------G-T-A-A--TAG--G---T--CGCA---A--TAC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-TTTC-GT-TTA--A-GAG----------TT-CA-G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG---A------ACTCGCGGA-G----TC-------------------------C----G-----ACG--TGG-GTT-T-----T--TT-AT--G-AC--------AA-AAAGA-ACT-TGTCC-A-AA--CAAAAT-T-A--TTGGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--C-AAAGT-T-GCA----TGTT-AGA-CA--AA-A-G-GC-CAACT-TTCA-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAAGAAATG-CGATTGG-C-----------A--C-TC--T--G-ACCATT-T--T--G-----AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-ACG---AA--A-----ACT-CAT-ACAGG-C-ACA-AAACATCT---TTGTTTC--AGG--T-AAATG-TAT-T-G--ATAACCTA-ATTTG-T-----GAT-A--------T-TT--CTATTTT---TT------CTAGAA-GAAC-ATTCT----ATTGTACTGATGTA---G--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-T
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gcgggatggtctccgaatcgtccaatttcgtaattaaattcgtgaatgacatcgtactcgtctatatcacatgtgagacatctaataatattcgtgtttccgtccgttcttctagcctcgtataataatcgtacaatgcggatctcacgatggaaaatcacggtaaccaccgaagttgcccgattgtttaagagtcaacacgacatcgtaataggtcgcaatacaatcaggacgccatttcgtttaagagttcagatggcatctagatgaactcgcggagtccgacgtgggttttttatgacaaaaagaacttgtccaaacaaaattattggtgaaaatagtcgatcattttcatttcaaagttgcatgttagacaaaaggccaactttcaataacgacacagaaaaaagaaatgcgattggcactctgaccattttgaacttagggaacatgacgaaaactcatacaggcacaaaacatctttgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatatttctattttttctagaagaacattctattgtactgatgtagttaagagagtaaacagtctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T----A-AGCG--AGTAAAAA-G-TGCA-CA--AAACTG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T----A-AGAG--AGTAAACA-A-TGCA-CG--AAACTG--T---GAAA-A-TT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCCTG-TTT--T---T--C--AAATT----CGA--C-GG-TATTTTCA
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AT-AG-TCG-AT-C--AT-TAT-C-AT-T-T--CAAA-GT-T-GCA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-C
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----TT----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TC
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgcgCCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGTA-GGA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcgTT-----TA-AACTG-AATC-G--GT--ATAATAGTAATAT--CGGACAC-A--CT-AC-A------------------------A-TAGTA------------------GCC-TATC-GAGGGACTTGCGCCGGAGAGA-T-AC-A-TT--C-G-ATGT-A-TC-GTAC-ACTTAATTACCGGACTATT-GTGTGG-ACCT---TTCGT-G-TTA--G-CA-T--CGT-GTGTC-----T----ATT---T-AGA--AAG-TGGTG-CTGTTTCGTA-AAATGG--TTCAGAAGTCACCG-TTGT---GAGCC-TT-CATGATTTC----------------GG--TC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-AC--CTTTCTG---------TT-TACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GTAGATGCA-TT------TGCC-G-TTT--T---TC-C--CAATT----CGG--CGGG-TATTTTCagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|5                          : gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtacgaagtaacacgaaaagccgcccgattgttcttaagatgtaactactacatcgttaatcagctagcatgcaatcagggcacctgacatcgtattaagtagatggcattctagatggaaccccgaacgccgaagggttttattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgcCGGATGG-TCT-C----CC----------AAT-C-GTC--AA-----TT----C-G---TAA-T-AA--T-TCG--T--A---T-G----------CA-GCTT---C--TC--G-T--CG-G-A-----TATG-A---A-T-CGT--GAA-GACTAAT------A----T-A-TA-TT-C---G-T-GGTTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-T-----CTCG-TAT-G----T-AA--AGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------T-C--C-A--AC-T---T-----C---AGATA-T-CAGC-G-AACTGG-AA------------T---CGA--A----G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GC-TG-C-C-G-ATT----G---T-TTA--AG---GATGG------T----AAC-ACGA----C--C-------G---------AG--G--------------------------A------C--G------GT--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATA--A-GAG----------TA----G-ATTGG-GCA-T-CT-TG-AGTG-G-A------ATTC-CGTA------TC--------------AGACA-G---CC----G-----A-AGTTGG-GTT-T-----T--T--AT--GCAC-C---AAGAT-AATAA---T-TGTC--A-TATATAAGAT-T-A----GAT--G-CAACT-AG-TCG-AT-C--AT-TTTTC-AT-TTT--CAAA-GTGT-GC-----TG---GGA-C---AA-T-G-GC--AACT-T--A---TA---A-CTGA-CA----CAGATAAT--AAATG-CGA-TGGGC-----------A---TTC--T--G-A-CGTTAG--T--G-C---AACG--TT----A---G-GCGG-ACATG-AC-----A--A-----ACT-CTT-ACAGA-C-ACATGC----CTA--TTGTTT-TTAGG--T-AAATG-TAT-T-GAT-TAACCTA-ATTTGGT-----GGT-T--------TATTTTCTTATTT---TT------CTAGAA-G-AC-A-T-T----ATT-TATG-AAG-A---T--T-A-AGAG--AGTAAACA-G--AC--CG--ACACAGGGT---GGGA-A-TTATT-T-ATTAGAATTGTGC-TACCAA-AAACAAGAATAGTTGGTCGA-CT------------GT-----ATA-CGA-CG-AT-ATGACATT-T-ACTTGT-AC--TTTCAC-AT-C-TAC-ATAT-----AATATTCT-TCTTT-AGCGCTATATC-----TGAAACTT-AACC-G-TAT--A-AACAGTA--AT--CG-ACACAAG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGT-GTC-------A-TGGT--------------A---TG-C-T-TC-GAG--ACT-GCGC--A---GACT-AC-A-TT--CTGGGTGCGA-CC-GT-T-ACTT-AT-AC--GA-TAT--GTGTG--A-----CTTCAT-GCT-A--GCCA-TC-GGT-ATGTT-TTCTT----ATT---TAAGA--A----G-TG-C--TTTCGTA-TA-TTGCATTCGG-AGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GGTATCTGG-ATTGTCTATCGTG----T-GA---CGTCT----------TT-GACCTTCG-T---TGT-GCTTC-TCA-GT-GAT--A-TT------TGCC-T-TTT--TG--T--CTAAAGTT----CGG--C-GG-CATTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGG-TCC-CT---CC----------GAA-T-GTC--AA-----TTT---C-G---TAG-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----AT-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC---T-CT-A-A----TTA-TA-T--C---G-T-G-TTT-A--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT--T-A-C-A----T--C---------GG-------C-C----A--AC-T---T-----C---A--TC-A-CA-CTA-A--TGG-AA-T----------AA--CGA--A----G------------T----A-ACA-AC-G---A--A--GC-TG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T----AAC-G----ACAT--C-------G-T-A-A--TA----------TGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GA-----------TA-C--G-AT--GTGCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---TC----G-----AAG--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AA--------TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GAT--G-AATAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--CAAAAGT-T--CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-AC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA-------GAAAAGAAA-TG-C-A-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---A-G--A-ACATG-AC----AA--A-----ACT-CCT-ACAGG-C-ACA-GCA--TCTA--TTGTTT--TAGG--T-AAATG-TAT-T-GATA--ACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---T-------CTAGAA-TGAC-A-TCT----ATT--ATT-ATG-A---TATTTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TGATTAGAAT-GTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-CTCT------------GTG----ATG-C-A-CGTAT--TGACATT-T-AATTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TG-TT-AAC-------------------TT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--TG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--A-GGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TCGGAG--ACT-GCG-CGA---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTGAT-AC--GA-TATC-GTGTG--AC----CTTCGT-G---AGTG-CA-TC-CAT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TT-GGAAGTCACCG-TGGT---GA-CC-TT-T-TA--TT-------------------------A-A----C-ATCGTA----T-GT--GCTTCT------------------------------------C-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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Reference ( family-1730 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AATTCGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------C-C--C-A--AC-T---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--AA---G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GCCTG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T---TAAC-ACGA-ACAT--C-------G-T-A-A--TAG--G-C-T--CGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----G-----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCT--CAAAAGT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAGAAAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CGAAA--A-----ACT-CTTA-CAGG-C-ACA-GCA-ATCTA--TTGTTTCTAGG--T-AAATG-TAT-T-GATATAACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TC-TT-AAC-CTGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGG---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT--CTTCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcgCGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA---------CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T---GT-T-T-T-TA---CATCG-TAT-A--A-T-AA-TCGT--T-A-C-A-A-----C---------GG-------C-C--C-A--AC-T---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CG---AA---G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--G-CTG-C-CCG-ATT----G---T-CTT---A---GATGT------G---TAAT-ACG--ACAT--T-------G-T-A-T--TAG--G-T-T--CGCA---A--TGC-GA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-AT-AG-A--G-G-A------A-TC-CGAA-G----TCG--C-CGA--------ACA-G---CC----GA----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-A--C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAA-ATAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT--G-TCG-AT----AT-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-GC-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-C-GC-CAAAT-T--A-ATTA---A-C-GA-CA----CA-AAAAAG-AAATGACGA-TGC-CA----------A--CTAC--T--G----ATTAT--T--G-G---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CGAAA--A-----ACT-CTTA-CAG
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TG-TAT-TTGATA--ACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-G-TCT----ATT-TATC-ATG-A---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-CGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AGATATTCT-TC-TT-ATT-ATGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-TG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GTGCCGA---GACT-AC-A-TT--A-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCTGGCTTCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--TCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAC-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtatttgataacctaatttgtgatttattctaatttttctagaaggacgtctatttatcatgatttaagagagtaaacagtgcacgaaacagtgaaaattattttattagaattgtgctaccaacaaacaagaacgtttgtcactgtgatacacgtatctgacatttacttgtacatttccacatcttactatataagatattcttcttattatgaatctgaacttaaccgcgtataacagtatatcgacactgttacataataaggtagtcatggtaacgccttcgagactgtgccgagactacattaggatgcaccgtacacttaatacgatatcgtgtgacctggcttcgtgtagcattcgtatgttcttcttatttagaacgtgtgcttttcgtatatgattcggaagtcaccgtgtgaccttcgtgttcgggtcggatgtcatcgtgtgatcttctgttgacatcgtatgtgcttctagtgaccatttgccgtttttcaaattcggcggcattttca
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AG--G-T-T--CGCA---A--TGC-GA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-AT-AG-A-TG-G-A------ACTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----GA----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-A---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-C-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAAAAAAAG-AAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTAC--T--G-A-CATTAT--T--G-G---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCA---GACT-AC-A-TT--C-GGGTGC-A-CC-GTAT-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT----TCAT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTTTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GG-ATC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CC-TCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-T-TTT--TTG-T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCa
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    g---AA-T-G-GCATAGTT-T--G-A-TG---A-T-GG---------GAAAAAGACA--G-CAG-CAG-C-----------G--CTAC--T--T-A-TTTTGA--T--G-C---TAC---GC----A---G-A-GA-ACATG-A--TGGAC--A-----ACT-CTTA-CAGG-T-CCA-AC--ATCT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----C-----------GAA-TCGTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-TTAA-AT-TCG--TGAA---T-GA---------CA-TCGT--AC--TC--G-T--C--T-A-----TA-TCA-C-A-T--GT--GA--GAC--AT-CT-A-A----T-AATA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-CCGTTC-T-TCTAG--CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT----A-C-A-A--TG-C---------GG----------------------------------A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-AAT--------CA--CG--------G------------T----A-ACC-ACCG---A--A--GT-TG-C-CCG-ATT----G---T--TT--AA---GA--G------T---CAAC-ACGA--CAT--C-------G-T-A-A--TAG--G---T--CGCA---A--TAC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-TTTC-GT-TTA--A-GAG----------TT-CA-G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG---A------ACTCGCGGA-G----TC-------------------------C----G-----ACG--TGG-GTT-T-----T--TT-AT--G-AC--------AA-AAAGA-ACT-TGTCC-A-AA--CAAAAT-T-A--TTGGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--C-AAAGT-TG-CA----TGTT-AGA-CA--AA-A-G-GC-CAACT-TTCA-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAAGAAATG-CGATTGG-C-----------A--C-TC--T--G-ACCATT-T--T--G-----AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CG-AA--A-----ACT-CATA-CAGG-C-ACA-AAACATCT---TTGTTTC-AGG--T-AAATG-TAT-T-G--ATAACCTA-ATTTG-T-----GAT-A--------T-TT--CTATTTT---TT------CTAGAA-GAAC-ATTCT----ATTGTACTGATGTA---G--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcgC-TT-AAA-CTAAATC-----TG-AACTTTAACA-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG--TAC--G-TTAAC-A-TA-AT--AAGGTAGTCTCCTCTTC-TGGTA-------------AACGCACC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCG---GACTGGC-T-TT--C-GGATGC-ATTC-GTAC-ACTTAAT-AT--AA-TATC-GTG-G--ACCT--TTCGGT-G-T-A--GCCA-TT-CGT-AT-TTCTTCTT----ATT---T-AG---ATG--G-TG-CT-TTTCGTATTA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-TT---G--CC-TT-CGTG--TTC----------------GA-GTC-GG-ATTGTC-ATCGTG----TAGA--CCTTCTG---------TTGGACA-TTGAT--ATGTGGCTTCTT-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---TTAC--AAATT----CGG--CTGGTTATTTTctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgcttaaactaaatctgaactttaacagcgtataacagtatatcgtacgttaacataataaggtagtctcctcttctggtaaacgcaccttcgagactgcgcccggactggctttcggatgcattcgtacacttaatataatatcgtggacctttcggtgtagccattcgtatttcttcttatttagatggtgcttttcgtattatggttcggaagtcaccgtttgccttcgtgttcgagtcggattgtcatcgtgtagaccttctgttggacattgatatgtggcttcttagtgatcatttgccgttttttacaaattcggctggttatttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcgggatggtctccgaatcgtccaatttcgtaattaaattcgtgaatgacatcgtactcgtctatatcacatgtgagacatctaataatattcgtgtttccgtccgttcttctagcctcgtataataatcgtacaatgcggatctcacgatggaaaatcacggtaaccaccgaagttgcccgattgtttaagagtcaacacgacatcgtaataggtcgcaatacaatcaggacgccatttcgtttaagagttcagatggcatctagatgaactcgcggagtccgacgtgggttttttatgacaaaaagaacttgtccaaacaaaattattggtgaaaatagtcgatcattttcatttcaaagttgcatgttagacaaaaggccaactttcaataacgacacagaaaaaagaaatgcgattggcactctgaccattttgaacttagggaacatgacgaaaactcatacaggcacaaaacatctttgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatatttctattttttctagaagaacattctattgtactgatgtagttaagagagtaaacagtctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T----A-AGCG--AGTAAAAA-G-TGCA-CA--AAACTG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T----A-AGAG--AGTAAACA-A-TGCA-CG--AAACTG--T---GAAA-A-TT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCCTG-TTT--T---T--C--AAATT----CGA--C-GG-TATTTTCA
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AT-AG-TCG-AT-C--AT-TAT-C-AT-T-T--CAAA-GT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-C
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----TT----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TC
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgcgCCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGTA-GGA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcgTT-----TA-AACTG-AATC-G--GT--ATAATAGTAATAT--CGGACAC-A--CT-AC-A------------------------A-TAGTA------------------GCC-TATC-GAGGGACTTGCGCCGGAGAGA-T-AC-A-TT--C-G-ATGT-A-TC-GTAC-ACTTAATTACCGGACTATT-GTGTGG-ACCT---TTCGT-G-TTA--G-CA-T--CGT-GTGTC-----T----ATT---T-AGA--AAG-TGGTG-CTGTTTCGTA-AAATGG--TTCAGAAGTCACCG-TTGT---GAGCC-TT-CATGATTTC----------------GG--TC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-AC--CTTTCTG---------TT-TACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GTAGATGCA-TT------TGCC-G-TTT--T---TC-C--CAATT----CGG--CGGG-TATTTTCagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|5                          : gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtacgaagtaacacgaaaagccgcccgattgttcttaagatgtaactactacatcgttaatcagctagcatgcaatcagggcacctgacatcgtattaagtagatggcattctagatggaaccccgaacgccgaagggttttattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgcCGGATGG-TCT-C----CC----------AAT-C-GTC--AA-----TT----C-G---TAA-T-AA--T-TCG--T--A---T-G----------CA-GCTT---C--TC--G-T--CG-G-A-----TATG-A---A-T-CGT--GAA-GACTAAT------A----T-A-TA-TT-C---G-T-GGTTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-T-----CTCG-TAT-G----T-AA--AGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------T-C--C-A--AC-T---T-----C---AGATA-T-CAGC-G-AACTGG-AA------------T---CGA--A----G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GC-TG-C-C-G-ATT----G---T-TTA--AG---GATGG------T----AAC-ACGA----C--C-------G---------AG--G--------------------------A------C--G------GT--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATA--A-GAG----------TA----G-ATTGG-GCA-T-CT-TG-AGTG-G-A------ATTC-CGTA------TC--------------AGACA-G---CC----G-----A-AGTTGG-GTT-T-----T--T--AT--GCAC-C---AAGAT-AATAA---T-TGTC--A-TATATAAGAT-T-A----GAT--G-CAACT-AG-TCG-AT-C--AT-TTTTC-AT-TTT--CAAA-GTGTG-C-----TG---GGA-C---AA-T-G-GC--AACT-T--A---TA---A-CTGA-CA----CAGATAAT--AAATG-CGA-TGGGC-----------A---TTC--T--G-A-CGTTAG--T--G-C---AACG--TT----A---G-GCGG-ACATG-A--C---A--A-----ACT-CTTA-CAGA-C-ACATGC----CTA--TTGTTTTTAGG--T-AAATG-TAT-T-GAT-TAACCTA-ATTTGGT-----GGT-T--------TATTTTCTTATTT---TT------CTAGAA-G-AC-A-T-T----ATT-TATG-AAG-A---T--T-A-AGAG--AGTAAACA-G--AC--CG--ACACAGGGT---GGGA-A-TTATT-T-ATTAGAATTGTGC-TACCAA-AAACAAGAATAGTTGGTCGA-CT------------GT-----ATA-CGA-CG-AT-ATGACATT-T-ACTTGT-AC--TTTCAC-AT-C-TAC-ATAT-----AATATTCT-TCTTT-AGCGCTATATC-----TGAAACTT-AACC-G-TAT--A-AACAGTA--AT--CG-ACACAAG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGT-GTC-------A-TGGT--------------A---TG-C-T-TC-GAG--ACT-GCGC--A---GACT-AC-A-TT--CTGGGTGCGA-CC-GT-T-ACTT-AT-AC--GA-TAT--GTGTG--A-----CTTCAT-GCT-A--GCCA-TC-GGT-ATGTT-TTCTT----ATT---TAAGA--A----G-TG-C--TTTCGTA-TA-TTGCATTCGG-AGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GGTATCTGG-ATTGTCTATCGTG----T-GA---CGTCT----------TT-GACCTTCG-T---TGT-GCTTC-TCA-GT-GAT--A-TT------TGCC-T-TTT--TG--T--CTAAAGTT----CGG--C-GG-CATTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGG-TCC-CT---CC----------GAA-T-GTC--AA-----TTT---C-G---TAG-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----AT-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC---T-CT-A-A----TTA-TA-T--C---G-T-G-TTT-A--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT--T-A-C-A----T--C---------GG-------C-C----A--AC-T---T-----C---A--TC-A-CA-CTA-A--TGG-AA-T----------AA--CGA--A----G------------T----A-ACA-AC-G---A--A--GC-TG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T----AAC-G----ACAT--C-------G-T-A-A--TA----------TGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GA-----------TA-C--G-AT--GTGCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---TC----G-----AAG--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AA--------TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GAT--G-AATAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--CAAAAGT-T--CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-AC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA-------GAAAAGAAA-TG-C-A-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