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Reference ( gi|3 )            :                                                                     CAAGAGGCTTATG-GG----TCAC--A--G--CT----CCCACCTAAGCA----GCAGTT-TC--TAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GGTT--CA--GA-A-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CTA-A----A-ACTTC---ATCA-A----TTA---CC--A----AA-CT---T-----TTAT----A----TTTGGCT-ACAA--A-TTCATT-A-----A---TTATC-AC---ATGC-CCT---------TCT-AGAGG--G--ATAT--G-CCCTTTTCATTTTAA
gi|10                         :                                                                     CGAGAGGCCCATT-AG----CCAC--ATTG--CT----C--ACTTGGGCA----GAAGTT-CC--TTGCAATGAAC----TTCA-G-CAAA--A----CTGTAGTATACT-ACAAGCA--GCTT-GGTT--CA--GA-A-
gi|15                         :                                                                    aCAAGAGGTCCATG-A------CACGTA--T--CG----CTCACCTGTGCA----GCAATC-CT--CAACAATTATCAAGATTGA-G-CAAA--T----C-ATCAT-TA-TGAC-AGCA---CTT-TGTTA-TA--GA-T-GAA-AG----------T----------C------A-AA---AGCTAAC-------A---A-C-A-ACC--A-AATTC---ATttttttttcagaaatgagttatcaaacttgattaaaaatatgcccttgtagaggggtatgggccttcattt
gi|26                         :                                                                   aaCAAAAGGCCCATT-G-----CCAC--T--A--CG----CTAACCTGATCA----ACAATT-CC--TTGCGGTAAATAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTt
gi|6                          :                                                                agataaAAGAAACCCATG-GGCTGATTAC--A--T--CT----ATCACCTGAGCA----GTATTT-CC--TAGCAATAAACAAGCTTGATA-CAACTTA----CTATCAT-TA-T-ACAGGCA--GCTT-GGTT--CA--GA-A-AAA-ACT-------TCT----------C------A-AA---GG--A----------------------------------ATTA-A----TTA---TC--A----AA------T-----TAATC---A----TT--------AA--A-CTCATT----------------------ATGC-CCT---------TGG-AGAGG--G--GTAT--G-GAC-TTTCATTTTAA
gi|9                          :                                                                        GAGG-TCACG-GA----CCAT--A--T--CA----CTCACTTAAG-A----GCAGTT-CC--TAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GGTT--CA--GA-A-AAC-AA
gi|21                         : gcaaggtcttgctacaaagtgtctatataaatgttgaactagtggttttaggttttttttaaaaataaaatGAGGTCCAAG-GA----CCAT--A--T--CA----CTCACTTAAG-A----GCAGTT-CC--TAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GGTT--CA--GA-A-A
gi|2                          :                                                                        tAGGCCCATA-GC----CCAC--ATTG--CT----C--ACCTGAGCA----GCAATT-CC--TAGCAATTTACAAGCTTGC-G-CTAA--A----CTATCAT-TT-T-ACAAGCA--GTTT-GGTT--AA--AA-A-AAA-AAAAAAAACTTTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------A---A-CTA-A----A-AATTA---ATTC-A----TAA---TC--A----AA-C----------TTAA----A------TGA-----AA--C-TTTGTA-A-----A---TTATC-AT---ATGC-TCA---------TGT-CGAGG--A--GTAT--GACCC--TTCATTTTAA
gi|19                         :                                                                     gaggcGGCCCAAG-GG----CCAC--ATTG--CT----C--ACCCCAGAA----ACATTT-TC--TA-CAAGAAACAAGCTTGA-T-CAGA--G----CTATGAT-TA-T-ACCAGCA--CATT-GGTT--AATTTA-A-AAA-AAA-------caaa
gi|11                         :                                                                           tatgATGAGG----TCAC--G--GACCTATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT-CC--TAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GGTT--CA--GA-A-AAC-AA
gi|5                          :         gcaaggtcttgctacaaagtgtctatataaatgttgaaactagtggttttaggttttttttaaaaataaaATG-GG----T-AT--AT-G--CT----C--ACCTGAGCAA---GCAGTT-CA--CAG-AAGAGAGAAGATTGA-G-AAAA--AA---CT--CAT-TA-T-ACGAGCA--GCTT-G--T--TA--G---------AA-------TTTCTTC------C------C-AA---AA-CCAT-------T---A-CTA-A----A-GTTTT----TTA-A----ATA---CT--A----AA-CTTAGT-----TTATGACAA----TTTAGCC-A-AA--A-TTAATGAA-----A---TTGTC-AT---ATG--TCT---------TGT-A-AGGAAG--GTAG--G-CC
gi|1                          :                                                                                                       ----CTCACATGTGCA----GAAGTT-CC--TCGCGACAAACAAGTTTGA-A-CAAA--G----CTGTCAT-TA-T-ACAAGGA--ACTT-GGTT--CT--G----AAA-AAC-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CTACAAATTA-ATTTCATGATCA-A----TTA---TT--ATCTTAA------T-----TAAT----AAAT-TTTAACTCAAAA--A-ATCTTA-A-----A---TTACC-GT---ATGC-CTT---------TGT-AGAGA--GGCACAT--G-tatactttaaa
gi|18                         :                                                                                                   atcg----CCCACTTGATCA----ATAGCC-CC--TAACATTAAACAATCTTAA-A-CAAA--A----TCATCAT-TA-T-A-----A--CTTT-AGTT--C---------AC-ATA-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-----------A-CTA-A----A-A-------ATCG-A----TTA---CC--tatagtccttcttcttaacgattt
gi|17                         :                                                                                                      acaaagCCACCTAGGCACTATGCAGTT-CC--TAGCTATAAACAAGCTTCA-G-CAAA--A----CTATTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GGTT--CA--CA-A-AAA-ACT-------TTT----------C------A-A
gi|4                          :                                                                                           atgaggcctattaaattgCATTTGAGCA----GCAGTT-CT--TGGCAATAAACAAACTTAA-G-CACA--T----CTATCAT-TA-T-ACAAACA--GTTT-GGTT--TA--GA-ATAAA-ACA---------------------------A-AA---GG-TATC-------G---A-CTA-AC---A-AC-TC---ATTA-A----AAA---TA--G----AA-CT---GGA---TCAT----AAAATTTT--CT-AAAA--A-TTCATG-A-----A---TTATC-GT---ATTC-TTT---------ATT-AGAGG--T--TCATG-G-CCC--TTAATTTTAAtg
gi|20                         :                                                                                                       agaccacatcggtGCA----ATAATT-CC--TATCAATACACAAACTGGA-G-TAAA--GTAAGCTTTCAT-TA-T-ACCAGCA--GTTTGGGTT--CA--G----TAA-AAA-------CTT----------C------A-CA---AG-TAAC-------ATGCA-TTA-A----A-Atatat
gi|12                         :                                                                                                                       ----GCAGTTATCGTTAGCAATAAACAAGCTTCA-GATAAA--G----CTACCA--TA-T--TAGGCATTCCTT-GGTT--CA--G------A-AAC-------TTG----------C------ACAA---GG-TAATGTTCAGGG---A-CTA-A----ATTTTTC---ATTA-A----TTATTTTC--A----AATCG---TAA---TTACTA--A----CTTTACT-AAAA--A-ACCATT-A-----AAGGGTATT-AC---AT
gi|7                          :                                                                                                                            CGGTT-CC--TAGCA-TAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CAATCGT-TT-T-ACAAGCA--GTTG-GGTT--TT--TTTA-AAA-AAA-------TT------------------G-AA---AG-T--------------A-CCA-A----A-----C---ATCA-AACTTTTA---TT--A--------T---TA----TCAT----A----TTTG----ACAAGGA-TTCATT-A-----CT--TTATC-AT---ATACTCCTGTACAGACATGT-AGAGA--G--GCAT--A-AC--TTTCATTCTAA
gi|14                         :                                                                                                                                              AATAGGCCTAA-A-CAAA-------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GCTT-GCTT--CC---A-A-AAT-AAA-------TTT-----------------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CTA-A----A-AATTT---GTTA-A----TTA---TC--A----AA-CT---T-----TAAC----A----ATT---C-AAAA--A--TCACC-A----------TATA-ACCTAATG--CCT---------TGT-AGATG--G--GTATG-G-CCC--TTCACTTcaaatt
gi|13                         :                                                                                                                                                  AGCCTAA-A-CAA--------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GC-T-GCTT--CC--AA-A-ATA-AGA-------TTT----------TTA----A-AA---GT-TAAC-------G---A-CTA-A----A-AATTG---GTTAGA----TCA---TCAAA----AA-CT---T-----TAA--------------GC-----A--A-TTCATA-ATCACCA---TTATTAACCTAATGCGCAT---------TGTAAGATG--G---TAT--G-CC---TTCACTTaa
gi|8                          :                                                                                                                                              atttaagTTGA-G-CAAA--A----TTATCAT-CA-T-ACAAGTA--GCTT-TTTTTCCA--G---------AA-------TTT----------TTTTTTAA-AA---GG-TAAC-------G---A-CTA----------------ATTA-A----TTA---TC--A----AA-CC---TAA---TAATCAAAA----CTTGACT-AAAA--A-TTCATA-A-----A---TTATC-AT---ATGC-Caa