---A-G--A-ACATG-A--C--AA--A-----ACT-CCTA-CAGG-C-ACA-GCA--TCTA--TTGTTT-TAGG--T-AAATG-TAT-T-GATA--ACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---T-------CTAGAA-TGAC-A-TCT----ATT--ATT-ATG-A---TATTTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TGATTAGAAT-GTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-CTCT------------GTG----ATG-C-A-CGTAT--TGACATT-T-AATTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TG-TT-AAC-------------------TT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--TG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--A-GGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TCGGAG--ACT-GCG-CGA---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTGAT-AC--GA-TATC-GTGTG--AC----CTTCGT-G---AGTG-CA-TC-CAT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TT-GGAAGTCACCG-TGGT---GA-CC-TT-T-TA--TT-------------------------A-A----C-ATCGTA----T-GT--GCTTCT------------------------------------C-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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Reference ( family-1730 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AATTCGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------C-C--C-A--AC-T---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--AA---G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GCCTG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T---TAAC-ACGA-ACAT--C-------G-T-A-A--TAG--G-C-T--CGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----G-----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCT--CAAAAGT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAGAAAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CGAAA--A-----ACT-CTTA-CAGG-C-ACA-GCA-ATCTA--TTGTTTCTAGG--T-AAATG-TAT-T-GATATAACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TC-TT-AAC-CTGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGG---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT--CTTCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcgCGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA---------CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T---GT-T-T-T-TA---CATCG-TAT-A--A-T-AA-TCGT--T-A-C-A-A-----C---------GG-------C-C--C-A--AC-T---T-----C---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CG---AA---G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--G-CTG-C-CCG-ATT----G---T-CTT---A---GATGT------G---TAAT-ACG--ACAT--T-------G-T-A-T--TAG--G-T-T--CGCA---A--TGC-GA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-AT-AG-A--G-G-A------A-TC-CGAA-G----TCG--C-CGA--------ACA-G---CC----GA----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-A--C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAA-ATAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT--G-TCG-AT----AT-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-GC-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-C-GC-CAAAT-T--A-ATTA---A-C-GA-CA----CA-AAAAAG-AAATGACGA-TGC-CA----------A--CTAC--T--G----ATTAT--T--G-G---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CGAAA--A-----ACT-CTTA-CAG
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TG-TAT-TTGATA--ACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-G-TCT----ATT-TATC-ATG-A---T--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-CGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AGATATTCT-TC-TT-ATT-ATGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-TG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GTGCCGA---GACT-AC-A-TT--A-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCTGGCTTCGT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TT-CGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--TCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAC-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtatttgataacctaatttgtgatttattctaatttttctagaaggacgtctatttatcatgatttaagagagtaaacagtgcacgaaacagtgaaaattattttattagaattgtgctaccaacaaacaagaacgtttgtcactgtgatacacgtatctgacatttacttgtacatttccacatcttactatataagatattcttcttattatgaatctgaacttaaccgcgtataacagtatatcgacactgttacataataaggtagtcatggtaacgccttcgagactgtgccgagactacattaggatgcaccgtacacttaatacgatatcgtgtgacctggcttcgtgtagcattcgtatgttcttcttatttagaacgtgtgcttttcgtatatgattcggaagtcaccgtgtgaccttcgtgttcgggtcggatgtcatcgtgtgatcttctgttgacatcgtatgtgcttctagtgaccatttgccgtttttcaaattcggcggcattttca
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AG--G-T-T--CGCA---A--TGC-GA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G-GCA-T-AT-AG-A-TG-G-A------ACTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----GA----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-A---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-C-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAAAAAAAG-AAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTAC--T--G-A-CATTAT--T--G-G---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCA---GACT-AC-A-TT--C-GGGTGC-A-CC-GTAT-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG--ACCT----TCAT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTTTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GG-ATC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CC-TCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-T-TTT--TTG-T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCa
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    g---AA-T-G-GCATAGTT-T--G-A-TG---A-T-GG---------GAAAAAGACA--G-CAG-CAG-C-----------G--CTAC--T--T-A-TTTTGA--T--G-C---TAC---GC----A---G-A-GA-ACATG-A--TGGAC--A-----ACT-CTTA-CAGG-T-CCA-AC--ATCT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----C-----------GAA-TCGTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-TTAA-AT-TCG--TGAA---T-GA---------CA-TCGT--AC--TC--G-T--C--T-A-----TA-TCA-C-A-T--GT--GA--GAC--AT-CT-A-A----T-AATA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-CCGTTC-T-TCTAG--CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT----A-C-A-A--TG-C---------GG----------------------------------A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-AAT--------CA--CG--------G------------T----A-ACC-ACCG---A--A--GT-TG-C-CCG-ATT----G---T--TT--AA---GA--G------T---CAAC-ACGA--CAT--C-------G-T-A-A--TAG--G---T--CGCA---A--TAC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-TTTC-GT-TTA--A-GAG----------TT-CA-G-AT--G-GCA-T-CT-AG-A-TG---A------ACTCGCGGA-G----TC-------------------------C----G-----ACG--TGG-GTT-T-----T--TT-AT--G-AC--------AA-AAAGA-ACT-TGTCC-A-AA--CAAAAT-T-A--TTGGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--C-AAAGT-TG-CA----TGTT-AGA-CA--AA-A-G-GC-CAACT-TTCA-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAAGAAATG-CGATTGG-C-----------A--C-TC--T--G-ACCATT-T--T--G-----AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CG-AA--A-----ACT-CATA-CAGG-C-ACA-AAACATCT---TTGTTTC-AGG--T-AAATG-TAT-T-G--ATAACCTA-ATTTG-T-----GAT-A--------T-TT--CTATTTT---TT------CTAGAA-GAAC-ATTCT----ATTGTACTGATGTA---G--TTA-AGAG--AGTAAACA-G-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcgC-TT-AAA-CTAAATC-----TG-AACTTTAACA-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG--TAC--G-TTAAC-A-TA-AT--AAGGTAGTCTCCTCTTC-TGGTA-------------AACGCACC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCG---GACTGGC-T-TT--C-GGATGC-ATTC-GTAC-ACTTAAT-AT--AA-TATC-GTG-G--ACCT--TTCGGT-G-T-A--GCCA-TT-CGT-AT-TTCTTCTT----ATT---T-AG---ATG--G-TG-CT-TTTCGTATTA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-TT---G--CC-TT-CGTG--TTC----------------GA-GTC-GG-ATTGTC-ATCGTG----TAGA--CCTTCTG---------TTGGACA-TTGAT--ATGTGGCTTCTT-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---TTAC--AAATT----CGG--CTGGTTATTTTctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgcttaaactaaatctgaactttaacagcgtataacagtatatcgtacgttaacataataaggtagtctcctcttctggtaaacgcaccttcgagactgcgcccggactggctttcggatgcattcgtacacttaatataatatcgtggacctttcggtgtagccattcgtatttcttcttatttagatggtgcttttcgtattatggttcggaagtcaccgtttgccttcgtgttcgagtcggattgtcatcgtgtagaccttctgttggacattgatatgtggcttcttagtgatcatttgccgttttttacaaattcggctggttatttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcgggatggtctccgaatcgtccaatttcgtaattaaattcgtgaatgacatcgtactcgtctatatcacatgtgagacatctaataatattcgtgtttccgtccgttcttctagcctcgtataataatcgtacaatgcggatctcacgatggaaaatcacggtaaccaccgaagttgcccgattgtttaagagtcaacacgacatcgtaataggtcgcaatacaatcaggacgccatttcgtttaagagttcagatggcatctagatgaactcgcggagtccgacgtgggttttttatgacaaaaagaacttgtccaaacaaaattattggtgaaaatagtcgatcattttcatttcaaagttgcatgttagacaaaaggccaactttcaataacgacacagaaaaaagaaatgcgattggcactctgaccattttgaacttagggaacatgacgaaaactcatacaggcacaaaacatctttgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatatttctattttttctagaagaacattctattgtactgatgtagttaagagagtaaacagtctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T----A-AGCG--AGTAAAAA-G-TGCA-CA--AAACTG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATG-A---T----A-AGAG--AGTAAACA-A-TGCA-CG--AAACTG--T---GAAA-A-TT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCCTG-TTT--T---T--C--AAATT----CGA--C-GG-TATTTTCA
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AT-AG-TCG-AT-C--AT-TAT-C-AT-T-T--CAAA-GT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-C
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATGG-TCT-C----TT----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TC
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgcgCCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGTA-GGA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcgTT-----TA-AACTG-AATC-G--GT--ATAATAGTAATAT--CGGACAC-A--CT-AC-A------------------------A-TAGTA------------------GCC-TATC-GAGGGACTTGCGCCGGAGAGA-T-AC-A-TT--C-G-ATGT-A-TC-GTAC-ACTTAATTACCGGACTATT-GTGTGG-ACCT---TTCGT-G-TTA--G-CA-T--CGT-GTGTC-----T----ATT---T-AGA--AAG-TGGTG-CTGTTTCGTA-AAATGG--TTCAGAAGTCACCG-TTGT---GAGCC-TT-CATGATTTC----------------GG--TC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-AC--CTTTCTG---------TT-TACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GTAGATGCA-TT------TGCC-G-TTT--T---TC-C--CAATT----CGG--CGGG-TATTTTCagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|5                          : gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtacgaagtaacacgaaaagccgcccgattgttcttaagatgtaactactacatcgttaatcagctagcatgcaatcagggcacctgacatcgtattaagtagatggcattctagatggaaccccgaacgccgaagggttttattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgcCGGATGG-TCT-C----CC----------AAT-C-GTC--AA-----TT----C-G---TAA-T-AA--T-TCG--T--A---T-G----------CA-GCTT---C--TC--G-T--CG-G-A-----TATG-A---A-T-CGT--GAA-GACTAAT------A----T-A-TA-TT-C---G-T-GGTTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-T-----CTCG-TAT-G----T-AA--AGT--T-A-C-A-A--T--C---------GG-------T-C--C-A--AC-T---T-----C---AGATA-T-CAGC-G-AACTGG-AA------------T---CGA--A----G------------T----A-ACC-AC-G---A--A--GC-TG-C-C-G-ATT----G---T-TTA--AG---GATGG------T----AAC-ACGA----C--C-------G---------AG--G--------------------------A------C--G------GT--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATA--A-GAG----------TA----G-ATTGG-GCA-T-CT-TG-AGTG-G-A------ATTC-CGTA------TC--------------AGACA-G---CC----G-----A-AGTTGG-GTT-T-----T--T--AT--GCAC-C---AAGAT-AATAA---T-TGTC--A-TATATAAGAT-T-A----GAT--G-CAACT-AG-TCG-AT-C--AT-TTTTC-AT-TTT--CAAA-GTGTG-C-----TG---GGA-C---AA-T-G-GC--AACT-T--A---TA---A-CTGA-CA----CAGATAAT--AAATG-CGA-TGGGC-----------A---TTC--T--G-A-CGTTAG--T--G-C---AACG--TT----A---G-GCGG-ACATG-A--C---A--A-----ACT-CTTA-CAGA-C-ACATGC----CTA--TTGTTTTTAGG--T-AAATG-TAT-T-GAT-TAACCTA-ATTTGGT-----GGT-T--------TATTTTCTTATTT---TT------CTAGAA-G-AC-A-T-T----ATT-TATG-AAG-A---T--T-A-AGAG--AGTAAACA-G--AC--CG--ACACAGGGT---GGGA-A-TTATT-T-ATTAGAATTGTGC-TACCAA-AAACAAGAATAGTTGGTCGA-CT------------GT-----ATA-CGA-CG-AT-ATGACATT-T-ACTTGT-AC--TTTCAC-AT-C-TAC-ATAT-----AATATTCT-TCTTT-AGCGCTATATC-----TGAAACTT-AACC-G-TAT--A-AACAGTA--AT--CG-ACACAAG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGT-GTC-------A-TGGT--------------A---TG-C-T-TC-GAG--ACT-GCGC--A---GACT-AC-A-TT--CTGGGTGCGA-CC-GT-T-ACTT-AT-AC--GA-TAT--GTGTG--A-----CTTCAT-GCT-A--GCCA-TC-GGT-ATGTT-TTCTT----ATT---TAAGA--A----G-TG-C--TTTCGTA-TA-TTGCATTCGG-AGTCACCG-T-AT---GA-CC-TT-CATG--TTC----------------GGTATCTGG-ATTGTCTATCGTG----T-GA---CGTCT----------TT-GACCTTCG-T---TGT-GCTTC-TCA-GT-GAT--A-TT------TGCC-T-TTT--TG--T--CTAAAGTT----CGG--C-GG-CATTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGG-TCC-CT---CC----------GAA-T-GTC--AA-----TTT---C-G---TAG-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----AT-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC---T-CT-A-A----TTA-TA-T--C---G-T-G-TTT-A--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT--T-A-C-A----T--C---------GG-------C-C----A--AC-T---T-----C---A--TC-A-CA-CTA-A--TGG-AA-T----------AA--CGA--A----G------------T----A-ACA-AC-G---A--A--GC-TG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---GATGG------T----AAC-G----ACAT--C-------G-T-A-A--TA----------TGCA---A--TGC-AA-TC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GA-----------TA-C--G-AT--GTGCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---TC----G-----AAG--