gi|16                         :                                                                                                          caaataagtggcccatgggcaacattgctcacttatactgcagTTGA-G-TAAA--A----CTATCAT-TA-C-ACAAGCA--ACTT-GGTT--CA--G--------AAA-------TTTTTTTTTTTCCC------A-AATATAT-TAAC-------A---A-CTA-G----A-TATTC---ATTA-A----TTA---TC--A----AA-CT---GAA---TTATCAA-A----CTTGACT-A-AA--A-Tg
gi|27                         :                                                                                                                                                                          TTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GGTT--CA--GA-A-AAACAAA-------ATT----------C------A-AA---GA-TAAC-------A---AGCTA-T----T-A-TCC---ATTA-A----TCA---TC--A----AA-CT---ctt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                  ----------C------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CTA-A----A-A-TTC---ATTA-A----TTA---
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             C---ATTA-A----TTA---TC--A----AA-CT---TAATCATCAT----A----CTTGACT-AAAA--A-TTCATT-A-----A---TTATG-AT---ATTC-CCT---------T-------G--G--ATAT--G-ACTTTTTttatgtgtccttgttgagaaaaatgacctttcattttattaacaaatttc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GACT-A-AA--A-TTCATT-A-----A---TTATT-AT---GTGT-CCT---------TGT-TGAGA--A--AAAT--G-ACC-TTTCATTTTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caaaagtaac-ACAA--A-GT-ATC-A-----C---CTA-C-AT---GTAC-CAC---------TGT-AGAGG--G--ATAT--G-GCC-TTTCATTttaacaaatttc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaattaaatgattaaactttactaaaaaaataaCAA--ACTTGATT-A-----A---AAAT-------ATGC-CCT---------TGT-AGAGG--G--GTATGGG-CC---TTCATTT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TAATCAAACTTAAAACAATTCGTATATTATTATATACTGCCCAATAGAGGGGTTGACCCTGCACTTTGACAAATTC






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consensus                     :                               CAAGAGGCCCATGGGCC----ACAT-G-CNCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GGTT--CA--GA-A-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTA----A-TCAT----A----CTTGACT-AAA-AA--TTCAT-AA-----ATT-ATCA------T-AT-GC------CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCC-CTTCATTTTAA
Reference ( family-168 )      :                               CGAGAGGCCCATGGGCC----ACAT-G-CTCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GGTT--CA--GA-A-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTA----A-TNAT----A----CTTGACT-AAA-AA--TTCAT-NA-----ATT-ATCA------T-AT-GC------CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGCCC-TTTCATTTTAA
gi|1                          :                                                             CTCACATGTGCA----GAAGTT--C-CTCGCGACAAACAAGTTTGA-A-CAAA--G----CTGTCAT-TA-T-ACAAGGA--ACTT-GGTT--CT--G----AAA-AAC-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-AC-A-A--A-TTA-ATTTCATGATCA-A----TTA---TT-AT-CTTA----ATTAAT----AAAT-TTTAACTCAAA-AA--ATCTT-AA-----ATT-ACCG------T-AT-GC------CTT---------TGTAGAGA--GGCACATGTATAGTC-CTTCTTCTTAA
gi|10                         :                           atcgCGAGAGGCCCATTAGCC----ACATTG-CTC--ACTTGGGCA----GAAGTT--C-CTTGCAATGAAC----TTCA-G-CAAA--A----CTGTAGTATACT-ACAAGCA--GCTT-GGTT--CA--G---------AATTTTT--TTT----------C------A-GA-------AAT-------G---------------------------------A-G----TTA---TCAA--------------------A----CTTGATT-AAA-A-----------------------A------T-AT-GC------CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGGC-CTTCATTTcgattt
gi|11                         :                                 aGAGGTC-ACGGACC-----TAT---CACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GGTT--CA--GA-A-AAC-AA
gi|12                         : gcaaggtcttgctacaaagtgtctatataaatgttgaaactagtggttttaggttttttttaaaaataaaat----GCAGTTATCGTTAGCAATAAACAAGCTTCA-GATAAA--G----CTACCA--TA-T--TAGGCATTCCTT-GGTT--CA--G------A-AAC-------TTG----------C------ACAA---GG-TAATGTTCAGGG---A-CT-A--A-ATTT-TTC-ATT--------A-A----TTATTTTCAAATCGTA----A-TTACTA--A----CTTTACT-AAA-AA--ACCAT-TA-----A
gi|13                         :                                                                                                    AGCCTAA-A-CAA--------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GC-T-GCTT--CC--AA-A-ATA-AGA-------TTT----------TTA----A-AA---GT-TAAC-------G---A-CTAA--A-A--A-TTG-GTT--------AGA----TCA---TCAAA----A--------------A----CTT---T-AAGCAA--TTCAT-AATCACCATT-ATTAACC---TAAT-GCG-----CAT---------TGTAAGAT--G------GTATGCC---TTCACTTagggtattacat
gi|14                         :                                                                                         atttaagAATAGGCCTAA-A-CAAA-------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GCTT-GCTT--C---CA-A-AAT-AAA-------TTT-----------------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CTAA--A-A--A-TTT-GTT--------A-A----TTA---TCAAA-CTT--------------------------T-AAC-AA--TTCAA-AA-----ATC-ACCA------T-ATAACCTAATGCCT---------TGTAGATG--G------GTATGGCC-CTTCACTTaa
gi|15                         :                               CAAGAGGTCCATGA--C----ACGT-ATCGCTCACCTGTGCA----GCAATC--C-TCAACAATTATCAAGATTGA-G-CAAA--T----C-ATCAT-TA-TGAC-AGCA---CTT-TGTTA-TA--GA-T-GAA-AG----------T----------C------A-AA---AGCTAAC-------A---A-CA-ACCA-A--A-TTC-ATT--------aa
gi|16                         :                                                                                                     aaTTGA-G-TAAA--A----CTATCAT-TA-C-ACAAGCA--ACTT-GGTT--CA--G--------AAA-------TTTTTTTTTTTCCC------A-AATATAT-TAAC-------A---A-CT-A--G-AT-A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTGA----A-TTATCAA-A----CTTGACT-AAA-A
gi|17                         :                                                               CACCTAGGCACTATGCAGTT--C-CTAGCTATAAACAAGCTTCA-G-CAAA--A----CTATTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GGTT--CA--CA-A-AAA-ACT-------TTT----------C------A-Atctt
gi|18                         :                                          atgaggcctattaaattgcCCCACTTGATCA----ATAGCC--C-CTAACATTAAACAATCTTAA-A-CAAA--A----TCATCAT-TA-T-A-----A--CTTT-AGTT--C---------AC-ATA-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-----------A-CT-A--A-A--A-ATCGATT--------A-tg
gi|19                         :                              acaaagGGCCCAAGGGCC----ACATTG-CTC--ACCCCAGAA----ACATTT--T-CTA-CAAGAAACAAGCTTGA-T-CAGA--G----CTATGAT-TA-T-ACCAGCA--CATT-GGTT--AATTTA-A-AAA-AAA-------cc
gi|2                          :                               tatgAGGCCCATAGCCC----ACATTG-CTC--ACCTGAGCA----GCAATT--C-CTAGCAATTTACAAGCTTGC-G-CTAA--A----CTATCAT-TT-T-ACAAGCA--GTTT-GGTT--AA--AA-A-AAA-AAAAAAAACTTTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------A---A-CT-A--A-A--A-----ATT--------A-A----T-----TCA-----TA----A-TCAA----A----CTTAAAT-GAA-AC--TTTGT-AA-----ATT-ATCA------T-AT-GC------TCA---------TGTCGAGG--A------GTATGACC-CTTCATTTTAA
gi|20                         :                                                                 gaggcGCA----ATAATT--C-CTATCAATACACAAACTGGA-G-TAAA--GTAAGCTTTCAT-TA-T-ACCAGCA--GTTTGGGTT--CA--G----TAA-AAA-------CTT----------C------A-CA---AG-TAAC-------ATGCA-TT-A--A-A--A-caaa
gi|21                         :                                  GAGGTCCAAGGACC----ATAT---CACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GGTT--CA--GA-A-A
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          tAAA-TTAA----A-TGATTAA-A----CTTTACT-AAA-AAAATAAAC-AA-----AGT-ATCACCTACAT-GT-AC------CAC---------TGTAGAGG--G------ATATGGCC-TTTCATT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                    ----------C------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TTA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GACT-AAA-A---TTCAT-TA-----ATT-ATTA------T-GT-GT------CCT---------TGTTGAGA--A------AAATGACC-TTTCATTTTAtgtgtccttgttgagaaaaatgacctttcattttattaacaaatttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                     caaaagtaacC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTA----A-TCATCAT-A----CTTGACT-AAA-AA--TTCAT-TA-----ATT-ATGA------T-AT-TC------CCT---------T------G--G------ATATGACT-TTTttaacaaatttc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 TA----A-TCAA----A----CTTAA---AAC-AA--TTCGT-AT-----ATT-ATTA------T-AT-ACTG----CCC---------AATAGAGG--G------GT-TGACC-CTGCACTTTGAt
gi|26                         :                               CAAAAGGCCCATTG-CC----AC-T-A-CGCTAACCTGATCA----ACAATT--C-CTTGCGGTAAATAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTcaaattc