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AA--------TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GAT--G-AATAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--CAAAAGT-T--CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-AC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA-------GAAAAGAAA-TG-C-A-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---A-G--A-ACATG-A--C--AA--A-----ACT-CCTA-CAGG-C-ACA-GCA--TCTA--TTGTTT-TAGG--T-AAATG-TAT-T-GATA--ACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---T-------CTAGAA-TGAC-A-TCT----ATT--ATT-ATG-A---TATTTA-AGAG--AGTAAACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TGATTAGAAT-GTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-CTCT------------GTG----ATG-C-A-CGTAT--TGACATT-T-AATTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TG-TT-AAC-------------------TT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--TG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--A-GGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TCGGAG--ACT-GCG-CGA---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTGAT-AC--GA-TATC-GTGTG--AC----CTTCGT-G---AGTG-CA-TC-CAT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TT-GGAAGTCACCG-TGGT---GA-CC-TT-T-TA--TT-------------------------A-A----C-ATCGTA----T-GT--GCTTCT------------------------------------C-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --T--A---T-GA-------T-CA-TCT---AC--TCCGG-TT-CG-T-A-----TG-G-A-C-AAT-CGT--GTA-AAG--AT-C--A-A----T-A-TAGTT-C-----T-G-TTT-C----G-T-C-GTTC-TGT-TA---CCTCG-TAT-A--A-T-AAT-CGT--T-AAC-A-A--T--CT--------GG-------CGC--C-A--AC-T---T-----T---A--TC-T-CA-C-G-A--TGG-AA-A----------TA--CGA--AAAAGA------------T----A-ACA-AC-G---A--A--AGCCG-C-CCG-ATT----G---T-CTT--AA---TATG-----------TAAT-CT---ACAT--C-------GTT-A-A--CA---G-C-T--CGCAC--A--TGC-AC-TC-A------G--GGCATCTAC--T----------------CAGC----A-T--C-GT-ATT-----AA----------TA----G-AT--G-GCA-T-TT-AG-A-TG-A-A--------CC-CGAA-A-----CG------------------------C----G-----A-A--TGG-TTTAT-----G--T--AT--G-AC-------AAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAAT-AAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCGAAT-C--AT-TCT-C-AT---T--CAA-----TG-CA-------T-GGG-C---AA-T-G-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C--A-CA----CAGAAAA--GAATTG-CGA-TGG-C-----------A--C--G--T--G-A-CATTATGGT--GCC---AAC---TT----A-----G-GA-ACATG-A--CGAAAAGA-----ACT-CTTA--AGG-C-ACA-GC--TTCTA--TTGTTTC-AGG--T-AAAacaatcgtgtaaagatcaatatagttctgtttcgtcgttctgttacctcgtataataatcgttaacaatctggcgccaactttatctcacgatggaaatacgaaaaagataacaacgaaagccgcccgattgtcttaatatgtaatctacatcgttaacagctcgcacatgcactcagggcatctactcagcatcgtattaatagatggcatttagatgaacccgaaacgcgaatggtttatgtatgacaaaaaagaacttgtctaaaaataaattatggtgaaaatagtcgaatcattctcattcaatgcatgggcaatggccaacttaataacacacagaaaagaattgcgatggcacgtgacattatggtgccaacttaggaacatgacgaaaagaactcttaaggcacagcttctattgtttcaggtaaa


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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TCAACGATACTTGGATAATTTCTAATTCCTGTGTCATCTTGTTGTCAAAATTCGGACAGGTGACGCGCAGGC






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Reference ( family-1730 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--AT--AAT-CG--T-T-A-C--A-AT-C---------GG-------C-C--CA--A-CT---TC---A--TCTCA-C-G-A--TGG-AA-A--TA--CG---AA----G------------TA-ACCAC-G---A--A--G--C-T-G-CCCGATTG---T-CTT--AA---GA-T-G-G-------T-A----AC-A-----CG-A-C--A--T-C-G-T-A-A--TA-G--GC-T--CGCA---A--TGC-AATC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GAG----------TA-C--G-AT--G--GCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----G-----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCT--CAAAAGT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAGAAAAAGAAAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CGAAA--A-----ACT-CTTA-CAGG-C-A--C--A-GCA-TCTA--TTGTTTCTAGG--T-AAATG-TAT-T-GATATAACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATGA-TA-TT-AAGAGAG-TA--AACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TCTT-AA--ACTGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGG---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG-AC----CTT-C--GT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TTCGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcgCGGATGG-TCT-C----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA---------CA-TCTT--GC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-TA-TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T---GT-T-T-T-TA---CATCG-TAT-A--AT--AAT-CG--T-T-A-C--A-A--C---------GG-------C-C--CA--A-CT---TC---A--TCTCA-C-G-A--TGG-AA-A--TA--CG---AA----G------------TA-ACCAC-G---A--A--G--C-T-G-CCCGATTG---T-CTT---A---GA-T-GTG-------T-A----AT-A-----CG-A-C--A--T-T-G-T-A-T--TA-G--GT-T--CGCA---A--TGC-GATC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G--GCA-T-AT-AG-A--G-G-A------A-TC-CGAA-G----TCG--C-CGA--------ACA-G---CC----GA----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-A--C---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAA-ATAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT--G-TCG-AT----AT-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-GC-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-C-GC-CAAAT-T--A-ATTA---A-C-GA-CA----CA-AAAAAG-AAATGACGA-TGC-CA----------A--CTAC--T--G----ATTAT--T--G-G---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--CGAAA--A-----ACT-CTTA-CAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -AAGAGAG-TA--AATACG-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-T-ATT-TTATTAGAATTGTGCGTACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-A-CT------------GTGTGAGGTA---A-CGTAT-CTGACATT-TTACTTGT-ACATTTCCACCATTCTTACTATATA---AAAATTTCA-TCT--AC--ACTGAATC-----TG-AACTT-AACC-GGCGT--ATAACAGT--TAT--CT-ACAC-AG-TT-ACCA-TA-AT--AAGATAGTC-------ACTGATA-------------A---AGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCGA---GACT-AC-AGTT--C-GGATGC-A-CCCGTAC-ACATAAT-AC--GA-TATC-GTGTG-AC----CTT-C--GT-G-T-A--G-CA-TT-CGTGATCTTCTTCTT----ATT---T-AGA--AC--TG-TG-CT-TTTCTTA-TA-TGGC-TTCGGAAGTCACCGAT-GT---GA-CCTTTCGTG--TTC----------------GG-TCC-GA-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CCTATGA---------TT-GACA-TAG-T--ATGT-GC-TC-T-AGGT-GAT-CATTT------TGCC-G-TTTTCT---T--T--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTC
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaGGATGG-TTTTC----CC----------GAA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAAAT-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----TA-GAA-C-A-T-CGT--GAA-GAC--AT-CT-A-A----T-A-T--TT-C---G-T-G-TTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--AA--AAT-CG--T-T-A-C--A-AT-C---------GG-------C-C--CA--A-CT---TC---A--TCTCA-C-G-A--TGG-AA-A--TA--CG---AA----G------------TA-ACCAC-G---A--A--G--C-T-T-CCCGATTG---T-CTT--AA---GA-T-G-G-------T-A----AC-A-----CGAA-C--A--T-C-G-T-A-A--TA-G--GC-T--CGCA---A--TGC-AATC-A------G--G------AC--A----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GAG----------TA-C--G-AT--G--GCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CA----G-----A-AT-TGG-GTT-
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TG-TAT-TTGATA--ACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---TT------CTAGAA-GGAC-G-TCT----ATT-TATC-ATGA-T--TT-AAGAGAG-TA--AACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAATTGTGC-TACCAACAAACAAGAA-CGTTTGTC-A-CT------------GTG----ATA-C-A-CGTAT-CTGACATT-T-ACTTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AGATATTCT-TCTT-AT--TATGAATC-----TG-AACTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG-ACAC-TG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GTGCCGA---GACT-AC-A-TT--A-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG-ACCTGGCTT-C--GT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-GT---GA-CC-TTCGTG--TTC----------------GG-GTC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--TCTTCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAC-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtatttgataacctaatttgtgatttattctaatttttctagaaggacgtctatttatcatgatttaagagagtaaacagtgcacgaaacagtgaaaattattttattagaattgtgctaccaacaaacaagaacgtttgtcactgtgatacacgtatctgacatttacttgtacatttccacatcttactatataagatattcttcttattatgaatctgaacttaaccgcgtataacagtatatcgacactgttacataataaggtagtcatggtaacgccttcgagactgtgccgagactacattaggatgcaccgtacacttaatacgatatcgtgtgacctggcttcgtgtagcattcgtatgttcttcttatttagaacgtgtgcttttcgtatatgattcggaagtcaccgtgtgaccttcgtgttcgggtcggatgtcatcgtgtgatcttctgttgacatcgtatgtgcttctagtgaccatttgccgtttttcaaattcggcggcattttca
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cggatggtctcccaatgtccaatttcgtcataagttcgtatgatcatcttactcgtcgtatagacatcgtgaagacatctgaatatattcgtgtttccatcgtcatttacctcgtataataattcgttacaatcggacccaacttcatctcacgatggaaatacgaaagtaaccacgaagcctgcccgattgtcttaagatggttaacacgaacatcgtagatagcgctgcaatgcaatcaggacgccatcgtattagagtacgatggcatctagatggaatttcgaagtcgccgaagacagccgagtgggattttatgaccaaaaaaaaaaaaaaattgtgtagaaaataaaattatgatgaaaatagtcgatcattttcattctcaaaagttgcatgtggacattggccaacttaataacgacacagaaaaagaaaatgacgatggcacttctgacattatctgcaattaattggaaacatgacaagaaacttttacaggcacagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTG---TTCTT--AA---AG-T-A-G-------T-ATTTTGT-A-----CG-A-C--A--T-C-G-T-A-A--TA-G--GC-T--TGCATGTA--TGT-AATCGA------G--G------AC-------------------C--C----ACT--C-GTGATTTGA-GAG----------TA-CAGG-ATT-G--GCA-T-CTTAG-A-TG-A-A------CTCCTCGAA-G----TCG--C--GA------AGACA-G---CC----G-----A-G--TGCTGTT-T-----T--CTGAT--G-ACAC---AAATATAAAAA-ACTCTGTCTTA-AAAATAAAA--T-A--TGGGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTTGCGAA-TCG--C-AAAGT-TG-CGTTATTG-T-GGA-CTAGAA-T-G-GC---ACT-T--ATA-TA---
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-G--GT-T--CGCA---A--TGC-GATC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--T-GAG----------TA-C--G-AT--G--GCA-T-AT-AG-A-TG-G-A------ACTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---CC----GA----A-G--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-A---AAAAA-AAAGA-ACT-TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GGT--G-AAAAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-TCC----AAAGT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-C-GC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA----CAAAAAAAG-AAATG-CGA-TGG-C-----------A--CTAC--T--G-A-CATTAT--T--G-G---AAC---TT----A---G-G-GA-ACATG-A--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T-GA-AT-TCG--T--A---T-GT-------T-CG-TTTTGAA-------G-T--CG-T-A------A-G-G-C-AAT-CGT--GAG-GGT--AT-CT-T-G----T-C-AA-AT-C---G-T-G-TCT-CATC-T-T-C-GT-C-T-T-GA---CTACG-TGT-G--AT--CAT-CG--C-T-G-C--C-AT-G---------AG-------T-T--TT--T-TT---TT---G--TCTCA-C-G-A--CGA-CA-A--TA--CG---AA----G------------GA-AACAA-A---G--A--G--C-T-G-CCTGATAT---C-CGT--AA---GA-T-G-C-------C-A----AC-A-----CG-A-C--T--A-C-G-T-G-A---A-G--TC-C------------------TC--------G--G------AT--G----------------C--T----G-T--C-AT----------G----------TA-T--G-AT-------A-T-CG-AA-A-TG-A-G------ACCA-CAAT-G----TCG--G-CGA------AGACA-G---CC----G-----A-
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCA---GACT-AC-A-TT--C-GGGTGC-A-CC-GTAT-ACTTAAT-AC--GA-TATC-GTGTG-AC----CTT-C--AT-G-T-A--G-CA-TT-CGT-ATGTTTTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGA--TTCGGAAGTCACCG-T-AT---GA-CC-TTCATG--TTC----------------GG-ATC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-GA--CC-TCTG---------TT-GACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-T-TTT--TTG-T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcgCTT-AA--ACTAAATC-----TG-AACTTTAACA-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--CG--TAC--G-TTAAC-A-TA-AT--AAGGTAGTCTCCTCTTC-TGGTA-------------AACGCACC-T-TC-GAG--ACT-GCGCCCG---GACTGGC-T-TT--C-GGATGC-ATTC-GTAC-ACTTAAT-AT--AA-TATC-GTG-G-AC----CTT-TCGGT-G-T-A--GCCA-TT-CGT-AT-TTCTTCTT----ATT---T-AG---ATG--G-TG-CT-TTTCGTATTA-TGG--TTCGGAAGTCACCG-T-TT---G--CC-TTCGTG--TTC----------------GA-GTC-GG-ATTGTC-ATCGTG----TAGA--CCTTCTG---------TTGGACA-TTGAT--ATGTGGCTTCTT-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-G-TTT--T---TTAC--AAATT----CGG--CTGGTTATTTTctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgcttaaactaaatctgaactttaacagcgtataacagtatatcgtacgttaacataataaggtagtctcctcttctggtaaacgcaccttcgagactgcgcccggactggctttcggatgcattcgtacacttaatataatatcgtggacctttcggtgtagccattcgtatttcttcttatttagatggtgcttttcgtattatggttcggaagtcaccgtttgccttcgtgttcgagtcggattgtcatcgtgtagaccttctgttggacattgatatgtggcttcttagtgatcatttgccgttttttacaaattcggctggttatttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gcgggatggtctccgaatcgtccaatttcgtaattaaattcgtgaatgacatcgtactcgtctatatcacatgtgagacatctaataatattcgtgtttccgtccgttcttctagcctcgtataataatcgtacaatgcggatctcacgatggaaaatcacggtaaccaccgaagttgcccgattgtttaagagtcaacacgacatcgtaataggtcgcaatacaatcaggacgccatttcgtttaagagttcagatggcatctagatgaactcgcggagtccgacgtgggttttttatgacaaaaagaacttgtccaaacaaaattattggtgaaaatagtcgatcattttcatttcaaagttgcatgttagacaaaaggccaactttcaataacgacacagaaaaaagaaatgcgattggcactctgaccattttgaacttagggaacatgacgaaaactcatacaggcacaaaacatctttgtttcaggtaaatgtattgataacctaatttgtgatatttctattttttctagaagaacattctattgtactgatgtagttaagagagtaaacagtctttccctcctctccttttgctggagagtctctatgcgttgcgctcttctacgttctccgatgcacccagaggtactttcttattttttattttgttgacagggcaggctcttcttccctgtcctttcctgcgttttggcggcgcatgGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATGA-TA-----AGCGAG-TA--AAAA-G-TGCA-CA--AAACTG--T---GAAA-A-TTATT-TTATTAGAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAA-GGAC-A-TCT----ATT-TATT-ATGA-TA-----AGAGAG-TA--AACA-A-TGCA-CG--AAACTG--T---GAAA-A-TT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GT-GAT-CA-TT------TGCCTG-TTT--T---T--C--AAATT----CGA--C-GG-TATTTTCA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAT-AC--GA-TATC-GTATG-AC----CTT-C--GT-G-T-A--G-CA-AT-CGT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT-AG-TCG-AT-C--AT-TAT-C-AT-T-T--CAAA-GT-TG-CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-GC-C