gi|27                         :                                                                                                                      agataaTTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GGTT--CA--GA-A-AAACAAA-------ATT----------C------A-AA---GA-TAAC-------A---AGCT-A--T-T--A-TCC-ATT--------A-A----TCA---TCAAA-CT
gi|3                          :                               CAAGAGGCTTATGGGTC----ACA--G-CTCCCACCTAAGCA----GCAGTT--T-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GGTT--CA--GA-A-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--ACTTC-ATC--------A-A----TTA---CCAAA-CTT-------TTAT----A----TTTGGCT-ACA-AA--TTCAT-TA-----ATT-ATCA------C-AT-GC------CCT---------TCTAGAGG--G------ATATGCCCTTTTCATTTTAA
gi|4                          :                                            GACC----ACAT---CGGTCATTTGAGCA----GCAGTT--C-TTGGCAATAAACAAACTTAA-G-CACA--T----CTATCAT-TA-T-ACAAACA--GTTT-GGTT--TA--GA-ATAAA-ACA---------------------------A-AA---GG-TATC-------G---A-CT-A--ACA--A-CTC-ATT--------A-A----AAA---TAGAA-CTGG----A-TCAT----AAAATTTT--CT-AAA-AA--TTCAT-GA-----ATT-ATCG------T-AT-TC------TTT---------ATTAGAGG--T------TCATGGCC-CTTAATTTTAA
gi|5                          :                                        aATGGGT-----ATAT-G-CTC--ACCTGAGCAA---GCAGTT--C-ACAG-AAGAGAGAAGATTGA-G-AAAA--AA---CT--CAT-TA-T-ACGAGCA--GCTT-G--T--TA--G---------AA-------TTTCTTC------C------C-AA---AA-CCAT-------T---A-CT-A--A-A--G-TTT-TTT--------A-A----ATA---CTAAA-CTTAGTTTA-TGAC----A----ATTTAGC-CAA-AA--TTAATGAA-----ATT-GTCA------T-AT-G-------TCT---------TGTA-AGGAAG------GTAGGCC---TATACTTTAAtatat
gi|6                          :                                 AGAAACCCATGGGCTGATTACAT---CTATCACCTGAGCA----GTATTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGATA-CAACTTA----CTATCAT-TA-T-ACAGGCA--GCTT-GGTT--CA--GA-A-AAA-ACT-------TCT----------C------A-AA---GG--A--------------------------------ATT--------A-A----TTA---TCAAA--TTA----A-TCAT----------T--------A-AA--CTCAT----------------------T-AT-GC------CCT---------TGGAGAGG--G------GTATGGAC-TTTCATTTTAAa
gi|7                          :                                                                             aCGGTT--C-CTAGCA-TAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CAATCGT-TT-T-ACAAGCA--GTTG-GGTT--TT--TTTA-AAA-AAA-------TT------------------G-AA---AG-TA---------------CC-A--A-A------C-ATC--------A-AACTTTTA---TTA----TTA------TCAT----A----TTTGAC--AAG-GA--TTCAT-TA-----CTTTATCA------T-AT-ACT-----CCTGTACAGACATGTAGAGA--G------GCATA-AC-TTTCATTCTAA
gi|8                          :                                 AGTGGCCCATGGGCA----ACATTG-CTC--ACTTATACT----GCAGTT----------------------GA-G-CAAA--A----TTATCAT-CA-T-ACAAGTA--GCTT-TTTTTCCA--GA-A---------------TTT----------TTTTTTAA-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-----------TT--------A-A----TTA---TCAAA-CCTA----A-TAATCAAAA----CTTGACT-AAA-AA--TTCAT-AA-----ATT-ATCA------T-AT-GC------Ccaaatt
gi|9                          :                            caaataGAGGTC-ACGGACC----ATAT---CACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GGTT--CA--GA-A-AAC-AAg





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lowQualScore                  :                                         5    5  5555    99 8          3 9999      99 1                    8 8    6666666       8  8 8       55    8  55  33  0000000000000000000000000000000000000000 1  999  2    55555555555 2  2 2222222222222   11111111 4 3333   111     222222222222222222222222  9999999 4 111  4  44    3333333333       333333 7   77 77777   444444444        99 222222      6  99          
consensus                     :                                CAAGAGGCCCATGGGCC----ACAT--CGCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-A---T----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCCC--TTCATTTTAA
Reference ( family-168 )      :                                CAAGAGGCCCATGGGCC----ACATG-CNCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-A---T----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCCC--TTCATTTTAA
gi|1                          :                                                          -CGCTCACATGTGCA----GAAGTT--C-CTCGCGACAAACAAGTTTGA-A-CAAA--G----CTGTCAT-TA-T-ACAAGGA--ACTT-GG--TT--CT--G---AAA-AAC-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-AC-A-A--A-TTA-ATTTCATGATCA-A----TTA---TT-AT-CTTAATTAA---T----AAAT-TTTAAC----TCA---AA-AA--ATCT-T-AA-----ATTACCG------T-ATG--C-----CTT---------TGTAGAGA--GGCACATGTATAGTCC--TTCTTCTTAA
gi|10                         :                              atCGAGAGGCCCATTAGCC----ACAT--TGCTCACTTGGGCA----GAAGTT--C-CTTGCAATGAAC----TTCA-G-CAAA--A----CTGTAGTATACT-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--G--------AATTTTT--TTT----------C------A-GA-------AAT-------G---------------------------------A-G----TTA---TCAA-------------------A----CTTGAT----T-A---AA-A-----------------------A------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGGCC--TTCATTTcgattt
gi|11                         :                                  aGAGGTC-ACGGACC-----TAT--CACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAC-AA
gi|12                         : gcaaggtcttgctacaaagtgtctatataaatgttgaaactagtggttttaggttttttttaaaaataaaat----GCAGTTATCGTTAGCAATAAACAAGCTTCA-GATAAA--G----CTACCA--TA-T--TAGGCATTCCTT-GG--TT--CA--G-----A-AAC-------TTG----------C------ACAA---GG-TAATGTTCAGGG---A-CT-A--A-ATTT-TTC-ATT--------A-A----TTATTTTCAAATCGTAATT-A---CTA--A----CTTTAC----T-A---AA-AA--ACCATT-AA-----A
gi|13                         :                                                                                                    AGCCTAA-A-CAA--------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GC-T-GC--TT--CC--AAA-ATA-AGA-------TTT----------TTA----A-AA---GT-TAAC-------G---A-CTAA--A-A--A-TTG-GTT--------AGA----TCA---TCAAA----A-------------A----CTT-------T-A---AGCAA--TTCA-T-AATCACCATTATTAACC---TAATG--CG----CAT---------TGTAAGAT--G------GTATG--CC--TTCACTTgggtattacat
gi|14                         :                                                                                         atttaagAATAGGCCTAA-A-CAAA-------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GCTT-GC--TT--CC---AA-AAT-AAA-------TTT-----------------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--AATTT-GTT--------A-A----TTA---TCAAA-CTT-----------------------------T-A---AC-AA--TTCA-A-AA-----ATCACCA------T-ATAACCTAATGCCT---------TGTAGATG--G------GTATGGCCC--TTCACTTaa
gi|15                         :                                CAAGAGGTCCATGA--C----ACGTATCGCTCACCTGTGCA----GCAATC--C-TCAACAATTATCAAGATTGA-G-CAAA--T----C-ATCAT-TA-TGAC-AGCA---CTT-TG--TTA-TA--GAT-GAA-AG----------T----------C------A-AA---AGCTAAC-------A---A-CA-ACCA-A--A-TTC-ATT--------aa
gi|16                         :                                                                                                     aaTTGA-G-TAAA--A----CTATCAT-TA-C-ACAAGCA--ACTT-GG--TT--CA--G-------AAA-------TTTTTTTTTTTCCC------A-AATATAT-TAAC-------A---A-CT-A--G-AT-A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTGAATT-A---TCAA-A----CTTGAC----T-A---AA-A
gi|17                         :                                                               CACCTAGGCACTATGCAGTT--C-CTAGCTATAAACAAGCTTCA-G-CAAA--A----CTATTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--CAA-AAA-ACT-------TTT----------C------A-Atctt
gi|18                         :                                          atgaggcctattaaattgcCCCACTTGATCA----ATAGCC--C-CTAACATTAAACAATCTTAA-A-CAAA--A----TCATCAT-TA-T-A-----A--CTTT-AG--TT--C--------AC-ATA-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-----------A-CT-A--A-A--A-ATCGATT--------A-tg
gi|19                         :                               acaaagGGCCCAAGGGCC----ACAT--TGCTCACCCCAGAA----ACATTT--T-CTA-CAAGAAACAAGCTTGA-T-CAGA--G----CTATGAT-TA-T-ACCAGCA--CATT-GG--TT--AATTTAA-AAA-AAA-------cc
gi|2                          :                                tatgAGGCCCATAGCCC----ACAT--TGCTCACCTGAGCA----GCAATT--C-CTAGCAATTTACAAGCTTGC-G-CTAA--A----CTATCAT-TT-T-ACAAGCA--GTTT-GG--TT--AA--AAA-AAA-AAAAAAAACTTTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------A---A-CT-A--A-A--A-----ATT--------A-A----T-----TCA-----TAATC-A---A----A----CTTAAA----T-G---AA-AC--TTTG-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----TCA---------TGTCGAGG--A------GTATGACCC--TTCATTTTAA
gi|20                         :                                                                 gaggcGCA----ATAATT--C-CTATCAATACACAAACTGGA-G-TAAA--GTAAGCTTTCAT-TA-T-ACCAGCA--GTTTGGG--TT--CA--G---TAA-AAA-------CTT----------C------A-CA---AG-TAAC-------ATGCA-TT-A--A-A--A-caaa
gi|21                         :                                   GAGGTCCAAGGACC----ATAT--CACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-A
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     tA---TTAAA---TGATT-A---A----A----CTTTAC----T-A---AA-AAAATAAA-C-AA-----AGTATCACCTACAT-GTA--C-----CAC---------TGTAGAGG--G------ATATGGCCT--TTCATT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                   aa----------C------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TTA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAC----T-A---AA-A---TTCA-T-TA-----ATTATTA------T-GTG--T-----CCT---------TGTTGAGA--A------AAATGACCT--TTCATTTTAtgtgtccttgttgagaaaaatgacctttcattttattaacaaatttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                      caaaagtaacC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-ATCAT----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-TA-----ATTATGA------T-ATT--C-----CCT---------T------G--G------ATATGACTT--TTttaacaaatttc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAATC-A---A----A----CTTAA-------A---AC-AA--TTCG-T-AT-----ATTATTA------T-ATA--CTG---CCC---------AATAGAGG--G------GT-TGACCC--TGCACTTTGAt
gi|26                         :                                CAAAAGGCCCATTG-CC----AC-TA-CGCTAACCTGATCA----ACAATT--C-CTTGCGGTAAATAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTcaaattc
gi|27                         :                                                                                                                      agataaTTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAACAAA-------ATT----------C------A-AA---GA-TAAC-------A---AGCT-A--T-T--A-TCC-ATT--------A-A----TCA---TCAAA-CT
gi|3                          :                                CAAGAGGCTTATGGGTC----ACA-G-CTCCCACCTAAGCA----GCAGTT--T-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--ACTTC-ATC--------A-A----TTA---CCAAA-CTT--TT-A---T----A----TTTGGC----T-A---CA-AA--TTCA-T-TA-----ATTATCA------C-ATG--C-----CCT---------TCTAGAGG--G------ATAT-GCCCTTTTCATTTTAA
gi|4                          :                                             GACC----ACAT--CGGTCATTTGAGCA----GCAGTT--C-TTGGCAATAAACAAACTTAA-G-CACA--T----CTATCAT-TA-T-ACAAACA--GTTT-GG--TT--TA--GAATAAA-ACA---------------------------A-AA---GG-TATC-------G---A-CT-A--ACA--A-CTC-ATT--------A-A----AAA---TAGAA-CTGGATC-A---T----AAAATTTT--C----T-A---AA-AA--TTCA-T-GA-----ATTATCG------T-ATT--C-----TTT---------ATTAGAGG--T------TCATGGCCC--TTAATTTTAA
gi|5                          :                                         aATGGGT-----ATATG-C--TCACCTGAGCAA---GCAGTT--C-ACAG-AAGAGAGAAGATTGA-G-AAAA--AA---CT--CAT-TA-T-ACGAGCA--GCTT-G----T--TA--G--------AA-------TTTCTTC------C------C-AA---AA-CCAT-------T---A-CT-A--A-A--G-TTT-TTT--------A-A----ATA---CTAAA-CTTAGTT-----T----A------TGACAATTT-AGCCAA-AA--TTAA-TGAA-----ATTGTCA------T-ATG--------TCT---------TGTA-AGGAAG------GTA-GG-CC--TATACTTTAAtatat
gi|6                          :                                 AAGAAACCCATGGGCTGATTACAT--CTATCACCTGAGCA----GTATTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGATA-CAACTTA----CTATCAT-TA-T-ACAGGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-ACT-------TCT----------C------A-AA---GG--A--------------------------------ATT--------A-A----TTA---TCAAA--TTAATC-A---T----------T---------------A-AA--CTCA-T---------------------T-ATG--C-----CCT---------TGGAGAGG--G------GTATGGACT--TTCATTTTAAa
gi|7                          :                                                                              CGGTT--C-CTAGCA-TAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CAATCGT-TT-T-ACAAGCA--G-TT-GGGTTT--TT--TTA-AAA-AAA-------TT------------------G-AA---AG-T--------------A-CC-A--A-A------C-ATC--------A-AACTTTTA---TTA----TT-ATC-A---T----A----TTTGAC------A---AG-GA--TTCATT-AC-----TTTATCA------T-ATA--CT----CCTGTACAGACATGTAGAGA--G------GCATAA-CT--TTCATTCTAA
gi|8                          :                                 AAGTGGCCCATGGGCA----ACAT--TGCTCACTTATACT----GCAGTT----------------------GA-G-CAAA--A----TTATCAT-CA-T-ACAAGTA--GCTT-TT--TTTCCA--GAA---------------TTT----------TTTTTTAA-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-----------TT--------A-A----TTA---TCAAA-CCTAATA-A---TCAAAA----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----Ccaaatt
gi|9                          :                              caaatGAGGTC-ACGGACC----ATAT--CACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAC-AAg





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consensus                     :                                CAAGAGGCCCATGGGCC----AC--ATCGCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-A---T----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCCC--TTCATTTTAA
Reference ( family-168 )      :                                CAAGAGGCCCATGGGCC----AC--ATCGCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-A---T----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCCC--TTCATTTTAA
gi|1                          :                                                       --ATCGCTCACATGTGCA----GAAGTT--C-CTCGCGACAAACAAGTTTGA-A-CAAA--G----CTGTCAT-TA-T-ACAAGGA--ACTT-GG--TT--CT--G---AAA-AAC-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-AC-A-A--A-TTA-ATTTCATGATCA-A----TTA---TT-AT-CTTAATTAA---T----AAAT-TTTAAC----TCA---AA-AA--ATCT-T-AA-----ATTACCG------T-ATG--C-----CTT---------TGTAGAGA--GGCACATGTATAGTCC--TTCTTCTTAA
gi|10                         :                                CGAGAGGCCCATTAGCC----AC--ATTGCTCACTTGGGCA----GAAGTT--C-CTTGCAATGAA----CTTCA-G-CAAA--A----CTGTAGTATACT-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--G--------AATTTTT--TTT----------C------A-GA-------AAT-------G---------------------------------A-G----TTA---TCAA-------------------A----CTTGAT----T-A---AA-A-----------------------A------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGGCC--TTCATTTcgattt
gi|11                         :                                  aGAGGTC-ACGGACC-----T--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAC-AA
gi|12                         : gcaaggtcttgctacaaagtgtctatataaatgttgaaactagtggttttaggttttttttaaaaataaaat----GCAGTTATCGTTAGCAATAAACAAGCTTCA-GATAAA--G----CTACCA--TA-T--TAGGCATTCCTT-GG--TT--CA--G-----A-AAC-------TTG----------C------ACAA---GG-TAATGTTCAGGG---A-CT-A--A-ATTT-TTC-ATT--------A-A----TTATTTTCAAATCGTAATT-A---CTA--A----CTTTAC----T-A---AA-AA--ACCATT-AA-----A
gi|13                         :                                                                                                    AGCCTAA-A-CAA--------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GC-T-GC--TT--CC--AAA-ATA-AGA-------TTT----------TTA----A-AA---GT-TAAC-------G---A-CTAA--A-A--A-TTG-GTT--------AGA----TCA---TCAAA----A-------------A----CTT-------T-A---AGCAA--TTCA-T-AATCACCATTATTAACC---TAATG--CG----CAT---------TGTAAGAT--G------GTATG--CC--TTCACTTgggtattacat
gi|14                         :                                                                                         atttaagAATAGGCCTAA-A-CAAA-------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GCTT-GC--TT--CC---AA-AAT-AAA-------TTT-----------------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--AATTT-GTT--------A-A----TTA---TCAAA-CTT-----------------------------T-A---AC-AA--TTCA-A-AA-----ATCACCA------T-ATAACCTAATGCCT---------TGTAGATG--G------GTATGGCCC--TTCACTTaa
gi|15                         :                                CAAGAGGTCCATGA--C----ACGTATCGCTCACCTGTGCA----GCAATC--C-TCAACAATTATCAAGATTGA-G-CAAA--T----C-ATCAT-TA-TGAC-AGCA---CTT-TG--TTA-TA--GAT-GAA-AG----------T----------C------A-AA---AGCTAAC-------A---A-CA-ACCA-A--A-TTC-ATT--------aa
gi|16                         :                                                                                                     aaTTGA-G-TAAA--A----CTATCAT-TA-C-ACAAGCA--ACTT-GG--TT--CA--G-------AAA-------TTTTTTTTTTTCCC------A-AATATAT-TAAC-------A---A-CT-A--G-AT-A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTGAATT-A---TCAA-A----CTTGAC----T-A---AA-A