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gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -C----CC----------GGA-T-GTC-CAA-----TTT---C-G---TAA-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcgTT-----TA-AACTG-AATC-G--GT--ATAATAGTAATAT--CGGACAC-A--CT-AC-A------------------------A-TAGTA------------------GCC-TATC-GAGGGACTTGCGCCGGAGAGA-T-AC-A-TT--C-G-ATGT-A-TC-GTAC-ACTTAATTACCGGACTATT-GTGTGGAC----CTTTC--GT-G-TTA--G-CA-T--CGT-GTGTC-----T----ATT---T-AGA--AAG-TGGTG-CTGTTTCGTA-AAATGG--TTCAGAAGTCACCG-TTGT---GAGCC-TTCATGATTTC----------------GG--TC-GG-A-TGTC-ATCGTG----T-AC--CTTTCTG---------TT-TACA-TCG-T--ATGT-GCTTC-T-A-GTAGATGCA-TT------TGCC-G-TTT--T---TC-C--CAATT----CGG--CGGG-TATTTTCagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgctttaaactgaatcggtataatagtaatatcggacacactacaatagtagcctatcgagggacttgcgccggagagatacattcgatgtatcgtacacttaattaccggactattgtgtggacctttcgtgttagcatcgtgtgtctatttagaaagtggtgctgtttcgtaaaatggttcagaagtcaccgttgtgagccttcatgatttcggtcggatgtcatcgtgtacctttctgtttacatcgtatgtgcttctagtagatgcatttgccgtttttcccaattcggcgggtattttc
gi|5                          : gcgggatgggtctcggtgttgaagtgtccaatttcgtataagtctctggtgatacatctactcgtatcgtatggacatcggtaaacgatctatatattctgtttccgtcgtctgttacctcgtataataatcgttaacaattcggcccaacttatctcacgatggaaagtacgaagtaacacgaaaagccgcccgattgttcttaagatgtaactactacatcgttaatcagctagcatgcaatcagggcacctgacatcgtattaagtagatggcattctagatggaaccccgaacgccgaagggttttattagacaaaaaaaacttgtctaaaaataaattagtggtgaaaatagtcgatcattctcatttcaagatgcatgggacaatggccaacttaataacgacacagaaaagaaattgcgattggcacgcttttgaacattttgcgcaaacttagggaacatgacgaaaaactctaaaggcacagcttctattgtttcaggtaaatgattgataaaccctaatttgtgatctttttctagattttctagaggacgatctatttattatgatatttagagagtaagcagttgcccgaaacagtgaaagtttatttagtcgtcttccgaaacatttctcatgcaaccagaggtactttccttttttgtattattttggtgacaggggcaggtttttcttcccctgccctttcctgcttttgcgctgcCGGATGG-TCT-C----CC----------AAT-C-GTC--AA-----TT----C-G---TAA-T-AA--T-TCG--T--A---T-G----------CA-GCTT---C--TC--G-T--CG-G-A-----TATG-A---A-T-CGT--GAA-GACTAAT------A----T-A-TA-TT-C---G-T-GGTTT-C--C-G-T-C-GT-C-T-T-T-----CTCG-TAT-G---T--AA--AG--T-T-A-C--A-AT-C---------GG-------T-C--CA--A-CT---TC---AGATATCAGC-G-AACTGG-AA----T---CG---AA----G------------TA-ACCAC-G---A--A--G--C-T-G-CC-GATTG---T-TTA--AG---GA-T-G-G-------T-A----AC-A-----CG-A-C-------C-G---------A-G--G------------------------A------C--G------GT--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATA--A-GAG----------TA----G-ATTGG--GCA-T-CT-TG-AGTG-G-A------ATTC-CGTA------TC--------------AGACA-G---CC----G-----A-AGTTGG-GTT-T-----T--T--AT--GCAC-C---AAGAT-AATAA---T-TGTC--A-TATATAAGAT-T-A----GAT--G-CAACT-AG-TCG-AT-C--AT-TTTTC-AT-TTT--CAAA-GTGTG-C-----TG---GGA-C---AA-T-G-GC--AACT-T--A---TA---A-CTGA-CA----CAGATAAT--AAATG-CGA-TGGGC-----------A---TTC--T--G-A-CGTTAG--T--G-C---AACG--TT----A---G-GCGG-ACATG-A--C---A--A-----ACT-CTTA-CAGA-C-A--C--ATGC---CTA--TTGTTTTTAGG--T-AAATG-TAT-T-GAT-TAACCTA-ATTTGGT-----GGT-T--------TATTTTCTTATTT---TT------CTAGAA-G-AC-A-T-T----ATT-TATG-A--A-GA-TT-AAGAGAG-TA--AACA-G--AC--CG--ACACAGGGT---GGGA-A-TTATT-T-ATTAGAATTGTGC-TACCAA-AAACAAGAATAGTTGGTCGA-CT------------GT-----ATA-CGA-CG-AT-ATGACATT-T-ACTTGT-AC--TTTCAC-AT-C-TAC-ATAT-----AATATTCT-TCTT-TAGCGCTATATC-----TGAAACTT-AACC-G-TAT--A-AACAGTA--AT--CG-ACACAAG-TT-AC-A-TA-AT--AAGGT-GTC-------A-TGGT--------------A---TG-C-T-TC-GAG--ACT-GCGC--A---GACT-AC-A-TT--CTGGGTGCGA-CC-GT-T-ACTT-AT-AC--GA-TAT--GTGTG-A-----CTT-C--AT-GCT-A--GCCA-TC-GGT-ATGTT-TTCTT----ATT---TAAGA--A----G-TG-C--TTTCGTA-TA-TTGCATTCGG-AGTCACCG-T-AT---GA-CC-TTCATG--TTC----------------GGTATCTGG-ATTGTCTATCGTG----T-GA---CGTCT----------TT-GACCTTCG-T---TGT-GCTTC-TCA-GT-GAT--A-TT------TGCC-T-TTT--TG--T--CTAAAGTT----CGG--C-GG-CATTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGG-TCC-CT---CC----------GAA-T-GTC--AA-----TTT---C-G---TAG-T-AA-GT-TCG--T--A---T-GA-------T-CA-TCTT--AC--TC--G-T--CG-T-A-----AT-G-A-C-A-T-CGT--GAA-GAC---T-CT-A-A----TTA-TA-T--C---G-T-G-TTT-A--C-G-T-C-GT-C-T-T-TA---CCTCG-TAT-A--AT--AAT-CG--T-T-A-C--A--T-C---------GG-------C-C---A--A-CT---TC---A--TCACA-CTA-A--TGG-AA-T--AA--CG---AA----G------------TA-ACAAC-G---A--A--G--C-T-G-CCCGATTG---T-CTT--AA---GA-T-G-G-------T-A----AC--------G-A-C--A--T-C-G-T-A-A--TA----------TGCA---A--TGC-AATC-A------G--G------AC--G----------------C--C----A-T--C-GT-ATT--A-GA-----------TA-C--G-AT--GT-GCA-T-CT-AG-A-TG-G-A------ATTC-CGAA-G----TCG--C-CGA------AGACA-G---TC----G-----AAG--TGG-GTT-T-----T--T--AT--G-AC-C---AAAAA-AA--------TGTCT-A-AAAATAAAAT-T-A--T-GAT--G-AATAT-AG-TCG-AT-C--AT-TTT-C-AT-T-T--CAAAAGT-T--CA----TG-T-GGA-C---AA-T-G-AC-CAACT-T--A-A-TA---A-C-GA-CA-------GAAAAGAAA-TG-C-A-TGG-C-----------A--CTTC--T--G-A-CATTAT--T--G-C---AAC---TT----A---A-G--A-ACATG-A--C--AA--A-----ACT-CCTA-CAGG-C-A--C--A-GCA-TCTA--TTGTTT-TAGG--T-AAATG-TAT-T-GATA--ACCTA-ATTTG-T-----GAT-T--------TATT--CTAATTT---T-------CTAGAA-TGAC-A-TCT----ATT--ATT-ATGA-TA-TTTAAGAGAG-TA--AACA-G-TGCA-CG--AAACAG--T---GAAA-A-TTATT-TGATTAGAAT-GTGC-TACCAACAAACAAGAA-AGTTTGTC-CTCT------------GTG----ATG-C-A-CGTAT--TGACATT-T-AATTGT-ACATTTCCAC-AT-CTTACTATATA---AAATATTCT-TGTT-AA--------------------CTT-AACC-G-CGT--ATAACAGTA-TAT--TG-ACAC-AG-TT-AC-A-TA-AT--A-GGTAGTC-------A-TGGTA-------------A---CGCC-T-TCGGAG--ACT-GCG-CGA---GACT-AC-A-TT--C-GGATGC-A-CC-GTAC-ACTTGAT-AC--GA-TATC-GTGTG-AC----CTT-C--GT-G---AGTG-CA-TC-CAT-ATGTTCTTCTT----ATT---T-AGA--ACG-TG-TG-CT-TTTCGTA-TA-TGG--TT-GGAAGTCACCG-TGGT---GA-CC-TTT-TA--TT-------------------------A-A----C-ATCGTA----T-GT--GCTTCT------------------------------------C-A-GT-GAT-CA-TT------TGCC-GTTTT--T---T--C--AAATT----CGG--C-GG-CATTTTCA
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Unaligned ( gi|30 ): TCAACGATACTTGGATAATTTCTAATTCCTGTGTCATCTTGTTGTCAAAATTCGGACAGGTGACGCGCAGGC