gi|17                         :                                   GAGGCCTAT----T----AA--ATTGC-CACCTAGGCACTATGCAGTT--C-CTAGCTATAAACAAGCTTCA-G-CAAA--A----CTATTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--CAA-AAA-ACT-------TTT----------C------A-Atctt
gi|18                         :                                                          atGCCCACTTGATCA----ATAGCC--C-CTAACATTAAACAATCTTAA-A-CAAA--A----TCATCAT-TA-T-A-----A--CTTT-AG--TT--C--------AC-ATA-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-----------A-CT-A--A-A--A-ATCGATT--------A-tg
gi|19                         :                                acaaaGGCCCAAGGGCC----AC--ATTGCTCACCCCAGAA----ACATTT--T-CTA-CAAGAAACAAGCTTGA-T-CAGA--G----CTATGAT-TA-T-ACCAGCA--CATT-GG--TT--AATTTAA-AAA-AAA-------cc
gi|2                          :                                tatgAGGCCCATAGCCC----AC--ATTGCTCACCTGAGCA----GCAATT--C-CTAGCAATTTACAAGCTTGC-G-CTAA--A----CTATCAT-TT-T-ACAAGCA--GTTT-GG--TT--AA--AAA-AAA-AAAAAAAACTTTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------A---A-CT-A--A-A--A-----ATT--------A-A----T-----TCA-----TAATC-A---A----A----CTTAAA----T-G---AA-AC--TTTG-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----TCA---------TGTCGAGG--A------GTATGACCC--TTCATTTTAA
gi|20                         :                                                                 gaggcGCA----ATAATT--C-CTATCAATACACAAACTGGA-G-TAAA--GTAAGCTTTCAT-TA-T-ACCAGCA--GTTTGGG--TT--CA--G---TAA-AAA-------CTT----------C------A-CA---AG-TAAC-------ATGCA-TT-A--A-A--A-caaa
gi|21                         :                                   GAGGTCCAAGGACC----AT--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-A
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     tA---TTAAA---TGATT-A---A----A----CTTTAC----T-A---AA-AAAATAAA-C-AA-----AGTATCACCTACAT-GTA--C-----CAC---------TGTAGAGG--G------ATATGGCCT--TTCATT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                   aa----------C------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TTA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAC----T-A---AA-A---TTCA-T-TA-----ATTATTA------T-GTG--T-----CCT---------TGTTGAGA--A------AAATGACCT--TTCATTTTAtgtgtccttgttgagaaaaatgacctttcattttattaacaaatttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                      caaaagtaacC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-ATCAT----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-TA-----ATTATGA------T-ATT--C-----CCT---------T------G--G------ATATGACTT--TTttaacaaatttc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAATC-A---A----A----CTTAA-------A---AC-AA--TTCG-T-AT-----ATTATTA------T-ATA--CTG---CCC---------AATAGAGG--G------GT-TGACCC--TGCACTTTGAt
gi|26                         :                                CAAAAGGCCCATTG-CC----AC--TACGCTAACCTGATCA----ACAATT--C-CTTGCGGTAAATAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTcaaattc
gi|27                         :                                                                                                                      agataaTTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAACAAA-------ATT----------C------A-AA---GA-TAAC-------A---AGCT-A--T-T--A-TCC-ATT--------A-A----TCA---TCAAA-CT
gi|3                          :                                CAAGAGGCTTATGGGTC----AC--AGCTCCCACCTAAGCA----GCAGTT--T-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--ACTTC-ATC--------A-A----TTA---CCAAA-CTT--TT-A---T----A----TTTGGC----T-A---CA-AA--TTCA-T-TA-----ATTATCA------C-ATG--C-----CCT---------TCTAGAGG--G------ATAT-GCCCTTTTCATTTTAA
gi|4                          :                                             GACC----AC--ATCGGTCATTTGAGCA----GCAGTT--C-TTGGCAATAAACAAACTTAA-G-CACA--T----CTATCAT-TA-T-ACAAACA--GTTT-GG--TT--TA--GAATAAA-ACA---------------------------A-AA---GG-TATC-------G---A-CT-A--ACA--A-CTC-ATT--------A-A----AAA---TAGAA-CTGGATC-A---T----AAAATTTT--C----T-A---AA-AA--TTCA-T-GA-----ATTATCG------T-ATT--C-----TTT---------ATTAGAGG--T------TCATGGCCC--TTAATTTTAA
gi|5                          :                                         aATGGGT-----AT--AT-GCTCACCTGAGCAA---GCAGTT--C-ACAG-AAGAGAGAAGATTGA-G-AAAA--AA---CT--CAT-TA-T-ACGAGCA--GCTT-G----T--TA--G--------AA-------TTTCTTC------C------C-AA---AA-CCAT-------T---A-CT-A--A-A--G-TTT-TTT--------A-A----ATA---CTAAA-CTTAGTT-----T----A------TGACAATTT-AGCCAA-AA--TTAA-TGAA-----ATTGTCA------T-ATG--------TCT---------TGTA-AGGAAG------GTA-GG-CC--TATACTTTAAtatat
gi|6                          :                                 AAGAAACCCATGGGCTGATTAC--ATCTATCACCTGAGCA----GTATTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGATA-CAACTTA----CTATCAT-TA-T-ACAGGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-ACT-------TCT----------C------A-AA---GG--A--------------------------------ATT--------A-A----TTA---TCAAA--TTAATC-A---T----------T---------------A-AA--CTCA-T---------------------T-ATG--C-----CCT---------TGGAGAGG--G------GTATGGACT--TTCATTTTAAa
gi|7                          :                                                                              CGGTT--C-CTAGCA-TAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CAATCGT-TT-T-ACAAGCA--G-TT-GGGTTT--TT--TTA-AAA-AAA-------TT------------------G-AA---AG-T--------------A-CC-A--A-A------C-ATC--------A-AACTTTTA---TTA----TT-ATC-A---T----A----TTTGAC------A---AG-GA--TTCATT-AC-----TTTATCA------T-ATA--CT----CCTGTACAGACATGTAGAGA--G------GCATAA-CT--TTCATTCTAA
gi|8                          :                                 AAGTGGCCCATGGGCA----AC--ATTGCTCACTTATACT----GCAGTT----------------------GA-G-CAAA--A----TTATCAT-CA-T-ACAAGTA--GCTT-TT--TTTCCA--GAA---------------TTT----------TTTTTTAA-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-----------TT--------A-A----TTA---TCAAA-CCTAATA-A---TCAAAA----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----Ccaaatt
gi|9                          :                              caaatGAGGTC-ACGGACC----AT--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAC-AAg





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consensus                     :                                CAAGAGGCCCATGGGCC----AC--ATCGCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-A---T----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCCC--TTCATTTTAA
Reference ( family-168 )      :                                CAAGAGGCCCATGGGCC----AC--ATCGCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-A---T----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCCC--TTCATTTTAA
gi|1                          :                                                       --ATCGCTCACATGTGCA----GAAGTT--C-CTCGCGACAAACAAGTTTGA-A-CAAA--G----CTGTCAT-TA-T-ACAAGGA--ACTT-GG--TT--CT--G---AAA-AAC-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-AC-A-A--A-TTA-ATTTCATGATCA-A----TTA---TT-AT-CTTAATTAA---T----AAAT-TTTAAC----TCA---AA-AA--ATCT-T-AA-----ATTACCG------T-ATG--C-----CTT---------TGTAGAGA--GGCACATGTATAGTCC--TTCTTCTTAA
gi|10                         :                                CGAGAGGCCCATTAGCC----AC--ATTGCTCACTTGGGCA----GAAGTT--C-CTTGCAATGAA----CTTCA-G-CAAA--A----CTGTAGTATACT-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--G--------AATTTTT--TTT----------C------A-GA-------AAT-------G---------------------------------A-G----TTA---TCAA-------------------A----CTTGAT----T-A---AA-A-----------------------A------T-ATG--C-----CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGGCC--TTCATTTcgattt
gi|11                         :                                  aGAGGTC-ACGGACC-----T--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAC-AA
gi|12                         : gcaaggtcttgctacaaagtgtctatataaatgttgaaactagtggttttaggttttttttaaaaataaaat----GCAGTTATCGTTAGCAATAAACAAGCTTCA-GATAAA--G----CTACCA--TA-T--TAGGCATTCCTT-GG--TT--CA--G-----A-AAC-------TTG----------C------ACAA---GG-TAATGTTCAGGG---A-CT-A--A-ATTT-TTC-ATT--------A-A----TTATTTTCAAATCGTAATT-A---CTA--A----CTTTAC----T-A---AA-AA--ACCATT-AA-----A
gi|13                         :                                                                                                    AGCCTAA-A-CAA--------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GC-T-GC--TT--CC--AAA-ATA-AGA-------TTT----------TTA----A-AA---GT-TAAC-------G---A-CTAA--A-A--A-TTG-GTT--------AGA----TCA---TCAAA----A-------------A----CTT-------T-A---AGCAA--TTCA-T-AATCACCATTATTAACC---TAATG--CG----CAT---------TGTAAGAT--G------GTATG--CC--TTCACTTgggtattacat
gi|14                         :                                                                                         atttaagAATAGGCCTAA-A-CAAA-------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GCTT-GC--TT--CC---AA-AAT-AAA-------TTT-----------------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--AATTT-GTT--------A-A----TTA---TCAAA-CTT-----------------------------T-A---AC-AA--TTCA-A-AA-----ATCACCA------T-ATAACCTAATGCCT---------TGTAGATG--G------GTATGGCCC--TTCACTTaa
gi|15                         :                                CAAGAGGTCCATGA--C----ACGTATCGCTCACCTGTGCA----GCAATC--C-TCAACAATTATCAAGATTGA-G-CAAA--T----C-ATCAT-TA-TGAC-AGCA---CTT-TG--TTA-TA--GAT-GAA-AG----------T----------C------A-AA---AGCTAAC-------A---A-CA-ACCA-A--A-TTC-ATT--------aa
gi|16                         :                                                                                                     aaTTGA-G-TAAA--A----CTATCAT-TA-C-ACAAGCA--ACTT-GG--TT--CA--G-------AAA-------TTTTTTTTTTTCCC------A-AATATAT-TAAC-------A---A-CT-A--G-AT-A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTGAATT-A---TCAA-A----CTTGAC----T-A---AA-A
gi|17                         :                                   GAGGCCTAT----T----AA--ATTGC-CACCTAGGCACTATGCAGTT--C-CTAGCTATAAACAAGCTTCA-G-CAAA--A----CTATTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--CAA-AAA-ACT-------TTT----------C------A-Atctt
gi|18                         :                                                          atGCCCACTTGATCA----ATAGCC--C-CTAACATTAAACAATCTTAA-A-CAAA--A----TCATCAT-TA-T-A-----A--CTTT-AG--TT--C--------AC-ATA-------TTT----------T------A-AA---GG-TAAC-----------A-CT-A--A-A--A-ATCGATT--------A-tg
gi|19                         :                                acaaaGGCCCAAGGGCC----AC--ATTGCTCACCCCAGAA----ACATTT--T-CTA-CAAGAAACAAGCTTGA-T-CAGA--G----CTATGAT-TA-T-ACCAGCA--CATT-GG--TT--AATTTAA-AAA-AAA-------cc
gi|2                          :                                tatgAGGCCCATAGCCC----AC--ATTGCTCACCTGAGCA----GCAATT--C-CTAGCAATTTACAAGCTTGC-G-CTAA--A----CTATCAT-TT-T-ACAAGCA--GTTT-GG--TT--AA--AAA-AAA-AAAAAAAACTTTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------A---A-CT-A--A-A--A-----ATT--------A-A----T-----TCA-----TAATC-A---A----A----CTTAAA----T-G---AA-AC--TTTG-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----TCA---------TGTCGAGG--A------GTATGACCC--TTCATTTTAA
gi|20                         :                                                                 gaggcGCA----ATAATT--C-CTATCAATACACAAACTGGA-G-TAAA--GTAAGCTTTCAT-TA-T-ACCAGCA--GTTTGGG--TT--CA--G---TAA-AAA-------CTT----------C------A-CA---AG-TAAC-------ATGCA-TT-A--A-A--A-caaa
gi|21                         :                                   GAGGTCCAAGGACC----AT--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-A
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     tA---TTAAA---TGATT-A---A----A----CTTTAC----T-A---AA-AAAATAAA-C-AA-----AGTATCACCTACAT-GTA--C-----CAC---------TGTAGAGG--G------ATATGGCCT--TTCATT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                   aa----------C------A-AA---AG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------A-A----TTA---TTA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAC----T-A---AA-A---TTCA-T-TA-----ATTATTA------T-GTG--T-----CCT---------TGTTGAGA--A------AAATGACCT--TTCATTTTAtgtgtccttgttgagaaaaatgacctttcattttattaacaaatttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                      caaaagtaacC-ATT--------A-A----TTA---TCAAA-CTTAATC-ATCAT----A----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-TA-----ATTATGA------T-ATT--C-----CCT---------T------G--G------ATATGACTT--TTttaacaaatttc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAATC-A---A----A----CTTAA-------A---AC-AA--TTCG-T-AT-----ATTATTA------T-ATA--CTG---CCC---------AATAGAGG--G------GT-TGACCC--TGCACTTTGAt
gi|26                         :                                CAAAAGGCCCATTG-CC----AC--TACGCTAACCTGATCA----ACAATT--C-CTTGCGGTAAATAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTcaaattc
gi|27                         :                                                                                                                      agataaTTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAACAAA-------ATT----------C------A-AA---GA-TAAC-------A---AGCT-A--T-T--A-TCC-ATT--------A-A----TCA---TCAAA-CT
gi|3                          :                                CAAGAGGCTTATGGGTC----AC--AGCTCCCACCTAAGCA----GCAGTT--T-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-AAA-------TTT----------C------A-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-A--ACTTC-ATC--------A-A----TTA---CCAAA-CTT--TT-A---T----A----TTTGGC----T-A---CA-AA--TTCA-T-TA-----ATTATCA------C-ATG--C-----CCT---------TCTAGAGG--G------ATAT-GCCCTTTTCATTTTAA
gi|4                          :                                             GACC----AC--ATCGGTCATTTGAGCA----GCAGTT--C-TTGGCAATAAACAAACTTAA-G-CACA--T----CTATCAT-TA-T-ACAAACA--GTTT-GG--TT--TA--GAATAAA-ACA---------------------------A-AA---GG-TATC-------G---A-CT-A--ACA--A-CTC-ATT--------A-A----AAA---TAGAA-CTGGATC-A---T----AAAATTTT--C----T-A---AA-AA--TTCA-T-GA-----ATTATCG------T-ATT--C-----TTT---------ATTAGAGG--T------TCATGGCCC--TTAATTTTAA
gi|5                          :                                         aATGGGT-----AT--AT-GCTCACCTGAGCAA---GCAGTT--C-ACAG-AAGAGAGAAGATTGA-G-AAAA--AA---CT--CAT-TA-T-ACGAGCA--GCTT-G----T--TA--G--------AA-------TTTCTTC------C------C-AA---AA-CCAT-------T---A-CT-A--A-A--G-TTT-TTT--------A-A----ATA---CTAAA-CTTAGTT-----T----A------TGACAATTT-AGCCAA-AA--TTAA-TGAA-----ATTGTCA------T-ATG--------TCT---------TGTA-AGGAAG------GTA-GG-CC--TATACTTTAAtatat
gi|6                          :                                 AAGAAACCCATGGGCTGATTAC--ATCTATCACCTGAGCA----GTATTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGATA-CAACTTA----CTATCAT-TA-T-ACAGGCA--GCTT-GG--TT--CA--GAA-AAA-ACT-------TCT----------C------A-AA---GG--A--------------------------------ATT--------A-A----TTA---TCAAA--TTAATC-A---T----------T---------------A-AA--CTCA-T---------------------T-ATG--C-----CCT---------TGGAGAGG--G------GTATGGACT--TTCATTTTAAa
gi|7                          :                                                                              CGGTT--C-CTAGCA-TAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CAATCGT-TT-T-ACAAGCA--G-TT-GGGTTT--TT--TTA-AAA-AAA-------TT------------------G-AA---AG-T--------------A-CC-A--A-A------C-ATC--------A-AACTTTTA---TTA----TT-ATC-A---T----A----TTTGAC------A---AG-GA--TTCATT-AC-----TTTATCA------T-ATA--CT----CCTGTACAGACATGTAGAGA--G------GCATAA-CT--TTCATTCTAA
gi|8                          :                                 AAGTGGCCCATGGGCA----AC--ATTGCTCACTTATACT----GCAGTT----------------------GA-G-CAAA--A----TTATCAT-CA-T-ACAAGTA--GCTT-TT--TTTCCA--GAA---------------TTT----------TTTTTTAA-AA---GG-TAAC-------G---A-CT-A--A-----------TT--------A-A----TTA---TCAAA-CCTAATA-A---TCAAAA----CTTGAC----T-A---AA-AA--TTCA-T-AA-----ATTATCA------T-ATG--C-----Ccaaatt
gi|9                          :                              caaatGAGGTC-ACGGACC----AT--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG--TT--CA--GAA-AAC-AAg


blockSeqs                     :                                         C    A  GATT  GT                CTAT      AT G                    T A    GTAAG         A  C G       TT    G  GT  TC  AAAAAAAAAAAAAACTTTTC                     C  TAT  C    GTTCAGGG    G  A AATTTTTC        .        G ACTT   TTT     CTGGATCATAAAATT           GACAATT . GCC  C  AA    TAATCACC         CCTACA A   AC TAATG   GTACAGACA        AA .           G  TT
blockSeqs                     :                                         T    G  .     .                 A         .  .                    . .    TTA           .  . .       .     .  .   A   GAAATTTTTTTTTTTCCC                       .  .    .    ATGC        .  . CCAAATTC        .        . .      .       CCTAATAATCAAAAC           GAT     . .    .  .     TTAA             ACC    .   .  TG      .                .  .           C  . 
blockSeqs                     :                                         C    C  .     .                 .         .  .                    . .    AA            .  . .       .     .  .   .   AAAATAAGATTTTTA                          .  .    .    G           .  . AAAATTT         .        . .      .       TCGTAATTACTAAC            TAC     . .    .  .     TGAA             .      .   .  G       .                .  .           C  . 
blockSeqs                     :                                         C    A  .     .                 .         .  .                    . .    A             .  . .       .     .  .   .   GAAAAACAAAATTC                           .  .    .    G           .  . GATATTC         .        . .      .       CTGAATTATCAAAC            GAC     . .    .  .     TTAC             .      .   .  T       .                .  .           C  . 
blockSeqs                     :                                         C    G  .     .                 .         .  .                    . .    G             .  . .       .     .  .   .   CAAAAAACTTTTC                            .  .    .    G           .  . AAAATCG         .        . .      .       CTTAATCATCATAC            AAA     . .    .  .     AAA              .      .   .  .       .                .  .           C  . 
blockSeqs                     :                                         C    A  .     .                 .         .  .                    . .    G             .  . .       .     .  .   .   GAAAAAAAATTTC                            .  .    .    A           .  . AAACTTC         .        . .      .       TAATCAAAC                 TAC     . .    .  .     TAA              .      .   .  .       .                .  .           C  . 
blockSeqs                     :                                         T    G  .     .                 .         .  .                    . .    T             .  . .       .     .  .   .   GAAAAAACTTCTC                            .  .    .    A           .  . ACAACTC         .        . .      .       TGATTAAAC                 GAC     . .    .  .     CAA              .      .   .  .       .                .  .           C  . 
blockSeqs                     :                                         C    G  .     .                 .         .  .                    . .    A             .  . .       .     .  .   .   GAATTTTTTTTTA                            .  .    .    A           .  . AAATTG          .        . .      .       CTTTTATAT                 GAC     . .    .  .     TTA              .      .   .  .       .                .  .           C  . 
blockSeqs                     :                                         C    G  .     .                 .         .  .                    . .    A             .  . .       .     .  .   .   GAATTTTTTTTC                             .  .    .    G           .  . AAATTC          .        . .      .       CTTAGTTTA                 GGC     . .    .  .     TTA              .      .   .  .       .                .  .           C  . 
blockSeqs                     :                                         .    A  .     .                 .         .  .                    . .    A             .  . .       .     .  .   .   AAAATAAATTT                              .  .    .    A           .  . TTATCC          .        . .      .       TTATCATAT                 GAC     . .    .  .     TAT              .      .   .  .       .                .  .           A  . 
blockSeqs                     :                                         .    .  .     .                 .         .  .                    . .    G             .  . .       .     .  .   .   GTAAAAACTTC                              .  .    .    G           .  . AAGTTT          .        . .      .       TTAATCAT                  GAC     . .    .  .     TTA              .      .   .  .       .                .  .           .  . 
blockSeqs                     :                                              .  .     .                 .         .  .                    . .    A             .  . .       .     .  .   .   GAATTTCTTCC                              .  .    .    G           .  . AAA             .        . .      .       AAC                       AA      . .    .  .     TGA              .      .   .  .       .                .  .           .  . 
blockSeqs                     :                                              .  .     .                 .         .  .                    . .    G             .  . .       .     .  .   .   TTAAAAAAATT                              .  .    .    T           .  . AAC             .        . .      .       CTT                       C       . .    .  .     TAA              .      .   .  .       .                .  .           .  . 
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consensus                     :                                CAAGAGGCCCATGGGCC----AC--ATCGCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG----TT--C----AG--AA-A---AAA---------TTT----------C------A-AAGGTA---AC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------AA----TTA---TCAAAC--T-AA--TCATC--A-AA-CTTGACT-AAA-AA--TTCA-T-AA-----ATT-ATCA------T-AT-GC------CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCCC--TTCATTTTAA
Reference ( family-168 )      :                                CAAGAGGCCCATGGGCC----AC--ATCGCTCACCTGAGCA----GCAGTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG----TT--C----AG--AA-A---AAA---------TTT----------C------A-AAGGTA---AC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------AA----TTA---TCAAAC--T-AA--TCATC--A-AA-CTTGACT-AAA-AA--TTCA-T-AA-----ATT-ATCA------T-AT-GC------CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGCCC--TTCATTTTAA
gi|1                          :                                                       --ATCGCTCACATGTGCA----GAAGTT--C-CTCGCGACAAACAAGTTTGA-A-CAAA--G----CTGTCAT-TA-T-ACAAGGA--ACTT-GG----TT--C----TG--AA-A---AAC---------TTT----------T------A-AAGGTA---AC-------G---A-CT-AC-A-A--A-TTA-ATTTCATGATCAA----TTA---TTATCT--T-AA--TTAAT--A-AATTTTAACTCAAA-AA--ATCT-T-AA-----ATT-ACCG------T-AT-GC------CTT---------TGTAGAGA--GGCACATGTATAGTCC--TTCTTCTTAA
gi|10                         :                                CGAGAGGCCCATTAGCC----AC--ATTGCTCACTTGGGCA----GAAGTT--C-CTTGCAATGAA----CTTCA-G-CAAA--A----CTGTAGTATACT-ACAAGCA--GCTT-GG----TT--C----AG----------AATTTTT----TTT----------C------A-GA---A---AT-------G---------------------------------AG----TTA---TCAA--------------------A-CTTGATT-AAA-A------------------------A------T-AT-GC------CCT---------TGTAGAGG--G------GTATGGGCC--TTCATTTcgattt
gi|11                         :                                  aGAGGTC-ACGGACC-----T--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG----TT--C----AG--AA-A---A
gi|12                         : gcaaggtcttgctacaaagtgtctatataaatgttgaaactagtggttttaggttttttttaaaaataaaat----GCAGTTATCGTTAGCAATAAACAAGCTTCA-GATAAA--G----CTACCA--TA-T--TAGGCATTCCTT-GG----TT--C----AG-----A---AAC---------TTG----------C------ACAAGGTA---ATGTTCAGGG---A-CT-A--A-ATTT-TTC-ATT--------AA----TTATTTTCAAATCGT-AA--TTA-C--T-AA-CTTTACT-AAA-AA--ACCATT-AA-----Acaa
gi|13                         :                                                                                                    AGCCTAA-A-CAA--------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GC-T-GC----TTC-C----AA--AATA---AGA---------TTT----------TTA----A-AAGTTA---AC-------G---A-CT-A--A-A--A-----ATT--------GG----TTA-------------GA--TCATCAAA-AA-CTT---T-AAGCAA--TTCA-T-AATCACCATT-ATTAACC---TAAT-GCG-----CAT---------TGTAAGAT--G------GTATG--CC--TTCACTTgggtattacat
gi|14                         :                                                                                         atttaagAATAGGCCTAA-A-CAAA-------CGATCAT-TT-T-ACAAGCA--GCTT-GC----TT--C----CA--AA-AT--AAA---------TTT-----------------A-AAAGTA---AC-------G---A-CTAA--A-A--A-TTT-GTT--------AA----TTA---TCAAAC--T------------------TTAAC------AA--TTCA-A-AA-----ATC-ACCA------T-ATAACCTAATGCCT---------TGTAGATG--G------GTATGGCCC--TTCACTTaa
gi|15                         :                                CAAGAGGTCCATGA--C----ACGTATCGCTCACCTGTGCA----GCAATC--C-TCAACAATTATCAAGATTGA-G-CAAA--T----C-ATCAT-TA-TGAC-AGCA---CTT-TG----TTA-T----AG--AT-G---AAA---------GTC----------A------A-AAGCTA---AC-------A---A-CA-ACCA-A--A-TTC-ATT--------aa
gi|16                         :                                                                                                     aaTTGA-G-TAAA--A----CTATCAT-TA-C-ACAAGCA--ACTT-GG----TT--C----AG--AA-A---------------TTTTTTTTTTTCCC------A-AATATATTAAC-------A---A-CT-A--G-AT-A-TTC-ATT--------AA----TTA---TCAAAC--TGAA--TTATC--A-AA-CTTGACT-AAA-A
gi|17                         :                                   GAGGCCTAT----T----AA--ATTGC-CACCTAGGCACTATGCAGTT--C-CTAGCTATAAACAAGCTTCA-G-CAAA--A----CTATTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GG----TT--C----AC--AA-A---AAACT-------TTT----------C------A-Atctt
gi|18                         :                                                          atGCCCACTTGATCA----ATAGCC--C-CTAACATTAAACAATCTTAA-A-CAAA--A----TCATCAT-TA-T-A-----A--CTTT-AG----TT--C---------A-C---ATA---------TTT----------T------A-AAGGTA---AC-----------A-CT-A--A-A--A-ATCGATT--------Atg
gi|19                         :                                acaaaGGCCCAAGGGCC----AC--ATTGCTCACCCCAGAA----ACATTT--T-CTA-CAAGAAACAAGCTTGA-T-CAGA--G----CTATGAT-TA-T-ACCAGCA--CATT-GGTTAATT--T----AA--AA-A---AAA---------cc
gi|2                          :                                tatgAGGCCCATAGCCC----AC--ATTGCTCACCTGAGCA----GCAATT--C-CTAGCAATTTACAAGCTTGC-G-CTAA--A----CTATCAT-TT-T-ACAAGCA--GTTT-GG----TT--A----AA--AA-A---AAAAAAAAAACTTTT----------C------A-AAGGTA---AC-------A---A-CT-A--A-A--A-----ATT--------AA----T-----TCA-----T-A-----ATC--A-AA-CTTAAAT-GAA-AC--TTTG-T-AA-----ATT-ATCA------T-AT-GC------TCA---------TGTCGAGG--A------GTATGACCC--TTCATTTTAA
gi|20                         :                                                                 gaggcGCA----ATAATT--C-CTATCAATACACAAACTGGA-G-TAAA--GTAAGCTTTCAT-TA-T-ACCAGCA--GTTTGGG----TT--C----AG--TA-A---AAA---------CTT----------C------A-CAAGTA---AC-------ATGCA-TT-A--A-A--A-caaa
gi|21                         :                                   GAGGTCCAAGGACC----AT--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG----TT--C----AG--AA-A---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 tAAAT--T-AAA-TGATT--A-AA-CTTTACT-AAA-AAAATAAA-C-AA-----AGT-ATCACCTACAT-GT-AC------CAC---------TGTAGAGG--G------ATATGGCCT--TTCATT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                             ----------C------A-AAAGTA---AC-------G---A-CT-A--A-A--A-TTC-ATT--------AA----TTA---TTA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GACT-AAA-A---TTCA-T-TA-----ATT-ATTA------T-GT-GT------CCT---------TGTTGAGA--A------AAATGACCT--TTCATTTTAtgtgtccttgttgagaaaaatgacctttcattttattaacaaatttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                             caaaagtaacC-ATT--------AA----TTA---TCAAAC--TTAA--TCATC--A-TA-CTTGACT-AAA-AA--TTCA-T-TA-----ATT-ATGA------T-AT-TC------CCT---------T------G--G------ATATGACTT--TTttaacaaatttc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATC--A-AA-CTTAA---AAC-AA--TTCG-T-AT-----ATT-ATTA------T-AT-ACTG----CCC---------AATAGAGG--G------GT-TGACCC--TGCACTTTGAt
gi|26                         :                              taCAAAAGGCCCATTG-CC----AC--TACGCTAACCTGATCA----ACAATT--C-CTTGCGGTAAATAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTcaaattc
gi|27                         :                                                                                                                      agataaTTAT-TA-C-AGAAGCA--GCAT-GG----TT--C----AG--AA-AAACAAA---------ATT----------C------A-AAGATA---AC-------A---AGCT-A--T-T--A-TCC-ATT--------AA----TCA---TCAAAC--T-
gi|3                          :                                CAAGAGGCTTATGGGTC----AC--AGCTCCCACCTAAGCA----GCAGTT--T-CTAGCAATAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CTATCAT-TA-T-ACAAGCA--GCTT-GG----TT--C----AGAAAA-A---AAA---------TTT----------C------A-AAGGTA---AC-------G---A-CT-A--A-A--ACTTC-ATC--------AA----TTA---CCAAAC--T-----T--TT--A-TA-TTTGGCT-ACA-AA--TTCA-T-TA-----ATT-ATCA------C-AT-GC------CCT---------TCTAGAGG--G------ATAT-GCCCTTTTCATTTTAA
gi|4                          :                                             GACC----AC--ATCGGTCATTTGAGCA----GCAGTT--C-TTGGCAATAAACAAACTTAA-G-CACA--T----CTATCAT-TA-T-ACAAACA--GTTT-GG----TT--T----AG--AATA---AAA----------------------CA-----A-AAGGTA---TC-------G---A-CT-A--ACA--A-CTC-ATT--------AA----AAA---TAGAAC--TGGA--TCATA--A-AA-TTTT-CT-AAA-AA--TTCA-T-GA-----ATT-ATCG------T-AT-TC------TTT---------ATTAGAGG--T------TCATGGCCC--TTAATTTTAA
gi|5                          :                                         aATGGGT-----AT--AT-GCTCACCTGAGCAA---GCAGTT--C-ACAG-AAGAGAGAAGATTGA-G-AAAA--AA---CT--CAT-TA-T-ACGAGCA--GCTT-G------T--T----AG----------AA---------TTTCTTC------C------C-AAAACC---AT-------T---A-CT-A--A-A--G-TTT-TTT--------AA----ATA---CTAAAC--T-TAGTTTATG--ACAA-TTTAGCC--AA-AA--TTAA-TGAA-----ATT-GTCA------T-AT-G-------TCT---------TGTA-AGGAAG------GTA-GG-CC--TATACTTTAAtatat
gi|6                          :                                 AAGAAACCCATGGGCTGATTAC--ATCTATCACCTGAGCA----GTATTT--C-CTAGCAATAAACAAGCTTGATA-CAACTTA----CTATCAT-TA-T-ACAGGCA--GCTT-GG----TT--C----AG--AA-A---AAACT-------TCT----------C------A-AAGG-A-----------------------------------ATT--------AA----TTA---TCAAAT--T-AA--TCATT--A-AA-C----------------TCA-T----------------------T-AT-GC------CCT---------TGGAGAGG--G------GTATGGACT--TTCATTTTAAa
gi|7                          :                                                                              CGGTT--C-CTAGCA-TAAACAAGCTTGA-G-CAAA--A----CAATCGT-TT-T-ACAAGCA--GTTG-GG----TT--TTTTTA---AA-A---AAA---------TT------------------G-AAAGTA------------------CC-A--A-A------C-ATC--------AAACTTTTA---TTA-----------TTATC--A-TA-TTTGAC--AAG-GA--TTCA-T-TA-----CTTTATCA------T-AT-ACT-----CCTGTACAGACATGTAGAGA--G------GCATAA-CT--TTCATTCTAA
gi|8                          :                                 AAGTGGCCCATGGGCA----AC--ATTGCTCACTTATACT----GCAGTT----------------------GA-G-CAAA--A----TTATCAT-CA-T-ACAAGTA--GCTT-TT----TTTCC----AG--AA-----------------TTT----------TTTTTTAA-AAGGTA---AC-------G---A-CT-A--A-----------TT--------AA----TTA---TCAAACC-T-AA--TAATC--A-AAACTTGACT-AAA-AA--TTCA-T-AA-----ATT-ATCA------T-AT-GC------Ccaaatt
gi|9                          :                              caaatGAGGTC-ACGGACC----AT--ATCACTCACTTAAG-A----GCAGTT--C-CTAGCAATAAAAAAGCTTGA-G-C-AA--G----CTATGAT-TA-T-GCAAGCA--GCAT-GG----TT--C----AG--AA-A---Ag